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Description
前述の内容は、添付の図面に示されているように、例示的な実施形態の以下のより具体的な説明から明らかであり、同様の参照文字は、異なる表示の全体にわたって同じ部分を参照している。図面は必ずしも原寸に比例しておらず、代わりに実施形態を説明することに重点が置かれている。
本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
(項目1)
配列番号4及び配列番号13を含む抗体;
配列番号5及び配列番号13を含む抗体;
配列番号6及び配列番号13を含む抗体;
配列番号7及び配列番号14を含む抗体;
配列番号8及び配列番号15を含む抗体;
配列番号9及び配列番号13を含む抗体;
配列番号10及び配列番号13を含む抗体;
配列番号41及び配列番号13を含む抗体;
配列番号42及び配列番号13を含む抗体;
配列番号43及び配列番号47を含む抗体;
配列番号44及び配列番号48を含む抗体;又は
配列番号45及び配列番号49を含む抗体
から選択される抗体のパラトープと同一であるパラトープを含む、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチド。
(項目2)
免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )及び免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )を含む、項目1に記載のポリペプチド。
(項目3)
a)配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44又は配列番号45の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、重鎖相補性決定領域2(HCDR2)、及び重鎖相補性決定領域3(HCDR3)と同一であるHCDR1、HCDR2、及びHCDR3を含む免疫グロブリン重鎖可変領域(V H );並びに
b)配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号47、配列番号48又は配列番号49の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LCDR2)、及び軽鎖相補性決定領域3(LCDR3)と同一であるLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )
を含む、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチド。
(項目4)
配列番号4及び配列番号13を含む抗体;
配列番号5及び配列番号13を含む抗体;
配列番号6及び配列番号13を含む抗体;
配列番号7及び配列番号14を含む抗体;
配列番号8及び配列番号15を含む抗体;
配列番号9及び配列番号13を含む抗体;
配列番号10及び配列番号13を含む抗体;
配列番号41及び配列番号13を含む抗体;
配列番号42及び配列番号13を含む抗体;
配列番号43及び配列番号47を含む抗体;
配列番号44及び配列番号48を含む抗体;又は
配列番号45及び配列番号49を含む抗体
から選択される抗体のHCDR1、HCDR2及びHCDR3、並びにLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、項目3に記載のポリペプチド。
(項目5)
配列番号4及び配列番号13;
配列番号5及び配列番号13;
配列番号6及び配列番号13;
配列番号7及び配列番号14;
配列番号8及び配列番号15;
配列番号9及び配列番号13;
配列番号10及び配列番号13;
配列番号41及び配列番号13;
配列番号42及び配列番号13;
配列番号43及び配列番号47;
配列番号44及び配列番号48;又は
配列番号45及び配列番号49;
を含む抗体のパラトープと同一であるパラトープをさらに含む、項目3又は4に記載のポリペプチド。
(項目6)
配列番号2を含む免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )を含む、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチドであって、
X 1 は、Tでないか;
X 2 は、Rでないか;
X 3 は、Sでないか;
X 4 は、Tでないか;
X 5 は、Tでないか;
X 6 は、Lでないか;
X 7 は、Lでないか;
X 8 は、Rでないか;
X 9 は、Tでないか;
X 10 は、Lでないか;又は
X 11 は、Yでないか、
又は前述の任意の組み合わせである、ポリペプチド。
(項目7)
配列番号11を含む免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )をさらに含む、項目6に記載のポリペプチドであって、
X 12 は、Sでないか;
X 13 は、Lでないか;又は
X 14 は、Vでないか;
又は前述の任意の組み合わせである、ポリペプチド。
(項目8)
配列番号2を含む免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )を含む、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチドであって、
X 1 は、T又はSであるか;
X 2 は、R又はWであるか;
X 3 は、S又はGであるか;
X 4 は、T、Q又はNであるか;
X 5 は、T又はKであるか;
X 6 は、L又はKであるか;
X 7 は、L又はTであるか;
X 8 は、R又はNであるか;
X 9 は、T又はSであるか;
X 10 は、L又はFであるか;又は
X 11 は、Y又はVであるか、
又は前述の任意の組み合わせである、ポリペプチド。
(項目9)
X 1 は、Sであるか;
X 2 は、Wであるか;
X 3 は、Gであるか;
X 4 は、Q又はNであるか;
X 5 は、Kであるか;
X 6 は、Kであるか;
X 7 は、Tであるか;
X 8 は、Nであるか;
X 9 は、Sであるか;
X 10 は、Fであるか;又は
X 11 は、Vであるか、
又は前述の任意の組み合わせである、項目8に記載のポリペプチド。
(項目10)
配列番号11を含む免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )をさらに含む、項目6に記載のポリペプチドであって、
X 12 は、S又はGであるか;
X 13 は、L又はQであるか;又は
X 14 は、V又はLであるか、
又は前述の任意の組み合わせである、ポリペプチド。
(項目11)
X 12 は、Gであるか;
X 13 は、Qであるか;又は
X 14 は、Lであるか、
又は前述の任意の組み合わせである、項目10に記載のポリペプチド。
(項目12)
前記V H が、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号41又は配列番号42の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、重鎖相補性決定領域2(HCDR2)、及び重鎖相補性決定領域3(HCDR3)と同一であるHCDR1、HCDR2、及びHCDR3を含む、項目6~11のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目13)
前記V L が、配列番号13、配列番号14又は配列番号15の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LCDR2)、及び軽鎖相補性決定領域3(LCDR3)と同一であるLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む、項目6~12のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目14)
配列番号46を含む免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )を含む、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチドであって、
X 1 は、E又はQであるか;
X 2 は、P又はSであるか;
X 3 は、A又はEであるか;
X 4 は、L又はVであるか;
X 5 は、I又はVであるか;
X 6 は、S又はTであるか;
X 7 は、A又はMであるか;
X 8 は、K又はQであるか;
X 9 は、G又はSであるか;
X 10 は、N、Q又はRであるか;
X 11 は、A又はSであるか;
X 12 は、P又はQであるか;
X 13 は、K又はSであるか;
X 14 は、Q又はRであるか;
X 15 は、L又はMであるか;
X 16 は、S又はTであるか;
X 17 は、A又はVであるか;
X 18 は、K又はTであるか;
X 19 は、S又はTであるか;
X 20 は、L又はMであるか;
X 21 は、E又はQであるか;
X 22 は、L又はWであるか;
X 23 は、N又はSであるか;
X 24 は、R又はSであるか;
X 25 は、K又はRであるか;
X 26 は、A又はSであるか;
X 27 は、D又はSであるか;
X 28 は、M又はVであるか;
X 29 は、F又はYであるか;
X 30 は、N又はRであるか;又は
X 31 は、V又はYであるか、
又は前述の任意の組み合わせである、ポリペプチド。
(項目15)
配列番号50を含む免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )をさらに含む、項目14に記載のポリペプチドであって、
X 32 は、D又はEであるか;
X 33 は、Q又はVであるか;
X 34 は、L又はMであるか;
X 35 は、G又はSであるか;
X 36 は、S又はTであるか;
X 37 は、A又はLであるか;
X 38 は、P又はVであるか;
X 39 は、D又はEであるか;
X 40 は、A又はVであるか;
X 41 は、I又はLであるか;
X 42 は、S又はTであるか;
X 43 は、E又はGであるか;
X 44 は、A、N、又はSであるか;
X 45 は、L又はYであるか;
X 46 は、E又はGであるか;
X 47 は、K又はQであるか;
X 48 は、K又はRであるか;
X 49 は、S又はTであるか;
X 50 は、A又はQであるか;
X 51 は、S又はTであるか;
X 52 は、I又はVであるか;
X 53 は、D又はSであるか;
X 54 は、R又はSであるか;
X 55 は、E又はQであるか;
X 56 は、T又はVであるか;
X 57 は、L又はQであるか;又は
X 58 は、L又はVであるか、
又は前述の任意の組み合わせである、ポリペプチド。
(項目16)
前記ポリペプチドが、配列番号4/配列番号13、配列番号5/配列番号13、配列番号6/配列番号13、配列番号7/配列番号14、配列番号8/配列番号15、配列番号9/配列番号13、配列番号10/配列番号13、配列番号41/配列番号13、配列番号42/配列番号13、配列番号43/配列番号47、配列番号44/配列番号48又は配列番号45/配列番号49から選択されるV H /V L の組み合わせのパラトープと同一であるパラトープを含む、項目6~15のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目17)
前記V H が、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44若しくは配列番号45、又は前述の組み合わせと少なくとも約85%同一である、項目2~16のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目18)
前記V H が、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44若しくは配列番号45、又は前述の組み合わせに対して約1~10個のアミノ酸置換を含む、項目2~17のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目19)
前記V L が、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号47、配列番号48若しくは配列番号49、又は前述の組み合わせと少なくとも85%同一である、項目2~18のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目20)
前記V L が、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号47、配列番号48若しくは配列番号49、又は前述の組み合わせに対して約1~10個のアミノ酸置換を含む、項目2~19のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目21)
前記アミノ酸置換が、保存的置換である、項目18又は20に記載のポリペプチド。
(項目22)
前記アミノ酸置換が、高度に保存的な置換である、項目21に記載のポリペプチド。
(項目23)
a)前記V H が、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号9、配列番号10、配列番号41又は配列番号42を含み;
b)前記V L が、配列番号13を含む、
項目2~22のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目24)
a)前記V H が、配列番号7を含み;
b)前記V L が、配列番号14を含む、
項目2~22のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目25)
a)前記V H が、配列番号8を含み;
b)前記V L が、配列番号15を含む、
項目2~22のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目26)
前記V H 及びV L が、ヒト化された、ヒトフレームワーク領域を含有する、又はそれらの組み合わせである、項目2~25のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目27)
a)前記V H が、配列番号43を含み;
b)前記V L が、配列番号47を含む、
項目2~22のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目28)
a)前記V H が、配列番号44を含み;
b)前記V L が、配列番号48を含む、
項目2~22のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目29)
a)前記V H が、配列番号45を含み;
b)前記V L が、配列番号49を含む、
項目2~22のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目30)
前記ポリペプチドが、抗体又はその抗原結合断片である、項目1~29のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目31)
前記抗原結合断片が、Fab、F(ab’) 2 、Fab’、scFv、又はFvから選択される、項目30に記載のポリペプチド。
(項目32)
抗体重鎖定常領域配列、抗体軽鎖定常領域配列、又は抗体重鎖定常領域配列及び抗体軽鎖定常領域配列の両方をさらに含む、項目30に記載のポリペプチド。
(項目33)
前記抗体重鎖定常領域が、IgA定常領域、IgD定常領域、IgE定常領域、IgG定常領域及びIgM定常領域からなる群から選択される、項目30に記載のポリペプチド。
(項目34)
前記抗体重鎖定常領域が、IgG1重鎖定常領域である、項目33に記載のポリペプチド。
(項目35)
κ定常領域又はλ定常領域からなる群から選択される抗体軽鎖定常領域をさらに含む、項目32~34のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目36)
前記抗体軽鎖定常領域が、κ軽鎖定常領域である、項目35に記載のポリペプチド。
(項目37)
前記ポリペプチドが、異種部分にコンジュゲートされている、項目1~36のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目38)
前記異種部分が、治療剤、診断薬、又はそれらの組み合わせである、項目37に記載のポリペプチド。
(項目39)
前記異種部分が、ポリエチレングリコール(PEG)、ヘキサデカン酸、ヒドロゲル、脂質ナノ粒子、ポリマーナノ粒子、及び異種ポリペプチド配列、或いはそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目37に記載のポリペプチド。
(項目40)
前記ポリマーナノ粒子が、ポリ(乳酸-コ-グリコール)酸(PLGA)を含む、項目39に記載のポリペプチド。
(項目41)
前記異種ポリペプチド配列が、担体ポリペプチドを含む、項目37に記載のポリペプチド。
(項目42)
前記担体ポリペプチドが、アルブミン又はFcポリペプチドである、項目41に記載
のポリペプチド。
(項目43)
前記ポリペプチドが、
a)10μM以下のK D でSARS-CoV-2に結合するか;
b)SARS-CoV-2のアンジオテンシン変換酵素2(ACE2)への結合を低減するか;又は
c)ヒト細胞におけるSARS-CoV-2の感染性を低下させるか、
又は前述の任意の組み合わせである、項目1~42のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目44)
前記SARS-CoV-2が、T19R、156del、157del、R158G、L452R、T478K、D614G、P681R、及びD950Nを含み、任意選択により、G142Dをさらに含むバリアントである、項目43に記載のポリペプチド。
(項目45)
前記ポリペプチドが、100nM以下のK D でSARS-CoV-2に結合する、項目43又は44に記載のポリペプチド。
(項目46)
前記ポリペプチドが、SARS-CoV-2のACE2への結合を少なくとも約30%低減する、項目43~45のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目47)
前記ACE2が、霊長類ACE2である、項目43~46のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目48)
前記霊長類ACE2が、ヒトACE2(GeneID59272;例示的なタンパク質配列NP_001358344.1)である、項目47に記載のポリペプチド。
(項目49)
前記霊長類ACE2が、チンパンジーACE2、マカクACE2、カニクイザルACE2及びそれらの組み合わせからなる群から選択される非ヒト霊長類ACE2である、項目47に記載のポリペプチド。
(項目50)
前記ポリペプチドが、ヒト細胞におけるSARS-CoV-2の感染性を、少なくとも約30%低減する、項目43に記載のポリペプチド。
(項目51)
項目1~50のいずれか一項に記載のポリペプチドを含む、融合タンパク質。
(項目52)
項目1~44のいずれか一項に記載のポリペプチド又は項目51に記載の融合タンパク質をコードする配列を含む、ポリヌクレオチド。
(項目53)
項目52に記載のポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
(項目54)
項目47に記載のポリヌクレオチド又は項目53に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
(項目55)
項目1~50のいずれか一項に記載のポリペプチド又は項目54に記載の融合タンパク質を含む、組成物。
(項目56)
1つ以上の医薬賦形剤、希釈剤、又は担体をさらに含む、項目55に記載の組成物。
(項目57)
有効量の項目55又は56に記載の組成物を対象に投与することを含む、それを必要とする前記対象を処置する方法。
(項目58)
細胞を、有効量の項目55又は56に記載の組成物と接触させることを含む、SARS-CoV-2スパイクと対象の前記細胞との間の融合を阻害する方法。
(項目59)
前記対象が、COVID-19を有する、項目57又58に記載の方法。
(項目60)
前記対象は、COVID-19を発症するリスクがある、項目57又58に記載の方法。
(項目61)
前記対象がヒトである、項目57~60のいずれか一項に記載の方法。
(項目62)
前記対象が心疾患を有する、項目57~61のいずれか一項に記載の方法。
(項目63)
前記心疾患が、うっ血性心疾患、冠動脈疾患、高血圧性心疾患、炎症性心疾患、肺性心疾患、リウマチ性心疾患、心臓弁膜症、心筋症、心不全、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目62に記載の方法。
(項目64)
前記心不全が、うっ血性心不全である、項目63に記載の方法。
(項目65)
前記炎症性心疾患が、心内膜炎、心肥大、心筋炎、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目63に記載の方法。
(項目66)
前記対象が、糖尿病を有する、項目57~65のいずれか一項に記載の方法。
(項目67)
前記対象が肺疾患を有する、項目57~66のいずれか一項に記載の方法。
(項目68)
前記肺疾患が、急性呼吸窮迫症候群、喘息、気管支炎、COPD、肺気腫、肺腫瘍、胸膜腔疾患、肺血管疾患、気道感染症、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目67に記載の方法。
(項目69)
a)前記気道感染症が、上気道感染症、下気道感染症、又は肺炎であるか;
b)前記胸膜腔疾患が、胸膜中皮腫又は緊張性気胸であるか;
c)前記肺血管疾患が、塞栓症、浮腫、動脈性高血圧症又は出血であるか;又は
d)それらの組み合わせである、
項目68に記載の方法。
(項目70)
前記対象が、タバコの喫煙者である、項目57~69のいずれか一項に記載の方法。
(項目71)
前記対象が、免疫無防備状態である、項目57~70のいずれか一項に記載の方法。
(項目72)
前記対象が、免疫抑制療法を受けている、項目71に記載の方法。
(項目73)
前記対象が、40歳以上である、項目57~72のいずれか一項に記載の方法。
(項目74)
治療有効量の追加の治療剤を前記対象に投与することをさらに含む、項目57~73のいずれか一項に記載の方法。
(項目75)
前記追加の治療剤が、抗ウイルス剤、ACE2阻害剤、追加のSARS-CoV-2スパイク結合抗体、抗生物質、抗マラリア剤、ワクチン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目74に記載の方法。
(項目76)
a)前記追加のSARS-CoV-2スパイク結合抗体が、バムラニビマブ、エテセビマブ、カシリビマブ、イムデビマブ、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるか;
b)前記抗ウイルス剤が、オセルタミビル(タミフル)、ファビピラビル、アマンタジン、レムデシビル、リマンタジン、プレコナリル、SARS-CoV-2に対するアンチセンスRNA、SARS-CoV-2に対するsiRNA、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるか;
c)前記ACE2阻害剤が、ACE2に対するRNAi、ACE2に対するsiRNA、ACE2のCRISPRベースの阻害剤、可溶性ACE2、可溶性ACE2バリアント、抗ACE2抗体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるか;
d)前記抗生物質が、アジスロマイシンを含むか;
e)前記抗マラリア剤が、クロロキンを含むか;
f)前記ワクチンが、核酸ワクチン又は不活化ウイルスワクチンであるか;又は
g)それらの組み合わせである、
項目75に記載の方法。
(項目77)
前記ワクチンが、mrna-1273、BNT162、INO-4800、AZD1222、Ad5-nCoV、PiCoVacc、NVX-CoV2373、又はそれらの組み合わせである、項目76に記載の方法。
本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
(項目1)
配列番号4及び配列番号13を含む抗体;
配列番号5及び配列番号13を含む抗体;
配列番号6及び配列番号13を含む抗体;
配列番号7及び配列番号14を含む抗体;
配列番号8及び配列番号15を含む抗体;
配列番号9及び配列番号13を含む抗体;
配列番号10及び配列番号13を含む抗体;
配列番号41及び配列番号13を含む抗体;
配列番号42及び配列番号13を含む抗体;
配列番号43及び配列番号47を含む抗体;
配列番号44及び配列番号48を含む抗体;又は
配列番号45及び配列番号49を含む抗体
から選択される抗体のパラトープと同一であるパラトープを含む、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチド。
(項目2)
免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )及び免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )を含む、項目1に記載のポリペプチド。
(項目3)
a)配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44又は配列番号45の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、重鎖相補性決定領域2(HCDR2)、及び重鎖相補性決定領域3(HCDR3)と同一であるHCDR1、HCDR2、及びHCDR3を含む免疫グロブリン重鎖可変領域(V H );並びに
b)配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号47、配列番号48又は配列番号49の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LCDR2)、及び軽鎖相補性決定領域3(LCDR3)と同一であるLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )
を含む、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチド。
(項目4)
配列番号4及び配列番号13を含む抗体;
配列番号5及び配列番号13を含む抗体;
配列番号6及び配列番号13を含む抗体;
配列番号7及び配列番号14を含む抗体;
配列番号8及び配列番号15を含む抗体;
配列番号9及び配列番号13を含む抗体;
配列番号10及び配列番号13を含む抗体;
配列番号41及び配列番号13を含む抗体;
配列番号42及び配列番号13を含む抗体;
配列番号43及び配列番号47を含む抗体;
配列番号44及び配列番号48を含む抗体;又は
配列番号45及び配列番号49を含む抗体
から選択される抗体のHCDR1、HCDR2及びHCDR3、並びにLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、項目3に記載のポリペプチド。
(項目5)
配列番号4及び配列番号13;
配列番号5及び配列番号13;
配列番号6及び配列番号13;
配列番号7及び配列番号14;
配列番号8及び配列番号15;
配列番号9及び配列番号13;
配列番号10及び配列番号13;
配列番号41及び配列番号13;
配列番号42及び配列番号13;
配列番号43及び配列番号47;
配列番号44及び配列番号48;又は
配列番号45及び配列番号49;
を含む抗体のパラトープと同一であるパラトープをさらに含む、項目3又は4に記載のポリペプチド。
(項目6)
配列番号2を含む免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )を含む、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチドであって、
X 1 は、Tでないか;
X 2 は、Rでないか;
X 3 は、Sでないか;
X 4 は、Tでないか;
X 5 は、Tでないか;
X 6 は、Lでないか;
X 7 は、Lでないか;
X 8 は、Rでないか;
X 9 は、Tでないか;
X 10 は、Lでないか;又は
X 11 は、Yでないか、
又は前述の任意の組み合わせである、ポリペプチド。
(項目7)
配列番号11を含む免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )をさらに含む、項目6に記載のポリペプチドであって、
X 12 は、Sでないか;
X 13 は、Lでないか;又は
X 14 は、Vでないか;
又は前述の任意の組み合わせである、ポリペプチド。
(項目8)
配列番号2を含む免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )を含む、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチドであって、
X 1 は、T又はSであるか;
X 2 は、R又はWであるか;
X 3 は、S又はGであるか;
X 4 は、T、Q又はNであるか;
X 5 は、T又はKであるか;
X 6 は、L又はKであるか;
X 7 は、L又はTであるか;
X 8 は、R又はNであるか;
X 9 は、T又はSであるか;
X 10 は、L又はFであるか;又は
X 11 は、Y又はVであるか、
又は前述の任意の組み合わせである、ポリペプチド。
(項目9)
X 1 は、Sであるか;
X 2 は、Wであるか;
X 3 は、Gであるか;
X 4 は、Q又はNであるか;
X 5 は、Kであるか;
X 6 は、Kであるか;
X 7 は、Tであるか;
X 8 は、Nであるか;
X 9 は、Sであるか;
X 10 は、Fであるか;又は
X 11 は、Vであるか、
又は前述の任意の組み合わせである、項目8に記載のポリペプチド。
(項目10)
配列番号11を含む免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )をさらに含む、項目6に記載のポリペプチドであって、
X 12 は、S又はGであるか;
X 13 は、L又はQであるか;又は
X 14 は、V又はLであるか、
又は前述の任意の組み合わせである、ポリペプチド。
(項目11)
X 12 は、Gであるか;
X 13 は、Qであるか;又は
X 14 は、Lであるか、
又は前述の任意の組み合わせである、項目10に記載のポリペプチド。
(項目12)
前記V H が、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号41又は配列番号42の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、重鎖相補性決定領域2(HCDR2)、及び重鎖相補性決定領域3(HCDR3)と同一であるHCDR1、HCDR2、及びHCDR3を含む、項目6~11のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目13)
前記V L が、配列番号13、配列番号14又は配列番号15の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LCDR2)、及び軽鎖相補性決定領域3(LCDR3)と同一であるLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む、項目6~12のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目14)
配列番号46を含む免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )を含む、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチドであって、
X 1 は、E又はQであるか;
X 2 は、P又はSであるか;
X 3 は、A又はEであるか;
X 4 は、L又はVであるか;
X 5 は、I又はVであるか;
X 6 は、S又はTであるか;
X 7 は、A又はMであるか;
X 8 は、K又はQであるか;
X 9 は、G又はSであるか;
X 10 は、N、Q又はRであるか;
X 11 は、A又はSであるか;
X 12 は、P又はQであるか;
X 13 は、K又はSであるか;
X 14 は、Q又はRであるか;
X 15 は、L又はMであるか;
X 16 は、S又はTであるか;
X 17 は、A又はVであるか;
X 18 は、K又はTであるか;
X 19 は、S又はTであるか;
X 20 は、L又はMであるか;
X 21 は、E又はQであるか;
X 22 は、L又はWであるか;
X 23 は、N又はSであるか;
X 24 は、R又はSであるか;
X 25 は、K又はRであるか;
X 26 は、A又はSであるか;
X 27 は、D又はSであるか;
X 28 は、M又はVであるか;
X 29 は、F又はYであるか;
X 30 は、N又はRであるか;又は
X 31 は、V又はYであるか、
又は前述の任意の組み合わせである、ポリペプチド。
(項目15)
配列番号50を含む免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )をさらに含む、項目14に記載のポリペプチドであって、
X 32 は、D又はEであるか;
X 33 は、Q又はVであるか;
X 34 は、L又はMであるか;
X 35 は、G又はSであるか;
X 36 は、S又はTであるか;
X 37 は、A又はLであるか;
X 38 は、P又はVであるか;
X 39 は、D又はEであるか;
X 40 は、A又はVであるか;
X 41 は、I又はLであるか;
X 42 は、S又はTであるか;
X 43 は、E又はGであるか;
X 44 は、A、N、又はSであるか;
X 45 は、L又はYであるか;
X 46 は、E又はGであるか;
X 47 は、K又はQであるか;
X 48 は、K又はRであるか;
X 49 は、S又はTであるか;
X 50 は、A又はQであるか;
X 51 は、S又はTであるか;
X 52 は、I又はVであるか;
X 53 は、D又はSであるか;
X 54 は、R又はSであるか;
X 55 は、E又はQであるか;
X 56 は、T又はVであるか;
X 57 は、L又はQであるか;又は
X 58 は、L又はVであるか、
又は前述の任意の組み合わせである、ポリペプチド。
(項目16)
前記ポリペプチドが、配列番号4/配列番号13、配列番号5/配列番号13、配列番号6/配列番号13、配列番号7/配列番号14、配列番号8/配列番号15、配列番号9/配列番号13、配列番号10/配列番号13、配列番号41/配列番号13、配列番号42/配列番号13、配列番号43/配列番号47、配列番号44/配列番号48又は配列番号45/配列番号49から選択されるV H /V L の組み合わせのパラトープと同一であるパラトープを含む、項目6~15のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目17)
前記V H が、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44若しくは配列番号45、又は前述の組み合わせと少なくとも約85%同一である、項目2~16のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目18)
前記V H が、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44若しくは配列番号45、又は前述の組み合わせに対して約1~10個のアミノ酸置換を含む、項目2~17のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目19)
前記V L が、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号47、配列番号48若しくは配列番号49、又は前述の組み合わせと少なくとも85%同一である、項目2~18のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目20)
前記V L が、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号47、配列番号48若しくは配列番号49、又は前述の組み合わせに対して約1~10個のアミノ酸置換を含む、項目2~19のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目21)
前記アミノ酸置換が、保存的置換である、項目18又は20に記載のポリペプチド。
(項目22)
前記アミノ酸置換が、高度に保存的な置換である、項目21に記載のポリペプチド。
(項目23)
a)前記V H が、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号9、配列番号10、配列番号41又は配列番号42を含み;
b)前記V L が、配列番号13を含む、
項目2~22のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目24)
a)前記V H が、配列番号7を含み;
b)前記V L が、配列番号14を含む、
項目2~22のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目25)
a)前記V H が、配列番号8を含み;
b)前記V L が、配列番号15を含む、
項目2~22のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目26)
前記V H 及びV L が、ヒト化された、ヒトフレームワーク領域を含有する、又はそれらの組み合わせである、項目2~25のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目27)
a)前記V H が、配列番号43を含み;
b)前記V L が、配列番号47を含む、
項目2~22のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目28)
a)前記V H が、配列番号44を含み;
b)前記V L が、配列番号48を含む、
項目2~22のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目29)
a)前記V H が、配列番号45を含み;
b)前記V L が、配列番号49を含む、
項目2~22のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目30)
前記ポリペプチドが、抗体又はその抗原結合断片である、項目1~29のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目31)
前記抗原結合断片が、Fab、F(ab’) 2 、Fab’、scFv、又はFvから選択される、項目30に記載のポリペプチド。
(項目32)
抗体重鎖定常領域配列、抗体軽鎖定常領域配列、又は抗体重鎖定常領域配列及び抗体軽鎖定常領域配列の両方をさらに含む、項目30に記載のポリペプチド。
(項目33)
前記抗体重鎖定常領域が、IgA定常領域、IgD定常領域、IgE定常領域、IgG定常領域及びIgM定常領域からなる群から選択される、項目30に記載のポリペプチド。
(項目34)
前記抗体重鎖定常領域が、IgG1重鎖定常領域である、項目33に記載のポリペプチド。
(項目35)
κ定常領域又はλ定常領域からなる群から選択される抗体軽鎖定常領域をさらに含む、項目32~34のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目36)
前記抗体軽鎖定常領域が、κ軽鎖定常領域である、項目35に記載のポリペプチド。
(項目37)
前記ポリペプチドが、異種部分にコンジュゲートされている、項目1~36のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目38)
前記異種部分が、治療剤、診断薬、又はそれらの組み合わせである、項目37に記載のポリペプチド。
(項目39)
前記異種部分が、ポリエチレングリコール(PEG)、ヘキサデカン酸、ヒドロゲル、脂質ナノ粒子、ポリマーナノ粒子、及び異種ポリペプチド配列、或いはそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目37に記載のポリペプチド。
(項目40)
前記ポリマーナノ粒子が、ポリ(乳酸-コ-グリコール)酸(PLGA)を含む、項目39に記載のポリペプチド。
(項目41)
前記異種ポリペプチド配列が、担体ポリペプチドを含む、項目37に記載のポリペプチド。
(項目42)
前記担体ポリペプチドが、アルブミン又はFcポリペプチドである、項目41に記載
のポリペプチド。
(項目43)
前記ポリペプチドが、
a)10μM以下のK D でSARS-CoV-2に結合するか;
b)SARS-CoV-2のアンジオテンシン変換酵素2(ACE2)への結合を低減するか;又は
c)ヒト細胞におけるSARS-CoV-2の感染性を低下させるか、
又は前述の任意の組み合わせである、項目1~42のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目44)
前記SARS-CoV-2が、T19R、156del、157del、R158G、L452R、T478K、D614G、P681R、及びD950Nを含み、任意選択により、G142Dをさらに含むバリアントである、項目43に記載のポリペプチド。
(項目45)
前記ポリペプチドが、100nM以下のK D でSARS-CoV-2に結合する、項目43又は44に記載のポリペプチド。
(項目46)
前記ポリペプチドが、SARS-CoV-2のACE2への結合を少なくとも約30%低減する、項目43~45のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目47)
前記ACE2が、霊長類ACE2である、項目43~46のいずれか一項に記載のポリペプチド。
(項目48)
前記霊長類ACE2が、ヒトACE2(GeneID59272;例示的なタンパク質配列NP_001358344.1)である、項目47に記載のポリペプチド。
(項目49)
前記霊長類ACE2が、チンパンジーACE2、マカクACE2、カニクイザルACE2及びそれらの組み合わせからなる群から選択される非ヒト霊長類ACE2である、項目47に記載のポリペプチド。
(項目50)
前記ポリペプチドが、ヒト細胞におけるSARS-CoV-2の感染性を、少なくとも約30%低減する、項目43に記載のポリペプチド。
(項目51)
項目1~50のいずれか一項に記載のポリペプチドを含む、融合タンパク質。
(項目52)
項目1~44のいずれか一項に記載のポリペプチド又は項目51に記載の融合タンパク質をコードする配列を含む、ポリヌクレオチド。
(項目53)
項目52に記載のポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
(項目54)
項目47に記載のポリヌクレオチド又は項目53に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
(項目55)
項目1~50のいずれか一項に記載のポリペプチド又は項目54に記載の融合タンパク質を含む、組成物。
(項目56)
1つ以上の医薬賦形剤、希釈剤、又は担体をさらに含む、項目55に記載の組成物。
(項目57)
有効量の項目55又は56に記載の組成物を対象に投与することを含む、それを必要とする前記対象を処置する方法。
(項目58)
細胞を、有効量の項目55又は56に記載の組成物と接触させることを含む、SARS-CoV-2スパイクと対象の前記細胞との間の融合を阻害する方法。
(項目59)
前記対象が、COVID-19を有する、項目57又58に記載の方法。
(項目60)
前記対象は、COVID-19を発症するリスクがある、項目57又58に記載の方法。
(項目61)
前記対象がヒトである、項目57~60のいずれか一項に記載の方法。
(項目62)
前記対象が心疾患を有する、項目57~61のいずれか一項に記載の方法。
(項目63)
前記心疾患が、うっ血性心疾患、冠動脈疾患、高血圧性心疾患、炎症性心疾患、肺性心疾患、リウマチ性心疾患、心臓弁膜症、心筋症、心不全、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目62に記載の方法。
(項目64)
前記心不全が、うっ血性心不全である、項目63に記載の方法。
(項目65)
前記炎症性心疾患が、心内膜炎、心肥大、心筋炎、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目63に記載の方法。
(項目66)
前記対象が、糖尿病を有する、項目57~65のいずれか一項に記載の方法。
(項目67)
前記対象が肺疾患を有する、項目57~66のいずれか一項に記載の方法。
(項目68)
前記肺疾患が、急性呼吸窮迫症候群、喘息、気管支炎、COPD、肺気腫、肺腫瘍、胸膜腔疾患、肺血管疾患、気道感染症、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目67に記載の方法。
(項目69)
a)前記気道感染症が、上気道感染症、下気道感染症、又は肺炎であるか;
b)前記胸膜腔疾患が、胸膜中皮腫又は緊張性気胸であるか;
c)前記肺血管疾患が、塞栓症、浮腫、動脈性高血圧症又は出血であるか;又は
d)それらの組み合わせである、
項目68に記載の方法。
(項目70)
前記対象が、タバコの喫煙者である、項目57~69のいずれか一項に記載の方法。
(項目71)
前記対象が、免疫無防備状態である、項目57~70のいずれか一項に記載の方法。
(項目72)
前記対象が、免疫抑制療法を受けている、項目71に記載の方法。
(項目73)
前記対象が、40歳以上である、項目57~72のいずれか一項に記載の方法。
(項目74)
治療有効量の追加の治療剤を前記対象に投与することをさらに含む、項目57~73のいずれか一項に記載の方法。
(項目75)
前記追加の治療剤が、抗ウイルス剤、ACE2阻害剤、追加のSARS-CoV-2スパイク結合抗体、抗生物質、抗マラリア剤、ワクチン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目74に記載の方法。
(項目76)
a)前記追加のSARS-CoV-2スパイク結合抗体が、バムラニビマブ、エテセビマブ、カシリビマブ、イムデビマブ、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるか;
b)前記抗ウイルス剤が、オセルタミビル(タミフル)、ファビピラビル、アマンタジン、レムデシビル、リマンタジン、プレコナリル、SARS-CoV-2に対するアンチセンスRNA、SARS-CoV-2に対するsiRNA、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるか;
c)前記ACE2阻害剤が、ACE2に対するRNAi、ACE2に対するsiRNA、ACE2のCRISPRベースの阻害剤、可溶性ACE2、可溶性ACE2バリアント、抗ACE2抗体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるか;
d)前記抗生物質が、アジスロマイシンを含むか;
e)前記抗マラリア剤が、クロロキンを含むか;
f)前記ワクチンが、核酸ワクチン又は不活化ウイルスワクチンであるか;又は
g)それらの組み合わせである、
項目75に記載の方法。
(項目77)
前記ワクチンが、mrna-1273、BNT162、INO-4800、AZD1222、Ad5-nCoV、PiCoVacc、NVX-CoV2373、又はそれらの組み合わせである、項目76に記載の方法。
Claims (53)
- a)配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44又は配列番号45の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、重鎖相補性決定領域2(HCDR2)、及び重鎖相補性決定領域3(HCDR3)と同一であるHCDR1、HCDR2、及びHCDR3を含む免疫グロブリン重鎖可変領域(VH);並びに
b)配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号47、配列番号48又は配列番号49の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LCDR2)、及び軽鎖相補性決定領域3(LCDR3)と同一であるLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含む免疫グロブリン軽鎖可変領域(VL)
を含む、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチド。 - 配列番号4及び配列番号13を含む抗体;
配列番号5及び配列番号13を含む抗体;
配列番号6及び配列番号13を含む抗体;
配列番号7及び配列番号14を含む抗体;
配列番号8及び配列番号15を含む抗体;
配列番号9及び配列番号13を含む抗体;
配列番号10及び配列番号13を含む抗体;
配列番号41及び配列番号13を含む抗体;
配列番号42及び配列番号13を含む抗体;
配列番号43及び配列番号47を含む抗体;
配列番号44及び配列番号48を含む抗体;又は
配列番号45及び配列番号49を含む抗体
から選択される抗体のHCDR1、HCDR2及びHCDR3、並びにLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、請求項1に記載のポリペプチド。 - 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチドであって、
a)配列番号2を含む免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )であって、
X1は、Tでないか;
X2は、Rでないか;
X3は、Sでないか;
X4は、Tでないか;
X5は、Tでないか;
X6は、Lでないか;
X7は、Lでないか;
X8は、Rでないか;
X9は、Tでないか;
X10は、Lでないか;
X 11は、Yでないか;
又は前述の任意の組み合わせである、免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )と、
b)配列番号11を含む免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )であって、
X 12 は、Sでないか;
X 13 は、Lでないか;
X 14 は、Vでないか;
又は前述の任意の組み合わせである、免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )と
を含む、ポリペプチド。 - 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチドであって、
a)配列番号2を含む免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )であって、
X1は、T又はSであるか;
X2は、R又はWであるか;
X3は、S又はGであるか;
X4は、T、Q又はNであるか;
X5は、T又はKであるか;
X6は、L又はKであるか;
X7は、L又はTであるか;
X8は、R又はNであるか;
X9は、T又はSであるか;
X10は、L又はFであるか;
X11は、Y又はVであるか;
又は前述の任意の組み合わせである、免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )と、
b)配列番号11を含む免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )であって、
X 12 は、S又はGであるか;
X 13 は、L又はQであるか;
X 14 は、V又はLであるか;
又は前述の任意の組み合わせである、免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )と
を含む、ポリペプチド。 - X1は、Sであるか;
X2は、Wであるか;
X3は、Gであるか;
X4は、Q又はNであるか;
X5は、Kであるか;
X6は、Kであるか;
X7は、Tであるか;
X8は、Nであるか;
X9は、Sであるか;
X10は、Fであるか;
X11は、Vであるか;
X 12 は、Gであるか;
X 13 は、Qであるか;
X 14 は、Lであるか;
又は前述の任意の組み合わせである、請求項4に記載のポリペプチド。
- a)前記VHが、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号41又は配列番号42の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、重鎖相補性決定領域2(HCDR2)、及び重鎖相補性決定領域3(HCDR3)と同一であるHCDR1、HCDR2、及びHCDR3を含むか;
b)前記V L が、配列番号13、配列番号14又は配列番号15の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LCDR2)、及び軽鎖相補性決定領域3(LCDR3)と同一であるLCDR1、LCDR2、及びLCDR3を含むか;あるいは
c)a)及びb)の両方である、
請求項5に記載のポリペプチド。 - 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2スパイク糖タンパク質(SARS-CoV-2スパイク)に特異的に結合するポリペプチドであって、
a)配列番号46を含む免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )であって、
X1は、E又はQであるか;
X2は、P又はSであるか;
X3は、A又はEであるか;
X4は、L又はVであるか;
X5は、I又はVであるか;
X6は、S又はTであるか;
X7は、A又はMであるか;
X8は、K又はQであるか;
X9は、G又はSであるか;
X10は、N、Q又はRであるか;
X11は、A又はSであるか;
X12は、P又はQであるか;
X13は、K又はSであるか;
X14は、Q又はRであるか;
X15は、L又はMであるか;
X16は、S又はTであるか;
X17は、A又はVであるか;
X18は、K又はTであるか;
X19は、S又はTであるか;
X20は、L又はMであるか;
X21は、E又はQであるか;
X22は、L又はWであるか;
X23は、N又はSであるか;
X24は、R又はSであるか;
X25は、K又はRであるか;
X26は、A又はSであるか;
X27は、D又はSであるか;
X28は、M又はVであるか;
X29は、F又はYであるか;
X30は、N又はRであるか;
X31は、V又はYであるか;
又は前述の任意の組み合わせである、免疫グロブリン重鎖可変領域(V H )と、
b)配列番号50を含む免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )であって
X 32 は、D又はEであるか;
X 33 は、Q又はVであるか;
X 34 は、L又はMであるか;
X 35 は、G又はSであるか;
X 36 は、S又はTであるか;
X 37 は、A又はLであるか;
X 38 は、P又はVであるか;
X 39 は、D又はEであるか;
X 40 は、A又はVであるか;
X 41 は、I又はLであるか;
X 42 は、S又はTであるか;
X 43 は、E又はGであるか;
X 44 は、A、N、又はSであるか;
X 45 は、L又はYであるか;
X 46 は、E又はGであるか;
X 47 は、K又はQであるか;
X 48 は、K又はRであるか;
X 49 は、S又はTであるか;
X 50 は、A又はQであるか;
X 51 は、S又はTであるか;
X 52 は、I又はVであるか;
X 53 は、D又はSであるか;
X 54 は、R又はSであるか;
X 55 は、E又はQであるか;
X 56 は、T又はVであるか;
X 57 は、L又はQであるか;又は
X 58 は、L又はVであるか、
又は前述の任意の組み合わせである、免疫グロブリン軽鎖可変領域(V L )と
を含む、ポリペプチド。 - a)前記VHが、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44若しくは配列番号45、又は前述の組み合わせと少なくとも約85%同一であるか;
b)前記V L が、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号47、配列番号48若しくは配列番号49、又は前述の組み合わせと少なくとも85%同一であるか;あるいは
c)a)及びb)の両方である、
請求項1に記載のポリペプチド。 - a)前記VHが、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44若しくは配列番号45、又は前述の組み合わせに対して約1~10個のアミノ酸置換を含むか;
b)前記V L が、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号47、配列番号48若しくは配列番号49、又は前述の組み合わせに対して約1~10個のアミノ酸置換を含むか;あるいは
c)a)及びb)の両方である、
請求項1に記載のポリペプチド。 - 前記アミノ酸置換が、保存的置換である、請求項9に記載のポリペプチド。
- 前記アミノ酸置換が、高度に保存的な置換である、請求項10に記載のポリペプチド。
- a)前記VHが、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号9、配列番号10、配列番号41又は配列番号42を含み、前記VLが、配列番号13を含む;
b)前記V H が、配列番号7を含み、前記V L が、配列番号14を含む;
c)前記V H が、配列番号8を含み、前記V L が、配列番号15を含む、
請求項1に記載のポリペプチド。 - 前記VH及びVLが、ヒト化された、ヒトフレームワーク領域を含有する、又はそれらの組み合わせである、請求項12に記載のポリペプチド。
- a)前記VHが、配列番号43を含み、前記VLが、配列番号47を含む;
b)前記V H が、配列番号44を含み、前記V L が、配列番号48を含む;
c)前記V H が、配列番号45を含み、前記V L が、配列番号49を含む、
請求項1に記載のポリペプチド。 - 前記ポリペプチドが、抗体又はその抗原結合断片である、請求項14に記載のポリペプチド。
- 前記抗原結合断片が、Fab、F(ab’)2、Fab’、scFv、又はFvから選択される、請求項15に記載のポリペプチド。
- 抗体重鎖定常領域配列、抗体軽鎖定常領域配列、又は抗体重鎖定常領域配列及び抗体軽鎖定常領域配列の両方をさらに含む、請求項15に記載のポリペプチド。
- 前記抗体重鎖定常領域が、IgA定常領域、IgD定常領域、IgE定常領域、IgG定常領域及びIgM定常領域からなる群から選択される、請求項17に記載のポリペプチド。
- 前記抗体重鎖定常領域が、IgG1重鎖定常領域である、請求項18に記載のポリペプチド。
- κ定常領域又はλ定常領域からなる群から選択される抗体軽鎖定常領域をさらに含む、請求項19に記載のポリペプチド。
- 前記抗体軽鎖定常領域が、κ軽鎖定常領域である、請求項20に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、異種部分にコンジュゲートされている、請求項1に記載のポリペプチド。
- 前記異種部分が、治療剤、診断薬、又はそれらの組み合わせである、請求項22に記載のポリペプチド。
- 前記異種部分が、ポリエチレングリコール(PEG)、ヘキサデカン酸、ヒドロゲル、脂質ナノ粒子、ポリマーナノ粒子、及び異種ポリペプチド配列、或いはそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項22に記載のポリペプチド。
- 前記ポリマーナノ粒子が、ポリ(乳酸-コ-グリコール)酸(PLGA)を含む、請求項24に記載のポリペプチド。
- 前記異種ポリペプチド配列が、担体ポリペプチドを含む、請求項24に記載のポリペプチド。
- 前記担体ポリペプチドが、アルブミン又はFcポリペプチドである、請求項26に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、
a)10μM以下のKDでSARS-CoV-2に結合するか;
b)SARS-CoV-2のアンジオテンシン変換酵素2(ACE2)への結合を低減するか;又は
c)ヒト細胞におけるSARS-CoV-2の感染性を低下させるか、
又は前述の任意の組み合わせである、請求項1に記載のポリペプチド。 - 前記SARS-CoV-2が、T19R、156del、157del、R158G、L452R、T478K、D614G、P681R、及びD950Nを含み、任意選択により、G142Dをさらに含むバリアントである、請求項28に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、100nM以下のKDでSARS-CoV-2に結合する、請求項28に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、SARS-CoV-2のACE2への結合を少なくとも約30%低減する、請求項28に記載のポリペプチド。
- 前記ACE2が、霊長類ACE2である、請求項28に記載のポリペプチド。
- 前記霊長類ACE2が、ヒトACE2(GeneID59272;例示的なタンパク質配列NP_001358344.1)である、請求項32に記載のポリペプチド。
- 前記霊長類ACE2が、チンパンジーACE2、マカクACE2、カニクイザルACE2及びそれらの組み合わせからなる群から選択される非ヒト霊長類ACE2である、請求項32に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが、ヒト細胞におけるSARS-CoV-2の感染性を、少なくとも約30%低減する、請求項28に記載のポリペプチド。
- 請求項1~35のいずれか一項に記載のポリペプチドを含む、融合タンパク質。
- a)請求項1~35のいずれか一項に記載のポリペプチド;又は
b)前記ポリペプチドを含む融合タンパク質
をコードする配列を含む、ポリヌクレオチド。 - 請求項37に記載のポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
- a)請求項1~35のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする配列を含むポリヌクレオチド;又は
b)前記ポリヌクレオチドを含む発現ベクター
を含む、宿主細胞。 - a)請求項1~35のいずれか一項に記載のポリペプチド;又は
b)前記ポリペプチドを含む融合タンパク質
を含む、組成物。 - 1つ以上の医薬賦形剤、希釈剤、又は担体をさらに含む、請求項40に記載の組成物。
- 処置を必要とする対象の処置における使用のための、請求項40に記載の組成物。
- SARS-CoV-2スパイクと対象の細胞との間の融合を阻害する方法における使用のための請求項40に記載の組成物であって、前記方法は、前記細胞を、有効量の前記組成物と接触させることを含む、組成物。
- a)前記対象が、COVID-19を有するか;
b)前記対象が、COVID-19を発症するリスクがあるか;
c)前記対象が、ヒトであるか;
d)前記対象が、心疾患を有するか;
e)前記対象が、糖尿病を有するか;
f)前記対象が、肺疾患を有するか;
g)前記対象が、タバコの喫煙者であるか;
h)前記対象が、免疫無防備状態であるか;
i)前記対象が、免疫抑制療法を受けているか;
j)前記対象が、40歳以上であるか;
又はそれらの任意の組み合わせである、
請求項42又は43に記載の使用のための組成物。 - 前記心疾患が、うっ血性心疾患、冠動脈疾患、高血圧性心疾患、炎症性心疾患、肺性心疾患、リウマチ性心疾患、心臓弁膜症、心筋症、心不全、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項44に記載の使用のための組成物。
- 前記心不全が、うっ血性心不全である、請求項45に記載の使用のための組成物。
- 前記炎症性心疾患が、心内膜炎、心肥大、心筋炎、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項45に記載の使用のための組成物。
- 前記肺疾患が、急性呼吸窮迫症候群、喘息、気管支炎、COPD、肺気腫、肺腫瘍、胸膜腔疾患、肺血管疾患、気道感染症、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項44に記載の使用のための組成物。
- a)前記気道感染症が、上気道感染症、下気道感染症、又は肺炎であるか;
b)前記胸膜腔疾患が、胸膜中皮腫又は緊張性気胸であるか;
c)前記肺血管疾患が、塞栓症、浮腫、動脈性高血圧症又は出血であるか;又は
d)それらの組み合わせである、
請求項48に記載の使用のための組成物。 - 前記組成物が、追加の治療剤と組み合わせて前記対象に投与されることを特徴とする、請求項42に記載の使用のための組成物。
- 前記追加の治療剤が、抗ウイルス剤、ACE2阻害剤、追加のSARS-CoV-2スパイク結合抗体、抗生物質、抗マラリア剤、ワクチン、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項50に記載の使用のための組成物。
- a)前記追加のSARS-CoV-2スパイク結合抗体が、バムラニビマブ、エテセビマブ、カシリビマブ、イムデビマブ、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるか;
b)前記抗ウイルス剤が、オセルタミビル(タミフル)、ファビピラビル、アマンタジン、レムデシビル、リマンタジン、プレコナリル、SARS-CoV-2に対するアンチセンスRNA、SARS-CoV-2に対するsiRNA、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるか;
c)前記ACE2阻害剤が、ACE2に対するRNAi、ACE2に対するsiRNA、ACE2のCRISPRベースの阻害剤、可溶性ACE2、可溶性ACE2バリアント、抗ACE2抗体、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるか;
d)前記抗生物質が、アジスロマイシンを含むか;
e)前記抗マラリア剤が、クロロキンを含むか;
f)前記ワクチンが、核酸ワクチン又は不活化ウイルスワクチンであるか;又は
g)それらの組み合わせである、
請求項51に記載の使用のための組成物。 - 前記ワクチンが、mrna-1273、BNT162、INO-4800、AZD1222、Ad5-nCoV、PiCoVacc、NVX-CoV2373、又はそれらの組み合わせである、請求項52に記載の使用のための組成物。
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