KR102243308B1 - 흑염소 계통식별용 snp 마커 및 이의 용도 - Google Patents

Abstract

본 발명은 흑염소 계통식별용 SNP 마커, 상기 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는 흑염소 계통식별용 조성물, 상기 조성물을 포함하는 흑염소 계통식별용 키트 및 상기 마커를 사용하여 흑염소의 계통을 식별하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에서 제공하는 흑염소 품종식별용 조성물을 이용하면, 식별하고자 하는 흑염소가 국내 4계통 중 어디에 속하는 흑염소인지를 유전자 수준에서 식별할 수 있으므로, 보다 정확한 흑염소의 품종관리에 널리 활용될 수 있을 것이다.

Description

흑염소 계통식별용 SNP 마커 및 이의 용도{Novel SNP marker for identification of black goat and uses thereof}

본 발명은 흑염소 계통식별용 SNP 마커 및 이의 용도에 관한 것으로, 보다 구체적으로 본 발명은 흑염소 계통식별용 SNP 마커, 상기 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는 흑염소 계통식별용 조성물, 상기 조성물을 포함하는 흑염소 계통식별용 키트 및 상기 마커를 사용하여 흑염소의 계통을 식별하는 방법에 관한 것이다.

흑염소는 한방에서 온양성 식품으로 분류하고 있다. 노인들의 몸이 차질 때에는 염소고기를 먹으면 온몸이 따뜻해진다고 하여 옛부터 임산부의 보약으로 널리 사용되어 왔다. 영양학적으로 볼 때, 흑염소육에는 지방질의 함량이 적은 반면 단백질과 칼슘그리고 철분이 많이 들어있고, 근육섬유가 연해서 소화 흡수율이 매우 높은 것으로 알려져 있다. 동의보감에 기록되어 있는 흑염소의 효능을 살펴보면, 흑염소는 3저 4고의 식품으로 불리우며, 속을 덥게 하고 내장을 보하고 기를 늘린다고 하였으며, 심장을 안정시키고 놀라는 것을 그치게 한다고 기록되어 있다. 또한 염소의 젖은 한랭과 허핍을 보하고, 염소의 허파는 폐를 보하고 기침을 그치게 하는 효능이 있으며, 콩팥은 신기허약을 보하고, 쓸개는 청맹을 다스리며 눈을 밝게 해준다고 기록되어 있다. 특히 뿔은 산후통, 풍두통을 없애고 골수는 양기 부족을 치료한다고 기재되어 있다.

1990년 이후, 흑염소에 대한 수입개방이 진행되고 있으며, 이에 따라, 흑염소의 사육두수는 점차 증가되고 있으나, 수입산 흑염소와 재래종 흑염소의 무분별한 교배에 의하여, 재래종 흑염소의 사육두수를 급격히 감소되고 있는 실정이다. 이에 따라, 재래종 흑염소를 보존하려는 정책이 뒤늦게 시행되어, 당진, 장수, 통영 등의 흑염소 계통이 보존되고 있으나, 이들 계통은 흑염소의 외관적인 특성에 따라 분류하고 있어, 명확한 계통을 유지하는데 어려움이 있다. 예를 들어, 당진 계통의 흑염소를 분류하는 외모 표준은 다음과 같다: "모색은 흑갈색 혹은 흑색으로 백색모의 혼재가 없어야 하며 다른 계통에 비해 긴 털을 가지고 있다. 특히 숫염소에서 흑모색 비해 갈색이 많은 짙은 흑갈색과 긴 털의 특징이 뚜렷하다. 뿔은 암수 모두 있으며, 숫염소는 나선 혹은 직선, 암염소는 궁형과 나선의 형태를 보인다. 또한 암수 모두 수염이 있고, 다른 재래염소 계통과 마찬가지로 육염이 없으며, 귀는 짧고 상향으로 쳐지지 않는다." 이 같은 분류기준은 주관적인 관점이 개입될 수 밖에 없기 때문에, 보다 명확한 흑염소의 계통 분류기준을 확립하여야 할 필요성이 대두되어, 이에 관한 연구가 활발히 진행되었다. 예를 들어, 1에는 Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) DNA Marker를 이용한 AFLP-PCR 유전자 지문분석 기법을 사용하여 한국 재래흑염소육을 감별하는 방법이 개발되었으나(한국축산식품학회지 v.22 no.4, 2002년, pp.301 - 309), 현존하는 흑염소 계통을 명확히 식별하지는 못하였으므로, 이를 위한 보다 적극적인 연구가 필요한 실정이다.

이러한 배경하에서, 본 발명자들은 흑염소의 계통을 명확히 식별할 수 있는 방법을 개발하고자 예의 연구노력한 결과, 흑염소 계통에 따라 차이를 나타내는 SNP 마커를 발굴하였는 바, 이들 SNP 마커를 사용하여 흑염소의 계통을 명확히 식별할 수 있음을 확인하고, 본 발명을 완성하였다.

본 발명의 주된 목적은 흑염소 계통식별용 SNP 마커를 제공하는 것이다.

본 발명의 다른 목적은 상기 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는 흑염소 계통식별용 조성물을 제공하는 것이다.

본 발명의 또 다른 목적은 상기 조성물을 포함하는 흑염소 계통식별용 키트를 제공하는 것이다.

본 발명의 또 다른 목적은 상기 조성물을 사용하여 흑염소의 계통을 식별하는 방법을 제공하는 것이다.

상술한 목적을 달성하기 위한, 본 발명의 일 실시양태는 흑염소 계통식별용 SNP 마커를 제공한다.

본 발명에서 제공하는 흑염소 계통식별용 SNP 마커는 snp42346-scaffold559-311056, snp8328-scaffold130-3011444, snp8317-scaffold130-2498079, snp46022-scaffold631-1730693, snp40368-scaffold515-3054409, snp53696-scaffold82-239368, snp53699-scaffold82-357819, snp53703-scaffold82-531765, snp53704-scaffold82-587189, snp50926-scaffold739-1589302, snp50925-scaffold739-1556203, snp7015-scaffold1259-344227, snp20495-scaffold202-5660539, snp20492-scaffold202-5543214, snp20491-scaffold202-5505660, snp20490-scaffold202-5472056, snp33231-scaffold39-4628, snp38040-scaffold474-167028, snp7977-scaffold129-617417, snp11901-scaffold144-2628266, snp42083-scaffold55-1985644, snp33393-scaffold392-1543422, snp12644-scaffold1482-83416, snp28831-scaffold310-5365848, snp28871-scaffold310-7069631, snp285-scaffold1007-813430, snp284-scaffold1007-754211, snp189-scaffold1003-323637, snp32377-scaffold368-765290, snp32376-scaffold368-705403, snp32375-scaffold368-658493, snp32374-scaffold368-625163, snp32373-scaffold368-587834, snp32370-scaffold368-454814, snp32369-scaffold368-408099, snp32368-scaffold368-377681, snp32366-scaffold368-305218, snp4356-scaffold1137-694167, snp4683-scaffold1152-307402, snp30564-scaffold339-321248, snp33091-scaffold386-396847, snp45467-scaffold620-1315765, snp39190-scaffold5-936305, snp18158-scaffold185-14973492, snp33157-scaffold388-1183943, snp33669-scaffold395-2029196, snp24221-scaffold247-1351970, snp5043-scaffold1170-88721, snp50217-scaffold717-6206911, snp39105-scaffold498-1004133, snp56059-scaffold875-326243, snp56054-scaffold875-139298, snp59930-scaffold998-14068, snp59937-scaffold998-344168, snp59959-scaffold998-1321665, snp59969-scaffold998-1724843, snp15530-scaffold1641-415024, snp58863-scaffold963-342613, snp37049-scaffold449-1390805, snp44946-scaffold612-1703474, snp42006-scaffold548-2798856, snp17320-scaffold18-4154892, snp11338-scaffold141-637604, snp57798-scaffold931-1763741, snp24629-scaffold2508-322935, snp6481-scaffold1230-106199, snp15641-scaffold165-2202458, snp22267-scaffold22-1694175, snp15298-scaffold163-476873, snp39686-scaffold505-797498, snp31006-scaffold3423-428862, snp47830-scaffold673-1651381, snp17173-scaffold1790-839956, snp37305-scaffold455-664274, snp55508-scaffold86-704514, snp35167-scaffold421-323627, snp59287-scaffold974-1156967, snp43002-scaffold570-363794, snp23428-scaffold2352-346197, snp52222-scaffold774-825598, snp47515-scaffold67-806294, snp18606-scaffold1881-25106, snp7055-scaffold126-1400752, snp7629-scaffold1274-136998, snp26172-scaffold274-340581, snp53484-scaffold811-325023 및 이들의 조합으로 구성된 군으로부터 선택되는 SNP를 포함한다.

상기 86종의 흑염소 계통식별용 SNP 마커는 흑염소의 1 내지 3번, 5번, 7번, 9 내지 16번, 19번, 21 내지 29번 염색체 상에 존재하는 공지된 SNP이다.

구체적으로, snp42346-scaffold559-311056는 1번 염색체 상에 존재하고; snp8328-scaffold130-3011444, snp8317-scaffold130-2498079, snp46022-scaffold631-1730693, snp40368-scaffold515-3054409, snp53696-scaffold82-239368, snp53699-scaffold82-357819, snp53703-scaffold82-531765, snp53704-scaffold82-587189, snp50926-scaffold739-1589302, snp50925-scaffold739-1556203, snp7015-scaffold1259-344227, snp20495-scaffold202-5660539, snp20492-scaffold202-5543214, snp20491-scaffold202-5505660, snp20490-scaffold202-5472056, snp33231-scaffold39-4628 및 snp38040-scaffold474-167028은 2번 염색체 상에 존재하며; snp7977-scaffold129-617417, snp11901-scaffold144-2628266 및 snp42083-scaffold55-1985644는 3번 염색체 상에 존재하고; snp33393-scaffold392-1543422, snp12644-scaffold1482-83416, snp28831-scaffold310-5365848, snp28871-scaffold310-7069631, snp285-scaffold1007-813430, snp284-scaffold1007-754211, snp189-scaffold1003-323637, snp32377-scaffold368-765290, snp32376-scaffold368-705403, snp32375-scaffold368-658493, snp32374-scaffold368-625163, snp32373-scaffold368-587834, snp32370-scaffold368-454814, snp32369-scaffold368-408099, snp32368-scaffold368-377681 및 snp32366-scaffold368-305218은 5번 염색체 상에 존재하며; snp4356-scaffold1137-694167, snp4683-scaffold1152-307402, snp30564-scaffold339-321248 및 snp33091-scaffold386-396847은 7번 염색체 상에 존재하고; snp45467-scaffold620-1315765 및 snp39190-scaffold5-936305는 9번 염색체 상에 존재하며; snp18158-scaffold185-14973492 및 snp33157-scaffold388-1183943은 10번 염색체 상에 존재하고; snp33669-scaffold395-2029196 및 snp24221-scaffold247-1351970은 11번 염색체 상에 존재하며; snp5043-scaffold1170-88721, snp50217-scaffold717-6206911 및 snp39105-scaffold498-1004133은 12번 염색체 상에 존재하고; snp56059-scaffold875-326243 및 snp56054-scaffold875-139298은 13번 염색체 상에 존재하며; snp59930-scaffold998-14068, snp59937-scaffold998-344168, snp59959-scaffold998-1321665, snp59969-scaffold998-1724843, snp15530-scaffold1641-415024, snp58863-scaffold963-342613, snp37049-scaffold449-1390805 및 snp44946-scaffold612-1703474는 14번 염색체 상에 존재하고; snp42006-scaffold548-2798856은 15번 염색체 상에 존재하며; snp17320-scaffold18-4154892 및 snp11338-scaffold141-637604는 16번 염색체 상에 존재하고; snp57798-scaffold931-1763741은 19번 염색체 상에 존재하며; snp24629-scaffold2508-322935, snp6481-scaffold1230-106199 및 snp15641-scaffold165-2202458은 21번 염색체 상에 존재하고; snp22267-scaffold22-1694175 및 snp15298-scaffold163-476873은 22번 염색체 상에 존재하며; snp39686-scaffold505-797498, snp31006-scaffold3423-428862, snp47830-scaffold673-1651381, snp17173-scaffold1790-839956 및 snp37305-scaffold455-664274는 23번 염색체 상에 존재하고; snp55508-scaffold86-704514, snp35167-scaffold421-323627 및 snp59287-scaffold974-1156967은 24번 염색체 상에 존재하며; snp43002-scaffold570-363794는 25번 염색체 상에 존재하고; snp23428-scaffold2352-346197, snp52222-scaffold774-825598 및 snp47515-scaffold67-806294는 26번 염색체 상에 존재하며; snp18606-scaffold1881-25106 및 snp7055-scaffold126-1400752는 27번 염색체 상에 존재하고; snp7629-scaffold1274-136998은 28번 염색체 상에 존재하며; snp26172-scaffold274-340581 및 snp53484-scaffold811-325023은 29번 염색체 상에 존재한다.

본 발명에서 제공하는 흑염소 계통식별용 SNP 마커는 계통을 식별하고자 하는 흑염소가 당진, 장수, 통영 및 경상대 계통 중 어디에 속하는지를 식별하는데 사용될 수 있다.

일 예로서, 서열번호 1의 염기서열을 가지는 snp50926-scaffold739-1589302, 서열번호 2의 염기서열을 가지는 snp50925-scaffold739-1556203 또는 서열번호 3의 염기서열을 가지는 snp15530-scaffold1641-415024의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 GG인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있다.

다른 예로서, 서열번호 4의 염기서열을 가지는 snp7055-scaffold126-1400752의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA이거나; 또는 서열번호 5의 염기서열을 가지는 snp53703-scaffold82-531765, 서열번호 6의 염기서열을 가지는 snp53704-scaffold82-587189 또는 서열번호 7의 염기서열을 가지는 snp22267-scaffold22-1694175의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 GG인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 장수 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있다.

또 다른 예로서, 서열번호 8의 염기서열을 가지는 snp7977-scaffold129-617417, 서열번호 9의 염기서열을 가지는 snp56054-scaffold875-139298, 서열번호 10의 염기서열을 가지는 snp59930-scaffold998-14068, 서열번호 11의 염기서열을 가지는 snp47515-scaffold67-806294 또는 서열번호 12의 염기서열을 가지는 snp26172-scaffold274-340581의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 AA이거나; 서열번호 13의 염기서열을 가지는 snp46022-scaffold631-1730693, 서열번호 14의 염기서열을 가지는 snp59959-scaffold998-1321665 또는 서열번호 15의 염기서열을 가지는 snp23428-scaffold2352-346197의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 GG이거나; 또는 서열번호 16의 염기서열을 가지는 snp59937-scaffold998-344168의 61번째 대립유전자 염기쌍이 CC인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있다.

또 다른 예로서, 서열번호 17의 염기서열을 가지는 snp40368-scaffold515-3054409, 서열번호 18의 염기서열을 가지는 snp53696-scaffold82-239368, 서열번호 19의 염기서열을 가지는 snp53699-scaffold82-357819, 서열번호 20의 염기서열을 가지는 snp20490-scaffold202-5472056, 서열번호 21의 염기서열을 가지는 snp33231-scaffold39-4628, 서열번호 22의 염기서열을 가지는 snp42083-scaffold55-1985644, 서열번호 23의 염기서열을 가지는 snp28871-scaffold310-7069631, 서열번호 24의 염기서열을 가지는 snp32377-scaffold368-765290, 서열번호 25의 염기서열을 가지는 snp32374-scaffold368-625163, 서열번호 26의 염기서열을 가지는 snp32368-scaffold368-377681, 서열번호 27의 염기서열을 가지는 snp4683-scaffold1152-307402, 서열번호 28의 염기서열을 가지는 snp33091-scaffold386-396847, 서열번호 29의 염기서열을 가지는 snp33669-scaffold395-2029196, 서열번호 30의 염기서열을 가지는 snp56059-scaffold875-326243, 서열번호 31의 염기서열을 가지는 snp58863-scaffold963-342613, 서열번호 32의 염기서열을 가지는 snp17320-scaffold18-4154892, 서열번호 33의 염기서열을 가지는 snp57798-scaffold931-1763741, 서열번호 34의 염기서열을 가지는 snp6481-scaffold1230-106199, 서열번호 35의 염기서열을 가지는 snp31006-scaffold3423-428862, 서열번호 36의 염기서열을 가지는 snp55508-scaffold86-704514, 서열번호 37의 염기서열을 가지는 snp59287-scaffold974-1156967, 서열번호 38의 염기서열을 가지는 snp52222-scaffold774-825598, 서열번호 39의 염기서열을 가지는 snp18606-scaffold1881-25106 또는 서열번호 40의 염기서열을 가지는 snp53484-scaffold811-325023의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 경상대 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있다.

또 다른 예로서, 서열번호 41의 염기서열을 가지는 snp42346-scaffold559-311056, 서열번호 42의 염기서열을 가지는 snp8328-scaffold130-3011444, 서열번호 43의 염기서열을 가지는 snp7015-scaffold1259-344227, 서열번호 44의 염기서열을 가지는 snp20492-scaffold202-5543214, 서열번호 45의 염기서열을 가지는 snp38040-scaffold474-167028, 서열번호 46의 염기서열을 가지는 snp33393-scaffold392-1543422, 서열번호 47의 염기서열을 가지는 snp12644-scaffold1482-83416, 서열번호 48의 염기서열을 가지는 snp28831-scaffold310-5365848, 서열번호 49의 염기서열을 가지는 snp285-scaffold1007-813430, 서열번호 50의 염기서열을 가지는 snp284-scaffold1007-754211, 서열번호 51의 염기서열을 가지는 snp189-scaffold1003-323637, 서열번호 52의 염기서열을 가지는 snp32376-scaffold368-705403, 서열번호 53의 염기서열을 가지는 snp32375-scaffold368-658493, 서열번호 54의 염기서열을 가지는 snp32373-scaffold368-587834, 서열번호 55의 염기서열을 가지는 snp32370-scaffold368-454814, 서열번호 56의 염기서열을 가지는 snp32369-scaffold368-408099, 서열번호 57의 염기서열을 가지는 snp32366-scaffold368-305218, 서열번호 58의 염기서열을 가지는 snp4356-scaffold1137-694167, 서열번호 59의 염기서열을 가지는 snp30564-scaffold339-321248, 서열번호 60의 염기서열을 가지는 snp45467-scaffold620-1315765, 서열번호 61의 염기서열을 가지는 snp18158-scaffold185-14973492, 서열번호 62의 염기서열을 가지는 snp24221-scaffold247-1351970, 서열번호 63의 염기서열을 가지는 snp39105-scaffold498-1004133, 서열번호 64의 염기서열을 가지는 snp37049-scaffold449-1390805, 서열번호 65의 염기서열을 가지는 snp44946-scaffold612-1703474, 서열번호 66의 염기서열을 가지는 snp11338-scaffold141-637604, 서열번호 67의 염기서열을 가지는 snp15641-scaffold165-2202458, 서열번호 68의 염기서열을 가지는 snp47830-scaffold673-1651381, 서열번호 69의 염기서열을 가지는 snp17173-scaffold1790-839956, 서열번호 70의 염기서열을 가지는 snp37305-scaffold455-664274, 서열번호 71의 염기서열을 가지는 snp35167-scaffold421-323627 또는 서열번호 72의 염기서열을 가지는 snp43002-scaffold570-363794의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 GG인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 경상대 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있다.

또 다른 예로서, 서열번호 73의 염기서열을 가지는 snp8317-scaffold130-2498079, 서열번호 74의 염기서열을 가지는 snp20495-scaffold202-5660539, 서열번호 75의 염기서열을 가지는 snp20491-scaffold202-5505660 또는 서열번호 76의 염기서열을 가지는 snp24629-scaffold2508-322935의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 CC인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 경상대 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있다.

또 다른 예로서, 서열번호 77의 염기서열을 가지는 snp33157-scaffold388-1183943의 61번째 대립유전자 염기쌍이 CC인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 또는 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고; 서열번호 78의 염기서열을 가지는 snp59969-scaffold998-1724843의 61번째 대립유전자 염기쌍이 GG인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 또는 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있으며; 서열번호 79의 염기서열을 가지는 snp7629-scaffold1274-136998의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 또는 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고; 서열번호 80의 염기서열을 가지는 snp11901-scaffold144-2628266의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 또는 장수 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있으며; 서열번호 81의 염기서열을 가지는 snp50217-scaffold717-6206911의 61번째 대립유전자 염기쌍이 GG인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 장수 또는 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있다.

또 다른 예로서, 서열번호 82의 염기서열을 가지는 snp39190-scaffold5-936305의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 경상대 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고, 상기 염기쌍이 GG인 경우, 장수 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있으며; 서열번호 83의 염기서열을 가지는 snp5043-scaffold1170-88721의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고, 상기 염기쌍이 GG인 경우, 장수 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있으며; 서열번호 84의 염기서열을 가지는 snp42006-scaffold548-2798856의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고, 상기 염기쌍이 GG인 경우, 경상대 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있으며; 서열번호 85의 염기서열을 가지는 snp15298-scaffold163-476873의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고, 상기 염기쌍이 CC인 경우, 경상대 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있으며; 서열번호 86의 염기서열을 가지는 snp39686-scaffold505-797498의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 장수 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고, 상기 염기쌍이 CC인 경우, 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있다.

본 발명의 다른 실시양태는 상기 SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는 흑염소 계통식별용 조성물을 제공한다.

본 발명의 용어 " SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제" 란, 상기 SNP의 다형성 부위를 증폭을 통해 확인하여 흑염소의 계통을 식별할 수 있는 수단을 의미하며, 구체적으로는 상기 SNP 마커를 포함하는 영역의 폴리뉴클레오티드를 특이적으로 증폭할 수 있는 프라이머를 의미할 수 있다.

본 발명의 용어 "프라이머"란, 짧은 자유 3' 말단 수산화기(free 3' hydroxyl group)를 가지는 염기 서열로 상보적인 템플레이트(template)와 염기쌍(base pair)을 형성할 수 있고 주형 가닥 복사를 위한 시작 지점으로 기능을 하는 짧은 서열을 의미한다. 프라이머는 적절한 완충용액 및 온도에서 중합반응(즉, DNA 폴리머레이즈 또는 역전사효소)을 위한 시약 및 상이한 4가지 뉴클레오사이드 트리포스페이트의 존재하에서 DNA 합성을 개시할 수 있다. PCR 조건, 센스 및 안티센스 프라이머의 길이는 당업계에 공지된 것을 기초로 변형할 수 있다.

본 발명에서 SNP 마커 증폭에 사용되는 프라이머는, 적절한 버퍼 중의 적절한 조건(예를 들면, 4개의 다른 뉴클레오시드 트리포스페이트 및 DNA, RNA 폴리머라제 또는 역전사 효소와 같은 중합제) 및 적당한 온도 하에서 주형-지시 DNA 합성의 시작점으로서 작용할 수 있는 단일가닥 올리고뉴클레오티드가 될 수 있는데, 상기 프라이머의 적절한 길이는 사용 목적에 따라 달라질 수 있으나, 통상 15 내지 30 뉴클레오티드이다. 짧은 프라이머 분자는 일반적으로 주형과 안정한 혼성체를 형성하기 위해서는 더 낮은 온도를 필요로 한다. 상기 프라이머 서열은 상기 SNP 마커와 완전하게 상보적일 필요는 없으나, 상기 SNP 마커와 혼성화 할 정도로 충분히 상보적이어야 한다.

본 발명의 프라이머는 포스포르아미다이트 고체 지지체 방법, 또는 기타 널리 공지된 방법을 사용하여 화학적으로 합성할 수 있다. 이러한 핵산 서열은 또한 당해 분야에 공지된 많은 수단을 이용하여 변형시킬 수 있다. 이러한 변형의 비-제한적인 예로는 메틸화, "캡화", 천연 뉴클레오타이드 하나 이상의 동족체로의 치환, 및 뉴클레오타이드 간의 변형, 예를 들면, 하전되지 않은 연결체(예: 메틸 포스포네이트, 포스포트리에스테르, 포스포로아미데이트, 카바메이트 등) 또는 하전된 연결체(예: 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트 등)로의 변형이 있을 수 있다.

일 예로서, 본 발명에서 제공하는 상기 SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제로는 서열번호 1 내지 86의 SNP 마커로 구성된 군으로부터 선택되는 SNP 마커를 포함하는 영역의 폴리뉴클레오티드를 증폭할 수 있는 프라이머가 될 수 있다.

본 발명의 또 다른 실시양태는 상기 조성물을 포함하는 흑염소 계통식별용 키트를 제공한다.

본 발명의 키트는, 계통을 식별하고자 하는 흑염소로부터 분리된 DNA 시료로부터 흑염소 계통식별용 SNP 마커 유전자를 증폭시킨 후, 증폭된 SNP 마커의 유전형을 확인하고, 이를 계통식별 분석법에 적용하여, 상기 흑염소가 어떠한 계통에 속하는 것인지를 식별하는데 사용될 수 있다.

구체적인 일례로서, 본 발명에서 제공하는 흑염소 계통식별용 키트는 Multi-plexing PCR을 수행하기 위해 필요한 요소를 포함하는 키트일 수 있다. 상기 Multi-plexing PCR 키트는, 상기 SNP 마커 유전자들에 대해 특이적인 각각의 프라이머 쌍 외에도 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액(pH 및 마그네슘 농도는 다양), 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs), Taq-폴리머라아제 등의 효소, DNase, RNAse 억제제, DEPC-수(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다.

다른 예로서, 본 발명에서 제공하는 흑염소 계통식별용 키트는 DNA 칩을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 흑염소 계통식별용 키트일 수 있다. DNA 칩 키트는, 일반적으로 편평한 고체 지지판, 전형적으로는 현미경용 슬라이드보다 크지않은 유리 표면에 핵산 종을 격자형 배열(gridded array)로 부착한 것으로, 칩 표면에 핵산이 일정하게 배열되어, DNA 칩 상의 핵산과 칩 표면에 처리된 용액 내에 포함된 상보적인 핵산 간에 다중 혼성화(hybridization) 반응이 일어나 대량 병렬 분석이 가능하도록 하는 도구로서, 이를 이용하여 다수의 흑염소의 계통을 동시에 식별할 수 있다.

본 발명의 또 다른 실시양태는 상기 조성물을 사용하여 흑염소의 계통을 식별하는 방법을 제공한다.

구체적으로, 본 발명에서 제공하는 흑염소의 계통을 식별하는 방법은 (a) 흑염소 개체로부터 분리된 시료의 DNA로부터 상기 흑염소 계통식별용 SNP 마커를 증폭시키는 단계; 및 (b) 상기 (a) 단계의 증폭된 각 SNP의 염기서열을 결정하고, 이를 분석하는 단계를 포함한다.

본 발명의 용어 "개체"란, 계통을 식별하고자 하는 대상인 흑염소를 의미하며, 상기 흑염소로부터 얻어진 검체를 이용하여, SNP의 유전자형을 분석함으로써 흑염소의 계통을 식별할 수 있다. 상기 검체로는 털, 뇨, 혈액, 각종 체액, 분리된 조직, 분리된 세포 또는 타액과 같은 시료 등으로부터 DNA를 수득할 수 있으나, 이에 특별히 제한되지는 않는다.

상기 흑염소의 계통을 식별하는 방법에 있어서, 흑염소 계통식별용 SNP 마커를 증폭시키는 단계는 흑염소 계통식별용 조성물 또는 상기 조성물에 포함된 상기 SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 사용하여 수행할 수 있는데, 이때 당업자에게 알려진 어떠한 방법이든 사용 가능하다. 예를 들면, 표적 핵산을 PCR을 통하여 증폭하고 이를 정제하여 얻을 수 있다. 그 외 리가제 연쇄 반응(LCR)(Wu 및 Wallace, Genomics 4, 560(1989), Landegren 등, Science 241, 1077(1988)), 전사증폭(transcription amplification)(Kwoh 등, Proc. Natl.Acad. Sci. USA 86, 1173(1989)) 및 자가유지 서열 복제(Guatelli 등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 1874(1990)) 및 핵산에 근거한 서열 증폭(NASBA)이 사용될 수 있다.

상기 염기서열을 결정하는 방법은 특별히 이에 제한되지 않으나, 일 예로서, 서열 분석, 마이크로어레이(microarray)에 의한 혼성화, 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 다이나믹 대립유전자 혼성화 기법(dynamic allele-specifichybridization, DASH), PCR 연장 분석, PCR-SSCP, PCR-RFLP 분석 또는 TaqMan 기법, SNPlex 플랫폼(Applied Biosystems), 질량 분석법(예를 들면, Sequenom의 MassARRAY 시스템), 미니-시퀀싱(mini-sequencing) 방법, Bio-Plex 시스템(BioRad), CEQ and SNPstream 시스템(Beckman), Molecular Inversion Probe 어레이 기술(예를 들면, Affymetrix GeneChip), 및 BeadArray Technologies(예를 들면, Illumina GoldenGate 및 Infinium 분석법) 등을 사용하여 수행될 수 있다.

상기 분석은 특별히 이에 제한되지 않으나, SNP 구조(STRUCTURE) 분석 또는 PCA(principal component analysis) 분석에 의해 수행될 수 있다.

본 발명에서 제공하는 흑염소 품종식별용 조성물을 이용하면, 식별하고자 하는 흑염소가 국내 4계통 중 어디에 속하는 흑염소인지를 유전자 수준에서 식별할 수 있으므로, 보다 정확한 흑염소의 품종관리에 널리 활용될 수 있을 것이다.

도 1a 내지 1d는 본 발명에서 제공하는 86개의 monomorphic SNP를 대상으로 STRUCTURE 분석을 수행한 결과를 나타내는 그래프이다.
도 2는 본 발명에서 제공하는 86개의 monomorphic SNP를 대상으로 2개의 주성분을 사용하여 PCA 분석을 수행한 결과를 나타내는 그래프이다.
도 3은 본 발명에서 제공하는 86개의 monomorphic SNP를 대상으로 3개의 주성분을 사용하여 PCA 분석을 수행한 결과를 나타내는 그래프이다.

이하 본 발명을 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.

실시예 1: 흑염소 집단에 대한 사전 검사

국내의 흑염소 계통으로 알려진 당진, 장수, 통영 및 경상대 계통에 포함된 흑염소 및 외래종과의 교잡 흑염소를 대상으로 각 계통에 대한 개체 수 및 성별, 도태 및 보존 현황에 대한 자료를 조사하였다(표 1).

실시예 2: 각 계통 별 monomorphic SNP 선별

먼저, 상기 실시예 1에서 사용된 당진, 장수, 통영 및 경상대 계통의 흑염소에 대한 유전체 정보를 분석하여, 각 계통에 따른 monomorphic SNP의 존재여부를 확인하였다.

그 결과, 각 계통별로 당진계통 12,670개, 장수계통 11,954개, 통영계통 12,832개, 경상대계통 26,003개의 monomorphic SNP가 존재함을 알 수 있었다.

다음으로, 상기 확인된 각 SNP들이 해당 계통에서 고유한 유전자형을 나타내는지 조사하였으나, 각 계통에 독립적으로 존재하는 Monomorphic SNP는 발견되지 않았다.

이에, 상기 각 SNP가 다른 계통에서 같은 유전자형을 가지는지 조사하여 중복되는 계통 수에 따라 분류하였다.

그 결과, 두 개의 계통에서 동일한 유전자형을 갖는 6개의 monomorphic SNP가 확인되었고, 세 개의 계통에서 동일한 유전자형을 갖는 86개의 monomorphic SNP가 확인되었으며, 4개 계통 모두에서 동일한 유전자형을 갖는 23,775개의 monomorphic SNP가 확인되었다.

이에 따라, 이하에서는, 적절한 통계분석 결과를 얻을 수 있는 86개의 monomorphic SNP를 사용하여 계통 식별이 가능한지의 여부를 확인하였다.

상기 86개의 monomorphic SNP에 대한 간략정보(염색체내 위치 및 SNP ID)를 각 염색체별로 분류한 결과는 다음과 같다(표 2 내지 24).

1번 염색체

위치	SNP ID
10,418,632	snp42346-scaffold559-311056

2번 염색체

위치

SNP ID

6,293,439 6,806,839 42,642,333 45,680,196 49,005,902 49,124,474 49,298,370 49,353,996 63,709,548 63,742,541 65,654,470 100,142,538 100,259,731 100,297,647 100,331,984 109,439,457 136,405,913

snp8328-scaffold130-3011444 snp8317-scaffold130-2498079 snp46022-scaffold631-1730693 snp40368-scaffold515-3054409 snp53696-scaffold82-239368 snp53699-scaffold82-357819 snp53703-scaffold82-531765 snp53704-scaffold82-587189 snp50926-scaffold739-1589302 snp50925-scaffold739-1556203 snp7015-scaffold1259-344227 snp20495-scaffold202-5660539 snp20492-scaffold202-5543214 snp20491-scaffold202-5505660 snp20490-scaffold202-5472056 snp33231-scaffold39-4628 snp38040-scaffold474-167028

3번 염색체

위치	SNP ID
29,739,398 48,376,280 59,682,060	snp7977-scaffold129-617417 snp11901-scaffold144-2628266 snp42083-scaffold55-1985644

5번 염색체

위치

SNP ID

56,064,816 57,621,215 68,238,321 69,947,056 73,688,756 73,747,962 74,814,310 75,422,563 75,484,600 75,532,890 75,565,897 75,604,240 75,736,431 75,783,327 75,813,671 75,886,394

snp33393-scaffold392-1543422 snp12644-scaffold1482-83416 snp28831-scaffold310-5365848 snp28871-scaffold310-7069631 snp285-scaffold1007-813430 snp284-scaffold1007-754211 snp189-scaffold1003-323637 snp32377-scaffold368-765290 snp32376-scaffold368-705403 snp32375-scaffold368-658493 snp32374-scaffold368-625163 snp32373-scaffold368-587834 snp32370-scaffold368-454814 snp32369-scaffold368-408099 snp32368-scaffold368-377681 snp32366-scaffold368-305218

7번 염색체

위치	SNP ID
6,613,285 10,565,867 64,948,071 73,221,188	snp4356-scaffold1137-694167 snp4683-scaffold1152-307402 snp30564-scaffold339-321248 snp33091-scaffold386-396847

9번 염색체

위치	SNP ID
57,498,314 85,469,234	snp45467-scaffold620-1315765 snp39190-scaffold5-936305

10번 염색체

위치	SNP ID
34,808,087 62,136,998	snp18158-scaffold185-14973492 snp33157-scaffold388-1183943

11번 염색체

위치	SNP ID
15,631,488 38,857,150	snp33669-scaffold395-2029196 snp24221-scaffold247-1351970

12번 염색체

위치	SNP ID
15,526,745 58,947,096 72,945,270	snp5043-scaffold1170-88721 snp50217-scaffold717-6206911 snp39105-scaffold498-1004133

13번 염색체

위치	SNP ID
15,574,186 15,761,411	snp56059-scaffold875-326243 snp56054-scaffold875-139298

14번 염색체

위치	SNP ID
42,087,324 42,419,110 43,388,795 43,793,148 45,411,315 58,242,353 59,055,831 67,676,551	snp59930-scaffold998-14068 snp59937-scaffold998-344168 snp59959-scaffold998-1321665 snp59969-scaffold998-1724843 snp15530-scaffold1641-415024 snp58863-scaffold963-342613 snp37049-scaffold449-1390805 snp44946-scaffold612-1703474

15번 염색체

위치	SNP ID
51,654,650	snp42006-scaffold548-2798856

16번 염색체

위치	SNP ID
28,987,486 42,276,165	snp17320-scaffold18-4154892 snp11338-scaffold141-637604

19번 염색체

위치	SNP ID
6,527,034	snp57798-scaffold931-1763741

21번 염색체

위치	SNP ID
18,123,908 33,294,411 54,809,637	snp24629-scaffold2508-322935 snp6481-scaffold1230-106199 snp15641-scaffold165-2202458

22번 염색체

위치	SNP ID
3,705,090 40,680,180	snp22267-scaffold22-1694175 snp15298-scaffold163-476873

23번 염색체

위치	SNP ID
11,562,485 33,547,841 35,222,137 40,565,166 48,195,512	snp39686-scaffold505-797498 snp31006-scaffold3423-428862 snp47830-scaffold673-1651381 snp17173-scaffold1790-839956 snp37305-scaffold455-664274

24번 염색체

위치	SNP ID
28,335,802 30,575,028 30,962,839	snp55508-scaffold86-704514 snp35167-scaffold421-323627 snp59287-scaffold974-1156967

25번 염색체

위치	SNP ID
5,958,379	snp43002-scaffold570-363794

26번 염색체

위치	SNP ID
702,572 7,104,274 15,241,174	snp23428-scaffold2352-346197 snp52222-scaffold774-825598 snp47515-scaffold67-806294

27번 염색체

위치	SNP ID
10,742,813 11,202,353	snp18606-scaffold1881-25106 snp7055-scaffold126-1400752

28번 염색체

위치	SNP ID
33,552,860	snp7629-scaffold1274-136998

29번 염색체

위치	SNP ID
31,640,232 44,398,844	snp26172-scaffold274-340581 snp53484-scaffold811-325023

실시예 3: STRUCTURE 분석을 이용한 계통식별

상기 실시예 2에서 선별한 86개의 monomorphic SNP를 대상으로 STRUCTURE 분석을 수행하였다(도 1a 내지 1d).

STRUCTURE ver.2.3.4 (July et al, 2012) 프로그램을 이용하여 분석을 수행하였으며, 각 집단에 대하여 실시예 2에서 선별한 86개의 monomorphic SNP에 대해 halpotype을 구한 뒤, 분석에 이용한 집단 내의 각 개체들 간의 유사한 유전적 구조를 조사하였다. 유전적 구조가 유사한 그룹의 수를 K 값을 이용하여 설정하였으며, 본 분석에서는 4개 계통에 대하여 분석하였으므로, 2에서 5까지의 그룹 수를 통한 유전적 유사 그룹을 알아보았다.

도 1a에서 2개 그룹(K = 2)으로 나누었을 때, 경상개 계통과 나머지 3개 계통이 유전적으로 서로 다른 구조를 가짐을 확인하였고, 같은 방법을 통하여 도 1c에서 4개 그룹으로 나누었을 때, 각 계통에 따라서 동일한 유전적 구조를 가짐을 확인 하였다.

먼저, 상기 86개의 monomorphic SNP를 2개 집단으로 분류하여 STRUCTURE 분석을 수행한 결과, 당진(DJ)과 경상대(GNU)가 고유의 유전적 구조를 가지는 것으로 나타나고, 장수(JS)와 통영(TY)는 당진의 유전적 구조를 더 많이 가지는 것으로 확인되었다.

또한, 도 1a 내지 1d에서 보듯이, 상기 86개의 monomorphic SNP를 4개 집단으로 분류하여 STRUCTURE 분석을 수행한 결과, 각 계통에 따라 고유의 유전적 구조를 나타냄을 알 수 있었다.

실시예 4: PCA(principal component analysis) 분석을 이용한 계통식별

상기 실시예 2에서 선별한 86개의 monomorphic SNP를 대상으로 PCA 분석을 수행하였다(도 2 및 3).

PCA 분석을 위해서 PLINK ver.1.90을 이용하여 각 개체에 대한 86개 SNP의 eigenvalue와 eigenvector를 구하고, R studio ver.1.1의 package를 이용하여 분석 결과를 그래프화 하였다.

전체 86개 SNP의 유전자형 중 2개의 주성분을 이용하여 도 2를 작성하였고, 3개의 주성분을 이용하여 도 3을 3차원 그래프로 작성하였다.

먼저, 도 2에서 보듯이, 2개의 component를 이용하여 PCA 분석을 수행한 결과, 당진(DJ)과 경상대(GNU)는 구분이 가능하나, 장수(JS)와 통영(TY)은 서로 혼재되어 구분되지 않음을 확인하였다.

따라서, 당진 계통과 경상대 계통, 그리고 장수와 통영 계통으로 3개 그룹으로 나눌 수 있음을 알 수 있었다.

또한, 도 3에서 보듯이, 3차원 PCA 분석을 수행한 결과, 당진(DJ)과 경상대(GNU) 뿐만 아니라, 장수(JS)와 통영(TY)도 구분이 가능함을 확인하였다.

따라서, 4개 계통이 각각의 서로 다른 군집을 형성할 수 있음을 알 수 있었다.

상술한 결과를 종합하면, 86개의 monomorphic SNP를 사용할 경우, 흑염소의 계통식별이 가능함을 알 수 있었다. 또한, 상기 monomorphic SNP를 사용한 PCA 분석을 수행할 경우에는 2차원 PCA 분석 보다는 3차원 PCA 분석을 수행할 경우, 보다 용이하게 흑염소의 계통을 식별할 수 있음을 알 수 있었다.

이상의 설명으로부터, 본 발명이 속하는 기술분야의 당업자는 본 발명이 그 기술적 사상이나 필수적 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 실시될 수 있다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 이와 관련하여, 이상에서 기술한 실시 예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적인 것이 아닌 것으로서 이해해야만 한다. 본 발명의 범위는 상기 상세한 설명보다는 후술하는 특허 청구범위의 의미 및 범위 그리고 그 등가 개념으로부터 도출되는 모든 변경 또는 변형된 형태가 본 발명의 범위에 포함되는 것으로 해석되어야 한다.

<110> REPUBLIC OF KOREA(MANAGEMENT : RURAL DEVELOPMENT ADMINISTRATION) <120> Novel SNP marker for identification of black goat and uses thereof <130> KPA190876-KR <160> 86 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 1 atgcactcaa acgaaactgg acttggtaga aacaatggct aaaagcatac atatgtgcac 60 rtgcacacac atgggcactc gcaacagcag aaggcaaatt atgaagggac aaaaaattag 120 t 121 <210> 2 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 2 tctatagagg aagctgctgt gtgactttgg gcaatgtact taacttctct gaacctcaat 60 rtccttatct ctaagatgaa gatgctaatg tctccttaca gatttagggt aaggataaca 120 t 121 <210> 3 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 3 ctctctctgg gctcattgct gctgctactt gcagccagat tctgtgcttc ctagaaaatc 60 rtcatccctt ttactgttta ttcttggggt ggattattag ttcccaaaaa ccagggtagt 120 g 121 <210> 4 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 4 aacatgaatg gatgagtaac acaacacttt aatttcaaga tactattaac tgacaatacc 60 rcctgtctta gcaaataaaa tagggcttaa tcatcataag gcattacttc tttgaattat 120 t 121 <210> 5 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 5 gtattctggc ctggagaatt ccatggacat gactgagcga ctttcacttt catagcttgc 60 rctttttagc atttgcatca acgatgagaa cgcacacttt ctgagtgcag tggctgctta 120 t 121 <210> 6 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 6 gagaagtatc aagaaacagg aggtaaaatc agaagttctt gactcaatct aggatgactc 60 rtaggtttct ggcttgaatg aaaggtgaat ggaaatactg ctatagatag gaaatacaag 120 g 121 <210> 7 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 7 aagatgtggg ctaaaacact acagggtacc caacaagtca ggaaacacag gatttaaaat 60 rcgttacatt tctttaataa tatgataact atgatttttg ttaacttcta gacatctttt 120 c 121 <210> 8 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 8 gatgatcgga tgggcattgc cattaggttg agttacactt gatccgataa ggcgaaaatt 60 rcatataatc tatattactc ttgacctgat tgttaagtgt ggcacacctt atttgtattt 120 t 121 <210> 9 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 9 tcttgccagc aatgcctgaa agtacctcaa ttctctgtgg aaactgacac ataaagaaac 60 rtacctgtca caggtgcata agagtggagg gtttattcta tgggctctgt cctcaccaga 120 a 121 <210> 10 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 10 aatgatatcc tcatgagggg tctttgatag aactaaagga aatagtgata aagatgcact 60 rctggacatt tattttttct attaaataac ttcaaaatgc ttttaaccta atatgaggct 120 a 121 <210> 11 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 11 attagcaacc actttggtct ctgacacata ttacgcagat attgaagtgt taatattacc 60 rcagcttgat tacaaaaggc agtgattaat ttaaaagcag acaaaaaaga tatgccctga 120 t 121 <210> 12 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 12 aagtagctgt accacgttac attcttgcca gcagtgcatc aggtttctga tatgagagaa 60 rtttgctttt ctaagatttt tgtctatctt tcatatttgt tctcagctgg tttgttcttc 120 t 121 <210> 13 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 13 ctttgtataa agttttaatt tacttggtat aaatacgttt tacaaatggt gtaagttagg 60 rttgcagttt tccttcatac actcaattgt cagtatgtta ctggcccagt catgtccagc 120 t 121 <210> 14 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 14 aatcaaagtt ttgataattc ctcagcccgt gttctaacca ctgaactaga tactcgggat 60 rttcctcgtc tacactgttc acctaagcac ttcatgaatt cagggactgt gtctcttact 120 c 121 <210> 15 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 15 ttgcggccaa tgctgacaaa cttctcctcg acctccagca agcggctgtc tatttccagc 60 rtcagaaaca agttctgcag ggggtctctg tccagctgct cctggaccgc tttgatctgg 120 a 121 <210> 16 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 16 gcctaggagg ctctagtcca tggggttgca atgagtcaga cacaaatgag caactaacac 60 mcacacagca cccttgagtc acagtaactt tcacagcaag aatggattag aagatgggcc 120 a 121 <210> 17 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 17 agggcaggca tccacatacc tgtctctgtg ctggcgccgg ttggtggtca gggccacagc 60 ratattgtcc cacgctttcc aaacttcccc ttggcctggg ttctcacagc caagctgatg 120 c 121 <210> 18 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 18 gcaaatgtga caacaggcaa aacaatcaag aaatagctaa ttaagaaact tactcagtaa 60 rgctttttgg aatgttgaaa tacctgaact attctctaag caaacccatg agagttaggg 120 g 121 <210> 19 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 19 cttttacttt ccaactcagg agagtacttg aaaagtcaag gcttaggatt ttaaatgatc 60 rtcaagtgct agtaacacta agccacaaat atgacttaat agtctctgct cttctgtttc 120 g 121 <210> 20 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 20 tgcttgtcca agagaaaacc caaaacattt cttcgtcttt tcatcagact gtttattttc 60 rttatcttct gtaaccataa ttaaacctgt ctttgattta ttttatgaac actgaaaacc 120 a 121 <210> 21 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 21 caaatgattt tttttcaagt tttaaaaact ttgcatcaag tcagaaattc cacaaggaca 60 rttcctctct tgtctcccag gatttgctcc tactattccc tctgtctaaa gtattattct 120 c 121 <210> 22 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 22 acactttcat tttacaattt cattttacaa aagctaacta aagagggcat gctaaatgca 60 rctcattggt tggttctaac agagcttgga gtttaataga actcaaagaa ttattctgga 120 t 121 <210> 23 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 23 caagcaaaac acaaacaggc aattaatctg tcagccctta cttagctcag ctgacttttc 60 rtttaatgct cataaatgtt gtgccttcga ttttgggttc catggtaacc tccttctccc 120 a 121 <210> 24 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 24 accaatttac attcccacca acagtgttgg aaggttcctt ttcctaagga aataattttt 60 rtttcctggt gtagcaatag cctgaaatgt ctcctgaatg tatgctgaat tttaagtctt 120 t 121 <210> 25 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 25 gaagaatttt aagtgtccat atcctattta ttacatttac tttgaaaata ctactacttt 60 rcttattgta acagttcccc cttgggtgcc tgggtaagga agtcatgttt taagttatca 120 t 121 <210> 26 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 26 gcaaactgag tgacaaatgt aatgttaagg aatgaaattt ctgagttatc agatacacat 60 rctcaaatgt gatggataaa gatcgacaaa gtcttatcat cttatagaaa cacaagccca 120 t 121 <210> 27 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 27 caagaaaatt tagcaatagc tatcgttaat cattgagcca catccagccc tccagaatac 60 rtgttgattc aaggatcttg catatattag agaaattcag gtgactaaca tacatgctta 120 t 121 <210> 28 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 28 aggcctgctt tatggaaact gatttatcaa gtgaaaggaa agggcaagga catgtatttt 60 rtcaaaatga gcataattta gcaagttaat gtggatattt tatgtgaaat ttccacactg 120 t 121 <210> 29 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 29 acgagcaatt aacatcacta tgttgaacaa atcacagatt acacaatcac caacattatt 60 rtagggtggt ggtggtagtg attatgcctt tccattttga aacacttcaa aaatcagttg 120 t 121 <210> 30 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 30 aagccagggg cctccttgag aacttgcatc ccagaaggaa gacttaacct tgaaccctgc 60 rctcctcttc accttggaca aagcttttta ctcagagagt ttacctctgc ccccttgtac 120 a 121 <210> 31 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 31 ccagggaagt ccctctgtcc ccctttaact ctctctcctg attacctcct ccctttaggt 60 matctcttgg tagatgtatt tccccagttt tctctcttgc catctctcat ttggtaatgg 120 a 121 <210> 32 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 32 acaaacagaa ttgtaactta acctggacaa ggaaagtttt ctttgttttt ttgaagaatc 60 rttgttttaa ctaagtcctc aaagtttctg ggtagtgatg gaatcattaa cccagagaag 120 a 121 <210> 33 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 33 gcatttctcc attcatttct gtttccataa ctgagatcta taccaggtgt tgactaagtc 60 rttccaccat ctccctttac aatgtttcct acttttagca tcagatcaac tattcaaaag 120 t 121 <210> 34 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 34 agaggtctcc tcgcttcaga ggcctcattt aaacccccac tttctgcaga cgaagtggac 60 rcccagcgga aggaggcaat taaggcgaag gtgatcagag tcccctgagg acatggggag 120 g 121 <210> 35 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 35 taaaatattt ttctgtgcat gtatgtgtgt attcagctgc atggaatcct agttcagcat 60 rtgggatctt gtggtacatg ggccacagca tgtaggatct tagctccctg accaggaatc 120 a 121 <210> 36 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 36 tttatgtcca ttgagtcggt gatgctattc cctaaaggaa agtagcctgg caatacaccc 60 rtatttgcct cgtacaactt ccttgttcct tttcccttct ggtgaagaaa gtctttcatt 120 t 121 <210> 37 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 37 cgactgttca ttaggtagag cttcacactg tgtgccagct aggtctttag ctgagagtgt 60 rcaaaagcac ttgcatggaa aactatatga aaaatgagcc ctaaagcagt attttatgta 120 t 121 <210> 38 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 38 ttgccgcgag tgggctttac ttctgaagct cagaacagtg gttcagagaa aaatatgtcc 60 rtgcattttc aaggtcagaa aaggaagtga agagcatcaa tatggagcag gcattgctgg 120 a 121 <210> 39 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 39 agtcatttcc caccagcatt actttagggt tatattaaga acttgcctcc agaatttgac 60 rcattcattc ataaacatat tttataagtt gattgtaaag tgtgctgaaa ggtaactcat 120 t 121 <210> 40 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 40 ccctggagtc agtgcccctg ggaatatggg cagggctttg tcctatgtat ccctgacttg 60 rggtctccca gcttaggggt gcctttctct ttagctccag gctagtaaac tcttatttgt 120 g 121 <210> 41 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 41 attggataca ttacttgagc ttccctgagc aattttacat atgccttaga tatatcaaat 60 rcaatgctgg agatctctgt atacttaatg actgcttatc tatttatcta catagttcct 120 t 121 <210> 42 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 42 aggtgggttc tttaccaccg agccaccagg gaggccccac gtcgtatatg cagtgcttct 60 rtgaacgcag ccgcaaaccc agtaacgcat ctacgtatga agcactgacc ggtgcgcttg 120 t 121 <210> 43 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 43 gagccctcta tgctgaccca ccatcctgag tctggaatct gttctgataa aatctgttac 60 raaatcagga cattctgctt tggagttttc caaaatgggc ttctgatcag gagaagaacc 120 t 121 <210> 44 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 44 ccattcatct caggttctcg ttcttcaact gaaacgacct gctcaatctg gcaagtgacc 60 rtggctaata tgttctttat cttttgccca aattctccat ttctcttgcc aaatattttt 120 a 121 <210> 45 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 45 ttttgttaca ggaagtcagg gattaatgga ctttgaagag tagcatctct tcatgtaacc 60 ragataagaa tataagtgaa aggggaaaga aactaggtga aatggcacac tataccagaa 120 c 121 <210> 46 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 46 agtgggtaac cattaaagtt gttgagtatt tgttgaatac atgtagggat aggaagtaac 60 rtgaaaatga ggaggatcag attgcactga atcatcatca tttcagtttt gaaaagttaa 120 a 121 <210> 47 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 47 cactcaggtt gaagcatatt tacatgctct attatggtta aaaagtcaat gcaaaagttg 60 rtgaatatcc tcactatgaa actctctttc ctccattttc atttctttca agtccacatt 120 t 121 <210> 48 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 48 acagttctgt ggacaaaacc tggcaccaat cagaaagttc agccagctca gttctcaaat 60 rttggtttat ctggatgatt ccttcattct aggcttcact ctttgggttg atacagcttt 120 a 121 <210> 49 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 49 aacagacatg gcagcgacag catgataaag atgctaggct ctgggaaccc cttcaggggc 60 rtagaggact tcttggagga ggtgttgttt caccagaaac ctggaagatg tgtaggaact 120 t 121 <210> 50 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 50 ccttgatgtt gcttctcgtc ctggtttgaa attcatagcc cagggcctgc ctttctccca 60 rtccaggtga gactggtttc cctttaccct gtccacctca agttccccag ccattttttc 120 t 121 <210> 51 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 51 tggggtttat cagaatgtaa cccctctgta agttgaggaa gatctgtact tttttgctgc 60 rtcaagctaa aaggaaacca gctatcatct tgtgagctgc cctgtataga ggcctctatt 120 a 121 <210> 52 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 52 gccttattaa aaaaatattt aatggaatag atctagaaat ctaaaaatat ttaatggaat 60 rttactttgg ctcaacataa aaagcacttt ttaactcata tttttaaaaa acactttgag 120 a 121 <210> 53 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 53 atatcattgc tgggggaatg gagaggaagg tagaattaat ggggttgcct tgtgtaaact 60 rctgctgtgt cttttaattt cacaggcttg tgtcttgtat tcttctatta ttgtctccca 120 t 121 <210> 54 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 54 ctgttaaaat agctctttga ctagccttgt ctatctggct ggctggtgag aataggcacc 60 rttcacaggc ctttgtgagc ctgaggagca gtaactattt aggcagttac ttccctggcc 120 t 121 <210> 55 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 55 aaaaaattct ttctacaaat aatatttatc ttggatcgaa gggccaaaga ttcaaaattc 60 rcaggcccat ggcaagacag aaaagtgaag gtgagataac actgttatgc tgaaaagctg 120 a 121 <210> 56 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 56 atagtgatat ggagaaaatc atatttacga aaattcttct tatgaacaga atgtggttaa 60 rgtcacttgt catagcttga aacccccagg ggcacacttg agcagtggtc tctaagccgc 120 t 121 <210> 57 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 57 gtcttaacac tctacctgcc tcattttcca atctcattgt taaacttttc agatatattc 60 rctctgaaat tttctttaaa atatcacttc aatgcttgtt aaggtaaggg gaagggaaaa 120 g 121 <210> 58 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 58 agatttattg tgtatttaat atctggccca tttattccag gagttctatt aaagaaataa 60 rcatgttttc atgatttaga gtgtagaatt ccaggggaaa aaaagaaaat atatctattc 120 t 121 <210> 59 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 59 ctatctgcta tttagtagca ggctatgctg gttagttgcc ttgcatgatg ggaaattctc 60 rttgtccatg aagtaggcag gactcttagc ccctcactgg gaaatggagg tttttggtgg 120 g 121 <210> 60 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 60 tgggagagta tgtggaaggg tagttacatc aaagcaagat tccacaggct tcagcttgac 60 rtctttggaa gagcatccag gtgtttcaac attttccatc tgtgttgtca actatcgttg 120 c 121 <210> 61 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 61 cctcttttat ctgaaaagag attacttggt cagtcaacag tagcatctac aacataccac 60 rcaaatcaag gaaagggatc taccagtgat tcttccttct ggctgcaaat cagaatcacc 120 t 121 <210> 62 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 62 ccaaaattct caggtattta agtggatttt tgagttttta aaacaaattt gcttgttccc 60 rcatcacttc tgtatttaag agaatttcca gtagtttatc tggagaagtc ataagttatt 120 a 121 <210> 63 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 63 ataatgtttt attgtcattt tttgattaga aaagtgcttt gaagaggctt ataaaaatac 60 rtttatatat aagctgtgca attctcagga aaactcaaac caaacaaagt acagccagtt 120 c 121 <210> 64 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 64 tgatttaccc tgtgcaatca tacagactct tgctcctctt tccaaagaaa cagtatcatc 60 rtgattgaag aaaaagaatc tagtcacttg aaatagcctt atatttttat aataaaaaga 120 a 121 <210> 65 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 65 gcttttatca tactctatgc tgtgaacaaa attctgtttg tgaacaattt tgtgatgggt 60 rtaacctcat tttagtcact cactgatagt cactaattca tccttcactt tttcagtcaa 120 t 121 <210> 66 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 66 tactgtcact gtagctgctc tgtttagacc gtgggtagac gccaatgcgg agacaggacc 60 rttctcgcgc tgtctgtagc ggccgcagta tcacttttca gatgtgtata ttgacaatag 120 g 121 <210> 67 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 67 ccttcttttc ttatgtgttt ggactggttt agaatttaaa aacctgtgac ctttgcagcc 60 rtgccctagg tgatcatcct ctccggccct acaactgcct ctacccagtg ggcattaggg 120 c 121 <210> 68 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 68 tctagacctc aaagttttct gagtcagtct ttaagtgaaa ttcacactcc agaatgatgc 60 rccgtgttca gtctgcagct tcaaatatcc cctcgtaaag taccacacac tcccaagata 120 g 121 <210> 69 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 69 catgagcctg gtcctttcca gttctgtgtc cacattggtg gcataggtct tcctttgagg 60 rcagaaacaa acaccaatat gatttctcaa gcacctaata agtgccctgc aatacataat 120 c 121 <210> 70 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 70 tatagtggct ttgcacagac cttgagacac aataggcact ccctaaacac cataactaaa 60 rgtgccatac ccctccctct catcagcctg actgagcaag tgagctctaa taagtcacca 120 c 121 <210> 71 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 71 accgaaaagc ctaggggttc agaactcaga ggctggagcc ccattattgg tctgaaaccc 60 ragtctgcta cttactgagt taataagttt gcctacagta tagagttttt atgagagtta 120 c 121 <210> 72 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 72 gatggcccgc ctggtatggt ggagcagacg gaaatggctg tttccatgtt attgagaaag 60 rcaccagagc tcagaatgta aagacagaaa atcatgtttt gaacattgag gaggcctcct 120 g 121 <210> 73 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 73 tagcacagaa aaaaggaatt gcacaagttt tcacaaatga gaccaaaggt tcaacgtcaa 60 mgtgtgtctg ctctgcagcc atttcaacaa cccaggagag gcggtcgttt ggaaactcgg 120 t 121 <210> 74 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 74 ttctttttcc tttaccggtt acccatctca ctgtagtcta ctgaaataag tttattttca 60 mtatgaataa cattataatc tgagcataaa ttctaaattg ataaccaagt tatcttagta 120 c 121 <210> 75 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 75 gttaaaaata gttctttata ctgtttcaat gtgggacctt ttaatgtatt tgataaggga 60 mtggccatga actaaccagc attaagagcc tagcaggact aggaatgctt tagcagagtg 120 a 121 <210> 76 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 76 cagtgtcctt gactggcaac tttcatttct cctaaagaat gtctaaggga atacaaaaag 60 mttcctgcta ctcattaaat ataggaggca aagtgggaaa aacaatttca gggagaaaca 120 g 121 <210> 77 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 77 atataacaca ctagaaacac ataacatctt tacctattat cctagagagg aggaaaaatt 60 mttttccctt ctaccttcct aactcgggga gttggtgatg gacagggagg cctgacatgc 120 t 121 <210> 78 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 78 ctagcatgat gtggagtttt ggttattttg tgattttttt ttgctcctgt ccacaagctt 60 rtacatctag gcacatgggt gcacttttct gggcaatatg gaatattcca aaagtccaaa 120 c 121 <210> 79 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 79 ttatcttgac attgggagat aactaaaata tccttgaaac ttatttttag ggctgaagac 60 rtatcatttt tttatctact aaataaccta aacagatctt tccttagcaa gtcaagttga 120 t 121 <210> 80 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 80 cactttagac tagatttcct tgtgcaaaac cactgcacct gacacctagg tctgcctgcc 60 rcatgatgca tgtgcccagc agagtgatct ggagtgctgt aagcagcaca gctgagcaga 120 c 121 <210> 81 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 81 aaataatccc tgctacatta agtgcataca actggtatat aaggaaaaat gaccccactg 60 rttaaacagt tctggaagga aaagaggtcc tttcccgtct tcactcacta cagagaacta 120 c 121 <210> 82 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 82 aactccttaa atgagctttc ctaatgaatc agtgtcagag caaagcttca ctgcctgtac 60 rttgttgact gacatctaga aggactgact gaaaccataa aggcatatta gaaaccaact 120 g 121 <210> 83 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 83 cagtattaaa attaaaaaag ctcaaaacaa aaattggtaa atctgtcaaa gcaaagggca 60 raatggaaga tgaggacaca gggcctatgt tgcccttggc tatgtacctg gaggacaata 120 a 121 <210> 84 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 84 acacacacac acacacacac acacagtctg aagctcccac catttaagtc actccagagg 60 rtcagacatt tccccctgag gccctgtaag gcacacacct cctgaatccc atcccccttc 120 c 121 <210> 85 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 85 ggccgagaga aggcctcctc ttgtcctcag ctgaaagtgt cctcatgctg tgaaggagtc 60 mcttttttgg ctctttgtgc agtcgccaaa ggacagtctc agcagggcag gcctgtggga 120 a 121 <210> 86 <211> 121 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SNP <400> 86 atttgaaatt caaattgtgg ggctttcctt tggtgcttca ggctgaaaac cacatctctt 60 matagtttct aaatgcctgt ttccatctac ttttaaagac agaaaaaaat taaggccaag 120 g 121

Claims (20)

1. 서열번호 41의 염기서열을 가지는 snp42346-scaffold559-311056, 서열번호 42의 염기서열을 가지는 snp8328-scaffold130-3011444, 서열번호 73의 염기서열을 가지는 snp8317-scaffold130-2498079, 서열번호 13의 염기서열을 가지는 snp46022-scaffold631-1730693, 서열번호 17의 염기서열을 가지는 snp40368-scaffold515-3054409, 서열번호 18의 염기서열을 가지는 snp53696-scaffold82-239368, 서열번호 19의 염기서열을 가지는 snp53699-scaffold82-357819, 서열번호 5의 염기서열을 가지는 snp53703-scaffold82-531765, 서열번호 6의 염기서열을 가지는 snp53704-scaffold82-587189, 서열번호 1의 염기서열을 가지는 snp50926-scaffold739-1589302, 서열번호 2의 염기서열을 가지는 snp50925-scaffold739-1556203, 서열번호 43의 염기서열을 가지는 snp7015-scaffold1259-344227, 서열번호 74의 염기서열을 가지는 snp20495-scaffold202-5660539, 서열번호 44의 염기서열을 가지는 snp20492-scaffold202-5543214, 서열번호 75의 염기서열을 가지는 snp20491-scaffold202-5505660, 서열번호 20의 염기서열을 가지는 snp20490-scaffold202-5472056, 서열번호 21의 염기서열을 가지는 snp33231-scaffold39-4628, 서열번호 45의 염기서열을 가지는 snp38040-scaffold474-167028, 서열번호 8의 염기서열을 가지는 snp7977-scaffold129-617417, 서열번호 80의 염기서열을 가지는 snp11901-scaffold144-2628266, 서열번호 22의 염기서열을 가지는 snp42083-scaffold55-1985644, 서열번호 46의 염기서열을 가지는 snp33393-scaffold392-1543422, 서열번호 47의 염기서열을 가지는 snp12644-scaffold1482-83416, 서열번호 48의 염기서열을 가지는 snp28831-scaffold310-5365848, 서열번호 23의 염기서열을 가지는 snp28871-scaffold310-7069631, 서열번호 49의 염기서열을 가지는 snp285-scaffold1007-813430, 서열번호 50의 염기서열을 가지는 snp284-scaffold1007-754211, 서열번호 51의 염기서열을 가지는 snp189-scaffold1003-323637, 서열번호 24의 염기서열을 가지는 snp32377-scaffold368-765290, 서열번호 52의 염기서열을 가지는 snp32376-scaffold368-705403, 서열번호 53의 염기서열을 가지는 snp32375-scaffold368-658493, 서열번호 25의 염기서열을 가지는 snp32374-scaffold368-625163, 서열번호 54의 염기서열을 가지는 snp32373-scaffold368-587834, 서열번호 55의 염기서열을 가지는 snp32370-scaffold368-454814, 서열번호 56의 염기서열을 가지는 snp32369-scaffold368-408099, 서열번호 26의 염기서열을 가지는 snp32368-scaffold368-377681, 서열번호 57의 염기서열을 가지는 snp32366-scaffold368-305218, 서열번호 58의 염기서열을 가지는 snp4356-scaffold1137-694167, 서열번호 27의 염기서열을 가지는 snp4683-scaffold1152-307402, 서열번호 59의 염기서열을 가지는 snp30564-scaffold339-321248, 서열번호 28의 염기서열을 가지는 snp33091-scaffold386-396847, 서열번호 60의 염기서열을 가지는 snp45467-scaffold620-1315765, 서열번호 82의 염기서열을 가지는 snp39190-scaffold5-936305, 서열번호 61의 염기서열을 가지는 snp18158-scaffold185-14973492, 서열번호 77의 염기서열을 가지는 snp33157-scaffold388-1183943, 서열번호 29의 염기서열을 가지는 snp33669-scaffold395-2029196, 서열번호 62의 염기서열을 가지는 snp24221-scaffold247-1351970, 서열번호 83의 염기서열을 가지는 snp5043-scaffold1170-88721, 서열번호 81의 염기서열을 가지는 snp50217-scaffold717-6206911, 서열번호 63의 염기서열을 가지는 snp39105-scaffold498-1004133, 서열번호 30의 염기서열을 가지는 snp56059-scaffold875-326243, 서열번호 9의 염기서열을 가지는 snp56054-scaffold875-139298, 서열번호 10의 염기서열을 가지는 snp59930-scaffold998-14068, 서열번호 16의 염기서열을 가지는 snp59937-scaffold998-344168, 서열번호 14의 염기서열을 가지는 snp59959-scaffold998-1321665, 서열번호 78의 염기서열을 가지는 snp59969-scaffold998-1724843, 서열번호 3의 염기서열을 가지는 snp15530-scaffold1641-415024, 서열번호 31의 염기서열을 가지는 snp58863-scaffold963-342613, 서열번호 64의 염기서열을 가지는 snp37049-scaffold449-1390805, 서열번호 65의 염기서열을 가지는 snp44946-scaffold612-1703474, 서열번호 84의 염기서열을 가지는 snp42006-scaffold548-2798856, 서열번호 32의 염기서열을 가지는 snp17320-scaffold18-4154892, 서열번호 66의 염기서열을 가지는 snp11338-scaffold141-637604, 서열번호 33의 염기서열을 가지는 snp57798-scaffold931-1763741, 서열번호 76의 염기서열을 가지는 snp24629-scaffold2508-322935, 서열번호 34의 염기서열을 가지는 snp6481-scaffold1230-106199, 서열번호 67의 염기서열을 가지는 snp15641-scaffold165-2202458, 서열번호 7의 염기서열을 가지는 snp22267-scaffold22-1694175, 서열번호 85의 염기서열을 가지는 snp15298-scaffold163-476873, 서열번호 86의 염기서열을 가지는 snp39686-scaffold505-797498, 서열번호 35의 염기서열을 가지는 snp31006-scaffold3423-428862, 서열번호 68의 염기서열을 가지는 snp47830-scaffold673-1651381, 서열번호 69의 염기서열을 가지는 snp17173-scaffold1790-839956, 서열번호 70의 염기서열을 가지는 snp37305-scaffold455-664274, 서열번호 36의 염기서열을 가지는 snp55508-scaffold86-704514, 서열번호 71의 염기서열을 가지는 snp35167-scaffold421-323627, 서열번호 37의 염기서열을 가지는 snp59287-scaffold974-1156967, 서열번호 72의 염기서열을 가지는 snp43002-scaffold570-363794, 서열번호 15의 염기서열을 가지는 snp23428-scaffold2352-346197, 서열번호 38의 염기서열을 가지는 snp52222-scaffold774-825598, 서열번호 11의 염기서열을 가지는 snp47515-scaffold67-806294, 서열번호 39의 염기서열을 가지는 snp18606-scaffold1881-25106, 서열번호 4의 염기서열을 가지는 snp7055-scaffold126-1400752, 서열번호 79의 염기서열을 가지는 snp7629-scaffold1274-136998, 서열번호 12의 염기서열을 가지는 snp26172-scaffold274-340581, 및 서열번호 40의 염기서열을 가지는 snp53484-scaffold811-325023의 조합으로 구성된 SNP를 포함하는, 흑염소 계통식별용 SNP(single nucleotide polymorphism) 마커 조성물로,
   상기 흑염소 계통은 당진, 장수, 통영 및 경상대로 구성된 군으로부터 선택되는 흑염소 계통인 것인, 흑염소 계통식별용 SNP 마커 조성물.
   
2. 삭제
3. 제1항의 흑염소 계통식별용 SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는, 흑염소 계통식별용 조성물.
   
4. 제3항에 있어서,
   상기 제제는 서열번호 1 내지 86의 SNP 마커로 구성된 군으로부터 선택되는 SNP 마커를 포함하는 영역의 폴리뉴클레오티드를 증폭할 수 있는 프라이머인 것인, 흑염소 계통식별용 조성물.
   
5. 제3항 또는 제4항의 흑염소 계통식별용 조성물을 포함하는, 흑염소 계통식별용 키트.
   
6. 제5항에 있어서,
   상기 키트는 Multi-plexing PCR 키트 또는 DNA 칩 키트인 것인, 흑염소 계통식별용 키트.
   
7. (a) 식별하고자 하는 흑염소 개체로부터 분리된 시료의 DNA로부터 제1항의 흑염소 계통식별용 SNP 마커를 증폭시키는 단계; 및
   (b) 상기 (a) 단계의 증폭된 각 SNP의 염기서열을 결정하고, 이를 분석하는 단계를 포함하는, 흑염소의 계통을 식별하는 방법으로서,
   상기 흑염소 계통은 당진, 장수, 통영 및 경상대로 구성된 군으로부터 선택되는 흑염소 계통인 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
   
8. 제7항에 있어서,
   상기 분석은 SNP 구조(STRUCTURE) 분석 또는 PCA(principal component analysis) 분석에 의해 수행되는 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
   
9. 제7항에 있어서,
   서열번호 1의 염기서열을 가지는 snp50926-scaffold739-1589302, 서열번호 2의 염기서열을 가지는 snp50925-scaffold739-1556203 또는 서열번호 3의 염기서열을 가지는 snp15530-scaffold1641-415024의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 GG인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 계통의 흑염소인 것으로 식별하는 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
   
10. 제7항에 있어서,
    서열번호 4의 염기서열을 가지는 snp7055-scaffold126-1400752의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA이거나; 또는 서열번호 5의 염기서열을 가지는 snp53703-scaffold82-531765, 서열번호 6의 염기서열을 가지는 snp53704-scaffold82-587189 또는 서열번호 7의 염기서열을 가지는 snp22267-scaffold22-1694175의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 GG인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 장수 계통의 흑염소인 것으로 식별하는 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
    
11. 제7항에 있어서,
    서열번호 8의 염기서열을 가지는 snp7977-scaffold129-617417, 서열번호 9의 염기서열을 가지는 snp56054-scaffold875-139298, 서열번호 10의 염기서열을 가지는 snp59930-scaffold998-14068, 서열번호 11의 염기서열을 가지는 snp47515-scaffold67-806294 또는 서열번호 12의 염기서열을 가지는 snp26172-scaffold274-340581의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 AA이거나; 서열번호 13의 염기서열을 가지는 snp46022-scaffold631-1730693, 서열번호 14의 염기서열을 가지는 snp59959-scaffold998-1321665 또는 서열번호 15의 염기서열을 가지는 snp23428-scaffold2352-346197의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 GG이거나; 또는 서열번호 16의 염기서열을 가지는 snp59937-scaffold998-344168의 61번째 대립유전자 염기쌍이 CC인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별하는 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
    
12. 제7항에 있어서,
    서열번호 17의 염기서열을 가지는 snp40368-scaffold515-3054409, 서열번호 18의 염기서열을 가지는 snp53696-scaffold82-239368, 서열번호 19의 염기서열을 가지는 snp53699-scaffold82-357819, 서열번호 20의 염기서열을 가지는 snp20490-scaffold202-5472056, 서열번호 21의 염기서열을 가지는 snp33231-scaffold39-4628, 서열번호 22의 염기서열을 가지는 snp42083-scaffold55-1985644, 서열번호 23의 염기서열을 가지는 snp28871-scaffold310-7069631, 서열번호 24의 염기서열을 가지는 snp32377-scaffold368-765290, 서열번호 25의 염기서열을 가지는 snp32374-scaffold368-625163, 서열번호 26의 염기서열을 가지는 snp32368-scaffold368-377681, 서열번호 27의 염기서열을 가지는 snp4683-scaffold1152-307402, 서열번호 28의 염기서열을 가지는 snp33091-scaffold386-396847, 서열번호 29의 염기서열을 가지는 snp33669-scaffold395-2029196, 서열번호 30의 염기서열을 가지는 snp56059-scaffold875-326243, 서열번호 31의 염기서열을 가지는 snp58863-scaffold963-342613, 서열번호 32의 염기서열을 가지는 snp17320-scaffold18-4154892, 서열번호 33의 염기서열을 가지는 snp57798-scaffold931-1763741, 서열번호 34의 염기서열을 가지는 snp6481-scaffold1230-106199, 서열번호 35의 염기서열을 가지는 snp31006-scaffold3423-428862, 서열번호 36의 염기서열을 가지는 snp55508-scaffold86-704514, 서열번호 37의 염기서열을 가지는 snp59287-scaffold974-1156967, 서열번호 38의 염기서열을 가지는 snp52222-scaffold774-825598, 서열번호 39의 염기서열을 가지는 snp18606-scaffold1881-25106 또는 서열번호 40의 염기서열을 가지는 snp53484-scaffold811-325023의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 경상대 계통의 흑염소인 것으로 식별하는 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
    
13. 제7항에 있어서,
    서열번호 41의 염기서열을 가지는 snp42346-scaffold559-311056, 서열번호 42의 염기서열을 가지는 snp8328-scaffold130-3011444, 서열번호 43의 염기서열을 가지는 snp7015-scaffold1259-344227, 서열번호 44의 염기서열을 가지는 snp20492-scaffold202-5543214, 서열번호 45의 염기서열을 가지는 snp38040-scaffold474-167028, 서열번호 46의 염기서열을 가지는 snp33393-scaffold392-1543422, 서열번호 47의 염기서열을 가지는 snp12644-scaffold1482-83416, 서열번호 48의 염기서열을 가지는 snp28831-scaffold310-5365848, 서열번호 49의 염기서열을 가지는 snp285-scaffold1007-813430, 서열번호 50의 염기서열을 가지는 snp284-scaffold1007-754211, 서열번호 51의 염기서열을 가지는 snp189-scaffold1003-323637, 서열번호 52의 염기서열을 가지는 snp32376-scaffold368-705403, 서열번호 53의 염기서열을 가지는 snp32375-scaffold368-658493, 서열번호 54의 염기서열을 가지는 snp32373-scaffold368-587834, 서열번호 55의 염기서열을 가지는 snp32370-scaffold368-454814, 서열번호 56의 염기서열을 가지는 snp32369-scaffold368-408099, 서열번호 57의 염기서열을 가지는 snp32366-scaffold368-305218, 서열번호 58의 염기서열을 가지는 snp4356-scaffold1137-694167, 서열번호 59의 염기서열을 가지는 snp30564-scaffold339-321248, 서열번호 60의 염기서열을 가지는 snp45467-scaffold620-1315765, 서열번호 61의 염기서열을 가지는 snp18158-scaffold185-14973492, 서열번호 62의 염기서열을 가지는 snp24221-scaffold247-1351970, 서열번호 63의 염기서열을 가지는 snp39105-scaffold498-1004133, 서열번호 64의 염기서열을 가지는 snp37049-scaffold449-1390805, 서열번호 65의 염기서열을 가지는 snp44946-scaffold612-1703474, 서열번호 66의 염기서열을 가지는 snp11338-scaffold141-637604, 서열번호 67의 염기서열을 가지는 snp15641-scaffold165-2202458, 서열번호 68의 염기서열을 가지는 snp47830-scaffold673-1651381, 서열번호 69의 염기서열을 가지는 snp17173-scaffold1790-839956, 서열번호 70의 염기서열을 가지는 snp37305-scaffold455-664274, 서열번호 71의 염기서열을 가지는 snp35167-scaffold421-323627 또는 서열번호 72의 염기서열을 가지는 snp43002-scaffold570-363794의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 GG인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 경상대 계통의 흑염소인 것으로 식별하는 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
    
14. 제7항에 있어서,
    서열번호 73의 염기서열을 가지는 snp8317-scaffold130-2498079, 서열번호 74의 염기서열을 가지는 snp20495-scaffold202-5660539, 서열번호 75의 염기서열을 가지는 snp20491-scaffold202-5505660 또는 서열번호 76의 염기서열을 가지는 snp24629-scaffold2508-322935의 61번째 대립유전자 염기쌍이 각각 CC인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 경상대 계통의 흑염소인 것으로 식별하는 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
    
15. 제7항에 있어서,
    서열번호 77의 염기서열을 가지는 snp33157-scaffold388-1183943의 61번째 대립유전자 염기쌍이 CC인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 또는 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고; 서열번호 78의 염기서열을 가지는 snp59969-scaffold998-1724843의 61번째 대립유전자 염기쌍이 GG인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 또는 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있으며; 서열번호 79의 염기서열을 가지는 snp7629-scaffold1274-136998의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 또는 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고; 서열번호 80의 염기서열을 가지는 snp11901-scaffold144-2628266의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 또는 장수 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있으며; 서열번호 81의 염기서열을 가지는 snp50217-scaffold717-6206911의 61번째 대립유전자 염기쌍이 GG인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 장수 또는 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별하는 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
    
16. 제7항에 있어서,
    서열번호 82의 염기서열을 가지는 snp39190-scaffold5-936305의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 경상대 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고; 상기 염기쌍이 GG인 경우, 장수 계통의 흑염소인 것으로 식별하는 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
    
17. 제7항에 있어서,
    서열번호 83의 염기서열을 가지는 snp5043-scaffold1170-88721의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고; 상기 염기쌍이 GG인 경우, 장수 계통의 흑염소인 것으로 식별하는 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
    
18. 제7항에 있어서,
    서열번호 84의 염기서열을 가지는 snp42006-scaffold548-2798856의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고; 상기 염기쌍이 GG인 경우, 경상대 계통의 흑염소인 것으로 식별하는 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
    
19. 제7항에 있어서,
    서열번호 85의 염기서열을 가지는 snp15298-scaffold163-476873의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 당진 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고; 상기 염기쌍이 CC인 경우, 경상대 계통의 흑염소인 것으로 식별하는 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
    
20. 제7항에 있어서,
    서열번호 86의 염기서열을 가지는 snp39686-scaffold505-797498의 61번째 대립유전자 염기쌍이 AA인 경우, 식별하고자 하는 흑염소가 장수 계통의 흑염소인 것으로 식별할 수 있고; 상기 염기쌍이 CC인 경우, 통영 계통의 흑염소인 것으로 식별하는 것인, 흑염소의 계통을 식별하는 방법.
    

Images