KR101505479B1 - 스테이플화된 개구린 4 유래 펩타이드 및 이를 포함하는 항균 또는 항암용 조성물 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 스테이플화된 개구린 4 유래 펩타이드 또는 이의 유도체에 관한 것이다. 또한, 본 발명은 상기 스테이플화된 펩타이드를 포함하는 항균 또는 항암용 조성물에 관한 것이다. 본 발명의 개구린 4 유래 스테이플화된 펩타이드는 α나선 형태의 펩타이드의 2차 구조를 안정적으로 유지함으로써, 높은 항균활성 및 단백질 분해효소에 높은 저항성을 나타내는바, 항균 또는 항암에 있어서 높은 효과를 기대할 수 있다.
Description
본 발명은 스테이플화된 개구린 4 유래 펩타이드 또는 이의 유도체 및, 상기 스테이플화된 펩타이드를 포함하는 항균 또는 항암용 조성물에 관한 것이다.
개구린 4 (Geagurin 4)는 국내산 옴개구리 (Rana rugosa)로부터 분리된 항생 및 항암 작용을 나타내는 천연 펩타이드이다. 개구린 4는 다른 개구린 펩타이드 유도체와 마찬가지로 α-나선 형태로 박테리아의 세포막에 작용하여 세포막을 파괴시킴으로써 항생작용을 나타내는 것으로 알려져 있다. 하지만 이 펩타이드는 아미노산 37개를 포함한 긴 서열을 갖기 때문에 실제 약품으로 사용하는데 제한이 따를 수 밖에 없다. 최근 서울대학교 약학대학의 이봉진교수 연구실에서는 이 펩타이드의 16번 위치에 있는 아스파르트산 대신 트립토판을 도입함으로써 아미노산 23개로 구성된 개구린 4 유도체가 높은 항생작용을 보인다는 것을 밝힌 바 있다. 하지만 23개로 이루어진 펩타이드는 여전히 합성과 제조에 높은 비용과 인력이 요구될 뿐 아니라 다른 펩타이드와 마찬가지로 체내에 투여 시 여러 단백질분해효소에 의해 쉽게 분해되기 때문에 여전히 의약품으로 사용하는데 제약이 있다.
본 발명의 일 양상은 스테이플화된 개구린 4 유래 펩타이드 또는 이의 유도체를 제공하는 것이다.
또한, 본 발명의 일 양상은 상기 스테이플화된 펩타이드를 포함하는 항균 또는 항암용 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 일 양상은 스테이플화된 개구린 4 유래 펩타이드 또는 이의 유도체를 제공한다.
이하에서 본 발명을 상세히 설명한다.
에스쿨렌틴-2EM (Esculentin-2EM) (개구린 4, geagurin 4)은 37개의 아미노산을 포함하는 개구린 펩타이드 중 가장 긴 펩타이드이다. 다른 개구린 펩타이드와 마찬가지로, 에스쿨렌틴-2EM은 양이온, 양극성이며, C-말단에 이황화결합을 갖는 α-나선 펩타이드이며, 박테리아 막의 파괴를 통한 항균 작용을 갖는 것으로 알려져있다. 에스쿨렌틴-2EM의 나선 형태 및 양극성 특징은 박테리아 막과의 상호작용 및 막 용해 활성에 필수적이다. 종래 연구는 짧은 서열의 에스쿨렌틴-2EM 유사체 형성에 중점을 두었다. 그러나, 에스큘렌틴-2EM 서열에서의 잔기의 절단은 언제나 항균 활성의 감소를 동반하였다. 예를 들면, 1999, P.D. Ryu 등은 에스쿨렌틴-2EM의 N-말단 23-잔기 단편이 항균활성을 전혀 나타내지 않는다는 것을 밝혔다. 이는 이 절단된 유도체가 생물학적 활성 α 나선 형태를 형성하는 능력이 없기 때문이다. 최근 연구에서, B.-J. Lee 등은 에스쿨렌틴-2EM 의 N-말단 23-잔기 단편의 N-말단의 16번째 자리의 트립토판으로의 치환 (E2EM23W)이 나선성 및 항균활성을 회복시킬 수 있다는 것을 밝혔다 (EurJBiochem 2002 4367). 16번째 자리의 트립토판 잔기는 양극성 나선의 E2EM23W의 친수성 면과 소수성 면 사이에 위치하며, E2EM23W 과 박테리아 막 표면간의 양극성 상호작용을 가능하게 한다. 이는 항균활성을 갖는 에스쿨렌틴-2EM의 가장 짧은 유사체를 밝힌 것이다.
본 발명자는 이에 착안하여, 기존의 에스쿨렌틴-2EM보다 짧고 높은 항균활성을 띄며, 단백질 분해효소에 대한 저항력이 높은 새로운 펩타이드를 발명하였다. 구체적으로, E2EM23W의 5-19 잔기로 구성된 E2EM15W에 있어서, 에스쿨렌틴-2EM의 아미노산 서열의 10 및 14번 위치에 옥트-4-에닐 (oct-4-enyl) 스테이플 교차-결합된 스테일플화된 유사체인 E2EM15W-S1 및 각기 상이한 위치에 트립토판이 치환된 E2EM15W-S2 및 E2EM15W-S3를 설계하였다.
따라서, 본 발명은 서열번호 3의 아미노산 서열로 이루어진 개구린 4 유래 펩타이드 (E2EM15W); 또는 서열번호 3의 아미노산 서열에서 1 내지 15번째 중 하나 이상의 아미노산이 트립토판으로 치환된 펩타이드 유도체;에서, 1 내지 11 번째 중 어느 하나의 아미노산 위치와 그로부터 4번째 뒤의 아미노산 위치가 탄화수소로 스테이플화 (stapling)된 펩타이드를 제공한다. 상기 치환된 펩타이드는 바람직하게는 5, 9 또는 12번째 아미노산 위치 중 어느 하나가 트립토판으로 치환된 것일 수 있다.
본 발명에서, 스테이플화 (stapling)란 펩타이드에 탄화수소의 교차-결합을 도입하여 펩타이드의 α나선형의 이차구조를 안정화시킬 수 있는 신기술 (J. Am . Chem. Soc . 2000, 122, 5891; 및 US7192713)이다. 펩타이드의 스테이플화는 도 1의 모식도에 나타내었다. 본 발명의 펩타이드의 스테이플화는 탄화수소에 의할 수 있다. 탄화수소는 포화 또는 불포화일 수 있으며, 바람직하게는 2 내지 40의 탄소수로 구성될 수 있으며, 단일결합, 이중결합 또는 삼중결합이 각각 독립적으로 1 내지 40개일 수 있다. 바람직하게는 상기 탄화수소의 탄소수가 8개인 경우, 이중결합이 4번 탄소 자리에 위치할 수 있으며 (옥트-4-에닐); 탄소수가 10개인 경우, 이중결합은 5번 탄소 자리에 위치할 수 있으며; 탄소수가 12의 경우, 이중 결합은 6번 탄소 자리에; 탄소수가 14개의 경우, 이중결합은 7번 탄소 자리에; 탄소수가 16개의 경우, 이중결합은 8번 탄소 자리에; 탄소수가 18개의 경우, 이중결합은 9번 탄소 자리에; 탄소수가 20개의 경우, 이중경합은 10번 탄소 자리에 위치할 수 있다. 가장 바람직하게 상기 탄화수소는 옥트-4-에닐 (oct-4-enyl)기이다.
단백질의 스테이플화를 위하여, 예를 들면, 펩타이드 서열 중 임의의 위치(i)와 그로부터 C 말단 쪽으로 4번째 위치(i+4)에 (S)-α-methyl,α-petenylglycine (S5) 아미노산을 갖는 펩타이드를 합성한 후, 이 두 개의 아미노산의 잔기를 Grubbs 1 촉매를 이용한 복분해반응으로 교차-결합시킨다.
교차결합된 스테이플을 도입하는 위치 i는 펩타이드 서열 중 어느 아미노산 위치도 될 수 있으며 i+4는 그로부터 C 말단 쪽으로 4번째 위치이다. 상기 아미노산 위치는 서열번호 3의 아미노산 서열로 이루어진 개구린 4 유래 펩타이드, 또는 이의 트립토판으로 치환된 펩타이드에서 1 내지 11 번째 중 어느 하나의 아미노산 위치와 그로부터 4번째 뒤의 아미노산 위치가 탄화수소로 스테이플화 (stapling)될 수 있으며, 더욱 바람직하게는 6번째의 아미노산 위치와 10번째 아미노산 위치가 스테이플화된 것일 수 있다. 가장 바람직하게는, 상기 스테이플화된 펩타이드는 서열번호 4 내지 6 중 어느 하나의 아미노산 서열로 이루어진 것일 수 있다.
본 발명의 다른 양상은 상기 스테이플화된 펩타이드를 포함하는 항균용 약학적 조성물을 제공한다.
본 발명의 개구린 4 유래 스테이플화된 펩타이드는 α나선 형태의 펩타이드의 2차 구조를 안정적으로 유지함으로써, 높은 항균활성을 나타낸다.
본 발명의 항균이란, 병원성 세균, 바이러스, 병원성 효모 또는 진균의 생장을 억제할 수 있는 활성을 의미한다.
상기 병원성 세균은 동식물의 생체에 침입하여 기생하면서 병을 일으키거나 위해를 주는 모든 미생물로서, 그람 양성균 및 그람 음성균을 포함하고, 예를 들면, 그람 양성균은 바실러스 서브틸러스 (Bacillus subtilis), 스타필로코커스 아우레우스(Staphylococus aureus) 및 스타필로코커스 에피더미스 (Staphylococcus epidermis)등을 포함하고, 그람 음성균은 대장균 (Escherichia coli), 쉬겔라 디센타리에 (Sigella dysentariae ), 폐렴간균 (Klebsiella pneumoniae) 등을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 또한, 상기 세균은 항생제 내성 세균일 수 있다.
또한, 상기 병원성 효모 및 진균은 병원성을 가지는 효모 및 진균으로서, 이에 제한되지는 않으나, 그 예로, 칸디다 알비칸스 (Candida albicans), 아스퍼질러스 휴미거투스 (Aspergillus humigatus), 사카로마이세스 세리비지에 (Saccharomyces cerevisiae) 및 크립토코커스 네오포만스 (Cryptococcus neoformans)를 포함한다.
본 발명의 상기 조성물은 병원성 세균, 바이러스, 효모 또는 진균에 의한 감염성 질환의 예방 또는 치료용 약학적 조성물일 수 있다.
본 발명에 있어서, 상기 병원성 세균에 의한 감염성 질환은 콜레라균에 의한 콜레라; 적리균에 의한 세균성 적리; 백일해균에 의한 백일해; 장티푸스균에 의한 장티푸스; 디프테리아균에 의한 후두디프테리아, 비(鼻)디프테리아; 페스트균에 의한 선(腺)페스트, 폐(肺)페스트; 용혈성 연쇄구균에 의한 성홍열, 단독(丹毒), 패혈증, 피부화농증; 결핵균에 의한 폐결핵, 관절결핵, 신장결핵, 결핵성 수막염; 살모넬라균 및 장염 비브리오 등에 의한 세균성 식중독일 수 있다. 또한, 상기 병원성 효모 및 진균에 의한 감염성 질환은 크립토코커스증(cryptococcosis), 칸디다증(candidasis), 피부사상균증(Dermatophytosis), 표재성 피부 곰팡이증(superficial mycoses), 뇌수막염, 뇌농양, 뇌종양, 히스토플라즈마증(Histoplasmosis), 뉴모시스티스 폐렴 또는 아스퍼질러스증(aspergillosis)일 수 있다.
또한, 본 발명의 상기 조성물은 항균용 의약외품에 이용될 수 있다.
"의약외품"은 사람이나 동물의 질병을 치료, 경감, 처치 또는 예방할 목적으로 사용되는 섬유, 고무제품 또는 이와 유사한 것, 인체에 대한 작용이 약하거나 인체에 직접 작용하지 아니하며, 기구 또는 기계가 아닌 것과 이와 유사한 것, 감염형 예방을 위하여 살균, 살충 및 이와 유사한 용도로 사용되는 제제 중 하나에 해당하는 물품으로서, 사람이나 동물의 질병을 진단, 치료, 경감, 처치 또는 예방할 목적으로 사용하는 물품 중 기구, 기계 또는 장치가 아닌 것 및 사람이나 동물의 구조와 기능에 약리학적 영향을 줄 목적으로 사용하는 물품 중 기구, 기계 또는 장치가 아닌 것을 제외한 물품을 의미한다.
본 발명의 항균제를 의약외품 첨가물로 사용할 경우, 상기 항균제를 그대로 첨가하거나 다른 의약외품 또는 의약외품 성분과 함께 사용할 수 있고, 통상적인 방법에 따라 적절하게 사용할 수 있다. 유효성분의 혼합량은 사용 목적에 따라 적합하게 결정될 수 있다.
본 발명의 의약외품 조성물은 이에 제한되지는 않으나, 바람직하게는 소독청결제, 샤워폼, 가그린, 물티슈, 세제비누, 핸드워시, 가습기 충진제, 마스크, 연고제 또는 필터충진제일 수 있다.
또한, 본 발명의 상기 항균 조성물은 병원성 세균, 바이러스, 효모 또는 진균에 의해 유발되는 질환의 예방 또는 개선용 식품첨가제를 제공한다.
상기 식품첨가제가 사용될 수 있는 식품은 특별히 제한되지 않고, 상기 식품첨가제에 포함되는 상기 스테이플화된 펩타이드 함량 역시 특별히 제한되지 않으며, 이들은 세균, 바이러스, 효모 또는 진균 등의 감염 용이성, 감염 정도를 감안하여 당업자가 필요에 따라 용이하게 결정할 수 있다.
본 발명의 항균제를 첨가할 수 있는 식품의 예로는 육류, 소세지, 빵, 쵸코렛, 캔디류, 스넥류, 과자류, 피자, 라면, 기타 면류, 껌류, 아이스크림류를 포함한 낙농제품, 각종 스프, 음료수, 차, 드링크제, 알코올 음료 및 비타민 복합제 등이 있고, 통상적인 의미에서의 건강기능식품을 모두 포함할 수 있으며, 동물을 위한 사료로 이용되는 식품을 포함할 수 있다.
또, 본 발명의 상기 항균 조성물은 병원성 세균, 바이러스, 효모 또는 진균에 의해 유발되는 질환의 예방 또는 개선용 사료첨가제로 이용될 수 있다.
사료에 첨가되는 상기 스테이플화된 펩타이드의 함량은 제한되지 않으며, 사료가 적용되는 동물의 종류, 연령, 성별, 임신 여부, 감염 용이성 또는 감염 정도에 따라 당업자가 필요에 따라서 용이하게 결정할 수 있다.
또 다른 하나의 양태로서, 본 발명의 상기 스테이플화된 펩타이드는 화장품에 적용될 수 있다.
본 발명의 화장품은 일반적인 유화 제형 및 가용화 제형의 형태로 제조할 수 있다. 상기 유화 제형으로는 영양화장수, 크림, 에센스 등이 있으며, 상기 가용화 제형으로는 유연화장수 등이 있다. 적합한 제형은 이에 제한되지는 않으나, 예를 들어 용액, 겔, 고체 또는 반죽 무수 생성물, 수상에 유상을 분산시켜 얻은 에멀젼, 현탁액, 마이크로에멀젼, 마이크로캡슐, 미세과립구 또는 이온형(리포좀), 바이온형의 소낭 분산제의 형태, 크림, 스킨, 로션, 파우더, 연고, 스프레이 또는 콘실 스틱의 형태일 수 있다. 또한, 포말(foam)의 형태 또는 압축된 추진제를 더 함유한 에어로졸 조성물의 형태일 수 있다.
상기 화장품은 추가적으로 지방 물질, 유기 용매, 용해제, 농축제 및 겔화제, 연화제, 항산화제, 현탁화제, 안정화제, 발포제, 방향제, 계면활성제, 물, 이온형 또는 비이온형 유화제, 충전제, 금속이온봉쇄제, 킬레이트화제, 보존제, 비타민, 차단제, 습윤화제, 필수 오일, 염료, 안료, 친수성 또는 친유성 활성제, 지질 소낭 또는 화장료 조성물에 통상적으로 사용되는 임의의 다른 성분과 같은 통상적으로 사용되는 보조제를 함유할 수 있다.
본 발명의 또 다른 양상은 상기의 스테이플화된 펩타이드를 포함하는 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
본 발명의 개구린 4 유래 스테이플화된 펩타이드는 α나선 형태의 펩타이드의 2차 구조를 안정적으로 유지함으로써, 생물학적으로 안정화된 형태인바, 효과적인 항암효과를 기대할 수 있다.
상기 암은 편평상피세포암, 소세포폐암, 비소세포폐암, 폐의 선암, 폐의 편평상피암, 복막암, 피부암, 피부 또는 안구내 흑색종, 직장암, 항문부근암, 식도암, 소장암, 내분비선암, 부갑상선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 만성 또는 급성 백혈병, 림프구 림프종, 간세포암, 위장암, 췌장암, 교아종, 경부암, 난소암, 간암, 방광암, 간종양, 유방암, 결장암, 대장암, 자궁내막 또는 자궁암, 침샘암, 신장암, 간암, 전립선암, 음문암, 갑상선암, 간암 및 두경부암으로 이루어진 군으로부터 선택되는 것일 수 있다.
상기 조성물이 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물로 제조되는 경우, 상기 조성물은 약학적으로 허용되는 담체를 포함할 수 있다. 상기 조성물에 포함되는 약학적으로 허용되는 담체는 제제시에 통상적으로 이용되는 것으로서, 락토스, 덱스트로스, 수크로스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아카시아 고무, 인산 칼슘, 알기네이트, 젤라틴, 규산 칼슘, 미세결정성 셀룰로스, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로스, 물, 시럽, 메틸 셀룰로스, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 활석, 스테아르산 마그네슘 및 미네랄 오일 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 상기 약학적 조성물은 상기 성분들 이외에 윤활제, 습윤제, 감미제, 향미제, 유화제, 현탁제, 보존제 등을 추가로 포함할 수 있다.
상기 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물은 경구 또는 비경구로 투여할 수 있다. 비경구 투여인 경우에는 정맥내 주입, 피하 주입, 근육 주입, 복강 주입, 내피 투여, 국소 투여, 비내 투여, 폐내 투여 및 직장내 투여 등으로 투여할 수 있다. 경구 투여시, 단백질 또는 펩타이드는 소화가 되기 때문에 경구용 조성물은 활성 약제를 코팅하거나 위에서의 분해로부터 보호되도록 제형화 되어야 한다. 또한, 상기 조성물은 활성 물질이 표적 세포로 이동할 수 있는 임의의 장치에 의해 투여될 수 있다.
상기 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물의 적합한 투여량은 제제화 방법, 투여 방식, 환자의 연령, 체중, 성, 병적 상태, 음식, 투여 시간, 투여 경로, 배설 속도 및 반응 감응성과 같은 요인들에 의해 다양하게 처방될 수 있다. 상기 조성물의 바람직한 투여량은 성인 기준으로 0.001-100 ㎎/kg 범위 내이다. 용어 "약학적 유효량"은 암을 예방 또는 치료하는 데, 또는 혈관신생으로 인한 질환의 예방 또는 치료하는 데 충분한 양을 의미한다.
상기 조성물은 당해 당업자가 용이하게 실시할 수 있는 방법에 따라, 약학적으로 허용되는 담체 및/또는 부형제를 이용하여 제제화함으로써 단위 용량 형태로 제조되거나 또는 다용량 용기 내에 내입시켜 제조될 수 있다. 이때 제형은 오일 또는 수성 매질중의 용액, 현탁액, 시럽제 또는 유화액 형태이거나 엑스제, 산제, 분말제, 과립제, 정제 또는 캅셀제 형태일 수도 있으며, 분산제 또는 안정화제를 추가적으로 포함할 수 있다. 또한, 상기 조성물은 개별 치료제로 투여하거나 다른 치료제와 병용하여 투여될 수 있고, 종래의 치료제와는 순차적 또는 동시에 투여될 수 있다.
본 발명의 개구린 4 유래 스테이플화된 펩타이드는 α나선 형태의 펩타이드의 2차 구조를 안정적으로 유지함으로써, 높은 항균활성 및 단백질 분해효소에 높은 저항성을 나타내는바, 항균 또는 항암에 있어서 높은 효과를 기대할 수 있다.
도 1은 펩타이드의 스테이플화 과정을 모식적으로 나타낸 도이다.
도 2는 스테이플화된 개구린 4 유래 또는 이의 트립토판이 치환된 펩타이드 유도체의 서열 정보 및 스테이플된 위치를 나타낸 도이다.
도 3은 각 펩타이드의 원평광 이원성을 나타낸 도이다.
도 4는 각 펩타이드의 트립신 소화에 따른 영향을 나타낸 도이다.
도 2는 스테이플화된 개구린 4 유래 또는 이의 트립토판이 치환된 펩타이드 유도체의 서열 정보 및 스테이플된 위치를 나타낸 도이다.
도 3은 각 펩타이드의 원평광 이원성을 나타낸 도이다.
도 4는 각 펩타이드의 트립신 소화에 따른 영향을 나타낸 도이다.
이하 본 발명을 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예
1: 시약의 준비
상업적으로 이용가능한 용매 및 시약을 매뉴얼에 따라 이용하였다. 모든 Fmoc-α-아미노산 (Okeanos Tech Co. Ltd.로부터 구입한 Fmoc-(S)-메틸, α-펜틸글라이신-OH), 2-(6-chloro-1-H-benzotriazole-1-yl)-1,1,3,3-테트라메틸암모늄 헥사플루오로포스페이트 (tetramethylaminium hexafluorophosphate; HCTU), 6-클로로-벤조트리아졸-1-일옥시-트리스-피롤리디노포스포늄 헥사플루오로포스페이트 (Chloro-benzotriazole-1-yloxy-tris-pyrrolidinophosphonium hexafluorophosphate) (PyClock) 및 Rink 아마이드 MBHA 수지를 NovaBiochem으로부터 구입하였다.
실시예
2:
펩타이드
디자인 및 합성
에스쿨렌틴-2EM 의 N-말단 23-잔기 단편에서 N-말단의 16번째 자리가 트립토판으로 치환된 유사체 (E2EM23W) 및 이의 절단된 유사체 E2EM15W를 대조군으로서 준비하였다. E2EM15W 는 SDS 미셀 중 E2EM23W 의 코어 나선 구간을 포함하는 E2EM23W의 5-19 잔기로 구성된다. E2EM15W의 스테이플화된 (stapled) 유사체를 설계하기 위하여, 에스쿨렌틴-2EM의 아미노산 서열의 10 및 14번 위치에 옥트-4-에닐 (oct-4-enyl) 스테이플 교차-결합된 스테이플화된 유사체 E2EM15W-S1를 준비하였다. 펩타이드의 스테이플화 모식도는 도 1에 나타내었다. 이 두 위치는 양극성 특성에 대한 방해를 최소화할 수 있는 탄화수소 매듭자리로 특정되었다; 이 두 잔기는 친수성과 소수성 면 사이의 접점에 위치한다. 또한, 각기 상이한 위치에 트립토판이 치환된 E2EM15W-S2 및 E2EM15W-S3를 준비하였다. 이 두 스테이플화된 펩타이드는 상이한 위치의 트립토판의 치환에 따른 효과를 관찰하기 위하여 설계되었다. 대조구 및 실험군 펩타이드의 구체적인 서열정보는 도 2에 나타내었다. 도 2에서 * 와 *는 탄화수소로 상호 스테이플화된 자리를 나타낸다.
또한, 상기 대조군 및 실험군 펩타이드의 ESI-MS 정보를 아래 표 1에 나타내었다.
| 펩타이드 | 분자식 | 계산질량 (M+3H)3+/3 | 확인질량 (M+3H)3+/3 |
| Ac-GGN4-23W-NH2 | C115H189O29N31 | 823.8 | 824 |
| Ac-GGN4-15W1-NH2 | C84H138O18N22 | 582.0 | 582 |
| Ac-GGN4-15W1-Stp-NH2 | C93H152O18N22 | 622.7 | 623 |
| Ac- GGN4-15W2-Stp -NH2 | C92H148O20N22 | 628.0 | 628 |
| Ac- GGN4-15W3-Stp -NH2 | C88H148O20N22 | 612.0 | 612 |
실험을 위하여 상기 표 1의 펩타이드를 합성하였다. 구체적으로는, 펩타이드를 Fmoc 화학 기술을 0.6 mmol/g.5a의 충진 수용능력(loading capacity)을 갖는 Rink 아마이드 MBHA 수지 상에서 이용하여 제조하였다. 건조된 수지 (50 mg, 30 μmol)를 사용 전에 NMP에서 10분 동안 불렸다. Fmoc-보호기를 NMP에서 25 % 피페리딘(piperidine)을 처리하여 제거하였다 (2 x 10분). 자연상의 아미노산을 활성화제로서 HCTU (4.75 당량), 5 당량의 Fmoc-아미노산 및 NMP 내의 10 당량의 DIEA를 이용하여 30분 동안 커플링(coupling)을 하였다. 5 당량의 올레핀 아미노산의 커플링을 Fmoc-아미노산(3 당량), PyClock(3 당량), DIEA(6 당량)을 이용하여 2시간 동안 수행하였다. 각각의 커플링 또는 탈보호 반응(deprotecting reaction) 후, 수지를 디클로로메탄(dichloromethane; DCM)(1 x 2 분), NMP (1 x 2 분), DCM (1 x 2 분) 및 NMP (1 x 2 분)을 이용하여 세척하였다.
실시예
3:
복분해반응
(
Metathesis
) 및 정제
곁사슬(side-chain)이 보호된 펩타이드인, 수지가 결합된 N-Fmoc의 고리-닫힘형 복분해반응 (ring-closing metathesis)을 20 mol %의 Grubbs I 촉매를 이용하여 수행하였다. 상기 반응을 액체 크로마토그래피-질량분석기 (liquid chromatography-mass spectrometry; LC/MS)에 의해 수지 부분 표본 (aliquot)으로부터 수득한 펩타이드의 분해 후 모니터링하였다. 반응 용액을 배수한 후, 수지를 DCE (dichloroethane) (3 x 2 분)를 이용하여 세척하였고 이후 DCM (3 x 2 분)으로 다시 세척하였다. 최종 탈보호 반응 후, N-말단의 아미노기를 45분 동안 NMP 내에서 아세트산 무수물 30 당량 및 60 당량의 DIEA을 이용하여 처리하였다. 수지를 DCM 및 DMF를 이용하여 세척하였고 진공 상태에서 하룻밤 동안 건조시켰다. 펩타이드를 탈보호시켰고 TFA/TIS/물 (95/2.5/2.5)의 혼합물을 첨가함으로써 수지로부터 2시간 동안 분해하였고 1:1의 n-펜텐(pentane) 및 디에틸 에테르(diethyl ether) 혼합용매를 첨가함으로써 침전시켰다. 첨전물을 원심분리기로 수집하였고, 아세토나이트릴 및 물의 1:1 혼합물에 용해시켰다. 상기 생성물을 Zorbax C18 칼럼(Agilent, 5㎛, 9.4 x 250 mm)을 이용한 역상 HPLC (high-performance liquid chromatography)에 의해 정제하였고 이후 LC/MS (Liquid chromatography/mass spectrometry)(Agilent, API4000)로 정제하였다.
E2EM23W. C115H189N29O31 [M+3H]3+/3에 대한 ESIMS m/z 계산값 823.82, 측정값 824.15.
E2EM15W. C84H138N18O22 [M+3H]3+/3에 대한 ESIMS m/z 계산값 582.03, 측정값 582.40.
E2EM15W-S1. C93H152N18O22 [M+3H]3+/3에 대한 ESIMS m/z 계산값 622.73, 측정값 623.10.
E2EM15W-S2. C92H148N20O22 [M+3H]3+/3에 대한 ESIMS m/z 계산값 628.05, 측정값 628.40.
E2EM15W-S3. C88H148N20O22 [M+3H]3+/3에 대한 ESIMS m/z 계산값 612.05, 측정값.612.35.
실시예
3: 항균활성 확인을 위한 항균
어세이
상기의 일렬의 E2EM 펩타이드를 이용하여, 선발된 그람 양성 및 그람 음성 박테리아에 대한 항균 활성을 측정하였다.
구체적으로, 항균 어세이는 표준 브로스 미량희석법 (broth microdilution method)을 이용하여 최소 억제 농도 (minimal inhibitory concentration, MIC) 값을 측정함으로써 수행하였다. 각 펩타이드의 항균 활성은 그람-양성균의 3개의 균주 (Bacillus subtilis ATCC 6633, Staphylococcus aureus ATCC 6538p, Staphylococcus epidermis ATCC 12228) 및 그람-음성균의 6개 균주 (Escherichia coli ATCC 25922, Shigella dysentariae ATCC 9752, Salmonella typhimurium ATCC 14028, Klebsiella pneumonia ATCC 10031, Proteus mirabilis ATCC 25933, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853)를 이용하여 수행하였다. 이 균주들을 2 ml LB (Luria-Bertani) 브로스에 접종하고 밤새 37 ℃에서 배양하였다.
펩타이드를 증류수에 용해시켰다. 펩타이드 용액을 96 웰 둥근 바닥 마이크로타이트 플레이트에 0.2 ㎍/mL 내지 200 ㎍/mL로 2 배 희석하여 준비하였다. 펩타이드를 포함하는 웰은 각 웰에 106 내지 108 콜로니-형성 단위 (CFU, colony-forming unit)/ml의 박테리아 현탁액을 첨가하여 배양하였다. LB 브로스는 펩타이드 용액의 희석 및 박테리아 접종물의 희석에 사용하였다. 37 ℃에서 24시간동안 배양 후, 웰의 최소억제농도 (MIC)를 분석하였다. MIC는 세포의 성장을 완전히 억제하는 가장 낮은 펩타이드 농도로 정의하였다. 실험은 2회 실시하였다. 모든 박테이라 균주는 KCTC (Korean Collection of Type Culture)의 KRIBB (Korean Research Institute of Bioscience and Biotechnology, Korea)으로부터 분양받았다.
항균 어세이의 결과는 아래 표 2과 같다.
| 세균 주 | E2EM23W | E2EM15W | E2EM15W-S1 | E2EM15W-S2 | E2EM15W-S3 | |
| Gram (+) | ||||||
| Bacillus subtilis | ATCC6633 | 50 | 200 | 3.13 | 6.25 | 6.25 |
| Staphylococcus aureus | ATCC6538p | 100 | 100 | 3.13 | 6.25 | 6.25 |
| Staphylococcus epidermis | ATCC12228 | >200 | >200 | >200 | >200 | 100 |
| Gram (-) | ||||||
| Escherichia coli | ATCC25922 | >200 | 200 | >200 | 100 | 100 |
| Shigella dysentariae | ATCC9752 | >200 | >200 | >200 | 50 | 50 |
| Salmonella typhimurium | ATCC14028 | >200 | >200 | >200 | >200 | >200 |
| Klebsiella pneumoniae | ATCC10031 | >200 | >200 | >200 | 50 | 50 |
| Proteus mirabilis | ATCC25933 | >200 | >200 | >200 | >200 | >200 |
| Pseudomonas aeuginose | ATCC27853 | >200 | >200 | >200 | 200 | >200 |
| 최소 억제 농도 ( Minimum Inhibitory Concentrations ) (㎍/ mL ) | ||||||
표 2에서 나타난 바와 같이, 이 실험에서 사용된 어세이 조건하에서, 23-잔기 스테이플화되지 않은 대조군 E2EM23W는 Bacillus subtilis 및 Staphylococcus aureus에 대하여 각각 50 및 100의 최소억제농도 (MIC, ㎍/ml)를 보였으나, 모든 종류의 그람 양성 박테리아를 포함한 다른 박테리아에 대해서는 검출가능한 항균 활성을 나타내지 않았다. 또한, 15-잔기 스테이플화되지 않은 대조군인 E2EM15W은 이 어세이에서 활성이 전혀 나타나지 않았다. 그에 반하여, 스테이플화된 펩타이드 모두는 두 종의 박테리아에 대하여 유의적으로 증가된 항균활성을 나타내었다. 특히, E2EM15W-S1 의 경우, 다른 펩타이드에 비하여 가장 높은 수준의 항균활성을 나타내었다: 이 펩타이드의 최소 억제 농도 (MICs, ㎍/mL)는 Bacillus subtilis 및 Staphylococcus aureus 각각에 대하여 3.13이었다. E2EM15W-S1는 비활성화인 E2EM15W의 스테이플화된 유도체인바, 이러한 결과는 탄화수소 스테이플 시스템이 펩타이드의 항균활성을 향상시킬수 있다는 것을 입증한다. 그러나, E2EM15W-S1은 다른 그람 양성균인 Staphylococcus epidermis 및 모든 그람-음성 박테리아에 대해서는 항균활성을 나타내지 않았다.
다른 스테이플화된 유사체 E2EM15W-S2 및 E2EM15W-S3는 E2EM15W-S1 보다 약간 작은 효과를 나타내지만, 여전히 Bacillus subtilis 및 Staphylococcus aureus에 대하여 유의적으로 증가된 항균 활성을 나타내었다. 그러나, E2EM15W-S1와는 다르게, E2EM15W-S2 및 E2EM15W-S3 는 Shigella dysentariae 및 Klebsiella pneumonia를 포함하는 몇몇의 그람-음성 박테리아에 대한 증가된 항균활성을 나타내었다.
실시예
4: 형태적 선호도 (
Conformational
preferences
)확인을 위한
원편광
이색성 (
Circular
dichroism
)
스테이플화된 유사체의 증가된 항균 활성이 그들의 나선 안정성과 관련이 있는지 확인하기 위하여, 원자외선 원편광 이색성 스펙트럼을 이용하여 형태적 선호도를 시험하였다.
구체적으로는, 펩타이드를 25 mM의 인산칼륨 완충액(pH 6.5)에 용해시켰고 상기 농도를 280nm(트립토판에 대한 흡광계수, λ280 = 5690cm-1)에서 흡수 분광기에 의해 측정하였다. 원편광 이색성 스펙트럼을 온도 조절기를 갖는 Chirascan HP 이중 극성 원평광 이색성 스펙트럼 상에서 하기 표준 측정 파라미터를 사용하여 수집하였다: 1 nm 대역폭, 및 0.1 cm 경로 길이. 모든 스펙트럼은 배경 (background)를 제외한 후, 몰 타원율 (molar ellipticity)의 등분 눈금으로 전환하였다. 곡선은 표준 파라미터로 평탄화하였다.
종전 연구에서, E2EM23W는 수용성 용액에서 불규칙 코일로 존재하지만, 막 유사 환경에서는 α 나선 형태를 띄는 것을 확인하였다. 탄화수소 스테이플 시스템은 공유결합을 통하여 펩타이드를 α 나선 형태로 변형시킬 수 있는 효과적인 화학적 수단인바, 스테이플화된 펩타이드의 나선성은 환경으로부터 비교적 독립적이다. 따라서, 본 발명자는 수용성 용액 중에서 펩타이드 샘플을 분석하였다. 각 펩타이드의 나선성은 평균 잔기의 타원율에 근거하여 측정하였으며, 이는 펩타이드 나선형의 양적 측정에 광범위하게 사용하는 것이다. 그 결과를 도 3에 나타내었다.
도3에 나타난 바와 같이, E2EM23W 는 불규칙 코일의 전형적인 원편광 이색성 스펙트럼을 나타냈으며, 나선 함량은 14 % 뿐이었다. 원평광 이색성은 E2EM15W이 동일한 조건 하에 더 낮은 나선성을 띈다는 것을 나타내었으며, 나선 함량은 4 %에 불과하였다; 이는 펩타이드가 짧을수록 α나선 형성이 더 어려운 것을 나타낸다. 그에 반하여, E2EM15W의 스테이플화된 3개의 유사체는 상당히 증가된 나선 함량을 나타내었으며, 이는 모든 탄화수소 스테이플 기술에 의한 나선-안정화 (helix-stabilization)의 높은 효율을 증명하는 것이다. 항균 어세이에서 가장 높은 활성을 나타낸 유사체인, E2EM15W-S1는 가장 높은 나선성 (47 %)를 나타내었으며, 이는 나선성과 항균 활성의 밀접한 연관성을 나타내는 것이다. E2EM15W-S1과 동일한 위치에 옥트-4-에닐 스테이플을 갖는 다른 유사체 E2EM15W-S2 및 E2EM15W-S3은 더 적은 나선 함량, 즉 각각 27 % 및 37 %를 나타내었다. 이 결과는 스테이플화된 펩타이드의 스캐폴드에서도 트립토판의 치환 위치가 나선-안정화에 영향을 미치는 것을 암시한다.
실시예
5: 프로테아제 저항성 (
Protease
resistance
)확인을 위한 트립신 소화
어세이
스테이플화된 펩타이드의 유의적인 특징은 프로테아제적 소화에 대한 증가된 저항성에 있다. 프로테아제가 펩타이드 물질을 인식하는 것에 있어서, 확장된 형태가 전제조건으로 작용하는 바, 스테이플화된 펩타이드의 프로테아제적 소화에 대한 증가된 안정성은 형태적 강도로부터 기인한다. 스테이플화된 유사체가 그들의 중요한 특정을 유지하는지 여부를 확인하기 위하여, 트립신 소화 어세이를 수행하였다.
트립신은 일반적으로 리신 및 아르기닌과 같은 양전하로 대전된 카르복실기 쪽을 절단한다. 에스쿨렌틴-2EM 유사체는 서열 내에 다수의 리신 잔기를 포함하는바, 이들은 근본적으로 트립신 단백질 분해에 취약하다.
구체적으로, 소화 완충액 (0.1 M NH4HCO3 완충액, pH 8.0) 중 25 ㎕의 트립신 용액 (1 ㎛, Sigma)을 소화 완충액 중 250 ㎕의 펩타이드 용액 (80 ㎛)에 첨가하였고 (기질/효소=1,600/1), 결과 혼합물을 실온에서 빠른 교반 (600 rpm)하에 배양하였다. 50 ㎕의 소화 혼합물을 0, 15, 30, 45 및 60분 시점에서 취하고, 2 ㎕의 트리플루오로아세트산으로 담금질 (quench)하였다. 잔류 기질과 가수분해된 산물을 280 nm에서의 LC-기반 피트 검출으로 정량화하였다. 각 실험을 2회씩 실시하였다. 반감기 (t1 /2)을 lnS (S는 절단되지 않은 물질 %) 대 시간 (min) 의 플롯으로부터 선형 회기 분석을 이용하여 결정하였으며, Kaleida Graph (Synergy Software)를 이용하였다 (t 1 /2 = ln2/기울기). 각 펩타이드에 대하여 25 ℃에서 효소/기질 비가 1/800가 되도록 트립신을 처리하였으며, 그 결과를 도 4에 나타내었다.
도 4에 나타난 바와 같이, 제1 시점 (15 분)에서, 스테이플화 되지 않은 유사체 E2EM23W 및 E2EM15W는 완전히 분해된 것을 HPLC를 통하여 확인할 수 있었던 반면, E2EM15W-1 및 3의 90 % 및 E2EM15W-2 의 75 %는 온전한 것으로 확인되었다. E2EM15W-1 및 3의 절반 이상이 트립신 처리후 60분 시점에서도 절단되지 않았다. 이들의 나선성 (47% v.s. 37%)의 차이에도 불구하고, E2EM15W-1 및 3은 유사한 단백질 가수분해적 안정성을 나타내었고, 반감기 (t 1 /2 )는 각각 72 및 71분이었다. 이와는 상이하게, 가장 낮은 나선성을 나타낸 E2EM15W-2의 경우, 트립신적 소화에 있어서 다른 스테이플화된 펩타이드와 비교하여 가장 취약하였다 (t 1 /2 = 37 분). 상기 결과를 종합하여 볼 때, 탄화수소 스테이플로 유도된 나선 안정성이 프로테아제 소화에 저항성을 증가시키는 것을 알 수 있다.
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<120> Stapled gaegurin 4 derived peptide and composition for antibiotic
or anticancer comprising the same
<130> 1-116p
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<210> 1
<211> 37
<212> PRT
<213> Gaegurin 4 peptide
<400> 1
Gly Ile Leu Asp Thr Leu Lys Gln Phe Ala Lys Gly Val Gly Lys Asp
1 5 10 15
Leu Val Lys Gly Ala Ala Gln Gly Val Leu Ser Thr Val Ser Cys Lys
20 25 30
Leu Ala Lys Thr Cys
35
<210> 2
<211> 23
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GGN4-23W
<400> 2
Gly Ile Leu Asp Thr Leu Lys Gln Phe Ala Lys Gly Val Gly Lys Trp
1 5 10 15
Leu Val Lys Gly Ala Ala Gln
20
<210> 3
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GGN4-15W1
<400> 3
Thr Leu Lys Gln Phe Ala Lys Gly Val Gly Lys Trp Leu Val Lys
1 5 10 15
<210> 4
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GGN4-15W1-Stp
<220>
<221> BINDING
<222> (6)
<223> hydrocarbon stapling cross linking with site 10
<220>
<221> BINDING
<222> (10)
<400> 4
Thr Leu Lys Gln Phe Xaa Lys Gly Val Xaa Lys Trp Leu Val Lys
1 5 10 15
<210> 5
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GGN4-15W2-Stp
<220>
<221> BINDING
<222> (6)
<223> hydrocarbon stapling cross linking with site 10
<220>
<221> BINDING
<222> (10)
<400> 5
Thr Leu Lys Gln Phe Xaa Lys Gly Trp Xaa Lys Asp Leu Val Lys
1 5 10 15
<210> 6
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GGN4-15W3-Stp
<220>
<221> BINDING
<222> (6)
<223> hydrocarbon stapling cross linking with site 10
<220>
<221> BINDING
<222> (10)
<400> 6
Thr Leu Lys Gln Trp Xaa Lys Gly Val Xaa Lys Asp Leu Val Lys
1 5 10 15
Claims (14)
- 서열번호 3의 아미노산 서열로 이루어진 개구린 4 유래 펩타이드; 또는 서열번호 3의 아미노산 서열에서 1 내지 15번째 중 하나의 아미노산이 트립토판으로 치환된 펩타이드 유도체;에서, 6번째의 아미노산 위치와 10번째 아미노산 위치가 탄화수소로 스테이플화 (stapling)된 펩타이드.
- 청구항 1에 있어서, 상기 탄화수소는 옥트-4-에닐기인 것인 스테이플화된 펩타이드.
- 청구항 1에 있어서, 상기 치환 펩타이드는 5, 9 또는 12번째 아미노산 위치 중 어느 하나가 트립토판으로 치환된 것인 스테이플화된 펩타이드.
- 삭제
- 청구항 1에 있어서, 상기 스테이플화된 펩타이드는 서열번호 4 내지 6 중 어느 하나의 아미노산 서열로 이루어진 것을 특징으로 하는, 스테이플화된 펩타이드.
- 청구항 1 내지 3, 5 중 어느 한 항의 스테이플화된 펩타이드를 포함하는 항균용 약학적 조성물.
- 청구항 6에 있어서, 상기 조성물을 병원성 세균, 바이러스, 병원성 효모 또는 진균에 대해 항생효과를 나타내는 것을 특징으로 하는, 항균용 약학적 조성물.
- 청구항 7에 있어서, 상기 병원성 세균은 그람 양성균 또는 그람 음성균인 것을 특징으로 하는, 항균용 약학적 조성물.
- 청구항 8에 있어서, 상기 그람 양성균은 바실러스 서브틸러스 (Bacillus subtilis), 스타필로코커스 아우레우스(Staphylococus aureus) 또는 스타필로코커스 에피더미스 (Staphylococcus epidermis) 인 것인, 항균용 약학적 조성물.
- 청구항 8에 있어서, 상기 그람 음성균은 대장균 (Escherichia coli), 쉬겔라 디센타리에 (Sigella dysentariae ) 또는 폐렴간균 (Klebsiella pneumoniae)인 것인, 항균용 약학적 조성물.
- 청구항 7에 있어서, 상기 병원성 효모 또는 진균은 칸디다 알비칸스 (Candida albicans), 아스퍼질러스 휴미거투스 (Aspergillus humigatus), 사카로마이세스 세리비지에 (Saccharomyces cerevisiae) 또는 크립토코커스 네오포만스 (Cryptococcus neoformans)인 것인, 항균용 약학적 조성물.
- 청구항 1 내지 3, 5 중 어느 한 항의 스테이플화된 펩타이드를 포함하는 항균용 식품 첨가제.
- 청구항 1 내지 3, 5 중 어느 한 항의 스테이플화된 펩타이드를 포함하는 항균용 사료 첨가제.
- 삭제
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| KR1020130060494A KR101505479B1 (ko) | 2013-05-28 | 2013-05-28 | 스테이플화된 개구린 4 유래 펩타이드 및 이를 포함하는 항균 또는 항암용 조성물 |
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