JP7842011B2 - ヘテロ二量体タンパク質 - Google Patents
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Description
本出願は、2019年9月27日に出願された米国仮出願第62/906,918号の利益を主張するものであり、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本開示は、ヘテロ二量体タンパク質(例えば、多特異性抗体)およびそれを作製する方法に関する。
2つ以上の結合特異性を含む多重特異性結合分子(例えば、多重特異性抗体)は、インビボで複数の標的の活性を調節するこれらの分子の能力を理由に、治療薬として大きな可能性を秘めている。多重特異性抗体を産生するための1つの一般的な方法は、2つの異なる抗体の重鎖をヘテロ二量体化することである。このヘテロ二量体化を促進するために、2つの抗体のCH3ドメインを操作して、ホモ二量体化よりも重鎖ヘテロ二量体化に対して選好を生じさせる相補的な変異セットを含ませる(例えば、各々全体が参照により本明細書に組み込まれる、Ridgway J.B.et al.,1996,Protein Eng.,9:617-621、および米国特許第9,409,989号を参照されたい)。
本開示は、天然由来の抗体と比べて、FcγRIIIAへの強化された結合を呈し、良好な製造可能性を呈するヘテロ二量体タンパク質(例えば、多重特異性抗体)を提供する。ヘテロ二量体タンパク質は、概して、アスパラギン酸、グルタミン酸、およびトリプトファンを、それぞれ、アミノ酸239位、332位、および366位に含む、第1のFcポリペプチドと、アスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを、それぞれ、アミノ酸239位、366位、368位、および407位に含むが、グルタミン酸をアミノ酸332位に含まない、第2のFcポリペプチドと、を含み、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。ある特定の実施形態では、ヘテロ二量体タンパク質は、アスパラギン酸、ロイシン、グルタミン酸、およびトリプトファンを、それぞれ、アミノ酸239位、330位、332位、および366位に含む、第1のFcポリペプチドと、アスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを、それぞれ、アミノ酸239位、366位、368位、および407位に含むが、ロイシンおよびグルタミン酸を、それぞれ、アミノ酸330位および332位に含まない、第2のFcポリペプチドと、を含み、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。かかるヘテロ二量体タンパク質は、多重特異性結合タンパク質(例えば、多重特異性抗体)として特に有用である。また、これらのヘテロ二量体タンパク質を含む医薬組成物、これらのヘテロ二量体タンパク質をコードする核酸、ならびにこれらのヘテロ二量体タンパク質を作製するための発現ベクターおよび宿主細胞も提供される。理論に拘束されることを意図するものではないが、出願人は、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第2のFcポリペプチドは、EUインデックスに従って番号付けされたアミノ酸239位、330位、332位、366位、368位、および407位に変異を含む対応するFcポリペプチドと比べて、熱安定性が改善されたと考える。
a)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第1および第2のFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
b)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第1および第2のFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むベクター、
c)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチド、および本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチド、
d)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチドを含む第1のベクター、および本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチドを含む第2のベクター、
e)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチドの第1の抗体重鎖をコードする第1のポリヌクレオチド、および本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第2のFcポリペプチドの第2の抗体重鎖をコードする第2のポリヌクレオチド、および任意選択で、第1のFcポリペプチドの第1の抗体軽鎖をコードする第3のポリヌクレオチド、および/または第2のFcポリペプチドの第2の抗体軽鎖をコードする第4のポリヌクレオチド
(第1のFcポリペプチドは、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含み、かつ第2のFcポリペプチドは、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む)、あるいは
f)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチドの第1の抗体重鎖をコードする第1のポリヌクレオチドを含む第1のベクター、および本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第2のFcポリペプチドの第2の抗体重鎖をコードする第2のポリヌクレオチドを含む第2のベクター、および任意選択で、第1のFcポリペプチドの第1の抗体軽鎖をコードする第3のポリヌクレオチドを含む第3のベクター、および/または第2のFcポリペプチドの第2の抗体軽鎖をコードする第4のポリヌクレオチドを含む第4のベクター
(第1のFcポリペプチドは、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含み、かつ第2のFcポリペプチドは、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む)、を含む。
a)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチドの第1の抗体重鎖をコードする第1のポリヌクレオチドと、
b)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第2のFcポリペプチドの第2の抗体重鎖をコードする第2のポリヌクレオチドと、
c)第1のFcポリペプチドの第1の抗体軽鎖をコードする第3のポリヌクレオチドと、
d)第2のFcポリペプチドの第2の抗体軽鎖をコードする第4のポリヌクレオチドとを、
ヘテロ二量体タンパク質が産生される条件下で発現させることを含み、
第1のFcポリペプチドは、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含み、かつ第2のFcポリペプチドは、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む。
a)第1の細胞内で、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチドを、第1のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
b)第2の細胞内で、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチドを、第2のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
c)ステップ(a)および(b)で産生された第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドを、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドがヘテロ二量体化してヘテロ二量体タンパク質を産生する条件下で接触させることと、を含む。
a)第1の細胞内で、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチドの、第1の抗体重鎖をコードする第1のポリヌクレオチドおよび第1の抗体軽鎖をコードする第2のポリヌクレオチドを、第1のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
b)第2の細胞内で、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第2のFcポリペプチドの、第2の抗体重鎖をコードする第3のポリヌクレオチドおよび第2の抗体軽鎖をコードする第4のポリヌクレオチドを、第2のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
c)ステップ(a)および(b)で産生された第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドを、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドがヘテロ二量体化してヘテロ二量体タンパク質を産生する条件下で接触させることと、を含み、
第1のFcポリペプチドは、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含み、かつ第2のFcポリペプチドは、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む。
天然由来の抗体と比べて、FcγRIIIAへの強化された結合を呈し、良好な製造可能性を呈するヘテロ二量体タンパク質(例えば、多重特異性抗体)が本明細書に提供される。ヘテロ二量体タンパク質は、概して、アスパラギン酸、グルタミン酸、およびトリプトファンを、それぞれ、アミノ酸239位、332位、および366位に含む、第1のFcポリペプチドと、アスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを、それぞれ、アミノ酸239位、366位、368位、および407位に含むが、グルタミン酸をアミノ酸332位に含まない、第2のFcポリペプチドと、を含み、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。ある特定の実施形態では、ヘテロ二量体タンパク質は、アスパラギン酸、ロイシン、グルタミン酸、およびトリプトファンを、それぞれ、アミノ酸239位、330位、332位、および366位に含む、第1のFcポリペプチドと、アスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを、それぞれ、アミノ酸239位、366位、368位、および407位に含むが、ロイシンおよびグルタミン酸を、それぞれ、アミノ酸330位および332位に含まない、第2のFcポリペプチドと、を含み、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。かかるヘテロ二量体タンパク質は、多重特異性結合タンパク質(例えば、多重特異性抗体)として特に有用である。また、これらのヘテロ二量体タンパク質を含む医薬組成物、これらのヘテロ二量体タンパク質をコードする核酸、ならびにこれらのヘテロ二量体タンパク質を作製するための発現ベクターおよび宿主細胞も提供される。
本明細書で使用される場合、「ヘテロ二量体タンパク質」という用語は、2つの非同一Fcポリペプチドの共有結合二量体または非共有結合二量体を含むタンパク質を指す。
一態様では、本開示は、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドを含むヘテロ二量体タンパク質を提供し、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、およびトリプトファンを、それぞれ、アミノ酸239位、332位、および366位に含み、第2のFcポリペプチドは、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを、それぞれ、アミノ酸239位、366位、368位、および407位に含むが、アミノ酸であるグルタミン酸をアミノ酸332位に含まず、アミノ酸位置は、その都度、EUインデックスに従って番号付けされる。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンをさらに含み、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンをさらに含み、第2のFcポリペプチドは、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
生理学的に許容可能な担体、賦形剤、または安定剤中で所望の程度の純度を有するヘテロ二量体タンパク質を含む組成物が、本明細書で提供される(例えば、Remington’s Pharmaceutical Sciences(1990)Mack Publishing Co.,Easton,PAを参照されたい)。許容される担体、賦形剤、または安定剤は、用いられる投与量および濃度でレシピエントにとって非毒性であり、リン酸などの緩衝剤、クエン酸塩、および他の有機酸;アスコルビン酸およびメチオニンを含む抗酸化剤;防腐剤(オクタデシルジメチルベンジル塩化アンモニウム;塩化ヘキサメトニウム;塩化ベンザルコニウム;塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチル、もしくはベンジルアルコール;メチルもしくはプロピルパラベンなどのアルキルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3-ペンタノール;およびm-クレゾールなど);低分子量(約10残基未満)ポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチン、もしくは免疫グロブリンなどのタンパク質;ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー;グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、もしくはリジンなどのアミノ酸;グルコース、マンノース、もしくはデキストリンを含む単糖類、二糖類、および他の炭水化物;EDTAなどのキレート剤;スクロース、マンニトール、トレハロース、もしくはソルビトールなどの糖類;ナトリウムなどの塩形成対イオン;金属複合体(例えば、Zn-タンパク質複合体);ならびに/またはTWEEN(商標)、PLURONICS(商標)、もしくはポリエチレングリコール(PEG)などの非イオン性界面活性剤を含む。
別の態様では、本明細書に記載のFcポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド、およびベクター、例えば、宿主細胞(例えば、E.coliおよび哺乳動物細胞)における組換え発現のためのかかるポリヌクレオチドを含むベクターが本明細書に提供される。本明細書に提供されるヘテロ二量体タンパク質の第1および/または第2のFcポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド、ならびにかかるポリヌクレオチド配列を含むベクター、例えば、宿主細胞、例えば、哺乳動物細胞におけるそれらの効率的発現のための発現ベクターが、本明細書に提供される。
実施例は、例解を目的として与えられ、制限を目的とするものではない。
この実施例は、標的1または標的2(ヒトT細胞の表面上に存在する2つの異なる抗原)に特異的なFcポリペプチドの合成およびヘテロ二量体化を説明する。
12個のFcポリペプチド(各々、標的1または標的2のいずれかに特異的な半抗体を含む)をCHO細胞中で発現させ、プロテインA親和性クロマトグラフィー(GE Healthcare)を使用して精製した。12個のFcポリペプチドの各々についての抗原結合部分の結合特異性および重鎖定常領域のアミノ酸配列を、表3に記載する。
表3に示されるFcポリペプチドをヘテロ二量体化して、表4に記載されるヘテロ二量体タンパク質を形成した。簡潔に述べると、表4に示される第1のFcポリペプチドと第2のFcポリペプチドとを、等モル量で、50mMの還元剤(2-MEA)の存在下で少なくとも2時間混合して、重鎖鎖間ジスルフィド結合を減少させた。次いで、Fcポリペプチドの混合物を、脱塩PD-10カラムを使用して再酸化緩衝液(pH6.0の10mMクエン酸ナトリウム、115mM NaCl)中に緩衝液交換して還元剤を除去し、室温で24時間インキュベートして、第1および第2のFcポリペプチドの二量体化を促進した。次いで、得られたFcポリペプチド混合物を、貯蔵緩衝液(pH6の10mMヒスチジン、および115mM NaCl)中に緩衝液交換した。純度および品質をSDS-PAGEにより決定し、二量体形成およびヘテロ二量体化率を、絶対サイズ排除クロマトグラフィー(ASEC)により評価した。
ヘテロ二量体タンパク質BA111、BA112、BA113、BA114、BA115、BA116、BA117、およびBA118の熱的安定性を評価した。1μLのSypro Orange Fluorescent Dye(5倍の最終Sypro濃度)を、PBSで希釈した4μgのタンパク質に加えた。Sypro Orange蛍光を、10℃~95℃で開始する熱勾配を使用してサーマルサイクラー(Biorad CFX96 Real-Time System C1000 PCR Detection System)で分析し、タンパク質熱シフトをCFX Maestroソフトウェアで分析した。棒グラフをプリズムで作成した。
この実施例は、表4に示されるヘテロ二量体タンパク質がそれらの意図された標的に結合する能力を示す。
ヘテロ二量体タンパク質BA111、BA112、BA113、BA114、ホモ二量体タンパク質BA119(WT IgG1)、およびIgG1アイソタイプ対照抗体が標的1に結合する能力を評価した。
ヘテロ二量体タンパク質BA115、BA116、BA117、BA118、ホモ二量体タンパク質BA120(WT IgG1)、およびIgG1アイソタイプ対照抗体が標的2に結合する能力を評価した。
この実施例は、表4に示されるヘテロ二量体タンパク質がそれらの意図された標的を発現する細胞中でシグナル伝達を遮断する能力を示す。
ヘテロ二量体タンパク質BA111、BA112、BA113、BA114、ホモ二量体タンパク質BA119(WT IgG1)、およびIgG1アイソタイプ対照抗体が標的1に結合することによりシグナル伝達を遮断する能力を、Jurkatレポーターアッセイを使用して評価した。
ヘテロ二量体タンパク質BA115、BA116、BA117、BA118、ホモ二量体タンパク質BA120(WT IgG1)、およびIgG1アイソタイプ対照抗体が標的2に結合することによりシグナル伝達を遮断する能力を、Jurkatレポーターアッセイを使用して評価した。
この実施例は、ヘテロ二量体タンパク質SEA刺激PBMCによるIL-2分泌を励起する能力を実証する。
標的1に特異的なヘテロ二量体タンパク質がSEA刺激PBMCによるIL-2分泌を励起する能力を調査した。
標的2に特異的なヘテロ二量体タンパク質がSEA刺激PBMCによるIL-2分泌を励起する能力を調査した。
6.5.1 FcγRIIIA(CD16)結合
6.5.1.1 標的1
BA111、BA112、BA113、およびBA114がFcγRIIIAに結合する能力を、細胞結合アッセイを使用して評価した。
BA115、BA116、BA117、およびBA118がFcγRIIIAに結合する能力を、細胞結合アッセイを使用して評価した。
BA112、BA113、BA114、BA115、BA116、BA117、およびBA118がFcγRI、FcγRIIa H/H、FcγRIIa R/R、およびFcγRIIbに結合する能力も細胞結合アッセイを使用して評価したが、有意な差異は観察されなかった。
この実施例は、標的1または標的2(ヒトT細胞の表面上に存在する2つの異なる抗原)に特異的な追加のFcポリペプチドの合成、ヘテロ二量体化、およびFc受容体結合を説明する。
Claims (17)
- 改善された熱安定性を呈し、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドを含むヘテロ二量体タンパク質であって、
a)前記第1のFcポリペプチドが、配列番号24のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み、前記アミノ酸配列が、アミノ酸239位、330位、332位、および366位に、それぞれアスパラギン酸、ロイシン、グルタミン酸、およびトリプトファンを含み、
b)前記第2のFcポリペプチドが、配列番号36のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み、前記アミノ酸配列が、アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にロイシンおよびアミノ酸332位にグルタミン酸を含まず、
アミノ酸位置が、EUインデックスに従って番号付けされる、ヘテロ二量体タンパク質。 - 前記第1のFcポリペプチドが、第1の抗原結合部分を含み、かつ/または前記第2のFcポリペプチドが、第2の抗原結合部分を含む、請求項1に記載のヘテロ二量体タンパク質。
- 前記第1および/または第2の抗原結合部分が、抗体可変ドメイン、細胞表面受容体の細胞外ドメイン、可溶性T細胞受容体、またはリガンドを含む、請求項2に記載のヘテロ二量体タンパク質。
- a)前記第1および/または第2の抗原結合部分が、VH、VL、VHH、VH/VL対、scFv、ダイアボディ、および/またはFabを含む、
b)前記細胞表面受容体が、腫瘍壊死因子スーパーファミリー受容体、血管内皮成長因子受容体、または形質転換成長因子受容体である、または
c)前記リガンドがホルモンまたは成長因子であり、
前記第1および第2の抗原結合部分が、同じまたは異なる標的分子に特異的に結合する、請求項3に記載のヘテロ二量体タンパク質。 - 前記第1および/または第2のFcポリペプチドが、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、またはIgA2のCH1ドメイン、ヒンジ領域、CH2ドメイン、および/またはCH3ドメインを含む、請求項1~4のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質。
- 前記第1および/または第2のFcポリペプチドが抗体重鎖を含む、請求項5に記載のヘテロ二量体タンパク質。
- a)前記抗体重鎖が、CH1ドメイン、および/またはヒンジ領域の一部を欠く、
b)前記抗体重鎖が全長抗体重鎖である、
c)前記抗体重鎖が、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、またはIgA2重鎖である、および/または
d)前記第1および/または第2のFcポリペプチドが抗体軽鎖をさらに含み、前記抗体軽鎖が、ヒトカッパまたはラムダ軽鎖である、
請求項6に記載のヘテロ二量体タンパク質。 - a)前記第1のFcポリペプチドが、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含む、
b)前記第2のFcポリペプチドが、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む、または
c)前記第1のFcポリペプチドが、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含み、前記第2のFcポリペプチドが、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む、
請求項1~7のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質。 - 前記第1および第2の半抗体が、異なる標的分子、または同じ標的分子の異なる領域に結合する、請求項8に記載のヘテロ二量体タンパク質。
- 請求項1~9のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質と、薬学的に許容される担体または賦形剤と、を含む、医薬組成物。
- 請求項1~9のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
- 請求項11に記載のポリヌクレオチドを含む、ベクター。
- 組換え宿主細胞であって、
a)請求項11に記載のポリヌクレオチド、
b)請求項12に記載のベクター、
c)請求項1~9のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチド、および請求項1~9のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチド、または
d)請求項1~9のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチドを含む第1のベクター、および請求項1~9のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチドを含む第2のベクター、
を含む、組換え宿主細胞。 - ヘテロ二量体タンパク質を産生する方法であって、前記方法が、
細胞内で、
a)請求項1~9のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチドと、
b)請求項1~9のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチドとを、
前記ヘテロ二量体タンパク質が産生される条件下で発現させることを含む、方法。 - ヘテロ二量体タンパク質を産生する方法であって、前記方法が、
a)第1の細胞内で、請求項1~9のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチドを、前記第1のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
b)第2の細胞内で、請求項1~9のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチドを、前記第2のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
c)ステップ(a)および(b)で産生された前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドを、前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドがヘテロ二量体化して前記ヘテロ二量体タンパク質を産生する条件下で接触させることと、を含む、方法。 - ヘテロ二量体タンパク質を産生する方法であって、前記方法が、
a)第1の細胞内で、請求項8に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1の抗体重鎖をコードする第1のポリヌクレオチドおよび請求項8に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1の抗体軽鎖をコードする第2のポリヌクレオチドを、前記第1のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
b)第2の細胞内で、請求項8に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第2の抗体重鎖をコードする第3のポリヌクレオチドおよび請求項8に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第2の抗体軽鎖をコードする第4のポリヌクレオチドを、前記第2のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
c)ステップ(a)および(b)で産生された前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドを、前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドがヘテロ二量体化して前記ヘテロ二量体タンパク質を産生する条件下で接触させることと、を含む、方法。 - ヘテロ二量体タンパク質を産生する方法であって、請求項1~9のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドを、前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドがヘテロ二量体化して前記ヘテロ二量体タンパク質を産生する条件下で接触させることを含む、方法。
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