JPWO2019140226A5 - - Google Patents
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- 対象における腫瘍の存在についてスクリーニングする方法であって、
ａ）前記対象からの生物学的サンプル中のウイルス由来の細胞フリー核酸の量を決定すること、
ｂ）（１）前記対象のベースライン年齢を上回る年齢、（２）前記対象の喫煙状態が喫煙者である、及び（３）サンプルが採取された日の周囲温度がベースライン温度を下回るからなる群から選択される属性に基づいて、あらかじめ決められたベースライン閾値よりも高い細胞フリー核酸の閾値を決定すること、及び
ｃ）前記ウイルス由来の細胞フリー核酸の前記量を前記閾値と比較し、それにより前記腫瘍について前記対象をスクリーニングすること
を含む方法。 - 前記閾値は、前記対象の前記喫煙状態に基づいて決定される、請求項１に記載の方法。
- 前記対象の前記喫煙状態が喫煙者である場合、前記閾値は、前記対象の前記喫煙状態が喫煙者でない場合よりも高く設定される、請求項２に記載の方法。
- 前記閾値は、前記対象の前記年齢に基づいて決定される、請求項１に記載の方法。
- 前記閾値は、対象年齢との正の相関を含む、請求項４に記載の方法。
- 前記閾値は、前記周囲温度に基づいて決定される、請求項１に記載の方法。
- 前記閾値は、周囲温度と負に相関される、請求項６に記載の方法。
- 前記周囲温度は、前記対象から前記サンプルが取得された位置から５０ｋｍ以内の位置で測定された温度である、請求項６に記載の方法。
- 前記周囲温度は、前記対象から前記サンプルが取得された日の平均周囲温度である、請求項６に記載の方法。
- 前記閾値は、前記対象の前記年齢及び前記対象の前記喫煙状態に基づいて決定される、請求項１に記載の方法。
- 前記閾値は、前記対象の前記年齢及び前記周囲温度に基づいて決定される、請求項１に記載の方法。
- 前記閾値は、前記対象の前記喫煙状態及び前記周囲温度に基づいて決定される、請求項１に記載の方法。
- 前記閾値は、前記対象の前記年齢、前記対象の前記喫煙状態及び前記周囲温度に基づいて決定される、請求項１に記載の方法。
- 前記閾値は、前記対象が糖尿病を有するか、アルコールを摂取するか、運動するか、高血圧症を有するか、高脂血症を有するか又は虚血性心疾患を有するかどうかに基づいて決定されない、請求項１に記載の方法。
- 前記ウイルス由来の細胞フリー核酸の前記量を、前記属性に基づく前記閾値と比較することは、細胞フリー核酸の前記量を、前記属性に基づかない閾値と比較することと比べて前記スクリーンの偽陽性率を低減する、請求項１に記載の方法。
- 前記量は、１ミリリットル当たりの前記ウイルス由来の細胞フリー核酸のコピー数（コピー／ｍＬ）を含む、請求項１に記載の方法。
- 前記生物学的サンプル中の前記ウイルス由来の細胞フリー核酸の前記量が前記閾値を上回る場合、前記腫瘍の存在について第２のスクリーンを実施することをさらに含む、請求項１に記載の方法。
- 前記第２のスクリーンは、第２の生物学的サンプル中の前記ウイルス由来の細胞フリー核酸のサイズを決定することを含む、請求項１７に記載の方法。
- 前記第２の生物学的サンプルは、前記生物学的サンプルと同一である、請求項１８に記載の方法。
- 前記第２の生物学的サンプルは、前記生物学的サンプルと異なる、請求項１８に記載の方法。
- 前記第２のスクリーンは、前記ウイルスに由来し、且つ所与の範囲内のサイズを有する細胞フリー核酸の量を、前記対象からの前記第２の生物学的サンプルから決定することを含む、請求項１８に記載の方法。
- 前記ウイルスに由来し、且つ所与の範囲内のサイズを有する前記細胞フリー核酸の前記量を決定することは、前記第２の生物学的サンプル中の前記細胞フリー核酸の大規模並列シーケンシングを行って、配列リードを生成することを含む、請求項２１に記載の方法。
- 前記生物学的サンプルは、血漿又は血清を含む、請求項１に記載の方法。
- 前記量を決定することは、前記細胞フリー核酸の増幅を含む、請求項１に記載の方法。
- 前記増幅は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を含む、請求項２４に記載の方法。
- 前記ＰＣＲは、定量ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）を含む、請求項２５に記載の方法。
- 前記腫瘍は、鼻咽頭がんである、請求項１～２６のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ウイルスは、エプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）である、請求項１～２６のいずれか一項に記載の方法。
- 請求項１～２６のいずれか一項に記載の方法の操作を実施するようにコンピューターシステムを制御するための複数の命令を記憶するコンピューター可読媒体を含むコンピューター製品。
- 請求項２９に記載のコンピューター製品と、前記コンピューター可読媒体に記憶された命令を実行するための１つ以上のプロセッサーとを含むシステム。
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