KR101172593B1 - SMAP1L gene polymorphism associated with asthma - Google Patents

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Abstract

본 발명은 SMAP1L 유전자 다형성이 아스피린 과민성 천식과 연관되어 있음을 밝히고, 이를 아스피린 과민성 천식 발병 가능성 예측 또는 진단에 이용하고자 한다.The present invention discloses that the SMAP1L gene polymorphism is associated with aspirin-sensitive asthma, and is used for predicting or diagnosing the possibility of developing aspirin-sensitive asthma.

Description

천식과 관련된 SMAP1L 유전자 다형성{SMAP1L gene polymorphism associated with asthma}SMAP1L gene polymorphism associated with asthma

본 발명은 아스피린 과민성 천식과 관련된 SMAP1L 유전자 다형성에 관한 것이다.The present invention relates to SMAP1L gene polymorphisms associated with aspirin hypersensitivity asthma.

폐의 염증에 의해 발병하는 천식은 유전적 요인 및 항원과 같은 환경적 요인 간의 상호 작용에 의해 촉발된다. 아스피린 과민성 천식(aspirin-intolerant asthma)은 천식 환자가 아스피린 및 다른 비스테로이드성 항염증제(NSAIDs) 투약 후 급성 기관지 수축을 나타내는 임상적 증후군을 의미한다. 본 임상적 증후군은 에오시노필 비부동염(eosinophilic rhinosinusitis), 비용종증(nasal polyposis), 아스피린 과민성 및 천식 등의 임상적 증상을 가진다. 천식 환자 중 아스피린 과민성 천식 환자는 5-15% 정도이며, 여성들에게서 보다 잘 발병하는 것으로 알려져 있다.Asthma, caused by inflammation of the lungs, is triggered by interactions between genetic factors and environmental factors such as antigens. Aspirin-intolerant asthma refers to a clinical syndrome in which asthma patients show acute bronchial contraction after administration of aspirin and other nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs). This clinical syndrome has clinical symptoms such as eosinophilic rhinosinusitis, nasal polyposis, aspirin hypersensitivity and asthma. Aspirin-sensitive asthma patients account for 5-15% of asthma patients and are more likely to develop in women.

본 발명자들은 아스피린 과민성 천식과 SMAP1L(Stromal membrane-associated protein 1-like) 유전자 다형성 사이에 관련이 있음을 발견하고, 이를 토대로 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 다형성 마커, 상기 다형성 마커를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 키트, 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단을 위해 정보를 제공하는 방법 등 여러 응용 방안을 제공하고자 한다.The inventors found a relationship between aspirin-sensitive asthma and stromal membrane-associated protein 1-like (SMAP1L) gene polymorphism. Or we will offer a variety of applications, including diagnostic kits and methods for providing information to predict or diagnose aspirin-sensitive asthma.

본 발명의 일측면은 서열 번호 77로 기재되는 SMAP1L(Stromal membrane-associated protein 1-like) 게놈 유전자 내에서 선택되며, 번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +32,831번째이며, C 또는 T인 염기(rs2982510C>T)를 포함하는 20-100개의 연속적인 뉴클레오티드로 구성된 폴리뉴클레오티드를 포함하는 아스피린 과민성 천식(Aspirin Intolerant Asthma : AIA) 예측 또는 진단용 다형성 마커를 제공한다.One aspect of the invention is selected within the SMAP1L (Stromal membrane-associated protein 1-like) genomic gene, set forth in SEQ ID NO: 77, is +32,831 from the translation start point (2,066 base of SEQ ID NO: 77), and C or T Provided is a polymorphic marker for predicting or diagnosing Aspirin Intolerant Asthma (AIA) comprising a polynucleotide consisting of 20-100 consecutive nucleotides including a phosphorus base (rs2982510C> T).

본 발명의 다른 일측면은 서열 번호 77로 기재되는 SMAP1L(Stromal membrane-associated protein 1-like) 게놈 유전자 내에서 선택되며, 번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +40,160번째이며, T 또는 G인 염기(rs2294752T>G)를 포함하는 20-100개의 연속적인 뉴클레오티드로 구성된 폴리뉴클레오티드를 포함하는 아스피린 과민성 천식(Aspirin Intolerant Asthma : AIA) 예측 또는 진단용 다형성 마커를 제공한다.Another aspect of the invention is selected within the Smalmal membrane-associated protein 1-like (SMAP1L) genomic gene, set forth in SEQ ID NO: 77, is + 40,160th from the translation start point (2,066th base of SEQ ID NO: 77), T or Provided is a polymorphic marker for predicting or diagnosing Aspirin Intolerant Asthma (AIA) comprising a polynucleotide consisting of 20-100 contiguous nucleotides comprising a base that is G (rs2294752T> G).

본 발명의 또 다른 일측면은 상기 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 다형성 마커를 증폭시킬 수 있는 프라이머(primer)를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 키트를 제공한다.Another aspect of the present invention provides a kit for predicting or diagnosing aspirin-sensitive asthma, including a primer capable of amplifying the aspirin-sensitive asthma predictive or diagnostic polymorphic marker.

본 발명의 또 다른 일측면은 상기 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 다형성 마커를 검출할 수 있는 프로브(probe)를 포함하는 아스피린 과민성 천식 진단 키트를 제공한다.Another aspect of the present invention provides an aspirin-sensitive asthma diagnosis kit comprising a probe capable of detecting the aspirin-sensitive asthma predictive or diagnostic polymorphic marker.

본 발명의 또 다른 일측면은 대상으로부터 분리된 혈액 시료로부터 게놈 DNA를 추출하는 단계; 상기 단계에서 추출한 게놈 DNA 상에 존재하는 상기 다형성 마커를 검출하는 단계; 상기 단계에서 얻은 다형성 마커 검출 결과와 정상군의 다형성 부위 검출 결과를 비교하는 단계를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단을 위해 정보를 제공하는 방법을 제공한다.Another aspect of the present invention comprises the steps of extracting genomic DNA from a blood sample isolated from the subject; Detecting the polymorphic marker present on the genomic DNA extracted in the step; The present invention provides a method for providing information for predicting or diagnosing aspirin-sensitive asthma, including comparing the polymorphic marker detection result obtained in the step with the polymorphic site detection result of the normal group.

본 발명자들은 SMAP1L 유전자 다형성이 아스피린 과민성 천식과 긴밀한 연관이 있음을 확인하였으며, 이러한 연관성은 아스피린 과민성 천식 발병 가능성 예측 또는 진단에 유용하게 이용될 수 있다. 예를 들어, 상기 SMAP1L 유전자 다형성 부위를 포함하는 폴리뉴클레오티드를 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 다형성 마커에 이용할 수 있으며, 상기 다형성 마커를 증폭시킬 수 있는 프라이머 또는 검출할 수 있는 프로브를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 키트로 응용 가능하다. 또한 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단을 위해 정보를 제공하는 방법에 이용할 수 있다.The present inventors have confirmed that the SMAP1L gene polymorphism is closely associated with aspirin-sensitive asthma, and this association can be usefully used for predicting or diagnosing aspirin-sensitive asthma. For example, a polynucleotide comprising the SMAP1L gene polymorphism site can be used for aspirin hypersensitivity asthma prediction or diagnostic polymorphism markers, and aspirin hypersensitivity asthma prediction including a primer capable of amplifying the polymorphic marker or a detectable probe Or as a diagnostic kit. It can also be used to provide information for predicting or diagnosing aspirin-sensitive asthma.

도 1 내지 3은 SMAP1L 유전자의 지도, 일배체형(haplotype) 및 LD를 나타낸다.
도 1은 염색체(chromosome) 1p35.3-p34.1 상 SMAP1L 유전자의 개략적인 유전자 지도 및 SNP(단일 염기 다형성)이다. 검은색 블록은 코딩 엑손(exon)을 나타내며, 흰색 블록은 5'UTR과 3'UTR을 나타낸다. UTR은 번역되지 않은 영역을 의미하며, 번역 사이트의 첫 번째 뉴클레오타이드는 +1로 언급된다.
도 2는 SMAP1L 유전자의 일배체형(haplotype)이다.
도 3은 SMAP1L SNP의 LD 계수(|D'|)이다.
1 to 3 show maps, haplotypes, and LDs of the SMAP1L gene.
1 is a schematic genetic map and SNP (single nucleotide polymorphism) of the SMAP1L gene on chromosome 1p35.3-p34.1. Black blocks represent coding exons and white blocks represent 5'UTR and 3'UTR. UTR refers to the untranslated region and the first nucleotide of the translation site is referred to as +1.
2 is a haplotype of the SMAP1L gene.
3 is the LD coefficient (| D '|) of the SMAP1L SNP.

천식은 평활근(smooth muscle) 기능 장애에 의해서뿐만 아니라 천식 발병의 새로운 기도 리모델링, 구체적으로, 기도 염증 반응에 의해 야기 된다고 알려져 있다. 더욱이, 달라진 운송 및 소실된 기도 반응성은 알러지성 기도 리모델링의 원인이 된다.Asthma is known to be caused not only by smooth muscle dysfunction but also by new airway remodeling of asthma development, specifically airway inflammatory responses. Moreover, altered transport and lost airway reactivity are responsible for allergic airway remodeling.

세포 내 신호전달 단백질의 수는 천식 발병에 관여하는 염증 과정의 원인이 되고, 이러한 단백질은 천식 치료를 위한 타겟이 된다. 염증 반응과 관련된 여러 요소들은 계면 활성 물질의 작용을 방해하는 기도의 단백질 침입과 관계 있다. 천식에서 폐포 계면 활성 물질의 세포 내 저장 능력 및 물리적 활성이 방해될 때, 이의 합성이 방해된다.
The number of intracellular signaling proteins is responsible for the inflammatory processes involved in asthma development, and these proteins are targets for the treatment of asthma. Several factors involved in the inflammatory response are related to protein invasion of the airways that interferes with the action of surfactants. When asthma interferes with the cellular storage capacity and physical activity of alveolar surfactants, their synthesis is hindered.

올비올라 타입 Ⅱ(alveolar type, ATⅡ) 세포는 계면-활성 리포프로테인(lipoprotein) 복합체인 폐포 계면 활성 물질을 합성한다. 많은 호르몬, 약학적 제제 및 생리화학적 요소들이 ATⅡ 세포에서 폐포 계면 활성 물질을 증가시키거나 감소시킨다고 알려져 있다. ATⅡ 세포에서의 엔도시토시스(endositosis)는 관련된 단백질 라멜라체(lamellar bodies, LB)의 재순환 또는 세포 외 공간에서의 계면 활성 물질 흡수(uptake)와 관련 있다. 특히, 이는 클라트린에 의존하는 계면 활성 물질의 흡수와 관련 있다.Alveolar type II (ATII) cells synthesize alveolar surfactant, which is an interfacial-active lipoprotein complex. Many hormones, pharmaceutical agents and physiochemical elements are known to increase or decrease alveolar surfactants in ATII cells. Endositosis in ATII cells is associated with the recycling of related protein lamellar bodies (LB) or uptake of surfactant in the extracellular space. In particular, this relates to the absorption of surfactants that depend on clathrin.

한편, Ca2 +는 내피 세포 타입에서 엔도시토시스와 관련 있을 수 있다, Ca2 +는 다른 세포 유형에서 클라트린의 축적을 개시하는 단백질 복합체 형성을 매개한다. 또한 상피 세포에서의 Ca2 + 농도 변화는 엔도시토시스를 조절함으로써 플라즈마 막의 단백질 조성을 조정한다. ATⅡ 세포에서의 Ca2 + 농도 상승은 엔소시토시스(exocytosis)를 촉발할 뿐만 아니라, 엔도시토시스 메커니즘에 맞선다. 결국 ATⅡ 세포는 물리적인 압력를 느끼고, Ca2 + 의존 계면 활성 물질 방출에 반응한다. 이러한 사실들은 엔도시토시스가 방해되면 계면 활성 물질 기능이 방해된다는 것을 나타낸다.
On the other hand, Ca 2 + may be associated with endocytosis in endothelial cell type, the Ca 2 + is mediated protein complexing to start the accumulation of Cloud trim in different cell types. In addition, Ca 2 + concentration change in the epithelial cell plasma membrane protein composition is adjusted by controlling the endocytosis. Ca 2 + concentration in the cell ATⅡ rise yen, as well as trigger the SAT SOCIETE sheath (exocytosis), matseonda the endocytosis mechanism. After ATⅡ cells respond to physical apryeokreul feel, Ca + 2-dependent surface-active substance release. These facts indicate that disruption of endocytosis disrupts the function of surfactant materials.

SMAP1L(stromal membrane-associated protein 1 like)은 SMAP2로도 알려져 있으며, GAP(GTPase-activating protein) 활성을 나타내고, 클라트린(clathrin) 중쇄 및 CALM(clathrin assembly lymphoid-myeloid)과 상호 작용한다. SMAP1L은 초기 엔도솜(endosome)/트랜스-골지 네트워크(TGN)에서 클라트린 AP-1 및 EpsinR을 위한 어댑터 단백질과 공-배치(co-lacalize)된다. 또한 SMAP1L 과발현은 TGN에 TGN38/46 분자의 축적을 지연시킨다. 이러한 사실은 SMAP1L이 클라트린- 및 AP-1-의존 방법에서 초기 엔도솜-TGN 경로에 작용한다는 것을 나타낸다. SMAP1L (stromal membrane-associated protein 1 like), also known as SMAP2, exhibits GAP (GTPase-activating protein) activity and interacts with clathrin heavy chain and clathrin assembly lymphoid-myeloid (CALM). SMAP1L is co-lacalized with adapter proteins for clathrin AP-1 and EpsinR in the early endosomal / trans-Golgi network (TGN). SMAP1L overexpression also delays the accumulation of TGN38 / 46 molecules in TGN. This fact indicates that SMAP1L acts on the early endosomal-TGN pathway in clathrin- and AP-1-dependent methods.

SMAP1L 유전자는 SMAP1의 상동체로서, 최근에 발견되어, 그 기능 및 메커니즘이 정확히 알려지지 않았다. 이는 엔도시토시스와 관련 있으며, 천식을 예로 들 수 있는 여러 질환과 관련된 분자의 분비에 중요한 역할을 한다. 구체적으로, SMAP1L 유전자는 클라트린(clathrin)과 직접적으로 상호 작용하며, 플라즈마 막에서 트랜스페린(transferrin) 수용체의 클라트린-의존 엔도시토시스를 조절한다. 클라트린과 SMAP1L의 직접적인 상호 작용을 고려할 때, SMAP1L 다형성은 아스피린 과민성 천식과 같은 천식 및 그 표현형과 관련 있을 것으로 여겨진다.
The SMAP1L gene is a homologue of SMAP1, recently discovered, and its function and mechanism are not exactly known. It is associated with endocytosis and plays an important role in the secretion of molecules associated with various diseases, such as asthma. Specifically, the SMAP1L gene interacts directly with clathrin and regulates clathrin-dependent endocytosis of the transferrin receptor in the plasma membrane. Given the direct interaction of clathrin with SMAP1L, the SMAP1L polymorphism is believed to be related to asthma and its phenotypes, such as aspirin-sensitive asthma.

본 발명은 SMAP1L 유전자 다형성이 아스피린 과민성 천식과 관련 있음을 밝혀 이에, SMAP1L 유전자 다형성 마커를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 다형성 마커를 제공한다. 본 발명의 다른 일측면은 SMAP1L 유전자 다형성 마커를 포함하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 다형성 마커를 제공한다. The present invention reveals that the SMAP1L gene polymorphism is associated with aspirin-sensitive asthma, and thus provides a polymorphic marker for predicting or diagnosing aspirin-sensitive asthma including the SMAP1L gene polymorphism marker. Another aspect of the invention provides a polymorphic marker for aspirin hypersensitivity asthma prediction or diagnosis comprising a polynucleotide comprising a SMAP1L gene polymorphism marker.

본 발명자들은 바이오테크놀로지 정보 국립 센터(National Center for Biotechnology Information)(build 36)에서 SMAP1L 게놈 염기 서열(Accession No. NT_032977.9)을 입수하였다.The inventors obtained SMAP1L genomic sequence (Accession No. NT_032977.9) from the National Center for Biotechnology Information (build 36).

본 발명의 일측면에서, 상기 SMAP1L 유전자 다형성 마커는 서열 번호 77로 기재되는 SMAP1L(Stromal membrane-associated protein 1-like) 게놈 유전자 내에서 선택되며, 번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +32,831번째이며, C 또는 T인 염기(rs2982510C>T)를 포함할 수 있다.In one aspect of the invention, the SMAP1L gene polymorphism marker is selected from within the SMAP1L (Stromal membrane-associated protein 1-like) genomic gene as set forth in SEQ ID NO: 77, and from the translation start point (2,066 base of SEQ ID NO: 77) And a base (rs2982510C> T) which is 32,831 th and C or T.

본 발명의 일측면에서, 상기 SMAP1L 유전자 다형성 마커는 서열 번호 77로 기재되는 SMAP1L(Stromal membrane-associated protein 1-like) 게놈 유전자 내에서 선택되며, 번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +40,160번째이며, T 또는 G인 염기(rs2294752T>G)를 포함할 수 있다.In one aspect of the invention, the SMAP1L gene polymorphism marker is selected from within the SMAP1L (Stromal membrane-associated protein 1-like) genomic gene as set forth in SEQ ID NO: 77, and from the translation start point (2,066 base of SEQ ID NO: 77) 40th and 160th, and may include a base (rs2294752T> G) that is T or G.

본 발명의 일측면에서, 상기 SMAP1L 유전자 다형성 마커를 포함하는 폴리뉴클레오티드는 서열 번호 77로 기재되는 SMAP1L(Stromal membrane-associated protein 1-like) 게놈 유전자 내에서 선택되며, 번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +32,831번째이며, C 또는 T인 염기(rs2982510C>T) 또는 번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +40,160번째이며, T 또는 G인 염기(rs2294752T>G)를 포함하는 20-100개의 연속적인 뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 본 발명의 다른 일측면에서 상기 폴리뉴클레오티드는 서열 번호 77로 기재되는 SMAP1L(Stromal membrane-associated protein 1-like) 게놈 유전자 내에서 선택되며, 번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +32,831번째이며, C 또는 T인 염기(rs2982510C>T) 또는 번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +40,160번째이며, T 또는 G인 염기(rs2294752T>G)를 포함하는 20-30개의 연속적인 뉴클레오티드를 포함할 수 있다.In one aspect of the invention, the polynucleotide comprising the SMAP1L gene polymorphism marker is selected within the SMAP1L (Stromal membrane-associated protein 1-like) genomic gene as set forth in SEQ ID NO: 77, and the translation start point (2,066 of SEQ ID NO: 77). The base is +32,831 from the base) and includes a base (rs2982510C> T) that is C or T or a base that is +40,160 from the start of translation (2,066 base in SEQ ID NO: 77) and a T or G (rs2294752T> G) It may contain 20-100 consecutive nucleotides. In another aspect of the invention the polynucleotide is selected from within the SMAP1L (Stromal membrane-associated protein 1-like) genomic gene, set forth in SEQ ID NO: 77, and +32,831 from the translation start point (2,066 base of SEQ ID NO: 77) 20-30 contiguous nucleotides comprising a base that is C or T (rs2982510C> T) or a + 40,160th base from the translation start point (2,066 base in SEQ ID NO: 77) and a base that is T or G (rs2294752T> G) It may include.

본 발명의 일측면은 상기 다형성 마커를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 조성물을 제공한다. 본 발명의 다른 일측면은 상기 다형성 마커를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 의료 또는 약학 조성물을 제공한다.
One aspect of the invention provides a composition for predicting or diagnosing aspirin hypersensitivity asthma comprising the polymorphic marker. Another aspect of the invention provides a medical or pharmaceutical composition for predicting or diagnosing aspirin-sensitive asthma comprising the polymorphic marker.

본 발명은 상기 SMAP1L 유전자 다형성 마커를 증폭시킬 수 있는 프라이머를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 키트를 제공한다.The present invention provides a kit for aspirin hypersensitivity asthma prediction or diagnosis comprising a primer capable of amplifying the SMAP1L gene polymorphism marker.

본 발명의 일측면에서, 상기 SMAP1L 유전자 다형성을 증폭시키는데 사용되는 키트 내의 프라이머는 상기 SMAP1L 유전자 다형성을 증폭시킬 수 있는 것은 모두 포함할 수 있다. 본 발명의 다른 일측면에서 상기 SMAP1L 유전자 다형성을 증폭시키는데 사용되는 키트 내의 프라이머는 서열번호 1 내지 76으로 기재되는 염기 서열 중 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In one aspect of the invention, the primers in the kit used to amplify the SMAP1L gene polymorphism may include any that can amplify the SMAP1L gene polymorphism. In another aspect of the present invention, the primer in the kit used to amplify the SMAP1L gene polymorphism may be one or more of the nucleotide sequences set forth in SEQ ID NOs: 1 to 76, but is not limited thereto.

본 발명의 다른 일측면에서, 상기 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 키트는 다른 단일 염기 다형성(SNP)을 증폭시키는데 사용되는 프라이머를 더 포함할 수 있다. 본 발명의 또 다른 일측면에서, 상기 키트는 다형성 마커를 이용하는 방법이 기재된 지시서를 더 포함할 수 있다.In another aspect of the invention, the aspirin-sensitive asthma prediction or diagnostic kit may further comprise a primer used to amplify another single base polymorphism (SNP). In another aspect of the invention, the kit may further comprise instructions describing how to use the polymorphic marker.

본 발명의 일측면에서, 상기 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 키트는 상기 다형성 마커를 검출할 수 있는 프로브(probe)를 포함할 수 있다. 본 발명의 다른 일측면에서, 상기 다형성 마커를 검출할 수 있는 프로브는 서열번호 1 내지 76으로 기재되는 염기 서열 중 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
In one aspect of the invention, the aspirin-sensitive asthma prediction or diagnostic kit may comprise a probe (probe) that can detect the polymorphic marker. In another aspect of the present invention, the probe capable of detecting the polymorphic marker may be one or more of the nucleotide sequences set forth in SEQ ID NOs: 1 to 76, but is not limited thereto.

발명의 일측면은 대상으로부터 분리된 혈액 시료로부터 게놈 DNA를 추출하는 단계; 상기 단계에서 추출한 게놈 DNA 상에 존재하는 상기 다형성 마커를 검출하는 단계; 상기 단계에서 얻은 다형성 마커 검출 결과와 정상군의 다형성 부위 검출 결과를 비교하는 단계를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단을 위해 정보를 제공하는 방법을 제공한다.One aspect of the invention comprises the steps of extracting genomic DNA from a blood sample isolated from the subject; Detecting the polymorphic marker present on the genomic DNA extracted in the step; The present invention provides a method for providing information for predicting or diagnosing aspirin-sensitive asthma, including comparing the polymorphic marker detection result obtained in the step with the polymorphic site detection result of the normal group.

본 발명의 일측면 중 상기 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단을 위해 정보를 제공하는 방법에서, 대상의 혈액, 타액, 머리카락, 피부 등 가능한 모든 출처로부터 대상의 DNA를 획득할 수 있다.In one aspect of the present invention, a method for providing information for predicting or diagnosing aspirin-sensitive asthma may obtain DNA of a subject from all possible sources such as blood, saliva, hair, and skin of the subject.

본 발명의 일측면 중 상기 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단을 위해 정보를 제공하는 방법에서, 혈액 시료로부터 게놈 DNA를 추출하는 단계는 통상적인 게놈 DNA를 추출하는 방법에 의할 수 있다.In one aspect of the present invention, the method for providing information for predicting or diagnosing aspirin-sensitive asthma may include extracting genomic DNA from a blood sample.

본 발명의 일측면 중 상기 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단을 위해 정보를 제공하는 방법에서, 다형성 마커를 검출하는 단계는 시퀀싱 분석, 마이크로어레이(microarray)에 의한 혼성화, 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 다이나믹 대립 유전자 혼성화 방법(dynamic allele-specific hybridization, DASH), PCR 연장 분석 및 TaqMan 기법 중 어느 하나에 의해 수행될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 상기 방법들은 염기 서열 결정을 위한 통상적인 방법을 사용할 수 있으며, 자동화된 유전자 분석기를 이용하여 수행될 수 있다.In one aspect of the present invention, in the method for providing information for predicting or diagnosing aspirin-sensitive asthma, detecting the polymorphic marker may include sequencing analysis, hybridization by microarray, and allele specific PCR. ), Dynamic allele-specific hybridization (DASH), PCR extension analysis, and TaqMan technique, but are not limited thereto. The methods can use conventional methods for sequencing and can be performed using an automated genetic analyzer.

본 발명의 일측면 중 상기 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단을 위해 정보를 제공하는 방법에서, 다형성 마커 검출 결과와 정상군의 다형성 부위 검출 결과를 비교하는 단계는 통상적인 비교 방법, 예를 들어 통계적 방법에 의할 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니다.
In a method of providing information for predicting or diagnosing aspirin-sensitive asthma in one aspect of the present invention, comparing the polymorphic marker detection result with the detection of the polymorphic site of the normal group in a conventional comparison method, for example, a statistical method. It may be, but is not limited to.

본 발명의 또 다른 일측면은 상기 SMAP1L 유전자 다형성 발현 촉진제 또는 억제제를 유효 성분으로 포함하는 아스피린 과민성 천식 억제 또는 치료용 조성물을 제공한다. 상기 SMAP1L 유전자 다형성 발현 촉진제를 유효 성분으로 포함하는 아스피린 과민성 천식 억제 또는 치료용 조성물에서, 상기 촉진제는 일반적으로 상기 SMAP1L 유전자 다형성 발현을 촉진할 수 있는 물질을 모두 포함한다. 상기 SMAP1L 유전자 다형성 발현 억제제를 유효 성분으로 포함하는 아스피린 과민성 천식 억제 또는 치료용 조성물에서, 상기 억제제는 일반적으로 상기 SMAP1L 유전자 다형성 발현을 억제할 수 있는 물질을 모두 포함한다. 상기 물질들은 예를 들어 천연물에서 추출되거나 인공적으로 합성된 것일 수 있다.Another aspect of the present invention provides a composition for inhibiting or treating aspirin-sensitive asthma including the SMAP1L gene polymorphism expression promoter or inhibitor as an active ingredient. In a composition for inhibiting or treating aspirin-sensitive asthma containing the SMAP1L gene polymorphism expression promoter as an active ingredient, the promoter generally includes all substances capable of promoting the expression of the SMAP1L gene polymorphism. In a composition for inhibiting or treating aspirin-sensitized asthma comprising the SMAP1L gene polymorphism expression inhibitor as an active ingredient, the inhibitor generally includes all substances capable of inhibiting the expression of the SMAP1L gene polymorphism. The materials can be extracted from natural products or artificially synthesized, for example.

본 발명의 다른 일측면에서 상기 아스피린 과민성 천식 억제 또는 치료용 조성물은 방부제, 안정화제, 수화제 또는 유화 촉진제, 삼투압 조절을 위한 염 및/또는 완충제 등의 약제학적 보조제 및 기타 치료적으로 유용한 물질을 추가로 함유할 수 있으며, 통상적인 방법에 따라 다양한 경구 투여제 또는 비경구 투여제 형태로 제형화할 수 있다. 또한, 상기 유효 성분의 약제학적으로 허용 가능한 용량, 즉 투여량은 치료 받을 대상의 연령, 성별, 체중, 치료할 특정 질환 또는 병리 상태, 질환 또는 병리 상태의 심각도, 투여 경로 및 처방자의 판단에 따라 달라질 것이다. 이러한 인자에 기초한 투여량 결정은 당업자의 수준 내에 있다.In another aspect of the present invention, the composition for inhibiting or treating aspirin-sensitized asthma may be added to pharmaceutical supplements such as preservatives, stabilizers, hydrates or emulsifiers, salts and / or buffers for controlling osmotic pressure, and other therapeutically useful substances. And may be formulated in various oral or parenteral dosage forms according to conventional methods. In addition, the pharmaceutically acceptable dose, ie dosage, of the active ingredient will vary depending on the age, sex, weight of the subject to be treated, the particular disease or pathology to be treated, the severity of the disease or pathology, the route of administration and the judgment of the prescriber. will be. Dosage determination based on these factors is within the level of skill in the art.

본 발명의 또 다른 일측면은 시험 물질이 상기 SMAP1L 유전자 다형성 발현을 촉진 또는 억제하는지 확인하는 단계를 포함하는 아스피린 과민성 천식 억제 또는 치료용 조성물 스크리닝 방법을 제공한다. 상기 아스피린 과민성 천식 억제 또는 치료용 조성물 스크리닝 방법에서, 상기 시험 물질은 아스피린 과민성 천식 억제 또는 치료용 조성물로 이용될 가능성이 있는 모든 물질을 포함한다. 본 발명의 다른 일측면에서, 상기 스크리닝 방법은 상기 시험 물질을 상기 SMAP1L 유전자 다형성에 당업계의 통상적인 방법으로 처리, 결합 내지 반응시키는 단계를 더 포함할 수 있다. 본 발명의 또 다른 일측면의 스크리닝 방법에서, 상기 시험 물질이 상기 SMAP1L 유전자 다형성 발현을 촉진 또는 억제하는 경우 아스피린 과민성 천식 억제 또는 치료용 조성물로 이용 가능하다고 판단하는 단계를 더 포함할 수 있다. 본 발명의 또 다른 일측면의 스크리닝 방법에서, 상기 시험 물질이 상기 SMAP1L 유전자 다형성 발현을 억제 또는 촉진하는 경우 그 데이터를 아스피린 과민성 천식 억제 또는 치료용 조성물로의 이용 가능성에 대한 보조적 판단 자료로 사용할 수 있다.Another aspect of the present invention provides a method for screening a composition for inhibiting or treating aspirin-sensitive asthma, including confirming whether a test substance promotes or inhibits expression of the SMAP1L gene polymorphism. In the screening method for inhibiting or treating aspirin-sensitive asthma, the test substance includes all substances that are likely to be used as compositions for inhibiting or treating aspirin-sensitive asthma. In another aspect of the invention, the screening method may further comprise the step of treating, binding or reacting the test substance to the SMAP1L gene polymorphism in a conventional manner in the art. In another aspect of the screening method of the present invention, when the test substance promotes or inhibits the expression of the SMAP1L gene polymorphism, the method may further include determining that it is usable as a composition for inhibiting or treating aspirin-sensitive asthma. In another aspect of the screening method of the present invention, when the test substance inhibits or promotes expression of the SMAP1L gene polymorphism, the data may be used as an adjuvant judgment data on the availability of the aspirin-sensitive asthma inhibitor or its therapeutic composition. have.

본 발명의 일측면에서, 상기 개시된 것 외에도 상기 SMAP1L 유전자 다형성이 아스피린 과민성 천식 발병과 긴밀한 연관이 있음을 토대로 이를 아스피린 과민성 천식의 예측, 진단, 조절, 제어를 위한 다양한 발명에로의 응용이 가능하다.
In one aspect of the present invention, since the SMAP1L gene polymorphism is closely related to the development of aspirin-sensitive asthma, in addition to the above, it is possible to apply it to various inventions for predicting, diagnosing, regulating, and controlling aspirin-sensitive asthma. .

본 발명의 일측면에서, 상기 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 다형성 마커, 상기 다형성 마커를 증폭시킬 수 있는 프라이머 또는 검출할 수 있는 프로브를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 키트, 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단을 위해 정보를 제공하는 방법, 아스피린 과민성 천식 억제 또는 치료용 조성물 및 아스피린 과민성 천식 억제 또는 치료용 조성물 스크리닝 방법은 동물 뿐만 아니라 사람에게도 적용 가능하다. 즉, 본 발명의 적용 대상은 동물 또는 사람일 수 있다.
In one aspect of the invention, the aspirin hypersensitivity asthma prediction or diagnostic polymorphism markers, aspirin hypersensitivity asthma prediction or diagnostic kit comprising a primer or a probe that can amplify the polymorphic marker, aspirin hypersensitivity asthma prediction or diagnosis Methods for providing hazard information, compositions for inhibiting or treating aspirin-sensitive asthma and screening compositions for inhibiting or treating aspirin-sensitive asthma are applicable to humans as well as animals. That is, the object of application of the present invention may be an animal or a human.

이하, 시험예를 들어 본 발명의 구성 및 효과를 보다 구체적으로 설명한다. 그러나 이들 시험예는 본 발명에 대한 이해를 돕기 위해 예시의 목적으로만 제공된 것일 뿐 본 발명의 범주 및 범위가 하기 시험예에 의해 제한되는 것은 아니다.
Hereinafter, the configuration and effects of the present invention will be described in more detail with reference to test examples. However, these test examples are provided only for the purpose of illustration to help the understanding of the present invention is not limited to the scope and scope of the present invention.

[시험예][Test Example]

1. 시험 대상 선정 및 분석1. Selection and analysis of test target

본 시험을 위해 총 592명의 대상자를 선정하였다. 본 대상자들은 모두 GINA 기준에 따라 천식으로 진단된 자들이다. 각 환자는 기관지 확장제(bronchodilator) 흡입으로 1초간 강행성 호기 용적인 FEV1이 15% 이상 증가하였고/하였거나, P20 메타콜린의 자극성 농도에 과반응성을 나타냈다. 고혈압/당뇨 환자와 안지오텐신 전환 효소(ACE) 저해제 복용자는 배제되었다. 대상자 중 시험군(163명)은 천식 환자 중에서도 아스피린 과민성 천식 환자로 진단된 자이며, 대조군(429명)은 아스피린 과민성이 아닌 것으로 진단된 천식 환자이다. 이들의 특징은 아래 표 1에 요약하였다. A total of 592 subjects were selected for this test. All of these subjects were diagnosed with asthma according to GINA criteria. Each patient had an increased expiratory volume of FEV 1 by more than 15% for one second with bronchodilator inhalation and / or overreacted to stimulating concentrations of P20 methacholine. Patients with hypertension / diabetes and those taking angiotensin converting enzyme (ACE) inhibitors were excluded. Of the subjects, the test group (163 patients) were diagnosed as aspirin-sensitive asthma patients among asthmatic patients, and the control group (429 patients) were asthmatic patients diagnosed as not aspirin-sensitive. Their characteristics are summarized in Table 1 below.

전체all 시험군Test group 대조군Control group 인원(명)Number of people 592592 163163 429429 발병 연령(평균)Age of onset (average) 46.1546.15 43.13*43.13 * 47.3047.30 성별(남/녀)Gender (male / female) 206/386206/386 59/10459/104 147/282147/282 체중(kg)Weight (kg) 62.81±0.8462.81 ± 0.84 61.25±0.3861.25 ± 0.38 63.40±0.9763.40 ± 0.97 흡연자 비율(%)% Of smokers 27.7027.70 21.47*21.47 * 30.0730.07 아스피린 투약 후 FEV1 하락%FEV 1 Decrease After Aspirin Dosing 9.27±13.249.27 ± 13.24 24.63±16.11**24.63 ± 16.11 ** 3.54±4.853.54 ± 4.85 혈액 에오시노필(%)Blood Eosinophil (%) 6.01±5.736.01 ± 5.73 5.96±5.215.96 ± 5.21 6.03±5.926.03 ± 5.92 FEV1(예측된 %)FEV 1 (% predicted) 90.54±6.9790.54 ± 6.97 90.35±14.04*90.35 ± 14.04 * 91.66±16.8791.66 ± 16.87 PC20 메타콜린(mg/ml)PC20 Methacholine (mg / ml) 6.43±8.676.43 ± 8.67 5.02±7.83*5.02 ± 7.83 * 6.91±8.906.91 ± 8.90 총 IgE(IU/ml)Total IgE (IU / ml) 357.65±604.09357.65 ± 604.09 348.60±596.44348.60 ± 596.44 361.00±607.56361.00 ± 607.56 피부 테스트 양성 비율(%)Skin test positive rate (%) 56.4256.42 52.7652.76 57.8157.81

*P < 0.05, **P< 0.0001(대조군 대비)
* P <0.05, ** P <0.0001 (vs. control)

상기 표 1에서 볼 수 있듯이, 시험군의 아스피린 투약 후 FEV1 하락%가 대조군에 비해 높았다(P<0.0001). 또한 발병 연령, 체중, 예측된 FEV1%, PC20 메타콜린 및 흡연자 비율 면에서 양 그룹은 차이가 있었다.
As shown in Table 1, the percent decrease in FEV 1 after the administration of aspirin in the test group was higher than that of the control group (P <0.0001). There were also differences between the two groups in terms of age of onset, body weight, predicted FEV 1 %, and PC20 methacholine and smoker rates.

2. SNP(single nucleotide polymorphism) 동정 및 유전자형 결정(genotyping)2. Identification of single nucleotide polymorphism (SNP) and genotyping

(1) SMAP1L 변이의 분포(1) Distribution of SMAP1L Mutations

바이오테크놀로지 정보 국립 센터(National Center for Biotechnology Information)(build 36)의 대상자들의 SMAP1L SNP 유전자형을 결정하였다. 게놈 DNA는 젠트라 퓨어진 키트(Gentra Puregene kit (Minneapolis, MN))를 사용하여, 제조사의 프로토콜에 따라 추출하였다. 유전자형 결정은 ABI 프리즘 7900HT 시퀀스 탐지 시스템(ABI prism 7900HT sequence detection system)(바이오시스템즈, CA, USA 제공)에서 택맨(TaqMan) 분석법을 사용하여 20ng의 게놈 DNA로 수행되었다. 유전자형 결정 데이터는 ABI-PRISM 시퀀스 탐지 시스템(SDS) 소프트웨어 버전 2.3을 사용하여 얻었다. 보유 데이터의 유전자형 결정 품질은 0.25에 맞춰졌다. SMAP1L에서 표 2의 프로브 시퀀스(probe sequence)로 골든 게이트 분석법(Golden Gate assay)를 이용하여 총 19개의 SNP의 유전자형을 결정하였다. 골든 게이트 분석법은 대립형질을 연장 및 리게이션(ligation)하고, primer로 증폭시킨 후 Universal IlluminaCode Assay에 혼성화(Hybridization)하여 이루어진다.SMAP1L SNP genotypes of subjects of the National Center for Biotechnology Information (build 36) were determined. Genomic DNA was extracted using the Gentra Puregene kit (Minneapolis, Minn.) According to the manufacturer's protocol. Genotyping was performed with 20 ng of genomic DNA using a TaqMan assay in an ABI prism 7900HT sequence detection system (Biosystems, Calif., USA). Genotyping data was obtained using ABI-PRISM Sequence Detection System (SDS) software version 2.3. The genotyping quality of the retention data was set at 0.25. In the SMAP1L, genotypes of 19 SNPs were determined using a Golden Gate assay with the probe sequences of Table 2. Golden gate analysis is performed by extending and ligation of alleles, amplifying with primers and hybridizing to Universal IlluminaCode Assay.

Figure 112010028972564-pat00001
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SMAP1L에서 결정한 총 19개의 SNP의 유전자형 결과는 아래 표 3과 같다. Genotype results of a total of 19 SNPs determined by SMAP1L are shown in Table 3 below.

SNPSNP IDID 대립형질Allele 위치location 빈도frequency 이형접합성Release Bondability HWEHWE rs209573rs209573 C>GC> G 프로모터Promoter 0.3040.304 0.4230.423 0.3130.313 rs1391315rs1391315 T>GT> G 인트론1Intron 1 0.1320.132 0.2290.229 0.5130.513 rs209584rs209584 A>GA> G 인트론1Intron 1 0.0820.082 0.1510.151 0.9000.900 rs383228rs383228 A>CA> C 인트론1Intron 1 0.3040.304 0.4230.423 0.3130.313 rs12566885rs12566885 A>GA> G 인트론1Intron 1 0.0900.090 0.1640.164 0.1310.131 rs209598rs209598 G>AG> A 인트론1Intron 1 0.3400.340 0.4490.449 0.1800.180 rs4660407rs4660407 G>CG> C 인트론1Intron 1 0.1690.169 0.2810.281 0.2500.250 rs2982506rs2982506 G>AG> A 인트론1Intron 1 0.0600.060 0.1130.113 0.5930.593 rs393985rs393985 A>GA> G 인트론1Intron 1 0.1710.171 0.2830.283 0.9350.935 rs16827275rs16827275 C>TC> T 인트론1Intron 1 0.1240.124 0.2170.217 0.8270.827 rs16827276rs16827276 C>TC> T 인트론1Intron 1 0.1320.132 0.2290.229 0.5130.513 rs2982510rs2982510 C>TC> T 인트론2Intron 2 0.3090.309 0.4270.427 0.6820.682 rs4660409rs4660409 C>TC> T 인트론4Intron 4 0.1510.151 0.2560.256 0.3940.394 rs16827291rs16827291 G>AG> A 인트론4Intron 4 0.3090.309 0.4270.427 0.3320.332 rs12068474rs12068474 C>TC> T 인트론5Intron 5 0.0910.091 0.1660.166 0.1230.123 rs2294752rs2294752 T>GT> G 인트론6Intron 6 0.3110.311 0.4280.428 0.7700.770 rs2294755rs2294755 C>TC> T 인트론6Intron 6 0.1720.172 0.2840.284 0.8970.897 rs446738rs446738 T>AT> A 인트론9Intron 9 0.3910.391 0.4760.476 0.8020.802 rs11208057rs11208057 A>GA> G 인트론9Intron 9 0.3100.310 0.4280.428 0.3500.350

* HWE: Hardy-Weinberg Equilibrium.
HWE: Hardy-Weinberg Equilibrium.

도 1 및 표 3에서 볼 수 있듯이, 하나의 SNP(rs209573)만이 프로모터 영역에 위치하였고, 나머지는 인트론 영역에 위치하였다. 모든 좌위의 유전자형 분포는 하디-와인버그 평형(Hardy-Weinberg Equilibrium)에 있었다(P>0.05). 각각의 일배체형(haplotype)을 PHASE(버전 2.0)의 알고리즘을 사용하여 추론하여, 빈도가 0.5를 넘는 6개의 일배체형을 분석을 위해 선택하였다. 이는 도 2에 나타난다. SMAP1L 다형성 사이에 연관 불평형(linkage disequilibrium, LD) 계수(|D|) 및 r 2 를 모든 대상자들을 상대로 계산하여 도 3에 나타내었다.As can be seen in Figure 1 and Table 3, only one SNP (rs209573) was located in the promoter region, the rest was located in the intron region. All locus genotype distributions were in the Hardy-Weinberg Equilibrium (P> 0.05). Each haplotype was inferred using the algorithm of PHASE (version 2.0) to select six haplotypes with frequencies greater than 0.5 for analysis. This is shown in FIG. Linkage disequilibrium (LD) coefficients (| D |) and r 2 between SMAP1L polymorphisms are calculated for all subjects and are shown in FIG. 3.

도 1 및 표 3에서 볼 수 있듯이, SMAP1L 중 SNP 2개의 세트(rs2982510C>T, rs2294752T>G)가 절대적 LD(|D|= 1 및 r 2 = 1)를 가졌다.
As can be seen in Figure 1 and Table 3, two sets of SNPs (rs2982510C> T, rs2294752T> G) in SMAP1L are the absolute LD (| D | = 1 and r 2 = 1).

(2) 다형성과 아스피린 과민성 천식간의 관계(2) Relationship between polymorphism and aspirin-sensitive asthma

복합(multiple) 로지스틱 분석을 이용하여 시험군과 대조군 간의 SMAP1L에서 19개 SNP 및 6개 일배체형에 대한 분석을 행하였다. 이 때 연령, 성별, 흡연 상태, 아토피 등을 공 변수로 하였다. 그 결과는 아래 표 4에 나타난다.Multiple logistic assays were used to analyze 19 SNPs and 6 haplotypes in SMAP1L between test and control groups. At this time, age, sex, smoking status, and atopy were used as empty variables. The results are shown in Table 4 below.

Figure 112010028972564-pat00003
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* P 값은 성별, 흡연 상태 및 아토피를 공변수로 조절하면서 로지스틱 분석한 값이며, **P 값은 SNPSpD 소프트웨어를 사용하여 복합 테스트로 보정된 값이다.* P values are logistic analysis with gender, smoking status and atopy adjusted as covariates. ** P values are corrected by complex tests using SNPSpD software.

* MAF: 소수 대립형질 빈도(minor allel frequency); OR: odds ratio; CI: 신뢰구간(confidence interval); Pcorr: 보정된 P 값
MAF: minor allel frequency; OR: odds ratio; CI: confidence interval; P corr: calibrated P value

표 4에서 알 수 있듯이, 2개의 단일 염기 다형성(rs2982510과 rs2294752)이 열성 모델에서 유의미성을 나타내었다. rs2982510과 rs2294752의 소수 대립형질 빈도(MAF)는 아스피린 내성 천식 환자(ATA)에서 보다 아스피린 과민성 천식 환자들에게서 더 낮았다. 즉, rs2982510과 rs2294752의 2개 다형성이 아스피린 과민성 천식과 관련 있음을 확인할 수 있었다.
As can be seen in Table 4, two single base polymorphisms (rs2982510 and rs2294752) were significant in the recessive model. The minor allele frequencies (MAF) of rs2982510 and rs2294752 were lower in aspirin-sensitive asthma patients than in aspirin-resistant asthma patients (ATA). In other words, two polymorphisms of rs2982510 and rs2294752 were associated with aspirin-sensitive asthma.

(3) 다형성과 아스피린 투약 후 FEV1 하락과의 관계(3) Relationship between polymorphism and decline in FEV 1 after aspirin dosing

아스피린 투약 후 FEV1 하락은 아스피린 과민성 천식의 중요 진단 마커이므로, SNP와 아스피린 투약 후 유전자형 또는 일배체형과 FEV1 하락의 관계에 대한 회귀 분석을 실시하였다. 그 결과를 아래 표 5에 나타내었다.Since a decrease in FEV 1 after aspirin dosing is an important diagnostic marker for aspirin-sensitive asthma, a regression analysis of the relationship between genotype or haplotype and FEV 1 drop after SNP and aspirin dosing was performed. The results are shown in Table 5 below.

Figure 112010028972564-pat00004
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* 회귀 분석의 P 값은 성별, 흡연 상태 및 아토피를 공변수로 조절한 공동-우성(Pa), 우성(Pb) 및 열성(Pc)의 값이며, **P 값은 SNPSpD 소프트웨어를 사용하여 복합 테스트로 보정된 값이다.* P values in regression analysis are co-dominant (Pa), dominant (Pb) and recessive (Pc) values with covariates of gender, smoking status, and atopy, and ** P values are combined using SNPSpD software. The value corrected by the test.

* C/C, C/R 및 C/R은 각각 공통(common) 대립형질의 동형 접합체(homozygous), 레어(rare) 대립형질의 이형 접합체(heterozygous) 및 동형 접합체를 의미한다.
* C / C, C / R and C / R mean homozygotes of common alleles, heterozygous and homozygotes of rare alleles.

표 5에서 볼 수 있듯이, 2개의 SNP(rs2982510 및 rs2294752)가 아스피린 투약 후 FEV1 하락%와 관련이 있다는 것을 확인할 수 있다. rs2982510 및/또는 rs2294752 소수 대립형질 동형 접합체를 가진 천식 환자들은 이형접합체 또는 주요 대립형질 동형 접합체를 가진 환자들에 비해 더 낮은 아스피린 투약 후 FEV1 하락을 나타냈다. 한편, FEV1 하락과 일배체형은 관련성이 없는 것으로 나타났다.
As shown in Table 5, it can be seen that the two SNPs (rs2982510 and rs2294752) are associated with the percent decrease in FEV 1 after aspirin dosing. Asthmatic patients with rs2982510 and / or rs2294752 minor allelic homozygotes showed lower FEV 1 after dosing aspirin compared to patients with heterozygotes or major allelic homozygotes. On the other hand, the decline in FEV 1 and the haplotype did not appear to be related.

3. 통계적 방법3. Statistical Method

모든 이대립형질 좌위 쌍 간의 Lewontin's D'(|D'|)과 LD coefficient r 2 을 계산하였다. 연관 불균형(linkage disequilibrium, LD)은 브로드 인스티튜트(http://www.broadinstitute.org/mpg/haploview)에서 다운받은 해플로뷰(Haploview) v4.1을 사용하여 얻었다. 일배체형은 먼저 PHASE 소프트웨어를 사용하여 측정한 후 SAS 버전 9.1(SAS Inc., Cary, NC)을 사용하여 로지스틱 분석하였다. 유전자형이 없는 대상자들은 SNP 및 일배체형 분석에서 제외하였다. 유전자형 및 일배체형 분포는 연령(연속 값), 성별(남성=0, 여성=1), 흡연 여부(비흡연자=0, 전 흡연자=1, 흡연자=2), 아토피(없음=0, 있음=1) 및 체질량 지수(BMI)를 공변수로 하여 로지스틱 분석을 실시하여 분석하였다. 유전자형과 일배체형 간의 아스피린 투약 후 FEV1 하락 차이는 선형 회귀 모델을 사용하여 계산되었다. 상기 데이터는 또한 SAS 버전 9.1을 사용하여 분석하였다. 각 유전자의 독립 마커 좌위의 유효 숫자는 SNPSpD(http://genepi.qimr.edu.au/ general/daleN/SNPSpD/) 소프트웨어를 사용하여 멀티 테스팅 보정으로 계산하였으며, 이는 SNP 간의 쌍(Pair-wise) 연관 불균형(LD)의 매트릭스의 스펙트럼 분해(SpD)에 기초한다.
Lewontin's D '(| D' |) and LD coefficient r 2 were calculated between all pairs of alleles. Linkage disequilibrium (LD) was obtained using Haploview v4.1, downloaded from the Broad Institute (http://www.broadinstitute.org/mpg/haploview). Haplotypes were first measured using PHASE software and then logistically analyzed using SAS version 9.1 (SAS Inc., Cary, NC). Subjects without genotype were excluded from SNP and haplotype analysis. Genotype and haplotype distributions include age (continuous value), gender (male = 0, female = 1), smoking status (non-smoker = 0, former smoker = 1, smoker = 2), atopy (none = 0, present = 1) ) And body mass index (BMI) were analyzed by logistic analysis. The difference in FEV 1 drop after aspirin dosing between genotype and haplotype was calculated using a linear regression model. The data was also analyzed using SAS version 9.1. The significant number of independent marker loci for each gene was calculated by multi-testing calibration using SNPSpD (http://genepi.qimr.edu.au/general/daleN/SNPSpD/) software, which is a pair-wise pairing between SNPs. ) Is based on the spectral decomposition (SpD) of the matrix of associative imbalance (LD).

본 실험 결과를 통해, 아스피린 과민성 천식과 관련 있는 SNP들은 인트론 2와 6에 위치하고 있다는 것이 밝혀졌다. 이는 인트론 영역 또한 다른 방법으로 전반적인 전사에 영향을 줄 수 있다는 것을 나타낸다. 최근 인트론 영역이 전사에 영향을 줄 수 있으며, 인트론 영역의 변이가 비정상적인 스플라이싱을 유도하고, 나아가 질병을 야기할 수 있다고 알려진 바 있다. 또한 인트론 영역의 SNP가 천식과 관련될 수 있다는 것도 알려진 바 있다. 따라서, SMAP1L 유전자의 rs2982510 및 rs2294752는 전사 과정에 영향을 줌으로써, 아스피린 과민성 천식의 발병에 영향을 줄 수 있을 것이다.The results indicate that SNPs associated with aspirin-sensitive asthma are located in introns 2 and 6. This indicates that intron regions can also affect overall transcription in other ways. Recently, it has been known that intron regions can affect transcription, and mutations in intron regions can lead to abnormal splicing and even cause disease. It is also known that SNPs in the intron region may be associated with asthma. Thus, rs2982510 and rs2294752 of the SMAP1L gene may affect the development of aspirin-sensitive asthma by affecting the transcriptional process.

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Claims (5)

삭제delete 삭제delete 서열 번호 77로 기재되는 SMAP1L(Stromal membrane-associated protein 1-like) 게놈 유전자 내에서 선택되고,
번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +32,831번째이며, C 또는 T인 염기(rs2982510C>T); 또는 번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +40,160번째이며, T 또는 G인 염기(rs2294752T>G)를 포함하는 20-100개의 연속적인 뉴클레오티드로 구성된 폴리뉴클레오티드를 포함하는 다형성 마커를
증폭시킬 수 있는 프라이머(primer)를 포함하는 아스피린 과민성 천식(Aspirin Intolerant Asthma : AIA) 예측 또는 진단용 키트.
Selected from within the SMAP1L (Stromal membrane-associated protein 1-like) genomic gene, set forth in SEQ ID NO: 77,
A base of +32,831, C or T (rs2982510C> T) from the translation start point (2,066 base of SEQ ID NO: 77); Or a polymorphic marker comprising a polynucleotide consisting of 20-100 contiguous nucleotides comprising a base (rs2294752T> G) that is +40,160 th from the translation start point (2,066 base in SEQ ID NO: 77) and is T or G (rs2294752T> G).
Aspirin Intolerant Asthma (AIA) prediction or diagnostic kit comprising a primer that can be amplified.
서열 번호 77로 기재되는 SMAP1L(Stromal membrane-associated protein 1-like) 게놈 유전자 내에서 선택되고,
번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +32,831번째이며, C 또는 T인 염기(rs2982510C>T); 또는 번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +40,160번째이며, T 또는 G인 염기(rs2294752T>G)를 포함하는 20-100개의 연속적인 뉴클레오티드로 구성된 폴리뉴클레오티드를 포함하는 다형성 마커를
검출할 수 있는 프로브(probe)를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 키트.
Selected from within the SMAP1L (Stromal membrane-associated protein 1-like) genomic gene, set forth in SEQ ID NO: 77,
A base of +32,831, C or T (rs2982510C> T) from the translation start point (2,066 base of SEQ ID NO: 77); Or a polymorphic marker comprising a polynucleotide consisting of 20-100 contiguous nucleotides comprising a base (rs2294752T> G) that is +40,160 th from the translation start point (2,066 base in SEQ ID NO: 77) and is T or G (rs2294752T> G).
Aspirin hypersensitivity asthma prediction or diagnostic kit comprising a detectable probe (probe).
대상으로부터 분리된 혈액 시료로부터 게놈 DNA를 추출하는 단계;
상기 단계에서 추출한 게놈 DNA 상에 존재하는
서열 번호 77로 기재되는 SMAP1L(Stromal membrane-associated protein 1-like) 게놈 유전자 내에서 선택되고
번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +32,831번째이며, C 또는 T인 염기(rs2982510C>T); 또는 번역 시작점(서열 번호 77의 2,066번째 염기)으로부터 +40,160번째이며, T 또는 G인 염기(rs2294752T>G)를 포함하는 20-100개의 연속적인 뉴클레오티드로 구성된 폴리뉴클레오티드를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단용 다형성 마커를 검출하는 단계; 및
상기 단계에서 얻은 다형성 마커 검출 결과와 정상군의 다형성 부위 검출 결과를 비교하는 단계를 포함하는 아스피린 과민성 천식 예측 또는 진단을 위해 정보를 제공하는 방법.
Extracting genomic DNA from blood samples isolated from the subject;
Present on the genomic DNA extracted in the step
Selected from within the SMAP1L (Stromal membrane-associated protein 1-like) genomic gene, set forth in SEQ ID NO: 77
A base of +32,831, C or T (rs2982510C> T) from the translation start point (2,066 base of SEQ ID NO: 77); Or predicting aspirin-sensitive asthma including a polynucleotide consisting of 20-100 contiguous nucleotides comprising a base that is at +40,160 from the start of translation (the 2,066 base of SEQ ID NO: 77) and the base is T or G (rs2294752T> G) or Detecting a diagnostic polymorphic marker; And
A method for providing information for predicting or diagnosing aspirin-sensitive asthma, comprising comparing a polymorphic marker detection result obtained in the step with a polymorphic site detection result of a normal group.
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