KR101000608B1 - 검버섯 발생 진단 키트 및 검버섯 발생 진단 방법 - Google Patents

검버섯 발생 진단 키트 및 검버섯 발생 진단 방법 Download PDF

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Abstract

본 발명은 검버섯 발생 진단 키트 및 검버섯 발생 진단 방법에 관한 것으로서, 구체적으로는 검버섯 발생에 따라 발현 패턴이 변화되는 유전자를 확인하여 검버섯 발생을 진단하기 위하여, 상기 유전자 서열의 폴리뉴클레오티드와 혼성화하는 프로브로서 하나 이상의 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드; 상기 유전자 서열의 폴리뉴클레오티드의 프라이머 쌍; 또는 상기 유전자에 의하여 코딩되는 폴리펩티드에 대한 모노클로날 항체를 하나 이상 포함하는 검버섯 발생 진단 키트 및 그를 이용하는 검버섯 발생 진단 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따르면 검버섯 발생에 따라 피부세포에서 정상치 이상으로 발현이 증가되는 64종의 유전자 및 발현이 감소되는 118종의 유전자를 검버섯 발생 마커 유전자로 하여 피부에서의 검버섯 발생을 빠르게 진단할 수 있다.
검버섯, 피부, 키트, 유전자 발현

Description

검버섯 발생 진단 키트 및 검버섯 발생 진단 방법 {Method and kit for diagnosis of Seborrheic keratosis}
본 발명은 검버섯 발생 진단 키트 및 검버섯 발생 진단 방법에 관한 것으로서, 구체적으로는 검버섯 발생에 따라 발현 패턴이 변화되는 유전자를 확인하여 검버섯 발생을 진단하기 위하여, 상기 유전자 서열의 폴리뉴클레오티드와 혼성화하는 프로브로서 하나 이상의 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드; 상기 유전자 서열의 폴리뉴클레오티드의 프라이머 쌍; 또는 상기 유전자에 의하여 코딩되는 폴리펩티드에 대한 모노클로날 항체를 하나 이상 포함하는 검버섯 발생 진단 키트 및 그를 이용하는 검버섯 발생 진단 방법에 관한 것이다.
사람의 유전체는 3x109개의 염기쌍으로 구성되어 있고, 대략 5 만개의 유전자를 가지고 있는 것으로 추측되며, 하나의 세포에서 발현되는 기능성 유전자의 개수는 대략 10,000개 정도로 추정된다. 즉 하나의 세포는 50,000개의 유전자 중 약 10,000개의 단백질만을 선택적으로 만들어내고 있으며, 어떤 단백질을 만들어내느냐에 따라 그 세포의 기능적 특성이 결정된다. 세포의 유전자 발현 특성의 차이는 서로 다른 세포 간에 나타날 뿐만 아니라, 동일한 세포의 병적인 상황, 예를 들면 정상 세포와 검버섯으로 흑화된 세포 간에도 나타난다. 종래의 생명과학은 이러한 유전자 발현의 변화를 일대일의 관계로부터 찾는 것이 관례였으나, 특정 단백질의 작용은 하나의 단백질에 국한되는 것이 아니고, 다양한 단백질의 발현에 관여하며, 세포의 특성은 특정 단백질 하나에 의하여 결정되는 것이 아니라 다양한 단백질들의 특성이 총체적으로 조화를 이룸으로써 결정된다고 판단되기 때문에 과거의 접근은 매우 제한적일 수밖에 없었다.
검버섯은 햇빛에 노출되는 부위에 발생하는 원형 또는 타원형의 갈색 또는 검은색 반점 또는 융기된 형태로서, 얼굴, 등, 손등, 팔, 다리 등의 자외선 노출 부위에 많이 나타나지만 다른 부위에도 발생할 수 있다. 그러나 피부의 검버섯 발생 과정에서 외부 자극 (UV, ROS 등)과 검버섯 발생 사이의 인과 관계가 명확하지 않기 때문에 효과적인 검버섯 발생 조절 방법이 개발되지 못하고 있다. 또한, 검버섯의 특성을 총체적으로 이해하기 위해 다양한 단백질들의 특성을 이해하려는 시도 또한 효능 물질 (코지산, 하이드로퀴논 등) 이나 자극원 (UV, ROS)을 세포에 처리한 배양 시스템 내 연구에 국한되어 그 한계를 가지고 있다.
이에, 본 발명자들은 인체의 얼굴 피부 조직을 제공 받아 검버섯 발생에 따라 변화되는 유전자의 행동 패턴을 분석함으로써, 검버섯 발생 과정에 관련된 주요 유전자 발현 패턴을 추적하여 이를 검버섯 발생에 대한 분자 표적으로 사용할 수 있다는 사실을 새로이 규명하였다. 따라서 본 발명의 목적은 검버섯 발생에 따라 발현이 증가 혹은 감소하는 유전자를 찾아내어, 이를 마커로 하는 검버섯 발생 진단 키트 및 검버섯 발생 진단 방법을 제공하는 것이다. 또한, 시험 화합물이 상기 유전자로부터 코딩된 단백질의 작용을 촉진 또는 억제하는지를 확인하여 검버섯 발생 억제제를 스크리닝하는 방법을 제공하는 것을 목적으로 한다.
상기 과제를 해결하기 위하여, 본 발명은 WNT3(NM_030753, 괄호안은 NCBI의 genebank accession ID를 의미함), TFIP11(NM_001008697;NM_012143), DUS3L(NM_020175), CDH3(NM_001793), PLAU(NM_002658), AQP3(NM_004925), CENPO(NM_024322), CDCP1(NM_022842;NM_178181), NEFL(NM_006158), TAX1BP3(NM_014604), COPZ2(NM_016429), SSBP3(NM_001009955;NM_018070;NM_145716), TNFRSF21(NM_014452), ZFP14(NM_020917), LOXL2(NM_002318), CCL2(NM_002982), RNASET2(NM_003730), KRTCAP3(NM_173853), SLC38A5(NM_033518), ZNRF1(NM_032268), TNC(NM_002160), SYT12(NM_177963), SYXBP5L(XM_045911;XM_938898), RBM14(NM_006328), GSR(NM_000637), ZC3HAV1(NM_020119;NM_024625), AQP3(NM_004925), MGC17330(NM_052880), PRSS16(NM_005865), MYO1F(NM_012335), SLC12A4(NM_005072), ITGA2(NM_002203), WNT5B(NM_030775;NM_032642), HNRPU(NM_004501;NM_031844), LTB4R2(NM_019839), KCNC4(NM_001039574;NM_004978;NM_153763), H2AFY2(NM_018649), BTN2A2(NM_006995;NM_181531), DYNLL2(NM_080677), ETV5(NM_004454), PCDHB13(NM_018933), ITGB4(NM_000213;NM_001005619;NM_001005731), GGA2(NM_015044), JAG2(NM_002226;NM_145159), COL17A1(NM_000494;NM_130778), DLX2(NM_004405), LDLR(NM_000527), GPRC5C(NM_018653;NM_022036), FBXO4(NM_012176;NM_033484), STC1(NM_003155), COL4A2(NM_001846), ADAMTSL3(NM_207517), KLC4(NM_138343;NM_201521;NM_201522;NM_201523), ID1(NM_002165;NM_181353), GALNT14(NM_024572), PAX6(NM_000280;NM_001604), IGFL1(BG775668), PLAT(BX641021), TNS4(AF370421), CLSTN1(AB020718), HOXA7(NM_006896), SILV(AK092881), MX1(AK096355) 및 CIDEB(AK122828)로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편으로서 10개 이상의 연속 뉴클레오티드를 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드; 및 상기 폴리뉴클레오티드를 표면에 결합시킨 고상 지지체를 포함하며, 진단 대상 피부세포의 전사체 중에서 상기 폴리뉴클레오티드에 혼성화된 전사체의 양이 정상치(본 발명에서 “정상치”란, 검버섯이 발생되지 않은 대조군을 의미하며, 보다 구체적으로는 검버섯이 발생되지 않은 대조군에 대한 측정 평균치를 의미함)보다 많으면 검버섯 발생 피부로 진단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 키트를 제공하고, CEP70(NM_024491), FIGN(NM_018086), PPIG(NM_004792), VGLL3(NM_016206), CDH19(NM_021153), CNTN3(NM_020872), INVS(NM_014425;NM_183245), RSN(NM_002956;NM_198240), DACT1(NM_016651), PLCB4(NM_000933;NM_182797), ERO1L(NM_014584), MGC34646(NM_173519), ZC3H7B(NM_017590), CNIH4(NM_014184), AKR1C3(NM_003739), GLDN(NM_181789), SCARA5(NM_173833), C17orf57(NM_152347), ERO1LB(NM_019891), SNX25(NM_031953), CBWD2;CBWD3;CBWD1(NM_172003;NM_201453;NM_018491), PNLIPRP3(NM_001011709), LRRC17(NM_001031692;NM_005824), RNUX1T1(NM_004349;NM_175634;NM_175635;NM_175636), C20orf19(NM_018474), PDZRN3(NM_015009), TMEM47(NM_031442), ARID4B(NM_016374;NM_031371), RBMS3(NM_001003792;NM_001003793;NM_014483), ECM2(NM_001393), RGS13(NM_002927;NM_144766), FIGN(NM_018086), LZIC(NM_032368), UQCRB(NM_006294), IL17D(NM_138284), ASPH(NM_004318;NM_020164;NM_032466;NM_032467;NM_032468), AKAP9(NM_005751;NM_147166;NM_147171;NM_147185), ZNF594(XM_290737;XM_932723;XM_932728;XM_932737;XM_940636;XM_944691;XM_944696;XM_944702), OSR2(NM_053001), FLJ21986(NM_024913), IRAK1BP1(NM_001010844), IGFBP7(NM_001553), BNIP3(NM_004052), PELI2(NM_021255), AGTPBP1(NM_015239), RBMS3(NM_001003792;NM_001003793;NM_014483), COL14A1(NM_021110), CFH(NM_000186;NM_001014975), PTGIS(NM_000961), SNED1(XM_059482;XM_940984), CDH12(NM_004061), PHIP(NM_017934), PNN(NM_002687), NDUFS4(NM_002495), ZNF521(NM_015461), VNN1(NM_004666), TRPS1(NM_014112), ABCA8(NM_007168), MRPS22(NM_020191), BDP1(NM_018429), MAMDC2(NM_153267), PCDH19(NM_020766), AMYA1;AMY1B;AMY1C;AMY2A;AMY2B(NM_001008221;NM_004038;NM_001008218;NM_001008219;NM_000699;NM_020978), PLEKHH2(NM_172069), DYNC2LI1(NM_001012665;NM_015522;NM_016008), MRPS22(NM_020191), FLJ46688(NM_001004330), ELOVL4(NM_022726), BRWD1(NM_001007246;NM_018963;NM_033656), MFAP5(NM_003480), ZNF415(NM_018355), PZP(NM_002864), KIAA1377(NM_020802), ZNF292(XM_048070;XM_932361;XM_932366;XM_938563;XM_943726;XM_943729), ATXN3(NM_001024631;NM_004993;NM_030660), EDG2(NM_001401;NM_057159), STEAP1(NM_012449), ZNF91(NM_003430), TTC3(NM_001001894;NM_003316), OMD(NM_005014), ECHDC1(NM_018479), OGN(NM_014057;NM_024416;NM_033014), SDCCAG1(NM_004713), AGR2(NM_006408), PPAP2B(NM_003713;NM_177414), ZNF83(NM_018300), DYNC2LI1(NM_001012665;NM_015522;NM_016008), USP53(NM_019050), C11orf74(NM_138787), JMJD11C(NM_004241), PCM1(NM_006197), FLJ20152(NM_001034850;NM_019000), FBNL1(NM_001996;NM_006485;NM_006486;NM_006487), CROP(NM_006107;NM_016424), ESCO1(NM_052911), GTF2F2(NM_004128), DCN(NM_001920;NM_133503;NM_133504;NM_133505;NM_133506;NM_133507), KIF5B(NM_004521), C20orf19(NM_018474), CFH;CFHR1(NM_000186;NM_001014975;NM_002113), DPT(NM_001937), AKR1C1(NM_001353), PAPPA(NM_002581), KIAA0738(NM_014719), LDB3(NM_007078), RECK(NM_021111), MLL5(NM_018682;NM_182931), PPARG(NM_005037;NM_015869;NM_138711;NM_138712), RBMS3(NM_001003792;NM_001003793;NM_014483), COX7C(NM_001867), AOX1(L11005), WISP2(AK074695), LOX(NM_002317), CFD(BQ712715), ICEBERG(DB328860), SCEL(BC047536), DEFB1(BG696638) 및 SPINK5(DQ149928)로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편으로서 10개 이상의 연속 뉴클레오티드를 포함하는 폴리뉴클레오티드, 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드; 및 상기 폴리뉴클레오티드를 표면에 결합시킨 고상 지지체를 포함하며, 진단 대상 피부세포의 전사체 중에서 상기 폴리뉴클레오티드에 혼성화된 전사체의 양이 정상치보다 적으면 검버섯 발생 피부로 진단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 키트를 제공한다.
본 발명은 또한 WNT3, TFIP11, DUS3L, CDH3, PLAU, AQP3, CENPO, CDCP1, NEFL, TAX1BP3, COPZ2, SSBP3, TNFRSF21, ZFP14, LOXL2, CCL2, RNASET2, KRTCAP3, SLC38A5, ZNRF1, TNC, SYT12, SYXBP5L, RBM14, GSR, ZC3HAV1, AQP3, MGC17330, PRSS16, MYO1F, SLC12A4, ITGA2, WNT5B, HNRPU, LTB4R2, KCNC4, H2AFY2, BTN2A2, DYNLL2, ETV5, PCDHB13, ITGB4, GGA2, JAG2, COL17A1, DLX2, LDLR, GPRC5C, FBXO4, STC1, COL4A2, ADAMTSL3, KLC4, ID1, GALNT14, PAX6, IGFL1, PLAT, TNS4, CLSTN1, HOXA7, SILV, MX1 및 CIDEB로 이루어진 군으로부터 선택된 폴리뉴클레오티드의 단편으로서 18-22개의 연속 뉴클레오티드를 포함하는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드; 및 상기 군으로부터 선택된 폴리뉴클레오티드에 상보적인 폴리뉴클레오티드의 단편으로서 18-22개의 연속 뉴클레오티드를 포함하는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하며, 진단 대상 피부세포에서 상기 폴리뉴클레오티드들을 프라이머로 하여 증폭된 DNA 양이 정상치보다 많으면 검버섯 발생 피부로 진단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 키트를 제공하고, CEP70, FIGN, PPIG, VGLL3, CDH19, CNTN3, INVS, RSN, DACT1, PLCB4, ERO1L, MGC34646, ZC3H7B, CNIH4, AKR1C3, GLDN, SCARA5, C17orf57, ERO1LB, SNX25, CBWD2;CBWD3; CBWD1, PNLIPRP3, LRRC17, RNUX1T1, C20orf19, PDZRN3, TMEM47, ARID4B, RBMS3, ECM2, RGS13, FIGN, LZIC, UQCRB, IL17D, ASPH, AKAP9, ZNF594, OSR2, FLJ21986, IRAK1BP1, IGFBP7, BNIP3, PELI2, AGTPBP1, RBMS3, COL14A1, CFH, PTGIS, SNED1, CDH12, PHIP, PNN, NDUFS4, ZNF521, VNN1, TRPS1, ABCA8, MRPS22, BDP1, MAMDC2, PCDH19, AMYA1;AMY1B;AMY1C;AMY2A;AMY2B, PLEKHH2, DYNC2LI1, MRPS22, FLJ46688, ELOVL4, BRWD1, MFAP5, ZNF415, PZP, KIAA1377, ZNF292, ATXN3, EDG2, STEAP1, ZNF91, TTC3, OMD, ECHDC1, OGN, SDCCAG1, AGR2, PPAP2B, ZNF83, DYNC2LI1, USP53, C11orf74, JMJD11C, PCM1, FLJ20152, FBNL1, CROP, ESCO1, GTF2F2, DCN, KIF5B, C20orf19, CFH;CFHR1, DPT, AKR1C1, PAPPA, KIAA0738, LDB3, RECK, MLL5, PPARG, RBMS3, COX7C, AOX1, WISP2, LOX, CFD, ICEBERG, SCEL, DEFB1 및 SPINK5로 이루어진 군으로부터 선택된 폴리뉴클레오티드의 단편으로서 18-22개의 연속 뉴클레오티드를 포함하는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드; 및 상기 군으로부터 선택된 폴리뉴클레오티드에 상보적인 폴리뉴클레오티드의 단편으로서 18-22개의 연속 뉴클레오티드를 포함하는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하며, 진단 대상 피부세포에서 상기 폴리뉴클레오티드들을 프라이머로 하여 증폭된 DNA 양이 정상치보다 적으면 검버섯 발생 피부로 진단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 키트를 제공한다.
본 발명은 WNT3, TFIP11, DUS3L, CDH3, PLAU, AQP3, CENPO, CDCP1, NEFL, TAX1BP3, COPZ2, SSBP3, TNFRSF21, ZFP14, LOXL2, CCL2, RNASET2, KRTCAP3, SLC38A5, ZNRF1, TNC, SYT12, SYXBP5L, RBM14, GSR, ZC3HAV1, AQP3, MGC17330, PRSS16, MYO1F, SLC12A4, ITGA2, WNT5B, HNRPU, LTB4R2, KCNC4, H2AFY2, BTN2A2, DYNLL2, ETV5, PCDHB13, ITGB4, GGA2, JAG2, COL17A1, DLX2, LDLR, GPRC5C, FBXO4, STC1, COL4A2, ADAMTSL3, KLC4, ID1, GALNT14, PAX6, IGFL1, PLAT, TNS4, CLSTN1, HOXA7, SILV, MX1 및 CIDEB로 이루어진 군으로부터 선택된 유전자에 의하여 코딩되 는 폴리펩티드에 대한 모노클로날 항체를 하나 이상 포함하며, 진단 대상 피부세포에서 상기 항체에 결합된 항원의 양이 정상치보다 많으면 검버섯 발생 피부로 진단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 키트를 제공하고, CEP70, FIGN, PPIG, VGLL3, CDH19, CNTN3, INVS, RSN, DACT1, PLCB4, ERO1L, MGC34646, ZC3H7B, CNIH4, AKR1C3, GLDN, SCARA5, C17orf57, ERO1LB, SNX25, CBWD2;CBWD3; CBWD1, PNLIPRP3, LRRC17, RNUX1T1, C20orf19, PDZRN3, TMEM47, ARID4B, RBMS3, ECM2, RGS13, FIGN, LZIC, UQCRB, IL17D, ASPH, AKAP9, ZNF594, OSR2, FLJ21986, IRAK1BP1, IGFBP7, BNIP3, PELI2, AGTPBP1, RBMS3, COL14A1, CFH, PTGIS, SNED1, CDH12, PHIP, PNN, NDUFS4, ZNF521, VNN1, TRPS1, ABCA8, MRPS22, BDP1, MAMDC2, PCDH19, AMYA1;AMY1B;AMY1C;AMY2A;AMY2B, PLEKHH2, DYNC2LI1, MRPS22, FLJ46688, ELOVL4, BRWD1, MFAP5, ZNF415, PZP, KIAA1377, ZNF292, ATXN3, EDG2, STEAP1, ZNF91, TTC3, OMD, ECHDC1, OGN, SDCCAG1, AGR2, PPAP2B, ZNF83, DYNC2LI1, USP53, C11orf74, JMJD11C, PCM1, FLJ20152, FBNL1, CROP, ESCO1, GTF2F2, DCN, KIF5B, C20orf19, CFH;CFHR1, DPT, AKR1C1, PAPPA, KIAA0738, LDB3, RECK, MLL5, PPARG, RBMS3, COX7C, AOX1, WISP2, LOX, CFD, ICEBERG, SCEL, DEFB1 및 SPINK5로 이루어진 군으로부터 선택된 유전자에 의하여 코딩되는 폴리펩티드에 대한 모노클로날 항체를 하나 이상 포함하며, 진단 대상 피부세포에서 상기 항체에 결합된 항원의 양이 정상치보다 적으면 검버섯 발생 피부로 진단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 키트를 제공한다.
또한 본 발명은 검버섯 발생을 진단하는 방법, 보다 구체적으로는 검버섯 발생을 진단하기 위해 필요한 정보를 제공하는 방법으로서, 진단 대상 표피 중의 WNT3, TFIP11, DUS3L, CDH3, PLAU, AQP3, CENPO, CDCP1, NEFL, TAX1BP3, COPZ2, SSBP3, TNFRSF21, ZFP14, LOXL2, CCL2, RNASET2, KRTCAP3, SLC38A5, ZNRF1, TNC, SYT12, SYXBP5L, RBM14, GSR, ZC3HAV1, AQP3, MGC17330, PRSS16, MYO1F, SLC12A4, ITGA2, WNT5B, HNRPU, LTB4R2, KCNC4, H2AFY2, BTN2A2, DYNLL2, ETV5, PCDHB13, ITGB4, GGA2, JAG2, COL17A1, DLX2, LDLR, GPRC5C, FBXO4, STC1, COL4A2, ADAMTSL3, KLC4, ID1, GALNT14, PAX6, IGFL1, PLAT, TNS4, CLSTN1, HOXA7, SILV, MX1 및 CIDEB 유전자로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 발현량이 정상치보다 많으면 검버섯 발생 피부인 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 방법을 제공하고, 진단 대상 표피 중의 CEP70, FIGN, PPIG, VGLL3, CDH19, CNTN3, INVS, RSN, DACT1, PLCB4, ERO1L, MGC34646, ZC3H7B, CNIH4, AKR1C3, GLDN, SCARA5, C17orf57, ERO1LB, SNX25, CBWD2;CBWD3; CBWD1, PNLIPRP3, LRRC17, RNUX1T1, C20orf19, PDZRN3, TMEM47, ARID4B, RBMS3, ECM2, RGS13, FIGN, LZIC, UQCRB, IL17D, ASPH, AKAP9, ZNF594, OSR2, FLJ21986, IRAK1BP1, IGFBP7, BNIP3, PELI2, AGTPBP1, RBMS3, COL14A1, CFH, PTGIS, SNED1, CDH12, PHIP, PNN, NDUFS4, ZNF521, VNN1, TRPS1, ABCA8, MRPS22, BDP1, MAMDC2, PCDH19, AMYA1;AMY1B;AMY1C;AMY2A;AMY2B, PLEKHH2, DYNC2LI1, MRPS22, FLJ46688, ELOVL4, BRWD1, MFAP5, ZNF415, PZP, KIAA1377, ZNF292, ATXN3, EDG2, STEAP1, ZNF91, TTC3, OMD, ECHDC1, OGN, SDCCAG1, AGR2, PPAP2B, ZNF83, DYNC2LI1, USP53, C11orf74, JMJD11C, PCM1, FLJ20152, FBNL1, CROP, ESCO1, GTF2F2, DCN, KIF5B, C20orf19, CFH;CFHR1, DPT, AKR1C1, PAPPA, KIAA0738, LDB3, RECK, MLL5, PPARG, RBMS3, COX7C, AOX1, WISP2, LOX, CFD, ICEBERG, SCEL, DEFB1 및 SPINK5 유전자로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 발현량이 정상치보다 적으면 검버섯 발생 피부인 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 방법을 제공한다.
본 발명은 검버섯 발생 억제제를 스크리닝하는 방법으로서, 세포에 시험 물질을 처리하는 단계; 및 시험 물질 처리 후 세포 내 WNT3, TFIP11, DUS3L, CDH3, PLAU, AQP3, CENPO, CDCP1, NEFL, TAX1BP3, COPZ2, SSBP3, TNFRSF21, ZFP14, LOXL2, CCL2, RNASET2, KRTCAP3, SLC38A5, ZNRF1, TNC, SYT12, SYXBP5L, RBM14, GSR, ZC3HAV1, AQP3, MGC17330, PRSS16, MYO1F, SLC12A4, ITGA2, WNT5B, HNRPU, LTB4R2, KCNC4, H2AFY2, BTN2A2, DYNLL2, ETV5, PCDHB13, ITGB4, GGA2, JAG2, COL17A1, DLX2, LDLR, GPRC5C, FBXO4, STC1, COL4A2, ADAMTSL3, KLC4, ID1, GALNT14, PAX6, IGFL1, PLAT, TNS4, CLSTN1, HOXA7, SILV, MX1 및 CIDEB 로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자에 의하여 코딩되는 단백질의 발현이 억제되는지를 확인하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 억제제 스크리닝 방법을 제공하고, 세포에 시험 물질을 처리하는 단계; 및 시험 물질 ㅊ처처리 후 세포 내 CEP70, FIGN, PPIG, VGLL3, CDH19, CNTN3, INVS, RSN, DACT1, PLCB4, ERO1L, MGC34646, ZC3H7B, CNIH4, AKR1C3, GLDN, SCARA5, C17orf57, ERO1LB, SNX25, CBWD2;CBWD3; CBWD1, PNLIPRP3, LRRC17, RNUX1T1, C20orf19, PDZRN3, TMEM47, ARID4B, RBMS3, ECM2, RGS13, FIGN, LZIC, UQCRB, IL17D, ASPH, AKAP9, ZNF594, OSR2, FLJ21986, IRAK1BP1, IGFBP7, BNIP3, PELI2, AGTPBP1, RBMS3, COL14A1, CFH, PTGIS, SNED1, CDH12, PHIP, PNN, NDUFS4, ZNF521, VNN1, TRPS1, ABCA8, MRPS22, BDP1, MAMDC2, PCDH19, AMYA1;AMY1B;AMY1C;AMY2A;AMY2B, PLEKHH2, DYNC2LI1, MRPS22, FLJ46688, ELOVL4, BRWD1, MFAP5, ZNF415, PZP, KIAA1377, ZNF292, ATXN3, EDG2, STEAP1, ZNF91, TTC3, OMD, ECHDC1, OGN, SDCCAG1, AGR2, PPAP2B, ZNF83, DYNC2LI1, USP53, C11orf74, JMJD11C, PCM1, FLJ20152, FBNL1, CROP, ESCO1, GTF2F2, DCN, KIF5B, C20orf19, CFH;CFHR1, DPT, AKR1C1, PAPPA, KIAA0738, LDB3, RECK, MLL5, PPARG, RBMS3, COX7C, AOX1, WISP2, LOX, CFD, ICEBERG, SCEL, DEFB1 및 SPINK5로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자에 의하여 코딩되는 단백질의 발현이 촉진되는지를 확인하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 억제제 스크리닝 방법을 제공한다.
본 발명에 따르면 검버섯 발생에 따라 피부세포에서 발현이 증가되거나 감소되는 유전자를 검버섯 발생 마커로 하여 피부에서의 검버섯 발생 가능성을 민감하고 빠르게 진단할 수 있다. 또한, 본 발명의 상기 유전자로부터 코딩된 단백질 작용을 촉진 또는 억제하는지를 확인하여 검버섯 발생 억제제 후보 화합물의 효능을 스크리닝할 수 있다.
이하 본 발명을 더욱 구체적으로 설명한다.
본 발명에서는 검버섯 발생에 따라 피부세포에서 발현이 증가하는 56종의 유전자를 발굴하였고, 또한 검버섯 발생에 따라 피부세포에서 발현이 감소하는 110종 의 유전자를 발굴하였으며, 이들이 검버섯 발생과 관련이 있다는 사실은 아직까지 보고되지 않았다. 하기 표 1은 피부세포에서 검버섯 발생에 따라 발현이 증가한 유전자, 표 2는 피부세포에서 검버섯 발생에 따라 발현이 감소한 유전자를 나열한 것이다. Gene symbol은 공식 유전자 심볼을, Gene title은 각 유전자의 이름을, 그리고 mRNA accession No. 는 NCBI의 genebank accession ID를 의미한다.
Gene Symbol Gene Title mRNA Accession No
WNT3 wingless-type MMTV integration site family, member 3 NM_030753
TFIP11 tuftelin interacting protein 11 NM_001008697;NM_012143
DUS3L dihydrouridine synthase 3-like (S. cerevisiae) NM_020175
CDH3 cadherin 3, type 1, P-cadherin (placental) NM_001793
PLAU plasminogen activator, urokinase NM_002658
AQP3 aquaporin 3 (Gill blood group) NM_004925
CENPO centromere protein O NM_024322
CDCP1 CUB domain containing protein 1 NM_022842;NM_178181
NEFL neurofilament, light polypeptide 68kDa NM_006158
TAX1BP3 Tax1 (human T-cell leukemia virus type I) binding protein 3 NM_014604
COPZ2 coatomer protein complex, subunit zeta 2 NM_016429
SSBP3 single stranded DNA binding protein 3 NM_001009955;NM_018070;NM_145716
TNFRSF21 tumor necrosis factor receptor superfamily, member 21 NM_014452
ZFP14 zinc finger protein 14 homolog (mouse) NM_020917
LOXL2 lysyl oxidase-like 2 NM_002318
CCL2 chemokine (C-C motif) ligand 2 NM_002982
RNASET2 ribonuclease T2 NM_003730
KRTCAP3 keratinocyte associated protein 3 NM_173853
SLC38A5 solute carrier family 38, member 5 NM_033518
ZNRF1 zinc and ring finger 1 NM_032268
TNC tenascin C (hexabrachion) NM_002160
SYT12 synaptotagmin XII NM_177963
STXBP5L syntaxin binding protein 5-like XM_045911;XM_938898
RBM14 RNA binding motif protein 14 NM_006328
GSR glutathione reductase NM_000637
ZC3HAV1 zinc finger CCCH-type, antiviral 1 NM_020119;NM_024625
AQP3 aquaporin 3 (Gill blood group) NM_004925
MGC17330 HGFL gene NM_052880
PRSS16 protease, serine, 16 (thymus) NM_005865
MYO1F myosin IF NM_012335
SLC12A4 solute carrier family 12 (potassium/chloride transporters), member 4 NM_005072
ITGA2 integrin, alpha 2 (CD49B, alpha 2 subunit of VLA-2 receptor) NM_002203
WNT5B wingless-type MMTV integration site family, member 5B NM_030775;NM_032642
HNRPU heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U (scaffold attachment factor A) NM_004501;NM_031844
LTB4R2 leukotriene B4 receptor 2 NM_019839
KCNC4 potassium voltage-gated channel, Shaw-related subfamily, member 4 NM_001039574;NM_004978;NM_153763
H2AFY2 H2A histone family, member Y2 NM_018649
BTN2A2 butyrophilin, subfamily 2, member A2 NM_006995;NM_181531
DYNLL2 dynein, light chain, LC8-type 2 NM_080677
ETV5 ets variant gene 5 (ets-related molecule) NM_004454
PCDHB13 protocadherin beta 13 NM_018933
ITGB4 integrin, beta 4 NM_000213;NM_001005619;NM_001005731
GGA2 golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 2 NM_015044
JAG2 jagged 2 NM_002226;NM_145159
COL17A1 collagen, type XVII, alpha 1 NM_000494;NM_130778
DLX2 distal-less homeobox 2 NM_004405
LDLR low density lipoprotein receptor (familial hypercholesterolemia) NM_000527
GPRC5C G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C NM_018653;NM_022036
FBXO4 F-box protein 4 NM_012176;NM_033484
STC1 stanniocalcin 1 NM_003155
COL4A2 collagen, type IV, alpha 2 NM_001846
ADAMTSL3 ADAMTS-like 3 NM_207517
KLC4 kinesin light chain 4 NM_138343;NM_201521;NM_201522;NM_201523
ID1 inhibitor of DNA binding 1, dominant negative helix-loop-helix protein NM_002165;NM_181353
GALNT14 UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 (GalNAc-T14) NM_024572
PAX6 paired box gene 6 (aniridia, keratitis) NM_000280;NM_001604
IGFL1 IGF family-like member 1 BG775668
PLAT plasminogen activator, tissue BX641021
TNS4 tensin 4 AF370421
CLSTN1 calsyntenin 1 AB020718
HOXA7 homeobox A7 NM_006896
SILV silver homolog (mouse) AK092881
MX1 myxovirus (influenza virus) resistance 1, interferon-inducible protein p78 (mouse) /// myxovirus (influenza virus) resistance 1, interferon-inducible protein p78 (mouse) AK096355
CIDEB cell death-inducing DFFA-like effector b AK122828
Gene Symbol Gene Title mRNA Accession No
CEP70 centrosomal protein 70kDa NM_024491
FIGN fidgetin NM_018086
PPIG peptidylprolyl isomerase G (cyclophilin G) NM_004792
VGLL3 vestigial like 3 (Drosophila) NM_016206
CDH19 cadherin 19, type 2 NM_021153
CNTN3 contactin 3 (plasmacytoma associated) NM_020872
INVS inversin NM_014425;NM_183245
RSN restin (Reed-Steinberg cell-expressed intermediate filament-associated protein) NM_002956;NM_198240
DACT1 dapper, antagonist of beta-catenin, homolog 1 (Xenopus laevis) NM_016651
PLCB4 phospholipase C, beta 4 NM_000933;NM_182797
ERO1L ERO1-like (S. cerevisiae) NM_014584
MGC34646 hypothetical protein MGC34646 NM_173519
ZC3H7B zinc finger CCCH-type containing 7B NM_017590
CNIH4 cornichon homolog 4 (Drosophila) NM_014184
AKR1C3 aldo-keto reductase family 1, member C3 (3-alpha hydroxysteroid dehydrogenase, type II) NM_003739
GLDN gliomedin NM_181789
SCARA5 scavenger receptor class A, member 5 (putative) NM_173833
C17orf57 chromosome 17 open reading frame 57 NM_152347
ERO1LB ERO1-like beta (S. cerevisiae) NM_019891
SNX25 sorting nexin 25 NM_031953
CBWD2;CBWD3;CBWD1 COBW domain containing 2;COBW domain containing 3;COBW domain containing 1 NM_172003;NM_201453;NM_018491
PNLIPRP3 pancreatic lipase-related protein 3 NM_001011709
LRRC17 leucine rich repeat containing 17 NM_001031692;NM_005824
RUNX1T1 runt-related transcription factor 1;translocated to, 1 (cyclin D-related) NM_004349;NM_175634;NM_175635;NM_175636
C20orf19 chromosome 20 open reading frame 19 NM_018474
PDZRN3 PDZ domain containing RING finger 3 NM_015009
TMEM47 transmembrane protein 47 NM_031442
ARID4B AT rich interactive domain 4B (RBP1- like) NM_016374;NM_031371
RBMS3 RNA binding motif, single stranded interacting protein NM_001003792;NM_001003793;NM_014483
ECM2 extracellular matrix protein 2, female organ and adipocyte specific NM_001393
RGS13 regulator of G-protein signalling 13 NM_002927;NM_144766
FIGN fidgetin NM_018086
LZIC leucine zipper and CTNNBIP1 domain containing NM_032368
UQCRB ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein NM_006294
IL17D interleukin 17D NM_138284
ASPH aspartate beta-hydroxylase NM_004318;NM_020164;NM_032466;NM_032467;NM_032468
AKAP9 A kinase (PRKA) anchor protein (yotiao) 9 NM_005751;NM_147166;NM_147171;NM_147185
ZNF594 zinc finger protein 594 XM_290737;XM_932723;XM_932728;XM_932737;XM_940636;XM_944691;XM_944696;XM_944702
OSR2 odd-skipped related 2 (Drosophila) NM_053001
FLJ21986 hypothetical protein FLJ21986 NM_024913
IRAK1BP1 interleukin-1 receptor-associated kinase 1 binding protein 1 NM_001010844
IGFBP7 insulin-like growth factor binding protein 7 NM_001553
BNIP3 BCL2/adenovirus E1B 19kDa interacting protein 3 NM_004052
PELI2 pellino homolog 2 (Drosophila) NM_021255
AGTPBP1 ATP/GTP binding protein 1 NM_015239
RBMS3 RNA binding motif, single stranded interacting protein NM_001003792;NM_001003793;NM_014483
COL14A1 collagen, type XIV, alpha 1 (undulin) NM_021110
CFH complement factor H NM_000186;NM_001014975
PTGIS prostaglandin I2 (prostacyclin) synthase NM_000961
SNED1 sushi, nidogen and EGF-like domains 1 XM_059482;XM_940984
CDH12 cadherin 12, type 2 (N-cadherin 2) NM_004061
PHIP pleckstrin homology domain interacting protein NM_017934
PNN pinin, desmosome associated protein NM_002687
NDUFS4 NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 4, 18kDa (NADH-coenzyme Q reductase) NM_002495
ZNF521 zinc finger protein 521 NM_015461
VNN1 vanin 1 NM_004666
TRPS1 trichorhinophalangeal syndrome I NM_014112
ABCA8 ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 8 NM_007168
MRPS22 mitochondrial ribosomal protein S22 NM_020191
BDP1 B double prime 1, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor IIIB NM_018429
MAMDC2 MAM domain containing 2 NM_153267
PCDH19 protocadherin 19 NM_020766
AMY1A;AMY1B;AMY1C;AMY2A;AMY2B amylase, alpha 1A;salivary;amylase, alpha 1B;amylase, alpha 1C;amylase, alpha 2A;pancreatic;amylase, alpha 2B (pancreatic) NM_001008221;NM_004038;NM_001008218;NM_001008219;NM_000699;NM_020978
PLEKHH2 pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 2 NM_172069
DYNC2LI1 dynein, cytoplasmic 2, light intermediate chain 1 NM_001012665;NM_015522;NM_016008
MRPS22 mitochondrial ribosomal protein S22 NM_020191
FLJ46688 FLJ46688 protein NM_001004330
ELOVL4 elongation of very long chain fatty acids (FEN1/Elo2, SUR4/Elo3, yeast)-like 4 NM_022726
BRWD1 bromodomain and WD repeat domain containing 1 NM_001007246;NM_018963;NM_033656
MFAP5 microfibrillar associated protein 5 NM_003480
ZNF415 zinc finger protein 415 NM_018355
PZP pregnancy-zone protein NM_002864
KIAA1377 KIAA1377 NM_020802
ZNF292 zinc finger protein 292 XM_048070;XM_932361;XM_932366;XM_938563;XM_943726;XM_943729
ATXN3 ataxin 3 NM_001024631;NM_004993;NM_030660
EDG2 endothelial differentiation, lysophosphatidic acid G-protein-coupled receptor, 2 NM_001401;NM_057159
STEAP1 six transmembrane epithelial antigen of the prostate 1 NM_012449
ZNF91 zinc finger protein 91 NM_003430
TTC3 tetratricopeptide repeat domain 3 NM_001001894;NM_003316
OMD osteomodulin NM_005014
ECHDC1 enoyl Coenzyme A hydratase domain containing 1 NM_018479
OGN osteoglycin (osteoinductive factor, mimecan) NM_014057;NM_024416;NM_033014
SDCCAG1 serologically defined colon cancer antigen 1 NM_004713
AGR2 anterior gradient 2 homolog (Xenopus laevis) NM_006408
PPAP2B phosphatidic acid phosphatase type 2B NM_003713;NM_177414
ZNF83 zinc finger protein 83 NM_018300
DYNC2LI1 dynein, cytoplasmic 2, light intermediate chain 1 NM_001012665;NM_015522;NM_016008
USP53 ubiquitin specific peptidase 53 NM_019050
C11orf74 chromosome 11 open reading frame 74 NM_138787
JMJD1C jumonji domain containing 1C NM_004241
PCM1 pericentriolar material 1 NM_006197
FLJ20152 hypothetical protein FLJ20152 NM_001034850;NM_019000
FBLN1 fibulin 1 NM_001996;NM_006485;NM_006486;NM_006487
CROP cisplatin resistance-associated overexpressed protein NM_006107;NM_016424
ESCO1 establishment of cohesion 1 homolog 1 (S. cerevisiae) NM_052911
GTF2F2 general transcription factor IIF, polypeptide 2, 30kDa NM_004128
DCN decorin NM_001920;NM_133503;NM_133504;NM_133505;NM_133506;NM_133507
KIF5B kinesin family member 5B NM_004521
C20orf19 chromosome 20 open reading frame 19 NM_018474
CFH;CFHR1 complement factor H;complement factor H-related 1 NM_000186;NM_001014975;NM_002113
DPT dermatopontin NM_001937
AKR1C1 aldo-keto reductase family 1, member C1 (dihydrodiol dehydrogenase 1;20-alpha (3-alpha)-hydroxysteroid dehydrogenase) NM_001353
PAPPA pregnancy-associated plasma protein A, pappalysin 1 NM_002581
KIAA0738 KIAA0738 gene product NM_014719
LDB3 LIM domain binding 3 NM_007078
RECK reversion-inducing-cysteine-rich protein with kazal motifs NM_021111
MLL5 myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia 5 (trithorax homolog, Drosophila) NM_018682;NM_182931
PPARG peroxisome proliferative activated receptor, gamma NM_005037;NM_015869;NM_138711;NM_138712
RBMS3 RNA binding motif, single stranded interacting protein NM_001003792;NM_001003793;NM_014483
COX7C cytochrome c oxidase subunit VIIc NM_001867
AOX1 aldehyde oxidase 1 L11005
WISP2 WNT1 inducible signaling pathway protein 2 AK074695
LOX lysyl oxidase NM_002317
CFD complement factor D (adipsin) BQ712715
ICEBERG ICEBERG caspase-1 inhibitor DB328860
SCEL sciellin BC047536
DEFB1 defensin, beta 1 BG696638
SPINK5 serine peptidase inhibitor, Kazal type 5 DQ149928
본 발명의 진단 키트에서 프로브로 사용되는 폴리뉴클레오티드는 검버섯 발생에 따라 발현이 증가하거나 감소하는 마커 유전자의 전장(full length) 또는 그의 단편을 포함한다. 단편의 길이는 10개 이상의 연속 뉴클레오티드를 포함하는 것이 바람직한데, 이는 프로브의 길이가 10bps이하이면 비특이적으로 결합되기 때문이다.
본 발명의 진단 키트에서 프라이머로 사용되는 폴리뉴클레오티드는 그 길이가 18-22개인 것이 바람직하다. 이는 프라이머의 길이가 18bps미만이면 비특이적으로 결합되고, 22bps를 초과하면 프라이머끼리 자체 결합하여 효율성이 떨어지며, 제작시에도 비용과 기술적인 면에서 비생산적이기 때문이다.
본 발명의 진단 키트에 포함된, 마커 유전자에 의하여 코딩되는 폴리펩티드에 대한 모노클로날 항체는 일반적인 모노클로날 항체 제조방법으로 제조된다.
이하, 하기 구체예를 들어 본 발명을 더욱 구체적으로 설명한다. 하기 구체예는 본 발명을 설명하기 위한 것이고 한정하기 위한 것은 아니다.
<실시예 1: 검버섯 마커 유전자 확인>
1.조직 샘플의 제작
조직 샘플은 검버섯 증상을 보이는 환자 4명으로부터 회수하였다. 동일 환자의 병변부와 정상부 조직을 각각 생검하여 세트로 조직을 회수하고, DMEM 배지(10% FBS, 페니실린/스트렙토마이신 100x 첨가), 5% CO2 농도, 37℃ 가습 인큐베이터에서 3~5차례 계대 배양하였다.
2.조직샘플로부터 RNA 채취
3~5차례 계대 배양한 세포로부터 RNA를 정제하기 위해 트리졸(trizol, Invitrogen, Carlsbad, CA, USA) )을 첨가해 세포를 분쇄시킨 후 클로로포름을 넣어 상층액의 RNA를 분리하였다. 얻어진 상층액의 RNA를 농축하기 위해 동량의 이소프로파놀을 넣고 원심분리하여 침전된 RNA를 얻고, 염기 제거를 위해 70% 에탄올로 침전된 RNA를 세척하였다.
3.마이크로어레이 실험
총 54,675종의 인간 전사체(transcripts) 프로브가 집적된 유전자 칩 HG U133 Plus 2.0 (Affymetrix®로 마이크로어레이 실험을 수행하여 검버섯 발생에 따라 발현에 변화가 나타나는 유전자를 선택하고 그 발현 패턴을 확인하였다. 10 ug의 RNA를 cDNA 합성에 이용하여, in vitro 전사방법으로 비오틴화(Biotinylated) cRNA를 합성하였다. 구체적으로는, Affymetrix에서 제안하는 프로토콜을 따라, 먼저 T7 프라이머 및 역전사효소를 이용하여 RNA로부터 프로모터를 포함하는 cDNA를 합성한 후, 이중 가닥의 cDNA를 원형으로 사용하여 in vitro 전사 반응을 수행하여 cRNA를 합성하였다. in vitro 전사 반응은 cRNA 증폭 및 표지화(labeling)를 위하여 T7 RNA 중합효소 및 비오틴화 리보뉴클레오티드 유사체를 이용하였다. 이렇게 제조된 비오틴화 cRNAs는 절편화(fragmentation) 된 후 상기 유전자 칩에서 17 시간 동안 42℃에서 혼성화되었다. 상기 유전자 칩은 세척, 염색 후 스캐닝하였고, 데이터 전처리는 GenPlex 소프트웨어의 기본 정규화(normalization) 알고리즘인 Global scaling를 적용하였다. 그 결과, 검버섯 발생 샘플과 대조군 샘플과의 유전자 발현에서 유의적 차이를 보이는 유전자군을 p-value와 유전자 발현 증가폭의 비교로 도 1에 나타내었다. 유전자 발현 패턴을 기준으로, 발현이 감소된 유전자의 경우 50%이하로 감소하고 동시에 p-value가 0.05 이하인 유전자, 발현이 증가된 유전자의 경우 2배 이상 증가하고 동시에 p-value가 0.05 이하인 유전자(도 1에서 붉은색으로 표시된 부분)를 선택하여 검버섯 발생을 진단하는 데 활용될 수 있는 유전자 마커로서 추출하였다. 그 결과가 상기 표 1 내지 2에 나열된 유전자이다.
도 1은 피부세포에서 검버섯 발생에 따라 대조군과의 유전자 발현에서 유의적 차이를 보이는 유전자군을 p-value와 유전자 발현 증가폭의 비교로 나타낸 것이다.

Claims (10)

  1. WNT3(NM_030753)의 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편으로서 10개 이상의 연속 뉴클레오티드를 포함하는 폴리뉴클레오티드,
    또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드; 및
    상기 폴리뉴클레오티드를 표면에 결합시킨 고상 지지체를 포함하며,
    진단 대상 피부세포의 전사체 중에서 상기 폴리뉴클레오티드에 혼성화된 전사체의 양이 검버섯이 발생되지 않은 대조군보다 많으면 검버섯 발생 피부로 진단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 키트.
  2. 제 1 항에 있어서,
    상기 WNT3(NM_030753) 외에 추가적으로, TFIP11(NM_001008697;NM_012143), DUS3L(NM_020175), CDH3(NM_001793), PLAU(NM_002658), AQP3(NM_004925), CENPO(NM_024322), CDCP1(NM_022842;NM_178181), NEFL(NM_006158), TAX1BP3(NM_014604), COPZ2(NM_016429), SSBP3(NM_001009955;NM_018070;NM_145716), TNFRSF21(NM_014452), ZFP14(NM_020917), LOXL2(NM_002318), CCL2(NM_002982), RNASET2(NM_003730), KRTCAP3(NM_173853), SLC38A5(NM_033518), ZNRF1(NM_032268), TNC(NM_002160), SYT12(NM_177963), SYXBP5L(XM_045911;XM_938898), RBM14(NM_006328), GSR(NM_000637), ZC3HAV1(NM_020119;NM_024625), AQP3(NM_004925), MGC17330(NM_052880), PRSS16(NM_005865), MYO1F(NM_012335), SLC12A4(NM_005072), ITGA2(NM_002203), WNT5B(NM_030775;NM_032642), HNRPU(NM_004501;NM_031844), LTB4R2(NM_019839), KCNC4(NM_001039574;NM_004978;NM_153763), H2AFY2(NM_018649), BTN2A2(NM_006995;NM_181531), DYNLL2(NM_080677), ETV5(NM_004454), PCDHB13(NM_018933), ITGB4(NM_000213;NM_001005619;NM_001005731), GGA2(NM_015044), JAG2(NM_002226;NM_145159), COL17A1(NM_000494;NM_130778), DLX2(NM_004405), LDLR(NM_000527), GPRC5C(NM_018653;NM_022036), FBXO4(NM_012176;NM_033484), STC1(NM_003155), COL4A2(NM_001846), ADAMTSL3(NM_207517), KLC4(NM_138343;NM_201521;NM_201522;NM_201523), ID1(NM_002165;NM_181353), GALNT14(NM_024572), PAX6(NM_000280;NM_001604), IGFL1(BG775668), PLAT(BX641021), TNS4(AF370421), CLSTN1(AB020718), HOXA7(NM_006896), SILV(AK092881), MX1(AK096355) 및 CIDEB(AK122828)로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 폴리뉴클레오티드 또는 그 단편으로서 10개 이상의 연속 뉴클레오티드를 더 포함하는 폴리뉴클레오티드,
    또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드; 및
    상기 폴리뉴클레오티드를 표면에 결합시킨 고상 지지체를 포함하며,
    진단 대상 피부세포의 전사체 중에서 상기 폴리뉴클레오티드에 혼성화된 전사체의 양이 검버섯이 발생되지 않은 대조군보다 많으면 검버섯 발생 피부로 진단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 키트.
  3. WNT3(NM_030753)의 폴리뉴클레오티드의 단편으로서 18-22개의 연속 뉴클레오티드를 포함하는 폴리뉴클레오티드; 및
    상기 폴리뉴클레오티드에 상보적인 폴리뉴클레오티드의 단편으로서 18-22개의 연속 뉴클레오티드를 포함하는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하며,
    진단 대상 피부세포에서 상기 폴리뉴클레오티드들을 프라이머로 하여 증폭된 DNA 양이 검버섯이 발생되지 않은 대조군보다 많으면 검버섯 발생 피부로 진단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 키트.
  4. 제 3 항에 있어서,
    상기 WNT3(NM_030753) 외에 추가적으로, TFIP11(NM_001008697;NM_012143), DUS3L(NM_020175), CDH3(NM_001793), PLAU(NM_002658), AQP3(NM_004925), CENPO(NM_024322), CDCP1(NM_022842;NM_178181), NEFL(NM_006158), TAX1BP3(NM_014604), COPZ2(NM_016429), SSBP3(NM_001009955;NM_018070;NM_145716), TNFRSF21(NM_014452), ZFP14(NM_020917), LOXL2(NM_002318), CCL2(NM_002982), RNASET2(NM_003730), KRTCAP3(NM_173853), SLC38A5(NM_033518), ZNRF1(NM_032268), TNC(NM_002160), SYT12(NM_177963), SYXBP5L(XM_045911;XM_938898), RBM14(NM_006328), GSR(NM_000637), ZC3HAV1(NM_020119;NM_024625), AQP3(NM_004925), MGC17330(NM_052880), PRSS16(NM_005865), MYO1F(NM_012335), SLC12A4(NM_005072), ITGA2(NM_002203), WNT5B(NM_030775;NM_032642), HNRPU(NM_004501;NM_031844), LTB4R2(NM_019839), KCNC4(NM_001039574;NM_004978;NM_153763), H2AFY2(NM_018649), BTN2A2(NM_006995;NM_181531), DYNLL2(NM_080677), ETV5(NM_004454), PCDHB13(NM_018933), ITGB4(NM_000213;NM_001005619;NM_001005731), GGA2(NM_015044), JAG2(NM_002226;NM_145159), COL17A1(NM_000494;NM_130778), DLX2(NM_004405), LDLR(NM_000527), GPRC5C(NM_018653;NM_022036), FBXO4(NM_012176;NM_033484), STC1(NM_003155), COL4A2(NM_001846), ADAMTSL3(NM_207517), KLC4(NM_138343;NM_201521;NM_201522;NM_201523), ID1(NM_002165;NM_181353), GALNT14(NM_024572), PAX6(NM_000280;NM_001604), IGFL1(BG775668), PLAT(BX641021), TNS4(AF370421), CLSTN1(AB020718), HOXA7(NM_006896), SILV(AK092881), MX1(AK096355) 및 CIDEB(AK122828)로 이루어진 군으로부터 선택된 폴리뉴클레오티드의 단편으로서 18-22개의 연속 뉴클레오티드를 더 포함하는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드; 및
    상기 폴리뉴클레오티드에 상보적인 폴리뉴클레오티드의 단편으로서 18-22개의 연속 뉴클레오티드를 포함하는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하며,
    진단 대상 피부세포에서 상기 폴리뉴클레오티드들을 프라이머로 하여 증폭된 DNA 양이 검버섯이 발생되지 않은 대조군보다 많으면 검버섯 발생 피부로 진단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 키트.
  5. WNT3(NM_030753) 유전자에 의하여 코딩되는 폴리펩티드에 대한 모노클로날 항체를 포함하며,
    진단 대상 피부세포에서 상기 항체에 결합된 항원의 양이 검버섯이 발생되지 않은 대조군보다 많으면 검버섯 발생 피부로 진단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 키트.
  6. 제 5 항에 있어서,
    상기 WNT3(NM_030753) 외에 추가적으로, TFIP11(NM_001008697;NM_012143), DUS3L(NM_020175), CDH3(NM_001793), PLAU(NM_002658), AQP3(NM_004925), CENPO(NM_024322), CDCP1(NM_022842;NM_178181), NEFL(NM_006158), TAX1BP3(NM_014604), COPZ2(NM_016429), SSBP3(NM_001009955;NM_018070;NM_145716), TNFRSF21(NM_014452), ZFP14(NM_020917), LOXL2(NM_002318), CCL2(NM_002982), RNASET2(NM_003730), KRTCAP3(NM_173853), SLC38A5(NM_033518), ZNRF1(NM_032268), TNC(NM_002160), SYT12(NM_177963), SYXBP5L(XM_045911;XM_938898), RBM14(NM_006328), GSR(NM_000637), ZC3HAV1(NM_020119;NM_024625), AQP3(NM_004925), MGC17330(NM_052880), PRSS16(NM_005865), MYO1F(NM_012335), SLC12A4(NM_005072), ITGA2(NM_002203), WNT5B(NM_030775;NM_032642), HNRPU(NM_004501;NM_031844), LTB4R2(NM_019839), KCNC4(NM_001039574;NM_004978;NM_153763), H2AFY2(NM_018649), BTN2A2(NM_006995;NM_181531), DYNLL2(NM_080677), ETV5(NM_004454), PCDHB13(NM_018933), ITGB4(NM_000213;NM_001005619;NM_001005731), GGA2(NM_015044), JAG2(NM_002226;NM_145159), COL17A1(NM_000494;NM_130778), DLX2(NM_004405), LDLR(NM_000527), GPRC5C(NM_018653;NM_022036), FBXO4(NM_012176;NM_033484), STC1(NM_003155), COL4A2(NM_001846), ADAMTSL3(NM_207517), KLC4(NM_138343;NM_201521;NM_201522;NM_201523), ID1(NM_002165;NM_181353), GALNT14(NM_024572), PAX6(NM_000280;NM_001604), IGFL1(BG775668), PLAT(BX641021), TNS4(AF370421), CLSTN1(AB020718), HOXA7(NM_006896), SILV(AK092881), MX1(AK096355) 및 CIDEB(AK122828)로 이루어진 군으로부터 선택된 유전자에 의하여 코딩되는 폴리펩티드에 대한 모노클로날 항체를 하나 이상 더 포함하며,
    진단 대상 피부세포에서 상기 항체에 결합된 항원의 양이 검버섯이 발생되지 않은 대조군보다 많으면 검버섯 발생 피부로 진단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 진단 키트.
  7. 검버섯 발생을 진단하기 위해 필요한 정보를 제공하는 방법으로서,
    진단 대상 표피 중의 WNT3(NM_030753) 유전자의 발현량이 검버섯이 발생되지 않은 대조군보다 많으면 검버섯 발생 피부인 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생을 진단하기 위해 필요한 정보를 제공하는 방법.
  8. 제 7 항에 있어서,
    검버섯 발생을 진단하기 위해 필요한 정보를 제공하는 방법으로서,
    진단 대상 표피 중의 상기 WNT3(NM_030753) 외에 추가적으로, TFIP11(NM_001008697;NM_012143), DUS3L(NM_020175), CDH3(NM_001793), PLAU(NM_002658), AQP3(NM_004925), CENPO(NM_024322), CDCP1(NM_022842;NM_178181), NEFL(NM_006158), TAX1BP3(NM_014604), COPZ2(NM_016429), SSBP3(NM_001009955;NM_018070;NM_145716), TNFRSF21(NM_014452), ZFP14(NM_020917), LOXL2(NM_002318), CCL2(NM_002982), RNASET2(NM_003730), KRTCAP3(NM_173853), SLC38A5(NM_033518), ZNRF1(NM_032268), TNC(NM_002160), SYT12(NM_177963), SYXBP5L(XM_045911;XM_938898), RBM14(NM_006328), GSR(NM_000637), ZC3HAV1(NM_020119;NM_024625), AQP3(NM_004925), MGC17330(NM_052880), PRSS16(NM_005865), MYO1F(NM_012335), SLC12A4(NM_005072), ITGA2(NM_002203), WNT5B(NM_030775;NM_032642), HNRPU(NM_004501;NM_031844), LTB4R2(NM_019839), KCNC4(NM_001039574;NM_004978;NM_153763), H2AFY2(NM_018649), BTN2A2(NM_006995;NM_181531), DYNLL2(NM_080677), ETV5(NM_004454), PCDHB13(NM_018933), ITGB4(NM_000213;NM_001005619;NM_001005731), GGA2(NM_015044), JAG2(NM_002226;NM_145159), COL17A1(NM_000494;NM_130778), DLX2(NM_004405), LDLR(NM_000527), GPRC5C(NM_018653;NM_022036), FBXO4(NM_012176;NM_033484), STC1(NM_003155), COL4A2(NM_001846), ADAMTSL3(NM_207517), KLC4(NM_138343;NM_201521;NM_201522;NM_201523), ID1(NM_002165;NM_181353), GALNT14(NM_024572), PAX6(NM_000280;NM_001604), IGFL1(BG775668), PLAT(BX641021), TNS4(AF370421), CLSTN1(AB020718), HOXA7(NM_006896), SILV(AK092881), MX1(AK096355) 및 CIDEB(AK122828)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자의 발현량이 검버섯이 발생되지 않은 대조군보다 많으면 검버섯 발생 피부인 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생을 진단하기 위해 필요한 정보를 제공하는 방법.
  9. 검버섯 발생 억제제를 스크리닝하는 방법으로서,
    세포에 시험 물질을 처리하는 단계; 및
    시험 물질 처리 후 세포 내 WNT3(NM_030753) 유전자에 의하여 코딩되는 단백질의 발현이 억제되는지를 확인하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 억제제 스크리닝 방법.
  10. 제 9 항에 있어서,
    검버섯 발생 억제제를 스크리닝하는 방법으로서,
    세포에 시험 물질을 처리하는 단계; 및
    시험 물질 처리 후 세포 내, 상기 WNT3(NM_030753) 외에 추가적으로, TFIP11(NM_001008697;NM_012143), DUS3L(NM_020175), CDH3(NM_001793), PLAU(NM_002658), AQP3(NM_004925), CENPO(NM_024322), CDCP1(NM_022842;NM_178181), NEFL(NM_006158), TAX1BP3(NM_014604), COPZ2(NM_016429), SSBP3(NM_001009955;NM_018070;NM_145716), TNFRSF21(NM_014452), ZFP14(NM_020917), LOXL2(NM_002318), CCL2(NM_002982), RNASET2(NM_003730), KRTCAP3(NM_173853), SLC38A5(NM_033518), ZNRF1(NM_032268), TNC(NM_002160), SYT12(NM_177963), SYXBP5L(XM_045911;XM_938898), RBM14(NM_006328), GSR(NM_000637), ZC3HAV1(NM_020119;NM_024625), AQP3(NM_004925), MGC17330(NM_052880), PRSS16(NM_005865), MYO1F(NM_012335), SLC12A4(NM_005072), ITGA2(NM_002203), WNT5B(NM_030775;NM_032642), HNRPU(NM_004501;NM_031844), LTB4R2(NM_019839), KCNC4(NM_001039574;NM_004978;NM_153763), H2AFY2(NM_018649), BTN2A2(NM_006995;NM_181531), DYNLL2(NM_080677), ETV5(NM_004454), PCDHB13(NM_018933), ITGB4(NM_000213;NM_001005619;NM_001005731), GGA2(NM_015044), JAG2(NM_002226;NM_145159), COL17A1(NM_000494;NM_130778), DLX2(NM_004405), LDLR(NM_000527), GPRC5C(NM_018653;NM_022036), FBXO4(NM_012176;NM_033484), STC1(NM_003155), COL4A2(NM_001846), ADAMTSL3(NM_207517), KLC4(NM_138343;NM_201521;NM_201522;NM_201523), ID1(NM_002165;NM_181353), GALNT14(NM_024572), PAX6(NM_000280;NM_001604), IGFL1(BG775668), PLAT(BX641021), TNS4(AF370421), CLSTN1(AB020718), HOXA7(NM_006896), SILV(AK092881), MX1(AK096355) 및 CIDEB(AK122828)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자에 의하여 코딩되는 단백질의 발현이 억제되는지를 확인하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 검버섯 발생 억제제 스크리닝 방법.
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