JP7842011B2 - ヘテロ二量体タンパク質 - Google Patents

ヘテロ二量体タンパク質

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Description

関連出願
本出願は、2019年9月27日に出願された米国仮出願第62/906,918号の利益を主張するものであり、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
1.技術分野
本開示は、ヘテロ二量体タンパク質(例えば、多特異性抗体)およびそれを作製する方法に関する。
2.背景技術
2つ以上の結合特異性を含む多重特異性結合分子(例えば、多重特異性抗体)は、インビボで複数の標的の活性を調節するこれらの分子の能力を理由に、治療薬として大きな可能性を秘めている。多重特異性抗体を産生するための1つの一般的な方法は、2つの異なる抗体の重鎖をヘテロ二量体化することである。このヘテロ二量体化を促進するために、2つの抗体のCH3ドメインを操作して、ホモ二量体化よりも重鎖ヘテロ二量体化に対して選好を生じさせる相補的な変異セットを含ませる(例えば、各々全体が参照により本明細書に組み込まれる、Ridgway J.B.et al.,1996,Protein Eng.,9:617-621、および米国特許第9,409,989号を参照されたい)。
ある特定の例では、ヒトFcガンマ受容体IIIA(FcγRIIIA)に対する多重特異性抗体のFc領域の結合を、対応する天然由来の抗体のFc領域の結合と比べて強化することが望ましい。この強化されたFcγRIIIA結合を達成する1つの方法は、多重特異性抗体のFc領域を操作して、EUインデックスに従うFc領域のアミノ酸239位、330位、および332位に、特異的アミノ酸変異を含めることである(例えば、Lazar,G.A.et al.,2006,PNAS,103(11):4005-4010を参照されたい)。しかしながら、出願人は、これらのFc変異を、EUインデックスに従うアミノ酸366位、368位、および407位でヘテロ二量体化を強化するFc変異と組み合わせることにより、これらの変異を含む多重特異性抗体の製造可能性に悪影響が生じ得ることを発見した。
したがって、FcγRIIIAへの強化された結合を呈すると同時に、良好な製造可能性を保持する、改善された多重特異性抗体が当該技術分野で必要とされている。
3.発明の概要
本開示は、天然由来の抗体と比べて、FcγRIIIAへの強化された結合を呈し、良好な製造可能性を呈するヘテロ二量体タンパク質(例えば、多重特異性抗体)を提供する。ヘテロ二量体タンパク質は、概して、アスパラギン酸、グルタミン酸、およびトリプトファンを、それぞれ、アミノ酸239位、332位、および366位に含む、第1のFcポリペプチドと、アスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを、それぞれ、アミノ酸239位、366位、368位、および407位に含むが、グルタミン酸をアミノ酸332位に含まない、第2のFcポリペプチドと、を含み、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。ある特定の実施形態では、ヘテロ二量体タンパク質は、アスパラギン酸、ロイシン、グルタミン酸、およびトリプトファンを、それぞれ、アミノ酸239位、330位、332位、および366位に含む、第1のFcポリペプチドと、アスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを、それぞれ、アミノ酸239位、366位、368位、および407位に含むが、ロイシンおよびグルタミン酸を、それぞれ、アミノ酸330位および332位に含まない、第2のFcポリペプチドと、を含み、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。かかるヘテロ二量体タンパク質は、多重特異性結合タンパク質(例えば、多重特異性抗体)として特に有用である。また、これらのヘテロ二量体タンパク質を含む医薬組成物、これらのヘテロ二量体タンパク質をコードする核酸、ならびにこれらのヘテロ二量体タンパク質を作製するための発現ベクターおよび宿主細胞も提供される。理論に拘束されることを意図するものではないが、出願人は、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第2のFcポリペプチドは、EUインデックスに従って番号付けされたアミノ酸239位、330位、332位、366位、368位、および407位に変異を含む対応するFcポリペプチドと比べて、熱安定性が改善されたと考える。
したがって、一態様では、本開示はヘテロ二量体タンパク質を提供する。
ある特定の実施形態では、本ヘテロ二量体タンパク質は、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドを含み、第1のFcポリペプチドは、アスパラギン酸、グルタミン酸、およびトリプトファンを、それぞれ、アミノ酸239位、332位、および366位に含み、第2のFcポリペプチドは、アスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを、それぞれ、アミノ酸239位、366位、368位、および407位に含むが、グルタミン酸をアミノ酸332位に含まず、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸330位にロイシンをさらに含み、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。ある特定の実施形態では、第2のFcポリペプチドは、アミノ酸330位にロイシンを含まず、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、第1の抗原結合部分を含み、かつ/または第2のFcポリペプチドは、第2の抗原結合部分を含む。ある特定の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合部分は、抗体可変ドメイン、細胞表面受容体の細胞外ドメイン、可溶性T細胞受容体(例えば、内在性膜貫通領域および細胞質領域を欠くT細胞受容体)、またはリガンドを含む。ある特定の実施形態では、第1および/または第2の抗原結合部分は、VH、VL、VHH、VH/VL対、scFv、ダイアボディ、および/またはFabを含む。ある特定の実施形態では、細胞表面受容体は、腫瘍壊死因子スーパーファミリー受容体、血管内皮成長因子受容体、または形質転換成長因子受容体である。ある特定の実施形態では、可溶性T細胞受容体は、1つ以上の操作されたジスルフィド結合によって安定化されたT細胞受容体の細胞外抗原結合部分を含む。ある特定の実施形態では、可溶性T細胞受容体は、可撓性リンカー(例えば、ペプチドリンカー)によって一緒に連結されたT細胞受容体の可変領域を含む一本鎖T細胞受容体を含む。ある特定の実施形態では、リガンドはホルモンまたは成長因子である。ある特定の実施形態では、第1および第2の抗原結合部分は、同じまたは異なる標的分子に特異的に結合する。
ある特定の実施形態では、第1および/または第2のFcポリペプチドは、ヒトIgG、IgG、IgG、IgG、IgA、またはIgAのCH1ドメイン、ヒンジ領域、CH2ドメイン、および/またはCH3ドメインを含む。ある特定の実施形態では、第1および/または第2のFcポリペプチドは抗体重鎖を含む。ある特定の実施形態では、抗体重鎖は、CH1ドメインおよび/またはヒンジ領域の一部を欠く。ある特定の実施形態では、抗体重鎖は完全長抗体重鎖である。ある特定の実施形態では、抗体重鎖は、ヒトIgG、IgG、IgG、IgG、IgA、またはIgA重鎖である。
ある特定の実施形態では、第1および/または第2のFcポリペプチドは、抗体軽鎖をさらに含む。ある特定の実施形態では、抗体軽鎖は、ヒトカッパまたはラムダ軽鎖である。
ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含み、かつ/または第2のFcポリペプチドは、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含み、かつ第2のFcポリペプチドは、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む。ある特定の実施形態では、第1および第2の半抗体は、異なる標的分子、または同じ標的分子の異なる領域に結合する。
ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号1~3、6~7、10~11、24~27、48~51、および62~65からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも75%同一(任意選択で、少なくとも76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%同一)であるアミノ酸配列を含み、かつ/または第2のFcポリペプチドは、配列番号1~3、5、12~13、36~37、60~61、および66~67からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも75%同一(任意選択で、少なくとも75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%同一)であるアミノ酸配列を含む。
ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号1~3、6~7、10~11、24~27、48~51、および62~65からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも75%同一(任意選択で、少なくとも76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%同一)であるアミノ酸配列を含み、かつ第2のFcポリペプチドは、配列番号1~3、5、6~7、12~13、36~37、60~61、および66~67からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも75%同一(任意選択で、少なくとも75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%同一)であるアミノ酸配列を含む。
ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号1~3、6~7、10~11、24~27、48~51、および62~65からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のFcポリペプチドは、配列番号1~3、5、12~13、36~37、60~61、および66~67からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドは、それぞれ、配列番号24および36、24および37、25および36、25および37、26および36、26および37、27および36、27および37、48および60、48および61、49および60、49および61、50および60、50および61、51および60、51および61、62および66、62および67、63および66、63および67、64および66、64および67、65および66、または65および67のアミノ酸配列と、少なくとも75%同一(例えば、少なくとも75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%同一)であるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドは、それぞれ、配列番号24および36、24および37、25および36、25および37、26および36、26および37、27および36、27および37、48および60、48および61、49および60、49および61、50および60、50および61、51および60、51および61、62および66、62および67、63および66、63および67、64および66、64および67、65および66、または65および67のアミノ酸配列を含む。
ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号51に記載のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号61に記載のアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号50に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号60に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号51に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号60に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号50に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号61に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号49に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号61に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号48に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号60に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号49に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号60に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号48に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号61に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号65に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号67に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号64に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号66に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号65に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号66に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号64に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号67に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号63に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号67に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号62に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号66に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号63に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号66に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号62に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号67に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号27に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号37に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号26に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号36に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号27に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号36に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号26に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号37に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号25に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号37に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号24に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号36に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号25に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号36に記載されるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号24に記載されるアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号37に記載されるアミノ酸配列を含む。
別の態様では、本開示は、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質を含む医薬組成物を提供する。ある特定の実施形態では、本医薬組成物は、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質と、薬学的に許容される担体または賦形剤とを含む。
別の態様では、本開示は、本明細書に開示されるFcポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチド、このポリヌクレオチドを含むベクター、ならびに本明細書に開示されるポリヌクレオチド、ベクター、およびFcポリペプチドを含む組換え宿主細胞を提供する。ある特定の実施形態では、単離されたポリヌクレオチドは、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第1および第2のFcポリペプチドをコードする。ある特定の実施形態では、ベクターは、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第1および第2のFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
ある特定の実施形態では、本組換え宿主細胞は、
a)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第1および第2のFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、
b)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第1および第2のFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むベクター、
c)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチド、および本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチド、
d)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチドを含む第1のベクター、および本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチドを含む第2のベクター、
e)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチドの第1の抗体重鎖をコードする第1のポリヌクレオチド、および本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第2のFcポリペプチドの第2の抗体重鎖をコードする第2のポリヌクレオチド、および任意選択で、第1のFcポリペプチドの第1の抗体軽鎖をコードする第3のポリヌクレオチド、および/または第2のFcポリペプチドの第2の抗体軽鎖をコードする第4のポリヌクレオチド
(第1のFcポリペプチドは、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含み、かつ第2のFcポリペプチドは、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む)、あるいは
f)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチドの第1の抗体重鎖をコードする第1のポリヌクレオチドを含む第1のベクター、および本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第2のFcポリペプチドの第2の抗体重鎖をコードする第2のポリヌクレオチドを含む第2のベクター、および任意選択で、第1のFcポリペプチドの第1の抗体軽鎖をコードする第3のポリヌクレオチドを含む第3のベクター、および/または第2のFcポリペプチドの第2の抗体軽鎖をコードする第4のポリヌクレオチドを含む第4のベクター
(第1のFcポリペプチドは、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含み、かつ第2のFcポリペプチドは、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む)、を含む。
別の態様では、本開示は、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質を産生するための方法を提供する。
ある特定の実施形態では、本方法は、細胞内で、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチド、および本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチドを、ヘテロ二量体タンパク質が産生される条件下で発現させることを含む。
ある特定の実施形態では、本方法は、細胞内で、
a)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチドの第1の抗体重鎖をコードする第1のポリヌクレオチドと、
b)本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第2のFcポリペプチドの第2の抗体重鎖をコードする第2のポリヌクレオチドと、
c)第1のFcポリペプチドの第1の抗体軽鎖をコードする第3のポリヌクレオチドと、
d)第2のFcポリペプチドの第2の抗体軽鎖をコードする第4のポリヌクレオチドとを、
ヘテロ二量体タンパク質が産生される条件下で発現させることを含み、
第1のFcポリペプチドは、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含み、かつ第2のFcポリペプチドは、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む。
ある特定の実施形態では、本方法は、
a)第1の細胞内で、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチドを、第1のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
b)第2の細胞内で、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質のうちのいずれかの第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチドを、第2のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
c)ステップ(a)および(b)で産生された第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドを、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドがヘテロ二量体化してヘテロ二量体タンパク質を産生する条件下で接触させることと、を含む。
ある特定の実施形態では、本方法は、
a)第1の細胞内で、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチドの、第1の抗体重鎖をコードする第1のポリヌクレオチドおよび第1の抗体軽鎖をコードする第2のポリヌクレオチドを、第1のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
b)第2の細胞内で、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第2のFcポリペプチドの、第2の抗体重鎖をコードする第3のポリヌクレオチドおよび第2の抗体軽鎖をコードする第4のポリヌクレオチドを、第2のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
c)ステップ(a)および(b)で産生された第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドを、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドがヘテロ二量体化してヘテロ二量体タンパク質を産生する条件下で接触させることと、を含み、
第1のFcポリペプチドは、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含み、かつ第2のFcポリペプチドは、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む。
ある特定の実施形態では、本方法は、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドを、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドがヘテロ二量体化してヘテロ二量体タンパク質を産生する条件下で接触させることを含む。
4.図面の簡単な説明
表3に記載されるFcポリペプチドのサブセットの発現レベルを示すグラフである。 熱変性遷移を測定することにより決定した、ヘテロ二量体タンパク質BA111、BA112、BA113、およびBA114(図2A、「抗標的1抗体」)、ならびにBA115、BA116、BA117、およびBA118(図2B、「抗標的2抗体」)の熱安定性を示すグラフである。 高レベルの細胞表面標的1を発現するように操作したJurkat細胞へのヘテロ二量体タンパク質BA111、BA112、BA113、BA114、BA119、およびIgGアイソタイプ対照抗体の結合を示すグラフである。各事例において、蛍光強度(MFI)の中央値によって評価したJurkat細胞への結合の程度を、細胞とともにインキュベートしたヘテロ二量体タンパク質(「抗体」)の濃度に対してプロットする。 高レベルの細胞表面標的2を発現するように操作したCHO細胞へのヘテロ二量体タンパク質BA115、BA116、BA117、BA118、BA120、およびIgGアイソタイプ対照抗体の結合を示すグラフである。各事例において、蛍光強度(MFI)の中央値によって評価したCHO細胞への結合の程度を、細胞とともにインキュベートしたヘテロ二量体タンパク質(「抗体」)の濃度に対してプロットする。 ヘテロ二量体タンパク質BA111、BA112、BA113、BA114、BA119、またはIgGアイソタイプ対照抗体を使用した、標的1遮断から生じるT細胞活性化の相対量を測定するIL-2ルシフェラーゼレポーターアッセイの結果を示すグラフである。IL-2遺伝子活性化のためのサロゲートマーカーであるルシフェラーゼ発現(平均RLUで測定)を、ヘテロ二量体タンパク質(「抗体」)濃度に対してプロットする。 ヘテロ二量体タンパク質BA115、BA116、BA117、BA118、BA120、またはIgGアイソタイプ対照抗体を使用した、標的2遮断から生じるT細胞活性化の相対量を測定するIL-2ルシフェラーゼレポーターアッセイの結果を示すグラフである。IL-2遺伝子活性化のためのサロゲートマーカーであるルシフェラーゼ発現(平均RLUで測定)を、ヘテロ二量体タンパク質(「抗体」)濃度に対してプロットする。 3つの異なるドナーである、ドナー1(図7A~7Dおよび図7I~7L)、ドナー2(図7E~7H)、およびドナー3(図7M~7P)において、ヘテロ二量体タンパク質BA111、BA112、BA113、BA114、BA119、および参照ホモ二量体タンパク質2が、SEAで刺激したPBMCによるIL-2分泌を誘導する能力を示すグラフである。S239D/A330L/I332E変異(「Fc強化」)を含むホモ二量体アイソタイプタンパク質を、アイソタイプ対照として使用した。IL-2濃度は、ヘテロ二量体タンパク質(「抗体」)濃度に対してプロットする。 3つの異なるドナーである、ドナー1(図8A~8Dおよび8M~8P)、ドナー2(図8I~8Lおよび8U~8X)、およびドナー3(図8E~8Hおよび8Q~8T)において、ヘテロ二量体タンパク質BA115、BA116、BA117、BA118、および参照ホモ二量体タンパク質1が、SEAで刺激したPBMCによるIL-2分泌を誘導する能力を示すグラフである。S239D/A330L/I332E変異(「Fc強化」)を含むホモ二量体アイソタイプタンパク質を、アイソタイプ対照として使用した。IL-2濃度は、ヘテロ二量体タンパク質(「抗体」)濃度に対してプロットする。 細胞表面ヒトFcγRIIIA V/Vを発現するCHO細胞(図9A)または細胞表面ヒトFcγRIIIA F/Fを発現するCHO細胞(図9B)へのヘテロ二量体タンパク質BA111、BA112、BA113、およびBA114の結合を示す一式のグラフである。蛍光強度(MFI)の幾何平均によって評価した細胞へのヘテロ二量体タンパク質結合のレベルを、細胞とともにインキュベートしたヘテロ二量体タンパク質(「Ab」)の濃度に対してプロットした。 細胞表面ヒトFcγRIIIA V/Vを発現するCHO細胞(図10A)または細胞表面ヒトFcγRIIIA F/Fを発現するCHO細胞(図10B)へのヘテロ二量体タンパク質BA115、BA116、BA117、およびBA118の結合を示す一式のグラフである。蛍光強度(MFI)の幾何平均によって評価した細胞へのヘテロ二量体タンパク質結合のレベルを、細胞とともにインキュベートしたヘテロ二量体タンパク質(「Ab」)の濃度に対してプロットした。 細胞表面ヒトFcγRIIIA F/Fを発現するCHO細胞への抗標的1ヘテロ二量体タンパク質の結合を示す一式のグラフである。蛍光強度(MFI)の幾何平均によって評価した細胞へのヘテロ二量体タンパク質結合のレベルを、細胞とともにインキュベートしたヘテロ二量体タンパク質の濃度に対してプロットした。 細胞表面ヒトFcγRIIIA F/Fを発現するCHO細胞への抗標的2ヘテロ二量体タンパク質の結合を示す一式のグラフである。蛍光強度(MFI)の幾何平均によって評価した細胞へのヘテロ二量体タンパク質結合のレベルを、細胞とともにインキュベートしたヘテロ二量体タンパク質の濃度に対してプロットした。
5.発明を実施するための形態
天然由来の抗体と比べて、FcγRIIIAへの強化された結合を呈し、良好な製造可能性を呈するヘテロ二量体タンパク質(例えば、多重特異性抗体)が本明細書に提供される。ヘテロ二量体タンパク質は、概して、アスパラギン酸、グルタミン酸、およびトリプトファンを、それぞれ、アミノ酸239位、332位、および366位に含む、第1のFcポリペプチドと、アスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを、それぞれ、アミノ酸239位、366位、368位、および407位に含むが、グルタミン酸をアミノ酸332位に含まない、第2のFcポリペプチドと、を含み、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。ある特定の実施形態では、ヘテロ二量体タンパク質は、アスパラギン酸、ロイシン、グルタミン酸、およびトリプトファンを、それぞれ、アミノ酸239位、330位、332位、および366位に含む、第1のFcポリペプチドと、アスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを、それぞれ、アミノ酸239位、366位、368位、および407位に含むが、ロイシンおよびグルタミン酸を、それぞれ、アミノ酸330位および332位に含まない、第2のFcポリペプチドと、を含み、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。かかるヘテロ二量体タンパク質は、多重特異性結合タンパク質(例えば、多重特異性抗体)として特に有用である。また、これらのヘテロ二量体タンパク質を含む医薬組成物、これらのヘテロ二量体タンパク質をコードする核酸、ならびにこれらのヘテロ二量体タンパク質を作製するための発現ベクターおよび宿主細胞も提供される。
5.1 定義
本明細書で使用される場合、「ヘテロ二量体タンパク質」という用語は、2つの非同一Fcポリペプチドの共有結合二量体または非共有結合二量体を含むタンパク質を指す。
本明細書で使用される場合、「Fcポリペプチド」という用語は、CH2ドメインおよびCH3ドメインを含むポリペプチドを指し、CH2ドメインのC末端は、CH3ドメインのN末端に(直接的にまたは間接的に)連結する。「Fcポリペプチド」という用語には、ジスルフィド結合によって(例えば、半抗体を形成するために)抗体軽鎖に連結した抗体重鎖が含まれる。
本明細書で使用される場合、「CH1ドメイン」という用語は、抗体重鎖の第1の定常ドメイン(例えば、EUインデックスに従って、ヒトIgGのアミノ酸118~215位)を指す。本用語には、天然由来のCH1ドメイン、および天然由来のCH1ドメインの操作されたバリアント(例えば、天然由来のCH1ドメインと比べて1つ以上のアミノ酸挿入、欠失、置換、または修飾を含むCH1ドメイン)が含まれる。
本明細書で使用される場合、「CH2ドメイン」という用語は、抗体重鎖の第2の定常ドメイン(例えば、EUインデックスに従って、ヒトIgGのアミノ酸231~340位)を指す。本用語には、天然由来のCH2ドメイン、および天然由来のCH2ドメインの操作されたバリアント(例えば、天然由来のCH2ドメインと比べて1つ以上のアミノ酸挿入、欠失、置換、または修飾を含むCH2ドメイン)が含まれる。
本明細書で使用される場合、「CH3ドメイン」という用語は、抗体重鎖の第3の定常ドメイン(例えば、EUインデックスに従って、ヒトIgGのアミノ酸341~447位)を指す。本用語には、天然由来のCH3ドメイン、および天然由来のCH2ドメインの操作されたバリアント(例えば、天然由来のCH3ドメインと比べて1つ以上のアミノ酸挿入、欠失、置換、または修飾を含むCH3ドメイン)が含まれる。
本明細書で使用される場合、「ヒンジ領域」という用語は、インタクトな抗体中で2つの重鎖間のジスルフィド結合を媒介する、システイン残基(例えば、EUインデックスに従って、ヒトIgGのアミノ酸226位および229位のシステイン残基)を含む抗体重鎖の部分を指す。本用語には、天然由来のヒンジ領域、および天然由来のヒンジ領域の操作されたバリアント(例えば、天然由来のヒンジ領域と比べて1つ以上のアミノ酸挿入、欠失、置換、または修飾を含むヒンジ領域)が含まれる。例示的な全長IgGヒンジ領域は、EUインデックスに従って、ヒトIgGのアミノ酸216~230位を含む。
本明細書で使用される場合、「EUインデックス」という用語は、各々全体が参照により本明細書に組み込まれる、Edelman,GM.et al.,Proc.Natl.Acad.USA,63,78-85(1969、およびKabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,U.S.Dept.Health and Human Services,5th edition,1991に記載されるように、抗体の定常領域のEU番号付け慣例を指す。本明細書で使用されるFcポリペプチドまたはその断片のアミノ酸位置のすべての番号付けは、EUインデックスに従う。
本明細書で使用される場合、「抗原結合部分」という用語は、抗原に特異的に結合する分子を指し、かかる結合は当業者によって理解されるとおりである。例えば、抗原に特異的に結合する抗原結合部分は、例えば、イムノアッセイ、BIAcore(登録商標)、KinExA 3000 instrument(Sapidyne Instruments、Boise,ID)、または当該技術分野において既知の他のアッセイにより決定して、概してより低い親和性で他の分子に結合する。ある特定の実施形態では、抗原に特異的に結合する抗原結合部分は、分子が別の抗原に非特異的に結合するときのKより少なくとも2log(例えば、10倍)、2.5log、3log、4log、またはそれ以上であるKで抗原に結合する。
本明細書で使用される場合、「抗体」という用語は、全長抗体、全長抗体の抗原結合断片、ならびに抗体CDR、VH領域、および/またはVL領域を含む分子を含む。抗体の例には、モノクローナル抗体、組換えで産生された抗体、単一特異性抗体、多重特異性抗体(二重特異性抗体)、ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、免疫グロブリン、合成抗体、2つの重鎖および2つの軽鎖分子を含む四量体抗体、抗体軽鎖単量体、抗体重鎖単量体、抗体軽鎖二量体、抗体重鎖二量体、抗体軽鎖-抗体重鎖対、細胞内抗体、ヘテロ複合体抗体、抗体-薬物コンジュゲート、単一ドメイン抗体、一価抗体、単鎖抗体または単鎖Fv(scFv)、ラクダ化抗体、アフィボディ、Fab断片、F(ab’)断片、ジスルフィド結合Fv(sdFv)、抗イディオタイプ(抗Id)抗体(例えば、抗抗Id抗体を含む)、ならびに上記のうちのいずれかの抗原結合断片が挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態では、本明細書に記載される抗体は、ポリクローナル抗体集団を指す。抗体は、免疫グロブリン分子の任意の種類(例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、もしくはIgY)、任意のクラス(例えば、IgG、IgG、IgG、IgG、IgA、またはIgA)、または任意のサブクラス(例えば、IgG2aまたはIgG2b)のものであり得る。ある特定の実施形態では、本明細書に記載される抗体は、IgG抗体、あるいはそのクラス(例えば、ヒトIgGもしくはIgG)またはサブクラスである。
本明細書で使用される場合、「VH」および「VL」という用語は、それぞれ、全体が参照により本明細書に組み込まれるKabat et al.,(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest(NIH Publication No.91-3242,Bethesda)に記載されるように、抗体重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを指す。
本明細書で使用される場合、「VHH」という用語は、全体が参照により本明細書に組み込まれるHamers-Casterman C.et al.,Nature(1993)363:446-8.10.1038/363446a0に記載されるように、ラクダの重鎖のみの抗体(HCAb)およびそのヒト化バリアントの重鎖可変ドメインを指す。
本明細書で使用される場合、「VH/VL対」という用語は、抗原の結合部位を一緒に形成するVHとVLとの組合せを指す。
本明細書で使用される場合、「重鎖」という用語は、抗体に関して使用されるとき、定常ドメインのアミノ酸配列に基づき、任意の異なる種類、例えば、アルファ(α)、デルタ(δ)、イプシロン(ε)、ガンマ(γ)、およびミュー(μ)を指してもよく、これは、それぞれ、IgGのサブクラス、例えば、IgG、IgG、IgG、およびIgGを含む、抗体のIgA、IgD、IgE、IgG、およびIgMクラスを生じる。
本明細書で使用される場合、「全長抗体重鎖」という用語は、N末端からC末端へ、VH、CH1領域、ヒンジ領域、CH2ドメイン、およびCH3ドメインを含む抗体重鎖を指す。
本明細書で使用される場合、「軽鎖」という用語は、抗体に関して使用されるとき、定常ドメインのアミノ酸配列に基づき、任意の異なる種類、例えば、カッパ(κ)またはラムダ(λ)を指し得る。軽鎖アミノ酸配列は、当該技術分野において周知である。具体的な実施形態では、軽鎖はヒト軽鎖である。
本明細書で使用される場合、「半抗体」という用語は、インタクトな野生型免疫グロブリンの重鎖および軽鎖と同じ様式で互いに連結した抗体重鎖および抗体軽鎖を指す。ある特定の実施形態では、半抗体は、全長抗体のヒンジ領域の重鎖間ジスルフィド結合の減少によって産生される。ある特定の実施形態では、半抗体は、細胞内での本明細書に開示されるFcポリペプチドの発現によって産生される。
5.2 ヘテロ二量体タンパク質
一態様では、本開示は、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドを含むヘテロ二量体タンパク質を提供し、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、およびトリプトファンを、それぞれ、アミノ酸239位、332位、および366位に含み、第2のFcポリペプチドは、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを、それぞれ、アミノ酸239位、366位、368位、および407位に含むが、アミノ酸であるグルタミン酸をアミノ酸332位に含まず、アミノ酸位置は、その都度、EUインデックスに従って番号付けされる。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンをさらに含み、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンをさらに含み、第2のFcポリペプチドは、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
別の態様では、本開示は、第1および第2のFcポリペプチドを含むヘテロ二量体タンパク質を提供し、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸366位にアミノ酸であるトリプトファンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、第2のFcポリペプチドは、
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
別の態様では、本開示は、第1および第2のFcポリペプチドを含むヘテロ二量体タンパク質を提供し、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸239位、330位、332位、および366位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、グルタミン酸、およびトリプトファンを含み、第2のFcポリペプチドは、
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
別の態様では、本開示は、第1および第2のFcポリペプチドを含むヘテロ二量体タンパク質を提供し、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸239位、330位、および366位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびトリプトファンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、第2のFcポリペプチドは、
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
別の態様では、本開示は、第1および第2のFcポリペプチドを含むヘテロ二量体タンパク質を提供し、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸330位、332位、および366位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、およびトリプトファンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、第2のFcポリペプチドは、
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
別の態様では、本開示は、第1および第2のFcポリペプチドを含むヘテロ二量体タンパク質を提供し、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸239位、332位、および366位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、およびトリプトファンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、第2のFcポリペプチドは、
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
別の態様では、本開示は、第1および第2のFcポリペプチドを含むヘテロ二量体タンパク質を提供し、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸239位および366位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびトリプトファンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、第2のFcポリペプチドは、
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
別の態様では、本開示は、第1および第2のFcポリペプチドを含むヘテロ二量体タンパク質を提供し、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸330位および366位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびトリプトファンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、第2のFcポリペプチドは、
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
別の態様では、本開示は、第1および第2のFcポリペプチドを含むヘテロ二量体タンパク質を提供し、第1のFcポリペプチドは、アミノ酸332位および366位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸およびトリプトファンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、第2のFcポリペプチドは、
(a)アミノ酸366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるセリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位、330位、および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、およびグルタミン酸を含まず、
(b)アミノ酸239位、330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、ロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸332位にアミノ酸であるグルタミン酸を含まず、
(c)アミノ酸330位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位にアミノ酸であるアスパラギン酸を含まず、
(d)アミノ酸239位、332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にアミノ酸であるロイシンを含まず、
(e)アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシンおよびグルタミン酸を含まず、
(f)アミノ酸330位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるロイシン、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および332位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびグルタミン酸を含まず、
(g)アミノ酸332位、366位、368位、および407位に、それぞれ、アミノ酸であるグルタミン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸239位および330位に、それぞれ、アミノ酸であるアスパラギン酸およびロイシンを含まず、
アミノ酸位置は、EUインデックスに従って番号付けされる。
本明細書に記載されるFcポリペプチドは、概して、CH2ドメインおよびCH3ドメインを含み、CH2ドメインのC末端は、CH3ドメインのN末端に(直接的にまたは間接的に)連結する。任意の天然由来またはバリアント型のCH2および/またはCH3ドメインを、本明細書に記載されるFcポリペプチドで使用することができる。例えば、ある特定の実施形態では、CH2および/またはCH3ドメインは、IgG、IgG、IgG、IgG、IgA、またはIgA抗体重鎖、例えば、ヒトIgG、IgG、IgG、IgG、IgA、またはIgA抗体重鎖からの天然由来のCH2またはCH3ドメインである。CH2およびCH3ドメインは、同じ抗体重鎖に由来しても、異なる抗体重鎖に由来してもよい。ある特定の実施形態では、本Fcポリペプチドは、単一抗体重鎖由来のCH2およびCH3ドメイン含有部分を含む。ある特定の実施形態では、CH2および/またはCH3ドメインは、それぞれ、天然由来のCH2またはCH3ドメインのバリアントである。ある特定の実施形態では、CH2および/またはCH3ドメインは、それぞれ、天然由来のCH2またはCH3ドメインと比べて、1つ以上のアミノ酸挿入、欠失、置換、または修飾を含むバリアントである。ある特定の実施形態では、CH2および/またはCH3ドメインは、それぞれ、1つ以上のCH2またはCH3ドメインのキメラである。ある特定の実施形態では、CH2ドメインは、EUインデックスに従って、天然由来のヒンジ領域(例えば、ヒトIgG)のアミノ酸231~340位を含む。ある特定の実施形態では、CH3ドメインは、EUインデックスに従って、天然由来のヒンジ領域(例えば、ヒトIgG)のアミノ酸341~447位を含む。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載されるFcポリペプチドは、ヒンジ領域をさらに含み、ヒンジ領域のC末端は、(直接的にまたは間接的に)CH2ドメインのN末端に連結する。例えば、ある特定の実施形態では、ヒンジ領域は、IgG、IgG、IgG、IgG、IgA、またはIgA抗体重鎖、例えば、ヒトIgG、IgG、IgG、IgG、IgA、またはIgA抗体重鎖からの天然由来のヒンジ領域である。ヒンジ領域は、CH2および/またはCH3ドメインと同じ抗体重鎖に由来しても、異なる抗体重鎖に由来してもよい。ある特定の実施形態では、ヒンジ領域は、それぞれ、天然由来のヒンジ領域と比べて、1つ以上のアミノ酸挿入、欠失、置換、または修飾を含むバリアントである。ある特定の実施形態では、ヒンジ領域は、1つ以上のヒンジ領域のキメラである。ある特定の実施形態では、ヒンジ領域は、EUインデックスに従って、天然由来のヒンジ領域(例えば、ヒトIgG)のアミノ酸226~229位を含む。ある特定の実施形態では、ヒンジ領域は、EUインデックスに従って、天然由来のヒンジ領域(例えば、ヒトIgG)のアミノ酸216~230位を含む。ある特定の実施形態では、ヒンジ領域は、EUインデックスに従って、天然由来のヒンジ領域(例えば、ヒトIgG)のアミノ酸216~230位を含む。ある特定の実施形態では、ヒンジ領域は、EUインデックスに従って、アミノ酸228位にセリン(S)を含む、バリアント型IgGヒンジ領域である。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載されるFcポリペプチドは、CH1ドメインをさらに含み、CH1ドメインのC末端は、(直接的にまたは間接的に)ヒンジ領域のN末端に連結する。例えば、ある特定の実施形態では、CH1ドメインは、IgG、IgG、IgG、IgG、IgA、またはIgA抗体重鎖、例えば、ヒトIgG、IgG、IgG、IgG、IgA、またはIgA抗体重鎖からの天然由来のCH1ドメインである。CH1ドメインは、ヒンジ領域、CH2ドメイン、および/またはCH3ドメインと同じ抗体重鎖に由来しても、異なる抗体重鎖に由来してもよい。ある特定の実施形態では、CH1ドメインは、天然由来のCH1ドメインと比べて、1つ以上のアミノ酸挿入、欠失、置換、または修飾を含むバリアントである。ある特定の実施形態では、CH1ドメインは、1つ以上のCH1ドメインのキメラである。ある特定の実施形態では、CH1ドメインは、EUインデックスに従って、天然由来のヒンジ領域(例えば、ヒトIgG)のアミノ酸118~215位を含む。
例示的なFcポリペプチドまたはその部分のアミノ酸配列を、本明細書の表1に示す。
ある特定の実施形態では、本ヘテロ二量体タンパク質は、配列番号24、25、26、27、48、49、50、51、62、63、64、または65のアミノ酸配列と、少なくとも75%同一(例えば、少なくとも75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%同一)であるアミノ酸配列を含む第1のFcポリペプチド、および/あるいは配列番号36、37、60、61、66、または67のアミノ酸配列と、少なくとも75%同一(例えば、少なくとも75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%同一)であるアミノ酸配列を含む第2のFcポリペプチド、を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリヌクレオチドは、配列番号24、25、26、27、48、49、50、51、62、63、64、または65のアミノ酸配列を含み、かつ/あるいは第2のFcポリヌクレオチドは、36、37、60、61、66、または67のアミノ酸配列を含む。ヘテロ二量体タンパク質の第1および第2のFcポリペプチドに組み込むことができるアミノ酸配列の例示的な対を、本明細書の表2に示す。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドは、それぞれ、表2のいずれかの行の第1および第2の列に示すアミノ酸配列を含む。
ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドは、それぞれ、配列番号24および36、24および37、25および36、25および37、26および36、26および37、27および36、27および37、48および60、48および61、49および60、49および61、50および60、50および61、51および60、51および61、62および66、62および67、63および66、63および67、64および66、64および67、65および66、または65および67のアミノ酸配列と、少なくとも75%同一(例えば、少なくとも75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%同一)であるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドは、それぞれ、配列番号24および36、24および37、25および36、25および37、26および36、26および37、27および36、27および37、48および60、48および61、49および60、49および61、50および60、50および61、51および60、51および61、62および66、62および67、63および66、63および67、64および66、64および67、65および66、または65および67のアミノ酸配列を含む。
一実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号22のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号30、34、36、71、72、73、または74のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号24のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号30、34、36、71、72、73、または74のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号68のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号30、34、36、71、72、73、または74のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号26のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号30、34、36、71、72、73、または74のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号75のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号30、34、36、71、72、73、または74のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番28のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号30、34、36、71、72、73、または74のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番69のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号30、34、36、71、72、73、または74のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番70のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号30、34、36、71、72、73、または74のアミノ酸配列を含む。
一実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号84のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号66、79、80、81、82、86、または87のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号62のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号66、79、80、81、82、86、または87のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号76のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号66、79、80、81、82、86、または87のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号64のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号66、79、80、81、82、86、または87のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号83のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号66、79、80、81、82、86、または87のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号85のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号66、79、80、81、82、86、または87のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号77のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号66、79、80、81、82、86、または87のアミノ酸配列を含む。別の実施形態では、第1のFcポリペプチドは、配列番号78のアミノ酸配列を含み、第2のFcポリペプチドは、配列番号66、79、80、81、82、86、または87のアミノ酸配列を含む。
ある特定の実施形態では、第1および/または第2のFcポリペプチドは、1つ以上の抗原結合部分をさらに含む。抗原結合部分は、Fcポリペプチドの任意の部分に(直接的または間接的に)連結し得る。例えば、抗原結合部分は、FcポリペプチドのN末端および/またはC末端に(直接的にまたは間接的に)連結し得る。加えてまたはあるいは、抗原結合部分は、Fcポリペプチド中で直列に一緒に連結し得る。
ある特定の実施形態では、ヘテロ二量体タンパク質中の第1および第2のFcポリペプチドは、各々、1つ以上の抗原結合部分を含む。かかる実施形態では、抗原結合部分の各々は、同じ抗原に結合することも、異なる抗原に結合することもできる。ある特定の実施形態では、本ヘテロ二量体タンパク質は、第1の抗原に結合する第1の抗原結合部分を含む第1のFcポリペプチドと、第2の抗原に結合する第2の抗原結合部分を含む第2のFcポリペプチドとを含み、第1の抗原と第2の抗原とは異なっている(例えば、異なる分子または同じ分子の異なる領域である)。
Fcポリペプチドに連結し得るいずれの種類の結合部分も、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質における使用に好適である。ある特定の実施形態では、結合部分は、抗体可変ドメインを含む。抗体可変ドメインを含む例示的な結合部分は、VH、VL、VHH、VH/VL対、scFv、ダイアボディ、またはFabを含むが、これらに限定されない。ある特定の実施形態では、結合部分は、リガンドを含む。例示的なリガンドには、ホルモンおよび成長因子、ならびにその類似体および模倣体が含まれるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態では、結合部分は、細胞表面受容体の細胞外ドメインを含む。例示的な細胞表面受容体には、腫瘍壊死因子スーパーファミリー受容体、血管内皮成長因子受容体、または形質転換成長因子受容体が含まれるが、これらに限定されない。細胞表面受容体のかかる細胞外ドメインは、受容体の天然リガンドを隔離するのに有用であることが当該技術分野で周知である。本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質における使用に好適な他の結合部分には、リポカリン(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれるGebauer M.et al.,2012,Method Enzymol 503:157-188を参照されたい)、アドネクチン(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれるLipovsek D.,2011,Protein Eng Des Sel 24:3-9)、アビマー(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれるSilverman J,et al.,2005,Nat Biotechnol 23:1556-1561を参照されたい)、フィノマー(例えば、Schlatter D,et al.,2012,mAbs 4:497-508を参照されたい)、クニッツドメイン(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれるHosse R.J.et al.,2006,Protein Sci 15:14-27を参照されたい)、ノッチン(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれるKintzing J.R.et al.,2016,Curr Opin Chem Biol 34:143-150を参照されたい)、アフィボディ(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれるFeldwisch J.et al.,2010 J Mol Biol 398:232-247を参照されたい)、およびDARPin(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれるPluckthun A.,2015,Annu Rev Pharmacol Toxicol 55:489-511を参照されたい)が含まれるが、これらに限定されない。
ある特定の実施形態では、ヘテロ二量体タンパク質中の第1および/または第2のFcポリペプチドは、各々、抗体重鎖を含む。抗体重鎖は、天然由来の全長抗体重鎖と比べて、1つ以上のアミノ酸挿入、欠失、置換、または修飾を含む、全長抗体重鎖またはバリアント型抗体重鎖であり得る。ある特定の実施形態では、抗体重鎖は、CH1ドメインを欠くか、または抗体軽鎖との重鎖の会合を防止するCH1ドメインもしくは重鎖可変ドメイン中の変異を含む。ある特定の実施形態では、抗体重鎖は、ヒンジ領域の一部を欠く。
抗体重鎖のいずれの種およびアイソタイプも、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質に使用することができる。ある特定の実施形態では、第1および/または第2のFcポリペプチドは、ヒトIgG、IgG、IgG、IgG、IgA、またはIgA抗体の重鎖またはそのバリアントを含む。ある特定の実施形態では、第1および/または第2のFcポリペプチドは、1つ以上のヒトIgG、IgG、IgG、IgG、IgA、またはIgA抗体重鎖のキメラである抗体重鎖を含む。
ある特定の実施形態では、第1および/または第2のFcポリペプチドは、抗体重鎖および抗体軽鎖(例えば、ヒトカッパまたはラムダ軽鎖)を含む。軽鎖は、抗体重鎖の任意の部分に(直接的または間接的に)連結し得る。ある特定の実施形態では、抗体重鎖および抗体軽鎖は、半抗体を形成するようにジスルフィド結合によって互いに連結する。
ある特定の実施形態では、本ヘテロ二量体タンパク質は、第1の半抗体を形成する第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1のFcポリペプチドと、第2の半抗体を形成する第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2のFcポリペプチドと、を含む。第1および第2の半抗体は、同じ抗原に結合することも、異なる抗原(例えば、異なる分子または同じ分子の異なる領域)に結合することもできる。
ある特定の実施形態では、本明細書に開示される第1および/または第2のFcポリペプチドのうちのいずれかのCH3ドメインは、C末端リジンをさらに含む。例えば、ある特定の実施形態では、表1に開示されるCH3ドメイン含有アミノ酸配列のうちのいずれか1つは、CH3ドメインのC末端にリジンをさらに含み得る。
ある特定の実施形態では、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質は、対応する先行技術のヘテロ二量体タンパク質(例えば、多重特異性抗体)と比べて、改善された生物物理特性(例えば、発現レベル、溶解性、熱安定性、製造可能性、および/または免疫原性)を呈する。ある特定の実施形態では、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質は、改善された熱安定性および製造可能性を呈する。
5.3 医薬組成物
生理学的に許容可能な担体、賦形剤、または安定剤中で所望の程度の純度を有するヘテロ二量体タンパク質を含む組成物が、本明細書で提供される(例えば、Remington’s Pharmaceutical Sciences(1990)Mack Publishing Co.,Easton,PAを参照されたい)。許容される担体、賦形剤、または安定剤は、用いられる投与量および濃度でレシピエントにとって非毒性であり、リン酸などの緩衝剤、クエン酸塩、および他の有機酸;アスコルビン酸およびメチオニンを含む抗酸化剤;防腐剤(オクタデシルジメチルベンジル塩化アンモニウム;塩化ヘキサメトニウム;塩化ベンザルコニウム;塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチル、もしくはベンジルアルコール;メチルもしくはプロピルパラベンなどのアルキルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3-ペンタノール;およびm-クレゾールなど);低分子量(約10残基未満)ポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチン、もしくは免疫グロブリンなどのタンパク質;ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー;グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、もしくはリジンなどのアミノ酸;グルコース、マンノース、もしくはデキストリンを含む単糖類、二糖類、および他の炭水化物;EDTAなどのキレート剤;スクロース、マンニトール、トレハロース、もしくはソルビトールなどの糖類;ナトリウムなどの塩形成対イオン;金属複合体(例えば、Zn-タンパク質複合体);ならびに/またはTWEEN(商標)、PLURONICS(商標)、もしくはポリエチレングリコール(PEG)などの非イオン性界面活性剤を含む。
具体的な実施形態では、医薬組成物は、薬学的に許容される担体中に、本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質、および任意選択で1つ以上の追加の予防薬または治療薬を含む。具体的な実施形態では、医薬組成物は、薬学的に許容される担体中に、有効量の本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質、および任意選択で1つ以上の追加の予防薬または治療薬を含む。ある特定の実施形態では、本ヘテロ二量体タンパク質は、医薬組成物に含まれる唯一の活性成分である。本明細書に記載される医薬組成物は、がんまたは感染症などの状態を治療するのに有用であり得る。一実施形態では、本発明は、医薬品として使用するための本発明のヘテロ二量体タンパク質を含む本発明の医薬組成物に関する。別の実施形態では、本発明は、がんまたは感染症の治療のための方法における使用のための本発明の医薬組成物に関する。
非経口調製物に使用される薬学的に許容される担体には、水性ビヒクル、非水性ビヒクル、抗微生物剤、等張剤、緩衝剤、抗酸化剤、局所麻酔剤、懸濁剤および分散剤、乳化剤、金属イオン封鎖剤、またはキレート剤、ならびに他の薬学的に許容される物質が含まれる。水性ビヒクルの例には、塩化ナトリウム注射液、リンゲル注射液、等張性デキストロース注射液、滅菌水注射液、デキストロースおよび乳酸リンゲル注射液が挙げられる。非水性非経口ビヒクルには、植物起源の固定油、綿実油、トウモロコシ油、ゴマ油、およびラッカセイ油が含まれる。静菌濃度または静真菌濃度の抗微生物剤は、フェノールまたはクレゾール、水銀、ベンジルアルコール、クロロブタノール、メチルおよびプロピルp-ヒドロキシ安息香酸エステル、チメロサール、塩化ベンザルコニウムおよび塩化ベンゼトニウムを含む複数回用量容器にパッケージングされた非経口調製物に添加され得る。等張剤には、塩化ナトリウムおよびデキストロースが含まれる。緩衝剤には、リン酸塩およびクエン酸塩が含まれる。抗酸化剤には、二硫酸ナトリウムが含まれる。局所麻酔剤には、プロカイン塩酸塩が含まれる。懸濁剤および分散剤には、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、およびポリビニルピロリドンが含まれる。乳化剤には、ポリソルベート80(TWEEN(登録商標)80)が含まれる。金属イオン封鎖剤またはキレート剤には、EDTAが含まれる。医薬担体にはまた、水混和性ビヒクル用のエチルアルコール、ポリエチレングリコール、およびプロピレングリコール、ならびにpH調整用の水酸化ナトリウム、塩酸、クエン酸、または乳酸が含まれる。
医薬組成物は、対象へのいずれの投与経路に対して製剤化されてもよい。投与経路の具体的な例には、鼻腔内、経口、肺、経皮、皮内、および非経口が挙げられる。皮下注射、筋肉内注射、または静脈内注射のいずれかを特徴とする非経口投与も本明細書で企図される。注射剤は、液体溶液または懸濁剤として、注射前の液体中の溶液または懸濁剤に好適な固体形態として、またはエマルションとしてのいずれかで、従来形態で調製され得る。注射剤、溶液、およびエマルションはまた、1つ以上の賦形剤を含む。好適な賦形剤は、例えば、水、生理食塩水、デキストロース、グリセロール、またはエタノールである。さらに、所望される場合、投与される医薬組成物はまた、湿潤剤または乳化剤、pH緩衝剤、安定剤、溶解性エンハンサー、および例えば酢酸ナトリウム、ソルビタンモノラウレート、オレイン酸トリエタノールアミン、およびシクロデキストリンなどの他のかかる薬剤などの、少量の非毒性補助物質を含み得る。
ヘテロ二量体タンパク質の非経口投与のための調製物には、注射の準備ができている滅菌溶液、皮下注射用錠剤を含む、使用直前に溶媒と混合される準備ができている凍結乾燥粉末などの滅菌乾燥可溶性生成物、注射の準備ができている滅菌懸濁剤、使用直前にビヒクルと混合される準備ができている滅菌乾燥不溶性生成物、および滅菌エマルションが含まれる。溶液は、水性または非水性のいずれであってもよい。
静脈内投与される場合、好適な担体には、生理食塩水またはリン酸緩衝生理食塩水(PBS)と、グルコース、ポリエチレングリコール、およびポリプロピレングリコールなどの増粘剤および可溶化剤、ならびにそれらの混合物を含む溶液とが含まれる。
ヘテロ二量体タンパク質を含む局所混合物は、局所および全身投与について記載されるように調製される。得られた混合物は、溶液、懸濁剤、エマルションなどであってもよく、クリーム、ゲル、軟膏、エマルション、溶液、エリキシル、ローション、懸濁液、チンキ、ペースト、発泡体、エアロゾル、灌注剤、スプレー、坐剤、包帯、皮膚パッチ、または局所投与に好適な任意の他の製剤として製剤化され得る。
本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質は、吸入などによって、局所適用のためのエアロゾルとして製剤化され得る(例えば、炎症性疾患、特に喘息の治療に有用なステロイド送達のためのエアロゾルを記載し、全体が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第4,044,126号、第4,414,209号、および第4,364,923号を参照されたい)。気道への投与のためのこれらの製剤は、ネブライザー用のエアロゾルもしくは溶液の形態で、または吹送用の微細粉末として、単独でまたはラクトースなどの不活性担体と組み合わせてもよい。このような場合、製剤の粒子は、一実施形態では、50ミクロン未満、一実施形態では、10ミクロン未満の直径を有する。
本明細書に開示されるヘテロ二量体タンパク質は、ゲル、クリーム、およびローションの形態で、皮膚および眼などの粘膜への局所適用、ならびに眼への適用、または嚢内もしくは脊髄内適用のためなど、部分的または局所的適用のために製剤化され得る。局所投与は、経皮送達、および眼もしくは粘膜への投与、または吸入療法も企図する。ヘテロ二量体タンパク質の鼻腔溶液を単独でまたは他の薬学的に許容される賦形剤と組み合わせて投与することもできる。
イオン電気泳動および電気泳動装置を含む経皮パッチは、当業者に周知であり、ヘテロ二量体タンパク質を投与するために使用することができる。例えば、かかるパッチは、米国特許第6,267,983号、第6,261,595号、第6,256,533号、第6,167,301号、第6,024,975号、第6,010,715号、第5,985,317号、第5,983,134号、第5,948,433号、および第5,860,957号に開示されており、それらのすべては、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質を含む医薬組成物は、溶液、エマルション、および他の混合物としての投与のために再構成され得る凍結乾燥粉末である。また、これは固形分またはゲルとして再構成および製剤化されてもよい。凍結乾燥粉末は、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質、またはその薬学的に許容される誘導体を好適な溶媒に溶解することによって調製される。ある特定の実施形態では、凍結乾燥粉末は、滅菌である。溶媒は、粉末または粉末から調製された再構成溶液の安定性または他の薬理学的成分を改善する賦形剤を含んでもよい。使用してもよい賦形剤には、デキストロース、ソルビトール、フルクトース、トウモロコシシロップ、キシリトール、グリセリン、グルコース、スクロース、または他の好適な薬剤が含まれるが、これらに限定されない。溶媒はまた、一実施形態では、ほぼ中性pHで、クエン酸塩、ナトリウム、もしくはリン酸カリウムなどの緩衝剤、または当業者に既知の他のかかる緩衝剤を含んでもよい。溶液のその後の滅菌濾過、それに続く当業者に既知の標準条件下での凍結乾燥により、所望の製剤が得られる。一実施形態では、得られた溶液は、凍結乾燥のためにバイアルに分配される。各バイアルは、化合物の単回用量または複数回用量を含む。凍結乾燥粉末は、約4℃~室温などの適切な条件下で保存することができる。この凍結乾燥粉末を注射用水で再構成することにより、非経口投与に使用するための製剤が得られる。再構成のためには、凍結乾燥粉末を滅菌水または他の好適な担体に加える。正確な量は、選択される化合物により左右される。かかる量は、経験的に決定することができる。
本明細書に提供されるヘテロ二量体タンパク質および他の組成物は、治療される対象の身体の特定の組織、受容体、または他の領域を標的とするように製剤化することもできる。多くのかかる標的化方法は、当業者に周知である。すべてのかかる標的化方法が、本組成物における使用のために本明細書で企図される。標的化方法の非限定的な例については、例えば、すべて全体が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第6,316,652号、第6,274,552号、第6,271,359号、第6,253,872号、第6,139,865号、第6,131,570号、第6,120,751号、第6,071,495号、第6,060,082号、第6,048,736号、第6,039,975号、第6,004,534号、第5,985,307号、第5,972,366号、第5,900,252号、第5,840,674号、第5,759,542号、および第5,709,874号を参照されたい。具体的な実施形態では、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質は、腫瘍を標的とする。
インビボ投与のため使用されるべき組成物は、滅菌であり得る。これは、例えば、無菌濾過膜を通した濾過により容易に成し遂げられる。
5.4 ヘテロ二量体タンパク質を産生するポリヌクレオチド、ベクター、および方法
別の態様では、本明細書に記載のFcポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド、およびベクター、例えば、宿主細胞(例えば、E.coliおよび哺乳動物細胞)における組換え発現のためのかかるポリヌクレオチドを含むベクターが本明細書に提供される。本明細書に提供されるヘテロ二量体タンパク質の第1および/または第2のFcポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド、ならびにかかるポリヌクレオチド配列を含むベクター、例えば、宿主細胞、例えば、哺乳動物細胞におけるそれらの効率的発現のための発現ベクターが、本明細書に提供される。
本明細書で使用される場合、「単離された」ポリヌクレオチドまたは核酸分子は、核酸分子の天然の供給源に(例えば、マウスまたはヒトに)存在する他の核酸分子から分離されるものである。さらに、cDNA分子のような「単離された」核酸分子は、組換え技術により産生されるとき、他の細胞材料もしくは培地を実質的に含まない可能性があるか、または化学的に合成されるとき、化学前駆体もしくは他の化学物質を実質的に含まない可能性がある。例えば、専門用語「実質的に含まない」は、約15%、10%、5%、2%、1%、0.5%、または0.1%未満(特に、約10%未満)の他の材料、例えば、細胞材料、培地、他の核酸分子、化学前駆体および/または他の化学物質を有する、ポリヌクレオチドまたは核酸分子の調製を含む。具体的な実施形態では、本明細書に記載されるFcポリペプチドをコードする核酸分子(複数可)は、単離または精製される。
特定の実施形態では、Fcポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドが本明細書に提供される。ある特定の態様では、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第1および/または第2のFcポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドが本明細書に提供される。
また、例えば、コドン/RNA最適化、異種性シグナル配列での代置、およびmRNA不安定性エレメントの除去により最適化されるFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドが本明細書に提供される。mRNAにおいてコドン変更を導入すること、および/もしくは阻害性領域を除外することによる、組換え発現のためのFcポリペプチドをコードする最適化された核酸を生成する方法は、例えば、米国特許第5,965,726号、第6,174,666号、第6,291,664号、第6,414,132号、および第6,794,498号(それらのすべては、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載される最適化方法を適切に適用することにより実施することができる。例えば、RNA内の可能性のあるスプライス部位および不安定性エレメント(例えば、A/TまたはA/Uリッチエレメント)は、組換え発現のためRNAの安定性を増大するために核酸配列によりコードされるアミノ酸を変更することなく、変異誘発され得る。変更は、例えば、同一のアミノ酸の代替コドンを使用する、遺伝子コードの縮重を利用する。ある特定の実施形態では、保存的変異、例えば、元々のアミノ酸と同様の化学構造ならびに特性および/または機能を有する同様のアミノ酸をコードするように、1つ以上のコドンを変更することが望ましい場合がある。かかる方法は、最適化されていないポリヌクレオチドによりコードされるFcポリタンパク質の発現と比べて、Fcポリタンパク質の発現を、少なくとも1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍、または100倍以上増加させることができる。
ある特定の実施形態では、Fcポリペプチドをコードする最適化されたポリヌクレオチド配列は、本明細書に記載されるFcポリペプチドをコードする最適化されていないポリヌクレオチド配列のアンチセンス(例えば、相補的)ポリヌクレオチドにハイブリダイズすることができる。具体的な実施形態では、本明細書に記載されるFcポリペプチドをコードする最適化されたヌクレオチド配列は、本明細書に記載されるFcポリペプチドをコードする最適化されていないポリヌクレオチド配列のアンチセンスポリヌクレオチドに、高ストリンジェンシー条件下でハイブリダイズする。具体的な実施形態では、本明細書に記載されるFcポリペプチドをコードする最適化されたヌクレオチド配列は、本明細書に記載されるFcポリペプチドをコードする最適化されていないヌクレオチド配列のアンチセンスポリヌクレオチドに、高ストリンジェンシー、中ストリンジェンシー、または低ストリンジェンシー条件下でハイブリダイズする。ハイブリダイゼーション条件に関する情報は説明されており、例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許出願公開第2005/0048549(例えば、段落72~73)を参照されたい。
当該技術分野で既知の任意の方法により、ポリヌクレオチドを得ることができ、またポリヌクレオチドのヌクレオチド配列を決定することができる。本明細書に記載されるFcポリペプチドおよびこれらのFcポリペプチドの修飾バージョンをコードするヌクレオチド配列は、当該技術分野で周知の方法を使用して決定することができ、すなわち、特定のアミノ酸をコードすることが知られているヌクレオチドコドンは、Fcポリペプチドをコードする核酸を生成するようにアセンブリされる。Fcポリペプチドをコードするかかるポリヌクレオチドは、化学的に合成されたオリゴヌクレオチドからアセンブリすることができ(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれる、Kutmeier G et al.,(1994),BioTechniques 17:242-6に記載されるとおり)、これは簡潔に言えば、Fcポリペプチドをコードする配列の一部を含む重複オリゴヌクレオチドの合成、それらのオリゴヌクレオチドのアニーリングおよびライゲーション、ならびにその後のPCRによるライゲーションされたオリゴヌクレオチドの増幅を伴う。
あるいは、本明細書に記載されるFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、当該技術分野で周知の方法(例えば、PCRおよび他の分子クローニング方法)を使用して、好適な供給源由来の核酸から生成することができる。PCR増幅法を使用して、ヘテロ二量体タンパク質の第1および/または第2のFcポリペプチドをコードする配列を含む核酸を得ることができる。増幅された核酸は、宿主細胞における発現のため、およびさらなるクローニングのために、ベクターにクローニングすることができる。
特定のFcポリペプチドをコードする核酸を含むクローンが利用できないが、Fcポリペプチド分子の配列は分かっている場合、Fcポリペプチドをコードする核酸は、配列の3’および5’末端にハイブリダイズ可能な合成プライマーを使用するPCR増幅によって、または特定の遺伝子配列に特異的なオリゴヌクレオチドプローブを使用してクローニングし、例えば、FcポリペプチドをコードするcDNAライブラリーからcDNAクローンを特定することによって、化学的に合成されるか、または好適な供給源(例えば、任意の組織、またはFcポリペプチドを発現する細胞から生成されるcDNAライブラリー、またはそれらから単離される核酸、好ましくはポリA+RNA)から得ることができる。次いで、PCRによって生成された増幅された核酸を、当該技術分野で周知の任意の方法を使用して、複製可能なクローニングベクターにクローニングすることができる。
本明細書に記載されるFcポリペプチドをコードするDNAは、従来的な手順を使用して(例えば、ヘテロ二量体タンパク質をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを使用することによって)容易に単離および配列決定することができる。単離したら、DNAを発現ベクター内に置き、次いでこれをE.coli細胞、シミアンCOS細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞(例えば、CHO GS System(商標)(Lonza)からのCHO細胞)、または別様にはFcポリペプチドを産生しない骨髄腫細胞などの宿主細胞にトランスフェクトして、組換え宿主細胞中のFcポリペプチドの合成を得ることができる。
高ストリンジェンシー、中ストリンジェンシー、または低ストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で、本明細書に記載されるFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドも提供される。具体的な実施形態では、本明細書に記載されるポリヌクレオチドは、高ストリンジェンシー、中ストリンジェンシー、または低ストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で、本明細書に提供されるヘテロ二量体タンパク質の第1および/または第2のFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドにハイブリダイズする。
ハイブリダイゼーション条件は、当該技術分野において説明されており、当業者には既知である。例えば、ストリンジェント条件下でのハイブリダイゼーションは、フィルター結合したDNAへの、6×塩化ナトリウム/クエン酸ナトリウム(SSC)における約45℃でのハイブリダイゼーション、続いて、0.2×SSC/0.1%SDSにおける約50~65℃での1回または複数回の洗浄を含んでもよく、高ストリンジェント条件下でのハイブリダイゼーションは、フィルター結合した核酸への、6×SSCにおける約45℃でのハイブリダイゼーション、続いて、0.1×SSC/0.2%SDSにおける約68℃での1回または複数回の洗浄を含んでもよい。他のストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でのハイブリダイゼーションは、当業者に既知であり、説明されている。例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれる、Ausubel FM et al.,eds.,(1989)Current Protocols in Molecular Biology,Vol.I,Green Publishing Associates,Inc.and John Wiley&Sons,Inc.,New Yorkの6.3.1~6.3.6および2.10.3頁を参照されたい。
ある特定の態様では、本明細書に記載されるFcポリペプチドを発現する(例えば、組換えで)細胞(例えば、宿主細胞)、および関連するポリヌクレオチド、および発現ベクターが提供される。宿主細胞における、好ましくは、哺乳動物細胞(例えば、CHO細胞)における組換え発現のためのFcポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを含むベクター(例えば、発現ベクター)が本明細書に提供される。また、本明細書に記載されるFcポリペプチドを組換え発現させるためのかかるベクターを含む宿主細胞が本明細書に提供される。特定の態様では、宿主細胞からかかるFcポリペプチドを発現させることを含む、本明細書に記載されるFcポリペプチドを産生するための方法が本明細書に提供される。
本明細書に記載されるFcポリペプチドの組換え発現は、概して、Fcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターの構築を伴う。本明細書に記載されるFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを得たら、Fcポリペプチド分子の製造のためのベクターを、当該技術分野で周知の技法を使用する組換えDNA技術により製造することができる。よって、ヌクレオチド配列をコードするFcポリペプチドを含むポリヌクレオチドを発現させることにより、タンパク質を調製するための方法が、本明細書に記載される。当業者に周知である方法を使用して、Fcポリペプチドコード配列および適切な転写および翻訳制御シグナルを含む発現ベクターを構築することができる。これらの方法には、例えば、インビトロ組換えDNA技法、合成技法、およびインビボ遺伝子組換えが含まれる。また、プロモーターに動作可能に連結した本明細書に記載されるFcポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む複製可能なベクターが提供される。
発現ベクターは、従来の技法により細胞(例えば、宿主細胞)に導入することができ、次に、得られた細胞を従来の技法により培養して、本明細書に記載されるFcポリペプチドを産生することができる。よって、宿主細胞中のかかる配列の発現のためにプロモーターに動作可能に連結した本明細書に記載されるFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する宿主細胞が本明細書に提供される。ある特定の実施形態では、ヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドの両方を個々にコードするベクターは、以下に詳述するように、ヘテロ二量体タンパク質全体の発現のために宿主細胞内で共発現され得る。ある特定の実施形態では、宿主細胞は、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドの両方をコードするポリヌクレオチドを含むベクターを含む。ある特定の実施形態では、宿主細胞は、2つの異なるベクターを含み、第1のベクターは、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含み、第2のベクターは、ヘテロ二量体タンパク質の第2のFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、宿主細胞は、以下の4つのベクター、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第1の半抗体の第1の抗体重鎖をコードするポリヌクレオチドを含む第1のベクター、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第2の半抗体の第2の抗体重鎖をコードするポリヌクレオチドを含む第2のベクター、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第1の半抗体の第1の抗体軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含む第3のベクター、および本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第2の半抗体の第2の抗体軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含む第4のベクター、を含む。ある特定の実施形態では、第1の半抗体の第1の抗体重鎖、第2の半抗体の第2の抗体重鎖、第1の半抗体の第1の抗体軽鎖、および第2の半抗体の第2の抗体軽鎖を個々にコードするベクターが宿主細胞内で共発現されて、ヘテロ二量体タンパク質を産生し得る。
他の実施形態では、第1の宿主細胞は、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む第1のベクターを含み、第2の宿主細胞は、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第2のFcポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む第2のベクターを含む。具体的な実施形態では、第1の細胞によって発現される第1のFcポリペプチドは、第2の細胞の第2のFcポリペプチドと会合して、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質を形成する。ある特定の実施形態では、第1の宿主細胞は、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第1の半抗体の第1の抗体重鎖をコードするポリヌクレオチドを含む第1のベクターと、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第1の半抗体の第1の抗体軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含む第2のベクターとを含み、第2の宿主細胞は、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第2の半抗体の第2の抗体重鎖をコードするポリヌクレオチドを含む第3のベクターと、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第2の半抗体の第2の抗体軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含む第4のベクターとを含む。ある特定の実施形態では、第1の細胞によって発現される第1の半抗体は、第2の細胞の第2の半抗体と会合して、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質を形成する。ある特定の実施形態では、かかる第1の宿主細胞およびかかる第2の宿主細胞を含む宿主細胞の集団が、本明細書に提供される。
様々な宿主発現ベクター系を利用して、本明細書に記載されるFcポリペプチドを発現させることができる(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第5,807,715号を参照されたい)。かかる宿主発現系は、目的のコード配列が産生され、続いて精製され得るビヒクルを示すが、適切なヌクレオチドコード配列で形質転換されるか、またはトランスフェクトされると、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質分子をインサイツで発現し得る細胞も示す。これらには、例えば、ヘテロ二量体タンパク質コード配列を含む組換えバクテリオファージDNA、プラスミドDNA、もしくはコスミドDNA発現ベクターで形質転換された細菌(例えば、E.coliおよびB.subtilis)などの微生物;例えば、ヘテロ二量体タンパク質コード配列を含む組換え酵母発現ベクターで形質転換された酵母(例えば、Saccharomyces Pichia);例えば、ヘテロ二量体タンパク質コード配列を含む組換えウイルス発現ベクター(例えば、バキュロウイルス)に感染させた昆虫細胞系;例えば、組換えウイルス発現ベクター(例えば、カリフラワーモザイクウイルス、CaMV;タバコモザイクウイルス、TMV)に感染させた、もしくは例えば、ヘテロ二量体タンパク質コード配列を含む組換えプラスミド発現ベクター(例えば、Tiプラスミド)で形質転換された植物細胞系(例えば、Chlamydomonas reinhardtiiなどの緑藻);または例えば、哺乳動物細胞のゲノムに由来するプロモーター(例えば、メタロチオネインプロモーター)もしくは哺乳動物ウイルスに由来するプロモーター(例えば、アデノウイルス後期プロモーター;ワクシニアウイルス7.5Kプロモーター)を含む組換え発現構築物を有する哺乳動物細胞系(例えば、COS(例えば、COS1またはCOS)、CHO、BHK、MDCK、HEK293、NS0、PER.C6、VERO、CRL7O3O、HsS78Bst、HeLa、およびNIH 3T3、HEK-293T、HepG2、SP210、R1.1、B-W、L-M、BSC1、BSC40、YB/20、およびBMT10細胞)が含まれるが、これらに限定されない。具体的な実施形態では、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質を発現させるための細胞は、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、例えば、CHO GS System(商標)(Lonza)からのCHO細胞である。特定の実施形態では、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質を発現させるための細胞は、ヒト細胞、例えば、ヒト細胞株である。特定の実施形態では、哺乳動物発現ベクターは、pOptiVEC(商標)またはpcDNA3.3である。特定の実施形態では、Escherichia coliまたは真核細胞(例えば、哺乳動物細胞)などの細菌細胞が、ヘテロ二量体タンパク質の発現に使用される。例えば、ヒトサイトメガロウイルス由来の主要な中間早期遺伝子プロモーターエレメントなどのベクターと併せた、CHO細胞などの哺乳動物細胞は、抗体などのタンパク質のための有効な発現系である(各々全体が参照により本明細書に組み込まれる、Foecking MK&Hofstetter H(1986)Gene 45:101-5、およびCockett MI et al.,(1990)Biotechnology 8(7):662-7)。ある特定の実施形態では、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質は、CHO細胞またはNS0細胞により産生される。具体的な実施形態では、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質をコードするヌクレオチド配列の発現は、構成的プロモーター、誘導性プロモーター、または組織特異的プロモーターによって調節される。
細菌系では、発現されるヘテロ二量体タンパク質に意図される使用に応じて、いくつかの発現ベクターを有利に選択することができる。例えば、ヘテロ二量体タンパク質の医薬組成物の生成のために、かかるタンパク質を大量に産生する場合、精製が容易な高レベルの融合タンパク質産物の発現を指示するベクターが望ましい場合がある。かかるベクターには、これらに限定されないが、融合タンパク質が産生されるように、タンパク質コード配列が、lac Zコード領域を有するフレーム内のベクター内に個別にライゲーションされ得るE.coli発現ベクターpUR278(Ruether U&Mueller-Hill B(1983)EMBO J 2:1791-1794)、pINベクター(Inouye S&Inouye M(1985)Nuc Acids Res 13:3101-3109、Van Heeke G&Schuster SM(1989)J Biol Chem 24 5503-5509)などが含まれ、それらのすべては、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。例えば、pGEXベクターを使用して、グルタチオン5-トランスフェラーゼ(GST)を含む融合タンパク質として外来ポリペプチドを発現させることもできる。概して、かかる融合タンパク質は可溶性であり、吸着およびマトリックスグルタチオンアガロースビーズへの結合によって溶解細胞から容易に精製され、その後、遊離グルタチオンの存在下で溶出され得る。pGEXベクターは、クローニングされた標的遺伝子産物がGST部分から放出され得るように、トロンビンまたは第Xa因子プロテアーゼ切断部位を含むように設計される。
昆虫系では、例えば、Autographa californica核多角体病ウイルス(AcNPV)を、外来遺伝子を発現するベクターとして使用することができる。ウイルスは、Spodoptera frugiperda内で成長する。タンパク質コード配列は、ウイルスの非必須領域(例えば、ポリヘドリン遺伝子)に個々にクローニングされ、AcNPVプロモーター(例えば、ポリヘドリンプロモーター)の制御下に置かれてもよい。
哺乳動物宿主細胞では、いくつかのウイルスベースの発現系を利用することができる。アデノウイルスを発現ベクターとして使用する場合、目的の抗体コード配列を、アデノウイルス転写/翻訳制御複合体、例えば、後期プロモーターおよび3部分(tripartite)リーダー配列にライゲーションし得る。次いで、このキメラ遺伝子を、インビトロまたはインビボ組換えによりアデノウイルスゲノム内に挿入し得る。ウイルスゲノムの非必須領域(例えば、領域ElまたはE3)での挿入は、感染した宿主において生存可能かつヘテロ二量体タンパク質を発現することができる組換えウイルスをもたらす(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれる、Logan &Shenk T(1984)PNAS 81(12):3655-9を参照されたい)。挿入されたタンパク質コード配列の効率的な翻訳には、特定の開始シグナルも必要とされ得る。これらのシグナルは、ATG開始コドンおよび隣接配列を含む。さらに、開始コドンは、挿入全体の翻訳を確実にするために、所望のコード配列のリーディングフレームと同調している必要がある。これらの外因性翻訳制御シグナルおよび開始コドンは、天然および合成の両方の様々な起源のものであり得る。発現の効率は、適切な転写エンハンサーエレメント、転写ターミネーターなどの包含によって強化することができる(例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれる、Bitter G et al.,(1987)Methods Enzymol.153:516-544を参照されたい)。
加えて、挿入された配列の発現を調節するか、または所望の特定の様式で遺伝子産物を修飾および処理する宿主細胞株が、選択され得る。タンパク質産物のかかる修飾(例えば、グリコシル化)およびプロセシング(例えば、切断)は、タンパク質の機能に重要であり得る。異なる宿主細胞は、タンパク質および遺伝子産物の翻訳後処理ならびに修飾の特徴的かつ特異的な機序を有する。適当な細胞株または宿主系は、発現される外来タンパク質の正しい修飾およびプロセシングを確実にするように選択され得る。この目的で、遺伝子産物の最初の転写、グリコシル化、およびリン酸化の適当なプロセシングのための細胞機構を保有する真核生物宿主細胞を使用することができる。かかる哺乳動物宿主細胞には、CHO、VERO、BHK、Hela、MDCK、HEK293、NIH3T3、W138、BT483、Hs578T、HTB2、BT2OおよびT47D、NS0(任意の免疫グロブリン鎖を内因的に産生しないマウス骨髄腫細胞株)、CRL7O3O、COS(例えば、COS1またはCOS)、PER.C6、VERO、HsS78Bst、HEK-293T、HepG2、SP210、R1.1、B-W、L-M、BSC1、BSC40、YB/20、BMT10、およびHsS78Bst細胞が含まれるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態では、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質は、CHO細胞などの哺乳動物細胞内で産生される。
具体的な実施形態では、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質は、フコース含量が低減しているか、またはフコースを含有しない。かかるタンパク質は、当業者に既知の技法を使用して製造することができる。例えば、本Fcポリペプチドは、フコシル化する能力が不足または欠如している細胞中で発現され得る。具体的な例において、α1,6-フコシルトランスフェラーゼの両対立遺伝子のノックアウトを有する細胞株を使用して、フコース含量が低減したFcポリペプチドを製造することができる。Potelligent(登録商標)システム(Lonza)は、フコース含量が低減したFcポリペプチドを産生するために使用することができる、かかるシステムの例である。
組換えタンパク質の長期間の高収率の産生のために、安定した発現細胞を生成し得る。例えば、本明細書に記載されるFcポリペプチドを安定して発現する細胞株を操作することができる。具体的な実施形態では、本明細書に提供される細胞は、会合して本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質を形成する第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドを安定して発現する。ある特定の実施形態では、本明細書に提供される第1の細胞は、第1のFcポリペプチドを安定して発現し、本明細書に提供される第2の細胞は、第2のFcポリペプチドを安定して発現する。ある特定の実施形態では、第1の細胞によって発現される第1のFcポリペプチドは、第2の細胞の第2のFcポリペプチドと会合して、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質を形成する。
ある特定の態様では、ウイルス複製起点を含む発現ベクターを使用するのではなく、宿主細胞を、適切な発現制御エレメント(例えば、プロモーター、エンハンサー、配列、転写ターミネーター、ポリアデニル化部位など)、および選択可能なマーカーによって制御されるDNAで形質転換することができる。外来DNA/ポリヌクレオチドの導入後、操作された細胞を富化培地中で1~2日間増殖させた後、選択培地に切り換え得る。組換えプラスミド中の選択マーカーは、選択に対する耐性を付与し、細胞がプラスミドをその染色体に安定的に組み込み、増殖して病巣を形成することを可能にし、それによりクローン化されて細胞株に拡大される。この方法を有利に利用して、本明細書に記載されるFcポリペプチドを発現する細胞株を操作することができる。かかる操作された細胞株は、Fcポリペプチドと直接的または間接的に相互作用する組成物のスクリーニングおよび評価に特に有用であり得る。
それぞれtk、hgprt、またはaprt細胞中の単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ(Wigler M et al.,(1977)Cell 11(1):223-32)、ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(Szybalska EH&Szybalski W(1962)PNAS 48(12):2026-2034)、およびアデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(Lowy I et al.,(1980)Cell 22(3):817-23)遺伝子を含むがこれらに限定、いくつかの選択系を使用することができ、それらのすべては、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。また、代謝拮抗物質耐性は、以下の遺伝子:メトトレキサートに対する耐性を付与するdhfr(Wingler M et al.,(1980)PNAS 77(6):3567-70、O’Hare K at al.,(1981)PNAS 78:1527-31)、ミコフェノール酸に対する耐性を付与するgpt(Mulligan RC&Berg P(1981)PNAS 78(4):2072-6)、アミノグリコシドG-418(Wu GY&Wu CH(1991)Biotherapy 3:87-95、Tolstoshev P(1993)Ann Rev Pharmacol Toxicol 32:573-596、Mulligan RC(1993)Science 260:926-932、およびMorgan RA&Anderson WF(1993)Ann Rev Biochem 62:191-217、Nabel GJ&Felgner PL(1993)Trends Biotechnol 11(5):211-5)に対する耐性を付与するneo、およびハイグロマイシンに対する耐性を付与するhygro(Santerre RF et al.,(1984)Gene 30(1-3):147-56)に対する選択の基準として使用することができる。組換えDNA技術の技術分野で一般的に既知の方法は、所望の組換えクローンを選択するために日常的に適用することができ、かかる方法は、例えば、Ausubel FM et al.,(eds.),Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley&Sons,NY(1993)、Kriegler M,Gene Transfer and Expression,A Laboratory Manual,Stockton Press,NY(1990)、ならびにDracopoli NC et al.,(eds),Current Protocols in Human Genetics,John Wiley&Sons,NY(1994)の第12章および第13章、Colbere-Garapin F et al.,(1981)J Mol Biol 150:1-14に記載されており、それらのすべては、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
タンパク質の発現レベルは、ベクター増幅によって増加させることができる(概説については、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、Bebbington CR&Hentschel CCG,The use of vectors based on gene amplification for the expression of cloned genes in mammalian cells in DNA cloning,Vol.3(Academic Press,New York,1987)を参照されたい)。Fcポリペプチドを発現するベクター系中のマーカーが増幅可能である場合、宿主細胞の培養に存在する阻害剤のレベルの増加により、マーカー遺伝子のコピー数が増加することになる。増幅領域はFcポリペプチド遺伝子と関連しているため、Fcポリペプチドの産生も増加することになる(全体が参照により本明細書に組み込まれる、Crouse GF et al.,(1983)Mol Cell Biol 3:257-66)。
宿主細胞は、本明細書に記載される2つ以上の発現ベクター、第1のFcポリペプチドをコードする第1のベクター、および第2のFcポリペプチドをコードする第2のベクターで共トランスフェクトすることができる。2つのベクターは、第1および第2のFcポリペプチドの等しい発現を可能にする同一の選択可能なマーカーを含み得る。宿主細胞は、異なる量の2つ以上の発現ベクターで共トランスフェクトすることができる。例えば、宿主細胞は、第1の発現ベクターおよび第2の発現ベクターの以下の比:約1:1、1:2、1:3、1:4、1:5、1:6、1:7、1:8、1:9、1:10、1:12、1:15、1:20、1:25、1:30、1:35、1:40、1:45、または1:50のうちのいずれか1つでトランスフェクトすることができる。
あるいは、ヘテロ二量体タンパク質の第1および第2のFcポリペプチドの両方をコードし、それらを発現することができる単一ベクターを使用することができる。第1および第2のFcポリペプチドのコード配列は、cDNAまたはゲノムDNAを含み得る。発現ベクターは、モノシストロニックであることもマルチシストロニックであることもできる。マルチシストロニック核酸構築物は、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、もしくはそれ以上の遺伝子/ヌクレオチド配列、または2~5個、5~10個、もしくは10~20個の範囲の遺伝子/ヌクレオチド配列をコードし得る。例えば、二相性核酸構築物は、以下の順序で、プロモーター、第1の遺伝子(例えば、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第1のFcポリペプチド)、および第2の遺伝子(例えば、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質の第2のFcポリペプチド)を含み得る。かかる発現ベクターでは、両方の遺伝子の転写はプロモーターによって駆動され得るが、第1の遺伝子からのmRNAの翻訳は、キャップ依存性の走査機構によって行われ得、第2の遺伝子からのmRNAの翻訳は、例えば、IRESによるキャップ非依存性の機構によって行われ得る。
本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質またはFcポリペプチドが組換え発現により産生されたら、これを、クロマトグラフィー(例えば、イオン交換、親和性、およびサイズ分類カラムクロマトグラフィー)、遠心分離、示差溶解度により、またはタンパク質の精製のための任意の他の標準的な技法により精製し得る。さらに、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質およびFcポリペプチドを、本明細書に記載されるか、またはそうでなければ当該技術分野で既知の異種ポリペプチド配列に融合させて、精製が促進してもよい。
具体的な実施形態では、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質またはFcポリペプチドは、単離または精製される。概して、単離されたタンパク質は、他のタンパク質を実質的に含まないタンパク質である。例えば、特定の実施形態では、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質またはFcポリペプチドの調製物は、細胞材料および/または化学前駆体を実質的に含まない。専門用語「細胞材料を実質的に含まない」は、タンパク質が、それが単離されるか、または組換え産生される元となる細胞の細胞成分から分離している、タンパク質の調製物を含む。したがって、細胞材料を実質的に含まないタンパク質は、約30%、20%、10%、5%、2%、1%、0.5%、もしくは0.1%(乾燥重量による)未満の、異種タンパク質(本明細書では「混在タンパク質」とも称される)を有するタンパク質、および/またはタンパク質のバリアント、例えば、タンパク質の異なる翻訳後修飾形態もしくはタンパク質の他の異なるバージョン(例えば、タンパク質断片)の調製物を含む。タンパク質が組換え産生されるとき、これはまた、概して、培養培地を実質的に含まず、すなわち、培養培地は、タンパク質調製物の体積の約20%、10%、2%、1%、0.5%、または0.1%未満を表す。タンパク質が化学合成により産生されるとき、これは、概して、化学前駆体または他の化学物質を実質的に含まず、すなわち、これは、タンパク質の合成に関与する化学前駆体または他の化学物質から分離している。したがって、タンパク質のかかる調製物は、約30%、20%、10%、または5%(乾燥重量で)未満の、目的のタンパク質以外の化学前駆体または化合物を有する。具体的な実施形態では、本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質およびFcポリペプチドは、単離または精製される。
本明細書に記載されるヘテロ二量体タンパク質およびFcポリペプチドは、例えば、化学合成または組換え発現技法によって、タンパク質を合成するための当該技術分野で既知の任意の方法によって産生され得る。本明細書に記載される方法は、別段に示されない限り、分子生物学、マイクロ生物学、遺伝子解析、組換えDNA、有機化学、生化学、PCR、オリゴヌクレオチド合成および修飾、核酸ハイブリダイゼーション、ならびに当該技術の内にある関連分野における従来の技法を用いる。これらの技法は、例えば、本明細書において引用される参考文献中で記載され、文献中で十分に説明される。例えば、すべて全体が参照により本明細書に組み込まれる、Maniatis T at al.,(1982)Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press、Sambrook J et al.,(1989),Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Second Edition,Cold Spring Harbor Laboratory Press、Sambrook J at al.,(2001)Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NY、Ausubel FM et al.,Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley&Sons(1987および年次更新)、Current Protocols in Immunology,John Wiley&Sons(1987および年次更新)Gait(ed.)(1984)Oligonucleotide Synthesis:A Practical Approach,IRL Press;Eckstein(ed.)(1991)Oligonucleotides and Analogues:A Practical Approach,IRL Press、Birren B et al.,(eds.)(1999)Genome Analysis:A Laboraroty Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Pressを参照されたい。
6.実施例
実施例は、例解を目的として与えられ、制限を目的とするものではない。
6.1 実施例1:Fcポリペプチドの合成およびヘテロ二量体化
この実施例は、標的1または標的2(ヒトT細胞の表面上に存在する2つの異なる抗原)に特異的なFcポリペプチドの合成およびヘテロ二量体化を説明する。
6.1.1 Fcポリペプチド合成
12個のFcポリペプチド(各々、標的1または標的2のいずれかに特異的な半抗体を含む)をCHO細胞中で発現させ、プロテインA親和性クロマトグラフィー(GE Healthcare)を使用して精製した。12個のFcポリペプチドの各々についての抗原結合部分の結合特異性および重鎖定常領域のアミノ酸配列を、表3に記載する。
Fcポリペプチド#4、5、2、10、11、および8のタンパク質発現レベルを測定し、比較した。図1に示されるように、Fcポリペプチド4および10(S239D/A330L/I332E変異およびT366S/L368A/Y407V変異の両方を含む)は、試験した他のFcポリペプチドと比べて無視できるレベルで発現した。
6.1.2 Fcポリペプチドのヘテロ二量体化
表3に示されるFcポリペプチドをヘテロ二量体化して、表4に記載されるヘテロ二量体タンパク質を形成した。簡潔に述べると、表4に示される第1のFcポリペプチドと第2のFcポリペプチドとを、等モル量で、50mMの還元剤(2-MEA)の存在下で少なくとも2時間混合して、重鎖鎖間ジスルフィド結合を減少させた。次いで、Fcポリペプチドの混合物を、脱塩PD-10カラムを使用して再酸化緩衝液(pH6.0の10mMクエン酸ナトリウム、115mM NaCl)中に緩衝液交換して還元剤を除去し、室温で24時間インキュベートして、第1および第2のFcポリペプチドの二量体化を促進した。次いで、得られたFcポリペプチド混合物を、貯蔵緩衝液(pH6の10mMヒスチジン、および115mM NaCl)中に緩衝液交換した。純度および品質をSDS-PAGEにより決定し、二量体形成およびヘテロ二量体化率を、絶対サイズ排除クロマトグラフィー(ASEC)により評価した。
6.1.3 熱安定性
ヘテロ二量体タンパク質BA111、BA112、BA113、BA114、BA115、BA116、BA117、およびBA118の熱的安定性を評価した。1μLのSypro Orange Fluorescent Dye(5倍の最終Sypro濃度)を、PBSで希釈した4μgのタンパク質に加えた。Sypro Orange蛍光を、10℃~95℃で開始する熱勾配を使用してサーマルサイクラー(Biorad CFX96 Real-Time System C1000 PCR Detection System)で分析し、タンパク質熱シフトをCFX Maestroソフトウェアで分析した。棒グラフをプリズムで作成した。
図2Aは、抗標的1ヘテロ二量体タンパク質BA111、BA112、BA113、およびBA114についての融解温度を示す。BA114の融解温度は、BA111、BA112、またはBA113よりも低い。
図2Bは、抗標的2ヘテロ二量体タンパク質BA115、BA116、BA117、およびBA118についての融解温度を示す。BA118の融解温度は、BA115、BA116、またはBA117よりも低い。
6.2 実施例2:標的結合
この実施例は、表4に示されるヘテロ二量体タンパク質がそれらの意図された標的に結合する能力を示す。
6.2.1 標的1
ヘテロ二量体タンパク質BA111、BA112、BA113、BA114、ホモ二量体タンパク質BA119(WT IgG)、およびIgGアイソタイプ対照抗体が標的1に結合する能力を評価した。
簡潔に述べると、ヒト標的1を発現するように操作されたJurkat細胞の凍結アリコートを37℃で解凍し、10%ウシ胎児血清(FBS)を37℃および5% CO2で補充したRPMI培地中で一晩培養した。細胞を計数し、それらの生存率を、細胞の20μlアリコートを380μlの生死判別色素と混合することによって、Muse装置(Luminex Corp.)を使用して評価した。次に、細胞を1500rpmで5分間遠心分離することによってペレット化し、2% FBS(FACS緩衝液)を補充した1倍リン酸緩衝液生理食塩水(PBS)に、最終濃度1×10細胞/mLまで再懸濁した。細胞を、96ウェルのU底組織培養プレートに、ウェル当たり1×10細胞の密度で播種し、FACS緩衝液で2回洗浄した。
50μg/ml~0.000005μg/mlの範囲の標準希釈を合計8回行って、ヘテロ二量体タンパク質をFACS緩衝液で1:10に連続希釈した。細胞を、50μlのヘテロ二量体タンパク質溶液に再懸濁し、30分間4℃でインキュベートした。
ヘテロ二量体タンパク質結合を検出するために、細胞を、冷FACS緩衝液で2回洗浄し、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)で標識したヤギ抗ヒトIgG(H+L)二次抗体を1:200の最終希釈で含有し、生/死染色溶液を1:1000最終希釈で含有するFACS緩衝液に再懸濁した。次に、細胞を30分間4℃でインキュベートし、冷FACS緩衝液で2回洗浄し、フローサイトメトリー(BD LSR Fortessaフローサイトメーター)により分析した。データを、FSC-A対SSC-A、SSC-H対SSC-A、およびSSC-A対生-死に順次ゲーティングを行うことによって、FlowJo(バージョン10、FLOWJO)ソフトウェアを使用して分析した。FITC染色の平均蛍光強度(MFI)値を計算し、GraphPad Prismソフトウェア(バージョン7、GraphPad Software Inc.)を使用してデータをプロットした。
図3に示されるように、BA111、BA112、BA113、BA114、およびBA119は、標的1発現細胞に対する強力かつ同等な結合を示した。
6.2.2 標的2
ヘテロ二量体タンパク質BA115、BA116、BA117、BA118、ホモ二量体タンパク質BA120(WT IgG)、およびIgGアイソタイプ対照抗体が標的2に結合する能力を評価した。
簡潔に述べると、標的2を発現するように操作されたCHO細胞の凍結アリコートを37℃で解凍し、10%ウシ胎児血清(FBS)を37℃および5% CO2で補充したF-12培地中で一晩培養した。細胞を計数し、それらの生存率を、Vi-XCell装置を使用して評価した。次に、細胞を1500rpmで5分間遠心分離することによってペレット化し、2% FBS(FACS緩衝液)を補充した1倍リン酸緩衝液生理食塩水(PBS)に、最終濃度1×10細胞/mLまで再懸濁した。細胞を、96ウェルのU底組織培養プレートに、ウェル当たり1×10細胞の密度で播種し、FACS緩衝液で2回洗浄した。
30μg/ml~0.013717μg/mlの範囲の標準希釈を合計8回行って、ヘテロ二量体タンパク質をFACS緩衝液で1:3に連続希釈した。細胞を、50μlのヘテロ二量体タンパク質溶液に再懸濁し、30分間4℃でインキュベートした。
ヘテロ二量体タンパク質結合を検出するために、細胞を、冷FACS緩衝液で2回洗浄し、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)で標識したヤギ抗ヒトIgG(H+L)二次抗体を1:200の最終希釈で含有し、生/死染色溶液を1:1000最終希釈で含有するFACS緩衝液に再懸濁した。次に、細胞を30分間4℃でインキュベートし、冷FACS緩衝液で2回洗浄し、フローサイトメトリー(BD LSR Fortessaフローサイトメーター)により分析した。データを、FSC-A対SSC-A、SSC-H対SSC-A、およびSSC-A対生-死に順次ゲーティングを行うことによって、FlowJoソフトウェアを使用して分析した。FITC染色の平均蛍光強度(MFI)値を計算し、GraphPad Prismソフトウェアを使用してデータをプロットした。
図4に示されるように、BA115、BA116、BA117、BA118、およびBA120は、標的2発現細胞に対する強力かつ同等な結合を示した。
6.3 実施例3:標的遮断
この実施例は、表4に示されるヘテロ二量体タンパク質がそれらの意図された標的を発現する細胞中でシグナル伝達を遮断する能力を示す。
6.3.1 標的1
ヘテロ二量体タンパク質BA111、BA112、BA113、BA114、ホモ二量体タンパク質BA119(WT IgG)、およびIgGアイソタイプ対照抗体が標的1に結合することによりシグナル伝達を遮断する能力を、Jurkatレポーターアッセイを使用して評価した。
簡潔に述べると、活性化を抑制するTCR活性化および阻害性コレセプターシグナル伝達の両方に応答することができる天然プロモーターによって駆動されるルシフェラーゼレポーターを用いてヒト標的1を発現するように操作されたヒトT細胞株(Jurkat)(Promega)を、製造業者のプロトコルに従って96ウェルの平底白色プレートにプレーティングし、50μg/ml~0.015μg/mlで培養培地中1対2.5に連続希釈した用量漸増のBA111、BA112、BA113、BA114、BA119、およびIgGアイソタイプ対照抗体で処理した。示されるヘテロ二量体タンパク質の機能的活性を評価するために、標的1の天然リガンドを発現するように操作したCHO-K1細胞、および抗原非依存的にT細胞受容体(TCR)複合体を活性化するように設計した操作された細胞表面タンパク質を、ヘテロ二量体タンパク質で処理したJurkatレポーター細胞株とともに、6時間、37℃および5% CO2で共培養した。ヘテロ二量体タンパク質が標的1のその天然リガンドとの相互作用を遮断し、T細胞活性化遺伝子活性を強化する能力を評価するために、Bio-Glo(商標)試薬およびEnvisionプレート読取り照度計を使用して、ルシフェラーゼ発現を定量した。
図5に示されるように、細胞株を共培養した結果、標的1の阻害性コレセプター(Jurkat細胞上で発現)がその天然リガンドCD80およびCD86(Raji細胞上で発現)と係合し、これにより、ルシフェラーゼ発現の欠如によって示されるように、T細胞活性化が阻害された。この阻害は、漸増濃度のBA111、BA112、BA113、BA114、またはホモ二量体タンパク質BA119を加えると軽減された。BA111、BA112、BA113、BA114、およびBA119は、IL-2レポーター遺伝子活性によって決定して、T細胞活性化の強化において機能的に同等であった。
6.3.2 標的2
ヘテロ二量体タンパク質BA115、BA116、BA117、BA118、ホモ二量体タンパク質BA120(WT IgG)、およびIgGアイソタイプ対照抗体が標的2に結合することによりシグナル伝達を遮断する能力を、Jurkatレポーターアッセイを使用して評価した。
簡潔に述べると、標的2の阻害性コレセプターを内因的に発現するヒトT細胞株(Jurkat)を操作して、細胞表面標的2、およびIL-2プロモーター(Promega)によって駆動されるルシフェラーゼレポーター遺伝子を構成的に発現するようにした。細胞を、製造業者のプロトコルに従って96ウェルの平底白色プレートにプレーティングし、漸増用量の示される抗標的2ヘテロ二量体タンパク質またはアイソタイプ対照IgG抗体で処理した。ヘテロ二量体タンパク質を、50μg/ml~0.015μg/mlの範囲の濃度で、培養培地中1:2.5に連続希釈した。標的2の天然リガンドを内因的に発現し、独自のT細胞活性化因子を発現するように操作された抗原提示細胞株(Raji)を製造業者の指示に従って調製し、ヘテロ二量体タンパク質で処理したJurkat細胞とともに、6時間、37℃および5% CO2で共培養した。ヘテロ二量体タンパク質が標的2の相互作用を遮断し、IL-2レポーター遺伝子活性を強化する能力を評価するために、Bio-Glo(商標)試薬およびEnvisionプレート読取り照度計を使用して、ルシフェラーゼ発現を定量した。
図6に示されるように、2つの細胞株を共培養した結果、標的2の阻害性コレセプター(Jurkat細胞上で発現)がその天然リガンド(Raji細胞上で発現)と係合し、これにより、ルシフェラーゼ発現の欠如によって示されるように、T細胞活性化が阻害された。この阻害は、漸増濃度のBA115、BA116、BA117、BA118、またはホモ二量体タンパク質BA120を加えると軽減された。BA115、BA116、BA117、BA118、およびBA120は、IL-2レポーター遺伝子活性によって決定して、T細胞活性化の強化において機能的に同等であった。
6.4 実施例4:SEA刺激アッセイ
この実施例は、ヘテロ二量体タンパク質SEA刺激PBMCによるIL-2分泌を励起する能力を実証する。
6.4.1 標的1
標的1に特異的なヘテロ二量体タンパク質がSEA刺激PBMCによるIL-2分泌を励起する能力を調査した。
簡潔に述べると、ドナー当たり3回の反復に十分な量のヘテロ二量体タンパク質の5倍濃縮中間原液を、1.2mLのブレットチューブ中で調製した。まず、500μg/mLの各ヘテロ二量体タンパク質420μLを、R10培地中で調製した。次に、ヘテロ二量体タンパク質を、合計8回の希釈で1対10に連続希釈した後、20μlのヘテロ二量体タンパク質混合物を丸底96ウェルプレートの対応するウェルに加えた。ヒトPBMCの凍結アリコートを液体窒素から取り出し、37℃の水で直ちに解凍した。細胞を、9mLの予め加温したR10培地に移し、2000rpmで2分間直ちに遠心分離した。次に、細胞を計数し、生存率を評価した。細胞を2000rpmで2分間遠心分離し、再懸濁した。
10μg/mLのSEA10μLを90μLのR10に加えて1μg/mLの中間濃縮物を作製することにより、SEAの中間原液濃縮物を作製した。細胞を刺激するために、1μg/mLのSEA中間原液35μLを28mLの細胞に加えた。細胞とSEAとの混合物80μLを対応するウェルに加え、37℃および5% COで4日間、加湿チャンバ内でインキュベートした。合計0.1×10細胞/ウェル、および最終濃度1ng/mLのSEAを使用した。
4日間インキュベートした後、プレートをインキュベーターから取り出し、手で穏やかに撹拌した後、2分間2000rpmで遠心分離した。サイトカイン分析のために、5μLの上清を384ウェルのAlphaLISAプレート(Perkin Elmer)に移した。IL-2の測定には、AlphaLISAキットを製造業者の指示に従って使用した。簡潔に述べると、アッセイ緩衝液を、2.5mLの10倍AlphaLISA Immunoassay Bufferを22.5mLの水に加えることによって調製した。ヒトIL-2分析物を使用し、製造業者の指示に従って標準希釈物を調製した。1.6倍AlphaLISA抗IL-2アクセプタービーズとビオチン化抗IL-2抗体との混合物を、アッセイ緩衝液中で調製した。8μLを各ウェルに加え、500rpmで90分間回転させながら、室温の暗所でインキュベートした。2.3倍ストレプトアビジンドナービーズ中間原液を、アッセイ緩衝液中で調製した。10μLを各ウェルに加え、500rpmで20分間回転させながら、室温の暗所でインキュベートした。AlphaLISAプレートを2000rpmで手短に遠心分離した。相対光単位(RLU)を、EnVisionプレートリーダー上でAlphaScreenプロトコルを使用して測定した。
図7A~7Pに示されるように、BA113は、同様に標的1に特異的である参照ホモ二量体タンパク質2に匹敵して、用量依存的様式でIL-2分泌を有力に強化した。BA113は、BA112およびBA111と比較して優れた機能的活性を示した。BA111は、S239D/A330L/I332E変異(「Fc強化」)を含むホモ二量体アイソタイプ対照タンパク質で処置した細胞に有意なレベルのIL-2分泌を誘導せず、アイソタイプ対照として使用した。BA114は、BA113と比較して、IL-2分泌の強化における効果が明らかに低かった。図7A~7Pに提示する結果は、3つの異なるドナーである、ドナー1(図7A~7Dおよび図7I~7L)、ドナー2(図7E~7H)、およびドナー3(図7M~7P)からのPBMCを使用して得たものである。
6.4.2 標的2
標的2に特異的なヘテロ二量体タンパク質がSEA刺激PBMCによるIL-2分泌を励起する能力を調査した。
実験は、BA115、BA116、BA117、BA118、および参照ホモ二量体タンパク質1を利用して、上記の実施例6.4.1に記載したとおりに実施した。S239D/A330L/I332E変異(「Fc強化」)を含むホモ二量体アイソタイプタンパク質を、アイソタイプ対照として使用した。
図8A~8Xに示されるように、BA117は、同様に標的2に特異的であるBA116およびBA115ならびに参照ホモ二量体タンパク質1と比較して、用量依存的様式でIL-2分泌を有力に強化し、優れた機能的活性を示した。BA115は、BA117、BA118、またはBA116と比較して、効力が有意に低かった。BA115およびBA118バリアントは、SEA刺激PBMCドナーからのIL-2分泌の強化に対する機能的活性が同等であった。
6.5 実施例5:Fc結合
6.5.1 FcγRIIIA(CD16)結合
6.5.1.1 標的1
BA111、BA112、BA113、およびBA114がFcγRIIIAに結合する能力を、細胞結合アッセイを使用して評価した。
簡潔に述べると、hFcγRIIIA(V/V)またはhFcγRIIIA(F/F)を発現するCHO細胞を凍結状態から解凍し、5mLのFACS緩衝液(DPBS、BSA 0.5%、アジド0.05%)に、4×10細胞/mLの密度で再懸濁した。細胞を、96ウェルのU底組織培養プレートに2×10細胞/ウェルの密度で分注し、次いで、FACS緩衝液で希釈した60μg/mL~7ng/mLの濃度のBA111、BA112、BA113、およびBA114の連続希釈物とともに、45分間4℃でインキュベートした。抗体染色のため、細胞を、冷FACS緩衝液で2回洗浄し、1:800の希釈でヤギ抗ヒト IgG-PE(F(ab)2抗Fc)(JIR、カタログ#109-116-098)を含むFACS緩衝液に再懸濁した。4℃で45分間インキュベーションした後、細胞を冷FACS緩衝液で2回洗浄し、細胞をフローサイトメトリー(BD LSR Fortessaフローサイトメーター)により分析した。データを、FSC-A対SSC-A、SSC-H対SSC-A、および計数対PEに対して順次ゲーティングを行うことによって、FlowJoソフトウェアで分析した。幾何平均蛍光強度(gMFI)値を計算し、GraphPad Prismソフトウェアによってデータをプロットした。データは3つの別々の実験に由来し、エラーバーは平均の標準誤差を表す。
図9Aおよび図9Bに示されるように、BA112、BA113、およびBA114は、CHO細胞上で発現されるFcγRIIIA V/V(図9A)およびF/F(図9B)に結合する。BA113は、BA111と比較して、FcγRIIIA V/V(図9A)およびF/F(図9B)への強化された結合を示す。
6.5.1.2 標的2
BA115、BA116、BA117、およびBA118がFcγRIIIAに結合する能力を、細胞結合アッセイを使用して評価した。
実験は、ヘテロ二量体タンパク質BA115、BA116、BA117、およびBA118を60μg/mL~7ng/mLの濃度で使用したことを除いて、6.5.1.1項に記載したとおりに実施した。データは3つの実験に由来し、エラーバーは平均の標準誤差を表す。
図10Aおよび図10Bに示されるように、BA116、BA117、およびBA118は、CHO細胞上で発現されるFcγRIIIA V/V(図10A)およびF/F(図10B)に結合する。BA117は、BA115と比較して、FcγRIIIA V/V(図10A)およびF/F(図10B)への強化された結合を示す。
6.5.2 他のFc受容体
BA112、BA113、BA114、BA115、BA116、BA117、およびBA118がFcγRI、FcγRIIa H/H、FcγRIIa R/R、およびFcγRIIbに結合する能力も細胞結合アッセイを使用して評価したが、有意な差異は観察されなかった。
6.5.3 追加のヘテロ二量体タンパク質に対するFcγRIIIA(CD16)結合
この実施例は、標的1または標的2(ヒトT細胞の表面上に存在する2つの異なる抗原)に特異的な追加のFcポリペプチドの合成、ヘテロ二量体化、およびFc受容体結合を説明する。
追加のFcポリペプチド(各々、標的1または標的2のいずれかに特異的な半抗体を含む)をCHO細胞中で発現させ、プロテインA親和性クロマトグラフィー(GE Healthcare)を使用して精製した。12個のFcポリペプチドの各々についての抗原結合部分の結合特異性および重鎖定常領域のアミノ酸配列を、表5に記載する。
表3および/または5に示されるFcポリペプチドをヘテロ二量体化して、表6に記載される単一特異性ヘテロ二量体タンパク質を形成した。ヘテロ二量体化は、実施例6.1.2に記載したとおりに行った。
表6のヘテロ二量体タンパク質がFcγRIIIA F/Fに結合する能力を、図11および表7に示される抗標的1ヘテロ二量体タンパク質の評価に使用した検出抗体がFcγ断片特異的なヤギ抗ヒトIgG-Alexa Fluor 488(JIR、カタログ#109-546-098)であったことを除いて実施例6.5.1に記載したとおりに、細胞結合アッセイを使用して評価した。図11および図12の両方で使用した希釈範囲は、1:4の段階希釈で100μg/ml~0μg/mlであった。各事例において、S239D/A330L/I332E変異(Fc強化)を含む参照ホモ二量体タンパク質を、比較のために使用した。
様々なFcポリペプチドを有する抗標的1ヘテロ二量体タンパク質が細胞表面ヒトFcγRIIIA F/Fを発現するCHO細胞に結合する能力を、図11A~11Gに示す。蛍光強度(MFI)の幾何平均によって評価した細胞へのヘテロ二量体タンパク質結合のレベルを、細胞とともにインキュベートしたヘテロ二量体タンパク質の濃度に対してプロットした。各ヘテロ二量体タンパク質の曲線下面積を表7に提示する。
様々なFcポリペプチドを有する抗標的2ヘテロ二量体タンパク質が細胞表面ヒトFcγRIIIA F/Fを発現するCHO細胞に結合する能力を、図12A~12Gに示す。蛍光強度(MFI)の幾何平均によって評価した細胞へのヘテロ二量体タンパク質結合のレベルを、細胞とともにインキュベートしたヘテロ二量体タンパク質の濃度に対してプロットした。各ヘテロ二量体タンパク質の曲線下面積を表8に提示する。
本発明は、本明細書に記載される特定の実施形態により、範囲が制限されるものではない。実際に、記載されるものに加えて、本明細書に開示される様々な変更が、前述の説明および添付の図面から当業者に明らかとなる。このような変更は、添付の請求の範囲内であることが意図される。
本明細書で引用されるすべての参考文献(例えば、公報または特許または特許出願)は、それぞれ個々の参考文献(例えば、公報または特許または特許出願)が、あらゆる目的のために全体が参照により組み込まれることが具体的かつ個別に示されるのと同程度に、全体が参照によりあらゆる目的のために本明細書に組み込まれる。他の実施形態は、以下の特許請求の範囲内にある。

Claims (17)

  1. 改善された熱安定性を呈し、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドを含むヘテロ二量体タンパク質であって、
    a)前記第1のFcポリペプチドが、配列番号24のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み、前記アミノ酸配列が、アミノ酸239位、330位、332位、および366位に、それぞれアスパラギン酸、ロイシン、グルタミン酸、およびトリプトファンを含み、
    b)前記第2のFcポリペプチドが、配列番号36のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含み、前記アミノ酸配列が、アミノ酸239位、366位、368位、および407位に、それぞれアスパラギン酸、セリン、アラニン、およびバリンを含むが、アミノ酸330位にロイシンおよびアミノ酸332位にグルタミン酸を含まず、
    アミノ酸位置が、EUインデックスに従って番号付けされる、ヘテロ二量体タンパク質。
  2. 前記第1のFcポリペプチドが、第1の抗原結合部分を含み、かつ/または前記第2のFcポリペプチドが、第2の抗原結合部分を含む、請求項1に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  3. 前記第1および/または第2の抗原結合部分が、抗体可変ドメイン、細胞表面受容体の細胞外ドメイン、可溶性T細胞受容体、またはリガンドを含む、請求項2に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  4. a)前記第1および/または第2の抗原結合部分が、VH、VL、VHH、VH/VL対、scFv、ダイアボディ、および/またはFabを含む、
    b)前記細胞表面受容体が、腫瘍壊死因子スーパーファミリー受容体、血管内皮成長因子受容体、または形質転換成長因子受容体である、または
    c)前記リガンドがホルモンまたは成長因子であり、
    前記第1および第2の抗原結合部分が、同じまたは異なる標的分子に特異的に結合する、請求項3に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  5. 前記第1および/または第2のFcポリペプチドが、ヒトIgG、IgG、IgG、IgG、IgA、またはIgAのCH1ドメイン、ヒンジ領域、CH2ドメイン、および/またはCH3ドメインを含む、請求項1~4のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  6. 前記第1および/または第2のFcポリペプチドが抗体重鎖を含む、請求項5に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  7. a)前記抗体重鎖が、CH1ドメイン、および/またはヒンジ領域の一部を欠く、
    b)前記抗体重鎖が全長抗体重鎖である、
    c)前記抗体重鎖が、ヒトIgG、IgG、IgG、IgG、IgA、またはIgA重鎖である、および/または
    d)前記第1および/または第2のFcポリペプチドが抗体軽鎖をさらに含み、前記抗体軽鎖が、ヒトカッパまたはラムダ軽鎖である、
    請求項6に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  8. a)前記第1のFcポリペプチドが、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含む、
    b)前記第2のFcポリペプチドが、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む、または
    c)前記第1のFcポリペプチドが、第1の抗体重鎖および第1の抗体軽鎖を含む第1の半抗体を含み、前記第2のFcポリペプチドが、第2の抗体重鎖および第2の抗体軽鎖を含む第2の半抗体を含む、
    請求項1~7のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  9. 前記第1および第2の半抗体が、異なる標的分子、または同じ標的分子の異なる領域に結合する、請求項8に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  10. 請求項1~のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質と、薬学的に許容される担体または賦形剤と、を含む、医薬組成物。
  11. 請求項1~のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
  12. 請求項11に記載のポリヌクレオチドを含む、ベクター。
  13. 組換え宿主細胞であって、
    a)請求項11に記載のポリヌクレオチド、
    b)請求項12に記載のベクター、
    c)請求項1~9のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチド、および請求項1~のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチド、または
    d)請求項1~のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチドを含む第1のベクター、および請求項1~のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチドを含む第2のベクター
    含む、組換え宿主細胞。
  14. ヘテロ二量体タンパク質を産生する方法であって、前記方法が
    胞内で、
    a)請求項1~のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチドと、
    b)請求項1~のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチドとを
    記ヘテロ二量体タンパク質が産生される条件下で発現させることを含む、方法。
  15. ヘテロ二量体タンパク質を産生する方法であって、前記方法が、
    a)第1の細胞内で、請求項1~のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1のFcポリペプチドをコードする第1のポリヌクレオチドを、前記第1のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
    b)第2の細胞内で、請求項1~のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第2のFcポリペプチドをコードする第2のポリヌクレオチドを、前記第2のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
    c)ステップ(a)および(b)で産生された前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドを、前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドがヘテロ二量体化して前記ヘテロ二量体タンパク質を産生する条件下で接触させることと、を含む、方法。
  16. ヘテロ二量体タンパク質を産生する方法であって、前記方法が、
    a)第1の細胞内で、請求項8に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1の抗体重鎖をコードする第1のポリヌクレオチドおよび請求項8に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1の抗体軽鎖をコードする第2のポリヌクレオチドを、前記第1のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
    b)第2の細胞内で、請求項8に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第2の抗体重鎖をコードする第3のポリヌクレオチドおよび請求項8に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第2の抗体軽鎖をコードする第4のポリヌクレオチドを、前記第2のFcポリペプチドが産生される条件下で発現させることと、
    c)ステップ(a)および(b)で産生された前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドを、前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドがヘテロ二量体化して前記ヘテロ二量体タンパク質を産生する条件下で接触させることと、を含む、方法。
  17. ヘテロ二量体タンパク質を産生する方法であって、請求項1~のいずれか一項に記載のヘテロ二量体タンパク質の前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドを、前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドがヘテロ二量体化して前記ヘテロ二量体タンパク質を産生する条件下で接触させることを含む、方法。
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