JP7635019B2 - アノテーションを支援するシステム、方法、及び、プログラム - Google Patents
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Description
図1は、本実施形態に係るシステム200の構成を例示した図である。図2は、撮影装置100の構成を例示した図である。図3は、光源ユニット104と撮影ユニット105の構成を例示した図である。図4は、制御装置130の構成を例示した図である。以下、図1から図4を参照しながら、システム200の構成について説明する。
図29は、本実施形態に係るシステムが行う処理の一例を示すフローチャートである。図30は、タイムラプス撮影処理の一例を示すフローチャートである。図31及び図32は、時系列順に配置された分類画像を例示した図である。以下、図29から図32を参照しながら、本実施形態に係るシステムが行う処理について説明する。図29に示す処理は、例えば、プロセッサ131がプログラム132aを実行することによって開始される。
図38は、本実施形態に係るシステムが行う処理の一例を示すフローチャートである。図39は、分類画像の選択方法について説明するための図である。図40は、時系列に配置された分類画像の別の例を示した図である。以下、図38から図40を参照しながら、本実施形態に係るシステムが行う処理について説明する。なお、本実施形態に係るシステムは、図38に示す処理を行うことで、アノテーションを付与すべき画像の選択を支援する。本実施形態に係るシステム(以降、単にシステムと記す)は、図29に示す処理の代わりに図38に示す処理を行う点が第2の実施形態に係るシステムとは異なるが、その他の点については、第2の実施形態に係るシステムと同様である。なお、図38に示す処理は、例えば、プロセッサ131がプログラム132aを実行することによって開始される。
図41は、本実施形態に係るシステムが行う処理の一例を示すフローチャートである。図42は、分類画像の透過率決定方法について説明するための図である。以下、図41及び図42を参照しながら、本実施形態に係るシステムが行う処理について説明する。なお、本実施形態に係るシステムは、図41に示す処理を行うことで、アノテーションを付与すべき画像の選択を支援する。本実施形態に係るシステム(以降、単にシステムと記す)は、図29に示す処理の代わりに図41に示す処理を行う点が第2の実施形態に係るシステムとは異なるが、その他の点については、第2の実施形態に係るシステムと同様である。なお、図41に示す処理は、例えば、プロセッサ131がプログラム132aを実行することによって開始される。
図43は、本実施形態に係るシステムが行う処理の一例を示すフローチャートである。図44は、アノテーション画面の更に別の例を示した図である。図45から図47は、アノテーションの調整方法について説明するための図である。以下、図43から図47を参照しながら、本実施形態に係るシステムが行う処理について説明する。なお、本実施形態に係るシステムは、図43に示す処理を行うことで、アノテーションを付与すべき画像の選択を支援する。本実施形態に係るシステム(以降、単にシステムと記す)は、図29に示す処理の代わりに図43に示す処理を行う点が第2の実施形態に係るシステムとは異なるが、その他の点については、第2の実施形態に係るシステムと同様である。なお、図43に示す処理は、例えば、プロセッサ131がプログラム132aを実行することによって開始される。
130、320 制御装置
131 プロセッサ
132 記憶装置
132a プログラム
132b 学習済みデータ
133 入力装置
134 表示装置
200、300 システム
C 容器
S 試料
Claims (18)
- 画像のアノテーションを支援するシステムであって、
アノテーションを付与する候補となる画像である対象画像を構成する複数の対象領域を前記対象画像に表れる特徴に基づいて分類した分類情報を生成する分類部と、
表示装置の画面上に、前記分類情報を可視化した分類画像を、前記対象画像と対比可能に配置する制御部と、を備え、
前記制御部は、
前記対象画像に前記分類画像を重畳し、
前記分類画像の信頼性に基づいて、前記分類画像の透過率を決定する
ことを特徴とするシステム。 - 画像のアノテーションを支援するシステムであって、
アノテーションを付与する候補となる画像である対象画像を構成する複数の対象領域を前記対象画像に表れる特徴に基づいて分類した分類情報を生成する分類部と、
表示装置の画面上に、前記分類情報を可視化した分類画像を、前記対象画像と対比可能に配置する制御部と、を備え、
前記分類情報は、前記複数の対象領域の各々毎に、
分類されたクラスを示すクラス情報と、
前記クラスへの分類に対する確率的スコアを示すスコア情報と、を含み、
前記制御部は、
前記対象画像に前記分類画像を重畳し、
前記分類画像を構成する複数の分類領域の透過率を、前記複数の対象領域のうちの対応する対象領域の前記スコア情報に基づいて決定する
ことを特徴とするシステム。 - 請求項1又は請求項2に記載のシステムにおいて、
前記制御部は、所定の指示に応じて、前記対象画像に重畳する前記分類画像の透過率を変更する
ことを特徴とするシステム。 - 請求項1乃至請求項3のいずれか1項に記載のシステムにおいて、
前記制御部は、前記表示装置の画面上に、前記分類部で生成された複数の分類情報を可視化した複数の分類画像であって、互いに異なる時刻に撮影した複数の対象画像に対応する複数の分類画像を、前記複数の対象画像の撮影時刻に基づいて、配置する
ことを特徴とするシステム。 - 請求項4に記載のシステムにおいて、
前記制御部は、前記表示装置の画面上に配置する前記複数の分類画像を、前記分類部で生成された複数の分類情報の比較に基づいて選択する
ことを特徴とするシステム。 - 請求項4又は請求項5に記載のシステムにおいて、
前記制御部は、
前記複数の分類画像を対応する前記複数の対象画像に重畳し、
前記複数の分類画像の透過率を、前記複数の分類画像に対応する複数の分類情報の比較に基づいて決定する
ことを特徴とするシステム。 - 請求項1乃至請求項6のいずれか1項に記載のシステムにおいて、
前記分類情報は、分類されたクラスを示すクラス情報を含み、
前記制御部は、所定の指示に応じて、前記分類画像において前記クラス情報に割り当てられる表示態様を変更する
ことを特徴とするシステム。 - 請求項1乃至請求項7のいずれか1項に記載のシステムにおいて、
前記対象画像は、培養容器内で培養される細胞を撮影した画像であり、
前記制御部は、
前記表示装置の画面上に、前記培養容器を模した容器画像を配置し、
前記容器画像上に、前記対象画像の前記培養容器上における撮影位置に基づいて、前記対象画像に対応する前記分類画像を配置する
ことを特徴とするシステム。 - 請求項8に記載のシステムにおいて、
前記培養容器は、マルチウェルプレートであり、
前記容器画像は、前記マルチウェルプレートに含まれる複数のウェルを模した複数のウェル画像を含み、
前記制御部は、前記複数のウェル画像に対応する位置に、対応するウェル内の細胞を撮影した複数の対象画像に対応する複数の分類画像を配置する
ことを特徴とするシステム。 - 請求項1乃至請求項9のいずれか1項に記載のシステムにおいて、
前記分類部は、オートエンコーダを構成するニューラルネットワークの全部又は一部を含む
ことを特徴とするシステム。 - 請求項1乃至請求項10のいずれか1項に記載のシステムにおいて、
前記制御部は、前記分類画像に基づいて、前記対象画像にアノテーションを付与する
ことを特徴とするシステム。 - 請求項1乃至請求項11のいずれか1項に記載のシステムにおいて、
前記制御部は、
前記表示装置の画面上に配置した対象画像又は分類画像の少なくとも一方の上にグリッド線を配置し、
利用者の入力に従って、前記グリッド線で囲まれた小領域単位で、前記対象画像にアノテーションを付与する
ことを特徴とするシステム。 - 請求項12に記載のシステムにおいて、
前記制御部は、前記利用者の入力に従って、前記小領域のサイズを変更する
ことを特徴とするシステム。 - 請求項2に記載のシステムにおいて、
前記制御部は、クラスタの重心からの距離を前記確率的スコアとして生成する
ことを特徴とするシステム。 - 画像のアノテーションを支援する方法であって、
アノテーションを付与する候補となる画像である対象画像を構成する複数の対象領域を、前記対象画像に表れる特徴に基づいて分類した分類情報を生成し、
表示装置の画面上に、前記分類情報を可視化した分類画像を、前記対象画像と対比可能に配置し、
前記対比可能に配置することは、
前記対象画像に前記分類画像を重畳することと、
前記分類画像の信頼性に基づいて、前記分類画像の透過率を決定することを含む
ことを特徴とする方法。 - 画像のアノテーションを支援する方法であって、
アノテーションを付与する候補となる画像である対象画像を構成する複数の対象領域を、前記対象画像に表れる特徴に基づいて分類した分類情報を生成し、
表示装置の画面上に、前記分類情報を可視化した分類画像を、前記対象画像と対比可能に配置し、
前記分類情報は、前記複数の対象領域の各々毎に、
分類されたクラスを示すクラス情報と、
前記クラスへの分類に対する確率的スコアを示すスコア情報と、を含み、
前記対比可能に配置することは、
前記対象画像に前記分類画像を重畳することと、
前記分類画像を構成する複数の分類領域の透過率を、前記複数の対象領域のうちの対応する対象領域の前記スコア情報に基づいて決定することと、を含む
ことを特徴とする方法。 - 画像のアノテーションを支援するプログラムであって、
アノテーションを付与する候補となる画像である対象画像を構成する複数の対象領域を、前記対象画像に表れる特徴に基づいて分類した分類情報を生成し、
表示装置の画面上に、前記分類情報を可視化した分類画像を、前記対象画像と対比可能に配置し、
前記対比可能に配置することは、
前記対象画像に前記分類画像を重畳することと、
前記分類画像の信頼性に基づいて、前記分類画像の透過率を決定することを含む、
処理をコンピュータに実行させることを特徴とするプログラム。 - 画像のアノテーションを支援するプログラムであって、
アノテーションを付与する候補となる画像である対象画像を構成する複数の対象領域を、前記対象画像に表れる特徴に基づいて分類した分類情報を生成し、
表示装置の画面上に、前記分類情報を可視化した分類画像を、前記対象画像と対比可能に配置し、
前記分類情報は、前記複数の対象領域の各々毎に、
分類されたクラスを示すクラス情報と、
前記クラスへの分類に対する確率的スコアを示すスコア情報と、を含み、
前記対比可能に配置することは、
前記対象画像に前記分類画像を重畳することと、
前記分類画像を構成する複数の分類領域の透過率を、前記複数の対象領域のうちの対応する対象領域の前記スコア情報に基づいて決定することと、を含む
処理をコンピュータに実行させることを特徴とするプログラム。
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| JP2021031192A JP7635019B2 (ja) | 2021-02-26 | 2021-02-26 | アノテーションを支援するシステム、方法、及び、プログラム |
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