JP7844591B2 - バイパラトピックFR-α抗体及びイムノコンジュゲート - Google Patents
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Description
ンのscFvは、VH-リンカー-VLのペプチド配向を有する。いくつかの実施形態では、第2のFRα結合ドメインのscFvは、VL-リンカー-VHのペプチドの配向を有する。いくつかの実施形態では、リンカーは、グリシン-セリンリンカーである。
CBは、本明細書で提供される任意のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片であり、
L2は、以下の式のうちの1つによって表され:
Rx、Ry、Rx’、及びRy’は、それぞれの存在について、独立してH、-OH、ハロゲン、-O-(C1-4アルキル)、-SO3H、-NR40R41R42 +、または任意選択で-OH、ハロゲン、SO3H、もしくはNR40R41R42 +によって置換されたC1-4アルキルであり、ここで、R40、R41、及びR42は、それぞれ独立してHまたはC1-4アルキルであり;
l及びkは、それぞれ独立して、1~10の整数であり;
l1は、2~5の整数であり;
k1は、1~5の整数であり;
s1は細胞結合剤CBに接続された部位を示し、s3はA基に接続された部位を示し;
Aは、アミノ酸残基または2~20個のアミノ酸残基を含むペプチドであり;
R1及びR2は、それぞれ独立して、HまたはC1-3アルキルであり;
L1は、以下の式によって表され:
-CR3R4-(CH2)1-8-C(=O)-
式中、R3及びR4は、それぞれ独立してHまたはMeであり、L1の-C(=O)-部分は、Dに接続されており;
Dは以下の式で表され:
パラトピック抗体またはその抗原結合断片であり;
R3及びR4は、それぞれ独立してHまたはMeであり;
m1、m3、n1、r1、s1、及びt1は、それぞれ独立して1~6の整数であり;
m2、n2、r2、s2、及びt2は、それぞれ独立して、1~7の整数であり;
t3は、1~12の整数であり;
D1は以下の式で表される:
m1及びm3は、それぞれ独立して、2~4の整数であり;
m2は、2~5の整数であり;
r1は、2~6の整数であり;
r2は、2~5の整数である。
-Val-Ala、D-Ala-Pro、またはD-Ala-tBu-Glyである。
Aは、Ala-Ala-Ala、Ala-D-Ala-Ala、Ala-Ala、D-Ala-Ala、Val-Ala、D-Val-Ala、D-Ala-Pro、またはD-Ala-tBu-Glyであり;
D1は以下の式で表される:
CBAは、本明細書で提供される任意のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片であり、
qは、1~10の整数、例えば、1または10であり;
D1は以下の式で表される:
CBAは、配列番号41~43のアミノ酸配列を含むバイパラトピック抗体または抗原結合断片であり;
D1は、以下の式で表され:
(A)は、本明細書で提供される任意のバイパラトピック抗体または抗原結合断片であり、
(L)は、リンカーであり;
(C)は細胞傷害性薬剤であり、リンカー(L)は(A)を(C)に連結する。
ミド)-テトラエチレングリコール]エステル(NHS-PEG4-マレイミド)からなる群から選択される。
本開示の理解を促すために、いくつかの用語及び語句を以下に定義する。
v19」(または「M9346A」)抗体は、配列番号47の全長重鎖(以下の配列番号47に関連して下線が付されている、可変重鎖配列配列番号24を含む)及び配列番号48の全長軽鎖(以下の配列番号48に関連して下線が付されている、可変軽鎖配列配列番号19を含む)を含む抗FRα抗体である。
3 heteroなど)。染色の均一性は、特定の強度で染色された細胞のパーセンテージ(%)で表すこともできる(例えば、25%の細胞が1、2、または3の強度で染色される;50%の細胞が1、2、または3の強度で染色される;70%の細胞が1、2、または3の強度で染色される)。別の例では、FRα発現の増加は、対照の値(例えば、がんのない、またはFRα値が上昇していないがんのある対象からの組織または細胞における発現レベル)と比較して、少なくとも2倍、少なくとも3倍、または、少なくとも5倍の増加の検出によって決定することができる。FRα発現は、免疫組織化学によって測定することができ、視覚的なスコアが与えられ、FRα陽性は、10倍以下の顕微鏡対物レンズでFRαの膜の染色が可視化される腫瘍細胞が50%以上あることを指す。
フト化」)(Jones et al.,Nature 321:522-525(1986);Riechmann et al.,Nature 332:323-327(1988);Verhoeyen et al.,Science 239:1534-1536(1988))。場合によっては、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク領域(FR)残基は、所望の特異性、親和性、及び機能を有する非ヒト種由来の抗体または断片における対応する残基で置き換えられる。ヒト化抗体またはその抗原結合断片を、Fvフレームワーク領域及び/または置き換えられた非ヒト残基内のいずれかでのさらなる残基の置換によってさらに改変し、抗体またはその抗原結合断片の特異性、親和性、及び/または機能を改善及び最適化することができる。一般に、ヒト化抗体またはその抗原結合断片は、非ヒト免疫グロブリンに対応するCDR領域の全てまたは実質的に全てを含む、少なくとも1つ、典型的には2つまたは3つの可変ドメインの実質的に全てを含むが、FR領域の全てまたは実質的に全ては、ヒト免疫グロブリンコンセンサス領域のものである。ヒト化抗体またはその抗原結合断片は、典型的にはヒト免疫グロブリンのものである免疫グロブリン定常領域またはドメイン(Fc)の少なくとも一部も含むことができる。ヒト化抗体を生成するために使用される方法の例は、米国特許第5,225,539号、Roguska et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,91(3):969-973(1994)、及びRoguska et al.,Protein Eng.9(10):895-904(1996)に記載されている。いくつかの実施形態では、「ヒト化抗体」は、表面再構成抗体である。
Immunological Interest,(5th ed.,1991,National Institutes of Health,Bethesda Md.),「Kabat」)、及び(2)抗原抗体複合体の結晶学的研究に基づくアプローチ(Al-lazikani et al,J.Molec.Biol.273:927-948(1997))。さらに、当該技術分野ではこれら2つの方法の組み合わせを用いてCDRを決定することもある。
えば、重鎖可変ドメインは、H2の残基52の後に単一のアミノ酸挿入(Kabatに従う残基52a)、ならびに重鎖FR残基82の後に挿入された残基(例えば、Kabatに従う残基82a、82b、及び82cなど)を含み得る。残基のKabatナンバリングは、「標準の」Kabatナンバリング配列との抗体の配列の相同性領域でのアラインメントによって所与の抗体について決定され得る。一方、Chothiaは構造ループの位置に言及する(Chothia and Lesk,J.Mol.Biol.196:901-917(1987))。Kabatナンバリング規則を用いてナンバリングした場合、Chothia CDR-H1ループの末端は、ループの長さに応じてH32とH34の間で異なる(これは、KabatナンバリングスキームがH35AとH35Bに挿入を置くためであり、35Aも35Bも存在しない場合、このループは32で終わり、35Aのみが存在する場合、このループは33で終わり、35A及び35Bの両方が存在する場合、このループは34で終わる)。AbM超可変領域は、KabatのCDRとChothiaの構造的ループとの折衷物を表し、Oxford MolecularのAbM抗体モデリングソフトウェアによって使用されている。
et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.,90:5873-5877(1993)において改変され、NBLAST及びXBLASTプログラムに組み込まれている(Altschul et al.,Nucleic Acids Res.,25:3389-3402(1991))アルゴリズムである。特定の実施形態では、ギャップ付きBLASTは、Altschul et al.,Nucleic Acids
Res.25:3389-3402(1997)に記載されているように使用され得る。BLAST-2、WU-BLAST-2(Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460-480(1996))、ALIGN、ALIGN-2(Genentech,South San Francisco,California)、またはMegalign(DNASTAR)は、配列を整列させるために使用できる追加の公的に利用可能なソフトウェアプログラムである。特定の実施形態では、2つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、GCGソフトウェアのGAPプログラムを使用して決定される(例えば、NWSgapdna.CMPマトリックスで、40、50、60、70、または90のギャップウェイト、及び1、2、3、4、5、または6の長さのウェイトを使用して)。特定の代替的な実施形態では、Needleman and Wunsch(J.Mol.Biol.(48):444-453(1970))のアルゴリズムを組み入れた、GCGソフトウェアパッケージのGAPプログラムは、2つのアミノ酸配列間の同一性パーセントを決定するのに使用できる(例えば、Blossum 62マトリックスまたはPAM250マトリックスのいずれかで、16、14、12、10、8、6、または4のギャップウェイト、及び1、2、3、4、または5の長さのウェイトを使用して)。代替的に、特定の実施形態では、ヌクレオチドまたはアミノ酸配列間の同一性パーセントは、Myers and Miller(CA
BIOS,4:11-17(1989))のアルゴリズムを使用して決定される。例えば、同一性パーセントは、ALIGNプログラム(バージョン2.0)を使用し、残基表、12のギャップ長ペナルティ、4のギャップペナルティと共にPAM120を使用して決定できる。特定のアラインメントソフトウェアによる最大アラインメントの適切なパラメーターは、当業者によって決定できる。特定の実施形態では、アラインメントソフトウェアのデフォルトパラメーターが使用される。特定の実施形態では、第2の配列アミノ酸に対する第1のアミノ酸配列の同一性パーセント「X」は、100×(Y/Z)として計算され、式中、Yは第1と第2の配列のアラインメントで同一の一致としてスコア付けされたアミノ酸残基の数(目視検査または特定の配列アラインメントプログラムによってアラインメントされた場合の)であり、Zは第2の配列の残基の総数である。第1の配列の長さが第2の配列よりも長い場合、第2の配列に対する第1の配列の同一性パーセントは、第1の配列に対する第2の配列の同一性パーセントよりも長くなる。
、同じ標的抗原上にあってもよく、異なる標的抗原上にあってもよい。
施形態では停止する)ことができ、腫瘍転移を阻害する(すなわち、ある程度遅くし、特定の実施形態では停止する)ことができ、腫瘍増殖をある程度阻害することができ、がんに関連する1つ以上の症状をある程度緩和することができ、及び/または無増悪生存期間(PFS)、無病生存期間(DFS)、または全生存期間(OS)の増加、完全奏効(CR)、部分奏効(PR)、場合によっては安定疾患(SD)の増加、進行性疾患(PD)の減少、進行までの時間(TTP)の短縮、またはそれらの任意の組み合わせなどの良好な奏効をもたらす。本明細書の「治療すること」の定義を参照されたい。薬物が増殖を妨げ及び/または既存のがん細胞を殺傷し得る限りにおいて、それは細胞増殖抑制性及び/または細胞傷害性であり得る。
内として理解することができる。別段文脈から明らかでない限り、本明細書において提供される全ての数値は、約という用語によって修飾される。
essentially of)」という用語で記載されている類似の実施形態も提供されていることを理解されたい。本開示において、「含む(comprises)」、「含むこと(comprising)」、「含むこと(containing)」、及び「有すること」などは、米国特許法に帰属するそれらの意味を有し得、「含む(includes)」、「含むこと(including)」、などを意味し得、「から本質的になる(consisting essentially of)」、または「から本質的になる(consists essentially)」などは、同様に米国特許法に帰属する意味を有し得、用語はオープンエンドであり、列挙されているものを超えるものの存在によって列挙されているものの基本的または新規の特性が変化しない限り、列挙されているものを超えるものの存在を許容するが、従来技術の実施形態を排除する。
本明細書で提供されるのは、バイパラトピック抗FRα抗体及びその抗原結合断片である。これらのバイパラトピック抗体及びその抗原結合断片は、FRαの第1のエピトープに結合する第1のFRα結合ドメインと、FRαの第2のエピトープに結合する第2のFRα結合ドメインと、を含む。FRαの第1のエピトープと第2のエピトープは重複しないエピトープである。これらのバイパラトピックの抗体及び抗原結合断片は、追加のFRα結合ドメインを含むことができる。例えば、四価バイパラトピック抗体またはその抗原結合断片は、第1のエピトープに結合する2つのFRα結合ドメインと、第2のエピトープに結合する2つのFRα結合ドメインと、を有することができる。例示的なバイパラトピック抗体及びその抗原結合断片を図1に示す。
バイパラトピック抗体またはその抗原結合断片を組み立てるために使用することができるFRα結合ドメインが、本明細書で開示される。FRα結合ドメインは、6つの相補性
決定領域(CDR)、すなわち、可変重鎖(VH)CDR1、VH CDR2、VH CDR3、可変軽鎖(VL)CDR1、VL CDR2、及びVL CDR3を含むことができる。FRα抗原結合ドメインは、可変重鎖(VH)と可変軽鎖(VL)とを含むことができる。VHとVLは、別個のポリペプチドであり得るか、または同じポリペプチドの一部であり得る(例えば、scFvにおいて)。
約99%、または100%の配列同一性を有するVHを含み、任意選択で、VHは、それぞれ配列番号10~12、またはそれぞれ配列番号15、16、及び12のVH CDR1、VH CDR2、及びVH CDR3の配列を含む。
CDR2、及びVL CDR3の配列を含み、(ii)VHは、配列番号22に対して、少なくとも70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、または100%の配列同一性を有し、任意選択で、VHは、それぞれ配列番号7~9、またはそれぞれ配列番号13、14、及び9のVH CDR1、VH CDR2、及びVH CDR3の配列を含む。
CDR2、及びVL CDR3の配列を含み、(ii)VHは、配列番号24に対して、少なくとも70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、または100%の配列同一性を有し、任意選択で、VHは、それぞれ配列番号10~12、またはそれぞれ配列番号15、16、及び12のVH CDR1、VH CDR2、及びVH CDR3の配列を含む。
の実施形態では、リンカーは任意の長さのものであってよく、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、50、もしくは60、またはそれ以上のアミノ酸を含むことができる。他の実施形態では、本開示に有用なリンカーは、少なくとも1つのアミノ酸及び100未満のアミノ酸、90未満のアミノ酸、80未満のアミノ酸、70未満のアミノ酸、60未満のアミノ酸、50未満のアミノ酸、40未満のアミノ酸、30未満のアミノ酸、20未満のアミノ酸、19未満のアミノ酸、18未満のアミノ酸、17未満のアミノ酸、16未満のアミノ酸、15未満のアミノ酸、14未満のアミノ酸、13未満のアミノ酸、または12未満のアミノ酸を有する。いくつかの実施形態では、リンカー配列は、グリシンアミノ酸残基を含む。他の例では、リンカー配列は、グリシンとセリンのアミノ酸残基の組み合わせを含む。
5%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、または100%の配列同一性であるアミノ酸配列を含むscFvを含み、任意選択で、scFvは、それぞれ配列番号1~3のVL CDR1、VL CDR2、及びVL CDR3の配列と、それぞれ配列番号7~9、またはそれぞれ配列番号13、14、及び9のVH CDR1、VH CDR2、及びVH CDR3の配列と、を含む。
バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片は、上述のFRα結合ドメインの組み合わせを含んでもよく、FRα結合ドメインは、FRαの重複していないエピトープに結合する。
標)は、短いペプチドリンカーによって連結されているタンデムscFvを指す(Chames & Baty,mAbs 1:539-47)。二重特異性抗体産生に対する他のアプローチには、4価のIgG-scFv融合体(Dong et al.,2011,MAbs 3:273-88);二重作用Fab(DAF)抗体(Bostrom et al.,2009,Science 323:1610-14);Igg様二重可変ドメイン抗体(DVD-Ig)(Wu et al.,2007,Nat Biotechnol 25:1290-97);及びIgG4分子間の動的交換の使用(van der Neut Kolfschoten et al.,2007,Science 317:1554-57)が含まれる。
が参照により本明細書に組み込まれる。
al.,Nature 332:323-327(1988);Verhoeyen et al.,Science 239:1534-1536(1988))。
VLとVHとの配列を含む、第1のFRα結合ドメインと、FRαへの結合についてhuMov19と競合しない第2のFRα結合ドメインと、を含む。いくつかの実施形態では、バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片は、それぞれ配列番号20と57の、VLとVHとの配列を含む、第1のFRα結合ドメインと、FRαへの結合についてhuMov19と競合しない第2のFRα結合ドメインと、を含む。
ク抗体またはその抗原結合断片は、FR57の可変軽鎖及び/または可変重鎖(例えば、それぞれ配列番号17及び/または22)と、huMOV19の可変軽鎖及び/または可変重鎖(例えば、それぞれ配列番号19及び/または57)と、を含む。
FR57の可変軽鎖及び/または可変重鎖(例えば、それぞれ配列番号18及び/または22)と、huMOV19の可変軽鎖及び/または可変重鎖(例えば、それぞれ配列番号19及び/または24)と、を含む。
22)と、huMOV19の可変軽鎖及び/または可変重鎖(例えば、それぞれ配列番号21及び/または26)と、を含む。
変重鎖(例えば、それぞれ配列番号21及び/または57)と、を含む。
(i)FR57と同じエピトープに結合するscFvと、(ii)huMov19と同じエピトープに結合する別個のポリペプチド上のVH及びVLを含むFRα結合ドメインと、を含む。いくつかの実施形態では、バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片は、配列番号27、配列番号21、及び配列番号24を含む。いくつかの実施形態では、バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片は、配列番号27、配列番号21、及び配列番号25を含む。いくつかの実施形態では、バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片は、配列番号27、配列番号21、及び配列番号57を含む。いくつかの実施形態では、バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片は、配列番号27、配列番号21、及び配列番号26を含む。
3ドメインの一部または全てを含んでいてもよく、あるいはバリアントCH2及び/またはバリアントCH3の配列を含んでもよい(例えば、完全なFc領域のCH2またはCH3ドメインに対して1つ以上の挿入及び/または1つ以上の欠失を含んでもよい)。そのようなFc領域は、非Fcポリペプチド部分を含み得るか、または非天然の完全なFc領域の部分を含み得るか、または天然に存在しないCH2及び/またはCH3ドメインの配向(例えば、2つのCH2ドメインまたは2つのCH3ドメイン、あるいはN末端からC末端方向に、CH3ドメインがCH2ドメインに連結されるなど)を含み得る。
7-20172(2008);Davis et al.,J.Rheumatol.34:2204-2210(2007);Bolt et al.,Eur.J.Immunol.23:403-411(1993);Alegre et al.,Transplantation 57:1537-1543(1994);Xu et al.,Cell Immunol.200:16-26(2000);Cole et al.,Transplantation 68:563-571(1999);Hutchins et al.,PNAS USA 92:11980-11984(1995);Reddy et al.,J.Immunol.164:1925-1933(2000);WO97/11971、及びWO07/106585;米国特許出願公開第2007/0148167A1号;McEarchern et al.,Blood 109:1185-1192(2007);Strohl,Curr.Op.Biotechnol.20:685-691(2009);ならびにKumagai et al.,J.Clin.Pharmacol.47:1489-1497(2007)を参照されたい(そのそれぞれの内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる))。
体またはその抗原結合断片のCH2及びCH3ドメインのための好ましいIgG1配列は、置換L234A/L235A(下線で示す)を含む(配列番号62):
IgG2-E333S;IgG2 H268Q、V309L、A330S、A331S;IgG4-S228P、L236E;IgG4-F234A、L235A;IgG4-F234A、G237A、E318A;IgG4-L235A、G237A、E318A;IgG4-L236E;IgG2-EU配列118~260;及びIgG4-EU配列261~447に対応する1つのまたは複数の改変を含み、ここで、位置のナンバリングは、Kabatに示されるEUインデックスによる。
al.,PNAS USA 105:20167-20172(2008)を参照されたい(それぞれは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる))。CDCを減少させる重鎖定常ドメイン配列改変の例としては、EUインデックスによる、IgG1-C226S、C229S、E233P、L234V、L235A;IgG1-C226S、P230S;IgG1-L234F、L235E、P331S;IgG1-S239D、A330L、I332E;IgG2 EU配列118~260;IgG4-EU配列261~447;及びIgG2-H268Q、V309L、A330S、A331Sに対応する1つ以上の改変が挙げられる。
356、360、362、376、378、380、382、413、424、428、433、434、435、及び436からなる群から選択される1つ以上の位置で半減期を延長させるアミノ酸置換を含み、ここで、アミノ酸位置のナンバリングはEUインデックスに従う。いくつかの実施形態では、バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片は、位置251~257、285~290、308~314、385~389、及び428~436におけるアミノ酸残基の一つ以上のアミノ酸置換を含み、ここで、アミノ酸位置のナンバリングはEUインデックスに従う。いくつかの実施形態では、バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片は、Kabat位置252のアミノ酸のTyr、Phe、Trp、もしくはThrによる置換;Kabat位置254のアミノ酸のThrによる置換;Kabat位置256のアミノ酸のSer、Arg、Gln、Glu、Asp、もしくはThrによる置換;Kabat位置257のアミノ酸のLeuによる置換;Kabat位置309のアミノ酸のProによる置換;Kabat位置311のアミノ酸のSerによる置換;Kabatの428位のアミノ酸のThr、Leu、Phe、もしくはSerによる置換;Kabatの433位のアミノ酸のArg、Ser、Iso、Pro、もしくはGlnによる置換;または、Kabatの434位のアミノ酸のTrp、Met、Ser、His、Phe、もしくはTyrによる置換の一つ以上を含む。より具体的には、バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片ドメインは、野生型ヒトIgGの定常ドメインに対して、Kabat位置252のアミノ酸のTyrによる置換、Kabat位置254のアミノ酸のTyrによる置換、及びKabat位置256のアミノ酸のGluによる置換を含むアミノ酸置換を含むことができる。
FRαに免疫特異的に結合するバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片は、例えば、化学合成または組換え発現技術によって、抗体の合成のための当該分野で公知の任意の方法により生成することができる。本明細書に記載の方法は、別途示されない限り、分子生物学、微生物学、遺伝子分析、組換えDNA、有機化学、生化学、PCR、オリゴヌクレオチド合成及び修飾、核酸ハイブリダイゼーション、及び当業者の範囲内の関連分野における従来の技術を使用する。これらの技術は、例えば、本明細書で引用された参考文献に記載されており、文献で完全に説明されている。例えば、Sambrook J e
t al.,(2001)Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NY;Ausubel FM et al.,Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons(1987 and annual updates);Current Protocols in Immunology,John Wiley & Sons(1987 and annual updates)Gait(ed.)(1984)Oligonucleotide Synthesis:A Practical Approach,IRL Press;Eckstein(ed.)(1991)Oligonucleotides and Analogues:A Practical Approach,IRL Press;Birren B et al.,(eds.)(1999)Genome Analysis:A
Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Pressを参照されたい。
抗体は、同じサブクラス(例えば、IgG1もしくはIgG3)または異なるサブクラス(例えば、IgG1及びIgG3、もしくはIgG3及びIgG4)の免疫グロブリン鎖から構成することができる。
して、抗体または抗原結合断片を発現させる(例えば、組換え発現)ことを含む、方法である。特定の実施形態では、細胞は単離された細胞である。特定の実施形態では、外因性ポリヌクレオチドが細胞に導入されている。特定の実施形態では、方法は、細胞または宿主細胞から得られた抗体または抗原結合断片を精製するステップをさらに含む。
et al.,(1997)Gene 187:9-18;Burton DR & Barbas CF(1994)Advan Immunol 57:191-280;PCT出願番号PCT/GB91/001134;国際公開番号WO90/02809、WO91/10737、WO92/01047、WO92/18619、WO93/11236、WO95/15982、WO95/20401、及びWO97/13844;ならびに米国特許第5,698,426号、同第5,223,409号、同第5,403,
484号、同第5,580,717号、同第5,427,908号、同第5,750,753号、同第5,821,047号、同第5,571,698号、同第5,427,908号、同第5,516,637号、同第5,780,225号、同第5,658,727号、同第5,733,743号、及び同第5,969,108号に開示されるものが挙げられる。
特定の実施形態では、本開示はバイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片、またはそのような抗体または断片のドメイン、例えば、VH、VL、VLとVH(例えば、scFvにおいて)、重鎖、軽鎖、scFvを伴う重鎖、scFvを伴う軽鎖、定常領域、またはscFvを伴う定常領域をコードする核酸を含むポリヌクレオチドを包含する。
3をコードするポリヌクレオチドを含む組成物、または、配列番号44をコードするポリヌクレオチドと配列番号45をコードするポリヌクレオチドと配列番号46をコードするポリヌクレオチドを含む組成物)である。本明細書でまた提供されるのは、任意のバイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片をコードするポリヌクレオチドの組み合わせを含む組成物(例えば、配列番号20をコードするポリヌクレオチドと配列番号57をコードするポリヌクレオチドを含む組成物)である。
本明細書に記載のポリヌクレオチドを含むベクター及び細胞も提供される。
可変ドメインに融合した重鎖または軽鎖(例えば、scFv))、可変ドメイン、VH及びVLを含むポリペプチド(例えば、scFv)、定常ドメイン、及びまたは定常ドメインを含む融合タンパク質(例えば、1つ以上の可変ドメインに融合された定常ドメイン(例えば、ScFv))をコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターの構築を含む。本明細書に記載の抗体またはその断片をコードするポリヌクレオチドが得られたら、抗体またはその断片の生成のためのベクターは、当該技術分野で周知の技術を用いて組換えDNA技術によって生成することができる。このように、抗体またはその断片をコードするヌクレオチド配列であるポリヌクレオチドを発現することによるタンパク質の調製方法が本明細書に記載される。当業者に周知の方法を使用して、抗体またはその断片のコード配列及び適切な転写及び翻訳制御シグナルを含む発現ベクターを構築することができる。これらの方法には、例えば、インビトロ組換えDNA技術、合成技術、及びインビボ遺伝子組換えが含まれる。プロモーターに作動可能に連結された、抗体またはその断片をコードするヌクレオチド配列を含む複製可能なベクターも提供される。そのようなベクターは、例えば、抗体分子の定常領域をコードするヌクレオチド配列を含むことができ(例えば、国際公開番号WO86/05807、及びWO89/01036;ならびに米国特許第5,122,464号)、抗体の可変ドメインは、重鎖全体、軽鎖全体、または重鎖と軽鎖の両方の全体の発現のためにそのようなベクターにクローニングすることができる。付加的な可変ドメインまたはFRα結合ドメイン(例えば、scFv)をコードするヌクレオチド配列はまた、FRα結合ドメインまたはその断片(例えば、VHまたはVL)に融合した重鎖または軽鎖を含む融合タンパク質の発現のためのそのようなベクターにクローニングすることができる。
合タンパク質をコードするポリヌクレオチドを1の比率で宿主細胞にトランスフェクトされる。
O細胞である。特定の実施形態では、FRα(例えば、ヒトFRα)に免疫特異的に結合する抗体をコードするヌクレオチド配列の発現は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、または組織特異的プロモーターによって調節される。
一態様において、本開示は、本明細書に記載のバイパラトピックFRα結合剤(例えば、抗体またはその抗原結合断片)と、細胞傷害性薬剤とを含むイムノコンジュゲートに関する。細胞傷害性薬剤は、「イムノコンジュゲート」、「コンジュゲート」、または「ADC」を生成するために、当該技術分野で公知の技術を用いて、直接的に、またはリンカーを介して間接的に、FRα結合剤に結合またはコンジュゲートさせることができる。
第1の実施形態では、本明細書で提供されるイムノコンジュゲートは、バイパラトピックFRα抗体またはその抗原結合断片上に位置する1つ以上のリジン残基のεアミノ基を介して本明細書に記載のマイタンシノイド化合物に共有結合された本明細書に記載のバイパラトピックFRα抗体抗またはその抗原結合性断片を含む。一実施形態では、イムノコンジュゲートは式(I):
CBは、バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片であり;
L2は、以下の式のうちの1つによって表され:
Rx、Ry、Rx’、及びRy’は、それぞれの存在について、独立してH、-OH、ハロゲン、-O-(C1-4アルキル)、-SO3H、-NR40R41R42 +、または任意選択で-OH、ハロゲン、SO3H、もしくはNR40R41R42 +によって置換されたC1-4アルキルであり、ここで、R40、R41、及びR42は、それぞれ独立してHまたはC1-4アルキルであり;
l及びkは、それぞれ独立して、1~10の整数であり;
l1は、2~5の整数であり;
k1は、1~5の整数であり;
s1は細胞結合剤CBに接続された部位を示し、s3はA基に接続された部位を示し;
Aは、アミノ酸残基または2~20個のアミノ酸残基を含むペプチドであり;
R1及びR2は、それぞれ独立して、HまたはC1-3アルキルであり;
L1は、以下の式によって表され:
-CR3R4-(CH2)1-8-C(=O)-
式中、R3及びR4は、それぞれ独立してHまたはMeであり、L1の-C(=O)-部
分は、Dに接続されており;
Dは以下の式で表され:
1~10の整数である。いくつかの実施形態では、qは、2~5の整数である。いくつかの実施形態では、qは、3~4の整数である。
ys、D-Val-Arg、D-Val-D-Cit、D-Val-D-Lys、D-Val-D-Arg、D-Arg-D-Arg、Ala-Ala、Ala-D-Ala、D-Ala-Ala、D-Ala-D-Ala、Ala-Met、Gln-Val、Asn-Ala、Gln-Phe、Gln-Ala、D-Ala-Pro、及びD-Ala-tBu-Glyからなる群から選択され、それぞれのペプチドの最初のアミノ酸はL2基に接続され、それぞれのペプチドの最後のアミノ酸は-NH-CR1R2-S-L1-Dに接続され、残りの変数は、第1の実施形態または第1の特定の実施形態で式(I)について上述したとおりである。
[01]第1の実施形態の第6の特定の実施形態では、本明細書で提供されるイムノコンジュゲートは、上述の式(I)で表され、式中、Dは、以下の式で表され:
R3及びR4は、それぞれ独立してHまたはMeであり;
m1、m3、n1、r1、s1、及びt1は、それぞれ独立して1~6の整数であり;
m2、n2、r2、s2、及びt2は、それぞれ独立して、1~7の整数であり;
t3は、1~12の整数であり;
D1は以下の式で表され:
m1及びm3は、それぞれ独立して、2~4の整数であり;
m2は、2~5の整数であり;
r1は、2~6の整数であり;
r2は、2~5の整数であり;
残りの変数は、第7の特定の実施形態に記載されているとおりである。
Aは、Ala-Ala-Ala、Ala-D-Ala-Ala、Ala-Ala、D-Ala-Ala、Val-Ala、D-Val-Ala、D-Ala-Pro、またはD-Ala-tBu-Glyであり;
D1は以下の式で表され:
CBAは、バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片であり、当該抗体またはその抗原結合断片は、(i)配列番号1~3の配列を有する、軽鎖相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2、及びL-CDR3、ならびに配列番号7~9の配列を有する重鎖相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2、及びH-CDR3と、(ii)配列番号4~6の配列を有する軽鎖相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2、及びL-CDR3、ならびにそれぞれ配列番号10~12の配列を有する重鎖相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2、及びH-CDR3と、を含み;
qは、1または2であり;
D1は以下の式で表される:
CBAは、バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片であり、当該抗体またはその抗原結合断片は、(i)配列番号1~3の配列を有する、軽鎖相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2、及びL-CDR3、ならびに配列番号7~9の配列を有する重鎖相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2、及びH-CDR3と、(ii)配列番号4~6の配列を有する軽鎖相補性決定領域L-CDR1、L-CDR2、及びL-CDR3、ならびにそれぞれ配列番号10~12の配列を有する重鎖相補性決定領域H-CDR1、H-CDR2、及びH-CDR3と、を含み;
qは、1~10の整数、例えば、1または10であり;
D1は以下の式で表される:
CBAは、バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片であり、(i)それぞれ配列番号18及び配列番号23の配列を有する軽鎖可変領域及び重鎖可変領域と、(ii)それぞれ配列番号19及び配列番号24の配列を有する軽鎖可変領域及び重鎖可変領域と、を含み;
qは、1または2である。
CBAは、バイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片であり、(i)それぞれ配列番号18及び配列番号23の配列を有する軽鎖可変領域及び重鎖可変領域と、(ii)それぞれ配列番号19及び配列番号24の配列を有する軽鎖可変領域及び重鎖可変領域と、を含み;
qは、1~10の整数、例えば、1または10である。いくつかの実施形態では、qは、2~5の整数である。いくつかの実施形態では、qは、3~4の整数である。
施形態のイムノコンジュゲートを含む組成物(例えば、医薬組成物)について、組成物中の、薬物抗体比(DAR)としても知られている、抗体分子あたりの細胞傷害性薬剤の平均数(すなわち、qの平均値)は、1.0~8.0の範囲である。いくつかの実施形態では、DARは、1.0~5.0、1.0~4.0、1.5~4.0、2.0~4.0、2.5~4.0、1.0~3.4、1.0~3.0、3.0~4.0、3.1~3.5、3.1~3.7、3.4~3.6、1.5~2.5、2.0~2.5、1.7~2.3、または1.8~2.2の範囲である。いくつかの実施形態では、DARは、4.0未満、3.8未満、3.6未満、3.5未満、3.0未満、または2.5未満である。いくつかの実施形態では、DARは3.1~3.7の範囲である。いくつかの実施形態では、DARは3.1~3.4の範囲である。いくつかの実施形態では、DARは3.3~3.7の範囲である。いくつかの実施形態では、DARは3.5~3.9の範囲である。いくつかの実施形態では、DARは、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、または3.8である。いくつかの実施形態では、DARは3.5である。いくつかの実施形態では、DARは1.8~2.0の範囲である。いくつかの実施形態では、DARは1.7~1.9の範囲である。いくつかの実施形態では、DARは1.9~2.1の範囲である。いくつかの実施形態では、DARは、1.9、2.0、または2.1である。いくつかの実施形態では、一つ以上のシステインチオール基を介してマイタンシノイド化合物に結合したバイパラトピック抗FRα抗体またはその抗原結合断片を含む本発明のイムノコンジュゲートについて、DARは、1.5~2.5、1.8~2.2、1.1~1.9、または1.9~2.1の範囲である。いくつかの実施形態では、DARは、1.8、1.9、2.0、または2.1である。
当該技術分野で知られている任意の適切なリンカーを、本開示のイムノコンジュゲートを調製する際に使用することができる。特定の実施形態では、リンカーは二官能性リンカーである。本明細書で使用される場合、「二官能性リンカー」という用語は、一方は細胞結合剤と反応することができ、もう一方はマイタンシノイド化合物と反応して2つの部分を一緒に結合する2つの反応性基を有する修飾剤を指す。そのような二官能性架橋剤は当該技術分野でよく知られている(例えば、Isalm and Dent in Bioconjugation chapter 5,p218-363,Groves Dictionaries Inc.New York,1999を参照されたい)。例えば、チオエーテル結合を介して結合を可能にする二官能性架橋剤としては、マレイミド基を導入するN-スクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)-シクロヘキサン-1-カルボキシレート(SMCC)、またはヨードアセチル基を導入するN-スクシンイミジル-4-(ヨードアセチル)-アミノベンゾエート(SIAB)が挙げられる。マレイミド基またはハロアセチル基を細胞結合剤に導入する他の二官能性架橋剤は、当該技術分野で周知であり(米国特許公開第2008/0050310号、同第20050169933号を参照されたい。Pierce Biotechnology Inc.P.O.Box 117,Rockland,IL 61105,USAから入手可能)、ビス-マレイミドポリエチレングリコール(BMPEO)、BM(PEO)2、BM(PEO)3、N-(β-マレイミドプロピルオキシ)スクシンイミドエステル(BMPS)、γ-マレイミド酪酸N-スクシンイミジルエステル(GMBS)、ε-マレイミドカプロン酸N-ヒドロキシスクシンイミドエステル(EMCS)、5-マレイミド吉草酸NHS、HBVS、N-スクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)-シクロヘキサン-1-カルボキシ-(6-アミドカプロエート)、これはSMCCの「長鎖」類似体である(LC-SMCC)、m-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシスクシンイミドエステル(MBS)、4-(4-N-マレイミドフェニル)-酪酸ヒドラジドまたはHCl塩(MPBH)、N-スクシンイミジル3-(ブロモアセトアミド)プロピオネート(SBAP)、N-スクシンイミジルヨードアセテート(SIA)、κ-マレイミドウンデカン酸N-スクシンイミジルエステル(KMUA)、N-スクシンイミジル4-(p-マレイミドフェ
ニル)-ブチレート(SMPB)、スクシンイミジル-6-(β-マレイミドプロピオンアミド)ヘキサノエート(SMPH)、スクシンイミジル-(4-ビニルスルホニル)ベンゾエート(SVSB)、ジチオビス-マレイミドエタン(DTME)、1,4-ビス-マレイミドブタン(BMB)、1,4-ビスマレイミジル-2,3-ジヒドロキシブタン(BMDB)、ビス-マレイミドヘキサン(BMH)、ビス-マレイミドエタン(BMOE)、スルホスクシンイミジル4-(N-マレイミド-メチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(スルホ-SMCC)、スルホスクシンイミジル(4-ヨード-アセチル)アミノベンゾエート(スルホ-SIAB)、m-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシスルホスクシンイミドエステル(スルホ-MBS)、N-(γ-マレイミドブトリルオキシ)スルホスクシンイミドエステル(スルホ-GMBSまたはsGMBS)、N-(ε-マレイミドカプロイルオキシ)スルホスクシミドエステル(スルホ-EMCS)、N-(κ-マレイミドウンデカノイルオキシ)スルホスクシンイミドエステル(スルホ-KMUS)、及びスルホスクシンイミジル4-(p-マレイミドフェニル)ブチレート(スルホ-SMPB)が挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、本開示のイムノコンジュゲートを作製するために使用され得る細胞傷害性薬剤である。本明細書で提供されるイムノコンジュゲートで使用される細胞傷害性薬剤は、細胞の死をもたらす、または細胞死を誘発する、または何らかの方法で細胞生存率を低下させる任意の化合物であり得、例えば、マイタンシノイド及びマイタンシノイド類似体、ベンゾジアゼピン、タキソイド、CC-1065及びCC-1065類似体、デュオカルマイシン及びデュオカルマイシン類似体、カリチアマイシンなどのエンジイン、オーリスタチンを含むドラスタチン及びドラスタチン誘導体、トメイマイシン誘導体、レプトマイシン誘導体、メトトレキサート、シスプラチン、カルボプラチン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、ビンクリスチン、ビンブラスチ
ン、メルファラン、マイトマイシンC、クロラムブシル、及びモルフォリノドキソルビシンが含まれる。特定の実施形態では、細胞傷害性薬剤は、マイタンシノイド及びマイタンシノイド類似体である。
L2 ’は、以下の構造式によって表され:
Rx、Ry、Rx’、及びRy’は、それぞれの存在について、独立してH、-OH、ハロゲン、-O-(C1-4アルキル)、-SO3H、-NR40R41R42 +、または任意選択で-OH、ハロゲン、-SO3H、もしくはNR40R41R42 +によって置換されたC1-4アルキルであり、ここで、R40、R41、及びR42は、それぞれ独立してHまたはC1-4アルキルであり;
l及びkは、それぞれ独立して、1~10の整数であり;
JCB ’は、-C(=O)OHまたは-COEであり、-COEは反応性エステルであり;
Aが、アミノ酸または2~20個のアミノ酸を含むペプチドであり;
R1及びR2は、それぞれ独立して、HまたはC1-3アルキルであり;
L1は、以下の式によって表され:
-CR3R4-(CH2)1-8-C(=O)-;
式中、R3及びR4は、それぞれ独立してHまたはMeであり、L1の-C(=O)-部分は、Dに接続されており;
Dが以下の式で表され:
A’は、アミノ酸または2~20個のアミノ酸を含むペプチド(すなわち、A-NH2)であり;
R1及びR2は、それぞれ独立して、HまたはC1-3アルキルであり;
L1は、-CR3R4-(CH2)1-8-C(=O)-であり;R3及びR4は、それぞれ独立してHまたはMeであり;
Dが以下の式で表され:
Rx’及びRy’は、それぞれの存在について、独立してH、-OH、ハロゲン、-O-(C1-4アルキル)、-SO3H、-NR40R41R42 +、または任意選択で-OH、ハロゲン、SO3H、もしくはNR40R41R42 +によって置換されたC1-4アルキルであり、ここで、R40、R41、及びR42は、それぞれ独立してHまたはC1-4アルキルであり;
kは、1~10の整数である。
Aは、アミノ酸残基または2~20個のアミノ酸残基を含むペプチドであり;
R1及びR2は、それぞれ独立して、HまたはC1-3アルキルであり;
L1は、-CR3R4-(CH2)1-8-C(=O)-であり;R3及びR4は、それぞれ独立してHまたはMeであり;
Dは以下の式で表され:
本明細書に記載の細胞傷害性薬剤(例えば、マイタンシノイド)に共有結合されたバイパラトピックFRα結合抗体またはその抗原結合断片を含むイムノコンジュゲートは、当該技術分野で公知の任意の適切な方法に従って調製することができる。
(a)式(III)または(IV)のマイタンシノイド化合物を本明細書に記載のリンカー化合物と反応させて、アミン反応性基またはチオール反応性基が結合した細胞傷害性薬剤-マイタンシノイド化合物(例えば、式(II)の化合物)であって、バイパラトピックFRα結合抗体またはその抗原結合断片に共有結合することのできるものを形成すること、及び
(b)バイパラトピックFRα結合抗体またはその抗原結合断片をマイタンシノイド-リンカー化合物と反応させてイムノコンジュゲートを形成すること。
(a)バイパラトピックFRα結合抗体またはその抗原結合断片を、本明細書に記載のリンカー化合物と反応させて、アミン反応性基またはチオール反応性が結合した改変されたバイパラトピックFRα結合抗体またはその抗原結合断片であって、式(III)または(IV)のマイタンシノイド化合物に共有結合することができるものを形成すること、及び
(b)改変されたバイパラトピックFRα結合抗体またはその抗原結合断片を式(III)または(IV)のマイタンシノイド化合物と反応させてイムノコンジュゲートを形成すること。
[02]別の特定の実施形態では、イムノコンジュゲートは、以下の式によって表される:
CFTタイプI及びタイプII、Bio-Rad Laboratories,Hercules,Calif.)が含まれる。適切なHCIC樹脂の例は、MEP Hypercel樹脂(Pall Corp.,East Hills,N.Y.)である。適切なHIC樹脂の例には、ブチルセファロース、ヘキシルセファロース、フェニルセファロース、及びオクチルセファロース樹脂(全てGE Healthcare,Piscataway,N.J.から)、ならびにマクロプレップメチル及びマクロプレップt-ブチル樹脂(Biorad Laboratories,Hercules,Calif.)が含まれる。適切なイオン交換樹脂の例には、SP-セファロース、CM-セファロース、及びQ-セファロース樹脂(全てGE Healthcare,Piscataway,N.J.から)、及びウノスフィアS樹脂(Bio-Rad Laboratories,Hercules,Calif.)が含まれる。適切な混合モードイオン交換体の例には、Bakerbond ABx樹脂(JT Baker,Phillipsburg N.J.)が含まれる。適切なIMAC樹脂の例には、キレートセファロース樹脂(GE
Healthcare,Piscataway,N.J.)及びProfinity IMAC樹脂(Bio-Rad Laboratories,Hercules,Calif.)が含まれる。適切な色素リガンド樹脂の例としては、ブルーセファロース樹脂(GE Healthcare,Piscataway,N.J.)及びアフィゲルブルー樹脂(Bio-Rad Laboratories,Hercules,Calif.)が挙げられる。適切なアフィニティー樹脂の例には、細胞結合剤が抗体である場合、プロテインAセファロース樹脂(例えば、MabSelect,GE Healthcare,Piscataway,N.J.)、細胞結合剤が適切なレクチン結合部位を有する場合、レクチンアフィニティー樹脂、例えば、Lentilレクチンセファロース樹脂(GE Healthcare,Piscataway,N.J.)が挙げられる。代替的に、細胞結合剤に特異的な抗体を使用することができる。このような抗体は、例えば、セファロース4ファストフロー樹脂(GE Healthcare,Piscataway,N.J.)に固定化することができる。適切な逆相樹脂の例としては、C4、C8、及びC18樹脂(Grace Vydac,Hesperia,Calif.)が挙げられる。
本明細書で提供されるのは、生理学的に許容される担体、賦形剤、または安定剤(Remington’s Pharmaceutical Sciences(1990)Mack Publishing Co.,Easton,PA)において所望の純度を有する、本明細書に記載のイムノコンジュゲート、抗体、またはその抗原結合断片を含む組成物である。許容される担体、賦形剤、または安定剤は、使用される投与量及び濃度でレシピエントに無毒である。
本開示のバイパラトピック抗FRα抗体、その抗原結合断片、及びイムノコンジュゲートは、がんの治療などの治療処置方法を含むがこれらに限定されない種々の用途に有用である。特定の実施形態では、薬剤は、腫瘍増殖を阻害するため及び/または腫瘍体積を低減するために有用である。使用方法は、インビトロまたはインビボの方法であってもよい。
くつかの実施形態では、患者から得られた試料中の細胞の少なくとも50%は、少なくとも1のFRαのIHCスコアを有する。いくつかの実施形態では、患者から得られた試料中の細胞の少なくとも66%は、少なくとも1のFRαのIHCスコアを有する。いくつかの実施形態では、患者から得られた試料中の細胞の少なくとも75%は、少なくとも1のFRαのIHCスコアを有する。
胞を、バイパラトピック抗FRα抗体、その抗原結合断片、及びイムノコンジュゲートと接触させることを含む。特定の実施形態では、腫瘍または腫瘍細胞を、バイパラトピック抗FRα抗体、その抗原結合断片、及びイムノコンジュゲートと接触させることは、動物モデル内で実施される。例えば、バイパラトピック抗FRα抗体、その抗原結合断片、及びイムノコンジュゲートは、免疫無防備状態のマウス(例えば、NOD/SCIDマウス)で増殖した1つ以上複数の腫瘍を示す異種移植片に投与されて腫瘍増殖を阻害する。いくつかの実施形態では、がん幹細胞は、例えば、組織生検、胸水、または血液試料などの患者試料から単離され、免疫無防備状態のマウスに注射され、次いで、バイパラトピック抗FRα抗体、その抗原結合断片、及びイムノコンジュゲートが投与されて腫瘍細胞増殖を阻害する。
素反応または分子相互作用を通じて、間接的に検出される酵素またはリガンドなどの部分が含まれるが、これらに限定されない。
二重特異性抗体の発現
上述のように、マウス抗FRα抗体のパネルは、標準的なハイブリドーマ技術によって生成され、表面再構成法を使用してヒト化された(例えば、WO2011/106528A1を参照されたい)。抗体は、FACS競合アッセイを使用して、結合についてMov19と競合するか(Bin 1)、そうでないか(Bin 2;FRα抗体A、FRα抗体B、FRα抗体C、及びFR57)に応じて、2つのBinに分類された。簡潔に述べると、1.5x10-9MのM9346Aビオチン化抗体を、一般的に5×10-8M~5×10-11Mの範囲の濃度のFRα抗体A、FRα抗体B、FRα抗体C、及びFR57と混合した。完全な結合競合の対照として、ビオチン化されていないM9346A抗体を使用した。混合物を、ウェルあたり20,000個のFRα陽性KB細胞を含む96ウェルプレートに加え、プレートを氷上で1時間インキュベートした。次いで、細胞を冷リン酸緩衝生理食塩水/1%ウシ血清アルブミンで洗浄し、結合したhuM9346A-ビオチンをストレプトアビジン-PE試薬で検出した。FACSCaliburフローサイトメーターを使用して試料を分析した。図1に示すように、対照抗体M9346AのみがhuM9346A-ビオチンと結合について競合し、分析された4つのFR-抗体のいずれも、huM9346A-ビオチンの結合を妨害しなかった。
Ridgway JB,Presta LC,Carter,P)。簡潔に述べると、FR1-57scFvは、C220S(対になっていないシステインをセリンに変異させる)及びノブ変異(T366W)を含む操作されたFc領域に融合され、Mov19 Fab領域は、ホール変異(T366S、L368A、及びY407V)を含む操作されたFcに融合された。別段の記載がない限り、全てのナンバリングはEUシステムに基づいている。図2は、以降の実験で評価されたさまざまな抗体フォーマットを示す。
伝子は、標準的な分子生物学技術を使用して、コドン最適化され、合成され、プラスミドにクローニングされた。トランスフェクション用の軽鎖プラスミドと重鎖プラスミドの比率は、Morrisonベースの分子の場合1:3に、非対称Fcベースの分子の場合9:3:1(Mov19LC:Mov19 HC-ホール:FR57scFv-ノブ)に維持された。図3に示されるように、非対称Fcベースの分子を生成するために、いくつかの重鎖及び軽鎖プラスミドトランスフェクション比が調査され、9:3:1の比率が最小限のホモ二量体を示した。
濾過された上清は、プロテインAアフィニティーとセラミックヒドロキシアパタイト(CHT)の2つのクロマトグラフィーステップから本質的になるスキームを使用して精製された。簡潔に述べると、濾過した上清を、1×PBS(pH7.3±0.1)で事前に平衡化したプロテインAカラムにロードした。非特異的宿主細胞タンパク質を減少させるために、カラムを1×PBS(pH7.3±0.1)で洗浄した。結合した抗体は、50mM塩化ナトリウム(pH3.2)を含む25mM酢酸を使用して溶出し、1MTris-baseで直ちにpH7.0±0.2に中和した。中和されたプールはCHT結合緩衝液(15mMリン酸ナトリウム、pH 7.0±0.1)中で1:10に希釈され、CHT結合緩衝液で事前に平衡化したタイプII CHTカラム(40μm粒経)にロードした。結合したタンパク質を直線勾配(10カラム容量で15mMから160mMのリン酸ナトリウム)を使用して溶出し、目的の画分(サイズ排除クロマトグラフィー、SECによる高いモノマーパーセント)をプールし、1×PBS(pH7.3±0.1)に対して透析し、濾過滅菌した。最終抗体濃度は、280nmでの吸光度と1.44mL mg-1 cm-1の吸光係数を測定することによって決定された。
親(Bin 1及びBin 2)抗体の結合特性
表10は、Bin 1及びBin 2抗体と組換えFRα抗原との結合の速度論的パラメーターを要約する。KD値は、Octet96システム(Fortebio)で実施されたバイオレイヤー干渉法を介して、基本的にメーカーの推奨手順に従って取得された。簡潔に述べると、抗ヒトまたは抗マウス-Fcセンサーを1×Kinetic Buffer(Fortebio)に10分間事前に浸し、Bin 1またはBin 2 IgGのいずれかの5μg/mLと5分間インキュベートした。次いで、センサーを1×Kin
etic Bufferに5分間移してベースラインを決定し、抗原の連続希釈液で結合(10分間)、1×Kinetic Bufferで解離(10分間)を順次行った。生データが収集され、処理され、Fortebio分析ソフトウェアを使用して単純な1:1結合モデルに適合され、動的パラメーターKon及びKoffを決定した。
バイパラトピック抗体は、Mov19抗体を別の重複しないエピトープを認識する抗体と組み合わせることによって作成された。特に、Morrisonのフォーマットに基づくIgGは、Bin IgGの1つからのscFvを別のBinからのIgGのC末端またはN末端に融合することによって生成された。表11に、調査した全ての組み合わせを示す。C末端に融合したscFvはVH-VL配向であり、N末端に融合したものはVL-VH配向であった。Mov19は、BrinkmannのVH44-VL100ジスルフィド安定化変異を含んで、または含まずに、VH-VL及びVL-VHの方向の両方でC末端のscFvとしてのみ探索された(PNAS 1993 August;90(16):7538-754.A recombinant immunotoxin containing a disulfide-stabilized Fv fragment.U Brinkmann,Y Reiter,S H Jung,B Lee,and I Pastan)。
5%を超える純度までさらに洗練され、さらに特性評価された。バイパラトピックアームの結合に対するscFvアームの全体的な分子立体配座または潜在的な構造変化の影響を説明するために、8つのMorrison構築物の各アームの結合効率を競合FACSアッセイでアッセイした。簡潔に述べると、FRα陽性T47D細胞を、対応するマウス親抗体と通常50nM~0.2nMの濃度範囲で混合した0.8nMのMorrison抗体とインキュベートした。氷上で2時間インキュベートした後、細胞を非結合抗体から洗い流し、結合したMorrison抗体を二次抗ヒトFITC標識抗体で検出した。親抗体の濃度を増加させた場合のMorrison抗体の結合の減少は、第2のアームのセットの結合に対する効果を示した。図4A~4H及び表12に示されるように、Morrisonの抗体の8つのうち5つは、完全に不活性であるか、または部分的に影響を受けたアームを有していた。機能アームの両方のセットを有する3つのMorrison抗体のうち、2つの抗体(FRα-抗体-A-scFv2-Mov19-IgG1及びFRα-抗体-C-scFv2-Mov19-IgG1)は安定性の問題を示した。これらのデータに基づいて、FR57scFv2-Mov19-IgG1(「4価」)がさらなる評価のために選択された。
抗体の結合とプロセシングに対する抗体フォーマットの影響は、3[H]抗体を使用してインビトロで評価された。簡潔に述べると、FRα陽性KB細胞を飽和濃度の親、KIHバイパラトピック、またはMorrison抗体に対して37℃で30分間曝露し、PBSで洗浄して未結合の抗体を除去し、新鮮な培地に再懸濁し、6%に加湿したCO2雰囲気中で37℃で22時間インキュベートした。アセトン抽出及び液体シンチレーションカウンティングに続いて、タンパク質を含まない放射能(プロセシングされた抗体)及びタンパク質関連放射能(プロセシングしていない抗体)の量を評価し、データを使用して細胞あたりの抗体結合部位(ABC)、プロセシングされた抗体%、プロセシングされた抗体の量を計算した。予備実験は、親抗体M9346AとhuFR57のプロセシングが類似していることを示した。したがって、1つの親抗体(M9346A)のみがさらなる実験で使用された。
FR57scfv-huMov19-スルホ-SPDB-DM4コンジュゲートの調製
FR57scfv-huMov19、スルホ-SPDB、及びDM4のモル濃度は、それぞれ280、343、412nmでのUV/Vis吸光度値と吸光係数を用いてベールの法則に従って計算された。リンカー濃度は、リンカーを50mMのリン酸カリウム緩衝液、50mMの塩化ナトリウムと2mMのEDTA、pH7.5中の25mMのDTTと反応させ、343nmでのチオピリジン放出を測定することによって決定した。薬物濃度は、DM4を50mMのリン酸カリウム緩衝液、50mMの塩化ナトリウム、2mMのEDTA、pH 7.5中の10mMのDTNB[5,5-ジチオビス-(2-ニトロ安息香酸)]と反応させ、412nmでの吸光度を測定することによって決定された。
寄与を説明する二項方程式を使用してAb濃度及びDM4濃度を計算することとによって決定された。最終的なFR57scfv-huMov19-スルホ-SPDB-DM4コンジュゲート試料に存在する非結合マイタンシノイドの量は、HISEPカラム(25cm×4.6mm、5μm)で分析した試料で観察されたピーク面積から計算した。コンジュゲート試料に存在する遊離マイタンシノイドパーセント(FM%)は、以下の式を使用して計算された:遊離マイタンシノイド%=(DM4による逆相PA 252)/(DM4による逆相PA 252+DM4によるフロースルーPA 252)×100%。
抗体コンジュゲーションの前に、1.5mMのスルホ-SPDBを30%水溶液[15mMのリン酸カリウムpH7.6)中の1.95mMのDM4及び70%有機[(N-N-ジメチルアセトアミド、DMA、SAFC)]と25℃で90分間反応させることにより、スルホ-SPDB-DM4インサイチュ混合物を調製した。コンジュゲーション反応中、3.0mg/mLの抗体溶液を、11%DMA(v/v)を含む15mMのリン酸カリウムpH7.6で、抗体の10倍モル過剰のスルホ-SPDB-DM4と25℃で15~20時間反応させた。反応物を、NAP脱塩カラムを使用して10mMのコハク酸塩、250mMのグリシン、0.5%スクロース、0.01%Tween 20、pH5.5の製剤緩衝液中に2回精製し、0.22μmPVDFメンブレンを備えたシリンジフィルターで濾過した。精製されたコンジュゲートは、UV-Visによって2.9モルDM4/モル抗体、SECによって90.6%モノマー、HPLC Hisepカラム分析によって1%未満の遊離薬物であることがわかった。
FR57scfv-huMov19、スルホ-GMBS、及びDM21のモル濃度は、それぞれ280、343、412nmでのUV/Vis吸光度値と吸光係数を用いてベールの法則に従って計算された。リンカー濃度は、リンカーを50mMのリン酸カリウム緩衝液、50mMの塩化ナトリウムと2mMのEDTA、pH7.5中の25mMのDTTの50mMのDTTと反応させ、343nmでのチオピリジン放出を測定することによって決定した。薬物濃度は、DM21を50mMのリン酸カリウム緩衝液、50mMの塩化ナトリウム、2mMのEDTA、pH 7.5中の10mMのDTNB[5,5-ジチオビス-(2-ニトロ安息香酸)]と反応させ、412nmでの吸光度を測定することによって決定された。
DM21によるフロースルーPA 252)×100%。
KIH-FR57scfv-huMov19-GMBS-DM21Lの最初のバッチは、インサイチュ混合物中のより低濃度の薬物とリンカー、及びコンジュゲーションプロセス中のより低濃度の抗体を使用して調製した。簡潔に述べると、コンジュゲーションの前に、1.5mMのスルホ-GMBSを、それぞれ60/40(v/v)DMA及びコハク酸緩衝液pH5.0中の1.95mMのDM21と反応させることにより、スルホ-GMBS-DM21のインサイチュ混合物を調製した。コンジュゲーションは、10%DMA(v/v)を含む、60mMの4-(2-ヒドロキシエチル)-1-ピペラジンプロパンスルホン酸(EPPS)pH8.0中の2.5mg/mLの抗体に対して7.5リンカー過剰のスルホ-GMBS-DM21で実施された。25℃で20~22時間インキュベートした後、反応物を、NAP脱塩カラムを使用して10mMのコハク酸塩、250mMのグリシン、0.5%スクロース、0.01%Tween 20、pH5.5中に2回精製し、0.22μmPVDFメンブレンフィルターで濾過した。精製されたコンジュゲートは、UV-Visによって3.1モルDM21/モル抗体、SECによって99.1%モノマー、HPLC Hisepカラム分析によって2%未満の遊離薬物であることがわかった。
バイパラトピックイムノコンジュゲートのインビトロ細胞傷害性
イムノコンジュゲートの細胞傷害性に対するバイパラトピック抗体フォーマットの効果は、KB、Igrov-1、及びT47D細胞を使用してインビトロで評価された。親抗体、KIH抗体、及びMorrison抗体のスルホ-SPDB-DM4コンジュゲートを、実施例3に記載の方法に従って調製した。コンジュゲートを適切な培地で希釈し、1×103細胞/ウェルを含む96ウェル平底プレートのウェルに添加した。プレートを37℃、6%CO2で5日間インキュベートした。細胞生存率は、製造元のプロトコールに従ってWST-8アッセイによって決定され、IC50は、シグモイド用量反応(可変勾配)非線形回帰カーブフィット(GraphPad Software Inc)を使用して生成された。
イムノコンジュゲートの治療効果に対する4価のバイパラトピック抗体フォーマットの効果は、OV-90異種移植モデルを使用してインビボで評価された。マウスは腫瘍体積によって群に無作為化され(群あたりn=6)、その後接種後7日目に投与された。これらの群には、製剤緩衝液を投与した対照群、2.5及び5mg/kgの4価-s-SPDB-DM4、ならびに2.5及び5mg/kgのM-s-SPDB-DM4が含まれていた。全てのマウスに、上述の化合物を単回静脈内投与した。接種後80日目に研究を終了した。
Res.1991 Sept.(51):4845-4852.Experimental Antitumor Activity of Taxotere(RP 56976,NSC 628503),a Taxol Analogue.M Bissery,D Guenard,F Gueritte-Voegelein,et alに記
載されるように評価した。
イムノコンジュゲートの治療効果に対する4価のバイパラトピック抗体フォーマットの効果は、IGROV-1異種移植モデルを使用してインビボで評価された。マウスは腫瘍体積によって群に無作為化され(群あたりn=8)、その後接種後11日目に投与された。これらの群には、製剤緩衝液を投与した対照群、100μg/kgの4価-s-SPDB-DM4、及び100μg/kgのM-s-SPDB-DM4が含まれていた。4価抗体と親抗体の分子量の違い(すなわち、50kDaの違い)による4価コンジュゲートの過少投与の可能性を説明するために、この研究及び今後の全ての研究では、用量をペイロードによって正規化した。全てのマウスに、上述の化合物を単回静脈内投与した。接種後81日目に研究を終了した。腫瘍の測定及び計算は、上述のサブセクション「OV-90ヒト卵巣癌異種移植片を有するSCIDマウスにおける4価バイパラトピックADCのインビボ抗腫瘍活性」に記載されているように決定された。
イムノコンジュゲートの治療効果に対するKIHバイパラトピック抗体フォーマットの効果は、OV-90異種移植モデルを使用してインビボで評価された。マウスは腫瘍体積によって群に無作為化され(群あたりn=6)、その後接種後7日目に投与された。これらの群には、製剤緩衝液を投与した対照群、40、20、及び10μg/kgのKIH-s-SPDB-DM4、ならびに20μg/kgのM-s-SPDB-DM4が含まれていた。全てのマウスに、上述の化合物を単回静脈内投与した。接種後80日目に研究を終了した。腫瘍の測定及び計算は、サブセクション「OV-90ヒト卵巣癌異種移植片を有するSCIDマウスにおける4価バイパラトピックADCのインビボ抗腫瘍活性」に記載されているように決定された。
DM21にコンジュゲートしたノブインホールバイパラトピック抗体のインビトロ細胞傷害性
DM21にコンジュゲートしたKIHバイパラトピック抗体のインビトロ細胞傷害性を
、実施例4に記載のプロトコール(「バイパラトピックイムノコンジュゲートのインビトロ細胞傷害性」)に従って複数の細胞株で評価した。以前の研究では、2つの親DM21コンジュゲート(M-DM21及びhuFR57-DM21)の活性が非常に類似していることが示された(図11)。さらなる全ての研究において、KIH-DM21の活性を親M抗体のコンジュゲート(M-s-SPDB-DM4及びM-DM21)と比較して、KIH-DM21の全体的な細胞傷害性に対するバイパラトピックフォーマット及びDM21ペイロードの寄与を評価した。
混合細胞培養においてFRα細胞を殺傷するKIH-DM21の能力は、複数の細胞株を使用してインビトロで評価された。他のインビトロ細胞傷害性実験と一致して、親抗体コンジュゲートM-DM21及びM-s-SPDB-DM4を対照として使用した。標的陽性細胞(KB、Igrov-1、Jeg-3またはT47D)と標的陰性細胞Namalwa/luc(すなわち、ルシフェラーゼを発現するNamalwa細胞)の混合培養を0.5nMのコンジュゲートに曝露した。この濃度のコンジュゲートは、細胞を単独でインキュベートした場合、標的陰性細胞に対して毒性がない。混合培養における標的陽性細胞のさまざまなパーセンテージ(9%~50%)がその後、試験された。5日間の曝露後、混合物中の標的陰性細胞の細胞増殖の阻害は、製造元のプロトコールに従ってOne
Glo(Promega)によって決定された。
OV-90ヒト卵巣癌異種移植片を有するSCIDマウスにおけるKIHバイパラトピックADCのインビボ抗腫瘍活性
低いFRα発現(Hスコア30)を有するOV-90異種移植モデルで、KIH-DM21のインビボ有効性を評価し、KIH-s-SPDB-DM4と比較した。マウスは腫瘍体積によって群に無作為化され(群あたりn=6)、その後接種後7日目に投与された。これらの群には、製剤緩衝液を投与した対照群、40、20、及び10μg/kgのKIH-s-SPDB-DM4、40、20、及び10μg/kgのKIH-DM21、20μg/kgのM-DM21、ならびに20μg/kgのM-s-SPDB-DM4が含まれていた。全てのマウスに、上述の化合物を単回静脈内投与した。接種後80日目に研究を終了した。腫瘍の測定及び計算は、実施例4のサブセクション「OV-90ヒト卵巣癌異種移植片を有するSCIDマウスにおける4価バイパラトピックADCのインビボ抗腫瘍活性」に記載されているように決定された。
中程度のFRα発現(Hスコア100)を有するIshikawa異種移植モデルで、DM21にコンジュゲートしたKIHバイパラトピック抗体のインビボ有効性を評価した。
中程度のFRα発現(Hスコア140)を有するIGROV-1異種移植モデルで、DM21にコンジュゲートしたKIHバイパラトピック抗体のインビボ有効性を評価した。マウスは腫瘍体積によって群に無作為化され(群あたりn=8)、その後接種後10日目に投与された。これらの群には、製剤緩衝液を投与した対照群、100及び50μg/kgのKIH-DM21、130及び70μg/kgのM-DM21、ならびに100及び50μg/kgのM-s-SPDB-DM4が含まれていた。全てのマウスに、上述の化合物を単回静脈内投与した。接種後120日目に研究を終了した。腫瘍の測定及び計算は、実施例4のサブセクション「OV-90ヒト卵巣癌異種移植片を有するSCIDマウスにおける4価バイパラトピックADCのインビボ抗腫瘍活性」に記載されているように決定された。
高いFRα発現(Hスコア300)を有するKB異種移植モデルで、DM21にコンジュゲートしたKIHバイパラトピック抗体のインビボ有効性を評価した。腫瘍が約100mm3に到達したとき、マウスは腫瘍体積によって群に無作為化され(群あたりn=6)、その後接種後6日目に投与された。これらの群には、製剤緩衝液を投与した対照群、50及び25μg/kgのKIH-DM21、50及び25μg/kgのM-DM21、ならびに50及び25μg/kgのM-s-SPDB-DM4が含まれていた。全てのマウスに、上述の化合物を単回静脈内投与した。接種後120日目に研究を終了した。腫瘍の測定及び計算は、実施例4のサブセクション「OV-90ヒト卵巣癌異種移植片を有するSCIDマウスにおける4価バイパラトピックADCのインビボ抗腫瘍活性」に記載されているように決定された。
DM21にコンジュゲートしたKIHバイパラトピック抗体のインビボ有効性はIMGN853抵抗性KB異種移植モデルで評価した。親KB細胞は1nMのDM1-Meの存在下で増殖させた。安定して増殖した培養物が確立された後、細胞をサブクローン化し、クローンを増殖させ、特徴評価して、凍結させた。この研究のためにサブクローン6Aを選択し、マウスに皮下接種した。腫瘍が約100mm3に到達したとき、マウスは腫瘍体積によって群に無作為化され(群あたりn=6)、その後接種後5日目に投与された。これらの群には、製剤緩衝液を投与した対照群、40及び20μg/kgのKIH-L-DM21、40及び20μg/kgのM-L-DM21、ならびに40及び20μg/kgのM-s-SPDB-DM4が含まれていた。全てのマウスに、上述の化合物を単回静脈内投与した。接種後78日目に研究を終了した。腫瘍の測定及び計算は、上述のOV-90ヒト卵巣癌異種移植片実験に記載されているように決定された。
μg/kg用量では、T-Cが6日、LCKが0.34(不活性)、PRが0/6、CRが0/6、TFSが0/6であった。KIH-L-DM21の20μg/kg群では、接種後8日目の最下点で3%の最小限の体重減少が見られた。要約すると、このモデルではKIH-L-DM21はM-L-DM21と同等の効果があり、KIH-L-DM21とM-L-DM21の両方がM-s-SPDB-DM4よりも効果的であった。
バイパラトピックなFRα標的化イムノコンジュゲートの毒性及び毒物動態プロファイルを、単回投与後のカニクイザルで評価した。簡潔に述べると、KIH-DM21は、用量レベルあたり2頭のオスのサルに対し、10または13mg/kgの用量レベルで10分間のゆっくりとしたボーラス注入として投与された。動物は投与後28日まで観察され、影響の回復、持続、または進行を評価した。体重、臨床観察、及び食物消費を評価し、臨床病理学パラメーター(血液学、血清化学、及び凝固)及び毒物動態パラメーターのために血液試料を収集した。
特定の実施形態では、例えば以下の項目が提供される。
(項目1)
ヒト葉酸受容体1(FRα)に特異的に結合するバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片であって、前記抗体またはその抗原結合断片は、
(a)FRαの第1のエピトープに結合する第1の可変重鎖(VH)及び第1の可変軽鎖(VL)を含む第1のFRα結合ドメインと、
(b)FRαの第2のエピトープに結合する第2のVH及び第2のVLを含む第2のFRα結合ドメインと、を含む、前記バイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目2)
前記第1のFRα結合ドメインが、配列番号24、25、26、及び57からなる群から選択されるVHアミノ酸配列と、配列番号19、20、及び21からなる群から選択されるVLアミノ酸配列と、を含む抗体と同じFRαエピトープに特異的に結合する、項目
1に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目3)
前記第1のFRα結合ドメインが、配列番号24、25、26、及び57からなる群から選択されるVHアミノ酸配列と、配列番号19、20、及び21からなる群から選択されるVLアミノ酸配列と、を含む抗体と同じFRαのエピトープへの結合を競合的に阻害する、項目1に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目4)
前記第2のFRα結合ドメインが、配列番号22または23のVHアミノ酸配列と、配列番号17または18のVLアミノ酸配列と、を含む抗体と同じFRαのエピトープに特異的に結合する、項目1~3のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目5)
前記第2のFRα結合ドメインが、配列番号22または23のVHアミノ酸配列と、配列番号17または18のVLアミノ酸配列と、を含む抗体と同じFRαのエピトープへの結合を競合的に阻害する、項目1~3のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目6)
前記第1のVHが、それぞれ(a)配列番号10~12または(b)配列番号15、16、及び12のアミノ酸配列を含むVH CDR1~3を含み、前記第1のVLが、それぞれ配列番号4~6のアミノ酸配列を含むVL CDR1~3を含む、項目1~5のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目7)
前記第1のVHが、配列番号24、25、26、及び57からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、及び/または前記第1のVLが、配列番号19、20、及び21からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、項目1~6のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目8)
前記第2のVHが、それぞれ(a)配列番号7~9または(b)配列番号13、14、及び9のアミノ酸配列を含むVH CDR1~3を含み、前記第2のVLが、それぞれ配列番号1~3のアミノ酸配列を含むVL CDR1~3を含む、項目1~7のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目9)
前記第2のVHが、配列番号22もしくは23のアミノ酸配列を含み、及び/または前記第2のVLが、配列番号17もしくは18のアミノ酸配列を含む、項目1~8のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目10)
前記第1のVHとVLの対、及び/または前記第2のVHとVLの対が、マウス、非ヒト、ヒト化、キメラ、表面再構成(resurfaced)、またはヒトである、項目1~9のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目11)
前記抗体またはその抗原結合断片が、ヒトFRαに結合するが、FOLR2またはFOLR3に結合しない、項目1~10のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目12)
前記第1のFRα結合ドメインが単鎖可変断片(scFv)である、項目1~11のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目13)
前記第1のFRα結合ドメインの前記scFvが、VH-リンカー-VLのペプチドの配向を有する、項目12に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目14)
前記第1のFRα結合ドメインの前記scFvが、VL-リンカー-VHのペプチドの配向を有する、項目12に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目15)
前記第2のFRα結合ドメインが単鎖可変断片(scFv)である、項目1~11のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目16)
前記第2のFRα結合ドメインの前記scFvが、VH-リンカー-VLのペプチドの配向を有する、項目15に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目17)
前記第2のFRα結合ドメインの前記scFvが、VL-リンカー-VHのペプチドの配向を有する、項目15に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目18)
前記リンカーがグリシン-セリンリンカーである、項目13~17のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目19)
前記第2のFRα結合ドメインが、配列番号27~29から選択されるアミノ酸配列を含む、項目1~18のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目20)
前記第1のFRα結合ドメインが、配列番号30~32から選択されるアミノ酸配列を含む、項目1~18のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目21)
(i)配列番号33及び34、(ii)配列番号35及び36、(iii)配列番号37及び38、または(iv)配列番号39及び40のアミノ酸配列を含む、項目1~20のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目22)
配列番号41~43のアミノ酸配列を含む、項目1~20のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目23)
配列番号44~46のアミノ酸配列を含む、項目1~20のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目24)
前記バイパラトピック抗体またはその抗原結合断片が、4価のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片である、項目1~23のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目25)
前記バイパラトピック抗体またはその抗原結合断片が、2価のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片である、項目1~23のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目26)
前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片が、タンデムscFv、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、及びノブインホール構造からなる群から選択されるFRα結合ドメインを含む、項目1~25のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目27)
ノブインホール(KIH)構造を有する、項目1~20及び22~26のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目28)
配列番号1~3及び7~9を含む前記FRα結合ドメインが、前記KIH構造のノブ側
にある、項目27に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目29)
配列番号1~3及び7~9を含む前記FRα結合ドメインが、前記KIH構造のホール側にある、項目27に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目30)
配列番号4~6及び10~12を含む前記FRα結合ドメインが、前記KIH構造のノブ側にある、項目27~29のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目31)
配列番号4~6及び10~12を含む前記FRα結合ドメインが、前記KIH構造のホール側にある、項目27~29のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目32)
全長抗体を含む、項目1~31のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目33)
前記第1のFRα結合ドメインが全長抗体である、項目1~32のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目34)
前記第2のFRα結合ドメインが全長抗体である、項目1~33のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目35)
抗原結合断片を含む、項目1~31のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目36)
前記第1のFRα結合ドメインが抗原結合断片である、項目1~35のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目37)
前記第2のFRα結合ドメインが抗原結合断片である、項目1~36のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目38)
配列番号41~43のアミノ酸配列を含む、バイパラトピック抗体またはその抗原結合断片。
(項目39)
項目1~38に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片をコードする単離された核酸分子の組み合わせ。
(項目40)
項目39に記載の核酸分子のうちの1つを含む、単離されたベクター。
(項目41)
項目39に記載の単離された核酸分子、または項目40に記載の単離されたベクターの組み合わせを含む宿主細胞。
(項目42)
E.coli、Pseudomonas、Bacillus、Streptomyces、酵母、CHO、YB/20、NS0、PER-C6、HEK-293T、NIH-3T3、HeLa、BHK、Hep G2、SP2/0、R1.1、B-W、L-M、COS 1、COS 7、BSC1、BSC40、BMT10細胞、植物細胞、昆虫細胞、及び組織培養におけるヒト細胞からなる群から選択される、項目41に記載の宿主細胞。
(項目43)
項目1~38のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体または抗原、項目39に記載の核酸分子、項目40に記載のベクター、または項目41もしくは42に記載の宿主細
胞の組み合わせと、薬学的に許容される担体または賦形剤と、を含む、医薬組成物。
(項目44)
項目1~38のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体と、薬学的担体または賦形剤を含む、医薬組成物。
(項目45)
項目1~23のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体を作製する方法であって、(a)前記抗体を発現する細胞を培養することと、(b)前記培養された細胞から前記抗体を単離することと、を含む、前記方法。
(項目46)
前記細胞が真核細胞である、項目45に記載の方法。
(項目47)
以下の式:
CBは、項目1~38のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片であり;
L2は、以下の式のうちの1つによって表され:
Rx、Ry、Rx’、及びRy’は、それぞれの存在について、独立してH、-OH、ハロゲン、-O-(C1-4アルキル)、-SO3H、-NR40R41R42 +、または任意選択で-OH、ハロゲン、SO3H、もしくはNR40R41R42 +によって置換されたC1-4アルキルであり、ここで、R40、R41、及びR42は、それぞれ独立してHまたはC1-4アルキルであり;
l及びkは、それぞれ独立して、1~10の整数であり;
l1は、2~5の整数であり;
k1は、1~5の整数であり;
s1は細胞結合剤CBに接続された部位を示し、s3はA基に接続された部位を示し;
Aが、アミノ酸残基または2~20個のアミノ酸残基を含むペプチドであり;
R1及びR2が、それぞれ独立して、HまたはC1-3アルキルであり;
L1が、以下の式によって表され:
-CR3R4-(CH2)1-8-C(=O)-
式中、R3及びR4が、それぞれ独立してHまたはMeであり、L1の-C(=O)-部分は、Dに接続されており;
Dが以下の式で表され:
(項目48)
Rx、Ry、Rx’、及びRy’の全てがHであり、l及びKが、それぞれ独立して、2~6の整数整数である、項目47に記載のイムノコンジュゲート。
(項目49)
Aが2~5個のアミノ酸残基を含むペプチドである、項目47または48に記載のイムノコンジュゲート。
(項目50)
Aが、Gly-Gly-Gly、Ala-Val、Val-Ala、D-Val-Ala、Val-Cit、D-Val-Cit、Val-Lys、Phe-Lys、Lys-Lys、Ala-Lys、Phe-Cit、Leu-Cit、Ile-Cit、Phe-Ala、Phe-N9-トシル-Arg、Phe-N9-ニトロ-Arg、Phe-Phe-Lys、D-Phe-Phe-Lys、Gly-Phe-Lys、Leu-Ala-Leu、Ile-Ala-Leu、Val-Ala-Val、Ala-Ala-Ala、D-Ala-Ala-Ala、Ala-D-Ala-Ala、Ala-Ala-D-Ala、Ala-Leu-Ala-Leu(配列番号54)、β-Ala-Leu-Ala-Leu(配列番号55)、Gly-Phe-Leu-Gly(配列番号56)、Val-Arg、Arg-Arg、Val-D-Cit、Val-D-Lys、Val-D-Arg、D-Val-Cit、D-Val-Lys、D-Val-Arg、D-Val-D-Cit、D-Val-D-Lys、D-Val-D-Arg、D-Arg-D-Arg、Ala-Ala、Ala-D-Ala、D-Ala-Ala、D-Ala-D-Ala、Ala-Met、Gln-Val、Asn-Ala、Gln-Phe、Gln-Ala、D-Ala-Pro、及びD-Ala-tBu-Glyからなる群から選択され、それぞれのペプチドの最初のアミノ酸がL2基に接続され、それぞれのペプチドの最後のアミノ酸が-NH-CR1R2-S-L1-Dに接続されている、項目49に記載のイムノコンジュゲート。
(項目51)
R1とR2が両方ともHである、項目47~50のいずれか1項に記載のイムノコンジュゲート。
(項目52)
L1が-(CH2)4-6-C(=O)-である、項目47~51のいずれか1項に記載のイムノコンジュゲート。
(項目53)
Dが以下の式で表される、項目47~52のいずれか1項に記載のイムノコンジュゲート:
前記イムノコンジュゲートが以下の式:
R3及びR4が、それぞれ独立してHまたはMeであり;
m1、m3、n1、r1、s1、及びt1が、それぞれ独立して1~6の整数であり;
m2、n2、r2、s2、及びt2が、それぞれ独立して、1~7の整数であり;
t3が、1~12の整数であり;
D1が以下の式で表される項目47~53のいずれか1項に記載のイムノコンジュゲート:
前記イムノコンジュゲートが以下の式で表され:
m1及びm3が、それぞれ独立して、2~4の整数であり;
m2が、2~5の整数であり;
r1が、2~6の整数であり;
r2が、2~5の整数である、項目54に記載のイムノコンジュゲート。
(項目56)
Aが、Ala-Ala-Ala、Ala-D-Ala-Ala、Ala-Ala、D-
Ala-Ala、Val-Ala、D-Val-Ala、D-Ala-Pro、またはD-Ala-tBu-Glyである、項目54または55に記載のイムノコンジュゲート。(項目57)
前記イムノコンジュゲートが以下の式:
Aが、Ala-Ala-Ala、Ala-D-Ala-Ala、Ala-Ala、D-Ala-Ala、Val-Ala、D-Val-Ala、D-Ala-Pro、またはD-Ala-tBu-Glyであり;
D1が以下の式で表される項目54に記載のイムノコンジュゲート:
前記イムノコンジュゲートが以下の式で表され:
前記イムノコンジュゲートが以下の式で表され:
CBAが、項目1~38のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片であり;
qが、1~10の整数であり;
D1が以下の式で表される項目47に記載のイムノコンジュゲート:
以下の式:
CBAが、配列番号41~43のアミノ酸配列を含むバイパラトピック抗体または抗原結合断片であり;
D1が、以下の式で表され:
qが、1~10の整数である、前記イムノコンジュゲート。
(項目61)
式(A)-(L)-(C)を有するイムノコンジュゲートであって、式中、
(A)が項目1~38のいずれか1項に記載のバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片であり;
(L)が、リンカーであり;
(C)が細胞傷害性薬剤であり、前記リンカー(L)が(A)を(C)に連結する、前記イムノコンジュゲート。
(項目62)
前記リンカーが、切断可能なリンカー、切断不可能なリンカー、親水性リンカー、及びジカルボン酸ベースのリンカーからなる群から選択される、項目61に記載のイムノコンジュゲート。
(項目63)
前記リンカーが、N-(γマレイミドブトリルオキシ)スルホスクシンイミドエステル(スルホ-GMBSまたはsGMBS)、γマレイミド酪酸N-スクシンイミジルエステル(GMBS)、N-スクシンイミジル4-(2-ピリジルジチオ)-2-スルホブタノエート(スルホ-SPDB);N-スクシンイミジル4-(2-ピリジルジチオ)ペンタノエート(SPP)またはN-スクシンイミジル4-(2-ピリジルジチオ)-2-スルホペンタノエート(スルホ-SPP);N-スクシンイミジル4-(2-ピリジルジチオ)ブタノエート(SPDB)、N-スクシンイミジル4-(マレイミドメチル)シクロヘ
キサンカルボキシレート(SMCC);N-スルホスクシンイミジル4-(マレイミドメチル)シクロヘキサンカルボキシレート(スルホSMCC);N-スクシンイミジル-4-(ヨードアセチル)-アミノ安息香酸(SIAB);及びN-スクシンイミジル-[(N-マレイミドプロピオンアミド)-テトラエチレングリコール]エステル(NHS-PEG4-マレイミド)からなる群から選択される、項目62に記載のイムノコンジュゲート。
(項目64)
前記リンカーが、スルホ-GMBSである、項目61~63のいずれか1項に記載のイムノコンジュゲート。
(項目65)
前記リンカーが、GMBSである、項目61~63のいずれか1項に記載のイムノコンジュゲート。
(項目66)
前記リンカーが、スルホ-SPDBである、項目61~63のいずれか1項に記載のイムノコンジュゲート。
(項目67)
前記細胞傷害性薬剤が、マイタンシノイド、マイタンシノイド類似体、ベンゾジアゼピン、タキソイド、CC-1065、CC-1065類似体、デュオカルマイシン、デュオカルマイシン類似体、カリチアマイシン、ドラスタチン、ドラスタチン類似体、アウリスタチン、トメイマイシン誘導体、及びレプトマイシン誘導体または薬剤のプロドラッグからなる群から選択される、項目61~66のいずれか1項に記載のイムノコンジュゲート。
(項目68)
前記細胞傷害性薬剤がマイタンシノイドである、項目61~67のいずれか1項に記載のイムノコンジュゲート。
(項目69)
前記マイタンシノイドがDM4である、項目68に記載のイムノコンジュゲート。
(項目70)
前記マイタンシノイドがDM21である、項目68に記載のイムノコンジュゲート。
(項目71)
第2の(C)をさらに含む、項目61~70のいずれか1項に記載のイムノコンジュゲート。
(項目72)
第3の(C)をさらに含む、項目71に記載のイムノコンジュゲート。
(項目73)
第4の(C)をさらに含む、項目72に記載のイムノコンジュゲート。
(項目74)
項目61~73のいずれか1項に記載の少なくとも1つのイムノコンジュゲートを含む組成物であって、前記イムノコンジュゲートが、Aあたり平均3~4個のCを含む前記組成物。
(項目75)
項目47~74のいずれか1項に記載のイムノコンジュゲートと、薬学的に許容される担体と、を含む、医薬組成物。
(項目76)
前記医薬組成物が、抗体またはその抗原結合断片あたり平均2~5の薬物を含む、項目75に記載の医薬組成物。
(項目77)
前記医薬組成物が、抗体またはその抗原結合断片あたり平均3~4の薬物を含む、項目75に記載の医薬組成物。
(項目78)
対象におけるがんを治療する方法であって、治療有効量の項目1~38のいずれか1項に記載の抗体もしくはその抗原結合断片、項目47~73のいずれか1項に記載のイムノコンジュゲート、または項目43、44、もしくは74~77に記載の組成物を、前記対象に投与することを含む、前記方法。
(項目79)
前記がんが、卵巣癌、子宮癌、腹膜癌、卵管癌、子宮内膜癌、肺癌、または脳癌である、項目78に記載の方法。
(項目80)
前記がんが卵巣癌である、項目78に記載の方法。
(項目81)
前記卵巣癌が、プラチナ抵抗性上皮卵巣癌である、項目80に記載の方法。
(項目82)
前記卵巣癌が、再発した上皮卵巣癌である、項目80に記載の方法。
(項目83)
前記卵巣癌が、プラチナ不応性上皮卵巣癌である、項目80に記載の方法。
(項目84)
前記がんが子宮癌である、項目78に記載の方法。
(項目85)
前記がんが腹膜癌である、項目78に記載の方法。
(項目86)
前記がんが卵管癌である、項目78に記載の方法。
(項目87)
前記がんが子宮内膜癌である、項目78に記載の方法。
(項目88)
前記がんが肺癌である、項目78に記載の方法。
(項目89)
前記がんが脳癌である、項目78に記載の方法。
(項目90)
前記がんがIMGN853抵抗性である、項目78~89のいずれか1項に記載の方法。
(項目91)
ステロイドの投与をさらに含む、項目78~90のいずれか1項に記載の方法。
Claims (30)
- がんの治療における使用のためのイムノコンジュゲートを含む医薬組成物であって、前記イムノコンジュゲートは、ヒト葉酸受容体1(FRα)に特異的に結合するバイパラトピック抗体またはその抗原結合断片及び細胞傷害性薬剤を含み、かつ以下の式で示され:
式中:
CBAが、前記バイパラトピック抗体またはその抗原結合断片であり;
qが、1~10の整数であり;及び
D1が以下の式:
で示され、
前記バイパラトピック抗体またはその抗原結合断片が、
(a)配列番号24の第1の可変重鎖(VH)及び配列番号19の第1の可変軽鎖(VL)を含む第1のFRα結合ドメイン;並びに
(b)配列番号23の第2のVH及び配列番号18の第2のVLを含む第2のFRα結合ドメインを含み、並びに
前記医薬組成物は、前記バイパラトピック抗体又はその抗原結合断片あたり平均3~4個の細胞傷害性薬剤を含む、医薬組成物。 - 前記がんが、卵巣癌、子宮癌、腹膜癌、卵管癌、子宮内膜癌、肺癌、または脳癌であ
る、請求項1に記載の医薬組成物。 - 前記がんが、プラチナ感受性である、請求項2に記載の医薬組成物。
- 前記がんが卵巣癌である、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記卵巣癌が、プラチナ抵抗性上皮卵巣癌である、請求項4に記載の医薬組成物。
- 前記卵巣癌が、再発した上皮卵巣癌である、請求項4に記載の医薬組成物。
- 前記卵巣癌が、プラチナ不応性上皮卵巣癌である、請求項4に記載の医薬組成物。
- 前記がんが子宮癌である、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記がんが腹膜癌である、詰求項1に記載の医薬組成物。
- 前記がんが卵管癌である、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記がんが子宮内膜癌である、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記がんが肺癌である、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記がんが脳癌である、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記がんがIMGN853抵抗性である、請求項1~13のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 前記医薬組成物がステロイドと共に投与するためのものである、請求項1~13のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- がんの治療における使用のためのイムノコンジュゲートを含む医薬組成物であって、前記イムノコンジュゲートは、ヒト葉酸受容体1(FRα)に特異的に結合するバイパラトピック抗体及び細胞傷害性薬剤を含み、かつ以下の式で示され:
式中:
CBAが、前記バイパラトピック抗体であり;
qが、1~10の整数であり;及び
D1が以下の式:
で示され、
前記バイパラトピック抗体が、配列番号41~43のアミノ酸配列を含み、並びに前記医薬組成物が、前記バイパラトピック抗体あたり平均3~4個の細胞傷害性薬剤を含む、医薬組成物。 - 前記がんが、卵巣癌、子宮癌、腹膜癌、卵管癌、子宮内膜癌、肺癌、または脳癌である、請求項16に記載の医薬組成物。
- 前記がんが、プラチナ感受性である、請求項17に記載の医薬組成物。
- 前記がんが卵巣癌である、請求項16に記載の医薬組成物。
- 前記卵巣癌が、プラチナ抵抗性上皮卵巣癌である、請求項19に記載の医薬組成物。
- 前記卵巣癌が、再発した上皮卵巣癌である、請求項19に記載の医薬組成物。
- 前記卵巣癌が、プラチナ不応性上皮卵巣癌である、請求項19に記載の医薬組成物。
- 前記がんが子宮癌である、請求項16に記載の医薬組成物。
- 前記がんが腹膜癌である、詰求項16に記載の医薬組成物。
- 前記がんが卵管癌である、請求項16に記載の医薬組成物。
- 前記がんが子宮内膜癌である、請求項16に記載の医薬組成物。
- 前記がんが肺癌である、請求項16に記載の医薬組成物。
- 前記がんが脳癌である、請求項16に記載の医薬組成物。
- 前記がんがIMGN853抵抗性である、請求項16~28のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 前記医薬組成物がステロイドと共に投与するためのものである、請求項16~28のいずれか1項に記載の医薬組成物。
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