KR101499813B1 - 론 단백질을 포함하는 고온 생장 가능한 재조합 미생물 및 열-쇼크 단백질을 이용한 바이러스의 열안정화 방법 - Google Patents

Abstract

본 발명은 샤페론 단백질을 포함하는 고온 생장가능한 재조합 미생물 및 열-쇼크(샤페론, 프로티아제) 단백질을 이용한 바이러스의 열안정화 방법으로서, 서열번호 2의 스몰 열-쇼크 단백질(small heat shock protein; sHSP), 서열번호 4의 론 단백질(Lon protein), 서열번호 6의 TON_B' 단백질, 서열번호 8의 TON_D 단백질 및 서열번호 10의 TON_E 단백질로 이루어진 그룹에서 선택되는 단백질을 포함하는 것을 특징으로 하는 고온생장 가능한 재조합 미생물을 제공한다. 또한 상기 재조합 미생물을 이용한 유용산물 생산방법을 제공한다. 한편, 서열번호 2의 스몰 열-쇼크 단백질(small heat shock protein; sHSP) 또는 서열번호 4의 론 단백질(Lon protein)을 이용한 바이러스 열안정화 방법을 제공한다.

Description

론 단백질을 포함하는 고온 생장 가능한 재조합 미생물 및 열-쇼크 단백질을 이용한 바이러스의 열안정화 방법{Recombinant microorganisms for growth at high temperature including lon protein and method for heat stabilization of virus using heat-shock protein}

본 발명은 론 단백질을 포함하는 것을 특징으로 하는 고온생장 가능한 재조합 미생물, 이를 이용한 유용산물 생산방법 및 론 단백질을 이용한 바이러스의 열안정화 방법에 관한 것이다.

대장균 (Escherichia coli)은 유전자 조작의 간편성 등 다양한 장점으로 인해 생명 과학 및 바이오테크놀로지 분야에서 가장 많이 사용되는 미생물이다. 특히 대장균은 현재까지 유전자 재조합 단백질 발현 숙주로 가장 적합하다 알려져 있으며, 의료용 단백질 및 효소 등의 생산, 대장균 대사 기작을 이용한 화학 물질 및 의약품 생산 등 다양하게 사용되고 있다.

일반적으로 대장균 활성 및 성장의 최적온도는 37℃로 알려져 있으며, 그 이상의 온도에서는 활성이 크게 감소하여 잘 자라지 못한다. 37℃ 이상의 높은 온도에서는 열에 의해 세포내 단백질의 잘못된 접힘으로 세포 내 많은 단백질의 활성도가 낮아지고 이는 대장균 활성의 감소를 나타낸다. 이로 인해 대장균을 이용한 단백질 생산 및 화학 물질 생산 등의 공정은 37℃ 또는 그 이하의 온도에서 이루어지고 있으며 이는 대장균의 이용 범위를 제한하고 있다. 예를 들면 단백질 생산 및 화학 물질 생산성이 37℃ 이상의 고온에서 높게 나타나는 경우에도 대장균의 사용은 효율이 낮은 37℃ 또는 그 이하의 온도에서 수행할 수밖에 없다. 이는 대장균을 이용한 공정의 가장 큰 문제점 중 하나라 할 수 있다.

한편, 단백질 생산성과 관련하여 중요한 문제 중 하나는 생성된 단백질이 활성상태를 지니기 위한 접힘(folding) 인데, 이때 중요한 역할을 하는 것이 분자샤페론(molecular chaperone)이다. 통상 분자샤페론은 열-쇼크 단백질 (heat shock protein) 그룹에 포함되며, 많은 경우 폴리펩타이드 내의 하부도메인 (subdomain) 간 또는 폴리펩타이드와 다른 분자들 간의 상호작용에 의해 부정확한 구조를 형성하는 것을 방지하는 역할을 한다. 분자샤페론은 정상세포의 성장에도 필요하지만 단백질을 비롯한 세포내 구성성분이 손상을 받는 스트레스 상황에서 그 필요성이 증가하게 된다. 따라서 분자샤페론들은 생리적, 환경적 다양한 스트레스 조건에서 그 발현이 증가하게 되는데, 열충격 시 발현이 증가되는 것으로 알려지고 있다.

따라서 본 발명자들은 서열번호 2의 스몰 열-쇼크 단백질(small heat shock protein; sHSP), 서열번호 4의 론 단백질(Lon protein), 서열번호 6의 TON_B' 단백질, 서열번호 8의 TON_D 단백질 및 서열번호 10의 TON_E 단백질과 같은 분자샤페론 단백질들을 발현시킨 재조합 미생물이 고온에서 활성을 나타내고, 고온에서 생장할 수 있음을 확인하고 본 발명을 완성하였다.

또한, 식품 유래 미생물에 의해 야기되는 식중독은 발생이 증가하고 그 양상이 다양화되어 인류의 건강을 위협하고 있다. 통계에 따르면, 2009년 미국에서 17,468건의 식중독이 발생하였으며(CDC, 2009), 한국에서 5,999건의 식중독이 발생하였다(KFDA, 2010). 그 중 Escherichia coli, Staphylococcus aureus에 의한 식중독 발생건수가 높게 발생되었으며(KFDA, 2010), 이들 병원성 세균은 식품을 수확 및 처리 가공에 의한 교차오염에 의해 발생 되고 있으며, 식품의 질을 떨어뜨릴 수 있으므로 이를 저해시킬 수 있는 방법이 필요하다. 그 중 박테리오파지(bacteriophage)는 세균을 숙주세포로 하는 바이러스로 세균에 기생하여 균체를 녹인 후 세균에 감염되어 숙주를 파괴시키는 작용을 한다. 현재 축산물의 경우 항생제 잔류 및 전이와 항생제 내성균 출현, 무항생제 계육에 대한 소비자 요구 증가 등의 이유로 항생제사용에 대한 규제가 증가하고 있어, 세균성 질병의 통제가 어려워지고 있다. 따라서 생물학적 물질인 phage의 사용이 관심이 증가하고 있다(Safe Food vol.06, No. 1, pp. 29-34). phage는 자연계에 널리 분포하고 있으며 적용 시 식품에 안정적이며 식품의 질에 영향을 주지 않는 장점이 있어 사용되어 오고 있으나, 열에 대해 민감하다는 단점이 있다.

따라서 본 발명자들은 서열번호 2의 스몰 열-쇼크 단백질(small heat shock protein; sHSP), 서열번호 4의 론 단백질(Lon protein)을 분리하여 박테리오파지와 접촉시 박테리오파지의 열안정성이 향상되는 것을 확인하고 본 발명을 완성하였다.

본 발명의 목적은 서열번호 2의 스몰 열-쇼크 단백질(small heat shock protein; sHSP), 서열번호 4의 론 단백질(Lon protein), 서열번호 6의 TON_B' 단백질, 서열번호 8의 TON_D 단백질 및 서열번호 10의 TON_E 단백질로 이루어진 그룹에서 선택되는 단백질을 포함하는 것을 특징으로 하는 고온생장 가능한 재조합 미생물을 제공하는 것이다.

또한, 본 발명의 목적은 상기 재조합 미생물을 이용한 유용산물 생산방법을 제공하는 것이다.

또한 본 발명의 목적은 서열번호 2의 스몰 열-쇼크 단백질(small heat shock protein; sHSP) 또는 서열번호 4의 론 단백질(Lon protein)을 이용한 바이러스 열안정화 방법을 제공하는 것이다.

본 발명의 다른 목적 및 이점은 하기의 발명의 상세한 설명, 청구범위 및 도면에 의해 보다 명확하게 된다.

본 발명의 제1의 양태는 서열번호 2의 스몰 열-쇼크 단백질(small heat shock protein; sHSP), 서열번호 4의 론 단백질(Lon protein), 서열번호 6의 TON_B' 단백질, 서열번호 8의 TON_D 단백질 및 서열번호 10의 TON_E 단백질로 이루어진 그룹에서 선택되는 단백질을 포함하는 것을 특징으로 하는 고온생장 가능한 재조합 미생물을 제공한다. 상세하게는, 상기 미생물은 원핵생물인 것을 특징으로 하고, 보다 상세하게는, 그람 음성세균인 것을 특징으로 하고, 보다 더 상세하게는, 대장균(E. coli)인 것을 특징으로 한다.

본 발명의 제2의 양태는 상기 재조합 미생물을 이용한 유용산물 생산방법을 제공한다. 보다 상세하게는, 상기 유용산물은 단백질, 탄수화물, 지방 또는 핵산인 것을 특징으로 한다.

본 명세서에서 언급된 "스몰 열 쇼크 단백질(small heat shock proteins: sHSPs)은 작은 분자량(20 kDa)을 가지는 열 쇼크 단백질들(heat shock proteins: HSPs)로 열 충격이나 특정 단백질의 과잉생산과 같은 스트레스에 의해 유도되고 단백질의 변성을 보호한다. sHSPs는 진핵생물(eukaryotes)에서 원핵생물(prokaryotes)에 이르기까지 모든 생물에 하나 이상씩 존재한다. 본 발명에 사용된 서열번호 2의 스몰 열 쇼크 단백질(small heat shock proteins: sHSPs)은 초고온 고세균인 파이로코커스 속 엔에이 투(Pyrococcus sp. NA2) 유래의 단백질이다.

본 명세서에 언급된 "론 단백질(Lon protein)"은 가장 원시적인 생명체로부터 인간에 이르기까지 지구상 모든 생명체에 존재하는 단백질로서, 일반적으로 세포 내 단백질들은 수명이 다하거나 여러 가지 스트레스에 의해 손상을 받으면 비정상적인 구조로 변하게 되는데, 론 단배질은 이렇게 손상된 단백질을 제거하는 프로티아제 활성을 가진다. 본 발명에 사용된 서열번호 4의 론 단백질(Lon protein)은 써모코커스 온누리누스 엔에이 원(Thermococcus onnurineus NA1) 유래의 단백질이다.

본 발명의 제3의 양태는 서열번호 2의 스몰 열-쇼크 단백질(small heat shock protein; sHSP) 또는 서열번호 4의 론 단백질(Lon protein)을 이용한 바이러스 열안정화 방법을 제공한다. 상세하게는, 상기 바이러스 열안정화 방법은 서열번호 2의 스몰 열-쇼크 단백질(small heat shock protein; sHSP) 또는 서열번호 4의 론 단백질(Lon protein)을 각각 분리하는 단계; 상기 분리된 단백질을 바이러스와 접촉하는 단계를 포함하는 바이러스 열안정화 방법을 제공한다. 보다 상세하게는 상기 바이러스는 박테리오파지 T4인 것을 특징으로 한다.

본 명세서에 언급된 '박테리오파지(Bacteriophage)'는 박테리아를 숙주세포로 하는 바이러스를 통칭하는 것으로서, 다른 바이러스와 마찬가지로 기본적으로 핵산인 DNA 또는 RNA를 단백질이 둘러싸고 있는 형태를 이루고 있다. 전체적으로 머리 몸 꼬리 세가지 구조로 이루어져 있으며, 머리의 형태는 정이십면체 형태를 가지고 있으며 꼬리는 박테리오파지가 숙주세포에 자신의 유전물질을 주입시킬 때 사용한다. 박테리오파지는 박테리아를 숙주세포로 삼기 때문에 주로 박테리아가 발견되는 곳에 존재한다. 한편,'박테리오파지 T4'는 이중나선 가닥의 DNA파지이다.

본 발명의 제4의 양태는 상기의 열안정화된 바이러스를 이용하여 세균을 사멸시키는 것을 특징으로 하는 식품보존방법을 제공한다.

본 발명의 제5의 양태는 서열번호 2의 스몰 열-쇼크 단백질(small heat shock protein; sHSP) 또는 서열번호 4의 론 단백질(Lon protein); 및 바이러스가 포함된 항균조성물을 제공한다.

본 발명의 제6의 양태는 상기 항균조성물이 포함된 식품조성물, 식품첨가제, 동물사료, 동물사료첨가제 또는 살균용 약품조성물을 제공한다.

본 발명에 의한 항균조성물을 포함하는 식품조성물의 경우, 식물스테롤(phytosterol), 타닌, 폴리페놀, 리놀렌산, 오메가-3 지방산, 안토시아닌계 색소 및 베타글루칸으로 이루어진 군에서 선택된 1 이상의 물질을 더 포함할 수 있다. 또한 액상, 과립상, 분체상, 겔상 등 어떠한 형태로도 제조될 수 있다고 할 것이며, 유제, 정제, 캅셀제, 과립제, 산제, 시럽제 등으로 제조될 수 있다. 유제나 시럽제와 같은 액체 조제물은, 물, 자당, 솔비톨, 과당 등의 당류, 폴리에틸렌글리콜, 프로필렌글리콜 등의 글리콜류, 참기름, 올리브유, 대두유 등의 유류, p-하이드록시안식향산 에스테르류 등의 방부제, 스트로베리 후레바, 페파민트 등의 후레바류 등을 첨가제로 사용하여 제조할 수 있다. 한편, 캅셀제, 정제, 산제, 과립제 등은, 유당, 포도당, 자당, 만니톨 등의 부형제(賦形劑), 전분, 아르긴산나트륨등의 붕괴제, 스테아린산마그네슘, 타르크 등의 활택제, 폴리비닐알콜, 히드록시프로필셀룰로스, 젤라틴 등의 결합제, 지방산에스테르 등의 계면활성제, 글리세린 등의 가소제 등을 첨가제로 사용해서 제조할 수 있다.

본 발명에 의한 항균조성물을 포함하는 약품조성물의 경우, 형태로서는 산제, 과립제, 정제, 캡슐제, 환제, 트로키(troche), 내용액제, 현탁제, 유제, 및 시럽제 등의 경구제로 사용할 수 있으며 이들을 증상에 따라 각각 단독으로 또는 조합해서 사용할 수 있다. 이들 각종 제제는 상용법으로 목적에 따라 주약에 부형제, 결합제, 방부제, 산화안정제, 붕괴제, 활택제, 교미제 등의 의약 제제 기술분야에서 통상 사용할 수 있는 기존에 알려진 담체를 사용하여 제제화할 수 있다.

사용할 수 있는 담체로는 제형에 따라 통상 사용되는 것은 특별한 제한이 없이 사용할 수있는데, 바람직한 것은 전분, 젖당, 만니톨, 카르복시메틸셀룰로오스, 콘스타치, 및 무기염 등의 고형 담체, 증류수, 생리식염수, 포도당 수용액, 에탄올 등의 알코올, 프로필렌글리콜, 및 폴리에틸렌글리콜 등의 액체담체, 및 각종 동식물유, 백색바셀린, 파라핀 및 왁스 등의 유성담체가 있다.

투약 단위는, 예를 들면 개별 투약량의 1, 2, 3 또는 4배를 함유하거나 또는 1/2, 1/3 또는 1/4배를 함유할 수 있다. 개별 투약량은 바람직하기로는 유효 약물이 1회에 투여되는 양을 함유하며, 이는 통상 1일 투여량의 전부, 1/2, 1/3 또는 1/4배에 해당한다. 유효용량은 농도 의존적이나 바람직하게는 10mg 내지 1g/㎏이고, 더욱 바람직하기로는 40 내지 200 mg/kg이며, 하루 1-6 회 투여될 수 있다.

본 발명에 따르면 분자샤페론(molecular chaperone) 단백질들을 발현시킨 재조합 미생물은 고온에서 활성을 나타내고, 고온에서 생장할 수 있으며, 이는 균주의 고온 배양도 가능하게 되어 균주의 이용 범위를 넓힐 수 있다.

또한 열-쇼크(분자샤페론, 프로티아제) 단백질들은 고온에서 박테리오파지의 열안정성을 증대시키는데, 박테리오파지는 세균을 숙주세포로 삼기 때문에 세균에 오염된 식품, 오수, 토양, 배설물, 농장 등에 오염된 세균을 제어하는데 적용가능하다. 따라서 본 발명에 의한 분자샤페론 단백질들은 고온에서도 박테리오파지의 첨가제로써 활용하여 사람의 질환치료, 가축의 사료산업 등 다양한 분야에서 응용될 수 있으며, 항생제의 대체재로서의 효과도 기대된다.

도 1은 열-쇼크(분자샤페론, 프로티아제) 단백질이 과발현된 대장균(E. coli)에 대한 고온에서의 생존가능성(A) 및 성장율(B)을 나타내고 있다.
도 2는 스몰 열-쇼크 단백질(small heat-shok protein; sHSP)과 론 단백질(Lon protein)의 분리 및 정제결과를 나타낸다.
도 3는 T4 phage stock을 10^-5로 희석하여 실험한 플라크의 타이터(titer)를 나타낸 그래프이다. 양성대조구(Positive control)는 열처리 하지 않은 것이고, 음성대조구(Negative control)는 65℃에서 열처리한 것이다.
도 4는 T4 phage stock을 10^-6로 희석하여 실험한 플라크의 타이터(titer)를 나타낸 그래프이다. 양성대조구(Positive control)는 열처리 하지 않은 것이고, 음성대조구(Negative control)는 65℃에서 열처리한 것이다.
도 5는 T4 phage stock을 10^-7로 희석하여 실험한 플라크의 타이터(titer)를 나타낸 그래프이다. 양성대조구(Positive control)는 열처리 하지 않은 것이고, 음성대조구(Negative control)는 65℃에서 열처리한 것이다.
도 6는 T4 phage stock을 10^-5, 10^-6, 10^-7로 희석하여 실험한 플라크의 타이터(titer)를 계산한 결과이다. P: 양성대조구(Positive control)로서 열처리 하지 않은 것이고, N: 음성대조구(Negative control)로서 65℃에서 열처리한 것이다.

이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다.

이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에 있어서 자명할 것이다.

< 실시예 1> 열-쇼크(분자 샤페론 , 프로티아제 ) 단백질을 암호화하는 유전자의 클로닝, 과발현

스몰 열-쇼크 단백질(small heat-shok protein; sHSP), 론 단백질(Lon protein)), TON_B' 단백질, TON_D 단백질, TON_E 단백질을 코딩하는 유전자는 강력한 T7/lac 프로모터를 가진 pET-24(+) 발현벡터에 클로닝 하였으며, 대장균[Escherichia coli Rosetta(DE3)pLysS] 시스템에서 과발현하였다. 상기 단백질에 대한 정보는 표 1에 나타냈다.

본 발명에 사용된 단백질들

단백질 이름	단백질의 기능 및 유래 균주	서열번호
sHSP	스몰 열-쇼크 단백질(small heat-shok protein) (Pyrococcus sp. NA2)	염기서열(서열번호 1) 아미노산서열(서열번호 2)
Lon	ATP-의존 프로테아제(ATP-dependent protease) (Thermococcus onnurineus NA1)	염기서열(서열번호 3) 아미노산서열(서열번호 4)
TON_B'	ATP-의존 프로테아제 돌연변이 단백질 (Thermococcus onnurineus NA1)	염기서열(서열번호 5) 아미노산서열(서열번호 6)
TON_D	프로테아좀 활성 뉴클레오티다제 (proteasome activating nucleotidase) (Thermococcus onnurineus NA1)	염기서열(서열번호 7) 아미노산서열(서열번호 8)
TON_E	써모좀(thermosome) (Pyrococcus sp. NA2 furiosus DSM3638)	염기서열(서열번호 9) 아미노산서열(서열번호 10)

대장균은 37℃에서 루리아-베르타니(Luria-Bertani) 배지를 사용하여 배양하였고, 카나마이신(kanamycin)이 최종 농도 50㎍/ml이 되도록 배지에 첨가하였다. 각각의 단백질은 이소프로필-β-D-티오갈락토피라노사이드(IPTG)를 중간 기하급수적 성장기에 첨가하고 37℃에서 3시간 동안 항온 배양하여 과량 발현을 유도하였다.

< 실시예 2> 열-쇼크(분자 샤페론 , 프로티아제 ) 과발현 시킨 대장균의 고온 생존가능성 및 성장율 측정

각각의 단백질을 포함하는 대장균의 생존가능성(survivability)은 LB 배지를 사용하여 50℃에서 시간에 따른 생존율(OD 600에서 흡광도를 측정)을 결정하였다. 과발현시킨 각각의 대장균은 LB 배지를 사용하여 흡광도를 1.0(OD 600)으로 희석하였다. 각각의 시료는 50℃ 배양기에서 정체 배양하였으며, 열안정성을 가지는 단백질(TON_C)과 공벡터(pET-24a)를 포함하는 대장균을 대조군으로 사용하였다.

성장율(Growth rate)을 측정하기 위하여, 흡광도 1.0으로 희석시킨 배양액을 seed로 사용하여 새로운 LB 배지에 각각 5% 접종하고 46℃ 진탕배양기(shaking incubator)에서 배양하였다. 대장균의 성장율은 OD 600에서 흡광도를 측정하여 결정하였다.

대조군(pET-24a 벡터를 포함하는 대장균)에 비하여 분자샤페론(molecular chaperone)을 포함하는 대장균의 생존율이 향상됨을 확인하였다. 대조군(25% 생존율)과 비교하여 스몰 열-쇼크 단백질(sHSP)과 론 단백질(Lon protein), TON_B' 단백질의 경우, 50℃에서 16시간 배양하였을 때 40% 생존율을 유지하였으며, TON_C, D, E의 경우는 60%까지 생존율을 유지하였다(도 1). 성장율 측정결과, 특이하게도 TON_E를 발현시킨 대장균은 46℃에서 성장 가능함을 확인하였다(도 1).

< 실시예 3> 과발현된 열-쇼크 단백질의 정제

세포는 원심분리(4℃에서 20분간 6,000 x g)를 통하여 얻어졌고, 스몰 열-쇼크 단백질은 1 mM EDTA, 0.3 mg/ml 리소자임(lysozyme)을 포함하는 20 mM sodium phophate 완충용액(pH 7.4), 론 단백질은 0.1 M KCl 및 10% 글리세롤을 포함하는 50 mM 트리스-HCl 완충용액 (pH 8.0)에서 각각 재현탁시켰다. 스몰 열-쇼크 단백질을 포함하는 세포는 초음파에 의해서 분쇄되어 원심분리(4℃에서 30분간 20,000 x g)되었고, 스몰 열-쇼크 단백질을 포함하는 pellet은 1 mM EDTA, 2 mM DTT를 포함하는 20 mM sodium phophate 완충용액(pH7.4)에서 85℃에서 열처리를 통하여 재현탁 시킨 후, 원심분리(4℃에서 20분간 20,000 x g)하여 상등액을 획득하였다. 론 단백질을 포함하는 세포는 초음파에 의해서 분쇄되어 원심분리 (4℃에서 30분간 20,000 x g)되었고, 용해성 단백질인 론 단백질을 포함하는 상등액은 다시 열처리를 시킨 후, 원심분리(4℃에서 20분간 20,000 x g)하여 상등액을 획득하였다.

각각의 얻어진 상등액은 HiLoad^TM 16/60 Superdex^TM 200 (Amersham Bioscience)의 컬럼에 처리되고, 150 mM NaCl을 포함하는 50 mM 트리스-HCl 완충용액 (pH 8.0)으로 용출되었다. 모아진 분획은 Centricon YM-10(Millipore, Bedford, MA)을 이용하여 농축하였다.

정제한 단백질 농도는 브래드포드의 비색분석 방법에 의해 결정하였으며, 단백질의 정제도는 표준 방법으로 수행되어진 소디움 도데실 설페이트-폴리아크릴아마이드 겔 전기영동 (SDS-PAGE) 분석에 의해서 확인하였다(도 2). 스몰 열-쇼크 단백질(small heat-shok protein; sHSP)은 대략 20kDa, 그리고 론 단백질(Lon protein)은 65 kDa의 분자량을 확인하였다. 각각의 단백질은 10 mg/ml의 농도로 농축하여 플라크 분석(plaque assay)를 위한 시료로써 사용하였다.

< 실시예 3> 플라크 분석( Plaque assay )

플라크 분석(Plaque assay)를 위하여 T4 phage와 숙주로써 대장균(E. coli BL21)을 사용하였다. 대장균은 37℃에서 루리아-베르타니(Luria-Bertani) 배지를 사용하여 16시간 배양하였다. 10㎕ T4 phage stock 용액과 90㎕ 스몰 열-쇼크 단백질(10 mg/ml) 및 90㎕ 론 단백질(10 mg/ml)을 각각 혼합한 뒤 상온에서 20분간 반응시켰다. 각각의 반응액은 65℃에서 10, 20, 30, 60분 열처리를 수행한 후, 루리아-베르타니(Luria-Bertani) 배지를 사용하여 10^-5, 10^-6, 10^{- 7}으로 희석하였다.

각각의 희석액에 60㎕ 대장균 배양액을 첨가하고 4 ml의 top agar(9 g agar, 10 g tryptone, 10 g NaCl, 5 g east extract, 1 l H₂O)를 첨가하고 즉시 layer agar plate(11 g agar, 10 g tryptone, 10 g NaCl, 5 g east extract, 1 l H₂O)에 붓고 혼합하였다. Plate는 37℃에서 16시간 배양하였다. 플라크(Plaque)의 역가(titer)는 10^-5 point(플라크 수가 100개 내외)에서 산출하였으며, 단위는 Pfu(plaque forming unit)/ml로 표현하였다.

< 실시예 4> 플라크 분석( Plaque assay )을 통한 T4 phage 의 열안정성 확인

T4 phage 열안정성에 미치는 분자 샤페론(moelcular chaperone)의 영향을 알아보기 위하여 10^-5, 10^-6, 10^-7로 희석하여 플라크 분석(plaque assay)을 수행하였다. 상온에서 반응한 T4 phage는 양성대조구(positive control)로써, 65℃에서 10~60분간 반응한 T4 phage는 음성대조구(negative control)로써 사용하였으며, TON_1374(CoA 합성 관련 단백질)와 BSA는 대조구로써 사용하였다. 음성대조구(negative control)의 경우 65℃에서 10분간 열처리 시 T4 phage의 96% 사멸하였으며, TON_1374와 BSA가 첨가되었을 때 역시 음성대조구(negative control)과 유사한 양상을 나타내었다. 이에 반하여 분자 샤페론(moelcular chaperone)에 포함되는 스몰 열-쇼크 단백질과 론 단백질을 첨가 시 T4 phage의 열에 의한 불활성화(inactivation)을 방지시켜 주는 활성을 확인하였다(도 3 내지 도 6).

자세한 플라크 분석을 위하여 10^-6로 희석한 T4 phage의 역가(titer)를 산출하였다. T4 phage에 스몰 열-쇼크 단백질을 첨가 시, 양성대조구(positive control)와 비교하여 각각 64%(65℃/10min), 33%(65℃/20min), 16%(65℃/30min)의 생존율을 나타내었으며, 론 단백질의 경우 스몰 열-쇼크 단백질보다 T4 phage의 열안정성에 보다 높은 활성을 나타내었다. 양성대조구(positive control)와 비교하여 각각 57%(65℃/20min), 42%(65℃/30min), 14%(65℃/60min)의 생존율을 보였다(도 6). 이에 반하여 TON_1374(CoA 합성 관련 단백질)와 BSA(bovine serum albumin)의 경우 T4 phage의 열안정성에 아무런 영향을 미치지 않았다.

<110> Korea Ocean Research & Development Institute <120> Recombinant microorganisms for growth at high temperature including chaperone proteins and method for heat stabilization of virus using heat-shock protein <130> PN110035 <160> 10 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 501 <212> DNA <213> Pyrococcus sp. NA2 <400> 1 atggtgagga ggagaaggtg ggacatttgg gatccattcg acctaataag agagatccaa 60 gaagaaatcg atgcaatgtt tgatgagttc ttcagcaggc caaggctgtg gacgtacaga 120 aggtggagag agcctgaact ttatgaagaa agtgccagag aagtctggag agagccattt 180 gtcgatatat tcgacagggg tgacgagttc gtcataatag ctgagctccc aggagttagg 240 aaggaggaca taaaggtcag agtaaccgag gacagtgtat atcttgaggc aatggtgaga 300 agagaaaagg agcttgagga ggagggggcc gttaggatag aaagatatta cagtggttac 360 agaagagtca taagacttcc agaggaagtt attccagaga aggcaaaggc taagtacaat 420 aacggtgtcc ttgagataag gattccaaag aagcacccaa gcaagaggga aggagaaggc 480 ttcgaggtaa agattgaatg a 501 <210> 2 <211> 166 <212> PRT <213> Pyrococcus sp. NA2 <400> 2 Met Val Arg Arg Arg Arg Trp Asp Ile Trp Asp Pro Phe Asp Leu Ile 1 5 10 15 Arg Glu Ile Gln Glu Glu Ile Asp Ala Met Phe Asp Glu Phe Phe Ser 20 25 30 Arg Pro Arg Leu Trp Thr Tyr Arg Arg Trp Arg Glu Pro Glu Leu Tyr 35 40 45 Glu Glu Ser Ala Arg Glu Val Trp Arg Glu Pro Phe Val Asp Ile Phe 50 55 60 Asp Arg Gly Asp Glu Phe Val Ile Ile Ala Glu Leu Pro Gly Val Arg 65 70 75 80 Lys Glu Asp Ile Lys Val Arg Val Thr Glu Asp Ser Val Tyr Leu Glu 85 90 95 Ala Met Val Arg Arg Glu Lys Glu Leu Glu Glu Glu Gly Ala Val Arg 100 105 110 Ile Glu Arg Tyr Tyr Ser Gly Tyr Arg Arg Val Ile Arg Leu Pro Glu 115 120 125 Glu Val Ile Pro Glu Lys Ala Lys Ala Lys Tyr Asn Asn Gly Val Leu 130 135 140 Glu Ile Arg Ile Pro Lys Lys His Pro Ser Lys Arg Glu Gly Glu Gly 145 150 155 160 Phe Glu Val Lys Ile Glu 165 <210> 3 <211> 1908 <212> DNA <213> Thermococcus onnurineus NA1 <400> 3 atgggggaca acgagaagat taatagggaa gccctggccc ccagggagta cggagagagc 60 ttagagcttg gtattgagtt tacgacaact gaggaaatcg aagttcccga gaagcttatc 120 gaccaagtca tcggccaaga acacgcggtt gaagttatca aaactgccgc caaccagaag 180 aggcatgttc ttctgatagg cgagccggga acaggtaagt ccatgctcgg tcaggccatg 240 gccgagctgt tgccaacaga aaccctagag gatatcctcg ttttccccaa tcccgaagac 300 gagaacatgc ccaggatcaa gaccgtccct gcctgtcagg gcaggcgtat tgtagagaaa 360 taccgcgaaa aggccaagag ccaggagagc gtaaaatcct acatcctcct ctttgtcatg 420 tttaccgtta tgctcgcact tttcattgaa ttcagtgcaa ctacactcct gatggggctc 480 ttcgttgtta tacttacaat aatggccctc tccaatatgc gccttaagag tactgtcctc 540 gttcccaagc ttcttgtgga caactgcgga agaaccaaag ctcccttcat cgacgctact 600 ggcgcccacg cgggagcgct ccttggtgat gtcagacatg accccttcca gagcggtggg 660 ctcggcactc ctgcccacga gcgcgttgag ccaggaatga tacaccgcgc tcacaaggga 720 gttctcttta tagacgagat tgccacgctc agccttaaga tgcaacagag cctcctcacc 780 gccatgcagg agaagaagtt cccgataacc ggccagagtg agatgtcgag cggtgcgatg 840 gtaaggactg aacctgttcc gtgtgacttc gtcctcgtcg cggcaggaaa cctcgataca 900 gtggacaaga tgcaccctgc actccgctcg aggatcaggg gttacggtta cgaggtctac 960 atgcgcacca ccatgccgga cacgatagag aacaggcgca agctcgttca gttcgtggct 1020 caagaggtca agcgcgacgg aaaaataccc cacttcacga aggaggctgt ggaagagata 1080 gtcagagagg cccagaagag ggctggaagg aaaggtcacc tcacgctccg cctcagagac 1140 ctcggcggta tcgtcagagc tgctggtgac atagctgtca agaagggcaa gaagtacgtg 1200 gaaagggaag acgtcattga ggcagtcaaa atggccaaac ccctcgagaa gcagcttgct 1260 gactggtaca tcgagcgcaa gaaggagtac caagtcatca agactgaggg tagcgagata 1320 ggtcgcgtca acggtctggc cgtcataggc gagcagagcg gtatagtcct tccgattgaa 1380 gcagttgtcg ccccagctgc gagcaaagaa gaaggaaaga ttatagttac aggaaagctc 1440 ggcgagatag cgaaggaagc cgttcagaac gtctcggcga taatcaagag gtacaaaggt 1500 gaggacataa gccgctacga tattcacgtc cagttcctcc agacctacga gggcgttgag 1560 ggcgactcag ccagcataag cgttgccacc gctgttatct cggcccttga ggggattccg 1620 ataagacagg acgtggccat gacaggttcg ctcagtgtcc gtggcgaggt gttgccgata 1680 ggcggtgcaa caccaaagat agaggccgca atagaggctg gcataaagat ggtcataatc 1740 cccaagagca acgagaagga cgtcttcctg agcaaggaca aggccgaaaa gatccagata 1800 ttcccggtcg 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cgttcagaac gtctcggcga taatcaagag gtacaaaggt 1500 gaggacataa gccgctacga tattcacgtc cagttcctcc agacctacga gggcgttgag 1560 ggcgacgcag ccagcataag cgttgccacc gctgttatct cggcccttga ggggattccg 1620 ataagacagg acgtggccat gacaggttcg ctcagtgtcc gtggcgaggt gttgccgata 1680 ggcggtgcaa caccagcgat agaggccgca atagaggctg gcataaagat ggtcataatc 1740 cccaagagca acgagaagga cgtcttcctg agcaaggaca aggccgaaaa gatccagata 1800 ttcccggtcg agaccatcga tgaagtcctt gagatagccc tcgaggagag cgagaagaag 1860 agggagcttc tcaggaggat ccgggagacc ctgccccttt ccctttga 1908 <210> 6 <211> 635 <212> PRT <213> Thermococcus onnurineus NA1 <400> 6 Met Gly Asp Asn Glu Lys Ile Asn Arg Glu Ala Leu Ala Pro Arg Glu 1 5 10 15 Tyr Gly Glu Ser Leu Glu Leu Gly Ile Glu Phe Thr Thr Thr Glu Glu 20 25 30 Ile Glu Val Pro Glu Lys Leu Ile Asp Gln Val Ile Gly Gln Glu His 35 40 45 Ala Val Glu Val Ile Lys Thr Ala Ala Asn Gln Lys Arg His Val Leu 50 55 60 Leu Ile Gly Glu Pro Gly Thr Gly Lys Ser Met Leu Gly Gln Ala Met 65 70 75 80 Ala Glu Leu Leu Pro Thr Glu 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gacacaggaa gacttcctca aagctattga gaaagttctt 1140 ggctcggagc agaggctctc ccagcagata gccatgcacg aggtcatgta cggctga 1197 <210> 8 <211> 398 <212> PRT <213> Thermococcus onnurineus NA1 <400> 8 Met Ser Ile Glu Asp Val Gly Ile Lys Pro Ser Glu Glu Tyr Asp Asp 1 5 10 15 Tyr Ile Met Tyr Leu Lys Lys Arg Ile Arg Gln Leu Glu Leu Gln Val 20 25 30 Arg Thr Leu Glu Ala Asp Lys Glu Arg Leu Glu Arg Glu Leu Ser Arg 35 40 45 Leu Arg Met Glu Met Ser Arg Leu Arg Gln Pro Pro Ala Phe Ala Gly 50 55 60 Thr Leu Ile Glu Leu Leu Asp Glu Asp Arg Ala Ile Val Gln Asn Tyr 65 70 75 80 Asn Gly Pro Arg Phe Val Val Arg Ile Ala Pro Trp Ile Glu Arg Glu 85 90 95 Asn Leu Lys Pro Gly Ala Arg Val Ala Leu Asp Gln Arg Thr Met Ala 100 105 110 Ile Val Glu Leu Leu Pro Ser Glu Lys Asp Pro Ser Val Leu Gly Phe 115 120 125 Glu Val Ile Glu Arg Pro Thr Val Ser Tyr Asn Asp Ile Gly Gly Leu 130 135 140 Asp Lys Gln Leu Gln Glu Leu Arg Glu Ala Ile Glu Leu Pro Leu Lys 145 150 155 160 His Pro Glu Leu Phe Glu Lys Val Gly Ile Glu Pro Pro Lys Gly Val 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375 380 Arg Leu Ser Gln Gln Ile Ala Met His Glu Val Met Tyr Gly 385 390 395 <210> 9 <211> 1653 <212> DNA <213> Pyrococcus sp. NA2 furiosus DSM3638 <400> 9 atggcccagt tagcaggtca accaatctta attttgcctg aaggaaccca gagatatgtt 60 ggaagagatg cacagagaat gaacatcctt gccgctagaa tcatagcgga gaccgtcagg 120 acaacactag gtccaaaggg tatggataag atgctcgtcg acagcctcgg tgacatcgta 180 atcaccaacg atggtgcaac gattctcgat gagatggaca tccagcaccc agcagctaag 240 atgatggttg aggtcgccaa gacccaggac aaggaggccg gtgatggtac taccactgca 300 gtagtcatcg ccggtgagct cctcaagaag gctgaggagt tgctcgacca gaacatccac 360 ccaagcatag tcatcaaggg ttacatgtta gcagctgaga aggctcagga aatactcgac 420 agcatagcca aggatgttaa gccagatgat gaagagattc tcctcaaggc agcaatgaca 480 gcaataactg gaaaggccgc agaggaggag agggagtact tggcaaagct cgcagttgag 540 gccgtcaagc tcgtagcaga ggagaaggac ggcaagttca aggttgacat cgacaacatc 600 aagttagaga agaaggaggg cggagctgtt agtgacacca agctcatcag aggtgtcgtc 660 atcgacaagg aggtagttca cccaggaatg ccaaagaggg ttgagaaggc taagatcgct 720 ctcataaacg atgcactaga ggtcaaggag accgagaccg atgcagagat aaggatcaca 780 agcccagagc agctccaggc cttccttgag caggaggaga agatgctcaa ggagatggtc 840 gacaagatca aggaggtcgg agcaaatgtc gtcttcgtcc agaagggaat tgatgacctt 900 gcacagcact acctagctaa gtatggaatc ttagctgtca gaagagtcaa gaagagcgac 960 atggagaagc tcgctaaggc taccggagct aagatcgtca ccaacataag agacctaacc 1020 ccagaggacc tcggtgaggc tgagcttgtt gaggagagga aagttgcagg agagaacatg 1080 atattcgttg agggctgcaa gaaccccaag gcagtaacga tcctcattag aggtggaact 1140 gagcacgtgg ttgacgaggt cgagagggcc cttgaggatg cagtcaaggt cgtcaaggac 1200 atcctcgagg acggaaagat cgtcgccggt ggtggagcta gcgagatcga gcttgcaatt 1260 aagctagacg agtacgccaa ggaggtcggt ggtaaggagc agctcgcaat tgaggccttc 1320 gcagaggctc tcaaggtgat tccaaggaca ctagctgaga acgctggact tgacccaatc 1380 gagaccctag tgaaggtcat tgcagctcac aaggagaagg gaccaaccat cggtatcgac 1440 gtctacgagg gcgagccagc tgacatgatg gagagaggag taatcgagcc agtgagggtc 1500 aagaagcagg caatcaagag cgctagcgag gcagcgataa tgatactaag aatcgacgat 1560 gtcatcgcag cacagaagct cgagaaggag aaggaaggag agaagggagg aggaagcgag 1620 gaattcagca gcagtagcag cgacctagac tga 1653 <210> 10 <211> 550 <212> PRT <213> Pyrococcus sp. NA2 furiosus DSM3638 <400> 10 Met Ala Gln Leu Ala Gly Gln Pro Ile Leu Ile Leu Pro Glu Gly Thr 1 5 10 15 Gln Arg Tyr Val Gly Arg Asp Ala Gln Arg Met Asn Ile Leu Ala Ala 20 25 30 Arg Ile Ile Ala Glu Thr Val Arg Thr Thr Leu Gly Pro Lys Gly Met 35 40 45 Asp Lys Met Leu Val Asp Ser Leu Gly Asp Ile Val Ile Thr Asn Asp 50 55 60 Gly Ala Thr Ile Leu Asp Glu Met Asp Ile Gln His Pro Ala Ala Lys 65 70 75 80 Met Met Val Glu Val Ala Lys Thr Gln Asp Lys Glu Ala Gly Asp Gly 85 90 95 Thr Thr Thr Ala Val Val Ile Ala Gly Glu Leu Leu Lys Lys Ala Glu 100 105 110 Glu Leu Leu Asp Gln Asn Ile His Pro Ser Ile Val Ile Lys Gly Tyr 115 120 125 Met Leu Ala Ala Glu Lys Ala Gln Glu Ile Leu Asp Ser Ile Ala Lys 130 135 140 Asp Val Lys Pro Asp Asp Glu Glu Ile Leu Leu Lys Ala Ala Met Thr 145 150 155 160 Ala Ile Thr Gly Lys Ala Ala Glu Glu Glu Arg Glu Tyr Leu Ala Lys 165 170 175 Leu Ala Val Glu Ala Val Lys Leu Val Ala Glu Glu Lys Asp Gly Lys 180 185 190 Phe Lys Val Asp Ile Asp Asn Ile Lys Leu Glu Lys Lys Glu Gly Gly 195 200 205 Ala Val Ser Asp Thr Lys Leu Ile Arg Gly Val Val Ile Asp Lys Glu 210 215 220 Val Val His Pro Gly Met Pro Lys Arg Val Glu Lys Ala Lys Ile Ala 225 230 235 240 Leu Ile Asn Asp Ala Leu Glu Val Lys Glu Thr Glu Thr Asp Ala Glu 245 250 255 Ile Arg Ile Thr Ser Pro Glu Gln Leu Gln Ala Phe Leu Glu Gln Glu 260 265 270 Glu Lys Met Leu Lys Glu Met Val Asp Lys Ile Lys Glu Val Gly Ala 275 280 285 Asn Val Val Phe Val Gln Lys Gly Ile Asp Asp Leu Ala Gln His Tyr 290 295 300 Leu Ala Lys Tyr Gly Ile Leu Ala Val Arg Arg Val Lys Lys Ser Asp 305 310 315 320 Met Glu Lys Leu Ala Lys Ala Thr Gly Ala Lys Ile Val Thr Asn Ile 325 330 335 Arg Asp Leu Thr Pro Glu Asp Leu Gly Glu Ala Glu Leu Val Glu Glu 340 345 350 Arg Lys Val Ala Gly Glu Asn Met Ile Phe Val Glu Gly Cys Lys Asn 355 360 365 Pro Lys Ala Val Thr Ile Leu Ile Arg Gly Gly Thr Glu His Val Val 370 375 380 Asp Glu Val Glu Arg Ala Leu Glu Asp Ala Val Lys Val Val Lys Asp 385 390 395 400 Ile Leu Glu Asp Gly Lys Ile Val Ala Gly Gly Gly Ala Ser Glu Ile 405 410 415 Glu Leu Ala Ile Lys Leu Asp Glu Tyr Ala Lys Glu Val Gly Gly Lys 420 425 430 Glu Gln Leu Ala Ile Glu Ala Phe Ala Glu Ala Leu Lys Val Ile Pro 435 440 445 Arg Thr Leu Ala Glu Asn Ala Gly Leu Asp Pro Ile Glu Thr Leu Val 450 455 460 Lys Val Ile Ala Ala His Lys Glu Lys Gly Pro Thr Ile Gly Ile Asp 465 470 475 480 Val Tyr Glu Gly Glu Pro Ala Asp Met Met Glu Arg Gly Val Ile Glu 485 490 495 Pro Val Arg Val Lys Lys Gln Ala Ile Lys Ser Ala Ser Glu Ala Ala 500 505 510 Ile Met Ile Leu Arg Ile Asp Asp Val Ile Ala Ala Gln Lys Leu Glu 515 520 525 Lys Glu Lys Glu Gly Glu Lys Gly Gly Gly Ser Glu Glu Phe Ser Ser 530 535 540 Ser Ser Ser Asp Leu Asp 545 550

Claims (19)

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10. 서열번호 4의 론 단백질(Lon protein)을 이용한 바이러스 열안정화 방법.
11. 제 10 항에 있어서, 상기 바이러스 열안정화 방법은 서열번호 4의 론 단백질(Lon protein)을 분리하는 단계; 상기 분리된 단백질을 바이러스와 접촉하는 단계를 포함하는 바이러스 열안정화 방법.
12. 제 10 항 또는 제 11 항에 있어서, 상기 바이러스는 박테리오파지 T4인 것을 특징으로하는 바이러스 열안정화 방법.
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