KR20230045891A - 고추역병균의 증식을 억제하는 NLP2 표적 dsRNA 및 이의 용도 - Google Patents
고추역병균의 증식을 억제하는 NLP2 표적 dsRNA 및 이의 용도 Download PDFInfo
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Abstract
본 발명은 서열번호 1의 염기서열로 표시되며, 고추역병균(Phytophthora capsici)의 NLP2 (Necrosis-inducing protein 2) 유전자의 발현을 억제하는 dsRNA 및 이의 용도에 관한 것으로, 본 발명에 따른 dsRNA는 고추역병 방제에 유용하게 활용될 수 있을 것이다.
Description
본 발명은 고추역병균(Phytophthora capsici)의 증식을 억제하는 NLP2 (Necrosis-inducing protein 2) 표적 dsRNA 및 이의 용도에 관한 것이다.
RNAi (RNA interference) 기술을 기반으로, 표적 RNA의 상동성 있는 RNA를 발현시킨 식물은 바이러스 방제 측면에서 효과적이고 영속적인 장점을 가지고 있다. 하지만, 이러한 형질전환 방법은 시간이 오래 걸리고, 고비용이며, 작물마다 효과적인 형질전환 방법이 다르고, GMO (Genetically modified organism)로 인한 국가적 규제 등의 단점을 가지고 있다. 이러한 문제점을 극복하기 위해서 RNAi 기작을 응용하여 바이러스 dsRNA를 식물에 직접 처리하는 방법이 대두되고 있다. dsRNA는 식물체에 주입된 후 성숙과정을 거쳐 다양한 siRNA (small interfering RNA)를 형성하고, siRNA는 Argonaute 단백질에 로딩되어 표적 mRNA와 상보적으로 결합 및 절단하여 표적 유전자의 발현을 조절한다.
고추의 역병은 파이토프토라 캡사이시(Phytophthora capsici)에 의해 발병하는 것으로, 고추를 비롯하여 가지과, 박과 작물 등 다양한 기주 식물들을 침해하여 경제적으로 큰 피해를 주는 주요 식물병원균이다. 국내에서는 1967년 고추에서 최초로 병 발생이 보고된 이후, 수박, 토마토, 가지, 오이, 참외, 호박 등에서도 발생이 보고되어 있다. 특히 국내 전체 채소작물 재배면적의 23%를 차지하는 고추에 발병하여 전국적으로 농가에 큰 피해를 주고 있으며, 그 피해는 날로 증가하고 있다.
한편, 한국공개특허 제2003-0089846호에는 '고추역병균 파이토프소라 캡사이시에 대해 항균활성을 가지는 신규한 바실러스 써큐란스 KLP1 균주와 이를 함유하는 미생물제제'가 개시되어 있고, 한국공개특허 제2015-0140510호에는 '담배나방 방제용 dsRNA, 이를 포함하는 살충제 조성물 및 방제방법'이 개시되어 있으나, 본 발명의 '고추역병균의 증식을 억제하는 NLP2 표적 dsRNA 및 이의 용도'에 대해서는 기재된 바가 없다.
본 발명은 상기와 같은 요구에 의해 도출된 것으로서, 본 발명자들은 고추역병균(Phytophthora capsici)의 NLP2 (Necrosis-inducing protein 2) 유전자를 표적으로 하는 dsRNA를 제작하고 이를 모델 식물에 전처리하고 고추역병균의 증식 여부를 확인한 결과, NLP2 유전자의 5' 부위를 표적으로 하는 dsRNA 처리에 의해 고추역병균의 증식이 현저히 억제되는 것을 확인함으로써, 본 발명을 완성하였다.
상기 과제를 해결하기 위해, 본 발명은 서열번호 1의 염기서열로 표시되며, 고추역병균(Phytophthora capsici)의 NLP2 (Necrosis-inducing protein 2) 유전자의 발현을 억제하는 dsRNA (double-stranded RNA)를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 dsRNA를 유효성분으로 포함하는 고추역병균 방제용 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 조성물을 식물, 식물의 종자 또는 재배지에 처리하는 단계를 포함하는 고추역병균의 방제 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 dsRNA를 포함하는 재조합 벡터를 제공한다.
본 발명은 NLP2 유전자를 표적으로 하는 dsRNA를 유효성분으로 하는 진균 억제제로서, 외래 합성 dsRNA가 곰팡이 방제를 위한 제제로 응용될 수 있는 가능성을 제시하였다. 또한, 본 발명의 dsRNA는 화학작물보호제 대체재로서 dsRNA를 활용하기 위한 기반 연구 및 혁신적인 Mode Of Action(MOA) 작물보호제 개발 등을 위한 농생명공학에 적용될 수 있을 것이다.
도 1은 고추역병균의 NLP2 유전자를 표적으로 하는 dsRNA의 표적 위치(A) 및 dsRNA의 처리에 따른 고추역병균의 감염정도(B) 및 NLP2 유전자의 5' 부위를 표적으로 하는 dsRNA의 서열(C)을 보여준다.
도 2는 담배(Nicotiana benthamiana) 식물에서 NLP2 유전자의 5' 부위 표적 dsRNA 처리에 따른 고추역병균의 증식 억제 효과를 확인한 것으로, (A)는 NLP2 유전자의 mRNA를 qPCR로 확인한 결과이고, (B)는 고추역병균의 감염정도를 UV 광에서 Fobi를 이용하여 클로로필(chlorophyll) 차이를 확인한 모습이며, (C)는 dsRNA 처리 모식도이다. ***: p < 0.001.
도 2는 담배(Nicotiana benthamiana) 식물에서 NLP2 유전자의 5' 부위 표적 dsRNA 처리에 따른 고추역병균의 증식 억제 효과를 확인한 것으로, (A)는 NLP2 유전자의 mRNA를 qPCR로 확인한 결과이고, (B)는 고추역병균의 감염정도를 UV 광에서 Fobi를 이용하여 클로로필(chlorophyll) 차이를 확인한 모습이며, (C)는 dsRNA 처리 모식도이다. ***: p < 0.001.
본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1의 염기서열로 표시되며, 고추역병균(Phytophthora capsici)의 NLP2 (Necrosis-inducing protein 2, 또는 NLP effector protein 2, Nep1-like protein 2) 유전자의 발현을 억제하는 dsRNA (double-stranded RNA)를 제공한다.
본 발명에 따른 dsRNA는 세포내에서 RNA 간섭(RNAi)에 의해 작용한다. RNA 간섭은 식물을 포함한 진핵생물에서 폭넓게 존재하는 전사 후 유전자 발현 조절 기작이다. 세포에 도입된 dsRNA는 RNAse Ⅲ 효소인 Dicer에 의해 처리되어, siRNA (small interference RNA)의 형태로 Argonaute 단백질과 리보뉴클레오복합체를 형성하여 표적 부위에 상보적 결합을 통해 표적 유전자를 절단하거나, 단백질 합성을 억제한다. 이로 인해 식물 세포에 도입된 바이러스 유전자를 표적으로 한 dsRNA에 유도된 RNA 간섭은 식물에 감염된 바이러스의 표적 유전자 발현 억제를 통하여 바이러스의 증식을 직접적으로 감소시키는 방식으로 작용한다.
본 발명에 따른 상기 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 dsRNA는 NLP2 유전자(서열번호 2)의 5' 부위 서열을 표적으로 하며, NLP2 유전자의 3' 부위를 표적으로 하는 dsRNA(도 1A 참고)에 비해 고추역병균의 증식억제 효과가 우수한 것이 특징이다.
본 발명에 사용된 dsRNA 또는 "이중가닥 RNA" 는 센스 및 안티센스가 결합된 것으로, 실질적으로 상보적인 2개의 핵산 가닥을 포함하는 이중체 구조를 갖는 리보핵산 분자의 복합체를 지칭한다. 이러한 이중가닥 RNA는 세포내로 도입시 단일가닥으로 분리되어, siRNA의 형태로 표적 전사 RNA에 결합하여, 이로부터 단백질이 합성되는 것을 방해한다. 따라서, 이중가닥을 형성할 수 있을 정도의 상보성을 가지는 한, 센스 및 안티센스 두 가닥이 완전히 상보적일 필요는 없고, 이런 의미에서 한 가닥의 서열만으로도, 다른 가닥의 서열은 적절하게 결정될 수 있을 것이다. 용어 "상보적"은, 두 가닥의 올리고뉴클레오티드 또는 폴리뉴클레오티드가 특정 조건 하에 혼성화하여 이중체(duplex) 구조를 형성할 수 있는 능력을 지칭한다. 본 발명에서는 dsRNA가 세포에 도입되어 본 발명에 따른 목적을 달성하는 한 다양한 상보성이 사용될 수 있다. 예를 들면, 두 가닥이 완전히 상보적이거나, 또는 실질적으로 상보적일 수 있다. 일 구현 예에선, 최대 4개, 3개 또는 2개 또는 1개의 미스매치된 염기 쌍을 포함할 수 있다.
본 발명의 상기 서열번호 1의 염기서열은 dsRNA에서 센스(sense) 가닥의 염기서열을 의미한다.
또한, 본 발명에 따른 dsRNA는 다수의 뉴클레오티드에서의 실질적인 변형 및 당해 분야에 공지된 모든 다양한 유형의 화학적 변형을 포함할 수 있다. 또한, 상기 dsRNA는 naked 형태의 dsRNA일 수 있고, dsRNA의 안정성 또는 표적 세포 내로의 흡수를 증진시킬 수 있는 다양한 물질 등으로 변형된 형태일 수 있다.
본 발명은 또한, 상기 dsRNA를 유효성분으로 포함하는 고추역병균 방제용 조성물을 제공한다.
본 발명에 따른 고추역병균 방제용 조성물에 있어서, 상기 dsRNA는 서열번호 1의 염기서열로 표시되며, 고추역병균(Phytophthora capsici)의 NLP2 (Necrosis-inducing protein 2) 유전자의 발현을 억제하는 dsRNA이다.
본 발명에 따른 고추역병균 방제용 조성물은 예를 들어, 직접 분사가능한 용액, 분말 및 현탁액의 형태 또는 고농축 수성, 유성 또는 다른 현탁액, 분산액, 에멀젼, 유성 분산액, 페이스트, 분진, 흩뿌림 물질 또는 과립제로 제조할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 고추역병균 방제용 조성물은 다양한 형태로 제제화할 수 있다. 상기 제제는 예를 들어 용매 및/또는 담체를 첨가함으로써 제조될 수 있다. 종종, 비활성 첨가제 및 표면-활성 물질, 예를 들어 유화제 또는 분산제를 제제에 혼합한다. 적합한 표면-활성 물질은 방향족 술폰산(예를 들어 리그노술폰산, 페놀-술폰산, 나프탈렌- 및 디부틸나프탈렌술폰산), 지방산, 알킬- 및 알킬아릴술포네이트, 알킬 라우릴 에테르, 지방 알코올 술페이트의 알칼리 금속, 알카라인 토금속, 암모늄염, 술페이트화 헥사-, 헵타- 및 옥타데칸올, 지방 알코올 글리콜 에테르의 염, 술포네이트 나프탈렌 및 이의 유도체, 포름알데히드의 축합물, 나프탈렌 또는 나프탈렌술폰산, 페놀 및 포름알데히드의 축합물, 폴리옥시에틸렌옥틸 페놀 에테르, 에톡실화 이소옥틸-, 옥틸- 또는 노닐페놀, 알킬페닐 또는 트리부틸페닐 폴리글리콜 에테르, 알킬아릴폴리에테르 알코올, 이소트리데실 알코올, 지방 알코올/에틸렌 옥사이드 축합물, 에톡실화 피마자유, 폴리옥시에틸렌 알킬에테르 또는 폴리옥시프로필렌, 라우릴 알코올 폴리글리콜 에테르 아세테이트, 소르비톨 에스테르, 리그닌-술파이트 폐액 또는 메틸셀룰로오스일 수 있으나, 이에 제한되지는 않는다.
적합한 고형 담체 물질은 원칙적으로, 모두 다공성이고, 농업적으로 허용가능한 담체, 예를 들어 광물토류(예컨대 실리카, 실리카 겔, 실리케이트, 활석, 고령토, 석회암, 석회, 초크, 보울, 황토, 점토류, 백운석, 규조토류, 황산칼슘, 황산 마그네슘, 산화마그네슘, 분쇄 합성물질), 비료(예컨대 황산암모늄, 인산암모늄, 질산암모늄, 우레아), 식물성 제품(예컨대 곡물 가루, 나무 껍질 가루, 목분(wood meal) 및 견과 껍질 가루) 또는 셀룰로오스 분말일 수 있으나, 이에 제한되지는 않는다. 또한, 상기 고형 담체는 1종류 또는 2종류 이상을 혼합하여 사용할 수도 있다.
본 발명은 또한, 상기 조성물을 식물, 식물의 종자 또는 재배지에 처리하는 단계를 포함하는 고추역병균의 방제 방법을 제공한다.
본 발명의 고추역병균의 방제 방법에 있어서, 상기 조성물은 서열번호 1의 염기서열로 표시되며, 고추역병균(Phytophthora capsici)의 NLP2 (Necrosis-inducing protein 2) 유전자의 발현을 억제하는 dsRNA를 유효성분으로 함유하는 조성물이다.
또한, 상기 처리는 고추역병균을 방제하기 위해 dsRNA의 유효량을 포함하는 조성물을 물로 균일하게 희석한 후 동력살포기와 같은 적절한 살포장치를 이용하여 식물에 직접 살포하거나, dsRNA의 유효량을 포함하는 조성물을 식물이나 식물의 종자에 침지하거나 관주, 즉, 분무하여 수행할 수 있다. 침지하는 방법의 경우, 조성물을 식물 주변의 토양에 붓거나 또는 종자를 조성물에 담가둘 수 있다. 본 발명의 방법에 적용될 수 있는 식물은 특별히 제한되지 않는다.
본 발명의 '유효량'은 재배 식물 상에서 곰팡이를 방제하는 데 충분하거나, 처리된 식물에 실질적인 손상을 초래하지 않는 조성물의 양을 의미한다. 이러한 양은 넓은 범위 내에서 달라질 수 있고, 다양한 인자, 처리된 재배 식물의 구체적 종류 및 상태, 서식 장소, 또는 기후 조건 등에 따라 좌우된다.
본 발명은 또한, 상기 서열번호 1의 염기서열로 표시되는 dsRNA를 포함하는 재조합 벡터를 제공한다.
본 발명에 따른 dsRNA는 센스 및 안티센스 방향을 동시에 발현하는 바이너리 형질전환용 벡터(Daisuke Miki와 Ko Shimamoto, Plant Cell Physiol. 45(4):490-495, 2004) 등에 게이트웨이 시스템(Gateway system; Invitrogen, USA) 방법으로 클로닝되어 사용될 수 있다. 이러한 벡터에는 다양한 프로모터, 예를 들면, 과발현을 위한 프로모터, 상시 발현을 위한 프로모터, 스트레스 조건에서 발현되는 유도성 프로모터, 목적 외래 서열을 식물생육 기간 중 일정 시기에 발현되도록 하는 프로모터, 식물조직의 특정 부분에만 발현하게 하는 프로모터 또는 목적 외래 서열의 발현을 높이기 위해 인핸서가 결합된 하이브리드 프로모터를 포함할 수 있다.
이하, 본 발명을 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.
재료 및 방법
1. dsRNA의 합성 및 병원균 준비
Thermofisher의 RNAi Megascript RNAi kit를 사용하여 dsRNA를 합성하였다. 각 dsRNA의 길이가 400bp가 넘지 않도록 하며 NLP2 (Necrosis-inducing protein 2) 유전자 내 모든 서열이 포함되도록 각 dsRNA 간에 일정 길이가 중첩(overlap) 되도록 디자인하였다(도 1A). 또한, 고추역병균(Phytophthora capsici) KACC 40476 균주는 서울대학교 농업생명과학대학 원예작물유전체학 연구실으로부터 제공받았으며, 암(dark) 조건의 16℃ 챔버에서 배양하였고, 실험 당일 균주 배지에 6 ml의 멸균한 삼차증류수를 부어 스크랩퍼로 균사를 긁은 뒤, 4℃ 냉장고에서 1시간 동안 배양하여 균주 접종을 준비하였다.
2. 모델식물에의 dsRNA 주입
이전의 연구에서 dsRNA를 전처리할 경우, 병원균의 증식 억제 효과가 가장 높다는 결과를 얻었다. 이에 본 발명에서는, 고추역병균의 처리 2일 전에 잎 1개당 500 ng/㎕ 농도의 dsRNA를 인필트레이션(infiltration) 기법으로 3주령의 담배(Nicotiana benthamiana) 식물체의 3개 잎에 주맥을 기준으로 오른편에 10 ㎍를 주입하였다. 주맥 기준 왼편에는 음성 대조군으로 루시퍼라제(luciferase) dsRNA(서열번호 3)를 동일한 양으로 주입하였다(도 2C).
2일 후 고추역병균을 dsRNA를 처리한 담배 잎에 세포계수기(hemocytometer)를 이용해 1mm2 안에 5개의 유주자(zoospore)가 있는 상태의 농도로 처리하였다. 역병균 처리 후 132 시간째에 FOBI 장비(Neoscience, Korea)를 이용하여 잎에 UV를 조사하여 살아있는 잎 조직에서 클로로필 정도를 확인하였다. 또한, 동일 담배 잎의 각 부위를 회수하여 총 RNA를 추출하고, 이를 사용하여 cDNA를 합성한 후, qPCR을 수행하였다.
3. qPCR (quantitative Polymerase chain reaction)
dsRNA에 의한 고추역병균 증식 억제 효과를 확인하기 위해, 병원균 감염 132 시간째에 획득한 잎 샘플로 총 RNA를 추출한 후 DNase 처리하고, 역전사 반응을 통해 cDNA로 합성한 뒤 qPCR을 진행하여 NLP2 mRNA의 상대적인 발현 수준을 측정하였다.
유전자 | 염기서열(5'→3') | |
NLP2 | 정방향 | CTATCGATCACGACCAAGTG (서열번호 4) |
역방향 | GTTCACAGCAGGGTAAGGAT (서열번호 5) | |
L23 (internal contorl) |
정방향 | AAGGATGCCGTGAAGAAGATGT (서열번호 6) |
역방향 | GCATCGTAGTCAGGAGTCAACC (서열번호 7) |
단계 | 온도 | 시간 | 반복 (cycle) |
Pre-incubation | 95℃ | 5분 | 1 |
Amplification | 95℃ | 10초 | 45 |
60℃ | 10초 | ||
72℃ | 10초 | ||
Melting curve | 95℃ | 5초 | 1 |
65℃ | 1분 | ||
cooling | 40℃ | 30초 | 1 |
실시예 1. 고추역병균의
NLP2
유전자를 표적으로 하는 dsRNA의 병균 증식 억제능 분석
본 발명자는 고추역병균(Phytophthora infestans)의 NLP2 (Necrosis-inducing protein 2) 유전자의 5' 또는 3'을 표적으로 하는 400 bp 크기의 dsRNA를 제작하였다(도 1A). 상기 dsRNA의 고추역병균 증식 억제능을 분석하기 위해, dsRNA를 전처리한 후 고추역병균을 담배 식물체의 잎에 처리하고 39시간 후에 UV 광에서 Fobi를 이용하여 클로로필(chlorophyll) 수준을 분석한 결과, NLP2 유전자의 3'을 표적으로 하는 dsRNA 처리군보다 5'을 표적으로 하는 dsRNA 처리군에서 보다 높은 클로로필 수준이 확인되어, 고추역병균에 대한 증식 억제 효과가 우수한 것을 확인할 수 있었다(도 1B). 이에, 본 발명자는 NLP2 유전자의 5'을 표적으로 하는 dsRNA를 이용하여 고추역병균 증식 억제능을 재분석하였다. 전술한 것과 같이, dsRNA를 전처리한 후 고추역병균을 담배 식물체의 잎에 처리하고 39시간 후에 클로로필 수준 및 역병균의 mRNA 발현량을 분석하였다.
그 결과, 루시퍼라제 dsRNA를 처리한 조건과 비교하여 NLP2의 5' 표적 dsRNA를 전처리하고 고추역병균을 처리한 실험군에서는 NLP2 mRNA의 상대적 발현 수준이 현저히 감소되어, 고추역병균의 증식이 억제되고 있음을 알 수 있었다(도 2A). 또한, NLP2 표적 dsRNA를 처리한 잎의 부위에서 루시퍼라제 dsRNA를 처리한 잎 부위에 비해 클로로필 수준에 큰 차이가 있음을 확인할 수 있었다(도 2B). 상기 결과는 본 발명에 따른 고추역병균의 NLP2 표적 dsRNA가 고추역병 방제에 효과적으로 사용될 수 있음을 시사하였다.
<110> Seoul National University R&DB Foundation
<120> dsRNA targeting NLP2 for inhibiting Phytophthora capsici
proliferation and uses thereof
<130> PN21317
<160> 7
<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1
<211> 400
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> dsRNA to NLP2
<400> 1
augaaauucg ucguuuuccu cugugcaauu gcugcggugg uagcuaccau ucaaggccaa 60
gagcagcagc agcaacaaca acugcccgca acuaucgauc acgaccaagu gaagcccuuc 120
ccacagccuc agccggucac cauuuccgag agggcugcga ugaaguucaa accccaacug 180
cacgucguug acggguguca uccuuacccu gcugugaacg acgcugguga aacgggcggg 240
ggcuugaaaa cuaccggguc cccuacagcg gggugcaagg gcuccgggug gggcucucag 300
guguauggcc gcucgacaug gcaccgagau gucugggcca ucauguacuc uugguauuuc 360
ccuaaagacu cgccaucgac uggucuaggc caucgacacg 400
<210> 2
<211> 741
<212> DNA
<213> Phytophthora capsici
<400> 2
atgaaattcg tcgttttcct ctgtgcaatt gctgcggtgg tagctaccat tcaaggccaa 60
gagcagcagc agcaacaaca actgcccgca actatcgatc acgaccaagt gaagcccttc 120
ccacagcctc agccggtcac catttccgag agggctgcga tgaagttcaa accccaactg 180
cacgtcgttg acgggtgtca tccttaccct gctgtgaacg acgctggtga aacgggcggg 240
ggcttgaaaa ctaccgggtc ccctacagcg gggtgcaagg gctccgggtg gggctctcag 300
gtgtatggcc gctcgacatg gcaccgagat gtctgggcca tcatgtactc ttggtatttc 360
cctaaagact cgccatcgac tggtctaggc catcgacacg actgggagca cgtaattgta 420
tggatcagca acccggacgt ccccaatccg acaattttgg cggtgacacc ctcggcacac 480
agcggctact cgaaatacgc acctcccagt gccgatacag tggacggtac gagcatcaag 540
gtcagatatg agagcaccta ccctatgaac cacgctacag acgtgaccac agaagccggc 600
gcgttccagg acttgattat gtgggaccag atgacggatg cagctcgaaa tgcgctcaac 660
acggtgagct ttggcgacgc gaacgtgccg atgaacgacg gtaattttgt ccccaaactg 720
gacaaggcct ggcccttcta g 741
<210> 3
<211> 500
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> dsRNA to luciferase
<400> 3
caucaucccu gaucugaucg gaauggguaa guccggcaag agcgggaaug gcucauaucg 60
ccuccuggau cacuacaagu accucaccgc uugguucgag cugcugaacc uuccaaagaa 120
aaucaucuuu gugggccacg acuggggggc uugucuggcc uuucacuacu ccuacgagca 180
ccaagacaag aucaaggcca ucguccaugc ugagaguguc guggacguga ucgaguccug 240
ggacgagugg ccugacaucg aggaggauau cgcccugauc aagagcgaag agggcgagaa 300
aauggugcuu gagaauaacu ucuucgucga gaccaugcuc ccaagcaaga ucaugcggaa 360
acuggagccu gaggaguucg cugccuaccu ggagccauuc aaggagaagg gcgagguuag 420
acggccuacc cucuccuggc cucgcgagau cccucucguu aagggaggca agcccgacgu 480
cguccagauu guccgcaacu 500
<210> 4
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 4
ctatcgatca cgaccaagtg 20
<210> 5
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 5
gttcacagca gggtaaggat 20
<210> 6
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 6
aaggatgccg tgaagaagat gt 22
<210> 7
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 7
gcatcgtagt caggagtcaa cc 22
Claims (5)
- 서열번호 1의 염기서열로 표시되며, 고추역병균(Phytophthora capsici)의 NLP2 (Necrosis-inducing protein 2) 유전자의 발현을 억제하는 dsRNA (double-stranded RNA).
- 제1항의 dsRNA를 유효성분으로 포함하는 고추역병균 방제용 조성물.
- 제2항의 조성물을 식물, 식물의 종자 또는 재배지에 처리하는 단계를 포함하는 고추역병균의 방제 방법.
- 제3항에 있어서, 상기 dsRNA의 처리는 침지 또는 분사의 방법인 것을 특징으로 하는 방제 방법.
- 제1항의 dsRNA를 포함하는 재조합 벡터.
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Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20030089846A (ko) * | 2002-05-20 | 2003-11-28 | 삼성에버랜드 주식회사 | 고추역병균 파이토프소라 캡사이시에 대해 항균활성을가지는 신규한 바실러스 써큐란스 klp1 균주와 이를함유하는 미생물제제 |
KR20150140510A (ko) * | 2014-06-05 | 2015-12-16 | 안동대학교 산학협력단 | 담배나방 방제용 dsRNA, 이를 포함하는 살충제 조성물 및 방제방법 |
KR20190051410A (ko) * | 2017-11-07 | 2019-05-15 | 서울대학교산학협력단 | 애멸구의 핵수용체 E75 유전자에 특이적인 dsRNA를 이용한 애멸구 매개 바이러스 방제용 조성물 및 방법 |
-
2021
- 2021-09-29 KR KR1020210128723A patent/KR102586681B1/ko active IP Right Grant
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20030089846A (ko) * | 2002-05-20 | 2003-11-28 | 삼성에버랜드 주식회사 | 고추역병균 파이토프소라 캡사이시에 대해 항균활성을가지는 신규한 바실러스 써큐란스 klp1 균주와 이를함유하는 미생물제제 |
KR20150140510A (ko) * | 2014-06-05 | 2015-12-16 | 안동대학교 산학협력단 | 담배나방 방제용 dsRNA, 이를 포함하는 살충제 조성물 및 방제방법 |
KR20190051410A (ko) * | 2017-11-07 | 2019-05-15 | 서울대학교산학협력단 | 애멸구의 핵수용체 E75 유전자에 특이적인 dsRNA를 이용한 애멸구 매개 바이러스 방제용 조성물 및 방법 |
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