JPH07203996A - Oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus and use thereof - Google Patents

Oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus and use thereof

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JPH07203996A
JPH07203996A JP6003132A JP313294A JPH07203996A JP H07203996 A JPH07203996 A JP H07203996A JP 6003132 A JP6003132 A JP 6003132A JP 313294 A JP313294 A JP 313294A JP H07203996 A JPH07203996 A JP H07203996A
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JP
Japan
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herpes simplex
simplex virus
oligonucleotide
human herpes
nucleic acid
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JP6003132A
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Japanese (ja)
Inventor
Koichi Yamanishi
弘一 山西
Toshiya Aono
利哉 青野
Motohiro Kondo
元宏 近藤
Yutaka Takarada
裕 宝田
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Toyobo Co Ltd
Original Assignee
Toyobo Co Ltd
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Publication date
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Abstract

PURPOSE:To obtain an oligonucleotide having high homology to a specific base sequence or its complementary sequence, capable of easily, quickly, specifically and sensitively detecting human herpes simplex virus and useful for labeled probe, primer, etc. CONSTITUTION:This new oligonucleotide has >=70% homology to a nucleic acid sequence expressed by formula I to VIII [A is adenine; C is cytosine; G is guanine; T is thymine; T at arbitrary position may be replaced with uracil (U)] or >=70% homology to a sequence complementary to the above sequence and is capable of easily, quickly, specifically and sensitively detecting human herpes simplex virus. The oligonucleotide can be chemically synthesized by a phosphoamidite method using a DNA synthesizer. Human herpes simplex virus can be detected by labeling the oligonucleotide with <32>P-phosphoric acid group, etc., to form a probe or primer and amplifying by PCR method.

Description

【発明の詳細な説明】Detailed Description of the Invention

【0001】[0001]

【産業上の利用分野】本発明はヒト単純疱疹ウイルス
(Herpes Simplex virus:HSV
と略すことがある)を簡便かつ迅速に検出するオリゴヌ
クレオチドおよびその用途に関する。
BACKGROUND OF THE INVENTION The present invention relates to human herpes simplex virus (HSV).
And a use thereof.

【0002】[0002]

【従来の技術】HSVは初感染では不顕性であることが
多いが、顕性である場合には重篤であることが多い。H
SVは初感染後、神経節に潜伏し、発熱・過労・免疫抑
制剤投与等が引き金となって、再活性化されることが知
られている。HSVには主として上半身に感染する1型
(HSV−1)と、下半身に感染する2型(HSV−
2)に分類される。HSVは口内炎・咽頭炎・角膜炎・
性器ヘルペスといった日常診療で頻繁に取り扱われる疾
病から、ヘルペス脳炎や、脳脊髄膜炎といった、命に関
わる重篤な疾病に至るまで、非常に多様な臨床像を示す
ことからその診断意義は高い。また、最近、アシクロビ
ル等の効果的な治療薬が開発されたことにより、簡便、
迅速な早期診断方法の確立が望まれている。
2. Description of the Related Art HSV is often subclinical in the initial infection, but it is often severe when it is overt. H
It is known that after the initial infection, SV is latent in the ganglia and is reactivated due to fever, overwork, administration of immunosuppressive agents, and the like. HSV is mainly type 1 (HSV-1), which infects the upper body, and type 2 (HSV-), which infects the lower body.
It is classified into 2). HSV is stomatitis, pharyngitis, keratitis,
The diagnostic significance is high because it shows an extremely diverse clinical picture, ranging from diseases that are frequently treated in daily medical care such as genital herpes to serious diseases that are fatal such as herpes encephalitis and meningitis. In addition, due to the recent development of effective therapeutic agents such as acyclovir,
It is desired to establish a rapid early diagnosis method.

【0003】HSVを検出する方法としては、培養法
や、免疫法が知られている。しかしながら、培養法では
分離培養から、同定まで5〜7日を要し、迅速な診断を
行うことができない。一方、免疫法の場合、抗原を検査
する方法では、株間変異の激しいHSVでは抗原性の多
様性が問題となる。また、抗体を検査する方法では、一
般に過去にそのウイルスに羅患したことを示す意味でし
かなく、検査時の状態を反映するものではない。
Culture methods and immunization methods are known as methods for detecting HSV. However, in the culture method, it takes 5 to 7 days from separation culture to identification, and rapid diagnosis cannot be performed. On the other hand, in the case of the immunization method, in the method of testing the antigen, the diversity of antigenicity becomes a problem in HSV in which the variation among strains is severe. In addition, the method of testing an antibody generally only indicates that the virus has been affected in the past, and does not reflect the state at the time of testing.

【0004】[0004]

【発明が解決しようとする課題】従って、本発明の目的
は、簡便、迅速、特異的且つ高感度にヒト単純疱疹ウイ
ルスを検出可能なオリゴヌクレオチドを提供することで
ある。
Therefore, an object of the present invention is to provide an oligonucleotide capable of detecting human herpes simplex virus conveniently, rapidly, specifically and with high sensitivity.

【0005】[0005]

【課題を解決するための手段】本発明者らはHSVの遺
伝子に関する種々の検討を重ねた結果、簡便、迅速、特
異的かつ高感度にHSVを検出できる配列を有するオリ
ゴヌクレオチドを得、それを用いた検出方法を確立し、
本発明を完成させるに至った。
Means for Solving the Problems As a result of various investigations concerning the gene of HSV, the present inventors have obtained an oligonucleotide having a sequence capable of detecting HSV simply, rapidly, specifically and with high sensitivity. Established the detection method used,
The present invention has been completed.

【0006】本発明は、HSVに特異的なオリゴヌクレ
オチド、すなわち、配列表・配列番号1〜8(但し、A
はアデニン、Cはシトシン、Gはグアニン、Tはチミン
を表す。また、任意の位置のTはウラシル(U)と置換
されてもよい)に示す核酸配列と70%以上の相同性を
有するか、またはそれらに相補的な配列と70%以上の
相同性を有するヒト単純疱疹ウイルス検出用オリゴヌク
レオチドである。
The present invention is directed to HSV-specific oligonucleotides, that is, SEQ ID NOS: 1 to 8 (provided that A
Represents adenine, C represents cytosine, G represents guanine, and T represents thymine. Also, T at any position has 70% or more homology with the nucleic acid sequence shown in uracil (U), or has 70% or more homology with the sequence complementary thereto. An oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus.

【0007】また本発明は、上記ヒト単純疱疹ウイルス
検出用オリゴヌクレオチドを標識化した標識核酸プロー
ブを試料中のDNAまたはRNAと交雑させ、交雑した
結合体の標識を測定することを特徴とする試料中のヒト
単純疱疹ウイルスの検出法である。
Further, the present invention is characterized in that a labeled nucleic acid probe labeled with the above-mentioned human herpes simplex virus detection oligonucleotide is hybridized with DNA or RNA in the sample, and the label of the hybridized conjugate is measured. It is a method for detecting human herpes simplex virus.

【0008】さらに本発明は上記ヒト単純疱疹ウイルス
検出用オリゴヌクレオチドである核酸プライマー、また
は該オリゴヌクレオチドを標識化した標識核酸プライマ
ーを試料中のDNAまたはRNAと交雑させ、プライマ
ーを伸長させ、得られたプライマー伸長物を測定するこ
とを特徴とする試料中のヒト単純疱疹ウイルスの検出法
である。
Further, the present invention is obtained by hybridizing a nucleic acid primer, which is the above-mentioned oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus, or a labeled nucleic acid primer labeled with the oligonucleotide, with DNA or RNA in a sample and extending the primer. A method for detecting human herpes simplex virus in a sample, which comprises measuring the primer extension product.

【0009】また本発明は上記ヒト単純疱疹ウイルス検
出用オリゴヌクレオチドを標識化した標識核酸プローブ
を含むことを特徴とする試料中のヒト単純疱疹ウイルス
検出用試薬キットである。
The present invention also provides a reagent kit for detecting human herpes simplex virus in a sample, which comprises a labeled nucleic acid probe labeled with the above-mentioned oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus.

【0010】さらに本発明は上記ヒト単純疱疹ウイルス
検出用オリゴヌクレオチドである核酸プライマー、また
は該オリゴヌクレオチドを標識化した標識核酸プライマ
ーを含むことを特徴とする試料中のヒト単純疱疹ウイル
スの検出用試薬キットである。
Further, the present invention comprises a nucleic acid primer which is the above-mentioned oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus, or a labeled nucleic acid primer obtained by labeling the oligonucleotide, and a reagent for detecting human herpes simplex virus in a sample. It's a kit.

【0011】本発明のヒト単純疱疹ウイルス検出用オリ
ゴヌクレオチドは、配列表・配列番号1〜8(但し、A
はアデニン、Cはシトシン、Gはグアニン、Tはチミン
を表す。また、任意の位置のTはウラシル(U)と置換
されてもよい)に示す核酸配列と70%以上の相同性を
有するか、またはそれらの相補的配列と70%以上の相
同性を有するものであり、ヒト単純疱疹ウイルスに特異
的に反応する。一般にオリゴヌクレオチドは化学合成に
より調製できるので、クローン化したオリゴヌクレオチ
ドまたはポリヌクレオチドに比べ容易、大量且つ安価に
一定品質のオリゴヌクレオチドを得ることが可能であ
る。
The oligonucleotides for detecting human herpes simplex virus of the present invention are shown in Sequence Listing, SEQ ID NOs: 1 to 8 (provided that A
Represents adenine, C represents cytosine, G represents guanine, and T represents thymine. Also, T at any position has 70% or more homology with the nucleic acid sequence shown in uracil (U), or has 70% or more homology with its complementary sequence. And reacts specifically with the human herpes simplex virus. In general, since oligonucleotides can be prepared by chemical synthesis, compared to cloned oligonucleotides or polynucleotides, it is possible to obtain oligonucleotides of constant quality in a large amount and at low cost.

【0012】本発明のオリゴヌクレオチドはデオキシリ
ボ核酸(DNA)でもリボ核酸(RNA)でもよい。リ
ボ核酸の場合はチミジン残基(T)をウリジン残基
(U)と読み替えることは言うまでもない。また合成に
際して任意の位置のTをUに変えて合成を行ない、ウリ
ジン残基を含むDNAであってもよい。同様に任意のU
をTに変えたチミジン残基を含むRNAであってもよ
い。またオリゴヌクレオチド中に欠失、挿入あるいは置
換といった点突然変異や、修飾ヌクレオチドがあっても
よい。
The oligonucleotide of the present invention may be deoxyribonucleic acid (DNA) or ribonucleic acid (RNA). In the case of ribonucleic acid, it goes without saying that the thymidine residue (T) is read as the uridine residue (U). Alternatively, a DNA containing a uridine residue may be used by synthesizing by changing T at any position to U at the time of synthesis. Similarly, any U
It may be RNA containing a thymidine residue in which is changed to T. The oligonucleotide may have point mutations such as deletion, insertion or substitution, and modified nucleotides.

【0013】本発明の標識核酸プローブは、上記ヒト単
純疱疹ウイルス検出用オリゴヌクレオチドに標識を結合
したものであり、標識物としては放射性物質や酵素、蛍
光物質、発光物質、抗原、ハプテン、酵素基質、不溶性
担体などの公知の標識を用いることができる。標識の仕
方は末端標識でも、配列の途中に標識してもよい。ま
た、糖、リン酸基、塩基部分への標識であってもよい。
The labeled nucleic acid probe of the present invention is one in which a label is bound to the above-mentioned oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus, and the labeled substance is a radioactive substance, an enzyme, a fluorescent substance, a luminescent substance, an antigen, a hapten, an enzyme substrate. A known label such as an insoluble carrier can be used. The labeling method may be end labeling or labeling in the middle of the sequence. It may also be a label on the sugar, phosphate group, or base moiety.

【0014】本発明の核酸プライマーは、上記ヒト単純
疱疹ウイルス検出用オリゴヌクレオチドをそのまま使用
するか、あるいは該オリゴヌクレオチドを標識化したも
のを使用する。
As the nucleic acid primer of the present invention, the above-mentioned human herpes simplex virus detection oligonucleotide is used as it is, or the oligonucleotide is labeled.

【0015】本発明のヒト単純疱疹ウイルス検出用オリ
ゴヌクレオチドを用いてHSVを検出する場合、(1)
本発明オリゴヌクレオチドをプローブとして検出する方
法、(2)本発明オリゴヌクレオチドをプライマーとし
てDNAポリメラーゼ等により伸長反応させて検出する
方法がある。上記(2)の場合、上記オリゴヌクレオチ
ドに標識を導入することにより検出が容易に可能とな
る。上記(1)の場合、本発明のオリゴヌクレオチドを
標識化した標識核酸プローブを試料中のDNAまたはR
NAと交雑させ、交雑した結合体の標識を適当な検出法
で検出することで達成される。一方、上記(2)の場
合、本発明のオリゴヌクレオチドをそのまま核酸プライ
マーとするか、または該オリゴヌクレオチドを標識化し
た標識核酸プライマーを試料中のDNAまたはRNAと
交雑させ、DNAポリメラーゼ等によりプライマーを伸
長させ、得られたプライマー伸長物を直接測定するか、
標識プローブを用いて測定する。
When HSV is detected using the human herpes simplex virus detection oligonucleotide of the present invention, (1)
There is a method of detecting the oligonucleotide of the present invention as a probe, and (2) a method of detecting the oligonucleotide of the present invention by using the oligonucleotide of the present invention as a primer for extension reaction with a DNA polymerase or the like. In the case of the above (2), detection can be easily performed by introducing a label into the above oligonucleotide. In the case of the above (1), the labeled nucleic acid probe labeled with the oligonucleotide of the present invention is used as DNA or R in a sample.
It is achieved by hybridizing with NA and detecting the label of the hybridized conjugate by an appropriate detection method. On the other hand, in the case of the above (2), the oligonucleotide of the present invention is used as a nucleic acid primer as it is, or a labeled nucleic acid primer obtained by labeling the oligonucleotide is hybridized with DNA or RNA in a sample, and the primer is treated with DNA polymerase or the like. Or measure the resulting primer extension directly, or
It measures using a labeled probe.

【0016】本発明のオリゴヌクレオチドをプライマー
として用いる場合、DNAポリメラーゼ等を使用する遺
伝子増幅(PCR等)を行なうことにより、HSVの遺
伝子のみを特異的に増幅することができる。増幅反応に
際しては反応時に放射性物質などの標識の結合したヌク
レオチドを取り込ませる方法や、増幅産物を電気泳動に
より分画して特異なバンドを検出することにより、容易
にHSVを検出することができる。さらに本発明の型特
異的オリゴヌクレオチドを用いることにより、電気泳動
後、増幅産物のサイズにより容易に型の判別も行うこと
ができる。また前述の標識オリゴヌクレオチドをプライ
マーとして用いれば増幅産物を直接検出することも可能
である。
When the oligonucleotide of the present invention is used as a primer, it is possible to specifically amplify only the HSV gene by carrying out gene amplification (PCR etc.) using DNA polymerase or the like. In the amplification reaction, HSV can be easily detected by a method of incorporating a labeled nucleotide such as a radioactive substance during the reaction or by fractionating the amplification product by electrophoresis to detect a specific band. Furthermore, by using the type-specific oligonucleotide of the present invention, the type can be easily determined by the size of the amplification product after electrophoresis. Further, the amplification product can be directly detected by using the above-mentioned labeled oligonucleotide as a primer.

【0017】本発明のヒト単純疱疹検出用試薬キット
は、本発明のヒト単純疱疹ウイルス検出用オリゴヌクレ
オチド、もしくはこのオリゴヌクレオチドを適当な標識
剤で標識化した標識オリゴヌクレオチドを含むものであ
る。核酸プライマーを含む試薬キットには標識プローブ
を含んでいてもよい。また、その他の成分としては、標
識検出物質や緩衝液などを含む。さらに核酸プライマ
ー、または標識核酸プライマーを含む本発明の試薬キッ
トには、他の成分として、核酸合成酵素(DNAポリメ
ラーゼ、RNAポリメラーゼ、逆転写酵素など)、酵素
に応じた基質(dNTP,rNTPなど)、標識検出物
質や緩衝液などを含む。
The human herpes simplex detection reagent kit of the present invention comprises the human herpes simplex virus detection oligonucleotide of the present invention or a labeled oligonucleotide obtained by labeling the oligonucleotide with an appropriate labeling agent. The reagent kit containing the nucleic acid primer may contain a labeled probe. Further, other components include a labeled detection substance, a buffer solution and the like. Furthermore, in the reagent kit of the present invention containing a nucleic acid primer or a labeled nucleic acid primer, as other components, a nucleic acid synthase (DNA polymerase, RNA polymerase, reverse transcriptase, etc.), a substrate corresponding to the enzyme (dNTP, rNTP, etc.) , Labeled detection substances and buffers.

【0018】また、本発明のオリゴヌクレオチドを固相
担体に結合させて捕捉プローブとして用いることもでき
る。この場合、捕捉プローブと、標識(核酸)プローブ
の組み合わせでサンドイッチアッセイを行ってもよい
し、標的核酸を標識して捕捉する方法もある。また、オ
リゴヌクレオチドをビオチンで標識し、ハイブリダイゼ
ーション後、アビジン結合担体で捕捉する方法もある。
サンドイッチアッセイにおいてはどちらか一方に本発明
のオリゴヌクレオチドを用いれば、該オリゴヌクレオチ
ドの特異性により特異的な測定が可能となり、他方のオ
リゴヌクレオチドの特異性は若干低くてもなんら問題は
ない。
Further, the oligonucleotide of the present invention can be bound to a solid phase carrier and used as a capture probe. In this case, the sandwich assay may be performed with a combination of a capture probe and a labeled (nucleic acid) probe, or there is a method of labeling and capturing a target nucleic acid. There is also a method in which an oligonucleotide is labeled with biotin, and after hybridization, it is captured with an avidin-binding carrier.
In the sandwich assay, if the oligonucleotide of the present invention is used for either one of them, specific measurement becomes possible due to the specificity of the oligonucleotide, and there is no problem even if the specificity of the other oligonucleotide is slightly low.

【0019】[0019]

【実施例】以下に、本発明の実施例を例示することによ
って、本発明の効果をより一層明確なものとする。
EXAMPLES The effects of the present invention will be further clarified by exemplifying the examples of the present invention.

【0020】実施例1 (各種オリゴヌクレオチドの合
成) ABI社DNAシンセサイザー391型を用いて、ホス
ホアミダイト法にて配列表・配列番号1〜8示される配
列を有するオリゴヌクレオチドを各種合成した。以下、
配列表・配列番号1〜8に示される各種オリゴヌクレオ
チドを、それぞれオリゴヌクレオチド(1) 〜(8) と呼
ぶ。手法はABI社マニュアルに従い、0.2μMスケ
ールで実施した。各種オリゴヌクレオチドの脱保護はア
ンモニア水で55℃一夜実施した。精製はファルマシア
社製FPLCで逆相カラムにて実施した。なお合成した
オリゴヌクレオチドは必要により以下の方法で5’末端
32P−リン酸基を結合させた。
Example 1 (Synthesis of Various Oligonucleotides) A variety of oligonucleotides having the sequences shown in the sequence listing and SEQ ID NOs: 1 to 8 were synthesized by the phosphoamidite method using ABI DNA Synthesizer Model 391. Less than,
The various oligonucleotides shown in Sequence Listing and SEQ ID NOS: 1 to 8 are referred to as oligonucleotides (1) to (8), respectively. The method was carried out on a 0.2 μM scale according to the ABI manual. Deprotection of various oligonucleotides was carried out with ammonia water at 55 ° C. overnight. Purification was carried out by FPLC manufactured by Pharmacia on a reverse phase column. If necessary, the synthesized oligonucleotide had a 32 P-phosphate group bonded to the 5'end by the following method.

【0021】 反応液組成 オリゴヌクレオチド 5〜20pmoles 10×T4ポリヌクレオチドキナーゼ緩衝液 10μl 1mM [γ-32PATP(10mCi/ml) 1μl T4ポリヌクレオチドキナーゼ(東洋紡製) 10単位 水 全量が100μlとなる量 上記のように調製した反応混合液を37℃で1時間反応
させた。ここで10×T4ポリヌクレオチドキナーゼ緩
衝液とは、0.5M Tris-HCl(pH8.0)、0.1M MgCl2、0.1M 2
-メルカプトエタノールを示す。
Reaction solution composition Oligonucleotide 5-20 pmoles 10 × T4 polynucleotide kinase buffer 10 μl 1 mM [γ- 32 P ATP (10 mCi / ml) 1 μl T4 polynucleotide kinase (manufactured by Toyobo) 10 units The reaction mixture prepared as described above was reacted at 37 ° C. for 1 hour. Here, the 10 × T4 polynucleotide kinase buffer means 0.5M Tris-HCl (pH8.0), 0.1M MgCl 2 , 0.1M 2
-Indicates mercaptoethanol.

【0022】実施例2 (ヒト単純疱疹ウイルスの共通
増幅) (1)キットA:ヒト単純疱疹ウイルス由来核酸を増幅
するためのキット (a)実施例1のオリゴヌクレオチド(1) (b)実施例1のオリゴヌクレオチド(2) (c)TthDNAポリメラーゼ(東洋紡製), dAT
P、dCTP,dGTP,dTTP
Example 2 (Common Amplification of Human Herpes Simplex Virus) (1) Kit A: Kit for Amplifying Human Herpes Simplex Virus Nucleic Acid (a) Oligonucleotide of Example 1 (1) (b) Example Oligonucleotide 1 (2) (c) Tth DNA polymerase (manufactured by Toyobo), dAT
P, dCTP, dGTP, dTTP

【0023】(2)ウイルス核酸の調製 ヒト単純疱疹ウイルス1型(HSV−1)の標準株とし
てSeibert株、同2型(HSV−2)の標準株と
してUW268株を用いた。また、特異性を調べるため
に水痘ー帯状疱疹ウイルス(VZV)河口株、EBウイ
ルス(EBV;Epstein−Barr viru
s)B95−8株、ヒトサイトメガロウイルス(CM
V;cytomegalovirus)AD169株、
ヒトヘルペスウイルス6型A型(HHV−6A)U11
02株、同B型(HHV−6B)橋本株、ヒトヘルペス
ウイルス7型(HHV−7)RK株、および、ヒト胎盤
DNA(シグマ社製)を用いた。ウイルス核酸は常法に
より調製した。
(2) Preparation of Viral Nucleic Acid The Seivert strain was used as a standard strain of human herpes simplex virus type 1 (HSV-1), and the UW268 strain was used as a standard strain of human type 2 (HSV-2). In addition, varicella-zoster virus (VZV) estuary strain and EB virus (EBV; Epstein-Barr virus) were used to examine specificity.
s) B95-8 strain, human cytomegalovirus (CM
V; cytomegalovirus) AD169 strain,
Human herpesvirus type 6 A (HHV-6A) U11
The strain 02, the same type B (HHV-6B) Hashimoto strain, the human herpesvirus type 7 (HHV-7) RK strain, and human placental DNA (manufactured by Sigma) were used. Viral nucleic acid was prepared by a conventional method.

【0024】PCR 反応液93μlに前記核酸溶液5μl、実施例1のオリ
ゴヌクレオチド(1) と(2) 1μlずつをプライマーとし
て加え、ヒト単純疱疹ウイルス由来核酸の増幅を行っ
た。反応液組成は以下の通りである。 反応液組成 KCl 50 mM Tris−HCl(pH8.3) 10 mM MgCl2 1.5 mM ゼラチン 0.01 % dATP, dCTP, dGTP, dTTP 各0.2 mM Tth DNA ポリメラーゼ 40 単位/ml
5 μl of the nucleic acid solution and 1 μl each of the oligonucleotides (1) and (2) of Example 1 were added as primers to 93 μl of the PCR reaction solution to amplify human herpes simplex virus-derived nucleic acid. The composition of the reaction solution is as follows. Reaction solution composition KCl 50 mM Tris-HCl (pH 8.3) 10 mM MgCl 2 1.5 mM Gelatin 0.01% dATP, dCTP, dGTP, dTTP 0.2 mM Tth DNA polymerase 40 units / ml

【0025】反応条件は次の通りである。 熱変性: 94℃、1分、 アニーリング:55℃、2分 重合反応: 75℃、1.5分 を30回行った。これらの操作はパーキン−エルマー/
シータス(Perkin-Elmer/Cetus)社のDNAサーマルサイ
クラーを用いて行った。
The reaction conditions are as follows. Heat denaturation: 94 ° C., 1 minute, annealing: 55 ° C., 2 minutes Polymerization reaction: 75 ° C., 1.5 minutes 30 times. These operations are Perkin-Elmer /
It was performed using a DNA thermal cycler manufactured by Cetus (Perkin-Elmer / Cetus).

【0026】検出 10μlの反応液を2%アガロースゲル電気泳動し、エ
チジウムブロマイド染色した後、紫外線での蛍光を検出
した(図1)。図1中、レーン2〜10は、それぞれH
SV−1、HSV−2、VZV、EBV、CMV、HH
V−6(A)、HHV−6(B)、HHV−7およびヒ
ト胎盤DNAを示す。また、レーン1、11は分子量マ
ーカーを示す。泳動の電気的条件は、定電圧100V、
時間は30分行った。操作方法並びに他の条件はManiat
isらのMolecular Cloning(1982) に記載の方法に従っ
た。反応液の他に分子量マーカーも同時に泳動し、相対
泳動度の比較により、検出されたヌクレオチド断片の長
さを算出した。
Detection 10 μl of the reaction solution was electrophoresed on a 2% agarose gel and stained with ethidium bromide, and then fluorescence from ultraviolet rays was detected (FIG. 1). In FIG. 1, lanes 2 to 10 are each H
SV-1, HSV-2, VZV, EBV, CMV, HH
V-6 (A), HHV-6 (B), HHV-7 and human placental DNA are shown. Lanes 1 and 11 show molecular weight markers. The electrical conditions for electrophoresis are a constant voltage of 100 V,
The time was 30 minutes. Operating method and other conditions are Maniat
The method described by Is et al., Molecular Cloning (1982) was followed. In addition to the reaction solution, a molecular weight marker was also electrophoresed at the same time, and the length of the detected nucleotide fragment was calculated by comparing the relative mobilities.

【0027】結果 PCR産物はヒト単純疱疹ウイルスを用いたときのみバ
ンドが観察された(図1:レーン2、3)。分子量マー
カーより、そのサイズは約320塩基対と同定された。
これは核酸配列から計算されるヌクレオチドの長さとよ
く一致した。
Results In the PCR product, a band was observed only when the human herpes simplex virus was used (FIG. 1: lanes 2 and 3). Its size was identified by molecular weight markers to be about 320 base pairs.
This was in good agreement with the nucleotide length calculated from the nucleic acid sequence.

【0028】実施例3 (ヒト単純疱疹ウイルスの特異
増幅) (1)キットB:ヒト単純疱疹ウイルス由来核酸を増幅
するためのキット (a)実施例1のオリゴヌクレオチド(1) (b)実施例1のオリゴヌクレオチド(3) (c)実施例1のオリゴヌクレオチド(4) (d)TthDNAポリメラーゼ(東洋紡製),dAT
P、dCTP,dGTP,dTTP
Example 3 (Specific Amplification of Human Herpes Simplex Virus) (1) Kit B: Kit for Amplifying Human Herpes Simplex Virus-Derived Nucleic Acid (a) Oligonucleotide of Example 1 (1) (b) Example Oligonucleotide 1 (3) (c) Oligonucleotide 1 of Example 1 (4) (d) Tth DNA polymerase (manufactured by Toyobo), dAT
P, dCTP, dGTP, dTTP

【0029】PCR 反応液93μlに前記核酸溶液5μl、実施例1のオリ
ゴヌクレオチド(1) 、(3) および(4) 1μlずつをプラ
イマーとして加え、ヒト単純疱疹ウイルス由来核酸の型
特異的増幅を行った。反応液組成、及び検出の方法は実
施例2と同様に行った。図2中、レーン2〜10は、そ
れぞれHSV−1、HSV−2、VZV、EBV、CM
V、HHV−6(A)、HHV−6(B)、HHV−7
およびヒト胎盤DNAを示す。また、レーン1、11は
分子量マーカーを示す。
5 μl of the nucleic acid solution and 1 μl each of the oligonucleotides (1), (3) and (4) of Example 1 were added as primers to 93 μl of the PCR reaction solution to perform type-specific amplification of human herpes simplex virus-derived nucleic acid. It was The composition of the reaction solution and the detection method were the same as in Example 2. In FIG. 2, lanes 2 to 10 are HSV-1, HSV-2, VZV, EBV, and CM, respectively.
V, HHV-6 (A), HHV-6 (B), HHV-7
And human placental DNA. Lanes 1 and 11 show molecular weight markers.

【0030】結果 PCR産物はヒト単純疱疹ウイルスを用いたときのみバ
ンドが観察された(図2:レーン2、3)。分子量マー
カーより、そのサイズはHSV−1では約210塩基
対、HSV−2では約280塩基対と同定された。これ
は核酸配列から計算されるヌクレオチドの長さとよく一
致した。
Results In the PCR product, a band was observed only when human herpes simplex virus was used (FIG. 2: lanes 2 and 3). From the molecular weight marker, the size was identified as about 210 base pairs for HSV-1 and about 280 base pairs for HSV-2. This was in good agreement with the nucleotide length calculated from the nucleic acid sequence.

【0031】実施例4 (ヒト単純疱疹ウイルスの特異
検出) 実施例2の増幅産物がどのヒト単純疱疹ウイルスに由来
するものか特定するためにドット・ブロット・ハイブリ
ダイゼーションを行った。 (1)キットC:ヒト単純疱疹ウイルス由来核酸を検出
するためのキット 実施例1のオリゴヌクレオチド(5) および(6) 、及び
(7) または(8) を含み、5’末端に、32P−リン酸基を
有している。 (2)ドット・ブロット・ハイブリダイゼーション 実施例2のPCR産物1μlに0.3規定のNaOHを
100μl加え、室温で15分間変性し、ドットブロッ
ター(BRL社製)を用いて5×SSCで湿潤したナイ
ロン膜(ハイボンドNプラス,アマシャム社製)にブロ
ットした。なおSSCとは15mMクエン酸三ナトリウ
ム、15mM塩化ナトリウム溶液を示し、5×SSCと
はSSCの5倍濃厚液を示す。この膜を80℃、30分
間加熱処理して核酸を固定化した後、ハイブリダイゼー
ションを行った。まず、乾燥した膜(8×12cm)を
5×SSCに5分間浸した。次にハイブリダイゼーショ
ンバック(BRL社製)に膜を移し、ハイブリダイゼー
ションバッファー(5×SSC、0.5%ウシ血清アル
ブミン、0.5%ポリビニールピロリドン、1%ドデシ
ル硫酸ナトリウム)5mlを加えてポリシーラーでシー
ルし、50℃、15分間プレハイブリダイゼーションを
行った。次にキットBのオリゴヌクレオチドプローブ
(5) から(8) の中のいずれか5μl を含むハイブリダイ
ゼーションバッファー5mlで55℃、15分間ハイブ
リダイゼーションを行った。膜をポリバックから取り出
し、洗浄液−1(1×SSC、1%ドデシル硫酸ナトリ
ウム)で55℃、5分間で2回、振とう洗浄した。洗浄
液−2(1×SSC)で室温、5分間で2回、振とう洗
浄した後、膜を充分乾燥させた。
Example 4 (Specific detection of human herpes simplex virus) Dot blot hybridization was carried out to identify which human herpes simplex virus the amplification product of Example 2 was derived from. (1) Kit C: Kit for detecting nucleic acid derived from human herpes simplex virus Oligonucleotides (5) and (6) of Example 1, and
It contains (7) or (8) and has a 32 P-phosphate group at the 5'end. (2) Dot Blot Hybridization 100 μl of 0.3 N NaOH was added to 1 μl of the PCR product of Example 2, denatured at room temperature for 15 minutes, and wetted with 5 × SSC using a dot blotter (manufactured by BRL). It was blotted on a nylon membrane (High Bond N Plus, manufactured by Amersham). SSC is a 15 mM trisodium citrate and 15 mM sodium chloride solution, and 5 × SSC is a 5-fold concentrated solution of SSC. This membrane was heated at 80 ° C. for 30 minutes to immobilize the nucleic acid, and then hybridized. First, the dried membrane (8 × 12 cm) was immersed in 5 × SSC for 5 minutes. Next, transfer the membrane to a hybridization bag (manufactured by BRL), add 5 ml of hybridization buffer (5 × SSC, 0.5% bovine serum albumin, 0.5% polyvinylpyrrolidone, 1% sodium dodecyl sulfate) to the policy. Seal with a stirrer and pre-hybridize at 50 ° C. for 15 minutes. Next, the oligonucleotide probe of kit B
Hybridization was carried out at 55 ° C. for 15 minutes with 5 ml of a hybridization buffer containing 5 μl of any one of (5) to (8). The membrane was taken out from Polyvac and washed with Washing Solution-1 (1 × SSC, 1% sodium dodecyl sulfate) at 55 ° C. for 5 minutes with shaking twice. The membrane was thoroughly dried after it was washed with Shake Solution-2 (1 × SSC) twice at room temperature for 5 minutes with shaking.

【0032】(3)検出 ナイロン膜にX線フィルム(New AIF RX 富士写真工業
製)を密着させ、−80℃で一昼夜感光させた。フィル
ムの感光度からヒト単純疱疹ウイルスの検出を行った。
(3) Detection An X-ray film (New AIF RX made by Fuji Photo Industry Co., Ltd.) was adhered to the nylon film and exposed at -80 ° C for a whole day and night. Human herpes simplex virus was detected from the photosensitivity of the film.

【0033】結果 それぞれのウイルスに特異的なオリゴヌクレオチド・プ
ローブはそれぞれのウイルス由来の増幅産物のみと特異
的に反応し、他のウイルス由来やヒトDNA由来の増幅
産物との反応は観察されなかった(表1)。
Results The oligonucleotide probes specific to the respective viruses specifically reacted only with the amplification products derived from the respective viruses, and no reaction with the amplification products derived from other viruses or human DNA was observed. (Table 1).

【0034】[0034]

【表1】 [Table 1]

【0035】実施例5 (ヒト単純疱疹ウイルスの高感
度特異検出) ヒト単純疱疹ウイルスに由来する増幅産物をより高感度
に検出するためにサザンブロット・ハイブリダイゼーシ
ョンを行った。 (1)キットD:ヒト単純疱疹ウイルス由来核酸を検出
するためのキット実施例1のオリゴヌクレオチド(5) 、
(7) または(6) 、(8) で、5’末端に、 32P−リン酸基
を有している。 (2)サザンブロット・ハイブリダイゼーション 実施例3のHSV−1由来PCR産物およびHSV−2
由来PCR産物を、それぞれ5段階の5倍希釈を行い原
液を含めて6種の濃度のPCR産物溶液を各々5μl を
2%アガロースゲルを用いて電気泳動を行った。エチジ
ウムブロマイド液で染色し写真撮影を行った後、Maniat
isらのMolecular Cloning (1982)に記載の方法により、
ナイロン膜(ハイボンドNプラス,アマシャム社製)に
ブロットした。ハイブリダイゼーションはプローブとし
て実施例1のオリゴヌクレオチド(6)(HSV−1用:
図3)及び (8)(HSV−2用:図4)を用いて実施例
4と同様に行った。
Example 5 (High Sensitivity of Human Herpes Simplex Virus)
Degree-specific detection) Amplification products derived from human herpes simplex virus are more sensitive
Southern blot hybridization to detect
I went to (1) Kit D: Detects human herpes simplex virus-derived nucleic acid
Kit for the preparation of the oligonucleotide of Example 1 (5),
(7) or (6), (8) at the 5'end, 32P-phosphate group
have. (2) Southern Blot Hybridization The HSV-1-derived PCR product of Example 3 and HSV-2
Each of the derived PCR products is diluted 5 times in 5 steps to obtain the original product.
5 μl of each of the 6 concentrations of PCR product solution
Electrophoresis was performed using a 2% agarose gel. Etisi
After staining with umbromide solution and taking a photograph, Maniat
By the method described in Molecular Cloning (1982) of is et al.
For nylon membrane (High Bond N Plus, Amersham)
Blotted. Hybridization as a probe
Oligonucleotide (6) of Example 1 (for HSV-1:
Example using (3) and (8) (for HSV-2: FIG. 4)
The same procedure as in 4 was performed.

【0036】(3)検出 実施例4と同様に行った(図3:HSV−1,図4:H
SV−2)。図3中、レーン2〜7は、それぞれPCR
産物の原液、同5倍希釈液、25倍希釈液、125倍希
釈液、625倍希釈液、3125倍希釈液を示す。ま
た、レーン1、11は分子量マーカーを示す。図4中、
レーン2〜7は、それぞれPCR産物の原液、同5倍希
釈液、25倍希釈液、125倍希釈液、625倍希釈
液、3125倍希釈液を示す。また、レーン1、11は
分子量マーカーを示す。 結果 HSV−1,HSV−2共に、電気泳動法では125倍
希釈液までしか検出することはできなかったが(図3−
A、図4−A)、サザンブロット・ハイブリダイゼーシ
ョンを行うことにより、3125倍希釈液まで検出する
ことができた(図3−B、図4−B)。
(3) Detection The same procedure as in Example 4 was performed (FIG. 3: HSV-1, FIG. 4: H).
SV-2). In FIG. 3, lanes 2 to 7 are PCRs, respectively.
The stock solution of the product, the same 5-fold diluted solution, the 25-fold diluted solution, the 125-fold diluted solution, the 625-fold diluted solution, and the 3125-fold diluted solution are shown. Lanes 1 and 11 show molecular weight markers. In FIG.
Lanes 2 to 7 show the stock solution of PCR product, the same 5-fold diluted solution, the 25-fold diluted solution, the 125-fold diluted solution, the 625-fold diluted solution, and the 3125-fold diluted solution, respectively. Lanes 1 and 11 show molecular weight markers. Results Both HSV-1 and HSV-2 could be detected up to a 125-fold diluted solution by electrophoresis (Fig. 3-
A, FIG. 4-A), and by performing Southern blot hybridization, it was possible to detect up to a 3125-fold diluted solution (FIG. 3-B, FIG. 4-B).

【0037】[0037]

【発明の効果】本発明により従来培養に時間のかかって
いたヒト単純疱疹ウイルスを迅速、簡便に特異的且つ高
感度で型別に測定することが可能となった。本発明のオ
リゴヌクレオチドは増幅反応のプライマーとしても、直
接検出用のプローブとしても用いることが可能である。
また。プライマーにより増幅した増幅産物をプローブで
検出することにより、感度、特異性をさらに高く検出す
ることも可能で、その臨床的意義は大きい。
INDUSTRIAL APPLICABILITY According to the present invention, it becomes possible to measure human herpes simplex virus, which has conventionally been time-consuming to culture, quickly, simply, and specifically and highly sensitively by type. The oligonucleotide of the present invention can be used both as a primer for amplification reaction and as a probe for direct detection.
Also. By detecting the amplification product amplified by the primer with a probe, it is possible to detect with higher sensitivity and specificity, which is of great clinical significance.

【0038】[0038]

【配列表】配列番号:1 配列の長さ:25 配列の型:核酸 鎖の数:両形態 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴 存在位置:1..25 特徴を決定した方法:S 他の特徴:ヒト単純疱疹ウイルスに共通の配列。 配列 GTTTGTGTGT TGTTCGGTCA TAAGC 25 [Sequence Listing] SEQ ID NO: 1 Sequence length: 25 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Both forms Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid Synthetic DNA Sequence features Location: 1..25 Features Method: S Other features: Sequence common to human herpes simplex virus. Array GTTTGTGTGT TGTTCGGTCA TAAGC 25

【0039】配列番号:2 配列の長さ:22 配列の型:核酸 鎖の数:両形態 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴 存在位置:1..22 特徴を決定した方法:S 他の特徴:ヒト単純疱疹ウイルスに共通の配列。 配列 GCGTAGTACA CCGTGATCGG GA 22SEQ ID NO: 2 Sequence length: 22 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Both forms Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid Synthetic DNA Sequence features Location: 1..22 Features Method determined: S Other features: Sequence common to human herpes simplex virus. Array GCGTAGTACA CCGTGATCGG GA 22

【0040】配列番号:3 配列の長さ:24 配列の型:核酸 鎖の数:両形態 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴 存在位置:1..24 特徴を決定した方法:S 他の特徴:ヒト単純疱疹ウイルス1型(HSV−1)に
特異的な配列。 配列 TCGGCCATCT TGAGAGAGGC ATCC 24
SEQ ID NO: 3 Sequence length: 24 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Both forms Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid Synthetic DNA Sequence features Location: 1..24 Method determined: S Other features: human herpes simplex virus type 1 (HSV-1) specific sequence. Sequence TCGGCCATCT TGAGAGAGGC ATCC 24

【0041】配列番号:4 配列の長さ:24 配列の型:核酸 鎖の数:両形態 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴 存在位置:1..24 特徴を決定した方法:S 他の特徴:ヒト単純疱疹ウイルス2型(HSV−2)に
特異的な配列。 配列 GGCTGAATGT GGTAAACACG CTTC 24
SEQ ID NO: 4 Sequence length: 24 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Both forms Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid Synthetic DNA Sequence features Location: 1..24 Method determined: S Other characteristics: human herpes simplex virus type 2 (HSV-2) specific sequence. Sequence GGCTGAATGT GGTAAACACG CTTC 24

【0042】配列番号:5 配列の長さ:25 配列の型:核酸 鎖の数:両形態 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴 存在位置:1..25 特徴を決定した方法:S 他の特徴:ヒト単純疱疹ウイルス1型(HSV−1)に
特異的な配列。 配列 AGCGCGAACG ACCAACTACC CCGAT 25
SEQ ID NO: 5 Sequence length: 25 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Both forms Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid Synthetic DNA Sequence features Location: 1..25 Features Method determined: S Other features: human herpes simplex virus type 1 (HSV-1) specific sequence. Array AGCGCGAACG ACCAACTACC CCGAT 25

【0043】配列番号:6 配列の長さ:25 配列の型:核酸 鎖の数:両形態 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴 存在位置:1..25 特徴を決定した方法:S 他の特徴:ヒト単純疱疹ウイルス1型(HSV−1)に
特異的な配列。 配列 TCAGTTATCC TTAAGGTCTC TTTTG 25
SEQ ID NO: 6 Sequence length: 25 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Both forms Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid Synthetic DNA Sequence features Location: 1..25 Features Method determined: S Other features: human herpes simplex virus type 1 (HSV-1) specific sequence. Sequence TCAGTTATCC TTAAGGTCTC TTTTG 25

【0044】配列番号:7 配列の長さ:25 配列の型:核酸 鎖の数:両形態 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴 存在位置:1..25 特徴を決定した方法:S 他の特徴:ヒト単純疱疹ウイルス2型(HSV−2)に
特異的な配列。 配列 TCCCAATCGA TTTCGCGGGA AGAAC 25
SEQ ID NO: 7 Sequence length: 25 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Both forms Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid Synthetic DNA Sequence features Location: 1..25 Features Method determined: S Other characteristics: human herpes simplex virus type 2 (HSV-2) specific sequence. Sequence TCCCAATCGA TTTCGCGGGA AGAAC 25

【0045】配列番号:8 配列の長さ:25 配列の型:核酸 鎖の数:両形態 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴 存在位置:1..25 特徴を決定した方法:S 他の特徴:ヒト単純疱疹ウイルス2型(HSV−2)に
特異的な配列。 配列 TTCCGGTTTT GGACCAGCTG ACCGA 25
SEQ ID NO: 8 Sequence length: 25 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Both forms Topology: Linear Sequence type: Other nucleic acid Synthetic DNA Sequence features Location: 1..25 Features Method determined: S Other characteristics: human herpes simplex virus type 2 (HSV-2) specific sequence. Sequence TTCCGGTTTT GGACCAGCTG ACCGA 25

【図面の簡単な説明】[Brief description of drawings]

【図1】実施例2の電気泳動結果を示す。FIG. 1 shows the results of electrophoresis of Example 2.

【図2】実施例3の電気泳動結果を示す。FIG. 2 shows the results of electrophoresis of Example 3.

【図3】実施例5のHSV−1由来PCR産物を用いた
場合の電気泳動(A)およびサザン・ハイブリダイゼー
ション(B)の結果を示す。
FIG. 3 shows the results of electrophoresis (A) and Southern hybridization (B) when using the HSV-1-derived PCR product of Example 5.

【図4】実施例5のHSV−2由来PCR産物を用いた
場合の電気泳動(A)およびサザン・ハイブリダイゼー
ション(B)の結果を示す。
FIG. 4 shows the results of electrophoresis (A) and Southern hybridization (B) when using the HSV-2-derived PCR product of Example 5.

Claims (11)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 配列表・配列番号1〜8(但し、Aはア
デニン、Cはシトシン、Gはグアニン、Tはチミンを表
す。また、任意の位置のTはウラシル(U)と置換され
てもよい)に示す核酸配列と70%以上の相同性を有す
るか、またはそれらの相補的配列と70%以上の相同性
を有することを特徴とするヒト単純疱疹ウイルス検出用
オリゴヌクレオチド。
1. Sequence Listing: SEQ ID NOS: 1 to 8 (where A is adenine, C is cytosine, G is guanine, T is thymine, and T at any position is replaced with uracil (U). The nucleic acid sequence shown in (1) may have a homology of 70% or more, or a complementary sequence thereof with a homology of 70% or more, for detecting human herpes simplex virus.
【請求項2】 配列表・配列番号1〜8(但し、Aはア
デニン、Cはシトシン、Gはグアニン、Tはチミンを表
す。また、任意の位置のTはウラシル(U)と置換され
てもよい)に示す核酸配列と70%以上の相同性を有す
ることを特徴とするヒト単純疱疹ウイルス検出用オリゴ
ヌクレオチド。
2. SEQ ID NO: 1 to 8 (where A is adenine, C is cytosine, G is guanine, T is thymine, and T at any position is replaced with uracil (U). An oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus, which has a homology of 70% or more with the nucleic acid sequence shown in FIG.
【請求項3】 配列表・配列番号1〜8(但し、Aはア
デニン、Cはシトシン、Gはグアニン、Tはチミンを表
す。また、任意の位置のTはウラシル(U)と置換され
てもよい)に示す核酸配列であることを特徴とするヒト
単純疱疹ウイルス検出用オリゴヌクレオチド。
3. Sequence Listing, SEQ ID NOS: 1 to 8 (where A is adenine, C is cytosine, G is guanine, T is thymine, and T at any position is replaced with uracil (U). Oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus.
【請求項4】 配列表・配列番号1〜8(但し、Aはア
デニン、Cはシトシン、Gはグアニン、Tはチミンを表
す。また、任意の位置のTはウラシル(U)と置換され
てもよい)に示す核酸配列の相補的配列と70%以上の
相同性を有することを特徴とするヒト単純疱疹ウイルス
検出用オリゴヌクレオチド。
4. SEQ ID NO: 1 to 8 (where A is adenine, C is cytosine, G is guanine, T is thymine, and T at any position is replaced with uracil (U). An oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus, which has a homology of 70% or more with the complementary sequence of the nucleic acid sequence shown in FIG.
【請求項5】 配列表・配列番号1〜8(但し、Aはア
デニン、Cはシトシン、Gはグアニン、Tはチミンを表
す。また、任意の位置のTはウラシル(U)と置換され
てもよい)に示す核酸配列の相補的配列であることを特
徴とするヒト単純疱疹ウイルス検出用オリゴヌクレオチ
ド。
5. SEQ ID NO: 1 to 8 (where A is adenine, C is cytosine, G is guanine, T is thymine, and T at any position is replaced with uracil (U). An oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus, which is a complementary sequence of the nucleic acid sequence shown in
【請求項6】 請求項1に記載されるヒト単純疱疹ウイ
ルス検出用オリゴヌクレオチドを標識化し、得られた標
識核酸プローブを試料中のDNAまたはRNAと交雑さ
せ、交雑した結合体の標識を測定することを特徴とする
試料中のヒト単純疱疹ウイルスの検出法。
6. A human herpes simplex virus detection oligonucleotide according to claim 1 is labeled, the obtained labeled nucleic acid probe is hybridized with DNA or RNA in a sample, and the label of the hybridized conjugate is measured. A method for detecting human herpes simplex virus in a sample, comprising:
【請求項7】 請求項1に記載されるヒト単純疱疹ウイ
ルス検出用オリゴヌクレオチドである核酸プライマーま
たは該オリゴヌクレオチドを標識化した標識核酸プライ
マーを試料中のDNAまたはRNAと交雑させ、プライ
マー伸長させ、得られたプライマー伸長物を測定するこ
とを特徴とする試料中のヒト単純疱疹ウイルスの検出
法。
7. A nucleic acid primer, which is the oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus according to claim 1, or a labeled nucleic acid primer labeled with the oligonucleotide is hybridized with DNA or RNA in a sample to extend the primer, A method for detecting human herpes simplex virus in a sample, which comprises measuring the obtained primer extension product.
【請求項8】 請求項1に記載されるヒト単純疱疹ウイ
ルス検出用オリゴヌクレオチドを標識化した標識核酸プ
ローブを含むことを特徴とする試料中のヒト単純疱疹ウ
イルスの検出用試薬キット。
8. A reagent kit for detecting human herpes simplex virus in a sample, which comprises the labeled nucleic acid probe labeled with the oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus according to claim 1.
【請求項9】 請求項1に記載されるヒト単純疱疹ウイ
ルス検出用オリゴヌクレオチドである核酸プライマーま
たは該オリゴヌクレオチドを標識化した標識核酸プライ
マーを含むことを特徴とする試料中のヒト単純疱疹ウイ
ルスの検出用試薬キット。
9. A human herpes simplex virus in a sample, which comprises a nucleic acid primer that is the oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus according to claim 1 or a labeled nucleic acid primer labeled with the oligonucleotide. Reagent kit for detection.
【請求項10】 請求項1に記載されるヒト単純疱疹ウ
イルス検出用オリゴヌクレオチドを標識化した標識核酸
プローブおよび請求項1に記載されるヒト単純疱疹ウイ
ルス検出用オリゴヌクレオチドである核酸プライマーま
たは該オリゴヌクレオチドを標識化した標識核酸プライ
マーを含むことを特徴とする試料中のヒト単純疱疹ウイ
ルスの検出用試薬キット。
10. A labeled nucleic acid probe labeled with the oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus according to claim 1, and a nucleic acid primer or the oligo that is the oligonucleotide for detecting human herpes simplex virus according to claim 1. A reagent kit for detecting human herpes simplex virus in a sample, which comprises a labeled nucleic acid primer labeled with a nucleotide.
【請求項11】 さらに核酸合成酵素およびdNTPお
よび/またはrNTPおよび緩衝液を含有することを特
徴とする請求項8〜10に記載される試料中のヒト単純
疱疹ウイルスの検出用試薬キット。
11. A reagent kit for detecting human herpes simplex virus in a sample according to claim 8, which further comprises a nucleic acid synthase, dNTP and / or rNTP, and a buffer solution.
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