KR102170423B1 - Age estimation method using body fluids - Google Patents
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Abstract
본 발명은 체액을 이용한 연령 추적 방법에 관한 것이다. 보다 상세하게는, 본 발명은 검사 대상 유래의 체액, 가장 바람직하게는 타액 시료 내 표적 유전자의 특정 CpG 위치(site)에 대한 DNA 메틸화 정도를 측정하여 이로부터 검사 대상의 연령을 추적하는 방법에 관한 것이다.
법과학 및 법의학 분야에서 증거물로부터 피해자, 또는 가해자의 연령을 추적하는 것은 사건해결의 큰 단서가 될 수 있다. 현재까지 연령 추정에 가장 효과적인 바이오마커는 DNA 메틸화 마커로 알려져 있으나, 종래의 연령 추정 방법은 다수의 유전자를 분석해야 하므로 연령 추적에 시간과 비용이 많이 소요되는 문제점이 있었다.
본 발명은 검사 대상 유래의 체액, 가장 바람직하게는 타액 시료를 이용한 연령 추적 방법에 관한 것으로, 4개 표적 유전자의 CpG 위치 메틸화로 검사 대상의 연령을 정확하게 추적할 수 있고, 분석 방법이 간단하여 시간과 비용이 절감되므로, 법과학 및 법의학 분야에서 크게 이용될 것으로 기대된다.The present invention relates to an age tracking method using body fluids. More specifically, the present invention relates to a method for tracking the age of a test subject by measuring the degree of DNA methylation for a specific CpG site of a target gene in a body fluid derived from a test subject, most preferably a saliva sample. will be.
In the field of forensic science and forensic medicine, tracking the age of a victim or perpetrator from evidence can be a great clue to case resolution. Until now, the most effective biomarker for age estimation is known as a DNA methylation marker, but the conventional age estimation method has a problem that it takes a lot of time and cost to track age because a number of genes must be analyzed.
The present invention relates to an age tracking method using a bodily fluid derived from a test object, most preferably a saliva sample. The age of the test subject can be accurately tracked by methylation of the CpG positions of four target genes, and the analysis method is simple. It is expected to be widely used in the field of forensic science and forensic medicine, as the cost and cost are reduced.
Description
본 발명은 체액을 이용한 연령 추적 방법에 관한 것이다. 보다 상세하게는, 본 발명은 검사 대상 유래의 체액, 가장 바람직하게는 타액 시료 내 표적 유전자의 특정 CpG 위치(site)에 대한 DNA 메틸화 정도를 측정하여 이로부터 검사 대상의 연령을 추적하는 방법에 관한 것이다.The present invention relates to an age tracking method using body fluids. More specifically, the present invention relates to a method for tracking the age of a test subject by measuring the degree of DNA methylation for a specific CpG site of a target gene in a body fluid derived from a test subject, most preferably a saliva sample. will be.
법과학 및 법의학 분야에서 증거물로부터 피해자, 또는 가해자의 연령을 추적하는 것은 사건해결의 큰 단서가 될 수 있다. 사건 현장의 증거물로부터 피해자, 또는 가해자의 DNA 유전자형 결과를 얻었다 할지라도 수득된 분석결과와 일치하는 DNA 정보가 유전자 데이터베이스에 존재하지 않으면 인물을 특정할 수 없으므로, 피해자, 또는 가해자를 직접적으로 특정할 수 있는 연령 추적은 더욱 중요하다고 할 것이다. 현재까지 연령 추정에 가장 효과적인 바이오마커는 DNA 메틸화 마커로 알려져 있으며, 이는 민족이나 집단의 다양성에 관계없이 적용 가능하므로 효용성이 매우 크다. 이와 관련하여, Hannum G 등은 혈액 시료로부터 유전자의 메틸화 측정에 의한 연령 예측 방법을 공지하였고(Mol Cell. 2013 Jan 24;49(2):359-367), Horvath S 등은 다양한 조직을 이용한 연령 예측 방법을 공지하였으나 70개 이상의 유전자 내 메틸화를 분석해야 하는 한계점이 있었다(Genome Biol. 2013;14(10):R115). 최근 타액 시료에서 DNA 메틸화 정도를 측정하여 연령을 추적하는 방법(국내 등록특허 제 10-1873303호)이 공지되었으나, 상기 발명은 2번의 PCR 증폭(Amplification) 과정이 필요하고, 7개 표적 유전자의 CpG 위치를 분석하므로, 연령 추적에 시간과 비용이 많이 소요되는 문제점이 있었다.In the field of forensic science and forensic medicine, tracking the age of a victim or perpetrator from evidence can be a great clue to case resolution. Even if the DNA genotyping result of the victim or perpetrator is obtained from evidence at the scene of the incident, the person cannot be identified unless DNA information consistent with the obtained analysis result exists in the genetic database, so the victim or perpetrator can be directly specified. It would be more important to track the age that is there. Until now, the most effective biomarker for age estimation is known as a DNA methylation marker, and it is highly effective because it can be applied regardless of ethnicity or group diversity. In this regard, Hannum G et al. known a method for predicting age by measuring the methylation of genes from blood samples (Mol Cell. 2013 Jan 24;49(2):359-367), Horvath S et al. Although the prediction method was known, there was a limitation in that methylation in more than 70 genes had to be analyzed (Genome Biol. 2013;14(10):R115). Recently, a method of tracking the age by measuring the degree of DNA methylation in saliva samples (Korean Patent No. 10-1873303) has been known, but the invention requires two PCR amplification processes, and the CpG of 7 target genes Since the location is analyzed, there is a problem that it takes a lot of time and cost to track age.
따라서 본 발명은 상기와 같은 종래의 기술 상의 문제점을 해결하기 위해 안출된 것으로, 대상 유래의 체액, 가장 바람직하게는 타액 시료 내 표적 유전자의 특정 CpG 위치(site)에 대한 DNA 메틸화 정도를 측정하여 이로부터 검사 대상의 연령을 추적하는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 4개 표적 유전자의 CpG 위치 메틸화로 검사 대상의 연령을 정확하게 추적할 수 있고, 분석 방법이 간단하여 시간과 비용이 절감되므로, 법과학 및 법의학 분야에서 크게 이용될 것으로 기대된다.Therefore, the present invention was devised to solve the problems of the prior art as described above, by measuring the degree of DNA methylation for a specific CpG site of a target gene in a bodily fluid derived from a target, most preferably a saliva sample. It relates to a method of tracking the age of the test subject. The present invention is expected to be widely used in forensic science and forensic medicine since it is possible to accurately track the age of a test target by methylation of the CpG positions of four target genes, and because the analysis method is simple, time and cost are saved.
본 발명은 상기와 같은 종래의 기술 상의 문제점을 해결하기 위해 안출된 것으로, 체액을 이용한 연령 추적 방법에 관한 것이다. The present invention was conceived to solve the problems of the prior art as described above, and relates to an age tracking method using body fluids.
그러나 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 당 업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.However, the technical problem to be achieved by the present invention is not limited to the problems mentioned above, and other problems that are not mentioned may be clearly understood by those of ordinary skill in the art from the following description.
이하, 본원에 기재된 다양한 구체예가 도면을 참조로 기재된다. 하기 설명에서, 본 발명의 완전한 이해를 위해서, 다양한 특이적 상세사항, 예컨대, 특이적 형태, 조성물 및 공정 등이 기재되어 있다. 그러나, 특정의 구체예는 이들 특이적 상세 사항 중 하나 이상 없이, 또는 다른 공지된 방법 및 형태와 함께 실행될 수 있다. 다른 예에서, 공지된 공정 및 제조 기술은 본 발명을 불필요하게 모호하게 하지 않게 하기 위해서, 특정의 상세사항으로 기재되지 않는다. "한 가지 구체예" 또는 "구체예"에 대한 본 명세서 전체를 통한 참조는 구체예와 결부되어 기재된 특별한 특징, 형태, 조성 또는 특성이 본 발명의 하나 이상의 구체예에 포함됨을 의미한다. 따라서, 본 명세서 전체에 걸친 다양한 위치에서 표현된 "한 가지 구체예에서" 또는 "구체예"의 상황은 반드시 본 발명의 동일한 구체예를 나타내지는 않는다. 추가로, 특별한 특징, 형태, 조성, 또는 특성은 하나 이상의 구체예에서 어떠한 적합한 방법으로 조합될 수 있다.Hereinafter, various embodiments described herein are described with reference to the drawings. In the following description, for a thorough understanding of the invention, various specific details, such as specific forms, compositions and processes, etc. are set forth. However, certain embodiments may be practiced without one or more of these specific details, or with other known methods and forms. In other instances, well-known processes and manufacturing techniques have not been described in specific details in order not to unnecessarily obscure the present invention. Reference throughout this specification to “one embodiment” or “an embodiment” means that a particular feature, form, composition, or characteristic described in connection with the embodiment is included in one or more embodiments of the invention. Thus, the context of “in one embodiment” or “an embodiment” expressed in various places throughout this specification does not necessarily represent the same embodiment of the invention. Additionally, particular features, shapes, compositions, or properties may be combined in one or more embodiments in any suitable manner.
명세서에서 특별한 정의가 없으면 본 명세서에 사용된 모든 과학적 및 기술적인 용어는 본 발명이 속하는 기술분야에서 당업자에 의하여 통상적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 가진다.Unless otherwise defined in the specification, all scientific and technical terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art to which the present invention belongs.
본 발명의 일 구체예에서 "생물학적 시료"란, 검사 대상의 유전자 정보를 확인할 수 있는 모든 시료를 의미하며, 바람직하게는 혈액, 혈장, 혈청, 타액 등일 수 있으나 CpG 마커를 확인할 수 있는 종류라면 이에 제한되지 않는다. In one embodiment of the present invention, the term "biological sample" means any sample capable of confirming the gene information of the test object, preferably blood, plasma, serum, saliva, etc., but if it is a type capable of confirming the CpG marker, Not limited.
본 발명의 일 구체예에서 “체액(body fluids)”이란, 동물의 체내의 혈관 또는 조직의 사이를 이동하는 액상의 총칭이다. 혈액, 혈장, 림프액, 방수액, 뇌척수액, 흉수, 누액(눈물), 소변, 타액(침), 쓸개즙, 양수, 정액, 조직액 등을 포함한다. 본 발명에서 있어서, 체액은 바람직하게는 타액을 의미하는 것이나, 이에 제한되는 것은 아니다.In one embodiment of the present invention, the term "body fluids" is a generic term for liquids that move between blood vessels or tissues in the body of an animal. It includes blood, plasma, lymph, aqueous humor, cerebrospinal fluid, pleural fluid, tear fluid (tears), urine, saliva (saliva), gallbladder, amniotic fluid, semen, tissue fluid, and the like. In the present invention, the bodily fluid preferably means saliva, but is not limited thereto.
본 발명의 일 구체예에서 “타액(saliva)”이란, 침샘으로부터 입 안으로 분비되는 분비액이다. 타액의 성분은 99% 이상이 물(수분)이며, 그 이외에 구강 건강에 매우 중요한 역할을 하는 다양한 전해질들(나트륨, 칼륨, 칼슘, 염화물, 마그네슘, 중탄산염, 인산염)과 단백질들, 다양한 효소들, 여러 종류의 면역글로불린(immunoglobulins), 항균 물질들(antimicrobial factors), 점막 당단백질들(mucosal glycoproteins), 극소량의 알부민(albumin), 몇 종류의 폴리펩타이드들(polypeptides)와 올리고펩타이드들(olygopeptides) 등이 포함된다. 건강한 성인에게서 생산되는 침의 양은 하루에 약 1 내지 1.5 L 정도이며, 침샘에서 혈관에 흐르는 혈액으로부터 필요한 성분을 축출하여 침으로 변환되는데, 변환 시간은 거의 실시간이다.In one embodiment of the present invention, "saliva" is a secretion fluid secreted from the salivary glands into the mouth. Saliva contains more than 99% of water (moisture), in addition to various electrolytes (sodium, potassium, calcium, chloride, magnesium, bicarbonate, phosphate) and proteins, various enzymes that play a very important role in oral health. Several types of immunoglobulins, antimicrobial factors, mucosal glycoproteins, trace amounts of albumin, several types of polypeptides and oligopeptides, etc. This includes. The amount of saliva produced by healthy adults is about 1 to 1.5 L per day, and the necessary components are extracted from the blood flowing in the blood vessels from the salivary glands and converted into saliva, and the conversion time is almost real time.
외부로 배출된 타액에는 구강 상피 세포가 같이 존재하고, 타액 내에 존재하는 구강 상피 세포로부터 유전자형을 분석할 수 있으므로, 타액 시료는 유전자형 분석 시료로서 중요하게 이용된다.Since oral epithelial cells are present in the saliva discharged to the outside, and genotyping can be performed from the oral epithelial cells present in the saliva, the saliva sample is importantly used as a genotyping sample.
본 발명의 일 구체예에서 “CpG 위치(CpG site)”란, DNA 상보 가닥에서 시토신과 구아닌 두 염기가 나란히 존재하는 부위를 의미하는 것으로, 메틸기(CH3)가 추가될 수 있다.In one embodiment of the present invention, “CpG site” refers to a site in which two bases of cytosine and guanine exist side by side in a DNA complementary strand, and a methyl group (CH 3 ) may be added.
본 발명의 일 구체예에서 “DNA 메틸화(DNA methylation)”란, 고등 생물의 발달에 매우 중요한 생화학적 과정으로, 전사를 억제하는 유전자 발현 조절 기작이다. 하나의 메틸기를 시토신의 피리미딘 고리 5번째 위치에 추가하거나 아데닌의 퓨린 고리의 숫자 6 질소에 추가하는 것을 포함한다(시토신과 아데닌은 DNA의 네 가지 염기에 속한다). DNA 메틸화는 일반적인 유기체적 진화와 세포적 변이를 위해 결정적인 것으로, 일반적으로 수정란(zygote) 생성 과정에서 사라지고, 발현 과정에서 차후의 세포 분화를 통해서 다시 생성된다. 추가적으로, DNA 메틸화는 안정적으로 세포에서 유전자 표현형을 감소시킬 수 있다. 특히 시토신의 5번 위치에서의 DNA 메틸화는 유전형을 줄이는 특별한 효과를 가지고 있어, 이를 이용하여 세포가 지나온 시간의 흐름을 유추할 수 있다. 인간의 유전체의 경우 메틸화된 시토신은 전체 시토신의 3~4% 정도 존재하는 것으로 알려져있고, CpG의 메틸화 정도나 양상은 포유동물의 종에 따라 다르고, 조직에 따라서도 특이적으로 나타나는 것으로 알려져 있다.In one embodiment of the present invention, “DNA methylation” is a very important biochemical process for the development of higher organisms, and is a mechanism for regulating gene expression that inhibits transcription. It involves adding one methyl group to position 5 of the pyrimidine ring of cytosine or to the
본 발명의 일 구체예에서 "키트(kit)"란, 검사 대상의 연령 예측과 연관 관계를 가지고 있는 CpG 마커를 확인하여 연령 예측에 필요한 정보를 제공하는 검진용 기기를 의미하며, 생물학적 시료로부터 상기 CpG 마커의 DNA 메틸화 비율을 확인할 수 있는 것으로, 바람직하게는 본 발명의 표적 유전자 SST(somatostatin), KLF14(Kruppel like factor 14), TSSK6(testis specific serine kinase 6), 및 SLC12A5(solute carrier family 12 member 5) 내의 CpG 마커(cg00481951, cg14361627, cg08928145, cg07547549)에 대하여 상보적인 서열을 가지는 프로브(probe) 또는 프라이머(primer) 세트를 포함하는 것이나, 이에 제한되는 것은 아니다.In one embodiment of the present invention, the term "kit" refers to a device for examination that provides information necessary for predicting age by identifying a CpG marker that has a relationship with predicting the age of a test subject, and It is possible to confirm the DNA methylation ratio of the CpG marker, preferably target genes of the present invention SST (somatostatin), KLF14 (Kruppel like factor 14), TSSK6 (testis specific serine kinase 6), and SLC12A5 (
본 발명의 일 구체예에서 "연령 예측용 기기"란, 대상자(subject)로부터 수득한 체액 시료 내 유전자의 CpG 마커(cg00481951, cg14361627, cg08928145, cg07547549)에 대한 메틸화 수준의 측정 결과로부터 대상자의 연령을 예측하는 기기로서, 대상자 유래 시료에 대한 CpG 마커의 메틸화 수준을 측정하여 대상자의 연령을 예측할 수 있는 기기라면 제한이 없다.In one embodiment of the present invention, the term "age prediction device" refers to the age of the subject from the measurement result of the methylation level for the CpG marker (cg00481951, cg14361627, cg08928145, cg07547549) of a gene in a bodily fluid sample obtained from a subject. As a predicting device, there is no limitation as long as it is a device capable of predicting the age of a subject by measuring the methylation level of a CpG marker in a sample derived from a subject.
본 발명에서 "중합효소연쇄반응(PCR, Polymerase Chain Reaction)"은 아주 적은 양의 DNA 만으로도 특정 부위의 DNA 염기서열을 기하급수적으로 증폭시킬 수 있는 간단하고 편리한 방법으로, 증폭하고자 하는 DNA에 특이적으로 결합하여 고온에서도 안정한 Taq DNA 중합효소를 사용하여 변성(denaturation), 어닐링(annealing), 연장(extension)의 과정을 반복적으로 실행함으로써 특정 DNA를 증폭시키는 것이다. PCR을 이용한 목적 유전자의 검출은 유전자를 인식하는 프라이머를 이용하여 이를 증폭 및 확인한다.In the present invention, "polymerase chain reaction (PCR)" is a simple and convenient method that can exponentially amplify the DNA sequence of a specific site with only a very small amount of DNA. It is specific to the DNA to be amplified. A specific DNA is amplified by repeatedly performing the processes of denaturation, annealing, and extension using Taq DNA polymerase, which is bonded and stable at high temperatures. The detection of a target gene using PCR is amplified and confirmed using a primer that recognizes the gene.
본 발명에서 "판별"이란 정량 및/또는 정성 분석을 포함하는 것으로, 존재, 부존재의 검출 및 농도 측정을 포함하는 것으로 이러한 방법은 당업계에 공지되어 있으며, 당업자라면 본원의 실시를 위해 적절한 방법을 선택할 수 있을 것이다. 본 발명에서의 "판별"은 검사대상 유래의 체액 시료 내 유전자 표적의 CpG 마커에 대하여 메틸화 정도를 측정하여 검사 대상에 대하여 예측되는 연령을 구분하는 것을 의미한다.In the present invention, "discrimination" includes quantitative and/or qualitative analysis, and includes detection of presence and absence and concentration measurement, and such methods are known in the art, and those skilled in the art will use appropriate methods for the practice of the present application. You will be able to choose. In the present invention, "discrimination" refers to determining the predicted age of the test subject by measuring the degree of methylation of the CpG marker of the gene target in the body fluid sample derived from the test subject.
본 발명자들은 상기 과제를 해결하기 위하여, 검사 대상 유래의 타액 시료 내 분석 대상인 특정한 CpG의 종류를 선별하고, 선별된 마커의 DNA 메틸화 및 비메틸화의 비율을 측정함으로써 오차범위를 최소화시킨 검사 대상의 연령 예측 방법을 구축하였다.In order to solve the above problem, the present inventors selected the type of specific CpG to be analyzed in the saliva sample derived from the test object, and measured the ratio of DNA methylation and non-methylation of the selected marker to minimize the error range. The prediction method was built.
본 발명의 목적은 검사 대상 유래의 타액 시료에 대하여 SST(somatostatin), KLF14(Kruppel like factor 14), TSSK6(testis specific serine kinase 6), 및 SLC12A5(solute carrier family 12 member 5) 유전자 내 CpG 마커(cg00481951, cg14361627, cg08928145, cg07547549)의 DNA 메틸화 정도를 측정하여 검사 대상의 연령을 예측하는 방법 또는 검사 대상의 연령 예측용 키트를 제공하는 것이다. An object of the present invention is a CpG marker in the SST (somatostatin), KLF14 (Kruppel like factor 14), TSSK6 (testis specific serine kinase 6), and SLC12A5 (
상기의 CpG 마커 cg00481951는 DNA 내의 CpG 위치 chr3:187387650으로, cg14361627는 chr7:130419116으로, cg08928145는 chr19:19625364으로, cg07547549는 chr20:44658225으로 정의된다.The CpG marker cg00481951 is defined as the CpG position chr3:187387650 in DNA, cg14361627 as chr7:130419116, cg08928145 as chr19:19625364, and cg07547549 as chr20:44658225.
본 발명의 일 구체예에서, 미지의 개체로부터 분리된 시료로 유전자의 CpG 마커에 대한 메틸화 분석(methylation assay) 단계를 포함하는 연령 예측 방법으로서, 상기 유전자는 SST(somatostatin), KLF14(Kruppel like factor 14), TSSK6(testis specific serine kinase 6), 및 SLC12A5(solute carrier family 12 member 5)인 것인 연령 예측 방법을 제공한다.In one embodiment of the present invention, as a method for predicting age comprising a methylation assay step for a CpG marker of a gene with a sample isolated from an unknown individual, the gene is SST (somatostatin), KLF14 (Kruppel like factor) 14), TSSK6 (testis specific serine kinase 6), and SLC12A5 (
상기의 CpG 마커는 SST에 대한 cg00481951, KLF14에 대한 cg14361627, TSSK6에 대한 cg08928145, 및 SLC12A5에 대한 cg07547549인 것이 가장 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.The CpG markers are most preferably cg00481951 for SST, cg14361627 for KLF14, cg08928145 for TSSK6, and cg07547549 for SLC12A5, but are not limited thereto.
또한 상기 메틸화 분석 단계는 각각의 CpG 마커의 메틸화 정도인 K값을 “{메틸화 카피/(메틸화 카피 + 비메틸화 카피)}×100”의 수식으로 산출하는 것인 연령 예측 방법을 제공한다.In addition, the methylation analysis step provides an age prediction method in which the K value, which is the degree of methylation of each CpG marker, is calculated by the formula of “{methylated copy/(methylated copy + unmethylated copy)}×100”.
또한 상기 메틸화 분석 단계 이후에, 각각의 CpG 마커의 메틸화 정도인 K값을 “-N1 + N2×(cg00481951의 K값) + N3×(cg14361627의 K값) + N4×(cg08928145의 K값) + N5×(cg07547549의 K값)”의 수식으로 산출하는 연령 산출 단계;를 추가로 포함하는 연령 예측 방법을 제공하고, 상기 N1은 -16.2 내지 3.8이고 상기 N2는 -3.3 내지 6.7이며 상기 N3는 -2.6 내지 7.4이며 상기 N4는 -2.7 내지 3.3이며 상기 N5는 -2.6 내지 3.4인 연령 예측 방법을 제공한다.In addition, after the methylation analysis step, the K value, which is the degree of methylation of each CpG marker, is "-N 1 + N 2 × (K value of cg00481951) + N 3 × (K value of cg14361627) + N 4 × (cg08928145). K value) + N 5 × (K value of cg07547549)” is an age calculation step of calculating an age, further comprising an age prediction method, wherein N 1 is -16.2 to 3.8, and N 2 is -3.3 To 6.7, N 3 is -2.6 to 7.4, N 4 is -2.7 to 3.3, and N 5 is -2.6 to 3.4.
상기 시료는 체액, 체조직, 및 모근으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나이고, 상기 체액은 혈액, 혈장, 림프액, 방수액, 뇌척수액, 흉수, 누액(눈물), 소변, 타액(침), 쓸개즙, 양수, 정액, 및 조직액으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나이며, 타액(침)인 것이 가장 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.The sample is any one selected from the group consisting of body fluid, body tissue, and hair root, and the body fluid is blood, plasma, lymph fluid, aqueous humor, cerebrospinal fluid, pleural fluid, tear fluid (tears), urine, saliva (saliva), bile fluid, amniotic fluid, semen , And any one selected from the group consisting of tissue fluid, saliva (saliva) is most preferred, but is not limited thereto.
본 발명의 다른 구체예에서, SST, KLF14, TSSK6, 및 SLC12A5를 포함하는 유전자군 내의 CpG 마커의 메틸화 분석용 프라이머 세트를 포함하는 연령 예측용 키트를 제공하고, 상기 CpG 마커는 SST에 대한 cg00481951, KLF14에 대한 cg14361627, TSSK6에 대한 cg08928145, 및 SLC12A5에 대한 cg07547549인 연령 예측용 키트를 제공하며, 상기 프라이머 세트는 서열번호 1, 서열번호 2, 서열번호 5, 서열번호 6, 서열번호 9, 서열번호 10, 서열번호 13, 및 서열번호 14로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나 이상을 포함하는 것인 연령 예측용 키트를 제공한다.In another embodiment of the present invention, there is provided a kit for age prediction comprising a primer set for methylation analysis of CpG markers in a gene group including SST, KLF14, TSSK6, and SLC12A5, wherein the CpG marker is cg00481951 for SST, Provides a kit for age prediction of cg14361627 for KLF14, cg08928145 for TSSK6, and cg07547549 for SLC12A5, the primer set being SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO It provides a kit for age prediction comprising any one or more selected from the group consisting of 10, SEQ ID NO: 13, and SEQ ID NO: 14.
상기 키트는 SST, KLF14, TSSK6, 및 SLC12A5를 포함하는 유전자군 내의 CpG 마커의 메틸화 분석용 프로브 세트를 추가로 포함할 수 있고, 상기 프로브 세트는 서열번호 3, 서열번호 4, 서열번호 7, 서열번호 8, 서열번호 11, 서열번호 12, 서열번호 15, 및 서열번호 16으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나 이상을 포함할 수 있다.The kit may further include a probe set for methylation analysis of CpG markers in the gene group including SST, KLF14, TSSK6, and SLC12A5, and the probe set is SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 7, and
본 발명의 또 다른 구체예에서, 미지의 개체로부터 분리된 시료 내 유전자의 CpG 마커의 메틸화 수준을 측정하는 분석부; 및 상기 메틸화 수준 측정 결과로부터 개체의 연령을 계산하는 산출부;를 포함하는 연령 예측용 기기로서, 상기 유전자는 SST, KLF14, TSSK6, 및 SLC12A5인 것인 연령 예측용 기기를 제공한다.In another embodiment of the present invention, an analysis unit for measuring the methylation level of a CpG marker of a gene in a sample isolated from an unknown individual; And a calculation unit for calculating the age of the individual from the methylation level measurement result, wherein the genes are SST, KLF14, TSSK6, and SLC12A5.
상기 CpG 마커는 SST에 대한 cg00481951, KLF14에 대한 cg14361627, TSSK6에 대한 cg08928145, 및 SLC12A5에 대한 cg07547549인 것이 가장 바람직하나, 이에 제한되는 것은 아니다.The CpG markers are most preferably cg00481951 for SST, cg14361627 for KLF14, cg08928145 for TSSK6, and cg07547549 for SLC12A5, but are not limited thereto.
또한 상기 메틸화 수준 측정은 각각의 CpG 마커의 메틸화 정도인 K값을 “{메틸화 카피/(메틸화 카피 + 비메틸화 카피)}×100”의 수식으로 산출하는 것인 연령 예측용 기기를 제공하고, 상기 개체의 연령 계산은 각각의 CpG 마커의 메틸화 정도인 K값을 “-N1 + N2×(cg00481951의 K값) + N3×(cg14361627의 K값) + N4×(cg08928145의 K값) + N5×(cg07547549의 K값)”의 수식으로 산출하는 것인 연령 예측용 기기를 제공하며, 상기 N1은 -16.2 내지 3.8이고 상기 N2는 -3.3 내지 6.7이며 상기 N3는 -2.6 내지 7.4이며 상기 N4는 -2.7 내지 3.3이며 상기 N5는 -2.6 내지 3.4인 연령 예측용 기기를 제공한다.In addition, the methylation level measurement provides an age prediction device that calculates the K value, which is the degree of methylation of each CpG marker, by the formula of “{methylated copy/(methylated copy + unmethylated copy)}×100”, and the In the calculation of the age of the individual, the K value, which is the degree of methylation of each CpG marker, is "-N 1 + N 2 × (K value of cg00481951) + N 3 × (K value of cg14361627) + N 4 × (K value of cg08928145). + N 5 × (K value of cg07547549)” provides an age prediction device that is calculated by the formula, wherein N 1 is -16.2 to 3.8, N 2 is -3.3 to 6.7, and N 3 is -2.6 To 7.4, and N 4 is -2.7 to 3.3, and N 5 is -2.6 to 3.4.
이하 상기 본 발명을 단계별로 상세히 설명한다.Hereinafter, the present invention is described in detail step by step.
법과학 및 법의학 분야에서 증거물로부터 피해자, 또는 가해자의 연령을 추적하는 것은 사건해결의 큰 단서가 될 수 있다. 현재까지 연령 추정에 가장 효과적인 바이오마커는 DNA 메틸화 마커로 알려져 있으나, 종래의 연령 추정 방법은 다수의 유전자를 분석해야 하므로 연령 추적에 시간과 비용이 많이 소요되는 문제점이 있었다.In the field of forensic science and forensic medicine, tracking the age of a victim or perpetrator from evidence can be a great clue to case resolution. Until now, the most effective biomarker for age estimation is known as a DNA methylation marker, but the conventional age estimation method has a problem that it takes a lot of time and cost to track age because a number of genes must be analyzed.
본 발명은 검사 대상 유래의 체액, 가장 바람직하게는 타액 시료를 이용한 연령 추적 방법에 관한 것으로, 4개 표적 유전자의 CpG 위치 메틸화로 검사 대상의 연령을 정확하게 추적할 수 있고, 분석 방법이 간단하여 시간과 비용이 절감되므로, 법과학 및 법의학 분야에서 크게 이용될 것으로 기대된다.The present invention relates to an age tracking method using a bodily fluid derived from a test object, most preferably a saliva sample. The age of the test subject can be accurately tracked by methylation of the CpG positions of four target genes, and the analysis method is simple. It is expected to be widely used in the field of forensic science and forensic medicine, as the cost and cost are reduced.
도 1은 본 발명의 일 실시예에 따른, 52세 타액 시료로 CpG 위치의 메틸화 정량한 결과이다. 도 1에서 파란색 원은 검출된 FAM 카피(메틸화 카피), 초록색 원은 검출된 HEX 카피(비메틸화 카피)를 나타낸다.
도 2는 본 발명의 일 실시예에 따른, 52세 타액 시료로 메틸화 백분율을 계산한 결과이다. 도 2에서 파란색 사각은 검출된 FAM 카피(메틸화 카피), 초록색 사각은 검출된 HEX 카피(비메틸화 카피), 주황색 마름모는 메틸화 카피의 백분율(%)을 나타낸다.
도 3은 본 발명의 일 실시예에 따른, 다양한 연령의 총 76개 타액 시료로부터 도출된 메틸화 백분율과 실제 연령을 변수로 작성한 분산형 그래프이다.
도 4는 본 발명의 일 실시예에 따른, 다양한 연령의 총 76개 타액 시료로부터 도출된 예측 연령과 실제 연령을 변수로 작성한 분산형 그래프이다.1 is a result of quantification of methylation at a CpG position in a 52-year-old saliva sample according to an embodiment of the present invention. In FIG. 1, the blue circle indicates the detected FAM copy (methylated copy), and the green circle indicates the detected HEX copy (non-methylated copy).
2 is a result of calculating the methylation percentage with a 52-year-old saliva sample according to an embodiment of the present invention. In FIG. 2, the blue square represents the detected FAM copy (methylated copy), the green square represents the detected HEX copy (unmethylated copy), and the orange diamond represents the percentage (%) of the methylated copy.
3 is a scatter graph in which the percent methylation and actual age derived from a total of 76 saliva samples of various ages are prepared as variables according to an embodiment of the present invention.
4 is a scatter graph in which predicted age and actual age derived from a total of 76 saliva samples of various ages are prepared as variables according to an embodiment of the present invention.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로서, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail through examples. These examples are only for describing the present invention more specifically, and it will be apparent to those of ordinary skill in the art that the scope of the present invention is not limited by these examples according to the gist of the present invention. .
실시예 1: 타액에서 DNA 추출 및 아황산염 변환(bisulfite conversion)Example 1: DNA extraction and sulfite conversion from saliva
타액 시료 400 ㎕로부터 QIAamp DNA Mini Kit(QIAGEN, Germany)을 사용하여 DNA를 추출하였고, 추출된 타액 DNA를 D.W. 20 ㎕로 용리하여 EZ DNA methylation Kit(Zymo Research, USA)로 아황산염 변환(bisulfite conversion)하였다. 키트를 이용하는 모든 실험 과정은 제조사에서 제공하는 프로토콜에 따라 수행하였다.DNA was extracted from 400 μl of saliva sample using QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN, Germany), and the extracted saliva DNA was used in D.W. It was eluted with 20 µl and converted to sulfite with an EZ DNA methylation Kit (Zymo Research, USA). All experimental procedures using the kit were performed according to the protocol provided by the manufacturer.
실시예 2: 디지털 PCR을 이용한 DNA 증폭Example 2: DNA amplification using digital PCR
상기 실시예 1의 DNA를 디지털 PCR로 증폭하였다. PCR은 QX200™ Droplet Digital™ PCR System(Bio-rad, USA)을 사용하였고, 1개의 시료 분석을 위해 4 웰(well)의 디지털 PCR 증폭이 수행되도록 설정하였다. 4 웰의 각각에 포함되는 4개의 프라이머/프로브 서열 정보는 하기 표 1에 기재하였다. 각 프라이머/프로브 세트는 4개의 CpG 위치의 메틸화 정량을 위해 제작하였고, 메틸화 카피를 정량하기 위한 프로브(Methyl probe)의 5'에 FAM 형광으로, 비메틸화 카피를 정량하기 위한 프로브(Unmethyl probe)의 5'에 HEX 형광으로 표지하였으며, 모든 프로브의 3'은 BHQ1을 표지하였다. 즉, FAM 형광 프로브는 메틸화 카피와 상보적인 서열로, HEX 형광 프로브는 비메틸화 카피와 상보적인 서열로 구성하였다.The DNA of Example 1 was amplified by digital PCR. For PCR, a QX200™ Droplet Digital™ PCR System (Bio-rad, USA) was used, and a 4-well digital PCR amplification was set to be performed for one sample analysis. Information on the sequence of the four primers/probes included in each of the 4 wells is shown in Table 1 below. Each primer/probe set was prepared for methylation quantification of four CpG sites, and FAM fluorescence was applied to 5'of the probe for quantifying methylated copies, and the probe for quantifying unmethylated copies (Unmethyl probe). 5'was labeled with HEX fluorescence, and 3'of all probes labeled BHQ1. That is, the FAM fluorescent probe was composed of a sequence complementary to the methylated copy, and the HEX fluorescent probe was composed of a sequence complementary to the unmethylated copy.
(SST)cg00481951
(SST)
(KLF14)cg14361627
(KLF14)
(TSSK6)cg08928145
(TSSK6)
(SLC12A5)cg07547549
(SLC12A5)
각 웰(well)당 droplet digital PCR mixture 조성은 하기 표 2에 기재하였다.The composition of the droplet digital PCR mixture per well is shown in Table 2 below.
(SST)cg00481951
(SST)
(KLF14)cg14361627
(KLF14)
(TSSK6)cg08928145
(TSSK6)
(SLC12A5)cg07547549
(SLC12A5)
Droplet digital PCR 증폭 프로토콜은 하기 표 3에 기재하였다.The droplet digital PCR amplification protocol is shown in Table 3 below.
그 외, 모든 Droplet Digital PCR 과정은 제조사 제공 프로토콜과 동일하게 수행하였다.In addition, all droplet digital PCR processes were performed in the same manner as the manufacturer's provided protocol.
실시예 3: 액적 분석(Droplet reading)Example 3: Droplet reading
52세 타액 시료로 상기 실시예 1 및 2를 수행한 액적 분석(Droplet reading) 결과를 도 1에 나타내었고, 상기 결과를 하기 표 4의 식에 따라 메틸화 카피 백분율 계산한 결과를 도2, 및 표 5에 나타내었다.Fig. 1 shows the results of droplet reading performed in Examples 1 and 2 with a 52-year-old saliva sample, and Fig. 2 shows the result of calculating the methylated copy percentage according to the formula in Table 4 below. It is shown in 5.
실시예 4: 회귀 분석 모델 설계Example 4: Regression Analysis Model Design
총 76개의 타액 시료(20대 20개, 30대 18개, 40대 19개, 50대 19개)를 이용하여 상기와 동일한 방법으로 4개 CpG 위치에 대한 메틸화 카피 백분율 수행하였고, 그 결과를 하기 표 6에 기재하였다. A total of 76 saliva samples (20 for 20, 18 for 30, 19 for 40, 19 for 50) were used in the same manner as above to perform methylation copy percentage for 4 CpG positions, and the results are as follows. It is described in Table 6.
상기 결과로 회귀 분석(Regression analysis)이 가능한지 확인하기 위해 CpG 위치별로 “메틸화 백분율 X 실제 연령(Chronological age)”으로 구성된 분산형 그래프를 작성하였고, 이를 도 3에 나타내었다. 그 결과, 4개 CpG 위치의 메틸화 백분율은 실제 연령과 양의 상관관계에 있음을 확인하였다.As a result of the above, in order to confirm whether regression analysis is possible, a scatter graph composed of “methylation percentage X actual age” for each CpG location was created, and is shown in FIG. 3. As a result, it was confirmed that the percent methylation at the four CpG sites had a positive correlation with the actual age.
분석된 4개 CpG 위치의 회귀 분석 결과를 이용하여 다 변량 회귀 분석 모델(Multivariate regression model)을 설계하였다. 설계된 결과를 이용하여 하기 표 7의 1차 방정식을 세우고, 이를 기초로 각 타액 DNA의 연령을 예측하여 하기 표 8에 기재하였다.A multivariate regression model was designed using the regression analysis results of the analyzed four CpG locations. Using the designed results, a first-order equation in Table 7 was established, and the age of each salivary DNA was predicted based on this and described in Table 8.
= -6.2+1.7*cg00481951+2.4*cg14361627+0.3*cg08928145+0.4*cg07547549Predicted Age
= -6.2+1.7*cg00481951+2.4*cg14361627+0.3*cg08928145+0.4*cg07547549
표 8의 결과로 예측 연령과 실제 연령을 변수로 한 분산형 그래프를 작성하여, 이를 도 4에 나타내었다. 분석 결과, 상관 계수(Spearman's rho)는 0.932, 실제 연령(Chr Age)으로 부터의 절대 평균 편차(MAD from chronological age)는 3.04로 도출되어, 본 발명의 방정식(표 7)을 이용한 연령 예측이 실제 연령과의 오차가 적고 정확하게 측정됨을 확인하였다.As a result of Table 8, a scatter graph using predicted age and actual age as variables was created and shown in FIG. 4. As a result of the analysis, the correlation coefficient (Spearman's rho) is 0.932, the absolute mean deviation (MAD from chronological age) from the actual age (Chr Age) is derived as 3.04, the age prediction using the equation (Table 7) of the present invention is actually It was confirmed that the error with age was small and was measured accurately.
본 발명에서는 기존 연령 예측 방법에 사용하는 CpG 마커 종류에 비해 적은 4가지 마커를 표적으로 메틸화 정도를 측정하여 상기 표 7에 기재된 바와 같이 연령 예측 모델을 구축하였다. 본 발명에 따른 연령 예측 방법을 사용하면 종래의 연령 예측 방법에 비해 분석 비용과 시간을 절감할 수 있고, 오차 범위가 개선되어 정확하게 검사 대상의 연령을 예측할 수 있다.In the present invention, as shown in Table 7 above, the age prediction model was constructed by measuring the degree of methylation as a target of four markers less than the CpG marker types used in the existing age prediction method. When the age prediction method according to the present invention is used, analysis cost and time can be reduced compared to the conventional age prediction method, and the error range is improved, so that the age of the test object can be accurately predicted.
본 명세서에서 인용한 모든 참조문헌, 기사, 공보 및 특허 및 특허 출원이 온전히 본 명세서에 참조로 병합되어 있다. 따라서, 하기 청구의 범위의 진의 및 범주는 상기한 바람직한 실시형태의 설명에 제한되어서는 안 된다.All references, articles, publications, and patents and patent applications cited in this specification are incorporated herein by reference in their entirety. Accordingly, the spirit and scope of the following claims should not be limited to the description of the preferred embodiments described above.
<110> BIOCORE CO., LTD. REPUBLIC O F KOREA (FORENSIC SERVICE DIRECTOR MINISTRY OF GOVERNMENT ADMINISTRATION AND HOME AFFAIRS) <120> Age estimation method using body fluids <130> PDPB192030 <160> 16 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SST Forward primer <400> 1 aagaggtagt agttttagag gttt 24 <210> 2 <211> 29 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SST Reverse primer <400> 2 cacaattcaa ataaattctt acttaacat 29 <210> 3 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SST Methyl probe <400> 3 agggatagac gttattgtyg t 21 <210> 4 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SST Unmethyl probe <400> 4 ttagggatag atgttattgt ygttt 25 <210> 5 <211> 31 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> KLF14 Forward primer <400> 5 ggttaagtta tgtttaatag ttttagaaat t 31 <210> 6 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> KLF14 Reverse primer <400> 6 aactactaca acccaaaaat tcc 23 <210> 7 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> KLF14 Methyl probe <400> 7 ttttgttttc gygttttttt ttttg 25 <210> 8 <211> 28 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> KLF14 Unmethyl probe <400> 8 ttattttgtt tttgygtttt tttttttg 28 <210> 9 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> TSSK6 Forward primer <400> 9 gggaagaaag ggaggga 17 <210> 10 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> TSSK6 Reverse primer <400> 10 aataattcca accattccta caac 24 <210> 11 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> TSSK6 Methyl probe <400> 11 tgygtcgttt tggtttagtg 20 <210> 12 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> TSSK6 Unmethyl probe <400> 12 tgygttgttt tggtttagtg t 21 <210> 13 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SLC12A5 Forward primer <400> 13 tggagtttag ttttattgga atgt 24 <210> 14 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SLC12A5 Reverse primer <400> 14 atttaactaa cccaaatcaa ccc 23 <210> 15 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SLC12A5 Methyl probe <400> 15 ttaaggtgtt ggaatgcgty 20 <210> 16 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SLC12A5 Unmethyl probe <400> 16 ttaaggtgtt ggaatgtgty g 21 <110> BIOCORE CO., LTD. REPUBLIC O F KOREA (FORENSIC SERVICE DIRECTOR MINISTRY OF GOVERNMENT ADMINISTRATION AND HOME AFFAIRS) <120> Age estimation method using body fluids <130> PDPB192030 <160> 16 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SST Forward primer <400> 1 aagaggtagt agttttagag gttt 24 <210> 2 <211> 29 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SST Reverse primer <400> 2 cacaattcaa ataaattctt acttaacat 29 <210> 3 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SST Methyl probe <400> 3 agggatagac gttattgtyg t 21 <210> 4 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SST Unmethyl probe <400> 4 ttagggatag atgttattgt ygttt 25 <210> 5 <211> 31 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> KLF14 Forward primer <400> 5 ggttaagtta tgtttaatag ttttagaaat t 31 <210> 6 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> KLF14 Reverse primer <400> 6 aactactaca acccaaaaat tcc 23 <210> 7 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> KLF14 Methyl probe <400> 7 ttttgttttc gygttttttt ttttg 25 <210> 8 <211> 28 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> KLF14 Unmethyl probe <400> 8 ttattttgtt tttgygtttt tttttttg 28 <210> 9 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> TSSK6 Forward primer <400> 9 gggaagaaag ggaggga 17 <210> 10 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> TSSK6 Reverse primer <400> 10 aataattcca accattccta caac 24 <210> 11 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> TSSK6 Methyl probe <400> 11 tgygtcgttt tggtttagtg 20 <210> 12 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> TSSK6 Unmethyl probe <400> 12 tgygttgttt tggtttagtg t 21 <210> 13 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SLC12A5 Forward primer <400> 13 tggagtttag ttttattgga atgt 24 <210> 14 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SLC12A5 Reverse primer <400> 14 atttaactaa cccaaatcaa ccc 23 <210> 15 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SLC12A5 Methyl probe <400> 15 ttaaggtgtt ggaatgcgty 20 <210> 16 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> SLC12A5 Unmethyl probe <400> 16 ttaaggtgtt ggaatgtgty g 21
Claims (15)
(b) 상기 (a)의 결과를 식 1에 대입하여 각 유전자의 CpG 마커의 메틸화 정도인 K값을 산출하는 단계; 및
(c) 상기 (b) 단계의 K값을 식 2에 대입하는 단계;를 포함하는 연령 예측 방법으로서,
상기 유전자의 CpG 마커는 SST(somatostatin)에 대한 cg00481951, KLF14(Kruppel like factor 14)에 대한 cg14361627, TSSK6(testis specific serine kinase 6)에 대한 cg08928145, 및 SLC12A5(solute carrier family 12 member 5)에 대한 cg07547549이고,
상기 식 1은 “{메틸화 카피/(메틸화 카피 + 비메틸화 카피)}×100”이며,
상기 식 2는 “-N1 + N2×(cg00481951의 K값) + N3×(cg14361627의 K값) + N4×(cg08928145의 K값) + N5×(cg07547549의 K값)” 으로서,
상기 식 2에서의 N1은 -16.2 내지 3.8이고 상기 N2는 -3.3 내지 6.7이며 상기 N3는 -2.6 내지 7.4이며 상기 N4는 -2.7 내지 3.3이며 상기 N5는 -2.6 내지 3.4인 것인, 연령 예측 방법.
(a) performing a methylation assay for the CpG marker of the gene with a sample isolated from an unknown individual;
(b) substituting the result of (a) into Equation 1 to calculate a K value, which is the degree of methylation of the CpG marker of each gene; And
(c) substituting the K value of step (b) into Equation 2; as an age prediction method comprising,
The CpG marker of the gene is cg00481951 for SST (somatostatin), cg14361627 for KLF14 (Kruppel like factor 14), cg08928145 for testis specific serine kinase 6 (TSSK6), and cg07547549 for solvent carrier family 12 member 5 (SLC12A5). ego,
Formula 1 is “{methylated copy/(methylated copy + unmethylated copy)}×100”,
Formula 2 is "-N 1 + N 2 × (K value of cg00481951) + N 3 × (K value of cg14361627) + N 4 × (K value of cg08928145) + N 5 × (K value of cg07547549)" as ,
N 1 in Formula 2 is -16.2 to 3.8, N 2 is -3.3 to 6.7, N 3 is -2.6 to 7.4, N 4 is -2.7 to 3.3, and N 5 is -2.6 to 3.4 Phosphorus, age prediction method.
상기 시료는 체액, 체조직, 및 모근으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나인, 연령 예측 방법.
The method of claim 1,
The sample is any one selected from the group consisting of body fluids, body tissues, and hair roots, age prediction method.
상기 체액은 혈액, 혈장, 림프액, 방수액, 뇌척수액, 흉수, 누액(눈물), 소변, 타액(침), 쓸개즙, 양수, 정액, 및 조직액으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나인, 연령 예측 방법.
The method of claim 6,
The body fluid is any one selected from the group consisting of blood, plasma, lymph fluid, aqueous humor, cerebrospinal fluid, pleural fluid, tear fluid (tears), urine, saliva (saliva), bile fluid, amniotic fluid, semen, and tissue fluid.
상기 K값으로부터 개체의 연령을 계산하는 산출부;를 포함하는 연령 예측용 기기로서,
상기 유전자의 CpG 마커는 SST에 대한 cg00481951, KLF14에 대한 cg14361627, TSSK6에 대한 cg08928145, 및 SLC12A5에 대한 cg07547549이고,
상기 분석부에서의 K값은 식 1로 산출하는 것이며,
상기 식 1은 “{메틸화 카피/(메틸화 카피 + 비메틸화 카피)}×100”이며,
상기 개체의 연령 계산은 식 2로 산출하는 것이며,
상기 식 2는 “-N1 + N2×(cg00481951의 K값) + N3×(cg14361627의 K값) + N4×(cg08928145의 K값) + N5×(cg07547549의 K값)” 으로서,
상기 식 2에서의 N1은 -16.2 내지 3.8이고 상기 N2는 -3.3 내지 6.7이며 상기 N3는 -2.6 내지 7.4이며 상기 N4는 -2.7 내지 3.3이며 상기 N5는 -2.6 내지 3.4인 것인, 연령 예측용 기기.
An analysis unit for analyzing a K value, which is a degree of methylation of a CpG marker of a gene in a sample isolated from an unknown individual; And
As an age prediction device comprising a; calculating unit for calculating the age of the individual from the K value,
The CpG markers of this gene are cg00481951 for SST, cg14361627 for KLF14, cg08928145 for TSSK6, and cg07547549 for SLC12A5,
The K value in the analysis unit is calculated by Equation 1,
Formula 1 is “{methylated copy/(methylated copy + unmethylated copy)}×100”,
The age calculation of the individual is calculated by Equation 2,
Equation 2 is “-N 1 + N 2 × (K value of cg00481951) + N 3 × (K value of cg14361627) + N 4 × (K value of cg08928145) + N 5 × (K value of cg07547549)” as ,
N 1 in Formula 2 is -16.2 to 3.8, N 2 is -3.3 to 6.7, N 3 is -2.6 to 7.4, N 4 is -2.7 to 3.3, and N 5 is -2.6 to 3.4 Phosphorus, age prediction device.
상기 시료는 체액, 체조직, 및 모근으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나인, 연령 예측용 기기.
The method of claim 13,
The sample is any one selected from the group consisting of body fluids, body tissues, and hair roots, age prediction device.
상기 체액은 혈액, 혈장, 림프액, 방수액, 뇌척수액, 흉수, 누액(눈물), 소변, 타액(침), 쓸개즙, 양수, 정액, 및 조직액으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나인, 연령 예측용 기기.
The method of claim 14,
The body fluid is any one selected from the group consisting of blood, plasma, lymph fluid, aqueous humor, cerebrospinal fluid, pleural fluid, tear fluid (tears), urine, saliva (saliva), bile fluid, amniotic fluid, semen, and tissue fluid.
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