KR20230156897A - 반감기 연장 조성물 및 방법 - Google Patents

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KR20230156897A
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데이비드 캠벨
토마스 알 디라이몬도
라메시 바트
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재눅스 테라퓨틱스 인크.
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Abstract

본원에서는 반감기 연장 항체 또는 항체 단편을 포함하는 폴리펩티드 및 폴리펩티드 복합체를 개시한다. 일부 실시양태에서, 반감기 연장 항체 또는 항체 단편은 단일 도메인 항체이다.

Description

반감기 연장 조성물 및 방법
상호 참조
본 출원은 202년 12월 8일 출원된 미국 가출원 제63/122,818호의 이익을 주장하고, 상기 출원은 그 전문이 본원에서 참조로 포함된다.
서열 목록
본 출원은 ASCII 포맷으로 전자적으로 제출된 서열 목록을 포함하고, 이는 그 전문이 본원에서 참조로 포함된다. 2021년 11월 30일 작성된 상기 ASCII 사본의 명칭은 52426-731_601_SL.txt이고, 그 크기는 39,169 바이트이다.
요약
본원에서는 상보성 결정 영역(CDR: complementarity determining region): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 항체 또는 항체 단편(H1)을 포함하는 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체로서, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 0-2개의 아미노산 변형을 포함하는 것인, 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다. 일부 실시양태에서, H1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1의 항체 또는 항체 단편은 단일 도메인 항체, 단일 쇄 가변 단편, Fab, 또는 Fab'를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1의 항체 또는 항체 단편은 단일 도메인 항체를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4에 따른 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 화학식 I: A1-L1-P1-H1에 따른 구성에서 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 절단가능한 링커(L1)를 통해 제1 표적 항원에의 제1 항원 인식 분자(A1)의 결합을 손상시키는 펩티드(P1)에 연결된다. 일부 실시양태에서, A1은 제2 항원 인식 분자(A2)에 추가로 연결된다. 일부 실시양태에서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 화학식 Ia: P2-L2-A2-A1-L1-P1-H1에 따른 것이고, 여기서, P2는 제2 표적 항원에의 A2의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고; L2는 A2를 P2에 연결하고, 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 제2 절단가능한 링커를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 H1을 P1에 연결하는 연결 모이어티(L3)를 포함한다. 일부 실시양태에서, L3은 5개 이상 50개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L3은 10개 이상 30개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L3은 10개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L3은 18개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L3은 26개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L3은 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L3은 아미노산 서열 GGGGSGGGS(서열 번호 19)를 포함한다. 일부 실시양태에서, A1은 항체 또는 항체 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, A1은 인간 또는 인간화된 항체 또는 항체 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, L1은 A1의 항체 또는 항체 단편의 N 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, L1은 A1의 항체 또는 항체 단편의 C 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2는 A1의 항체 또는 항체 단편의 C 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, A1의 항체 또는 항체 단편은 단일 쇄 가변 단편, 단일 도메인 항체, 또는 Fab 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, A1 단일 쇄 가변 단편(scFv)이다. 일부 실시양태에서, scFv는 scFv 중쇄 폴리펩티드 및 scFv 경쇄 폴리펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, A1은 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, A1의 항체 또는 그의 항체 단편은 단일 쇄 가변 단편(scFv), 중쇄 가변 도메인(VH 도메인), 경쇄 가변 도메인(VL 도메인), 또는 낙타류 유래 단일 도메인 항체의 가변 도메인(VHH)을 포함한다. 일부 실시양태에서, 제1 표적 항원은 이펙터 세포 항원을 포함한다. 일부 실시양태에서, 제1 표적 항원은 CD3이다. 일부 실시양태에서, A1은 항CD3e 단일 쇄 가변 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, A1은 CD3 발현 세포 상의 CD3에 대해 1 μM 이하의 KD 결합을 갖는 항CD3e 단일 쇄 가변 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, A1은 각각 인간 CD3에 특이적으로 결합할 수 있는 가변 경쇄 및 가변 중쇄를 포함한다. 일부 실시양태에서, A1은 뮤로모납-CD3(OKT3), 오텔릭시주맙(TRX4), 테플리주맙(MGA031), 비실리주맙(Nuvion), SP34, X35, VIT3, BMA030 (BW264/56), CLB-T3/3, CRIS7, YTH12.5, F111-409, CLB-T3.4.2, TR-66, WT32, SPv-T3b, 11D8, XIII-141, XIII-46, XIII-87, 12F6, T3/RW2-8C8, T3/RW2-4B6, OKT3D, M-T301, SMC2, F101.01, UCHT-1, WT-31, 15865, 15865v12, 15865v16, 및 15865v19로 이루어진 군으로부터 선택되는 상보성 결정 영역(CDR)을 포함한다. 일부 실시양태에서, 화학식 I의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 L1이 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단될 때, 이펙터 세포에 결합한다. 일부 실시양태에서, 화학식 I의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 L1이 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단되고, A1이 이펙터 세포에 결합할 때, 이펙터 세포에 결합한다. 일부 실시양태에서, 이펙터 세포는 T 세포이다. 일부 실시양태에서, A1은 이펙터 세포 상의 TCR-CD3 복합체의 일부인 폴리펩티드에 결합한다. 일부 실시양태에서, TCR-CD3 복합체의 일부인 폴리펩티드는 인간 CD3ε이다. 일부 실시양태에서, A2는 항체 또는 항체 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, A2의 항체 또는 그의 항체 단편은 단일 쇄 가변 단편, 단일 도메인 항체, Fab', 또는 Fab를 포함한다. 일부 실시양태에서, A2의 항체 또는 그의 항체 단편은 단일 쇄 가변 단편(scFv), 중쇄 가변 도메인(VH 도메인), 경쇄 가변 도메인(VL 도메인), 또는 낙타류 유래 단일 도메인 항체의 가변 도메인(VHH)을 포함한다. 일부 실시양태에서, A2의 항체 또는 그의 항체 단편은 인간화 또는 인간 항체 또는 그의 항체 단편이다. 일부 실시양태에서, A2는 Fab 또는 Fab'이다. 일부 실시양태에서, Fab 또는 Fab'는 (a) Fab 경쇄 폴리펩티드 및 (b) Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, 제2 표적 항원은 종양 항원을 포함한다. 일부 실시양태에서, A2의 항체 또는 항체 단편은 표피 성장 인자 수용체(EGFR: epidermal growth factor receptor) 결합 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, A2의 항체 또는 항체 단편은 메소텔린 결합 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1은 제1 표적 항원에의 A1의 결합을 손상시킨다. 일부 실시양태에서, P1은 이온 상호작용, 정전기적 상호작용, 소수성 상호작용, Pi-스태킹 상호작용, 및 H-결합 상호작용, 또는 그의 조합을 통해 A1에 결합된다. 일부 실시양태에서, P1은 제1 표적 항원과 70% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P2는 제2 표적 항원에의 A2의 결합을 손상시킨다. 일부 실시양태에서, P2는 이온 상호작용, 정전기적 상호작용, 소수성 상호작용, Pi-스태킹 상호작용, 및 H-결합 상호작용, 또는 그의 조합을 통해 A2에 결합된다. 일부 실시양태에서, P2는 항원 결합 부위에서 또는 그 인근에서 A2에 결합된다. 일부 실시양태에서, P2는 제2 표적 항원과 70% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2 길이가 10개 이상의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2 길이가 10개 이상의 아미노산 길이 및 길이가 20개 이하의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2는 길이가 16개 이상의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2 길이가 40개 이하의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2는 적어도 2개의 시스테인 아미노산 잔기를 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2는 환형 펩티드 또는 선형 펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2는 환형 펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2는 선형 펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, L1은 A1의 N 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, L1은 A1의 C 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, L2는 A2의 N 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, L2는 A2의 C 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 5개 이상 50개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 10개 이상 30개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 10개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 18개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 26개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 (G2S)n(여기서, n은 1 내지 3의 정수임)(서열 번호 20)을 포함하는 화학식을 갖는다. 일부 실시양태에서, L1은 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L1이 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단되어 A1을 제1 표적 항원에 노출시킬 때 P1은 A1로부터 비결합 상태가 된다. 일부 실시양태에서, L2가 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단되어 A2를 제2 표적 항원에 노출시킬 때 P2는 A2로부터 비결합 상태가 된다. 일부 실시양태에서, 종양 특이적 프로테아제는 메탈로프로테아제, 세린 프로테아제, 시스테인 프로테아제, 트레오닌 프로테아제, 및 아스파르트산 프로테아제로 이루어진 군으로부터 선택된다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 우로키나제 절단가능한 아미노산 서열, 매트립타제 절단가능한 아미노산 서열, 매트릭스 메탈로프로테아제 절단가능한 아미노산 서열, 또는 레구마인 절단가능한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 GGGGSLSGRSDNHGSSGT(서열 번호 21), GGGGSSGGSGGSGLSGRSDNHGSSGT(서열 번호 22), ASGRSDNH(서열 번호 23), LAGRSDNH(서열 번호 24), ISSGLASGRSDNH(서열 번호 25), ISSGLLAGRSDNH(서열 번호 26), LSGRSDNH(서열 번호 27), ISSGLLSGRSDNP(서열 번호 28), ISSGLLSGRSDNH(서열 번호 29), LSGRSDNHSPLGLAGS(서열 번호 30), SPLGLAGSLSGRSDNH(서열 번호 31), SPLGLSGRSDNH(서열 번호 32), LAGRSDNHSPLGLAGS(서열 번호 33), LSGRSDNHVPLSLKMG(서열 번호 34), 및 LSGRSDNHVPLSLSMG(서열 번호 35)로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 ASGRSDNH(서열 번호 23), LAGRSDNH(서열 번호 24), ISSGLASGRSDNH(서열 번호 25), 및 ISSGLLAGRSDNH(서열 번호 26)로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드는 A1의 단일 쇄 가변 단편(scFv)의 C 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드는 단일 쇄 가변 단편(scFv) A1의 C 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드는 A1의 단일 쇄 가변 단편(scFv)의 N 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드는 단일 쇄 가변 단편(scFv) A1의 N 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2는 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2는 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2는 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2는 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드에 결합된다.
본원에서는 (i) 상기 실시양태 중 어느 하나의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체; 및 (ii) 약학적으로 허용되는 부형제를 포함하는 약학 조성물을 개시한다.
본원에서는 상기 실시양태 중 어느 하나의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 코딩하는 단리된 재조합 핵산 분자를 개시한다.
본원에서는 화학식 II: L1a-P1a-H1a에 따른 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체로서, 상기 식에서, L1a는 비절단시, P1a를 제1 표적 항원에 결합하는 제1 항원 인식 분자에 연결하는 종양 특이적 프로테아제 절단된 연결 모이어티를 포함하고; P1a는 L1a 비절단시, 제1 표적 항원에의 제1 항원 인식 분자의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고; H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 분자를 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 0-2개의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1a의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a의 항체 또는 항체 단편은 단일 도메인 항체, 단일 쇄 가변 단편, Fab, 또는 Fab'를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1의 항체 또는 항체 단편은 단일 도메인 항체를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4에 따른 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1a L1a 비절단시, 이펙터 세포 항원에의 제1 항원 인식 분자의 결합을 손상시킨다. 일부 실시양태에서, 제1 항원 인식 분자는 항체 또는 항체 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, 이펙터 세포 항원은 항CD3 이펙터 세포 항원이다. 일부 실시양태에서, P1a는 이펙터 세포 항원과 70% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1a는 길이가 10개 이상의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a 길이가 10개 이상의 아미노산 길이 및 길이가 20개 이하의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a는 길이가 16개 이상의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a 길이가 40개 이하의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a는 적어도 2개의 시스테인 아미노산 잔기를 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a는 환형 펩티드 또는 선형 펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a는 환형 펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a는 선형 펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 H1a를 P1a에 연결하는 연결 모이어티(L3a)를 포함한다. 일부 실시양태에서, L3a는 5개 이상 50개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L3a는 10개 이상 30개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L3a는 10개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L3a는 18개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L3a는 26개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L3a는 (G2S)n(여기서, n은 1 내지 3의 정수임)(서열 번호 20)을 포함하는 화학식을 갖는다. 일부 실시양태에서, L3a는 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L3a는 GGGGSGGGS(서열 번호 19)에 따른 아미노산 서열을 포함한다.
도면의 간단한 설명
본 발명의 신규한 특징은 특히 첨부된 청구범위에 기재되어 있다. 본 발명의 원리가 이용되는 예시적인 실시양태를 설명하는 하기 상세한 설명 및 첨부된 도면을 참조함으로써 본 발명의 특징 및 장점을 더욱 잘 이해할 수 있을 것이다:
도 1a는 소 혈청 알부민에의 단일 도메인 항체의 결합 곡선을 도시한 것이다.
도 1b는 마우스 혈청 알부민에의 단일 도메인 항체의 결합 곡선을 도시한 것이다.
도 1c는 시노몰구스 원숭이 혈청 알부민에의 단일 도메인 항체의 결합 곡선을 도시한 것이다.
도 1d는 인간 혈청 알부민에의 단일 도메인 항체의 결합 곡선을 도시한 것이다.
도 2a는 pH 7.4에서의 HE-1 항알부민의 적정 데이터를 도시한 것이다.
도 2b는 pH 5.5에서의 HE-1 항알부민의 적정 데이터를 도시한 것이다.
도 3a는 pH 7.4에서 시노몰구스 원숭이 혈청 알부민에 결합하는 단일 도메인 항체의 적정 데이터를 도시한 것이다.
도 3b는 pH 7.4에서 인간 혈청 알부민에 결합하는 단일 도메인 항체의 적정 데이터를 도시한 것이다.
도 3c는 pH 5.5에서 시노몰구스 원숭이 혈청 알부민에 결합하는 단일 도메인 항체의 적정 데이터를 도시한 것이다.
도 3d는 pH 5.5에서 인간 혈청 알부민에 결합하는 단일 도메인 항체의 적정 데이터를 도시한 것이다.
도 4는 FcRn 인식을 차단하지 않고, 인간 혈청 알부민에의 단일 도메인 항체의 결합 데이터를 도시한 것이다.
도 5는 ELISA에 의해 측정된, PSMA에의 폴리펩티드 복합체 PC1 및 PC2의 결합 데이터를 도시한 것이다.
도 6은 ELISA에 의해 측정된, CD3에의 폴리펩티드 복합체 PC1 및 PC2의 결합 데이터를 도시한 것이다.
도 7은 CD8+ T 세포의 존재하에서 폴리펩티드 복합체 PC1 및 PC2에 의해 매개되는 22Rv1 종양 세포 살해를 도시한 것이다.
도 8은 단일 IV 볼루스 주사 후 시노몰구스 원숭이에서의 폴리펩티드 복합체 PC1의 약동학적 데이터를 도시한 것이다.
도 9는 단일 IV 볼루스 주사 후 시노몰구스 원숭이에서의 폴리펩티드 복합체 PC2의 약동학적 데이터를 도시한 것이다.
도 10은 ELISA에 의해 측정된, TROP2에의 폴리펩티드 복합체 PC1 및 PC4의 결합 데이터를 도시한 것이다.
도 11은 ELISA에 의해 측정된, CD3에 결합하는 폴리펩티드 복합체 PC1 및 PC4의 결합 데이터를 도시한 것이다.
도 12는 CD8+ T 세포의 존재하에서 폴리펩티드 복합체 PC3 및 PC4에 의해 매개되는 H292 종양 세포 살해를 도시한 것이다.
도 13은 단일 IV 볼루스 주사 후 시노몰구스 원숭이에서의 폴리펩티드 복합체 PC3의 약동학적 데이터를 도시한 것이다.
도 14는 단일 IV 볼루스 주사 후 시노몰구스 원숭이에서의 폴리펩티드 복합체 PC4의 약동학적 데이터를 도시한 것이다.
상세한 설명
단백질 기반 요법, 예컨대, 항체 및 이중특이적 또는 다중특이적 항체, 예컨대, T 세포 인게이저는 다양한 질환 및 장애에 효과적인 것으로 입증되었다. 임의의 요법과 같이, 질환 조직에서는 단백질 기반 요법의 활성을 유지하면서, 건강한 조직에서는 단백질 기반 요법의 표적에서 벗어난 효과는 최소화할 필요가 있다. 그러한 전략법 중 하나는 단백질 기반 요법에 필요한 결합 부위를 단백질 기반 요법에 연결된 펩티드로 차단하여 단백질 기반 요법이 건강한 조직에 있을 때에는 그의 표적 항원과 결합 또는 상호작용하지 못하게 방해하는 불활성 형태의 단백질 기반 요법을 생성하는 것이다. 원하는 질환 상태 미세환경에서 단백질 기반 요법을 활성화시키기 위해, 펩티드는 질환 상태 미세환경에 특이적인 프로테아제에 의해 절단가능한 링커로 단백질 기반 요법에 연결된다. 이어서, 펩티드는 질환 상태 미세 환경에 있을 때, 단백질 기반 요법으로부터 유리된다.
단백질 기반 요법의 약동학적 특성을 개선시키기 위해, 반감기 연장 분자가 요법에 부착된다. 반감기 연장 분자를 단백질 기반 요법에 부착하기 위한 상기 위치 중 하나는 단백질 기반 요법이 건강한 조직에 있을 때에는 표적 항원과 결합 또는 상호작용하지 못하게 차단하는 펩티드이다. 질환 상태 미세환경에서 펩티드가 절단되면, 반감기 연장 분자 또한 단백질 기반 요법으로부터 유리된다.
본원에서는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 항체 또는 항체 단편(H1)을 포함하는 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체로서, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 0-2개의 아미노산 변형을 포함하는 것인, 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다.
일부 실시양태에서, 반감기 연장 항체 또는 항체 단편(H1)을 포함하는 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 암 치료를 필요로 하는 피험체에서 암을 치료하는 방법에서 사용된다. 일부 실시양태에서, 암을 치료하는 방법은 암 치료를 필요로 하는 피험체에게 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 항체 또는 항체 단편(H1)을 포함하는 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 투여하는 단계를 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 0-2개의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 실시양태에서, 암은 EGFR을 발현하는 세포를 갖는다. 일부 경우에서, 암은 고형 종양 암이다. 일부 실시양태에서, 암은 폐암, 유방암(예컨대, HER2+; ER/PR+; TNBC), 자궁경부암, 난소암, 결장직장암, 췌장암 또는 위암이다.
일부 실시양태에서, H1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 2개에 0-2개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 3개에 0-2개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 1개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 2개에 1개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 3개에 1개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 70%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 80%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 85%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 91%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 92%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 93%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 94%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 96%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 97%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 98%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4에 따른 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는다.
일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는다.
일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는다.
본원에서는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 항체 또는 항체 단편(H1)을 포함하는 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체로서, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 5를 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 0-2개의 아미노산 변형을 포함하는 것인, 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다.
일부 실시양태에서, 반감기 연장 항체 또는 항체 단편(H1)을 포함하는 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 암 치료를 필요로 하는 피험체에서 암을 치료하는 방법에서 사용된다. 일부 실시양태에서, 암을 치료하는 방법은 암 치료를 필요로 하는 피험체에게 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 항체 또는 항체 단편(H1)을 포함하는 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 투여하는 단계를 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 5를 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 0-2개의 아미노산 변형을 포함한다. 일부 실시양태에서, 암은 EGFR을 발현하는 세포를 갖는다. 일부 경우에서, 암은 고형 종양 암이다. 일부 실시양태에서, 암은 폐암, 유방암(예컨대, HER2+; ER/PR+; TNBC), 자궁경부암, 난소암, 결장직장, 췌장암 또는 위암이다.
일부 실시양태에서, H1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 5를 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 2개에 0-2개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 5를 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 3개에 0-2개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 5를 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 1개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 5를 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 2개에 1개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 5를 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 3개에 1개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6과 적어도 70%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6과 적어도 80%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6과 적어도 85%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6과 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6과 적어도 91%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6과 적어도 92%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6과 적어도 93%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6과 적어도 94%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6과 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6과 적어도 96%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6과 적어도 97%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6과 적어도 98%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6과 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6에 따른 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는다.
일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는다.
일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1은 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는다.
일부 실시양태에서, H1의 항체 또는 항체 단편은 단일 도메인 항체, 단일 쇄 가변 단편, Fab, 또는 Fab'를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1의 항체 또는 항체 단편은 단일 도메인 항체를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1의 항체 또는 항체 단편은 Fab를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1의 항체 또는 항체 단편은 Fab'를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1의 항체 또는 항체 단편은 scFv를 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 인간 혈청 알부민, 시노몰구스 혈청 알부민, 및 마우스 혈청 알부민으로부터 선택되는 혈청 알부민에 결합한다. 일부 실시양태에서, H1은 유사한 결합 친화도(Kd)로 인간 혈청 알부민 및 시노몰구스 혈청 알부민에 결합한다. 일부 실시양태에서, H1은 인간 및 시노몰구스 혈청 알부민에 대한 상기 단백질의 결합 친화도(Kd)보다 약 1.5배 내지 약 20배 더 약한 결합 친화도(Kd)로 마우스 혈청 알부민에 결합한다. 일부 실시양태에서, H1은 약 1 nM 내지 약 100 nM의 인간 Kd(hKd: human Kd)로 인간 혈청 알부민에 결합하고, 1 nM 내지 100 nM의 시노몰구스 Kd(cKd: cynomolgus Kd)로 시노몰구스 혈청 알부민에 결합한다. 일부 실시양태에서, H1의 hKd 및 cKd는 1 nM 내지 약 5 nM, 또는 약 5 nM 내지 약 10 nM이다. 일부 실시양태에서, H1의 hKd 및 cKd는 약 1 nM 내지 약 2 nM, 약 2 nM 내지 약 3 nM, 약 3 nM 내지 약 4 nM, 약 4 nM 내지 약 5 nM, 약 5 nM 내지 약 6 nM, 약 6 nM 내지 약 7 nM, 약 7 nM 내지 약 8 nM, 약 8 nM 내지 약 9 nM, 또는 약 9 nM 내지 약 10 nM이다. 일부 실시양태에서, H1의 hKd과 cKd 사이의 비(hKd:cKd)는 약 20:1 내지 약 1:2이다.
일부 실시양태에서, H1 단백질은 적어도 12시간, 적어도 20시간, 적어도 25시간, 적어도 30시간, 적어도 35시간, 적어도 40시간, 적어도 45시간, 적어도 50시간, 또는 적어도 100시간의 제거 반감기를 포함한다.
일부 실시양태에서, H1의 항체 또는 항체 단편은 중쇄 가변 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1의 중쇄 가변 도메인은 IgG1, IgG2, IgG3, 또는 IgG4 중쇄의 가변 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1의 항체 또는 항체 단편은 경쇄 가변 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1의 경쇄 가변 도메인은 IgG1, IgG2, IgG3, 또는 IgG4 경쇄의 가변 도메인을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1은 하기 화학식 I에 따른 구성에서 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 절단가능한 링커(L1)를 통해 제1 항원 인식 분자(A1)의 제1 표적 항원에의 결합을 손상시키는 펩티드(P1)에 연결된다:
A1-L1-P1-H1 (화학식 I).
일부 실시양태에서, A1은 제2 항원 인식 분자(A2)에 추가로 연결된다. 일부 실시양태에서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 하기 화학식 Ia에 따른 것이다:
P2-L2-A2-A1-L1-P1-H1 (화학식 Ia)
상기 식에서, P2는 A2의 제2 표적 항원에의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고; L2는 A2를 P2에 연결하고, 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 제2 절단가능한 링커를 포함한다.
일부 실시양태에서, 본원에서는 하기 화학식 II에 따른 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
L1a-P1a-H1a (화학식 II)
상기 식에서, L1a는 비절단시, P1a를 제1 표적 항원에 결합하는 제1 항원 인식 분자에 연결하는 종양 특이적 프로테아제 절단된 연결 모이어티를 포함하고; P1a는 L1a 비절단시, 제1 표적 항원에의 제1 항원 인식 분자의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고; H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 분자를 포함하고, 여기서, H1a의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 0-2개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1a의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 2개에 0-2개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1a의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 3개에 0-2개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1a의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 1개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1a의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 2개에 1개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1a의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 3개에 1개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 70%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 80%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 85%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 91%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 92%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 93%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 94%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 96%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 97%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 98%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4에 따른 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는다.
일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는다.
일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는다.
일부 실시양태에서, H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1a의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 5를 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 2개에 0-2개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1a의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 5를 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 3개에 0-2개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1a의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 5를 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 1개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1a의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 5를 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 2개에 1개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1a의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 5를 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 3개에 1개의 아미노산 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6과 적어도 70%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6과 적어도 80%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6과 적어도 85%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6과 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6과 적어도 91%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6과 적어도 92%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6과 적어도 93%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6과 적어도 94%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6과 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6과 적어도 96%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6과 적어도 97%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6과 적어도 98%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6과 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6에 따른 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는다.
일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 115개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는다.
일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시양태에서, H1a는 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는다.
일부 실시양태에서, H1a의 항체 또는 항체 단편은 단일 도메인 항체, 단일 쇄 가변 단편, Fab, 또는 Fab'를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a의 항체 또는 항체 단편은 단일 도메인 항체를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a의 항체 또는 항체 단편은 Fab를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a의 항체 또는 항체 단편은 Fab'를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a의 항체 또는 항체 단편은 scFv를 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a의 항체 또는 항체 단편은 중쇄 가변 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a의 중쇄 가변 도메인은 IgG1, IgG2, IgG3, 또는 IgG4 중쇄의 가변 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a의 항체 또는 항체 단편은 경쇄 가변 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a의 경쇄 가변 도메인은 IgG1, IgG2, IgG3, 또는 IgG4 경쇄의 가변 도메인을 포함한다.
일부 실시양태에서, H1a는 인간 혈청 알부민, 시노몰구스 혈청 알부민, 및 마우스 혈청 알부민으로부터 선택되는 혈청 알부민에 결합한다. 일부 실시양태에서, H1a는 유사한 결합 친화도(Kd)로 인간 혈청 알부민 및 시노몰구스 혈청 알부민에 결합한다. 일부 실시양태에서, H1a는 인간 및 시노몰구스 혈청 알부민에 대한 상기 단백질의 결합 친화도(Kd)보다 약 1.5배 내지 약 20배 더 약한 결합 친화도(Kd)로 마우스 혈청 알부민에 결합한다. 일부 실시양태에서, H1a는 약 1 nM 내지 약 100 nM의 인간 Kd(hKd)로 인간 혈청 알부민에 결합하고, 1 nM 내지 100 nM의 시노몰구스 Kd(cKd)로 시노몰구스 혈청 알부민에 결합한다. 일부 실시양태에서, H1a의 hKd 및 cKd는 1 nM 내지 약 5 nM, 또는 약 5 nM 내지 약 10 nM이다. 일부 실시양태에서, H1a의 hKd 및 cKd는 약 1 nM 내지 약 2 nM, 약 2 nM 내지 약 3 nM, 약 3 nM 내지 약 4 nM, 약 4 nM 내지 약 5 nM, 약 5 nM 내지 약 6 nM, 약 6 nM 내지 약 7 nM, 약 7 nM 내지 약 8 nM, 약 8 nM 내지 약 9 nM, 또는 약 9 nM 내지 약 10 nM이다. 일부 실시양태에서, H1a의 hKd와 cKd 사이의 비(hKd:cKd)는 약 20:1 내지 약 1:2이다.
일부 실시양태에서, H1a 단백질은 적어도 12시간, 적어도 20시간, 적어도 25시간, 적어도 30시간, 적어도 35시간, 적어도 40시간, 적어도 45시간, 적어도 50시간, 또는 적어도 100시간의 제거 반감기를 포함한다.
일부 실시양태에서, H1 또는 H1a는 변형된 아미노산 또는 비천연 아미노산, 또는 변형된 비천연 아미노산, 또는 그의 조합을 포함한다. 일부 실시양태에서, 변형된 아미노산 또는 변형된 비천연 아미노산은 번역 후 변형을 포함한다. 일부 실시양태에서, H1 또는 H1a는 아세틸화, 아실화, ADP-리보실화, 아미드화, 플라빈의 공유 부착, 헴 모이어티의 공유 부착, 뉴클레오티드 또는 뉴클레오티드 유도체의 공유 부착, 지질 또는 지질 유도체의 공유 부착, 포스파티딜이노시톨의 공유 부착, 가교결합, 고리화, 디술피드 결합 형성, 탈메틸화, 공유 가교결합의 형성, 시스틴의 형성, 피로글루타메이트의 형성, 포르밀화, 감마 카복실화, 글리코실화, GPI 앵커 형성, 하이드록실화, 아이오딘화, 메틸화, 미리스토일화, 산화, 단백질분해성 프로세싱, 인산화, 프레닐화, 라세미화, 셀레노일화, 황산화, 아미노산의 단백질로의 전달-RNA 매개 첨가, 예컨대, 아르기닐화 및 유비퀴틴화를 포함하나, 이에 제한되지 않는 변형을 포함한다. H1 또는 H1a에의 변형은 펩티드 백본, 아미노산 측쇄 및 말단을 포함하여 어디에서나 이루어진다.
Figure pct00001
연결 모이어티( L 3 또는 L 3a )
일부 실시양태에서, H1은 H1을 P1에 연결하는 연결 모이어티(L3)를 포함한다. 일부 실시양태에서, H1a는 H1a를 P1a에 연결하는 연결 모이어티(L3a)를 포함한다.
일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 5개 이상 50개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 10개 이상 30개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 10개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서,L3 또는 L3a는 18개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 26개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다.
일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (G2S)n(서열 번호 20), (GS)n(서열 번호 36), (GSGGS)n(서열 번호 37), (GGGS)n(서열 번호 38), (GGGGS)n(서열 번호 39), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 40), 으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다.
일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (G2S)n의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GS)n의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GSGGS)n(서열 번호 15)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GGGS)n(서열 번호 16)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GGGGS)n(서열 번호 17)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GSSGGS)n(서열 번호 18)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다.
일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (G2S)n의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GS)n의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GSGGS)n(서열 번호 15)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GGGS)n(서열 번호 16)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GGGGS)n(서열 번호 17)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GSSGGS)n(서열 번호 18)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다.
일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (G2S)n(서열 번호 20)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GS)n(서열 번호 36), 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GSGGS)n(서열 번호 37)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GGGS)n(서열 번호 38)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GGGGS)n(서열 번호 39)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L3 또는 L3a는 (GSSGGS)n(서열 번호 40)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다.
제1 항원 인식 분자(A 1 )
일부 실시양태에서, A1 항체 또는 항체 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, A1은 인간 또는 인간화된 항체 또는 항체 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, L1은 A1의 항체 또는 항체 단편의 N 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, L1은 A1의 항체 또는 항체 단편의 C 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2는 A1의 항체 또는 항체 단편의 C 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, A1의 항체 또는 항체 단편은 단일 쇄 가변 단편, 단일 도메인 항체, 또는 Fab 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, A1 단일 쇄 가변 단편(scFv)이다. 일부 실시양태에서, scFv는 scFv 중쇄 폴리펩티드 및 scFv 경쇄 폴리펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, A1은 단일 도메인 항체이다. 일부 실시양태에서, A1의 항체 또는 그의 항체 단편은 단일 쇄 가변 단편(scFv), 중쇄 가변 도메인(VH 도메인), 경쇄 가변 도메인(VL 도메인), 또는 낙타류 유래 단일 도메인 항체의 가변 도메인(VHH)을 포함한다.
일부 실시양태에서, 제1 표적 항원은 이펙터 세포 항원을 포함한다. 일부 실시양태에서, 제1 표적 항원은 분화 클러스터 3(CD3: cluster of differentiation 3)이다. 일부 실시양태에서, A1은 항CD3e 단일 쇄 가변 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, A1은 CD3 발현 세포 상의 CD3에 대해 1 μM 이하의 KD 결합을 갖는 항CD3e 단일 쇄 가변 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, A1은 각각 인간 CD3에 특이적으로 결합할 수 있는 가변 경쇄 및 가변 중쇄를 포함한다. 일부 실시양태에서, A1은 뮤로모납-CD3(OKT3), 오텔릭시주맙(TRX4), 테플리주맙(MGA031), 비실리주맙(Nuvion), SP34, X35, VIT3, BMA030 (BW264/56), CLB-T3/3, CRIS7, YTH12.5, F111-409, CLB-T3.4.2, TR-66, WT32, SPv-T3b, 11D8, XIII-141, XIII-46, XIII-87, 12F6, T3/RW2-8C8, T3/RW2-4B6, OKT3D, M-T301, SMC2, F101.01, UCHT-1, WT-31, 15865, 15865v12, 15865v16, 및 15865v19로 이루어진 군으로부터 선택되는 상보성 결정 영역(CDR)을 포함한다. 일부 실시양태에서, 화학식 I의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 L1이 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단될 때, 이펙터 세포에 결합한다. 일부 실시양태에서, 화학식 I의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 L1이 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단되고, A1이 이펙터 세포에 결합할 때, 이펙터 세포에 결합한다. 일부 실시양태에서, 이펙터 세포는 T 세포이다. 일부 실시양태에서, A1은 이펙터 세포 상의 TCR-CD3 복합체의 일부인 폴리펩티드에 결합한다. 일부 실시양태에서, TCR-CD3 복합체의 일부인 폴리펩티드는 인간 CD3ε이다.
일부 실시양태에서, 제1 표적 항원은 종양 항원을 포함한다. 일부 실시양태에서, 제1 표적 항원은 표피 성장 인자 수용체(EGFR), 메소텔린, 전립선 특이적 막 항원 (PSMA: ostate-specific membrane antigen), 또는 종양 연관 칼슘 신호 전달인자 2(TROP2: tumor-associated calcium signal transducer 2)이다. 일부 실시양태에서, A1 A2의 항체 또는 그의 항체 단편은 인간화 또는 인간 항체 또는 그의 항체 단편이다. 일부 실시양태에서, A1은 Fab 또는 Fab'이다. 일부 실시양태에서, A1은 Fab 또는 Fab'가 (a) Fab 경쇄 폴리펩티드 및 (b) Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하는 것이다.
제2 항원 인식 분자(A 2 )
일부 실시양태에서, A2는 항체 또는 항체 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, A2의 항체 또는 그의 항체 단편은 단일 쇄 가변 단편, 단일 도메인 항체, Fab', 또는 Fab를 포함한다. 일부 실시양태에서, A2의 항체 또는 그의 항체 단편은 단일 쇄 가변 단편(scFv), 중쇄 가변 도메인(VH 도메인), 경쇄 가변 도메인(VL 도메인), 또는 낙타류 유래 단일 도메인 항체의 가변 도메인(VHH)을 포함한다. 일부 실시양태에서, A2의 항체 또는 그의 항체 단편은 인간화 또는 인간 항체 또는 그의 항체 단편이다. 일부 실시양태에서, Fab 또는 Fab'이다. 일부 실시양태에서, Fab 또는 Fab'는 (a) Fab 경쇄 폴리펩티드 및 (b) Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, 제2 표적 항원은 종양 항원을 포함한다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 항체 단편은 표피 성장 인자 수용체(EGFR) 결합 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 그의 항체 단편은 메소텔린 결합 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 그의 항체 단편은 PSMA 결합 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, 항체 또는 그의 항체 단편은 TROP2 결합 도메인을 포함한다.
일부 실시양태에서, 제2 표적 항원은 이펙터 세포 항원을 포함한다. 일부 실시양태에서, 제2 표적 항원은 CD3이다. 일부 실시양태에서, A2는 항CD3e 단일 쇄 가변 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, A2는 CD3 발현 세포 상의 CD3에 대해 1 μM 이하의 KD 결합을 갖는 항CD3e 단일 쇄 가변 단편을 포함한다. 일부 실시양태에서, A2는 각각 인간 CD3에 특이적으로 결합할 수 있는 가변 경쇄 및 가변 중쇄를 포함한다. 일부 실시양태에서, A2는 뮤로모납-CD3(OKT3), 오텔릭시주맙(TRX4), 테플리주맙(MGA031), 비실리주맙(Nuvion), SP34, X35, VIT3, BMA030 (BW264/56), CLB-T3/3, CRIS7, YTH12.5, F111-409, CLB-T3.4.2, TR-66, WT32, SPv-T3b, 11D8, XIII-141, XIII-46, XIII-87, 12F6, T3/RW2-8C8, T3/RW2-4B6, OKT3D, M-T301, SMC2, F101.01, UCHT-1, WT-31, 15865, 15865v12, 15865v16, 및 15865v19로 이루어진 군으로부터 선택되는 상보성 결정 영역(CDR)을 포함한다. 일부 실시양태에서, 화학식 I의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 L2가 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단될 때, 이펙터 세포에 결합한다. 일부 실시양태에서, 화학식 I의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 L2가 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단되고, A2가 이펙터 세포에 결합할 때, 이펙터 세포에 결합한다. 일부 실시양태에서, 이펙터 세포는 T 세포이다. 일부 실시양태에서, A2는 이펙터 세포 상의 TCR-CD3 복합체의 일부인 폴리펩티드에 결합한다. 일부 실시양태에서, TCR-CD3 복합체의 일부인 폴리펩티드는 인간 CD3ε이다.
펩티드(P 1 , P 1a , 또는 P 2 )
P1은 제1 표적 항원에의 A1의 결합을 손상시킨다. 일부 실시양태에서, P1은 이온 상호작용, 정전기적 상호작용, 소수성 상호작용, Pi-스태킹 상호작용, 및 H-결합 상호작용, 또는 그의 조합을 통해 A1에 결합된다. 일부 실시양태에서, P1은 제1 표적 항원과 70% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1은 제1 표적 항원과 70% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1은 제1 표적 항원과 75% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1은 제1 표적 항원과 80% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1은 제1 표적 항원과 85% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1은 제1 표적 항원과 90% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1은 제1 표적 항원과 95% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1은 제1 표적 항원과 98% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1은 제1 표적 항원과 99% 미만의 서열 상동성을 갖는다.
일부 실시양태에서, P2는 제2 표적 항원에의 A2의 결합을 손상시킨다. 일부 실시양태에서, P2는 이온 상호작용, 정전기적 상호작용, 소수성 상호작용, Pi-스태킹 상호작용, 및 H-결합 상호작용, 또는 그의 조합을 통해 A2에 결합된다. 일부 실시양태에서, P2는 항원 결합 부위에서 또는 그 인근에서 A2에 결합된다. 일부 실시양태에서, P2는 제2 표적 항원과 70% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P2는 제2 표적 항원과 70% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P2는 제2 표적 항원과 75% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P2는 제2 표적 항원과 80% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P2는 제2 표적 항원과 85% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P2는 제2 표적 항원과 90% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P2는 제2 표적 항원과 95% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P2는 제2 표적 항원과 98% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P2는 제2 표적 항원과 99% 미만의 서열 상동성을 갖는다.
일부 실시양태에서, P1 또는 P2 길이가 10개 이상의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2 길이가 10개 이상의 아미노산 길이 및 길이가 20개 이하의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2는 길이가 16개 이상의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2 길이가 40개 이하의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2는 적어도 2개의 시스테인 아미노산 잔기를 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2는 환형 펩티드 또는 선형 펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2는 환형 펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, P1 또는 P2는 선형 펩티드를 포함한다.
일부 실시양태에서, P1a 길이가 10개 이상의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a 길이가 10개 이상의 아미노산 길이 및 길이가 20개 이하의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a는 길이가 16개 이상의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a 길이가 40개 이하의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a는 적어도 2개의 시스테인 아미노산 잔기를 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a는 환형 펩티드 또는 선형 펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a는 환형 펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a는 선형 펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, P1a는 이펙터 세포 항원과 70% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1a는 이펙터 세포 항원과 75% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1a는 이펙터 세포 항원과 80% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1a는 이펙터 세포 항원과 85% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1a는 이펙터 세포 항원과 90% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1a는 이펙터 세포 항원과 95% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1a는 이펙터 세포 항원과 98% 미만의 서열 상동성을 갖는다. 일부 실시양태에서, P1a는 이펙터 세포 항원과 99% 미만의 서열 상동성을 갖는다.
일부 실시양태에서, P1, P2, 또는 P1a는 변형된 아미노산 또는 비천연 아미노산, 또는 변형된 비천연 아미노산, 또는 그의 조합을 포함한다. 일부 실시양태에서, 변형된 아미노산 또는 변형된 비천연 아미노산은 번역 후 변형을 포함한다. 일부 실시양태에서, P1, P2, 또는 P1a는 아세틸화, 아실화, ADP-리보실화, 아미드화, 플라빈의 공유 부착, 헴 모이어티의 공유 부착, 뉴클레오티드 또는 뉴클레오티드 유도체의 공유 부착, 지질 또는 지질 유도체의 공유 부착, 포스파티딜이노시톨의 공유 부착, 가교결합, 고리화, 디술피드 결합 형성, 탈메틸화, 공유 가교결합의 형성, 시스틴의 형성, 피로글루타메이트의 형성, 포르밀화, 감마 카복실화, 글리코실화, GPI 앵커 형성, 하이드록실화, 아이오딘화, 메틸화, 미리스토일화, 산화, 단백질분해성 프로세싱, 인산화, 프레닐화, 라세미화, 셀레노일화, 황산화, 아미노산의 단백질로의 전달-RNA 매개 첨가, 예컨대, 아르기닐화 및 유비퀴틴화를 포함하나, 이에 제한되지 않는 변형을 포함한다. P1, P2, 또는 P1a에의 변형은 펩티드 백본, 아미노산 측쇄 및 말단을 포함하여 어디에서나 이루어진다.
일부 실시양태에서, P1, P2, 또는 P1a는 알부민 또는 알부민 단편을 포함하지 않는다. 일부 실시양태에서, P1, P2, 또는 P1a는 알부민 결합 도메인을 포함하지 않는다.
절단가능한 링커(L 1 또는 L 2 )
일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 5개 이상 50개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 10개 이상 30개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 10개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 18개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 26개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열이다.
일부 실시양태에서, L1은 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L1은 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L1은 (G2S)n(서열 번호 20), (GS)n(서열 번호 36), (GSGGS)n(서열 번호 37), (GGGS)n(서열 번호 38), (GGGGS)n(서열 번호 39), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 40)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다.
일부 실시양태에서, L1은 (G2S)n의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GS)n의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GSGGS)n(서열 번호 15)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GGGS)n(서열 번호 16)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GGGGS)n(서열 번호 17)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GSSGGS)n(서열 번호 18)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다.
일부 실시양태에서, L1은 (G2S)n의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GS)n의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GSGGS)n(서열 번호 15)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GGGS)n(서열 번호 16)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GGGGS)n(서열 번호 17)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GSSGGS)n(서열 번호 18)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다.
일부 실시양태에서, L1은 (G2S)n(서열 번호 20)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GS)n(서열 번호 36)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GSGGS)n(서열 번호 37)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GGGS)n(서열 번호 38)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GGGGS)n(서열 번호 39)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L1은 (GSSGGS)n(서열 번호 40)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다.
일부 실시양태에서, L1은 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질이다. 일부 실시양태에서, 종양 특이적 프로테아제는 메탈로프로테아제, 세린 프로테아제, 시스테인 프로테아제, 트레오닌 프로테아제, 및 아스파르트산 프로테아제로 이루어진 군으로부터 선택된다. 일부 실시양태에서, L1은 우로키나제 절단가능한 아미노산 서열, 매트립타제 절단가능한 아미노산 서열, 매트릭스 메탈로프로테아제 절단가능한 아미노산 서열, 또는 레구마인 절단가능한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, L1은 GGGGSLSGRSDNHGSSGT(서열 번호 21), GGGGSSGGSGGSGLSGRSDNHGSSGT(서열 번호 22), ASGRSDNH(서열 번호 23), LAGRSDNH(서열 번호 24), ISSGLASGRSDNH(서열 번호 25), ISSGLLAGRSDNH(서열 번호 26), LSGRSDNH(서열 번호 27), ISSGLLSGRSDNP(서열 번호 28), ISSGLLSGRSDNH(서열 번호 29), LSGRSDNHSPLGLAGS(서열 번호 30), SPLGLAGSLSGRSDNH(서열 번호 31), SPLGLSGRSDNH(서열 번호 32), LAGRSDNHSPLGLAGS(서열 번호 33), LSGRSDNHVPLSLKMG(서열 번호 34), 및 LSGRSDNHVPLSLSMG(서열 번호 35)로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, L1은 ASGRSDNH(서열 번호 23), LAGRSDNH(서열 번호 24), ISSGLASGRSDNH(서열 번호 25), 및 ISSGLLAGRSDNH(서열 번호 26)로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, L2는 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L2는 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L2는 (G2S)n(서열 번호 20), (GS)n(서열 번호 36), (GSGGS)n(서열 번호 37), (GGGS)n(서열 번호 38), (GGGGS)n(서열 번호 39), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 40)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다.
일부 실시양태에서, L2는 (G2S)n의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GS)n의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GSGGS)n(서열 번호 15)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GGGS)n(서열 번호 16)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GGGGS)n(서열 번호 17)의 화학식을 갖고, 여기서, L2는 1 이상의 정수이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GSSGGS)n(서열 번호 18)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수이다.
일부 실시양태에서, L2는 (G2S)n의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GS)n의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GSGGS)n(서열 번호 15)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GGGS)n(서열 번호 16)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GGGGS)n(서열 번호 17)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GSSGGS)n(서열 번호 18)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 정수 1이다.
일부 실시양태에서, L2는 (G2S)n(서열 번호 20)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GS)n(서열 번호 36)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GSGGS)n(서열 번호 37)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GGGS)n(서열 번호 38)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GGGGS)n(서열 번호 39)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다. 일부 실시양태에서, L2는 (GSSGGS)n(서열 번호 40)의 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수이다.
일부 실시양태에서, L2는 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질이다. 일부 실시양태에서, 종양 특이적 프로테아제는 메탈로프로테아제, 세린 프로테아제, 시스테인 프로테아제, 트레오닌 프로테아제, 및 아스파르트산 프로테아제로 이루어진 군으로부터 선택된다. 일부 실시양태에서, L2는 우로키나제 절단가능한 아미노산 서열, 매트립타제 절단가능한 아미노산 서열, 매트릭스 메탈로프로테아제 절단가능한 아미노산 서열, 또는 레구마인 절단가능한 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, L2는 GGGGSLSGRSDNHGSSGT(서열 번호 21), GGGGSSGGSGGSGLSGRSDNHGSSGT(서열 번호 22), ASGRSDNH(서열 번호 23), LAGRSDNH(서열 번호 24), ISSGLASGRSDNH(서열 번호 25), ISSGLLAGRSDNH(서열 번호 26), LSGRSDNH(서열 번호 27), ISSGLLSGRSDNP(서열 번호 28), ISSGLLSGRSDNH(서열 번호 29), LSGRSDNHSPLGLAGS(서열 번호 30), SPLGLAGSLSGRSDNH(서열 번호 31), SPLGLSGRSDNH(서열 번호 32), LAGRSDNHSPLGLAGS(서열 번호 33), LSGRSDNHVPLSLKMG(서열 번호 34), 및 LSGRSDNHVPLSLSMG(서열 번호 35)로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시양태에서, L2는 ASGRSDNH(서열 번호 23), LAGRSDNH(서열 번호 24), ISSGLASGRSDNH(서열 번호 25), 및 ISSGLLAGRSDNH(서열 번호 26)로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 변형된 아미노산 또는 비천연 아미노산, 또는 변형된 비천연 아미노산, 또는 그의 조합을 포함한다. 일부 실시양태에서, 변형된 아미노산 또는 변형된 비천연 아미노산은 번역 후 변형을 포함한다. 일부 실시양태에서, L1 또는 L2는 아세틸화, 아실화, ADP-리보실화, 아미드화, 플라빈의 공유 부착, 헴 모이어티의 공유 부착, 뉴클레오티드 또는 뉴클레오티드 유도체의 공유 부착, 지질 또는 지질 유도체의 공유 부착, 포스파티딜이노시톨의 공유 부착, 가교결합, 고리화, 디술피드 결합 형성, 탈메틸화, 공유 가교결합의 형성, 시스테인의 형성, 피로글루타메이트의 형성, 포르밀화, 감마 카복실화, 글리코실화, GPI 앵커 형성, 하이드록실화, 아이오딘화, 메틸화, 미리스토일화, 산화, 단백질분해성 프로세싱, 인산화, 프레닐화, 라세미화, 셀레노일화, 황산화, 아미노산의 단백질로의 전달-RNA 매개 첨가, 예컨대, 아르기닐화 및 유비퀴틴화를 포함하나, 이에 제한되지 않는 변형을 포함한다. L1 또는 L2에의 변형은 펩티드 백본, 아미노산 측쇄 및 말단을 포함하여 어디에서나 이루어진다.
구성
일부 실시양태에서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드는 A1의 단일 쇄 가변 단편(scFv)의 C 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드는 단일 쇄 가변 단편(scFv) A1의 C 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드는 A1의 단일 쇄 가변 단편(scFv)의 N 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드는 단일 쇄 가변 단편(scFv) A1의 N 말단에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2는 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2는 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2는 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드에 결합된다. 일부 실시양태에서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드는 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2는 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드에 결합된다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 1에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00002
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하는 단일 쇄 가변 단편(scFv)을 포함하고, 여기서, scFv는 이펙터 세포 항원에의 scFv의 결합을 손상시키는 펩티드(P1)에 연결되고, P1은 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티(L1)에 의해 scFv의 경쇄 가변 도메인의 N 말단에 연결되고, P1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 0-2개의 아미노산 변형을 포함하고; Fab는 종양 세포 항원에 결합하고, 여기서, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 및 Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, 여기서, Fab 중쇄 폴리펩티드는 scFv의 중쇄 가변 도메인의 C 말단에 연결되고, 여기서, Fab는 P2 및 L2에 연결되고, 여기서, P2 종양 세포 항원에의 Fab의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고; L2 Fab 경쇄 폴리펩티드를 P2에 연결하고, 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티를 포함한다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 2에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00003
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하는 단일 쇄 가변 단편(scFv)을 포함하고, 여기서, scFv는 이펙터 세포 항원에의 scFv의 결합을 손상시키는 펩티드에 연결되고, 펩티드는 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 scFv의 경쇄 가변 도메인에 연결되고, 펩티드는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, Fab는 종양 세포 항원에 결합하고, 여기서, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 쇄 및 Fab 중쇄 폴리펩티드 쇄를 포함하고, 여기서, Fab 중쇄 폴리펩티드 쇄는 scFv의 중쇄 가변 도메인의 C 말단에 연결된다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 3에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00004
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하는 단일 쇄 가변 단편(scFv)을 포함하고, 여기서, scFv는 이펙터 세포 항원에의 scFv의 결합을 손상시키는 펩티드(P1)에 연결되고, P1은 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 scFv의 경쇄 가변 도메인의 N 말단에 연결되고, P1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, Fab는 종양 세포 항원에 결합하고, 여기서, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 및 Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, 여기서, Fab 경쇄 폴리펩티드는 scFv의 중쇄 가변 도메인의 C 말단에 연결되고, 여기서, Fab는 P2 및 L2에 연결되고, 여기서, P2는 종양 세포 항원에의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고; L2는 Fab 중쇄 폴리펩티드를 P2에 연결하고, 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티를 포함한다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 4에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00005
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하는 단일 쇄 가변 단편(scFv)을 포함하고, 여기서, scFv는 이펙터 세포 항원에의 scFv의 결합을 손상시키는 펩티드에 연결되고, 펩티드는 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 scFv의 경쇄 가변 도메인에 연결되고, 펩티드는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, Fab는 종양 세포 항원에 결합하고, 여기서, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 및 Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, 여기서, Fab 경쇄 폴리펩티드는 scFv의 중쇄 가변 도메인의 C 말단에 연결된다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 5에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00006
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하는 단일 쇄 가변 단편(scFv)을 포함하고, 여기서, scFv는 이펙터 세포 항원에의 scFv의 결합을 손상시키는 펩티드(P1)에 연결되고, P1은 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 scFv의 중쇄 가변 도메인의 N 말단에 연결되고, P1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, Fab는 종양 세포 항원에 결합하고, 여기서, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 및 Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, 여기서, Fab 중쇄 폴리펩티드는 scFv의 경쇄 가변 도메인의 C 말단에 연결되고, 여기서, Fab는 P2 및 L2에 연결되고, 여기서, P2는 종양 세포 항원에의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고; L2는 Fab 경쇄 폴리펩티드를 P2에 연결하고, 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티를 포함한다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 6에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00007
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하는 단일 쇄 가변 단편(scFv)을 포함하고, 여기서, scFv는 이펙터 세포 항원에의 scFv의 결합을 손상시키는 펩티드에 연결되고, 펩티드는 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 scFv의 중쇄 가변 도메인에 연결되고, 펩티드는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, Fab는 종양 세포 항원에 결합하고, 여기서, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 쇄 및 Fab 중쇄 폴리펩티드 쇄를 포함하고, 여기서, Fab 중쇄 폴리펩티드 쇄는 scFv의 경쇄 가변 도메인의 C 말단에 연결된다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 7에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00008
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하는 단일 쇄 가변 단편(scFv)을 포함하고, 여기서, scFv는 이펙터 세포 항원에의 scFv의 결합을 손상시키는 펩티드(P1)에 연결되고, P1은 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티(L1)에 의해 scFv의 중쇄 가변 도메인의 N 말단에 연결되고, P1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, Fab는 종양 세포 항원에 결합하고, 여기서, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 및 Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, 여기서, Fab 경쇄 폴리펩티드는 scFv의 경쇄 가변 도메인의 C 말단에 연결되고, 여기서, Fab는 P2 및 L2에 연결되고, 여기서, P2는 종양 세포 항원에의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고; L2는 Fab 중쇄 폴리펩티드를 P2에 연결하고, 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티를 포함한다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 8에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00009
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하는 단일 쇄 가변 단편(scFv)을 포함하고, 여기서, scFv는 이펙터 세포 항원에의 scFv의 결합을 손상시키는 펩티드에 연결되고, 펩티드는 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 scFv의 중쇄 가변 도메인의 N 말단에 연결되고, 펩티드는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, Fab는 종양 세포 항원에 결합하고, 여기서, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 및 Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, 여기서, Fab 경쇄 폴리펩티드는 scFv의 경쇄 가변 도메인의 C 말단에 연결된다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 9에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00010
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 종양 세포 항원에의 Fab의 결합을 손상시키는 펩티드(P1)에 연결되고, P1은 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 Fab 경쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결되고, P1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 단일 쇄 가변 단편(scFv)은 이펙터 세포 항원에 결합하고, scFv는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하고, 여기서, scFv의 중쇄 가변 도메인은 Fab 중쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결되고, 여기서, Fab는 P2 및 L2에 연결되고, 여기서, P2는 이펙터 세포 항원에의 scFv의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고; L2는 scFv의 경쇄 가변 도메인을 P2에 연결하고, 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티를 포함한다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 10에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00011
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 종양 세포 항원에 결합하는 Fab를 포함하고, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 및 Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, 여기서, Fab는 종양 세포 항원에의 Fab의 결합을 손상시키는 펩티드에 연결되고, 펩티드는 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 Fab 경쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결되고, 펩티드는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 단일 쇄 가변 단편(scFv)은 이펙터 세포 항원에 결합하고, scFv는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하고, 여기서, scFv의 중쇄 가변 도메인은 Fab 중쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결된다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 11에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00012
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 종양 세포 항원에 결합하는 Fab를 포함하고, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 및 Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, 여기서, Fab는 종양 세포 항원에의 Fab의 결합을 손상시키는 펩티드(P1)에 연결되고, P1은 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 Fab 중쇄 폴리펩티드 의 N 말단에 연결되고, P1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 단일 쇄 가변 단편(scFv)은 이펙터 세포 항원에 결합하고, scFv는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하고, 여기서, scFv의 중쇄 가변 도메인은 Fab 경쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결되고, 여기서, scFv는 P2 및 L2에 추가로 연결되고, 여기서, P2는 이펙터 세포 항원에의 scFv의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고, L2는 scFv의 경쇄 가변 도메인을 P2에 연결하고, 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티를 포함한다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 12에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00013
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 종양 세포 항원에 결합하는 Fab를 포함하고, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 및 Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, 여기서, Fab는 종양 세포 항원에의 Fab의 결합을 손상시키는 펩티드에 연결되고, 펩티드는 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 Fab 중쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결되고, 펩티드는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 단일 쇄 가변 단편(scFv)은 이펙터 세포 항원에 결합하고, scFv는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하고, 여기서, scFv의 중쇄 가변 도메인은 Fab 경쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결된다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 13에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00014
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 종양 세포 항원에 결합하는 Fab를 포함하고, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 및 Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, 여기서, Fab는 종양 세포 항원에의 Fab의 결합을 손상시키는 펩티드(P1)에 연결되고, P1은 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 Fab 경쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결되고, P1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 단일 쇄 가변 단편(scFv)은 이펙터 세포 항원에 결합하고, scFv는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하고, 여기서, scFv의 경쇄 가변 도메인은 Fab 중쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결되고, 여기서, scFv는 P2 및 L2에 연결되고, 여기서, P2는 이펙터 세포 항원에의 scFv의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고, L2는 scFv의 중쇄 가변 도메인을 P2에 연결하고, 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티를 포함한다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 14에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00015
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 종양 세포 항원에 결합하는 Fab를 포함하고, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 및 Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, 여기서, Fab는 종양 세포 항원에의 Fab의 결합을 손상시키는 펩티드에 연결되고, 펩티드는 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 Fab 경쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결되고, 펩티드는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 단일 쇄 가변 단편(scFv)은 이펙터 세포 항원에 결합하고, scFv는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하고, 여기서, scFv의 경쇄 가변 도메인은 Fab 중쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결된다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 15에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00016
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 종양 세포 항원에 결합하는 Fab를 포함하고, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 및 Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, 여기서, Fab는 종양 세포 항원에의 Fab의 결합을 손상시키는 펩티드(P1)에 연결되고, P1은 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 Fab 중쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결되고, P1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 단일 쇄 가변 단편(scFv)은 이펙터 세포 항원에 결합하고, scFv는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하고, 여기서, scFv의 경쇄 가변 도메인은 Fab 경쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결되고, 여기서, scFv는 P2 및 L2에 연결되고, 여기서, P2는 이펙터 세포 항원에의 scFv의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고, L2는 scFv의 중쇄 가변 도메인을 P2에 연결하고, 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티를 포함한다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 하기 구성 16에 따른 구조적 배열을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 개시한다:
Figure pct00017
여기서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 종양 세포 항원에 결합하는 Fab를 포함하고, Fab는 Fab 경쇄 폴리펩티드 및 Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, 여기서, Fab는 종양 세포 항원에의 Fab의 결합을 손상시키는 펩티드에 연결되고, 펩티드는 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 연결 모이어티에 의해 Fab 중쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결되고, 펩티드는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 단일 도메인 항체(H1)에 추가로 연결되고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 단일 쇄 가변 단편(scFv)은 이펙터 세포 항원에 결합하고, scFv는 경쇄 가변 도메인 및 중쇄 가변 도메인을 포함하고, 여기서, scFv의 경쇄 가변 도메인은 Fab 경쇄 폴리펩티드의 N 말단에 연결된다.
폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 코딩하는 폴리뉴클레오티드
본원에서는 일부 실시양태에서, 본원에 개시된 바와 같은 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 코딩하는 단리된 재조합 핵산 분자를 개시한다. 일부 실시양태에서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 항체 또는 항체 단편을 포함한다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 항체 또는 항체 단편(H1)을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 코딩하는 단리된 재조합 핵산 분자로서, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 0-2개의 아미노산 변형을 포함하는 것인, 단리된 재조합 핵산 분자를 개시한다.
일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 4와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩한다. 일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 4와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩한다. 일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 4와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩한다. 일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 4에 따른 아미노산 서열을 코딩한다.
일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 코딩한다. 일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 코딩한다. 일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기로 이루어지고, 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩한다. 일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기로 이루어지고, 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩한다.
본원에서는 일부 실시양태에서, 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 항체 또는 항체 단편(H1)을 포함하는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 코딩하는 단리된 재조합 핵산 분자로서, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 5를 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 0-2개의 아미노산 변형을 포함하는 것인, 단리된 재조합 핵산 분자를 개시한다.
일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 6과 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩한다. 일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 6과 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩한다. 일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 6과 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩한다. 일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 6에 따른 아미노산 서열을 코딩한다.
일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 코딩한다. 일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 코딩한다. 일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기로 이루어지고, 서열 번호 6의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩한다. 일부 실시양태에서, 단리된 핵산은 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기로 이루어지고, 서열 번호 6의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩한다.
약학 조성물
본원에서는 일부 실시양태에서, (a) 본원에 개시된 바와 같은 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체; 및 (b) 약학적으로 허용되는 부형제를 포함하는 약학 조성물을 개시한다.
일부 실시양태에서, 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 검출가능한 표지, 치료제 또는 약동학적 변형 모이어티를 추가로 포함한다. 일부 실시양태에서, 검출가능한 표지는 형광 표지, 방사성 표지, 효소, 핵산 프로브 또는 조영제를 포함한다.
피험체에게 투여하기 위해, 본원에 개시된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체는 하나 이상의 약학적으로 허용되는 담체 또는 부형제와 함께 약학 조성물로 제공될 수 있다. 용어 "약학적으로 허용되는 담체"는 성분의 생물학적 활성의 유효성을 방해하지 않고, 이를 투여받는 환자에게 독성을 띠지 않는 임의의 담체를 포함하나, 이에 제한되지 않는다. 적합한 약학적 담체의 예는 당업계에 널리 공지되어 있고, 포스페이트 완충처리된 염수 용액, 물, 에멀젼, 예컨대, 오일/물 에멀젼, 다양한 유형의 습윤화제, 멸균 용액 등을 포함한다. 이러한 담체는 통상의 방법에 의해 제제화될 수 있고, 적합한 용량으로 피험체에게 투여될 수 있다. 바람직하게, 조성물은 멸균된 것이다. 이들 조성물은 또한 예컨대, 보존제, 유화제 및 분산제와 같은 애주번트를 함유할 수 있다. 다양한 항박테리아제 및 항진균제를 포함함으로써 미생물 작용을 확실하게 방지할 수 있다.
약학 조성물은 (원하는 투여 방법에 따라) 임의의 적합한 형태일 수 있다. 이는 단위 제형으로 제공될 수 있고, 밀봉된 용기에 제공될 수 있으며, 키트의 일부로서 제공될 수 있다. 상기 키트는 사용 지침서를 포함할 수 있다. 이는 복수의 상기 단위 제형을 포함할 수 있다.
약학 조성물은 비경구(예컨대, 피하, 근육내 또는 정맥내) 경로를 포함하는 임의의 적절한 경로에 의한 투여에 적합할 수 있다. 상기 조성물은 약학 분야에 공지된 임의의 방법에 의해, 예를 들어, 활성 성분을 멸균 조건하에 담체(들) 또는 부형제(들)와 혼합함으로써 제조할 수 있다.
본 개시내용의 물질의 투여량은 치료하고자 하는 질환 또는 장애, 치료하고자 하는 개체의 연령 및 병태 등에 따라 넓은 한계치 사이에서 달라질 수 있고, 의사는 최종적으로 사용되는 적절한 투여량을 결정할 것이다.
일부 실시양태에서, 본원에 기술된 폴리펩티드(예컨대, 항체 및 그의 결합 단편)는 특히 화학적 합성 또는 재조합 발현에 의한 폴리펩티드(예컨대, 항체)의 합성에 유용한 것으로 당업계에 공지된 임의의 방법을 사용하여 제조되며, 바람직하게는 재조합 발현 기술에 의해 제조된다.
일부 경우에서, 항체 또는 그의 결합 단편은 재조합적으로 발현되고, 항체 또는 그의 결합 단편을 코딩하는 핵산은 (예컨대, 문헌 [Kutmeier et al., 1994, BioTechniques 17:242]에 기술된 바와 같이) 화학적으로 합성된 올리고뉴클레오티드로부터 어셈블리되며, 이는 항체를 코딩하는 서열의 일부를 함유하는 오버랩핑 올리고뉴클레오티드의 합성, 상기 올리고뉴클레오티드의 어닐링 및 라이게션 및 이어서, 라이게이션된 올리고뉴클레오티드의 PCR에 의한 증폭을 포함한다.
대안적으로, 항체를 코딩하는 핵산 분자는 임의로 서열의 3' 말단 및 5' 말단에 하이브리드화 가능한 합성 프라이머를 사용하는 PCR 증폭에 의해 또는 특정 유전자 서열에 특이적인 올리고뉴클레오티드 프로브를 사용하는 클로닝에 의해 적합한 공급원(예를 들어, 면역글로불린을 발현하는 임의의 조직 또는 세포로부터 생성된 cDNA 라이브러리 또는 항체 cDNA 라이브러리)으로부터 생성된다.
일부 경우에서, 항체 또는 그의 결합 단편은 임의로 예컨대, 문헌 [Kohler and Milstein (1975, Nature 256:495-497)]에 의해 기술된 바와 같이, 또는 문헌 [Kozbor et al. (1983, Immunology Today 4:72)] 또는 [Cole et al. (1985 in Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, Inc., pp. 77-96)]에 의해 기술된 바와 같이, 마우스와 같은 동물을 면역화하여 다중클론 항체를 생성하거나, 더욱 바람직하게, 단일클론 항체를 생성함으로써 생성된다. 대안적으로, 항체의 적어도 Fab 부분을 코딩하는 클론은 (예컨대, 문헌 [Huse et al., 1989, Science 246:1275-1281]에 기술된 바와 같이), 또는 특정 항원에 결합하는 Fab 단편의 클론에 대한 Fab 발현 라이브러리를 스크리닝하거나, 항체 라이브러리를 스크리닝함으로써(예컨대, 문헌 [Clackson et al, 1991, Nature 352:624]; [Hane et al, 1997 Proc Natl Acad Sci USA 94:4937] 참조) 임의로 수득된다.
일부 실시양태에서, 적절한 생물학적 활성의 인간 항체 분자로부터의 유전자와 함께 적절한 항원 특이성의 마우스 항체 분자로부터의 유전자를 스플라이싱하여 "키메라 항체"를 생성하기 위해 개발된 기술(문헌 [Morrison et al., 1984, Proc. Natl. Acad. Sci. 81:851-855]; [Neuberger et al., 1984, Nature 312:604-608]; [Takeda et al., 1985, Nature 314:452-454])이 이용된다. 키메라 항체는 상이한 부분이 상이한 동물 종으로부터 유래한 분자, 예컨대, 뮤린 단일클론 항체로부터 유래된 가변 영역과 인간 면역글로불린 불변 영역을 갖는 것들이다.
일부 실시양태에서, 단일 쇄 항체의 제조를 위한 것으로 기재된 기술(미국 특허 제4,694,778호; 문헌 [Bird, 1988, Science 242:423-42]; [Huston et al., 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883]; 및 [Ward et al., 1989, Nature 334:544-54])은 단일 쇄 항체를 제조하는 데 적합하다. 단일 쇄 항체는 아미노산 브릿지를 통해 Fv 영역의 중쇄 단편과 경쇄 단편을 연결시켜 단일 쇄 폴리펩티드를 생성함으로써 형성된다. 이. 콜라이(E. coli)에서의 기능성 Fv 단편의 어셈블리를 위한 기술 또한 임의로 사용된다(문헌 [Skerra et al, 1988, Science 242:1038-1041]).
일부 실시양태에서, 항체의 뉴클레오티드 서열을 포함하는 발현 벡터 또는 항체의 뉴클레오티드 서열은 통상적인 기술(예컨대, 전기천공, 리포솜 형질감염 및 인산칼슘 침전)에 의해 숙주 세포로 전달되고, 이어서, 형질감염된 세포는 항체를 제조하는 통상적인 기술에 의해 배양된다. 구체적인 실시양태에서, 항체의 발현은 구성적, 유도성 또는 조직 특이적 프로모터에 의해 조절된다.
일부 실시양태에서, 다양한 숙주 발현 벡터 시스템이 본원에 기술된 항체 또는 그의 결합 단편을 발현시키기 위해 이용된다. 상기 숙주 발현 시스템은 항체의 코딩 서열이 생성된후, 이어서, 정제되도록 하는 비히클을 나타낼 뿐만 아니라, 또한 적절한 뉴클레오티드 코딩 서열로 형질전환되거나, 형질감염되는 경우에 항체 또는 그의 결합 단편을 동소에서 발현하는 세포를 나타낸다. 이들은 항체 또는 그의 결합 단편 코딩 서열을 함유하는 재조합 박테리오파지 DNA, 플라스미드 DNA 또는 코스미드 DNA 발현 벡터로 형질전환된 박테리아(예컨대, 이. 콜라이 및 비. 섭틸리스(B. subtilis))와 같은 미생물; 항체 또는 그의 결합 단편 코딩 서열을 함유하는 재조합 효모 발현 벡터로 형질전환된 효모(예컨대, 사카로마이세스 피치아(Saccharomyces Pichia)); 항체 또는 그의 결합 단편 코딩 서열을 함유하는 재조합 바이러스 발현 벡터(예컨대, 배큘로바이러스)로 감염된 곤충 세포 시스템; 재조합 바이러스 발현 벡터(예컨대, 콜리플라워 모자이크 바이러스(CaMV: cauliflower mosaic virus) 및 담배 모자이크 바이러스(TMV: tobacco mosaic virus)로 감염되거나, 항체 또는 그의 결합 단편 코딩 서열을 함유하는 재조합 플라스미드 발현 벡터(예컨대, Ti 플라스미드)로 형질전환된 식물 세포 시스템; 또는 포유동물 세포의 게놈으로부터 유래된 프로모터(예컨대, 메탈로티오네인 프로모터) 또는 포유동물 바이러스로부터 유래된 프로모터(예컨대, 아데노바이러스 후기 프로모터; 백시니아 바이러스 75K 프로모터)를 함유하는 재조합 발현 구성물을 보유하는 포유동물 세포 시스템(예컨대, COS, CHO, BH, 293, 293T, 3T3 세포)을 포함하나, 이에 제한되지 않는다.
재조합 단백질의 장기간의 고수율 제조를 위해서는 안정한 발현이 바람직하다. 일부 경우에서, 항체를 안정하게 발현하는 세포주는 임의로 조작된다. 바이러스 복제 기점을 함유하는 발현 벡터를 사용하기보다는, 숙주 세포를 적절한 발현 제어 요소(예컨대, 프로모터, 인핸서, 서열, 전사 종결인자, 폴리아데닐화 부위 등) 및 선별가능한 마커에 의해 제어되는 DNA로 형질전환시킨다. 이어서, 외래 DNA의 도입 후, 조작된 세포를 강화 배지에서 1 내지 2일 동안 성장시킨 후, 선택 배지로 교체한다. 재조합 플라스미드에서 선별가능한 마커는 선별에 대한 내성을 부여하고, 세포가 플라스미드를 그의 염색체 내로 안정적으로 통합하고, 성장시켜 병소를 형성할 수 있게 하고, 결국 클로닝되고 세포주로 확장되도록 한다. 상기 방법은 유리하게는 항체 또는 그의 결합 단편을 발현하는 세포주를 조작하는 데 사용될 수 있다.
일부 경우에서, 단순 포진 바이러스 티미딘 키나제(문헌 [Wigler et al., 1977, Cell 11:223]), 하이포크잔틴-구아닌 포스포리보실트랜스퍼라제(문헌 [Szybalska & Szybalski, 192, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 48:202]) 및 아데닌 포스포리보실트랜스퍼라제(문헌 [Lowy et al., 1980, Cell 22:817]) 유전자를 포함하나, 이에 제한되지 않는, 다수의 선별 시스템이 각각 tk-, hgprt-, 또는 aprt- 세포에서 사용된다. 또한, 하기 유전자들에 대한 선택의 기준으로서 대사길항물질 내성이 사용된다: 메토트렉세이트에 대한 내성을 부여하는 dhfr(문헌 [Wigler et al., 1980, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:357]; [O'Hare et al., 1981, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78:1527]); 미코페놀산에 대한 내성을 부여하는 gpt(문헌 [Mulligan & Berg, 1981, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78:2072]); 아미노글리코사이드 G-418에 대한 내성을 부여하는 neo(문헌 [Clinical Pharmacy 12:488-505]; [Wu and Wu, 1991, Biotherapy 3:87-95]; [Tolstoshev, 1993, Ann. Rev. Pharmacol. Toxicol. 32:573-596]; [Mulligan, 1993, Science 260:926-932]; 및 [Morgan and Anderson, 1993, Ann. Rev. Biochem. 62:191-217; May 1993, TIB TECH 11(5):155-215]) 및 하이그로마이신에 대한 내성을 부여하는 hygro(문헌 [Santerre et al., 1984, Gene 30:147]). 사용될 수 있는 재조합 DNA 기술 분야에 흔히 공지된 방법은 문헌 [Ausubel et al. (eds., 1993, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, NY]; [Kriegler, 1990, Gene Transfer and Expression, A Laboratory Manual, Stockton Press, NY; and in Chapters 12 and 13], [Dracopoli et al. (eds), 1994, Current Protocols in Human Genetics, John Wiley & Sons, NY.]; [Colberre-Garapin et al., 1981, J. Mol. Biol. 150:1])에 기술되어 있다.
일부 경우에서, 항체의 발현 수준은 벡터 증폭에 의해 증가된다(리뷰를 위해, 문헌 [Bebbington and Hentschel, the use of vectors based on gene amplification for the expression of cloned genes in mammalian cells in DNA cloning, Vol. 3. (Academic Press, New York, 1987)] 참조). 항체를 발현하는 벡터 시스템에서 마커가 증폭가능할 때, 숙주 세포의 배양물에 존재하는 억제제 수준의 증가는 마커 유전자의 카피 수를 증가시킬 것이다. 증폭된 영역은 항체의 뉴클레오티드 서열과 연관되어 있기 때문에, 항체 생성 또한 증가할 것이다(문헌 [Crouse et al., 1983, Mol. Cell Biol. 3:257]).
일부 경우에서, 예를 들어, 크로마토그래피(예컨대, 이온 교환, 친화도, 특히, 단백질 A 후, 특정 항원에 대한 친화도에 의한 및 크기 컬럼 크로마토그래피), 원심분리, 차등적 용해성에 의한 또는 단백질 정제를 위한 임의의 다른 표준 기술에 의한 항체의 정제를 위해 당업계에 공지된 임의의 방법이 사용된다.
발현 벡터
일부 실시양태에서, 벡터는 진핵생물 또는 원핵생물 공급원으로부터 유래된 임의의 적합한 벡터를 포함한다. 일부 경우에서, 벡터는 박테리아(예컨대, 이. 콜라이), 곤충, 효모(예컨대, 피치아 파스토리스(Pichia pastoris)), 조류 또는 포유동물 공급원으로부터 수득된다. 예시적인 박테리아 벡터는 pACYC177, pASK75, pBAD 벡터 시리즈, pBADM 벡터 시리즈, pET 벡터 시리즈, pETM 벡터 시리즈, pGEX 벡터 시리즈, pHAT, pHAT2, pMal-c2, pMal-p2, pQE 벡터 시리즈, pRSET A, pRSET B, pRSET C, pTrcHis2 시리즈, pZA31-Luc, pZE21-MCS-1, pFLAG ATS, pFLAG CTS, pFLAG MAC, pFLAG Shift-12c, pTAC-MAT-1, pFLAG CTC, 또는 pTAC-MAT-2를 포함한다.
예시적인 곤충 벡터는 pFastBac1, pFastBac DUAL, pFastBac ET, pFastBac HTa, pFastBac HTb, pFastBac HTc, pFastBac M30a, pFastBact M30b, pFastBac, M30c, pVL1392, pVL1393, pVL1393 M10, pVL1393 M11, pVL1393 M12, FLAG 벡터, 예컨대, pPolh-FLAG1 또는 pPolh-MAT 2, 또는 MAT 벡터, 예컨대, pPolh-MAT1, 또는 pPolh-MAT2를 포함한다.
일부 경우에서, 효모 벡터는 게이트웨이(Gateway)® pDEST™ 14 벡터, 게이트웨이® pDEST™ 15 벡터, 게이트웨이® pDEST™ 17 벡터, 게이트웨이® pDEST™ 24 벡터, 게이트웨이® pYES-DEST52 벡터, pBAD-DEST49 게이트웨이® 목적 벡터, pAO815 피치아 벡터, pFLD1 피치아 파스토리스 벡터, pGAPZA,B, & C 피치아 파스토리스 벡터, pPIC3.5K 피치아 벡터, pPIC6 A, B, & C 피치아 벡터, pPIC9K 피치아 벡터, pTEF1/Zeo, pYES2 효모 벡터, pYES2/CT 효모 벡터, pYES2/NT A, B, & C 효모 벡터, 또는 pYES3/CT 효모 벡터를 포함한다.
예시적인 조류 벡터는 pChlamy-4 벡터 또는 MCS 벡터를 포함한다
포유동물 벡터의 예는 일시적 발현 벡터 또는 안정한 발현 벡터를 포함한다. 포유동물 일시적 발현 벡터는 pRK5, p3xFLAG-CMV 8, pFLAG-Myc-CMV 19, pFLAG-Myc-CMV 23, pFLAG-CMV 2, pFLAG-CMV 6a,b,c, pFLAG-CMV 5.1, pFLAG-CMV 5a,b,c, p3xFLAG-CMV 7.1, pFLAG-CMV 20, p3xFLAG-Myc-CMV 24, pCMV-FLAG-MAT1, pCMV-FLAG-MAT2, pBICEP-CMV 3, 또는 pBICEP-CMV 4를 포함할 수 있다. 포유동물 안정한 발현 벡터는 pFLAG-CMV 3, p3xFLAG-CMV 9, p3xFLAG-CMV 13, pFLAG-Myc-CMV 21, p3xFLAG-Myc-CMV 25, pFLAG-CMV 4, p3xFLAG-CMV 10, p3xFLAG-CMV 14, pFLAG-Myc-CMV 22, p3xFLAG-Myc-CMV 26, pBICEP-CMV 1, 또는 pBICEP-CMV 2를 포함할 수 있다.
일부 경우에서, 무세포 시스템은 세포로부터의 세포질 및/또는 핵 성분의 혼합물이며, 시험관내 핵산 합성을 위해 사용된다. 일부 경우에서, 무세포 시스템은 원핵 세포 성분 또는 진핵 세포 성분을 사용한다. 때때로, 핵산 합성은 예를 들어, 드로소필라(Drosophila) 세포, 제노푸스(Xenopus) 난자, 또는 HeLa 세포에 기반한 무세포 시스템에서 수득된다. 예시적인 무세포 시스템은 이. 콜라이 S30 추출물 시스템, 이. 콜라이 T7 S30 시스템, 또는 PURExpress®를 포함하나, 이에 제한되지 않는다.
숙주 세포
일부 실시양태에서, 숙주 세포는 천연 유래 세포 또는 유전자 변형된 세포와 같은 임의의 적합한 세포를 포함한다. 일부 경우에서, 숙주 세포는 생산 숙주 세포이다. 일부 경우에서, 숙주 세포는 진핵 세포이다. 다른 예에서 숙주 세포는 원핵 세포이다. 일부 경우에서, 진핵 세포는 진균(예컨대, 효모 세포), 동물 세포, 또는 식물 세포를 포함한다. 일부 경우에서, 원핵 세포는 박테리아 세포이다. 박테리아 세포의 예는 그람 양성 박테리아 또는 그람 음성 박테리아를 포함한다. 때때로, 그람 음성 박테리아는 혐기성, 막대형, 또는 둘 모두이다.
일부 경우에서, 그람 양성 박테리아는 악티노박테리아(Actinobacteria), 피르미쿠테스(Firmicutes), 또는 테네리쿠테스(Tenericutes)를 포함한다. 일부 경우에서, 그람 음성 박테리아는 아퀴피카에(Aquificae), 데이노코쿠스-써무스(Deinococcus-Thermus), 피브로박테레스-클로로비/박테로이데테스(Fibrobacteres-Chlorobi/Bacteroidetes)(FCB 군), 푸소박테리아(Fusobacteria), 겜마티모나데테스(Gemmatimonadetes), 니트로스피라에(Nitrospirae), 플란크토마이세테스-베루코미크로비아/클라미디아에(Planctomycetes-Verrucomicrobia/Chlamydiae)(PVC군), 프로테오박테리아(Proteobacteria), 스피로카에테스(Spirochaetes) 또는 시네르기스테테스(Synergistetes)를 포함한다. 다른 박테리아는 아시도박테리아(Acidobacteria), 클로로플렉시(Chloroflexi), 크리시오게네테스(Chrysiogenetes), 시아노박테리아(Cyanobacteria), 데페리박테레스(Deferribacteres), 딕티오글로미(Dictyoglomi), 써모데술포박테리아(Thermodesulfobacteria) 또는 써모토가에(Thermotogae)일 수 있다. 박테리아 세포는 에스케리키아 콜라이(Escherichia coli), 클로스트리디움 보툴리눔(Clostridium botulinum) 또는 콜라이 바실리(Coli bacilli)일 수 있다.
예시적인 원핵 숙주 세포는 BL21, Mach1™, DH10B™, TOP10, DH5α, DH10Bac™, OmniMax™, MegaX™, DH12S™, INV110, TOP10F', INVαF, TOP10/P3, ccdB Survival, PIR1, PIR2, Stbl2™, Stbl3™, 또는 Stbl4™를 포함하나, 이에 제한되지 않는다.
일부 경우에서, 동물 세포는 척추동물 또는 무척추동물로부터의 세포를 포함한다. 일부 경우에서, 동물 세포는 해양 무척추동물, 어류, 곤충, 양서류, 파충류 또는 포유동물로부터의 세포를 포함한다. 일부 경우에서, 진균 세포는 맥주 효모, 제빵 효모 또는 와인 효모와 같은 효모 세포를 포함한다.
진균은 아스코마이세테스(ascomycetes), 예컨대, 효모, 곰팡이, 사상성 진균, 바시디오마이세테스(basidiomycetes), 또는 자이고마이세테스(zygomycetes)를 포함한다. 일부 경우에서, 효모는 아스코마이코타(Ascomycota) 또는 바시디오마이코타(Basidiomycota)를 포함한다. 일부 경우에서, 아스코마이코타는 사카로마이코티나(Saccharomycotina)(진정 효모, 예컨대, 사카로마이세스 세레비시아에(Saccharomyces cerevisiae)(제빵 효모)) 또는 타프리노마이코티나(Taphrinomycotina)(예컨대, 쉬조사카로마이세테스(Schizosaccharomycetes)(분열 효모))를 포함한다. 일부 경우에서, 바시디오마이코타(Basidiomycota)는 아가리코마이코티나(Agaricomycotina)(예를 들어, 트레멜로마이세테스(Tremellomycetes)) 또는 푸시니오마이코티나(Pucciniomycotina)(예컨대, 마이크로보트리요마이세테스(Microbotryomycetes))를 포함한다.
예시적인 효모 또는 사상성 진균으로는 예를 들어, 사카로마이세스 속, 쉬조사카로마이세스(Schizosaccharomyces) 속, 칸디다(Candida) 속, 피치아 속, 한세눌라(Hansenula) 속, 클루이베로마이세스(Kluyveromyces) 속, 지고사카로마이세스(Zygosaccharomyces) 속, 야로위아(Yarrowia) 속, 트리코스포론(Trichosporon) 속, 로도스포리디(Rhodosporidi) 속, 아스페르길루스(Aspergillus) 속, 푸사리움(Fusarium) 속, 또는 트리코데르마(Trichoderma) 속을 포함한다. 예시적인 효모 또는 사상성 진균으로는 예를 들어, 사카로마이세스 세레비시아에, 쉬조사카로마이세스 폼베(Schizosaccharomyces pombe) 종, 칸디다 우틸리스(Candida utilis) 종, 칸디다 보이디니(Candida boidini) 종, 칸디다 알비칸스(Candida albicans) 종, 칸디다 트로피칼리스(Candida tropicalis) 종, 칸디다 스텔라토이데아(Candida stellatoidea) 종, 칸디다 글라브라타(Candida glabrata) 종, 칸디다 크루세이(Candida krusei) 종, 칸디다 파라프실로시스(Candida parapsilosis) 종, 칸디다 구일리에르몬디이(Candida guilliermondii) 종, 칸디다 비스와나티이(Candida viswanathii) 종, 칸디다 루시타니아에(Candida lusitaniae) 종, 로도토룰라 무실라기노사(Rhodotorula mucilaginosa) 종, 피치아 메타놀리카(Pichia metanolica) 종, 피치아 안구스타(Pnichia angusta) 종, 피치아 파스토리스 종, 피치아 아노말라(Pichia anomala) 종, 한세눌라 폴리모르파(Hansenula polymorpha) 종, 클루이베로미세스 락티스(Kluyveromyces lactis) 종, 지고사카로마이세스 로욱시이(Zygosaccharomyces rouxii ) 종, 야로위아 리폴리티카(Yarrowia lipolytica) 종, 트리코스포론 풀루란스(Trichosporon pullulans) 종, 로도스로리디움 토루-아스페르길루스 니거(Rhodosporidium toru - Aspergillus niger) 종, 아스페르길루스 니둘란스(Aspergillus nidulans) 종, 아스페르길루스 아와모리(Aspergillus awamori) 종, 아스페르길루스 오리자에(Aspergillus oryzae) 종, 트리코데르마 레세이(Trichoderma reesei) 종, 야로위아 리폴리티카(Yarrowia lipolytica) 종, 브레타노미세스 브룩셀렌시스(Brettanomyces bruxellensis) 종, 칸디다 스텔라타(Candida stellata) 종, 쉬조사카로마이세스 폼베(Schizosaccharomyces pombe) 종, 토룰라스포라 델브루엑키이(Torulaspora delbrueckii) 종, 지고사카로마이세스 바일리이(Zygosaccharomyces bailii) 종, 크립토코쿠스 네오포르만스(Cryptococcus neoformans) 종, 크립토코쿠스 가티이(Cryptococcus gattii) 종, 또는 사카로마이세스 보울라르디이(Saccharomyces boulardii) 종을 포함한다.
예시적인 효모 숙주 세포는 피치아 파스토리스 효모 균주, 예컨대, GS115, KM71H, SMD1168, SMD1168H, 및 X-33; 및 사카로마이세스 세레비시아에 효모 균주, 예컨대, INVSc1을 포함하나, 이에 제한되지 않는다.
일부 경우에서, 추가적인 동물 세포는 연체동물, 절지동물, 환형동물 또는 해면동물로부터 얻어지는 세포를 포함한다. 일부 경우에서, 추가적인 동물 세포는 예컨대, 영장류, 유인원, 말, 소, 돼지, 개, 고양이 또는 설치류로부터의 포유동물 세포이다. 일부 경우에서, 설치류는 마우스, 래트, 햄스터, 저빌쥐, 햄스터, 친칠라, 팬시 래트 또는 기니아 피그를 포함한다.
예시적인 포유동물 숙주 세포는 293A 세포주, 293FT 세포주, 293F 세포, 293 H 세포, CHO DG44 세포, CHO-S 세포, CHO-K1 세포, FUT8 KO CHOK1, Expi293F™ 세포, Flp-In™ T-REx™ 293 세포주, Flp-In™-293 세포주, Flp-In™-3T3 세포주, Flp-In™-BHK 세포주, Flp-In™-CHO 세포주, Flp-In™-CV-1 세포주, Flp-In™-Jurkat 세포주, FreeStyle™ 293-F 세포, FreeStyle™ CHO-S 세포, GripTite™ 293 MSR 세포주, GS-CHO 세포주, HepaRG™ 세포, T-REx™ Jurkat 세포주, Per.C6 세포, T-REx™-293 세포주, T-REx™-CHO 세포주, 및 T-REx™-HeLa 세포주를 포함하나, 이에 제한되지 않는다.
일부 경우에서, 포유동물 숙주 세포는 안정한 세포주, 또는 관심 유전 물질을 그 자체 게놈에 도입시키고, 여러 세대의 세포 분열 후에 유전 물질의 생성물을 발현할 수 있는 능력을 가진 세포주이다. 일부 경우에서, 포유동물 숙주 세포는 일시적 세포주, 또는 관심 유전 물질을 그 자체 게놈에 도입시키지 않고, 여러 세대의 세포 분열 후에 유전 물질의 생성물을 발현할 능력이 없는 세포주이다.
예시적인 곤충 숙주 세포는 드로소필라 S2 세포, Sf9 세포, Sf21 세포, High Five™ 세포 및 expresSF+® 세포를 포함하나, 이에 제한되지 않는다.
일부 경우에서, 식물 세포는 조류로부터의 세포를 포함한다. 예시적인 곤충 세포주는 클라미도모나스 레이하르드티이(Chlamydomonas reinhardtii) 137c, 또는 시네코코쿠스 엘론가투스(Synechococcus elongatus) PPC 7942로부터의 계통을 포함하나, 이에 제한되지 않는다.
제조 물품
본 발명의 또 다른 측면에서, 상기 기술된 장애의 치료, 예방 및/또는 진단에 유용한 물질을 포함하는 제조 물품을 제공한다. 제조 물품은 용기, 및 용기 상에 있거나, 용기와 결합된 라벨 또는 패키지 삽입물을 포함한다. 적합한 용기는, 예를 들어, 병, 바이알, 주사기, IV 용액 백 등을 포함한다. 용기는 다양한 물질, 예컨대, 유리 또는 플라스틱으로부터 형성될 수 있다. 용기는 조성물을 그 자체로 수용하거나, 병태의 치료, 예방 및/또는 진단에 효과적인 또 다른 조성물과 조합하여 수용하며, 멸균 접근 포트를 가질 수 있다(예를 들어, 용기는 피하 주사 바늘로 뚫을 수 있는 마개를 갖는 정맥내 용액 백 또는 바이알일 수 있다). 조성물 중 적어도 하나의 활성제는 CD3에 특이적으로 결합하는 제1 항원 결합 부위 및 본원에 상기 정의된 종양 항원에 특이적으로 결합하는 제2 항원 결합 부위를 포함하는 이중특이적 항체이다.
라벨 또는 패키지 삽입물은 조성물이 선택된 병태의 치료를 위해 사용된다는 것을 나타낸다. 또한, 제조 물품은 (a) 내부에 조성물로서 본 발명의 이중특이적 항체를 포함하는 조성물이 담긴 제1 용기; 및 (b) 내부에 조성물로서 추가의 세포독성제 또는 다른 치료제를 포함하는 조성물이 담긴 제2 용기를 포함할 수 있다. 본 발명의 상기 실시양태에서 제조 물품은 조성물이 특정한 병태를 치료하는 데 사용될 수 있다는 것을 나타내는 패키지 삽입물을 추가로 포함할 수 있다.
대안적으로 또는 추가적으로, 제조 물품은 약학적으로 허용되는 완충제, 예컨대, 정균 주사용수(BWFI: bacteriostatic water for injection), 포스페이트 완충처리된 염수, 링거액 및 덱스트로스 용액을 포함하는 제2(또는 제3) 용기를 추가로 포함할 수 있다. 이는 다른 완충제, 희석제, 필터, 바늘 및 주사기를 포함하는, 상업적 및 사용자 관점에서 바람직한 다른 물질을 추가로 포함할 수 있다.
특정 정의
본원에서 사용된 용어는 단지 구체적인 사례를 설명하기 위한 것이며, 제한하는 것으로 의도되지 않는다. 본원에서 사용되는 바, "하나"("a," "an") 및 "그"라는 단수 형태는 문맥상 달리 명백하게 명시되지 않는 한, 복수 형태를 또한 포함하는 것으로 의도된다. 더욱이, 용어 "포함하는(including)," "포함한다(includes)," "갖는(having)," "갖는다(has)," "~와 함께(with)" 또는 그의 변형어가 상세한 설명 및/또는 청구범위에서 사용되는 한, 상기 용어들은 용어 "포함하는(comprising)"과 유사한 방식으로 포괄적인 것으로 의도된다.
용어 "항체"는 가장 넓은 의미로 사용되며 완전히 어셈블리 항체, 항원에 결합할 수 있는 항체 단편, 예를 들어 Fab, F(ab')2, Fv, 단일 쇄 항체(scFv), 디아바디, 항체 키메라, 하이브리드 항체, 이중특이적 항체 등을 포함한다.
용어 "상보성 결정 영역" 또는 "CDR"은 항체가 결합하는 에피토프에 대해 구조상 상보적이고, 나머지 가변 영역보다 더 가변적인 항체의 가변 영역의 세그먼트이다. 따라서, CDR은 때때로 초가변 영역으로 지칭된다. 가변 영역은 3개의 CDR을 포함한다. CDR 펩티드는 관심 항체의 CDR을 코딩하는 유전자를 구성함으로써 수득할 수 있다. 상기 유전자는 예를 들어, 항체 생산 세포의 RNA로부터 가변 영역을 합성하기 위해 중합효소 연쇄 반응을 사용함으로써 제조된다. 예를 들어, 문헌 [Larrick et al., Methods: A Companion to Methods in Enzymology 2: 106 (1991)]; [Courtenay-Luck, "Genetic Manipulation of Monoclonal Antibodies," in Monoclonal Antibodies: Production, Engineering and Clinical Application, Ritter et al. (eds.), pages 166-179 (Cambridge University Press 1995)]; 및 [Ward et al., "Genetic Manipulation and Expression of Antibodies," in Monoclonal Antibodies: Principles and Applications, Birch et al., (eds.), pages 137-185 (Wiley-Liss, Inc. 1995)]를 참조한다.
용어 "Fab"는 경쇄의 불변 도메인 및 중쇄의 제1 불변 도메인(CH1)을 함유하는 단백질을 지칭한다. Fab 단편은 항체 힌지 영역으로부터의 하나 이상의 시스테인을 포함하는 중쇄 CH1 도메인의 카복시 말단에 몇 개의 잔기가 부가된다는 점에서 Fab' 단편과 상이하다. Fab'-SH는 본원에서 불변 도메인의 시스테인 잔기(들)가 유리 티올 기를 갖는 Fab'에 대한 명칭이다. Fab' 단편은 F(ab')2 단편의 중쇄 디술피드 브릿지를 환원시킴으로써 생성된다. 항체 단편의 다른 화학적 커플링도 공지되어 있다.
"단일 쇄 가변 단편(scFv)"은 10 내지 약 25개의 아미노산의 짧은 링커 펩티드로 연결된, 항체의 중쇄(VH) 및 경쇄(VL) 가변 영역의 융합 단백질이다. 링커는 일반적으로 가요성을 위한 글리신 뿐만 아니라, 용해도를 위한 세린 또는 트레오닌이 풍부하며, VH의 N 말단을 VL의 C 말단과 연결하거나, 그 반대로 연결할 수 있다. 상기 단백질은 불변 영역을 제거하고, 링커를 도입했음에도 불구하고, 원래 항체의 특이성을 유지한다. scFv 항체는 예컨대, 문헌 [Houston, J. S., Methods in Enzymol. 203 (1991) 46-96]에 기술되어 있다. 추가로, 항체 단편은 VH 도메인의 특징, 즉, VL 도메인과 함께 어셈블리하여 기능적 항원 결합 부위를 형성하고, 이로써, 전장 항체의 항원 결합 특성을 제공할 수 있는 특징, 또는 VL 도메인의 특징, 즉, VH도메인과 함께 어셈블리하여 기능적 항원 결합 부위를 형성하고, 이로써, 전장 항체의 항원 결합 특성을 제공할 수 있는 특징을 갖는 단일 쇄 폴리펩티드를 포함한다.
본원에서 사용되는 바, 서열에 대한 "아미노산 서열 동일성(%)"이라는 용어는 서열을 정렬하고, 최대 서열 동일성(%)을 달성하기 위해 필요한 경우, 갭을 도입한 후, 및 보존적 치환을 서열 동일성의 일부로 고려하지 않으면서, 특정 서열 중의 아미노산 잔기와 동일한 후보 서열 중의 아미노산 잔기의 백분율(%)로 정의된다. 아미노산 서열 동일성(%)을 결정하기 위한 목적을 위한 정렬은 예를 들어, 공개적으로 이용가능한 컴퓨터 소프트웨어, 예컨대, EMBOSS MATCHER, EMBOSS WATER, EMBOSS STRETCHER, EMBOSS NEEDLE, EMBOSS LALIGN, BLAST, BLAST-2, ALIGN 또는 Megalign(DNASTAR) 소프트웨어를 이용하여 당업자의 기술 범위 내에 포함된 다양한 방식으로 달성될 수 있다. 당업자는 비교되는 서열의 전체 길이에 걸쳐 최대 정렬을 달성하는 데 필요한 임의의 알고리즘을 포함하여 정렬을 측정하기 위한 적절한 파라미터를 결정할 수 있다.
ALIGN-2가 아미노산 서열 비교를 위해 사용되는 상황에서, 주어진 아미노산 서열 B에 대한, 그와의 또는 그 대비의, 주어진 아미노산 서열 A의 아미노산 서열 동일성(%)(이는 대안적으로 주어진 아미노산 서열 B에 대한, 그와의 그 대비의 특정 아미노산 서열 동일성(%)을 갖거나, 또는 포함하는 주어진 아미노산 서열 A로 표현될 수 있다) 하기와 같이: 100 x 분율 X/Y(여기서, X는 A 및 B의 프로그램 정렬에서 서열 정렬 프로그램 ALIGN-2에 의해 동일한 매치로 점수화된 아미노산 잔기 개수이고, Y는 B 중 아미노산 잔기의 총 개수이다)로 계산된다. 여기서, 아미노산 서열 A의 길이가 아미노산 서열 B의 길이와 동일하지 않은 경우, B에 대한 A의 아미노산 서열 동일성(%)은 A에 대한 B의 아미노산 서열 동일성(%)과 동일하지 않다는 것을 이해할 것이다. 달리 구체적으로 언급되지 않는 한, 본원에서 사용되는 모든 아미노산 서열 동일성(%) 값은 ALIGN-2 컴퓨터 프로그램을 사용하여 바로 앞 단락에 기술된 바와 같이 수득된다.
본 개시내용의 바람직한 실시양태가 본원에 제시되고, 기술되었지만, 상기 실시양태는 단지 예로서 제공된다는 것이 당업자에게 명백할 것이다. 이제 본 개시내용으로부터 벗어남 없이, 당업자는 다수의 변형, 변경 및 치환을 고안해 낼 것이다. 본원에 기술된 본 개시내용의 실시양태에 대한 다양한 대안이 본 개시내용을 실시하는 데 사용될 수 있다는 것을 이해하여야 한다. 하기 청구범위는 본 개시내용의 범주를 정의하고, 이들 청구범위 내의 방법과 구조 및 그의 등가물은 그에 의해 포함되는 것으로 의도된다.
실시양태
실시양태 1은 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 항체 또는 항체 단편(H1)을 포함하는 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체로서, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 0-2개의 아미노산 변형을 포함하는 것인, 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 2는 H1이 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고; 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하는 것인, 실시양태 1의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 3은 H1의 항체 또는 항체 단편이 단일 도메인 항체, 단일 쇄 가변 단편, Fab, 또는 Fab'를 포함하는 것인, 실시양태 1 또는 2의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 4는 H1의 항체 또는 항체 단편이 단일 도메인 항체를 포함하는 것인, 실시양태 3의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 5는 H1이 서열 번호 4와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 1-4 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 6은 H1이 서열 번호 4와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 1-5 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 7은 H1이 서열 번호 4와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 1-6 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 8은 H1이 서열 번호 4에 따른 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 1-7 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 9는 H1이 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 1-4 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 10은 H1이 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 1-4 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 11은 H1이 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 것인, 실시양태 1-4 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 12는 H1이 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 것인, 실시양태 1-4 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 13은 H1이 하기 화학식 I: A1-L1-P1-H1에 따른 구성에서 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 절단가능한 링커(L1)를 통해 제1 표적 항원에의 제1 항원 인식 분자(A1)의 결합을 손상시키는 펩티드(P1)에 연결된 것인, 실시양태 1-12 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 14는 A1이 제2 항원 인식 분자(A2)에 추가로 연결된 것인, 실시양태 13의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 15는 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체가 하기 화학식 Ia: P2-L2-A2-A1-L1-P1-H1에 따른 것이고, 여기서, P2는 제2 표적 항원에의 A2의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고; L2는 A2를 P2에 연결하고, 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 제2 절단가능한 링커를 포함하는 것인, 실시양태 14의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 16은 H1이 H1을 P1에 연결하는 연결 모이어티(L3)를 포함하는 것인, 실시양태 1-15 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 17은 L3이 5개 이상 50개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 16의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 18은 L3이 10개 이상 30개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 16의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 19는 L3이 10개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 16의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 20은 L3이 18개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 16의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 21은 L3이 26개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 16의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 22는 L3이 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수인 것인, 실시양태 16의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 23은 L3이 아미노산 서열 GGGGSGGGS(서열 번호 19)를 포함하는 것인, 실시양태 22의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 24는 A1이 항체 또는 항체 단편을 포함하는 것인, 실시양태 13-23 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 25는 A1이 인간 또는 인간화된 항체 또는 항체 단편을 포함하는 것인, 실시양태 24의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 26은 L1이 A1의 항체 또는 항체 단편의 N 말단에 결합된 것인, 실시양태 13-25 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 27은 A2가 A1의 항체 또는 항체 단편의 N 말단에 결합된 것인, 실시양태 15-25 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 28은 L1이 A1의 항체 또는 항체 단편의 C 말단에 결합된 것인, 실시양태 13-25 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 29는 A2가 A1의 항체 또는 항체 단편의 C 말단에 결합된 것인, 실시양태 15-25 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 30은 A1의 항체 또는 항체 단편이 단일 쇄 가변 단편, 단일 도메인 항체, 또는 Fab 단편을 포함하는 것인, 실시양태 13-29 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 31은 A1이 단일 쇄 가변 단편(scFv)인 것인, 실시양태 30의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 32는 scFv가 scFv 중쇄 폴리펩티드 및 scFv 경쇄 폴리펩티드를 포함하는 것인, 실시양태 31의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 33은 A1이 단일 도메인 항체인 것인, 실시양태 30의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 34는 A1의 항체 또는 그의 항체 단편이 단일 쇄 가변 단편(scFv), 중쇄 가변 도메인(VH 도메인), 경쇄 가변 도메인(VL 도메인), 또는 낙타류 유래 단일 도메인 항체의 가변 도메인(VHH)을 포함하는 것인, 실시양태 30의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 35는 제1 표적 항원이 이펙터 세포 항원을 포함하는 것인, 실시양태 13-34 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 36은 제1 표적 항원이 CD3인 것인, 실시양태 13-35 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 37은 A1이 항CD3e 단일 쇄 가변 단편을 포함하는 것인, 실시양태 13-36 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 38은 A1이 CD3 발현 세포 상의 CD3에 대해 1 μM 이하의 KD 결합을 갖는 항CD3e 단일 쇄 가변 단편을 포함하는 것인, 실시양태 13-37 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 39는 A1이 각각 인간 CD3에 특이적으로 결합할 수 있는 가변 경쇄 및 가변 중쇄를 포함하는 것인, 실시양태 13-38 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 40은 A1이 뮤로모납-CD3(OKT3), 오텔릭시주맙(TRX4), 테플리주맙(MGA031), 비실리주맙(Nuvion), SP34, X35, VIT3, BMA030 (BW264/56), CLB-T3/3, CRIS7, YTH12.5, F111-409, CLB-T3.4.2, TR-66, WT32, SPv-T3b, 11D8, XIII-141, XIII-46, XIII-87, 12F6, T3/RW2-8C8, T3/RW2-4B6, OKT3D, M-T301, SMC2, F101.01, UCHT-1, WT-31, 15865, 15865v12, 15865v16, 및 15865v19로 이루어진 군으로부터 선택되는 상보성 결정 영역(CDR)을 포함하는 것인, 실시양태 13-39 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 41은 화학식 I의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체가 L1이 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단될 때, 이펙터 세포에 결합하는 것인, 실시양태 13-40 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 42는 화학식 I의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체가 L1이 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단되고, A1이 이펙터 세포에 결합할 때, 이펙터 세포에 결합하는 것인, 실시양태 13-40 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 43은 이펙터 세포가 T 세포인 것인, 실시양태 42의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 44는 A1이 이펙터 세포 상의 TCR-CD3 복합체의 일부인 폴리펩티드에 결합하는 것인, 실시양태 43의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 45는 TCR-CD3 복합체의 일부인 폴리펩티드가 인간 CD3ε인 것인, 실시양태 44의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 46은 A2가 항체 또는 항체 단편을 포함하는 것인, 실시양태 15-45 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 47은 A2의 항체 또는 항체 단편이 단일 쇄 가변 단편, 단일 도메인 항체, Fab', 또는 Fab를 포함하는 것인, 실시양태 46의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 48은 A2의 항체 또는 항체 단편이 단일 쇄 가변 단편(scFv), 중쇄 가변 도메인(VH 도메인), 경쇄 가변 도메인(VL 도메인), 또는 낙타류 유래 단일 도메인 항체의 가변 도메인(VHH)을 포함하는 것인, 실시양태 46의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 49는 A2의 항체 또는 그의 항체 단편이 인간화 또는 인간 항체 또는 그의 항체 단편인 것인, 실시양태 46-48 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 50은 A2가 Fab 또는 Fab'인 것인, 실시양태 47의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 51은 Fab 또는 Fab'가 (a) Fab 경쇄 폴리펩티드 및 (b) Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하는 것인, 실시양태 50의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 52는 제2 표적 항원이 종양 항원을 포함하는 것인, 실시양태 15-51 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 53은 A2의 항체 또는 A2 그의 항체 단편이 표피 성장 인자 수용체(EGFR) 결합 도메인, 메소텔린 결합 도메인, PSMA 결합 도메인, 또는 TROP2 결합 도메인을 포함하는 것인, 실시양태 46-52 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 54는 A2의 항체 또는 항체 단편이 PSMA 결합 도메인 또는 TROP2 결합 도메인을 포함하는 것인, 실시양태 46-52 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 55는 P1이 제1 표적 항원에의 A1의 결합을 손상시키는 것인, 실시양태 13-54 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 56은 P1이 이온 상호작용, 정전기적 상호작용, 소수성 상호작용, Pi-스태킹 상호작용, 또는 H-결합 상호작용, 또는 그의 조합을 통해 A1에 결합된 것인, 실시양태 13-55 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 57은 P1이 제1 표적 항원과 70% 미만의 서열 상동성을 갖는 것인, 실시양태 13-56 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 58은 P2가 제2 표적 항원에의 A2의 결합을 손상시키는 것인, 실시양태 13-57 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 59는 P2가 이온 상호작용, 정전기적 상호작용, 소수성 상호작용, Pi-스태킹 상호작용, 및 H-결합 상호작용, 또는 그의 조합을 통해 A2에 결합된 것인, 실시양태 15-58 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 60은 P2가 항원 결합 부위에서 또는 그 인근에서 A2에 결합된 것인, 실시양태 15-59 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 61은 P2가 제2 표적 항원과 70% 미만의 서열 상동성을 갖는 것인, 실시양태 15-60 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 62는 P1 또는 P2가 길이가 10개 이상의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함하는 것인, 실시양태 13-61 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 63은 P1 또는 P2가 길이가 10개 이상의 아미노산 길이 및 길이가 20개 이하의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함하는 것인, 실시양태 13-61 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 64는 P1 또는 P2가 길이가 16개 이상의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함하는 것인, 실시양태 13-61 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 65는 P1 또는 P2가 길이가 40개 이하의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함하는 것인, 실시양태 13-61 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 66은 P1 또는 P2가 적어도 2개의 시스테인 아미노산 잔기를 포함하는 것인, 실시양태 13-61 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 67은 P1 또는 P2가 환형 펩티드 또는 선형 펩티드를 포함하는 것인, 실시양태 13-61 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 68은 P1 또는 P2가 환형 펩티드를 포함하는 것인, 실시양태 13-61 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 69는 P1 또는 P2가 선형 펩티드를 포함하는 것인, 실시양태 13-61 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 70은 L1이 A1의 N 말단에 결합된 것인, 실시양태 13-69 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 71은 L1이 A1의 C 말단에 결합된 것인, 실시양태 13-69 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 72는 L2가 A2의 N 말단에 결합된 것인, 실시양태 15-69 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 73은 L2가 A2의 C 말단에 결합된 것인, 실시양태 15-69 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 74는 L1 또는 L2가 5개 이상 50개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 13-73 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 75는 L1 또는 L2가 10개 이상 30개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 13-73 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 76은 L1 또는 L2가 10개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 13-73 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 77은 L1 또는 L2가 18개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 13-73 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 78은 L1 또는 L2가 26개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 13-73 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 79은 L1 또는 L2가 (G2S)n(서열 번호 20)을 포함하는 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 내지 3의 정수인, 실시양태 13-73 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 80은 L1이 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수인 것인, 실시양태 13-73 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 81은 L1이 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단되어 A1을 제1 표적 항원에 노출시킬 때 P1이 A1로부터 비결합 상태가 되는 것인, 실시양태 13-80 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 82는 L2가 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단되어 A2를 제2 표적 항원에 노출시킬 때 P2가 A2로부터 비결합 상태가 되는 것인, 실시양태 13-81 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 83은 종양 특이적 프로테아제가 메탈로프로테아제, 세린 프로테아제, 시스테인 프로테아제, 트레오닌 프로테아제, 및 아스파르트산 프로테아제 로 이루어진 군으로부터 선택되는 것인, 실시양태 13-82 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 84는 L1 또는 L2가 우로키나제 절단가능한 아미노산 서열, 매트립타제 절단가능한 아미노산 서열, 매트릭스 메탈로프로테아제 절단가능한 아미노산 서열, 또는 레구마인 절단가능한 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 13-82 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 85는 L1 또는 L2가 GGGGSLSGRSDNHGSSGT(서열 번호 21), GGGGSSGGSGGSGLSGRSDNHGSSGT(서열 번호 22), ASGRSDNH(서열 번호 23), LAGRSDNH(서열 번호 24), ISSGLASGRSDNH(서열 번호 25), ISSGLLAGRSDNH(서열 번호 26), LSGRSDNH(서열 번호 27), ISSGLLSGRSDNP(서열 번호 28), ISSGLLSGRSDNH(서열 번호 29), LSGRSDNHSPLGLAGS(서열 번호 30), SPLGLAGSLSGRSDNH(서열 번호 31), 및 SPLGLSGRSDNH(서열 번호 32)로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 13-84 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 86은 L1 또는 L2가 ASGRSDNH(서열 번호 23), LAGRSDNH(서열 번호 24), ISSGLASGRSDNH(서열 번호 25), 및 ISSGLLAGRSDNH(서열 번호 26)로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 13-84 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 87은 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드가 A1의 단일 쇄 가변 단편(scFv)의 C 말단에 결합된 것인, 실시양태 47-86 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 88은 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드가 A1의 단일 쇄 가변 단편(scFv)의 C 말단에 결합된 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드가 A1의 단일 쇄 가변 단편(scFv)의 C 말단에 결합된 것인, 실시양태 47-86 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 89는 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드가 A1의 단일 쇄 가변 단편(scFv)의 N 말단에 결합된 것인, 실시양태 47-86 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 90은 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드가 A1의 단일 쇄 가변 단편(scFv)의 N 말단에 결합된 것인, 실시양태 47-86 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 91은 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합된 것인, 실시양태 47-86 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 92는 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합된 것인, 실시양태 47-86 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 93은 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합된 것인, 실시양태 47-86 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 94는 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합된 것인, 실시양태 47-86 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 95는 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2가 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드에 결합된 것인, 실시양태 47-86 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 96은 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2가 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드에 결합된 것인, 실시양태 47-86 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 97은 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2가 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드에 결합된 것인, 실시양태 47-86 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 98은 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2가 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드에 결합된 것인, 실시양태 47-86 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 99는 (a) 실시양태 1-98 중 어느 하나의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체; 및 (b) 약학적으로 허용되는 부형제를 포함하는 약학 조성물을 포함한다.
실시양태 100은 실시양태 1-98 중 어느 하나의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 코딩하는 단리된 재조합 핵산 분자를 포함한다.
실시양태 101은 화학식 II: L1a-P1a-H1a에 따른 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체로서, 상기 식에서, L1a는 비절단시, P1a를 제1 표적 항원에 결합하는 제1 항원 인식 분자에 연결하는 종양 특이적 프로테아제 절단된 연결 모이어티를 포함하고; P1a는 L1a 비절단시, 제1 표적 항원에의 제1 항원 인식 분자의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고; H1a는 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 분자를 포함하고, 여기서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; 여기서, CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 0-2개의 아미노산 변형을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 102는 H1a가 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, 여기서, H1a의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하는 것인, 실시양태 101의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 103은 H1a의 항체 또는 항체 단편이 단일 도메인 항체, 단일 쇄 가변 단편, Fab, 또는 Fab'를 포함하는 것인, 실시양태 101 또는 102의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 104는 H1a의 항체 또는 항체 단편이 단일 도메인 항체를 포함하는 것인, 실시양태 103의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 105는 H1a가 서열 번호 4와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 101-104 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 106은 H1a가 서열 번호 4와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 101-105 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 107은 H1a가 서열 번호 4와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 101-106 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 108은 H1a가 서열 번호 4에 따른 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 101-107 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 109는 H1a가 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 101-104 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 110은 H1a가 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 101-104 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 111은 H1a가 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 것인, 실시양태 101-104 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 112는 H1a가 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 것인, 실시양태 101-104 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 113은 P1a L1a 비절단시, 이펙터 세포 항원에의 제1 항원 인식 분자의 결합을 손상시키는 것인, 실시양태 101-104 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 114는 제1 항원 인식 분자가 항체 또는 항체 단편을 포함하는 것인, 실시양태 101-104 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 115는 이펙터 세포 항원이 항CD3 이펙터 세포 항원인 것인, 실시양태 113의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 116은 P1a가 이펙터 세포 항원과 70% 미만의 서열 상동성을 갖는 것인, 실시양태 113 또는 115의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 117은 P1a가 길이가 10개 이상의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함하는 것인, 실시양태 101-116 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 118은 P1a가 길이가 10개 이상의 아미노산 길이 및 길이가 20개 이하의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함하는 것인, 실시양태 101-116 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 119는 P1a가 길이가 16개 이상의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함하는 것인, 실시양태 101-116 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 120은 P1a가 길이가 40개 이하의 아미노산 길이인 펩티드 서열을 포함하는 것인, 실시양태 101-116 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 121은 P1a가 적어도 2개의 시스테인 아미노산 잔기를 포함하는 것인, 실시양태 101-120 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 122는 P1a가 환형 펩티드 또는 선형 펩티드를 포함하는 것인, 실시양태 101-121 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 123은 P1a가 환형 펩티드를 포함하는 것인, 실시양태 101-122 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 124는 P1a가 선형 펩티드를 포함하는 것인, 실시양태 101-122 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 125는 H1a가 H1a를 P1a에 연결하는 연결 모이어티(L3a)를 포함하는 것인, 실시양태 101-124 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 126은 L3a가 5개 이상 50개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 101-125 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 127은 L3a가 10개 이상 30개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 101-126 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 128은 L3a가 10개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 101-125 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 129은 L3a가 18개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 101-125 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 130은 L3a가 26개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 것인, 실시양태 101-125 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 131은 L3a가 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기서, n은 1 이상의 정수인 것인, 실시양태 101-130 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시양태 132는 L3a가 GGGGSGGGS(서열 번호 19)에 따른 아미노산 서열을 포함하는 것인, 실시양태 101-131 중 어느 하나의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 포함한다.
실시예
실시예 1: 혈청 알부민 결합 ELISA
단일 도메인 항체를 효소 결합 면역흡착 검정법(ELISA: enzyme linked immunosorbent assay)에 의해 마우스, 소, 시노몰구스 원숭이, 및 인간으로부터의 혈청 알부민에 결합할 수 있는 그의 능력에 대해 평가하였다. 간략하면, 단일 도메인 항체를 알부민 코팅된 ELISA 플레이트에 적정하였다. 세척 후, 결합된 단일 도메인 항체를 2차 호스 래디쉬 퍼옥시다제 항체 접합체를 이용하여 검출하였다. 다시 세척한 후, 표준 ELISA 기술을 이용하여 플레이트를 현상시키고, 산을 이용하여 정지시켰다. 50% 최대 신호를 달성하는 데 요구되는 단일 도메인 항체의 농도 또는 EC50을 그래프패드 프리즘(Graphpad prism)을 이용하여 계산하였다. 데이터는 도 1a-1d에 제시되어 있다.
실시예 2 : 인간 혈청 알부민의 pH 의존적 동역학적 결합
옥테트(Octet) RED96 장비를 이용하여 인간 혈청 알부민에 대한 단일 도메인 항체 결합 동역학적 성질을 평가하였다. 간략하면, 비오티닐화된 인간 혈청 알부민을 스트렙타비딘 바이오센서 상에 포획시키고, 바이오시틴으로 ??칭하고, 완충제 중에서 기준선을 설정하였다. 이어서, 중성 또는 산성 pH의 완충제 중에서 적정된 단일 도메인 항체를 알부민 로딩된 바이오센서 상에서 회합시켰다. 회합 후, 바이오센서를 중성 또는 산성 pH의 완충제로 옮기고, 단일 도메인 항체 해리를 측정하였다. 회합 및 해리 동역학적 성질을 실시간으로 측정하고, 1:1 결합 모델로 피팅하였다. 이어서, 상이한 단일 도메인 항체 간에 온 속도, 오프 속도, 및 친화도(KD)를 비교하였다. 데이터는 도 2a - 2b에 제시되어 있다.
Figure pct00018
Figure pct00019
Figure pct00020
Figure pct00021
실시예 3: ELISA에 의한 시노몰구스 원숭이( cyno ) 및 인간 알부민에의 pH 의존적 결합
단일 도메인 항체를 중성 및 산성 pH에서 효소 결합 면역흡착 검정법(ELISA)에 의해 시노몰구스 원숭이 또는 인간으로부터의 혈청 알부민에 결합할 수 있는 그의 능력에 대해 평가하였다. 간략하면, 단일 도메인 항체를 알부민 코팅된 ELISA 플레이트 상에서 중성 또는 산성 완충제에 적정하였다. 세척 후, 결합된 단일 도메인 항체를 2차 호스 래디쉬 퍼옥시다제 항체 접합체를 이용하여 검출하였다. 다시 세척한 후, 표준 ELISA 기술을 이용하여 플레이트를 현상시키고, 산을 이용하여 정지시켰다. 50% 최대 신호를 달성하는 데 요구되는 단일 도메인 항체의 농도 또는 EC50를 그래프패드 프리즘을 이용하여 계산하였다. 이어서, 중성 및 산성 pH에서의 단일 도메인 항체 친화도를 비교하였다. 데이터는 도 3a-도 3d에 제시되어 있다.
Figure pct00022
실시예 4: 인간 알부민에 대한 단일 도메인 항체 및 FcRn 동역학적 결합 경쟁
단일 도메인 항체를 FcRn 인식을 차단하지 않고, 인간 혈청 알부민에 결합할 수 있는 그의 능력에 대해 평가하였다. 간략하면, 비오티닐화된 인간 혈청 알부민을 스트렙타비딘 바이오센서 상에 로딩하고, 바이오시틴 중에서 ??칭하고, 산성 완충제 중에서 기준선을 설정하였다. 이어서, 포화될 때까지 단일 도메인 항체를 센서 상에서 회합시켰다 (회합 1). 이어서, 이제는 FcRn 또한 함유하는 동일한 농도의 단일 도메인 항체로 센서를 옮겼다 (회합 2). 제2 회합 단계 동안의 신호 증가는 FcRn이 결합된 단일 도메인 항체로 이미 포화된 알부민과 관련하여 인간 알부민에 추가로 결합할 수 있다는 것을 암시한다. 따라서, 회합 2는 단일 도메인 항체가 알부민 결합 부위에 대해 FcRn과 경쟁하는지 여부를 시험한다. 마지막으로, 바이오센서를 완충제로 옮기고, 해리를 관찰하였다. 알부민의 FcRn 경쟁적 결합이 결여된 것으로 공지된 양성 대조군 단일 도메인 항체를 비교를 위해 사용하였다. 데이터는 도 4에 제시되어 있다.
실시예 5: 생체내 반감기 연장을 위한 폴리펩티드 서열
폴리펩티드 복합체 PC1, PC2, PC3, 및 PC4는 표 7에 개시된 경쇄(LC) 및 중쇄(HC) 아미노산 서열을 갖는다. HE-1 서열(서열 번호 4)이 PC2 LC 내로 및 PC4 HC에 도입된다. HE-1 서열이 도입된 PC2 및 PC4를 각각 PC1 및 PC3과 비교하여 시노몰구스 원숭이에서 HE-1이 생체내 반감기 연장에 미치는 효과를 나타낸다. 서열 번호 7 및 서열 번호 8은 PC1의 각 LC 및 HC 아미노산 서열이다. 서열 번호 9 및 서열 번호 10은 PC2의 각 LC 및 HC 아미노산 서열이다. 서열 번호 11 및 서열 번호 12는 PC3의 각 LC 및 HC 아미노산 서열이다. 서열 번호 13 및 서열 번호 14는 PC4의 각 LC 및 HC 아미노산 서열이다. PC1 및 PC2는 PSMA 및 CD3 표적화 영역을 포함하고, PC3 및 PC4는 TROP2 및 CD3 표적화 영역을 포함한다. PC2는 단일 마스크를 포함하고, PC4는 이중 마스크를 포함한다. PC2는 구성 8에 따른 구성을 갖고, PC4는 구성 5에 따른 구성을 갖는다.
Figure pct00023
Figure pct00024
실시예 6: 폴리펩티드 복합체(PC1 및 PC2)에 의한 PSMA CD3e 결합
폴리펩티드 복합체 PC1 및 PC2를 ELISA를 사용하여 PSMA 및 CD3e에의 결합에 대해 평가하였다. 마스크 절단을 위해 매트립타제 효소(MTSP1)의 존재하에 PC2를 이용한 결합 연구 또한 수행하였다. PSMA 및 CD3e에 대한 결합 데이터는 도 56에 각각 제시되어 있다.
실시예 7: CD8+ T 세포 존재하의 폴리펩티드 복합체 매개의, 22RV1 종양 세포 살해
PSMA 양성 종양 세포주 22Rv1을 이용하여 기능성 시험관내 종양 세포 살해 검정법에서 폴리펩티드 복합체 PC1 및 PC2를 평가하였다. 종양 세포가 센서 표면에 부착, 확산 및 확장됨에 따라 증가한 센서 임피던스 측정치(세포 지수)에 의존하는 애질런트(Agilent)로부터 입수한 xCelligence 실시간 세포 분석기를 이용하여 종양 세포 살해를 측정하였다. 유사하게, 종양 세포가 살해됨에 따라, 임피던스가 감소하였다. 웰당 10,000개의 종양 세포를 첨가하고, 96 웰 E-플레이트에 밤새도록 부착시켰다. 다음날, 30,000개의 CD8+ T 세포와 함께 인간 혈청 보충 배지에서 적정된 폴리펩티드 복합체를 웰에 첨가하였다. 추가 72시간 동안 10분마다 세포 지수를 측정하였다. 이어서, 세포 지수 x 시간(종양 세포 성장 동역학적 성질)을 폴리펩티드 복합체 농도 대비로 플롯팅하였고, 여기서, 종양 성장을 50%만큼 감소시키는 데 필요한 농도(IC50)는 그래프패드 프리즘 소프트웨어를 이용하여 계산하였다. 도 7은 PC1, PC2, 및 MTSP1로 절단된 PC2로 처리된 22Rv1에 대한 세포독성 데이터를 나타낸 것이다. 데이터는 표 8에 요약되어 있고, PC1이 PC2보다 22Rv1 세포에 대해 300배 초과로 더 큰 세포독성을 띤다는 것을 보여준다. 효소 절단에 의한 PC2의 차폐 해제는 세포 독성을 150배 초과만큼 증가시켰다.
Figure pct00025
실시예 8: 시노몰구스 원숭이에서의 PC1 및 PC2의 약동학적 성질
시노몰구스 원숭이에서 PC1 및 PC2의 폴리펩티드 분자의 약동학적 성질 및 탐색적 안전성을 평가하였다. 간략하면, 체중이 대략 3 킬로그램 (kg)인 시노몰구스 원숭이에 폴리펩티드를 IV 볼루스로 투여하고, 매일 유해 사례에 대해 관찰하였다. 살아있는 동안 어떤 유해 사례도 관찰되지 않았다. 투여 후, 특정 시점에 혈액을 K2 EDTA 튜브에 수집하고, 혈장으로 프로세싱하였다. 분석시까지 혈장을 냉동 보관하였다. 표준 ELISA 기술을 통해 대조군 시노몰구스 혈장 중에 희석된 참조 표준 대비로 혈장 중 폴리펩티드 분자의 농도를 측정하였다. 혈장 농도 곡선을 분포 및 제거 단계를 나타내는 표준 2단계 지수 방정식에 피팅하였다. 약동학적 성질을 피팅함으로써 CMAX, 반감기(t1/2), 분포 부피(Vd), 제거(CL), 및 7일 곡선하 면적(AUC)을 계산할 수 있었고, 이는 PC1에 대해서는 표 9에, 및 PC2에 대해서는 표 10에 제시되어 있다. PC1(10 ㎍/kg IV)에 대한 약동학적 데이터는 도 8에 제시되어 있다. PC2(87 ㎍/kg IV)에 대한 약동학적 데이터는 도 9에 제시되어 있다. 시노몰구스 원숭이에서 측정된 약동학적 성질이 인간에서의 주 1회 투여를 뒷받침한다.
Figure pct00026
Figure pct00027
실시예 9: 폴리펩티드 복합체(PC1 및 PC4)에 의한 TROP2 CD3e 결합
폴리펩티드 복합체 PC1 및 PC4를 ELISA를 사용하여 TROP2 및 CD3e에의 결합에 대해 평가하였다. 마스크 절단을 위해 매트립타제(MTSP1)의 존재하에 PC4를 이용한 결합 연구 또한 수행하였다. TROP2 및 CD3e에 대한 결합 데이터는 도 1011에 각각 제시되어 있다.
실시예 10: CD8+ T 세포 존재하의 폴리펩티드 복합체 매개의, H292 세포 살해
TROP2 양성 종양 세포주 HCT116, NCI-H292, 및 MDAMB231을 이용하여 기능성 시험관내 종양 세포 살해 검정법에서 폴리펩티드 복합체 PC3 및 PC4를 평가하였다. 종양 세포주가 센서 표면에 부착, 확산 및 확장됨에 따라 증가한 센서 임피던스 측정치(세포 지수)에 의존하는 애질런트로부터 입수한 xCelligence 실시간 세포 분석기를 이용하여 종양 세포 살해를 측정하였다. 유사하게, 종양 세포가 살해됨에 따라, 임피던스가 감소하였다. 웰당 10,000개의 종양 세포를 첨가하고, 96 웰 E-플레이트에 밤새도록 부착시켰다. 다음날, 30,000개의 CD8+ T 세포와 함께 인간 혈청 보충 배지에서 적정된 폴리펩티드 복합체를 웰에 첨가하였다. 추가 72시간 동안 10분마다 세포 지수를 측정하였다. 이어서, 세포 지수 x 시간(종양 세포 성장 동역학적 성질)을 폴리펩티드 복합체 농도 대비로 플롯팅하였고, 여기서, 종양 성장을 50% 감소시키는 데 필요한 농도(IC50)는 그래프패드 프리즘 소프트웨어를 이용하여 계산하였다. 도 12는 PC3, PC4, 및 MTSP1로 절단된 PC4로 처리된 H292 세포에 대한 세포독성 데이터를 나타낸 것이다. 데이터는 표 11에 요약되어 있다. 표 11을 참조하면, PC3은 PC4보다 H292 세포에 대해 4000배 초과로 더 큰 세포독성을 띤다. MTSP-1로 PC4를 절단하였을 때, 폴리펩티드 복합체의 세포독성은 현저히 증가하였다.
Figure pct00028
실시예 11: 시노몰구스 원숭이에서의 PC3 및 PC4의 약동학적 성질
시노몰구스 원숭이에서 폴리펩티드 분자 PC3 및 PC4의 약동학적 성질 및 탐색적 안전성을 평가하였다. 간략하면, 체중이 대략 3 킬로그램 (kg)인 시노몰구스 원숭이에 폴리펩티드를 IV 볼루스로 투여하고, 매일 유해 사례에 대해 관찰하였다. 살아있는 동안 어떤 유해 사례도 관찰되지 않았다. 투여 후, 특정 시점에 혈액을 K2 EDTA 튜브에 수집하고, 혈장으로 프로세싱하였다. 분석시까지 혈장을 냉동 보관하였다. 표준 ELISA 기술을 통해 대조군 시노몰구스 혈장 중에 희석된 참조 표준 대비로 혈장 중 폴리펩티드 분자의 농도를 측정하였다. 혈장 농도 곡선을 분포 및 제거 단계를 나타내는 표준 2단계 지수 방정식에 피팅하였다. 약동학적 성질을 피팅함으로써 CMAX, 반감기(t1/2), 분포 부피(Vd), 제거(CL), 및 7일 곡선하 면적(AUC)을 계산할 수 있었고, 이는 PC3에 대해서는 표 12에, 및 PC4에 대해서는 표 13에 제시되어 있다. PC3(3 ㎍/kg IV)에 대한 약동학적 데이터는 도 13에 제시되어 있다. PC4(1000 ㎍/kg IV)에 대한 약동학적 데이터는 도 14에 제시되어 있다. 시노몰구스 원숭이에서 측정된 약동학적 성질이 인간에서의 주 1회 투여를 뒷받침한다.
Figure pct00029
Figure pct00030
SEQUENCE LISTING <110> JANUX THERAPEUTICS, INC. <120> HALF-LIFE EXTENDING COMPOSITIONS AND METHODS <130> 52426-731.601 <140> <141> <150> 63/122,818 <151> 2020-12-08 <160> 40 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 8 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 1 Gly Ser Thr Phe Tyr Thr Ala Val 1 5 <210> 2 <211> 8 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 2 Ile Arg Trp Thr Ala Leu Thr Thr 1 5 <210> 3 <211> 17 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 3 Ala Ala Arg Gly Thr Leu Gly Leu Phe Thr Thr Ala Asp Ser Tyr Asp 1 5 10 15 Tyr <210> 4 <211> 124 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 4 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Tyr Thr Ala 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Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp 325 330 335 Val Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Asn Tyr Asn Ser Ala Pro Phe Thr Phe 340 345 350 Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser 355 360 365 Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala 370 375 380 Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val 385 390 395 400 Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser 405 410 415 Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr 420 425 430 Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Cys 435 440 445 Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn 450 455 460 Arg Gly Glu Cys 465 <210> 8 <211> 226 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 8 Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ala Phe Ser Arg Tyr 20 25 30 Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Gln Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Gly Gly Asp Phe Leu Tyr Tyr Tyr Tyr Tyr Gly Met Asp Val 100 105 110 Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly 115 120 125 Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly 130 135 140 Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val 145 150 155 160 Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe 165 170 175 Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val 180 185 190 Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val 195 200 205 Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys 210 215 220 Ser Cys 225 <210> 9 <211> 645 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide <400> 9 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Tyr Thr Ala 20 25 30 Val Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Ala Ile Arg Trp Thr Ala Leu Thr Thr Ser Tyr Ala Asp Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Gly Ala Lys Thr Thr Leu Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Ala Arg Gly Thr Leu Gly Leu Phe Thr Thr Ala Asp Ser Tyr Asp 100 105 110 Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly 115 120 125 Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Val Tyr Cys Gly Pro Glu Phe Asp Glu 130 135 140 Ser Val Gly Cys Met Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Leu Ser Gly 145 150 155 160 Arg Ser Asp Ala Gly Ser Pro Leu Gly Leu Ala Gly Ser Gly Gly Gly 165 170 175 Ser Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly 180 185 190 Gly Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Lys 195 200 205 Tyr Ala Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp 210 215 220 Val Ala Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala 225 230 235 240 Asp Ser Val Lys Asp Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn 245 250 255 Thr Ala Tyr Leu Gln Met Asn Asn Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val 260 265 270 Tyr Tyr Cys Val Arg His Gly Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Ile Ser Tyr 275 280 285 Trp Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly 290 295 300 Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Thr Val 305 310 315 320 Val Thr Gln Glu Pro Ser Leu Thr Val Ser Pro Gly Gly Thr Val Thr 325 330 335 Leu Thr Cys Gly Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Ser Gly Asn Tyr Pro 340 345 350 Asn Trp Val Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Gly Leu Ile Gly 355 360 365 Gly Thr Lys Phe Leu Ala Pro Gly Thr Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser 370 375 380 Leu Leu Gly Gly Lys Ala Ala Leu Thr Leu Ser Gly Val Gln Pro Glu 385 390 395 400 Asp Glu Ala Glu Tyr Tyr Cys Val Leu Trp Tyr Ser Asn Arg 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13 Gly Gly Val Asp Phe Cys Lys Ile Tyr Ser Trp Pro Val Cys His Gln 1 5 10 15 Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Leu Ser Gly Arg Ser Asp Ala Gly Ser 20 25 30 Pro Leu Gly Leu Ala Gly Ser Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln 35 40 45 Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Ser Ile Thr 50 55 60 Cys Lys Ala Ser Gln Asp Val Ser Ile Ala Val Ala Trp Tyr Gln Gln 65 70 75 80 Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ser Ala Ser Tyr Arg 85 90 95 Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp 100 105 110 Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr 115 120 125 Tyr Cys Gln Gln His Tyr Ile Thr Pro Leu Thr Phe Gly Ala Gly Thr 130 135 140 Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe 145 150 155 160 Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys 165 170 175 Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val 180 185 190 Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln 195 200 205 Asp Ser Lys Asp Ser 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of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 18 Gly Ser Ser Gly Gly Ser 1 5 <210> 19 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 19 Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser 1 5 <210> 20 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <220> <221> SITE <222> (1)..(9) <223> This sequence may encompass 1-3 "Gly Gly Ser" repeating units <400> 20 Gly Gly Ser Gly Gly Ser Gly Gly Ser 1 5 <210> 21 <211> 18 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 21 Gly Gly Gly Gly Ser Leu Ser Gly Arg Ser Asp Asn His Gly Ser Ser 1 5 10 15 Gly Thr <210> 22 <211> 26 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 22 Gly Gly Gly Gly Ser Ser Gly Gly Ser Gly Gly Ser Gly Leu Ser Gly 1 5 10 15 Arg Ser Asp Asn His Gly Ser Ser Gly Thr 20 25 <210> 23 <211> 8 <212> 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Claims (100)

  1. 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하는 반감기 연장 항체(H1) 또는 항체 단편을 포함하는 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체로서, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하고; CDR은 HC-CDR1, HC-CDR2, 또는 HC-CDR3 중 적어도 하나에 0-2개의 아미노산 변형을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  2. 제1항에 있어서, H1이 상보성 결정 영역(CDR): HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3을 포함하고, H1의 HC-CDR1, HC-CDR2, 및 HC-CDR3은 HC-CDR1: 서열 번호 1, HC-CDR2: 서열 번호 2, 및 HC-CDR3: 서열 번호 3을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  3. 제1항에 있어서, H1의 항체 또는 항체 단편이 단일 도메인 항체, 단일 쇄 가변 단편, Fab, 또는 Fab'를 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  4. 제3항에 있어서, H1의 항체 또는 항체 단편이 단일 도메인 항체를 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  5. 제1항에 있어서, H1이 서열 번호 4와 적어도 90%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  6. 제1항에 있어서, H1이 서열 번호 4와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  7. 제1항에 있어서, H1이 서열 번호 4와 적어도 99%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  8. 제1항에 있어서, H1이 서열 번호 4에 따른 아미노산 서열을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  9. 제1항에 있어서, H1이 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  10. 제1항에 있어서, H1이 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  11. 제1항에 있어서, H1이 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 110개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  12. 제1항에 있어서, H1이 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기의 아미노산 서열을 포함하고, 서열 번호 4의 적어도 120개의 연속 아미노산 잔기와 적어도 95%의 서열 동일성을 갖는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  13. 제1항에 있어서, H1이 하기 화학식 I에 따른 구성에서 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 절단가능한 링커(L1)를 통해 제1 표적 항원에의 제1 항원 인식 분자(A1)의 결합을 손상시키는 펩티드(P1)에 연결된 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체:
    A1-L1-P1-H1 (화학식 I).
  14. 제13항에 있어서, A1이 제2 항원 인식 분자(A2)에 추가로 연결되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  15. 제14항에 있어서, 하기 화학식 Ia에 따른 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체:
    P2-L2-A2-A1-L1-P1-H1 (화학식 Ia),
    상기 화학식에서 P2는 제2 표적 항원에의 A2의 결합을 손상시키는 펩티드를 포함하고; L2는, A2를 P2에 연결하고 종양 특이적 프로테아제에 대한 기질인 제2 절단가능한 링커를 포함한다.
  16. 제1항에 있어서, H1이 H1을 P1에 연결하는 연결 모이어티(L3)를 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  17. 제16항에 있어서, L3이 5개 이상 50개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  18. 제16항에 있어서, L3이 10개 이상 30개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  19. 제16항에 있어서, L3이 10개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  20. 제16항에 있어서, L3이 18개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  21. 제16항에 있어서, L3이 26개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  22. 제16항에 있어서, L3이 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기에서 n은 1 이상의 정수인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  23. 제22항에 있어서, L3이 아미노산 서열 GGGGSGGGS(서열 번호 19)를 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  24. 제14항에 있어서, A1이 항체 또는 항체 단편을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  25. 제24항에 있어서, A1이 인간 또는 인간화된 항체 또는 항체 단편을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  26. 제24항에 있어서, L1이 A1의 항체 또는 항체 단편의 N 말단에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  27. 제24항에 있어서, A2가 A1의 항체 또는 항체 단편의 N 말단에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  28. 제24항에 있어서, L1이 A1의 항체 또는 항체 단편의 C 말단에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  29. 제24항에 있어서, A2가 A1의 항체 또는 항체 단편의 C 말단에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  30. 제24항에 있어서, A1의 항체 또는 항체 단편이 단일 쇄 가변 단편, 단일 도메인 항체, 또는 Fab 단편을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  31. 제30항에 있어서, A1이 단일 쇄 가변 단편(scFv)인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  32. 제31항에 있어서, scFv가 scFv 중쇄 폴리펩티드 및 scFv 경쇄 폴리펩티드를 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  33. 제30항에 있어서, A1이 단일 도메인 항체인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  34. 제30항에 있어서, A1의 항체 또는 그의 항체 단편이 단일 쇄 가변 단편(scFv), 중쇄 가변 도메인(VH 도메인), 경쇄 가변 도메인(VL 도메인), 또는 낙타류 유래 단일 도메인 항체의 가변 도메인(VHH)을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  35. 제13항에 있어서, 제1 표적 항원이 이펙터 세포 항원을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  36. 제13항에 있어서, 제1 표적 항원이 CD3인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  37. 제13항에 있어서, A1이 항CD3e 단일 쇄 가변 단편을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  38. 제13항에 있어서, A1이 CD3 발현 세포 상의 CD3에 대해 1 μM 이하의 KD 결합을 갖는 항CD3e 단일 쇄 가변 단편을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  39. 제13항에 있어서, A1이, 각각 인간 CD3에 특이적으로 결합할 수 있는 가변 경쇄 및 가변 중쇄를 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  40. 제13항에 있어서, A1이 뮤로모납-CD3(OKT3), 오텔릭시주맙(TRX4), 테플리주맙(MGA031), 비실리주맙(Nuvion), SP34, X35, VIT3, BMA030 (BW264/56), CLB-T3/3, CRIS7, YTH12.5, F111-409, CLB-T3.4.2, TR-66, WT32, SPv-T3b, 11D8, XIII-141, XIII-46, XIII-87, 12F6, T3/RW2-8C8, T3/RW2-4B6, OKT3D, M-T301, SMC2, F101.01, UCHT-1, WT-31, 15865, 15865v12, 15865v16, 및 15865v19로 이루어진 군으로부터 선택되는 상보성 결정 영역(CDR)을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  41. 제13항에 있어서, L1이 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단될 때 화학식 I의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체가 이펙터 세포에 결합하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  42. 제13항에 있어서, L1이 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단되고 A1이 이펙터 세포에 결합할 때 화학식 I의 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체가 이펙터 세포에 결합하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  43. 제42항에 있어서, 이펙터 세포가 T 세포인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  44. 제43항에 있어서, A1이 이펙터 세포 상의 TCR-CD3 복합체의 일부인 폴리펩티드에 결합하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  45. 제44항에 있어서, TCR-CD3 복합체의 일부인 폴리펩티드가 인간 CD3ε인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  46. 제15항에 있어서, A2가 항체 또는 항체 단편을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  47. 제46항에 있어서, A2의 항체 또는 그의 항체 단편이 단일 쇄 가변 단편, 단일 도메인 항체, Fab', 또는 Fab를 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  48. 제46항에 있어서, A2의 항체 또는 그의 항체 단편이 단일 쇄 가변 단편(scFv), 중쇄 가변 도메인(VH 도메인), 경쇄 가변 도메인(VL 도메인), 또는 낙타류 유래 단일 도메인 항체의 가변 도메인(VHH)을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  49. 제46항에 있어서, A2의 항체 또는 그의 항체 단편이 인간화 또는 인간 항체 또는 그의 항체 단편인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  50. 제47항에 있어서, A2가 Fab 또는 Fab'인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  51. 제50항에 있어서, Fab 또는 Fab'가 (a) Fab 경쇄 폴리펩티드 및 (b) Fab 중쇄 폴리펩티드를 포함하고, A1이 scFv 경쇄 폴리펩티드 및 scFv 중쇄 폴리펩티드를 포함하는 단일 쇄 가변 단편(scFv)을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  52. 제15항에 있어서, 제2 표적 항원이 종양 항원을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  53. 제46항에 있어서, A2의 항체 또는 그의 항체 단편이 표피 성장 인자 수용체(EGFR) 결합 도메인, 메소텔린 결합 도메인, PSMA 결합 도메인, 또는 TROP2 결합 도메인을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  54. 제46항에 있어서, A2의 항체 또는 항체 단편이 PSMA 결합 도메인 또는 TROP2 결합 도메인을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  55. 제13항에 있어서, P1이 제1 표적 항원에의 A1의 결합을 손상시키는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  56. 제13항에 있어서, P1이 이온 상호작용, 정전기적 상호작용, 소수성 상호작용, Pi-스태킹 상호작용, 또는 H-결합 상호작용, 또는 그의 조합을 통해 A1에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  57. 제13항에 있어서, P1이 제1 표적 항원과 70% 미만의 서열 상동성을 갖는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  58. 제15항에 있어서, P2가 제2 표적 항원에의 A2의 결합을 손상시키는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  59. 제15항에 있어서, P2가 이온 상호작용, 정전기적 상호작용, 소수성 상호작용, Pi-스태킹 상호작용, 및 H-결합 상호작용, 또는 그의 조합을 통해 A2에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  60. 제15항에 있어서, P2가 항원 결합 부위에서 또는 그 인근에서 A2에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  61. 제15항에 있어서, P2가 제2 표적 항원과 70% 미만의 서열 상동성을 갖는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  62. 제15항에 있어서, P1 또는 P2가 10개 이상의 아미노산 길이의 펩티드 서열을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  63. 제15항에 있어서, P1 또는 P2가 10개 이상의 아미노산 길이 및 20개 이하의 아미노산 길이의 펩티드 서열을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  64. 제15항에 있어서, P1 또는 P2가 16개 이상의 아미노산 길이의 펩티드 서열을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  65. 제15항에 있어서, P1 또는 P2가 40개 이하의 아미노산 길이의 펩티드 서열을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  66. 제15항에 있어서, P1 또는 P2가 적어도 2개의 시스테인 아미노산 잔기를 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  67. 제15항에 있어서, P1 또는 P2가 환형 펩티드 또는 선형 펩티드를 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  68. 제15항에 있어서, P1 또는 P2가 환형 펩티드를 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  69. 제15항에 있어서, P1 또는 P2가 선형 펩티드를 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  70. 제15항에 있어서, L1이 A1의 N 말단에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  71. 제15항에 있어서, L1이 A1의 C 말단에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  72. 제15항에 있어서, L2가 A2의 N 말단에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  73. 제15항에 있어서, L2가 A2의 C 말단에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  74. 제15항에 있어서, L1 또는 L2가 5개 이상 50개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  75. 제15항에 있어서, L1 또는 L2가 10개 이상 30개 이하의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  76. 제15항에 있어서, L1 또는 L2가 10개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  77. 제15항에 있어서, L1 또는 L2가 18개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  78. 제15항에 있어서, L1 또는 L2가 26개 이상의 아미노산을 갖는 펩티드 서열인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  79. 제15항에 있어서, L1 또는 L2가 (G2S)n(서열 번호 20)을 포함하는 화학식을 갖고, 여기에서 n은 1 내지 3의 정수인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  80. 제15항에 있어서, L1이 (G2S)n, (GS)n, (GSGGS)n(서열 번호 15), (GGGS)n(서열 번호 16), (GGGGS)n(서열 번호 17), 및 (GSSGGS)n(서열 번호 18)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학식을 갖고, 여기에서 n은 1 이상의 정수인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  81. 제13항에 있어서, L1이 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단되어 A1을 제1 표적 항원에 노출시킬 때 P1이 A1로부터 비결합 상태가 되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  82. 제15항에 있어서, L2가 종양 특이적 프로테아제에 의해 절단되어 A2를 제2 표적 항원에 노출시킬 때 P2가 A2로부터 비결합 상태가 되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  83. 제13항에 있어서, 종양 특이적 프로테아제가 메탈로프로테아제, 세린 프로테아제, 시스테인 프로테아제, 트레오닌 프로테아제, 및 아스파르트산 프로테아제로 이루어진 군으로부터 선택되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  84. 제15항에 있어서, L1 또는 L2가 우로키나제 절단가능한 아미노산 서열, 매트립타제 절단가능한 아미노산 서열, 매트릭스 메탈로프로테아제 절단가능한 아미노산 서열, 또는 레구마인 절단가능한 아미노산 서열을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  85. 제15항에 있어서, L1 또는 L2가 GGGGSLSGRSDNHGSSGT(서열 번호 21), GGGGSSGGSGGSGLSGRSDNHGSSGT(서열 번호 22), ASGRSDNH(서열 번호 23), LAGRSDNH(서열 번호 24), ISSGLASGRSDNH(서열 번호 25), ISSGLLAGRSDNH(서열 번호 26), LSGRSDNH(서열 번호 27), ISSGLLSGRSDNP(서열 번호 28), ISSGLLSGRSDNH(서열 번호 29), LSGRSDNHSPLGLAGS(서열 번호 30), SPLGLAGSLSGRSDNH(서열 번호 31), SPLGLSGRSDNH(서열 번호 32), LAGRSDNHSPLGLAGS(서열 번호 33), LSGRSDNHVPLSLKMG(서열 번호 34), 및 LSGRSDNHVPLSLSMG(서열 번호 35)로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  86. 제15항에 있어서, L1 또는 L2가 ASGRSDNH(서열 번호 23), LAGRSDNH(서열 번호 24), ISSGLASGRSDNH(서열 번호 25), 및 ISSGLLAGRSDNH(서열 번호 26)로 이루어진 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함하는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  87. 제51항에 있어서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드가 A1의 단일 쇄 가변 단편(scFv)의 C 말단에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  88. 제51항에 있어서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드가 A1의 단일 쇄 가변 단편(scFv)의 C 말단에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  89. 제51항에 있어서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드가 A1의 단일 쇄 가변 단편(scFv)의 N 말단에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  90. 제51항에 있어서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드가 A1의 단일 쇄 가변 단편(scFv)의 N 말단에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  91. 제51항에 있어서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  92. 제51항에 있어서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  93. 제51항에 있어서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  94. 제51항에 있어서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  95. 제51항에 있어서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2가 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  96. 제51항에 있어서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 중쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2가 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  97. 제51항에 있어서, A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2가 A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  98. 제51항에 있어서, A2의 Fab 경쇄 폴리펩티드가 A1의 scFv 경쇄 폴리펩티드에 결합되고, L2가 A2의 Fab 중쇄 폴리펩티드에 결합되는 것인 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체.
  99. (i) 제1항의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체; 및
    (ii) 약학적으로 허용되는 부형제
    를 포함하는 약학 조성물.
  100. 제1항의 단리된 폴리펩티드 또는 폴리펩티드 복합체를 코딩하는 단리된 재조합 핵산 분자.
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