KR101136964B1 - 닭의 칼슘감지수용체 유전자를 이용하여 닭의 유전적경제형질을 판정하는 방법 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 닭의 칼슘감지수용체 유전자를 이용하여 닭의 유전적 경제형질을 판정하는 방법에 관한 것으로, (a) 닭 시료의 게놈 유전자와 닭 유래의 칼슘감지수용체(CaSR) 유전자에 대응되는 증폭용 프라이머를 사용하여 PCR 방법으로 칼슘감지수용체 유전자를 증폭하는 단계; (b) 상기 증폭된 칼슘감지수용체 유전자를 RFLP 방법으로 제한효소 Nco Ⅰ에 처리한 다음, 상기 유전자 처리물에서 칼슘감지수용체의 미스센스 돌연변이(염기치환)에 의한 대립 유전자형의 차이에 따른 시료별 SNP 표지 인자를 검출하는 단계; 및 (c) 상기 검출된 SNP 표지 인자로부터 닭의 시산일령, 난중, 산란수 또는 체중을 예측하는 단계;를 포함하여 이루어지는 것을 특징으로 한다.
본 발명은 닭의 경제형질을 개량하는데 있어서 매우 중요한 역할을 수행할 수 있을 것으로 판단된다.
닭, 칼슘감지수용체, SNP, 개량
Description
본 발명은 닭의 칼슘감지수용체 유전자를 이용하여 닭의 유전적 경제형질을 판정하는 방법에 관한 것으로, 보다 상게하게는 닭으로부터 칼슘감지수용체(CaSR) 유전자를 이용한 PCR-RFLP 방법으로 개체별 SNP의 표지 인자(marker)를 검출하고, 상기 검출된 개체별 SNP 표지 인자로부터 닭의 경제형질인 시산일령, 난중, 산란수 또는 체중 등을 유의적으로 예측하여 판정하는 방법에 관한 것이다.
칼슘감지수용체(CaSR) 유전자는 Calcium Sensing Receptor의 약자로 세포의 밖에서 칼슘의 항상성을 조절하는 역할을 담당하며 부갑상선 호르몬의 분비를 조절하고 비뇨기에서 칼슘의 흡수를 담당하는 것으로 알려져 있다(David 등, 1999; Hough 등, 2004; Cifuentes 등, 2005; Pidasheva 등, 2005; Robert 등, 2006; Yun 등, 2007).
일반적으로 체내의 칼슘농도가 증가하면 갑상선에서 칼시토닌을 분비하게 되어 신장에서는 칼슘이온 배출이 증가하고 작은 창자에서는 칼슘이온 흡수를 촉진하 며, 체내의 칼슘농도가 감소하게 되면 부갑상선에서 부갑상선호르몬을 분비하게 되어 신장에서 칼슘이온 배출이 감소하고 작은 창자에서 칼슘이온의 흡수를 촉진하는 것으로 알려져 있다. 이때, 체내의 칼슘 농도의 저하는 뇌하수체 분비기관에서 성장호르몬의 분비를 자극하게 되고(Hall 등, 1985), 프로게스테론의 분비를 강화시켜주는 역할을 하는 것으로 보고되고 있어(Veldhuis 등 1982), 체내의 칼슘농도는 성장과 번식에 관련한 호르몬 분비에 큰 영향을 미치는 것으로 판단하고 있다.
최근 인간의 칼슘감지수용체(CaSR) 유전자에 대한 연구에서는 인간 CaSR 유전자 내 A986S 변이 지역의 유전자 다형성은 체내의 칼슘농도의 증가와 감소를 초래하고 있으며 골다공증 및 고혈압 및 비만 등의 질병과 연관되는 것으로 밝혀졌다(David 등, 1999; Felderbauer 등, 2005; Robert 등, 2006; Yun 등, 2007).
또한, 인간에 대한 칼슘의 순환 및 골 밀도와 관련한 칼슘감지수용체 유전자의 연구에서는 칼슘감지수용체의 유전적 변이는 종양과 관련된 질병을 일으킬 수 있는 것으로 보고하고 있으며(Peters 등, 2004), 과칼슘혈증 및 부갑상건기능 항진증과 같은 칼슘 관련 질병과도 연관성이 있음을 보고하고 있다(Felderbaure 등, 2005).
이와 같이, 인간의 칼슘감지수용체 유전자는 여러 측면에서 많은 연구가 진행되어지고 있으며 질병 및 여러 형질에 있어 중요한 후보유전자로 인정받고 있다.
한편, 인간과 닭의 칼슘감지수용체 유전자는 비교적 높은 상동성을 지니고 있는 것으로 알려져 있으며, 닭에서도 인간과 유사하게 염기변이 다형성이 발생하는 것으로 보고되어 있다.
하지만, 종래에서는 닭의 칼슘감지수용체 유전자를 이용하여 시산일령, 난중, 산란수 또는 등의 경제형질을 예측하는 판정방법에 대해서는 전혀 알려진 바가 없다.
이에, 본 발명자는 닭의 칼슘감지수용체 유전자의 염기변이 다형성을 이용하여 닭의 형질이나 질병을 예측할 수 있는 판정 방법을 개발하고자 하였으며, 닭의 칼슘감지수용체의 유전자 다형성과 닭의 경제형질 간에 유의적으로 연관관계가 있음을 입증함으로써, 본 발명을 완성하였다.
따라서, 본 발명의 목적은 닭의 개체별 칼슘감지수용체 유전자에서 PCR-RFLP 방법으로 개체별 유전자 다형성을 검출하고, 상기 검출된 유전자 다형성으로부터 닭의 경제형질을 예측하는 판정방법을 제공하는 것이다.
특히, 우리나라의 농축산물 개방에 따른 경쟁력 확보 차원에서, 본 발명은 칼슘감지수용체 유전자 내 염기변이지역(A963S)을 이용하여 한국재래닭의 시산일령을 개량하기 위한 방법을 제공하는 것이다.
상기와 같은 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 (a) 닭 시료의 게놈 유전자와 닭 유래의 칼슘감지수용체(CaSR) 유전자에 대응되는 증폭용 프라이머를 사용하여 PCR 방법으로 칼슘감지수용체 유전자를 증폭하는 단계; (b) 상기 증폭된 칼슘감지수용체 유전자를 RFLP 방법으로 제한효소 Nco Ⅰ에 처리한 다음, 상기 유전자 처리물에서 칼슘감지수용체의 미스센스 돌연변이(염기치환)에 의한 대립 유전자형의 차이에 따른 시료별 SNP 표지 인자를 검출하는 단계; 및 (c) 상기 검출된 SNP 표지 인자로부터 닭의 시산일령, 난중, 산란수 또는 체중을 예측하는 단계;를 포함하여 이루어지는 닭의 유전적 경제형질을 판정하는 방법을 제공한다.
이하, 본 발명을 상세히 설명하기로 한다.
이때, 사용되는 기술 용어 및 과학 용어에 있어서 다른 정의가 없다면, 이 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자가 통상적으로 이해하고 있는 의미를 가진다.
또한, 종래와 동일한 기술적 구성 및 작용에 대한 반복되는 설명은 생략하기로 한다.
본 발명에서 미스센스 돌연변이(missense mutation)는 유전자의 한 염기가 다른 염기로 치환되면서 코돈이 바뀌어서 발현 시 다른 아미노산으로 바뀌는 돌연변이를 말한다.
SNP(Single Nucleotide Polymorphism)는 단일염기변이를 말하는 것으로 동종 간의 개체별 염기의 차이를 나타내는 것이다.
본 발명에서 시산일령(時産日齡; The first lay day)은 암탉이 태어나서 최초로 산란하는 날을 말하고, 난중(卵重)은 계란의 무게를 말한다.
본 발명에서 PCR(Polymerase Chain Reaction)은 유전자의 특정 부위를 증폭하기 위하여, DNA 중합효소와 증폭하고자 하는 유전자의 특정 부위의 양 끝단에 대응되는 프라이머를 사용하여 필요로 하는 유전자의 특정부위를 증폭하는 공지된 방법을 말한다.
본 발명에서 RFLP 방법(Restriction Fragment Length Polymorphism)은 게놈 내에 단일 염기쌍의 변이에 의해 점 돌연변이(point mutation)가 발생되면 이를 특 정 제한효소로 절단하였을 때, 제한효소의 인지부위가 새로 생성되거나 현존하는 제한효소 인지부위가 소실되어 DNA 절편 길이의 양상이 개체별로 다양하게 나타나는 DNA의 다형성을 전기영동으로 감지하는 공지된 방법을 말한다(Bostein et.al, 1980).
본 발명은 필요로 하는 경제형질을 갖는 닭을 사육하거나 개량할 수 있도록, 닭으로부터 칼슘감지수용체(CaSR) 유전자를 이용한 PCR-RFLP 방법으로 개체별 SNP의 표지 인자(marker)를 검출하고, 상기 검출된 개체별 SNP 표지 인자로부터 닭의 경제형질인 시산일령, 난중, 산란수 또는 체중 등을 유의적으로 예측하여 판단할 수 있게 것이다. 즉, 본 발명은 칼슘감지수용체의 유전자에서 개체별로 미스센스 돌연변이의 발생 여부에 따라 나타나는 개체적 대립유전자형의 SNP 차이와 닭의 경제형질인 시산일령, 난중, 산란수 또는 체중 등 간의 관계를 통계적으로 분석하여 유의적으로 연관 관계가 있음을 과학적으로 입증함으로써, 칼슘감지수용체 유전자의 개체별 SNP를 닭의 경제형질을 예측하는 표지 인자로 사용할 수 있게 한 것이다.
이때, 본 발명에서 칼슘감지수용체 유전자를 PCR 방법으로 증폭하기 위한 증폭용 프라이머(primer)로는 서열번호 5 및 6으로 표시되는 프라이머를 사용하는 것이 바람직하다. 하지만, 본 발명이 상술한 프라이머에 국한되는 것은 아니며, 본 발명의 목적에 따라 상기 칼슘감지수용체 유전자를 PCR 방법으로 증폭할 수 있는 프라이머라면 그 어느 것을 사용해도 무방하다.
그리고, 본 발명에서 칼슘감지수용체 유전자에서 발생되는 미스센스 돌연변 이는 서열번호 2에 표시한 바와 같이 서열번호 1에 표시된 염기서열에서 엑손 1(exon 1) 지역에 해당하는 3,194번째 염기가 구아닌(G)에서 티민(T)으로 치환되는 변이가 이루어져서 발현 시 아미노산 서열 963 지역의 알라닌(GCC)이 세린(TCC)으로 바뀌게 되는 것을 말한다. 이를 본 발명에서는 A963S로 명명하였다.
또한, 본 발명에서는 개체별로 칼슘감지수용체 유전자의 미스센스 돌연변이의 발생 여부에 따라서 서열번호 1로 표시되는 유전자로만 이루어지는 대립유전자형을 AA 유전자형으로 표기하고, 서열번호 1로 표시되는 유전자와 서열번호 2로 표시되는 유전자로 이루어지는 대립유전자형을 AS 유전자형이라 표기하며, 서열번호 2로 표시되는 유전자로만 이루어지는 대립유전자형을 SS 유전자 형이라 표기한다.
상술한 바와 같이, 본 발명은 닭으로부터 칼슘감지수용체(CaSR) 유전자를 이용한 PCR-RFLP 방법으로 개체별 SNP의 표지 인자(marker)의 특성을 분석하여 닭의 경제형질인 시산일령, 난중, 산란수 또는 체중 등을 유의적으로 예측하여 판단할 수 있는 방법을 개발함으로써, 필요로 하는 경제형질을 갖는 닭을 선별하여 사육하거나 사육 닭을 개량하기 위한 연구에 적용할 수 있게 한 것이다.
한편, 본 발명에서 닭 시료는 피검체로부터 채취한 세포, 조직, 혈청, 혈액, 혈장, 대소변, 림프액 및 뇌척수액 등에서 선택된 시료를 사용할 있으며, 바람직하게는 채취가 용이한 조직, 혈액, 혈청 또는 혈장을 사용한다.
이와 같이, 본 발명은 닭의 개체별 칼슘감지수용체 유전자에서 PCR-RFLP 방법으로 검출된 개체별 유전자 다형성으로부터 닭의 경제형질을 예측할 수 있게 한 것이다.
따라서, 본 발명에 따른 닭의 경제형질의 예측방법은 닭의 경제형질을 개량하는데 있어서 매우 중요한 역할을 수행할 수 있을 것으로 판단된다.
이하, 본 발명을 구체적인 실시예에 의해 보다 더 상세히 설명하고자 한다. 하지만, 본 발명은 하기 실시예에 의해 한정되는 것은 아니며, 본 발명의 사상과 범위 내에서 여러 가지 변형 또는 수정할 수 있음은 이 분야에서 당업자에게 명백한 것이다.
[
실시예
]
1. 공시 재료
축산기술연구소에서 사육중인 검정자료 (시산일령, 산란수, 난중, 체중)를 보유한 한국재래닭 60수와 레그혼 60수를 선발하여 혈액을 채취하였으며 수집된 혈액으로 부터 게놈 DNA(genomic DNA)를 정제하여 공시재료로 이용하였다.
2. 게놈 DNA의 추출
공시축의 혈액으로부터 DNA의 분리 및 추출는 Genomic DNA Extraction kit(BioneerTM)으로 지침서에 따라 실행되었고, 분리된 DNA는 TE Buffer(10mM Tris-HCL, pH 7.4 1mM EDTA)에 용해하였다.
3. 유전자 증폭
PCR (Polymerase Chain Reaction)반응액은 Template DNA 1㎕, 각각의 Primer 0.1 ㎕(10pmole), dNTP 1 ㎕, 10X Buffer 1.2 ㎕ 및 Taq polymerase 0.06 ㎕를 첨가하여 PCR 반응액을 총 10㎕로 조정한 후 94℃에서 pre-denaturation 4분, 94 ℃에서 denaturation 40초, 53.6℃ annealing 40초, Primer Extension 72℃ 1분으로 총 35cycle로 실행 후 final Extension을 72℃ 20분 동안 수행하여 증폭된 PCR-Products는 Ethdium Bromide를 첨가한 2% agarose gel에서 전기영동 하여 확인하였다.
4. 염기서열 분석
칼슘감지수용체 유전자의 변이지역 확인을 위해 PCR Product 5㎕에 ExoSAP-IT(Amersham Bioscience, USA) 2㎕을 첨가하여 총 부피를 7㎕로 하여 37℃에서 20분, 80℃에서 20분간 반응시켜 증폭산물 이외의 이물질을 제거하여 준 다음 E.T terminator dye(Amersham Bioscience, USA)을 제작사의 지침서에 따라 표 1의 primer와 함께 GeneAmp PCR System 2700(Applied Biosystems)을 이용하여 재증폭 과정을 수행하였다. 전처리 과정을 통해 얻어진 산물을 MegaBace Analysis System (Amersham Bioscience, USA.)을 이용하여 염기서열을 결정하였다. 결정된 염기서열은 seqMAN (DNA STAR Inc.) 프로그램을 이용하여 변이 지역을 확인하였다.
5. 제한효소 처리
닭의 칼슘감지수용체 유전자 내에 존재하는 변이 지역의 유전자형을 확인하기 위하여 PCR 증폭여부 및 크기가 확인 되어진 증폭산물 10 ㎕를 제한효소 Nco I(C＾CATG_G)를 이용하여 65℃에서 6시간 동안 절단반응을 시킨 후 EtBr(Ethiduim bromide)가 포함된 agarose gel(3%)에서 100V로 30분 동안 전기영동을 실시하여 절단된 유형에 따라 유전자형을 결정하였다.
6. 통계적 분석
7. 닭 칼슘감지수용체 유전자 내 변이지역 탐색 및 유전자형 분석
칼슘감지수용체 유전자 내 염기서열 분석을 통해서 exon 1지역의 3194bp(accession no. XM_416491)에서 G가 T로 치환되는 변이를 확인하였다. 이 변이는 아미노산서열 963지역의 Alanine(GCC)이 Serine(TCC)으로 바뀌는 missense mutation으로 확인되었으며 A963S로 표기하기로 하였다.
A963S 지역의 유전자형 분석을 위해 염기서열 변이지역을 인식하는 제한효소 Nco I(C＾CATG_G)를 이용하여 PCR-RFLP을 실시하였으며 확인된 유전자형은 AA, AS 그리고 SS이다. 각 유전자형 별로 확인된 단편의 유형은 도 1에 나타내었다. Lane 1과 2는 AS 유전자형이며 468 bp, 218 bp 그리고 250 bp, 3개의 단편을 확인하였다. 250 bp와 218bp두 개의 단편이 확인된 Lane3은 AA 유전자형이며 Lane 4는 468 bp의 단편이 확인된 SS 유전자형이다. 분석된 A963S의 유전자형 빈도를 표 2에 제시하였다. 한국재래닭의 AS유전자형이 65%로 가장 높은 출현빈도를 보였으며 SS유전자형이 23%, AA유전자형이 12%로 나타났다. 반면, 레그혼 품종에서는 AS유전자형이 92%로 높은 빈도를 나타냈으며 AA유전자형이 0.8%의 빈도를 보였다. 그리고 레그혼 품종에서 SS 유전자형은 발견되지 않았다.
8. A963S 유전자형과
경제형질간의
연관성 분석
표 3은 분석에 활용된 집단의 시산일령, 산란수, 난중 그리고 체중에 관한 평균값을 나타낸 것이다. 한국재래닭과 레그혼 간의 각 형질별 차이가 확연하게 나타나고 있음을 확인할 수 있었다.
각 개체들이 보유한 경제형질의 성적과 A963S 유전자형간의 연관성 분석 결과를 표 4와 표 5에 제시하였다. 표 4는 레그혼 집단에서 분석된 결과를 제시한 것으로 결과에 따르면 시산일령에서 유전자형과의 유의한 연관성이 검출되었다. AA(137.6±2.63)유전자형은 AS(143.0±1.60) 유전자형보다 빠른 시산일령을 가진 것으로 나타났다. 표 5는 한국재래닭 집단에서 분석된 결과를 제시한 것으로 결과에 따르면 시산일령과 난중에서 유전자형과의 유의한 연관성이 검출되었다. 시산일령의 경우 AA(151.0±2.87)와 AS(152.6±1.21) 유전자형은 SS(159.43±2.03) 유전자형보다 빠른 것으로 나타났으며 난중은 SS(50.4±0.81)유전자형이 AA(47.5±1.15)와 AS(47.85±0.49)유전자형보다 무거운 것으로 나타났다.
상술한 결과, 본 발명에 따른 칼슘감지수용체 유전자의 다형성과 경제형질이 유의적으로 연관성이 있음을 입증하였다. 특히, 시산일령의 경우 A963S 지역의 변이가 칼슘농도의 조절에 영향을 미치고 이에 따른 프로게스테론이나 성장 호르몬 등의 분비에 영향을 미쳐서 나타난 것으로 추정된다.
따라서, 본 발명에서는 대립유전자 A 유전자형을 분자생물학적 마커로 이용하여 경제형질을 개량하는데 있어서 산란일령 등의 경제형질을 앞당기는데 큰 기여를 할 수 있을 것으로 판단된다.
도 1은 칼슘감지수용체 유전자의 대립유전자형을 RFLP 방법으로 나타낸 사진이다.
도 2는 인간 칼슘감지수용체(A986S)와 닭 칼슘감지수용체(A963S)의 돌연변이 지역의 부분적 염기서열을 비교하여 나타낸 것이다.
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<220>
<221> mutation
<222> (3194)
<400> 1
gggcaagagc tggtggcggc aggagcggcc ccggcggcgg gacgagttct tgaagatggg 60
ctctctgtaa tgctttggtc atgaagaaac aaggaacact gaattgctgt tttacaatgg 120
agaaaacaga gggacaaata ccagcactgt ggcttccacc ttgttgctta tctctctgca 180
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acatccgctt tcttacattg tcttttccaa ttttacatcc tataacccct tggtgaaagg 300
aggaaca atg act tta tat agc tgc tgt ttg att ctt ttg ctg ttt acc 349
Met Thr Leu Tyr Ser Cys Cys Leu Ile Leu Leu Leu Phe Thr
1 5 10
tgg aac act gct gcc tat ggg cca aac caa cgg gca cag aag aag gga 397
Trp Asn Thr Ala Ala Tyr Gly Pro Asn Gln Arg Ala Gln Lys Lys Gly
15 20 25 30
gac att att ctt gga gga ttg ttc ccc atc cat ttt gga gtg gct gct 445
Asp Ile Ile Leu Gly Gly Leu Phe Pro Ile His Phe Gly Val Ala Ala
35 40 45
aaa gac cag gat cta aag tca aga ccc gaa tca gtg gag tgc ata agg 493
Lys Asp Gln Asp Leu Lys Ser Arg Pro Glu Ser Val Glu Cys Ile Arg
50 55 60
tat aat ttc cga ggc ttc cgc tgg ctc cag gct atg atc ttt gcc ata 541
Tyr Asn Phe Arg Gly Phe Arg Trp Leu Gln Ala Met Ile Phe Ala Ile
65 70 75
gaa gaa ata aat aat agc cca aat ctc ctt ccc aac atg acc ttg gga 589
Glu Glu Ile Asn Asn Ser Pro Asn Leu Leu Pro Asn Met Thr Leu Gly
80 85 90
tac agg ata ttt gac act tgc aat aca gtc tct aaa gcc ctt gag gcc 637
Tyr Arg Ile Phe Asp Thr Cys Asn Thr Val Ser Lys Ala Leu Glu Ala
95 100 105 110
act ctg agt ttt gtg gcc cag aac aag ata gac tcc ttg aac ctg gat 685
Thr Leu Ser Phe Val Ala Gln Asn Lys Ile Asp Ser Leu Asn Leu Asp
115 120 125
gaa ttc tgc aac tgc tca gaa cat atc cct tcc acc att gca gtc gtg 733
Glu Phe Cys Asn Cys Ser Glu His Ile Pro Ser Thr Ile Ala Val Val
130 135 140
ggg gca acc ggc tct ggg gtt tcc acc gct gtg gcc aat ctg ctg gga 781
Gly Ala Thr Gly Ser Gly Val Ser Thr Ala Val Ala Asn Leu Leu Gly
145 150 155
ctc ttt tac ata cct cag gtc agc tat gcc tca tcc agt cgt ctc ttg 829
Leu Phe Tyr Ile Pro Gln Val Ser Tyr Ala Ser Ser Ser Arg Leu Leu
160 165 170
agc aac aag aac cag ttc aag tcc ttc ctc cgc aca atc ccc aat gac 877
Ser Asn Lys Asn Gln Phe Lys Ser Phe Leu Arg Thr Ile Pro Asn Asp
175 180 185 190
gag cat cag gcc act gcg atg gca gac atc atc gag tac ttc cgc tgg 925
Glu His Gln Ala Thr Ala Met Ala Asp Ile Ile Glu Tyr Phe Arg Trp
195 200 205
aac tgg gtg gga acg att gca gct gat gat gac tat ggc cgg cca ggg 973
Asn Trp Val Gly Thr Ile Ala Ala Asp Asp Asp Tyr Gly Arg Pro Gly
210 215 220
att gaa aag ttt cgg gag gag gcg gag gag aga gat atc tgc att gat 1021
Ile Glu Lys Phe Arg Glu Glu Ala Glu Glu Arg Asp Ile Cys Ile Asp
225 230 235
ttt agt gag ctc atc tcc cag tac tca gat gaa gaa gag att cag cag 1069
Phe Ser Glu Leu Ile Ser Gln Tyr Ser Asp Glu Glu Glu Ile Gln Gln
240 245 250
gtg gtg gag gtc atc cag aac tcc aca gca cga gtg att gtg gtt ttc 1117
Val Val Glu Val Ile Gln Asn Ser Thr Ala Arg Val Ile Val Val Phe
255 260 265 270
tcc agt gga cca gac ctg gaa ccc ctc atc aaa gag att gtc agg cga 1165
Ser Ser Gly Pro Asp Leu Glu Pro Leu Ile Lys Glu Ile Val Arg Arg
275 280 285
aac atc act gga aag atc tgg ctg gca agt gaa gcc tgg gcc agt tca 1213
Asn Ile Thr Gly Lys Ile Trp Leu Ala Ser Glu Ala Trp Ala Ser Ser
290 295 300
tcc ctg ata gcc atg cca gag ttc ttc cgt gtc atc ggc agc acc att 1261
Ser Leu Ile Ala Met Pro Glu Phe Phe Arg Val Ile Gly Ser Thr Ile
305 310 315
ggg ttt gca ctg aag gca ggc cag atc cca ggc ttt cgc gag ttc ctg 1309
Gly Phe Ala Leu Lys Ala Gly Gln Ile Pro Gly Phe Arg Glu Phe Leu
320 325 330
cag aag gtg cat ccc aag aag tct gcc aac aat gga ttt gcc aag gag 1357
Gln Lys Val His Pro Lys Lys Ser Ala Asn Asn Gly Phe Ala Lys Glu
335 340 345 350
ttt tgg gaa gag aca ttt aac tgc tat ctc ccc agt gag tcc aaa aat 1405
Phe Trp Glu Glu Thr Phe Asn Cys Tyr Leu Pro Ser Glu Ser Lys Asn
355 360 365
tct cca gct tca gct tcc ttc cac aag gcc cac gaa gag ggc ttg gga 1453
Ser Pro Ala Ser Ala Ser Phe His Lys Ala His Glu Glu Gly Leu Gly
370 375 380
gct gga aat ggt aca gct gcc ttc cga cct cca tgc aca ggt gat gag 1501
Ala Gly Asn Gly Thr Ala Ala Phe Arg Pro Pro Cys Thr Gly Asp Glu
385 390 395
aac atc acc agt gtg gaa aca ccg tac atg gac ttc aca cac ttg cgg 1549
Asn Ile Thr Ser Val Glu Thr Pro Tyr Met Asp Phe Thr His Leu Arg
400 405 410
ata tcc tat aat gta tat ttg gca gta tat tct att gct cac gct ttg 1597
Ile Ser Tyr Asn Val Tyr Leu Ala Val Tyr Ser Ile Ala His Ala Leu
415 420 425 430
cag gat ata tat act tgt acc cct ggg aaa gga ctc ttc acc aac gga 1645
Gln Asp Ile Tyr Thr Cys Thr Pro Gly Lys Gly Leu Phe Thr Asn Gly
435 440 445
tcc tgt gca gac att aag aag gtt gag gca tgg cag gtt ctg aag cac 1693
Ser Cys Ala Asp Ile Lys Lys Val Glu Ala Trp Gln Val Leu Lys His
450 455 460
ctg cgc cac tta aat ttc acc agt aac atg ggg gag caa gtg gac ttt 1741
Leu Arg His Leu Asn Phe Thr Ser Asn Met Gly Glu Gln Val Asp Phe
465 470 475
gat gag ttt gga gac ctg gtg ggg aat tac tca ata atc aac tgg cat 1789
Asp Glu Phe Gly Asp Leu Val Gly Asn Tyr Ser Ile Ile Asn Trp His
480 485 490
ctc tct cca gag gat ggc tca gtc gtc ttt gag gag gtt ggg cac tac 1837
Leu Ser Pro Glu Asp Gly Ser Val Val Phe Glu Glu Val Gly His Tyr
495 500 505 510
aat gtg tat gcc aag aaa ggg gag agg ctc ttt atc aat gaa aac aaa 1885
Asn Val Tyr Ala Lys Lys Gly Glu Arg Leu Phe Ile Asn Glu Asn Lys
515 520 525
atc ctg tgg agt gga ttc tca aag gag gtg ccc ttc tct aac tgc agc 1933
Ile Leu Trp Ser Gly Phe Ser Lys Glu Val Pro Phe Ser Asn Cys Ser
530 535 540
agg gac tgc ctg cca ggc acc agg aag ggc att att gag gga gag ccc 1981
Arg Asp Cys Leu Pro Gly Thr Arg Lys Gly Ile Ile Glu Gly Glu Pro
545 550 555
act tgc tgc ttc gag tgt gtg gac tgc cct gat gga gag tac agt gat 2029
Thr Cys Cys Phe Glu Cys Val Asp Cys Pro Asp Gly Glu Tyr Ser Asp
560 565 570
gaa aca gat gca agt gct tgt gac aag tgc cct gag gat tac tgg tct 2077
Glu Thr Asp Ala Ser Ala Cys Asp Lys Cys Pro Glu Asp Tyr Trp Ser
575 580 585 590
aat gag aac cac aca tcc tgc atc ccc aag cag ata gag ttt cta tcc 2125
Asn Glu Asn His Thr Ser Cys Ile Pro Lys Gln Ile Glu Phe Leu Ser
595 600 605
tgg aca gag ccc ttt gga atc gct tta act ctc ttt gct gtg ctg gga 2173
Trp Thr Glu Pro Phe Gly Ile Ala Leu Thr Leu Phe Ala Val Leu Gly
610 615 620
att ttc ctg act tct ttt gtc ctg gga gtc ttc acc aaa ttt cgc aac 2221
Ile Phe Leu Thr Ser Phe Val Leu Gly Val Phe Thr Lys Phe Arg Asn
625 630 635
act ccc atc gtc aag gcc aca aac cgg gag ctg tcc tac ctc ctc ctc 2269
Thr Pro Ile Val Lys Ala Thr Asn Arg Glu Leu Ser Tyr Leu Leu Leu
640 645 650
ttc tcc ttg ctc tgc tgc ttc tct agc tca ttg ttc ttc att gga gag 2317
Phe Ser Leu Leu Cys Cys Phe Ser Ser Ser Leu Phe Phe Ile Gly Glu
655 660 665 670
cca cag aac tgg act tgc cgt ctg cgg cag cca gct ttt ggc atc agc 2365
Pro Gln Asn Trp Thr Cys Arg Leu Arg Gln Pro Ala Phe Gly Ile Ser
675 680 685
ttt gtc ctc tgc atc tcc tgc atc ctg gtg aaa acc aat cgt gtc ctg 2413
Phe Val Leu Cys Ile Ser Cys Ile Leu Val Lys Thr Asn Arg Val Leu
690 695 700
ctt gtc ttc gag gca aag atc cct aca agc ctc cac cga aaa tgg tgg 2461
Leu Val Phe Glu Ala Lys Ile Pro Thr Ser Leu His Arg Lys Trp Trp
705 710 715
ggc ctc aac ctc cag ttc ctc ctg gtc ttc ttg tgc aca ttt gtg cag 2509
Gly Leu Asn Leu Gln Phe Leu Leu Val Phe Leu Cys Thr Phe Val Gln
720 725 730
att gtc atc tgc gtg att tgg ctc tac acg gcc cca cca tcc agt tat 2557
Ile Val Ile Cys Val Ile Trp Leu Tyr Thr Ala Pro Pro Ser Ser Tyr
735 740 745 750
cga aac cat gag ctg gag gat gag att atc ttc atc acc tgc cat gaa 2605
Arg Asn His Glu Leu Glu Asp Glu Ile Ile Phe Ile Thr Cys His Glu
755 760 765
ggc tcc ttg atg gcc ctt ggc ttc ctc att ggc tac acc tgt ctc ctg 2653
Gly Ser Leu Met Ala Leu Gly Phe Leu Ile Gly Tyr Thr Cys Leu Leu
770 775 780
gca gcc atc tgc ttc ttc ttt gcc ttt aag tct cga aaa ctg cct gag 2701
Ala Ala Ile Cys Phe Phe Phe Ala Phe Lys Ser Arg Lys Leu Pro Glu
785 790 795
aac ttc aat gag gcc aag ttc atc acc ttc agc atg ctg atc ttc ttc 2749
Asn Phe Asn Glu Ala Lys Phe Ile Thr Phe Ser Met Leu Ile Phe Phe
800 805 810
att gtc tgg atc tcc ttc atc cct gct tac gcc agc aca tat ggc aaa 2797
Ile Val Trp Ile Ser Phe Ile Pro Ala Tyr Ala Ser Thr Tyr Gly Lys
815 820 825 830
ttt gtc tct gct gtg gag gtg att gca ata ctg gct gcc agt ttt ggg 2845
Phe Val Ser Ala Val Glu Val Ile Ala Ile Leu Ala Ala Ser Phe Gly
835 840 845
ctt ctg gcc tgc atc ttc ttt aac aaa gtc tac atc atc ctc ttc aag 2893
Leu Leu Ala Cys Ile Phe Phe Asn Lys Val Tyr Ile Ile Leu Phe Lys
850 855 860
cct tcc cgc aac aca atc gag gag gtg cgc tgc agc aca gct gcc cac 2941
Pro Ser Arg Asn Thr Ile Glu Glu Val Arg Cys Ser Thr Ala Ala His
865 870 875
gct ttc aag gtg gcc gcc agg gcc acg ctg aga cgc agc aat gtg tca 2989
Ala Phe Lys Val Ala Ala Arg Ala Thr Leu Arg Arg Ser Asn Val Ser
880 885 890
cgc aag cgt tcc aac agc ctc gga ggt tcc acc ggt tcc acc cca tcc 3037
Arg Lys Arg Ser Asn Ser Leu Gly Gly Ser Thr Gly Ser Thr Pro Ser
895 900 905 910
tcc tcc atc agc agc aag agc aac cat gaa gac cct ttt cct cta ccg 3085
Ser Ser Ile Ser Ser Lys Ser Asn His Glu Asp Pro Phe Pro Leu Pro
915 920 925
gct tct gct gag cgg cag cgg cag cag cag cgt ggg tgc aag cag aag 3133
Ala Ser Ala Glu Arg Gln Arg Gln Gln Gln Arg Gly Cys Lys Gln Lys
930 935 940
gtc agc ttt ggg agt ggt acg gtc acc ttg tca ctg agt ttt gag gag 3181
Val Ser Phe Gly Ser Gly Thr Val Thr Leu Ser Leu Ser Phe Glu Glu
945 950 955
cca cag aag aac gcc atg gcc aac agg aac gcc aag cgc agg aac tcc 3229
Pro Gln Lys Asn Ala Met Ala Asn Arg Asn Ala Lys Arg Arg Asn Ser
960 965 970
ctg gag gcc cag aac agc gat gac agc ctg atg cgg cac agg gcc ctg 3277
Leu Glu Ala Gln Asn Ser Asp Asp Ser Leu Met Arg His Arg Ala Leu
975 980 985 990
ctc gct cta cag aac agc gag tcc ctc agt gcc gag cct ggc ttc cag 3325
Leu Ala Leu Gln Asn Ser Glu Ser Leu Ser Ala Glu Pro Gly Phe Gln
995 1000 1005
aca gca tcc agc cca gag acc agt tca cag gag tcg gta gtg gga gac 3373
Thr Ala Ser Ser Pro Glu Thr Ser Ser Gln Glu Ser Val Val Gly Asp
1010 1015 1020
aac aaa gaa gag gta cca aac cct gag gca gag ccc tcc ctg ccg tca 3421
Asn Lys Glu Glu Val Pro Asn Pro Glu Ala Glu Pro Ser Leu Pro Ser
1025 1030 1035
gct aac tcc cga aat ttt ata ggc act gga ggc agc tct gtc aca gaa 3469
Ala Asn Ser Arg Asn Phe Ile Gly Thr Gly Gly Ser Ser Val Thr Glu
1040 1045 1050
aac aca gta cat tcc taacaa aagaaggtca tgaaaagcac ttccccagga 3520
Asn Thr Val His Ser
1055
ggaacttgct cacctcttgc ttctgaatgg gaaagacaac aaagatacat atctgtgaca 3580
cagtcccacc acacattgtt gctatcacca gcagggtaaa acacgtgcct ccagaggaaa 3640
gactaccaga agcctgtgtg tggggagcct caaactgaat ttgcagttgc tttactgaaa 3700
tcaggacacg tggggaggac aagtgaagat tgcctctggt ggggcttaaa gtagaactct 3760
gcatattgtc ttgcctctgt aagcttttcc tgccagactg caactcagct gactatggga 3820
ggcactgagc aattccacta tactctgctt ttacatttat gtataatatt cctctttccc 3880
actatgtata atattccctc tttatccagt atatgtgatc tgtaaccacg tgcatcagga 3940
ctctcagctc ttcaaaagca agacacacgg tttcacttgg ggaaagcacg gtcattggga 4000
aaataaaaaa gcccccaaca tcctgcatgc tgtgtacagc caagggtgtg aacatgtaaa 4060
gtatttaatg tgacggagca ccctgctatt tatatttagt aatgtcccaa tttctcctct 4120
ctgcccagca ggaaatactg gacaataccc ttcatagact ccattgcact agaccaagct 4180
actaggttcc tactggtttc ttccagcaga tgtagcttta cctccagcct gcctgctttg 4240
gtggaagggg agaacaggtt gtaaatcccc ctggagattg ctgcgagagc acaatgagat 4300
gtattcgtga ttgattatgt cgctagtagt tgtatgctta acaaagtgtt gctgctgtaa 4360
tattccacat ggcatacgtg gctaaccctt ccacaccata gtcagtgttg tgctttgcca 4420
tattaatccg cctcataccc acacatagca ttgcgctggt tgtgacaata cttgtgggcc 4480
tgatacaaag ccaatgaaac aaggtgaaat ggagaaatag cccccaaatt tgataatatt 4540
tgagatgagt attgcaagtg tgcatgctgg tagaggatgg agtaaataaa acatacagag 4600
ttgggctctg agacgtgcaa acagacaaat gagtaaattg gatgtttggt tcctgtaggc 4660
cttcaagtac gttatgtccc tgttggccca tcttgaagag acagtaccta aacaagaaga 4720
gtgcactgtg ccttggtgag agtaaggact tcaaaagaga gcacatcaga acttcattag 4780
tcttggctct tgttcagcac cccaaaagta gacataagtg ctcctgactg cgcacgatgt 4840
gcccggttcc tctgcattct gcgaatgttg aagtaagaga gtccttagaa cagatttctg 4900
ttgcagcctg aagaaagaaa gagtgaccct aggcaacttg gcaggaaggg caaggttatt 4960
ctgtagaatt tacttccctc ttcccagatc ccatatgcaa aaacaggcat ttgtcatgag 5020
gatgtcagta cctgccctca tcacacacag aggcactcta gaccactgtg gaaaggtata 5080
taggcctgct acttattgtg aatggagatg aaaggactgt tgtgaatgtg atggggaaaa 5140
taccacaatt ctcttgttac tgtttttgct tggttgatgt tttgtgtttt tgtgtggttt 5200
ttttctcgcc agagcaggaa aataaaactt acaggtgaca ttactgcata aa 5252
<210> 2
<211> 1059
<212> PRT
<213> Gallus gallus
<400> 2
Met Thr Leu Tyr Ser Cys Cys Leu Ile Leu Leu Leu Phe Thr Trp Asn
1 5 10 15
Thr Ala Ala Tyr Gly Pro Asn Gln Arg Ala Gln Lys Lys Gly Asp Ile
20 25 30
Ile Leu Gly Gly Leu Phe Pro Ile His Phe Gly Val Ala Ala Lys Asp
35 40 45
Gln Asp Leu Lys Ser Arg Pro Glu Ser Val Glu Cys Ile Arg Tyr Asn
50 55 60
Phe Arg Gly Phe Arg Trp Leu Gln Ala Met Ile Phe Ala Ile Glu Glu
65 70 75 80
Ile Asn Asn Ser Pro Asn Leu Leu Pro Asn Met Thr Leu Gly Tyr Arg
85 90 95
Ile Phe Asp Thr Cys Asn Thr Val Ser Lys Ala Leu Glu Ala Thr Leu
100 105 110
Ser Phe Val Ala Gln Asn Lys Ile Asp Ser Leu Asn Leu Asp Glu Phe
115 120 125
Cys Asn Cys Ser Glu His Ile Pro Ser Thr Ile Ala Val Val Gly Ala
130 135 140
Thr Gly Ser Gly Val Ser Thr Ala Val Ala Asn Leu Leu Gly Leu Phe
145 150 155 160
Tyr Ile Pro Gln Val Ser Tyr Ala Ser Ser Ser Arg Leu Leu Ser Asn
165 170 175
Lys Asn Gln Phe Lys Ser Phe Leu Arg Thr Ile Pro Asn Asp Glu His
180 185 190
Gln Ala Thr Ala Met Ala Asp Ile Ile Glu Tyr Phe Arg Trp Asn Trp
195 200 205
Val Gly Thr Ile Ala Ala Asp Asp Asp Tyr Gly Arg Pro Gly Ile Glu
210 215 220
Lys Phe Arg Glu Glu Ala Glu Glu Arg Asp Ile Cys Ile Asp Phe Ser
225 230 235 240
Glu Leu Ile Ser Gln Tyr Ser Asp Glu Glu Glu Ile Gln Gln Val Val
245 250 255
Glu Val Ile Gln Asn Ser Thr Ala Arg Val Ile Val Val Phe Ser Ser
260 265 270
Gly Pro Asp Leu Glu Pro Leu Ile Lys Glu Ile Val Arg Arg Asn Ile
275 280 285
Thr Gly Lys Ile Trp Leu Ala Ser Glu Ala Trp Ala Ser Ser Ser Leu
290 295 300
Ile Ala Met Pro Glu Phe Phe Arg Val Ile Gly Ser Thr Ile Gly Phe
305 310 315 320
Ala Leu Lys Ala Gly Gln Ile Pro Gly Phe Arg Glu Phe Leu Gln Lys
325 330 335
Val His Pro Lys Lys Ser Ala Asn Asn Gly Phe Ala Lys Glu Phe Trp
340 345 350
Glu Glu Thr Phe Asn Cys Tyr Leu Pro Ser Glu Ser Lys Asn Ser Pro
355 360 365
Ala Ser Ala Ser Phe His Lys Ala His Glu Glu Gly Leu Gly Ala Gly
370 375 380
Asn Gly Thr Ala Ala Phe Arg Pro Pro Cys Thr Gly Asp Glu Asn Ile
385 390 395 400
Thr Ser Val Glu Thr Pro Tyr Met Asp Phe Thr His Leu Arg Ile Ser
405 410 415
Tyr Asn Val Tyr Leu Ala Val Tyr Ser Ile Ala His Ala Leu Gln Asp
420 425 430
Ile Tyr Thr Cys Thr Pro Gly Lys Gly Leu Phe Thr Asn Gly Ser Cys
435 440 445
Ala Asp Ile Lys Lys Val Glu Ala Trp Gln Val Leu Lys His Leu Arg
450 455 460
His Leu Asn Phe Thr Ser Asn Met Gly Glu Gln Val Asp Phe Asp Glu
465 470 475 480
Phe Gly Asp Leu Val Gly Asn Tyr Ser Ile Ile Asn Trp His Leu Ser
485 490 495
Pro Glu Asp Gly Ser Val Val Phe Glu Glu Val Gly His Tyr Asn Val
500 505 510
Tyr Ala Lys Lys Gly Glu Arg Leu Phe Ile Asn Glu Asn Lys Ile Leu
515 520 525
Trp Ser Gly Phe Ser Lys Glu Val Pro Phe Ser Asn Cys Ser Arg Asp
530 535 540
Cys Leu Pro Gly Thr Arg Lys Gly Ile Ile Glu Gly Glu Pro Thr Cys
545 550 555 560
Cys Phe Glu Cys Val Asp Cys Pro Asp Gly Glu Tyr Ser Asp Glu Thr
565 570 575
Asp Ala Ser Ala Cys Asp Lys Cys Pro Glu Asp Tyr Trp Ser Asn Glu
580 585 590
Asn His Thr Ser Cys Ile Pro Lys Gln Ile Glu Phe Leu Ser Trp Thr
595 600 605
Glu Pro Phe Gly Ile Ala Leu Thr Leu Phe Ala Val Leu Gly Ile Phe
610 615 620
Leu Thr Ser Phe Val Leu Gly Val Phe Thr Lys Phe Arg Asn Thr Pro
625 630 635 640
Ile Val Lys Ala Thr Asn Arg Glu Leu Ser Tyr Leu Leu Leu Phe Ser
645 650 655
Leu Leu Cys Cys Phe Ser Ser Ser Leu Phe Phe Ile Gly Glu Pro Gln
660 665 670
Asn Trp Thr Cys Arg Leu Arg Gln Pro Ala Phe Gly Ile Ser Phe Val
675 680 685
Leu Cys Ile Ser Cys Ile Leu Val Lys Thr Asn Arg Val Leu Leu Val
690 695 700
Phe Glu Ala Lys Ile Pro Thr Ser Leu His Arg Lys Trp Trp Gly Leu
705 710 715 720
Asn Leu Gln Phe Leu Leu Val Phe Leu Cys Thr Phe Val Gln Ile Val
725 730 735
Ile Cys Val Ile Trp Leu Tyr Thr Ala Pro Pro Ser Ser Tyr Arg Asn
740 745 750
His Glu Leu Glu Asp Glu Ile Ile Phe Ile Thr Cys His Glu Gly Ser
755 760 765
Leu Met Ala Leu Gly Phe Leu Ile Gly Tyr Thr Cys Leu Leu Ala Ala
770 775 780
Ile Cys Phe Phe Phe Ala Phe Lys Ser Arg Lys Leu Pro Glu Asn Phe
785 790 795 800
Asn Glu Ala Lys Phe Ile Thr Phe Ser Met Leu Ile Phe Phe Ile Val
805 810 815
Trp Ile Ser Phe Ile Pro Ala Tyr Ala Ser Thr Tyr Gly Lys Phe Val
820 825 830
Ser Ala Val Glu Val Ile Ala Ile Leu Ala Ala Ser Phe Gly Leu Leu
835 840 845
Ala Cys Ile Phe Phe Asn Lys Val Tyr Ile Ile Leu Phe Lys Pro Ser
850 855 860
Arg Asn Thr Ile Glu Glu Val Arg Cys Ser Thr Ala Ala His Ala Phe
865 870 875 880
Lys Val Ala Ala Arg Ala Thr Leu Arg Arg Ser Asn Val Ser Arg Lys
885 890 895
Arg Ser Asn Ser Leu Gly Gly Ser Thr Gly Ser Thr Pro Ser Ser Ser
900 905 910
Ile Ser Ser Lys Ser Asn His Glu Asp Pro Phe Pro Leu Pro Ala Ser
915 920 925
Ala Glu Arg Gln Arg Gln Gln Gln Arg Gly Cys Lys Gln Lys Val Ser
930 935 940
Phe Gly Ser Gly Thr Val Thr Leu Ser Leu Ser Phe Glu Glu Pro Gln
945 950 955 960
Lys Asn Ala Met Ala Asn Arg Asn Ala Lys Arg Arg Asn Ser Leu Glu
965 970 975
Ala Gln Asn Ser Asp Asp Ser Leu Met Arg His Arg Ala Leu Leu Ala
980 985 990
Leu Gln Asn Ser Glu Ser Leu Ser Ala Glu Pro Gly Phe Gln Thr Ala
995 1000 1005
Ser Ser Pro Glu Thr Ser Ser Gln Glu Ser Val Val Gly Asp Asn Lys
1010 1015 1020
Glu Glu Val Pro Asn Pro Glu Ala Glu Pro Ser Leu Pro Ser Ala Asn
1025 1030 1035 1040
Ser Arg Asn Phe Ile Gly Thr Gly Gly Ser Ser Val Thr Glu Asn Thr
1045 1050 1055
Val His Ser
<210> 3
<211> 5252
<212> DNA
<213> Gallus gallus
<220>
<221> CDS
<222> (308)..(3484)
<220>
<221> mutation
<222> (3194)
<400> 3
gggcaagagc tggtggcggc aggagcggcc ccggcggcgg gacgagttct tgaagatggg 60
ctctctgtaa tgctttggtc atgaagaaac aaggaacact gaattgctgt tttacaatgg 120
agaaaacaga gggacaaata ccagcactgt ggcttccacc ttgttgctta tctctctgca 180
gacatgtgtc ccaaatgctc tctgggctgt attaaggaaa ggaaaagctt agacattaca 240
acatccgctt tcttacattg tcttttccaa ttttacatcc tataacccct tggtgaaagg 300
aggaaca atg act tta tat agc tgc tgt ttg att ctt ttg ctg ttt acc 349
Met Thr Leu Tyr Ser Cys Cys Leu Ile Leu Leu Leu Phe Thr
1 5 10
tgg aac act gct gcc tat ggg cca aac caa cgg gca cag aag aag gga 397
Trp Asn Thr Ala Ala Tyr Gly Pro Asn Gln Arg Ala Gln Lys Lys Gly
15 20 25 30
gac att att ctt gga gga ttg ttc ccc atc cat ttt gga gtg gct gct 445
Asp Ile Ile Leu Gly Gly Leu Phe Pro Ile His Phe Gly Val Ala Ala
35 40 45
aaa gac cag gat cta aag tca aga ccc gaa tca gtg gag tgc ata agg 493
Lys Asp Gln Asp Leu Lys Ser Arg Pro Glu Ser Val Glu Cys Ile Arg
50 55 60
tat aat ttc cga ggc ttc cgc tgg ctc cag gct atg atc ttt gcc ata 541
Tyr Asn Phe Arg Gly Phe Arg Trp Leu Gln Ala Met Ile Phe Ala Ile
65 70 75
gaa gaa ata aat aat agc cca aat ctc ctt ccc aac atg acc ttg gga 589
Glu Glu Ile Asn Asn Ser Pro Asn Leu Leu Pro Asn Met Thr Leu Gly
80 85 90
tac agg ata ttt gac act tgc aat aca gtc tct aaa gcc ctt gag gcc 637
Tyr Arg Ile Phe Asp Thr Cys Asn Thr Val Ser Lys Ala Leu Glu Ala
95 100 105 110
act ctg agt ttt gtg gcc cag aac aag ata gac tcc ttg aac ctg gat 685
Thr Leu Ser Phe Val Ala Gln Asn Lys Ile Asp Ser Leu Asn Leu Asp
115 120 125
gaa ttc tgc aac tgc tca gaa cat atc cct tcc acc att gca gtc gtg 733
Glu Phe Cys Asn Cys Ser Glu His Ile Pro Ser Thr Ile Ala Val Val
130 135 140
ggg gca acc ggc tct ggg gtt tcc acc gct gtg gcc aat ctg ctg gga 781
Gly Ala Thr Gly Ser Gly Val Ser Thr Ala Val Ala Asn Leu Leu Gly
145 150 155
ctc ttt tac ata cct cag gtc agc tat gcc tca tcc agt cgt ctc ttg 829
Leu Phe Tyr Ile Pro Gln Val Ser Tyr Ala Ser Ser Ser Arg Leu Leu
160 165 170
agc aac aag aac cag ttc aag tcc ttc ctc cgc aca atc ccc aat gac 877
Ser Asn Lys Asn Gln Phe Lys Ser Phe Leu Arg Thr Ile Pro Asn Asp
175 180 185 190
gag cat cag gcc act gcg atg gca gac atc atc gag tac ttc cgc tgg 925
Glu His Gln Ala Thr Ala Met Ala Asp Ile Ile Glu Tyr Phe Arg Trp
195 200 205
aac tgg gtg gga acg att gca gct gat gat gac tat ggc cgg cca ggg 973
Asn Trp Val Gly Thr Ile Ala Ala Asp Asp Asp Tyr Gly Arg Pro Gly
210 215 220
att gaa aag ttt cgg gag gag gcg gag gag aga gat atc tgc att gat 1021
Ile Glu Lys Phe Arg Glu Glu Ala Glu Glu Arg Asp Ile Cys Ile Asp
225 230 235
ttt agt gag ctc atc tcc cag tac tca gat gaa gaa gag att cag cag 1069
Phe Ser Glu Leu Ile Ser Gln Tyr Ser Asp Glu Glu Glu Ile Gln Gln
240 245 250
gtg gtg gag gtc atc cag aac tcc aca gca cga gtg att gtg gtt ttc 1117
Val Val Glu Val Ile Gln Asn Ser Thr Ala Arg Val Ile Val Val Phe
255 260 265 270
tcc agt gga cca gac ctg gaa ccc ctc atc aaa gag att gtc agg cga 1165
Ser Ser Gly Pro Asp Leu Glu Pro Leu Ile Lys Glu Ile Val Arg Arg
275 280 285
aac atc act gga aag atc tgg ctg gca agt gaa gcc tgg gcc agt tca 1213
Asn Ile Thr Gly Lys Ile Trp Leu Ala Ser Glu Ala Trp Ala Ser Ser
290 295 300
tcc ctg ata gcc atg cca gag ttc ttc cgt gtc atc ggc agc acc att 1261
Ser Leu Ile Ala Met Pro Glu Phe Phe Arg Val Ile Gly Ser Thr Ile
305 310 315
ggg ttt gca ctg aag gca ggc cag atc cca ggc ttt cgc gag ttc ctg 1309
Gly Phe Ala Leu Lys Ala Gly Gln Ile Pro Gly Phe Arg Glu Phe Leu
320 325 330
cag aag gtg cat ccc aag aag tct gcc aac aat gga ttt gcc aag gag 1357
Gln Lys Val His Pro Lys Lys Ser Ala Asn Asn Gly Phe Ala Lys Glu
335 340 345 350
ttt tgg gaa gag aca ttt aac tgc tat ctc ccc agt gag tcc aaa aat 1405
Phe Trp Glu Glu Thr Phe Asn Cys Tyr Leu Pro Ser Glu Ser Lys Asn
355 360 365
tct cca gct tca gct tcc ttc cac aag gcc cac gaa gag ggc ttg gga 1453
Ser Pro Ala Ser Ala Ser Phe His Lys Ala His Glu Glu Gly Leu Gly
370 375 380
gct gga aat ggt aca gct gcc ttc cga cct cca tgc aca ggt gat gag 1501
Ala Gly Asn Gly Thr Ala Ala Phe Arg Pro Pro Cys Thr Gly Asp Glu
385 390 395
aac atc acc agt gtg gaa aca ccg tac atg gac ttc aca cac ttg cgg 1549
Asn Ile Thr Ser Val Glu Thr Pro Tyr Met Asp Phe Thr His Leu Arg
400 405 410
ata tcc tat aat gta tat ttg gca gta tat tct att gct cac gct ttg 1597
Ile Ser Tyr Asn Val Tyr Leu Ala Val Tyr Ser Ile Ala His Ala Leu
415 420 425 430
cag gat ata tat act tgt acc cct ggg aaa gga ctc ttc acc aac gga 1645
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435 440 445
tcc tgt gca gac att aag aag gtt gag gca tgg cag gtt ctg aag cac 1693
Ser Cys Ala Asp Ile Lys Lys Val Glu Ala Trp Gln Val Leu Lys His
450 455 460
ctg cgc cac tta aat ttc acc agt aac atg ggg gag caa gtg gac ttt 1741
Leu Arg His Leu Asn Phe Thr Ser Asn Met Gly Glu Gln Val Asp Phe
465 470 475
gat gag ttt gga gac ctg gtg ggg aat tac tca ata atc aac tgg cat 1789
Asp Glu Phe Gly Asp Leu Val Gly Asn Tyr Ser Ile Ile Asn Trp His
480 485 490
ctc tct cca gag gat ggc tca gtc gtc ttt gag gag gtt ggg cac tac 1837
Leu Ser Pro Glu Asp Gly Ser Val Val Phe Glu Glu Val Gly His Tyr
495 500 505 510
aat gtg tat gcc aag aaa ggg gag agg ctc ttt atc aat gaa aac aaa 1885
Asn Val Tyr Ala Lys Lys Gly Glu Arg Leu Phe Ile Asn Glu Asn Lys
515 520 525
atc ctg tgg agt gga ttc tca aag gag gtg ccc ttc tct aac tgc agc 1933
Ile Leu Trp Ser Gly Phe Ser Lys Glu Val Pro Phe Ser Asn Cys Ser
530 535 540
agg gac tgc ctg cca ggc acc agg aag ggc att att gag gga gag ccc 1981
Arg Asp Cys Leu Pro Gly Thr Arg Lys Gly Ile Ile Glu Gly Glu Pro
545 550 555
act tgc tgc ttc gag tgt gtg gac tgc cct gat gga gag tac agt gat 2029
Thr Cys Cys Phe Glu Cys Val Asp Cys Pro Asp Gly Glu Tyr Ser Asp
560 565 570
gaa aca gat gca agt gct tgt gac aag tgc cct gag gat tac tgg tct 2077
Glu Thr Asp Ala Ser Ala Cys Asp Lys Cys Pro Glu Asp Tyr Trp Ser
575 580 585 590
aat gag aac cac aca tcc tgc atc ccc aag cag ata gag ttt cta tcc 2125
Asn Glu Asn His Thr Ser Cys Ile Pro Lys Gln Ile Glu Phe Leu Ser
595 600 605
tgg aca gag ccc ttt gga atc gct tta act ctc ttt gct gtg ctg gga 2173
Trp Thr Glu Pro Phe Gly Ile Ala Leu Thr Leu Phe Ala Val Leu Gly
610 615 620
att ttc ctg act tct ttt gtc ctg gga gtc ttc acc aaa ttt cgc aac 2221
Ile Phe Leu Thr Ser Phe Val Leu Gly Val Phe Thr Lys Phe Arg Asn
625 630 635
act ccc atc gtc aag gcc aca aac cgg gag ctg tcc tac ctc ctc ctc 2269
Thr Pro Ile Val Lys Ala Thr Asn Arg Glu Leu Ser Tyr Leu Leu Leu
640 645 650
ttc tcc ttg ctc tgc tgc ttc tct agc tca ttg ttc ttc att gga gag 2317
Phe Ser Leu Leu Cys Cys Phe Ser Ser Ser Leu Phe Phe Ile Gly Glu
655 660 665 670
cca cag aac tgg act tgc cgt ctg cgg cag cca gct ttt ggc atc agc 2365
Pro Gln Asn Trp Thr Cys Arg Leu Arg Gln Pro Ala Phe Gly Ile Ser
675 680 685
ttt gtc ctc tgc atc tcc tgc atc ctg gtg aaa acc aat cgt gtc ctg 2413
Phe Val Leu Cys Ile Ser Cys Ile Leu Val Lys Thr Asn Arg Val Leu
690 695 700
ctt gtc ttc gag gca aag atc cct aca agc ctc cac cga aaa tgg tgg 2461
Leu Val Phe Glu Ala Lys Ile Pro Thr Ser Leu His Arg Lys Trp Trp
705 710 715
ggc ctc aac ctc cag ttc ctc ctg gtc ttc ttg tgc aca ttt gtg cag 2509
Gly Leu Asn Leu Gln Phe Leu Leu Val Phe Leu Cys Thr Phe Val Gln
720 725 730
att gtc atc tgc gtg att tgg ctc tac acg gcc cca cca tcc agt tat 2557
Ile Val Ile Cys Val Ile Trp Leu Tyr Thr Ala Pro Pro Ser Ser Tyr
735 740 745 750
cga aac cat gag ctg gag gat gag att atc ttc atc acc tgc cat gaa 2605
Arg Asn His Glu Leu Glu Asp Glu Ile Ile Phe Ile Thr Cys His Glu
755 760 765
ggc tcc ttg atg gcc ctt ggc ttc ctc att ggc tac acc tgt ctc ctg 2653
Gly Ser Leu Met Ala Leu Gly Phe Leu Ile Gly Tyr Thr Cys Leu Leu
770 775 780
gca gcc atc tgc ttc ttc ttt gcc ttt aag tct cga aaa ctg cct gag 2701
Ala Ala Ile Cys Phe Phe Phe Ala Phe Lys Ser Arg Lys Leu Pro Glu
785 790 795
aac ttc aat gag gcc aag ttc atc acc ttc agc atg ctg atc ttc ttc 2749
Asn Phe Asn Glu Ala Lys Phe Ile Thr Phe Ser Met Leu Ile Phe Phe
800 805 810
att gtc tgg atc tcc ttc atc cct gct tac gcc agc aca tat ggc aaa 2797
Ile Val Trp Ile Ser Phe Ile Pro Ala Tyr Ala Ser Thr Tyr Gly Lys
815 820 825 830
ttt gtc tct gct gtg gag gtg att gca ata ctg gct gcc agt ttt ggg 2845
Phe Val Ser Ala Val Glu Val Ile Ala Ile Leu Ala Ala Ser Phe Gly
835 840 845
ctt ctg gcc tgc atc ttc ttt aac aaa gtc tac atc atc ctc ttc aag 2893
Leu Leu Ala Cys Ile Phe Phe Asn Lys Val Tyr Ile Ile Leu Phe Lys
850 855 860
cct tcc cgc aac aca atc gag gag gtg cgc tgc agc aca gct gcc cac 2941
Pro Ser Arg Asn Thr Ile Glu Glu Val Arg Cys Ser Thr Ala Ala His
865 870 875
gct ttc aag gtg gcc gcc agg gcc acg ctg aga cgc agc aat gtg tca 2989
Ala Phe Lys Val Ala Ala Arg Ala Thr Leu Arg Arg Ser Asn Val Ser
880 885 890
cgc aag cgt tcc aac agc ctc gga ggt tcc acc ggt tcc acc cca tcc 3037
Arg Lys Arg Ser Asn Ser Leu Gly Gly Ser Thr Gly Ser Thr Pro Ser
895 900 905 910
tcc tcc atc agc agc aag agc aac cat gaa gac cct ttt cct cta ccg 3085
Ser Ser Ile Ser Ser Lys Ser Asn His Glu Asp Pro Phe Pro Leu Pro
915 920 925
gct tct gct gag cgg cag cgg cag cag cag cgt ggg tgc aag cag aag 3133
Ala Ser Ala Glu Arg Gln Arg Gln Gln Gln Arg Gly Cys Lys Gln Lys
930 935 940
gtc agc ttt ggg agt ggt acg gtc acc ttg tca ctg agt ttt gag gag 3181
Val Ser Phe Gly Ser Gly Thr Val Thr Leu Ser Leu Ser Phe Glu Glu
945 950 955
cca cag aag aac gcc atg gcc aac agg aac gcc aag cgc agg aac tcc 3229
Pro Gln Lys Asn Ala Met Ala Asn Arg Asn Ala Lys Arg Arg Asn Ser
960 965 970
ctg gag gcc cag aac agc gat gac agc ctg atg cgg cac agg gcc ctg 3277
Leu Glu Ala Gln Asn Ser Asp Asp Ser Leu Met Arg His Arg Ala Leu
975 980 985 990
ctc gct cta cag aac agc gag tcc ctc agt gcc gag cct ggc ttc cag 3325
Leu Ala Leu Gln Asn Ser Glu Ser Leu Ser Ala Glu Pro Gly Phe Gln
995 1000 1005
aca gca tcc agc cca gag acc agt tca cag gag tcg gta gtg gga gac 3373
Thr Ala Ser Ser Pro Glu Thr Ser Ser Gln Glu Ser Val Val Gly Asp
1010 1015 1020
aac aaa gaa gag gta cca aac cct gag gca gag ccc tcc ctg ccg tca 3421
Asn Lys Glu Glu Val Pro Asn Pro Glu Ala Glu Pro Ser Leu Pro Ser
1025 1030 1035
gct aac tcc cga aat ttt ata ggc act gga ggc agc tct gtc aca gaa 3469
Ala Asn Ser Arg Asn Phe Ile Gly Thr Gly Gly Ser Ser Val Thr Glu
1040 1045 1050
aac aca gta cat tcc taacaa aagaaggtca tgaaaagcac ttccccagga 3520
Asn Thr Val His Ser
1055
ggaacttgct cacctcttgc ttctgaatgg gaaagacaac aaagatacat atctgtgaca 3580
cagtcccacc acacattgtt gctatcacca gcagggtaaa acacgtgcct ccagaggaaa 3640
gactaccaga agcctgtgtg tggggagcct caaactgaat ttgcagttgc tttactgaaa 3700
tcaggacacg tggggaggac aagtgaagat tgcctctggt ggggcttaaa gtagaactct 3760
gcatattgtc ttgcctctgt aagcttttcc tgccagactg caactcagct gactatggga 3820
ggcactgagc aattccacta tactctgctt ttacatttat gtataatatt cctctttccc 3880
actatgtata atattccctc tttatccagt atatgtgatc tgtaaccacg tgcatcagga 3940
ctctcagctc ttcaaaagca agacacacgg tttcacttgg ggaaagcacg gtcattggga 4000
aaataaaaaa gcccccaaca tcctgcatgc tgtgtacagc caagggtgtg aacatgtaaa 4060
gtatttaatg tgacggagca ccctgctatt tatatttagt aatgtcccaa tttctcctct 4120
ctgcccagca ggaaatactg gacaataccc ttcatagact ccattgcact agaccaagct 4180
actaggttcc tactggtttc ttccagcaga tgtagcttta cctccagcct gcctgctttg 4240
gtggaagggg agaacaggtt gtaaatcccc ctggagattg ctgcgagagc acaatgagat 4300
gtattcgtga ttgattatgt cgctagtagt tgtatgctta acaaagtgtt gctgctgtaa 4360
tattccacat ggcatacgtg gctaaccctt ccacaccata gtcagtgttg tgctttgcca 4420
tattaatccg cctcataccc acacatagca ttgcgctggt tgtgacaata cttgtgggcc 4480
tgatacaaag ccaatgaaac aaggtgaaat ggagaaatag cccccaaatt tgataatatt 4540
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ttgggctctg agacgtgcaa acagacaaat gagtaaattg gatgtttggt tcctgtaggc 4660
cttcaagtac gttatgtccc tgttggccca tcttgaagag acagtaccta aacaagaaga 4720
gtgcactgtg ccttggtgag agtaaggact tcaaaagaga gcacatcaga acttcattag 4780
tcttggctct tgttcagcac cccaaaagta gacataagtg ctcctgactg cgcacgatgt 4840
gcccggttcc tctgcattct gcgaatgttg aagtaagaga gtccttagaa cagatttctg 4900
ttgcagcctg aagaaagaaa gagtgaccct aggcaacttg gcaggaaggg caaggttatt 4960
ctgtagaatt tacttccctc ttcccagatc ccatatgcaa aaacaggcat ttgtcatgag 5020
gatgtcagta cctgccctca tcacacacag aggcactcta gaccactgtg gaaaggtata 5080
taggcctgct acttattgtg aatggagatg aaaggactgt tgtgaatgtg atggggaaaa 5140
taccacaatt ctcttgttac tgtttttgct tggttgatgt tttgtgtttt tgtgtggttt 5200
ttttctcgcc agagcaggaa aataaaactt acaggtgaca ttactgcata aa 5252
<210> 4
<211> 1059
<212> PRT
<213> Gallus gallus
<400> 4
Met Thr Leu Tyr Ser Cys Cys Leu Ile Leu Leu Leu Phe Thr Trp Asn
1 5 10 15
Thr Ala Ala Tyr Gly Pro Asn Gln Arg Ala Gln Lys Lys Gly Asp Ile
20 25 30
Ile Leu Gly Gly Leu Phe Pro Ile His Phe Gly Val Ala Ala Lys Asp
35 40 45
Gln Asp Leu Lys Ser Arg Pro Glu Ser Val Glu Cys Ile Arg Tyr Asn
50 55 60
Phe Arg Gly Phe Arg Trp Leu Gln Ala Met Ile Phe Ala Ile Glu Glu
65 70 75 80
Ile Asn Asn Ser Pro Asn Leu Leu Pro Asn Met Thr Leu Gly Tyr Arg
85 90 95
Ile Phe Asp Thr Cys Asn Thr Val Ser Lys Ala Leu Glu Ala Thr Leu
100 105 110
Ser Phe Val Ala Gln Asn Lys Ile Asp Ser Leu Asn Leu Asp Glu Phe
115 120 125
Cys Asn Cys Ser Glu His Ile Pro Ser Thr Ile Ala Val Val Gly Ala
130 135 140
Thr Gly Ser Gly Val Ser Thr Ala Val Ala Asn Leu Leu Gly Leu Phe
145 150 155 160
Tyr Ile Pro Gln Val Ser Tyr Ala Ser Ser Ser Arg Leu Leu Ser Asn
165 170 175
Lys Asn Gln Phe Lys Ser Phe Leu Arg Thr Ile Pro Asn Asp Glu His
180 185 190
Gln Ala Thr Ala Met Ala Asp Ile Ile Glu Tyr Phe Arg Trp Asn Trp
195 200 205
Val Gly Thr Ile Ala Ala Asp Asp Asp Tyr Gly Arg Pro Gly Ile Glu
210 215 220
Lys Phe Arg Glu Glu Ala Glu Glu Arg Asp Ile Cys Ile Asp Phe Ser
225 230 235 240
Glu Leu Ile Ser Gln Tyr Ser Asp Glu Glu Glu Ile Gln Gln Val Val
245 250 255
Glu Val Ile Gln Asn Ser Thr Ala Arg Val Ile Val Val Phe Ser Ser
260 265 270
Gly Pro Asp Leu Glu Pro Leu Ile Lys Glu Ile Val Arg Arg Asn Ile
275 280 285
Thr Gly Lys Ile Trp Leu Ala Ser Glu Ala Trp Ala Ser Ser Ser Leu
290 295 300
Ile Ala Met Pro Glu Phe Phe Arg Val Ile Gly Ser Thr Ile Gly Phe
305 310 315 320
Ala Leu Lys Ala Gly Gln Ile Pro Gly Phe Arg Glu Phe Leu Gln Lys
325 330 335
Val His Pro Lys Lys Ser Ala Asn Asn Gly Phe Ala Lys Glu Phe Trp
340 345 350
Glu Glu Thr Phe Asn Cys Tyr Leu Pro Ser Glu Ser Lys Asn Ser Pro
355 360 365
Ala Ser Ala Ser Phe His Lys Ala His Glu Glu Gly Leu Gly Ala Gly
370 375 380
Asn Gly Thr Ala Ala Phe Arg Pro Pro Cys Thr Gly Asp Glu Asn Ile
385 390 395 400
Thr Ser Val Glu Thr Pro Tyr Met Asp Phe Thr His Leu Arg Ile Ser
405 410 415
Tyr Asn Val Tyr Leu Ala Val Tyr Ser Ile Ala His Ala Leu Gln Asp
420 425 430
Ile Tyr Thr Cys Thr Pro Gly Lys Gly Leu Phe Thr Asn Gly Ser Cys
435 440 445
Ala Asp Ile Lys Lys Val Glu Ala Trp Gln Val Leu Lys His Leu Arg
450 455 460
His Leu Asn Phe Thr Ser Asn Met Gly Glu Gln Val Asp Phe Asp Glu
465 470 475 480
Phe Gly Asp Leu Val Gly Asn Tyr Ser Ile Ile Asn Trp His Leu Ser
485 490 495
Pro Glu Asp Gly Ser Val Val Phe Glu Glu Val Gly His Tyr Asn Val
500 505 510
Tyr Ala Lys Lys Gly Glu Arg Leu Phe Ile Asn Glu Asn Lys Ile Leu
515 520 525
Trp Ser Gly Phe Ser Lys Glu Val Pro Phe Ser Asn Cys Ser Arg Asp
530 535 540
Cys Leu Pro Gly Thr Arg Lys Gly Ile Ile Glu Gly Glu Pro Thr Cys
545 550 555 560
Cys Phe Glu Cys Val Asp Cys Pro Asp Gly Glu Tyr Ser Asp Glu Thr
565 570 575
Asp Ala Ser Ala Cys Asp Lys Cys Pro Glu Asp Tyr Trp Ser Asn Glu
580 585 590
Asn His Thr Ser Cys Ile Pro Lys Gln Ile Glu Phe Leu Ser Trp Thr
595 600 605
Glu Pro Phe Gly Ile Ala Leu Thr Leu Phe Ala Val Leu Gly Ile Phe
610 615 620
Leu Thr Ser Phe Val Leu Gly Val Phe Thr Lys Phe Arg Asn Thr Pro
625 630 635 640
Ile Val Lys Ala Thr Asn Arg Glu Leu Ser Tyr Leu Leu Leu Phe Ser
645 650 655
Leu Leu Cys Cys Phe Ser Ser Ser Leu Phe Phe Ile Gly Glu Pro Gln
660 665 670
Asn Trp Thr Cys Arg Leu Arg Gln Pro Ala Phe Gly Ile Ser Phe Val
675 680 685
Leu Cys Ile Ser Cys Ile Leu Val Lys Thr Asn Arg Val Leu Leu Val
690 695 700
Phe Glu Ala Lys Ile Pro Thr Ser Leu His Arg Lys Trp Trp Gly Leu
705 710 715 720
Asn Leu Gln Phe Leu Leu Val Phe Leu Cys Thr Phe Val Gln Ile Val
725 730 735
Ile Cys Val Ile Trp Leu Tyr Thr Ala Pro Pro Ser Ser Tyr Arg Asn
740 745 750
His Glu Leu Glu Asp Glu Ile Ile Phe Ile Thr Cys His Glu Gly Ser
755 760 765
Leu Met Ala Leu Gly Phe Leu Ile Gly Tyr Thr Cys Leu Leu Ala Ala
770 775 780
Ile Cys Phe Phe Phe Ala Phe Lys Ser Arg Lys Leu Pro Glu Asn Phe
785 790 795 800
Asn Glu Ala Lys Phe Ile Thr Phe Ser Met Leu Ile Phe Phe Ile Val
805 810 815
Trp Ile Ser Phe Ile Pro Ala Tyr Ala Ser Thr Tyr Gly Lys Phe Val
820 825 830
Ser Ala Val Glu Val Ile Ala Ile Leu Ala Ala Ser Phe Gly Leu Leu
835 840 845
Ala Cys Ile Phe Phe Asn Lys Val Tyr Ile Ile Leu Phe Lys Pro Ser
850 855 860
Arg Asn Thr Ile Glu Glu Val Arg Cys Ser Thr Ala Ala His Ala Phe
865 870 875 880
Lys Val Ala Ala Arg Ala Thr Leu Arg Arg Ser Asn Val Ser Arg Lys
885 890 895
Arg Ser Asn Ser Leu Gly Gly Ser Thr Gly Ser Thr Pro Ser Ser Ser
900 905 910
Ile Ser Ser Lys Ser Asn His Glu Asp Pro Phe Pro Leu Pro Ala Ser
915 920 925
Ala Glu Arg Gln Arg Gln Gln Gln Arg Gly Cys Lys Gln Lys Val Ser
930 935 940
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945 950 955 960
Lys Asn Ala Met Ala Asn Arg Asn Ala Lys Arg Arg Asn Ser Leu Glu
965 970 975
Ala Gln Asn Ser Asp Asp Ser Leu Met Arg His Arg Ala Leu Leu Ala
980 985 990
Leu Gln Asn Ser Glu Ser Leu Ser Ala Glu Pro Gly Phe Gln Thr Ala
995 1000 1005
Ser Ser Pro Glu Thr Ser Ser Gln Glu Ser Val Val Gly Asp Asn Lys
1010 1015 1020
Glu Glu Val Pro Asn Pro Glu Ala Glu Pro Ser Leu Pro Ser Ala Asn
1025 1030 1035 1040
Ser Arg Asn Phe Ile Gly Thr Gly Gly Ser Ser Val Thr Glu Asn Thr
1045 1050 1055
Val His Ser
<210> 5
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Chicken CaSR_F
<400> 5
agcaatgtgt cacgcaag 18
<210> 6
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Chicken CaSR_R
<400> 6
gcctataaaa tttcgggagt 20
Claims (5)
- (a) 닭 시료의 게놈 유전자와 닭 유래의 칼슘감지수용체(CaSR) 유전자에 대응되는 증폭용 프라이머를 사용하여 PCR 방법으로 칼슘감지수용체 유전자를 증폭하는 단계;(b) 상기 증폭된 칼슘감지수용체 유전자를 RFLP 방법으로 제한효소 Nco Ⅰ에 처리한 다음, 상기 유전자 처리물에서 칼슘감지수용체의 미스센스 돌연변이(염기치환)에 의한 대립 유전자형의 차이에 따른 시료별 SNP 표지 인자를 검출하는 단계; 및(c) 상기 검출된 SNP 표지 인자로부터 닭의 시산일령, 난중, 산란수 또는 체중을 예측하는 단계;를 포함하여 이루어지는 닭의 유전적 경제형질을 판정하는 방법.
- 제 1 항에 있어서,상기 (a) 단계에서 증폭용 프라이머는 서열번호 5와 6으로 표시된 프라이머를 사용하는 것을 특징으로 하는 닭의 유전적 경제형질을 판정하는 방법.
- 제 1 항에 있어서,상기 칼슘감지수용체(CaSR) 유전자는 서열번호 1로 표시되는 염기서열인 것을 특징으로 하는 닭의 유전전 경제형질을 판정하는 방법.
- 제 3 항에 있어서,상기 (b) 단계의 미스센스 돌연변이는 서열번호 1에 표시된 염기서열에서 3,194번째(G↔T)의 염기치환으로 발생되는 것임을 특징으로 하는 닭의 유전적 경제형질을 판정하는 방법.
- 제 1 항 내지 제 4 항 어느 한 항에 있어서,상기 (b)의 대립 유전자형은 서열번호 1로 표시되는 유전자로만 이루어지는 AA 유전자형, 서열번호 1로 표시된 유전자와 서열번호 2로 표시되는 유전자로 이루어진 AS 유전자형 또는 서열번호 2로 표시되는 유전자로만 이루어지는 SS 유전자형인 것을 특징으로 하는 닭의 유전적 경제형질을 판정하는 방법.
Priority Applications (1)
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| KR1020070120686A KR101136964B1 (ko) | 2007-11-26 | 2007-11-26 | 닭의 칼슘감지수용체 유전자를 이용하여 닭의 유전적경제형질을 판정하는 방법 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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| KR1020070120686A KR101136964B1 (ko) | 2007-11-26 | 2007-11-26 | 닭의 칼슘감지수용체 유전자를 이용하여 닭의 유전적경제형질을 판정하는 방법 |
Publications (2)
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Family
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Family Applications (1)
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| KR1020070120686A KR101136964B1 (ko) | 2007-11-26 | 2007-11-26 | 닭의 칼슘감지수용체 유전자를 이용하여 닭의 유전적경제형질을 판정하는 방법 |
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| KR (1) | KR101136964B1 (ko) |
Families Citing this family (5)
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| CN112746109B (zh) * | 2021-01-15 | 2022-07-05 | 广西大学 | 基于全基因组测序筛选的与南丹瑶鸡体重、体尺相关的snp分子标记组合及应用 |
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| CN114921572B (zh) * | 2022-06-17 | 2023-05-05 | 江西农业大学 | 一种用于鉴别泰和乌鸡品种的snp分子标记及其应用 |
| CN117070639B (zh) * | 2023-08-08 | 2024-02-02 | 江苏省家禽科学研究所 | 与鸡产蛋总重关联的snp遗传标记在鸡遗传育种中的应用 |
Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6210964B1 (en) | 1997-08-18 | 2001-04-03 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Avian extracellular calcium-sensing receptor |
-
2007
- 2007-11-26 KR KR1020070120686A patent/KR101136964B1/ko not_active IP Right Cessation
Patent Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6210964B1 (en) | 1997-08-18 | 2001-04-03 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Avian extracellular calcium-sensing receptor |
Non-Patent Citations (2)
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|---|
| 홍윤숙, 한경대학교 생물환경정보통신전문대학원 석사학위논문 (2007.08.) * |
| 홍윤숙, 한경대학교 생물환경정보통신전문대학원 석사학위논문 (2007.08.)* |
Also Published As
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|---|---|
| KR20090054024A (ko) | 2009-05-29 |
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