KR102270384B1 - 비결핵 항산균에 의한 감염 후 자발적 균 음전 예측용 바이오마커 - Google Patents

비결핵 항산균에 의한 감염 후 자발적 균 음전 예측용 바이오마커 Download PDF

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Abstract

본 발명은 대사체(metabolites)를 이용하여 비결핵 항산균에 의한 감염 후 예후로, 자발적 균 음전 발생 여부를 예측하는 방법에 관한 것이다.

Description

비결핵 항산균에 의한 감염 후 자발적 균 음전 예측용 바이오마커{Biomarker for predicting natural negative conversion of nontuberculous mycobacterial culture}
본 발명은 비결핵 항산균에 의한 감염 후 예후로, 특히는 자발적 균 음전의 발생 여부를 예측하기 위한 바이오마커와, 상기 예측을 위한 키트 또는 예측 방법에 관한 것이다.
마이코박테리움 (Mycobacterium) 속(屬)에는 결핵, 우형결핵 (牛形結核), 나병 (癩病)과 같이 사람과 동물에 심각한 질병을 일으키는 균 종 (species)뿐 아니라, 기회 감염균으로 일컬어지는 균 종, 그리고 자연환경에서 볼 수 있는 사물 (死物) 기생의 균 종 (saprophytic species) 등 현재까지 약 72 종(species)이 알려져 있으며, 그 중 인체 질환과 관련된 것이 25종에 이르는 것으로 알려져 있다. 이러한 마이코박테리움 속은 일반적으로 사용되는 염색액으로는 용이하게 염색되지 않지만 일단 염색되면 알코올이나 염산 등으로 처리시에도 용이하게 탈색되지 않기 때문에 항산균이라고도 불린다.
비결핵 항산균(Nontuberculous mycobacteria; NTM)은 결핵균(Mycobacterium tuberculosis complex) 및 나균(Mycobacterium leprae)을 제외한 항산균을 의미한다. 한편, 마이코박테리움 아비움 복합체(Mycobacterium avium complex; MAC)에 속하는 비결핵 항산균주 중 흔히 인간에게서 폐 질환을 일으키는 균주로는 공식적으로 대략 180 종 이상이 규명되었다. MAC는 주로 M. 아비움(M. avium)과 M. 인트라셀룰라(M. intracellulare)를 포함하고, 마이코박테리움 압세수스(Mycobacterium abscessus; MAB)는 주로 M. 압세수스 아종인 압세수스(M. abscessus subspecies abscessus)와 M. 압세수스 아종인 마실리엔시스(M. abscessus subspecies massiliense)를 포함한다. 최근 전세계적으로 비결핵 항산균에 기인한 폐 감염 보고가 증가하고 있지만, 건강한 개체군으로부터 비결핵 항산균 폐 감염 질환자를 구별하기 위한 바이오마커나, 질환에 대한 병태 생리의 연구가 부족한 실정이다.
본 발명의 일 목적은 비결핵 항산균의 감염 후 예후로, 자발적 균 음전의 발생 여부를 예측하기 위한 바이오마커 조성물을 제공하고자 한다.
본 발명의 다른 목적은 비결핵 항산균의 감염 후 예후로, 자발적 균 음전의 발생 여부를 예측하기 위한 키트를 제공하고자 한다.
본 발명의 또 다른 목적은 비결핵 항산균의 감염 후 예후로, 자발적 균 음전의 발생 여부를 예측하는 방법을 제공하고자 한다.
그러나 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 당 업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.
본 발명의 일 구현 예에 따르면, 대사체를 포함하는, 비결핵 항산균의 감염 후 예후 예측용 바이오마커 조성물에 관한 것이다.
본 발명에서 "예후"란 비결핵 항산균의 감염 후 해당 개체에서 치료 성공 여부, 재발, 전이, 약물 반응성, 내성 등과 같은 여부를 판단하는 것을 의미하나, 본 발명에서는 특히 상기 비결핵 항산균의 감염 후 적절한 치료 없이도 자발적으로 균 음전의 발생 여부를 목적으로 한다.
본 발명에 따른 예후 예측용 바이오마커는 비결핵 항산균의 감염 후 예후가 상대적으로 좋은 자, 즉 자발적 균 음전이 발생하거나 발생할 가능성이 높은 자와, 예후가 상대적으로 나쁜 자, 즉 자발적 균 음전이 발생하지 않거나 발생할 가능성이 낮은 자를 구분하여 진단할 수 있는 물질로, 비결핵 항산균에 의해 감염되었으나 자발적 균 음전이 발생한 대상체 유래의 생물학적 시료에서 증가 또는 감소 양상을 보이는 대사체, 바람직하게는 혈액 대사체를 포함한다.
본 발명에서 상기 "치료"는 이롭거나 바람직한 임상적 결과를 수득하기 위한 접근을 의미하는 것으로, 본 발명의 목적을 위해서, 이롭거나 바람직한 임상적 결과는 비제한적으로, 증상의 완화, 질병 범위의 감소, 질병 상태의 안정화 (즉, 악화되지 않음), 질병 진행의 지연 또는 속도의 감소, 질병 상태의 개선 또는 일시적 완화 및 경감 (부분적이거나 전체적으로), 검출 가능 하거나 또는 검출되지 않거나의 여부를 포함할 수 있고, 치료를 받지 않았을 때 예상되는 생존율과 비교하여 생존율을 늘이는 것을 의미할 수도 있다. 치료는 치료학적 치료 및 예방적 또는 예방 조치 방법 모두를 가리킨다. 상기 치료들은 예방되는 장애뿐만 아니라 이미 발생한 장애에 있어서 요구되는 치료를 포함한다. 질병을 "완화(Palliating)"하는 것은 치료를 하지 않은 경우와 비교하여, 질병 상태의 범위 및/또는 바람직하지 않은 임상적 징후가 감소되거나 및/또는 진행의 시간적 추이(time course)가 늦춰지거나 길어지는 것을 의미한다. 본 발명의 목적상 상기 치료는 항생제를 사용하여 수행될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "항생제"는 리팜핀, 아이소니아지드, 에탐부톨, 피라지나마이드(pyrazinamide, PZA), 퀴놀론계, 또는 아미노글라이코사이드계일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 여기서 상기 퀴놀론계 항생제는 날리딕스산(nalidixic acid), 마보플록사신(marbofloxacin), 옥솔린산(oxolinic acid), 목시플록사신(moxifloxacin), 트로바플록사신(trovafloxacin), 가티플록사신(gatifloxacin), 플루메퀸(flumequine), 프룰리플록사신(prulifloxacin), 제미플록사신(gemifloxacin), 시프로플록사신(ciprofloxacin), 시타플록사신(sitafloxacin) 또는 클리나플록사신(clinafloxacin) 등일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 또한, 상기 아미노글라이코사이드계 항생제는 스트렙토마이신(streptomycin), 네오마이신(neomycin), 프라마이세틴(framycetin), 겐타마이신(gentamycin), 노보비오신(novobiocin), 가나마이신(kanamycin), 아미카신(amikacin), 시소마이신(sisomycin) 또는 스펙티노마이신(spectinomycin) 등일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "균 음전"이란 객담의 도말 검사 또는 배양 검사 상 비결핵 항산균이 검출되지 않은 상태를 의미하며, 일 예시로 객담 도말 검사 연속 3회 모두 비결핵 항산균이 검출되지 않는 '음성'으로 판정되거나, 객담 배양 검사 1회에서 비결핵 항산균이 검출되지 않는 '음성'으로 판정된 경우일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "대사체(metabolite)"는 대사물질 또는 대사산물이라고도 불리우며, 물질 대사의 중간 생성물 또는 생성물이다. 이러한 대사체는 연료, 구조, 신호전달, 효소에 대한 촉진 및 저해 효과, 그 자신의 촉매 활성(일반적으로 효소에 대한 보조 인자로서), 방어, 다른 생물체와의 상호작용(예: 색소, 방향 화합물, 페로몬)을 포함하는 다양한 기능을 가지고 있다. 1차 대사체는 정상적인 생장, 발생 및 생식에 직접적으로 관여한다. 2차 대사체는 이러한 과정들에 직접적으로 관여하지 않지만, 대개 중요한 생태학적 기능을 가지고 있다.
본 발명에서 상기 대사체는 생체 기원의 시료, 즉 생물학적 시료로부터 수득한 대사 물질을 말하는 것으로, 상기 생물학적 시료는 생물학적 체액, 조직 또는 세포를 의미하는 것으로, 예를 들면, 전혈(whole blood), 백혈구(leukocytes), 말초혈액 단핵 세포(peripheral blood mononuclear cells), 백혈구 연층(buffy coat), 혈장(plasma), 혈청(serum), 객담(sputum), 눈물(tears), 점액(mucus), 세비액(nasal washes), 비강 흡인물(nasal aspirate), 호흡(breath), 소변(urine), 정액(semen), 침(saliva), 복강 세척액(peritoneal washings), 복수(ascites), 낭종액(cystic fluid), 뇌척수막 액(meningeal fluid), 양수(amniotic fluid), 선액(glandular fluid), 췌장액(pancreatic fluid), 림프액(lymph fluid), 흉수(pleural fluid), 유두 흡인물(nipple aspirate), 기관지 흡인물(bronchial aspirate), 활액(synovial fluid), 관절 흡인물(joint aspirate), 기관 분비물(organ secretions), 세포(cell), 세포 추출물(cell extract) 및 뇌척수액(cerebrospinal fluid) 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있으나, 바람직하게는 전혈(whole blood), 혈장(plasma) 또는 혈청(serum)일 수 있고, 보다 바람직하게는 혈청(serum)일 수 있다.
본 발명에서는 상기 대사체를 검출하기 위해 전혈, 혈장 또는 혈청을 전처리할 수 있다. 예를 들어, 여과, 증류, 추출, 분리, 농축, 방해 성분의 불활성화, 시약의 첨가 등을 포함할 수 있다. 또한, 상기 대사체는 대사 및 대사 과정에 의해 생산된 물질 또는 생물학적 효소 및 분자에 의한 화학적 대사작용으로 발생한 물질 등을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 대사체는 혈액, 바람직하게는 혈청 기원의 액상 시료로부터 수득한 대사물질인 것이 바람직하고, 구체적인 예를 들면, 아미노산(amino acid), 아미노산 유도체, 알란토인(Allantoin), N,N-디메틸글라이신(N,N-Dimethylglycine), 말산(Malic acid) 및 글리세롤 3-포스페이트(Glycerol 3-phosphate)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 말산(Malic acid)은 L-형태(L-form)인 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 아미노산 및 그 유도체는 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine), 트립토판(Tryptophan) 및 호모세린(Homoserine)으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 아미노산은 L-형태(L-form)일 수 있고, 바람직하게는 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine), 트립토판(Tryptophan) 또는 호모세린(Homoserine)은 L-형태(L-form)인 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 비결핵 항산균은 마이코박테리움 아비움(M. avium), 마이코박테리움 압세수스(M. abscessus), 마이코박테리움 플라베센스(M. flavescence), 마이코박테리움 아프리카눔(M. africanum), 마이코박테리움 보비스(M. bovis), 마이코박테리움 첼로네(M. chelonae), 마이코박테리움 셀라툼(M. celatum), 마이코박테리움 포르투이툼(M. fortuitum), 마이코박테리움 고르도네(M. gordonae), 마이코박테리움 가스트리(M. gastri), 마이코박테리움 헤모필룸(M. haemophilum), 마이코박테리움 인트라셀루라레(M. intracellulare), 마이코박테리움 칸사시이(M. kansasii), 마이코박테리움 말모엔스(M. malmoense), 마이코박테리움 마리눔(M. marinum), 마이코박테리움 스줄가이(M. szulgai), 마이코박테리움 테레(M. terrae), 마이코박테리움 스크로풀라세움(M. scrofulaceum), 마이코박테리움 울서란스(M. ulcerans), 마이코박테리움 시미애(M. simiae) 및 마이코박테리움 제노피(M. xenopi)로 구성된 군으로부터 선택된 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 다른 구현 예에 따르면, 대사체의 농도를 측정하는 정량 장치를 포함하는, 비결핵 항산균의 감염 후 예후 예측용 키트에 관한 것이다.
본 발명에서 상기 대사체는 생체 기원의 시료, 즉 생물학적 시료로부터 수득한 대사 물질을 말하는 것으로, 상기 생물학적 시료는 생물학적 체액, 조직 또는 세포를 의미하는 것으로, 예를 들면, 전혈(whole blood), 백혈구(leukocytes), 말초혈액 단핵 세포(peripheral blood mononuclear cells), 백혈구 연층(buffy coat), 혈장(plasma), 혈청(serum), 객담(sputum), 눈물(tears), 점액(mucus), 세비액(nasal washes), 비강 흡인물(nasal aspirate), 호흡(breath), 소변(urine), 정액(semen), 침(saliva), 복강 세척액(peritoneal washings), 복수(ascites), 낭종액(cystic fluid), 뇌척수막 액(meningeal fluid), 양수(amniotic fluid), 선액(glandular fluid), 췌장액(pancreatic fluid), 림프액(lymph fluid), 흉수(pleural fluid), 유두 흡인물(nipple aspirate), 기관지 흡인물(bronchial aspirate), 활액(synovial fluid), 관절 흡인물(joint aspirate), 기관 분비물(organ secretions), 세포(cell), 세포 추출물(cell extract) 및 뇌척수액(cerebrospinal fluid) 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있으나, 바람직하게는 전혈(whole blood), 혈장(plasma) 또는 혈청(serum)일 수 있고, 보다 바람직하게는 혈청(serum)일 수 있다.
본 발명에서는 상기 대사체를 검출하기 위해 전혈, 혈장 또는 혈청을 전처리할 수 있다. 예를 들어, 여과, 증류, 추출, 분리, 농축, 방해 성분의 불활성화, 시약의 첨가 등을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 대사체는 혈액, 바람직하게는 혈청 기원의 액상 시료로부터 수득한 대사물질인 것이 바람직하고, 구체적인 예를 들면, 아미노산(amino acid), 아미노산 유도체, 알란토인(Allantoin), N,N-디메틸글라이신(N,N-Dimethylglycine), 말산(Malic acid) 및 글리세롤 3-포스페이트(Glycerol 3-phosphate)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 말산(Malic acid)은 L-형태(L-form)인 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 아미노산 및 그 유도체는 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine), 트립토판(Tryptophan) 및 호모세린(Homoserine)으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 아미노산은 L-형태(L-form)일 수 있고, 바람직하게는 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine), 트립토판(Tryptophan) 또는 호모세린(Homoserine)은 L-형태(L-form)인 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 정량 장치는 핵자기 공명 분광 분석기 (NMR), 크로마토그래피 또는 질량분석기일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에서 이용되는 크로마토그래피는 고성능 액체 크로마토그래피(High Performance Liquid Chromatography, HPLC), 액체-고체 크로마토그래피(Liquid-Solid Chromatography, LSC), 종이크로마토그래피(Paper Chromatography, PC), 박층 크로마토그래피(Thin-Layer Chromatography, TLC), 기체-고체 크로마토그래피(Gas-Solid Chromatography, GSC), 액체-액체 크로마토그래피(Liquid-Liquid Chromatography, LLC), 포말 크로마토그래피(Foam Chromatography, FC), 유화 크로마토그래피(Emulsion Chromatography, EC), 기체-액체 크로마토그래피(Gas-Liquid Chromatography, GLC), 이온 크로마토그래피(Ion Chromatography, IC), 겔 여과 크로마토그래피(Gel Filtration Chromatograhy, GFC) 또는 겔 투과 크로마토그래피(Gel Permeation Chromatography, GPC)를 포함하나, 이에 제한되지 않고 당업계에서 통상적으로 사용되는 모든 정량용 크로마토그래피를 사용할 수 있다.
본 발명에서 상기 질량분석기는 특별한 제한없이 종래 공지된 질량 분석기를 이용할 수 있지만, 구체적으로 예를 들면, 푸리에 변환 질량분석기(FTMS, Fourier transform mass spectrometer), 말디토프 질량분석기(MALDI-TOF MS), Q-TOF MS 또는 LTQ-Orbitrap MS일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 키트에서 비결핵 항산균 및 예후에 관한 정의는 상기 본 발명의 바이오마커 조성물에 기재된 바와 중복되어 명세서의 과도한 혼잡을 피하기 위해 이하 그 기재를 생략한다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 대사체의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는 비결핵 항산균의 감염 후 예후를 예측하기 위한 정보 제공 방법에 관한 것이다.
본 발명에서 상기 "목적하는 개체"란 비결핵 항산균에 의한 감염 여부가 불확실한 개체로, 감염 가능성이 높은 개체를 의미하거나, 비결핵 항산균에 의해 감염되었거나 감염된 것으로 진단받았으나 균 음전 발생 여부가 불확실한 개체로, 균 음전 발생 가능성이 높은 개체를 의미한다.
본 발명에서 상기 "생물학적 시료"는 개체로부터 얻어지거나 개체로부터 유래된 임의의 물질, 생물학적 체액, 조직 또는 세포를 의미하는 것으로, 전혈(whole blood), 백혈구(leukocytes), 말초혈액 단핵 세포(peripheral blood mononuclear cells), 백혈구 연층(buffy coat), 혈장(plasma), 혈청(serum), 객담(sputum), 눈물(tears), 점액(mucus), 세비액(nasal washes), 비강 흡인물(nasal aspirate), 호흡(breath), 소변(urine), 정액(semen), 침(saliva), 복강 세척액(peritoneal washings), 복수(ascites), 낭종액(cystic fluid), 뇌척수막 액(meningeal fluid), 양수(amniotic fluid), 선액(glandular fluid), 췌장액(pancreatic fluid), 림프액(lymph fluid), 흉수(pleural fluid), 유두 흡인물(nipple aspirate), 기관지 흡인물(bronchial aspirate), 활액(synovial fluid), 관절 흡인물(joint aspirate), 기관 분비물(organ secretions), 세포(cell), 세포 추출물(cell extract) 및 뇌척수액(cerebrospinal fluid) 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있으며, 바람직하게는 전혈(whole blood), 혈장(plasma) 또는 혈청(serum)일 수 있고, 보다 바람직하게는 혈청(serum)일 수 있다.
본 발명에서는 상기 대사체의 발현 수준을 측정하기에 앞서, 상기 생물학적 시료, 바람직하게는 전혈, 혈장 또는 혈청을 전처리하는 단계를 수행할 수 있다. 본 발명에서 상기 전처리로는, 예를 들어, 여과, 증류, 추출, 분리, 농축, 방해 성분의 불활성화, 시약의 첨가 등을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 대사체는 혈액, 바람직하게는 혈청 기원의 액상 시료로부터 수득한 대사물질인 것이 바람직하고, 구체적인 예를 들면, 아미노산(amino acid), 아미노산 유도체, 알란토인(Allantoin), N,N-디메틸글라이신(N,N-Dimethylglycine), 말산(Malic acid) 및 글리세롤 3-포스페이트(Glycerol 3-phosphate)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 말산(Malic acid)은 L-형태(L-form)인 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 아미노산 및 그 유도체는 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine), 트립토판(Tryptophan) 및 호모세린(Homoserine)으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 아미노산은 L-형태(L-form)일 수 있고, 바람직하게는 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine), 트립토판(Tryptophan) 또는 호모세린(Homoserine)은 L-형태(L-form)인 것이 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 대사체의 발현 수준은 정량 장치를 이용하여 수행될 수 있다. 본 발명에서 상기 정량 장치는 핵자기 공명 분광 분석기 (NMR), 크로마토그래피 또는 질량분석기일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에서 이용되는 크로마토그래피는 고성능 액체 크로마토그래피(High Performance Liquid Chromatography, HPLC), 액체-고체 크로마토그래피(Liquid-Solid Chromatography, LSC), 종이크로마토그래피(Paper Chromatography, PC), 박층 크로마토그래피(Thin-Layer Chromatography, TLC), 기체-고체 크로마토그래피(Gas-Solid Chromatography, GSC), 액체-액체 크로마토그래피(Liquid-Liquid Chromatography, LLC), 포말 크로마토그래피(Foam Chromatography, FC), 유화 크로마토그래피(Emulsion Chromatography, EC), 기체-액체 크로마토그래피(Gas-Liquid Chromatography, GLC), 이온 크로마토그래피(Ion Chromatography, IC), 겔 여과 크로마토그래피(Gel Filtration Chromatograhy, GFC) 또는 겔 투과 크로마토그래피(Gel Permeation Chromatography, GPC)를 포함하나, 이에 제한되지 않고 당업계에서 통상적으로 사용되는 모든 정량용 크로마토그래피를 사용할 수 있다.
본 발명에서 상기 질량분석기는 특별한 제한없이 종래 공지된 질량 분석기를 이용할 수 있지만, 구체적으로 예를 들면, 푸리에 변환 질량분석기(FTMS, Fourier transform mass spectrometer), 말디토프 질량분석기(MALDI-TOF MS), Q-TOF MS 또는 LTQ-Orbitrap MS일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 측정된 상기 대사체의 발현 수준이 대조군에 비하여 증가 또는 감소된 경우, 비결핵 항산균에 의한 감염 후 예후가 좋을 것, 바람직하게는 균 음전이 발생하였거나 발생할 가능성이 높은 것, 보다 바람직하게는 적절한 치료 없이도 자발적으로 균 음전이 발생하였거나 발생할 가능성이 높은 것으로 예측하는 단계를 더 포함할 수 있다.
본 발명의 일 예시로, 본 발명에서 상기 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 측정된 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine), 트립토판(Tryptophan), 호모세린(Homoserine), N,N-디메틸글라이신(N,N-Dimethylglycine), 말산(Malic acid) 및 글리세롤 3-포스페이트(Glycerol 3-phosphate)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 발현 수준이 대조군에 비하여 증가된 경우, 비결핵 항산균에 의한 감염 후 비결핵 항산균에 의한 감염 후 예후가 좋을 것, 바람직하게는 균 음전이 발생하거나 발생할 가능성이 높은 것, 보다 바람직하게는 적절한 치료 없이도 자발적으로 균 음전이 발생하거나 발생할 가능성이 높은 것으로 예측하는 단계를 더 포함할 수 있다.
본 발명의 다른 예시로, 본 발명에서 상기 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 측정된 알란토인(Allantoin)의 발현 수준이 대조군에 비하여 감소된 경우, 비결핵 항산균에 의한 감염 후 예후가 좋을 것, 바람직하게는 균 음전이 발생하거나 발생할 가능성이 높은 것, 보다 바람직하게는 적절한 치료 없이도 자발적으로 균 음전이 발생하거나 발생할 가능성이 높은 것으로 예측하는 단계를 더 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 "대조군"이란 비결핵 항산균에 의해 감염되지 않은 정상 대조군이거나, 비결핵 항산균에 의해 감염된 환자 모집단의 중앙값(또는 해당 환자의 평균값)이거나, 비결핵 항산균에 의한 감염 후 예후가 나쁜 환자, 바람직하게는 균 음전이 발생하지 않았거나 발생할 가능성이 낮은 환자, 보다 바람직하게는 적절한 치료 없이도 자발적으로 균 음전이 발생하지 않았거나 발생할 가능성이 낮은 환자 모집단의 중앙값(또는 해당 환자의 평균값)일 수 있다.
본 발명의 정보 제공 방법에서 비결핵 항산균의 감염 질환에 관한 정의는 상기 본 발명의 바이오마커 조성물에 기재된 바와 중복되어 명세서의 과도한 혼잡을 피하기 위해 이하 그 기재를 생략한다.
이처럼 본 발명에서는 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 혈액 대사체의 발현 수준을 측정함으로써 비결핵 항산균에 의한 감염 후 예후로, 특히는 균 음전의 발생 여부를 간단하고 용이하면서도 정확하게 예측할 수 있고, 이에 따라 항생제 치료 여부를 조기에 결정하는 등 적절한 치료를 할 수 있을 것으로 기대된다.
본 발명에서는 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 혈액 대사체의 발현 수준을 측정함으로써 비결핵 항산균에 의한 감염 후 예후로, 특히는 균 음전의 발생 여부를 간단하고 용이하면서도 정확하게 예측할 수 있다.
도 1은 본 발명의 일 실시예에서 항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자와 자발적으로 균 음전이 발생한 환자의 혈청 시료에서 글리세롤 3-포스페이트(Glycerol 3-phosphate)의 발현 수준을 비교한 그래프를 나타낸 것이다.
도 2는 본 발명의 일 실시예에서 항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자와 자발적으로 균 음전이 발생한 환자의 혈청 시료에서 L-트레오닌(L-Threonine)의 발현 수준을 비교한 그래프를 나타낸 것이다.
도 3은 본 발명의 일 실시예에서 항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자와 자발적으로 균 음전이 발생한 환자의 혈청 시료에서 L-트립토판(L-Tryptophan)의 발현 수준을 비교한 그래프를 나타낸 것이다.
도 4는 본 발명의 일 실시예에서 항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자와 자발적으로 균 음전이 발생한 환자의 혈청 시료에서 호모세린(Homoserine)의 발현 수준을 비교한 그래프를 나타낸 것이다.
도 5는 본 발명의 일 실시예에서 항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자와 자발적으로 균 음전이 발생한 환자의 혈청 시료에서 N,N-디메틸글라이신(N,N-Dimethylglycine)의 발현 수준을 비교한 그래프를 나타낸 것이다.
도 6은 본 발명의 일 실시예에서 항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자와 자발적으로 균 음전이 발생한 환자의 혈청 시료에서 L-발린(L-Valine)의 발현 수준을 비교한 그래프를 나타낸 것이다.
도 7은 본 발명의 일 실시예에서 항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자와 자발적으로 균 음전이 발생한 환자의 혈청 시료에서 L-라이신(L-Lysine)의 발현 수준을 비교한 그래프를 나타낸 것이다.
도 8은 본 발명의 일 실시예에서 항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자와 자발적으로 균 음전이 발생한 환자의 혈청 시료에서 L-이소류신(L-Isoleucine)의 발현 수준을 비교한 그래프를 나타낸 것이다.
도 9는 본 발명의 일 실시예에서 항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자와 자발적으로 균 음전이 발생한 환자의 혈청 시료에서 L-류신(L-Leucine)의 발현 수준을 비교한 그래프를 나타낸 것이다.
도 10은 본 발명의 일 실시예에서 항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자와 자발적으로 균 음전이 발생한 환자의 혈청 시료에서 L-말산(L-Malic acid)의 발현 수준을 비교한 그래프를 나타낸 것이다.
도 11은 본 발명의 일 실시예에서 항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자와 자발적으로 균 음전이 발생한 환자의 혈청 시료에서 알란토인(Allantoin)의 발현 수준을 비교한 그래프를 나타낸 것이다.
이하, 본 발명을 하기의 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 의해 한정되는 것은 아니다.
실시예
[실험예 1] MAC 감염 환자와 자발적으로 균 음전된 환자의 시료 수집
2012년 1월부터 2016년 8월까지의 대략 6년간 서울 삼성병원에서 수집한 마이코박테리움 아비움 복합체(Mycobacterium avium complex) (avium : 46명, intracellulare : 50명, 총 96명) 감염 환자의 항생제 치료 전 혈청 샘플 96개와 항생제 치료 없이도 자발적인 균 음전이 이루어지는 환자의 혈청 샘플 30개를 준비하였다.
[실험예 2] 시료에 대한 전처리
먼저, 상기 실험예 1에서 얻어진 혈청 시료 (50 μl)에 300 μl 클로로포름, 150 μl 메탄올 (chloroform-methanol, 2:1, v/v, 4 ℃)을 첨가하고 30초 동안 섞어 주었다. 여기에 150 μl 물을 첨가하고 30 초 동안 섞은 뒤 ICE에 넣어 10 분간 방치하여 추출하였다. 이후, 원심분리기기를 이용하여 10 분간 13,000 rpm, 4 ℃에서 원심분리한 뒤 상층액(250 μl) 분리해내어 Speed vacuum (full vacuum, no temp, 5hours)을 이용하여 건조하여 이하의 대사체 분석 전까지 -20 ℃에서 보관하였다. 질량 분석기 분석을 위해 건조된 시료를 250 μl 아세토니트릴-H2O(Acetonitrile-H2O)(75:25, v/v)에 재용해 후, 존재할 가능성이 있는 불순물 제거를 위하여 필터 튜브(Filter tube)(Costar 8169)를 이용하여 여과한 후 분석을 진행하였다. 기계 품질 관리(Machinery Quality Control; MQC)로, MS/MS 기기상태를 체크하기 위하여 혈청 샘플과 같은 전 처리방법으로 건강한 사람의 혈청을 기계 품질 관리(MQC)의 샘플로 사용하여 배치 당 4회 반복 분석하였다. 시료 품질 관리(Sample Quality Control; SQC)를 위하여 각 배치 안에서 시료 간의 차이를 비교하기 위해 시료 당 20 μl씩 모아 시료 품질 관리를 제작하여 배치 당 4회 반복 분석하였다.
[실험예 3] HPLC-Triple Quad-MS를 통한 대사체 분석
혈청에서 처리한 분석 시료 내의 극성 대사체를 분석하기 위하여 크로마토그래피-텐덤 질량분석기(HPLC-MS/MS)를 이용하여 분석을 진행하였다. 사용된 장비는 Agilent 1200 HPLC와 Sciex API4000 triple quadrupole MS를 이용하였다. 친수성 상호 작용을 위한 크로마토그래피 조건으로는 Luna PFPP(2.0 x 150 mm, 3μm, Phenomenex) 컬럼을 이용하여 20 ℃에서 용매에 따른 2가지 방법으로 기울기 용리를 이용하여 극성 대사체들을 분리하였다. 첫 번째 이동상으로는 (A) H2O (v/v) 및 (B) 아세토니트릴 (v/v)을 이용하였고, 두 번째 이동상으로는 (A) H2O (v/v, 0.1% formic acid) 및 (B) 아세토니트릴 (v/v)을 이용하였으며, 각각 조건의 기울기 용리는 총 분석 시간을 15분으로 하여 아래 표 1과 동일하게 수행하였다. 분무기 가스(Ion-Source Gas 1/2) 단위는 50/50 임의 단위(arbitrary unit)이었으며, 가스 커튼(Curtain Gas)의 단위는 25 임의 단위(arbitrary unit)이었다. 소스 온도(Source temperature)는 500 ℃이고, 이온 스프레이 부유 전압(Ion-spray Floating Voltage)은 5,5 kV(negative -4.5kV)이며, 매스 범위(Mass range)는 50 ~ 1000 m/z이었다. 시료 주입은 HTC_PAL system/CTC analytics auto-sampler를 이용하여 3 μl씩 주입하였으며, 텐덤 질량 분석기 조건 (예약 다중 반응 검지법; Scheduled Multiple Reaction Monitoring, sMRM)은 아래 표 2 및 3과 같이 수행하였다. 단, 하기 표 2 및 3에서 m/z는 질량 대 전하비(mass to charge ratio)를 의미하고, RT는 머무름 시간(Retention time)을 의미하며, CE는 충돌 에너지(Collision energy)를 의미하고, (+)는 양이온 모드를, (-)는 음이온 모드를 의미하며, sMRM 분석을 통해 얻어진 결과는 Sciex의 정량 분석 소프트웨어(Quantitative Analysis Software)를 통하여 로우 데이터(raw data)를 계산하였고, MQC data 평균값을 이용하여 상대 표준 편차(RSD<20)이하의 대사체를 산출하였다.
시간(분) 이동상 A(%) 이동상 B(%) 유속(mL/min)
0 100 0 0.35
8 73 27 0.35
9 15 85 0.35
10 100 0 0.35
15 100 0 0.35
포름산 방법 (+), 대사체 32종
대사체 종류(Compounds) m/z Product ion RT CE
세린(L-Serine) 106 60 0.9 15
프롤린(L-Proline) 116 70 1.13 21
발린(L-Valine) 118 72 1.41 15
트레오닌(L-Threonine) 120 74 0.96 15
이소류신(L-isoLeucine) 132 86 1.93 15
류신(L-Leucine) 132 86 2.3 15
아스파라긴(L-Asparagine) 133 74 0.9 17
글루타민(L-Glutamine) 147 84 0.95 23
라이신(L-Lycine) 147 84 0.74 23
글루타메이트(L-Glutamate) 148 84 1 23
메티오닌(L-Methionine) 150 104 1.8 11
페닐알라닌(L-Phenylalanine) 166 120 6.41 17
알지닌(L-Arginine) 175 70 0.8 35
트립토판(L-Tryptophan) 205 188 8.4 13
다이메틸글라이신(N,N-Dimethylglycine) 104 58 1.21 27
콜린(Choline) 104 60 0.9 19
글라이신(Glycine) 76 30 1.06 16
폴레이트(Folate) 442 295 9.58 19
아데닌(Adenine) 136 119 1.75 24
호모시스테인(Homocysteine) 136 90 1.26 15
하이포잔틴(Hypoxanthine) 137 110 2.8 29
잔틴(Xanthine) 153 110 2.5 23
알란토인(Allantoin) 159 99 1.17 13
사이토신(Cytosine) 112 95 0.98 17
호모세린(Homoserine) 120 56 1.03 27
티아민(Thiamine) 265 122 0.96 17
시스테인(Cysteine) 122 59 1.24 27
CMP 324 112 1.68 16
UMP 325 97 3 49
AMP 348 136 1.99 21
IMP 349 137 5.7 17
스펄민(Spermine) 203 112 0.53 27
포름산 방법 (-), 대사체 24종
대사체 종류(Compounds) m/z Product ion RT CE
아스팔테이트(L-Aspartate) 132 88 0.96 -17
락테이트(S)-Lactate 89 43 1.74 -18
포스포글리세라이트(3-Phosphoglycerate) 185 97 2.11 -22
석시네이트(Succinate) 117 73 3.88 -18
말레이트(L-Malic acid) 133 115 1.78 -16
시트레이트(Citrate) 191 111 3.58 -12
하이드로글루타레이트(D-2-Hydroyglutaric acid) 147 129 1.03 -14
GTP 522 424 1.6 -30
아세틸포스페이트(Acetylphosphate) 139 79 1.65 -22
칼바모일포스페이트(Carbamoyl-phosphate) 140 79 0.9 -22
글리세라이트(Glycerate) 105 75 1.24 -15
포스포에놀파이루베이트(Phosphoenolpyruvate) 167 79 2.3 -16
디하이드록시아세톤포스페이트
(Dihydroxyacetone phosphate)		 169 79 1.7 -38
글리세롤 3-포스페이트(Glycerol 3-Phosphate) 171 79 1.5 -22
시키메이트(Shikimate) 173 93 1.65 -16
알란토에이트(Allontoate) 175 132 1.05 -12
디옥시리보스 1-포스페이트(Deoxyrebose 1-Phosphate) 213 79 1.6 -33
리불로스 5-포스페이트(D-Ribulose 5-Phosphate) 229 79 1.3 -48
글루코스 6-포스페이트(Glucose 6-Phosphate) 259 79 1.73 -40
프룩토스 1,6-비스포스페이트
(Fructose 1,6-Bisphosphate)		 339 271 0.98 -18
dGMP 346 79 2.02 -20
PRPP 389 291 1.4 -18
이타코네이트(Itaconate) 129 85 6.4 -14
프룩토스 6-포스페이트(Fructose 6-Phosphate) 259 79 1.23 -54
[ 실험예 4] 비결핵 항산균 감염 후 자발적 균 음전 발생자의 혈청 시료 내 대사체 분석 결과
항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자와 자발적으로 균 음전된 환자의 대사체 농도를 비교하기 위해 다음의 통계 검정 2가지 방법으로 Metaboanalyst(data 통계사이트)와 SPSS 통계 프로그램을 이용하여 데이터를 산출하였고, 그 결과를 이용하여 자발적 균 음전의 발생 여부를 예측할 수 있고 그에 따라 항생제 치료의 필요 여부를 결정할 수 있는 대사체 총 11 종을 각각의 p-value와 발현 수준의 배수 변화(Fold change) 값을 토대로 선정하여 그 결과를 하기 표 4 및 5와, 도 1 내지 11에 나타내었다. 단, 도 1 내지 11에서 Dx0(Success & Fail)는 항생제 치료 시작 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자 96명의 혈청 샘플에서 각 대사체의 발현 수준을 나타낸 것이고, Spontaneous는 항생제 치료 없이 자발적으로 균 음전된 환자 30명의 혈청 샘플에서 각 대사체의 발현 수준을 나타낸 것이다. 또한, 유의성 unpaired t-test에서 *P<0.05; **P<0.01; ***P<0.001를 의미한다.
자발적 균 음전 성공 환자 시료에서 증가된 대사체
대사체 종류(Compounds) 유의성 (p-value) Fold Change
트레오닌(L-Threonine) 0.0246 1.29
트립토판(L-Tryptophan) 0.0251 1.19
호모세린(Homoserine) 0.0217 1.31
N,N-다이메틸글라이신
(N,N-Dimethylglycine)		 0.013 1.26
글리세롤 3-포스페이트
(Glycerol 3-phosphate)		 0.0261 1.79
라이신(L-Lysine) 0.0509 1.26
발린(L-Valine) 0.052 1.17
이소류신(L-isoLeucine) 0.0646 1.56
류신(L-Leucine) 0.0618 1.45
말릭 엑시드(L-Malic acid) 0.0608 1.67
자발적 균 음전 성공 환자 시료에서 감소되어 있는 대사체
대사체 종류(Compounds) 유의성 (p-value) Fold Change
알란토인(Allantoin) 0.062 0.91
상기 표 4 및 5와, 도 1 내지 11에서 보는 바와 같이, 혈액 대사체 중 L-발린(L-Valine), L-라이신(L-Lysine), L-트레오닌(L-Threonine), L-이소류신(L-Isoleucine), L-류신(L-Leucine), L-트립토판(L-Tryptophan), 호모세린(Homoserine), N,N-디메틸글라이신(N,N-Dimethylglycine), L-말산(L-Malic acid) 및 글리세롤 3-포스페이트(Glycerol 3-phosphate)은 항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자에서의 중앙값 대비 자발적으로 균 음전이 발생한 환자 군에서 유의적으로 그 발현이 증가하였고, 그 외에 알란토인(Allantoin)은 항생제 치료 전의 마이코박테리움 아비움 복합체(MAC) 감염 환자에서의 중앙값 대비 자발적으로 균 음전이 발생한 환자 군에서 유의적으로 그 발현이 감소한 것을 확인할 수 있었다.
이를 통하여 대사체로, L-발린(L-Valine), L-라이신(L-Lysine), L-트레오닌(L-Threonine), L-이소류신(L-Isoleucine), L-류신(L-Leucine), L-트립토판(L-Tryptophan), 호모세린(Homoserine), N,N-디메틸글라이신(N,N-Dimethylglycine), L-말산(L-Malic acid), 글리세롤 3-포스페이트(Glycerol 3-phosphate) 및 알란토인(Allantoin)을 비결핵 항산균에 의한 감염 후 자발적 균 음전 발생 여부를 예측하여 항생제 치료 여부를 결정하기 위한 바이오마커로 사용할 수 있음을 알 수 있었다.

Claims (20)

  1. 아미노산(amino acid), 아미노산 유도체, 알란토인(Allantoin), N,N-디메틸글라이신(N,N-Dimethylglycine), 말산(Malic acid) 및 글리세롤 3-포스페이트(Glycerol 3-phosphate)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 대사체를 포함하고,
    상기 아미노산 및 아미노산 유도체는 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine), 트립토판(Tryptophan) 및 호모세린(Homoserine)으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성의 판단용 바이오마커 조성물.
  2. 삭제
  3. 제1항에 있어서,
    상기 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine) 또는 트립토판(Tryptophan)은 L-형태(L-form)인, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성의 판단용 바이오마커 조성물.
  4. 제1항에 있어서,
    상기 대사체는 목적하는 개체의 전혈(whole blood), 혈장(plasma) 또는 혈청(serum) 유래인 것인, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성의 판단용 바이오마커 조성물.
  5. 제1항에 있어서,
    상기 비결핵 항산균은 마이코박테리움 아비움(M. avium), 마이코박테리움 압세수스(M. abscessus), 마이코박테리움 플라베센스(M. flavescence), 마이코박테리움 아프리카눔(M. africanum), 마이코박테리움 보비스(M. bovis), 마이코박테리움 첼로네(M. chelonae), 마이코박테리움 셀라툼(M. celatum), 마이코박테리움 포르투이툼(M. fortuitum), 마이코박테리움 고르도네(M. gordonae), 마이코박테리움 가스트리(M. gastri), 마이코박테리움 헤모필룸(M. haemophilum), 마이코박테리움 인트라셀루라레(M. intracellulare), 마이코박테리움 칸사시이(M. kansasii), 마이코박테리움 말모엔스(M. malmoense), 마이코박테리움 마리눔(M. marinum), 마이코박테리움 스줄가이(M. szulgai), 마이코박테리움 테레(M. terrae), 마이코박테리움 스크로풀라세움(M. scrofulaceum), 마이코박테리움 울서란스(M. ulcerans), 마이코박테리움 시미애(M. simiae) 및 마이코박테리움 제노피(M. xenopi)로 구성된 군으로부터 선택되는, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성의 판단용 바이오마커 조성물.
  6. 아미노산(amino acid), 아미노산 유도체, 알란토인(Allantoin), N,N-디메틸글라이신(N,N-Dimethylglycine), 말산(Malic acid) 및 글리세롤 3-포스페이트(Glycerol 3-phosphate)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 대사체의 농도를 측정하는 정량 장치를 포함하고,
    상기 아미노산 및 아미노산 유도체는 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine), 트립토판(Tryptophan) 및 호모세린(Homoserine)으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성의 판단용 키트.
  7. 삭제
  8. 제6항에 있어서,
    상기 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine) 또는 트립토판(Tryptophan)은 L-형태(L-form)인, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성의 판단용 키트.
  9. 제6항에 있어서,
    상기 대사체는 목적하는 개체의 전혈(whole blood), 혈장(plasma) 또는 혈청(serum) 유래인 것인, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성의 판단용 키트.
  10. 제6항에 있어서,
    상기 정량 장치는 핵자기 공명 분광 분석기 (NMR), 크로마토그래피 또는 질량분석기인, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성의 판단용 키트.
  11. 제6항에 있어서,
    상기 비결핵 항산균은 마이코박테리움 아비움(M. avium), 마이코박테리움 압세수스(M. abscessus), 마이코박테리움 플라베센스(M. flavescence), 마이코박테리움 아프리카눔(M. africanum), 마이코박테리움 보비스(M. bovis), 마이코박테리움 첼로네(M. chelonae), 마이코박테리움 셀라툼(M. celatum), 마이코박테리움 포르투이툼(M. fortuitum), 마이코박테리움 고르도네(M. gordonae), 마이코박테리움 가스트리(M. gastri), 마이코박테리움 헤모필룸(M. haemophilum), 마이코박테리움 인트라셀루라레(M. intracellulare), 마이코박테리움 칸사시이(M. kansasii), 마이코박테리움 말모엔스(M. malmoense), 마이코박테리움 마리눔(M. marinum), 마이코박테리움 스줄가이(M. szulgai), 마이코박테리움 테레(M. terrae), 마이코박테리움 스크로풀라세움(M. scrofulaceum), 마이코박테리움 울서란스(M. ulcerans), 마이코박테리움 시미애(M. simiae) 및 마이코박테리움 제노피(M. xenopi)로 구성된 군으로부터 선택되는, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성의 판단용 키트.
  12. 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 아미노산(amino acid), 아미노산 유도체, 알란토인(Allantoin), N,N-디메틸글라이신(N,N-Dimethylglycine), 말산(Malic acid) 및 글리세롤 3-포스페이트(Glycerol 3-phosphate)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 대사체의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하고,
    상기 아미노산 및 아미노산 유도체는 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine), 트립토판(Tryptophan) 및 호모세린(Homoserine)으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하며,
    상기 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 측정된 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine), 트립토판(Tryptophan), N,N-디메틸글라이신(N,N-Dimethylglycine), 말산(Malic acid) 및 글리세롤 3-포스페이트(Glycerol 3-phosphate)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 발현 수준이 대조군에 비하여 증가되거나 측정된 알란토인(Allantoin)의 발현 수준이 대조군에 비하여 감소된 경우, 비결핵 항산균에 의한 감염 후 자발적 균 음전이 발생하거나 발생할 가능성이 높은 것으로 판단하는 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성을 판단하기 위한 정보 제공 방법.
  13. 제12항에 있어서,
    상기 생물학적 시료는 전혈(whole blood), 백혈구(leukocytes), 말초혈액 단핵 세포(peripheral blood mononuclear cells), 백혈구 연층(buffy coat), 혈장(plasma), 혈청(serum), 객담(sputum), 눈물(tears), 점액(mucus), 세비액(nasal washes), 비강 흡인물(nasal aspirate), 호흡(breath), 소변(urine), 정액(semen), 침(saliva), 복강 세척액(peritoneal washings), 복수(ascites), 낭종액(cystic fluid), 뇌척수막 액(meningeal fluid), 양수(amniotic fluid), 선액(glandular fluid), 췌장액(pancreatic fluid), 림프액(lymph fluid), 흉수(pleural fluid), 유두 흡인물(nipple aspirate), 기관지 흡인물(bronchial aspirate), 활액(synovial fluid), 관절 흡인물(joint aspirate), 기관 분비물(organ secretions), 세포(cell), 세포 추출물(cell extract) 및 뇌척수액(cerebrospinal fluid) 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상인, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성을 판단하기 위한 정보 제공 방법.
  14. 삭제
  15. 제12항에 있어서,
    상기 발린(Valine), 라이신(Lysine), 트레오닌(Threonine), 이소류신(Isoleucine), 류신(Leucine) 또는 트립토판(Tryptophan)은 L-형태(L-form)인, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성을 판단하기 위한 정보 제공 방법.
  16. 제12항에 있어서,
    상기 대사체의 발현 수준을 측정하기에 앞서, 상기 생물학적 시료를 여과, 증류, 추출, 분리, 농축, 방해 성분의 불활성화 또는 시약의 첨가의 전처리하는 단계를 더 포함하는, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성을 판단하기 위한 정보 제공 방법.
  17. 제12항에 있어서,
    상기 대사체의 발현 수준을 측정하는 단계는 핵자기 공명 분광 분석기 (NMR), 크로마토그래피 또는 질량분석기인 정량 장치를 이용하여 수행되는, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성을 판단하기 위한 정보 제공 방법.
  18. 삭제
  19. 삭제
  20. 제12항에 있어서,
    상기 비결핵 항산균은 마이코박테리움 아비움(M. avium), 마이코박테리움 압세수스(M. abscessus), 마이코박테리움 플라베센스(M. flavescence), 마이코박테리움 아프리카눔(M. africanum), 마이코박테리움 보비스(M. bovis), 마이코박테리움 첼로네(M. chelonae), 마이코박테리움 셀라툼(M. celatum), 마이코박테리움 포르투이툼(M. fortuitum), 마이코박테리움 고르도네(M. gordonae), 마이코박테리움 가스트리(M. gastri), 마이코박테리움 헤모필룸(M. haemophilum), 마이코박테리움 인트라셀루라레(M. intracellulare), 마이코박테리움 칸사시이(M. kansasii), 마이코박테리움 말모엔스(M. malmoense), 마이코박테리움 마리눔(M. marinum), 마이코박테리움 스줄가이(M. szulgai), 마이코박테리움 테레(M. terrae), 마이코박테리움 스크로풀라세움(M. scrofulaceum), 마이코박테리움 울서란스(M. ulcerans), 마이코박테리움 시미애(M. simiae) 및 마이코박테리움 제노피(M. xenopi)로 구성된 군으로부터 선택되는, 비결핵 항산균의 감염 후 자발적 균 음전의 발생 가능성을 판단하기 위한 정보 제공 방법.
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BMC infectious diseases, 2019, Vol.19, pp 1-9.
PLoS One, 2014, Vol.9, pp 1-11.

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