JP7419068B2 - 悪性腫瘍を特定するためのキット及びその使用 - Google Patents
悪性腫瘍を特定するためのキット及びその使用 Download PDFInfo
- Publication number
- JP7419068B2 JP7419068B2 JP2019533333A JP2019533333A JP7419068B2 JP 7419068 B2 JP7419068 B2 JP 7419068B2 JP 2019533333 A JP2019533333 A JP 2019533333A JP 2019533333 A JP2019533333 A JP 2019533333A JP 7419068 B2 JP7419068 B2 JP 7419068B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- alkyl
- ptprk
- rspo3
- fusion
- amplification
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 title claims description 62
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims description 346
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims description 346
- 101000591201 Homo sapiens Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa Proteins 0.000 claims description 313
- 102100034089 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa Human genes 0.000 claims description 305
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 300
- 230000004927 fusion Effects 0.000 claims description 278
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 206
- 102100022766 R-spondin-3 Human genes 0.000 claims description 200
- 101000825960 Homo sapiens R-spondin-3 Proteins 0.000 claims description 199
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 185
- -1 substituted Chemical class 0.000 claims description 131
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 114
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 101
- 101150039757 EIF3E gene Proteins 0.000 claims description 100
- 102100033132 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E Human genes 0.000 claims description 95
- 101100279491 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) int6 gene Proteins 0.000 claims description 95
- 101000825949 Homo sapiens R-spondin-2 Proteins 0.000 claims description 81
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 claims description 79
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 claims description 79
- 102100022763 R-spondin-2 Human genes 0.000 claims description 77
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 claims description 76
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 64
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims description 57
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 50
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 claims description 49
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 claims description 48
- 125000001072 heteroaryl group Chemical group 0.000 claims description 48
- QTRXIFVSTWXRJJ-UHFFFAOYSA-N 2-(1,3-dimethyl-2,6-dioxopurin-7-yl)-n-(6-phenylpyridazin-3-yl)acetamide Chemical compound C1=2C(=O)N(C)C(=O)N(C)C=2N=CN1CC(=O)NC(N=N1)=CC=C1C1=CC=CC=C1 QTRXIFVSTWXRJJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 39
- 125000000623 heterocyclic group Chemical group 0.000 claims description 36
- 125000004452 carbocyclyl group Chemical group 0.000 claims description 32
- 102000013814 Wnt Human genes 0.000 claims description 29
- 108050003627 Wnt Proteins 0.000 claims description 29
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 claims description 25
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 24
- 230000004156 Wnt signaling pathway Effects 0.000 claims description 22
- 125000004737 (C1-C6) haloalkoxy group Chemical group 0.000 claims description 20
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 20
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 20
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 20
- 125000000171 (C1-C6) haloalkyl group Chemical group 0.000 claims description 18
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 18
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 claims description 17
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 16
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 claims description 15
- 229940123882 Porcupine inhibitor Drugs 0.000 claims description 12
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims description 12
- 125000000753 cycloalkyl group Chemical group 0.000 claims description 10
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 claims description 10
- 150000002367 halogens Chemical class 0.000 claims description 10
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims description 10
- 230000036210 malignancy Effects 0.000 claims description 10
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 9
- 125000006273 (C1-C3) alkyl group Chemical group 0.000 claims description 8
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims description 7
- 125000001188 haloalkyl group Chemical group 0.000 claims description 7
- 230000011664 signaling Effects 0.000 claims description 7
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims description 6
- 241001481760 Erethizon dorsatum Species 0.000 claims description 5
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 5
- 125000004438 haloalkoxy group Chemical group 0.000 claims description 5
- 206010017993 Gastrointestinal neoplasms Diseases 0.000 claims description 4
- 210000000436 anus Anatomy 0.000 claims description 4
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 claims description 4
- 210000003238 esophagus Anatomy 0.000 claims description 4
- 210000000232 gallbladder Anatomy 0.000 claims description 4
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 claims description 4
- 210000002429 large intestine Anatomy 0.000 claims description 4
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 claims description 4
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 claims description 4
- 210000000664 rectum Anatomy 0.000 claims description 4
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 claims description 4
- 210000000813 small intestine Anatomy 0.000 claims description 4
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 claims description 4
- 125000000547 substituted alkyl group Chemical group 0.000 claims description 4
- 125000004663 dialkyl amino group Chemical group 0.000 claims description 3
- 229920006395 saturated elastomer Chemical group 0.000 claims description 3
- 239000012188 paraffin wax Substances 0.000 claims description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 2
- DNSISZSEWVHGLH-UHFFFAOYSA-N butanamide Chemical compound CCCC(N)=O DNSISZSEWVHGLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical group O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 125000003107 substituted aryl group Chemical group 0.000 claims 1
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 273
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 178
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 83
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 68
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 67
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 54
- 239000002585 base Substances 0.000 description 37
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 28
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 27
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 25
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 25
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 24
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 23
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 22
- 239000012807 PCR reagent Substances 0.000 description 20
- 230000001351 cycling effect Effects 0.000 description 20
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 20
- 125000002950 monocyclic group Chemical group 0.000 description 20
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 18
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 17
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 17
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 17
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 17
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 16
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 16
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 16
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 15
- 125000002023 trifluoromethyl group Chemical group FC(F)(F)* 0.000 description 15
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 14
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 14
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 14
- 238000013102 re-test Methods 0.000 description 14
- 125000001140 1,4-phenylene group Chemical group [H]C1=C([H])C([*:2])=C([H])C([H])=C1[*:1] 0.000 description 12
- DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N Acetamide Chemical compound CC(N)=O DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 12
- 125000001153 fluoro group Chemical group F* 0.000 description 12
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 12
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 12
- 125000001541 3-thienyl group Chemical group S1C([H])=C([*])C([H])=C1[H] 0.000 description 11
- 239000013614 RNA sample Substances 0.000 description 11
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 description 10
- 208000001333 Colorectal Neoplasms Diseases 0.000 description 10
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 10
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 10
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 10
- 125000004076 pyridyl group Chemical group 0.000 description 10
- 125000006413 ring segment Chemical group 0.000 description 10
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 101150109344 Ptprk gene Proteins 0.000 description 9
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 9
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 9
- 125000000113 cyclohexyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 9
- 125000004216 fluoromethyl group Chemical group [H]C([H])(F)* 0.000 description 9
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 9
- 125000001436 propyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 9
- 239000012453 solvate Substances 0.000 description 9
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 9
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- VIJSPAIQWVPKQZ-BLECARSGSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-acetamido-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-4,4-dimethylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]propanoyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)pentanoic acid Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(C)=O VIJSPAIQWVPKQZ-BLECARSGSA-N 0.000 description 8
- 125000004169 (C1-C6) alkyl group Chemical group 0.000 description 8
- UDGUGZTYGWUUSG-UHFFFAOYSA-N 4-[4-[[2,5-dimethoxy-4-[(4-nitrophenyl)diazenyl]phenyl]diazenyl]-n-methylanilino]butanoic acid Chemical compound COC=1C=C(N=NC=2C=CC(=CC=2)N(C)CCCC(O)=O)C(OC)=CC=1N=NC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 UDGUGZTYGWUUSG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N Propylene glycol Chemical compound CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 125000003342 alkenyl group Chemical group 0.000 description 8
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 8
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 8
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 8
- 239000012458 free base Substances 0.000 description 8
- 125000004051 hexyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 8
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 8
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 8
- 125000000959 isobutyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 description 8
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 8
- 125000004108 n-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 8
- 125000001280 n-hexyl group Chemical group C(CCCCC)* 0.000 description 8
- 125000000740 n-pentyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 8
- 125000004123 n-propyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 8
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 8
- 125000001147 pentyl group Chemical group C(CCCC)* 0.000 description 8
- 125000002914 sec-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 8
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 8
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 7
- 101150116752 Rspo3 gene Proteins 0.000 description 7
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 7
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 7
- 125000002619 bicyclic group Chemical group 0.000 description 7
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 7
- 229940125898 compound 5 Drugs 0.000 description 7
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 7
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 7
- 125000000842 isoxazolyl group Chemical group 0.000 description 7
- 125000003373 pyrazinyl group Chemical group 0.000 description 7
- 125000002098 pyridazinyl group Chemical group 0.000 description 7
- 125000000714 pyrimidinyl group Chemical group 0.000 description 7
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 7
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 6
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- GLUUGHFHXGJENI-UHFFFAOYSA-N Piperazine Chemical compound C1CNCCN1 GLUUGHFHXGJENI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 6
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 6
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 6
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 6
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 6
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 6
- 125000000392 cycloalkenyl group Chemical group 0.000 description 6
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 6
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 6
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 6
- 229920000609 methyl cellulose Polymers 0.000 description 6
- 235000010981 methylcellulose Nutrition 0.000 description 6
- 239000001923 methylcellulose Substances 0.000 description 6
- 229960002900 methylcellulose Drugs 0.000 description 6
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 6
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 6
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 6
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 6
- 125000000437 thiazol-2-yl group Chemical group [H]C1=C([H])N=C(*)S1 0.000 description 6
- ANRHNWWPFJCPAZ-UHFFFAOYSA-M thionine Chemical class [Cl-].C1=CC(N)=CC2=[S+]C3=CC(N)=CC=C3N=C21 ANRHNWWPFJCPAZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 6
- 125000006552 (C3-C8) cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 5
- 241000416162 Astragalus gummifer Species 0.000 description 5
- 238000011729 BALB/c nude mouse Methods 0.000 description 5
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 235000019483 Peanut oil Nutrition 0.000 description 5
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 5
- 229920001615 Tragacanth Polymers 0.000 description 5
- 125000000304 alkynyl group Chemical group 0.000 description 5
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 5
- XZOWIJDBQIHMFC-UHFFFAOYSA-N butanamide Chemical compound CCCC(N)=O.CCCC(N)=O XZOWIJDBQIHMFC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 5
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 description 5
- 125000001309 chloro group Chemical group Cl* 0.000 description 5
- 125000001559 cyclopropyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C1([H])* 0.000 description 5
- 230000034994 death Effects 0.000 description 5
- 231100000517 death Toxicity 0.000 description 5
- 239000007884 disintegrant Substances 0.000 description 5
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 5
- 239000000796 flavoring agent Substances 0.000 description 5
- 125000004785 fluoromethoxy group Chemical group [H]C([H])(F)O* 0.000 description 5
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 5
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 5
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 5
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 5
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 5
- 238000011275 oncology therapy Methods 0.000 description 5
- 239000000312 peanut oil Substances 0.000 description 5
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 5
- 239000000651 prodrug Substances 0.000 description 5
- 229940002612 prodrug Drugs 0.000 description 5
- YGSDEFSMJLZEOE-UHFFFAOYSA-N salicylic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1O YGSDEFSMJLZEOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- VBICKXHEKHSIBG-UHFFFAOYSA-N 1-monostearoylglycerol Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(O)CO VBICKXHEKHSIBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- IZHVBANLECCAGF-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxy-3-(octadecanoyloxy)propyl octadecanoate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(O)COC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC IZHVBANLECCAGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000004105 2-pyridyl group Chemical group N1=C([*])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 4
- 125000003349 3-pyridyl group Chemical group N1=C([H])C([*])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 4
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 4
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 4
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 4
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229920003171 Poly (ethylene oxide) Chemical class 0.000 description 4
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000002441 X-ray diffraction Methods 0.000 description 4
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 4
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 4
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 4
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 4
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 4
- 239000001768 carboxy methyl cellulose Substances 0.000 description 4
- 125000000596 cyclohexenyl group Chemical group C1(=CCCCC1)* 0.000 description 4
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 4
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 4
- 235000013355 food flavoring agent Nutrition 0.000 description 4
- 235000003599 food sweetener Nutrition 0.000 description 4
- 230000036571 hydration Effects 0.000 description 4
- 238000006703 hydration reaction Methods 0.000 description 4
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 4
- 239000000314 lubricant Substances 0.000 description 4
- HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L magnesium stearate Chemical compound [Mg+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 239000001788 mono and diglycerides of fatty acids Substances 0.000 description 4
- QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000002971 oxazolyl group Chemical group 0.000 description 4
- FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N papa-hydroxy-benzoic acid Natural products OC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000003386 piperidinyl group Chemical group 0.000 description 4
- 239000001267 polyvinylpyrrolidone Substances 0.000 description 4
- 235000013855 polyvinylpyrrolidone Nutrition 0.000 description 4
- 229920000036 polyvinylpyrrolidone Polymers 0.000 description 4
- 125000003226 pyrazolyl group Chemical group 0.000 description 4
- 125000000719 pyrrolidinyl group Chemical group 0.000 description 4
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 4
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 4
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 4
- 125000004434 sulfur atom Chemical group 0.000 description 4
- 239000000375 suspending agent Substances 0.000 description 4
- 239000003765 sweetening agent Substances 0.000 description 4
- MPLHNVLQVRSVEE-UHFFFAOYSA-N texas red Chemical compound [O-]S(=O)(=O)C1=CC(S(Cl)(=O)=O)=CC=C1C(C1=CC=2CCCN3CCCC(C=23)=C1O1)=C2C1=C(CCC1)C3=[N+]1CCCC3=C2 MPLHNVLQVRSVEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000000335 thiazolyl group Chemical group 0.000 description 4
- 125000000081 (C5-C8) cycloalkenyl group Chemical group 0.000 description 3
- IXPNQXFRVYWDDI-UHFFFAOYSA-N 1-methyl-2,4-dioxo-1,3-diazinane-5-carboximidamide Chemical compound CN1CC(C(N)=N)C(=O)NC1=O IXPNQXFRVYWDDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- BZTDTCNHAFUJOG-UHFFFAOYSA-N 6-carboxyfluorescein Chemical compound C12=CC=C(O)C=C2OC2=CC(O)=CC=C2C11OC(=O)C2=CC=C(C(=O)O)C=C21 BZTDTCNHAFUJOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HBAQYPYDRFILMT-UHFFFAOYSA-N 8-[3-(1-cyclopropylpyrazol-4-yl)-1H-pyrazolo[4,3-d]pyrimidin-5-yl]-3-methyl-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-2-one Chemical class C1(CC1)N1N=CC(=C1)C1=NNC2=C1N=C(N=C2)N1C2C(N(CC1CC2)C)=O HBAQYPYDRFILMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 244000215068 Acacia senegal Species 0.000 description 3
- 235000006491 Acacia senegal Nutrition 0.000 description 3
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 3
- WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N Bromine atom Chemical compound [Br] WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 3
- 229920000084 Gum arabic Polymers 0.000 description 3
- 101100118591 Homo sapiens EIF3E gene Proteins 0.000 description 3
- 101100531974 Homo sapiens RSPO2 gene Proteins 0.000 description 3
- 101100531980 Homo sapiens RSPO3 gene Proteins 0.000 description 3
- 238000011887 Necropsy Methods 0.000 description 3
- MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N Oxalic acid Chemical compound OC(=O)C(O)=O MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 3
- 102000002727 Protein Tyrosine Phosphatase Human genes 0.000 description 3
- RWRDLPDLKQPQOW-UHFFFAOYSA-N Pyrrolidine Chemical compound C1CCNC1 RWRDLPDLKQPQOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 3
- YTPLMLYBLZKORZ-UHFFFAOYSA-N Thiophene Chemical compound C=1C=CSC=1 YTPLMLYBLZKORZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000010489 acacia gum Nutrition 0.000 description 3
- DPXJVFZANSGRMM-UHFFFAOYSA-N acetic acid;2,3,4,5,6-pentahydroxyhexanal;sodium Chemical compound [Na].CC(O)=O.OCC(O)C(O)C(O)C(O)C=O DPXJVFZANSGRMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 3
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 3
- 235000010419 agar Nutrition 0.000 description 3
- 229940023476 agar Drugs 0.000 description 3
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 description 3
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 description 3
- GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N bromine Substances BrBr GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229910052794 bromium Inorganic materials 0.000 description 3
- 125000001246 bromo group Chemical group Br* 0.000 description 3
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 3
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 3
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 3
- 235000010980 cellulose Nutrition 0.000 description 3
- 125000000068 chlorophenyl group Chemical group 0.000 description 3
- 235000013985 cinnamic acid Nutrition 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000003086 colorant Substances 0.000 description 3
- 125000001511 cyclopentyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 3
- 238000011161 development Methods 0.000 description 3
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 3
- 239000002270 dispersing agent Substances 0.000 description 3
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 3
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 3
- 239000002702 enteric coating Substances 0.000 description 3
- 238000009505 enteric coating Methods 0.000 description 3
- 125000001207 fluorophenyl group Chemical group 0.000 description 3
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 3
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 3
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 3
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 3
- 230000036541 health Effects 0.000 description 3
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 3
- SUMDYPCJJOFFON-UHFFFAOYSA-N isethionic acid Chemical compound OCCS(O)(=O)=O SUMDYPCJJOFFON-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000010445 lecithin Nutrition 0.000 description 3
- 239000000787 lecithin Substances 0.000 description 3
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 3
- 229940057995 liquid paraffin Drugs 0.000 description 3
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 3
- 208000037819 metastatic cancer Diseases 0.000 description 3
- 208000011575 metastatic malignant neoplasm Diseases 0.000 description 3
- WBYWAXJHAXSJNI-UHFFFAOYSA-N methyl p-hydroxycinnamate Natural products OC(=O)C=CC1=CC=CC=C1 WBYWAXJHAXSJNI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 125000002757 morpholinyl group Chemical group 0.000 description 3
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 3
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 3
- 125000001715 oxadiazolyl group Chemical group 0.000 description 3
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 description 3
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 3
- 125000004193 piperazinyl group Chemical group 0.000 description 3
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 3
- 229960004063 propylene glycol Drugs 0.000 description 3
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 3
- 108020000494 protein-tyrosine phosphatase Proteins 0.000 description 3
- PBMFSQRYOILNGV-UHFFFAOYSA-N pyridazine Chemical compound C1=CC=NN=C1 PBMFSQRYOILNGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 125000004527 pyrimidin-4-yl group Chemical group N1=CN=C(C=C1)* 0.000 description 3
- 230000004044 response Effects 0.000 description 3
- 229960004889 salicylic acid Drugs 0.000 description 3
- 235000010413 sodium alginate Nutrition 0.000 description 3
- 239000000661 sodium alginate Substances 0.000 description 3
- 229940005550 sodium alginate Drugs 0.000 description 3
- 235000019812 sodium carboxymethyl cellulose Nutrition 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 3
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 3
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 3
- 239000003826 tablet Substances 0.000 description 3
- YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran Natural products C=1C=COC=1 YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WGTODYJZXSJIAG-UHFFFAOYSA-N tetramethylrhodamine chloride Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(N(C)C)=CC2=[O+]C2=CC(N(C)C)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O WGTODYJZXSJIAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 125000004001 thioalkyl group Chemical group 0.000 description 3
- 125000003944 tolyl group Chemical group 0.000 description 3
- PUPZLCDOIYMWBV-UHFFFAOYSA-N (+/-)-1,3-Butanediol Chemical compound CC(O)CCO PUPZLCDOIYMWBV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LNAZSHAWQACDHT-XIYTZBAFSA-N (2r,3r,4s,5r,6s)-4,5-dimethoxy-2-(methoxymethyl)-3-[(2s,3r,4s,5r,6r)-3,4,5-trimethoxy-6-(methoxymethyl)oxan-2-yl]oxy-6-[(2r,3r,4s,5r,6r)-4,5,6-trimethoxy-2-(methoxymethyl)oxan-3-yl]oxyoxane Chemical compound CO[C@@H]1[C@@H](OC)[C@H](OC)[C@@H](COC)O[C@H]1O[C@H]1[C@H](OC)[C@@H](OC)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](OC)[C@H](OC)O[C@@H]2COC)OC)O[C@@H]1COC LNAZSHAWQACDHT-XIYTZBAFSA-N 0.000 description 2
- 125000006704 (C5-C6) cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 2
- GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N (±)-α-Tocopherol Chemical compound OC1=C(C)C(C)=C2OC(CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WBYWAXJHAXSJNI-VOTSOKGWSA-M .beta-Phenylacrylic acid Natural products [O-]C(=O)\C=C\C1=CC=CC=C1 WBYWAXJHAXSJNI-VOTSOKGWSA-M 0.000 description 2
- IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 0.000 description 2
- IHXWECHPYNPJRR-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxycyclobut-2-en-1-one Chemical class OC1=CC(=O)C1 IHXWECHPYNPJRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HVBSAKJJOYLTQU-UHFFFAOYSA-N 4-aminobenzenesulfonic acid Chemical compound NC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 HVBSAKJJOYLTQU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZEYHEAKUIGZSGI-UHFFFAOYSA-N 4-methoxybenzoic acid Chemical compound COC1=CC=C(C(O)=O)C=C1 ZEYHEAKUIGZSGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000339 4-pyridyl group Chemical group N1=C([H])C([H])=C([*])C([H])=C1[H] 0.000 description 2
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 2
- BPYKTIZUTYGOLE-IFADSCNNSA-N Bilirubin Chemical compound N1C(=O)C(C)=C(C=C)\C1=C\C1=C(C)C(CCC(O)=O)=C(CC2=C(C(C)=C(\C=C/3C(=C(C=C)C(=O)N\3)C)N2)CCC(O)=O)N1 BPYKTIZUTYGOLE-IFADSCNNSA-N 0.000 description 2
- VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L Calcium carbonate Chemical compound [Ca+2].[O-]C([O-])=O VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 229920002134 Carboxymethyl cellulose Polymers 0.000 description 2
- 229920002261 Corn starch Polymers 0.000 description 2
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 2
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 2
- RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-N D-gluconic acid Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-N 0.000 description 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 2
- PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N Fluorine Chemical compound FF PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N Fumaric acid Chemical compound OC(=O)\C=C\C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N 0.000 description 2
- AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N Glycolic acid Chemical compound OCC(O)=O AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 2
- 229920002907 Guar gum Polymers 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 2
- 240000007472 Leucaena leucocephala Species 0.000 description 2
- 235000010643 Leucaena leucocephala Nutrition 0.000 description 2
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 2
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 2
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 2
- AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N Methanesulfonic acid Chemical compound CS(O)(=O)=O AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N Morpholine Chemical compound C1COCCN1 YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 2
- HSHXDCVZWHOWCS-UHFFFAOYSA-N N'-hexadecylthiophene-2-carbohydrazide Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCNNC(=O)c1cccs1 HSHXDCVZWHOWCS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010029260 Neuroblastoma Diseases 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N Piperidine Chemical compound C1CCNCC1 NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KYQCOXFCLRTKLS-UHFFFAOYSA-N Pyrazine Chemical compound C1=CN=CC=N1 KYQCOXFCLRTKLS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KAESVJOAVNADME-UHFFFAOYSA-N Pyrrole Chemical compound C=1C=CNC=1 KAESVJOAVNADME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N Pyruvic acid Chemical compound CC(=O)C(O)=O LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SMWDFEZZVXVKRB-UHFFFAOYSA-N Quinoline Chemical compound N1=CC=CC2=CC=CC=C21 SMWDFEZZVXVKRB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000041829 R-spondin family Human genes 0.000 description 2
- 108091078718 R-spondin family Proteins 0.000 description 2
- 235000019485 Safflower oil Nutrition 0.000 description 2
- BCKXLBQYZLBQEK-KVVVOXFISA-M Sodium oleate Chemical compound [Na+].CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC([O-])=O BCKXLBQYZLBQEK-KVVVOXFISA-M 0.000 description 2
- 235000021355 Stearic acid Nutrition 0.000 description 2
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 2
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N Tetrahydrofuran Chemical compound C1CCOC1 WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 2
- 210000003567 ascitic fluid Anatomy 0.000 description 2
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 2
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 description 2
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 description 2
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000012216 bentonite Nutrition 0.000 description 2
- 239000000440 bentonite Substances 0.000 description 2
- 229940092782 bentonite Drugs 0.000 description 2
- 229910000278 bentonite Inorganic materials 0.000 description 2
- SVPXDRXYRYOSEX-UHFFFAOYSA-N bentoquatam Chemical compound O.O=[Si]=O.O=[Al]O[Al]=O SVPXDRXYRYOSEX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IOJUPLGTWVMSFF-UHFFFAOYSA-N benzothiazole Chemical compound C1=CC=C2SC=NC2=C1 IOJUPLGTWVMSFF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 229940105329 carboxymethylcellulose Drugs 0.000 description 2
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 2
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 2
- 229930016911 cinnamic acid Natural products 0.000 description 2
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 2
- 239000003240 coconut oil Substances 0.000 description 2
- 235000019864 coconut oil Nutrition 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 2
- 239000008120 corn starch Substances 0.000 description 2
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 2
- 125000001995 cyclobutyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 2
- 238000011393 cytotoxic chemotherapy Methods 0.000 description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 2
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 2
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 2
- 238000007847 digital PCR Methods 0.000 description 2
- 125000002147 dimethylamino group Chemical group [H]C([H])([H])N(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N dimethylselenoniopropionate Natural products CCC(O)=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZUOUZKKEUPVFJK-UHFFFAOYSA-N diphenyl Chemical compound C1=CC=CC=C1C1=CC=CC=C1 ZUOUZKKEUPVFJK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- POULHZVOKOAJMA-UHFFFAOYSA-M dodecanoate Chemical compound CCCCCCCCCCCC([O-])=O POULHZVOKOAJMA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 2
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 2
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 2
- 229940093476 ethylene glycol Drugs 0.000 description 2
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 2
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 2
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 2
- 150000002191 fatty alcohols Chemical class 0.000 description 2
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 2
- 239000011737 fluorine Substances 0.000 description 2
- 229910052731 fluorine Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000003709 fluoroalkyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 2
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- 235000001727 glucose Nutrition 0.000 description 2
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 2
- 229940074045 glyceryl distearate Drugs 0.000 description 2
- 229940075507 glyceryl monostearate Drugs 0.000 description 2
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 2
- 235000010417 guar gum Nutrition 0.000 description 2
- 239000000665 guar gum Substances 0.000 description 2
- 229960002154 guar gum Drugs 0.000 description 2
- 150000004677 hydrates Chemical class 0.000 description 2
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 2
- 235000010979 hydroxypropyl methyl cellulose Nutrition 0.000 description 2
- 239000001866 hydroxypropyl methyl cellulose Substances 0.000 description 2
- 229920003088 hydroxypropyl methyl cellulose Polymers 0.000 description 2
- 125000002962 imidazol-1-yl group Chemical group [*]N1C([H])=NC([H])=C1[H] 0.000 description 2
- 125000002883 imidazolyl group Chemical group 0.000 description 2
- 238000002991 immunohistochemical analysis Methods 0.000 description 2
- 238000011532 immunohistochemical staining Methods 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 2
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 2
- AWJUIBRHMBBTKR-UHFFFAOYSA-N isoquinoline Chemical compound C1=NC=CC2=CC=CC=C21 AWJUIBRHMBBTKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000001786 isothiazolyl group Chemical group 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 2
- 229960001375 lactose Drugs 0.000 description 2
- 229940070765 laurate Drugs 0.000 description 2
- 229940067606 lecithin Drugs 0.000 description 2
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 2
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 235000019359 magnesium stearate Nutrition 0.000 description 2
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 2
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 2
- 125000000250 methylamino group Chemical group [H]N(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- LXCFILQKKLGQFO-UHFFFAOYSA-N methylparaben Chemical compound COC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 LXCFILQKKLGQFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000006399 methylpyrazinyl group Chemical group 0.000 description 2
- 230000003990 molecular pathway Effects 0.000 description 2
- 229920001206 natural gum Polymers 0.000 description 2
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000006574 non-aromatic ring group Chemical group 0.000 description 2
- OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Natural products CCCCCCCC(C)CCCCCCCCC(O)=O OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004006 olive oil Substances 0.000 description 2
- 235000008390 olive oil Nutrition 0.000 description 2
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 2
- 125000003854 p-chlorophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(*)=C([H])C([H])=C1Cl 0.000 description 2
- VLTRZXGMWDSKGL-UHFFFAOYSA-N perchloric acid Chemical compound OCl(=O)(=O)=O VLTRZXGMWDSKGL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000843 phenylene group Chemical group C1(=C(C=CC=C1)*)* 0.000 description 2
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 2
- BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N platinum Chemical compound [Pt] BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000003367 polycyclic group Chemical group 0.000 description 2
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 2
- 229920001296 polysiloxane Polymers 0.000 description 2
- QELSKZZBTMNZEB-UHFFFAOYSA-N propylparaben Chemical compound CCCOC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 QELSKZZBTMNZEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000004307 pyrazin-2-yl group Chemical group [H]C1=C([H])N=C(*)C([H])=N1 0.000 description 2
- 125000002206 pyridazin-3-yl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)N=N1 0.000 description 2
- 125000000246 pyrimidin-2-yl group Chemical group [H]C1=NC(*)=NC([H])=C1[H] 0.000 description 2
- 125000000168 pyrrolyl group Chemical group 0.000 description 2
- 108010054624 red fluorescent protein Proteins 0.000 description 2
- 238000012552 review Methods 0.000 description 2
- 235000005713 safflower oil Nutrition 0.000 description 2
- 239000003813 safflower oil Substances 0.000 description 2
- 239000008159 sesame oil Substances 0.000 description 2
- 235000011803 sesame oil Nutrition 0.000 description 2
- WXMKPNITSTVMEF-UHFFFAOYSA-M sodium benzoate Chemical compound [Na+].[O-]C(=O)C1=CC=CC=C1 WXMKPNITSTVMEF-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000004299 sodium benzoate Substances 0.000 description 2
- 235000010234 sodium benzoate Nutrition 0.000 description 2
- 229920001027 sodium carboxymethylcellulose Polymers 0.000 description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 2
- PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N squalane Chemical compound CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 2
- 229940032147 starch Drugs 0.000 description 2
- 239000008117 stearic acid Substances 0.000 description 2
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 2
- 229960004793 sucrose Drugs 0.000 description 2
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 2
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 125000001113 thiadiazolyl group Chemical group 0.000 description 2
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N trans-butenedioic acid Natural products OC(=O)C=CC(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KQTIIICEAUMSDG-UHFFFAOYSA-N tricarballylic acid Chemical compound OC(=O)CC(C(O)=O)CC(O)=O KQTIIICEAUMSDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 2
- 229920001285 xanthan gum Polymers 0.000 description 2
- 235000010493 xanthan gum Nutrition 0.000 description 2
- 239000000230 xanthan gum Substances 0.000 description 2
- 229940082509 xanthan gum Drugs 0.000 description 2
- 108091005957 yellow fluorescent proteins Proteins 0.000 description 2
- QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N (2R)-2-hydroxy-2-phenylacetic acid Chemical compound O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1.O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1 QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N 0.000 description 1
- CMIBUZBMZCBCAT-HZPDHXFCSA-N (2r,3r)-2,3-bis[(4-methylbenzoyl)oxy]butanedioic acid Chemical compound C1=CC(C)=CC=C1C(=O)O[C@@H](C(O)=O)[C@H](C(O)=O)OC(=O)C1=CC=C(C)C=C1 CMIBUZBMZCBCAT-HZPDHXFCSA-N 0.000 description 1
- 125000004400 (C1-C12) alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004178 (C1-C4) alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006650 (C2-C4) alkynyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006717 (C3-C10) cycloalkenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006376 (C3-C10) cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005913 (C3-C6) cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- AFDXODALSZRGIH-QPJJXVBHSA-N (E)-3-(4-methoxyphenyl)prop-2-enoic acid Chemical group COC1=CC=C(\C=C\C(O)=O)C=C1 AFDXODALSZRGIH-QPJJXVBHSA-N 0.000 description 1
- WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N (E)-8-Octadecenoic acid Natural products CCCCCCCCCC=CCCCCCCC(O)=O WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GVJHHUAWPYXKBD-IEOSBIPESA-N (R)-alpha-Tocopherol Natural products OC1=C(C)C(C)=C2O[C@@](CCC[C@H](C)CCC[C@H](C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C GVJHHUAWPYXKBD-IEOSBIPESA-N 0.000 description 1
- BJEPYKJPYRNKOW-REOHCLBHSA-N (S)-malic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- AAFXQFIGKBLKMC-KQQUZDAGSA-N (e)-3-[4-[(e)-2-carboxyethenyl]phenyl]prop-2-enoic acid Chemical compound OC(=O)\C=C\C1=CC=C(\C=C\C(O)=O)C=C1 AAFXQFIGKBLKMC-KQQUZDAGSA-N 0.000 description 1
- SLLFVLKNXABYGI-UHFFFAOYSA-N 1,2,3-benzoxadiazole Chemical compound C1=CC=C2ON=NC2=C1 SLLFVLKNXABYGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BBVIDBNAYOIXOE-UHFFFAOYSA-N 1,2,4-oxadiazole Chemical compound C=1N=CON=1 BBVIDBNAYOIXOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NAOLWIGVYRIGTP-UHFFFAOYSA-N 1,3,5-trihydroxyanthracene-9,10-dione Chemical compound C1=CC(O)=C2C(=O)C3=CC(O)=CC(O)=C3C(=O)C2=C1 NAOLWIGVYRIGTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940058015 1,3-butylene glycol Drugs 0.000 description 1
- FCEHBMOGCRZNNI-UHFFFAOYSA-N 1-benzothiophene Chemical compound C1=CC=C2SC=CC2=C1 FCEHBMOGCRZNNI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WLXGQMVCYPUOLM-UHFFFAOYSA-N 1-hydroxyethanesulfonic acid Chemical compound CC(O)S(O)(=O)=O WLXGQMVCYPUOLM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RTBFRGCFXZNCOE-UHFFFAOYSA-N 1-methylsulfonylpiperidin-4-one Chemical compound CS(=O)(=O)N1CCC(=O)CC1 RTBFRGCFXZNCOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QWENRTYMTSOGBR-UHFFFAOYSA-N 1H-1,2,3-Triazole Chemical compound C=1C=NNN=1 QWENRTYMTSOGBR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HYZJCKYKOHLVJF-UHFFFAOYSA-N 1H-benzimidazole Chemical compound C1=CC=C2NC=NC2=C1 HYZJCKYKOHLVJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BAXOFTOLAUCFNW-UHFFFAOYSA-N 1H-indazole Chemical compound C1=CC=C2C=NNC2=C1 BAXOFTOLAUCFNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VGIRNWJSIRVFRT-UHFFFAOYSA-N 2',7'-difluorofluorescein Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1C1=C2C=C(F)C(=O)C=C2OC2=CC(O)=C(F)C=C21 VGIRNWJSIRVFRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DCYGAPKNVCQNOE-UHFFFAOYSA-N 2,2,2-triphenylacetic acid Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(C=1C=CC=CC=1)(C(=O)O)C1=CC=CC=C1 DCYGAPKNVCQNOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SMZOUWXMTYCWNB-UHFFFAOYSA-N 2-(2-methoxy-5-methylphenyl)ethanamine Chemical compound COC1=CC=C(C)C=C1CCN SMZOUWXMTYCWNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N 2-Propenoic acid Natural products OC(=O)C=C NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZYHQGITXIJDDKC-UHFFFAOYSA-N 2-[2-(2-aminophenyl)ethyl]aniline Chemical group NC1=CC=CC=C1CCC1=CC=CC=C1N ZYHQGITXIJDDKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YHPKGSLWSUCJQK-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[2-[[5-amino-2-[[2-[(2,4-diamino-4-oxobutanoyl)amino]-4-methylpentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-4-methylsulfanylbutanoyl]amino]-3-carboxypropanoyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino) Chemical compound NC(N)=NCCCC(C(=O)NC(C(C)C)C(O)=O)NC(=O)C(CC(O)=O)NC(=O)C(CCSC)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(N)CC(N)=O YHPKGSLWSUCJQK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006276 2-bromophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(Br)=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 125000004182 2-chlorophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(Cl)=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 125000004198 2-fluorophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(F)=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- LODHFNUFVRVKTH-ZHACJKMWSA-N 2-hydroxy-n'-[(e)-3-phenylprop-2-enoyl]benzohydrazide Chemical compound OC1=CC=CC=C1C(=O)NNC(=O)\C=C\C1=CC=CC=C1 LODHFNUFVRVKTH-ZHACJKMWSA-N 0.000 description 1
- 125000004204 2-methoxyphenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(*)=C(OC([H])([H])[H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- OPJKGTJXHVPYIM-UHFFFAOYSA-N 2-methylprop-2-enamide;phenol Chemical compound CC(=C)C(N)=O.OC1=CC=CC=C1 OPJKGTJXHVPYIM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MPPQGYCZBNURDG-UHFFFAOYSA-N 2-propionyl-6-dimethylaminonaphthalene Chemical class C1=C(N(C)C)C=CC2=CC(C(=O)CC)=CC=C21 MPPQGYCZBNURDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BNBQQYFXBLBYJK-UHFFFAOYSA-N 2-pyridin-2-yl-1,3-oxazole Chemical compound C1=COC(C=2N=CC=CC=2)=N1 BNBQQYFXBLBYJK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000175 2-thienyl group Chemical group S1C([*])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 20:1omega9c fatty acid Natural products CCCCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZOOGRGPOEVQQDX-UUOKFMHZSA-N 3',5'-cyclic GMP Chemical compound C([C@H]1O2)OP(O)(=O)O[C@H]1[C@@H](O)[C@@H]2N1C(N=C(NC2=O)N)=C2N=C1 ZOOGRGPOEVQQDX-UUOKFMHZSA-N 0.000 description 1
- 125000004189 3,4-dichlorophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(Cl)=C(Cl)C([H])=C1* 0.000 description 1
- LJGHYPLBDBRCRZ-UHFFFAOYSA-N 3-(3-aminophenyl)sulfonylaniline Chemical group NC1=CC=CC(S(=O)(=O)C=2C=C(N)C=CC=2)=C1 LJGHYPLBDBRCRZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 3-azaniumyl-2-hydroxypropanoate Chemical compound NCC(O)C(O)=O BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006275 3-bromophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(Br)=C([H])C(*)=C1[H] 0.000 description 1
- 125000004179 3-chlorophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(*)=C([H])C(Cl)=C1[H] 0.000 description 1
- 125000004180 3-fluorophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(*)=C([H])C(F)=C1[H] 0.000 description 1
- 125000004207 3-methoxyphenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(*)=C([H])C(OC([H])([H])[H])=C1[H] 0.000 description 1
- KWGPBDBAAXYWOJ-UHFFFAOYSA-N 3-naphthalen-2-ylprop-2-enoic acid Chemical compound C1=CC=CC2=CC(C=CC(=O)O)=CC=C21 KWGPBDBAAXYWOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OARACWRRJFXGLU-UHFFFAOYSA-N 4-(2-methyl-6,7-dihydro-5h-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-4-yl)-4-oxo-n-(6-pyridin-3-ylpyridazin-3-yl)butanamide Chemical compound C1CCN2N=C(C)C=C2N1C(=O)CCC(=O)NC(N=N1)=CC=C1C1=CC=CN=C1 OARACWRRJFXGLU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RURHILYUWQEGOS-VOTSOKGWSA-N 4-Methylcinnamic acid Chemical group CC1=CC=C(\C=C\C(O)=O)C=C1 RURHILYUWQEGOS-VOTSOKGWSA-N 0.000 description 1
- QEYONPKSDTUPAX-UHFFFAOYSA-N 4-bromo-2-chloro-6-fluorophenol Chemical compound OC1=C(F)C=C(Br)C=C1Cl QEYONPKSDTUPAX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WRFYIYOXJWKONR-UHFFFAOYSA-N 4-bromo-2-methoxyaniline Chemical compound COC1=CC(Br)=CC=C1N WRFYIYOXJWKONR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004800 4-bromophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(*)=C([H])C([H])=C1Br 0.000 description 1
- XRHGYUZYPHTUJZ-UHFFFAOYSA-N 4-chlorobenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=C(Cl)C=C1 XRHGYUZYPHTUJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001255 4-fluorophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(*)=C([H])C([H])=C1F 0.000 description 1
- HIQIXEFWDLTDED-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxy-1-piperidin-4-ylpyrrolidin-2-one Chemical compound O=C1CC(O)CN1C1CCNCC1 HIQIXEFWDLTDED-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940090248 4-hydroxybenzoic acid Drugs 0.000 description 1
- 125000004172 4-methoxyphenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(OC([H])([H])[H])=C([H])C([H])=C1* 0.000 description 1
- UWAUSMGZOHPBJJ-UHFFFAOYSA-N 4-nitro-1,2,3-benzoxadiazole Chemical compound [O-][N+](=O)C1=CC=CC2=C1N=NO2 UWAUSMGZOHPBJJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NNJMFJSKMRYHSR-UHFFFAOYSA-N 4-phenylbenzoic acid Chemical compound C1=CC(C(=O)O)=CC=C1C1=CC=CC=C1 NNJMFJSKMRYHSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KDDQRKBRJSGMQE-UHFFFAOYSA-N 4-thiazolyl Chemical compound [C]1=CSC=N1 KDDQRKBRJSGMQE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004199 4-trifluoromethylphenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1*)C(F)(F)F 0.000 description 1
- NSPMIYGKQJPBQR-UHFFFAOYSA-N 4H-1,2,4-triazole Chemical compound C=1N=CNN=1 NSPMIYGKQJPBQR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006163 5-membered heteroaryl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004938 5-pyridyl group Chemical group N1=CC=CC(=C1)* 0.000 description 1
- CWDWFSXUQODZGW-UHFFFAOYSA-N 5-thiazolyl Chemical group [C]1=CN=CS1 CWDWFSXUQODZGW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 9-Heptadecensaeure Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000004384 Alopecia Diseases 0.000 description 1
- 239000005995 Aluminium silicate Substances 0.000 description 1
- 108010011485 Aspartame Proteins 0.000 description 1
- 239000005711 Benzoic acid Substances 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-DCSYEGIMSA-N Beta-Lactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-DCSYEGIMSA-N 0.000 description 1
- 206010005003 Bladder cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000019838 Blood disease Diseases 0.000 description 1
- 241000167854 Bourreria succulenta Species 0.000 description 1
- 208000003174 Brain Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 125000003601 C2-C6 alkynyl group Chemical group 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000009030 Carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 208000016718 Chromosome Inversion Diseases 0.000 description 1
- WBYWAXJHAXSJNI-SREVYHEPSA-N Cinnamic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C1=CC=CC=C1 WBYWAXJHAXSJNI-SREVYHEPSA-N 0.000 description 1
- RGHNJXZEOKUKBD-UHFFFAOYSA-N D-gluconic acid Natural products OCC(O)C(O)C(O)C(O)C(O)=O RGHNJXZEOKUKBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 239000012129 DRAQ7 reagent Substances 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N Dextrotartaric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N 0.000 description 1
- 206010012735 Diarrhoea Diseases 0.000 description 1
- 235000019739 Dicalciumphosphate Nutrition 0.000 description 1
- XBPCUCUWBYBCDP-UHFFFAOYSA-N Dicyclohexylamine Chemical compound C1CCCCC1NC1CCCCC1 XBPCUCUWBYBCDP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SNRUBQQJIBEYMU-UHFFFAOYSA-N Dodecane Natural products CCCCCCCCCCCC SNRUBQQJIBEYMU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LVGKNOAMLMIIKO-UHFFFAOYSA-N Elaidinsaeure-aethylester Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCCCC(=O)OCC LVGKNOAMLMIIKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010014733 Endometrial cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010014759 Endometrial neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 208000000461 Esophageal Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 239000001856 Ethyl cellulose Substances 0.000 description 1
- ZZSNKZQZMQGXPY-UHFFFAOYSA-N Ethyl cellulose Chemical compound CCOCC1OC(OC)C(OCC)C(OCC)C1OC1C(O)C(O)C(OC)C(CO)O1 ZZSNKZQZMQGXPY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108060002716 Exonuclease Proteins 0.000 description 1
- 102100037362 Fibronectin Human genes 0.000 description 1
- 108010067306 Fibronectins Proteins 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010068370 Glutens Proteins 0.000 description 1
- 244000148687 Glycosmis pentaphylla Species 0.000 description 1
- 208000017604 Hodgkin disease Diseases 0.000 description 1
- 208000021519 Hodgkin lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 208000010747 Hodgkins lymphoma Diseases 0.000 description 1
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 239000004166 Lanolin Substances 0.000 description 1
- FTNIPWXXIGNQQF-UHFFFAOYSA-N Maltopentose Chemical compound OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(CO)OC(OC2C(OC(OC3C(OC(OC4C(OC(O)C(O)C4O)CO)C(O)C3O)CO)C(O)C2O)CO)C(O)C1O FTNIPWXXIGNQQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 206010027406 Mesothelioma Diseases 0.000 description 1
- CERQOIWHTDAKMF-UHFFFAOYSA-N Methacrylic acid Chemical compound CC(=C)C(O)=O CERQOIWHTDAKMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MBBZMMPHUWSWHV-BDVNFPICSA-N N-methylglucamine Chemical compound CNC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO MBBZMMPHUWSWHV-BDVNFPICSA-N 0.000 description 1
- 206010028813 Nausea Diseases 0.000 description 1
- 208000034176 Neoplasms, Germ Cell and Embryonal Diseases 0.000 description 1
- GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N Nitric acid Chemical compound O[N+]([O-])=O GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000015914 Non-Hodgkin lymphomas Diseases 0.000 description 1
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 1
- NASRDENTZCCAPN-UHFFFAOYSA-N OC([Na])=O Chemical compound OC([Na])=O NASRDENTZCCAPN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010030155 Oesophageal carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000005642 Oleic acid Substances 0.000 description 1
- ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N Oleic acid Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010033128 Ovarian cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010061535 Ovarian neoplasm Diseases 0.000 description 1
- ZCQWOFVYLHDMMC-UHFFFAOYSA-N Oxazole Chemical compound C1=COC=N1 ZCQWOFVYLHDMMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 239000004264 Petrolatum Substances 0.000 description 1
- PCNDJXKNXGMECE-UHFFFAOYSA-N Phenazine Natural products C1=CC=CC2=NC3=CC=CC=C3N=C21 PCNDJXKNXGMECE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 1
- 229920000331 Polyhydroxybutyrate Polymers 0.000 description 1
- 229920001710 Polyorthoester Polymers 0.000 description 1
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 description 1
- WDVSHHCDHLJJJR-UHFFFAOYSA-N Proflavine Chemical compound C1=CC(N)=CC2=NC3=CC(N)=CC=C3C=C21 WDVSHHCDHLJJJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N Propanedioic acid Natural products OC(=O)CC(O)=O OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- WTKZEGDFNFYCGP-UHFFFAOYSA-N Pyrazole Chemical compound C=1C=NNC=1 WTKZEGDFNFYCGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical compound C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N R-2-phenyl-2-hydroxyacetic acid Natural products OC(=O)C(O)C1=CC=CC=C1 IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710110295 R-spondin-2 Proteins 0.000 description 1
- 101710110310 R-spondin-3 Proteins 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 208000006265 Renal cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 235000011034 Rubus glaucus Nutrition 0.000 description 1
- 244000235659 Rubus idaeus Species 0.000 description 1
- 235000009122 Rubus idaeus Nutrition 0.000 description 1
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 229920001800 Shellac Polymers 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- DWAQJAXMDSEUJJ-UHFFFAOYSA-M Sodium bisulfite Chemical compound [Na+].OS([O-])=O DWAQJAXMDSEUJJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 208000005718 Stomach Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N Succinic acid Natural products OC(=O)CCC(O)=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000019486 Sunflower oil Nutrition 0.000 description 1
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N Tartaric acid Natural products [H+].[H+].[O-]C(=O)C(O)C(O)C([O-])=O FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FZWLAAWBMGSTSO-UHFFFAOYSA-N Thiazole Chemical compound C1=CSC=N1 FZWLAAWBMGSTSO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000024770 Thyroid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 208000007097 Urinary Bladder Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 229930003427 Vitamin E Natural products 0.000 description 1
- 206010047700 Vomiting Diseases 0.000 description 1
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 1
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 1
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 1
- 229920002494 Zein Polymers 0.000 description 1
- ZHAFUINZIZIXFC-UHFFFAOYSA-N [9-(dimethylamino)-10-methylbenzo[a]phenoxazin-5-ylidene]azanium;chloride Chemical compound [Cl-].O1C2=CC(=[NH2+])C3=CC=CC=C3C2=NC2=C1C=C(N(C)C)C(C)=C2 ZHAFUINZIZIXFC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- DPKHZNPWBDQZCN-UHFFFAOYSA-N acridine orange free base Chemical compound C1=CC(N(C)C)=CC2=NC3=CC(N(C)C)=CC=C3C=C21 DPKHZNPWBDQZCN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BGLGAKMTYHWWKW-UHFFFAOYSA-N acridine yellow Chemical compound [H+].[Cl-].CC1=C(N)C=C2N=C(C=C(C(C)=C3)N)C3=CC2=C1 BGLGAKMTYHWWKW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001251 acridines Chemical class 0.000 description 1
- 125000005073 adamantyl group Chemical group C12(CC3CC(CC(C1)C3)C2)* 0.000 description 1
- 239000000443 aerosol Substances 0.000 description 1
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 description 1
- 235000010443 alginic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000000783 alginic acid Substances 0.000 description 1
- 229920000615 alginic acid Polymers 0.000 description 1
- 229960001126 alginic acid Drugs 0.000 description 1
- 150000004781 alginic acids Chemical class 0.000 description 1
- 229910052783 alkali metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910052784 alkaline earth metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000003302 alkenyloxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004183 alkoxy alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005133 alkynyloxy group Chemical group 0.000 description 1
- 229940087168 alpha tocopherol Drugs 0.000 description 1
- BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N alpha-hydroxysuccinic acid Natural products OC(=O)C(O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000012211 aluminium silicate Nutrition 0.000 description 1
- 150000003863 ammonium salts Chemical class 0.000 description 1
- 210000004381 amniotic fluid Anatomy 0.000 description 1
- 229920000469 amphiphilic block copolymer Polymers 0.000 description 1
- JFCQEDHGNNZCLN-UHFFFAOYSA-N anhydrous glutaric acid Natural products OC(=O)CCCC(O)=O JFCQEDHGNNZCLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000129 anionic group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003945 anionic surfactant Substances 0.000 description 1
- 150000001454 anthracenes Chemical class 0.000 description 1
- PYKYMHQGRFAEBM-UHFFFAOYSA-N anthraquinone Natural products CCC(=O)c1c(O)c2C(=O)C3C(C=CC=C3O)C(=O)c2cc1CC(=O)OC PYKYMHQGRFAEBM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000004056 anthraquinones Chemical class 0.000 description 1
- 229940027998 antiseptic and disinfectant acridine derivative Drugs 0.000 description 1
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 description 1
- 125000000732 arylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004104 aryloxy group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000605 aspartame Substances 0.000 description 1
- IAOZJIPTCAWIRG-QWRGUYRKSA-N aspartame Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)OC)CC1=CC=CC=C1 IAOZJIPTCAWIRG-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- 235000010357 aspartame Nutrition 0.000 description 1
- 229960003438 aspartame Drugs 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- JPIYZTWMUGTEHX-UHFFFAOYSA-N auramine O free base Chemical compound C1=CC(N(C)C)=CC=C1C(=N)C1=CC=C(N(C)C)C=C1 JPIYZTWMUGTEHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003851 azoles Chemical class 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- RFRXIWQYSOIBDI-UHFFFAOYSA-N benzarone Chemical compound CCC=1OC2=CC=CC=C2C=1C(=O)C1=CC=C(O)C=C1 RFRXIWQYSOIBDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SRSXLGNVWSONIS-UHFFFAOYSA-N benzenesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C1=CC=CC=C1 SRSXLGNVWSONIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940092714 benzenesulfonic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000010233 benzoic acid Nutrition 0.000 description 1
- SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N benzopyrrole Natural products C1=CC=C2NC=CC2=C1 SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N benzoquinolinylidene Natural products C1=CC=CC2=CC3=CC=CC=C3N=C21 DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920002988 biodegradable polymer Polymers 0.000 description 1
- 239000004621 biodegradable polymer Substances 0.000 description 1
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 1
- 239000004305 biphenyl Substances 0.000 description 1
- 235000010290 biphenyl Nutrition 0.000 description 1
- 201000000053 blastoma Diseases 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 125000004799 bromophenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 235000019437 butane-1,3-diol Nutrition 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N butanedioic acid Chemical compound O[14C](=O)CC[14C](O)=O KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N 0.000 description 1
- 125000004369 butenyl group Chemical group C(=CCC)* 0.000 description 1
- 125000004106 butoxy group Chemical group [*]OC([H])([H])C([H])([H])C(C([H])([H])[H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000000480 butynyl group Chemical group [*]C#CC([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910000019 calcium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000010216 calcium carbonate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 239000000378 calcium silicate Substances 0.000 description 1
- 229910052918 calcium silicate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000012241 calcium silicate Nutrition 0.000 description 1
- OYACROKNLOSFPA-UHFFFAOYSA-N calcium;dioxido(oxo)silane Chemical compound [Ca+2].[O-][Si]([O-])=O OYACROKNLOSFPA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007894 caplet Substances 0.000 description 1
- 150000001721 carbon Chemical group 0.000 description 1
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 1
- 235000010948 carboxy methyl cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 239000008112 carboxymethyl-cellulose Substances 0.000 description 1
- 235000010418 carrageenan Nutrition 0.000 description 1
- 239000000679 carrageenan Substances 0.000 description 1
- 229920001525 carrageenan Polymers 0.000 description 1
- 229940113118 carrageenan Drugs 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 108020001778 catalytic domains Proteins 0.000 description 1
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003093 cationic surfactant Substances 0.000 description 1
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 1
- 235000019693 cherries Nutrition 0.000 description 1
- 238000004296 chiral HPLC Methods 0.000 description 1
- 125000004803 chlorobenzyl group Chemical group 0.000 description 1
- 208000006990 cholangiocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000013375 chromatographic separation Methods 0.000 description 1
- 150000001851 cinnamic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 235000015165 citric acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 208000022136 colorectal lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 238000010961 commercial manufacture process Methods 0.000 description 1
- 238000012777 commercial manufacturing Methods 0.000 description 1
- 229940125904 compound 1 Drugs 0.000 description 1
- 238000013270 controlled release Methods 0.000 description 1
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 1
- 235000005687 corn oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000002285 corn oil Substances 0.000 description 1
- 235000012343 cottonseed oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000002385 cottonseed oil Substances 0.000 description 1
- 150000001893 coumarin derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 238000002425 crystallisation Methods 0.000 description 1
- 230000008025 crystallization Effects 0.000 description 1
- 125000001162 cycloheptenyl group Chemical group C1(=CCCCCC1)* 0.000 description 1
- 125000000582 cycloheptyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- UKJLNMAFNRKWGR-UHFFFAOYSA-N cyclohexatrienamine Chemical group NC1=CC=C=C[CH]1 UKJLNMAFNRKWGR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000522 cyclooctenyl group Chemical group C1(=CCCCCCC1)* 0.000 description 1
- 125000000640 cyclooctyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000000298 cyclopropenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C1([H])* 0.000 description 1
- 210000002726 cyst fluid Anatomy 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 125000001295 dansyl group Chemical class [H]C1=C([H])C(N(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])=C2C([H])=C([H])C([H])=C(C2=C1[H])S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 125000002704 decyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002939 deleterious effect Effects 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000645 desinfectant Substances 0.000 description 1
- NEFBYIFKOOEVPA-UHFFFAOYSA-K dicalcium phosphate Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O NEFBYIFKOOEVPA-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 229940038472 dicalcium phosphate Drugs 0.000 description 1
- 229910000390 dicalcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 1
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 1
- 230000001079 digestive effect Effects 0.000 description 1
- 125000005043 dihydropyranyl group Chemical group O1C(CCC=C1)* 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- 125000003438 dodecyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 1
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 1
- 201000008184 embryoma Diseases 0.000 description 1
- 239000003974 emollient agent Substances 0.000 description 1
- YQGOJNYOYNNSMM-UHFFFAOYSA-N eosin Chemical compound [Na+].OC(=O)C1=CC=CC=C1C1=C2C=C(Br)C(=O)C(Br)=C2OC2=C(Br)C(O)=C(Br)C=C21 YQGOJNYOYNNSMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001973 epigenetic effect Effects 0.000 description 1
- 201000004101 esophageal cancer Diseases 0.000 description 1
- 125000004185 ester group Chemical group 0.000 description 1
- CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-M ethanesulfonate Chemical compound CCS([O-])(=O)=O CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 125000001301 ethoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])O* 0.000 description 1
- 235000019325 ethyl cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 229920001249 ethyl cellulose Polymers 0.000 description 1
- LVGKNOAMLMIIKO-QXMHVHEDSA-N ethyl oleate Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC LVGKNOAMLMIIKO-QXMHVHEDSA-N 0.000 description 1
- 229940093471 ethyl oleate Drugs 0.000 description 1
- 102000013165 exonuclease Human genes 0.000 description 1
- 238000010195 expression analysis Methods 0.000 description 1
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 108091006047 fluorescent proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000034287 fluorescent proteins Human genes 0.000 description 1
- 125000004175 fluorobenzyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000037406 food intake Effects 0.000 description 1
- 238000010575 fractional recrystallization Methods 0.000 description 1
- 239000001530 fumaric acid Substances 0.000 description 1
- 125000001634 furandiyl group Chemical group O1C(=C(C=C1)*)* 0.000 description 1
- WIGCFUFOHFEKBI-UHFFFAOYSA-N gamma-tocopherol Natural products CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCC1CCC2C(C)C(O)C(C)C(C)C2O1 WIGCFUFOHFEKBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010017758 gastric cancer Diseases 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000007897 gelcap Substances 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007614 genetic variation Effects 0.000 description 1
- 208000005017 glioblastoma Diseases 0.000 description 1
- 239000000174 gluconic acid Substances 0.000 description 1
- 235000012208 gluconic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960001031 glucose Drugs 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 235000021312 gluten Nutrition 0.000 description 1
- 229960005150 glycerol Drugs 0.000 description 1
- 150000002334 glycols Chemical class 0.000 description 1
- 239000003979 granulating agent Substances 0.000 description 1
- 208000024963 hair loss Diseases 0.000 description 1
- 230000003676 hair loss Effects 0.000 description 1
- 125000004970 halomethyl group Chemical group 0.000 description 1
- 201000010536 head and neck cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000014829 head and neck neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000003862 health status Effects 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 208000014951 hematologic disease Diseases 0.000 description 1
- 208000018706 hematopoietic system disease Diseases 0.000 description 1
- 206010073071 hepatocellular carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 231100000844 hepatocellular carcinoma Toxicity 0.000 description 1
- 125000003187 heptyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 244000144980 herd Species 0.000 description 1
- 125000003707 hexyloxy group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])O* 0.000 description 1
- 239000000017 hydrogel Substances 0.000 description 1
- 125000004435 hydrogen atom Chemical class [H]* 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 125000003037 imidazol-2-yl group Chemical group [H]N1C([*])=NC([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 125000002140 imidazol-4-yl group Chemical group [H]N1C([H])=NC([*])=C1[H] 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N indole Natural products CC1=CC=CC2=C1C=CN2 PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N indolenine Natural products C1=CC=C2CC=NC2=C1 RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001041 indolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 229940102223 injectable solution Drugs 0.000 description 1
- 229940102213 injectable suspension Drugs 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 229910010272 inorganic material Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011147 inorganic material Substances 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000010255 intramuscular injection Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 1
- 230000002427 irreversible effect Effects 0.000 description 1
- 229940045996 isethionic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N isooleic acid Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCCC(O)=O QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003253 isopropoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(O*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- XUGNVMKQXJXZCD-UHFFFAOYSA-N isopropyl palmitate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC(C)C XUGNVMKQXJXZCD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZLTPDFXIESTBQG-UHFFFAOYSA-N isothiazole Chemical compound C=1C=NSC=1 ZLTPDFXIESTBQG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CTAPFRYPJLPFDF-UHFFFAOYSA-N isoxazole Chemical compound C=1C=NOC=1 CTAPFRYPJLPFDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NLYAJNPCOHFWQQ-UHFFFAOYSA-N kaolin Chemical compound O.O.O=[Al]O[Si](=O)O[Si](=O)O[Al]=O NLYAJNPCOHFWQQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002147 killing effect Effects 0.000 description 1
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 1
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 1
- 235000019388 lanolin Nutrition 0.000 description 1
- 229940039717 lanolin Drugs 0.000 description 1
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 1
- 239000004973 liquid crystal related substance Substances 0.000 description 1
- 210000002751 lymph Anatomy 0.000 description 1
- 125000000040 m-tolyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(*)=C([H])C(=C1[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 159000000003 magnesium salts Chemical class 0.000 description 1
- 229940107698 malachite green Drugs 0.000 description 1
- FDZZZRQASAIRJF-UHFFFAOYSA-M malachite green Chemical compound [Cl-].C1=CC(N(C)C)=CC=C1C(C=1C=CC=CC=1)=C1C=CC(=[N+](C)C)C=C1 FDZZZRQASAIRJF-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N maleic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N 0.000 description 1
- 239000011976 maleic acid Substances 0.000 description 1
- 239000001630 malic acid Substances 0.000 description 1
- 235000011090 malic acid Nutrition 0.000 description 1
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 229960002510 mandelic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 239000001525 mentha piperita l. herb oil Substances 0.000 description 1
- DZVCFNFOPIZQKX-LTHRDKTGSA-M merocyanine Chemical compound [Na+].O=C1N(CCCC)C(=O)N(CCCC)C(=O)C1=C\C=C\C=C/1N(CCCS([O-])(=O)=O)C2=CC=CC=C2O\1 DZVCFNFOPIZQKX-LTHRDKTGSA-M 0.000 description 1
- 229940098779 methanesulfonic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000004292 methyl p-hydroxybenzoate Substances 0.000 description 1
- 235000010270 methyl p-hydroxybenzoate Nutrition 0.000 description 1
- 229960002216 methylparaben Drugs 0.000 description 1
- 125000006405 methylpyridazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006393 methylpyrimidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004170 methylsulfonyl group Chemical group [H]C([H])([H])S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 239000002480 mineral oil Substances 0.000 description 1
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 1
- 231100000324 minimal toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 210000003097 mucus Anatomy 0.000 description 1
- LNOPIUAQISRISI-UHFFFAOYSA-N n'-hydroxy-2-propan-2-ylsulfonylethanimidamide Chemical compound CC(C)S(=O)(=O)CC(N)=NO LNOPIUAQISRISI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SHXOKQKTZJXHHR-UHFFFAOYSA-N n,n-diethyl-5-iminobenzo[a]phenoxazin-9-amine;hydrochloride Chemical compound [Cl-].C1=CC=C2C3=NC4=CC=C(N(CC)CC)C=C4OC3=CC(=[NH2+])C2=C1 SHXOKQKTZJXHHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JXTPJDDICSTXJX-UHFFFAOYSA-N n-Triacontane Natural products CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC JXTPJDDICSTXJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006606 n-butoxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003136 n-heptyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000001298 n-hexoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])O* 0.000 description 1
- 125000003935 n-pentoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])O* 0.000 description 1
- 125000003506 n-propoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])O* 0.000 description 1
- YZMHQCWXYHARLS-UHFFFAOYSA-N naphthalene-1,2-disulfonic acid Chemical compound C1=CC=CC2=C(S(O)(=O)=O)C(S(=O)(=O)O)=CC=C21 YZMHQCWXYHARLS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PSZYNBSKGUBXEH-UHFFFAOYSA-N naphthalene-1-sulfonic acid Chemical compound C1=CC=C2C(S(=O)(=O)O)=CC=CC2=C1 PSZYNBSKGUBXEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AAXKMXAEFVWFDC-UHFFFAOYSA-N naphthalene;prop-2-enoic acid Chemical compound OC(=O)C=C.C1=CC=CC2=CC=CC=C21 AAXKMXAEFVWFDC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002790 naphthalenes Chemical class 0.000 description 1
- 125000001624 naphthyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000008693 nausea Effects 0.000 description 1
- VOFUROIFQGPCGE-UHFFFAOYSA-N nile red Chemical compound C1=CC=C2C3=NC4=CC=C(N(CC)CC)C=C4OC3=CC(=O)C2=C1 VOFUROIFQGPCGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910017604 nitric acid Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000000449 nitro group Chemical group [O-][N+](*)=O 0.000 description 1
- 208000002154 non-small cell lung carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000002736 nonionic surfactant Substances 0.000 description 1
- 231100000956 nontoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 125000003261 o-tolyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(*)=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000002347 octyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N oleic acid Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(O)=O ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 201000008968 osteosarcoma Diseases 0.000 description 1
- WCPAKWJPBJAGKN-UHFFFAOYSA-N oxadiazole Chemical compound C1=CON=N1 WCPAKWJPBJAGKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000004866 oxadiazoles Chemical class 0.000 description 1
- 235000006408 oxalic acid Nutrition 0.000 description 1
- KHPXUQMNIQBQEV-UHFFFAOYSA-N oxaloacetic acid Chemical compound OC(=O)CC(=O)C(O)=O KHPXUQMNIQBQEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GHTWDWCFRFTBRB-UHFFFAOYSA-M oxazine-170 Chemical compound [O-]Cl(=O)(=O)=O.N1=C2C3=CC=CC=C3C(NCC)=CC2=[O+]C2=C1C=C(C)C(N(C)CC)=C2 GHTWDWCFRFTBRB-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 150000004893 oxazines Chemical class 0.000 description 1
- 125000004287 oxazol-2-yl group Chemical group [H]C1=C([H])N=C(*)O1 0.000 description 1
- 125000004304 oxazol-5-yl group Chemical group O1C=NC=C1* 0.000 description 1
- AFDXODALSZRGIH-UHFFFAOYSA-N p-coumaric acid methyl ether Natural products COC1=CC=C(C=CC(O)=O)C=C1 AFDXODALSZRGIH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001037 p-tolyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000001312 palmitoyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- WLJNZVDCPSBLRP-UHFFFAOYSA-N pamoic acid Chemical compound C1=CC=C2C(CC=3C4=CC=CC=C4C=C(C=3O)C(=O)O)=C(O)C(C(O)=O)=CC2=C1 WLJNZVDCPSBLRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 239000013610 patient sample Substances 0.000 description 1
- JZRYQZJSTWVBBD-UHFFFAOYSA-N pentaporphyrin i Chemical compound N1C(C=C2NC(=CC3=NC(=C4)C=C3)C=C2)=CC=C1C=C1C=CC4=N1 JZRYQZJSTWVBBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004115 pentoxy group Chemical group [*]OC([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C(C([H])([H])[H])([H])[H] 0.000 description 1
- 235000019477 peppermint oil Nutrition 0.000 description 1
- 229940066842 petrolatum Drugs 0.000 description 1
- 235000019271 petrolatum Nutrition 0.000 description 1
- 239000008177 pharmaceutical agent Substances 0.000 description 1
- 229940124531 pharmaceutical excipient Drugs 0.000 description 1
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 1
- 150000008105 phosphatidylcholines Chemical class 0.000 description 1
- 235000011007 phosphoric acid Nutrition 0.000 description 1
- IEQIEDJGQAUEQZ-UHFFFAOYSA-N phthalocyanine Chemical compound N1C(N=C2C3=CC=CC=C3C(N=C3C4=CC=CC=C4C(=N4)N3)=N2)=C(C=CC=C2)C2=C1N=C1C2=CC=CC=C2C4=N1 IEQIEDJGQAUEQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004482 piperidin-4-yl group Chemical group N1CCC(CC1)* 0.000 description 1
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 1
- 229910052697 platinum Inorganic materials 0.000 description 1
- 210000004910 pleural fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000005015 poly(hydroxybutyrate) Substances 0.000 description 1
- 229920000747 poly(lactic acid) Polymers 0.000 description 1
- 229920001515 polyalkylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920001610 polycaprolactone Polymers 0.000 description 1
- 229920002721 polycyanoacrylate Polymers 0.000 description 1
- 229920000728 polyester Polymers 0.000 description 1
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 description 1
- 239000004626 polylactic acid Substances 0.000 description 1
- 229920000656 polylysine Polymers 0.000 description 1
- 229920006324 polyoxymethylene Polymers 0.000 description 1
- 229920001451 polypropylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 159000000001 potassium salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 238000004237 preparative chromatography Methods 0.000 description 1
- 229960000286 proflavine Drugs 0.000 description 1
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 1
- BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N propan-1-ol Chemical compound CCCO BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004368 propenyl group Chemical group C(=CC)* 0.000 description 1
- 235000019260 propionic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004405 propyl p-hydroxybenzoate Substances 0.000 description 1
- 235000010232 propyl p-hydroxybenzoate Nutrition 0.000 description 1
- 235000013772 propylene glycol Nutrition 0.000 description 1
- 229960003415 propylparaben Drugs 0.000 description 1
- 125000002568 propynyl group Chemical group [*]C#CC([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 125000004353 pyrazol-1-yl group Chemical group [H]C1=NN(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 150000003220 pyrenes Chemical class 0.000 description 1
- 125000004940 pyridazin-4-yl group Chemical group N1=NC=C(C=C1)* 0.000 description 1
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004528 pyrimidin-5-yl group Chemical group N1=CN=CC(=C1)* 0.000 description 1
- 229940107700 pyruvic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000007859 qualitative PCR Methods 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- JWVCLYRUEFBMGU-UHFFFAOYSA-N quinazoline Chemical compound N1=CN=CC2=CC=CC=C21 JWVCLYRUEFBMGU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N quinbolone Chemical compound O([C@H]1CC[C@H]2[C@H]3[C@@H]([C@]4(C=CC(=O)C=C4CC3)C)CC[C@@]21C)C1=CCCC1 IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 1
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CVHZOJJKTDOEJC-UHFFFAOYSA-N saccharin Chemical compound C1=CC=C2C(=O)NS(=O)(=O)C2=C1 CVHZOJJKTDOEJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000019204 saccharin Nutrition 0.000 description 1
- 229940081974 saccharin Drugs 0.000 description 1
- 239000000901 saccharin and its Na,K and Ca salt Substances 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 238000013341 scale-up Methods 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 230000009919 sequestration Effects 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 239000004208 shellac Substances 0.000 description 1
- 229940113147 shellac Drugs 0.000 description 1
- ZLGIYFNHBLSMPS-ATJNOEHPSA-N shellac Chemical compound OCCCCCC(O)C(O)CCCCCCCC(O)=O.C1C23[C@H](C(O)=O)CCC2[C@](C)(CO)[C@@H]1C(C(O)=O)=C[C@@H]3O ZLGIYFNHBLSMPS-ATJNOEHPSA-N 0.000 description 1
- 235000013874 shellac Nutrition 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 229920002545 silicone oil Polymers 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 235000015424 sodium Nutrition 0.000 description 1
- 229940083542 sodium Drugs 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 229960003885 sodium benzoate Drugs 0.000 description 1
- 229940001607 sodium bisulfite Drugs 0.000 description 1
- 235000010267 sodium hydrogen sulphite Nutrition 0.000 description 1
- RYYKJJJTJZKILX-UHFFFAOYSA-M sodium octadecanoate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O RYYKJJJTJZKILX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 description 1
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 description 1
- 229940032094 squalane Drugs 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 1
- 201000011549 stomach cancer Diseases 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 229950000244 sulfanilic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000002600 sunflower oil Substances 0.000 description 1
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000454 talc Substances 0.000 description 1
- 229910052623 talc Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000002626 targeted therapy Methods 0.000 description 1
- 239000011975 tartaric acid Substances 0.000 description 1
- 235000002906 tartaric acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960001367 tartaric acid Drugs 0.000 description 1
- 238000012956 testing procedure Methods 0.000 description 1
- 150000003536 tetrazoles Chemical class 0.000 description 1
- 125000004496 thiazol-5-yl group Chemical group S1C=NC=C1* 0.000 description 1
- 239000002562 thickening agent Substances 0.000 description 1
- 125000004568 thiomorpholinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229930192474 thiophene Natural products 0.000 description 1
- 201000002510 thyroid cancer Diseases 0.000 description 1
- 229960000984 tocofersolan Drugs 0.000 description 1
- AOBORMOPSGHCAX-DGHZZKTQSA-N tocofersolan Chemical compound OCCOC(=O)CCC(=O)OC1=C(C)C(C)=C2O[C@](CCC[C@H](C)CCC[C@H](C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C AOBORMOPSGHCAX-DGHZZKTQSA-N 0.000 description 1
- 230000000699 topical effect Effects 0.000 description 1
- 235000010487 tragacanth Nutrition 0.000 description 1
- 239000000196 tragacanth Substances 0.000 description 1
- 229940116362 tragacanth Drugs 0.000 description 1
- WBYWAXJHAXSJNI-VOTSOKGWSA-N trans-cinnamic acid Chemical compound OC(=O)\C=C\C1=CC=CC=C1 WBYWAXJHAXSJNI-VOTSOKGWSA-N 0.000 description 1
- 230000005026 transcription initiation Effects 0.000 description 1
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 206010044412 transitional cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 1
- 230000005945 translocation Effects 0.000 description 1
- 150000003626 triacylglycerols Chemical class 0.000 description 1
- 125000004950 trifluoroalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000876 trifluoromethoxy group Chemical group FC(F)(F)O* 0.000 description 1
- 208000029729 tumor suppressor gene on chromosome 11 Diseases 0.000 description 1
- 230000003827 upregulation Effects 0.000 description 1
- 201000005112 urinary bladder cancer Diseases 0.000 description 1
- 230000002485 urinary effect Effects 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 description 1
- 235000019165 vitamin E Nutrition 0.000 description 1
- 229940046009 vitamin E Drugs 0.000 description 1
- 239000011709 vitamin E Substances 0.000 description 1
- 230000008673 vomiting Effects 0.000 description 1
- 239000001993 wax Substances 0.000 description 1
- 150000003732 xanthenes Chemical class 0.000 description 1
- 239000005019 zein Substances 0.000 description 1
- 229940093612 zein Drugs 0.000 description 1
- UHVMMEOXYDMDKI-JKYCWFKZSA-L zinc;1-(5-cyanopyridin-2-yl)-3-[(1s,2s)-2-(6-fluoro-2-hydroxy-3-propanoylphenyl)cyclopropyl]urea;diacetate Chemical compound [Zn+2].CC([O-])=O.CC([O-])=O.CCC(=O)C1=CC=C(F)C([C@H]2[C@H](C2)NC(=O)NC=2N=CC(=CC=2)C#N)=C1O UHVMMEOXYDMDKI-JKYCWFKZSA-L 0.000 description 1
- 239000002076 α-tocopherol Substances 0.000 description 1
- 235000004835 α-tocopherol Nutrition 0.000 description 1
- 229930195724 β-lactose Natural products 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
- A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
- A61K31/519—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
- A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
- A61K31/519—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
- A61K31/52—Purines, e.g. adenine
- A61K31/522—Purines, e.g. adenine having oxo groups directly attached to the heterocyclic ring, e.g. hypoxanthine, guanine, acyclovir
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Pathology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Oncology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Nitrogen Condensed Heterocyclic Rings (AREA)
Description
関連出願の相互参照
本出願は、2016年12月21日出願のシンガポール仮出願第10201610735P号及び2017年5月19日出願のシンガポール仮出願第10201704134V号の優先権の利益を主張し、両出願の内容は、すべての目的でその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本出願は、2016年12月21日出願のシンガポール仮出願第10201610735P号及び2017年5月19日出願のシンガポール仮出願第10201704134V号の優先権の利益を主張し、両出願の内容は、すべての目的でその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本発明は、分子生物学、特にバイオマーカーに関する。特に、本発明は、Wntシグナリング経路の阻害剤による治療に感受性であるか、又は感受性である可能性が高い悪性腫瘍と関連付けられるバイオマーカーの検出及び定量に関する。
がんは、世界で第2位の死亡原因であり、2012年において820万例の死亡原因である。ここ数十年、標準医療は、群ベースの疫学研究によってガイドされており、個体の遺伝的変異によっては説明されず、結論のほとんどは、集団レベルに基づく。更に、がんの治療は歴史的に、全身性細胞傷害性化学療法からなっている。化学療法は、増殖又は分裂中の細胞を殺滅する一般的な目的を有し、化学療法は、がんを有する一部の患者においては症状を低減し、クオリティ・オブ・ライフを改善し、生存を延長する。しかしながら、全身性細胞傷害性化学療法はまた、正常な非がん性細胞を殺滅し、したがって、多くの副作用、例えば脱毛、下痢、吐き気、嘔吐、血液障害、消化器障害及び排尿障害をもたらす。
現代の個別化医療の発展は、過去十年にわたり改善されてきた。現代の個別化医療は、ターゲティング療法に基づく。ターゲティングがん療法においては、がんを引き起こす変更された経路及び成分についての情報が利用可能であることが重要である。個別化医療の目的は、適切な薬物を適切な用量で、最小限の毒性で、又は毒性を伴わずに、適切な患者について適切な時間に使用することである。悪性腫瘍を駆動する分子経路の理解の改善は、悪性細胞の開始における特定の分子経路をターゲティングする剤の開発をもたらした。これらの剤が、悪性細胞を優先的に殺滅することができるが、正常細胞には比較的無害であることが期待されている。
がんを有する患者において、多くの型の遺伝的及び後成的変異が存在するので、様々ながん患者のための様々なターゲティングがん療法を開発することについて継続中の要求が存在している。また、がん患者をスクリーニングし、がん患者に適切なターゲティングがん療法を選択する、より迅速かつ高感度の方法について継続中の要求が存在している。
第1の態様においては、PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を増幅することができるプライマー対、野生型PTPRK及び/若しくは野生型RSPO3配列を増幅することができるコントロールプライマー対、並びに/又は合成オリゴヌクレオチド内部コントロール鋳型配列、及び合成内部コントロール鋳型配列を増幅することができる内部コントロールプライマー対を含む、Wntシグナリング経路の阻害剤による治療に感受性の悪性腫瘍を患う対象を特定するための多重化増幅反応キットが提供される。
第2の態様においては、悪性腫瘍を患う対象においてPTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を検出する方法であって、対象からの試料から核酸を抽出する工程と;1つ又は複数のプライマー対により核酸を増幅する工程であって、プライマー対が、PTPRK(e13)-RSPO3(e2)遺伝子融合物を増幅することができる、工程と;増幅した核酸を検出する工程とを含む方法が提供される。
第3の態様においては、悪性腫瘍を患う対象においてWntシグナリングの阻害剤への感受性を特定する方法であって、対象からの試料から核酸を抽出する工程と;PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を増幅することができるプライマー対により核酸を増幅する工程と;PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物が増幅された場合、Wntシグナリングの阻害剤への感受性を特定する工程とを含む方法が提供される。
第4の態様においては、前記悪性腫瘍が、第2又は第3の態様の方法に従って特定されている、悪性腫瘍を有する対象を治療する方法が提供される。
本発明は、詳細な説明を参照して、非限定的な実施例及び添付の図面と併せて考慮するとより理解されるであろう。
同じがん療法を与えても、がん患者は概して、異なって反応することが知られており、他の患者より明確に反応する患者もいれば、全く反応しない患者もいる。このような差についての根底にある理由は、大部分は知られていない。したがって、本分野における研究者らは、好適なターゲティングがん療法を提供するために、がん患者の反応におけるこのような差をもたらす様々な理由を特定しようとしてきた。本出願においては、本発明者らは、PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を有する患者は、そのような遺伝子融合物を有しない患者と比較して、Wntシグナリング経路の阻害剤により、より良く治療され得ることを発見した。別の例においては、PTPRK(e1)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を有する患者はまた、そのような遺伝子融合物を有しない患者と比較して、Wntシグナリング経路の阻害剤により治療され得ることが分かった。それゆえ、患者試料においてPTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物及び/又はPTPRK(e1)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を検出することは、Wntシグナリング経路の阻害剤を使用するターゲティング療法に好適な患者を特定することにおいて有用であり得る。
第1の態様においては、本発明は、PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対);野生型PTPRK及び/若しくは野生型RSPO3配列を増幅することができるコントロールプライマー対(又はそれを増幅するコントロールプライマー対);並びに/又は合成オリゴヌクレオチド内部コントロール鋳型配列、及び合成内部コントロール鋳型配列を増幅することができる内部コントロールプライマー対(又はそれを増幅する内部コントロールプライマー対)を含む、Wntシグナリング経路の阻害剤による治療に感受性の悪性腫瘍を患う対象を特定するための多重化増幅反応キットについて言及する。別の例においては、PTPRK(e1)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対);野生型PTPRK及び/若しくは野生型RSPO3配列を増幅することができるコントロールプライマー対(又はそれを増幅するコントロールプライマー対);並びに/又は合成オリゴヌクレオチド内部コントロール鋳型配列、及び合成内部コントロール鋳型配列を増幅することができる内部コントロールプライマー対(又はそれを増幅する内部コントロールプライマー対)を含む、Wntシグナリング経路の阻害剤による治療に感受性の悪性腫瘍を患う対象を特定するための多重化増幅反応キットが開示される。
本明細書において使用するとき、「多重」という用語又はその文法的同等物は、単一の増幅実験における所与の試料中の1つを超える目的の標的配列の検出及び/又は増幅を指す。一例においては、そのような1つを超える目的の標的配列のうちの1つのみが、Wntシグナリング経路の阻害剤による治療に感受性の悪性腫瘍を患う対象の特定のために使用され、他の目的の標的配列は、コントロールとして働く。言及を容易にするために、そのような1つの目的の標的配列は、「目的のキー標的配列」と本明細書において呼ばれる。多重増幅実験においては、多数のプライマー組が典型的に、多数の目的の標的配列を同時に増幅するために、同じ増幅反応において使用される。一度に多数の目的の配列をターゲティングすることによって、単一の増幅反応から追加の情報を得てもよく、そうしない場合は、実行するのに数倍の試薬及びより長い時間を要し得る。特定の一実施形態においては、多重は、単一の増幅実験における所与の試料中の3つの異なる標的配列の検出及び/又は増幅を指す。別の特定の実施形態においては、多重は、単一の増幅実験における所与の試料中の4つの異なる標的配列の検出及び/又は増幅を指す。様々な他の実施形態においては、多重は、単一の増幅実験における所与の試料中の2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20個又はそれよりも多い異なる標的配列の検出及び/又は増幅を指す。
「増幅反応」という用語は、本明細書において使用するとき、標的配列の追加のコピーを生成する反応を指す。標的配列を増幅するために分子生物学において使用される典型的な増幅反応は、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)である。PCRの例として、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応、リアルタイム逆転写ポリメラーゼ連鎖反応、デジタルポリメラーゼ連鎖反応、定量ポリメラーゼ連鎖反応、定性ポリメラーゼ連鎖反応、定量リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応又は定量逆転写ポリメラーゼ連鎖反応が挙げられるが、これらに限定されない。特定の一例においては、増幅反応は、リアルタイムPCR増幅反応である。
リアルタイムPCRは、PCR中に、すなわち、リアルタイムで、従来型PCRにおけるようにその終わりにではなく、ターゲティングしたDNA分子の増幅をモニターする。リアルタイムPCRは、定量的に(定量リアルタイムPCR)、及び半定量的に、すなわち、ある特定の量のDNA分子を超えて/未満で(半定量リアルタイムPCR)、使用することができる。定量リアルタイムPCR(qrt-PCR)法は、増幅が進行するにつれて増幅した生成物の量を測定するために、蛍光色素又はフルオロフォア含有DNAプローブを使用する。
デジタルPCR(dPCR:Digital PCR)は、数千の試料を同時に増幅し、各々は、エマルション内の別々の水滴中にある。
定量PCR(qPCR)は、試料中の特定の量の標的DNA(又はRNA)を測定するために使用される。真の指数関数的増幅相内のみの増幅を測定することによって、測定した生成物の量は、標的の開始量をより正確に反映する。増幅中に生成物の量をモニターする特別なサーマルサイクラーが使用される。
定性PCRは、存在する量を定量することなく、試料中の標的DNA(RNA)の存在又は非存在を検出するために使用されるPCR法を指す。
逆転写PCRは、RNAをcDNAに逆転写し、増幅するために使用される。PCRに先行して、RNAをcDNAに変換する酵素である逆転写酵素を使用する反応が行われる。2つの反応を、管内で組み合わせてもよく、PCRの初期加熱工程は、転写酵素を不活性化するために使用される。RT-PCRは、遺伝子の発現を検出する発現プロファイリングにおいて広く使用される。それはまた、RNA転写産物の配列を得るために使用することができ、これは転写開始及び終止部位の決定を補助し、遺伝子配列中のエクソン及びイントロンの位置のマッピングを促進し得る。
一部の例においては、PCR増幅は、TaqManプローブの使用を含む。TaqManプローブは、定量PCRの特異性を増大させるために設計された加水分解プローブである。TaqManプローブ原理は、相補的標的配列へのハイブリダイゼーション中に二重標識プローブを切断するTaqポリメラーゼの5'-3'エキソヌクレアーゼ活性、及びフルオロフォアベースの検出に頼る。他の定量PCR法と同様に、得られた蛍光シグナルは、PCRの指数関数的段階中の生成物蓄積の定量測定を可能にする。TaqManプローブは、検出の特異性を顕著に増大させる。
「対象」という用語は、本明細書において使用するとき、治療、観察又は実験の対象である動物、好ましくは哺乳動物、最も好ましくはヒトを指す。一例においては、対象は、ヒトではない。対象は、例えば非ヒト哺乳動物であってもよい。
「悪性腫瘍」という用語は、本明細書において使用するとき、異常な細胞が制御なく分裂し、近傍の組織に侵入する疾患を指す。悪性疾患は通常、がんとして公知である。本明細書において説明する方法又はキットによって特定又は治療され得るがんの主要な型として、癌腫、肉腫、リンパ腫、胚細胞腫瘍及び芽腫が挙げられるが、これらに限定されない。がんの特定の型として、肺がん、黒色腫、結腸直腸がん、神経芽細胞腫、乳がん、前立腺がん、腎細胞がん、移行上皮癌、胆管細胞癌、脳がん、非小細胞肺がん、膵がん、胃癌、膀胱がん、食道がん、中皮腫、甲状腺がん、頭頸部がん、骨肉腫、肝細胞癌、原発不明癌、卵巣癌、子宮内膜癌、神経膠芽腫、ホジキンリンパ腫及び非ホジキンリンパ腫が挙げられるが、これらに限定されない。一部の特定の例においては、本明細書において開示する方法又はキットによって特定又は治療される悪性腫瘍は、肺がん、黒色腫、結腸直腸がん、リンパ腫及び神経芽細胞腫である。一例においては、悪性腫瘍は、固形悪性腫瘍である。一部の例においては、悪性腫瘍は、食道、胆嚢、肝臓、膵臓、胃、小腸、大腸、結腸、直腸又は肛門の消化器がんである。
特定の一例においては、悪性腫瘍は、結腸直腸がんである。一例においては、がんは、侵襲性及び/又は転移性がんである。別の例においては、がんは、ステージIIがん、ステージIIIがん又はステージIVがんである。別の例においては、がんは、初期転移性がんである。一例においては、初期転移性がんは、必ずしも初期段階のがんではない。一部の例においては、悪性腫瘍は、上昇したWnt活性レベルによって特徴付けられる。上昇したWnt活性レベルは、悪性腫瘍を有しない対象のWnt活性レベル又は所与の集団中の悪性腫瘍を有しない対象における平均Wnt活性レベルの少なくとも10%、又は少なくとも20%、又は少なくとも30%、又は少なくとも40%、又は少なくとも50%、又は少なくとも60%、又は少なくとも70%、又は少なくとも80%、又は少なくとも90%、又は少なくとも100%、又は少なくとも110%、又は少なくとも120%、又は少なくとも130%、又は少なくとも140%、又は少なくとも150%、又は少なくとも160%、又は少なくとも170%、又は少なくとも180%、又は少なくとも190%、又は少なくとも200%であるWnt活性によって定義することができる。一部の例においては、上昇したWnt活性レベルは、転写において、又は転写後において上昇している。
「PTPRK」という用語は、本明細書において使用するとき、ヒトにおいてタンパク質チロシンホスファターゼ受容体タイプKをコードするPTPRK遺伝子を指す。タンパク質チロシンホスファターゼ受容体タイプKは、タンパク質チロシンホスファターゼ(PTP)ファミリーのメンバーである。タンパク質チロシンホスファターゼ受容体タイプKは、細胞外領域、単一の膜貫通領域及び2つのタンデム触媒ドメインを所有し、したがって、受容体型のPTPを示す。細胞外領域は、メプリン-A5抗原-PTP mu(MAM)ドメイン、Ig様ドメイン及び4つのフィブロネクチンタイプIII様反復を含有する。PTPRKはまた、PTPカッパ又はPTPκとして公知である。ヒトPTPRK遺伝子のヌクレオチド配列は、配列番号1によって表され、全部で30個のエクソンを有する。
「PTPRK(en)」という用語は、本明細書において使用するとき、PTPRK遺伝子のエクソン番号nを指す。例えば、「PTPRK(e13)」という用語は、本明細書において使用するとき、PTPRK遺伝子のエクソン13を指す。ヒトPTPRK遺伝子のエクソン13のヌクレオチド配列は、配列番号2によって表される。
「RSPO3」という用語は、本明細書において使用するとき、RSPO3遺伝子を指す。この遺伝子は、R-スポンジンファミリーに属し、タンパク質R-スポンジン-3をコードする。ヒトRSPO3遺伝子のヌクレオチド配列は、配列番号3によって表され、全部で5個のエクソンを有する。
「RSPO3(em)」という用語は、本明細書において使用するとき、RSPO3遺伝子のエクソン番号mを指す。例えば、「RSPO3(e2)」という用語は、本明細書において使用するとき、RSPO3遺伝子のエクソン2を指す。ヒトRSPO3遺伝子のエクソン2のヌクレオチド配列は、配列番号4によって表される。
「遺伝子融合物」という用語は、本明細書において使用するとき、2つの以前に分離した遺伝子から形成したハイブリッド遺伝子を指す。それは通常、転座、中間部欠損又は染色体逆位の結果として起こり得る。遺伝子融合物は、悪性腫瘍の形成において重要な役割を果たす突然変異の一形態である。
「野生型」という用語は、遺伝子の文脈で本明細書において使用するとき、特定の集団中の健康な個体集団における遺伝子の最も一般的な遺伝子型を指す。野生型遺伝子は、任意の突然変異、特に遺伝子融合物を含有しない遺伝子である。野生型遺伝子は、多重化増幅反応においてコントロールとして使用される。試料中の目的の標的配列が遺伝子融合物、例えばA-B遺伝子融合物である場合、野生型遺伝子A及び野生型遺伝子Bの両方又はそれらの組合せを、コントロールとして使用することができる。
標的配列を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)は典型的に、フォワードプライマー及びリバースプライマーを含む。標的遺伝子融合物を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)は典型的に、融合部位にまたがる。
一例においては、標的配列が、PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を含む場合、標的配列を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)は、PTPRK(e13)の3'末端及びRSPO3(e2)の5'末端にまたがる。特定の一例においては、プライマー対は、PTPRK(e13)をターゲティングするフォワードプライマーと、RSPO3(e2)をターゲティングするリバースプライマーとを含む。別の例においては、プライマー対は、PTPRK(e12/e13)をターゲティングするフォワードプライマーと、RSPO3(e2)をターゲティングするリバースプライマーとを含む。ヒトPTPRK遺伝子のエクソン12のヌクレオチド配列は、配列番号5によって表される。標的配列PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物のためのフォワードプライマーの特定の一例は、(5'-3')GGAGAAGGAAACTARAACCCAGT(配列番号6)の配列を含み、同じ標的配列のためのリバースプライマーの特定の一例は、(5'-3')GTCTGGGCTTACATGACAARCATC(配列番号7)の配列を含む。一例においては、標的配列PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物のためのフォワードプライマーは、配列番号6の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。別の例においては、標的配列PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物のためのリバースプライマーは、配列番号7の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。
一例においては、野生型PTPRK遺伝子を検出するために、PTPRK(e12～e14)によって表されるPTPRK遺伝子のエクソン12～14を、標的配列として使用する。この標的配列を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)は、したがって、PTPRK(e12)の3'末端、全PTPRK(e13)及びPTPRK(e14)の5'末端にまたがる。ヒトPTPRK遺伝子のエクソン14のヌクレオチド配列は、配列番号8によって表される。特定の一例においては、プライマー対は、PTPRK(e12)をターゲティングするフォワードプライマーと、PTPRK(e14)をターゲティングするリバースプライマーとを含む。別の例においては、プライマー対は、PTPRK(e12/e13)をターゲティングするフォワードプライマーと、PTPRK(e14)をターゲティングするリバースプライマーとを含む。標的配列PTPRK(e12～e14)のためのフォワードプライマーの特定の一例は、(5'-3')GGAGAAGGAAACTARAACCCAGT(配列番号9)の配列を含み、同じ標的配列のためのリバースプライマーの特定の一例は、(5'-3')GCTATTTTCACCACTCTGTCYGT(配列番号10)の配列を含む。一例においては、標的配列PTPRK(e12～e14)のためのフォワードプライマーは、配列番号9の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。別の例においては、標的配列PTPRK(e12～e14)のためのリバースプライマーは、配列番号10の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。
一例においては、野生型RSPO3遺伝子を検出するために、RSPO3(e1/e2)によって表されるRSPO3遺伝子のエクソン1及び2を、標的配列として使用する。この標的配列を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)は、したがって、RSPO3(e1)の3'末端及びRSPO3(e2)の5'末端にまたがる。ヒトRSPO3遺伝子のエクソン1のヌクレオチド配列は、配列番号11によって表される。特定の一例においては、プライマー対は、(5'-3')CTCYTTGGCAGCCTTGACT(配列番号12)の配列を含むフォワードプライマーと、配列(5'-3')AATACATCGGCAGCCAAAACG(配列番号13)又は(5'-3')AATACMTYGGCAGCCAAAACG(配列番号14)を含むリバースプライマーとを含む。一例においては、標的配列RSPO3(e1/e2)のためのフォワードプライマーは、配列番号12の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。別の例においては、標的配列RSPO3(e1/e2)のためのリバースプライマーは、配列番号13若しくは配列番号14の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。
「内部コントロール」という用語は、本明細書において使用するとき、増幅系が機能しているかどうかを示すために、及び真の標的陰性を、例えばPCR阻害によって引き起こされる増幅失敗と区別するために使用され得る参照配列である内部陽性コントロールを指す。内部コントロールは、任意の天然に存在する生物において見られない人工標的配列を含む。
試料中に内部コントロールがない場合、試験した標的配列について増幅シグナルが検出されないとき、真の陰性と偽陰性とを識別することは可能ではない。試料中に内部コントロールが含まれるが、うまく増幅されず、試験した標的配列について増幅シグナルが検出されない場合、それは、陰性増幅結果が、偽陰性であることを示す。試料中に内部コントロールが含まれ、うまく増幅されたが、試験した標的配列について増幅シグナルが検出されない場合、それは、陰性増幅結果が、真の陰性であることを示す。
一部の例においては、内部コントロールは、配列番号69の標的配列、その相補配列、断片又はバリアントを含む。一部の例においては、内部コントロール標的配列を増幅することができる内部コントロールプライマー対(又はそれを増幅する内部コントロールプライマー対)は、(5'-3')GCGCCCGAACAGTATCGCGTTT(配列番号16)の配列を含むフォワードプライマーと、(5'-3')AGCCTCCGCTAGTCACCCAA(配列番号17)の配列を含むリバースプライマーとを含む。一例においては、内部コントロール標的配列のためのフォワードプライマーは、配列番号16の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。別の例においては、内部コントロール標的配列のためのリバースプライマーは、配列番号17の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。
上記に説明する成分を有するキットは、1つの目的のキー標的配列の検出のために設計した多重化増幅反応のために使用される。例えば、偽陽性又は偽陰性特定率を低減することによって、Wntシグナリング経路の阻害剤による治療に感受性の悪性腫瘍を患う対象をより良く特定するために、1つの目的のキー標的配列の検出結果は、他の1つ又は複数の目的のキー標的配列の検出結果との組合せにおいて使用することができる。したがって、一部の例においては、第1の態様のキットは、1つ又は複数の追加の多重化増幅反応を行うために設計した成分を含む。そのような1つ又は複数の追加の多重化増幅反応は、1つ又は複数のR-スポンジン遺伝子融合物、例えば非限定的に、PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物及びEIF3E(e1)-RSPO2(e2)融合物の検出のために設計される。したがって、一部の例においては、第1の態様のキットは、1つ若しくは複数のR-スポンジン遺伝子融合物を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)であって、R-スポンジン遺伝子融合物が、PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物及びEIF3E(e1)-RSPO2(e2)融合物である、プライマー対;野生型PTPRK、野生型EIF3E、野生型RSPO2及び/若しくは野生型RSPO3配列を増幅することができるコントロールプライマー対(又はそれを増幅するコントロールプライマー対);並びに/又は合成オリゴヌクレオチド内部コントロール鋳型配列、及び1つ若しくは複数の合成内部コントロール鋳型配列を増幅することができる内部コントロールプライマー対(又はそれを増幅する内部コントロールプライマー対)を更に含む。好ましい例においては、多重化増幅反応間の相互作用を最小限にするために、1つ又は複数の多重化増幅反応は、別々に行われる。しかしながら、様々な検出可能な標識を伴うプローブの適切な使用により、多重化増幅反応のうちの1つ又は複数は、1つの反応に組み合わせることができる。
「PTPRK(e1)」という用語は、本明細書において使用するとき、PTPRK遺伝子のエクソン1を指す。ヒトPTPRK遺伝子のエクソン1のヌクレオチド配列は、配列番号18によって表される。PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)は、PTPRK(e1)の3'末端及びRSPO3(e2)の5'末端にまたがる。特定の一例においては、プライマー対は、PTPRK(e1)をターゲティングするフォワードプライマーと、RSPO3(e2)をターゲティングするリバースプライマーとを含む。標的配列PTPRK(e1)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物のためのフォワードプライマーの特定の一例は、(5'-3')CTSYTTTTGTGGCGYTCT(配列番号19)の配列を含み、同じ標的配列のためのリバースプライマーの特定の一例は、(5'-3')CTCYTTGGCAGCCTTGACT(配列番号20)の配列を含む。一例においては、標的配列PTPRK(e1)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物のためのフォワードプライマーは、配列番号19の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。別の例においては、標的配列PTPRK(e1)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物のためのリバースプライマーは、配列番号20の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。
目的のキー標的配列PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物の検出のために設計した多重化増幅反応について、野生型PTPRK遺伝子を検出するために、PTPRK(e1/e2)によって表されるPTPRK遺伝子のエクソン1及び2を、標的配列として使用する。ヒトPTPRK遺伝子のエクソン2のヌクレオチド配列は、配列番号21によって表される。この標的配列を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)は、したがって、PTPRK(e1)の3'末端及びPTPRK(e2)の5'末端にまたがる。特定の一例においては、プライマー対は、PTPRK(e1)をターゲティングするフォワードプライマーと、PTPRK(e2)をターゲティングするリバースプライマーとを含む。標的配列PTPRK(e1/e2)のためのフォワードプライマーの特定の一例は、(5'-3')CTSYTTTTGTGGCGYTCT (配列番号22)の配列を含み、同じ標的配列のためのリバースプライマーの特定の例は、(5'-3')CCTGGTGGTAATCACAGGS(配列番号23)又は(5'-3')CCTGGTGGTAATCACAGGC(配列番号24)の配列を含む。一例においては、標的配列PTPRK(e1/e2)のためのフォワードプライマーは、配列番号22の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。別の例においては、標的配列PTPRK(e1/e2)のためのリバースプライマーは、配列番号23若しくは配列番号24の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。
目的のキー標的配列PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物の検出のために設計した多重化増幅反応について、野生型RSPO3遺伝子を検出するために、RSPO3(e1/e2)を、標的配列として使用する。RSPO3(e1/e2)の検出のために使用されるプライマーの例は、上記に説明する。
「PTPRK(e7)」という用語は、本明細書において使用するとき、PTPRK遺伝子のエクソン7を指す。ヒトPTPRK遺伝子のエクソン7のヌクレオチド配列は、配列番号25によって表される。PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)は、PTPRK(e7)の3'末端及びRSPO3(e2)の5'末端にまたがる。特定の一例においては、プライマー対は、PTPRK(e7)をターゲティングするフォワードプライマーと、RSPO3(e2)をターゲティングするリバースプライマーとを含む。標的配列PTPRK(e7)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物のためのフォワードプライマーの特定の一例は、(5'-3')ATCCGAGTTCTRCTTACAAGACCT(配列番号26)の配列を含み、同じ標的配列のためのリバースプライマーの特定の一例は、(5'-3')CTCYTTGGCAGCCTTGACT(配列番号27)の配列を含む。一例においては、標的配列PTPRK(e7)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物のためのフォワードプライマーは、配列番号26の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。別の例においては、標的配列PTPRK(e7)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物のためのリバースプライマーは、配列番号27の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。
目的のキー標的配列PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物の検出のために設計した多重化増幅反応について、野生型PTPRK遺伝子を検出するために、PTPRK(e7/e8)によって表されるPTPRK遺伝子のエクソン7及び8を、標的配列として使用する。ヒトPTPRK遺伝子のエクソン8のヌクレオチド配列は、配列番号28によって表される。この標的配列を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)は、したがって、PTPRK(e7)の3'末端及びPTPRK(e8)の5'末端にまたがる。特定の一例においては、プライマー対は、PTPRK(e7)をターゲティングするフォワードプライマーと、PTPRK(e8)をターゲティングするリバースプライマーとを含む。標的配列PTPRK(e7/e8)のためのフォワードプライマーの特定の一例は、(5'-3')ATCCGAGTTCTRCTTACAAGACCT(配列番号29)の配列を含み、同じ標的配列のためのリバースプライマーの特定の例は、(5'-3')CCGTCTTGCCTGTATTTSAGC(配列番号30)の配列を含む。一例においては、標的配列PTPRK(e7/e8)のためのフォワードプライマーは、配列番号29の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。別の例においては、標的配列PTPRK(e7/e8)のためのリバースプライマーは、配列番号30の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。
目的のキー標的配列PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物の検出のために設計した多重化増幅反応について、野生型RSPO3遺伝子を検出するために、RSPO3(e1/e2)を、標的配列として使用する。RSPO3(e1/e2)の検出のために使用されるプライマーの例は、上記に説明する。
「EIF3E」という用語は、本明細書において使用するとき、翻訳開始を刺激する複合体である真核生物翻訳開始因子3(省略形eIF3)複合体のeIF3サブユニットである、サブユニットEをコードする、EIF3E遺伝子を指す。ヒトにおいては、eIF3は、13個の非同一サブユニット(eIF3a～m)からなる。ヒトEIF3E遺伝子のヌクレオチド配列は、配列番号31によって表され、全部で13個のエクソンを有する。
「EIF3E(ep)」という用語は、本明細書において使用するとき、EIF3E遺伝子のエクソン番号pを指す。例えば、「EIF3E(e1)」という用語は、本明細書において使用するとき、EIF3E遺伝子のエクソン1を指す。ヒトEIF3E遺伝子のエクソン1のヌクレオチド配列は、配列番号32によって表される。
「RSPO2」という用語は、本明細書において使用するとき、RSPO2遺伝子を指す。この遺伝子は、R-スポンジンファミリーに属し、タンパク質R-スポンジン-2をコードする。ヒトRSPO2遺伝子のヌクレオチド配列は、配列番号33によって表され、全部で3個のエクソンを有する。
「RSPO2(eq)」という用語は、本明細書において使用するとき、RSPO2遺伝子のエクソン番号qを指す。例えば、「RSPO2(e2)」という用語は、本明細書において使用するとき、RSPO2遺伝子のエクソン2を指す。ヒトRSPO2遺伝子のエクソン2のヌクレオチド配列は、配列番号34によって表される。
EIF3E(e1)-RSPO2(e2)融合物を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)は、EIF3E(e1)の3'末端及びRSPO2(e2)の5'末端にまたがる。特定の一例においては、プライマー対は、EIF3E(e1)をターゲティングするフォワードプライマーと、RSPO2(e2)をターゲティングするリバースプライマーとを含む。標的配列EIF3E(e1)-RSPO2(e2) R-スポンジン遺伝子融合物のためのフォワードプライマーの特定の一例は、(5'-3')TCGGCATCTAGTCTTTCCGCTTYGGAGAAGGAAACTARAACCCAGT(配列番号35)の配列を含み、標的配列EIF3E(e1)-RSPO2(e2) R-スポンジン遺伝子融合物のためのフォワードプライマーの別の例は、(5'-3')TCGGCATCTAGTCTTTCCGCTTY(配列番号36)の配列を含み、同じ標的配列のためのリバースプライマーの特定の一例は、(5'-3')AGTTCAGCGCGATCAGCA(配列番号37)の配列を含む。一例においては、標的配列EIF3E(e1)-RSPO2(e2) R-スポンジン遺伝子融合物のためのフォワードプライマーは、配列番号35若しくは36の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。別の例においては、標的配列EIF3E(e1)-RSPO2(e2) R-スポンジン遺伝子融合物のためのリバースプライマーは、配列番号37の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。
一例においては、野生型EIF3E遺伝子を検出するために、EIF3E(e1/e2)によって表されるEIF3E遺伝子のエクソン1及び2を、標的配列として使用する。この標的配列を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)は、したがって、EIF3E(e1)の3'末端及びEIF3E(e2)の5'末端にまたがる。ヒトEIF3E遺伝子のエクソン2のヌクレオチド配列は、配列番号38によって表される。特定の一例においては、プライマー対は、EIF3E(e1)をターゲティングするフォワードプライマーと、EIF3E(e2)をターゲティングするリバースプライマーとを含む。標的配列EIF3E(e1/e2)のためのフォワードプライマーの特定の一例は、(5'-3')GCATCTAGTCTTTCCGCTT(配列番号39)の配列を含み、同じ標的配列のためのリバースプライマーの特定の一例は、(5'-3')ACATCCATAGCAAAGTCTACC(配列番号40)の配列を含む。一例においては、標的配列EIF3E(e1/e2)のためのフォワードプライマーは、配列番号39の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。別の例においては、標的配列EIF3E(e1/e2)のためのリバースプライマーは、配列番号40の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。
一例においては、野生型RSPO2遺伝子を検出するために、RSPO2(e1/e2)によって表されるRSPO2遺伝子のエクソン1及び2を、標的配列として使用する。この標的配列を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)は、したがって、RSPO2(e1)の3'末端及びRSPO2(e2)の5'末端にまたがる。ヒトRSPO2遺伝子のエクソン1のヌクレオチド配列は、配列番号41によって表される。特定の一例においては、プライマー対は、(5'-3')ACGTGCTAACCAAGCGGCTC(配列番号42)又は(5'-3')TTCTGCCTTCTACAGCTCGGA(配列番号43)の配列を含むフォワードプライマーと、(5'-3')TTCAGCGCGATCAGCATCTCT(配列番号44)又は(5'-3')AGTTCAGCGCGATCAGCA(配列番号45)の配列を含むリバースプライマーとを含む。一例においては、標的配列RSPO2(e1/e2)のためのフォワードプライマーは、配列番号42若しくは43の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。別の例においては、標的配列RSPO2(e1/e2)のためのリバースプライマーは、配列番号44若しくは45の配列又はその相補配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有する。
一部の例においては、1つ又は複数の多重化増幅反応において使用される内部コントロールは同じであり、それゆえ、内部コントロールを増幅することができる内部コントロールプライマー対(又はそれを増幅する内部コントロールプライマー対)もまた、同じである。様々な内部コントロール及びそれらのそれぞれのプライマー対は、公知の方法を使用して設計することができる。当業者は、必要な内部コントロールが、本分野において利用可能な情報及び知識に基づいて当業者によって構築され得ることを認識及び理解し得る。一例においては、内部コントロール配列は、配列番号69として提供されている。
好適なプライマーを使用することの他に、標的配列の増幅は、標的配列に結合することができるプローブ(又はそれに結合するプローブ)の使用を更に含み得る。
一部の例においては、第1の態様のキットは、1つ若しくは複数のR-スポンジン遺伝子融合物、1つ若しくは複数の野生型遺伝子又は1つ若しくは複数の内部コントロール配列における配列に相補的な1つ又は複数のプローブ配列を更に含む。
一例においては、使用されるプローブは、少なくとも1つの検出可能な標識を含む成分を含む。一例においては、検出可能な標識は、光学シグナルを生成することができる。一例においては、検出可能な標識は、フルオロフォア部分を含む。フルオロフォアの例として、蛍光タンパク質、例えばGFP(緑色蛍光タンパク質)、YFP(黄色蛍光タンパク質)、RFP(赤色蛍光タンパク質);キサンテン誘導体(例えばフルオレセイン、ローダミン、オレゴングリーン、エオシン、6-カルボキシフルオレセイン及びテキサスレッド)、シアニン誘導体(例えばシアニン、インドカルボシアニン、オキサカルボシアニン、チアカルボシアニン及びメロシアニン)、Seta、SeTau及びSquare色素を含むスクアライン誘導体及び環置換スクアライン、ナフタレン誘導体(ダンシル及びプロダン誘導体)、クマリン誘導体、オキサジアゾール誘導体(例えばピリジルオキサゾール、ニトロベンゾキサジアゾール及びベンゾキサジアゾール)、アントラセン誘導体(例えばアントラキノン、DRAQ5、DRAQ7及びCyTRAKオレンジ)、ピレン誘導体(例えばカスケードブルー)、オキサジン誘導体(例えばナイルレッド、ナイルブルー、クレシルバイオレット、オキサジン170)、アクリジン誘導体(例えばプロフラビン、アクリジンオレンジ、アクリジンイエロー)、アリールメチン誘導体(例えばオーラミン、クリスタルバイオレット、マラカイトグリーン)、テトラピロール誘導体(例えばポルフィン、フタロシアニン、ビリルビン)からなる群から選択される非タンパク質フルオロフォア並びにそれらの誘導体が挙げられるが、これらに限定されない。一部の例においては、フルオロフォアは、FAM(カルボキシフルオレセイン)、HEX(カルボキシ-2,4,4,5,7,7-ヘキサクロロフルオレセインスクシンイミジルエステル)、JOE(6-カルボキシ-4',5'-ジクロロ-2',7'-ジメトキシフルオレセインスクシンイミジルエステル)、シアニン3、シアニン5、TAMRA(5-(及び-6)-カルボキシテトラメチルローダミンスクシンイミジルエステル)、Tye 563、Tye 556、TEX 615、LCRED640、テキサスレッド(スルホローダミン101酸塩化物)又はCal Red 610である。一部の特定の例においては、フルオロフォアは、FAM、シアニン5、テキサスレッド、Cal Red 610又はHEXである。
多数の標的配列の検出のための多重化増幅反応においては、様々な標的配列について典型的に様々な検出可能な標識が使用される。例えば、検出可能な標識Aは、キー標的配列Aのために使用され、検出可能な標識Bは、野生型コントロールBのために使用され、検出可能な標識Cは、野生型コントロールCのために使用され、検出可能な標識Dは、野生型コントロールDのために使用される。好ましい例においては、様々な検出可能な標識の発光波長は、干渉を最小限にするために十分に分離されている。例えば、各発光波長間の差は、少なくとも30nm、又は少なくとも40nm、又は少なくとも50nm、又は少なくとも60nm、又は少なくとも70nm、又は少なくとも80nm、又は少なくとも90nm、又は少なくとも100nm、又は少なくとも110nm、又は少なくとも120nm、又は少なくとも130nm、又は少なくとも140nm、又は少なくとも150nm、又は少なくとも160nm、又は少なくとも170nm、又は少なくとも180nm、又は少なくとも190nm、又は少なくとも200nm、又は少なくとも210nm、又は少なくとも220nm、又は少なくとも230nm、又は少なくとも240nm、又は少なくとも250nm、又は少なくとも260nm、又は少なくとも270nm、又は少なくとも280nm、又は少なくとも290nm、又は少なくとも300nmである。一部の特定の例においては、キー標的配列のためのプローブにおいて使用されるフルオロフォアは、FAM(カルボキシフルオレセイン)であり、野生型コントロールのためのプローブにおいて使用されるフルオロフォアは、テキサスレッド(スルホローダミン101酸塩化物)であり、別の野生型コントロールのためのプローブにおいて使用されるフルオロフォアは、シアニン5であり、内部コントロールのためのプローブにおいて使用されるフルオロフォアは、HEX(カルボキシ-2,4,4,5,7,7-ヘキサクロロフルオレセインスクシンイミジルエステル)である。
一例においては、少なくとも1つの検出可能な標識は、可変性シグナルを生成することができる。可変性シグナルは、プローブの標的配列へのハイブリダイゼーションに際して生成され得る。例えば、シグナルは、プローブが標的配列に結合する前に検出可能であってもよく、プローブの標的配列へのハイブリダイゼーションに際して、シグナルは、強度が低減するか、又は完全に検出不能になる。別の例においては、検出可能なシグナルは、プローブの標的配列へのハイブリダイゼーションに際してのみ生成してもよく、或いは、検出可能なシグナルの強度は、プローブの標的配列へのハイブリダイゼーションに際して増大してもよい。
一例においては、成分は、2つの検出可能な標識を含む。一例においては、2つの検出可能な標識は独立して機能し、一方で別の例においては、2つの検出可能な標識は、相互作用標識対である。相互作用標識対は、可変性シグナルを産生することができる。例えば、シグナルは、プローブが標的配列に結合する前に検出可能であってもよく、プローブの標的配列へのハイブリダイゼーションに際して、シグナルは、強度が低減するか、又は完全に検出不能になる。別の例においては、検出可能なシグナルは、プローブの標的配列へのハイブリダイゼーションに際してのみ生成してもよく、或いは、検出可能なシグナルの強度は、プローブの標的配列へのハイブリダイゼーションに際して増大してもよい。特定の一例においては、両方の検出可能な標識がプローブ配列によって共に連結されている場合、検出可能なシグナルは産生しない。少なくとも1つの検出可能な標識がプローブから切断されると、検出可能なシグナルが産生する。
一部の例においては、相互作用標識対は、フルオロフォアとクエンチャーとの対を含み得る。特定の一例においては、フルオロフォアは、プローブの5'末端に位置し、クエンチャーは、プローブの3'末端に位置する。クエンチャーの例として、TAMRA(テトラメチルローダミン)、TaqMan(登録商標)MGB(小溝結合剤)及びBHQ(商標)(Black Hole Quencher(商標))が挙げられるが、これらに限定されない。
多重化増幅反応において使用され得る一部の特定の例示的なプローブ配列として、PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物のための(6FAM)5'-CCAGYTCYCCKCAGTGCATCCT-3'(BHQ1)(配列番号46)、PTPRK(e1/e2)野生型コントロールのための(TxRd)5'-AAGTACAGCCACCTGCGGAGA-3'(BHQ2)(配列番号47)又は(TxRd)5'-AAGTAYAGCCAYCTGMGGAGA-3'(BHQ2)(配列番号48)、RSPO3(e1/e2)野生型コントロールのための(Cy5)5'-TGCATTCTTCGCTGGCGCCTT-3'(BHQ2)(配列番号49)、内部コントロールのための(HEX)5'-AGGTCGGGTGGGCGGGTCGTTA-3'(BHQ1)(配列番号50)、PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物のための(6FAM)5'-ACCAGAASAAAATGTGCAGTGCATCC-3'(BHQ1)(配列番号51)、PTPRK(e7/e8)野生型コントロールのための(TxRd)5'-ATGTGCMGAACCTATGAGAACCCCAA-3'(BHQ2)(配列番号52)、PTPRK(e13)-RSPO3(e2)融合物のための(6FAM)5'-AYGCATTGCTACAAAAGTGCATCCTA-3'(BHQ1)(配列番号53)又は(6FAM)5'-ACTAACGTTAGGATGCAMTTTTGTAGCAATG-3'(BHQ1)(配列番号54)、PTPRK(e12～e14)野生型コントロールのための(TxRd)5'-AYCCCAGATCCCGCCAAGCA-3'(BHQ2)(配列番号55)、EIF3E(e1)-RSPO2(e2)融合物のための(6FAM)5'-SCGCCACGAACCTCCTTTACAGAG-3'(BHQ1)(配列番号56)、EIF3E(e1/e2)野生型コントロールのための(TxRd)5'-ATTGGARCTTCTTAGTGATACCAACA-3'(BHQ2)(配列番号57)及びRSPO2(e1/e2)野生型コントロールのための(Cy5)5'-CTCCCTAGGCGCSGTGCTCCATC-3'(BHQ2)(配列番号58)又は(Cy5)5'-CCACGAACCAATTGTRTCGCTTCCTG-3'(BHQ2)(配列番号59)が挙げられるが、これらに限定されない。
一部の例においては、第1の態様のキットは、1つ又は複数の陽性コントロールを更に含み、各々は、目的の遺伝子融合物及び野生型コントロールについてのものである。各々の陽性コントロールは一般的に、目的の標的配列に対応する単一の長いオリゴヌクレオチドを含有するプラスミドを含む。各多重化増幅反応中に、増幅反応が機能していることを確実にするために、好適な陽性コントロール反応は、試験反応に伴って設定される。
対応するプラスミドマップは、図31において見ることができ、インサート配列は、配列番号59～68において見ることができる。
第1の態様のキットのプライマー及びプローブは、短いアンプリコンの増幅及び検出のために設計される。短いアンプリコンは、例えば約300塩基対未満、約290塩基対未満、約280塩基対未満、約270塩基対未満、約260塩基対未満、約250塩基対未満、約240塩基対未満、約230塩基対未満、約220塩基対未満、約210塩基対未満、約200塩基対未満、約190塩基対未満、約180塩基対未満、約170塩基対未満、約160塩基対未満、約150塩基対未満、約140塩基対未満、約130塩基対未満、約120塩基対未満、約110塩基対未満、約100塩基対未満、約90塩基対未満、約80塩基対未満、約70塩基対未満、約60塩基対未満又は約50塩基対未満のアンプリコンを指す。短いアンプリコンの特定の例は、150塩基対未満、140塩基対未満、130塩基対未満、120塩基対未満、110塩基対未満又は100塩基対未満を有する。特定の一例においては、短いアンプリコンは、130塩基対未満である。
一部の例においては、第1の態様のキットは、ポリメラーゼ連鎖反応を実行するための試薬を更に含む。そのような試薬として、デオキシリボヌクレオチド(dNTP)、DNAポリメラーゼ、塩及び緩衝液が挙げられるが、これらに限定されない。DNAポリメラーゼは、鋳型鎖に相補的な塩基を付加することによって、伸長中のDNA鎖へのdNTPの付加を触媒する。
第2の態様においては、悪性腫瘍を患う対象においてPTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を検出する方法であって、対象からの試料から核酸を抽出する工程と;1つ又は複数のプライマー対により核酸を増幅する工程であって、プライマー対が、PTPRK(e13)-RSPO3(e2)遺伝子融合物を増幅することができる、工程と;増幅した核酸を検出する工程とを含む方法が提供される。一部の例においては、第2の態様の方法は、PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物及び/又はEIF3E(e1)-RSPO2(e2)融合物を増幅することができる1つ又は複数のプライマー対(又はそれを増幅する1つ又は複数のプライマー対)により核酸を増幅する工程を更に含む。
第3の態様においては、悪性腫瘍を患う対象においてWntシグナリングの阻害剤への感受性を特定する方法であって、対象からの試料から核酸を抽出する工程と;PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を増幅することができるプライマー対(又はそれを増幅するプライマー対)により核酸を増幅する工程と;PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物が増幅された場合、Wntシグナリングの阻害剤への感受性を特定する工程とを含む方法が提供される。一部の例においては、第3の態様の方法は、PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物又はEIF3E(e1)-RSPO2(e2)融合物を増幅することができる1つ又は複数の追加のプライマー対(又はそれを増幅する1つ若しくは複数の追加のプライマー対)により核酸を増幅する工程と、PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e13)-RSPO3(e2)融合物又はEIF3E(e1)-RSPO2(e2)融合物が増幅された場合、Wntシグナリングの阻害剤への感受性を特定する工程とを更に含む。
PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物、PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物及び/又はEIF3E(e1)-RSPO2(e2)融合物を増幅することができるプライマー及びプライマー対(又はそれを増幅するプライマー及びプライマー対)は、本開示において説明する通りである。
各多重化増幅実験について、少なくとも以下の反応(及びその反復):遺伝子融合物及び野生型コントロールの各々についての陽性コントロール反応、陰性コントロール反応並びに試験反応が設定される。すべての反応は、同じ試薬、プライマー及び/又はプローブを含有し、唯一の相違は、各反応に添加される試料である。陽性コントロール反応に添加される試料は、上記に定義する標的遺伝子融合物又は野生型配列についての陽性コントロールである。陰性コントロールに添加される試料は、任意の鋳型を含有しない。陰性コントロールに添加される典型的な試料は、ヌクレアーゼフリー水である。試験反応に添加される試料は、目的の対象から得た生物試料である。一例においては、融合物Aは、3重(例えば、融合物A及び2 WT)として行われる。別の例においては、融合物Bは、2重(例えば、融合物B及びWT)として行われる。また別の例においては、融合物Cは、2重(例えば、融合物C及びWT)として行われる。別の例においては、融合物Cは、2重(例えば、融合物C+WT PTPRK)として行われる。更なる例においては、融合物Dは、3重(例えば、融合物D及びWT)として行われる。また別の例においては、融合物Dは、3重(例えば、融合物D及びWT EIF3E及びWT RSPO2)として行われる。
一例においては、生物試料は、少なくとも一部の生物材料、例えば核酸分子、特にリボ核酸(RNA)を含む。一部の例においては、生物試料は、固形組織試料又は液体試料(例えば、全血、血清、血漿、脳脊髄液、中枢脊髄液、リンパ液、嚢胞液、痰、便、胸水、粘液、胸腔内液、腹水、羊水、腹腔液、唾液、気管支洗浄液及び尿)から得たRNAを含む。一部の特定の例においては、生物試料は、腫瘍組織、例えばホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)固定腫瘍組織又は新鮮凍結腫瘍からの組織から得たRNAを含む。
第1の態様のキットを使用して行った多重化増幅反応の各々の結果は、公知の多重増幅反応分析法を使用して分析することができる。使用した増幅反応がリアルタイムポリメラーゼ連鎖反応(リアルタイムPCR)である場合、リアルタイムPCR反応からの結果は、主にCt値を使用して分析される。
本明細書において互換的に使用される「Ct値」又は閾値サイクル値という用語は、反応中に産生した蛍光が、バックグラウンド蛍光を顕著に超える蛍光シグナルである蛍光閾値と交差するサイクル数を指す。閾値サイクルでは、反応の初期指数関数的増幅相中に検出可能な量のアンプリコン生成物が産生している。閾値サイクルは、目的の遺伝子の元の相対的発現レベルに対して反比例する。
リアルタイムPCR反応においては、Ct値は、増幅曲線及び蛍光閾値に基づいて容易に得ることができる。増幅曲線は、試料の連続希釈物について得られた半対数曲線であり、Y軸は、ログスケールの蛍光レベルを表し、X軸は、サイクル数を表す。増幅曲線は、初期相、指数関数的増幅相及びプラトー相を有する。
多重化増幅反応における目的の標的配列の各々の増幅曲線に基づいて、標的配列の各々についてCt値を得ることができる。目的の標的遺伝子融合物配列のCt値は、Cttと表し、目的の標的野生型コントロール配列のCt値は、Ctcと表す。1つを超える野生型コントロールを使用した場合、異なるCtc値は、Ctc1、Ctc2等と表すことができる。目的の標的遺伝子融合物と目的の標的野生型コントロール配列とのCt値間の差は、ΔCtと表し、ΔCt=Ctt-Ctcである。1つを超える野生型コントロールを使用した場合、異なるΔCt値は、ΔCt1、ΔCt2等と表すことができる。各遺伝子融合物についてのΔCtは、試料中の融合物の割合を示す。
多重化増幅反応を適切に設定することを確実にするために、陽性コントロール反応の各々のCt値は、所定のCt値範囲内に入らなければならない。例えば、陽性コントロール反応が、目的の標的遺伝子融合物についての陽性コントロールである場合、目的の標的遺伝子融合物のCt値は、所定のCt値範囲内に入らなければならず;陽性コントロール反応が、目的の標的野生型遺伝子についての陽性コントロールである場合、目的の標的野生型遺伝子のCt値は、所定のCt値範囲内に入らなければならない。Ct値範囲は典型的に、約15～約40、又は約16～約39、又は約17～約38、又は約18～約37、又は約19～約36、又は約20～約35、又は約21～約34、又は約22～約33、又は約23～約32、又は約24～約31、又は約25～約30、又は約26～約29、又は約27～約28である。陽性コントロールのCt値が所定の範囲外に入る場合、陽性コントロール反応は、失敗と考えられる。
陰性コントロール反応における目的の標的遺伝子融合物及び目的の標的野生型遺伝子の両方のCt値は、反応設定において汚染がないことを確実にするために、約40を超えるべきである。陰性コントロール反応における内部コントロールのCt値は、所定のCt値範囲内に入らなければならない。Ct値範囲は典型的に、約15～約40、又は約16～約39、又は約17～約38、又は約18～約37、又は約19～約36、又は約20～約35、又は約21～約34、又は約22～約33、又は約23～約32、又は約24～約31、又は約25～約30、又は約26～約29、又は約27～約28である。陰性コントロール反応における内部コントロールのCt値が所定の範囲外に入る場合、陰性コントロール反応は、失敗と考えられる。
上記に説明する陽性コントロール反応及び陰性コントロール反応のいずれか1つが失敗した場合、すべての試験反応の結果を使用すべきない。上記に説明する陽性コントロール反応及び陰性コントロール反応の両方の設定が成功した場合、試験反応から得た結果を、試料分析に使用することができる。
各試験反応においては、内部コントロール反応のCt値は、所定のCt値範囲内に入らなければならない。Ct値範囲は典型的に、約15～約40、又は約16～約39、又は約17～約38、又は約18～約37、又は約19～約36、又は約20～約35、又は約21～約34、又は約22～約33、又は約23～約32、又は約24～約31、又は約25～約30、又は約26～約29、又は約27～約28である。1つの特定の試験反応における内部コントロールのCt値が、所定の範囲外に入る場合、この試験反応は、失敗と考えられ、この試験反応から得た結果は、試料を分析するときに無視するべきである。
試験反応において、目的の標的遺伝子融合物のCt値(すなわち、Ctt)が、所定のCt値範囲内に入る場合、試験反応は、目的の標的遺伝子融合物について増幅陽性と考えられる。Cttが、所定のCt値範囲の上限を超える場合、試験反応は、目的の標的遺伝子融合物について増幅陰性と考えられる。同様に、目的の標的野生型コントロールのCt値(すなわち、Ctc1、Ctc2等)が、所定のCt値範囲内に入る場合、試験反応は、目的の標的野生型コントロールについて増幅陽性と考えられる。Ctc1及び/又はCtc2等が、所定のCt値範囲の上限を超える場合、試験反応は、目的の標的野生型コントロールについて増幅陰性と考えられる。Ct値範囲は典型的に、約15～約40、又は約16～約39、又は約17～約38、又は約18～約37、又は約19～約36、又は約20～約35、又は約21～約34、又は約22～約33、又は約23～約32、又は約24～約31、又は約25～約30、又は約26～約29、又は約27～約28である。
試験反応が、目的の標的遺伝子融合物について増幅陰性である場合、試験した対象は、Wntシグナリング経路の阻害剤による治療に感受性である悪性腫瘍を患っていないと特定される。試験反応が、目的の標的遺伝子融合物及び目的の標的野生型コントロールの両方について増幅陽性である場合、試験した対象が、Wntシグナリング経路の阻害剤による治療に感受性である悪性腫瘍を患っているかどうかを決定するために、上記に定義する値ΔCt(又はΔCt1、ΔCt2等)を使用する。
値ΔCt(又はΔCt1、ΔCt2等)が、カットオフ値又はそれ未満である場合、試験した対象は、Wntシグナリング経路の阻害剤による治療に感受性である悪性腫瘍を患っていると特定される。値ΔCt(又はΔCt1、ΔCt2等)が、カットオフ値を超える場合、試験した対象は、Wntシグナリング経路の阻害剤による治療に感受性である悪性腫瘍を患っていないと特定される。
試験反応からの結果はまた、がんの検出に使用することができる。試験反応が、目的の標的遺伝子融合物について増幅陰性である場合、試験した対象は、がんを患っていないと特定される。試験反応が、目的の標的遺伝子融合物及び目的の標的野生型コントロールの両方について増幅陽性である場合、試験した対象が、がんを患っているかどうかを決定するために、上記に定義する値ΔCt(又はΔCt1、ΔCt2等)を使用する。値ΔCt(又はΔCt1、ΔCt2等)が、カットオフ値又はそれ未満である場合、試験した対象は、がんを患っていると特定される。ΔCt(又はΔCt1、ΔCt2等)が、カットオフ値を超える場合、試験した対象は、がんを患っていないと特定される。
本明細書において開示するキットを使用して行われる多重化増幅反応は、結果が、多くの場合2日、又は1日、又は22時間、又は20時間、又は18時間、又は16時間、又は12時間、又は10時間、又は8時間、又は6時間、又は4時間、又は2時間より短い、短期間内に分析に利用可能になることを可能にする。
第4の態様においては、悪性腫瘍を患う対象を治療する方法であって、第1の態様のキット、又は第2若しくは第3の態様の方法を使用して悪性腫瘍を特定する工程と、Wntシグナリング経路の阻害剤により対象を治療する工程とを含む方法が提供される。また、Wntシグナリング経路の阻害剤による治療に感受性の悪性腫瘍の治療のための医薬の製造における、Wntシグナリング経路の阻害剤の使用が提供され、ここで悪性腫瘍は、第1の態様のキット、又は第2若しくは第3の態様の方法を使用して特定される。
阻害剤の酵素への結合、及び後続の、酵素からの放出の測定値は、所与の基質濃度で50%酵素活性をもたらす阻害剤濃度を反映する「IC50」値である。
「治療有効量」という用語は、本明細書において使用するとき、研究者、獣医、医師又は他の臨床医が探求する組織系、動物又はヒトにおいて、治療される疾患又は障害の症状の軽減を含む、生物応答又は医療応答を誘発する活性化合物又は医薬剤の量を意味する。
本明細書において使用するとき、「薬学的に許容される」という用語は、ヒト及び獣医学的使用の両方を包含する:例えば、「薬学的に許容される」という用語は、獣医学的に許容される化合物又はヒト医薬及び健康管理において許容される化合物を包含する。一例においては、ヒト医薬及び健康管理は除外される。
「任意選択で置換されている」という用語は、1つ若しくは複数の置換基が存在し得るか、又は置換基が存在しない場合があることを示す。置換基は、上記基(アルキル、アリール、ヘテロアリール、非芳香環)上に存在してもよく、存在しなくてもよい。基の構造によって指示される通り、基上に0、1、2、3若しくは4つ、又は4つよりも多い置換基が存在し得る。可能な置換基として、ハロゲン(例えば、フッ素、塩素又は臭素)、アルキル基、アルコキシ基(すなわち、アルキルが上記に定義する通りであるO-アルキル)、アリールオキシ基(すなわち、アリールが上記に定義する通りであるO-アリール)、エステル、アミド又はスルホン酸エステル基(すなわち、Rが上記に定義するアルキルであるCO2R、CONHR、SO3R)が挙げられるが、しかしながら、他の置換基は、追加的に、又は代替として存在してもよい。置換基が示されている場合、「任意選択で置換されている」という用語は、示されていない追加の置換基の可能性を示す。したがって、例えば構造Iにおいて、Arは「任意選択で置換されている」と示されている場合、これは、Cy及びNR5に加えて更なる置換基の可能性を示すが、Cy又はNR5のいずれかが非存在であり得る可能性を示さない。したがって、例えば、Arは「二置換されている」芳香環であると示されている場合、これは、環上に2つの置換基のみが存在する、すなわち、Cy及びアミド窒素以外の追加の置換基はないことを意味すると解釈するべきである。例えば、化合物1における1,4-フェニレン基は、「二置換されている」とみなされる。
説明及び特許請求の範囲全体を通して、「アルキル」という表現は、具体的に限定しない限り、C1～12アルキル基又はC1～12を超えるアルキル基、好適にはC1～6アルキル基、例えばC1～4アルキル基を示す。アルキル基は、直鎖又は分岐鎖であり得る。好適なアルキル基として、例えばメチル、エチル、プロピル(例えばn-プロピル及びイソプロピル)、ブチル(例えばn-ブチル、イソ-ブチル、sec-ブチル及びtert-ブチル)、ペンチル(例えばn-ペンチル)、ヘキシル(例えばn-ヘキシル)、ヘプチル(例えばn-ヘプチル)、オクチル(例えばn-オクチル)、イソオクチル、デシル及びドデシルが挙げられる。例えば「アルコキシ」、「ハロアルキル」及び「チオアルキル」という表現における「アルク(alk)」という表現は、「アルキル」の定義に従って解釈するべきである。アルコキシ基の例として、メトキシ、エトキシ、プロポキシ(例えばn-プロポキシ)、ブトキシ(例えばn-ブトキシ)、ペントキシ(例えばn-ペントキシ)、ヘキソキシ(例えばn-ヘキソキシ)、ヘプトキシ(例えばn-ヘプトキシ)及びオクトキシ(例えばn-オクトキシ)が挙げられる。チオアルキル基の例として、メチルチオ-が挙げられる。ハロアルキル基の例として、フルオロアルキル、例えばCF3が挙げられる。ある特定の場合、それらは、環状構造を含有し得る。環状構造基の例として、シクロヘキシル、メチルシクロヘキシル、イソプロピルシクロペンチル、シクロブチルエチル等が挙げられる。ある特定の例においては、それらは、かご構造、例えばアダマンチルではない。
「アルケニル」という表現は、具体的に限定しない限り、任意の所望の位置に少なくとも1つの二重結合を含有し、任意の三重結合を含有しないC2～12アルケニル基、好適にはC2～6アルケニル基、例えばC2～4アルケニル基を示す。アルケニル基は、直鎖又は分岐鎖であり得る。1つの二重結合を含むアルケニル基の例として、プロペニル及びブテニルが挙げられる。2つの二重結合を含むアルケニル基の例として、ペンタジエニル、例えば(1E,3E)-ペンタジエニルが挙げられる。
「アルキニル」という表現は、具体的に限定しない限り、任意の所望の位置に少なくとも1つの三重結合を含有し、また1つ又は複数の二重結合を含有する場合もあり、含有しない場合もあるC2～12アルキニル基、好適にはC2～6アルキニル基、例えばC2～4アルキニル基を示す。アルキニル基は、直鎖又は分岐鎖であり得る。アルキニル基の例として、プロピニル及びブチニルが挙げられる。
「アルキレン」という表現は、nが、具体的に限定しない限り、整数、例えば1～12、1～6、2～6又は2～5である、式-(CH2)n-の鎖を示す。
「シクロアルキル」という表現は、具体的に限定しない限り、C3～10シクロアルキル基(すなわち、3～10個の環炭素原子)、より好適にはC3～8シクロアルキル基、例えばC3～6シクロアルキル基を示す。シクロアルキル基の例として、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル及びシクロオクチルが挙げられる。環炭素原子の最も好適な数は、3～6個である。
「シクロアルケニル」という表現は、具体的に限定しない限り、C3～10シクロアルケニル基(すなわち、3～10個の環炭素原子)、好適にはC5～10シクロアルケニル基(すなわち、5～10個の環炭素原子)、より好適にはC5～8シクロアルケニル基、例えばC5～6シクロアルケニル基を示す。シクロアルケニル基の例として、シクロプロペニル、シクロヘキセニル、シクロヘプテニル及びシクロオクテニルが挙げられる。環炭素原子の最も好適な数は、5～6個である。
「カルボシクリル」という表現は、具体的に限定しない限り、すべての環原子が炭素であり、3～12個の環炭素原子、好適には3～10個の炭素原子、より好適には3～8個の炭素原子を含有する任意の環系を示す。カルボシクリル基は、飽和又は部分不飽和であり得るが、芳香環を含まない。カルボシクリル基の例として、単環式、二環式及び三環式環系、特に単環式及び二環式環系が挙げられる。他のカルボシクリル基として、架橋環系(例えばビシクロ[2.2.1]ヘプテニル)が挙げられる。カルボシクリル基の特定の例は、シクロアルキル基である。カルボシクリル基の更なる例は、シクロアルケニル基である。
「ヘテロシクリル」及び「非芳香環」という表現は、具体的に限定しない限り、説明内で互換的に使用してもよく、1つ又は複数(例えば1、2又は3つ)の環原子がヘテロ原子によって置換されているカルボシクリル基を指す。環は、4～8つの環原子、通常5又は6つを有し得る。ヘテロ原子は通常、N、S及びOから選択される。ヘテロシクリル基の特定の例は、1つ又は複数(例えば1、2又は3つ、特に1又は2つ、具体的に1つ)の環原子がN、S又はOから選択されるヘテロ原子によって置換されているシクロアルキル基(例えばシクロペンチル又はより特にシクロヘキシル)である。1つのヘテロ原子を含有するヘテロシクリル基の例として、ピロリジン、テトラヒドロフラン及びピペリジンが挙げられ、2つのヘテロ原子を含有するヘテロシクリル基の例として、モルホリン及びピペラジンが挙げられる。ヘテロシクリル基の更なる特定の例は、1つ又は複数(例えば1、2又は3つ、特に1又は2つ、具体的に1つ)の環原子が、N、S及びOから選択されるヘテロ原子によって置換されているシクロアルケニル基(例えばシクロヘキセニル基)である。このような基の例は、ジヒドロピラニル(例えば3,4-ジヒドロ-2H-ピラン-2-イル-)である。ヘテロシクリル基は、炭素環原子又は窒素環原子によって分子の他の1つ又は複数の部分に連結され得る。構造(I)中のCy基は、そのような環の例であり得る。
「アリール」という表現は、具体的に限定しない限り、C6～12アリール基、好適にはC6～10アリール基、より好適にはC6～8アリール基を示す。アリール基は、少なくとも1つの芳香環(例えば1、2又は3つの環)を含有する。多数の芳香環を有するアリール基として、縮合芳香環及び1つの単結合によって互いにつながった芳香環が挙げられる。1つの芳香環を有する典型的なアリール基の例は、フェニルである。2つの縮合芳香環を有する典型的なアリール基の例は、ナフチルである。2つの直接つながった芳香環を有する芳香基の例は、ビフェニルである。アリール基は、別に示さない限り、任意の好適な置換パターン、例えばオルト、メタ、パラを有する。示さない限り、それらは、任意の適切な数の置換基を有し得る(例えば単環式芳香族は、1～5つの置換基を有してもよく、縮合二環式芳香族は、1～7つの置換基を有してもよい等)。
「ヘテロアリール」という表現は、具体的に限定しない限り、1つ又は複数(例えば1、2、3又は4つ、好適には1、2又は3つ)の環原子がヘテロ原子によって置換されており、前記ヘテロ原子が通常、N、S及びO、そうでなければ1つ又は複数(例えば1、2、3又は4つ、好適には1、2又は3つ)の環原子を含有する5員芳香環から(独立して)選択され、前記ヘテロ原子が通常、N、S及びOから選択される、アリール残基を示す。ヘテロアリール基は、窒素以外の環ヘテロ原子を有しない。ヘテロアリール基は典型的に、それらが二環式又は多環式でない限り、5又は6つの環原子を有する。別に示さない限り、それらは、任意の好適な置換パターンを有してもよく、任意の適切な数の置換基を有してもよい。ヘテロアリール基は、単環式又は二環式又は多環式であり得る。縮合環は各々、少なくとも1つがヘテロアリールであれば、ヘテロアリール環又はホモアリール環のいずれかであってもよい。1つのヘテロ原子を有する単環式ヘテロアリール基の例として、5員環(例えばピロール、フラン、チオフェン)及び6員環(例えばピリジン、例えばピリジン-2-イル、ピリジン-3-イル及びピリジン-4-イル)が挙げられる。2つのヘテロ原子を有する単環式ヘテロアリール基の例として、5員環(例えばピラゾール、オキサゾール、イソキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、例えばイミダゾール-1-イル、イミダゾール-2-イル、イミダゾール-4-イル)及び6員環(例えばピリダジン、ピリミジン、ピラジン)が挙げられる。3つのヘテロ原子を有する単環式ヘテロアリール基の例として、1,2,3-トリアゾール、1,2,4-トリアゾール、1,2,3-オキサジアゾール及び1,2,4-オキサジアゾールが挙げられる。4つのヘテロ原子を有する単環式ヘテロアリール基の例として、テトラゾールが挙げられる。二環式ヘテロアリール基の例として、インドール(例えばインドール-6-イル)、ベンゾフラン、ベンズチオフェン、キノリン、イソキノリン、インダゾール、ベンズイミダゾール、ベンズチアゾール、キナゾリン及びプリンが挙げられる。ヘテロアリール基は、炭素環原子又は窒素環原子によって分子の他の1つ又は複数の部分に連結され得る。
上記に挙げるアリール及びヘテロアリール基は、適切な場合、任意選択で、各々独立して一価又は多価の(すなわち、1より大きい結合価を有する)官能基から選択される1つ又は複数(例えば1、2又は3つ、好適には1又は2つ)の基によって置換されていてもよい。好適な置換基として、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロアルキル、-アルコキシ(例えばOMe)、シクロアルキル、アルケニルオキシ-、アルキニルオキシ-、アルコキシアルキル-、ニトロ、ハロゲン(例えばフルオロ、クロロ及びブロモ)、シアノ、ヒドロキシル、オキソ、-C(O)-アルキル(例えばCOMe)、C(O)OH、-C(O)Oアルキル(例えば-C(O)OMe)、-OC(O)アルキル(例えば-OC(O)Me)、-NH2、-NHアルキル(例えば-NHMe)、-N(アルキル)2(例えばジメチルアミノ-)、-C(O)NH2、-C(O)NH(アルキル)(例えば-C(O)NHMe)、-NHC(O)アルキル(例えば-NHC(O)Me)、-C(NH)NH2、チオアルキル(例えば-チオメチル)、-SO2アルキル(例えばSO2Me)、-SOアルキル(例えば-SOMe)、-SO2シクロアルキル及び-SOシクロアルキルが挙げられる。より典型的には、置換基は、アルキル(例えばMe)、フルオロアルキル(例えばCF3及びCHF2)、アルコキシ(例えばOMe)、ハロゲン及びヒドロキシルから選択される。
「-アルキルアリール」という表現は、具体的に限定しない限り、アルキレン部分、例えばC1～4アルキレン部分を介してつながっているアリール残基を示す。そのような基の例は、ベンジル:PhCH2-である。
「ハロゲン」又は「ハロ」という用語は、フッ素(F)、塩素(Cl)及び臭素(Br)を含む。
「アミノ」という用語は、-NH2基を指す。
「オキソ」という用語は、それが置換している炭素原子と共に、カルボニル基C=Oを形成する酸素原子を指す。
「-アリールヘテロシクリル」という用語は、アリール部分を介してつながっているヘテロシクリル残基を指す。
「結合」という用語は、化合物又は分子中の原子間の連結である。結合は、単結合、二重結合又は三重結合であってもよい。
立体異性体:
特許請求に係る化合物のすべての可能な立体異性体は、本発明に含まれる。
本発明による化合物が、少なくとも1つのキラル中心を有する場合、それらは、したがって、エナンチオマーとして存在し得る。化合物が、2つ又はそれよりも多いキラル中心を所有する場合、それらは、加えて、ジアステレオマーとして存在し得る。すべてのそのような異性体及びそれらの混合物は、本発明の範囲内に包含されることが理解されるべきである。
立体異性体の調製及び単離:
本発明による化合物の調製のための方法が、立体異性体の混合物を生じる場合、これらの異性体は、従来技術、例えば分取クロマトグラフィーによって分離してもよい。化合物を、ラセミ体で調製してもよく、或いは、個々のエナンチオマーを、エナンチオ特異的合成又は分解のいずれかによって調製してもよい。化合物を、例えば、標準技術、例えば、(-)-ジ-p-トルオイル-d-酒石酸及び/又は(+)-ジ-p-トルオイル-l-酒石酸等の光学活性酸との塩形成によるジアステレオマー対の形成、並びに後続の分別再結晶及び遊離塩基の再生によってそれらの成分エナンチオマーに分解してもよい。化合物をまた、ジアステレオマーエステル又はアミドの形成、並びに後続のクロマトグラフィー分離及びキラル補助剤の除去によって分解してもよい。或いは、化合物を、キラルHPLCカラムを使用して分解してもよい。
薬学的に許容される塩:
遊離化合物とそれらの塩又は溶媒和物の形態の化合物との間の密接な関係に照らして、化合物がこの文脈において言及される場合、対応する塩、溶媒和物又は多形体もまた、それらがその状況下で可能であるか、又は適切であるならば、意図される。
式(I)の化合物の塩及び溶媒和物、並びに医薬における使用のために好適なそれらの生理学的に機能的な誘導体は、対イオン又は関連付けられる溶媒が薬学的に許容されるものである。しかしながら、薬学的に許容されない対イオン又は関連付けられる溶媒を有する塩及び溶媒和物は、例えば、他の化合物並びにそれらの薬学的に許容される塩及び溶媒和物の調製における中間体としての使用のために、本発明の範囲内である。
本発明による好適な塩は、有機及び無機両方の酸又は塩基で形成した塩を含む。薬学的に許容される酸付加塩として、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、クエン酸、酒石酸、リン酸、乳酸、ピルビン酸、酢酸、トリフルオロ酢酸、トリフェニル酢酸、スルファミン酸、スルファニル酸、コハク酸、シュウ酸、フマル酸、マレイン酸、リンゴ酸、マンデル酸、グルタミン酸、アスパラギン酸、オキサロ酢酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、アリールスルホン酸(例えばp-トルエンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸、ナフタレンスルホン酸又はナフタレンジスルホン酸)、サリチル酸、グルタル酸、グルコン酸、トリカルバリル酸、桂皮酸、置換されている桂皮酸(例えば4-メチル及び4-メトキシ桂皮酸を含むフェニル、メチル、メトキシ又はハロ置換桂皮酸)、アスコルビン酸、オレイン酸、ナフトン酸、ヒドロキシナフトン酸(例えば1-又は3-ヒドロキシ-2-ナフトン酸)、ナフタレンアクリル酸(例えばナフタレン-2-アクリル酸)、安息香酸、4-メトキシ安息香酸、2-又は4-ヒドロキシ安息香酸、4-クロロ安息香酸、4-フェニル安息香酸、ベンゼンアクリル酸(例えば1,4-ベンゼンジアクリル酸)、イセチオン酸、過塩素酸、プロピオン酸、グリコール酸、ヒドロキシエタンスルホン酸、パモ酸、シクロヘキサンスルファミン酸、サリチル酸、サッカリン酸及びトリフルオロ酢酸から形成した塩が挙げられる。薬学的に許容される塩基塩として、アンモニウム塩、ナトリウム及びカリウム塩等のアルカリ金属塩、カルシウム及びマグネシウム塩等のアルカリ土類金属塩、並びにジシクロヘキシルアミン及びN-メチル-D-グルカミン等の有機塩基による塩が挙げられる。
本発明の化合物のすべての薬学的に許容される酸付加塩形態は、本発明の範囲によって包含されることが意図される。
多形結晶形態:
更に、化合物の結晶形態の一部は、多形体として存在してもよく、それ自体、本発明に含まれることが意図される。加えて、化合物の一部は、水との溶媒和物(すなわち、水和物)又は通常の有機溶媒との溶媒和物を形成してもよく、そのような溶媒和物はまた、本発明の範囲内に包含されることが意図される。塩を含む化合物はまた、それらの水和物の形態で得ることができるか、又はそれらの結晶化のために使用される他の溶媒を含み得る。
プロドラッグ:
本発明は、その範囲内に本発明の化合物のプロドラッグを更に含む。一般的に、そのようなプロドラッグは、in vivoで容易に所望の治療活性化合物に変換可能な、化合物の機能的誘導体である。したがって、これらの場合、本発明の治療方法において、「投与すること」という用語は、特許請求に係る化合物のうちの1つ又は複数のプロドラッグバージョンであるが、対象への投与後にin vivoで上記特定の化合物に変換するプロドラッグバージョンにより説明される様々な障害の治療を包含する。
保護基:
本発明の化合物の調製のための方法のいずれかの間、関係する分子のいずれか上の感受性又は反応性の基を保護することが必要、かつ/又は望ましい場合がある。これは、従来型保護基の手段によって達成され得る。保護基は、本分野から公知の方法を使用して便利な後続段階で除去され得る。
本明細書において使用するとき、「組成物」という用語は、治療有効量の特許請求に係る化合物を含む製品、及び直接又は間接的に特許請求に係る化合物の組合せから生じる任意の製品を包含すると意図される。
ガレヌス製剤のための担体及び添加剤:
混合物に添加され得る担体は、非限定的に、好適な結合剤、懸濁剤、潤滑剤、風味材料、甘味料、保存剤、コーティング、崩壊剤、色素及び着色剤を含む、必要かつ不活性な医薬賦形剤を含む。
したがって、例えば懸濁剤、エリキシル剤及び溶液等の液体経口調製物について、好適な担体及び添加剤は有利に、水、グリコール、油、アルコール、着香剤、保存剤、着色剤等を含む場合があり;例えば粉末、カプセル、ジェルキャップ及び錠剤等の固体経口調製物について、好適な担体及び添加剤は、デンプン、糖、希釈剤、造粒剤、潤滑剤、結合剤、崩壊剤等を含む。
ターゲティング可能な薬物担体としての可溶性ポリマーは、ポリビニルピロリドン、ピランコポリマー、ポリヒドロキシプロピルメタクリルアミドフェノール、ポリヒドロキシエチルアスパルトアミドフェノール、又はパルミトイル残基で置換されているポリエチレンオキシド-ポリルリジンを含み得る。更に、本発明の化合物は、薬物の制御放出を達成することにおいて有用な生分解性ポリマーのクラス、例えばポリ乳酸、ポリイプシロンカプロラクトン、ポリヒドロキシ酪酸、ポリオルトエステル、ポリアセタール、ポリジヒドロピラン、ポリシアノアクリレート及びハイドロゲルの架橋又は両親媒性ブロックコポリマーに連結され得る。
好適な結合剤として、デンプン、ゼラチン、ブドウ糖若しくはベータ乳糖等の天然糖、トウモロコシ甘味料、アカシア、トラガカント等の天然及び合成ガム、又はオレイン酸ナトリウム、ステアリン酸ナトリウム、ステアリン酸マグネシウム、安息香酸ナトリウム、酢酸ナトリウム、塩化ナトリウム等が挙げられるが、これらに限定されない。
崩壊剤として、デンプン、メチルセルロース、寒天、ベントナイト、キサンタンガム等が挙げられるが、これらに限定されない。
構造(I)を有するWnt阻害剤の例示的で非限定的な実施形態をここで開示する。
本開示は、構造(I):
{式中:
R1、R2、R3、R4及びR5は各々独立して、H又はアルキル基であってもよく;
Dは、H、ハロゲン、アルキル、シクロアルキル、アリール及びジアルキルアミノからなる群から選択してもよく、各々(H及びハロゲン以外)は、任意選択で置換され;
Arは、各々任意選択で置換されているアリール又はヘテロアリール基であってもよく;
Cyは、少なくとも1つのヘテロ原子を含有するアリール、ヘテロアリール又は飽和環であってもよく、各々は、任意選択で置換され;
nは、1～3の整数であってもよい}
を有するWnt阻害剤を提供する。
R1、R2、R3、R4及びR5は各々独立して、H又はアルキル基であってもよく;
Dは、H、ハロゲン、アルキル、シクロアルキル、アリール及びジアルキルアミノからなる群から選択してもよく、各々(H及びハロゲン以外)は、任意選択で置換され;
Arは、各々任意選択で置換されているアリール又はヘテロアリール基であってもよく;
Cyは、少なくとも1つのヘテロ原子を含有するアリール、ヘテロアリール又は飽和環であってもよく、各々は、任意選択で置換され;
nは、1～3の整数であってもよい}
を有するWnt阻害剤を提供する。
一部の例においては、n=1であり、R3及びR4のうちの1つがメチルであり、他方がHである場合、化合物の立体化学は、部分構造(II)
において示される通りである。
一部の特定の例においては、n=1であり、R3及びR4のうちの1つはメチルであり、他方はHであり、化合物の立体化学は、部分構造(II)において示される通りである。
本明細書において後に構造(I)の化合物5と呼ばれる化合物(ETC-1922159又は省略してETC-159とも呼ばれる)は、構造(I)を有するWnt阻害剤の範囲内に明白に含まれる。構造(I)の化合物5は、後に定義する構造(IV)
の化合物として更に公知である。
以下の特定の選択肢は、個々に、又は任意の好適な組合せにおいて、構造(I)を有するWnt阻害剤と関連して使用され得る。
R1及びR2は独立して、メチル又はエチルであってもよい。それらは、両方ともメチルであってもよい。R3及びR4は、両方ともHであってもよい。それらは、両方ともアルキル、例えばメチル又はエチルであってもよい。R3及びR4のうちの1つは、アルキル(例えばメチル又はエチル)であってもよく、他方は、Hであってもよい。R5は、水素であってもよい。それは、メチルであってもよく、又は一部の他のアルキルであってもよい。
Arが、6員環である場合、それは、1,4-二置換されていてもよい。Arが、5員環である場合、それは、1,3-二置換されていてもよい。Arは、1,2-二置換されていない環であってもよい。この文脈においては、「二置換されている」は、Cy及びNR5による置換を指す。
Arは、二置換ベンゼン環(すなわち、フェニレン環)、二置換チオフェン環、又は1～4つの窒素原子を有する二置換窒素ヘテロ環であってもよい。それは、0～2つの窒素原子を有する6員芳香環であってもよい。それは、2-チアゾリル環ではない環であってもよい。それは、ピリダジン環、例えばピリダジン-3,6-ジイルであってもよい。
Cyは、0～2つの窒素原子、0又は1つの硫黄原子及び0又は1つの酸素原子を有する5又は6員芳香環であってもよい。或いは、それは、ピペラジンであってもよい。ピペラジンは、両方の窒素原子上で置換されていてもよい。Cyは、塩素を含有しなくてもよい。それは、(任意選択で追加的に置換されている)クロロフェニル基ではない基であってもよい。一部の例においては、化合物Iは、塩素を有しない。
nは、1であってもよい。
Dは、Hであってもよい。
モジュレートすることは、阻害することであってもよい。
特定の例においては、R1及びR2は、両方ともメチルである。R3、R4、R5及びDは、すべてHであり、nは、1である。この例の特定の場合においては、Arは、1又は2つの窒素原子を有し、Cy及びアミド窒素以外の置換基を有しない6員環であり、これらは、環上で1,4-関係である。
Wnt阻害剤の構造(I)及び(II)においては、nは、1～5であってもよい。それは、1～3であってもよい。それは、1、2、3、4又は5のいずれか1つであってもよい。置換基Dは、H、ハロゲン、アルキル、シクロアルキル、アリール又はジアルキルアミノであってもよく、各々(H及びハロゲン以外)は、任意選択で置換されている。例として、水素、塩素、臭素、メチル、エチル、プロピル、シクロプロピル、フェニル、トリフルオロメチル、ジメチルアミノ、N-ピペリジニル、N-ピペラジニル、N-メチル-N'-ピペラジニル等が挙げられる。
多くの例において、nは、1である。
一部の場合、置換基R3及びR4は同じであり、その他の場合、それらは異なる。それらが異なる事象においては、それらは、それらが結合する炭素原子で立体化学を生じる。一般的に、その炭素での(又は各炭素での)立体化学は、(S)又は(R)であり得る。特定の例においては、nが1であり、R3及びR4のうちの1つがHであり、他方がアルキル基である場合、好ましい立体化学は、構造(II)において示される通りであり、Meは、アルキル基を表し得る。アルキル基がメチルである場合、この立体化学は、特に好ましい。
構造(I)におけるAr基の例として、1,4-フェニレン、2,5-ピリジンジイル、3,6-ピリダジンジイル、2,5-ピラジンジイル、2,5-チオフェンジイル、2,4-チオフェンジイル、2,5-フランジイル、2,4-フランジイル等が挙げられる。構造(I)におけるCy基の例として、フェニル、チアゾール-2-イル、チオフェン-2-イル、チオフェン-3-イル、ピリジン-1-イル、ピリジン-2-イル、ピリジン-3-イル、ピリダジン-3-イル、ピリダジン-4-イル、ピリミジン-2-イル、ピリミジン-4-イル、ピリミジン-4-イル、N-イミダゾリル、2-、4-若しくは5-チアゾリル、2-、4-若しくは5-オキサゾリル、N-モルホリニル又はN'置換N-ピペラジニルが挙げられる。ピペラジニル置換基のN'位上の好適な置換基として、Xが、t-ブトキシ、ネオペンチル、メチル、フェニル、p-クロロフェニル、ベンジル、α,α-ジフルオロベンジル、クロロベンジル、フルオロベンジル等である-C(=O)Xが挙げられる。
一部の例においては、R1及びR2は、同じである。それらは、両方ともメチルであってもよい。それらは、両方ともエチルであってもよい。後者の場合、Arは、1,4-フェニレンであってもよく、Cyは、チオフェン-3-イルであってもよい。
一部の例においては、DはHである。他の例においては、Dは、メチル、シクロプロピル、トリフルオロメチル、フェニル、ジメチルアミノ、モルホリン-N-イル、チオフェン-3-イル又はブロモであってもよい。DがHではない(例えば、メチル、シクロプロピル、トリフルオロメチル、フェニル、ジメチルアミノ、モルホリン-N-イル、チオフェン-3-イル又はブロモである)事象においては、Arは、1,4-フェニレンであってもよく、Cyは、チオフェン-3-イルであってもよい。
一部の例においては、nは1であり、他の例においては、それは2又は3である。nが2又は3である事象においては、Arは、1,4-フェニレンであってもよく、Cyは、チオフェン-3-イル又はチアゾール-2-イルであってもよい。
一部の例においては、R3及びR4は、両方ともH又は両方ともメチルのいずれかである。他の例においては、1つはHであり、他方はメチル又はエチルである。それらが両方ともHではない事象においては、Arは、1,4-フェニレンであってもよい。或いは、それらが両方ともHではない場合、Arは、1,4-フェニレンであるか、若しくはCyは、フェニルであるか、又はいずれかは、チアゾール-2-イルである。
一部の例においては、R5は、Hである。
一部の例においては、Arは、1,4-フェニレンであり、Cyは、チオフェン-3-イル又はチアゾール-2-イルである。特定の例においては、Arは、1,4-フェニレンであり、Cyは、チオフェン-3-イルである。
特定の例においては、R1及びR2は両方ともMeであり、DはHであり、nは1であり、R3及びR4は両方ともHである。この例においては、Arが、1,4-フェニレンである場合、Cyが、チオフェン-3-イルではないことが好ましい。この例の変形形態においては、R1及びR2は両方ともメチルではないか、又はDはHではないか、又はnは1ではないか、又はR3及びR4は両方ともHではなく(任意選択で、これらのうちの1つを超えるもの、及び特定の場合すべてが適用し)、Arは、1,4-フェニレンであり、Cyは、チオフェン-3-イル又はチアゾール-2-イルである(任意選択で、Arは、1,4-フェニレンであり、Cyは、チオフェン-3-イルである)。
一部の例においては、構造(I)として定義する化合物7、13、27、28、39、42、43、44、58、65、71、80及び83のうちの任意の1つ又は複数、任意選択ですべては、本発明の範囲から除外され得る。一部の例においては、化合物8、12、55及び85のうちの任意の1つ又は複数、任意選択ですべてはまた、除外され得る。
一部の例においては、Ar及びCyは、両方とも任意選択で置換されているフェニル環ではない。一部の例においては、Ar及びCyのうちの少なくとも1つは、ヘテロ芳香族又は非芳香族である。一部の例においては、Ar及びCyのうちの少なくとも1つは、ヘテロ芳香族である。
一部の例においては、Arが、1,4-フェニレン又は2,5-ピリジルである場合、Cyは、1つ以下の環窒素原子を有する。他の例においては、Arが、5員環である場合、それは、オキサゾールジイルではない。また他の例においては、Arが、5員環である場合、それは、チオフェンジイル、例えばチオフェン-2,4-ジイルであってもよい。本明細書の文脈においては、「Aである場合、Bである」という言及は、Aがその場合ではないこと、又はA及びBの両方がその場合ではないことのいずれかの可能性を示すと解釈されるべきである。それゆえ、例えば、「Arが5員環である場合、それはチオフェンジイルであってもよい」という記載は、Arが5員環ではないこと、そうでなければArがチオフェンジイル環であることのいずれかを意味すると解釈され得る。そのような場合、Arは、例えばピリジンジイル環であり得るが、フランジイル環ではあり得ない。
本開示は、特に、構造(I)の2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-1,2,3,6-テトラヒドロ-7H-プリン-7-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミドの遊離塩基の無水形態、この遊離塩基の無水形態を含有する医薬組成物、及びある特定の健康状態の治療におけるこの遊離塩基の無水形態の使用方法を包含し得る。この化合物、構造(I)の2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-1,2,3,6-テトラヒドロ-7H-プリン-7-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド又は2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-2,3-ジヒドロ-1H-プリン-7(6H)-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミドは、構造(IV)の化合物として更に標識され、これは、構造(I)の化合物5(ETC-159)としても公知である。
構造(I)の2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-1,2,3,6-テトラヒドロ-7H-プリン-7-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミドに関連して、初期研究は、好ましい化学的形態である遊離塩基について行われ、製造条件によって1つを超える結晶形態をとることが分かったこの化合物について、多形は頻繁にあることを示した。加えて、含水量はバッチ毎に変動することが観察された。
したがって、上記に特定した問題のうちの1つ又は複数を克服又は改善する、構造(I)の2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-1,2,3,6-テトラヒドロ-7H-プリン-7-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミドの単一の多形形態を調製した。
本開示は、それゆえ、構造(I)の2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-1,2,3,6-テトラヒドロ-7H-プリン-7-イル)-n-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミドの遊離塩基の無水形態(非水和型単一多形体)を包含する。
無水遊離塩基は、結晶であってもよい。結晶無水遊離塩基は、X線回折で22.2°±0.5°での2シータスケール上のピークを示す。それはまた、X線回折で5.5°±0.5°及び14.2°±0.5°での2シータスケール上のピークを示す。特に、それは、X線回折で5.5°±0.5°及び12.5°±0.5°、14.2°±0.5°、16.7°±0.5°、17.7°±0.5°、18.8°±0.5°、22.4°±0.5°、24.2°±0.5°及び31.7°±0.5°からなる群から選択される2シータスケール上の少なくとも4つのピークを示す。具体的には、それは、X線回折で5.5°±0.5°及び12.5°±0.5°、14.2°±0.5°、16.7°±0.5°、17.7°±0.5°、18.0°±0.5°、18.8°±0.5°、19.6°±0.5°、20.6°±0.5°、22.4°±0.5°、24.2°±0.5°、24.4°±0.5°、25.0°±0.5°、27.0°±0.5°、27.6°±0.5°、29.8°±0.5°、31.7°±0.5°及び32.2°±0.5°の2シータスケール上のピークを示す。
様々な例において上記に示す限定の(すべてではないが)多くは、組み合わせて共に使用してもよく、本発明は、それらが実行可能なそのような組合せを明白に企図することが理解される。
構造(I)を有するWnt阻害剤の特定の(しかし、非限定的な)例を、以下:
に示す。
構造(III)を有するWnt阻害剤の例示的で非限定的な実施形態を、ここで開示する。本開示は、構造(III):
、又はそのすべての互変異性体及び立体異性体を含むその薬学的に許容される塩、溶媒和物若しくは多形体を有するWnt阻害剤を提供し、式中、以下の通りである:
R1は、H;任意選択で、C1～6アルコキシ、NH2、-NHC1～3アルキル及び-N(C1～3アルキル)2から各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているアルキル;-C(O)Oアルキル;ハロアルキル;ハロアルコキシ;又は-アルキルアリールを表し得る;
各R2は独立して、H;任意選択で、C1～6アルコキシ、NH2、-NHC1～3アルキル及び-N(C1～3アルキル)2から各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているアルキル;-アルキルアリール;任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、C1～6ハロアルキル、C1～6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているカルボシクリル;任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル及び-C(O)NHC1～6アルキルから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているヘテロシクリル;-NHアルキル;-N(アルキル)2;アミノ;ヒドロキシル;アルコキシ;又はハロを表し得る;
nは、0、1又は2を表し得る;
R3は、H又はアルキルを表し得る;
R4は、H又はアルキルを表し得る;
R5は、H又はアルキルを表し得る;
W及びXは各々独立して、C=O;C=S;又はCH2を表し得る;
Yは、アリール;ヘテロアリール;任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、C1～6ハロアルキル、C1～6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているカルボシクリル;又は任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル及び-C(O)NHC1～6アルキルから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているヘテロシクリルを表し得る;
Yは、アリール又は6員単環式ヘテロアリールを更に表し得る;
Zは、任意選択で、C1～6アルコキシ、NH2、-NHC1～3アルキル及び-N(C1～3アルキル)2から各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているアルキル;アリール;ヘテロアリール;-アルキルアリール;-アルキルヘテロアリール;任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、C1～6ハロアルキル、C1～6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているカルボシクリル;任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル及び-C(O)NHC1～6アルキルから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているヘテロシクリル;カルボシクリルが、任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、C1～6ハロアルキル、C1～6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されている-アルキルカルボシクリル;ヘテロシクリルが、任意選択で、C1～6アルキル、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル及び-C(O)NHC1～6アルキルから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されている-アルキルヘテロシクリル;カルボシクリルが、任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、C1～6ハロアルキル、C1～6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されている-アリールカルボシクリル;又はヘテロシクリルが、任意選択で、C1～6アルキル、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル及び-C(O)NHC1～6アルキルから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されている-アリールヘテロシクリルを表し得る;
Zは、アリール又はヘテロアリールを更に表し得る。
可変性のYの文脈においては、Yは連結基であり、末端基ではないので、「アリール」という用語は、「アリーレン」を意味すると理解される(例えば、「フェニル」は、「フェニレン」(すなわち、C6H4)を意味すると理解される)。他のY環(例えばヘテロアリール)についての用語は、同様に解釈されるべきである。Yが置換されていないと言及される場合、これは、Z及びNR5以外の他の置換基は意味しないと理解される。Yが単置換されていると言及される場合、これは、Z及びNR5以外の1つの置換基を意味すると理解される。
R1が、任意選択で、C1～6アルコキシ、NH2、-NHC1～3アルキル及び-N(C1～3アルキル)2から各々独立して選択され得る1つ又は複数の置換基によって置換されているアルキルを表す場合、置換基の例として、メトキシ、-NH2、-NHメチル及び-NH(メチル)2が挙げられる。例として、C1～6アルキル(例えば置換されていないC1～6アルキル)、例えばメチル、エチル、プロピル(例えばn-プロピル、イソプロピル)、ブチル(例えばn-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル)、ペンチル(例えばn-ペンチル)及びヘキシル(例えばn-ヘキシル)が挙げられる。C1～6アルキル基の例は、メチル及びエチル、特にメチルである。
R1が、-C(O)Oアルキルを表す場合、例として、-C(O)OC1～6アルキル、例えば-C(O)OMe、-C(O)OEt、-C(O)OPr及び-C(O)OiPrが挙げられる。特定の例は、-C(O)OMeである。
R1が、ハロアルキルを表す場合、例として、C1～6ハロアルキル、例えばCH2F、CHF2、CF3、CH2CH2F、CH2CHF2、CH2CF3、CHFCH3及びCF2CH3が挙げられる。特定の例は、CF3である。
R1が、ハロアルコキシを表す場合、例として、C1～6ハロアルコキシ、例えばOCF3が挙げられる。
R2が、任意選択で、C1～6アルコキシ、NH2、-NHC1～3アルキル及び-N(C1～3アルキル)2から各々独立して選択され得る1つ又は複数の置換基によって置換されているアルキルを表す場合、置換基の例として、メトキシ、-NH2、-NHメチル及び-NH(メチル)2が挙げられる。例として、C1～6アルキル(例えば置換されていないC1～6アルキル)、例えばメチル、エチル、プロピル(例えばn-プロピル、イソプロピル)、ブチル(例えばn-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル)、ペンチル(例えばn-ペンチル)及びヘキシル(例えばn-ヘキシル)が挙げられる。C1～6アルキル基の例は、メチルである。
R2が、-アルキルアリールを表す場合、例として、ベンジルが挙げられる。
R2が、任意選択で、C1～6アルキル(例えばメチル)、C1～6アルコキシ(例えばメトキシ)、C1～6ハロアルキル(例えばフルオロメチル、例えばトリフルオロメチル)、C1～6ハロアルコキシ(例えばフルオロメトキシ、例えばトリフルオロメトキシ)及びハロ(例えばフルオロ、例えばクロロ)から各々独立して選択され得る1つ又は複数の置換基によって置換されているカルボシクリルを表す場合、例として、C3～C6シクロアルキル、例えばシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル及びシクロヘキシルが挙げられる。置換されている例として、メチルによって置換されているシクロヘキシルが挙げられる。
R2が、任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル及び-C(O)NHC1～6アルキルから各々独立して選択され得る1つ又は複数の置換基によって置換されているヘテロシクリルを表す場合、Yは、任意選択で、C1～6アルキル(例えばメチル)によって置換されているヘテロシクリルを表し得る。例として、単環式ヘテロシクリルが挙げられる。ヘテロシクリル基は、置換されていなくてもよく、又は例えば1若しくは2つ(例えば1つ)の置換基(例えば1つのメチル基)を有してもよい。例として、ピペリジニル、モルホリニル、ピロリジニル、4,5-ジヒドロピラゾリル及び4,5-ジヒドロイソキサゾリルが挙げられる。特定の例は、ピロリジニルである。
R2が、-NHアルキルを表す場合、例として、-NHMe、NHEt、NHPr及びNHiPr、特にNHMeが挙げられる。
R2が、-N(アルキル)2を表す場合、例として、-N(Me)2が挙げられる。
R2が、アルコキシを表す場合、例として、メトキシ及びエトキシ、とりわけメトキシが挙げられる。
nが、1を表す場合、-(CHR2)n-の例として、-CH2-及び-CH(CH3)-が挙げられる。
nが、2を表す場合、-(CHR2)n-の例として、-CH2-CH2-、-CH2CH(CH3)-、-CH(CH3)CH2-及び-CH(CH3)-CH(CH3)-が挙げられる。-(CHR2)2-基の例は、-CH2-CH2-である。
R3が、アルキルを表す場合、例として、C1～6アルキル、例えばメチル、エチル、プロピル(例えばn-プロピル、イソプロピル)、ブチル(例えばn-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル)、ペンチル(例えばn-ペンチル)及びヘキシル(例えばn-ヘキシル)が挙げられる。C1～6アルキル基の例は、メチルである。
R4が、アルキルを表す場合、例として、C1～6アルキル、例えばメチル、エチル、プロピル(例えばn-プロピル、イソプロピル)、ブチル(例えばn-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル)、ペンチル(例えばn-ペンチル)及びヘキシル(例えばn-ヘキシル)が挙げられる。C1～6アルキル基の例は、メチルである。
R5が、アルキルを表す場合、例として、C1～6アルキル、例えばメチル、エチル、プロピル(例えばn-プロピル、イソプロピル)、ブチル(例えばn-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル)、ペンチル(例えばn-ペンチル)及びヘキシル(例えばn-ヘキシル)が挙げられる。C1～6アルキル基の例は、メチルである。
Yが、アリールを表す場合、例として、任意選択で置換されているフェニルが挙げられる。置換基の例として、C1～6アルキル(例えばメチル)、C1～6アルコキシ(例えばメトキシ)、ハロ及びC1～6ハロアルキル(例えばフルオロメチル、例えばトリフルオロメチル)から各々独立して選択され得る1つ又は複数(例えば1又は2つ、とりわけ1つ)の置換基が挙げられる。例として、置換されていないフェニル、メチルフェニル、メトキシフェニル、フルオロフェニル、クロロフェニル及びトリフルオロメチルフェニルが挙げられる。特定の例として、置換されていないフェニルが挙げられる。特定の例としてまた、メチルフェニル、メトキシフェニル、フルオロフェニルが挙げられる。Z及びNR5は、フェニル環上で互いに対して1及び4位に位置し得る(すなわち、Z及びNR5は、パラ関係を有する)。
Yが、ヘテロアリールを表す場合、例として、単環式(例えば5及び6員)及び二環式(例えば9及び10員)ヘテロアリール環、とりわけ単環式ヘテロアリール環、特に6員単環式ヘテロアリール環が挙げられる。単環式ヘテロアリールの例は、1又は2つの窒素原子(例えば1つ又は例えば2つ)及び任意選択で、酸素又は硫黄原子を含む、1、2又は3つの環ヘテロ原子(例えば1又は2つ、例えば1つ)を含み得る。5員単環式ヘテロアリール基の例として、ピロリル、ピラゾリル、イミダゾリル、オキサゾリル、イソキサゾリル、チアゾリル、イソチアゾリル、オキサジアゾリル及びチアジアゾリルが挙げられる。Yが、5員単環式ヘテロアリールである場合、Z及びNR5は、環上で非隣接環原子に位置し得る。6員単環式ヘテロアリール基の例として、ピリジニルが挙げられる。6員単環式ヘテロアリール基の例としてまた、ピリダジニル、ピリミジニル及びピラジニルが挙げられる。Yが、6員単環式ヘテロアリールである場合、Z及びNR5は、環上で互いに対して1及び4位に位置し得る(すなわち、Z及びNR5は、パラ関係を有する)。上記に挙げたヘテロアリール基は、置換されていなくてもよく、1つ又は複数(例えば1又は2つ、特に1つ)の置換基によって置換されていてもよい。置換基の例は、C1～6アルキル(例えばメチル)、C1～6アルコキシ(例えばメトキシ)、ハロ(例えばフルオロ)及びC1～6ハロアルキル(例えばフルオロメチル、例えばトリフルオロメチル)から独立して選択される。Yが、置換されていないヘテロアリールである場合、例として、イソキサゾリル(例えば(NR5が5位に存在し、Zが3位に存在する)イソキサゾリル-5-イル及び(NR5が3位に存在し、Zが5位に存在する)イソキサゾリル-3-イル、とりわけイソキサゾリル-5-イル)、オキサジアゾリル、ピリジニル(例えばピリジン-2-イル又はピリジン-3-イル)、ピリダジニル(例えばピリダジン-3-イル)、ピリミジニル(例えばピリミジン-3-イル)、ピラジニル(例えばピラジン-2-イル)が挙げられる。Yが、置換されているヘテロアリールである場合、Yは、例えばメチル又はフルオロによって置換されていてもよい。Yが、置換されているヘテロアリールである場合、例として、メチルピリジニル、フルオロピリジニル、メチルピリダジニル、メチルピラジニル、メチルピリミジニル及び1-メチルピラゾリルが挙げられる。
Yが、任意選択で、C1～6アルキル(例えばメチル)、C1～6アルコキシ(例えばメトキシ)、C1～6ハロアルキル(例えばフルオロメチル、例えばトリフルオロメチル)、C1～6ハロアルコキシ(例えばフルオロメトキシ)及びハロ(例えばフルオロ、例えばクロロ)から各々独立して選択され得る1つ又は複数の置換基によって置換されているカルボシクリルを表す場合、Yは、任意選択で、C1～6アルキルによって置換されているカルボシクリルを表し得る。例として、任意選択で、C1～6アルキル(例えばメチル)によって置換されている単環式カルボシクリルが挙げられる。カルボシクリルの例として、C3～8シクロアルキル(例えばシクロヘキシル)及びC5～8シクロアルケニル(例えばシクロヘキセニル)が挙げられる。カルボシクリル環は、任意選択で、1、2又は3つの、独立して選択され得る置換基(例えば1又は2つ、とりわけ1つ、例えば1つのメチル基)によって置換されている。Yが、カルボシクリルを表す場合、Yは、C3～8シクロアルキル、例えばC5～6シクロアルキルを表し得る。特定の例は、シクロヘキシルである。Yが、6員カルボシクリルである場合、Z及びNR5は、カルボシクリル環上で互いに対して1及び4位に位置し得る。
Yが、任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル及び-C(O)NHC1～6アルキルから各々独立して選択され得る1つ又は複数の置換基によって置換されているヘテロシクリルを表す場合、Yは、任意選択で、C1～6アルキル(例えばメチル)によって置換されているヘテロシクリルを表し得る。例として、単環式ヘテロシクリルが挙げられる。ヘテロシクリル基は、置換されていなくてもよく、例えば1又は2つ(例えば1つ)の置換基(例えば1つのメチル基)を有してもよい。例として、ピペリジニル、モルホリニル、ピロリジニル、4,5-ジヒドロピラゾリル及び4,5-ジヒドロイソキサゾリルが挙げられる。特定の例として、4,5-ジヒドロイソキサゾリル(例えば4,5-ジヒドロイソキサゾール-5-イル)及びピペリジニル(例えばピペリジン-4-イル)が挙げられる。Yが、6員ヘテロシクリルである場合、Z及びNR5は、ヘテロシクリル環上で互いに対して1及び4位に位置し得る。Yが、ヘテロシクリルを表す場合、一実施形態においては、Zは、-アルキルアリールを表さない。
Zが、任意選択で、C1～6アルコキシ、NH2、-NHC1～3アルキル及び-N(C1～3アルキル)2から各々独立して選択され得る1つ又は複数の置換基によって置換されているアルキルを表す場合、置換基の例として、メトキシ、-NH2、-NHメチル及び-NH(メチル)2が挙げられる。例として、C1～6アルキル(例えば置換されていないC1～6アルキル)、例えばメチル、エチル、プロピル(例えばn-プロピル、イソプロピル)、ブチル(例えばn-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル)、ペンチル(例えばn-ペンチル)及びヘキシル(例えばn-ヘキシル)が挙げられる。例としてまた、C3～6アルキル(例えば置換されていないC3～6アルキル)、例えばプロピル(例えばn-プロピル、イソプロピル)、ブチル(例えばn-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル)、ペンチル(例えばn-ペンチル)及びヘキシル(例えばn-ヘキシル)が挙げられる。C1～6アルキル基の例は、メチル及びtert-ブチルである。
Zが、アリールを表す場合、例として、任意選択で置換されているフェニルが挙げられる。置換基の例として、フルオロ、クロロ、ブロモ、アミノ、メトキシ、メチル、ハロアルキル(例えばフルオロメチル、例えばトリフルオロメチル)、-COOH、-C(O)NMe2、ジメチルアミノ及び-NHC(O)Meから各々独立して選択され得る1つ又は複数(例えば1又は2つ、とりわけ1つ)の置換基が挙げられる。例として、置換されていないフェニルが挙げられる。置換されている例として、フルオロフェニル(例えば2-フルオロフェニル、3-フルオロフェニル及び4-フルオロフェニル)、クロロフェニル(例えば2-クロロフェニル、3-クロロフェニル、4-クロロフェニル及び3,4-ジクロロフェニル)、ブロモフェニル(例えば2-ブロモフェニル、3-ブロモフェニル及び4-ブロモフェニル)、アミノフェニル(例えば2-アミノフェニル、3-アミノフェニル、4-アミノフェニル)、メトキシフェニル(例えば2-メトキシフェニル、3-メトキシフェニル及び4-メトキシフェニル)、メチルフェニル(例えば2-メチルフェニル、3-メチルフェニル及び4-メチルフェニル)、フルオロメチルフェニル(例えば3-トリフルオロメチルフェニル及び4-トリフルオロメチルフェニル)、カルボキシフェニル(例えば3-(COOH)-フェニル)、3-(C(O)NMe2)-フェニル)、3-ジメチルアミノフェニル及び3-(NHC(O)Me)-フェニルが挙げられる。
Zが、ヘテロアリールを表す場合、例として、単環式(例えば5及び6員)及び二環式(例えば9及び10員)ヘテロアリール環、とりわけ単環式環が挙げられる。単環式ヘテロアリールの例は、1又は2つの窒素原子(例えば1つ又は例えば2つ)及び任意選択で、酸素又は硫黄原子を含む、1、2又は3つの環ヘテロ原子(例えば1又は2つ、例えば1つ)を含む。5員単環式ヘテロアリール基の例として、ピロリル、ピラゾリル、イミダゾリル、オキサゾリル、イソキサゾリル、チアゾリル、イソチアゾリル、オキサジアゾリル及びチアジアゾリルが挙げられる。6員単環式ヘテロアリール基の例として、ピリジニルが挙げられる。6員単環式ヘテロアリール基の例としてまた、ピリダジニル、ピリミジニル及びピラジニルが挙げられる。上記に挙げたヘテロアリール基は、置換されていなくてもよく、1つ又は複数(例えば1又は2つ、特に1つ)の置換基によって置換されていてもよい。置換基の例は、メチル、フルオロ、クロロ、アミノ、ハロメチル(例えばフルオロメチル、例えばトリフルオロメチル)から独立して選択される。置換されていない例として、ピリジニル(例えばピリジン-2-イル、ピリジン-3-イル及びピリジン-4-イル)、ピラジニル(例えばピラジン-2-イル)、ピリダジニル(例えばピリダジン-3-イル)、ピリミジニル(例えばピリミジン-2-イル、ピリミジン-4-イル及びピリミジン-5-イル)、オキサゾリル(例えばオキサゾール-2-イル及びオキサゾール-5-イル)、チアゾリル(例えばチアゾール-2-イル及びチアゾール-5-イル)及びピラゾリル(例えばピラゾール-1-イル)が挙げられる。置換されている例として、クロロピリジニル(例えば4-クロロピリジン-2-イル、5-クロロピリジン-2-イル及び5-クロロピリジン-3-イル)、フルオロピリジニル(例えば4-フルオロピリジン-2-イル、5-フルオロピリジン-2-イル及び5-フルオロピリジン-3-イル)、メチルピリジニル(例えば2-メチルピリジン-5-イル、6-メチルピリジン-2-イル及び5-メチルピリジン-3-イル)、フルオロメチルピリジニル(例えば5-トリフルオロメチルピリジン-3-イル)、アミノピリジニル(例えば5-アミノピリジン-3-イル)、メチルピラジニル(例えば5-メチルピラジン-2-イル)、メチルチアゾリル(例えば2-メチルチアゾール-4-イル)及びメチルピラゾリル(例えば1-メチルピラゾール-5-イル)が挙げられる。
Zが、-アルキルアリールを表す場合、例として、ベンジルが挙げられる。
Zが、-アルキルヘテロアリール(例えば-CH2-ヘテロアリール)を表す場合、例として、-アルキルピロリル、-アルキルピラゾリル、-アルキルイミダゾリル、-アルキルオキサゾリル、-アルキルイソキサゾリル、-アルキルチアゾリル、-アルキルイソチアゾリル、-アルキルオキサジアゾリル、-アルキルチアジアゾリル、-アルキルピリジニル、-アルキルピリダジニル、-アルキルピリミジニル及び-アルキルピラジニルが挙げられる。
Zが、任意選択で、C1～6アルキル(例えばメチル)、C1～6アルコキシ(例えばメトキシ)、C1～6ハロアルキル(例えばフルオロメチル)、C1～6ハロアルコキシ(例えばフルオロメトキシ)及びハロ(例えばフルオロ、例えばクロロ)から各々独立して選択され得る1つ又は複数の置換基によって置換されているカルボシクリルを表す場合、Zは、任意選択で、C1～6アルキルによって置換されているカルボシクリルを表し得る。例として、任意選択で、C1～6アルキル(例えばメチル)によって置換されている単環式カルボシクリルが挙げられる。カルボシクリルの例として、C3～8シクロアルキル(例えばシクロヘキシル)及びC5～8シクロアルケニル(例えばシクロヘキセニル)が挙げられる。カルボシクリル環は、任意選択で、1、2又は3つの置換基(例えば1又は2つ、とりわけ1つ、例えば1つのメチル基)によって置換されていてもよい。Zが、カルボシクリルを表す場合、Zは、C3～8シクロアルキル、例えばC5～6シクロアルキルを表し得る。特定の例は、シクロヘキシルである。
Zが、任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル、-C(O)NHC1～6アルキル、C1～6アルキル(例えばメチル)、-C(O)OC1～6アルキル(例えば-C(O)Oメチル)、-C(O)C1～6アルキル(例えば-C(O)メチル)、-C(O)NHC1～6アルキル(例えば-C(O)NHメチル)から各々独立して選択され得る1つ又は複数の置換基によって置換されているヘテロシクリルを表す場合、例として、置換されていないヘテロシクリル及び1又は2つ(例えば1つ)の置換基を有するヘテロシクリルが挙げられる。例として、1つの窒素原子(例えばピロリジニル及びピペリジニル)又は2つの窒素原子(例えばピペラジニル)を含有するヘテロシクリル基が挙げられる。例としてまた、1つの窒素原子及び1つの酸素原子(例えばモルホリニル)又は1つの硫黄原子(例えばチオモルホリニル)を含有するヘテロシクリル基が挙げられる。一例においては、Zが置換されている場合、環窒素原子は置換されていてもよい。置換されている例として、置換されているピペラジニル、例えば4-置換ピペラジニル、例えば4-Boc-ピペラジニル、4-(C(O)Me)-ピペラジニル、4-(C(O)NHEt)ピペラジニル及び4-メチルピペラジニルが挙げられる。
Zが、カルボシクリルが、任意選択で、C1～6アルキル(例えばメチル)、C1～6ハロアルキル(例えばフルオロメチル、例えばトリフルオロメチル)、C1～6アルコキシ(例えばメトキシ)、C1～6ハロアルコキシ(例えばフルオロメトキシ)及びハロ(例えばフルオロ、例えばクロロ)から各々独立して選択され得る1つ又は複数の置換基によって置換されている-アルキルカルボシクリル(例えば-CH2-カルボシクリル)を表す場合、例として、-CH2-シクロプロピル及び-CH2-シクロブチルが挙げられる。
Zが、ヘテロシクリルが、任意選択で、C1～6アルキル、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル、-C(O)NHC1～6アルキル、C1～6アルキル(例えばメチル)、-C(O)OC1～6アルキル(例えば-C(O)Oメチル)、-C(O)C1～6アルキル(例えば-C(O)メチル)、-C(O)NHC1～6アルキル(例えば-C(O)NHメチル)から各々独立して選択され得る1つ又は複数の置換基によって置換されている-アルキルヘテロシクリルを表す場合、例として、-CH2-ヘテロシクリル、例えば-CH2-モルホリニル、-CH2-ピペラジニル、-CH2-ピペリジニル及び-CH2-ピロリジニルが挙げられる。
Zが、カルボシクリルが、任意選択で、C1～6アルキル(例えばメチル)、C1～6アルコキシ(例えばメトキシ)、C1～6ハロアルキル(例えばフルオロメチル、例えばトリフルオロメチル)、C1～6ハロアルコキシ(例えばフルオロメトキシ)及びハロ(例えばフルオロ、例えばクロロ)から各々独立して選択され得る1つ又は複数の置換基によって置換されている-アリールカルボシクリルを表す場合、Zは、フェニルカルボシクリルであってもよい。カルボシクリル環は、置換されていなくてもよく、1つ又は複数のC1～6アルキル基によって置換されていてもよい。カルボシクリル環は、単環式であってもよい。カルボシクリル環の例は、シクロアルキルである。例として、シクロプロピルフェニル-及びシクロヘキシルフェニル-が挙げられる。
Zが、ヘテロシクリルが、任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル、-C(O)NHC1～6アルキル、C1～6アルキル(例えばメチル)、-C(O)OC1～6アルキル(例えば-C(O)Oメチル)、-C(O)C1～6アルキル(例えば-C(O)メチル)、-C(O)NHC1～6アルキル(例えば-C(O)NHメチル)から各々独立して選択され得る1つ又は複数の置換基によって置換されている-アリールヘテロシクリルを表す場合、Zは、-フェニルヘテロシクリルであってもよい。ヘテロシクリル環は、単環式であってもよく、1又は2つ(例えば1つ)の窒素原子を含有してもよい。例として、モルフィノリルフェニル-、ピペラジニルフェニル-、ピペリジニルフェニル-、ピロリジニルフェニル-が挙げられる。特定の例は、3-(モルホリン-4-イル)フェニル-である。
好適には、R1は、H、メチル、エチル、-C(O)OMe、CF3又はOMeを表し得る。一例においては、R1は、メチルを表す。
好適には、各R2は独立して、H又はアルキルを表し得る。より好適には、R2は、H又はメチルを表す。一例においては、R2は、Hを表す。一例においては、R2は、メチルを表す。
好適には、nは、0又は1を表してもよく、例えばnは、1を表す。
好適には、R3は、H又はメチルを表してもよく、例えばR3は、Hを表す。
好適には、R4は、H又はメチルを表してもよく、例えばR4は、Hを表す。
好適には、R5は、H又はメチルを表してもよく、例えばR5は、Hを表す。
好適には、W及びXは、互いに同じである。
好適には、W及びXは各々、C=Oを表し得る。
好適には、Yは、アリール(例えばフェニル)又はヘテロアリール(例えば1又は2つの窒素原子を含む1、2又は3つの環ヘテロ原子を含む5又は6員単環式ヘテロアリール、例えばイソキサゾリル、ピリジニル、ピリダジニル、ピリミジニル又はピラジニル)を表し得る。一例においては、Yは、フェニルを表す。一例においては、Yは、単環式ヘテロアリールを表す。一例においては、Yは、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、ハロ及びC1～6ハロアルキルから各々独立して選択される1つ又は複数の置換基によって置換されている。一例においては、Yは、置換されていない。一例においては、Yは、単置換されている。Yが、5員である場合、好適には、Z及びNR5は、環上で非隣接環原子に位置する。Yが、6員である場合、好適には、Z及びNR5は、環上で互いに対して1及び4位に位置する(すなわち、Z及びNR5は、パラ関係を有する)。
好適には、Zは、アリール(例えばフェニル)又はヘテロアリール(例えば6員ヘテロアリール、例えばピリジニル、ピリダジニル、ピリミジニル又はピラジニル、とりわけピリジニル;又は5員ヘテロアリール、例えばオキサゾリル、チアゾリル、ピラゾリル)を表し得る。一例においては、Zは、ヘテロアリールを表す。一例においては、Zは、アリールを表す。一例においては、Zは、メチル又はエチルを表さない。一例においては、Zは、置換されていないアルキルを表さない。
本開示は、式(IIIA):
の化合物、又はそのすべての互変異性体及び立体異性体を含むその薬学的に許容される塩、溶媒和物若しくは多形体である、構造(III)を有するWnt阻害剤を提供し、式中:
R1は、アルキルを表し得る;
各R2は独立して、H;アルキル;任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、C1～6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されていてもよいカルボシクリル;-NHアルキル;-N(アルキル)2;アミノ;ヒドロキシル;アルコキシ;又はハロを表し得る;
nは、0、1又は2を表し得る;
R4は、H又はアルキルを表し得る;
R5は、H又はアルキルを表し得る;
W及びXは各々独立して、C=O又はC=Sを表し得る(一部の例においては、W及びXは、両方ともC=Oである);
Yは、アリール;ヘテロアリール;任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、C1～6ハロアルキル、C1～6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているカルボシクリル;又は任意選択で、C1～6アルキル、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル及び-C(O)NHC1～6アルキルから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているヘテロシクリルを表し得る;
Zは、アルキル;アリール;ヘテロアリール;任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、C1～6ハロアルコキシ(例えばフルオロメトキシ)、C1～6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているカルボシクリル;任意選択で、C1～6アルキル、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル及び-C(O)NHC1～6アルキルから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているヘテロシクリル;カルボシクリルが、任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、C1～6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されている-アリールカルボシクリル;又はヘテロシクリルが、任意選択で、C1～6アルキル、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル及び-C(O)NHC1～6アルキルから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されている-アリールヘテロシクリルを表し得る。
R1は、アルキルを表し得る;
各R2は独立して、H;アルキル;任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、C1～6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されていてもよいカルボシクリル;-NHアルキル;-N(アルキル)2;アミノ;ヒドロキシル;アルコキシ;又はハロを表し得る;
nは、0、1又は2を表し得る;
R4は、H又はアルキルを表し得る;
R5は、H又はアルキルを表し得る;
W及びXは各々独立して、C=O又はC=Sを表し得る(一部の例においては、W及びXは、両方ともC=Oである);
Yは、アリール;ヘテロアリール;任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、C1～6ハロアルキル、C1～6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているカルボシクリル;又は任意選択で、C1～6アルキル、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル及び-C(O)NHC1～6アルキルから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているヘテロシクリルを表し得る;
Zは、アルキル;アリール;ヘテロアリール;任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、C1～6ハロアルコキシ(例えばフルオロメトキシ)、C1～6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているカルボシクリル;任意選択で、C1～6アルキル、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル及び-C(O)NHC1～6アルキルから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されているヘテロシクリル;カルボシクリルが、任意選択で、C1～6アルキル、C1～6アルコキシ、C1～6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されている-アリールカルボシクリル;又はヘテロシクリルが、任意選択で、C1～6アルキル、-C(O)OC1～6アルキル、-C(O)C1～6アルキル及び-C(O)NHC1～6アルキルから各々独立して選択される1つ若しくは複数の置換基によって置換されている-アリールヘテロシクリルを表し得る。
一例においては、R1がメチルを表し;R2がHを表し;nが1を表し;W及びXが各々、C=Oを表し;R3がHを表し;R4がHを表し;Yがイソキサゾリルを表し;Zが、任意選択で、クロロ、フルオロ、ブロモ、メチル又はメトキシによって置換されているフェニルを表す、構造(III)を有するWnt阻害剤が提供される。
一例においては、R1がメチルを表し;R2がHを表し;nが1を表し;W及びXが各々、C=Oを表し;R3がHを表し;R4がHを表し;Yがフェニルを表し;Zが、任意選択で、フルオロ、クロロ、アミノ、メチル又はメトキシによって置換されているフェニルを表す、構造(III)を有するWnt阻害剤が提供される。
一例においては、R1がメチルを表し;R2がHを表し;nが1を表し;W及びXが各々、C=Oを表し;R3がHを表し;R4がHを表し;Yがピリジニルを表し;Zが、任意選択で、フルオロ、クロロ、メチル、アミノ又はトリフルオロメチルによって置換されているピリジニルを表す、構造(III)を有するWnt阻害剤が提供される。
一例においては、R1がメチルを表し;R2がHを表し;nが1を表し;W及びXが各々、C=Oを表し;R3がHを表し;R4がHを表し;Yが、ピリダジニル、ピリミジニル又はピラジニルを表し;Zが、任意選択で、フルオロ、クロロ、メチル、アミノ又はトリフルオロメチルによって置換されているピリジニルを表す、構造(III)を有するWnt阻害剤が提供される。
一例においては、R2、R4及びR5は、すべてHであり、n=1であり、W及びXは、両方ともC=Oである。
更なる例においては、構造(III)の4-(2-メチル-6,7-ジヒドロピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-4(5H)-イル)-4-オキソ-N-(6-(ピリジン-3-イル)ピリダジン-3-イル)ブタンアミドが提供され得る。4-(2-メチル-6,7-ジヒドロピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-4(5H)-イル)-4-オキソ-N-(6-(ピリジン-3-イル)ピリダジン-3-イル)ブタンアミドという化合物名を有する構造(III)の化合物51(ETC-569)は、後に定義する構造(V)の化合物としても公知であり得る。
一例においては、Zは、トリフルオロアルキルによって置換されているフェニルではない。
一例においては、Yが、イソキサゾリルである場合、Zは、イソキサゾリル環の4位に位置しない。
構造(III)を有するWnt阻害剤の化合物の特定の(しかし、非限定的な)例を、以下に示す:
Wntシグナリング経路の阻害剤は、porcupine阻害剤であり得る。porcupine阻害剤は、Wnt-porcupine阻害剤であり得る。
porcupine阻害剤は、2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-1,2,3,6-テトラヒドロ-7H-プリン-7-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド、2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-2,3-ジヒドロ-1H-プリン-7(6H)-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド又は構造(IV)の化合物であってもよく、4-(2-メチル-6,7-ジヒドロピラゾロール[1,5-a]ピリミジン-4(5H)-イル)-4-オキソ-N-(6-(ピリジン-3-イル)ピラジジン-3-イル)ブタンアミド又は構造(V)の化合物であってもよい。porcupine阻害剤はまた、構造(I)の化合物5(ETC-159)又は構造(III)の化合物51(ETC-569)であり得る。
porcupine阻害剤は、2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-1,2,3,6-テトラヒドロ-7H-プリン-7-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド、2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-2,3-ジヒドロ-1H-プリン-7(6H)-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド又は構造(IV)の化合物であり得る。porcupine阻害剤はまた、構造(I)の化合物5(ETC-159)であり得る。porcupine阻害剤は、4-(2-メチル-6,7-ジヒドロピラゾロール[1,5-a]ピリミジン-4(5H)-イル)-4-オキソ-N-(6-(ピリジン-3-イル)ピラジジン-3-イル)ブタンアミド又は構造(V)の化合物であり得る。porcupine阻害剤は、構造(III)の化合物51(ETC-569)であり得る。
Wnt-porcupine阻害剤は、2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-1,2,3,6-テトラヒドロ-7H-プリン-7-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド、2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-2,3-ジヒドロ-1H-プリン-7(6H)-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド又は構造(IV)の化合物であってもよく、4-(2-メチル-6,7-ジヒドロピラゾロール[1,5-a]ピリミジン-4(5H)-イル)-4-オキソ-N-(6-(ピリジン-3-イル)ピラジジン-3-イル)ブタンアミド又は構造(V)の化合物であってもよい。Wnt-porcupine阻害剤はまた、構造(I)の化合物5(ETC-159)又は構造(III)の化合物51(ETC-569)であり得る。
Wnt-porcupine阻害剤は、2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-1,2,3,6-テトラヒドロ-7H-プリン-7-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド、2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-2,3-ジヒドロ-1H-プリン-7(6H)-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド又は構造(IV)の化合物であり得る。Wnt-porcupine阻害剤は、4-(2-メチル-6,7-ジヒドロピラゾロール[1,5-a]ピリミジン-4(5H)-イル)-4-オキソ-N-(6-(ピリジン-3-イル)ピラジジン-3-イル)ブタンアミド又は構造(V)の化合物であり得る。Wnt-porcupine阻害剤はまた、構造(I)の化合物5(ETC-159)であり得る。Wnt-porcupine阻害剤はまた、構造(III)の化合物51(ETC-569)であり得る。
スケールアップ及びcGMP生成に、最終的には臨床使用及び商業使用に好適な固体状態形態の薬物の開発において、目的の標的に対する許容される薬物活性レベルは、重要な変数のうちの、考慮しなければならない唯一のものである。例えば、医薬組成物の製剤において、薬学的に活性な物質が、商業的製造方法において容易に再生することができ、薬学的に活性な物質が曝露される条件に耐えるのに十分に強固である形態であることは不可避である。
製造の意味においては、商業的製造中に、薬学的に活性な物質の製造方法が、同じ製造条件を使用した場合に同じ材料が再生されるようなものであることが重要である。加えて、薬学的に活性な物質が固体形態で存在し、製造条件の若干の変化が、生成される薬学的に活性な物質の固体形態の主要な変化をもたらさないことが望ましい。例えば、製造方法は、信頼できる基礎に基づいて同じ結晶特性を有する材料を生成し、また、同じ水和レベルを有する材料を生成することが重要である。
加えて、薬学的に活性な物質が、分解、吸湿性及び後続のその固体形態への変化の両方に対して安定であることが重要である。薬学的に活性な成分の、医薬製剤への組込みを促進するために、これは重要である。薬学的に活性な物質が、それが(ゆっくりと、又は経時的に)水を吸収するという意味において吸湿性(「粘着性」)である場合、同じ投与形態を提供するのに添加するべき物質の量が、水和の程度によって大きく変動するので、薬学的に活性な物質を薬物に確実に配合することはほとんど不可能である。更に、水和又は固体形態における変動(「多形」)は、物理化学特性、例えば可溶性又は溶解速度における変化をもたらす場合があり、これは次に、患者における経口吸収の不定を引き起こし得る。
したがって、薬学的に活性な剤の化学的安定性、固体状態安定性及び「棚寿命」は、非常に重要な因子である。理想的な状況においては、薬学的に活性な剤及びそれを含有する任意の組成物は、活性成分の物理化学特性、例えばその活性、含水量、溶解特性、固体形態等における顕著な変化を示すことなく、かなりの期間にわたり有効に保存することが可能であるべきである。
本開示はまた、上記に説明する無水遊離塩基を含む医薬組成物を包含する。
本開示のモジュレーター化合物及び阻害化合物並びにモジュレーター剤及び阻害剤は、治療的に、又は予防的に組成物として投与され得る。治療適用においては、組成物は、疾患及びその合併症を治療又は少なくとも部分的に阻止するのに十分な量で、疾患を既に患っている患者に投与される。組成物は、患者を有効に治療するのに十分な量の化合物又は剤を提供するべきである。
任意の特定の患者について治療的に有効な用量レベルは、治療する障害及び障害の重症度;使用する化合物又は剤の活性;使用する組成物;患者の年齢、体重、健康状態、性別及び食事;投与時間;投与経路;剤又は化合物の隔離速度;治療期間;治療との組合せで、又は治療と同時に使用する薬物を含む様々な因子に、医薬において周知の他の関連する因子と共に、依存する。
当業者は、ルーチン実験によって、適用可能な疾患を治療するのに必要であり得る剤又は化合物の有効な非毒性量を決定することができる。
一般的には、有効な投与量は、約0.0001mg～約1000mg/体重kg/24時間の範囲内;典型的に約0.001mg～約750mg/体重kg/24時間;約0.01mg～約500mg/体重kg/24時間;約0.1mg～約500mg/体重kg/24時間;約0.1mg～約250mg/体重kg/24時間;約1.0mg～約250mg/体重kg/24時間であると予測される。より典型的には、有効な用量範囲は、約1.0mg～約200mg/体重kg/24時間;約1.0mg～約100mg/体重kg/24時間;約1.0mg～約50mg/体重kg/24時間;約1.0mg～約25mg/体重kg/24時間;約5.0mg～約50mg/体重kg/24時間;約5.0mg～約20mg/体重kg/24時間;約5.0mg～約15mg/体重kg/24時間の範囲内であると予測される。
或いは、有効な投与量は、最高で約500mg/m2であり得る。一般的には、有効な投与量は、約25～約500mg/m2、好ましくは約25～約350mg/m2、より好ましくは約25～約300mg/m2、またより好ましくは約25～約250mg/m2、更により好ましくは約50～約250mg/m2、また更により好ましくは約75～約150mg/m2の範囲内であると予測される。
典型的には、治療適用においては、治療は通常、疾患状態の持続期間の間であり得る。
更に、最適量及び個々の投与量の間隔は、治療する疾患状態の性質及び程度、投与の形態、経路及び部位、並びに治療する特定の個体の性質によって決定されることが、当業者に明らかである。更に、そのような最適条件は、従来技術によって決定することができる。
また、最適治療過程、例えば規定日数について1日当たりに与えられる組成物の用量数は、従来型の治療決定試験過程を使用して、当業者によって確認することができることは、当業者に明らかである。
一般的に、好適な組成物は、当業者に公知の方法に従って調製してもよく、したがって、薬学的に許容される担体、希釈剤及び/又は補助剤を含んでもよい。
これらの組成物は、標準の経路によって投与することができる。一般的に、組成物は、非経口(例えば静脈内、脊髄内、皮下又は筋内)、経口又は局所経路によって投与され得る。より好ましくは、投与は、非経口経路による。
担体、希釈剤及び補助剤は、組成物の他の成分と調和し、その受容者に有害でないという点で「許容される」ものでなければならない。
薬学的に許容される担体又は希釈剤の例は、鉱質除去水又は蒸留水;食塩水;植物ベースの油、例えばピーナッツ油、ベニバナ油、オリーブ油、綿実油、トウモロコシ油、ゴマ油、ラッカセイ油又はココナッツ油;ポリシロキサン、例えばメチルポリシロキサン、フェニルポリシロキサン及びメチルフェニルポリシロキサンを含むシリコーン油;揮発性シリコーン;鉱油、例えば流動パラフィン、ソフトパラフィン又はスクアラン;セルロース誘導体、例えばメチルセルロース、エチルセルロース、カルボキシメチルセルロース、カルボキシメチルセルロースナトリウム又はヒドロキシプロピルメチルセルロース;低級アルカノール、例えばエタノール又はイソプロパノール;低級アラルカノール;低級ポリアルキレングリコール又は低級アルキレングリコール、例えばポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール、エチレングリコール、プロピレングリコール、1,3-ブチレングリコール又はグリセリン;脂肪酸エステル、例えばパルミチン酸イソプロピル、ミリスチン酸イソプロピル又はオレイン酸エチル;ポリビニルピロリドン;寒天;カラゲナン;トラガカントガム又はアカシアガム及び黄色ワセリンである。典型的に、1つ又は複数の担体は、組成物の10質量%～99.9質量%を形成する。
本明細書において開示する組成物は、注射による投与に好適な形態、経口摂取に好適な製剤の形態(例えばカプセル、錠剤、キャプレット、エリキシル剤等)、吸入による、例えば鼻内吸入又は経口吸入による投与に好適なエーロゾル形態、非経口投与、すなわち、皮下、筋内又は静脈内注射に好適な形態であり得る。
注射用溶液又は懸濁液としての投与のために、非毒性の非経口で許容される希釈剤又は担体は、リンガー液、等張食塩水、リン酸緩衝食塩水、エタノール及び1,2プロピレングリコールを含み得る。
経口使用に好適な担体、希釈剤、賦形剤及び補助剤の一部の例として、ピーナッツ油、流動パラフィン、カルボキシメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、アルギン酸ナトリウム、アカシアガム、トラガカントガム、デキストロース、ショ糖、ソルビトール、マンニトール、ゼラチン及びレシチンが挙げられる。加えて、これらの経口製剤は、好適な着香剤及び着色剤を含有し得る。カプセル形態で使用される場合、カプセルは、崩壊を遅延させるグリセリルモノステアレート又はグリセリルジステアレート等の化合物でコーティングされ得る。
補助剤として典型的に、軟化薬、乳化剤、増粘剤、保存剤、殺菌剤及び緩衝剤が挙げられる。
経口投与のための固体形態は、ヒト及び獣医学的医薬の実施において許容される結合剤、甘味料、崩壊剤、希釈剤、着香料、コーティング剤、保存剤、潤滑剤及び/又は時間遅延剤を含有し得る。好適な結合剤として、アカシアガム、ゼラチン、トウモロコシデンプン、トラガカントガム、アルギン酸ナトリウム、カルボキシメチルセルロース又はポリエチレングリコールが挙げられる。好適な甘味料として、ショ糖、乳糖、ブドウ糖、アスパルテーム又はサッカリンが挙げられる。好適な崩壊剤として、トウモロコシデンプン、メチルセルロース、ポリビニルピロリドン、グアーガム、キサンタンガム、ベントナイト、アルギン酸又は寒天が挙げられる。好適な希釈剤として、乳糖、ソルビトール、マンニトール、デキストロース、カオリン、セルロース、炭酸カルシウム、ケイ酸カルシウム又はリン酸二カルシウムが挙げられる。好適な着香剤として、ペパーミント油、ヒメコウジ油、サクランボ、オレンジ又はラズベリー着香料が挙げられる。好適なコーティング剤として、アクリル酸及び/若しくはメタクリル酸並びに/若しくはそれらのエステルのポリマー若しくはコポリマー、ワックス、脂肪アルコール、ゼイン、シェラック又はグルテンが挙げられる。好適な保存剤として、安息香酸ナトリウム、ビタミンE、アルファ-トコフェロール、アスコルビン酸、メチルパラベン、プロピルパラベン又は重亜硫酸ナトリウムが挙げられる。好適な潤滑剤として、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸、オレイン酸ナトリウム、塩化ナトリウム又はタルクが挙げられる。好適な時間遅延剤として、グリセリルモノステアレート又はグリセリルジステアレートが挙げられる。
経口投与のための液体形態は、上記の剤に加えて、液体担体を含有し得る。好適な液体担体として、水、油、例えばオリーブ油、ピーナッツ油、ゴマ油、ヒマワリ油、ベニバナ油、ラッカセイ油、ココナッツ油、流動パラフィン、エチレングリコール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、エタノール、プロパノール、イソプロパノール、グリセロール、脂肪アルコール、トリグリセリド又はそれらの混合物が挙げられる。
経口投与のための懸濁液は、分散剤及び/又は懸濁剤を更に含み得る。好適な懸濁剤として、カルボキシメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ポリビニルピロリドン、アルギン酸ナトリウム又はアセチルアルコールが挙げられる。好適な分散剤として、レシチン;ステアリン酸等の脂肪酸のポリオキシエチレンエステル;ポリオキシエチレンソルビトールモノ又はジオレイン酸塩、ステアリン酸塩又はラウリン酸塩;ポリオキシエチレンソルビタンモノ又はジオレイン酸塩、ステアリン酸塩又はラウリン酸塩等が挙げられる。
経口投与のためのエマルションは、1つ又は複数の乳化剤を更に含み得る。好適な乳化剤として、上記に例示する分散剤、又は天然ガム、例えばグアーガム、アカシアガム若しくはトラガカントガムが挙げられる。
非経口で投与可能な組成物を調製するための方法は、当業者に明らかである。
組成物は、任意の好適な界面活性剤、例えばアニオン性、カチオン性又は非イオン性界面活性剤、例えばソルビタンエステル又はそのポリオキシエチレン誘導体を組み込み得る。懸濁剤、例えば天然ガム、セルロース誘導体、又は無機材料、例えばシリカ系シリカ類、及び他の成分、例えばラノリンもまた、含めてもよい。
組成物はまた、リポソームの形態で投与してもよい。リポソームは一般的に、リン脂質又は他の脂質物質に由来し、水性媒体中に分散される単層又は多層水和液体結晶によって形成される。リポソームを形成することができる任意の非毒性の生理学的に許容され、かつ代謝可能な脂質を使用することができる。リポソーム形態の組成物は、安定化剤、保存剤、賦形剤等を含有してもよい。好ましい脂質は、天然及び合成の両方である、リン脂質及びホスファチジルコリン(レシチン)である。リポソームを形成するための方法は、本分野において公知である。
経口製剤を、1つ又は複数の薬理学的に許容される成分と共に配合して、腸溶コーティングを伴う錠剤又はカプセル等を作製してもよい。そのような製剤のための方法は、当業者に周知である。腸溶コーティングは、Sandsらの、2004年8月19日公開の「Pharmaceutical formulations targeting specific regions of the gastrointestinal tract」という題名の米国特許出願公開第20040162263号において記載されているような、バイオアベイラビリティを向上させるために組成物又は活性薬物の、消化管の特定の領域への送達を向上させる腸溶コーティングであり得る。
本明細書において使用するとき、「a」、「an」及び「the」という単数形は、文脈が明らかにそうでないことを規定しない限り、複数の参照物を含む。例えば、「プライマー」という用語は、その混合物を含む複数のプライマーを含む。
本明細書において使用するとき、「約」という用語は、製剤の成分の濃度の文脈において、典型的には示される値の+/-5%、より典型的には示される値の+/-4%、より典型的には示される値の+/-3%、より典型的には示される値の+/-2%、更により典型的には示される値の+/-1%、更により典型的には示される値の+/-0.5%を意味する。時間の持続期間の文脈において使用する場合、「約」という用語は、典型的には示される時間の+/-20%、より典型的には示される時間の+/-15%、より典型的には示される時間の+/-10%、より典型的には示される時間の+/-5%、更により典型的には示される時間の+/-2%、更により典型的には示される時間の+/-1%を意味する。例えば、示される時間の持続期間が1日である場合、「約1日」という用語は、1日+/-0～6時間を指し得る。別の例として、示される時間の持続期間が1時間である場合、「約1時間」という用語は、1時間+/-0～10分間を指し得る。
本開示全体を通して、ある特定の例が、範囲形式で開示され得る。範囲形式の説明は単に便利及び簡潔さのためであり、開示される範囲に対する変更不可能な限定として解釈されるべきではないことが理解されるべきである。したがって、範囲の説明は、特に開示されるすべての可能な下位範囲及びその範囲内の個々の数値を有すると考えられるべきである。例えば、1～6等の範囲の説明は、特に開示される下位範囲、例えば1～3、1～4、1～5、2～4、2～6、3～6等並びにその範囲内の個々の数、例えば1、2、3、4、5及び6を有すると考えられるべきである。これは、範囲の広さにかかわらず適用される。
本明細書において例示的に説明する本発明は、好適に、本明細書において具体的に開示されていない任意の1つ又は複数の要素、1つ又は複数の限定の非存在下において実施され得る。したがって、例えば、「～を含む(comprising)」、「～を含む(including)」、「～を含有する(containing)」等の用語は、拡張的に、かつ限定することなく解釈されるべきである。加えて、本明細書において用いる上記用語及び表現は、説明の用語として、限定の用語としてではなく、使用されており、そのような用語及び表現の使用において、示され、説明される特徴又はその部分の任意の均等物を除外する意図はないが、様々な改変が、特許請求に係る本発明の範囲内で可能であることが認識される。したがって、本発明は好ましい実施形態によって具体的に開示されているが、本明細書において開示するその中で具体化される本発明の任意選択の特徴、改変及び変形形態に、当業者は頼ることができ、そのような改変及び変形形態は、本発明の範囲内であると考えられることが理解されるべきである。
本発明は、本明細書において広く、一般的に説明されている。一般的な開示内に入る、より狭い種及び亜属の分類の各々はまた、本発明の部分を形成する。これは、切除された材料が本明細書において具体的に列挙されるかどうかにかかわらず、部類から任意の主題を除去するという条件付き又は消極的限定の、本発明の一般的な説明を含む。
他の実施形態は、以下の特許請求の範囲及び非限定的な実施例の範囲内にある。加えて、本発明の特徴又は態様がマーカッシュ群において説明される場合、当業者は、本発明がまた、それによってマーカッシュ群の任意の個々のメンバー又はメンバーの下位群において説明されることを認識する。
(実施例1)
単一化PTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物陽性コントロール検証のためのPCRプロトコル
単一化PTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物陽性コントロール検証のためのPCRプロトコル
PCR試薬
SuperScript III Platinum一段階定量的RT-PCRシステム(100反応用のカタログ番号11732-020、500反応用のカタログ番号11732-088、Invitrogen社)
SuperScript III Platinum一段階定量的RT-PCRシステム(100反応用のカタログ番号11732-020、500反応用のカタログ番号11732-088、Invitrogen社)
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 1(表2)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 1(表2)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件
データ分析
PTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、PTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。内部コントロールプラスミド100コピーを各試料に添加する。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の増幅プロットを図4A及び図4Bに示し、それぞれのCt値は各増幅プロットの下に示した。
(実施例2)
単一化PTPRK(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及びヒト全RNA中におけるPTPRK(e1/e2)野生型の単一化検出
単一化PTPRK(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及びヒト全RNA中におけるPTPRK(e1/e2)野生型の単一化検出
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 4(表5)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 4(表5)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
PTPRK(e1/e2)野生型の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、PTPRK(e1/e2)野生型を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。内部コントロールプラスミド100コピーを各試料に添加する。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の増幅プロットを図5A及び図5Bに示し、ヒト全RNAを含有する試料中のPTPRK(e1/e2)野生型及び内部コントロールの増幅プロットを図5C及び図5Dに示す。各Ct値は、各増幅プロットの下に示す。
(実施例3)
単一化RSPO3(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及びヒト全RNA中におけるRSPO3(e1/e2)野生型の単一化検出
単一化RSPO3(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及びヒト全RNA中におけるRSPO3(e1/e2)野生型の単一化検出
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 6(表7)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 6(表7)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
RSPO3(e1/e2)野生型の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、RSPO3(e1/e2)野生型を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。内部コントロールプラスミド100コピーを各試料に添加する。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の増幅プロットを図6A及び図6Bに示し、ヒト全RNAを含有する試料中のRSPO3(e1/e2)野生型及び内部コントロールの増幅プロットを図6C及び図6Dに示す。各Ct値は、各増幅プロットの下に示す。
(実施例4)
多重化PTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物陽性コントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
多重化PTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物陽性コントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 8(表9)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 8(表9)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
PTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、PTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の多重化増幅プロットを図7A及び図7Cに示す。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の単一化増幅プロットを図7B及び図7Dに示す。各Ct値は、増幅プロットの下に示す。多重化増幅反応を使用して得られたCt値と単一化増幅反応を使用して得られたCt値の間の差はΔCtによって表され、また表に含まれる。PTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物の検出のために算出された平均ΔCt値は-2.44で、1プラスミドコピー/μlの試料のCt値は算出から除外する。内部コントロールの検出のために算出された平均ΔCt値は-0.41である。
(実施例5)
多重化PTPRK(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
多重化PTPRK(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 10(表11)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 10(表11)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
PTPRK(e1/e2)野生型の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、PTPRK(e1/e2)野生型を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。内部コントロールプラスミド100コピーを各試料に添加する。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の多重化増幅プロットを図8A及び図8Cに示す。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の単一化増幅プロットを図8B及び図8Dに示す。各Ct値は、増幅プロットの下に示す。多重化増幅反応を使用して得られたCt値と単一化増幅反応を使用して得られたCt値の間の差はΔCtによって表され、また表に含まれる。PTPRK(e1/e2)野生型の検出のために算出された平均ΔCt値は-1.47で、1プラスミドコピー/μlの試料のCt値は算出から除外する。内部コントロールの検出のために算出された平均ΔCt値は-0.07である。
(実施例6)
多重化RSPO3(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
多重化RSPO3(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 12(表13)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 12(表13)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
RSPO3(e1/e2)野生型の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、RSPO3(e1/e2)野生型を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の多重化増幅プロットを図9A及び図9Cに示す。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の単一化増幅プロットを図9B及び図9Dに示す。各Ct値は、増幅プロットの下に示す。多重化増幅反応を使用して得られたCt値と単一化増幅反応を使用して得られたCt値の間の差はΔCtによって表され、また表に含まれる。RSPO3(e1/e2)野生型の検出のために算出された平均ΔCt値は-0.31で、内部コントロールの検出のために算出された平均ΔCt値は0.20である。
(実施例7)
ヒト全RNA中のPTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e1/e2)野生型及びRSPO3(e1/e2)野生型の多重化検出のためのPCRプロトコル並びに単一化プロトコルとの比較
ヒト全RNA中のPTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e1/e2)野生型及びRSPO3(e1/e2)野生型の多重化検出のためのPCRプロトコル並びに単一化プロトコルとの比較
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 14(表15)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 14(表15)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
ヒト全RNAを含有する試料中のPTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e1/e2)野生型及びRSPO3(e1/e2)野生型並びに内部コントロールの多重化検出の増幅プロットを図10Aに示す。PTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e1/e2)野生型及びRSPO3(e1/e2)野生型の単一化反応のそれぞれの増幅プロットを図10B～図10Dに示す。各Ct値は、増幅プロットの下に示す。多重化増幅反応を使用して得られたCt値と単一化増幅反応を使用して得られたCt値の間の差はΔCtによって表され、また表に含まれる。
(実施例8)
CR3150腫瘍RNA中のPTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e1/e2)野生型及びRSPO3(e1/e2)野生型の多重化検出のためのPCRプロトコル並びに単一化プロトコルとの比較
CR3150腫瘍RNA中のPTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e1/e2)野生型及びRSPO3(e1/e2)野生型の多重化検出のためのPCRプロトコル並びに単一化プロトコルとの比較
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 16(表17)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 16(表17)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
CR3150腫瘍RNAを含有する試料中のPTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e1/e2)野生型及びRSPO3(e1/e2)野生型並びに内部コントロールの多重化検出の増幅プロットを図11Aに示す。PTPRK(e1)+RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e1/e2)野生型及びRSPO3(e1/e2)野生型の単一化反応のそれぞれの増幅プロットを図11B～図11Dに示す。各Ct値は、増幅プロットの下に示す。多重化増幅反応を使用して得られたCt値と単一化増幅反応を使用して得られたCt値の間の差はΔCtによって表され、また表に含まれる。
(実施例9)
多重化PTPRK(e7)+RSPO3(e2)融合物陽性コントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
多重化PTPRK(e7)+RSPO3(e2)融合物陽性コントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 18(表19)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 18(表19)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
PTPRK(e7)+RSPO3(e2)融合物の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、PTPRK(e7)+RSPO3(e2)融合物を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。内部コントロールプラスミド100コピーを各試料に添加する。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の多重化増幅プロットを図12A及び図12Cに示す。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の単一化増幅プロットを図12B及び図12Dに示す。各Ct値は、増幅プロットの下に示す。多重化増幅反応を使用して得られたCt値と単一化増幅反応を使用して得られたCt値の間の差はΔCtによって表され、また表に含まれる。PTPRK(e7)+RSPO3(e2)融合物の検出のために算出された平均ΔCt値は-1.14で、1プラスミドコピー/μlの試料のCt値は算出から除外する。内部コントロールの検出のために算出された平均ΔCt値は-0.58である。
(実施例10)
多重化PTPRK(e7/e8)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
多重化PTPRK(e7/e8)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 20(表21)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 20(表21)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
PTPRK(e7/e8)野生型の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、PTPRK(e7/e8)野生型を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。内部コントロールプラスミド100コピーを各試料に添加する。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の多重化増幅プロットを図13A及び図13Cに示す。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の単一化増幅プロットを図13B及び図13Dに示す。各Ct値は、増幅プロットの下に示す。多重化増幅反応を使用して得られたCt値と単一化増幅反応を使用して得られたCt値の間の差はΔCtによって表され、また表に含まれる。PTPRK(e7/e8)野生型の検出のために算出された平均ΔCt値は-0.23で、1プラスミドコピー/μlの試料のCt値は算出から除外する。内部コントロールの検出のために算出された平均ΔCt値は-0.55である。
(実施例11)
多重化RSPO3(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
多重化RSPO3(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 22(表23)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 22(表23)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
RSPO3(e1/e2)野生型の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、RSPO3(e1/e2)野生型を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。内部コントロールプラスミド100コピーを各試料に添加する。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の多重化増幅プロットを図14A及び図14Cに示す。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の単一化増幅プロットを図14B及び図14Dに示す。各Ct値は、増幅プロットの下に示す。多重化増幅反応を使用して得られたCt値と単一化増幅反応を使用して得られたCt値の間の差はΔCtによって表され、また表に含まれる。RSPO3(e1/e2)野生型の検出のために算出された平均ΔCt値は-0.73で、1プラスミドコピー/μlの試料のCt値は算出から除外する。内部コントロールの検出のために算出された平均ΔCt値は-0.18である。
(実施例12)
ヒト全RNA中のPTPRK(e7)+RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7/e8)野生型及びRSPO3(e1/e2)野生型の多重化検出のためのPCRプロトコル並びに単一化プロトコルとの比較
ヒト全RNA中のPTPRK(e7)+RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7/e8)野生型及びRSPO3(e1/e2)野生型の多重化検出のためのPCRプロトコル並びに単一化プロトコルとの比較
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 24(表25)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 24(表25)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
ヒト全RNAを含有する試料中のPTPRK(e7)+RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7/e8)野生型及びRSPO3(e1/e2)野生型並びに内部コントロールの多重化検出の増幅プロットを図15Aに示す。PTPRK(e7)+RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7/e8)野生型及びRSPO3(e1/e2)野生型の単一化反応のそれぞれの増幅プロットを図15B～図15Dに示す。各Ct値は、増幅プロットの下に示す。多重化増幅反応を使用して得られたCt値と単一化増幅反応を使用して得られたCt値の間の差はΔCtによって表され、また表に含まれる。
(実施例13)
多重化PTPRK(e13)+RSPO3(e2)融合物陽性コントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
多重化PTPRK(e13)+RSPO3(e2)融合物陽性コントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 26(表27)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 26(表27)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
PTPRK(e13)+RSPO3(e2)融合物の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、PTPRK(e13)+RSPO3(e2)融合物を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。内部コントロールプラスミド100コピーを各試料に添加する。多重化増幅反応を使用して得られたCt値と単一化増幅反応を使用して得られたCt値の間の差はΔCtによって表され、また表に含まれる。PTPRK(e13)+RSPO3(e2)融合物の検出のために算出された平均ΔCt値は-0.33で、1プラスミドコピー/μlの試料のCt値は算出から除外する。内部コントロールの検出のために算出された平均ΔCt値は0.01である。
(実施例14)
多重化PTPRK(e12-e14)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
多重化PTPRK(e12-e14)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル及び単一化プロトコルとの比較
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 28(表29)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 28(表29)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
PTPRK(e12-e14)野生型の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、PTPRK(e12-e14)野生型を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。内部コントロールプラスミド100コピーを各試料に添加する。各Ct値は、増幅プロットの下に示す。多重化増幅反応を使用して得られたCt値と単一化増幅反応を使用して得られたCt値の間の差はΔCtによって表され、また表に含まれる。PTPRK(e12-e14)野生型の検出のために算出された平均ΔCt値は0.25である。内部コントロールの検出のために算出された平均ΔCt値は0.07である。
(実施例15)
ヒト全RNA中のPTPRK(e13)+RSPO3(e2)融合物及びPTPRK(e12-e14)野生型の多重化検出のためのPCRプロトコル並びに単一化プロトコルとの比較
ヒト全RNA中のPTPRK(e13)+RSPO3(e2)融合物及びPTPRK(e12-e14)野生型の多重化検出のためのPCRプロトコル並びに単一化プロトコルとの比較
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 30(表31)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 30(表31)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
多重化増幅反応を使用して得られたCt値と単一化増幅反応を使用して得られたCt値の間の差はΔCtによって表され、また表に含まれる。
(実施例16)
CR2506腫瘍RNA中のPTPRK(e13)+RSPO3(e2)融合物及びPTPRK(e12-e14)野生型の多重化検出のためのPCRプロトコル並びに単一化プロトコルとの比較
CR2506腫瘍RNA中のPTPRK(e13)+RSPO3(e2)融合物及びPTPRK(e12-e14)野生型の多重化検出のためのPCRプロトコル並びに単一化プロトコルとの比較
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 32(表33)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 32(表33)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
各Ct値は、増幅プロットの下に示す。多重化増幅反応を使用して得られたCt値と単一化増幅反応を使用して得られたCt値の間の差はΔCtによって表され、また表に含まれる。
(実施例17)
単一化EIF3E(e1)+RSPO2(e2)融合物陽性コントロール検証のためのPCRプロトコル
単一化EIF3E(e1)+RSPO2(e2)融合物陽性コントロール検証のためのPCRプロトコル
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 34(表35)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 34(表35)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
EIF3E(e1)+RSPO2(e2)融合物の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、EIF3E(e1)+RSPO2(e2)融合物を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。内部コントロールプラスミド100コピーを各試料に添加する。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の増幅プロットを図16A及び図16Bに示し、それぞれのCt値は各増幅プロットの下に示した。
(実施例18)
単一化EIF3E(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル
単一化EIF3E(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 36(表37)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 36(表37)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
EIF3E(e1/e2)野生型の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、EIF3E(e1/e2)野生型を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。内部コントロールプラスミド100コピーを各試料に添加する。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の増幅プロットを図17A及び図17Bに示し、それぞれのCt値は各増幅プロットの下に示した。
(実施例19)
単一化RSPO2(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル
単一化RSPO2(e1/e2)野生型陽性プラスミドコントロール検証のためのPCRプロトコル
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 38(表39)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 38(表39)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
RSPO2(e1/e2)野生型の増幅曲線を作成するために、陽性コントロールプラスミドの試料が陽性コントロールプラスミドの1000、100、10及び1コピーをそれぞれ含有するように、RSPO2(e1/e2)野生型を含有する陽性コントロールプラスミドの連続希釈を実施する。内部コントロールプラスミド100コピーを各試料に添加する。連続希釈した陽性コントロールプラスミド及び内部コントロールを含有する試料の増幅プロットを図18A及び図18Bに示し、それぞれのCt値は各増幅プロットの下に示した。
(実施例23)
ヒト全RNA中のEIF3E(e1)+RSPO2(e2)融合物、EIF3E(e1/e2)野生型及びRSPO2(e1/e2)野生型の多重化検出のためのPCRプロトコル
ヒト全RNA中のEIF3E(e1)+RSPO2(e2)融合物、EIF3E(e1/e2)野生型及びRSPO2(e1/e2)野生型の多重化検出のためのPCRプロトコル
使用したPCR試薬は実施例1と同じである。
マスターミックス調製
PCR反応用のマスターミックスは、Table 40(表41)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
PCR反応用のマスターミックスは、Table 40(表41)に記載したように調製される(反応量=25μl)。
RT-PCRサイクリング条件は実施例1と同じである。
データ分析
ヒト全RNAを含有する試料中のEIF3E(e1)+RSPO2(e2)融合物、EIF3E(e1/e2)野生型及びRSPO2(e1/e2)野生型並びに内部コントロールの多重化検出の増幅プロットを図19A及び図19Bに示す。各Ct値は、増幅プロットの下に示す。
結果分析のための諾否の基準を確立するために使用した方法の例を以下の実施例において提供する。
(実施例24)
操作コントロール許容基準
操作コントロール許容基準
結果分析で使用するための許容可能な操作Ct値の例をここに挙げる。
*特に記載がない限り、許容可能な値は規定した値内で、規定した値を含む。増幅無しはCt>42を意味する。
陽性コントロール(PC)については、各PC反応のFAM、TxRd及びCy5シグナルがCt範囲内であることを確実にする。Ct値が許容範囲外の場合、実施例25に進む。
鋳型無しコントロール(NTC)
FAM、TxRd及びCy5反応において、各NTC反応が増幅無し(すなわち、Ct>42)を示すことを確実にする(増幅があれば汚染を意味する)。任意のNTCアッセイがFAM、TxRd及び/又はCy5チャネルにおいて増幅を示す場合、すなわち、Ct値が42未満か、42と等しい場合、実施例25に進む。
FAM、TxRd及びCy5反応において、各NTC反応が増幅無し(すなわち、Ct>42)を示すことを確実にする(増幅があれば汚染を意味する)。任意のNTCアッセイがFAM、TxRd及び/又はCy5チャネルにおいて増幅を示す場合、すなわち、Ct値が42未満か、42と等しい場合、実施例25に進む。
内部コントロール(IC)
この反応は融合物/WTアッセイ反応より劣っていることがあるので、PCウェルのIC(HEX)増幅は評価しないものとする。各NTC反応が範囲内であるHEXチャネル(IC)のCt値を示すことを確実にする。任意のNTC反応が許容範囲外のHEX値を有する場合、操作は操作コントロール許容基準を満たさず、操作者は実施例25に進めなければならない。操作コントロールがすべて許容範囲内の場合、実施例26に進む。
この反応は融合物/WTアッセイ反応より劣っていることがあるので、PCウェルのIC(HEX)増幅は評価しないものとする。各NTC反応が範囲内であるHEXチャネル(IC)のCt値を示すことを確実にする。任意のNTC反応が許容範囲外のHEX値を有する場合、操作は操作コントロール許容基準を満たさず、操作者は実施例25に進めなければならない。操作コントロールがすべて許容範囲内の場合、実施例26に進む。
(実施例25)
操作コントロール再試験基準
操作コントロールが実施例24で規定した基準を満たさなかった場合、使用者は以下に記載したように進めなければならない。再試験の詳細を実行し、必要ならば、調査及び判断理由の詳細を試験報告書に付録として添えるものとする。必要ならば、偏差を記録する。
操作コントロール再試験基準
操作コントロールが実施例24で規定した基準を満たさなかった場合、使用者は以下に記載したように進めなければならない。再試験の詳細を実行し、必要ならば、調査及び判断理由の詳細を試験報告書に付録として添えるものとする。必要ならば、偏差を記録する。
陽性コントロール(PC)
FAM、TxRd及びCy5Ct値が任意の反応の規定から外れる場合、全操作は無効で、反復しなければならない。無効な操作を記録し、失敗が体系的と思われる場合(偶発的な場合とは対照的に)、失敗の原因を調査して記録する。調査はまた、研究は反復すべきか、又は問題が露見した点から継続することができるかも考慮する。
FAM、TxRd及びCy5Ct値が任意の反応の規定から外れる場合、全操作は無効で、反復しなければならない。無効な操作を記録し、失敗が体系的と思われる場合(偶発的な場合とは対照的に)、失敗の原因を調査して記録する。調査はまた、研究は反復すべきか、又は問題が露見した点から継続することができるかも考慮する。
無効な操作を2回反復してもよい。同じFAM、TxRd及びC5Ct値が規定から外れたままの場合、原因は体系的と考えられ、したがって調査する。反復操作が異なる理由、例えば、NTC汚染のために失敗した場合、その失敗は本来の失敗理由のために実施され得る反復の数に加算しないものとする。
鋳型無しコントロール(NTC)
任意のNTC反応で、増幅がFAM、TxRd及び/又はCy5チャネルでCt42の前に(又はCt42で)検出される場合、全操作は無効と考えられる。無効な操作を記録し、失敗が体系的と思われる場合(偶発的な場合とは対照的に)、失敗の原因を調査して記録する。調査はまた、研究は反復すべきか、又は問題が露見した点から継続することができるかも考慮する。
任意のNTC反応で、増幅がFAM、TxRd及び/又はCy5チャネルでCt42の前に(又はCt42で)検出される場合、全操作は無効と考えられる。無効な操作を記録し、失敗が体系的と思われる場合(偶発的な場合とは対照的に)、失敗の原因を調査して記録する。調査はまた、研究は反復すべきか、又は問題が露見した点から継続することができるかも考慮する。
無効な操作を2回反復してもよい。同じFAM、TxRd及び/又はCy5汚染が残存する場合、原因は体系的と考えられ、したがって調査する。反復操作が異なる理由、例えば、PC失敗のために失敗した場合、その失敗は本来の失敗理由のために実施され得る反復の数に加算しないものとする。
内部コントロール(IC)
NTCにおいてIC(HEX)Ct値が規定を外れている場合、反応は無効である。この反応によるデータは使用することができず、全操作は無効と考えられる。無効な操作を記録し、失敗が体系的と思われる場合(偶発的な場合とは対照的に)、失敗の原因を調査して記録する。調査はまた、研究は反復すべきか、又は問題が露見した点から継続することができるかも考慮する。
NTCにおいてIC(HEX)Ct値が規定を外れている場合、反応は無効である。この反応によるデータは使用することができず、全操作は無効と考えられる。無効な操作を記録し、失敗が体系的と思われる場合(偶発的な場合とは対照的に)、失敗の原因を調査して記録する。調査はまた、研究は反復すべきか、又は問題が露見した点から継続することができるかも考慮する。
無効な操作を2回反復してもよい。同じIC(HEX)Ctが規定から外れたままの場合、原因は体系的と考えられ、したがって調査する。反復操作が異なる理由、例えば、PC失敗のために失敗した場合、その失敗は本来の失敗理由のために実施され得る反復の数に加算しないものとする。
(実施例26)
試料許容基準
試料を含有する反応が有効であることを確認するために、以下に記載したように調べるべきである。
試料許容基準
試料を含有する反応が有効であることを確認するために、以下に記載したように調べるべきである。
試料:PTPRK WT反応許容基準
各試料のPTPRK WT反応TxRd Ct値が範囲内であることを確認し、アッセイに過剰に添加されておらず、使用されたDNAが不十分ではないことを検証する。Ct値が範囲内である場合、試料PTPRK WT反応許容基準は満たされており、試料融合反応は評価することができる。操作者は以下の項目「試料:融合アッセイ許容基準」に進むべきである。Ct値が許容範囲を外れる場合、その試料を使用する反応はすべて無効であり、データは使用することはできない。操作者は実施例27の再試験基準に進むべきである。
各試料のPTPRK WT反応TxRd Ct値が範囲内であることを確認し、アッセイに過剰に添加されておらず、使用されたDNAが不十分ではないことを検証する。Ct値が範囲内である場合、試料PTPRK WT反応許容基準は満たされており、試料融合反応は評価することができる。操作者は以下の項目「試料:融合アッセイ許容基準」に進むべきである。Ct値が許容範囲を外れる場合、その試料を使用する反応はすべて無効であり、データは使用することはできない。操作者は実施例27の再試験基準に進むべきである。
試料:RSPO3 WT反応許容基準
*特に記載がない限り、許容可能な値は規定した値内で、規定した値を含む。
各試料のRSPO3 WT反応Cy5 Ct値が範囲内であることを確認し、上記の表に示した。Cy5 Ct値が範囲内である場合、試料RSPO3 WT反応許容基準は満たされており、試料融合反応は評価することができる。操作者は以下の項目「試料:融合アッセイ許容基準」に進むべきである。Cy5 Ct値が許容範囲を外れるが、TxRd Ct値が上記に示した範囲内にある場合、その試料を使用する反応はすべて依然として有効であり、データは使用される。操作者は以下の項目「試料:融合アッセイ許容基準」に進むべきである。Cy5 Ct値が許容範囲を外れ、TxRd Ct値もPTPRK WT反応ミックスの許容範囲を外れる場合、その試料を使用する反応はすべて無効であり、データは使用することができない。操作者は実施例27の再試験基準に進むべきである。
試料:融合アッセイ許容基準
*許容可能な値は、規定した値内で、規定した値を含む。
FAM Ctが上記表で述べた許容可能な範囲を上回るか、又はFAM増幅がない場合、操作者は以下の項目「試料:内部コントロール(HEX)許容基準」に進みIC(HEX)を評価するべきである。IC(HEX)が有効な場合、結果は「変異は検出されない」と考えられる。これらの試料は反復せず、統計学的分析を支持するデータセットに利用される。
試料:内部コントロール(HEX)許容基準
FAM/TxRd/Cy5反応における陽性増幅の反応について(すなわち、Ct≦42)、FAM/TxRd/Cy5反応よりも劣っている可能性があるので、IC HEX Ctは必ずしも規定範囲内ではない。FAM、TxRd及びCy5増幅がない場合、HEX Ct値は規定範囲内にあるはずであり、そうでなければ反応は失敗と考えられ、以下の実施例27で記載した再試験基準の対象となる。
FAM/TxRd/Cy5反応における陽性増幅の反応について(すなわち、Ct≦42)、FAM/TxRd/Cy5反応よりも劣っている可能性があるので、IC HEX Ctは必ずしも規定範囲内ではない。FAM、TxRd及びCy5増幅がない場合、HEX Ct値は規定範囲内にあるはずであり、そうでなければ反応は失敗と考えられ、以下の実施例27で記載した再試験基準の対象となる。
(実施例27)
試料再試験基準
試料:PTPRK WT反応再試験基準
試料が実施例26で規定した基準を満たさなかった場合、使用者は以下に記載したように進めるべきである。再試験の詳細を実施し、必要ならば、調査及び判断理由の詳細を試験報告書に付録として添えるものとする。必要ならば、偏差を記録する。無効な試料はもう1回再試験してもよい。同じTxRd Ctが規定を外れたままの場合、試料は元の希釈していない100%融合物標準を使用して再度製造され、再試験しなければならない。反復操作が異なる理由、例えば、NTC汚染のために失敗した場合、その失敗は本来の失敗理由のために実施され得る反復の数に加算しないものとする。
試料再試験基準
試料:PTPRK WT反応再試験基準
試料が実施例26で規定した基準を満たさなかった場合、使用者は以下に記載したように進めるべきである。再試験の詳細を実施し、必要ならば、調査及び判断理由の詳細を試験報告書に付録として添えるものとする。必要ならば、偏差を記録する。無効な試料はもう1回再試験してもよい。同じTxRd Ctが規定を外れたままの場合、試料は元の希釈していない100%融合物標準を使用して再度製造され、再試験しなければならない。反復操作が異なる理由、例えば、NTC汚染のために失敗した場合、その失敗は本来の失敗理由のために実施され得る反復の数に加算しないものとする。
試料: RSPO3 WT反応再試験基準
試料が実施例26で規定した基準を満たさなかった場合、使用者は以下に記載したように進めるべきである。再試験の詳細を実施し、必要ならば、調査及び判断理由の詳細を試験報告書に付録として添えるものとする。必要ならば、偏差を記録する。無効な試料はもう1回再試験してもよい。同じCy5及びTxRd Ct値が規定を外れたままの場合、試料は元の希釈していない100%融合物標準を使用して再度製造され、再試験しなければならない。反復操作が異なる理由、例えば、NTC汚染のために失敗した場合、その失敗は本来の失敗理由のために実施され得る反復の数に加算しないものとする。
試料が実施例26で規定した基準を満たさなかった場合、使用者は以下に記載したように進めるべきである。再試験の詳細を実施し、必要ならば、調査及び判断理由の詳細を試験報告書に付録として添えるものとする。必要ならば、偏差を記録する。無効な試料はもう1回再試験してもよい。同じCy5及びTxRd Ct値が規定を外れたままの場合、試料は元の希釈していない100%融合物標準を使用して再度製造され、再試験しなければならない。反復操作が異なる理由、例えば、NTC汚染のために失敗した場合、その失敗は本来の失敗理由のために実施され得る反復の数に加算しないものとする。
試料:融合アッセイ再試験基準
試料が実施例26で規定した基準を満たさなかった場合、使用者は以下に記載したように進めるべきである。再試験の詳細を実施し、必要ならば、調査及び判断理由の詳細を試験報告書に付録として添えるものとする。必要ならば、偏差を記録する。無効な試料はもう1回再試験してもよい。同じFAM Ct値が規定を外れたままの場合、試料は元の希釈していない100%融合物標準を使用して再度製造され、再試験しなければならない。反復操作が異なる理由、例えば、NTC汚染のために失敗した場合、その失敗は本来の失敗理由のために実施され得る反復の数に加算しないものとする。
試料が実施例26で規定した基準を満たさなかった場合、使用者は以下に記載したように進めるべきである。再試験の詳細を実施し、必要ならば、調査及び判断理由の詳細を試験報告書に付録として添えるものとする。必要ならば、偏差を記録する。無効な試料はもう1回再試験してもよい。同じFAM Ct値が規定を外れたままの場合、試料は元の希釈していない100%融合物標準を使用して再度製造され、再試験しなければならない。反復操作が異なる理由、例えば、NTC汚染のために失敗した場合、その失敗は本来の失敗理由のために実施され得る反復の数に加算しないものとする。
試料:内部コントロール(HEX)再試験基準
試料が実施例26で規定した基準を満たさなかった場合、使用者は以下に記載したように進めるべきである。再試験の詳細を実施し、必要ならば、調査及び判断理由の詳細を試験報告書に付録として添えるものとする。必要ならば、偏差を記録する。FAM、TxRd及びCy5増幅がなく(すなわち、Ct>42)、IC(HEX)Ct値が範囲外の場合、これらの反応は失敗で、これらの反応のデータは使用することができない。無効な試料はもう1回再試験してもよい。IC (HEX) Ctが規定を外れたままの場合、試料は元の希釈していない100%変異標準を使用して再度製造し、再試験しなければならない。反復操作が異なる理由、例えば、PC失敗のために失敗した場合、その失敗は本来の失敗理由のために実施され得る反復の数に加算しないものとする。
試料が実施例26で規定した基準を満たさなかった場合、使用者は以下に記載したように進めるべきである。再試験の詳細を実施し、必要ならば、調査及び判断理由の詳細を試験報告書に付録として添えるものとする。必要ならば、偏差を記録する。FAM、TxRd及びCy5増幅がなく(すなわち、Ct>42)、IC(HEX)Ct値が範囲外の場合、これらの反応は失敗で、これらの反応のデータは使用することができない。無効な試料はもう1回再試験してもよい。IC (HEX) Ctが規定を外れたままの場合、試料は元の希釈していない100%変異標準を使用して再度製造し、再試験しなければならない。反復操作が異なる理由、例えば、PC失敗のために失敗した場合、その失敗は本来の失敗理由のために実施され得る反復の数に加算しないものとする。
(実施例28)
試料融合物状態の割当
操作が一旦許容基準を満たしたら、試料融合物状態は以下に記載したように定義される。
試料融合物状態の割当
操作が一旦許容基準を満たしたら、試料融合物状態は以下に記載したように定義される。
ΔCtの算出
全融合反応について、以下の式を用いてΔCt値を算出する。
ΔCt=Ct融合反応-CtPTPRK WT反応
全融合反応について、以下の式を用いてΔCt値を算出する。
ΔCt=Ct融合反応-CtPTPRK WT反応
ΔCt値を提供されたアッセイカットオフ値と比較する。ΔCt値がカットオフを下回るか、同等の場合、「融合物は検出された」ものとする。ΔCt値が規定した範囲を下回る場合、すなわち陰性ΔCt値の場合、「融合物は検出された」ものとする。ΔCt値がカットオフを上回る場合、「融合物は検出されなかった」ものとする。
Claims (26)
- 配列番号6の配列を有するフォワードプライマー、及び配列番号7の配列を有するリバースプライマーを含む、PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を増幅することができるプライマー対、
配列番号54もしくは配列番号53の配列を有するプローブ、
野生型PTPRK及び/若しくは野生型RSPO3配列を増幅することができるコントロールプライマー対、並びに/又は
合成オリゴヌクレオチド内部コントロール鋳型配列、及び合成内部コントロール鋳型配列を増幅することができる内部コントロールプライマー対
を含む、Wntシグナリング経路の阻害剤による治療に感受性の悪性腫瘍を患う対象を特定するための多重化増幅反応キット。 - 1つ若しくは複数のR-スポンジン遺伝子融合物を増幅することができるプライマー対であって、R-スポンジン遺伝子融合物が、PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物若しくはEIF3E(e1)-RSPO2(e2)融合物である、プライマー対、
野生型PTPRK、野生型EIF3E、野生型RSPO2及び/若しくは野生型RSPO3配列を増幅することができるコントロールプライマー対、並びに/又は
合成オリゴヌクレオチド内部コントロール鋳型配列、及び1つ若しくは複数の合成内部コントロール鋳型配列を増幅することができる内部コントロールプライマー対
を含む1つ又は複数の追加の多重化増幅反応
を更に含む、請求項1に記載のキット。 - リアルタイム定量ポリメラーゼ連鎖反応を実行するための試薬を更に含む、請求項1に記載のキット。
- Wnt阻害剤が、構造(I):
R1、R2、R3、R4及びR5は各々独立して、H又はアルキル基であり;
Dは、H、ハロゲン、アルキル、シクロアルキル、アリール及びジアルキルアミノからなる群から選択され、各々(H及びハロゲン以外)は、任意選択で置換され;
Arは、任意選択で置換されているアリール又はヘテロアリール基であり;
Cyは、少なくとも1つのヘテロ原子を含有するアリール、ヘテロアリール又は飽和環であり、各々は、任意選択で置換され;
nは、1～3の整数であり、
n=1である場合、R3及びR4のうちの1つはメチルであり、他方はHであり、化合物の立体化学は、部分構造(II):
を有する、請求項1に記載のキット。 - Wnt阻害剤が、構造(III):
R1は、H;任意選択で置換されているアルキル(任意選択の置換基は、C1-6アルコキシ、NH2、-NHC1-3アルキル及び-N(C1-3アルキル)2から各々独立して選択される1つ又は複数の置換基を含む);-C(O)Oアルキル;ハロアルキル;ハロアルコキシ;又は-アルキルアリールを表し;
各R2は独立して、H;任意選択で置換されているアルキル(任意選択の置換基は、C1-6アルコキシ、NH2、-NHC1-3アルキル及び-N(C1-3アルキル)2から各々独立して選択される1つ又は複数の置換基を含む);-アルキルアリール;任意選択で置換されているカルボシクリル(任意選択の置換基は、C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、C1-6ハロアルキル、C1-6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ又は複数の置換基を含む);任意選択で置換されているヘテロシクリル(任意選択の置換基は、C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、-C(O)OC1-6アルキル、-C(O)C1-6アルキル及び-C(O)NHC1-6アルキルから各々独立して選択される1つ又は複数の置換基を含む);-NHアルキル;-N(アルキル)2;アミノ;ヒドロキシル;アルコキシ又はハロを表し;
nは、0、1又は2を表し;
R3は、H又はアルキルを表し;
R4は、H又はアルキルを表し;
R5は、H又はアルキルを表し;
W及びXは各々独立して、C=O;C=S;又はCH2を表し;
Yは、アリール;ヘテロアリール;任意選択で置換されているカルボシクリル(任意選択の置換基は、C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、C1-6ハロアルキル、C1-6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ又は複数の置換基を含む);又は任意選択で置換されているヘテロシクリル(任意選択の置換基は、C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、-C(O)OC1-6アルキル、-C(O)C1-6アルキル及び-C(O)NHC1-6アルキルから各々独立して選択される1つ又は複数の置換基を含む)を表し;
Zは、任意選択で置換されているアルキル(任意選択の置換基は、C1-6アルコキシ、NH2、-NHC1-3アルキル及び-N(C1-3アルキル)2から各々独立して選択される1つ又は複数の置換基を含む);アリール;ヘテロアリール;-アルキルアリール;-アルキルヘテロアリール;任意選択で置換されているカルボシクリル(任意選択の置換基は、C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、C1-6ハロアルキル、C1-6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ又は複数の置換基を含む);任意選択で置換されているヘテロシクリル(任意選択の置換基は、C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、-C(O)OC1-6アルキル、-C(O)C1-6アルキル及び-C(O)NHC1-6アルキルから各々独立して選択される1つ又は複数の置換基を含む);カルボシクリルが任意選択で置換されている-アルキルカルボシクリル(任意選択の置換基は、C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、C1-6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ又は複数の置換基を含む);ヘテロシクリルが任意選択で置換されている-アルキルヘテロシクリル(任意選択の置換基は、C1-6アルキル、-C(O)OC1-6アルキル、-C(O)C1-6アルキル及び-C(O)NHC1-6アルキルから各々独立して選択される1つ又は複数の置換基を含む);カルボシクリルが任意選択で置換されている-アリールカルボシクリル(任意選択の置換基は、C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、C1-6ハロアルコキシ及びハロから各々独立して選択される1つ又は複数の置換基を含む);又はヘテロシクリルが任意選択で置換されている-アリールヘテロシクリル(任意選択の置換基は、C1-6アルキル、-C(O)OC1-6アルキル、-C(O)C1-6アルキル及び-C(O)NHC1-6アルキルから各々独立して選択される1つ又は複数の置換基を含む)を表す}
を有する、請求項1に記載のキット。 - Wntシグナリング経路の阻害剤が、porcupine阻害剤である、請求項1に記載のキット。
- porcupine阻害剤が、
2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-1,2,3,6-テトラヒドロ-7H-プリン-7-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド、2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-2,3-ジヒドロ-1H-プリン-7(6H)-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド、若しくは構造(IV):
4-(2-メチル-6,7-ジヒドロピラゾロール[1,5-a]ピリミジン-4(5H)-イル)-4-オキソ-N-(6-(ピリジン-3-イル)ピラジジン-3-イル)ブタンアミド、若しくは構造(V):
である、請求項6に記載のキット。 - 悪性腫瘍が、上昇したWnt活性レベルによって特徴付けられる、請求項1に記載のキット。
- 上昇したWnt活性レベルが、転写において、又は転写後において上昇している、請求項8に記載のキット。
- 悪性腫瘍が、固形悪性腫瘍である、請求項1に記載のキット。
- 悪性腫瘍が、食道、胆嚢、肝臓、膵臓、胃、小腸、大腸、結腸、直腸又は肛門の消化器がんである、請求項1に記載のキット。
- 悪性腫瘍を患う対象においてPTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を検出する方法であって、
対象からの試料から核酸を抽出する工程と、
1つ又は複数のプライマー対により核酸を増幅する工程であって、
プライマー対が、PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を増幅することができ、配列番号6の配列を有するフォワードプライマー、及び配列番号7の配列を有するリバースプライマーを含む、
工程と、
配列番号54もしくは配列番号53の配列を有するプローブにより、増幅したPTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を検出する工程と
を含む方法。 - PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物及び/又はEIF3E(e1)-RSPO2(e2)融合物を増幅することができる1つ又は複数のプライマー対により核酸を増幅する工程を更に含む、請求項12に記載の方法。
- 試料が、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)固定腫瘍組織又は新鮮凍結腫瘍からの組織である、請求項12に記載の方法。
- 核酸が、RNAである、請求項12に記載の方法。
- 増幅工程が、リアルタイムPCR増幅反応を含む、請求項12に記載の方法。
- 悪性腫瘍が、食道、胆嚢、肝臓、膵臓、胃、小腸、大腸、結腸、直腸又は肛門の消化器がんである、請求項12に記載の方法。
- 1つ又は複数のR-スポンジン遺伝子融合物が検出された場合、Wntシグナリング経路の阻害剤により対象をさらに治療することになる、請求項12に記載の方法。
- Wntシグナリング経路の阻害剤が、porcupine阻害剤である、請求項18に記載の方法。
- porcupine阻害剤が、
2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-1,2,3,6-テトラヒドロ-7H-プリン-7-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド、2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-2,3-ジヒドロ-1H-プリン-7(6H)-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド、若しくは構造(IV):
4-(2-メチル-6,7-ジヒドロピラゾロール[1,5-a]ピリミジン-4(5H)-イル)-4-オキソ-N-(6-(ピリジン-3-イル)ピラジジン-3-イル)ブタンアミド、若しくは構造(V):
である、請求項19に記載の方法。 - 悪性腫瘍を患う対象においてWntシグナリングの阻害剤への感受性を特定する方法であって、
対象からの試料から核酸を抽出する工程と、
PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を増幅することができるプライマー対により核酸を増幅する工程であって、PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を増幅することができるプライマー対が、配列番号6の配列を有するフォワードプライマー、及び配列番号7の配列を有するリバースプライマーを含む工程と、
配列番号54もしくは配列番号53の配列を有するプローブにより、増幅したPTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物を検出する工程と、
PTPRK(e13)-RSPO3(e2) R-スポンジン遺伝子融合物が増幅された場合、Wntシグナリングの阻害剤への感受性を特定する工程と
を含む方法。 - PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物又はEIF3E(e1)-RSPO2(e2)融合物を増幅することができる1つ又は複数の追加のプライマー対により核酸を増幅する工程と、
PTPRK(e1)-RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e7)-RSPO3(e2)融合物、PTPRK(e13)-RSPO3(e2)融合物又はEIF3E(e1)-RSPO2(e2)融合物が増幅された場合、Wntシグナリングの阻害剤への感受性を特定する工程と
を更に含む、請求項21に記載の方法。 - 悪性腫瘍が、請求項21に記載の方法に従って特定されている、悪性腫瘍を有する対象を治療するための医薬の製造におけるWntシグナリング経路の阻害剤の使用。
- Wntシグナリング経路の阻害剤が、Wnt-porcupine阻害剤である、請求項23に記載の使用。
- Wnt-porcupine阻害剤が、
2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-1,2,3,6-テトラヒドロ-7H-プリン-7-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド、2-(1,3-ジメチル-2,6-ジオキソ-2,3-ジヒドロ-1H-プリン-7(6H)-イル)-N-(6-フェニルピリダジン-3-イル)アセトアミド、若しくは構造(IV):
4-(2-メチル-6,7-ジヒドロピラゾロール[1,5-a]ピリミジン-4(5H)-イル)-4-オキソ-N-(6-(ピリジン-3-イル)ピラジジン-3-イル)ブタンアミド、若しくは構造(V):
である、請求項24に記載の使用。 - 悪性腫瘍が、食道、胆嚢、肝臓、膵臓、胃、小腸、大腸、結腸、直腸又は肛門の消化器がんである、請求項21に記載の方法。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2023093506A JP2023111961A (ja) | 2016-12-21 | 2023-06-06 | 悪性腫瘍を特定するためのキット及びその使用 |
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| SG10201610735P | 2016-12-21 | ||
| SG10201610735P | 2016-12-21 | ||
| SG10201704134V | 2017-05-19 | ||
| SG10201704134V | 2017-05-19 | ||
| PCT/SG2017/050638 WO2018117972A1 (en) | 2016-12-21 | 2017-12-21 | Kit for identifying malignancy, and uses thereof |
Related Child Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2023093506A Division JP2023111961A (ja) | 2016-12-21 | 2023-06-06 | 悪性腫瘍を特定するためのキット及びその使用 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2020503018A JP2020503018A (ja) | 2020-01-30 |
| JP7419068B2 true JP7419068B2 (ja) | 2024-01-22 |
Family
ID=62626898
Family Applications (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2019533333A Active JP7419068B2 (ja) | 2016-12-21 | 2017-12-21 | 悪性腫瘍を特定するためのキット及びその使用 |
| JP2023093506A Pending JP2023111961A (ja) | 2016-12-21 | 2023-06-06 | 悪性腫瘍を特定するためのキット及びその使用 |
Family Applications After (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2023093506A Pending JP2023111961A (ja) | 2016-12-21 | 2023-06-06 | 悪性腫瘍を特定するためのキット及びその使用 |
Country Status (5)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US11649505B2 (ja) |
| EP (1) | EP3559264A4 (ja) |
| JP (2) | JP7419068B2 (ja) |
| CN (2) | CN110506129B (ja) |
| WO (1) | WO2018117972A1 (ja) |
Families Citing this family (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN114025764A (zh) * | 2019-05-22 | 2022-02-08 | 新加坡科技研究局 | 药物组合 |
| WO2020236083A1 (en) * | 2019-05-22 | 2020-11-26 | Agency For Science, Technology And Research | Oral formulations, methods of manufacture and uses thereof |
Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2016518328A (ja) | 2013-03-12 | 2016-06-23 | キュアジェニックス インコーポレイテッド | 癌治療のための化合物 |
| WO2016191525A1 (en) | 2015-05-26 | 2016-12-01 | Curegenix Corporation | Tumor biomarkers and use thereof |
Family Cites Families (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| MX366804B (es) * | 2012-02-11 | 2019-07-25 | Genentech Inc | Translocaciones de la r-espondina y sus metodos de uso. |
-
2017
- 2017-12-21 JP JP2019533333A patent/JP7419068B2/ja active Active
- 2017-12-21 CN CN201780086999.8A patent/CN110506129B/zh active Active
- 2017-12-21 US US16/471,320 patent/US11649505B2/en active Active
- 2017-12-21 EP EP17883782.9A patent/EP3559264A4/en active Pending
- 2017-12-21 WO PCT/SG2017/050638 patent/WO2018117972A1/en unknown
- 2017-12-21 CN CN202310760815.9A patent/CN118497323A/zh active Pending
-
2023
- 2023-04-06 US US18/131,678 patent/US20230366031A1/en active Pending
- 2023-06-06 JP JP2023093506A patent/JP2023111961A/ja active Pending
Patent Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2016518328A (ja) | 2013-03-12 | 2016-06-23 | キュアジェニックス インコーポレイテッド | 癌治療のための化合物 |
| WO2016191525A1 (en) | 2015-05-26 | 2016-12-01 | Curegenix Corporation | Tumor biomarkers and use thereof |
Non-Patent Citations (4)
| Title |
|---|
| A. Lee, et al.，PCR Methods and Applications，1995年，Vol.4，p.283-287 |
| B Madan，Oncogene，2015年08月10日，35，2197-2207 |
| B. Sanchez-Vega, et al.，Journal of Molecular Diagnostics，2002年，Vol.4, No.4，p.223-229 |
| Jonathan D Boone，Laboratory Investigation，2015年12月14日，96(2)，249-259 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN110506129B (zh) | 2023-06-30 |
| EP3559264A4 (en) | 2020-08-12 |
| CN118497323A (zh) | 2024-08-16 |
| JP2023111961A (ja) | 2023-08-10 |
| US20230366031A1 (en) | 2023-11-16 |
| JP2020503018A (ja) | 2020-01-30 |
| WO2018117972A1 (en) | 2018-06-28 |
| US20200002772A1 (en) | 2020-01-02 |
| CN110506129A (zh) | 2019-11-26 |
| EP3559264A1 (en) | 2019-10-30 |
| US11649505B2 (en) | 2023-05-16 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP7071044B2 (ja) | ヒダントインを含むデオキシウリジントリホスファターゼ阻害剤 | |
| JP2023111961A (ja) | 悪性腫瘍を特定するためのキット及びその使用 | |
| CN103153064B (zh) | 抑制egfr导致的癌症中细胞增殖的方法 | |
| CN110128415B (zh) | 用作免疫调节剂的吲哚啉类化合物及其制备方法 | |
| KR20200038545A (ko) | 스플라이싱을 조절하는 방법 및 조성물 | |
| TW202043212A (zh) | Shp2抑制劑及其應用 | |
| TW201245161A (en) | 1-(arylmethyl)quinazoline-2,4(1H,3H)-diones as PARP inhibitors and the use thereof | |
| MX2007002040A (es) | Compuestos utiles para inhibir chk1. | |
| BR112020011203B1 (pt) | Composto derivado de pirimidina, composição farmacêutica compreendendo o mesmo e uso do dito composto para o tratamento de câncer de pulmão | |
| JP2023095928A (ja) | 癌を処置するためのｅｚｈ２阻害剤の使用 | |
| EP3180004B1 (en) | Cancer therapeutics | |
| WO2009102433A2 (en) | Compounds with mdr1-inverse activity | |
| CN105745198B (zh) | 羧甲基哌啶衍生物 | |
| CN115304583A (zh) | 靶向抑制clk2的5-吡啶-1h-吲唑类化合物及其应用 | |
| WO2012033601A1 (en) | Thiosemicarbazones with mdr1 - inverse activity | |
| CN110467616B (zh) | 含杂芳基取代哒嗪酮结构的三唑并吡嗪类化合物的制备及应用 | |
| JP2021527071A (ja) | Ｅｐａｃ阻害剤としてのチエノ［２，３−ｂ］ピリジン誘導体及びその医薬用途 | |
| CN114763360A (zh) | 手性大环化合物作为蛋白激酶抑制剂及其用途 | |
| KR102215255B1 (ko) | 타우 응집체에 선택적으로 결합하는 형광 탐침자로서 유효한 신규 화합물 및 이의 제조 방법 | |
| AU2020374269A1 (en) | Novel heterocyclic-substituted pyrimidine derivative exhibiting cancer cell growth inhibitory effect, and pharmaceutical composition containing same | |
| CN105130907B (zh) | 嘧啶类化合物及其用途 | |
| WO2017097215A1 (zh) | 内嵌脲类结构的wnt通路抑制剂 | |
| CN113980003B (zh) | 一种2-((2-甲氧基苯基)磺酰基)异吲哚啉类化合物及其制备方法 | |
| EP4320194B1 (en) | Probe directed to enzyme aldh1a3 and use thereof in the diagnosis of glioblastoma | |
| AU2016323777A1 (en) | DNA binding agents with a minor groove binding tail |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20201207 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20211129 |
|
| A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20220228 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20220526 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20220912 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20221212 |
|
| A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20230206 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20230606 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20230608 |
|
| A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20230718 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20231010 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20231108 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20231211 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20240110 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7419068 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |