KR20180055247A - 클라비박터 미시가넨시스 아종 동정 방법 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 클라비박터 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis) 아종 동정방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 시료로부터 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하여 클라비박터 미시가넨시스 아종을 동정하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 클라비박터 미시가넨시스 아종 동정 방법 및 클라비박터 미시가넨시스 아종 동정용 프로브를 이용할 경우, 클라비박터 속으로부터 클라비박터 미시가넨시스 아종을 효과적으로 동정할 수 있다.
Description
본 발명은 클라비박터 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis) 아종 동정방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 시료로부터 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하여 클라비박터 미시가넨시스 아종을 동정하는 방법에 관한 것이다.
식물 병원세균의 유전자 동정방법으로는 Dot-blot, 중합효소 연쇄반응(PCR) 등의 방법이 이용된다. 특히 PCR은 Dot-blot 방법보다 시간, 노력, 인력 등이 경제적이기 때문에 최근 널리 사용되고 있는 방법이다. PCR(중합효소 연쇄반응, polymerase chain reaction) 동정 방법은 10~20bp로 구성된 특정 DNA 단편(프라이머)을 세균의 게놈유전자(genomic DNA)에 접촉(annealing)한 후 내열성 DNA 중합효소(Taq polymerase)를 첨가하는 합성 반응이다. 상기 합성 반응을 반복적으로 행하게 되면, 프라이머가 결합된 영역이 급속히 증폭하게 된다. 그 PCR 증폭산물을 아가로스 젤(agarose gel) 또는 아크릴아마이드 젤(acrylamide gel)에 전기영동하고 에티디움 브로마이드(ethidium bromide) 및 은 염색(silver stain)으로 DNA를 염색한 후 나타나는 DNA 밴드의 유무 또는 형태의 차이를 통해, 세균종의 DNA 다형성을 동정할 수 있다. 현재, 이러한 PCR에 의한 세균의 동정법은 인체나 동물의 세균성 질병을 동정에 주로 이용되나, 최근에는 식물 병원균을 동정할 수 있도록 PCR 동정법이 개발되어 병의 동정과 함께 수출입 농산물의 검역에 이용되고 있다. 또한, PCR 동정 방법은 다른 방법에 비해 소요되는 시간이 짧고, 동정에 소요되는 비용이 저렴하며 또한, 많은 샘플을 동시에 검정할 수 있어 경제적이다.
클라비박터 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis)의 아종은 농가에 큰 피해를 입히는 식물병원균으로, 이를 검출할 수 있는 진단 방법의 개발이 요구된다. 그러나 기존의 PCR 동정 방법으로는 유전적 유사도로 인한 종간 구분의 어려움이 있어서, 이를 극복할 수 있는 해결책이 필요한 실정이다. 따라서, 식물병원세균간의 종 또는 병원형 특이적 염기 및 염기 조합을 통해, 식물병원균인 클라비박터 미시가넨시스 아종을 동정할 수 있는 방법의 개발이 요구 된다.
이에 본 발명이 해결하고자 하는 과제는, 시료로부터 23S rRNA를 분리하고 염기서열을 확인하여, 특정한 염기서열의 조합으로부터 클라비박터 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis) 아종을 동정하는 방법을 제공하는 것이다.
또한, 본 발명이 해결하고자 하는 과제는, 특정한 DNA 서열의 폴리뉴클레오티드의 조합을 포함하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 동정용 프로브를 제공하는 것이다.
상기 기술적 과제를 달성하기 위하여, 본 발명은 클라비박터 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis) 아종 동정 방법 및 동정용 프로브를 제공한다.
본 발명에 있어서, 상기 클라비박터 미시가넨시스 아종은 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis), 클라비박터 미시가넨시스 아종 세페도니쿠스(Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus), 클라비박터 미시가넨시스 아종 인시디오수스(Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus), 클라비박터 미시가넨시스 아종 네브라스켄시스(Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis) 및 클라비박터 미시가넨시스 아종 테셀라리우스(Clavibacter michiganensis subsp. tessellarius)로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나일 수 있다. 상기 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스는 토마토분리균 또는 고추분리균일 수 있다.
본 발명의 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) 토마토분리균 동정 방법은 (a) 시료로부터 23S rRNA를 분리하는 단계; (b) 상기 (a) 단계에서 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 확인된 염기의 조합이 서열번호 1의 110번째 염기 A, 서열번호 1의 147번째 염기 G, 서열번호 1의 433번째 염기 G, 서열번호 1의 501번째 염기 A, 서열번호 1의 549번째 염기 T, 서열번호 1의 638번째 염기 C, 서열번호 1의 704번째 염기 G, 서열번호 1의 777번째 염기 A, 서열번호 1의 808번째 염기 G, 서열번호 1의 1038번째 염기 G, 서열번호 1의 1042번째 염기 G, 서열번호 1의 1112번째 염기 A, 서열번호 1의 1159번째 염기 G, 서열번호 1의 1340번째 염기 G, 서열번호 1의 1354번째 염기 C, 서열번호 1의 1396~1397번째 염기 AC, 서열번호 1의 1454번째 염기 G, 서열번호 1의 1584번째 염기 A, 서열번호 1의 1836번째 염기 A, 서열번호 1의 1858번째 염기 A, 서열번호 1의 2420번째 염기 T, 서열번호 1의 2487번째 염기 C, 서열번호 1의 2649번째 염기 T, 서열번호 1의 2745번째 염기 T, 서열번호 1의 2940번째 염기 T, 서열번호 1의 2945번째 염기 G, 서열번호 1의 2977번째 염기 A, 및 서열번호 1의 3024번째 염기 A인 경우 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스 토마토분리균으로 판단하는 단계를 포함할 수 있다.
본 발명의 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) 고추분리균 동정 방법은 (a) 시료로부터 23S rRNA를 분리하는 단계; (b) 상기 (a) 단계에서 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 확인된 염기의 조합이 서열번호 2의 110번째 염기 G, 서열번호 2의 147번째 염기 G, 서열번호 2의 433번째 염기 G, 서열번호 2의 501번째 염기 A, 서열번호 2의 549번째 염기 T, 서열번호 2의 638번째 염기 C, 서열번호 2의 704번째 염기 G, 서열번호 2의 777번째 염기 A, 서열번호 2의 808번째 염기 G, 서열번호 2의 1038번째 염기 G, 서열번호 2의 1042번째 염기 A, 서열번호 2의 1112번째 염기 A, 서열번호 2의 1159번째 염기 G, 서열번호 2의 1340번째 염기 T, 서열번호 2의 1354번째 염기 C, 서열번호 2의 1396~1397번째 염기 AC, 서열번호 2의 1454번째 염기 G, 서열번호 2의 1584번째 염기 A, 서열번호 2의 1836번째 염기 G, 서열번호 2의 1858번째 염기 A, 서열번호 2의 2420번째 염기 T, 서열번호 2의 2487번째 염기 C, 서열번호 2의 2649번째 염기 T, 서열번호 2의 2745번째 염기 T, 서열번호 2의 2940번째 염기 T, 서열번호 2의 2945번째 염기 G, 서열번호 2의 2977번째 염기 A, 및 서열번호 2의 3024번째 염기 A인 경우 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스 고추분리균으로 판단하는 단계를 포함할 수 있다.
본 발명의 클라비박터 미시가넨시스 아종 세페도니쿠스(Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus) 동정 방법은 (a) 시료로부터 23S rRNA를 분리하는 단계; (b) 상기 (a) 단계에서 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 확인된 염기의 조합이 서열번호 3의 110번째 염기 A, 서열번호 3의 147번째 염기 G, 서열번호 3의 433번째 염기 G, 서열번호 3의 501번째 염기 G, 서열번호 3의 549번째 염기 T, 서열번호 3의 638번째 염기 T, 서열번호 3의 704번째 염기 A, 서열번호 3의 777번째 염기 A, 서열번호 3의 808번째 염기 A, 서열번호 3의 1038번째 염기 G, 서열번호 3의 1042번째 염기 G, 서열번호 3의 1112번째 염기 G, 서열번호 3의 1159번째 염기 G, 서열번호 3의 1206번째 염기 C, 서열번호 3의 1340번째 염기 T, 서열번호 3의 1354번째 염기 C, 서열번호 3의 1396~1397번째 염기 AC, 서열번호 3의 1454번째 염기 G, 서열번호 3의 1584번째 염기 A, 서열번호 3의 1836번째 염기 G, 서열번호 3의 1858번째 염기 A, 서열번호 3의 2420번째 염기 A, 서열번호 3의 2487번째 염기 G, 서열번호 3의 2649번째 염기 T, 서열번호 3의 2745번째 염기 T, 서열번호 3의 2940번째 염기 T, 서열번호 3의 2945번째 염기 G, 서열번호 3의 2977번째 염기 G, 및 서열번호 3의 3024번째 염기 A인 경우 클라비박터 미시가넨시스 아종 세페도니쿠스로 판단하는 단계를 포함할 수 있다.
본 발명의 클라비박터 미시가넨시스 아종 인시디오수스(Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus) 동정 방법은 (a) 시료로부터 23S rRNA를 분리하는 단계; (b) 상기 (a) 단계에서 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 확인된 염기의 조합이 서열번호 4의 110번째 염기 A, 서열번호 4의 147번째 염기 A, 서열번호 4의 433번째 염기 A, 서열번호 4의 501번째 염기 A, 서열번호 4의 549번째 염기 T, 서열번호 4의 638번째 염기 C, 서열번호 4의 704번째 염기 G, 서열번호 4의 777번째 염기 G, 서열번호 4의 808번째 염기 G, 서열번호 4의 1038번째 염기 G, 서열번호 4의 1042번째 염기 G, 서열번호 4의 1112번째 염기 A, 서열번호 4의 1159번째 염기 G, 서열번호 4의 1340번째 염기 G, 서열번호 4의 1354번째 염기 C, 서열번호 4의 1396~1397번째 염기 TA, 서열번호 4의 1454번째 염기 A, 서열번호 4의 1584번째 염기 A, 서열번호 4의 1836번째 염기 A, 서열번호 4의 1858번째 염기 A, 서열번호 4의 2420번째 염기 T, 서열번호 4의 2487번째 염기 C, 서열번호 4의 2649번째 염기 T, 서열번호 4의 2745번째 염기 T, 서열번호 4의 2940번째 염기 A, 서열번호 4의 2945번째 염기 G, 서열번호 4의 2977번째 염기 A, 및 서열번호 4의 3024번째 염기 C인 경우 클라비박터 미시가넨시스 아종 인시디오수스로 판단하는 단계를 포함할 수 있다.
본 발명의 클라비박터 미시가넨시스 아종 네브라스켄시스(Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis) 동정 방법은 (a) 시료로부터 23S rRNA를 분리하는 단계; (b) 상기 (a) 단계에서 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 확인된 염기의 조합이 서열번호 5의 110번째 염기 G, 서열번호 5의 147번째 염기 G, 서열번호 5의 433번째 염기 G, 서열번호 5의 501번째 염기 A, 서열번호 5의 549번째 염기 T, 서열번호 5의 638번째 염기 C, 서열번호 5의 704번째 염기 G, 서열번호 5의 777번째 염기 A, 서열번호 5의 808번째 염기 G, 서열번호 5의 1038번째 염기 A, 서열번호 5의 1042번째 염기 A, 서열번호 5의 1112번째 염기 A, 서열번호 5의 1159번째 염기 G, 서열번호 5의 1340번째 염기 T, 서열번호 5의 1354번째 염기 T, 서열번호 5의 1396~1397번째 염기 AC, 서열번호 5의 1454번째 염기 G, 서열번호 5의 1584번째 염기 C, 서열번호 5의 1836번째 염기 C, 서열번호 5의 1858번째 염기 A, 서열번호 5의 2420번째 염기 T, 서열번호 5의 2487번째 염기 C, 서열번호 5의 2649번째 염기 T, 서열번호 5의 2745번째 염기 C, 서열번호 5의 2940번째 염기 T, 서열번호 5의 2945번째 염기 G, 서열번호 5의 2977번째 염기 A, 및 서열번호 5의 3024번째 염기 C인 경우 클라비박터 미시가넨시스 아종 네브라스켄시스로 판단하는 단계를 포함할 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 클라비박터 미시가넨시스 아종 네브라스켄시스는 서열번호 5의 Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis BC2998의 23S rRNA 뿐만 아니라, 서열번호 7의 Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis BC3118이 적용될 수도 있다.
본 발명의 클라비박터 미시가넨시스 아종 테셀라리우스(Clavibacter michiganensis subsp. tessellarius) 동정 방법은 (a) 시료로부터 23S rRNA를 분리하는 단계; (b) 상기 (a) 단계에서 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 확인된 염기의 조합이 서열번호 6의 110번째 염기 A, 서열번호 6의 147번째 염기 G, 서열번호 6의 433번째 염기 G, 서열번호 6의 501번째 염기 A, 서열번호 6의 549번째 염기 T, 서열번호 6의 638번째 염기 C, 서열번호 6의 704번째 염기 G, 서열번호 6의 777번째 염기 A, 서열번호 6의 808번째 염기 G, 서열번호 6의 1038번째 염기 G, 서열번호 6의 1042번째 염기 G, 서열번호 6의 1112번째 염기 A, 서열번호 6의 1159번째 염기 G, 서열번호 6의 1340번째 염기 G, 서열번호 6의 1354번째 염기 C, 서열번호 6의 1396~1397번째 염기 AC, 서열번호 6의 1454번째 염기 G, 서열번호 6의 1584번째 염기 A, 서열번호 6의 1836번째 염기 G, 서열번호 6의 1858번째 염기 G, 서열번호 6의 2420번째 염기 T, 서열번호 6의 2487번째 염기 C, 서열번호 6의 2649번째 염기 A, 서열번호 6의 2745번째 염기 T, 서열번호 6의 2940번째 염기 T, 서열번호 6의 2945번째 염기 G, 서열번호 6의 2977번째 염기 A, 및 서열번호 6의 3024번째 염기 A인 경우 클라비박터 미시가넨시스 아종 테셀라리우스로 판단하는 단계를 포함할 수 있다.
또한, 본 발명은 특정한 유전자들의 염기 조합으로 구성된 클라비박터 미시가넨시스 아종 동정용 프로브 조성물을 제공한다. 즉, 본 발명의 프로브 조성물은 클라비박터 미시가넨시스 아종의 23S rRNA 유전자의 염기서열 조합을 통해, 각각의 클라비박터 미시가넨시스 아종을 동정할 수 있다.
본 발명의 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) 토마토분리균 동정용 프로브는 서열번호 1의 110번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 147번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 433번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 501번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 549번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 638번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 704번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 777번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 808번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1038번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1042번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1112번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1159번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1340번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1354번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1396~1397번째 염기 AC를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1454번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1584번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1836번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1858번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2420번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2487번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2649번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2745번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2940번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2945번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2977번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 3024번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 및 이들의 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함할 수 있다.
본 발명의 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) 고추분리균 동정용 프로브는 서열번호 2의 110번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 147번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 433번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 501번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 549번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 638번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 704번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 777번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 808번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1038번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1042번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1112번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1159번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1340번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1354번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1396~1397번째 염기 AC를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1454번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1584번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1836번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1858번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2420번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2487번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2649번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2745번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2940번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2945번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2977번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 3024번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 및 이들의 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함할 수 있다.
본 발명의 클라비박터 미시가넨시스 아종 세페도니쿠스(Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus) 동정용 프로브는 서열번호 3의 110번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 147번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 433번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 501번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 549번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 638번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 704번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 777번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 808번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1038번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1042번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1112번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1159번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1206번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1340번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1354번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1396~1397번째 염기 AC를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1454번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1584번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1836번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1858번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2420번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2487번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2649번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2745번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2940번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2945번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2977번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 3024번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 및 이들의 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함할 수 있다.
본 발명의 클라비박터 미시가넨시스 아종 인시디오수스(Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus) 동정용 프로브는 서열번호 4의 110번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 147번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 433번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 501번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 549번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 638번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 704번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 777번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 808번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1038번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1042번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1112번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1159번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1340번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1354번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1396~1397번째 염기 TA를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1454번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1584번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1836번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1858번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2420번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2487번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2649번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2745번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2940번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2945번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2977번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 3024번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 및 이들의 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함할 수 있다.
본 발명의 클라비박터 미시가넨시스 아종 네브라스켄시스(Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis) 동정용 프로브는 서열번호 5의 110번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 147번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 433번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 501번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 549번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 638번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 704번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 777번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 808번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1038번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1042번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1112번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1159번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1340번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1354번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1396~1397번째 염기 AC를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1454번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1584번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1836번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1858번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2420번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2487번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2649번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2745번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2940번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2945번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2977번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 3024번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 및 이들의 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함할 수 있다.
본 발명의 클라비박터 미시가넨시스 아종 테셀라리우스(Clavibacter michiganensis subsp. tessellarius) 동정용 프로브는 서열번호 6의 110번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 147번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 433번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 501번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 549번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 638번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 704번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 777번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 808번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1038번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1042번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1112번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1159번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1340번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1354번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1396~1397번째 염기 AC를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1454번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1584번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1836번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1858번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2420번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2487번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2649번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2745번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2940번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2945번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2977번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 3024번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 및 이들의 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 (a) 단계에서 핵산의 분리는 당업계에서 통상적으로 사용되는 방법에 따라 수행될 수 있으며, 상업적으로 판매되는 추출 키트를 이용하여 수행할 수 있다.
또한 상기 (b) 단계에서 염기서열은 당업계에 공지된 자동 또는 수동의 염기서열 분석방법에 따라 수행될 수 있으며, 바람직하게는 검사체 또는 시료를 대상으로 PCR을 수행하여 23S rRNA에 상응하는 PCR 산물을 제조한 다음 이의 서열을 공지의 염기서열 분석방법에 따라서 분석하여 수행할 수 있다.
상기 (c) 단계에서는 서열번호 1 내지 6 중 어느 하나를 기준으로 본 발명의 미생물에서의 판단점에 해당하는 염기서열을 확인하여 본 발명의 미생물에 해당하는지 여부를 판별할 수 있다.
한편, 본 발명은 본 발명의 프로브가 기질상에 집적되어 있는 것을 특징으로 하는 본 발명의 미생물의 검출용 마이크로어레이를 제공한다. 상기 마이크로어레이는 본 발명의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 것을 제외하고는 통상적인 마이크로어레이로 이루어지며, 마커로 사용되는 폴리뉴클레오티드를 기관 상에 고정화하여 마이크로어레이를 제조하는 방법은 당업계에 잘 알려져 있다.
또한, 본 발명은 본 발명의 미생물의 검출용 마커로서 서열번호 1 내지 6 중 어느 하나로 표시되는 염기서열을 가지는 뉴클레오티드에서, 본 발명의 미생물의 판단점에 해당하는 각각의 염기가 치환된 것을 특징으로 하는 검출용 마커를 제공한다.
본 발명의 뉴클레오티드, 프로브 또는 마커는 DNA 또는 RNA일 수 있으며, RNA의 경우 서열에 기재된 티민이 우라실로 대체되는 것은 당업자에게 자명하다.
본 발명의 클라비박터 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis) 아종 동정 방법 및 클라비박터 미시가넨시스 아종 동정용 프로브를 이용할 경우, 클라비박터 속으로부터 클라비박터 미시가넨시스 아종을 효과적으로 동정할 수 있다.
도 1은 프라이머가 Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis의 23s rRNA 염기서열(Genebank 수탁번호: AM711867)에 결합하는 위치를 나타낸 모식도이다.
도 2는 여러 프라이머 조합을 사용하여 Clavibacter michiganensis subsp. michigenesis 등의 23S rRNA의 유전자를 증폭시킨 결과를 나타낸다 (1: Clavibacter michiganensis subsp. michigenesis, 2: Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis, 3: Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus, 4: Curtobacterium flaccumfaciens pv. betae, 5: Rathayibacter toxicus).
도 3은 Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis의 23s rRNA 염기서열(Genebank 수탁번호: AM711867)을 기준으로 서열번호 1 내지 7의 염기서열 차이가 있는 위치를 나타낸 분석 결과이다.
도 2는 여러 프라이머 조합을 사용하여 Clavibacter michiganensis subsp. michigenesis 등의 23S rRNA의 유전자를 증폭시킨 결과를 나타낸다 (1: Clavibacter michiganensis subsp. michigenesis, 2: Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis, 3: Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus, 4: Curtobacterium flaccumfaciens pv. betae, 5: Rathayibacter toxicus).
도 3은 Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis의 23s rRNA 염기서열(Genebank 수탁번호: AM711867)을 기준으로 서열번호 1 내지 7의 염기서열 차이가 있는 위치를 나타낸 분석 결과이다.
이하, 본 발명의 이해를 돕기 위하여 실시예 등을 들어 상세하게 설명하기로 한다. 그러나, 본 발명에 따른 실시예들은 여러 가지 다른 형태로 변형될 수 있으며, 본 발명의 범위가 하기 실시예들에 한정되는 것으로 해석되어서는 안 된다. 본 발명의 실시예들은 당업계에서 평균적인 지식을 가진 자에게 본 발명을 보다 완전하게 설명하기 위해 제공되는 것이다.
실시예 1:
Clavibacter michiganensis
아종들의 23S rRNA 분석
하기 실험 방법을 통하여, Clavibacter michiganensis 아종에 대한 동정용 프로브를 설계하였다. 본 발명에서 사용한 전체 RNA 분리 및 염기서열 증폭, 분석방법은 다음과 같다.
<1-1> 균들의 23S rRNA 증폭
Clavibacter michiganensis 아종(Clavibacter michiganensis subsp. michigenesis, Clavi. michiganensis subsp. nebraskensis 및 Clavi. michiganensis subsp. sepedonicus), Curtobacterium flaccumfaciens pv. betae 및 Rathayibacter toxicus의 DNA를 분리한 후, 하기 표 1과 같은 프라이머 쌍의 조합을 이용하여, 각각의 23s rRNA를 증폭시켰다. 하기 프라이머가 Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis의 23s rRNA 염기서열(Genebank 수탁번호: AM711867)에 결합하는 위치를 도 1에 나타내었다.
| 프라이머 명칭 | 프라이머 서열 |
| Clavi23SF3 (전방향) | 5‘- (33)*CAGGTCAGCTCCACGAGTC(47)-3’ |
| Clavi23SR2 (역방향) | 5‘- (832)TAAAGGTCACGGGGTCTTTCC(852)-3’ |
| Clavi23SF10 (전방향) | 5‘- (3124)CGGTGGATGCCTTGGCATCT(3105)-3’ |
| Clavi23SR13 (역방향) | 5‘- (2462)GATATGTGGCGAGGTTAACCCG(2441)-3’ |
PCR 완충액은 dNTP 0.2 mM, MgCl2 1.5 mM, 프라이머 10 pM 및 Taq DNA polymerase 0.2 Unit을 사용하였다. 분리한 각각의 DNA와 상기 PCR 완충액을 포함하는 반응액을 95℃에서 1분 동안 가열 후, 95℃ 1분, 68℃ 1분, 72℃ 3분으로 30회 반복하였다. 증폭 후 PCR 산물은 1× TBE 완충액과 1.5 % 아가로즈 겔을 사용하여 전기영동한 후 ethidium bromide로 염색한 후 ultraviolet lamp에서 확인하였다.
도 2에 나타난 실험 결과를 볼 때, Clavi23SF3 및 Clavi23SR13 프라이머 조합은 Clavibacter michiganensis subsp. michigenesis, Clavi. michiganensis subsp. nebraskensis, Clavi. michiganensis subsp. sepedonicus, Curtobacterium flaccumfaciens pv. betae 및 Rathayibacter toxicus의 23S rRNA 유전자를 증폭시키는 것을 확인하였다.
<1-2> 증폭한 23s rRNA 서열 분석
상기 실시예 <1-1>에서 얻은 PCR 산물들의 염기서열은 BioEdit Sequence Alignment Editor를 이용하여 분석하였다. 본 실험에서 사용한 균들의 23s rRNA 서열들은 하기 표 2와 같이 서열번호로 정리하였다.
| 서열번호 | 균주 명칭 |
| 1 | Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis 토마토분리균 BC2720 |
| 2 | Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis 고추분리균 BC2964 |
| 3 | Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus BC2999 |
| 4 | Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus BC2997 |
| 5 | Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis BC2998 |
| 6 | Clavibacter michiganensis subsp. tessellarius BC3000 |
| 7 | Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis BC3118 |
실시예 2:
Clavibacter michiganensis
아종 간의 23s rRNA 서열 비교 분석
상기 표 2의 서열번호 1 내지 7 간에 염기서열 차이를 비교하였다. 염기서열은 BioEdit Sequence Alignment Editor를 이용하여 비교하였다. Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis의 23s rRNA 염기서열(Genebank 수탁번호: AM711867)을 기준으로 염기서열 차이가 있는 위치는 하기와 같으며, 분석 결과는 도 3에 나타내었다. 하기 괄호 안의 숫자는 각 서열번호에서 염기서열 차이가 있는 위치를 의미하며, 괄호 앞의 염기는 해당 위치에 차이가 있는 염기서열을 의미한다.
<2-1> Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis 토마토분리균
A(110), G(147), G(433), A(501), T(549), C(638), G(704), A(777), G(808), G(1038), G(1042), A(1112), G(1159), G(1340), C(1354), AC(1396, 1397), G(1454), A(1584), A(1836), A(1858), T(2420), C(2487), T(2649), T(2745), T(2940), G(2945), A(2977), A(3024)
<2-2> Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis 고추분리균
G(110), G(147), G(433), A(501), T(549), C(638), G(704), A(777), G(808), G(1038), A(1042), A(1112), G(1159), T(1340), C(1354), AC(1396, 1397), G(1454), A(1584), G(1836), A(1858), T(2420), C(2487), T(2649), T(2745), T(2940), G(2945), A(2977), A(3024)
<2-3> Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis
G(110), G(147), G(433), A(501), T(549), C(638), G(704), A(777), G(808), A(1038), A(1042), A(1112), G(1159), T(1340), T(1354), AC(1396, 1397), G(1454), C(1584), C(1836), A(1858), T(2420), C(2487), T(2649), C(2745), T(2940), G(2945), A(2977), C(3024)
<2-4> Clavibacter michiganensis subsp. tessellarius
A(110), G(147), G(433), A(501), T(549), C(638), G(704), A(777), G(808), G(1038), G(1042), A(1112), G(1159), G(1340), C(1354), AC(1396, 1397), G(1454), A(1584), G(1836), G(1858), T(2420), C(2487), A(2649), T(2745), T(2940), G(2945), A(2977), A(3024)
<2-5> Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus
A(110), A(147), A(433), A(501), T(549), C(638), G(704), G(777), G(808), G(1038), G(1042), A(1112), G(1159), G(1340), C(1354), TA(1396, 1397), A(1454), A(1584), A(1836), A(1858), T(2420), C(2487), T(2649), T(2745), A(2940), G(2945), A(2977), C(3024)
<2-6> Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus
A(110), G(147), G(433), G(501), T(549), T(638), A(704), A(777), A(808), G(1038), G(1042), G(1112), G(1159), C(1206, 삽입), T(1340), C(1354), AC(1396, 1397), G(1454), A(1584), G(1836), A(1858), A(2420), G(2487), T(2649), T(2745), T(2940), G(2945), G(2977), A(3024)
<110> REPUBLIC OF KOREA(MANAGEMENT : RURAL DEVELOPMENT ADMINISTRATION)
<120> Method of identifying Clavibacter michiganensis subspecies
<130> P16-276, 2016-0452-10-A
<160> 7
<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1
<211> 2991
<212> DNA
<213> Unknown
<220>
<223> Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis BC2720 Tomato
<400> 1
ctgcctatca acccggtagt ctagccggga gccttcaccc taaaagggat ggaaatctca 60
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<212> DNA
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<220>
<223> Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus BC2999
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<223> Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus BC2997
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<212> DNA
<213> Unknown
<220>
<223> Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis BC2998
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caggctacat agaagacgga tttgcctatc ttctgcccta catccttaga ccgggacaac 1380
catcgcccgg ctcagctacc ttcctgcgtc acacctgtta atacgctaaa cgccccagcg 1440
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gcctgcattc tcactcgtgt ggcctccacg gctggttcac accgccgctt cgctggccac 1740
acgacgctct cctacccatc catacggctg gaccacgaag gcctgcctat aatataaatg 1800
ccacaacttc ggtggcgtgc ttgagccccg ttacattgtc ggcgcggaat cacttgacca 1860
gtgagctatt acgcactctt tcaagggtgg ctgcttctaa gccaacctcc tggttgtcta 1920
tgcaactcca catcctttcc cacttagcac gcgcttaggg accttagatg gtggtctggg 1980
ttgtttccct ctcgacgatg aagcttatcc cccaccgtct cactgctgcg ctctcactta 2040
ccggcattcg gagtttggct gaagtcagta accttttggg gcccatcgtc catccagtag 2100
ctctacctcc ggcaagaaac acgcaacgct gcacctaaat gcatttcgga gagaaccagc 2160
tatcacgaag tttgattggc ctttcacccc tatccacagc tcatcccctc cattttcaac 2220
tgaagtgggt tcggtcctcc acgacgtctt accgtcgctt caacctggcc atggatagat 2280
cacttcgctt cgggtctaga acatgcgact catacgccct attaagactc gctttcgcta 2340
cggctgcccc tcacgggtta acctcgccac atatcactaa ctcgcaggct cattcttcaa 2400
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actatttcac tcccctcccg gggtactttt cacctttccc tcacggtact tgtccgctat 2520
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agctcggtag aactgtacgg aaagtcccgc aaccccgacc atgcaactcc taccggatat 2760
cacacatgat cggtttggcc tcttccggtt tcgctcgcca ctactaacgg aatcgctttt 2820
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atatattcag gcgggagtca ccaggtcacc caaagggcct ggcggggttt ccccattcgg 2940
agatcctcgg atcacagctc tattatcagc tccccgaggc ttatcgcaga t 2991
<210> 6
<211> 2991
<212> DNA
<213> Unknown
<220>
<223> Clavibacter michiganensis subsp. tessellarius BC3000
<400> 6
ctgcctatca acccggtagt ctagccggga gccttcaccc taaaagggat ggaaatctca 60
tctcgaagcc ggcttcccgc ttagatgctt tcagcggtta tccgttccga acgtagctaa 120
tcagcggtgc tcctggcgga acaactgaca caccagaggt tcgtccatcc cggtcctctc 180
gtactaggga tagatcttct caaatttcct acgcgcgcag cggataggga ccgaactgtc 240
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tatggactct tgggcaagat cagcctgtta tccccgaggt accttttatc cgttgagcga 420
cagcgcttcc acaagccact gccggatcac tagtcccgac tttcgtccct gctcgacttg 480
tcagtctcac agtcaagctc ccttgtgcac ttacactcga cacctgatta ccaaccaggt 540
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atcctacaca agccacaccg aacaccaata ccaagctgta gtaaaggtca cggggtcttt 780
ccgtcctgct gcgcgtaacg agcatcttta ctcgtagtgc aatttcgccg agttcgcggt 840
tgagacagct gggaagtcgt tacgccattc gtgcaggtcg gaacttaccc gacaaggaat 900
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caggctacat agaagacgga tttgcctatc ttctgcccta catccttaga ccgggacaac 1380
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tggccctgga acccttggtc tttcggagga cgggtttctc acccgtcttt cgctactcat 1680
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ccggcattcg gagtttggct gaagtcagta accttttggg gcccatcgtc catccagtag 2100
ctctacctcc ggcaagaaac acgcaacgct gcacctaaat gcatttcgga gagaaccagc 2160
tatcacgaag tttgattggc ctttcacccc tatccacagc tcatcccctc cattttcaac 2220
tgaagtgggt tcggtcctcc acgacgtctt accgtcgctt caacctggcc atggatagat 2280
cacttcgctt cgggtctaga acatgcgact catacgccct attaagactc gctttcgcta 2340
cggctgcccc tcacgggtta acctcgccac atatcactaa ctcgcaggct cattcttcaa 2400
aaggcacgct gtcacaccaa caagggtgct ccaacggttt gtaagcaaac ggtttcaggt 2460
actatttcac tcccctcccg gggtactttt cacctttccc tcacggtact tgtccgctat 2520
cggtcatctg ggagtattta ggcttatcag gtggtcctga cagattcaca cgggatttca 2580
cgggccccgt gctacttggg atactctccg gacaggcgac gacatttcga ctacggggtt 2640
cgcaccctct atgactggcc tttcaagacc attcgtctat atcgcgctca ttgccctcac 2700
agctcggtag aactgtacgg aaagtcccgc aaccccgacc atgcaactcc taccggatat 2760
cacacatgat cggtttggcc tcttccggtt tcgctcgcca ctactaacgg aatcgctttt 2820
gctttctctt cctgtgggta ctgagatgtt tcacttcccc acgttccctc tacccgccct 2880
atatattcag gcgggagtca ccaggtcacc caaagggcct ggcggggttt ccccattcgg 2940
agatcctcgg atcaaagctc tattatcagc tccccgaggc ttatcgcaga t 2991
<210> 7
<211> 2991
<212> DNA
<213> Unknown
<220>
<223> Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis BC3118
<400> 7
ctgcctatca acccggtagt ctagccggga gccttcaccc tgaaagggat ggaaatctca 60
tctcgaagcc ggcttcccgc ttagatgctt tcagcggtta tccgttccga acgtagctaa 120
tcagcggtgc tcctggcgga acaactgaca caccagaggt tcgtccatcc cggtcctctc 180
gtactaggga tagatcttct caaatttcct acgcgcgcag cggataggga ccgaactgtc 240
tcacgacgtt ctaaacccag ctcgcgtacc gctttaatgg gcgaacagcc caacccttgg 300
gacctactcc agccccagga tgcgacgagc cgacatcgag gtgccaaacc atgccgtcga 360
tatggactct tgggcaagat cagcctgtta tccccgaggt accttttatc cgttgagcga 420
cagcgcttcc acaagccact gccggatcac tagtcccgac tttcgtccct gctcgacttg 480
tcagtctcac agtcaagctc ccttgtgcac ttacactcga cacctgatta ccaaccaggt 540
tgagggaacc tttgggcgcc tccgttactc tttaggaggc aaccgcccca gttaaactac 600
ccaccaggca ctgtccctga accggattac ggttcgaagt tagatatcca gagtgaccag 660
agtggtattt caacaatgac tccacccgaa ctagcgtccg agcttcacag tctcccacct 720
atcctacaca agccacaccg aacaccaata ccaagctgta gtaaaggtca cggggtcttt 780
ccgtcctgct gcgcgtaacg agcatcttta ctcgtagtgc aatttcgccg agttcgcggt 840
tgagacagct gggaagtcgt tacgccattc gtgcaggtcg gaacttaccc gacaaggaat 900
ttcgctacct taggatggtt atagttacca ccgccgttta ctggggctta aattctcagc 960
ttcgcactta cgtgctaacc gttcctctta accttccagc accgggcagg cgtcagtccg 1020
tatacatcgt cttgcgactt agcacggacc tgtgttttta gtaaacagtc gcttcccact 1080
ggtctctgcg gccttcaaac gcttcaggag taaatcccta cacgcctcag gccccccttc 1140
tcccgaagtt acgggggcat tttgccgagt tccttaacca cgattctctc gatctcctta 1200
gtattctcta cctgaccacc tgagtcggtt tggggtacgg gcgattggaa cctcgcgtcg 1260
atgcttttct cggcagcata ggattactga tttcgtccgt gaggactacc catcgggtct 1320
caggctacat agaagacgga tttgcctatc ttctgcccta catccttaga ccgggacaac 1380
catcgcccgg ctcagctacc ttcctgcgtc acacctgtta atacgctaaa cgccccagcg 1440
tagggtcgtg tgctaggcca agaccgtcac cccgaaggga tcgaatcaag gattcagaca 1500
cttagcatta ctggcttgtc ttgggcggtt cttcatcggt acgggaatat caacccgttg 1560
tccatcgact acgcctgtcg gcctcgcctt aggtcccgac ttacccaggg cggattagcc 1620
tggccctgga acccttggtc tttcggagga cgggtttctc acccgtcttt cgctactcat 1680
gcctgcattc tcactcgtgt ggcctccacg gctggttcac accgccgctt cgctggccac 1740
acgacgctct cctacccatc catacggctg gaccacgaag gcctgcctat aatataaatg 1800
ccacaacttc ggtggcgtgc ttgagccccg ttacattgtc ggcgcggaat cacttgacca 1860
gtgagctatt acgcactctt tcaagggtgg ctgcttctaa gccaacctcc tggttgtcta 1920
tgcaactcca catcctttcc cacttagcac gcgcttaggg accttagatg gtggtctggg 1980
ttgtttccct ctcgacgatg aagcttatcc cccaccgtct cactgctgcg ctctcactta 2040
ccggcattcg gagtttggct gaagtcagta accttttggg gcccatcgtc catccagtag 2100
ctctacctcc ggcaagaaac acgcaacgct gcacctaaat gcatttcgga gagaaccagc 2160
tatcacgaag tttgattggc ctttcacccc tatccacagc tcatcccctc cattttcaac 2220
tgaagtgggt tcggtcctcc acgacgtctt accgtcgctt caacctggcc atggatagat 2280
cacttcgctt cgggtctaga acatgcgact catacgccct attaagactc gctttcgcta 2340
cggctgcccc tcacgggtta acctcgccac atatcactaa ctcgcaggct cattcttcaa 2400
aaggcacgct gtcacaccaa caagggtgct ccaacggttt gtaagcaaac ggtttcaggt 2460
actatttcac tcccctcccg gggtactttt cacctttccc tcacggtact tgtccgctat 2520
cggtcatctg ggagtattta ggcttatcag gtggtcctga cagattcaca cgggatttct 2580
cgggccccgt gctacttggg atactctccg gacaggcgac gacatttcga ctacggggtt 2640
cgcaccctct atgactggcc tttcaagacc attcgcctat atcgcgctca ttgccctcac 2700
agctcggtag aactgtacgg aaagtcccgc aaccccgacc atgcaactcc taccggatat 2760
cacacatgat cggtttggcc tcttccggtt tcgctcgcca ctactaacgg aatcgctttt 2820
gctttctctt cctgtgggta ctgagatgtt tcacttcccc acgttccctc tacccaccct 2880
atatattcag gcgggagtca ccaggtcacc caaagggcct ggcggggttt ccccattcgg 2940
agatcctcgg atcacagctc tattatcagc tccccgaggc ttatcgcaga t 2991
Claims (18)
- (a) 시료로부터 23S rRNA를 분리하는 단계; (b) 상기 (a) 단계에서 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 확인된 염기의 조합이 서열번호 1의 110번째 염기 A, 서열번호 1의 147번째 염기 G, 서열번호 1의 433번째 염기 G, 서열번호 1의 501번째 염기 A, 서열번호 1의 549번째 염기 T, 서열번호 1의 638번째 염기 C, 서열번호 1의 704번째 염기 G, 서열번호 1의 777번째 염기 A, 서열번호 1의 808번째 염기 G, 서열번호 1의 1038번째 염기 G, 서열번호 1의 1042번째 염기 G, 서열번호 1의 1112번째 염기 A, 서열번호 1의 1159번째 염기 G, 서열번호 1의 1340번째 염기 G, 서열번호 1의 1354번째 염기 C, 서열번호 1의 1396~1397번째 염기 AC, 서열번호 1의 1454번째 염기 G, 서열번호 1의 1584번째 염기 A, 서열번호 1의 1836번째 염기 A, 서열번호 1의 1858번째 염기 A, 서열번호 1의 2420번째 염기 T, 서열번호 1의 2487번째 염기 C, 서열번호 1의 2649번째 염기 T, 서열번호 1의 2745번째 염기 T, 서열번호 1의 2940번째 염기 T, 서열번호 1의 2945번째 염기 G, 서열번호 1의 2977번째 염기 A, 및 서열번호 1의 3024번째 염기 A인 경우 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) 토마토분리균으로 판단하는 단계를 포함하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스 토마토분리균 동정 방법.
- (a) 시료로부터 23S rRNA를 분리하는 단계; (b) 상기 (a) 단계에서 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 확인된 염기의 조합이 서열번호 2의 110번째 염기 G, 서열번호 2의 147번째 염기 G, 서열번호 2의 433번째 염기 G, 서열번호 2의 501번째 염기 A, 서열번호 2의 549번째 염기 T, 서열번호 2의 638번째 염기 C, 서열번호 2의 704번째 염기 G, 서열번호 2의 777번째 염기 A, 서열번호 2의 808번째 염기 G, 서열번호 2의 1038번째 염기 G, 서열번호 2의 1042번째 염기 A, 서열번호 2의 1112번째 염기 A, 서열번호 2의 1159번째 염기 G, 서열번호 2의 1340번째 염기 T, 서열번호 2의 1354번째 염기 C, 서열번호 2의 1396~1397번째 염기 AC, 서열번호 2의 1454번째 염기 G, 서열번호 2의 1584번째 염기 A, 서열번호 2의 1836번째 염기 G, 서열번호 2의 1858번째 염기 A, 서열번호 2의 2420번째 염기 T, 서열번호 2의 2487번째 염기 C, 서열번호 2의 2649번째 염기 T, 서열번호 2의 2745번째 염기 T, 서열번호 2의 2940번째 염기 T, 서열번호 2의 2945번째 염기 G, 서열번호 2의 2977번째 염기 A, 및 서열번호 2의 3024번째 염기 A인 경우 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) 고추분리균으로 판단하는 단계를 포함하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스 고추분리균 동정 방법.
- (a) 시료로부터 23S rRNA를 분리하는 단계; (b) 상기 (a) 단계에서 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 확인된 염기의 조합이 서열번호 3의 110번째 염기 A, 서열번호 3의 147번째 염기 G, 서열번호 3의 433번째 염기 G, 서열번호 3의 501번째 염기 G, 서열번호 3의 549번째 염기 T, 서열번호 3의 638번째 염기 T, 서열번호 3의 704번째 염기 A, 서열번호 3의 777번째 염기 A, 서열번호 3의 808번째 염기 A, 서열번호 3의 1038번째 염기 G, 서열번호 3의 1042번째 염기 G, 서열번호 3의 1112번째 염기 G, 서열번호 3의 1159번째 염기 G, 서열번호 3의 1206번째 염기 C, 서열번호 3의 1340번째 염기 T, 서열번호 3의 1354번째 염기 C, 서열번호 3의 1396~1397번째 염기 AC, 서열번호 3의 1454번째 염기 G, 서열번호 3의 1584번째 염기 A, 서열번호 3의 1836번째 염기 G, 서열번호 3의 1858번째 염기 A, 서열번호 3의 2420번째 염기 A, 서열번호 3의 2487번째 염기 G, 서열번호 3의 2649번째 염기 T, 서열번호 3의 2745번째 염기 T, 서열번호 3의 2940번째 염기 T, 서열번호 3의 2945번째 염기 G, 서열번호 3의 2977번째 염기 G, 및 서열번호 3의 3024번째 염기 A인 경우 클라비박터 미시가넨시스 아종 세페도니쿠스(Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus)로 판단하는 단계를 포함하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 세페도니쿠스 동정 방법
- (a) 시료로부터 23S rRNA를 분리하는 단계; (b) 상기 (a) 단계에서 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 확인된 염기의 조합이 서열번호 4의 110번째 염기 A, 서열번호 4의 147번째 염기 A, 서열번호 4의 433번째 염기 A, 서열번호 4의 501번째 염기 A, 서열번호 4의 549번째 염기 T, 서열번호 4의 638번째 염기 C, 서열번호 4의 704번째 염기 G, 서열번호 4의 777번째 염기 G, 서열번호 4의 808번째 염기 G, 서열번호 4의 1038번째 염기 G, 서열번호 4의 1042번째 염기 G, 서열번호 4의 1112번째 염기 A, 서열번호 4의 1159번째 염기 G, 서열번호 4의 1340번째 염기 G, 서열번호 4의 1354번째 염기 C, 서열번호 4의 1396~1397번째 염기 TA, 서열번호 4의 1454번째 염기 A, 서열번호 4의 1584번째 염기 A, 서열번호 4의 1836번째 염기 A, 서열번호 4의 1858번째 염기 A, 서열번호 4의 2420번째 염기 T, 서열번호 4의 2487번째 염기 C, 서열번호 4의 2649번째 염기 T, 서열번호 4의 2745번째 염기 T, 서열번호 4의 2940번째 염기 A, 서열번호 4의 2945번째 염기 G, 서열번호 4의 2977번째 염기 A, 및 서열번호 4의 3024번째 염기 C인 경우 클라비박터 미시가넨시스 아종 인시디오수스(Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus)로 판단하는 단계를 포함하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 인시디오수스 동정 방법.
- (a) 시료로부터 23S rRNA를 분리하는 단계; (b) 상기 (a) 단계에서 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 확인된 염기의 조합이 서열번호 5의 110번째 염기 G, 서열번호 5의 147번째 염기 G, 서열번호 5의 433번째 염기 G, 서열번호 5의 501번째 염기 A, 서열번호 5의 549번째 염기 T, 서열번호 5의 638번째 염기 C, 서열번호 5의 704번째 염기 G, 서열번호 5의 777번째 염기 A, 서열번호 5의 808번째 염기 G, 서열번호 5의 1038번째 염기 A, 서열번호 5의 1042번째 염기 A, 서열번호 5의 1112번째 염기 A, 서열번호 5의 1159번째 염기 G, 서열번호 5의 1340번째 염기 T, 서열번호 5의 1354번째 염기 T, 서열번호 5의 1396~1397번째 염기 AC, 서열번호 5의 1454번째 염기 G, 서열번호 5의 1584번째 염기 C, 서열번호 5의 1836번째 염기 C, 서열번호 5의 1858번째 염기 A, 서열번호 5의 2420번째 염기 T, 서열번호 5의 2487번째 염기 C, 서열번호 5의 2649번째 염기 T, 서열번호 5의 2745번째 염기 C, 서열번호 5의 2940번째 염기 T, 서열번호 5의 2945번째 염기 G, 서열번호 5의 2977번째 염기 A, 및 서열번호 5의 3024번째 염기 C인 경우 클라비박터 미시가넨시스 아종 네브라스켄시스(Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis)로 판단하는 단계를 포함하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 네브라스켄시스 동정 방법.
- (a) 시료로부터 23S rRNA를 분리하는 단계; (b) 상기 (a) 단계에서 분리한 23S rRNA의 염기를 확인하는 단계; 및 (c) 상기 (b) 단계에서 확인된 염기의 조합이 서열번호 6의 110번째 염기 A, 서열번호 6의 147번째 염기 G, 서열번호 6의 433번째 염기 G, 서열번호 6의 501번째 염기 A, 서열번호 6의 549번째 염기 T, 서열번호 6의 638번째 염기 C, 서열번호 6의 704번째 염기 G, 서열번호 6의 777번째 염기 A, 서열번호 6의 808번째 염기 G, 서열번호 6의 1038번째 염기 G, 서열번호 6의 1042번째 염기 G, 서열번호 6의 1112번째 염기 A, 서열번호 6의 1159번째 염기 G, 서열번호 6의 1340번째 염기 G, 서열번호 6의 1354번째 염기 C, 서열번호 6의 1396~1397번째 염기 AC, 서열번호 6의 1454번째 염기 G, 서열번호 6의 1584번째 염기 A, 서열번호 6의 1836번째 염기 G, 서열번호 6의 1858번째 염기 G, 서열번호 6의 2420번째 염기 T, 서열번호 6의 2487번째 염기 C, 서열번호 6의 2649번째 염기 A, 서열번호 6의 2745번째 염기 T, 서열번호 6의 2940번째 염기 T, 서열번호 6의 2945번째 염기 G, 서열번호 6의 2977번째 염기 A, 및 서열번호 6의 3024번째 염기 A인 경우 클라비박터 미시가넨시스 아종 테셀라리우스(Clavibacter michiganensis subsp. tessellarius)로 판단하는 단계를 포함하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 테셀라리우스 동정 방법.
- 서열번호 1의 110번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 147번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 433번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 501번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 549번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 638번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 704번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 777번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 808번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1038번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1042번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1112번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1159번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1340번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1354번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1396~1397번째 염기 AC를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1454번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1584번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1836번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 1858번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2420번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2487번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2649번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2745번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2940번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2945번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 2977번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 1의 3024번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 및 이들의 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) 토마토분리균 동정용 프로브 조성물.
- 서열번호 2의 110번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 147번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 433번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 501번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 549번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 638번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 704번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 777번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 808번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1038번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1042번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1112번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1159번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1340번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1354번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1396~1397번째 염기 AC를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1454번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1584번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1836번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 1858번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2420번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2487번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2649번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2745번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2940번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2945번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 2977번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 2의 3024번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 및 이들의 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) 고추분리균 동정용 프로브 조성물.
- 서열번호 3의 110번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 147번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 433번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 501번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 549번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 638번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 704번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 777번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 808번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1038번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1042번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1112번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1159번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1206번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1340번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1354번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1396~1397번째 염기 AC를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1454번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1584번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1836번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 1858번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2420번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2487번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2649번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2745번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2940번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2945번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 2977번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 3의 3024번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 및 이들의 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 세페도니쿠스(Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus) 동정용 프로브 조성물.
- 서열번호 4의 110번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 147번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 433번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 501번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 549번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 638번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 704번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 777번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 808번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1038번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1042번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1112번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1159번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1340번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1354번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1396~1397번째 염기 TA를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1454번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1584번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1836번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 1858번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2420번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2487번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2649번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2745번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2940번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2945번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 2977번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 4의 3024번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 및 이들의 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 인시디오수스(Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus) 동정용 프로브 조성물.
- 서열번호 5의 110번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 147번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 433번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 501번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 549번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 638번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 704번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 777번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 808번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1038번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1042번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1112번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1159번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1340번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1354번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1396~1397번째 염기 AC를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1454번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1584번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1836번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 1858번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2420번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2487번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2649번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2745번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2940번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2945번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 2977번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 5의 3024번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 및 이들의 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 네브라스켄시스(Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis) 동정용 프로브 조성물.
- 서열번호 6의 110번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 147번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 433번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 501번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 549번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 638번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 704번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 777번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 808번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1038번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1042번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1112번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1159번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1340번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1354번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1396~1397번째 염기 AC를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1454번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1584번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1836번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 1858번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2420번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2487번째 염기 C를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2649번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2745번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2940번째 염기 T를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2945번째 염기 G를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 2977번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드, 서열번호 6의 3024번째 염기 A를 포함하는 20-100개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 및 이들의 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 테셀라리우스(Clavibacter michiganensis subsp. tessellarius) 동정용 프로브 조성물.
- 제7항의 프로브 조성물이 기질상에 집적되어 있는 것을 특징으로 하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) 토마토분리균 검출용 마이크로어레이.
- 제8항의 프로브 조성물이 기질상에 집적되어 있는 것을 특징으로 하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 미시가넨시스(Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) 고추분리균 검출용 마이크로어레이.
- 제9항의 프로브 조성물이 기질상에 집적되어 있는 것을 특징으로 하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 세페도니쿠스(Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus) 검출용 마이크로어레이.
- 제10항의 프로브 조성물이 기질상에 집적되어 있는 것을 특징으로 하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 인시디오수스(Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus) 검출용 마이크로어레이.
- 제11항의 프로브 조성물이 기질상에 집적되어 있는 것을 특징으로 하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 네브라스켄시스(Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis) 검출용 마이크로어레이.
- 제12항의 프로브 조성물이 기질상에 집적되어 있는 것을 특징으로 하는 클라비박터 미시가넨시스 아종 테셀라리우스(Clavibacter michiganensis subsp. tessellarius) 검출용 마이크로어레이.
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