KR100990330B1 - IbOrange gene involved in carotenoid accumulation from Ipomoea batatas - Google Patents

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Abstract

본 발명은 카로티노이드 축적에 관련된 고구마 유래 IbOrange 단백질, 상기 단백질을 코딩하는 유전자, 상기 유전자를 포함하는 재조합 벡터, 상기 재조합 벡터로 형질전환된 숙주세포 및 IbOrange 유전자 증폭용 프라이머 세트에 관한 것이다.The present invention relates to a sweet potato-derived IbOrange protein related to carotenoid accumulation, a gene encoding the protein, a recombinant vector comprising the gene, a host cell transformed with the recombinant vector, and a primer set for amplifying the IbOrange gene.

본 발명에 따르면, IbOrange 유전자를 통하여 카로티노이드 함량을 높임으로써 기능성 향상뿐만 아니라 환경 스트레스에 내성이 강한 식물체를 개발할 수 있을 것으로 기대된다.According to the present invention, by increasing the carotenoid content through the IbOrange gene is expected to be able to develop plants that are resistant to environmental stress as well as improving the functionality.

카로티노이드, 고구마, orange 유전자, 프라이머 Carotenoids, sweet potatoes, orange genes, primers

Description

고구마 유래의 카로티노이드 축적에 관련된 IbOrange 유전자{IbOrange gene involved in carotenoid accumulation from Ipomoea batatas}IbOrange gene involved in carotenoid accumulation from Ipomoea batatas}

본 발명은 카로티노이드 함량이 높은 신황미 품종 고구마 유래의 orange 유전자에 관한 것으로, 보다 상세하게는 카로티노이드 생합성에 관련된 유전자의 발현을 조절하여 카로티노이드의 생산을 증대시키고 chromoplast (유색체 또는 잡색체)에서의 카로티노이드 축적에 관여하는 단백질 및 이를 코딩하는 유전자에 관한 것이다.The present invention relates to an orange gene derived from sweet potato varieties of high sulfur cultivars of high carotenoid content, and more particularly, to regulate the expression of genes related to carotenoid biosynthesis, thereby increasing the production of carotenoids and accumulating carotenoids in chromoplasts (chromosomes or chromosomes). It relates to a protein involved in and a gene encoding the same.

고구마(Ipomoea batatas L. Lam)는 비교적 척박한 땅에도 재배가 가능할 뿐만 아니라 헥타르당 생산량이 약 30톤으로 높아 식량과 가축사료로 이용되는 대표적인 뿌리작물이다. 특히 고구마는 건물중의 약 70%가 전분으로 이루어져 주정의 원료작물로 오래전부터 이용되었으며, 바이오에탄올 생산을 위한 친환경 대체에너지작물로 최근 재조명되고 있다.Sweet Potato ( Ipomoea batatas L. Lam) can be cultivated on relatively poor lands and has a high yield of about 30 tons per hectare, which is a representative root crop for food and livestock feed. In particular, about 70% of the buildings are made of starch, which has been used as a raw material for alcoholic beverages for a long time, and has recently been re-examined as an environmentally friendly alternative energy crop for bioethanol production.

최근 급속한 산업화와 인구증가에 의해 지구규모의 환경문제와 식량문제가 제기되고 있어 사막화지역, 공해지역, 추운 지역 등 조건 불리한 지역에서도 잘 자라는 환경재해 내성 농작물 개발이 활발히 이루어지고 있다. 특히 조건 불리 지역 에 적합한 산업용 고구마를 개발하기 위하여 분자육종에 의한 환경재해 내성 형질전환 고구마 연구가 시도되고 있다 (Lim et al. Mol Breeding 19, 227-239, 2007).Recently, due to the rapid industrialization and population increase, environmental and food problems on a global scale have been raised, and the development of environmentally resistant crops that grow well in unfavorable areas such as deserted areas, high seas and cold areas is being actively developed. In particular, in order to develop industrial sweet potatoes suitable for the conditionally disadvantaged area, research on environmentally resistant transgenic sweet potatoes by molecular breeding has been attempted (Lim et al. Mol Breeding 19, 227-239, 2007).

세계보건기구 (WHO)는 전 세계 1억 명 이상의 어린이들이 비타민A의 부족으로 고생하고 있으며 이로 인해 매년 50만 명 이상의 어린이들이 실명하고 있다고 발표하였다. 베타카로틴은 비타민A의 전구체로서 영양강화제, 식품보조제의 생리활성 기능을 가지고 있어 식품에서의 카로티노이드 축적에 관한 대사공학 연구는 영양학적 가치를 높이기 위한 필수 연구 대상이라 할 수 있다. 베타카로틴은 높은 항산화활성을 가진 물질로서 생리활성 기능뿐 아니라 식물 자체의 산화 스트레스에 대한 방어 기작에도 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있으며 최근 카로티노이드 생합성이 식물호르몬의 하나인 ABA에 의해 영향을 받는 것이 밝혀짐으로써 이들 항산화 물질과 환경 스트레스에 대한 연구의 필요성이 대두 되었다.The World Health Organization (WHO) has announced that more than 100 million children worldwide suffer from a lack of vitamin A, which causes more than half a million children to lose sight each year. Beta-carotene is a precursor of vitamin A, and has the physiologically active functions of nutrient enhancers and food supplements. Therefore, metabolic engineering studies on carotenoid accumulation in foods are essential subjects for enhancing nutritional value. Beta-carotene is a substance with high antioxidant activity and is known to play an important role not only in physiological activity but also in the defense mechanism against oxidative stress of the plant itself. Recently, carotenoid biosynthesis is affected by ABA, one of plant hormones. As a result, research on these antioxidants and environmental stresses has emerged.

한편 미국 코넬대학의 Lu 등은 꽃양배추에서 돌연변이가 일어난 Orange 유전자가 chromoplast 내에서 카로티노이드의 축적에 관여함을 발표하였다 (Lu S et al. 2006 Plant Cell. 18:3594-3605, 2006).Meanwhile, Lu et al., Cornell University, announced that the Orange gene, which was mutated in cauliflower, was involved in the accumulation of carotenoids in chromoplasts (Lu S et al. 2006 Plant Cell. 18: 3594-3605, 2006).

본 발명은 상기와 같은 요구에 의해 안출된 것으로서, 본 발명자들은 카로티노이드 함량이 높은 신황미 고구마 품종으로부터 orange 유전자를 클로닝하였고, 대장균에서의 재조합 단백질 생성을 확인함으로써 본 발명을 완성하게 되었다.The present invention has been made in accordance with the above requirements, the present inventors have cloned the orange gene from the new wangwang sweet potato varieties with high carotenoid content, and completed the present invention by confirming the production of recombinant protein in E. coli.

상기 과제를 해결하기 위해, 본 발명은 카로티노이드 축적에 관련된 고구마 유래 IbOrange 단백질을 제공한다.In order to solve the above problems, the present invention provides a sweet potato-derived IbOrange protein related to carotenoid accumulation.

본 발명은 또한, IbOrange 단백질을 코딩하는 유전자를 제공한다.The present invention also provides a gene encoding the IbOrange protein.

본 발명은 또한, IbOrange 유전자를 포함하는 재조합 벡터를 제공한다.The invention also relates to IbOrange A recombinant vector comprising a gene is provided.

본 발명은 또한, 상기 재조합 벡터로 형질전환된 숙주세포를 제공한다.The present invention also provides a host cell transformed with the recombinant vector.

본 발명은 또한, IbOrange 유전자 증폭용 프라이머 세트를 제공한다.The present invention also provides a primer set for IbOrange gene amplification.

본 발명에 따르면, 본 발명의 신황미 고구마 유래 orange 단백질 및 유전자는 건조 스트레스와 식물 방어 기작에 관련되는 ABA, 에테폰, 메틸 자스모네이트, 살리실산 등의 식물 호르몬에 의해 발현이 강하게 유도되는 것을 확인하였다. 따라서, IbOrange 유전자를 통하여 카로티노이드 함량을 높임으로써 기능성 향상뿐만 아니라 환경 스트레스에 내성이 강한 식물체를 개발할 수 있을 것으로 기대된다.According to the present invention, the orange protein and genes derived from sweet yellow rice of the present invention are confirmed that expression is strongly induced by plant hormones such as ABA, ethephon, methyl jasmonate, and salicylic acid related to dry stress and plant defense mechanisms. It was. Therefore, by increasing the carotenoid content through the IbOrange gene is expected to be able to develop a plant that is resistant to environmental stress as well as functional enhancement.

본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 카로티노이드 축적에 관련된 고구마 (Ipomoea batatas) 유래 IbOrange 단백질을 제공한다.In order to achieve the object of the present invention, the present invention provides IbOrange protein derived from sweet potato (Ipomoea batatas) related to carotenoid accumulation.

본 발명에 따른 IbOrange 단백질의 범위는 신황미 품종 고구마로부터 분리된 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열을 갖는 단백질 및 상기 단백질의 기능적 동등물을 포함한다. "기능적 동등물"이란 아미노산의 부가, 치환 또는 결실의 결과, 상기 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열과 적어도 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 더 더욱 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것으로, 서열번호 2로 표시되는 단백질과 실질적으로 동질의 생리활성을 나타내는 단백질을 말한다.The range of IbOrange protein according to the present invention includes a protein having an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 isolated from Cinchu rice varieties of sweet potato and a functional equivalent of the protein. "Functional equivalent" means at least 70%, preferably at least 80%, more preferably at least 90%, even more preferably at least 70% of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 as a result of the addition, substitution, or deletion of the amino acid Is 95% or more of sequence homology, and refers to a protein that exhibits substantially homogeneous physiological activity with the protein represented by SEQ ID NO: 2.

또한, 본 발명은 상기 IbOrange 단백질을 코딩하는 유전자를 제공한다. 본 발명의 유전자는 IbOrange 단백질을 코딩하는 게놈 DNA와 cDNA를 모두 포함한다. 바람직하게는, 본 발명의 유전자는 서열번호 1로 표시되는 염기서열을 포함할 수 있다. 또한, IbOrange 유전자는 multigene 패밀리로서 고구마 내에 상동성(homologous) 유전자들이 많이 존재하는데, 본 발명의 IbOrange 유전자는 서열번호 1의 염기서열을 갖는 IbOrange 유전자뿐만 아니라, IbOrange 유전자의 multigene 패밀리도 포함할 수 있다.The present invention also provides a gene encoding the IbOrange protein. Genes of the invention include both genomic DNA and cDNA encoding IbOrange proteins. Preferably, the gene of the present invention may include the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1. In addition, the IbOrange gene is a multigene family, and there are many homologous genes in sweet potatoes. The IbOrange gene of the present invention may include not only an IbOrange gene having a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, but also a multigene family of IbOrange genes. .

또한, 상기 염기 서열의 변이체가 본 발명의 범위 내에 포함된다. 구체적으로, 상기 유전자는 서열번호 1의 염기 서열과 각각 70% 이상, 더욱 바람직하게는 80% 이상, 더 더욱 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 가지는 염기 서열을 포함할 수 있다. 폴리뉴클레오티드에 대한 "서열 상동성의 %"는 두 개의 최적으로 배열된 서열과 비교 영역을 비교함으로써 확인되며, 비교 영역에서의 폴리뉴클레오티드 서열의 일부는 두 서열의 최적 배열에 대한 참고 서열(추가 또는 삭제를 포함하지 않음)에 비해 추가 또는 삭제(즉, 갭)를 포함할 수 있다.Variants of the above base sequences are also included within the scope of the present invention. Specifically, the gene has a base sequence having a sequence homology of at least 70%, more preferably at least 80%, even more preferably at least 90%, most preferably at least 95% with the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, respectively. It may include. The "% sequence homology" for a polynucleotide is identified by comparing two optimally arranged sequences with a comparison region, wherein part of the polynucleotide sequence in the comparison region is the reference sequence (addition or deletion) for the optimal alignment of the two sequences. It may include the addition or deletion (ie, gap) compared to).

본 발명의 IbOrange cDNA 유전자의 전체 길이는 942 bp의 cDNA가 313 아미노산을 코딩하고 있다 (도 1 참고). 아미노산 배열로 예측한 등전점 (pI)과 분자량 (Mw)은 각각 8.46 과 34.4 kDa 이다. 유전자를 데이터베이스에서 블라스트한 결과, chaperone으로 알려진 DNA J 단백질의 일종으로 다른 Orange 단백질에서 잘 보존되어있는 시스테인이 반복되는 CxxCxGxG의 반복 모티브를 가지고 있다.In the overall length of the IbOrange cDNA gene of the present invention, 942 bp cDNA encodes 313 amino acids (see FIG. 1). The isoelectric point (pI) and molecular weight (Mw) predicted by the amino acid sequence are 8.46 and 34.4 kDa, respectively. As a result of blasting the gene from the database, it is a type of DNA J protein known as chaperone, which has a repeat motif of CxxCxGxG, which is a cysteine that is well conserved in other Orange proteins.

본 발명의 IbOrange 유전자는 미색 고구마인 율미, 자색 고구마인 신자미, 황색 고구마인 신황미의 모든 품종에서 발현되는 것을 확인하였다 (도 4 참고). IbOrange 유전자는 식물체 전반에 걸쳐 고르게 발현되고 특히 잎 (leaf) 과 실뿌리(fibrous root)에서 강하게 발현되는 양상을 보였다 (도 5 참고). IbOrange gene of the present invention was found to be expressed in all varieties of off-white sweet potato, Yumi, purple sweet potato, Shinjami, yellow sweet potato, Xinhuangmi (see Fig. 4). IbOrange gene was expressed evenly throughout the plant, especially strong in the leaf (leaf) and fibrous root (fibrous root) (see Figure 5).

본 발명의 IbOrange 유전자는 ABA, 에테폰, 메틸 자스모네이트, 또는 살리실산 등의 식물 호르몬에 의해 발현이 강하게 유도될 수 있다. 본 발명의 IbOrange 유전자는 ABA를 처리했을 때 잎에서는 뚜렷한 변화가 없으나 뿌리에서 36시간 후에 IbOrange 유전자가 강하게 발현하는 것을 보여주었다. 에테폰(ethephone)을 처리한 경우에는 잎과 뿌리에서 처리 후 36시간에 IbOrange 유전자의 발현이 유도되는 것을 보여주는데, 특히 잎에서 보다 강하게 발현되는 것을 알 수 있었다. 메틸 자스모네이트의 처리시에는 잎의 경우 처리 후 12시간부터 IbOrange 유전자의 발현이 강하게 유도되어 36시간까지 지속되는 것을 보여주었고 뿌리에서는 24시간부터 약 하게 증가하다가 36시간에 강하게 발현되는 것을 보여주었다. 살리실산을 처리하였을 때는 잎과 뿌리 전반에 걸쳐 큰 변화는 없으나 잎에서 처리 후 12시간부터 36시간까지 IbOrange 유전자의 발현이 약하게 증가하는 것을 볼 수 있었다 (도 6 참고).The IbOrange gene of the present invention can be strongly induced by plant hormones such as ABA, ethephon, methyl jasmonate, or salicylic acid. The IbOrange gene of the present invention showed no significant change in leaves when ABA was treated, but showed strong expression of IbOrange gene after 36 hours in the root. In the case of treatment with ethephone, the expression of IbOrange gene was induced at 36 hours after treatment in leaves and roots, particularly in leaves. In the case of methyl jasmonate treatment, IbOrange gene expression was strongly induced from 12 hours after treatment and lasted up to 36 hours, and the root increased slightly from 24 hours and then strongly expressed at 36 hours. . When salicylic acid was treated, there was no significant change across the leaves and roots, but the expression of IbOrange gene was weakly increased from 12 hours to 36 hours after treatment in the leaves (see FIG. 6).

또한, 본 발명은 본 발명에 따른 IbOrange 유전자를 포함하는 재조합 벡터를 제공한다. 상기 재조합 벡터는 바람직하게는 재조합 대장균 발현 벡터이다.The present invention also provides a recombinant vector comprising the IbOrange gene according to the present invention. The recombinant vector is preferably a recombinant E. coli expression vector.

용어 "재조합"은 세포가 이종의 핵산을 복제하거나, 상기 핵산을 발현하거나 또는 펩티드, 이종의 펩티드 또는 이종의 핵산에 의해 코딩된 단백질을 발현하는 세포를 지칭하는 것이다. 재조합 세포는 상기 세포의 천연 형태에서는 발견되지 않는 유전자 또는 유전자 절편을, 센스 또는 안티센스 형태 중 하나로 발현할 수 있다. 또한 재조합 세포는 천연 상태의 세포에서 발견되는 유전자를 발현할 수 있으며, 그러나 상기 유전자는 변형된 것으로써 인위적인 수단에 의해 세포 내 재도입된 것이다.The term "recombinant" refers to a cell in which a cell replicates a heterologous nucleic acid, expresses the nucleic acid, or expresses a protein encoded by a peptide, a heterologous peptide, or a heterologous nucleic acid. The recombinant cell can express a gene or a gene fragment that is not found in the natural form of the cell in one of the sense or antisense form. Recombinant cells can also express genes found in natural cells, but the genes have been modified and reintroduced into cells by artificial means.

용어 "벡터"는 세포 내로 전달하는 DNA 단편(들), 핵산 분자를 지칭할 때 사용된다. 벡터는 DNA를 복제시키고, 숙주세포에서 독립적으로 재생산될 수 있다. 용어 "전달체"는 흔히 "벡터"와 호환하여 사용된다. 용어 "발현 벡터"는 목적한 코딩 서열과, 특정 숙주 생물에서 작동가능하게 연결된 코딩 서열을 발현하는데 필수적인 적정 핵산 서열을 포함하는 재조합 DNA 분자를 의미한다.The term "vector" is used to refer to a DNA fragment (s), nucleic acid molecule, which is transferred into a cell. The vector replicates the DNA and can be independently regenerated in the host cell. The term "carrier" is often used interchangeably with "vector". The term “expression vector” refers to a recombinant DNA molecule comprising a coding sequence of interest and a suitable nucleic acid sequence necessary to express a coding sequence operably linked in a particular host organism.

본 발명의 벡터는 전형적으로 클로닝 또는 발현을 위한 벡터로서 구축될 수 있다. 또한, 본 발명의 벡터는 원핵 세포 또는 진핵 세포를 숙주로 하여 구축될 수 있다. 예를 들어, 본 발명의 벡터가 발현 벡터이고, 원핵 세포를 숙주로 하는 경우에는, 전사를 진행시킬 수 있는 강력한 프로모터 (예컨대, pLλ프로모터, trp 프로모터, lac 프로모터, T7 프로모터, tac 프로모터 등), 해독의 개시를 위한 리보좀 결합 자리 및 전사/해독 종결 서열을 포함하는 것이 일반적이다. 숙주 세포로서 대장균(E. coli)이 이용되는 경우, E. coli 트립토판 생합성 경로의 프로모터 및 오퍼레이터 부위, 그리고 파아지 λ의 좌향 프로모터 (pLλ프로모터)가 조절 부위로서 이용될 수 있다.Vectors of the invention can typically be constructed as vectors for cloning or expression. In addition, the vector of the present invention can be constructed using prokaryotic or eukaryotic cells as hosts. For example, when the vector of the present invention is an expression vector and the prokaryotic cell is a host, a strong promoter (for example, a pLλ promoter, a trp promoter, a lac promoter, a T7 promoter, a tac promoter, etc.) capable of promoting transcription, It is common to include ribosomal binding sites and transcription / detox termination sequences for initiation of translation. When E. coli is used as a host cell, a promoter and an operator site of the E. coli tryptophan biosynthetic pathway, and a phage λ left promoter (pLλ promoter) can be used as regulatory sites.

한편, 본 발명에 이용될 수 있는 벡터는 당업계에서 종종 사용되는 플라스미드 (예: pSC101, ColE1, pBR322, pUC8/9, pHC79, pGEX 시리즈, pET 시리즈 및 pUC19 등), 파지 (예: λgt4·λB, λ-Charon, λΔz1 및 M13 등) 또는 바이러스 (예: SV40 등)를 조작하여 제작될 수 있다.On the other hand, vectors that can be used in the present invention are plasmids (eg, pSC101, ColE1, pBR322, pUC8 / 9, pHC79, pGEX series, pET series and pUC19, etc.) which are often used in the art, phage (e.g. λgt4.λB , λ-Charon, λΔz1 and M13, etc.) or viruses (eg SV40, etc.).

한편, 본 발명의 벡터가 발현 벡터이고, 진핵 세포를 숙주로 하는 경우에는, 포유동물 세포의 게놈으로부터 유래된 프로모터 (예: 메탈로티오닌 프로모터) 또는 포유동물 바이러스로부터 유래된 프로모터 (예: 아데노바이러스 후기 프로모터, 백시니아 바이러스 7.5K 프로모터, SV40 프로모터, 사이토메갈로바이러스 프로모터 및 HSV의 tk 프로모터)가 이용될 수 있으며, 전사 종결 서열로서 폴리아데닐화 서열을 일반적으로 갖는다.On the other hand, when the vector of the present invention is an expression vector and the eukaryotic cell is a host, a promoter derived from the mammalian cell genome (for example, metallothionine promoter) or a promoter derived from a mammalian virus (for example, adeno) Late viral promoter, vaccinia virus 7.5K promoter, SV40 promoter, cytomegalovirus promoter and tk promoter of HSV) can be used and generally have a polyadenylation sequence as a transcription termination sequence.

본 발명의 벡터는 선택표지로서, 당업계에서 통상적으로 이용되는 항생제 내성 유전자를 포함할 수 있으며, 예를 들어 암피실린, 겐타마이신, 카베니실린, 클로람페니콜, 스트렙토마이신, 카나마이신, 게네티신, 네오마이신 및 테트라사이클 린에 대한 내성 유전자가 있다.Vectors of the present invention may include antibiotic resistance genes commonly used in the art as optional markers, for example ampicillin, gentamicin, carbenicillin, chloramphenicol, streptomycin, kanamycin, geneticin, neomycin And resistance genes for tetracycline.

본 발명은 또한, 본 발명의 재조합 벡터로 형질전환된 숙주세포를 제공한다. 본 발명의 벡터를 안정되면서 연속적으로 클로닝 및 발현시킬 수 있는 숙주세포는 당업계에 공지된 어떠한 숙주세포도 이용할 수 있으며, 예컨대, E. coli JM109, E. coli BL21, E. coli RR1, E. coli LE392, E. coli B, E. coli X 1776, E. coli W3110, 바실러스 서브틸리스, 바실러스 츄린겐시스와 같은 바실러스 속 균주, 그리고 살모넬라 티피무리움, 세라티아 마르세슨스 및 다양한 슈도모나스 종과 같은 장내균과 균주 등이 있다. 상기 숙주세포는 바람직하게는 대장균이다.The present invention also provides a host cell transformed with the recombinant vector of the present invention. The host cell capable of continuously cloning and expressing the vector of the present invention in a stable manner can be used in any host cell known in the art, for example, E. coli JM109, E. coli BL21, E. coli RR1, E. strains of the genus Bacillus, such as coli LE392, E. coli B, E. coli X 1776, E. coli W3110, Bacillus subtilis, Bacillus thuringiensis, and Salmonella typhimurium, Serratia marcensons, and various Pseudomonas species. Enterobacteria and strains. The host cell is preferably Escherichia coli.

또한, 본 발명의 벡터를 진핵 세포에 형질전환시키는 경우에는 숙주세포로서, 효모(Saccharomyce cerevisiae), 곤충세포, 사람세포 (예컨대, CHO 세포주 (Chinese hamster ovary), W138, BHK, COS-7, 293, HepG2, 3T3, RIN 및 MDCK 세포주) 등이 이용될 수 있다.In addition, when transforming a vector of the present invention to eukaryotic cells, yeast ( Saccharomyce) as a host cell cerevisiae ), insect cells, human cells (eg, CHO cell line (Chinese hamster ovary), W138, BHK, COS-7, 293, HepG2, 3T3, RIN and MDCK cell lines) and the like.

본 발명의 벡터를 숙주세포 내로 운반하는 방법은, 숙주 세포가 원핵 세포인 경우, CaCl2 방법 (Cohen, S.N. et al., Proc. Natl. Acac. Sci. USA, 9:2110-2114(1973)), 하나한 방법 (Hanahan, D., J. Mol. Biol., 166:557-580(1983)) 및 전기천공 방법 (Dower, W.J. et al., Nucleic. Acids Res., 16:6127-6145(1988)) 등에 의해 실시될 수 있다. 또한, 숙주세포가 진핵세포인 경우에는, 미세주입법(Capecchi, M.R., Cell, 22:479(1980)), 칼슘포스페이트 침전법 (Graham, F.L. et al., Virology, 52:456(1973)), 전기천공법(Neumann, E. et al., EMBO J., 1:841(1982)), 리포좀-매개 형질감염법(Wong, T.K. et al., Gene, 10:87(1980)), DEAE-덱스트란 처리법(Gopal, Mol. Cell Biol., 5:1188-1190(1985)), 및 유전자 밤바드먼트(Yang et al., Proc.Natl. Acad. Sci., 87:9568-9572(1990)) 등에 의해 벡터를 숙주세포 내로 주입할 수 있다.The method of carrying the vector of the present invention into a host cell is performed by the CaCl 2 method (Cohen, SN et al., Proc. Natl. Acac. Sci. USA, 9: 2110-2114 (1973), when the host cell is a prokaryotic cell). ), Hanahan method (Hanahan, D., J. Mol. Biol., 166: 557-580 (1983)) and electroporation method (Dower, WJ et al., Nucleic. Acids Res., 16: 6127-6145 (1988)) and the like. In addition, when the host cell is a eukaryotic cell, microinjection method (Capecchi, MR, Cell, 22: 479 (1980)), calcium phosphate precipitation method (Graham, FL et al., Virology, 52: 456 (1973)), Electroporation (Neumann, E. et al., EMBO J., 1: 841 (1982)), liposome-mediated transfection (Wong, TK et al., Gene, 10:87 (1980)), DEAE- Dextran treatment (Gopal, Mol. Cell Biol., 5: 1188-1190 (1985)), and gene balm (Yang et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 87: 9568-9572 (1990)) The vector can be injected into the host cell.

본 발명은 또한, IbOrange 유전자 증폭용 프라이머 세트를 제공한다. 상기 프라이머 세트는 서열번호 3 및 4의 올리고뉴클레오티드로 이루어질 수 있다. The present invention also provides a primer set for IbOrange gene amplification. The primer set may consist of oligonucleotides of SEQ ID NOs: 3 and 4.

상기 프라이머 세트는 서열번호 3의 서열 내의 20개 이상의 연속 뉴클레오티드의 절편으로 이루어진 올리고뉴클레오티드들로 구성되는 군으로부터 선택된 하나 이상의 올리고뉴클레오티드 및 서열번호 4의 서열 내의 20개 이상의 연속 뉴클레오티드의 절편으로 이루어진 올리고뉴클레오티드들로 구성되는 군으로부터 선택된 하나 이상의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 프라이머 세트로 이루어질 수 있다.The primer set is at least one oligonucleotide selected from the group consisting of fragments of at least 20 contiguous nucleotides in the sequence of SEQ ID NO: 3 and oligonucleotides consisting of fragments of at least 20 contiguous nucleotides in the sequence of SEQ ID NO: 4 It may consist of a primer set comprising one or more oligonucleotides selected from the group consisting of.

상기 프라이머 세트는 바람직하게는, 서열번호 3의 서열 내의 21개 이상, 22개 이상, 23개 이상, 24개 이상, 25개 이상, 26개 이상, 27개 이상, 28개 이상, 29개 이상, 30개의 연속 뉴클레오티드의 절편으로 이루어진 올리고뉴클레오티드들로 구성되는 군으로부터 선택된 하나 이상의 올리고뉴클레오티드 및 서열번호 4의 서열 내의 21개 이상, 22개 이상, 23개 이상, 24개 이상, 25개 이상, 26개 이상, 27개 이상, 28개 이상, 29개 이상, 30개의 연속 뉴클레오티드의 절편으로 이루어진 올리고뉴클레오티드들로 구성되는 군으로부터 선택된 하나 이상의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 프라이머 세트일 수 있다.The primer set is preferably 21 or more, 22 or more, 23 or more, 24 or more, 25 or more, 26 or more, 27 or more, 28 or more, 29 or more, in the sequence of SEQ ID NO: 3, At least 21 oligonucleotides selected from the group consisting of oligonucleotides consisting of fragments of 30 consecutive nucleotides and at least 21, at least 22, at least 23, at least 24, at least 25, at least 26 in the sequence of SEQ ID NO: 4 Or at least 27, at least 28, at least 29, at least 30 oligonucleotides consisting of a sequence of oligonucleotides consisting of a set of primers comprising at least one oligonucleotide selected from the group consisting of.

상기 프라이머 세트는 가장 바람직하게는 서열번호 3 및 서열번호 4의 프라 이머 세트로 이루어질 수 있다.The primer set may most preferably consist of a primer set of SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 4.

본 발명에 있어서, "프라이머"는 카피하려는 핵산 가닥에 상보적인 단일 가닥 올리고뉴클레오티드 서열을 말하며, 프라이머 연장 산물의 합성을 위한 개시점으로서 작용할 수 있다. 상기 프라이머의 길이 및 서열은 연장 산물의 합성을 시작하도록 허용해야 한다. 본 명세서에 있어서, 프라이머로서 이용된 올리고뉴클레오티드는 또한 뉴클레오티드 유사체(analogue), 예를 들면, 포스포로티오에이트(phosphorothioate), 알킬포스포로티오에이트 또는 펩티드 핵산(peptide nucleic acid)를 포함할 수 있거나 또는 삽입 물질(intercalating agent)를 포함할 수 있다.In the present invention, "primer" refers to a single stranded oligonucleotide sequence that is complementary to the nucleic acid strand to be copied and may serve as a starting point for the synthesis of the primer extension product. The length and sequence of the primer should allow to start the synthesis of the extension product. As used herein, oligonucleotides used as primers may also include nucleotide analogues such as phosphorothioate, alkylphosphothioate or peptide nucleic acid, or It may comprise an intercalating agent.

이하, 본 발명을 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, the present invention will be described in detail by way of examples. However, the following examples are illustrative of the present invention, and the present invention is not limited to the following examples.

실시예Example

<< 실시예Example 1> 고구마  1> sweet potato IbOrangeIbOrange 유전자의  Gene 클로닝Cloning , 염기서열 분석 및 유연관계 분석, Sequencing and softness analysis

고구마 (Ipomoea batatas (L.) Lam) 품종 신황미 식물체의 잎에서 QIAGEN사의 RNeasy Mini Kit를 이용하여 total RNA를 분리하였다. Invitrogen의 RT-PCR용 SuperScript III First-Strand Synthesis System을 이용하여 first cDNA를 합성하였다. Orange 유전자를 분리하기 위해, TIGR Plant Transcript Assemblies의 웹사이트 (http://plantta.tigr.org/)에서 꽃양배추의 Orange 유전자를 가지고 블라스 트한 결과 고구마와 가까운 나팔꽃 (Ipomoea nil)의 EST 클론으로부터 Orange 유전자와 비슷한 염기서열을 갖는 클론을 찾았고 이 유전자로부터 고구마에서 orange 유전자를 클로닝하기 위한 PCR 프라이머를 제작하였다. 프라이머 서열은 하기와 같다: 정방향 프라이머 (5'-atggtatattcaggtagaatcttgtcgctc-3'; 서열번호 3)와 역방향 프라이머 (5'-ttaatcaaatgggtcaattcgtgggtcatg-3'; 서열번호 4). 프라이머의 염기서열에는 Invitrogen의 gateway 발현 시스템을 이용하기 위해 상기 프라이머의 5' 말단에 어댑터 서열 (대문자)을 각각 추가하였다. 염기서열은 정방향 프라이머 (5'-CAAAAAAGCAGGCTNNatggtatattcaggtagaatcttgtcgctc-3'; 서열번호 5)와 역방향 프라이머 (5'-CAAGAAAGCTGGGTNttaatcaaatgggtcaattcgtgggtcatg-3'; 서열번호 6)이다. Clonetech 사의 advantage2 중합효소를 이용하여 PCR을 수행하였고, 예상 크기의 PCR 산물을 pGEMeasy 클로닝 벡터 (Promega)를 이용하여 클로닝한 후, 시퀀싱하여 전체 염기서열을 확인하였다. 이 cDNA 유전자의 이름을 IbOrange cDNA라고 명명하였다.Total RNA was isolated from leaves of sweet potato (Ipomoea batatas (L.) Lam) varieties of yellow rice plants using QRNGEN's RNeasy Mini Kit. First cDNA was synthesized using Invitrogen's SuperScript III First-Strand Synthesis System for RT-PCR. To isolate the Orange gene, blast the cabbage with the Orange gene of cauliflower on the website of the TIGR Plant Transcript Assemblies (http://plantta.tigr.org/) to find the Orange from the EST clone of Ipomoea nil, which is close to sweet potato. A clone with a nucleotide sequence similar to that of the gene was found and PCR primers for cloning the orange gene in sweet potato were prepared from this gene. The primer sequence is as follows: forward primer (5'-atggtatattcaggtagaatcttgtcgctc-3 '; SEQ ID NO: 3) and reverse primer (5'-ttaatcaaatgggtcaattcgtgggtcatg-3'; SEQ ID NO: 4). In the base sequence of the primer, an adapter sequence (uppercase) was added to the 5 'end of the primer to use the gateway expression system of Invitrogen. The base sequence is a forward primer (5'- CAAAAAAGCAGGCTNN atggtatattcaggtagaatcttgtcgctc-3 '; SEQ ID NO: 5) and a reverse primer (5'- CAAGAAAGCTGGGTN ttaatcaaatgggtcaattcgtgggtcatg-3'; SEQ ID NO: 6). PCR was performed using Clonetech's advantage2 polymerase, and the PCR product of the expected size was cloned using pGEMeasy cloning vector (Promega), followed by sequencing to confirm the entire nucleotide sequence. The cDNA gene was named IbOrange cDNA.

IbOrange cDNA 유전자의 전체 길이는 942 bp의 cDNA가 313 아미노산을 코딩하며, N-말단에 플라스티드 타겟의 시그널 펩티드를 가지고 있다 (도 1). 유전자를 데이터베이스에서 블라스트한 결과 chaperone으로 알려진 DNA J 단백질의 일종으로 다른 Orange 단백질에서 잘 보존되어있는 시스테인이 반복되는 CxxCxGxG의 반복 모티브를 가지고 있다. 본 발명의 IbOrange의 코딩 부분의 아미노산 서열과 다양한 식물 종의 Orange 사이의 유연관계를 Blast X와 ClustalW 프로그램(http://plant.pdrc.re.kr/gene/align/ClustalW.html)를 이용하여 조사한 결과, 나팔꽃 (Ipomoea nil)의 putative orange 유전자와 97%의 가장 높은 상동성을 보였으며, 그외에도 토마토 (Lycopersicon esculentum)의 putative orange 유전자, 포도 (Vitis vinifera) 유전자, 애기장대(Arabidopsis thaliana)의 At5g61670 유전자, 꽃양배추 (Brassica oleracea var. botrytis)의 유전자와 73~80%의 상동성을 보였다 (도 2 및 도 3).The overall length of the IbOrange cDNA gene is 942 bp cDNA codes for 313 amino acids, and has a signal target of the plastid target at the N-terminus (FIG. 1). The result of blasting the gene from the database is a type of DNA J protein known as chaperone, which has a repeat motif of CxxCxGxG that repeats cysteines that are well conserved in other Orange proteins. Using the Blast X and ClustalW program (http://plant.pdrc.re.kr/gene/align/ClustalW.html), the flexible relationship between the amino acid sequence of the coding portion of IbOrange of the present invention and Orange of various plant species The results showed the highest homology of 97% to the putative orange gene of morning glory (Ipomoea nil), as well as the putative orange gene of tomato (Lycopersicon esculentum), grape (Vitis vinifera) gene and Arabidopsis thaliana. At5g61670 gene, cabbage (Brassica oleracea var. Botrytis) showed a homology of 73 ~ 80% (Fig. 2 and 3).

<< 실시예Example 2>  2> IbOrangeIbOrange 유전자의 고구마 품종별, 조직별 발현 분석 Analysis of Gene Expression by Sweet Potato Varieties and Tissues

본 발명의 IbOrange 유전자의 고구마 품종별, 조직별 발현 양상을 분석하기 위해 RT-PCR을 수행하였다. QIAGEN사의 RNeasy Mini Kit를 이용하여 total RNA를 분리하고 Invitrogen 사의 RT-PCR 용 SuperScript III First-Strand Synthesis System을 이용하여 first cDNA를 합성하였다. 사용된 프라이머의 염기서열은 (정방향: 5'-atcttgtcgctctcgtcctccacgacgccg-3'(서열번호 7), 역방향: 5'-cgtgggtcatgctcgcttgccatagccatc-3'(서열번호 8))이다.RT-PCR was performed to analyze the expression patterns of sweet potato varieties and tissues of the IbOrange gene of the present invention. Total RNA was isolated using QIAGEN's RNeasy Mini Kit, and first cDNA was synthesized using Invitrogen's SuperScript III First-Strand Synthesis System for RT-PCR. The base sequence of the primer used is (forward: 5'-atcttgtcgctctcgtcctccacgacgccg-3 '(SEQ ID NO: 7), reverse: 5'-cgtgggtcatgctcgcttgccatagccatc-3' (SEQ ID NO: 8)).

그 결과, IbOrange 유전자는 미색 고구마인 율미(Ym), 자색 고구마인 신자미(Jm), 황색 고구마인 신황미 (Hm)의 모든 품종에서 발현되는 것을 확인하였다 (도 4). 또한, 식물체의 조직별 분석에서 IbOrange 유전자는 식물체 전반에 걸쳐 고르게 발현되고, 특히 잎 (leaf) 과 실뿌리(fibrous root)에서 강하게 발현되는 양상을 보였다 (도 5). 따라서, IbOrange 유전자는 품종 여부에 관계없이 식물체 전반에 걸쳐 고르게 발현되는 유전자임을 알 수 있었다. As a result, it was confirmed that IbOrange gene is expressed in all varieties of off-white sweet potato, Yumi (Ym), purple sweet potato, Shinjami (Jm), and yellow sweet potato, Xinhuangmi (Hm) (FIG. 4). In addition, in the tissue-specific analysis of plants, the IbOrange gene was expressed evenly throughout the plant, particularly in the leaf and fibrous root (FIG. 5). Therefore, IbOrange gene was found to be a gene that is expressed evenly throughout the plant regardless of breed.

<< 실시예Example 3> 다양한 식물 호르몬 처리에 의한  3> By various plant hormone treatment IbOrangeIbOrange 유전자의 발현 분석 Gene expression analysis

본 발명의 IbOrange 유전자의 건조 스트레스와 식물 방어 기작에 관련되는 ABA, 에테폰, 메틸 자스모네이트, 살리실산 등의 식물 호르몬에 의한 발현 양상을 조사하기 위해, 각 호르몬의 처리 후 시간대 (0, 12, 24, 36, 48 시간) 별로 상기 실시예 1과 2에서 수행한 방법으로 RNA를 분리한 후 cDNA를 각각 합성하였다. 상기 실시예 2에서 사용한 IbOrange 유전자 특이적 프라이머로 RT-PCR를 수행하였다. 그 결과, IbOrange 유전자는 다음과 같은 발현 양상을 보였다. ABA; 잎에서는 뚜렷한 변화가 없으나 뿌리에서 36시간 후에 IbOrange 유전자가 강하게 발현하는 것을 보여준다. 에테폰; 잎과 뿌리에서 처리 후 36시간에 IbOrange 유전자의 발현이 유도되는 것을 보여주는데, 특히 잎에서 보다 강하게 발현되는 것을 알 수 있다. 메틸 자스모네이트; 잎의 경우 처리 후 12시간부터 IbOrange 유전자의 발현이 강하게 유도되어 36시간까지 지속되는 것을 보여주고 있고 뿌리에서는 24시간부터 약하게 증가하다가 36시간에 강하게 발현되는 것을 보여준다. 살리실산; 잎과 뿌리 전반에 걸쳐 큰 변화는 없으나 잎에서 처리 후 12시간부터 36시간까지 IbOrange 유전자의 발현이 약하게 증가하는 것을 볼 수 있었다 (도 6).In order to investigate the expression patterns of plant hormones such as ABA, ethephon, methyl jasmonate, and salicylic acid related to dry stress and plant defense mechanism of the IbOrange gene of the present invention, the time period after treatment of each hormone (0, 12, 24, 36, 48 hours) RNA was isolated by the method described in Examples 1 and 2 and cDNA was synthesized, respectively. RT-PCR was performed with the IbOrange gene specific primer used in Example 2 above. As a result, the IbOrange gene showed the following expression pattern. ABA; There is no obvious change in the leaves, but IbOrange genes are strongly expressed after 36 hours in the roots. Ethephon; It is shown that the expression of IbOrange gene is induced at 36 hours after treatment in leaves and roots, particularly in leaves. Methyl jasmonate; In the case of leaves, the expression of IbOrange gene is strongly induced from 12 hours after treatment and lasts up to 36 hours, and the root is weakly increased from 24 hours and then strongly expressed at 36 hours. Salicylic acid; There was no significant change throughout the leaves and roots, but IbOrange gene expression was slightly increased from 12 hours to 36 hours after treatment in the leaves (Fig. 6).

일반적으로 건조 스트레스 하에서는 식물호르몬인 ABA의 양이 증가하며 ABA가 건조에 대응하여 식물의 기공 개폐를 조절하는 것으로 알려져 있다. 한편 카로티노이드는 ABA의 전구물질로서 건조 스트레스에 의한 ABA의 증가는 카로티노이드의 증가와 직접적인 관련이 있을 것으로 생각된다. 따라서 본 실험에서의 ABA 처리에 의한 IbOrange 유전자의 발현증가는 건조 스트레스와 IbOrange와의 상관관계를 잘 보여주고 있다.In general, under the dry stress, the amount of ABA, a plant hormone, is increased, and ABA is known to regulate the pore opening and closing of plants in response to drying. On the other hand, carotenoids are precursors of ABA, and the increase of ABA due to dry stress is thought to be directly related to the increase of carotenoids. Therefore, the increase of IbOrange gene expression by ABA treatment in this experiment shows the correlation between dry stress and IbOrange.

<< 실시예Example 4>  4> IbOrangeIbOrange 유전자의 대장균 발현을 통한 단백질 생성 확인 Confirmation of protein production by expression of E. coli gene

IbOrange 유전자가 실제로 원하는 크기의 단백질을 생성하는지를 확인하기 위해, IbOrange 유전자의 코딩부분을 pDONR207 벡터에 클로닝하여 히스티딘 친화성 태그 (histidine affinity tag)와 글루타치온-S-트랜스퍼라아제 (GST) 융합 단백질이 있는 발현벡터 pDEST 17과 pDEST 15에 도입하였다. 이 발현 벡터를 대장균 발현균주 (BL21 DE3)에 형질전환하여 IPTG로 orange 단백질의 발현을 유도하였다. 대장균의 단백질을 추출하여 SDS-PAGE 젤 분석을 통하여 확인한 결과, 34kDa의 히스티딘 태그가 붙어 있는 재조합 단백질과 57kDa의 GST-융합 단백질의 생성을 확인할 수 있었다 (도 7). 따라서, 본 발명에서 클로닝된 IbOrange 유전자가 orange 단백질을 코딩하는 유전자임을 다시 한번 확인시켜 주었다.To confirm that the IbOrange gene actually produces a protein of the desired size, the coding portion of the IbOrange gene was cloned into the pDONR207 vector, which contains a histidine affinity tag and a glutathione-S-transferase (GST) fusion protein. The expression vectors pDEST 17 and pDEST 15 were introduced. This expression vector was transformed into E. coli expression strain (BL21 DE3) to induce the expression of orange protein by IPTG. As a result of extracting the E. coli protein and confirming it through SDS-PAGE gel analysis, it was confirmed that the recombinant protein tagged with 34 kDa histidine and the GST-fusion protein of 57 kDa (FIG. 7). Therefore, it was confirmed once again that the cloned IbOrange gene in the present invention is a gene encoding an orange protein.

그러므로, 본 발명의 IbOrange 유전자를 통하여 카로티노이드 함량을 높임으로써 기능성 향상뿐만 아니라 환경 스트레스에 내성이 강한 식물체 개발에 매우 유용하게 사용될 수 있을 것으로 본다.Therefore, by increasing the carotenoid content through the IbOrange gene of the present invention it is expected that it can be very useful for the development of plants resistant to environmental stress as well as functional enhancement.

도 1은 본 발명의 고구마 (품종 신황미) 유래 IbOrange 유전자의 염기서열과 이로부터 추론한 아미노산 서열을 나타낸 그림이다. 밑줄 친 부분은 plastid localization signal 이며, 전체 942 bp의 cDNA가 313 아미노산을 코딩하고 있다. 1 is a diagram showing the nucleotide sequence of the sweet potato (breed yellow rice) derived IbOrange gene of the present invention and the amino acid sequence inferred therefrom. The underlined portion is the plastid localization signal, with a total of 942 bp cDNA encoding 313 amino acids.

도 2는 본 발명의 고구마 (Ipomoea batatas) IbOrange 유전자의 추론된 단백질의 아미노산 서열과 여러 식물(나팔꽃,토마토, 포도, 콩, 대두, 목화, 애기장대, 꽃양배추, 단수수, 옥수수, 벼, 보리)의 orange 유전자 아미노산 서열을 비교한 그림이다.Figure 2 is the amino acid sequence of the deduced protein of the sweet potato (Ipomoea batatas) IbOrange gene of the present invention and various plants (morning flower, tomato, grapes, beans, soybeans, cotton, Arabidopsis, cauliflower, singular, corn, rice, barley Figure shows a comparison of the amino acid sequence of orange genes.

도 3은 본 발명의 IbOrange 유전자의 추론된 단백질의 아미노산 서열과 여러 식물(나팔꽃,토마토, 포도, 콩, 대두, 목화, 애기장대, 꽃양배추, 단수수, 옥수수, 벼, 보리)의 orange 유전자 사이의 유연 관계를 나타낸 그림이다. Figure 3 is between the amino acid sequence of the deduced protein of the IbOrange gene of the present invention and the orange gene of various plants (morning glory, tomato, grapes, beans, soybeans, cotton, Arabidopsis, cauliflower, singular, corn, rice, barley) This figure shows the flexible relationship of.

도 4는 고구마 품종별로 본 발명의 IbOrange 유전자가 발현하는 양상을 RT-PCR을 수행하여 전기영동한 사진이다. Ym; 율미, Jm; 신자미, Hm; 신황미.Figure 4 is a picture of the IbOrange gene expression of the present invention for each sweet potato varieties electrophoresis by performing RT-PCR. Ym; Yulmi, Jm; Shinjami, Hm; Xinhuangmi.

도 5는 고구마의 부위별로 본 발명의 IbOrange 유전자가 발현하는 양상을 RT-PCR을 수행하여 전기영동한 사진이다. L, leaf (잎); S, stem (줄기); storage roots (저장뿌리); fibrous roots (실뿌리); thick pigmented roots (굵은 뿌리). Figure 5 is a photograph of electrophoresis by performing RT-PCR on the expression of the IbOrange gene of the present invention for each portion of the sweet potato. L, leaf; S, stem; storage roots; fibrous roots (roots); thick pigmented roots.

도 6은 고구마 잎과 뿌리에 식물호르몬인 ABA, 에틸렌의 전구물질인 에테폰, 메틸 자스모네이트(MeJA), 살리실산(SA)를 처리 후 0, 12, 24, 36, 48 시간째 본 발명의 IbOrange 유전자의 발현양상을 RT-PCR을 수행하여 전기영동한 사진이다.6 is sweet potato leaves and roots of the present invention, 0, 12, 24, 36, 48 hours after treatment with plant hormones ABA, ethylene precursors etepon, methyl jasmonate (MeJA), salicylic acid (SA) The expression pattern of IbOrange gene is electrophoresed by RT-PCR.

도 7은 대장균을 이용하여 IbOrange 유전자의 재조합 단백질 생산을 보여주 는 단백질 전기영동 사진이다. 레인 1; His-tag를 갖는 가용성 IbOrange, 레인 2; His-tag를 갖는 불용성 IbOrange, 레인 3; GST-tag를 갖는 가용성 IbOrange, 레인 4; GST-tag를 갖는 불용성 IbOrange.Figure 7 is a protein electrophoresis picture showing recombinant protein production of IbOrange gene using E. coli. Lane 1; Soluble IbOrange with His-tag, lane 2; Insoluble IbOrange with His-tag, lane 3; Soluble IbOrange with GST-tag, lane 4; Insoluble IbOrange with GST-tag.

<110> Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology <120> IbOrange gene involved in carotenoid accumulation from Ipomoea batatas <130> PN08125 <160> 8 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 942 <212> DNA <213> Ipomoea batatas <400> 1 atggtatatt caggtagaat cttgtcgctc tcgtcctcca cgacgccgtt tcatctctcc 60 acttcgccgt tccacagttc ccggtatcat ctccatggaa ggctcaaatc cagagtcaga 120 ttgcgtccta tggccgccga tgccgattcc tcctcctttt cttcatccgt cgacaccgaa 180 gcacccgata aaaacgcagc cgggttttgt attatagaag ggcctgagac agtgcaggac 240 tttgctcaaa tggaattgaa agaaattcaa gacaatattc ggagtcgccg gaataaaata 300 tttttgcata tggaagaggt tcgtaggctg agaatacagc aacgaattaa gaatgctgag 360 cttgggaatc ttaatgaaaa gcaagaaaat aaacttccga attttccttc gttcattcct 420 tttttgcctc ctctgacatc cgcaaatctt aaacaatatt atgccacttg tttctctctc 480 atagccggag ttatgctttt tggcggactg ctagcaccta ctttggaact aaaattgggc 540 ttaggaggta catcgtacgc tgatttcatt cgcagcatgc accttccgat gcaattaagt 600 gatgtggacc ccattgtggc gtccttctcc ggtggagcag tcggggtaat ctctgccttg 660 atggtagttg aaataaacaa tgtgaaacag caggagcata agaggtgcaa gtactgttta 720 ggaacagggt atcttgcatg tgctcgctgt tcaagcactg gatcactagt ccttatcgaa 780 cctgtctcca cagttaatcg tggagatcag ccactatcac cacctaaaac agaaagatgc 840 acaaactgct cgggttcagg gaaggtcatg tgccctacat gtctttgtac tgggatggct 900 atggcaagcg agcatgaccc acgaattgac ccatttgatt aa 942 <210> 2 <211> 313 <212> PRT <213> Ipomoea batatas <400> 2 Met Val Tyr Ser Gly Arg Ile Leu Ser Leu Ser Ser Ser Thr Thr Pro 1 5 10 15 Phe His Leu Ser Thr Ser Pro Phe His Ser Ser Arg Tyr His Leu His 20 25 30 Gly Arg Leu Lys Ser Arg Val Arg Leu Arg Pro Met Ala Ala Asp Ala 35 40 45 Asp Ser Ser Ser Phe Ser Ser Ser Val Asp Thr Glu Ala Pro Asp Lys 50 55 60 Asn Ala Ala Gly Phe Cys Ile Ile Glu Gly Pro Glu Thr Val Gln Asp 65 70 75 80 Phe Ala Gln Met Glu Leu Lys Glu Ile Gln Asp Asn Ile Arg Ser Arg 85 90 95 Arg Asn Lys Ile Phe Leu His Met Glu Glu Val Arg Arg Leu Arg Ile 100 105 110 Gln Gln Arg Ile Lys Asn Ala Glu Leu Gly Asn Leu Asn Glu Lys Gln 115 120 125 Glu Asn Lys Leu Pro Asn Phe Pro Ser Phe Ile Pro Phe Leu Pro Pro 130 135 140 Leu Thr Ser Ala Asn Leu Lys Gln Tyr Tyr Ala Thr Cys Phe Ser Leu 145 150 155 160 Ile Ala Gly Val Met Leu Phe Gly Gly Leu Leu Ala Pro Thr Leu Glu 165 170 175 Leu Lys Leu Gly Leu Gly Gly Thr Ser Tyr Ala Asp Phe Ile Arg Ser 180 185 190 Met His Leu Pro Met Gln Leu Ser Asp Val Asp Pro Ile Val Ala Ser 195 200 205 Phe Ser Gly Gly Ala Val Gly Val Ile Ser Ala Leu Met Val Val Glu 210 215 220 Ile Asn Asn Val Lys Gln Gln Glu His Lys Arg Cys Lys Tyr Cys Leu 225 230 235 240 Gly Thr Gly Tyr Leu Ala Cys Ala Arg Cys Ser Ser Thr Gly Ser Leu 245 250 255 Val Leu Ile Glu Pro Val Ser Thr Val Asn Arg Gly Asp Gln Pro Leu 260 265 270 Ser Pro Pro Lys Thr Glu Arg Cys Thr Asn Cys Ser Gly Ser Gly Lys 275 280 285 Val Met Cys Pro Thr Cys Leu Cys Thr Gly Met Ala Met Ala Ser Glu 290 295 300 His Asp Pro Arg Ile Asp Pro Phe Asp 305 310 <210> 3 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Forward primer <400> 3 atggtatatt caggtagaat cttgtcgctc 30 <210> 4 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Reverse primer <400> 4 ttaatcaaat gggtcaattc gtgggtcatg 30 <210> 5 <211> 46 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Forward primer <400> 5 caaaaaagca ggctnnatgg tatattcagg tagaatcttg tcgctc 46 <210> 6 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Reverse primer <400> 6 caagaaagct gggtnttaat caaatgggtc aattcgtggg tcatg 45 <210> 7 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Forward primer <400> 7 atcttgtcgc tctcgtcctc cacgacgccg 30 <210> 8 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Reverse primer <400> 8 cgtgggtcat gctcgcttgc catagccatc 30 <110> Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology <120> IbOrange gene involved in carotenoid accumulation from Ipomoea          batatas <130> PN08125 <160> 8 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 942 <212> DNA <213> Ipomoea batatas <400> 1 atggtatatt caggtagaat cttgtcgctc tcgtcctcca cgacgccgtt tcatctctcc 60 acttcgccgt tccacagttc ccggtatcat ctccatggaa ggctcaaatc cagagtcaga 120 ttgcgtccta tggccgccga tgccgattcc tcctcctttt cttcatccgt cgacaccgaa 180 gcacccgata aaaacgcagc cgggttttgt attatagaag ggcctgagac agtgcaggac 240 tttgctcaaa tggaattgaa agaaattcaa gacaatattc ggagtcgccg gaataaaata 300 tttttgcata tggaagaggt tcgtaggctg agaatacagc aacgaattaa gaatgctgag 360 cttgggaatc ttaatgaaaa gcaagaaaat aaacttccga attttccttc gttcattcct 420 tttttgcctc ctctgacatc cgcaaatctt aaacaatatt atgccacttg tttctctctc 480 atagccggag ttatgctttt tggcggactg ctagcaccta ctttggaact aaaattgggc 540 ttaggaggta catcgtacgc tgatttcatt cgcagcatgc accttccgat gcaattaagt 600 gatgtggacc ccattgtggc gtccttctcc ggtggagcag tcggggtaat ctctgccttg 660 atggtagttg aaataaacaa tgtgaaacag caggagcata agaggtgcaa gtactgttta 720 ggaacagggt atcttgcatg tgctcgctgt tcaagcactg gatcactagt ccttatcgaa 780 cctgtctcca cagttaatcg tggagatcag ccactatcac cacctaaaac agaaagatgc 840 acaaactgct cgggttcagg gaaggtcatg tgccctacat gtctttgtac tgggatggct 900 atggcaagcg agcatgaccc 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Leu Lys Leu Gly Leu Gly Gly Thr Ser Tyr Ala Asp Phe Ile Arg Ser             180 185 190 Met His Leu Pro Met Gln Leu Ser Asp Val Asp Pro Ile Val Ala Ser         195 200 205 Phe Ser Gly Gly Ala Val Gly Val Ile Ser Ala Leu Met Val Val Glu     210 215 220 Ile Asn Asn Val Lys Gln Gln Glu His Lys Arg Cys Lys Tyr Cys Leu 225 230 235 240 Gly Thr Gly Tyr Leu Ala Cys Ala Arg Cys Ser Ser Thr Gly Ser Leu                 245 250 255 Val Leu Ile Glu Pro Val Ser Thr Val Asn Arg Gly Asp Gln Pro Leu             260 265 270 Ser Pro Pro Lys Thr Glu Arg Cys Thr Asn Cys Ser Gly Ser Gly Lys         275 280 285 Val Met Cys Pro Thr Cys Leu Cys Thr Gly Met Ala Met Ala Ser Glu     290 295 300 His Asp Pro Arg Ile Asp Pro Phe Asp 305 310 <210> 3 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Forward primer <400> 3 atggtatatt caggtagaat cttgtcgctc 30 <210> 4 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Reverse primer <400> 4 ttaatcaaat gggtcaattc gtgggtcatg 30 <210> 5 <211> 46 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Forward primer <400> 5 caaaaaagca ggctnnatgg tatattcagg tagaatcttg tcgctc 46 <210> 6 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Reverse primer <400> 6 caagaaagct gggtnttaat caaatgggtc aattcgtggg tcatg 45 <210> 7 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Forward primer <400> 7 atcttgtcgc tctcgtcctc cacgacgccg 30 <210> 8 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Reverse primer <400> 8 cgtgggtcat gctcgcttgc catagccatc 30  

Claims (8)

서열번호 2의 아미노산 서열로 이루어진, 고구마 (Ipomoea batatas) 유래의 IbOrange 단백질.IbOrange protein from sweet potato (Ipomoea batatas) consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO. 제1항의 IbOrange 단백질을 코딩하는 유전자.The gene encoding the IbOrange protein of claim 1. 제2항에 있어서, 상기 유전자는 서열번호 1의 염기서열로 이루어진 것을 특징으로 하는 유전자.According to claim 2, wherein the gene is a gene, characterized in that consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1. 제2항에 있어서, 상기 유전자는 ABA, 에테폰, 메틸 자스모네이트, 또는 살리실산에 의해 발현이 증가하는 것을 특징으로 하는 유전자.The gene of claim 2, wherein the gene is increased in expression by ABA, etepon, methyl jasmonate, or salicylic acid. 제2항의 유전자를 포함하는 재조합 벡터.Recombinant vector comprising the gene of claim 2. 제5항의 재조합 벡터로 형질전환된 숙주세포.A host cell transformed with the recombinant vector of claim 5. 제6항에 있어서, 대장균인 것을 특징으로 하는 숙주세포.The host cell according to claim 6, which is E. coli. 삭제delete
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