KR102478476B1 - LOC_Os09g04310 gene for controlling disease resistance of plant and uses thereof - Google Patents

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Abstract

본 발명은 식물체의 병 저항성을 조절하는 LOC_Os09g04310 유전자 및 이의 용도에 관한 것으로, 본 발명의 LOC_Os09g04310 유전자의 발현을 조절하여 흰잎마름병에 저항성을 갖는 새로운 식물체를 개발하는데 유용하게 활용될 수 있을 것으로 기대된다.The present invention relates to the LOC_ Os09g04310 gene that regulates the disease resistance of plants and its use, and is expected to be useful for developing new plants resistant to white leaf blight by regulating the expression of the LOC_ Os09g04310 gene of the present invention. do.

Description

식물체의 병 저항성을 조절하는 LOC_Os09g04310 유전자 및 이의 용도{LOC_Os09g04310 gene for controlling disease resistance of plant and uses thereof}LOC_Os09g04310 gene for controlling disease resistance of plants and its uses {LOC_Os09g04310 gene for controlling disease resistance of plant and uses thereof}

본 발명은 식물체의 병 저항성을 조절하는 LOC_Os09g04310 유전자 및 이의 용도에 관한 것이다.The present invention relates to a LOC_ Os09g04310 gene that regulates plant disease resistance and uses thereof.

흰잎마름병균(Xanthomonas oryzae pv. oryzae, Xoo)은 그람음성 박테리아로서 벼 흰잎마름병의 주요 병원체이며 전 세계적으로 벼의 박테리아성 질병의 주원인으로 알려져 있다. 흰잎마름병균은 기주 식물체의 상처 또는 배수조직을 통해 감염되며 피복조직을 통해 증식되고 관다발계를 통해 이동한다. 분자마커 연구를 통해 얻어진 흰잎마름병균의 다양성, 분포도, 계통 및 감염성에 대한 상관관계는 흰잎마름병균의 계통정보에 대한 보다 많은 이해를 도와주었고, 아시아에서 발생하는 흰잎마름병균들이 지역에 따라 서로 다른 양상을 나타내고 있음을 보여주었다. White leaf blight ( Xanthomonas oryzae pv. oryzae , Xoo) is a gram-negative bacterium, which is a major pathogen of white leaf blight in rice and is known as a major cause of bacterial diseases in rice worldwide. White leaf blight is infected through wounds or drainage tissues of host plants, proliferates through covering tissues, and moves through the vascular system. Correlation of diversity, distribution, phylogeny, and infectivity of white leaf blight obtained through molecular marker research helped to better understand the phylogenetic information of white leaf blight, showed that the shape of

한국형 흰잎마름병균의 계통은 필리핀형 및 일본형과 각각 64% 및 58%의 계통학적 차이를 보였고, 이러한 한국형 흰잎마름병균은 다른 나라에 비해 유전적 변이가 심화된 계통으로 감염경로가 보다 다양할 것으로 예상된다. 한국형 K1 균주는 세균성 마름병 저항성 유전자인 Xa1Xa3 유전자를 보유하고 있는 벼 품종의 확산에 의해 감소되는 추세이이지만, K2와 K3 균주는 한국에서 계속해서 증식하고 있는 상황이다. 새로운 병원체인 K3a는 2003년에 심각한 흰잎마름병 피해를 주었던 K3와 동일한 감염 양상을 보이고 있다.The strains of the Korean type white blight showed phylogenetic differences of 64% and 58% from the Philippine type and the Japanese type, respectively. It is expected. The Korean K1 strain is on the decline due to the spread of rice cultivars that have the bacterial blight resistance genes Xa1 and Xa3 , but the K2 and K3 strains continue to proliferate in Korea. K3a, a new pathogen, shows the same infection pattern as K3, which caused severe white leaf blight damage in 2003.

기능적 유전자 분석은 식물에서 비특이적 발현 단백질 유전자를 조사함에 있어서 검증된 유전자의 생물학적 유의성을 검증하는데 필수적인 것으로 입증되었다. 비록 Xa 유전자로써 언급되는 몇몇 유전자가 존재하나 벼와 흰잎마름병의 올리고뉴클오티드 마이크로어레이 분석을 통해 식물 면역 네트워크에 관여할 것으로 여겨지는 비특이적 발현 단백질은 알려진 바 없다. Functional genetic analysis has proven essential to verify the biological significance of validated genes in examining non-specifically expressed protein genes in plants. Although several genes referred to as Xa genes exist, non-specific expressed proteins that are considered to be involved in the plant immune network through oligonucleotide microarray analysis of rice and white leaf blight are not known.

본 발명자는 Xoo의 한국형 균주 K2에 대한 내성과 관련된 중요한 유전자를 확인하기 위해 자포니카 벼 품종인 '동진'과 '진백'의 전장 유전체 마이크로어레이 분석을 수행하여 여러 유전자의 과발현을 확인하였는데, 그 중 LOC_Os09g04310 유전자는 특성이 규명되지 않은 발현 단백질이었다. 따라서, 본 발명은 벼의 Xoo 감염에 반응하는 발현 단백질의 기능을 검증하기 위해 수행되었다.In order to identify important genes related to resistance to the Korean strain K2 of Xoo , the present inventors performed genome microarray analysis of japonica rice cultivars 'Dongjin' and 'Jinbaek' to confirm overexpression of several genes, among which LOC_ The Os09g04310 gene was an uncharacterized expressed protein. Therefore, the present invention was carried out to verify the function of the expressed protein in response to Xoo infection in rice.

한편, 한국등록특허 제1636154호에는 '흰잎마름병 저항성 메틸전이효소 및 이를 이용한 형질전환 식물체'가 개시되어 있고, 한국공개특허 제2013-0055766호에는 벼 유래 PSK08 유전자를 이용한 '유전자 발현 억제를 통한 벼 흰잎마름병 저항성 부여법'이 개시되어 있으나, 본 발명의 식물체의 병 저항성을 조절하는 LOC_Os09g04310 유전자 및 이의 용도에 대해서는 기재된 바가 없다.On the other hand, Korean Patent Registration No. 1636154 discloses 'a methyltransferase resistant to white leaf blight and a transformed plant using the same', and Korean Patent Publication No. 2013-0055766 discloses 'a rice through gene expression suppression using a PSK08 gene derived from rice'. A method for imparting white leaf blight resistance is disclosed, but the LOC_Os09g04310 gene and its use for regulating the disease resistance of plants of the present invention are not described.

본 발명은 상기와 같은 요구에 의해 도출된 것으로서, 본 발명자들은 벼의 9번 염색체에 존재하는 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 LOC_Os09g04310 유전자를 과발현하는 벼 형질전환체를 제조한 후 흰잎마름병원균(Xanthomonas oryzae pv. oryzae strain K2)을 접종하여 흰잎마름병에 의한 식물체의 손상 정도를 관찰한 결과, LOC_Os09g04310 유전자를 과발현하는 벼 형질전환체가 야생형 동진벼(흰잎마름병 감수성)에 비해 병변 길이가 감소된 것을 확인하였고, 이를 통해 LOC_Os09g04310 유전자가 흰잎마름병에 대한 식물체의 저항성을 증가시킬 수 있음을 확인함으로써, 본 발명을 완성하였다.The present invention was derived from the above request, and the present inventors prepared a rice transformant overexpressing the LOC_ Os09g04310 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 present in rice chromosome 9, and then white leaf blight pathogen ( Xanthomonas oryzae pv. oryzae strain K2) was inoculated and the degree of plant damage caused by the white leaf blight was observed. As a result, the rice transformants overexpressing the LOC_ Os09g04310 gene were superior to the wild-type Dongjin rice (susceptibility to white leaf blight). It was confirmed that the length of the lesion was reduced, and through this, it was confirmed that the LOC_ Os09g04310 gene could increase the resistance of plants to white leaf blight, thereby completing the present invention.

상기 과제를 해결하기 위해, 본 발명은 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 LOC_Os09g04310 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 식물세포를 형질전환시켜 LOC_Os09g04310 유전자의 발현을 조절하는 단계를 포함하는 식물체의 식물병 저항성을 조절하는 방법을 제공한다.In order to solve the above problems, the present invention is a plant disease resistance of plants comprising the step of regulating the expression of the LOC_ Os09g04310 gene by transforming plant cells with a recombinant vector containing the LOC_ Os09g04310 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 provides a way to regulate

또한, 본 발명은 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 LOC_Os09g04310 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 식물세포를 형질전환하는 단계; 및 상기 형질전환된 식물세포로부터 식물을 재분화하는 단계;를 포함하는 식물병 저항성이 조절된 형질전환 식물체의 제조방법을 제공한다.In addition, the present invention comprises the steps of transforming a plant cell with a recombinant vector containing the LOC_ Os09g04310 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1; and regenerating plants from the transformed plant cells.

또한, 본 발명은 상기 제조방법에 의해 제조된 식물병 저항성이 조절된 형질전환 식물체 및 이의 형질전환된 종자를 제공한다.In addition, the present invention provides a transgenic plant with controlled plant disease resistance prepared by the above production method and a transformed seed thereof.

또한, 본 발명은 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 LOC_Os09g04310 유전자를 유효성분으로 함유하는 식물체의 식물병 저항성 조절용 조성물을 제공한다.In addition, the present invention provides a composition for regulating plant disease resistance of plants containing the LOC_ Os09g04310 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 as an active ingredient.

본 발명의 LOC_Os09g04310 유전자를 과발현시킨 형질전환 식물체는 흰잎마름병에 대한 저항성이 증대되므로, LOC_Os09g04310 유전자의 발현 조절을 통해 흰잎마름병에 대한 저항성이 조절된 형질전환 식물체를 개발하여 농작물의 생산성을 향상시킬 수 있을 것으로 기대된다.Since the transgenic plants overexpressing the LOC_ Os09g04310 gene of the present invention have increased resistance to white leaf blight, the productivity of crops can be improved by developing transgenic plants with controlled resistance to white leaf blight by controlling the expression of the LOC_ Os09g04310 gene. hope to be able to

도 1은 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 LOC_Os09g04310 유전자를 포함하는 재조합 벡터의 모식도이다.
도 2는 벼 표준유전체(Nipponbare 품종) 내 LOC_Os09g04310 유전자(REF-NB)와 본 발명에서 클로닝된 LOC_Os09g04310 유전자의 염기서열을 비교한 결과이다.
도 3은 LOC_Os09g04310 유전자를 과발현시킨 벼 형질전환체의 조직별(뿌리, root; 줄기, stem; 잎집, leaf sheath; 잎, leaf; 및 지엽, flag leaf)·생육 시기별(발아, germination stage; 3엽 단계, 3-leaf stage; 최고분얼기 단계, maximum tillering stage; 유수분화기, panicle initiation stage)에 따른 LOC_Os09g04310 유전자의 발현 수준을 확인한 PCR 결과이다.
도 4는 LOC_Os09g04310 유전자 과발현 벼 형질전환체에서 삽입 유전자의 카피 수를 확인한 PCR 결과이다. NC(Negative control, 음성대조군): 동진벼, PC(Positive control, 양성대조군): mock 벡터(LOC_Os09g04310 유전자가 삽입되지 않은 pCAMBIA1300 벡터).
도 5는 흰잎마름병 감수성 품종인 야생형 동진벼(DJ), 흰잎마름병 저항성 품종인 진백벼(JB) 및 LOC_Os09g04310 유전자 과발현 벼 형질전환체(LOC_Os09g04310 OX-1, 2 및 3)에 흰잎마름병원균(X. oryzae pv. oryzae strain K2)을 접종하고 8일, 12일 및 16일 후 각 식물체의 병변 길이(lesion length)를 측정한 결과이다.
도 6은 흰잎마름병 감수성 품종인 야생형 동진벼(Dongjin), 흰잎마름병 저항성 품종인 진백벼(Jinbaek) 및 LOC_Os09g04310 유전자 과발현 벼 형질전환체(LOC_Os09g04310 OX-1, 2 및 3)에 흰잎마름병원균(X. oryzae pv. oryzae strain K2)을 접종하고 각 식물체에서 흰잎마름병에 대한 손상 정도를 관찰한 사진이다.
1 is a schematic diagram of a recombinant vector containing a LOC_Os09g04310 gene composed of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1.
2 is a result of comparing the nucleotide sequences of the LOC_ Os09g04310 gene (REF-NB) in the rice standard genome (Nipponbare cultivar) and the LOC_ Os09g04310 gene cloned in the present invention.
Figure 3 shows the rice transformants overexpressing the LOC_ Os09g04310 gene by tissue (root, stem; stem; leaf sheath; leaf, leaf; and flag leaf) and growth period (germination, germination stage; This is the PCR result confirming the expression level of the LOC_ Os09g04310 gene according to three-leaf stage, 3-leaf stage; maximum tillering stage; panicle initiation stage).
4 is a PCR result confirming the copy number of the inserted gene in the rice transformant overexpressing the LOC_ Os09g04310 gene. NC (Negative control): Dongjinbyeop, PC (Positive control): mock vector (pCAMBIA1300 vector without LOC_ Os09g04310 gene inserted).
Figure 5 is a white leaf blight susceptible variety, wild type Dongjinbyeo (DJ), white leaf blight resistant variety, Jinbaekbyeo (JB), and LOC_ Os09g04310 gene overexpressing rice transformants ( LOC_ Os09g04310 OX-1, 2 and 3). oryzae pv. oryzae strain K2) was inoculated and the lesion length of each plant was measured 8 days, 12 days and 16 days later.
6 is a white leaf blight susceptible variety, wild type Dongjin rice (Dongjin), a white leaf blight resistant variety, Jinbaek rice ( Jinbaek ), and a white leaf blotch pathogen ( X This is a photograph of the degree of damage to white leaf blight in each plant after inoculation with oryzae pv. oryzae strain K2).

본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 LOC_Os09g04310 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 식물세포를 형질전환시켜 LOC_Os09g04310 유전자의 발현을 조절하는 단계를 포함하는 식물체의 식물병 저항성을 조절하는 방법을 제공한다.In order to achieve the object of the present invention, the present invention is a plant plant comprising the step of regulating the expression of the LOC_ Os09g04310 gene by transforming plant cells with a recombinant vector containing the LOC_ Os09g04310 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 A method for regulating disease resistance is provided.

본 발명에 따른 식물체의 식물병 저항성을 조절하는 방법은 상기 LOC_Os09g04310 유전자를 식물세포에서 과발현시켜 식물체의 식물병에 대한 저항성을 증가시키는 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.The method of regulating plant disease resistance of plants according to the present invention may be to overexpress the LOC_ Os09g04310 gene in plant cells to increase plant disease resistance, but is not limited thereto.

본 발명의 일 구현 예에 따른 방법에 있어서, 상기 식물병은 흰잎마름병, 도열병, 줄무늬잎마름병, 잎집무늬병, 검은줄오갈병, 점무늬병, 무름병, 시들음병, 혹병 및 궤양병 등 광역의 식물병일 수 있고, 바람직하게는 흰잎마름병원균(Xanthomonas oryzae pv. oryzae strain K2)에 의해 유발되는 흰잎마름병일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the method according to an embodiment of the present invention, the plant disease may be a wide range of plant diseases such as white leaf blight, blast disease, striped leaf blight, leaf sheath disease, black streak disease, spot blotch disease, soft rot, wilt disease, warp disease, and ulcer disease, Preferably, it may be white leaf blight caused by a white leaf blight pathogen ( Xanthomonas oryzae pv. oryzae strain K2), but is not limited thereto.

또한, 본 발명의 일 구현 예에 따른 식물체의 식물병 저항성을 조절하는 방법에 있어서, 상기 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 LOC_Os09g04310 유전자는 참조서열(http://rice.plantbiology.msu.edu/cgi-bin/sequence_display.cgi?orf=LOC_Os09g04310)의 코딩 서열(coding sequence, CDS)과 100%의 상동성을 갖는 서열로 이루어져 있다(도 2 참고).In addition, in the method for controlling plant disease resistance of a plant according to an embodiment of the present invention, the LOC_ Os09g04310 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 is a reference sequence (http://rice.plantbiology.msu.edu/ cgi-bin/sequence_display.cgi?orf=LOC_Os09g04310) and a sequence having 100% homology with the coding sequence (CDS) (see FIG. 2).

본 발명의 상기 LOC_Os09g04310 유전자의 범위는 LOC_Os09g04310 유전자의 게놈 DNA, cDNA 및 합성 DNA를 모두 포함한다. 바람직하게는, 본 발명의 LOC_Os09g04310 유전자는 서열번호 1로 표시되는 염기서열을 포함할 수 있다. 또한, 상기 염기서열의 상동체가 본 발명의 범위 내에 포함된다. 구체적으로, 상기 유전자는 서열번호 1의 염기 서열과 각각 70% 이상, 더 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 가지는 염기서열을 포함할 수 있다. 폴리뉴클레오티드에 대한 "서열 상동성의 %"는 두 개의 최적으로 배열된 서열을 비교함으로써 확인되며, 비교 영역에서의 폴리뉴클레오티드 서열의 일부는 두 서열의 최적 배열에 대한 참고 서열(추가 또는 삭제를 포함하지 않음)에 비해 추가 또는 삭제(즉, 갭)을 포함할 수 있다.The scope of the LOC_ Os09g04310 gene of the present invention includes genomic DNA, cDNA and synthetic DNA of the LOC_ Os09g04310 gene. Preferably, the LOC_ Os09g04310 gene of the present invention may include the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1. In addition, homologues of the above nucleotide sequences are included within the scope of the present invention. Specifically, the gene includes a base sequence having 70% or more, more preferably 80% or more, more preferably 90% or more, and most preferably 95% or more sequence homology with the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, respectively. can do. The "% sequence homology" for polynucleotides is determined by comparing two optimally aligned sequences, wherein a portion of the polynucleotide sequence in the region of comparison is a reference sequence (not containing additions or deletions) to the optimal alignment of the two sequences. may include additions or deletions (i.e., gaps) compared to

본 명세서에서, 용어 "재조합"은 세포가 이종의 핵산을 복제하거나, 상기 핵산을 발현하거나 또는 펩티드, 이종의 펩티드 또는 이종의 핵산에 의해 암호된 단백질을 발현하는 세포를 지칭하는 것이다. 재조합 세포는 상기 세포의 천연 형태에서는 발견되지 않는 유전자 또는 유전자 절편을, 센스 또는 안티센스 형태 중 하나로 발현할 수 있다. 또한 재조합 세포는 천연 상태의 세포에서 발견되는 유전자를 발현할 수 있으며, 그러나 상기 유전자는 변형된 것으로서 인위적인 수단에 의해 세포 내 재도입된 것이다.As used herein, the term "recombinant" refers to a cell that replicates, expresses a heterologous nucleic acid, or expresses a peptide, a protein encoded by a heterologous peptide, or a heterologous nucleic acid. Recombinant cells can express genes or gene segments not found in the cell's native form, either in sense or antisense form. A recombinant cell may also express a gene found in the cell in its natural state, but the gene has been reintroduced into the cell by artificial means as a modified one.

본 명세서에서, 용어 "벡터"는 세포 내로 전달하는 DNA 단편(들), 핵산 분자를 지칭할 때 사용된다. 벡터는 DNA를 복제시키고, 숙주세포에서 독립적으로 재생산될 수 있다. 용어 "전달체"는 흔히 "벡터"와 호환하여 사용된다.In this specification, the term "vector" is used to refer to DNA fragment(s) or nucleic acid molecules that are delivered into cells. Vectors replicate DNA and can reproduce independently in host cells. The term “delivery vehicle” is often used interchangeably with “vector”.

본 발명의 벡터는 전형적으로 발현 또는 클로닝을 위한 벡터로서 구축될 수 있다. 또한, 본 발명의 벡터는 원핵세포 또는 진핵세포를 숙주로 하여 구축될 수 있다. 예를 들어, 본 발명의 벡터가 발현 벡터이고, 원핵세포를 숙주로 하는 경우에는, 전사를 진행시킬 수 있는 강력한 프로모터(예를 들면, pLλ 프로모터, trp 프로모터, lac 프로모터, T7 프로모터, tac 프로모터 등), 해독의 개시를 위한 리보솜 결합 자리 및 전사/해독 종결 서열을 포함하는 것이 일반적이다. 숙주세포로서 대장균(Escherichia coli)이 이용되는 경우, E. coli 트립토판 생합성 경로의 프로모터 및 오퍼레이터 부위, 그리고 파아지 λ의 좌향 프로모터(pLλ 프로모터)가 조절 부위로서 이용될 수 있다.Vectors of the invention may typically be constructed as vectors for expression or cloning. In addition, the vector of the present invention can be constructed using a prokaryotic or eukaryotic cell as a host. For example, when the vector of the present invention is an expression vector and a prokaryotic cell is used as a host, a strong promoter capable of promoting transcription (eg, pLλ promoter, trp promoter, lac promoter, T7 promoter, tac promoter, etc.) ), a ribosome binding site for initiation of translation, and a transcription/translation termination sequence. When Escherichia coli is used as a host cell, promoter and operator sites of the E. coli tryptophan biosynthetic pathway and leftward promoter (pLλ promoter) of phage λ may be used as control sites.

본 발명의 재조합 벡터에서, 상기 프로모터는 형질전환에 적합한 프로모터들로서, 바람직하게는 CaMV 35S 프로모터, 액틴 프로모터, 유비퀴틴 프로모터, pEMU 프로모터, MAS 프로모터 또는 히스톤 프로모터일 수 있으며, 바람직하게는 CaMV 35S 프로모터일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the recombinant vector of the present invention, the promoter may be promoters suitable for transformation, preferably CaMV 35S promoter, actin promoter, ubiquitin promoter, pEMU promoter, MAS promoter or histone promoter, preferably CaMV 35S promoter. However, it is not limited thereto.

본 명세서에서, 용어 "프로모터"란 구조 유전자로부터의 DNA 업스트림의 영역을 의미하며 전사를 개시하기 위하여 RNA 폴리머라아제가 결합하는 DNA 분자를 말한다. "식물 프로모터"는 식물 세포에서 전사를 개시할 수 있는 프로모터이다. "항시성(constitutive) 프로모터"는 대부분의 환경 조건 및 발달 상태 또는 세포 분화하에서 활성이 있는 프로모터이다. 형질전환체의 선택이 각종 단계에서 각종 조직에 의해서 이루어질 수 있기 때문에 항시성 프로모터가 본 발명에서 바람직할 수 있다. 따라서, 항시성 프로모터는 선택 가능성을 제한하지 않는다.As used herein, the term "promoter" refers to a region of DNA upstream from a structural gene and refers to a DNA molecule to which RNA polymerase binds to initiate transcription. A "plant promoter" is a promoter capable of initiating transcription in a plant cell. A “constitutive promoter” is a promoter that is active under most environmental conditions and states of development or cell differentiation. Constitutive promoters may be preferred in the present invention because selection of transformants may be made by various tissues at various stages. Thus, constitutive promoters do not limit selection possibilities.

본 발명의 재조합 벡터는 당업자에 주지된 방법에 의해 구축될 수 있다. 상기 방법은 시험관 내 재조합 DNA 기술, DNA 합성 기술 및 생체 내 재조합 기술 등을 포함한다. 상기 DNA 서열은 mRNA 합성을 이끌기 위해 발현 벡터 내의 적당한 프로모터에 효과적으로 연결될 수 있다. 또한 벡터는 번역 개시 부위로서 리보솜 결합 부위 및 전사 터미네이터를 포함할 수 있다.The recombinant vector of the present invention can be constructed by methods well known to those skilled in the art. The method includes in vitro recombinant DNA technology, DNA synthesis technology, in vivo recombinant technology, and the like. The DNA sequence can be effectively linked to a suitable promoter in an expression vector to direct mRNA synthesis. In addition, the vector may include a ribosome binding site and a transcription terminator as a translation initiation site.

본 발명의 재조합 벡터의 바람직한 예는 아그로박테리움 튜머파시엔스(Agrobacterium tumefaciens)와 같은 적당한 숙주에 존재할 때 그 자체의 일부, 소위 T-영역을 식물 세포로 전이시킬 수 있는 Ti-플라스미드 벡터이다. 다른 유형의 Ti-플라스미드 벡터(EP 0 116 718 B1호 참조)는 현재 식물 세포, 또는 잡종 DNA를 식물의 게놈 내에 적당하게 삽입시키는 새로운 식물이 생산될 수 있는 원형질체로 잡종 DNA 서열을 전이시키는데 이용되고 있다. Ti-플라스미드 벡터의 특히 바람직한 형태는 EP 0 120 516 B1호 및 미국 특허 제4,940,838호에 청구된 바와 같은 소위 바이너리(binary) 벡터이다. 본 발명에 따른 DNA를 식물 숙주에 도입시키는데 이용될 수 있는 다른 적합한 벡터는 이중 가닥 식물 바이러스(예를 들면, CaMV) 및 단일 가닥 바이러스, 제미니 바이러스 등으로부터 유래될 수 있는 것과 같은 바이러스 벡터, 예를 들면 비완전성 식물 바이러스 벡터로부터 선택될 수 있다. 그러한 벡터의 사용은 특히 식물 숙주를 적당하게 형질전환하는 것이 어려울 때 유리할 수 있다.A preferred example of the recombinant vector of the present invention is a Ti-plasmid vector capable of transferring a part of itself, the so-called T-region, into plant cells when present in a suitable host such as Agrobacterium tumefaciens . Another type of Ti-plasmid vector (see EP 0 116 718 B1) is currently used to transfer hybrid DNA sequences into plant cells, or protoplasts, from which new plants can be produced that properly integrate the hybrid DNA into the plant's genome. there is. A particularly preferred form of the Ti-plasmid vector is the so-called binary vector as claimed in EP 0 120 516 B1 and US Pat. No. 4,940,838. Other suitable vectors that can be used to introduce DNA according to the present invention into plant hosts include viral vectors, such as those that can be derived from double-stranded plant viruses (eg, CaMV) and single-stranded viruses, gemini viruses, and the like. For example, it may be selected from incomplete plant viral vectors. The use of such vectors can be particularly advantageous when properly transforming a plant host is difficult.

재조합 발현 벡터는 바람직하게는 하나 이상의 선택성 마커를 포함할 수 있다. 상기 마커는 통상적으로 화학적인 방법으로 선택될 수 있는 특성을 갖는 핵산 서열로, 형질전환된 세포를 비형질전환 세포로부터 구별할 수 있는 모든 유전자가 이에 해당된다. 상기 마커 유전자는 항생제 내성 유전자(antibiotics resistance gene)일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.Recombinant expression vectors may preferably contain one or more selectable markers. The marker is a nucleic acid sequence having a characteristic that can be selected by a conventional chemical method, and includes all genes capable of distinguishing transformed cells from non-transformed cells. The marker gene may be an antibiotics resistance gene, but is not limited thereto.

본 발명의 재조합 벡터에서, 통상의 터미네이터를 사용할 수 있으며, 그 예로는 노팔린 신타아제(NOS) 터미네이터, 벼 α-아밀라아제(RAmy1 A) 터미네이터, 파세올린(phaseoline) 터미네이터, 아그로박테리움 튜머파시엔스(Agrobacterium tumefaciens)의 옥토파인 신타아제(Octopine synthase) 유전자의 터미네이터 등이 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다. 터미네이터의 필요성에 관하여, 그러한 영역이 식물 세포에서의 전사의 확실성 및 효율을 증가시키는 것으로 일반적으로 알려져 있다. 그러므로 터미네이터의 사용은 본 발명의 내용에서 매우 바람직하다.In the recombinant vector of the present invention, it is possible to use a conventional terminator, for example, a nopaline synthase (NOS) terminator, a rice α-amylase (RAmy1 A) terminator, a phaseoline terminator, Agrobacterium tumefaciens ( Agrobacterium tumefaciens ) of octopine synthase (Octopine synthase) gene terminator and the like, but is not limited thereto. Regarding the need for terminators, it is generally known that such regions increase the certainty and efficiency of transcription in plant cells. Therefore, the use of terminators is highly desirable in the context of the present invention.

본 발명의 벡터를 안정되면서 연속적으로 클로닝 및 발현시킬 수 있는 숙주세포는 당업계에 공지된 어떠한 숙주세포도 이용할 수 있으며, 원핵세포의 예로는, E. coli JM109, E. coli BL21, E. coli RR1, E. coli LE392, E. coli B, E. coli X 1776, E. coli W3110, 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis), 바실러스 츄린겐시스(Bacillus thuringiensis)와 같은 바실러스 속 균주, 그리고 살모넬라 티피무리움(Salmonella typhimurium), 세라티아 마르세슨스(Serratia marcescens) 및 다양한 슈도모나스 종과 같은 장내균과 균주 등이 있다.Any host cell known in the art can be used as a host cell capable of stably and continuously cloning and expressing the vector of the present invention, and examples of prokaryotic cells include E. coli JM109, E. coli BL21, and E. coli. Bacillus genus strains such as RR1, E. coli LE392, E. coli B, E. coli X 1776, E. coli W3110, Bacillus subtilis , Bacillus thuringiensis , and Salmonella typhimurium Enterobacteriaceae and strains such as Salmonella typhimurium , Serratia marcescens and various Pseudomonas species.

본 발명의 벡터를 진핵세포에 형질전환시키는 경우에는 숙주세포로서, 효모(Saccharomyce cerevisiae), 곤충세포, 사람세포(예컨대, CHO 세포주(Chinese hamster ovary), W138, BHK, COS-7, 293, HepG2, 3T3, RIN 및 MDCK 세포주) 및 식물세포 등이 이용될 수 있다. 숙주세포는 바람직하게는 식물세포이다.When the vector of the present invention is transformed into a eukaryotic cell, as a host cell, yeast ( Saccharomyce cerevisiae ), insect cell, human cell (eg, CHO cell line (Chinese hamster ovary), W138, BHK, COS-7, 293, HepG2 , 3T3, RIN and MDCK cell lines) and plant cells, etc. may be used. The host cell is preferably a plant cell.

본 발명의 벡터를 숙주세포 내로 운반하는 방법은, 숙주세포가 원핵세포인 경우, CaCl2 방법, 하나한 방법(Hanahan, D., 1983 J. Mol. Biol. 166, 557-580) 및 전기천공 방법 등에 의해 실시될 수 있다. 또한, 숙주세포가 진핵세포인 경우에는, 미세주입법, 칼슘포스페이트 침전법, 전기천공법, 리포좀-매개 형질감염법, DEAE-덱스트란 처리법, 및 유전자 밤바드먼트 등에 의해 벡터를 숙주세포 내로 주입할 수 있다.Methods for delivering the vector of the present invention into a host cell, when the host cell is a prokaryotic cell, include the CaCl 2 method, the Hanhan method (Hanahan, D., 1983 J. Mol. Biol. 166, 557-580), and electroporation. It can be implemented by methods and the like. In addition, when the host cell is a eukaryotic cell, the vector can be injected into the host cell by microinjection, calcium phosphate precipitation, electroporation, liposome-mediated transfection, DEAE-dextran treatment, and gene bombardment. can

본 발명은 또한, 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 LOC_Os09g04310 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 식물세포를 형질전환하는 단계; 및The present invention also includes the steps of transforming plant cells with a recombinant vector containing the LOC_ Os09g04310 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1; and

상기 형질전환된 식물세포로부터 식물을 재분화하는 단계;를 포함하는 식물병 저항성이 조절된 형질전환 식물체의 제조방법을 제공한다.It provides a method for producing a transgenic plant with controlled plant disease resistance, comprising: regenerating a plant from the transformed plant cell.

본 발명의 식물병 저항성이 조절된 형질전환 식물체의 제조방법에 있어서, 상기 LOC_Os09g04310 유전자의 범위는 전술한 것과 같다.In the method for producing a transgenic plant with controlled plant disease resistance of the present invention, the range of the LOC_ Os09g04310 gene is the same as described above.

본 발명의 일 구현 예에 따른 제조방법에 있어서, 식물병 저항성이 조절된 형질전환 식물체의 제조방법은 상기 LOC_Os09g04310 유전자를 식물세포에서 과발현시켜 식물체의 식물병에 대한 저항성을 증가시키는 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the production method according to one embodiment of the present invention, the method for producing a transgenic plant with controlled plant disease resistance may be to increase the resistance of the plant to plant disease by overexpressing the LOC_ Os09g04310 gene in plant cells. Not limited to this.

본 발명에 따른 제조방법에 있어서, 상기 식물병은 바람직하게는 흰잎마름병원균(Xanthomonas oryzae pv. oryzae strain K2)에 의해 유발되는 흰잎마름병일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the manufacturing method according to the present invention, the plant disease may preferably be white leaf blight caused by a white leaf blight pathogen ( Xanthomonas oryzae pv. oryzae strain K2), but is not limited thereto.

식물의 형질전환은 DNA를 식물에 전이시키는 임의의 방법을 의미한다. 그러한 형질전환 방법은 반드시 재생 및(또는) 조직 배양기간을 가질 필요는 없다. 식물 종의 형질전환은 이제는 쌍자엽 식물뿐만 아니라 단자엽 식물 양자를 포함한 식물 종에 대해 일반적이다. 원칙적으로, 임의의 형질전환 방법은 본 발명에 따른 잡종 DNA를 적당한 선조 세포로 도입시키는데 이용될 수 있다. 방법은 원형질체에 대한 칼슘/폴리에틸렌 글리콜 방법(Krens, F.A. et al., 1982, Nature 296, 72-74; Negrutiu I. et al., 1987, Plant Mol. Biol. 8, 363-373), 원형질체의 전기천공법(Shillito R.D. et al., 1985, Bio/Technol. 3, 1099-1102), 식물 요소로의 현미주사법(Crossway A. et al., 1986, Mol. Gen. Genet. 202, 179-185), 각종 식물 요소의(DNA 또는 RNA-코팅된) 입자 충격법(Klein T.M. et al., 1987, Nature 327, 70), 식물의 침윤 또는 성숙 화분 또는 소포자의 형질전환에 의한 아그로박테리움 튜머파시엔스 매개된 유전자 전이에서(비완전성) 바이러스에 의한 감염(EP 0 301 316호) 등으로부터 적당하게 선택될 수 있다. 본 발명에 따른 바람직한 방법은 아그로박테리움 매개된 DNA 전달을 포함한다. 특히 바람직한 것은 EP A 120 516호 및 미국 특허 제4,940,838호에 기재된 바와 같은 소위 이원 벡터 기술을 이용하는 것이다.Plant transformation refers to any method of transferring DNA into a plant. Such transformation methods need not necessarily have a period of regeneration and/or tissue culture. Transformation of plant species is now common for plant species including both dicotyledonous as well as monocotyledonous plants. In principle, any transformation method can be used to introduce the hybrid DNA according to the present invention into suitable progenitor cells. The method is the calcium/polyethylene glycol method for protoplasts (Krens, F.A. et al., 1982, Nature 296, 72-74; Negrutiu I. et al., 1987, Plant Mol. Biol. 8, 363-373), Electroporation (Shillito R.D. et al., 1985, Bio/Technol. 3, 1099-1102), microinjection into plant elements (Crossway A. et al., 1986, Mol. Gen. Genet. 202, 179-185 ), Agrobacterium tumefacies by particle bombardment of various plant elements (DNA or RNA-coated) (Klein T.M. et al., 1987, Nature 327, 70), infiltration of plants or transformation of mature pollen or microspores It can be appropriately selected from infections by viruses in (incomplete) ens-mediated gene transfer (EP 0 301 316) and the like. Preferred methods according to the present invention include Agrobacterium mediated DNA delivery. Particularly preferred is the use of so-called binary vector techniques as described in EP A 120 516 and US Pat. No. 4,940,838.

또한, 상기 형질전환된 식물세포로부터 형질전환 식물을 재분화하는 방법은 당업계에 공지된 임의의 방법을 이용할 수 있다.In addition, as a method for regenerating a transgenic plant from the transformed plant cell, any method known in the art may be used.

본 발명은 또한, 상기 제조방법에 의해 제조된 식물병 저항성이 조절된 형질전환 식물체 및 이의 형질전환된 종자를 제공한다.The present invention also provides a transgenic plant with controlled plant disease resistance prepared by the above production method and a transformed seed thereof.

본 발명의 형질전환 식물체는 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 LOC_Os09g04310 유전자를 식물세포에서 과발현시켜 식물체의 식물병에 대한 저항성이 비형질전환체에 비해 증가된 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.The transgenic plant of the present invention may be one in which the LOC_ Os09g04310 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 is overexpressed in plant cells to increase resistance to plant diseases compared to non-transformed plants, but is not limited thereto.

또한, 상기 식물병은 바람직하게는 흰잎마름병원균(Xanthomonas oryzae pv. oryzae strain K2)에 의해 유발되는 흰잎마름병일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In addition, the plant disease may preferably be white leaf blight caused by a white leaf blight pathogen ( Xanthomonas oryzae pv. oryzae strain K2), but is not limited thereto.

상기 식물체는 벼, 보리, 밀, 호밀, 옥수수, 사탕수수, 귀리, 양파 등의 단자엽 식물 또는 애기장대, 감자, 가지, 담배, 고추, 토마토, 우엉, 쑥갓, 상추, 도라지, 시금치, 근대, 고구마, 당근, 미나리, 배추, 양배추, 갓무, 수박, 참외, 오이, 호박, 박, 딸기, 대두, 녹두, 강낭콩, 완두 등의 쌍자엽일 수 있고, 바람직하게는 단자엽 식물일 수 있으며, 더욱 바람직하게는 벼일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.The plants are rice, barley, wheat, rye, corn, sugarcane, oats, onion, or Arabidopsis monocotyledonous plants, potatoes, eggplants, tobacco, peppers, tomatoes, burdock, crown daisy, lettuce, bellflower, spinach, chard, sweet potato , Dicotyledons such as carrots, parsley, Chinese cabbage, cabbage, mustard radish, watermelon, melon, cucumber, pumpkin, gourd, strawberry, soybean, mung bean, kidney bean, pea, etc., preferably a monocotyledonous plant, more preferably It may be rice, but is not limited thereto.

본 발명은 또한, 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 LOC_Os09g04310 유전자를 유효성분으로 함유하는 식물병 저항성 조절용 조성물을 제공한다. 본 발명의 조성물은 유효성분으로 식물체의 흰잎마름병원균(Xanthomonas oryzae pv. oryzae strain K2)에 의해 유발되는 흰잎마름병에 대한 저항성을 조절할 수 있는 LOC_Os09g04310 유전자를 포함하며, 상기 LOC_Os09g04310 유전자의 발현이 증가되면 식물체의 흰잎마름병에 대한 저항성을 증가시킬 수 있다.The present invention also provides a composition for regulating plant disease resistance containing the LOC_ Os09g04310 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 as an active ingredient. The composition of the present invention contains, as an active ingredient, the LOC_ Os09g04310 gene capable of controlling the resistance to white leaf blight caused by the plant's white leaf blight pathogen ( Xanthomonas oryzae pv. oryzae strain K2), and the expression of the LOC_ Os09g04310 gene is increased. It can increase the resistance of plants to white leaf blight.

이하, 본 발명을 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명은 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, the present invention will be described in detail by examples. However, the following examples are merely illustrative of the present invention, and the content of the present invention is not limited to the following examples.

재료 및 방법Materials and Methods

1. LOC_1. LOC_ Os09g04310Os09g04310 유전자 분리 gene isolation

흰잎마름병에 강한 벼 품종 '진백'의 어린 잎을 사용하여 RNAiso Plus extraction reagent(Takara Bio Inc., 일본)로 총 RNA를 추출한 후 추출된 RNA 약 1 ug을 주형으로 하여 Superscript III First-Strand cDNA Synthesis Kit(Invitrogen, 미국)로 cDNA를 합성하였고, 유전자의 PCR 증폭을 위해 표 1의 프라이머 세트를 사용하였다(표 1). PCR 과정은 전변성 95℃ 5분; 변성(denaturation) 95℃ 30초, 결합(annealing) 55℃ 30초, 신장(extension) 72℃ 2분의 과정을 총 35회 반복; 최종 신장 72℃ 10분;의 조건으로 수행하였다. PCR 산물 확인을 위해 에티디움 브로마이드(ethidium bromide)가 포함된 1%(w/v) 아가로스 겔을 이용하여 전기영동하였고, 예상된 크기의 PCR 산물은 아가로스 겔에서 추출하여 Gel purification kit(Bioneer, 미국)를 사용하여 정제하였다. 정제된 PCR 산물은 pGEMT-easy 벡터(Promega, 미국) 내부로 서브클로닝하고 마크로젠(Macrogen, 한국)에 의뢰하여 서열을 분석하였다. 계층적 군집분석으로 다중 염기서열 정렬을 통하여 염기서열 상동성을 확인하였다.Total RNA was extracted with RNAiso Plus extraction reagent (Takara Bio Inc., Japan) using young leaves of 'Jinbaek', a rice variety that is resistant to white leaf blight, and about 1 ug of the extracted RNA was used as a template for Superscript III First-Strand cDNA Synthesis cDNA was synthesized with Kit (Invitrogen, USA), and the primer set shown in Table 1 was used for PCR amplification of the gene (Table 1). The PCR process was pre-denaturation at 95° C. for 5 minutes; The process of denaturation at 95°C for 30 seconds, annealing at 55°C for 30 seconds, and extension at 72°C for 2 minutes was repeated a total of 35 times; Final elongation at 72°C for 10 minutes; To confirm the PCR product, electrophoresis was performed using a 1% (w/v) agarose gel containing ethidium bromide, and the PCR product of the expected size was extracted from the agarose gel and purified using a Gel purification kit (Bioneer , USA) was used for purification. The purified PCR product was subcloned into a pGEMT-easy vector (Promega, USA) and sequenced by Macrogen (Macrogen, Korea). Base sequence homology was confirmed through multiple base sequence alignment by hierarchical clustering analysis.

본 발명에 사용된 프라이머 정보Primer information used in the present invention Gene IDGene ID Seq(5'→3') (서열번호)Seq(5'→3') (SEQ ID NO) 제한효소restriction enzyme LOC_Os09g04310 LOC_ Os09g04310 F: ggtaccATGGCAGCCAGAACAAGCGCTA (2)F: ggtaccATGGCAGCCAGAACAAGCGCTA (2) KpnI Kpn I R: tctagaTTAGCAATTTGCTTCACCGGTAGG (3)R: tctagaTTAGCAATTTGCTTCACCGGTAGG (3) XbaI Xba I

소문자: 제한효소 인식자리Lower case: Restriction enzyme recognition site

2. 과발현 재조합 벡터 제작2. Construction of overexpressing recombinant vector

LOC_Os09g04310 유전자의 전장 cDNA는 T4 ligase kit(Promega, 미국)를 사용하여 pCAMBIA1300 vector(Takara, 일본)의 제한효소 KpnI와 XbaI 사이에 삽입하였다. 식물 선발 마커로 hptII(hygromycin phosphotransferase II) 유전자를 사용하였으며, 삽입 유전자의 과발현을 유도하기 위하여 35S 프로모터를 사용하였다(도 1).The full-length cDNA of the LOC_ Os09g04310 gene was inserted between the restriction enzymes Kpn I and Xba I in the pCAMBIA1300 vector (Takara, Japan) using the T4 ligase kit (Promega, USA). The hptII ( hygromycin phosphotransferase II) gene was used as a plant selection marker, and the 35S promoter was used to induce overexpression of the inserted gene (FIG. 1).

3. 벼 형질전환체 제작3. Production of rice transformants

완성된 벡터는 아그로박테리움 튜메파시엔스 균주인 EHA105로 형질전환하였고, 형질전환 아그로박테리움은 카나마이신(kanamycin, 50 ㎎/L)이 포함된 1.5% AB 배지의 28℃ 암조건에서 배양하여 선발하였다. 형질전환된 아그로박테리움은 AAM 배지에 현탁하여 최종 농도 OD600에서 0.01로 맞춘 후 실험에 사용하였다. 10일 동안 배양시킨 벼 종자 유래 캘러스를 아그로박테리움 현탁액에서 3분간 감염시키고 건조시킨 후 0.4% 젤라이트(gelrite)가 포함된 2N6-AS 배지에서 배양하였고, 아그로박테리아와 캘러스를 25℃의 암조건에서 공동배양한 후 캘러스에서 아그로박테리움을 제거하기 위해 카베니실린(carbenicillin, 500 ㎎/L)이 포함된 증류수를 이용하여 세척하였다. 세척이 끝난 캘러스는 하이그로마이신(hygromycin, 50 ㎎/L)과 카베니실린(400 ㎎/L)이 포함된 2N6-CP 배지에서 32℃의 연속 광조건으로 2주간 배양하였다. 이후 증식된 캘러스를 MSR-CP 배지로 옮겨 줄기와 뿌리의 신장을 유도하고 지속적인 계대배양을 실시하였으며, 캘러스에서 재분화된 식물체는 토양으로 옮겨 온실에서 2주간 재배하였다. 조직배양과 형질전환에 사용한 배지의 조성은 한국등록특허 제2103189호의 표 2에 나타난 것과 같다.The completed vector was transformed into EHA105, an Agrobacterium tumefaciens strain, and the transformed Agrobacterium was selected by culturing in a 1.5% AB medium containing kanamycin (50 mg/L) at 28°C in the dark. . Transformed Agrobacterium was suspended in AAM medium, adjusted to a final concentration of OD 600 of 0.01, and then used in the experiment. Rice seed-derived callus cultured for 10 days was infected with Agrobacterium suspension for 3 minutes, dried, and then cultured in 2N6-AS medium containing 0.4% gelrite. After co-culture, callus was washed with distilled water containing carbenicillin (500 mg/L) to remove Agrobacterium. The washed callus was cultured in 2N6-CP medium containing hygromycin (50 mg/L) and carbenicillin (400 mg/L) under continuous light conditions at 32°C for 2 weeks. Thereafter, the proliferated callus was transferred to MSR-CP medium to induce stem and root elongation, and continuous subculture was performed. The regenerated plants from the callus were transferred to soil and grown in a greenhouse for 2 weeks. The composition of the medium used for tissue culture and transformation is as shown in Table 2 of Korean Registered Patent No. 2103189.

4. 게놈 DNA 추출4. Genomic DNA extraction

총 게놈 DNA는 이앙 2주 후 어린 잎을 이용하여 TissueLyser II system(QIAGEN, 영국) 및 CTAB(Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide)를 사용하여 추출하였다. DNA 추출 후 DNA의 순도와 농도는 분광광도계(NanoDropTM One, Thermo Fisher Scientific, 미국)를 이용하여 측정하였고, 추출된 DNA는 멸균수로 희석하여 -20℃에 보관 및 사용하였다.Total genomic DNA was extracted using the TissueLyser II system (QIAGEN, UK) and CTAB (Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide) using young leaves 2 weeks after transplanting. After DNA extraction, the purity and concentration of DNA was measured using a spectrophotometer (NanoDrop TM One, Thermo Fisher Scientific, USA), and the extracted DNA was diluted with sterile water and stored at -20 °C before use.

5. TaqMan qPCR을 통한 Copy 수 분석5. Copy number analysis through TaqMan qPCR

T0 형질전환체에 삽입된 유전자의 Copy 수를 확인하기 위하여 TaqMan assay(Applied Biosystems, 미국)를 수행하였다. 10 ng의 DNA에 목표유전자 염기서열 탐지용 FAM dye-labeled MGB probe, 레퍼런스 유전자 염기서열 탐지용 VIC dye-labeled TAMRA probe, AmpliTaq Gold DNA polymerase가 포함된 TaqMan Genotyping Master Mix와 dNTPs를 혼합하여 사용하였고, 모든 qPCR 반응은 ABI 7900HT 장비(Alpplied Biosystems, 미국)를 이용하여 3반복으로 진행하였으며, 95℃에서 10분 동안 변성 과정 후에 95℃에서 15초, 60℃에서 60초간 반응하였다. 데이터 분석을 위하여 CopyCaller Software v 2.0(Applied Biosystems, 미국)를 이용하였다.TaqMan assay (Applied Biosystems, USA) was performed to confirm the copy number of the gene inserted into the T 0 transformant. 10 ng of DNA was mixed with FAM dye-labeled MGB probe for target gene sequence detection, VIC dye-labeled TAMRA probe for reference gene sequence detection, TaqMan Genotyping Master Mix containing AmpliTaq Gold DNA polymerase and dNTPs, All qPCR reactions were performed in triplicate using ABI 7900HT equipment (Alpplied Biosystems, USA), followed by denaturation at 95 °C for 10 minutes, followed by 15 seconds at 95 °C and 60 seconds at 60 °C. For data analysis, CopyCaller Software v 2.0 (Applied Biosystems, USA) was used.

6. LOC_6. LOC_ Os09g04310Os09g04310 의 발현 분석Expression analysis of

형질전환체의 조직별 및 생육 시기별 LOC_Os09g04310 유전자의 발현 분석을 위하여 다양한 조직(뿌리, 줄기, 잎집, 잎, 지엽) 및 생육 시기(발아기, 3엽기, 최대분얼기, 이삭형성기)에서 RNA를 추출하였다.To analyze the expression of the LOC_ Os09g04310 gene by tissue and growth period of transformants, RNA was analyzed in various tissues (root, stem, leaf sheath, leaf, branch) and growth period (germination, trifoliate, maximal division, ear formation). extracted.

7. 흰잎마름병에 대한 저항성 검증7. Verification of resistance to white leaf blight

LOC_Os09g04310 유전자 과발현 벼 형질전환체, 야생형 동진벼(흰잎마름병 감수성) 및 진백벼(흰잎마름병 저항성)의 파종 후 7주령 식물체에 흰잎마름병원균(X. oryzae pv. oryzae strain K2, 108 CFU/㎖)을 접종하고 8일, 12일, 16일 후에 잎 조직의 병변 길이를 측정하여 감염성 정도를 판단하였다. 각 5번 반복으로 진행하였다.LOC_ Os09g04310 gene After sowing the overexpressing rice transformants, wild-type Dongjinbyeo (white leaf blight susceptible) and Jinbaek rice (white leaf blight resistance), 7-week-old plants were inoculated with the white leaf blotch pathogen ( X. oryzae pv. oryzae strain K2, 10 8 CFU/㎖) After 8 days, 12 days, and 16 days, the length of the leaf tissue was measured to determine the degree of infectivity. Each was repeated 5 times.

실시예 1. 클로닝된 LOC_Example 1. Cloned LOC_ Os09g04310 Os09g04310 유전자의 특성Characteristics of genes

진백벼에서 LOC_Os09g04310 유전자를 클로닝한 후 염기서열 분석을 진행한 결과, 주석(annotation)이 없는 비특이적 발현 단백질 코딩 유전자임을 확인하였다. 또한 본 발명에서 클로닝된 LOC_Os09g04310 유전자는 벼의 9번 염색체에 위치하고, 분자량과 등전점은 각각 34.788 kDa 및 8.9587로 예측되었으며, 317개의 아미노산 잔기를 인코딩하는 951 bp의 오픈 리딩 프레임(ORF)을 가지는 것을 확인하였다. As a result of sequencing after cloning the LOC_ Os09g04310 gene from Jinbaek rice, it was confirmed that it was a non-annotated gene encoding a non-specific expressed protein. In addition, the LOC_ Os09g04310 gene cloned in the present invention is located on chromosome 9 of rice, and its molecular weight and isoelectric point were predicted to be 34.788 kDa and 8.9587, respectively, and have an open reading frame (ORF) of 951 bp encoding 317 amino acid residues. Confirmed.

게다가, 벼 표준유전체(Nipponbare 품종) 내 LOC_Os09g04310 위치의 염기서열(http://rice.plantbiology.msu.edu/cgi-bin/sequence_display.cgi?orf=LOC_Os09g04310)과 진백벼에서 클로닝된 LOC_Os09g04310 유전자의 염기서열을 비교하면 100%의 상동성을 나타내는 것을 확인하였다(도 2).In addition, the nucleotide sequence of LOC_ Os09g04310 in the rice standard genome (Nipponbare cultivar) (http://rice.plantbiology.msu.edu/cgi-bin/sequence_display.cgi?orf=LOC_Os09g04310) and the LOC_ Os09g04310 gene cloned from Jinbaek rice Comparing the nucleotide sequences of , it was confirmed that they showed 100% homology (FIG. 2).

실시예 2. 클로닝된 LOC_Example 2. Cloned LOC_ Os09g04310 Os09g04310 유전자의 시공간 특이적 발현Spatio-temporal specific expression of genes

벼 형질전환 식물체의 조직별·생육 시기에 따른 LOC_Os09g04310 유전자의 발현 수준을 분석한 결과, 뿌리(root) 및 줄기(stem)에 비해 잎집(leaf sheath), 잎(leaf) 및 지엽(flag leaf)에서 LOC_Os09g04310 유전자의 발현이 비교적 높음을 확인하였고, 생육 시기(발아, germination stage; 3엽 단계, 3-leaf stage; 최고분얼기 단계, maximum tillering stage; 유수분화기, panicle initiation stage)에 따라 LOC_Os09g04310 유전자의 발현이 증가함을 확인하였다(도 3).As a result of analyzing the expression level of the LOC_ Os09g04310 gene according to tissue and growth period of rice transgenic plants, leaf sheath, leaf, and flag leaf compared to root and stem. It was confirmed that the expression of the LOC_ Os09g04310 gene was relatively high in , LOC_ Os09g04310 depending on the growth period (germination stage; 3-leaf stage; maximum tillering stage; panicle initiation stage). It was confirmed that the expression of the gene increased (FIG. 3).

실시예 3. 과발현 벼 형질전환체 개발Example 3. Development of overexpressing rice transformants

LOC_Os09g04310 유전자의 전장 cDNA가 삽입된 과발현 재조합 벡터로 자포니카 벼 품종인 '동진'에 형질전환한 후, 재조합 벡터의 삽입 여부를 확인하기 위해 T0 형질전환체를 이용하여 삽입 유전자 및 HPT 마커를 대상으로 PCR 분석을 수행하여 LOC_Os09g04310 유전자가 성공적으로 도입되었음을 확인하였다(데이터 미제시). 또한, T0 형질전환체로부터 추출된 gDNA를 이용하여 삽입 유전자의 카피 수를 확인하기 위해 TaqMan qPCR을 진행하여, 단일카피(sigle copy) 수를 보유하는 LOC_Os09g04310-1, 2 및 3 계통을 선발하였다(도 4).After transforming 'Dongjin', a japonica rice cultivar, with an overexpression recombinant vector into which the full-length cDNA of the LOC_ Os09g04310 gene was inserted, the T 0 transformant was used to target the inserted gene and HPT marker to confirm whether the recombinant vector was inserted. PCR analysis was performed to confirm successful introduction of the LOC_ Os09g04310 gene (data not shown). In addition, TaqMan qPCR was performed to confirm the copy number of the inserted gene using the gDNA extracted from the T 0 transformant, and LOC_ Os09g04310 -1, 2 and 3 strains having a single copy number were selected. (FIG. 4).

실시예 4. 벼 형질전환체의 흰잎마름병에 대한 저항성 검정Example 4. Resistance assay for white leaf blight of rice transformants

LOC_Os09g04310 유전자가 과발현된 벼 형질전환체(LOC_Os09g04310-1, 2 및 3)에 흰잎마름병원균 K2를 접종한 후, 8일, 12일 및 16일째에 각 식물체의 병변 길이(lesion length)를 측정하여 LOC_Os09g04310 유전자의 과발현이 흰잎마름병 저항성에 미치는 영향을 분석하였다.After inoculating rice transformants with LOC_ Os09g04310 gene overexpression (LOC_ Os09g04310 -1, 2 and 3) with white leaf blight pathogen K2, the lesion length of each plant was measured on the 8th, 12th and 16th days The effect of LOC_ Os09g04310 gene overexpression on white leaf blight resistance was analyzed.

그 결과, 접종 8일째의 경우 야생형 동진벼(흰잎마름병 감수성)와 모든 형질전환체의 병변 길이가 유사한 수준임을 확인하였다. 그러나 접종 12일째의 경우 야생형 동진벼의 병변 길이는 약 13 cm, 형질전환체의 병변 길이는 약 6.5~8.5 cm로 확인되었고, 접종 16일째의 경우 야생형 동진벼의 병변 길이는 약 19 cm, 과발현 형질전환체의 병변 길이는 약 8.5~9.9 cm로 확인되어, 야생형 동진벼가 LOC_Os09g04310 유전자 과발현 벼 형질전환체에 비해 흰잎마름병에 대한 손상 정도가 매우 심각한 수준임을 확인하였다. 반면, 흰잎마름병 저항성 품종인 진백벼는 다른 실험군과 비교하여 병변 길이가 가장 짧았다(도 5 및 도 6).As a result, on the 8th day of inoculation, it was confirmed that the lesion length of all transformants was similar to that of wild-type Dongjinbyeo (susceptibility to white leaf blight). However, on the 12th day of inoculation, the lesion length of wild-type Dongjinbyeo was confirmed to be about 13 cm, and the lesion length of the transformant was about 6.5 to 8.5 cm. On the 16th day of inoculation, the lesion length of wild-type Dongjinbyeo was about 19 cm, The length of the lesion on the sieve was confirmed to be about 8.5 to 9.9 cm, and it was confirmed that the degree of damage to white leaf blight was very serious in wild-type Dongjinbyeo compared to the LOC_ Os09g04310 gene overexpressing rice transformants. On the other hand, Jinbaek rice, a variety resistant to white leaf blight, had the shortest lesion length compared to other experimental groups (FIGS. 5 and 6).

상기 결과를 통해, 본 발명의 LOC_Os09g04310 유전자가 식물체에서 과발현되면 흰잎마름병에 대한 저항성이 증가되는 것을 알 수 있었고, LOC_Os09g04310 유전자의 발현 조절을 통해 식물체의 흰잎마름병에 대한 저항성을 조절할 수 있을 것으로 사료되었다.Through the above results, it can be seen that resistance to white leaf blight is increased when the LOC_ Os09g04310 gene of the present invention is overexpressed in plants, and it is thought that the resistance to white leaf blight of plants can be controlled by controlling the expression of the LOC_ Os09g04310 gene It became.

<110> Chungbuk National University Industry-Academic Cooperation Foundation <120> LOC_Os09g04310 gene for controlling disease resistance of plant and uses thereof <130> PN20176 <160> 3 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 951 <212> DNA <213> Oryza sativa <400> 1 atggcagcca gaacaagcgc taacttctca tcatgcttta ccttcctgaa ggaagcccta 60 gtcctcccaa ctcagaaccc caagctcttc acacctgtct tcctcctgat cgcgcttcct 120 agcttccttg tcctctctac caatgtccta ttcgtccagc cactctccat ggacatggcc 180 gaacttgcaa tcaagctcca gaccaccgac ccttccagcg ccgagtaccg catgatcctg 240 gaggagctga aacatgacgt tacacagctc atcctcgtcg tcgtcgccgt cgagctcgtc 300 gctttggtgc ttggcttcgt caatcagtgc gtcggcttct tcgcggcctc ctccacctac 360 tccggcgacc gctactcgct cccggagctc ctccgcaagg cgatgaaggg gaatctcaag 420 ggtcctctca taaccatcgc catggtcacc gtactccggg tcacatacat ggcgctcctc 480 ggtgttctaa tctattccgt catgcaagtg caacggcact acttgatcaa ggtgctctcc 540 gtgcaagtcc tcctcttcgt cctctgtttc ctcgccttcc tctacttcaa cgtcgttggc 600 atggtgagcg tcgccgtgtc ggtgggcgac acggagcgcc gcgggatccg ggcgctccgg 660 caggcgtggc ggctgatgac gcgggtgagg aggaaggagg gcctcgtgct ggtggtggcc 720 atctgcctct tgtcgatagc tgtcagcccg gtgaacctgg tcgctgctgc gtacacgaag 780 aacatggtac tggggctatg cctcttggtc gtctatgctc tgctgtctgg tgcagagcag 840 ctgttctact ttgcagcagc cacggtgtac tactgccaag caatggacag caagggagag 900 gccatggatt atgcatacgc caagatccct accggtgaag caaattgcta a 951 <210> 2 <211> 28 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 2 ggtaccatgg cagccagaac aagcgcta 28 <210> 3 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 3 tctagattag caatttgctt caccggtagg 30 <110> Chungbuk National University Industry-Academic Cooperation Foundation <120> LOC_Os09g04310 gene for controlling disease resistance of plant and uses it <130> PN20176 <160> 3 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 951 <212> DNA <213> Oryza sativa <400> 1 atggcagcca gaacaagcgc taacttctca tcatgcttta ccttcctgaa ggaagcccta 60 gtcctcccaa ctcagaaccc caagctcttc acacctgtct tcctcctgat cgcgcttcct 120 agcttccttg tcctctctac caatgtccta ttcgtccagc cactctccat ggacatggcc 180 gaacttgcaa tcaagctcca gaccaccgac ccttccagcg ccgagtaccg catgatcctg 240 gaggagctga aacatgacgt tacacagctc atcctcgtcg tcgtcgccgt cgagctcgtc 300 gctttggtgc ttggcttcgt caatcagtgc gtcggcttct tcgcggcctc ctccacctac 360 tccggcgacc gctactcgct cccggagctc ctccgcaagg cgatgaaggg gaatctcaag 420 ggtcctctca taaccatcgc catggtcacc gtactccggg tcacatacat ggcgctcctc 480 ggtgttctaa tctattccgt catgcaagtg caacggcact acttgatcaa ggtgctctcc 540 gtgcaagtcc tcctcttcgt cctctgtttc ctcgccttcc tctacttcaa cgtcgttggc 600 atggtgagcg tcgccgtgtc ggtgggcgac acggagcgcc gcgggatccg ggcgctccgg 660 caggcgtggc ggctgatgac gcgggtgagg aggaaggagg gcctcgtgct ggtggtggcc 720 atctgcctct tgtcgatagc tgtcagcccg gtgaacctgg tcgctgctgc gtacacgaag 780 aacatggtac tggggctatg cctcttggtc gtctatgctc tgctgtctgg tgcagagcag 840 ctgttctact ttgcagcagc cacggtgtac tactgccaag caatggacag caagggagag 900 gccatggatt atgcatacgc caagatccct accggtgaag caaattgcta a 951 <210> 2 <211> 28 <212> DNA <213> artificial sequence <220> <223> primer <400> 2 ggtaccatgg cagccagaac aagcgcta 28 <210> 3 <211> 30 <212> DNA <213> artificial sequence <220> <223> primer <400> 3 tctagattag caatttgctt caccggtagg 30

Claims (9)

서열번호 1의 염기서열로 이루어진 LOC_Os09g04310 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 식물세포를 형질전환시켜 LOC_Os09g04310 유전자의 발현을 과발현시키는 단계를 포함하는 식물체의 흰잎마름병(bacterial leaf blight disease) 저항성을 증가시키는 방법.A method for increasing bacterial leaf blight disease resistance of a plant comprising the step of over-expressing the expression of the LOC_ Os09g04310 gene by transforming plant cells with a recombinant vector containing the LOC_ Os09g04310 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 . 삭제delete 삭제delete 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 LOC_Os09g04310 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 식물세포를 형질전환하여 형질전환된 식물세포에서 LOC_Os09g04310 유전자를 과발현시키는 단계; 및
상기 형질전환된 식물세포로부터 식물을 재분화하는 단계;를 포함하는 흰잎마름병(bacterial leaf blight disease) 저항성이 증가된 형질전환 식물체의 제조방법.
Transforming plant cells with a recombinant vector containing the LOC_ Os09g04310 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 to overexpress the LOC_ Os09g04310 gene in the transformed plant cells; and
A method for producing a transgenic plant with increased resistance to bacterial leaf blight disease, comprising: regenerating a plant from the transformed plant cell.
삭제delete 제4항의 방법에 의해 제조된 흰잎마름병(bacterial leaf blight disease) 저항성이 증가된 형질전환 식물체.A transgenic plant with increased resistance to bacterial leaf blight disease prepared by the method of claim 4. 삭제delete 제6항에 따른 식물체의 형질전환된 종자.Transformed seeds of plants according to claim 6. 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 LOC_Os09g04310 유전자를 유효성분으로 함유하는 식물체의 흰잎마름병(bacterial leaf blight disease) 저항성 증가용 조성물.A composition for increasing bacterial leaf blight disease resistance of a plant containing the LOC_ Os09g04310 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 as an active ingredient.
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Seok-Jun Moon 등. PLoS ONE. Vol. 13, No. 11, 페이지 1-22 (2018.11.16.)*

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