JP7412006B2 - 誘導性ｔ細胞レセプター及びその使用 - Google Patents

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Description

本発明は、誘導性Ｔ細胞レセプター（をコードする核酸）、このような誘導性Ｔ細胞レセプター（コードする核酸）を含む組成物及びキット、ベクター及び宿主細胞、誘導性Ｔ細胞レセプター及びこのようなＴ細胞レセプターを含む宿主細胞の調製におけるそれらの使用、このような誘導性Ｔ細胞レセプターを調製するための及びＴ細胞レセプターを二量体化するための方法、並びに特にガンを処置するためのこのような化合物及びそれらを含む医薬組成物の医療用途に関する。特に、本発明は、特許請求の範囲で定義されるように、１つ以上の核酸分子を含む組み合わせであって、前記１つ以上の核酸分子が、二量体化ドメインに連結されたＴＣＲアルファ鎖をコードする核酸配列Ａと、二量体化ドメインに連結されたＴＣＲベータ鎖をコードする核酸配列Ｂとを含む組み合わせ、並びにこのような核酸分子によりコードされるタンパク質、並びに対応する使用及び方法に関する。
強力なＴ細胞療法の開発はまた、オンターゲット及びオフターゲット副作用などの有害事象のリスクの増加を伴う。Ｔ細胞療法がより効率的になるにつれて、サイトカイン放出症候群などの急性毒性はより明白になった。安全な養子Ｔ細胞療法のために、遺伝子改変Ｔ細胞をコントロールする能力が非常に重要である。遺伝子改変Ｔ細胞をコントロールする方法の開発は、集中的な研究の対象になっている。Ｔ細胞抑制薬の投与は、一般に、不完全かつ非特異的である。自殺遺伝子などのさらなる安全スイッチを用いたＴ細胞の操作は、最終的には、それらの細胞のほとんどの枯渇につながっている。しかしながら、その結果として起こる基本アポトーシスの増加及び残りのＴ細胞のエクスパンションは、その有効性を制限する可能性がある。
したがって、本発明の根底にある技術的問題は、上記目的に対応することであった。技術的問題は、本明細書に記載され、実施例に示され、特許請求の範囲で定義される手段及び方法により解決された。
本発明者らは上記問題に取り組み、コントロール可能なＴＣＲタンパク質発現を誘発するリコンビナントＴ細胞レセプター（ＴＣＲ）の改変を開発した。本発明の誘導性ＴＣＲは、定常アルファ及び／又はベータ鎖における突然変異を含み、両鎖の対形成の喪失をもたらす。加えて、本発明の誘導性ＴＣＲは、定常アルファ鎖及びベータ鎖の下流に付加された二量体化ドメインを含む。二量体化ドメインは、二量体化剤の追加に応じた条件付き二量体化状態を特徴とする。各二量体化剤を用いた二量体化の誘導により、所定のＴＣＲの膜発現が達成される。
したがって、本発明は、リコンビナント抗原特異的Ｔ細胞レセプター（ＴＣＲ）の改変であって、前記抗原特異的リコンビナントＴＣＲのタンパク質膜発現のコントロールを誘発する改変を提供する。さらなる態様では、本発明は、このようなＴＣＲ改変をコードする核酸、このような核酸を含むベクター、このようなベクター及び核酸を含む宿主細胞、並びにそれらの様々な使用及び用途を提供する。
具体的には、驚くべきことに本発明との関連で見出されたように、ＴＣＲのＣ末端定常アルファ及び／又はベータ鎖における点突然変異は、２つの鎖の自然対形成の抑制又は阻害をもたらす。その結果として、ＴＣＲは、Ｔ細胞レセプター複合体ＣＤ３と一緒に正しく対形成したアルファ及びベータ鎖の複合体を形成し得ない。したがって、リコンビナントＴ細胞の表面上で発現されるＴＣＲがないか又はごく少数であることにより、Ｔ細胞は、抗原を認識することができず、その後、機能をトリガーすることができない。
加えて、二量体化剤の追加によるＴＣＲの二量体化を可能にするために、二量体化ドメインは、ＴＣＲのアルファ及びベータ鎖の定常領域の下流に導入され、二量体化ドメイン及び二量体化剤は、点突然変異によるＴＣＲの対形成の抑制／阻害を克服する。したがって、オーバーレイの原理は、ＴＣＲアルファ及びベータ鎖の誘導された二量体化、例えば化学的に誘導された二量体化（ＣＩＤ）であり、二量体化剤の非存在下では、鎖は対形成しない。
したがって、本発明は、それぞれ定常アルファ及びベータ鎖の下流に二量体化ドメインを有する誘導性Ｔ細胞レセプター（ＴＣＲ）であって、二量体化剤による誘導により、二量体化して細胞膜の表面上で発現される誘導性Ｔ細胞レセプター（ＴＣＲ）に関する。
一態様では、本発明は、１つ以上の核酸分子を含む組み合わせであって、前記１つ以上の核酸分子が、
（ａ）（ｉ）配列番号２と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％同一のアミノ酸配列をコードする核酸配列、及び（ｉｉ）配列番号２と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％同一のアミノ酸配列をコードする前記核酸配列に下流連結された誘導性二量体化ドメインをコードする核酸配列を含む核酸配列Ａ；並びに（ｂ）（ｉ）配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９８，５％又は９９％同一のアミノ酸配列をコードする核酸配列、及び（ｉｉ）（ａ）（ｉｉ）の配列番号２と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％同一のアミノ酸配列をコードする前記核酸配列に連結された前記二量体化ドメインの局在化と同様に、配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％同一のアミノ酸配列をコードする前記核酸配列に下流連結された誘導性二量体化ドメインであって、（ａ）（ｉｉ）の配列番号２と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％同一のアミノ酸配列をコードする前記核酸配列に連結された前記二量体化ドメインに対応する誘導性二量体化ドメインをコードする核酸配列を含む核酸配列Ｂ
を含み、（ａ）（ｉ）の配列番号２と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９７，５％、９８％、９８，５％若しくは９９％同一の前記アミノ酸配列が、配列番号２と比較して少なくとも１つ、好ましくは少なくとも２つのアミノ酸置換を含み、及び／又は（ｂ）（ｉ）の配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９７，５％、９８％、９８，５％若しくは９９％同一の前記アミノ酸配列が、配列番号４と比較して少なくとも１つ、好ましくは少なくとも２つ、より好ましくは少なくとも３つのアミノ酸置換を含む組み合わせに関する。
本発明によれば、それぞれ（ＴＣＲ定常アルファ鎖をコードする）配列番号２又は（ＴＣＲ定常ベータ鎖対立遺伝子２をコードする）配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％同一のアミノ酸配列をコードする前記核酸配列に下流連結された誘導性二量体化ドメインをコードする核酸配列を含む核酸配列Ａ又はＢの記載はまた、前記核酸配列Ａ又はＢによりコードされる対応するアミノ酸配列（すなわち、タンパク質）が、それぞれ配列番号２又は４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９７，５％、９８％、９８，５％若しくは９９％同一のアミノ酸配列をコードする前記核酸配列によりコードされるアミノ酸配列（すなわち、タンパク質）に下流連結された誘導性二量体化ドメインを含むことを意味する。換言すれば、ＴＣＲ定常アルファ又はベータ鎖及び二量体化ドメインをコードするコード核酸配列は連結されているだけではなく、コード及び発現されるアミノ酸配列及びしたがってポリペプチドも連結されている（すなわち、それぞれ、誘導性二量体化ドメインに連結されたＴＣＲ定常アルファ鎖を含むタンパク質、及び／又は誘導性二量体化ドメインに連結されたＴＣＲ定常ベータ鎖を含むタンパク質をもたらす）。本発明との関連で理解されるように、配列番号２又は４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％同一のアミノ酸配列をコードする前記核酸配列は、それぞれＴＣＲ定常アルファ又はベータ鎖をコードする。核酸配列Ａ及びＢ（及びしたがって前記配列を含む核酸分子）によりコードされるアミノ酸配列（すなわち、タンパク質）は、好ましくは、本発明との関連では、それぞれ誘導性二量体化ドメインを含むＴＣＲアルファ及びベータ鎖（各可変及び定常領域を含む）をコードすると理解されるので、本明細書に記載される誘導性ＴＣＲの提供及び調製に適切である。
本発明によれば、核酸配列Ａは、好ましくは、可変及び定常領域を含むＴＣＲアルファ鎖をコードし、核酸配列Ｂは、好ましくは、可変及び定常領域を含むＴＣＲベータ鎖をコードする。当技術分野で公知であるように、ＴＣＲは、アルファ及びベータ鎖から主に構成され、各鎖は、可変及び定常領域を含み、ＴＣＲは、隣接膜貫通領域及び細胞質領域をさらに含む。定常領域は、ＴＣＲの可変領域の下流及び細胞膜の近位に位置し、続いて膜貫通領域及び短い細胞質領域がある。アルファ及びベータ鎖の定常領域は、通常、細胞外ドメインにおけるシステインベースのジスルフィド結合により対形成する（例えば、Glusman et al., Immunity (2001), 15: 337-349; Call et al., Cell (2002), 111: 967-979を参照のこと)。本発明の要点は、ＴＣＲのアルファ及び／又はベータ鎖の定常領域が、アルファ及びベータ鎖の前記対形成の喪失をもたらす１つ以上の突然変異を含むことにある（すなわち、核酸配列Ａにより含まれる対応するＴＣＲ定常アルファ鎖をコードする配列番号２と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６９７％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％同一のアミノ酸配列、及び核酸配列Ｂにより含まれる対応するＴＣＲ定常ベータ鎖をコードする配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％同一のアミノ酸配列、ここで、前記鎖は、ＴＣＲ定常アルファ及び／又はベータ鎖における１つ以上の突然変異により、対形成能力障害を示す）。したがって、それぞれ配列番号１及び／又は３と比較した核酸配列Ａ及び／又はＢにより含まれるヌクレオチド差異であって、本明細書に記載されるアミノ酸置換をもたらすヌクレオチド差異は、好ましくは、ＴＣＲのアルファ及び／又はベータ鎖の自然対形成の喪失をもたらす。本発明によれば、この自然対形成の喪失は、核酸配列Ａ及びＢに導入される配列によりコードされる二量体化ドメインを介した誘導された（コントロールされた）二量体化により克服され得、前記二量体化ドメインは、本明細書に記載される適切な二量体化剤の追加により二量体化する。すなわち、適切な二量体化剤の追加により誘導されない限り、前記二量体化ドメインは二量体化しないか又は少なくとも実質的に二量体化しないので、誘導性二量体化ドメインとも称される。したがって、本明細書に記載及び提供される核酸分子の組み合わせは、本明細書に記載される二量体化剤の追加により誘導され得る（すなわち、各アルファ及びベータ鎖の二量体化の誘導）誘導性ＴＣＲ（ｉＴＣＲ）の調製を提供するか、又はそれに使用され得る。本明細書で使用される場合、「組み合わせ」という用語はまた、前記核酸分子の１つ以上が組み合わせで含まれるか又は一緒にされた「組成物」を含み得るか又は「組成物」と称され得る。
本明細書に記載される核酸分子の核酸配列Ａは、配列番号２（ＴＣＲアルファ鎖のヒト定常領域のａａ配列をコードする配列番号２）と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％、好ましくは少なくとも９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％、より好ましくは少なくとも９８，５％又はさらに９９％同一のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。本明細書に記載される核酸分子の核酸配列Ｂは、配列番号４（ＴＣＲベータ鎖のヒト定常領域のａａ配列をコードする配列番号４）と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％、好ましくは少なくとも９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％、より好ましくは少なくとも９８％又はさらに９８．５％同一のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。本発明との関連では、配列番号２と比較したアミノ酸置換は、好ましくは、保存的アミノ酸置換である。保存的アミノ酸置換は当技術分野で公知であり、特定の物理的及び／又は化学的特性を有するあるアミノ酸が、同じ化学的又は物理的特性を有する別のアミノ酸と交換されたアミノ酸置換が挙げられる。例えば、保存的アミノ酸置換は、例えば、酸性アミノ酸が別の酸性アミノ酸で置換されたもの、非極性側鎖を有するアミノ酸が非極性側鎖を有する別のアミノ酸で置換されたもの、塩基性アミノ酸が別の塩基性アミノ酸で置換されたもの、極性側鎖を有するアミノ酸が極性側鎖を有する別のアミノ酸で置換されたものなどであり得、関与する残基の極性、電荷、溶解度、疎水性、親水性及び／又は両親媒性における類似性に基づいて作製され得る。例えば、「保存的」置換は、以下の表Ｉにおいて「例示的な置換」として掲載されている置換を意味し得る。本明細書で使用される場合、「高度に保存的な」置換は、以下の表Ｉにおいて「好ましい置換」という見出しで示されている置換を意味する。
Figure 0007412006000001
本発明の一実施態様では、（ａ）（ｉ）の配列番号２と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％若しくは９９％（好ましくは、少なくとも９８，５又は９９％％）同一の前記アミノ酸配列は、配列番号２と比較して位置４４及び／若しくは４７にアミノ酸置換を含み、並びに／又は（ｂ）（ｉ）の配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８％又は９８，５％）同一の前記アミノ酸配列は、配列番号４と比較して位置４、５、３７、６３、７７及び／若しくは７９にアミノ酸置換を含む。本発明の一実施態様では、配列番号２と比較した位置４４及び／又は４７のアミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換である。
配列番号２に示されるアミノ酸配列は、配列番号１に示されるヌクレオチド配列によりコードされ得る。したがって、配列番号２と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８，５％又は９９％）同一のアミノ酸配列であって、本明細書に記載される（ａ）（ｉ）の核酸配列によりコードされるアミノ酸配列は、各ヌクレオチド配列が、配列番号２と比較した対応するアミノ酸置換をもたらすために置き換えられた配列番号１のヌクレオチド配列によりコードされ得る。配列番号２のアミノ酸配列はまた、１つ以上のヌクレオチドが置き換えられた配列番号１のヌクレオチド配列によりコードされ得、このような置き換えは、アミノ酸置換に翻訳されない（サイレント突然変異）。したがって、配列番号２と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８％又は９８，５％）同一のアミノ酸配列をコードする核酸配列は、各ヌクレオチド配列が、配列番号２と比較した対応するアミノ酸置換をもたらすために置き換えられた配列番号１のヌクレオチド配列であって、アミノ酸置換をもたらさないさらなるヌクレオチド置き換えをさらに含むヌクレオチド配列に対応し得る。
同様に、配列番号４に示されるアミノ酸配列は、配列番号３に示されるヌクレオチド配列によりコードされ得る。したがって、配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８，５％又は９９％）同一のアミノ酸配列であって、本明細書に記載される（ｂ）（ｉ）の核酸配列によりコードされるアミノ酸配列は、各ヌクレオチド配列が、配列番号４と比較した対応するアミノ酸置換をもたらすために置き換えられた配列番号３のヌクレオチド配列によりコードされ得る。配列番号４のアミノ酸配列はまた、１つ以上のヌクレオチドが置き換えられた配列番号３のヌクレオチド配列によりコードされ得、このような置き換えは、アミノ酸置換に翻訳されない（サイレント突然変異）。したがって、配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８％又は９８，５％）同一のアミノ酸配列をコードする核酸配列は、各ヌクレオチド配列が、配列番号４と比較した対応するアミノ酸置換をもたらすために置き換えられた配列番号３のヌクレオチド配列であって、アミノ酸置換をもたらさないさらなるヌクレオチド置き換えをさらに含むヌクレオチド配列に対応し得る。
表２は、ヒトＴＣＲのアルファ及びベータ鎖のアルファ及びベータ定常領域（それぞれ、配列番号２及び４を参照のこと）の両方に導入されたアミノ酸変化を示し、（ＴＣＲ定常アルファ鎖の）配列番号２及び（ＴＣＲ定常ベータ鎖の）配列番号４と比較したアミノ酸配列の変化は、実施例１～６に見られ得るように、アルファ及びベータ鎖対形成の障害をもたらすが、ＴＣＲのアルファ鎖とＣＤ３イプシロン及びデルタサブユニットとの正確なアセンブリ、並びにＴＣＲのベータ鎖とＣＤ３ガンマ及びイプシロンサブユニットとのアセンブリを依然として可能にする。置換のアミノ酸位置は、図１１及び１２に示されているように、配列表を参照して、及びＩＭＧＴナンバリングシステムを参照して示されている。当業者には明らかであるように、ＩＭＧＴナンバリングにしたがって、位置８４．１は、ヒトＴＣＲアミノ酸配列の位置８４と８５との間の位置である(Lefranc, M.-P., Immunology Today 18, 509 (1997))。
Figure 0007412006000002
表３は、ヒトＴＣＲのベータ定常領域（配列番号４）に導入されたアミノ酸変化を示し、（ＴＣＲ定常ベータ鎖の）配列番号４と比較したアミノ酸配列の変化は、実施例７及び８に見られ得るように、アルファ及びベータ鎖対形成の障害をもたらすが、ＴＣＲのアルファ鎖とＣＤ３イプシロン及びデルタサブユニットとの正確なアセンブリ、並びにＴＣＲのベータ鎖とＣＤ３ガンマ及びイプシロンサブユニットとのアセンブリを依然として可能にする。Ｃ１及びＣ２と称されるＴＣＲベータ鎖定常領域の２つの対立遺伝子がある。置換のアミノ酸位置は、図１２に示されているように、配列表を参照して、及びＩＭＧＴナンバリングシステムを参照して示されている。以下の表３は、ベータ定常鎖の２つの対立遺伝子間の差異を示す。配列番号４は、位置４、５及び３７（以下の表に示されているＩＭＧＴナンバリングを使用した場合には１．３、１．４及び２９）のアミノ酸Ｋ、Ｎ及びＹを示すＣ２定常鎖を指すが、図１２は、Ｃ１定常鎖を示す。表３に概説されている位置における定常鎖の突然変異は、アルファ及びベータ鎖の対形成の減少をもたらす。
Figure 0007412006000003
本発明の一実施態様では、それぞれ核酸配列Ａ及びＢに下流連結された前記二量体化ドメインは、好ましくはＴＣＲの発現及び局在化後に細胞質領域で発現されると、ＴＣＲのＣ末端に位置する。これとの関連では、当業者には明らかであるように、ＴＣＲは、通常、（ＣＤ３複合体との）アルファ及びベータ鎖の複合体形成後に（例えば、Call et al., loc. cit.を参照のこと)、すなわち、本明細書で定義及び提供される核酸配列Ａ及びＢによりコードされる前記二量体化ドメインの二量体化後に、細胞の膜に局在化する。
本発明の一実施態様では、本明細書に記載及び提供される組み合わせ（又は組成物）について、前記核酸配列Ａ及び核酸配列Ｂは、別個の核酸分子により含まれ得るか、又は１つの核酸分子中に含まれ得る。例えば、核酸配列Ａ及びＢは、同じ核酸分子、例えば発現カセット上に位置し得る。このような発現カセットでは、核酸配列Ａ及びＢは、好ましくは、同程度の量の発現を可能にするために、同じ発現コントロール下、例えば同じプロモーター又は同じプロモータータイプのコントロール下にあり得る。
本発明の一実施態様では、（ａ）（ｉ）の前記核酸配列は、配列番号２と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８，５％又は９９％）同一のアミノ酸配列であって、配列番号２のアミノ酸配列と比較して少なくとも１つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列をコードし、前記置換は、Ｔ４４Ａ及びＴ４７Ａからなる群より選択され；並びに／又は（ｂ）（ｉ）の前記核酸配列は、配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８％又は９８，５％）同一のアミノ酸配列であって、配列番号４のアミノ酸配列と比較して少なくとも１つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列をコードし、前記置換は、Ｌ６３Ａ、Ｓ７７Ａ及びＲ７９Ａからなる群より選択される。別の実施態様では、（ｂ）（ｉ）の前記核酸は、配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８％又は９８，５％）同一のアミノ酸配列であって、配列番号４のアミノ酸配列と比較して少なくとも１つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列をコードし、前記置換は、Ｋ４Ｖ、Ｎ５Ｐ及びＹ３７Ｋからなる群より選択される。
本発明の好ましい一実施態様では、（ａ）（ｉ）の前記核酸配列は、配列番号２と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８，５％又は９９％）同一のアミノ酸配列であって、配列番号２のアミノ酸配列と比較して２つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列をコードし、前記２つの置換は、Ｔ４４Ａ及びＴ４７Ａであり；並びに（ｂ）（ｉ）の前記核酸配列は、配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８％又は９８，５％）同一のアミノ酸配列であって、配列番号４のアミノ酸配列と比較して３つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列をコードし、前記３つの置換は、Ｌ６３Ａ、Ｓ７７Ａ及びＲ７９Ａである。
別の好ましい実施態様では、（ａ）（ｉ）の前記核酸配列は、配列番号２と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８，５％又は９９％）同一のアミノ酸配列をコードし、（ｂ）（ｉ）の前記核酸配列は、配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８％又は９８，５％）同一のアミノ酸配列であって、配列番号４のアミノ酸配列と比較して３つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列をコードし、前記３つの置換は、Ｋ４Ｖ、Ｎ５Ｐ及びＹ３７Ｋである。
本発明の一実施態様では、核酸配列Ａは、配列番号５に示されるアミノ酸配列をコードする。
本発明の一実施態様では、核酸配列Ｂは、配列番号６に示されるアミノ酸配列をコードする。
本発明との関連では、誘導性二量体化ドメインは、二量体化剤の追加により二量体化する二量体化ドメインである。それぞれ核酸配列Ａ及びＢによりコードされるアミノ酸配列（すなわち、タンパク質）では、二量体化ドメインは、対形成能力障害を示す（それぞれ配列番号２又は配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９８，５％又は９９％同一の核酸配列によりコードされる）定常アルファ又はベータ鎖の下流（すなわち、Ｃ末端）に連結され位置する。好ましくは、誘導性二量体化ドメインは、ｉＴＣＲの細胞質ドメインに位置する。当業者が把握するように、ＴＣＲは小胞体（ＥＲ）で形成され、次いで、アルファ及びベータ鎖の対形成により、ＣＤ３と複合体形成し、次いで、ゴルジ装置を介して細胞膜／細胞表面に局在化する。本発明との関連では、ｉＴＣＲのアルファ及びベータ鎖は、本明細書に記載及び提供される各定常領域における突然変異により対形成しないので、誘導性二量体化ドメインを介した二量体化によりＥＲから離脱しない（そして、適切な二量体化剤の追加により二量体化する）。本発明との関連では、誘導性二量体化ドメインは、ホモ又はヘテロ二量体化ドメイン、好ましくはホモ二量体化ドメインであり得る。本発明との関連では、このような二量体化ドメインの適切な例は当技術分野で公知であり、とりわけ、エストロゲンレセプター(例えば、ＥＲＴ２;Ballister, Publicly Accessible Penn Dissertations (2014), 1202: Inducible Protein Dimerization: New Tools and Applications to Understanding the Mitotic Checkpointを参照のこと)、ＦＫＢＰ(Ballister, loc.citを参照のこと)、ＦＫＢＰ／カルシニューリンＡ（ＣＮＡ）(Ho et al., Nature (1996), 382: 822-826を参照のこと); ＦＫＢＰ／ＣｙＰ－Ｆａｓ(Belshaw et al., PNAS (1996), 93: 4304-4607を参照のこと)、ＦＫＢＰ／ｍＴＯＲのＦＲＢドメイン(. Ballister, Publicly Accessible Penn Dissertations (2014), 1202: Inducible Protein Dimerization: New Tools and Applications to Understanding the Mitotic Checkpoint)、ＧｙｒＢ(M.A. Farrar et al., Methods in Enzymology, Volume 327, 2000, pages 421-429).)、ＧＡＩ／ＧＩＤ１(Miyamato et al., Nature Chemical Biology (2012), 8: 465-470)、Ｓｎａｐ－Ｔａｇ／ＨａｌｏＴａｇ(Erhart et al., Chem & Biol (2013), 20: 549-557を参照のこと)及びｅＤＨＦＲ／ＨａｌｏＴａｇ(Ballister et al., Nature Communications 5, Article number: 5475 (2014), doi: 10.1038/ncomms6475)を含む。
本発明は、本明細書に記載及び提供される核酸配列Ａ及び核酸配列Ｂを含む発現カセット、又は少なくとも２つの発現カセットであって、少なくとも１つの発現カセットが本明細書に記載及び提供される核酸配列Ａを含み、少なくとも１つの発現カセットが本明細書に記載及び提供される核酸配列Ｂを含む少なくとも２つの発現カセットに関する。本発明の一実施態様では、核酸配列Ａ及びＢは、同じエレメント（例えば、プロモーター及び／又はエンハンサー、オペレーター、リプレッサー及び転写終結シグナルなど）のコントロール下にあり、同じ発現コントロールにより含まれる場合には、同じエレメントの共通のコントロール下にあり得る。プロモーターは、例えば、構成的プロモーター又は誘導性プロモーターであり得る。哺乳動物宿主細胞のための適切なプロモーター／エンハンサーは当技術分野で公知であり、例えば、ＳＶ４０、ＡｄＭＬＰ、メタロチオネインプロモーター、７．５Ｋプロモーター、ＭＩＥＰ、ＥＦ１Ａ、ＣＭＶ、ＰＧＫなどを含む。
本発明はさらに、本明細書に記載及び提供される核酸配列Ａ及び／若しくはＢ又は本明細書に記載及び提供される発現カセットを含むベクターに関する。適切なベクターは、ベクターが導入される（トランスフォーメーション、トランスダクションされる）各宿主細胞に依存し、当技術分野で公知である。本明細書で使用される場合、「ベクター」という用語は、限定されないが、プラスミド、ウイルスベクター（レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、ポリオーマウイルスベクター及びアデノウイルス随伴ベクター（ＡＡＶ）を含む；本発明との関連では、レトロウイルス及びレンチウイルスベクターが好ましい）、ファージ、ファージミド、コスミド及び人工染色体（ＢＡＣ及びＹＡＣを含む）を包含する。ベクターそれ自体は、一般に、挿入フラグメント（導入遺伝子）及びベクターの「骨格」として機能するより長い配列を含むヌクレオチド配列、一般にはＤＮＡ配列である。操作されたベクターは、典型的には、宿主細胞における自己複製起点（ポリヌクレオチドの安定な発現が所望である場合）、選択マーカー及び制限酵素切断部位（例えば、マルチクローニングサイト、ＭＣＳ）を含む。ベクターは、本明細書に記載される当技術分野で公知のプロモーター／エンハンサー及び他のコントロールエレメント、例えばオペレーター、リプレッサー及び転写終結シグナル、並びに遺伝子マーカー、レポーター遺伝子、ターゲティング配列及び／又はタンパク質精製タグをさらに含み得る。当業者に公知であるように、多くの適切なベクターが利用可能であり、多くが市販されている。適切なベクターの例は、例えば、J. Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (4th edition), Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York (2012)に提供されている。
本発明のベクターはまた、発現ベクターであり得る。「発現ベクター」又は「発現構築物」は、適切な宿主細胞における異種ポリヌクレオチド配列、例えば本発明との関連で記載及び提供される（核酸配列Ａ及びＢによりコードされる）ＴＣＲ鎖をコードする配列の転写及びそれらのｍＲＮＡの翻訳のために使用され得る。複製起点、選択マーカー及び制限酵素切断部位の他に、発現ベクターは、典型的には、発現させるべき異種ポリヌクレオチドに作動可能に連結された１つ以上の調節配列を含む。「調節配列」という用語は、特定の宿主生物又は宿主細胞における（異種）ポリヌクレオチドの作動可能に連結されたコード配列の発現に必要な核酸配列を指し、したがって、転写調節配列及び翻訳調節配列を含む。典型的には、原核細胞における異種ポリヌクレオチド配列の発現に必要な調節配列としては、プロモーター、場合によりオペレーター配列及びリボソーム結合部位が挙げられる。真核生物では、典型的には、プロモーター、ポリアデニル化シグナル、エンハンサー及び場合によりスプライスシグナルが必要とされる。また、培養培地中への目的のポリペプチドの分泌を可能にするために、特定の開始シグナル及び分泌シグナルもベクターに導入され得る。核酸は、それが特に同じポリヌクレオチド分子上の別の核酸配列と機能的な関係になるように配置された場合、「作動可能に連結」されている。例えば、プロモーターは、それがコード配列の発現を引き起こすことができる場合、異種遺伝子のコード配列と作動可能に連結されている。プロモーターは、典型的には、目的のポリペプチドをコードする遺伝子の上流に配置され、前記遺伝子の発現をレギュレーションする。哺乳動物宿主細胞の発現のための例示的な調節配列としては、哺乳動物細胞において高いレベルのタンパク質の発現を指令するウイルス配列、例えばサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）に由来するプロモーター及び／又はエンハンサー（例えば、ＣＭＶプロモーター／エンハンサー）、サルウイルス４０（ＳＶ４０）（例えば、ＳＶ４０プロモーター／エンハンサー）、アデノウイルス（例えば、アデノウイルス主要後期プロモーター（ＡｄＭＬＰ））及びポリオーマが挙げられる。前記に示されているように、発現ベクターはまた、複製起点及び選択マーカーを含み得る。本発明のベクターは、１つ以上の選択マーカーをさらに含み得る。真核宿主細胞に使用するに適切な選択マーカーとしては、限定されないが、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ（ｔｋ）、ヒポキサンチン－グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ（ｈｇｐｒｔ）及びアデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ（ａｐｒｔ）遺伝子が挙げられる。他の遺伝子としては、ｄｈｆｒ（メトトレキサート抵抗性）、ｇｐｔ（ミコフェノール酸抵抗性）、ｎｅｏ（Ｇ－４１８抵抗性）及びｈｙｇｒｏ（ハイグロマイシン抵抗性）が挙げられる。ベクター増幅は、発現レベルを増加させるために使用され得る。一般に、選択マーカー遺伝子は、発現させるべきポリヌクレオチド配列に直接連結され得るか、又はコトランスフォーメーションにより同じ宿主細胞に導入され得る。上記を考慮して、したがって、本発明はさらに、ベクターに挿入された（すなわち、含まれる）１つ以上の本明細書に記載されるヌクレオチド配列を提供する。具体的には、本発明は、本明細書に記載及び提供される核酸配列Ａ及び／又はＢを含む（複製可能な）ベクターを提供する。
当業者は、例えば、ヌクレオチド配列Ａ及び／又はＢによりコードされるアミノ酸配列（タンパク質）の発現を目的とした宿主細胞に基づいて、適切な発現ベクターを容易に選択することができるであろう。適切な発現ベクターの特定の例は、ウイルスベクター、例えばレトロウイルスベクター、例えばＭＰ７１ベクター又はレトロウイルスＳＩＮベクター；及びレンチウイルスベクター又はレンチウイルスＳＩＮベクターである。ウイルスベクターは、例えば、リンパ球に感染することができ、これは続いて、ヌクレオチド配列Ａ及び／又はＢによりコードされるアミノ酸配列（タンパク質）を発現すると想定される。適切な発現ベクターの別の例は、Ｓｌｅｅｐｉｎｇ Ｂｅａｕｔｙ（ＳＢ）トランスポゾントランスポザーゼＤＮＡプラスミド系、すなわちＳＢ ＤＮＡプラスミドである。本発明の核酸及び／又は、特に発現構築物はまた、一過性ＲＮＡトランスフェクションにより細胞に移入され得る。ネイティブＴＣＲ発現のために現在使用されているウイルスベクターは、典型的には、１つのベクターにおけるＴＣＲアルファ鎖遺伝子及びＴＣＲベータ鎖遺伝子を、ブタテッショウウイルス由来の内部リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）配列又は２Ａペプチド配列のいずれかと連結し、トランスダクション細胞内のウイルスプロモーターのコントロール下で単一のメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）分子の発現をもたらす。しかしながら、当業者は、本発明のヌクレオチド配列Ａ及び／又はＢを適切な発現系、例えばＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ又はＳｌｅｅｐｉｎｇ Ｂｅａｕｔｙ（ＳＢ）トランスポゾンに導入するための他の公知の系を容易に選択して使用することもできるであろう。
本発明はまた、本明細書に記載及び提供される核酸配列によりコードされる、とりわけ、核酸配列Ａ及び／又はＢによりコードされるアミノ酸配列及びタンパク質（この文脈では互換的に使用される）に関する。核酸配列Ａ及びＢを含む核酸によりコードされるアミノ酸配列（タンパク質）の組み合わせは、本明細書に記載及び提供されるｉＴＣＲの調製を提供するか又はそれに有用である。したがって、本発明はまた、核酸配列Ａ及びＢを含む核酸によりコードされるアミノ酸配列（タンパク質）を使用することにより調製されるか、又は核酸配列Ａ及びＢを含む核酸を使用することにより調製されるｉＴＣＲに関する。本明細書に記載されるように、ｉＴＣＲは、アルファ及びベータ鎖の対形成の障害を示すＴＣＲであって、アルファ及びベータ鎖の両方に（本明細書に記載される）Ｃ末端誘導性二量体化ドメインを含むが、適切な二量体化剤の追加により二量体化するＴＣＲである。ＴＣＲの対形成能力は、本発明との関連では、所定のＴＣＲ産生細胞の細胞膜において、細胞膜における（それぞれ配列番号２及び４に示されるＴＣＲ定常アルファ及びベータ鎖を有する）ネイティブヒトＴＣＲの量と比較して少なくとも２、３、４又は５倍未満のＴＣＲが測定され得る場合に「損なわれた」とみなされ得る。適切な測定方法は当技術分野で公知であり、例えば、本明細書に例示されるフローサイトメトリーを含む。
本発明はまた、配列番号２と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８，５％又は９９％）同一のアミノ酸配列及びタンパク質コード核酸配列であって、配列番号４のネイティブヒトＴＣＲ定常ベータ鎖と対形成することができないＴＣＲ定常アルファ鎖をコードするアミノ酸配列及びタンパク質コード核酸配列に関する。本発明はまた、配列番号４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８％又は９８，５％）同一のアミノ酸配列及びタンパク質コード核酸配列であって、配列番号２のネイティブヒトＴＣＲ定常アルファ鎖と対形成することができないＴＣＲ定常ベータ鎖をコードするアミノ酸配列及びタンパク質コード核酸配列に関する。
本明細書に記載されるように、（下流連結された二量体化ドメインを有するそれぞれＴＣＲアルファ又はベータ鎖をコードする）核酸Ａ又はＢによりコードされる（それぞれＴＣＲ定常アルファ又はベータ鎖をコードする）配列番号２又は４と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８，５％又は９９％）同一のアミノ酸配列に連結された誘導性二量体化ドメインは、適切な二量体化剤の追加により二量体化して、両鎖を一緒にする。このような二量体化剤は、当業者に公知であるように、本明細書で提供される組み合わせ又は組成物の核酸分子を使用して調製すべきｉＴＣＲのアルファ及びベータ鎖に連結された対応する二量体化ドメインに依存する。例えば、適切な二量体化剤は、（各二量体化ドメインに応じて）タモキシフェン（例えば、４－ヒドロキシタモキシフェン）、エンドキシフェン、ＡＰ２１９６７、４－（１－［４－（ジメチルアミノエトキシ）フェニル］－２－フェニル－１－ブテニル）フェノール及び２３，２７－エポキシ－３Ｈ－ピリド［２，１－ｃ］［１，４］オキサアザシクロヘントリアコンチン、ＦＫ１０１２、ＦＫ５０６、ＦＫＣｓＡ、ラパマイシン、クメルマイシン、ジベレリン、ＨａＸＳ及びＴＭＰ－ＨＴａｇを含む。本発明の一実施態様では、特に核酸配列Ａ及びＢによりコードされる二量体化ドメインであるエストロゲンレセプター（例えば、ＥＲＴ２）の場合、二量体化剤は、タモキシフェン又はエンドキシフェン、好ましくはエンドキシフェンである。適切な二量体化ドメイン／二量体化剤ペアの例は表４に示されている。
Figure 0007412006000004
本発明はまた、それぞれ配列番号２又は４（核酸配列Ａの場合には配列番号２及び核酸配列Ｂの場合には配列番号４）と少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７，５％、９８％、９８，５％又は９９％（好ましくは、少なくとも９８，５％又は９９％）同一のアミノ酸配列に連結された二量体化ドメインに対応する二量体化剤と一緒に、本明細書に記載及び提供される核酸配列Ａ及び／若しくはＢを含む１つ以上の核酸分子を含む組み合わせ若しくは組成物、本明細書に記載及び提供される発現カセット、本明細書に記載及び提供される宿主細胞並びに／又は本明細書に記載及び提供されるベクターを含むキットに関し、前記二量体化剤は、前記二量体化ドメインの二量体化を誘導することができる。二量体化ドメインの二量体化を誘導する能力は、本明細書にも例示される当技術分野で公知の方法により測定され得る。本質的に、薬剤の追加により、細胞膜において、本発明の方法、組み合わせ、組成物、化合物、ベクター、宿主細胞又はキットを使用して調製されたｉＴＣＲの増加した発現及び局在化が測定され得る場合、前記薬剤は、本発明との関連では、誘導性二量体化ドメインを二量体化することができる；好ましくは、所定の宿主細胞の細胞膜では、前記二量体化剤の追加なしの場合よりも少なくとも２倍、３倍、４倍又は５倍（好ましくは、少なくとも５倍）多いｉＴＣＲが存在する。細胞表面上のＴＣＲを測定するための適切な方法は当技術分野で公知であり、フローサイトメトリーを含む（例えば、図２を参照のこと）。二量体化ドメイン及び二量体化剤の適切なペアは表４に例示されている。
本発明はまた、本明細書に記載及び提供される核酸配列Ａ及び核酸配列Ｂを含む核酸分子、本明細書に記載及び提供される発現カセット並びに／又は本明細書に記載及び提供されるベクターを含む宿主細胞に関する。適切な宿主細胞は当技術分野で公知であり、とりわけ、原核及び真核細胞、好ましくは真核細胞、例えば哺乳動物細胞を含む。宿主細胞は、例えば、産生宿主細胞又はエフェクター宿主細胞を含み得る。
本発明にしたがって、様々な宿主細胞が使用され得る。本明細書で使用される場合、「宿主細胞」という用語は、本明細書に記載される核酸分子若しくはベクターのレシピエントであり得るか若しくは前記レシピエントであった、及び／又は本発明のアミノ酸配列（すなわち、タンパク質）（例えば、ｉＴＣＲ）を発現する（及び場合により分泌する）細胞を包含する。「細胞」及び「細胞培養物」という用語は、特に明確な指定がない限り、互換的に使用される。「宿主細胞」という用語はまた、「宿主細胞株」を含む。一般に、「宿主細胞」という用語は原核細胞又は真核細胞を含み、限定されないが、細菌細胞、酵母細胞、真菌細胞、植物細胞及び動物細胞、例えば昆虫細胞及び哺乳動物細胞、例えばマウス細胞、ラット細胞、マカク細胞又はヒト細胞などが挙げられる。上記を考慮して、したがって、本発明は、とりわけ、本明細書に記載されるアミノ酸配列（例えば、ｉＴＣＲ）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド又はベクター、例えば発現ベクターを含む宿主細胞を提供する。本発明のポリヌクレオチド及び／又はベクターは、当技術分野で公知の慣用的な方法を使用して、例えばトランスフェクション、トランスフォーメーションなどにより宿主細胞に導入され得る。
「トランスフェクション」は、核酸分子又はポリヌクレオチド（ベクターを含む）をターゲット細胞に計画的に導入するプロセスである。例は、ＲＮＡトランスフェクション、すなわち、ＲＮＡ（例えば、in vitroで転写されるＲＮＡ、すなわちｉｖｔＲＮＡ）を宿主細胞に導入するプロセスである。前記用語は、主に、真核細胞における非ウイルス的方法に使用される。「トランスダクション」という用語は、多くの場合、ウイルス媒介性核酸分子又はポリヌクレオチド移入を説明するために使用される。動物細胞のトランスフェクションは、典型的には、材料の取り込みを可能にするために、細胞膜に一過性の孔又は「穴」を開けることを含む。トランスフェクションは、リン酸カルシウム法を使用して、エレクトロポレーションにより、細胞のスクイージングにより、又は陽イオン性脂質を材料と混合してリポソームを生成し、これを細胞膜と融合させ、その積荷を内側に蓄積させることにより行なわれ得る。真核宿主細胞をトランスフェクションするための例示的な技術としては、脂質小胞媒介性取り込み、熱ショック媒介性取り込み、リン酸カルシウム媒介性トランスフェクション（リン酸カルシウム／ＤＮＡの共沈降）、マイクロインジェクション及びエレクトロポレーションが挙げられる。
「トランスフォーメーション」という用語は、細菌細胞への、及びまた非動物真核細胞（植物細胞を含む）への核酸分子又はポリヌクレオチド（ベクターを含む）の非ウイルス的移入を説明するために使用される。したがって、トランスフォーメーションは、細胞膜を通したその周囲からの直接的な取り込み及びその後の外来性遺伝物質（核酸分子）の取り込みから生じる細菌細胞又は非動物真核細胞の遺伝子改変である。トランスフォーメーションは、人工的な手段により行なわれ得る。トランスフォーメーションが起こるために、細胞又は細菌は、トランスフォーメーション受容性状態になければならず、これは飢餓及び細胞密度などの環境条件に対する期間限定の応答として起こり得る。原核生物トランスフォーメーションのために、技術としては、熱ショック媒介性取り込み、インタクトな細胞と細菌プロトプラストとの融合、マイクロインジェクション及びエレクトロポレーションが挙げられ得る。植物トランスフォーメーションのための技術としては、例えば、A. tumefaciensによるAgrobacterium媒介性移入、急速に噴射されるタングステン又は金ミクロ射出粒子、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション及びポリエチレングリコール媒介性取り込みが挙げられる。上記を考慮して、したがって、本発明はさらに、本明細書に記載される少なくとも１つのポリヌクレオチド配列及び／又はベクターを含む宿主細胞を提供する。
本発明のアミノ酸配列（例えば、タンパク質）の発現のために、挿入されたポリヌクレオチド配列の発現をモデュレーションし、並びに／又は所望により遺伝子産物（すなわち、ＲＮＡ及び／又はタンパク質）を改変及びプロセシングする宿主細胞が選択され得る。遺伝子産物のこのような改変（例えば、グリコシル化）及びプロセシング（例えば、切断）は、ＴＣＲの機能に重要であり得る。異なる宿主細胞が、遺伝子産物の翻訳後プロセシング及び改変のための特徴的かつ特異的な機序を有する。産物の正しい改変及びプロセシングを確実にするために、適切な細胞株又は宿主系が選択され得る。この目的のために、一次転写産物の適切なプロセシング、遺伝子産物のグリコシル化及びリン酸化のための細胞機序を有する真核宿主細胞が使用され得る。（ａ）特に可溶形の本発明のタンパク質（例えば、ｉＴＣＲ）を発現させ及び取得するための宿主細胞（「産生宿主細胞」）、並びに（ｂ）本発明のＴＣＲを発現し、エフェクター機能を有する宿主細胞（「エフェクター宿主細胞」）を提供することが本明細書で想定される。このような「フェクター宿主細胞」は治療適用に特に有用であり、それを必要とする被験体への投与に想定される。好ましい「エフェクター宿主細胞」としては、リンパ球、例えば細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、ナチュラルキラーＴ（ＮＫＴ）細胞、ガンマ／デルタＴ細胞が挙げられる。
本発明のタンパク質の発現のために使用される「産生宿主細胞」は、好ましくは、多量のリコンビナントタンパク質を発現することができる。「産生宿主細胞」として使用され得る例示的な哺乳動物宿主細胞としては、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞、例えばＤＨＦＲマイナスＣＨＯ細胞、例えばＤＧ４４及びＤＵＸＢＩ １細胞、ＮＳＯ細胞、ＣＯＳ細胞（ＳＶ４０Ｔ抗原を有するＣＶＩの誘導体）、ＨＥＫ２９３細胞（ヒト腎臓細胞）及びＳＰ２細胞（マウス骨髄腫細胞）が挙げられる。他の例示的な宿主細胞株としては、限定されないが、ＨＥＬＡ（ヒト子宮頸ガン）、ＣＶＩ（マウス腎臓株）、ＶＥＲＹ、ＢＨＫ（ベビーハムスター腎臓）、ＭＤＣＫ、２９３、ＷＩ３８、Ｒ１６１０（チャイニーズハムスター線維芽細胞）、ＢＡＬＢＣ／３Ｔ３（マウス線維芽細胞）、ＨＡＫ（ハムスター腎臓株）、Ｐ３ｘ６３－Ａｇ３．６５３（マウス骨髄腫）、ＢＦＡ－ＩｃＩＢＰＴ（ウシ内皮細胞）及びＲＡＪＩ（ヒト白血球）が挙げられる。宿主細胞株は、典型的には、業者American Tissue Culture Collection (ATCC)又は公開されている文献から入手可能である。細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞又は植物細胞などの非哺乳動物細胞も容易に入手可能であり、上記「産生宿主細胞」としても使用され得る。例示的な細菌宿主細胞としては、腸内細菌、例えばEscherichia coli、Salmonella; Bacillaceae、例えばBacillus subtilis; Pneumococcus; Streptococcus及びHaemophilus influenzaが挙げられる。他の宿主細胞としては、酵母細胞、例えばSaccharomyces cerevisiae及びPichia pastorisが挙げられる。昆虫細胞としては、限定されないが、Spodoptera frugiperda細胞が挙げられる。前記によれば、考えられる発現系（すなわち、上記発現ベクターを含む宿主細胞）としては、リコンビナントバクテリオファージＤＮＡ、プラスミドＤＮＡ又はコスミドＤＮＡ発現ベクターを用いてトランスフォーメーションされた細菌（例えば、E. coli、B. subtilis）などの微生物；リコンビナント酵母発現ベクターでトランスフォーメーションされた酵母（例えば、Saccharomyces、Pichia）；リコンビナントウイルス発現ベクター（例えば、バキュロウイルス）に感染させた昆虫細胞系；リコンビナントウイルス発現ベクター（例えば、カリフラワーモザイクウイルス、ＣａＭＶ；タバコモザイクウイルス、ＴＭＶ）に感染させたか又はリコンビナントプラスミド発現ベクター（例えば、Ｔｉプラスミド）を用いてトランスフォーメーションされた植物細胞系が挙げられる。哺乳動物細胞のゲノムに由来するプロモーター（例えば、メタロチオネインプロモーター）又は哺乳動物ウイルスに由来するプロモーター（例えば、アデノウイルス後期プロモーター；ワクシニアウイルス７．５Ｋプロモーター、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）主要最初期プロモーター（ＭＩＥＰ）プロモーター）を含有するリコンビナント発現構築物を有する哺乳動物発現系は、多くの場合に好ましい。適切な哺乳動物宿主細胞は、公知の細胞株（例えば、ＣＯＳ細胞、ＣＨＯ細胞、ＢＬＫ細胞、２９３細胞、３Ｔ３細胞）から選択され得るが、しかしながら、細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、ナチュラルキラーＴ（ＮＫＴ）細胞、γ／δＴ細胞などのリンパ球を使用することも考えられる。
前記によれば、本発明はまた、本明細書に記載されるタンパク質を生産及び取得するための方法であって、（ｉ）前記タンパク質の発現を引き起こす条件下で宿主細胞（すなわち、産生宿主細胞）をインキュベーションする工程、及び（ｉｉ）前記タンパク質を精製する工程を含む方法を提供する。発現ベクターを有する宿主細胞を、本明細書で提供されるタンパク質、特に本明細書に記載されるそれぞれ核酸配列Ａ及びＢによりコードされる定常アルファ鎖及び／又はベータ鎖の産生に適切な条件下で成長させ、アルファ鎖及び／又はベータ鎖のタンパク質合成についてアッセイする。二本鎖ＴＣＲの発現のために、アルファ鎖及びベータ鎖の両方をコードするベクターは、分子全体の発現のために宿主細胞において共発現され得る。
本発明のタンパク質（例えば、ｉＴＣＲ）が発現されたら、それは、当技術分野で公知の任意の精製方法により、例えば、クロマトグラフィー（例えば、イオン交換クロマトグラフィー（例えば、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー）、アフィニティクロマトグラフィー、特にプロテインＡ、プロテインＧ、若しくはレクチンアフィニティクロマトグラフィー、サイズカラムクロマトグラフィー）、遠心分離、示差溶解度、疎水性相互作用クロマトグラフィーにより、又はタンパク質の精製のための任意の他の標準的な技術により精製され得る。当業者は、回収すべきタンパク質の個々の特徴に基づいて適切な精製方法を容易に選択することができるであろう。
前述のように、本発明はまた、本発明のヌクレオチド配列、ベクター又はタンパク質を含む「エフェクター宿主細胞」を提供する。前記エフェクター宿主細胞は、慣用的な方法を使用して、本発明のタンパク質をコードする核酸配列を含むように改変され、本明細書に記載されるタンパク質を特に細胞表面上で発現すると想定される。本発明の目的のために、「本発明のタンパク質を発現する改変宿主細胞」は、一般に、例えば添付の実施例に記載されているＲＮＡトランスフェクションにより、本発明のタンパク質を発現するように処理又は変化された（エフェクター又は産生）宿主細胞を指す。本明細書の他の場所に記載されるものなどの他の改変方法又はトランスフェクション法又はトランスダクション法も想定される。したがって、「改変宿主細胞」という用語は、本発明のタンパク質を好ましくは発現する「トランスフェクションされた」、「トランスダクションされた」及び「遺伝子操作された」宿主細胞を含む。好ましくは、このような「（改変）エフェクター宿主細胞」（特に「（改変）エフェクターリンパ球」）は、タンパク質がその特異的な抗原ターゲットに結合すると、細胞内シグナル伝達を通してエフェクター機能を媒介することができる。このようなエフェクター機能としては、例えば、パーフォリン（ターゲット細胞膜に穴を作る）、グランザイム（細胞内で作用してアポトーシスをトリガーするプロテアーゼである）の遊離、Ｆａｓリガンド（Ｆａｓを有するターゲット細胞においてアポトーシスを活性化する）の発現、並びにサイトカイン、好ましくはＴｈ１／Ｔｃ１サイトカイン、例えばＩＦＮ－γ、ＩＬ－２及びＴＮＦ－αの遊離が挙げられる。したがって、処置すべき被験体におけるその抗原ターゲットを認識してそれに結合することができる本発明のタンパク質を発現するように操作されたエフェクター宿主細胞は、上記エフェクター機能を実行し、それにより、ターゲット（例えば、ガン）細胞を死滅させると想定される。ターゲット細胞の細胞溶解は、例えば、トランスフェクションレシピエントＴ細胞との共培養中に蛍光標識ターゲット細胞の消失を検出するＣＴＬ蛍光死滅アッセイ(CTL, USA)を用いて評価され得る。
上記を考慮して、エフェクター宿主細胞は、好ましくは、機能的ｉＴＣＲ（すなわち、これは、典型的には本明細書に記載されるｉＴＣＲアルファ鎖及びベータ鎖を含む）；並びにまた、シグナル伝達サブユニットＣＤ３ガンマ、デルタ、イプシロン及びゼータ（ＣＤ３複合体）を発現する。また、共レセプターのＣＤ４又はＣＤ８の発現も望ましい場合がある。一般に、抗原の結合、レセプターの活性化及び下流シグナリングに関与する必要な遺伝子（例えば、Ｌｃｋ、ＦＹＮ、ＣＤ４５及び／又はＺａｐ７０）を有するリンパ球、すなわちＴ細胞は、エフェクター宿主細胞として特に適切である。しかしながら、「結合ドメイン」として本発明のＴＣＲを発現するが、ＣＤ３シグナル伝達サブユニット及び／又は前記下流シグナリング分子を含まない（すなわち、本明細書に記載される抗原ターゲットを認識することができるが、ＣＤ３及び／又は前記下流シグナリング分子により媒介されるエフェクター機能を有しない）エフェクター宿主細胞も本明細書で想定される。このようなエフェクター細胞は、本明細書に記載される抗原ターゲットを認識することができ、場合により、ＣＤ３シグナリング及び／又は前記下流シグナリング分子のシグナリングに関連しない他の機能を引き起こすことができると想定される。例としては、本発明のタンパク質を発現し、例えば、抗原ターゲットの認識により細胞傷害性顆粒を放出することができるＮＫ又はＮＫＴ細胞が挙げられる。したがって、細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ナチュラル-キラー（ＮＴ）細胞、ナチュラルキラーＴ（ＮＫＴ）細胞、γ／δＴ細胞は、本発明によれば、有用なリンパ球エフェクター宿主細胞であると考えられる。本発明のリコンビナントｉＴＣＲを発現するこのようなリンパ球はまた、本明細書では「改変エフェクターリンパ球」とも称される。しかしながら、当業者は、一般に、当技術分野で公知のリコンビナント遺伝子操作方法により、所望のエフェクター機能をもたらすタンパク質シグナリング経路の任意の成分を適切な宿主細胞に導入し得ることを容易に認識するであろう。エフェクター宿主細胞、特にリンパ球、例えばＴ細胞は、処置すべき被験体から得られ、本発明のタンパク質を発現するようにトランスフォーメーション又はトランスダクションされた自己宿主細胞であり得る。典型的には、タンパク質のリコンビナント発現は、添付の実施例に記載されているウイルスベクターを使用することにより達成されるであろう。患者から細胞を取得及び単離するための技術は、当技術分野で公知である。前述のように、本明細書で提供されるエフェクター宿主細胞は、治療適用に特に想定される。治療有効性を増加させるために、宿主細胞のさらなる遺伝子改変が望ましい場合がある。例えば、「エフェクター宿主細胞」として自己ＣＤ８＋Ｔ細胞を使用する場合、適切なさらなる改変としては、内因性ＴＣＲ、ＣＴＬＡ－４及び／又はＰＤ－１の発現のダウンレギュレーション；並びに／又は、ＣＤ２８、ＣＤ１３４、ＣＤ１３７などの共刺激分子の増幅が挙げられる。上述の遺伝子改変を達成するための手段及び方法は、当技術分野で記載されている。
宿主細胞のターゲットゲノム遺伝子操作方法は当技術分野で公知であり、ｓｉＲＮＡを用いた遺伝子ノックダウンの他に、いわゆる「プログラム可能なヌクレアーゼ」、例えばジンクフィンガーヌクレアーゼ（ＺＦＮ）、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ（ＴＡＬＥＮ）及びとりわけKim & Kim Nature Reviews Genetics 15, 321-334 (2014)に議論されている細菌のクラスタ化され規則的に間隔があいた短い回文構造の繰返し（ＣＲＩＳＰＲ）－Ｃａｓ（ＣＲＩＳＰＲ関連）系から誘導されるＲＮＡ誘導操作ヌクレアーゼ（ＲＧＥＮ）が挙げられる。例えば、ＴＡＬＥＮなどのプログラム可能なヌクレアーゼは、ＰＤ－１、ＣＴＬＡ－４又は内因性ＴＣＲなどの「所望ではない」タンパク質をコードするＤＮＡ領域を切断し、それにより、それらの発現を減少させるために用いられ得る。Ｔ細胞を（エフェクター）宿主細胞として使用する場合、内因性ＴＣＲのダウンレギュレーションは、内因性及び外因性ＴＣＲアルファ鎖／ベータ鎖の望ましくない「誤対形成」を減少させる利点を有する。
本発明はまた、本明細書に記載及び提供される核酸配列Ａによりコードされるタンパク質及び核酸配列Ｂによりコードされるタンパク質を二量体化するための、本明細書に記載される二量体化剤の使用に関する。本発明の一実施態様では、本明細書に記載及び提供される核酸配列Ａによりコードされるタンパク質及び核酸配列Ｂによりコードされるタンパク質を二量体化するために使用すべき二量体化剤は、エンドキシフェンであり得る。
本発明はさらに、本明細書に記載及び提供される核酸配列Ａによりコードされるタンパク質及び核酸配列Ｂによりコードされるタンパク質を二量体化するための方法であって、本明細書に記載される二量体化剤（例えば、タモキシフェン又はエンドキシフェン、好ましくはエンドキシフェン）を前記タンパク質に追加する工程を含む方法に関する。
本発明はさらに、誘導性Ｔ細胞レセプター（ｉＴＣＲ）を調製するための方法であって、本明細書に記載及び提供される核酸配列Ａ及び核酸配列Ｂ、本明細書に記載及び提供される発現カセット又は本明細書に記載及び提供されるベクターを、前記核酸配列Ａ及び前記核酸配列Ｂの発現を可能にする条件下で、宿主細胞にin vitroで導入する工程を含む方法に関する。適切なトランスフォーメーション／トランスダクション方法及び発現方法は当技術分野で公知であり、本明細書にも記載される。
本発明はさらに、改変Ｔ細胞、例えばＴリンパ球を生成するための、本明細書に記載及び提供される組み合わせ若しくは組成物、本明細書に記載及び提供される発現カセット又は本明細書に記載及び提供されるベクターの使用に関する。
本発明はさらに、Ｔ細胞療法において使用するための、本明細書に記載及び提供される組み合わせ若しくは組成物、本明細書に記載及び提供される発現カセット、本明細書に記載及び提供されるベクター、本明細書に記載及び提供される宿主細胞又は本明細書に記載及び提供されるタンパク質に関する。
本発明はさらに、ガンの処置において使用するための、本明細書に記載及び提供される組み合わせ若しくは組成物、本明細書に記載及び提供される発現カセット、本明細書に記載及び提供されるベクター、本明細書に記載及び提供される宿主細胞又は本明細書に記載及び提供されるタンパク質に関する。この文脈で処置され得るガンは、全ての種類のガン、特に固形ガン（例えば、小細胞上肺ガン、乳ガン、結腸直腸ガン、膵臓ガン、卵巣ガン、皮膚ガン、前立腺ガン、脳又は神経系のガン、頭頸部ガン、精巣ガン、肺ガン、肝臓ガン、腎臓ガン、膀胱ガン、胃腸ガン、骨ガン、内分泌系のガン、リンパ系のガン、線維肉腫、神経直腸腫瘍、中皮腫、類表皮ガン腫又はカポジ肉腫）及び血液ガン（白血病）を含む。
本発明はさらに、本明細書に記載及び提供される組み合わせ組成物、本明細書に記載及び提供される発現カセット組成物、本明細書に記載及び提供されるベクター組成物、本明細書に記載及び提供される宿主細胞組成物又は本明細書に記載及び提供されるタンパク質組成物を含む医薬組成物に関する。
「医薬組成物」という用語は、特に、ヒトへの投与に適切な組成物を指す。しかしながら、非ヒト動物への投与に適切な組成物もまた、一般に、前記用語により包含される。医薬組成物及びその成分（すなわち、活性剤及び場合により賦形剤）は、好ましくは、薬学的に許容し得るものであり、すなわち、レシピエントにおいて望ましくない局所作用又は全身作用を全く引き起こさずに、所望の治療効果を誘発することができる。本発明の薬学的に許容し得る組成物は、例えば、無菌であり得る。具体的には、「薬学的に許容し得る」という用語は、動物、より具体的にはヒトにおける使用のために、規制当局又は他の一般に認められている薬局方により承認されていることを意味し得る。上記活性剤（例えば、宿主細胞又はｉＴＣＲ）は、好ましくは、医薬組成物中に治療有効量で存在する。「治療有効量」は、所望の治療効果を誘発する活性剤の量を意味する。治療有効性及び毒性は、標準的な手順により、例えば細胞培養物又は試験動物において、例えばＥＤ５０（個体群の５０％に治療効果がある用量）及びＬＤ５０（個体群の５０％に致死的である用量）で決定され得る。治療効果と毒性作用との間の用量比は治療指数であり、これはＥＤ５０／ＬＤ５０比として表現され得る。大きな治療指数を示す医薬組成物が好ましい。
核酸、タンパク質、ベクター又は宿主細胞の正確な投与量は、公知の技術を使用して当業者により確認可能であろう。適切な投与量は、十分な量の本発明の活性剤を提供し、好ましくは治療に有効であり、すなわち、所望の治療効果を誘発する。当技術分野で公知であるように、処置の目的（例えば、寛解維持対疾患の急性増悪）、投与経路、投与時刻及び投与頻度、製剤、年齢、体重、全般的な健康状態、性別、食事、疾患状態の重症度、薬物の組み合わせ、反応過敏性及び治療法に対する耐容性／応答性のための調整が必要であり得る。適切な投与量範囲は、細胞培養アッセイ及び動物試験から得られたデータを使用して決定され得、ＥＤ５０が含まれ得る。典型的には、投与量は、投与経路に応じて、０．１～１０００００μgで変化し得、総用量は最大約２ｇであり得る。本発明の活性剤の例示的な投与量は、約０．０１mg/kg～約１０mg/kg、約０．１mg/kg～約１０mg/kg、約１mg/kg～約１０mg/kg、約１mg/kg～約５mg/kg、約０．０１mg/kg～約１mg/kg又は約０．１mg/kg～約１mg/kgの範囲内である。特定の投与量及び送達方法に関する指針は、文献に提供されている。処置は、本発明の活性剤の治療有効用量の単回投与又は治療有効用量の複数回投与を必要とし得ることが認識されている。例えば、いくつかの医薬組成物は、特定の組成物の製剤、半減期及びクリアランス速度に応じて、３～４日間毎に１回、週１回又は２週間毎に１回又は１カ月以内に１回投与され得る。医薬組成物は、１つ以上の賦形剤及び／又はさらなる活性剤を場合により含み得る。
「賦形剤」という用語は、充填剤、結合剤、崩壊剤、コーティング剤、吸着剤、接着防止剤、潤滑剤、保存剤、抗酸化剤、芳香剤、着色剤、甘味剤、溶媒、共溶媒、緩衝剤、キレート剤、粘度付与剤、表面活性剤、希釈剤、湿潤剤、担体、希釈剤、保存剤、乳化剤、安定化剤及び等張化剤を含む。所望の本発明の医薬組成物を調製するために適切な賦形剤を選択することは当業者の知識範囲内である。本発明の医薬組成物に使用するための例示的な担体としては、食塩水、緩衝食塩水、デキストロース及び水が挙げられる。典型的には、適切な賦形剤の選択は、とりわけ、使用される活性剤、処置すべき疾患、及び医薬組成物の所望の製剤に依存するであろう。
本発明はさらに、上記に詳述される１つ以上の本発明の活性剤（例えば、宿主細胞又はｉＴＣＲ構築物）と、処置すべき疾患の治療及び／又は予防に適切な１つ以上のさらなる活性剤とを含む医薬組成物を提供する。組み合わせに適切な活性成分の好ましい例としては、公知の抗ガン薬、例えばシスプラチン、マイタンシン誘導体、ラケルマイシン、カリケアマイシン、ドセタキセル、エトポシド、ゲムシタビン、イホスファミド、イリノテカン、メルファラン、ミトキサントロン、ポルフィマーナトリウム、フォトフリンＩＩ、テモゾロミド、トポテカン、グルクロン酸トリメトレキサート、アウリスタチンＥ、ビンクリスチン及びドキソルビシン；並びに、ペプチド細胞毒素、例えばリシン、ジフテリア毒素、シュードモナス細菌外毒素Ａ、ＤＮＡアーゼ及びＲＮＡアーゼ；放射性核種、例えばヨウ素１３１、レニウム１８６、インジウム１１１、イットリウム９０、ビスマス２１０及び２１３、アクチニウム２２５及びアスタチン２１３；プロドラッグ、例えば抗体に指向する酵素プロドラッグ；免疫刺激剤、例えばＩＬ－２、ケモカイン、例えばＩＬ－８、血小板因子４、悪性黒色腫成長刺激タンパク質など、抗体又はそのフラグメント、例えば抗ＣＤ３抗体又はそのフラグメント、補体活性化因子、異種タンパク質ドメイン、同種タンパク質ドメイン、ウイルス／細菌タンパク質ドメイン及びウイルス／細菌ペプチドが挙げられる。様々な経路が、本発明の医薬組成物の投与のために適用可能である。典型的には、投与は非経口的に達成されるであろう。非経口送達方法としては、局所、動脈内、筋肉内、皮下、髄内、くも膜下腔内、脳室内、静脈内、腹腔内、子宮内、膣内、舌下又は鼻腔内投与が挙げられる。
本発明の医薬組成物は、とりわけ、使用される活性剤に応じて様々な剤形で、例えば固形剤、液剤、気体剤形、若しくは凍結乾燥剤形で製剤化され得、とりわけ、軟膏、クリーム、経皮パッチ、ゲル、散剤、錠剤、液剤、エアゾール、顆粒剤、丸剤、懸濁剤、乳化剤、カプセル剤、シロップ剤、液剤、エリキシル剤、エキス剤、チンキ剤、若しくは液体エキス剤の剤形で、又は所望の投与方法に特に適切な剤形で製剤化され得る。医薬を生産するためのそれ自体が公知のプロセスは、Remington’s Pharmaceutical Sciences (Ed. Maack Publishing Co, Easton, Pa., 2012)の第２２版に示され、例えば、慣用的な混合、溶解、造粒、糖衣錠作製、研和、乳化、カプセル化、封鎖又は凍結乾燥プロセスを含み得る。例えば、本明細書に記載される宿主細胞を含む医薬組成物は、典型的には、液体剤形で提供され、好ましくは薬学的に許容し得る緩衝液を含む。本発明の医薬組成物が調製された後、それらを適切な容器に入れ、示された容態の処置のためにラベルされ得る。このようなラベルは、例えば、投与量、投与頻度及び投与方法を含むであろう。
上記を考慮して、したがって、本発明は、医薬として使用するための、本明細書に記載されるタンパク質（例えば、ｉＴＣＲ）、核酸、ベクター及び／又は宿主細胞を提供する。「処置」という用語は、その全ての文法形において、それを必要とする被験体の治療的又は予防的処置を含む。「治療的処置又は予防的処置」は、臨床徴候及び／若しくは病的徴候の完全予防を目的とする予防的処置、又は臨床徴候及び／若しくは病的徴候の回復又は寛解を目的とする治療的処置を含む。したがって、「処置」という用語はまた、疾患の回復又は予防を含む。
「被験体」又は「個体」又は「動物」又は「患者」という用語は、治療が望まれる任意の被験体、特に哺乳動物被験体を指すために本明細書で互換的に使用される。哺乳動物被験体としては、一般に、ヒト、非ヒト霊長類、イヌ、ネコ、モルモット、ウサギ、ラット、マウス、ウマ、ウシ、雌ウシなどが挙げられる。しかしながら、本明細書で提供されるタンパク質（例えば、ｉＴＣＲ）、核酸、ベクター、宿主細胞及び医薬組成物は、ヒト被験体の処置のために特に想定されることが容易に理解されるであろう。
治療のために、タンパク質（例えば、ｉＴＣＲ）、核酸、ベクター（例えば、ウイルスベクター）又は宿主細胞は、それを必要とする被験体に直接投与され得る。前記方法は、（ａ）本発明の（ｉ）タンパク質（例えば、ｉＴＣＲ）、（ｉｉ）核酸、（ｉｉｉ）ベクター、（ｉｖ）宿主細胞及び／又は（ｖ）医薬組成物の１つ以上を提供する工程；並びに（ｂ）（ｉ）～（ｖ）の１つ以上をそれを必要とする被験体に投与する工程を含み得る。場合により、前記方法は、ガン治療のさらに他の工程、例えば放射線療法又は１つ以上の抗ガン剤の投与を含み得る。
本発明の処置はまた、（ａ）リンパ球を含む被験体のサンプルを提供する工程；（ｂ）本発明のタンパク質（例えば、ｉＴＣＲ）、核酸、ベクター、宿主細胞及び／又は医薬組成物の１つ以上を提供する工程、（ｃ）工程（ｂ）の（ｉ）～（ｖ）の１つ以上を工程（ａ）のリンパ球に導入し、それにより、改変リンパ球を得る工程、（ｄ）工程（ｃ）の改変リンパ球をそれを必要とする被験体又は患者に投与する工程を含み得る。工程（ａ）で提供されるリンパ球は、前記「エフェクター宿主細胞」であると特に想定され、有利には、Ｔ細胞、ＮＫ細胞及び／又はＮＫＴ細胞、特にＣＤ８＋Ｔ細胞から選択され；当技術分野で公知な慣用的な方法により、以前の工程（ａ’）で被験体のサンプル（特に血液サンプル）から得られ得る。しかしながら、本発明のタンパク質（例えば、ｉＴＣＲ）を好ましくは発現することができ、本明細書に記載される所望の生物学的エフェクター機能を発揮する他のリンパ球を使用することも考えられる。また、前記リンパ球は、典型的には、被験体の免疫系との適合性のために選択され、すなわち、前記リンパ球は、好ましくは免疫反応を誘発しないであろう。例えば、「遍在的レシピエント細胞」、すなわちin vitroで成長及びエクスパンションさせることのできる所望の生物学的エフェクター機能を発揮する遍在的な適合性のリンパ球を使用することが考えられる。したがって、このような細胞の使用は、工程（ａ）における被験体自身のリンパ球を入手及び提供する必要性がないであろう。ex vivo工程（ｃ）の導入は、エレクトロポレーションを介して、本明細書に記載される核酸又はベクターをリンパ球に導入することにより、又はエフェクター宿主細胞との関連で以前に記載されるレンチウイルスベクター若しくはレトロウイルスベクターなどのウイルスベクターでリンパ球を感染させることにより実施され得る。他の考えられる方法としては、リポソームなどのトランスフェクション試薬の使用、すなわち一過性ＲＮＡトランスフェクションが挙げられる。例えば、（レトロ）ウイルスベクター又は一過性ＲＮＡトランスフェクションによる（初代）Ｔ細胞への抗原特異的ＴＣＲ遺伝子の移入は、その後にドナーに再導入され得る腫瘍関連抗原特異的Ｔ細胞であって、前記抗原を発現する腫瘍細胞を特異的にターゲティング及び破壊する腫瘍関連抗原特異的Ｔ細胞を生成するための有望なツールに相当する。
上記を考慮して、したがって、本発明のさらなる態様は、改変リンパ球を生成するための、本明細書の他の場所に記載されるタンパク質（例えば、ｉＴＣＲ）、核酸配列、ベクター及び／又は宿主細胞の使用である。例えば、核酸及びベクターをリンパ球に導入するための手段及び方法は当技術分野で公知であり、上記本明細書に記載される。
本明細書で使用される場合、「ａ」、「ａｎ」及び「ｔｈｅ」という単数形は、文脈上特に明確な指示がない限り、複数の対象物を含むことに注意しなければならない。したがって、例えば、「試薬」への言及は、１つ以上のこのような異なる試薬を含み、「方法」への言及は、本明細書に記載される方法について改変又は置き換えられ得る当業者に公知な等価な工程及び方法への言及を含む。
特に指示がない限り、一連の又は最小量のエレメントの前にある「少なくとも」という用語は、一連の全てのエレメントを指すと理解すべきである。当業者は、単に慣用的な実験を使用して、本明細書に記載される本発明の具体的な実施態様に対する多くの均等物を認識又は確認することができるであろう。このような均等物は、本発明により包含されることが意図される。また、「少なくとも」という用語は、厳密な量および上限を含み、例えば、「少なくとも５つ」はまた、「厳密に５つ」の意味を包含し、又は「少なくとも３つ」は、「厳密に３つ」を含む。
「及び／又は」という用語は、本明細書で使用される場合にはいつでも、「及び」、「又は」及び「前記用語により接続されるエレメントの全ての組み合わせ又は任意の他の組み合わせ」の意味を含む。
本明細書で使用される場合、「約」又は「およそ」という用語は、所定の数値又は範囲の２０％以内、好ましくは１０％以内、より好ましくは５％以内を意味する。しかしながら、それはまた具体数を含み、例えば「約２０」は２０を含む。
「未満」、「少なくとも」又は「超える」という用語は具体数を含む。例えば、２０未満は、２０未満か又はそれに等しいことを意味する。同様に、多い又は超えるは、それぞれ多いか若しくはそれに等しい、又は超えるか若しくはそれに等しいことを意味する。
本明細書及びそれに続く特許請求の範囲の全体を通して、文脈上特に必要がない限り、「含む（comprise）」という単語及び「含む（comprises）」及び「含む（comprising）」などの変化形は、記載の整数若しくは工程、又は整数群若しくは工程群を包含するが、任意の他の整数若しくは工程、又は整数群若しくは工程群を排除するものではないと理解されるであろう。本明細書で使用される場合、「含む（comprising）」という用語は、「含有する」若しくは「含む（including）」という用語、又は本明細書で使用される場合、「有する」という用語で置換され得ることがある。また、「含む」及びその変形はまた、「からなる」という意味を含む。
本明細書で使用される場合、「からなる」は、特許請求の範囲の構成要件に明記されていないあらゆるエレメント、工程又は成分を排除する。本明細書で使用される場合、「から本質的になる」は、特許請求の範囲の基本的かつ新規な特徴に実質的に影響を及ぼさない材料又は工程を排除しない。
本明細書における各場合では、「含む」、「から本質的になる」及び「からなる」という用語はいずれも、他の２つの用語のいずれかと置き換えられ得る。
本発明は、本明細書に記載される特定の方法、プロトコール、材料、試薬及び物質に限定されず、したがって変更され得ると理解すべきである。本明細書で使用される用語は、特定の実施態様を説明する目的のためだけのものであり、本発明の範囲を限定する意図はなく、本発明の範囲は特許請求の範囲のみにより定義される。
本明細書の文書全体で引用される全ての刊行物及び特許（全ての特許、特許出願、科学文献、製造業者の仕様書、説明書などを含む）（上記又は下記）はその全体が参照により本明細書に組み入れられる。本明細書中のものはいずれも、本発明が先行発明を理由としてこのような開示に先んじる権利がないことの承認であると捉えられるものではない。参照により組み入れられる材料が本明細書と相反するか又は矛盾する範囲では、本明細書は、任意のこのような材料を取り替えるであろう。
本明細書で使用される場合、「ポリヌクレオチド」又は「核酸」という用語は、ポリリボヌクレオチド配列及びポリデオキシリボヌクレオチド配列、例えば、各々一本鎖及び／又は二本鎖形で鎖状若しくは環状の改変又は改変されていないＲＮＡ又はＤＮＡ又はその混合物（ハイブリッド分子を含む）を含む。したがって、本発明の核酸は、ＤＮＡ（例えば、ｄｓＤＮＡ、ｓｓＤＮＡ、ｃＤＮＡ）、ＲＮＡ（例えば、ｄｓＲＮＡ、ｓｓＲＮＡ、ｍＲＮＡ、ｉｖｔＲＮＡ）、その組み合わせ又はその誘導体（例えば、ＰＮＡ）を含む。「核酸配列」又は「（ポリ）ヌクレオチド配列」という用語は、本明細書では互換的に使用される。同様に、当業者には明らかであるように、「アミノ酸配列」、「ポリペプチド」又はタンパク質という用語は、本明細書では互換的に使用され得る。
ポリヌクレオチドは、慣用的なホスホジエステル結合又は非慣用的な結合（例えば、アミド結合、例えば、ペプチド核酸（ＰＮＡ）に見られるような）を含み得る。本発明のポリヌクレオチドはまた、１つ以上の改変塩基、例えばトリチル化塩基及び異常な塩基、例えばイノシンを含有し得る。本発明の結合分子がポリヌクレオチドから発現され得る限り、他の改変（化学的改変、酵素的改変又は代謝的改変を含む）も考えられ得る。ポリヌクレオチドは、本明細書の他の場所で定義される単離形態で提供され得る。ポリヌクレオチドは、調節配列、例えば転写コントロール配列（プロモーター、エンハンサー、オペレーター、リプレッサー及び転写終結シグナルを含む）、リボソーム結合部位、イントロンなどを含み得る。
本発明はさらに、ｉＴＣＲ機能をスクリーニング又は試験するための方法であって、ベクター（例えば、レンチウイルスベクター、例えばｐＣＤＨなど）を使用して、レポーター遺伝子（例えば、蛍光タンパク質、例えばＧＦＰ、ＹＦＰ、ＣＦＰ、ｅＧＦＰ、ｉｅＧＦＰ；好ましくはｉｅＧＦＰ）を宿主細胞（例えば、ＴＣＲ－宿主細胞；好ましくはＴリンパ球、例えばＪｕｒｋａｔ－７６など）に導入する工程、ベクター（例えば、レンチウイルスベクター、例えばｐＣＤＨなど；好ましくは前記レポーター遺伝子と同じベクター）を使用して、本明細書に記載及び提供される核酸配列Ａ及びＢを含む１つ以上の核酸分子（好ましくは発現カセット；「ｉＴＣＲ構築物」）を同じ宿主細胞にさらに導入する工程、本明細書に記載される二量体化剤（例えば、エストロゲンレセプター（例えば、ＥＴＲ２）が二量体化ドメインである場合にはタモキシフェン又はエンドキシフェン）と一緒に前記宿主細胞を、（ｉ）ＴＣＲにより認識される抗原ペプチドと共にインキュベーションする工程、並びに前記レポーター遺伝子のシグナリングを、ヒトネイティブＴＣＲ遺伝子カセット（すなわち、定常アルファ及びベータ鎖の下流に連結された二量体化ドメインを有しないそれぞれ配列番号２及び４のＴＣＲ定常アルファ及びベータ鎖）を除いて同じベクター構築物が導入されたコントロール細胞のものと比較する工程を含む方法に関する。細胞膜への（ｉ）ＴＣＲの取り込みは、当技術分野で公知の方法により、例えば、本明細書に例示されるフローサイトメトリーにより測定され得る（例えば、図４及び実施例３を参照のこと）。ｉＴＣＲ構築物で処理された宿主細胞と、ネイティブＴＣＲで処理された細胞との同程度のシグナリングは、本発明によるｉＴＣＲ機能の成功を示す。この文脈における「同程度」は、例えば、ｉＴＣＲ構築物を有する宿主細胞のシグナリングが、ネイティブＴＣＲ構築物を有する宿主細胞のものの少なくとも６０％、７０％、８０％又は９０％ほどの強さ、好ましくはネイティブＴＣＲ構築物を有する宿主細胞のものの少なくとも９３％、９５％、９６％、９８％、９８，５％又は９９％ほどの強さである場合を意味し得る。
図１は、誘導性ＴＣＲの概略図を示す。点突然変異（「アスタリスク」）は、所定のＴＣＲの定常（「ｃ」）アルファ（「α」）及びベータ（「β」）鎖に導入されている。突然変異により、ＴＣＲアルファ－ＣＤ３及びＴＣＲベータ－ＣＤ３複合体は、小胞体中で対形成し得ない。二量体化ドメイン（「ＤＤ」）又はあるいはヘテロ二量体化ドメイン（「ＨＤ」）は、同じＴＣＲの定常アルファ及びベータ鎖の両方のＣ末端に挿入されている。二量体化又はヘテロ二量体化剤（「ＤＡ又はＨＡ」）の導入により、アルファ及びベータ鎖の対形成並びにＣＤ３（「ＣＤ３」）及びＴＣＲを含むその後の機能クラスタの形成（ＣＤ３ゼータ鎖（「ζ鎖」、ゼータ鎖」を含む）が発生し得るので、ＴＣＲは、細胞の表面上で発現され得る。 図２は、誘導性ＴＣＲ Ｇ１１－３（ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３、ＭＨＣ－ＩＩ拘束ＴＣＲ）をトランスダクションし、１０μM ４－ヒドロキシタモキシフェン（４－ヒドロキシタモキシフェン、４－（１－［４－（ジメチルアミノエトキシ）フェニル］－２－フェニル－１－ブテニル）フェノール、Sigma-Aldrich、ＤＭＳＯ中５mMストック）による誘導の６時間後に、ＣＤ３－ＴＣＲ複合体の膜発現についてフローサイトメトリーにより試験したＴＣＲ－Ｊｕｒｋａｔ－７６（Ｊｕｒｋａｔ７６細胞は、ＣＤ８陰性ヒトＴ細胞リンパ腫Ｊｕｒｋａｔ細胞株のＴＣＲα－及びβ－誘導体であり、M. Heemskerkにより寄贈された）細胞を示す。細胞を含有する細胞培養培地で４－ヒドロキシタモキシフェンを１０μMに希釈し（中央のプロット）、又は４－ヒドロキシタモキシフェンを追加しなかった（「タモキシフェンなし」、左端及び右端のプロット）。非トランスダクションＪｕｒｋａｔ－７６細胞をＴＣＲ発現のネガティブコントロールとして使用し、、ｗｔ Ｇ１１－３をトランスダクションしたＪｕｒｋａｔ－７６ (Milosevic S. et al., J Virol 2006 Nov 80(21):10357-64)をＧ１１－３ ＴＣＲ発現のポジティブコントロールとして使用した。細胞を抗ＣＤ３－ＰＥＣｙ７及び抗ｐａｎＴＣＲ－ＰＥで染色した。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。 図３ａは、１０μM ４－ヒドロキシタモキシフェンによる誘導後に、又はタモキシフェンを用いずに、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３をトランスダクションし、ＣＤ３－ＴＣＲ複合体の膜発現についてフローサイトメトリーにより評価したＴＣＲ－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞を示す。非トランスダクションＴＣＲ－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞をＴＣＲ発現のネガティブコントロールとして使用した。細胞を抗ＣＤ３－ＰＥＣｙ７及び抗ｐａｎＴＣＲ－ＰＥで染色し、４－ヒドロキシタモキシフェン処理の０．５時間、１時間、４時間、６時間及び２４時間後にフローサイトメトリーを実施した。図３ｂは、５μM又は１０μM ４－ヒドロキシタモキシフェンのいずれかを使用した経時的（０．５時間、１時間、４時間、６時間及び２４時間）なｉＴＣＲ－Ｇ１１－３誘導の動態を示す。細胞を抗ＣＤ３－ＰＥＣｙ７及び抗ｐａｎＴＣＲ－ＰＥで染色し、４－ヒドロキシタモキシフェン処理の０．５時間、１時間、４時間、６時間及び２４時間後にフローサイトメトリーを実施した。graphPad Prism 7を使用して、グラフをプロットした。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。 図３ａは、１０μM ４－ヒドロキシタモキシフェンによる誘導後に、又はタモキシフェンを用いずに、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３をトランスダクションし、ＣＤ３－ＴＣＲ複合体の膜発現についてフローサイトメトリーにより評価したＴＣＲ－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞を示す。非トランスダクションＴＣＲ－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞をＴＣＲ発現のネガティブコントロールとして使用した。細胞を抗ＣＤ３－ＰＥＣｙ７及び抗ｐａｎＴＣＲ－ＰＥで染色し、４－ヒドロキシタモキシフェン処理の０．５時間、１時間、４時間、６時間及び２４時間後にフローサイトメトリーを実施した。図３ｂは、５μM又は１０μM ４－ヒドロキシタモキシフェンのいずれかを使用した経時的（０．５時間、１時間、４時間、６時間及び２４時間）なｉＴＣＲ－Ｇ１１－３誘導の動態を示す。細胞を抗ＣＤ３－ＰＥＣｙ７及び抗ｐａｎＴＣＲ－ＰＥで染色し、４－ヒドロキシタモキシフェン処理の０．５時間、１時間、４時間、６時間及び２４時間後にフローサイトメトリーを実施した。graphPad Prism 7を使用して、グラフをプロットした。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。 図３ａは、１０μM ４－ヒドロキシタモキシフェンによる誘導後に、又はタモキシフェンを用いずに、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３をトランスダクションし、ＣＤ３－ＴＣＲ複合体の膜発現についてフローサイトメトリーにより評価したＴＣＲ－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞を示す。非トランスダクションＴＣＲ－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞をＴＣＲ発現のネガティブコントロールとして使用した。細胞を抗ＣＤ３－ＰＥＣｙ７及び抗ｐａｎＴＣＲ－ＰＥで染色し、４－ヒドロキシタモキシフェン処理の０．５時間、１時間、４時間、６時間及び２４時間後にフローサイトメトリーを実施した。図３ｂは、５μM又は１０μM ４－ヒドロキシタモキシフェンのいずれかを使用した経時的（０．５時間、１時間、４時間、６時間及び２４時間）なｉＴＣＲ－Ｇ１１－３誘導の動態を示す。細胞を抗ＣＤ３－ＰＥＣｙ７及び抗ｐａｎＴＣＲ－ＰＥで染色し、４－ヒドロキシタモキシフェン処理の０．５時間、１時間、４時間、６時間及び２４時間後にフローサイトメトリーを実施した。graphPad Prism 7を使用して、グラフをプロットした。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。 図４は、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及び誘導性ＮＦＡＴ応答性ＧＦＰレポーター（ｉｅＧＦＰ）をトランスダクションし、５μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで６時間誘導したＪｕｒｋａｔ－７６を示す。関連ＴＤＡＷＲＦＡＭＮＹＰＲＮＰＴ（「ＴＤＡ」）ペプチド又は非関連ＰＥＶＷＩＬＳＰＬＬＲＨＧ（「ＰＥＶ」）ペプチドのいずれかをロードしたＬＣＬを培養物に追加した。共培養物におけるＬＣＬ：Ｊｕｒｋａｔ－７６の比は１：１であった。ｗｔ（野生型）Ｇ１１－３をトランスダクションしたＪｕｒｋａｔ－７６をポジティブコントロールとして使用した。コインキュベーションの２４時間後にフローサイトメトリーを実施し、ＣＤ３、ＴＣＲ及びＧＦＰ発現について細胞を評価した。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。 図５ａは、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及びｉｅＧＦＰをトランスダクションし、１μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで一晩誘導し、又は処理せずに放置した（なし）Ｊｕｒｋａｔ－７６を示す。非関連ＰＥＶペプチドをロードしたＬＣＬを培養物に追加し、Incucyte Zoomデバイス(IncuCyte Zoom HD/2CLR System, Essen Bioscience)を使用してＧＦＰ誘導を経時的に追跡した（１時間、１．５時間及び３．５時間が示されている）。図５ｂは、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及びｉｅＧＦＰをトランスダクションし、１μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで一晩誘導し、又は処理せずに放置した（なし）Ｊｕｒｋａｔ－７６を示す。関連ＴＤＡペプチドをロードしたＬＣＬを培養物に追加し、Incucyte Zoomデバイスを使用してＧＦＰ誘導を経時的に追跡した（１時間、１．５時間及び３．５時間が示されている）。図５ｃ：ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及びｉｅＧＦＰをトランスダクションしたＪｕｒｋａｔ－７６を、０．１μM、１μM又は５μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで一晩誘導した。関連ＴＤＡペプチドをロードしたＬＣＬを培養物に追加し、Incucyte Zoomデバイスを使用してＧＦＰ誘導を１３時間追跡した。ｗｔ－Ｇ１１－３をトランスダクションしたＪｕｒｋａｔ－７６をポジティブコントロールとして使用した。動態の最初の１４時間が示されている。Excelを使用して、グラフをプロットした。ＧＦＰ蛍光強度は、緑色較正単位（ＧＣＵ）×mm2としてｙ軸に示されている。 図５ａは、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及びｉｅＧＦＰをトランスダクションし、１μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで一晩誘導し、又は処理せずに放置した（なし）Ｊｕｒｋａｔ－７６を示す。非関連ＰＥＶペプチドをロードしたＬＣＬを培養物に追加し、Incucyte Zoomデバイス(IncuCyte Zoom HD/2CLR System, Essen Bioscience)を使用してＧＦＰ誘導を経時的に追跡した（１時間、１．５時間及び３．５時間が示されている）。図５ｂは、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及びｉｅＧＦＰをトランスダクションし、１μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで一晩誘導し、又は処理せずに放置した（なし）Ｊｕｒｋａｔ－７６を示す。関連ＴＤＡペプチドをロードしたＬＣＬを培養物に追加し、Incucyte Zoomデバイスを使用してＧＦＰ誘導を経時的に追跡した（１時間、１．５時間及び３．５時間が示されている）。図５ｃ：ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及びｉｅＧＦＰをトランスダクションしたＪｕｒｋａｔ－７６を、０．１μM、１μM又は５μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで一晩誘導した。関連ＴＤＡペプチドをロードしたＬＣＬを培養物に追加し、Incucyte Zoomデバイスを使用してＧＦＰ誘導を１３時間追跡した。ｗｔ－Ｇ１１－３をトランスダクションしたＪｕｒｋａｔ－７６をポジティブコントロールとして使用した。動態の最初の１４時間が示されている。Excelを使用して、グラフをプロットした。ＧＦＰ蛍光強度は、緑色較正単位（ＧＣＵ）×mm2としてｙ軸に示されている。 図５ａは、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及びｉｅＧＦＰをトランスダクションし、１μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで一晩誘導し、又は処理せずに放置した（なし）Ｊｕｒｋａｔ－７６を示す。非関連ＰＥＶペプチドをロードしたＬＣＬを培養物に追加し、Incucyte Zoomデバイス(IncuCyte Zoom HD/2CLR System, Essen Bioscience)を使用してＧＦＰ誘導を経時的に追跡した（１時間、１．５時間及び３．５時間が示されている）。図５ｂは、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及びｉｅＧＦＰをトランスダクションし、１μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで一晩誘導し、又は処理せずに放置した（なし）Ｊｕｒｋａｔ－７６を示す。関連ＴＤＡペプチドをロードしたＬＣＬを培養物に追加し、Incucyte Zoomデバイスを使用してＧＦＰ誘導を経時的に追跡した（１時間、１．５時間及び３．５時間が示されている）。図５ｃ：ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及びｉｅＧＦＰをトランスダクションしたＪｕｒｋａｔ－７６を、０．１μM、１μM又は５μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで一晩誘導した。関連ＴＤＡペプチドをロードしたＬＣＬを培養物に追加し、Incucyte Zoomデバイスを使用してＧＦＰ誘導を１３時間追跡した。ｗｔ－Ｇ１１－３をトランスダクションしたＪｕｒｋａｔ－７６をポジティブコントロールとして使用した。動態の最初の１４時間が示されている。Excelを使用して、グラフをプロットした。ＧＦＰ蛍光強度は、緑色較正単位（ＧＣＵ）×mm2としてｙ軸に示されている。 ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及びｉｅＧＦＰをトランスダクションしたＪｕｒｋａｔ－７６を０．０５μM又は０．１μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで一晩誘導した。サンプルを洗浄し、洗浄の１時間、２時間及び４時間後に、関連ＴＤＡペプチドをロードしたＬＣＬを追加し、Incucyte Zoomデバイスを使用してＧＦＰ誘導を追跡した。ポジティブコントロール（左端列の写真）では、関連ＴＤＡペプチドをロードしたＬＣＬを培養物に追加し、洗浄を実施しなかった。 図７ａは、誘導性ＴＣＲ ｉＴＣＲ ＮＹ－ＥＳＯ（ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ、ＭＨＣ－Ｉ拘束ＴＣＲ、上プロット）又はｗｔ－ＮＹ－ＥＳＯ ＴＣＲ（下プロット）のいずれかをトランスダクションし、ＣＤ３－ＴＣＲ複合体の膜発現についてフローサイトメトリーにより試験したＴＣＲ－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞を示す。トランスダクション細胞はまた、ＢＦＰ（青色蛍光タンパク質。ｉＴＣＲをコードするベクターはまた、別個に発現されるレポーター遺伝子として青色蛍光タンパク質（ｍＴａｇ－ＢＦＰ）を含有するので、トランスダクション細胞のみがＢＦＰ陽性である）を発現する（左のプロット）。右のプロットは、ＢＦＰ＋細胞のＣＤ３及びＴＣＲ染色を示す。細胞を抗ＣＤ３－ＰＥＣｙ７及び抗ｐａｎＴＣＲ－ＰＥで染色した。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。図７ｂは、誘導性ＴＣＲ ＮＹ－ＥＳＯ（ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ、ＭＨＣ－Ｉ拘束ＴＣＲ、上プロット）又はｗｔ－ＮＹ－ＥＳＯ ＴＣＲ（下プロット）のいずれかをトランスダクションし、１μM ４－ヒドロキシタモキシフェン（ＤＭＳＯ中５mMストック）で誘導したＴＣＲ－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞を示す。細胞を含有する細胞培養培地で４－ヒドロキシタモキシフェンを１０μMに希釈した。トランスダクション細胞はまた、ＢＦＰを発現する（左のプロット）。右のプロットは、ＢＦＰ＋細胞のＣＤ３及びＴＣＲ染色を示す。細胞を抗ＣＤ３－ＰＥＣｙ７及び抗ｐａｎＴＣＲ－ＰＥで染色した。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。 図７ａは、誘導性ＴＣＲ ｉＴＣＲ ＮＹ－ＥＳＯ（ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ、ＭＨＣ－Ｉ拘束ＴＣＲ、上プロット）又はｗｔ－ＮＹ－ＥＳＯ ＴＣＲ（下プロット）のいずれかをトランスダクションし、ＣＤ３－ＴＣＲ複合体の膜発現についてフローサイトメトリーにより試験したＴＣＲ－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞を示す。トランスダクション細胞はまた、ＢＦＰ（青色蛍光タンパク質。ｉＴＣＲをコードするベクターはまた、別個に発現されるレポーター遺伝子として青色蛍光タンパク質（ｍＴａｇ－ＢＦＰ）を含有するので、トランスダクション細胞のみがＢＦＰ陽性である）を発現する（左のプロット）。右のプロットは、ＢＦＰ＋細胞のＣＤ３及びＴＣＲ染色を示す。細胞を抗ＣＤ３－ＰＥＣｙ７及び抗ｐａｎＴＣＲ－ＰＥで染色した。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。図７ｂは、誘導性ＴＣＲ ＮＹ－ＥＳＯ（ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ、ＭＨＣ－Ｉ拘束ＴＣＲ、上プロット）又はｗｔ－ＮＹ－ＥＳＯ ＴＣＲ（下プロット）のいずれかをトランスダクションし、１μM ４－ヒドロキシタモキシフェン（ＤＭＳＯ中５mMストック）で誘導したＴＣＲ－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞を示す。細胞を含有する細胞培養培地で４－ヒドロキシタモキシフェンを１０μMに希釈した。トランスダクション細胞はまた、ＢＦＰを発現する（左のプロット）。右のプロットは、ＢＦＰ＋細胞のＣＤ３及びＴＣＲ染色を示す。細胞を抗ＣＤ３－ＰＥＣｙ７及び抗ｐａｎＴＣＲ－ＰＥで染色した。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。 図８ａ：ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ－ｍＴａｇ－ＢＦＰ（ＭＨＣ－Ｉ拘束ＴＣＲ）及びｉｅＧＦＰをトランスダクションしたＪｕｒｋａｔ－７６を、非関連ＶＬＤＧＬＤＶＬＬペプチド又は関連ペプチドＳＬＬＭＷＩＴＱＣのいずれかをロードしたＴ２細胞と共にインキュベーションした。共培養物におけるＴ２：Ｊｕｒｋａｔ－７６の比は１：１であった。ＣＤ１９のコインキュベーション染色の２４時間後にフローサイトメトリーを実施し、青色蛍光、ＡＰＣ及びＦＩＴＣチャネルの蛍光を決定した。ゲーティング戦略は、ＣＤ１９－（陰性）（したがって、ＣＤ１９＋（陽性）であるＴ２ターゲット細胞を除く）及びＢＦＰ＋でゲーティングし、ＦＡＣＳのＦＩＴＣチャネルのｉｅＧＦＰの蛍光を決定することであった。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。図８ｂ：ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ（ＭＨＣ－Ｉ拘束ＴＣＲ）及びｉｅＧＦＰをトランスダクションしたＪｕｒｋａｔ－７６を、１μMエンドキシフェン（（Ｅ／Ｚ）－エンドキシフェン塩酸塩水和物、Sigma-Aldrich））で一晩誘導し、次いで、非関連ＶＬＤＧＬＤＶＬＬ（「Ｔ２－ｉｒｒ．Ｐｅｐｔ．」）ペプチド又は関連ペプチドＳＬＬＭＷＩＴＱＣ（「Ｔ２－ｒｅｌ．ｐｅｐｔ．」）のいずれかをロードしたＴ２細胞と共にインキュベーションした。共培養物におけるＴ２：Ｊｕｒｋａｔ－７６の比は１：１であった。コインキュベーションの２４時間後にフローサイトメトリーを実施し、ＢＦＰ（トランスダクタント）、ＣＤ３、ＴＣＲ及びＧＦＰ発現について細胞を評価した。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。 図８ａ：ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ－ｍＴａｇ－ＢＦＰ（ＭＨＣ－Ｉ拘束ＴＣＲ）及びｉｅＧＦＰをトランスダクションしたＪｕｒｋａｔ－７６を、非関連ＶＬＤＧＬＤＶＬＬペプチド又は関連ペプチドＳＬＬＭＷＩＴＱＣのいずれかをロードしたＴ２細胞と共にインキュベーションした。共培養物におけるＴ２：Ｊｕｒｋａｔ－７６の比は１：１であった。ＣＤ１９のコインキュベーション染色の２４時間後にフローサイトメトリーを実施し、青色蛍光、ＡＰＣ及びＦＩＴＣチャネルの蛍光を決定した。ゲーティング戦略は、ＣＤ１９－（陰性）（したがって、ＣＤ１９＋（陽性）であるＴ２ターゲット細胞を除く）及びＢＦＰ＋でゲーティングし、ＦＡＣＳのＦＩＴＣチャネルのｉｅＧＦＰの蛍光を決定することであった。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。図８ｂ：ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ（ＭＨＣ－Ｉ拘束ＴＣＲ）及びｉｅＧＦＰをトランスダクションしたＪｕｒｋａｔ－７６を、１μMエンドキシフェン（（Ｅ／Ｚ）－エンドキシフェン塩酸塩水和物、Sigma-Aldrich））で一晩誘導し、次いで、非関連ＶＬＤＧＬＤＶＬＬ（「Ｔ２－ｉｒｒ．Ｐｅｐｔ．」）ペプチド又は関連ペプチドＳＬＬＭＷＩＴＱＣ（「Ｔ２－ｒｅｌ．ｐｅｐｔ．」）のいずれかをロードしたＴ２細胞と共にインキュベーションした。共培養物におけるＴ２：Ｊｕｒｋａｔ－７６の比は１：１であった。コインキュベーションの２４時間後にフローサイトメトリーを実施し、ＢＦＰ（トランスダクタント）、ＣＤ３、ＴＣＲ及びＧＦＰ発現について細胞を評価した。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。 ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ（ＭＨＣ－Ｉ拘束ＴＣＲ）をトランスダクションしたＣＤ８＋ＰＢＬ又はｗｔ－ＮＹ－ＥＳＯを発現するＣＤ８＋ＰＢＬを１、５、１０若しくは２０μMエンドキシフェンで一晩誘導し、又は誘導せずに放置した（エンドキシフェンなし）。誘導の２４時間後、関連ペプチドＳＬＬＭＷＩＴＱＣ又は非関連ペプチドＶＬＤＧＬＤＶＬＬをロードしたＴ２細胞を培養物に追加した。Ｔ２ターゲットによる刺激の２４時間後に培養上清を用いて実施した標準的なＩＦＮ－γＥＬＩＳＡにより、ＩＦＮ－γ分泌を検出した。誘導の４８時間後にフローサイトメトリーを実施し、ＢＦＰ（トランスダクタント）、ＣＤ３及びＢＶ６－５について細胞を評価した。示されている例示的なプロットは、誘導なしの場合の又は２０μMエンドキシフェンありの場合のｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯトランスダクションＣＤ８＋ＰＢＬである。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。graphPad Prism 7を使用して、グラフをプロットした。 ｉ－ＮＹ－ＥＳＯ（ＭＨＣ－Ｉ拘束ＴＣＲ）をトランスダクションしたＣＤ８＋ＰＢＬ又はｗｔ－ＮＹ－ＥＳＯを発現するＣＤ８＋ＰＢＬを１０μMエンドキシフェンで２０時間誘導し（＋誘導）、又は処理せずに放置した（誘導なし）。次いで、細胞を、関連ペプチドをロードしたＮｕｃｌｉｇｈｔＲｅｄを発現するＴ２細胞（＋ｐｅｐｔ）又は非関連コントロールペプチドをロードしたＴ２ ＮｕｃｌｉｇｈｔＲｅｄ細胞（＋ｃｔｒｌ）と共にインキュベーションした。Incucyte Zoomデバイスを使用して、Ｔ２細胞の死滅を経時的に追跡した。Ａ）写真は、Ｔ細胞及びターゲット細胞のインキュベーションの４２時間後を示す。上パネルでは、Ｔ細胞をエンドキシフェンで誘導しなかった。下パネルは、エンドキシフェンで誘導したＴ細胞を示す。Ｔ２ ＮｕｃｌｉｇｈｔＲｅｄ細胞は中央に表示されており、暗灰色である。エフェクター細胞は薄灰色である。Ｂ）グラフは、経時的なＴ２ ＮｕｃｌｉｇｈｔＲｅｄ細胞の密度（最大４２時間）を示す。モックは、非トランスダクションＣＤ８＋ＰＢＬである。 ヒト定常アルファ領域のＩＭＧＴによるアミノ酸ナンバリング命名法を使用したＴＣＲアルファ定常領域：http://www.imgt.org/IMGTrepertoire/Proteins/alleles/index.php?species=Homo%20sapiens&group=TRAC&gene=TRAC1, ヒト定常アルファ領域のＩＭＧＴによるアミノ酸ナンバリング命名法を使用したＴＣＲアルファ定常領域：http://www.imgt.org/IMGTrepertoire/Proteins/alleles/index.php?species=Homo%20sapiens&group=TRAC&gene=TRAC1, ヒト定常アルファ領域のＩＭＧＴによるアミノ酸ナンバリング命名法を使用したＴＣＲアルファ定常領域：http://www.imgt.org/IMGTrepertoire/Proteins/alleles/index.php?species=Homo%20sapiens&group=TRAC&gene=TRAC1, ヒト定常ベータ領域対立遺伝子Ｃ１のＩＭＧＴによるアミノ酸ナンバリング命名法を使用したＴＣＲベータ定常領域：http://www.imgt.org/IMGTrepertoire/Proteins/alleles/index.php?species=Homo%20sapiens&group=TRBC&gene=TRBC1. ヒト定常ベータ領域対立遺伝子Ｃ１のＩＭＧＴによるアミノ酸ナンバリング命名法を使用したＴＣＲベータ定常領域：http://www.imgt.org/IMGTrepertoire/Proteins/alleles/index.php?species=Homo%20sapiens&group=TRBC&gene=TRBC1. ヒト定常ベータ領域対立遺伝子Ｃ１のＩＭＧＴによるアミノ酸ナンバリング命名法を使用したＴＣＲベータ定常領域：http://www.imgt.org/IMGTrepertoire/Proteins/alleles/index.php?species=Homo%20sapiens&group=TRBC&gene=TRBC1. ヒト定常ベータ領域対立遺伝子Ｃ１のＩＭＧＴによるアミノ酸ナンバリング命名法を使用したＴＣＲベータ定常領域：http://www.imgt.org/IMGTrepertoire/Proteins/alleles/index.php?species=Homo%20sapiens&group=TRBC&gene=TRBC1. ＰＲＡＭＥ抗原を認識するｗｔ ＴＣＲ（ｗｔ ＴＣＲ）、並びに定常ベータ鎖（配列番号４）におけるアミノ酸残基４、５及び３７がそれぞれＶ、Ｐ及びＫに突然変異したＰＲＡＭＥ抗原を認識するＴＣＲをトランスダクションしたＴＣＲ－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞。モックコントロールは、非トランスダクションＪｕｒｋａｔ－７６ ＴＣＲ－／－細胞である。ＣＤ３及びＴＣＲ発現について、フローサイトメトリーにより細胞を評価した。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。 ｉｅＧＦＰレポーターを含有するＴＣＲ－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞を、定常アルファ及びベータ鎖の両Ｃ末端にエストロゲンレセプターを有し、定常ベータ鎖（配列番号４）におけるアミノ酸残基４、５及び３７がそれぞれＶ、Ｐ及びＫに突然変異したＧ１１－３ ＴＣＲでトランスダクションした。細胞を１μMエンドキシフェンで２４時間誘導した。次いで、細胞を、関連ＴＤＡＷＲＦＡＭＮＹＰＲＮＰＴペプチド（関連）又は非関連ＰＥＶＷＩＬＳＰＬＬＲＨＧペプチド（非関連）のいずれかをロードしたＬＣＬ細胞と共にインキュベーションした。共培養物におけるＬＣＬ：Ｊｕｒｋａｔ－７６の比は１：１であった。コインキュベーションの２４時間後に、誘導ｅＧＦＰのフローサイトメトリー評価を実施した。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。
以下の実施例は本発明を例示するが、しかしながら、本発明及び特許請求の範囲を限定するものではない。
実施例
略語及び同義語
ＡＰＣ 抗原提示細胞
ＢＦＰ 青色蛍光タンパク質
ＥＲ 小胞体
ＥＲＴ２ エストロゲンレセプター（突然変異された変異体）
ＧＦＰ 緑色蛍光タンパク質
ｉＴＣＲ 誘導性ＴＣＲ
ｉｅＧＦＰ 誘導性強化ＧＦＰ
ＬＣＬ リンパ芽球様細胞株
Ｏｎ／ｏｆｆ 誘導性ＴＣＲ
ＰＢＬ 末梢血リンパ球
ＴＣＲ Ｔ細胞レセプター
４－ＯＨ－タモキシフェン ４－ヒドロキシタモキシフェン
実施例１：Ｔ細胞レセプターを誘導性にする
ＴＣＲアルファ及びベータ鎖対形成を障害することを目的として、本発明者らは、ＴＣＲアルファ定常及びＴＣＲベータ定常領域のアミノ酸突然変異であって、ＴＣＲアルファ及びベータ鎖対形成を障害するるが、ＴＣＲアルファ鎖とＣＤ３イプシロン及びＣＤ３デルタとの対形成、並びにＴＣＲベータ鎖とＣＤ３ガンマ及びＣＤ３イプシロンとの対形成を妨げないアミノ酸突然変異を検索した。このようなアミノ酸を同定するために、本発明者らは文献の広範な検索を行い、公知のＴＣＲの結晶構造がＴＣＲアルファ及びベータ鎖とＣＤ３サブユニットとの不変相互作用を保持することを検討した（表２及び３）。問題のＴＣＲを誘導性にするために、二量体化（例えば、ＥＲＴ２）又はヘテロ二量体化（例えば、ＦＫＢＰ、ＦＲＢ）ドメインを、各突然変異非対形成アルファ及びベータ定常領域のＣ末端に挿入する。このｉＴＣＲを有する細胞を二量体化剤（例えば、４－ヒドロキシタモキシフェン、４－（１－［４－（ジメチルアミノエトキシ）フェニル］－２－フェニル－１－ブテニル）フェノール、Sigma-Aldrich）又はヘテロ二量体剤（例えば、ＡＰ２１９６７、２３，２７－エポキシ－３Ｈ－ピリド［２，１－ｃ］［１，４］オキサアザシクロヘントリアコンチン；Sigma-Aldrich）に曝露することにより、ＴＣＲα－ＣＤ３εδ複合体は、小胞体中でＴＣＲβ－ＣＤ３εγ複合体と対形成し、続いて、ＴＣＲα－ＣＤ３εδ－ＴＣＲβ－ＣＤ３εγは、ゴルジ装置中でＣＤ３ζとアセンブルされ、細胞表面に輸送されるはずである(Feige MJ., et al. J Biol Chem. 2015 Oct 30; 290(44):26821-31)。ｉＴＣＲが細胞表面上にあると、それは、元の非誘導性ＴＣＲと同等に、抗原提示細胞（ＡＰＣ）により提示されるそのｐＭＨＣ複合体を認識するはずである（図１）。
実施例２：Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞における４－ヒドロキシタモキシフェンを使用した、ＭＨＣクラスＩＩ拘束ｉＴＣＲアルファ及びベータ鎖対形成の障害並びにアルファ及びベータ対形成の誘導の試験
ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３を含有する合成カセットをレンチウイルスベクターｐＣＤＨにクローニングし、０．５×１０６個のＴＣＲ－／－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞にトランスダクションした（図２～６）。ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３ ＴＣＲカセットは、ＭＨＣクラスＩＩ拘束ＴＣＲ Ｇ１１－３のＶ－アルファ及びＶ－ベータ配列と(Milosevic S. et al., J Virol 2006 Nov 80(21):10357-64)、表２に示されているアルファ及びベータ定常領域に突然変異と、各アルファ及びベータ定常領域のＣ末端にＥＲＴ２とを含有する。ＥＲＴ２は、エストロゲンレセプターのヒトリガンド結合ドメインの突然変異型であり、タモキシフェン活性代謝産物に結合し得るが、エストラジオールに結合し得ない(Feil R., et al., Biochem Biophys Res Commun. 1997 Aug 28;237(3):752-7)。ＥＲＴ２ヌクレオチド及びアミノ酸配列は、それぞれ配列番号７及び８に示されている。フローサイトメトリーを使用して、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３を有する非誘導性Ｊｕｒｋａｔ細胞を抗ＣＤ３（ＣＤ３－ＰＥＣｙ７、ＳＫ７、５５７８５１、BD）及び抗ＴＣＲ（ｐａｎＴＣＲ－ＰＥ、ＩＰ２６、Ｂ４９１７７、Beckman Coulter）で染色することにより、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３の発現の欠如を試験した。４－ヒドロキシタモキシフェンによる誘導がない場合、ＣＤ３又はＴＣＲを細胞の表面上で検出することができなかった。対照的に、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３を有するＪｕｒｋａｔ細胞を１０μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで誘導することにより、誘導の６時間後に、ＴＣＲ及びＣＤ３の両方を細胞の表面上で検出することができた（図２）。ｉＴＣＲの表面発現を検出し得る最も早い時点及び最も遅い時点を特定するために、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３を有するＪｕｒｋａｔ細胞を５又は１０μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで誘導し、処理の０．５時間、１時間、４時間、６時間及び２４時間後に、ＣＤ３及びＴＣＲ発現についてアッセイした（図３ａ及び３ｂ）。非誘導性Ｊｕｒｋａｔ及び非トランスダクションＴＣＲ－／－ＪｕｒｋａｔをＴＣＲ／ＣＤ３表面発現のネガティブコントロールとして使用した。誘導の４時間後に表面ｉＴＣＲ発現を検出することができ、２４時間後であっても発現は持続していた。
実施例３：Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞における４－ヒドロキシタモキシフェンを用いた、ｉＴＣＲアルファ及びベータ鎖対形成の誘導後のＭＨＣクラスＩＩ拘束ｉＴＣＲ機能の試験
一般に、ＴＣＲトランスダクションＪｕｒｋａｔ細胞は、ｐＭＨＣ認識によりサイトカインを分泌しないので、本発明者らは、機能的ＴＣＲシグナリングのリードアウトとして誘導性ＮＦＡＴ応答性ＧＦＰレポーターカセット（ｉｅＧＦＰ）を使用した。ｉｅＧＦＰカセットをレンチウイルスベクターｐＣＤＨ(System Biosciences)にクローニングし、０．５×１０６個のＴＣＲ－／－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞にトランスダクションした。次いで、ｉｅＧＦＰを有する同じＪｕｒｋａｔ細胞を、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３カセットを有するレンチウイルスベクターをトランスダクションした（図４～６）。また、ｗｔ Ｇ１１－３ ＴＣＲを、ｉｅＧＦＰを有するＪｕｒｋａｔ細胞にトランスダクションし、Ｇ１１－３ ＴＣＲシグナリングのポジティブコントロールとして機能させた（図４及び５ｃ）。非関連ペプチド「ＰＥＶ」（ＰＥＶＷＩＬＳＰＬＬＲＨＧ）又はペプチド「ＴＤＡ」（ＴＤＡＷＲＦＡＭＮＹＰＲＮＰＴ）（これは、Ｇ１１－３ ＴＣＲにより認識される）のいずれかをロードした（抗原提示細胞として使用した）ＬＣＬ細胞を、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３－ｉｅＧＦＰ Ｊｕｒｋａｔ細胞又はｗｔ－Ｇ１１－３－ｉｅＧＦＰ Ｊｕｒｋａｔ細胞のいずれかと共にインキュベーションした。ペプチドを１×１０－５Ｍの濃度でロードした。予想どおり、５μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで誘導し、ＬＣＬ＋ＴＤＡと共にインキュベーションした後に、ｗｔ－Ｇ１１－３を発現するＪｕｒｋａｔ細胞、又はｉＴＣＲ－Ｇ１１－３を発現するＪｕｒｋａｔ細胞のいずれかについてのみ、ＧＦＰシグナル及びしたがって機能的ＴＣＲシグナリングが見られた（図４）。抗ＣＤ３（ＣＤ３－ＰＥＣｙ７、ＳＫ７、５５７８５１、BD）及び抗ＴＣＲ（ｐａｎＴＣＲ－ＰＥ、ＩＰ２６、Ｂ４９１７７、Beckman Coulter）の染色について、フローサイトメトリー分析を実施した。
実施例４：４－ヒドロキシタモキシフェンの除去時の、ｐＭＨＣ認識後ｉＴＣＲシグナリングの速度及びＴＣＲシグナルカスケードのスイッチオフの速度の決定。
ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３がどれほど速くシグナリングし得るかを決定するために、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及びｉｅＧＦＰを有する１×１０４個のＪｕｒｋａｔ細胞を１μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで一晩（ＯＮ）誘導した。誘導なしの場合のＴＣＲ発現の欠如をモニタリングするために、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及びｉｅＧＦＰを有するＪｕｒｋａｔ細胞をコントロールとして処理せずに放置した。ＰＥＶ非関連ペプチドをロードしたＬＣＬ（図５ａ）又はＴＤＡ関連ペプチドをロードしたＬＣＬ（図５ｂ）のいずれかを培養物に追加し、Incucyteデバイスを使用してＧＦＰシグナルを経時的に追跡した。関連ペプチドをロードしたＡＰＣ（抗原提示細胞）とのインキュベーションの１時間後直ぐに、ＧＦＰシグナルは開始し（図５ｂ及び５ｃ）、シグナルは、インキュベーションの約７時間後まで増加し続ける（図５ｃ）。ペプチドを１×１０－５Ｍの濃度でロードした。興味深いことに、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３ ＴＣＲにより誘発されたＧＦＰシグナルは、ｗｔ－Ｇ１１－３ ＴＣＲにより誘発されたシグナルよりも経時的に常に高かった（図５ｃ）。ＡＰＣとして機能するＬＣＬ上のｉＴＣＲ発現Ｔ細胞に非関連ペプチドが提示されると、ＧＦＰの誘導は見られなかった。
４－ヒドロキシタモキシフェンの除去時にｉＴＣＲがどれほと速くダウンレギュレーションされるかを分析するために、最初に、ｉＴＣＲ－Ｇ１１－３及びｉｅＧＦＰを発現するＪｕｒｋａｔ細胞を０．０５μM又は０．１μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで一晩誘導した。翌日、細胞から４－ヒドロキシタモキシフェンを洗い流し、又は洗浄せずに放置し（ポジティブコントロール）、４－ヒドロキシタモキシフェンの除去の１時間、２時間又は４時間後に、関連ＴＤＡペプチドをロードしたＬＣＬと共にインキュベーションし、続いて、Incucyteを使用してＧＦＰシグナルを検出した（図６）。０．０５μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで誘導した細胞から二量体化剤を洗い流した１時間後に、及び０．１μM ４－ヒドロキシタモキシフェンを洗い流した４時間後に、未洗浄コントロールと比較したＧＦＰシグナルの減少が既に見られた。したがって、ｉＴＣＲを迅速に誘導し、二量体化剤の除去により迅速にダウンレギュレーションすることができた。
実施例５：Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞における４－ヒドロキシタモキシフェンを用いた、ｉＴＣＲアルファ及びベータ鎖対形成の誘導後のＭＨＣクラスＩ拘束ｉＴＣＲの発現及び機能の試験
Ｐ２Ａにより分離されたｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ ＴＣＲ及びｍＴａｇ－ＢＦＰを含有する合成カセットをレンチウイルスベクターｐＣＤＨにクローニングし、０．５×１０６個のＴＣＲ－／－Ｊｕｒｋａｔ－７６細胞にトランスダクションした（図７及び８）。ｉＴＣＲをコードするベクターはまた、別個に発現されるレポーター遺伝子として青色蛍光タンパク質（ｍＴａｇ－ＢＦＰ）を含有するので、全てのトランスダクション細胞はＢＦＰ陽性である。ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ ＴＣＲカセットは、ＮＹ－ＥＳＯ抗原（ベンチマークＮＹ－ＥＳＯ ＴＣＲ；国際公開公報第２００５／１１３５９５号を参照のこと）を認識するＭＨＣクラスＩ拘束ＴＣＲのＶ－アルファ及びＶ－ベータ配列と、表２に示されているアルファ及びベータ定常領域に突然変異と、各アルファ及びベータ定常領域のＣ末端にＥＲＴ２とを含有する。フローサイトメトリーのために、ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯを有する非誘導性Ｊｕｒｋａｔ細胞を抗ＣＤ３及び抗ＴＣＲで染色することにより、ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯの発現の欠如を試験したところ、４－ヒドロキシタモキシフェンによる誘導なしの場合の細胞の表面上では、ＣＤ３又はＴＣＲを検出することができなかった（図７ａ）。対照的に、ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯを有するＪｕｒｋａｔ細胞を１μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで誘導することにより、ＴＣＲ及びＣＤ３の両方を細胞の表面上で検出することができた（図７ｂ）。抗ＣＤ３（ＣＤ３－ＰＥＣｙ７、ＳＫ７、５５７８５１、BD）及び抗ＴＣＲ（ｐａｎＴＣＲ－ＰＥ、ＩＰ２６、Ｂ４９１７７、Beckman Coulter）の染色について、フローサイトメトリー分析を実施した。
誘導の際に、ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯが機能的であるかを決定するために、ｉｅＧＦＰを有するＪｕｒｋａｔ細胞を、ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯカセットを有するレンチウイルスベクターをトランスダクションした。また、ｗｔ ＮＹ－ＥＳＯ ＴＣＲを、ｉｅＧＦＰを有するＪｕｒｋａｔ細胞にトランスダクションし、ＮＹ－ＥＳＯ ＴＣＲシグナリングのポジティブコントロールとして機能させた。非関連ペプチドＶＬＤＧＬＤＶＬＬ（図８ａ）又は関連ペプチドＳＬＬＭＷＩＴＱＣ（図８ｂ）（これは、ＮＹ－ＥＳＯ ＴＣＲにより認識される）のいずれかをロードしたＴ２細胞を、ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ－ｉｅＧＦＰ Ｊｕｒｋａｔｓ又はｗｔ－ＮＹ－ＥＳＯ－ｉｅＧＦＰ Ｊｕｒｋａｔと共にインキュベーションした。ペプチドを１×１０－５Ｍの濃度でロードした。予想どおり、１μM ４－ヒドロキシタモキシフェンで誘導し、Ｔ２＋関連ペプチドと共にインキュベーションした後に、ｗｔ－ＮＹ－ＥＳＯを発現するＪｕｒｋａｔ、又はｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯを発現するＪｕｒｋａｔのいずれかについてのみ、ＧＦＰシグナル及びしたがって機能的ＴＣＲシグナリングが見られた。ＣＤ１９陰性ＢＦＰ陽性細胞についてゲーティング戦略をゲーティングし、続いて、ｉｅＧＦＰ蛍光（ＣＤ１９－ＡＰＣｅＦ７８０、ＨＩＢ１９、４７－０１９９－４２、eBioscience）を決定した。
実施例６：ＣＤ８＋ＰＢＬにおけるエンドキシフェンを用いた、ｉＴＣＲアルファ及びベータ鎖対形成の誘導後のＭＨＣクラスＩ拘束ｉＴＣＲ発現及び機能の試験
市販の細胞単離キット（ＣＤ８＋未使用）を使用してＣＤ８＋細胞について、健常ドナー由来のＰＢＬを濃縮し、ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯカセットを有するレンチウイルスベクター又はポジティブコントロールとしてｗｔ－ＮＹ－ＥＳＯを有するレンチウイルスベクターをトランスダクションした。４－ヒドロキシタモキシフェンによるｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯの誘導は、試験したいかなる濃度においてもＰＢＬでｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯを誘導しなかったので（データは示さず）、本発明者らは、エンドキシフェンと称される別の活性タモキシフェン代謝産物を使用した。いずれかのｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯを有するＣＤ８＋細胞を２０μMエンドキシフェンで一晩誘導し、又は処理せずに放置した。次いで、ＣＤ３（ＣＤ３－ＰＥＣｙ７、ＳＫ７、５５７８５１、BD）及び特異的Ｖ－ベータファミリーＢＶ６－５（抗体：ＴＲＢＶ６－５－ＰＥ、ＩＭＭＵ ２２２、ＩＭ２２９２、Beckman Coulter）について、細胞を染色した。エンドキシフェンによる処理は、細胞の表面上におけるｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯの誘導をもたらした（図９）。処理なしの場合、内因性発現ＢＶ６－５陽性細胞のみが見られる。
ＰＢＬにおいて誘導された場合にｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯが機能的であるかを決定するために、関連ペプチドＳＬＬＭＷＩＴＱＣ又は非関連ペプチドＶＬＤＧＬＤＶＬＬをロードしたＴ２細胞を、１、５、１０若しくは２０μMエンドキシフェン誘導ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ ＣＤ８＋ＰＢＬ又は非誘導ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯ ＣＤ８＋ＰＢＬ又はポジティブコントロールとしてｗｔ－ＮＹ－ＥＳＯを有するＣＤ８＋ＰＢＬと共にインキュベーションした。ペプチドを１×１０－５Ｍの濃度でロードした。１日後、培養物の上清を収集し、標準的なＩＦＮ－γＥＬＩＳＡを実施した。ｗｔ－ＮＹ－ＥＳＯについてはエンドキシフェン処理にかかわらず、及びｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯについてはエンドキシフェンによる誘導後にのみ、ＩＦＮ－γを高レベルで検出することができた（図９）。これらの結果は、ｉＴＣＲ－ＮＹ－ＥＳＯをＰＢＬの表面上で誘導することができ、それがｗｔ－ＮＹ－ＥＳＯ ＴＣＲと同じ機能特徴を有することを示している。
さらなる実験では、ｉ－ＴＣＲを有するＴ細胞は細胞毒性であり、ターゲットを排除し得ることが見出された。この場合もやはり、ｉ－ＮＹ－ＥＳＯ（ＭＨＣ－Ｉ拘束ＴＣＲ）をトランスダクションしたＣＤ８＋ＰＢＬ又はｗｔ－ＮＹ－ＥＳＯを発現するＣＤ８＋ＰＢＬを１０μMエンドキシフェンで２０時間誘導し（＋誘導）、又は処理せずに放置した（誘導なし）。次いで、細胞を、関連ペプチドをロードしたＮｕｃｌｉｇｈｔＲｅｄを発現するＴ２細胞（＋ｐｅｐｔ）又は非関連コントロールペプチドをロードしたＴ２ ＮｕｃｌｉｇｈｔＲｅｄ細胞（＋ｃｔｒｌ）と共にインキュベーションした。Incucyte Zoomデバイスを使用して、Ｔ２細胞の死滅を経時的に追跡した。図１０Ａの写真は、Ｔ細胞及びターゲット細胞のインキュベーションの４２時間後を示す。上パネルでは、Ｔ細胞をエンドキシフェンで誘導しなかった。下パネルは、エンドキシフェンで誘導したＴ細胞を示す。Ｔ２ ＮｕｃｌｉｇｈｔＲｅｄ細胞は中央に表示されており、暗灰色である。エフェクター細胞は薄灰色である。図１０Ｂでは、グラフは、経時的なＴ２ ＮｕｃｌｉｇｈｔＲｅｄ細胞の密度（最大４２時間）を示す。図１０では、モックという表示の細胞は、非トランスダクションＣＤ８＋ＰＢＬである。
実施例７：ｗｔ ＴＣＲ、並びにベータ鎖（配列番号４、表３を参照のこと）に突然変異Ｋ４Ｖ、Ｎ５Ｐ及びＹ３７Ｋを有するＴＣＲをトランスダクションしたＴＣＲ－／－細胞におけるＣＤ３及びＴＣＲ発現の試験。
Ｊｕｒｋａｔ－７６ ＴＣＲ－／－を、ＰＲＡＭＥ抗原を認識するｗｔ ＴＣＲ（ｗｔ ＴＣＲ）、並びに定常ベータ鎖（配列番号４）にアミノ酸突然変異Ｋ４Ｖ、Ｎ５Ｐ及びＹ３７Ｋを有するＰＲＡＭＥを認識するＴＣＲをトランスダクションした。モックコントロールは、非トランスダクションＪｕｒｋａｔ－７６ ＴＣＲ－／－細胞である。フローサイトメトリーを実施し、ＣＤ３及びＴＣＲ発現について細胞を評価した。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。図１３から分かるように、突然変異ＴＣＲはＣＤ３及びＴＣＲの発現を示さないが、これは、突然変異ＴＣＲが膜上で発現され得ないことを示している。
実施例８：ベータ鎖（配列番号４、表３）における突然変異Ｋ４Ｖ、Ｎ５Ｐ及びＹ３７ＫはＴＣＲ発現を妨げるが、これは、アルファ及びベータ定常鎖のＣ末端に含まれるエストロゲンレセプターの二量体化によりレスキューされ得る
ｉｅＧＦＰレポーターを含有するＪｕｒｋａｔ－７６を、定常アルファ及びベータ鎖のＣ末端の両方にエストロゲンレセプターを有し、定常ベータ鎖（配列番号４、表３）にアミノ酸残基Ｋ４Ｖ、Ｎ５Ｐ及びＹ３７Ｋを有するＧ１１－３ ＴＣＲにトランスダクションした。細胞を１μMエンドキシフェンで２４時間誘導した。次いで、細胞を、非関連ペプチド又は関連ペプチドのいずれかをロードしたＬＣＬ細胞と共にインキュベーションした。共培養物におけるＬＣＬ：Ｊｕｒｋａｔ－７６の比は１：１であった。コインキュベーションの２４時間後にフローサイトメトリーを実施し、ｅＧＦＰ発現について細胞を評価した。分析ツールFlowJo V10を使用して、プロットを生成した。図１４は、ｉｅＧＦＰが、関連ペプチドに応答して発現されたことを示す。これは、ベータ定常鎖の位置４、５及び３７に突然変異を有するＴＣＲが、エンドキシフェン誘導二量体化後に依然として機能的であることを明らかにしている。したがって、エンドキシフェンにより誘導される二量体化後のＴＣＲ－ＣＤ３複合体形成を妨げずに、定常ベータ鎖（配列番号４）の位置４、５及び３７のアミノ酸を突然変異させることができる。

Claims (21)

  1. １つ以上の核酸分子を含む組成物であって、前記１つ以上の核酸分子が、
    （ａ）
    （ｉ）配列番号２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列であって、配列番号２と比較して位置４４及び／又は４７にアミノ酸置換を場合により含むアミノ酸配列をコードする核酸配列、及び
    （ｉｉ）配列番号２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列をコードする前記核酸配列に下流連結された誘導性二量体化ドメインをコードする核酸配列
    を含む核酸配列Ａ；並びに
    （ｂ）
    （ｉ）配列番号４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列であって、配列番号４と比較して位置４、５、３７、６３、７７及び７９からなる群より選択される位置に少なくとも１つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列をコードする核酸配列、及び
    （ｉｉ）配列番号４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列をコードする前記核酸配列に下流連結された誘導性二量体化ドメインをコードする核酸配列であって、該二量体化ドメインが、（ａ）（ｉ）の配列番号２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列をコードする核酸配列に連結された二量体化ドメインに対応する、核酸配列
    を含む核酸配列Ｂ
    を含み、
    （ａ）（ｉ）の配列番号２と少なくとも９０％同一の前記アミノ酸配列が、配列番号２と比較して少なくとも１つのアミノ酸置換を含む、組成物。
  2. 前記核酸配列Ａ及び前記核酸配列Ｂが、別個の核酸分子により含まれるか、又は１つの核酸分子中に含まれる、請求項１に記載の組成物。
  3. （ａ）（ａ）（ｉ）の前記核酸配列が、配列番号２のアミノ酸配列と比較して少なくとも１つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列をコードし、前記置換が、Ｔ４４Ａ及びＴ４７Ａからなる群より選択され；並びに／又は
    （ｂ）（ｂ）（ｉ）の前記核酸配列が、配列番号４のアミノ酸配列と比較して少なくとも１つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列をコードし、前記置換が、Ｋ４Ｖ、Ｎ５Ｐ、Ｙ３７Ｋ、Ｌ６３Ａ、Ｓ７７Ａ及びＲ７９Ａからなる群より選択される、
    請求項１又は２に記載の組成物。
  4. （ｃ）（ａ）（ｉ）の前記核酸配列が、配列番号２のアミノ酸配列と比較して２つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列をコードし、前記２つの置換が、Ｔ４４Ａ及びＴ４７Ａであり；並びに
    （ｄ）（ｂ）（ｉ）の前記核酸配列が、配列番号４のアミノ酸配列と比較して３つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列をコードし、前記３つの置換が、Ｋ４Ｖ、Ｎ５Ｐ及びＹ３７Ｋ又はＬ６３Ａ、Ｓ７７Ａ及びＲ７９Ａである、請求項３に記載の組成物。
  5. 前記二量体化ドメインが、ホモ二量体化ドメイン又はヘテロ二量体化ドメインである、請求項１～４のいずれか一項に記載の組成物。
  6. 前記二量体化ドメインが、ＥＲＴ２、ＦＫＢＰ、カルシニューリンＡ（ＣＮＡ）、ＣｙＰ－Ｆａｓ、ＧｙｒＢ、ＧＡＩ、ＧＩＤ１、Ｓｎａｐ－ｔａｇ、ＨａｌｏＴａｇ、ｅＤＨＦＲ及びｍＴＯＲのＦＲＢドメインからなる群より選択されるホモ二量体化ドメイン又はヘテロ二量体化ドメインである、請求項５記載の組成物。
  7. 請求項１～６のいずれか一項で定義される前記核酸配列Ａ及び前記核酸配列Ｂを含む発現カセット、又は少なくとも２つの発現カセットであって、少なくとも１つの発現カセットが、請求項１～６のいずれか一項で定義される前記核酸配列Ａを含み、少なくとも１つの発現カセットが、請求項１～６のいずれか一項で定義される前記核酸配列Ｂを含む少なくとも２つの発現カセット。
  8. １つ以上の請求項７で定義される発現カセットを含むベクターであって、レトロウイルスベクター又はレンチウイルスベクターである、ベクター。
  9. 請求項１～６のいずれか一項に記載の組成物、請求項７に記載の発現カセット又は請求項８に記載のベクターと、請求項１～６のいずれか一項で定義される配列番号２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列をコードする前記核酸配列に連結された前記二量体化ドメイン及び配列番号４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列をコードする前記核酸配列に連結された前記二量体化ドメインに対応する二量体化剤とを含むキットであって、前記二量体化剤が前記二量体化ドメインの二量体化を誘導することができる、キット。
  10. 前記二量体化剤が、４－ヒドロキシタモキシフェン、エンドキシフェン、４－（１－［４－（ジメチルアミノエトキシ）フェニル］－２－フェニル－１－ブテニル）フェニル、ＡＰ２１９６７及び２３，２７－エポキシ－３Ｈ－ピリド［２，１－ｃ］［１，４］オキサアザシクロヘントリアコンチン、ＦＫ１０１２、ＦＫ５０６、ＦＫＣｓＡ、ラパマイシン、クーママイシン、ジベレリン、ＨａＸＳ並びにＴＭＰ－ＨＴａｇからなる群より選択される、請求項９記載のキット。
  11. 請求項１～６のいずれか一項で定義される前記核酸配列Ａ及び前記核酸配列Ｂ、請求項７で定義される発現カセット又は請求項８で定義されるベクターを含む宿主細胞であって、宿主細胞は、Ｔリンパ球であり、請求項９で定義される前記二量体化剤を含む、宿主細胞。
  12. Ｔリンパ球が、ヒトＴリンパ球である、請求項１１に記載の宿主細胞。
  13. 請求項１～６のいずれか一項で定義される前記核酸配列Ａ及び前記核酸配列Ｂによりコードされる、タンパク質。
  14. 請求項１～６のいずれか一項で定義される前記核酸配列Ａによりコードされるタンパク質及び前記核酸配列Ｂによりコードされるタンパク質を二量体化するための、請求項９で定義される二量体化剤の使用。
  15. 二量体化剤が、エンドキシフェンである、請求項１４に記載の使用。
  16. 請求項１～６のいずれか一項で定義される前記核酸配列Ａによりコードされるタンパク質及び前記核酸配列Ｂによりコードされるタンパク質を二量体化するための方法であって、請求項９で定義される前記二量体化剤を前記タンパク質に追加する工程を含む、方法。
  17. 誘導性Ｔ細胞レセプターを調製するための方法であって、請求項１～６のいずれか一項で定義される前記核酸配列Ａ及び前記核酸配列Ｂ、請求項７で定義される発現カセット又は請求項８で定義されるベクターを、前記核酸配列Ａ及び前記核酸配列Ｂの発現を可能にする条件下で宿主細胞にin vitroで導入する工程を含む、方法。
  18. Ｔ細胞療法において使用するための、請求項１～６のいずれか一項で定義される組成物、請求項７で定義される発現カセット、請求項８で定義されるベクター、請求項１１で定義される宿主細胞又は請求項１３で定義されるタンパク質。
  19. ガンの処置において使用するための、請求項１～６のいずれか一項で定義される組成物、請求項７で定義される発現カセット、請求項８で定義されるベクター、請求項１１で定義される宿主細胞又は請求項１３で定義されるタンパク質。
  20. 前記ガンが、固形ガン又は血液ガンである、請求項１９に記載の組成物、発現カセット、ベクター、宿主細胞又はタンパク質。
  21. 請求項１～６のいずれか一項で定義される組成物、請求項７で定義される発現カセット、請求項８で定義されるベクター、請求項１１で定義される宿主細胞又は請求項１３で定義されるタンパク質を含む、医薬組成物。
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