JP7478807B2 - シュードモナス菌ＰｃｒＶを特異的に認識する抗体及びその使用 - Google Patents

シュードモナス菌ＰｃｒＶを特異的に認識する抗体及びその使用 Download PDF

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Description

ＡＳＣＩＩテキストファイルでの配列表の提出
以下に提出されるＡＳＣＩＩテキストファイルにおける内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。配列表のコンピュータ可読形態（ＣＲＦ）（ファイル名：７１０２６２０００３４０ＳＥＱＬＩＳＴ．ｔｘｔ；記録日：２０１９年３月３１日；サイズ：４７ＫＢ）
本発明は、緑膿菌（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ，ＰＡ）ＰｃｒＶを特異的に認識する抗体、その調製方法及び使用に関するものであり、当該使用には、それを用いてシュードモナス菌感染を治療及び予防する方法を含む。
緑膿菌は、自然界に広く存在する、絶対好気性グラム陰性桿菌である。緑膿菌は、病原性が通常低いが、日和見感染を引き起こす病原菌であり、癌、糖尿病、免疫不全症などの様々な既存の疾患を有する患者や免疫抑制作用を示す医薬品を投与する患者によく発生する。皮膚粘膜が破れた患者は、緑膿菌に感染しやすく、そして、慢性構造性肺疾患（例えば、慢性閉塞性肺疾患や嚢胞性線維症）の患者にもかなりのリスクがある。緑膿菌は、肺炎、尿路感染症、敗血症などを引き起こすことが多く、深刻な結果をもたらすことがよくある。１０％に至るまでの病院における感染は、緑膿菌に起因し、緑膿菌菌血症の患者の死亡率は、４０％に近づいている。臨床分野において、緑膿菌感染は、治療が最も難しい感染症の１つと見なされている。緑膿菌自体は、既存の抗生物質に対する感受性が低いだけでなく、様々な抗生物質に対する耐性が高い傾向があるためである。従って、抗生物質ライブラリーを開発する戦略は、緑膿菌感染に対する対応においてメリットが限られている。
緑膿菌は、病院における獲得感染、特に機械的に換気された患者における主な原因の１つであり、嚢胞性線維症患者の主な死因である。病気の重症度に関連する重要な病原性因子は、細菌毒素を宿主細胞の細胞質に直接注入する緑膿菌ＩＩＩ型分泌システム（Ｔ３ＳＳ）である。緑膿菌は、緑膿菌ＩＩＩ型分泌システム（Ｔ３ＳＳ）で毒素を真核細胞に注入することによって、高い細胞毒性を発揮する。ＰｃｒＶは、ＩＩＩ型分泌システムを構成するタンパク質であり、２９４残基（ＮＣＢＩ受託番号：ＡＡＣ４５９３５，ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１）からなる。そして、当該タンパク質をコードするオペロン配列は公開されている（ＵＳ ６，５５１，７９５，Ｙａｈｒ，Ｔ．Ｌ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．，１９９７，ｖｏｌ．１７９，ｐ．７１６５）。Ｔ３ＳＳインジェクティソーム複合体の先端に位置するＰｃｒＶタンパク質は、Ｔ３ＳＳ機能に必須であり、緑膿菌を標的とする免疫予防戦略の動物モデルで十分に検証された標的である。緑膿菌のＴ３ＳＳは、この日和見病原菌による感染症へ介入するための十分に検証された標的である。動物モデルにおいて、Ｔ３ＳＳ成分タンパク質による能動ワクチン接種とＰｃｒＶを標的とする受動免疫療法との両方は、緑膿菌による疾患を強力に軽減する。ＰｃｒＶの制御は、緑膿菌感染を制御する治療手段（Ｔ．Ｓａｗａ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，１９９９，ｖｏｌ．５，ｐ．３９２）を導く可能性があるため、ＰｃｒＶに対して中和活性を有するポリクローナル抗体（Ｓｈｉｍｅ Ｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２００１，ｖｏｌ．１６７，ｐ．５８８０，Ｉｍａｍｕｒａ Ｙ ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒ．Ｒｅｓｐｉｒ．Ｊ．，２００７，Ｖｏｌ．２９，ｐ．９６５）及びモノクローナル抗体（ＷＯ２００２０６４１６１Ａ２，Ｋａｒｉｎｅ Ｆａｕｒｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｅ．Ｂａｓｅｄ．Ｔｈｅｒａｐｉｅｓ ａｎｄ Ｖａｃｃｉｎｅｓ，２００３，Ｖｏｌ．１，Ｄａｒａ Ｗ．Ｆｒａｎｋ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｎｆｅｃｔ．Ｄｉｓｅａｓｅ，２００２， Ｖｏｌ．１８６，ｐ．６４）が報告された。しかし、ポリクローナル抗体は、抗原性を改善することが困難であるため、ヒト化すること及び医薬組成物として使用することは困難である。Ｖ２Ｌ２と呼ばれるＰｃｒＶに対する抗体は、Ｗａｒｒｅｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，２０１４，Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ．Ａｇｅｎｔｓ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒ．，５８，４３８４-４３９１に記載されている。ＰｃｒＶ特異的マウスモノクローナル抗体ＭＡＢ１６６に基づく抗ＰｃｒＶモノクローナル抗体のペグ化されたＦａｂフラグメントは、機械的に換気された患者において緑膿菌呼吸器感染症の予防に対して不活性である。ＭＡＢ１６６は、インビトロで緑膿菌Ｔ３ＳＳを効果的にブロックすることができるが、動物モデルにおいて保護のために比較的高い抗体用量を必要とする。本願は、インビトロ及びインビボでＰｃｒＶの強力な阻害を示した新規の抗ＰｃｒＶモノクローナル抗体を提供する。
本明細書で言及された全ての刊行物、特許、特許出願及び公開された特許出願に記載された内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本願は、シュードモナス菌ＰｃｒＶ上のエピトープに特異的に結合する単離された抗ＰｃｒＶ抗体、及びそのシュードモナス菌感染を治療するための方法を提供する。
本願の一態様では、シュードモナス菌ＰｃｒＶ上のエピトープに特異的に結合する単離された抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、前記エピトープは、シュードモナス菌ＰｃｒＶのＧｌｎ１６０、Ａｓｐ１６５、Ａｓｐ１７０、Ａｓｐ１７３、Ｔｈｒ１７５及びＳｅｒ２０２からなる群から選択される１つ、２つ、３つ、４つ、５つ又は６つのアミノ酸残基を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体がシュードモナス菌ＰｃｒＶに結合するＫｄ値は、約０．１ｐＭ～１ｎＭである。
本願の一態様では、重鎖可変ドメイン(ＶＨ)及び軽鎖可変ドメイン(ＶＬ)を含み、前記ＶＨは、Ｘ１Ｘ２Ｘ３ＭＳ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３９)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＤ又はＳであり、Ｘ２がＹ又はＮであり、Ｘ３がＰ、Ｈ、Ｙ又はＳである重鎖相補性決定領域(ＨＣ－ＣＤＲ)１と、Ｘ１ＩＳＥＳＧＧＳＴＸ２Ｘ３ＡＤＳＶＫＧ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４０)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＧ又はＶであり、Ｘ２がＮ又はＹであり、Ｘ３がＤ又はＹであるＨＣ－ＣＤＲ２と、ＧＲＦＸ１Ｘ２Ｘ３Ｘ４Ｘ５Ｘ６ＦＸ７ＲＡＶＹＧＭＤＶ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＳ又はＣであり、Ｘ２がＴ、Ｇ、Ｄ、Ｙ、Ｑ又はＡであり、Ｘ３がＳ、Ｄ、Ｎ、Ｅ、Ｌ、Ａ又はＹであり、Ｘ４がＳ、Ｔ、Ｙ又はＡであり、Ｘ５がＳ、Ｈ、Ｑ、Ａ、Ｒ、Ｋ、Ｇ、Ｅ、Ｙ又はＤであり、Ｘ６がＨ又はＣであり、Ｘ７がＦ又はＹであるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、ＲＡＳＱＧＩＸ１ＳＹＬＡ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４２)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＳ又はＲである軽鎖相補性決定領域(ＬＣ－ＣＤＲ)１と、ＡＡＳＴＬＱＳ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、ＱＱＬＸ１ＳＹＰＬＸ２(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４３)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＳ、Ｎ又はＫであり、Ｘ２がＳ又はＴであるＬＣ－ＣＤＲ３とを含む、単離された抗ＰｃｒＶ抗体を提供する。
いくつかの実施例において、重鎖可変ドメイン(ＶＨ)及び軽鎖可変ドメイン(ＶＬ)を含み、前記ＶＨは、ＤＸ１Ｘ２ＭＳ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４４)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＮ又はＹであり、Ｘ２がＰ、Ｈ又はＹである重鎖相補性決定領域(ＨＣ－ＣＤＲ)１と、Ｘ１ＩＳＥＳＧＧＳＴＮＹＡＤＳＶＫＧ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４５)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＧ又はＶであるＨＣ－ＣＤＲ２と、ＧＲＦＳＴＸ１ＳＸ２ＨＦＸ３ＲＡＶＹＧＭＤＶ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４６)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＮ、Ｓ、Ｄ又はＬであり、Ｘ２がＳ又はＡであり、Ｘ３がＦ又はＹであるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、ＲＡＳＱＧＩＳＳＹＬＡ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含む軽鎖相補性決定領域(ＬＣ－ＣＤＲ)１と、ＡＡＳＴＬＱＳ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、ＱＱＬＳＳＹＰＬＸ１(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４７)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＳ又はＴであるＬＣ－ＣＤＲ３とを含む、単離された抗ＰｃｒＶ抗体を提供する。いくつかの実施例において、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：４８～６４のいずれか１つで示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：６５～７０のいずれか１つで示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む、単離された抗ＰｃｒＶ抗体を提供する。
いくつかの実施例において、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１～８のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：９～１４のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１５～３１のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：３２～３３のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：３５～３８のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む、上記のいずれか１つの単離された抗ＰｃｒＶ抗体を提供する。
いくつかの実施例において、(ｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｉｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｉｉｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｉｖ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｖ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｖｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｖｉｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｖｉｉｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２２を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｉｘ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２３を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｘ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２４を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｘｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｘｉｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｘｉｉｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｘｉｖ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｘｖ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、
前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｘｖｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｘｖｉｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１４を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、或いは(ｘｖｉｉｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３８を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む、上記のいずれか１つの単離された抗ＰｃｒＶ抗体を提供する。
いくつかの実施例において、(ｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｉｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、(ｉｉｉ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含むか、或いは(ｉｖ)ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む、上記のいずれか１つの単離された抗ＰｃｒＶ抗体を提供する。
いくつかの実施例において、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：４８～６４のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：４８～６４のいずれか１つと少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：６５～７０のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：６５～７０のいずれか１つと少なくとも約９０％の配列同一性を有する、上記のいずれか１つの単離された抗ＰｃｒＶ抗体。いくつかの実施例において、単離された抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：５１～５２及び６１～６２のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：５１～５２及び６１～６２のいずれか１つと少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５若しくは６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５若しくは６７と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記単離された抗ＰｃｒＶ抗体は、(ｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４８を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含むか、(ｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含むか、(ｉｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６６を含むか、(ｉｖ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含むか、(ｖ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含むか、(ｖｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含むか、(ｖｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５４を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含むか、(ｖｉｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５５を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含むか、(ｉｘ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含むか、(ｘ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５７を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６８を含むか、(ｘｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５８を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６９を含むか、(ｘｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含むか、(ｘｉｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含むか、(ｘｉｖ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６１を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含むか、(ｘｖ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含むか、(ｘｖｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含むか、(ｘｖｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含むか、或いは(ｘｖｉｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７０を含む。
いくつかの実施例において、上記のいずれか１つの単離された抗ＰｃｒＶ抗体と競合的にＰｃｒＶに特異的に結合する、単離された抗ＰｃｒＶ抗体を提供する。いくつかの実施例において、上記のいずれか１つの単離された抗ＰｃｒＶ抗体と同じエピトープに特異的に結合する、単離された抗ＰｃｒＶ抗体を提供する。
いくつかの実施例において、Ｆｃフラグメントを含む上記のいずれか１つの単離された抗ＰｃｒＶ抗体を提供する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、全長のＩｇＧ抗体である。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、全長のＩｇＧ１又はＩｇＧ４抗体である。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、キメラ抗体、ヒト抗体又はヒト化抗体である。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ）’２、Ｆａｂ’－ＳＨ、一本鎖抗体（ｓｃＦｖ）、Ｆｖフラグメント、ｄＡｂ、Ｆｄ、及びダイアボディからなる群から選択される抗原結合性フラグメントである。
いくつかの実施例において、上記のいずれか１つの単離された抗ＰｃｒＶ抗体をコードする単離された核酸分子を提供する。いくつかの実施例において、上記のいずれか１つの単離された核酸分子を含む、ベクターを提供する。いくつかの実施例において、上記のいずれか１つの単離された抗ＰｃｒＶ抗体、上記のいずれか１つの単離された核酸分子、又は上記のいずれか１つのベクターを含む、宿主細胞を提供する。いくつかの実施例において、ａ）抗ＰｃｒＶ抗体を有効に発現する条件で上記のいずれか１つの宿主細胞を培養すること、及びｂ）宿主細胞から、発現された抗ＰｃｒＶ抗体を得ることを含む、抗ＰｃｒＶ抗体を調製する方法を提供する。
いくつかの実施例において、有効量の上記のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体又は上記のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体を含む医薬組成物を個体へ投与することを含む、必要とする個体における疾患又は病症を治療及び／又は予防する方法を提供する。いくつかの実施例において、上記のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体又は上記のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体を含む医薬組成物の、疾患又は病症を治療するための医薬品の調製における使用を提供する。いくつかの実施例において、疾患又は病症は、病原菌感染である。いくつかの実施例において、感染は、グラム陰性菌感染である。いくつかの実施例において、前記細菌は、緑膿菌である。いくつかの実施例において、疾患又は病症は、緑膿菌感染による症状の一種又は複数種を含む。いくつかの実施例において、症状は、熱、悪寒、疲労、筋肉及び関節の痛み、関節の腫れ、頭痛、下痢、皮膚発疹、創傷の膿、細菌血症、急性肺炎、及び腹腔内感染のうちの一種又は複数種を含む。
いくつかの実施例において、治療薬の一種又は複数種を投与することをさらに含む上記のいずれか１つの治療方法を提供する。いくつかの実施例において、治療薬の少なくとも一種は、抗生物質である。いくつかの実施例において、抗生物質は、イミペネム、トブラマイシン、シプロフロキサシン、メロペネム、及びアズトレオナムのうちの一種又は複数種である。
上記のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体、上記のいずれか１つの核酸、上記のいずれか１つのベクター、上記のいずれか１つの単離された宿主細胞を含む医薬組成物、試薬キット及び製品をさらに提供する。
図１Ａ～１Ｂは、親１３－４２モノクローナル抗体及び参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤと比較して、リード最適化抗体のＲＢＣ溶解を阻害する能力を示す。 図２Ａ～２Ｂは、親１３－４２モノクローナル抗体と比較して、リード最適化抗体のＡ５４９細胞溶解を阻害する能力を示す。 図３は、参照抗体Ｍａｂ１６６及びＶ２Ｌ２－ＭＤと比較して、ＥＬＩＳＡによって計測されたリード最適化抗体７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１及び６Ｄ１０のＢＶ粒子に対する交差反応を示す。 図４Ａ～４Ｅは、ＦＡＣＳによって計測された１３－４２モノクローナル抗体並びに最適化抗体７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１及び６Ｄ１０のＰｃｒＶ陰性であるＡ５４９細胞に対する交差反応を示す。 図５Ａ、５Ｂ及び５Ｃは、それぞれ、親１３－４２モノクローナル抗体及び参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤと比較して、最適化抗体７Ｂ１、７Ｃ１及び８Ｃ１の菌株Ｏ１－５２／６６（図５Ａ）、Ｏ１６－１７７／８１（図５Ｂ）及びＯ６－５７／６６（図５Ｃ）によるＲＢＣ溶解を阻害する能力を示す。 図６Ａ～６Ｄは、それぞれ、親１３－４２モノクローナル抗体と比較して、最適化抗体７Ｂ１、７Ｃ１及び８Ｃ１の菌株Ｏ１－５２／６６（図６Ａ）、Ｏ６－５７／６６（図６Ｂ）、Ｏ１６－１７７／８１（図６Ｃ）及びＯ１１－ＰＡ１０３（図６Ｄ）によるＡ５４９細胞溶解を阻害する能力を示す。 図７Ａは、親１３－４２モノクローナル抗体と比較して、リード最適化抗体７Ｂ１、７Ｃ１及び３Ｇ３のマウス急性肺炎モデル（ＰＡ１０３菌株，１×ＬＤ９０）において生存率を予防的に向上させる能力を示す。図７Ｂは、親１３－４２モノクローナル抗体と比較して、リード最適化抗体７Ｂ１、７Ｃ１及び３Ｇ３のマウス急性肺炎モデル（ＰＡ１０３菌株，２×ＬＤ９０）において生存率を予防的に向上させる能力を示す。 図８Ａ～８Ｂは、親１３－４２モノクローナル抗体、参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤ並びにリード最適化抗体７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１及び６Ｄ１０のマウス急性肺炎モデルにおいて緑膿菌の臓器負担を予防的に低下させる能力を示す。 図９は、親１３－４２モノクローナル抗体と比較して、リード最適化抗体７Ｂ１、７Ｃ１及び８Ｃ１のマウス腹腔内感染モデル（５７／６６菌株，３×ＬＤ９０）において生存率を予防的に向上させる能力を示す。 図１０は、親１３－４２モノクローナル抗体と比較して、リード最適化抗体７Ｂ１、７Ｃ１及び８Ｃ１の免疫不全マウス急性肺炎モデル（５７／６６菌株，１×ＬＤ９０）において生存率を予防的に向上させる能力を示す。 図１１Ａ～１１Ｂは、参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤと比較して、リード最適化抗体７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１及び６Ｄ１０のマウス急性肺炎モデル（ＰＡ１０３菌株，１×ＬＤ９０）において生存率を治療的に向上させる能力を示す。 図１２Ａ～１２Ｂは、単独で、或いは抗生物質であるメロペネム（ＭＥＭ）、トブラマイシン（ＴＯＢ）又はシプロフロキサシン（ＣＩＰ）と組み合わせて投与する時、リード最適化抗体７Ｂ１及び８Ｃ１のマウス腹腔内感染モデル（ＰＡ１０３菌株，３×ＬＤ９０）において生存率を予防的に向上させる能力を示す。 図１３Ａ～１３Ｂは、それぞれ、静脈内投与量が３ｍｇ／ｋｇ又は３０ｍｇ／ｋｇである時、最適化抗体７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１、６Ｄ１０又は参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤのラットにおける薬物動態プロファイルを示す。 図１４Ａ～１４Ｄは、ＥＬＩＳＡによって計測された最適化抗体７Ｂ１の野生型ＰｃｒＶ及び例示的なアミノ酸残基の突然変異を有するＰｃｒＶに対する結合親和性を示す。
本発明の一態様では、抗ＰｃｒＶ抗体を提供する。ｓｃＦｖファージライブラリでのスクリーニング、親和性成熟及び適切にデザインされた生化学と生物学実験の組合せにより、ＰｃｒＶに結合できる効力のある抗体分子を同定し、前記抗体は、赤血球及びＡ５４９細胞の溶解を阻害することができ、また、生体内に緑膿菌に対する治療的及び予防的な保護を提供することができる。本明細書に提供された結果から、既知の抗ＰｃｒＶ抗体Ｍａｂ１６６又はＶ２Ｌ２－ＭＤと比較して、本発明に記載の抗体は、ＰｃｒＶの異なる領域又はエピトープに結合することが分かっており、そして、驚いたことは、様々な生物学実験で、それらが既知の抗ＰｃｒＶ抗体よりも更に効果的であることが明らかになった。
本発明に提供の抗ＰｃｒＶ抗体は、例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体、抗ＰｃｒＶ一本鎖抗体（ｓｃＦｖｓ）、抗ＰｃｒＶ Ｆｃ融合タンパク質、多重特異性（例えば、二重特異性）抗ＰｃｒＶ抗体、抗ＰｃｒＶ免疫結合体などを含む。
本発明の一態様では、シュードモナス菌ＰｃｒＶ上のエピトープに特異的に結合する単離された抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、ここで、前記エピトープは、シュードモナス菌ＰｃｒＶのＧｌｎ１６０、Ａｓｐ１６５、Ａｓｐ１７０、Ａｓｐ１７３、Ｔｈｒ１７５及びＳｅｒ２０２からなる群から選択される１、２、３、４、５又は６つのアミノ酸残基を含む。
本発明は、また、特異的配列を有する抗ＰｃｒＶ抗体、及びこれらの抗体と競合するか、又は同じエピトープに結合する抗体を提供する。
本発明は、また、抗ＰｃｒＶ抗体をコードする核酸、抗ＰｃｒＶ抗体を含む組成物、並びに抗ＰｃｒＶ抗体を調製及び使用する方法を提供する。
定義
本明細書に記載されるように、「治療（ｔｒｅａｔｍｅｎｔ）」又は「治療している（ｔｒｅａｔｉｎｇ）」は、有利的又は所望的な臨床結果を含む結果を得る方法である。本発明の目的に鑑み、前記有利的又は所望的な臨床結果は、疾患による一種又は複数種の症状を緩和すること、疾患の程度を軽減すること、疾患を安定すること（例えば、疾患の悪化を予防又は遅延）、疾患の拡散を予防又は遅延すること（例えば、病原菌の全身拡散）、疾患の再発を予防又は遅延すること、疾患の進みを遅延又は遅らせること、疾患の状態を改善すること、疾患（一部又は全部）を緩和すること、疾患の治療に必要する一種又は複数種の他の薬物の量を減少すること、疾患の進みを遅延すること、生存質量を改善又は向上すること、体重を増加すること、及び／又は生存期間を延長すること、から選択される一種又は複数種を含むが、これらに限定されない。同時に、「治療」は、また、感染症の病理学的結果の減少（例えば、宿主細胞の溶解又は壊死）を含む。本発明の方法は、これらの治療のいずれか１つ又は複数を考慮する。
「予防する（ｐｒｅｖｅｎｔ）」という用語及び「予防した（ｐｒｅｖｅｎｔｅｄ）」、「予防している（ｐｒｅｖｅｎｔｉｎｇ）」、「予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎ）」などのような類似の単語は、疾患又は病症（例えば、病原体の感染）の発生又は再発の可能性を予防、阻害又は減少する方法を示す。それは、さらにある疾患又は病症の発生又は再発を遅延すること、或いはある疾患又は病症の症状の発生又は再発を遅延することを指す。ここで用いられるように、「予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎ）」及び類似の単語は、さらに疾患又は病症の発生又は再発の前にその強度、影響、症状及び／又は負担を軽減することを含む。ここで用いられるように、「予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎ）」及び類似の単語は、さらに疾患又は病症の発生又は再発のリスク及び感受性、例えば病原体の感染を減少することを含む。
「抗体」という用語は、全長の抗体及びその抗原結合性フラグメントを含む。全長の抗体は、重鎖二本及び軽鎖二本を含む。重鎖可変領域及び軽鎖可変領域は、抗原との結合を担当する。二本の鎖における可変領域は、一般的に３つの高度可変ループを含む。そのループは、相補性決定領域（ＣＤＲｓ）と称する（軽鎖（ＬＣ）ＣＤＲｓは、ＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、重鎖（ＨＣ）ＣＤＲｓは、ＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含む。）。本願に記載の抗体又は抗原結合性フラグメントのＣＤＲ境界は、Ｋａｂａｔ、 Ｃｈｏｔｈｉａ又はＡｌ－Ｌａｚｉｋａｎｉの慣例により定義又は認識される（Ａｌ－Ｌａｚｉｋａｎｉ １９９７；Ｃｈｏｔｈｉａ １９８５；Ｃｈｏｔｈｉａ １９８７；Ｃｈｏｔｈｉａ １９８９；Ｋａｂａｔ １９８７；Ｋａｂａｔ １９９１）。重鎖又は軽鎖の３つのＣＤＲ領域は、フレームワーク領域（ＦＲｓ）と称されるフランキング領域の間に挿入され、前記フレームワーク領域（ＦＲｓ）はＣＤＲ領域よりさらに高度な保存性を持ち、高度可変ループを支持する足場を形成する。重鎖の定常領域及び軽鎖の定常領域は、抗原結合に参加しないが、多種の効果機能を示す。抗体は、それらの重鎖の定常領域のアミノ酸配列に基づいて分類される。抗体の５つの主なクラス又はアイソタイプは、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ及びＩｇＭであり、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ及びＩｇＭは、それぞれα、δ、ε、γ及びμ型重鎖を有することを特徴とする。いくつの主なクラスは、サブクラス、例えば、ＩｇＧ１（γ１重鎖）、ＩｇＧ２（γ２重鎖）、ＩｇＧ３（γ３重鎖）、ＩｇＧ４（γ４重鎖）、ＩｇＡ１（α１重鎖ｎ）又はＩｇＡ２（α２重鎖）に分類される。
本明細書に記載されるように、「抗原結合性フラグメント」という用語は、例えば、ダイアボディ（ｄｉａｂｏｄｙ）、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖフラグメント、ジスルフィド安定化Ｆｖフラグメント（ｄｓＦｖ）、（ｄｓＦｖ）２、二重特異性ｄｓＦｖ（ｄｓＦｖ－ｄｓＦｖ’）、ジスルフィド安定化ダイアボディ（ｄｓダイアボディ）、一本鎖抗体（ｓｃＦｖ）、ｓｃＦｖダイマー（二価ダイアボディ）、一つ以上のＣＤＲｓを含む抗体フラグメントからなる多重特異性抗体、単一ドメイン抗体、ナノボディ、ドメイン抗体、二価ドメイン抗体、又は抗原に結合できるが、完全な抗体構造を含まない任意の他の抗体フラグメントを含む抗体フラグメントを指す。抗原結合性フラグメントは、前記抗体フラグメントを含む融合タンパク質をさらに含有する。抗原結合性フラグメントは、親抗体又は親抗体フラグメント（例えば、親ｓｃＦｖ）と同じ抗原に結合できる。いくつかの実施例において、抗原結合性フラグメントは、一つ以上の異なるヒト抗体からのフレームワーク領域に移植された特定のヒト抗体からの一つ以上のＣＤＲｓを含み得る。
本明細書に記載されるように、「エピトープ」という用語は、抗体又は抗体部分に結合する抗原上の特定の原子又はアミノ酸のグループを指す。２つの抗体又は抗体部分が抗原に対する競合的結合を示す場合、それらは、抗原内の同じエピトープに結合し得る。
本明細書に記載されるように、第一抗体は、等モル濃度の第一抗体の存在下で、第二抗体の標的ＰｃｒＶ結合を少なくとも５０％（例えば、少なくとも５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％又は９９％）を阻害する場合、ＰｃｒＶ標的への結合について、第二抗体と「競合する」、またはその逆である。ＰＣＴ刊行物であるＷＯ ０３／４８７３１には、抗体交差競合に基づくハイスループット抗体の「エピトープ分類」の方法が記載されている。
本明細書に記載されるように、「特異的に結合」、「特異的に認識」又は「…にとって特異的である」という用語は、測定可能及び再現可能な相互作用、例えば、生体分子を含む異種分子集団の存在下で標的の存在を決定する標的と抗体との間の結合を指す。例えば、抗体がある標的（エピトープであっても良い）を特異的に認識できるとは、当該抗体と他の標的との結合と比べて、当該抗体と当該標的との結合には、より高い親和性があり、より高い結合力があり、より容易でより長い持続時間があると指す。いくつかの実施例において、抗原を特異的に認識する抗体は、他の標的に対するその結合親和性の少なくとも10倍の結合親和性で、抗原の1つまたは複数の抗原決定基と反応する。
本明細書に記載されるように、「単離された」抗ＰｃｒＶ抗体は、（１）天然に存在するタンパク質とは無関係であり、（２）同じ供給源由来の他のタンパク質を含まなく、（３）異種由来の細胞によって発現され、又は（４）自然界に存在しない抗ＰｃｒＶ抗体を指す。
本明細書に記載されるように、「単離された核酸」という用語は、ゲノム、ｃＤＮＡ又は合成由来の核酸、或いはそれらの組合を指す。その起源によれば、前記「単離された核酸」は、（１）天然に見出された「単離された核酸」におけるポリヌクレオチドの全部又は一部とは無関係であり、（２）天然状態でそれと連結していないポリヌクレオチドと作動可能に連結しており、又は（３）より大きい配列の一部として天然に存在しないものを指す。
本明細書に記載されるように、「ＣＤＲ」又は「相補性決定領域」という用語は、重鎖ポリペプチド及び軽鎖ポリペプチドの可変領域に見出される非連続抗原結合部位を指す。Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２５２：６６０９－６６１６（１９７７）；Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．Ｄｅｐｔ．ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ ａｎｄ Ｈｕｍａｎ Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，「Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ ｉｎｔｅｒｅｓｔ」（１９９１）、Ｃｈｏｔｈｉａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１－９１７（１９８７）、Ａｌ－Ｌａｚｉｋａｎｉ Ｂ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ． Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２７３：９２７－９４８（１９９７）、ＭａｃＣａｌｌｕｍ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２６２：７３２－７４５（１９９６）、Ａｂｈｉｎａｎｄａｎ ａｎｄ Ｍａｒｔｉｎ，Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，４５：３８３２－３８３９（２００８）、Ｌｅｆｒａｎｃ Ｍ．Ｐ．ｅｔ ａｌ．，Ｄｅｖ．Ｃｏｍｐ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，２７：５５－７７（２００３）、及びＨｏｎｅｇｇｅｒ ａｎｄ Ｐｌuｃｋｔｈｕｎ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，３０９：６５７－６７０（２００１）には、既にこれらの特定の領域が説明しており、お互いに比較する場合、これらの定義は、アミノ酸残基の重複又はサブセットを含む。しかしながら、抗体又は移植抗体又はその変異体のＣＤＲに対するあらゆる定義方式は、本明細書に定義及び使用される用語の範囲にあることが意図される。上記参照文献の各々に定義されるＣＤＲを含むアミノ酸残基は、比較として、表１に挙げられる。ＣＤＲ予測アルゴリズム及びインターフェースは、本分野では既知であり、例えば、Ａｂｈｉｎａｎｄａｎ ａｎｄ Ｍａｒｔｉｎ，Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，４５：３８３２－３８３９（２００８）；Ｅｈｒｅｎｍａｎｎ Ｆ．ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，３８：Ｄ３０１－Ｄ３０７（２０１０）；及びＡｄｏｌｆ－Ｂｒｙｆｏｇｌｅ Ｊ．ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，４３：Ｄ４３２－Ｄ４３８（２０１５）を含む文献には、説明がある。本段落に引用された参考文献の内容は、本出願で使用するように、及び本願の１つ又は複数の特許請求の範囲に含めることができるように、全体として本明細書に組み込まる。
「キメラ抗体」という用語は、重鎖及び／又は軽鎖の一部が、特定の種に由来する抗体、又は特定の抗体クラス或いはサブクラスに属する抗体中の対応する配列と同一又は相同であり、こ（れら）の鎖の残りは、他の種に由来する、又は他の抗体クラス或いはサブクラスに属する抗体中の対応する配列と同一又は相同である抗体を指す。そして、このような抗体フラグメントは、本願の生物学的活性を有すればよく（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔｅｎｔ Ｎｏ．４，８１６，５６７；ａｎｄ Ｍｏｒｒｉｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８１：６８５１－６８５５（１９８４）を参照）。
「Ｆｖ」は、インタクトな抗原認識及び結合部位を含む最小の抗体フラグメントである。当該フラグメントは、一つの重鎖可変ドメイン及び一つの軽鎖可変ドメインが緊密な非共有結合で連結されたダイマーである。この二つのドメインの折り畳みから、６つの高度可変ループ（軽鎖及び重鎖にはそれぞれ３つのループ）が生じられ、前記高度可変ループは、抗原結合のためのアミノ酸残基を提供し、抗体に抗原結合特異性を付与する。しかしながら、単一の可変ドメイン（又は抗原特異的な３つのＣＤＲｓのみを含む半分Ｆｖフラグメント）であっても、その親和性がインタクトな結合部位より低いにも関わらず、抗原を認識及び結合する能力を有する。
「ｓＦｖ」又は「ｓｃＦｖ」とも称する「一本鎖Ｆｖ」は、単一のポリペプチド鎖に連結されたＶＨ抗体ドメイン及びＶＬ抗体ドメインを含む抗体フラグメントを指す。いくつかの実施例において、ｓｃＦｖポリペプチドは、ｓｃＦｖが抗原結合の理想的な構造を形成させるための、ＶＨとＶＬとの間の連結ポリペプチドをさらに含む。ｓｃＦｖの概要について、Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ ｉｎ Ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，ｖｏｌ．１１３，Ｒｏｓｅｎｂｕｒｇ ａｎｄ Ｍｏｏｒｅ ｅｄｓ．，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ－Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ｐｐ．２６９－３１５（１９９４）を参照する。
「ダイアボディ（ｄｉａｂｏｄｉｅｓ）」という用語は、短いリンカー（例えば、５～１０残基）を用いてＶＨとＶＬとの間にｓｃＦｖフラグメント（前記段落の内容を参照）を構築することによって調製される小さな抗体フラグメントを指す。これによって、可変ドメインが鎖内対合ではなく、鎖間対合が達成され、２価のフラグメント、つまり二つの抗原結合部位を有するフラグメントが生成される。二重特異性のダイアボディは、二つの「クロスオーバー」ｓｃＦｖフラグメントのヘテロダイマーであり、中では、二つの抗体のＶＨドメイン及びＶＬドメインは、異なるポリペプチド鎖に位置する。ＥＰ ４０４，０９７；ＷＯ９３／１１１６１；Ｈｏｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９０：６４４４－６４４８（１９９３）において、既にダイアボディに対して全面的に説明した。
非ヒト（例えば、げっ歯類）抗体の「ヒト化」形態は、非ヒト抗体に由来する最少の配列を含むキメラ抗体である。ヒト化抗体の大部分は、ヒト免疫グロブリン（レシピエント抗体）であり、レシピエント抗体の超可変領域（ＨＶＲ）に由来する残基は、所望の抗体特異性、親和性及び性能を有する、マウス、ラット、ウサギ又は非ヒト霊長類動物の非ヒト種（ドナー抗体）に由来する超可変領域で置換される。ある特定の場合において、ヒト免疫グロブリンのフレームワーク領域（ＦＲ）における残基は、対応する非ヒト残基で置換される。なお、ヒト化抗体は、レシピエント抗体にもドナー抗体にも存在しない残基を含んでも良い。これらの修飾は、抗体の性能をさらに改善させることができる。通常、ヒト化抗体は、実質的に少なくとも１つ、一般的には２つの可変ドメインを含み、中では全て又は実質的に全ての高度可変ループは、全て非ヒト免疫グロブリンの高度可変ループに対応し、全て又は実質的に全てのフレームワーク領域はヒト免疫グロブリン配列である。ヒト抗体は、任意選択で、免疫グロブリン定常領域（Ｆｃ）の少なくとも一部、典型的にはヒト免疫グロブリンの定常領域も含む。詳細は、Ｊｏｎｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３２１：５２２－５２５（１９８６）；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３３２：３２３－３２９（１９８８）；及びＰｒｅｓｔａ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．２：５９３－５９６（１９９２）を参照すれば良い。
本明細書に同定されるポリペプチド及び抗体配列の「アミノ酸配列同一性百分率（％）」又は「相同性」は、候補配列及び比較しようとするポリペプチド配列における同じアミノ酸残基の占める百分率として定義される。そして、配列を比較した後、配列同一性の一部としてアミノ酸残基のいずれかの保存的置換を考慮する。アミノ酸配列同一性の百分率は、本分野の技術的範囲内の様々な比較方法、例えば、ＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴ－２、ＡＬＩＧＮ、Ｍｅｇａｌｉｇｎ（ＤＮＡＳＴＡＲ）、又はＭＵＳＣＬＥソフトウェアなどの公に利用可能なコンピューター ソフトウェアによって決定することができる。当業者は、比較された配列の全長にわたって最大の比較を達成するために必要な任意のアルゴリズムを含む、測定や比較のための適切なパラメータを決定することができる。しかしながら、本願の目的のために、アミノ酸配列同一性百分率の値は、配列比較コンピュータプログラムＭＵＳＣＬＥ（Ｅｄｇａｒ， Ｒ．Ｃ．， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ３２（５）：１７９２－１７９７， ２００４； Ｅｄｇａｒ， Ｒ．Ｃ．， ＢＭＣ Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ５（１）：１１３， ２００４）を使用して生成されたものである。
「Ｆｃ受容体」又は「ＦｃＲ」という用語は、抗体のＦｃ領域に結合する受容体を説明するために用いられる。いくつかの実施例において、本願に記載されるＦｃＲは、ＩｇＧ抗体（γ受容体の一種）に結合するＦｃＲであり、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ及びＦｃγＲＩＩＩサブクラスの受容体を含み、これらの受容体の対立遺伝子変異体及び選択的スプライシング形態も含む。ＦｃγＲＩＩ受容体は、ＦｃγＲＩＩＡ（活性化受容体）及びＦｃγＲＩＩＢ（阻害受容体）を含む。ＦｃγＲＩＩＡ（活性化受容体）及びＦｃγＲＩＩＢ（阻害受容体）は、類似のアミノ酸配列を有し、主には、細胞質ドメインで、異なるとこるがある。活性化受容体ＦｃγＲＩＩＡは、その細胞質ドメインに免疫受容体チロシン活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）を含む。阻害受容体ＦｃγＲＩＩＢは、その細胞質ドメインに免疫受容体チロシン阻害モチーフ（ＩＴＩＭ）（Ｍ．ｉｎ Ｄａeｒｏｎ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５：２０３－２３４（１９９７）を参照）を含む。前記用語は、同種異型、例えばＦｃγＲＩＩＩＡ同種異型：ＦｃγＲＩＩＩＡ－Ｐｈｅ１５８、ＦｃγＲＩＩＩＡ－Ｖａｌ１５８、ＦｃγＲＩＩＡ－Ｒ１３１及び／又はＦｃγＲＩＩＡ－Ｈ１３１をさらに含む。Ｒａｖｅｔｃｈ ａｎｄ Ｋｉｎｅｔ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ ９：４５７－９２（１９９１）及びＣａｐｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｍｅｔｈｏｄｓ ４：２５－３４（１９９４）；及びｄｅ Ｈａａｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｌａｂ．Ｃｌｉｎ．Ｍｅｄ．１２６：３３０－４１（１９９５）において、ＦｃＲｓに対して説明した。本願におけるＦｃＲとの用語は、将来特定されるＦｃＲｓを含む他のタイプのＦｃＲｓを含有する。ＦｃＲとの用語は、母体ＩｇＧｓの新生児への移行を担当する新生児受容体ＦｃＲｎも含む（Ｇｕｙｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１１７：５８７（１９７６）ａｎｄ Ｋｉｍ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２４：２４９（１９９４））。
「ＦｃＲｎ」という用語は、新生児Ｆｃ受容体（ＦｃＲｎ）を指す。ＦｃＲｎは、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）と構造で類似し、α鎖がβ２ミクログロブリンに非共有結合して構成される。新生児Ｆｃ受容体ＦｃＲｎの複数の機能は、Ｇｈｅｔｉｅ ａｎｄ Ｗａｒｄ（２０００）Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１８，７３９－７６６．において説明されている。ＦｃＲｎは、母親から新生児への免疫グロブリンＩｇＧｓの受動輸送及び血清ＩｇＧレベルの調節において重要な役割を果たす。ＦｃＲｎは、レスキュー受容体として、細胞内及び細胞間で完全な形でエンドサイトーシスされたＩｇＧを結合及び輸送し、デフォルトの分解経路からそれらをレスキューする。
ヒトＩｇＧ Ｆｃ領域の「ＣＨ１ドメイン」は、通常、１１８位のアミノ酸から２１５位のアミノ酸まで延長する（ＥＵ番号付けシステム）。
「ヒンジ領域」は、通常、ヒトＩｇＧ１の２１６位であるＧｌｕから２３０位であるＰｒｏ（Ｂｕｒｔｏｎ，Ｍｏｌｅｃ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２２：１６１－２０６（１９８５））まで延長する範囲と定義される。重鎖間のジスルフィド結合を形成する最初と最後のシステイン残基をＩｇＧ１と同じ位置に配置することにより、他のＩｇＧのアイソタイプのヒンジ領域をＩｇＧ１配列と比較させることができる。
ヒトＩｇＧ Ｆｃ領域の「ＣＨ２ドメイン」は、通常、２３１位のアミノ酸から３４０位のアミノ酸まで延長する。ＣＨ２ドメインは、別のドメインと密接に対合しないという点で独特である。その代わりに、２つのＮ末端で連結された分岐糖鎖は、完全な形態の天然ＩｇＧ分子の２つのＣＨ２ドメインの間に挿入する。糖は、ドメインとドメインとの対合の置換物とすることができ、ＣＨ２ドメインの安定性に寄与すると推測される。Ｂｕｒｔｏｎ， Ｍｏｌｅｃ Ｉｍｍｕｎｏｌ． ２２：１６１－２０６（１９８５）。
「ＣＨ３」ドメインは、Ｆｃ領域内でＣ末端残基からＣＨ２ドメイン（３４１位のアミノ酸から抗体配列のＣ末端まで、通常はＩｇＧの４４６又は４４７位目のアミノ酸残基）まで延長する部分を含む。
「機能性Ｆｃフラグメント」は、天然のＦｃ領域の配列が有する「エフェクター機能」を備える。代表的な「エフェクター機能」は、Ｃ１ｑ結合、補体依存性細胞傷害（ＣＤＣ）、Ｆｃ受容体結合、抗体依存性細胞障害作用（ＡＤＣＣ）、食作用、細胞表面受容体のダウンレギュレーション（例えば、Ｂ細胞受容体；ＢＣＲ）等を含む。このようなエフェクター機能について、通常、Ｆｃ領域と結合ドメイン（例えば、抗体可変ドメイン）との組み合わせを必要とし、本分野で公知の様々な実験方法を利用して評価することができる。
「変化した」ＦｃＲ結合親和性又はＡＤＣＣ活性を有するＩｇＧ Ｆｃ変異体の抗体は、親ポリペプチド、又は天然のＦｃ配列を含むポリペプチドと比較して、そのＦｃＲ結合活性及び／又はＡＤＣＣ活性が増加又は低減されている。ＦｃＲへの「結合が増強」を示すＦｃ変異体は、親ポリペプチド、又は天然のＩｇＧ Ｆｃ配列を含むポリペプチドより、少なくとも一種のＦｃＲに対してより高い親和性（例えば、より低い見かけのＫｄ又はＩＣ５０値）を有する。いくつかの実施例において、結合能力は、親ポリペプチドより、約３倍を増加し、例えば、５、１０、２５、５０、６０、１００、１５０、２００倍、５００倍まで高い、又は結合能力が２５％～１０００％のいずれを向上させる。ＦｃＲへの「結合が低減」を示すＦｃ変異体は、親ポリペプチドより、少なくとも一種のＦｃＲに対してより低い親和性（例えば、より高い見かけのＫｄ又はＩＣ５０値）を有する。親ポリペプチドより、その結合能力が４０％又はその以上を低下させる。
「抗体依存性細胞障害作用」又は「ＡＤＣＣ」は、細胞毒性の一形態であり、分泌されたＩｇが、ある細胞毒性細胞（例えば、ナチュラルキラー細胞（ＮＫ）、好中球及びマクロファージ）に存在するＦｃ受容体（ＦｃＲｓ）に結合し、これらの細胞毒性エフェクター細胞を、抗原を運ぶ標的細胞に特異的に結合させてから、細胞毒素を利用して標的細胞を殺すことを指す。抗体は細胞毒性細胞を「武装」させるのは、その毒性に必要である。ＡＤＣＣを介在する主な細胞型において、ＮＫ細胞はＦｃγＲＩＩＩのみを発現し、単球はＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ及びＦｃγＲＩＩＩを発現する。Ｒａｖｅｔｃｈ ａｎｄ Ｋｉｎｅｔ， Ａｎｎｕ． Ｒｅｖ． Ｉｍｍｕｎｏｌ ９：４５７－９２（１９９１）ページ４６４目のＴａｂｌｅ ３において、造血細胞でのＦｃＲ発現をまとめる。目的の分子のＡＤＣＣ活性を評価するために、イン・ビトロのＡＤＣＣ実験を行うことができ、これは米国特許Ｎｏ．５，５００，３６２又は５，８２１，３３７において説明されている。このような実験に適したエフェクター細胞には、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）及びナチュラルキラー細胞（ＮＫ）が含まれる。選択的に、目的の分子のＡＤＣＣ活性は、イン・ビボで評価してもよく、例えば、Ｃｌｙｎｅｓ ｅｔ ａｌ．ＰＮＡＳ（ＵＳＡ）９５：６５２－６５６（１９９８）に開示された動物モデルにおいて説明されている。
野生型ＩｇＧ Ｆｃを含むポリペプチド又は親ポリペプチドより、変異Ｆｃ領域を含むポリペプチドは、ヒトエフェクター細胞の存在下で、「増強されたＡＤＣＣ活性」を示すか、ＡＤＣＣ効果をより効果的に介在でき、変異Ｆｃ領域を含む前記ポリペプチドは、実験時、野生型ＩｇＧ Ｆｃを含むポリペプチド（又は親ポリペプチド）との量が実質的に同じである場合、イン・ビトロ又はイン・ビトロのいずれの状況でもＡＤＣＣをより効果的に介在できる。通常、このような変異体は、本分野で既知のいずれのイン・ビトロのＡＤＣＣ実験方法で同定し、例えば、ＡＤＣＣの活性を同定する、例えば動物モデル等を使用する実験と方法に用いられる。いくつかの実施例において、このような変異体は、野生型Ｆｃ（又は親ポリペプチド）と比較すると、ＡＤＣＣを介在する効果は、５～１００倍、例えば２５～５０倍が向上する。
「補体依存性細胞傷害」又は「ＣＤＣ」とは、補体の存在下で標的細胞を溶解することを指す。代表的な補体経路の活性化は、補体システムの第一成分（Ｃ１ｑ）と、相同抗原に結合する抗体（適切な構造を持つサブクラス）との結合によって開始される。補体の活性化を評価するために、例えば、Ｇａｚｚａｎｏ－Ｓａｎｔｏｒｏ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｉｍｍｕｎｏｌ． Ｍｅｔｈｏｄｓ ２０２：１６３（１９９６）に説明されるＣＤＣ実験を行っても良い。米国特許Ｎｏ．６，１９４，５５１Ｂ１及びＷＯ９９／５１６４２において、変化したＦｃ領域アミノ酸配列、並びに、増加又は低減されたＣ１ｑ結合能を有するポリペプチド変異体が説明されている。これらの特許刊行物の内容は、引用により、明確に本明細書に組み込まれる。また、Ｉｄｕｓｏｇｉｅ ｅｔ ａｌ． Ｊ． Ｉｍｍｕｎｏｌ． １６４： ４１７８－４１８４（２０００）を参照する。
別に断らない限り、「アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列」は、互いに縮重し、且つ同じアミノ酸配列をコードするすべてのヌクレオチド配列を含む。タンパク質又はＲＮＡをコードするヌクレオチド配列は、イントロンをさらに含んでもよく、例えば、タンパク質をコードするヌクレオチド配列は、いくつかの形態においてイントロンを含む。
「作動可能に連結」という用語は、調節配列と異種ヌクレオチド配列との間の機能的連結を指し、これにより、後者を発現させる。例えば、第１のヌクレオチド配列と第２のヌクレオチド配列が機能的な関係である場合、第１のヌクレオチド配列と第２のヌクレオチド配列は作動可能に連結される。例えば、プロモーターがコード配列の転写又は発現に影響を与える場合、当該プロモーターとコード配列は作動可能に連結される。通常、作動可能に連結されるＤＮＡ配列は連続的であり、必要に応じて、２つのタンパク質コード領域を同じオープンリーディングフレームにおいて連結できる。
「相同性（Ｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓ）」とは、２つのポリペプチド間又は２つの核酸分子間の配列類似性又は配列同一性である。２つの比較される配列の同じ位置が同じ塩基又はアミノ酸モノマーサブユニットである場合、例えば、２つのＤＮＡ分子の同じ位置がいずれもアデニンである場合、２つのＤＮＡ分子はその位置で相同である。２つの配列間の相同性百分率とは、２つの配列において、位置の総数に対する、共有される一致又は相同位置の数の比に１００を掛ける関数である。例えば、２つの配列において、１０つの位置のうち６つが一致又は相同である場合、２つの配列の相同性は６０％である。例えば、ＤＮＡ配列ＡＴＴＧＣＣとＴＡＴＴＧＣの相同性は５０％である。通常、２つの配列を比較する時、最大の相同性を得るために比較を行う。
本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体又は組成物の「有効量」とは、特定の目的を達成するのに十分な量を指す。「有効量」は、経験、及び前記目的に関連する既知の方法によって決定することができる。
「治療有効量」という用語とは、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体又は組成物が個体の疾患又は障害を効果的に「治療」できる使用量を指す。緑膿菌感染の場合、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体又は組成物の治療有効量は、感染の細胞の数を減らし、感染の拡大を阻害（即ち、ある程度で緩和又は好ましくは停止）し、及び／又は感染に関連する１つ以上の症状を緩和することができる量である。感染された場合、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体又は組成物は、緑膿菌の生長を阻害すること及び／又は緑膿菌を殺すことができ、抗ＰｃｒＶ抗体は、細胞増殖抑制性又は細胞毒性があるものであり得る。いくつかの実施例において、治療有効量とは、患者において感染を阻害する量を指す。いくつかの実施例において、治療有効量とは、患者において感染を完全に根絶する量を指す。
本明細書で使用されるように、「薬学的に許容される」又は「薬理学的に適合性のある」とは、生物学的活性がなく、又は他の望ましくない特性を有しない材料であり、例えば、当該材料は、不良な生物効果を引き起こさないように、又は有害な方式で組成物に含まれる他の任意の成分と相互作用しないように、患者に投与される医薬組成物に添加することができる。薬学的に許容される担体又は賦形剤は、好ましくは、毒物学又は製造試験に必要な基準を満たし、及び／又は米国食品医薬品局によって編集された不活性成分ガイドに含まれている。
本明細書に記載の本出願の実施例は、「…からなる」及び／又は「実質的に…からなる」の実施例を含むと理解されるべきである。
本明細書に言及される「約」は、数値又はパラメータであり、当該数値又はパラメータ自体の変体も含む（及び説明する）。例えば、「約Ｘ」に関する説明は、「Ｘ」に対する説明を含む。
本明細書に使用されるように、ある数値又はパラメータでは「ない（ｎｏｔ）」に関する説明は、通常、当該数値又はパラメータ「以外（ｏｔｈｅｒ ｔｈａｎ）」を意味して説明する。例えば、当該方法はＸ型感染の治療には使用できないとは、当該方法が通常、Ｘ型感染以外の種類の治療に使用されると意味する。
別段で明確に説明しない限り、本明細書及び請求の範囲に使用される単数形「一つ」、「一個」及び「当該」は、複数の対象を含む。
抗ＰｃｒＶ抗体
本発明の一態様では、ＰｃｒＶに特異的に結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供する。前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ヒト化抗体、キメラ抗体、マウス抗体、ヒト抗体、及び本明細書に記載の重鎖及び／又は軽鎖ＣＤＲｓを含有する抗体分子を含むが、これらに限定されない。本発明の一態様では、ＰｃｒＶに特異的に結合する単離された抗体を提供する。予想の抗ＰｃｒＶ抗体は、例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体（例えば全長のＩｇＧ１、ＩｇＧ２又はＩｇＧ４）、抗ＰｃｒＶ一本鎖抗体、多重特異性（例えば、二重特異性）抗ＰｃｒＶ抗体、抗ＰｃｒＶ免疫結合体などを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体は、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ(ａｂ)’２、Ｆａｂ’－ＳＨ、一本鎖抗体(ｓｃＦｖ)、Ｆｖフラグメント、ｄＡｂ、Ｆｄ、ナノボディ、ダイアボディ（ｄｉａｂｏｄｙ）又は線状抗体である。いくつかの実施例において、ＰｃｒＶに特異的に結合する抗体とは、ＰｃｒＶに対する抗体の結合親和性が、非標的への結合の結合親和性より少なくとも１０倍以上（例えば、１０、１０２、１０３、１０４、１０５、１０６、又は１０７倍を含む）であることを指す。いくつかの実施例において、非標的とは、ＰｃｒＶの抗原ではないことを指す。結合親和性は、例えば、ＥＬＩＳＡ、蛍光活性化セルソーティング（ＦＡＣＳ）分析、又は放射性免疫沈降分析（ＲＩＡ）などの本分野で既知の方法によって測定することができる。Ｋｄ値は、例えば、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）技術又はバイオレイヤー干渉技術（ＢＬＩ）などの本分野で既知の方法によって測定することができる。
いくつかの実施例において、シュードモナス菌ＰｃｒＶに特異的に結合する前記抗ＰｃｒＶ抗体又は抗原結合性フラグメントは、(ａ)緑膿菌のオプソニン食作用性殺傷(ＯＰＫ)を促進、介在又は増強し、及び／又は(ｂ)III型毒素分泌システムの活性を破壊する。
本明細書では、ヒト配列を含む抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、ヒトＣＤＲ配列を含むヒト重鎖可変ドメイン及び軽鎖可変ドメイン）について詳しく説明しているが、同時に非ヒト抗ＰｃｒＶ抗体も熟慮されている。いくつかの実施例において、非ヒト抗ＰｃｒＶ抗体は、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体のヒトＣＤＲ配列及び非ヒトフレームワーク領域配列を含む。いくつかの実施例において、非ヒトフレームワーク領域配列は、例えば、マウス、ラット、ウサギ、ブタ、ウシ（例えば、ウシ、オウシ、スイギュウ）、シカ、ヒツジ、ヤギ、ニワトリ、ネコ、イヌ、フェレット、霊長類（例えば、コザル、マカク）などの哺乳類動物を含む、本明細書に記載の一種以上のヒトＣＤＲ配列を利用して合成重鎖及び／又は軽鎖可変ドメインを形成するために使用され得る任意の配列を含む。いくつかの実施例において、非ヒト抗ＰｃｒＶ抗体は、本明細書に記載の一種以上のヒトＣＤＲ配列を非ヒトフレームワーク配列（例えば、マウス又はニワトリのフレームワーク配列）に移植することによって産生される抗ＰｃｒＶ抗体を含む。
いくつかの実施例において、例示的なＰｃｒＶタンパク質の完全なアミノ酸配列は、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１を含むか、又はアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１からなる。いくつかの実施例において、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶ上のエピトープに特異的に認識する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶに特異的であり、種交差反応性または他の種類の非シュードモナス菌タンパク質交差反応性を示しない。
いくつかの実施例において、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶにおける線状エピトープに特異的に結合する。いくつかの実施例において、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶにおける非線状エピトープに特異的に結合する。いくつかの実施例において、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶ上のエピトープに特異的に結合し、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１に従って、前記エピトープがシュードモナス菌ＰｃｒＶのＧｌｎ１６０、Ａｓｐ１６５、Ａｓｐ１７０、Ａｓｐ１７３、Ｔｈｒ１７５及びＳｅｒ２０２からなる群から選択される１つ、２つ、３つ、４つ、５つ又は６つのアミノ酸残基を含む。いくつかの実施例において、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶ上のエピトープに特異的に結合し、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１に従って、前記エピトープがシュードモナス菌ＰｃｒＶのＧｌｎ１６０、Ａｓｐ１６５、Ａｓｐ１７０、Ａｓｐ１７３、Ｔｈｒ１７５及びＳｅｒ２０２からなる群から選択される少なくとも２つのアミノ酸残基を含む。いくつかの実施例において、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶ上のエピトープに特異的に結合し、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１に従って、前記エピトープがシュードモナス菌ＰｃｒＶのＧｌｎ１６０、Ａｓｐ１６５、Ａｓｐ１７０、Ａｓｐ１７３、Ｔｈｒ１７５及びＳｅｒ２０２からなる群から選択される少なくとも３つのアミノ酸残基を含む。いくつかの実施例において、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶ上のエピトープに特異的に結合し、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１に従って、前記エピトープがシュードモナス菌ＰｃｒＶのＧｌｎ１６０、Ａｓｐ１６５、Ａｓｐ１７０、Ａｓｐ１７３、Ｔｈｒ１７５及びＳｅｒ２０２からなる群から選択される少なくとも４つのアミノ酸残基を含む。いくつかの実施例において、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶ上のエピトープに特異的に結合し、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１に従って、前記エピトープがシュードモナス菌ＰｃｒＶのＧｌｎ１６０、Ａｓｐ１６５、Ａｓｐ１７０、Ａｓｐ１７３、Ｔｈｒ１７５及びＳｅｒ２０２からなる群から選択される少なくとも５つのアミノ酸残基を含む。いくつかの実施例において、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶ上のエピトープに特異的に結合し、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１に従って、前記エピトープがシュードモナス菌ＰｃｒＶのＧｌｎ１６０、Ａｓｐ１６５、Ａｓｐ１７０、Ａｓｐ１７３、Ｔｈｒ１７５及びＳｅｒ２０２を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、重鎖定常領域及び軽鎖定常領域を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＩｇＧ１型重鎖定常領域を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＩｇＧ２型重鎖定常領域を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＩｇＧ３型重鎖定常領域を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＩｇＧ４型重鎖定常領域を含む。いくつかの実施例において、前記ＩｇＧとは、ヒトＩｇＧを指す。いくつかの実施例において、前記重鎖定常領域は、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７３を含むか、又はアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７３からなる。いくつかの実施例において、前記重鎖定常領域は、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７４を含むか、又はアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７４からなる。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、λ軽鎖定常領域を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、κ軽鎖定常領域を含む。いくつかの実施例において、前記軽鎖定常領域は、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７２を含むか、又はアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７２からなる。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、抗体重鎖可変ドメイン及び抗体軽鎖可変ドメインを含む。
本発明の一態様では、単離された抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、重鎖可変ドメイン(ＶＨ)及び軽鎖可変ドメイン(ＶＬ)を含み、前記ＶＨは、Ｘ１Ｘ２Ｘ３ＭＳ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３９)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＤ又はＳであり、Ｘ２がＹ又はＮであり、Ｘ３がＰ、Ｈ、Ｙ又はＳである重鎖相補性決定領域(ＨＣ－ＣＤＲ)１と、Ｘ１ＩＳＥＳＧＧＳＴＸ２Ｘ３ＡＤＳＶＫＧ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４０)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＧ又はＶであり、Ｘ２がＮ又はＹであり、Ｘ３がＤ又はＹであるＨＣ－ＣＤＲ２と、ＧＲＦＸ１Ｘ２Ｘ３Ｘ４Ｘ５Ｘ６ＦＸ７ＲＡＶＹＧＭＤＶ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＳ又はＣであり、Ｘ２がＴ、Ｇ、Ｄ、Ｙ、Ｑ又はＡであり、Ｘ３がＳ、Ｄ、Ｎ、Ｅ、Ｌ、Ａ又はＹであり、Ｘ４がＳ、Ｔ、Ｙ又はＡであり、Ｘ５がＳ、Ｈ、Ｑ、Ａ、Ｒ、Ｋ、Ｇ、Ｅ、Ｙ又はＤであり、Ｘ６がＨ又はＣであり、Ｘ７がＦ又はＹであるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、ＲＡＳＱＧＩＸ１ＳＹＬＡ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４２)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＳ又はＲである軽鎖相補性決定領域(ＬＣ－ＣＤＲ)１と、ＡＡＳＴＬＱＳ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、ＱＱＬＸ１ＳＹＰＬＸ２(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４３)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＳ、Ｎ又はＫであり、Ｘ２がＳ又はＴであるＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１～８のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個（例えば１個、２個又は３個）のアミノ酸置換を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：９～１４のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個（例えば１個、２個又は３個）のアミノ酸置換を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１５～３１のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個（例えば１個、２個又は３個）のアミノ酸置換を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２若しくは３３又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個（例えば１個、２個又は３個）のアミノ酸の置換を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個（例えば１個、２個又は３個）のアミノ酸の置換を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：３５～３８のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個（例えば１個、２個又は３個）のアミノ酸の置換を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１～８のいずれか１つを含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：９～１４のいずれか１つを含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１５～３１のいずれか１つを含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２又は３３を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：３５～３８のいずれか１つを含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：４８～６４のいずれか１つで示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：６５～７０のいずれか１つで示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：４８～６４のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：４８～６４のいずれか１つと少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：６５～７０のいずれか１つ又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：６５～７０のいずれか１つと少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：４８～６４のいずれか１つを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：６５～７０のいずれか１つを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、全長の抗体である。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＩｇＧ１型定常ドメインを含む。いくつかの実施例において、前記ＩｇＧ１とは、ヒトＩｇＧ１を指す。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＩｇＧ４型定常ドメインを含む。いくつかの実施例において、前記ＩｇＧ４とは、ヒトＩｇＧ４を指す。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体の重鎖定常領域は、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７３を含むか、又はアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７３からなる。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体の重鎖定常領域は、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７４を含むか、又はアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７４からなる。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体の軽鎖定常領域は、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７２を含むか、又はアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７２からなる。
いくつかの実施例において、単離された抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、重鎖可変ドメイン(ＶＨ)及び軽鎖可変ドメイン(ＶＬ)を含み、前記ＶＨは、ＤＸ１Ｘ２ＭＳ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４４)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＮ又はＹであり、Ｘ２がＰ、Ｈ又はＹである重鎖相補性決定領域(ＨＣ－ＣＤＲ)１と、Ｘ１ＩＳＥＳＧＧＳＴＮＹＡＤＳＶＫＧ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４５)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＧ又はＶであるＨＣ－ＣＤＲ２と、ＧＲＦＳＴＸ１ＳＸ２ＨＦＸ３ＲＡＶＹＧＭＤＶ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４６)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＮ、Ｓ、Ｄ又はＬであり、Ｘ２がＳ又はＡであり、Ｘ３がＦ又はＹであるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、ＲＡＳＱＧＩＳＳＹＬＡ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含む軽鎖相補性決定領域(ＬＣ－ＣＤＲ)１と、ＡＡＳＴＬＱＳ(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、ＱＱＬＳＳＹＰＬＸ１(ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４７)又はその変異体を含み、前記変異体が最大約３個のアミノ酸置換を含み、Ｘ１がＳ又はＴであるＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ： ５１で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、如アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６１で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４８又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４８と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４８を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４８で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６６又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６６と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６６を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６６で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５３又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５３と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５３で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５４又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５４と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５４を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５４で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２２を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２２を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２２を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２２を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５５と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５５を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５５で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２３を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２３を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２３を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２３を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２４を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２４を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２４を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２４を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５７と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６８又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６８と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５７を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６８を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５７で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６８で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５８又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５８と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６９又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６９と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５８を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６９を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５８で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：６９で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６１又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６１と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６１を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６１で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１４を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１４を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１４を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１４を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３８を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３８を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と特異的に競合できる抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３８を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、以下のような抗体と同じエピトープに結合する抗ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３８を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２と少なくとも約９０％（例えば、少なくとも９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％）の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７０又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７０と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７０を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２で示されるＶＨに含まれるＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＨＣ－ＣＤＲ３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７０で示されるＶＬに含まれるＬＣ－ＣＤＲ１、ＬＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３を含む。
いくつかの実施例において、競合実験により、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体と競合的にＰｃｒＶに結合するモノクローナル抗体を同定することができる。競合実験は、同じエピトープ又は空間上で重なるエピトープを認識すること、又は１つの抗体が競合的に別の抗体の抗原への結合を阻害することにより、２つの抗体が同じエピトープに結合するかどうかを判断できる。いくつかの実施例において、このような競合的な抗体は、本明細書に記載の抗体と同じエピトープに結合する。いくつかの例示的な競合実験は、例えば、Ｈａｒｌｏｗ ａｎｄ Ｌａｎｅ（１９８８）Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ ｃｈ．１４（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ， Ｎ．Ｙ．）に記載された一般的な実験を含むが、これに限定されない。抗体が結合するエピトープを解析するための詳細な例示的な方法は、例えば、Ｍｏｒｒｉｓ（１９９６）"Ｅｐｉｔｏｐｅ Ｍａｐｐｉｎｇ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ，"ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ｖｏｌ． ６６（Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ， Ｔｏｔｏｗａ， Ｎ．Ｊ．）に記載された通りである。いくつかの実施例において、２つの抗体は、それぞれが５０％以上の他の抗体の結合をブロックする場合、同じエピトープに結合すると考えられる。いくつかの実施例において、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体と競合する抗体は、キメラ抗体、ヒト化抗体、又はヒト抗体である。
例示的な抗ＰｃｒＶ抗体配列は、表２及び表３に示す。当業者は、ＣＤＲの位置を予測し、且つ抗体の軽鎖可変領域及び重鎖可変領域を定義するために、多くの既知のアルゴリズムがあることが知っている。本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体のＣＤＲｓ、ＶＨ配列及び／又はＶＬ配列を含むが、予測アルゴリズムに基づいて以下の表に例示されていない抗体も本発明の範囲内にある。
結合親和性
結合親和性は、Ｋｄ、Ｋｏｆｆ、Ｋｏｎ、又はＫａで表すことができる。本明細書で使用される場合、「Ｋｏｆｆ」との用語は、抗体／抗原複合体からの抗体の解離速度定数を指すことが意図される。「Ｋｏｆｆ」は、キネティックセレクション装置（ｋｉｎｅｔｉｃ ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ｓｅｔ ｕｐ）によって測定される。「Ｋｏｎ」との用語は、抗体が抗原に結合して抗体／抗原複合体を形成する場合の結合速度定数である。本明細書に用いられる場合、平衡解離定数「Ｋｄ」との用語は、特異的抗体－抗原相互作用の解離定数を指し、平衡状態にある抗体分子の溶液中に存在するすべての抗体結合ドメインの半分を占めるために必要な抗原濃度を説明し、Ｋｏｆｆ／Ｋｏｎに等しい。Ｋｄの測定は、全ての結合分子が溶液にあることを前提として行う。抗体が細胞壁と連結する場合、例えば酵母発現系では、対応する解離速度定数は、ＥＣ５０で表し、Ｋｄの適切な近似値を提供する。親和定数Ｋａは、解離定数Ｋｄの逆数である。
平衡解離定数（Ｋｄ）は、抗体部分と抗原との親和性を示す指標として使用される。例えば、各種標識試薬で標識した抗体を使用したＳｃａｔｃｈａｒｄ法や、Ｂｉａｃｏｒｅ（Ａｍｅｒｓｈａｍ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ社製）を用いた表面プラズモン共鳴による生体分子相互作用分析を、取扱説明書や付属のキットに従って行うことにより、容易に分析することができる。。これらの方法で得られたＫｄ値は、Ｍ（Ｍｏｌｓ）を単位として表される。標的に特異的に結合する抗体のＫｄ値は、例えば、≦１０－７Ｍ、≦１０－８Ｍ、≦１０－９Ｍ、≦１０－１０Ｍ、≦１０－１１Ｍ、≦１０－１２Ｍ又は≦１０－１３Ｍでありうる。
抗体の結合特異性は、本分野での既知の方法によって測定することができる。これらの方法は、Ｗｅｓｔｅｒｎ ｂｌｏｔｓ、ＥＬＩＳＡ－、ＲＩＡ－、ＥＣＬ－、ＩＲＭＡ－、ＥＩＡ－、ＢＩＡｃｏｒｅテスト及びペプチドスキャン等を含むが、これらに限定されない。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＰｃｒＶ標的に特異的に結合し、そのＫｄ値は、１０－７Ｍ～１０－１３Ｍ（例えば、１０－７Ｍ～１０－１３Ｍ、１０－８Ｍ～１０－１３Ｍ、１０－９Ｍ～１０－１３Ｍ又は１０－１０Ｍ～１０－１２Ｍ）である。従って、いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体とＰｃｒＶとの間の結合のＫｄ値は、１０－７Ｍ～１０－１３Ｍ、１×１０－７Ｍ～５×１０－１３Ｍ、１０－７Ｍ～１０－１２Ｍ、１０－７Ｍ～１０－１１Ｍ、１０－７Ｍ～１０－１０Ｍ、１０－７Ｍ～１０－９Ｍ、１０－８Ｍ～１０－１３Ｍ、１×１０－８Ｍ～５×１０－１３Ｍ、１０－８Ｍ～１０－１２Ｍ、１０－８Ｍ～１０－１１Ｍ、１０－８Ｍ～１０－１０Ｍ、１０－８Ｍ～１０－９Ｍ、５×１０－９Ｍ～１×１０－１３Ｍ、５×１０－９Ｍ～１×１０－１２Ｍ、５×１０－９Ｍ～１×１０－１１Ｍ、５×１０－９Ｍ～１×１０－１０Ｍ、１０－９Ｍ～１０－１３Ｍ、１０－９Ｍ～１０－１２Ｍ、１０－９Ｍ～１０－１１Ｍ、１０－９Ｍ～１０－１０Ｍ、５×１０－１０Ｍ～１×１０－１３Ｍ、５×１０－１０Ｍ～１×１０－１２Ｍ、５×１０－１０Ｍ～１×１０－１１Ｍ、１０－１０Ｍ～１０－１３Ｍ、１×１０－１０Ｍ～５×１０－１３Ｍ、１×１０－１０Ｍ～１×１０－１２Ｍ、１×１０－１０Ｍ～５×１０－１２Ｍ、１×１０－１０Ｍ～１×１０－１１Ｍ、１０－１１Ｍ～１０－１３Ｍ、１×１０－１１Ｍ～５×１０－１３Ｍ、１０－１１Ｍ～１０－１２Ｍ、１０－１２Ｍ～１０－１３Ｍである。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体とＰｃｒＶとの間の結合のＫｄ値が１０－７Ｍ～１０－１３Ｍである。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体と非標的との間の結合のＫｄ値は、抗ＰｃｒＶ抗体と標的との間のＫｄ値より高く、本明細書に引用のいくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体と標的（例えば、ＰｃｒＶ）との間の結合親和性は、ＰｃｒＶ抗体と非標的との間の結合親和性より高い。いくつかの実施例において、非標的とは、非ＰｃｒＶ抗原を指す。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体（ＰｃｒＶに対して）と非ＰｃｒＶ標的との間の結合のＫｄ値は、抗ＰｃｒＶ抗体と標的ＰｃｒＶとの間の結合のＫｄ値の少なくとも１０倍、例えば、１０～１００倍、１００～１０００倍、１０３～１０４倍、１０４～１０５倍、１０５～１０６倍、１０６～１０７倍、１０７～１０８倍、１０８～１０９倍、１０９～１０１０倍、１０１０～１０１１倍、１０１１～１０１２倍である。
核酸
抗ＰｃｒＶ抗体をコードする核酸分子も含まれる。いくつかの実施例において、本明細書に記載の全長の抗ＰｃｒＶ抗体のいずれかを含む、全長の抗ＰｃｒＶ抗体をコードする核酸（又は核酸のセット）が提供される。いくつかの実施例において、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体の核酸（又は核酸のセット）は、ペプチドタグ（タンパク質精製タグ、Ｈｉｓタグ、ＨＡタグなど）をコードする核酸配列をさらに含み得る。
本明細書では、抗ＰｃｒＶ抗体を含む単離された宿主細胞、抗ＰｃｒＶ抗体のポリペプチド成分をコードする単離された核酸、又は本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体のポリペプチド成分をコードする核酸を含むベクターも含まれる。
本願は、これらの核酸配列の変異体をさらに含む。例えば、変異体は、少なくとも中程度のストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、本願の抗ＰｃｒＶ抗体をコードする核酸配列とハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。
本願は、本願の核酸が挿入されたベクターも提供する。
簡単に言えば、例えば、プロモーター（例えば、リンパ球特異的プロモーター）及び３’非翻訳領域（ＵＴＲ）を含む５’及び３’末端調節エレメントに作動可能に連結されるように、抗ＰｃｒＶ抗体をコードする天然又は合成核酸を適切な発現ベクターに挿入することによって、抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）の発現が達せされ得る。前記ベクターは、真核宿主細胞における複製と組み込みに好適であり得る。典型的なクローニング及び発現ベクターは、目的の核酸配列の発現を調節するために有用な転写及び翻訳ターミネーター、開始配列、及びプロモーターを含む。
本願に記載の核酸は、標準的な遺伝子送達プロトコルを使用することにより、核酸免疫化及び遺伝子治療に使用することもできる。遺伝子送達の方法は、本分野で公知である。例えば、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏｓ．５，３９９，３４６、５，５８０，８５９、５，５８９，４６６を参照し、その全体の内容を引用することにより本明細書に組み込まれる。いくつかの実施例において、本願は、遺伝子治療ベクターをさらに提供する。
核酸は、様々な種類のベクターにクローニングし得る。例えば、核酸は、プラスミド、ファージミド、ファージ誘導体、動物ウイルス及びコスミドを含むベクターにクローニングしうるが、これらに限定されない。特に対象となるベクターは、発現ベクター、複製ベクター、プローブ生成ベクター及び配列決定ベクターを含む。
また、発現ベクターは、ウイルスベクターの形態で細胞に供することができる。ウイルスベクター技術は、本分野で周知であり、例えば、Ｇｒｅｅｎ ａｎｄ Ｓａｍｂｒｏｏｋ（２０１３，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ）、及び他のウイルス学又は分子生物学のハンドブックに記載されている。ベクターとして用いられるウイルスは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス及びレンチウイルスを含むが、これらに限定されない。通常、適切なベクターは、少なくとも一種の生物で機能する複製起点、プロモーター配列、便利な制限エンドヌクレアーゼ部位、及び一つ以上の選択マーカーを含む（例えば、ＷＯ ０１／９６５８４；ＷＯ ０１／２９０５８；及びＵ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．６，３２６，１９３参照）。
哺乳類動物細胞への遺伝子導入のための多くのウイルスに基づくシステムが既に開発されてきた。例えば、レトロウイルスは、遺伝子送達システムに便利なプラットフォームを提供する。選択された遺伝子は、本分野で既知の技術を利用してベクターに挿入され、レトロウイルス粒子に包装される。次いで、組換えウイルスを単離し、イン・ビトロ又はイン・ビボで受験者の細胞へ送達する。多くのレトロウイルスシステムが本分野において既知である。いくつかの実施例において、アデノウイルスベクターを使用する。多くのアデノウイルスベクターが本分野において既知である。いくつかの実施例において、レンチウイルスベクターを使用する。レンチウイルスなどのレトロウイルスから誘導されたベクターは、導入された遺伝子が長期で安定的に整合及びサブセルにおける繁殖を可能にするため、長期的な遺伝子導入を達成するための適切な手段である。レンチウイルスベクターは、非分裂細胞例えば肝細胞を形質導入することができるため、マウス白血病ウイルスなどの腫瘍から誘導されたレトロウイルスよりもさらなる利点を有する。それとともに、レンチウイルスベクターは、低免疫原性とのさらなる利点もある。
エンハンサーなどの他のプロモーターエレメントは、転写初期頻度を調節する。通常、それらは、開始部位の３０－１１０ｂｐ上流の領域に位置するが、最近、多くのプロモーターが開始部位の下流のにも機能要素を含むことが見出されている。プロモーター要素間の間隔は、通常、フレキシブルであるため、要素同士の位置交換又は移動する時に、プロモーターの機能が維持される。チミジンキナーゼ（ｔｋ）プロモーターでは、プロモーターエレメント要素間の間隔は、活性の低下が始まる前に、５０ｂｐまで増加させることができる。
適切なプロモーターの一例は、前初期サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）プロモーター配列である。このプロモーター配列は、それに作動可能に連結された任意のポリヌクレオチド配列の高レベルの発現を駆動することができる、強力な構成的プロモーター配列である。適切なプロモーターの他の例は、伸長成長因子１α（ＥＦ－１α）プロモーターである。しかしながら、他の構成的プロモーターも使用しても良く、それは、シミアンウイルス４０（ＳＶ４０）初期プロモーター、マウス乳腺腫瘍ウイルス（ＭＭＴＶ）、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）ロングターミナルリピート（ＬＴＲ）プロモーター、ＭｏＭｕＬＶプロモーター、家禽白血病ウイルスプロモーター、Ｅｐｓｔｅｉｎ－Ｂａｒｒウイルス前初期プロモーター、ルース肉腫ウイルスプロモーター、及びヒト遺伝子プロモーターを含むが、これらに限定されなく、当該ヒト遺伝子プロモーターは、アクチンプロモーター、ミオシンプロモーター、ヘモグロビンプロモーター及びクレアチンキナーゼプロモーターを含むが、これらに限定されない。また、本願を、構成的プロモーターの使用に限定されるべきではない。誘導性プロモーターも本願の一部として考えられる。誘導性プロモーターを使用することにより、発現が望まれる場合、作動可能に連結されたポリヌクレオチド配列の発現をオンにし、発現が望まれない場合、発現をオフにすることができる分子スイッチが提供される。誘導性プロモーターは、メタロチオネインプロモーター、糖質コルチコイドプロモーター、プロゲステロンプロモーター及びテトラサイクリンプロモーターを含むが、これらに限定されない。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体の発現は、誘導可能である。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体をコードする核酸配列は、本明細書に記載の任意の誘導性プロモーターを含む誘導性プロモーターに作動可能に連結される。
誘導性プロモーター
誘導性プロモーターを使用することにより、発現が望まれる場合、作動可能に連結されたポリヌクレオチド配列の発現をオンにし、発現が望まれない場合、発現をオフにすることができる分子スイッチが提供される。真核細胞に適用する例示的な誘導性プロモーターは、ホルモン調節エレメント（例えば、Ｍａｄｅｒ，Ｓ．ａｎｄ Ｗｈｉｔｅ，Ｊ．Ｈ．（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：５６０３－５６０７を参照）、合成リガンド調節エレメント（（Ｓｐｅｎｃｅｒ，Ｄ．Ｍ．ｅｔ ａｌ（１９９３）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６２：１０１９－１０２４を参照）及び電離放射線調節エレメント（Ｍａｎｏｍｅ，Ｙ．ｅｔ ａｌ．（１９９３）Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ３２：１０６０７－１０６１３；Ｄａｔｔａ，Ｒ．ｅｔ ａｌ．（１９９２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８９：１０１４－１０１５３を参照）を含むが、これらに限定されない。イン・ビボ又はイン・ビトロ哺乳類動物システムに適用する他の例示的な誘導性プロモーターは、Ｇｉｎｇｒｉｃｈ ｅｔ ａｌ．（１９９８）Ａｎｎｕａｌ Ｒｅｖ．Ｎｅｕｒｏｓｃｉ ２１：３７７－４０５を参照する。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を発現するための誘導性プロモーターシステムは、Ｔｅｔシステムである。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を発現するための誘導性プロモーターシステムは、大腸菌由来のｌａｃリプレッサーシステムである。
本願に使用の例示的な誘導性プロモーターシステムは、Ｔｅｔシステムである。当該システムは、Ｇｏｓｓｅｎなど（１９９３）によって説明されたものである。例示的な一例において、目的のポリヌクレオチドは、一つ以上のＴｅｔオペレーター（ＴｅｔＯ）部位を含むプロモーターによって制御される。非活性化状態では、Ｔｅｔリプレッサー（ＴｅｔＲ）がＴｅｔＯ部位に結合し、プロモーターの転写を阻害する。活性化状態では、例えば、テトラサイクリン（Ｔｃ）、無水テトラサイクリン、ドキシサイクリン（Ｄｏｘ）又はその活性類似体などの誘導剤の存在下で、誘導剤は、ＴｅｔＯからのＴｅｔＲの放出を引き起こし、それによって、転写を可能にする。ドキシサイクリンはテトラサイクリン抗生物質ファミリーのメンバーの一つであり、その化学名は１－ジメチルアミノ－２，４ａ，５，７，１２－ペンタヒドロキシ－１１－メチル－４，６－ジオキシ－１，４ａ，１１，１１ａ，１２，１２ａ－ヘキサヒドロテトラエン－３－カルボキサミドである。
一つの実施例において、ＴｅｔＲは、例えば、マウス又はヒト細胞などの哺乳類動物細胞での発現に適用するためにコドン最適化されている。ほとんどのアミノ酸は、遺伝暗号の縮重のために複数のコドンによってコードされており、核酸によってコードされるアミノ酸配列を変更することなく、所与の核酸のヌクレオチド配列の実質的な変化を可能にする。しかしながら、多くの生物体では、コドンを使用する点で異なりがあり、これは「コドンバイアス」（即ち、特定のアミノ酸に対する特定のコドンの使用に対するバイアス）とも呼ばれる。コドンバイアスは、通常、特定のコドンのｔＲＮＡの優勢な種の存在と相関することが多く、これによりｍＲＮＡ翻訳の効率が向上する。従いまして、特定の生物（例えば、原核生物）に由来するコード配列は、コドン最適化を通じて、異なる生物（例えば、真核生物）における改善された発現のために調整され得る。
Ｔｅｔシステムの他の具体的なバリエーションには、以下の「Ｔｅｔ－Ｏｆｆ」及び「Ｔｅｔ－Ｏｎ」システムが含まれる。Ｔｅｔ－Ｏｆｆシステムにおいて、転写はＴｃ又はＤｏｘの存在下で、非活性化である。そのシステムでは、単純ヘルペスウイルス由来のＶＰ１６の強力なトランス活性化ドメインに融合したＴｅｔＲで構成されるテトラサイクリン制御トランス活性化タンパク質（ｔＴＡ）は、テトラサイクリン応答性プロモーターエレメント（ＴＲＥ）の転写制御下に標的核酸の発現を調節する。ＴＲＥは、プロモーター（通常、ヒトサイトメガロウイルスの前初期プロモーターに由来する最小のプロモーター配列）に融合したＴｅｔＯ配列コンカテマーで構成される。Ｔｃ又はＤｏｘが存在しない場合、ｔＴＡはＴＲＥに結合し、標的遺伝子の転写を活性化する。Ｔｃ又はＤｏｘが存在する場合、ｔＴＡはＴＲＥに結合できず、標的遺伝子が発現できない。
逆に、Ｔｅｔ－Ｏｎシステムにおいて、転写は、Ｔｃ又はＤｏｘの存在下で活性化される状態になる。Ｔｅｔ－Ｏｎシステムは、逆テトラサイクリン調節トランス活性化因子ｒｔＴＡに基づいている。ｔＴＡと同様に、ｒｔＴＡは、ＴｅｔＲリプレッサーとＶＰ１６トランス活性化ドメインで構成された融合タンパク質である。しかしながら、ＴｅｔＲのＤＮＡ結合領域における４個のアミノ酸の変化により、ｒｔＴＡの結合特性を変えて、そのｒｔＴＡは、Ｄｏｘが存在する場合、ターゲット導入遺伝子ＴＲＥ内のｔｅｔＯ配列のみを認識できる。従いまして、Ｔｅｔ－Ｏｎシステムでは、ＴＲＥによって調節される標的遺伝子の転写は、Ｄｏｘの存在のみでｒｔＴＡによって活性化することができる。
別の誘導性プロモーターシステムは、大腸菌由来のｌａｃリプレッサーシステムである（Ｂｒｏｗｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃｅｌｌ ４９：６０３－６１２（１９８７）を参照）。Ｌａｃリプレッサーシステムは、ｌａｃオペレーター（ｌａｃＯ）を含むプロモーターに作動可能に連結された目的のポリヌクレオチドの転写を調節することによって機能する。Ｌａｃリプレッサー（ｌａｃＲ）はＬａｃＯに結合し、それによって目的のポリヌクレオチドの転写を防ぐ。目的のポリヌクレオチドの発現は、適切な誘導剤、例えば、イソプロピル－β－Ｄチオガラクトピラノシド（ＩＰＴＧ）によって誘導される。
ポリペプチド又はその一部の発現を評価するために、細胞に導入しようとする発現ベクターは、ウイルスベクターによってトランスフェクト又は感染した細胞集団からの発現細胞の同定及び選択を容易にするために、選択マーカー遺伝子又はレポーター遺伝子、或いはその両方をさらに含み得る。他の一方では、選択マーカーは、単独のＤＮＡフラグメント上に運ばれ、そしてコトランスフェクション実験において使用され得る。選択マーカー遺伝子又はレポーター遺伝子のいずれも、宿主細胞で発現できるように、適切な調節配列に隣接することができる。有用な選択マーカーは、例えば、ｎｅｏ及び類似の遺伝子のような抗生物質耐性遺伝子を含む。
レポーター遺伝子は、潜在的にトランスフェクトされた細胞の同定、及び調節配列の機能評価に用いられる。通常、レポーター遺伝子は、受容体の生物体又は組織に存在しないか、又は受容体の生物体又は組織が発現しない遺伝子であり、そして、レポーター遺伝子は、例えば、酵素活性のような検出しやすい特性を発現するポリペプチドをコードする。レポーター遺伝子の発現は、ＤＮＡが受容体細胞に導入された後の適切な時期に検出される。適切なレポーター遺伝子は、ルシフェラーゼ、β－ガラクトシダーゼ、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ、分泌型アルカリホスファターゼ、又は緑色蛍光タンパク質をコードする遺伝子を含みうる（例えば、Ｕｉ－Ｔｅｌ ｅｔ ａｌ．， ２０００ ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔｅｒｓ ４７９： ７９－８２）。適切な発現システムは公知であり、既知の技術によって調製するか、又は商業的に入手することができる。通常、レポーター遺伝子の最高の発現レベルを示す最小の５’フランキング領域を持つ構築体は、プロモーターとして同定される。このようなプロモーター領域は、レポーター遺伝子に連結され、プロモーター駆動性転写を調節するいくつの物質の能力を評価するために使用できる。
いくつかの実施例において、本明細書に記載のいずれか一つの全長の抗ＰｃｒＶ抗体をコードする核酸を提供する。いくつかの実施例において、前記核酸は、全長の抗ＰｃｒＶ抗体の重鎖及び軽鎖をコードする一つ以上の核酸配列を含む。いくつかの実施例において、前記一つ以上の核酸配列の各核酸配列は単独のベクターに含まれる。いくつかの実施例において、少なくともいくつかの核酸配列は同じベクターに含まれる。いくつかの実施例において、全ての核酸配列は同じベクターに含まれる。ベクターは、例えば、哺乳類動物発現ベクター及びウイルスベクター（例えば、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス及びレンチウイルスに由来するベクター）から選択されることができる。
遺伝子を細胞に導入し、それらを発現させる方法は、本分野では、既知である。発現ベクターの文脈において、ベクターは、本分野の任意の方法によって、哺乳類動物細胞、細菌、酵母、又は昆虫細胞などの宿主細胞に容易に導入することができる。例えば、発現ベクターは、物理的、化学的又は生物学的方法によって宿主細胞に導入することができる。
ポリヌクレオチドを宿主細胞に導入する物理的方法には、リン酸カルシウム沈殿、リポフェクション、遺伝子衝撃、マイクロインジェクション、エレクトロポレーションなどが含まれる。ベクター及び／又は外因性核酸を含む細胞を調製する方法は、本分野で周知である。例えば、Ｇｒｅｅｎ ａｎｄ Ｓａｍｂｒｏｏｋ（２０１３，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ）を参照する。いくつかの実施例において、宿主細胞へのポリヌクレオチドの導入は、リン酸カルシウムトランスフェクションによって行われる。
目的のポリヌクレオチドを宿主細胞に導入する生物学的方法として、ＤＮＡやＲＮＡベクターを用いる方法が挙げられる。ウイルスベクター、特にレトロウイルスベクターは、ヒト細胞などの哺乳類動物細胞に遺伝子を挿入するために最も広く使用されている方法になる。他のウイルスベクターは、レンチウイルス、ポックスウイルス、単純ヘルペスウイルス１型、アデノウイルス、及びアデノ随伴ウイルスに由来しうる。例えば、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏｓ．５，３５０，６７４及び５，５８５，３６２を参照する。
ポリヌクレオチドを宿主細胞に導入するための化学的方法には、高分子複合体、ナノカプセル、ミクロスフェア、磁気ビーズなどのコロイド分散システム、及び水中油型エマルジョン、ミセル、混合ゲルクラスターとリポソームを含む脂質をベースとするシステムが含まれる。イン・ビボ及びイン・ビトロで送達ベクターとして使用される例示的なコロイドシステムは、リポソーム（例えば、人工膜小胞）である。
非ウイルス送達システムを使用する場合、例示的な送達ベクターはリポソームである。脂質製剤を使用して核酸を宿主細胞に導入すること（イン・ビトロ、エクス・ビボ、又はイン・ビボ）が考えられる。他の一方では、前記核酸は、脂質に結合することができる。脂質に結合された核酸は、リポソームの水性内部に包まれ、リポソームの脂質二重層に分散され、リポソーム及びオリゴヌクレオチドに結合する連結分子を介してリポソームに接続され、リポソームに埋め込まれ、リポソームと複合体を形成し、脂質を含む溶液に分散して、脂質と混合し、脂質に結合し、脂質に懸濁し、ミセルに含まれるか又はミセルと混合し、或いは他の方法で脂質に結合し得る。脂質、脂質／ＤＮＡ又は脂質／発現ベクターに関連する組成物は、溶液中で特定の構造に限定されない。例えば、それらは、二重層構造、ミセル、又は「崩壊した」構造で存在し得る。それらは、単純に溶液中に分散させることもでき、不均一なサイズ又は形状の凝集体を形成する可能性がある。脂質は、脂肪物質であり、天然存在又は合成された脂質でありうる。例えば、脂質は、細胞質に自然に存在する脂肪滴と、脂肪酸、アルコール、アミン、アミノアルコール、アルデヒドなどの、長鎖脂肪族炭化水素及びその誘導体を含む一種類の化合物とを含有する。
外因性核酸を宿主細胞に導入するための方法であれ、又は細胞を他の方法で本出願の阻害剤に曝露するための方法であれ、組換えＤＮＡ配列が宿主細胞に存在することを確認するために、様々な実験を行うことができる。このような実験は、例えば、当業者に周知の「分子生物学」実験を含む。例えば、Ｓｏｕｔｈｅｒｎ及びＮｏｒｔｈｅｒｎ ｂｌｏｔｔｉｎｇ、ＲＴ－ＰＣＲ及びＰＣＲ；「生化学」実験、例えば、ある特定のポリペプチドの存在又は不在による検出、免疫学的方法（ＥＬＩＳＡ及びＷｅｓｔｅｒｎ ｂｌｏｔｓ）又は本明細書に記載の実験による同定は、全て本願の範囲に含まれる。
抗ＰｃｒＶ抗体の調製
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、モノクローナル抗体であるか、又はモノクローナル抗体に由来するものである。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、モノクローナル抗体由来のＶＨ及びＶＬドメイン、又はその変異体を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、さらに、モノクローナル抗体由来のＣＨ１及びＣＬドメイン、又はその変異体を含む。モノクローナル抗体は、例えば、ハイブリドーマ法、酵母ディスプレイ法、ファージディスプレイ法、または組換えＤＮＡ法を使用する方法などの本分野で既知の方法を使用して調製することができる。また、例示的な酵母ディスプレイ法及びファージディスプレイ法は、本明細書及び以下の実施例において説明されている。
ハイブリドーマ法では、通常、ハムスター、マウス、又は他の適切な宿主動物を免疫剤で免疫して、免疫剤に特異的に結合する抗体を産生するか、又は産生できるリンパ球を誘導する。また、イン・ビトロでリンパ球を免疫化することができる。免疫剤は、目的のタンパク質のポリペプチド又は融合タンパク質を含み得る。通常、ヒト由来細胞が必要である場合、末梢血リンパ球（ＰＢＬ）が適用され、非ヒト哺乳類動物由来細胞が必要である場合、脾臓細胞又はリンパ節細胞が適用される。リンパ球は、適切な融合剤、例えば、ポリエチレングリコールを使用して不死化細胞株と融合され、ハイブリドーマ細胞を形成する。不死化細胞株は通常、形質転換された哺乳類動物細胞であり、特にげっ歯類、ウシ科、及びヒトの骨髄腫細胞である。通常、ラット又はマウスの骨髄腫細胞株が適用される。ハイブリドーマ細胞は、適切な培地で培養することができ、前記培養基には、未融合の不死化細胞の増殖又は生存を阻害する一種以上の物質が含まれることが好ましい。例えば、親細胞には、ヒポキサンチン－グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ（ＨＧＰＲＴ「又は」ＨＰＲＴ）を欠いている場合、ハイブリドーマ細胞培養培地には通常、ヒポキサンチン、アミノプテリン、及びチミジン（ＨＡＴ培地）が含まれ、当該培養培地は、ＨＧＰＲＴ欠損細胞の増殖を防ぐことができる。
いくつかの実施例において、不死化細胞株は、効率的に融合し、選択された抗体産生細胞によって抗体の安定で高レベルの発現をサポートし、そしてこの細胞は、いくつの培地、例えば、ＨＡＴ培地に感受性がある。いくつかの実施例において、不死化細胞株は、マウス骨髄腫細胞株であり、例えば、当該マウス骨髄腫細胞株は、カリフォルニア州サンディエゴのソーク細胞コレクション及びバージニア州マナッサスのアメリカンタイプカルチャーコレクションから得られる。また、ヒト骨髄腫及びマウス－ヒトハイブリッド骨髄腫細胞株の、ヒトモノクローナル抗体の調製のための使用についても説明されている。
そして、ハイブリドーマ細胞を培養する培地中にポリペプチドに対するモノクローナル抗体が存在するかどうかを測定することができる。ハイブリドーマ細胞によって産生されるモノクローナル抗体の結合特異性は、放射性免疫沈降分析法（ＲＩＡ）又は酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）のような免疫沈降法又はイン・ビトロ結合実験によって決定することができる。このような技術又は分析方法は本分野で既知である。モノクローナル抗体の結合親和性は、例えば、Ｍｕｎｓｏｎ ａｎｄ Ｐｏｌｌａｒｄ， Ａｎａｌ． Ｂｉｏｃｈｅｍ．，１０７：２２０（１９８０）に記載されたＳｃａｔｃｈａｒｄ 解析によって決定することができる。
所望のハイブリドーマ細胞が同定された後、標的クローンを限界希釈法によってサブクローン化し、標準的な方法によって培養することができる。この目的に基づく適切な培地は、例えば、改良されたＥａｇｌｅ培地（ＤＭＥＭ）及びＲＰＭＩ－１６４０を含む。又は、ハイブリドーマ細胞は、哺乳類動物の体内で腹水の形で増殖することができる。
サブクローンによって分泌されるモノクローナル抗体は、例えば、プロテインＡ－セファロース、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析又はアフィニティークロマトグラフィーのような従来の免疫グロブリン精製法によって、培地又は腹水から分離又は精製することができる。
いくつかの実施例において、本明細書に記載の上記のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体では、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、抗体ライブラリー（例えば、ｓｃＦｖ又はＦａｂフラグメントを提示するファージライブラリー）から選択されるクローン化配列を含む。前記クローンは、コンビナトリアルライブラリー中の所望の活性を有する抗体フラグメントをスクリーニングすることによって同定することができる。例えば、本分野において、ファージディスプレイライブラリーを生成し、これらのライブラリーをスクリーニングして、所望の結合特性を有する抗体を得るための様々な方法が知られている。このような方法は、例えば、Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ １７８：１－３７（Ｏ’Ｂｒｉｅｎ ｅｔ ａｌ．，ｅｄ．，Ｈｕｍａｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，Ｎ．Ｊ．，２００１）において説明されている。そして、更に例えば、ＭｃＣａｆｆｅｒｔｙ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３４８：５５２－５５４；Ｃｌａｃｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３５２：６２４－６２８（１９９１）；Ｍａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２２：５８１－５９７（１９９２）；Ｍａｒｋｓ ａｎｄ Ｂｒａｄｂｕｒｙ，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ２４８：１６１－１７５（Ｌｏ，ｅｄ．，Ｈｕｍａｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，Ｎ．Ｊ．，２００３）；Ｓｉｄｈｕ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３３８（２）：２９９－３１０（２００４）；Ｌｅｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３４０（５）：１０７３－１０９３（２００４）；Ｆｅｌｌｏｕｓｅ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １０１（３４）：１２４６７－１２４７２（２００４）；ａｎｄ Ｌｅｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２８４（１－２）：１１９－１３２（２００４）において説明されている。
特定のファージディスプレイ法では、ＶＨ及びＶＬ遺伝子の全ての構成成分をそれぞれポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によりクローンし、ファージライブラリーでランダムに再結合されてから、抗原に結合できるファージをスクリーニングされる。これは、例えば、Ｗｉｎｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１２： ４３３－４５５（１９９４）に記載されている。ファージは、通常ｓｃＦｖフラグメント又はＦａｂフラグメントとして抗体フラグメントをディスプレイする。免疫由来のライブラリーファージは、ハイブリドーマ細胞を構築する必要なしに、免疫原に対する高親和性抗体を提供する。或いは、ナイーブレパートリー（例えば、ヒト由来）をクローンして、何の免疫化せずに複数の非自己抗原及び自己抗原に対する抗体の単一の供給源を提供することができる。これは、例えば、Ｇｒｉｆｆｉｔｈｓ ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ， １２： ７２５－７３４（１９９３）に記載されている。最後に、ナイーブライブラリーは、さらに、幹細胞からの再配列されていないＶ－ｇｅｎｅフラグメントをクローニングし、ランダム配列を含むＰＣＲプライマーを使用してＣＤＲ３高度可変領域をコードし、イン・ビトロで再配列する方法で調製しうる。これは、例えば、Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ａｎｄ Ｗｉｎｔｅｒ，Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ．，２２７：３８１－３８８（１９９２）に記載されている。ヒト抗体ファージライブラリーを説明した特許刊行物は、例えば、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，７５０，３７３、及びＵＳ Ｐａｔｅｎｔ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ Ｎｏｓ． ２００５／００７９５７４、２００５／０１１９４５５、２００５／０２６６０００、２００７／０１１７１２６、２００７／０１６０５９８、 ２００７／０２３７７６４、２００７／０２９２９３６及び２００９／０００２３６０を含む。
前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ファージディスプレイを適用して、ライブラリーにおける標的ＰｃｒＶに特異的に結合できる抗ＰｃｒＶ抗体の部分をスクリーニングして調製することができる。当該ライブラリーは、ヒトｓｃＦｖファージディスプレイライブラリーであり得、少なくとも１×１０９（例えば、少なくとも１×１０９、２．５×１０９、５×１０９、７．５×１０９、１×１０１０、２．５×１０１０、５×１０１０、７．５×１０１０又は１×１０１１）種の多様性を有する特定のヒト抗体フラグメントである。いくつかの実施例において、前記ライブラリーは、健康な受験者のヒトＰＭＢＣｓ及び脾臓から抽出されたＤＮＡで構築されたヒト天然ライブラリーであり、全てのヒト重鎖及び軽鎖サブファミリーを含む。いくつかの実施例において、前記ライブラリーは、様々な疾患の患者、例えば、自己免疫疾患の患者、がんの患者、及び感染性疾患の患者から単離されたＰＭＢＣｓから抽出されたＤＮＡで構築されたヒト天然ライブラリーである。いくつかの実施例において、前記ライブラリーは、半合成のヒトライブラリーであり、ここで、重鎖ＣＤＲ３が完全にランダムであり、全てのアミノ酸（システインを除く）が同じ確率で任意の所定の位置に存在する（例えば、Ｈｏｅｔ，Ｒ．Ｍ．ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２３（３）：３４４－３４８，２００５を参照）。いくつかの実施例において、半合成のヒトライブラリーの重鎖ＣＤＲ３の長さは、５から２４個（例えば、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３又は２４）のアミノ酸の長さである。いくつかの実施例において、前記ライブラリーは、全合成のファージディスプレイライブラリーである。いくつかの実施例において、前記ライブラリーは、非ヒトファージディスプレイライブラリーである。
標的ＰｃｒＶに対して高い親和性を有するファージクローンは、標的ＰｃｒＶへのファージの反復結合によってスクリーニングすることができ、前記標的ＰｃｒＶは、固体支持体（例えば、溶液パニング（Ｐａｎｎｉｎｇ）に用いるビーズ又は細胞パニングに用いる哺乳類動物細胞）に結合し、そして結合されていないファージを除去し、特異的に結合されたファージを溶出する。続いて、結合されたファージクローンを溶出し、適切な宿主細胞、例えばＥ．ｃｏｌｉ ＸＬ１－Ｂｌｕｅに対する感染に用いられ、発現及び精製をする。特異的にＰｃｒＶに結合するファージクローンを濃縮するように、溶液パンニング、細胞パンニング、又は両方の組み合わせなどの複数ラウンドのパンニング（例えば、２、３、４、５、６又はそれ以上の任意のラウンド）を行っても良い。濃縮されたファージクローンの、標的ＰｃｒＶへの特異的結合は、例えば、ＥＬＩＳＡ及びＦＡＣＳを含む、本分野で既知の任意の方法によって検出することができる。
モノクローナル抗体は、例えば、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔｅｎｔ Ｎｏ．４，８１６，５６７に記載された組換えＤＮＡ法によっても調製できる。本願に記載のモノクローナル抗体をコードするＤＮＡは、従来の方法（例えば、マウス抗体の軽鎖及び重鎖をコードする遺伝子に特異的に結合するオリゴヌクレオチドプローブ）によって容易に単離及び配列決定することができる。前記のようなハイブリドーマ細胞又は本願のＰｃｒＶ特異的ファージクローンは、このＤＮＡの供給源とすることができる。単離した後、ＤＮＡを発現ベクターに入れ、そして、当該ベクターを、例えば、シミアン（Ｓｉｍｉａｎ）ＣＯＳ細胞、チャイニーズハムスター卵巣がん（ＣＨＯ）細胞、又は免疫グロブリンを産生しない骨髄腫細胞のような宿主細胞にトランスフェクトして、組換え宿主細胞内で合成されたモノクローナル抗体を得る。前記ＤＮＡは、修飾されてもよく、例えば、コード配列でヒト重鎖及び軽鎖定常ドメインを置換し、及び／又はフレームワーク領域で相同な非ヒト配列を置換し（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔｅｎｔ Ｎｏ．４，８１６，５６７；Ｍｏｒｒｉｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，ｓｕｐｒａ）、又は、共有結合で免疫グロブリンのコード配列における非免疫グロブリンポリペプチドのコード配列の全部又は一部を連結する。この非免疫グロブリンポリペプチドは、本願の抗体の定常ドメインを置換することができ、又は本願の抗体の可変ドメイン内の抗原結合部位を置換し、キメラ二価抗体を形成することができる。
前記抗体は一価抗体であり得る。一価抗体を調製する方法は当分野で既知である。例えば、免疫グロブリン軽鎖及び修飾された重鎖の組換に関する発現法である。通常、重鎖が互いに架橋するのを防ぐために、重鎖がＦｃ領域の任意の位置で短く切られる。また、架橋を防ぐために、関連するシステイン残基が他のアミノ酸残基に置換又は削除される。
インビトロ法は、一価抗体の調製にも適用される。抗体を消化して抗体フラグメント、特にＦａｂフラグメントを生成するのは、本分野で知られている任意の方法で達成することができる。
所望の結合特異性（抗体－抗原結合部位）を有する抗体可変ドメインは、免疫グロブリン定常ドメインと融合できる。好ましくは、ヒンジ、ＣＨ２及びＣＨ３領域の少なくとも一部を含む免疫グロブリン重鎖定常ドメインと融合される。いくつかの実施例において、軽鎖結合に必要な部位を含む第１の重鎖定常領域（ＣＨ１）は、少なくとも一種の融合物中に存在する。免疫グロブリン重鎖融合物および所望により免疫グロブリン軽鎖をコードするＤＮＡを、別個の発現ベクターに挿入し、適切な宿主生物に同時トランスフェクトする。
完全ヒト抗体及びヒト化抗体
前記抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）は、ヒト化抗体又は完全ヒト抗体であり得る。非ヒト（マウスなど）抗体部分のヒト化形態は、キメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖又はそれらのフラグメント（例えばＦｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、ｓｃＦｖ又は抗体のその他の抗原結合サブ配列）であり、これは、通常、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小の配列を含む。ヒト化抗体は、ヒト免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖又はそのフラグメント（レシピエント抗体）を含み、ここで、受容体ＣＤＲからの残基が、例えば、マウス、ラット、又はウサギのＣＤＲなどの、所望な特異性、親和性及び性能を持つ非ヒト（ドナー抗体）のＣＤＲ残基によって置換される。いくつかの実施例において、ヒト免疫グロブリンＦｖフレームワーク領域の残基は、対応する非ヒト残基に置換される。ヒト化抗体は、レシピエント抗体に属しなく、導入されたＣＤＲ又はフレームワーク領域の配列にも存在しないアミノ酸残基をさらに含み得る。通常、ヒト化抗体は、少なくとも１つ、通常は２つの可変ドメインを含み、可変ドメインにおいて、全て又は実質的に全てのＣＤＲ領域が非ヒト免疫グロブリンのＣＤＲ領域に対応し、全て又は実質的に全てのフレームワーク領域がヒト免疫グロブリンコンセンサス配列である。
通常、ヒト化抗体は、非ヒトから導入された１つ以上のアミノ酸残基を含む。これらの非ヒトアミノ酸残基は、通常、「インポート」残基と呼ばれ、通常、「インポート」可変ドメインに由来する。いくつかの実施例において、ヒト化は、実質的にＷｉｎｔｅｒと彼の同僚の以下の方法（Ｊｏｎｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３２１：５２２－５２５（１９８６）；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３３２：３２３－３２７（１９８８）；Ｖｅｒｈｏｅｙｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２３９：１５３４－１５３６（１９８８））に従って実行し、げっ歯類動物のＣＤＲｓ又はＣＤＲ配列でヒト化抗体の対応する配列を置換する。従って、このような「ヒト化」抗体部分（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔｅｎｔ Ｎｏ．４，８１６，５６７）は、実質的に完全のヒト化抗体より不完全であって、その可変ドメインは、既に非ヒト化に由来する対応する配列に置換された。実際には、ヒト化抗体部分は、典型的には、いくつかのＣＤＲ残基及び可能のいくつかのフレームワーク領域の残基が、げっ歯類抗体の類似部位からの残基によって置換されているヒト抗体部分である。
完全ヒト抗体は、ヒト化の代替形の一つである。例えば、現在、免疫化後、内因性免疫グロブリンを産生せずに、完全な完全ヒト抗体ライブラリーを生成することができる通常遺伝子改変動物（例えば、マウス）を作製することができる。例えば、キメラ及び生殖細胞突然変異マウスにおいて、抗体重鎖結合領域（ＪＨ）遺伝子のホモ接合体の欠失は、完全に、内因性抗体の産生を阻害することが報告された。ヒト生殖細胞株免疫グロブリン遺伝子アレイをこのような生殖細胞突然変異マウスに移して、抗原刺激下で完全ヒト抗体を産生することができる。例えば、ａｋｏｂｏｖｉｔｓ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ ＵＳＡ，９０：２５５１（１９９３）；Ｊａｋｏｂｏｖｉｔｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３６２：２５５－２５８（１９９３）；Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｙｅａｒ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌ．，７：３３（１９９３）；Ｕ．Ｓ． Ｐａｔｅｎｔ Ｎｏｓ．５，５４５，８０６，５，５６９，８２５，５，５９１，６６９；５，５４５，８０７；及びＷＯ９７／１７８５２を参照する。又は、完全ヒト抗体は、ヒト免疫グロブリン遺伝子座を遺伝子改変動物に導入すること（例えば、内因性免疫グロブリン遺伝子が部分的又は完全にサイレンシングされたマウス）によって調製することができる。刺激されると、完全ヒト抗体の産生は、遺伝子の再配列、組み立て、抗体ライブラリーを含むあらゆる面で、ヒトでの産生と非常に類似することが分かる。この方法は、例えば、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔｅｎｔ Ｎｏｓ．５，５４５，８０７；５，５４５，８０６；５，５６９，８２５；５，６２５，１２６；５，６３３，４２５；ａｎｄ ５，６６１，０１６，ａｎｄ Ｍａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，１０：７７９－７８３（１９９２）；Ｌｏｎｂｅｒｇ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３６８：８５６－８５９（１９９４）；Ｍｏｒｒｉｓｏｎ，Ｎａｔｕｒｅ，３６８：８１２－８１３（１９９４）；Ｆｉｓｈｗｉｌｄ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，１４：８４５－８５１（１９９６）；Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒ，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，１４：８２６（１９９６）；Ｌｏｎｂｅｒｇ ａｎｄ Ｈｕｓｚａｒ，Ｉｎｔｅｒｎ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１３：６５－９３（１９９５）において説明されている。
完全ヒト抗体は、イン・ビトロでＢ細胞を活性化することによって（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔｅｎｔｓ ５，５６７，６１０及び５，２２９，２７５を参照）、又はファージディスプレイライブラリーを含む本分野で既知の様々な技術を使用することによっても生成される。Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ａｎｄ Ｗｉｎｔｅｒ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２２７：３８１（１９９１）；Ｍａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２２２：５８１（１９９１）．Ｃｏｌｅ ｅｔ ａｌ．及びＢｏｅｒｎｅｒ ｅｔ ａｌ．等の技術も、完全ヒトモノクローナル抗体の調製に用いられる。Ｃｏｌｅ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ａｎｄ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ，Ａｌａｎ Ｒ．Ｌｉｓｓ，ｐ．７７（１９８５）ａｎｄ Ｂｏｅｒｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１４７（１）：８６－９５（１９９１）を参照する。
抗ＰｃｒＶ抗体変異体
いくつかの実施例において、本明細書に提供の抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）のアミノ酸配列の変異体も含まれる。例えば、抗体の結合親和性及び／又は他の生物学的活性を改善することが望ましい場合がある。抗体のアミノ酸配列変異体は、抗体をコードするヌクレオチド配列に適切な修飾を導入することによって、又はペプチド合成によって調製することができる。そのような修飾は、例えば、抗体のアミノ酸配列中の残基の欠失及び／又は挿入及び／又は置換を含む。最終的な構築は、抗原結合性などの所望の特性を有させるように、アミノ酸残基の欠失、挿入、及び置換の任意の組み合わせによって完了することができる。
いくつかの実施例において、１つ以上のアミノ酸置換を有する、抗ＰｃｒＶ抗体変異体を提供する。置換された突然変異の目的の部位は、高可変ドメイン（ＨＶＲｓ）及びフレームワーク領域（ＦＲｓ）を含む。標的抗体にアミノ酸置換を導入し、目的の活性（例えば、改善された生物活性、保持／改善された抗原結合能、低減された免疫原性、又は改善された緑膿菌のような病原菌のオプソニン食作用性殺傷（ＯＰＫ））がある製品をスクリーニングし得る。
保存的置換は、以下の表４に示す。
側鎖の性質により、アミノ酸を異なる種類に分ける。
ａ、疎水性アミノ酸：ノルロイシンノルロイシンＮｏｒｌｅｕｃｉｎｅ、メチオニンＭｅｔ、アラニンＡｌａ、バリンＶａｌ、ロイシンＬｅｕ、イソロイシンＩｌｅ；
ｂ、中性親水性アミノ酸：システインＣｙｓ、セリンＳｅｒ、スレオニンＴｈｒ、アスパラギンＡｓｎ、グルタミンＧｌｎ；
ｃ、酸性アミノ酸：アスパラギン酸Ａｓｐ、グルタミン酸Ｇｌｕ；
ｄ、塩基性アミノ酸：ヒスチジンＨｉｓ、リジンＬｙｓ、アルギニンＡｒｇ；
ｅ、鎖の方向に影響を与えるアミノ酸：グリシンＧｌｙ、プロリンＰｒｏ；
ｆ、芳香族アミノ酸：トリプトファンＴｒｐ、チロシンＴｙｒ、フェニルアラニンＰｈｅ。
非保存的アミノ酸の置換には、上記の一種類から別の種類への置換が含まれる。
例示的な置換変異体は、例えば、ファージディスプレイに基づく親和性成熟技術によって産生される、親和性成熟抗体である。要するに、１つ以上のＣＤＲ残基を突然変異させ、変異体抗体がファージ上に部分的にディスプレイされ、特定の生物学的活性（例えば、ＲＢＣ細胞溶解阻害実験に基づく生物学的活性又は結合親和性）を有する変異体をスクリーニングする。ＲＢＣ細胞溶解阻害実験に基づく生物学的活性又は結合親和性を得るように、ＨＶＲｓ領域に変更（例えば、置換）を行うことができる。このような変更は、ＨＶＲの「ホットスポット領域」、つまり体細胞の成熟中に高頻度の突然変異が起こったコドンによってコードされる残基（例えば、Ｃｈｏｗｄｈｕｒｙ，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２０７：１７９－１９６（２００８）を参照）、及び／又は特異性決定残基（ＳＤＲｓ）で行われ、得られた変異体ＶＨ及びＶＬの結合親和性を測定する。二次ライブラリーの構築及び再選択による親和性成熟は、いくつかの文献に記載されている。例えば、Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ｅｔ ａｌ． ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ １７８：１－３７（Ｏ’Ｂｒｉｅｎ ｅｔ ａｌ．， ｅｄ．， Ｈｕｍａｎ Ｐｒｅｓｓ， Ｔｏｔｏｗａ， ＮＪ，（２００１））。
いくつかの親和性成熟の実施例において、様々な方法（例えば、Ｅｒｒｏｒ Ｐｒｏｎｅ ＰＣＲ、チェーンシャッフリング又はオリゴヌクレオチド特異的突然変異誘発）のいずれかによって、多様性を選択される、親和性成熟に用いられる可変遺伝子に導入する。そして、二次ライブラリーを作成する。当該ライブラリーに対してスクリーニングして、所望の親和性を有する抗体変異体を同定する。もう一つの方法は、ＨＶＲが介在する多様性の導入の方法を含み、ここでは、いくつかのＨＶＲ残基（例えば、一回に４～６つの残基）がランダム化される。抗原結合に関与するＨＶＲ残基は、特異的に同定され、例えば、アラニンスキャニングによって変異誘発又はモデリングする。通常、ＣＤＲ－Ｈ３及びＣＤＲ－Ｌ３領域は特に重要な標的である。
いくつかの実施例において、置換、挿入、又は欠失は、１つ以上のＨＶＲ内で起こる可能性があり、このような変化が抗体の抗原への結合能力を実質的に低下させなければよい。例えば、結合親和性を実質的に低下させない保存的変化（例えば、本明細書で言及される保存的置換）は、ＨＶＲｓにおいて生成される。これらの変化は、ＨＶＲの「ホットスポット領域」又はＳＤＲ領域以外で発生する可能性がある。上記に提供された変異体ＶＨ及びＶＬ配列のいくつかの実施例において、各ＨＶＲは変化しないか、又は１つ、２つ、もしくは３つ以下のアミノ酸置換を含む。
Ｃｕｎｎｉｎｇｈａｍ ａｎｄ Ｗｅｌｌｓ（１９８９）Ｓｃｉｅｎｃｅ， ２４４：１０８１－１０８５に記載されているように、抗体から、標的突然変異されうるアミノ酸残基又は領域を同定できる有用な方法は、「アラニンスキャニング突然変異」と呼ばれる。当該方法では、標的残基における１つ又は１つのグループ（例えば、アルギニン、アスパラギン酸、ヒスチジン、リジン及びグルタミン酸などの荷電残基）は、中性、又は負に荷電したアミノ酸（例えば、アラニン又はポリアラニン）より置換されて、抗体と抗原の間の相互作用が影響を受けるかどうかを決定する。アミノ酸の位置に置換をさらに導入して、その位置が最初の置換に対して機能的感受性があることを証明することができる。あるいは／さらに、抗原－抗体複合体の結晶構造によって、抗体と抗原との間の接触部位を同定することができる。これらの接触部位に位置する残基及び隣接する残基は、置換候補体として標的化又は削除することができる。変異体をスクリーニングして、所望の性質を持っているかどうかを判定する。
アミノ酸配列の挿入は、アミノ末端及び／又はカルボキシル末端に、長さが１個の残基から１００個以上の残基を含むポリペプチドを融合することを含み、さらに、配列に１個以上の残基を挿入することも含む。末端挿入の例として、Ｎ末端にメチオニル残基を有する抗体を含む。他の抗体分子の挿入変異体は、抗体分子のＮ末端又はＣ末端に酵素（例えば、ＡＤＥＰＴ）、又は抗体の血清半減期を増加させるポリペプチドを融合することを含む。
Ｆｃ領域変異体
いくつかの実施例において、１つ以上のアミノ酸修飾は、本明細書に記載の抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体又は抗ＰｃｒＶ抗体融合タンパク質）のＦｃ領域に導入され、それにより、Ｆｃ領域変異体が生成される。いくつかの実施例において、Ｆｃ領域変異体は、ＡＤＣＣエフェクター機能が増強されており、これは、通常、Ｆｃに結合する受容体（ＦｃＲｓ）に関連する。いくつかの実施例において、Ｆｃ領域変異体は、低減されたＡＤＣＣエフェクター機能を有する。Ｆｃ配列の変化又は突然変異によってそのエフェクター機能に影響を与える例がたくさんあり、例えば、ＷＯ００／４２０７２及びＳｈｉｅｌｄｓ ｅｔ ａｌ．Ｊ Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．９（２）：６５９１－６６０４（２００１）において、ＦｃＲｓとの結合を増強又は低減することに関連する抗体変異体を記載された。この刊行物の内容は、引用により本明細書に組み込まれる。
抗体依存性細胞障害作用（ＡＤＣＣ）は、腫瘍細胞に対する治療用抗体の作用メカニズムである。ＡＤＣＣは、細胞が介在する免疫防御であり、標的細胞膜の表面の抗原が特定の抗体（例えば、抗ＰｃｒＶ抗体）によって結合されると、免疫システムのエフェクター細胞が自発に標的細胞（例えば、感染された細胞）を溶解する。通常、ＡＤＣＣ効果は、抗体によって活性化されたＮＫ細胞に関わる。ＮＫ細胞は、Ｆｃ受容体ＣＤ１６を発現する。当該受容体は、標的細胞の表面に結合する抗体分子のＦｃ部分を認識して結合する。ＮＫ細胞の表面で最も一般的なＦｃ受容体は、ＣＤ１６又はＦｃγＲＩＩＩである。Ｆｃ受容体と抗体Ｆｃ領域との結合は、ＮＫ細胞の活性化を引き起こし、細胞溶解粒子が放出させ、続いて標的細胞がアポトーシスする。
いくつかの実施例において、本願は、また、全部ではなく一部のエフェクター機能を有するＦｃ領域を含む抗ＰｃｒＶ抗体変異体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体変異体）に関し、これにより、体内で延長された半減期を有するが、特定のエフェクター機能（例えば、ＣＤＣ又はＡＤＣＣ）は必須でなく、又は有害であり、本願では、このような抗ＰｃｒＶ抗体が理想的な候補である。イン・ビトロ及び／又はイン・ビボで細胞毒性試験を実施することにより、ＣＤＣ及び／又はＡＤＣＣ活性の低下／消耗を確認する。例えば、Ｆｃ受容体（ＦｃＲ）結合試験によって、抗体のＦｃγＲ結合能力が欠如する（これによって、ＡＤＣＣ活性が欠如する可能性がある）が、ＦｃＲｎ結合能力を依然として保持していることを確認する。ＡＤＣＣを介在する主な細胞において、ＮＫ細胞はＦｃγＲＩＩＩのみを発現し、単球はＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ及びＦｃγＲＩＩＩを発現する。Ｒａｖｅｔｃｈ ａｎｄ Ｋｉｎｅｔ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ ９：４５７－４９２（１９９１）ページ４６４目のＴａｂｌｅ ３において、造血細胞でのＦｃＲ発現をまとめる。イン・ビトロで標的分子のＡＤＣＣ活性を評価する非限定的な実例は、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，５００，３６２において説明されている（例えば、Ｈｅｌｌｓｔｒｏｍ，Ｉ．ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８３：７０５９－７０６３（１９８６））及びＨｅｌｌｓｔｒｏｍ，Ｉ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８２：１４９９－１５０２（１９８５）；Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．５，８２１，３３７（ｓｅｅ Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎ，Ｍ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１６６：１３５１－１３６１（１９８７）を参照）。また、非放射性検出法を使用しても良い（例えば、ＡＣＴＩTMフローサイトメトリー非放射性細胞毒性試験（ＣｅｌｌＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．Ｍｏｕｎｔａｉｎ Ｖｉｅｗ， Ｃａｌｉｆ．）及びＣＹＴＯＴＯＸ ９６TM非放射性細胞毒性試験（Ｐｒｏｍｅｇａ， Ｍａｄｉｓｏｎ， Ｗｉｓ．）を参照）。このような実験に使用された効果細胞は、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）及びナチュラルキラー細胞（ＮＫ）を含む。また、Ｃｌｙｎｅｓ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９５：６５２－６５６（１９９８）に記載されたように、目的の分子のＡＤＣＣ活性は、体内、例えば動物モデルで試験される。同時に、Ｃ１ｑ結合試験を実行することによって、抗体がＣ１ｑに結合できず、ＣＤＣ活性が欠如ことを確認できる。例えば、ＷＯ２００６／０２９８７９及びＷＯ２００５／１００４０２におけるＣ１ｑ及びＣ３ｃ結合ＥＬＩＳＡを参照する。補体活性化の状況を評価するために、ＣＤＣ測定を行う（例えば、Ｇａｚｚａｎｏ－Ｓａｎｔｏｒｏ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２０２：１６３（１９９６）；Ｃｒａｇｇ，Ｍ．Ｓ．ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ １０１：１０４５－１０５２（２００３）；及びＣｒａｇｇ，Ｍ．Ｓ．ａｎｄ Ｍ．Ｊ．Ｇｌｅｎｎｉｅ，Ｂｌｏｏｄ １０３：２７３８－２７４３（２００４）を参照）。本分野で既知の方法を使用して、ＦｃＲｎ結合及びイン・ビボでのクリアランス／半減期を測定する（例えば、Ｐｅｔｋｏｖａ，Ｓ．Ｂ．ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｔ’ｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１８（１２）：１７５９－１７６９（２００６）を参照）。
低減されたエフェクター機能を有する抗体は、Ｆｃ領域の残基２３８、２６５、２６９、２７０、２９７、３２７及び３２９位で１つ以上の残基が置換されるものを含む（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．６，７３７，０５６）。これらのＦｃ変異体は、２６５、２６９、２７０、２９７及び３２７位で２つ以上の残基が置換されたＦｃ変異体を含み、２６５及び２９７位残基がアラニンに置換された「ＤＡＮＡ」と呼ばれるＦｃ変異体を含む（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．７，３３２，５８１）。
このような、ＦｃＲｓとの結合能力の向上又は低減に関連する抗体変異体は既に記載されている（例えば、Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．６，７３７，０５６；ＷＯ ２００４／０５６３１２及びＳｈｉｅｌｄｓ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ９（２）：６５９１－６６０４（２００１）を参照）。
いくつかの実施例において、Ｆｃ領域の変更は、オプソニン作用の変更（すなわち、向上又は低下）をもたらし、Ｍｏｏｒｅ ｅｔ ａｌ．， ＭＡｂｓ． ２(２)：１８１－１８９(２０１０)に記載されているものを参照する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）変異体に関し、それは、１個以上のアミノ酸置換を有するＦｃ領域変異体を含み、半減期を延長できたり、Ｆｃ受体（ＦｃＲｎ）との結合を増強できる。半減期を延長でき、又はＦｃＲｎ結合を改善できる抗体は、ＵＳ２００５／００１４９３４Ａ１（Ｈｉｎｔｏｎ等）において記載されている。これらの抗体Ｆｃ領域は、１個以上のアミノ酸が置換され、Ｆｃ領域とＦｃＲｎとの結合を増強する。これらのＦｃ変異体は、Ｆｃ領域において、２３８、２５６、２６５、２７２、２８６、３０３、３０５、３０７、３１１、３１２、３１７、３４０、３５６、３６０、３６２、３７６、３７８、３８０、３８２、４１３、４２４又は４３４位の残基が１個以上置換されたもの、例えば、Ｆｃ領域の４３４位残基が置換されたもの（Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．７，３７１，８２６）を含む。
同時に、Ｄｕｎｃａｎ ＆ Ｗｉｎｔｅｒ， Ｎａｔｕｒｅ ３２２：７３８－４０（１９８８）； Ｕ．Ｓ． Ｐａｔ． Ｎｏ． ５，６４８，２６０； Ｕ．Ｓ． Ｐａｔ． Ｎｏ． ５，６２４，８２１及びＷＯ ９４／２９３５１に関する他の変異Ｆｃ領域の例を参照する。
本願は、本明細書に記載のいずれか１つのＦｃ変異体又はその組み合わせを含む抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）が考えられる。
グリコシル化変異体
いくつかの実施例において、本明細書に提供の抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）は、抗ＰｃｒＶ抗体のグリコシル化の程度を増加又は減少させるように、変更される。抗ＰｃｒＶ抗体上のグリコシル化部位を添加又は削除するために、抗ＰｃｒＶ抗体又はそのポリペプチド部分のアミノ酸配列を変更することによって１つ以上のグリコシル化部位を添加又は除去して便利に達成する。
ここで、抗ＰｃｒＶ抗体がＦｃ領域を含む場合、それに接続されている炭水化物を変化させることができる。哺乳類動物細胞によって産生される天然抗体は、通常、分岐した二分岐オリゴ糖を含み、当該オリゴ糖は通常、Ｎ－結合を通じてＦｃ領域のＣＨ２ドメインにおけるＡｓｎ２９７に結合し、例えば、Ｗｒｉｇｈｔ ｅｔ ａｌ．，ＴＩＢＴＥＣＨ １５：２６－３２（１９９７）を参照する。前記オリゴ糖は、例えば、マンノース、Ｎ－アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）、ガラクトース及びシアル酸、並びに二分岐オリゴ糖構造の「ステム」部分のＧｌｃＮＡｃに連結するトレハロースのような様々な糖を含み得る。いくつかの実施例において、本願の抗ＰｃｒＶ抗体をオリゴ糖修飾して、特定の改善された特性を有する抗ＰｃｒＶ抗体変異体を生成することができる。
Ｆｃ領域のＣＨ２ドメインに連結されるＮ－グリカンは、異質的である。ＣＨＯ細胞で産生される抗体又はＦｃ融合タンパク質は、フコシルトランスフェラーゼ活性によってフコシル化されて、Ｓｈｏｊｉ－Ｈｏｓａｋａ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｂｉｏｃｈｅｍ． ２００６， １４０：７７７－ ８３を参照する。通常、ヒト血清で、ごく一部の天然に存在するフコシル化されていないＩｇＧｓが検出される。Ｆｃ領域のＮ－グリコシル化は、Ｆｃ領域のＦｃＲへの結合にとって重要であるが、フコシル化されていないＮ－グリカンは、ＦｃとＦｃＲＩＩＩａとの結合能力を増強される。ＦｃＲＩＩＩａとの結合能力の増強は、ＡＤＣＣ効果を増強し、これは、細胞毒性を必要とする特定の抗体治療適用で有利である。
いくつかの実施例において、Ｆｃが介在する細胞毒性が必要ない場合、増強されたエフェクター機能は有害でありうる。いくつかの実施例において、Ｆｃフラグメント又はＣＨ２ドメインは非グリコシル化されているものである。いくつかの実施例において、ＣＨ２ドメインにおけるＮ－グリコシル化部位を突然変異させて、そのグリコシル化を防ぐ。
いくつかの実施例において、Ｆｃ領域を含む抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）変異体を提供し、ここで、Ｆｃ領域に連結される炭水化物構造には、フコースが減少しているか、又はフコースが欠如し、これは、ＡＤＣＣの機能を増強する可能性がある。具体的には、本明細書は、ＰｃｒＶ抗体を提供し、当該ＰｃｒＶ抗体は、野生型ＣＨＯ細胞が産生された同じ抗ＰｃｒＶ抗体と比較して、減少されたフコースがある。つまり、それらは、天然のＣＨＯ細胞（例えば、天然のグリコシル化形態を産生するＣＨＯ細胞、天然のＦＵＴ８遺伝子を含むＣＨＯ細胞）によって産生される抗体と比較して、より少ない量のフコースがあることを特徴とする。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体のＮ－結合型グリカンは、５０％、４０％、３０％、２０％、１０％又は５％より少ない量のフコースを有する。例えば、当該抗ＰｃｒＶ抗体のフコースの含有量は、１％－８０％、１％－６５％、５％－６５％又は２０％－４０％でありうる。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体のＮ－結合型グリカンは、フコースを含まなく、即ち、抗ＰｃｒＶ抗体は、完全にフコースを含まなく、又はフコースを有しない、又は脱フコシル化されたものである。フコースの含有量は、ＷＯ ２００８／０７７５４６に記載されたように、ＭＡＲＤＩ－ＴＯＦ質量分析によって測定された、Ａｓｎ２９７に連結された全ての糖構造（例えば、複合体、ハイブリッド、又はマンノース構造）の合計量に対する、Ａｓｎ２９７に連結された糖鎖内のフコースの平均含有量を計算することによって決定される。Ａｓｎ２９７とは、Ｆｃ領域の２９７位のアスパラギン残基（ＥＵ Ｆｃ領域残基番号付けシステム）である。しかしながら、抗体配列のわずかな変化によって、Ａｓｎ２９７は、また２９７位の上流又は下流の約±３アミノ酸、即ち、２９４及び３００位の間に位置しても良い。これらのフコシル化変異体は、増強されたＡＤＣＣ機能を持つ可能性がある。例えば、ＵＳ Ｐａｔｅｎｔ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ Ｎｏｓ．ＵＳ２００３／０１５７１０８（Ｐｒｅｓｔａ，Ｌ．），ＵＳ２００４／００９３６２１（Ｋｙｏｗａ Ｈａｋｋｏ Ｋｏｇｙｏ Ｃｏ．，Ｌｔｄ）を参照する。「脱フコース基化」又は「フコース欠損」の抗体変異体に関連する刊行物の実例として、ＵＳ２００３／０１５７１０８；ＷＯ２０００／６１７３９；ＷＯ２００１／２９２４６；ＵＳ２００３／０１１５６１４；ＵＳ２００２／０１６４３２８；ＵＳ２００４／００９３６２１；ＵＳ２００４／０１３２１４０；ＵＳ２００４／０１１０７０４；ＵＳ２００４／０１１０２８２；ＵＳ２００４／０１０９８６５；ＷＯ２００３／０８５１１９；ＷＯ２００３／０８４５７０；ＷＯ２００５／０３５５８６；ＷＯ２００５／０３５７７８；ＷＯ２００５／０５３７４２；ＷＯ２００２／０３１１４０；Ｏｋａｚａｋｉ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３３６：１２３９－１２４９（２００４）；Ｙａｍａｎｅ－Ｏｈｎｕｋｉ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．Ｂｉｏｅｎｇ．８７：６１４（２００４）を含む。脱フコシル化された抗体を産生できる細胞株は、タンパク質フコシル化機能が欠如するＬｅｃ１３ ＣＨＯ細胞（Ｒｉｐｋａ ｅｔ ａｌ．Ａｒｃｈ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．２４９：５３３－５４５（１９８６）；ＵＳ Ｐａｔ Ａｐｐｌ Ｎｏ ＵＳ２００３／０１５７１０８Ａ１， Ｐｒｅｓｔａ，Ｌ；及びＷＯ ００４／０５６３１２Ａ１，Ａｄａｍｓ ｅｔ ａｌ．，特に実施例１１）、及び、例えば、α－１，６－フコシルトランスフェラーゼ遺伝子、ＦＵＴ８遺伝子がノックアウトされたＣＨＯ細胞のようなノックアウト細胞株（Ｙａｍａｎｅ－Ｏｈｎｕｋｉ ｅｔ ａｌ． Ｂｉｏｔｅｃｈ． Ｂｉｏｅｎｇ． ８７：６１４（２００４）；Ｋａｎｄａ， Ｙ． ｅｔ ａｌ．， Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ． Ｂｉｏｅｎｇ．，９４（４）：６８０－６８８（２００６）；及びＷＯ２００３／０８５１０７）を含む。
抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）変異体は、さらに、二分オリゴ糖に関し、例えば、抗ＰｃｒＶ抗体のＦｃ領域に連結された二分岐オリゴ糖は、ＧｌｃＮＡｃによって均等に分割される。この抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）変異体は、減少されたフコシル化及び／又は増強されたＡＤＣＣ機能を持つ可能性がある。このような抗体の実例は、ＷＯ２００３／０１１８７８（Ｊｅａｎ－Ｍａｉｒｅｔ ｅｔ ａｌ．）；Ｕ．Ｓ．Ｐａｔ．Ｎｏ．６，６０２，６８４（Ｕｍａｎａ ｅｔ ａｌ．）；ＵＳ２００５／０１２３５４６（Ｕｍａｎａ ｅｔ ａｌ．），及びＦｅｒｒａｒａ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｂｉｏｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，９３（５）：８５１－８６１（２００６）に説明されている。本願は、また、抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）変異体に関し、当該抗ＰｃｒＶ抗体は、Ｆｃ領域に結合したオリゴ糖に少なくとも１つのガラクトース残基を持つ。このような抗ＰｃｒＶ抗体変異体は、増強されたＣＤＣ機能を持つ可能性がある。このような変異体は、例えば、ＷＯ１９９７／３００８７（Ｐａｔｅｌ ｅｔ ａｌ．）；ＷＯ １９９８／５８９６４（Ｒａｊｕ，Ｓ．）；及びＷＯ １９９９／２２７６４（Ｒａｊｕ，Ｓ．）に説明されている。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）変異体は、ＦｃγＲＩＩＩに結合できるＦｃ領域を含む。いくつかの実施例において、Ｆｃ領域を含む前記抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）変異体は、ヒトエフェクター細胞（例えば、Ｔ細胞）の存在下で、ＡＤＣＣ活性を示し、又は、ヒト野生型ＩｇＧ１ Ｆｃ領域を有する他の同じ抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）と比較して、ヒトエフェクター細胞の存在下で、増強されたＡＤＣＣ活性を有する。
システイン操作変異体
いくつかの実施例において、システインが操作された抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）の調製が必要とし、当該抗ＰｃｒＶ抗体において、１つ以上のアミノ酸残基がシステイン残基に置換される。いくつかの実施例において、置換された残基は、抗ＰｃｒＶ抗体のアクセス可能な部位（ａｃｃｅｓｓｉｂｌｅ ｓｉｔｅ）に現れる。これらの残基をシステインで置換することにより、活性があるスルフヒドリル基は、抗ＰｃｒＶ抗体のアクセス可能な部位に位置し、当該抗ＰｃｒＶ抗体と他の部分とのカップリング、例えば、薬物部分又はリンカー－薬物部分のカップリングに用いられて、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ免疫カップリング体を調製する。システインが操作された抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）は、例えば、Ｕ．Ｓ． Ｐａｔ． Ｎｏ． ７，５２１，５４１に記載されたように調製できる。
誘導体
いくつかの実施例において、本明細書に提供の抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）は、本分野で知られており、容易に入手可能な他の非タンパク質部分を含むように、さらに修飾され得る。抗ＰｃｒＶ抗体の一部を誘導体化するのに適している部分は、水溶性重合体を含むが、これに限定されない。水溶性ポリマーの非限定的な例として、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、エチレングリコール／プロピレングリコール共重合体、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ－１，３－ジオキソラン、ポリ－１，３，６－トリオキサン、エチレン／無水マレイン酸共重合体、ポリアミノ酸（単独重合体又はランダム共重合体）、デキストラン又はポリ（ｎ－ビニルピロリドン）ポリエチレングリコール、プロピレングリコール単独重合体、プロピレンオキシド／エチレンオキシド共重合体、ポリオキシエチル化ポリオール（例えば、グリセリン）、ポリビニルアルコール及びそれらの混合物を含むが、これらに限定されない。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、水中で安定しているため、製造において利点がある。重合体は任意の分子量であり得、分岐又は非分岐であり得る。抗ＰｃｒＶ抗体に結合する重合体の数は変わってもよく、そして複数の重合体が結合されている場合、それらは同じ分子でも異なる分子でもよい。通常、誘導体化に用いられる重合体の量及び／又はタイプは、抗ＰｃｒＶ抗体の改善しようとする特性又は機能、抗ＰｃｒＶ抗体誘導体が特定の条件下での治療に用いるかどうかなどを含む因子を考慮して決定するが、これらに限定されない。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体（全長の抗ＰｃｒＶ抗体など）と、放射線への曝露によって選択的に加熱され得る非タンパク質性部分とのコンジュゲートを提供する。いくつかの実施例において、非タンパク質性部分は、カーボンナノチューブである（Ｋａｍ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １０２：１１６００－１１６０５（２００５））。放射線は、任意の波長であってもよく、通常の細胞に害を及ぼさなく、非タンパク質性部分を抗ＰｃｒＶ抗体－非タンパク質性部分に近接する細胞が殺される温度に加熱する波長を含むが、これらに限定されない。
医薬組成物
本明細書は、いずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）、抗体をコードする核酸、抗体をコードする核酸を含むベクター、又は本明細書に記載の核酸又はベクターを含む宿主細胞を含有する組成物（例えば、医薬組成物、ここでは、製剤ともいう。）をさらに提供する。いくつかの実施例において、本明細書に記載のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体、及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を提供する。
必要な純度の抗ＰｃｒＶ抗体を、任意の製薬上許容される担体、賦形剤、又は安定剤と混合することによって（Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ １６ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｏｓｏｌ，Ａ．Ｅｄ．（１９８０））、適切な抗ＰｃｒＶ抗体製剤を得て、凍結乾燥製剤又は液体製剤の形に調製する。許容される担体、賦形剤又は安定剤は、使用された量及び濃度で受験者に対して無毒であり、これらは、リン酸塩、クエン酸及び他の有機酸のような緩衝液；アスコルビン酸及びメチオニンを含む抗酸化剤；防腐剤（例えば、オクタデシルジメチルベンジル塩化アンモニウム；ヘキサメチル塩化アンモニウム；塩化ベンザルコニウム；塩化ベンゼトニウム；フェノール；ブタノール又はベンジルアルコール； ｐ－ヒドロキシ安息香酸メチル又はｐ－ヒドロキシ安息香酸プロピルのようなｐ－ヒドロキシ安息香酸アルキルエステル；カテコール；レゾルシノール；シクロヘキサノール；３－ペンタノール及びｍ－クレゾール）；低分子量（約１０残基未満）のポリペプチド；例えば、血清アルブミン、ゼラチン又は免疫グロブリンのようなタンパク質；ポリビニルピロリドンのような親水性重合体；例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン又はリジンのようなアミノ酸；単糖、二糖及びグルコース、マンノース又はデキストリンを含む他の炭水化物；ＥＤＴＡのようなキレート剤；スクロース、マンニトール、トレハロース又はソルビトールのような糖類；ナトリウムなどの塩形成対イオン；金属複合体（例えば亜鉛－タンパク質複合体）；及び／又はＴＷＥＥＮTM，ＰＬＵＲＯＮＩＣＳTM又はポリエチレングリコール（ＰＥＧ）のような非イオン性界面活性剤）を含む；例示的な製剤はＷＯ９８／５６４１８に記載されており、それらの内容は引用により本明細書に明示的に組み込まれる。皮下投与に適した凍結乾燥製剤は、ＷＯ９７／０４８０１に記載されている。このような凍結乾燥製剤は、適切な希釈剤を用いて高タンパク質濃度の調製物に再構成することができ、そして再構成された製剤は、皮下投与によって本明細書に記載の治療しようとする個体に投与することができる。カチオン性リポソーム又はリポソームは、本願における抗ＰｃｒＶ抗体を細胞に送達することに用いられる。
本明細書に記載の製剤は、抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）に加えて、特定の病症の治療に必要な一種以上の他の活性物質を含み得、この活性物質は、好ましくは相補的活性があり、かつ副作用のない物質である。例えば、抗ＰｃｒＶ抗体に加えて、抗腫瘍剤、成長阻害剤、細胞毒性剤又は化学療法剤をさらに含めることが必要な場合がある。これらの分子は、予期された目的に有効な量で組み合わせて存在する。他の物質の有効量は、製剤中の抗ＰｃｒＶ抗体の含有量、疾患又は障害或いは治療の種類、及び前記の他の要因に依存する。これらの薬物は通常、本明細書に記載される投与量と同じ投与量及び投与経路で使用され、又は現在適用されている投与量の１％から９９％で使用される。
前記抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）は、凝集技術及び界面重合によって調製されたマイクロカプセルに封入されることもでき、例えば、コロイド状薬物送達システム（例えば、リポソーム、アルブミンミクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子及びナノカプセル）又は粗いエマルジョン中のヒドロキシメチルセルロース又はゼラチン－マイクロカプセル及びポリ（メチルメタクリレート）マイクロカプセルに封入される。これで、徐放性製剤を調製できる。
抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）の徐放性製剤を調製できる。徐放性製剤の適切な実例は、抗体（又はそのフラグメント）を含有する固体疎水性重合体の半透性マトリックスを含み、これらのマトリックスは、成形品、例えば、フィルム又はマイクロカプセルの形態である。徐放性マトリックスの実例として、ポリエステル、ヒドロゲル（例えば、ポリ（２－ヒドロキシエチルメタクリレート）又はポリ（ビニルアルコール））、ポリ乳酸（Ｕ．Ｓ． Ｐａｔ． Ｎｏ． ３，７７３，９１９）、Ｌ－グルタミン酸及びＬ－グルタミン酸エチル共重合体、非分解性エチレン－酢酸ビニル、ＬＵＰＲＯＮ ＤＥＰＯＴＴＭ（乳酸－グリコール酸共重合体と酢酸ロイプロリドからなる注射可能なミクロスフェア）のような分解性乳酸－グリコール酸共重合体及びポリ－Ｄ（－）－ ３－ヒドロキシ酪酸を含む。エチレン－酢酸ビニルや乳酸－グリコール酸のような重合体分子は１００日以上放出できるが、一部のヒドロゲルはより短い時間でタンパク質を放出できる。封入された抗体が体内に長期間留まると、３７°Ｃの高湿環境に曝されるために変性又は凝集し、生物活性が失われたり、免疫原性が変化したりする可能性がある。対応するメカニズムによって、抗ＰｃｒＶ抗体を安定化するための合理的な対策を設計することができる。例えば、凝集メカニズムは、チオジスルフィド交換によって分子間Ｓ－Ｓ結合を形成する場合、スルフヒドリル残基の修飾、酸性溶液中での凍結乾燥、含水量の制御、適切な添加剤の使用、及び特定の重合体マトリックス組成物の開発によって安定化を達成できる。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）は、クエン酸塩、塩化ナトリウム、酢酸塩、コハク酸塩、グリシン、ポリソルベート８０（ツイン８０）又はそれらの任意の組み合わせの緩衝液において調製される。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体は、約１００ｍＭ～約１５０ｍＭのグリシンを含む緩衝液において調製される。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体は、約５０ｍＭ～約１００ｍＭのＮａＣｌを含む緩衝液において調製される。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体は、約１０ｍＭ～約５０ｍＭの酢酸塩を含む緩衝液において調製される。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体は、約１０ｍＭ～約５０ｍＭのコハク酸塩を含む緩衝液において調製される。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体は、約０．００５％～約０．０２％のポリソルベート８０を含む緩衝液において調製される。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体は、ｐＨ値が５．１～５．６である緩衝液において調製される。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体は、１０ｍＭのクエン酸塩と、１００ｍＭのＮａＣｌと、１００ｍＭのグリシンと、０．０１％ポリソルベート８０を含む緩衝液において調製され、その製剤のｐＨ値が５．５である。
イン・ビボ投与のための製剤は無菌でなければならない。これは、例えば、滅菌フィルター膜を適用した濾過によって容易に達成することができる。
抗ＰｃｒＶ抗体を使用する治療方法又は予防方法
いくつかの実施例において、本明細書に記載のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体へ投与することを含む、個体のシュードモナス菌感染を治療する方法を提供する。いくつかの実施例において、シュードモナス菌感染を治療する方法は、シュードモナス菌感染に関連する疾患及び/又は病症に対する治療的又は予防的な効果をさらに提供する。いくつかの実施例において、本明細書に記載のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を予防する方法を提供する。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体（上記のいずれか１つのＰｃｒＶ抗体）又は医薬組成物（上記のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体を含む医薬組成物）による疾患又は病症を治療するための医薬品の調製における使用を提供する。
シュードモナス菌感染に関連する疾患及び/又は症状は、発熱、悪寒、疲労、筋肉及び関節の痛み、関節の腫れ、頭痛、下痢、皮膚発疹、創傷の膿、細菌血症、急性肺炎、腹腔内感染を含むが、これらに限定されない。さらなる例示的な疾患は、呼吸器感染、細菌血症、敗血症性ショック、化膿性関節炎、腸炎、皮膚及び軟組織感染（火傷創傷感染など）、尿路感染、腸感染、潰瘍性角膜炎、慢性化膿性中耳炎、乳様突起炎、副鼻腔炎及び心内膜炎を含むが、これらに限定されない。いくつかの実施例において、シュードモナス菌感染を治療又は予防する方法により、シュードモナス菌感染による死亡率を低下させる。
いくつかの実施例において、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶにおける線状エピトープに特異的に結合する。いくつかの実施例において、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶにおける非線状エピトープに特異的に結合する。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶ上のエピトープに結合し、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１に従って、前記エピトープが前記シュードモナス菌ＰｃｒＶのＧｌｎ１６０、Ａｓｐ１６５、Ａｓｐ１７０、Ａｓｐ１７３、Ｔｈｒ１７５及びＳｅｒ２０２からなる群から選択される１つ、２つ、３つ、４つ、５つ又は６つのアミノ酸残基を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１～８のいずれか１つを含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：９～１４のいずれか１つを含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１５～３１のいずれか１つを含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２～３３のいずれか１つを含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：３５～３８のいずれか１つを含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１～８のいずれか１つを含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：９～１４のいずれか１つを含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１５～３１のいずれか１つを含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２～３３のいずれか１つを含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：３５～３８のいずれか１つを含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１～８のいずれか１つを含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：９～１４のいずれか１つを含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：１５～３１のいずれか１つを含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２～３３のいずれか１つを含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：３５～３８のいずれか１つを含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：４８～６４のいずれか１つを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：６５～７０のいずれか１つを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：４８～６４のいずれか１つを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：６５～７０のいずれか１つを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：４８～６４のいずれか１つを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯｓ：６５～７０のいずれか１つを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４８を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４８を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４８又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４８と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６６を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６６を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６６又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６６と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５３又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５３と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５４を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５４を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５４又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５４と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２２を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２２を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５５を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５５を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２２を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５５と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２３を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２３を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２３を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２４を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２４を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５７を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６８を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５７を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６８を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２４を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５７と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６８又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６８と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５８を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６９を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５８を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６９を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５８又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５８と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６９又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６９と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２７を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６１を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６１を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６１又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６１と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１４を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１４を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１４を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３８を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３８を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７０を含む。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と同じエピトープに結合し、当該抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７０を含む。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ又は前記ＶＨの変異体及びＶＬ又は前記ＶＬの変異体を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７を含むＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３を含むＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９を含むＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＨの変異体がＨＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２を含むＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４を含むＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３８を含むＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬの変異体がＬＣ－ＣＤＲｓにおいて最大約５個のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２と少なくとも約９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７０又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７０と少なくとも約９０％の配列同一性を有する。
いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体を含む有効量の組成物を個体に投与することを含む、個体におけるシュードモナス菌感染を治療又は予防する方法を提供し、ここで、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、シュードモナス菌ＰｃｒＶ上のエピトープに特異的に結合し、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１に従って、前記エピトープがシュードモナス菌ＰｃｒＶのＧｌｎ１６０、Ａｓｐ１６５、Ａｓｐ１７０、Ａｓｐ１７３、Ｔｈｒ１７５及びＳｅｒ２０２からなる群から選択される１つ、２つ、３つ、４つ、５つ又は６つのアミノ酸残基を含む。いくつかの実施例において、前記組成物における抗ＰｃｒＶ抗体は、以下のような抗体と競合し、当該抗体は、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１によるシュードモナス菌ＰｃｒＶのＧｌｎ１６０、Ａｓｐ１６５、Ａｓｐ１７０、Ａｓｐ１７３、Ｔｈｒ１７５及びＳｅｒ２０２２からなる群から選択される１つ、２つ、３つ、４つ、５つ又は６つのアミノ酸残基に結合する。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、抗体重鎖定常領域及び抗体軽鎖定常領域を含む本明細書に記載のいずれか１つの治療又は予防する方法を提供する。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＩｇＧ１重鎖定常領域を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＩｇＧ２重鎖定常領域を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＩｇＧ３重鎖定常領域を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む。いくつかの実施例において、前記ＩｇＧは、ヒトＩｇＧである。いくつかの実施例において、重鎖定常領域は、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７３を含むか、又はアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７３からなる。いくつかの実施例において、重鎖定常領域は、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７４を含むか、又はアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７４からなる。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、λ軽鎖定常領域を含む。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、κ軽鎖定常領域を含む。いくつかの実施例において、軽鎖定常領域は、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７２を含むか、又はアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７２からなる。いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体は、抗体重鎖可変ドメイン及び抗体軽鎖可変ドメインを含む。
いくつかの実施例において、本明細書に記載のいずれか１つの治療又は予防する方法は、シュードモナス菌感染に関連する疾患及び/又は病症に対する治療的又は予防的な効果をさらに提供する。いくつかの実施例において、前記方法は、個体におけるシュードモナス菌感染を予防することができる。
いくつかの実施例において、前記個体は、哺乳類動物（例えば、ヒト、ヒト以外の霊長類、ラット、マウス、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、イヌ、ネコ等）である。いくつかの実施例において、前記個体はヒトである。いくつかの実施例において、前記個体は、臨床患者、臨床試験ボランティア、実験動物などである。いくつかの実施例において、前記個体は、年齢が６０歳未満（例えば、５０歳未満、４０歳未満、３０歳未満、２５歳未満、２０歳未満、１５歳未満、又は１０歳未満を含む）である。いくつかの実施例において、前記個体の年齢は、６０歳超（例えば、７０超、８０超、９０超又は１００歳超を含む）である。
いくつかの実施例において、前記個体は、緑膿菌感染に関連する１つ又は複数の危険因子を有する。例えば、いくつかの実施例において、前記個体は、皮膚の粘膜層が露出または破壊された状態である。いくつかの実施例において、前記個体は、１つ又は複数の火傷を有する。いくつかの実施例において、前記個体は、１つ又は複数の外科的創傷を有する。いくつかの実施例において、前記個体は、皮膚疾患を有する。いくつかの実施例において、前記個体は、機械的人工呼吸器又は導管などの異物が挿入されるが、これらに限定されない。いくつかの実施例において、前記個体は、ＨＩＶ感染、ＡＩＤＳ及び／又は好中球欠損症を含むがこれらに限定されない免疫不全症と診断されるか、又は遺伝的にその傾向がある。いくつかの実施例において、前記個体は、１つ又は複数の形態の化学療法を受けた。いくつかの実施例において、前記個体は、１つ又は複数の形態の糖質コルチコイド治療を受けた。いくつかの実施例において、前記個体は、癌、糖尿病及び／又は慢性構造性肺疾患（嚢胞性線維症またはＣＯＰＤなど）と診断されるか、又は遺伝的にその傾向がある。いくつかの実施例において、前記個体は、消化器系及び／又は他の器官における細菌叢の不均衡と診断されるか、又は遺伝的にその傾向がある。いくつかの実施例において、前記個体は、上記の１つ又は複数の疾患又は病症に関連する１つ又は複数の危険因子を有する。
いくつかの実施例において、本願は、ＰｃｒＶ抗体を含有する組成物を個体へ投与することを含む、抗ＰｃｒＶ抗体（本明細書に記載のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体、例えば単離された抗ＰｃｒＶ抗体）を個体の病原菌に感染された細胞に送達する方法を提供する。
いくつかの実施例において、本明細書に記載のいずれか１つの方法は、１つ又は複数の追加の治療薬を投与することをさらに含む。いくつかの実施例において、治療薬の少なくとも１つは、抗生物質である。いくつかの実施例において、前記抗生物質は、ペニシリン、セファロスポリン、カルバペネム、フルオロキノロン、アミノグリコシド、モノバクタム、ポリミキシン、β－ラクタマーゼ阻害剤を含有する抗生物質の組み合わせ、又はそれらの任意の組成物である。いくつかの実施例において、前記抗生物質は、セフェピム、セフタジジム、セフピロメ、イミペネム、メロペネム、チカルシリン、ピペラシリン、アズロシリン、カルベニシリン、メズロシリン、アズトレオナム、トブラマイシン、ゲンタマイシン、アミカシン、シプロフロキサシン、レボフロキサシン、セフォペラゾン－スルバクタム、ピペラシリン－タゾバクタム、ホスホマイシン、又はそれらの任意の組み合わせである。いくつかの実施例において、前記抗生物質は、イミペネム、トブラマイシン、シプロフロキサシン、メロペネム、及びアズトレオナムの一種又は複数種である。いくつかの実施例において、前記抗生物質は、ゲンタマイシン、アンピシリン及びカナマイシンの一種又は複数種である。
ＰｃｒＶ発現を示す感染性病原体の多くの診断方法及びこれらの疾患の臨床的説明は、本分野において既知である。このような方法は、例えば、免疫組織化学、ＰＣＲ、及び蛍光ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）を含むが、これらに限定されない。
いくつかの実施例において、前記抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）及び／又は本願の組成物は、第二の薬剤、第三の薬剤又は第四の薬剤（例えば、抗生物質を含む）と併用することにより、ＰｃｒＶを発現する病原菌に関連する疾患及び/又は病症を治療又は予防する。
抗ＰｃｒＶ抗体抗体の投与量及び方法
個体（例えば、ヒト）に投与される抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、単離された抗ＰｃｒＶ抗体）組成物の剤量は、特定の組成物、投与方式、及び治療される疾患のタイプによって異なり得る。いくつかの実施例において、組成物（例えば、単離された抗ＰｃｒＶ抗体を含む組成物）の量は、シュードモナス菌感染の治療又は予防において、客観的応答（例えば、部分応答又は完全応答）を効果的に生成することができる。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体組成物の量は、個体において完全応答を産生するのに十分である。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体組成物の量は、個体において部分応答を産生するのに十分である。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体組成物の投与量（例えば、単独で投与される場合）は、抗ＰｃｒＶ抗体組成物を使用して治療する個体群において、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６４％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％又は９０％を上回る全応答率を産生するのに十分である。個体が本明細書に記載の治療方法に対する応答は、例えば、グラム染色又は他の表現型試験方法などの方法によるシュードモナス菌検出によって決定することができる。
いくつかの実施例において、組成物（例えば、単離された抗ＰｃｒＶ抗体を含む組成物）の量は、個体の無増悪生存期間を延長するのに十分である。いくつかの実施例において、組成物の量は、個体の全生存期間を延長するのに十分である。いくつかの実施例において、抗ＰｃｒＶ抗体組成物を使用して治療する個体群において、組成物の量（例えば、単独で投与される場合）は、５０％、６０％、７０％又は７７％より高い臨床利点を産生するのに十分である。
いくつかの実施例において、組成物（例えば、単離された抗ＰｃｒＶ抗体を含む組成物）の量は、単独で投与される場合、又は、第二の薬剤、第三の薬剤及び／又は第四の薬剤と併用して投与する場合、治療前の同じ受験者又は治療されない他の受験者の対応する臓器負担と比較して、シュードモナス菌の臓器負担の数を少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％又は１００％まで十分に低減する。標準的な方法、例えば、精製酵素のイン・ビトロ検出、細胞による検出、動物モデル、又はヒト試験で治療効果を測定することができる。
いくつかの実施例において、組成物が個体に投与される場合、組成物中の抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）の量は、毒性効果（即ち、臨床的に許容されるレベルよりも高い効果）を引き起こすレベルより低く、又は潜在的な副作用が制御又は許容されるレベルにある。
いくつかの実施例において、同じ投与計画に従って、組成物の量は、組成物の最大耐量（ＭＴＤ）に近い。いくつかの実施例において、組成物の量は、ＭＴＤの８０％、９０％、９５％又は９８％より高い。
いくつかの実施例において、組成物における抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）の含有量は、０．００１μｇ～１０００μｇの範囲内にある。
いくつかの実施例において、前記組成物又は方法は、一種又は複数種の抗生物質をさらに含む。いくつかの実施例において、組成物における抗生物質（例えば、イミペネム、トブラマイシン、シプロフロキサシン、メロペネム、アズトレオナム、チカルシリン、ピペラシリン、アズロシリン、カルベニシリン、メズロシリン、ゲンタマイシン又はアミカシン）の含有量は、０．００１μｇ～１０００μｇの範囲内にある。
上記のいずれか１つの実施例において、組成物における抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）の有効量は、体重によって計算すれば、０．１μｇ／ｋｇ～１００ｍｇ／ｋｇの範囲内にある。
上記のいずれか１つの実施例において、組成物における抗生物質（例えば、イミペネム、トブラマイシン、シプロフロキサシン、メロペネム、アズトレオナム、チカルシリン、ピペラシリン、アズロシリン、カルベニシリン、メズロシリン、ゲンタマイシン又はアミカシン）の有効量は、体重によって計算すれば、０．１μｇ／ｋｇ～１００ｍｇ／ｋｇの範囲内にある。
抗ＰｃｒＶ抗体組成物は、例えば、静脈内注射、動脈内投与、腹腔注射、肺内投与、経口投与、吸入投与、血管内投与、筋肉注射、気管内投与、皮下注射、眼内投与、髄腔内投与、粘膜投与、又は経皮投与を含む様々な経路を通じて、個体（例えば、ヒト）に投与することができる。いくつの実施例において、組成物の徐放性製剤を使用する。いくつの実施例において、組成物は、静脈内投与される。いくつかの実施例において、組成物は、門脈内に投与される。いくつの実施例において、組成物は動脈内投与される。いくつの実施例において、組成物は腹腔内投与される。いくつの実施例において、組成物は肝内投与される。いくつの実施例において、組成物は肝動脈注入によって投与される。いくつの実施例において、組成物は、第１の病変部位から離れた部位に投与される。
製品及び試薬キット
いくつかの実施例において、個体におけるシュードモナス菌感染の治療又は予防に用いられるか、又は、抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）をＰｃｒＶを発現する病原体が付着した細胞に送達することに用いられる物質を含む製品を提供する。前記製品は、容器と、当該容器に付随する容器上のラベル又はパッケージ説明書を含みうる。適切な容器は、例えば、ボトル、バイアル、注射器などを含む。容器は、例えば、ガラスやプラスチックのような様々な材料で制作できる。通常、当該容器内は、本明細書に記載の、疾患又は病症を効果的に治療することができる組成物を含み、そして、無菌ポートを有する（例えば、当該容器は、静脈輸液バッグ又は皮下注射針によって突き刺すことができるキャップ付きのバイアルであり得る。）ものである。組成物には、少なくとも１つの活性物質として、本願に記載の抗ＰｃｒＶ抗体を含む。ラベル又は外装説明書には、当該組成物を使用して治療できる特定の病症を示している。ラベル又は外装説明書には、抗ＰｃｒＶ抗体組成物を患者に投与するための説明書がさらに含まれている。併用療法を含む製品及び試薬キットのいずれも、本明細書の範囲内にある。
外装説明書とは、通常治療用製品の市販パッケージ内の説明書であり、これらの治療用製品の使用に関する適応症、使用法、投与量、投与、禁忌症及び／又は警告情報を含む。いくつかの実施例において、外装説明書は、当該組成物が細菌感染の治療に用いられることを示している。いくつかの実施例において、外装説明書は、当該組成物がシュードモナス菌感染の治療に用いられることを示している。
また、前記製品は、第２の容器をさらに含んでもよく、当該第２の容器が、例えば、注射用静菌性水（ＢＷＦＩ）、リン酸緩衝液、グリーン溶液、又はグルコース溶液などの薬学的に許容される緩衝液を含む。また、当該第２の容器が、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、注射針、注射器などの商業的及びユーザーの観点から必要な他の材料も含みうる。
なお、本願は、任意で製品と組み合わせて、例えば、個体におけるシュードモナス菌感染の治療又は予防の治療に用いられか、または、抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）をＰｃｒＶを発現する病原体が付着した細胞に送達することに用いられるなどの様々な目的に用いる試薬キットを提供する。本願の試薬キットは、一つ以上の容器を含み、当該容器は、抗ＰｃｒＶ抗体組成物（又は単回剤形及び／又は製品）を含み、いくつかの実施例において、さらに他の薬剤（例えば、本明細書に記載されている薬剤）及び／又は本明細書に記載のいずれか１つの方法と一致する取扱説明書を含む。当該試薬キットは、さらに、適切な治療個体を選択することに対する説明を含み得る。本願の試薬キッ付きの取扱説明書は、通常、ラベル又は外装説明書（試薬キットに含まれている紙）に書かれた説明であり、機械読取可能な説明（例えば、磁気又は光学ストレージディスクにおける説明）も許容される。
例えば、いくつかの実施例において、試薬キットは、抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）を含む組成物を含有する。いくつかの実施例において、試薬キットは、ａ）本明細書に記載のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体を含む組成物、及びｂ）抗ＰｃｒＶ抗体の効果（例えば治療効果、検出効果）を増強することができる少なくとも一種の有効量の他の薬剤を含む。いくつかの実施例において、試薬キットは、ａ）本明細書に記載のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体を含む組成物、及びｂ）個体に抗ＰｃｒＶ抗体組成物を投与し、個体におけるシュードモナス菌感染の治療に用いられる取扱説明書を含む。いくつかの実施例において、試薬キットは、ａ）本明細書に記載のいずれか１つの抗ＰｃｒＶ抗体を含む組成物、ｂ）抗ＰｃｒＶ抗体の効果（例えば治療効果、検出効果）を増強することができる少なくとも一種の有効量の他の薬剤、及びｃ)個体に抗ＰｃｒＶ抗体組成物及び他の物質を投与し、個体におけるシュードモナス菌感染の治療に用いられる取扱説明書を含む。前記抗ＰｃｒＶ抗体及び他の物質は、別々の容器又は同じ容器に存在することができる。例えば、当該試薬キットは、一種の特定の組成物又は二種以上の組成物を含み得、中では、一種の組成物が、抗ＰｃｒＶ抗体を含み、他の一種の組成物が他の薬剤を含む。
いくつかの実施例において、試薬キットは、抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）をコードする核酸（又は核酸のセット）を含む。いくつかの実施例において、試薬キットは、ａ）抗ＰｃｒＶ抗体をコードする核酸（又は核酸のセット）、及びｂ）核酸（又は核酸のセット）を発現する宿主細胞を含む。いくつかの実施例において、試薬キットは、ａ)抗ＰｃｒＶ抗体をコードする核酸（又は核酸のセット）、及びｂ）：ｉ）宿主細胞に抗ＰｃｒＶ抗体を発現すること、ｉｉ）抗ＰｃｒＶ抗体を含む組成物を調製すること、及びｉｉｉ）個体に抗ＰｃｒＶ抗体を含む組成物を投与し、個体におけるシュードモナス菌感染の治療又は予防に用いられること；に適している使用説明書を含む。いくつかの実施例において、試薬キットは、ａ）抗ＰｃｒＶ抗体をコードする核酸（又は核酸のセット）、ｂ）核酸（又は核酸のセット）を発現する宿主細胞、及びｃ）：ｉ）宿主細胞に抗ＰｃｒＶ抗体を発現すること、ｉｉ）抗ＰｃｒＶ抗体を含む組成物を調製すること、及びｉｉｉ）個体に抗ＰｃｒＶ抗体を含む組成物を投与し、個体におけるシュードモナス菌感染の治療又は予防に用いられること；に適している使用説明書を含む。
本願に記載の試薬キットは、適切な形式でパッケージされる。適切なパッケージとして、バイアル、ボトル、ジャー、柔軟な包装（例えば、密封されたポリエステルフィルム又はビニール袋）などが含まれるが、これらに限定されない。試薬キットは、例えば、緩衝液及び説明情報のような他の成分を任意的に提供しうる。従って、本願は、バイアル、ボトル、ジャー、柔軟なパッケージ（密封されたポリエステルフィルムやビニール袋）などを含む製品をさらに提供する。
抗ＰｃｒＶ抗体組成物の取扱説明書に関して、通常、投与量、投与期間及び投与経路のような情報を含む。容器は、単位用量、バルク（例えば、複数用量包装）又はサブ単位用量であり得る。例えば、十分な用量の本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体（例えば、全長の抗ＰｃｒＶ抗体）を含む試薬キットを提供し、個体に対して長期間（例えば、１週間、８日、９日、１０日、１１日、１２日、１３日、２週間、３週間、４週間、６週間、８週間、３ヶ月、４ヶ月、５ヶ月、７ヶ月、８ヶ月、９ヶ月又はその以上）で効果的な治療をおこなう。試薬キットは、また複数単位用量の抗ＰｃｒＶ抗体、医薬組成物、及び取扱説明書を含み得て、十分な量でパッケージし、病院薬局や調剤薬局などの薬局での保管及び使用することに用いる。
当業者は、本願の範囲及び趣旨における若干の実施例を認識できる。次に、以下の非限定的な実施例を参照して、本出願をより詳細に説明する。以下の実施例は、本願をさらに説明するものであり、本願の範囲に対するいずれかの方式で制限するものとして解釈されるべきではない。
実施例
実施例１：組換えシュードモナス菌ＰｃｒＶの調製及び抗ＰｃｒＶ一本鎖抗体（ｓｃＦｖ）のスクリーニング
組換えシュードモナス菌ＰｃｒＶの調製
ＰｃｒＶ（ＰＡＯ１）の全長配列を合成し（Ｇｅｎｅｒａｙ，Ｓｈａｎｇｈａｉ）、制限エンドヌクレアーゼ部位ＮｄｅＩ及びＢａｍＨＩを使用して発現ベクターｐＥＴにサブクローン化した。ＰｃｒＶの標識には、Ｈｉｓタグ又は従来使用されているその他のタグを用いた。発現ベクターｐＥＴ－６ｈｉｓ－ＰｃｒＶ及びｐＥＴ－６ｈｉｓ－Ａｖｉ－ＰｃｒＶを産生した。これらの構築において、「Ｈｉｓ」は、Ｈｉｓタグを表し、「Ａｖｉ」は、アビジンタグを表した。製造元のプロトコルに従って組換えＰｃｒＶ（ｐＥＴ－６ｈｉｓ－ＰｃｒＶ、ｐＥＴ－６Ｈｉｓ－Ａｖｉ－ＰｃｒＶを含む）の発現及び精製を行った。簡単に言えば、大腸菌細胞を発現ベクターで転換して、前記細胞をＩＰＴＧで誘導し、２５°Ｃ、２２０ｒｐｍで一晩培養した。続いて、大腸菌細胞を超音波処理し、細胞破片をペレット化して除去し、遠心分離によってタンパク質を分離した。
Ｈｉｓタグを発現するタンパク質を製造元のプロトコルに従ってＮｉ Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ精製を使用して精製した。具体的に、Ｑｉａｇｅｎ Ｎｉ－ＮＴＡスーパーフローカートリッジ（Ｑｉａｇｅｎ Ｎｉ－ＮＴＡ Ｓｕｐｅｒｆｌｏｗ ｃａｒｔｒｉｄｇｅｓ）を使用して固定化金属アフィニティークロマトグラフィー(ＩＭＡＣ)分析に使用した。まず、カートリッジは、緩衝液Ａ１（５０ｍＭ Ｎａ３ＰＯ４，０．１５Ｍ ＮａＣｌ，ｐＨ７．２）を使用して、流速１５０ｃｍ／ｈで平衡化された。培養上清液のｐＨを７．２に調整し、室温で１５０ｃｍ／ｈでカートリッジに流した。続いて、緩衝液Ａ１（カートリッジの体積の６倍）を使用して、１５０ｃｍ／ｈの流速でカートリッジを再平衡化した。カートリッジの体積の１０倍のＰＢ溶液５０ｍＭ（０．１５Ｍ ＮａＣｌ及び０．２Ｍ イミダゾールを含み、ｐＨ７．２）を使用してカートリッジを洗浄し、溶出液を収集した。
ビオチン化ＰｃｒＶ抗原の調製
ビオチンリガーゼＢ０１０１Ａ（ＧＥＮＥＣＯＰＯＥＩＡＴＭ）を使用して６Ｈｉｓ－Ａｖｉ－ＰｃｒＶのビオチン化を製造元のプロトコルに従って行った。簡単に言えば、緩衝液Ａ／Ｂとビオチンリガーゼを６Ｈｉｓ－Ａｖｉ－ＰｃｒＶに添加して、３０℃で１時間インキュベートした。ビオチン化されたＰｃｒＶは、以下、Ｂｈａｖｉ－ＰｃｒＶと呼ばれた。ビオチン化の効率は、ＥＬＩＳＡ法により測定された。簡単に言えば、磁気ビーズ（ＤｙｎａｂｅａｄｓＴＭ ＭｙＯｎｅＴＭ Ｓｔｒｅｐｔａｖｉｄｉｎ Ｔ１）とインキュベートすることにより、Ｂｈａｖｉ－ＰｃｒＶを除去し、既知濃度の６Ｈｉｓ－Ａｖｉ－ＰｃｒＶを標準物質として、上清液における６Ｈｉｓ－Ａｖｉ－ＰｃｒＶの濃度をＥＬＩＳＡで定量した。ビオチン化効率が９０％であると決定された。
抗ＰｃｒＶ一本鎖抗体（ｓｃＦｖ）のスクリーニング
酵母ｓｃＦｖ抗体ディスプレイライブラリーの構築：２０００のヒト血液サンプルからＲＮＡを抽出し、逆転写によってｃＤＮＡを得て、ＶＨ－及びＶＫ－特異的プライマーを使用してＶＨ及びＶＫフラグメントを増幅した。ゲル抽出及び精製した後、リンカーを介してＶＨ及びＶＫを連結することによりｓｃＦｖを構築した。それらのｓｃＦｖｓを酵母ディスプレイプラスミドＰＹＤ１にクローニングして、それを酵母にエレクトロポレーションして、酵母ｓｃＦｖ抗体ディスプレイライブラリーを得た。
ＰｃｒＶ結合による抗ＰｃｒＶ一本鎖抗体（ｓｃＦｖ）のスクリーニング
酵母ディスプレイライブラリーからＰｃｒＶを認識するｓｃＦｖを単離された。簡単に言えば、磁気活性化セルソーティング（ＭＡＣＳ）を使用して、抗ＰｃｒＶ ｓｃＦｖ抗体を発現する細胞を濃縮した。製造元のプロトコルに従って、Ｂｈａｖｉ－ＰｃｒＶを磁気ビーズ（ＤｙｎａｂｅａｄｓＴＭ ＭｙＯｎｅＴＭ Ｓｔｒｅｐｔａｖｉｄｉｎ Ｔ１）と一晩混合し、ビオチン化されたＰｃｒＶを磁気ビーズにコーティングさせた。次に、ｓｃＦｖ抗体酵母ライブラリーをコーティングされたＰｃｒＶと混合され、ＰｃｒＶ認識抗体を表示する酵母を濃縮したが、結合しない酵母が洗浄ステップで洗い流された。続いて、収集した酵母細胞をＰｃｒＶタンパク質で標識し、ＦＡＣＳで選別して、ＰｃｒＶに高い親和性を持つ抗体を表示する酵母をスクリーニングした。ＦＡＣＳを介在するスクリーニングを２～３サイクル繰り返した。スクリーニングされた酵母ライブラリー細胞を寒天の上に置き、単一コロニーを選択して、さらなるＦＡＣＳ分析を行った。ＰｃｒＶへの正の結合を示した酵母クローンから、各ｓｃＦｖ遺伝子を原核生物の発現ベクターにサブクローニングして、６－Ｈｉｓタグと融合した。その後、Ｈｉｓタグを標識するｓｃＦｖｓを上記したＮｉ Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ精製を使用して精製した。陽性ｓｃＦｖ抗体のパネルは、スクリーニングプロセスの最後に取得され、緑膿菌によるＲＢＣ溶解を阻害する能力について機能試験を受けた。
ＲＢＣ溶解阻害による抗ＰｃｒＶ ｓｃＦｖ候補の分析
モノクローナルｓｃＦｖ抗体をスクリーニングし、ＲＢＣ溶解アッセイによって生物学的活性を評価した。簡単に言えば、新鮮なヒト全血又はウサギ全血を遠心分離することにより赤血球（ＲＢＣｓ）を調製し、ＥＤＴＡを添加してリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）で複数回洗浄した。１０％ウシ胎児血清（ＦＢＳ，Ｇｉｂｃｏ）を含有するＤＭＥＭ培地においてＲＢＣｓ（２．５％（ｖ／ｖ）最終）を洗浄し、ＰＢＳで希釈した精製された抗ＰｃｒＶ抗体と一緒に丸底９６ウェルプレートのウェルに入れた。２×ＹＴ培地（Ｏｘｆｏｒｄ）において緑膿菌菌株５７／６６(Ｏ６)を対数増殖期中期まで増殖させ、遠心分離によって回収し、６００ｎｍにおける光学密度（ＯＤ６００）が０．１５になるまでＦＢＳを含有するＤＭＥＭ培地においてに再懸濁した。１０μｌの細菌懸濁液をＲＢＣ－抗体混合物に加え、攪拌により混合し、３７°Ｃ、５％ ＣＯ２で３時間インキュベートした。プレートを短時間遠心分離（１０００ｒｐｍ，１ｍｉｎ）して無傷のＲＢＣｓをペレット化し、上清液を平底９６ウェルプレートに移し、ＯＤ４０５を測定して溶解を検出した。これにより、溶解阻害の相対量を算出してプロットした。抗体のＩＣ５０値も決定した。
実施例２：全長のヒトＰｃｒＶ抗体の調製及び特性評価
全長のヒトＰｃｒＶ抗体の調製
最も潜在力があるｓｃＦｖ抗体を、ヒトＩｇＧ１の重鎖定常ドメイン及びヒトκ軽鎖定常ドメインを持つヒトＩｇＧ１抗体分子に再構築した。原核生物発現ベクターからＶＬ及びＶＨを増幅して、それぞれ、真核生物発現ベクターｐＴＴ５－Ｌ（κ定常ドメインを含む）、及びｐＴＴ５－Ｈ１（ＩｇＧ１重鎖定常ドメインを含む）に構築した。２９３Ｆ細胞のトランスフェクトに用いるように、軽鎖及び重鎖を発現するプラスミドを抽出した。前記細胞を３７°Ｃ、８％ＣＯ２、１２０ｒｐｍで５日間培養した後、培養液における抗体をＰｒｏｔｅｉｎ Ａ アフィニティークロマトグラフィーカラムで精製した。
簡単に言えば、まず、０．１５Ｍ ＮａＣｌ及び５０ｍＭ ＰＢＳを含む６倍カラム体積のＰＢＳ緩衝液（ｐＨ７．２）を使用して、１５０ｃｍ／ｈの流速でＰｒｏｔｅｉｎ Ａ カラムを平衡化した。培養上清をｐＨ７．２に調整し、１５０ｃｍ／ｈの流速でカラムに通した。更に平衡化した後、５０ｍＭのクエン酸ナトリウム緩衝液（ｐＨ３．５）を使用してカラムを洗い流し、抗ＰｃｒＶ抗体を含む溶出液を回収した。実施例１における方法及び以下で説明する方法に従って、全長の抗体について、ＲＢＣ溶解阻害(実施例1を参照)、Ａ５４９／Ｕ９３７細胞溶解阻害及びマウス急性肺炎モデルにおける生存率の改善を特性評価した。
Ａ５４９又はＵ９３７溶解阻害による抗ＰｃｒＶ候補の分析
緑膿菌による細胞毒性及び細胞溶解を阻害する能力をアッセイするために、１０％ウシ胎児血清を含有するＤＭＥＭにおいて、候補の抗ＰｃｒＶ抗体を、白い９６ウェルプレート（Ｎｕｎｃ Ｎｕｎｃｌｏｎ Ｄｅｌｔａ）に播種したヒト気管支上皮細胞株Ａ５４９又はヒト組織球性リンパ腫細胞株Ｕ９３７に添加した。対数増殖期菌株ＰＡ１０３(Ｏ１１)緑膿菌を感染多重度１０（ＭＯＩ=１０）で添加し、３７°Ｃ、５％ ＣＯ２で２時間インキュベートした後、室温で２０分間平衡化した。ＣｙｔｏＴｏｘ－ＯＮＥキット（Ｐｒｏｍｅｇａ）を使用して溶解した細胞から放出された乳酸デヒドロゲナーゼ（ＬＤＨ）を定量し、膜の完全性をアッセイした。これにより、溶解阻害の相対量をプロットした。抗体のＩＣ５０値も決定した。
マウス急性肺炎モデルによる抗ＰｃｒＶ候補の分析
候補の抗ＰｃｒＶ抗体がマウス急性肺炎モデルにおいて生存を改善する能力をアッセイした。予防モデルにおいて、感染の２４時間前に、７～８週齢のＢＡＬＢ／ｃマウス（Ｖｉｔａｌ Ｒｉｖｅｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ）へ候補の抗体又はＰＢＳを１、５、１０又は２５ｍｇ／ｋｇのマウス体重の用量で腹腔内（ｉ．ｐ．）投与した。前に記載（ＤｉＧｉａｎｄｏｍｅｎｉｃｏ ｅｔ ａｌ．，２００７，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．，１０４：４６２４－４６２９）されたように実施された急性肺炎モデルを生成するために、ＢＡＬＢ／ｃマウスへ４０μｌの接種液に懸濁する致死量又は２倍の致死量（８×１０５～１．６×１０６ ＣＦＵ；１×又は２×ＬＤ９０）の緑膿菌（ＰＡ１０３菌株）を鼻腔内接種した。マウスの生存率は、感染後７日間記録された。
１３－４２モノクローナル抗体をリード抗体としての更なる最適化
調製された全長の抗体のうち、ＲＢＣ溶解、Ａ５４９細胞又はＵ９３７細胞溶解を阻害する能力、及びマウス急性肺炎モデルにおける生存率を改善する能力により、１３－４２モノクローナル抗体をリード親抗体として選択した。
実施例３：最適化された全長の抗ＰｃｒＶ抗体の調製及び特性評価
調製された全長の抗体のうち、１３－４２をリード親抗体として選択して更なる最適化を行った。特に、重鎖のＣＤＲ３領域(ＨＣ－ＣＤＲ３)の遊離システイン残基とグリコシル化部位を除去し、ＨＣ－ＣＤＲ１、ＨＣ－ＣＤＲ２及びＬＣ－ＣＤＲ３における１１つのアミノ酸残基を選択的に操作することにより、ヒト生殖系列とのホモロジーを改善するように、１３－４２を最適化した。２つの方法により１３－４２由来の抗体を最適化した。
第１方法では、まず、ＨＣ－ＣＤＲ３における2つのシステインをコードする遺伝子座を突然変異させて終止コドンをコードすることにより、最適化テンプレートを生成した。続いて、終止コドンをコードする変異遺伝子座（前に２つのシステインをコードした）をランダムに２０つのアミノ酸のいずれかに突然変異させた。同時に、ＨＣ－ＣＤＲ３における任意のＮＸＳ配列のＡｓｎ(Ｎ)又はＳｅｒ(Ｓ)を突然変異させることにより、ＨＣ－ＣＤＲ３におけるグリコシル化部位（即ちＮＳＳ）を除去した。そして、ＨＣ－ＣＤＲ３における残りのアミノ酸のそれぞれの遺伝子座は、一度に1つずつランダムに突然変異した。最後に、ＬＣ－ＣＤＲ３、ＨＣ－ＣＤＲ１及びＨＣ－ＣＤＲ２における非ヒトアミノ酸配列を突然変異させて、ヒト配列とのホモロジーを改善した。
代替スキームでは、まず、ＨＣ－ＣＤＲ３における2つのシステインをコードする遺伝子座を突然変異させて終止コドンをコードすることにより、最適化テンプレートを生成した。続いて、終止コドンをコードする変異遺伝子座（前に２つのシステインをコードした）をランダムに２０つのアミノ酸のいずれかに突然変異させた。同時に、ＨＣ－ＣＤＲ３における、システインに隣接されたすべてのアミノ酸の遺伝子座は、同時にランダムに突然変異した。最後に、ＬＣ－ＣＤＲ３、ＨＣ－ＣＤＲ１及びＨＣ－ＣＤＲ２における非ヒトアミノ酸配列を突然変異させて、ヒト配列とのホモロジーを改善した。
１３－４２のｓｃＦｖから始めて、上記したように、ＣＤＲ領域における突然変異を含むファージｓｃＦｖディスプレイライブラリーを生成した。ＥＬＩＳＡ又はＢＬＩにより、高い親和性と低い解離速度でＰｃｒＶに結合できる突然変異体を識別し、これらの突然変異体がＲＢＣ溶解及びＡ５４９細胞溶解を阻害する機能を測定した。親１３－４２ｓｃＦｖと比較して同等又は改善された生物学的活性を示す１３－４２から最適化されたｓｃＦｖ抗体を使用して、全長の抗体を調製した。選択の最後に、最適化された全長の抗体のセットを得た。
ＥＬＩＳＡにより最適化された抗体とＰｃｒＶとの結合をアッセイした。ＥＬＩＳＡ実験において、合成ＰｃｒＶを使用して９６ウェルプレートのウェルをコーティングした。翌日、ＰＢＳＴで洗浄した後、２００μＬのＰＢＳ－ミルクで１時間ブロッキングし、ＰＢＳＴで洗浄し、抗体を加えて３７℃で１時間インキュベートした。プレートを０．１％のＴＢＳＴ溶液で６回洗浄した後、各ウェルに１００μＬのヤギ抗ヒトＦｃ抗体－ＡＰ（ＰＢＳで１：３０００希釈する）を添加し、１時間インキュベートした。０．１％のＴＢＳＴで６回洗浄した後、各ウェルに５０μｌのｐＮＰＰを添加し、３７℃で１０～２０分間発色した。マイクロプレートリーダーにより４１０ｎｍにおいて信号を読み取った。表５に示すように、ＥＬＩＳＡ結果（ＯＤ４１０）を分析して、ＥＣ５０値を計算した。
ＢＬＩにより最適化された抗ＰｃｒＶモノクローナル抗体クローン７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１、６Ａ１０、５Ｂ３、３Ｂ１２、４Ａ１０、２Ｂ１、７Ｂ２、３Ｈ１０、３Ｇ３、３Ａ１１及び３Ａ９とＰｃｒＶとの結合速度論及び親和性を測定し、結果を表６に示す。
そして、最適化された全長の抗体に対して、実施例１及び実施例２に記載された方法に従って、ＲＢＣ溶解及びＡ５４９細胞溶解を阻害する能力を特性評価した。
最適化された抗ＰｃｒＶ抗体の、緑膿菌によるＲＢＣ及びＡ５４９細胞溶解への阻害
最適化された抗ＰｃｒＶ抗体の、ＲＢＣ溶解への阻害
最適化された抗ＰｃｒＶモノクローナル抗体クローン７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１、６Ｄ１０、６Ａ１０、５Ｂ３、３Ｂ１２、４Ａ１０、２Ｂ１、７Ｂ２、３Ｈ１０、３Ｇ３、９Ｂ１２、３Ａ９、２Ｄ３、７Ｂ１－１Ｆ５がＲＢＣ溶解を阻害する能力を親１３－４２モノクローナル抗体及び参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤと比較した。ＲＢＣ溶解阻害アッセイは、実施例１に記載されているように実施された。
図１Ａ、１Ｂ及び表７に示すように、親１３－４２モノクローナル抗体及び参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤと比較して、１３－４２から最適化されたすべての抗体は、ＲＢＣ溶解を阻害することにおいて、より良い又は同等の効果を示した。
最適化された抗ＰｃｒＶ抗体のＡ５４９細胞溶解への阻害
親１３－４２モノクローナル抗体とともに、最適化された抗ＰｃｒＶ抗体７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１、６Ｄ１０、６Ａ１０、５Ｂ３、３Ｂ１２、４Ａ１０、２Ｂ１、７Ｂ２、３Ｈ１０、３Ｇ３、３Ａ１１、３Ａ９がＡ５４９細胞溶解を阻害する能力を評価した。Ａ５４９細胞溶解阻害アッセイは、実施例２に記載されているように実施された。
図２Ａ、２Ｂ及び表８に示すように、与親１３－４２モノクローナル抗体と比較して、１３－４２から最適化されたすべての抗体は、Ａ５４９溶解を阻害することにおいて、より良い又は同等の効果を示した。
実施例４：最適化された抗ＰｃｒＶ抗体の特異性と親和性の特性評価
最適化された抗体において、７Ｃ１、７Ｂ１、８Ｃ１及び６Ｄ１０がＰｃｒＶと結合する親和性及び特異性について、さらに特性評価を行った。
最適化された抗体とＰｃｒＶとの結合親和性
ＢＩＡＣＯＲＥ（ＧＥ社）により最適化された抗ＰｃｒＶモノクローナル抗体クローン７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１、６Ｄ１０及び参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤとＰｃｒＶとの結合定数（ｋａ）、解離定数（ｋｄ）及び平衡解離定数（ｋＤ）を測定した。最適化されたクローン７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１、６Ｄ１０（それぞれ、８．４７Ｅ－１１Ｍ、４．５７Ｅ－１１Ｍ、３．１６Ｅ－１１Ｍ、５．２０Ｅ－１１Ｍ）のｋＤ値とＶ２Ｌ２－ＭＤ抗体（４Ｅ－１１Ｍ）のｋＤ値が同等である。また、同等のｋａ及びｋｄ値で示されるように、最適化された抗体７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１及び６Ｄ１０は、ＰｃｒＶに結合することにおいて、同等の結合及び解離速度論を示した（データが示さない）。
抗ＰｃｒＶ抗体の特異性
ＢＶ粒子及びＰｃｒＶ陰性Ａ５４９細胞との交差反応性を測定することにより、最適化された抗ＰｃｒＶ抗体の特異性について、特性評価を行った。
ＢＶ粒子との交差反応性：前に記載された方法（Ｈoｔｚｅｌ Ｉ，ｅｔ ａｌ，２０１２，ｍＡｂｓ ４：６，７５３-７６０参照）によって、ＥＬＩＳＡで最適化された抗体（７Ｃ１、７Ｂ１、８Ｃ１、６Ｄ１０）及び参照抗体（Ｖ２Ｌ２－ＭＤ、Ｍａｂ１６６）のＢＶ粒子に対する交差反応性をテストした。図３に示すように、Ｍａｂ１６６は、ＢＶ粒子に対する高レベルの非特異的結合を示した。これに対して、最適化された抗体７Ｃ１、７Ｂ１、８Ｃ１、６Ｄ１０は、Ｖ２Ｌ２－ＭＤに似ていてＭａｂ１６６よりはるかに低い低レベルの非特異的結合を示した。
Ａ５４９細胞との交差反応性：ＦＡＣＳで親抗体１３－４２、最適化された抗体７Ｃ１、７Ｂ１、８Ｃ１、６Ｄ１０及びＶ２Ｌ２－ＭＤのＰｃｒＶ陰性Ａ５４９細胞に対する交差反応性をテストした。図４Ａ～４Ｅに示すように、１３－４２モノクローナル抗体及び最適化された抗体７Ｃ１、７Ｂ１、８Ｃ１、６Ｄ１０は、いずれも陰性コントロール（抗体なし）及びＶ２Ｌ２－ＭＤに似ている低レベルのＡ５４９細胞結合を示した一方、Ａ５４９細胞の上のＧＭ－ＣＳＦに特異的な陽性コントロール抗体は、Ａ５４９細胞に対してさらなる高レベルの結合を示した。
まとめると、これらの結果から、最適化された抗体７Ｃ１、７Ｂ１、８Ｃ１及び６Ｄ１０は、親抗体１３－４２及び参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤに似ている低い非特異的結合を示すとともに、別の参照である抗ＰｃｒＶ抗体Ｍａｂ１６６よりはるかに低い非特異的結合を示すことが分かる。
実施例５：最適化された全長の抗ＰｃｒＶ抗体広範囲の緑膿菌菌株の中和
最適化された抗ＰｃｒＶ抗体が広範囲の緑膿菌菌株を中和できるかどうかを調べるために、最適化された抗ＰｃｒＶ抗体が緑膿菌感染の臨床例の７０％を代表する複数の臨床的に関連する緑膿菌菌株（Ｏ６、Ｏ１１、Ｏ１、Ｏ１６）によるＲＢＣ及びＡ５４９細胞溶解を阻害する能力を調査した。
最適化された抗ＰｃｒＶ抗体によるＲＢＣ溶解阻害
親１３－４２モノクローナル抗体及び参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤと比較して、最適化された抗ＰｃｒＶモノクローナル抗体クローン７Ｃ１、８Ｃ１及び７Ｂ１がさまざまな緑膿菌菌株（Ｏ１－５２／６６、Ｏ１６－１７７／８１及びＯ６－５７／６６）によるＲＢＣ溶解を阻害する效力について、さらに分析した。ＲＢＣ溶解阻害アッセイは、実施例１に記載されているように実施された。
図５Ａ～５Ｃ及び表９に示すように、最適化されたモノクローナル抗体クローン７Ｃ１、８Ｃ１及び７Ｂ１は、菌株Ｏ１－５２／６６、Ｏ１６－１７７／８１及びＯ６－５７／６６によるＲＢＣ溶解の阻害において、参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤ又は親１３－４２モノクローナル抗体より良い效力を示した。

最適化された抗ＰｃｒＶ抗体によるＡ５４９細胞溶解阻害
親１３－４２モノクローナル抗体と比較して、最適化された抗ＰｃｒＶモノクローナル抗体クローン７Ｃ１、８Ｃ１及び７Ｂ１がさまざまな緑膿菌菌株（Ｏ６－５７／６６、Ｏ１１－ＰＡ１０３、Ｏ１－５２／６６及びＯ１６－１７７／８１）によるＡ５４９細胞溶解を阻害する能力について、分析した。Ａ５４９細胞溶解阻害アッセイは、実施例２に記載されているように実施された。
図６Ａ～６Ｄ及び表１０に示すように、最適化されたモノクローナル抗体クローン７Ｃ１、８Ｃ１及び７Ｂ１は、菌株Ｏ６－５７／６６、Ｏ１１－ＰＡ１０３、Ｏ１－５２／６６及びＯ１６－１７７／８１によるＡ５４９溶解の阻害において、親１３－４２モノクローナル抗体に相当する效力を示した。
最適化された抗体が広範囲で緑膿菌菌株を中和できるかどうかをさらに説明するために、これらの抗体が様々な形態のＰｃｒＶ突然変異体に結合する能力をテストした。簡単に言えば、Ｇｅｎｅｂａｎｋデータベースからランダムに１００個のＰｃｒＶ配列を選択した。配列番号ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１に示される野生型配列と比較して、選択された配列の１３％は、７Ｂ１に結合するエピトープの周りの主な突然変異である部位２２５にＲ、Ｇ又はＫ（野生型配列ＳＥＱ Ｎｏ：７１では、Ｓである）を含んだ。
最適化された７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１及び６Ｄ１０抗体のこれらのＰｃｒＶ突然変異体（部位２２５突然変異）への親和性及び特異性を特性評価したところ、前記抗体がこれらの突然変異体にも強く結合することが分かった（データが示さない）。これらの結果は、さらに、最適化された抗ＰｃｒＶ抗体が様々な形態のＰｃｒＶ突然変異体を発現するできる広範囲の緑膿菌菌株を中和できることを示した。
実施例６：最適化された抗ＰｃｒＶ抗体の緑膿菌感染の予防的治療の使用
マウス肺炎モデル、腹腔内感染モデル及び免疫不全マウス肺炎モデルにおける生存率の改善によって、緑膿菌感染から予防的に保護するという最適化された抗ＰｃｒＶ抗体の能力は、実証された。
抗ＰｃｒＶ抗体によるマウス肺炎モデルの生存率の改善
親１３－４２モノクローナル抗体及び前に記載されたＨＩＶを広く中和する抗体であるＨＩＶ－１０Ｅ８（Ｈｕａｎｇ Ｊ，ｅｔ ａｌ，２０１２，Ｎａｔｕｒｅ ４９１：４０６参照）と比較して、マウス肺炎モデルにおける最適化された抗体７Ｃ１、７Ｂ１及び３Ｇ３の生存率を改善する能力を評価した。
予防モデルにおいて、感染の２４時間前に、７～８週齢のＢＡＬＢ／ｃマウス（Ｖｉｔａｌ Ｒｉｖｅｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ）へ抗体を１又は１０ｍｇ／ｋｇのマウス体重の用量で腹腔内（ｉ．ｐ．）投与した。急性肺炎を誘発するために、ＢＡＬＢ／ｃマウスへ４０μｌの接種液に懸濁する致死量（１×ＬＤ９０）又は２倍の致死量（２×ＬＤ９０）（８×１０５～１．６×１０６ ＣＦＵ）の緑膿菌（ＰＡ１０３菌株）を鼻腔内接種した。マウスの生存率は、感染後７日間記録された。その結果は、カプランマイヤー生存曲線で表された。
図７Ａ～７Ｂにおけるカプランマイヤー生存曲線に示すように、陰性コントロールと比較して、１倍及び２倍の致死量（１×ＬＤ９０又は２×ＬＤ９０；８×１０５～１．６×１０６ ＣＦＵ）の緑膿菌（ＰＡ１０３菌株）を接種した場合、すべての抗ＰｃｒＶ抗体は、生存率の大幅な改善を示した（Ｐ<０．００１）。また、親１３－４２モノクローナル抗体と比較して、最適化された抗体７Ｃ１、７Ｂ１は、同等又はより良い生存率の改善を示した（Ｐ<０．０５）。生存率の差は、ログランク検定によって計算された。
抗ＰｃｒＶ抗体を投与したマウス肺炎モデルにおける臓器負荷
参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤと比較して、親抗ＰｃｒＶ抗体１３－４２モノクローナル抗体の急性肺炎モデルにおける臓器負荷を軽減する能力を評価した。最適化された抗ＰｃｒＶ抗体クローン７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１及び６Ｄ１０の急性肺炎モデルにおける臓器負荷を軽減する能力をさらに評価した。ＨＩＶ－１０Ｅ８は、陰性コントロールとした。
予防モデルにおいて、感染の２４時間前に、７～８週齢のＢＡＬＢ／ｃマウス（Ｖｉｔａｌ Ｒｉｖｅｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ）へ抗体又はＰＢＳを１０ｍｇ／ｋｇのマウス体重の用量で腹腔内（ｉ．ｐ．）投与した。急性肺炎を誘発するために、ＢＡＬＢ／ｃマウスへ４０μｌの接種液に懸濁する半分の致死量（０．５×ＬＤ９０；３×１０５ ＣＦＵ）の緑膿菌（ＰＡ１０３菌株）を鼻腔内接種した。感染の２４時間後、マウスを安楽死させ、肺、脾臓、腎臓を摘出し、ホモジナイズし、希釈してから寒天に播種し、それぞれの臓器サンプルにおける緑膿菌の負荷を表す生菌単位（ＣＦＵ）を測定した。
図８Ａに示すように、マウス肺炎モデルにおいて、１３－４２モノクローナル抗体は、Ｖ２Ｌ２－ＭＤと比較して、より良い肺の臓器負荷を軽減する効果及び類似な脾臓及び腎臓の臓器負荷を軽減する効果を示した。
図８Ｂに示すように、マウス肺炎モデルにおいて、抗ＰｃｒＶモノクローナル抗体クローン７Ｂ１、７Ｃ１、８Ｃ１及び６Ｄ１０は、Ｖ２Ｌ２－ＭＤと比較して、肺、脾臓、腎臓の臓器負荷を軽減することに同等の効果を示し、ＨＩＶ－１０Ｅ８と比較して、肺、脾臓、腎臓の臓器負荷を軽減するのにより高い効果を示した。
抗ＰｃｒＶ抗体を投与したマウス腹腔内感染モデルの生存率の改善
１３－４２モノクローナル抗体と比較して、最適化された抗ＰｃｒＶ抗体７Ｃ１、７Ｂ１及び８Ｃ１のマウス腹腔内感染モデルの生存を改善する能力を評価した。ＨＩＶ－１０Ｅ８は、陰性コントロールとした。マウス腹腔内感染モデルは、前記のように生成された（Ｗａｒｒｅｎｅｒ ｅｔ ａｌ，２０１４，Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ．Ａｇｅｎｔｓ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒ．，５８，４３８４－４３９１参照）。
予防モデルにおいて、感染の２４時間前に、７～８週齢のＢＡＬＢ／ｃマウス（Ｖｉｔａｌ Ｒｉｖｅｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ）へ抗体を５又は２５ｍｇ／ｋｇのマウス体重の用量で腹腔内（ｉ．ｐ．）投与した。腹腔内感染を誘発するために、ＢＡＬＢ／ｃマウスへ３００μｌの接種液に懸濁する３倍の致死量（３×ＬＤ９０＝７×１０５ ＣＦＵ）の緑膿菌（Ｏ６－５７／６６菌株）を腹腔内接種した。マウスの生存率は、感染後５日間記録された。
図９に示すように、陰性コントロールと比較して、３倍の死量（３×ＬＤ９０）の緑膿菌を接種した場合、すべての抗ＰｃｒＶ抗体は、２５ｍｇ／ｋｇの抗体用量で、生存率の大幅な改善を示した（Ｐ<０．０００１）。また、親１３－４２モノクローナル抗体と比較して、最適化された抗体７Ｃ１、７Ｂ１は、５ｍｇ／ｋｇ抗体用量で、同等又はより良い生存率の改善を示した（Ｐ<０．０５）。生存率の差は、ログランク検定によって計算された。
抗ＰｃｒＶ抗体を投与した免疫不全マウス肺炎モデルの生存率の改善
１３－４２モノクローナル抗体と比較して、最適化された抗ＰｃｒＶ抗体７Ｃ１、７Ｂ１及び８Ｃ１の免疫不全マウス肺炎モデルにおける生存率を改善する能力を評価した。ＨＩＶ－１０Ｅ８は、陰性コントロールとした。免疫不全マウス急性肺炎モデルは、前記のように生成された（ＤｉＧｉａｎｄｏｍｅｎｉｃｏ ｅｔ ａｌ．，２０１４，Ｓｃｉ．Ｔｒａｎｓｌ．Ｍｅｄ．，６：２６２ｒａ１５５）。
予防モデルにおいて、免疫抑制を達成するために、まず、緑膿菌感染の４日前及び１日前に、７～８週齢のＢＡＬＢ／ｃマウス（Ｖｉｔａｌ Ｒｉｖｅｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ）へ１５０ｍｇ／ｋｇのシクロホスファミドを２回投与し、白血球数を抑制した。その後、感染の２４時間前に、抗体を３．２又は５ｍｇ／ｋｇのマウス体重の用量で腹腔内（ｉ．ｐ．）投与した。急性肺炎を誘発するために、ＢＡＬＢ／ｃマウスへ４０μｌの接種液に懸濁する致死量（１×ＬＤ９０＝１０ＰＦＵ）の緑膿菌（Ｏ６－５７／６６菌株）を鼻腔内接種した。マウスの生存率は、感染後１０日間記録された。
図１０に示すように、陰性コントロールと比較して、致死量（１×ＬＤ９０）の緑膿菌を接種した場合、すべての抗ＰｃｒＶ抗体は、生存率の大幅な改善を示した（Ｐ<０．０５）。また、親１３－４２抗体と比較して、最適化された抗体７Ｃ１は、より良い生存率の改善を示し（Ｐ<０．０５）、親１３－４２抗体と比較して、最適化された抗体７Ｂ１、８Ｃ１は、同等又はより良い生存率の改善を示した（Ｐ<０．０５）。生存率の差は、ログランク検定によって計算された。
まとめると、これらの結果は、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体は、免疫不全マウス急性肺炎モデルにおいて緑膿菌感染の予防に有用であることを示した。
実施例７：最適化された抗ＰｃｒＶ抗体の緑膿菌感染の治療の使用
マウス肺炎モデルにおける生存率の改善によって、緑膿菌感染を治療するという最適化された抗ＰｃｒＶ抗体の効力は、実証された。
最適化された抗ＰｃｒＶ抗体によるマウス肺炎モデルの生存率の改善
陽性コントロールであるＶ２Ｌ２－ＭＤと比較して、マウス肺炎モデルにおける最適化された抗ＰｃｒＶ抗体７Ｃ１、７Ｂ１、８Ｃ１及び６Ｄ１０の生存率を改善する能力を評価した。ＨＩＶ－１０Ｅ８は、陰性コントロールとした。
治療モデルにおいて、急性肺炎を誘発するために、７～８週齢のＢＡＬＢ／ｃへ４０μｌの接種液に懸濁する致死量（１×ＬＤ９０＝８×１０５ＣＦＵ）の緑膿菌（ＰＡ１０３菌株）を鼻腔内接種した。感染の１時間後に、抗体又はＰＢＳを１ｍｇ／ｋｇ又は１０ｍｇ／ｋｇのマウス体重の用量で静脈内（ｉ．ｖ．）投与した。マウスの生存率は、感染後６日間記録された。
図１１Ａ～１１Ｂに示すように、陰性コントロールと比較して、致死量（１×ＬＤ９０）の緑膿菌を接種した場合、すべての抗ＰｃｒＶ抗体、生存率の大幅な改善を示した（Ｐ<０．０５）。また、Ｖ２Ｌ２－ＭＤと比較して、最適化された抗体７Ｃ１、７Ｂ１、８Ｃ１及び６Ｄ１０は、同等の生存率の改善を示した。生存率の差は、ログランク検定によって計算された。それらの結果は、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体は、緑膿菌感染の治療に有用であることを示した。
実施例８：最適化された抗ＰｃｒＶ抗体と抗生物質とを併用する緑膿菌感染の治療
抗生物質と組み合わせる抗ＰｃｒＶ抗体によるマウス腹腔内感染モデルの生存率の改善
抗生物質であるメロペネム、トブラマイシン、シプロフロキサシンと比較して、また、７Ｂ１又は８Ｃ１といずれか１つの抗生物質との併用治療と比較して、マウス腹腔内感染モデルにおける最適化された抗ＰｃｒＶ抗体７Ｂ１又は８Ｃ１の生存率を改善する能力を評価した。ＨＩＶ－１０Ｅ８は、陰性コントロールとした。
予防モデルにおいて、抗ＰｃｒＶ抗体をアッセイした。試験の感染の２４時間前に、７～８週齢のＢＡＬＢ／ｃマウス（Ｖｉｔａｌ Ｒｉｖｅｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ）へ抗体を、又は感染の１時間後に抗生物質を腹腔内注射した。具体的に、マウスへ、最適化された抗ＰｃｒＶ抗体クローン７Ｂ１又は８Ｃ１（５ｍｇ／ｋｇ）、メロペネム（３ｍｇ／ｋｇ）、トブラマイシン（１０ｍｇ／ｋｇ）、シプロフロキサシン（３０ｍｇ／ｋｇ）、若しくは７Ｂ１又は８Ｃ１といずれか１つの抗生物質との組み合わせをそれぞれ投与した。腹腔内感染を誘発するために、ＢＡＬＢ／ｃマウスへ３００μｌの接種液に懸濁する３倍の致死量（３×ＬＤ９０＝７×１０５ＣＦＵ）の緑膿菌（ＰＡ１０３菌株）を腹腔内接種した。マウスの生存率は、感染後５日間記録された。
図１２Ａに示すように、抗生物質であるメロペネム（３ｍｇ／ｋｇ）と比較して、３倍の致死量（３×ＬＤ９０）の緑膿菌を接種した場合、最適化された抗体７Ｂ１（５ｍｇ／ｋｇ）は、より良い又は同等の生存率の改善を示した。抗体を単独に使用した治療又は各抗生物質を単独に使用した治療と比較して、７Ｂ１（５ｍｇ／ｋｇ）と抗生物質であるメロペネム（３ｍｇ／ｋｇ）、トブラマイシン（１０ｍｇ／ｋｇ）又はシプロフロキサシン（３０ｍｇ／ｋｇ）との組み合わせは、生存率の大幅な改善を示した（ｐ<０．０５）。図１２Ｂに示すように、抗体を単独に使用した治療、又は各抗生物質を単独に使用した治療と比較して、８Ｃ１（５ｍｇ／ｋｇ）と抗生物質であるトブラマイシン（１０ｍｇ／ｋｇ）又はシプロフロキサシン（３０ｍｇ／ｋｇ）との組み合わせは、生存率の大幅な改善を示した（ｐ<０．０５）。これらの結果から、本明細書に記載の抗ＰｃｒＶ抗体と抗生物質との併用は、緑膿菌を中和することにおける臨床的可能性を示すことが分かる。
実施例９：最適化された抗ＰｃｒＶ抗体の薬物動態学
親１３－４２抗ＰｃｒＶ抗体及び最適化されたクローンのインビボ薬物動態を調査するために、ラットにおける７Ｃ１、７Ｂ１、８Ｃ１及び６Ｄ１０抗体の血漿レベルを経時的に測定した。
ラットにおける薬物動態学：４０匹の健康な成体ラット（体重約０．２ｋｇ／匹）を等しく２つのグループに分け、各グループの平均体重に大差がない。一つのグループに３０ｍｇ／ｋｇの用量でＶ２Ｌ２－ＭＤ、７Ｃ１、７Ｂ１、８Ｃ１又は６Ｄ１０を静脈内注射し、他のグループに３ｍｇ／ｋｇの用量でＶ２Ｌ２－ＭＤ、７Ｃ１、７Ｂ１、８Ｃ１又は６Ｄ１０を静脈内注射した。注射から０時間、０．５時間、２時間、８時間、１日、３日、７日、１１日、１７日、２３日、３１日、４１日、５２日後にそれぞれ採血した。遠心分離した後、ＥＬＩＳＡ法により血漿における抗体濃度をアッセイした。ＥＬＩＳＡ実験において、合成されたＰｃｒＶを９６ウェルプレートでコーティングした。翌日、ＰＢＳＴ溶液で洗浄した後、２００μＬのＰＢＳ－ミルクで１時間ブロッキングし、ＰＢＳＴで洗浄し、血漿を加えて３７℃に１時間インキュベートした。プレートを０．１％のＴＢＳＴ溶液で６回洗浄した後、各ウェルに１００μｌのヤギ抗ヒトＦｃ抗体－ＡＰ（ＰＢＳで１：３０００希釈した）を添加し、１時間インキュベートした。０．１％のＴＢＳＴで６回洗浄した後、各ウェルに５０μｌのｐＮＰＰを添加し、３７℃で１０～２０ｍｉｎ分間発色した。マイクロプレートリーダーにより４１０ｎｍにおいて信号を読み取った。
図１３Ａ及び１３Ｂに示すように、高い用量及び低い用量（３ｍｇ／ｋｇ又は３０ｍｇ／ｋｇ）で静脈内注射した場合、参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤと比較して、７Ｃ１、７Ｂ１、８Ｃ１又は６Ｄ１０の半減期は、同等又はより長く、参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤと比較して、最適化された抗体は、異なる用量でより安定した薬物動態学を示した。
実施例１０：最適化された抗体によって認識されるエピトープ
抗ＰｃｒＶ抗体によって結合されるエピトープを特性評価するために、ＰｃｒＶタンパク質に突然変異を導入して、ＥＬＩＳＡにより最適化された抗体７Ｂ１モノクローナル抗体がこれらのＰｃｒＶ突然変異体に結合する能力を測定した。
抗ＰｃｒＶ抗体のエピトープのスクリーニング
Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ Ｓｔｕｄｉｏソフトウェアを使用して、ＰｃｒＶ上の７Ｂ１及び最適化された抗体に結合する予測された部位を同定し、結合部位内及び結合部位に近接するアミノ酸残基を選択して、アラニンスキャンを行った。続いて、これらの選択された突然変異を有するＰｃｒＶタンパク質が発現された。ＥＬＩＳＡによって、７Ｂ１－ＩｇＧ１と各突然変異ＰｃｒＶタンパク質との結合親和性を分析した。図１４Ａ～１４Ｄは、抗体と突然変異したＰｃｒＶとのＥＬＩＳＡ結合曲線を示し、突然変異の位置が配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１に従った。本明細書において、ＰｃｒＶは、Ｈｉｓタグ付き野生型緑膿菌ＰｃｒＶ（ＰｃｒＶ－６Ｈｉｓ）を表す。野生型ＰｃｒＶのアミノ酸配列上の様々な位置の突然変異は、上記のようなアラニンスキャン技術で生成された。図１４Ａ～１４Ｄに示すように、部位Ｑ１６０での突然変異は、７Ｂ１－ＩｇＧ１による結合に明らかな影響を与えた（図１４Ｃ）。これに対して、ＰｃｒＶにおけるＱ１６０の突然変異は、参照抗体Ｖ２Ｌ２－ＭＤによる結合に（データが示さない）影響を与えなかった。部位Ｄ１６５での突然変異も、７Ｂ１－ＩｇＧ１による結合に影響を与えた（図１４Ｃ）。また、部位Ｄ１７０、Ｄ１７３、Ｔ１７５及びＳ２０２のそれぞれの突然変異は、７Ｂ１－ＩｇＧ１による結合に影響を与えた（図１４Ｄ）。これらの結果に基づいて、７Ｂ１－ＩｇＧ１抗体の例示的なエピトープは、同定され、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７１に従って、アミノ酸残基Ｇｌｎ１６０、Ａｓｐ１６５、Ａｓｐ１７０、Ａｓｐ１７３、Ｔｈｒ１７５及びＳｅｒ２０２を含む。

Claims (19)

  1. (ｉ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｉｉ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｉｉｉ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｉｖ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｖ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｖｉ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｖｉｉ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２１からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｖｉｉｉ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２２からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｉｘ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２３からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｘ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１２からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２４からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｘｉ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２５からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｘｉｉ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２６からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｘｉｉｉ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２７からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｘｉｖ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｘｖ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｘｖｉ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、
    (ｘｖｉｉ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１４からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含むか、或いは
    (ｘｖｉｉｉ)Ｖ Ｈ 及びＶ Ｌ を含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７からなるＨＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３からなるＨＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９からなるＨＣ－ＣＤＲ３とを含み、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２からなるＬＣ－ＣＤＲ１と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４からなるＬＣ－ＣＤＲ２と、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３８からなるＬＣ－ＣＤＲ３とを含み、
    前記ＨＣ－ＣＤＲとは、重鎖相補性決定領域であり、前記ＬＣ－ＣＤＲとは、軽鎖相補性決定領域である、単離された抗ＰｃｒＶ抗体。
  2. (ｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４８又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４８と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｉｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６６又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６６と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｉｖ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｖ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｖｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５３又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５３と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｖｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５４又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５４と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｖｉｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５５と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｉｘ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｘ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５７と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６８又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６８と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｘｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５８又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５８と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６９又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６９と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｘｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｘｉｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｘｉｖ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６１又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６１と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｘｖ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｘｖｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６３と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６５と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、
    (ｘｖｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６４と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７と少なくとも９０％の配列同一性を有するか、或いは
    (ｘｖｉｉｉ)ＶＨ及びＶＬを含み、前記ＶＨは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６２と少なくとも９０％の配列同一性を有し、前記ＶＬは、アミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７０又はその変異体を含み、前記変異体がアミノ酸配列ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７０と少なくとも９０％の配列同一性を有する、
    請求項１に記載の単離された抗ＰｃｒＶ抗体。
  3. 前記抗ＰｃｒＶ抗体は、Ｆｃフラグメントを含む、
    請求項１又は２に記載の単離された抗ＰｃｒＶ抗体。
  4. 前記抗ＰｃｒＶ抗体は、全長のＩｇＧ抗体である、
    請求項３に記載の単離された抗ＰｃｒＶ抗体。
  5. 前記抗ＰｃｒＶ抗体は、全長のＩｇＧ１又はＩｇＧ４抗体である、
    請求項４に記載の単離された抗ＰｃｒＶ抗体。
  6. 前記抗ＰｃｒＶ抗体は、キメラ抗体、ヒト抗体又はヒト化抗体である、
    請求項１～５のいずれか１項に記載の単離された抗ＰｃｒＶ抗体。
  7. 前記抗ＰｃｒＶ抗体は、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ）’２、Ｆａｂ’－ＳＨ、一本鎖抗体（ｓｃＦｖ）、Ｆｖフラグメント、ｄＡｂ、Ｆｄ、及びダイアボディからなる群から選択される抗原結合性フラグメントである、
    請求項１又は２に記載の単離された抗ＰｃｒＶ抗体。
  8. 請求項１～７のいずれか１項に記載の単離された抗ＰｃｒＶ抗体をコードする、単離された核酸分子。
  9. 請求項８に記載の単離された核酸分子を含む、ベクター。
  10. 請求項１～７のいずれか１項に記載の単離された抗ＰｃｒＶ抗体、請求項８に記載の単離された核酸分子、又は請求項９に記載のベクターを含む、単離された宿主細胞。
  11. 単離された抗ＰｃｒＶ抗体を調製する方法であって、
    ａ）抗ＰｃｒＶ抗体を有効に発現する条件で請求項１０に記載の単離された宿主細胞を培養すること、及び
    ｂ）前記宿主細胞から、発現された抗ＰｃｒＶ抗体を得ることを含む、単離された抗ＰｃｒＶ抗体の調製方法。
  12. 請求項１～７のいずれか１項に記載の単離された抗ＰｃｒＶ抗体、請求項８に記載の単離された核酸分子、請求項９に記載のベクター、又は請求項１０に記載の単離された宿主細胞と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
  13. 必要とする個体における病原菌感染の治療薬の製造における、請求項１～７のいずれか１項に記載の単離された抗ＰｃｒＶ抗体、請求項８に記載の単離された核酸分子、請求項９に記載のベクター、請求項１０に記載の単離された宿主細胞、又は請求項１２に記載する医薬組成物の使用。
  14. 前記感染は、グラム陰性菌感染である、
    請求項１３に記載の使用。
  15. 前記グラム陰性菌は、緑膿菌である、
    請求項１４に記載の使用。
  16. 前記病原菌感染は、緑膿菌感染による症状の一種又は複数種を含む、
    請求項１３～１５のいずれか１項に記載の使用。
  17. 前記症状は、熱、悪寒、疲労、筋肉及び関節の痛み、関節の腫れ、頭痛、下痢、皮膚発疹、創傷の膿、細菌血症、急性肺炎、腹腔内感染、呼吸器感染、敗血症性ショック、化膿性関節炎、腸炎、皮膚及び軟組織感染、尿路感染、腸感染、潰瘍性角膜炎、慢性化膿性中耳炎、乳様突起炎、副鼻腔炎、及び心内膜炎のうちの一種又は複数種を含む、
    請求項１６に記載の使用。
  18. 前記単離された抗ＰｃｒＶ抗体、前記単離された核酸分子、前記ベクター、前記単離された宿主細胞、又は前記医薬組成物は抗生物質とともに投与するために使用されるものである、
    請求項１３～１７のいずれか１項に記載の使用。
  19. 前記抗生物質は、イミペネム、トブラマイシン、シプロフロキサシン、メロペネム、及びアズトレオナムのうちの一種又は複数種である、
    請求項１８に記載の使用。
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