JPWO2019186999A1 - イメージングデータ処理装置及びイメージングデータ処理プログラム - Google Patents
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Abstract
Description
しかしながら、こうした方法を用いて複数の画像のうちの一つ又は複数を変形させて位置合わせを行っても、次のような問題があった。
a)処理対象である複数のイメージングデータに基づいて生成された複数の画像の中の一つを基準として、それぞれ得られた一又は複数の試料について同じ又は互いに類似している部位が一致するように、前記基準とされた画像以外の他の画像における各微小領域の位置の移動を伴う変形処理を行う画像位置合わせ処理部と、
b)前記画像位置合わせ処理部において基準とされた画像上又は前記画像位置合わせ処理部において変形された画像の中の一つの画像上で、ユーザに関心領域を設定させる関心領域設定受付部と、
c)前記画像位置合わせ処理部による処理後の複数の画像及び基準とされた画像の中で前記関心領域設定受付部において関心領域が設定された画像を除く他の画像において、該画像位置合わせ処理部による処理の際に移動された微小領域の中心点が前記関心領域設定受付部により設定された関心領域の枠内に存在する微小領域が該関心領域に含まれる微小領域であるとみなすことにより、各画像において関心領域に含まれる微小領域を決定する関心領域対応微小領域決定部と、
を備えることを特徴としている。
a)処理対象である複数のイメージングデータに基づいて生成された複数の画像の中の一つを基準として、それぞれ得られた一又は複数の試料について同じ又は互いに類似している部位が一致するように、前記基準とされた画像以外の他の画像における各微小領域の位置の移動を伴う変形処理を行う画像位置合わせ処理機能部と、
b)前記画像位置合わせ処理機能部において基準とされた画像上又は前記画像位置合わせ処理機能部において変形された画像の中の一つの画像上で、ユーザに関心領域を設定させる関心領域設定受付機能部と、
c)前記画像位置合わせ処理機能部による処理後の複数の画像及び基準とされた画像の中で前記関心領域設定受付機能部において関心領域が設定された画像を除く他の画像において、該画像位置合わせ処理機能部による処理の際に移動された微小領域の中心点が前記関心領域設定受付機能部により設定された関心領域の枠内に存在する微小領域が該関心領域に含まれる微小領域であるとみなすことにより、各画像において関心領域に含まれる微小領域を決定する関心領域対応微小領域決定機能部と、
して動作させることを特徴としている。
a)処理対象である複数のイメージングデータに基づいて生成された複数の画像の中の一つを基準として、それぞれ得られた一又は複数の試料について同じ又は互いに類似している部位が一致するように、前記基準とされた画像以外の他の画像における各微小領域の位置の移動を伴う変形処理を行う画像位置合わせ処理部と、
b)前記画像位置合わせ処理部において基準とされた画像上又は前記画像位置合わせ処理部において変形された画像の中の一つの画像上で、ユーザに関心領域を設定させる関心領域設定受付部と、
c)前記画像位置合わせ処理部による処理後の複数の画像及び基準とされた画像の中で前記関心領域設定受付部において関心領域が設定された画像を除く他の画像において、前記関心領域設定受付部により設定された関心領域に相当する関心領域の枠内では、前記関心領域が設定された画像上で前記関心領域設定受付部により設定された関心領域の枠内に存在する微小領域の中心点に対応する位置におけるデータ値を、前記画像位置合わせ処理部による処理の際に移動された複数の微小領域の中心点の位置におけるデータ値を用いた補間処理により算出し、その算出されたデータ値を前記関心領域が設定された画像を除く他の画像上の関心領域に含まれる仮想的な各微小領域のデータ値として採用する関心領域内データ値演算部と、
を備えることを特徴としている。
a)処理対象である複数のイメージングデータに基づいて生成された複数の画像の中の一つを基準として、それぞれ得られた一又は複数の試料について同じ又は互いに類似している部位が一致するように、前記基準とされた画像以外の他の画像における各微小領域の位置の移動を伴う変形処理を行う画像位置合わせ処理機能部と、
b)前記画像位置合わせ処理機能部において基準とされた画像上又は前記画像位置合わせ処理機能部において変形された画像の中の一つの画像上で、ユーザに関心領域を設定させる関心領域設定受付機能部と、
c)前記画像位置合わせ処理機能部による処理後の複数の画像及び基準とされた画像の中で前記関心領域設定受付機能部において関心領域が設定された画像を除く他の画像において、前記関心領域設定受付機能部により設定された関心領域に相当する関心領域の枠内では、前記関心領域が設定された画像上で前記関心領域設定受付機能部により設定された関心領域の枠内に存在する微小領域の中心点に対応する位置におけるデータ値を、前記画像位置合わせ処理機能部による処理の際に移動された複数の微小領域の中心点の位置におけるデータ値を用いた補間処理により算出し、その算出されたデータ値を前記関心領域が設定された画像を除く他の画像上の関心領域に含まれる仮想的な各微小領域のデータ値として採用する関心領域内データ値演算機能部と、
して動作させることを特徴としている。
a)処理対象である複数のイメージングデータに基づいて生成された複数の画像の中の一つを基準として、それぞれ得られた一又は複数の試料について同じ又は互いに類似している部位が一致するように、前記基準とされた画像以外の他の画像における各微小領域の位置の移動を伴う変形処理を行う画像位置合わせ処理部と、
b)前記画像位置合わせ処理部において変形された画像の中でユーザにより選択された一つの画像を所定の微小範囲に区切り、各微小領域の中心点に対応するデータ値を、前記画像位置合わせ処理部による変形処理の際に移動された複数の微小領域の中心点の位置におけるデータ値を用いた補間処理により算出し、該補間処理により算出されたデータ値に基づく画像を表示して該画像上でユーザに関心領域を設定させる関心領域設定受付部と、
c)前記画像位置合わせ処理部による処理後の複数の画像及び基準とされた画像の中で前記関心領域設定受付部において関心領域が設定された画像を除く他の画像において、少なくとも前記画像位置合わせ処理部により変形処理がなされた画像については画像毎に、前記関心領域設定受付部により設定された関心領域に相当する関心領域の枠内において、前記関心領域が設定された画像上で前記関心領域設定受付部により設定された関心領域の枠内に存在する微小領域の中心点に対応する位置におけるデータ値を、前記画像位置合わせ処理部による処理の際に移動された複数の微小領域の中心点の位置におけるデータ値を用いた補間処理により算出し、その算出されたデータ値を各画像上の関心領域に含まれる仮想的な各微小領域のデータ値として採用する関心領域内データ値演算部と、
を備えることを特徴としている。
a)処理対象である複数のイメージングデータに基づいて生成された複数の画像の中の一つを基準として、それぞれ得られた一又は複数の試料について同じ又は互いに類似している部位が一致するように、前記基準とされた画像以外の他の画像における各微小領域の位置の移動を伴う変形処理を行う画像位置合わせ処理機能部と、
b)前記画像位置合わせ処理機能部において変形された画像の中でユーザにより選択された一つの画像を所定の微小範囲に区切り、各微小領域の中心点に対応するデータ値を、前記画像位置合わせ処理機能部による変形処理の際に移動された複数の微小領域の中心点の位置におけるデータ値を用いた補間処理により算出し、該補間処理により算出されたデータ値に基づく画像を表示して該画像上でユーザに関心領域を設定させる関心領域設定受付機能部と、
c)前記画像位置合わせ処理機能部による処理後の複数の画像及び基準とされた画像の中で前記関心領域設定受付機能部において関心領域が設定された画像を除く他の画像において、少なくとも前記画像位置合わせ処理機能部により変形処理がなされた画像については画像毎に、前記関心領域設定受付機能部により設定された関心領域に相当する関心領域の枠内において、前記関心領域が設定された画像上で前記関心領域設定受付機能部により設定された関心領域の枠内に存在する微小領域の中心点に対応する位置におけるデータ値を、前記画像位置合わせ処理機能部による処理の際に移動された複数の微小領域の中心点の位置におけるデータ値を用いた補間処理により算出し、その算出されたデータ値を各画像上の関心領域に含まれる仮想的な各微小領域のデータ値として採用する関心領域内データ値演算機能部と、
して動作させることを特徴としている。
以下、本発明に係るイメージングデータ処理装置を用いたイメージング質量分析装置の一実施例について、添付図面を参照して説明する。
イメージング質量分析部1は例えばマトリクス支援レーザ脱離イオン化イオントラップ飛行時間型質量分析装置(MALDI−IT−TOFMS)を含み、生体組織切片などの試料6上の2次元的な測定領域内の多数の測定点それぞれについてのマススペクトルデータ(又はnが2以上のMSnスペクトルデータ)を取得する。光学顕微観察部2は同じ試料6上の少なくとも測定領域を含む範囲の光学顕微画像を取得するものである。
本発明に係るイメージングデータ処理装置を用いたイメージング質量分析装置の別の実施例について、添付図面を参照して説明する。図6は第2実施例のイメージング質量分析装置の要部の構成図、図7は第2実施例のイメージング質量分析装置における関心領域設定処理の説明図である。
図6において、図1に示した第1実施例のイメージング質量分析装置と同じ構成要素には同じ符号を付している。この第2実施例のイメージング質量分析装置は第1実施例のイメージング質量分析装置とほぼ同じ構成要素を有するが、データ処理部3が中心点データ値補間演算部301を有する点が第1実施例と相違する。この相違点を中心に、第2実施例のイメージング質量分析装置の特徴的な動作について説明する。
上記第1、第2実施例では、MSイメージング画像の位置合わせのために光学顕微画像の位置合わせにより取得した画像変形情報を用いたが、これはMSイメージング画像上で観測される分布のパターンでは十分な位置合わせが難しいことが多いためである。したがって、複数のMSイメージング画像上で観測される分布のパターンで十分な位置合わせが可能である場合には、あえて光学顕微画像の位置合わせにより取得した画像変形情報を用いる必要はないし、図2におけるステップS2、S3の処理自体が不要である。
2…光学顕微観察部
3…データ処理部
30…データ格納部
31…光学画像作成部
32…MSイメージング画像作成部
33…光学画像位置合わせ処理部
34…画像変形情報記憶部
35…MSイメージング画像位置合わせ処理部
36…関心領域設定部
37…関心領域内微小領域決定部
38…解析処理部
39…表示処理部
301…中心点データ値補間演算部
4…操作部
5…表示部
6…試料
Claims (6)
- 試料上の2次元的な測定領域内の複数の微小領域においてそれぞれ所定の分析又は観察を行うことで得られたデータの集合であるイメージングデータを処理するものであり、観察対象である部位が同じ又は互いに類似している複数の試料についてそれぞれ得られたイメージングデータ、又は、観察対象である部位が同じである一つの試料について異なる分析又は観察手法で得られた若しくは異なるパラメータの下で得られたイメージングデータを処理するイメージングデータ処理装置において、
a)処理対象である複数のイメージングデータに基づいて生成された複数の画像の中の一つを基準として、それぞれ得られた一又は複数の試料について同じ又は互いに類似している部位が一致するように、前記基準とされた画像以外の他の画像における各微小領域の位置の移動を伴う変形処理を行う画像位置合わせ処理部と、
b)前記画像位置合わせ処理部において基準とされた画像上又は前記画像位置合わせ処理部において変形された画像の中の一つの画像上で、ユーザに関心領域を設定させる関心領域設定受付部と、
c)前記画像位置合わせ処理部による処理後の複数の画像及び基準とされた画像の中で前記関心領域設定受付部において関心領域が設定された画像を除く他の画像において、該画像位置合わせ処理部による処理の際に移動された微小領域の中心点が前記関心領域設定受付部により設定された関心領域の枠内に存在する微小領域が該関心領域に含まれる微小領域であるとみなすことにより、各画像において関心領域に含まれる微小領域を決定する関心領域対応微小領域決定部と、
を備えることを特徴とするイメージングデータ処理装置。 - 試料上の2次元的な測定領域内の複数の微小領域においてそれぞれ所定の分析又は観察を行うことで得られたデータの集合であるイメージングデータを処理するものであり、観察対象である部位が同じ又は互いに類似している複数の試料についてそれぞれ得られたイメージングデータ、又は、観察対象である部位が同じである一つの試料について異なる分析又は観察手法で得られた若しくは異なるパラメータの下で得られたイメージングデータを処理するイメージングデータ処理装置において、
a)処理対象である複数のイメージングデータに基づいて生成された複数の画像の中の一つを基準として、それぞれ得られた一又は複数の試料について同じ又は互いに類似している部位が一致するように、前記基準とされた画像以外の他の画像における各微小領域の位置の移動を伴う変形処理を行う画像位置合わせ処理部と、
b)前記画像位置合わせ処理部において基準とされた画像上又は前記画像位置合わせ処理部において変形された画像の中の一つの画像上で、ユーザに関心領域を設定させる関心領域設定受付部と、
c)前記画像位置合わせ処理部による処理後の複数の画像及び基準とされた画像の中で前記関心領域設定受付部において関心領域が設定された画像を除く他の画像において、前記関心領域設定受付部により設定された関心領域に相当する関心領域の枠内では、前記関心領域が設定された画像上で前記関心領域設定受付部により設定された関心領域の枠内に存在する微小領域の中心点に対応する位置におけるデータ値を、前記画像位置合わせ処理部による処理の際に移動された複数の微小領域の中心点の位置におけるデータ値を用いた補間処理により算出し、その算出されたデータ値を前記関心領域が設定された画像を除く他の画像上の関心領域に含まれる仮想的な各微小領域のデータ値として採用する関心領域内データ値演算部と、
を備えることを特徴とするイメージングデータ処理装置。 - 試料上の2次元的な測定領域内の複数の微小領域においてそれぞれ所定の分析又は観察を行うことで得られたデータの集合であるイメージングデータを処理するものであり、観察対象である部位が同じ又は互いに類似している複数の試料についてそれぞれ得られたイメージングデータ、又は、観察対象である部位が同じである一つの試料について異なる分析又は観察手法で得られた若しくは異なるパラメータの下で得られたイメージングデータを処理するイメージングデータ処理装置において、
a)処理対象である複数のイメージングデータに基づいて生成された複数の画像の中の一つを基準として、それぞれ得られた一又は複数の試料について同じ又は互いに類似している部位が一致するように、前記基準とされた画像以外の他の画像における各微小領域の位置の移動を伴う変形処理を行う画像位置合わせ処理部と、
b)前記画像位置合わせ処理部において変形された画像の中でユーザにより選択された一つの画像を所定の微小範囲に区切り、各微小領域の中心点に対応するデータ値を、前記画像位置合わせ処理部による変形処理の際に移動された複数の微小領域の中心点の位置におけるデータ値を用いた補間処理により算出し、該補間処理により算出されたデータ値に基づく画像を表示して該画像上でユーザに関心領域を設定させる関心領域設定受付部と、
c)前記画像位置合わせ処理部による処理後の複数の画像及び基準とされた画像の中で前記関心領域設定受付部において関心領域が設定された画像を除く他の画像において、少なくとも前記画像位置合わせ処理部により変形処理がなされた画像については画像毎に、前記関心領域設定受付部により設定された関心領域に相当する関心領域の枠内において、前記関心領域が設定された画像上で前記関心領域設定受付部により設定された関心領域の枠内に存在する微小領域の中心点に対応する位置におけるデータ値を、前記画像位置合わせ処理部による処理の際に移動された複数の微小領域の中心点の位置におけるデータ値を用いた補間処理により算出し、その算出されたデータ値を各画像上の関心領域に含まれる仮想的な各微小領域のデータ値として採用する関心領域内データ値演算部と、
を備えることを特徴とするイメージングデータ処理装置。 - 試料上の2次元的な測定領域内の複数の微小領域においてそれぞれ所定の分析又は観察を行うことで得られたデータの集合であるイメージングデータを処理するものであり、観察対象である部位が同じ又は互いに類似している複数の試料についてそれぞれ得られたイメージングデータ、又は、観察対象である部位が同じである一つの試料について異なる分析又は観察手法で得られた若しくは異なるパラメータの下で得られたイメージングデータを処理するイメージングデータ処理プログラムであって、コンピュータを、
a)処理対象である複数のイメージングデータに基づいて生成された複数の画像の中の一つを基準として、それぞれ得られた一又は複数の試料について同じ又は互いに類似している部位が一致するように、前記基準とされた画像以外の他の画像における各微小領域の位置の移動を伴う変形処理を行う画像位置合わせ処理機能部と、
b)前記画像位置合わせ処理機能部において基準とされた画像上又は前記画像位置合わせ処理機能部において変形された画像の中の一つの画像上で、ユーザに関心領域を設定させる関心領域設定受付機能部と、
c)前記画像位置合わせ処理機能部による処理後の複数の画像及び基準とされた画像の中で前記関心領域設定受付機能部において関心領域が設定された画像を除く他の画像において、該画像位置合わせ処理機能部による処理の際に移動された微小領域の中心点が前記関心領域設定受付機能部により設定された関心領域の枠内に存在する微小領域が該関心領域に含まれる微小領域であるとみなすことにより、各画像において関心領域に含まれる微小領域を決定する関心領域対応微小領域決定機能部と、
して動作させることを特徴とするイメージングデータ処理用プログラム。 - 試料上の2次元的な測定領域内の複数の微小領域においてそれぞれ所定の分析又は観察を行うことで得られたデータの集合であるイメージングデータを処理するものであり、観察対象である部位が同じ又は互いに類似している複数の試料についてそれぞれ得られたイメージングデータ、又は、観察対象である部位が同じである一つの試料について異なる分析又は観察手法で得られた若しくは異なるパラメータの下で得られたイメージングデータを処理するイメージングデータ処理プログラムであって、コンピュータを、
a)処理対象である複数のイメージングデータに基づいて生成された複数の画像の中の一つを基準として、それぞれ得られた一又は複数の試料について同じ又は互いに類似している部位が一致するように、前記基準とされた画像以外の他の画像における各微小領域の位置の移動を伴う変形処理を行う画像位置合わせ処理機能部と、
b)前記画像位置合わせ処理機能部において基準とされた画像上又は前記画像位置合わせ処理機能部において変形された画像の中の一つの画像上で、ユーザに関心領域を設定させる関心領域設定受付機能部と、
c)前記画像位置合わせ処理機能部による処理後の複数の画像及び基準とされた画像の中で前記関心領域設定受付機能部において関心領域が設定された画像を除く他の画像において、前記関心領域設定受付機能部により設定された関心領域に相当する関心領域の枠内では、前記関心領域が設定された画像上で前記関心領域設定受付機能部により設定された関心領域の枠内に存在する微小領域の中心点に対応する位置におけるデータ値を、前記画像位置合わせ処理機能部による処理の際に移動された複数の微小領域の中心点の位置におけるデータ値を用いた補間処理により算出し、その算出されたデータ値を前記関心領域が設定された画像を除く他の画像上の関心領域に含まれる仮想的な各微小領域のデータ値として採用する関心領域内データ値演算機能部と、
して動作させることを特徴とするイメージングデータ処理用プログラム。 - 試料上の2次元的な測定領域内の複数の微小領域においてそれぞれ所定の分析又は観察を行うことで得られたデータの集合であるイメージングデータを処理するものであり、観察対象である部位が同じ又は互いに類似している複数の試料についてそれぞれ得られたイメージングデータ、又は、観察対象である部位が同じである一つの試料について異なる分析又は観察手法で得られた若しくは異なるパラメータの下で得られたイメージングデータを処理するイメージングデータ処理プログラムであって、コンピュータを、
a)処理対象である複数のイメージングデータに基づいて生成された複数の画像の中の一つを基準として、それぞれ得られた一又は複数の試料について同じ又は互いに類似している部位が一致するように、前記基準とされた画像以外の他の画像における各微小領域の位置の移動を伴う変形処理を行う画像位置合わせ処理機能部と、
b)前記画像位置合わせ処理機能部において変形された画像の中でユーザにより選択された一つの画像を所定の微小範囲に区切り、各微小領域の中心点に対応するデータ値を、前記画像位置合わせ処理機能部による変形処理の際に移動された複数の微小領域の中心点の位置におけるデータ値を用いた補間処理により算出し、該補間処理により算出されたデータ値に基づく画像を表示して該画像上でユーザに関心領域を設定させる関心領域設定受付機能部と、
c)前記画像位置合わせ処理機能部による処理後の複数の画像及び基準とされた画像の中で前記関心領域設定受付機能部において関心領域が設定された画像を除く他の画像において、少なくとも前記画像位置合わせ処理機能部により変形処理がなされた画像については画像毎に、前記関心領域設定受付機能部により設定された関心領域に相当する関心領域の枠内において、前記関心領域が設定された画像上で前記関心領域設定受付機能部により設定された関心領域の枠内に存在する微小領域の中心点に対応する位置におけるデータ値を、前記画像位置合わせ処理機能部による処理の際に移動された複数の微小領域の中心点の位置におけるデータ値を用いた補間処理により算出し、その算出されたデータ値を各画像上の関心領域に含まれる仮想的な各微小領域のデータ値として採用する関心領域内データ値演算機能部と、
して動作させることを特徴とするイメージングデータ処理プログラム。
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