JP7629640B2 - 評価装置、評価方法およびプログラム - Google Patents
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Description
本願は、2019年11月15日に日本に出願された特願2019-207348号と、2020年4月9日に日本に出願された特願2020-070309号と、について優先権を主張し、それらの内容をここに援用する。
図1は、本発明の第1の実施形態に係る生体組織の評価方法について説明する図である。本実施形態の生体組織の評価方法は、OCTシステム1において、所定の時間内に、試料Smに対して複数回のOCT(光干渉断層)撮影を行う撮影手段(撮影部)10と、各回のOCTの画像から得られるOCT信号強度の時間変化を計測する計測手段(計測部)22と、時間変化に基づいて、試料Smとする生体組織の活動を定量評価する評価手段(評価部)24と、を備えた生体組織の評価装置20を用い、次の手順に沿って、生体組織が有している微小な揺らぎを可視化するとともに、定量的に評価するものである(図8参照)。
人がん組織由来の細胞を球状に培養した腫瘍凝集体サンプルに対して、4時間おきに、従来のOCT撮影を行った。
比較例1と同様の腫瘍凝集体サンプルに対して、一例として、2時間おきに、13ms間隔で100回の高速OCT撮影を行った。観測期間間隔を2時間としたのは、試料とする腫瘍凝集体組織が生体から取り出してから死に至るまでの期間(典型的には、1~3日程度)における活動状態の変化傾向を捉えるために十分なためである。また、1回の観測期間を13ms間隔で100回、即ち、1.3秒としたのは、この観測期間が観測期間間隔よりも十分に短く、組織を構成する細胞の運動もしくは細胞内の活動(例えば、数Hz~20Hz)に応じた光学的特性の時間変化を把握するのに十分なためである。続いて、各回のOCTの画像から得られるOCT信号強度の時間変化に基づいて、スペックルバリアンスを算出した。
比較例1と同様の腫瘍凝集体サンプルに対して、実施例1と同様の高速OCT撮影を行った。続いて、各回のOCTの画像から得られるOCT信号強度の時間変化に基づいて、OCT相関の減衰速度を算出した。
比較例1と同様の腫瘍凝集体サンプルに対して、実施例1と同様の高速OCT撮影を行った。続いて、各回のOCTの画像から得られるOCT信号強度に基づいて、深さ方向に対するOCT信号強度の減衰係数(AC:Attenuation Coefficient)を算出した。
生体組織の一部として切り出した、ネズミの肝臓サンプルに対して、1時間おきに、従来のOCT撮影を行った。
比較例2と同様の肝臓サンプルに対して、1時間おきに、10ms間隔で100回の高速OCT撮影を行った。続いて、各回のOCTの画像から得られるOCT信号強度の時間変化に基づいて、スペックルバリアンスを算出した。
比較例2と同様の肝臓サンプルに対して、実施例4と同様の高速OCT撮影を行った。続いて、各回のOCTの画像から得られるOCT信号強度の時間変化に基づいて、OCT相関の減衰速度を算出した。
比較例2と同様の肝臓サンプルに対して、実施例4と同様の高速OCT撮影を行った。続いて、各回のOCTの画像から得られるOCT信号強度に基づいて、深さ方向に対するOCT信号強度の減衰係数(AC)を算出した。
次に、本発明の第2の実施形態について説明する。
上記のダイナミックOCTと呼ばれる解析手法によれば、細胞など生体組織をなす内因性散乱因子の局所的活動を表現可能とする。しかしながら、非特許文献1に記載の手法では、表現される局所的活動の定量性に乏しいため、生体の活性を正しく評価することが困難なことがあった。
他方、糖尿病研究、循環器研究などの応用面では、微小血管、リンパ管、心筋など特定の組織に特異性を有する可視化するための手法としてダイナミクスイメージングの応用が期待されている。生体組織の活性を定量的に評価するために、生体組織の同じ位置において、複数回のOCT計測を行い、各回の計測により得られるOCT信号強度の時間変化を解析することも考えられる。しかしながら、組織内のあらゆる微小な動きがOCT信号の時間変化に反映されるため、単に信号強度の時間変化を解析するだけでは、特定の組織に対する活性を定量的に評価することができないことがあった。本実施形態は、この点に鑑みて提案されたものである。
次に、本実施形態に係る計測信号処理装置200の構成例について説明する。図10は、本実施形態に係る計測信号処理装置200の構成例を示すブロック図である。計測信号処理装置200は、PPDU150から入力される第1水平偏波スペクトル干渉信号、第2水平偏波スペクトル干渉信号、第1垂直偏波スペクトル干渉信号および第2垂直偏波スペクトル干渉信号から試料内の観測点における偏光特性をそれぞれ解析し、解析した偏光特性を示す偏光特性値の時間変更特性を解析し、解析した時間変動特性を示す時間変動特性値を定める。計測信号処理装置200は、観測点ごとに定めた時間変動特性値に応じた色または階調を示す信号値に変換し、変換した信号値を観測点に対応する画素ごとに画像データを生成し、生成した画像データを出力してもよい。
制御部210は、光学系制御部212、計測信号取得部214、偏光解析部216、変動特性解析部218、画像処理部220および出力処理部222を含んで構成される。本実施形態に係る計測信号取得部214と偏光解析部216は、OCT信号を取得し、取得したOCT信号に基づく信号値を試料の観測点ごとに取得する計測部として機能する。変動特性解析部218は、所定期間ごとに、取得された信号値の時間変動特性を示す時間変動特性値を算出する評価部として機能する。
画像処理部220は、出力処理部222から入力される制御信号に応じて出力画像データを記憶部230に記憶してもよい。
表示部250は、制御部210から入力される出力画像データに基づく画像を表示する。表示部250は、例えば、液晶ディスプレイ、有機エレクトロルミネッセンスディスプレイなどのいずれを備えてもよい。
次に、本実施形態に係るOCT信号処理の例について説明する。図11は、本実施形態に係るOCT信号処理の一例を示すフローチャートである。
(ステップS102)計測信号取得部214は、光学系から第1水平偏波スペクトル干渉信号、第2水平偏波スペクトル干渉信号、第1垂直偏波スペクトル干渉信号および第2垂直偏波スペクトル干渉信号を取得し、取得された信号のそれぞれから第1水平偏波OCT信号、第2水平偏波OCT信号、第1垂直偏波OCT信号および第2垂直偏波OCT信号を算出する。
(ステップS104)偏光解析部216は、計測信号取得部214により取得された第1水平偏波OCT信号、第2水平偏波OCT信号、第1垂直偏波OCT信号および第2垂直偏波OCT信号に基づいて観測点ごとにジョーンズ行列を構成する。偏光解析部216は、構成したジョーンズ行列から所定の偏光特性値を算出する。
(ステップS108)画像処理部220は、変動特性解析部218で算出された観測点ごとの時間変動特性値を、個々の観測点に対応する画素における画素値に変換する。
(ステップS110)画像処理部220は、変換した画素値を示す出力画像データを表示部250に出力する(画像表示)。よって、表示部250は、観測対象領域における偏光特性を示す時間変動特性値の観測対象領域における分布を可視化する。
次に、偏光特性値と時間変動特性値の例について説明する。偏光解析部216は、偏光特性値として、例えば、位相遅延(Phase Retardation)を算出する。位相遅延は、複屈折(Birefringence)により生ずる通常光線と異常光線との位相差である。即ち、通常光線と異常光線は、試料の光学軸に対して互いに直交する偏光方向を有し、それぞれ異なる速度で試料を透過する。位相遅延のうち表面から試料内の注目する観測点まで累積された位相遅延は累積位相遅延(CPR:Cumulative Phase Retardation)と呼ばれる。偏光解析部216は、(3)式に示すように深さzの観測点に対応する試料表面上の位置におけるジョーンズ行列の逆行列Jm0 -1に深さzの観測点における計測ジョーンズ行列Jmzを乗じて観測点における累積ジョーンズ行列(Cumulative Jones Matrix)Jczを算出する。累積ジョーンズ行列Jczは試料表面から深さzの観測点までの偏光状態の変化を示す。
Masahiro Yamanari et al.: “Estimation of Jones matrix, birefringence and entropy using Cloude-Pottier decomposition in polarization-sensitive optical coherence tomography: erratum,” Biomedical Optics EXPRESS Vol. 7, No.11, p.4636-4637, published 1 Nov. 2016
次に、上記の時間変動特性値の算出例について説明する。図13は、複屈折率の分散の空間分布の一例を示す図である。図13では、生体組織内の観測点ごとの複屈折率の分散を濃淡で示す。観測点は、x-z平面内に分布している。明るい部分ほど複屈折率の分散が大きく、暗い部分ほど複屈折率の分散が小さい。図13において上方の黒で塗りつぶされている部分は組織外を示す。全体として組織の表面よりも内部の方が複屈折率の分散が大きくなる傾向がある。
また、計測信号処理装置200は、上記のように入出力部240、表示部250および操作部260のいずれも備えてもよいし、それらの一部または全部が省略されてもよい。また、評価装置20も、入出力部240、表示部250および操作部260に相当する機能構成のいずれも備えてもよいし、それらの一部または全部が省略されてもよい。
また、計測信号処理装置200の制御部210において画像処理部220と出力処理部222の一方または両方が省略されてもよい。画像処理部220が省略される場合、制御部210は、生成した時間変動特性値を示すデータを、データ蓄積装置、PC、他の画像処理装置など、他の機器に無線または有線で、例えば、ネットワークを経由して出力してもよい。また、評価装置20も、画像処理部220と出力処理部222の一方または両方に相当する機能構成のいずれも備えてもよいし、それらの一部または全部が省略されてもよい。出力先とする機器は、画像処理部220と同様の機能、つまり、評価装置20または計測信号処理装置200から入力されるデータに基づいて出力画像データを生成し、生成した出力画像データに基づく画像を表示する機能を有してもよい。評価装置20において、計測信号処理装置200の画像処理部220と出力処理部222の一方または両方に相当する機能構成が省略されてもよい。
また、上述した実施形態における評価装置20もしくは計測信号処理装置200の一部、または全部を、LSI(Large Scale Integration)等の集積回路として実現してもよい。評価装置20もしくは計測信号処理装置200の各機能ブロックは個別にプロセッサ化してもよいし、一部、または全部を集積してプロセッサ化してもよい。また、集積回路化の手法はLSIに限らず専用回路、または汎用プロセッサで実現してもよい。また、半導体技術の進歩によりLSIに代替する集積回路化の技術が出現した場合、当該技術による集積回路を用いてもよい。
以上、本発明の好ましい実施形態を説明したが、本発明はこれら実施形態及びその変形例に限定されることはない。本発明の主旨を逸脱しない範囲で、構成の付加、省略、置換、およびその他の変更が可能である。
また、本発明は前述した説明によって限定されることはなく、添付の特許請求の範囲によってのみ限定される。
Claims (19)
- 試料とする生体組織の状態を示す光干渉断層(OCT:Optical Coherence Tomography)信号を取得し、
前記OCT信号に基づく信号値を、前記試料における観測点ごとに取得する計測部と、
前記信号値の所定期間内における時間変動特性を示す時間変動特性値を算出する評価部と、を有し、
前記評価部は、
前記信号値と、当該信号値を時間シフト量τで時間シフトした信号値との相関係数を前記時間シフト量τごとに算出し、
前記時間シフト量τがゼロである前記相関係数を用いず、前記時間シフト量τがゼロでない前記相関係数を用いて、
前記時間シフト量τの増加に伴う前記相関係数の減衰速度を前記時間変動特性値として算出する
評価装置。 - 前記評価部は、
前記所定期間内の各フレーム時刻における前記OCT信号の信号強度と当該信号強度の平均値との偏差の二乗和を分散として算出し、
前記所定期間内の各フレーム時刻における前記OCT信号の信号強度と当該信号強度の平均値との偏差と、当該フレーム時刻から時間シフト量τで時間シフトしたシフト時刻における前記OCT信号の信号強度と、時間シフトした当該信号強度の平均値との偏差との積の総和を共分散として算出し、
前記共分散を前記分散で除算して前記相関係数として、前記時間シフト量τごとに算出し、
前記時間シフト量τごとの前記相関係数を用いて所定の減衰関数を用いて回帰分析し、前記相関係数を近似する当該減衰関数のパラメータを前記減衰速度として観測点ごとに算出する
請求項1に記載の評価装置。 - 試料とする生体組織の状態を示す光干渉断層(OCT:Optical Coherence Tomography)信号を取得し、
前記OCT信号に基づく信号値を、前記試料における観測点ごとに取得する計測部と、
前記信号値の所定期間内における時間変動特性を示す時間変動特性値を算出する評価部と、を有し、
前記計測部は、
前記試料に第1偏光状態で入射される第1入射成分に対して前記試料から反射または散乱した成分に前記第1入射成分が干渉した第1干渉成分のうち第1偏光状態を有する第1計測信号、前記第1干渉成分に対する第2偏光状態を有する第2計測信号、前記試料に第2偏光状態で入射される第2入射成分に対して前記試料から反射または散乱した成分に前記第2入射成分が干渉した第2干渉成分のうち第1偏光状態を有する第3計測信号、および前記第2干渉成分に対する第2偏光状態を有する第4計測信号に基づいて、前記試料内の観測点における偏光特性に基づく偏光特性値を定め、
前記評価部は、
前記偏光特性値の時間変動特性を示す前記時間変動特性値を定める
評価装置。 - 前記計測部は、前記第1計測信号、前記第2計測信号、前記第3計測信号、および前記第4計測信号に基づいて、観測点ごとにジョーンズ行列を定め、前記試料内の観測点におけるジョーンズ行列と前記試料の表面におけるジョーンズ行列から前記観測点における累積ジョーンズ行列を定め、
前記偏光特性値として、前記累積ジョーンズ行列の固有値間の位相差である累積位相遅指標値を定める
請求項3に記載の評価装置。 - 前記計測部は、前記第1計測信号、前記第2計測信号、前記第3計測信号、および前記第4計測信号に基づいて、観測点ごとにジョーンズ行列を定め、前記試料内の第1観測点におけるジョーンズ行列と前記試料内の第2観測点におけるジョーンズ行列から前記第1観測点ならびに前記第2観測点との間の局所ジョーンズ行列を定め、
前記局所ジョーンズ行列の固有値間の位相差である局所位相遅延に基づく前記偏光特性値を定める
請求項3に記載の評価装置。 - 前記計測部は、
前記局所位相遅延を前記試料に入射する入射光の波数と、前記第1観測点と前記第2観測点との厚みで除算して複屈折率を定める
請求項5に記載の評価装置。 - 前記評価部は、前記偏光特性値の分散または標準偏差に基づく前記時間変動特性値を算出する
請求項3に記載の評価装置。 - 前記評価部は、前記偏光特性値の対数値の分散または標準偏差に基づく前記時間変動特性値を算出する
請求項3に記載の評価装置。 - 前記評価部は、前記偏光特性値の標準偏差を複屈折率の平均値で除算して動的コントラストを算出する
請求項3に記載の評価装置。 - 前記計測部は、前記偏光特性値として、前記第1計測信号と前記第2計測信号に基づく第1ジョーンズベクトル、および前記第3計測信号と前記第4計測信号に基づく第2ジョーンズベクトルを、それぞれ第1ストークスベクトル、および第2ストークスベクトルに変換し、
前記評価部は、前記時間変動特性値として、前記第1ストークスベクトルの時間平均値と前記第2ストークスベクトルの時間平均値に基づいて時間偏光均一度を定める
請求項3に記載の評価装置。 - 前記計測部は、前記第1ストークスベクトルからノイズ成分を差し引いた補正後の第1ストークスベクトルの時間平均値と、前記第2ストークスベクトルからノイズ成分を差し引いた補正後の第2ストークスベクトルの時間平均値に基づいて時間偏光均一度を定める
請求項10に記載の評価装置。 - 前記計測部は、前記偏光特性値として、前記第1計測信号、前記第2計測信号、前記第3計測信号、および前記第4計測信号に基づいて、観測点ごとにジョーンズ行列を定め、
前記評価部は、前記時間変動特性値として、前記ジョーンズ行列のフォンノイマンエントロピーを算出する
請求項3に記載の評価装置。 - 前記評価部は、
前記第1計測信号と前記第2計測信号に基づく第1ジョーンズベクトル、および前記第3計測信号と前記第4計測信号に基づく第2ジョーンズベクトルから、それぞれ変換された第1ストークスベクトルの時間偏光均一度、および第2ストークスベクトルの時間偏光均一度からノイズ成分のエントロピーを算出し、
前記フォンノイマンエントロピーを前記ノイズ成分のエントロピーに基づいて補正する
請求項12に記載の評価装置。 - 前記第1偏光状態は水平偏光であり、前記第2偏光状態は垂直偏光であり、
前記第1計測信号は第1水平偏波スペクトル干渉信号であり、
前記第2計測信号は第2水平偏波スペクトル干渉信号であり、
前記第3計測信号は第1垂直偏波スペクトル干渉信号であり、
前記第4計測信号は第2垂直偏波スペクトル干渉信号である
請求項3から請求項13のいずれか一項に記載の評価装置。 - 前記評価部は、
前記所定期間よりも長い観測期間間隔ごとに前記時間変動特性値を算出する
請求項1から請求項14のいずれか一項に記載の評価装置。 - 前記時間変動特性値に基づいて前記試料の活性状態を示す評価値を定める出力処理部を備える
請求項1から請求項15のいずれか一項に記載の評価装置。 - 入力値の変化に対して単調に変化する出力値を与える関数を用いて前記観測点ごとの前記時間変動特性値に対する出力値を信号値として有する画像データを生成する画像処理部を備える
請求項1から請求項16のいずれか一項に記載の評価装置。 - 評価装置における方法であって、
試料とする生体組織の状態を示す光干渉断層(OCT:Optical Coherence Tomography)信号を取得し、
前記OCT信号に基づく信号値を、前記試料における観測点ごとに取得する計測ステップと、
前記信号値の所定期間内における時間変動特性を示す時間変動特性値を算出する評価ステップと、を有し、
前記計測ステップにおいて、
前記試料に第1偏光状態で入射される第1入射成分に対して前記試料から反射または散乱した成分に前記第1入射成分が干渉した第1干渉成分のうち第1偏光状態を有する第1計測信号、前記第1干渉成分に対する第2偏光状態を有する第2計測信号、前記試料に第2偏光状態で入射される第2入射成分に対して前記試料から反射または散乱した成分に前記第2入射成分が干渉した第2干渉成分のうち第1偏光状態を有する第3計測信号、および前記第2干渉成分に対する第2偏光状態を有する第4計測信号に基づいて、前記試料内の観測点における偏光特性に基づく偏光特性値を定め、
前記評価ステップにおいて、
前記偏光特性値の時間変動特性を示す前記時間変動特性値を定める
評価方法。 - 評価装置のコンピュータに、
試料とする生体組織の状態を示す光干渉断層(OCT:Optical Coherence Tomography)信号を取得し、
前記OCT信号に基づく信号値を、前記試料における観測点ごとに取得する計測手順と、
前記信号値の所定期間内における時間変動特性を示す時間変動特性値を算出する評価手順と、を実行させるためのプログラムであって、
前記計測手順において、
前記試料に第1偏光状態で入射される第1入射成分に対して前記試料から反射または散乱した成分に前記第1入射成分が干渉した第1干渉成分のうち第1偏光状態を有する第1計測信号、前記第1干渉成分に対する第2偏光状態を有する第2計測信号、前記試料に第2偏光状態で入射される第2入射成分に対して前記試料から反射または散乱した成分に前記第2入射成分が干渉した第2干渉成分のうち第1偏光状態を有する第3計測信号、および前記第2干渉成分に対する第2偏光状態を有する第4計測信号に基づいて、前記試料内の観測点における偏光特性に基づく偏光特性値を定め、
前記評価手順において、
前記偏光特性値の時間変動特性を示す前記時間変動特性値を定める
プログラム。
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