KR20210100655A - 항-클라우딘 항체 및 이의 용도 - Google Patents

항-클라우딘 항체 및 이의 용도 Download PDF

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Abstract

항-클라우딘 18.2 항체 및 이를 포함하는 약학적 조성물이 본원에 개시된다. 일부 구현예에서, 암을 가진 대상체를 항-클라우딘 18.2 항체로 치료하는 방법 그리고 항-클라우딘 18.2 항체로 세포 사멸 효과를 유도하는 방법이 본원에 또한 기재된다.

Description

항-클라우딘 항체 및 이의 용도
교차-참조
본원은, 2018년 12월 7일 출원된, 특허 협력 조약 출원 번호 PCT/CN2018/119797에 우선권을 주장하고, 상기 출원은 모든 목적을 위하여 그 전체가 참조로 본원에 편입된다.
개시내용의 배경
위식도암 및 췌장암은 충족되지 않은 의료 요구가 가장 높은 악성종양 중 하나이다. 위암 (GC)은 암-관련된 사망의 세번째 가장 흔한 원인으로서 자리잡고 위암 환자의 가장 큰 분율이 동아시아, 특히 한국, 몽골, 일본, 및 중국에서 분포된다. 췌장암은 선진국에서 임의의 암의 가장 높은 사망률을 갖고 양쪽 미국 및 중국에서 증가하는 것으로 예상된다.
개시내용의 개요
특정 구현예에서, 항-클라우딘 18.2 항체 그리고 이를 포함하는 약학적 조성물이 본원에 개시된다. 특정 구현예에서, 항-클라우딘 18.2 항체로 암을 갖는 대상체를 치료하는 방법 그리고 항-클라우딘 18.2 항체로 세포 사멸 효과를 유도하는 방법이 본원에 또한 기재된다.
특정 구현예에서, 참조 항체 175D10의 EC50 미만인 절반 최대 유효 농도 (EC50)를 포함하는 항-클라우딘 18.2 (항-CLDN18.2) 항체가 본원에 개시되고, 여기서 상기 참조 항체 175D10은 서열번호: 98에서 제시된 중쇄 (HC) 서열 그리고 서열번호: 99에서 제시된 경쇄 (LC) 서열을 포함한다.
특정 구현예에서, 번역후 변형 부위에서 적어도 1개의 돌연변이를 포함하는 항-클라우딘 18.2 (항-CLDN18.2) 항체가 본원에 개시된다.
특정 구현예에서, 향상된 항체-의존적 세포-매개된 세포독성 (ADCC)을 수여하는 Fc 영역에서 적어도 1개의 돌연변이를 포함하는 항-클라우딘 18.2 (항-CLDN18.2) 항체가 본원에 개시되고, 여기서 상기 향상된 ADCC는 서열번호: 98에서 제시된 중쇄 (HC) 서열 그리고 서열번호: 99에서 제시된 경쇄 (LC) 서열을 포함하는 참조 항체 175D10과 비교된다. 일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체의 EC50은 약 5 nM 이하이다. 일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체의 EC50은 약 5 nM, 약 4 nM, 약 3 nM, 약 2 nM, 약 1 nM, 약 0.5 nM, 또는 더 낮다.
특정 구현예에서, 참조 항체 175D10의 결합 친화성에 비해 CLDN18.2에 더 높은 결합 친화성을 포함하는 항-클라우딘 18.2 (항-CLDN18.2) 항체가 본원에 개시되고, 여기서 상기 참조 항체 175D10은 서열번호: 98에서 제시된 중쇄 (HC) 서열 그리고 서열번호: 99에서 제시된 경쇄 (LC) 서열을 포함한다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 가변 중쇄 (VH) 영역 및 가변 경쇄 (VL) 영역을 포함하고, 여기서 상기 VH 영역은 CDR1 서열 GFSLTSYX1VX2; 여기서 X1은 N 또는 G로부터 선택되고; X2는 Y 또는 H로부터 선택됨; CDR2 서열 VIWX3X4GX5TX6YX7X8X9LX10S; 여기서 X3은 N 또는 P로부터 선택되고; X4는 T 또는 G로부터 선택되고; X5는 A 또는 N으로부터 선택되고; X6은 R 또는 N으로부터 선택되고; X7은 N, Q, 또는 E로부터 선택되고; X8은 S 또는 I로부터 선택되고; X9는 T 또는 A로부터 선택되고; X10은 K 또는 M으로부터 선택되고; CDR3 서열 DX11X12X13X14X15X16X17X18X19X20; 여기서 X11은 S 또는 R로부터 선택되고; X12는 A 또는 R로부터 선택되고; X13은 M 또는 L로부터 선택되고; X14는 P 또는 A로부터 선택되고; X15는 A 또는 M으로부터 선택되고; X16은 I 또는 D로부터 선택되고; X17은 P 또는 Y로부터 선택되고; X18은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 F이고; X19는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 A이고; X20은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 Y임,을 포함한다. 일부 구현예에서, VH 영역은 CDR1 서열 X21X22X23X24X25SFGMH; 여기서 X21은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 G이고; X22는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 F이고; X23은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 T이고; X24는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 F이고; X25는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 S임; CDR2 서열 YISSGSX26X27IYYX28DX29X30KG; 여기서 X26은 S 또는 G로부터 선택되고; X27은 P 또는 S로부터 선택되고; X28은 V 또는 A로부터 선택되고; X29는 K 또는 T로부터 선택되고; X30은 L 또는 V로부터 선택됨; 및 CDR3 서열 AX31X32X33X34X35X36X37X38X39X40X41; 여기서 X31은 G 또는 T로부터 선택되고; X32는 Y 또는 S로부터 선택되고; X33은 A 또는 Y로부터 선택되고; X34는 V 또는 Y로부터 선택되고; X35는 R 또는 Y로부터 선택되고; X36은 N 또는 G로부터 선택되고; X37은 A 또는 N으로부터 선택되고; X38은 L 또는 A로부터 선택되고; X39는 D 또는 L로부터 선택되고; X40은 Y 또는 E로부터 선택되고; X41은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 Y임,을 포함한다. 일부 구현예에서, VH 영역은 서열번호: 1로 이루어지는 CDR1 서열, CDR2 서열 VIWNTGATRYX7SX9LKS, 및 서열번호: 3으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하고, 여기서 X7은 N, Q, 또는 E로부터 선택되고; X9는 T 또는 A로부터 선택된다. 일부 구현예에서, VH 영역은 서열번호: 13으로 이루어지는 CDR1 서열, CDR2 서열 VIWPGGNTNYX7X8ALMS, 및 서열번호: 15로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하고, 여기서 X7은 N 또는 E로부터 선택되고; X8은 S 또는 I로부터 선택된다. 일부 구현예에서, VH 영역은 서열번호: 1, 7, 10, 또는 13으로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 2, 4, 5, 6, 8, 11, 14, 16, 또는 17로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 3, 9, 12, 또는 15로부터 선택된 CDR3 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, VH 영역은 서열번호: 1로 이루어지는 CDR1 서열; 서열번호: 2, 4, 5, 또는 6으로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 3으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, VH 영역은 서열번호: 13으로 이루어지는 CDR1 서열; 서열번호: 14, 16, 또는 17로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 15로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, VH 영역은 서열번호: 7로 이루어지는 CDR1 서열, 서열번호: 8로 이루어지는 CDR2 서열, 및 서열번호: 9로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, VH 영역은 서열번호: 10으로 이루어지는 CDR1 서열, 서열번호: 11로 이루어지는 CDR2 서열, 및 서열번호: 12로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, VL 영역은 서열번호: 18, 21, 24-28, 31-35, 38, 또는 39로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 19, 22, 29, 또는 36으로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 20, 23, 30, 또는 37로부터 선택된 CDR3 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, VL 영역은 서열번호: 21 또는 24-27로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 22로 이루어지는 CDR2 서열; 및 서열번호: 23으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, VL 영역은 서열번호: 28 또는 31-34로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 29로 이루어지는 CDR2 서열; 및 서열번호: 30으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, VL 영역은 서열번호: 35, 38, 또는 39로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 36으로 이루어지는 CDR2 서열; 및 서열번호: 37로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, VL 영역은 서열번호: 18로 이루어지는 CDR1 서열, 서열번호: 19로 이루어지는 CDR2 서열, 및 서열번호: 20으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 전장 항체이다. 일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 결합 단편이다. 일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 1가 Fab', 2가 Fab2, 단일-쇄 가변 단편 (scFv), 디아바디, 미니바디, 나노바디, 단일-도메인 항체 (sdAb), 또는 카멜리드 항체 또는 이의 결합 단편을 포함한다. 일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편, 단클론성 항체 또는 이의 결합 단편, 또는 이중특이적 항체 또는 이의 결합 단편을 포함한다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 번역후 변형 부위에서 돌연변이를 포함한다. 일부 구현예에서, 돌연변이는 VH 영역의 아미노산 위치 60, 61, 또는 62에 있고, 여기서 상기 아미노산 위치는 서열번호: 40의 위치 60, 61, 또는 62에 상응한다. 일부 구현예에서, 돌연변이는 서열번호: 40의 아미노산 위치 60 또는 62에 있다. 일부 구현예에서, 돌연변이는 서열번호: 57의 아미노산 위치 60 또는 61에 있다. 일부 구현예에서, 아미노산 잔기 N60에서 돌연변이는 글루타민 또는 글루탐산에 대한 것이다. 일부 구현예에서, 아미노산 잔기 S61에서 돌연변이는 이소류신에 대한 것이다. 일부 구현예에서, 아미노산 잔기 T62에서 돌연변이는 알라닌에 대한 것이다. 일부 구현예에서, 돌연변이는 VL 영역의 아미노산 위치 31 또는 32에 있고, 여기서 상기 아미노산 위치는 서열번호: 46, 52, 또는 60의 위치 31 또는 32에 상응한다. 일부 구현예에서, 돌연변이는 서열번호: 46, 52, 또는 60의 아미노산 위치 31 또는 32에 있다. 일부 구현예에서, 아미노산 잔기 N31에서 돌연변이는 아스파르트산 또는 글루탐산에 대한 것이다. 일부 구현예에서, 아미노산 잔기 S32에서 돌연변이는 류신, 발린, 또는 이소류신에 대한 것이다. 일부 구현예에서, 돌연변이는 참조 항체 175D10에 비해 변형된 항-CLDN18.2 항체의 결합 친화성을 향상시킨다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 키메라 항체 또는 이의 결합 단편을 포함한다. 일부 구현예에서, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 40-43에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 44에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다. 일부 구현예에서, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 45에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 ID 번호: 46-50에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다. 일부 구현예에서, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 51에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 52-56에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다. 일부 구현예에서, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 57-59에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 60-62에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다. 일부 구현예에서, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 63에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 CH 영역 그리고 서열번호: 64에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 CL 영역을 포함한다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편을 포함한다. 일부 구현예에서, 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 65-68에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 69-73에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다. 일부 구현예에서, 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 74-76에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 77-80에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다. 일부 구현예에서, 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 81-84에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 85-88에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다. 일부 구현예에서, 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 89-92에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 93-97에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 IgM 프레임워크를 포함한다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 IgG2 프레임워크를 포함한다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 IgG1 프레임워크를 포함한다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 FC 영역에서 하나 이상의 돌연변이를 포함한다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 돌연변이는 아미노산 위치 S239, 아미노산 위치 I332, 아미노산 위치 F243, 아미노산 위치 R292, 아미노산 위치 Y300, 아미노산 위치 V305, 아미노산 위치 P396 또는 이들의 조합에서 돌연변이를 포함한다. 일부 구현예에서, FC 영역에서 하나 이상의 돌연변이는 향상된 ADCC를 참조 항체 175D10에 수여한다. 일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 참조 항체 175D10과 비교하여 보체-의존적 세포독성 (CDC) 활동성을 갖는다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 페이로드에 추가로 컨쥬게이션된다. 일부 구현예에서, 페이로드는 아우리스타틴 또는 이의 유도체 이의이다. 일부 구현예에서, 아우리스타틴 유도체는 모노메틸 아우리스타틴 E (MMAE)이다. 일부 구현예에서, 아우리스타틴 유도체는 모노메틸 아우리스타틴 F (MMAF)이다.
일부 구현예에서, 약물-대-항체 비 (DAR)는 약 2, 약 3, 또는 약 4이다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 참조 항체 175D10과 결합 에피토프를 공유한다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 마우스 및 사이노몰구스 CLDN18.2 단백질에 대한 교차-결합 활동성을 갖는다.
특정 구현예에서, CLDN18.2의 아이소폼에 특이적으로 결합하는 항-클라우딘 18.2 (항-CLDN18.2) 항체가 본원에 개시된다. 일부 구현예에서, CLDN18.2의 아이소폼은 세포주 SNU620에서 발현된 아이소폼이다.
특정 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체를 인코딩하는 핵산 폴리머가 본원에 개시된다.
특정 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체를 인코딩하는 핵산 폴리머를 포함하는 벡터가 본원에 개시된다.
특정 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체; 및 약학적으로 허용가능한 부형제를 포함하는 약학적 조성물이 본원에 개시된다. 일부 구현예에서, 약학적 조성물은 전신적 투여를 위하여 제형화된다. 일부 구현예에서, 약학적 조성물은 비경구 투여를 위하여 제형화된다.
특정 구현예에서, 대상체에게 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체 또는 본원에 기재된 약학적 조성물을 투여하는 단계, 그렇게 함으로써 대상체에서 암을 치료하는 단계를 포함하는, CLDN18.2 단백질의 과발현을 특징으로 하는 암을 갖는 대상체를 치료하는 방법이 본원에 개시된다. 일부 구현예에서, 암은 위장암이다. 일부 구현예에서, 위장암은 위암이다. 일부 구현예에서, 위장암은 췌장암이다. 일부 구현예에서, 위장암은 식도암 또는 담관암종이다. 일부 구현예에서, 암은 폐암 또는 난소암이다. 일부 구현예에서, 상기 방법은 대상체에게 추가의 치료적 제제를 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 일부 구현예에서, 추가의 치료적 제제는 화학치료적 제제, 면역치료적 제제, 표적화된 치료적 제제, 호르몬-기반된 치료적 제제, 줄기-세포 기반된 치료적 제제, 또는 방사선을 포함한다. 일부 구현예에서, 추가의 치료적 제제 및 항-CLDN18.2 항체는 동시에 투여된다. 일부 구현예에서, 추가의 치료적 제제 및 항-CLDN18.2 항체는 순차적으로 투여된다. 일부 구현예에서, 추가의 치료적 제제는 항-CLDN18.2 항체에 앞서 투여된다. 일부 구현예에서, 추가의 치료적 제제는 항-CLDN18.2 항체의 투여 후 투여된다. 일부 구현예에서, 추가의 치료적 제제 및 항-CLDN18.2 항체는 별도 복용량으로서 제형화된다. 일부 구현예에서, 대상체는 인간이다.
특정 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체를 내재화하는데 그리고 그렇게 함으로써 세포 사멸 효과를 유도하는데 충분한 시간 동안 페이로드를 포함하는 항-CLDN18.2 항체와 복수의 세포를 접촉시키는 단계를 포함하는, 세포 사멸 효과를 유도하는 방법이 본원에 개시된다. 일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체를 포함한다. 일부 구현예에서, 페이로드는 메이탄시노이드, 아우리스타틴, 탁소이드, 칼리키아미신, 듀오카르마이신, 아마톡신, 또는 이들의 유도체를 포함한다. 일부 구현예에서, 페이로드는 아우리스타틴 또는 이의 유도체 이의를 포함한다. 일부 구현예에서, 페이로드는 모노메틸 아우리스타틴 E (MMAE)이다. 일부 구현예에서, 페이로드는 모노메틸 아우리스타틴 F (MMAF)이다.일부 구현예에서, 세포는 암 세포이다. 일부 구현예에서, 세포는 위장암 출신이다. 일부 구현예에서, 위장암은 위암이다. 일부 구현예에서, 위장암은 췌장암이다. 일부 구현예에서, 위장암은 식도암 또는 담관암종이다. 일부 구현예에서, 세포는 폐암 또는 난소암 출신이다. 일부 구현예에서, 상기 방법은 시험관내 방법이다. 일부 구현예에서, 상기 방법은 생체내 방법이다. 일부 구현예에서, 대상체는 인간이다.
특정 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체, 본원에 기재된 벡터, 또는 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체를 포함하는 약학적 조성물을 포함하는 키트가 본원에 개시된다.
도면의 간단한 설명
본 개시내용의 다양한 양태는 첨부된 청구항에서 구체적으로 제시된다. 본 개시내용의 특성 및 이점의 더 나은 이해는, 본 개시내용의 원리가 활용되는, 실례적 구현예를 제시하는 다음의 상세한 설명, 그리고 이의 동반하는 도면을 참조로 수득될 것이다:
도 1은 HEK293 세포에서 CLDN18.2의 조작된 발현을 실례한다.
도 2는 인간 CLDN18.2 DNA 서열을 실례한다.
도 3은 CLDN18.2 ECL1 DNA를 실례한다.
도 4a-도 4c는 CHO-CLDN18.2 세포에서 정제된 항-CLDN18.2 마우스-생성된 항체의 용량-의존적 결합 곡선을 실례한다. 항체는 175D10의 것과 비교하여 가장 높은 (도 4a), 더 높은 (도 4b) 및 유사한 또는 약한 (도 4c) 최대 결합을 보여주었다.
도 5a-도 5b는 위암 세포주 SNU601 (도 5a) 및 SNU620 (도 5b)에 결합하는 항체를 실례한다. 넘버링 "1", "2", "3", 및 "4"는 282A12, 175D10, 101C6, 및 아이소타입 대조군, 각각을 나타낸다.
도 6a-도 6d는 CHO-CLDN18.2 세포주에 특이적으로 결합하는 키메라 364D1A7 및 413H9F8을 실례한다. 도6a 및 도6b는 CHO-CLDN18.1 및 CHO-CLDN18.2 세포주에서 키메라 364D1A7의 결합 곡선을 실례한다. 도6c 및 도6d는 CHO-CLDN18.1 및 CHO-CLDN18.2 세포주에서 키메라 413H9F8의 결합 곡선을 실례한다. CHO-CLDN18.1 세포주는 도 6a 및 도 6c에서 도시된 실험에 활용되었고 CHO-CLDN18.2 세포주는 도 6b 및 도 6d에서 도시된 실험에 활용되었다. 키메라 175D10 및 부계 항체는 대조군의 역할을 한다.
도 7a-도 7d는 CHO-CLDN18.2 세포주에 대한 키메라 282A12F3 변이체의 도에스(does)-의존적 결합을 실례한다. 도 7a 및 도 7c는 CHO-CLDN18.1 세포주에서 돌연변이체 PTM 부위 (282A12F3-VH-N60Q 및 282A12F3-VH-N60E)를 가진 키메라 항체 및 키메라 항체 (xi282A12F3)의 결합 곡선을 도시한다. 도 7b 및 도 7d는 CHO-CLDN18.2 세포주에서 돌연변이체 PTM 부위 (282A12F3-VH-N60Q 및 282A12F3-VH-N60E)를 가진 키메라 항체 및 키메라 항체 (xi282A12F3)의 결합 곡선을 도시한다.
도 8a-도 8d는 CHO-CLDN18.2 세포주에 대한 키메라 413H9F8 변이체의 용량-의존적 결합을 실례한다. 도 8a 및 도 8c는 CHO-CLDN18.1 세포주에서 뮤린 항체 (413H9F8), 키메라 항체 (xi413H9F8), 및 돌연변이체 PTM 부위 (413H9F8-VL-N31E, 413H9F8-VL-S32L, 및 413H9F8-VL-S32V)를 가진 키메라 항체의 결합 곡선을 도시한다. 도 8b 및 도 8d는 CHO-CLDN18.2 세포주에서 뮤린 항체 (413H9F8), 키메라 항체 (xi413H9F8), 및 돌연변이체 PTM 부위 (413H9F8-VL-N31E, 413H9F8-VL-S32L, 및 413H9F8-VL-S32V)를 가진 키메라 항체의 결합 곡선을 도시한다.
도 9a-도 9d는 CHO-CLDN18.2 세포주에 대한 키메라 364D1A7 변이체의 용량-의존적 결합을 실례한다. 도 9a 및 도 9c는 CHO-CLDN18.1 세포주에서 뮤린 항체 (364D1A7), 키메라 항체 (xi364D1A7), 및 돌연변이체 PTM 부위 (364D1A7-VL-N31E, 364D1A7-VL-S32L, 및 364D1A7-VL-S32V)를 가진 키메라 항체의 결합 곡선을 도시한다. 도 9b 및 도 9d는 CHO-CLDN18.2 세포주에서 뮤린 항체 (364D1A7), 키메라 항체 (xi364D1A7), 및 돌연변이체 PTM 부위 (364D1A7-VL-N31E, 364D1A7-VL-S32L, 및 364D1A7-VL-S32V)를 가진 키메라 항체의 결합 곡선을 도시한다.
도 10a-도 10b는 CHO-CLDN18.2 세포주에 대한 키메라 357B8F8 변이체의 용량-의존적 결합을 실례한다. 도 10a는 CHO-CLDN18.1 세포주에서 돌연변이체 PTM 부위를 가진 키메라 357B8F8 항체의 결합 곡선을 도시한다. 도 10b는 CHO-CLDN18.2 세포주에서 돌연변이체 PTM 부위를 가진 키메라 357B8F8 항체의 결합 곡선을 도시한다.
도 11a-도 11c는 SNU620 암 세포주에서 예시적 키메라 항체 변이체의 결합을 실례한다. SNU620 위암 세포주에서 돌연변이체 PTM 부위를 가진 키메라 항체의 결합 곡선은 다음과 같다: 도 11a, 413H9F8; 도 11b, 264D1A7; 및 도 11c, 357B8F8.
도 12a-도 12d는 CHO-CLDN18.2 세포주에 대한 키메라 항체의 경쟁적 결합을 실례한다. CHO-CLDN18.2 세포에 관한 xi175D10 (도 12a), 282A12F3 (T62A) (도 12b), 413H9F8-VL-S32V (도 12c), 및 364D1A7-VL-S32V (도 12d)의 결합은 xi175D10, 282A12F3(T62A), 413H9F8-VL-S32V, 364D1A7-VL-S32V, 또는 hIgG1의 예시적 농도로 인큐베이션 후 모니터링되었다.
도 13a-도 13e는 예시적 항체에 의한 CLDN18.2의 상이한 종에서 교차-종 결합 활동성을 실례한다. hz282 (도 13a), xi175D10 (도 13b), 413H9F8-VL-S32V(도 13c), 364D1A7-VL-S32V(도 13d), 및 357B8F8-VH-S61I-VL-S32I (도 13e)의 결합 친화성은 인간 (닫힌 사각형), 마우스 (닫힌 원형), 또는 사이노몰구스 (닫힌 삼각형) CLDN18.2를 발현시키는 CHO 세포에서 결정되었다. hIgG1은 음성 대조군으로서 설정되었다.
도 14a-도 14b는 항-CLDN18.2 항체 및 FcR-TANK (CD16A-15V) 세포에 의해 유도된 CLDN18.2 특이적 ADCC 활동성을 실례한다. 항-CLDN18.2 항체 변이체의 ADCC 활동성은 CHO-CLDN18.1 (도 14a) 및 CHO-CLDN18.2 세포주 (도 14b)에서 결정되었다.
도 15는 NCI-N87 세포주에서 키메라 항체 변이체의 ADCC 활동성을 실례한다. ADCC 활동성은 2:1의 이펙터 (FcR-TANK (CD16A-15V)): 표적 세포 비, 및 16-시간 인큐베이션 시간에서 분석되었다. 중복된 웰로부터의 데이터.
도 16은 NUGC4-18.2 세포주에서 키메라 항체 변이체의 ADCC 활동성을 실례한다. ADCC 활동성은 40:1의 이펙터 (PBMC): 표적 세포 비, 및 5-시간 인큐베이션 시간에서 분석되었다. 중복된 웰을 가진 1개의 공여체로부터의 데이터.
도 17은 CHO-18.2 세포주에서 키메라 항체 변이체의 CDC 활동성을 실례한다.
도 18a-도 18b는 CHO-CLDN18.2에 결합하는 인간화된 282A12F3 (T62A) 항체를 실례한다. 도 18a는 CHO-CLDN18.2 세포에 관한 인간화된 282A12F3 (T62A) 항체의 결합 곡선을 도시한다. 도 18b는 CHO-CLDN18.1 세포에 관한 인간화된 282A12F3 (T62A) 항체의 결합 곡선을 도시한다.
도 19a-도 19b는 SNU620 위암 세포에 결합하는 인간화된 282A12F3 (T62A) 항체를 실례한다. 도 19a는 SNU620 위암 세포에 관한 인간화된 282A12F3 (T62A) 항체 hz282-1~hz282-10의 결합 곡선을 도시한다. 도 19b는 SNU620 위암 세포에 관한 인간화된 282A12F3 (T62A) 항체 hz282-11~hz282-20의 결합 곡선을 도시한다.
도 20a-도 20d는 CHO-CLDN18.2 세포에 대한 인간화된 413H9F8-VL-S32V (전략 1)의 결합 친화성을 실례한다. 인간화된 413H9F8-VL-S32V 항체의 전체 결합 곡선은 다음과 같이 실례된다: 도 20a에서 413H9F8-cp1, 413H9F8-cp2, 및 413H9F8-cp3; 도 20b에서 413H9F8-cp4, 413H9F8-cp5, 및 413H9F8-cp 6; 도 20c에서 413H9F8-cp7, 413H9F8-cp8, 및 413H9F8-cp9; 그리고 도 20d에서 413H9F8-cp10, 413H9F8-cp811, 및 413H9F8-cp12. 본 실험은 CHO-CLDN18.2 세포에서 실시되었다.
도 21a-도 21d는 CHO-CLDN18.2 세포에 관한 전략 2에서 인간화된 413H9F8-VL-S32V의 결합 친화성을 실례한다. 인간화된 413H9F8-VL-S32V 항체의 전체 결합 곡선은 다음과 같이 실례된다: 도 21a에서 413H9F8-H1L1, 413H9F8-H2L1, 413H9F8-H3L1, 및 413H9F8-H4L1; 도 21b에서 413H9F8-H1L2, 413H9F8-H2L2, 413H9F8-H3L2, 및 413H9F8-H4L2; 도 21c에서 413H9F8-H1L3, 413H9F8-H2L3, 413H9F8-H3L3, 및 413H9F8-H4L3; 도 21d에서 413H9F8-H1L4, 413H9F8-H2L4, 413H9F8-H3L4, 및 413H9F8-H4L4. 본 실험은 CHO-CLDN18.2 세포에서 실시되었다.
도 22a-도 22e는 CHO-CLDN18.2 세포에 관한 인간화된 364D1A7-VL-S32V의 결합 친화성을 실례한다. 인간화된 364D1A7-VL-S32V 항체의 전체 결합 곡선은 다음과 같이 실례된다: 도 22a에서 364D1A7-H1L1, 364D1A7-H2L1, 364D1A7-H3L1, 및 364D1A7-H4L1; 도 22b에서 364D1A7-H1L2, 364D1A7-H2L2, 364D1A7-H3L2, 및 364D1A7-H4L2; 도 22c에서 364D1A7-H1L3, 364D1A7-H2L3, 364D1A7-H3L3, 및 364D1A7-H4L3; 도 22d에서 364D1A7-H1L4, 364D1A7-H2L4, 364D1A7-H3L4, 및 364D1A7-H4L4; 도 22e에서 364D1A7-H1L5, 364D1A7-H2L5, 364D1A7-H3L5, 및 364D1A7-H4L5. 본 실험은 CHO-CLDN18.2 세포에서 실시되었다.
도 23a-도 23c는 CHO-CLDN18.2 세포에 관한 인간화된 413H9F8-VL-32V 및 364D1A7-VL-S32V 항체의 결합 친화성을 실례한다. 도 23a 및 도 23b는 CHO-CLDN18.2 세포에 관한 인간화된 413H9F8-VL-S32V 항체의 전체 결합 곡선을 도시한다. 도 23c는 CHO-CLDN18.2 세포에 관한 인간화된 364D1A7-VL-S32V 항체의 전체 결합 곡선을 도시한다.
도 24a-도 24c는 NCI-N87-CLDN18.2 위암 세포주에 대한 cR-TANK (CD16A-15V) 세포로 인간화된 항체 변이체의 ADCC 활동성을 실례한다. 413H9F8 (도 24a 및 도 24b)의 인간화된 항체 및 364D1A7 (도 24c) 항체는 8:1의 이펙터: 표적 세포 비로 NCI-N87-CLDN18.2 세포에 대한 FcR-TANK (CD16A-15V) 세포로 ADCC를 유도하는 그들의 능력에 대하여 분석되었다. 혼합된 세포는 4 시간 동안 배양되었다.
도 25a-도 25c는 NUGC4-CLDN18.2 위암 세포주에 대한 인간 PBMC로 인간화된 항체 변이체의 ADCC 활동성을 실례한다. 413H9F8 (도 25a 및 도 25b)의 인간화된 항체 및 364D1A7 (도 25c) 항체는 40:1의 이펙터: 표적 세포 비로 NUGC4-CLDN18.2 세포에 대한 인간 PBMC로 ADCC를 유도하는 그들의 능력에 대하여 분석되었고, 세포는 5 시간 동안 배양되었다. 데이터는 중복된 웰을 가진 1개의 공여체 출신이다.
도 26a-도 26b는 CHO-18.2 세포주에 관한 인간화된 항체 변이체의 CDC 활동성을 실례한다. 인간화된 413H9F8-VL-S32V (도 26a) 및 364D1A7-VL-S32V (도 26b) 항체의 CDC 활동성은 CHO-CLDN18.2 세포에 대한 인간 혈청으로 결정되었다.
도 27은 연구에서 사용된 Mab-mc-vc-PAB-MMAE를 위한 예시적 설계 구조를 실례한다.
도 28a-도 28b는 HEK293-CLDN18.2 세포의 생존력을 억제하는 CLDN18.2-특이적 ADC를 실례한다. HEK293-CLDN18.2 (도 28a) 및 HK293 (도 28b) 세포의 생존력은 5 일 동안 ADC xi175D10-vcMMAE (DAR=4.02), 282A12F3(T62A)-vcMMAE (DAR=3.94) 및 hIgG1-vcMMAE (DAR=3.91) 및 노출된 항체 xi175D10 282A12F3(T62A) 및 hIgG1로 치료후 결정되었다. 생존력은 CLDN18.2를 발현시키는 HEK293 세포주에서 결정되었다.
도 29a-도 29b는 NCI-N87-CLDN18.2 및 NUGC4-CLDN18.2 세포의 생존력을 억제하는 CLDN18.2-특이적 ADC를 실례한다. NCI-N87-CLDN18.2 (도 29a) 및 NUGC4-CLDN18.2 (도 29b) 세포의 생존력은 5 일 동안 ADC xi175D10-vcMMAE (DAR=4.02), 282A12F3 (T62A)-vcMMAE (DAR=3.94), 및 hIgG1-vcMMAE (DAR=3.91)로 치료후 결정되었다.
도 30a-도 30b는 PANC-1-CLDN18.2 세포의 생존력 억제된 CLDN18.2-특이적 ADC를 실례한다. 도 30a는 PANC-1-CLDN18.2 세포에 관한 282A12F3 (T62A)의 ADCC 효능을 도시한다. 도 30b는 5 일 동안 CLDN18.2-특이적 ADC, xi175D10-vcMMAE (DAR=4.02), 282A12F3 (T62A)-vcMMAE (DAR=3.94), 및 hIgG1-vcMMAE (DAR=3.91)로 치료된 후 PANC-1-CLDN18.2 세포의 생존력을 도시한다.
도 31은 CHO-CLDN18.2 세포주에 대한 FcR-TANK (CD16A-15V) 세포로 413H9F8-cp2 변이체의 ADCC 활동성을 실례한다.
도 32는 NUGC4-CLDN18.2 위암 세포주에 대한 인간 PBMC로 413H9F8-cp2 및 413H9F8-H2L2 변이체의 ADCC 활동성을 실례한다.
도 33a-33b는 NUGC4-CLDN18.2 세포 (도 33a) 및 NCI-N87-CLDN18.2 세포 (도 33b)에 의한 항-CLDN18.2 항체의 내재화를 실례한다.
도 34는 누드 마우스내 인간 위암 GA0006 환자 유래된 이종이식 (PDX) 모델에서 항-CLDN18.2 항체의 효능을 실례한다.
도 35a-35e는 Nu/Nu 마우스내 췌장암의 마우스 이종이식 모델에서 항-CLDN18.2 항체의 효능을 실례한다.
도 36은 인간 위암 GA0006 환자 유래된 이종이식 (PDX) 모델에서 항-CLD1N8.2 항체 및 화학요법의 조합적 효능을 실례한다.
개시내용의 상세한 설명
클라우딘 (CLDN)은 상피-세포 장벽 기능 및 극성을 조절하는 중심 밀착 접합 단백질이고, 그렇게 함으로써 정점과 기저측 원형질 막 도메인 사이 경계를 창출한다. 현재까지, CLDN 계열의 27개 구성원은 상이한 기관-특이적 발현 패턴으로 기재되었다. 클라우딘의 발현 수준이 인간 신생물에서 종종 비정상인 것으로 나타났다. CLDN 계열 구성원 중 하나인 CLDN-18 아이소폼 2 (CLDN18.2)는 선택적 위 혈통 항원이고, 정상 조직에서 이의 발현은 위 점막의 분화된 상피 세포로 국한된다.
CLDN18.2 단백질은 마우스, 랫트, 토끼, 개, 원숭이, 및 인간에서 고도로 보존되고, 4개의 경막 도메인 및 2개의 세포외 도메인을 포함한다. 제 1 세포외 도메인 내에서 51개 아미노산 잔기 중 약 8개는 폐-조직 특이적 CLDN-18 아이소폼 1 (CLDN18.1)과 상이하고, 단클론성 항체 결합을 위한 에피토프의 역할을 할 수 있다.
암 설정 하에서, CLDN18.2는 종양 발달 및 진행에 관여되는 것으로 나타났다. 실제로, CLDN18.2는 인간 위암 세포의 표면 및 이의 전이에 관해 표시되는 것으로 나타났고 (Sahin, 등, "Claudin-18 splice variant 2 is a pan-cancer target suitable for therapeutic antibody development", Clin Cancer Res 2008; 14:7624-34) 이의 이소 활성화는 췌장암에서 관찰되었다 (Woll, 등, "Claudin 18.2 is a target for IMAB362 antibody in pancreatic neoplasms", Int J Cancer 2014; 134: 731-739; 및 Tanaka, 등, "Claudin-18 is an early-stage marker of pancreatic carcinogenesis", J Histochem Cytochem 2011; 59: 942-952). CLDN18.2의 이상 활성화는 담관, 식도, 난소, 및 폐 암에서 또한 관찰되었고, 저조한 전반적 생존 및 림프절 전이와 연관되었다 (Shinozaki, 등, "Claudin-18 in biliary neoplasms. Its significance in the classification of intrahepatic cholangiocarcinoma", Virchows Arch 2011; 459: 73-80; 및 Micke, 등, "Aberrantly activated claudin 6 and 18.2 as potential therapy targets in non-small-cell lung cancer", Int J CNCER 2014; 135: 2206-2214).
특정 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체 및 이의 용도가 본원에 개시된다. 일부 사례에, 항-CLDN18.2 항체는 키메라 항체이다. 다른 사례에, 항-CLDN18.2 항체는 인간화된 항체이다. 추가의 사례에, 치료 방법 그리고 항-CLDN18.2 항체를 활용하는 세포 사멸 효과를 유도하는 방법이 본원에 개시된다.
항-클라우딘 18.2 항체
특정 구현예에서, 항-클라우딘 18.2 (항-CLDN18.2) 항체가 본원에 개시된다. 일부 사례에, 항-CLDN18.2 항체는 CLDN18.2의 세포외 도메인에 결합한다. 일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체는 CLDN18.2의 제 1 세포외 도메인에 결합한다. 일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체는 CLDN18.2의 제 1 세포외 도메인 내에서 8개 잔기 영역, 예를 들면, 인간 CLDN18.2 (UniProtKB Identifier P56856-2)의 잔기 32-41에 결합한다. 일부 구현예에서, 참조 항-CLDN18.2 항체보다 상이한 기능적 속성을 가진, 및/또는 CLDN18.2의 아이소폼 쪽으로 선택성을 가진, 번역후 변형 부위에서 하나 이상의 돌연변이를 포함하는 항-CLDN18.2 항체가 본원에 또한 기재된다.
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 참조 항-CLDN18.2 항체의 EC50 미만인 절반 최대 유효 농도 (EC50)를 포함한다. 일부 사례에, 참조 항체는, 서열번호: 98 및 서열번호: 99, 각각에서 제시된 중쇄 (HC) 서열 및 경쇄 (LC) 서열을 포함하는, 175D10이다. 일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체의 EC50은 약 5 nM 이하이다. 일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체의 EC50은 약 4 nM, 약 3 nM, 약 2 nM, 약 1 nM, 약 0.5 nM, 또는 더 낮다.
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 참조 항-CLDN18.2 항체의 결합 친화성에 비해 CLDN18.2에 대한 더 높은 결합 친화성을 포함한다. 일부 경우에, 참조 항체는, 서열번호: 98 및 서열번호: 99, 각각에서 제시된 중쇄 서열 및 경쇄 서열을 포함하는, 175D10이다.
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 참조 항-CLDN18.2 항체와 비교하여 향상된 항체-의존적 세포-매개된 세포독성 (ADCC)을 갖는다. 일부 경우에, 참조 항체는, 서열번호: 98 및 서열번호: 99, 각각에서 제시된 중쇄 서열 및 경쇄 서열을 포함하는, 175D10이다. 일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체는 향상된 ADCC를 수여하는 Fc 영역에 돌연변이를 추가로 포함한다.
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 번역후 변형 부위에서 적어도 1개의 돌연변이를 포함한다.
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 CLDN18.2의 아이소폼에 특이적으로 결합한다. 일부 경우에, CLDN18.2의 아이소폼은 세포주 SNU620에서 발현된 아이소폼이다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 가변 중쇄 (VH) 영역 및 가변 경쇄 (VL) 영역을 포함하고, 여기서 상기 VH 영역은 CDR1 서열 GFSLTSYX1VX2; CDR2 서열 VIWX3X4GX5TX6YX7X8X9LX10S; 및 CDR3 서열 DX11X12X13X14X15X16X17X18X19X20을 포함하고; 여기서 X1은 N 또는 G로부터 선택되고; X2는 Y 또는 H로부터 선택되고; X3은 N 또는 P로부터 선택되고; X4는 T 또는 G로부터 선택되고; X5는 A 또는 N으로부터 선택되고; X6은 R 또는 N으로부터 선택되고; X7은 N, Q, 또는 E로부터 선택되고; X8은 S 또는 I로부터 선택되고; X9는 T 또는 A로부터 선택되고; X10은 K 또는 M으로부터 선택되고; X11은 S 또는 R로부터 선택되고; X12는 A 또는 R로부터 선택되고; X13은 M 또는 L로부터 선택되고; X14는 P 또는 A로부터 선택되고; X15는 A 또는 M으로부터 선택되고; X16은 I 또는 D로부터 선택되고; X17은 P 또는 Y로부터 선택되고; X18은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 F이고; X19는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 A이고; X20은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 Y이다.
일부 사례에, VH 영역은 CDR1 서열 X21X22X23X24X25SFGMH; CDR2 서열 YISSGSX26X27IYYX28DX29X30KG; 및 CDR3 서열 AX31X32X33X34X35X36X37X38X39X40X41을 포함하고; 여기서 X21은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 G이고; X22는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 F이고; X23은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 T이고; X24는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 F이고; X25는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 S이고; X26은 S 또는 G로부터 선택되고; X27은 P 또는 S로부터 선택되고; X28은 V 또는 A로부터 선택되고; X29는 K 또는 T로부터 선택되고; X30은 L 또는 V로부터 선택되고; X31은 G 또는 T로부터 선택되고; X32는 Y 또는 S로부터 선택되고; X33은 A 또는 Y로부터 선택되고; X34는 V 또는 Y로부터 선택되고; X35는 R 또는 Y로부터 선택되고; X36은 N 또는 G로부터 선택되고; X37은 A 또는 N으로부터 선택되고; X38은 L 또는 A로부터 선택되고; X39는 D 또는 L로부터 선택되고; X40은 Y 또는 E로부터 선택되고; X41은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 Y이다.
일부 구현예에서, VH 영역은 표 1로부터 선택된 CDR1, CDR2, 및 CDR3 서열을 포함한다.
Figure pct00001
일부 사례에, VH 영역은 서열번호: 1로 이루어지는 CDR1 서열, CDR2 서열 VIWNTGATRYX7SX9LKS, 및 서열번호: 3으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하고, 여기서 X7은 N, Q, 또는 E로부터 선택되고; X9는 T 또는 A로부터 선택된다.
일부 사례에, VH 영역은 서열번호: 13으로 이루어지는 CDR1 서열, CDR2 서열 VIWPGGNTNYX7X8ALMS, 및 서열번호: 15로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하고, 여기서 X7은 N 또는 E로부터 선택되고; X8은 S 또는 I로부터 선택된다.
일부 사례에, VH 영역은 서열번호: 1, 7, 10, 또는 13으로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 2, 4, 5, 6, 8, 11, 14, 16, 또는 17로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 3, 9, 12, 또는 15로부터 선택된 CDR3 서열을 포함한다.
일부 사례에, VH 영역은 서열번호: 1로 이루어지는 CDR1 서열; 서열번호: 2, 4, 5, 또는 6으로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 3으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다.
일부 사례에, VH 영역은 서열번호: 13으로 이루어지는 CDR1 서열; 서열번호: 14, 16, 또는 17로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 15로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다.
일부 사례에, VH 영역은 서열번호: 7로 이루어지는 CDR1 서열, 서열번호: 8로 이루어지는 CDR2 서열, 및 서열번호: 9로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다.
일부 사례에, VH 영역은 서열번호: 10으로 이루어지는 CDR1 서열, 서열번호: 11로 이루어지는 CDR2 서열, 및 서열번호: 12로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다.
일부 구현예에서, VL 영역은 표 2로부터 선택된 CDR1, CDR2, 및 CDR3 서열을 포함한다.
Figure pct00002
일부 사례에, VL 영역은 서열번호: 18, 21, 24-28, 31-35, 38, 또는 39로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 19, 22, 29, 또는 36으로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 20, 23, 30, 또는 37로부터 선택된 CDR3 서열을 포함한다.
일부 사례에, VL 영역은 서열번호: 21 또는 24-27로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 22로 이루어지는 CDR2 서열; 및 서열번호: 23으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다.
일부 사례에, VL 영역은 서열번호: 28 또는 31-34로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 29로 이루어지는 CDR2 서열; 및 서열번호: 30으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다.
일부 사례에, VL 영역은 서열번호: 35, 38, 또는 39로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 36으로 이루어지는 CDR2 서열; 및 서열번호: 37로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다.
일부 사례에, VL 영역은 서열번호: 18로 이루어지는 CDR1 서열, 서열번호: 19로 이루어지는 CDR2 서열, 및 서열번호: 20으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함한다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 CDR1 서열 GFSLTSYX1VX2; CDR2 서열 VIWX3X4GX5TX6YX7X8X9LX10S; 및 CDR3 서열 DX11X12X13X14X15X16X17X18X19X20을 포함하는 VH 영역; 여기서 X1은 N 또는 G로부터 선택되고; X2는 Y 또는 H로부터 선택되고; X3은 N 또는 P로부터 선택되고; X4는 T 또는 G로부터 선택되고; X5는 A 또는 N으로부터 선택되고; X6은 R 또는 N으로부터 선택되고; X7은 N, Q, 또는 E로부터 선택되고; X8은 S 또는 I로부터 선택되고; X9는 T 또는 A로부터 선택되고; X10은 K 또는 M으로부터 선택되고; X11은 S 또는 R로부터 선택되고; X12는 A 또는 R로부터 선택되고; X13은 M 또는 L로부터 선택되고; X14는 P 또는 A로부터 선택되고; X15는 A 또는 M으로부터 선택되고; X16은 I 또는 D로부터 선택되고; X17은 P 또는 Y로부터 선택되고; X18은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 F이고; X19는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 A이고; X20은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 Y임; 그리고 서열번호: 18, 35, 38, 또는 39로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 19 또는 36으로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 20 또는 37로부터 선택된 CDR3 서열을 포함하는 VL 영역을 포함한다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 CDR1 서열 X21X22X23X24X25SFGMH; CDR2 서열 YISSGSX26X27IYYX28DX29X30KG; 및 CDR3 서열 AX31X32X33X34X35X36X37X38X39X40X41을 포함하는 VH 영역; 여기서 X21은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 G이고; X22는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 F이고; X23은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 T이고; X24는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 F이고; X25는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 S이고; X26은 S 또는 G로부터 선택되고; X27은 P 또는 S로부터 선택되고; X28은 V 또는 A로부터 선택되고; X29는 K 또는 T로부터 선택되고; X30은 L 또는 V로부터 선택되고; X31은 G 또는 T로부터 선택되고; X32는 Y 또는 S로부터 선택되고; X33은 A 또는 Y로부터 선택되고; X34는 V 또는 Y로부터 선택되고; X35는 R 또는 Y로부터 선택되고; X36은 N 또는 G로부터 선택되고; X37은 A 또는 N으로부터 선택되고; X38은 L 또는 A로부터 선택되고; X39는 D 또는 L로부터 선택되고; X40은 Y 또는 E로부터 선택되고; X41은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 Y임; 그리고 서열번호: 21, 24-28, 또는 31-34로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 22 또는 29로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 23 또는 30으로부터 선택된 CDR3 서열을 포함하는 VL 영역을 포함한다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 서열번호: 1로 이루어지는 CDR1 서열, CDR2 서열 VIWNTGATRYX7SX9LKS, 및 서열번호: 3으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는 VH 영역, 여기서 X7은 N, Q, 또는 E로부터 선택되고; X9는 T 또는 A로부터 선택됨; 그리고 서열번호: 18로 이루어지는 CDR1 서열, 서열번호: 19로 이루어지는 CDR2 서열, 및 서열번호: 20으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는 VL 영역을 포함한다.
일부 사례에, 항-CLDN18.2 항체는 서열번호: 13으로 이루어지는 CDR1 서열, CDR2 서열 VIWPGGNTNYX7X8ALMS, 및 서열번호: 15로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는 VH 영역, 여기서 X7은 N 또는 E로부터 선택되고; X8은 S 또는 I로부터 선택됨; 그리고 서열번호: 35, 38, 또는 39로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 36으로 이루어지는 CDR2 서열; 및 서열번호: 37로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는 VL 영역을 포함한다.
일부 사례에, 항-CLDN18.2 항체는 서열번호: 1, 7, 10, 또는 13으로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 2, 4, 5, 6, 8, 11, 14, 16, 또는 17로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 3, 9, 12, 또는 15로부터 선택된 CDR3 서열을 포함하는 VH 영역; 그리고 서열번호: 18, 21, 24-28, 31-35, 38, 또는 39로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 19, 22, 29, 또는 36으로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 20, 23, 30, 또는 37로부터 선택된 CDR3 서열을 포함하는 VL 영역을 포함한다.
일부 사례에, 항-CLDN18.2 항체는 서열번호: 1로 이루어지는 CDR1 서열; 서열번호: 2, 4, 5, 또는 6으로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 3으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는 VH 영역; 그리고 서열번호: 18로 이루어지는 CDR1 서열, 서열번호: 19로 이루어지는 CDR2 서열, 및 서열번호: 20으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는 VL 영역을 포함한다.
일부 사례에, 항-CLDN18.2 항체는 서열번호: 13으로 이루어지는 CDR1 서열; 서열번호: 14, 16, 또는 17로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 15로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는 VH 영역; 그리고 서열번호: 35, 38, 또는 39로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 36으로 이루어지는 CDR2 서열; 및 서열번호: 37로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는 VL 영역을 포함한다.
일부 사례에, 항-CLDN18.2 항체는 서열번호: 7로 이루어지는 CDR1 서열, 서열번호: 8로 이루어지는 CDR2 서열, 및 서열번호: 9로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는 VH 영역; 그리고 서열번호: 21 또는 24-27로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 22로 이루어지는 CDR2 서열; 및 서열번호: 23으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는 VL 영역을 포함한다.
일부 사례에, 항-CLDN18.2 항체는 서열번호: 10으로 이루어지는 CDR1 서열, 서열번호: 11로 이루어지는 CDR2 서열, 및 서열번호: 12로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는 VH 영역; 그리고 서열번호: 28 또는 31-34로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 29로 이루어지는 CDR2 서열; 및 서열번호: 30으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는 VL 영역을 포함한다.
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 전장 항체 또는 이의 결합 단편이다. 일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체는 키메라 항체 또는 이의 결합 단편이다. 다른 경우에, 항-CLDN18.2 항체는 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편이다. 추가의 경우에, 항-CLDN18.2 항체는 단클론성 항체 또는 이의 결합 단편이다.
일부 사례에, 항-CLDN18.2 항체는 1가 Fab', 2가 Fab2, 단일-쇄 가변 단편 (scFv), 디아바디, 미니바디, 나노바디, 단일-도메인 항체 (sdAb), 또는 카멜리드 항체 또는 이의 결합 단편을 포함한다.
일부 사례에, 항-CLDN18.2 항체는 이중특이적 항체 또는 이의 결합 단편이다. 예시적 이중특이적 항체 형식은, 비제한적으로, 놉-인투-홀 (Knobs-into-Holes) (KiH), 비대칭 재-조작 기술(Asymmetric Re-engineering Technology)-면역글로불린 (ART-Ig), 트리오맙 콰드로마(Triomab quadroma), 이중특이적 단클론성 항체 (BiMAb, BsmAb, BsAb, bsMab, BS-Mab, 또는 Bi-MAb), 아지메트릭(Azymetric), T-세포 수용체에 기반된 항체에 의한 이중특이적 관여(Bispecific Engagement by Antibodies based on the T-cell receptor) (BEAT), 이중특이적 T-세포 관여제(Bispecific T-cell Engager) (BiTE), Biclonics, Fab-scFv-Fc, 투-인-원/이중 작용(Two-in-one/Dual Action) Fab (DAF), FinomAb, scFv-Fc-(Fab)-융합, Dock-aNd-Lock (DNL), Adaptir (이전에 SCORPION), 텐덤 디아바디(Tandem diAbody) (TandAb), 이중-친화성-재표적화(Dual-affinity-ReTargeting) (DART), 나노바디, 트리플바디, 텐덤스 scFv (taFv), 트리플 헤드(triple head), 텐덤 dAb/VHH, 트리플 dAb/VHH, 또는 4가 dAb/VHH를 포함한다. 일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체는 Brinkmann 및 Kontermann, "The making of bispecific antibodies", MABS 9(2): 182-212 (2017)의 도 2에서 실례된 이중특이적 항체 형식을 포함하는 이중특이적 항체 또는 이의 결합 단편이다.
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 번역후 변형 부위에서 돌연변이를 포함한다. 일부 사례에, 돌연변이는 VH 영역 내에 있다. 다른 사례에, 돌연변이는 VL 영역 내에 있다. 추가의 사례에, 2개 이상의 돌연변이는 VH 영역, VL 영역, 또는 이들의 조합 내에 있다.
일부 사례에, 돌연변이는, 아미노산 위치가 서열번호: 40의 위치 60, 61, 또는 62에 상응하는, 항-CLDN18.2 항체의 VH 영역의 아미노산 위치 60, 61, 또는 62에 있다. 일부 사례에, 돌연변이는, 서열번호: 40의 위치 60 또는 61에 상응하는, 아미노산 위치 60 또는 61에 있다. 일부 사례에, 돌연변이는, 서열번호: 40의 위치 60 또는 62에 상응하는, 아미노산 위치 60 또는 62에 있다. 일부 경우에, 돌연변이는, 서열번호: 40의아미노산 위치 60 (N60) 또는 61 (S61)에 있다. 일부 경우에, 돌연변이는 서열번호: 40의 아미노산 위치 60 (N60) 또는 62 (T62)에 있다. 일부 경우에, 돌연변이는 참조 항체 175D10에 비해 항-CLDN18.2 항체의 결합 친화성을 향상시킨다.
일부 사례에, 돌연변이는, 아미노산 위치가 서열번호: 57의 위치 60, 61, 또는 62에 상응하는, 항-CLDN18.2 항체의 VH 영역의 아미노산 위치 60, 61, 또는 62에 있다. 일부 사례에, 돌연변이는, 서열번호: 57의 위치 60 또는 61에 상응하는, 아미노산 위치 60 또는 61에 있다. 일부 사례에, 돌연변이는, 서열번호: 57의 위치 60 또는 62에 상응하는, 아미노산 위치 60 또는 62에 있다. 일부 경우에, 돌연변이는 서열번호: 57의 아미노산 위치 60 (N60) 또는 61 (S61)에 있다. 일부 경우에, 돌연변이는 서열번호: 57의 아미노산 위치 60 (N60) 또는 62 (T62)에 있다. 일부 경우에, 돌연변이는 참조 항체 175D10에 비해 항-CLDN18.2 항체의 결합 친화성을 향상시킨다.
일부 사례에, 아미노산 잔기 N60은 극성 아미노산 또는 산성 아미노산으로 돌연변이된다. 일부 사례에, 아미노산 잔기 N60은 세린, 트레오닌, 아스파라긴, 또는 글루타민으로부터 선택된 극성 아미노산으로 돌연변이된다. 일부 사례에, 아미노산 잔기 N60은 아스파르트산 또는 글루탐산으로부터 선택된 산 아미노산으로 돌연변이된다. 일부 경우에, 아미노산 잔기 N60은 글루타민으로 돌연변이된다. 일부 경우에, 아미노산 잔기 N60은 글루탐산으로 돌연변이된다.
일부 사례에, 아미노산 잔기 S61은, 알라닌, 시스테인, 글리신, 이소류신, 류신, 메티오닌, 페닐알라닌, 프롤린, 트립토판, 티로신, 및 발린으로부터 임의로 선택된, 무-극성 잔기로 돌연변이된다. 일부 경우에, 아미노산 잔기 S61은 이소류신으로 돌연변이된다.
일부 사례에, 아미노산 잔기 T62는, 알라닌, 시스테인, 글리신, 이소류신, 류신, 메티오닌, 페닐알라닌, 프롤린, 트립토판, 티로신, 및 발린으로부터 임의로 선택된, 무-극성 잔기로 돌연변이된다. 일부 경우에, 아미노산 잔기 T62는 알라닌으로 돌연변이된다.
일부 사례에, 돌연변이는 항-CLDN18.2 항체의 VL 영역의 아미노산 위치 31 또는 32에 있으며 상기 아미노산 위치는 서열번호: 46의 위치 31 또는 32에 상응한다. 일부 경우에, 돌연변이는 서열번호: 46의 아미노산 위치 31 (N31) 또는 32 (S32)에 있다. 일부 경우에, 돌연변이는 참조 항체 175D10에 비해 항-CLDN18.2 항체의 결합 친화성을 향상시킨다.
일부 사례에, 돌연변이는 항-CLDN18.2 항체의 VL 영역의 아미노산 위치 31 또는 32에 있으며 상기 아미노산 위치는 서열번호: 52의 위치 31 또는 32에 상응한다. 일부 경우에, 돌연변이는 서열번호: 52의 아미노산 위치 31 (N31) 또는 32 (S32)에 있다. 일부 경우에, 돌연변이는 참조 항체 175D10에 비해 항-CLDN18.2 항체의 결합 친화성을 향상시킨다.
일부 사례에, 돌연변이는 항-CLDN18.2 항체의 VL 영역의 아미노산 위치 31 또는 32에 있으며 상기 아미노산 위치는 서열번호: 60의 위치 31 또는 32에 상응한다. 일부 경우에, 돌연변이는 서열번호: 60의 아미노산 위치 31 (N31) 또는 32 (S32)에 있다. 일부 경우에, 돌연변이는 참조 항체 175D10에 비해 항-CLDN18.2 항체의 결합 친화성을 향상시킨다.
일부 경우에, 아미노산 잔기 N31은 산성 아미노산으로 돌연변이된다. 일부 경우에, 아미노산 잔기 N31은 아스파르트산 또는 글루탐산으로 돌연변이된다. 일부 경우에, 아미노산 잔기 N31은 아스파르트산으로 돌연변이된다. 일부 경우에, 아미노산 잔기 N31은 글루탐산으로 돌연변이된다.
일부 경우에, 아미노산 잔기 S32는, 알라닌, 시스테인, 글리신, 이소류신, 류신, 메티오닌, 페닐알라닌, 프롤린, 트립토판, 티로신, 및 발린으로부터 임의로 선택된, 무-극성 잔기로 돌연변이된다. 일부 경우에, 아미노산 잔기 S32는 류신, 발린, 또는 이소류신으로 돌연변이된다. 일부 경우에, 아미노산 잔기 S32는 류신으로 돌연변이된다. 일부 경우에, 아미노산 잔기 S32는 발린으로 돌연변이된다. 일부 경우에, 아미노산 잔기 S32는 이소류신으로 돌연변이된다.
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는, 아미노산 위치가 서열번호: 57의 위치 60, 61, 또는 62에 상응하는, 항-CLDN18.2 항체의 VH 영역의 아미노산 위치 60, 61, 또는 62에서 돌연변이; 그리고 아미노산 위치가 서열번호: 60의 위치 31 또는 32에 상응하는, 항-CLDN18.2 항체의 VL 영역의 아미노산 위치 31 또는 32에서 돌연변이를 포함한다. 일부 사례에, 돌연변이는 아미노산 위치 60 또는 61에 있으며 상기 아미노산 위치는 서열번호: 57의 위치 60 또는 61에 상응한다. 일부 사례에, 돌연변이는 아미노산 위치 60 또는 62에 있으며 상기 아미노산 위치는 서열번호: 57의 위치 60 또는 62에 상응한다. 일부 경우에, 돌연변이는 서열번호: 57의 아미노산 위치 60 (N60) 또는 61 (S61)에 있다. 일부 경우에, 돌연변이는 서열번호: 57의 아미노산 위치 60 (N60) 또는 62 (T62)에 있다. 일부 경우에, 돌연변이는 서열번호: 60의 아미노산 위치 31 (N31) 또는 32 (S32)에 있다. 일부 경우에, 돌연변이는 참조 항체 175D10에 비해 항-CLDN18.2 항체의 결합 친화성을 향상시킨다.
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 키메라 항체 또는 이의 결합 단편이다. 일부 사례에, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 40-43에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 44에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다. 일부 경우에, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 45에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 ID 번호: 46-50에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다. 일부 경우에, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 51에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 52-56에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다. 일부 경우에, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 57-59에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 60-62에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다.
일부 구현예에서, 키메라 항-CLDN18.2 항체의 VH 영역 및 VL 영역은 표 3에서 실례된다. 밑줄친 영역은 각자의 CDR1, CDR2, 또는 CDR3 서열을 나타낸다.
Figure pct00003
Figure pct00004
일부 경우에, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편은 추가로 서열번호: 63에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 CH 영역 그리고 서열번호: 64에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 CL 영역을 포함한다. 일부 경우에, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편은 표 4에서 제시된 바와 같이 CH 영역 및 CL 영역을 포함한다.
Figure pct00005
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편이다. 일부 사례에, 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 65-68에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 69-73에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다. 일부 사례에, 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 74-76에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 77-80에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다. 일부 사례에, 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 81-84에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 85-88에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다. 일부 사례에, 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편은 서열번호: 89-92에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 93-97에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함한다.
일부 구현예에서, 인간화된 항-CLDN18.2 항체의 VH 영역 및 VL 영역은 표 5에서 실례된다. 밑줄친 영역은 각자의 CDR1, CDR2, 또는 CDR3 서열을 나타낸다.
Figure pct00006
Figure pct00007
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 표 6에서 실례된 바와 같이 VH 영역 및 VL 영역을 포함한다.
Figure pct00008
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 표 7에서 실례된 바와 같이 VH 영역 및 VL 영역을 포함한다.
Figure pct00009
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 표 8에서 실례된 바와 같이 VH 영역 및 VL 영역을 포함한다.
Figure pct00010
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 표 9에서 실례된 바와 같이 VH 영역 및 VL 영역을 포함한다.
Figure pct00011
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 IgM, IgG (예를 들면, IgG1, IgG2, IgG3, 또는 IgG4), IgA, 또는 IgE로부터 선택된 프레임워크 영역을 포함한다. 일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체는 IgM 프레임워크를 포함한다. 일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체는 IgG (예를 들면, IgG1, IgG2, IgG3, 또는 IgG4) 프레임워크를 포함한다. 일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체는 IgG1 프레임워크를 포함한다. 일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체는 IgG2 프레임워크를 포함한다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 프레임워크 영역에서, 예를 들면, CH1 도메인, CH2 도메인, CH3 도메인, 힌지 영역, 또는 이들의 조합에서 하나 이상의 돌연변이를 포함한다. 일부 경우에, 하나 이상의 돌연변이는 Fc 수용체 상호작용을 조정하여, 예를 들면, Fc 이펙터 기능 예컨대 ADCC 및/또는 보체-의존적 세포독성 (CDC)을 증가시킨다. 일부 경우에, 하나 이상의 돌연변이는 항체를 안정화시키고/거나 항체의 반감기를 증가시킨다. 추가의 경우에, 하나 이상의 돌연변이는 당화를 조정한다.
일부 구현예에서, Fc 영역은 Fc 수용체 상호작용을 조정하여, 예를 들면, 이펙터 기능 예컨대 ADCC 및/또는 CDC를 향상시키는 하나 이상의 돌연변이를 포함한다. 그와 같은 사례에, 돌연변이된 이펙터 기능을 조정하는 경우 예시적 잔기는, 잔기 위치가 IgG1에 상응하고 잔기 넘버링이 Kabat 넘버링 (Kabat 등 1991 Sequences of Proteins of Immunological Interest의 EU 지수)에 따르는, S239, F243, R292, Y300, V305, P396, K326, A330, I332, 또는 E333을 포함한다. 일부 사례에, 하나 이상의 돌연변이는 S239D, F243L, R292P, Y300L, V305I, P396L, K326W, A330L, I332E, E333A, E333S, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 경우에, 하나 이상의 돌연변이는 S239D, I332E, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 경우에, 하나 이상의 돌연변이는 F243L, R292P, Y300L, V305I, P396L, I332E, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 경우에, 하나 이상의 돌연변이는 S239D, A330L, I332E, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 경우에, 하나 이상의 돌연변이는 K326W, E333S, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 경우에, 돌연변이는 E333A를 포함한다.
일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체는 참조 항체 175D10과 결합 에피토프를 공유한다.
일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체는 마우스 및 사이노몰구스 CLDN18.2 단백질에 대한 교차-결합 활동성을 갖는다.
항체 생산
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 항원성 조성물로 생산 동물을 주사함으로써 표준 프로토콜에 의해 키워진다. 예를 들면, Harlow 및 Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988 참고. 전체 단백질, 또는 단백질의 더 큰 섹션을 활용하는 경우, 항체는 생산 동물을 단백질 및 적당한 보조제 (예를 들면, 프로인트, 프로인트 완전, 수중유 에멀젼, 등)으로 면역화시킴으로써 키워질 수 있다. 더 작은 펩타이드가 활용되는 경우, 펩타이드를 더 큰 분자로 컨쥬게이션하여 면역자극성 컨쥬게이트를 만드는 것이 유리하다. 그러한 용도에 상업적으로 이용가능한 흔히 활용된 컨쥬게이트 단백질은 소 혈청 알부민 (BSA) 및 키홀 림펫 헤모시아닌 (KLH)을 포함한다. 특정 에피토프에 대한 항체를 키우기 위해, 전체 서열에서 유래된 펩타이드는 활용될 수 있다. 대안적으로, 단백질 표적의 상대적으로 짧은 펩타이드 부분에 대한 항체를 생성하기 위해, 폴리펩타이드가 담체 단백질, 예컨대 난백알부민, BSA 또는 KLH에 접합되면 우수한 면역 반응은 유인될 수 있다.
다클론성 또는 단클론성 항-CLDN18.2 항체는 인간 면역글로불린을 생산하기 위해 유전적으로 변경된 동물로부터 생산될 수 있다. 트렌스제닉 동물은 동물의 천연 항체를 생산하지 않는 "녹-아웃" 동물을 초기에 생산함으로써, 그리고 (예를 들면, 인간 인공 염색체의 사용에 의해) 인간 항체 유전자좌를 가진 동물을 안정하게 형질전환시킴으로써 생산될 수 있다. 그러한 경우에, 인간 항체만이 그 다음 동물에 의해 만들어진다. 그러한 동물을 생성하는, 그리고 그로부터 항체를 유도하는 기법은, 참조로 본원에 전체 편입된, 미국 특허 번호 6,162,963 및 6,150,584에서 기재된다. 그러한 항체는 인간 이종발생성 항체로서 지칭될 수 있다.
대안적으로, 항-CLDN18.2 항체는 인간 가변 영역을 함유하는 파아지 라이브러리로부터 생산될 수 있다. 참조로 본원에 전체 편입된, 미국 특허 번호 6,174,708 참고.
본원에 개시된 임의의 구현예들의 일부 양태에서, 항-CLDN18.2 항체는 하이브리도마에 의해 생산된다.
단클론성 항-CLDN18.2 항체의 경우, 하이브리도마는 자극된 면역 세포, 예컨대 접종된 동물의 비장으로부터 세포를 단리시킴으로써 형성될 수 있다. 이들 세포는 그 다음, 세포 배양물에서 무한대로 복제할 수 있는, 불멸화된 세포, 예컨대 골수종 세포 또는 형질전환된 세포에 융합되고, 그렇게 함으로써 불멸의, 면역글로불린-분비 세포주를 생산할 수 있다. 활용된 불멸의 세포주는 특정 영양물의 활용에 필요한 효소에서 결핍되도록 선택될 수 있다. 많은 그러한 세포주 (예컨대 골수종)는 당업자에 공지되고, 예를 들어 티미딘 키나제 (TK) 또는 하이포크산틴-구아닌 포스포리복실 트랜스퍼라제 (HGPRT)를 포함한다. 이들 결핍은, 예를 들어, 하이포크산틴 아미노프테린티미딘 배지 (HAT)에서 성장하는 그들의 능력에 따라 융합된 세포를 선택하게 한다.
이 밖에도, 항-CLDN18.2 항체는 유전적 조작에 의해 생산될 수 있다.
본원에 개시된 항-CLDN18.2 항체는 인간에서 원치않는 면역 반응, 예를 들어, 아나필락시스성 쇼크를 유도하기 위해 감소된 성향을 가질 수 있고, 항체 치료적 또는 이미지화 제제로 반복된 복용량을 예방할 면역 반응 (예를 들면, 인간-항-뮤린-항체 "HAMA" 반응)을 프라이밍하기 위하여 감소된 성향을 또한 나타낼 수 있다. 그러한 항-CLDN18.2 항체는, 비제한적으로, 인간화된, 키메라, 또는 이종발생성 인간 항-CLDN18.2 항체를 포함한다.
키메라 항-CLDN18.2 항체는, 예를 들어, 주로 인간 도메인을 가진 항체를 생산하기 위해, 인간 불변 경쇄 및 중쇄 영역과, 뮤린 (또는 기타 동물-유래된) 하이브리도마 클론으로부터 수득된, 뮤린 가변 경쇄 및 중쇄 영역 (VK 및 VH)을 조합시킴으로써 재조합 수단에 의해 만들어질 수 있다. 그러한 키메라 항체의 생산은 당업계에서 널리 공지되고, (예를 들면, 참조로 본원에 전체 편입된, 미국 특허 번호 5,624,659에서 기재된 바와 같이) 표준 수단에 의해 달성될 수 있다.
비-인간 (예를 들면 설치류 또는 영장류) 항체에 적용하는 경우 용어 "인간화된"은 비-인간 면역글로불린에서 유래된 최소 서열을 함유하는 하이브리드 면역글로불린, 면역글로불린 쇄 또는 이의 단편이다. 대부분, 인간화된 항체는 수령체의 상보적 결정 영역 (CDR)으로부터의 잔기가 원하는 특이성, 친화성 및 능력을 갖는 비-인간 종 (공여체 항체) 예컨대 마우스, 랫트, 토끼 또는 영장류의 CDR로부터 잔기에 의해 대체되는 인간 면역글로불린 (수령체 항체)이다. 일부 사례에, 인간 면역글로불린의 Fv 프레임워크 영역 (FR) 잔기는 상응하는 비-인간 잔기에 의해 대체된다. 게다가, 인간화된 항체는 수령체 항체에서도 유입된 CDR 또는 프레임워크 서열에서도 발견되지 않는 잔기를 포함할 수 있다. 이들 변형은 실시되어 항체 성능을 추가로 개선하고 최적화하며 인체에 도입된 경우 면역원성을 최소화한다. 일부 예에서, 인간화된 항체는 적어도 1개, 및 전형적으로 2개, 가변 도메인의 실질적으로 모두를 포함할 것이고, 여기에서 CDR 영역의 모두 또는 실질적으로 모두는 비-인간 면역글로불린의 것들에 상응하고 FR 영역의 모두 또는 실질적으로 모두는 인간 면역글로불린 서열의 것들이다. 인간화된 항체는 면역글로불린 불변 영역 (Fc)의 적어도 한 부분, 전형적으로 인간 면역글로불린의 것을 또한 포함할 수 있다.
인간화된 항체는 인간-유사 면역글로불린 도메인을 함유하고 동물-유래된 항체의 상보성-결정 영역만을 편입시키도록 조작될 수 있다. 이것은 단클론성 항원 결합 단위 또는 단클론성 항체의 가변 영역의 초-가변 루프의 서열을 주의해서 검사함으로써, 그리고 이들을 인간 항원 결합 단위 또는 인간 항체 쇄의 구조에 맞춤화함으로써 성취될 수 있다. 예를 들면, 참조로 본원에 전체 편입된, 미국 특허 번호 6,187,287 참고.
비-인간 항체의 인간화 방법은 당업계에서 널리 공지된다. "인간화된" 항체는 서열의 적어도 일부가 더욱 유사한 인간 면역글로불린으로 만들기 위해 이의 초기 형태로부터 변경된 항체이다. 일부 버전에서, 중 (H) 쇄 및 경 (L) 쇄 불변 (C) 영역은 인간 서열로 대체된다. 이것은 가변 (V) 영역 및 이종성 면역글로불린 C 영역을 포함하는 융합 폴리펩타이드일 수 있다. 일부 버전에서, 상보성 결정 영역 (CDR)은 비-인간 항체 서열을 포함하고, 반면에 V 프레임워크 영역은 인간 서열로 또한 전환된다. 예를 들어, EP 0329400 참고. 일부 버전에서, V 영역은 인간 및 마우스 V 영역의 공통 서열을 설계함으로써, 그리고 공통 서열 사이 상이한 CDR 외부 잔기를 전환시킴으로써 인간화된다.
원칙적으로, 인간화된 항체로부터 프레임워크 서열은 CDR 그래프팅을 위한 템플레이트의 역할을 할 수 있지만; 그와 같은 프레임워크로의 직진하는 CDR 대체가 항원에 대한 결합 친화성의 상당한 손실로 이어질 수 있음이 입증되었다. Glaser 등 (1992)　J. Immunol.　149:2606; Tempest 등 (1992)　Biotechnology　9:266; 및 Shalaby 등 (1992)　J. Exp. Med.　17:217. 인간 항체 (HuAb)가 본래의 뮤린 항체 (muAb)에 더욱 상동성일수록, 인간 프레임워크가 친화성을 감소시킬 수 있는 뮤린 CDR에 왜곡을 도입할 가능성이 적다. 항체 서열 데이터베이스에 대한 서열 상동성 조사에 기반하여, 기타 고도로 상동성 HuAb가, 특히 인간 서브그룹 I로부터 카파 L 쇄 또는 인간 서브그룹 III으로부터 H 쇄가 또한 적당할 것이어도, HuAb IC4는 muM4TS.22에 양호한 프레임워크 상동성을 제공한다. Kabat 등 (1987). 다양한 컴퓨터 프로그램 예컨대 ENCAD (Levitt 등 (1983)　J. Mol. Biol.　168:595)는 V 영역을 위한 이상적 서열을 예측하는데 이용가능하다. 본 발명은 그래서 상이한 가변 (V) 영역을 가진 HuAb를 포괄한다. 적당한 V 영역 서열을 결정하는 것 그리고 이들 서열을 최적화하는 것은 당업자의 기술 내이다. 감소된 면역원성을 가진 항체의 수득 방법은 미국 특허 번호 5,270,202 및 EP 699,755에서 또한 기재된다.
인간화된 항체는 부계 및 인간화된 서열의 3차원 모델을 사용하여 부계 서열 및 다양한 개념적 인간화된 산물의 분석의 과정에 의해 제조될 수 있다. 3차원 면역글로불린 모델은 당업자에게 익숙하다. 선택된 후보 면역글로불린 서열의 유망한 3차원 입체배치적 구조를 실례하고 디스플레이하는 컴퓨터 프로그램은 이용가능하다. 이들 디스플레이의 검사는 후보 면역글로불린 서열의 기능화에서 잔기의 유사한 역할의 분석, 즉, 이의 항원을 결합시키기 위한 후보 면역글로불린의 능력에 영향을 미치는 잔기의 분석을 허용한다. 이러한 방식으로, FR 잔기는 원하는 항체 특징, 예컨대 표적 항원(들)에 대하여 증가된 친화성이 달성되도록 공통 및 유입 서열로부터 선택 및 조합될 수 있다.
대상체 항원 결합 단위의 인간화 공정은 다음과 같을 수 있다. 가장 적합한 생식계열 억셉터 중쇄 및 경쇄 가변 영역은 그래프팅을 위한 인간 항체 생식계열의 상동성, 표준 구조 및 물리적 속성을 기반으로 선택된다. mVH/VL 대 그라프팅된 hVH/VL의 컴퓨터 모델링은 수행되고 프로토타입 인간화된 항체 서열은 생성된다. 모델링이 프레임워크 복귀-돌연변이에 대한 필요성을 나타냈다면, 지시된 FW 변화를 가진 제 2 변이체는 생성된다. 선택된 생식계열 프레임워크 및 뮤린 CDR을 인코딩하는 DNA 단편은 합성된다. 합성된 DNA 단편은 IgG 발현 벡터로 서브클로닝되고 서열은 DNA 시퀀싱에 의해 확인된다. 인간화된 항체는 세포, 예컨대 293F에서 발현되고 단백질은, 예를 들어 MDM 식균작용 검정 및 항원 결합 검정에서 시험된다. 인간화된 항원 결합 단위는 항원 결합 친화성에서, 예를 들어, 표적 항원을 발현시키는 세포 상에서 FACS에 의해 부계 항원 결합 단위와 비교된다. 친화성이 부계 항원 결합 단위보다 낮은 2-배 초과이면, 인간화된 변이체의 제 2 라운드는 상기 기재된 바와 같이 생성 및 시험될 수 있다.
상기 언급된 바와 같이, 항-CLDN18.2 항체는 "1가" 또는 "다가" 중 어느 하나일 수 있다. 전자가 항원-결합 단위 당 1개 결합 부위를 갖는 반면에, 후자는 동일한 또는 상이한 종류의 1개 초과 항원에 결합할 수 있는 다중 결합 부위를 함유한다. 결합 부위의 수에 따라 항원 결합 단위는 (2개 항원-결합 부위를 갖는) 2가, (3개 항원-결합 부위를 갖는) 3가, (4개 항원-결합 부위를 갖는) 4가, 및 기타 등등일 수 있다.
다가 항-CLDN18.2 항체는 그들의 결합 특이성에 근거하여 추가로 분류될 수 있다. "단일특이적" 항-CLDN18.2 항체는 동일한 종류의 하나 이상의 항원에 결합할 수 있는 분자이다. "다중특이적" 항-CLDN18.2 항체는 적어도 2개의 상이한 항원에 대하여 결합 특이성을 갖는 분자이다. 그러한 분자가 정상적으로 2개의 뚜렷한 항원 (즉 이중특이적 항-CLDN18.2 항체)을 단지 결합할 반면, 추가의 특이성을 가진 항체 예컨대 삼중특이적 항체는 본원에 사용된 경우 이러한 표현에 의해 포괄된다. 본 개시내용은 추가로 다중특이적 항-CLDN18.2 항체를 제공한다. 다중특이적 항-CLDN18.2 항체는 적어도 2개의 뚜렷한 항원에 결합할 수 있는 다가 분자, 예를 들면, 2개 및 3개의 뚜렷한 항원, 각각애 결합 특이성을 나타내는 이중특이적 및 삼중특이적 분자이다.
폴리뉴클레오타이드 및 벡터
일부 구현예에서, 본 개시내용은 본원에 개시된 임의의 항-CLDN18.2 항체를 인코딩하는 단리된 핵산을 제공한다. 또 다른 구현예에서, 본 개시내용은 본원에 개시된 임의의 항-CLDN18.2 항체를 인코딩하는 핵산 서열을 포함하는 벡터를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 발명은 본원에 개시된 항-CLDN18.2 항체의 경-쇄 CDR 및 중-쇄 CDR을 인코딩하는 단리된 핵산을 제공한다.
대상체 항-CLDN18.2 항체는 재조합 DNA 기술, 합성 화학 기법, 또는 이들의 조합에 의해 제조될 수 있다. 예를 들어, 경쇄 CDR 및 중쇄 CDR을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체의 원하는 구성요소를 인코딩하는 서열은 당업계에 공지된 표준 분자성 기법을 사용하여 발현 벡터로 전형적으로 클로닝 조립된다. 이들 서열은 원하는 단백질 서열을 인코딩하는 다른 벡터로부터, 각자의 템플레이트 핵산을 사용하는 PCR-생성된 단편으로부터, 또는 원하는 서열을 인코딩하는 합성 올리고뉴클레오타이드의 조립에 의해 조립될 수 있다. 발현 시스템은 관심의 항-CLDN18.2 항체를 포함하는 발현하는 벡터로 적당한 세포를 형질감염시킴으로써 창출될 수 있다.
실재하는 항체의 경쇄 또는 중쇄의 다양한 영역에 상응하는 뉴클레오타이드 서열은 비제한적으로 하이브리드화, PCR, 및 DNA 시퀀싱을 포함하는 관행 기법을 사용하여 용이하게 수득될 수 있고 시퀀싱될 수 있다. 단클론성 항체를 생산하는 하이브리도마 세포는 항체 뉴클레오타이드 서열의 바람직한 공급원의 역할을 한다. 단클론성 항체의 배열을 생산하는 엄청난 수의 하이브리도마 세포는 공적 또는 사적 레퍼토리로부터 수득될 수 있다. 가장 큰 기탁 에이전트는 American Type Culture Collection (atcc.org)으로, 널리 특성화된 하이브리도마 세포주의 다양한 수집물을 제공한다. 대안적으로, 항체 뉴클레오타이드는 면역화된 또는 비-면역화된 설치류 또는 인간으로부터, 그리고 장기 예컨대 비장 및 말초 혈액 림프구로부터 수득될 수 있다. 항체 뉴클레오타이드의 추출 및 합성에 적용가능한 특이적 기법은 Orlandi 등(1989)　Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A　86: 3833-3837; Larrick 등 (1989)　Biochem. Biophys. Res. Commun.　160:1250-1255; Sastry 등 (1989)　Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A.　86: 5728-5732; 및 미국 특허 번호 5,969,108에서 기재된다.
항-CLDN18.2 항체를 인코딩하는 폴리뉴클레오타이드는 예를 들어, 상동성 비-인간 서열의 대신에 인간 중쇄 및 경쇄 불변 영역을 코딩 서열로 치환함으로써 또한 변형될 수 있다. 그러한 방식으로, 원래 항-CLDN18.2 항체의 결합 특이성을 보유하는 키메라 항체가 제조된다.
본 개시내용에서 구현된 폴리뉴클레오타이드가 예시된 폴리펩타이드의 기능적 균등물 및 이의 단편에 대하여 코딩하는 것들을 포함하는 것이 또한 이해된다. 기능적으로 균등한 폴리펩타이드는 그렇게 함으로써 인코딩된 폴리펩타이드의 속성을 향상시키거나, 감소시키거나 유의미하게 영향을 미치지 않는 것들을 포함한다. 기능적 균등물은 보존적 아미노산 치환을 갖는 폴리펩타이드, 융합을 포함하는 유사체, 및 돌연변이체일 수 있다.
유전 코드의 퇴행성으로 인해, 항원 결합 단위 코딩 서열뿐만 아니라 본 발명의 폴리뉴클레오타이드 및 벡터의 작제에 적당한 서열의 뉴클레오타이드에서 상당한 변이가 있을 수 있다. 서열 변이체는 변형된 DNA 또는 아미노산 서열, 하나 이상의 치환, 결실, 또는 부가를 가질 수 있고, 이의 순 효과는 원하는 항원-결합 활동성을 보유하는 것이다. 예를 들어, 다양한 치환은 어느 한쪽 인코딩된 아미노산을 변경하지 않거나 보존적 변화를 초래하지 않는 코딩 영역에서 실시될 수 있다. 이들 치환은 본 발명에 의해 포괄된다. 보존적 아미노산 치환은 다음의 그룹 내에서 치환을 포함한다: 글리신, 알라닌; 발린, 이소류신, 류신; 아스파르트산, 글루탐산; 아스파라긴, 글루타민; 세린, 트레오닌; 리신, 아르기닌; 및 페닐알라닌, 티로신. 보존적 치환이 생산되어야 하는 폴리펩타이드에서 함유된 하나 이상의 아미노산 잔기를 효과적으로 변화시키는 반면, 치환은 생산되어야 하는 생성된 항원 결합 단위의 항원-결합 활동성을 방해할 것으로 예상되지 않는다. 인코딩된 아미노산 잔기를 변경시키지 않는 뉴클레오타이드 치환은 상이한 시스템에서 유전자 발현을 최적화하는데 유용하다. 적당한 치환은 당업자에게 공지되고, 예를 들어, 발현 시스템에서 바람직한 코돈 용법을 반영하기 위해 실시된다.
원하는 경우, 재조합 폴리뉴클레오타이드는 유전자 산물의 정제 및 발현의 검출을 용이하게 하는 이종성 서열을 포함할 수 있다. 그러한 서열의 예는 당업계에 공지되고 리포터 단백질 예컨대 β-갈락토시다제, β-락타마제, 클로람페니콜 아세틸트랜스퍼라제 (CAT), 루시퍼라제, 녹색 형광성 단백질 (GFP) 및 그들의 유도체를 인코딩하는 것들을 포함한다. 정제를 용이하게 하는 기타 이종성 서열은 에피토프 예컨대 Myc, (인플루엔자 바이러스 혈구응집소에서 유래된) HA, His-6, FLAG, 또는 면역글로불린의 Fc 부분, 글루타티온 S-트랜스퍼라제 (GST), 및 말토스-결합 단백질 (MBP)에 대하여 코딩할 수 있다.
본원에 개시된 폴리뉴클레오타이드는 상기 기재된 다양한 화학적으로 기능적 모이어티에 컨쥬게이션될 수 있다. 흔히 이용된 모이어티는 검출가능한 신호를 생산할 수 있는 라벨, 신호 펩타이드, 면역학적 반응성을 향상시키는 제제, 고체 지지체에 커플링을 용이하게 하는 제제, 백신 담체, 생물반응 조절제, 상자성 라벨 및 약물을 포함한다. 모이어티는 재조합으로 또는 당업계에 공지된 기타 수단에 의해 공유 연결된 폴리뉴클레오타이드일 수 있다.
본원에 개시된 폴리뉴클레오타이드는 추가의 서열, 예컨대 동일한 전사 단위 내에서 추가의 인코딩 서열, 제어 요소 예컨대 프로모터, 리보솜 결합 부위, 및 폴리아데닐화 부위, 동일한 또는 상이한 프로모터의 제어 하에서 추가의 전사 단위, 숙주 세포의 클로닝, 발현, 및 형질전환을 허용하는 서열, 그리고 본 발명의 구현예를 제공하기에 바람직할 수 있는 바와 같이 임의의 그러한 작제물을 포함할 수 있다.
본원에 개시된 폴리뉴클레오타이드는 화학적 합성, 재조합 클로닝 방법, PCR, 또는 이들의 임의의 조합을 사용하여 수득될 수 있다. 화학적 폴리뉴클레오타이드 합성의 방법은 당업계에 널리 공지되고 본원에 상세히 기재될 필요는 없다. 당업자는 DNA 합성기를 사용함으로써 또는 상업 서비스로부터 주문함으로써 원하는 폴리뉴클레오타이드를 수득하기 위해 본원에 제공된 서열 데이터를 사용할 수 있다.
원하는 서열을 포함하는 폴리뉴클레오타이드는 복제 및 증폭을 위하여 적당한 숙주 세포에 차례로 도입될 수 있는 적당한 벡터에 삽입될 수 있다. 따라서, 상기 기재된 폴리뉴클레오타이드 중 하나 이상을 포함하는 다양한 벡터는 본원에 고려된다. 본원에 개시된 항-CLDN18.2 항체를 인코딩하는 적어도 1개의 벡터를 포함하는 발현 벡터의 선택가능한 라이브러리가 또한 제공된다.
벡터는 일반적으로 항원 결합 단위를 발현시키는데 요구된 전사적 또는 번역적 제어 서열을 포함한다. 적당한 전사 또는 번역적 제어 서열은 비제한적으로 복제 기원, 프로모터, 인핸서, 리프레서 결합 영역, 전사 개시 부위, 리보솜 결합 부위, 번역 개시 부위, 그리고 전사 및 번역을 위한 종료 부위를 포함한다.
프로모터의 선택은 주로 벡터가 도입되는 숙주 세포에 의존할 것이다. 원하는 경쇄 또는 중쇄 유전자와 정상적으로 연관된 프로모터를 활용하는 것이 또한 가능하고, 단 그러한 제어 서열은 숙주 세포 시스템과 호환성이다. 세포-특이적 또는 조직-특이적 프로모터는 또한 사용될 수 있다. 엄청나게 다양한 조직 특이적 프로모터는 해당 분야에서 장인에 의해 기재되고 이용되었다. 선택적 동물 세포에서 작동하는 예시적 프로모터는 간세포-특이적 프로모터 및 심장 근육 특이적 프로모터를 포함한다. 수령체 세포 유형의 선택에 의존하여, 당업자는 본 발명의 발현 벡터의 작제에 적용가능한 다른 적당한 세포-특이적 또는 조직-특이적 프로모터를 알 것이다.
공지된 분자성 클로닝 또는 유전자 조작 기법을 사용하여, 적절한 전사적 제어 서열, 인핸서, 터미네이터, 또는 당업계에서 공지된 임의의 기타 유전적 요소는, 선택적으로 본 발명에 따라 발현되도록 온전한 선택가능한 융합 유전자와 추가적으로, 작동 관계에 통합될 수 있다. 상기-기재된 요소 이외에도, 그와 같은 마커 유전자가 숙주 세포에 공동-도입된 또 다른 폴리뉴클레오타이드 서열에서 운반될 수 있어도, 벡터는 선택가능한 마커 (예를 들어, 벡터로 형질전환된 숙주 세포의 생존 또는 성장에 필요한 단백질을 인코딩하는 유전자)를 함유할 수 있다.
본원에 기재된 폴리뉴클레오타이드 및 벡터는 몇몇 특이적 용도를 갖는다. 이들은, 예를 들어, 항원 결합 단위의 생산을 위한 발현 시스템에서 유용하다. 그러한 폴리뉴클레오타이드는 원하는 폴리뉴클레오타이드의 증폭을 가져오기 위한 프라이머로서 유용하다. 게다가, 폴리뉴클레오타이드는 백신, 진단제, 및 약물을 포함하는 약학적 조성물에서 또한 유용하다.
숙주 세포는, 그 중에서도, 대상 폴리뉴클레오타이드, 벡터의 저장소로서, 또는 그들의 항원 결합 특이성에 기반된 원하는 항-CLDN18.2 항체를 생산 및 스크리닝하기 위한 비히클로서 사용될 수 있다.
따라서, 본 개시내용은 원하는 항원과 면역반응성인 항-CLDN18.2 항체의 확인 방법을 제공한다. 그와 같은 방법은 다음의 단계를 포함할 수 있다: (a) 항-CLDN18.2 항체의 유전적으로 다양한 라이브러리를 제조하고, 여기서 상기 라이브러리는 적어도 1개의 대상체 항-CLDN18.2 항체를 포함하는 것인 단계; (b) 항-CLDN18.2 항체의 라이브러리를 원하는 항원와 접촉시키는 단계; (c) 항-CLDN18.2 항체와 항원 사이 특이적 결합을 검출하고, 그렇게 함으로써 원하는 항원와 면역반응성인 항-CLDN18.2 항체를 확인하는 단계.
원하는 항원에 특이적으로 결합하는 항-CLDN18.2 항체의 능력은 당업계에서 널리 확립된 다양한 절차에 의해 시험될 수 있다. Harlow 및 Lane (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York; Gherardi 등 (1990)　J. Immunol. Meth.　126:61-68 참고. 전형적으로, 원하는 결합 특이성을 나타내는 항-CLDN18.2 항체는 직접적으로 면역검정에 의해, 예를 들어, 고체 지지체 또는 기질에서 고정화되는 항원과 라벨링된 항-CLDN18.2 항체를 반응시킴으로써 검출될 수 있다. 일반적으로, 항원이 부착되는 기질은 면역검정 동안 비-특이적 결합의 낮은 수준을 나타내는 재료로 제작된다. 예시 고체 지지체는 다음 유형의 재료 중 하나 이상으로 만들어진다: 플라스틱 폴리머, 유리, 셀룰로스, 니트로셀룰로스, 반도체 재료, 및 금속. 일부 예에서, 기질은 페트리 접시, 크로마토그래피 비드, 자기 비드, 및 기타 등등이다.
그러한 고상 검정의 경우, 반응되지 않은 항-CLDN18.2 항체는 세정에 의해 제거된다. 그러나, 액상 검정에서, 반응되지 않은 항-CLDN18.2 항체는 일부 기타 분리 기법, 예컨대 여과 또는 크로마토그래피에 의해 제거된다. 라벨링된 항-CLDN18.2 항체에 항원을 결합시킨 후, 결합된 라벨의 양은 결정된다. 이러한 기법의 변이형은, 항원이 원래 결합 분자와 포화상태로 결합되는, 경쟁적 검정이다. 대상체 항-CLDN18.2 항체의 모집단이 복합체에 도입되는 경우, 더 높은 결합 친화성을 나타내는 것들만이 경쟁할 수 있을 것이고, 그래서 항원에 결합되어 있을 것이다.
대안적으로, 주어진 항원에의 특이적 결합은, 세포 상에서 원하는 항원을 선별되도록 제시하는 단계, 그 다음 검출가능한 제제에 커플링되는 항-CLDN18.2 항체로 표적 세포를 라벨링하는 단계, 이어서 세포 선별기에서 라벨링된 세포를 라벨링되지 않은 것들과 분리하는 단계를 포함하는, 세포 선별에 의해 사정될 수 있다. 정교화된 세포 분리 방법은 형광-활성화된 세포 선별 (FACS)이다. 미세한 흐름에서 단일 파일로 이동하는 세포는 레이저 빔에 통과되고, 형광적으로 라벨링된 항-CLDN18.2 항체에 의해 결합된 각 세포의 형광은 그 다음 측정된다.
용출된 항-CLDN18.2 항체의 후속 분석은 경쇄 및 중쇄의 아미노산 서열을 묘사하기 위한 단백질 시퀀싱을 포함할 수 있다. 연역된 아미노산 서열에 근거하여, 항-CLDN18.2 항체를 인코딩하는 cDNA는 그 다음 PCR, 라이브러리 스크리닝, 실재하는 핵산 데이터베이스에서의 상동성 검색, 또는 이들의 임의의 조합을 포함하는 재조합 클로닝 방법에 의해 수득될 수 있다. 흔히 이용된 데이터베이스는 비제한적으로 GenBank, EMBL, DDBJ, PDB, SWISS-PROT, EST, STS, GSS 및 HTGS를 포함한다.
항-CLDN18.2 항체의 라이브러리가 파아지 또는 박테리아성 입자 상에서 디스플레이되는 경우, 선택은 바람직하게는 친화성 크로마토그래피를 사용하여 수행된다. 상기 방법은 전형적으로 항원 코팅된 플레이트, 컬럼 매트릭스, 세포에 또는 용액내 바이오티닐화된 항원에 파아지 항-CLDN18.2 항체의 라이브러리 결합 이어서 포착으로 진행한다. 고체 상에 결합된 파아지 또는 박테리아는 세정되고 그 다음 가용성 합텐, 산 또는 알칼리에 의해 용출된다. 대안적으로, 증가하는 농도의 항원은 친화성 매트릭스로부터 항-CLDN18.2 항체를 해리시키는데 사용될 수 있다. 항원에 대한 극히 높은 친화성 또는 친화력을 가진 특정 항-CLDN18.2 항체의 경우, 충분한 용출은 WO 92/01047에서 기재된 바와 같이 높은 pH 또는 가벼운 환원 용액을 요구할 수 있다.
선택의 효율은 세정 동안 해리의 역학, 그리고 단일 파아지 또는 박테리아에서 다중 항-CLDN18.2 항체가 고체 지지체 상에서 항원에 동시에 결합할 수 있는지 여부를 포함하는 몇몇 인자의 조합에 의존하는 경향이 있다. 예를 들어, 신속한 해리 역학 (및 약한 결합 친화성)을 가진 항체는 고체 지지체에서 짧은 세정, 다가 디스플레이 그리고 항원의 높은 코팅 밀도의 사용에 의해 보유될 수 있다. 반대로, 느린 해리 역학 (및 양호한 결합 친화성)을 가진 항-CLDN18.2 항체의 선택은 긴 세정, 1가 파아지, 그리고 항원의 낮은 코팅 밀도의 사용에 의해 선호될 수 있다.
원하는 경우, 항-CLDN18.2 항체의 라이브러리는 원치않는 항체를 반대-선택하기 위해 관련없는 항원에 대해 사전-선택될 수 있다. 라이브러리는 또한, 예를 들어, 항-이디오타입성 항체를 단리시키기 위해 관련된 항원에 대해 사전-선택될 수 있다.
숙주 세포
일부 구현예에서, 본 개시내용은 본원에 개시된 항-CLDN18.2 항체 중 어느 하나를 발현시키는 숙주 세포를 제공한다. 대상체 숙주 세포는 전형적으로 본원에 개시된 항-CLDN18.2 항체 중 어느 하나를 인코딩하는 핵산을 포함한다.
본 발명은 폴리뉴클레오타이드, 벡터, 또는 상기 기재된 벡터의 라이브러리로 형질감염된 숙주 세포를 제공한다. 벡터는, 전기천공, 미세발사체 폭격; 리포펙션, 감염 (벡터가 감염성 제제와 커플링되는 경우), 염화 칼슘, 염화 루비듐, 인산 칼슘, DEAE-덱스트란, 또는 기타 물질을 이용하는 형질감염을 포함하는, 다수의 적절한 수단 중 어느 하나에 의해 적당한 원핵 또는 진핵 세포에 도입될 수 있다. 벡터를 도입하기 위한 수단의 선택은 종종 숙주 세포의 특성에 의존할 것이다.
대부분 동물 세포의 경우, 임의의 상기-언급된 방법은 벡터 전달에 적당하다. 바람직한 동물 세포는, 다량으로, 예를 들면 밀리그램 수준에 외인성으로 도입된 유전자 산물을 발현시킬 수 있는, 척추동물 세포, 바람직하게는 포유동물 세포이다. 바람직한 세포의 비-제한 예는 NIH3T3 세포, COS, HeLa, 및 CHO 세포이다.
일단 적당한 숙주 세포에 도입되면, 항-CLDN18.2 항체의 발현은 당업계에서 공지된 임의의 핵산 또는 단백질 검정을 사용하여 결정될 수 있다. 예를 들어, 경쇄 CDR 또는 중쇄 CDR의 전사된 mRNA의 존재, 또는 항-CLDN18.2 항체는, 항-CLDN18.2 항체를 인코딩하는 폴리뉴클레오타이드의 임의의 영역에 상보적인 프로브를 사용하는 종래의 하이브리드화 검정 (예를 들면 노던 블랏 분석), 증폭 절차 (예를 들면 RT-PCR), SAGE (미국 특허 번호 5,695,937), 및 배열-기반된 기술 (예를 들면 미국 특허 번호 5,405,783, 5,412,087 및 5,445,934 참고)에 의해 검출 및/또는 정량화될 수 있다.
벡터의 발현은 또한 발현된 항-CLDN18.2 항체를 검사함으로써 결정될 수 있다. 다양한 기법은 단백질 분석을 위한 분야에서 이용가능하다. 이들은 비제한적으로 방사면역검정, ELISA (효소 연결 면역방사 검정), "샌드위치" 면역검정, 면역방사 검정, 현장 면역검정 (예를 들면, 콜로이드성 금, 효소 또는 방사성동위원소 라벨 사용), 웨스턴 블랏 분석, 면역침전 검정, 면역형광 검정, 및 SDS-PAGE를 포함한다.
페이로드
일부 구현예에서, 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체는 페이로드에 추가로 컨쥬게이션된다. 일부 사례에, 페이로드는 항-CLDN18.2 항체에 직접적으로 컨쥬게이션된다. 다른 사례에, 페이로드는 링커를 통해 항-CLDN18.2 항체에 간접적으로 컨쥬게이션된다. 일부 경우에, 페이로드는 작은 분자, 단백질 또는 이의 기능적 단편, 펩타이드, 또는 핵산 폴리머를 포함한다.
일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체에 컨쥬게이션된 페이로드의 수 (예를 들면, 약물-대-항체 비 또는 DAR)는 약 1:1, 1개 페이로드 대 1개 항-CLDN18.2 항체이다. 일부 경우에, 페이로드 대 항-CLDN18.2 항체의 비는 약 2:1, 3:1, 4:1, 5:1, 6:1, 7:1, 8:1, 9:1, 10:1, 11:1, 12:1, 13:1, 14:1, 15:1, 16:1, 17:1, 18:1, 19:1, 또는 20:1이다. 일부 경우에, 페이로드 대 항-CLDN18.2 항체의 비는 약 2:1이다. 일부 경우에, 페이로드 대 항-CLDN18.2 항체의 비는 약 3:1이다. 일부 경우에, 페이로드 대 항-CLDN18.2 항체의 비는 약 4:1이다. 일부 경우에, 페이로드 대 항-CLDN18.2 항체의 비는 약 6:1이다. 일부 경우에, 페이로드 대 항-CLDN18.2 항체의 비는 약 8:1이다. 일부 경우에, 페이로드 대 항-CLDN18.2 항체의 비는 약 12:1이다.
일부 구현예에서, 페이로드는 작은 분자이다. 일부 사례에, 작은 분자는 세포독성 페이로드이다. 예시적 세포독성 페이로드는 비제한적으로 미세소관 파괴 제제, DNA 변형 제제, 또는 Akt 억제제를 포함한다.
일부 구현예에서, 페이로드는 미세소관 파괴 제제를 포함한다. 예시적 미세소관 파괴 제제는 비제한적으로 2-메톡시에스트라디올, 아우리스타틴, 칼콘, 콜히친, 콤브레타스타틴, 크립토피신, 딕티오스타틴, 디스코더몰라이드, 돌라스테인, 엘레우테로빈, 에포틸론, 할리콘드린, 라우리말라이드, 메이탄신, 노스카피노이드, 파클리탁셀, 펠로루사이드, 포몹신, 포도필로톡신, 리족신, 스폰지스타틴, 탁산, 튜불라이신, 빈카 알칼로이드, 비노렐빈, 또는 이들의 유도체 또는 유사체를 포함한다.
일부 구현예에서, 튜불라이신은 튜불라이신 유사체 또는 유도체 예컨대 미국 특허 번호 8580820 및 8980833에서 그리고 미국 공개 번호 20130217638, 20130224228, 및 201400363454에 기재된 것이다.
일부 구현예에서, 메이탄신은 메이탄시노이드이다. 일부 구현예에서, 메이탄시노이드는 DM1, DM4, 또는 안사미토신이다. 일부 구현예에서, 메이탄시노이드는 DM1이다. 일부 구현예에서, 메이탄시노이드는 DM4이다. 일부 구현예에서, 메이탄시노이드는 안사미토신이다. 일부 구현예에서, 메이탄시노이드는 메이탄시오니드 유도체 또는 유사체 예컨대 미국 특허 번호 5208020, 5416064, 7276497, 및 6716821 또는 미국 공개 번호 2013029900 및 US20130323268에서 기재된 것이다.
일부 구현예에서, 페이로드는 돌라스타틴, 또는 이의 유도체 또는 유사체이다. 일부 구현예에서, 돌라스타틴은 돌라스타틴 10 또는 돌라스타틴 15, 또는 이의 유도체 또는 유사체이다. 일부 구현예에서, 돌라스타틴 10 유사체는 아우리스타틴, 소블리도틴, 심플로스타틴 1, 또는 심플로스타틴 3이다. 일부 구현예에서, 돌라스타틴 15 유사체는 세마도틴 또는 타시도틴이다.
일부 구현예에서, 돌라스타틴 10 유사체는 아우리스타틴 또는 아우리스타틴 유도체이다. 일부 구현예에서, 아우리스타틴 또는 아우리스타틴 유도체는 아우리스타틴 E (AE), 아우리스타틴 F (AF), 아우리스타틴 E5-벤조일발레르산 에스테르 (AEVB), 모노메틸 아우리스타틴 E (MMAE), 모노메틸 아우리스타틴 F (MMAF), 또는 모노메틸 아우리스타틴 D (MMAD), 아우리스타틴 PE, 또는 아우리스타틴 PYE이다. 일부 구현예에서, 아우리스타틴 유도체는 모노메틸 아우리스타틴 E (MMAE)이다. 일부 구현예에서, 아우리스타틴 유도체는 모노메틸 아우리스타틴 F (MMAF)이다. 일부 구현예에서, 아우리스타틴은 아우리스타틴 유도체 또는 유사체 예컨대 미국 특허 번호 6884869, 7659241, 7498298, 7964566, 7750116, 8288352, 8703714, 및 8871720에서 기재된 것이다.
일부 구현예에서, 페이로드는 DNA 변형 제제를 포함한다. 일부 구현예에서, DNA 변형 제제는 DNA 클리버(cleaver), DNA 인터칼레이터(intercalator), DNA 전사 억제제, 또는 DNA 가교제를 포함한다. 일부 사례에, DNA 클리버는 블레오마이신 A2, 칼리키아미신, 또는 이의 유도체 또는 유사체를 포함한다. 일부 사례에, DNA 인터칼레이터는 독소루비신, 에피루비신, PNU-159682, 듀오카르마이신, 피롤로벤조디아제핀, 올리고마이신 C, 다우노루비신, 발루비신, 토포테칸, 또는 이들의 유도체 또는 유사체를 포함한다. 일부 사례에, DNA 전사 억제제는 닥티노마이신을 포함한다. 일부 사례에, DNA 가교제는 미토마이신 C를 포함한다.
일부 구현예에서, DNA 변형 제제는 암사크린, 안트라사이클린, 캄프토테신, 독소루비신, 듀오카르마이신, 에네디인, 에토포시드, 인돌리노벤조디아제핀, 네트롭신, 테니포시드, 또는 이들의 유도체 또는 유사체를 포함한다.
일부 구현예에서, 안트라사이클린은 독소루비신, 다우노루비신, 에피루비신, 이다루비신, 미토마이신-C, 닥티노마이신, 미트라마이신, 네모루비신, 피산트론, 사바루비신, 또는 발루비신이다.
일부 구현예에서, 캄프토테신의 유사체는 토포테칸, 이리노테칸, 실라테칸, 코시테칸, 엑사테칸, 루르토테칸, 기마테칸, 벨로테칸, 루비테칸, 또는 SN-38이다.
일부 구현예에서, 듀오카르마이신은 듀오카르마이신 A, 듀오카르마이신 B1, 듀오카르마이신 B2, 듀오카르마이신 C1, 듀오카르마이신 C2, 듀오카르마이신 D, 듀오카르마이신 SA, 또는 CC-1065이다. 일부 구현예에서, 에네디인은 칼리키아미신, 에스페라미신, 또는 다이네미신 A이다.
일부 구현예에서, 피롤로벤조디아제핀은 안트라마이신, 압베이마이신, 치카마이신, DC-81, 마제트라마이신, 네오트라마이신 A, 네오트라미이신 B, 포로트라마이신, 프로트라카르신, 시바노미신 (DC-102), 시비로마이신, 또는 토마이마이신이다. 일부 구현예에서, 피롤로벤조디아제핀은 토마이마이신 유도체, 예컨대 미국 특허 번호 8404678 및 8163736에서 기재된 것이다. 일부 구현예에서, 피롤로벤조디아제핀은 예컨대 미국 특허 번호 8426402, 8802667, 8809320, 6562806, 6608192, 7704924, 7067511, US7612062, 7244724, 7528126, 7049311, 8633185, 8501934, 및 8697688 및 미국 공개 번호 US20140294868에서 기재된 것이다.
일부 구현예에서, 피롤로벤조디아제핀은 피롤로벤조디아제핀 이량체이다. 일부 구현예에서, PBD 이량체는 대칭 이량체이다. 대칭 PBD 이량체의 예는, 비제한적으로, SJG-136 (SG-2000), ZC-423 (SG2285), SJG-720, SJG-738, ZC-207 (SG2202), 및 DSB-120 (표 2)를 포함한다. 일부 구현예에서, PBD 이량체는 비대칭 이량체이다. 비대칭 PBD 이량체의 예는, 비제한적으로, SJG-136 유도체 예컨대 미국 특허 번호 8697688 및 9242013 및 미국 공개 번호 20140286970에서 기재된 것을 포함한다.
일부 구현예에서, 페이로드는 Akt 억제제를 포함한다. 일부 경우에, Akt 억제제는 이파타세르팁 (GDC-0068) 또는 이의 유도체를 포함한다.
일부 구현예에서, 페이로드는, 비제한적으로 폴리머라제 II 억제제 예컨대 a-아마니틴, 및 폴리(ADP-리보스) 폴리머라제 (PARP) 억제제를 포함하는, 폴리머라제 억제제를 포함한다. 예시적 PARP 억제제는, 비제한적으로 이니파립(Iniparib) (BSI 201), 탈라조파립(Talazoparib) (BMN-673), 올라파립(Olaparib) (AZD-2281), 올라파립, 루카파립(Rucaparib) (AG014699, PF-01367338), 벨리파립(Veliparib) (ABT-888), CEP 9722, MK 4827, BGB-290, 또는 3-아미노벤즈아미드를 포함한다.
일부 구현예에서, 페이로드는 검출가능한 모이어티를 포함한다. 예시적 검출가능한 모이어티는 형광성 염료; 효소; 기질; 화학발광성 모이어티; 특이적 결합 모이어티 예컨대 스트렙타비딘, 아비딘, 또는 비오틴; 또는 방사성동위원소를 포함한다.
일부 구현예에서, 페이로드는 면역조절 제제를 포함한다. 유용한 면역조절 제제는 종양에 관한 호르몬 작용을 차단하는 항-호르몬 그리고 사이토카인 생산을 억압하는, 자가-항원 발현을 하향-조절하는, 또는 MHC 항원을 마스킹하는 면역억제 제제를 포함한다. 대표적 항-호르몬은, 예를 들어, 타목시펜, 랄록시펜, 4(5)-이미다졸을 억제하는 아로마타제, 4-하이드록시타목시펜, 트리옥시펜, 케옥시펜, LY 117018, 오나픈스톤, 및 토레미펜을 포함하는 항-에스트로겐; 그리고 항-안드로겐 예컨대 플루타미드, 닐루타미드, 비칼루타미드,류프롤리드, 및 고세렐린; 그리고 항-부신 제제를 포함한다. 실례적 면역억제 제제는, 비제한적으로 2-아미노-6-아릴-5-치환된 피리미딘, 아자티오프린, 사이클로포스파미드, 브로모크립틴, 다나졸, 답손, 글루타르알데하이드, MHC 항원 및 MHC 단편에 대한 항-이디오타입성 항체, 사이클로스포린 A, 스테로이드 예컨대 글루코코르티코스테로이드, 스트렙토키나제, 또는 라파마이신을 포함한다.
일부 구현예에서, 페이로드는 면역 조정제를 포함한다. 예시적 면역 조정제는, 비제한적으로, 간사이클로비에, 에타너셉트, 타크롤리무스, 시롤리무스, 보클로스포린, 사이클로스포린, 라파마이신, 사이클로포스파미드, 아자티오프린, 마이코페놀게이트 모페틸, 메토트렉스트레이트, 글루코코르티코이드 및 이들의 유사체, 크산틴, 줄기 세포 성장 인자, 림프독소, 조혈 인자, 종양 괴사 인자 (TNF) (예를 들면, TNFα), 인터류킨 (예를 들면, 인터류킨-1 (IL-1), IL-2, IL-3, IL-6, IL-10, IL-12, IL-18, 및 IL-21), 콜로니 자극 인자 (예를 들면, 과립구-콜로니 자극 인자 (G-CSF) 및 과립구 대식세포-콜로니 자극 인자 (GM-CSF)), 인터페론 (예를 들면, 인터페론-알파, 인터페론-베타, 인터페론-감마), "S1 인자"로 지정된 줄기 세포 성장 인자, 에리트로포이에틴 및 트롬보포이에틴, 또는 이들의 조합을 포함한다.
일부 구현예에서, 페이로드는 면역독소를 포함한다. 면역독소는, 비제한적으로, 리신, 방사성핵종, 미국자리공 항바이러스 단백질, 슈도모나스 외독소 A, 디프테리아 독소, 리신 A 쇄, 진균성 독소 예컨대 레스트릭토신 및 포스포리파제 효소를 포함한다. 일반적으로, "Chimeric Toxins", Olsnes 및 Pihl,　Pharmac. Ther.　15:355-381 (1981); 및 "Monoclonal Antibodies for Cancer Detection and Therapy", eds. Baldwin and Byers, pp. 159-179, 224-266, Academic Press (1985) 참고.
일부 사례에, 페이로드는 핵산 폴리머를 포함한다. 그와 같은 사례에, 핵산 폴리머는 짧은 간섭 핵산 (siNA), 짧은 간섭 RNA (siRNA), 이중-가닥 RNA (dsRNA), 마이크로-RNA (miRNA), 짧은 헤어핀 RNA (shRNA), 안티센스 올리고뉴클레오타이드를 포함한다. 다른 사례에, 핵산 폴리머는, 예를 들면, 세포독성 단백질 또는 펩타이드나 세포사멸성 유발 단백질 또는 펩타이드를 인코딩하는 mRNA를 포함한다. 예시적 세포독성 단백질 또는 펩타이드는 박테리아성 세포독소 예컨대 알파-기공 형성 독소 (예를 들면, E. 콜리로부터 사이토라이신 A), 베타-기공-형성 독소 (예를 들면, α-헤몰라이신, PVL-판톤 발렌틴 류코시딘, 에어로라이신, 클로스트리디알 엡실론-독소,　클로스트리듐 퍼프린젠스 엔테로톡신), 이원 독소 (탄저 독소, 부종 독소,　C. 보툴리눔 C2 독소, C 스피로포메 독소,　C. 퍼프린젠스 아이오타 독소,　C. 디피실 세포-치사 독소 (A 및 B)), 프리온, 파라스포린, 콜레스테롤-의존적 사이토라이신 (예를 들면, 뉴몰라이신), 작은 기공-형성 독소 (예를 들면, 그라마시딘(Gramicidin) A), 사이아노톡신 (예를 들면, 마이크로사이스틴, 노둘라린), 용혈독, 신경독 (예를 들면, 보툴리눔 신경독), 세포독소, 콜레라 독소, 디프테리아 독소,　슈도모나스 외독소 A, 파상풍 독소, 또는 면역독소 (이다루비신, 리신 A, CRM9, 미국자리공 항바이러스성 단백질, DT)를 포함한다. 예시적 세포사멸성 유발 단백질 또는 펩타이드는 세포사멸성 프로테아제 활성화 인자-1 (Apaf-1), 사이토크롬-c, 카스파제 개시제 단백질 (CASP2, CASP8, CASP9, CASP10), 세포사멸 유도 인자 (AIF), p53, p73, p63, Bcl-2, Bax, 그랜자임 B, 폴리-ADP 리보오스 폴리머라제 (PARP), 및 P 21-활성화된 키나제 2 (PAK2)를 포함한다. 추가의 사례에, 핵산 폴리머는 핵산 디코이를 포함한다. 일부 사례에, 핵산 디코이는 단백질-결합 핵산의 모방체 예컨대 RNA-기반된 단백질-결합 모방체이다. 예시적 핵산 디코이는 전사활성화 영역 (TAR) 디코이 및 Rev 반응 요소 (RRE) 디코이를 포함한다.
일부 경우에, 페이로드는 압타머이다. 압타머는 특이적 표적 분자에 결합하는 작은 올리고뉴클레오타이드 또는 펩타이드 분자이다. 예시적 핵산 압타머는 DNA 압타머, RNA 압타머, 또는 하나 이상의 부자연스러운 뉴클레오타이드를 포함하는 RNA 및/또는 DNA 압타머인 XNA 압타머를 포함한다. 예시적 핵산 압타머는 ARC19499 (Archemix Corp.), REG1 (Regado Biosciences), 및 ARC1905 (Ophthotech)를 포함한다.
본원에 기재된 구현예에 따른 핵산은 자연 발생 핵산, 또는 하나 이상의 뉴클레오타이드 유사체를 임의로 포함하거나 그렇지 않으면 자연 발생 핵산의 것과 상이한 구조를 갖는다. 예를 들어, 2'-변형은 할로, 알콕시, 및 알릴옥시 기를 포함한다. 일부 구현예에서, 2'-OH 기는 H, OR, R, 할로, SH, SR, NH2, NHR, NR2　또는 CN으로부터 선택된 기에 의해 대체되고, 여기서 R은 C1-C6 알킬, 알케닐, 또는 알키닐이고, 할로는 F, Cl, Br, 또는 I이다. 변형된 연결기의 예는 포스포로티오에이트 및 5'-N-포스포르아미다이트 연결기를 포함한다.
다양한 상이한 뉴클레오타이드 유사체, 변형된 백본, 또는 비-천연 발생 인터뉴클레오사이드 연결기를 갖는 핵산은 본원에 기재된 구현예에 따라 활용된다. 일부 경우에, 핵산은 천연 뉴클레오사이드 (즉, 아데노신, 티미딘, 구아노신, 시티딘, 우리딘, 데옥시아데노신, 데옥시티미딘, 데옥시구아노신, 및 데옥시시티딘) 또는 변형된 뉴클레오사이드를 포함한다. 변형된 뉴클레오타이드의 예는 염기 변형된 뉴클레오사이드 (예를 들면, 아라시티딘, 이노신, 이소구아노신, 네불라린, 슈도우리딘, 2,6-디아미노퓨린, 2-아미노퓨린, 2-티오티미딘, 3-데아자-5-아자시티딘, 2'-데옥시우리딘, 3-니토르피롤, 4-메틸인돌, 4-티오우리딘, 4-티오티미딘, 2-아미노아데노신, 2-티오티미딘, 2-티오우리딘, 5-브로모시티딘, 5-요오도우리딘, 이노신, 6-아자우리딘, 6-클로로퓨린, 7-데아자아데노신, 7-데아자구아노신, 8-아자아데노신, 8-아지도아데노신, 벤즈이미다졸, M1-메틸아데노신, 피롤로-피리미딘, 2-아미노-6-클로로퓨린, 3-메틸 아데노신, 5-프로피닐시티딘, 5-프로피닐우리딘, 5-브로모우리딘, 5-플루오로우리딘, 5-메틸시티딘, 7-데아자아데노신, 7-데아자구아노신, 8-옥소아데노신, 8-옥소구아노신, O(6)-메틸구아닌, 및 2-티오시티딘), 화학적으로 또는 생물학적으로 변형된 염기 (예를 들면, 메틸화된 염기), 변형된 당류 (예를 들면, 2'-플루오로리보스, 2'-아미노리보스, 2'-아지도리보스, 2'-O-메틸리보스, L-거울상이성질체성 뉴클레오사이드 아라비노스, 및 헥소스), 변형된 포스페이트 기 (예를 들면, 포스포로티오에이트 및 5'-N-포스포르아미다이트 연결기), 및 이들의 조합을 포함한다. 핵산의 화학적 합성을 위한 천연 및 변형된 뉴클레오타이드 단량체는 용이하게 이용가능하다. 일부 경우에, 그러한 변형을 포함하는 핵산은 자연 발생 뉴클레오타이드만으로 이루어지는 핵산에 비해 개선된 속성을 표시한다. 일부 구현예에서, 본원에 기재된 핵산 변형은 뉴클레아제 (예를 들면 엑소뉴클레아제, 엔도뉴클레아제, 등)에 의한 소화를 감소 및/또는 예방하는데 활용된다. 예를 들어, 핵산의 구조는 소화를 감소시키기 위해 한쪽 또는 양쪽 가닥의 3' 말단에 뉴클레오타이드 유사체를 포함함으로써 안정화될 수 있다.
상이한 뉴클레오타이드 변형 및/또는 백본 구조는 핵산에서 다양한 위치에 실재할 수 있다. 그러한 변형은 모르폴리노, 펩타이드 핵산 (PNA), 메틸포스포네이트 뉴클레오타이드, 티올포스포네이트 뉴클레오타이드, 2'-플루오로 N3-P5'-포스포르아미다이트, 1',5'-안하이드로헥시톨 핵산 (HNA), 또는 이들의 조합을 포함한다.
컨쥬게이션 화학
일부 사례에, 페이로드는 천연 결찰에 의해 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체에 컨쥬게이션된다. 일부 사례에, 컨쥬게이션은 하기에서 기재된 바와 같다: Dawson, 등 "Synthesis of proteins by native chemical ligation", Science 1994, 266, 776-779; Dawson, 등 "Modulation of Reactivity in Native Chemical Ligation through the Use of Thiol Additives", J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 4325-4329; Hackeng, 등 "Protein synthesis by native chemical ligation: Expanded scope by using straightforward methodology.", Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 10068-10073; 또는 Wu, 등 "Building complex glycopeptides: Development of a cysteine-free native chemical ligation protocol", Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 4116-4125. 일부 사례에, 컨쥬게이션은 미국 특허 번호 8,936,910에서 기재된 바와 같다.
일부 사례에, 페이로드는 "흔적없는" 커플링 기술 (Philochem)을 활용하는 부위-지향된 방법에 의해 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체에 컨쥬게이션된다. 일부 사례에, "흔적없는" 커플링 기술은 그 다음 알데하이드 기를 함유하는 폴리핵산 분자를 가진 컨쥬게이트인 결합 모이어티 상에서 N-말단 1,2-아미노티올 기를 활용한다 (Casi 등, "Site-specific traceless coupling of potent cytotoxic drugs to recombinant antibodies for pharmacodelivery", JACS 134(13): 5887-5892 (2012) 참고)
일부 사례에, 페이로드는 결합 모이어티에 편입된 부자연스러운 아미노산을 활용하는 부위-지향된 방법에 의해 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체에 컨쥬게이션된다. 일부 사례에, 부자연스러운 아미노산은 p-아세틸페닐알라닌 (pAcPhe)을 포함한다. 일부 사례에, pAcPhe의 케토 기는 알콕시-아민 데리바티브드(derivatived) 컨쥬게이션하는 모이어티에 선택적으로 커플링하여 옥심 결합을 형성한다. (Axup 등, "Synthesis of site-specific antibody-drug conjugates using unnatural amino acids", PNAS 109(40): 16101-16106 (2012) 참고).
일부 사례에, 페이로드는 효소-촉매화된 공정을 활용하는 부위-지향된 방법에 의해 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체에 컨쥬게이션된다. 일부 사례에, 부위-지향된 방법은 SMARTag™ 기술 (Redwood)을 활용한다. 일부 사례에, SMARTag™ 기술은 알데하이드 태그의 존재 하에서 산화 공정을 통해서 포르밀글리신-생성 효소 (FGE)에 의해 시스테인으로부터 포르밀글리신 (FGly) 잔기의 생성 그리고 하이드라지노-픽테트-스펜글러(hydrazino-Pictet-Spengler) (HIPS) 결찰을 통해 알킬하이드레인-기능화된 폴리핵산 분자에 FGly의 후속 컨쥬게이션을 포함한다. (Wu 등, "Site-specific chemical modification of recombinant proteins produced in mammalian cells by using the genetically encoded aldehyde tag", PNAS 106(9): 3000-3005 (2009); Agarwal, 등, "A Pictet-Spengler ligation for protein chemical modification", PNAS 110(1): 46-51 (2013) 참고).
일부 사례에, 효소-촉매화된 공정은 미생물 트랜스글루타미나제 (mTG)를 포함한다. 일부 경우에, 페이로드는 미생물 트랜스글루타미나제 촉매화된 공정을 활용하여 항-CLDN18.2 항체에 컨쥬게이션된다. 일부 사례에, mTG는 인식 서열 내에서 글루타민의 아미드 측쇄와 기능화된 폴리핵산 분자의 일차 아민 사이 공유 결합의 형성을 촉매화한다. 일부 사례에, mTG는 스트렙토마이세스 모바렌시스(Streptomyces mobarensis)로부터 생산된다. (Strop 등, "Location matters: site of conjugation modulates stability and pharmacokinetics of antibody drug conjugates", Biology 20(2) 161-167 (2013) 참고).
일부 사례에, 페이로드는, 서열-특이적 트랜스펩티다제를 활용하는, PCT 공개 번호 WO2014/140317에서 기재된 바와 같은 방법에 의해 본원에 기재된 항-CD38 항체, 항-ICAM1 항체, 또는 다중-특이적 항체 (예를 들면, 이중특이적 항-CD38/ICAM1 항체)에 컨쥬게이션된다.
일부 사례에, 페이로드는 미국 특허 공개 번호 2015/0105539 및 2015/0105540에서 기재된 바와 같은 방법에 의해 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체에 컨쥬게이션된다.
링커
일부 사례에, 상기 기재된 링커는, 분지된 또는 분지되지 않은 단량체의 장쇄, 및/또는 2차원 또는 3차원으로 단량체의 가교된 네트워크로 이루어지는 천연 또는 합성 폴리머를 포함한다. 일부 사례에, 링커는 폴리사카라이드, 리그닌, 고무, 또는 폴리알킬렌 옥사이드 (예를 들면, 폴리에틸렌 글리콜)를 포함한다.
일부 사례에, 링커는, 비제한적으로, 알파-, 오메가-디하이드록시폴리에틸렌글리콜, 생분해성 락톤-기반된 폴리머, 예를 들면 폴리아크릴산, 폴리락티드 산 (PLA), 폴리(글리콜산) (PGA), 폴리프로필렌, 폴리스티렌, 폴리올레핀, 폴리아미드, 폴리시아노아크릴레이트, 폴리이미드, 폴리에틸렌테레프탈라트 (PET, PETG), 폴리에틸렌 테레프탈레이트 (PETE), 폴리테트라메틸렌 글리콜 (PTG), 또는 폴리우레탄 뿐만 아니라 이들의 혼합물을 포함한다. 본원에 사용된 바와 같이, 혼합물은 동일한 화합물 내에서 뿐만 아니라 블록 코폴리머와 관련하여 상이한 폴리머의 사용을 지칭한다. 일부 경우에, 블록 코폴리머는 폴리머의 적어도 1개의 섹션이 또 다른 폴리머의 단량체로부터 구성되는 폴리머이다. 일부 사례에, 링커는 폴리알킬렌 옥사이드를 포함한다. 일부 사례에, 링커는 PEG를 포함한다. 일부 사례에, 링커는 폴리에틸렌 이미드 (PEI) 또는 하이드록시 에틸 전분 (HES)을 포함한다.
일부 경우에, 폴리알킬렌 옥사이드 (예를 들면, PEG)는 폴리디스퍼스(polydispers) 또는 모노디스퍼스(monodispers) 화합물이다. 일부 사례에, 폴리디스퍼스 재료는, 산술평균 중량 (중량 평균) 크기 및 분산도를 특징으로 하는, 재료의 상이한 분자량의 분산적 분포를 포함한다. 일부 사례에, 단분산적 PEG는 분자의 1개 크기를 포함한다. 일부 구현예에서, 링커는 다중- 또는 단일분산된 폴리알킬렌 옥사이드 (예를 들면, PEG)이고 표시된 분자량은 폴리알킬렌 옥사이드, 예를 들면, PEG, 분자의 분자량의 평균을 나타낸다.
일부 구현예에서, 링커는 폴리알킬렌 옥사이드 (예를 들면, PEG)를 포함하고 폴리알킬렌 옥사이드 (예를 들면, PEG)의 분자량은 약 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, 1000, 1100, 1200, 1300, 1400, 1450, 1500, 1600, 1700, 1800, 1900, 2000, 2100, 2200, 2300, 2400, 2500, 2600, 2700, 2800, 2900, 3000, 3250, 3350, 3500, 3750, 4000, 4250, 4500, 4600, 4750, 5000, 5500, 6000, 6500, 7000, 7500, 8000, 10,000, 12,000, 20,000, 35,000, 40,000, 50,000, 60,000, 또는 100,000 Da이다.
일부 구현예에서, 폴리알킬렌 옥사이드 (예를 들면, PEG)는 개별 PEG이고, 여기에서 상기 개별 PEG는 1개 초과 반복 에틸렌 옥사이드 단위를 포함하는 폴리머성 PEG이다. 일부 사례에, 개별 PEG (dPEG)는 2 내지 60, 2 내지 50, 또는 2 내지 48개 반복 에틸렌 옥사이드 단위를 포함한다. 일부 사례에, dPEG는 약 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 35, 40, 42, 48, 50개 이상의 반복 에틸렌 옥사이드 단위를 포함한다. 일부 사례에, dPEG는 약 2개 이상의 반복 에틸렌 옥사이드 단위를 포함한다. 일부 경우에, dPEG는 단계식 양식으로 순수한 (예를 들면, 약 95%, 98%, 99%, 또는 99.5%) 출발 재료로부터 단일 분자량 화합물로서 합성된다. 일부 경우에, dPEG는, 평균 분자량보다는, 특정 분자량을 갖는다. 일부 경우에, 본원에 기재된 dPEG는 Quanta Biodesign, LMD제 dPEG이다.
일부 사례에, 링커는 2 내지 60, 2 내지 50, 또는 2 내지 48개의 반복 에틸렌 옥사이드 단위를 선택적으로 포함하는 개별 PEG이다. 일부 경우에, 링커는 약 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 35, 40, 42, 48, 50개 이상의 반복 에틸렌 옥사이드 단위를 포함하는 dPEG를 포함한다. 일부 경우에, 링커는 Quanta Biodesign, LMD제 dPEG이다.
일부 구현예에서, 링커는 폴리펩타이드 링커이다. 일부 사례에, 폴리펩타이드 링커는 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90, 100개 이상의 아미노산 잔기를 포함한다. 일부 사례에, 폴리펩타이드 링커는 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8개 이상의 아미노산 잔기를 포함한다. 일부 사례에, 폴리펩타이드 링커는 많아야 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8개, 또는 미만 아미노산 잔기를 포함한다. 일부 경우에, 폴리펩타이드 링커는 (예를 들면, 어느 한쪽 효소적으로 또는 화학적으로) 절단가능한 폴리펩타이드 링커이다. 일부 경우에, 폴리펩타이드 링커는 비-절단가능한 폴리펩타이드 링커이다. 일부 사례에, 폴리펩타이드 링커는 Val-Cit (발린-시트룰린), Gly-Gly-Phe-Gly, Phe-Lys, Val-Lys, Gly-Phe-Lys, Phe-Phe-Lys, Ala-Lys, Val-Arg, Phe-Cit, Phe-Arg, Leu-Cit, Ile-Cit, Trp-Cit, Phe-Ala, Ala-Leu-Ala-Leu, 또는 Gly-Phe-Leu-Gly를 포함한다. 일부 사례에, 폴리펩타이드 링커는 펩타이드 예컨대: Val-Cit (발린-시트룰린), Gly-Gly-Phe-Gly, Phe-Lys, Val-Lys, Gly-Phe-Lys, Phe-Phe-Lys, Ala-Lys, Val-Arg, Phe-Cit, Phe-Arg, Leu-Cit, Ile-Cit, Trp-Cit, Phe-Ala, Ala-Leu-Ala-Leu, 또는 Gly-Phe-Leu-Gly를 포함한다. 일부 경우에, 폴리펩타이드 링커는 L-아미노산, D-아미노산, 또는 양쪽 L- 및 D-아미노산의 혼합물을 포함한다.
일부 사례에, 링커는 동종이작용적 링커를 포함한다. 예시적 동종이작용적 링커는 비제한적으로, 로만트(Lomant) 시약 디티오비스(석신이미딜프로피오네이트) DSP, 3'3'-디티오비스(설포석신이미딜 프로피오네이트(DTSSP), 디석신이미딜 수베레이트 (DSS), 비스(설포석신이미딜)수베레이트 (BS), 디석신이미딜 타르트레이트 (DST), 디설포석신이미딜 타르트레이트 (설포 DST), 에틸렌 글리코비스(석신이미딜석시네이트) (EGS), 디석신이미딜 글루타레이트 (DSG), N,N'-디석신이미딜 카보네이트 (DSC), 디메틸 아디피미데이트 (DMA), 디메틸 피멜이미데이트 (DMP), 디메틸 수베르이미데이트 (DMS), 디메틸-3,3'-디티오비스프로피온이미데이트 (DTBP), 1,4-디-3'-(2'-피리딜디티오)프로피온아미도)부탄 (DPDPB), 비스말레이미도헥산 (BMH), 아릴 할라이드-함유 화합물 (DFDNB), 예컨대 예를 들면 1,5-디플루오로-2,4-디니트로벤젠 또는 1,3-디플루오로-4,6-디니트로벤젠, 4,4'-디플루오로-3,3'-디니트로페닐설폰 (DFDNPS), 비스-[β-(4-아지도살리실아미도)에틸]디설파이드 (BASED), 포름알데하이드, 글루타르알데하이드, 1,4-부탄디올 디글리시딜 에테르, 아디프산 다하이드라지드, 카보하이드라지드, o-톨루이딘, 3,3'-디메틸벤지딘, 벤지딘, α,α'-p-디아미노디페닐, 디요오도-p-자일렌 설폰산, N,N'-에틸렌-비스(요오도아세트아미드), 또는 N,N'-헥사메틸렌-비스(요오도아세트아미드)를 포함한다.
일부 구현예에서, 링커는 이종이작용적 링커를 포함한다. 예시적 이종이작용적 링커는, 비제한적으로, 아민-반응성 및 설프하이드릴 크로스-링커 예컨대 N-석신이미딜 3-(2-피리딜디티오)프로피오네이트 (sPDP), 장-쇄 N-석신이미딜 3-(2-피리딜디티오)프로피오네이트 (LC-sPDP), 수용성-장-쇄 N-석신이미딜 3-(2-피리딜디티오) 프로피오네이트 (설포-LC-sPDP), 석신이미딜옥시카보닐-α-메틸-α-(2-피리딜디티오)톨루엔 (sMPT), 설포석신이미딜-6-[α-메틸-α-(2-피리딜디티오)톨루아미도]헥사노에이트 (설포-LC-sMPT), 석신이미딜-4-(N-말레이미도메틸)사이클로헥산-1-카복실레이트 (sMCC), 설포석신이미딜-4-(N-말레이미도메틸)사이클로헥산-1-카복실레이트 (설포-sMCC), m-말레이미도벤조일-N-하이드록시석신이미드 에스테르 (MB), m-말레이미도벤조일-N-하이드록시설포석신이미드 에스테르 (설포-MB), N-석신이미딜(4-요오도아세틸)아미노벤조에이트 (sIAB), 설포석신이미딜(4-요오도아세틸)아미노벤조에이트 (설포-sIAB), 석신이미딜-4-(p-말레이미도페닐)부티레이트 (sMPB), 설포석신이미딜-4-(p-말레이미도페닐)부티레이트 (설포-sMPB), N-(γ-말레이미도부티릴옥시)석신이미드 에스테르 (GMB), N-(γ-말레이미도부티릴옥시)설포석신이미드 에스테르 (설포-GMB), 석신이미딜 6-((요오도아세틸)아미노)헥사노에이트 (sIAX), 석신이미딜 6-[6-(((요오도아세틸)아미노)헥사노일)아미노]헥사노에이트 (sIAXX), 석신이미딜 4-(((요오도아세틸)아미노)메틸)사이클로헥산-1-카복실레이트 (sIAC), 석신이미딜 6-((((4-요오도아세틸)아미노)메틸)사이클로헥산-1-카보닐)아미노) 헥사노에이트 (sIACX), p-니트로페닐 요오도아세테이트 (NPIA), 카보닐-반응성 및 설프히드릴-반응성 크로스-링커 예컨대 4-(4-N-말레이미도페닐)부티르산 하이드라지드 (MPBH), 4-(N-말레이미도메틸)사이클로헥산-1-카복실-하이드라지드-8 (M2C2H), 3-(2-피리딜디티오)프로피오닐 하이드라지드 (PDPH), 아민-반응성 및 광반응성 크로스-링커 예컨대 N-하이드록시석신이미딜-4-아지도살리실산 (NHs-AsA), N-하이드록시설포석신이미딜-4-아지도살리실산 (설포-NHs-AsA), 설포석신이미딜-(4-아지도살리실아미도)헥사노에이트 (설포-NHs-LC-AsA), 설포석신이미딜-2-(ρ-아지도살리실아미도)에틸-1,3'-디티오프로피오네이트 (sAsD), N-하이드록시석신이미딜-4-아지도벤조에이트 (HsAB), N-하이드록시설포석신이미딜-4-아지도벤조에이트 (설포-HsAB), N-석신이미딜-6-(4'-아지도-2'-니트로페닐아미노)헥사노에이트 (sANPAH), 설포석신이미딜-6-(4'-아지도-2'-니트로페닐아미노)헥사노에이트 (설포-sANPAH), N-5-아지도-2-니트로벤조일옥시석신이미드 (ANB-NO), 설포석신이미딜-2-(m-아지도-o-니트로벤즈아미도)-에틸-1,3'-디티오프로피오네이트 (sAND), N-석신이미딜-4(4-아지도페닐)1,3'-디티오프로피오네이트 (sADP), N-설포석신이미딜(4-아지도페닐)-1,3'-디티오프로피오네이트 (설포-sADP), 설포석신이미딜 4-(ρ-아지도페닐)부티레이트 (설포-sAPB), 설포석신이미딜 2-(7-아지도-4-메틸코우마린-3-아세트아미드)에틸-1,3'-디티오프로피오네이트 (sAED), 설포석신이미딜 7-아지도-4-메틸코우마인-3-아세테이트 (설포-sAMCA), ρ-니트로페닐 디아조피루베이트 (ρNPDP), ρ-니트로페닐-2-디아조-3,3,3-트리플루오로프로피오네이트 (PNP-DTP), 설프히드릴-반응성 및 광반응성 크로스-링커 예컨대1-(ρ-아지도살리실아미도)-4-(요오도아세트아미도)부탄 (AsIB), N-[4-(ρ-아지도살리실아미도)부틸]-3'-(2'-피리딜디티오)프로피온아미드 (APDP), 벤조페논-4-요오도아세트아미드, 벤조페논-4-말레이미드 카보닐-반응성 및 광반응성 크로스-링커 예컨대 ρ-아지도벤조일 하이드라지드 (ABH), 카복실레이트-반응성 및 광반응성 크로스-링커 예컨대 4-(ρ-아지도살리실아미도)부틸아민 (AsBA), 및 아르기닌-반응성 및 광반응성 크로스-링커 예컨대 ρ-아지도페닐 글리옥살 (APG)을 포함한다.
일부 구현예에서, 링커는 벤조산 기, 또는 이의 유도체 이의를 포함한다. 일부 사례에, 벤조산 기 또는 이의 유도체 이의는 파라아미노벤조산 (PABA)을 포함한다. 일부 사례에, 벤조산 기 또는 이의 유도체 이의는 감마-아미노부티르산 (GABA)을 포함한다.
일부 구현예에서, 링커는 말레이미드 기, 펩타이드 모이어티, 및/또는 벤조산 기 중 하나 이상을, 임의의 조합으로 포함한다. 일부 구현예에서, 링커는 말레이미드 기, 펩타이드 모이어티, 및/또는 벤조산 기의 조합을 포함한다. 일부 사례에, 말레이미드 기는 말레이미도카프로일 (mc)이다. 일부 사례에, 펩타이드 기는 val-cit이다. 일부 사례에, 벤조산 기는 PABA이다. 일부 사례에, 링커는 mc-val-cit 기를 포함한다. 일부 경우에, 링커는 val-cit-PABA 기를 포함한다. 추가의 경우에, 링커는 mc-val-cit-PABA 기를 포함한다.
일부 구현예에서, 링커는 자가-희생적 링커 또는 자가-제거 링커이다. 일부 경우에, 링커는 자가-희생적 링커이다. 다른 경우에, 링커는 자가-제거 링커 (예를 들면, 환화 자가-제거 링커)이다. 일부 사례에, 링커는 미국 특허 번호 9,089,614 또는 PCT 공개 번호 WO2015038426에서 기재된 링커를 포함한다.
일부 구현예에서, 링커는 수지상 유형 링커이다. 일부 사례에, 수지상 유형 링커는 분지화하는, 다기능적 링커 모이어티를 포함한다. 일부 사례에, 수지상 유형 링커는 PAMAM 덴드리머를 포함한다.
일부 구현예에서, 링커는 절단 후 항체 또는 페이로드에 링커 모이어티 (예를 들면, 원자 또는 링커 기)를 남겨 두지 않는 링커 또는 흔적없는 링커이다. 예시적 흔적없는 링커는, 비제한적으로, 게르마늄 링커, 실리슘 링커, 황 링커, 셀레늄 링커, 질소 링커, 인 링커, 붕소 링커, 크롬 링커, 또는 페닐하이드라지드 링커를 포함한다. 일부 경우에, 링커는 Hejesen, 등, "A traceless aryl-triazene linker for DNA-directed chemistry", Org Biomol Chem 11(15): 2493-2497 (2013)에서 기재된 바와 같은 흔적없는 아릴-트리아진 링커이다. 일부 사례에, 링커는 Blaney, 등, "Traceless solid-phase organic synthesis", Chem. Rev. 102: 2607-2024 (2002)에서 기재된 흔적없는 링커이다. 일부 사례에, 링커는 미국 특허 번호 6,821,783에서 기재된 바와 같은 흔적없는 링커이다.
사용 방법
특정 구현예에서, CLDN18.2의 단백질의 과발현을 특징으로 하는 암을 갖는 대상체를 치료하는 방법이 본원에 개시된다. 일부 경우에, 상기 방법은 대상체에서 암을 치료하기 위해 본원에 기재된 항-CLDN18.2 항체 또는 항-CLDN18.2 항체를 포함하는 약학적 조성물을 상기 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다. 일부 경우에, 암은 위장암이다. 예시적 위장암은 식도, 담낭 및 담도, 간, 췌장, 위, 소장, 대장, 결장, 직장, 및/또는 항문의 암을 포함한다.
일부 사례에, 위장암은 위 (또는 위) 암이다. 일부 경우에, 위 (또는 위) 암은 위의 선암, 위 림프종, 위장 기질 종양 (GIST), 유암종 종양, 편평 세포 암종, 소세포 암종, 또는 평활근육종을 포함한다.
일부 사례에, 위장암은 췌장암이다. 일부 경우에, 췌장암은 외분비 종양 예컨대 췌장의 선암, 선포 세포 암종, 관내 유두-점액성 신생물 (IPMN), 또는 점액성 낭포암종; 또는 (섬 세포 종양으로서도 공지된) 췌장 신경내분비 종양 (PNET) 예컨대 가스트린종, 글루카가노마(glucaganoma), 인슐린종, 소마토스타틴종, VIP종, 또는 비기능적 섬 세포 종양을 포함한다.
일부 사례에, 위장암은 식도암이다. 일부 경우에, 식도암은 식도의 선암, 편평 세포 암종, 또는 소 세포 암종을 포함한다.
일부 사례에, 위장암은 담관암종이다.
일부 사례에, 암은 폐암이다. 일부 경우에, 폐암은 비-소 세포 폐암 (NSCLC) 예컨대 폐 선암, 편평 세포 암종, 또는 대 세포 암종; 또는 소 세포 폐암 (SCLC)을 포함한다.
일부 사례에, 암은 난소암이다. 일부 경우에, 난소암은 상피 난소 종양, 난소 생식 세포 종양, 난소 간질 종양, 또는 원발성 복막 종양을 포함한다.
일부 구현예에서, 본 방법은 추가로 대상체에게 추가의 치료적 제제를 투여하는 단계를 포함한다. 일부 사례에, 추가의 치료적 제제는 화학치료적 제제, 면역치료적 제제, 표적화된 치료적 제제, 호르몬-기반된 치료적 제제, 또는 줄기-세포 기반된 치료적 제제를 포함한다.
일부 사례에, 추가의 치료적 제제는 화학치료적 제제를 포함한다. 예시적 화학치료적 제제는, 비제한적으로, 알킬화 제제 예컨대 시클로포스파미드, 메클로레타민, 클로람부실, 멜팔란, 다카바진, 또는 니트로소우레아스; 안트라사이클린 예컨대 다우노루비신, 독소루비신, 에피루비신, 이다루비신, 미톡산트론, 또는 발루비신; 세포골격계 교란물질 예컨대 파클리탁셀, 도세탁셀, 아브락산, 또는 탁소테레; 에포틸론; 히스톤 데아세틸라제 억제제 예컨대 보리노스타트 또는 로미뎁신; 토포이소머라제 I 억제제 예컨대 이리노테칸 또는 토포테칸; 토포이소머라제 II 억제제 예컨대 에토포시드, 테니포시드, 또는 타플루포시드; 키나제 억제제 예컨대 보르테조밉, 엘로티닙, 게피티닙, 이마티닙, 베무라페닙, 또는 비스모데집; 뉴클레오타이드 유사체 및 전구체 유사체 예컨대 아자시티딘, 아자티오프린, 카페시타빈, 시타라빈, 독시플루리딘, 플루오로우라실, 젬시타빈, 하이드로지우레아, 메르캅토퓨린, 메토트렉세이트, 또는 티오구아닌; 백금-기반된 제제 예컨대 카보플라틴, 시스플라틴, 또는 옥살리플라틴; 레티노이드 예컨대 트레티노인, 알리트레티노인, 벡사로텐; 또는 빈카 알칼로이드 및 유도체 예컨대 빈블라스틴, 빈크리스틴, 빈데신, 또는 비노렐빈을 포함한다.
일부 사례에, 추가의 치료적 제제는 면역치료적 제제를 포함한다. 일부 사례에, 면역요법은 입양 세포 요법이다. 예시적 입양 세포 요법은 Adaptimmune제 AFP TCR, MAGE-A10 TCR, 또는 NY-ESO-TCR; Unum Therapeutics제 ACTR087/리툭시맙; Juno Therapeutics제 항-BCMA CAR-T 세포 요법, 항-CD19 "장갑" CAR-T 세포 요법, JCAR014, JCAR018, JCAR020, JCAR023, JCAR024, 또는 JTCR016; Celgene/Juno Therapeutics제 JCAR017; Intrexon제 항-CD19 CAR-T 세포 요법; Kite Pharma제 항-CD19 CAR-T 세포 요법, 액시캡타겐 실로루셀, KITE-718, KITE-439, 또는 NY-ESO-1 T-세포 수용체 요법; Sorrento Therapeutics제 항-CEA CAR-T 요법; TNK Therapeutics/Sorrento Therapeutics제 항-PSMA CAR-T 세포 요법; Atara Biotherapeutics제 ATA520; Aurora BioPharma제 AU101 및 AU105; Cell Medica제 발타류셀-T (CMD-003); bluebird bio제 bb2121; Bellicum Pharmaceuticals제 BPX-501, BPX-601, 또는 BPX-701; Kiromic제 BSK01; Immunocore제 IMCgp100; Jounce Therapeutics제 JTX-2011; Lion Biotechnologies제 LN-144 또는 LN-145; Mustang Bio제 MB-101 또는 MB-102; Celyad제 NKR-2; Celgene제 PNK-007; Novartis Pharmaceuticals제 티사겐레클류셀-T; 또는 Tessa Therapeutics제 TT12를 포함한다.
일부 사례에, 면역요법은 수지상 세포-기반된 요법이다.
일부 사례에, 면역요법은 예를 들면, 인터류킨 (IL) 예컨대 IL-2, IL-15, 또는 IL-21, 인터페론 (IFN)-α 또는 과립구 대식세포 콜로니-자극 인자 (GM-CSF)를 포함하는, 사이토카인-기반된 요법을 포함한다.
일부 사례에, 면역요법은 면역 관문 조정제를 포함한다. 예시적 면역 관문 조정제는 PD-1 조정제 예컨대 Bristol-Myers Squibb제 니볼루맙 (Opdivo), Merck제 펨브롤리주맙 (Keytruda), Agenus제 AGEN 2034, BeiGene제 BGB-A317, Boehringer-Ingelheim Pharmaceuticals제 Bl-754091, CBT Pharmaceuticals제 CBT-501 (게놀림주맙), Incyte제 INCSHR1210, Janssen Research & Development제 JNJ-63723283, MedImmune제 MEDI0680, MacroGenics제 MGA 012, Novartis Pharmaceuticals제 PDR001, Pfizer제 PF-06801591, Regeneron Pharmaceuticals/Sanofi제 REGN2810 (SAR439684), 또는 TESARO제 TSR-042; CTLA-4 조정제 예컨대 이필리무맙 (Yervoy), 또는 Agenus제 AGEN 1884; PD-L1 조정제 예컨대 AstraZeneca제 두르발루맙 (Imfinzi), Genentech제 아테졸리주맙 (MPDL3280A), EMD Serono/Pfizer제 아벨루맙, CytomX Therapeutics제 CX-072, Novartis Pharmaceuticals제 FAZ053, 3D Medicine/Alphamab제 KN035, Eli Lilly제 LY3300054, 또는 EMD Serono제 M7824 (항-PD-L1/TGFbeta trap); LAG3 조정제 예컨대 Bristol-Myers Squibb제 BMS-986016, Novartis Pharmaceuticals제 IMP701, Novartis Pharmaceuticals제 LAG525, 또는 Regeneron Pharmaceuticals제 REGN3767; OX40 조정제 예컨대 Bristol-Myers Squibb제 BMS-986178, GlaxoSmithKline제 GSK3174998, Agenus/Incyte제 INCAGN1949, MedImmune제 MEDI0562, Pfizer제 PF-04518600, 또는 Genentechp제 RG7888; GITR 조정제 예컨대 Novartis Pharmaceuticals제 GWN323, Agenus/Incyte제 INCAGN1876, MedImmune제 MEDI1873, Merck제 MK-4166, 또는 Leap Therapeutics제 TRX518; KIR 조정제 예컨대 Bristol-Myers Squibb제 리릴루맙; 또는 TIM 조정제 예컨대 Novartis Pharmaceuticals제 MBG453 또는 Tesaro제 TSR-022를 포함한다.
일부 사례에, 추가의 치료적 제제는 호르몬-기반된 치료적 제제를 포함한다. 예시적 호르몬-기반된 치료적 제제는, 비제한적으로, 아로마타제 억제제 예컨대 레트로졸, 아나스트로졸, 엑세메스탄, 또는 아미노글루테티미드; 고나도트로핀-방출 호르몬 (GnRH) 유사체 예컨대 류프로렐린 또는 고세렐린; 선택적 에스트로겐 수용체 조정제 (SERMs) 예컨대 타목시펜, 랄록시펜, 토레미펜, 또는 풀베스트란트; 항안드로겐 예컨대 플루타미드 또는 비칼루타미드; 프로게스토겐 예컨대 메게스트롤 아세테이트 또는 메드록시프로게스테론 아세테이트; 안드로겐 예컨대 플루옥시메스테론; 에스트로겐 예컨대 에스트로겐 디에틸스틸베스트롤 (DES), 이스트레이스(Estrace), 또는 폴리에스트라디올 포스페이트; 또는 소마토스타틴 유사체 예컨대 옥트레오티드를 포함한다.
일부 사례에, 추가의 치료적 제제는 일선 치료적 제제이다.
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체 및 추가의 치료적 제제는 동시에 투여된다.
일부 사례에, 항-CLDN18.2 항체 및 추가의 치료적 제제는 순차적으로 투여된다. 그와 같은 사례에, 항-CLDN18.2 항체는 추가의 치료적 제제 투여에 앞서 대상체에게 투여된다. 다른 사례에, 항-CLDN18.2 항체는 추가의 치료적 제제가 투여된 후 대상체에게 투여된다.
일부 경우에, 추가의 치료적 제제 및 항-CLDN18.2 항체는 별도 복용량으로서 제형화된다.
일부 사례에, 대상체는 수술을 받았다. 일부 사례에, 항-CLDN18.2 항체 및 선택적으로 추가의 치료적 제제는 수술후 대상체에게 투여된다. 일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체 및 선택적으로 추가의 치료적 제제는 수술에 앞서 대상체에게 투여된다.
일부 사례에, 대상체는 방사선을 받았다. 일부 사례에, 항-CLDN18.2 항체 및 선택적으로 추가의 치료적 제제는 방사선 치료 동안 또는 후 대상체에게 투여된다. 일부 경우에, 항-CLDN18.2 항체 및 선택적으로 추가의 치료적 제제는 방사선 받기에 앞서 대상체에게 투여된다.
일부 사례에, 대상체는 인간이다.
일부 구현예에서, 세포 사멸 효과를 유도하는 방법이 본원에 또한 기재된다. 일부 경우에, 본 방법은 세포 사멸 효과를 유도하기 위해 항-CLDN18.2 항체를 내재화하는데 충분한 시간 동안 페이로드를 포함하는 항-CLDN18.2 항체와 복수의 세포를 접촉시키는 단계를 포함한다. 일부 경우에, 페이로드는 메이탄시노이드, 아우리스타틴, 탁소이드, 칼리키아미신, 듀오카르마이신, 아마톡신, 또는 이의 유도체를 포함한다. 일부 경우에, 페이로드는 아우리스타틴 또는 이의 유도체 이의를 포함한다. 일부 경우에, 페이로드는 모노메틸 아우리스타틴 E (MMAE)이다. 일부 경우에, 페이로드는 모노메틸 아우리스타틴 F (MMAF)이다.
일부 사례에, 세포는 암 세포이다. 일부 경우에, 세포는 위장암에서 비롯된 것이다. 일부 경우에, 위장암은 위암이다. 일부 경우에, 위장암은 췌장암이다. 일부 경우에, 위장암은 식도암 또는 담관암종이다.일부 경우에, 세포는 폐암 또는 난소암에서 비롯된 것이다.
일부 구현예에서, 본 방법은 시험관내 방법이다.
일부 구현예에서, 본 방법은 생체내 방법이다.
약학적 조성물
일부 구현예에서, 항-CLDN18.2 항체는 약학적 조성물로서 추가로 제형화된다. 일부 사례에, 약학적 조성물은, 비제한적으로, 비경구 (예를 들면, 정맥내, 피하, 근육내, 동맥내, 진피내, 복강내, 유리체강내, 뇌내, 또는 뇌실내), 경구, 비강내, 구강내, 직장내, 또는 경피내 투여 경로를 포함하는, 다중 투여 경로에 의해 대상체에게 투여를 위하여 제형화된다. 일부 사례에, 본원에 기재하는 약학적 조성물은 비경구 (예를 들면, 정맥내, 피하, 근육내, 동맥내, 진피내, 복강내, 유리체강내, 뇌내, 또는 뇌실내) 투여를 위하여 제형화된다. 다른 사례에, 본원에 기재하는 약학적 조성물은 경구 투여를 위하여 제형화된다. 더욱 다른 사례에, 본원에 기재하는 약학적 조성물은 비강내 투여를 위하여 제형화된다.
일부 구현예에서, 약학적 제형은 비제한적으로, 수성 액체 분산액, 자가-유화 분산액, 고체 용액, 리포솜성 분산액, 에어로졸, 고체 복용량 형태, 분말, 즉시 방출 제형, 제어 방출 제형, 신속 용융 제형, 정제, 캡슐, 환제, 지연 방출 제형, 연장 방출 제형, 박동성 방출 제형, 다중 미립자 제형 (예를 들면, 나노입자 제형), 및 혼합된 즉시 및 제어 방출 제형을 포함한다.
일부 사례에, 약학적 제형은 다중 미립자 제형을 포함한다. 일부 사례에, 약학적 제형은 나노입자 제형을 포함한다. 예시적 나노입자는 비제한적으로 상자성 나노입자, 초상자성 나노입자, 금속 나노입자, 풀러린-유사 재료, 무기 나노튜브, 덴드리머 (예컨대 공유적으로 부착된 금속 킬레이트를 가진 것), 나노섬유, 나노혼, 나노-어니온, 나노로드, 나노로프 및 양자점을 포함한다. 일부 사례에, 나노입자는 금속 나노입자, 예를 들면, 스칸듐, 티타늄, 바나듐, 크롬, 망간, 철, 코발트, 니켈, 구리, 아연, 이트륨, 지르코늄, 니오븀, 몰리브덴, 루테늄, 로듐, 팔라듐, 은, 카드뮴, 하프늄, 탄탈, 텅스텐, 레늄, 오스뮴, 이리듐, 백금, 금, 가돌리늄, 알루미늄, 갈륨, 인듐, 주석, 탈륨, 납, 비스무트, 마그네슘, 칼슘, 스트론튬, 바륨, 리튬, 나트륨, 칼륨, 붕소, 규소, 인, 게르마늄, 비소, 안티몬, 및 이들의 조합, 합금 또는 산화물의 나노입자이다.
일부 사례에, 나노입자는, 코어-쉘 나노 입자에서와 같이, 코어 또는 코어 및 쉘을 포함한다. 일부 경우에, 나노입자는 약 500nm, 400nm, 300nm, 200nm, 또는 100nm 미만의 적어도 1개의 치수를 갖는다.
일부 구현예에서, 약학적 조성물은 본원에 개시된 조성물과의 호환성, 및 원하는 복용량 형태의 방출 프로파일 속성에 근거하여 선택된 담체 또는 담체 재료를 포함한다. 예시적 담체 재료는, 예를 들면, 결합제, 현탁 제제, 붕해 제제, 충전 제제, 계면활성제, 가용화제, 안정제, 윤활제, 습윤 제제, 희석제, 및 기타 등등을 포함한다. 약학적으로 호환성 담체 재료는, 비제한적으로, 아카시아, 젤라틴, 콜로이드성 이산화 규소, 칼슘 글리세로포스페이트, 칼슘 락테이트, 말토덱스트린, 글리세린, 마그네슘 실리케이트, 폴리비닐피롤리돈 (PVP), 콜레스테롤, 콜레스테롤 에스테르, 카제인 나트륨, 대두 레시틴, 타우로콜산, 포스포티딜콜린, 염화 나트륨, 인산 삼칼슘, 인산 이칼륨, 셀룰로오스 및 셀룰로오스 컨쥬게이트, 설탕 나트륨 스테아로일 락틸레이트, 카라기난, 모노글리세라이드, 디글리세라이드, 전호화 전분, 및 기타 등등을 포함한다. 예를 들면, Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Nineteenth Ed (Easton, Pa.: Mack Publishing Company, 1995); Hoover, John E., Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co., Easton, Pennsylvania 1975; Liberman, H.A. and Lachman, L., Eds., Pharmaceutical Dosage Forms, Marcel Decker, New York, N.Y., 1980; 및 Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, Seventh Ed. (Lippincott Williams & Wilkins1999) 참고.
일부 사례에, 약학적 조성물은 추가로 산 예컨대 아세트산, 붕산, 시트르산, 락트산, 인산 및 염화수소산; 염기 예컨대 수산화 나트륨, 인산 나트륨, 붕산 나트륨, 시트르산 나트륨, 아세트산 나트륨, 락트산 나트륨 및 트리스-하이드록시메틸아미노메탄; 그리고 완충액 예컨대 시트레이트/덱스트로스, 중탄산 나트륨 및 염화 암모늄을 포함하는 pH 조정 제제 또는 완충 제제를 포함한다. 그러한 산, 염기 및 완충액은 허용가능한 범위에서 조성물의 pH를 유지하는데 필요한 양으로 포함된다.
일부 사례에, 약학적 조성물은 조성물의 삼투압 농도를 허용가능한 범위로 가져오는데 필요한 양으로 하나 이상의 염을 포함한다. 그러한 염은 나트륨, 칼륨 또는 암모늄 양이온 및 염화물, 시트르산염, 아스코르브산염, 붕산염, 인산염, 중탄산염, 황산염, 티오황산염 또는 중아황산염 음이온을 갖는 것들을 포함하고; 적당한 염은 염화 나트륨, 염화 칼륨, 티오황산 나트륨, 중아황산 나트륨 및 황산 암모늄을 포함한다.
일부 사례에, 약학적 조성물이 추가로 화합물을 안정화하는데 사용되는 희석제를 포함하는 것은 이들이 보다 안정한 환경을 제공할 수 있기 때문이다. (또한 pH 제어 또는 유지를 제공할 수 있는) 완충된 용액에서 용해된 염은, 비제한적으로, 인산염 완충된 식염 용액을 포함하는, 당업계에서 희석제로서 활용된다. 특정 사례에, 희석제는 압축을 촉진시키기 위해 조성물의 벌크를 증가시키거나 캡슐 충전을 위한 균질 블렌드에 대하여 충분한 벌크를 창출한다. 그러한 화합물은 예를 들면, 락토오스, 전분, 만니톨, 소르비톨, 덱스트로스, 미정질 셀룰로오스 예컨대 Avicel®; 이염기성 인산 칼슘, 인산 이칼슘 이수화물; 인산 삼칼슘, 인산 칼슘; 무수 락토오스, 분무-건조된 락토오스; 전호화 전분, 압축성 설탕, 예컨대 Di-Pac® (Amstar); 만니톨, 하이드록시프로필메틸셀룰로오스, 하이드록시프로필메틸셀룰로오스 아세테이트 스테아레이트, 수크로오스-기반된 희석제, 제과 설탕; 일염기성 황산 칼슘 일수화물, 황산 칼슘 이수화물; 락트산 칼슘 삼수화물, 덱스트레이트; 가수분해된 시리얼 고형물, 아밀로오스; 분말화된 셀룰로오스, 탄산 칼슘; 글리신, 카올린; 만니톨, 염화 나트륨; 이노시톨, 벤토나이트, 및 기타 등등을 포함할 수 있다.
일부 경우에, 약학적 조성물은 물질의 분해 또는 붕괴를 촉진시키기 위한 붕괴 제제 또는 붕괴제를 포함한다. 용어 "붕괴하다"는 위장 유체와 접촉된 경우 복용량 형태의 분해 및 분산 양쪽을 포함한다. 붕괴 제제의 예는 전분, 예를 들면, 천연 전분 예컨대 옥수수 전분 또는 감자 전분, 전호화 전분 예컨대 National 1551 또는 Amijel®, 또는 나트륨 전분 글리콜레이트 예컨대 Promogel® 또는 Explotab®, 셀룰로오스 예컨대 목재 제품, 메틸결정질 셀룰로오스, 예를 들면, Avicel®, Avicel® PH101, Avicel® PH102, Avicel® PH105, Elcema® P100, Emcocel®, Vivacel®, Ming Tia®, 및 Solka-Floc®, 메틸셀룰로오스, 크로스카멜로오스, 또는 가교된 셀룰로오스, 예컨대 가교된 나트륨 카복시메틸셀룰로오스 (Ac-Di-Sol®), 가교된 카복시메틸셀룰로오스, 또는 가교된 크로스카멜로오스, 가교된 전분 예컨대 나트륨 전분 글리콜레이트, 가교된 폴리머 예컨대 크로스포비돈, 가교된 폴리비닐피롤리돈, 알긴산염 예컨대 알긴산 또는 알긴산의 염 예컨대 알긴산 나트륨, 클레이 예컨대 Veegum® HV (규산 알루미늄 마그네슘), 검 예컨대 한천, 구아, 메뚜기 콩, 카라야(Karaya), 펙틴, 또는 트라가칸트, 나트륨 전분 글리콜레이트, 벤토나이트, 천연 스폰지, 계면활성제, 수지 예컨대 양이온-교환 수지, 감귤류 펄프, 나트륨 라우릴 설페이트, 조합 전분내 나트륨 라우릴 설페이트, 및 기타 등등을 포함한다.
일부 사례에, 약학적 조성물은 충전 제제 예컨대 락토스, 탄산 칼슘, 인산 칼슘, 이염기성 인산 칼슘, 황산 칼슘, 미정질 셀룰로오스, 셀룰로오스 분말, 덱스트로스, 덱스트레이트, 덱스트란, 전분, 전호화 전분, 수크로스, 자일리톨, 락티톨, 만니톨, 소르비톨, 염화 나트륨, 폴리에틸렌 글리콜, 및 기타 등등을 포함한다.
윤활제 및 활택제는 재료의 접착 또는 마찰 예방, 감소 또는 억제를 위하여 본원에 기재된 약학적 조성물에서 또한 선택적으로 포함된다. 예시적 윤활제는, 예를 들면, 스테아르산, 수산화 칼슘, 탈크, 나트륨 스테아릴 푸메레이트(fumerate), 탄화수소 예컨대 미네랄 오일, 또는 수소화 식물성 오일 예컨대 수소화 대두 오일 (Sterotex®), 고급 지방산 및 그들의 알칼리-금속 및 알칼리 토금속 염, 예컨대 알루미늄, 칼슘, 마그네슘, 아연, 스테아르산, 스테아르산 나트륨, 글리세롤, 탈크, 왁스, Stearowet®, 붕산, 벤조산 나트륨, 아세트산 나트륨, 염화 나트륨, 류신, 폴리에틸렌 글리콜 (예를 들면, PEG-4000) 또는 메톡시폴리에틸렌 글리콜 예컨대 Carbowax™, 올레산 나트륨, 벤조산 나트륨, 베헨산 글리세릴, 폴리에틸렌 글리콜, 마그네슘 또는 나트륨 라우릴 설페이트, 콜로이드성 실리카 예컨대 Syloid™, Cab-O-Sil®, 전분 예컨대 옥수수 전분, 실리콘 오일, 계면활성제, 및 기타 등등을 포함한다.
가소제는 미세캡슐화 재료 또는 필름 코팅물을 연화시켜 이들을 덜 부서지게 만드는데 사용된 화합물을 포함한다. 적당한 가소제는, 예를 들면, 폴리에틸렌 글리콜 예컨대 PEG 300, PEG 400, PEG 600, PEG 1450, PEG 3350, 및 PEG 800, 스테아르산, 프로필렌 글리콜, 올레산, 트리에틸 셀룰로오스 및 트리아세틴을 포함한다. 가소제는 분산 제제 또는 습윤 제제의 역할을 또한 할 수 있다.
가용화제는 화합물 예컨대 트리아세틴, 트리에틸시트레이트, 에틸 올레에이트, 에틸 카프릴레이트, 나트륨 라우릴 설페이트, 나트륨 독쿠세이트, 비타민 E TPGS, 디메틸아세트아미드, N-메틸피롤리돈, N-하이드록시에틸피롤리돈, 폴리비닐피롤리돈, 하이드록시프로필메틸 셀룰로오스, 하이드록시프로필 사이클로덱스트린, 에탄올, n-부탄올, 이소프로필 알코올, 콜레스테롤, 담즙 염, 폴리에틸렌 글리콜 200-600, 글리코푸롤, 트란스쿠톨, 프로필렌 글리콜, 및 디메틸 이소소르비드 및 기타 등등을 포함한다.
안정제는 화합물 예컨대 임의의 항산화 제제, 완충액, 산, 보존제 및 기타 등등을 포함한다.
현탁 제제는 화합물 예컨대 폴리비닐피롤리돈, 예를 들면, 폴리비닐피롤리돈 K12, 폴리비닐피롤리돈 K17, 폴리비닐피롤리돈 K25, 또는 폴리비닐피롤리돈 K30, 비닐 피롤리돈/비닐 아세테이트 코폴리머 (S630), 폴리에틸렌 글리콜, 예를 들면, 폴리에틸렌 글리콜은 약 300 내지 약 6000, 또는 약 3350 내지 약 4000, 또는 약 7000 내지 약 5400의 분자량을 가질 수 있음, 나트륨 카복시메틸셀룰로오스, 메틸셀룰로오스, 하이드록시프로필메틸셀룰로오스, 하이드록시메틸셀룰로오스 아세테이트 스테아레이트, 폴리소르베이트-80, 하이드록시에틸셀룰로오스, 알긴산 나트륨, 검, 예컨대, 예를 들면, 트라가칸트 검 및 아카시아 검, 구아 검, 잔탄 검을 포함하는, 잔탄, 설탕, 셀룰로식(cellulosic), 예컨대, 예를 들면, 나트륨 카복시메틸셀룰로오스, 메틸셀룰로오스, 나트륨 카복시메틸셀룰로오스, 하이드록시프로필메틸셀룰로오스, 하이드록시에틸셀룰로오스, 폴리소르베이트-80, 알긴산 나트륨, 폴리에톡시화된 소르비탄 모노라우레이트, 폴리에톡시화된 소르비탄 모노라우레이트, 포비돈 및 기타 등등을 포함한다.
계면활성제는 화합물 예컨대 나트륨 라우릴 설페이트, 나트륨 독쿠세이트, Tween 60 또는 80, 트리아세틴, 비타민 E TPGS, 소르비탄 모노올레에이트, 폴리옥시에틸렌 소르비탄 모노올레에이트, 폴리소르베이트, 폴락소머(polaxomer), 담즙 염, 글리세릴 모노스테아레이트, 에틸렌 옥사이드 및 프로필렌 옥사이드의 코폴리머, 예를 들면, Pluronic® (BASF), 및 기타 등등을 포함한다. 추가의 계면활성제는 폴리옥시에틸렌 지방 산 글리세라이드 및 식물성 오일, 예를 들면, 폴리옥시에틸렌 (60) 수소화 피마자유; 및 폴리옥시에틸렌 알킬에테르 및 알킬페닐 에테르, 예를 들면, 옥톡시놀 10, 옥톡시놀 40을 포함한다. 때때로, 계면활성제는 물리적 안정성을 향상시키기 위해 또는 기타 목적을 위하여 포함된다.
점도 향상 제제는, 예를 들면, 메틸 셀룰로오스, 잔탄 검, 카복시메틸 셀룰로오스, 하이드록시프로필 셀룰로오스, 하이드록시프로필메틸 셀룰로오스, 하이드록시프로필메틸 셀룰로오스 아세테이트 스테아레이트, 하이드록시프로필메틸 셀룰로오스 프탈레이트, 카보머, 폴리비닐 알코올, 알긴산염, 아카시아, 키토산 및 이들의 조합을 포함한다.
습윤 제제는 화합물 예컨대 올레산, 글리세릴 모노스테아레이트, 소르비탄 모노올레에이트, 소르비탄 모노라우레이트, 트리에탄올아민 올레에이트, 폴리옥시에틸렌 소르비탄 모노올레에이트, 폴리옥시에틸렌 소르비탄 모노라우레이트, 나트륨 독쿠세이트, 나트륨 올레에이트, 나트륨 라우릴 설페이트, 나트륨 독쿠세이트, 트리아세틴, Tween 80, 비타민 E TPGS, 암모늄 염 및 기타 등등을 포함한다.
치료적 레지멘
일부 구현예에서, 본원에 기재된 약학적 조성물은 치료적 응용을 위하여 투여된다. 일부 구현예에서, 약학적 조성물은 1회/일, 2회/일, 3회/일 또는 초과 투여된다. 약학적 조성물은 날마다, 매일, 격일, 주 5 일, 1회 1주, 격주, 2 주/월, 3 주/월, 월 1회, 월 2회, 3회/월, 또는 초과 투여된다. 약학적 조성물은 적어도 1 개월, 2 개월, 3 개월, 4 개월, 5 개월, 6 개월, 7 개월, 8 개월, 9 개월, 10 개월, 11 개월, 12 개월, 18 개월, 2 년, 3 년, 또는 초과 동안 투여된다.
환자의 상태가 개선하는 경우에서, 의사의 재량에 따라 조성물의 투여는 연속으로 주어지고; 대안적으로, 투여 중인 조성물의 용량은 시간의 특정 기간 (즉, "약물 휴일") 동안 일시적으로 감소되거나 일시적으로 정지된다. 일부 사례에, 약물 휴일의 기간은, 예를 들어 2 일, 3 일, 4 일, 5 일, 6 일, 7 일, 10 일, 12 일, 15 일, 20 일, 28 일, 35 일, 50 일, 70 일, 100 일, 120 일, 150 일, 180 일, 200 일, 250 일, 280 일, 300 일, 320 일, 350 일, 또는 365 일을 포함하는, 2 일과 1 년 사이 다양하다. 약물 휴일 동안 용량 감소는, 예를 들어, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100%를 포함하는, 10%-100%이다.
일단 환자의 병태의 개선이 발생하였다면, 유지 용량은 필요하면 투여된다. 후속적으로, 복용량 또는 투여의 빈도, 또는 양쪽은, 증상의 기능으로서, 개선된 질환, 장애, 또는 병태가 유지되는 수준까지 감소될 수 있다.
일부 구현예에서, 그와 같은 양에 상응하는 주어진 제제의 양은 인자 예컨대 특정한 화합물, 질환의 중증도, 대상체의 정체성 (예를 들면, 체중) 또는 치료가 필요한 숙주에 따라 다양하지만, 그럼에도 불구하고, 예를 들면, 투여 중인 특정 제제, 투여의 경로, 및 치료 중인 대상체 또는 숙주를 포함하는, 환자를 둘러싸는 특정한 환경에 따라 당업계에 공지된 방식으로 일상적으로 결정된다. 일부 사례에, 원하는 용량은 동시에 (또는 시간의 짧은 기간 동안) 또는 적당한 간격에, 예를 들어 하루에 2, 3, 4 이상의 하위-용량으로 투여된 단일 용량으로 또는 분할된 용량으로서 편리하게 제시된다.
개별 치료 레지멘과 관련하여 변수의 수가 많기 때문에, 상기의 범위는 단지 제안적이고, 이들 권장된 값으로부터 유의미하게 벗어나는 경우가 흔하다. 그러한 복용량은, 사용된 화합물의 활동성, 치료될 질환 또는 병태, 투여의 방식, 개별 대상체의 요구사항, 치료될 질환 또는 상태의 중증도, 그리고 실무자의 판단에 제한되지 않는, 다수의 변수에 따라 변경된다.
일부 구현예에서, 그러한 치료적 레지멘의 독성 및 치료적 효능은, 비제한적으로, LD50 (모집단의 50%에 치명적인 용량) 및 ED50 (모집단의 50%에서 치료적으로 효과적인 용량)의 결정을 포함하는, 세포 배양물 또는 실험 동물에서 표준 약학적 절차에 의해 결정된다. 독성 효과와 치료적 효과 사이 용량 비는 치료적 지수이고 LD50과 ED50 사이 비로서 표현된다. 높은 치료적 지수를 나타내는 화합물이 바람직하다. 세포 배양 검정 및 동물 연구로부터 수득된 데이터는 인간에서 사용을 위한 복용량의 범위를 공식화하는데 사용된다. 그러한 화합물의 복용량은 바람직하게는 최소 독성으로 ED50을 포함하는 순환하는 농도의 범위 내에 있다. 복용량은 이용된 복용량 형태 그리고 활용된 투여의 경로에 따라 이 범위 내에서 다양하다.
키트/제조 물품
특정 구현예에서, 본원에 기재된 조성물 및 방법 중 하나 이상으로 사용을 위한 키트 및 제조 물품이 본원에 개시된다. 그러한 키트는 하나 이상의 용기 예컨대 바이알, 튜브, 및 기타 등등을 받도록 구획화되는 담체, 패키지, 또는 용기를 포함하고, 각각의 용기(들)은 본원에 기재된 방법에서 사용되도록 별도 요소 중 하나를 포함한다. 적당한 용기는, 예를 들어, 병, 바이알, 주사기, 및 시험 튜브를 포함한다. 일 구현예에서, 용기는 다양한 재료 예컨대 유리 또는 플라스틱으로부터 형성된다.
본원에 제공된 제조 물품은 패키징 재료를 함유한다. 약학적 패키징 재료의 예는, 비제한적으로, 블리스터 팩, 병, 튜브, 백, 용기, 병, 그리고 선택된 제형 및 의도된 투여 및 치료의 방식에 적당한 임의의 패키징 재료를 포함한다.
예를 들어, 용기(들)은 본원에 개시된 바와 같은 항-CLDN18.2 항체, 본원에 기재된 하나 이상의 항체를 생산하기 위한 숙주 세포, 및/또는 본원에 기재된 항체를 인코딩하는 핵산 분자를 포함하는 벡터를 포함한다. 그러한 키트는 선택적으로 본원에 기재된 방법에서 이의 사용에 관련하는 식별하는 설명 또는 라벨 또는 지침을 포함한다.
키트는 전형적으로 사용을 위한 내용물 및/또는 지침을 열거하는 라벨, 그리고 사용을 위한 지침이 있는 패키지 삽입물을 포함한다. 한 세트의 지침은 또한 전형적으로 포함될 것이다.
일 구현예에서, 라벨은 용기 상에 있거나 또는 용기와 회합되어 있다. 일 구현예에서, 라벨은 라벨을 형성하는 문자, 숫자 또는 기타 캐릭터가 용기 자체에 부착, 금형 또는 식각되는 경우 용기에 접해 있고; 라벨은, 예를 들면, 패키지 삽입물로서 용기를 또한 보관하는 그릇 또는 담체 내에서 존재하는 경우 용기와 연관된다. 일 구현예에서, 라벨은 내용물이 특정 치료적 응용에 사용되기 위한 것임을 나타내는데 사용된다. 라벨은 또한 예컨대 본원에 기재된 방법에서 내용물의 사용을 위한 지시를 나타낸다.
특정 구현예에서, 약학적 조성물은 본원에 제공된 화합물을 함유하는 하나 이상의 단위 복용량 형태를 함유하는 팩 또는 디스펜서 장치로 제시된다. 팩에는, 예를 들어, 금속 또는 플라스틱 호일, 예컨대 블리스터 팩이 들어있다. 일 구현예에서, 팩 또는 디스펜서 장치는 투여를 위한 지침이 동반된다. 일 구현예에서, 팩 또는 디스펜서는 의약품의 제조, 사용, 또는 판매를 규제하는 정부 기관에 의해 규정된 형태로 용기와 연관된 통지와 또한 동반되고, 상기 통지는 인간 또는 수의학 투여를 위한 약물의 형태의 기관의 승인을 반영한다. 그러한 통지는, 예를 들어, 약물 처방을 위하여 미국 식품 의약국에 의해 승인된 라벨링, 또는 승인된 제품 삽입물이다. 일 구현예에서, 호환성 약학적 담체에서 제형화된 본원에 제공된 화합물을 함유하는 조성물은 지정된 병태의 치료를 위하여 또한 제조되고, 적절한 용기에 배치되고, 라벨링된다.
특정 전문용어
달리 정의되지 않는 한, 본원에 사용된 모든 기술 및 과학 용어는 청구된 주제가 속하는 당업자 중 한명에 의해 흔히 이해되는 바와 동일한 의미를 갖는다. 전술한 일반 설명 및 다음의 상세한 설명이 단지 예시적이고 설명적이며 임의의 청구된 주제를 제한하지 않는다는 것이 이해되어야 한다. 본원에서, 단수의 사용은 특별히 달리 명시되지 않는 한 복수를 포함한다. 명세서 및 첨부된 청구항에서 사용된 바와 같이, 단수 형태 "a", "an" 및 "the"는 문맥이 달리 명확하게 지시하지 않는 한 복수 지시대상을 포함한다는 것이 유의되어야 한다. 본원에서, "또는"의 사용은 달리 명시되지 않는 한 "및/또는"을 의미한다. 게다가, 용어 "포함하는" 뿐만 아니라 다른 형태, 예컨대 "포함하다", "포함한다", 및 "포함된"의 사용은 제한되지 않는다.
본원에 사용된 바와 같이, 범위 및 양은 "약" 특정한 값 또는 범위로서 표현될 수 있다. 약은 또한 정확한 양을 포함한다. 이러 이유로 "약 5 μL"는 "약 5 μL" 및 또한 "5 μL"를 의미한다. 일반적으로, 용어 "약"은 실험 오차 이내, 예를 들면, 15%, 10%, 또는 5% 이내인 것으로 예상될 양을 포함한다.
본원에 사용된 섹션 제목은 구성 목적으로만 사용되며 기재된 주제를 제한하는 것으로 해석되지 않아야 한다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어 "개체(들)", "대상(들)" 및 "환자(들)"는 임의의 포유류를 의미한다. 일부 구현예에서, 포유류는 인간이다. 일부 구현예에서, 포유류는 비-인간이다. 어떤 용어도 의료 종사자 (예를 들면 의사, 등록 간호사, 전문 간호사, 의사 보조원, 잡역 또는 호스피스 직원)의 감독 (예를 들면 지속적 또는 간헐적)을 특징으로 하는 상황을 요구하거나 이에 제한되지 않는다.
용어 "폴리펩타이드", "펩타이드" 및 "단백질"은 임의의 길이의 아미노산의 폴리머를 지칭하기 위해 본원에서 호환적으로 사용된다. 폴리머는 선형, 환형, 또는 분지형일 수 있고, 변형된 아미노산을 포함할 수 있고, 비-아미노산에 의해 방해될 수 있다. 상기 용어는 또한, 예를 들어, 황화, 당화, 지질화, 아세틸화, 인산화, 요오드화, 메틸화, 산화, 단백질 분해처리, 인산화, 프레닐화, 라세미화, 셀레노일화, 단백질에 아미노산의 전이-RNA 매개된 부가 예컨대 아르기닐화, 유비퀴틴화, 또는 임의의 기타 교정, 예컨대 라벨링 구성요소와 컨쥬게이션을 통해 변형된 아미노산 폴리머를 포괄한다.
본원에 사용된 바와 같이 용어 "아미노산"은, 글리신 및 양쪽 D 또는 L 광학 이성질체, 그리고 아미노산 유사체 및 펩타이드모방체를 포함하는, 어느 한쪽 천연 및/또는 부자연스러운 또는 합성 아미노산을 지칭한다.
지명된 단백질"에서 유래된" 폴리펩타이드 또는 아미노산 서열은 폴리펩타이드의 기원을 지칭한다. 바람직하게는, 폴리펩타이드는 서열에서 인코딩된 폴리펩타이드의 것, 또는 한 부분이 적어도 10-20 아미노산, 또는 적어도 20-30 아미노산, 또는 적어도 30-50 아미노산으로 이루어지는 한 부분과 본질적으로 동일한, 또는 서열에서 인코딩된 폴리펩타이드와 면역학적으로 식별가능한 아미노산 서열을 갖는다. 이러한 전문용어는 또한 지명된 핵산 서열로부터 발현된 폴리펩타이드를 포함한다.
Kabat 넘버링 시스템과 관련하여, 항체 중쇄 분자 내에서 CDR은 전형적으로, 1개 또는 2개 추가의 아미노산을 선택적으로 포함할 수 있는, 아미노산 위치 31 내지 35, (35 A 및 35B로서 Kabat 넘버링 스킴에서 지칭된) 35 (CDR1)에 이어서, 아미노산 위치 50 내지 65 (CDR2), 및 아미노산 위치 95 내지 102 (CDR3)에 존재한다. Kabat 넘버링 시스템을 사용하여, 항체 경쇄 분자 내에서 CDR은 전형적으로 아미노산 위치 24 내지 34 (CDR1), 아미노산 위치 50 내지 56 (CDR2), 및 아미노산 위치 89 내지 97 (CDR3)에 존재한다. 당업자에게 널리 공지된 바와 같이, Kabat 넘버링 시스템을 사용하여, 항체 가변 도메인의 실제 선형 아미노산 서열은 FR 및/또는 CDR의 단축 또는 연장으로 인해 더 적거나 추가의 아미노산을 함유할 수 있고, 그래서, 아미노산의 Kabat 번호는 이의 선형 아미노산 번호와 반드시 동일하지 않다.
실시예
이들 실시예는 설명적 목적으로만 제공되고 본원에 제공된 청구범위를 제한하기 위한 것은 아니다.
실시예 1 - 표적 및 시약
CLDN18.2를 과-발현시키는 HEK293 및 CHO 세포는 면역화 및 스크리닝 목적으로 NovoBioSci 및 Genomeditech에서 생성되었다. CLDN18.2를 발현시키는 HEK293 세포는 IRES에 의해 GFP와 공-발현되었다. GFP 및 CLDN18.2의 발현은 CLDN18 (ab203563)에 대해 상업적으로 이용가능한 형광-라벨링된 항체로 염색함으로써 입증되었다 (도 1). CHO 세포에서 CLDN18.2의 발현은 DNA 시퀀싱에 의해 확인되었다.
실시예 2 - 면역화
항체를 생성하기 위한 랫트의 면역화는 하기 면역화 일정 (표 10)을 사용하여 실행된다. 간단히 말해서, 첫번째 2개 면역화에서, 2개 유형의 DNA 작제물, 어느 한쪽 세포외 루프 1 (ECL1, 도 3) 단독 또는 전장 CLDN18.2 (도 2) DNA가 사용되었다. 세번째 면역화는 CLDN18.2를 과-발현시키는 HEK293 세포로 실시되었고, 네번째 면역화는 CLDN18.2를 과-발현시키는 세포와 어느 한쪽 상응하는 DNA 또는 DNA를 사용하여 실시되었다. 최종 부스트는 CLDN18.2를 과-발현시키는 HEK293 세포로 실시되었다. 4마리 랫트는 융합에 사용되었다.
Figure pct00012
마우스 면역화 (표 11)를 위하여, CLDN18.2를 과-발현시키는 CHO 또는 HEK293 세포는 4 라운드의 면역화 더하기 최종 부스트에서 사용되었다. 4마리 마우스는 각 그룹에서 사용되었고 3개의 융합은 수행되어 하이브리도마를 생성하였다.
Figure pct00013
실시예 3 - FACS 결합에 의한 일차 하이브리도마 클론의 스크리닝
하이브리도마 상청액은 CHO-CLDN18.2에 특이적으로 결합하였다. 총 80개의 96-웰 플레이트는 씨딩되었고 면역화된 동물의 하이브리도마로부터 세포-기반된 ELISA에 의해 스크리닝되었다. 194개 클론은 > 0.3의 OD 값에 기반하여 양성으로서 식별되었다. CLDN 18.1이 아닌 CLDN18.2에 특이적으로 결합하였던 항체를 수득하기 위해, 조작된 세포주, CHO-CLDN18.1 및 CHO-CLDN18.2를 이용한 랫트 또는/및 마우스 면역화로부터의 하이브리도마는 스크리닝되었다. 간단히, 50 μL CHO-CLDN18.1 또는 CHO-CLDN18.2 세포 (세포 밀도: 2x106 세포/mL, 생존력>90%)는 1시간 동안 4℃에 96 웰 플레이트에서 동등 부피 하이브리도마 상청액으로 인큐베이션되었다. FACS 완충액 (2% FBS를 함유하는 DPBS)으로 세정된 후, 세포/항체 혼합물은 이차 항체 (Goat anti Rat IgG(H+L) iFlour 647, Genscript, 또는 Alexa Flour® 647-컨쥬게이션된 토끼 항-마우스 IgG, Jackson ImmunoResearch)로 염색되었다. 마지막으로, 혼합물은 세정되었고 FACS 완충액으로 재현탁되었고, BD FACS Celesta에서 FACS 분석을 거쳤다. 미가공 데이터는 FlowJo 소프트웨어로 분석되었다.
면역화된 랫트로부터의 7개 하이브리도마 및 면역화된 마우스로부터의 31개 하이브리도마는 CHO-CLDN18.1 세포에 대한 그들 각자의 결합과 비교된 경우 CHO-CLDN18.2에 대한 더 강한 특정 결합을 보여주었다.
실시예 4 - 정제된 항체는 CHO-CLDN18.2에 특이적으로 결합한다
정제된 항체는 상청액으로부터 단백질 G 친화성 정제에 의해 생성되었다. 간단히, 하이브리도마 상청액은 30 분 동안 8000 rpm 및 4℃에 원심분리되었다. 다음으로 상청액은 0.22 μm 정밀여과 막으로 여과되었다. NaCl은 10 mL 상청액에 대하여 1 g NaCl의 비로 상청액에 첨가되었다. 상청액 샘플은 4℃에 3 mL / 분의 속력으로 정제 컬럼 상에 장입되었다. 단백질 G 수지는 4-5 컬럼 부피의 1 x PBS로 평형화되었고, 그 다음 용출액 완충액 (0.1M Tris, pH12)으로 세정되었다. 중성화 완충액은 그 다음 용출된 항체를 함유하는 수집 튜브에 즉시 첨가되어 pH를 중성화하였다. 다음으로, 용출된 항체는 2 시간 동안 실온에서 1xPBS에 대해 투석되었다. 항체는 후속적으로 분석을 위하여 저장되었다.
정제된 랫트 항체는 상기 기재된 방법에 따라 CLDN18.2 또는 CLDN18.1을 과-발현시키는 세포를 사용하는 결합 검정에서 시험되었다. 4개 정제된 랫트 항체 181B7B7, 193H11D8, 184A10D8, 및 282A12F3은 CLDN 18.1이 아닌, CLDN18.2에 특이적 결합을 보여주었다. 특히, 282A12F3은 참조 항체 175D10보다 CLDN18.2에 더 강한 결합을 보여주었고, 2개 정제된 랫트 항체 101C6A8 및 186A4B9는 양쪽 CLDN18.1 및 CLDN18.2에 결합하였다.
325F12H3, 325E8C8, 328G2C4, 350G12E1, 357B8F8, 360F1G1, 364D1A7, 382A11H12, 399H6A10, 406D10H7, 408B9D4, 409E2C5, 413B5B4, 413H9F8, 416E8G10, 417H3B1, 420G5E2, 및 429G1B7을 포함하는 18개 정제된 마우스 항체는 CLDN18.1이 아닌, CLDN18.2에 특이적 결합을 보여주었다. 특히, 325E8C8, 350G12E1, 357B8F8, 364D1A7, 408B9D4, 및 413H9F8은 참조 항체 175D10보다 CHO-CLDN18.2에 더 강한 결합을 보여주었다.
실시예 5 - 정제된 항체의 결합 곡선
결합 곡선은 하이브리도마 항체의 결합 친화성을 등급화하기 위해 생성되었다. 간단히, 각 웰에 대하여 총 1x105 CHO-CLDN18.2 세포는 96-웰 플레이트에서 씨딩되었고 FACS 완충액 (2% FBS를 함유하는 DPBS)에 의해 2회 세정되었다. 세포는 1 시간 동안 시리즈 희석된 정제된 하이브리도마 항체에 의해 인큐베이션되었다. 일차 항체 인큐베이션 후, 세포는 FACS 완충액에 의해 2회 동안 세정되었다. 그 다음, 세포는 이차 항체 (Alexa Flour® 647-컨쥬게이션된 토끼 항-마우스 IgG, Jackson ImmunoResearch)로 염색되었다. 염색된 세포의 Alexa Fluor 647 신호는 BD FACS Celesta에 의해 검출되었고 기하학적 산술평균 형광 신호는 결정되었다. FlowJo 소프트웨어는 분석에 사용되었다. 데이터는 항체 농도 대 산술평균 형광 신호의 로그로서 플롯팅되었다. 비선형 회귀 분석은 GraphPad Prism 6 (GraphPad Software)에 의해 수행되었고 EC50 값은 계산되었다.
도 4a-도 4c에서 도시된 바와 같이, 정제된 항-CLDN18.2 마우스-생성된 항체는 CHO-CLDN18.2 세포에서 용량-의존적 결합을 보여주었다. 18개 시험된 항체 중 5개 항체, 325E8C8, 350G12E1, 364D1A7, 408B9D4, 및 413H9F8은 참조 항체 175D10의 것과 비교하여 최고 최대 결합을 보여주었다 (도 4a). 5개 항체, 417H3B1, 413B5B4, 357B8F8, 360F1G1 및 429G1B7은 175D10의 것보다 더 높은 그러나 항체 325E8C8, 350G12E1, 364D1A7, 408B9D4, 및 413H9F8 미만인 최대 결합을 보여주었다 (도 4b). 추가의 시험된 항체는 175D10의 것과 비교하여 유사한 또는 더 약한 최대 결합을 보여주었다 (도 4c). CLDN18.2에 대한 선택 항-CLDN18.2 항체의 EC50은 약 10 nM 이하이었다 (표 12).
Figure pct00014
본원에서 그리고 하기 표에서 사용된 용어 "na."는 "적용불가능"을 나타낸다.
실시예 6 - 위암 세포주에 대한 항체의 결합
위암 세포주 SNU601 및 SNU620은 CLDN18.2의 내인성 발현을 갖는다. SNU601 및 SNU620 세포에서 CLDN18.2의 발현은 CLDN18.2 특이적 프라이머 및 DNA 시퀀싱을 사용하는 RT-PCR에 의해 확인되었다. CLDN18.2의 발현이 높은 SNU601 및 SNU620 세포는 결합 검정을 위하여 선별되었다. 결합 검정은 이전에 기재된 바와 같이 수행되었다. 랫트 생성된 클론 282A12 및 101C6 및 참조 항체 175D10은 모두 위암 계통 SNU601에 결합하였지만, 클론 282A12 및 101C6은 또한 SU620에 결합하였다 (도 5a 및 도 5b).
SNU620 세포주는 내인성 발현된 CLDN18.2에 대한 마우스 단클론성 항체의 결합 친화성을 결정하는데 사용되었다. 모든 뮤린-면역화된 양성 항체는 10 μg/mL의 최종 농도로 시험되었다. 325F12H3, 325E8C8, 328G2C4, 350G12E1, 360F1G1, 364D1A7, 406D10H7, 408B9D4, 409E2C5, 413B5B4, 413H9F8, 416E8G10, 417H3B1, 420G5E2, 및 429G1B7을 포함하는 18개 마우스 단클론성 항체 중에서 15개는 175D10과 비교하여 SU620에 더 강한 결합을 보여주었다. 특히, 413H9F8, 364D1A7, 및 408B9D4는 SNU620 암 세포에 강하게 결합하였다.
요약하면, 항체 예컨대 282A12F3, 364D1A7, 및 413H9F8은 CHO-CLDN18.2 및 위암 SNU620에 특이적으로 결합하였다 (표 13).
Figure pct00015
실시예 7 - 키메라화
뮤린 및 랫트 항체는 인간 IgG1의 불변 영역 그리고 신호 서열의 아미노산을 인코딩하는 DNA 서열을 포함하는 pCDNA3.1(+) 플라스미드에서 뮤린 및 랫트 경쇄 가변 영역을 발현시킴으로써 키메라화되었다. 인간 IgG1의 중쇄 및 경쇄 불변 영역 (CH 및 CL)의 서열은 표 4에서 나타난다.
CHO-CLDN18.2 세포주에서 키메라 항체의 결합 친화성은 이전에 기재된 바와 같이 결정되었다. 도 6a-도 6d에서 도시된 바와 같이, 키메라 항체 282A12F3, 64D1A7, 및 413H9F8은 CLDN18.2에 특이적으로 결합한다. 키메라 282A12F3, 64D1A7 및 413H9F8은 참조 항체 175D10과 비교해서 더 강한 결합 친화성을 보여주었다.
실시예 8 - 번역후 변형 부위의 제거 및 항체 서열 분석
하이브리도마 기술에 의한 항체의 서열은, 치료적 단백질의 개발 동안 문제점 예컨대 증가된 이질성, 감소된 생물활성, 감소된 안정성, 면역원성, 단편화 및 응집을 때때로 야기시키는, 번역후 변형 (PTM)을 위하여 분석되었다. PTM의 잠재적 영향은 그들의 위치 그리고 일부 경우에 용매 노출에 의존한다. 모든 서열의 CDR은 아스파라긴 탈아미노화, 아스파르테이트 이성질체화, 유리 시스테인 티올 기, N-당화, 산화, 및 잠재적 가수 분해 부위에 의한 단편화로 분석되었다.
인간 생식계열 서열에 대한 부계 서열의 다중 정렬은 Igblast 도구를 사용하여 수행되었다. 인간 생식계열에 대한 부계 항체 서열 정렬에 기반하여, 최고 상동성 엔트리가 확인되었다.
항체 282A12F3, 413H9F8 및 364D1A7의 구조적 모델은 맞춤형 빌드 호몰로지 모델 (Build Homology Models) 프로토콜을 사용하여 생성되었다. 후보 구조적 템플레이트 단편은 표적에 대한 그들의 서열 동일성, 뿐만 아니라 템플레이트 구조의 정성적 결정학적 측정에 기반된 PDB 데이터베이스로부터 채점, 등급 및 선택되었다. 개별적으로 282A12F3, 413H9F8, 364D1A7에 대하여 상동성 모델링 데이터에 기반하여, 프레임워크 영역 (FR) 및 CDR 영역에서 노출된 잔기는 식별되었고, 단백질 구조 표면 상에서 잠재적 PTM 부위는 강조되었다. 인간 생식계열 템플레이트에 대한 서열 동일성 및 PTM 분석 데이터에 기반하여, 3개 항체 282A12F3, 413H9F8, 및 364D1A7은 추가 인간화를 위하여 부계 항체로서 활용되었다.
PTM 부위 제거된 돌연변이체의 결합 시험은 양성 대조군으로서 참조 항체 175D10과 함께, CLDN18.2 또는 CLDN18.1을 발현시키는 세포에서 시험되었다. 도 7a-도 10b에서 도시된 바와 같이, 잠재적 PTM 부위 제거 후, 282A12F3 클론으로부터 282A12F3-VH-N60Q, 282A12F3-VH-N60E, 및 282A12F3(T62A), 413H9F8 클론으로부터 413H9F8-VL-N31E, 413H9F8-VL-S32L, 및 413H9F8-VL-S32V, 그리고 364D1A7 클론으로부터 364D1A7-VL-N31E, 364D1A7-VL-S32L, 및 364D1A7-VL-S32V는 CHO-CLDN18.1 세포주 대신 CHO-CLDN18.2에 특이적 결합을 보여주었다. 잠재적 PTM 부위 제거를 가진 항체들 모두는 CHO-CLDN18.2 세포에 대한 참조 항체 175D10과 비교하여 더 강한 결합을 가졌다. 357B8F8 클론으로부터 357B8F8-VH-N60E-VL-N31E, 357B8F8-VH-N60E-VL-S32I, 357B8F8-VH-S61I-VL-N31E, 및 357B8F8-VH-S61I-VL-S32I는 CHO-CLDN18.2에 특이적 결합을 보여주었지만, 357B8F8-VH-S61I-VL-S32I만은 CHO-CLDN18.2에 대한 175D10 (xi175D10)과 비교가능한 결합 친화성을 보여주었다.
PTM 제거 돌연변이를 가진 키메라 클론은 상기 기재된 바와 같이 내인성 CLDN18.2 발현을 가진 SNU620에 대한 그들의 결합에 대하여 시험되었다. 도 11a-도 11c에서 도시된 바와 같이, 양쪽 413H9F8 및 364D1A7 변이체는 SNU620에 상이한 수준으로 결합하였다. S32V 및 S32L 돌연변이체는 N31E 돌연변이체보다 CHO-CLDN18.2 및 SNU620 세포에 더 양호한 결합 활동성을 보여주었다. 클론 413H9F8은 364D1A7보다 CLDN18.2에 더 양호한 결합 활동성을 보여주었다. 키메라 357B8F8, 및 이의 PTM 제거 변이체는 SNU620 암 세포주에 결합할 수 없고, 이는 참조 항체 175D10과 유사하다.
실시예 9 - 키메라 항체의 경쟁적 결합
CLDN18.2의-결합 항체의 에피토프 결합 그룹을 조사하기 위해, 4개 키메라 항체는 CHO-CLDN18.2 세포를 사용하여 그들의 경쟁적 결합 활동성에 대하여 시험되었다. 각 항체의 작업 농도는 CHO-CLDN18.2 세포-기반된 결합 검정에 의해 결정되었다. 세포는 수집되었고 PBS로 세정되었고, 그 다음 PBS내 50 μL의 1x105 세포는 96-웰 플레이트에 첨가되었다. 시험 항체는 12개 지점에 대하여 3-배 시리즈에서 PBS로 60 μg/mL로부터 희석되었고 50 μL의 희석된 항체는 세포와 혼합되었고, 4℃에 120 분 동안 인큐베이션되었다. 다음으로, 웰들은 PBS로 세정되었다. 경쟁적 결합 검정을 위하여, 100 μL 비오틴-라벨링된 항-CLDN18.2 항체는 작업 농도 (5, 1, 0.5 및 1 μg/mL의 xi175D10, 282A12F3 (T62A), 413H9F8-VL-S32V, 및 364D1A7-VL-S32V 각각)로 첨가되었다. 비오틴-라벨링된 염소 항-인간 IgG Fc는 대조군으로서 100 μL/웰에서 1:800 희석으로 첨가되었다. 플레이트는 4℃에 40 분 동안 인큐베이션되었다. 스트렙타비딘-APC (1:1700)는 비오틴-라벨링된 항체를 검출하는데 사용되었다. 유세포 분석은 결합을 측정하기 위해 수행되었다.
CHO-CLDN18.2에서 175D10의 결합은 282A12F3 (T62A), 413H9F8-VL-S32V, 또는 364D1A7-VL-32V에 의해 완전히 억제되었다 (도 12a-도 12d). CHO-CLDN18.2에서 282A12 (T62A)의 결합은 413H9F8-VL-S32V 또는 364D1A7-VL-S32V에 의해 완전히 억제되었고, 175D10에 의해 부분적으로 억제되었다. CHO-CLDN18.2에서 413H9F8-VL-S32V 및 364D1A7-VL-S32V의 결합은 175D10 또는 282A12F3 (T62A)에 의해 부분적으로 억제되었다.
실시예 10 - 마우스 및 사이노몰구스 CLDN18.2에 관한 교차-결합 활동성
종 교차-반응성은 약리학 모델 (마우스) 및 독성 모델 (사이노몰구스 원숭이)에서 임상 후보의 평가를 가능하게 한다. 항-인간 CLDN18.2 항체의 종 교차-반응성은 세포 기반된 결합 검정에 의해 결정되었다. 뮤린 및 사이노몰구스 CLDN18.2에 대한 확인된 단클론성 항체의 결합은 유세포 분석에 의해 분석되었다. HEK293 세포는 형광 마커 및 뮤린 CLDN18.2 및 사이노몰구스 CLDN18.2로 일시적으로 공-형질감염되었다. 간단히, 접시 당 2.5×106 HEK-293 세포는 각 접시에 대하여 10 mL DMEM 배지가 있는 2개 10-cm2 접시에 플레이팅되었다. 플레이팅 24 시간 후, 세포는 마우스 GFP-CLDN18.2 및 사이노몰구스 GFP-CLDN18.2 플라스미드로 형질감염되었다. 접시 당 10 μg의 총 플라스미드 덩어리는 20 μL Lipofectamine 2000 (Life Technologies)을 사용하여 형질감염되었다. 배양 배지는 형질감염 5 시간 후 대체되었다. 형질감염 48 시간 후, 세포는 해리되었고 결합 친화성 검출을 위하여 준비되었다. 인간 CLDN18.2를 발현시키는 안정한 세포주 HEK293-GFP-CLDN18.2는 인간 GFP-CLDN18.2를 검출하는데 사용되었다.
항-인간 CLDN18.2 항체의 결합 친화성은 인간, 마우스 및 사이노몰구스 CLDN18.2 과-발현시키는 세포에 관해 결정되었다. 간단히, 각 웰에 대하여 1×105 세포는 96-웰 플레이트에서 씨딩되었고 2회 동안 FACS 완충액 (2% FBS를 함유하는 D-PBS)에 의해 세정되었다. 세포는 1 시간 동안 시리즈 희석된 항-CLDN18.2 항체에 의해 인큐베이션되었다. 대조 그룹은 인간 IgG1로 인큐베이션된 암 세포를 포함하였다. 일차 항체 인큐베이션 후, 세포는 2회 동안 FACS 완충액에 의해 세정되었다. 그 다음, 세포는 4℃에 30 분 동안 Alexa Fluor 647 라벨링된 항-인간 IgG 이차 항체 (Jackson ImmunoResearch Laboratories)에 의해 염색되었다. 염색된 세포의 Alexa Fluor 647 및 GFP 신호는 BD FACS Celesta에 의해 검출되었고 기하학적 산술평균 형광 신호는 결정되었다. FlowJo 소프트웨어는 분석에 사용되었다. 데이터는 Alexa Fluor 647 /GFP에 의해 항체 농도 대 산술평균 형광 비로서 플롯팅되었다. 비선형 회귀 분석은 GraphPad Prism 6 (GraphPad Software)에 의해 수행되었다. 도 13a-도 13e에서 도시된 바와 같이, 키메라 항체 413H9F8, 364D1A7, 및 357B8F8, 인간화된 282A12(T62A) (hz282-11) 및 참조 항체 175D10의 변이체는 마우스 및 사이노몰구스 CLDN18.2와 교차 반응하였다. 시험된 항체들 모두는 사이노몰구스 및 마우스 CLDN18.2의 것과 비교하여 인간 CLDN18.2에 더 강한 결합을 보여주었다.
실시예 11 - 키메라 항체의 항체-의존적 세포성 세포독성 (ADCC)
키메라 항-CLDN18.2 항체는 CHO-CLDN18.2 세포에서 특이적 ADCC를 유도하였다.
항-CLDN18.2 항체 유도된 ADCC의 특이성은 CHO-CLDN18.1 및 CHO-CLDN18.2 세포에서 시험되었다. 표적 세포, CHO-CLDN18.1 및 CHO-CLDN18.2는 30 분 동안 2.5 μM의 최종 농도로 CFSE (Life technology)에 의해 라벨링되었다. 라벨링된 표적 세포 농도는 2×105 세포/mL로 조정되었고, 이펙터 세포 (ImmuneOnco사에 의해 개발된 CD16a를 과발현시키는 조작된 NK92 세포주이었던, FcR-TANK (CD16A-15V))는 8×105 세포/mL로 조정되었다. 그 다음, 50 μL의 표적 세포 현탁액, 100 μL의 이펙터 세포 현탁액 및 50 μL의 시리즈 희석된 항체는 각 웰에서 혼합되었다 (이펙터 세포/표적 세포 비는 8:1이었다). 이중 웰은 각 농도의 항체에 대하여 준비되었다. 대조 그룹은 이펙터 세포만으로 인큐베이션된 암 세포를 포함하였다. 4-16 시간 동안 37℃, 5% CO2에서 인큐베이션 후, 1 μg/mL 7-AAD (Invitrogen)는 첨가되었고 유세포 분석 (BD FACS Celesta)에 의해 분석되었다. ADCC는 공식: ADCC % = 항체가 있는 % 7-AAD 양성 세포 - 항체가 없는 % 7-AAD 양성 세포에 의해 계산되었다.
항-CLDN18.2 항체 및 FcR-TANK (CD16A-15V) 세포는 NCI-N87-CLDN18.2 위 세포주에서 ADCC를 유도하였다
키메라 항체 및 인간화된 항체의 ADCC는 NCI-N87 암 세포에서 시험되었다. 표적 세포는 30 분 동안 2.5 μM의 최종 농도에서 CFSE (Life technology)에 의해 라벨링되었다. 라벨링된 표적 세포 농도는 2×105 세포/mL로 조정되었고, 이펙터 세포 (FcR-TANK (CD16A-15V)는 8×105 세포/mL로 조정되었다. 그 다음, 50 μL의 표적 세포 현탁액, 100 μL의 이펙터 세포 현탁액 및 50 μL의 시리즈 희석된 항체는 각 웰에서 혼합물이었다 (이펙터 세포/표적 세포 비는 8:1이었다). 이중 웰은 각 농도의 항체에 대하여 준비되었다. 대조 그룹은 이펙터 세포만으로 인큐베이션된 암 세포를 포함하였다. 4-16 시간 동안 37℃, 5% CO2에서 인큐베이션 후, 1 μg/mL 7-AAD (Invitrogen)는 첨가되었고 유세포 분석 (BD FACS Celesta)에 의해 분석되었다. ADCC는 공식: ADCC % = 항체가 있는 % 7-AAD 양성 세포 - 항체가 없는 % 7-AAD 양성 세포에 의해 계산되었다.
인간 말초 혈액 단핵 세포 (PBMC)는 NUGC4-CLDN18.2 위암 세포주에서 ADCC를 유도하였다
PBMC에 의해 유도된 키메라 항체 및 인간화된 항체의 ADCC는 NUGC4-CLDN18.2 위암 세포에서 시험되었다. 건강한 대상체의 저온보존된 PBMC (AllCells)는 검정 1일 전 해동되었고 CO2 인큐베이터에서 200 IU IL-2 (R&D)가 있는 RPMI-10% FBS에서 밤새 배양되었다. 표적 세포는 15 분 동안 2.5 μM의 최종 농도에서 CFSE (Life technology)에 의해 라벨링되었다. 염색 후, 세포 농도는 6×104 세포/mL로 조정되었고 1×106 세포/mL로 조정된 PBMC의 2-배 부피와 혼합되었다 (이펙터 세포/표적 세포 비는 40:1이었다). 그 다음, 150 μL의 혼합된 표적 및 이펙터 세포 현탁액 및 50 μL의 시리즈 희석된 항체는 각 웰에서 혼합되었다. 이중 웰은 각 농도의 항체에 대하여 준비되었다. 표적 세포 단독은 대조 그룹이었다. 5 시간 동안 37℃, 5% CO2에서 인큐베이션 후, 1 μg/mL PI (Invitrogen)은 첨가되었고 유세포 분석 (BD FACS Celesta)에 의해 분석되었다. 특이적 세포독성은 공식: 특이적 세포독성 = 항체가 있는 % PI 양성 세포 - 항체가 없는 % PI 양성 세포에 의해 계산되었다.
종양 특이적 mAb는 항체-의존적 세포-매개된 세포독성 (ADCC)을 포함하는 Fc-기반된 기전을 통해서 그들의 효과를 발휘할 수 있다. CLDN18.2의 특이적 키메라 항체의 ADCC 기능은 선택된 항체의 존재 하에서 NK 세포주 또는 PBMC 유도된 ADCC에 의해 분석되었다. 도 14a-도 14b에서 도시된 바와 같이, 키메라 항체는 인간 CLDN18.1 (CHO-CLDN18.1) 또는 인간 CLDN18.2 (CHO-CLDN18.2)의 안정적 발현을 가진 CHO 세포에 대해 FcR-TANK (CD16A-15V)로 ADCC를 유도하는 그들의 능력에 대하여 분석되었다. CLDN18.2 특이적 항체, 282A12F3 (T62A), xi175D10, 413H9F8, 및 364D1A7은 CHO-CLDN18.1이 아닌 CHO-CLDN18.2의 ADCC 매개된 용해를 유도하였다. 양쪽 CLDN18.1 및 CLDN18.2에 결합하는, 클론 101C6은 양쪽 CHO-CLDN18.1 및 CHO-CLDN18.2 세포에 대해 ADCC 활동성을 유도하였다. 282A12F3 (T62A), xi175D10, 413H9F8, 및 364D1A의 특이적 ADCC 활동성은 CLDN18.2에 대한 그들의 특이적 결합 프로파일과 일치한다.
인간 CLDN18.2 (NCI-N87-CLDN18.2)의 안정한 발현을 가진 위암 주 NCI-N87은 키메라 항체의 ADCC 활동성을 시험하기 위한 표적 세포로서 사용되었다. 도 15 및 표 14에서 나타난 바와 같이, 282A12F3 (T62A), 참조 항체 175D10, 413H9F8, 및 364D1A7은 NCI-N87-CLDN18.2 세포의 ADCC 매개된 용해를 유도하였다. 클론 282A12F3, 413H9F8, 및 364D1A7은 참조 항체 175D10보다 더 강한 ADCC 활동성을 보여주었고, 반면 357B8F8은 더 약한 활동성을 보여주었다. S239D/I332E Fc 변이체는 항체의 향상된 ADCC 활동성을 매개하는 것으로 나타났다 (Lazar, 등, "Engineered antibody Fc variants with enhanced effector funciton," PNAS USA 2006; 103: 4005-4010). 175D10의 Fc에서 S239D/I332E 돌연변이는 ADCC 활동성 (175D10-V2)을 향상시키기 위해 도입되었다. 도 15 및 표 14에서 나타난 바와 같이, Fc (xi175D10-V2)에서 S239D/I332E 돌연변이를 가진 175D10은 이의 부계 항체 175D10보다 더 강한 ADCC 활동성을 가졌다.
CLDN18.2의 특이적 항체의 기능을 추가로 검증하기 위해, 건강한 인간 기증자로부터 저온보존된 PBMC는 CLDN18.2 (NUGC4-CLDN18.2)의 안정한 발현을 가진 또 다른 위암 주 NUGC4에 대한 그들의 ADCC 활동성을 시험하는데 사용되었다. 도 16 및 표 15에서 나타난 바와 같이, 282A12F3 (T62A), xi175D10, 413H9F8, 및 364D1A7은 농도 의존적 방식으로 NUGC4-CLDN18.2 세포의 ADCC 매개된 용해를 유도하였다. 282A12F3, 357B8F8, 413H9F8, 및 364D1A7은 대조 항체175D10보다 더 강한 ADCC 활동성을 보여주었고, 413H9F8는 최고 최대 특이적 세포독성을 보여주었다.
Figure pct00016
Figure pct00017
실시예 12 - 키메라 항체의 보체-의존적 세포독성 (CDC) 활동성
일부 사례에, 종양 특이적 mAb는 또한 보체-의존적 세포독성 (CDC)을 통해서 그들의 효과를 발휘한다. 인간 혈청 및 CHO-CLDN18.2 세포주는 키메라 항체의 CDC 기능을 검증하는데 사용되었다. 50 μL 3x104 CHO-CLDN18.2 세포는 25 μL 일련의 희석된 키메라 항-인간 CLDN18.2 mAb와 혼합되었다. 실온에서 15~30 분 동안 인큐베이션됨. 25 μL의 40% 인간 혈청은 첨가되어 10%의 최종 혈청 농도를 얻었다. 30 분 동안 37℃, 5% CO2에서 인큐베이션 후, 1 μg/mL PI (Invitrogen)는 첨가되었고 유세포 분석 (BD FACS Celesta)에 의해 분석되었다.
도 17에서 도시된 바와 같이, 키메라 항체, 282A12F3 (T62A), xi175D10, 413H9F8-VL-S32V, 및 364D1A7-VL-S32V는 CHO-CLDN18.2의 CDC 매개된 용해를 유도하였다. 항체 282A12F3 (T62A), 413H9F8-VL-S32V, 및 364D1A7-VL-S32V는 참조 항체 175D10과 비교하여 더 강한 CDC를 유도하였다.
실시예 13 - 예시적 항-CLDN18.2 항체의 인간화
항체 282A12F3의 인간화
뮤린 항체의 인간화는 CDR 잔기를 마우스 항체로부터 인간 생식계열 프레임워크에 그라프팅함으로써 수행되었다. 먼저, 선택된 후보의 VH 및 VL 영역의 서열은 인간 생식계열 서열과 비교되었고, 가장 적합한 생식계열 억셉터는 상동성, 표준 구조 및 물리적 속성에 기반하여 선택되었다. 후속적으로, 후보의 구조 모델은 상동성 모델링을 사용하여 생성되었다. 후보 항체의 양쪽 중쇄 및 경쇄에서 CDR 영역은 고정되었고 뮤린 프레임워크는 선택된 인간 생식계열 프레임워크로 대체되었다. CDR 입체배치에 잠재적으로 영향을 미치는 마우스와 인간 프레임워크 사이 상이한 잔기는 복귀 돌연변이를 거치게 되었다. 설계된 인간화된 변이체를 인코딩하는 DNA 단편은 합성되었고 IgG 발현 벡터로 서브클로닝되었다. DNA 서열은 시퀀싱에 의해 확인되었다. 인간화된 중쇄 및 경쇄의 상이한 조합은 CHO-K1에 발현을 위하여 공-형질감염되었다. 인간화된 항체는, 예를 들어, 표적 항원을 발현시키는 세포에서 FACS에 의해 항원 결합 친화성에서 부계 항체와 비교되었다.
T부터 A까지 돌연변이된 VH 서열에서 1개의 당화 부위가 있었다. 상기 서열은 또한 유리 시스테인 또는 Asn/Asp 분해 모티프 NG 또는 DG를 함유하지 않았다. 282A12 VH (서열번호: 40) 및 282A12 VL (서열번호: 44)의 원래 서열은 분석을 위하여 BLAST에 입력되었고; 최상의 돌연변이 부위의 서열은 CDR 그라프팅을 위한 상동성 분석에 따라 선택되었다.
서열번호: 65-68은 4개 변이체 282A12 VH 서열을 실례하고 서열번호: 69-73은 5개 변이체 282A12 VL 서열을 실례한다.
표 6은 282A12F3 (T62A)의 인간화된 중쇄 및 경쇄 조합을 실례한다.
항체 413H9F8-VL-S32V의 인간화
약간 상이한 CDR-그라프팅 접근법이 있는 2개 전략은 413H9F8-VL-S32V의 인간화 설계에 활용되었다. 서열번호: 74-76은 3개 변이체 413H9F8 VH 서열을 실례하고 서열번호: 77-80은 첫번째 전략을 활용하였던 4개 변이체 413H9F8 VL 서열을 실례한다. 표 7은 413H9F8-VL-S32V 유도체의 인간화된 중쇄 및 경쇄 조합을 실례한다.
두번째 전략 하에서, 서열번호: 81-84는 4개 변이체 413H9F8 VH 서열을 실례하고 서열번호: 85-88은 4개 변이체 413H9F8 VL 서열을 실례한다. 표 8은 413H9F8-VL-S32V 유도체의 인간화된 중쇄 및 경쇄 조합을 실례한다.
364D1A7-VL-S32V의 인간화
서열번호: 89-92는 4개 변이체 364D1A7 VH 서열을 실례하고 서열번호: 93-97은 5개 변이체 364D1A7 VL 서열을 실례한다. 표 9는 364D1A7-VL-S32V 유도체의 인간화된 중쇄 및 경쇄 조합을 실례한다.
실시예 14 - 인간화된 282A12F3 (T62A) 항체의 결합 활동성
인간화된 항체의 결합 친화성 및 특이성은 상기 기재된 CHO-CLDN18.1 및 CHO-CLDN18.2 세포를 사용하는 FACS 분석에 의해 부계 항체의 것들과 비교되었다. 도 18a-도 18b에서 도시된 바와 같이, hz282-3, hz282-4, hz282-8, hz282-10, hz282-11, hz282-12, hz282-15, hz282-19, 및 hz282-10을 포함하는 인간화된 282A12F3 (T62A) 클론은 282A12F3 (T62A)와 CHO-CLDN18.2에 대한 유사한 결합 친화성을 보여주었다. 인간화된 클론의 어느 것도 CHO-CLDN18.1에 결합하지 않았다. 상기 데이터는 인간화된 282A12F3 (T62A) 항체가 CLDN18.2에 결합 특이성 및 친화성을 보유하였다는 것을 나타낸다.
인간화된 282A12T62A 클론의 결합 친화성은 SNU620 위암 세포에서 추가로 검증되었다. 도 19a-도 19b에서 도시된 바와 같이, 대부분의 인간화된 282A12T62A 클론은 SNU620 암 세포에 높은 결합 친화성을 보여주었다. 282A2-VHg0 중쇄를 포함하는 항체, 예를 들면, hz282-1, hz282-5, hz282-9, hz282-13, 및 hz282-17은 SNU620에 결합하지 않아, 282A12(T62A)의 Vh 영역의 FR3에서, 적어도 2개 잔기, K 및 V가 SNU620에 결합하는 것에서 관여됨을 나타내었다 (표 6).
결합 친화성 및 특이성 데이터는 표 16에서 요약된다. 282A12 (T62A)의 인간화된 항체의 대부분은 부계 항체의 특이성 및 친화성을 보유하였다.
Figure pct00018
실시예 15 - 인간화된 413H9F8-VL-S32V 및 364D1A7-VL-S32V 항체의 결합 활동성
인간화된 413H9F8-VL-S32V 및 364D1A7-VL-S32V 항체의 결합 친화성 및 특이성은 CHO-CLDN18.1 및 CHO-CLDN18.2 세포를 사용하는 FACS 분석에 의해 부계 항체의 것들과 비교되었다. 도 20a-도 20d, 도 21a-도 21d, 표 17, 및 표 18에서 나타난 바와 같이, 시험된 인간화된 413H9F8-VL-S32V 항체의 모두는 CHO-CLDN18.2 세포에서 413H9F8-VL-S32V에 비교가능한 결합 친화성을 보여주었다. 도 22a-도 22e 및 표 19에서 나타난 바와 같이, 시험된 인간화된 364D1A7-VL-S32V 항체의 모두는 CHO-CLDN18.2 세포에서 364D1A7-VL-S32V에 비교가능한 결합 친화성을 보여주었다. 인간화된 413H9F8-VL-S32V 및 364D1A7-VL-S32V 항체의 결합 친화성은 SNU620 위암 세포에서 추가로 검증되었다. 도 23a-도 23c에서 도시된 바와 같이, 시험된 인간화된 413H9F8-VL-S32V 및 364D1A7-VL-S32V 항체의 모두는 그들의 부계 항체와 비교하여 SNU620 위암 세포에 유사한 친화성을 보여주었다. 상기 데이터는 인간화된 413H9F8-VL-S32V 및 364D1A7-VL-S32V 항체가 결합 특이성 및 친화성을 보유하였다는 것을 나타낸다.
Figure pct00019
Figure pct00020
Figure pct00021
실시예 16 - 예시적 인간화된 항체의 ADCC 기능
인간화된 항체의 CLDN18.2 특이적 ADCC 활동성은 상기 기재된 바와 같이 CHO-CLDN18.1 및 CHO-CLDN18.2 세포주에서 검증되었다. 도 14a-도 14b에서 도시된 바와 같이, 인간화된 항체 413H9F8-H1L1 및 364D1A7-H1L1은 CHO-CLDN18.1이 아닌 CHO-CLDN18.2의 ADCC 매개된 용해를 유도하였다. 인간화된 항체가 그들의 부계 항체의 표적 특이성을 보유하였다는 것을 나타낸다.
인간화된 항체 변이체 및 부계 항체의 ADCC 효능은 분석되었다. 간단히, 이펙터 FcR-TANK (CD16A-15V) 세포는 8:1의 이펙터: 표적 세포 비로 CFSE 라벨링된 표적 세포 NCI-N87-CLDN18.2와 혼합되었다. 혼합된 세포는 4 시간 동안 인간화된 항체와 배양되었다. ADCC 효능은 분석되었고 상기 기재된 바와 같이 계산되었다. 도 24a-도 24c 및 표 20에서 나타난 바와 같이, 시험된 인간화된 413H9F8-VL-S32V 및 364D1A7-VL-S32V 항체의 거의 모두는 그들의 부계 항체 각각과 비교하여 유사한 ADCC 활동성을 보여주었다. 인간화된 항체의 ADCC 활동성은 상기 기재된 바와 같이 NUGC4-CLDN18.2 위암 세포에 대해 PBMC로 추가로 시험되었다. 도 25a-도 25c 및 표 21에서 나타난 바와 같이, 시험된 인간화된 413H9F8-VL-S32V 및 364D1A7-VL-S32V 항체의 거의 모두는 그들의 부계 항체 각각과 비교해서 비교가능한 ADCC 활동성을 보여주었다.
Figure pct00022
Figure pct00023
실시예 17 인간화된 항-CLDN18.2 항체의 Fc 변이체의 ADCC 활동성.
그들의 중쇄에서 상이한, G1m1 (D356/L358), G1m-1 (E356/M358), G1m3 (R214), 및 G1m17 (K214)을 포함하는, 인간 IgG1의 4개 주요 알로타입이 있다. 알로타입은 공우성 멘델 방식으로 유전되고, 다양한 세트의 조합은 아프리카인, 백인, 및 몽골인 인구 (PMID: 25368619, 26685205)에서 발견된다. 연구에서 포함되는 항-CLDN18.2 항체는 D356/L358 또는 E356/M358이 있는 Fc 변이체를 갖는다. 예를 들어, 참조 항체 Xi175D10은 D356/L358이 있는 Fc 변이체를 갖는다. D356/L358 및 E356/M358의 Fc 변이체를 가진 항체가 유사한 ADCC 활동성 (데이터 나타나지 않음)을 갖는다는 것이 뚜렷하다. "DL"이름 접미사는 Fc에서 D356/L358을 가진 항체를 나타내기 위해 추가되었고, 반면 E356/M358 변이체의 것들의 경우, 특정 이름 접미사는 추가되지 않았다. S239D/I332E 및 F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L 돌연변이를 포함하는, 다양한 Fc 조작 접근법은 항체 (PMID: 29070978)의 이펙터 기능을 향상시키기 위해 개발되었다.
S239D/I332E를 가진 항-CLDN18.2 항체 또는 F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L Fc 변이체는 그들의 이펙터 기능을 개선하기 위해 생성되었다. "V2" 이름 접미사는 S239D/I332E Fc 변이체를 가진 항체에 대하여 추가되었고, "MG" 이름 접미사는 F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L Fc 변이체를 가진 항체에 대하여 추가되었다.
상이한 Fc 변이체를 가진 항-CLDN18.2 항체의 ADCC 효과는 상기 기재된 바와 같이 CHO-CLDN18.2 세포주에서 평가되었다. 간단히, 이펙터 FcR-TANK (CD16A-15V) 세포는 4:1의 이펙터: 표적 세포 비로 CFSE 라벨링된 표적 세포 CHO-CLDN18.2와 혼합되었다. 혼합된 세포는 4 시간 동안 항체와 배양되었다. ADCC 효과는 분석되었고 상기 기재된 바와 같이 계산되었다. 도 31 및 표 22에서 나타난 바와 같이, 양쪽 413H9F8-cp2-V2-DL 및 413H9F8-cp2- MG-DL은 그들의 부계 항체 413H9F8-cp2와 비교해서 향상된 ADCC 활동성을 보여주었다.
Figure pct00024
인간화된 항체의 ADCC 활동성은 상기 기재된 바와 같이 NUGC4-CLDN18.2 위암 세포에 대해 PBMC로 추가로 시험되었다. 상이한 Fc 변이체를 가진 인간화된 항체 413H9F8-cp2 및 413H9F8-H2L2는 40:1의 이펙터: 표적 세포 비로 NUGC4-CLDN18.2 세포에 대해 인간 PBMC로 ADCC를 유도하는 그들의 능력에 대하여 분석되었고, 세포는 5 시간 동안 배양되었다. 데이터는 하나의 건강한 공여체에서 유래된 PBMC로부터 생성된다. 각 데이터 지점은 중복의 평균 값을 나타낸다. 도 32 및 표 23에서 나타난 바와 같이, 413H9F8-H2L2 및 413H9F8-cp2의 양쪽 "V2" 및 "MG" 변이체는 그들의 부계 항체 각각과 비교해서 향상된 ADCC 활동성을 보여주었다.
Figure pct00025
실시예 18 - 선택된 인간화된 항체의 CDC 활동성
인간화된 항체 변이체의 CDC 활동성은 상기 기재된 바와 같이 부계 항체와 그들의 CDC 기능을 비교하기 위해 분석되었다. 도 26a-도 26b 및 표 24에서 나타난 바와 같이, 시험된 인간화된 413H9F8-VL-S32V 및 364D1A7-VL-S32V 클론의 거의 모두는 그들의 부계 항체 각각와 비교하여 유사한 CDC 활동성을 보여주었다.
Figure pct00026
실시예 19 종양 세포에 의한 항-CLDN18.2 항체의 내재화.
종양 세포에 의한 항체의 내재화는 항체 내재화를 유도하기 위해 37℃에서 인큐베이션 후 항체의 세포 표면 보유를 검출함으로써 간접적으로 결정되었다. 간단히, NUGC4-CLDN18.2 및 NCI-N87-CLDN18.2 세포는 수집되었고 세정 완충액 (1% FBS가 있는 PBS)로 세정되었고, 1x105 세포 /50 μL로 조정되었다. 항체는 20 μg/mL로 희석되었고, 50 μL의 희석된 항체는 1:1의 부피 비로 세포와 혼합되었고, 이어서 30 분 동안 빙조에서 인큐베이션되었다. 세포는 사전-냉각 세정 완충액으로 2회 세정되었고 800 μL 사전-냉각 세정 완충액으로 재현탁되었다. 100 μL 세포 현탁액은 상이한 시점에서 96-웰 플레이트에 첨가되었고 37℃에서 인큐베이션되었다. 200 μL의 사전-냉각 세정 완충액은 첨가되어 모든 샘플의 내포작용 온도 조건을 중단시켰다. 빙조에서 인큐베이션된 샘플은 내재화가 없거나 최소인 대조군으로서 설정되었다. 1회 세정 후, 100 μL/웰의 두번째 항체 (AF647 - 염소 항-인간 IgG Fcγ, Jackson, #109-606-170, 1:800 희석)는 첨가되었고 30 분 동안 빙조에서 인큐베이션되었다. 세포는 사전-냉각 세정 완충액으로 2회 세정되었고 200 μL 사전-냉각 세정 완충액으로 재현탁되었고, 유세포 분석 (BD FACS Celesta)에 의해 분석되었다.
항체의 % 내재화 = [(빙조에서 인큐베이션된) MFI - (상이한 시간 동안 37℃에서 인큐베이션된) MFI]/(빙조에서 인큐베이션된) MFIx100%.
도 33 a에서 도시된 바와 같이, (Xi282A12F3(T62A)-V2-DL, hz282-11-V2 및 hz282-15-V2 변이체를 포함하는) 282A12F3 및 Xi175D10-V2는 NUGC4-CLDN18.2 세포에 의해 재빨리 내재화되었고 항체의 80% 초과는 2 시간 동안 37℃에서 인큐베이션 후 내재화되었다. Xi350G12E1-V2-DL 및 Xi325E8C80V2-DL의 약 50%는 2 시간 동안 37℃에서 인큐베이션 후 NUGC4-CLDN18.2 세포에 의해 내재화되었다. 413H9F8-VL-S32V-V2-DL 및 Xi408B9D4-V2-DL, Xi417H3B1-V2-DL, Xi328G2C4-V2-DL 및 Xi325F12H3-V2-DL의 15% 미만이 2 시간 동안 37℃에서 인큐베이션 후 NUGC4-CLDN18.2 세포에 의해 내재화된 것이 뚜렷하였다. NCI-N87-CLDN18.2 세포는 내재화 검정에 또한 이용되었다 (도 33 b). 구체적으로, 50% 초과의 Xi175D10-V2, (Xi282A12F3(T62A)-V2-DL, hz282-11-V2 및 hz282-15-V2 변이체를 포함하는) 282A12F3, xi350G12E1-V2-DL 및 Xi325E8C80V2-DL은 2 시간 동안 37℃에서 인큐베이션 후 NCI-N87-CLDN18.2 세포에 의해 내재화되었다. 30% 미만의 413H9F8-VL-S32V-V2-DL, Xi408B9D4-V2-DL, Xi417H3B1-V2-DL, Xi328G2C4-V2-DL 및 Xi325F12H3-V2-DL은 2 시간 동안 37℃에서 인큐베이션 후 NCI-N87-CLDN18.2 세포에 의해 내재화되었다.
일괄하여, 위암 세포주에서 과발현된 CLDN18.2에 282A12F3의 관여는 항체의 높은 수준 내재화로 이어지고, 반면에 항체 413H9F8-VL-S32V-V2-DL, Xi408B9D4-V2-DL, Xi417H3B1-V2-DL, Xi328G2C4-V2-DL 및 Xi325F12H3-V2-DL은 최소 내지 가벼운 항체 내재화를 단지 유발시키고, 항체 Xi175D10-V2, Xi325E8C80V2-DL 및 xi350G12E1-V2-DL은 중간 내지 높은 수준 내재화를 유도한다.
실시예 20 - 항체-약물 컨쥬게이션
노출된 항체 175D10 (xi175D10), 282A12F3(T62A) 및 아이소타입 대조 항체 인간 IgG1은, 절단가능한 발린-시트룰린 (vc) 링커를 포함하는 모노메틸 아우리스타틴 E (MMAE) 유도체인, mc-vc-PAB-MMAE에 컨쥬게이션되었다 (도 27). 간단히, 항체는 4 시간 초과 동안 4 ℃ 냉장고에서 해동되었고 밤새 4 ℃에서 컨쥬게이션 완충액 (25 mM Na2B4O7, 25 mM NaCl, 1 mM DTPA, pH 7.4)에 대해 투석되었다. 항체는, 2 시간 동안 25 ℃ 수조에서 인큐베이션하는, 신선하게 제조된 TCEP 작업 용액 (시스테인-말레이미드 컨쥬게이션 완충액내 5 mM TCEP, TCEP-HCl)을 첨가함으로써 감소되었다. 항체는, 2 시간 동안 25 ℃ 수조에서 혼합물을 인큐베이션하는, 10% v/v Organic Solvent (DMSO)의 존재 하에서 6의 비로 DMSO (10 mM)내 신선하게 제조된 mc-vc-PAB-MMAE (XDCExplorer) 작업 용액으로 컨쥬게이션되었다. 항체-약물 컨쥬게이션은, 4 시간 후 하나의 투석 완충액 교환과 함께, 밤새 4 ℃에서 L-히스티딘 투석 완충액 (20 mM L-히스티딘, pH 5.5)에 대해 투석되었다. 최종 산물은 추출되었고 0.2m 필터로 여과되었고, 품질은 HIC-HPLC에 의해 분석되었다. HIC-HPLC 결과는 모든 컨쥬게이트의 약물-대-항체 비 (DAR) 값이 3.5 내지 4.0 범위인 것을 보여주었다 (표 25). TCEP 몰비에서 증가와 함께, ADC의 DAR 값은 또한 증가하였다.
Figure pct00027
실시예 21 - HEK293-CLDN18.2 세포에서 ADC의 세포 사멸 활동성
(3개의 상이한 DAR을 가진) xi-175D10-vcMMAE, 282A12F3(T62A)-vcMMAE, 및 huIgG1-vcMMAE 뿐만 아니라 상응하는 노출된 항체의 세포독성은 CLDN18.2 (HK293-CLDN18.2) 세포주를 과-발현시키면서 HEK29에서 시험되었다. 간단히, HK293-CLDN18.2 세포는 96-웰 플레이트에서 씨딩되었고 37℃, 5% CO2에서 밤새 성장되었다. 노출된 항체 및 ADC는 4X 농도 (60 μg/mL, 400nM)로 제조되었고 세포 성장 배지에서 5-배 일련 희석되었다. 100 μL의 일차 희석물은 100 μL 배지와 혼합되어 2X 농도를 만들었다. 50 μL의 각 복합 희석물은 세포에 삼중으로 첨가되었다. 세포는 5 일 동안 37℃, 5% CO2에서 인큐베이션되었다. 세포독성은 CellTiter Glo Luminescent Cell Viability Assay 키트 (Promega)에 의해 결정되었다. 100 μl/웰 CellTiter Glo 시약은 세포 생존력 판독을 위하여 첨가되었다. 진탕기에서 10 분 동안 실온에서 인큐베이션하였고, 계획상 발광을 기록하였다.
도 28a-도 28b에서 도시된 바와 같이, 세포 생존력은 노출된 항체로 처리에 의해 영향받지 않았고, 반면, 세포 생존력은 ADC 282A12F3 (T62A)-vcMMAE 및 xi175D10-vcMMAE으로 처리된 때 농도 의존적 방식으로 감소되었다. 게다가, 282A12F3 (T62A)-vcMMAE는 xi175D10-vcMMAE와 비교하여 세포사 유도에서 더욱 효율적이었다. ADC 282A12F3 (T62A)-vcMMAE 및 xi175D10-vcMMAE는 HEK293 세포의 생존력에 영향을 미치지 않았고, 이는 CLDN18.2 음성이다. ADC 282A12F3 (T62A)-vcMMAE 및 xi175D10-vcMMAE가 CLDN18.2 양성 세포의 생존력을 특이적으로 억제시킨다는 것을 나타낸다.
실시예 22- NCI-N87-CLDN18.2 세포에서 ADC의 세포 사멸 활동성
과-발현하는 CLDN18.2, NCI-N87-CLDN18.2 및 NUGC4-CLDN18.2 세포를 가진 2개 위암 세포주는 상기 기재된 바와 같이 ADC의 세포 사멸 활동성을 시험하는데 사용되었다. 도 29a-도 29b에서 도시된 바와 같이, 세포 생존력은 ADC 282A12F3 (T62A)- vcMMAE 및 xi175D10-vcMMAE로 처리된 때 농도 의존적 방식으로 감소되었다. 게다가, 282A12 (T62A)-vcMMAE ADC는 xi175D10- vcMMAE보다 더 높은 세포 사멸을 유도하였다. NUGC4-CLDN18.2는 NCI-N87-CLDN18.2 세포와 비교해서 ADC 유도된 세포사에 덜 민감하였다.
실시예 23 - ADCC에 덜 민감한 세포에서 ADC의 세포 사멸 활동성
CLDN18.2로 안정하게 형질감염되고 키메라 282A12F3 (T62A) 매개된 ADCC 효능 (도 30a)에 덜 민감한 것으로 나타난 췌장암 세포주 PANC-1-CLDN18.2는 ADC-의존적 세포 사멸 검정에서 사용되었다. 도 30b에서 도시된 바와 같이, 양쪽 282A12F3 (T62A)-vcMMAE 및 xi175D10-vcMMAE는 농도 의존적 방식으로 PANC-1-CLDN18.2 세포의 생존력을 억제시켰고, 282A12F3 (T62A)-vcMMAE는 PANC-1-CLDN18.2 세포의 세포사 유도에서 xi175D10-vcMMAE보다 더욱 강력하였다.
요약하면, 항-CLDN18.2-ADC는, HEK293-CLDN18.2, NCI-N87-CLDN18.2, 및 NUGC4-CLDN18.2를 포함하는, CLDN18.2를 과발현하는 세포주를 사멸시켰다. 282A12F3 (T62A)-vcMMAE는 시험된 세포주의 생존력 억제에서 xi175D10-vcMMAE보다 더욱 강력하였다. 게다가, 3.5 내지 4.0 범위의 약물-항체-비는 ADC의 세포 사멸 활동성을 조정하는 것으로 관찰되지 않았다 (표 26).
Figure pct00028
실시예 24 누드 마우스내 인간 위암 GA0006 환자 유래된 이종이식 (PDX) 모델에서 항-CLDN18.2 항체의 효능.
항-CLDN18.2 항체의 생체내 효능은 누드 마우스내 환자 유래된 이종이식 (PDX) 모델에서 시험되었다. GA0006은 ERBB2의 다중카피, 선암 유형의 병리학적 진단을 받은 아시아인 위암 환자의 위에서 유래되었다. GA0006에서 CLDN18.2의 높은 발현은 항-CLDN18.2 항체 (데이터 나타나지 않음)로 IHC 및 FACS 분석에 의해 확인되었다. BALB/c 누드 마우스는 우측 발목에 크기 약 3 mm×3 mm×3 mm의 종양으로 피하로 접종되었다. 마우스는, 평균 종양 크기가 약 100 mm3에 도달한 때, 8개 그룹 (그룹 당 8마리 마우스): PBS, hIgG1 아이소타입 (100 mg/kg), xi175D10-V2, 413H9F8-H2L2-V2-DL 및 413H9F8-cp2-V2-DL (50 및 100 mg/kg)으로 무작위로 분할되었다. 종양-부피에 대한 변동의 계수는 40% 미만이었고, 이는 공식: CV= SD/MTV×100%에 의해 계산되었다. 무작위의 날은 0 일차로서 기록되었다. 마우스의 치료는 0 일차에 개시되었다. 항체는 정맥내 및 복강내 주사를 교대하면서 3 주 동안 주당 3회 투여되었다. 종양 크기는 주마다 2회 모니터링되었다.
도 34에서 도시된 바와 같이, 50 mg/kg의 xi175D10-V2 또는 413H9F8-H2L2-V2-DL 치료는, 유의미한 차이 (p>0.05)를 달성하지 못했어도, 아이소타입 (100 mg/kg) 그룹과 비교해서 종양 성장을 지체시켰다. 100 mg/kg의 xi175D10-V2 및 413H9F8-H2L2-V2-DL 치료는 아이소타입 (100 mg/kg) (p<0.05 및 p<0.01)으로 치료된 것들과 비교해서 종양 성장을 상당히 억제시켰다. 양쪽 50 및 100 mg/kg의 413H9F8-cp2-V2-DL 치료는 아이소타입 (100 mg/kg) (p<0.0001)으로 치료된 것들과 비교해서 종양 성장을 상당히 억제시켰다. 50 mg/kg의 413H9F8-cp2-V2-DL 치료는 xi175D10-V2 (50 mg/kg) 및 413H9F8-H2L2-V2-DL (50 mg/kg) (p<0.0001 및 p<0.01)으로 치료된 것들과 비교해서 종양 성장을 상당히 억제시켰다. 100 mg/kg의 413H9F8-cp2-V2-DL 치료는 xi175D10-V2 (100 mg/kg) 및 413H9F8-H2L2-V2-DL (100 mg/kg) (p<0.001 및 p<0.0001)로 치료된 것들과 비교해서 종양 성장을 상당히 억제시켰다.
실시예 25 Nu/Nu 마우스내 췌장암의 마우스 이종이식 모델에서 항-CLDN18.2 항체의 효능
항-CLDN18.2 항체의 생체내 효능은 Nu/Nu 마우스내 췌장암의 피하 이종이식 모델에서 시험되었다. CLDN18.2를 과발현시키는 췌장암 세포주 MIA Paca-2 (MIA Paca-2-CLDN18.2)는, 공기 중 5% CO2의 대기에서 37℃에, 10% 태아 소 혈청, 2.5% 말 혈청, 1% 페니실린/스트렙토마이신, 5 μg/mL의 블라스티시딘으로 보충된 DMEM 배지에서 단층 배양물로서 시험관내 유지되었다. MIA Paca-2-CLDN18.2 세포는 트립신-EDTA 치료로 주마다 2회 일상적으로 2차 배양되었다. 지수적 성장기에서 성장하는 MIA Paca-2-CLDN18.2 세포는 수확되었고 종양 접종에 대하여 계수되었다. Nu/Nu 누드 마우스, 암컷, 4-6 주령은 종양 발달을 위하여 0.2 ml의 PBS (Matrigel로 보충됨, PBS: Matrigel=1:1)에서 5×106 MIA Paca-2-CLDN18.2 세포로 우측 옆구리에 피하로 접종되었다. Paca-2-CLDN18.2 종양 보유 Nu/Nu 마우스 (그룹 당 10마리 마우스)의 치료는 종양 접종 3 일후 개시되었다. 항-CLDN18.2 항체 (10 및 40 mg/kg)는 정맥내 및 복강내 주사를 교대하면서 5 주 동안 주당 2회 투여되었다. PBS 또는 아이소타입 (hIgG1, 40 mg/kg)으로 치료된 종양 보유 Nu/Nu 마우스는 음성 대조군으로서 설정되었다.
10 및 40 mg/kg에 Xi175D10-V2, 413H9F8-H2L2-V2-DL로 치료된 마우스는 PBS 또는 아이소타입 (40 mg/kg) (p<0.01)으로 치료된 마우스와 비교해서 상당한 종양 성장 지체를 보여주었다 (도 35 a-d). 40 mg/kg에 413H9F8-cp2-V2-DL로 치료된 마우스는 PBS 또는 아이소타입 (40 mg/kg) (p<0.01)으로 치료된 것들과 비교해서 종양 성장을 상당히 억제시켰다 (도 35a 및 e). 10 mg/kg에 413H9F8-cp2-V2-DL로 치료된 마우스는 종양 성장을 억제시켰지만, PBS 또는 아이소타입 (40 mg/kg)으로 치료된 것들과 비교해서 상당한 차이는 없었다 (도 35 a 및 e).
실시예 26 인간 위암 GA0006 환자 유래된 이종이식 (PDX) 모델에서 항-CLD1N8.2 항체 및 화학요법의 조합적 효능
PDX 마우스 모델은 상기 기재된 바와 같이 확립되었다. 마우스의 치료는 0 일차에 개시되었다. 종양 보유 마우스는 PBS, EOF (1.25 mg/kg 에피루비신, 3.25 mg/kg 옥살리플라틴 및 56.25 mg/kg 5-플루오로우라실), EOF와 조합된 xi175D10-V2 (40 mg/kg) 또는 EOF와 조합된 413H9F8-H2L2-V2-DL (40 mg/kg)로 치료되었다. EOF는 주마다 1회 복강내로 투여되었다. 항체는 정맥내 및 복강내 주사를 교대함으로써 주당 3회 투여되었다. 종양 크기는 주마다 2회 모니터링되었다. 전체적으로, 5회의 EOF 투여 및 14회의 항체 치료는 실행되었다.
도 36에서 도시된 바와 같이, EOF 단독 또는 xi175D10-V2 또는 413H9F8-H2L2-V2-DL과 조합된 EOF로의 치료는 PBS (p<0.01)로 치료된 것들과 비교해서 종양 성장을 상당히 억제시켰다. EOF와 조합된 413H9F8-H2L2-V2-DL은 EOF 요법 단독 (p<0.01)보다 우수한 효과를 보여주었다. 하지만, EOF와 조합된 xi175D10-V2는 EOF 요법 단독 (p=0.147)과 비교해서 더 양호한 효과를 보여주지 못했다. 게다가, EOF와 413H9F8-H2L2-V2-DL의 결합체는 EOF (p<0.05)와 xi175D10-V2의 결합체보다 우수하였다.
실시예 27
표 27은 참조 항체 175D10 (xi175D10)의 중쇄 및 경쇄 서열을 실례한다.
Figure pct00029
본 개시내용의 바람직한 구현예가 본원에 나타나고 기재된 동안, 그러한 구현예가 예만의 방식으로 제공되는 것이 당업자에게 명백할 것이다. 수많은 변동, 변화, 및 치환은 본 개시내용에서 이탈 없이 당업자에게 이제 발생할 것이다. 본원에 기재된 본 개시내용의 구현예에 대한 다양한 대안이 본 개시내용 실시에서 이용될 수 있다는 것이 이해되어야 한다. 하기 청구항이 본 개시내용의 범위를 정의한다는 것 그리고 이들 청구항의 범위 내에서 방법 및 구조 그리고 그들의 균등물이 그렇게 함으로써 포함되는 것이 의도된다.

Claims (97)

  1. 참조 항체 175D10의 EC50 미만인 절반 최대 유효 농도 (EC50)를 포함하는 항-클라우딘 18.2 (항-CLDN18.2) 항체에 있어서, 상기 참조 항체 175D10이 서열번호: 98에서 제시된 중쇄 (HC) 서열 및 서열번호: 99에서 제시된 경쇄 (LC) 서열을 포함하는, 항체.
  2. 번역후 변형 부위에서 적어도 1개의 돌연변이를 포함하는, 항-클라우딘 18.2 (항-CLDN18.2) 항체.
  3. 향상된 항체-의존적 세포-매개된 세포독성 (ADCC)을 수여하는 Fc 영역에서 적어도 1개의 돌연변이를 포함하는 항-클라우딘 18.2 (항-CLDN18.2) 항체에 있어서, 상기 향상된 ADCC가 서열번호: 98에서 제시된 중쇄 (HC) 서열 및 서열번호: 99에서 제시된 경쇄 (LC) 서열을 포함하는 참조 항체 175D10과 비교되는, 항체.
  4. 제 1 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체의 EC50이 약 5 nM 이하인, 항-CLDN18.2 항체.
  5. 제 1 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체의 EC50이 약 5 nM, 약 4 nM, 약 3 nM, 약 2 nM, 약 1 nM, 약 0.5 nM 이하인, 항-CLDN18.2 항체.
  6. 참조 항체 175D10의 결합 친화성에 비해 CLDN18.2에 더 높은 결합 친화성을 포함하는 항-클라우딘 18.2 (항-CLDN18.2) 항체에 있어서, 상기 참조 항체 175D10이 서열번호: 98에서 제시된 중쇄 (HC) 서열 및 서열번호: 99에서 제시된 경쇄 (LC) 서열을 포함하는, 항체.
  7. 제 1 항 내지 제 6 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 가변 중쇄 (VH) 영역 및 가변 경쇄 (VL) 영역을 포함하고, 상기 VH 영역이 하기를 포함하는, 항-CLDN18.2 항체:
    CDR1 서열 GFSLTSYX1VX2;
    여기서 X1은 N 또는 G로부터 선택되고; X2는 Y 또는 H로부터 선택됨;
    CDR2 서열 VIWX3X4GX5TX6YX7X8X9LX10S;
    여기서 X3은 N 또는 P로부터 선택되고; X4는 T 또는 G로부터 선택되고; X5는 A 또는 N으로부터 선택되고; X6은 R 또는 N으로부터 선택되고; X7은 N, Q, 또는 E로부터 선택되고; X8은 S 또는 I로부터 선택되고; X9는 T 또는 A로부터 선택되고; X10은 K 또는 M으로부터 선택됨; 및
    CDR3 서열 DX11X12X13X14X15X16X17X18X19X20;
    여기서 X11은 S 또는 R로부터 선택되고; X12는 A 또는 R로부터 선택되고; X13은 M 또는 L로부터 선택되고; X14는 P 또는 A로부터 선택되고; X15는 A 또는 M으로부터 선택되고; X16은 I 또는 D로부터 선택되고; X17은 P 또는 Y로부터 선택되고; X18은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 F이고; X19는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 A이고; X20은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 Y임.
  8. 제 1 항 내지 제 6 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 VH 영역이 하기를 포함하는, 항-CLDN18.2 항체:
    CDR1 서열 X21X22X23X24X25SFGMH;
    여기서 X21은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 G이고; X22는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 F이고; X23은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 T이고; X24는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 F이고; X25는 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 S임;
    CDR2 서열 YISSGSX26X27IYYX28DX29X30KG;
    여기서 X26은 S 또는 G로부터 선택되고; X27은 P 또는 S로부터 선택되고; X28은 V 또는 A로부터 선택되고; X29는 K 또는 T로부터 선택되고; X30은 L 또는 V로부터 선택됨; 및
    CDR3 서열 AX31X32X33X34X35X36X37X38X39X40X41;
    여기서 X31은 G 또는 T로부터 선택되고; X32는 Y 또는 S로부터 선택되고; X33은 A 또는 Y로부터 선택되고; X34는 V 또는 Y로부터 선택되고; X35는 R 또는 Y로부터 선택되고; X36은 N 또는 G로부터 선택되고; X37은 A 또는 N으로부터 선택되고; X38은 L 또는 A로부터 선택되고; X39는 D 또는 L로부터 선택되고; X40은 Y 또는 E로부터 선택되고; X41은 존재 또는 부재이고, 존재하는 경우에는 Y임.
  9. 제 1 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 VH 영역이 서열번호: 1로 이루어지는 CDR1 서열, CDR2 서열 VIWNTGATRYX7SX9LKS, 및 서열번호: 3으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하고, X7이 N, Q, 또는 E로부터 선택되고; X9가 T 또는 A로부터 선택되는, 항-CLDN18.2 항체.
  10. 제 1 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 VH 영역이 서열번호: 13으로 이루어지는 CDR1 서열, CDR2 서열 VIWPGGNTNYX7X8ALMS, 및 서열번호: 15로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하고, X7이 N 또는 E로부터 선택되고; X8이 S 또는 I로부터 선택되는, 항-CLDN18.2 항체.
  11. 제 1 항 내지 제 10 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 VH 영역이 서열번호: 1, 7, 10, 또는 13으로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 2, 4, 5, 6, 8, 11, 14, 16, 또는 17로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 3, 9, 12, 또는 15로부터 선택된 CDR3 서열을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  12. 제 1 항 내지 제 10 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 VH 영역이 서열번호: 1로 이루어지는 CDR1 서열; 서열번호: 2, 4, 5, 또는 6으로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 3으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  13. 제 1 항 내지 제 10 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 VH 영역이 서열번호: 13으로 이루어지는 CDR1 서열; 서열번호: 14, 16, 또는 17로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 15로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  14. 제 1 항 내지 제 10 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 VH 영역이 서열번호: 7로 이루어지는 CDR1 서열, 서열번호: 8로 이루어지는 CDR2 서열, 및 서열번호: 9로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  15. 제 1 항 내지 제 10 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 VH 영역이 서열번호: 10으로 이루어지는 CDR1 서열, 서열번호: 11로 이루어지는 CDR2 서열, 및 서열번호: 12로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  16. 제 1 항 내지 제 15 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 VL 영역이 서열번호: 18, 21, 24-28, 31-35, 38, 또는 39로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 19, 22, 29, 또는 36으로부터 선택된 CDR2 서열; 및 서열번호: 20, 23, 30, 또는 37로부터 선택된 CDR3 서열을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  17. 제 1 항 내지 제 15 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 VL 영역이 서열번호: 21 또는 24-27로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 22로 이루어지는 CDR2 서열; 및 서열번호: 23으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  18. 제 1 항 내지 제 15 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 VL 영역이 서열번호: 28 또는 31-34로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 29로 이루어지는 CDR2 서열; 및 서열번호: 30으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  19. 제 1 항 내지 제 15 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 VL 영역이 서열번호: 35, 38, 또는 39로부터 선택된 CDR1 서열; 서열번호: 36으로 이루어지는 CDR2 서열; 및 서열번호: 37로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  20. 제 1 항 내지 제 15 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 VL 영역이 서열번호: 18로 이루어지는 CDR1 서열, 서열번호: 19로 이루어지는 CDR2 서열, 및 서열번호: 20으로 이루어지는 CDR3 서열을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  21. 제 1 항 내지 제 20 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 전장 항체인, 항-CLDN18.2 항체.
  22. 제 1 항 내지 제 20 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 결합 단편인, 항-CLDN18.2 항체.
  23. 제 1 항 내지 제 22 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 1가 Fab', 2가 Fab2, 단일-쇄 가변 단편 (scFv), 디아바디, 미니바디, 나노바디, 단일-도메인 항체 (sdAb), 또는 카멜리드 항체 또는 이의 결합 단편을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  24. 제 1 항 내지 제 22 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편, 단클론성 항체 또는 이의 결합 단편, 또는 이중특이적 항체 또는 이의 결합 단편을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  25. 제 1 항 내지 제 24 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 번역후 변형 부위에서 돌연변이를 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  26. 제 25 항에 있어서, 상기 돌연변이가 VH 영역의 아미노산 위치 60, 61, 또는 62에 있고, 상기 아미노산 위치가 서열번호: 40의 위치 60, 61, 또는 62에 상응하는, 항-CLDN18.2 항체.
  27. 제 26 항에 있어서, 상기 돌연변이가 서열번호: 40의 아미노산 위치 60 또는 62에 있는, 항-CLDN18.2 항체.
  28. 제 26 항에 있어서, 상기 돌연변이가 서열번호: 57의 아미노산 위치 60 또는 61에 있는, 항-CLDN18.2 항체.
  29. 제 26 항 내지 제 28 항 중 어느 한 항에 있어서, 아미노산 잔기 N60에서 상기 돌연변이가 글루타민 또는 글루탐산에 대한 것인, 항-CLDN18.2 항체.
  30. 제 26 항 내지 제 28 항 중 어느 한 항에 있어서, 아미노산 잔기 S61에서 상기 돌연변이가 이소류신에 대한 것인, 항-CLDN18.2 항체.
  31. 제 26 항 내지 제 28 항 중 어느 한 항에 있어서, 아미노산 잔기 T62에서 상기 돌연변이가 알라닌에 대한 것인, 항-CLDN18.2 항체.
  32. 제 25 항에 있어서, 상기 돌연변이가 VL 영역의 아미노산 위치 31 또는 32에 있고, 상기 아미노산 위치가 서열번호: 46, 52, 또는 60의 위치 31 또는 32에 상응하는, 항-CLDN18.2 항체.
  33. 제 32 항에 있어서, 상기 돌연변이가 서열번호: 46, 52, 또는 60의 아미노산 위치 31 또는 32에 있는, 항-CLDN18.2 항체.
  34. 제 32 항 또는 제 33 항에 있어서, 아미노산 잔기 N31에서 상기 돌연변이가 아스파르트산 또는 글루탐산에 대한 것인, 항-CLDN18.2 항체.
  35. 제 32 항 또는 제 33 항에 있어서, 아미노산 잔기 S32에서 상기 돌연변이가 류신, 발린, 또는 이소류신에 대한 것인, 항-CLDN18.2 항체.
  36. 제 25 항 내지 제 35 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 돌연변이가 참조 항체 175D10에 비해 변형된 항-CLDN18.2 항체의 결합 친화성을 향상시키는, 항-CLDN18.2 항체.
  37. 제 1 항 내지 제 36 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 키메라 항체 또는 이의 결합 단편을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  38. 제 37 항에 있어서, 상기 키메라 항체 또는 이의 결합 단편이 서열번호: 40-43에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 44에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  39. 제 37 항에 있어서, 상기 키메라 항체 또는 이의 결합 단편이 서열번호: 45에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 ID 번호: 46-50에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  40. 제 37 항에 있어서, 상기 키메라 항체 또는 이의 결합 단편이 서열번호: 51에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 52-56에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  41. 제 37 항에 있어서, 상기 키메라 항체 또는 이의 결합 단편이 서열번호: 57-59에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 60-62에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  42. 제 37 항 내지 제 41 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 키메라 항체 또는 이의 결합 단편이 서열번호: 63에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 CH 영역 그리고 서열번호: 64에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 CL 영역을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  43. 제 1 항 내지 제 36 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  44. 제 43 항에 있어서, 상기 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편이 서열번호: 65-68에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 69-73에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  45. 제 43 항에 있어서, 상기 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편이 서열번호: 74-76에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 77-80에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  46. 제 43 항에 있어서, 상기 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편이 서열번호: 81-84에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 85-88에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  47. 제 43 항에 있어서, 상기 인간화된 항체 또는 이의 결합 단편이 서열번호: 89-92에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VH 영역 그리고 서열번호: 93-97에 대한 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 서열 동일성을 포함하는 VL 영역을 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  48. 제 1 항 내지 제 47 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 IgM 프레임워크를 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  49. 제 1 항 내지 제 47 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 IgG2 프레임워크를 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  50. 제 1 항 내지 제 47 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 IgG1 프레임워크를 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  51. 제 1 항 내지 제 50 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 상기 FC 영역에서 하나 이상의 돌연변이를 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  52. 제 51 항에 있어서, 상기 하나 이상의 돌연변이가 아미노산 위치 S239, 아미노산 위치 I332, 아미노산 위치 F243, 아미노산 위치 R292, 아미노산 위치 Y300, 아미노산 위치 V305, 아미노산 위치 P396 또는 이들의 조합에서 돌연변이를 포함하는, 항-CLDN18.2 항체.
  53. 제 51 항 또는 제 52 항에 있어서, 상기 FC 영역에서 하나 이상의 돌연변이가 향상된 ADCC를 상기 참조 항체 175D10에 수여하는, 항-CLDN18.2 항체.
  54. 제 1 항 내지 제 53 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 참조 항체 175D10과 비교하여 보체-의존적 세포독성 (CDC) 활동성을 갖는, 항-CLDN18.2 항체.
  55. 제 1 항 내지 제 54 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 페이로드에 추가로 컨쥬게이션되는, 항-CLDN18.2 항체.
  56. 제 55 항에 있어서, 상기 페이로드가 아우리스타틴 또는 이의 유도체 이의인, 항-CLDN18.2 항체.
  57. 제 56 항에 있어서, 상기 아우리스타틴 유도체가 모노메틸 아우리스타틴 E (MMAE)인, 항-CLDN18.2 항체.
  58. 제 56 항에 있어서, 상기 아우리스타틴 유도체가 모노메틸 아우리스타틴 F (MMAF)인, 항-CLDN18.2 항체.
  59. 제 55 항 내지 제 58 항 중 어느 한 항에 있어서, 약물-대-항체 비 (DAR)가 약 2, 약 3, 또는 약 4인, 항-CLDN18.2 항체.
  60. 제 1 항 내지 제 59 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 참조 항체 175D10과 결합 에피토프를 공유하는, 항-CLDN18.2 항체.
  61. 제 1 항 내지 제 60 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 마우스 및 사이노몰구스 CLDN18.2 단백질에 교차-결합 활동성을 갖는, 항-CLDN18.2 항체.
  62. CLDN18.2의 아이소폼에 특이적으로 결합하는, 항-클라우딘 18.2 (항-CLDN18.2) 항체.
  63. 제 62 항에 있어서, CLDN18.2의 상기 아이소폼이 세포주 SNU620에서 발현된 아이소폼인, 항-CLDN18.2 항체.
  64. 제 1 항 내지 제 63 항 중 어느 한 항의 항-CLDN18.2 항체를 인코딩하는, 핵산 폴리머.
  65. 제 64 항의 핵산 폴리머를 포함하는, 벡터.
  66. 제 1 항 내지 제 63 항 중 어느 한 항의 항-CLDN18.2 항체; 및
    약학적으로 허용가능한 부형제
    를 포함하는, 약학적 조성물.
  67. 제 66 항에 있어서, 상기 약학적 조성물이 전신적 투여를 위하여 제형화되는, 약학적 조성물.
  68. 제 66 항 또는 제 67 항에 있어서, 상기 약학적 조성물이 비경구 투여를 위하여 제형화되는, 약학적 조성물.
  69. CLDN18.2 단백질의 과발현을 특징으로 하는 암을 갖는 대상체를 치료하는 방법으로서,
    상기 대상체에게 제 1 항 내지 제 63 항 중 어느 한 항의 항-CLDN18.2 항체 또는 제 66 항 내지 제 68 항 중 어느 한 항의 약학적 조성물을 투여하고, 그렇게 함으로써 상기 대상체에서 상기 암을 치료하는 단계
    를 포함하는, 방법.
  70. 제 69 항에 있어서, 상기 암이 위장암인, 방법.
  71. 제 70 항에 있어서, 상기 위장암이 위암인, 방법.
  72. 제 70 항에 있어서, 상기 위장암이 췌장암인, 방법.
  73. 제 70 항에 있어서, 상기 위장암이 식도암 또는 담관암종인, 방법.
  74. 제 69 항에 있어서, 상기 암이 폐암 또는 난소암인, 방법.
  75. 제 69 항에 있어서, 상기 대상체에게 추가의 치료적 제제를 투여하는 단계를 추가로 포함하는, 방법.
  76. 제 75 항에 있어서, 상기 추가의 치료적 제제가 화학치료적 제제, 면역치료적 제제, 표적화된 치료적 제제, 호르몬-기반된 치료적 제제, 줄기-세포 기반된 치료적 제제, 또는 방사선을 포함하는, 방법.
  77. 제 75 항 또는 제 76 항에 있어서, 상기 추가의 치료적 제제 및 상기 항-CLDN18.2 항체가 동시에 투여되는, 방법.
  78. 제 75 항 또는 제 76 항에 있어서, 상기 추가의 치료적 제제 및 상기 항-CLDN18.2 항체가 순차적으로 투여되는, 방법.
  79. 제 78 항에 있어서, 상기 추가의 치료적 제제가 항-CLDN18.2 항체에 앞서 투여되는, 방법.
  80. 제 78 항에 있어서, 상기 추가의 치료적 제제가 항-CLDN18.2 항체의 투여 후 투여되는, 방법.
  81. 제 75 항 내지 제 80 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 추가의 치료적 제제 및 상기 항-CLDN18.2 항체가 별도 복용량으로서 제형화되는, 방법.
  82. 세포 사멸 효과를 유도하는 방법으로서,
    상기 항-CLDN18.2 항체를 내재화하고 그렇게 함으로써 상기 세포 사멸 효과를 유도하는데 충분한 시간 동안 페이로드를 포함하는 항-CLDN18.2 항체와 복수의 세포를 접촉시키는 단계
    를 포함하는, 방법.
  83. 제 82 항에 있어서, 상기 항-CLDN18.2 항체가 제 1 항 내지 제 54 항 중 어느 한 항의 항-CLDN18.2 항체를 포함하는, 방법.
  84. 제 83 항에 있어서, 상기 페이로드가 메이탄시노이드, 아우리스타틴, 탁소이드, 칼리키아미신, 듀오카르마이신, 아마톡신, 또는 이들의 유도체를 포함하는, 방법.
  85. 제 83 항에 있어서, 상기 페이로드가 아우리스타틴 또는 이의 유도체 이의를 포함하는, 방법.
  86. 제 85 항에 있어서, 상기 페이로드가 모노메틸 아우리스타틴 E (MMAE)인, 방법.
  87. 제 85 항에 있어서, 상기 페이로드가 모노메틸 아우리스타틴 F (MMAF)인, 방법.
  88. 제 82 항에 있어서, 상기 세포가 암 세포인, 방법.
  89. 제 88 항에 있어서, 상기 세포가 위장암 출신인, 방법.
  90. 제 89 항에 있어서, 상기 위장암이 위암인, 방법.
  91. 제 89 항에 있어서, 상기 위장암이 췌장암인, 방법.
  92. 제 89 항에 있어서, 상기 위장암이 식도암 또는 담관암종인, 방법.
  93. 제 88 항에 있어서, 상기 세포가 폐암 또는 난소암 출신인, 방법.
  94. 제 82 항 내지 제 93 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법이 시험관내 방법인, 방법.
  95. 제 82 항 내지 제 93 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 방법이 생체내 방법인, 방법.
  96. 제 69 항 내지 제 95 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 인간인, 방법.
  97. 제 1 항 내지 제 63 항 중 어느 한 항의 항-CLDN18.2 항체, 제 65 항의 벡터, 또는 제 66 항 내지 제 68 항 중 어느 한 항의 약학적 조성물을 포함하는, 키트.
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