KR100898246B1 - Novel Corynebacterium glutamicum promoter - Google Patents

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Abstract

본 발명은 코리네박테리움 글루타미쿰 세포로부터 유래한 신규한 프로모터 핵산 분자, 이러한 핵산 분자를 포함하는 벡터, 이러한 벡터로 형질전환된 숙주 세포 및 이러한 핵산 분자를 사용하여 목적 유전자의 발현을 유도하는 방법에 관한 것이다.The present invention relates to novel promoter nucleic acid molecules derived from Corynebacterium glutamicum cells, vectors comprising such nucleic acid molecules, host cells transformed with such vectors and using such nucleic acid molecules to induce expression of the gene of interest. It is about a method.

코리네박테리움 글루타미쿰, 프로모터, 핵산, 벡터, 형질전환 Corynebacterium glutamicum, promoter, nucleic acid, vector, transformation

Description

신규한 코리네박테리움 글루타미쿰 프로모터 {Novel Corynebacterium glutamicum promoter}Novel Corynebacterium Glutacum Promoter Novel Corynebacterium glutamicum promoter

본 발명은 목적 유전자의 발현을 유도할 수 있는 신규한 코리네박테리움 글루타미쿰 프로모터 핵산 분자, 이러한 핵산 분자를 포함하는 벡터, 이러한 벡터로 형질전환된 숙주 세포 및 이러한 프로모터 핵산 분자를 사용하여 목적 유전자의 발현을 유도하는 방법에 관한 것이다.The present invention uses a novel Corynebacterium glutamicum promoter nucleic acid molecule capable of inducing expression of a target gene, a vector comprising such nucleic acid molecule, a host cell transformed with such a vector and a promoter nucleic acid molecule. It relates to a method of inducing expression of a gene.

코리네형 세균은 전통적으로 아미노산과 핵산관련물질의 생산에 가장 널리 이용되는 산업용 미생물로서, 주로 L-라이신(lysine), L-트레오닌(threonine), L-아르기닌(arginine), L-쓰레오닌, 및 글루탐산 등의 아미노산 및 각종 핵산을 포함한 사료, 의약품 및 식품 등의 분야에서 다양한 용도를 갖는 화학물질을 생산하는데 이용되는 그람양성세균이며, 생육에 비오틴을 요구한다. 세포분열시 직각으로 굽어지는 특징(snapping)을 가지고 있으며, 생성된 대사물질에 대한 분해활성이 낮은 것도 이 균이 가지는 장점 중 하나이다. 대표적인 균종으로는 코리네박테리움 글루타미쿰 (Corynebacterium glutamicum)을 포함한 코리네박테리움 속, 브레비박테리움 플라붐(Brevibacterium flavum)을 포함한 브리비박테리움 속, 아쓰로박터 종(Athrobacter sp.), 및 마이크로박테리움 종 (Microbacterium sp.) 등이 있다.Coryneform bacteria are traditionally the most widely used industrial microorganisms for the production of amino acids and nucleic acid-related substances, mainly L-lysine, L-threonine, L-arginine, L-threonine, And gram-positive bacteria used to produce chemicals having various uses in fields such as feed, pharmaceuticals, and foods including amino acids such as glutamic acid and various nucleic acids, and require biotin for growth. It has a characteristic of snapping at right angles during cell division, and its low degradation activity on the generated metabolite is one of the advantages of the bacteria. Representative species include Corynebacterium, including Corynebacterium glutamicum, Bribibacterium, including Brevibacterium flavum, Athrobacter sp., And Microbacterium sp.

이러한 코리네형 세균을 유전공학적, 대사공학적 기술을 이용하여 목적 물질들을 고역가로 생산할 수 있는 균주로 개발하기 위해서는, 균주 내에서 여러 가지 대사과정에 관련된 유전자의 발현을 선택적으로 조절할 수 있어야 한다. 이러한 조절을 위해서는, 조절 유전자의 하나로서 DNA 분자 상에 RNA 합성 효소가 결합하여 전사(transcription)를 시작하는 부위인 프로모터의 활성이 강력하거나 범용성을 가져야 하며, 아미노산 또는 핵산 등의 목적 물질들을 과발현시키기 위해서는, 이러한 프로모터의 탐색이 필수적이다.In order to develop such coryneform bacteria into strains capable of producing high titers of target substances using genetic engineering and metabolic engineering techniques, the expression of genes related to various metabolic processes in the strain should be selectively controlled. For this regulation, one of the regulatory genes must have a strong or universal activity of a promoter, a site where RNA synthase binds to a DNA molecule to initiate transcription, and overexpresses target substances such as amino acids or nucleic acids. In order to do this, the search for these promoters is essential.

코리네형 세균에서 유전자를 발현시키기 위해서는, 일반적으로 자체 유전자들이 원래 갖고 있던 프로모터를 사용하는 것이 일반적이었다 (Vasicova, P., et al., J. Bacteriol., 181, 6188-6191, (1999) 등). In order to express genes in coryneform bacteria, it was common to use promoters originally possessed by their own genes (Vasicova, P., et al., J. Bacteriol., 181, 6188-6191, (1999), etc.). ).

한편, 코리네형 세균에서의 유전자 발현을 위한 프로모터 서열은 대장균(Escherichia coli)이나 고초균(Bacillus subtilis) 등과 같은 다른 산업용 미생물과는 달리 일반적인 구조가 알려지지 않았다. 따라서, 많은 연구자들은 클로람페니콜(chloramphenicol)과 같은 항생제 내성 유전자의 프로모터 부분을 제거하고, 여기에 코리네형 세균으로부터 분리한 게놈 DNA를 적절한 제한효소로 절단하여 도입한 후, 이것으로 코리네형 세균을 형질전환시켜 얻은 균주의 항생제 내성을 측정 함으로써 프로모터를 개발해 왔었다(Eikmanns, B.J., et al ., Gene , 102:93-98, 1991; Patek, M., et al ., Microbiology, 142:1297-1309, 1996). Meanwhile, the promoter sequence for gene expression in coryneform bacteria is Escherichia coli ) or Bacillus Unlike other industrial microorganisms such as subtilis ), the general structure is unknown. Therefore, many researchers have removed the promoter portion of antibiotic resistance genes such as chloramphenicol, introduced genomic DNA isolated from coryneform bacteria with appropriate restriction enzymes, and then transformed the coryneform bacteria. Promoters have been developed by measuring the antibiotic resistance of the resulting strains (Eikmanns, BJ, et. al ., Gene , 102: 93-98, 1991; Patek, M., et al ., Microbiology , 142: 1297-1309, 1996).

코리네형 세균 유래의 프로모터와 관련된 선행특허로는 코리네박테리움 유래의 프로모터가 기재된 특허로서 미국등록특허 5,700,661 "Gene expression regulatory DNA", 미국등록특허 5,965,391 "DNA which regulates gene expression in coryneform bacteria", 미국등록특허 7,141,388 "Nucleotide sequences for transcreptional regulation in corynebacterium glutamicum", 및 한국등록특허 10-0653742 "신규한 L-라이신-유도성 프로모터" 등이 있으며, 코리네박테리움 암모니아게네스 유래의 프로모터가 기재된 한국공개특허 10-2006-0068505 "코리네박테리움 속 세포로부터 유래된 신규한 프로모터서열, 그를 포함하는 발현 카세트 및 벡터, 상기 벡터를 포함하는 숙주 세포 및 그를 이용하여 유전자를 발현하는 방법"이 있다.Prior patents related to promoters derived from Coryneform bacteria include patents describing promoters derived from Corynebacterium, and are described in US Patent 5,700,661 "Gene expression regulatory DNA", US Patent 5,965,391 "DNA which regulates gene expression in coryneform bacteria", USA Patent No. 7,141,388 "Nucleotide sequences for transcreptional regulation in corynebacterium glutamicum", and Korea Patent No. 10-0653742 "New L-lysine-induced promoter", and the like, and disclosed in Korea disclosed a promoter derived from Corynebacterium ammonia genes Patent 10-2006-0068505 “Novel promoter sequences derived from cells of the genus Corynebacterium, expression cassettes and vectors comprising them, host cells comprising said vectors and methods of expressing genes using the same”.

그러나, 기존에 개발된 프로모터 서열들은 특별한 유도제 존재 하에서 발현정도가 증가하는 등의 유전자 발현의 선택성 및 발현효율 등의 측면에서 여전히 개선의 여지를 안고 있었다.  However, previously developed promoter sequences still have room for improvement in terms of selectivity and expression efficiency of gene expression such as increased expression in the presence of a specific inducer.

한편, 종래에 프로모터를 탐색하는 방법에는 (1) 클로닝된 단편이 프로모터 활성을 포함하는 경우에만 발현되는 리포터 유전자의 전방에 게놈성 DNA 단편을 무작위로 클로닝시키는 프로모터 프로브 벡터의 이용법, (2) 유전자 특이적 프로브에 기초한 하이브리드화를 이용하여 유전자 라이브러리로부터 유전자 및 이의 프로모 터의 분리법, (3) 유도성 cDNA 프로브 및 비유도성 cDNA 프로브를 사용한 유전자 뱅크의 차별 하이브리드화법 등이 있었다.On the other hand, the conventional method of searching for a promoter includes (1) the use of a promoter probe vector for randomly cloning a genomic DNA fragment in front of a reporter gene expressed only when the cloned fragment contains promoter activity, and (2) a gene. Hybridization based on specific probes has been used to isolate genes and their promoters from gene libraries, and (3) differential hybridization of gene banks using inducible and non-inducible cDNA probes.

이에 본 발명자는 리포터 유전자 전방에 게놈성 DNA 단편을 클로닝시켜 리포터 유전자를 통해 프로모터 활성 정도를 알아볼 수 있는 프로모터 프로브 벡터의 이용법을 응용하여, 코리네박테리움 글루타미쿰 게놈 유전자의 DNA 마이크로어레이(microarray)를 통해 발현율이 높은 유전자로 선별된 유전자의 예상 프로모터 폴리뉴클레오타이드를 연쇄중합법(PCR)로 증폭한 후, GFP 리포터 유전자 앞부분에 연결시켜 GFP 활성 정도를 확인함으로써, 신규한 코리네박테리움 글루타미쿰 유래 프로모터 핵산 분자를 제공할 수 있게 되어 본 발명을 완성하였다.The present inventors cloned genomic DNA fragments in front of the reporter gene and applied the use of a promoter probe vector that can determine the degree of promoter activity through the reporter gene, thereby applying a DNA microarray of the Corynebacterium glutamicum genomic gene. New corynebacterium glutamime by amplifying the predicted promoter polynucleotide of a gene selected as a gene with high expression rate by a) and then linking it to the front of the GFP reporter gene to confirm the degree of GFP activity. It was possible to provide a Qum-derived promoter nucleic acid molecule to complete the present invention.

본 발명의 목적은 신규한 코리네박테리움 글루타미쿰 프로모터 핵산 분자를 제공하는 것이다.It is an object of the present invention to provide a novel Corynebacterium glutamicum promoter nucleic acid molecule.

본 발명의 또 다른 목적은 상기한 신규 프로모터 핵산 분자를 포함하는 벡터를 제공하는 것이다.It is still another object of the present invention to provide a vector comprising the novel promoter nucleic acid molecule described above.

본 발명의 또 다른 목적은 상기한 벡터로 형질전환된 형질전환체를 제공하는 것이다.Still another object of the present invention is to provide a transformant transformed with the vector.

본 발명의 또 다른 목적은 상기한 신규 프로모터 핵산 분자를 사용하여 목적 유전자의 발현을 유도하는 방법을 제공하는 것이다.Still another object of the present invention is to provide a method for inducing expression of a gene of interest using the novel promoter nucleic acid molecule described above.

하나의 양태로서, 본 발명은 서열번호 1 또는 2의 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 신규한 코리네박테리움 글루타미쿰 프로모터 핵산 분자에 관한 것이다.In one embodiment, the present invention relates to a novel Corynebacterium glutamicum promoter nucleic acid molecule comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 or 2.

본 발명의 코리네박테리움 글루타미쿰 프로모터 핵산 분자는 코리네형 세균(Coryneform bacterium) 유래의 프로모터로서, 바람직하게는 원핵세포, 특히 대장균 또는 코리네형 세균에서의 유전자 발현을 위한 프로모터로 유용하다.The Corynebacterium glutamicum promoter nucleic acid molecule of the present invention is a promoter derived from Coryneform bacterium, and is preferably used as a promoter for gene expression in prokaryotic cells, particularly E. coli or Coryneform bacteria.

본 발명의 용어 "코리네형 세균"은 코리네박테리움(Corynebacterium) 또는 브레비박테리움(Brevibacterium) 속의 미생물을 포함하는 개념이다. 이러한 코리네형 세균은 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032 외에 다른 코리네박테리움속, 특히 코리네박테리움 글루타미쿰 종의 적당한 균주로는 공지된 야생형 균주, 코리네박테리움 써모아미노게네스(thermoaminogenes) FERM BP-1539, 브레비박테리움 플라붐(Brevibacterium flavum) ATCC 14067, 브레비박테리움 락토페르멘툼(lactofermentum) ATCC 13869, 및 이들로부터 제조된 L-아미노산 생산 돌연변이체 또는 균주, 예를 들면, 코리네박테리움 글루타미쿰 KFCC 10881, 코리네박테리움 글루타미쿰 KFCC 11001 등을 포함하나, 이들 예에 한정되는 것은 아니다.The term "coryneform bacterium" of the present invention is a concept including microorganisms of the genus Corynebacterium (Corynebacterium) or Brevibacterium (Brevibacterium). This coryneform bacterium is a wild-type strain known as Corynebacterium glutamicum, in addition to Corynebacterium glutamicum ATCC 13032, in particular Corynebacterium glutamicum species, known as Corynebacterium thermoaminogenes ( thermoaminogenes) FERM BP-1539, Brevibacterium flavum ATCC 14067, Brevibacterium lactofermentum ATCC 13869, and L-amino acid producing mutants or strains prepared therefrom, for example , Corynebacterium glutamicum KFCC 10881, Corynebacterium glutamicum KFCC 11001 and the like, but is not limited to these examples.

본 발명에서 용어 "프로모터"란 폴리머라제에 대한 결합 부위를 포함하고 프로모터 하위 유전자의 mRNA로의 전사 개시 활성을 가지는, 암호화 영역의 상위(upstream)의 비해독된 핵산서열, 즉, 폴리머라제가 결합하여 유전자의 전사를 개시하도록 하는 DNA 영역을 말하며, mRNA 전사 개시부위의 5' 부위에 위치한다. As used herein, the term "promoter" refers to a non-ready nucleic acid sequence upstream of a coding region, that is, a polymerase, that contains a binding site for a polymerase and has a transcription initiation activity to an mRNA of a promoter subgene. Refers to a DNA region for initiating transcription of a gene and is located at the 5 'region of the mRNA transcription initiation site.

구체적인 일 양태로서, 본 발명의 프로모터는 코리네박테리움 글루타미쿰 게놈으로부터 분리한 butA 유전자의 프로모터 (N1, 서열번호 1의 뉴클레오타이드 서열로 정의됨), 또는 pyk 유전자의 프로모터 (N2, 서열번호 2의 뉴클레오타이드 서열로 정의됨)에 관한 것이다.In a specific embodiment, the promoter of the present invention is a promoter of the butA gene isolated from the Corynebacterium glutamicum genome (N1, defined by the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1), or the promoter of the pyk gene (N2, SEQ ID NO: 2). As defined by the nucleotide sequence of).

본 발명의 구체적인 일 실시예로서, 본 발명자는 DNA 마이크로어레이를 이용하여 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032의 약 3000개의 유전자의 전체 게놈 발현량 측정을 통해 신규한 프로모터, 구체적으로 butA, pyk 유전자의 프로모터를 선별하였다. As a specific embodiment of the present invention, the present inventors use a DNA microarray to measure novel genome expression of about 3000 genes of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032, and thus, a novel promoter, specifically, butA and pyk genes. Promoter of was selected.

본 발명에 있어서, 'butA 유전자' 및 'pyk 유전자'는 이미 공개되어 있는 코리네박테리움 글루타미쿰 게놈 유전자의 염기서열로부터 그 유전자 정보를 확보할 수 있다. 예를 들어, 본 발명에서 사용되는 butA, pyk 유전자는 미국국립보건원 유전자은행 (NIH GenBank)으로부터 단백질들의 유전정보를 확보할 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니다. 본 발명에서 사용되는 'butA 유전자'는 유전자은행 등록번호 NCgl2582로서, L-2,3-부탄디올 디하이드로게네이즈(L-2.3-butanediol dehydrogenase)를 코딩하며, 'pyk 유전자'는 유전자은행 등록번호 NCgl2008로서, 피루베이트 카이네이즈(pyruvate kinase)를 코딩한다.In the present invention, the 'butA gene' and the 'pyk gene' can obtain the genetic information from the nucleotide sequence of the Corynebacterium glutamicum genomic gene that is already published. For example, the butA and pyk genes used in the present invention can obtain genetic information of proteins from the National Institutes of Health Gene Bank (NIH GenBank), but is not limited thereto. The 'butA gene' used in the present invention is GenBank registration number NCgl2582, which encodes L-2,3-butanediol dehydrogenase (L-2.3-butanediol dehydrogenase), and the 'pyk gene' is GenBank registration number NCgl2008 As an example, pyruvate kinase is encoded.

또한, 본 발명에 따른 'butA 유전자' 및 'pyk 유전자'는 각각 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032 균주 유래의 NCgl2582, NCgl2008 서열을 갖는 것뿐만 아니라, 코리네박테리움 속에 속하는 미생물에 존재하는 유전자로서 상기 NCgl2582 또는 NCgl2008의 유전자 산물과 실질적으로 동일한 산물을 발현하는 유전자를 의미한다. '실질적으로 동일'이란 각 유전자 산물과 동일한 종류의 활성 및 조절 기작을 갖는 것을 의미한다.In addition, the 'butA gene' and the 'pyk gene' according to the present invention not only have NCgl2582 and NCgl2008 sequences derived from the Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 strain, but also exist in the microorganisms belonging to the genus Corynebacterium. As a gene means a gene that expresses substantially the same product as the gene product of NCgl2582 or NCgl2008. “Substantially identical” means having the same kind of activity and regulatory mechanisms as each gene product.

본 발명의 프로모터 핵산 분자에 포함되는 서열번호 1 또는 2 뉴클레오타이드 서열은 최근의 여러 가지 연구기법, 예를 들어 방향성 진화법(directed evolution) 또는 부위특이돌연변이기술(site-directed mutagenesis) 등의 방법을 통해 일정 정도 변형이 가능하다. 즉, 본 발명의 본 발명의 코리네박테리움 글루타미쿰 프로모터 핵산 분자는 상기한 코리네박테리움 글루타미쿰 프로모터 핵산 분자 와 기능적으로 동일한 작용을 수행하는 이의 작용성 등가물을 포함하는데, 상기 작용성 등가물은 인위적인 변형에 의해 뉴클레오타이드의 일부 염기서열이 결실(deletion), 치환(substitution), 삽입(insertion) 또는 이들의 조합(combination)에 의해 변형된 변이체(variants) 또는 동일한 작용을 수행하는 상기 폴리뉴클레오티드의 작용성 단편(fragments)을 포함할 수 있다.SEQ ID NO: 1 or 2 nucleotide sequence contained in the promoter nucleic acid molecule of the present invention through a variety of recent research techniques, such as directed evolution or site-directed mutagenesis, etc. Some deformation is possible. That is, the Corynebacterium glutamicum promoter nucleic acid molecule of the present invention of the present invention includes a functional equivalent thereof that performs a functionally identical function to the Corynebacterium glutamicum promoter nucleic acid molecule described above. Equivalents are those polynucleotides in which some sequences of nucleotides are modified by artificial modification, or variants or the same function in which modifications are made by deletion, substitution, insertion, or combination thereof. And functional fragments of.

본 기술분야의 당업자라면 이러한 인위적인 변형에 의해 70% 이상의 상동성이 유지되는 염기서열이 본 발명에서 목적하는 유전자 발현을 위한 프로모터 활성을 보유하는 한, 본 발명의 신규한 프로모터와 균등물로서 본 발명의 권리 범위에 속함을 쉽게 이해할 수 있을 것이다.Those skilled in the art will appreciate that the present invention is equivalent to the novel promoters and equivalents of the present invention, so long as the sequence that maintains at least 70% homology by such an artificial modification retains the promoter activity for the gene expression desired in the present invention. It is easy to understand that it belongs to the scope of rights.

따라서, 또 다른 구체적인 일 양태로서, 본 발명의 프로모터 핵산 분자는 상기한 뉴클레오타이드 서열과 70% 이상의 상동성(homology)을 나타내고 프로모터 활성을 가지는 뉴클레오타이드 서열을 포함한다.Thus, as another specific aspect, the promoter nucleic acid molecule of the present invention comprises a nucleotide sequence that exhibits at least 70% homology with the above-described nucleotide sequence and has a promoter activity.

본 발명에서 사용된 용어 "상동성"은 야생형(wild type) 핵산 서열과의 유사한 정도를 나타내기 위한 것으로서, 서열번호 1 또는 2로 정의되는 본 발명의 프로모터의 핵산 서열과 바람직하게는 70% 이상, 보다 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상 동일할 수 있는 DNA 서열을 포함한다.   이러한 상동성의 비교는 육안으로나 구입이 용이한 비교 프로그램을 이용하여 수행할 수 있다.  시판되는 컴퓨터 프로그램은 2개 이상의 서열 간의 상동성을 백분율(%)로 계산할 수 있으며, 상동성(%)은 인접한 서열에 대해 계산될 수 있다. As used herein, the term "homology" is intended to indicate a degree of similarity to a wild type nucleic acid sequence, preferably 70% or more of the nucleic acid sequence of the promoter of the present invention defined by SEQ ID NO: 1 or 2. More preferably at least 80%, even more preferably at least 90%, most preferably at least 95%. This homology comparison can be performed by using a comparison program that is easy to see with the naked eye. Commercially available computer programs can calculate the percent homology between two or more sequences, and the percent homology can be calculated for adjacent sequences.

또 다른 구체적인 일 양태로서, 본 발명의 프로모터 핵산 분자는 서열번호1, 2 또는 이들과 70% 이상의 상동성을 나타내고 프로모터 활성을 가지는 뉴클레오타이드 서열에 상보적인(complementary) 뉴클레오타이드 서열을 포함하는데, 바람직하게는, 이들은 상기 뉴클레오타이드와 동등한 프로모터 활성을 가지는 것이 좋다.In another specific aspect, a promoter nucleic acid molecule of the present invention comprises a nucleotide sequence complementary to a nucleotide sequence having at least 70% homology with SEQ ID No. 1, 2 or these and having promoter activity, preferably , They preferably have a promoter activity equivalent to the nucleotides.

본 발명에 사용된 용어, "상보적인"은 뉴클레오타이드 또는 핵산, 예를 들어 이중가닥 DNA 분자의 2개의 가닥간 또는 올리고뉴클레오타이드 프라이머와 서열분석되거나 증폭될 단일 가닥 핵산 상의 프라이머 결합 부위간의 하이브리드화 또는 염기 짝지음을 의미한다.As used herein, the term “complementary” refers to a hybridization or base between two strands or oligonucleotide primers of a nucleotide or nucleic acid, eg, a double stranded DNA molecule, and a primer binding site on a single stranded nucleic acid to be sequenced or amplified. It means mating.

본 발명의 프로모터 핵산 분자는 표준 분자 생물학 기술을 이용하여 분리 또는 제조할 수 있다. 예를 들어, 적절한 프라이머 서열을 이용하여 PCR을 통해 분리할 수 있다. 또한, 자동화된 DNA 합성기를 이용하는 표준 합성 기술을 이용하여 제조할 수도 있다.Promoter nucleic acid molecules of the invention can be isolated or prepared using standard molecular biology techniques. For example, it can be separated by PCR using the appropriate primer sequence. It can also be prepared using standard synthetic techniques using automated DNA synthesizers.

또 다른 양태로서, 본 발명은 상기한 신규 코리네박테리움 글루타미쿰 프로모터 핵산 분자를 포함하는 벡터에 관한 것이다.In another aspect, the present invention relates to a vector comprising the novel Corynebacterium glutamicum promoter nucleic acid molecule described above.

본 발명의 용어 "벡터"는 적합한 숙주 내에서 목적 유전자를 발현시킬 수 있도록 적합한 조절 서열에 작동 가능하게 연결된 유전자의 염기서열을 함유하는 DNA 제조물을 의미한다. 상기 조절 서열은 전사를 개시할 수 있는 프로모터, 그러한 전 사를 조절하기 위한 임의의 오퍼레이터 서열, 적합한 mRNA 리보좀 결합 부위를 코딩하는 서열, 및 전사 및 해독의 종결을 조절하는 서열을 포함한다. 상기 용어 "작동 가능하게 연결된"이란 프로모터 서열이 상기 코딩 서열의 전사를 개시 및 매개하도록, 상기 코딩 서열과 프로모터가 기능적으로 연결되어 있는 것을 의미한다. 본 발명에서 사용되는 벡터는 숙주 중에서 복제가능한 것이면 특별히 한정되지 않으며 당 업계에 알려진 임의의 벡터를 이용할 수 있다. 예컨대 플라스미드, 파지 입자, 또는 간단하게 잠재적 게놈 삽입물일 수 있으며, 바람직하게는 pECCG117(KFCC-10763) 또는 pCR2.1-TOPO(Invitrogen, USA)을 사용할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 벡터는 적당한 숙주 내로 형질전환된 후, 숙주 게놈과 무관하게 복제되거나 기능할 수 있으며, 일부 경우엔 게놈 그 자체에 통합될 수 있다.As used herein, the term "vector" refers to a DNA preparation containing a nucleotide sequence of a gene operably linked to a suitable regulatory sequence to allow expression of the gene of interest in a suitable host. Such regulatory sequences include promoters capable of initiating transcription, any operator sequence for regulating such transcription, sequences encoding suitable mRNA ribosomal binding sites, and sequences regulating termination of transcription and translation. The term "operably linked" means that the coding sequence and the promoter are functionally linked such that the promoter sequence initiates and mediates the transcription of the coding sequence. The vector used in the present invention is not particularly limited as long as it is replicable in the host, and any vector known in the art may be used. For example, it may be a plasmid, phage particles, or simply a potential genomic insert, preferably pECCG117 (KFCC-10763) or pCR2.1-TOPO (Invitrogen, USA), but are not limited thereto. The vector can be transformed into a suitable host and then replicated or functioned independently of the host genome, and in some cases integrated into the genome itself.

또한, 본 발명의 벡터는 필요에 따라 선택 마커(selection market)를 포함할 수 있다. 선택 마커는 벡터로 형질전환된 세포를 선별하기 위한 것으로, 약물 내성, 영양 요구성, 세포 독성제에 대한 내성 또는 표면 단백질의 발현과 같은 선택가능 표현형을 부여하는 마커들이 사용될 수 있다. 선택제(selective agent)가 처리된 환경에서는 선택 마커를 발현하는 세포만 생존하므로 형질전환된 세포를 선별할 수 있다.In addition, the vector of the present invention may include a selection market if necessary. The selection marker is for selecting cells transformed with the vector, and markers may be used that confer a selectable phenotype such as drug resistance, nutritional requirements, resistance to cytotoxic agents or expression of surface proteins. In an environment treated with a selective agent, only cells expressing a selection marker survive, so that transformed cells can be selected.

본 발명의 벡터는 코리네박테리움 글루타미쿰 프로모터 핵산 분자를 포함하는 조절 서열과 목적 유전자를 포함하는 코딩서열을 작동적으로 연결시켜 다양한 목적 단백질을 재조합적으로 생산할 수 있다. 상기 코딩서열은 예를 들면, 전체 유 전자, 또는 그의 일정한 영역을 코딩하는 서열일 수 있다. 코딩서열의 예는 아미노산(구체적으로, L-라이신, L-트레오닌 또는 L-아르기닌 등)이나 뉴클레오티드의 대사 산물(구체적으로, GMP 또는 IMP 등)과 연관되어 있는 유전자의 코딩서열일 수 있으며, 본 발명은 이에 제한되지 않는다. 본 발명의 벡터를 사용하여 발현시키기에 바람직한 목적 유전자로서, 예를 들면 L-라이신(L-lysine)의 생합성 경로에 관여하는 여러 가지 단백질을 코딩하는 유전자들; 아스파르테이트키나제(lysC), 디아미노피멜레이트 탈수소효소(ddh), 아스파르테이트 세미알데히드 탈수소효소(asd), 디히드로디피콜리네이트 신타제(dapA), 디히드로디피콜리네이트리덕타제(dapB), 디아미노피멜레이트 에피어라제(dapF), 또는 디아미노피멜레이트 데카르복실라제(lysA) 등이 사용될 수 있으며, 반드시 이들로 제한되지는 않는다. The vector of the present invention can recombinantly produce various target proteins by operatively linking a regulatory sequence comprising a Corynebacterium glutamicum promoter nucleic acid molecule with a coding sequence comprising a target gene. The coding sequence may be, for example, a sequence encoding an entire gene, or a constant region thereof. Examples of coding sequences may be coding sequences of genes associated with amino acids (specifically, such as L-lysine, L-threonine or L-arginine) or metabolites of nucleotides (specifically, GMP or IMP, etc.). The invention is not limited thereto. Preferred genes for expression using the vectors of the invention include, for example, genes encoding various proteins involved in the biosynthetic pathway of L-lysine; Aspartate kinase (lysC), diaminopimelate dehydrogenase (ddh), aspartate semialdehyde dehydrogenase (asd), dihydrodipicolinate synthase (dapA), dihydrodipicolinate reductase (dapB) , Diaminopimelate epilases (dapF), or diaminopimelate decarboxylase (lysA) and the like can be used, but are not necessarily limited thereto.

또한, 본 발명의 벡터는 정량화할 수 있는 단백질을 코딩하는 유전자(이하, '리포터 유전자'라 함)가 발현되도록 프로모터의 하위(downstream)에 연결시켜 프로모터 활성정도를 측정할 수도 있다. 리포터 유전자로는 녹색형광단백질(Green Fluorescent Protein, GFP)을 이용하는 것이 바람직하다.In addition, the vector of the present invention may be linked to the downstream of the promoter (expression 'reporter gene') to express a gene encoding a protein that can be quantified to measure the degree of promoter activity. As a reporter gene, it is preferable to use Green Fluorescent Protein (GFP).

본 발명의 구체적인 실시예에서는, 본 발명에 따른 서열번호 1, 2의 신규한 프로모터 핵산 분자(N1, N2)를 삽입하기 위한 벡터로서, 코리네박테리움 글루타미쿰으로의 형질전환에 사용 가능한 셔틀벡터인 pECCG117(Biotechnology letters vol 13, No.10, p.721-726(1991) 또는 대한민국 특허공고 제92-7401호)을 이용하였다. 또한, 상기 벡터에 프로모터 활성을 측정하기 위한 리포터유전자로서 GFP를 코딩하는 gfp 유전자를 포함시키고, 선택마커로서 카나마이신 내성 유전자를 포함시켜, 최종적으로 서열번호 1의 프로모터(N1)를 포함하는 벡터 pECCG117-N1-GFP, 및 서열번호 2의 프로모터(N2)를 포함하는 벡터 pECCG116-N2-GFP를 제작하였다(도 1).In a specific embodiment of the present invention, as a vector for inserting the novel promoter nucleic acid molecules (N1, N2) of SEQ ID NOs: 1 and 2 according to the present invention, a shuttle usable for transformation into Corynebacterium glutamicum The vector pECCG117 (Biotechnology letters vol 13, No. 10, p. 721-726 (1991) or Korean Patent Publication No. 92-7401) was used. In addition, gfp encoding GFP as a reporter gene for measuring promoter activity in the vector. A vector pECCG117-N1-GFP comprising the gene of SEQ ID NO: 1, including the kanamycin resistance gene as a selection marker, and finally comprising the promoter of SEQ ID NO: 1, and a promoter (N2) of SEQ ID NO: 2 N2-GFP was produced (FIG. 1).

또 다른 양태로서, 본 발명은 상기한 벡터로 형질전환된 형질전환체에 관한 것이다. 본 발명의 형질전환체는 벡터를 프로모터가 작용할 수 있는 양태로 숙주세포 내에 도입시키는 것에 의해 구축될 수 있다. In another aspect, the present invention relates to a transformant transformed with the vector described above. The transformant of the present invention can be constructed by introducing a vector into a host cell in an embodiment in which a promoter can act.

본 발명의 용어 "형질전환"은 DNA를 숙주로 도입하여 DNA가 염색체외 인자로서 또는 염색체 통합완성에 의해 복제가능하게 되는 것을 의미한다.The term "transformation" of the present invention means that DNA is introduced into a host so that the DNA is replicable as an extrachromosomal factor or by chromosomal integration.

본 발명의 벡터를 형질전환시키는 방법은 핵산을 세포 내로 도입하는 어떤 방법도 포함되며, 숙주세포에 따라 당 분야에서 공지된 바와 같이 적합한 표준 기술을 선택하여 수행할 수 있다. 예를 들어, 전기천공법(electroporation), 인산칼슘(CaPO4) 침전, 염화칼슘(CaCl2) 침전, 미세주입법(microinjection), 폴리에틸렌글리콜(PEG)법, DEAE-덱스트란법, 양이온 리포좀법, 및 초산 리튬-DMSO법 등이 있다. Methods for transforming a vector of the present invention include any method for introducing nucleic acids into cells, and can be carried out by selecting appropriate standard techniques as known in the art depending on the host cell. For example, electroporation, calcium phosphate (CaPO 4 ) precipitation, calcium chloride (CaCl 2 ) precipitation, microinjection, polyethylene glycol (PEG) method, DEAE-dextran method, cationic liposome method, and Lithium acetate-DMSO method;

상기 숙주 세포로는 DNA의 도입효율이 높고, 도입된 DNA의 발현 효율이 높은 숙주를 사용하는 것이 좋은데, 원핵 및 진핵을 포함한 모든 미생물을 사용 가능하며, 바람직하게는 대장균이나 코리네형 세균, 더욱 바람직하게는 코리네박테리움 클루타미쿰 ATCC 10881 을 사용할 수 있다. As the host cell, it is preferable to use a host having high DNA introduction efficiency and a high expression efficiency of the introduced DNA, and all microorganisms including prokaryotic and eukaryotic may be used, preferably E. coli or coryneform bacteria, more preferably. For example, Corynebacterium glutamicum ATCC 10881 may be used.

본 발명의 구체적인 실시예에서는, 본 발명에 따른 서열번호 1의 프로모터(N1)를 포함하는 벡터 pECCG117-N1-GFP를 코리네박테리움 글루타미쿰 10881에 형질전환시켜 목적 유전자를 과발현시킬 수 있는 형질전환체를 제조하였다. 본 발명에서는 상기 형질전환체를 CA01-0086으로 명명하고, 2007년 7월 23일자로 한국미생물보존센터(Korean Culture center of Microorganisms, 이하, "KCCM"으로 약칭함)에 수탁번호 KCCM 10875P로 기탁하였다. 또한, 서열번호 2의 프로모터(N2)를 포함하는 벡터 pECCG116-N2-GFP를 코리네박테리움 글루타미쿰 10881에 형질전환시켜 목적 유전자를 과발현시킬 수 있는 형질전환체를 제조한 후, 상기 형질전환체를 CA01-0087로 명명하고, 수탁번호 KCCM 10876P으로 기탁하였다.In a specific embodiment of the present invention, the vector pECCG117-N1-GFP comprising the promoter (N1) of SEQ ID NO: 1 according to the present invention is transformed into Corynebacterium glutamicum 10881 to transform the target gene overexpression A converter was prepared. In the present invention, the transformant was named CA01-0086, and deposited on the Korean Culture Center of Microorganisms (hereinafter abbreviated as "KCCM") as accession number KCCM 10875P as of July 23, 2007. . In addition, the vector pECCG116-N2-GFP containing the promoter (N2) of SEQ ID NO: 2 was transformed into Corynebacterium glutamicum 10881 to prepare a transformant capable of overexpressing a gene of interest. The sieve was named CA01-0087 and deposited with accession number KCCM 10876P.

또 다른 양태로서, 본 발명은 상기한 코리네박테리움 글루타미쿰 프로모터 핵산 분자를 포함하는 벡터로 형질전환된 형질전환체를 배양하는 단계를 포함하는 목적 유전자의 발현 방법에 관한 것이다. In still another aspect, the present invention relates to a method of expressing a gene of interest comprising culturing a transformant transformed with a vector comprising the aforementioned Corynebacterium glutamicum promoter nucleic acid molecule.

또한, 상기 형질전환체를 배양하는 단계를 포함하는 L-라이신의 제조방법이다.In addition, the method of producing L- lysine comprising the step of culturing the transformant.

본 발명에서 "목적 유전자의 발현"이란 것은 상기 목적 유전자를 발현시켜 목적 유전자가 코딩하는 단백질을 생산하는 것을 의미할 수 있다. 본 발명에서 목적 유전자를 발현하는 방법은 상기 목적 유전자를 포함하는 벡터로 형질전환된 형질전환체(숙주세포)를 배양하여 상기 목적 유전자가 코딩하는 단백질을 발현시키는 방법이며, 이를 통해 상기 단백질이 관여되는 생합성 경로의 최종산물을 제조할 수 있다. In the present invention, "expression of the target gene" may mean to produce the protein encoded by the target gene by expressing the target gene. In the present invention, a method of expressing a target gene is a method of expressing a protein encoded by the target gene by culturing a transformant (host cell) transformed with a vector containing the target gene, thereby inducing the protein. The final product of the biosynthetic pathway can be prepared.

최종 산물은 바람직하게는 L-아미노산, 더욱 바람직하게는 L-라이신일 수 있 다. 본 발명에서 목적 유전자는 상기에서 설명한 바와 같이 바람직하게는 L-라이신(L-lysine)의 생합성 경로에 관여하는 여러 가지 단백질을 코딩하는 유전자들일 수 있으며, 이들 목적 유전자의 발현을 통해 L-라이신 생합성에 필요한 효소를 포함한 단백질들을 생산해냄으로써, 최종 산물인 L-라이신을 효율적으로 제조할 수 있다. The final product may preferably be L-amino acid, more preferably L-lysine. In the present invention, the gene of interest may be genes encoding various proteins involved in the biosynthetic pathway of L-lysine, as described above, and L-lysine biosynthesis through expression of these genes of interest. By producing proteins containing enzymes necessary for the production of the final product L- lysine can be efficiently produced.

본 발명에서 형질전환체의 배양은 널리 공지된 방법에 따라서 수행될 수 있고, 배양 온도 및 시간, 배지의 pH 등의 조건은 적절하게 조절될 수 있다. 이들 공지된 배양 방법은 문헌[Chmiel; Bioprozesstechnik 1. Einfuhrung in die Bioverfahrenstechnik (Gustav Fischer Verlag, Stuttgart, 1991), 및 Storhas; Bioreaktoren und periphere Einrichtungen (Vieweg Verlag, Braunschweig / Wiesbaden, 1994)]에 상세히 기술되어 있다.Culture of the transformant in the present invention can be carried out according to well-known methods, conditions such as the culture temperature and time, the pH of the medium can be appropriately adjusted. These known culture methods are described in Chmiel; Bioprozesstechnik 1. Einfuhrung in die Bioverfahrenstechnik (Gustav Fischer Verlag, Stuttgart, 1991), and Storhas; Bioreaktoren und periphere Einrichtungen (Vieweg Verlag, Braunschweig / Wiesbaden, 1994).

사용되는 배양 배지는 특정한 균주의 요구 조건을 적절하게 충족시켜야 한다. 다양한 미생물에 대한 배양 배지는 공지되어 있다(예를 들면, "Manual of Methods for General Bacteriology" from American Society for Bacteriology (Washington D.C., USA, 1981)). 배지 내 탄소 공급원은 당 및 탄수화물(예: 글루코오스, 슈크로오스, 락토오스, 프럭토오스, 말토오스, 몰라세, 전분 및 셀룰로오스), 유지 및 지방(예: 대두유, 해바라기씨유, 땅콩유 및 코코넛유), 지방산(예: 팔미트산, 스테아르산 및 리놀레산), 알콜(예: 글리세롤 및 에탄올) 및 유기산(예: 아세트산) 등을 이용할 수 있다. 이들 물질은 개별적으로 또는 혼합물로서 사용될 수 있다. 질소 공급원은 질소-함유 유기 화합물(예: 펩톤, 효모 추출액, 육즙, 맥아 추출액, 옥수수 침지액, 대두 박분 및 우레아), 또는 무기 화합물(예: 황산암모늄, 염화암모늄, 인산암모늄, 탄산암모늄 및 질산암모늄)을 이용할 수 있으며, 이들 물질 또한 개별적으로 또는 혼합물로서 사용될 수 있다. 인 공급원으로서 인산이수소칼륨 또는 인산수소이칼륨 또는 상응하는 나트륨 함유 염을 이용할 수 있다. 또한, 배양 배지는 성장에 필수적인 금속염(예: 황산마그네슘 또는 황산철)을 함유할 수 있으며, 최종적으로, 아미노산 및 비타민과 같은 필수 성장-촉진 물질을 상기 언급한 물질 외에 사용할 수 있다. 적합한 전구체를 상기 배양 배지에 추가로 가할 수 있다. 상기 공급 물질은 배양물에 한번에 모두 가하거나, 배양중 적절하게 공급할 수 있다.The culture medium used should suitably meet the requirements of the particular strain. Culture media for various microorganisms are known (eg, "Manual of Methods for General Bacteriology" from American Society for Bacteriology (Washington D.C., USA, 1981)). Carbon sources in the medium include sugars and carbohydrates (e.g. glucose, sucrose, lactose, fructose, maltose, molasses, starch and cellulose), fats and fats (e.g. soybean oil, sunflower seed oil, peanut oil and coconut oil). ), Fatty acids such as palmitic acid, stearic acid and linoleic acid, alcohols such as glycerol and ethanol, organic acids such as acetic acid, and the like. These materials can be used individually or as a mixture. Nitrogen sources can be nitrogen-containing organic compounds such as peptone, yeast extract, gravy, malt extract, corn steep liquor, soybean meal and urea, or inorganic compounds such as ammonium sulfate, ammonium chloride, ammonium phosphate, ammonium carbonate and nitrate Ammonium) can be used, and these materials can also be used individually or as a mixture. Potassium dihydrogen phosphate or dipotassium hydrogen phosphate or the corresponding sodium containing salts can be used as the phosphorus source. In addition, the culture medium may contain metal salts necessary for growth (eg, magnesium sulfate or iron sulfate), and finally, essential growth-promoting substances such as amino acids and vitamins may be used in addition to the substances mentioned above. Suitable precursors may further be added to the culture medium. The feed material may be added to the culture all at once or may be appropriately supplied during the culture.

배양물의 pH는 염기성 화합물(예: 수산화나트륨, 수산화칼륨 또는 암모니아) 또는 산성 화합물(예: 인산 또는 황산)을 적절히 사용하여 조절할 수 있다. 발포는 지방산 폴리글리콜 에스테르와 같은 거포제를 사용하여 조절할 수 있다. 플라스미드의 안정성은 선택적으로 작용하는 적합한 물질, 예를 들어 항생제를 배지에 가하여 유지할 수 있다. 산소 또는 산소-함유 가스 혼합물, 예를 들어 공기를 배양물 중으로 도입시켜 호기성 조건을 유지시킬 수 있다. 배양 온도는 통상적으로 20 내지 45℃, 바람직하게는 25 내지 40℃이다.The pH of the culture can be adjusted by appropriate use of a basic compound (eg sodium hydroxide, potassium hydroxide or ammonia) or an acidic compound (eg phosphoric acid or sulfuric acid). Foaming can be controlled using foaming agents such as fatty acid polyglycol esters. The stability of the plasmid can be maintained by the addition of a suitable substance that selectively acts, for example antibiotics. Oxygen or oxygen-containing gas mixtures, such as air, may be introduced into the culture to maintain aerobic conditions. Incubation temperature is usually 20 to 45 ℃, preferably 25 to 40 ℃.

본 발명은 하기 실시예를 통해 더욱 구체적으로 설명된다. 그러나, 이들 실시예에 의해 본 발명이 한정되어서는 안 된다.The invention is explained in greater detail through the following examples. However, the present invention should not be limited by these examples.

본 발명에 따른 코리네박테리움 글루타미쿰 유래의 신규한 프로모터 N1 또는 N2는 특정한 조건 없이도 강력한 프로모터 활성을 나타내어, 코리네형 세균을 포함하는 다양한 세포에서 목적 유전자의 고발현을 유도하여 고효율로 단백질을 얻을 수 있는 장점이 있다.The novel promoter N1 or N2 derived from Corynebacterium glutamicum according to the present invention exhibits strong promoter activity without specific conditions, inducing high expression of a target gene in various cells including coryneform bacteria and efficiently There is an advantage that can be obtained.

실시예Example 1: 프로모터 서열을 함유하는 재조합 벡터의 제작 1: Construction of a Recombinant Vector Containing a Promoter Sequence

(1) 코리네박테리움 글루타미쿰 유래의 신규한 프로모터 대상 유전자의 선정 (1) Selection of novel promoter target genes derived from Corynebacterium glutamicum

코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032를 5리터 발효조에서 배양한 후, 균체를 수집하였다. 상기 균체를 대상으로 게놈 DNA 칩(지노믹트리(주), cDNA 칩)을 통해 약 3000개의 유전자의 mRNA 발현도를 조사하였다. 전체 유전자들 중에서 총 게놈 발현량의 2.8%, 1.11%를 차지하고 있는 유전자 butA 및 유전자 pyk를 본원 발명의 신규한 프로모터를 위한 대상 유전자로 선정하였다.After culturing Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 in a 5 liter fermenter, the cells were collected. The cells were examined for mRNA expression levels of about 3000 genes through genomic DNA chips (Genomic Tree, Inc., cDNA chip). Among the genes, genes butA and pyk, which account for 2.8% and 1.11% of total genome expression, were selected as target genes for the novel promoter of the present invention.

(2) 예상 프로모터 부위 DNA 단편 증폭(2) amplification of expected promoter region DNA fragments

코리네박테리움 글루타미쿰 게놈 유전자의 염기서열은 이미 명백하게 밝혀져 있으며 공개되어 있다(Appl. Microbiol. Biotechnol., 62(2-3), 99-109(2003): GenBank Accession No. NC_003450). 미국국립보건원 유전자은행 (NIH GenBank)으로부터 단백질들의 유전자정보(butA ; NCgl2582, / pyk ; NCgl2008)를 확보하였다. 각 단백질 오픈리딩프레임 (ORF)의 앞부분에 위치한 예상 프로모터 (서열번호 1: butA의 프로모터 N1, 서열번호 2: pyk의 프로모터 N2)를 증폭하기 위해 보고된 염기서열에 근거하여 아래 표 1과 같이 제한효소 EcoRV 절단부위를 포함하는 프라이머를 합성하였다. The base sequence of the Corynebacterium glutamicum genome gene is already clearly identified and published (Appl. Microbiol. Biotechnol., 62 (2-3), 99-109 (2003): GenBank Accession No. NC — 003450). Genetic information (butA; NCgl2582, / pyk; NCgl2008) of proteins was obtained from the National Institutes of Health (NIH GenBank). Based on the reported base sequence to amplify the predicted promoter (SEQ ID NO: 1: butA promoter N1, SEQ ID NO: 2: pyk promoter N2) located at the front of each protein open reading frame (ORF) as shown in Table 1 below. A primer comprising the enzyme EcoRV cleavage site was synthesized.

코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032 균주의 염색체 DNA를 주형으로 하고, 각각 프라이머 1과 2(서열번호 3과 4) 및 프라이머 3과 4(서열번호 5와 6)를 이용하여 연쇄중합법(PCR법)[Sambrook et al, Molecular Cloning, a Laboratory Manual (1989), Cold Spring Harbor Laboratories](PCR 조건: 변성 = 94℃, 1분 / 어닐링 = 55℃, 1분 / 중합 = 72℃, 30초, 30회)을 이용하여 butA 유전자 및 pyk 유전자의 예상 프로모터 부위를 증폭하여 준비하였다. As a template, chromosomal DNA of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 strain was used as a template, and PCR (PCR) was performed using primers 1 and 2 (SEQ ID NOs: 3 and 4) and primers 3 and 4 (SEQ ID NOs: 5 and 6), respectively. Sambrook et al, Molecular Cloning, a Laboratory Manual (1989), Cold Spring Harbor Laboratories (PCR conditions: denaturation = 94 ° C, 1 min / annealing = 55 ° C, 1 min / polymerization = 72 ° C, 30 seconds, 30 times) was used to amplify the expected promoter region of the butA gene and pyk gene was prepared.

프라이머 서열Primer sequence N1N1 프라이머1(서열번호3) AAGCTG GGTACC GATAG TTCAA ACCGC 프라이머2(서열번호4) ACTTC CTCTT GCTTC CTCAAPrimer 1 (SEQ ID NO: 3) AAGCTG GGTACC GATAG TTCAA ACCGC Primer 2 (SEQ ID NO: 4) ACTTC CTCTT GCTTC CTCAA N2N2 프라이머3(서열번호5) AAGCTG GGTACC GTCTG TTGCA GCAGA 프라이머4(서열번호6) CATAA GCCTA GTACG TCATTPrimer 3 (SEQ ID NO: 5) AAGCTG GGTACC GTCTG TTGCA GCAGA Primer 4 (SEQ ID NO: 6) CATAA GCCTA GTACG TCATT GFPGfp 프라이머5(서열번호7) GATATC ATGAG TAAAG GAGAA GAACT 프라이머6(서열번호8) CTGCAG TTATT TGTAG TGAGC TCATCPrimer 5 (SEQ ID NO: 7) GATATC ATGAG TAAAG GAGAA GAACT Primer 6 (SEQ ID NO: 8) CTGCAG TTATT TGTAG TGAGC TCATC

(3) 프로모터 활성 측정을 위한 벡터의 제작(3) Construction of vector for measuring promoter activity

본 실시예에서는 상기에서 준비된 butA 및 pyk 유전자의 예상 프로모터 부위의 활성을 코리네박테리움에서 측정하기 위해, 리포터 유전자인 GFP 및 신규 프로모터가 삽입된 pECCG117-N1-GFP 와 pECCG117-N2-GFP 벡터를 각각 제작하였다.In this example, in order to measure the activity of the predicted promoter regions of the butA and pyk genes prepared above in Corynebacterium, the reporter genes GFP and pECCG117-N1-GFP and pECCG117-N2-GFP vectors inserted with the new promoter were inserted. Each was produced.

상기 실시예 1-(2)에서 얻어진 DNA 단편들과 GFP 유전자를 코리네박테리움에 삽입하기 위하여 다음과 같은 과정을 거쳤다. 우선 GFP는 pGFuv vector (clontech 사, 미국)를 주형으로 하고, 서열번호 7번과 8번 프라이머(표 1)를 사용하여 각각 증폭하고 제한효소 EcoRV와 PstI를 이용하여 pECCG117에 라이게이션하여 pECCG117-GFP 벡터를 얻었고(대한민국 특허공고 '제92-7401 호' 및 대한민국 등록특허 '제10-0620092'), EcoRV로 다시 제한효소를 처리하여 GFP 유전자 앞에 신규 프로모터(N1, N2)를 각각 300bp 삽입하여 pECCG117-N1-GFP 와 pECCG117-N2-GFP 벡터를 제작하였다(도 1). DNA fragments and GFP obtained in Example 1- (2) To insert the gene into Corynebacterium, the following process was carried out. First, GFP is based on a pGFuv vector (clontech, USA), amplified using primers SEQ ID No. 7 and 8 (Table 1), and ligated to pECCG117 using restriction enzymes EcoRV and PstI, respectively, to pECCG117-GFP. The vector was obtained (Korean Patent Publication No. 92-7401 and Korean Patent Registration No. 10-0620092), and further processed by restriction enzymes with EcoRV to insert 300bps of new promoters (N1, N2) in front of the GFP gene, respectively, pECCG117 -N1-GFP and pECCG117-N2-GFP vectors were constructed (FIG. 1).

실시예Example 2.  2. 신규한New 프로모터 서열을 포함하는 벡터의  Of a vector comprising a promoter sequence 코리네박테리움Corynebacterium 내 삽입 My insert

L-라이신 생산균주인 코리네박테리움 글루타미쿰 KFCC 10881에 상기에서 제작한 pECCG117-N1-GFP 와 pECCG117-N2-GFP 벡터를 각각 전기펄스법으로 형질전환한 후 (Appl. Microbiol.Biotechnol. (1999) 52:541-545에 의한 형질전환법 이용), 카나마이신 (kanamycin) 25mg/L를 함유한 선별 배지에서 항생제 카나마이신에 대한 감수성을 가진 콜로니를 선별하였다.After the above-described pECCG117-N1-GFP and pECCG117-N2-GFP vectors were transformed into L-lysine producing strain Corynebacterium glutamicum KFCC 10881, respectively, (Appl. Microbiol. Biotechnol. ( 1999) using a transformation method of 52: 541-545), and colonies with susceptibility to the antibiotic kanamycin were selected in a selection medium containing kanamycin 25 mg / L.

프로모터가 N1을 포함한 벡터로 형질전환된 균주는 CA01-0086, 프로모터 N2를 포함한 벡터로 형질전환된 균주는 CA01-0087으로 명명하였으며, 2007년 7월 23일자로 한국미생물보존센터에 CA01-0086 균주를 수탁번호 KCCM 10875P로, CA01-0087 균주를 수탁번호 KCCM 10876P으로 기탁하였다.The strain transformed with the vector containing the promoter N1 was named CA01-0086, and the strain transformed with the vector containing the promoter N2 was named CA01-0087. As of July 23, 2007, the strain CA01-0086 was transferred to the Korea Microbiological Conservation Center. Was deposited with accession number KCCM 10875P, and CA01-0087 strain was deposited with accession number KCCM 10876P.

실시예Example 3:  3: 코리네박테리움에서In the Corynebacterium 프로모터 서열의 활성 Activity of promoter sequence

(1) GFP유전자의 활성 측정을 통한 프로모터 발현 강도 예측(1) Predicting promoter expression intensity by measuring activity of GFP gene

획득된 형질전환 균주들은 프로모터 서열의 활성측정을 위해 아래와 같은 방법으로 배양하였다. The obtained transformed strains were cultured in the following manner to measure the activity of the promoter sequence.

배지[포도당 20 g, 황산암모늄 5 g, 효모 추출물 5g,요소 1.5 g, KH2PO4 4 g, K2HPO4 8 g, MgSO4 7 H2O 0.5 g, 바이오틴 150 ㎍, 티아민 염산염 1.5 mg, 칼슘 판토테인산 3mg, 니코틴아마이드 3 mg (공정수 1 리터 기준), pH 7.2] 25 ml이 포함된 250 ml 코너-바플 플라스크에 형질전환된 코리네박테리움 글루타미쿰 균주들을 20분의 1 비율로 각각 접종하고 30 ℃에서 배양 중기(흡광도=10)까지 진탕 배양 (200 rpm) 하였다. 배양 종료 후 원심분리에 의해 균체를 회수하여 100 mM Tris -Hcl 버퍼(pH 7.0)에 현탁한 뒤 초음파 파쇄법으로 세포를 파괴하고 다시 고속 원심분리하여 상등액을 얻었다. 위 방법으로 얻어진 상등액에서 단백질 1 mg씩 취하여 GFP 발현 강도를 측정하여 효소 활성 정도를 알아보았다. 표 2는 각 프로모터가 교체된 균주들의 GFP 활성을 측정한 결과이다. 그 결과 각 프로모터가 교체된 균주들이 GFP 활성을 가짐을 확인하였다.Medium [glucose 20 g, ammonium sulfate 5 g, yeast extract 5 g, urea 1.5 g, KH 2 PO 4 4 g, K 2 HPO 4 8 g, MgSO 4 7 H 2 O 0.5 g, biotin 150 μg, thiamine hydrochloride 1.5 mg 1 mg of Corynebacterium glutamicum strains transformed into a 250 ml corner-baffle flask containing 25 ml of calcium pantothenic acid, 3 mg of nicotinamide (1 liter of process water), pH 7.2]. Each was inoculated at a rate and shaken (200 rpm) at 30 ° C. until the middle stage of the culture (absorbance = 10). After completion of the culture, the cells were recovered by centrifugation, suspended in 100 mM Tris-Hcl buffer (pH 7.0), and the cells were disrupted by ultrasonic disruption, followed by high-speed centrifugation to obtain a supernatant. 1 mg of protein was taken from the supernatant obtained by the above method, and GFP expression intensity was measured to determine the degree of enzyme activity. Table 2 shows the results of measuring the GFP activity of the strains with each promoter replaced. As a result, it was confirmed that the strains each promoter was replaced with GFP activity.

균주Strain GFPGfp 발현강도 ( Expression intensity ( FUFU /Of mgmg )) CA01-0086CA01-0086 733.4 733.4 CA01-0087CA01-0087 1230.3 1230.3 KFCC10881KFCC10881 0 0

(2) GFP유전자의 활성 측정을 통한 프로모터 활성 비교(2) Comparison of promoter activity by measuring activity of GFP gene

본 발명의 상기한 butA, pyk 유전자의 프로모터 N1, N2의 프로모터 활성과 코리네박테리움 글루타미쿰 유래의 다른 프로모터들과의 활성 비교를 위해, 코리네박테리움 글루타미쿰 유래 유전자인 mdh (말레이트 디하이드로게네이즈(malate dehydrogenase)를 코딩하는 유전자), gap (글리세르알데하이드-3-포스페이트 디하이드로게네이즈(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)를 코딩하는 유전자), fba (프럭토즈-비스포스페이트 알도레이즈(fructose-bisphosphate aldolase)를 코딩하는 유전자), 및 rotamase (펩티딜-프로릴 시스-트랜스 아이소머레이즈(peptidyl-prolyl cis-trans isomerase)를 코딩하는 유전자)를 선별하였다. 미국국립보건원 유전자은행 (NIH GenBank)으로부터 단백질들의 유전자정보(mdh ; NCgl2297 / gap ; NCgl1526 / fba ; NCgl2673 / rotamase ; NCgl0033)를 얻었다. For comparison of the promoter activity of the promoters N1 and N2 of the butA and pyk genes of the present invention with those of other promoters derived from Corynebacterium glutamicum, the gene derived from Corynebacterium glutamicum is mdh (horse Gene coding for rate dehydrogenase), gap (gene coding for glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase), fba (fructose-bisphosphate aldo) Genes encoding fructose-bisphosphate aldolase), and rotamase (genes encoding peptidyl-prolyl cis-trans isomerase). Gene information of proteins (mdh; NCgl2297 / gap; NCgl1526 / fba; NCgl2673 / rotamase; NCgl0033) was obtained from the National Institutes of Health (NIH GenBank).

각각의 유전자에 대한 프로모터를 실시예 1에 기재된 방법으로 준비한 후, 실시예 2에 기재된 방법으로 각각의 프로모터가 삽입된 형질전환체를 제조하였다. 상기 각기 다른 유전자의 프로모터 서열이 삽입된 형질전환체들의 프로모터 활성을 비교하기 위해 본 발명의 형질전환체(CA01-0086, CA01-0087)과 함께 실시예 3-(1)의 방법으로 GFP 발현 강도를 측정하였다. Promoters for each gene were prepared by the method described in Example 1, followed by the method described in Example 2 to prepare a transformant with each promoter inserted. GFP expression intensity by the method of Example 3- (1) together with the transformants (CA01-0086, CA01-0087) of the present invention to compare the promoter activity of the transformants inserted with the promoter sequences of the different genes Was measured.

하기 표 3은 코리네박테리움 글루타미쿰 유래 프로모터들의 GFP 활성을 비교한 결과이다. Table 3 below shows the results of comparing GFP activity of Corynebacterium glutamicum-derived promoters.

유전자gene NCglNCgl GFPGfp 발현 강도 ( Expression intensity ( FUFU /Of mgmg )) butAbutA NCgl2582NCgl2582 733.38733.38 pykpyk NCgl2008NCgl2008 1230.301230.30 mdhmdh NCgl2297NCgl2297 43.6943.69 gapgap NCgl1526NCgl1526 173.42173.42 fbafba NCgl2673NCgl2673 40.1540.15 rotamaserotamase NCgl0033NCgl0033 21.2321.23

상기 결과에서 보듯이, 본 발명의 신규한 프로모터 N1 또는 N2가 삽입된 균주들(butA 또는 pyk 유전자의 프로모터가 삽입된 균주들)이 코리네박테리움 글루타미쿰 유래의 다른 프로모터들이 삽입된 균주들에 비해 GFP 발현 강도가 높았으며, 이는 프로모터 활성이 크다는 것을 의미한다. As shown in the above results, strains in which the novel promoter N1 or N2 of the present invention (strains in which the promoter of butA or pyk gene is inserted) are inserted into other promoters derived from Corynebacterium glutamicum Compared to the GFP expression intensity was high, which means that the promoter activity is large.

이상의 설명으로부터, 본 발명이 속하는 기술분야의 당업자는 본 발명이 그 기술적 사상이나 필수적 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 실시될 수 있음을 이해할 수 있다. 이와 관련하여, 이상에서 기술한 실시예 및 실험예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 제한적인 것이 아닌 것으로 이해하여야 한다. 본 발명의 범위는 전술한 상세한 설명보다는 후술되는 특허청구범위의 의미 및 범위, 그리고 그 등가 개념으로부터 도출되는 모든 변경 또는 변형된 형태가 본 발명의 범위에 포섭되는 것으로 해석되어야 한다. From the above description, those skilled in the art can understand that the present invention can be implemented in other specific forms without changing the technical spirit or essential features. In this regard, it should be understood that the examples and experimental examples described above are exemplary in all respects and not restrictive. The scope of the present invention should be construed to encompass the meaning and scope of the following claims rather than the foregoing detailed description, and all changes or modifications derived from the equivalent concept thereof are included in the scope of the present invention.

본 발명에 따른 코리네박테리움 글루타미쿰 유래의 신규한 프로모터 N1 또는 N2는 특정한 조건 없이도 강력한 프로모터 활성을 나타내어, 목적 단백질을 고효율로 발현할 수 있는 고역가 균주 개발에 이용할 수 있으며, 아미노산, 핵산, 및 단 백질 등을 생산해내는 코리네형 세균을 포함하는 산업용 미생물의 생산 효율을 증대시킬 수 있다.The novel promoter N1 or N2 derived from Corynebacterium glutamicum according to the present invention exhibits strong promoter activity without specific conditions, and can be used for the development of high titer strains capable of expressing the target protein with high efficiency, and include amino acids, nucleic acids, And it can increase the production efficiency of industrial microorganisms, including coryneform bacteria that produce proteins and the like.

도 1 은 프로모터 탐색 벡터의 제작 방법을 나타낸 모식도이다. 프로모터의 활성도를 측정하기 위해서 녹색형광단백질(Green Fluorescence Protein, GFP) 효소법을 사용하였다. 1 is a schematic diagram showing a method for producing a promoter search vector. Green Fluorescence Protein (GFP) enzyme method was used to measure the activity of the promoter.

<110> CJ corporation <120> Novel Corynebacterium glutamicum promoter <130> PA9707-0484 <160> 6 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 300 <212> DNA <213> Corynebacterium glutamicum <220> <221> promoter <222> (1)..(300) <223> promoter of butA gene <400> 1 gatagttcaa accgccaggc aacttcactg agattccacc acgcgaatta atagtcaccg 60 gcccgattcg cttcgatccg gaaacgccag acttagaaac attcagccaa ctgtcttttc 120 cggtcttaat aattttccga taattcagtc ccatgtgaac cagcataatc ttcatcacat 180 ggtgtgtgca gaaatatttt tgctggtcta ttgtggcgac cgagggcctt tgaaggttcg 240 acaaactgta taaggccttg aatcttgaga atttattttg aggaagcaag aggaagtgtc 300 300 <210> 2 <211> 300 <212> DNA <213> Corynebacterium glutamicum <220> <221> promoter <222> (1)..(300) <223> promoter of pyk gene <400> 2 gtctgttgca gcagatgctg tagcttcgcc ggatggaaaa cccttgccga aagcagggga 60 gggcattgat ggagaaacgc cctcaacgcg ataggtttca accataggcc tgacctggct 120 gagatgtttt tggtagaaaa accgagtgcc cgaattgttt tgtgggtgcc cggttttttc 180 tgatttaagc acgtcagagg cgtagaacat tgtctgttca cactctgggt cgcaagattc 240 atcgagaatt aatggtagta cctgtggctt gagggggaat gacgtactag gcttatgggc 300 300 <210> 3 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer 1 for amplifying the promoter of butA gene <400> 3 aagctgggta ccgatagttc aaaccgc 27 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer 2 for amplifying the promoter of butA gene <400> 4 acttcctctt gcttcctcaa 20 <210> 5 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer 3 for amplifying the promoter of pyk gene <400> 5 aagctgggta ccgtctgttg cagcaga 27 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer 4 for amplifying the promoter of pyk gene <400> 6 cataagccta gtacgtcatt 20 <110> CJ corporation <120> Novel Corynebacterium glutamicum promoter <130> PA9707-0484 <160> 6 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 300 <212> DNA <213> Corynebacterium glutamicum <220> <221> promoter (222) (1) .. (300) <223> promoter of but A gene <400> 1 gatagttcaa accgccaggc aacttcactg agattccacc acgcgaatta atagtcaccg 60 gcccgattcg cttcgatccg gaaacgccag acttagaaac attcagccaa ctgtcttttc 120 cggtcttaat aattttccga taattcagtc ccatgtgaac cagcataatc ttcatcacat 180 ggtgtgtgca gaaatatttt tgctggtcta ttgtggcgac cgagggcctt tgaaggttcg 240 acaaactgta taaggccttg aatcttgaga atttattttg aggaagcaag aggaagtgtc 300                                                                          300 <210> 2 <211> 300 <212> DNA <213> Corynebacterium glutamicum <220> <221> promoter (222) (1) .. (300) <223> promoter of pyk gene <400> 2 gtctgttgca gcagatgctg tagcttcgcc ggatggaaaa cccttgccga aagcagggga 60 gggcattgat ggagaaacgc cctcaacgcg ataggtttca accataggcc tgacctggct 120 gagatgtttt tggtagaaaa accgagtgcc cgaattgttt tgtgggtgcc cggttttttc 180 tgatttaagc acgtcagagg cgtagaacat tgtctgttca cactctgggt cgcaagattc 240 atcgagaatt aatggtagta cctgtggctt gagggggaat gacgtactag gcttatgggc 300                                                                          300 <210> 3 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer 1 for amplifying the promoter of but A gene <400> 3 aagctgggta ccgatagttc aaaccgc 27 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer 2 for amplifying the promoter of but A gene <400> 4 acttcctctt gcttcctcaa 20 <210> 5 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer 3 for amplifying the promoter of pyk gene <400> 5 aagctgggta ccgtctgttg cagcaga 27 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer 4 for amplifying the promoter of pyk gene <400> 6 cataagccta gtacgtcatt 20  

Claims (10)

서열번호 1 또는 2의 뉴클레오타이드 서열로 구성된 프로모터 핵산 분자.A promoter nucleic acid molecule consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 or 2. 제1항의 프로모터 핵산 분자를 포함하는 벡터.A vector comprising the promoter nucleic acid molecule of claim 1. 제2항에 있어서, 상기 벡터는 도 1에 나타낸 pECCG117-N1-GFP 또는 pECCG117-N2-GFP 인 벡터.The vector of claim 2, wherein the vector is pECCG117-N1-GFP or pECCG117-N2-GFP shown in FIG. 1. 제2항의 벡터로 형질전환된 형질전환체.A transformant transformed with the vector of claim 2. 제4항에 있어서, 상기 형질전환체는 코리네박테리움 속 또는 브리비박테리움 속인 형질전환체.The transformant of claim 4, wherein the transformant is a genus Corynebacterium or Bribibacterium. 제5항에 있어서, 상기 코리네박테리움 속 형질전환체는 코리네박테리움 글루 타미쿰인 형질전환체.The transformant of claim 5, wherein the transformant of the genus Corynebacterium is Corynebacterium glutamicum. 제6항에 있어서, 서열번호 1의 프로모터를 포함하는 벡터로 형질전환된 코리네박테리움 글루타미쿰 KCCM 10875P인 형질전환체.The transformant of claim 6, which is Corynebacterium glutamicum KCCM 10875P transformed with a vector comprising a promoter of SEQ ID NO: 1. 제6항에 있어서, 서열번호 2의 프로모터를 포함하는 벡터로 형질전환된 코리네박테리움 글루타미쿰 KCCM 10876P인 형질전환체.The transformant of claim 6, which is Corynebacterium glutamicum KCCM 10876P transformed with a vector comprising a promoter of SEQ ID NO: 2. 8. 제4항 내지 제8항 중 어느 한 항에 따른 형질전환체를 배양하는 단계를 포함하는 목적 유전자의 발현 방법.A method for expressing a gene of interest comprising culturing the transformant according to any one of claims 4 to 8. 제4항 내지 제8항 중 어느 한 항에 따른 형질전환체를 배양하는 단계를 포함하는 L-라이신의 제조방법.A method for producing L-lysine comprising culturing the transformant according to any one of claims 4 to 8.
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