JP7315729B2 - 2-ペンチルフランを有効成分として含有する退行性脳疾患の治療用組成物 - Google Patents
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Description
1.小膠細胞と星状細胞の培養
本実施例では、1次的に小膠細胞または星状細胞をE18.5マウス胚芽の大脳皮質から抽出した後(Tamashiro et al.,2012)、実施例1のように培養した。より具体的に、マウス胚芽の皮質を収集した後、冷たい上澄み液(#14170-112;Thermo Fisher Scientific)に貯蔵し、0.25%トリプシン溶液(#15090-046;Thermo Fisher Scientific)で37℃で20分間前処理した。その後、10%FBS(#SH30919.03;Hyclone)、2mM L-グルタミン(#25030-081;Thermo Fisher Scientific)、0.04%ブドウ糖(#G7021;Sigma Aldrich)、および1%ペニシリン/ストレプトマイシン(#15140-122;Thermo Fisher Scientific)が添加された最小栄養培地で細胞をプレーティングした後に、40μmストレーナー(#352340;Thermo Fisher Scientific)を用いてろ過した。小膠細胞は、poly-D-lysine(#P7280;Sigma Aldrich)でメッキされたT75フラスコに1.2×107 cellの密度でプレーティングした。2時間後、前記混合物は、Dulbecco’s modified eagle medium(DMEM;#SH30243.01;Hyclone)培地に移され、2週間3日を周期として培地を交替した。このような混合液から小膠細胞を分離するために、まず37℃で150rpmで2時間振とうした後に、小膠細胞を含む混合液を上部から別途に抽出して移した後、室温で1300rpmで5分間遠心分離して小膠細胞を分離することができた。分離した小膠細胞は、培養培地に移した。小膠細胞を移した後、残った混合液を160rpmで1日間振とう培養して小膠細胞を完全に除去した。次に、0.25%トリプシンを処理して星状細胞を分離し、T75フラスコで4日間さらに培養して収集した。収集した小膠細胞と星状細胞の純度は、qRT-PCR分析およびマーカー遺伝子とタンパク質であるIba-1およびGfapを用いてimmunocytochemistryを用いて評価した。
カプセル化した2つの血清型の菌株(D39 S.pneumonia,Kim et al.,2015)を30gの滅菌されたTodd Hewitt Broth(#249240;BD Biosciences)、0.5%の酵母抽出液(#288620;BD Biosciences)と共に培養した。次に、成長したバクテリアをThy brothに移し、37℃で24~48時間の間培養して108CFU/mlの濃度になるようにした。培養液は、4,000xgで4℃を維持しつつ、10分間遠心分離して培養上澄み液(Sup)を分離し、腹腔内注射(IP)に使用した。代謝物を含む分画物を分離するために、ultracel YM-3膜を用いて追加でろ過した(3kDa pore,Millipore Corporation,Bedford,MA)。しかも、実験のために98%純度の合成2-PF溶液を準備した後に、同量のメタノールを溶液に添加して混合溶液を作成した(St.Louis,MO,USA社の溶液を購入)。102または104濃度の2-pentylfuranがSupに添加され、結果物は、0.1%のTFAで処理された。
すべてのマウスは、標準温度調節、実験室条件、または着色されたトンネル、迷路、登山材料、ランニングホイールに自由に接近できる条件下で、DGISTの動物管理倫理委員会の承認を受けたプロトコルに従って維持、および管理された。in vivo、ex vivoの実験両方で8~10週のBL6Jまたは異型接合体CX3CR1+/GFPマウスを利用した。前記マウスは、C57/BL6JとCX3CR1GFP/GFPを交差交配して生成した(Jung et al.2000)。すべてのマウスは、室温で12時間の周期で任意に無菌食品と水を提供された。
mRNAの測定のために、製造メーカーのプロトコルに従ってTRIzol試薬(Invitrogen,Carlsbad,CA)を用いてMagNa lyser(Roche Molecular Diagnostics)を使って赤血球と小膠細胞、星状細胞、Hana3A細胞または大脳皮質細胞からRNAを分離した。以後、分離したmRNAを使って逆転写を通じてcDNAを生成した(PrimeScriptTM 1st strおよびcDNA Synthesis kit-#6110;Takara Bio Incを利用)。この過程は、quantitative real-time-PCR(LightCycler(登録商標)480 SYBR Green I Masterを利用)を通じてリアルタイムで定量的に測定した。測定値は、2-ΔΔCt methodを用いて計算した。
小膠細胞から分泌されたTnf、Il6、Il1bサイトカインの発現レベルは、製造メーカープロトコルに従って測定された。より具体的には、2-PFあるいは細胞上澄み液で処理した後24時間後にELISAにより測定された。ELISAキットは、BD biosciencesから購入した(#DY410 for Tnf;#DY406 for Il6;#DY401 for Il1b)。
小膠細胞活性化の形態学的変化を分析するために、9週齢のCX3CR1GFP/+マウスを使用した。2つのマウスに2-PFが含まれたIPおよび含まれていないIPをそれぞれ注入した後、2時間後に低温切除術を用いて脳切片を抽出した。厚さ40μmの脳組織の切片を1μmにさらに小さく均一化して準備した後に、40倍拡大共焦点顕微鏡を用いて小膠細胞のGFPシグナルを測定した。Zeiss ZEN Software(Zeiss)を使って小膠細胞のGFP-pixel signalを分析した。
スーパーオキシドの濃度は、VersaMax microplate readerを使ってシトクロムcが減少する程度を測定して計算した(Babior et al.,1973)。小膠細胞は、96 well plateに1.0×105 cells/wellの濃度で培養され、前記小膠細胞は、2-ペンチルフラン、シトクロムcが存在する10μM ATP溶液、あるいはSupをcytochalasin B(5μM;#C66762;Sigma Aldrich)と混ぜた溶液により活性化した。これによるROSの濃度は、1分間隔で25分間550nmで光吸収の変化を通じて測定された。
multiwell Boyden chamberを用いて細胞走化性を測定した。より具体的には、PBSに2時間の間10mg/mlフィブロネクチン(Sigma-Aldrich)によりポリカーボネートフィルター(8μm pore;#101-8;Neuroprobe)をコーティングし、コーティングされたフィルターをBoyden chamberに設置した。また、プレートの底面を2-ペンチルフランを含有する無血清DMEMまたは培養上澄み液で満たした。次に、小膠細胞またはHana3A細胞を嗅覚受容体構造に感染させた後、無血清DMEMに懸濁させた。その後、37℃で小膠細胞は4時間、Hana3A細胞は8時間の間放置した。底面に沈んだ細胞は、4%PFAで固定させ、ヘマトキシリンで10分間染色した。固定された細胞は、scored eyepieceを使って無作為に選択された5個の固定磁場(200X)で光学顕微鏡で計数された。化学走化性指数は、無処理群を標準として細胞の移動数として定義された。
初代小膠細胞を24-well plate(5×105 cells/well)に接種後、24時間の間培養した。細胞を2-PFまたはsupとともに30分間予備培養し、37℃で30日間無血清DMEMからFITC-dextran(1mg/ml、PBSの中の20mg/ml;#FD70S;Sigma Aldrich)に移して4℃のPBSで洗浄した。PBSで0.25%トリプシン(#15090-046;Thermo Fisher Scientific)により細胞を分離し、分離した細胞をFACS AccuriTM C6(BD Biosciences)で分析した。平均蛍光強度(MFI)は、前記ソフトウェアを使って各条件における蛍光ヒストグラムを統合して計算した。食作用指数は、無処理群を標準としてMFIとして定義された。
活性酸素の濃度は、2’,7’ -Dichlorodihydrofluorescein diacetate(DCF-DA,#D6883;Sigma Aldrich)を使って既存の方法からささいな修正を経た方法を用いて測定した(Bae et al.,2001)。より具体的に、初代小膠細胞を24時間の間24-well plate(5.0×105 cells/well)で10μM DCF-DAで37℃の温度で30分間処理した。一つのプレートは、2-PFで処理し、一つは、そうではなかった。それぞれのwellにある細胞は、flow cytometer(FACS AccuriTM C6;BD Biosciences)で測定された。MFIは、前記方法の同様に測定された。
マウスとヒトゲノムDNAからの全体長さの嗅覚受容体遺伝子を適切なプライマーを使って増幅させた。これによって生成されたcDNAを制限酵素で分解した後、前記記述されたように、N-terminal Lucy、Flag、およびRho tagsを含有するPME18S表現ベクターで制限酵素部位を有する嗅覚受容体構造を生成するために生成物を連結させた。すべての嗅覚受容体の構造は、配列分析により確認された(Shepard et al.,2013)。次に、RTP1Sを有するHana3A細胞で形質を感染させ、以前に記述されたように、細胞膜における位置と存在を確認した(Behrens et al.,2009;ZhuangおよびMatsunami、2008)。このような形質感染は、Lipofectamine2000(#11668-019;Thermo Fisher Scientific)を使って製造メーカーの指示により行われた。より具体的には、形質転換された細胞をポリDリシン(10μg/ml;#P7280;Sigma Aldrich)でコーティングされたカバースリップ(#0101050;Marienfeld)上で成長させた。次に、暖かいPBS溶液で洗浄し、氷で30分間冷却させて、エンドシトシスを遮断させた。その後、冷たいPBSで洗浄した後、細胞を2分間氷で冷却されたメタノールとアセトンで固定させた(v/v=1:1)(Methanol:#106009;MERCK,Acetone:#179124;Sigma Aldrich)。その後、細胞を室温下に1時間の間正常ウマ血清(#008-000-121;Jackson ImmunoResearch)と共にインキュベーションした。マウス抗ロドプシン(anti-Rho;1:1,000;#MABN15;Millipore)あるいはウサギ抗Olfr110(#ab177327;Abcam)を4℃で一晩中インキュベーションさせた。その後、PBSで洗浄した後、Cy3-コンジュゲートロバ抗マウス抗体(1:1,000;#715-165-150;Jackson ImmunoResearch)、Alexa488-コンジュゲートロバ抗マウス(1:1,000;#715-545-150;Jackson ImmunoResearch)、あるいはCy3-コンジュゲートロバ抗ウサギ抗体(1:1,000;#711-165-152;Jackson ImmunoResearch)を室温で1時間の間処理した。細胞をDAPI(#H-1200;Vector Laboratories)を含むVectashield蛍光マウント媒質で装着した。異種嗅覚受容体の表現は、共焦点レーザースキャニング顕微鏡LSM700とZENソフトウェア(Zeiss)で分析した。
Dual-Gloルシフェラーゼ分析システム(#E2940;Promega)を嗅覚受容体リガンドスクリーニングに使用した。より具体的には、Hana3A細胞を形質転換する1日前に白色ポリスチレン96-well plate(#353296;BD Biosciences)に形質感染1日前に塗抹した。各プレートに対してpCRELuc(1μg;#219076;Agilent Technologies)、pRL-SV40(1μg;#E2231;Promega)、RTP1S(1μg)、およびOR(6μg;あるいはMock)ベクターを24時間の間形質感染させた。製造メーカーのプロトコルに従ってLipofectamine2000(#11668-019;Thermo Fisher Scientific)を使って分析した。形質感染した細胞を多様な濃度の希釈されたodorantsを用いてCD293培地(#11913-019;Thermo Fisher Scientific)内で37℃で4時間の間刺激させた。ルシフェラーゼの活性は、renilla luciferaseの活性で正常化した。SpectraMax L microplate reader(Molecular Devices)を用いて発光量を測定した。
Olfr110/111のマウスの嗅覚受容体相同性モデリングは、テンプレート検索、遺伝子シーケンスの整列、モデル確定、モデル量評価などを含む。また、これは、ウェブ基盤相同性モデリングツールであるSWISS-MODELを通じて行われた。Olfr110/111のアミノ酸配列は、UniprotKB/Swiss-Prot databaseを使ってNCBI Protein BLASTから初めて収得した。Olfr110/111に対するテンプレート検索は、SWISS-MODEL Template Library(SMTL)のBLASTおよびHHblitsを使用した。結果的に、179個と186個のテンプレートを発見することができた。Olfr110/111の相同性モデルを構築するために、ヒトアデノシンA2A受容体(resolution:2.7Å,PDB ID:3VG9)のX線結晶構造を鋳型構造として選択し、これは、配列同一性および類似性の両方に基づく。3d相同性モデル構造は、Promodを使って生成した。生成されたモデルの全体的な評価は、QMEAN scoring機能を利用した。Olfr110/111の最終3Dモデル構造は、SWISS-MODELウェブサイトからダウンロードされた。
リガンドの二次元的構造は、ChemBioDraw(ver.11.0.1)により生成され、これをChem3D Pro(ver.11.0.1)に伝送して3次元構造を生成した。リガンド準備および最適化に利用された過程は、SYBYL-X 2.1.1(Tripos Inc.,St.Louis)の「sanitize」プロトコル(基本値)を使って行われた。Olfr110/111(template structure PDB ID:3VG9)の相同性モデルは、SWISS-MODEL相同性モデリングツールを用いて生成された。SYBYL-X 2.1.1の構造準備ツールは、タンパク質の準備過程でも利用された。アミノ酸残基の欠損は修正され、TRIPOS force fieldを用いてタンパク質に水素原子が追加で添加された。次に、POWELL方法(Abagyan et al.,1994)で、初期最適化設定が基本設定から‘none’変化させた後、タンパク質最小化過程を行った。EHgks終結勾配は、0.5kcal/(mol*Å)に設定され、最大反復は、1000回に設定された。次に、Surflex-Dock GeomX module(SYBYL-X 2.1.1)を用いて前記方法で準備されたタンパク質とリガンドを使って全体ドッキングプロセスが行われた。ドッキングサイトは、Surflex-Dock protomolにより誘導され、これは、理想的なリガンドの表現型であって、存在する結合部位とのすべての相互作用を示すことができることが特徴である。このプロトコルは、SYBYL-X 2.1.1.のMulti channel surfaceで最も大きく発現する受容体を共同で選択して捜し出して定義された。2つのプロトコルの発生因子であるBloatとThersholdは、それぞれ0.5(Å)および0に設定された。発生するposesの最大値は、20であり、生成されたフォース間の最小RMSDは、20に設定された。poses間のRMSDの最小値は、0.05に設定された。Surflex-dock GeomXの他のドッキング因子は、基本値に設定された。
Olfr110構造の特異的突然変異ベクターは、PfuUltra High-Fidelity DNA polymerase(#600380;Agilent Technologies)を使って生成した。すべての突然変異ベクター(F102W;F104W;Y252F;Y259F;F102W/F104W;Y252F/Y259F;F102W/Y252F/Y259F;F104W/Y252F/Y259F;F102W/F104W/Y252F/Y259F)の順序は、正方向および逆方向である(Macrogen)。
合成2-PF溶液(98%以上の純度)は、Sigma Aldrich(St.Louis,MO,USA)から購入した。同量のabsolute(99.9%)メタノールを2PFのoriginal溶液に添加した。2-PFのoriginal溶液とメタノールを添加した溶液(2-PF+CH3OH)を直接注入質量分光法(direct infusion mass spectrometry)で分析した。合成2-PFのliquid-chromatography-tandem-mass-spectrometry(LC-MS/MS)分析のために、2-PF+CH3OH溶液を使用した。SupおよびControl media(Ctrl)のLC-MS/MS分析のために、SupまたはCtrl(1 ml)を3kDの加工サイズを有するultracel YM-3膜を通じてフィルタリングしてタンパク質を除去した(Millipore Corporation,Bedford,MA)。500μlのflow-throughを同じ体積のメタノールと混合した。生成されたサンプルを10分間超音波(sonicated)処理し、4℃で20分間14,000gで遠心分離させた(Lau et al.,2015)。上澄み液をLC-MS/MSで分析した(図3A-B)。また、102と104uM濃度の2-PFがSupに追加された。生成されたサンプルを0.1%TFA(trifluoroacetic acid)で酸性化させた後、LC-MS/MSで分析した。
2-PFおよび2-PF+CH3OHサンプルを500μlガス密閉注射器を使って加熱したエレクトロスプレーイオン源に20μl/分の流速で注入した。また、Q Exactive Hybrid Quadrupole-Orbitrap mass spectrometerの単一イオンモニタリング方法で8分間測定した。しかも、キャピラリー電圧は、3.5kV(ポジティブモード)に設定され、ソルベント除去キャピラリーの温度は、250℃に設定された。次に、全体MSを70,000(m/z 200)の分解能で50~750 Thomsons(Th)間の質量範囲でモニタリングした。最大イオン注入時間は、100msであり、自動利得制御値は、1×106である。隔離窓は、1.0m/zに設定された(Looβe et al.,2015)。
analytical column(Thermo Scientific,Easy-Column、75μm×50cm)とtrap column(75μm×2cm)が装着されたThermo EASY-nLC 1000(Thermo Scientific,Odense,Denmark)をLC separationに利用した。これより、パラメーターは次の通りである:injection volume=10μl;operation temperature of the analytical columns=50℃;flow rate=300 nL/min;およびmobile phase A=0.1%formic acidおよびmobile phase B=0.1%formic acidおよび2%water in acetonitrile.LC separationのために、次のような濃度勾配が50分間利用された。:2% to 40% solvent Bを36min、40%~80% solvent B over 6分およびfrom 80%~2%solvent B over 6分。LCから溶出された試料は、ナノ電子噴霧装置が装着されたQ-ExactiveTM hybrid quadrupole-Orbitrap mass spectrometer(Thermo Scientific)を使って分析した。キャピラリー電圧は、3.5kV(positive mode)に設定され、キャピラリーの温度は、250℃に設定された。また、Q-Exactiveは、データ依存モードに設定され、7万解像度(at m/z 200)で50~750Th質量範囲のスキャンを行った。実験結果、最も多く検出された上位10個のイオンまで1.0m/zで隔離された。また、前記イオンは、高いエネルギーとの衝突によって切片化されることを確認した。MSスキャンは、17,500の解像度として検出された(Saigusa et al.,2016)。最大イオン注入時間は、full MSおよびMS/MS scansの場合、それぞれ100msおよび50msであった。automated gain control target valueは、full MSおよびMS/MS scansそれぞれに対して1.0×106および1.0×105に設定された。
full MSおよびMS/MS scansを含む全体MSスキャンを用いて取得した未加工データから2-PFの前駆体イオンが抽出された(m/z=153.091 Da)。前記前駆体イオンは、2ppmの許容誤差内でクロマトグラフィーピークを17および22または16および22に設定して抽出されたのである。それぞれのスペクトルでm/zf-the mass of CH3のピークと相当するものを連結し、結果的に断片化されたピークイオンとして候補構造が得られた(HMDB)(Wishart et al.,2007)。
protease inhibitors(#04-693-116-001;Roche Molecular Diagnostics)、DMSF(Sigma-Aldrich)およびlysed using MagNA lyser(Roche Molecular Diagnostics)があるT-PER(登録商標)reagent(#78510;Thermo Fisher Scientific)を用いて細胞と組織を準備した後、MagNAレーザーを使って溶解させた(Roche Molecular Diagnostics)。総タンパク質抽出物は、Bradford分析法で定量化した。前記サンプルを7.5%SDS-PAGEあるいは4-20%gradient mini-PROTEIN TGX Precast Gels(#456-1064;Bio-Rad Laboratories)に溶解した後、nitrocellulose membranes(#10600002;GE Healthcare)にブロッティングした。その後、膜を5%の脱脂粉乳とTBST、0.1%TWEEN(登録商標)20(#P9416;Sigma-Aldrich)およびTris-buffered salineで1時間の間ブロッキングした後、4℃で一晩中1次抗体と共にインキュベーションさせた。前記抗体は、次の通りである:Olfr110(36kDa;1:1,000;#ab177327;Abcam)、抗ロドプシン(39kDa;1:1,000;#MABN15;Millipore)、CREB(43kDa;1:1,000;#9197;Cell Signaling Technology)、phospho-CREB(43kDa;1:1,000;#9198;Cell Signaling Technology)、ERK(44kDa;1:1,000;#sc094;Santa Cruz)、phospho-ERK(42,44kDa;1:1,000;#sc-7383;Santa Cruz)、phospho-Akt(60kDa;1:500;sc-293125;Santa Cruz)、phospho-JNK(46,54kDa;1:500;sc-6254;Santa Cruz)、phosphor-p38(38kDa;1:1,000;sc-7973;Santa Cruz)、あるいはbeta-Actin(45kDa;1:10,000;#4967;Cell Signaling Technology)。また、Isotype-matched horseradishペルオキシダーゼ-コンジュゲート2次抗体は、常温で2時間の間TBST中の抗ウサギ(#711-035-152;Jackson ImmunoResearch)を1:100,000として、抗マウス(#715-035-150;Jackson ImmunoResearch)を1:40,000として使用された。免疫反応性タンパク質バンドは、SuperSignalTM West Pico Chemiluminescent Substrate(#34080;Thermo Fisher Scientific)を使用した。
免疫蛍光染色のために48時間の間標準条件でpoly-D-lysine(10μg/ml;#P7280;Sigma Aldrich)で22mmカバースリップ(#0101050;Marienfeld)をコーティングした後に、小膠細胞を培養させた。その後、細胞をPBSで洗浄し、4%のパラホルムアルデヒド(#6148;Sigma Aldrich)で5分間固定させた。その後、4%の正常ウマ血清(#008-000-121;Jackson ImmunoResearch)と0.1%TWEEN(登録商標)20(#P9416;Sigma-Aldrich)を含有するPBSで室温で1時間の間培養させた。次に、細胞を羅列した1次抗体とともに4℃で一晩中ブロッキングした。抗体は、次の通りである:Olfr110(rabbit-anti-Olfr110;1:10,000;#ab177327;Abcam)、Iba-1(goat-anti-Iba-1;1:1,000;#ab5076;Abcam)、およびGFAP(mouse-anti-GFAP;1:1,000;#556330;BD Biosciences)。サンプルは、常温で1時間の間2次抗体とともに0.1%TWEEN(登録商標)20(#P9416;Sigma-Aldrich)を含むPBS溶液で培養された。2次抗体は、次の通りである:Cy3-コンジュゲートロバ抗ウサギ(1:1,000;#711-165-152;Jackson ImmunoResearch)、Alexa488-コンジュゲートロバ抗ヤギ(1:1,000;#705-545-147;Jackson ImmunoResearch)、あるいはAlexa488-コンジュゲートロバ抗マウス(1:1,000;#715-545-150;Jackson ImmunoResearch)。その後、細胞をDAPI(#H-1200;Vector Laboratories)を含むVectashield蛍光物質で装着させた後に、共焦点レーザースキャニング顕微鏡を用いて、LSM700とZENソフトウェア(Zeiss)を用いて実験の結果物となるイメージを収得した。
マウスを400mgのketamine/kg体重の用量を麻酔させ、硬膜外に灌流させた後、4%のPBS中のパラホルムアルデヒド(PFA;#6148;Sigma Aldrich)で固定させた。マウスの脳は、4時間の間4℃の4%PFAに移した後、30%のスクラーゼ溶液で1日間保管した。その後、O.C.T化合物(#4583;Scigen)を用いて洗浄した後に、cryotome(#HM 550;Thermo Fisher Scientific)を用いて厚さ40μmに切り出して標本を形成した。前記脳標本は、スライドに保管され、同時に0.3%PBST(1X PBS/0.3%Triton X-100)中の2%ロバ血清で30分間浸漬させた後に、4℃のblocking bufferで一晩中1次抗体と共に培養された。1次抗体は、次の通りである:rabbit anti-Olfr110;1:10,000;#ab177327;Abcam,goat anti-Iba-1;1:1,000;#ab5076;Abcam,mouse anti-GFAP;1:1,000;#556330;BD Biosciences)
マウスの初代小膠細胞は、形質感染1日前に6 well plateに位置させた。次に、初代小膠細胞を分化させるために、製造メーカーのプロトコルに従ってOpti-MEM(#11058021;Thermo Fisher Scientific)中でLipofectamine RNAiMAX(#13778150,Themo Fisher Scientific)を使用した。また、100nMのOlfr110 siRNA(#LQ-064350-01-0002;4セットのON-TARGET+マウスOlfr110 siRNA;#1:CCUGUAAUUUAUACGCUAA;#2:CGUUAAGGUACUCAUUUAU;#3:CUGAAUGAAUUGCAGUAUU #4:GAUUGAUCUCAGUGCUGUA,Dharmacon)または100nM非標的siRNA(UGGUUUACAUGUCGACUAA,Thermo Fisher Scientific)を用いて24時間の間培養した。siRNA伝達効率は、siGLO Red oligonucleotide duplex(#D-001630-02-05,Thermo Fisher Scientific)を用いて確認した。以後、言及した部位指定突然変異誘発法を用いていくつかの沈黙ホモ突然変異(5’-CUCAACGAGCUGCAAUACC-3’)を有するOlfr110のsiRNA #3構造ベクターを生成した後、Olfr110ノックダウンのために24時間の間形質感染させた。構造ベクター実験で、前記構造ベクターは、製造メーカーのプロトコルに従ってLipofectamineLTX(#15338100;Thermo Fisher Scientific)を使用し、非標的またはsiRNA #3形質感染細胞で24時間の間形質を感染させた。
9週齢のCX3CR1GFP/+雄マウスをケタミンで麻酔させた後に小さい穴(~1mM in diameter)を頭蓋骨に穿設し、脳に接近可能なstereotaxic注入を施行した(bregma-0.11mm、1mm left spot from longitudinal fissure)。製造メーカーのプロトコルに従って、Lipofectamine RNAiMAXを用いてMock vector(knockdownの場合)あるいはrescue vector(recoveryの場合)が存在する0.5μl of siRNA(665ng)および0.5μl of siGLO Red oligonucleotide duplex(133ng,#D-001630-02-05,Thermo Fisher Scientific)を大脳皮質に注入した。0.5μl/minの速度でヘミルトン注射器を用いて注入が行われた。注射後48時間後に、前述した方法(Takayama et al.,2016)とは若干修正して生体外イメージング分析方法を行った。siRNA構造の伝達は、siGLO REDオリゴヌクレオチド二量体の赤色蛍光により確認できた。また、qRT-PCRを用いて注射部位で形質感染の効率性も確認できた。
2時間の間vehicle(対照群)、Sup(MOI 100)または2-PF(100μM)を処理した後、RNeasy mini Kit(Qiagen、74104)を使って2×106個の初代小膠細胞からトータルRNAを分離し、定量製造メーカーの標準プロトコルに従ってQubit RNA HS分析キット(Thermo Fisher Scientific,Q32852)を使って分析した。Agilent Technologies 2100 BioAnalyzerを使って各サンプルのRNA integrity number(RIN)を測定し、すべてのサンプルのRINは、8.5以上であり、これは、mRNAシーケンシングに適合する。製造メーカーの推奨プロトコルSMARTer-Seq v4 Ultra Low input RNA Kit(Clontech,634888)に従って全長cDNAを生成した。cDNAの一番目のストランド合成は、10ngのtotal RNAから1μlの3’SMART CDS primer II Aを3分間72℃で添加することによって始まった。SMARTer-seq v4 oligoおよびSMARTScribe逆転写酵素を添加して2番目のストランドを合成し、反応物を42℃で90分間インキュベーションした後、70℃で10分間不活性化させた。二本鎖cDNAをPCRにより8サイクルの間増幅させ、Agencourt AMPure bead(Beckman,A63881)を使って精製した。mRNA-seq libraryは、製造メーカーのNextera XT DNA library準備キット(illumina,FC-131-1024)推奨プロトコルに従って生成された。cDNAは、tagmentation(sequencing adaptorで分割されると同時にタギング)し、Nextera XT DNA Index Kit(Illumina,FC-131-1001)のIndex Primersを使ってPCRで増幅させた。PCR後、AMPure beadsを使ってDNA libraryを精製し、Agilent 2100 Bioanalyzerを使って品質を評価した。個別サンプルのDNA libraryは、KAPA library定量キット(KAPA biosystems,KK4854)を使って定量化した後、poolingした。Illumina Hiseq2500装備ですべてのライブラリーをシーケンシングして、二重インデックスされた100bp paired readsを生成し、各サンプルに対して平均5,800万readsを生成した。FastQC(Babraham Bioinformatics)を使ってraw sequencesの品質を確認し、cutadapterソフトウェアを使ってアダプタシーケンスを整理した。残っているreadsは、基本オプションと共にTopHat(Trapnell et al.,2009)を使ってマウスreference genome(GRCm38)に整列した。次に、整列したreadsをannotationが完了した遺伝子に組み立て、Cufflinks(Trapnell et al.,2010)を使ってfragments per kilobase per million mapped reads FPKMを計算した。
平均的に各標本から5,800万件のデータが収集され、データの89.9%がマウスの参照ゲノムに整列された。少なくとも一つのサンプルでFPKM>1の遺伝子は、以前に記述されたように発現することが明らかにされた(Graveley et al.,2011)。それぞれのサンプルのFPKM値を集めた後に、log2に変換されたFPKM値に量子正規化(Bolstad et al.,2003)を適用した。DEGを識別するために、このような正規値を以前に報告された統合統計テスト(Leeなど、2010)を使って次のような比較を行った。前記比較は、Sup-treated samplesとControlを(Sup)、2-PF処理されたサンプルとControl(2-PF)を比較することである。まず、各遺伝子に対してStudent’s t-testを行って、T-valueを得た後に、無作為標本抽出実験を1,000回行い、これを通じて得られたT値にガウスカーネル密度推定を適用した。T値に対する経験的ヌル分布を生成した。また、各遺伝子に対して、観察されたT値の補正P値は、両側検定法による経験的分布を使って計算された。DEGは、補正されたP値が0.05未満であり、絶対log2-median-ratio>cutoff(Sup vs 対照群の場合、log2倍数変化=0.41および0.54、対照群の場合、2 vs PF)遺伝子であることが確認された。
初代小膠細胞を48 well plate(2×105 cells/well)に接種し、30分間30μM forskolin(#F3917,Sigma Aldrich)、または2-PF(10,100,500μM)で処理した。抑制剤の効果を確認するために、1mM of SQ22536(#17318-31-9;Calbiochem)を30分間前処理した。細胞を10分間0.1M of HCl with 1%triton × 100 for 10min溶液で溶解させ、溶解液を600Хgの強度で2分間遠心分離させた。前記上澄み液は、直接cAMP ELISAキット(Enzo Life Science)を用いて製造メーカーのプロトコルに従ってcAMP分析に使用した。光学密度は、405nmでVersaMax microplate reader(Molecular Devices)を使って分析した。
poly-D-lysineでコーティングされた18mm口径顕微鏡cover glasses(#0111580;Marienfeld)に新しく分離した小膠細胞を位置させ、24時間後に、前記小膠細胞は、superfusion chamberで30分間培養させる。前記チャンバーは、0.22μmでろ過したRinger’s solution(115mM NaCl,2.5mM KCl,1mM CaCl2,1.5mM MgCl2,4.5mM HEPES,pH7.4)中に4μM of Fura-2/AM(Ca2+-sensitive fluorescent dye;#F1221;Thermo Fisher Scientific)が一緒にあるものである。前記カルシウム染色培養後に、チャンバーは、反転した顕微鏡に位置させ、3-PF処理前にRinger’s solutionで20分間洗浄した。この際、前記溶液のflow rateは、12ml/minである。次に、初代小膠細胞に300μM ATP(#A2383;Sigma Aldrich)を5秒間処理させた。その後、5分間洗浄後、100μM濃度の2-ペンチルフラン溶液で5秒間初代小膠細胞を処理した。この段階は、2つの濃度(300および1000μM)の2-ペンチルフラン溶液で進行された。最後に、300μM ATP溶液を5秒間処理する。放出された蛍光物質は、2秒ごとにCCDカメラを用いて撮影された。Pseudo-color imagesは、fractional fluorescence changes(ΔF/F、Δ[Ca2+]i)を用いて変換された。また、このイメージは、細胞内部のカルシウムイオンの変化を示す。撮影されたイメージの色強度は、最大1.5±0.1AU(arbitrary linear units)および最小0.4±0.1AUに設定された。代表的は、カルシウムイオンピークは、160個の細胞を分析した後に選択された。
本実験で使用された化学物質は、Sigma-Aldrichから購入した。購入したすべての化合物は、次の通りである:Acetic acid(#695092)、acetone(#W332607)、2-aminoacetophenone(#W390607)、dimethyl sulfide(#471577)、ethanol(#E7023)、hexanal(#115606)、hydrogen sulfide(#742546)、indole(#W259306)、isopentanol(#320021)、2-pentylfuran(#W331708)、trimethylamine(#W324108)、furan(#185922)、2-methylfuran(#M46846)、2,3-dimethylfuran(#428469)、2-ethylfuran(#W367303)、2-propylfuran(#P1488;東京化成工業株式会社try,TCI)、2-butylfuran(#CDS001204)、2-t-butylfuran(#386278)、2-hexylfuran(#H26698;Alfa Aesar)、およびDMSOに希釈された2-heptylfuran(#A10604;AlfaAesar)(#D2650;Sigma Aldrich)。DMSOに希釈されたATP(#A2383;Sigma Aldrich)。DMSOに希釈されたadenylyl cyclase、PKA、ERK、G、およびPLC経路の抑制剤、次の濃度による抑制剤:pd98059 50μM(#PHZ1164;Thermo Fisher Scientific)、300μM SQ22536(#568500;Calbiochem)、5μM U73122(#662035;Calbiochem)、10μM H-89(#tlrl-h89;InvivoGen)、および10μM Gallein(#371709;Calbiochem.また、それぞれの抑制剤は、実験1時間前に前処理された。
本実験ですべてのデータは、平均±SEMで表示された。統計的有意性は、測定を繰り返したり、the GraphPad Prism 5 Software package(GraphPad Software Inc.)を用いてrespective control valuesをunpaired Student’s t-test方法で測定した。
病的行動は、過多サイトカインの分泌により誘発される症状の一つであることが知られている(Dantzer et al.,2008)。本実験では、マウスの腹腔内にS.pneumoniae培養液を注射後にマウスの移動性を測定して、病的行動の誘導可否と反応を確認した。マウスに現れる反応中の摂取の変化、体重の変化、体重や体温などの変化は、即刻反応に該当した。実験者らは、マウスの移動性変化量に集中した(Dantzer et al.,2008)。腹腔内注射後にマウスの移動性が大幅に(P<0.01)減少することを確認し、このような変化は、注射量にも有意的な依存性があった(図1参照)。これとは対照的に、対照群を腹腔内に投入したマウスの場合、症状の訴えがないことを観察できた。このような症状の訴え、病的行動は、免疫系の過多サイトカイン分泌によるものであって(Konsman et al.,2002)、実際マウスのサイトカイン分泌の有無を確認するために、大脳皮質におけるサイトカインmRNAレベルを測定して比較した。この際、分析方法としては、quantitative real-time polymerase chain reaction(qPT-PCR)を利用した。実験群において腹腔内注射は、大脳皮質における炎症性、そして非炎症性サイトカインの分泌を対照群と比較したとき、全部有意的に(P<1.0×10-3)増加したことを確認できた(図2参照)。感染後の小膠細胞と星状細胞は、それぞれ全部proとantiサイトカインを分泌することが知られており(Norden et al.,2016)、本発明者らは、小膠細胞と星状細胞を腹腔内に注射した場合、2つのうちいずれかの場合において優先的にサイトカイン分泌が上昇するかを調査した。結果的に、5個のサイトカインのmRNAの分泌の有意的な(P<1.0×10-3)上昇が小膠細胞において確認された。Tnf、Il6、Il1b、Il10、Il13サイトカインがそれであり、これらは、全部小膠細胞の注入時に上昇したが、星状細胞の注入によってはそうでなかった(図3参照)。またTnf、Il6、Il1bの増加は、また、用量依存的であることを確認できた(図4参照)。
本発明者は、S.pneumoniaeから放出された代謝物が嗅覚受容体に結合して小膠細胞の活性化を誘導できるという仮設をたてた。1次的に嗅覚受容体候補を決定するために、初代小膠細胞のmRNA sequencing分析を施行した。これによって発見された13個の嗅覚受容体は、Olfr111、Olfr110、Olfr482、Olfr99、Olfr132、Olfr115、Olfr77、Olfr543、Olfr461、Olfr455、Olfr1420、Olfr1417、およびOlfr57であり、このうち、Olfr111/110が最も多く発現することを確認できた(図11参照)。また、遺伝子表現型データベース(GSE52564;(Zhang et al.,2014)を用いて小膠細胞で発現する7種類の嗅覚受容体を追加で発見した(Olfr110、Olfr111、Olfr99、Olfr1029、Olfr433、Olfr222、およびOlfr920)。このような7個の嗅覚受容体は、Olfr111/110を含み、他の細胞と比較すると、小膠細胞において特に発現するものである。このような過程を統合して合計17個の候補受容体を算出した。
3.1.2-PFによる小膠細胞の活性化有無の確認
次に、liquid-chromatography-tandemmass-spectrometry(LC-MS/MS)分析を用いてSupに2-PFが存在するかを確認した。liquid-chromatography-tandemmass-spectrometry(LC-MS/MS)を使って2-PFに関するデータを得た後、質量電荷比を用いて2-PFイオン前駆体を確認した(m/z=153.091)。結果的に、前駆体イオンは、Sup中では確認されたが、対照群では確認されなかった(図20参照)。また、合成2-PFのSupにおいて同じMSスペクトルを有することを確認した(図21参照)。F102で処理した場合と、F104で処理した場合、2-PF前駆体イオンの強度を比較した結果、F104を処理した場合、F102を処理した場合よりさらに強度が増加したこと(56.0倍)を確認できた(図22参照)。このような結果は、Supに2-PFが具体的に存在することを意味する。また、Supにおいて2-PFが小膠細胞の活性化を誘発するかを調査するために、2-PFを100、300、500μMで処理し、1次的に小膠細胞を処理した。結果的に、小膠細胞の濃度勾配に比例して有意的に(P<1.0×10-3)細胞走化性(図23参照)、活性酸素分泌(図24参照)、食作用(図25参照)が増加することを確認できた。
小膠細胞の活性化による病的行動の増加は、分泌されるサイトカインの増加に起因することが知られている。サイトカインの増加とともに病的行動の増加を確認するために本実験が進行された。病的行動の評価は、前記マウスにSupまたは2-PFのIPの注入後に行われた。
本実験では、小膠細胞の食作用を調べるために、9週齢の雄CX3CR1GFP/+マウスの脳をvibratome(Leica VT1200)を用いて厚さ150μmに切り出した後、氷冷された人工脳脊髄液(aCSF:120mM NaCl,25mM NaHCO3,1.25mM NaH2PO4,5mM KCl,1mM CaCl2,1mM MgSO4,305mOsm glucose,pH7.4)に保管した。その後、スライスされた脳を細胞破片の除去のために培養させた。酸素処理されたaCSFを37℃で2時間の間perfusion chamberで前処理した。引き続いて、培養前に9.10×107 microspheres(360/407mm;#17458;Polysciences)を含む500μlのaCSFとともに培養し、オーダーメード型ナイロングリッドで覆った。共焦点顕微鏡を使って92分間1分間隔でTime lapse動画を撮影した。食細胞作用をする小膠細胞の数をイメージから計算した。
本発明者らは、2-PFにより誘導される小膠細胞の活性化がOlfr110により仲介されるかを実験した。実験で、Olfr110に対する特定siRNAとsiRNAを回復させるOlfr110の特異的突然変異ベクター構造を設計した。4つのsiRNA候補のうち3番がHana3A細胞においてOlfr110のmRNAとタンパク質レベルを効果的に減少させることができた。形質感染後、初代小膠細胞においてmRNAとタンパク質の減少を観察できたが、構造ベクターは、siRNAにより誘発されたmRNAとタンパク質の減少を回復させた。このsiRNAと構造ベクターを用いて、Olfr110が2-PF誘発性小膠細胞の活性化に及ぼす影響を確認できた。第一に、Olfr110の無力化は、2-PFにより誘導された初代小膠細胞の炎症性サイトカインmRNAレベルの増加を減少させ、反対に、構造ベクターは、このような無力化による効果を回復させた。また、mRNAだけでなく、タンパク質レベルでも同様の効果を観察できた。2-PFにより誘導されて増加した活性酸素は、siRNAにより減少し、構造ベクターによりさらに回復された。しかしながら、P2Y受容体により仲介される活性酸素の増加は、構造ベクターの存在により影響を受けなかった。Olfr110 knockdownおよびrescue effects後、食作用と細胞走化性においても2-PFによる同様の現象を観察できた。
Olfr110を通した小膠細胞の活性化を分子的観点で理解するために、本実験では、Supまたは2-PFで処理した初代小膠細胞のmRNA-シーケンス分析を行った。mRNAシーケンシングデータを使ってそれぞれ1124、1438個の表現された遺伝子(DEGs)を確認できた(図42参照)。このような(DEGs)の有意的部分は(P<0.01)は、253個の遺伝子部分であり、本実験で253個の遺伝子(22.5および17.6% of 1124および1438 DEGs)が2つの実験群の間で共有されることを確認した。253個の共有DEGの中で135および78個の遺伝子が2-PF処理された小膠細胞においてそれぞれ一定にup-regulatedあるいはdown regulatedされる形状を示したが、残りの40個の遺伝子は、そうではなかった(図43参照)。次に、gene ontology biological processes(GOBPs)分析方法を用いて上と下に重なるこのような重なり遺伝子と関連した調査を行った。up-regulatedされる遺伝子は、小膠細胞活性と関連があった。活性化の具体的な内容は、次の通りである(図44参照):サイトカイン分泌(サイトカイン生成および分泌)、細胞走化性(血液細胞移動および走化性)、活性酸素生成(活性酸素および活性酸素代謝過程に対する細胞反応)および食作用である。このようなデータは、Supと2-PF処理した実験群の両方が小膠細胞の活性化を調節する遺伝子をup-regulatedすることによって活性化を誘導する反面、down-regulated遺伝子は転写を調節することを意味する(データ不図示)。結果的に、Olfr110に対する2-PFの結合が小膠細胞活性化に関与し、これによって、up-regulatedを誘導するシグナル伝達経路が活性化されるという事実を確認できた。このようなシグナル伝達システムを理解するために、サイトカイン生成、走化性、活性酸素生成および食作用に関連したシグナル伝達システムの相互作用を説明するネットワークモデルを再構成する必要があった(データ不図示)。新しく確立されたモデルは、cAMP、MAPK、PI3K、PLC、およびCa2+のシグナル伝達経路が小膠細胞の活性化に関与する遺伝子をup-regulatedすることを確認し、これは、以前の研究結果と一致した(VerderioおよびMatteoli、2001)。
以前の研究により嗅覚受容体の場合、活性剤と抑制剤が構造的に関連があるという報告があった。これを基に本発明者らは、2-PFと誘導体のうちでOlfr110とOlfr1111と結合しない誘導体(2-メチルフラン、2,3-ジメチルフラン、2-エチルフラン、2-ヘキシルフラン、または2-ヘプチルフラン)を同時に処理して、2-PFの活性を減少させる2-エチルフラン(2-ethylfuran、2-EF)を選別した。Hana3A細胞にOlfr110をtransfectionした後、2-PFを300μMで固定し、2-EFを1μM~10mMまでそれぞれ異なる濃度で2-PFとともに処理して競合的活性を測定し、2-EFの濃度が増加するほど2-PFの活性が減少することを確認した(Kd=120μM)。結果的に、Olfr110のagonistである2-PFが誘導させた活性酸素は、その競合的抑制剤(competitive inhibitor,antagonist)の2-EFにより減少する(図54参照)。競合的抑制剤として選別された2-EFの小膠細胞活性を確認するために、初代小膠細胞に2-EFの濃度を0、100、300、および500μMで前処理し、100 MOIのSupを処理し、活性酸素の生成量を測定した。結果的に、100のMOIにより生成された活性酸素は、2-EFの濃度が増加するほど、生成された活性酸素の量が少なくなることを観察できた(図55の左側を参照)。次に、Supに5のMOIを処理し、同時に2-PFを500μM処理後、2-エチルフランの濃度を0、100、300、および500μMで同時に処理した。その後、活性酸素の濃度を測定した。その結果、MOI5により活性酸素が生成され、また、500μMの2-PFにより活性酸素の生成がさらに増加した(図55の右側を参照)。しかしながら、添加された2-EFの濃度が高いほど、生成された活性酸素の濃度が低いことを確認できた。これは、活性酸素が経済的抑制剤である2-EFにより抑制された結果を得たことを意味する。
Claims (6)
- 2-ペンチルフラン(pentylfuran)、その溶媒和物、立体異性体またはこれらの薬学的に許容可能な塩を有効成分として含み、前記2-ペンチルフランは、小膠細胞を活性化させる、アルツハイマー病の予防または治療用薬学的組成物。
- 前記2-ペンチルフランは、下記化学式1で表される、請求項1に記載の薬学的組成物。
- 前記組成物は、薬学的に許容される担体、賦形剤または希釈剤をさらに含む、請求項1に記載の薬学的組成物。
- 前記活性化した小膠細胞は、食作用が促進され、これによってアルツハイマー病を誘発する物質を減少させる、請求項1に記載の薬学的組成物。
- 2-ペンチルフラン(pentylfuran)、その溶媒和物、立体異性体またはこれらの薬学的に許容可能な塩を有効成分として含み、前記2-ペンチルフランは、小膠細胞を活性化させる、アルツハイマー病の予防または改善用健康機能食品。
- 前記2-ペンチルフランは、下記化学式1で表される、請求項5に記載のアルツハイマー病の予防または改善用健康機能食品。
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