KR20210063202A - Composition for diagnosing polycystic kidney disease comprising agent for detecting Metrnl and use thereof - Google Patents

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KR20210063202A
KR20210063202A KR1020200083006A KR20200083006A KR20210063202A KR 20210063202 A KR20210063202 A KR 20210063202A KR 1020200083006 A KR1020200083006 A KR 1020200083006A KR 20200083006 A KR20200083006 A KR 20200083006A KR 20210063202 A KR20210063202 A KR 20210063202A
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안규리
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서울대학교산학협력단
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Abstract

The present invention provides a polycystic kidney disease (PKD) diagnostic composition comprising an agent capable of detecting Metrnl expression, a polycystic kidney disease diagnostic kit comprising the composition, and a method for screening a therapeutic agent for polycystic kidney diseases, comprising measuring the expression level of Metrnl. By using the polycystic kidney disease marker Metrnl provided in the present invention, it is possible to diagnose polycystic kidney diseases from a sample obtained by a non-invasive method such as urine from a patient and predict the prognosis.

Description

Metrnl 검출용 제제를 포함하는 다낭신의 진단용 조성물 및 이의 이용 {Composition for diagnosing polycystic kidney disease comprising agent for detecting Metrnl and use thereof}Composition for diagnosing polycystic kidney disease comprising agent for detecting Metrnl and use thereof

본 발명은 METRNL 단백질 및/또는 이를 암호화하는 유전자의 발현을 검출할 수 있는 제제를 포함하는, 다낭신(PKD)의 진단 및/또는 예후 예측용 조성물, 상기 조성물을 포함하는 다낭신의 진단 및/또는 예후 예측용 키트 및 METRNL 단백질 및/또는 이를 암호화하는 유전자의 발현을 검출하는 제제를 이용한 다낭신의 예방 또는 치료용 조성물을 스크리닝하는 방법에 관한 것이다. The present invention provides a composition for diagnosing and/or predicting polycystic kidney (PKD), comprising an agent capable of detecting the expression of METRNL protein and/or a gene encoding the same, and diagnosis and/or polycystic kidney comprising the composition It relates to a method for screening a composition for preventing or treating polycystic kidney using a kit for predicting prognosis and an agent for detecting the expression of METRNL protein and/or a gene encoding the same.

다낭신 또는 다낭포성 신장 질환은 액체로 채워진 여러 개의 낭종으로 인해 신장이 벌집 모양으로 변형되는 유전 질환으로, 상염색체 우성 다낭신(ADPKD), 상염색체 열성 다낭신(ARPKD) 등으로 분류된다.Polycystic kidney disease or polycystic kidney disease is a genetic disease in which the kidney is deformed into a honeycomb shape due to multiple fluid-filled cysts, and is classified into autosomal dominant polycystic kidney (ADPKD) and autosomal recessive polycystic kidney (ARPKD).

상염색체 우성 다낭신(ADPKD, 이하 "다낭신"이라 한다)은 신장에서 가장 흔한 유전성 신장질환으로, 1000명당 1명 꼴의 발병률을 보인다. 다낭신 환자는 양쪽 콩팥에 다수의 낭종이 발생하고, 낭종의 크기와 수가 증가하여 결국에는 50-60대에 신장 기능이 정지하여 죽음에 이르게 된다. 낭종의 진행은 낭종 표피 세포의 증식이 일어난 후 낭종 안으로 낭종액이 차게 되면서 낭종의 크기가 커지게 되며 진행된다.Autosomal dominant polycystic kidney (ADPKD, hereinafter referred to as "polycystic kidney") is the most common hereditary kidney disease in the kidney, with an incidence of 1 in 1,000 people. In patients with polycystic kidney, multiple cysts develop in both kidneys, and the size and number of cysts increase, eventually leading to death due to renal function cessation in the 50s and 60s. The cyst progresses as the cyst epithelial cells proliferate and the cyst fluid fills the cyst, causing the cyst to increase in size.

다낭신은 국내 투석 환자의 원인 중 약 2%를 차지하여, 당뇨, 고혈압, 사구체 신염 다음으로 흔하게 나타난다. 다낭신은 양쪽 콩팥의 구조적, 기능적 결함을 가져올 뿐만 아니라, 각종 신장의 합병증을 동반할 수 있기 때문에 비교적 질환의 초기 단계에서부터 관리가 필요하다.Polycystic kidney accounts for about 2% of domestic dialysis patients, and is the second most common cause after diabetes, hypertension, and glomerulonephritis. Polycystic kidneys not only cause structural and functional defects in both kidneys, but also can accompany various renal complications, so management is required from the relatively early stage of the disease.

다낭신의 원인 유전자는 PKD1과 PKD2 유전자로, 각각 polycystin-1과 polycystin-2라는 단백질을 코딩한다. 다낭신 진단 환자의 85%는 PKD1 유전자의 결함, 나머지 15%는 PKD2 유전자의 결함이 원인인 것으로 알려져 있다.The causative genes of polycystic kidney are PKD1 and PKD2 genes, which encode proteins called polycystin-1 and polycystin-2, respectively. It is known that 85% of patients diagnosed with polycystic kidney are due to a defect in the PKD1 gene and the remaining 15% to a defect in the PKD2 gene.

현재 다낭신의 완치 방법은 알려져 있지 않으며, 최근 치료 방향은 합병증에 의한 질병 이환 및 사망을 감소 시키는 방향으로 연구가 진행되고 있으며, 이를 위해 비침습적인 방법으로 초기에 다낭신을 진단할 수 있는 기술의 개발이 요구된다.Currently, there is no known cure method for polycystic kidney, and recent research is being conducted in the direction of reducing disease morbidity and death due to complications. To this end, development of a technology that can diagnose polycystic kidney in an early stage in a non-invasive way this is required

본 발명의 목적은 메테오린 유사체(Meteorin-like, METRNL)를 검출하는 제제를 포함하는 다낭신의 진단 및/또는 예후 예측용 조성물을 제공하는 것이다. It is an object of the present invention to provide a composition for diagnosing and/or predicting prognosis of polycystic kidney comprising an agent for detecting a meteorin-like (METRNL).

본 발명의 또 다른 목적은 상기 진단용 조성물을 포함하는 다낭신의 진단 및/또는 예후 예측용 키트 또는 진단 및/또는 예후 예측에 필요한 정보를 제공하는 방법을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a kit for diagnosis and/or prognosis prediction of polycystic kidney, or a method for providing information necessary for diagnosis and/or prognosis prediction, comprising the diagnostic composition.

본 발명의 또 다른 목적은 METRNL의 양을 측정하는 단계를 포함하는 다낭신의 예방 또는 치료제의 스크리닝 방법을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a screening method for the prevention or treatment of polycystic kidney, comprising the step of measuring the amount of METRNL.

상기 본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명자들은 다낭신 환자의 낭종 표피 세포 및 배양액에서 METRNL을 암호화하는 유전자의 전사량 및/또는 METRNL 단백질의 발현량이 증가함을 확인하여, 다낭신에 대한 바이오마커로서의 기능을 확인함으로써 본 발명을 완성하였다.In order to achieve the object of the present invention, the present inventors confirmed that the transcription amount of the gene encoding METRNL and/or the expression level of the METRNL protein increases in cystic epithelial cells and culture medium of polycystic kidney patients. The present invention was completed by confirming the function as a marker.

본 발명은 메테오린 유사체(Meteorin-like, METRNL)을 검출하는 제제를 포함하는, 다낭신의 진단 및/또는 예후 예측용 조성물, 상기 조성물을 포함하는 다낭신의 진단 및/또는 예후 예측용 키트, 및 METRNL 유전자의 전사량 및/또는 METRNL 단백질의 발현량을 측정하는 단계를 포함하는, 다낭신 진단 및/또는 예후 예측에 필요한 정보를 제공하는 방법을 제공한다.The present invention provides a composition for diagnosing and/or predicting polycystic kidney, comprising an agent for detecting a meteorin-like (METRNL), a kit for diagnosis and/or prognosis of polycystic kidney comprising the composition, and METRNL It provides a method for providing information necessary for diagnosing polycystic kidney and/or prognosis, comprising measuring the amount of transcription of a gene and/or the expression level of METRNL protein.

본 발명은 또한 세포에 후보 물질을 처리하여 METRNL 유전자의 전사량 및/또는 METRNL 단백질의 발현량을 조사하는 단계를 포함하는, 다낭신의 경감 또는 치료용 조성물을 스크리닝하는 방법을 제공한다.The present invention also provides a method for screening a composition for alleviation or treatment of polycystic kidney, comprising the step of treating the cell with a candidate substance and examining the transcription amount of the METRNL gene and/or the expression level of the METRNL protein.

이하 본 발명을 더욱 상세하게 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail.

본 발명에서, 용어 "진단"은 병리 상태의 존재 또는 특징을 확인하는 것을 의미한다. 본 발명의 목적상, 진단은 다낭신 돌연변이 유전자의 존재 또는 발병 여부를 확인하는 것이다. In the present invention, the term "diagnosing" means identifying the presence or characteristics of a pathological condition. For the purposes of the present invention, diagnosis is to determine whether the polycystic kidney mutant gene is present or has the onset.

본 발명에서 상기 "다낭신"은 다낭포성 신장질환 또는 다낭성 신장질환을 의미하며, 예를 들어 상염색체 우성 다낭성 신장질환 또는 상염색체 열성 다낭성 신장질환일 수 있으며, 일 예에서, 상염색체 우성 다낭성 신장질환일 수 있다. 상기 상염색체 우성 다낭성 신장질환은 "상염색체 우성 다낭신"과 혼용하여 사용될 수 있으며, PKD1 및/또는 PKD2 유전자의 결함을 포함하는 것일 수 있다.In the present invention, the "polycystic kidney" refers to polycystic kidney disease or polycystic kidney disease, for example, it may be autosomal dominant polycystic kidney disease or autosomal recessive polycystic kidney disease, and in one example, autosomal dominant polycystic kidney disease. may be a disease. The autosomal dominant polycystic kidney disease may be used interchangeably with "autosomal dominant polycystic kidney", and may include a defect in PKD1 and/or PKD2 genes.

본 발명에서 "METRNL 유전자"는 METRNL 단백질을 암호화하는 유전자를 의미하며, "METRNL 발현"은 METRNL 단백질을 암호화하는 유전자의 전사 및/또는 발현, 및 METRNL 단백질의 발현을 모두 포함한다. In the present invention, "METRNL gene" refers to a gene encoding METRNL protein, and "METRNL expression" includes both transcription and/or expression of a gene encoding METRNL protein, and expression of METRNL protein.

본 발명이 제공하는 다낭신 진단용 조성물은, METRNL 단백질을 암호화하는 유전자의 mRNA 및/또는 METRNL 단백질을 검출하는 제제를 포함한다.The composition for diagnosing polycystic kidney provided by the present invention includes an agent for detecting mRNA and/or METRNL protein of a gene encoding METRNL protein.

상기 mRNA를 검출하는 제제는 mRNA의 발현량의 측정 목적 범위에서 당업자가 자유롭게 선택하여 사용할 수 있으며, 예를 들어, METRNL 유전자에 특이적으로 결합하는 올리고뉴클레오티드, 프라이머 또는 프로브일 수 있다. 상기 프라이머는 서열번호 1 및 2의 핵산 서열로 이루어지는 프라이머 쌍일 수 있다.The agent for detecting the mRNA can be freely selected and used by a person skilled in the art within the range for measuring the expression level of mRNA, for example, it may be an oligonucleotide, primer, or probe that specifically binds to the METRNL gene. The primer may be a pair of primers consisting of the nucleic acid sequences of SEQ ID NOs: 1 and 2.

상기 METRNL 단백질을 검출하는 제제는 단백질의 발현 또는 활성 수준을 측정할 수 있는 제제라면 제한 없이 선택하여 이용할 수 있으며, 예를 들어, 상기 METRNL 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 펩타이드, 압타머 또는 뉴클레오티드일 수 있다. 상기 단백질의 발현 여부를 측정하는 제제는 상기 단백질에 대하여 특이적으로 결합하기 위한 목적 범위 내에서의 모든 종류의 항체를 의미하고, 예를 들어, 다클론 항체, 단클론 항체, 재조합 항체 및 이들의 조합을 모두 포함하나 이에 제한되는 것은 아니다.The agent for detecting the METRNL protein can be selected and used without limitation as long as it is an agent capable of measuring the expression or activity level of the protein, for example, an antibody, peptide, aptamer or nucleotide that specifically binds to the METRNL protein. can be The agent for measuring the expression of the protein refers to all kinds of antibodies within the target range for specifically binding to the protein, for example, polyclonal antibodies, monoclonal antibodies, recombinant antibodies, and combinations thereof. All include, but not limited to.

상기 검출 제제는 생물학적 시료로부터 METRNL 단백질을 암호화하는 유전자의 mRNA 및/또는 METRNL 단백질을 검출하기 위한 목적 범위에서 제한 없이 사용 가능하며, 상기 생물학적 상기 시료는 환자의 조직, 혈액, 세포, 혈장, 혈청, 뇨, 낭종액, 및 타액으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. 일 예에서 상기 생물학적 시료는 비침습적 방법으로 환자로부터 분리된 시료일 수 있다. The detection agent can be used without limitation in the range of purposes for detecting the mRNA and/or the METRNL protein of a gene encoding the METRNL protein from a biological sample, and the biological sample is a patient's tissue, blood, cell, plasma, serum, It may be one or more selected from the group consisting of urine, cyst fluid, and saliva, but is not limited thereto. In one example, the biological sample may be a sample isolated from a patient by a non-invasive method.

본 발명의 일 실시예에서, 다낭신 환자로부터 분리된 신장 표피세포에서 전체 RNA를 추출한 후 RT-PCR을 통해 cDNA를 제작하고, 해당 cDNA를 주형으로 하여 다시 PCR을 수행하여 건강군과 환자군의 METRNL 유전자의 mRNA 발현량을 비교하였다. PCR 후 각 시료를 전기영동하여 밴드 세기를 비교한 결과, 상염색체 우성 다낭신 환자들의 신장 낭종 표피 세포들에게서 METRNL의 mRNA 발현량이 대조군(정상군 세포)에 비해 통계적으로 유의미하게 높게 나타났다. 따라서 METRNL 유전자 또는 상기 유전자가 코딩하는 METRNL 단백질은 다낭신, 예를 들어, 상염색체 우성 다낭신 진단용 바이오마커로서 활용될 수 있다.In one embodiment of the present invention, after extracting total RNA from renal epithelial cells isolated from polycystic kidney patients, cDNA is prepared through RT-PCR, and PCR is performed again using the cDNA as a template to perform METRNL in the healthy and patient groups mRNA expression levels of genes were compared. As a result of comparing the band intensity by electrophoresis of each sample after PCR, the mRNA expression level of METRNL in the epithelial cells of the renal cyst of the autosomal dominant polycystic kidney patients was statistically significantly higher than that of the control group (normal cells). Therefore, the METRNL gene or the METRNL protein encoded by the gene can be utilized as a biomarker for diagnosing polycystic kidney, for example, autosomal dominant polycystic kidney.

본 발명의 일 실시예에서, 다낭신 환자로부터 분리된 신장 표피세포 내의 METRNL 단백질의 발현 양상을 Western blot을 통해 확인하였다. 그 결과, 밴드가 매우 희미하게 나타난 대조군(건강군) 세포에 비해 METRNL 단백질 밴드가 현저히 선명하게 나타나, mRNA와 마찬가지로 METRNL 단백질의 발현량 또한 환자군에서 증가함을 확인하였다(도 1b). 따라서 METRNL 단백질은 다낭신, 예를 들어, 상염색체 우성 다낭신 진단용 바이오마커로서 활용될 수 있다.In one embodiment of the present invention, the expression pattern of METRNL protein in renal epithelial cells isolated from polycystic kidney patients was confirmed by Western blot. As a result, the METRNL protein band appeared remarkably clear compared to the control (health group) cells in which the band appeared very faint, confirming that the expression level of the METRNL protein was increased in the patient group like mRNA ( FIG. 1b ). Therefore, METRNL protein can be utilized as a biomarker for diagnosing polycystic kidney, for example, autosomal dominant polycystic kidney.

본 발명의 일 실시예에서, 다낭신 환자로부터 분리된 신장 표피세포 배양액 내의 METRNL 단백질의 양을 ELISA로 측정하였다. 그 결과, 대조군(비환자 또는 건강군) 세포의 배양액에 비해 환자 샘플 모두에서 통계적으로 유의미하게 배양액 내 METRNL 단백질의 양이 증가하였다. 따라서 세포 외로 분비되는 METRNL의 양 또한 다낭신 환자에서 현저히 높음을 확인하였으며, 이를 통해 비침습적 방법을 사용하여 METRNL을 검출함으로써 다낭신, 예를 들어 상염색체 우성 다낭신의 진단이 가능함을 알 수 있다.In one embodiment of the present invention, the amount of METRNL protein in the renal epidermal cell culture isolated from a polycystic kidney patient was measured by ELISA. As a result, the amount of METRNL protein in the culture medium was significantly increased in all of the patient samples compared to the culture medium of the control (non-patient or healthy group) cells. Therefore, it was confirmed that the amount of extracellularly secreted METRNL was also significantly higher in patients with polycystic kidney, and through this, it can be seen that polycystic kidney, for example, autosomal dominant polycystic kidney, can be diagnosed by detecting METRNL using a non-invasive method.

본 발명의 일 실시예에서, 다낭신 환자 중 예후가 좋은 것으로 알려져 있는 Non-progressor 그룹, 다낭신 환자 중 예후가 좋지 않은 것으로 알려져 있는 Progressor 그룹의 소변 내 METRNL 함량을 측정하였다. 그 결과, 예후가 좋은 것으로 알려져 있는 그룹(Non-progressor)에서의 METRNL 함량이 예후가 좋지 않은 것으로 알려져 잇는 그룹(Progressor)에서의 METRNL 함량보다 낮게 나타나, METRNL을 이용해 다낭신, 예를 들어 상염색체 우성 다낭신의 예후를 신뢰도 있게 예측할 수 있음을 확인하였다(도 2b). 따라서 본 발명이 제공하는 다낭신의 진단용 및/또는 예후 예측용 조성물은 소변 시료로부터 METRNL 단백질을 검출할 수 있어, 다낭신의 비침습적 진단 및/또는 예후 예측에 활용될 수 있다.In one embodiment of the present invention, the METRNL content in the urine of the non-progressor group known to have a good prognosis among polycystic kidney patients and the progressor group known to have a poor prognosis among polycystic kidney patients was measured. As a result, the METRNL content in the group known to have a good prognosis (Non-progressor) was lower than the METRNL content in the group known to have a poor prognosis (Progressor). It was confirmed that the prognosis of the dominant polycystic kidney can be reliably predicted (FIG. 2b). Therefore, the composition for diagnosis and/or prognosis of polycystic kidney provided by the present invention can detect METRNL protein from a urine sample, and thus can be utilized for non-invasive diagnosis and/or prediction of polycystic kidney.

본 발명의 또 다른 일 예는 METRNL 단백질을 암호화하는 유전자로부터 전사된 mRNA 및/또는 METRNL 단백질을 검출하는 제제를 포함하는, 다낭신 진단용 키트에 관한 것이다.Another embodiment of the present invention relates to a kit for diagnosing polycystic kidney, comprising an agent for detecting mRNA and/or METRNL protein transcribed from a gene encoding METRNL protein.

상기 진단용 키트는 상기 METRNL 단백질을 암호화하는 유전자 및/또는 METRNL 단백질을 검출하기 위한 제제로서, 예를 들어 프라이머, 프로브, 안티센스 올리고뉴클레오티드, 압타머, 및 항체로 이루어지는 군에서 선택되는 하나 이상의 제제를 포함할 뿐만 아니라, 분석 방법에 적합한 1종 이상의 다른 구성성분 조성물, 용액, 및/또는 장치가 포함될 수 있다.The diagnostic kit is an agent for detecting the gene encoding the METRNL protein and/or the METRNL protein, and includes, for example, one or more agents selected from the group consisting of primers, probes, antisense oligonucleotides, aptamers, and antibodies. In addition, one or more other component compositions, solutions, and/or devices suitable for analytical methods may be included.

구체적인 일 예로서, 본 발명에서 METRNL 단백질을 암호화하는 유전자의 mRNA 발현 정도를 측정하기 위한 키트는 실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR)을 수행하기 위해 필요한 필수 구성을 포함하는 키트일 수 있다. 상기 RT-PCR 키트는, METRNL 단백질을 암호화하는 유전자의 mRNA에 특이적인 각각의 프라이머쌍 외에, 테스트튜브 또는 다른 적절한 컨테이너(container), 반응 완충액(pH 및 마그네슘 농도는 다양), 데옥시뉴클레오티드(dNTPs), Taq-중합효소(Taq-polymerase), 및 역전사 효소와 같은 효소, DNase, RNase 억제제, DEPC-수(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한 정량 대조구로 사용되는 유전자에 특이적인 프라이머 쌍을 포함할 수 있다. 또한 일 예에서, 본 발명의 키트는 DNA 칩(chip)을 수행하기 위해 필요한 필수 구성을 포함하는 진단용 키트일 수 있다. DNA 칩 키트는, 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA가 프로브로 부착되어 있는 기판, 형광 표식 프로브를 제작하기 위한 시약, 제제, 효소 등을 포함할 수 있다. 또한, 기판은 정량 대조군 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA를 포함할 수 있다.As a specific example, the kit for measuring the mRNA expression level of the gene encoding the METRNL protein in the present invention may be a kit including essential components necessary for performing real-time polymerase chain reaction (RT-PCR). The RT-PCR kit contains, in addition to each primer pair specific for the mRNA of the gene encoding the METRNL protein, a test tube or other suitable container, reaction buffer (pH and magnesium concentration vary), deoxynucleotides (dNTPs) ), Taq-polymerase, and enzymes such as reverse transcriptase, DNase, RNase inhibitors, DEPC-water, sterile water, and the like. It may also include a pair of primers specific for a gene used as a quantitative control. Also, in one example, the kit of the present invention may be a diagnostic kit including essential components necessary for performing a DNA chip. The DNA chip kit may include a substrate to which cDNA corresponding to a gene or fragment thereof is attached as a probe, reagents, agents, enzymes, and the like for preparing a fluorescently-labeled probe. In addition, the substrate may include cDNA corresponding to a quantitative control gene or a fragment thereof.

또 다른 구체적인 일 예로서, 본 발명에서 METRNL 단백질의 발현 정도를 측정하기 위한 키트는 항체의 면역학적 검출을 위하여 기질, 적당한 완충 용액, 발색 효소 또는 형광물질로 표지된 2차 항체, 발색 기질 등을 포함할 수 있다. 상기에서 기질은 니트로셀룰로오스 막, 폴리 비닐 수지로 합성된 96-웰 플레이트 폴리스티렌 수지로 합성된 96-웰 플레이트 및/또는 유리로 된 슬라이스 글라스 등이 이용될 수 있고, 발색 효소는 퍼옥시다아제(peroxidase), 알칼라인 포스파타아제(Alkaline Phosphatase)가 사용될 수 있고, 형광 물질은 FITC, RITC 등이 사용될 수 있으며, 발색 기질은 ABTS(2,2'-아지노-비스(4-에틸벤조티아졸린-6-설폰산)) 또는 OPD(o-페닐렌디아민), TMB(테트라메틸 벤지딘)가 사용될 수 있다.As another specific example, the kit for measuring the expression level of the METRNL protein in the present invention includes a substrate, an appropriate buffer solution, a secondary antibody labeled with a chromogenic enzyme or fluorescent substance, a chromogenic substrate, etc. for immunological detection of the antibody. may include In the above substrate, a nitrocellulose membrane, a 96-well plate synthesized from a polyvinyl resin, a 96-well plate synthesized from a polystyrene resin, and/or a glass slice glass may be used, and the chromogenic enzyme is peroxidase , Alkaline Phosphatase may be used, FITC, RITC, etc. may be used as a fluorescent material, and ABTS (2,2'-azino-bis(4-ethylbenzothiazoline-6-sulfonyl) as a chromogenic substrate. phonic acid)) or OPD (o-phenylenediamine), TMB (tetramethyl benzidine) may be used.

상기 키트의 구성에서 예시된 각 물질은 예시를 위한 것일 뿐, 통상의 기술자가 필요에 따라 적절히 구성을 변경할 수 있다.Each material exemplified in the composition of the kit is for illustration only, and a person skilled in the art may appropriately change the composition as needed.

본 발명의 또 다른 일 예는 시료로부터 METRNL 단백질을 암호화하는 유전자 및/또는 METRNL 단백질의 발현량을 측정하는 단계를 포함하는, 다낭신 진단 및/또는 다낭신의 예후 예측에 필요한 정보를 제공하는 방법에 관한 것이다. Another embodiment of the present invention is a method for providing information necessary for diagnosing polycystic kidney and/or predicting the prognosis of polycystic kidney, comprising measuring the expression level of a gene encoding METRNL protein and/or METRNL protein from a sample it's about

상기 시료는 환자 및/또는 대조군의 조직, 혈액, 세포, 혈장, 혈청, 뇨, 낭종액, 및 타액으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 것일 수 있다. The sample may be one or more selected from the group consisting of tissue, blood, cells, plasma, serum, urine, cyst fluid, and saliva of a patient and/or control group.

상기 방법은, 환자로부터 분리된 시료로부터 METRNL 유전자의 mRNA 및/또는 METRNL 단백질의 발현 정도를 측정하는 단계, 및 상기 METRNL 유전자의 mRNA 및/또는 METRNL 단백질의 발현 정도를 대조군 시료 내 METRNL 유전자의 mRNA 및/또는 METRNL 단백질의 발현 정도와 비교하는 단계를 포함할 수 있다.The method includes measuring the expression level of the mRNA and/or METRNL protein of the METRNL gene from a sample isolated from the patient, and measuring the expression level of the mRNA and/or METRNL protein of the METRNL gene in the control sample. / or comparing the expression level of the METRNL protein.

상기 대조군은 건강군 및/또는 다낭신 환자가 아닌 개체군을 의미한다. The control group refers to a population that is not a healthy group and/or a polycystic kidney patient.

상기 METRNL 유전자의 mRNA 발현 정도를 측정하는 방법은, 예를 들어 역전사효소 중합효소연쇄반응(RT-PCR), 경쟁적 역전사효소 중합효소연쇄반응, 실시간 역전사효소 중합효소연쇄반응(Real time RT-PCR), RNase 보호 분석법, 노던 블롯팅, 및 DNA 칩으로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상의 방법을 이용하는 것일 수 있다.The method for measuring the mRNA expression level of the METRNL gene is, for example, reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR), competitive reverse transcriptase polymerase chain reaction, real time reverse transcriptase polymerase chain reaction (Real time RT-PCR) , an RNase protection assay, Northern blotting, and one or more methods selected from the group consisting of a DNA chip may be used.

상기 역전사효소 중합효소 연쇄반응은, 반응 후 전기영동하여 밴드 패턴과 밴드의 두께를 확인함으로써 METRNL 유전자의 mRNA 발현 여부 및 발현 정도를 확인 가능하고, 이를 대조군과 비교함으로써 다낭신의 발병 또는 진행 정도를 진단할 수 있다. 구체적으로, METRNL 유전자의 mRNA 발현량이 대조군보다 낮게 나타나는 경우, 다낭신이 발병한 것으로 진단할 수 있다. In the reverse transcriptase polymerase chain reaction, it is possible to check the mRNA expression and expression level of the METRNL gene by checking the band pattern and the thickness of the band by electrophoresis after the reaction, and by comparing it with the control group, the onset or progression of polycystic kidney is diagnosed can do. Specifically, when the mRNA expression level of the METRNL gene appears lower than that of the control group, polycystic kidney disease can be diagnosed.

상기 METRNL 단백질의 발현량을 측정하는 방법은, 웨스턴 블롯팅, ELISA, 방사선면역분석법, 방사 면역 확산법, 오우크테로니 면역 확산법, 로케트 면역 전기영동, 조직면역 염색, 면역 침전 분석법, 보체 고정 분석법, FACS, 및 단백질 칩으로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상의 방법을 수행될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.Methods for measuring the expression level of the METRNL protein include Western blotting, ELISA, radioimmunoassay, radioimmunodiffusion, Oukteroni immunodiffusion, rocket immunoelectrophoresis, tissue immunostaining, immunoprecipitation assay, complement fixation assay, One or more methods selected from the group consisting of FACS, and protein chips may be performed, but are not limited thereto.

일 구체예로, 상기 단백질 발현 정도 측정은 ELISA법을 이용하는 것이다. ELISA는 고체 지지체에 부착된 항원을 인지하는 표지된 항체를 이용하는 직접적 ELISA, 고체 지지체에 부착된 항원을 인지하는 항체의 복합체에서 포획 항체를 인지하는 표지된 항체를 이용하는 간접적 ELISA, 고체 지지체에 부착된 항체와 항원의 복합체에서 항원을 인지하는 표지된 또 다른 항체를 이용하는 직접적 샌드위치 ELISA, 고체 지지체에 부착된 항체와 항원의 복합체에서 항원을 인지하는 또 다른 항체와 반응시킨 후 이 항체를 인지하는 표지된 2차 항체를 이용하는 간접적 샌드위치 ELISA 등 다양한 ELISA 방법을 포함한다. 보다 바람직하게는, 고체 지지체에 항체를 부착시키고 시료를 반응시킨 후 항원-항체 복합체의 항원을 인지하는 표지된 항체를 부착시켜 효소적으로 발색시키거나 항원-항체복합체의 항원을 인지하는 항체에 대해 표지된 2차 항체를 부착시켜 효소적으로 발색시키는 샌드위치 ELISA 방법에 의해서 검출한다. 다낭신 마커인 METRNL 단백질과 항체의 복합체 형성 정도를 확인하여, 다낭신의 발병 여부 및/또는 진행예후를 확인할 수 있다.In one embodiment, the protein expression level is measured using an ELISA method. ELISA is a direct ELISA using a labeled antibody recognizing an antigen attached to a solid support, an indirect ELISA using a labeled antibody recognizing a capture antibody in a complex of an antibody recognizing an antigen attached to a solid support, and an indirect ELISA using a labeled antibody recognizing an antigen attached to a solid support. Direct sandwich ELISA using another labeled antibody that recognizes the antigen in a complex of the antibody and the antigen, reacts with another antibody that recognizes the antigen in the complex of the antibody attached to a solid support and the antigen, followed by a labeled antibody that recognizes the antibody It includes various ELISA methods, such as an indirect sandwich ELISA using a secondary antibody. More preferably, after attaching an antibody to a solid support and reacting the sample, a labeled antibody recognizing the antigen of the antigen-antibody complex is attached to enzymatically develop color or for an antibody recognizing the antigen of the antigen-antibody complex Detection is performed by a sandwich ELISA method in which a labeled secondary antibody is attached and enzymatically developed. By confirming the degree of complex formation between the polycystic kidney marker METRNL protein and the antibody, it is possible to determine whether polycystic kidney disease occurs and/or the prognosis of progression.

일 예에서, 상기 단백질 발현 정도 측정은 METRNL 단백질에 대한 하나 이상의 항체가 기판 위의 정해진 위치에 배열되어 고밀도로 고정화되어 있는 단백질 칩을 이용하는 것이다. 단백질 칩을 이용하여 시료를 분석하는 방법은, 시료에서 단백질을 분리하고, 분리한 단백질을 단백질 칩과 혼성화시켜서 항원-항체 복합체를 형성시키고, 이를 판독하여, 단백질의 존재 또는 발현 정도를 확인하여, 다낭신의 발병 여부 및/또는 진행 예후를 확인할 수 있다.In one example, the protein expression level is measured using a protein chip in which one or more antibodies against METRNL protein are arranged at a predetermined position on a substrate and immobilized at a high density. In the method of analyzing a sample using a protein chip, a protein is separated from a sample, the separated protein is hybridized with a protein chip to form an antigen-antibody complex, and the presence or expression level of the protein is checked by reading it, It is possible to determine whether polycystic kidney is onset and/or the prognosis of progression.

본 발명이 제공하는 다낭신 진단에 관한 정보를 제공하는 방법은, 상기 환자 시료에서의 METRNL 유전자의 mRNA 및/또는 METRNL 단백질의 발현량을 건강 대조군의 METRNL 유전자의 mRNA 및/또는 METRNL 단백질의 발현 정도와 비교하는 단계 이후 환자 시료에서의 METRNL 유전자의 mRNA 및/또는 METRNL 단백질의 발현량이 정상군보다 높은 경우 다낭신 환자로 결정하는 단계를 추가로 더 포함할 수 있다.In the method for providing information on diagnosis of polycystic kidney provided by the present invention, the expression level of METRNL gene mRNA and/or METRNL protein expression level in the patient sample is measured by the expression level of METRNL gene mRNA and/or METRNL protein expression level of a healthy control group. After the step of comparing with, when the expression level of the METRNL gene mRNA and/or the METRNL protein in the patient sample is higher than that of the normal group, the method may further include determining a polycystic kidney patient.

일 예에서, METRNL 단백질을 암호화하는 유전자의 mRNA 량이 정상군에 비해 2 내지 100배, 3 내지 100배, 5 내지 100배, 7 내지 100배, 10 내지 100배, 2 내지 50배, 2 내지 50배, 5 내지 50배, 7 내지 50배, 10 내지 50배, 2 내지 25배, 3 내지 25배, 5 내지 25배, 7 내지 25배, 또는 10 내지 25배인 경우, 상염색체 우성 다낭신 환자로 결정할 수 있다.In one example, the amount of mRNA of the gene encoding the METRNL protein is 2 to 100 times, 3 to 100 times, 5 to 100 times, 7 to 100 times, 10 to 100 times, 2 to 50 times, 2 to 50 times compared to the normal group. Autosomal dominant polycystic kidney when fold, 5 to 50 fold, 7 to 50 fold, 10 to 50 fold, 2 to 25 fold, 3 to 25 fold, 5 to 25 fold, 7 to 25 fold, or 10 to 25 fold can be decided with

일 예에서, 시료 내 METRNL 단백질의 함량이 정상군에 비해 2 내지 100배, 2 내지 50배, 2 내지 30배, 5 내지 100배, 5 내지 50배, 5 내지 30배, 10 내지 100배, 10 내지 50배, 10 내지 30배, 10 내지 25배, 15 내지 100배, 15 내지 50배, 15 내지 30배, 또는 15 내지 25배인 경우, 상염색체 우성 다낭신 환자로 결정할 수 있다. In one example, the content of the METRNL protein in the sample is 2 to 100 times, 2 to 50 times, 2 to 30 times, 5 to 100 times, 5 to 50 times, 5 to 30 times, 10 to 100 times, compared to the normal group, 10 to 50 times, 10 to 30 times, 10 to 25 times, 15 to 100 times, 15 to 50 times, 15 to 30 times, or 15 to 25 times, it can be determined as an autosomal dominant polycystic kidney patient.

상기 검출 방법을 통하여 다낭신의 발병 여부, 다낭신 환자의 낭종 형성 및 진행 예후를 진단할 수 있다. 즉, 환자의 METRNL 단백질을 암호화하는 유전자 및/또는 METRNL 단백질의 발현 정도를 건강 대조군에서의 METRNL 단백질을 암호화하는 유전자 및/또는 METRNL 단백질 발현 정도와 비교함으로써 환자의 METRNL 유전자 및/또는 METRNL 단백질 발현 정도가 건강 대조군에서보다 더 높게 나타나면, 다낭신이 발병 또는 진행될 것으로 진단할 수 있다.Through the detection method, it is possible to diagnose the onset of polycystic kidney, cyst formation and prognosis in polycystic kidney patients. That is, by comparing the expression level of the gene encoding the METRNL protein and/or the METRNL protein in the patient with the expression level of the gene encoding the METRNL protein and/or the METRNL protein in the healthy control group, the expression level of the METRNL gene and/or the METRNL protein in the patient is higher than in the healthy control group, polycystic kidney disease can be diagnosed as onset or progression.

본 발명의 일 실시예에서, 다낭신 환자의 낭종 표피 세포 내 METRNL 유전자의 mRNA양을 RT-PCR을 이용하여 측정한 결과, 건강 대조군 세포에서는 밴드가 희미하게 나타난 반면, 환자군 세포에서는 선명한 밴드가 나타났다.In one embodiment of the present invention, as a result of measuring the mRNA amount of the METRNL gene in the cystic epithelial cells of a polycystic kidney patient using RT-PCR, a faint band appeared in the healthy control cells, whereas a clear band appeared in the patient group cells. .

본 발명이 제공하는 다낭신의 예후 예측에 필요한 정보를 제공하는 방법은, 환자로부터 분리된 시료 내 METRNL 단백질을 암호화하는 유전자 및/또는 METRNL 단백질의 발현량을 측정하는 단계를 포함한다.The method of providing information necessary for predicting the prognosis of polycystic kidney provided by the present invention includes measuring the expression level of a gene encoding METRNL protein and/or METRNL protein in a sample isolated from a patient.

본 발명이 제공하는 다낭신의 예후 예측에 필요한 정보를 제공하는 방법은, 상기 다낭신의 진단에 필요한 정보를 제공하는 방법을 수행하여, 또는 상기 방법 외의 다낭신 진단 방법을 이용해 다낭신 환자로 결정된 환자에 대해 수행되는 것일 수 있다.In the method of providing information necessary for predicting the prognosis of polycystic kidney provided by the present invention, the method for providing information necessary for the diagnosis of polycystic kidney is performed, or a patient determined to be polycystic kidney using a polycystic kidney diagnosis method other than the above method. may be performed for

일 예에서, 상기 시료 내 METRNL 단백질의 농도가 0.25 내지 10pg/mg creatinine, 0.25 내지 5pg/mg creatinine, 0.25 내지 2pg/mg creatinine, 0.5 내지 10pg/mg creatinine, 0.5 내지 5pg/mg creatinine, 또는 0.5 내지 2pg/mg creatinine인 경우, 다낭신의 예후가 나쁜 것으로 예측할 수 있다. In one example, the concentration of the METRNL protein in the sample is 0.25 to 10pg/mg creatinine, 0.25 to 5pg/mg creatinine, 0.25 to 2pg/mg creatinine, 0.5 to 10pg/mg creatinine, 0.5 to 5pg/mg creatinine, or 0.5 to In the case of 2pg/mg creatinine, it can be predicted that the prognosis of polycystic kidney is poor.

본 명세서에서 다낭신의 예후는 낭종의 수, 크기, 및/또는 신장 기능을 고려하여, 시간의 경과에 따라 낭종의 수 및/또는 크기의 증가 및/또는 신장 기능의 저하가 예견되는 경우 예후가 나쁘다고 판정할 수 있다.In the present specification, the prognosis of polycystic kidney is that the prognosis is poor when an increase in the number and/or size of cysts and/or a decrease in renal function is predicted over time in consideration of the number, size, and/or renal function of the cyst. can be judged.

본 발명의 또 다른 일 예는, 다낭신 치료제의 후보 물질을 처리하는 단계 및 METRNL 유전자 및/또는 METRNL 단백질의 발현량 변화를 검출하는 단계를 포함하는, 다낭신 치료제의 스크리닝 방법에 관한 것이다.Another example of the present invention relates to a screening method for a polycystic kidney treatment, comprising the steps of treating a candidate substance for a polycystic kidney treatment and detecting a change in the expression level of the METRNL gene and/or the METRNL protein.

본 발명에 있어서, 다낭신 치료제란 다낭신의 진행을 완화하거나 중단시키는 물질을 포함한다. 다장신의 진행은 다낭신의 예후가 나빠지는 방향으로 병기가 진행되는 것을 의미한다.In the present invention, the treatment for polycystic kidney includes a substance that alleviates or stops the progression of polycystic kidney. The progression of multiple stature means that the stage progresses in the direction of worsening the prognosis of polycystic kidney.

구체적으로, 다낭신 치료 후보 물질의 존재 및 부재 하에서 METRNL 유전자 및/또는 METRNL 단백질의 발현 증감을 비교하는 방법으로 다낭신 치료제를 스크리닝하는 데 유용하게 사용할 수 있다. METRNL 유전자의 mRNA 또는 METRNL 단백질 농도를 직간접적으로 감소시키는 물질은 다낭신의 치료제로 선택될 수 있다. 즉, 다낭신 치료제 후보 물질의 존재 하에 본 발명의 마커 METRNL 유전자 및/또는 METRNL 단백질의 발현 정도를 측정하여 양자를 비교한 후, 다낭신 치료제 후보 물질이 존재할 때의 METRNL 유전자 및/또는 METRNL 단백질의 발현 정도가 다낭신 후보 물질의 부재 하에서의 METRNL 유전자 및/또는 METRNL 단백질의 발현 정도보다 감소시키는 물질을 다낭신의 치료제로 결정할 수 있다. Specifically, it is a method of comparing the increase or decrease in the expression of METRNL gene and/or METRNL protein in the presence and absence of a polycystic kidney treatment candidate, which can be usefully used for screening polycystic kidney treatment agents. Substances that directly or indirectly decrease the mRNA or METRNL protein concentration of the METRNL gene may be selected as a therapeutic agent for polycystic kidney. That is, after measuring the expression level of the marker METRNL gene and/or METRNL protein of the present invention in the presence of a polycystic kidney drug candidate, and comparing both, the METRNL gene and/or METRNL protein in the presence of a polycystic kidney drug candidate substance A substance whose expression level reduces the expression level of the METRNL gene and/or METRNL protein in the absence of a polycystic kidney candidate may be determined as a therapeutic agent for polycystic kidney.

본 발명이 제공하는 METRNL 유전자의 전사량 및/또는 METRNL 단백질의 발현량을 측정하는 제제를 포함하는 진단용 조성물은, 저비용으로 다낭신의 조기 진단 및 이에 따른 병증의 관리에 유용하게 이용될 수 있다. 특히 향후 환자의 신장 낭종 크기 증식을 억제할 수 있는 치료제 개발을 위한 타겟으로 적용 가능하다.The diagnostic composition comprising an agent for measuring the transcription level of the METRNL gene and/or the expression level of the METRNL protein provided by the present invention can be usefully used for the early diagnosis of polycystic kidney and management of the associated disease at low cost. In particular, it can be applied as a target for the development of therapeutic agents that can inhibit the growth of renal cyst size in patients in the future.

본 발명이 제공하는 METRNL 유전자의 전사량 및/또는 METRNL 단백질의 발현량을 측정하는 제제를 포함하는 조성물을 이용하여 다낭신 환자의 낭종의 증식 예후를 예측할 수 있으며, 이를 추적 관찰함으로써 향후 환자의 낭종 증식에 따른 발병 진행 정도를 예측할 수 있는 바이오마커로 활용 가능하고, 이를 통해 환자 개인 맞춤형 치료를 제공할 수 있다.The prognosis of proliferation of cysts in patients with polycystic kidney can be predicted by using a composition comprising an agent for measuring the transcription amount of the METRNL gene and/or the expression level of the METRNL protein provided by the present invention, and by following this, the cyst of the patient in the future It can be used as a biomarker that can predict the degree of disease progression according to proliferation, and through this, it is possible to provide personalized treatment for each patient.

도 1a는 다낭신 환자의 낭종 표피 세포(Cyst#1 및 Cyst#2)와 대조군 세포(RPTEC)에서의 METRNL 유전자 발현량을 실시간 중합효소연쇄반응을 이용해 확인한 결과이다.
도 1b는 다낭신 환자의 낭종 표피 세포와 대조군 세포에서의 METRNL 단백질의 발현량을 Western blot을 이용하여 확인한 결과 사진이다.
도 2a는 다낭신 환자의 낭종 표피 세포와 대조군 세포에서의 METRNL 단백질의 발현량을 ELISA를 이용해 정량 분석한 그래프이다.
도 2b는 다낭신 환자 중 예후가 나쁜 것으로 알려진 돌연변이를 가진 그룹(Progressor)과 예후가 좋은 것으로 알려진 돌연변이를 가진 그룹(Non-progressor)의 소변 내 METRNL의 양을 ELISA를 이용해 측정한 결과 그래프이다.
1a is a result of confirming the expression level of METRNL gene in cyst epithelial cells (Cyst#1 and Cyst#2) and control cells (RPTEC) of polycystic kidney patients using real-time polymerase chain reaction.
Figure 1b is a photograph of the result of confirming the expression level of METRNL protein in cystic epithelial cells and control cells of polycystic kidney patients using Western blot.
2A is a graph illustrating quantitative analysis of the expression level of METRNL protein in cyst epithelial cells and control cells of a polycystic kidney patient using ELISA.
Figure 2b is a graph showing the results of measuring the amount of METRNL in urine of a group with a mutation known to have a bad prognosis (Progressor) and a group with a mutation known to have a good prognosis (Non-progressor) among polycystic kidney patients using ELISA.

이하 본 발명을 실시예에 의해 구체적으로 설명한다. 그러나 하기 실시예는 본 발명을 예시하기 위한 것일 뿐, 본 발명의 권리범위를 제한하지 않는다.Hereinafter, the present invention will be described in detail by way of Examples. However, the following examples are only for illustrating the present invention, and do not limit the scope of the present invention.

실시예 1. 시료의 준비Example 1. Preparation of samples

다낭신 환자의 신장 조직 샘플은 서울대학교병원으로부터 공급받았다. 상염색체 우성 다낭신 환자로부터 추출된 신장에서 낭종의 일부를 추출하여 세포 배양을 진행하였다. 세포 배양은 DMEM/10%(v/v) FBS 배지에서 37℃, 5% CO2 조건에서 진행되었다. 대조군 시료로는 ATCC에서 구매한 RPTEC/TERT1 (CRL-4031) 이라는 정상 신장 표피 세포를 사용하였다. Kidney tissue samples from patients with polycystic kidney were supplied by Seoul National University Hospital. Cell culture was performed by extracting a part of the cyst from the kidney extracted from a patient with autosomal dominant polycystic kidney. Cell culture was performed in DMEM/10% (v/v) FBS medium at 37°C and 5% CO2 conditions. As a control sample, normal renal epidermal cells called RPTEC/TERT1 (CRL-4031) purchased from ATCC were used.

실시예 2. 다낭신 환자의 낭종 표피 세포에서 Metrnl 발현량 확인Example 2. Confirmation of Metrnl expression level in cyst epithelial cells of polycystic kidney patients

2-1. RNA 시료 준비2-1. RNA sample preparation

실시예 1에서 배양된 세포로부터 Qiagen사의 RNeasy Plus Mini Kit를 사용하여 세포 내 전체 RNA를 추출하였다. 구체적으로, 먼저 세포를 1X10^7 개로 수득하여 RLT lysis buffer를 사용하여 cell lysis를 진행하였다. Lysate를 gDNA Eliminator spin column에 옮긴 후 10,000rpm에 30초간 원심분리 후, Flow-through에 동일량의 70% EtOH를 넣어 섞은 후 RNeasy spin column에 옮겨 10,000rpm에 15초간 원심분리하였다. RW1 buffer 700ul를 column에 넣은 후 10,000rpm에 15초간 원심분리 후 RPE buffer 500ul를 column에 넣은 후 10,000rpm에 15초간 원심분리를 수행한 후, Air dry 후 50ul RNase-free water를 column에 넣은 후 10,000rpm에 15초간 원심분리하여 전체 RNA를 추출하였다.Total intracellular RNA was extracted from the cells cultured in Example 1 using Qiagen's RNeasy Plus Mini Kit. Specifically, 1X10^7 cells were first obtained and cell lysis was performed using RLT lysis buffer. Lysate was transferred to the gDNA Eliminator spin column, centrifuged at 10,000 rpm for 30 seconds, the same amount of 70% EtOH was added to the flow-through, mixed, and then transferred to an RNeasy spin column and centrifuged at 10,000 rpm for 15 seconds. After putting 700ul of RW1 buffer into the column, centrifugation at 10,000rpm for 15 seconds, adding 500ul of RPE buffer to the column, centrifugation at 10,000rpm for 15 seconds, air dry 50ul RNase-free water into the column, and then 10,000 Total RNA was extracted by centrifugation at rpm for 15 seconds.

2-2. RT-PCR2-2. RT-PCR

상기 추출된 전체 RNA를 주형으로, TAKARA 사의 PrimeScript RT-PCR Kit를 이용하여 역전사 중합효소 연쇄반응(reverse transcription polymerase chain reaction; RT-PCR)을 통해 cDNA를 제작하였다. Reaction Mixture, Reagent Mixture 및 Thermal condition 정보는 하기와 같다.Using the extracted total RNA as a template, cDNA was prepared through reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) using TAKARA's PrimeScript RT-PCR Kit. Reaction Mixture, Reagent Mixture, and Thermal condition information are as follows.

(1) Reaction mixture;(1) reaction mixture;

Template (RNA) 2ugTemplate (RNA) 2ug

Oligo dT primer (2.5uM) 1ulOligo dT primer (2.5uM) 1ul

dNTP (10mM each) 1uldNTP (10mM each) 1ul

RNase Free dH2O up to 10ulRNase Free dHO up to 10ul

Denaturation at 65℃ for 5 minDenaturation at 65℃ for 5 min

(2) Reagent mixture;(2) Reagent mixture;

Reaction mixture 10ulreaction mixture 10ul

5X PrimeScript Buffer 4ul5X PrimeScript Buffer 4ul

RNase Inhibitor (40U/ul) 0.5ulRNase Inhibitor (40U/ul) 0.5ul

PriemScript RTase 0.5ulPriemScript RTase 0.5ul

RNase Free dH2O 5ulRNase Free dH 2 O 5ul

(3) Thermal condition;(3) Thermal condition;

30℃ 10 min30℃ 10 min

42℃ 30 min42℃ 30 min

95℃ 5min95℃ 5min

4℃ 보관4℃ storage

2-3. 건강군과 환자군의 Metrnl 발현량 비교2-3. Comparison of Metrnl expression levels between healthy and patient groups

실시예 2-2에서 제작된 cDNA 시료를 주형으로 하여, 하기 표 2에 기재된 서열번호 1 및 2의 프라이머 세트를 이용하여 Metrnl을 암호화하는 유전자의 발현량을 역전사 중합효소연쇄반응(RT-PCR)을 이용해 증폭하여 건강군과 환자군의 Metrnl 발현량을 비교하였다. 대조군으로는 GAPDH 유전자를 사용하였다. GAPDH 유전자의 증폭 및 Metrnl cDNA의 증폭에 사용된 프라이머 세트를 하기 표 1에 나타내었다. Using the cDNA sample prepared in Example 2-2 as a template, the expression level of the gene encoding Metrnl was measured by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) using the primer sets of SEQ ID NOs: 1 and 2 shown in Table 2 below. was amplified to compare Metrnl expression levels in the healthy and patient groups. As a control, the GAPDH gene was used. The primer sets used for the amplification of the GAPDH gene and the amplification of Metrnl cDNA are shown in Table 1 below.

서열번호Sequence number 프라이머primer 서열 (5'>3')sequence (5'>3') 1One Metrnl_forwardMetrnl_forward CAAGTTACCCACGAGCCTGAGCAAGTTACCCACGAGCCTGAG 22 Metrnl_reverseMetrnl_reverse CGGCCCACGGAGTCAGTCCGGCCCACGGAGTCAGTC 33 GAPDH_forwardGAPDH_forward TTGCCATCAATGACCCCTTCATTGCCATCAATGACCCCTTCA 44 GAPDH_reverseGAPDH_reverse CGCCCCACTTGATTTTGGACGCCCCACTTGATTTTGGA

PCR 후 각 시료를 아가로스 젤에서 전기영동하여 각 PCR 산물의 밴드 세기를 통해 mRNA 발현량을 비교하였다. 도 1a에 상염색체 우성 다낭신 환자들의 신장 낭종 표피 세포들에게서 Metrnl 유전자의 mRNA 발현량을 조사한 결과의 사진을 나타내었다. 대조군인 GAPDH의 밴드 세기는 대조군 세포(control, RPTEC)와 상염색체 우성 다낭신 환자 세포들 사이에서 큰 변화를 보이지 않았으나, Metrnl의 경우, 대조군 세포에서의 밴드의 세기(intensity)보다 약한 밴드가 나타난 반면, 상염색체 우성 다낭신 환자군에서는 밴드가 대조군 세포에서의 밴드 세기와 유사한 강도로 나타나, 환자군에서 Metrnl의 mRNA 발현량이 공통적으로 증가하였음이 확인되었다. After PCR, each sample was electrophoresed on an agarose gel to compare mRNA expression levels through the band intensity of each PCR product. Figure 1a shows a photograph of the result of examining the mRNA expression level of Metrnl gene in renal cyst epithelial cells of autosomal dominant polycystic kidney patients. The band intensity of the control GAPDH did not show a significant change between the control cells (control, RPTEC) and the autosomal dominant polycystic kidney patient cells, but in the case of Metrnl, a band weaker than the intensity of the band in the control cells appeared. On the other hand, in the autosomal dominant polycystic kidney patient group, the band appeared with a strength similar to that in the control cell, confirming that the mRNA expression level of Metrnl was increased in common in the patient group.

도 1a에 상염색체 우성 다낭신 환자들의 전기영동 결과 나타난 band 사진과 실시간 중합효소연쇄반응(Real time-PCR, RT-PCR) 결과 그래프를 나타내었다. 대조군인 RPTEC에서의 fold change를 1로 두었을 때, 환자 2인의 fold change는 각각 15.25 및 20.07 으로 측정되어 건강군에 비해 다낭신 환자에서 Metrnl의 발현량이 현저히 높게 나타나는 것을 정량적으로 확인하였다.Fig. 1a shows a band photograph and a graph of real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) results of electrophoresis results of autosomal dominant polycystic kidney patients. When the fold change in the control group, RPTEC, was set to 1, the fold change of 2 patients was measured to be 15.25 and 20.07, respectively, and it was quantitatively confirmed that the expression level of Metrnl was significantly higher in the polycystic kidney patients than in the healthy group.

추가로, Western blot을 이용해 상기 대조군 세포와 다낭신 환자의 신장 낭종 표피 세포에서의 Metrnl 발현량을 확인하였다. 단백질 발현량을 살필 대조군으로는 b-actin 단백질을 선정하였으며, METRNL에 대해서는 Abcam 사의 anti-METRNL (ab235775) 항체를, b-actin에 대해서는 Sigma 사의 monoclonal anti-b-actin (A5316) 항체를 각각 1:1000 희석 농도로 이용하였다.In addition, the expression level of Metrnl was confirmed in the control cells and the epithelial cells of the renal cyst of the polycystic kidney patient using Western blot. As a control to check the protein expression level, b-actin protein was selected. For METRNL, Abcam's anti-METRNL (ab235775) antibody, and for b-actin, Sigma's monoclonal anti-b-actin (A5316) antibody was 1 each. : It was used at a dilution concentration of 1000.

도 1b에 Western blot 결과를 나타내었다.Western blot도 RT-PCR에서와 마찬가지로, 낭종 표피 세포(Cyst #1 및 Cyst #2로 표시)에서의 Metrnl 단백질이 대조군 세포에 비해 증가함을 확인하였다.Western blot results are shown in FIG. 1B. As in RT-PCR, Western blot confirmed that Metrnl protein in cyst epithelial cells (indicated as Cyst #1 and Cyst #2) was increased compared to control cells.

실시예 3. 다낭신 환자의 낭종 표피 세포 배양액에서 Metrnl의 양 확인 Example 3. Confirmation of Metrnl Amount in Cyst Epidermal Cell Culture of Polycystic Kidney Patients

다낭신 환자의 낭종 표피 세포에서 Metrnl이 세포 배양액에서 축적이 비환자군에 비해 증가되었는지 여부를 살피기 위해 실시예 1과 실질적으로 동일한 방법으로 배양된 신장 낭종 표피 세포와 대조군 세포 (RPTEC)의 배양액에 대해 효소결합면역흡착검사(Enzyme-linked immunosorbent assay; ELISA)를 수행하였다. In order to examine whether the accumulation of Metrnl in the cystic epithelial cells of a polycystic kidney patient in the cell culture medium was increased compared to that of the non-patient group, the renal cyst epithelial cells and control cells (RPTEC) cultured in substantially the same manner as in Example 1. An enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) was performed.

구체적으로, 실시예 1에서와 실질적으로 동일한 방법으로 환자로부터 분리한 낭종 표피 세포(Cyst #1 및 #2)와 대조군 세포(RPTEC)를 각각 배양하고, R&D System 사의 Human Meteorin-like/METRNL(DY7867-05) ELISA kit를 이용하여 Metrnl의 양을 측정하였다. Specifically, cyst epithelial cells (Cyst #1 and #2) and control cells (RPTEC) isolated from the patient in substantially the same manner as in Example 1 were cultured, respectively, and Human Meteorin-like/METRNL (DY7867 of R&D System) -05) The amount of Metrnl was measured using an ELISA kit.

도 2a에 상염색체 우성 다낭신 환자의 배양액(cyst#1 및 Cyst#2)에서 Metrnl의 양을 ELISA로 측정한 결과 그래프를 나타내었다. ELISA 결과 환자 2명의 샘플 모두에서 통계적으로 유의미하게 세포 배양액 내 Metrnl 단백질의 양이 증가하였음을 확인할 수 있었다. 구체적으로, 대조군은 1.99 pg/mL, 환자의 경우 각각 84.94 pg/mL 및 95.00 pg/mL의 Metrnl 단백질 농도를 보였다. Figure 2a shows a graph of the results of measuring the amount of Metrnl in the culture medium (cyst#1 and Cyst#2) of autosomal dominant polycystic kidney patients by ELISA. As a result of ELISA, it was confirmed that the amount of Metrnl protein in the cell culture medium was increased in a statistically significant manner in both samples of the two patients. Specifically, the control group showed Metrnl protein concentrations of 1.99 pg/mL, and the patients had Metrnl protein concentrations of 84.94 pg/mL and 95.00 pg/mL, respectively.

따라서 Metrnl이 상염색체 우성 다낭신 환자의 신장 낭종 표피 세포에서 발현량이 증가함이 확인되었으며, 특히 환자로부터 분리된 신장 낭종 표피 세포(Cyst#1 및 Cyst#2)에서만 Metrnl의 분비량이 높게 나타남을 확인하였다. Therefore, it was confirmed that the expression level of Metrnl was increased in renal cyst epithelial cells of autosomal dominant polycystic kidney patients. In particular, it was confirmed that Metrnl secretion was high only in renal cyst epithelial cells isolated from the patient (Cyst#1 and Cyst#2). did.

실시예 4. 소변 샘플에서 Metrnl의 양 확인Example 4. Determination of Amount of Metrnl in Urine Sample

비침습적 방법을 이용하여 Metrnl을 이용한 상염색체 우성 다낭신의 진단 및 예후 예측 가능성을 확인하기 위해, 환자군에서 상염색체 돌연변이의 종류에 따라 분류된 Non-progressor 및 Progressor 군의 환자 소변을 이용해 ELISA를 이용해 소변 내 OPN 단백질 양을 측정하였다.In order to confirm the diagnostic and prognostic predictability of autosomal dominant polycystic kidney using Metrnl using a non-invasive method, urine from non-progressor and Progressor patients classified according to the type of autosomal mutation in the patient group was used and ELISA was used. My OPN protein amount was measured.

구체적으로, Non-progressor 군은 미국의 Mayo Clinic 분류에 따라 Class 1A-1B에 해당하는 그룹, 즉, 나이에 따른 신장 부피가 적으며 PKD2 유전자 돌연변이와 PKD1 missense 돌연변이를 가지는 그룹으로 분류된 환자 11명을 대상으로 하였다. Progressor 군은 미국 Mayo Clinic 분류에 따라 Class 1C-1E에 해당하는 그룹, 즉, 나이에 따른 신장 부피가 크며 PKD1 유전자에 nonsense 돌연변이를 가지는 것으로 확인된 환자 11명을 대상으로 하였다. Specifically, the non-progressor group was classified into a group corresponding to Class 1A-1B according to the Mayo Clinic classification in the United States, that is, a group with a small kidney volume according to age and a PKD2 gene mutation and a PKD1 missense mutation. 11 patients was targeted. The Progressor group included 11 patients who were identified as having a nonsense mutation in the PKD1 gene with a large kidney volume according to age, that is, a group corresponding to Class 1C-1E according to the Mayo Clinic classification in the United States.

ELISA는 상기 실시예 3과 실질적으로 동일한 방법으로 수행되었으며, 그 결과 그래프를 도 2b에 나타내었다. ELISA 결과, 예후가 비교적 좋은 것으로 알려진 돌연변이를 가진 환자군인 Non-progressor 그룹과 예후가 비교적 좋지 않다고 알려진 돌연변이를 가진 환자군인 Progressor 그룹 사이에서도 예후가 비교적 좋은 Non-progressor 그룹에서의 Metrnl 농도가 Progressor 군에 비해 저농도로 나타나, Metrnl 단백질 및 이를 암호화하는 유전자와 상기 유전자로부터 전사된 mRNA 모두 상염색체 우성 다낭신의 예후를 예측할 수 있는 바이오마커로서 활용할 수 있음을 확인하였다.ELISA was performed in substantially the same manner as in Example 3, and the result is shown in the graph in FIG. 2B. As a result of ELISA, the Metrnl concentration in the non-progressor group with a relatively good prognosis was higher in the Progressor group even between the Non-progressor group, a patient group with a mutation known to have a relatively good prognosis, and the Progressor group, a patient group with a mutation known to have a relatively poor prognosis. Appears at a low concentration compared to that, it was confirmed that Metrnl protein, a gene encoding it, and mRNA transcribed from the gene can all be utilized as biomarkers that can predict the prognosis of autosomal dominant polycystic kidney.

<110> Seoul National University R&DB Foundation <120> Composition for diagnosing polycystic kidney disease comprising agent for detecting Metrnl and use thereof <130> DPP20201841KR <150> KR 10-2019-0151709 <151> 2019-11-22 <160> 4 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Metrnl_forward <400> 1 caagttaccc acgagcctga g 21 <210> 2 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Metrnl_reverse <400> 2 cggcccacgg agtcagtc 18 <210> 3 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GAPDH_forward <400> 3 ttgccatcaa tgaccccttc a 21 <210> 4 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GAPDH_reverse <400> 4 cgccccactt gattttgga 19 <110> Seoul National University R&DB Foundation <120> Composition for diagnosing polycystic kidney disease comprising agent for detecting Metrnl and use thereof <130> DPP20201841KR <150> KR 10-2019-0151709 <151> 2019-11-22 <160> 4 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Metrnl_forward <400> 1 caagttaccc acgagcctga g 21 <210> 2 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Metrnl_reverse <400> 2 cggccccacgg agtcagtc 18 <210> 3 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GAPDH_forward <400> 3 ttgccatcaa tgaccccttc a 21 <210> 4 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GAPDH_reverse <400> 4 cgccccactt gattttgga 19

Claims (10)

메테오린 유사체(Meteorin-like, Metrnl) 단백질을 검출하는 제제, 및 메테오린 유사체 단백질을 암호화하는 유전자의 mRNA를 검출하는 제제로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 제제를 포함하는, 다낭신의 진단용 조성물.A composition for diagnosis of polycystic kidney, comprising at least one agent selected from the group consisting of an agent for detecting a meteorin-like (Metrnl) protein, and an agent for detecting the mRNA of a gene encoding a meteorin-like protein. 제1항에 따른 조성물을 포함하는, 다낭신의 진단용 키트.A kit for diagnosis of polycystic kidney, comprising the composition according to claim 1. 메테오린 유사체(Meteorin-like, Metrnl) 단백질을 검출하는 제제, 및 메테오린 유사체 단백질을 암호화하는 유전자의 mRNA를 검출하는 제제로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 제제를 포함하는, 다낭신의 예후 예측용 조성물.A composition for predicting the prognosis of polycystic kidney, comprising at least one agent selected from the group consisting of an agent for detecting a meteorin-like (Metrnl) protein, and an agent for detecting mRNA of a gene encoding a meteorin-like protein. 제3항에 따른 조성물을 포함하는, 다낭신의 예후 예측용 키트.A kit for predicting the prognosis of polycystic kidney, comprising the composition according to claim 3 . 환자로부터 분리된 시료로부터 Metrnl 단백질을 암호화하는 유전자, 및 METRNL 단백질로 이루어지는 군에서 선택되는 하나 이상의 발현량을 측정하는 단계를 포함하는, 다낭신 진단에 필요한 정보를 제공하는 방법A method for providing information necessary for diagnosing polycystic kidney, comprising measuring the expression level of one or more selected from the group consisting of a gene encoding Metrnl protein and METRNL protein from a sample isolated from a patient 제5항에 있어서, 상기 시료는 환자의 조직, 혈액, 세포, 혈장, 혈청, 뇨, 낭종액, 및 타액으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 것인, 방법.The method of claim 5, wherein the sample is at least one selected from the group consisting of tissue, blood, cells, plasma, serum, urine, cyst fluid, and saliva of a patient. 제5항에 있어서, 다낭신 환자가 아닌 대조군으로부터 분리된 시료로부터 Metrnl 단백질을 암호화하는 유전자, 및 Metrnl 단백질로 이루어지는 군에서 선택되는 하나 이상의 발현량을 측정하는 단계;
환자와 대조군의 발현량을 비교하는 단계; 및
상기 환자 시료에서의 발현량이 대조군에 비해 높은 경우, 상기 환자를 다낭신 환자로 결정하는 단계를 포함하는, 방법.
The method of claim 5, further comprising: measuring the expression level of one or more selected from the group consisting of a gene encoding Metrnl protein and Metrnl protein from a sample isolated from a control group other than a polycystic kidney patient;
comparing the expression levels of the patient and the control group; and
When the expression level in the patient sample is higher than that of the control, determining the patient as a polycystic kidney patient.
환자로부터 분리된 시료로부터 Metrnl 단백질을 암호화하는 유전자, 및 Metrnl 단백질로 이루어지는 군에서 선택되는 하나 이상의 발현량을 측정하는 단계를 포함하는, 다낭신의 예후 예측에 필요한 정보를 제공하는 방법.A method for providing information necessary for predicting the prognosis of polycystic kidney, comprising measuring the expression level of one or more selected from the group consisting of a gene encoding Metrnl protein and Metrnl protein from a sample isolated from a patient. 제8항에 있어서, 상기 시료는 환자의 조직, 혈액, 세포, 혈장, 혈청, 뇨, 낭종액, 및 타액으로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 것인, 방법.The method of claim 8, wherein the sample is at least one selected from the group consisting of tissue, blood, cells, plasma, serum, urine, cyst fluid, and saliva of a patient. 제8항에 있어서, 상기 Metrnl 단백질의 농도가 0.25 내지 10pg/mg creatinine인 경우, 다낭신의 예후가 나쁜 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 방법.
The method according to claim 8, comprising determining that the prognosis of polycystic kidney is poor when the concentration of Metrnl protein is 0.25 to 10 pg/mg creatinine.
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