JPWO2021159129A5 - - Google Patents
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Description
引用された参考文献中に見出される任意の定義および/または記載間に相違がある場合
には、本開示が支配するものとする。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
少なくとも2つの環状RNA(circRNA)をタンデムでコードする核酸分子を含む組成物。
(項目2)
前記組成物が、少なくとも2つの環状RNA(circRNA)をコードする核酸分子を含み、前記核酸分子が、
(i)第1のcircRNAコード配列を含む第1のcircRNA、および
(ii)第2のcircRNAコード配列を含む第2のcircRNA
を含み、前記第2のcircRNAが、前記第1のcircRNA中の前記第1のcircRNAコード配列とタンデムであり、
タンデムの前記第1のcircRNAコード配列および前記第2のcircRNAが、イントロンエレメントに隣接している、項目1に記載の組成物。
(項目3)
前記核酸分子が、少なくとも1つのプロモーター領域をさらに含み、
前記少なくとも1つのプロモーター領域が、RNAポリメラーゼII型、RNAポリメラーゼIII型、またはそれらの任意の組合せを動員することができる、項目1または項目2のいずれか一項に記載の組成物。
(項目4)
前記核酸分子が、左バックスプライシングイントロンエレメントおよび右バックスプライシングイントロンエレメントをさらに含み、
前記第1のcircRNAコード配列が、前記左バックスプライシングイントロンエレメントおよび前記右バックスプライシングイントロンエレメントに隣接しており、
前記右バックスプライシングイントロンが、少なくとも1つのtRNA由来イントロンを含み、
前記少なくとも1つのtRNA由来イントロンが、スプライシングの際に第2のcircRNAをコードするtRNA配列を含む、項目1から3のいずれか一項に記載の組成物。
(項目5)
第1のcircRNAコード配列が、
前記第1のcircRNAコード配列に隣接するイントロンエレメントの内側の5’非翻訳領域(5’UTR)であって、内部リボソーム進入部位(IRES)である5’UTR、および
3’UTR中、かつ前記第1のcircRNAコード配列および第2のcircRNAに隣接するイントロンエレメントの内側の、翻訳調節領域
をさらに含む、項目1から4のいずれか一項に記載の組成物。
(項目6)
タンデムの第1のcircRNAコード配列および第2のcircRNAに隣接するイントロンエレメントが、バックスプライスされて、前記circRNAが、共有結合的に閉環される部位において傷跡を形成することなしに前記少なくとも2つのcircRNAを生じる、項目1から5のいずれか一項に記載の組成物。
(項目7)
項目1から6のいずれかの少なくとも2つのcircRNAをコードする前記核酸分子を含むアデノ随伴ウイルス(AAV)ゲノム。
(項目8)
少なくとも1つの環状RNA(circRNA)をコードする核酸分子を含む少なくとも1つのAAVゲノムカセット
バックスプライシングカセット中にオープンリーディングフレーム(ORF)に先行する内部リボソーム進入部位(IRES)エレメントを含む少なくとも1つのcircRNA
を含むアデノ随伴ウイルス(AAV)粒子であって、
前記バックスプライシングカセットが、目的の少なくとも1つのcircRNAコード配列を含む、アデノ随伴ウイルス(AAV)粒子。
(項目9)
少なくとも1つの環状RNA(circRNA)をコードする前記核酸分子が、tRNA由来イントロンエレメントに隣接しており、
前記tRNA由来イントロンエレメントが、少なくとも1つのcircRNAコード配列のための少なくとも1つのtRNAスプライシングカセットを含む、項目8に記載のAAV粒子。
(項目10)
前記AAV粒子が、前記目的の少なくとも1つのcircRNAコード配列に隣接するイントロン対をさらに含み、前記目的の少なくとも1つのcircRNAコード配列に隣接する前記イントロン対が、約750ヌクレオチドの欠失を含む、項目8または項目9のいずれかに記載のAAV粒子。
(項目11)
前記目的の少なくとも1つのcircRNAコード配列に隣接する前記イントロン対が、約250ヌクレオチドの欠失を含む左イントロンおよび約500ヌクレオチドの欠失を含む右イントロンを含む、項目10に記載のAAV粒子。
(項目12)
目的のcircRNAコード配列を細胞に送達する方法であって、前記細胞を、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物または項目8から11に記載のAAV粒子に導入するステップを含む、方法。
(項目13)
目的のcircRNAコード配列を組織に送達する方法であって、前記組織を、項目1から7に記載の組成物または項目8から11に記載のAAV粒子のいずれかに導入するステップを含む、方法。
(項目14)
対象における疾患または状態を処置する方法であって、項目1から7に記載の組成物または項目8から11に記載のAAV粒子のいずれかの有効量を前記対象に投与するステップを含み、前記有効量が、前記対象における疾患または状態の少なくとも1つの症状を低減させる量である、方法。
(項目15)
組織において少なくとも1つの環状RNA(circRNA)を発現させる方法であって、項目8から11のいずれか一項に記載の少なくとも1つのAAV粒子を前記組織に投与するステップを含み、前記少なくとも1つのcircRNAの発現が、ベースラインと比較して実質的に増加する、方法。
(項目16)
前記少なくとも1つのcircRNAの発現が、ベースラインと比較して少なくとも2倍増加する、項目15に記載の方法。
(項目17)
前記少なくとも1つのAAV粒子が、心臓組織、肝臓組織、骨格筋組織、またはそれらの任意の組合せに送達された場合、前記少なくとも1つのcircRNAの発現が、ベースラインと比較して少なくとも4倍増加する、項目15または項目16のいずれかに記載の方法。
(項目18)
前記少なくとも1つのAAV粒子が骨格筋組織に送達された場合、前記少なくとも1つのcircRNAの発現が、ベースラインと比較して少なくとも50倍増加する、項目15から17のいずれか一項に記載の方法。
(項目19)
前記少なくとも1つのAAV粒子が、筋肉内注射、静脈内注射、冠動脈内注射、動脈内注射、またはそれらの任意の組合せによって投与される、項目12から18のいずれか一項に記載の方法。
には、本開示が支配するものとする。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
少なくとも2つの環状RNA(circRNA)をタンデムでコードする核酸分子を含む組成物。
(項目2)
前記組成物が、少なくとも2つの環状RNA(circRNA)をコードする核酸分子を含み、前記核酸分子が、
(i)第1のcircRNAコード配列を含む第1のcircRNA、および
(ii)第2のcircRNAコード配列を含む第2のcircRNA
を含み、前記第2のcircRNAが、前記第1のcircRNA中の前記第1のcircRNAコード配列とタンデムであり、
タンデムの前記第1のcircRNAコード配列および前記第2のcircRNAが、イントロンエレメントに隣接している、項目1に記載の組成物。
(項目3)
前記核酸分子が、少なくとも1つのプロモーター領域をさらに含み、
前記少なくとも1つのプロモーター領域が、RNAポリメラーゼII型、RNAポリメラーゼIII型、またはそれらの任意の組合せを動員することができる、項目1または項目2のいずれか一項に記載の組成物。
(項目4)
前記核酸分子が、左バックスプライシングイントロンエレメントおよび右バックスプライシングイントロンエレメントをさらに含み、
前記第1のcircRNAコード配列が、前記左バックスプライシングイントロンエレメントおよび前記右バックスプライシングイントロンエレメントに隣接しており、
前記右バックスプライシングイントロンが、少なくとも1つのtRNA由来イントロンを含み、
前記少なくとも1つのtRNA由来イントロンが、スプライシングの際に第2のcircRNAをコードするtRNA配列を含む、項目1から3のいずれか一項に記載の組成物。
(項目5)
第1のcircRNAコード配列が、
前記第1のcircRNAコード配列に隣接するイントロンエレメントの内側の5’非翻訳領域(5’UTR)であって、内部リボソーム進入部位(IRES)である5’UTR、および
3’UTR中、かつ前記第1のcircRNAコード配列および第2のcircRNAに隣接するイントロンエレメントの内側の、翻訳調節領域
をさらに含む、項目1から4のいずれか一項に記載の組成物。
(項目6)
タンデムの第1のcircRNAコード配列および第2のcircRNAに隣接するイントロンエレメントが、バックスプライスされて、前記circRNAが、共有結合的に閉環される部位において傷跡を形成することなしに前記少なくとも2つのcircRNAを生じる、項目1から5のいずれか一項に記載の組成物。
(項目7)
項目1から6のいずれかの少なくとも2つのcircRNAをコードする前記核酸分子を含むアデノ随伴ウイルス(AAV)ゲノム。
(項目8)
少なくとも1つの環状RNA(circRNA)をコードする核酸分子を含む少なくとも1つのAAVゲノムカセット
バックスプライシングカセット中にオープンリーディングフレーム(ORF)に先行する内部リボソーム進入部位(IRES)エレメントを含む少なくとも1つのcircRNA
を含むアデノ随伴ウイルス(AAV)粒子であって、
前記バックスプライシングカセットが、目的の少なくとも1つのcircRNAコード配列を含む、アデノ随伴ウイルス(AAV)粒子。
(項目9)
少なくとも1つの環状RNA(circRNA)をコードする前記核酸分子が、tRNA由来イントロンエレメントに隣接しており、
前記tRNA由来イントロンエレメントが、少なくとも1つのcircRNAコード配列のための少なくとも1つのtRNAスプライシングカセットを含む、項目8に記載のAAV粒子。
(項目10)
前記AAV粒子が、前記目的の少なくとも1つのcircRNAコード配列に隣接するイントロン対をさらに含み、前記目的の少なくとも1つのcircRNAコード配列に隣接する前記イントロン対が、約750ヌクレオチドの欠失を含む、項目8または項目9のいずれかに記載のAAV粒子。
(項目11)
前記目的の少なくとも1つのcircRNAコード配列に隣接する前記イントロン対が、約250ヌクレオチドの欠失を含む左イントロンおよび約500ヌクレオチドの欠失を含む右イントロンを含む、項目10に記載のAAV粒子。
(項目12)
目的のcircRNAコード配列を細胞に送達する方法であって、前記細胞を、項目1から7のいずれか一項に記載の組成物または項目8から11に記載のAAV粒子に導入するステップを含む、方法。
(項目13)
目的のcircRNAコード配列を組織に送達する方法であって、前記組織を、項目1から7に記載の組成物または項目8から11に記載のAAV粒子のいずれかに導入するステップを含む、方法。
(項目14)
対象における疾患または状態を処置する方法であって、項目1から7に記載の組成物または項目8から11に記載のAAV粒子のいずれかの有効量を前記対象に投与するステップを含み、前記有効量が、前記対象における疾患または状態の少なくとも1つの症状を低減させる量である、方法。
(項目15)
組織において少なくとも1つの環状RNA(circRNA)を発現させる方法であって、項目8から11のいずれか一項に記載の少なくとも1つのAAV粒子を前記組織に投与するステップを含み、前記少なくとも1つのcircRNAの発現が、ベースラインと比較して実質的に増加する、方法。
(項目16)
前記少なくとも1つのcircRNAの発現が、ベースラインと比較して少なくとも2倍増加する、項目15に記載の方法。
(項目17)
前記少なくとも1つのAAV粒子が、心臓組織、肝臓組織、骨格筋組織、またはそれらの任意の組合せに送達された場合、前記少なくとも1つのcircRNAの発現が、ベースラインと比較して少なくとも4倍増加する、項目15または項目16のいずれかに記載の方法。
(項目18)
前記少なくとも1つのAAV粒子が骨格筋組織に送達された場合、前記少なくとも1つのcircRNAの発現が、ベースラインと比較して少なくとも50倍増加する、項目15から17のいずれか一項に記載の方法。
(項目19)
前記少なくとも1つのAAV粒子が、筋肉内注射、静脈内注射、冠動脈内注射、動脈内注射、またはそれらの任意の組合せによって投与される、項目12から18のいずれか一項に記載の方法。
Claims (20)
- 核酸配列を含む核酸分子であって、前記核酸が、第1の環状RNA(circRNA)および第2のcircRNAを含む少なくとも2つの環状RNA(circRNA)をコードする、核酸分子。
- 前記核酸配列が、
(i)第1の調節エレメントに隣接する第1のcircRNAコード配列、および
(ii)第2の調節エレメントに隣接する第2のcircRNAコード配列
を含む、請求項1に記載の核酸分子。 - 前記核酸配列が、少なくとも1つのバックスプライシングカセットおよび少なくとも1つのtRNAスプライシングカセットを含む、請求項1または請求項2に記載の核酸分子。
- 前記核酸配列が、少なくとも1つのプロモーター領域をさらに含み、前記少なくとも1つのプロモーター領域が、RNAポリメラーゼII型、RNAポリメラーゼIII型、またはそれらの任意の組合せを動員することができる、請求項1から3のいずれか一項に記載の核酸分子。
- 前記第1のcircRNAコード配列が、左バックスプライシングイントロンエレメントおよび右バックスプライシングイントロンエレメントに隣接しており、
前記右バックスプライシングイントロンエレメントが、前記第2のcircRNAコード配列を含む、請求項2から4のいずれか一項に記載の核酸分子。 - 前記右バックスプライシングイントロンエレメントが、tRNA由来イントロンエレメントを含む、請求項5に記載の核酸分子。
- 前記左バックスプライシングイントロンエレメントが、Aluエレメントを含み、前記右バックスプライシングイントロンエレメントが、Aluエレメントを含む、請求項5または請求項6に記載の核酸分子。
- 前記左バックスプライシングイントロンエレメントが、約750ヌクレオチドの欠失を含む、請求項7に記載の核酸分子。
- 前記第1のcircRNAコード配列が、5’非翻訳領域(5’UTR)および3’UTRを含み、前記5’UTRが、内部リボソーム進入部位(IRES)を含む、請求項2から8のいずれか一項に記載の核酸分子。
- 前記第1のcircRNAが、治療的タンパク質または治療的RNAをコードする、請求項1から9のいずれか一項に記載の核酸分子。
- 前記第2のcircRNAが、アプタマー、ガイドRNA、タンパク質スポンジ、miRNAスポンジ、タンパク質結合性RNA、天然に存在するcircRNA、アンチセンスRNA、長鎖非コードRNA(lncRNA)、低分子活性化RNA(saRNA)、機能的非コードRNA、リボソームRNA(rRNA)、核小体低分子RNA(snoRNA)、核内低分子RNA(snRNA)、piwi相互作用RNA(piRNA)、Y-RNA、7SK RNA、または7S RNAをコードする、請求項1から10のいずれか一項に記載の核酸分子。
- 請求項1から11のいずれか一項に記載の核酸分子を含むアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクター。
- 請求項12に記載のAAVベクターを含むAAV粒子。
- 請求項1から11のいずれか一項に記載の核酸分子または請求項13に記載のAAV粒子、および薬学的に許容される担体または賦形剤を含む医薬組成物。
- 少なくとも2つのcircRNAを細胞または組織に送達する方法における使用のための、請求項1から11のいずれか一項に記載の核酸分子または請求項13に記載のAAV粒子を含む組成物、あるいは請求項14に記載の医薬組成物であって、前記方法が、前記組成物または前記医薬組成物を前記細胞または組織に導入するステップを含む、組成物または医薬組成物。
- 対象における疾患または状態を処置する方法における使用のための、請求項1から11のいずれか一項に記載の核酸分子または請求項13に記載のAAV粒子を含む組成物、あるいは請求項14に記載の医薬組成物であって、前記方法が、前記組成物または前記医薬組成物の有効量を前記対象に投与するステップを含み、前記有効量が、前記対象における疾患または状態の少なくとも1つの症状を低減させる量である、組成物または医薬組成物。
- 前記方法が、少なくとも1つのAAV粒子を組織に投与するステップを含み、少なくとも2つの環状RNAが、前記組織において発現され、前記少なくとも2つのcircRNAの発現が、前記少なくとも1つのAAV粒子の投与前のベースラインの発現と比較して実質的に増加する、請求項16に記載の使用のための前記核酸分子またはAAV粒子を含む組成物、または医薬組成物。
- 前記少なくとも2つのcircRNAの発現が、前記少なくとも1つのAAV粒子の投与前のベースラインの発現と比較して少なくとも2倍増加する、請求項17に記載の使用のための組成物または医薬組成物。
- 前記少なくとも2つのcircRNAの発現が、前記少なくとも1つのAAV粒子の投与前の、心臓組織、肝臓組織、骨格筋組織、またはそれらの任意の組合せにおけるベースラインの発現と比較して少なくとも4倍増加する、請求項17に記載の使用のための組成物または医薬組成物。
- 前記少なくとも2つのcircRNAの発現が、前記少なくとも1つのAAV粒子の投与の前の、骨格筋組織におけるベースラインの発現と比較して少なくとも50倍増加する、請求項17に記載の使用のための組成物または医薬組成物。
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