JPH10501985A - Interleukin-1β converting enzyme-like apoptotic protease-1 and 2 - Google Patents

Interleukin-1β converting enzyme-like apoptotic protease-1 and 2

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JPH10501985A
JPH10501985A JP8503077A JP50307796A JPH10501985A JP H10501985 A JPH10501985 A JP H10501985A JP 8503077 A JP8503077 A JP 8503077A JP 50307796 A JP50307796 A JP 50307796A JP H10501985 A JPH10501985 A JP H10501985A
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    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
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Abstract

(57)【要約】 ヒトインターロイキン-1β変換酵素様アポトーシスプロテアーゼ-1および-2、ならびにこれらのポリペプチドをコードするDNA(RNA)を、開示する。また、組換え技術によるこのようなポリペプチド、ならびにこのようなポリペプチドに対する抗体およびアンタゴニスト/インヒビターを生成するための手順が提供される。また、例えば、抗腫瘍剤および抗ウイルス剤としてのポリペプチド、ならびに例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、慢性関節リウマチ、および頭部外傷の治療のための、このようなポリペプチドに対する抗体およびアンタゴニスト/インヒビターの使用方法を提供する。   (57) [Summary] Disclosed are human interleukin-1β converting enzyme-like apoptotic proteases-1 and -2, and DNA (RNA) encoding these polypeptides. Also provided are procedures for producing such polypeptides, and antibodies and antagonists / inhibitors to such polypeptides, by recombinant techniques. Also, polypeptides, eg, as anti-tumor and anti-viral agents, and antibodies and antagonists / inhibitors to such polypeptides, eg, for the treatment of Alzheimer's disease, Parkinson's disease, rheumatoid arthritis, and head trauma Provides usage of

Description

【発明の詳細な説明】 インターロイキン-1β変換酵素様アポトーシスプロテアーゼ-1および2 本発明は、新たに同定したポリヌクレオチド、このようなポリヌクレオチドに よりコードされるポリペプチド、このようなポリヌクレオチドおよびポリペプチ ドの使用、ならびにこのようなポリヌクレオチドおよびポリペプチドの生成に関 する。より特定すると、本発明のポリペプチドは、インターロイキン−1β変換 酵素様アポトーシスプロテアーゼ−1およびインターロイキン−1β変換酵素様 アポトーシスプロテアーゼ−2であり、本明細書中以後、しばしば集合的に「IC E-LAP-1および2」と呼ばれる。本発明はまた、このようなポリペプチドの作用を 阻害することに関する。 インターロイキン−1β変換酵素(ICE)は、pro-IL-1βを、成熟かつ活性型のI L-1βへ切断することに関与し、そしてまた生物体が望まない細胞を除去するプ ロセスであるプログラムされた細胞死(またはアポトーシス)に関与することが最 近発見された。本発明は、構造的にICEと関係のあるICE-LAP-1および2に関する 。 線虫caenorhabditis elegans において、プログラムされた細胞死の遺伝的経 路が確認された(Ellis、R.E.ら、Annu.Rev.Cell Biol.、7:663-698(1991))。2 個の遺伝子(ced-3およびced-4)は、C.elegansにおいてプログラムされた細胞死 を経る細胞にとって不可欠なものである。(Ellis,H.M.、およびHorvitz,H.R.、C ell、44:817-829(1986))。これらの2個の遺伝子の機能を除去する劣性変異体は 、C.elegansの発生の間、正常なプログラムされた細胞死を妨げる。ced-3タンパ ク質に対する公知の脊椎動物の対応物は、ICEである。ced-3とICEとの間の全体 にわたるアミノ酸の同一性は、28%であり、115個のアミノ酸の領域(ced-3の残 基246-360およびICEの残基164-278)で最も高い同一性(43%)を示す。この領域は 、保存されたペンタペプチドQACRG(ced-3の残基356-360)を含み、このペプチド はICE機能にとって不可欠であると知られているシステインを含む。本発明のICE -LAP-1および2ポリペプチドはまた、同じ保存されたペンタペプチドおよびICE機 能にとって不可欠なシステイン残基を有する。 ced-3とICEとの間の類似性は、ced-3がシステインプロテアーゼとして機能し 得ることだけでなく、ICEが脊椎動物のプログラムされた細胞死の遺伝子として 作用し得ることも示唆する。ced-3および脊椎動物の対応物(ICE)は、胚発生の 間、プログラムされた細胞死を制御する(Gagliarnini、V.ら、Science、263:826 :828(1994)。 ICE mRNAは種々の組織で検出され、そのような組織として、末梢血液単球、末 梢血液リンパ球、末梢血液好中球、休止または活性化された末梢血液Tリンパ球 、胎盤、Bリンパ芽球株CB23、および単球白血病細胞株THP-1細胞(Cerreti、D.P .、ら、Science、256:97-100(1992))が挙げられる。このことは、ICEがpro-IL-1 βに加えてさらなる基質を有し得ることを示唆する。ICEが作用し、細胞死を起 こす基質は、現在未知である。一つの可能性は、それが、C.elegansの細胞死遺 伝子ced-4の脊椎動物ホモログであり得ることである。あるいは、ICEは、細胞生 存に不可欠なタンパク質をタンパク質分解的に切断することにより、直接的に細 胞死を起こし得る。 哺乳動物遺伝子bcl-2により、細胞自己不活化からリンパ球と呼ばれる免疫細 胞を保護することが発見された。また、crmA(牛痘ウイルス遺伝子産生物)は、IC Eのタンパク質分割能を阻害する。 本発明の1局面によれば、ICE-LAP-1および2、ならびにそのフラグメント、ア ナログ、およびそれらの誘導体である新規の成熟ポリペプチドが提供される。本 発明のポリペプチドは、ヒト起源のものである。 本発明の別の局面によれば、このようなポリペプチドをコードするポリヌクレ オチド(DNAまたはRNA)が提供される。 本発明のさらなる局面によれば、このようなポリペプチドを組換え技術により 生成するためのプロセスが提供される。 本発明のさらなる局面によれば、このようなポリペプチド、またはこのような ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを、治療目的(例えば、抗ウイルス 剤、抗腫瘍剤、ならびに胚発生および組織恒常性(homeostasis)を調節すること として)のために利用するためのプロセスが提供される。 本発明のさらなる局面によれば、このようなポリペプチドに対する抗体が提供 される。 本発明のさらに他の局面によれば、例えば、アルツハイマー病、パーキンソン 病、慢性関節リウマチ、敗血症性ショックおよび頭部傷害の処置において、この ようなポリペプチドの作用を阻害するために用いられ得るこのようなポリペプチ ドに対するアンタゴニスト/インヒビターが提供される。 本発明のこれらの局面および他の局面は、本明細書中の教示から当業者には明 らかであるべきである。 以下の図面は、本発明の実施態様の例示であり、請求の範囲に含まれる本発明 の範囲を限定することを意図しない。 図1は、ICE-LAP-1のcDNA配列および対応する推定アミノ酸配列を示す。示さ れるアミノ酸配列によりコードされるポリペプチドは、ポリペプチドの推定の成 熟形態(最初のメチオニン残基を除く)であり、そしてアミノ酸に対して、標準的 な1文字略記が用いられる。 図2は、ICE-LAP-2のcDNA配列および対応する推定アミノ酸配列を示す。示さ れるアミノ酸配列によりコードされるポリペプチドは、ポリペプチドの推定の成 熟形態(最初のメチオニン残基を除く)である。 図3は、ICE-LAP-1とICEとのアミノ酸配列の比較を示す。 図4は、種々のヒト組織における濃度を示すICE-LAP-1のノーザンブロット分 析を行った後のゲルを図示する。 本発明の局面によれば、図1および図2の推定アミノ酸配列を有する成熟ポリ ペプチドをコードし、またはATCC寄託番号75772および75819として寄託されたク ローンのcDNAによりコードされる成熟ポリペプチドの単離された核酸(ポリヌク レオチド)が提供される。ATCC寄託番号75772は、ICE-LAP-1についてコードする cDNAを包含し、およびATCC寄託番号75819は、ICE-LAP-2についてコードするcDNA を包含する。 ICE-LAP-1をコードするポリヌクレオチドが、ヒト胎児肝臓由来のcDNAライブ ラリーにおいて発見された。このことは、インターロイキン−1β変換酵素ファ ミリーに、構造的に関係する。これは、約377個のアミノ酸残基のタンパク質を コードするオープンリーディングフレームを含む。このタンパク質は、ヒトイン ターロイキン−1β変換酵素に、アミノ酸配列全体にわたって68%の類似性およ び53%の同一性で最も高い程度の相同性を示す。ペンタペプチドQACRGが、保存 され、アミノ酸位256-260に位置することを示す。 ICE-LAP-2をコードするポリヌクレオチドが、ヒトJurkat細胞由来のcDNAライ ブラリーにおいて発見された。このことは、ICEファミリーに構造的に関係する 。これは、約435個のアミノ酸残基のタンパク質をコードするオープンリーディ ングフレームを含む。このタンパク質は、マウスNedd-2タンパク質に、128個の アミノ酸の範囲にわたって91%の同一性および94%の類似性で最も高い程度の相 同性を示す。タンパク質全体は、C.elegansの細胞死タンパク質ced-3に、400個 のアミノ酸残基にわたって約40%の同一性および60%の類似性で最も高い程度の 相同性を示す。ペンタペプチドQACRGは、保存され、アミノ位301-305に位置する こともまた重要てある。 本発明のポリヌクレオチドは、RNAの形態、または、DNAの形態であり得る。DN Aの形態は、cDNA、ゲノムDNAおよび合成DNAを包含する。DNAは二本鎖または一本 鎖であり得る。そして、一本鎖の場合、コード鎖または非コード(アンチセンス )鎖であり得る。成熟ポリペプチドをコードするコード配列は、図1および図2 に示すコード配列と同一であり得るか、寄託したクローンのコード配列と同一で あり得る。あるいは、コード配列が、遺伝コードの重複または縮重の結果として 、同じ成熟ポリペプチドをコードする異なるコード配列、ならびに図1および図 2のDNAまたは寄託したcDNAとして、その誘導体であり得る。 図1および図2の成熟ポリペプチドまたは寄託したcDNAによりコードされる成 熟ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは;成熟ポリペプチドのコード配 列のみ;成熟ポリペプチドのコード配列および付加的なコード配列(例えば、リ ーダー配列もしくは分泌配列またはプロタンパク質配列;成熟ポリペプチドのコ ード配列(および必要に応じて付加的なコード配列)および非コード配列(例え ば、イントロンまたは成熟ポリペプチドのコード配列の5’および/または3’ の非コード配列)を包含し得る。 従って、用語「ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド」は、ポリペプチ ドのコード配列のみを含むポリヌクレオチドならびにさらなるコード配列および /または非コード配列を含むポリヌクレオチドを包含する。 本発明はさらに、図1または図2の推定アミノ酸配列を有するポリペプチドま たは寄託したクローンのcDNAによりコードされるポリペプチドの、フラグメント 、アナログ、および誘導体をコードする本明細書中上記のポリヌクレオチドの変 異体に関する。ポリヌクレオチドの変異体は、ポリヌクレオチドの天然に存在す る対立遺伝子変異体またはポリヌクレオチドの非天然に存在する変異体であり得 る。 従って、本発明は、図1または図2に示すものと同じ成熟ポリペプチドまたは その寄託したクローンのcDNAによりコードされる同じ成熟ポリペプチドをコード するポリヌクレオチド、ならびにこのようなポリヌクレオチドの変異体を包含す る。これらの変異体は、図1および図2のポリペプチドまたは寄託したクローン のcDNAによりコードされるポリペプチドのフラグメント、誘導体、またはアナロ グをコードする。このようなヌクレオチド変異体は、欠失変異体、置換変異体、 および付加または挿入変異体を包含する。 本明細書中上記で示したように、ポリヌクレオチドは、図1または図2に示す コード配列または寄託したクローンのコード配列の天然に存在する対立遺伝子変 異体であるコード配列を有し得る。当該分野で公知であるように、対立遺伝子変 異体は、ヌクレオチドの置換、欠失、または付加を有し得るポリヌクレオチド配 列の別の形態であり、これはコードされるポリペプチドの機能を実質的には変化 させない。ポリヌクレオチドはまた、成熟タンパク質およびさらなる5'アミノ酸 残基であるプロタンパク質をコードし得る。プロ配列を有する成熟タンパク質は プロタンパク質であり、そしてそれは不活性型のタンパク質である。一旦プロ配 列が切断されると、活性な成熟タンパク質が残る。 従って、例えば、本発明のポリヌクレオチドは、成熟タンパク質、またはプロ 配列を有するタンパク質もしくはプロ配列およびプレ配列(リーダー配列)の両 方を有するタンパク質をコードし得る。 本発明のポリヌクレオチドはまた、本発明のポリペプチドの精製を可能にする 配列にインフレームで融合されたコード配列を有し得る。マーカー配列は、細菌 宿主の場合にマーカーに融合された成熟ポリペプチドの精製に備えるpQE-9ベク ターにより供給されるヘキサヒスチジンタグであり得る。または、例えば、マー カー配列は、哺乳動物宿主(例えば、COS-7細胞)が使用される場合、ヘマグル チニン(HA)タグであり得る。HAタグは、インフルエンザヘマグルチニンタンパ ク質由来のエピトープに対応する(Wilson,I.ら、Cell、37:767(1984))。 本発明はさらに、配列間に少なくとも50%および好ましくは70%の同一性が存 在する場合、本明細書中上記の配列にハイブリダイズするポリヌクレオチドに関 する。本発明は特に、本明細書中上記のポリヌクレオチドにストリンジェントな 条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドに関する。本明細書中で用いられ る用語「ストリンジェントな条件」は、ハイブリダイゼーションが、配列間に少 なくとも95%および好ましくは少なくとも97%の同一性が存在する場合のみに生 じることをいう。好ましい実施態様において本明細書中上記のポリヌクレオチド にハイブリダイズするポリヌクレオチドは、図1および図2のcDNAまたは寄託し たcDNAによりコードされる成熟ポリペプチドと実質的に同じ生物学的機能または 生物学的活性を保持するポリペプチドをコードする。 本明細書中でいう寄託物(1つまたは複数)は、特許手続きの目的のための微 生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約の条項下に維持される。これら の寄託物は、当業者に便宜上のみ提供され、そして米国特許法第112条の下で寄 託が必要とされることを容認するものではない。寄託物に含まれるポリヌクレオ チドの配列、ならびにそれによりコードされるポリペプチドのアミノ酸配列は、 本明細書中に参考として援用されており、そして本明細書中の配列の記載とのい かなる矛盾の場合も制御されている。寄託物を製造し、使用し、または販売する ためには実施許諾が必要とされ得、そしてこのような実施許諾はこれによって与 えられるわけではない。 本発明はさらに、図1および図2の推定アミノ酸配列を有する、または寄託し たcDNAによりコードされるアミノ酸配列を有するICE-LAP-1およびICE-LAP-2ポリ ペプチド、ならびにこのようなポリペプチドのフラグメント、アナログ、および 誘導体に関する。 用語「フラグメント」、「誘導体」、および「アナログ」は、図1および図2 のポリペプチド、または寄託したcDNAによりコードされるポリペプチドをいう場 合は、このようなポリペプチドと本質的に同じ生物学的機能または生物学的活性 を保持するポリペプチドを意味する。そして、この場合、誘導体は増強したまた 低減した生物学的機能を有するポリペプチドを包含する。アナログは、プロタン パク質部分の切断により活性化されて活性な成熟ポリペプチドを生成し得るプロ タンパク質を包含する。 本発明のポリペプチドは、組換えポリペプチド、天然のポリペプチド、または 合成ポリペプチドであり得、好ましくは組換えポリペプチドであり得る。 図1および図2のポリペプチド、または寄託したcDNAによりコードされるポリ ペプチドのフラグメント、誘導体、またはアナログは、(i)その中で1以上のア ミノ酸残基が保存または非保存アミノ酸残基(好ましくは保存アミノ酸残基)で 置換され、そしてこのような置換されるアミノ酸残基が、遺伝コードによりコー ドされるアミノ酸残基であり得るかまたはあり得ないフラグメント、誘導体、ま たはアナログ、または(ii)その中で1以上のアミノ酸残基が置換基を含有するフ ラグメント、誘導体、またはアナログ、または(iii)その中で成熟ポリペプチド がポリペプチドの半減期を増加させる化合物(例えば、ポリエチレングリコール )のような別の化合物に融合されているフラグメント、誘導体、またはアナログ 、または(iv)その中でリーダー配列または分泌配列あるいは成熟ポリペプチドま たはプロタンパク質配列の精製に用いられる配列のようなさらなるアミノ酸が成 熟ポリペプチドに融合されるフラグメント、誘導体、またはアナログであり得る 。このようなフラグメント、誘導体、およびアナログは、本明細書中の教示から 、当業者の範囲内にあると考えられる。 本発明のポリペプチドおよびポリヌクレオチドは、好ましくは単離された形態 で提供され、そして好ましくは均質に精製される。用語「単離された」は、物質 がその本来の環境(例えば、天然に存在する場合は、天然の環境)から取り出さ れていることを意味する。例えば、生きている動物に存在する天然のポリヌクレ オチドまたはポリペプチドは単離されていないが、天然系において共存する物質 の幾らかまたは全部から分離された同一のポリヌクレオチドまたはポリペプチド は、単離されている。このようなポリヌクレオチドはベクターの一部であり得、 および/またはこのようなポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、組成物の一 部であり得、そしてさらにこのようなベクターまたは組成物がその天然の環境の 一部ではないため単離され得る。 本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドを含むベクター、本発明のベクター を用いて遺伝子操作される宿主細胞、および組換え技術によって本発明のポリペ プチドを生成することに関する。 宿主細胞は、本発明のベクター(これは例えば、クローニングベクターまたは 発現ベクターであり得る)を用いて遺伝子操作(形質導入または形質転換または トランスフェクト)される。ベクターは、例えば、プラスミド、ウイルス粒子、 ファージなどの形態であり得る。操作された宿主細胞は、プロモーターを活性化 し、形質転換体を選択し、またはICE-LAP-1遺伝子を増幅するために適切に改変 された従来の栄養培地中で培養され得る。培養条件(例えば、温度、pHなど)は 、発現のために選択される宿主細胞で以前に使用された条件であり、そして当業 者には明らかである。 本発明のポリヌクレオチドは、組換え技術によりポリペプチドを生成するため に用いられ得る。従って、例えば、ポリヌクレオチドは、ポリペプチドを発現す るための種々の発現ベクターのいずれか1つ内に含まれ得る。このようなベクタ ーは、染色体、非染色体、および合成DNA配列を包含し、例えば、SV40の誘導体 ;細菌性プラスミド;ファージDNA;バキュロウイルス;酵母プラスミド;プラ スミドおよびファージDNAの組み合わせに由来するベクター、ワクシニア、アデ ノウイルス、鶏痘ウイルス、および仮性狂犬病のようなウイルスDNAである。し かし、宿主において複製可能で、そして存続可能である限り、任意の他のベクタ ーが使用され得る。 適切なDNA配列は、種々の手順によりベクターに挿入され得る。一般に、DNA配 列は当該分野で公知の手順により適切な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入され る。このような手順および他の手順は、当業者に公知の範囲内であると考えられ る。 発現ベクター中のDNA配列は、適切な発現制御配列(1つまたは複数)(プロ モーター)に作動可能に連結され、mRNAの合成を指示する。このようなプロモー ターの代表的な例としては、以下が挙げられ得る:レトロウイルス(例えば、RSV 、HIV、HTLVI、CMV、またはSV40プロモーター)由来のLTR、E.coli lacまたはtrp 、 λファージPLプロモーター、および原核細胞または真核細胞あるいはそれらのウ イルス内で遺伝子の発現を制御することが公知である他のプロモーター。しかし 、細胞シグナル(例えばヒト-β-アクチンプロモーター)もまた、用いられ得る 。発現ベクターはまた、翻訳開始のためのリボソーム結合部位および転写ターミ ネーターを含有し得る。ベクターはまた、遺伝子のコピー数を増幅するための適 切な配列を含み得る。 さらに、発現ベクターは、好ましくは、形質転換された宿主細胞の選択のため の表現型特性(例えば、真核細胞培養物についてはジヒドロ葉酸レダクターゼま たはネオマイシン耐性、またはE .coliにおけるテトラサイクリン耐性またはア ンピシリン耐性)を提供する1つ以上の選択マーカー遺伝子を含有する。 本明細書中上記のような適切なDNA配列ならびに適切なプロモーター配列また は制御配列を含有するベクターは、適切な宿主を形質転換して宿主にタンパク質 を発現させるために用いられ得る。 適切な宿主の代表的な例としては、以下が挙げられ得る:細菌細胞(例えば、E .coliBacillus subtilis 、Streptomyces、Salmonella typhimurium);真菌 細胞(例えば酵母);昆虫細胞(例えば、DrosophilaおよびSf9);動物細胞( 例えば、CHO、COS、HEK 293またはBowes黒色腫);植物細胞など。適切な宿主の 選択は、本明細書中の教示から当業者の範囲内であると考えられる。 さらに詳細には、本発明はまた、上記で広範に記載した1つ以上の配列を含む 組換え構築物を包含する。構築物は、ベクター(例えば、プラスミドベクターま たはウイルスベクター)を包含し、このベクターの中には本発明の配列が正方向 または逆方向に挿入されている。この実施態様の好ましい局面によれば、構築物 はさらに、配列に作動可能に連結された調節配列(例えば、プロモーターを包含 する)を含む。多数の適切なベクターおよびプロモーターが当業者には公知であ り、そして購入可能である。以下のベクターが例として提供される。細菌性:pQ E70、pQE60、pQE-9(Qiagen)、pbs、pD10、phagescript、psiX174、pbluescript SK、pbsks、pNH8a、pNH16a、pNH18A、pNH46A(Stratagene);ptrc99a、pKK223-3 、pKK233-3、pDR540、pRIT5(Pharmacia)。真核性:pWLNEO、pSV2CAT、pOG44、pX T1、pSG(Stratagene);pSVK3、pBPV、pMSG、pSVL(Pharmacia)。しかし、宿 主において複製可能で、そして存続可能である限り、任意の他のプラスミドまた はベクターも使用され得る。 プロモーター領域は、CAT(クロラムフェニコールトランスフェラーゼ)ベク ターまたは選択マーカーを有する他のベクターを使用して、任意の所望の遺伝子 から選択され得る。2つの適切なベクターは、pKK232-8およびpCM7である。特に よく知られた細菌プロモーターは、lacI、lacZ、T3、T7、-gpt、λPR、PL、およ びtrpを含む。真核プロモーターは、CMV即時初期型、HSVチミジンキナーゼ、初 期SV40および後期SV40、レトロウイルス由来のLTR、およびマウスメタロチオネ インIを包含する。適切なベクターおよびプロモーターの選択は、十分に当業者 のレベルの範囲内にある。 さらなる実施態様では、本発明は上記の構築物を含有する宿主細胞に関する。 宿主細胞は、高等真核細胞(例えば、哺乳動物細胞)または下等真核細胞(例え ば、酵母細胞)であり得るか、または宿主細胞は原核細胞(例えば、細菌細胞) であり得る。構築物の宿主細胞への導入は、リン酸カルシウムトランスフェクシ ョン、DEAE-デキストラン媒介トランスフェクション、リポフェクションまたは エレクトロポレーションにより達成され得る(Davis,L.、Dibner,M.、Battey,I .、Basic Methods in Molecular Biology、1986)。 宿主細胞中の構築物は、組換え配列によりコードされる遺伝子産物を産生する ために、従来の方法で使用され得る。あるいは、本発明のポリペプチドは、従来 のペプチド合成機により合成的に生成され得る。 成熟タンパク質は、哺乳動物細胞、酵母、細菌、または他の細胞中で適切なプ ロモーターの制御下で発現され得る。無細胞翻訳系もまた、このようなタンパク 質を生成するために、本発明のDNA構築物に由来するRNAを使用して用いられ得る 。原核宿主および真核宿主で使用される適切なクローニングベクターおよび発現 ベクターは、Sambrookら、Molecular Cloning: A Laboratory Manual,第2版( Cold Spring Harbor、N.Y.、1989)(この開示は、本明細書中に参考として援用 されている)に記載されている。 本発明のポリペプチドをコードするDNAの高等真核生物による転写は、ベクタ ーにエンハンサー配列を挿入することにより増大される。エンハンサーはDNAの シス作用因子であり、通常は約10〜約300bpであり、これはプロモーターに作用 してその転写を増大させる。例としては、複製起点bp100〜270の後期側のSV40エ ンハンサー、サイトメガロウイルスの早期プロモーターエンハンサー、複製起点 の後期側のポリオーマエンハンサー、およびアデノウイルスエンハンサーを包含 する。 一般に、組換え発現ベクターは、複製起点および宿主細胞の形質転換を可能と する選択マーカー(例えば、E .coliのアンピシリン耐性遺伝子およびS .cerevi siae のTRP1遺伝子)および下流の構造配列の転写を指示する高発現遺伝子に由来 するプロモーターを含有する。このようなプロモーターは、特に解糖酵素(例え ば、3-ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK)、α因子、酸性ホスファターゼ、また は熱ショックタンパク質など)をコードするオペロンに由来し得る。異種構造配 列は、翻訳開始配列および翻訳終止配列、および好ましくは翻訳されたタンパク 質を細胞周辺腔または細胞外培地へ分泌することを指示し得るリーダー配列と適 切な相内で組立てられる。必要に応じて、異種配列は、所望の特徴(例えば、発 現された組換え産物の安定化または簡略化された精製)を与えるN末端同定ペプ チドを含む融合タンパク質をコードし得る。 細菌の使用に有用な発現ベクターは、機能的なプロモーターと作動可能な読み とり相で、所望のタンパク質をコードする構造DNA配列を適切な翻訳開始シグナ ルおよび翻訳終止シグナルと共に挿入することにより構築される。ベクターは、 1以上の表現型選択マーカー、ならびに、ベクターの維持を保証するため、およ び所望により宿主内での増幅を提供するために複製起点を含有する。形質転換の ために適切な原核宿主は、E .coliBacillus subtilisSalmonella typhimuri um 、ならびにPseudomonas属、Streptomyces属、およびStaphylococcus属の種々 の種を包含するが、他の種もまた選択対象として用いられ得る。 代表的な、しかし限定しない例として、細菌の使用に有用な発現ベクターは、 周知のクローニングベクターpBR322(ATCC 37017)の遺伝エレメントを含む市販 のプラスミドに由来する選択マーカーおよび細菌の複製起点を含有し得る。この ような市販のベクターは、例えば、pKK223-3(Pharmacia Fine Chemicals、Upps ala、Sweden)およびGEM1(Promega Biotec、Madison、WI、USA)を包含する。こ れらのpBR322「骨格」部分は、適切なプロモーターおよび発現されるべき構造配 列と組み合わされる。 適切な宿主系統の形質転換および適切な細胞密度への宿主系統の増殖に続いて 、選択されたプロモーターは、適切な手段(例えば、温度シフトまたは化学的誘 導)により誘導され、そして細胞はさらなる期間培養される。 細胞は、代表的には遠心分離により収集され、物理的手段または化学的手段に より破砕され、そして得られた粗抽出物はさらなる精製のために保持される。 タンパク質の発現において用いられる微生物細胞は、凍結融解サイクル、超音 波処理、機械的破砕、または細胞溶解剤の使用を包含する任意の便利な方法によ り破砕され得、このような方法は、当業者に周知である。 種々の哺乳動物細胞の培養系もまた、組換えタンパク質を発現するために用い られ得る。哺乳動物発現系の例は、Gluzman、Cell、23: 175(1981)に記載されて いるサル腎臓繊維芽細胞のCOS-7株、および適合性のベクターを発現し得る他の 細胞株(例えば、C127、3T3、CHO、HeLa、およびBHK細胞株)を包含する。哺乳 動物発現ベクターは、複製起点、適切なプロモーターおよびエンハンサー、ポリ アデニル化部位、、スプライスドナー部位およびスプライスアクセプター部位、 転写終止配列、および5’フランキング非転写配列を含有し得る。SV40スプライ スおよびポリアデニル化部位に由来するDNA配列は、必要な非転写遺伝エレメン トを提供するために使用され得る。 ICE-LAP-1およびICE-LAP-2ポリペプチドは、以下に挙げる方法により組換え細 胞培養物から回収され、そして精製され得る。これらの方法には、硫安沈殿また はエタノール沈殿、酸抽出、陰イオンまたは陽イオン交換クロマトグラフィー、 リン酸セルロースクロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、ア フィニティークロマトグラフィー、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィー 、およびレクチンクロマトグラフィーが包含される。必要に応じて、タンパク質 の再折りたたみ(refolding)工程が、成熟タンパク質の配置を完全にするため に使用され得る。最終的に、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)が、最終的な精 製工程に用いられ得る。 本発明のポリペプチドは、天然の精製された産物、または化学合成手順の産物 であり得るか、あるいは原核宿主または真核宿主(例えば、培養物中の細菌、酵 母、高等植物、昆虫、および哺乳動物細胞により)から組換え技術により生成さ れ得る。組換え産生手順に用いられる宿主に依存して、本発明のポリペプチドは 、グリコシル化され得るか、あるいはグリコシル化され得ない。本発明のポリペ プチドはまた、開始メチオニンアミノ酸残基を含み得る。 ICE-LAP-1およびICE-LAP-2ポリペプチドは、異常に制御されたプログラム細胞 死を処置するために用いられ得る。異常に制御されたプログラム細胞死は、細胞 成長の異常な量によるガンの基礎的な原因であり得る。それゆえ、ICE-LAP遺伝 子は、プログラムされた細胞死に関係するので、望まれない細胞(例えば、ガン 細胞)を標的するのに用いられ得る。ICE-LAP-1およびICE-LAP-2はまた、脊椎動 物の成長および組織の恒常性(そのアポトーシス能による)を制御するのに用いら れる。 また、プログラム細胞死は、細胞の主要な抗ウイルス防衛メカニズムの一つで あり得るので、ICE-LAP-1およびICE-LAP-2ポリペプチドは、抑制されたプログラ ム細胞死に打ち勝つことで、多くのウイルス感染に打ち勝つために用いられ得る 。 ICE-LAP-1およびICE-LAP-2はまた、細胞死に対するウイルス感染細胞を標的す ることにより免疫抑制に関連する異常(例えば、AIDS)を処置するのに用いられ得 る。 本発明のポリペプチドはまた、同様の生物学的活性を有する他の分子を同定す るために用いられ得る。これに対するスクリーニングの例は、オリゴヌクレオチ ドプロープを合成するために公知のDNA配列を用いることによる、ICE-LAP遺伝子 のコード領域の単離を包含する。本発明の遺伝子との配列相補を有する標識オリ ゴヌクレオチドは、ヒトcDNA、ゲノムDNA、またはmRNAのライブラリーのスクリ ーニングに用いられ、ライブラリーの内のどのメンバーとプロープがハイブリダ イズするかを決定する。 このポリペプチドはまた、本発明に従って、インビボでのこのようなポリペプ チドの発現により使用され得る。これはしばしば「遺伝子治療」と呼ばれる。 従って、例えば、患者由来の細胞は、ポリペプチドをコードするポリヌクレオ チド(DNAまたはRNA)を用いてエキソビボで操作され得、次いで、操作された細 胞はこのポリペプチドで処置されるべき患者に提供される。このような方法は当 該分野で周知である。例えば、細胞は、本発明のポリペプチドをコードするRNA を含有するレトロウイルス粒子の使用により、当該分野で公知の手順によって操 作され得る。 同様に、細胞は、インビボでのポリペプチドの発現のために、例えば、当該分 野で公知の手順によりインビボで操作され得る。当該分野で公知のように、本発 明のポリペプチドをコードするRNAを含有するレトロウイルス粒子を産生するた めの産生細胞は、インビボで細胞を操作するためおよびインビボでのポリペプチ ドの発現のために患者に投与され得る。このような方法により本発明のポリペプ チドを投与するためのこれらの方法および他の方法は、本発明の教示から当業者 には明らかである。例えば、細胞を操作するための発現ベヒクル(vehicle)は、 レトロウイルス以外のもの(例えば、アデノウイルス)であり得る。これは、適 切な送達ベヒクルと組み合わせた後インビボで細胞を操作するために使用され得 る。 本発明のポリペプチドは、適切な薬学的キャリアと組み合わせて用いられ得る 。このような組成物は、治療有効量のポリペプチド、および薬学的に受容可能な キャリアまたは賦形剤を包含する。このようなキャリアとしては、生理食塩液、 緩衝化生理食塩液、デキストロース、水、グリセロール、エタノール、およびそ れらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。処方は、投与の態様 に合わせるべきである。 本発明はまた、本発明の薬学的組成物の1つ以上の成分で満たされた1つ以上 の容器を含有する薬学的パックまたはキットを提供する。このような容器は、薬 剤または生物学的製品の製造、使用、または販売を統制する政府機関により規定 された形式の通知と関連し得、この通知はヒトへの投与についての製造、使用、 または販売における政府機関による認可を反映する。さらに、本発明のポリペプ チドは、他の治療用化合物と併用して用いられ得る。 薬学的組成物は、静脈内、腹腔内、筋内、皮下、鼻腔内または皮内経路による ような、都合の良い方法で投与され得る。ICE-LAP-1およびICE-LAP-2は、特異的 な症候の処置および/または予防に対して有効である量で投与される。一般に、 ICE-LAP-1およびICE-LAP-2は、例えば少なくとも約10μg/kg体重の量で投与され 、そしてほとんどの場合、1日当たり8mg/kg体重を超過しない量で投与される 。ほとんどの場合、投与経路、症状などを考慮して、用量は毎日約10μg/kg体重 〜約1mg/kg体重である。 本発明の配列はまた、染色体の同定に有益であり得る。この配列は、個々のヒ ト染色体上の特定の位置を特異的に標的化し、そしてその位置でハイブリダイズ し得る。さらに、現在は染色体上の特定の部位を同定する必要がある。現在、染 色体位置の標識に利用可能な実際の配列データ(反復多型)に基づいた染色体標 識試薬はほとんどない。本発明によるDNAの染色体へのDNAのマッピングは、これ らの配列と疾患に関する遺伝子との相関において重要な、第1歩である。 簡略に述べれば、配列は、cDNAからPCRプライマー(好ましくは15〜25bp)を 調製することにより染色体にマップされ得る。cDNAのコンピューター解析が、ゲ ノムDNA内で1つより多いエキソンにまたがらず、従って増幅プロセスを複雑化 しないプライマーを迅速に選択するために使用される。次いで、これらのプライ マーは、個々のヒト染色体を含有する体細胞ハイブリッドのPCRスクリーニング に使用される。プライマーに対応するヒト遺伝子を含有するハイブリッドのみが 増幅フラグメントを生じる。 体細胞ハイブリッドのPCRマッピングは、特定の染色体に特定のDNAを割り当て るための迅速な手順である。本発明を同じオリゴヌクレオチドプライマーと共に 使用して、特定の染色体由来のフラグメントのパネルまたは類似の様式の大きな ゲノムクローンのプールを用いて部分的位置決め(sublocalization)が達成され 得る。染色体にマップするために同様に使用され得る他のマッピング戦略は、イ ンサイチュハイブリダイゼーション、標識したフローサイトメトリーで選別した (flow-sorted)染色体を用いるプレスクリーニング、および染色体特異的cDNA ライブラリーを構築するためのハイブリダイゼーションによるプレ選択を包含す る。 cDNAクローンの中期染色体展開物への蛍光インサイチュハイブリダイゼーショ ン(FISH)は、1工程で正確な染色体位置を提供するために使用され得る。この技 術は、500または600塩基ほどの短いcDNAで使用され得る;しかし、2,000bpより も大きいクローンの方が、簡便な検出に十分なシグナル強度で独特の染色体位置 に結合しやすい。FISHは、ESTが由来するクローンの使用を必要とし、そしてこ のクローンは長いほど好ましい。例えば、2,000bpが良好であり、4,000bpはより 良好であり、そして4,000bpを超える長さは、合理的な割合の時間で(a resonab le percentage of the time)良好な結果を得るためにおそらく必ずしも必要で ない。この技術の総説としては、Vermaら、Human Chromosomes: a Manual of B asic Techniques,Pergamon Press、New York(1988)を参照のこと。 一旦配列が正確な染色体位置にマップされると、染色体上での配列の物理的な 位置を遺伝的地図のデータと相関させ得る。このようなデータは、例えば、V.M cKusick、Mendelian Inheritance in Man に見出される(Johns Hopkins Univers ity Welch Medical Libraryからオンラインで入手可能である)。次いで、同一の 染色体領域にマップされている遺伝子と疾患との関係が、連鎖解析(物理的に隣 接した遺伝子の同時遺伝)により同定される。 次に、罹患個体と非罹患個体との間のcDNAまたはゲノム配列の差異を決定する 必要がある。変異がいくつかまたはすべての罹患個体に観察されるが正常な個体 には観察されない場合、この変異は疾患の原因因子であると思われる。 物理的マッピングおよび遺伝的マッピング技術の現在の解像度では、疾患に関 する染色体領域に正確に位置決めされたcDNAは、50と500との間の潜在的原因遺 伝子の1つであり得る。(これは、1メガ塩基のマッピング解像度で、そして20 kbあたり1遺伝子と仮定する。) このポリペプチド、そのフラグメントまたは他の誘導体、またはそれらのアナ ログ、あるいはそれらを発現する細胞は、それらに対する抗体を生成させるため の免疫原として使用され得る。これらの抗体は、例えば、ポリクローナル抗体ま たはモノクローナル抗体であり得る。本発明はまた、キメラ抗体、単鎖抗体およ びヒト化抗体、ならびにFabフラグメント、またはFab発現ライブラリーの産物を 包含する。当該分野で公知の種々の手順が、このような抗体およびフラグメント の生成のために使用され得る。 本発明の配列に対応するポリペプチドに対して生成される抗体は、動物へのポ リペプチドの直接注射により、または動物へのポリペプチドの投与により得られ 得る。この動物は、好ましくはヒトではない。次いで、このようにして得られた 抗体は、ポリペプチド自体に結合する。このようにして、ポリペプチドのフラグ メントのみをコードする配列でさえも、天然のポリペプチド全体に結合する抗体 を生成するために使用され得る。次いで、このような抗体は、そのポリペプチド を発現する組織からそのポリペプチドを単離するために使用され得る。 モノクローナル抗体の調製のために、連続的な細胞株培養により産生される抗 体を提供する任意の技術が使用され得る。例としては、ハイブリドーマ技術(Ko hlerおよびMilstein、1975、Nature、256: 495-497)、トリオーマ技術、ヒトB 細胞ハイブリドーマ技術(Kozborら、1983、Immunology Today 4:72)、および ヒトモノクローナル抗体を生成するためのEBVハイブリドーマ技術(Coleら、198 5、Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy、Alan R.Liss,Inc.、77-96頁 )が挙げられる。 単鎖抗体を生成するために記載された技術(米国特許第4,946,778号)を、本 発明の免疫原性ポリペプチド産物に対する単鎖抗体を生成するために適合させ得 る。 本発明はまた、宿主から得られたサンプル(例えば、血液、尿、または血清サ ンプル)中の、ICE-LAP-1およびICE-LAP-2のレベルを検出する診断アッセイに関 する。ICE-LAP-1およびICE-LAP-2のレベルは、例えば、当該分野で公知の手順に よるイムノアッセイ技術により検出され得る。このようなアッセイの例は、ICE- LAP-1およびICE-LAP-2抗原に特異の二つの抗体、好ましくは、抗体の一つが、標 識される(例えば、指示酵素(例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ)のような 適切な標識を結合させることにより)モノクローナル抗体を利用するサンドイッ チアッセイであり、非標識抗体は、好ましくは固体支持体上にある。抗原が存在 する場合、抗原は、両方の抗体に結合する。ペルオキシダーゼ結合抗体の抗原へ の結合の後、ペルオキシダーゼは、測定可能で、その濃度がサンプル中の抗原の 量に関係する着色産生物を生成させるために用いられ得る。酵素の触媒性質によ り、系はシグナルを非常に増幅する。ICE-LAP-1およびICE-LAP-2の変化したレベ ルは、上記の特定の疾患を指示する。 本発明はまた、本発明のポリペプチドのアンタゴニスト/インヒビターに関す る。アンタゴニスト/インヒビターは、ポリペプチドの機能を減少または排除す るために使用され得る。 アンタゴニストの例は、抗体であり、またはいくつかの場合では、ICE-LAP-1 およびICE-LAP-2ポリペプチドに結合するオリゴヌクレオチドである。インヒビ ターの例は小分子であり、この小分子は、ポリペプチドの触媒部位に結合してこ れを塞ぎ、それにより触媒部位を基質に接近不能にし、その結果正常な生物学的 活性が妨害される。小分子の例は、小ペプチドまたはペプチド様分子を包含する が、それらに限定されない。 インビボでの、ICE-LAP-1およびICE-LAP-2のレベルは、アンチセンス技術の使 用による、インビボでのICE-LAP-1およびICE-LAP-2の産生を阻害するアンチセン ス構築物の投与により減少し得る。アンチセンス技術は、3重ヘリックスの形成 あるいはアンチセンスDNAまたはアンチセンスRNAを介して遺伝子発現を制御する ために使用され得る。これらの方法は両方とも、DNAまたはRNAへのポリヌクレオ チドの結合に基づく。例えば、本発明の成熟ポリペプチドをコードするポリヌク レオチド配列の5'コード部分が、約10塩基対〜40塩基対の長さのアンチセンスR NAオリゴヌクレオチドを設計するために使用される。DNAオリゴヌクレオチドは 、転写に関わる遺伝子の領域に相補的であるように設計され(3重ヘリックス− Leeら、Nucl.Acids Res.、6:3073(1979);Cooneyら、Science、241:456(1988) ;およびDervanら、Science、251:1360(1991)を参照のこと)、その結果ICE-LAP -1およびICE-LAP-2ポリペプチドの転写および生成を防ぐ。アンチセンスRNAオリ ゴヌクレオチドは、インビボでmRNAにハイブリダイズし、そしてICE-LAP-1およ びICE-LAP-2ポリペプチドへのmRNA分子の翻訳をブロックする(アンチセンス−O kano、J.Neurochem.、56:560(1991);Oligodeoxynucleotides as Antisense In hibitors of Gene Expression、CRC Press、Boca Raton、FL(1988)を参照のこと )。 アンタゴニスト/インヒビターは、心血管症、卒中、外傷、および他の退行性 疾患(ICE-LAP-1およびICE-LAP-2の異常な調制が、病理的細胞死、例えば、免疫 抑制関係疾患、アルツハイマー病、パーキンソン病、慢性関節リウマチを起こし 得る場合)に関係する非プログラム壊死性細胞死を処置するのに用いられ得る。 アンタゴニスト/インヒビターはまた、肺および気管、中枢神経系、目およ び耳、関節、骨、心血管系、ならびに胃腸系および泌尿系の免疫に基づく疾患を 処置するのに用いられ得る。アンタゴニスト/インヒビターは、薬学的に受容可 能なキャリア(例えば、本明細書中上記)との組成物において用いられ得る。 本発明は、さらに、本発明のICE-LAP-1およびICE-LAP-2ポリペプチドのアンタ ゴニスト/インヒビターまたはアゴニストを同定するための分子をスクリーニン グするプロセスに関する。アゴニストは、ICE-LAP-1およびICE-LAP-2の本来の生 物学的機能を増加させるが、一方、アンタゴニストは、このような機能を減少さ せまた除去する。このようなアッセイの例は、基質への作用を可能にし、そして これらの化合物が、ICE-LAP-1およびICE-LAP-2が基質を切断することを妨げるか 、または切断を促進するかどうかを決定する条件下で、ICE-LAP-1およびICE-LAP -2、ならびに潜在的なアンタゴニスト化合物またはアゴニスト化合物とそれらの 自然基質との組み合わせを包含する。 本発明を以下の実施例を参照にしてさらに記載する;しかし、本発明はこのよ うな実施例に限定されないことを理解されたい。すべての部または量は、他に明 記しない限り重量基準である。 以下の実施例の理解を容易にするために、現れる頻度の高い特定の方法および /または用語を記載する。 「プラスミド」は、小文字のpの前および/または後の大文字および/または 数字により示される。本明細書中の出発プラスミドは、市販であるか、制限基準 なく公的に入手可能であるか、または公表された手順に従って入手可能なプラス ミドから構築され得るかのいずれかである。さらに、記載されるプラスミドと等 価なプラスミドが当該分野で公知であり、そして当業者には明らかである。 DNAの「消化」は、DNA中の特定の配列でのみ作用する制限酵素でそのDNAを触 媒反応的に切断することをいう。本明細書中で使用される種々の制限酵素は、市 販されており、そしてそれらの反応条件、補因子、および他の必要条件は当業者 に公知のものが使用された。分析目的には、代表的には1μgのプラスミドまた はDNAフラグメントを、約2単位の酵素とともに約20μlの緩衝溶液中で使用する 。プラスミド構築のためのDNAフラグメントを単離する目的のために、代表的に は 5〜50μgのDNAを20〜250単位の酵素で、より大きな容量中で消化する。特定の 制限酵素のための適切な緩衝液および基質量は、製造者により特定される。37℃ での約1時間のインキュベーション時間が通常使用されるが、これは供給者の説 明書に従って変化し得る。消化後、反応物をポリアクリルアミドゲルで直接電気 泳動して所望のフラグメントを単離する。 切断されたフラグメントのサイズ分離は、Goeddel,D.ら、Nucleic Acids Res .、8:4057(1980)により記載された8%ポリアクリルアミドゲル、またはアガロ ースゲル(0.5〜1.5%)を使用して行われる。 「オリゴヌクレオチド」は、1本鎖ポリデオキシヌクレオチドまたは2つの相 補的なポリデオキシヌクレオチド鎖のいずれかをいい、これらは化学的に合成さ れ得る。このような合成オリゴヌクレオチドは、5'リン酸を有さず、従ってキ ナーゼの存在下でリン酸とATPとを添加しなければ別のオリゴヌクレオチドに連 結しない。合成オリゴヌクレオチドは、脱リン酸化されていないフラグメントに 連結する。 「連結」は、2つの2本鎖核酸フラグメントの間でリン酸ジエステル結合を形 成するプロセスをいう(Maniatis,T.ら、前出、146頁)。他に提供しない限り、 連結は、ほぼ等モル量の連結されるべきDNAフラグメント0.5μgあたり10単位のT 4 DNAリガーゼ(「リガーゼ」)とともに、公知の緩衝液および条件を用いて達 成され得る。 他に記載しない限り、形質転換はGraham,F.およびVan der Eb,A.、Virology 、52:456-457(1973)の方法に記載されるように行った。 実施例1 COS 細胞における組み換えICE-LAP-1の発現 発現プラスミド(ICE-LAP-1 HA)は、以下を含むベクターpcDNAI/Amp(Invitr ogen)に由来する:1)SV40複製開始点、2)アンピシリン耐性遺伝子、3)E.col i複製開始点、4)CMVプロモーター、それに続くポリリンカー領域、SV40イント ロンおよびポリアデニル化部位。全ICE-LAP-1前駆体およびその3'末端にインフ レームに融合したHAタグをコードするDNAフラグメントを、ベクターのポリリン カー領域にクローン化した。従って、組み換えタンパク質発現は、CMVプロモー ター下の支配を受ける。HAタグは、前記のインフルエンザヘマグルチニンタンパ ク質由来のエピトープに対応する(I.Wilson、H.Niman、R.Heighten、A.Che renson、M.Connolly、およびR.Lerner、1984、Cell 37、767)。本発明者の標 的タンパク質に対するHAタグの融合は、HAエピトープを認識する抗体と共に、組 換えタンパク質の容易な検出を可能にする。 プラスミド構成方法は、以下の通りである: ICE-LAP-1(ATCC # 75772)をコードするDNA配列を2つのプライマーを用いて 、全長のICE-LAP-1上のPCRにより構築した:5'プライマ-配列(5'-GTTCACTATGG CAGAAGGCAAGGACAG-3')は、ICE-LAP-1翻訳開始部位ATG、続いて開始コドンから 始まるICE-LAP-1コード配列の17ヌクレオチドを含有する;3'配列5'-AATCAAGCG TAGTCTGGGACGTCGTATGGGTAATTGCCAGGAAAGAGGTAGAAA-3'は、翻訳停止コドン、HAタ グおよびICE-LAP-1コード配列の最後の28ヌクレオチド(停止コドンを含まない )を含有する。従って、PCR産物は、インフレームに融合したHAタグを伴うICE-L AP-1コード配列、およびHAタグに隣接する翻訳終了停止コドンを含有する。PCR 増幅DNAフラグメントを、平滑端連結によりpcDNAI/Ampと連結した。連結混合物 を、E.coli株SURE(Stratagene Cloning Systems、11099 North Torrey Pines R oad、La Jolla、CA 92037から入手可能)に形質転換した。形質転換培養物をア ンピシリン培地プレート上に塗布して、そして耐性コロニーを選択した。プラス ミドDNAを、形質転換体から単離し、そして正しいフラグメントの存在に対する 制限分析により試験した。組換えICE-LAP-1の発現のために、COS細胞を、DEAEデ キストラン法により発現ベクターを用いてトランスフェクトした(J.Sambrook 、E.Fritsch、T.Maniatis、Molecular Cloning:A Laboratory Manual、Cold Spring Laboratory Press、(1988))。ICE-LAP-1 HAタンパク質の発現を、放射 性標識法および免疫沈降法により検出した(E.Harlow、D.Lane、Antibodies: A Laboratory Manual、Cold Spring Harbor Laboratory Press、(1989))。細胞 質を、トランスフェクションの2日後に35S-システインで8時間標識した。次い で培養培地を採集し、そして細胞を界面活性剤で溶解した(RIPA緩衝液(150mM NaCl、1% NP-40、0.1% SDS、1% NP-40、0.5% DOC、50mM Tris、pH 7.5) )。 (Wilson,I.ら、前出37:767(1984))。細胞溶解産物および培養培地の両方を、 HA特異的モノクローナル抗体で沈澱させた。沈澱したタンパク質を、15%SDS-PA GEゲルで分析した。 実施例2 COS 細胞における組み換えICE-LAP-2の発現 発現プラスミド(ICE-LAP-2 HA)は、以下を含むベクターpcDNAI/Amp(Invitr ogen)に由来する:1)SV40複製開始点、2)アンピシリン耐性遺伝子、3)E.col i複製開始点、4)CMVプロモーター、それに続くポリリンカー領域、SV40イント ロンおよびポリアデニル化部位。全ICE-LAP-2前駆体およびその3'末端にインフ レームに融合したHAタグをコードするDNAフラグメントを、ベクターのポリリン カー領域にクローン化した。従って、組み換えタンパク質発現は、CMVプロモー ター下の支配を受ける。HAタグは、前記のインフルエンザヘマグルチニンタンパ ク質由来のエピトープに対応する(I.Wilson、H.Niman、R.Heighten、A.Che renson、M.Connolly、およびR.Lerner、1984、Cell 37、767)。本発明者の標 的タンパク質に対するHAタグの融合は、HAエピトープを認識する抗体と共に、組 換えタンパク質の容易な検出を可能にする。 プラスミド構成方法は、以下の通りである: ICE-LAP-2(ATCC # 75819)をコードするDNA配列を、2つのプライマーを用いて 、全長のICE-LAP-2上のPCRにより構築した:5'プライマー(5'-AGCTGATGGCCGCT GACAGGGG-3')は、ICE-LAP-2翻訳開始部位(ATG)、続いて開始コドンから始まるI CE-LAP-2コード配列の14ヌクレオチドを含有する;3'配列(5’AATCAAGCGTAGTC TGGGACGTCGTATGGGTATGTGGGAGGGTGTCCTGGGA 3')は、翻訳停止コドン、HAタグお よびICE-LAP-2コード配列の最後の20ヌクレオチド(停止コドンを含まない)を 含有する。従って、PCR産物は、インフレームに融合したHAタグを伴うICE-LAP-2 コード配列、HAタグに隣接する翻訳終了停止コドンを含有する。PCR増幅DNAフラ グメントを、平滑端連結によるpcDNAI/Ampと連結した。連結混合物を、E.coli株 SURE(Stratagene Cloning Systems、11099 North Torrey Pines Road、La Joll a、CA 92037から入手可能)に形質転換した。形質転換培養物をアンピシリン培 地プ レート上に塗布し、そして耐性コロニーを選択した。プラスミドDNAを、形質転 換体から単離し、そして正しいフラグメントの存在に対する制限分析により試験 した。組換えICE-LAP-2の発現のために、COS細胞を、DEAEデキストラン法により 発現ベクターを用いてトランスフェクトした(J.Sambrook、E.Fritsch、T.Ma niatis、Molecular Cloning:A Laboratory Manual、Cold Spring Laboratory P ress、(1989))。ICE-LAP-2 HAタンパク質の発現を、放財性標識法および免疫沈 降法により検出した(E.Harlow、D.Lane、Antibodies:A Laboratory Manual 、Cold Spring Harbor Laboratory Press、(1988))。細胞を、トランスフェク ションの2日後に35S-システインで8時間標識した。次いで培養培地を採集し、 そして細胞を界面活性剤で溶解した(RIPA緩衝液(150mM NaCl、1% NP-40、0. 1% SDS、1% NP-40、0.5% DOC、50mM Tris、pH 7.5))。(Wilson,I.ら、前 出 37:767(1984))。細胞溶解物および培養培地の両方を、HA特異的モノクロー ナル抗体で沈澱させた。沈澱したタンパク質を、15%SDS-PAGEゲルで分析した。 実施例3 ヒト組織におけるICE-LAP-1の発現パターン ノーザンブロット分析を行い、ヒト組織におけるICE-LAP-1の発現レベルを試 験した。細胞の全RNAサンプルを、RNAzolTMBシステム(Biotecx Laboratories,I nc.6023 South Loop East、Houston、TX 77033)で単離した。指示された各ヒト 組織から単離された、約10μgの全RNAを1%アガロースゲルで分離し、そしてナ イロンフィルター上でブロットした。(Sambrook、Fritsch、およびManiatis、M olecular Cloning、Cold Spring Harbor Press、(1989))。標識反応を、50ngの DNAフラグメントを用いてStratagene Prime-Itキットに従って行った。標識され たDNAを、Select-G-50カラムで精製した。(5Prime−3Prime,Inc.5603 Arapaho e Road、Boulder、CO 80303)。次いで、フィルターを、放射能標識された全長 のICE-LAP-1遺伝子を用いて、0.5M NaPO4(pH7.4)および7%SDS中、1,000,000cp m/mlで一晩65℃で、ハイブリダイズした。0.5×SSCで、0.1%SDSを用いて、室温 で2回、そして60℃で2回洗浄した後、次いでフィルターを、-70℃で増強スク リーン(intensifying screen)とともに一晩曝した。ICE-LAP-1に対するメッセ ージRNAは、肝臓において多量である。(図5)。 実施例4 ヒト組織におけるICE-LAP-2の発現パターン ノーザンブロット分析を行い、ヒト組織におけるICE-LAP-2の発現レベルを試 験した。細胞の全RNAサンプルを、RNAzolTMBシステム(Biotecx Laboratories,I nc.6023 South Loop EaSt、Houston、TX 77033)で単離した。指示された各ヒト 組織から単離された、約10μgの全RNAを1%アガロースゲルで分離し、そしてナ イロンフィルター上でブロットした。(Sambrook、Fritsch、およびManiatis、M olecular Cloning、Cold Spring Harbor Press、(1989))。標識反応を、50ngの DNAフラグメントを用いてStratagene Prime-Itキットに従って行った。標識され たDNAを、Select-G-50カラムで精製した。(5Prime−3Prime,Inc.5603 Arapaho e Road、Boulder、CO 80303)。次いで、フィルターを、放射能標識された全長 のICE-LAP-2遺伝子を用いて、0.5M NaPO4(pH7.4)および7%SDS中、1,000,000cp m/mlで一晩65℃で、ハイブリダイズした。0.5×SSCで、0.1%SDSを用いて、室温 で2回、そして60℃で2回洗浄した後、次いでフィルターを、-70℃で増強スク リーンとともに一晩曝した。 本発明の多くの改変および変化は、上記の教示に照らして、可能であり、従っ て、添付の請求の範囲内で、本発明は、具体的に記載される以外にも実施し得る 。 DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION   Interleukin-1β converting enzyme-like apoptosis protease-1 and 2   The present invention relates to newly identified polynucleotides, such polynucleotides. Polypeptides, such polynucleotides and polypeptides Use of such polynucleotides and the production of such polynucleotides and polypeptides I do. More specifically, the polypeptides of the present invention may have an interleukin-1β conversion Enzyme-like apoptotic protease-1 and interleukin-1β converting enzyme-like It is an apoptotic protease-2, and hereafter, often collectively as "IC Called E-LAP-1 and 2 ". The present invention also relates to the action of such a polypeptide. Related to inhibiting.   Interleukin-1β converting enzyme (ICE) converts pro-IL-1β to mature, active I Involved in cleavage to L-1β and also removes unwanted cells from the organism. Process is most likely involved in programmed cell death (or apoptosis). Recently discovered. The present invention relates to ICE-LAP-1 and 2 which are structurally related to ICE. .   The genetic pathway of programmed cell death in the nematode caenorhabditis elegans The path was confirmed (Ellis, R.E., et al., Annu. Rev. Cell Biol., 7: 663-698 (1991)). 2 Genes (ced-3 and ced-4) are programmed cell death in C. elegans It is essential for cells to go through. (Ellis, H.M., and Horvitz, H.R., C ell, 44: 817-829 (1986)). A recessive mutant that eliminates the function of these two genes Blocks normal programmed cell death, during C. elegans development. ced-3 tampa The known vertebrate counterpart to dentin is ICE. The whole between ced-3 and ICE The amino acid identity over the entire region is 28%, a region of 115 amino acids (the remainder of ced-3). It shows the highest identity (43%) at groups 246-360 and residues 164-278 of the ICE. This area Contains the conserved pentapeptide QACRG (residues 356-360 of ced-3) Contains cysteines known to be essential for ICE function. ICE of the present invention -LAP-1 and 2 polypeptides also have the same conserved pentapeptide and ICE It has cysteine residues essential for its function.   The similarity between ced-3 and ICE indicates that ced-3 functions as a cysteine protease. Not only gain, but also ICE as a gene for vertebrate programmed cell death It also suggests that it can work. ced-3 and vertebrate counterparts (ICE) During programmed cell death (Gagliarnini, V. et al., Science, 263: 826 : 828 (1994).   ICE mRNA is detected in various tissues, such as peripheral blood monocytes, Peripheral blood lymphocytes, peripheral blood neutrophils, resting or activated peripheral blood T lymphocytes , Placenta, B lymphoblastoid cell line CB23, and monocyte leukemia cell line THP-1 cells (Cerreti, D.P. , Et al., Science, 256: 97-100 (1992)). This means that ICE is pro-IL-1 Suggests that it may have additional substrates in addition to β. ICE acts to cause cell death Substrate substrates are currently unknown. One possibility is that it is a cell death of C. elegans It could be a vertebrate homolog of the gene ced-4. Alternatively, ICE is Proteolytic cleavage of essential proteins directly Bleeding can occur.   The mammalian gene bcl-2 allows immune cells called lymphocytes to Was found to protect the vesicles. In addition, crmA (copox virus gene product) is IC Inhibits E's ability to split proteins.   According to one aspect of the present invention, ICE-LAP-1 and 2, and fragments thereof, Novel mature polypeptides that are nalogs and their derivatives are provided. Book The polypeptides of the invention are of human origin.   According to another aspect of the invention, a polynucleotide encoding such a polypeptide is provided. Otides (DNA or RNA) are provided.   According to a further aspect of the present invention, such a polypeptide is obtained by recombinant technology. A process for generating is provided.   According to a further aspect of the invention, such a polypeptide, or such a Polynucleotides encoding polypeptides may be used for therapeutic purposes (eg, antiviral Agents, antitumor agents, and regulating embryonic development and homeostasis A process is provided for utilizing   According to a further aspect of the present invention, there is provided an antibody against such a polypeptide. Is done.   According to yet another aspect of the present invention, for example, Alzheimer's disease, Parkinson Disease, rheumatoid arthritis, septic shock and head injury Such polypeptides that can be used to inhibit the action of such polypeptides Provided are antagonists / inhibitors to the drug.   These and other aspects of the invention will be apparent to those skilled in the art from the teachings herein. Should be clear.   BRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS The following drawings are illustrative of embodiments of the invention and are intended to be within the scope of the claims Is not intended to limit the scope of   FIG. 1 shows the cDNA sequence of ICE-LAP-1 and the corresponding deduced amino acid sequence. Show The polypeptide encoded by the amino acid sequence Mature form (excluding the first methionine residue), and standard amino acids A one-letter abbreviation is used.   FIG. 2 shows the cDNA sequence of ICE-LAP-2 and the corresponding deduced amino acid sequence. Show The polypeptide encoded by the amino acid sequence Mature form (excluding the first methionine residue).   FIG. 3 shows a comparison of the amino acid sequences of ICE-LAP-1 and ICE.   FIG. 4 shows Northern blots of ICE-LAP-1 showing concentrations in various human tissues. The gel after the precipitation is illustrated.   According to an aspect of the present invention, a mature polypeptide having the deduced amino acid sequence of FIGS. A peptide encoding the peptide or deposited as ATCC Deposit Nos. 75772 and 75819 The isolated nucleic acid of the mature polypeptide encoded by the Reotide) is provided. ATCC deposit number 75772 codes for ICE-LAP-1 Includes cDNA and ATCC Deposit No. 75819 encodes cDNA for ICE-LAP-2 Is included.   The polynucleotide encoding ICE-LAP-1 is a cDNA library from human fetal liver Found at the rally. This indicates that the interleukin-1β converting enzyme fa Structurally related to Millie. This translates into a protein of about 377 amino acid residues. Includes open reading frame to encode. This protein is 68% similarity and overall amino acid sequence to terleukin-1β converting enzyme And 53% identity show the highest degree of homology. Pentapeptide QACRG preserved And shows that it is located at amino acid positions 256-260.   A polynucleotide encoding ICE-LAP-2 is obtained from a cDNA line derived from human Jurkat cells. Found in Burrly. This is structurally relevant to the ICE family . This is an open-ready protein that encodes a protein of about 435 amino acid residues. Including frame. This protein contains 128 of the mouse Nedd-2 proteins. Highest degree of phase with 91% identity and 94% similarity over the amino acid range Show the same sex. Total protein is 400 cells in C. elegans cell death protein ced-3 Of the highest degree with about 40% identity and 60% similarity across amino acid residues Shows homology. The pentapeptide QACRG is conserved and is located at amino positions 301-305 That is also important.   The polynucleotide of the present invention may be in the form of RNA or DNA. DN Form A includes cDNA, genomic DNA and synthetic DNA. DNA is double-stranded or single-stranded Can be a chain. And in the case of single strand, coding strand or non-coding (antisense ) Can be a chain. The coding sequence encoding the mature polypeptide is shown in FIGS. Or the same as the coding sequence of the deposited clone. possible. Alternatively, if the coding sequence is a result of duplication or degeneracy of the genetic code , Different coding sequences encoding the same mature polypeptide, and FIGS. The DNA or the deposited cDNA may be a derivative thereof.   The mature polypeptide of FIG. 1 and FIG. The polynucleotide encoding the mature polypeptide comprises a coding sequence for the mature polypeptide. Sequence only; coding sequence for mature polypeptide and additional coding sequences (eg, Leader sequence or secretory sequence or proprotein sequence; Code sequences (and additional coding sequences as needed) and non-coding sequences (e.g., For example, 5 'and / or 3' of the coding sequence of an intron or mature polypeptide. Non-coding sequence).   Thus, the term "polynucleotide encoding a polypeptide" refers to a polypeptide. And a further coding sequence comprising only the coding sequence of And / or polynucleotides containing non-coding sequences.   The present invention further relates to polypeptides having the deduced amino acid sequence of FIG. 1 or FIG. Fragment of a polypeptide encoded by the cDNA of the deposited clone or Variants of the above-described polynucleotides encoding amino acids, analogs, and derivatives Regarding foreign bodies. Polynucleotide variants are naturally occurring variants of the polynucleotide. Allelic variants or non-naturally occurring variants of the polynucleotide You.   Thus, the present invention provides the same mature polypeptide or that shown in FIG. 1 or FIG. Encodes the same mature polypeptide encoded by the cDNA of the deposited clone Polynucleotides, as well as variants of such polynucleotides. You. These variants are those of the polypeptides of FIGS. 1 and 2 or the deposited clones. Fragments, derivatives, or analogs of a polypeptide encoded by the cDNA of Code. Such nucleotide variants include deletion variants, substitution variants, And addition or insertion variants.   As indicated hereinabove, the polynucleotide may be as shown in FIG. 1 or FIG. Naturally occurring allelic variations of the coding sequence or the coding sequence of the deposited clone It may have a coding sequence that is variant. As is known in the art, allelic variation Variants are polynucleotide sequences that may have nucleotide substitutions, deletions, or additions. Another form of sequence that substantially alters the function of the encoded polypeptide Do not let. A polynucleotide may also comprise a mature protein and additional 5 'amino acids The residue may encode a proprotein. Mature proteins with prosequences It is a proprotein, and it is an inactive form of the protein. Once professional distribution When the row is cut, the active mature protein remains.   Thus, for example, a polynucleotide of the invention may comprise a mature protein, Both a protein having a sequence or both a prosequence and a presequence (leader sequence) May be encoded.   The polynucleotide of the present invention also allows for purification of the polypeptide of the present invention. It may have the coding sequence fused in frame to the sequence. Marker sequences are bacterial PQE-9 vector in preparation for purification of the mature polypeptide fused to the marker in the case of the host Hex-histidine tag supplied by the protein. Or, for example, The Kerr sequence may be a hemagglutinin when a mammalian host (eg, COS-7 cells) is used. It can be a tinin (HA) tag. HA tag is for influenza hemagglutinin Corresponds to the epitope from the protein (Wilson, I. et al., Cell, 37: 767 (1984)).   The invention further provides that there is at least 50% and preferably 70% identity between the sequences. If present, the polynucleotides that hybridize to the sequences described herein I do. The invention is particularly applicable to the polynucleotides described above which are stringent. A polynucleotide that hybridizes under conditions. As used herein The term "stringent conditions" means that hybridization is less between sequences. Generated only if at least 95% and preferably at least 97% identity is present It means In a preferred embodiment, a polynucleotide as described herein above The polynucleotide that hybridizes to the cDNA of FIG. 1 and FIG. Substantially the same biological function as the mature polypeptide encoded by the cDNA or Encodes a polypeptide that retains biological activity.   The deposit (s) referred to in this specification is a fine deposit for patent processing purposes. Maintained under the terms of the Budapest Treaty on the International Recognition of Deposits of Organisms. these Deposits are provided solely for convenience to those of skill in the art and are not permitted under 35 U.S.C. 112. It is not an admission that trust is required. Polynucleotides in the deposit The sequence of the tide, as well as the amino acid sequence of the polypeptide encoded thereby, It is hereby incorporated by reference and has the sequence description herein. The case of such a contradiction is also controlled. Manufacture, use, or sell the deposit May require a license, and such a license is hereby granted. Not necessarily.   The invention further has or has the deposited amino acid sequence of FIGS. 1 and 2. ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 having an amino acid sequence encoded by the cDNA Peptides, and fragments, analogs, and Related to derivatives.   The terms "fragment," "derivative," and "analog" are described in FIGS. A polypeptide or a polypeptide encoded by the deposited cDNA If so, essentially the same biological function or biological activity as such a polypeptide. Means a polypeptide that retains And in this case, the derivative is Includes polypeptides having reduced biological function. Analog is Protan A protein that can be activated by cleavage of a protein moiety to produce an active mature polypeptide Proteins.   The polypeptide of the present invention may be a recombinant polypeptide, a natural polypeptide, or It can be a synthetic polypeptide, preferably a recombinant polypeptide.   1 or 2 or the polypeptide encoded by the deposited cDNA A fragment, derivative, or analog of a peptide may comprise (i) one or more Amino acid residues are conserved or non-conserved amino acid residues (preferably conserved amino acid residues) Substituted and such substituted amino acid residues are encoded by the genetic code. Fragments, derivatives or even amino acid residues that may or may not be Or an analog, or (ii) in which one or more amino acid residues contain a substituent. Fragment, derivative, or analog, or (iii) the mature polypeptide therein. Are compounds that increase the half-life of the polypeptide (eg, polyethylene glycol Fragment, derivative, or analog fused to another compound, such as Or (iv) a leader or secretory sequence or a mature polypeptide. Or additional amino acids such as those used to purify proprotein sequences. Can be a fragment, derivative, or analog fused to a mature polypeptide . Such fragments, derivatives and analogs are derived from the teachings herein. Are considered to be within the purview of those skilled in the art.   The polypeptides and polynucleotides of the present invention are preferably in isolated form And is preferably purified to homogeneity. The term "isolated" refers to a substance Removed from its natural environment (eg, the natural environment if it occurs naturally) Means that it is. For example, natural polynuclei present in living animals Otides or polypeptides not isolated, but coexist in natural systems The same polynucleotide or polypeptide isolated from some or all of the same Has been isolated. Such a polynucleotide can be part of a vector, And / or such a polynucleotide or polypeptide may be one of the compositions And may further comprise such a vector or composition in its natural environment. It is not a part and can be isolated.   The present invention also provides a vector comprising the polynucleotide of the present invention, a vector of the present invention. Host cells that are genetically engineered with Related to generating peptides.   The host cell is a vector of the present invention (for example, a cloning vector or Genetic manipulation (transduction or transformation or Transfected). Vectors include, for example, plasmids, viral particles, It may be in the form of a phage or the like. Engineered host cells activate the promoter And select appropriate transformants or modify appropriately to amplify ICE-LAP-1 gene Cultured in a conventional nutrient medium. Culture conditions (eg, temperature, pH, etc.) Are the conditions previously used in the host cell selected for expression, and It is clear to the person.   The polynucleotides of the present invention can be used to produce polypeptides by recombinant techniques. Can be used. Thus, for example, a polynucleotide expresses a polypeptide For expression in any one of a variety of expression vectors. Vector like this Include chromosomal, non-chromosomal, and synthetic DNA sequences and include, for example, SV40 derivatives Bacterial plasmid; phage DNA; baculovirus; yeast plasmid; Vectors, vaccinia, and adenoviruses derived from combinations of sumid and phage DNA Virus DNA, such as virus, fowlpox virus, and pseudorabies. I However, any other vector as long as it is replicable and viable in the host. Can be used.   The appropriate DNA sequence can be inserted into the vector by various procedures. Generally, DNA distribution The sequence is inserted into the appropriate restriction endonuclease site by procedures known in the art. You. Such and other procedures are considered to be within the purview of those skilled in the art. You.   The DNA sequence in the expression vector contains the appropriate expression control sequence (s) (pro Operably linked to a motor) to direct mRNA synthesis. Such a promotion Representative examples of the virus may include the following: retroviruses (eg, RSV , HIV, HTLVI, CMV, or SV40 promoter) derived LTR,E.coli lacOrtrp , λ phage PLPromoters and prokaryotic or eukaryotic cells or their cells Other promoters known to control the expression of genes in irs. However Alternatively, cell signals such as the human-β-actin promoter can also be used. . Expression vectors also provide a ribosome binding site for translation initiation and a transcription terminator. Noether. Vectors can also be used to amplify gene copy numbers. It can include a unique sequence.   Furthermore, the expression vector is preferably for selection of transformed host cells. Phenotypic characteristics (eg, for eukaryotic cell cultures, dihydrofolate reductase or Or neomycin resistance, orE . coliTetracycline resistance or Contains one or more selectable marker genes that provide for (ampicillin resistance).   A suitable DNA sequence as described herein above, as well as a suitable promoter sequence or The vector containing the control sequences is used to transform the Can be used to express   Representative examples of suitable hosts may include: bacterial cells (eg,E . coli ,Bacillus subtilis , Streptomyces, Salmonella typhimurium);fungus Cells (eg, yeast); insect cells (eg,DrosophilaandSf9); Animal cells ( For example, CHO, COS, HEK 293 or Bowes melanoma); plant cells and the like. Of a suitable host The selection is deemed to be within the scope of those skilled in the art from the teachings herein.   More particularly, the present invention also includes one or more of the sequences broadly described above. Includes recombinant constructs. The construct may be a vector (eg, a plasmid vector or Or a viral vector), in which the sequence of the present invention has a forward orientation. Or they are inserted in the opposite direction. According to a preferred aspect of this embodiment, the construct Further comprises a regulatory sequence operably linked to the sequence (eg, including a promoter). To). Many suitable vectors and promoters are known to those of skill in the art. And can be purchased. The following vectors are provided as examples. Bacterial: pQ E70, pQE60, pQE-9 (Qiagen), pbs, pD10, phagescript, psiX174, pbluescript SK, pbsks, pNH8a, pNH16a, pNH18A, pNH46A (Stratagene); ptrc99a, pKK223-3 , PKK233-3, pDR540, pRIT5 (Pharmacia). Eukaryotic: pWLNEO, pSV2CAT, pOG44, pX T1, pSG (Stratagene); pSVK3, pBPV, pMSG, pSVL (Pharmacia). But the inn Any other plasmid or plasmid as long as it is replicable and viable in the main Can also be used as a vector.   The promoter region is CAT (chloramphenicol transferase) vector Using any vector that has a desired marker or other Can be selected from Two suitable vectors are pKK232-8 and pCM7. Especially Well known bacterial promoters include lacI, lacZ, T3, T7, -gpt, λPR, PL, And And trp. Eukaryotic promoters include CMV immediate early, HSV thymidine kinase, SV40 and late SV40, LTRs from retrovirus, and mouse metallothione In I. Selection of the appropriate vector and promoter is well within the skill of the art. Within the level of   In a further embodiment, the present invention relates to a host cell containing the above-described construct. Host cells can be higher eukaryotic cells (eg, mammalian cells) or lower eukaryotic cells (eg, Or a host cell can be a prokaryotic cell (eg, a bacterial cell). Can be The introduction of the construct into the host cells is performed by calcium phosphate transfection. Reaction, DEAE-dextran mediated transfection, lipofection or It can be achieved by electroporation (Davis, L., Dibner, M., Battey, I ., Basic Methods in Molecular Biology, 1986).   The construct in the host cell produces the gene product encoded by the recombinant sequence To be used in a conventional manner. Alternatively, the polypeptide of the present invention Can be produced synthetically by a peptide synthesizer.   Mature proteins are suitable for use in mammalian cells, yeast, bacteria, or other cells. And can be expressed under the control of a promoter. Cell-free translation systems also use such proteins. Can be used to generate quality using RNA from the DNA constructs of the present invention. . Appropriate cloning vectors and expression for use in prokaryotic and eukaryotic hosts Vectors are described in Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edition ( Cold Spring Harbor, N.Y., 1989) (the disclosure of which is incorporated herein by reference). Has been described).   Transcription of a DNA encoding a polypeptide of the present invention by higher eukaryotes may be a vector It is increased by inserting an enhancer sequence into the gene. Enhancers are DNA Cis-acting factor, usually about 10 to about 300 bp, which acts on the promoter To increase its transcription. An example is the SV40 mutant on the late side of the replication origin bp 100-270. Enhancer, cytomegalovirus early promoter enhancer, origin of replication Includes late-stage polyoma enhancer and adenovirus enhancer I do.   In general, recombinant expression vectors enable the origin of replication and the transformation of host cells. Selectable marker (for example,E . coliAmpicillin resistance gene andS . cerevi siae TRP1 gene) and highly expressed genes that direct transcription of downstream structural sequences Contains a promoter. Such promoters are particularly useful for glycolytic enzymes (eg, For example, 3-phosphoglycerate kinase (PGK), α-factor, acid phosphatase, May be derived from an operon that encodes a heat shock protein. Heterogeneous structure The columns are the translation initiation and termination sequences, and preferably the translated protein. A leader sequence that can direct secretion of the protein into the periplasmic space or extracellular medium. Assembled in the most difficult phase. If desired, the heterologous sequence may have desired characteristics (eg, expression). N-terminal identification peptides that provide for stabilization or simplified purification of the expressed recombinant product) It may encode a fusion protein comprising a tide.   Expression vectors useful for bacterial use include functional promoters and operable readouts. In the interrogation phase, the structural DNA sequence encoding the desired protein is replaced with an appropriate translation initiation signal. And a translation termination signal. The vector is One or more phenotypic selectable markers, and to ensure the maintenance of the vector, and And optionally an origin of replication to provide for amplification in the host. Transformed Prokaryotic hosts suitable forE . coli,Bacillus subtilis,Salmonella typhimuri um And various species of the genera Pseudomonas, Streptomyces, and Staphylococcus But other species may also be used as selections.   As a representative, but non-limiting example, an expression vector useful for bacterial use is Commercially available containing the genetic elements of the well-known cloning vector pBR322 (ATCC 37017) And a bacterial origin of replication. this Such commercially available vectors are, for example, pKK223-3 (Pharmacia Fine Chemicals, Upps ala, Sweden) and GEM1 (Promega Biotec, Madison, WI, USA). This These pBR322 "backbone" portions contain a suitable promoter and the structural elements to be expressed. Combined with columns.   Following transformation of the appropriate host line and propagation of the host line to the appropriate cell density, , The selected promoter may be selected by appropriate means (eg, temperature shift or chemical induction). And the cells are cultured for an additional period.   Cells are typically harvested by centrifugation and applied by physical or chemical means. More disrupted and the resulting crude extract is retained for further purification.   Microbial cells used in protein expression include freeze-thaw cycles, supersonic By any convenient method, including sonication, mechanical disruption, or use of cell lysing agents. And such methods are well known to those skilled in the art.   Various mammalian cell culture systems have also been used to express recombinant proteins. Can be Examples of mammalian expression systems are described in Gluzman, Cell, 23: 175 (1981). COS-7 strain of monkey kidney fibroblasts, and other capable of expressing compatible vectors Cell lines (eg, C127, 3T3, CHO, HeLa, and BHK cell lines). Feeding Animal expression vectors contain an origin of replication, appropriate promoters and enhancers, An adenylation site, a splice donor site and a splice acceptor site, It may contain a transcription termination sequence, and a 5 'flanking non-transcribed sequence. SV40 splice DNA sequences derived from the DNA and polyadenylation sites contain the necessary non-transcribed genetic elements. Can be used to provide   ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 polypeptides are recombinantly produced by the methods described below. Can be recovered from cell cultures and purified. These methods include ammonium sulfate precipitation or Is ethanol precipitation, acid extraction, anion or cation exchange chromatography, Cellulose phosphate chromatography, hydrophobic interaction chromatography, Affinity chromatography, hydroxylapatite chromatography , And lectin chromatography. If necessary, protein Refolding process completes the placement of the mature protein Can be used for Ultimately, high performance liquid chromatography (HPLC) It can be used in the manufacturing process.   The polypeptides of the present invention may be natural purified products or products of chemical synthetic procedures. Or a prokaryotic or eukaryotic host (eg, a bacterium, an enzyme in culture). Produced by recombinant techniques from mother, higher plants, insects, and mammalian cells). Can be Depending on the host used for the recombinant production procedure, the polypeptide of the invention may be , Can be glycosylated or not glycosylated. Polype of the present invention The peptide may also include an initial methionine amino acid residue.   ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 polypeptides are abnormally regulated programmed cells Can be used to treat death. Abnormally controlled programmed cell death An abnormal amount of growth may be the underlying cause of cancer. Therefore, ICE-LAP genetics Offspring are involved in programmed cell death and therefore are unwanted cells (e.g., cancer Cells). ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 also Used to control growth of tissues and homeostasis of tissues (due to their apoptotic potential) It is.   Also, programmed cell death is one of the cell's major antiviral defense mechanisms. Because it is possible, ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 polypeptides will Can be used to overcome many viral infections by overcoming cell death .   ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 also target virus-infected cells for cell death Can be used to treat disorders associated with immunosuppression (e.g., AIDS). You.   The polypeptides of the present invention also identify other molecules with similar biological activities. Can be used to An example of a screen for this is the oligonucleotide The ICE-LAP gene by using a known DNA sequence to synthesize a dope probe Isolation of the coding region of Labeled oligonucleotide having sequence complementarity with the gene of the present invention Gonucleotides are used to screen human cDNA, genomic DNA, or mRNA libraries. Which members and probes from the library are hybridized Decide what to do.   The polypeptides may also be used in vivo in accordance with the present invention. It can be used by expression of the tide. This is often called "gene therapy".   Thus, for example, a cell from a patient can be a polynucleotide encoding a polypeptide. Can be engineered ex vivo with a peptide (DNA or RNA) and then engineered cells. The vesicle is provided to a patient to be treated with the polypeptide. Such a method is It is well known in the art. For example, a cell may comprise an RNA encoding a polypeptide of the invention. Is manipulated by procedures known in the art by use of retroviral particles containing Can be made.   Similarly, cells can be used, for example, to express the polypeptide for in vivo expression of the polypeptide. It can be manipulated in vivo by known procedures in the field. As is known in the art, To produce retroviral particles containing RNA encoding the light polypeptide Producing cells for engineering cells in vivo and for polypeptides in vivo Can be administered to the patient for the expression of the drug. By such a method, the polypeptide of the present invention These and other methods for administering tides are known to those of skill in the art from the teachings of the present invention. It is clear. For example, an expression vehicle for manipulating cells is It can be other than a retrovirus (eg, an adenovirus). This is suitable Can be used to manipulate cells in vivo after combination with a smart delivery vehicle You.   The polypeptides of the present invention can be used in combination with a suitable pharmaceutical carrier. . Such compositions comprise a therapeutically effective amount of the polypeptide, and a pharmaceutically acceptable A carrier or excipient is included. Such carriers include physiological saline, Buffered saline, dextrose, water, glycerol, ethanol, and These combinations include, but are not limited to. The formulation is the mode of administration Should be adjusted to   The invention also relates to one or more components filled with one or more components of the pharmaceutical composition of the invention. A pharmaceutical pack or kit containing the container of Such containers are Stipulated by government agencies governing the manufacture, use, or sale of agents or biological products May be associated with a notice in the form of Or reflect government approvals in sales. Further, the polypep of the present invention Tide may be used in combination with other therapeutic compounds.   Pharmaceutical compositions may be administered by intravenous, intraperitoneal, intramuscular, subcutaneous, intranasal or intradermal routes. Such can be administered in any convenient manner. ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 are specific Is administered in an amount effective for treatment and / or prevention of any symptoms. In general, ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 are administered, for example, in an amount of at least about 10 μg / kg body weight. , And in most cases, no more than 8 mg / kg body weight per day . In most cases, the dose is about 10 μg / kg body weight daily, taking into account the administration route, symptoms, etc. ~ 1 mg / kg body weight.   The sequences of the present invention may also be useful for chromosome identification. This array is Specifically target a specific location on the chromosome, and hybridize at that location I can do it. In addition, it is now necessary to identify specific sites on the chromosome. Currently, dyed Chromosome markers based on actual sequence data (repetitive polymorphisms) that can be used to label chromosome locations There are few reagents. Mapping of DNA to chromosome of DNA according to the present invention This is an important first step in the correlation between these sequences and genes related to diseases.   Briefly, the sequence consists of a PCR primer (preferably 15-25 bp) from the cDNA. It can be mapped to a chromosome by preparation. Computer analysis of cDNA Does not span more than one exon in nome DNA, thus complicating the amplification process Used to quickly select primers that do not. Then these ply Mer is a PCR screener for somatic cell hybrids containing individual human chromosomes Used for Only hybrids containing the human gene corresponding to the primer This produces an amplified fragment.   PCR mapping of somatic cell hybrids assigns specific DNA to specific chromosomes A quick procedure for The present invention with the same oligonucleotide primer Use a panel of fragments from a particular chromosome or similar format in a large Sublocalization is achieved using a pool of genomic clones obtain. Other mapping strategies that can also be used to map to chromosomes are In situ hybridization, labeled by flow cytometry (Flow-sorted) Prescreening using chromosomes and chromosome-specific cDNA Includes pre-selection by hybridization to construct libraries You.   Fluorescence in situ hybridization of cDNA clones to metaphase chromosomal spreads (FISH) can be used to provide a precise chromosomal location in one step. This technique Surgery can be used with cDNAs as short as 500 or 600 bases; Larger clones have unique chromosomal locations with sufficient signal strength for easy detection Easy to combine. FISH requires the use of clones from which ESTs are derived, and The longer the clone, the better. For example, 2,000bp is better and 4,000bp is more Good and over 4,000 bp in length at a reasonable rate of time (a resonab le percentage of the time) probably necessary to get good results Absent. For a review of this technology, see Verma et al., Human Chromosomes: a Manual of B See asic Techniques, Pergamon Press, New York (1988).   Once a sequence has been mapped to the exact chromosomal location, the physical The location can be correlated with genetic map data. Such data is described, for example, in M cKusick, found in Mendelian Inheritance in Man (Johns Hopkins Univers (available online from ity Welch Medical Library). Then the same The relationship between the gene mapped to the chromosomal region and the disease is analyzed by linkage analysis (physical neighbors). (Inheritance of adjacent genes).   Next, determine the differences in the cDNA or genomic sequence between affected and unaffected individuals There is a need. Mutation is observed in some or all affected individuals but is normal If not observed, the mutation is likely to be a causative agent of the disease.   With the current resolution of physical and genetic mapping techniques, CDNA that is correctly located in the chromosomal region of interest has between 50 and 500 potential causes. It may be one of the genes. (This is a mapping resolution of 1 megabase, and 20 Assume one gene per kb. )   The polypeptide, a fragment or other derivative thereof, or an analog thereof. Logs, or cells that express them, generate antibodies against them Can be used as an immunogen. These antibodies are, for example, polyclonal antibodies. Or a monoclonal antibody. The present invention also relates to chimeric antibodies, single chain antibodies and And humanized antibodies, as well as Fab fragments or the products of an Fab expression library. Include. Various procedures known in the art may be used for such antibodies and fragments. Can be used for the generation of   Antibodies raised against polypeptides corresponding to the sequences of the present invention may be used to Obtained by direct injection of the polypeptide or by administration of the polypeptide to the animal. obtain. The animal is preferably not a human. Then obtained in this way The antibody binds to the polypeptide itself. Thus, the polypeptide flag Antibodies that bind to the entire native polypeptide, even sequences that encode only Can be used to generate Such an antibody is then Can be used to isolate the polypeptide from a tissue that expresses.   Antibodies produced by continuous cell line cultures for the preparation of monoclonal antibodies Any technique for providing the body can be used. Examples include hybridoma technology (Ko hler and Milstein, 1975, Nature, 256: 495-497), trioma technology, human B Cell hybridoma technology (Kozbor et al., 1983, Immunology Today 4:72), and EBV hybridoma technology for producing human monoclonal antibodies (Cole et al., 198 5, Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, Inc., pp. 77-96 ).   The technique described for generating single chain antibodies (U.S. Pat. Can be adapted to generate single chain antibodies to the immunogenic polypeptide products of the invention. You.   The invention also relates to a sample (eg, blood, urine, or serum sample) obtained from a host. ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 levels in I do. ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 levels can be determined, for example, by procedures known in the art. By immunoassay techniques. An example of such an assay is ICE- Two antibodies specific for the LAP-1 and ICE-LAP-2 antigens, preferably one of the antibodies are labeled (Eg, such as indicator enzymes (eg, horseradish peroxidase)) Sandwiches using monoclonal antibodies (by attaching appropriate labels) And the unlabeled antibody is preferably on a solid support. Antigen present If so, the antigen binds to both antibodies. Peroxidase-conjugated antibody to antigen After binding, peroxidase is measurable and its concentration is determined by the concentration of antigen in the sample. It can be used to produce a quantity related colored product. Depends on the catalytic properties of the enzyme And the system greatly amplifies the signal. Changed level of ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 Indicate the specific diseases described above.   The present invention also relates to antagonists / inhibitors of the polypeptides of the present invention. You. Antagonists / inhibitors reduce or eliminate polypeptide function Can be used to   An example of an antagonist is an antibody, or in some cases, ICE-LAP-1 And ICE-LAP-2 polypeptides. Inhibi An example of a small molecule is a small molecule that binds to the catalytic site of a polypeptide. The catalytic site, thereby making the catalytic site inaccessible to the substrate, thereby Activity is disrupted. Examples of small molecules include small peptides or peptide-like molecules But not limited to them.   In vivo, the levels of ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 are determined using antisense technology. Antisense that inhibits the production of ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 in vivo Can be reduced by the administration of the DNA construct. Antisense technology forms a triple helix Alternatively, regulate gene expression through antisense DNA or antisense RNA Can be used for Both of these methods use polynucleotides for DNA or RNA. Based on the linkage of the tide. For example, a polynucleic acid encoding the mature polypeptide of the invention The 5 'coding portion of the reotide sequence is an antisense R of about 10 to 40 base pairs in length. Used to design NA oligonucleotides. DNA oligonucleotides Designed to be complementary to the region of the gene involved in transcription (triple helix- Lee et al., Nucl. Acids Res., 6: 3073 (1979); Cooney et al., Science, 241: 456 (1988). And Dervan et al., Science, 251: 1360 (1991)), and consequently ICE-LAP. Prevents transcription and production of -1 and ICE-LAP-2 polypeptides. Antisense RNA The oligonucleotide hybridizes to the mRNA in vivo, and ICE-LAP-1 and Blocking translation of mRNA molecules into ICE-LAP-2 and ICE-LAP-2 polypeptides (antisense-O kano, J .; Neurochem., 56: 560 (1991); Oligodeoxynucleotides as Antisense In See hibitors of Gene Expression, CRC Press, Boca Raton, FL (1988) ).   Antagonists / inhibitors may cause cardiovascular disease, stroke, trauma, and other degenerative Diseases (abnormal regulation of ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 may lead to pathological cell death, eg, immune Causes suppression-related diseases, Alzheimer's disease, Parkinson's disease, rheumatoid arthritis Can be used to treat non-programmed necrotic cell death associated with     Antagonists / inhibitors may also be found in lung and trachea, central nervous system, eyes and For immune-based disorders of the ears, joints, bones, cardiovascular, and gastrointestinal and urinary systems Can be used to treat. Antagonists / inhibitors are pharmaceutically acceptable Can be used in compositions with active carriers, such as those described herein above.   The present invention further provides an ANT-LAP-1 and ICE-LAP-2 polypeptide of the invention. Screening molecules to identify gonists / inhibitors or agonists Related to the process of Agonists are the natural sources of ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2. While increasing physical function, antagonists decrease such function. And remove it. Examples of such assays allow for action on a substrate, and Do these compounds prevent ICE-LAP-1 and ICE-LAP-2 from cleaving the substrate ICE-LAP-1 and ICE-LAP under conditions that determine whether -2, as well as potential antagonist or agonist compounds and their Includes combinations with natural substrates.   The invention will be further described with reference to the following examples; It should be understood that the present invention is not limited to such an embodiment. All parts or quantities are stated Unless indicated otherwise, by weight.   To facilitate understanding of the following examples, certain frequently occurring methods and And / or describe terms.   “Plasmids” are capital letters before and / or after a lower case p and / or Indicated by numbers. The starting plasmids herein are either commercially available or subject to restriction criteria. Plus publicly available or available according to published procedures Either can be constructed from mid. In addition, the plasmids described Valent plasmids are known in the art and will be apparent to those skilled in the art.   `` Digestion '' of DNA involves touching it with a restriction enzyme that acts only at certain sequences in the DNA. It means to cut by a medium reaction. The various restriction enzymes used herein are commercially available. Are sold and their reaction conditions, cofactors, and other requirements are The known ones were used. For analytical purposes, typically 1 μg of plasmid or Uses a DNA fragment with about 2 units of enzyme in about 20 μl of buffer solution . For the purpose of isolating DNA fragments for plasmid construction, typically Is Digest 5-50 μg of DNA with 20-250 units of enzyme in a larger volume. specific Appropriate buffers and substrate amounts for restriction enzymes are specified by the manufacturer. 37 ℃ An incubation time of about 1 hour is usually used, but this is It can vary according to the written instructions. After digestion, the reaction is directly electrophoresed on a polyacrylamide gel. Run to isolate the desired fragment.   Size separation of the cleaved fragments is described by Goeddel, D. et al., Nucleic Acids Res. 8% polyacrylamide gel described by 8: 4057 (1980), or agaro This is done using swell gel (0.5-1.5%).   "Oligonucleotide" refers to a single-stranded polydeoxynucleotide or two phases. Refers to any of the complementary polydeoxynucleotide chains, which are chemically synthesized Can be Such synthetic oligonucleotides have no 5 'phosphate and therefore If phosphate and ATP are not added in the presence of the Do not tie. Synthetic oligonucleotides are converted to non-dephosphorylated fragments. connect.   "Ligation" forms a phosphodiester bond between two double-stranded nucleic acid fragments. (Maniatis, T. et al., Supra, p. 146). Unless you provide otherwise, Ligation is performed with approximately equimolar amounts of 10 units of T / 0.5 μg of DNA fragment to be ligated. 4 Along with DNA ligase (“ligase”), use known buffers and conditions. Can be achieved.   Unless otherwise stated, transformations were performed by Graham, F. and Van der Eb, A., Virology. 52: 456-457 (1973).                                 Example 1 COS Expression of recombinant ICE-LAP-1 in cells   The expression plasmid (ICE-LAP-1 HA) contains the vector pcDNAI / Amp (Invitr ogen): 1) SV40 replication origin, 2) ampicillin resistance gene, 3) E.col i replication origin, 4) CMV promoter, followed by polylinker region, SV40 Ron and polyadenylation sites. All ICE-LAP-1 precursors and an inf The DNA fragment encoding the HA tag fused to the Cloned into Kerr region. Therefore, recombinant protein expression is Under the control of the territory. The HA tag is for the influenza hemagglutinin protein (I. Wilson, H. Niman, R. Heighten, A. Che renson, M .; Connolly, and R. Lerner, 1984, Cell 37, 767). Inventor's mark Fusion of an HA tag to a specific protein, together with an antibody that recognizes the HA epitope, Enables easy detection of the recombinant protein.   The plasmid construction method is as follows:   A DNA sequence encoding ICE-LAP-1 (ATCC # 75772) was prepared using two primers. Was constructed by PCR on full length ICE-LAP-1: 5 ′ primer-sequence (5′-GTTCACTATGG CAGAAGGCAAGGACAG-3 ') from the ICE-LAP-1 translation start site ATG, followed by the start codon Contains 17 nucleotides of the starting ICE-LAP-1 coding sequence; 3 'sequence 5'-AATCAAGCG TAGTCTGGGACGTCGTATGGGTAATTGCCAGGAAAGAGGTAGAAA-3 ′ is a translation stop codon, HA tag And the last 28 nucleotides of the ICE-LAP-1 coding sequence (not including the stop codon) ). Therefore, the PCR product was ICE-L with the HA tag fused in-frame. Contains the AP-1 coding sequence and a translation termination stop codon adjacent to the HA tag. PCR The amplified DNA fragment was ligated with pcDNAI / Amp by blunt end ligation. Concatenated mixture Was replaced with E. coli strain SURE (Stratagene Cloning Systems, 11099 North Torrey Pines R oad, available from La Jolla, CA 92037). A. Stained on ampicillin media plates and resistant colonies were selected. plus Mid DNA was isolated from transformants and tested for the presence of the correct fragment. Tested by restriction analysis. For expression of recombinant ICE-LAP-1, COS cells were Transfected with an expression vector by the kisstran method (J. Sambrook , E. Fritsch, T .; Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press, (1988)). ICE-LAP-1 HA protein expression Detected by the sexual labeling method and the immunoprecipitation method (E. Harlow, D. Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, (1989)). cell Check the quality two days after transfection35Labeled with S-cysteine for 8 hours. Next The culture medium was harvested with and the cells were lysed with detergent (RIPA buffer (150 mM NaCl, 1% NP-40, 0.1% SDS, 1% NP-40, 0.5% DOC, 50 mM Tris, pH 7.5) ). (Wilson, I. et al., Supra at 37: 767 (1984)). Both cell lysate and culture medium Precipitated with HA specific monoclonal antibody. Precipitated protein is purified with 15% SDS-PA Analyzed on GE gel.                                 Example 2 COS Expression of recombinant ICE-LAP-2 in cells   The expression plasmid (ICE-LAP-2 HA) contains the vector pcDNAI / Amp (Invitr ogen): 1) SV40 replication origin, 2) ampicillin resistance gene, 3) E.col i replication origin, 4) CMV promoter, followed by polylinker region, SV40 Ron and polyadenylation sites. All ICE-LAP-2 precursors and inflation at their 3 'end The DNA fragment encoding the HA tag fused to the Cloned into Kerr region. Therefore, recombinant protein expression is Under the control of the territory. The HA tag is for the influenza hemagglutinin protein (I. Wilson, H. Niman, R. Heighten, A. Che renson, M .; Connolly, and R. Lerner, 1984, Cell 37, 767). Inventor's mark Fusion of an HA tag to a specific protein, together with an antibody that recognizes the HA epitope, Enables easy detection of the recombinant protein.   The plasmid construction method is as follows:   The DNA sequence encoding ICE-LAP-2 (ATCC # 75819) was prepared using two primers. Was constructed by PCR on full-length ICE-LAP-2: 5 ′ primer (5′-AGCTGATGGCCGCT GACAGGGG-3 ') is an ICE-LAP-2 translation initiation site (ATG) followed by an I Contains 14 nucleotides of the CE-LAP-2 coding sequence; 3 'sequence (5' AATCAAGCGTAGTC TGGGACGTCGTATGGGTATGTGGGAGGGTGTCCTGGGA 3 ') is a translation stop codon, HA tag and And the last 20 nucleotides of the ICE-LAP-2 coding sequence (not including the stop codon) contains. Thus, the PCR product was ICE-LAP-2 with the HA tag fused in-frame. The coding sequence contains a translation termination stop codon adjacent to the HA tag. PCR amplified DNA Fragment was ligated with pcDNAI / Amp by blunt end ligation. The concatenated mixture is transferred to the E. SURE (Stratagene Cloning Systems, 11099 North Torrey Pines Road, La Joll a, available from CA 92037). Transform the culture into ampicillin Ground Plates were plated and resistant colonies were selected. Transform plasmid DNA Isolated from recombinant and tested by restriction analysis for the presence of the correct fragment did. For expression of recombinant ICE-LAP-2, COS cells were harvested by the DEAE dextran method. Transfected using an expression vector (J. Sambrook, E. Fritsch, T. Ma niatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory P ress, (1989)). ICE-LAP-2 HA protein expression was determined by free labeling and immunoprecipitation. Detected by the descending method (E. Harlow, D. Lane, Antibodies: A Laboratory Manual Cold Spring Harbor Laboratory Press, (1988)). Transfect cells Two days after the35Labeled with S-cysteine for 8 hours. The culture medium is then collected, The cells were then lysed with a detergent (RIPA buffer (150 mM NaCl, 1% NP-40, 0. 1% SDS, 1% NP-40, 0.5% DOC, 50 mM Tris, pH 7.5)). (Wilson, I. et al., Before Ex 37: 767 (1984)). Both cell lysate and culture medium are Precipitated with null antibody. The precipitated protein was analyzed on a 15% SDS-PAGE gel.                                 Example 3 Expression pattern of ICE-LAP-1 in human tissues   Perform Northern blot analysis to determine the level of ICE-LAP-1 expression in human tissues. Tested. RNAzolTMB system (Biotecx Laboratories, I nc. 6023 South Loop East, Houston, TX 77033). Each person instructed Approximately 10 μg of total RNA isolated from the tissue was separated on a 1% agarose gel and Blotted on Iron filter. (Sambrook, Fritsch, and Maniatis, M olecular Cloning, Cold Spring Harbor Press, (1989)). Labeling reaction with 50 ng This was performed according to the Stratagene Prime-It kit using the DNA fragment. Marked The purified DNA was purified on a Select-G-50 column. (5Prime-3Prime, Inc. 5603 Arapaho e Road, Boulder, CO 80303). The filter is then used to remove the radiolabeled full length 0.5M NaPO using ICE-LAP-1 geneFour(pH 7.4) and 1,000,000 cp in 7% SDS Hybridized overnight at 65 ° C. at m / ml. 0.5 × SSC, 0.1% SDS, room temperature After washing twice at 60 ° C and twice at 60 ° C, the filter is then Exposure overnight with lean (intensifying screen). Messe for ICE-LAP-1 Gage RNA is abundant in the liver. (FIG. 5).                                 Example 4 Expression pattern of ICE-LAP-2 in human tissues   Perform Northern blot analysis to test for ICE-LAP-2 expression levels in human tissues. Tested. RNAzolTMB system (Biotecx Laboratories, I nc. 6023 South Loop EaSt, Houston, TX 77033). Each person instructed Approximately 10 μg of total RNA isolated from the tissue was separated on a 1% agarose gel and Blotted on Iron filter. (Sambrook, Fritsch, and Maniatis, M olecular Cloning, Cold Spring Harbor Press, (1989)). Labeling reaction with 50 ng This was performed according to the Stratagene Prime-It kit using the DNA fragment. Marked The purified DNA was purified on a Select-G-50 column. (5Prime-3Prime, Inc. 5603 Arapaho e Road, Boulder, CO 80303). The filter is then used to remove the radiolabeled full length 0.5M NaPO using ICE-LAP-2 geneFour(pH 7.4) and 1,000,000 cp in 7% SDS Hybridized overnight at 65 ° C. at m / ml. 0.5 × SSC, 0.1% SDS, room temperature After washing twice at 60 ° C and twice at 60 ° C, the filter is then Exposure overnight with lean.   Many modifications and variations of the present invention are possible and in light of the above teachings. Thus, within the scope of the appended claims, the invention may be practiced other than as specifically described. .

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI // C12P 21/08 7823−4B C12Q 1/68 A C12Q 1/68 9735−4B C12N 5/00 B (C12N 9/64 C12R 1:91) (72)発明者 ローゼン, クレイグ エイ. アメリカ合衆国 メリーランド 20882, レイトンズビル,ローリング ヒル ロ ード 22400 (72)発明者 ハスティングス, グレッグ エイ. アメリカ合衆国 メリーランド 20850, ロックビル,ゲイブル リッジ テラス 9913, アパートメント エイチ (72)発明者 ハドソン, ピーター エル. アメリカ合衆国 メリーランド 20874, ジャーマンタウン,ハイストリーム ド ライブ 19041 (72)発明者 カークネス, エウェン エフ. アメリカ合衆国 ワシントン ディーシー 20008,キャセドラル アベニュー 2301, アパートメント 406──────────────────────────────────────────────────の Continued on the front page (51) Int.Cl. 6 Identification code Agency reference number FI // C12P 21/08 7823-4B C12Q 1/68 A C12Q 1/68 9735-4B C12N 5 / 00B (C12N 9/64 C12R 1:91) (72) Rosen, Craig A. Inventor, Maryland, USA 20882, Rolling Hill Road 22400, Laytonsville, USA (72) Inventor Hastings, Greg A. Maryland, 20850, Rock Building, Gable Ridge Terrace 9913, Apartment H (72) Inventor Hudson, Peter El. United States Maryland 20874, Germantown, Highstream Drive 19041 (72) Inventor Kirknes, Ewen F. United States Wa Cantonal Deasy 20008, Kyasedoraru Avenue 2301, Apartment 406

Claims (1)

【特許請求の範囲】 1.単離されたポリヌクレオチドであって: (a)図1の推定アミノ酸配列を有するICE-LAP-1ポリペプチドをコードするポリヌ クレオチド、または該ポリペプチドのフラグメント、アナログ、もしくは誘導体 ; (b)図2の推定アミノ酸配列を有するICE-LAP-2ポリペプチドをコードするポリヌ クレオチドまたは該ポリペプチドのフラグメント、アナログ、もしくは誘導体; (c)ATCC寄託番号75772に含まれるcDNAによりコードされるアミノ酸配列を有する ICE-LAP-1ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、または該ポリペプチド のフラグメント、アナログ、もしくは誘導体;および (d)ATCC寄託番号75819に含まれるcDNAによりコードされるアミノ酸配列を有する ICE-LAP-2ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、または該ポリペプチド のフラグメント、アナログ、もしくは誘導体 からなる群より選択される、ポリヌクレオチド。 2.前記ポリヌクレオチドがDNAである、請求項1に記載のポリヌクレオチド 。 3.前記ポリヌクレオチドがRNAである、請求項1に記載のポリヌクレオチド 。 4.前記ポリヌクレオチドがゲノムDNAである、請求項1に記載のポリヌクレ オチド。 5.前記ポリヌクレオチドが、図1の推定アミノ酸配列を有するICE-LAP-1を コードする、請求項2に記載のポリヌクレオチド。 6.前記ポリヌクレオチドが、図2の推定アミノ酸配列を有するICE-LAP-2を コードする、請求項2に記載のポリヌクレオチド。 7.前記ポリヌクレオチドが、ATCC寄託番号75772のcDNAによりコードされるI CE-LAP-1ポリペプチドをコードする、請求項2に記載のポリヌクレオチド。 8.前記ポリヌクレオチドが、ATCC寄託番号75819のcDNAによりコードされるI CE-LAP-2ポリペプチドをコードする、請求項2に記載のポリヌクレオチド。 9.図1に示されるICE-LAP-1のコード配列を有する、請求項1に記載のポリ ヌクレオチド。 10.図2に示されるICE-LAP-2のコード配列を有する、請求項1に記載のポ リヌクレオチド。 11.ATCC寄託番号75772として寄託されたICE-LAP-1のコード配列を有する、 請求項2に記載のポリヌクレオチド。 12.ATCC寄託番号75819として寄託されたICE-LAP-2のコード配列を有する、 請求項2に記載のポリヌクレオチド。 13.請求項2に記載のDNAを含有するベクター。 14.請求項13に記載のベクターで遺伝操作された宿主細胞。 15.前記DNAによりコードされたポリペプチドを請求項14に記載の宿主細 胞から発現する工程、を包含する、ポリペプチドを産生する方法。 16.請求項13に記載のベクターを用いて細胞を遺伝操作する工程を包含す る、ポリペプチドを発現し得る細胞を産生するプロセス。 17.請求項2に記載のDNAに対してハイブリダイズし得、かつICE-LAP-1活性 を有するポリペプチドをコードする単離されたDNA。 18.請求項2に記載のDNA対してハイブリダイズし得、かつICE-LAP-2活性を 有するポリペプチドをコードする単離されたDNA。 19.ポリペプチドであって:(i)図1の推定アミノ酸配列を有するICE-LAP-1 ポリペプチド、ならびにそのフラグメント、アナログ、および誘導体;(ii)図2 の推定アミノ酸配列を有するICE-LAP-2ポリペプチド、ならびにそのフラグメン ト、アナログ、および誘導体;(iii)ATCC寄託番号75772のcDNAによりコードされ るICE-LAP-1ポリペプチド、ならびに該ポリペプチドのフラグメント、アナログ 、および誘導体;および(iv)ATCC寄託番号75819のcDNAによりコードされるICE-LA P-2ポリペプチド、ならびに該ポリペプチドのフラグメント、アナログ、および 誘導体、 からなる群から選択される、ポリペプチド。 20.前記ポリペプチドが図1の推定アミノ酸配列を有するICE-LAP-1である 、請求項19に記載のポリペプチド。 21.前記ポリペプチドが図2の推定アミノ酸配列を有するICE-LAP-2である 、請求項19に記載のポリペプチド。 22.請求項19に記載のポリペプチドに対する抗体。 23.請求項19に記載のポリペプチドに対するアンタゴニスト/インヒビタ ー。 24.請求項19に記載のポリペプチドの治療的有効量を患者に投与する工程 を包含する、ICE-LAP-1を必要とする患者を処置する方法。 25.請求項19に記載のポリペプチドの治療的有効量を患者に投与する工程 を包含する、ICE-LAP-2を必要とする患者を処置する方法。 26.請求項23に記載のアンタゴニスト/インヒビターの治療的有効量を患 者に投与する工程を包含する、ICE-LAP-1の阻害を必要とする患者を処置する方 法。 27.請求項23に記載のアンタゴニスト/インヒビターの治療的有効量を患 者に投与する工程を包含する、ICE-LAP-2の阻害を必要とする患者を処置する方 法。 28.前記ポリペプチドの前記治療的有効量が、該ポリペプチドをコードしか つインビボで該ポリペプチドを発現するDNAを前記患者に提供することにより投 与される、請求項24に記載の方法。 29.前記ポリペプチドの前記治療的有効量が、該ポリペプチドをコードしか つインビボで該ポリペプチドを発現するDNAを前記患者に提供することにより投 与される、請求項25に記載の方法。[Claims]   1. An isolated polynucleotide comprising: (a) Polynucleotide encoding ICE-LAP-1 polypeptide having the deduced amino acid sequence of FIG. Nucleotides, or fragments, analogs, or derivatives of the polypeptides ; (b) a polynucleotide encoding an ICE-LAP-2 polypeptide having the deduced amino acid sequence of FIG. A nucleotide or a fragment, analog, or derivative of the polypeptide; (c) having the amino acid sequence encoded by the cDNA contained in ATCC Deposit No. 75772 A polynucleotide encoding an ICE-LAP-1 polypeptide, or the polypeptide Fragments, analogs or derivatives of (d) having the amino acid sequence encoded by the cDNA contained in ATCC Deposit No. 75819 A polynucleotide encoding an ICE-LAP-2 polypeptide, or the polypeptide Fragments, analogs or derivatives of A polynucleotide selected from the group consisting of:   2. The polynucleotide according to claim 1, wherein the polynucleotide is DNA. .   3. The polynucleotide according to claim 1, wherein the polynucleotide is RNA. .   4. The polynucleotide according to claim 1, wherein the polynucleotide is genomic DNA. Otide.   5. The polynucleotide comprises ICE-LAP-1 having the deduced amino acid sequence of FIG. 3. The polynucleotide of claim 2, which encodes.   6. The polynucleotide comprises ICE-LAP-2 having the deduced amino acid sequence of FIG. 3. The polynucleotide of claim 2, which encodes.   7. The polynucleotide is an ICC encoded by the cDNA of ATCC Deposit No. 75772. 3. The polynucleotide of claim 2, which encodes a CE-LAP-1 polypeptide.   8. The polynucleotide is an ICC encoded by the cDNA of ATCC Deposit No. 75819. 3. The polynucleotide of claim 2, which encodes a CE-LAP-2 polypeptide.   9. 2. The polypeptide according to claim 1, which has the coding sequence of ICE-LAP-1 shown in FIG. nucleotide.   10. 2. The polypeptide according to claim 1, having the coding sequence of ICE-LAP-2 shown in FIG. Renucleotide.   11. Having the coding sequence of ICE-LAP-1 deposited as ATCC deposit number 75772, The polynucleotide according to claim 2.   12. Having the coding sequence of ICE-LAP-2, deposited as ATCC deposit no. The polynucleotide according to claim 2.   13. A vector containing the DNA according to claim 2.   14. A host cell genetically engineered with the vector of claim 13.   15. The host cell according to claim 14, wherein the polypeptide encoded by the DNA is used. A method of producing a polypeptide, comprising the step of expressing from a cell.   16. 14. Genetic manipulation of cells using the vector according to claim 13. Process for producing a cell capable of expressing a polypeptide.   17. An ICE-LAP-1 activity capable of hybridizing to the DNA according to claim 2. An isolated DNA encoding a polypeptide having the formula:   18. It can hybridize to the DNA according to claim 2, and has ICE-LAP-2 activity. An isolated DNA encoding a polypeptide having   19. A polypeptide comprising: (i) ICE-LAP-1 having the deduced amino acid sequence of FIG. Polypeptides, and fragments, analogs, and derivatives thereof; (ii) FIG. ICE-LAP-2 polypeptide having a deduced amino acid sequence and its fragment (Iii) encoded by the cDNA under ATCC Deposit No. 75772 ICE-LAP-1 polypeptide, and fragments and analogs of the polypeptide ICE-LA encoded by the cDNA of ATCC Deposit No. 75819 P-2 polypeptides, and fragments, analogs, and Derivatives, A polypeptide selected from the group consisting of:   20. The polypeptide is ICE-LAP-1 having the deduced amino acid sequence of FIG. The polypeptide of claim 19.   21. The polypeptide is ICE-LAP-2 having the deduced amino acid sequence of FIG. The polypeptide of claim 19.   22. An antibody against the polypeptide of claim 19.   23. An antagonist / inhibitor for the polypeptide of claim 19. -   24. Administering a therapeutically effective amount of the polypeptide of claim 19 to the patient. A method of treating a patient in need of ICE-LAP-1 comprising:   25. Administering a therapeutically effective amount of the polypeptide of claim 19 to the patient. A method of treating a patient in need of ICE-LAP-2, comprising:   26. 24. A therapeutically effective amount of the antagonist / inhibitor of claim 23. To treat patients in need of ICE-LAP-1 inhibition, including the step of administering to patients Law.   27. 24. A therapeutically effective amount of the antagonist / inhibitor of claim 23. To treat patients in need of ICE-LAP-2 inhibition, including the step of administering to the elderly Law.   28. The therapeutically effective amount of the polypeptide only encodes the polypeptide Providing the patient with DNA expressing the polypeptide in vivo. 25. The method of claim 24, wherein the method is provided.   29. The therapeutically effective amount of the polypeptide only encodes the polypeptide Providing the patient with DNA expressing the polypeptide in vivo. 26. The method of claim 25 provided.
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