JPS59224566A - 腫瘍ゲンに関連する再配列dna断片の検出方法 - Google Patents

腫瘍ゲンに関連する再配列dna断片の検出方法

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JPS59224566A
JPS59224566A JP59032717A JP3271784A JPS59224566A JP S59224566 A JPS59224566 A JP S59224566A JP 59032717 A JP59032717 A JP 59032717A JP 3271784 A JP3271784 A JP 3271784A JP S59224566 A JPS59224566 A JP S59224566A
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dna
fragment
sample
tumor gene
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JP59032717A
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フイリツプ・レダ−
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    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
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    • C12Q2600/156Polymorphic or mutational markers

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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 本発明は腫瘍ゲンに関連する再配列DNA断片の検出に
関し、一層詳細には、該検出に用いるプローフニ関する
。かかる再配列を検出することに原因となる構成的に再
配列した腫瘍ゲンを検出するのにも有用である。
バーキットリンパ腫や慢性の骨髄性白血病等の咄乳動物
の癌における悪性細胞の多くは、再配列或は転座染色体
が存在し、かかる染色体の一部(バーキットリンパ腫の
場合、転座腫瘍ゲンはmyc遺伝子として知られている
)はその正常な染色体位置により抗体分子の2つのタン
白質鎖の内の重い方に暗号規定する範囲に移動すること
が報告された。サイエンス、′!18巻、983−98
5(1982)lアダムス等、Proe 、Natl、
Aead。
5c10合衆国、79巻、6966−6970(198
2)。
ある種の染色体転座は、特定のヒトやネズミ(murl
ne )  の白血病及びリンパ腫に極めて特有のもの
であるから、該染色体転座の発生はこれらの細胞の悪性
形質転換に不可欠であると考えられる。これについては
、「ネーチャー」294巻、513−518(1981
)にフレインにより、及び「サイエンス」216巻、7
49−’751(1982)にローリ−により指摘され
ている。
ヒトのバーキットリンパ腫やネズミの形質細胞腫細胞で
は、これらの転座は、免疫グロブリン(Ig)遺伝子が
配Wぎれる染色体を含むと述べられてきた。事実、ヒト
では、これらの転座は免疫グロブリン遺伝子を暗号化す
るそれらの染色体セグメントを正確に含む(即ち、バー
キットリンパ腫では、相互側Wくは8q24及び14q
52(Ig)()、2p15(k)又は22(111(
λ)を含む)。
鳥類のMC−29ウイルス性形質転換遺伝子の同族体で
あるヒ)c−myc遺伝子を染色体8の横じま(バンド
)q24、即ち特有のバーキット転座についてのブレー
クポイントに置き、かつe−m)reを含有するか或は
e−In7eに関連するDNA断片をバーキット細胞系
において再配置することがしばしばある。バーキットリ
ンパ腫細胞の全′Cが再配列を表示するわけではないが
、かかる再配列を示すものが事実悪性であることは確か
である。
本発明は、試料細胞及び正常対照細胞からのDNAを固
体支持体に固定させ、該固定DNAを、悪性細胞中で染
色体再配列を受ける標MDNA断片で雑種形成させて該
試料細胞中に再配列が存在するか否かを決定することか
ら成る生物学的試料中の悪性細胞の同定方法から成る。
再配列されるDNA断片、即ちヒ)c−myc断片を、
鳥類のv−myc遺伝子(2,8Kb Bam H1断
片)でふるい分けされた無作為のヒトの胚肝ライブラリ
ーから誘導し、かつり胃−ンを発生させた。
t5Kbs@t1断片をサブクローン化し、適当な制限
酵素消化、ブ四ツ) (blot )  雑種形成、ヘ
テロ〜複式遺伝地図作製(mapping )によって
表示してAluシーケンスを無くし、かつMC29V 
−mye遺伝子の5′位へのプローグ相同によって決ま
るようなc−’mye遺伝子の51位を表わした。
このサブクレーンをSst 1で消化し、1.5Kb挿
入物をプラスミドシーケンスから分離した。t5Kb断
片を従来方法によって32pで椋鎗して雑種形成プロー
ブとして用いた。i、5Kb断片を含有するプラスミド
をアメリカンタイプカルチャーコレクションに寄託し、
1913!1年1月51日付でATCC番号39286
としてS詔されている。
プローブを用いて悪性の細胞を検出する場合には、被検
査細胞の試料、例えは生体標本或は血液標本等を溶解し
て、DNAを抽出し、制限エンドヌクレアーゼで消化し
、アガロース中で電気泳動させて断片を分離し、かつ細
JJQ D N A断片を従来方法によって固体支持拐
上に固定させる。次に、固定されたDNA試料を標HD
Nh断片プローブで雑種形成検定させる。対照と同じ位
置のみならず更に再配列或は転座した位置においても同
様に雑種形成を示すそれらの試料は忍性である。
実施例 キーチャー298巻、474−6(1982)にルノア
ール等によって記載されるようなヒトバーキットリンパ
)庫細胞糸の12種の異る菌株をフランス、リヨン、イ
ンターナシミナルエージェンシーフオーリサーチオンキ
ャンサーから得、かつ各菌株からのゲノムDNAをネー
チャー294巻、556−540(1981)にヒータ
ー等によって説明されるように調製した。使用した細胞
系及び各細胞系における染色体転座は次の通りであった
: BL22(8114)BL!11(8+14)+R
aji(8+14)tseraphina(814)+
BL42(8+14)+Ly65 (8q−)tBJA
B(無し)+JBL2(8+2)+Ly66(8+2)
+BL2(8+22)、正常なヒトの白血球を対照とし
て用いた。
各DNA検体を制限エンドヌクレアーゼEeoR1で消
化し、0.8%アガロースゲル中で電気泳動にかけて断
片を分離した。分離された断片を、次に、アルカリ水溶
液で変性し、ゲル帯(5trIp )からニトロセルロ
ースろ紙に移し、JoMolec、Blol。
28巻、505−517(1975)、サザーン記載の
ように減圧中で焼いてろ過帯(’ fllter 5t
r1p )の上に固定させた。次に、各検体を、ホルム
アミド40%及び5x 5SC(SSCは塩化すトリウ
ム0・15M水溶液、クエン酸ナトリウム0.15 M
水溶液)を含有する標識プローブの溶液で47℃におい
て8時間雑種形成させ、D、1%SDS (ナトリウム
ドデシルスルフェート)を含有する01SSCで洗浄し
、特異結合されたり或は雑種形成されたプルーブのすべ
てを除き、かつオートラジオグラフィーを行わせる。
正常のヒト対照を含む全ての検体は、プローブの再配列
しないc−mycの対立コピーに相当する1 2、5 
Kb gco R1断片への雑種形成を示した。
加えて、プローブはBL22 、 Bl、51 、E員
ji、Ly65及びJBL2中のこの遺伝子のその他の
対立コピーの再配列を表わす別の帯を検出した。同じ細
胞系からの他のDNA検体を、制限内ヌクレアーゼBa
mH1がEeo R1に1itき換えた以外は同じ方法
で処理した。この方法はRajl、BL22、Ly65
(1)再配列を確認し、かつ加えて5erILphin
a及びBL42の再配列を示すものであった。
腫瘍ゲンをDNA断片の転座によって再配列しえば慢性
の骨髄性白血病の悪性細胞の場合に得られる。
1□  4エ 憾゛) 一ノ′ 手続補正d4 昭和59年4月18日 特許庁長官 若 杉 和 夫 殿 事fl (1’)表示 昭和59年特 前箱32717
  弓補1;をする者 ’iJT件との関係           特許出願人
代理人 補正の対象 補正の内容  別紙の通り 1、 明a書4頁下から2行の「プローグ」を「プルー
ブJに訂正する。
2、 同7頁1行の「5×」を「5倍の」に訂正する。
3、 同同5行の「01」を70. I M Jに訂正
する。
4 同量下から5行の(−Bam H1が」を1Bam
H1を」に訂正する。

Claims (3)

    【特許請求の範囲】
  1. (1)試料細H3及び正常対照細胞からのDNAを固体
    支持体に固定させ、 該固定DNAを、悪性細胞中で染色体再配列を受けるD
    NAの標識断片で雑種形成させて該試料[J中に再配列
    が存在するか否かを決定することから成る生物学的試料
    中の腫瘍ゲンに関連する再配列DNA断片の検出方法。
  2. (2)前記細胞がヒト由来のものである特許請求の範囲
    第1項記載の方法。
  3. (3)前記悪性細胞がバーキットリンパ腫#17胞であ
    り、前記DNA断片がプラスミドATCC9号5928
    6からのt 5 Kb断片である特許請求の範囲第2項
    記載の方法。
JP59032717A 1983-02-25 1984-02-24 腫瘍ゲンに関連する再配列dna断片の検出方法 Pending JPS59224566A (ja)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US469797 1983-02-25
US06/469,797 US4542096A (en) 1983-02-25 1983-02-25 Detecting rearranged human c-myc DNA fragments associated with oncogenes

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JPS59224566A true JPS59224566A (ja) 1984-12-17

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JP59032717A Pending JPS59224566A (ja) 1983-02-25 1984-02-24 腫瘍ゲンに関連する再配列dna断片の検出方法

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EP (1) EP0117727A3 (ja)
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GR (1) GR81659B (ja)

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GR81659B (ja) 1984-12-12
EP0117727A2 (en) 1984-09-05
CA1214092A (en) 1986-11-18
EP0117727A3 (en) 1988-01-20
DK98584D0 (da) 1984-02-24
US4542096A (en) 1985-09-17
DK98584A (da) 1984-08-26

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