KR101606918B1 - 인간화 저-만노스형 엔-당질 합성 식물 및 이의 용도 - Google Patents

인간화 저-만노스형 엔-당질 합성 식물 및 이의 용도 Download PDF

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Abstract

본 발명은 인간화된 저-만노스형 엔-당질을 포함하는 단백질을 생산하는 식물체 및 이를 이용한 인간화된 맞춤형 저-만노스형 엔-당질을 포함하는 단백질의 생산방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 식물체는 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 I(FucTa), 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 II(FucTb), 베타1,2-자일로실트랜스퍼레이즈(XylT) 및 N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼레이즈 II(GnTII) 유전자에 T-DNA가 삽입되어 상기 효소의 기능을 상실하고, 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(FUT8) 유전자를 도입하여 상기 효소의 기능을 가짐으로써, 인간화된 맞춤형 저-만노스형 엔-당질을 포함하는 단백질을 생산할 수 있다. 따라서 본 발명에 따른 저-만노스형 엔-당질을 포함하는 단백질은 대식세포 표적화/리소좀 축적 질환의 단백질 치료제로서, 만노스 말단을 가지는 당단백질 의약품 등에 이용될 수 있으므로 단백질 의약품 분야에서 유용하게 이용될 수 있다.

Description

인간화 저-만노스형 엔-당질 합성 식물 및 이의 용도{Plant synthesizing humanized paucimannose type N-glycan and uses thereof}
본 발명은 알파1,3-퓨코스(α1,3-fucose) 및 베타1,2-자일로스(β1,2-xylose) 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 인간화된 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 형질전환 식물체 및 상기 식물체를 이용한 인간화된 저-만노스형 엔-당질을 포함하는 단백질의 생산 방법에 관한 것이다.
생명공학 기술의 눈부신 성장은 의약품, 식품, 환경, 농업, 해양, 바이오 에너지, 생물 공정 및 측정 시스템 등 여러 분야의 산업화를 이루어냈다. 이 중 바이오의약품 분야는 부가가치가 가장 크고, 전 세계적으로 거대한 규모의 시장을 형성하고 있으며 급속도로 성장하고 있다. 바이오의약품이란 재조합 DNA 기술을 응용하여 생물세포에서 생산된 진단, 예방 및 치료용 단백질, 호르몬, 백신 등의 의약품을 말한다. 잘 알려진 바이오의약품으로는 자가면역질환의 치료에 사용되는 Remicade, Enbrel, Humira, Cimzia, Simponi, Remsima 등을 포함한 tumor necrosis factor-alpha (TNFα) 억제 항체류, B-세포성 림프종 및 백혈병의 치료에 사용되는 Rituxan, HER2 수용체 과발현성 유방암 치료에 사용되는 Herceptin, 안과 치료에 사용되는 혈관생성 억제 항체류인 Avastin과 Lucentis, 다발성경화증의 치료에 사용되는 인터페론(interferon β1α), 당뇨병 환자에 사용되는 인슐린(insulin), 적혈구 생성 촉진 인자(Erythropoietin: EPO), 라이소좀 저장 질환(Lysosomal Storage Disease: LSD)의 치료에 사용되는 Cerezyme과 Fabrazyme 등이 있다(Lawrence, Nat Biotechnol 25, 380-382, 2007; Walsh, Nat Biotechnol 28, 917-924, 2010).
이러한 바이오의약품은 주로 중국 햄스터 난소 세포(CHO cell)나 인간 섬유아세포(human fibroblast)와 같은 동물 세포배양 시스템을 이용하여 생산되고 있다. 동물세포를 이용한 바이오의약품 생산 시스템은 고효율 단백질 발현 시스템이 구축되어 있고 단백질의 접힘(protein folding)과 번역 후 변형(Post-Translational Modification)이 인체에서 생산된 단백질과 유사하기 때문에 단백질의 구조와 관련된 부작용이 없는 바이오의약품을 생산할 수 있다는 이점을 가지고 있다(Schmidt et al., Protein Expr Purif 10, 226-236, 1997). 하지만 우발적인 감염성 프라이온단백질(PrPSc) 보유 개체의 출연과 동물성 바이러스 병원체의 오염에 의한 바이오의약품 생산공장 폐쇄에 관한 보고는 동물 및 동물 세포의 구성 요소를 사용한 바이오의약품 생산 시스템과 방식의 안정성에 관한 심각한 우려를 제기하고 있다. 따라서 이러한 한계를 극복하고 급증하는 바이오의약품의 수요를 충족시키기 위해서 더욱 안전하고 효율적인 새로운 생산 시스템의 개발이 시급히 요구되고 있다.
한편 식물세포는 동물세포와 유사한 단백질 번역 후 변형 시스템을 가지고 있고 병원성 바이러스와 프라이온 등의 오염으로부터 안전할 뿐 아니라 동물 세포 시스템에 비해 세포주나 계통 확립이 용이하고 배양 조건이 까다롭지 않아 바이오의약품을 효율적이고 경제적으로 생산할 수 있는 잠재성을 가지고 있다. 그럼에도 불구하고 아직까지 식물 세포를 이용한 바이오의약품 생산이 활발하게 이루어지지 않는 이유는 단백질 번역 후 변형 중 하나인 단백질의 당질화(glycosylation) 과정이 인체에서 진행되는 단백질 당질화 과정과 차이를 나타내기 때문이다. 특히 포유동물의 엔-당질(N-glycan) 구조에 없는 β1,2-자일로스(β1,2-xylose)와 α1,3-퓨코스(α1,3-fucose) 잔기가 식물에서 생산된 당단백질에 특이적으로 부가된다. 이러한 식물 특이적 엔-당질 구조를 포함한 바이오의약품을 인체치료에 사용할 경우 알레르기를 포함한 면역 반응이 유발될 수 있다는 우려가 제기되고 있다(Jin et al., Glycobiology 18, 235-241, 2008). 따라서 식물을 이용한 바이오의약품 생산 시스템을 개발하기 위해서는 체계적이고 효율적인 단백질 발현 및 분리 시스템을 확립함과 동시에 인체에서 생산되는 단백질과 동일한 엔-당질 구조를 가지는 당단백질을 생산할 수 있도록 단백질의 당질화 과정을 재구성하는 연구 개발이 반드시 필요하다.
본 발명에서는 상기와 같은 현재 기술 분야의 문제점을 해결하기 위하여 인간화 저-만노스형 엔-당질 구조를 가진 베타-글루코세레브로시다아제와 같은 바이오의약품으로서의 당단백질을 효율적이고 경제적으로 생산할 수 있는 식물을 개발하고자 한다. 인간화 저-만노스형 엔-당질 구조를 가지는 당단백질을 생산하는 식물을 만들기 위하여 4개의 식물 내재 당전이효소의 활성을 제거하고 인간 유래 당전이효소의 활성을 도입하는 당질공학(glycoengineering) 기술을 이용하고자 한다.
한국공개특허 제2013-0125337호에는 '고-만노오스형 N-글라이칸을 생산하는 식물체 및 이를 이용한 고-만노오스형 N-글라이칸의 생산방법'이 개시되어 있고, 국제출원특허 PCT/US2007/060642에는 '식물에서 N-글리칸의 인간화 및 최적화 조성물 및 방법'이 개시되어 있으나, 본 발명의 인간화 저-만노스형 엔-당질 합성 식물에 대해서는 개시된 바가 없다.
본 발명은 상기와 같은 요구에 의해 도출된 것으로서, 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 I(α1,3-fucosyltransferase I: FucTa), 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 II(α1,3-fucosyltransferase II: FucTb), 베타1,2-자일로실트랜스퍼레이즈(β1,2-xylosyltransferase: XylT) 및 N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼레이즈 II(beta1,2-N-acetylglucosaminyltransferase II: GnTII) 유전자에 T-DNA가 삽입된 기능상실 4중 돌연변이체(quadruple mutant: qm)에 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 유전자를 도입한 형질전환 식물체(quadruple mutant with FUT8: qmF)를 제작하여 상기 qmF 식물체로부터 식물 특이적인 알파1,3-퓨코스(α1,3-fucose) 및 베타1,2-자일로스(β1,2-xylose) 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(Man3GlcNAc[Fuc(α1,6)]GlcNAc)을 포함하는 단백질을 생산함을 확인함으로써 본 발명을 완성하였다.
상기 과제를 해결하기 위해, 본 발명은 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 I(α1,3-fucosyltransferase I: FucTa), 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 II(α1,3-fucosyltransferase II: FucTb), 베타1,2-자일로실트랜스퍼레이즈(β1,2-xylosyltransferase: XylT) 및 베타1,2-N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼레이즈 II(β1,2-N-acetylglucosaminyltransferase II: GnTII)의 기능이 상실된, 알파1,3-퓨코스(α1,3-fucose) 및 베타1,2-자일로스(β1,2-xylose) 잔기를 포함하지 않는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 4중 돌연변이(quadruple mutant: qm) 식물체를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 4중 돌연변이 식물체에 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 단백질을 코딩하는 유전자가 삽입되어, 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 형질전환 식물체를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 형질전환 식물체의 캘러스 및 종자를 제공한다.
또한, 본 발명은
(1) FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII 단백질의 기능이 상실된, 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 4중 돌연변이(quadruple mutant: qm) 식물체를 제조하는 단계; 및
(2) 상기 (1)단계에서 제조된 4중 돌연변이 식물체를 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환하여 FUT8 유전자를 과발현하고, FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII 단백질 기능이 상실된 형질전환 식물체를 선발하는 단계를 포함하여 제조하는 것을 특징으로 하는 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 형질전환 식물체의 제조 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 방법에 의해 제조된 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 형질전환 식물체를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 식물체 내에서 외래 당단백질 코딩 유전자를 발현시키는 단계를 포함하는 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질의 생산 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 방법에 의해 생산된 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 제공한다.
본 발명에 따른 맞춤형 저-만노스형 엔-당질 생산 식물체(qmF)는 고셰병(Gaucher disease) 치료 효소로 사용되는 글루코세레브로시다아제(glucocerebrosidase)와 같이 저-만노스 말단을 가지는 엔-당질(N-glycan)을 포함한 당단백질 의약품의 생산에 이용될 수 있으므로 바이오의약품 분야에서 유용할 것으로 기대된다.
도 1은 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 I(α1,3-fucosyltransferase I: FucTa), 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 II(α1,3-fucosyltransferase II: FucTb), 베타1,2-자일로실트랜스퍼레이즈(β1,2-xylosyltransferase: XylT), 및 N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼레이즈 II(beta1,2-N-acetylglucosaminyltransferase II: GnTII) 유전자에 T-DNA가 삽입된 기능상실 돌연변이체(qm)를 선별하고 이들을 교배하여 식물 특이적인 β1,2-xylose와 α1,3-fucose 잔기를 포함하지 않고 고-만노스형과 저-만노스형 엔-당질을 생산하는 4중 돌연변이 식물체(qm)를 제작하고 qm 식물체에 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 유전자를 도입하여 기능을 나타나게 함으로써 인간화된 저-만노스형 엔-당질(Man3GlcNAc[Fuc(α1,6)]GlcNAc)을 주로 생산하는 식물체(qmF)를 제작하는 과정을 모식화한 것이다.
도 2는 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 유전자가 Ubiquitin 1 프로모터(Ubi1P)의 조절 하에 항구적으로 발현되는 유전자 구성체 중 Ubiquitin 1 프로모터(Ubi1P): 앞쪽 소문자 700-nt, 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 유전자: 중간 대문자 1,728-nt, Ubiquitin 1 polyadenylation 신호 (Ubi1 polyA): 뒤쪽 소문자 370-nt 서열(서열번호 30)을 나타낸 것이다.
도 3은 인간 유래 FUT8 유전자를 qm 식물체에 도입하기 위한 바이너리 벡터의 유전자 지도와 제한효소 자리를 나타낸 것이다.
도 4는 애기장대 FucTa, FucTb, XylT GnTII 유전자에 T-DNA가 삽입되어 유전자의 기능이 완전히 상실되거나 심각하게 억제된 4중 돌연변이체 qmqm 식물체에 인간 유래 FUT8 유전자를 도입하여 기능을 나타내는 qmF 식물체에 관한 것이다. 도 3A에는 애기장대의 WT, qm 그리고 qmF 식물체의 표현형을 나타내었다. 도 3B에는 프라이머 쌍을 이용하여 WT, qm 그리고 qmF 식물체의 FucTa, FucTb, XylT, GnTII 유전자 돌연변이 및 동형접합체 형성 여부 그리고 T-DNA의 삽입여부를 지노타이핑(genotyping)하여 나타내었다. 도 3C에는 WT, qm 그리고 qmF 식물체에서 분리된 RNA를 주형으로 역전사 중합효소 연쇄반응(Reverse transcription polymerase chain reaction)을 통하여 FucTa, FucTb, XylT, GnTII 및 인간 유래 FUT8 유전자의 발현을 확인한 결과를 나타내었다.
도 5는 면역 블롯과 친화성 블롯 분석을 이용한 WT, qmqmF 식물체의 당질구조를 분석한 결과를 나타낸 것이다. CBB: Coomassie brilliant blue (CBB) stain, Anti-HRP: horseradish peroxidase (HRP: α1,3-fucose와 β1,2-xylose 잔기를 함유한 엔-당질을 가진 펩티이드에 특이적으로 결합) 항체를 이용한 면역 블롯, Anti-fucose: α1,3-fucose 잔기를 함유한 엔-당질을 가진 펩티이드에 특이적인 항체를 이용한 면역 블롯, Anti-xylose: β1,2-xylose 잔기를 함유한 엔-당질을 가진 펩티이드에 특이적인 항체를 이용한 면역 블롯, ConA: Concanavalin A (ConA: 중간 또는 비환원 말단에 만노스나 포도당 잔기를 함유한 엔-당질을 가진 펩티이드에 특이적인 렉틴)를 이용한 친화성 블롯, GS-II: 열대 아프리카 콩과 식물인 Griffonia simplicifolia 의 씨앗에서 분리된 렉틴(비환원 말단에 α- 또는 β-GlcNAc 잔기를 함유한 엔-당질을 가진 펩티이드에 특이적으로 결합)을 이용한 친화성 블롯, LCA: Lens Culinaris Agglutinin (LCA: 비환원 말단 α-mannose 잔기와 코어 α1,6-fucose 잔기를 함유한 엔-당질을 가진 펩티이드에 강하게 결합)을 이용한 친화성 블롯
도 6은 MALDI-TOF 질량분석을 이용한 야생형 (WT) 식물체의 엔-당질 구조를 분석한 결과를 나타낸 것이다.
도 7은 MALDI-TOF 질량분석을 이용한 qm 식물체의 전체 엔-당질 구조를 분석한 결과를 나타낸 것이다.
도 8은 MALDI-TOF 질량분석을 이용한 qmF 식물체의 전체 엔-당질 구조를 분석한 결과를 나타낸 것이다.
도 9는 WT, qmqmF 식물체에 존재하는 각 구조의 엔-당질의 상대적인 양(면적비율: Peak Area %)을 보여주는 것이다.
본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 I(α1,3-fucosyltransferase I: FucTa), 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 II(α1,3-fucosyltransferase II: FucTb), 베타1,2-자일로실트랜스퍼레이즈(β1,2-xylosyltransferase: XylT) 및 베타1,2-N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼레이즈 II(β1,2-N-acetylglucosaminyltransferase II: GnTII)의 기능이 상실된, 알파1,3-퓨코스(α1,3-fucose) 및 베타1,2-자일로스(β1,2-xylose) 잔기를 포함하지 않는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 4중 돌연변이(quadruple mutant: qm) 식물체를 제공한다.
상기 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII의 기능을 상실한 4중 돌연변이 식물체는 FucTa, FucTb, XylTGnTII 유전자 각각의 염기서열의 일부 또는 전체가 제거되거나 T-DNA를 포함한 외래 유전자가 삽입된 것을 특징으로 한다.
상기 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII의 기능을 상실시키는 방법은 당업계에 공지된 방법, 즉, 게놈 변형 (genome modification), 유전자 결실(gene deletion), 유전자 삽입(gene insertion), T-DNA 삽입, 상동 재조합(homologous recombination) 또는 트랜스포존 태깅(transposon tagging) 등의 방법일 수 있으며, 바람직하게는 T-DNA가 삽입된 식물체의 형질전환(transformation) 집단에서 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII 유전자 발현이 결여됨으로써 상기 단백질의 기능을 상실시키는 방법일 수 있다.
상기 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII 단백질의 범위는 각각 서열번호 2, 4, 6 및 8의 아미노산 서열을 갖는 단백질 및 상기 단백질의 기능적 동등물을 포함한다. "기능적 동등물"이란 아미노산의 부가, 치환 또는 결실의 결과, 각각 서열번호 2, 4, 6 및 8의 아미노산 서열과 적어도 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 더 더욱 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것으로, 각각 서열번호 2, 4, 6 및 8의 아미노산 서열를 갖는 단백질과 실질적으로 동질의 생리활성을 나타내는 단백질을 말한다.
또한, 상기 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII 단백질을 코딩하는 유전자는 게놈 DNA와 cDNA를 모두 포함한다. 바람직하게는, 본 발명의 FucTa, FucTb, XylT GnTII 유전자 cDNA 서열은 각각 서열번호 1, 3, 5 및 7로 표시되는 염기서열을 포함할 수 있다. 또한, 상기 염기 서열의 상동체가 본 발명의 범위 내에 포함된다. 구체적으로, 상기 FucTa, FucTb, XylT GnTII 유전자는 각각 서열번호 1, 3, 5 및 7의 염기서열과 70% 이상, 더욱 바람직하게는 80% 이상, 더 더욱 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 가지는 염기 서열을 포함할 수 있다. 폴리뉴클레오티드에 대한 "서열 상동성의 %"는 두 개의 최적으로 배열된 서열과 비교 영역을 비교함으로써 확인되며, 비교 영역에서의 폴리뉴클레오티드 서열의 일부는 두 서열의 최적 배열에 대한 참고 서열(추가 또는 삭제를 포함하지 않음)에 비해 추가 또는 삭제(즉, 갭)를 포함할 수 있다.
본 발명의 일 구현 예에 따른 상기 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII 기능 상실은 각각 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII 유전자에 T-DNA가 삽입되어 이루어 질 수 있으나, 이에 한정하지 않는다.
또한, 본 발명은 상기 4중 돌연변이 식물체에 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 단백질을 코딩하는 유전자가 삽입되어, 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 형질전환 식물체를 제공한다.
본 발명의 일 구현 예에 따른 상기 식물체에서, 변형된 엔-당질(N-glycan)은 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질일 수 있으며, 바람직하게는 Man3GlcNAc[Fuc(α1,6)]GlcNAc일 수 있다.
상기 FUT8 유전자의 삽입은 서열번호 10의 아미노산 서열로 이루어진 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환시킴으로써 수행되어질 수 있다.
상기 FUT8 유전자는 게놈 DNA와 cDNA를 모두 포함한다. 바람직하게는, FUT8 유전자 cDNA 서열은 서열번호 9로 이루어진 염기서열을 포함할 수 있다.
본 발명의 용어 "재조합"은 세포가 이종의 핵산을 복제하거나, 상기 핵산을 발현하거나 또는 펩티드, 이종의 펩티드 또는 이종의 핵산에 의해 암호된 단백질을 발현하는 세포를 지칭하는 것이다. 재조합 세포는 상기 세포의 천연 형태에서는 발견되지 않는 유전자 또는 유전자 절편을, 센스 또는 안티센스 형태 중 하나로 발현할 수 있다. 또한 재조합 세포는 천연 상태의 세포에서 발견되는 유전자를 발현할 수 있으며, 그러나 상기 유전자는 변형된 것으로서 인위적인 수단에 의해 세포 내 재도입된 것이다.
용어 "벡터"는 세포 내로 전달하는 DNA 단편(들), 핵산 분자를 지칭할 때 사용된다. 벡터는 DNA를 복제시키고, 숙주세포에서 독립적으로 재생산될 수 있다. 용어 "전달체"는 흔히 "벡터"와 호환하여 사용된다. 용어 "발현 벡터"는 목적한 코딩 서열과, 특정 숙주 생물에서 작동가능하게 연결된 코딩 서열을 발현하는데 필수적인 적정 핵산 서열을 포함하는 재조합 DNA 분자를 의미한다. 진핵세포에서 이용가능한 프로모터, 인핸서, 종결신호 및 폴리아데닐레이션 신호는 공지되어 있다.
상기 재조합 벡터는 바람직하게는 재조합 식물 발현 벡터이다.
식물 발현 벡터의 바람직한 예는 아그로박테리움 투머파시엔스(Agrobacterium tumefaciens)와 같은 적당한 숙주에 존재할 때 그 자체의 일부, 소위 T-영역을 식물 세포로 전이시킬 수 있는 Ti-플라스미드 벡터이다. 다른 유형의 Ti-플라스미드 벡터(EP 0 116 718 B1호 참조)는 현재 식물 세포, 또는 잡종 DNA를 식물의 게놈 내에 적당하게 삽입시키는 새로운 식물이 생산될 수 있는 원형질체로 잡종 DNA 서열을 전이시키는데 이용되고 있다. Ti-플라스미드 벡터의 특히 바람직한 형태는 EP 0 120 516 B1호 및 미국 특허 제4,940,838호에 청구된 바와 같은 소위 바이너리(binary) 벡터이다. 본 발명에 따른 DNA를 식물 숙주에 도입시키는데 이용될 수 있는 다른 적합한 벡터는 이중 가닥 식물 바이러스(예를 들면, CaMV) 및 단일 가닥 바이러스, 게미니 바이러스 등으로부터 유래될 수 있는 것과 같은 바이러스 벡터, 예를 들면 비완전성 식물 바이러스 벡터로부터 선택될 수 있다. 그러한 벡터의 사용은 특히 식물 숙주를 적당하게 형질전환하는 것이 어려울 때 유리할 수 있다.
발현 벡터는 바람직하게는 하나 이상의 선택성 마커를 포함할 것이다. 상기 마커는 통상적으로 화학적인 방법으로 선택될 수 있는 특성을 갖는 핵산 서열로, 형질전환된 세포를 비형질전환 세포로부터 구별할 수 있는 모든 유전자가 이에 해당된다. 그 예로는 글리포세이트(glyphosate) 또는 포스피노트리신(phosphinothricin)과 같은 제초제 저항성 유전자, 카나마이신(Kanamycin), G418, 블레오마이신(Bleomycin), 하이그로마이신(hygromycin), 클로람페니콜(chloramphenicol)과 같은 항생제 내성 유전자가 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명의 식물 발현 벡터에서, 프로모터는 CaMV 35S, 액틴, 유비퀴틴, pEMU, MAS 또는 히스톤 프로모터일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. "프로모터"란 용어는 구조 유전자로부터의 DNA 업스트림의 영역을 의미하며 전사를 개시하기 위하여 RNA 폴리머라아제가 결합하는 DNA 분자를 말한다. "식물 프로모터"는 식물 세포에서 전사를 개시할 수 있는 프로모터이다. "구성적(constitutive) 프로모터"는 대부분의 환경 조건 및 발달 상태 또는 세포 분화하에서 활성이 있는 프로모터이다. 형질전환체의 선택이 각종 단계에서 각종 조직에 의해서 이루어질 수 있기 때문에 구성적 프로모터가 본 발명에서 바람직할 수 있다. 따라서, 구성적 프로모터는 선택 가능성을 제한하지 않는다.
본 발명의 재조합 벡터에서, 통상의 터미네이터를 사용할 수 있으며, 그 예로는 노팔린 신타아제(NOS), 벼 α-아밀라아제 RAmy1 A 터미네이터, 파세올린(phaseoline) 터미네이터, 아그로박테리움 투메파시엔스(Agrobacterium tumefaciens)의 옥토파인(Octopine) 유전자의 터미네이터, 대장균의 rrnB1/B2 터미네이터 등이 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다. 터미네이터의 필요성에 관하여, 그러한 영역이 식물 세포에서의 전사의 확실성 및 효율을 증가시키는 것으로 일반적으로 알려져 있다. 그러므로, 터미네이터의 사용은 본 발명의 내용에서 매우 바람직하다.
본 발명의 벡터를 숙주세포 내로 운반하는 방법은, 미세주입법, 칼슘포스페이트 침전법, 전기천공법, 리포좀-매개 형질감염법, DEAE-덱스트란 처리법, 및 유전자 밤바드먼트 등에 의해 벡터를 숙주세포 내로 주입할 수 있다.
본 발명의 일 구현 예에 따른 재조합 벡터는 애기장대 유비퀴틴 1 프로모터, 서열번호 10의 아미노산 서열로 이루어진 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 단백질을 코딩하는 유전자 및 애기장대 유비퀴틴 1 폴리아데닐화(polyadenylation) 신호를 갖는 뉴클레오타이드(서열번호 30)를 포함하는 것을 특징으로 한다.
본 발명의 식물체는 이에 한정되지 않지만, 식량작물류, 채소작물류, 특용작물류, 과수류, 화훼류 및 사료작물류일 수 있으며, 바람직하게는 벼, 밀, 보리, 옥수수, 콩, 감자, 팥, 귀리, 수수, 애기장대, 배추, 무, 고추, 딸기, 토마토, 수박, 오이, 양배추, 참외, 호박, 파, 양파, 당근, 인삼, 담백, 목화, 참깨, 사탕수수, 사탕무우, 들깨, 땅콩, 유채, 사과나무, 배나무, 대추나무, 복숭아, 양다래, 포도, 감귤, 감, 자두, 살구, 바나나, 장미, 글라디올러스, 거베라, 카네이션, 국화, 백합, 튤립, 라이그라스, 레드클로버, 오차드그라스, 알파파, 톨페스큐 및 페레니얼라이그라스로 이루어진 군으로부터 선택된 것일 수 있으며, 바람직하게는 쌍자엽 식물이며, 더욱 바람직하게는 애기장대(Arabidopsis thaliana)이다.
본 발명의 일 구현 예에서는 FucTa, FucTb, XylT GnTII 유전자의 발현이 제거된 qm 식물체에 인간유래 FUT8 유전자의 발현이 도입되어 기능을 나타내는 애기 장대를 선별하였다.
또한, 본 발명은 상기 형질전환 식물체의 캘러스 및 종자를 제공한다.
또한, 본 발명은
(1) FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII 단백질의 기능이 상실된, 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 4중 돌연변이(quadruple mutant: qm) 식물체를 제조하는 단계; 및
(2) 상기 (1)단계에서 제조된 4중 돌연변이 식물체를 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환하여 FUT8 유전자를 과발현하고, FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII 단백질 기능이 상실된 형질전환 식물체를 선발하는 단계를 포함하여 제조하는 것을 특징으로 하는 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 형질전환 식물체의 제조 방법을 제공한다.
상기 (1)단계의 4중 돌연변이(quadruple mutant: qm) 식물체는 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII 단백질의 기능이 각각 상실된 별개의 돌연변이 식물체를 교배하여 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 식물체를 선발하는 단계에 의해 제조되는 것을 특징으로 한다.
본 발명의 일 구현 예에 따른 상기 (1) 단계의 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII의 기능을 상실한 식물체를 확인하는 방법에 있어서, 한 개의 T-DNA가 각각 FucTa, FucTb , XylT GnTII 유전자 내에만 삽입되어 이들 유전자의 발현이 제거되거나 심각하게 억제된 라인을 선별하기 위해서는 선택 배지에서 제초제 또는 항생제 내성의 분리비율을 분석하거나, FucTa, FucTb, XylT GnTII 유전자와 T-DNA에 특이적인 프라이머 쌍을 사용한 중합효소 연쇄 반응(Polymerase Chain Reaction, PCR)을 통한 형질전환 식물체의 게놈 DNA 내에 존재하는 돌연변이 유전자 및 T-DNA 삽입 여부를 분석하는 방법 등을 통해 T-DNA 삽입된 식물체를 선별할 수 있다. 또한 역전사 중합효소 연쇄반응(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction, RT-PCR)을 통한 이들 유전자의 전사체 발현 분석을 통해 형질전환체의 상동염색체에 모두 T-DNA 삽입된 애기장대 동형접합체 라인을 선별할 수 있다.
또한 본 발명의 일 구현 예에 따른 상기 (2) 단계의 인간 유래 FUT8 유전자를 도입하여 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8)의 기능을 나타내는 식물체를 확인하는 방법에 있어서, FUC8 유전자의 발현을 나타내는 라인을 선별하기 위해서는 선택 배지에서 제초제 또는 항생제 내성의 분리비율을 분석하거나, FUT8 유전자 특이적인 프라이머 쌍을 사용한 중합효소 연쇄 반응을 통한 형질전환 식물체의 게놈 DNA 내에 존재하는 FUT8 유전자 삽입 여부를 분석하는 방법 등을 통해 형질전환 식물체를 선별할 수 있다. 또한 역전사 중합효소 연쇄반응을 통한 상기 유전자의 전사체 발현을 분석할 수 있다.
또한, 본 발명은 상기 방법에 의해 제조된 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 형질전환 식물체를 제공한다.
본 발명의 일 구현 예에 따른 상기 형질전환 식물체에서 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII의 기능 상실 및 FUT8 유전자 발현에 의한 엔-당질 분석법으로는 면역 블롯 및 친화성 블롯 분석법을 포함할 수 있다. FucTa, FucTb, XylT, GnTII 및 FUT8의 활성은 당업계에 공지된 어떠한 방법으로도 분석할 수 있으며, 바람직하게는 알파1,3-퓨코스, 베타1,2-자일로스(각각 1:10000 희석, Agrisera), HRP(horseradish peroxidase)(1:10000 희석, Sigma) 항체를 이용해 식물 특이적 단당류와 복합형 엔-당질을 탐지하는 면역 블로팅(immunoblotting)과 ConA(Concanavalin A)(Sigma)를 이용한 만노스형 엔-당질 탐지, GS-II(Griffonia simplicifolia)(Molecular probes) 렉틴을 이용한 N-아세틸글루코사민형(GlcNAc type) 엔-당질 탐지, LCA(Lens culinaris)(USBiological) 렉틴을 이용한 알파1,6-퓨코스를 포함하는 엔-당질을 탐지하는 친화성 블로팅(affinoblotting)을 수행하여 분석할 수 있고, 또는 전체 엔-당질을 펩타이드:N-글라이카네이즈 에이(peptide:N-glycanase A: PNGase A)로 잘라낸 후 MALDI-TOF 질량 분석을 통하여 전체 엔-당질 프로파일링을 통하여 분석할 수 있다.
상기 면역 블롯 및 친화성 블롯에는 퍼옥시데이즈(POD), 알칼리포스포테이즈, β-갈락토시데이즈, 유레이즈, 카탈레이즈, 글루코스옥시데이즈, 락트산 탈수소 효소, 아밀레이즈 또는 바이오틴-아비딘 복합체 등의 효소가 사용될 수 있고, 형광 면역 측정법의 경우에는 플루오레세인이소티오시아네이트, 테트라메틸로다민이소티시아네이트, 치환 로다민이소티오시아네이트, 디클로로리아진이소티오시아네이트, 알렉사(Alexa) 또는 알렉사플루오로(AlexaFluoro) 등의 형광성 물질 또는 형광단이 사용될 수 있으며, 방사 면역 측정법에는 트리티움, 요오드, 인, 황 등의 방사성 동위원소가 사용될 수 있으며, 발광 면역 측정법에는 루시퍼레이즈 방법, 루미놀 퍼옥시데이즈 POD 방법 등이 디옥세탄 화합물 등의 발광성 물질 등과 함께 사용될 수 있다. 아비딘-바이오틴 방법, 스트랩토아비딘-바이오틴 방법 등을 이용할 때처럼 항체가 필요에 따라서는 표지 물질과 결합될 수도 있다. 표지 물질과 항체의 결합은 효소 면역 측정법에 있어서는 글루타르알데히드법, 말레이미드법, 피리딜디술피드법, 과요오드산법 등의 방법이 사용될 수 있으며, 방사 면역 측정법에 있어서는 클로라민T법, 볼턴-헌터법 등의 방법이 사용될 수 있다.
면역학적 측정 방법으로는 상기 예시한 4가지 방법 이외에, 면역 침강법, 면역비탑법, 웨스턴 블로팅법, 면역 염색법, 면역 확산법 등을 예로 들 수 있으나, 이에 한정되지 않고, 당업계에 통상의 면역 블롯 방법(immunoblotting)을 모두 포함할 수 있다.
상기 엔-당질을 가지는 단백질의 정제 및 분석 방법은 공지된 방법에 의해 확인될 수 있다. 공지된 방법은 크로마토그래피법, 전기영동법, 질량분석법 등의 통상의 당업계에 공지된 방법을 모두 포함한다. 바람직하게는 HPLC(high performance liquid chromatography) 프로파일링, MALDI-TOF(matrix-assisted laser desorption/ionization) 질량분석법을 포함하나, 이에 한정되지 않는다.
또한, 본 발명은 상기 식물체 내에서 외래 당단백질 코딩 유전자를 발현시키는 단계를 포함하는 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질의 생산 방법을 제공한다.
상기 식물체 내에서 외래 당단백질 코딩 유전자의 발현은 상기 외래 당단백질 코딩 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 식물체를 형질전환시킴으로써 수행할 수 있다.
상기 외래 당단백질은 인간 베타-글루코세레브로시다아제(β-glucocerebrosidase), 에리트로포이에틴(erythropoietin, EPO), 인간 성장 호르몬(Human Growth Hormone, hGH), B형 간염 백신(hepatitis B vaccine), 인슐린, 인터루킨, 인터페론, 혈소판 유도 성장 인자, 헤모글로빈, 엘라스틴, 콜라겐, 섬유아세포 성장 인자, 인간 성장 인자, 인간 혈정 알부민, 콜로니 촉진 인자(colony-Stimulatin Factors, CSFs) 및 항체를 포함하나 이에 한정하지 않는다.
상기 당단백질의 생산방법은 식물체의 조직 또는 세포 내에서 인간화된 저-만노스형 엔-당질을 가지는 단백질을 발현시키고, 상기 발현된 외래 당단백질을 분리 및 정제하는 단계를 포함하나, 이에 한정하지 않고 당업계에 공지된 방법에 의한 것을 포함한다.
상기 발현된 외래 당단백질의 정제는 염석법, 투석법, 크로마토그래피법, 전기영동법 및 초원심분리법 등의 방법을 이용할 수 있다. 취급규모가 큰 경우에는 염농도 또는 pH를 변화시켜 이에 대한 용해도가 다른 단백질을 원심조작으로 분리하는 방법(염석)을 일반적으로 사용한다. 또한, 단백질의 정전기적 상호작용의 차이를 이용한 이온크로마토그래피나 단백질 분자의 크기나 형태에 따라 분리시키는 여과크로마토그래피, 특이적인 분자간 상호작용을 이용한 친화성 크로마토그래피, 원심력에 대한 침강속도의 차이를 이용하여 용액 내 또는 설탕 등의 밀도구배 내에서 생체물질을 분리시키는 초원심분리법이 가능할 수 있으나, 이에 한정되지 않고, 당업계에 공지된 통상의 방법을 모두 포함할 수 있다.
또한, 본 발명은 상기 방법에 의해 생산된 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 제공한다.
이하, 본 발명을 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예 1. 인간 유래 FUT8 유전자의 발현을 위한 바이너리 벡터 구축
알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8)의 효소활성을 위한 FUT8 유전자의 도입을 위해, 서열번호 18 및 19의 프라이머(표 2 참고)를 이용한 PCR 방법을 이용하여 인간 cDNA 라이브러리로부터 FUT8 유전자를 암호화하는 cDNA를 분리하였고, 염기서열을 시퀀싱(sequencing)으로 분석하였다. 서열이 확인된 FUT8 유전자는 항구적으로 발현되는 Ubiquitin 1 프로모터(Ubi1P)의 조절 하에 발현되도록 유전자 구성체를 제작하였고, TflA 유전자의 활성에 의해 톡소플라빈(toxoflavin) 저항성을 나타내는 바이너리 벡터에 유전자 구성체를 넣어 FUT8 유전자 발현 벡터를 구축하였다. 상기 결과를 도 2와 도 3에 나타내었다.
실시예 2. T-DNA가 삽입된 애기장대 FucTa , FucTb , XylT , GnTII 유전자의 기능상실 4중 돌연변이 식물체( quadruple mutant : qm ) 및 인간 유래 FUT8 유전자를 도입한 qmF 식물체 제조
1. 식물 재료 및 성장 조건
애기장대 WT(Arabidopsis thaliana Columbia; Col-0), qmqmF 식물체의 종자를 멸균하여 3% 수크로스(sucrose) 및 0.25% 젤라틴 검이 보충된 염 혼합물을 포함하는 MS 배지(Duchefa, http://www.duchefa-biochemie.nl/)를 이용하여 보광(supplemental lighting)(8 시간 암기/16 시간 명기; 120 μmol m-2 sec-1)을 갖는 성장 챔버에서 22℃ 및 70% 습도 조건으로 배양하였다. 상기 식물들의 표현형 차이는 도 4A에 나타내었다.
2. FUT8 유전자를 도입한 qmF 식물체 제조
실시예 1에서 구축한 바이너리 벡터는 아그로박테리움 투메파시엔스(Agrobacterium tumefaciens)를 이용하여 qm 식물체에 도입하였다. 형질전환된 qmF 이형접합성 식물체는 바이너리 벡터에 포함된 TflA 유전자에 의해 나타나는 톡소플라빈(toxoflavin) 저항성을 이용하여 선별하였다. 또한 단일 복제체(single copy)로서 존재한다는 것을 확인하기 위해 멘델 분리 비율을 확인하였다. 상기 결과를 하기 표 1에 나타내었다.
라인 전체 저항성 감수성 χ2
4 100 74 23 0.05
6 100 82 18 2.61
표 1에 나타낸 바와 같이, 톡소플라빈을 포함하는 배지에서 이형접합성 qmF 식물 라인의 자손 개체들의 비율을 확인하였다. χ2 검증을 통하여 T-DNA 삽입 복제수(copy number)를 평가하였고, 라인 4와 라인 6의 χ2 검증 유의 수준은 각각 0.05와 2.61이다. 단일 복제체를 확인한 qmF 식물라인으로부터 수득한 자손 개체들은 다시 한번 톡소플라빈을 포함하는 배지에서 저항성 테스트를 통해 동형접합성 qmF 식물체를 획득하였다.
3. 삽입 서열의 유전자형 검사(Genotyping)
FucTa, FucTb, XylT, GnTII 유전자에 T-DNA가 삽입된 돌연변이주를 Arabidopsis Biological Resource Center(http://abrc.osu.edu/)에서 생산된 T-DNA 돌연변이체 콜렉션으로부터 수득하였다. 수득한 식물체 중 상동염색체에 모두 T-DNA 삽입된 애기장대 동형접합체 라인을 선별하기 위하여 표 2의 프라이머 쌍을 사용한 PCR과 역전사 중합효소 연쇄반응(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction, RT-PCR)을 실시하였다. 선별된 유전자 돌연변이 동형접합체들을 각각 교배 하였고, 유전자형 검사를 통해 FucTa, FucTb, XylT, GnTII 유전자의 4중 돌연변이 동형접합체인 qm 식물체를 선별하였다. 상기 결과를 도 4B에 나타내었다.
유전자형 검사를 위해 게놈 DNA는 페놀-클로로포름을 이용하여 애기장대의 잎으로부터 추출하였다. 각 유전자에 특이적인 프라이머(표 2 참고)의 조합을 이용한 PCR로 T-DNA의 삽입 부위 및 동형접합성을 확인하였다. PCR 반응 조건은 하기와 같다; 1회, 95℃에서 2분(변성); 30회, 95℃에서 20초(변성), 58℃에서 40초(어닐링), 72℃에서 1분(신장); 및 1회, 72℃에서 5분. PCR은 e-Taq DNA 중합효소 혼합물(SolGent)을 이용하여 수행하였다.
4. 역전사 중합효소 연쇄반응을 이용한 FucTa, FucTb, XylT, GnTII 및 FUT8 유전자의 발현분석
전체 RNA는 NucleoSpin RNA Plant Kit(Macherey-Nagel)를 이용하여 메뉴얼에 따라 애기장대의 잎 조직으로부터 추출하였다. 추출된 전체 RNA는 ReverTraAce-a kit(Toyobo)를 사용하여 cDNA를 제작하였다. 1 ㎕의 상기 단일 가닥 cDNA를 후속 PCR의 주형(template)으로 사용하였다. FucTa, FucTb, XylT, GnTIIFUT8 유전자의 발현을 각각 확인하기 위하여 표 2에서 명시한 정방향 및 역방향 프라이머 세트를 이용하였다. 튜불린 프라이머는 RNA 함량의 대조군으로 이용하였다. PCR 반응 조건은 하기와 같다; 1회, 95℃에서 2분(변성); 30회, 95℃에서 20초(변성), 58℃에서 40초(어닐링), 72℃에서 1분(신장); 및 1회, 72℃에서 5분. RT-PCR은 e-Taq DNA Polymerase 혼합물(SolGent)을 이용하여 수행하였다.
본 발명에서 사용된 프라이머
프라이머 염기서열(5'->3') 용도 서열번호
FucTa-F GAGGAGGCAAAAATTACATGTATATGCTCATCC 유전자형 검사 11
FucTa-R CAGCGACTAGAGATTGGAAGAACTTCTCTGTG 유전자형 검사, RT-PCR 12
FucTb-F TGTCTCCGGTACAGCCAAAAACTGAGAG 유전자형 검사, RT-PCR 13
FucTb-R AAGCAGCAGGGTTAGCTGCGAGATACTT 유전자형 검사, RT-PCR 14
XylT-F CACAGAGAGGAATGATGGAATCTTCAGCTT 유전자형 검사 15
XylT-R ATTCAACATCTCATCATTCACCAGCCG 유전자형 검사, RT-PCR 16
GnTII-F GGTGGATGATGAACACTGTATGGGATGG 유전자형 검사 17
GnTII-R TCATGGAGATGCACTGCTACTGCTGTAAC 유전자형 검사, RT-PCR 18
FucTa-LB GCGTGGACCGCTTGCTGCAACT 유전자형 검사 19
FucTb-LB CCCATTTGGACGTGAATGTAGACAC 유전자형 검사 20
XylT-LB GCCTTTTCAGAAATGGATAAATAGCCTTGCTTC 유전자형 검사 21
GnTII-LB TGTGCCAGGTGCCCACGGAATAG 유전자형 검사 22
FucTa-RTF ATGGGTGTTTTCTCCAATCTTCGAGGT RT-PCR 23
XylT-RTF ATGAGTAAACGGAATCCGAAGATTCTGAA RT-PCR 24
GnTII-RTF ATGGCAAATCTTTGGAAGAAGCAGA RT-PCR 25
FUT8-F CCATGGCAATTACTGTCTCATTAGTGAACAAT RT-PCR 26
FUT8-R ACTAGTTATTTCTCAGCCTCAGGATATGTGGG 클로닝, RT-PCR 27
Tubulin-F ATCGATTCCGTTCTCGATGT 클로닝, RT-PCR 28
Tubulin-R ATCCAGTTCCTCCTCCCAAC RT-PCR 29
실시예 3. 면역 블랏 및 친화성 블랏 분석을 이용한 WT, qm 그리고 qmF 식물체의 엔-당질 분석 및 검증
면역 블랏 및 친화성 블랏 분석을 위해 3주생의 WT, qmqmF 식물체에서 전체 단백질을 추출하였다. 전체 단백질 추출물을 10% SDS-PAGE 젤에 전개하였고 나이트로 셀룰로오스막(Hybond-ECL, Amersham)에 이동시켰다. 식물체 특이적인 당 잔기를 갖는 엔-당질을 면역 블로팅으로 측정하기 위해 막을 α1,3-퓨코스, β1,2-자일로스(Agrisera) 또는 HRP(Sigma)에 대한 항체로 표지하였다. 또한 고-만노스형 엔-당질과 GlcNAc 말단을 가지는 엔-당질을 친화성 블랏으로 측정하기 위해 각각 ConA(Sigma)과 GS-II 렉틴(Molecular Probes)을 이용하였다. 그리고 α1,6-퓨코스 당 잔기를 갖는 엔-당질을 친화성 블랏으로 측정하기 위해 주로 만노스 잔기를 포함한 엔-당질을 가진 펩타이드를 인지하지만 엔-당질이 α1,6-퓨코스 잔기를 포함할 경우 친화성이 강력히 증가되는 LCA 렉틴(USBiological)을 이용하였다.
애기장대 qm 식물체가 식물 특이적인 α1,3-퓨코스, β1,2-자일로스 잔기가 없는 저-만노스형 맞춤형 엔-당질을 가지는 단백질을 생산하는지를 확인하고 qmF 식물체가 인간화된 α1,6-퓨코스 당 잔기를 포함하는 맞춤형 저-만노스형 엔-당질을 가지는 단백질을 생산하는지 확인하기 위해 본 발명자는 항-HRP, 항-퓨코스, 항-자일로스 항체를 이용한 면역 블랏과 ConA, GS-II, LCA를 이용한 친화성 블랏 분석을 수행하였다. 상기 결과를 도 5에 나타내었다.
도 5에 나타낸 바와 같이, 항-HRP, 항-퓨코스, 항-자일로스 항체는 WT 식물체로부터 유래된 단백질에만 반응하였고, qmqmF 식물체로부터 유래된 단백질에는 반응하지 않았다. 이것은 α1,3-퓨코스 및 β1,2-자일로스 잔기를 포함하는 저-만노스형 및 복합형 엔-당질이 qmqmF 식물체에는 합성되지 않는다는 것을 보여주었다. 대조적으로, ConA는 qmqmF 식물체로부터 분리된 단백질과 강한 반응을 나타내었으나, WT에서 분리된 단백질과는 약한 반응을 나타내었고, GS-II의 경우 야생형, qmqmF 식물체에 거의 유사한 반응을 나타내었다. 이것은 만노스형 엔-당질의 양이 qmqmF 식물체에서 증가되었다는 것을 나타낸다.
또한 주로 만노스 잔기를 포함한 엔-당질을 가진 펩타이드를 인지하지만 엔-당질이 α1,6-퓨코스 잔기를 포함할 경우 친화성이 강력히 증가되는 LCA는 WT 및 qm 식물체로부터 분리된 단백질과는 약한 반응을 나타내었으나, qmF 식물체에서 특히 강한 반응을 보여주었다. 이것은 인간화된 α1,6-퓨코스 잔기를 포함하는 인간화된 맞춤형 저-만노스형 엔-당질의 양이 qmF 식물체에서 특이적으로 증가되었다는 것을 보여준다.
실시예 4. MALDI-TOF(Matrix-assisted laser-desorption time-of-flight) 질량 분석을 이용한 WT, qm qmF 식물체의 엔-당질 분석 및 검증
1. 엔-당질 분리, 정제 및 퍼메틸화(permethylation)
WT, qmqmF 식물체로부터 엔-당질 정제를 위한 단백질을 Bakker 등의 방법 (Bakker 등, 2006, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103:7577-7582)에 따라 추출하였다. 상기 단백질을 트립신을 이용하여 분해하였고 고정된 엔-당질을 PNGase A(Peptide N-Glycosidase A)(Prozyme, 미국)에 의해 방출시켰다. 상기 샘플을 C18 Sep-Pak 카트리지를 통과시킨 후 동결 건조시켰다. 탄수화물 분획물을 다이메틸설폭사이드(DMSO)에서 용해시킨 후 Anumula 및 Taylor의 방법(Anumula 및 Taylor, 1992, Aanl. Biochem. 203:101-108)에 따라 퍼메틸화(permethylation) 시켰다.
2. MALDI-TOF(Matrix-assisted laser-desorption time-of-flight) 질량 분석
본 발명자들은 리플렉터 양이온 모드(reflector positive ion mode)에서 MALDI-TOF 질량 분석법을 50%(v/v) 메탄올 용액 내의 20 mg ml-1 다이하이록시벤조산(DHBA)을 이용하여 수행하였다. 스펙트럼을 LTQ XL(Thermo Fisher Scientific Inc.)을 이용함으로써 수득하였다.
정량적이고 비교 구조적인 정보를 얻기 위해서, 식물체로부터 추출된 당단백질을 MALDI-TOF 질량분석법(mass spectrometry)에 이용하였다. 상기 결과를 도 6 내지 도 9에 나타내었다.
WT로부터 수득한 엔-당질의 질량 스펙트럼은 고-만노스형 엔-당질과 α1,3-퓨코스, β1,2-자일로스 잔기를 포함하는 다양한 구조의 엔-당질이 WT에서 생성된다는 것을 보여주었다(도 6). qm 식물체로부터 수득한 엔-당질의 질량 스펙트럼은 α1,3-퓨코스, β1,2-자일로스 잔기를 포함하는 저-만노스 및 복합형 엔-당질이 qm 식물체에서는 생성되지 않고 주로 α1,3-퓨코스, β1,2-자일로스를 포함하지 않는 저-만노스형과 고-만노스형 엔-당질이 생성되고 있다는 것을 보여주었다(도 7). 이들에 비해 qmF 식물체에서 분리된 엔-당질의 질량 스펙트럼은 주로 α1,6-퓨코스 잔기를 포함하는 저-만노스형과 고-만노스형 엔-당질이 생성되지만, α1,3-퓨코스, β1,2-자일로스 잔기를 포함하는 식물 특이적인 저-만노스형 엔-당질이 생성되지 않는 것을 보여주었다(도 8).
측정된 m/z 엔-당질 구조 WT (%) qm (%) qmF (%)
1171.3928 Man3GlcNAc2 0.64 26.57 12.22
1331.4238 Man3XylGlcNAc2 3.50 ND ND
1345.4227 Man3FucGlcNAc2 0.54a ND 23.32b
1375.4401 Man4GlcNAc2 0.53 1.64 1.61
1416.4695 GlcNAcMan3GlcNAc2 0.35 17.57 6.15
1505.4685 Man3XylFucGlcNAc2 19.15 ND ND
1535.4751 Man4XylGlcNAc2 1.54 ND ND
1576.4882 GlcNAcMan3XylGlcNAc2 1.97 ND ND
1579.4950 Man5GlcNAc2 21.90 24.54 19.72
1590.4923 GlcNAcMan3FucGlcNAc2 0.51c ND 12.54d
1750.5334 GlcNAcMan3XylFucGlcNAc2 9.64 ND ND
1783.5295 Man6GlcNAc2 9.43 9.36 8.10
1987.5796 Man7GlcNAc2 7.93 8.22 6.89
1995.5853 GlcNAc2Man3XylFucGlcNAc2 10.40 ND ND
2191.6177 Man8GlcNAc2 6.11 6.50 4.82
2395.6563 Man9GlcNAc2 5.86 5.60 4.63
Total 100 100 100
aMan3FucGlcNAc2=Man3GlcNAcFucα(1-3)GlcNAc, bMan3FucGlcNAc2=Man3GlcNAcFucα(1-6)GlcNAc, cGlcNAcMan3FucGlcNAc2=GlcNAcMan3GlcNAcFucα(1-3)GlcNAc, dGlcNAcMan3FucGlcNAc2=GlcNAcMan3GlcNAcFucα(1-6)GlcNAc; ND, not detected; Man, 만노스; Xyl, 자일로스; GlcNAc, N-아세틸글루코사민; Fuc, 퓨코스; Gal, 갈락토오스
상기 표 3은 WT, qmqmF 식물체로부터 수득한 엔-당질의 MALDI-TOF MS 분석 결과를 나타낸 것이다. 상기 수치는 각 구조의 엔-당질의 상대적인 양(면적비율: Peak Area %)을 나타낸 것이다. 상기 결과를 도 9에 나타내었다.
WT, qmqmF 식물체로부터 수득한 엔-당질의 정량 분석을 분석 이전에 퍼메틸화에 의해 유도체로 생성된 엔-당질을 이용하여 MALDI-TOF 질량분석에 의해 수행하였다. 양호한 이온 통계를 얻기 위해, 제시된 스펙트럼을 100 레이저 샷의 다양한 스펙트럼으로부터 생성하였다. 전체 통합된 동위 원소 집단의 적분된 피크 면적을 상대적 정량 분석으로 측정하였다.
상기 실험결과를 종합해 볼 때, 본 발명자는 애기장대에서 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 I(α1,3-fucosyltransferase I: FucTa), 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 II(α1,3-fucosyltransferase II: FucTb), 베타1,2-자일로실트랜스퍼레이즈(β1,2-xylosyltransferase: XylT) 및 N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼레이즈 II(β1,2-N-acetylglucosaminyltransferase II: GnTII)의 활성 부족은 골지체에서 식물 특이적인 엔-당질 형성을 완전히 억제하게 만들고, 식물 특이적인 엔-당질 형성 결함은 Man3GlcNAc2 형태를 갖는, 저-만노스형 엔-당질의 축적을 유도한다는 것을 확인하였다. 또한 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 유전자를 qm 식물체에 도입하여 지속적으로 발현시킴으로써 α1,6-퓨코스를 가지는 인간화된 맞춤형 저-만노스형 엔-당질([Man3GlcNAc[Fuc(α1,6)]GlcNAc)의 축적을 주요한 생성물로 유도한다는 것을 확인하였다.
<110> INDUSTRY-ACADEMIC COOPERATION FOUNDATION GYEONGSANG NATIONAL UNIVERSITY <120> Plant synthesizing humanized paucimannose type N-glycan and uses thereof <130> PN14169 <160> 30 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 1332 <212> DNA <213> Arabidopsis thaliana <400> 1 atgggtgttt tctccaatct tcgaggtcct aaaattggat tgacccatga agaattgcct 60 gtagtagcca atggctctac ttcttcttct tcgtctcctt cctctttcaa gcgtaaagtc 120 tcgacctttt tgccaatctg cgtggctctt gtcgtcatta tcgagatcgg gttcctctgt 180 cggctcgata acgcttcttt ggtcgatacg ttaacccatt ttttcaccaa gtcgtcgtcc 240 gatttgaaag ttgggtcagg aatagagaaa tgccaggagt ggttagagag agtggattca 300 gttacttatt ctagagattt cactaaagat ccgattttta tctctggtag taacaaggac 360 ttcaaatcgt gctctgttga ttgtgtaatg ggattcactt cagataagaa acctgatgcg 420 gcttttggat taagtcatca acctggaaca ctcagtataa tccgttccat ggaatcagca 480 cagtattacc aagagaataa tcttgctcaa gctcttgaag ccttaatgaa gacgaatgtt 540 aagattgatt cttatggtgg ttgtcaccgg aatcgggatg ggagtgtgga gaaggttgaa 600 gctcttaagc actacaaatt cagtctagct tttgagaaca ccaacgagga ggattatgtc 660 acagagaagt tcttccaatc tctagtcgct ggatctgtcc ctgtggttgt tggagctcca 720 aatatagaag aatttgcacc ttctcctgac tcattccttc acattaagca gatggatgat 780 gtcaaggcag ttgcaaagaa aatgaagtat cttgcggata accctgacgc ctataatcag 840 acgctaagat ggaaacatga aggcccttca gattctttta aggcacttat tgatatggct 900 gctgtacact cttcttgtcg tctctgcatc tttgtggcta caaggattcg tgagcaagaa 960 gagaagagcc ctgagtttaa gagacgaccc tgcaaatgca ccagaggctc agagacagtt 1020 tatcatttgt atgttagaga aagaggacgg tttgacatgg aatccatctt cttgaaggat 1080 ggaaatctga ctctggaagc tctggaatct gcggttcttg cgaagttcat gtctctgaga 1140 tatgaaccaa tatggaagaa ggaaagaccc gcgagcttaa gaggagacgg caagcttaga 1200 gtacatggga tatatcctat tggtctgact caaagacaag ctctttacaa cttcaaattc 1260 gaaggaaatt caagtctcag tactcacata cagagaaacc cttgtcccaa attcgaagtt 1320 gtctttgtct aa 1332 <210> 2 <211> 443 <212> PRT <213> Arabidopsis thaliana <400> 2 Met Gly Val Phe Ser Asn Leu Arg Gly Pro Lys Ile Gly Leu Thr His 1 5 10 15 Glu Glu Leu Pro Val Val Ala Asn Gly Ser Thr Ser Ser Ser Ser Ser 20 25 30 Pro Ser Ser Phe Lys Arg Lys Val Ser Thr Phe Leu Pro Ile Cys Val 35 40 45 Ala Leu Val Val Ile Ile Glu Ile Gly Phe Leu Cys Arg Leu Asp Asn 50 55 60 Ala Ser Leu Val Asp Thr Leu Thr His Phe Phe Thr Lys Ser Ser Ser 65 70 75 80 Asp Leu Lys Val Gly Ser Gly Ile Glu Lys Cys Gln Glu Trp Leu Glu 85 90 95 Arg Val Asp Ser Val Thr Tyr Ser Arg Asp Phe Thr Lys Asp Pro Ile 100 105 110 Phe Ile Ser Gly Ser Asn Lys Asp Phe Lys Ser Cys Ser Val Asp Cys 115 120 125 Val Met Gly Phe Thr Ser Asp Lys Lys Pro Asp Ala Ala Phe Gly Leu 130 135 140 Ser His Gln Pro Gly Thr Leu Ser Ile Ile Arg Ser Met Glu Ser Ala 145 150 155 160 Gln Tyr Tyr Gln Glu Asn Asn Leu Ala Gln Ala Leu Glu Ala Leu Met 165 170 175 Lys Thr Asn Val Lys Ile Asp Ser Tyr Gly Gly Cys His Arg Asn Arg 180 185 190 Asp Gly Ser Val Glu Lys Val Glu Ala Leu Lys His Tyr Lys Phe Ser 195 200 205 Leu Ala Phe Glu Asn Thr Asn Glu Glu Asp Tyr Val Thr Glu Lys Phe 210 215 220 Phe Gln Ser Leu Val Ala Gly Ser Val Pro Val Val Val Gly Ala Pro 225 230 235 240 Asn Ile Glu Glu Phe Ala Pro Ser Pro Asp Ser Phe Leu His Ile Lys 245 250 255 Gln Met Asp Asp Val Lys Ala Val Ala Lys Lys Met Lys Tyr Leu Ala 260 265 270 Asp Asn Pro Asp Ala Tyr Asn Gln Thr Leu Arg Trp Lys His Glu Gly 275 280 285 Pro Ser Asp Ser Phe Lys Ala Leu Ile Asp Met Ala Ala Val His Ser 290 295 300 Ser Cys Arg Leu Cys Ile Phe Val Ala Thr Arg Ile Arg Glu Gln Glu 305 310 315 320 Glu Lys Ser Pro Glu Phe Lys Arg Arg Pro Cys Lys Cys Thr Arg Gly 325 330 335 Ser Glu Thr Val Tyr His Leu Tyr Val Arg Glu Arg Gly Arg Phe Asp 340 345 350 Met Glu Ser Ile Phe Leu Lys Asp Gly Asn Leu Thr Leu Glu Ala Leu 355 360 365 Glu Ser Ala Val Leu Ala Lys Phe Met Ser Leu Arg Tyr Glu Pro Ile 370 375 380 Trp Lys Lys Glu Arg Pro Ala Ser Leu Arg Gly Asp Gly Lys Leu Arg 385 390 395 400 Val His Gly Ile Tyr Pro Ile Gly Leu Thr Gln Arg Gln Ala Leu Tyr 405 410 415 Asn Phe Lys Phe Glu Gly Asn Ser Ser Leu Ser Thr His Ile Gln Arg 420 425 430 Asn Pro Cys Pro Lys Phe Glu Val Val Phe Val 435 440 <210> 3 <211> 1542 <212> DNA <213> Arabidopsis thaliana <400> 3 atgggtgttt tctcgaatct tcgaggaccc agagccggag ctacccacga tgaatttccg 60 gcgaccaatg gctctccttc gtcttcttct tctccatctt catcaatcaa gcgaaaatta 120 tcgaatttgt taccactctg cgttgctctg gtagttatcg ctgagatcgg gtttctgggt 180 cggctcgata aagtcgcttt ggttgatacg ttgactgatt tcttcaccca gtctccgtca 240 ctctcgcagt ctccaccggc gagatccgat cggaagaaga tcggattatt tactgatagg 300 agctgcgagg agtggttgat gagagaagat tcagttactt actctagaga ttttactaaa 360 gatccaattt ttatctctgg tggtgaaaag gactttcaat ggtgttctgt ggattgtaca 420 tttggagata gttcagggaa aacaccagat gctgcgtttg gattaggtca gaaacctgga 480 actcttagta taatacgttc catggaatca gcacagtatt atccagaaaa tgatcttgca 540 caggcacgac ggagaggtta tgatatagtg atgaccacta gtctatcatc agatgttcct 600 gttggatatt tttcgtgggc ggagtatgat attatgtctc cggtacagcc aaaaactgag 660 agagctattg cagctgcttt tatttctaat tgtggtgctc ggaattttcg tctacaagca 720 cttgaggcat tgatgaaaac taacattaag attgattctt atggtggttg tcatcgaaac 780 cgggatggga aagttgacaa 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Thr His 1 5 10 15 Asp Glu Phe Pro Ala Thr Asn Gly Ser Pro Ser Ser Ser Ser Ser Pro 20 25 30 Ser Ser Ser Ile Lys Arg Lys Leu Ser Asn Leu Leu Pro Leu Cys Val 35 40 45 Ala Leu Val Val Ile Ala Glu Ile Gly Phe Leu Gly Arg Leu Asp Lys 50 55 60 Val Ala Leu Val Asp Thr Leu Thr Asp Phe Phe Thr Gln Ser Pro Ser 65 70 75 80 Leu Ser Gln Ser Pro Pro Ala Arg Ser Asp Arg Lys Lys Ile Gly Leu 85 90 95 Phe Thr Asp Arg Ser Cys Glu Glu Trp Leu Met Arg Glu Asp Ser Val 100 105 110 Thr Tyr Ser Arg Asp Phe Thr Lys Asp Pro Ile Phe Ile Ser Gly Gly 115 120 125 Glu Lys Asp Phe Gln Trp Cys Ser Val Asp Cys Thr Phe Gly Asp Ser 130 135 140 Ser Gly Lys Thr Pro Asp Ala Ala Phe Gly Leu Gly Gln Lys Pro Gly 145 150 155 160 Thr Leu Ser Ile Ile Arg Ser Met Glu Ser Ala Gln Tyr Tyr Pro Glu 165 170 175 Asn Asp Leu Ala Gln Ala Arg Arg Arg Gly Tyr Asp Ile Val Met Thr 180 185 190 Thr Ser Leu Ser Ser Asp Val Pro Val Gly Tyr Phe Ser Trp Ala Glu 195 200 205 Tyr Asp Ile Met Ser Pro Val Gln Pro Lys Thr Glu Arg Ala Ile Ala 210 215 220 Ala Ala Phe Ile Ser Asn Cys Gly Ala Arg Asn Phe Arg Leu Gln Ala 225 230 235 240 Leu Glu Ala Leu Met Lys Thr Asn Ile Lys Ile Asp Ser Tyr Gly Gly 245 250 255 Cys His Arg Asn Arg Asp Gly Lys Val Asp Lys Val Glu Ala Leu Lys 260 265 270 Arg Tyr Lys Phe Ser Leu Ala Phe Glu Asn Thr Asn Glu Glu Asp Tyr 275 280 285 Val Thr Glu Lys Phe Phe Gln Ser Leu Val Ala Gly Ser Val Pro Val 290 295 300 Val Val Gly Pro Pro Asn Ile Glu Glu Phe Ala Pro Ala Ser Asp Ser 305 310 315 320 Phe Leu His Ile Lys Thr Met Glu Asp Val Glu Pro Val Ala Lys Arg 325 330 335 Met Lys Tyr Leu Ala Ala Asn Pro Ala Ala Tyr Asn Gln Thr Leu Arg 340 345 350 Trp Lys Tyr Glu Gly Pro Ser Asp Ser Phe Lys Ala Leu Val Asp Met 355 360 365 Ala Ala Val His Ser Ser Cys Arg Leu Cys Ile Phe Leu Ala Thr Arg 370 375 380 Val Arg Glu Gln Glu Glu Glu Ser Pro Asn Phe Lys Lys Arg Pro Cys 385 390 395 400 Lys Cys Ser Arg Gly Gly Ser Asp Thr Val Tyr His Val Phe Val Arg 405 410 415 Glu Arg Gly Arg Phe Glu Met Glu Ser Val Phe Leu Arg Gly Lys Ser 420 425 430 Val Thr Gln Glu Ala Leu Glu Ser Ala Val Leu Ala Lys Phe Lys Ser 435 440 445 Leu Lys His Glu Ala Val Trp Lys Lys Glu Arg Pro Gly Asn Leu Lys 450 455 460 Gly Asp Lys Glu Leu Lys Ile His Arg Ile Tyr Pro Leu Gly Leu Thr 465 470 475 480 Gln Arg Gln Ala Leu Tyr Asn Phe Lys Phe Glu Gly Asn Ser Ser Leu 485 490 495 Ser Ser His Ile Gln Asn Asn Pro Cys Ala Lys Phe Glu Val Val Phe 500 505 510 Val <210> 5 <211> 1605 <212> DNA <213> Arabidopsis thaliana <400> 5 atgagtaaac ggaatccgaa gattctgaag atttttctgt atatgttact tctcaactct 60 ctctttctca tcatctactt cgtttttcac tcatcgtcgt tttcaccgga gcagtcacag 120 cctcctcata tataccacgt ttcagtgaat aaccaatcgg cgattcagaa accgtggccg 180 atcttacctt cttacctccc atggacgccg ccgcagagga atctaccaac tggctcctgc 240 gaaggttact tcgggaatgg atttacaaag agagttgact tccttaagcc gaggattgga 300 ggaggaggag aaggaagctg gttccgatgt ttttacagtg agacattaca gagttcgatt 360 tgtgaaggaa ggaatctgag aatggttccg gatcggattg ttatgtcgag aggaggtgag 420 aagttagagg aagttatggg gaggaaagag gaggaggagc ttcctgcgtt tcgacaaggt 480 gcgtttgagg tagcggaaga ggtttcttca cggttaggtt ttaagagaca ccgtcgtttt 540 ggtggaggag aaggaggtag tgcggtttct cggcggctgg tgaatgatga gatgttgaat 600 gaatatatgc aagaaggtgg aattgataga catacaatga gagatttggt tgcttcgatt 660 cgtgctgttg ataccaatga tttcgtttgt gaagagtggg tggaggaacc gaccttgctt 720 gtcactagat tcgagtacgc aaatctcttc catactgtga cagattggta tagtgcctat 780 gtttcgtcta gagtcaccgg tttgcctaat cgacctcacg ttgttttcgt tgacggacac 840 tgcacgacgc agctagaaga aacatggaca gctttgtttt ccggaatcag atacgcaaag 900 aacttcacca aaccggtttg tttccgccac gcgattcttt caccattggg atacgaaacc 960 gctcttttta aaggcttgtc cggagaaata gactgcaagg gagattcagc tcacaatctg 1020 tggcaaaacc cggacgataa aaggactgcg aggatatcag agtttggtga aatgatcaga 1080 gcagctttcg ggttgcctgt caatagacac cgctcattag aaaagccgct atcatcatca 1140 tcatcatcag cctcagttta taatgttctt tttgtccgcc gtgaagatta cttagcccat 1200 cctcgtcatg gcggtaaagt ccagtctcgg ctcatcaatg aggaagaagt gttcgactcg 1260 ttgcatcatt gggttgcaac tgggtccacc ggtctgacca aatgcgggat taaccttgtg 1320 aatggcttgc ttgcacacat gtcaatgaaa gatcaagtcc gagccattca agatgcttca 1380 gtgatcatag gagctcatgg agcaggactg actcacattg tctctgcaac accaaacaca 1440 acgatatttg agataataag cgtcgagttt cagagacctc atttcgagct tatagctaag 1500 tggaaaggat tggagtatca cgcgatgcat ctggcgaact cacgagcgga accaacggct 1560 gtgattgaga agttaacgga gatcatgaag agccttggct gctaa 1605 <210> 6 <211> 534 <212> PRT <213> Arabidopsis thaliana <400> 6 Met Ser Lys Arg Asn Pro Lys Ile Leu Lys Ile Phe Leu Tyr Met Leu 1 5 10 15 Leu Leu Asn Ser Leu Phe Leu Ile Ile Tyr Phe Val Phe His Ser Ser 20 25 30 Ser Phe Ser Pro Glu Gln Ser Gln Pro Pro His Ile Tyr His Val Ser 35 40 45 Val Asn Asn Gln Ser Ala Ile Gln Lys Pro Trp Pro Ile Leu Pro Ser 50 55 60 Tyr Leu Pro Trp Thr Pro Pro Gln Arg Asn Leu Pro Thr Gly Ser Cys 65 70 75 80 Glu Gly Tyr Phe Gly Asn Gly Phe Thr Lys Arg Val Asp Phe Leu Lys 85 90 95 Pro Arg Ile Gly Gly Gly Gly Glu Gly Ser Trp Phe Arg Cys Phe Tyr 100 105 110 Ser Glu Thr Leu Gln Ser Ser Ile Cys Glu Gly Arg Asn Leu Arg Met 115 120 125 Val 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cggaatgtat ctttgttttt tttgttttgt aacatatttc gttttccgat 180 ttagatcgga tctccttttc cgttttgtcg gaccttcttc cggtttatcc ggatctaata 240 atatccatct tagacttagc taagtttgga tctgtttttt ggttagctct tgtcaatcgc 300 ctcatcatca gcaagaaggt gaaatttttg acaaataaat cttagaatca tgtagtgtct 360 ttggaccttg ggaatgatag aaacgatttg ttatagctac tctatgtatc agaccctgac 420 caagatccaa caatctcata ggttttgtgc atatgaaacc ttcgactaac gagaagtggt 480 cttttaatga gagagatatc taaaatgtta tcttaaaagc ccactcaaat ctcaaggcat 540 aaggtagaaa tgcaaatttg gaaagtgggc tgggcctttt gtggtaaagg cctgtaacct 600 agcccaatat tagcaaaacc ctagacgcgt acattgacat atataaaccc gcctcctcct 660 tgtttagggt ttctacgtga gagaagacga aacacaaacc atggggcctt ggactggttc 720 ctggcgttgg attatgctca ttctttttgc ctgggggacc ttgctgtttt atataggtgg 780 tcacttggta cgagataatg accatcctga tcactctagc cgagaactgt ccaagattct 840 ggcaaagctt gaacgcttaa aacagcagaa tgaagacttg aggcgaatgg ccgaatctct 900 ccggatacca gaaggcccta ttgatcaggg gccagctata ggaagagtac gcgttttaga 960 agagcagctt gttaaggcca 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ctgccttcca tcccattgaa gagtacatgg tgcatgttga 1860 agaacatttt cagcttcttg cacgcagaat gcaagtggac aaaaaaagag tgtatttggc 1920 cacagatgac ccttctttat taaaggaggc aaaaacaaag taccccaatt atgaatttat 1980 tagtgataac tctatttcct ggtcagctgg actgcacaat cgatacacag aaaattcact 2040 tcgtggagtg atcctggata tacattttct ctctcaggca gacttcctag tgtgtacttt 2100 ttcatcccag gtctgtcgag ttgcttatga aattatgcaa acactacatc ctgatgcctc 2160 tgcaaacttc cattctttag atgacatcta ctattttggg ggccagaatg cccacaatca 2220 aattgccatt tatgctcacc aaccccgaac tgcagatgaa attcctatgg aacctggaga 2280 tatcattggt gtggctggaa atcattggga tggctattct aaaggtgtca acaggaaatt 2340 gggaaggacg ggcctatatc cctcctacaa agttcgagag aagatagaaa cggtcaagta 2400 ccccacatat cctgaggctg agaaataact agtatcaaga atcccatctc ttgcttgctt 2460 ttttttgttg tcttcccttt gatagggttt gtttttcttg tttcagtgac tttctatgtt 2520 aaaagataat gtcagtaaaa ggatttggtt ttctattatt ctgaatcgat tacggaagat 2580 tcttgcttaa ttccaatcta tacaagtatc gtgaaataat gaccgtttat gtgattagga 2640 gacgtgtttc attaataaaa tataagatca atacattgtt agtagtgata aactatgtac 2700 aaattgtatt gattgtaaaa gaaacacaat aggttccttt tttctacaat atattgtgac 2760 agactctctg ttttaacgaa tgaattaaat ttgtcgac 2798

Claims (19)

  1. 각각 서열번호 2, 4, 6 및 8의 아미노산 서열로 이루어진 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 I(α1,3-fucosyltransferase I: FucTa), 알파1,3-퓨코실트랜스퍼레이즈 II(α1,3-fucosyltransferase II: FucTb), 베타1,2-자일로실트랜스퍼레이즈(β1,2-xylosyltransferase: XylT) 및 베타1,2-N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼레이즈 II(β1,2-N-acetylglucosaminyltransferase II: GnTII)의 기능이 상실된, 알파1,3-퓨코스(α1,3-fucose) 및 베타1,2-자일로스(β1,2-xylose) 잔기를 포함하지 않는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 4중 돌연변이(quadruple mutant: qm) 식물체.
  2. 제1항에 있어서, 상기 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII의 기능을 상실한 4중 돌연변이 식물체는 FucTa, FucTb, XylTGnTII 유전자 각각의 염기서열의 일부 또는 전체가 제거되거나 T-DNA를 포함한 외래 유전자가 삽입된 것을 특징으로 하는 4중 돌연변이 식물체.
  3. 제1항에 있어서, 상기 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII의 기능 상실은 게놈 변형 (genome modification), 유전자 결실(gene deletion), 유전자 삽입(gene insertion), T-DNA 삽입, 상동 재조합(homologous recombination) 또는 트랜스포존 태깅(transposon tagging)의 방법으로 이루어진 군으로부터 선택된 1종 이상의 방법에 의해 수행되는 것을 특징으로 하는 4중 돌연변이 식물체.
  4. 삭제
  5. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항의 4중 돌연변이 식물체에 서열번호 10의 아미노산 서열로 이루어진 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 단백질을 코딩하는 유전자가 삽입되어, 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 형질전환 식물체.
  6. 제5항에 있어서, 상기 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)은 Man3GlcNAc[Fuc(α1,6)]GlcNAc 인 것을 특징으로 하는 형질전환 식물체.
  7. 제5항에 있어서, 상기 FUT8 유전자의 삽입은 서열번호 10의 아미노산 서열로 이루어진 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환시킴으로써 수행되는 것을 특징으로 하는 형질전환 식물체.
  8. 제7항에 있어서, 상기 재조합 벡터는 애기장대 유비퀴틴 1 프로모터, 서열번호 10의 아미노산 서열로 이루어진 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 단백질을 코딩하는 유전자 및 애기장대 유비퀴틴 1 폴리아데닐화(polyadenylation) 신호를 갖는 뉴클레오타이드를 포함하는 것을 특징으로 하는 형질전환 식물체.
  9. 제5항에 있어서, 상기 식물체는 벼, 밀, 보리, 옥수수, 콩, 감자, 팥, 귀리, 수수, 애기장대, 배추, 무, 고추, 딸기, 토마토, 수박, 오이, 양배추, 참외, 호박, 파, 양파, 당근, 인삼, 담백, 목화, 참깨, 사탕수수, 사탕무우, 들깨, 땅콩, 유채, 사과나무, 배나무, 대추나무, 복숭아, 양다래, 포도, 감귤, 감, 자두, 살구, 바나나, 장미, 글라디올러스, 거베라, 카네이션, 국화, 백합, 튤립, 라이그라스, 레드클로버, 오차드그라스, 알파파, 톨페스큐 및 페레니얼라이그라스로 이루어진 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 형질전환 식물체.
  10. 제5항에 따른 형질전환 식물체의 캘러스.
  11. 제5항에 따른 식물체의 형질전환된 종자.
  12. (1) 각각 서열번호 2, 4, 6 및 8의 아미노산 서열로 이루어진 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII 단백질의 기능이 상실된, 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 4중 돌연변이(quadruple mutant: qm) 식물체를 제조하는 단계; 및
    (2) 상기 (1)단계에서 제조된 4중 돌연변이 식물체를 서열번호 10의 아미노산 서열로 이루어진 인간 유래 알파1,6-퓨코실트랜스퍼레이즈(α1,6-fucosyltransferase: FUT8) 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 형질전환하여 FUT8 유전자를 과발현하고, FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII 단백질 기능이 상실된 형질전환 식물체를 선발하는 단계를 포함하여 제조하는 것을 특징으로 하는 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 형질전환 식물체의 제조 방법.
  13. 제12항에 있어서, 상기 (1)단계의 4중 돌연변이(quadruple mutant: qm) 식물체는 FucTa, FucTb, XylT 및 GnTII 단백질의 기능이 각각 상실된 별개의 돌연변이 식물체를 교배하여 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 식물체를 선발하는 단계에 의해 제조되는 것을 특징으로 하는 형질전환 식물체의 제조 방법.
  14. 제12항의 방법에 의해 제조된 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질을 생산하는 형질전환 식물체.
  15. 제5항의 식물체 내에서 외래 당단백질 코딩 유전자를 발현시키는 단계를 포함하는 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질의 생산 방법.
  16. 제15항에 있어서, 상기 식물체 내에서 외래 당단백질 코딩 유전자의 발현은 상기 외래 당단백질 코딩 유전자를 포함하는 재조합 벡터로 식물체를 형질전환시킴으로써 수행되는 것을 특징으로 하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질의 생산 방법.
  17. 제15항에 있어서, 상기 발현된 외래 당단백질을 분리 및 정제하는 단계를 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질의 생산 방법.
  18. 제17항에 있어서, 상기 발현된 외래 당단백질의 정제는 염석법, 투석법, 크로마토그래피법, 전기영동법 및 초원심분리법으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 방법에 의해 수행되는 것을 특징으로 하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질의 생산 방법.
  19. 제15항의 방법에 의해 생산된 알파1,3-퓨코스 및 베타1,2-자일로스 잔기를 포함하지 않고 알파1,6-퓨코스(α1,6-fucose) 잔기를 함유하는 저-만노스형 엔-당질(N-glycan)을 포함하는 단백질.
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