KR20210000257A - Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration - Google Patents
Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration Download PDFInfo
- Publication number
- KR20210000257A KR20210000257A KR1020190168276A KR20190168276A KR20210000257A KR 20210000257 A KR20210000257 A KR 20210000257A KR 1020190168276 A KR1020190168276 A KR 1020190168276A KR 20190168276 A KR20190168276 A KR 20190168276A KR 20210000257 A KR20210000257 A KR 20210000257A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- brain
- damage
- blood
- gene
- present
- Prior art date
Links
- 208000014644 Brain disease Diseases 0.000 title claims abstract description 76
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 title claims abstract description 26
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims abstract description 21
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 title claims abstract description 15
- 230000008499 blood brain barrier function Effects 0.000 title abstract description 83
- 210000001218 blood-brain barrier Anatomy 0.000 title abstract description 83
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 title abstract description 15
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 claims abstract description 85
- 230000006378 damage Effects 0.000 claims abstract description 77
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 26
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 115
- 108010081689 Osteopontin Proteins 0.000 claims description 54
- 102000004264 Osteopontin Human genes 0.000 claims description 54
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 51
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 34
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims description 24
- 210000004088 microvessel Anatomy 0.000 claims description 17
- 230000004952 protein activity Effects 0.000 claims description 16
- 206010012289 Dementia Diseases 0.000 claims description 10
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 10
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 10
- 208000007333 Brain Concussion Diseases 0.000 claims description 9
- 208000010877 cognitive disease Diseases 0.000 claims description 6
- 208000032109 Transient ischaemic attack Diseases 0.000 claims description 5
- 206010002026 amyotrophic lateral sclerosis Diseases 0.000 claims description 5
- 208000027061 mild cognitive impairment Diseases 0.000 claims description 5
- 201000010875 transient cerebral ischemia Diseases 0.000 claims description 5
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 claims description 4
- 208000014674 injury Diseases 0.000 claims description 4
- 230000000472 traumatic effect Effects 0.000 claims 4
- 238000010171 animal model Methods 0.000 abstract description 23
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 abstract description 8
- 238000012216 screening Methods 0.000 abstract description 8
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 abstract 1
- 101100453990 Mus musculus Klk1 gene Proteins 0.000 description 51
- 101150055061 LCN2 gene Proteins 0.000 description 47
- 101150080672 Bst2 gene Proteins 0.000 description 46
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 23
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 21
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 21
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 18
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 17
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 15
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 15
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 13
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 12
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 11
- 101100365661 Mus musculus Scgb3a2 gene Proteins 0.000 description 10
- 230000009525 mild injury Effects 0.000 description 10
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 7
- 230000003412 degenerative effect Effects 0.000 description 7
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 7
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 6
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 6
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 6
- 102100035405 Neutrophil gelatinase-associated lipocalin Human genes 0.000 description 6
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 6
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 6
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 6
- 101001023833 Homo sapiens Neutrophil gelatinase-associated lipocalin Proteins 0.000 description 5
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 5
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 5
- 210000005013 brain tissue Anatomy 0.000 description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 5
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 5
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 5
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 5
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 5
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 4
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 4
- 208000018737 Parkinson disease Diseases 0.000 description 4
- 238000003559 RNA-seq method Methods 0.000 description 4
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 4
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 4
- 239000002872 contrast media Substances 0.000 description 4
- 238000002595 magnetic resonance imaging Methods 0.000 description 4
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 4
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 4
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 4
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 3
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 3
- 102100037268 Secretoglobin family 3A member 1 Human genes 0.000 description 3
- 101710176361 Secretoglobin family 3A member 1 Proteins 0.000 description 3
- 239000000091 biomarker candidate Substances 0.000 description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 3
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 description 3
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 3
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 3
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 3
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 3
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 3
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 3
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- GEYOCULIXLDCMW-UHFFFAOYSA-N 1,2-phenylenediamine Chemical compound NC1=CC=CC=C1N GEYOCULIXLDCMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000024827 Alzheimer disease Diseases 0.000 description 2
- 102100037086 Bone marrow stromal antigen 2 Human genes 0.000 description 2
- 238000000018 DNA microarray Methods 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- 101000605522 Homo sapiens Kallikrein-1 Proteins 0.000 description 2
- 101001091385 Homo sapiens Kallikrein-6 Proteins 0.000 description 2
- 102100034866 Kallikrein-6 Human genes 0.000 description 2
- 108010006444 Leucine-Rich Repeat Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102100035987 Leucine-rich alpha-2-glycoprotein Human genes 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 2
- 238000010802 RNA extraction kit Methods 0.000 description 2
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 2
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 2
- 230000008512 biological response Effects 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 230000003920 cognitive function Effects 0.000 description 2
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 2
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 2
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000006870 function Effects 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 2
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 2
- 230000001678 irradiating effect Effects 0.000 description 2
- 210000004901 leucine-rich repeat Anatomy 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 2
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 2
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 2
- UAIUNKRWKOVEES-UHFFFAOYSA-N 3,3',5,5'-tetramethylbenzidine Chemical compound CC1=C(N)C(C)=CC(C=2C=C(C)C(N)=C(C)C=2)=C1 UAIUNKRWKOVEES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YRNWIFYIFSBPAU-UHFFFAOYSA-N 4-[4-(dimethylamino)phenyl]-n,n-dimethylaniline Chemical compound C1=CC(N(C)C)=CC=C1C1=CC=C(N(C)C)C=C1 YRNWIFYIFSBPAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- 208000009304 Acute Kidney Injury Diseases 0.000 description 1
- 208000036764 Adenocarcinoma of the esophagus Diseases 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 102100033312 Alpha-2-macroglobulin Human genes 0.000 description 1
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 1
- 102000007592 Apolipoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010071619 Apolipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 108010051118 Bone Marrow Stromal Antigen 2 Proteins 0.000 description 1
- 208000003174 Brain Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 102100029391 Cardiotrophin-like cytokine factor 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710107109 Cardiotrophin-like cytokine factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000029816 Collagenase Human genes 0.000 description 1
- 108060005980 Collagenase Proteins 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 1
- 102000016911 Deoxyribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010053770 Deoxyribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 238000008157 ELISA kit Methods 0.000 description 1
- 229930186217 Glycolipid Natural products 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000015779 HDL Lipoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010010234 HDL Lipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 101000740785 Homo sapiens Bone marrow stromal antigen 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000783723 Homo sapiens Leucine-rich alpha-2-glycoprotein Proteins 0.000 description 1
- 101001082142 Homo sapiens Pentraxin-related protein PTX3 Proteins 0.000 description 1
- 241000713772 Human immunodeficiency virus 1 Species 0.000 description 1
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 1
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 1
- 102000008070 Interferon-gamma Human genes 0.000 description 1
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 1
- 102000013462 Interleukin-12 Human genes 0.000 description 1
- 108010065805 Interleukin-12 Proteins 0.000 description 1
- 102000004889 Interleukin-6 Human genes 0.000 description 1
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 1
- 102100038297 Kallikrein-1 Human genes 0.000 description 1
- 101710083711 Leucine-rich alpha-2-glycoprotein Proteins 0.000 description 1
- 102000019298 Lipocalin Human genes 0.000 description 1
- 108050006654 Lipocalin Proteins 0.000 description 1
- 108010051335 Lipocalin-2 Proteins 0.000 description 1
- 101100365659 Mus musculus Scgb3a1 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 1
- 206010030137 Oesophageal adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 1
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 1
- 102100027351 Pentraxin-related protein PTX3 Human genes 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 1
- 108010015078 Pregnancy-Associated alpha 2-Macroglobulins Proteins 0.000 description 1
- 229940124158 Protease/peptidase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 1
- 208000033626 Renal failure acute Diseases 0.000 description 1
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 102000054727 Serum Amyloid A Human genes 0.000 description 1
- 108700028909 Serum Amyloid A Proteins 0.000 description 1
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 1
- 108090000190 Thrombin Proteins 0.000 description 1
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 1
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 201000011040 acute kidney failure Diseases 0.000 description 1
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- OHDRQQURAXLVGJ-HLVWOLMTSA-N azane;(2e)-3-ethyl-2-[(e)-(3-ethyl-6-sulfo-1,3-benzothiazol-2-ylidene)hydrazinylidene]-1,3-benzothiazole-6-sulfonic acid Chemical compound [NH4+].[NH4+].S/1C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N(CC)C\1=N/N=C1/SC2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N1CC OHDRQQURAXLVGJ-HLVWOLMTSA-N 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 210000002805 bone matrix Anatomy 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- UBAZGMLMVVQSCD-UHFFFAOYSA-N carbon dioxide;molecular oxygen Chemical group O=O.O=C=O UBAZGMLMVVQSCD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000021164 cell adhesion Effects 0.000 description 1
- 230000011712 cell development Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000003593 chromogenic compound Substances 0.000 description 1
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 1
- 230000006999 cognitive decline Effects 0.000 description 1
- 229960002424 collagenase Drugs 0.000 description 1
- 238000004040 coloring Methods 0.000 description 1
- 238000010835 comparative analysis Methods 0.000 description 1
- 230000024203 complement activation Effects 0.000 description 1
- 230000009514 concussion Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 1
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 206010014599 encephalitis Diseases 0.000 description 1
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 208000028653 esophageal adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 1
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 1
- 238000011331 genomic analysis Methods 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 208000003906 hydrocephalus Diseases 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 239000012216 imaging agent Substances 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 238000000760 immunoelectrophoresis Methods 0.000 description 1
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 1
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 238000012744 immunostaining Methods 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 229960003130 interferon gamma Drugs 0.000 description 1
- 229940117681 interleukin-12 Drugs 0.000 description 1
- 229940100601 interleukin-6 Drugs 0.000 description 1
- 230000009545 invasion Effects 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 210000002864 mononuclear phagocyte Anatomy 0.000 description 1
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 238000002610 neuroimaging Methods 0.000 description 1
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 1
- 229920006284 nylon film Polymers 0.000 description 1
- QYSGYZVSCZSLHT-UHFFFAOYSA-N octafluoropropane Chemical compound FC(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)F QYSGYZVSCZSLHT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 description 1
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 210000002997 osteoclast Anatomy 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 230000035515 penetration Effects 0.000 description 1
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 230000035699 permeability Effects 0.000 description 1
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 description 1
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 1
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 1
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 1
- 229920000656 polylysine Polymers 0.000 description 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 229920001296 polysiloxane Polymers 0.000 description 1
- 229920005990 polystyrene resin Polymers 0.000 description 1
- 229920000915 polyvinyl chloride Polymers 0.000 description 1
- 230000004793 poor memory Effects 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 230000004850 protein–protein interaction Effects 0.000 description 1
- 229940024999 proteolytic enzymes for treatment of wounds and ulcers Drugs 0.000 description 1
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 1
- 239000011535 reaction buffer Substances 0.000 description 1
- 238000010807 real-time PCR kit Methods 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 206010039073 rheumatoid arthritis Diseases 0.000 description 1
- YVSWPCCVTYEEHG-UHFFFAOYSA-N rhodamine B 5-isothiocyanate Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=C(N=C=S)C=C1C(O)=O YVSWPCCVTYEEHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003161 ribonuclease inhibitor Substances 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- FZHAPNGMFPVSLP-UHFFFAOYSA-N silanamine Chemical compound [SiH3]N FZHAPNGMFPVSLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003270 steroid hormone Substances 0.000 description 1
- 239000012089 stop solution Substances 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 229920002994 synthetic fiber Polymers 0.000 description 1
- 102000013498 tau Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010026424 tau Proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000009210 therapy by ultrasound Methods 0.000 description 1
- 229960004072 thrombin Drugs 0.000 description 1
- 210000001578 tight junction Anatomy 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011222 transcriptome analysis Methods 0.000 description 1
- 229960001322 trypsin Drugs 0.000 description 1
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 1
- 238000012285 ultrasound imaging Methods 0.000 description 1
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 description 1
- 210000001631 vena cava inferior Anatomy 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K67/00—Rearing or breeding animals, not otherwise provided for; New or modified breeds of animals
- A01K67/027—New or modified breeds of vertebrates
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2207/00—Modified animals
- A01K2207/35—Animals modified by environmental factors, e.g. temperature, O2
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2227/00—Animals characterised by species
- A01K2227/10—Mammal
- A01K2227/105—Murine
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2267/00—Animals characterised by purpose
- A01K2267/03—Animal model, e.g. for test or diseases
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/60—Complex ways of combining multiple protein biomarkers for diagnosis
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Immunology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Environmental Sciences (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Animal Husbandry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Biodiversity & Conservation Biology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
본 발명은 뇌미세혈관 손상 뇌질환 진단용 바이오 마커 조성물, 보다 상세하게는, MRI 영상 기반으로 뇌 국소영역을 정밀하게 구분하여 해당 국소 영역에서만 혈뇌장벽 변성을 유도하여, 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌질환 동물 모델을 제조하는 방법, 상기 동물 모델을 이용한 혈뇌장벽 변성으로 인한 뇌미세혈관 손상 뇌질환 진단용 바이오 마커를 스크리닝 하는 방법 및 혈뇌장벽 변성으로 인한 뇌미세혈관 손상 뇌질환 진단용 바이오 마커 조성물에 관한 것이다. The present invention is a biomarker composition for diagnosing brain microvascular damage brain disease, more specifically, by precisely classifying a local area of the brain based on an MRI image to induce blood-brain barrier degeneration only in that local area, and brain disease due to brain microvascular damage A method of manufacturing an animal model, a method for screening a biomarker for diagnosing brain microvascular damage due to blood-brain barrier degeneration using the animal model, and a biomarker composition for diagnosing brain microvascular damage due to blood-brain barrier degeneration.
혈뇌장벽은 뇌와 혈관 사이에 존재하는 장벽으로, 뇌에 외부 물질이 들어오는 것을 막는다. 혈뇌장벽은 뇌에 외부 물질이 들어오는 것을 막고, 대사에 필요한 물질을 받아들여 뇌를 보호하는 역할을 한다. 예를 들어 뇌에서 세균 또는 바이러스로의 침입을 막고, 포도당 공급과 산소-이산화탄소 교환을 원활하게 한다. 혈액은 혈뇌장벽을 통해 여과되며, 결과적으로 뇌에 다다르는 물질은 물이나 기체 분자, 포도당, 특정 지용성 등 극소수이다. 혈뇌장벽은 혈관을 뇌의 내피세포로 감싸는 모양을 띄며, 내피세포는 서로 밀착 연접(tight junction)되어 있기에 세포 사이로 물질이 지나가는 것이 불가능하다. 이 때문에 혈뇌장벽은 진단을 위한 다양한 영상제뿐 아니라, 종양, 알츠하이머, 파킨슨병 등 뇌에 질병이 생겼을 때 약물이 통과하는 것을 막아 뇌 관련 진단 및 치료 기술 개발에 저해가 되고 있다. The blood-brain barrier is a barrier that exists between the brain and blood vessels, preventing foreign substances from entering the brain. The blood-brain barrier blocks foreign substances from entering the brain and protects the brain by receiving substances necessary for metabolism. For example, it prevents the invasion of bacteria or viruses from the brain, and facilitates glucose supply and oxygen-carbon dioxide exchange. Blood is filtered through the blood-brain barrier, and as a result, very few substances that reach the brain are water or gas molecules, glucose, and certain fat-soluble substances. The blood-brain barrier has the shape of enclosing blood vessels with endothelial cells of the brain, and since the endothelial cells are tight junctions, it is impossible for substances to pass between cells. For this reason, the blood-brain barrier prevents the passage of drugs not only for various imaging agents for diagnosis, but also for diseases in the brain such as tumors, Alzheimer's, and Parkinson's disease.
최근 연구에서, 알츠하이머 치매의 최초 신호는 혈뇌장벽의 누출이라는 결과가 나왔다. 미국 서던 캘리포니아대학 의대 신경유전자 연구소(Neurogenetic Institute) 소장 베리슬라프 즐로코비치 박사 연구팀에서는 치매는 주범으로 알려진 뇌 신경세포의 독성 단백질 베타 아밀로이드의 응집(plaque)과 타우 단백질의 엉킴(tangle)과 관계없이 혈뇌장벽 누출이 독립적인 위험요인이라는 연구결과를 발표하였다. 인지기능이 정상인 노인 161명을 대상으로 5년에 걸쳐 각종 테스트를 통해 인지기능을 평가하면서 뇌 영상 검사와 뇌 척수액 분석을 통해 혈뇌장벽의 투과성을 측정한 결과, 인지기능 저하와 혈뇌장벽 누출 사이에 밀접한 연관이 있었다. 특히 기억력이 많이 떨어지는 사람일수록 말초 혈관의 혈뇌장벽 누출이 가장 심한 것으로 나타났다. 치매뿐만 아니라 파킨슨 병 등 퇴행성 뇌질환과 혈뇌장벽 손상에 대한 연관성 연구도 많이 진행 중이다. 상기 연구를 위해 치매, 파킨슨병과 같이 퇴행성 뇌질환을 연구하기 위한, 혈뇌장벽 손상으로 인한 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌질환 동물모델이 필요하다. 그러나 기존에 뇌혈관장벽에 관한 모델로 널리 사용되는 동물 모델의 경우 침습적이고, 실시간 관찰이 어려우며 개별 세포요소의 기능을 구별하기 어렵고, 동물실험에 대한 윤리적인 문제가 지속적으로 제기됨에 따라 대안적인 동물 연구 모델이 필요한 실정이다. Recent studies have shown that the first sign of Alzheimer's dementia is a leakage of the blood-brain barrier. Dr. Verislav Zlokovic, director of the Neurogenetic Institute at the University of Southern California, USA, found that dementia is related to plaque and tangle of tau protein, a toxic protein in brain neurons known as the main culprit. The results of a study that the blood-brain barrier leakage is an independent risk factor were published. As a result of measuring the permeability of the blood-brain barrier through brain imaging tests and cerebrospinal fluid analysis, while evaluating cognitive function through various tests over 5 years in 161 elderly people with normal cognitive function, the difference between cognitive decline and blood-brain barrier leakage. It was closely related. In particular, it was found that the blood-brain barrier leakage of peripheral blood vessels was the most severe in people with poor memory. In addition to dementia, there are many studies on the relationship between degenerative brain diseases such as Parkinson's disease and blood-brain barrier damage. For this study, an animal model of brain disease due to brain microvascular damage due to blood-brain barrier damage is needed to study degenerative brain diseases such as dementia and Parkinson's disease. However, in the case of an animal model, which is widely used as a model for the cerebrovascular barrier, it is invasive, it is difficult to observe in real time, it is difficult to distinguish the function of individual cellular elements, and as ethical issues for animal experiments continue to be raised, an alternative animal Research models are needed.
이에 본 발명자들은 혈뇌장벽의 손상 동물 모델을 개발하기 위해 연구를 거듭한 결과, 마우스에 초음파 에너지를 조사하여 혈뇌장벽의 변성을 유도하여 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환 마우스 모델을 제작하였고, 상기 마우스 모델의 뇌 조직에서 분리한 단백질을 분석하여 혈뇌장벽의 변성으로 인한 뇌 미세혈관 손상 뇌질환과 관련된 바이오 마커를 스크리닝한 결과, Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2이 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌질환과 관련된 바이오 마커임을 확인함으로써, 본 발명을 완성하였다.Accordingly, the present inventors have repeatedly researched to develop an animal model that damages the blood-brain barrier, and as a result, by irradiating ultrasound energy to the mouse to induce degeneration of the blood-brain barrier, a mouse model for brain disease due to brain microvascular damage was produced, and the mouse As a result of screening biomarkers related to brain microvascular damage brain disease due to degeneration of the blood-brain barrier by analyzing proteins isolated from the brain tissue of the model, Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명의 목적은 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자를 포함하는, 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환 진단용 바이오 마커 조성물을 제공하는데 있다. An object of the present invention is a bio for diagnosing brain diseases due to brain microvascular damage, comprising any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명의 다른 목적은 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 mRNA 발현 또는 이의 단백질 활성 수준을 측정하는 제제를 포함하는 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환 진단용 조성물을 제공하는 것이다. Another object of the present invention is to provide an agent for measuring the mRNA expression or protein activity level of any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명의 또 다른 목적은 상기 서술한 조성물을 포함하는 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환 진단용 키트를 제공하는 것이다. Another object of the present invention is to provide a kit for diagnosing brain diseases due to brain microvascular damage comprising the above-described composition.
본 발명의 또 다른 목적은 하기의 단계를 포함하는 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 스크리닝 하는 방법을 제공하는데 있다. (a) 생물학적 샘플에 임의의 화합물을 처리하는 단계; (b) 상기 생물학적 샘플로부터 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자 또는 이의 단백질의 발현 수준 또는 활성 수준을 확인하는 단계; 및 (c) 상기 발현 수준을 임의의 화합물을 처리하지 않은 정상 대조군에서의 상기 유전자 또는 이의 발현 단백질의 수준과 또는 활성 수준을 비교하는 단계.Another object of the present invention is to provide a method for screening a pharmaceutical composition for the prevention or treatment of brain diseases caused by brain microvascular damage comprising the following steps. (a) treating the biological sample with any compound; (b) confirming the expression level or activity level of any one or more genes or proteins thereof selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명의 다른 목적은 (a) 마우스에 집속 초음파를 0.25 내지 0.27 MPa로 10초 내지 230초 동안 처리는 단계를 포함하는 optimal BBB 변성 마우스 모델을 제작하는 방법을 제공하는데 있다.Another object of the present invention is to provide a method for producing an optimal BBB denatured mouse model comprising the step of (a) treating the mouse with focused ultrasound at 0.25 to 0.27 MPa for 10 to 230 seconds.
본 발명의 다른 목적은 (a) 마우스에 집속 초음파 0.42 내지 0.44 MPa로 10초 내지 230초 동안 처리하는 단계를 포함하는 mild damaged BBB 변성 마우스 모델을 제작하는 방법을 제공하는데 있다.Another object of the present invention is to provide a method of manufacturing a mild damaged BBB denatured mouse model comprising (a) treating the mouse with focused ultrasound of 0.42 to 0.44 MPa for 10 to 230 seconds.
상기 목적을 달성하기 위해, 본 발명은 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자를 포함하는 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환 진단용 바이오 마커 조성물을 제공할 수 있다. In order to achieve the above object, the present invention includes any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명은 또한 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 mRNA 발현 또는 이의 단백질 활성 수준을 측정하는 제제를 포함하는 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환 진단용 조성물을 제공할 수 있다. The present invention also includes an agent for measuring the mRNA expression or protein activity level of any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
상기 제제는 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머 또는 프로브일 수 있다. The agent may be a primer or probe that specifically binds to any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
상기 제제는 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 단백질에 특이적으로 결합하는 항체일 수 있다. The agent may be an antibody that specifically binds to the protein of any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명은 또한 상기 서술한 조성물을 포함하는 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환 진단용 키트를 제공할 수 있다. The present invention can also provide a kit for diagnosing brain diseases due to brain microvascular damage comprising the composition described above.
본 발명은 또한 생물학적 시료로부터 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 mRNA 발현 또는 이의 단백질 활성 수준을 측정하는 단계;를 포함하는 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환 진단을 위한 정보제공방법을 제공할 수 있다. The present invention also comprises the steps of measuring the mRNA expression or protein activity level of any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명은 하기의 단계를 포함하는 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 스크리닝 하는 방법을 제공할 수 있다: (a) 생물학적 샘플에 임의의 화합물을 처리하는 단계; (b) 상기 생물학적 샘플로부터 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자 또는 이의 단백질의 발현 수준 또는 활성 수준을 확인하는 단계; 및 (c) 상기 발현 수준을 임의의 화합물을 처리하지 않은 정상대조군에서의 상기 유전자 또는 이의 발현 단백질의 수준과 또는 활성 수준을 비교하는 단계.The present invention can provide a method for screening a pharmaceutical composition for preventing or treating brain diseases caused by brain microvascular damage comprising the following steps: (a) treating a biological sample with an arbitrary compound; (b) confirming the expression level or activity level of any one or more genes or proteins thereof selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명은 (a) 마우스에 집속 초음파를 0.25 내지 0.27 MPa로 10초 내지 230초 동안 처리는 단계를 포함하는 optimal BBB 변성 마우스 모델을 제작하는 방법을 제공할 수 있다. The present invention can provide a method of producing an optimal BBB denatured mouse model comprising the step of (a) treating the mouse with focused ultrasound at 0.25 to 0.27 MPa for 10 to 230 seconds.
본 발명은 (a) 마우스에 집속 초음파 0.42 내지 0.44 MPa로 10초 내지 230초 동안 처리하는 단계를 포함하는 mild damaged BBB 변성 마우스 모델을 제작하는 방법을 제공할 수 있다. The present invention can provide a method of manufacturing a mild damaged BBB denatured mouse model comprising (a) treating the mouse with focused ultrasound of 0.42 to 0.44 MPa for 10 to 230 seconds.
본 발명은 집속 초음파를 마우스에 조사하여 혈뇌장벽(blood-brain barrier; BBB)의 개통으로 인한 뇌 미세혈관 손상 뇌 질환 마우스 모델을 제작하였다. 또한 상기 집속 초음파의 세기를 조절하여 혈뇌장벽의 개통 정도를 조절 하였고, 상기 조절로 경도 손상(optimal damage) 및 중등 손상(mild damage)를 일으켜, optimal BBB 변성 마우스 모델 및 mild BBB 변성 마우스 모델을 제작 하였다. 상기 mild BBB 변성 마우스의 뇌를 가지고, 생물학적 분석 방법인 transcriptome sequencing analysis를 진행하여, BBB의 변성으로 인한 뇌질환 진단 마커를 발굴한 결과, Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2이 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환을 진단할 수 있다는 것을 확인하였다. 상기 시험결과를 바탕으로 optimal BBB 변성 동물 모델 및 mild BBB 변성 동물 모델의 혈액에서 Klk 6 및 Lcn2을 확인인한 결과 증가하는 것을 확인하였다. 상기의 결과를 토대로 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2을 이용하여 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환, 예를 들어 치매, 뇌암, 파킨슨, 뇌진탕 (TBI) 또는 뇌졸중을 진단 할 수 있는 효과가 있다. In the present invention, focused ultrasound was irradiated to the mouse to produce a mouse model of brain microvascular damage due to the opening of the blood-brain barrier (BBB). In addition, by adjusting the intensity of the focused ultrasound, the degree of opening of the blood-brain barrier was controlled, and by the adjustment, optimal and mild damage were caused to produce an optimal BBB degenerated mouse model and a mild BBB degenerated mouse model. I did. With the brain of the mild BBB degenerated mouse, a transcriptome sequencing analysis was performed, which is a biological analysis method, to find a diagnostic marker for brain disease due to degeneration of BBB, Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
도 1은 집속 초음파를 이용한 BBB 개통 동물모델을 제작하는 방법의 모식도이다.
도 2는 자기공명영상장치를 이용하여 집속 초음파를 이용한 BBB 동물모델의 BBB 변성 정도를 확인한 결과이다.
도 3은 유전체 분석을 통한 BBB 변성 뇌 조직에서 유전자 발현의 변화를 확인한 결과이다.
도 4는 유전체 분석 결과를 바탕으로 혈액 바이오 마커 후보를 선정한 결과이다.
도 5는 BBB 동물모델의 혈액에서 KLK 6 및 LCN 2의 발현 정도를 확인한 결과이다. 1 is a schematic diagram of a method of manufacturing a BBB opening animal model using focused ultrasound.
2 is a result of confirming the degree of BBB degeneration of a BBB animal model using focused ultrasound using a magnetic resonance imaging device.
3 is a result of confirming the change in gene expression in BBB denatured brain tissue through genomic analysis.
4 is a result of selecting a blood biomarker candidate based on the result of genome analysis.
5 is a result of confirming the expression level of KLK 6 and LCN 2 in the blood of the BBB animal model.
이하, 본 발명을 보다 상세히 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail.
본 발명은 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자를 포함하는 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환 진단용 바이오 마커 조성물을 제공할 수 있다. The present invention provides a biomarker composition for diagnosing brain diseases due to brain microvascular injury comprising any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
혈뇌장벽은 뇌와 혈관 사이에 존재하는 장벽으로, 뇌에 외부 물질이 들어오는 것을 막는다. 최근 연구에서 혈뇌장벽 누출이 독립적인 위험요인이라는 연구결과가 발표되었다. 따라서 치매, 파킨슨병과 같은 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌질환을 연구하기 위해, 혈뇌장벽 손상 동물모델이 필요하다. 그러나 기존에 뇌혈관장벽에 관한 모델로 널리 사용되는 동물 모델의 경우 실시간 관찰이 어려우며 개별 세포요소의 기능을 구별하기 어렵고, 동물실험에 대한 윤리적인 문제가 지속적으로 제기됨에 따라 대안적인 동물 연구 모델이 필요한 실정이다. 이에 본 발명자들은 집속 초음파를 마우스에 조사하여 혈뇌장벽(blood-brain barrier; BBB)의 개통 모델을 제작하였다. 특정 집속 초음파의 세기를 조절하여 혈뇌장벽의 개통 정도를 조절 하였고, 상기 조절로 경도 손상(optimal damage) 및 중등 손상(mild damage)을 일으켜, optimal BBB 변성 마우스 모델 및 mild BBB 변성 마우스 모델을 제작하였다. 상기 mild BBB 변성 마우스의 뇌를 가지고, 생물학적 분석 방법인 transciptome sequencing analysis를 진행하여, 뇌 미세혈관 손상으로 인한 뇌질환 진단 마커를 발굴하였다. BBB의 손상이 중반 정도로 예상할 수 있는 mild damage BBB 조건에서 RNA sequencing 분석 결과를 통해 시간에 따른 유전자 발현 변화를 control 그룹과 비교하였을 때, 48시간 째 약 518개의 유전자가 증가되었고 174개의 유전자가 감소되는 경향을 나타내었다 (도 3). 상기의 결과를 바탕으로 mild damage BBB 조건에서의 혈액 바이오 마커 후보군을 선정하였다. 518개의 유전자중 Control 대비 3배 이상 증가되고 혈액에서 검출할 수 있는 수용성의 단백질을 코딩 하고 있는 10개(Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2)의 유전자를 후보군으로 선정하였다 (도 4). 상기 유전자 중 KLK 6 및 LCN2의 경우에는 optimal BBB 변성 마우스 모델 및 mild BBB 변성 마우스 모델의 혈액에서 확인한 결과, KlK6의 혈액에서의 발현은 optimal condition과 mild damaged condition에서 BBB 개통 후 시간이 지남에 따라 점차 증가되었고, LCN2의 혈액 내 발현은 optimal condition BBB 개통 후 12시간까지 증가되다가 다시 감소됨을 확인하였다. 이를 통해 뇌미세혈관 손상에 의한 뇌질환의 혈액 바이오 마커 발굴 가능성을 확인하였다 (도 5). The blood-brain barrier is a barrier that exists between the brain and blood vessels, preventing foreign substances from entering the brain. In a recent study, studies have shown that leakage of the blood-brain barrier is an independent risk factor. Therefore, in order to study brain diseases caused by brain microvascular damage such as dementia and Parkinson's disease, an animal model of blood-brain barrier damage is needed. However, in the case of an animal model that is widely used as a model for the cerebrovascular barrier, it is difficult to observe in real time, it is difficult to distinguish the functions of individual cellular elements, and as ethical issues for animal experiments continue to be raised, alternative animal research models are It is a necessary situation. Accordingly, the present inventors produced an opening model of a blood-brain barrier (BBB) by irradiating focused ultrasound to the mouse. The degree of patency of the blood-brain barrier was controlled by controlling the intensity of a specific focused ultrasound, and the adjustment caused optimal and mild damage, thereby creating an optimal BBB denatured mouse model and a mild BBB denatured mouse model. . With the brain of the mild BBB denatured mouse, transciptome sequencing analysis, which is a biological analysis method, was performed to find a marker for diagnosis of brain disease due to brain microvascular injury. When comparing the change of gene expression over time with the control group through RNA sequencing analysis under the condition of mild damage, where the damage of the BBB is expected to be mid-range, about 518 genes increased and 174 genes decreased at 48 hours. Showed a tendency to become (Fig. 3). Based on the above results, a blood biomarker candidate group under mild damage BBB condition was selected. Of the 518 genes, 10 (Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명에 있어서, Lcn2 (Lipocalin 2)은 리포칼린 계열에 속하는 단백질을 암호화하는 유전자로 지질, 스테로이드 호르몬 및 레티노이드와 같은 작은 소수성 분자를 운반한다. 혈액과 소변에서 상기 단백질의 존재는 급성 신장 손상의 초기 바이오 마커이다. 그러나 상기 유전자의 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환의 상관관계에 대해서는 전혀 개시되어 있지 않다. 본 발명의 Lcn2의 정보는 예를 들어 NCBI gene ID NM 008491에 개시된 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다. In the present invention, Lcn2 (Lipocalin 2) is a gene encoding a protein belonging to the lipocalin family and carries small hydrophobic molecules such as lipids, steroid hormones, and retinoids. The presence of this protein in blood and urine is an early biomarker of acute kidney injury. However, the correlation of brain diseases caused by brain microvascular damage of the gene is not disclosed at all. The information on Lcn2 of the present invention is preferably disclosed in, for example, NCBI gene ID NM 008491, but is not limited thereto.
본 발명에 있어서, SPP1(Secreted Phosphoprotein 1)은 파골 세포가 광물질화된 골기질(mineralized bone matrix)에 결합하는데 관여한다. 상기 유전자의 단백질은 또한 인터페론-γ 및 인터루킨-12의 발현을 상향 조절하는 사이토카인 (cytokine)이다. 그러나 상기 유전자의 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환의 상관관계에 대해서는 전혀 개시되어 있지 않다. 본 발명의 SPP1의 정보는 예를 들어 NCBI gene ID NM_001204201에 개시된 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다. In the present invention, SPP1 (Secreted Phosphoprotein 1) is involved in the binding of osteoclasts to mineralized bone matrix. The protein of this gene is also a cytokine that upregulates the expression of interferon-γ and interleukin-12. However, the correlation of brain diseases caused by brain microvascular damage of the gene is not disclosed at all. The information on SPP1 of the present invention is preferably disclosed in, for example, NCBI gene ID NM_001204201, but is not limited thereto.
본 발명에 있어서, Saa3 (Serum amyloid A 3)은 고밀도 지단백질과 관련된 아포질 단백질의 계열이다. 그러나 상기 유전자의 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환의 상관관계에 대해서는 전혀 개시되어 있지 않다. 본 발명의 Saa3 의 정보는 예를 들어 NCBI IDNM_011315에 개시된 것이 바람직하나 이에 제한되는 것은 아니다. In the present invention, Saa3 (Serum amyloid A 3) is a family of apolipoproteins related to high-density lipoproteins. However, the correlation of brain diseases caused by brain microvascular damage of the gene is not disclosed at all. The information of Saa3 of the present invention is preferably disclosed in NCBI IDNM_011315, for example, but is not limited thereto.
본 발명에 있어서, Ptx3(Pentraxin 3)은 여러 중간엽과 상피 세포 유형, 특히 내피 세포 및 단핵 식세포에서 염증성 자극에 대한 반응으로 염증성 사이토카인에 의해 유도된다. 상기 유전자의 단백질은 섬유 세포 분화를 촉진하고 염증 및 보체 활성화 조절에 관여한다. 여러 염증성 질환의 바이오 마커이다. 그러나 상기 유전자의 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환의 상관관계에 대해서는 전혀 개시되어 있지 않다. 본 발명의 Ptx3의 정보는 예를 들어 NCBI gene ID NM_008987에 개시된 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다. In the present invention, Ptx3 (Pentraxin 3) is induced by inflammatory cytokines in response to inflammatory stimuli in several mesenchymal and epithelial cell types, particularly endothelial cells and mononuclear phagocytes. The protein of this gene promotes fibroblast differentiation and is involved in the regulation of inflammation and complement activation. It is a biomarker of several inflammatory diseases. However, the correlation of brain diseases caused by brain microvascular damage of the gene is not disclosed at all. Ptx3 information of the present invention is preferably disclosed in, for example, NCBI gene ID NM_008987, but is not limited thereto.
본 발명에 있어서, A2m(Alpha-2-Macroglobulin)은 프로테아제 억제제 및 사이토카인 트랜스 포터이다. 상기 유전자는 트립신, 트롬빈 및 콜라게나제를 포함하여 광범위한 단백질 분해 효소를 억제하기 위해 사용된다. 염증성 사이토 카인을 억제한다. 그러나 상기 유전자의 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환의 상관관계에 대해서는 전혀 개시되어 있지 않다. 본 발명의 A2m의 정보는 예를 들어 NCBI gene ID NM_175628에 개시된 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다. In the present invention, A2m (Alpha-2-Macroglobulin) is a protease inhibitor and a cytokine transporter. These genes are used to inhibit a wide range of proteolytic enzymes, including trypsin, thrombin and collagenase. Inhibits inflammatory cytokines. However, the correlation of brain diseases caused by brain microvascular damage of the gene is not disclosed at all. The information on A2m of the present invention is preferably disclosed in, for example, NCBI gene ID NM_175628, but is not limited thereto.
본 발명에 있어서, Lrg1 (Leucine Rich Alpha-2-Glycoprotein)은 Lrg1을 포함하는 leucine-rich repeat (LRR) family는 단백질-단백질 상호작용, 신호 전달 및 세포 부착 및 발달에 관여한다. LRG1은 수두증과 관련이 있다. 그러나 상기 유전자의 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환의 상관관계에 대해서는 전혀 개시되어 있지 않다. 본 발명의 Lrg1의 정보는 예를 들어 NCBI gene ID NM_029796에 개시된 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, Lrg1 (Leucine Rich Alpha-2-Glycoprotein) is a leucine-rich repeat (LRR) family including Lrg1, which is involved in protein-protein interaction, signal transduction, and cell adhesion and development. LRG1 is associated with hydrocephalus. However, the correlation of brain diseases caused by brain microvascular damage of the gene is not disclosed at all. The information on Lrg1 of the present invention is preferably disclosed in, for example, NCBI gene ID NM_029796, but is not limited thereto.
본 발명에 있어서, Klk 6(Kallikrein Related Peptidase 6)은 단백질 코딩 유전자이다. 상기 유전자와 관련된 질병에는 위 식도 선암과 시뉴클라식시 병이 있다. 일반적은 암 및 기타 질병 바이오 마커이다. 그러나 상기 유전자의 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환의 상관관계에 대해서는 전혀 개시되어 있지 않다. 본 발명의 Klk 6의 정보는 예를 들어 NCBI gene ID NM_001164696에 개시된 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, Klk 6 (Kallikrein Related Peptidase 6) is a protein coding gene. Diseases associated with the gene include gastric esophageal adenocarcinoma and synuclavism. It is a common cancer and other disease biomarker. However, the correlation of brain diseases caused by brain microvascular damage of the gene is not disclosed at all. The information of
본 발명에 있어서, Clcf1(Cardiotrophin Like Cytokine Factor 1)은 인터루킨-6 신호전달과 면역계에서 사이토카인 신호전달과 관련되어 있다. 그러나 상기 유전자의 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환의 상관관계에 대해서는 전혀 개시되어 있지 않다. 본 발명의 Clcf1의 정보는 예를 들어 NCBI gene ID NM_001310038에 개시된 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, Clcf1 (Cardiotrophin Like Cytokine Factor 1) is involved in interleukin-6 signaling and cytokine signaling in the immune system. However, the correlation of brain diseases caused by brain microvascular damage of the gene is not disclosed at all. The Clcf1 information of the present invention is preferably disclosed in, for example, NCBI gene ID NM_001310038, but is not limited thereto.
본 발명에 있어서, SCGB3A1(Secretoglobin Family 3A Member 1)은 사이토카인 활성과 관련되어 있다. 그러나 상기 유전자의 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환의 상관관계에 대해서는 전혀 개시되어 있지 않다. 본 발명의 SCGB3A1의 정보는 예를 들어 NCBI gene ID NM_054037에 개시된 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, SCGB3A1 (Secretoglobin Family 3A Member 1) is associated with cytokine activity. However, the correlation of brain diseases caused by brain microvascular damage of the gene is not disclosed at all. The information on SCGB3A1 of the present invention is preferably disclosed in, for example, NCBI gene ID NM_054037, but is not limited thereto.
본 발명에 있어서, Bst2 (Bone Marrow Stromal Cell Antigen 2)은 pre-2 세포 성장 및 류마티스성 관절염에 관여한다. BST2와 관련된 질병으로는 인간 면역 결핍 바이러스 1 형 및 웨스타일 뇌염이 있다. 그러나 상기 유전자의 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환의 상관관계에 대해서는 전혀 개시되어 있지 않다. 본 발명의 Bst2 의 정보는 예를 들어 NCBI gene ID NM_198095에 개시된 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다. In the present invention, Bst2 (Bone Marrow Stromal Cell Antigen 2) is involved in pre-2 cell growth and rheumatoid arthritis. Diseases associated with BST2 include human
본 발명에 있어서, ‘진단’은 병리 상태의 존재 또는 특징을 확인하는 것을 의미한다. 본 발명의 목적상, 진단이란 뇌 미세혈관의 손상으로 인한 뇌질환의 발병 여부를 확인하는 것이다. 상기 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환은 바람직하게는 경도인지장애 (Mild cognitive impairment), 경도의 외상성뇌질환 (MTBI, mild traumatic brain injury), 일과성 허혈성발작, 루게릭병 치매, 알츠하이머, 파킨슨 등일 수 있으나 이에 제한되지 않는다. 또한 상기 뇌미세혈관 손상은 뇌혈관장벽의 개통 또는 누출로 발생하는 것일 수 있다. In the present invention, “diagnosis” means confirming the presence or characteristics of a pathological condition. For the purposes of the present invention, diagnosis is to determine whether a brain disease has occurred due to damage to the brain microvessels. Brain diseases caused by damage to the brain microvessels are preferably mild cognitive impairment, mild traumatic brain injury (MTBI), transient ischemic attack, Lou Gehrig's disease dementia, Alzheimer's, Parkinson, etc. However, it is not limited thereto. In addition, the brain microvascular damage may be caused by the opening or leakage of the cerebrovascular barrier.
본 발명에 있어서, ‘바이오 마커’란 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환을 진단할 수 있는 물질, 즉 생물학적 시료에서 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌질환의 발생 여부를 구분하여 진단할 수 있는 물질로, 정상 개체와 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌질환 개체 간의 유의적인 차이를 보이는 폴리펩타이드, 핵산 (예:mRNA 등), 지질, 당지질, 당단백질, 당(단당류, 이당류, 올리고당류 등) 등과 같은 유기 생체 분자 등을 포함한다. 본 발명의 목적상 바이오 마커는 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자가 mild BBB 변성 마우스 모델에서 시간이 경과함에 따라 증가하는 바, Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 정도가 뇌미세혈관 손상으로 인한 뇌 질환의 발병을 뒷받침한다. In the present invention, the'biomarker' is a substance capable of diagnosing brain diseases due to brain microvascular damage, that is, a substance capable of distinguishing and diagnosing whether or not brain diseases due to brain microvascular damage in a biological sample, Organic organisms such as polypeptides, nucleic acids (e.g. mRNA, etc.), lipids, glycolipids, glycoproteins, sugars (monosaccharides, disaccharides, oligosaccharides, etc.) that show significant differences between normal individuals and individuals with brain disease caused by brain microvascular damage Includes molecules and the like. Biomarkers for the purposes of the present invention are any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명의 목적상 바이오 마커는 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자로, mild BBB 변성 동물모델에서 시간에 따라서 발현이 증가된 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 증가된 발현 정도가 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환의 발병을 뒷받침한다.For the purposes of the present invention, the biomarker is any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명은 또한 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 mRNA 발현 또는 이의 단백질 활성 수준을 측정하는 제제를 포함하는 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환 진단용 조성물을 제공할 수 있다. The present invention also includes an agent for measuring the mRNA expression or protein activity level of any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명의 일 실시예에 따르면, 본 발명의 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자는 건강한 정상인에 비하여 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환 모델에서 유의하게 증가하는 바, 이의 유전자 mRNA 발현 또는 이의 단백질 수준을 측정함으로써 퇴행성 뇌질환의 진단이 가능하다. According to an embodiment of the present invention, any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명에 있어서, Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 mRNA 발현 수준의 측정은 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환의 진단을 위하여 생물학적 시료에서 바이오 마커 유전자의 존재 여부와 발현 정도를 확인하는 과정으로, 표적 유전자부터 전사된 mRNA의 수준을 측정하는 방법에 사용되는 제제를 이용해 mRNA의 양을 측정한다. 구체적으로 본 발명에서 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 mRNA 수준을 측정하는 제제는 바람직하게는 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 쌍 또는 프로브이며, Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 염기 서열이 유전자 은행에 등록되어 있으므로 당업자는 상기 서열을 바탕으로 이들 유전자의 특정 영역을 특이적으로 증폭하는 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 쌍 또는 프로브를 디자인 할 수 있다. In the present invention, measurement of the mRNA expression level of any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명에 있어서, Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 단백질 활성 수준 측정은 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환의 진단을 위하여 생물학적 시료에서 바이오 마커 단백질의 존재 여부와 발현 정도를 확인하는 과정으로, 바람직하게는 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 단백질에 대하여 특이적으로 결합하는 항체를 이용해 단백질의 양을 확인할 수 있다. In the present invention, measurement of the protein activity level of any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
상기 항체는 당해 분야에서 공지된 용어로서 항원성 부위에 대해서 지시되는 특이적인 단백질 분자를 지칭하는 것으로, 본 발명의 목적상 항체는 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2에 특이적으로 결합하는 항체를 의미하며, 이러한 항체는 각 유전자를 통상적인 방법에 따라 발현벡터에 클로닝하여 상기 유전자에 의해 코딩되는 단백질을 얻고, 얻어진 단백질로부터 통상적인 방법에 의해 제조될 수 있다. 여기에는 상기 단백질에서 만들어 질 수 있는 부분 펩티드도 포함된다. 본 발명의 항체의 형태는 특별히 제한되지 않으며 폴리클로날 항체, 모노클로날 항체 또는 항원 결합성을 갖는 것이면 그것의 일부도 본 발명의 항체에 포함되고 모든 면역글로불린 항체가 포함된다. 나아가, 본 발명의 항체에는 인간화 항체 등의 특수항체도 포함된다. The antibody is a term known in the art and refers to a specific protein molecule directed to an antigenic site. For the purposes of the present invention, antibodies are Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명은 상기 서술한 조성물을 포함하는 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환 진단용 키트를 제공할 수 있다. The present invention can provide a kit for diagnosing brain diseases due to damage to brain microvessels comprising the above-described composition.
본 발명의 키트에는 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2 유전자의 mRNA 발현 또는 이의 단백질 활성 수준을 측정하는 제제 외에, 분석방법에 적합한 한 종류 이상의 다른 구성성분 조성물, 용액 또는 장치가 포함될 수 있으며, 어떠한 형태로든 본 발명의 범위를 제한하지 않는다. In the kit of the present invention, in addition to the agent measuring the mRNA expression or protein activity level of the Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
구체적인 일례로서, 본 발명에서 상기 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2 유전자의 mRNA 발현 수준을 측정하기 위한 키트는 RT-PCR을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있다. 상기 RT-PCR 키트는 마커 유전자에 대한 특이적인 프라이머 쌍 외에도 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액, 데옥시뉴클레오티드(우센), Taq-중합효소 및 역전사효소와 같은 효소, DNase, RNase 억제제, DEPC-물(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다. As a specific example, the kit for measuring the mRNA expression level of the Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
또한, 본 발명의 키트는 마이크로어레이 칩을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있다. 상기 마이크로어레이 칩 키트는, 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA가 프로브로 부착되어 있는 기판을 포함하고 기판은 정량 대조구 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA를 포함할 수 있으며, 본 발명의 마커를 이용 하여 당업계에서 통상적으로 사용되는 제조 방법에 의하여 용이하게 제조될 수 있다. 마이크로어레이 칩을 제작하기 위해서, 상기 탐색된 마커를 탐침 DNA 분자로 이용하여 DNA 칩의 기판상에 고정화시키기 위해 파이조일렉트릭(piezoelectric) 방식을 이용한 마이크로피펫팅(micropipetting)법 또는 핀(pin) 형태의 스폿터(spotter)를 이용한 방법 등을 사용하는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니다. 상기 마이크로어레이 칩의 기판은 아미노-실란(amino-silane), 폴리-L-라이신(poly-Llysine) 및 알데히드(aldehyde)로 이루어진 군에서 선택되는 활성기가 코팅된 것이 바람직하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 또한, 상기 기판은 슬라이드 글래스, 플라스틱, 금속, 실리콘, 나일론 막 및 니트로셀룰로스 막(nitrocellulose membrane)으로 이루어진 군에서 선택되는 것이 바람직하나 이에 한정되는 것은 아니다.In addition, the kit of the present invention may be a kit including essential elements necessary to perform a microarray chip. The microarray chip kit includes a substrate to which cDNA corresponding to a gene or a fragment thereof is attached as a probe, and the substrate may include a cDNA corresponding to a quantitative control gene or a fragment thereof, using the marker of the present invention. It can be easily manufactured by a manufacturing method commonly used in the art. In order to manufacture a microarray chip, a micropipetting method or a pin form using a piezoelectric method to immobilize on the substrate of the DNA chip using the searched marker as a probe DNA molecule It is preferable to use a method using a spotter (spotter) of, but is not limited thereto. The substrate of the microarray chip is preferably coated with an active group selected from the group consisting of amino-silane, poly-Llysine, and aldehyde, but is not limited thereto. . In addition, the substrate is preferably selected from the group consisting of slide glass, plastic, metal, silicone, nylon film, and nitrocellulose membrane, but is not limited thereto.
또한, 본 발명에서 상기 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2 단백질 활성 수준을 측정하기 위한 키트는 항체의 면역학적 검출을 위하여 기질, 적당한 완충 용액, 발색 효소 또는 형광 물질로 표지된 2차 항체, 및 발색 기질 등을 포함할 수 있다. 상기에서 기질은 니트로셀룰로오스 막, 폴리비닐 수지로 합성된 96 웰 플레이트, 폴리스틸렌 수지로 합성된 96 웰 플레이트 및 유리로 된 슬라이드 글라스 등이 이용될 수 있고, 발색효소는 퍼옥시다아제(peroxidase), 알칼라인 포스파타아제(alkaline phosphatase) 등이 사용될 수 있고, 형광물질은 FITC, RITC등이 사용될 수 있고, 발색 기질액은 ABTS(2,2'-아지노-비스-(3-에틸벤조티아졸린-6-설폰산)) 또는 OPD(o-페닐렌디아민), TMB(테트라메틸 벤지딘)가 사용될 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.In addition, in the present invention, the kit for measuring the protein activity level of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명은 또한 생물학적 시료로부터 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 mRNA 발현 또는 이의 단백질 활성 수준을 측정하는 단계;를 포함하는 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환 진단을 위한 정보제공방법을 제공할 수 있다. The present invention also comprises the steps of measuring the mRNA expression or protein activity level of any one or more genes selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명의 일 실시예에 따르면, 집속초음파 조사에 따른 BBB 개통후 시간에 따른 생물학적 반응을 확인하기 위해서 시간에 따라 (1시간, 6시간, 12시간, 24시간, 48시간) mild BBB 변성 뇌조직을 획득한 후, RNA sequencing 분석 결과를 통해 시간에 따른 유전자 발현 변화를 control 그룹과 비교하였을 때, 48시간 째 약 518개의 유전자가 증가되었고 174개의 유전자가 감소되는 경향을 나태었고, 518개의 유전자중 Control 대비 3배 이상 증가되고 혈액에서 검출할 수 있는 soluble form의 단백질을 coding 하고 있는 10개(Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2)의 유전자를 선정한 바, 생물학적 시료에서 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2의 발현 비교 분석을 통해 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환의 진단을 위한 정보를 제공할 수 있다. According to an embodiment of the present invention, mild BBB denatured brain tissue according to time (1 hour, 6 hours, 12 hours, 24 hours, 48 hours) in order to confirm the biological response according to time after BBB opening according to focused ultrasound irradiation After obtaining, RNA sequencing analysis results showed that about 518 genes increased and 174 genes decreased at 48 hours when comparing gene expression changes over time with the control group. Selected 10 genes (Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명에 있어서, 진단을 위한 정보제공방법은 진단을 위한 예비적 단계로써 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환의 진단을 위하여 필요한 객관적인 기초정보를 제공하는 것이며 의사의 임상학적 판단 또는 소견은 제외된다. In the present invention, the method of providing information for diagnosis is a preliminary step for diagnosis, and provides objective basic information necessary for diagnosis of brain diseases caused by damage to brain microvessels, and clinical judgment or findings of doctors are excluded. .
본 발명에 있어서, '생물학적 시료'란 개체로부터 분리되어 목적 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 직접적인 대상을 의미하고, 조직, 세포, 전혈, 혈청, 혈장, 타액 또는 뇨와 같은 시료 등을 포함한다. 예를 들어, 본 발명의 시료란 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환 의심 개체에서 뇌 질환의 발병 여부를 진단하기 위한 시료로서, 바람직하게는 혈액일 수 있다. In the present invention, the term'biological sample' means a direct object that is isolated from an individual to measure the expression level of a target gene or protein, and includes samples such as tissues, cells, whole blood, serum, plasma, saliva or urine. . For example, the sample of the present invention is a sample for diagnosing the onset of a brain disease in an individual suspected of having a brain disease due to damage to brain microvessels, and may preferably be blood.
본 발명에 있어서, 'mRNA 발현 수준을 측정하기 위한 분석 방법'에는 중합효소반응(PCR), 역전사 중합효소반응 (RT-PCR), 경쟁적 역전사 중합효소반응(Competitive RT-PCR), 실시간 역전사 중합효소반응(Realtime RT-PCR), RNase 보호분석법(RPA; RNase protection assay), 노던 블랏팅(northern blotting), 또는 DNA 마이크로어레이 분석법 등이 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the present invention, the'analytical method for measuring the mRNA expression level' includes a polymerase reaction (PCR), a reverse transcription polymerase reaction (RT-PCR), a competitive reverse transcription polymerase reaction (Competitive RT-PCR), and a real-time reverse transcription polymerase. Reaction (Realtime RT-PCR), RNase protection assay (RPA), northern blotting, or DNA microarray analysis, but are not limited thereto.
본 발명에 있어서, '단백질 활성 수준을 측정하기 위한 분석 방법'에는 웨스턴 블랏팅(western blotting), ELISA(enzyme linked immunosorbent assay), 방사선면역분석법(Radioimmunoassay), 방사면역 확산법 (Radioimmunodiffusion), 오우크테로니(Ouchterlony) 면역 확산법, 로케트(Rocket) 면역전기영동, 조직면역염색, 면역 침전분석법(immunoprecipitation assay), 보체 고정 분석법(complete fixation assay), 유세포분석법 (Fluorescence Activated Cell Sorter, FACS) 또는 단백질 칩(protein chip) 분석법 등이 있으나, 이에 제한되지 않는다. In the present invention, the'analysis method for measuring the protein activity level' includes western blotting, ELISA (enzyme linked immunosorbent assay), radioimmunoassay, radioimmunodiffusion, and octero. Ouchterlony immune diffusion method, Rocket immunoelectrophoresis, tissue immunostaining, immunoprecipitation assay, complete fixation assay, flow cytometry (Fluorescence Activated Cell Sorter, FACS) or protein chip ( protein chip) analysis, but is not limited thereto.
본 발명의 방법은 상기 측정된 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2 유전자의 mRNA 발현 또는 이의 단백질 활성 수준을 대조군에서 측정된 수준과 비교하는 단계를 포함할 수 있다. 상기 대조군은 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환이 발명하지 않은 건강한 사람이다. 이에 따라 본 발명의 방법은 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2 유전자의 mRNA 발현 또는 이의 단백질 활성 수준이 대조군 보다 높을 경우, 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환이 진행 중이거나 이미 발병하였을 것으로 판단 할 수 있다. The method of the present invention comprises the step of comparing the measured mRNA expression or protein activity level of the Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
(a) 생물학적 샘플에 임의의 화합물을 처리하는 단계; (b) 상기 생물학적 샘플로부터 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 및 Bst2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자 또는 이의 단백질의 발현 수준 또는 활성 수준을 확인하는 단계; 및 (c) 상기 발현 수준을 임의의 화합물을 처리하지 않은 정상대조군에서의 상기 유전자 또는 이의 발현 단백질의 수준과 또는 활성 수준을 비교하는 단계; 를 포함하는 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 스크리닝 하는 방법을 제공할 수 있다. (a) treating the biological sample with any compound; (b) confirming the expression level or activity level of any one or more genes or proteins thereof selected from the group consisting of Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명에 있어서, 스크리닝은 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환의 치료 효과를 가지는 물질을 선별하는 조작에 관한 것이다. In the present invention, screening relates to an operation of selecting a substance having a therapeutic effect on a brain disease caused by damage to brain microvessels.
본 발명에 있어서, 상기 (a) 단계의 후보물질은 뇌 질환의 치료 활성을 테스트할 물질을 의미하며, 예컨대 추출물, 단백질, 올리고펩티드, 소형 유기 분자, 다당류, 폴리뉴클레오티드 및 광범위한 화합물 들의 임의 분자를 포함할 수 있다. 이러한 후보 물질은 천연물질뿐 아니라, 합성 물질도 포함한다. In the present invention, the candidate substance in step (a) refers to a substance to be tested for the therapeutic activity of brain diseases, such as extracts, proteins, oligopeptides, small organic molecules, polysaccharides, polynucleotides, and arbitrary molecules of a wide range of compounds. Can include. These candidates include natural as well as synthetic materials.
본 발명에 있어서, 상기 (b) 단계의 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2 유전자의 mRNA 발현 또는 이의 단백질 활성 수준을 측정하는 단계는 시료에서 후보물질 처리에 의한 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2을 암호화하는 핵산 또는 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2 단백질의 존재 여부와 발현 정도를 확인하는 과정이다. In the present invention, the step of measuring the mRNA expression or protein activity level of the Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
본 발명의 스크리닝 방법은 (c) 상기 (b) 단계에서 측정한 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2 유전자의 mRNA 또는 이의 단백질의 활성이 상기 후보물질을 처리하지 않은 대조군의 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2 유전자의 mRNA 발현 또는 이의 단백질의 활성보다 낮은 경우, 후보물질을 뇌 질환의 치료제로 판단하는 단계를 추가로 더 포함할 수 있다. 다시 말해, 후보물질의 처리에 의해 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2 유전자의 mRNA 발현 또는 이의 단백질의 활성이 후보물질 비처리군의 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2의 mRNA 발현 또는 이의 단백질의 활성보다 낮아지는 경우 상기 후보물질을 뇌 질환 치료제로 판단할 수 있고, 그와 반대로 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2 유전자의 mRNA 발현 또는 이의 단백질의 활성이 후보물질 비처리군의 Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1, Klk 6, clcf 1, Scgb3a 또는 Bst2 유전자의 mRNA 발현 또는 이의 단백질 활성량과 비슷하거나 보다 높아지는 경우 뇌미세혈관의 손상으로 인한 뇌 질환 치료제로 사용할 수 없다 판단 할 수 있다. In the screening method of the present invention, (c) the activity of the mRNA of the Lcn2, SPP1, Saa3, Ptx3, A2m, Lrg1,
(a) 마우스에 집속 초음파를 0.25 내지 0.27 MPa로 10초 내지 230초 동안 처리는 단계를 포함하는 optimal BBB 변성 마우스 모델을 제작하는 방법을 제공할 수 있다. (a) It can provide a method of producing an optimal BBB denatured mouse model comprising the step of treating the mouse with focused ultrasound at 0.25 to 0.27 MPa for 10 to 230 seconds.
본 발명은 (a) 마우스에 집속 초음파 0.42 내지 0.44 MPa로 10초 내지 230초 동안 처리하는 단계를 포함하는 mild BBB 변성 마우스 모델을 제작하는 방법을 제공할 수 있다. The present invention can provide a method of producing a mild BBB denatured mouse model comprising the step of (a) treating the mouse with focused ultrasound of 0.42 to 0.44 MPa for 10 to 230 seconds.
중복되는 내용은 본 명세서의 복잡성을 고려하여 생락하며, 본 명세서에서 달리 정의되지 않은 용어들은 본 발명이 속하는 분야에서 통상적으로 사용되는 의미를 갖는 것이다.Redundant content is omitted in consideration of the complexity of the present specification, and terms that are not otherwise defined herein have meanings commonly used in the field to which the present invention belongs.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 보다 상세하게 설명한다. 그러나 하기 실시 예는 본 발명의 내용을 구체화하기 위한 것일 뿐 이에 의해 본 발명이 한정되는 것은 아니다. Hereinafter, the present invention will be described in more detail through examples. However, the following examples are only for embodiing the contents of the present invention and the present invention is not limited thereto.
BBB변성 모델의 제작 Creation of BBB degeneration model
만성 퇴행성 뇌질환은 대부분의 경우 BBB의 손상으로 인해 그 결합이 느슨해져 있다. 이에 본 연구진들은 집속 초음파를 이용하여 BBB의 개통 유도하였다. 뇌질환의 BBB 변성 정도를 조절하여, 퇴행성 뇌질환 모델의 초기 BBB 손상 정도의 동물 모델과 퇴행성 뇌질환 모델의 중기 BBB 손상 정도의 동물 모델을 제작하였다. 8주령의 ICR mice를 이용하여 집속 초음파 유도 BBB 개통 동물 모델을 제작하였다. MRgFUS 기기를 이용한 초음파 처리는 FUS 기기(RK-100)를 사용하였으며, 도 1에 기기 구성의 개략도가 나타나 있다. MR 영상유도 집중초음파 시스템은 도1에 개략도가 나타나 있다. 시스템은 초음파 컨트롤 시스템과 초음파 조사 시스템 (MR 환경 호환)으로 이루어져 있다. 구체적으로 초음파 컨트롤 시스템은 초음파 변환기에 RF 파워를 전달할 수 있는 fuction generator와 RF amplifier로 이루어져 있으며 초음파 변환기에 전달되는 power를 실시간으로 측정할 수 있는 power meter로 구성되어 있다. 초음파 조사 시스템은 초음파 변환기, 초음파 변환기를 3차원으로 정밀 제어 할 수 있는 3축 제어부, water tank로 구성되어 MRI 장비 환경 내에서도 구동가능하게 설계되어 있다. MR 영상유도 집중초음파 시스템은 Bruker 9.4T MRI (BioSpec 94/20 USR - 9.4T, Bruker, MA, USA) 시스템과 연동되어 있다. 구체적인 실험 프로토콜은 초음파 영상 진단용 조영제인 미소기포(DEFINITY®를 생리식염수에 1:50의 비율로 희석하여 0.012ml/s의 속도로 동물의 정맥에 주입한다. 희석된 미소기포를 주입하는 동안 1s에 10ms의 burst length를 가지는 집속 초음파를 MR영상 기반으로 원하는 뇌 지역에 2분간 조사하였다. MR 영상을 통해 MR 조영제 주입 전과 주입 후 영상을 비교하여 BBB 개폐를 확인할 수 있다. 뇌질환의 BBB 변성 정도에 따른 바이오 마커를 발굴하기 위해 optimal damage (0.25~0.27 MPa) 조건과 mild damage BBBD (0.42-0.44 MPa)조건의 초음파 에너지를 ICR mice의 뇌의 thalmus 부위에 조사하여 BBB 변성을 유도하였다. 초음파 조사조건은 중심주파수 1.1 MHz를 이용하여 RFP는 1Hz, 120초동안 조사하였다 (도 1). optimal damage (0.25~0.27 MPa) 조건과 mild damage BBBD (0.42-0.44 MPa)조건의 마우스의 MR영상을 확인하였다 (도 2). MR image는 BBB 개통후 조영제를 투여하고, 시간에 따른 enhancement 정도를 확인하였으며, 관상면(coronal), 축상면(axial) 그리고 시상면 (sagittal) 방향으로 이미지를 획득하였다. MR 조영제 투과정도에 따른 intensity 측정을 통해 optimal(~50%) 및 mild (~100%) BBB 조건으로 실험을 진행하였다. 집속초음파 조사에 따른 BBB 개통후 시간에 따른 생물학적 반응을 확인하기 위해서 시간에 따라 (1시간, 6시간, 12시간, 24시간, 48시간) BBB 변성 뇌조직을 획득하였으며, 각 그룹의 mouse에서 혈액을 약 1ml 채취하여 혈청을 분리하였다. In most cases of chronic degenerative brain disease, the bond is loose due to damage to the BBB. Therefore, the researchers induce the opening of the BBB using focused ultrasound. By controlling the degree of BBB degeneration of brain disease, an animal model of the degree of initial BBB damage of the degenerative brain disease model and an animal model of the mid-term BBB damage of the degenerative brain disease model were produced. Using 8-week-old ICR mice, a focused ultrasound-guided BBB patency animal model was constructed. The ultrasonic treatment using the MRgFUS device used a FUS device (RK-100), and a schematic diagram of the device configuration is shown in FIG. 1. A schematic diagram of an MR image-guided focused ultrasound system is shown in FIG. 1. The system consists of an ultrasonic control system and an ultrasonic irradiation system (compatible with MR environments). Specifically, the ultrasonic control system consists of a fuction generator that can transmit RF power to the ultrasonic transducer and an RF amplifier, and is composed of a power meter that can measure the power delivered to the ultrasonic transducer in real time. The ultrasonic irradiation system consists of an ultrasonic transducer, a three-axis control unit that can precisely control the ultrasonic transducer in three dimensions, and a water tank, and is designed to be driven even in the environment of MRI equipment. The MR image-guided focused ultrasound system is linked with the Bruker 9.4T MRI (BioSpec 94/20 USR-9.4T, Bruker, MA, USA) system. A specific experimental protocol is that microbubbles (DEFINITY®), a contrast agent for ultrasound imaging, are diluted in physiological saline at a ratio of 1:50 and injected into the veins of animals at a rate of 0.012ml/s. During the injection of the diluted microbubbles, in 1s Focused ultrasound with a burst length of 10 ms was irradiated for 2 minutes in the desired brain region based on MR images, and the BBB opening and closing can be confirmed by comparing the images before and after the injection of the MR contrast agent through MR images. In order to discover biomarkers according to the conditions, ultrasound energy under optimal damage (0.25~0.27 MPa) and mild damage BBBD (0.42-0.44 MPa) conditions were irradiated to the thalmus area of the brain of ICR mice to induce BBB degeneration. RFP was irradiated for 120 seconds at 1 Hz using a central frequency of 1.1 MHz (Fig. 1). MR images of mice under optimal damage (0.25 ~ 0.27 MPa) and mild damage BBBD (0.42-0.44 MPa) conditions were confirmed. For MR images, after BBB was opened, a contrast agent was administered, the degree of enhancement over time was checked, and images were acquired in the coronal, axial and sagittal directions. The experiment was conducted under optimal (~50%) and mild (~100%) BBB conditions through intensity measurement according to the degree of contrast medium penetration.In order to confirm the biological response according to time after BBB opening according to focused ultrasound irradiation, (1 hour, 6 hours, 12 hours, 24 hours, 48 hours) BBB denatured brain tissue was obtained, and about 1 ml of blood was collected from mice of each group and serum was separated.
Transcriptome analysis (전사체 분석)Transcriptome analysis
실시예 1의 방법으로 제작된 optimal damage BBB 동물 모델 및 mild damage BBB 동물모델에 집속 초음파를 조사한 뇌 부분의 조직을 액체 질소에 급속 냉동시킨 후, RNA isolation kit (Qiagen)를 이용하여 RNA를 분리하였다. 총 RNA를 Dnase를 처리하여 DNA 오염을 방지하고, library 제작을 위해 random fragmentation을 제작하였다. RNA fragment를 역전사 효소로 반응시켜 cDNA를 제작하고 만들어 cDNA 양쪽 끝에 adpator를 붙여 sequencing을 수행하였다. sequencing을 통해 얻어진 raw data의 quality를 분석하고 각 샘플의 transcript quantification을 통해 발현량을 FPKM(Fragments per kilobase of transcript per milion mapped reads)값으로 추출하였다 (도 3). 퇴행성 뇌질환의 초기단계로 예상할 수 있는 optimal BBBD 조건에서 RNA sequencing 분석을 통해 시간에 따른 유전자의 발현 변화를 control과 비교하였을 때, 약 20,000개의 유전자중 BBBD에 의해 증가 또는 감소되는 유전자의 발현차이가 약 30개에서 70개 정도로 control과 크게 차이가 없음을 확인 하였다. BBB의 손상이 중반 정도로 예상할 수 있는 mild damage BBBD 조건에서 RNA sequencing 분석 결과를 통해 시간에 따른 유전자 발현 변화를 control 그룹과 비교하였을 때, 48시간 째 약 518개의 유전자가 증가되었고 174개의 유전자가 감소되는 경향을 나타내었다 (도 3). 상기의 결과를 바탕으로 mild damage BBBD 조건에서의 혈액이나 뇌 조직 바이오 마커 후보군을 선정하였다. 518개의 유전자중 Control 대비 3배 이상 증가되고 혈액에서 검출할 수 있는 soluble form의 단백질을 coding 하고 있는 10개의 유전자를 선정하여 후보군으로 선정하였다 (도 4). In the optimal damage BBB animal model and mild damage BBB animal model produced by the method of Example 1, the tissue of the brain portion irradiated with focused ultrasound was rapidly frozen in liquid nitrogen, and then RNA was isolated using an RNA isolation kit (Qiagen). . Total RNA was treated with DNA to prevent DNA contamination, and random fragmentation was prepared for library construction. The RNA fragment was reacted with reverse transcriptase to produce cDNA, and sequencing was performed by attaching an adpator to both ends of the cDNA. The quality of raw data obtained through sequencing was analyzed, and expression levels were extracted as FPKM (Fragments per kilobase of transcript per milion mapped reads) through transcript quantification of each sample (Fig. 3). When comparing changes in gene expression over time with control through RNA sequencing analysis under optimal BBBD conditions that can be predicted as an early stage of degenerative brain disease, the difference in expression of genes increased or decreased by BBBD among about 20,000 genes. It was confirmed that there was no significant difference from the control in about 30 to 70. When comparing the change of gene expression over time with the control group through RNA sequencing analysis in the mild damage BBBD condition, where the damage of the BBB is expected to be mid-range, about 518 genes increased and 174 genes decreased at 48 hours. Showed a tendency to become (Fig. 3). Based on the above results, a blood or brain tissue biomarker candidate group under mild damage BBBD condition was selected. Among the 518 genes, 10 genes that were increased by more than 3 times compared to Control and that coded proteins in a soluble form that can be detected in blood were selected as candidate groups (Fig. 4).
유전체 분석 결과와 유전자 발현량의 상관관계 검증Verification of correlation between genome analysis results and gene expression levels
상기 실시예3의 후보 유전자의 sequencing 결과가 유의한지 확인하기 위해 real time PCR실험기법으로 후보군유전자 발현을 확인하여 상관관계를 확인하였다. 실시예 1의 방법으로 제작된 optimal damage BBB 동물 모델 및 mild damage BBB 동물모델에 집속 초음파를 조사한 뇌 부분의 조직을 액체 질소에 급속 냉동시킨 후, Quiagne RNA isolation kit (Quiagen)를 이용하여 RNA를 분리하였다. 총 RNA를 Dnase를 처리하여 DNA 오염을 방지하고, library 제작을 위해 random fragmentation을 제작하였다. RNA fragment를 역전사 효소로 반응시켜 cDNA를 제작하였다. SYBR®그린 마스터 PCR 믹스 10 μL, 포워드 및 리버스 프라이머 각 5 pmol, 희석된 cDNA 주형 1 μL 및 적절한 양의 멸균 증류수를 함유한 20 μL 반응물 부피에서 SYBR®그린 리얼-타임 PCR 키트를 사용하여 qRT-PCR을 수행했다. 유전자 증폭 조건은 다음과 같았다. 3 분 간 95 ℃에서 초기 변성; 15 초간 95 ℃에서 변성, 60 초간 60 ℃에서 아닐링 및 60 초간 72 ℃에서 신장 40 사이클; 및 5 분간 72 ℃에서 마지막 신장하였다. ABI 스텝 원 플러스 리얼-타임 PCR 시스템에서 qRT-PCR을 수행했다. 모든 정량은 내부 표준으로 U6과 함께 수행되었다. PCR 프라이머 서열은 하기 표 1과 같다. 그 결과 시간에 따른 유전자의 sequencing결과와 qRT-PCR결과가 유사하다는 것을 확인하였다 (도 4). In order to confirm whether the sequencing result of the candidate gene of Example 3 was significant, the correlation was confirmed by confirming the expression of the candidate gene by a real time PCR experimental technique. In the optimal damage BBB animal model and mild damage BBB animal model produced by the method of Example 1, the tissue of the brain portion irradiated with focused ultrasound was rapidly frozen in liquid nitrogen, and then RNA was isolated using a Quiagne RNA isolation kit (Quiagen). I did. Total RNA was treated with DNA to prevent DNA contamination, and random fragmentation was prepared for library construction. The RNA fragment was reacted with reverse transcriptase to prepare cDNA. QRT- using the SYBR® Green Real-Time PCR Kit in a 20 μL reaction volume containing 10 μL of SYBR® Green Master PCR Mix, 5 pmol each of forward and reverse primers, 1 μL of diluted cDNA template, and an appropriate amount of sterile distilled water. PCR was performed. Gene amplification conditions were as follows. Initial denaturation at 95° C. for 3 minutes; 40 cycles of denaturation at 95°C for 15 seconds, annealing at 60°C for 60 seconds and stretching at 72°C for 60 seconds; And finally stretching at 72° C. for 5 minutes. QRT-PCR was performed on the ABI Step One Plus real-time PCR system. All quantifications were performed with U6 as an internal standard. PCR primer sequences are shown in Table 1 below. As a result, it was confirmed that the sequencing result of the gene over time and the qRT-PCR result were similar (FIG. 4).
ELISAELISA
집속초음파를 이용한 BBB 개통을 유도한 동물모델을 시간에 따라 sacrifice하고, 하대정맥에서 혈액을 약 1ml 정도 취하여, 상온에서 약 30분 혈액을 응고시킨 후, 6000rpm에서 30분간 원심 분리하여 상층액만을 분리하여 serum을 획득하였다. LCN2 ELISA kit (BosterBio社)와 KLK6 (LS bio社)를 이용하여 실험을 수행하기 위해서 serum을 50배와 10배로 blocking buffer에 희석 한 후에 ELISA plate에 100 ul씩 분주하였다. 상온에서 2시간동안 incubation후에 wash buffer로 5분씩 세 번 세척하였다. Biotin이 labelling되어 있는 antibody solution을 100ul씩 분주하고 37 ℃, 1시간동안 incubation하고, wash buffer로 5분씩 3번 세척하였다. ABC solution을 100ul씩 분주하고 37 ℃에서 30분 동안 incubation하고 wash buffer로 세척 후에 TMB substrate solution 90ul를 첨가하여 37 ℃에서 30분 동안 incubation후에 100ul의 stop solution을 첨가하고 plate reader (Tecan 社)를 이용하여 450nm 파장에서 흡광도를 측정하여 결과를 분석하였다. KlK6의 혈액에서의 발현은 optimal condition과 mild damaged condition에서 BBB 개통후 시간이 지남에 따라 점차 증가됨을 확인할 수 있었다. 또한 LCN2의 혈액내 발현이 optimal condition BBB 개통 후 12시간까지 증가되다가 다시 감소됨을 확인하였다. 이를 통해 뇌미세혈관 손상에 의한 혈액 바이오 마커 발굴 가능성을 확인하였다.The animal model that induced the BBB opening using focused ultrasound was sacrificed over time, and about 1 ml of blood was taken from the inferior vena cava, coagulated at room temperature for about 30 minutes, and then centrifuged at 6000 rpm for 30 minutes to separate only the supernatant. Thus, serum was obtained. To perform the experiment using LCN2 ELISA kit (BosterBio) and KLK6 (LS bio), serum was diluted 50 times and 10 times in blocking buffer, and then 100 ul each was dispensed into ELISA plate. After incubation for 2 hours at room temperature, it was washed three times for 5 minutes each with a wash buffer. 100ul of biotin-labeled antibody solution was dispensed, incubated at 37°C for 1 hour, and washed 3 times for 5 minutes each with a wash buffer. Dispense 100ul of ABC solution, incubate at 37℃ for 30 minutes, wash with wash buffer, add 90ul of TMB substrate solution, incubate at 37℃ for 30 minutes, add 100ul of stop solution, and use a plate reader (Tecan) Then, the absorbance was measured at 450nm wavelength and the results were analyzed. It was confirmed that the expression of KlK6 in the blood gradually increased with time after BBB opening in the optimal condition and mild damaged condition. In addition, it was confirmed that the blood expression of LCN2 increased until 12 hours after the opening of the optimal condition BBB, and then decreased again. This confirmed the possibility of discovering blood biomarkers due to brain microvascular damage.
<110> Daegu-Gyeongbuk Medical Innovation Foundation <120> Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration <130> 1065304 <160> 12 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> LCN2_forward <400> 1 tggaagaacc aaggagctgt 20 <210> 2 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> LCN2_reverse <400> 2 cacactcacc acccattcag 20 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SPP1_forward <400> 3 tctgatgaga ccgtcactgc 20 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SPP1_reverse <400> 4 cctcagtcca taagccaagc 20 <210> 5 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cfcl1-forward <400> 5 aacttggaag tgtggcgaag 20 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cfcl1_reverse <400> 6 tacgtcggag ttcagctgtg 20 <210> 7 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Scgb3a1_forward <400> 7 tctgtgtggc tctgctcagt 20 <210> 8 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Scgb3a1_reverse <400> 8 ggccaagtgg cttaatggta 20 <210> 9 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Klk6_forward <400> 9 tgtgctgatg tccatctggt 20 <210> 10 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Klk6_reverse <400> 10 gacctccaga atcaccctga 20 <210> 11 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Ptx3_forward <400> 11 atttgggtca aagccacaga 20 <210> 12 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Ptx3_reverse <400> 12 cagccagctt gttctccttt 20 <110> Daegu-Gyeongbuk Medical Innovation Foundation <120> Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration <130> 1065304 <160> 12 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> LCN2_forward <400> 1 tggaagaacc aaggagctgt 20 <210> 2 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> LCN2_reverse <400> 2 cacactcacc acccattcag 20 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SPP1_forward <400> 3 tctgatgaga ccgtcactgc 20 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SPP1_reverse <400> 4 cctcagtcca taagccaagc 20 <210> 5 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cfcl1-forward <400> 5 aacttggaag tgtggcgaag 20 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cfcl1_reverse <400> 6 tacgtcggag ttcagctgtg 20 <210> 7 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Scgb3a1_forward <400> 7 tctgtgtggc tctgctcagt 20 <210> 8 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Scgb3a1_reverse <400> 8 ggccaagtgg cttaatggta 20 <210> 9 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Klk6_forward <400> 9 tgtgctgatg tccatctggt 20 <210> 10 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Klk6_reverse <400> 10 gacctccaga atcaccctga 20 <210> 11 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Ptx3_forward <400> 11 atttgggtca aagccacaga 20 <210> 12 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Ptx3_reverse <400> 12 cagccagctt gttctccttt 20
Claims (4)
Mild cognitive impairment, mild traumatic brain injury (MTBI), transient ischemic attack, Lou Gehrig's disease, including the composition of any one of claims 1 to 3 A kit for diagnosing any one brain disease selected from the group consisting of dementia, Alzheimer's and Parkinson.
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020190168276A KR20210000257A (en) | 2019-12-16 | 2019-12-16 | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration |
PCT/KR2020/008163 WO2020262935A1 (en) | 2019-06-24 | 2020-06-23 | Bio-marker composition for diagnosis of brain disease caused by brain microvascular damage |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020190168276A KR20210000257A (en) | 2019-12-16 | 2019-12-16 | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020190075235A Division KR102100588B1 (en) | 2019-06-24 | 2019-06-24 | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20210000257A true KR20210000257A (en) | 2021-01-04 |
Family
ID=74130462
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020190168276A KR20210000257A (en) | 2019-06-24 | 2019-12-16 | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
KR (1) | KR20210000257A (en) |
-
2019
- 2019-12-16 KR KR1020190168276A patent/KR20210000257A/en not_active IP Right Cessation
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
KR102100588B1 (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
KR20210056313A (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
KR20210057716A (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
KR101984285B1 (en) | Composition for diagnosing disease | |
KR102207696B1 (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
KR102207698B1 (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
KR102207699B1 (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
KR102207697B1 (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
KR102108176B1 (en) | Peptide biomarker for the diagnosis of Alzheimer’s Dementia | |
KR102347835B1 (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
KR102347836B1 (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
KR20210000257A (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
WO2020262937A1 (en) | Bio-marker composition for diagnosis of brain disease caused by brain microvascular damage | |
WO2020262935A1 (en) | Bio-marker composition for diagnosis of brain disease caused by brain microvascular damage | |
WO2020262939A1 (en) | Biomarker composition for diagnosing brain disease due to brain microvascular damage | |
KR102651118B1 (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
KR102635834B1 (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
KR102635835B1 (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
KR102651116B1 (en) | Biomarker composition for diagnosis of brain diseases due to blood-brain barrier degeneration | |
KR20220126661A (en) | Composition for diagnosing pancreatic cancer | |
US20150030609A1 (en) | Diagnosis and treatment of traumatic brain injury | |
WO2023287269A1 (en) | Bio-marker composition for diagnosing brain disease due to brain microvascular damage | |
KR102108171B1 (en) | Peptide biomarker for the diagnosis of Alzheimer’s Dementia | |
KR20200001068A (en) | Biomaker composition for diagnosing atrophy | |
KR102533728B1 (en) | Markers specific for brain derived ectosome and non-invasive method for diagnosing dementia |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
AMND | Amendment | ||
E601 | Decision to refuse application | ||
X091 | Application refused [patent] | ||
AMND | Amendment | ||
X601 | Decision of rejection after re-examination |