KR102289133B1

KR102289133B1 - 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균 및 이의 용도

Info

Publication number: KR102289133B1
Application number: KR1020200041154A
Authority: KR
Inventors: 이은열; 이옥경; 박예림
Original assignee: 경희대학교 산학협력단
Priority date: 2020-04-03
Filing date: 2020-04-03
Publication date: 2021-08-13

Abstract

본 발명은 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH)를 코딩하는 유전자를 포함하는 C3 내지 C6의 다이올 생산용 재조합 벡터, 상기 유전자가 도입된 C3 내지 C6의 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균, 상기 재조합 벡터 또는 형질전환 미생물을 포함하는 C3 내지 C6의 다이올 생산용 조성물, 상기 조성물을 포함하는 C3 내지 C6의 다이올 생산용 키트 및 생촉매로 상기 형질전환 미생물을 이용하여 C3-C6 알켄을 전환하는 단계를 포함하는 C3 내지 C6의 다이올 생산방법에 관한 것이다. 본 발명의 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH)가 도입된 형질전환 메탄자화균을 이용하면, 알켄으로부터 다이올을 생산할 수 있어 상온·상압에서 다이올을 대량 생산하는데 유용하게 사용될 수 있다.

Description

다이올 생산용 형질전환 메탄자화균 및 이의 용도 {Transformed methanotrophs for producing diols and uses thereof}

본 발명은 다이올 (diol) 생산용 형질전환 메탄자화균 (methanotroph) 및 이의 용도에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 C3 내지 C6의 다이올 생성능을 가지는 형질전환 메탄자화균 및 이를 이용한 다이올의 생산 방법에 관한 것이다.

현재까지 보고된 다이올의 산업적인 생산 기술은 석유로부터 높은 온도와 압력하에서 화학적 방법을 통해 얻어진다. 이러한 다이올의 생산은 알켄의 크래킹 (cracking), 에폭시데이션 (epoxidation), 가수분해 반응을 통한 일련의 과정이 필요하다. 이렇게 만들어진 다이올은 고부가가치를 가지며, 많은 응용 분야를 가진다. 예를 들어, 1,2-프로판다이올은 불포화 폴리에스테르 (UPRs) 산업, 플라스틱 산업, 제빙 및 부동액, 화장품, 식품, 제약, 염료의 첨가제, 액체 세제 등에서 사용된다. 1,2-부탄다이올은 폴리에스테르 수지의 제조 및 가소제 등에서 사용되며, 1,2-펜탄다이올은 향균 작용을 가지고 있어 헤어나 스킨 컨디셔닝제로 이용되고, 다른 방부제의 향균 활성을 증가시킬 수 있다. 1,2-헥산다이올은 화장품과 제약 분야에서 파라벤을 대체할 수 있는 방부제 역할로 주목받고 있다. 이러한 다이올들은 폭넓은 활용에도 불구하고 다이올의 화학적 생산은 초기 공정 설계 비용이 높고 생산성이 낮다는 한계점을 가지고 있다. 이에 반해 미생물을 활용한 생물학적 방법을 이용한 다이올의 생산은 상온·상압에서 반응이 가능하여 화학적 방법 대비 생산비용이 저렴하며 기질의 순도에 크게 영향을 받지 않고 고농도의 다이올을 생산할 수 있다.

현재까지 보고된 미생물을 이용한 다이올의 생물학적 생산 기술은 대부분 기질로 포도당이나 락테이트를 활용하였으며 이로부터 다이올을 생산하기 위하여 여러 단계의 반응을 수행하는 3종 이상의 외래 유전자의 도입이 필수적이다. 본 발명에서는 원유 정제 공정에서 발생하는 알켄을 기질로 활용함으로써 기존 기술 대비 기질 공급 비용을 절감할 수 있으며, 메탄자화균을 생촉매로 사용함으로써 단순한 반응 단계를 통해 기존 기술 대비 이론 수율 향상을 기대할 수 있다.

최근, 대사공학적으로 조작된 형질전환 메탄자화균을 이용한 메탄의 생물학적 전환을 고부가가치 물질의 생산이 많이 시도되었지만, 산업적으로 이용하기에는 목적 산물의 수율이 낮아 산업용 균주로써의 경쟁력 확보가 어려운 실정이다.

메탄자화균은 메탄을 유일 탄소원 및 에너지원으로 사용할 수 있는 원핵생물로써 메탄산화효소 (methane monooxygenase, MMO)를 보유하고 있어 알칸, 알켄, 에테르 및 방향족 화합물을 산화시킬 수 있으며 알켄의 에폭시데이션을 통해 에폭사이드를 형성할 수 있는 것으로 보고되어 있다. 메탄산화효소는 수용성 메탄산화효소(soluble methane monooxygenase; sMMO), 미립자메탄산화효소(particulate methane monooxygenase; pMMO)로 분류되며, pMMO는 C2-C4의 짧은 사슬의 알켄에 대한 높은 친화력을 가지며, sMMO는 pMMO대비 기질 특이성이 상대적으로 넓어 다양한 알켄 기질을 에폭시데이션하는 것으로 보고되고 있다.

본 특허에서는 메탄자화균에 내재된 메탄산화효소 (methane monooxygenase, MMO)의 활성을 이용하여 알켄을 에폭사이드로 전환하고, 메탄자화균 내 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase, EH)의 과발현을 통해 에폭사이드를 다이올로 전환함으로써 (도 1 참조) 두 단계의 단순한 반응 경로를 통해 저가의 알켄으로부터 고부가가치 다이올을 생산할 수 있다. 기존 당 또는 락테이트를 기질로 이용한 다이올 생산은 여러 반응 단계에서 NADH 등의 보조인자를 요구하며, 보조인자의 부족은 미생물의 성장 저하 또는 목적산물의 생산성 저하를 초래하는 것으로 알려져 있으나, 에폭사이드 가수분해 효소는 반응 단계에서 NADH 등의 보조인자를 요구하지 않아 보조인자의 부족으로 발생하는 목적산물의 생산성 저하 문제를 해결할 수 있는 기술로 평가받을 수 있다.

본 발명의 하나의 목적은 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase, EH)에 활성을 가져 다양한 다이올을 생산하는 형질전환 메탄자화균을 제공하는 것이다.

본 발명의 다른 목적은 상기 형질전환 메탄자화균을 이용한 알켄 기질로부터 다이올의 제조방법을 제공하는 것이다.

상기 과제를 해결하기 위하여,

본 발명은 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH)를 코딩하는 유전자를 포함하는 다이올 생산용 재조합 벡터를 제공한다.

본 발명의 일 실시예에 있어서, 상기 “에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH)”는 에폭사이드 (epoxide)를 다이올 (diol)로의 전환을 촉매하는 효소인 것일 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.

본 발명의 일 실시예에 있어서, 상기 “다이올”은 C3 내지 C6인 것일 수 있으며 더욱 구체적으로는 1,2-프로판다이올, 1,2-부탄다이올, 1,2-펜탄다이올 및 1,2-헥산다이올인 중 어느 하나 이상으로 이루어진 것일 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.

본 발명의 일 실시예에 있어서, 상기 “에폭사이드 가수분해효소”는 Caulobacter crescentus (Cc), Mugil cephalus (Mc) 또는 Rhodotorula glutinis (Rg) 유래인 것일 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.

본 발명의 일 실시예에 있어서, 상기 에폭사이드 가수분해효소 중 “Caulobacter crescentus (Cc) 유래의 에폭사이드 가수분해효소를 코딩하는 유전자”는 서열번호 1로 표시되고, “Mugil cephalus (Mc) 유래의 에폭사이드 가수분해효소를 코딩하는 유전자”는 서열번호 2로 표시되며, “Rhodotorula glutinis (Rg) 유래의 에폭사이드 가수분해효소를 코딩하는 유전자”는 서열번호 3으로 표시되는 것일 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.

또한, 본 발명은 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH)를 코딩하는 유전자가 도입된 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균을 제공한다.

본 발명의 일 실시예에 있어서, 상기 “메탄자화균”은 메틸로모나스 속 (Methylomonas), 메틸로박터 속 (Methylobacter), 메틸로코커스 속 (Methylococcus), 메틸로스페라 속 (Methylosphaera), 메틸로칼덤 속 (Methylocaldum), 메틸로글로버스 속 (Methyloglobus), 메틸로사르시나 속 (Methylosarcina), 메틸로프로펀더스 속 (Methyloprofundus), 메틸로썰머스 속 (Methylothermus), 메틸로할로비우스 속 (Methylohalobius), 메틸로게아 속 (Methylogaea), 메틸로마리넘 속 (Methylomarinum), 메틸로벌럼 속 (Methylovulum), 메틸로마리노범 속 (Methylomarinovum), 메틸로러브럼 속 (Methylorubrum), 메틸로파라코커스 속 (Methyloparacoccus), 메틸로시스티스 속 (Methylocystis), 메틸로셀라 속 (Methylocella), 메틸로캡사 속 (Methylocapsa), 메틸로퍼룰라 속 (Methylofurula), 메틸아시디필럼 속 (Methylacidiphilum), 메틸아시디마이크로비움 속 (Methylacidimicrobium), 메틸로마이크로비움 속 (Methylomicrobium) 또는 메틸로시너스 속 (Methylosinus) 균주인 것일 수 있고, 더욱 구체적으로는 메틸로시너스 트리코스포륨 (Methylosinus trichosporium) OB3b일 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.

또한, 본 발명은 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH)를 코딩하는 유전자를 포함하는 다이올 생산용 재조합 벡터, 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH)를 코딩하는 유전자가 도입된 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균 또는 상기 형질전환 메탄자화균의 배양산물을 포함하는, 다이올 생산용 조성물을 제공한다.

본 발명의 일 실시예에 있어서, 상기 “배양산물”은 상기 형질전환 메탄자화균의 배양물, 배양상등액, 파쇄물 및 이들의 분획물로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상인 것일 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.

아울러, 본 발명은 상기의 조성물을 포함하는 다이올 생산용 키트를 제공한다.

마지막으로, 본 발명은 상기의 형질전환 메탄자화균을 알켄을 포함하는 배지에서 배양하는 단계를 포함하는, 알켄기질로부터 다이올을 생산하는 방법을 제공한다.

본 발명의 형질전환 메탄자화균은 알켄으로부터 C3 내지 C6의 다이올을 생산할 수 있는바, 경제적으로 다이올을 대량 생산하는 방법으로 유용하게 사용될 수 있다.

도 1은 메탄자화균에서 다이올을 생산하기 위한 대사공학 경로를 간략히 도식화한 도이다.
도 2는 pAWP89 벡터에 CcEH gene (Caulobacter crescentus 유래의 에폭사이드 가수분해효소)가 형질전환된 벡터 맵을 도식화한 도이다.
도 3은 pAWP89 벡터에 McEH gene (Mugil cephalus 유래의 에폭사이드 가수분해효소)가 형질전환된 벡터 맵을 도식화한 도이다.
도 4는 pAWP89 벡터에 RgEH gene (Rhodotorula glutinis 유래 에폭사이드 가수분해효소)가 형질전환된 벡터 맵을 도식화한 도이다.
도 5는 M. trichosporium OB3b와 M. alcaliphilum 20Z를 생촉매로 사용하여 알켄으로부터 에폭시데이션 (epoxidation)을 수행한 결과를 나타낸 도이다M. alcaliphilum 20Z를 생촉매로 사용하여 알켄으로부터 에폭시데이션 (epoxidation)을 수행한 결과를 나타낸 도이다.
도 6은 M. trichosporium OB3b 형질 전환체와 M. alcaliphilum 20Z 형질 전환체를 생촉매로 사용하여 20% 알켄(v/v)이 보충된 바이알에서 보조인자로 formate를 첨가하여 다이올 생성을 생산한 결과를 나타낸 도이다.
도 7은 M. trichosporium OB3b 형질 전환체에서 C3 알켄으로부터 C3 다이올을 생산하는 반응조건 (pH, formate 의 농도, substrate 의 농도, cell 농도) 최적화를 나타낸 도이다.
도 8은 30% 알켄(v/v)이 보충된 바이알에서 보조인자로 formate를 첨가한 M. trichosporium OB3b 형질 전환체의 C3~C6 다이올의 생성을 시간별로 나타낸 도이다 (●; 1,2-propandiol, ○; 1,2-butanediol, ▼; 1,2-pentanediol,▽; 1,2-hexanediol).

이하, 첨부된 도면을 참조하여 본 발명의 실시예로 본 발명을 상세히 설명하기로 한다. 다만, 하기 실시예는 본 발명에 대한 예시로 제시되는 것으로, 당업자에게 주지 저명한 기술 또는 구성에 대한 구체적인 설명이 본 발명의 요지를 불필요하게 흐릴 수 있다고 판단되는 경우에는 그 상세한 설명을 생략할 수 있고, 이에 의해 본 발명이 제한되지는 않는다. 본 발명은 후술하는 특허 청구범위의 기재 및 그로부터 해석되는 균등 범주 내에서 다양한 변형 및 응용이 가능하다.

또한, 본 명세서에서 사용되는 용어 (terminology)들은 본 발명의 바람직한 실시예를 적절히 표현하기 위해 사용된 용어들로서, 이는 사용자, 운용자의 의도 또는 본 발명이 속하는 분야의 관례 등에 따라 달라질 수 있다. 따라서, 본 용어들에 대한 정의는 본 명세서 전반에 걸친 내용을 토대로 내려져야 할 것이다. 명세서 전체에서, 어떤 부분이 어떤 구성요소를 "포함"한다고 할 때, 이는 특별히 반대되는 기재가 없는 한 다른 구성요소를 제외하는 것이 아니라 다른 구성 요소를 더 포함할 수 있는 것을 의미한다.

본 명세서 전체에 걸쳐, 특정 물질의 농도를 나타내기 위하여 사용되는 '%'는 별도의 언급이 없는 경우, 고체/고체는 (w/w) %, 고체/액체는 (w/v) %, 그리고 액체/액체는 (v/v) %이다.

본 발명에서 사용되는 모든 기술용어는, 달리 정의되지 않는 이상, 본 발명의 관련 분야에서 통상의 당업자가 일반적으로 이해하는 바와 같은 의미로 사용된다. 또한 본 명세서에는 바람직한 방법이나 시료가 기재되나, 이와 유사하거나 동등한 것들도 본 발명의 범주에 포함된다. 본 명세서에 참고문헌으로 기재되는 모든 간행물의 내용은 본 발명에 도입된다.

일 측면에서, 본 발명자는 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH)를 코딩하는 유전자를 포함하는 다이올 생산용 재조합 벡터를 개발하였다.

일 측면에서, 본 발명자는 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH)를 코딩하는 유전자가 도입되어 알켄에서 다이올의 생산을 하는 유형 Ⅰ methanotrophs, Methylomicrobium alcaliphilum 20Z과 유형 II methanotrophs, Methylosinus trichosporium OB3b의 대사공학적으로 형질전환된 균주를 개발하였다.

일 측면에서, 본 발명자는 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH)를 코딩하는 유전자를 포함하는 다이올 생산용 재조합 벡터, 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH)를 코딩하는 유전자가 도입된 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균 또는 상기 형질전환 메탄자화균의 배양산물을 포함하는, 다이올 생산용 조성물을 개발하였다.

일 측면에서, 본 발명자는 상기의 형질전환 메탄자화균을 알켄을 포함하는 배지에서 배양하는 단계를 포함하는, 알켄 기질로부터 다이올을 생산하는 방법을 개발하였다.

이를 구체적으로 설명하면 다음과 같다. 한편, 본 발명에서 개시된 각각의 설명 및 실시 형태는 각각의 다른 설명 및 실시 형태에도 적용될 수 있다. 즉, 본 발명에서 개시된 다양한 요소들의 모든 조합이 본 발명의 범주에 속한다. 또한, 하기 기술된 구체적인 서술에 의하여 본 발명의 범주가 제한된다고 볼 수 없다. 상기 목적을 달성하기 위한 본 발명의 양태는 epoxide hydrolase 효소의 활성을 가진 다양한 다이올의 생산용 형질전환 메탄자화균을 제공한다.

또한, 발명자들은 다양한 다이올을 생산하기 위한 보다 환경친화적인 방법으로, 바이오매스를 활용한 방법에 대해 예의 연구 노력한 결과, 놀랍게도 본 발명의 형질전환 메탄자화균을 이용할 경우 다양한 다이올이 생산 가능함을 확인하였다. 메탄자화균에 다이올 생합성 경로를 도입함으로써 알켄으로부터 다이올을 생산할 수 있음은 지금까지 전혀 알려지지 않았고, 본 발명을 통해 최초로 개발되었다는 점에서 그 의의가 매우 크다고 할 수 있다.

본 발명에서 용어 “다이올 (diol)”은 두 개의 하이드록시기 (-OH 그룹)을 포함하고 있는 화합물이고, 1,2-프로판다이올은 불포화 폴리에스테르 (UPRs) 산업, 플라스틱 산업, 제빙 및 부동액, 화장품, 식품, 제약, 염료의 첨가제, 액체 세제 등에서 사용된다. 1,2-부탄다이올은 폴리에스테르 수지의 제조 및 가소제 등에서 사용된다. 1,2-펜탄다이올은 향균 작용을 가지고 있어 헤어나 스킨 컨디셔닝제로 이용되며, 다른 방부제의 향균 활성을 증가시킬 수 있다. 1,2-헥산다이올은 화장품과 제약 분야에서 파라벤을 대체할 수 있는 방부제 역할로 사용될 수 있다.

본 발명에서 용어 “메탄자화균 (methanotroph)”은 메탄을 주요 탄소원 또는 에너지원으로 사용하는 세균을 의미한다. 상기 메탄자화균은 본 발명에서 형질전환의 대상이 되는 숙주 균주를 의미할 수 있으며, 본 발명의 목적상 알켄을 기질로 사용하여, 에폭사이드를 거쳐 최종적으로 다이올 (diol)을 생산할 수 있는 한 특별히 이에 제한되지 않는다.

상기 메탄자화균은 메탄 등 C1 화합물을 에너지원으로 사용할 수 있는 것인한 특별히 이에 제한되지 않으나, 메틸로모나스 속 (Methylomonas), 메틸로박터속 (Methylobacter), 메틸로코커스 속 (Methylococcus), 메틸로스페라 속 (Methylosphaera), 메틸로칼덤 속 (Methylocaldum), 메틸로글로버스 속 (Methyloglobus), 메틸로사르시나 속 (Methylosarcina), 메틸로프로펀더스 속 (Methyloprofundus), 메틸로썰머스 속 (Methylothermus), 메틸로할로비우스 속 (Methylohalobius), 메틸로게아 속 (Methylogaea), 메틸로마리넘 속 (Methylomarinum), 메틸로벌럼 속 (Methylovulum), 메틸로마리노범 속 (Methylomarinovum), 메틸로러브럼 속 (Methylorubrum), 메틸로파라코커스 속 (Methyloparacoccus), 메틸로시스티스 속 (Methylocystis), 메틸로셀라 속 (Methylocella), 메틸로캡사 속 (Methylocapsa), 메틸로퍼룰라 속 (Methylofurula), 메틸아시디필럼 속 (Methylacidiphilum), 메틸아시디마이크로비움 속 (Methylacidimicrobium), 메틸로마이크로비움 속 (Methylomicrobium) 또는 메틸로시너스 속 (Methylosinus) 균주일 수 있으며, 구체적으로 메틸로시너스 트리코스포륨 (Methylosinus trichosporium) OB3b, 메틸로머이크로븀 알칼리필륨 (Methylomicrobium alcaliphilum) 20Z일 수 있다.

이러한 메탄자화균을 이용한 바이오 전환 공정의 경우, 독성이 있는 부산물을 피할 수 있어 환경적인 면에서 장점이 있으며, 기존 산업적으로 이용되는 화학적 공정과 비교하여 상온, 상압에서 전환이 가능하므로 적은 에너지가 소요된다.

본 발명에서 용어 “형질전환 메탄자화균”은 상기 메탄자화균의 유전자를 도입하거나 또는 제거하여 형질을 전환시킨 균주를 의미한다.

구체적으로, 본 발명의 형질전환 메탄자화균은 에폭사이드 가수분해효소가 발현된 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. 본 발명에 있어서, 상기 형질전환 메탄자화균은 다이올 생산능이 없는 야생형에 비해 다이올 생산능이 현저히 향상된 것일 수 있다.

본 발명에서 용어 “에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase, EH)”는 에폭사이드 하이드라타제 (epoxide hydratase)로도 알려져 있으며, epoxide를 diol로 전환을 촉매하는 효소를 의미한다.

상기 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase, EH) 를 코딩하는 유전자는 Caulobacter crescentus 유래일 수 있으며, 구체적으로 서열번호 1의 염기서열로 구성된 것일 수 있다. 보다 구체적으로, 상기 서열번호 1의 서열과 70% 이상, 구체적으로는 80% 이상, 보다 구체적으로는 90%이상, 보다 더 구체적으로는 95%이상, 가장 구체적으로는 99% 이상의 상동성을 나타내는 염기서열로서 실질적으로 epoxide hydrolase 활성을 가진 단백질 발현 가능한 경우, 제한 없이 포함될 수 있다.

상기 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase, EH) 를 코딩하는 유전자는 Mugil cephalus 유래일 수 있으며, 구체적으로 서열번호 2의 염기서열로 구성된 것일 수 있다. 보다 구체적으로, 상기 서열번호 2의 서열과 70% 이상, 구체적으로는 80% 이상, 보다 구체적으로는 90%이상, 보다 더 구체적으로는 95%이상, 가장 구체적으로는 99% 이상의 상동성을 나타내는 염기서열로서 실질적으로 epoxide hydrolase 활성을 가진 단백질 발현 가능한 경우, 제한 없이 포함될 수 있다.

상기 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase, EH) 를 코딩하는 유전자는 Rhodotorula glutinis 유래일 수 있으며, 구체적으로 서열번호 3의 염기서열로 구성된 것일 수 있다. 보다 구체적으로, 상기 서열번호 3의 서열과 70% 이상, 구체적으로는 80% 이상, 보다 구체적으로는 90%이상, 보다 더 구체적으로는 95%이상, 가장 구체적으로는 99% 이상의 상동성을 나타내는 염기서열로서 실질적으로 epoxide hydrolase 활성을 가진 단백질 발현 가능한 경우, 제한 없이 포함될 수 있다.

전술한 효소는 본 발명에서 사용되는 활성을 나타내는 한, 각 효소 또는 단백질을 구성하는 아미노산 서열의 하나 이상의 위치에서의 하나 이상의 아미노산이 치환, 결실, 삽입, 첨가 또는 역위된 아미노산 서열을 포함할 수 있는데, 상기 효소의 활성을 나타내는 한, 상기 각 효소 또는 단백질의 아미노산 서열에 대하여, 80% 이상, 구체적으로는 90% 이상, 보다 구체적으로는 95% 이상, 보다 더 구체적으로는 99% 이상의 상동성을 가지는 것으로, 실질적으로 효소와 동일하거나 상응하는 활성을 가지는 아미노산 서열의 경우도 본 발명의 범주에 포함됨은 당업자에게 자명하다.

상기 목적을 달성하기 위한 본 발명의 다른 하나의 양태는 상기 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균을 배양하는 단계를 포함하는, 다이올 제조방법을 제공하는 것이다.

본 발명에서 용어 "배양"은 목적하는 세포 또는 조직 등을 인공적으로 조절한 환경 조건에서 생육하는 것을 의미한다. 상기 환경 조건은 대표적으로 영양소, 온도, 삼투압, pH, 기체 조성, 빛 등이 있으나, 직접적인 영향을 주는 것은 배지이며, 배지는 크게 액체배지와 고체 배지로 나뉠 수 있다. 본 발명의 형질전환 메탄자화균의 배양은 당업계에 널리 알려져 있는 방법을 이용하여 수행할 수 있다.

구체적으로, 상기 배양은 상기 형질전환 메탄자화균으로부터 다이올을 생산할 수 있는 한 특별히 이에 제한되지 않으나, 유가 배양 또는 주입배치 또는 반복 유가 배양 공정 (fed batch or repeated fed batch process)에서 연속식으로 배양할 수 있다. 배양에 사용되는 배지는 메탄자화균의 배양에 사용되는 것으로 알려진 NMS (nitrate mineral salts) 배지를 사용할 수 있고, 메탄자화균에 따라 상기 배지에 포함된 성분 또는 이의 함량을 적절히 조절한 배지를 사용할 수 있으나, 이에 특별히 제한되는 것은 아니다. 본 발명에서 형질전환 메탄자화균의 배양 온도는 15℃ 내지 45℃, 구체적으로 20℃ 내지 40℃, 보다 구체적으로 25℃ 내지 35℃일 수 있으며, 메탄과 균주의 원활한 접촉을 위해, 150rpm 내지 300rpm, 구체적으로 180rpm 내지 270rpm, 보다 구체적으로 200rpm 내지 250rpm으로 교반할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.

본 발명에 있어서, 상기 다이올의 제조방법은 상기 형질전환 메탄자화균을 알켄을 포함하는 배양액에 배양하는 것일 수 있다.

본 발명에 있어서, 상기 제조방법은 배양액으로부터 다이올을 회수하는 단계를 추가로 포함할 수 있다. 상기 다이올을 회수하는 단계는 배양 방법에 따라 당업계에 공지된 적합한 방법에 의해 수행될 수 있다.

구체적으로, 공지된 다이올 회수 방법은 특별히 이에 제한되지 않으나, 원심분리, 여과, 추출, 분무, 건조, 증발, 침전, 결정화, 전기영동, 분별 용해 (예를 들면 암모늄 설페이트 침전), 크로마토그래피 (예를 들면 HPLC, GC, 이온교환, 친화성, 소수성 및 크기배제) 등의 방법이 사용될 수 있다.

이하, 실시예를 통하여 본 발명을 보다 자세히 설명한다. 다만, 상기 실시예 및 실험예는 본 발명에 대한 예시로 제시되는 것으로, 당업자에게 주지 저명한 기술 또는 구성에 대한 구체적인 설명이 본 발명의 요지를 불필요하게 흐릴 수 있다고 판단되는 경우에는 그 상세한 설명을 생략할 수 있고, 이에 의해 본 발명이 제한되지는 않는다. 본 발명은 후술하는 특허청구범위의 기재 및 그로부터 해석되는 균등 범주 내에서 다양한 변형 및 응용이 가능하다.

실시예 1. 시약 및 올리고뉴클레오티드

Lamp Pfu 중합 효소 및 제한 효소는 BioFACT (한국)에서 구입하였다. Kit of Wizard Genomic DNA Purification Kit (Promega, USA)를 사용하여 게놈 DNA를 추출하였다. PCR 정제 키트 및 플라스미드 추출 키트는 GeneAll Biotechnology (한국)에서 구입하였다. NE (England)에서 구입한 모든 플라스미드는 Gibson 어셈블리를 사용하여 제작하였다.

실시예 2. 형질전환 메탄자화균을 이용한 다이올의 생산성을 위한 세포 배양 및 회수

M. trichosporium OB3b (NCIMB 11131)은 2μM의 CuSO₄를 포함한 NMS (nitrate mineral salt) 배지에서 배양하였다. M. trichosporium OB3b 세포를 50ml의 NMS 배지가 들어있고 스크류 캡으로 밀봉된 500ml 배플 플라스크 (baffled flask)에서 30℃로 230rpm으로 교반하며 배양하였다. 기밀식 주사기 (gas-tight syringe)를 사용한 가스 교환에 의해 최종 농도 20% (v/v) 메탄을 공급하였으며, 헤드스페이스를 매일 새것으로 교환하였다. M. alcaliphilum 20Z은 1%의 메탄올을 포함한 20Z NMS 배지에서 배양되었다. M. alcaliphilum 20Z 세포를 50ml의 20Z NMS 배지가 들어있고 스크류 캡으로 밀봉된 500ml 배플 플라스크에서 30℃로 230rpm으로 교반하며 배양하였다. 세포 배양의 광학 밀도는 1cm 경로 길이의 1.5ml 큐벳을 사용하여 IMPLEN 광도계에서 측정하였다. 50μg/ml의 최종 농도를 갖는 카나마이신 (Kan)을 재조합 플라스미드를 함유하는 M. trichosporium OB3b, M. alcaliphilum 20Z 및 대장균 모두를 선별하는 데에 사용하였다.

실시예 3. 에폭사이드 및 다이올의 분석

에폭사이드의 정량은 Beta-DEX 컬럼 (30m X 0.25mm X 0.25μm; SUPELCO)을 장착한 GC (Younglin)를 사용하여 측정하였다. 다이올의 정량은 RI 검출기 및 Aminex HPX-87H 유기산 컬럼 (300mm Х 7.8mm; Bio-Rad)을 장착한 HPLC (Jasco Co., Japan)와 FID 검출기 및 HP-INNOWAX 컬럼 (30m X 0.53mm X 1.00μm; Agilent Technology)을 장착한 GC (Younglin)를 사용하여 측정하였다. HPLC는 황산 (5mM)을 60℃에서 유속 0.7mL/분으로 이동상으로 사용하였다. 모든 반응산물은 사용하기 전 0.2μm 멤브레인을 통해 여과하였다.

실시예 4. 야생형 메탄자화균을 이용한 알켄 기질로부터 에폭사이드 생산, 추출 및 정량 확인

상기 실시예 2의 방법으로 형질전환 메탄자화균을 배양한 후, 상기 실시예 3의 방법으로 에폭사이드를 분석 및 정량하였다.

메탄자화균의 유형에 따라 보유하고 있는 MMO의 종류가 다르므로 본 발명의 실시 예에서는, type I의 pMMO와, type II의 sMMO를 이용하여 알켄에 대한 에폭사이드 전환 효율을 평가하고자 실험을 진행하였다. M. trichosporium OB3b와 M. alcaliphilum 20Z 균주를 생촉매로 사용하여 각각 12시간의 반응을 수행하였고, M. alcaliphilum 20Z는 C3-C5 알켄으로부터 각각 73.28 mg/L의 프로필렌 옥사이드, 42.69mg/L의 1,2-에폭시부탄, 12.91 mg/L의 1,2-에폭시펜탄을 생산하였으며 M. trichosporium OB3b는 C3-C6 알켄으로부터 86.81mg/L의 프로필렌 옥사이드, 69.01mg/L의 1,2-에폭시부탄, 28.08 mg/L의 1,2-에폭시펜탄, 및 20.13,mg/L의 1,2-에폭시헥산이 생산됨을 확인하였다. 각각의 알켄 기질에 대하여 M. trichosporium OB3b가 M. alcaliphilum 20Z보다 에폭시데이션 활성이 우수함을 확인할 수 있었다 (C3 에폭사이드 1.18배, C4 에폭사이드 1.62배, C5 에폭사이드 2.18배).

서열번호	유전자	서열
1	CcEH	atgacggacaccccttcaaaggcccttgctctccccgccccgcagtacgccgaggtcaacggcatccgcatggcctattacgaggctggaccgcgccagggcgttccgatcgtcttctgccatggcttccccgagctggcgttctcgtggcgccatcagatcgccgccctcgccgccgccgggcgctgggtgatcgcgcccgaccagcgcggctatggcctgactcccggtcccgaagcggtcgaggcctatgacatggagcacctgaccggcgaccttgtgggcctgctcgaccatctgggcgtggagaaagcgatcttcgtcggtcacgactggggcggcatcgtcgtgtggcaactgccgctgatgcaccctggccgggtcgccgggatcatcgggctgaacacgcccttcttcccgcgcctgccgctggatccgatccagatgtaccgcaacgcctatggcgacgacatgtacatcgtccacttccagcagccgggcgtcgccgatgcgcaactgggcgcggatgtggaaaagaccatccgctacttcatgcgcaagcccaagggcacgcaggaggacttcctggcccagccggccgagcgtcgcagcctggccttgcagaccgccctcgcccactacgagccgtccaccgacgacaaccagttcctgacgcccgacgagctggccttcttcgtcgaggcgttccagcgcacaggcttcaccggcggcatcaactggtatcgcaacttcacccgcaactgggagcgttcagagcacctgccgcgccgggtcgacggcattccctgcctgatgatcatggcggagctggacgtcgtgctgccccccgccatggccgaccgcatgggcgaccagatcagcgaccttgagaaggtgctgatcgagggcagcggccactggacccagcaggaaaaacccgccgaggtgaacgccgcgctcctggactggctggaccgccgcttcccgctttag
2	McEH	aggagaaaagtgaaaaccattcctctgggtgaaggctggtggggagcagggagaaagccactgtcagaggatgatcaaatccatccctttaaagtgcaaacgtcagataaagagattcaggacctccatgagcgcattgacagaacccgctacgctgatcccttagaagatagctgcttccactatggcttcaattccacttatctcaagaaagtggtttcctactggagacatgagtttgactggaagaagcaggtggcaatgcttaatgagtatccacactttaaaaccaaaatagaaggactggatatacacttcatccacgtgcgcccgcctcgccgcgagaaccaaaaggtcctgcctctcatgcttgtccacggctggccgggctcgttctacgagttctacaagattctgccacttctcacgcagaaccacgacggtgtcgcgtttgaggtcatatgcccatccatccccggctacggtttctccgacgcccctcataaacaagggttcaacaccctcgctgctgccagggttttcctgacactgatggagcgtttggggttctcaaagttctatctgcagggaggagactggggctcgctcatcaccaccaacatggcacagatgaagcctctctgtgtgaaaggtctccacctaaacatgttcctatcaaggagaggtttcaaaatgctgttgtccctcatgattggtccgtatctgcccttcctggtgggcttcagtcgggaagatgttcgccgcttgttcccctactttgagaagaatgtatggagcatgctgagggaatcaggctaccttcacattcaggccactaaaccggacactgcaggttgtggagtgaataactctcctgtaggcttggcagcctacatcctggaaaagttctccacctggactgattcaaacaaccgagaactggaggatggtgggctggaaagaaaattcagcctgaatgaactcttgacaaatgtcatgatctactggactacaggctccatagtgtcctccatgcgcttctacaaagagaacttaaagagtaatcctgagagcagagtggatggaaagactaatgtttacgtgcctactggactggctgccttccctggagagctgatgcattgccctaaatcatgggcgcagcttaagtatgaagacatctacacctacacattcatgccccgaggaggccacttcgctgcctttgaagagcccgagctgttagccaacgacattttccattttgtcaaaaaagtggagaagaagttctga
3	RgEH	ATGGCGACACACACATTCGCTTCGCCTCCCACCCGCTTCACCGTCGACATCCCGCAGTCAGAAGTCGACGAACTTCACTTCCGACTCGACAAGAACCGCTGGCCAGCGGCAGAGATCGTTCCGGAGGATGGGACGGACGATCCGACGGCGTTTGGTCTTGGAGCAGGACCGACGCTGCCACTCATGAAGGAACTGGCGAAGGGTTGGCGCAAGTTCGACTGGAAGAAGGCGCAGGACGACCTCAACACCTTCGAGCACTACACTGTCGAAATTGAGGATCTCTCGATCCACTTCCTCCACCACCGCTCGACTCGTCCGAAGGCTGTTCCCCTCATCCTCTGCCACGGCTGGCCAGGCCACTTCGGCGAGTTCCTCAACGTCATCCCGCTCTTGACGGAGCCGGCGGACCCGTCTGCACAGGCGTTCCACGTCGTCGTGCCCTCGATGCCTGGTTATGCCTGGTCTTCGCCTCCTCCGTCCTCCAAGTGGAGCATGCCTGACACCGCGCGGGTCTTCGACAAGCTTATGACCGGGCTTGGCTACGAGAAGTACATGGCGCAGGGCGGAGACTGGGGCAGCATCGCTGCTCGCTGCCTTGGCTCGCTTCACAAGGATCACTGCAAAGCCGTCCACCTCAACTTCCTCCCCGTCTTCCCGCCCGTCCCGATGTGGCTCATCAACCCACACACGCTCCTCGCCTGGGCTCCGCGCTTCCTCGTGCCGGAGAAGCAGGCTGCGCGTATGAAGCGCGGGTTGGCGTATCTCGAGAAGGGCTCCGCCTACTACGTCATGCAGCAGTTGACGCCTCGCACGCCCGCGTACGGTCTGACCGACAGTCCCGTCGGCTTGCTGGCCTGGATTGGCGAGAAGTTCGAGCCGACCATTCAGGAGGCGAGCAAGCAAGCCCAGCCGACCCTGACTCGTGACGAGCTCTACTTCACCTGCTCGCTGTACTGGTTCACCCGCTCAATCGGCACCTCCTTCCTCCCCTACTCGCTCAACTCGCACTTCACCACCTTCCTGACCGACAGCAAGTACCACTTGCCCAACTTTGCCCTCTCGCTCTACCCGGGCGAGATCTACTGCCCTGCAGAACGGGACGCTAAGCGAACTGGCAACCTCAAGTGGATCAAGGAGGCTCCGGACGGAGGACACTTTGCTGCGCTCGAGAAGCCCGACGTGTTTGTCGACCATCTCAGGGAGGCGTTCGGCGTCATGTGGGAGAAG

실시예 5. 다이올 생합성 경로 구축을 위한 벡터시스템 구축

프라이머 pAWP89-Tac-For/pAWP89-Tac-Rev (표 2)를 사용하여 벡터 pAWP89를 선형화하기 위해 역 PCR을 사용하였다.

서열번호	프라이머	서열
4	pAWP89-Tac-For	TAGTTGTCGGGAAGATGCGT
5	pAWP89-Tac-Rev	AGCTGTTTCCTGTGTGAATA
6	CcEH-For	TTCACACAGGAAACAGCTATGACGGACACCCCTTCAAA
7	CcEH-Rev	GCATCTTCCCGACAACTACTAAAGCGGGAAGCGGCG
8	McEH-For	TTCACACAGGAAACAGCTATGCAAAGACTGGAGCTTTTGA
9	McEH-Rev	GCATCTTCCCGACAACTATCAGAACTTCTTCTCCACTT
10	RgEH-For	TTCACACAGGAAACAGCATGGCGACACACACATTCGCTTC
11	RgEH-Rev	GCATCTTCCCGACAACTTCTCCCACATGACGCCGAACG

에폭사이드 가수분해 효소 (epoxide hydrolase) 유전자를 게놈 DNA로부터 증폭시키고 Gibson 어셈블리 (표 3)에 의해 pAWP89 벡터로 구축하였다.

플라스미드 이름	특징	문헌
pAWP89		Puri et al., 2015
pAWP89-CcEH	pAWP89-CcEH containing CcEH gene from E.coli driven by P _tac promoter	This study
pAWP89-McEH	pAWP89-McEH containing McEH gene from E.coli driven by P _tac promoter	This study
pAWP89-RgEH	pAWP89-RgEH containing RgEH gene from E.coli driven by P _tac promoter	This study
균주	특징	문헌
Escherichia coli MG1655	Cloning host	Invitrogen
Escherichia coli S17-1
Methanotrophs
Methylosinus trichosporium OB3b	Wild type strain	Ono, M., & Okura, I. 1990
Methylomicrobium alcaliphilum 20Z	Wild type strain	This study
OB3b/CcEH	M. trichosporium OB3b harboring pAWP89-CcEH	This study
OB3b/McEH	M. trichosporium OB3b harboring pAWP89-McEH	This study
OB3b/RgEH	M. trichosporium OB3b harboring pAWP89-RgEH	This study
20Z/CcEH	M. alcaliphilum 20Z harboring pAWP89-CcEH	This study
20Z/McEH	M. alcaliphilum 20Z harboring pAWP89-McEH	This study
20Z/RgEH	M. alcaliphilum 20Z harboring pAWP89-RgEH	This study

상기 3가지 형태의 EH 유전자들은 각각 tac 프로모터하에 M. trichosporium OB3b와 M. alcaliphilum 20Z에 각각 발현시켰다.

실시예 6. 다이올 생합성 경로 구축을 위한 벡터시스템의 M. trichosporium OB3b로의 형질전환

상기 실시예 5를 통하여 얻어진 재조합 발현용 벡터를 야생형 메탄자화균 M. trichosporium OB3b에 형질전환 시키기 위하여, 컨주게이션 (conjugation)을 실시하였다. OD₆₀₀에서 약 0.2까지 자란 M. trichosporium OB3b를 사용하였다. M. trichosporium OB3b 50ml 및 도입될 플라스미드를 포함하는 공여자 E. coli S17-1 10ml를 NMS로 세척하였다. 이후, 이들을 0.2μm 멸균 니트로셀룰로스 필터에 혼합된 세포를 도포하였다. 필터를 0.02% (w/v) 프로테오스-펩톤 (proteose-peptone)을 포함한 NMS 한천 배지에 놓고, 메탄 (대기 중 50 %)의 존재 하에 30℃에서 24시간 동안 배양하였다. 0.02% (w/v) 프로테오스-펩톤 (proteose-peptone)을 포함한 NMS 한천 플레이트로부터의 세포를 10mL NMS 배지에 재현탁시키고, 7000g에서 5분 동안 원심분리하여 세포를 회수하였다. 세포 펠렛은 카나마이신이 포함된 NMS 한천에 도말하고 단일한 콜로니가 나타날 때까지 메탄/공기 (1:1, v/v)와 함께 2-3주 동안 배양하였다.

상기 실시예 5를 통하여 얻어진 재조합 발현용 벡터를 야생형 메탄자화균 M. alcaliphilum 20Z에 형질전환 시키기 위하여, 전기천공법 (electrporation)을 실시하였다. OD600에서 0.7까지 자란 M. alcaliphilum 20Z를 사용하였다. M. alcaliphilum 20Z 50ml는 하베스팅되어 멸균수에 재현탁하였다. 재현탁된 M. alcaliphilum 20Z에 도입될 플라스미드는 cuvette내에서 전기 충격을 통하여 형질 전환되었다. cuvette내의 형질 전환된 M. alcaliphilum 20Z는 20Z NMS에 하루 동안 안정화한 후, 5000g에서 10분 동안 원심분리하여 세포를 회수하였다. 세포 펠렛은 카나마이신과 메탄올이 포함된 20 NMS 한천에 도말하고 단일한 콜로니가 나타날 때까지 10일 동안 배양하였다.

형질전환 메탄자화균을 선별하기 위하여, 16s rDNA 분석법을 통하여 M. trichosporium OB3b와 M. alcaliphilum 20Z임을 확인하고 프라이머를 이용하여 각각의 유전자가 삽입되었는지 확인하였다. 이를 통해 형질전환 메탄자화균을 얻었다.

실시예 7. 형질전환 메탄자화균을 이용한 알켄 기질로부터 다이올 생산, 추출 및 정량 확인

상기 실시예 2의 방법으로 형질전환 메탄자화균을 배양한 후 알켄으로부터 다이올 전환 반응을 수행하고, 상기 실시예 3의 방법으로 다이올을 분석 및 정량하였다.

본 발명의 실시예에서는, Caulobacter crescentus (Cc) 유래의 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH) 유전자, Mugil cephalus (Mc) 유래의 에폭사이드 가수분해효소 유전자, Rhodotorula glutinis (Rg) 유래의 에폭사이드 가수분해효소 유전자들을 type II 메탄자화균 M. trichosporium OB3b 내, type Ⅰ 메탄자화균 M. alcaliphilum 20Z에 발현시킨 결과, 12시간의 반응에서 CcEH를 발현시킨 M. trichosporium OB3b, M. alcaliphilum 20Z에서 각각 92.93, 27.76 mg/L의 1,2-프로판다이올, 44.15, 7.86 mg/L의 1,2-부탄다이올이 생산됨을 확인하였다. McEH를 발현시킨 M. trichosporium OB3b, M. alcaliphilum 20Z 각각 66.66, 18.13 mg/L의 1,2-프로판다이올, 9.68, 4.83 mg/L의 1,2-부탄다이올이 생산됨을 확인하였다. RgEH를 발현시킨 M. trichosporium OB3b, M. alcaliphilum 20Z 각각 85.51, 26.48 mg/L의 1,2-프로판다이올, 24.94, 6.50 mg/L의 1,2-부탄다이올이 생산됨을 확인하였다. 이 결과로서, CcEH를 발현시킨 형질전환 균주가 가장 높은 농도의 다이올을 생산하였으며, 이는 가장 낮은 전환을 보인 McEH에 비해 1,2-프로판다이올 1.39배, 1,2-부탄다이올 1.53배 더 높은 다이올 농도를 보였다. 추가적으로 CcEH가 형질전환된 M. trichosporium OB3b가 M. alcaliphilum 20Z보다 C3 다이올에서 2.10배, C4 다이올에서 3.53배 더 높았다 (도 6 참조).

실시예 8. 형질 전환 M. trichosporium OB3b을 이용한 C3 알켄 기질로부터 C3 다이올 생산의 최적화 조건 확인

본 발명의 실시예에서는, 형질 전환된 M. trichosporium OB3b에서의 프로펜 기질로부터 1,2-프로판다이올의 생산량을 증가시키기 위하여 다양한 조건 변화 하에서 진행하였다. 20mM의 sodium phosphate buffer의 pH를 6, 7, 8, 9에서 반응시킨 결과, pH 6에서 84.67 mg/L, pH 7에서 96.17 mg/L, pH 8에서 85.68 mg/L, pH 9에서 73.25mg/L의 1,2-프로판다이올이 생산됨은 확인하였다. 이와 같은 결과에서, pH 7에서 가장 높은 농도의 다이올이 생산되었다 (도 7(A) 참조).

NADH의 공급을 위해 추가적으로 넣어주는 sodium formate의 농도를 0, 10, 20, 40, 80mM에서 반응시킨 결과, 0mM의 formate 하에서 64.61 mg/L, 10mM의 formate 하에서 79.15 mg/L, 20mM의 formate 하에서 85.99 mg/L, 40mM의 formate 하에서 94.28 mg/L, 80mM의 formate 하에서 86.93 mg/L의 1,2-프로판다이올이 생산됨을 확인하였다. 이와 같은 결과에서, 40mM의 formate 농도에서 가장 높은 농도의 1,2-프로판다이올이 생산되었다 (도 7(B) 참조).

기질로서 기체를 사용하였기 때문에 헤드스페이스의 기질 농도에 따라 알켄으로부터 다이올 생산능을 평가하기 위하여 반응을 실시하였다. 헤드스페이스에 10. 20, 30, 40, 50%의 알켄을 각각 주입하고 반응시킨 결과, 헤드스페이스의 10% 기질에서 90.10 mg/L, 헤드스페이스의 20% 기질에서 102.2 mg/L, 헤드스페이스의 30% 기질에서 107.7 mg/L, 헤드스페이스의 40% 기질에서 108.8 mg/L, 헤드스페이스의 50% 기질에서 109.8 mg/L의 1,2-프로판다이올이 생산됨을 확인하였다. 이를 통해, 헤드스페이스의 기질 농도를 30% 이상 공급하더라도 다이올 생산량이 크게 증가하지 않는 것을 확인하였다 (도 7(C) 참조).

균주의 농도를 1, 3, 5, 7, 10 g DCW/L에서 반응시킨 결과, 1g DCW/L의 셀 농도에서 105.64 mg/L, 3g DCW/L의 셀 농도에서 182.69 mg/L, 5g DCW/L의 셀 농도에서 222.39 mg/L, 7g DCW/L의 셀 농도에서 251.18 mg/L, 10g DCW/L의 셀 농도에서 263.46 mg/L의 1,2-프로판다이올이 생산됨을 확인하였으며, 10g DCW/L의 셀 농도에서 가장 높은 농도의 다이올을 생산하였다 (도 7(D) 참조).

실시예 9. 형질 전환 M. trichosporium OB3b을 이용한 C3-C6 알켄 기질로부터 C3-C6 다이올 생산

상기 실시예 2의 방법으로 형질전환 메탄자화균을 배양한 후 알켄으로부터 다이올 전환 반응을 수행하고, 상기 실시예 3의 방법으로 다이올을 분석 및 정량하였다.상기 실시예 7의 방법으로 알켄으로부터 다이올 전환 실험을 진행하였으며, 효율적인 실험을 위해 7g/L로 진행하였다.

본 발명의 실시 예에서는, 시간에 따른 C3~C6 알켄으로부터 C3~C6 다이올을 생산하였으며, 결과로부터 12시간에서 255.08mg/L의 1,2-프로판다이올, 165.09mg/L의 1,2-부탄다이올, 43.38mg/L의 1,2-펜탄다이올, 16.44mg/L의 1,2-헥산다이올이 생산됨을 확인하였다.

이 결과는 형질전환된 메탄자화균을 사용하여 유일한 탄소원으로서 알켄으로부터 다이올의 생산됨을 확인하였으므로 본 발명을 완성하였다 (도 8 참조).

이제까지 본 발명에 대하여 그 바람직한 실시예들을 중심으로 살펴보았다. 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자는 본 발명이 본 발명의 본질적인 특성에서 벗어나지 않는 범위에서 변형된 형태로 구현될 수 있음을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 개시된 실시 예들은 한정적인 관점이 아니라 설명적인 관점에서 고려되어야 한다. 본 발명의 범위는 전술한 설명이 아니라 특허 청구 범위에 나타나 있으며, 그와 동등한 범위 내에 있는 모든 차이점은 본 발명에 포함된 것으로 해석되어야 할 것이다.

<110> University-Industry Cooperation Group of Kyung Hee University <120> Transformed methanotrophs for producing diols and uses thereof <130> PN2002-085 <160> 3 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 993 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CcEH gene <400> 1 atgacggaca ccccttcaaa ggcccttgct ctccccgccc cgcagtacgc cgaggtcaac 60 ggcatccgca tggcctatta cgaggctgga ccgcgccagg gcgttccgat cgtcttctgc 120 catggcttcc ccgagctggc gttctcgtgg cgccatcaga tcgccgccct cgccgccgcc 180 gggcgctggg tgatcgcgcc cgaccagcgc ggctatggcc tgactcccgg tcccgaagcg 240 gtcgaggcct atgacatgga gcacctgacc ggcgaccttg tgggcctgct cgaccatctg 300 ggcgtggaga aagcgatctt cgtcggtcac gactggggcg gcatcgtcgt gtggcaactg 360 ccgctgatgc accctggccg ggtcgccggg atcatcgggc tgaacacgcc cttcttcccg 420 cgcctgccgc tggatccgat ccagatgtac cgcaacgcct atggcgacga catgtacatc 480 gtccacttcc agcagccggg cgtcgccgat gcgcaactgg gcgcggatgt ggaaaagacc 540 atccgctact tcatgcgcaa gcccaagggc acgcaggagg acttcctggc ccagccggcc 600 gagcgtcgca gcctggcctt gcagaccgcc ctcgcccact acgagccgtc caccgacgac 660 aaccagttcc tgacgcccga cgagctggcc ttcttcgtcg aggcgttcca gcgcacaggc 720 ttcaccggcg gcatcaactg gtatcgcaac ttcacccgca actgggagcg ttcagagcac 780 ctgccgcgcc gggtcgacgg cattccctgc ctgatgatca tggcggagct ggacgtcgtg 840 ctgccccccg ccatggccga ccgcatgggc gaccagatca gcgaccttga gaaggtgctg 900 atcgagggca gcggccactg gacccagcag gaaaaacccg ccgaggtgaa cgccgcgctc 960 ctggactggc tggaccgccg cttcccgctt tag 993 <210> 2 <211> 1293 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> McEH gene <400> 2 aggagaaaag tgaaaaccat tcctctgggt gaaggctggt ggggagcagg gagaaagcca 60 ctgtcagagg atgatcaaat ccatcccttt aaagtgcaaa cgtcagataa agagattcag 120 gacctccatg agcgcattga cagaacccgc tacgctgatc ccttagaaga tagctgcttc 180 cactatggct tcaattccac ttatctcaag aaagtggttt cctactggag acatgagttt 240 gactggaaga agcaggtggc aatgcttaat gagtatccac actttaaaac caaaatagaa 300 ggactggata tacacttcat ccacgtgcgc ccgcctcgcc gcgagaacca aaaggtcctg 360 cctctcatgc ttgtccacgg ctggccgggc tcgttctacg agttctacaa gattctgcca 420 cttctcacgc agaaccacga cggtgtcgcg tttgaggtca tatgcccatc catccccggc 480 tacggtttct ccgacgcccc tcataaacaa gggttcaaca ccctcgctgc tgccagggtt 540 ttcctgacac tgatggagcg tttggggttc tcaaagttct atctgcaggg aggagactgg 600 ggctcgctca tcaccaccaa catggcacag atgaagcctc tctgtgtgaa aggtctccac 660 ctaaacatgt tcctatcaag gagaggtttc aaaatgctgt tgtccctcat gattggtccg 720 tatctgccct tcctggtggg cttcagtcgg gaagatgttc gccgcttgtt cccctacttt 780 gagaagaatg tatggagcat gctgagggaa tcaggctacc ttcacattca ggccactaaa 840 ccggacactg caggttgtgg agtgaataac tctcctgtag gcttggcagc ctacatcctg 900 gaaaagttct ccacctggac tgattcaaac aaccgagaac tggaggatgg tgggctggaa 960 agaaaattca gcctgaatga actcttgaca aatgtcatga tctactggac tacaggctcc 1020 atagtgtcct ccatgcgctt ctacaaagag aacttaaaga gtaatcctga gagcagagtg 1080 gatggaaaga ctaatgttta cgtgcctact ggactggctg ccttccctgg agagctgatg 1140 cattgcccta aatcatgggc gcagcttaag tatgaagaca tctacaccta cacattcatg 1200 ccccgaggag gccacttcgc tgcctttgaa gagcccgagc tgttagccaa cgacattttc 1260 cattttgtca aaaaagtgga gaagaagttc tga 1293 <210> 3 <211> 1227 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RgEH gene <400> 3 atggcgacac acacattcgc ttcgcctccc acccgcttca ccgtcgacat cccgcagtca 60 gaagtcgacg aacttcactt ccgactcgac aagaaccgct ggccagcggc agagatcgtt 120 ccggaggatg ggacggacga tccgacggcg tttggtcttg gagcaggacc gacgctgcca 180 ctcatgaagg aactggcgaa gggttggcgc aagttcgact ggaagaaggc gcaggacgac 240 ctcaacacct tcgagcacta cactgtcgaa attgaggatc tctcgatcca cttcctccac 300 caccgctcga ctcgtccgaa ggctgttccc ctcatcctct gccacggctg gccaggccac 360 ttcggcgagt tcctcaacgt catcccgctc ttgacggagc cggcggaccc gtctgcacag 420 gcgttccacg tcgtcgtgcc ctcgatgcct ggttatgcct ggtcttcgcc tcctccgtcc 480 tccaagtgga gcatgcctga caccgcgcgg gtcttcgaca agcttatgac cgggcttggc 540 tacgagaagt acatggcgca gggcggagac tggggcagca tcgctgctcg ctgccttggc 600 tcgcttcaca aggatcactg caaagccgtc cacctcaact tcctccccgt cttcccgccc 660 gtcccgatgt ggctcatcaa cccacacacg ctcctcgcct gggctccgcg cttcctcgtg 720 ccggagaagc aggctgcgcg tatgaagcgc gggttggcgt atctcgagaa gggctccgcc 780 tactacgtca tgcagcagtt gacgcctcgc acgcccgcgt acggtctgac cgacagtccc 840 gtcggcttgc tggcctggat tggcgagaag ttcgagccga ccattcagga ggcgagcaag 900 caagcccagc cgaccctgac tcgtgacgag ctctacttca cctgctcgct gtactggttc 960 acccgctcaa tcggcacctc cttcctcccc tactcgctca actcgcactt caccaccttc 1020 ctgaccgaca gcaagtacca cttgcccaac tttgccctct cgctctaccc gggcgagatc 1080 tactgccctg cagaacggga cgctaagcga actggcaacc tcaagtggat caaggaggct 1140 ccggacggag gacactttgc tgcgctcgag aagcccgacg tgtttgtcga ccatctcagg 1200 gaggcgttcg gcgtcatgtg ggagaag 1227

Claims

에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH)를 코딩하는 유전자가 도입된 메탄자화균 발현용 재조합 벡터를 포함하는 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균에서,
상기 형질전환 메탄자화균은 알켄을 기질로 활용하는 것을 특징으로 하는, 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균.
제1항에 있어서,
상기 에폭사이드 가수분해효소 (epoxide hydrolase; EH)는 에폭사이드 (epoxide)를 다이올 (diol)로의 전환을 촉매하는 효소인, 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균.
제1항에 있어서,
상기 다이올은 C3 내지 C6인 것인, 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균.
제3항에 있어서,
상기 다이올은 1,2-프로판다이올, 1,2-부탄다이올, 1,2-펜탄다이올 및 1,2-헥산다이올인 중 어느하나 이상으로 이루어진 것인, 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균.
제1항에 있어서,
상기 에폭사이드 가수분해효소는 Caulobacter crescentus (Cc), Mugil cephalus (Mc) 또는 Rhodotorula glutinis (Rg) 유래인 것인, 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균.
제5항에 있어서,
상기 에폭사이드 가수분해효소 중 Caulobacter crescentus (Cc) 유래의 에폭사이드 가수분해효소를 코딩하는 유전자는 서열번호 1로 표시되고, Mugil cephalus (Mc) 유래의 에폭사이드 가수분해효소를 코딩하는 유전자는 서열번호 2로 표시되며, Rhodotorula glutinis (Rg) 유래의 에폭사이드 가수분해효소를 코딩하는 유전자는 서열번호 3으로 표시되는 것인, 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균.
삭제
제1항에 있어서,
상기 메탄자화균은 메틸로모나스 속 (Methylomonas), 메틸로박터 속 (Methylobacter), 메틸로코커스 속 (Methylococcus), 메틸로스페라 속 (Methylosphaera), 메틸로칼덤 속 (Methylocaldum), 메틸로글로버스 속 (Methyloglobus), 메틸로사르시나 속 (Methylosarcina), 메틸로프로펀더스 속 (Methyloprofundus), 메틸로썰머스 속 (Methylothermus), 메틸로할로비우스 속 (Methylohalobius), 메틸로게아 속 (Methylogaea), 메틸로마리넘 속 (Methylomarinum), 메틸로벌럼 속 (Methylovulum), 메틸로마리노범 속 (Methylomarinovum), 메틸로러브럼 속 (Methylorubrum), 메틸로파라코커스 속 (Methyloparacoccus), 메틸로시스티스 속 (Methylocystis), 메틸로셀라 속 (Methylocella), 메틸로캡사 속 (Methylocapsa), 메틸로퍼룰라 속 (Methylofurula), 메틸아시디필럼 속 (Methylacidiphilum), 메틸아시디마이크로비움 속 (Methylacidimicrobium), 메틸로마이크로비움 속 (Methylomicrobium) 또는 메틸로시너스 속 (Methylosinus) 균주인, 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균.
제8항에 있어서,
상기 메틸로시너스 속 (Methylosinus) 균주는 메틸로시너스 트리코스포륨 (Methylosinus trichosporium) OB3b인, 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균.
제1항의 다이올 생산용 형질전환 메탄자화균 또는 상기 형질전환 메탄자화균의 반응산물을 포함하는, 다이올 생산용 조성물.
제10항에 있어서,
상기 배양산물은 상기 형질전환 메탄자화균의 배양물, 배양상등액, 파쇄물 및 이들의 분획물로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상인 것인, 다이올 생산용 조성물.
제10항 또는 제11항의 다이올 생산용 조성물을 포함하는, 다이올 생산용 키트.
제1항의 형질전환 메탄자화균을 이용하여 알켄을 포함하는 반응물에서 다이올로 전환하는 단계를 포함하는, 알켄 기질로부터 다이올을 생산하는 방법.