KR20150024128A - Method for decreasing mortality rate in commercial farm piglet - Google Patents
Method for decreasing mortality rate in commercial farm piglet Download PDFInfo
- Publication number
- KR20150024128A KR20150024128A KR20130101198A KR20130101198A KR20150024128A KR 20150024128 A KR20150024128 A KR 20150024128A KR 20130101198 A KR20130101198 A KR 20130101198A KR 20130101198 A KR20130101198 A KR 20130101198A KR 20150024128 A KR20150024128 A KR 20150024128A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- fut1
- pigs
- rflp
- gene
- mortality rate
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
- C12Q1/683—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism involving restriction enzymes, e.g. restriction fragment length polymorphism [RFLP]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
- C12R2001/185—Escherichia
- C12R2001/19—Escherichia coli
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
본 발명은 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법에 관한 것으로서, 더욱 상세하게는 장관독소생산성 대장균 (Enterotoxigenic Escherichia coli F18; ETEC F18)에 저항성이 있는 돼지를 검정하여 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법에 관한 것이다.
The present invention relates to a method for reducing the mortality of a weaned pig, and more particularly to a method for reducing the mortality of the weaned pig by assaying a porcine resistant to enterotoxigenic Escherichia coli F18 (ETEC F18).
대장균은 면역력이 약한 자돈에서 대장균증을 유발하여 자돈의 생존률을 저하시키고 돼지의 생산성을 감소시키는 요인으로 작용할 수 있어 Fut1 유전자의 자돈 생존률과의 연관성에 관해 연구할 필요성이 있다. Escherichia coli may induce colicosis in pigs with weak immunity, which may reduce the survival rate of piglets and decrease the productivity of pigs. Therefore, there is a need to investigate the relationship between the piglet survival rate and Fut1 gene.
돼지 당 전이효소 유전자인 Fut1 유전자는 대장균에 대한 자돈의 저항성 및 민감성 차이를 유발시키는 유전자로서, 장내에서 독성을 가져 이유자돈의 설사병과 부종 (edema)을 야기하는 항원인 Enterotoxigenic Escherichia coli F18 (ETEC F18) 수용체의 발현을 조절하는 유전자이다. ETEC F18의 유착에 대한 감수성은 장의 상피조직에서 Fut1 유전자의 발현에 전적으로 의존하여 307 염기위치에서의 구아닌에 대한 아데닌의 대체는 103 위치에서의 알라닌에서 트레오닌으로의 아미노산 대체 결과로 나타나 Fut1 유전자의 효소 활력을 현저하게 낮춰준다.The Fut1 gene, a porcine glycoprotein gene, is a gene that induces the resistance and sensitivity difference of piglets against Escherichia coli. Enterotoxigenic Escherichia coli F18 (ETEC F18), which is toxic in the intestine and causes edema of yeast piglets, It is a gene that regulates receptor expression. The susceptibility of ETEC F18 to adhesion is entirely dependent on the expression of the Fut1 gene in the epithelial tissues of the intestine, and the substitution of adenine for guanine at the 307 base position results in the substitution of alanine to threonine for amino acid 103, Significantly lower the vitality.
그러나, 종래기술은 Fut1 유전자의 전사해독틀 307번째 염기서열에 존재하는 SNP(G/A)의 AA 유전자형이 돼지 소장 내 ETEC F18에 대한 저항성과 관련성이 있음을 나타내고 있을 뿐, Fut1 유전자의 M307 염기 다형성과 자돈 생존률의 연관성을 분석하여 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법에 관해서는 나타내고 있지 않으며 종래 돼지 육종 산업에서 Fut1 유전자를 활용한 기술의 발전이 미흡하였다.However, the prior art shows that the AA genotype of the SNP (G / A) existing in the 307th nucleotide sequence of the transcription and translation of the Fut1 gene is related to the resistance to the ETEC F18 in the small intestine, and the M307 base There is no report on the method of decreasing the mortality of weeds by analyzing the relationship between polymorphism and the survival rate of piglets, and the development of the technology using the Fut1 gene in the conventional breeding industry of pigs was insufficient.
관련 선행기술로 대한민국 등록특허 0432588호(돼지 설사병 저항성 유전자 검정방법)이 있으나 선행기술은 돼지 유행성 설사병 바이러스 및 전염성 위장염 바이러스를 감별하기 위한 프라이머를 제공하고 있을 뿐, 자돈의 불완전한 면역시스템이 발달하는 과정에서 발생하는 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법에 관해서는 개시된 바가 없다.
Korean prior art 0432588 (method for assaying resistance to pig diarrhea resistance) is known as a prior art, but the prior art provides a primer to discriminate between swine diarrhea virus and infectious gastroenteritis virus, and the development of incomplete immune system of piglets There has been no disclosure of a method for reducing the mortality of the weaning piglet that occurs in the human body.
본 발명의 목적은 돼지의 육종에 있어서 장관독소생산성 대장균 (Enterotoxigenic Escherichia coli F18; ETEC F18)에 저항성이 있는 돼지를 감별하여 조기 폐사 자돈 개체와 성공적 시판 개체 간의 Fut1 유전자의 대립유전자(allele)에 따른 생존률을 규명함으로써, 돼지 소장 내 ETEC F18에 대한 저항성 및 민감성과 관련된 Fut1의 전사해독틀 307번째 염기서열에서의 SNP를 활용하여 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법을 제공함에 있다.
It is an object of the present invention to identify pigs resistant to enterotoxigenic Escherichia coli F18 (ETEC F18) in the breeding of pigs, and to identify pigs resistant to enterotoxigenic Escherichia coli F18 (ETEC F18) according to alleles of Fut1 gene between early dead piglets and successful commercial individuals By identifying the survival rate, we provide a method for reducing the mortality of the weaned pig by utilizing the SNP in the 307th nucleotide sequence of Fut1's transcriptional translation frame related to resistance and sensitivity to ETEC F18 in the small intestine.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 돼지의 육종에 있어서, (1) 돼지의 지노믹 DNA를 분리하는 단계; (2) 상기 (1)단계에서 분리한 지노믹 DNA를 Fut1 (Alpha (1,2) fucosyltransferase) 유전자의 단일 염기 다형성 (SNP; single nucleotide polymorphism) 지역을 증폭할 수 있는 프라이머를 이용하여 PCR 증폭하는 단계; (3) 상기 (2)단계에서 증폭한 PCR 산물을 제한효소 단편 길이 다형성 (RFLP; restriction fragment length polymorphism) 분석법을 이용하여 상기 Fut1 유전자의 단일 염기 다형성 지역의 유전형질을 감별하는 단계; 및 (4) 상기 (3)단계에서 감별한 유전형질이 GG 유전자형인 돼지를 도태시키는 단계;를 포함하는 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법을 제공한다.In order to accomplish the above object, the present invention provides a method for breeding pigs, comprising the steps of: (1) separating genomic DNA of a pig; (2) The genomic DNA isolated in the above step (1) is subjected to PCR amplification using a primer capable of amplifying a single nucleotide polymorphism (SNP) region of Fut1 (Alpha (1,2) fucosyltransferase) step; (3) discriminating the genetic traits of the single nucleotide polymorphism region of the Fut1 gene using the restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of the PCR product amplified in the step (2); And (4) culling a porcine of the GG genotype of the genetic trait identified in the step (3).
상기 (2)단계에서 Fut1 유전자의 단일 염기 다형성 지역은 Fut1 유전자의 307번째 염기서열에 존재하는 것을 특징으로 한다.In step (2), the single nucleotide polymorphism region of the Fut1 gene is present in the 307th nucleotide sequence of the Fut1 gene.
상기 (2)단계에서 프라이머는 5′-CCAACGCCTCCGATTCCTGT-3′ 및 5′-GTGCATGGCAGGCTGGATGA-3′인 것을 특징으로 한다.In the step (2), the primers are 5'-CCAACGCCTCCGATTCCTGT-3 'and 5'-GTGCATGGCAGGCTGGATGA-3'.
상기 (3)단계에서 RFLP에 이용되는 제한효소는 HhaⅠ인 것을 특징으로 한다.The restriction enzyme used in RFLP in step (3) is Hha I.
상기 (4)단계에서 GG 유전자형은 117 bp 및 44 bp의 PCR-RFLP 패턴을 갖는 것을 특징으로 한다.
In step (4), the GG genotype has a PCR-RFLP pattern of 117 bp and 44 bp.
상기와 같은 본 발명에 따르면, PCR-RFLP를 이용한 Fut1 유전자의 M307 염기 다형성 분석을 통해 장관독소생산성 대장균 (Enterotoxigenic Escherichia coli F18; ETEC F18)에 저항성이 있는 돼지를 감별함으로써, 시판되는 돼지의 이유자돈 폐사율을 30 % 이상 감소시키고, 농장의 이유자돈 폐사율을 감소시켜 농장 돼지의 육종에 기여하고 농장에서의 이유자돈 폐사로 기인하는 시간적, 금전적 손실을 감소시킬 수 있는 효과가 있다.
According to the present invention as described above, M307 of Fut1 gene using PCR-RFLP By differentiating pigs resistant to Enterotoxigenic Escherichia coli F18 (ETEC F18) by baseline polymorphism analysis, it is possible to reduce the mortality rate of pigs by 30% or more, reduce the mortality rate of farms, It contributes to breeding and can reduce the time and money losses caused by weaning pigs on farms.
도 1은 HhaⅠ으로 처리된 Fut1 유전자 M307 위치에서의 PCR-RFLP 패턴 (Lane M : size maker, 1 : GG, 2 : AG, 3 : AA, 4 : uncut, 5 : negative control).1 shows the PCR-RFLP pattern (Lane M: size maker, 1: GG, 2: AG, 3: AA, 4: uncut, 5: negative control) at the position of Fut1 gene M307 treated with Hha I.
이하, 본 발명을 상세히 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in detail.
본 발명은 돼지의 육종에 있어서 시판되는 돼지의 Fut1 유전자 ORF(open reading frame) 307번째 염기 위치에서의 단일 염기 다형성(SNP)을 제한효소 처리에 의한 DNA 절편 길이 차이를 이용하여 분석함으로써, 장관독소생산성 대장균(ETEC F18)에 저항성이 있는 돼지를 감별하여 이유자돈 폐사율을 감소시키는 데 활용하는 방법에 관한 것이다.In the present invention, single base polymorphism (SNP) at the 307th base position of Fut1 gene open reading frame (ORF) of pigs commercially available in pigs is analyzed by using DNA fragment length difference by restriction enzyme treatment, The present invention relates to a method for distinguishing pigs resistant to productive Escherichia coli (ETEC F18) to reduce the mortality of weaning pigs.
본 발명은 돼지의 육종에 있어서, (1) 돼지의 지노믹 DNA를 분리하는 단계; (2) 상기 (1)단계에서 분리한 지노믹 DNA를 Fut1 (Alpha (1,2) fucosyltransferase) 유전자의 단일 염기 다형성 (SNP; single nucleotide polymorphism) 지역을 증폭할 수 있는 프라이머를 이용하여 PCR 증폭하는 단계; (3) 상기 (2)단계에서 증폭한 PCR 산물을 제한효소 단편 길이 다형성 (RFLP; restriction fragment length polymorphism) 분석법을 이용하여 상기 Fut1 유전자의 단일 염기 다형성 지역의 유전형질을 감별하는 단계; 및 (4) 상기 (3)단계에서 감별한 유전형질이 GG 유전자형인 돼지를 도태시키는 단계;를 포함하는 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법을 제공한다.The present invention relates to a method for breeding pigs, comprising the steps of: (1) separating the genomic DNA of a pig; (2) The genomic DNA isolated in the above step (1) is subjected to PCR amplification using a primer capable of amplifying a single nucleotide polymorphism (SNP) region of Fut1 (Alpha (1,2) fucosyltransferase) step; (3) discriminating the genetic traits of the single nucleotide polymorphism region of the Fut1 gene using the restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of the PCR product amplified in the step (2); And (4) culling a porcine of the GG genotype of the genetic trait identified in the step (3).
상기 (1)단계에서 지노믹 DNA는 세포 핵, 예를 들어 백혈구 세포, 모낭, 귀 절흔 및 근육을 포함하는 모든 조직 공급원으로부터 얻어 제조될 수 있다.In step (1), the genomic DNA can be obtained from all tissue sources including cell nuclei, such as leukocyte cells, hair follicles, ear cusps and muscle.
상기 (2)단계에서 Fut1 유전자의 단일 염기 다형성 지역은 Fut1 유전자의 307번째 염기서열에 존재하여 제한효소 단편 길이 다형성 분석법을 이용하여 Fut1 유전자의 307번째 염기서열에 존재하는 단일 염기 다형성 지역의 유전형질을 감별하는 것이 바람직하다.In step (2), the single nucleotide polymorphism region of the Fut1 gene is present in the 307th nucleotide sequence of the Fut1 gene, and the genotype of the single nucleotide polymorphic region present in the 307th nucleotide sequence of the Fut1 gene using the restriction fragment length polymorphism analysis . ≪ / RTI >
상기 (2)단계에서 프라이머는 5′-CCAACGCCTCCGATTCCTGT-3′ 및 5′-GTGCATGGCAGGCTGGATGA-3′인 것이 바람직하다.In the step (2), the primers are preferably 5'-CCAACGCCTCCGATTCCTGT-3 'and 5'-GTGCATGGCAGGCTGGATGA-3'.
상기 (3)단계에서 RFLP에 이용되는 제한효소는 HhaⅠ인 것이 바람직하다.The restriction enzyme used in RFLP in step (3) is preferably Hha I.
상기 (4)단계에서 GG 유전자형은 117 bp 및 44 bp의 PCR-RFLP 패턴을 갖는다.In step (4), the GG genotype has a PCR-RFLP pattern of 117 bp and 44 bp.
본 발명에 따른 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법을 통해 AA 또는 AG 유전자형을 가진 개체를 종돈 육성에 활용하고 GG 유전자형을 가진 개체를 도태시킴으로써 현재의 자돈 폐사율을 30 % 이상 감소시킬 것으로 판단된다.The method of reducing the mortality of the weeds according to the present invention is considered to reduce the current poultry mortality rate by more than 30% by using the individuals having the AA or AG genotype in the breeding of the breeding stock and culling the individuals having the GG genotype.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 예시하기 위한 것으로서, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것으로 해석되지 않는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. It is to be understood by those skilled in the art that these embodiments are merely illustrative of the present invention and that the scope of the present invention is not construed as being limited by these embodiments.
실시예 1. 지노믹 DNA 분리Example 1. Genomic DNA Isolation
이표한 후에 얻은 돼지의 귀 조직으로부터 지노믹 DNA를 분리하기 위해 25 : 24 : 1의 부피비를 갖는 페놀/클로로폼/이소아밀알코올 (phenol/chloroform/isoamylalcohol; PCI) 용액을 이용하였다. A phenol / chloroform / isoamylalcohol (PCI) solution with a volume ratio of 25: 24: 1 was used to separate the genomic DNA from the ear tissue of the pigs obtained after the labeling.
귀 조직들을 적당한 크기로 잘라 용해 버퍼 (lysis buffer)에 넣고 proteinase K를 첨가하여 55 ℃에서 6 시간 동안 용해시킨 다음, PCI 용액을 첨가하여 원심분리하였다. 상층액으로부터 알코올 침전을 통해 지노믹 DNA를 침전시키고 그 펠렛을 농도가 75 %인 에탄올로 세척한 후 공기로 건조하고 3차 증류수에 녹여 지노믹 DNA를 얻었다.
The ear tissues were cut to a suitable size, placed in a lysis buffer, added with proteinase K, dissolved at 55 ° C for 6 hours, and then PCI solution was added and centrifuged. The genomic DNA was precipitated from the supernatant through alcohol precipitation, and the pellet was washed with ethanol having a concentration of 75%, dried with air and dissolved in tertiary distilled water to obtain genomic DNA.
실시예 2. PCR 증폭Example 2. PCR amplification
PCR 증폭을 위한 프라이머는 5′-CCAACGCCTCCGATTCCTGT-3′ 및 5′-GTGCATGGCAGGCTGGATGA-3′을 이용하였다.Primers for PCR amplification were 5'-CCAACGCCTCCGATTCCTGT-3 'and 5'-GTGCATGGCAGGCTGGATGA-3'.
PCR 증폭을 위한 반응액은 PCR 버퍼 (10mM Tris, pH 8.3; 50mM KCl; 1.5mM MgCl), 200μM dNTPs, 0.3μM 프라이머, 0.5 unit SuperthermTM DNA 폴리머레이즈 (JMR holdings, UK) 및 50~100ng DNA를 함께 총 부피 15μl로 조성하였다. 반응조건은 유전자증폭기 (Thermocycler 3000, Biometra, Germany)를 사용하여 95 oC에서 5분간 예열한 후, 94 oC에서 45초간 변성, 60 oC에서 45초간 중합 및 72 oC에서 45초간 신장 반응을 총 35회 반복한 다음, 마지막으로 72 oC에서 7분간 가열한 후 PCR 반응을 종료하였다.
The reaction solution for PCR amplification was prepared by adding PCR buffer (10 mM Tris, pH 8.3; 50 mM KCl; 1.5 mM MgCl 2), 200 μM dNTPs, 0.3 μM primer, 0.5 unit Supertherm ™ DNA polymerase (JMR holdings, UK) Together with a total volume of 15 μl. The reaction conditions were pre-heated at 95 ° C for 5 min using a gene amplifier (Thermocycler 3000, Biometra, Germany), denaturated at 94 ° C for 45 sec, polymerized at 60 ° C for 45 sec and elongated at 72 ° C for 45 sec Was repeated 35 times in total, and finally the PCR reaction was terminated after heating at 72 ° C for 7 minutes.
실시예 3. RFLP 분석Example 3. Analysis of RFLP
Fut1 유전자의 ORF(open reading frame) 307번째 염기서열에 위치한 G/A SNP를 RFLP로 분석하기 위해 제한효소 HhaI을 사용하였다.The restriction enzyme HhaI was used to analyze the G / A SNP located in the 307th open reading frame (ORF) sequence of Fut1 gene by RFLP.
7μl의 PCR 산물에 10 U의 HhaI (New England Biolabs, USA)을 넣어 총 부피 15μl로 37 oC에서 3 시간 동안 반응시킨 다음, ethidium bromide (EtBr)로 염색한 4% 메타포 아가로즈 겔(metaphor agarose gel)에서 전기영동을 통해 RFLP 패턴을 확인하였다(도 1 참조).
The reaction mixture was reacted at 37 ° C for 3 hours in a total volume of 15 μl with 10 U of HhaI (New England Biolabs, USA) in 7 μl of the PCR product. The reaction was then repeated with a 4% metaphor agarose gel stained with ethidium bromide (EtBr) gel). The RFLP pattern was confirmed by electrophoresis (see FIG. 1).
실험예.Experimental example.
Fut1 유전자와 농장에서 이유자돈의 사망률과의 연관성을 분석하기 위해 A종돈 사업소의 협조를 받아 "조기폐사 자돈개체" 252두와 "성공적 시판개체" 254두의 두 집단에 대한 시료를 제공받아 본 발명에 따른 PCR-RFLP 분석을 통한 Fut1 유전자의 307 염기 위치에 대한 염기 다형성을 분석하였다.In order to analyze the association between Fut1 gene and the death rate of the weaned pigs in the farm, we received samples from two groups of "Early-dead Pond" 252 individuals and "Successful commercial individuals" And the nucleotide polymorphisms of the Fut1 gene at 307 bases were analyzed by PCR-RFLP analysis.
그 결과, 생존 집단의 경우 유전자형별로 AA=13.4%, GA=40.2%, GG=46.5%로 나타났고, 폐사 집단의 경우 AA=2.8%, GA=26.6%, GG=70.6%로 나타났다. 생존돈의 경우 AA가 많고 GG가 적으며 폐사돈의 경우 AA가 적고 GG가 높게 나타남을 알 수 있었다. 또한, 이형접합자인 GA의 경우도 생존돈에서 훨씬 많이 나타남을 알 수 있었다. 이는 자돈 설사에 저항성을 보이는 A 염기를 가지는 대립유전자의 빈도가 생존돈에서 훨씬 높음을 나타낸다.As a result, AA = 13.4%, GA = 40.2% and GG = 46.5% in the survival group and AA = 2.8%, GA = 26.6% and GG = 70.6%, respectively. In the case of survival money, AA and GG were low, and AA was low and GG was high. Also, GA, a heterozygote, was found to be much higher in survival rate. This indicates that the frequency of the allele with the A base, which is resistant to the parasitic diarrhea, is much higher than the survival rate.
상기와 같은 결과의 구체적인 분석을 위해 생존율 통계를 분석한 결과, AA 유전자형을 가졌을 때 GA 유전자형을 가졌을 때보다 3.19배 생존율이 높으며, AA 유전자형의 경우 GG 유전자형의 경우보다 7.33배 생존율이 높고, GA 유전자형은 GG 유전자형과 비교하였을 때 2.3배 생존율이 높았다.For the analysis of the above results, the survival rate was analyzed and it was found that the survival rate was 3.19 times higher when the AA genotype was compared with the GA genotype. The AA genotype had a higher survival rate 7.33 times than the GG genotype, Were 2.3 times more likely to survive when compared to the GG genotype.
대한한돈협회의 2012년 전국 양돈농가 경영실태조사 보고서에 의하면, 표 4와 같이 2012년 사고 및 폐사율이 심한 단계는 이유자돈 단계로서 54.34 %로 대부분의 폐사가 이유자돈시기에 집중되는 것을 알 수 있다. According to the report of the National Association of Poultry Farmers in 2012, the most severe accidents and mortality rates in 2012 are 54.34% as shown in Table 4, indicating that most of the deaths are concentrated in the poverty line.
또한, 농가규모별 사고 및 폐사율도 마찬가지로 표 5에서 보는 바와 같이 이유자돈이 가장 높고 비육기간이 가장 낮게 조사되었으며, 이유자돈 시기는 5,000두 이상에서 43.97 %, 2,000두 미만에서 61.06 %로 가장 높았다. 이유자돈 시기에서의 폐사율은 전체 규모 평균적으로 51.36 %이었다. In addition, the accidents and mortality rates by farm size were the highest as shown in Table 5, with the highest value of weaned pigeon and the lowest value of the fattening period, with 43.97% in the over 5,000 dogs and 61.06% in the dogs below 2,000 dogs. The mortality rate during the weaning period was 51.36% on average.
본 발명에 따른 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법을 돼지 육종에 적용할 경우, 표 3의 이유자돈 생존율 통계에 근거한 이유자돈의 폐사율 변화는 전체 규모 평균 51.36 % (2012년도 기준)에서 35.95 %로 15.04 %가 감소될 것으로 예측된다.When the method of reducing the mortality of the piglets according to the present invention is applied to the pig breeding, the change in the mortality rate of the piglet piglets based on the weaning pig survival rate statistics in Table 3 is reduced from 15.34% to 35.95% .
이상, 본 발명내용의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서, 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 실시태양일 뿐이며, 이에 의해 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백할 것이다. 따라서 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항들과 그것들의 등가물에 의해 정의된다고 할 것이다.
Having described specific portions of the present invention in detail, it will be apparent to those skilled in the art that this specific description is only a preferred embodiment and that the scope of the present invention is not limited thereby. It will be obvious. Accordingly, the actual scope of the present invention will be defined by the appended claims and their equivalents.
Claims (5)
(1) 돼지의 지노믹 DNA를 분리하는 단계;
(2) 상기 (1)단계에서 분리한 지노믹 DNA를 Fut1 (Alpha (1,2) fucosyltransferase) 유전자의 단일 염기 다형성 (SNP; single nucleotide polymorphism) 지역을 증폭할 수 있는 프라이머를 이용하여 PCR 증폭하는 단계;
(3) 상기 (2)단계에서 증폭한 PCR 산물을 제한효소 단편 길이 다형성 (RFLP; restriction fragment length polymorphism) 분석법을 이용하여 상기 Fut1 유전자의 단일 염기 다형성 지역의 유전형질을 감별하는 단계; 및
(4) 상기 (3)단계에서 감별한 유전형질이 GG 유전자형인 돼지를 도태시키는 단계;
를 포함하는 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법.
In the breeding of pigs,
(1) separating the genomic DNA of the pig;
(2) The genomic DNA isolated in the above step (1) is subjected to PCR amplification using a primer capable of amplifying a single nucleotide polymorphism (SNP) region of Fut1 (Alpha (1,2) fucosyltransferase) step;
(3) discriminating the genetic traits of the single nucleotide polymorphism region of the Fut1 gene using the restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of the PCR product amplified in the step (2); And
(4) culling the pig having the GG genotype of the genetic trait discriminated in the step (3);
To reduce the mortality of the piglets.
상기 (2)단계에서 Fut1 유전자의 단일 염기 다형성 지역은 Fut1 유전자의 307번째 염기서열에 존재하는 것을 특징으로 하는 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법.
The method according to claim 1,
Wherein the single nucleotide polymorphic region of the Fut1 gene in the step (2) is present in the 307th nucleotide sequence of the Fut1 gene.
상기 (2)단계에서 프라이머는 5′-CCAACGCCTCCGATTCCTGT-3′ 및 5′-GTGCATGGCAGGCTGGATGA-3′인 것을 특징으로 하는 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법.
The method according to claim 1,
Wherein the primer in step (2) is 5'-CCAACGCCTCCGATTCCTGT-3 'and 5'-GTGCATGGCAGGCTGGATGA-3'.
상기 (3)단계에서 RFLP에 이용되는 제한효소는 HhaⅠ인 것을 특징으로 하는 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법.
The method according to claim 1,
Wherein the restriction enzyme used in RFLP in step (3) is Hha I.
상기 (4)단계에서 GG 유전자형은 117 bp 및 44 bp의 PCR-RFLP 패턴을 갖는 것을 특징으로 하는 이유자돈의 폐사율을 감소시키는 방법.
The method according to claim 1,
Wherein the GG genotype has a PCR-RFLP pattern of 117 bp and 44 bp in step (4).
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR20130101198A KR20150024128A (en) | 2013-08-26 | 2013-08-26 | Method for decreasing mortality rate in commercial farm piglet |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR20130101198A KR20150024128A (en) | 2013-08-26 | 2013-08-26 | Method for decreasing mortality rate in commercial farm piglet |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| KR20150024128A true KR20150024128A (en) | 2015-03-06 |
Family
ID=53020910
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| KR20130101198A KR20150024128A (en) | 2013-08-26 | 2013-08-26 | Method for decreasing mortality rate in commercial farm piglet |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| KR (1) | KR20150024128A (en) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN107699624A (en) * | 2017-10-25 | 2018-02-16 | 上海交通大学 | The SNP marker of little MeiShan pig and raw meat product combines and authentication method |
-
2013
- 2013-08-26 KR KR20130101198A patent/KR20150024128A/en not_active Application Discontinuation
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN107699624A (en) * | 2017-10-25 | 2018-02-16 | 上海交通大学 | The SNP marker of little MeiShan pig and raw meat product combines and authentication method |
| CN107699624B (en) * | 2017-10-25 | 2021-06-29 | 上海交通大学 | SNP marker combination and identification method of small plum mountain pigs and raw meat products |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN109943646B (en) | Method for CNV molecular marker of cattle PLAG1 gene and application thereof | |
| Yilmaz et al. | Polymorphism of the ovine calpastatin gene in some Turkish sheep breeds | |
| CN109694906B (en) | Specific molecular marker for identifying sex of eriocheir sinensis | |
| KR101474284B1 (en) | Microsatellite Marker for individualization in Korean native chicken and individualizing Method Using the Same | |
| Riaz et al. | Molecular marker assisted study of kappa-casein gene in Nili-Ravi (buffalo) breed of Pakistan | |
| CN107828902B (en) | SNP molecular marker related to sheep tail length and application thereof | |
| Hossain et al. | Association of GDF9 gene polymorphisms with litter size in indigenous sheep of Bangladesh | |
| CN110079613B (en) | Molecular marker of heat stress tolerance of Holstein cattle and detection method | |
| KR20150024128A (en) | Method for decreasing mortality rate in commercial farm piglet | |
| CN113817841B (en) | SNP (Single nucleotide polymorphism) marker primer pair related to swine nipple number traits and application thereof | |
| Basavaraju et al. | Genetic diversity in common carp stocks assayed by random‐amplified polymorphic DNA markers | |
| Engle et al. | Genome-wide association study for stayability measures in Nellore-Angus crossbred cows | |
| CN102181582B (en) | Method for detecting classical swine fever resistance character of swine and special kit thereof | |
| RU2703396C2 (en) | Diagnostic technique for polymorphism of genes agrn, isg15 and hes4 causing lethal genetic defect of multiple arthrogryposis of cattle meat breeds | |
| RU2673746C1 (en) | Method for diagnostics of cow immunity to mastitis | |
| Sharma et al. | Polymorphism study of BMPR-1B and BMP-15 genes in Berari goats | |
| Fadhil et al. | Molecular characterization of mx gene polymorphism in gerze chicken breed and pure line chicken breed | |
| KR101953840B1 (en) | The primer set of RFLP methods for determining Apis mellifera species using analysis of single nucleotide polymorphism | |
| CN109628607B (en) | SNP marker related to digestibility of Suhuai pig neutral detergent fiber and application thereof | |
| KR20130050832A (en) | Methods of genetic characteristics and cumulative power of discrimination in korean native chicken and korean native commercial chicken | |
| CN108165640B (en) | SNP locus related to resistance or susceptibility of diarrhea of suckling piglet and molecular marker detection and application | |
| CN107760792B (en) | SNP marker of goat NOD1 gene and application | |
| Ramesha et al. | Status of genetic disorders among indigenous and crossbred breeding bulls in India | |
| Thilakarathna et al. | Use of molecular biology techniques for animal identification and traceability | |
| Hussain et al. | Characterization of interferon alpha of major histocompatibility complex class I in Punjab urial (Ovis vignei punjabiensis) |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A201 | Request for examination | ||
| E902 | Notification of reason for refusal | ||
| E601 | Decision to refuse application |