KR20120079281A - A novel flavimycin compound having peptide deformylayse inhibition and antibacterial activity - Google Patents

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Abstract

PURPOSE: A novel flavimycin compound and an antibacterial composition containing the same are provided to treat infectious diseases by superbacteria. CONSTITUTION: An antibacterial composition contains a compound of chemical formula 1 or 2, or isomer, derivative, or pharmaceutically acceptable salt thereof. The compound is prepared from Aspergillus flavipes F020543 strain(KCTC 10880BP). The composition has an antibacterial activity against Staphylococus aureus, Bacillus subtilis, Staphylococcus epidermis, methicillin-resistant Staphylococcus aureus(MRSA), or quinolone-resistant Staphylococcus aureus(QRSA). A composition for suppressing peptide diformylase activity contains the compound of chemical formula 1 or 2. A method for preparing the compound of chemical formula 1 or 2 comprises: a step of culturing Aspergillus flavipes F020543 strain(KCTC 10880BP) or mutant strain thereof; a step of extracting the strain culture liquid and mycelium with an organic solvent; and a step of performing chromatography of the ethyl acetate extract.

Description

펩티드 디포밀라제 저해 및 항균 활성을 갖는 신규한 프라비마이신 화합물{A novel flavimycin compound having peptide deformylayse inhibition and antibacterial activity}A novel flavimycin compound having peptide deformylayse inhibition and antibacterial activity

본 발명은 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 신규한 프라비마이신 화합물, 이를 유효성분으로 포함하는 항균용 조성물, 펩티드 디포밀라제 활성 억제용 조성물 및 아스퍼질러스 프라빕스F020543 균주를 이용하여 상기 화합물을 제조하는 방법에 관한 것이다.
The present invention uses the novel pravimycin compound represented by the formula (1) or (2), an antimicrobial composition comprising the same as an active ingredient, a composition for inhibiting peptide deformillase activity, and an Aspergillus prabibs F020543 strain. It relates to a manufacturing method.

1990년 중반부터 시작한 병원 미생물 유전체 연구 결과, 새로운 항생제 표적이 발굴되어 새로운 개념의 항생제 개발 가능성을 열어주고 있다. 미생물 유전체 정보를 활용하여 발굴 검증된 새로운 항생제 표적 중의 하나로서 단백질 생합성효소인 펩티드 디포밀라제(Pepetide deformylase; PDF)가 있다. 세균이 단백질 합성을 위해 tRNA에 메티오닌이 결합된 후 트랜스포밀라제(transformylase)에 의해 포르밀화(formylation) 되고, 단백질 합성이 완료된 후 PDF에 의해 포르밀(formyl)기가 떨어지면서 활성 단백질이 된다. 이와 같이, PDF는 세균의 생육에 필수적인 효소이면서 대부분의 병원균에 존재하고, 항균 스펙트럼도 광범위한 스펙트럼(broad spectrum)을 나타내는 훌륭한 항생제 표적이다. 또한, 사람에서는 미토콘드리아에서 유사한 유전자가 존재하나 아무런 기능을 하지 않는 것으로 밝혀져 사람에 대한 독성이 낮은 것으로 알려져 있다(Drug Discovery Today 6(18) 954-961, 2001).Hospital microbial genome research, which began in the mid-1990s, has uncovered new antibiotic targets, opening up the possibility of developing new concepts. One of the new antibiotic targets identified and validated using microbial genome information is the protein biosynthetic peptide Peformide deformylase (PDF). Bacteria are bound to tRNA for protein synthesis, and then formylated by transformylase. After protein synthesis is completed, formyl groups drop by PDF to become active proteins. As such, PDF is an enzyme that is essential for bacterial growth and is present in most pathogens, and the antimicrobial spectrum is a good antibiotic target with a broad spectrum. In addition, in humans, similar genes are present in mitochondria but are found to have no function and are known to be low in human toxicity (Drug Discovery Today 6 (18) 954-961, 2001).

또한, PDF는 말라리아를 일으키는 열대 열원충(Plasmodium falciparum)과 같은 Apicomplexa에 존재하는 것으로 알려져 있다. 실제로 기존의 PDF 저해제인 악티노인(actinonin)이 열대 열원충의 생육을 저해하는 것으로 보고되어 PDF 저해제는 말라리아 치료제로서도 유망하다.
PDFs are also known to exist in Apicomplexa, such as the Plasmodium falciparum, which causes malaria. In fact, the existing PDF inhibitor actinonin (actinonin) has been reported to inhibit the growth of tropical heat worms, PDF inhibitor is also promising as a treatment for malaria.

지금까지 알려진 PDF 저해제로는 하이드록사메이트(hydroxamate) 작용기를 가진 펩티드 화합물인 악티노인과 다국적 제약회사인 노바티스사가 개발하여 임상 1상 중에 있는 역-하이드록사메이트(reverse hydroxamate) 작용기를 가진 악티논(actinone) 유도체 화합물인 LBM-415와 BB-83698 화합물 등이 알려져 있다(Curr. Med. Chem. 12: 1607-1621, 2005). The known PDF inhibitors include actinone, a peptide compound with hydroxamate functional groups, and actinone, a reverse hydroxamate functional group, developed by the multinational pharmaceutical company Novartis, actinone) derivative compounds LBM-415 and BB-83698 are known (Curr. Med. Chem. 12: 1607-1621, 2005).

그러나, 상기 화합물들은 인-비트로(in vitro) 항균 활성은 좋지만, 펩티드 화합물이기 때문에 인체 흡수와 인체 내에서의 안정성에 대한 문제점을 가지고 있다.
However, the compounds have good in vitro antimicrobial activity, but because they are peptide compounds, they have problems with human absorption and stability in the human body.

이에, 본 발명자들은 미생물의 대사산물로부터 PDF의 활성을 저해하는 물질을 개발하기 위해 예의 노력한 결과, PDF를 강하게 억제하는 물질을 생산하는 곰팡이를 발견하고 생산 균주의 미생물학적 특성을 규명함과 동시에 그 균주의 배양액으로부터 새로운 PDF 활성 저해 물질을 순수하게 분리 정제한 후, 화학구조를 결정하고 활성을 검토 확인함으로써, 본 발명을 완성하였다.
Accordingly, the present inventors have made diligent efforts to develop a substance which inhibits the activity of PDF from the metabolite of a microorganism. As a result, the present inventors have found a fungus producing a substance that strongly inhibits the PDF, and at the same time, characterized the microbiological characteristics of the producing strain. The present invention was completed by purely separating and purifying new PDF activity inhibitory substance from the culture medium of the strain, and then determining the chemical structure and examining and confirming the activity.

본 발명의 목적은 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 화합물, 그의 이성질체, 유도체 또는 약학적으로 허용가능한 염을 포함하는 항균용 조성물을 제공하는 것이다.It is an object of the present invention to provide an antimicrobial composition comprising a compound represented by Formula 1 or Formula 2, an isomer thereof, a derivative thereof or a pharmaceutically acceptable salt thereof.

본 발명의 다른 목적은 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 화합물을 포함하는 펩티드 디포밀라제 활성 억제용 조성물을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a composition for inhibiting peptide deformylase activity, which comprises a compound represented by Formula 1 or Formula 2.

본 발명의 또 다른 목적은 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 화합물을 유효성분으로 포함하는 항균용 의약외품 조성물을 제공하는 것이다.Another object of the present invention to provide an antimicrobial composition for antimicrobial comprising a compound represented by the formula (1) or (2) as an active ingredient.

본 발명의 또 다른 목적은 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 화합물을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a compound represented by the formula (1) or (2).

본 발명의 또 다른 목적은 상기 화합물의 생산방법을 제공하는 것이다.
Another object of the present invention is to provide a method for producing the compound.

상기의 목적을 달성하기 위하여, 하나의 양태로서 본 발명은 하기 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 화합물, 그의 이성질체, 유도체 또는 약학적으로 허용가능한 염을 포함하는 항균용 조성물을 제공한다.
In order to achieve the above object, the present invention as one embodiment provides an antimicrobial composition comprising a compound represented by the following formula (1) or (2), isomers, derivatives or pharmaceutically acceptable salts thereof.

[화학식 1 : 프라비마이신 A][Formula 1: Pravimycin A]

Figure pat00001

Figure pat00001

[화학식 2 : 프라비마이신 B][Formula 2: Prabimycin B]

Figure pat00002

Figure pat00002

본 발명의 화합물은 프라비마이신 A 및 B 뿐만 아니라, 그의 이성질체, 유도체 또는 약학적으로 허용가능한 염을 포함한다. 상기 프라비마이신 화합물은 본 발명자들에 의해 새롭게 발견 및 동정된 화합물로서, 우수한 항균활성을 나타낸다.Compounds of the present invention include prabimycin A and B, as well as isomers, derivatives or pharmaceutically acceptable salts thereof. The prabimycin compound is a newly discovered and identified compound by the present inventors, and exhibits excellent antimicrobial activity.

본 발명에서, '이성질체'란 화학식은 같으나 동일하지는 않은 화합물의 관계를 의미하며, 이러한 이성질체의 종류에는 구조 이성질체, 기하 이성질체, 광학 이성질체 및 기하 이성질체가 있다. 입체이성질체란, 동일한 화학적 구성을 갖지만, 공간 중에서 원자 또는 기의 배열의 측면에서 상이한 화합물 의미하고, 광학 이성질체(거울상 이성질체)는 서로 겹치지 않는 거울상을 갖는 한 화합물의 두 입체이성질체를 의미하며, 부분입체이성질체는 둘 이상의 비대칭 중심을 가지고 그것의 분자들이 서로 거울상이 아닌 입체이성질체를 의미한다.In the present invention, the 'isomer' refers to a relationship between compounds having the same chemical formula but not identical, and the kind of such isomers includes structural isomers, geometric isomers, optical isomers, and geometric isomers. A stereoisomer means a compound having the same chemical composition but different in terms of the arrangement of atoms or groups in space, and an optical isomer (enantiomer) means two stereoisomers of a compound having mirror images that do not overlap each other, and diastereomers Isomers refer to stereoisomers that have two or more asymmetric centers and whose molecules are not mirror images of each other.

본 발명에서, "유도체"는 프라비마이신 A 또는 B 화합물의 구조 일부를 다른 원자나 원자단으로 치환하여 얻어지는 화합물을 의미하며, "약학적으로 허용가능한 염"은 화합물의 상대적으로 무독성인 무기 및 유기산 부가염을 의미한다.In the present invention, "derivative" means a compound obtained by substituting a part of the structure of a prabimycin A or B compound with another atom or group of atoms, and a "pharmaceutically acceptable salt" means a relatively non-toxic inorganic and organic acid of the compound. It means addition salt.

본 발명의 화합물은 우수한 펩티드 디포밀라제 저해 활성을 갖는다. 본 발명의 일 실시예에서는, 예시적으로 주요 병원균인 스타필로코커스 아우레우스의 펩티드 디포밀라제(PDF)에 대한 프라비마이신 A 및 B의 효소 저해능을 측정하였고, 그 결과, 프라비마이신 A 및 B의 IC50은 각각 35.8μM 및 32.1μM로서 PDF 활성을 강하게 억제시킴을 확인할 수 있었다(실시예 3 및 표 3). 이와 같은 결과는, 본 발명의 화합물이 항균용 조성물로 사용될 수 있음을 뒷받침하는 것이다.The compounds of the present invention have excellent peptide deformillase inhibitory activity. In one embodiment of the present invention, the enzyme inhibitory ability of prabimycin A and B against peptide deformillase (PDF) of Staphylococcus aureus, an exemplary major pathogen, was measured. As a result, prabimycin A was measured. IC 50 of B and 35.8μM and 32.1μM, respectively, it was confirmed that strongly inhibit the PDF activity (Example 3 and Table 3). These results support that the compound of the present invention can be used as an antimicrobial composition.

또한, 본 발명의 화합물은 PDF의 활성을 강하게 저해하므로 열대열원충(Plasmodium falciparum) 등에 의해 유발되는 말라리아의 예방 또는 치료용으로 유용하게 사용할 수 있다.In addition, since the compound of the present invention strongly inhibits the activity of PDF, it can be usefully used for the prevention or treatment of malaria caused by Plasmodium falciparum.

본 발명의 화합물은 당업계에서 통상적으로 사용되는 방법에 따라 합성할 수 있으며, 균주로부터 생산되는 천연 화합물로서 수득할 수도 있다. 본 발명의 화합물은 바람직하게는 아스퍼질러스 프라빕스(Aspergillus flavipes ) 균주로부터 생산할 수 있으며, 보다 바람직하게는 아스퍼질러스 프라빕스F020543 균주(수탁번호 : KCTC 10880BP)로부터 생산할 수 있다.
The compounds of the present invention can be synthesized according to methods commonly used in the art, and can also be obtained as natural compounds produced from strains. The compound of the present invention is preferably Aspergillus flavipes ) , and more preferably from the Aspergillus prabib F020543 strain (Accession Number: KCTC 10880BP).

다른 하나의 양태로서, 본 발명은 본 발명의 항균용 조성물을 병원성 미생물 또는 내성균에 의한 감염성 질환이 발병한 개체에게 투여하는 단계를 포함하는 병원성 미생물 또는 내성균에 의한 감염성 질환의 치료방법을 제공한다.As another aspect, the present invention provides a method for treating an infectious disease caused by a pathogenic microorganism or resistant bacteria, comprising administering the antimicrobial composition of the present invention to a subject having an infectious disease caused by the pathogenic microorganism or resistant bacteria.

본 발명에서 용어, "치료"란 약학 조성물의 투여에 의해 병원성 미생물 또는 내성균에 의한 감염성 질환에 의한 증세가 호전되거나 이롭게 변경하는 모든 행위를 의미하며, 본 발명에서 용어, "개체"란 병원성 미생물 또는 내성균에 의한 감염성 질환이 발병하였거나 발병할 수 있는 인간을 포함한 모든 동물을 의미하고, 본 발명의 약학 조성물을 개체에게 투여함으로써, 상기 질환을 효과적으로 치료할 수 있다.As used herein, the term "treatment" means any action that improves or advantageously changes the symptoms caused by an infectious disease caused by a pathogenic microorganism or a resistant bacterium by administration of a pharmaceutical composition. In the present invention, the term "individual" refers to a pathogenic microorganism or Means all animals, including humans that have developed or can infect infectious diseases caused by resistant bacteria, and by administering the pharmaceutical composition of the present invention to an individual, the disease can be effectively treated.

본 발명에 있어서, 상기 병원성 미생물은 동식물의 생체에 침입하여 기생하면서 병을 일으키거나 위해를 주는 모든 미생물로서, 그람 양성균 및 그람 음성균의 세균, 효모 및 진균을 포함하고, 바람직하게는 스타필로코커스 아우레우스, 스타필로코커스 에피더미스, 바실러스 서브틸리스 또는 칸디다 알비칸스 일 수 있다.In the present invention, the pathogenic microorganisms are all microorganisms that cause disease or harm while invading the living organisms of animals and plants, and include bacteria, yeasts and fungi of Gram-positive bacteria and Gram-negative bacteria, preferably Staphylococcus aureus. Reus, Staphylococcus epidermis, Bacillus subtilis or Candida albicans.

본 발명에 있어서, 상기 내성균은 임의의 질환 및 이의 합병증 또는 임의의 박테리아성 장애 및 이의 합병증을 치료 또는 예방하기 위하여 약물을 지속적으로 사용한 결과, 해당 세균이 항생제에 대한 저항성을 나타내는 것을 의미한다. 상기 항생제의 예로는 세팔로스포린, 퀴놀론 및 플루오로퀴놀론, 페니실린, 베타 락타마제 억제제, 카르베페넴, 모노박탐, 마크롤리드 및 린코사민, 글리코펩티드, 리팜핀, 옥사졸리디논, 테트라사이클린, 아미노글리코시드, 스트렙토그라민 및 술폰아미드 등이 있으며, 항생제 내성균은 상기 열거된 항생제를 처리하는 경우에도 저항성을 나타내어 개체에서 지속적으로 질환이 유지되며, 바람직하게는 MRSA(methicillin-resistant Staphylococcus aureus) 또는 QRSA(Quinolone-resistant Staphylococcus aureus) 일 수 있다.In the present invention, the resistant bacteria means that the bacterium exhibits resistance to antibiotics as a result of continuous use of the drug to treat or prevent any disease and its complications or any bacterial disorders and complications thereof. Examples of such antibiotics include cephalosporins, quinolones and fluoroquinolones, penicillins, beta lactamase inhibitors, carbepenems, monobactams, macrolides and lincosamines, glycopeptides, rifampins, oxazolidinones, tetracyclines, aminoglycoses Seeds, streptogramamine and sulfonamides, and antibiotic-resistant bacteria are resistant even when the antibiotics listed above are treated, so that the disease is maintained continuously in the subject, preferably MRSA (methicillin-resistant Staphylococcus aureus) or QRSA ( Quinolone-resistant Staphylococcus aureus).

본 발명의 일 실시예에서는, 예시적으로 스타필로코커스 아우레우스, 스타필로코커스 에피더미스, 바실러스 서브틸리스, MRSA 및 QRSA에 대한 프라비마이신 A 및 B의 항균활성을 측정하였고, 그 결과, 프라비마이신 A 및 B는 각 균에 대하여 강력한 항균활성을 나타내었다(32 ㎍/㎖의 MIC, 실시예 4 및 표 4). 따라서, 본 발명의 화합물은 병원성 미생물 또는 내성균에 의한 감염성 질환의 예방 또는 치료에 유용하게 사용될 수 있다.In one embodiment of the present invention, the antimicrobial activity of prabimycin A and B against Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermis, Bacillus subtilis, MRSA and QRSA was measured. , Prabimycin A and B showed potent antimicrobial activity against each bacterium (32 μg / ml MIC, Example 4 and Table 4). Therefore, the compounds of the present invention can be usefully used for the prevention or treatment of infectious diseases caused by pathogenic microorganisms or resistant bacteria.

본 발명의 항균용 조성물은 본 발명의 화합물뿐만 아니라, 병원성 세균에 대한 항균활성을 갖는 공지의 유효성분을 1종 이상 더 함유할 수 있다.The antimicrobial composition of the present invention may contain not only the compound of the present invention but also one or more known active ingredients having antimicrobial activity against pathogenic bacteria.

또한, 본 발명의 항균용 조성물은 약학적으로 허용가능한 담체를 추가적으로 포함할 수 있다.In addition, the antimicrobial composition of the present invention may further include a pharmaceutically acceptable carrier.

본 발명에서의 용어 "약학적으로 허용가능한 담체"는 임의의 대상 조성물 또는 성분을 하나의 기관, 또는 신체의 부분으로부터 다른 기관, 또는 신체의 부분으로의 운반 또는 수송하는 것에 관여하는 액체 또는 고체 충전제, 희석제, 부형제, 용매 또는 캡슐화 물질과 같은 제약상 허용가능한 물질, 조성물 또는 비히클을 지칭하며, 본 발명의 조성물은 투여를 위해서 상기 기재한 유효성분 이외에 약학적으로 허용가능한 담체, 부형제 또는 희석제를 더 포함할 수 있다. 상기 담체, 부형제 및 희석제로는 락토오스, 덱스트로오스, 수크로오스, 소르비톨, 만니톨, 자일리톨, 에리스리톨, 말티톨, 전분, 아카시아 고무, 알지네이트, 젤라틴, 칼슘 포스페이트, 칼슘 실리케이트, 셀룰로오스, 메틸 셀룰로오스, 미정질 셀룰로오스, 폴리비닐 피롤리돈, 물, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 탈크, 스테아린산 마그네슘 및 광물유를 들 수 있다.The term "pharmaceutically acceptable carrier" in the present invention refers to liquid or solid fillers involved in the transport or transport of any subject composition or component from one organ or part of the body to another organ or part of the body. Refers to a pharmaceutically acceptable material, composition or vehicle, such as a diluent, excipient, solvent or encapsulating material, wherein the composition of the present invention further comprises a pharmaceutically acceptable carrier, excipient or diluent in addition to the active ingredients described above for administration. It may include. The carrier, excipient and diluent may include lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, xylitol, erythritol, maltitol, starch, acacia rubber, alginate, gelatin, calcium phosphate, calcium silicate, cellulose, methyl cellulose, microcrystalline cellulose, Polyvinyl pyrrolidone, water, methylhydroxybenzoate, propylhydroxybenzoate, talc, magnesium stearate and mineral oil.

또한, 본 발명의 항균용 조성물은 각각 통상의 방법에 따라 산제, 과립제, 정제, 캡슐제, 현탁액, 에멀젼, 시럽, 에어로졸 등의 경구형 제형, 외용제, 좌제 또는 멸균 주사용액의 형태로 제형화하여 사용할 수 있다. 상세하게는 제형화할 경우 통상 사용하는 충진제, 증량제, 결합제, 습윤제, 붕해제, 계면활성제 등의 희석제 또는 부형제를 사용하여 조제될 수 있다. 경구투여를 위한 고형제제로는 정제, 환제, 산제, 과립제, 캡슐제 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 이러한 고형제제는 상기 화학식 1 또는 2의 화합물에 적어도 하나 이상의 부형제, 예를 들면, 전분, 칼슘 카보네이트, 수크로오스, 락토오스, 젤라틴 등을 섞어 조제될 수 있다. 또한, 단순한 부형제 이외에 스테아린산 마그네슘, 탈크 같은 윤활제들도 사용될 수 있다. 경구를 위한 액상 제제로는 현탁제, 내용액제, 유제, 시럽제 등을 포함하나, 이에 한정되지 않으며, 흔히 사용되는 단순 희석제인 물, 리퀴드 파라핀 이외에 여러 가지 부형제, 예를 들면 습윤제, 감미제, 방향제, 보존제 등을 첨가하여 조제될 수 있다. 비경구 투여를 위한 제제는 멸균된 수용액, 비수성 용제, 현탁제, 유제, 동결건조 제제 및 좌제를 포함한다. 비수성 용제 및 현탁제로는 프로필렌글리콜, 폴리에틸렌 글리콜, 올리브 오일과 같은 식물성 오일, 에틸올레이트와 같은 주사 가능한 에스테르 등이 사용될 수 있다. 좌제의 기제로는 위텝솔, 마크로골, 트윈 61, 카카오지, 라우린지, 글리세로젤라틴 등이 사용될 수 있다.In addition, the antimicrobial compositions of the present invention may be formulated in the form of powders, granules, tablets, capsules, suspensions, emulsions, syrups, aerosols, oral formulations, external preparations, suppositories, or sterile injectable solutions according to conventional methods. Can be used. Specifically, when formulated, it may be prepared using conventional diluents or excipients such as fillers, extenders, binders, wetting agents, disintegrating agents, and surfactants. Solid preparations for oral administration include, but are not limited to, tablets, pills, powders, granules, capsules, and the like. Such solid preparations may be prepared by mixing at least one excipient such as starch, calcium carbonate, sucrose, lactose, gelatin and the like with the compound of Formula 1 or 2. In addition to simple excipients, lubricants such as magnesium stearate and talc may also be used. Liquid preparations for oral use include, but are not limited to, suspending agents, solvents, emulsions, syrups, and the like, and various excipients, such as wetting agents, sweeteners, fragrances, It can be prepared by adding a preservative or the like. Formulations for parenteral administration include sterile aqueous solutions, non-aqueous solvents, suspensions, emulsions, lyophilized preparations and suppositories. As the non-aqueous solvent and suspending agent, propylene glycol, polyethylene glycol, vegetable oils such as olive oil, injectable esters such as ethyl oleate and the like can be used. As the base of the suppository, utopsol, macrogol, tween 61, cacao butter, laurin butter, glycerogelatin and the like can be used.

뿐만 아니라, 본 발명의 조성물은 목적하는 방법에 따라 경구 투여하거나 비경구 투여(예를 들어, 정맥 내, 피하, 복강 내 또는 국소에 적용)할 수 있으며, 투여량은 환자의 상태 및 체중, 질병의 정도, 약물형태, 투여경로 및 기간에 따라 다르지만, 당업자에 의해 적절하게 선택될 수 있다. 필요에 따라 일일 1회 내지 수회로 나누어 투여할 수 있으며, 병원성 세균 및 내성균에 대한 예방 또는 치료를 위하여 단독으로, 또는 수술, 호르몬 치료, 약물 치료 및 생물학적 반응 조절제를 사용하는 방법들과 병용하여 사용할 수 있다.
In addition, the compositions of the present invention can be administered orally or parenterally (eg, intravenously, subcutaneously, intraperitoneally or topically) according to the desired method, and the dosage is determined by the condition and weight of the patient, disease Depending on the degree, drug form, route of administration, and duration, it may be appropriately selected by those skilled in the art. It may be administered once or several times daily as needed, and used alone or in combination with methods using surgery, hormone therapy, drug treatment and biological response modifiers for the prevention or treatment of pathogenic bacteria and resistant bacteria. Can be.

또 다른 하나의 양태로서, 본 발명은 상기 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 화합물을 포함하는 펩티드 디포밀라제 활성 억제용 조성물을 제공한다. As another aspect, the present invention provides a composition for inhibiting peptide deformylase activity comprising the compound represented by the formula (1) or (2).

세균이 단백질 합성을 위해 tRNA에 메티오닌(methionine)이 결합된 후 트랜스포밀라제(transformylase)에 의해 포르밀화(formylation) 되고, 단백질 합성이 완료된 후 포르밀(formyl)기가 떨어지면서 활성 단백질이 되는데, 이때, 상기 펩티드 디포밀라제에 의해 포르밀기가 떨어지면서 활성 단백질이 된다. Bacteria are bound to tRNA for protein synthesis by methionine, and then formylated by transformylase. After protein synthesis is completed, formyl groups drop to become active proteins. At this time, the formyl group is dropped by the peptide deformillase to become an active protein.

상기 펩티드 디포밀라제는 세균의 생육에 필수적인 효소이면서 대부분의 병원균에 존재하는 것으로 알려져 있다. 또한, 펩티드 디포밀라제는 말라리아를 일으키는 열대 열원충(Plasmodium falciparum)과 같은 Apicomplexa에 존재하는 것으로 알려져 있다.The peptide deformylase is known to be present in most pathogens while being an enzyme necessary for the growth of bacteria. Peptide deformylase is also known to be present in Apicomplexa, such as the Plasmodium falciparum, which causes malaria.

본 발명의 일 실시예에서는 상기 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 화합물이 펩티드 디포밀라제에 대한 저해 활성이 있음을 확인하였다(실시예 3 및 표 3). In one embodiment of the present invention it was confirmed that the compound represented by the formula (1) or (2) has inhibitory activity against peptide deformillase (Example 3 and Table 3).

또 다른 하나의 양태로서, 본 발명은 상기 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 화합물을 유효성분으로 포함하는 항균용 의약외품 조성물을 제공한다. 즉, 본 발명은 병원성 미생물 또는 내성균에 의한 감염성 질환의 예방 또는 개선을 목적으로 의약외품 조성물을 제공하는 것이다.As another aspect, the present invention provides an antimicrobial composition for antimicrobial comprising the compound represented by the formula (1) or formula (2) as an active ingredient. That is, the present invention provides a quasi-drug composition for the purpose of preventing or improving infectious diseases caused by pathogenic microorganisms or resistant bacteria.

본 발명의 의약외품 조성물은 다른 의약외품 또는 의약외품 성분과 함께 사용할 수 있고, 통상적인 방법에 따라 적절하게 사용될 수 있다. 유효성분의 혼합양은 사용 목적(예방, 건강 또는 치료적 처치)에 따라 적합하게 결정될 수 있다. The quasi-drug composition of the present invention can be used together with other quasi-drugs or quasi-drug components, and can be suitably used according to a conventional method. The mixed amount of the active ingredient may be appropriately determined depending on the purpose of use (prevention, health or therapeutic treatment).

상기 의약외품 조성물은 소독청결제, 샤워폼, 가그린, 물티슈, 세제비누, 핸드워시, 가습기 충진제, 마스크, 연고제 또는 필터충진제일 수 있다.
The quasi-drug composition may be a disinfectant cleaner, a shower foam, a gagreen, a wet tissue, a detergent soap, a hand wash, a humidifier filler, a mask, an ointment, or a filter filler.

또 다른 하나의 양태로서, 본 발명은 화학식 1로 표시되는 프라비마이신 A 또는 화학식 2로 표시되는 프라비마이신 B 화합물을 제공한다.As another aspect, the present invention provides a prabimycin A represented by the formula (1) or a prabimycin B compound represented by the formula (2).

상기 프라비마이신은 아스퍼질러스 프라빕스F020543 균주를 배양하여 수득한 신규 화합물로서, 흰색 분말로 획득하였으며, 프라비마이신 A는 C18H18O9의 분자식, 378의 분자량을 갖는 신규 화합물이며, 프라비마이신 B는 C19H20O10의 분자식, 408의 분자량을 갖는 신규 화합물이다.
The prabimycin is a novel compound obtained by culturing Aspergillus prabibs F020543 strain, obtained as a white powder, prabimycin A is a novel compound having a molecular formula of C 18 H 18 O 9 , a molecular weight of 378, Prabimycin B is a novel compound with a molecular formula of C 19 H 20 O 10 , having a molecular weight of 408.

또 다른 하나의 양태로서, 아스퍼질러스 프라빕스F020543 균주(KCTC 10880BP) 또는 그의 돌연변이주를 배양하는 단계; 2) 상기 1)단계에서 얻어진 균주의 배양액 및 균사체를 유기용매로 추출한 후 에틸아세테이트로 추출하는 단계; 및 상기 2)단계에서 얻어진 에틸아세테이트 추출물에 크로마토그래피를 수행하여 본 발명의 화합물을 얻는 단계를 포함하는 본 발명의 화합물을 제조하는 방법을 제공한다.In another embodiment, the method comprises the steps of: culturing Aspergillus prabibs F020543 strain (KCTC 10880BP) or a mutant thereof; 2) extracting the culture medium and mycelium of the strain obtained in step 1) with an organic solvent and then extracting with ethyl acetate; And performing chromatography on the ethyl acetate extract obtained in step 2) to obtain a compound of the present invention.

상기 1) 단계를 구체적으로 설명하면, 곰팡이의 제반성질은 일정한 것이 아니라 자연적으로 혹은 인공적으로 용이하게 변화되는 것이 일반적인 성질이며, 본 발명의 아스퍼질러스 프라빕스F020543 균주도 그 성상이 변화하기 쉽다. 따라서, 상기 균주는 아스퍼질러스 프라빕스F020543 균주는 물론, 상기 균주에서 유래하는 돌연변이주(자연돌연변이 또는 인공돌연변이주), 형질접합체 또는 유전공학적인 방법에 의해 새롭게 만들어진 균주도 포함할 수 있다.When the step 1) is described in detail, the general properties of the mold are not constant, but are easily changed naturally or artificially, and the Aspergillus prapips F020543 strain of the present invention is also easy to change its properties. Thus, the strain may include the Aspergillus prabbius F020543 strain, as well as strains newly produced by mutant strains (natural or mutagenic strains), conjugates or genetic engineering methods derived from the strains.

상기 아스퍼질러스 프라빕스F020543 균주 또는 그의 돌연변이주의 배양은 통상의 미생물이 사용할 수 있는 영양원을 함유하는 배지에서 배양한다. 영양원으로는 종래 곰팡이의 배양에 이용되고 있는 공지의 영양원을 사용한다. 예를 들어, 탄소원으로는 글루코오스, 물엿, 덱스트린, 전분, 당밀, 동물유, 식물유 등을 사용할 수 있으며, 질소원으로는 밀기울, 대두박, 소맥, 맥아, 면실박, 어박, 콘스팁리커, 육즙, 효모 추출물, 황산암모니움, 질산소다, 요소 등을 사용할 수 있다. 필요에 따라, 식염, 칼륨, 마그네슘, 코발트, 염소, 인산, 황산 및 기타 이온생성을 촉진하는 무기염류를 첨가하면 매우 효과적이다. 배양방법으로는 호기적 조건에서는 진탕배양 혹은 정치배양이 가능하다.The culture of Aspergillus prabibs F020543 strain or mutant strain thereof is cultured in a medium containing nutrients that can be used by conventional microorganisms. As a nutrient source, the well-known nutrient source currently used for the cultivation of a mold is used. For example, as a carbon source, glucose, starch syrup, dextrin, starch, molasses, animal oil, vegetable oil, etc. may be used, and as nitrogen sources, bran, soybean meal, wheat, malt, cottonseed gourd, fishmeal, corn steep liquor, gravy, yeast Extracts, ammonium sulfate, sodium nitrate, urea and the like can be used. If necessary, it is very effective to add salts, potassium, magnesium, cobalt, chlorine, phosphoric acid, sulfuric acid and other inorganic salts that promote ion generation. As a culture method, shaking culture or political culture is possible under aerobic conditions.

배양온도는 상기의 각 조건들에서 배양할 경우 조건에 따라 약간씩 상이하기는 하나, 보통 20~37℃에서 배양하는 것이 적당하며, 대부분의 경우에는 26~30℃에서 배양한다. 또한, 배양기간은 진탕배양, 정치배양의 경우 모두 통상 4일 내지 7일간 배양할 때 본 발명의 프라비마이신 화합물의 생산이 최고에 달하였다.The culture temperature is slightly different depending on the conditions when the culture in each of the above conditions, it is usually suitable to incubate at 20 ~ 37 ℃, in most cases it is incubated at 26 ~ 30 ℃. In addition, in the culture period of shaking and stationary culture, the production of the prabimycin compound of the present invention reached the highest when usually cultured for 4 days to 7 days.

상기 2) 단계는 아스퍼질러스 프라빕스F020543 균주 또는 그의 돌연변이주의 배양액 및 균사체를 추출하는 단계로, 프라비마이신 화합물은 균주의 배양액뿐만 아니라 균사체 부분에도 존재한다. 따라서, 균주의 배양액 및 균사체에 아세톤 등의 유기용매를 가하여 배양액 및 균사체로부터 유효성분을 추출한 후 감압하에 아세톤을 증발시키고, 에틸아세테이트로 용매 추출한 후, 에틸아세테이트 용매층을 감압농축하여 에틸아세테이트를 제거한다.Step 2) is a step of extracting the culture medium and mycelia of the Aspergillus prabibs F020543 strain or a mutant strain thereof, the prabimycin compound is present in the mycelia portion as well as the culture solution of the strain. Therefore, by adding an organic solvent such as acetone to the culture medium and mycelium of the strain, extracting the active ingredient from the culture medium and the mycelium, acetone is evaporated under reduced pressure, solvent extraction with ethyl acetate, and the ethyl acetate solvent layer is concentrated under reduced pressure to remove ethyl acetate. do.

상기 3) 단계는 본 발명의 화합물을 분리하는 단계로, 화합물의 정제 및 분리는 당업계에서 통상적으로 사용되는 방법이 제한 없이 사용될 수 있으며, 필요에 따라 배지의 종류, 배양 조건, 추출 정제 방법 등을 변화시켜, 수득량 및 수득률을 조절할 수 있음은 자명하다. 본 발명의 일 실시예에서는, 예시적으로 이하의 방법으로 에틸아세테이트 추출물에 크로마토그래피를 수행하여 본 발명의 화합물 제조하였다.Step 3) is a step of separating the compound of the present invention, the purification and separation of the compound can be used without limitation the methods commonly used in the art, if necessary, the type of medium, culture conditions, extraction purification method, etc. It is obvious that the yield and yield can be controlled by changing the. In one embodiment of the present invention, the compound of the present invention was prepared by performing chromatography on ethyl acetate extract by the following method.

상기 2)단계에서 얻은 에틸아세테이트 농축액을 클로로포름:메탄올을 20:1 내지 1:1로 하여 실리카겔 컬럼 크로마토그래피를 실시하여 얻어진 활성분획을 감압농축하여 오일성 조유효성분을 얻은 뒤, 메탄올을 용매로 하여 세파덱스 LH-20 컬럼 크로마토그래피에서 정제하였다. 최종적으로 활성분획을 메탄올:물 = 30:70인 용매조건에서 HPLC를 실시하여 2개의 순수한 화합물, 프라비마이신 A 및 B를 얻었다(실시예 2).
The ethyl acetate concentrate obtained in step 2) was subjected to silica gel column chromatography using chloroform: methanol at 20: 1 to 1: 1 to concentrate the active fraction under reduced pressure to obtain an oily crude active ingredient, and then methanol as a solvent. Purification on Sephadex LH-20 column chromatography. Finally, the active fractions were subjected to HPLC under a solvent condition of methanol: water = 30: 70 to obtain two pure compounds, prabimycin A and B (Example 2).

본 발명의 화합물은 PDF의 활성을 강력하게 저해함으로써, 병원성 미생물 및 항생제 내성균에 대하여 강력한 항균력을 가지며, 특히, 항생제 내성균인 MRSA 및 QRSA에 대하여 강력한 항균 활성을 나타내므로 슈퍼박테리아에 의한 감염성 질환의 치료에 유용하게 사용할 수 있다.
The compound of the present invention strongly inhibits the activity of PDF, has a strong antimicrobial activity against pathogenic microorganisms and antibiotic resistant bacteria, and particularly shows a strong antimicrobial activity against the antibiotic resistant bacteria MRSA and QRSA, so as to treat infectious diseases caused by superbacteria This can be useful for.

도 1은 본 발명에 따른 프라비마이신 A의 화학구조식을 보인 도면이다.
도 2는 본 발명에 따른 프라비마이신 B의 화학구조식을 보인 도면이다.
도 3은 프라비마이신 A의 PDF 저해활성을 보인 그래프이다.
1 is a view showing the chemical structural formula of prabimycin A according to the present invention.
Figure 2 is a view showing the chemical structural formula of pravimycin B according to the present invention.
3 is a graph showing the PDF inhibitory activity of prabimycin A.

이하, 본 발명을 실시예 및 실험예에 의해 보다 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.
Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples and Experimental Examples. However, the following examples are merely to illustrate the present invention is not limited to the contents of the present invention.

실시예Example 1 :  One : AspergillusAspergillus flavipesflavipes F020543F020543 균주의 분리 Isolation of strain

본 발명자들은 펩타이드 디포밀라제 저해활성을 갖는 물질을 생산하는 균주를 스크리닝하기 위하여, 전국 토양으로부터 곰팡이를 분리한 후 상기 곰팡이 균주들로부터 펩타이드 디포밀라제 저해활성을 갖는 곰팡이 F543을 분리하였다. 상기 F543 균주는 conidia가 작고 smooth-walled인 점, plate상에서 봤을 때 conidia색이 회색빛이 도는 연한 오렌지색(pale grayish orange)색을 띠는 점, biseriate aspergilli(metulae와 phialide위에 conidia를 형성)위에 conidia를 형성하는 점으로 전형적인 Aspergillus flavipes (Bain. & Sart.) Thom & Church 1926으로 동정하였고, 이를 Aspergillus flavipesF543으로 명명하였다. 본 발명자들은 상기 균주를 2005년 12월 9일자로 한국생명공학연구원 유전자원센터에 기탁하였다(수탁번호 : KCTC 10880BP).
The present inventors isolated the fungus F543 having a peptide deformillase inhibitory activity from the fungal strains after screening the fungus to isolate the strain producing a substance having a peptide deformillase inhibitory activity. The F543 strain is conidia small and smooth-walled, conidia pale grayish orange when viewed on a plate, and conidia on biseriate aspergilli (which forms conidia on metulae and phialide). Aspergillus flavipes (Bain. & Sart.) Thom & Church 1926 was identified as the point of formation, which was named Aspergillus flavipes F543. The present inventors deposited the strain at the Genetic Resource Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, December 9, 2005 (Accession Number: KCTC 10880BP).

실시예Example 2 :  2 : AspergillusAspergillus flavipesflavipes F020543F020543 균주로부터  From strain 프라비마이신의Fravimycin 분리 및 정제 Separation and Purification

2-1. 2-1. AspergillusAspergillus flavipesflavipes F020543F020543 균주의 배양 Culture of strain

Aspergillus flavipesF020543 균주를 배양하기 위하여, 종 배지로는 0.3% 효모 추출액(yeast extract), 0.3% 맥아 추출물(malt extract), 0.5% 트립톤(tryptone), 1% 글루코오즈를 함유한 배지를 멸균 전에 pH 5.5로 조절한 후 사용하였다.To cultivate the Aspergillus flavipesF020543 strain, species medium containing 0.3% yeast extract, 0.3% malt extract, 0.5% tryptone, 1% glucose before pH sterilization It was used after adjusting to 5.5.

상기 종배지 20 ㎖가 담긴 100 ㎖ 용량의 삼각 플라스크를 121℃에서 20분간 멸균한 후, Aspergillus flavipesF020543 균주의 사면배양 시험관으로부터 1 백금을 접종하여 28℃에서 3일간 진탕배양 한 후, 이것을 1차 종배양액으로 사용하였다. 그런 다음에 상기 멸균된 배지가 들어 있는 500 ㎖ 용량의 삼각플라스크(48개)에 종배양액를 접종하여 28℃에서 7일간 진탕배양 하였다.
A 100 ml Erlenmeyer flask containing 20 ml of the seed medium was sterilized at 121 ° C. for 20 minutes, inoculated with 1 platinum from a slope culture tube of Aspergillus flavipesF020543 strain, and incubated at 28 ° C. for 3 days. Used as a culture. Then, the seed culture solution was inoculated into a 500 ml Erlenmeyer flask containing 48 sterile media and incubated at 28 ° C. for 7 days.

2-2. 2-2. AspergillusAspergillus flavipesflavipes F020543F020543 균주로부터  From strain 프라비마이신의Fravimycin 분리 및 정제 Separation and Purification

상기 실시예 2-1에서 배양한 배양액 및 균사체의 아세톤 추출액을 에틸아세테이드로 3번 용매 추출하였다. 이와 같이 하여 얻어진 유효성분을 함유하고 있는 에틸아세테이트 용매층을 감압농축하여 에틸아세테이트를 제거한 후, 클로로포름:메탄올을 20:1-1:1인 용매로 하여 실리카겔 컬럼 크로마토그래피를 실시하였다. 이렇게 하여 얻어진 활성분획을 감압농축하여 오일성 조유효성분을 얻은 뒤, 메탄올을 용매로 하여 세파덱스 LH-20 컬럼 크로마토그래피에서 정제하였다. 최종적으로 활성분획을 메탄올:물 = 30:70인 용매조건에서 HPLC를 실시하여 프라비마이신 A 및 B를 분리하였다.
The acetone extract of the culture medium and mycelium cultured in Example 2-1 was solvent extracted three times with ethyl acetate. The ethyl acetate solvent layer containing the active ingredient thus obtained was concentrated under reduced pressure to remove ethyl acetate, and then silica gel column chromatography was performed using chloroform: methanol as a solvent having 20: 1-1: 1. The active fraction thus obtained was concentrated under reduced pressure to obtain an oily crude active ingredient, which was then purified by Sephadex LH-20 column chromatography using methanol as a solvent. Finally, the active fractions were subjected to HPLC in a solvent condition of methanol: water = 30: 70 to separate prabimycin A and B.

상기 Aspergillus flavipesF020543 균주로부터 분리한 프라비마이신 A 및 B의 이화학적 특성은 다음과 같았다.
The physicochemical characteristics of pravimycin A and B isolated from the Aspergillus flavipesF020543 strain were as follows.

화합물 1 : Compound 1: 프라비마이신Pravimycin A A

1) 물성 : 흰색 분말;1) Physical property: white powder;

2) 분자량 : 378;2) molecular weight: 378;

3) 고분해능 ESI-MS: 3) High Resolution ESI-MS:

실험치 m/z 377.0874 (M-H)- (C18H17O9), 계산치 377.0878;Found m / z 377.0874 (MH) (C 18 H 17 O 9 ), calcd 377.0878;

4) 분자식 : C18H18O9;4) Molecular Formula: C 18 H 18 O 9 ;

5) 자외선흡수스펙트럼 [UV (MeOH) λmax (logε)]: 211 (4.38), 271 (3.14)nm;5) UV absorption spectrum [UV (MeOH) λ max (logε)]: 211 (4.38), 271 (3.14) nm;

6) IR 스펙트럼: 3397, 1631, 1317, 1021 cm-1;6) IR spectrum: 3397, 1631, 1317, 1021 cm −1 ;

7) 핵자기 공명 (NMR) 데이터 : 다이메칠설폭사이드(DMSO-d6)를 용매로한 1H 및 13C NMR 데이터는 하기 표 1에 나타내었다.
7) Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Data: 1 H and 13 C NMR data using dimethyl sulfoxide (DMSO-d 6 ) as a solvent are shown in Table 1 below.

Figure pat00003
Figure pat00003

8) 화학구조식8) Chemical Structural Formula

Figure pat00004
Figure pat00004

화합물 2 : Compound 2: 프라비마이신Pravimycin B  B

1) 물질의 성상 : 흰색 분말;1) the appearance of the substance: white powder;

2) 분자량 : 408;2) molecular weight: 408;

3) 고분해능 ESI-MS: 3) High Resolution ESI-MS:

실험치 m/z 377.0874 (M-H)- (C19H20O10), 계산치 377.0878;Found m / z 377.0874 (MH) (C 19 H 20 O 10 ), calcd. 377.0878;

4) 분자식 : C19H20O10;4) Molecular Formula: C 19 H 20 O 10 ;

5) 자외선흡수스펙트럼 [UV (MeOH) λmax (logε)] : 211 (4.38), 271 (3.14)nm;5) UV absorption spectrum [UV (MeOH) λ max (logε)]: 211 (4.38), 271 (3.14) nm;

6) IR 스펙트럼: 3397, 1631, 1317, 1021 cm-1;6) IR spectrum: 3397, 1631, 1317, 1021 cm −1 ;

7) 핵자기 공명 (NMR) 데이터 : 다이메칠설폭사이드(DMSO-d6)을 용매로한 1H 및 13C NMR 데이터는 하기 표 2에 나타내었다.
7) Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Data: 1 H and 13 C NMR data using dimethyl sulfoxide (DMSO-d 6 ) as a solvent are shown in Table 2 below.

Figure pat00005
Figure pat00005

8) 화학구조식8) Chemical Structural Formula

Figure pat00006

Figure pat00006

실시예Example 3 :  3: 프라비마이신Pravimycin 화합물의 펩티드 디포밀라제( Peptide deformillase of compounds ( PeptidePeptide deformylasedeformylase , PDF) 저해 활성 측정, PDF) Inhibition activity measurement

본 발명에 따른 프라비마이신의 PDF 저해 활성을 확인하기 위하여, 하기와 같은 효소 역가 측정 실험을 수행하였다.In order to confirm the PDF inhibitory activity of prabimycin according to the present invention, the following enzyme titer assay was performed.

효소 역가 측정을 위해서 PDF-FDH(formate dehydrogenase) coupled assay를 구축하였다. 유전자 재조합 기술에 의해 제조된 스타필로코커스 아우레우스(Staphylococcus aureus) PDF를 사용하였다. 역가 측정은 50 mM HEPES 완충용액(pH 7.5) 중에서 수행하였으며, 기질로는 f-MAS(N-fromylmethionine-alanine-serine) 4 mM, NAD 2 mM, BSA 1 mg/㎖를 사용하였고, PDF는 30-50 nM 사용하였으며, FDH는 0.05 Unit을 사용하였다. 효소를 첨가하고 상온에서 60분 동안 반응시킨 후, UV-분광분석기를 이용하여 340 nm에서 NADH(nicotinamide adenine dinucleotide)의 흡광도 증가를 측정하였다. 저해능을 평가한 화합물은 디메칠설폭사이드(DMSO) 용매에 용해시켜 전체 반응액의 5% 이내로 첨가하여 효소 저해능을 평가하였다. 효소 저해능은 시험 화합물이 없는 상태에서의 NADH 증가 정도에 대한 시험 화합물의 NADH 증가 정도를 백분율로 표시하였으며, 50%의 효소 활성을 저해하는 각 시험 화합물의 농도를 IC50으로 결정하였다. 결과는 표 3에 나타내었고, 프라비마이신 A의 PDF 저해활성 그래프는 도 3에 도시하였다.
A PDF-FDH (formate dehydrogenase) coupled assay was constructed to measure enzyme titers. Staphylococcus aureus PDF prepared by genetic recombination technology was used. Titer measurements were performed in 50 mM HEPES buffer (pH 7.5), and as a substrate, N-fromylmethionine-alanine-serine (f-MAS) 4 mM, NAD 2 mM, BSA 1 mg / ml, PDF was 30 -50 nM was used and FDH was 0.05 Unit. After the enzyme was added and reacted at room temperature for 60 minutes, the absorbance of NADH (nicotinamide adenine dinucleotide) was measured at 340 nm using a UV-spectrophotometer. Compounds evaluated for inhibition were dissolved in dimethyl sulfoxide (DMSO) solvent and added within 5% of the total reaction solution to evaluate enzyme inhibition. Enzyme inhibition capacity was expressed as a percentage of the NADH increase of the test compound to the increase in NADH increase in the absence of the test compound, and the concentration of each test compound that inhibited 50% of enzyme activity was determined as IC 50 . The results are shown in Table 3, and the graph of PDF inhibition activity of prabimycin A is shown in FIG.

화합물compound IC50(μM)IC 50 ([mu] M) 프라비마이신 APhramycin A 35.835.8 프라비마이신 BPravimycin B 32.132.1

표 3에 나타난 바와 같이, 프라비마이신 A 및 B의 펩티드 디포밀라제에 대한 IC50 각각 35.8 μM 및 32.1 μM로서 우수한 펩티드 디포밀라제 저해 활성을 나타내었다(표 3). 또한, 도 3을 보면 프라비마이신 A는 10μM에서 26%, 30μM에서 46%, 35.8 μM에서 50%, 100μM에서 69%의 펩티드 디포밀라제 저해 활성을 보여, 농도 의존적으로 펩티드 디포밀라제의 활성을 강력하게 저해하였다(도 3).
As shown in Table 3, the IC 50 for peptide deformillase of prabimycin A and B is Excellent peptide deformylase inhibitory activity was shown as 35.8 μM and 32.1 μM, respectively (Table 3). In addition, as shown in Figure 3, pramycin A shows peptide deformylase inhibitory activity of 26% at 10μM, 46% at 30μM, 50% at 35.8μM, 69% at 100μM, and activity of peptide deformillase in a concentration-dependent manner. Strongly inhibited (FIG. 3).

실시예Example 4 :  4 : 프라비마이신Pravimycin 화합물의 항균 활성 측정 Determination of Antimicrobial Activity of Compounds

본 발명에 따른 프라비마이신 화합물의 항균 활성을 확인하기 위하여, 하기와 같은 실험을 수행하였다. In order to confirm the antimicrobial activity of the prabimycin compound according to the present invention, the following experiment was performed.

시험균주는 MHB(Mueller Hinton broth)에서 배양하였으며, 액체 배지 희석법(broth micro dilution)으로 항균활성을 측정하였다. 하룻밤 배양한 시험균을 2 x 100,000/㎖가 되도록 희석한 후, 96 웰 플레이트에 각 웰(well) 당 100 ㎕씩 분주하고, 프라비마이신 A, B 및 양성 대조군인 악티노인(actinonin)을 최고 128 ㎍/㎖의 농도부터 점차 2-fold 희석하여 처리하였다. 각 화합물은 DMSO에 희석하였으며, DMSO의 농도는 대략 1/100로 맞추어 실험을 실시하였다. 20시간 동안 배양한 후, 650 nm에서 OD 값을 측정하여 세균의 생육을 조사하였다. 세균의 생육을 완전히 저해한 화합물의 최소농도를 MIC로 결정하고, 그 결과를 하기 표 4에 나타내었다.
The test strain was cultured in Mueller Hinton broth (MHB), and the antimicrobial activity was measured by broth micro dilution. After diluting the test bacteria incubated overnight to 2 x 100,000 / ㎖, dispense 100 μl per well in 96 well plate, and actinin (frainomycin A, B and positive control) Treatment was carried out with 2-fold dilution gradually from concentrations up to 128 μg / ml. Each compound was diluted in DMSO, and the experiment was performed to adjust the concentration of DMSO to approximately 1/100. After incubation for 20 hours, the growth of bacteria was examined by measuring the OD value at 650 nm. The minimum concentration of the compound which completely inhibited the growth of bacteria was determined by MIC, and the results are shown in Table 4 below.

MIC(㎍/㎖)MIC (μg / ml) S. aureusS. aureus MRSA3167MRSA3167 QRSA3505QRSA3505 B. subtilisB. subtilis S. epidermisS. epidermis 프라비마이신 APhramycin A 3232 3232 6464 3232 3232 프라비마이신 BPravimycin B 3232 3232 3232 3232 3232 악티노닌Actinine 3232 3232 3232 3232 3232

표 4에 나타난 바와 같이, 본 발명의 프라비마이신 A 및 B 화합물은 주요 병원균인 스타필로코커스 아우레우스(S. aureus)에 대하여 우수한 항균 활성을 보였고(32㎍/㎖의 MIC), 특히 항생제 내성균인 MRSA(methicillin-resistant Staphylococcus aureus) 및 QRSA(Quinolone-resistant Staphylococcus aureus)에 대해서도 우수한 항균활성을 나타내었다. 또한, 바실러스 서브틸리스(B. subtilis) 및 스타필로코커스 에피더미스(S. epidermis)에 대해서도 비슷한 항균활성을 나타내었다(32㎍/㎖의 MIC, 표 4).
As shown in Table 4, the prabimycin A and B compounds of the present invention showed excellent antibacterial activity against S. aureus, a major pathogen (32 μg / ml MIC), in particular antibiotics. It also showed excellent antimicrobial activity against the resistant bacteria MRSA (methicillin-resistant Staphylococcus aureus) and QRSA (Quinolone-resistant Staphylococcus aureus). Similar antimicrobial activity was also observed for B. subtilis and S. epidermis (32 μg / ml MIC, Table 4).

한국생명공학연구원Korea Biotechnology Research Institute KCTC10880BPKCTC10880BP 2005120920051209

Claims (10)

하기 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 화합물, 그의 이성질체, 유도체 또는 약학적으로 허용가능한 염을 포함하는 항균용 조성물.
[화학식 1]
Figure pat00007

[화학식 2]
Figure pat00008

An antimicrobial composition comprising a compound represented by Formula 1 or Formula 2, an isomer thereof, a derivative thereof, or a pharmaceutically acceptable salt thereof.
[Formula 1]
Figure pat00007

(2)
Figure pat00008

제1항에 있어서, 상기 화합물은 아스퍼질러스 프라빕스(Aspergillus flavipes) F020543 균주(KCTC 10880BP)로부터 생산되는 것인 조성물.
The composition of claim 1, wherein the compound is produced from Aspergillus flavipes F020543 strain (KCTC 10880BP).
제1항에 있어서, 상기 조성물은 스타필로코커스 아우레우스(Staphylococus aureus), 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis), 스타필로코커스 에피더미스(Staphylococcus epidermis), 메티실린-저항성 포도상구균(methicillin-resistant Staphylococcus aureus, MRSA) 및 퀴놀론-저항성 포도상구균(Quinolone-resistant Staphylococcus aureus, QRSA)으로 이루어지는 군에서 선택된 어느 하나 이상의 균에 대한 항균 활성을 나타내는 것인 조성물.The method of claim 1, wherein the composition is Staphylococus aureus, Bacillus subtilis, Staphylococcus epidermis, Methicillin-resistant staphylococci (methicillin-resistant) Staphylococcus aureus (MRSA) and Quinolone-resistant Staphylococcus aureus (QSA) composition that exhibits antimicrobial activity against any one or more bacteria selected from the group consisting of. 제1항에 있어서, 상기 화합물은 펩티드 디포밀라제(Peptide deformylase) 저해 활성을 갖는 것인 조성물.
The composition of claim 1, wherein the compound has a peptide deformylase inhibitory activity.
제1항에 있어서, 상기 조성물은 약학적으로 허용가능한 담체를 추가로 포함하는 것인 조성물.
The composition of claim 1, wherein the composition further comprises a pharmaceutically acceptable carrier.
하기 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 화합물을 포함하는 펩티드 디포밀라제(Peptide deformylase) 활성 억제용 조성물.
[화학식 1]
Figure pat00009

[화학식 2]
Figure pat00010

A composition for inhibiting peptide deformylase activity comprising a compound represented by Formula 1 or Formula 2.
[Formula 1]
Figure pat00009

(2)
Figure pat00010

제6항에 있어서, 상기 조성물은 스타필로코커스 아우레우스(Staphylococus aureus), 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis), 스타필로코커스 에피더미스(Staphylococcus epidermis), 메티실린-저항성 포도상구균(methicillin-resistant Staphylococcus aureus, MRSA) 및 퀴놀론-저항성 포도상구균(Quinolone-resistant Staphylococcus aureus, QRSA)으로 이루어지는 군에서 선택된 어느 하나 이상의 균에 대한 항균 활성을 나타내는 것인 조성물.
The method of claim 6, wherein the composition is Staphylococus aureus, Bacillus subtilis, Staphylococcus epidermis, Methicillin-resistant staphylococci (methicillin-resistant) Staphylococcus aureus (MRSA) and Quinolone-resistant Staphylococcus aureus (QSA) A composition that exhibits antimicrobial activity against any one or more bacteria selected from the group consisting of.
하기 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 화합물을 유효성분으로 포함하는 항균용 의약외품 조성물.
[화학식 1]
Figure pat00011


[화학식 2]
Figure pat00012

Antimicrobial quasi-drug composition comprising the compound represented by the following formula (1) or (2) as an active ingredient.
[Formula 1]
Figure pat00011


(2)
Figure pat00012

하기 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 화합물.
[화학식 1]
Figure pat00013


[화학식 2]
Figure pat00014

A compound represented by the following formula (1) or (2).
[Formula 1]
Figure pat00013


(2)
Figure pat00014

1) 아스퍼질러스 프라빕스F020543 균주(KCTC 10880BP) 또는 그의 돌연변이주를 배양하는 단계;
2) 상기 1)단계에서 얻어진 균주의 배양액 및 균사체를 유기용매로 추출한 후 에틸아시테이트로 추출하는 단계; 및
3) 상기 2)단계에서 얻어진 에틸아세테이트 추출물에 크로마토그래피를 수행하여 제9항의 화합물을 얻는 단계를 포함하는 제9항에 따른 화합물의 제조방법.
1) culturing the Aspergillus prabiles F020543 strain (KCTC 10880BP) or a mutant thereof;
2) extracting the culture medium and mycelium of the strain obtained in step 1) with an organic solvent and then with ethyl acetate; And
3) A method for preparing a compound according to claim 9, comprising the step of obtaining the compound of claim 9 by chromatography on the ethyl acetate extract obtained in step 2).
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CN113249231B (en) * 2021-05-21 2022-08-02 中国医学科学院医药生物技术研究所 Gram-positive bacterium resisting compound derived from polar region source fungi as well as preparation method and application thereof
CN115197192B (en) * 2022-07-26 2023-09-29 郑州轻工业大学 Macrolide compound aspergillide A
CN116082461B (en) * 2022-10-14 2023-11-14 浙江大学 Small molecular peptide with antibacterial activity and application thereof

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* Cited by examiner, † Cited by third party
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EP0953294B1 (en) * 1998-04-27 2005-09-21 Symrise GmbH & Co. KG Use of 3,6-Dimethyl-2-(3H)-benzofuranone as a flavouring agent, food and oral care compositions comprising 3,6-dimethyl-2-(3H)-benzofuranon
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