JPH11215987A - Tsa305遺伝子 - Google Patents

Tsa305遺伝子

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JPH11215987A
JPH11215987A JP10126803A JP12680398A JPH11215987A JP H11215987 A JPH11215987 A JP H11215987A JP 10126803 A JP10126803 A JP 10126803A JP 12680398 A JP12680398 A JP 12680398A JP H11215987 A JPH11215987 A JP H11215987A
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Abstract

(57)【要約】 【課題】特に膵臓癌の研究、診断、治療等の分野で有効
な新規な膵臓特異的遺伝子を提供。 【解決手段】配列番号:1で示されるアミノ酸配列の全
部又は一部をコードする塩基配列を含む膵臓特異的遺伝
子。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、膵臓に特異的に発
現している遺伝子TSA305、より詳しくは、線虫の
sel−1と高い相同性を有し、癌に対して抑制的に働
くと考えられる新規な膵臓特異的遺伝子に関する。また
本発明は、かかる遺伝子によってコードされる新規な蛋
白質及びその特異抗体にも関する。
【0002】
【従来の技術】膵臓癌は、日本人及び西側諸国の癌関連
死亡順位において4位及び5位を占める消化器系の悪性
腫瘍の中でも最も予後不良な癌のひとつである(Poston,
J. G., et al., Gut., 32, 800-812 (1991))。癌研究
における最も重要なゴールは、癌化に至る早期の遺伝子
変化を見分けることである。この変化の見極めは、早期
診断のための遺伝子的なツールの開発とこの致死的な疾
患をより効果的に治療するための新規な治療的アプロー
チとを導くことができる。
【0003】一方、線虫のsel−1遺伝子は、線虫に
おいて神経発生の際の外胚葉からニューロブラストへの
分化を抑制するNotch/lin−12に対して抑制
的に働くことが報告されている(Genetics, 143 (1), 2
37-247 (1996) : Development, 124 (3), 637-644 (199
7))。該Notch/lin−12は、その強制発現が
乳癌や白血病を惹起させるため、癌関連遺伝子と考えら
れており、該癌関連遺伝子の抑制的な働きをなす上記s
el−1遺伝子は、癌に対しても抑制的に働くとも考え
られるが、現在尚之等遺伝子の役割については明確に解
明されている訳ではない。
【0004】かかる遺伝子の生理的役割の解明とそれに
より得られる情報は、癌化や炎症等の疾患の発症機能の
解明に重要であり、これらは、基礎科学研究の分野はも
とより、医薬品分野においても癌や炎症等の疾患の解明
やその処置法等の開発面からも望まれているところであ
る。
【0005】
【発明が解決しようとする課題】本発明は、斯界で要望
される前記の情報、殊にsel−1遺伝子と相同性を有
する新規な蛋白相同物をコードする遺伝子を提供するこ
とを目的とする。
【0006】上記目的より、本発明者は、各種ヒト組織
由来の遺伝子につき検索を重ねた結果、該目的に合致す
る新しい膵臓特異的遺伝子の単離、同定に成功し、ここ
に本発明を完成するに至った。
【0007】
【課題を解決するための手段】即ち、本発明によれば、
以下の(a)及び(b)のいずれかの蛋白質をコードす
る塩基配列を含む遺伝子TSA305、特にヒト遺伝子
である当該遺伝子が提供される。
【0008】(a)配列番号:1で示されるアミノ酸配
列からなる蛋白質、(b)配列番号:1で示されるアミ
ノ酸配列において1又は複数のアミノ酸が欠失、置換又
は付加されたアミノ酸配列からなり、TSA305との
結合活性を有する蛋白質。
【0009】また、本発明によれば、上記の遺伝子によ
ってコードされるTSA305蛋白及びこれに結合性を
有する特異抗体が提供される。
【0010】更に、本発明によれば、以下の(a)及び
(b)のいずれかのポリヌクレオチドからなる遺伝子T
SA305、特にヒト遺伝子である当該遺伝子が提供さ
れる。
【0011】(a)配列番号:2で示される塩基配列の
全部又は一部を含むポリヌクレオチド、(b)配列番
号:2で示される塩基配列からなるDNAとストリンジ
ェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチ
ド。
【0012】加えて、本発明によれば、遺伝子検出用の
特異プローブ又は特異プライマーとして使用されるDN
A断片である上記遺伝子が提供される。
【0013】以下、本明細書におけるアミノ酸、ペプチ
ド、塩基配列、核酸等の略号による表示は、IUPAC
−IUBの規定〔IUPAC-IUB Communication on Biologi
calNomenclature, Eur. J. Biochem., 138: 9 (198
4)〕、「塩基配列又はアミノ酸配列を含む明細書等の作
成のためのガイドライン」(特許庁編)及び当該分野に
おける慣用記号に従うものとする。
【0014】
【発明の実施の形態】本発明遺伝子の一具体例として
は、後述する実施例に示される「TSA305」と名付
けられたPCR産物のDNA配列から演繹されるものを
挙げることができる。その塩基配列は、配列番号:2に
示されるとおりである。
【0015】該遺伝子は、配列番号:1に示される79
4アミノ酸配列の新規な膵臓特異的蛋白(TSA305
蛋白という)をコードするヒトcDNAであり、全長7
885塩基からなっている。
【0016】本発明遺伝子TSA305の発現産物であ
るTSA305蛋白は、FASTAプログラム(Person
W. R., et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA., 85,
2444-2448 (1988))を利用したGenBank/EMBLデーターベ
ースの検索の結果、線虫のsel−1遺伝子(前記文献
参照)と非常に高い相同性を有していることが確認され
た。このことから、本発明遺伝子は、胚発生の全般に関
わるとされている癌関連遺伝子Noctch/lin−
12に対して、上記sel−1と同様に、抑制的に働く
と考えられる。
【0017】また、本発明遺伝子の染色体上の位置は、
インスリン依存性糖尿病(IDDM)の原因遺伝子が存
在するとされる第14染色体q24.3−q31.1で
ある。このことから、本発明遺伝子は、糖尿病との関連
が強く示唆される。
【0018】更に、本発明遺伝子の遺伝子産物は、フィ
ブロネクチンTypeIIコラーゲン結合ドメインを含む
蛋白であることが明らかとなった。かかるN末端付近の
コラーゲン結合部位は線維化との関わりを示唆するもの
であり、このことから本発明遺伝子は、線維症との関連
も強く示唆される。
【0019】加えて、本発明遺伝子は、試験した膵癌標
本の全てにおいてその発現の欠失が認められ、主に正常
膵臓に発現することから、癌化における潜在的な予測の
価値を提言する。
【0020】従って、本発明に係わる遺伝子TSA30
5及びその遺伝子産物の提供は、上記乳癌、白血病、線
維症、糖尿病、膵癌等の各種疾患、殊に膵癌の解明、把
握、診断、予防及び治療等に極めて有用な情報乃至手段
を与える。また、本発明遺伝子は、上記各種疾患の処置
に利用される本発明遺伝子の発現を誘導する新規薬剤の
開発の上でも好適に利用できる。更に、個体或は組織に
おける本発明遺伝子の発現又はその産物の発現の検出
や、該遺伝子の変異(欠失や点変異)又は発現異常の検
出等は、上記疾患の解明や診断上において好適に利用で
きると考えられる。
【0021】本発明遺伝子は、具体的には配列番号:1
で示されるアミノ酸配列からなる蛋白質をコードする塩
基配列を含む遺伝子又は配列番号:2で示される塩基配
列の全部或は一部を含むポリヌクレオチドからなる遺伝
子として例示されるが、特にこれらに限定されることな
く、例えば、上記特定のアミノ酸配列において一定の改
変を有する遺伝子や上記特定の塩基配列と一定の相同性
を有する遺伝子であることができる。
【0022】即ち、本発明遺伝子には、配列番号1に示
されるアミノ酸配列において1又は複数のアミノ酸が欠
失、置換又は付加されたアミノ酸配列からなる蛋白質を
コードする塩基配列を含む遺伝子もまた包含される。こ
こで、「アミノ酸の欠失、置換又は付加」の程度及びそ
れらの位置等は、改変された蛋白質が、配列番号:1で
示されるアミノ酸配列からなる蛋白質と同様の機能を有
する同効物であれば特に制限されない。具体的には、T
SA305とのインビトロ結合活性を保持するものが挙
げられる。
【0023】尚、これらアミノ酸配列の改変(変異)等
は、天然において、例えば突然変異や翻訳後の修飾等に
より生じることもあるが、天然由来の遺伝子(例えば本
発明の具体例遺伝子)に基づいて人為的に改変すること
もできる。本発明は、このような改変・変異の原因及び
手段等を問わず、上記特性を有する全ての改変遺伝子を
包含するものである。
【0024】上記の人為的手段としては、例えばサイト
スペシフィック・ミュータゲネシス〔Methods in Enzym
ology, 154: 350, 367-382 (1987);同 100: 468 (198
3);Nucleic Acids Res., 12: 9441 (1984);続生化学
実験講座1「遺伝子研究法II」、日本生化学会編, p105
(1986)〕等の遺伝子工学的手法、リン酸トリエステル
法やリン酸アミダイト法等の化学合成手段〔J. Am. Che
m. Soc., 89: 4801 (1967);同91: 3350 (1969);Scien
ce, 150: 178 (1968);Tetrahedron Lett., 22:1859 (1
981);同24: 245 (1983)〕及びそれらの組合せ方法等が
例示できる。
【0025】本発明遺伝子のひとつの態様としては、配
列番号:2で示される塩基配列の全部或は一部を含むポ
リヌクレオチドからなる遺伝子を例示できるが、この塩
基配列は、上記アミノ酸配列(配列番号:1)の各アミ
ノ酸残基を示すコドンの一つの組合せ例でもあり、本発
明遺伝子はこれらに限らず、各アミノ酸残基に対して任
意のコドンを組合せ選択した塩基配列を有することも勿
論可能である。該コドンの選択は、常法に従うことがで
き、例えば利用する宿主のコドン使用頻度等を考慮する
ことができる〔Ncleic Acids Res., 9: 43 (1981)〕。
【0026】また、本発明遺伝子は、例えば配列番号:
2の具体例で示されるように、一本鎖DNAの塩基配列
として表示されるが、本発明はかかる塩基配列に相補的
な塩基配列からなるポリヌクレオオチドやこれらの両者
を含むコンポーネントも当然に包含するものであり、ま
た、cDNA等のDNAに限定されることもない。
【0027】更に、本発明の遺伝子は、前記のとおり、
配列番号:2に示される塩基配列の全部又は一部を含む
ポリヌクレオチドからなるものに限定されず、当該塩基
配列と一定の相同性を有する塩基配列からなるものも包
含するものである。かかる遺伝子としては、少なくと
も、下記に掲げるようなストリンジェントな条件下で、
配列番号:2で示される塩基配列からなるDNAとハイ
ブリダイズし、一定の条件下での洗浄してもこれより脱
離しないものが挙げられる。
【0028】即ち、配列番号:2の塩基配列を有するD
NAと、6×SSC中65℃一夜の条件下或は50%ホ
ルムアミドを含む4×SSC中37℃一夜の条件下にお
いてハイブリダイズし、2×SSC中65℃での30分
間の洗浄条件下においても該DNAから脱離しない塩基
配列を有する遺伝子が例示される。ここで、SSCは、
標準食塩−クエン酸緩衝液である(standard saline ci
trate; 1×SSC = 0.15M NaCl, 0.015M sodium citrat
e)。
【0029】本発明の遺伝子は、その具体例についての
配列情報に基づいて、一般的な遺伝子工学的手法により
容易に製造・取得することができる〔Molecular Clonin
g 2dEd, Cold Spring Harbor Lab. Press (1989);続生
化学実験講座「遺伝子研究法I、II、III」、日本生化
学会編(1986)等参照〕。
【0030】具体的には、本発明遺伝子が発現される適
当な起源より、常法に従ってcDNAライブラリーを調
製し、該ライブラリーから、本発明遺伝子に特有の適当
なプローブや抗体を用いて所望クローンを選択すること
により実施できる〔Proc. Natl. Acad. Sci., USA., 7
8: 6613 (1981);Science, 222: 778 (1983)等〕。
【0031】上記において、cDNAの起源としては、
本発明遺伝子を発現する各種の細胞、組織やこれらに由
来する培養細胞等、特に膵臓組織が例示され、これらか
らの全RNAの分離、mRNAの分離や精製、cDNA
の取得とそのクローニング等はいずれも常法に従い実施
できる。尚、cDNAライブラリーは市販されてもお
り、本発明においてはそれらcDNAライブラリー、例
えばクローンテック社(Clontech Lab. Inc.)より市販
の各種cDNAライブラリー等を用いることもできる。
【0032】本発明遺伝子をcDNAライブラリーから
スクリーニングする方法も、特に制限されず、通常の方
法に従うことができる。具体的には、例えばcDNAに
より産生される蛋白質の特異抗体を使用した免疫的スク
リーニングにより対応するcDNAクローンを選択する
方法、目的のDNA配列に選択的に結合するプローブを
用いたプラークハイブリダイゼーション、コロニーハイ
ブリダイゼーション等やこれらの組合せ等を例示でき
る。
【0033】ここで用いられるプローブとしては、本発
明遺伝子の塩基配列に関する情報をもとにして化学合成
されたDNA等が一般的に例示できるが、勿論既に取得
された本発明遺伝子そのものやその断片等も良好に利用
できる。
【0034】また、上記特異抗体に代えてTSA305
蛋白を利用した、蛋白質相互作用クローニング法(prot
ein interaction cloning procedure)によることもで
き、更に、本発明遺伝子の塩基配列情報に基づき設定し
たセンス・プライマー、アンチセンス・プライマーをス
クリーニング用プローブとして用いることもできる。
【0035】本発明では、またディファレンシャルデイ
スプレイ法(Liand P., et al., Science, 257, 967-97
1 (1992))によって、異なる条件下の細胞もしくは複数
の異なる細胞群間のmRNAの発現を直接比較、検討す
ることができる。
【0036】本発明遺伝子の取得に際しては、PCR法
〔Science, 230: 1350 (1985)〕によるDNA/RNA
増幅法も好適に利用できる。殊に、ライブラリーから全
長のcDNAが得られ難いような場合には、レース法
(RACE:Rapid amplification of cDNA ends;実験
医学、12(6): 35 (1994))、殊に5’−レース(5’−
RACE)法〔Proc. Natl. Acad. Sci., USA., 8: 899
8 (1988)〕等の採用が好適である。かかるPCR法の採
用に際して使用されるプライマーは、既に本発明によっ
て明らかにされた本発明遺伝子の配列情報に基づいて適
宜設定でき、これは常法に従い合成できる。
【0037】尚、増幅させたDNA/RNA断片の単離
精製は、前記の通り常法に従うことができ、例えばゲル
電気泳動法等によればよい。
【0038】上記で得られる本発明遺伝子或は各種DN
A断片は、常法、例えばジデオキシ法〔Proc. Natl. Ac
ad. Sci., USA., 74: 5463 (1977)〕やマキサム−ギル
バート法〔Method in Enzymology, 65: 499 (1980)〕等
に従って、また簡便には市販のシークエンスキット等を
用いて、その塩基配列を決定することができる。
【0039】本発明遺伝子の利用によれば、一般の遺伝
子工学的手法を用いることにより、その遺伝子産物を容
易に大量に安定して製造することができる。従って、本
発明は、本発明にかかるTSA305遺伝子を含有する
ベクター(発現ベクター)及び該ベクターによって形質
転換された宿主細胞並びに該宿主細胞を培養することに
よりTSA305蛋白を製造する方法をも提供するもの
である。
【0040】該製造方法は、通常の遺伝子組換え技術
〔Science, 224: 1431 (1984); Biochem. Biophys. Re
s. Comm., 130: 692 (1985); Proc. Natl. Acad. Sci.,
USA.,80: 5990 (1983)及び前記引用文献等参照〕に従
うことにより実施できる。
【0041】上記宿主細胞としては、原核生物及び真核
生物のいずれも用いることができ、例えば原核生物の宿
主としては、大腸菌や枯草菌といった一般的に用いられ
るものが広く挙げられるが、好適には大腸菌、とりわけ
エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)K12株に含
まれるものが例示できる。また、真核生物の宿主細胞に
は、脊椎動物、酵母等の細胞が含まれ、前者としては、
例えばサルの細胞であるCOS細胞〔Cell, 23: 175 (1
981)〕やチャイニーズ・ハムスター卵巣細胞及びそのジ
ヒドロ葉酸レダクターゼ欠損株〔Proc. Natl. Acad. Sc
i., USA., 77:4216 (1980)〕等が、後者としては、サッ
カロミセス属酵母細胞等が好適に用いられているが、こ
れらに限定される訳ではない。
【0042】脊椎動物細胞を宿主とする場合の発現ベク
ターとしては、通常、発現しようとする本発明遺伝子の
上流に位置するプロモーター、RNAのスプライス部
位、ポリアデニル化部位及び転写終了配列等を保有する
ものが挙げられ、これは更に必要により複製起点を有し
ていてもよい。該発現ベクターの例としては、具体的に
は、例えばSV40の初期プロモーターを保有するpS
V2dhfr〔Mol. Cell. Biol., 1: 854 (1981)〕等が例
示できる。また、酵母細胞を宿主とする場合の発現ベク
ターの具体例としては、例えば酸性ホスフアターゼ遺伝
子に対するプロモーターを有するpAM82〔Proc. Na
tl. Acad. Sci., USA., 80: 1 (1983)〕等を例示でき
る。
【0043】原核生物細胞を宿主とする場合は、該宿主
細胞中で複製可能なベクターを用いて、このベクター中
に本発明遺伝子が発現できるように該遺伝子の上流にプ
ロモーター及びSD(シャイン・アンド・ダルガーノ)
塩基配列、更に蛋白合成開始に必要な開始コドン(例え
ばATG)を付与した発現プラスミドを好適利用でき
る。上記ベクターとしては、一般にpBR322及びそ
の改良ベクターがよく用いられるが、これらに限定され
ず各種のベクターを利用することができる。プロモータ
ーとしても特に限定なく、例えばトリプトファン(trp)
プロモーター、lpp プロモーター、lac プロモーター、
PL/PR プロモーター等をいずれも好適に使用できる。
【0044】尚、本発明遺伝子の発現ベクターとして
は、通常の融合蛋白発現ベクターも好ましく利用でき、
該ベクターの具体例としては、グルタチオン−S−トラ
ンスフェラーゼ(GST)との融合蛋白として発現させ
るためのpGEX(Promega 社)等を例示できる。
【0045】上記所望の組換えDNA(発現ベクター)
の宿主細胞への導入方法・形質転換法にも特に制限はな
く、一般的な各種方法を採用できる。また得られる形質
転換体も、常法に従い培養することができ、該培養によ
り本発明遺伝子によりコードされる目的のTSA305
蛋白が発現・産生され、形質転換体の細胞内、細胞外若
しくは細胞膜上に蓄積若しくは分泌される。
【0046】上記培養に用いられる培地としては、採用
した宿主細胞に応じて慣用される各種のものを適宜選択
利用でき、その培養も宿主細胞の生育に適した条件下で
実施できる。
【0047】かくして得られる組換え蛋白(TSA30
5蛋白)は、所望により、その物理的性質、化学的性質
等を利用した各種の分離操作従って分離、精製すること
ができる〔「生化学データブックII」、1175-1259頁、
第1版第1刷、1980年 6月23日株式会社東京化学同人発
行;Biochemistry, 25(25): 8274 (1986); Eur. J. Bio
chem., 163: 313 (1987) 等参照〕。該方法としては、
具体的には例えば通常の再構成処理、蛋白沈澱剤による
処理(塩析法)、遠心分離、浸透圧ショック法、超音波
破砕、限外濾過、分子篩クロマトグラフィー(ゲル濾
過)、吸着クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグ
ラフィー、アフィニティクロマトグラフィー、高速液体
クロマトグラフィー(HPLC)等の各種液体クロマト
グラフィー、透析法、これらの組合せ等が挙げられ、特
に好ましい上記方法としては、本発明のTSA305蛋
白の特異抗体を結合させたカラムを利用するアフィニテ
ィクロマトグラフィーを例示できる。
【0048】しかして、本発明は、例えば上記の如くし
て得られる、新規なTSA305蛋白自体をも提供する
ものである。該蛋白は、TSA305との結合活性を有
することにより特徴付けられ、前記のとおり医薬分野に
おいて有用である。
【0049】また、このTSA305蛋白は、該蛋白の
特異抗体を作成する為の免疫抗原としても利用できる。
ここで抗原として用いられるコンポーネントは、例えば
上記遺伝子工学的手法に従って大量に産生された蛋白或
はそのフラグメントであることができ、これら抗原を利
用することにより、所望の抗血清(ポリクローナル抗
体)及びモノクローナル抗体を収得することができる。
該抗体の製造方法自体は、当業者によく理解されている
ところであり、本発明においてもこれら常法に従うこと
ができる〔続生化学実験講座「免疫生化学研究法」、日
本生化学会編(1986)等参照〕。
【0050】例えば、抗血清の取得に際して利用される
免疫動物としては、ウサギ、モルモット、ラット、マウ
スやニワトリ等の通常動物を任意に選択でき、上記抗原
を使用する免疫方法や採血等もまた常法に従い実施でき
る。
【0051】また、モノクローナル抗体の取得も、常法
に従い、上記免疫抗原で免疫した動物の形質細胞(免疫
細胞)と形質細胞腫細胞との融合細胞を作成し、これよ
り所望抗体を産生するクローンを選択し、該クローンの
培養により実施することができる。免疫動物は、一般に
細胞融合に使用する形質細胞腫細胞との適合性を考慮し
て選択され、通常マウスやラット等が有利に用いられて
いる。免疫は、上記抗血清の場合と同様であり、所望に
より通常のアジュバント等と併用して行なうこともでき
る。
【0052】尚、融合に使用される形質細胞腫細胞とし
ても、特に限定なく、例えばp3(p3/x63-Ag8)〔Natu
re, 256: 495-497 (1975)〕、p3−U1〔Current Top
icsin Microbiology and Immunology, 81: 1-7 (197
8)〕、NS−1〔Eur. J. Immunol., 6: 511-519 (197
6)〕、MPC−11〔Cell, 8: 405-415 (1976)〕、S
P2/0〔Nature, 276: 269-271 (1978)〕等、ラット
におけるR210〔Nature,277: 131-133 (1979)〕等及
びそれらに由来する細胞等の各種の骨髄腫細胞をいずれ
も使用できる。
【0053】上記免疫細胞と形質細胞腫細胞との融合
は、通常の融合促進剤、例えばポリエチレングリコール
(PEG)やセンダイウイルス(HVJ)等の存在下に
公知の方法に準じて行なうことができ、所望のハイブリ
ドーマの分離もまた同様に行ない得る〔Meth. in Enzym
ol., 73: 3 (1981);上記続生化学実験講座等〕。
【0054】また、目的とする抗体産生株の検索及び単
一クローン化も常法により実施され、例えば抗体産生株
の検索は、上記の本発明抗原を利用したELISA法
〔Meth. in Enzymol., 70: 419-439 (1980)〕、プラー
ク法、スポット法、凝集反応法、オクテロニー(Ouchte
rlony)法、ラジオイムノアッセイ等の一般に抗体の検
出に用いられている種々の方法に従い実施することがで
きる。
【0055】かくして得られるハイブリドーマからの本
発明抗体の採取は、該ハイブリドーマを常法により培養
してその培養上清として得る、また、ハイブリドーマを
これと適合性のある哺乳動物に投与して増殖させその腹
水として得る方法等により実施される。前者の方法は、
高純度の抗体を得るのに適しており、後者の方法は、抗
体の大量生産に適している。このようにして得られる抗
体は、更に塩析、ゲル濾過、アフィニティクロマトグラ
フイー等の通常の手段により精製することができる。
【0056】かくして得られる抗体は、本発明のTSA
305蛋白に結合性を有することによって特徴付けら
れ、これは、前述したTSA305蛋白の精製及びその
免疫学的手法による測定乃至識別等に有利に利用でき
る。本発明は、かかる新規な抗体をも提供するものであ
る。
【0057】また、本発明によって明らかにされた本発
明遺伝子の配列情報を基にすれば、例えば該遺伝子の一
部又は全部の塩基配列を利用することにより、個体もし
くは各種組織における本発明遺伝子の発現の検出を行う
ことができる。
【0058】かかる検出は常法に従って行うことがで
き、例えばRT−PCR〔Reverse transcribed-Polyme
rase chain reaction; E.S. Kawasaki, et al., Amplif
ication of RNA. In PCR Protocol, A Guide to method
s and applications, AcademicPress, Inc., SanDiego,
21-27 (1991)〕によるRNA増幅やノーザンブロット
解析〔Molecular Cloning, Cold Spring Harbor Lab.
(1989)〕、in situ RT−PCR〔Nucl. Acids Res.,
21: 3159-3166 (1993)〕や in situ ハイブリダイゼー
ション等の細胞レベルでのそれら測定、NASBA法
〔Nucleic acid sequence-based amplification, Natur
e, 350: 91-92 (1991)〕及びその他の各種方法によりい
ずれも良好に実施し得る。
【0059】尚、RT−PCR法を採用する場合におい
て、用いられるプライマーは、本発明遺伝子のみを特異
的に増幅できる該遺伝子特有のものである限り何等限定
されず、本発明の遺伝情報に基いてその配列を適宜設定
することができる。通常、これは20〜30ヌクレオチ
ド程度の部分配列を有するものとすることができる。
【0060】このように、本発明は、本発明にかかるT
SA305遺伝子の検出用の特異プライマー及び/又は
特異プローブとして使用されるDNA断片をも提供する
ものである。
【0061】
【発明の効果】本発明によれば、新規な膵臓特異的遺伝
子TSA305及びこれによりコードされる蛋白が提供
され、これらの利用により、膵臓癌等の癌や癌化の解
明、その診断、予防及び治療等に有用な技術が提供され
る。
【0062】
【実施例】以下、本発明を更に詳しく説明するため、実
施例を挙げる。
【0063】
【実施例1】(1-1) 〔α-33P〕ATPで標識した表出
方法 組織特異的な手法において発現したヒト遺伝子を確認す
るために〔α-33P〕ATPで標識した表出方法を用い
た。該方法の手順は本質的に以下に示すリアングの方法
(Liang P., et al., Science, 257, 967-971 (1992))に
よって行なった。 即ち、13のヒト組織(成人脳、胎
児脳、肺、肝臓、胃、膵臓、脾臓、乳、膀胱、胎盤、睾
丸、腎臓及び心臓:クローンテック社製)の各々から単
離したポリA RNA(0.2μg)を、ジエチルピロ
カーボネート処理された水の8μl中で3’-アンカード
・オリゴdTプライマーG(T)15MA(MはG、A
及びCの混合液である)の25pmolと混合し、65℃で
5分間加熱した。この溶液に4μlの5×ファースト・
ストランド緩衝液(BRL社製)、2μlの0.1M
DTT(BRL社製)、1μlの250mM dNTPs
(BRL社製)、1μlのリボヌクレアーゼ・インヒビ
ター(40単位;TOYOBO社製)及び1μlのスー
パースクリプトII逆転写酵素(200単位;BRL社
製)を加えた。各反応液の最終容量は20μlであっ
た。各溶液を37℃で1時間培養した後、30μlの蒸
留した水の付加により2.5倍までに希釈し、使用時ま
で−20℃で貯蔵した。
【0064】cDNAは、〔α-33P〕ATPで標識し
た(アマシャム社製)3’−アンカード・プライマーの
存在下でPCRによって増幅した。このcDNAのPC
R増幅は、以下のとおり実施された。即ち、各20μl
のPCR混合液は、2μlのRT反応混合液、2μlの
10×PCR緩衝液(タカラ社製)、4μlの2.5m
M dNTPs、0.25μlのEx Taq DNAポリ
メラーゼ(5単位/ml:タカラ社製)、〔α-33P〕
ATPで標識した25pmolの3’−アンカード・オリゴ
−dTプライマー及び25pmolの5’−プライマー(N
o.20、5’−GATCTGACAC−3’の任意配
列を有する10−merデオキシオリゴヌクレオチド・
プライマー)を含んでいた。また、PCR反応は以下の
条件で行なった。即ち、95℃で3分間、40℃で5分
間及び72℃で5分間を1サイクルとして行ない、それ
から95℃で0.5分間、40℃で2分間及び72℃で
1分間を40サイクル行ない、最後に72℃で5分間反
応させた。
【0065】PCR反応サンプルをエタノールで抽出
し、フォルムアミド・シークエンシング染料中に再懸濁
して、6%アクリルアミド7.5Mウレア・シークエン
シング・ゲル上で反応させた。ゲルは固定することなし
に乾燥させ、一晩オートラジオグラフィーを実施した。
【0066】(1-2) 増幅されたcDNA断片のサブ・
クローニング 予め乾燥ゲルを載せた3MM濾紙上にラジオアクティブ
インクで印を付けておき、これとオートラジオグラムを
あわせることにより、目的のcDNAを含むバンドが含
まれるゲルを、3MM濾紙ごと切り出した後、300μ
lのdH2Oにて1時間撹袢した。ポリアクリルアミド
・ゲルと濾紙を取り除いた後、cDNAを担体として1
μlの10mg/mlグリコーゲンと0.3M NaO
Acの存在下、エタノール沈澱によって再回収し、10
μlのdH2Oに再溶解した。再増幅のために、5μl
のこの溶液が用いられた。PCRの条件とプライマーは
最初のPCRに対してと同じであった。適当な大きさの
再増幅産物を第一のPCR産物として再回収し、それか
らそのPCR産物をPuc118ベクター(タカラ社製)のHinc
II部位にクローンニングした。核酸配列はABI37
7自動シークエンサー(アプライド・バイオ・システム
ズ社製)によって決定した。
【0067】上記方法にて、13のヒト組織から単離し
たmRNAを用いて異なる表出パターンを比較した結
果、膵臓に特異的に発現した一つのPCR産物を確認し
た。これをTSA305と命名した。
【0068】この産物は、371ヌクレオチドからなっ
ていた。FASTAプログラム(Person W. R., et al.,
Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 85, 2444-2448 (198
8))を使用するGenBanck/EMBLデータ・ベ
ース中のDNA配列とこのヌクレオチド・データとの比
較より、このPCR産物が他の如何なる公知のDNA配
列と相同性がないことが明らかとなった。
【0069】(1-3) cDNAのスクリーニング ヒト正常膵臓cDNAライブラリーは、オリゴ(dT)+
ランダムヘキサマー−プライムド・ヒト正常膵臓cDN
AとUni-ZAPTM XR(ストラタジーン社製)を用い
て、構築した。1×106個のクローンの全体を上記方
法によって単離し、〔α−32P〕−dCTPにて標識さ
れたcDNA断片を用いてそのスクリーニングを行なっ
た。陽性クローンを選択し、それらの挿入cDNA部を
pBluescript II SK(-)中のイン・ビボに切り出した。
【0070】その結果、本発明者らは、TSA305に
対して約100のプラークを確認した。この結果より、
全RNA間の転写量は、およそ0.01%であると計算
された。TSA305に相同する集合したcDNA配列
(TSA305)は、計算された分子量88768Da
を有する794アミノ酸の蛋白をコードする2382ヌ
クレオチドのオープン・リーディング・フレームを含む
7885ヌクレオチドを含んでいた。
【0071】一次配列からこの遺伝子の産物(TSA3
05蛋白)は、フィブロネクチンTypeIIコラーゲン
結合ドメインを含む蛋白であることが明らかとなった。
【0072】その染色体上の位置は、インスリン依存性
糖尿病(IDDM)の原因遺伝子が存在するとされる第
14染色体q24.3−q31.1であった。
【0073】また、本発明遺伝子TSA305は、線虫
のsel−1と高いホモロジーを有していた。
【0074】(2) 組織における発現 組織におけるTSA305の発現プロファイルを調べる
ため、各種のヒト組織を用いたノーザンブロット分析を
行った。
【0075】ノーザン・ブロツト分析には、ヒトMTN
(Multiple-Tissue Northern)ブロットIとII(クロー
ンテック社製)を使用した。cDNA断片は、T3とT
7プロモーター配列のプライマー・セットを用い、PC
Rによって〔α−32P〕−dCTPで標識した。増幅産
物を含むメンブランをプレハイブリダイズ(条件は製品
のプロトコールに従った)し、そしてそれから製品のプ
ロトコールに従い、ハイブリダイゼーションを行なっ
た。
【0076】ハイブリダイゼーション後、洗浄した膜を
−80℃で24時間オートラジオグラフに露光した。そ
の結果は図1に示すとおりである。
【0077】該図において、用いたヒト組織は、心臓
(Heart)、脳(brain)、睾丸(Placenta)、肺(Lun
g)、肝臓(Liver)、骨格筋(Skeletal muscle)、腎
臓(Kidney)、膵臓(Pancreas)、脾臓(Spleen)、胸
腺(Thymus)、膀胱(Prostate)、胎盤(Testis)、卵
巣(Ovary)、小腸(Small intestine)、結腸(Colo
n)及び末梢血白血球(Peripheral blood leukocyte)
である。
【0078】該図より、TSA305に相同する転写体
が膵臓(Pancreas)において特異的に観察された。
【0079】(3) FISH 染色体の整列のためのFISHは、公知の方法(Takahas
hi E., et al., Hum.Genet., 86, 14-16 (1990))に従っ
て、各コスミドDNAの0.5μgをプローブとして使
用して実施した。FISHはプロビア100フィルム
(フジ社製、ISO100)又はCCDカメラ・システ
ム(アプライド・イメージング、サイトビジョン社製)
によって捕えられた。
【0080】その結果、100の典型的なR−バンド
(前)分裂中期の細胞を試験したシグナルは、第14染色
体のバンドq24.3−q31.1に局在していた。従
って、TSA305染色体の局在部位は、14q24.
3−q31.1と同定できた。
【0081】(4) RT−PCR分析による膵臓癌細胞
株と膵臓癌組織における転写物の発現 TSA305遺伝子の発現がヒト膵臓癌細胞株と膵臓癌
組織において変異するかどうかを調べるために、4つの
細胞株(Aspc1(転移性腺癌, J. Natl. Cancer In
st., 67, 563-569 (1981)),Bxpc3(腺癌・未分
化, Cancer Invest., 4, 15-23 (1986)),MiaPa
ca2(腺癌, Int. J. Cancer, 19, 128-135 (1977))
及びPANC1(類上皮性、膵管癌, Int. J. Cancer,
15, 741-747 (1975))と9の膵臓の癌組織(東京大学医
科研究所、中村先生より供与)のRT−PCR分析を行
なった。
【0082】即ち、全RNAをISOGEN(和光社
製)を使用して細胞株と膵臓癌組織から単離した10μ
lの全RNAを10単位のRNaseフリーDNase
I(ベーリンガー・マインハイム社製)で15分間処
理し、フェノール−クロロフォルムで2回抽出し、エタ
ノールで沈澱させた。一本鎖cDNAをオリゴd(T)
とランダムプライマーを使用してSuperscript ITM RN
aseH-逆転写酵素(ライフ・テクノロジー社製)に
よって合成した。2μlの各産物をPCR増幅のために
用いた。
【0083】配列番号:4及び配列番号:5として示す
塩基配列のプライマーP1及びP2Sを、25サイクル
のPCR増幅のために使用した。
【0084】尚、PCR反応は25ngcDNA、10
μM各プライマー、2.5mM dNTP及び0.25
UのExtaq DNAポリメラーゼ(タカラ社製)を
含む20μl溶液中で行なった。PCR産物は、エチジ
ウム・ブロマイト染色した1.5%アガロースゲル中に
溶解させた。
【0085】上記に従い、4種の細胞株(レーン1=A
spc1,レーン2=Bxpc3,レーン3=MiaP
aca2,レーン4=PANC1)と正常膵臓組織(No
rmalPancreas、レーン5)をRT−PCR分析した結果
は、図2に示す通りである。尚、図の上段はTSA30
5の結果を、下段はコントロールとしてのβ2−ミクロ
グロブリン(β2−microglobulin)の結果を示す。
【0086】該図より、TSA305発現は、全ての癌
組織においては見当らず、正常膵臓組織(レーン5参
照)にのみ認められることが判った。
【0087】(5) 膵癌におけるTSA305遺伝子の
発現(RT−PCR) TSA305遺伝子の発現を、膵癌患者サンプル(1
T、2T、3T、5T、6T、7T、10T及び11
T)、膵癌(Tumor Pancreas)及び正常膵(Invitrogen;
Human Normal Pancreas)並びに同一患者膵臓の癌部
(23T)及び非癌部(23N)について、RT−PC
R法により検出した。即ち、各サンプルよりmRNAを
抽出し、TSA305の1581−2382bp(80
1塩基対)をRT−PCRにて増幅させ、発現の有無を
検出した。濃度コントロールとしてβ2−ミクログロブ
リン(microglobulin)を用いた。結果を図3に示す。
【0088】該図より、正常膵臓の発現に比べて、膵臓
癌サンプル全例においてTSA305遺伝子の発現の低
下或いは欠損が観察された。
【0089】
【配列表】(1) GENERAL INFORMATION: (i) APPLICANT: Ostuka Pharmaceutical Co., Ltd. (ii) TITLE OF INVENTION: TSA305遺伝子 (iii) NUMBER OF SEQUENCES: 5 (iv) COMPUTER READABLE FORM: (A) MEDIUM TYPE: Floppy disk (B) COMPUTER: IBM PC compatible (C) OPERATING SYSTEM: PC-DOS/MS-DOS (D) SOFTWARE: PatentIn Release #1.0, Version #1.30 (vi) CURRENT APPLICATION DATA: (A) APPLICATION NUMBER: (B) FILING REFERENCE: F18JP (C) FILING DATE: 20-April-1998
【0090】(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO:1: (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS: (A) LENGTH: 794 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECULE TYPE: protein (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO:1: Met Arg Val Arg Ile Gly Leu Thr Leu Leu Leu Cys Ala Val Leu Leu 1 5 10 15 Ser Leu Ala Ser Ala Ser Ser Asp Glu Glu Gly Ser Gln Asp Glu Ser 20 25 30 Leu Asp Ser Lys Thr Thr Leu Thr Ser Asp Glu Ser Val Lys Asp His 35 40 45 Thr Thr Ala Gly Arg Val Val Ala Gly Gln Ile Phe Leu Asp Ser Glu 50 55 60 Glu Ser Glu Leu Glu Ser Ser Ile Gln Glu Glu Glu Asp Ser Leu Lys 65 70 75 80 Ser Gln Glu Gly Glu Ser Val Thr Glu Asp Ile Ser Phe Leu Glu Ser 85 90 95 Pro Asn Pro Glu Asn Lys Asp Tyr Glu Glu Pro Lys Lys Val Arg Lys 100 105 110 Pro Ala Leu Thr Ala Ile Glu Gly Thr Ala His Gly Glu Pro Cys His 115 120 125 Phe Pro Phe Leu Phe Leu Asp Lys Glu Tyr Asp Glu Cys Thr Ser Asp 130 135 140 Gly Arg Glu Asp Gly Arg Leu Trp Cys Ala Thr Thr Tyr Asp Tyr Lys 145 150 155 160 Ala Asp Glu Lys Trp Gly Phe Cys Glu Thr Glu Glu Glu Ala Ala Lys 165 170 175 Arg Arg Gln Met Gln Glu Ala Glu Met Met Tyr Gln Thr Gly Met Lys 180 185 190 Ile Leu Asn Gly Ser Asn Lys Lys Ser Gln Lys Arg Glu Ala Tyr Arg 195 200 205 Tyr Leu Gln Lys Ala Ala Ser Met Asn His Thr Lys Ala Leu Glu Arg 210 215 220 Val Ser Tyr Ala Leu Leu Phe Gly Asp Tyr Leu Pro Gln Asn Ile Gln 225 230 235 240 Ala Ala Arg Glu Met Phe Glu Lys Leu Thr Glu Glu Gly Ser Pro Lys 245 250 255 Gly Gln Thr Ala Leu Gly Phe Leu Tyr Ala Ser Gly Leu Gly Val Asn 260 265 270 Ser Ser Gln Ala Lys Ala Leu Val Tyr Tyr Thr Phe Gly Ala Leu Gly 275 280 285 Gly Asn Leu Ile Ala His Met Val Leu Gly Tyr Arg Tyr Trp Ala Gly 290 295 300 Ile Gly Val Leu Gln Ser Cys Glu Ser Ala Leu Thr His Tyr Arg Leu 305 310 315 320 Val Ala Asn His Val Ala Ser Asp Ile Ser Leu Thr Gly Gly Ser Val 325 330 335 Val Gln Arg Ile Arg Leu Pro Asp Glu Val Glu Asn Pro Gly Met Asn 340 345 350 Ser Gly Met Leu Glu Glu Asp Leu Ile Gln Tyr Tyr Gln Phe Leu Ala 355 360 365 Glu Lys Gly Asp Val Gln Ala Gln Val Gly Leu Gly Gln Leu His Leu 370 375 380 His Gly Gly Arg Gly Val Glu Gln Asn His Gln Arg Ala Phe Asp Tyr 385 390 395 400 Phe Asn Leu Ala Ala Asn Ala Gly Asn Ser His Ala Met Ala Phe Leu 405 410 415 Gly Lys Met Tyr Ser Glu Gly Ser Asp Ile Val Pro Gln Ser Asn Glu 420 425 430 Thr Ala Leu His Tyr Phe Lys Lys Ala Ala Asp Met Gly Asn Pro Val 435 440 445 Gly Gln Ser Gly Leu Gly Met Ala Tyr Leu Tyr Gly Arg Gly Val Gln 450 455 460 Val Asn Tyr Asp Leu Ala Leu Lys Tyr Phe Gln Lys Ala Ala Glu Gln 465 470 475 480 Gly Trp Val Asp Gly Gln Leu Gln Leu Gly Ser Met Tyr Tyr Asn Gly 485 490 495 Ile Gly Val Lys Arg Asp Tyr Lys Gln Ala Leu Lys Tyr Phe Asn Leu 500 505 510 Ala Ser Gln Gly Gly His Ile Leu Ala Phe Tyr Asn Leu Ala Gln Met 515 520 525 His Ala Ser Gly Thr Gly Val Met Arg Ser Cys His Thr Ala Val Glu 530 535 540 Leu Phe Lys Asn Val Cys Glu Arg Gly Arg Trp Ser Glu Arg Leu Met 545 550 555 560 Thr Ala Tyr Asn Ser Tyr Lys Asp Gly Asp Tyr Asn Ala Ala Val Ile 565 570 575 Gln Tyr Leu Leu Leu Ala Glu Gln Gly Tyr Glu Val Ala Gln Ser Asn 580 585 590 Ala Ala Phe Ile Leu Asp Gln Arg Glu Ala Ser Ile Val Gly Glu Asn 595 600 605 Glu Thr Tyr Pro Arg Ala Leu Leu His Trp Asn Arg Ala Ala Ser Gln 610 615 620 Gly Tyr Thr Val Ala Arg Ile Lys Leu Gly Asp Tyr His Phe Tyr Gly 625 630 635 640 Phe Gly Thr Asp Val Asp Tyr Glu Thr Ala Phe Ile His Tyr Arg Leu 645 650 655 Ala Ser Glu Gln Gln His Ser Ala Gln Ala Met Phe Asn Leu Gly Tyr 660 665 670 Met His Glu Lys Gly Leu Gly Ile Lys Gln Asp Ile His Leu Ala Lys 675 680 685 Arg Phe Tyr Asp Met Ala Ala Glu Ala Ser Pro Asp Ala Gln Val Pro 690 695 700 Val Phe Leu Ala Leu Cys Lys Leu Gly Val Val Tyr Phe Leu Gln Tyr 705 710 715 720 Ile Arg Glu Thr Asn Ile Arg Asp Met Phe Thr Gln Leu Asp Met Asp 725 730 735 Gln Leu Leu Gly Pro Glu Trp Asp Leu Tyr Leu Met Thr Ile Ile Ala 740 745 750 Leu Leu Leu Gly Thr Val Ile Ala Tyr Arg Gln Arg Gln His Gln Asp 755 760 765 Met Pro Ala Pro Arg Pro Pro Gly Pro Arg Pro Ala Pro Pro Gln Gln 770 775 780 Glu Gly Pro Pro Glu Gln Gln Pro Pro Gln 785 790
【0091】(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO:2: (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS: (A) LENGTH: 2382 base pairs (B) TYPE: nucleic acid (C) STRANDEDNESS: single (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECULE TYPE: DNA(cDNA) (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO:2: ATGCGGGTCC GGATAGGGCT GACGCTGCTG CTGTGTGCGG TGCTGCTGAG CTTGGCCTCG 60 GCGTCCTCGG ATGAAGAAGG CAGCCAGGAT GAATCCTTAG ATTCCAAGAC TACTTTGACA 120 TCAGATGAGT CAGTAAAGGA CCATACTACT GCAGGCAGAG TAGTTGCTGG TCAAATATTT 180 CTTGATTCAG AAGAATCTGA ATTAGAATCC TCTATTCAAG AAGAGGAAGA CAGCCTCAAG 240 AGCCAAGAGG GGGAAAGTGT CACAGAAGAT ATCAGCTTTC TAGAGTCTCC AAATCCAGAA 300 AACAAGGACT ATGAAGAGCC AAAGAAAGTA CGGAAACCAG CTTTGACCGC CATTGAAGGC 360 ACAGCACATG GGGAGCCCTG CCACTTCCCT TTTCTTTTCC TAGATAAGGA GTATGATGAA 420 TGTACATCAG ATGGGAGGGA AGATGGCAGA CTGTGGTGTG CTACAACCTA TGACTACAAA 480 GCAGATGAAA AGTGGGGCTT TTGTGAAACT GAAGAAGAGG CTGCTAAGAG ACGGCAGATG 540 CAGGAAGCAG AAATGATGTA TCAAACTGGA ATGAAAATCC TTAATGGAAG CAATAAGAAA 600 AGCCAAAAAA GAGAAGCATA TCGGTATCTC CAAAAGGCAG CAAGCATGAA CCATACCAAA 660 GCCCTGGAGA GAGTGTCATA TGCTCTTTTA TTTGGTGATT ACTTGCCACA GAATATCCAG 720 GCAGCGAGAG AGATGTTTGA GAAGCTGACT GAGGAAGGCT CTCCCAAGGG ACAGACTGCT 780 CTTGGCTTTC TGTATGCCTC TGGACTTGGT GTTAATTCAA GTCAGGCAAA GGCTCTTGTA 840 TATTATACAT TTGGAGCTCT TGGGGGCAAT CTAATAGCCC ACATGGTTTT GGGTTACAGA 900 TACTGGGCTG GCATCGGCGT CCTCCAGAGT TGTGAATCTG CCCTGACTCA CTATCGTCTT 960 GTTGCCAATC ATGTTGCTAG TGATATCTCG CTAACAGGAG GCTCAGTAGT ACAGAGAATA 1020 CGGCTGCCTG ATGAAGTGGA AAATCCAGGA ATGAACAGTG GAATGCTAGA AGAAGATTTG 1080 ATTCAATATT ACCAGTTCCT AGCTGAAAAA GGTGATGTAC AAGCACAGGT TGGTCTTGGA 1140 CAACTGCACC TGCACGGAGG GCGTGGAGTA GAACAGAATC ATCAGAGAGC ATTTGACTAC 1200 TTCAATTTAG CAGCAAATGC TGGCAATTCA CATGCCATGG CCTTTTTGGG AAAGATGTAT 1260 TCGGAAGGAA GTGACATTGT ACCTCAGAGT AATGAGACAG CTCTCCACTA CTTTAAGAAA 1320 GCTGCTGACA TGGGCAACCC AGTTGGACAG AGTGGGCTTG GAATGGCCTA CCTCTATGGG 1380 AGAGGAGTTC AAGTTAATTA TGATCTAGCC CTTAAGTATT TCCAGAAAGC TGCTGAACAA 1440 GGCTGGGTGG ATGGGCAGCT ACAGCTTGGT TCCATGTACT ATAATGGCAT TGGAGTCAAG 1500 AGAGATTATA AACAGGCCTT GAAGTATTTT AATTTAGCTT CTCAGGGAGG CCATATCTTG 1560 GCTTTCTATA ACCTAGCTCA GATGCATGCC AGTGGCACCG GCGTGATGCG ATCATGTCAC 1620 ACTGCAGTGG AGTTGTTTAA GAATGTATGT GAACGAGGCC GTTGGTCTGA AAGGCTTATG 1680 ACTGCCTATA ACAGCTATAA AGATGGCGAT TACAATGCTG CAGTGATCCA GTACCTCCTC 1740 CTGGCTGAAC AGGGCTATGA AGTGGCACAA AGCAATGCAG CCTTTATTCT TGATCAGAGA 1800 GAAGCAAGCA TTGTAGGTGA GAATGAAACT TATCCCAGAG CTTTGCTACA TTGGAACAGG 1860 GCCGCCTCTC AAGGCTATAC TGTGGCTAGA ATTAAGCTCG GAGACTACCA TTTCTATGGG 1920 TTTGGCACCG ATGTAGATTA TGAAACTGCA TTTATTCATT ACCGTCTGGC TTCTGAGCAG 1980 CAACACAGTG CACAAGCTAT GTTTAATCTG GGATATATGC ATGAGAAAGG ACTGGGCATT 2040 AAACAGGATA TTCACCTTGC GAAACGTTTT TATGACATGG CAGCTGAAGC CAGCCCAGAT 2100 GCACAAGTTC CAGTCTTCCT AGCCCTCTGC AAATTGGGCG TCGTCTATTT CTTGCAGTAC 2160 ATACGGGAAA CAAACATTCG AGATATGTTC ACCCAACTTG ATATGGACCA GCTTTTGGGA 2220 CCTGAGTGGG ACCTTTACCT CATGACCATC ATTGCGCTGC TGTTGGGAAC AGTCATAGCT 2280 TACAGGCAAA GGCAGCACCA AGACATGCCT GCACCCAGGC CTCCAGGGCC ACGGCCAGCT 2340 CCACCCCAGC AGGAGGGGCC ACCAGAGCAG CAGCCACCAC AG 2382
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TCTTGATACT 5338 AAGGATTTGT TACTTTTTTG CATATTAGGT TAATTTTTAC CTTACATGTG AGAGTCTTAC 5398 CACTAAGCCA TTCTGTCTCT GTACTGTTGG GAAGTTTTGG AAACCCCTGC CAGTGATCTG 5458 GTGATGATCT GATGATTTAT TTAAAGAGCC GTTGATGCCT CCAGGAAACT TAAGTATTTT 5518 ATTAATATAT ATATAGGAAT TTTTTTTTAT TTTGCTTTGT CTTTCTCTCC CTTCTTTTAT 5578 CCTCATGTTC ATTCTTCAAA CCAGTGTTTT GGAAGTATGC ATGCAGGCCT ATAAATGAAA 5638 AACACAATTC TTTATGTGTA TAGCATGTGT ATTAATGTCT AACTACATAC GCAAAAACTT 5698 CCTTTACAGA GGTTCGGACT AACATTTCAC ATGCACATTT CAAAACAAGA TGTGTCATGA 5758 AAACAGCCCC TTTACCTGCC AAGACAAGCA GGGCTATATT TCAGTGACAG CTGGATATTT 5818 TGTTTCTGAA AGTGAATCTC ATAATATATA TATGTATTAC ACATTATTAT GACTAGAAGT 5878 ATGTAAGAAA TGATCAGAAC AAAAGAAAAT TTCTATTTTC ATGCAAATAT TTTTCATCAG 5938 TCATCACTCT CAAATATAAA TTAAAATATA ACACTCCTGA ATGCCTGAGG CACGATCTGG 5998 ATTTTAAATG TGTGGTATTC ATTGAAAAGA AGCTCTCCAC CCACTTGGTA TTTCAAGAAA 6058 ATTTAAAACG ATCCCAAGGA AAGATGATTT GTATGTTAAA GTGACTGCAC AAGTAAAAGT 6118 CCAATGTTGT GTGCATGAAA AGGATTCCTT GGTTATGTGC AGGGAATCAT 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CCCAGCAGGC 7018 AACTCAAAGA GGTAACTGAG GTAAAATGTT CCAGCTCAGA AGCATTGGAT CTTGGATAAA 7078 AAGCCTACAT GATGCAAACT GTGGCAACTG AGATGTCAGA TCTCAAGATC TCAAATTGTA 7138 CTTGTGGGAG CACAGTCAGT GACCCCAGAT GACCTTGACT GACCTAAAAG TTGTGGGGGA 7198 AGTCGGATGT CAGAGCCTTA ACACCAGCAG GTGACCATCC AACCTGGGGC AATGCCTGCC 7258 TGTTCACCAC TTAGCCTCTT TCTGGCAAGT CATTAGAATG TCCTCCATCT TCATTGGCTG 7318 CAACTTGATG AGCTACAGCC TCTTTCCTAA CTTCCTTTAT GATGCTAGTT TAGGTTGGTT 7378 ATACCAGCTT GGAAGTATGC TTAGATTAAG TTACAGCAGA TACACAAATT AGATGCAAGT 7438 AAAAAAAATC AGAATTTCTG TAGTAGAAAC TACGAAAAAT AAAAAGGAAA GTTTTTACTT 7498 TTTGGGTATT TTTTTACGAA TAAGAAAAAG TGAGCGTTAA TCAGTTCAAA AGGAGGTACT 7558 GCTGTGTAAT GGGCTTTGTA CGTTCCTTCT CATGTCACTT ACGTCACTAC TTCGCCATCA 7618 AATTGAACAA GCTTTTAATT AGATCCTGAA AATTCACTAT GCTAGTAGTT TATTGGTAGT 7678 ATTATATTTT GAGTAGAACT CTGATTTTCC CTAGAGGCCA AATTCTTTTT ATCTGGGTTA 7738 ATTTCTTTTA AACATAACAA TGTTAATGCT GAATTGTATA TTAAATCCCA TTTCTAAAAA 7798 CCACACAATT TTTTCTCATG TAAGTTGAGT GGAATGTGGT TAGTTAACTG AATTTGGAAT 7858 GTTCATATAA ATAATTTGTT GCTGCTC 7885
【0093】(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO:4: (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS: (A) LENGTH: 28 base pairs (B) TYPE: nucleic acid (C) STRANDEDNESS: single (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECULE TYPE: Other nucleic acid (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO:4: GATCGGATCC AGGAGGATGC GGGTCCGG 28
【0094】(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO:5: (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS: (A) LENGTH: 30 base pairs (B) TYPE: nucleic acid (C) STRANDEDNESS: single (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECULE TYPE: Other nucleic acid (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO:5: GATCCTCGAG TTACTGTGGT GGCTGCTGCT 30
【図面の簡単な説明】
【図1】実施例1の(2)に従うノーザンブロット分析に
より調べた本発明遺伝子のヒト組織における分布を示す
図面代用写真である。
【図2】実施例1の(4)に従う、正常膵臓細胞(ノーマ
ル,Normal)、4種の細胞株(Cell line)をRT−P
CR分析した結果を示す図面代用写真であり、上段はT
SA305の結果を、下段はコントロールとしてのβ2
−ミクログロブリンの結果を示す。
【図3】実施例1の(5)に従う、膵癌サンプルその他を
RT−PCR分析した結果を示す図面代用写真であり、
上段はTSA305の結果を、下段はコントロールとし
てのβ2−ミクログロブリンの結果を示す。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 FI C12Q 1/68 C12N 5/00 B

Claims (6)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】以下の(a)及び(b)のいずれかの蛋白
    質をコードする塩基配列を含む膵臓特異的遺伝子TSA
    305: (a)配列番号:1で示されるアミノ酸配列からなる蛋
    白質 (b)配列番号:1で示されるアミノ酸配列において1
    又は複数のアミノ酸が欠失、置換又は付加されたアミノ
    酸配列からなり、TSA305との結合活性を有する蛋
    白質。
  2. 【請求項2】以下の(a)及び(b)のいずれかのポリ
    ヌクレオチドからなる膵臓特異的遺伝子TSA305: (a)配列番号:2で示される塩基配列の全部又は一部
    を含むポリヌクレオチド、(b)配列番号:2で示され
    る塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下
    でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
  3. 【請求項3】ヒト遺伝子である請求項1又は2に記載の
    遺伝子。
  4. 【請求項4】TSA305遺伝子検出用の特異プローブ
    又は特異プライマーとして使用されるDNA断片である
    請求項2に記載の遺伝子。
  5. 【請求項5】請求項1に記載の遺伝子によってコードさ
    れるTSA305蛋白。
  6. 【請求項6】請求項5に記載のTSA305蛋白に結合
    性を有する抗体。
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