JPWO2020110330A1 - ペプチドチオエステル、ペプチドの新規製造方法 - Google Patents
ペプチドチオエステル、ペプチドの新規製造方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JPWO2020110330A1 JPWO2020110330A1 JP2020557536A JP2020557536A JPWO2020110330A1 JP WO2020110330 A1 JPWO2020110330 A1 JP WO2020110330A1 JP 2020557536 A JP2020557536 A JP 2020557536A JP 2020557536 A JP2020557536 A JP 2020557536A JP WO2020110330 A1 JPWO2020110330 A1 JP WO2020110330A1
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- peptide
- glycosylated
- producing
- group
- amino acid
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- BHQUBONFIYNJDA-UHFFFAOYSA-N [O-][N+](c(cc1)cnc1S)=O Chemical compound [O-][N+](c(cc1)cnc1S)=O BHQUBONFIYNJDA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LKNPLDRVWHXGKZ-UHFFFAOYSA-N [O-][N+](c(cccn1)c1S)=O Chemical compound [O-][N+](c(cccn1)c1S)=O LKNPLDRVWHXGKZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 0 *CC(C1)C(CNCC(c2ccccc2)S)CC1C(O)=O Chemical compound *CC(C1)C(CNCC(c2ccccc2)S)CC1C(O)=O 0.000 description 1
- OBBYHALTVIDRAU-YSSFQJQWSA-N C[C@@H](C(S)=O)NC([C@H](Cc1ccccc1)NC(CNC(CNC([C@H](Cc(cc1)ccc1O)N)=O)=O)=O)=O Chemical compound C[C@@H](C(S)=O)NC([C@H](Cc1ccccc1)NC(CNC(CNC([C@H](Cc(cc1)ccc1O)N)=O)=O)=O)=O OBBYHALTVIDRAU-YSSFQJQWSA-N 0.000 description 1
- WHMDPDGBKYUEMW-UHFFFAOYSA-N Sc1ccccn1 Chemical compound Sc1ccccn1 WHMDPDGBKYUEMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/107—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/107—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides
- C07K1/113—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides without change of the primary structure
- C07K1/1133—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides without change of the primary structure by redox-reactions involving cystein/cystin side chains
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/02—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length in solution
- C07K1/026—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length in solution by fragment condensation in solution
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/107—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides
- C07K1/1072—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides by covalent attachment of residues or functional groups
- C07K1/1077—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides by covalent attachment of residues or functional groups by covalent attachment of residues other than amino acids or peptide residues, e.g. sugars, polyols, fatty acids
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
- Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
- Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
【解決手段】 (1)C末端にCGCトリプレットを有するペプチドチオエステルを準備する工程、(2)CGCトリプレットにおけるC末端システインのSH基とグリシンのカルボニル基との間で転移を生じさせ、R−X−CG−チオエステルを得る工程、および(3)前記R−X−CG−チオエステルにおいて、システインのSH基とXのカルボニル基との転移と、システインのアミノ基とグリシンのチオール基との転移とを生じさせて、ペプチドチオエステルを得る工程を含む、ペプチドチオエステルの製造方法、および当該方法により製造されたペプチドチオエステルを用いたペプチドの製造方法が提供される。
【選択図】 なし
Description
(1)以下の配列:
を有するペプチドを準備する工程、
(2)CGCトリプレットにおけるC末端システインのSH基とグリシンのカルボニル基との間で転移を生じさせ、R−X−CG−チオエステルを得る工程、および
(3)前記R−X−CG−チオエステルにおいて、システインのSH基とXのカルボニル基との転移と、システインのアミノ基とグリシンのチオエステルのカルボニル基との間での閉環縮合とを生じさせて、ペプチドチオエステルを得る工程、
を含む、
製造方法。
前記ペプチドは、化学合成により、または、発現系による発現により、取得されたものである、
製造方法。
前記工程(2)の反応は、2−メルカプトエタンスルフォン酸ナトリウム(MESNa)、2−アミノエタンチオール、およびビス(2−スルファニルエチル)アミンよりなる群から選択される少なくとも1種のチオールの存在下で行われる、
製造方法。
前記工程(3)の反応は、2−メルカプトエタンスルフォン酸ナトリウム(MESNa)、メルカプトフェニル酢酸(MPAA)、2−メルカプトプロピオン酸、チオフェノール、ベンジルメルカプタン、3/4−メルカプトベンジルスルフォネートから選択される少なくとも1種のチオールの存在下で行われる、
製造方法。
(2−1)工程(2)の反応後、工程(3)の前に、R−X−CG−チオエステルを精製する工程、
をさらに含む
製造方法。
前記ペプチドは、糖鎖付加ペプチドである、
製造方法。
(A)[1]〜[6]のいずれかに記載の製造方法によって製造されたペプチドチオエステル、および
(B)アミノチオアシッドまたはペプチドチオアシッド
を縮合させて、ペプチドを得る工程を含み、
ここで、前記(A)および(B)を構成するアミノ酸の側鎖の少なくとも一部が未保護である、
ことを特徴とする、
製造方法。
前記(A)および(B)を構成するアミノ酸の側鎖の全てが未保護である、
製造方法。
糖鎖付加ペプチドの製造方法である
ことを特徴とする、
製造方法。
前記ペプチドチオエステルは、糖鎖付加ペプチドチオエステルである、
製造方法。
前記アミノチオアシッドもしくはまたはペプチドチオアシッドは、糖鎖付加アミノチオアシッドまたは糖鎖付加ペプチドチオアシッドである、
製造方法。
前記糖鎖付加アミノチオアシッドは、Asn、Ser、Thr、HylまたはHypよりなる群から選択される糖鎖付加アミノ酸のチオアシッドである、
製造方法。
前記糖鎖付加ペプチドチオアシッド中の糖鎖付加アミノ酸は、Asn、Ser、Thr、HylまたはHypよりなる群から選択される糖鎖付加アミノ酸である、
製造方法。
前記糖鎖付加ペプチドチオアシッドは、糖鎖付加アミノチオアシッドと、側鎖に前記糖鎖付加アミノチオアシッド中のチオ酸基(−SH)とジスルフィド結合を形成し得る修飾基を有するシステインをそのN末端に有するペプチドとを反応させ、反応後のペプチドのC末端にチオ酸基を導入することにより得られたものである、
製造方法。
(a)[1]〜[6]のいずれかに記載の製造方法によって製造されたペプチドチオエステル、および
(b)下記構造:
を有する補助基がそのN末端に導入されたアミノ酸またはペプチド
を縮合させて、ペプチドを得る工程を含み、
ここで、前記(a)および(b)を構成するアミノ酸の側鎖の少なくとも一部が未保護である、
ことを特徴とする、
製造方法。
前記Xは、アリールである、
製造方法。
前記(a)および(b)を構成するアミノ酸の側鎖の全てが未保護である、
製造方法。
糖鎖付加ペプチドの製造方法である
ことを特徴とする、
製造方法。
前記ペプチドチオエステルは、糖鎖付加ペプチドチオエステルである、
製造方法。
前記「補助基がそのN末端に導入されたアミノ酸またはペプチド」は、補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加アミノ酸または糖鎖付加ペプチドである、
製造方法。
前記「補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加アミノ酸」は、前記補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加Asn、糖鎖付加Ser、糖鎖付加Thrおよび糖鎖付加Hylよりなる群から選択される、
製造方法。
前記「補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加アミノ酸」は、下記の構造:
を有する糖鎖付加アミノ酸である、
製造方法。
前記アミノ酸Xは、Asn、Ser、ThrおよびHylよりなる群から選択される、
製造方法。
前記「補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加アミノ酸」は、下記の構造:
を有する糖鎖付加ジペプチドである、
製造方法。
(AA)ペプチドチオエステル、および
(BB)アミノチオアシッドまたはペプチドチオアシッド
を縮合させて、ペプチドを得る工程を含み、
ここで、前記(AA)および(BB)を構成するアミノ酸の側鎖の少なくとも一部が未保護である、
ことを特徴とする、
製造方法。
前記(AA)および(BB)を構成するアミノ酸の側鎖の全てが未保護である、
製造方法。
糖鎖付加ペプチドの製造方法である
ことを特徴とする、
製造方法。
前記ペプチドチオエステルは、糖鎖付加ペプチドチオエステルである、
製造方法。
前記アミノチオアシッドもしくはまたはペプチドチオアシッドは、糖鎖付加アミノチオアシッドまたは糖鎖付加ペプチドチオアシッドである、
製造方法。
前記糖鎖付加アミノチオアシッドは、Asn、Ser、Thr、HylまたはHypよりなる群から選択される糖鎖付加アミノ酸のチオアシッドである、
製造方法。
前記糖鎖付加ペプチドチオアシッド中の糖鎖付加アミノ酸は、Asn、Ser、Thr、HylまたはHypよりなる群から選択される糖鎖付加アミノ酸である、
製造方法。
前記糖鎖付加ペプチドチオアシッドは、糖鎖付加アミノチオアシッドと、側鎖に前記糖鎖付加アミノチオアシッド中のチオ酸基(−SH)とジスルフィド結合を形成し得る修飾基を有するシステインをそのN末端に有するペプチドとを反応させ、反応後のペプチドのC末端にチオ酸基を導入することにより得られたものである、
製造方法。
(aa)ペプチドチオエステル、および
(bb)下記構造:
を有する補助基がそのN末端に導入されたアミノ酸またはペプチド
を縮合させて、ペプチドを得る工程を含み、
ここで、前記(aa)および(bb)を構成するアミノ酸の側鎖の少なくとも一部が未保護である、
ことを特徴とする、
製造方法。
前記Xは、アリールである、
製造方法。
前記(aa)および(bb)を構成するアミノ酸の側鎖の全てが未保護である、
製造方法。
糖鎖付加ペプチドの製造方法である
ことを特徴とする、
製造方法。
前記ペプチドチオエステルは、糖鎖付加ペプチドチオエステルである、
製造方法。
前記「補助基がそのN末端に導入されたアミノ酸またはペプチド」は、補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加アミノ酸または糖鎖付加ペプチドである、
製造方法。
前記「補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加アミノ酸」は、前記補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加Asn、糖鎖付加Ser、糖鎖付加Thrおよび糖鎖付加Hylよりなる群から選択される、
製造方法。
前記「補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加アミノ酸」は、下記の構造:
を有する糖鎖付加アミノ酸である、
製造方法。
前記アミノ酸Xは、Asn、Ser、ThrおよびHylよりなる群から選択される、
製造方法。
前記「補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加アミノ酸」は、下記の構造:
を有する糖鎖付加ジペプチドである、
製造方法。
前記アミノ酸Xは、Asn、Ser、ThrおよびHylよりなる群から選択される、
糖鎖付加アミノ酸。
本発明において、「アミノ酸」は、その最も広い意味で用いられ、天然のアミノ酸、すなわち、セリン(Ser)、アスパラギン(Asn)、バリン(Val)、ロイシン(Leu)、イソロイシン(Ile)、アラニン(Ala)、チロシン(Tyr)、グリシン(Gly)、リジン(Lys)、アルギニン(Arg)、ヒスチジン(His)、アスパラギン酸(Asp)、グルタミン酸(Glu)、グルタミン(Gln)、トレオニン(Thr)、システイン(Cys)、メチオニン(Met)、フェニルアラニン(Phe)、トリプトファン(Trp)、プロリン(Pro)に加えて、アミノ酸変異体などの非天然アミノ酸を含む。したがって、本発明において、アミノ酸として、例えばL−アミノ酸;D−アミノ酸;化学修飾されたアミノ酸:ノルロイシン、β−アラニン、オルニチンなどの生体内でタンパク質の構成材料とならないアミノ酸:アミノ酸の側鎖置換基がさらに別の置換基によって置換された変異体(例えばヒドロキシリジン(Hyl)、ヒドロキシプロリン(Hyp))などが含まれる。
糖鎖が結合するアミノ酸の種類に特に限定はなく、天然アミノ酸、非天然アミノ酸のいずれを用いることもできる。糖鎖付加アミノ酸が生体内に糖ペプチド(糖タンパク質)として存在するものと同一または類似の構造を有するという観点からは、糖鎖付加アミノ酸は、N−結合型糖鎖のような糖鎖付加Asn、O−結合型糖鎖のような糖鎖付加Serおよび糖鎖付加Thr、糖鎖付加Hyl、糖鎖付加Hypが好ましく、特に糖鎖付加Asnが好ましい。
本発明は、一態様において、ペプチドチオエステルの製造方法(以下、「本発明のペプチドチオエステル製造法」とも称する)に関する。
本発明のペプチドチオエステル製造法は、
(1)以下の配列:
を有するペプチドを準備する工程、
(2)CGCトリプレットにおけるC末端システインのSH基とグリシンのカルボニル基との間で転移を生じさせ、R−X−CG−チオエステルを得る工程、および
(3)前記R−X−CG−チオエステルにおいて、システインのSH基とXのカルボニル基との転移と、システインのアミノ基とグリシンのチオエステルのカルボニル基との間での閉環縮合とを生じさせて、ペプチドチオエステルを得る工程、
を含む。
ペプチド(1)は、化学合成により製造できるだけでなく、発現系により製造したものをそのまま用いることもできる。したがって、本発明は、化学合成での製造が困難な、サイズの大きなペプチドにも適用することができる点で、極めて汎用性が高いという利点を有している。
別の態様において、本発明は、ペプチドの製造方法(以下、「本発明のペプチド製造法」とも称する)に関する。
本発明のペプチド製造法は、
(A)ペプチドチオエステル、および
(B)アミノチオアシッドもしくはペプチドチオアシッド、または、下記構造:
を有する補助基(以下、本発明の補助基とも称する)がそのN末端に導入されたアミノ酸またはペプチド
を縮合させて、ペプチドを得る工程を含み、
ここで、上記(A)および(B)を構成するアミノ酸の側鎖の少なくとも一部が未保護であることを特徴とする。
上記糖鎖付加アミノ酸において、好ましくは、Xは、Xは、Asn、Ser、ThrまたはHylである。
上記糖鎖付加アミノ酸において、チオール基(−SH)は、保護されていても、保護されていなくてもよい。
上記糖鎖付加アミノ酸において、側鎖の糖鎖は、保護されていても、保護されていなくてもよい。
上記糖鎖付加ジペプチドにおいて、チオール基(−SH)は、保護されていても、保護されていなくてもよい。
上記糖鎖付加ジペプチドにおいて、側鎖の糖鎖は、保護されていても、保護されていなくてもよい。
合成したアミノチオアシッドに対してペプチドチオエステル 7(0.5〜2.0当量)およびDIEA(5.0〜10.0当量)を加え、Ar雰囲気下室温で反応させた。反応溶液のアミノチオアシッドは、10〜30mMで反応を効率的に進行させることができる。反応追跡は逆相HPLCを用いて行った。反応は、通常、いずれの基質においても3〜6時間以内に完了する。
本縮合反応は、ペプチドチオアシッドおよびN末端にNpys修飾を行ったペプチドとのライゲーション反応である。これはTamらの方法を参考に行った(Liu,C.;Rao,C.;Tam,J.P. Acyl Disulfide−Mediated Intramolecular Acylation for Orthogonal Coupling Between Unprotected Peptide Segments. Mechanism and Application. Tetrahedron Letters.,1996,37,933−936.)。
(1)糖鎖N末端側ライゲーション
(1−1)補助基の合成
下記反応スキームにしたがって、化学式C23H22OSで示す補助基を合成した。
1−フェニルエタン−1,2−ジオール(3.96g、28.9mmol)、TrtCl(8.77g、31.8mmol、1.1当量)、DMAP(0.354g、2.89mmol、0.1当量)、および攪拌子をナスフラスコに入れ、真空ラインで1時間乾燥させた。アルゴン置換後、ピリジン(72ml、400mM)を加えて、50℃のオイルバスで一晩攪拌させた。その間TLC(展開溶媒 ヘキサン:酢酸エチル=2:1)で反応追跡を行った。16時間後、真空ポンプにより減圧濃縮し、ピリジンを除いた。十分にピリジンが除去された後、酢酸エチルで希釈し、飽和塩化アンモニウム水溶液、飽和食塩水、H2Oで抽出した。有機層を減圧濃縮後、シリカゲルカラム精製(直径=30mm、展開溶媒 ヘキサン:酢酸エチル=11:1)にて目的物を得た。(10.1g,92%)。
化学式:C27H24O2
[M+Na]+:Cal.403.8 Found.403.3
[M+K]+:Cal.419.8 Found.419.3
1H NMR(CDCl3,400MHz)
δ:7.42−7.23(m,20H),4.76(m,1H),3.45(m,1H),3,28(m,1H),2.76(d,1H)
1−フェニル−2−(トリチルオキシ)エタノール(7.11g、18.7mmol)をDCM(95mL、200mM)に溶かし、氷浴中でDIEA(6.5mL、37.4mmol、2当量)を加えたのちゆっくりとMsCl(1.75mL、22.4mmol、1.2当量)を滴下した。滴下終了後、氷浴を外し徐々に室温へと戻した。この間TLC(展開溶媒 ヘキサン:酢酸エチル=4:1)で反応追跡を行った。5分後、飽和塩化アンモニウム水溶液、飽和食塩水、H2Oで抽出した。有機層にMgSO4を加えてろ過した後、減圧濃縮して真空ラインで1時間乾燥させた。クルードのまま、DMF(250mL,150mM)に溶かし、KsAc(4.27g、37.4mmol、2当量)加えて、40℃のオイルバスで一晩攪拌させた。この間TLC(展開溶媒 ヘキサン:酢酸エチル=4:1)で反応追跡を行った。酢酸エチルで希釈し、飽和食塩水で抽出した。減圧濃縮後、シリカゲルカラム精製(直径=50mm、展開溶媒 ヘキサン:トルエン=1:1)によって目的物を得た(5.82g、71%)。
化学式:C29H26O2S
[M+Na]+:Cal.461.0 Found. 461.3
[M+K]+:Cal.477.2 Found. 477.5
1H NMR(CDCl3,400MHz)
δ:7.35−7.21(m,20H),4.85(t,1H),3.45(d,1H),3,41(d,1H),2.30(S,3H)
S−(1−フェニル−2−(トリチルオキシ)エチル)エタンチオエート(5.19g、11.9mmol)をメタノール:酢酸エチル=4:1(118mL、100mM)に溶かし、ゆっくりとN2H4・H2O(0.865mL、17.9mmol、1.5当量)を滴下して室温で攪拌した。その間TLC(展開溶媒 ヘキサン:トルエン=3:1)で反応追跡を行った。1時間後、酢酸エチルで希釈し、飽和塩化アンモニウム水溶液、飽和食塩水、H2Oで抽出した。有機層を減圧濃縮してシリカゲルカラム精製(直径=50mm、展開溶媒 ヘキサン:トルエン=3:1)によって目的物を得た(3.98g、84%)。
化学式: C27H24OS
[M+Na]+:Cal.419.5 Found. 419.4
[M+K]+:Cal.435.2 Found. 435.1
1H NMR(CDCl3,400MHz)
δ:7.40−7.20(m,20H),4.09(q,1H),3.45(m,2H),2.33(S,1H)
1−フェニル−2−(トリチルオキシ)エタン−1−チオール (3.58g、9.03mmol)をギ酸:Et2O=1:1(30mL、300mM)に溶かし、室温で攪拌した。その間TLC(展開溶媒 ヘキサン:酢酸エチル=6:1)で反応追跡を行った。直後、ピペリジン(約20mL)を氷浴中でゆっくりと加えてクエンチし、反応溶液を酢酸エチルで希釈したのち、飽和炭酸ナトリウム水溶液、飽和食塩水、H2Oで抽出した。有機層を減圧濃縮してシリカゲルカラム精製(直径=50mm、展開溶媒 ヘキサン:酢酸エチル=6:1)によって目的物を得た(2.80g、78%)。
化学式:C27H24OS
[M+Na]+:Cal.419.5 Found. 419.3
[M+K]+:Cal.435.2 Found. 435.0
1H NMR(CDCl3,400MHz)
δ:7.44−7.23(m),3.46(m,1H),3.38(t,1H),3.31(m,1H),1.50(t,1H)
2−フェニル−2−(トリチルチオ)エタノール(1.9g、4.91mmol)にNa2CO3(約6当量程度)を加え、DCM50mlに溶かした。ここへデス−マーチンペルヨージナン(DMP)(2.29g、5.40mmol、1.1当量)をDCM48mlに溶かしたものを少しずつ滴下した。反応は10分で終了し、この間TLC(展開溶媒 ヘキサン:DCM=1:3)で反応追跡を行った。これを過剰のEt2Oで希釈し、飽和炭酸ナトリウム水溶液、飽和食塩水、H2Oで抽出した。この時水層と有機層の間に白いポリマーのようなものができるが、抽出操作を続けるとほとんど水層に移動した。その後ドラフト内で減圧濃縮し、シリカゲルカラム精製(ヘキサン:DCM=1:3、直径30mm)によって目的物を得た(1.35g、70%)。
化学式:C27H22OS
[M+Na]+:Cal.417.1 Found.417.2
[M+K]+:Cal.433.2 Found.433.3
1H NMR(CDCl3,400MHz)
δ:8.99(d,1H)7.44−7.21(20H,m),3.99(d,1H)
化学式:C34H37NO3S
[M+H]+:Cal.540.25 Found.540.1
化学式:C115H166N8O64S
[M+H]+:Cal.2715.97 Found.2715.8
化学式:C131H178N8O66S
[M+H]+:Cal.2951.94 Found.2952.0
上記(1)〜(4)にしたがって取得した糖鎖付加アミノ酸−補助基複合体を、下記反応スキームにしたがって、ペプチドチオエステル体(LRLRGG−COSRおよびALLX−COSR)とのライゲーションに用いた。
MPAAの付加体の形で得られたが、TCEPを添加すると全て目的のライゲーションプロダクトとして得られた。(HPLC 面積収率>99%、図17)
化学式:C140H220N20O72S
[M+H]+ Calcd.3366.3903 Found.3366.3962
糖鎖からPac基が脱保護したライゲーションプロダクトも認められたため、反応系に200mM MESNa、0.5μLのピペリジンを加えてPac基を全て脱保護したのち、面積収率を求めた(面積収率88%、図18)。
化学式:C117H186N14O68S
[M+H]+Calcd.2908.13 Found.2908.2
糖鎖からPac基が脱保護したライゲーションプロダクトも認められたため、脱保護体も含めて面積収率を求めた(面積収率77%)。
化学式:C130H196N12O71S(Pac基が外れていないライゲーションプロダクト)
[M+H]+Calcd.3094.18 Found.3094.32
糖鎖からPac基が脱保護したライゲーションプロダクトも認められたため、脱保護体も含めて面積収率を求めた(面積収率76%)。
化学式:C132H200N12O70S
[M+H]+Calcd.3106.22 Found.3106.38
(2−1)糖鎖アミノ酸の合成
下記に反応スキームにしたがって、アミノ酸(セリン)C末端のNHNHBoc化を行った。
化学式:C27H35N3O6
[M+Na]+:Cal.520.2 Found. 520.2
[M+K]+:Cal. 536.3 Found. 536.3
1H NMR(CDCl3,400MHz)
δ:7.65−7.25(m,10H),5.70(s,1H),4.40(d,2H),4.32(s,3H),3.81(s,1H),1.26(s,9H)
Fmoc−Asn(ジフェナシル−シアリルオリゴサッカライド)(10.1mg、3.58μmol)に、DMF(715μL、5mM)にNH2−Ser(OtBu)−NHNHBoc(4.9mg、17.9μmol、5当量)、およびPyBOP(9.5mg、17.9μmol、5当量)を溶かしたものを加えた。ここへDIEA(4.2μL、25.1μmol、7当量)を追加して−20℃で20分間攪拌した。この間、反応追跡は、UPLCで行い、反応終了後、ゲルろ過Sephadex LH−20、CH3CN:H2O=1:1にて試薬を取り除き、凍結乾燥させた(9.2mg、84%、図19)。次にこのサンプルにTFA/TIPS(95:5、200μL)を加え、1時間氷浴中で攪拌した。その後、冷やした10倍量のEt2Oによって、Boc、tBuの脱保護体を沈殿させて得た。その後、蒸留水を加えて希釈し、凍結乾燥させた(7.8mg、89%)。
次に、このサンプルに、10mM NaNO2(6MGd・HCl、200mM リン酸緩衝液、pH4.0)を50μl加えて、−20℃で攪拌した。30分後、UPLCによって、末端がアジド体になったことを確認したのち、サンプル中で200mMの濃度になるようMESNaを加えてpH7に調整した。3時間後、UPLCによって、末端がチオエステル体になったことを確認したのち、ゲルろ過(Sephadex LH−20,CH3CN:H2O=1:1)によって目的物を得た(6.1mg,75%、図20)。
化学式:C124H175N9O72S2
[M+H]+:Cal.3007.98 Found.3007.84
化学式:C133H184N10O72S
[M+H]+:Cal.3106.99 Found.3107.01
(1)C末端CGCのNS転移を伴うMENSaチオエステル化
Claims (47)
- ペプチドチオエステルの製造方法であって、
(1)以下の配列:
を有するペプチドを準備する工程、
(2)CGCトリプレットにおけるC末端システインのSH基とグリシンのカルボニル基との間で転移を生じさせ、R−X−CG−チオエステルを得る工程、および
(3)前記R−X−CG−チオエステルにおいて、システインのSH基とXのカルボニル基との転移と、システインのアミノ基とグリシンのチオエステルのカルボニル基との間での閉環縮合とを生じさせて、ペプチドチオエステルを得る工程、
を含む、
製造方法。 - 請求項1に記載の製造方法であって、
前記ペプチドは、化学合成により、または、発現系による発現により、取得されたものである、
製造方法。 - 請求項1または2に記載の製造方法であって、
前記工程(2)の反応は、2−メルカプトエタンスルフォン酸ナトリウム(MESNa)、2−アミノエタンチオール、およびビス(2−スルファニルエチル)アミンよりなる群から選択される少なくとも1種のチオールの存在下で行われる、
製造方法。 - 請求項1〜3のいずれか1項に記載の製造方法であって、
前記工程(3)の反応は、2−メルカプトエタンスルフォン酸ナトリウム(MESNa)、メルカプトフェニル酢酸(MPAA)、2−メルカプトプロピオン酸、チオフェノール、ベンジルメルカプタン、3/4−メルカプトベンジルスルフォネートから選択される少なくとも1種のチオールの存在下で行われる、
製造方法。 - 請求項1〜4のいずれか1項に記載の製造方法であって、
(2−1)工程(2)の反応後、工程(3)の前に、R−X−CG−チオエステルを精製する工程、
をさらに含む
製造方法。 - 請求項1〜5のいずれか1項に記載の製造方法であって、
前記ペプチドは、糖鎖付加ペプチドである、
製造方法。 - ペプチドの製造方法であって、
(A)請求項1〜6のいずれか1項に記載の製造方法によって製造されたペプチドチオエステル、および
(B)アミノチオアシッドまたはペプチドチオアシッド
を縮合させて、ペプチドを得る工程を含み、
ここで、前記(A)および(B)を構成するアミノ酸の側鎖の少なくとも一部が未保護である、
ことを特徴とする、
製造方法。 - 請求項7に記載のペプチドの製造方法であって、
前記(A)および(B)を構成するアミノ酸の側鎖の全てが未保護である、
製造方法。 - 請求項7または8に記載のペプチドの製造方法であって、
糖鎖付加ペプチドの製造方法である
ことを特徴とする、
製造方法。 - 請求項9に記載のペプチドの製造方法であって、
前記ペプチドチオエステルは、糖鎖付加ペプチドチオエステルである、
製造方法。 - 請求項9に記載のペプチドの製造方法であって、
前記アミノチオアシッドもしくはまたはペプチドチオアシッドは、糖鎖付加アミノチオアシッドまたは糖鎖付加ペプチドチオアシッドである、
製造方法。 - 請求項11に記載のペプチドの製造方法であって、
前記糖鎖付加アミノチオアシッドは、Asn、Ser、Thr、HylまたはHypよりなる群から選択される糖鎖付加アミノ酸のチオアシッドである、
製造方法。 - 請求項11に記載のペプチドの製造方法であって、
前記糖鎖付加ペプチドチオアシッド中の糖鎖付加アミノ酸は、Asn、Ser、Thr、HylまたはHypよりなる群から選択される糖鎖付加アミノ酸である、
製造方法。 - 請求項11または13に記載のペプチドの製造方法であって、
前記糖鎖付加ペプチドチオアシッドは、糖鎖付加アミノチオアシッドと、側鎖に前記糖鎖付加アミノチオアシッド中のチオ酸基(−SH)とジスルフィド結合を形成し得る修飾基を有するシステインをそのN末端に有するペプチドとを反応させ、反応後のペプチドのC末端にチオ酸基を導入することにより得られたものである、
製造方法。 - 請求項16に記載のペプチドの製造方法であって、
前記Xは、アリールである、
製造方法。 - 請求項16または17に記載のペプチドの製造方法であって、
前記(a)および(b)を構成するアミノ酸の側鎖の全てが未保護である、
製造方法。 - 請求項16〜18のいずれか1項に記載のペプチドの製造方法であって、
糖鎖付加ペプチドの製造方法である
ことを特徴とする、
製造方法。 - 請求項19に記載のペプチドの製造方法であって、
前記ペプチドチオエステルは、糖鎖付加ペプチドチオエステルである、
製造方法。 - 請求項19に記載のペプチドの製造方法であって、
前記「補助基がそのN末端に導入されたアミノ酸またはペプチド」は、補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加アミノ酸または糖鎖付加ペプチドである、
製造方法。 - 請求項21に記載のペプチドの製造方法であって、
前記「補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加アミノ酸」は、前記補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加Asn、糖鎖付加Ser、糖鎖付加Thr、糖鎖付加Hylおよび糖鎖付加Hypよりなる群から選択される、
製造方法。 - 請求項23に記載のペプチドの製造方法であって、
前記アミノ酸Xは、Xは、Asn、Ser、ThrおよびHylよりなる群から選択される、
製造方法。 - ペプチドの製造方法であって、
(AA)ペプチドチオエステル、および
(BB)アミノチオアシッドまたはペプチドチオアシッド
を縮合させて、ペプチドを得る工程を含み、
ここで、前記(AA)および(BB)を構成するアミノ酸の側鎖の少なくとも一部が未保護である、
ことを特徴とする、
製造方法。 - 請求項26に記載のペプチドの製造方法であって、
前記(AA)および(BB)を構成するアミノ酸の側鎖の全てが未保護である、
製造方法。 - 請求項26または27に記載のペプチドの製造方法であって、
糖鎖付加ペプチドの製造方法である
ことを特徴とする、
製造方法。 - 請求項28に記載のペプチドの製造方法であって、
前記ペプチドチオエステルは、糖鎖付加ペプチドチオエステルである、
製造方法。 - 請求項28に記載のペプチドの製造方法であって、
前記アミノチオアシッドもしくはまたはペプチドチオアシッドは、糖鎖付加アミノチオアシッドまたは糖鎖付加ペプチドチオアシッドである、
製造方法。 - 請求項30に記載のペプチドの製造方法であって、
前記糖鎖付加アミノチオアシッドは、Asn、Ser、Thr、HylまたはHypよりなる群から選択される糖鎖付加アミノ酸のチオアシッドである、
製造方法。 - 請求項30に記載のペプチドの製造方法であって、
前記糖鎖付加ペプチドチオアシッド中の糖鎖付加アミノ酸は、Asn、Ser、Thr、HylまたはHypよりなる群から選択される糖鎖付加アミノ酸である、
製造方法。 - 請求項30または32に記載のペプチドの製造方法であって、
前記糖鎖付加ペプチドチオアシッドは、糖鎖付加アミノチオアシッドと、側鎖に前記糖鎖付加アミノチオアシッド中のチオ酸基(−SH)とジスルフィド結合を形成し得る修飾基を有するシステインをそのN末端に有するペプチドとを反応させ、反応後のペプチドのC末端にチオ酸基を導入することにより得られたものである、
製造方法。 - 請求項35に記載のペプチドの製造方法であって、
前記Xは、アリールである、
製造方法。 - 請求項35または36に記載のペプチドの製造方法であって、
前記(aa)および(bb)を構成するアミノ酸の側鎖の全てが未保護である、
製造方法。 - 請求項35〜37のいずれか1項に記載のペプチドの製造方法であって、
糖鎖付加ペプチドの製造方法である
ことを特徴とする、
製造方法。 - 請求項38に記載のペプチドの製造方法であって、
前記ペプチドチオエステルは、糖鎖付加ペプチドチオエステルである、
製造方法。 - 請求項38に記載のペプチドの製造方法であって、
前記「補助基がそのN末端に導入されたアミノ酸またはペプチド」は、補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加アミノ酸または糖鎖付加ペプチドである、
製造方法。 - 請求項40に記載のペプチドの製造方法であって、
前記「補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加アミノ酸」は、前記補助基がそのN末端に導入された糖鎖付加Asn、糖鎖付加Ser、糖鎖付加Thr、糖鎖付加Hylおよび糖鎖付加Hypよりなる群から選択される、
製造方法。 - 請求項42に記載のペプチドの製造方法であって、
前記アミノ酸Xは、Xは、Asn、Ser、ThrおよびHylよりなる群から選択される、
製造方法。 - 請求項45に記載の糖鎖付加アミノ酸であって、
前記アミノ酸Xは、Xは、Asn、Ser、ThrおよびHylよりなる群から選択される、
糖鎖付加アミノ酸。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2023077093A JP2023100883A (ja) | 2018-11-30 | 2023-05-09 | ペプチドチオエステル、ペプチドの新規製造方法 |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2018226094 | 2018-11-30 | ||
JP2018226094 | 2018-11-30 | ||
PCT/JP2019/008381 WO2020110330A1 (ja) | 2018-11-30 | 2019-03-04 | ペプチドチオエステル、ペプチドの新規製造方法 |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2023077093A Division JP2023100883A (ja) | 2018-11-30 | 2023-05-09 | ペプチドチオエステル、ペプチドの新規製造方法 |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPWO2020110330A1 true JPWO2020110330A1 (ja) | 2021-10-21 |
JPWO2020110330A5 JPWO2020110330A5 (ja) | 2022-01-26 |
JP7281826B2 JP7281826B2 (ja) | 2023-05-26 |
Family
ID=70852749
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2020557536A Active JP7281826B2 (ja) | 2018-11-30 | 2019-03-04 | ペプチドチオエステル、ペプチドの新規製造方法 |
JP2023077093A Pending JP2023100883A (ja) | 2018-11-30 | 2023-05-09 | ペプチドチオエステル、ペプチドの新規製造方法 |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2023077093A Pending JP2023100883A (ja) | 2018-11-30 | 2023-05-09 | ペプチドチオエステル、ペプチドの新規製造方法 |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20230143844A1 (ja) |
JP (2) | JP7281826B2 (ja) |
KR (1) | KR20210098466A (ja) |
CA (1) | CA3121437A1 (ja) |
WO (1) | WO2020110330A1 (ja) |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2292724A1 (en) * | 1997-06-13 | 1998-12-17 | Gryphon Sciences | Solid phase native chemical ligation of unprotected or n-terminal cysteine protected peptides in aqueous solution |
-
2019
- 2019-03-04 CA CA3121437A patent/CA3121437A1/en active Pending
- 2019-03-04 KR KR1020217017591A patent/KR20210098466A/ko not_active Application Discontinuation
- 2019-03-04 US US17/298,125 patent/US20230143844A1/en active Pending
- 2019-03-04 JP JP2020557536A patent/JP7281826B2/ja active Active
- 2019-03-04 WO PCT/JP2019/008381 patent/WO2020110330A1/ja active Application Filing
-
2023
- 2023-05-09 JP JP2023077093A patent/JP2023100883A/ja active Pending
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
ANGEWANDTE CHEMIE INTERNATIONAL EDITION, vol. 55, JPN6022052971, 2016, pages 10363 - 10367, ISSN: 0004944659 * |
PEPTIDE SCIENCE, vol. 2008, JPN6022052969, 2009, pages 175 - 176, ISSN: 0004944657 * |
ROYAL SOCIETY OPEN SCIENCE, vol. 5, JPN6022052970, 20 June 2018 (2018-06-20), pages 172455 - 1, ISSN: 0004944658 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2023100883A (ja) | 2023-07-19 |
WO2020110330A1 (ja) | 2020-06-04 |
JP7281826B2 (ja) | 2023-05-26 |
US20230143844A1 (en) | 2023-05-11 |
CA3121437A1 (en) | 2020-06-04 |
KR20210098466A (ko) | 2021-08-10 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US20160002286A1 (en) | Chemical preparation of ubiquitin thioesters and modifications thereof | |
JP2009533328A (ja) | グリコペプチドの調製法 | |
EP3004134B1 (en) | Peptide ligation | |
JP7281826B2 (ja) | ペプチドチオエステル、ペプチドの新規製造方法 | |
EP1631597A2 (en) | Displaceable linker solid phase chemical ligation | |
JP6321542B2 (ja) | タンパク質の合成方法 | |
Ma et al. | Postligation-desulfurization: a general approach for chemical protein synthesis | |
EP4204434A1 (en) | An improved process for fmoc synthesis of etelcalcetide | |
US9127041B2 (en) | Process for production of peptide thioester | |
US8981049B2 (en) | Aziridine mediated native chemical ligation | |
JP2004508383A (ja) | 拡張天然型化学的ライゲーション | |
JP2013533254A (ja) | ペプチド合成で使用するための化合物 | |
JP7067798B2 (ja) | アミノ酸ポリマーの製造方法 | |
Wang | Chemical Synthesis of Homogeneous Glycoprotein Mimetics | |
US8895696B1 (en) | Methods for forming peptides and peptide conjugates and peptides and peptide conjugates compositions formed thereby | |
Raz | Development of a tert-butyl thiol linker for the synthesis of peptide thioesters and thioacids for application in chemical ligation methods |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A80 | Written request to apply exceptions to lack of novelty of invention |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A801 Effective date: 20210518 |
|
A80 | Written request to apply exceptions to lack of novelty of invention |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A80 Effective date: 20210518 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20220118 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20220118 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20221214 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20230123 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20230410 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20230509 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7281826 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |