JP7239790B1 - ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物 - Google Patents
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Abstract
Description
第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含む。
(a)前記本開示のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物と、他のユーストマ植物とを交雑する工程;
(b)前記(a)工程より得られたユーストマ植物またはその後代系統から、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物を選抜する工程。
被検ユーストマ植物から、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含むユーストマ植物を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する選抜工程を含む。
本明細書において、「ユーストマ植物」は、リンドウ科(Gentianaceae)のユーストマ属(Eustoma)に分類される植物を意味する。前記ユーストマ植物は、例えば、トルコギキョウ、リシアンサス等とも呼ばれる。
ある態様において、本開示は、ユーストマ植物におけるユーストマ立枯病抵抗性の指標として使用可能なマーカーを提供する。本開示のマーカーは、ユーストマ植物のユーストマ立枯病抵抗性マーカーであって、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含むこと、すなわち、第20染色体上のユーストマ立枯病遺伝子座を指標とすることを特徴とする。本開示のマーカーによれば、ユーストマ立枯病抵抗性の有無を検出できる。
前記(1)および前記(3)の組合せ;
前記(2)および前記(3)の組合せ;
前記(1)、前記(2)および前記(3)の組合せ。
前記抵抗性遺伝子座は、前記(1)に示すように、例えば、前記SNPマーカーによって規定されてもよい。前記SNPマーカーは、特に制限されず、例えば、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378等があげられる。なお、これらのSNP解析は、例えば、下記参考文献1を参照できる。また、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378は、本発明者らが新たに同定したSNPマーカーであり、当該技術分野における当業者であれば、後述するこれらのSNPマーカーを含む塩基配列に基づき、前記SNPマーカーの座乗位置を特定できる。
参考文献1:Erik W. Ohlson et.al., “Identification and Mapping of Late Blight Resistance Quantitative Trait Loci in Tomato Accession PI163245”, The Plant Genome, vol.11, no.3, 180007.
配列番号1:5'-TTGACCAACACAAGGTGTCATTCTGCAAACAGGCTTTCGGTATAGCAGCAGTGAAACACTCAAACTGTACGTGTCCATGGGTTCAAATTTTTGATCTCTT[T]GAGCAAATCCCAACCCGAGTACTAACTGAGATATGTCCTGGGGACCGTAGCAAGATATCTAAATGAATGTGCAGTCTATTCCTATTTTTAACTTACATAT-3'
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配列番号79:5'-TTTTTTCTTCCTGTTCAAAAGCATCCAATTTTATGCATTTTGGTACCTAG[A]TTTGGTGAATTTTGATAAAGATTTGATCTTTATAATTTTTTATTGGGGCT-3'
配列番号3:5'-TTTACAGGAGCGTAACGAGAGGTTATTTTACAAGCTTCTAATTGACAATGTGGACGAACTCCTTCCTGTGGTGTACACTCCCACTGTTGGTGAGGCTTGC[A]AGAAATATGGAAGCATTTTCAAGCGTCCTCAGGGTCTCTTCATCAGTTTGAAAGAAAGGTTCTGTCATTTGTTTTTAATTTGTCTTAAAACGACTACTGT-3'
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配列番号4:5'-TGAAGTTTGGAGAGTCTCTAGGGCTATTAAACATGCATCATTAGTACTTCATGGTGATTTCACATGAAGGTGCTT[G]CAGAAAGAATTCACAGGAATGCTTTTTTGTTGTATATCAAAATATTCGTATTGAATGTCTTTTTTTTTTTCTGGC-3'
配列番号72:5'-ATGTCACTTCTAGAACTGATTTGTGCCTTTTATTTGTGTGGTTTTTGGTT[A]GATCATCTGTATGAGTACGCAATATTTTGGTTTAATGTTGATCTTAATCA-3'
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配列番号75:5'-ACACAACAGGTGCAGTGCTCAACTCAGCCAAACTACTATAAGTATTGACC[A]AGCTGAGCTGACCACAAGTGTACAACTACGTACTGCTGATACCCTTTCAT-3'
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配列番号77:5'-GCTGCATCGAGATTTCAAGAATCAAGATCAAAGCACATCAATCCCCAATT[T]CCCTAACGTTCTGAGCAATTCTTCAAAATAAAAGTACTCCCCAGTCAACA-3'
配列番号78:5'-TTATTCTTTATTTTGTGCAAGAGGTTGTTTCCACGGCTCGAACTCCTAAC[A]TCAAAGTCACAAAACAGCAACCGTACCAGTTGCTACAAGAACCGTCGTTC-3'
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SNP(g)、SNP(h)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(g)、SNP(h)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(g)、SNP(h)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(g)、SNP(i)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(g)、SNP(i)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(g)、SNP(i)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(g)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(g)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(g)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(h)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(h)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(h)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(a)、SNP(b)、SNP(c)、およびSNP(d)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、およびSNP(g)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、およびSNP(h)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、およびSNP(i)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(g)、およびSNP(h)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(g)、およびSNP(i)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(g)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(g)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(g)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(h)、およびSNP(i)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(h)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(h)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(h)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(i)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(i)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(i)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(h)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(i)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(h)、およびSNP(i)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(h)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(h)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(h)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(i)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(i)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(i)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(h)、およびSNP(i)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(h)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(h)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(h)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(i)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(i)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(i)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(h)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(h)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(h)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(h)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(i)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、およびSNP(i)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(i)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(i)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(i)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(g)、SNP(h)、およびSNP(i)の組合せ;
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SNP(c)、SNP(g)、SNP(h)、およびSNP(k)の組合せ;
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SNP(c)、SNP(g)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(c)、SNP(g)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(g)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(c)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(k)の組合せ;
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SNP(c)、SNP(h)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(c)、SNP(h)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(h)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(c)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、およびSNP(i)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(i)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(i)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(i)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(h)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(f)、SNP(h)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(h)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(f)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
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SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
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SNP(h)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
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SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(h)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(i)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、およびSNP(i)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(i)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(i)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(i)、およびSNP(l)の組合せ;
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SNP(b)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(c)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(g)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(j)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(g)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ。
前記組合せのうち、ユーストマ立枯病抵抗性との相関性がより高いことから、好ましくは、例えば、以下の組合せである。
SNP(f)およびSNP(k)の組合せ;
SNP(a)、SNP(b)、およびSNP(c)の組合せ;
SNP(a)、SNP(b)、SNP(c)、およびSNP(d)の組合せ;
SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)の組合せ。
前記抵抗性遺伝子座は、前記(2)に示すように、例えば、前記SNPマーカーを含む塩基配列によって規定されてもよい。前記抵抗性遺伝子座は、例えば、前記塩基配列からなるものでもよいし、前記塩基配列を含むものでもよい。
(a)下記(a1)、(a2)、または(a3)のポリヌクレオチド:
(a1)配列番号1の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(a2)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列において、1もしくは数個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(a3)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列に対して、80%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b) 下記(b1)、(b2)、または(b3)のポリヌクレオチド
(b1)配列番号2の塩基配列からなるポリヌクレオチド
(b2)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列において、1もしくは数個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド
(b3)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列に対して、80%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド
(c1)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド
(c2)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列において、1もしくは数個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド
(c3)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列に対して、80%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド
(d1)配列番号4の塩基配列からなるポリヌクレオチド
(d2)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列において、1もしくは数個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド
(d3)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列に対して80%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド
(f1)配列番号72の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f2)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列において、1もしくは数個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f3)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列に対して80%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g1)配列番号73の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g2)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列において、1もしくは数個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g3)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列に対して80%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h1)配列番号74の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h2)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列において、1もしくは数個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h3)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列に対して80%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i1)配列番号75の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i2)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列において、1もしくは数個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i3)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列に対して80%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j1)配列番号76の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j2)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列において、1もしくは数個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j3)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列に対して80%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k1)配列番号77の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k2)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列において、1もしくは数個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k3)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列に対して80%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l1)配列番号78の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l2)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列において、1もしくは数個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l3)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列に対して80%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(a)および(b)のポリヌクレオチドの組合せ;
(a)および(c)のポリヌクレオチドの組合せ;
(a)および(d)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)および(c)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)および(d)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)および(f)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)および(g)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)および(d)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)および(f)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)および(g)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)および(g)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(i)および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(i)および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(i)および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(j)および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(j)および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(k)および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(a)、(b)、および(c)のポリヌクレオチドの組合せ;
(a)、(b)、および(d)のポリヌクレオチドの組合せ;
(a)、(c)、および(d)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、および(d)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、および(f)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、および(g)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、および(g)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、および(g)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(a)、(b)、(c)、および(d)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、および(g)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(h)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(h)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(h)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(h)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(h)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(h)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(h)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(h)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(h)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(h)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(h)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(h)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(h)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(h)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(h)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(h)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(h)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(h)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(h)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、および(h)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(h)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(h)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(h)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(h)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(h)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(h)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(h)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(h)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(h)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(h)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
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(b)、(g)、(h)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(h)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
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(b)、(g)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
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(c)、(f)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(h)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(h)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(h)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(h)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
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(c)、(g)、(h)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
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(c)、(g)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
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(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、および(i)のポリヌクレオチドの組合せ;
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(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
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(b)、(c)、(f)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
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(b)、(f)、(h)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(h)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(h)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(h)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(h)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(h)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(h)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(h)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(g)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、および(j)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(h)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(h)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(h)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(h)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(h)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(h)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(h)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(h)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(g)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(g)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(g)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、(k)および(l)のポリヌクレオチドの組合せ。
前記組合せのうち、ユーストマ立枯病抵抗性との相関性がより高いことから、好ましくは、例えば、以下の組合せである。
(f)および(k)のポリヌクレオチドの組合せ;
(a)、(b)、および(c)のポリヌクレオチドの組合せ;
(a)、(b)、(c)、および(d)のポリヌクレオチドの組合せ;
(b)、(c)、(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドの組合せ。
前記抵抗性遺伝子座は、前述のように、SNPマーカーと連鎖する。このため、前記抵抗性遺伝子座は、前記(3)に示すように、例えば、前記2つのSNPマーカーの部位間の領域の塩基配列、または前記2つのSNPマーカーにより規定される領域(座乗位置またはマッピング領域ともいう)によって規定されてもよい。前記2つのSNPマーカーの部位間の領域の塩基配列は、特に制限されず、例えば、前記染色体における、Egra20_3656645、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378からなる群から選択された2つのSNPマーカーの部位間の領域の塩基配列等があげられる。前記2つのSNPマーカーの部位間の領域の塩基配列は、例えば、後述する受託番号FERM BP-22427で寄託されたユーストマ植物(以下、「寄託系統」ともいう)における対応する2つのSNPマーカーの部位間の領域の塩基配列を参照できる。前記寄託系統の塩基配列を参照する場合、前記2つのSNPマーカーの部位間の領域の塩基配列は、例えば、前記寄託系統の塩基配列と完全または部分的に一致する。後者の場合、前記2つのSNPマーカーの部位間の領域の塩基配列は、例えば、前記2つのSNPマーカーの部位間の領域の塩基配列で特定される抵抗性遺伝子座を有するユーストマ植物が、ユーストマ立枯病抵抗性を示せばよい。前記部分的な一致は、例えば、前記寄託系統の塩基配列に対する同一性により規定できる。前記同一性は、例えば、80%以上、85%以上、89%以上、90%以上、95%以上、96%以上、97%以上、98%以上、99%以上、99.1%以上、99.2%以上、99.3%以上、99.4%以上、99.5%以上、99.6%以上、99.7%以上、99.8%以上、または99.9%以上である。前記抵抗性遺伝子座が前記(3)で特定される場合、前記抵抗性遺伝子座は、例えば、前記2つのSNPマーカーの部位間の領域に座乗しているということもできる。前記抵抗性遺伝子座を座乗している領域により特定する場合、前記抵抗性遺伝子座は、さらに、前記SNPマーカーまたは前記SNPマーカーを含む塩基配列と組合せて特定してもよい。
配列番号5:5'-CACAGGTGGTAGGATGGCCTCCAGTTCGATCGTTCCGAAAGAATTCAATGGCAAACAATCCTCACAAGGCTGATGAAGAAGCAGATGCAATGACTGGAAG[C]AGTCGTCTTTACGTCAAAGTTAGCATGGATGGTGCCCCTTATCTGAGGAAAGTTGATATCAAGACATACAACAGCTACAAGGACCTGTCCTCTGCACTTG-3'
(1)上流側端部のSNPが、SNP(e)またはSNP(a)であり、下流側端部のSNPが、SNP(c)またはSNP(d)である;
(2)上流側端部のSNPが、SNP(e)であり、下流側端部のSNPが、SNP(d)である;
(3)上流側端部のSNPが、SNP(a)であり、下流側端部のSNPが、SNP(d)である;
(4)上流側端部のSNPが、SNP(a)であり、下流側端部のSNPが、SNP(c)である;
(5)上流側端部のSNPが、SNP(b)であり、下流側端部のSNPが、SNP(c)である。
(6)上流側端部のSNPが、SNP(b)であり、下流側端部のSNPが、SNP(d)である。
(7)上流側端部のSNPが、SNP(b)であり、下流側端部のSNPが、SNP(l)である。
(8)上流側端部のSNPが、SNP(f)であり、下流側端部のSNPが、SNP(k)である。
前記組合せのうち、ユーストマ立枯病抵抗性との相関性がより高いことから、好ましくは、例えば、以下の組合せである。
前記(2)~(8)の組合せ;
前記組合せのうち、ユーストマ立枯病抵抗性との相関性がさらに高いことから、より好ましくは、例えば、以下の組合せである。
前記(3)の組合せ;
前記(5)の組合せ;
前記(7)の組合せ;
前記(8)の組合せ。
条件(i):
前記染色体における、SNP(e)およびSNP(d)の部位間の領域の塩基配列を含み、または座乗し、且つ、
前記領域の塩基配列において、SNP(a)、SNP(b)、SNP(c)、およびSNP(d)からなる群から選択された少なくとも一つのSNPマーカーを有し、好ましくは、SNP(a)、SNP(b)、SNP(c)からなる群から選択された少なくとも一つのSNPマーカーを有する(で特定される);
条件(ii):
前記染色体における、SNP(a)およびSNP(d)の部位間の領域の塩基配列を含み、または座乗し、且つ、
前記領域の塩基配列において、SNP(a)、SNP(b)、SNP(c)、およびSNP(d)からなる群から選択された少なくとも一つのSNPマーカーを有し、好ましくは、SNP(a)、SNP(b)、SNP(c)からなる群から選択された少なくとも一つのSNPマーカーを有する(で特定される);
条件(iii):
前記染色体における、SNP(a)およびSNP(c)の部位間の領域の塩基配列を含み、または、且つ、
前記領域の塩基配列において、SNP(a)、SNP(b)、およびSNP(c)からなる群から選択された少なくとも一つのSNPマーカーを有する(で特定される);
条件(iv):
前記染色体における、SNP(b)およびSNP(l)の部位間の領域の塩基配列を含み、または座乗し、且つ、
前記領域の塩基配列において、SNP(b)、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、SNP(k)、およびSNP(l)からなる群から選択された少なくとも一つのSNPマーカーを有する(で特定される);
条件(v):
前記染色体における、SNP(f)およびSNP(k)の部位間の領域の塩基配列を含み、または座乗し、且つ、
前記領域の塩基配列において、SNP(c)、SNP(f)、SNP(g)、SNP(h)、SNP(i)、SNP(j)、およびSNP(k)からなる群から選択された少なくとも一つのSNPマーカーを有する(で特定される)。
条件(vi):
前記染色体における、SNP(b)およびSNP(l)の部位間の領域の塩基配列を含み、または座乗し、且つ、
前記領域の塩基配列において、SNP14~SNP59およびSNP60からなる群から選択された少なくとも一つのSNPマーカーを有する(で特定される);
条件(vii):
前記染色体における、SNP(f)およびSNP(k)の部位間の領域の塩基配列を含み、または座乗し、且つ、
前記領域の塩基配列において、SNP18~SNP48およびSNP49からなる群から選択された少なくとも一つのSNPマーカーを有する(で特定される)。
別の態様において、本開示は、ユーストマ立枯病に対して抵抗性を示すユーストマ植物を提供する。本開示のユーストマ植物は、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物であって、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含む。本開示のユーストマ植物は、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含むことから、ユーストマ立枯病に対して抵抗性を示すことができる。本開示のユーストマ植物の説明において、前記第20染色体上の前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、例えば、本開示のユーストマ立枯病抵抗性マーカーと読み替え可能である。
寄託の種類:国際寄託
寄託機関名:独立行政法人製品評価技術基盤機構 特許生物寄託センター
あて名:日本国 〒292-0818 千葉県木更津市かずさ鎌足2-5-8 120号室
受託番号:FERM BP-22427
識別のための表示:Takii 21
受領日:2021年9月1日
別の態様において、本開示は、ユーストマ立枯病に抵抗性を示すユーストマ植物の部分を提供する。本開示は、前記本開示のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の部分である。本開示のユーストマ植物は、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含む。本開示のユーストマ植物の部分は、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含むことから、ユーストマ立枯病に対して抵抗性を示すことができる。本開示のユーストマ植物の説明において、前記第20染色体上の前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、例えば、本開示のユーストマ立枯病抵抗性マーカーと読み替え可能である。
別の態様において、本開示は、ユーストマ立枯病に対して抵抗性を示す、ユーストマ植物の製造方法を提供する。本開示のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法(以下、「製造方法」ともいう)は、下記(a)および(b)工程を含む。本開示の製造方法は、下記(a)の工程のみを含んでもよい。
(b)前記(a)工程より得られたユーストマ植物またはその後代系統から、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物を選抜する工程。
(x)被検ユーストマ植物から、前記本開示のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物を選抜する工程。
(x2)前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座の存在により、前記被検ユーストマ植物を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する選抜工程
前記(x)工程における前記選抜は、例えば、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378からなる群から選択された少なくとも一つのSNPマーカーで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ植物の選抜である。前記選択されるSNPマーカーは、特に制限されず、例えば、前記本開示のマーカーにおける「(1)SNPマーカーによる特定」の説明を援用できる。
前記(x)工程における前記選抜は、例えば、前記(a)、(b)、(c)、(d)、(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)からなる群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ植物の選抜である。前記(a)、(b)、(c)、(d)、(f)、(g)、(h)、(i)、(j)、(k)、および(l)のポリヌクレオチドは、例えば、前記本開示のマーカーにおける「(2)SNPマーカーを含む塩基配列による特定」の説明を援用できる。
前記(x)工程における前記選抜は、例えば、前記染色体における、Egra20_3656645、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378からなる群から選択された2つのSNPマーカーの部位間の領域の塩基配列を含むユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ植物の選抜である。前記2つのSNPマーカーの部位間の領域の塩基配列は、例えば、前記本開示のユーストマ立枯病抵抗性マーカーにおける「(3)2つのSNPマーカーの部位間の領域による特定」の説明を援用できる。
(b1)前記(a)工程より得られたユーストマ植物またはその後代系統について、染色体上における、ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座の有無を検出する検出工程
(b2)前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座の存在により、前記(a)工程により得られたユーストマ植物またはその後代系統を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する選抜工程
別の態様において、本開示は、ユーストマ立枯病に対して抵抗性を示す、ユーストマ植物をスクリーニングする方法を提供する。本開示のスクリーニング方法は、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物のスクリーニング方法であって、被検ユーストマ植物から、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含むユーストマ植物を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する選抜工程を含む。本開示のスクリーニング方法によれば、ユーストマ立枯病に対して抵抗性を示す可能性があるユーストマ植物をスクリーニングできる。また、本開示のスクリーニング方法によれば、交雑によりユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物を生産するための親をスクリーニングすることができる。
別の態様において、本開示は、ユーストマ植物におけるユーストマ立枯病に対する抵抗性を検出する方法を提供する。本開示の検出方法は、ユーストマ植物のユーストマ立枯病抵抗性の検出方法であって、被検ユーストマ植物の第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を検出する検出工程を含む。本開示の検出方法によれば、対象のユーストマ植物がユーストマ立枯病に対して抵抗性を示すかを検出できる。本開示のユーストマ植物のユーストマ立枯病抵抗性の検出方法は、例えば、ユーストマ植物におけるユーストマ立枯病抵抗性のスクリーニング方法ということもできる。
別の態様において、本開示は、ユーストマ植物に、ユーストマ立枯病の抵抗性を付与する方法を提供する。本開示のユーストマ植物へのユーストマ立枯病抵抗性の付与方法は、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を、ユーストマ植物に導入する導入工程を含むことを特徴とする。本開示の付与方法によれば、前記第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座、すなわち、前記本開示のユーストマ立枯病抵抗性マーカーを導入することにより、ユーストマ植物にユーストマ立枯病抵抗性を付与できる。
別の態様において、本開示は、FERM BP-22427で特定される寄託系統またはその後代系統を識別しうる方法を提供する。本開示の識別方法は、FERM BP-22427で特定される寄託系統またはその後代系統の識別方法であって、被検ユーストマ植物のSNP1~65およびSNP66からなる群から選択された少なくとも1つのSNPを検出するSNP検出工程を含む。本開示の識別方法によれば、前記被検ユーストマ植物が、前記寄託系統またはその後代系統であるかを識別しうる。前記識別は、例えば、鑑別、鑑定、検出、判定、判別、評価等ということもできる。このため、本開示の識別方法は、例えば、鑑別方法、鑑定方法、検出方法、判定方法、判別方法、評価方法等ということもできる。
新規な立枯病抵抗性ユーストマ植物について、ユーストマ立枯病菌に対し抵抗性を示すことを確認し、また新規なユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座の特定を行った。
接種に供試するユーストマ植物は、タキイたねまぎ培土を詰めた288穴セルトレイに播種し、12週間育苗した。前記育苗後、前記ユーストマ植物は、タキイたねまぎ培土を詰めた55穴セルトレイに移植した。
ユーストマ立枯病菌(Fusarium oxysporum)は、山形県のユーストマ栽培圃場において、自然発病した立枯病罹病ユーストマ植物に由来するものを使用した。前記立枯病菌は、下記の接種試験により、前記罹病性ユーストマ植物に感染可能な病原菌であることを確認した。
ジャガイモ(300.0g煎汁) 1000mL
Ca(NO3)2・4H2O 0.5g
Na2HPO4・12H2O 2.0g
ペプトン 5.0g
ショ糖 20.0g
pH6.8~7.0
発病度1:無病徴
発病度2:植物体の一部が萎凋
発病度3:植物体の全体が萎凋または枯死
前記接種試験を行った結果、高度な立枯病抵抗性を示す、新規の立枯病抵抗性ユーストマ系統を得た。以下、この立枯病抵抗性ユーストマ植物を親系統という。また、前記親系統は、受託番号FERM BP-22427で寄託した。以下、前記親系統を、寄託系統ともいう。
立枯病抵抗性を持つ前記寄託系統(以下、「PR系統」ともいう)と、立枯病罹病性(感受性)ユーストマ植物「ミンク」(タキイ種苗株式会社、以下、「PS系統」ともいう)とを交雑して、F1世代を取得した。つぎに、前記F1世代を自殖することにより、F2世代の種子を得た。さらに、前記F2世代の植物を自殖することにより、192個体のF3世代種子(以下、「192系統」ともいう)を得た。
新規な立枯病抵抗性ユーストマ植物が有する抵抗性遺伝子座について、他のユーストマ植物が有していないことを確認した。
寄託系統およびその後代系統を識別可能なSNPマーカーを同定した。
寄託系統(PR系統)および下記市販のユーストマ品種を用いて、寄託系統特異的なSNPマーカーを探索した。
(タキイ種苗社製)パレオピンク、ファルダダブルブルー、ミンク、ラ・フォリア、雪てまり、マイコ
(カネコ社製)エグゼラベンダー、コレゾライトピンク
(住化農業資材社製)セレブピンク、海ほのか
(サカタのタネ社製)ロベラ クリアピンク
(ミヨシ社製)ボレロホワイト
新規な立枯病抵抗性ユーストマ植物について、ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座の詳細な位置の特定を行った。
上記の実施形態および実施例の一部または全部は、以下の付記のように記載されうるが、以下には限られない。
<ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物>
(付記1)
ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物であって、
第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含む、ユーストマ植物。
(付記2)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、
Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378からなる群から選択されたSNPマーカー、および/または、
SNP1~65および66からなる群から選択されたSNPマーカー
で特定される、付記1に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物。
(付記3)
Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、付記2に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物。
(付記4)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、
下記(a)~(d)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチド、および/または、
SNP1~65および66を含むポリヌクレオチドからなる群から選択されたポリヌクレオチド
で特定される、付記1から3のいずれかに記載のユーストマ植物:
(a)下記(a1)、(a2)、または(a3)のポリヌクレオチド:
(a1)配列番号1の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(a2)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(a3)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b)下記(b1)、(b2)、または(b3)のポリヌクレオチド:
(b1)配列番号2の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b2)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b3)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c)下記(c1)、(c2)、または(c3)のポリヌクレオチド:
(c1)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c2)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c3)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d)下記(d1)、(d2)、または(d3)のポリヌクレオチド:
(d1)配列番号4の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(d2)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d3)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f)下記(f1)、(f2)、または(f3)のポリヌクレオチド:
(f1)配列番号72の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f2)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f3)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g)下記(g1)、(g2)、または(g3)のポリヌクレオチド:
(g1)配列番号73の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g2)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g3)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h)下記(h1)、(h2)、または(h3)のポリヌクレオチド:
(h1)配列番号74の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h2)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h3)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i)下記(i1)、(i2)、または(i3)のポリヌクレオチド:
(i1)配列番号75の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i2)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i3)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j)下記(j1)、(j2)、または(j3)のポリヌクレオチド:
(j1)配列番号76の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j2)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j3)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k)下記(k1)、(k2)、または(k3)のポリヌクレオチド:
(k1)配列番号77の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k2)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k3)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l)下記(l1)、(l2)、または(l3)のポリヌクレオチド:
(l1)配列番号78の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l2)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l3)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド。
(付記5)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、前記(b)、(c)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定される、付記4に記載のユーストマ植物。
(付記6)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、前記染色体における、Egra20_3656645、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378、および/または、SNP1~66からなる群から選択された2つのSNPマーカーの部位間の領域に座乗している、付記1から5のいずれかに記載のユーストマ植物。
(付記7)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、前記染色体における、
前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間、または
前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間、
の領域に座乗している、付記6に記載のユーストマ植物。
(付記8)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、およびEgra20_3914662からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP14~SNP59およびSNP60からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、または
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP18~SNP48およびSNP49からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
付記7に記載のユーストマ植物。
(付記9)
前記ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物は、受託番号FERM BP-22427で特定されるユーストマ植物またはその後代系統である、付記1から8のいずれかに記載のユーストマ植物。
(付記10)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、受託番号FERM BP-22427で特定されるユーストマ植物のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座に由来する、付記1から9のいずれかに記載のユーストマ植物。
<ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の部分>
(付記11)
付記1から10のいずれかに記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の部分。
(付記12)
前記植物の部分が、種子である、付記11に記載の植物の部分。
<製造方法>
(付記13)
下記(a)および(b)工程を含むことを特徴とする、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法:
(a)付記1から10のいずれかに記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物と、他のユーストマ植物とを交雑する工程;
(b)前記(a)工程より得られたユーストマ植物またはその後代系統から、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物を選抜する工程。
(付記14)
前記(a)工程に先立って、下記(x)工程を含む、付記13に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(x)被検ユーストマ植物から、付記1から10のいずれかに記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物を選抜する工程
(付記15)
前記(x)工程における前記選抜が、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含むユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記14に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(付記16)
前記(x)工程における前記選抜が、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378からなる群から選択されたSNPマーカー、および/または、SNP1~65および66からなる群から選択されたSNPマーカーで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記15に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(付記17)
前記(x)工程における前記選抜が、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記16に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(付記18)
前記(x)工程における前記選抜が、下記(a)~(d)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドおよび/または、SNP1~65および66を含むポリヌクレオチドからなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記15から17に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法:
(a)下記(a1)、(a2)、または(a3)のポリヌクレオチド:
(a1)配列番号1の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(a2)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(a3)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b)下記(b1)、(b2)、または(b3)のポリヌクレオチド:
(b1)配列番号2の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b2)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b3)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c)下記(c1)、(c2)、または(c3)のポリヌクレオチド:
(c1)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c2)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c3)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d)下記(d1)、(d2)、または(d3)のポリヌクレオチド:
(d1)配列番号4の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(d2)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d3)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f)下記(f1)、(f2)、または(f3)のポリヌクレオチド:
(f1)配列番号72の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f2)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f3)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g)下記(g1)、(g2)、または(g3)のポリヌクレオチド:
(g1)配列番号73の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g2)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g3)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h)下記(h1)、(h2)、または(h3)のポリヌクレオチド:
(h1)配列番号74の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h2)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h3)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i)下記(i1)、(i2)、または(i3)のポリヌクレオチド:
(i1)配列番号75の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i2)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i3)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j)下記(j1)、(j2)、または(j3)のポリヌクレオチド:
(j1)配列番号76の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j2)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j3)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k)下記(k1)、(k2)、または(k3)のポリヌクレオチド:
(k1)配列番号77の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k2)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k3)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l)下記(l1)、(l2)、または(l3)のポリヌクレオチド:
(l1)配列番号78の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l2)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l3)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド。
(付記19)
前記(x)工程における前記選抜が、前記(b)、(c)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記18に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(付記20)
前記(x)工程における前記選抜が、前記染色体における、Egra20_3656645、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378、および/または、SNP1~66からなる群から選択された2つのSNPマーカーの部位間の領域に座乗しているユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記15から19のいずれかに記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(付記21)
前記(x)工程における前記選抜が、前記染色体における、
前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間、または
前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間、
の領域に座乗しているユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記20に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(付記22)
前記(x)工程における前記選抜が、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、およびEgra20_3914662からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP14~SNP59およびSNP60からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、または
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP18~SNP48およびSNP49からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記21に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(付記23)
前記(b)工程における前記選抜が、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含むユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記13から22のいずれかに記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(付記24)
前記(b)工程における前記選抜が、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378からなる群から選択されたSNPマーカー、および/または、SNP1~65および66からなる群から選択されたSNPマーカーで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記13から23のいずれかに記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(付記25)
前記(b)工程における前記選抜が、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記24に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(付記26)
前記(b)工程における前記選抜が、下記(a)~(d)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドおよび/または、SNP1~65および66を含むポリヌクレオチドからなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記13から25のいずれかに記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法:
(a)下記(a1)、(a2)、または(a3)のポリヌクレオチド:
(a1)配列番号1の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(a2)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(a3)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b)下記(b1)、(b2)、または(b3)のポリヌクレオチド:
(b1)配列番号2の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b2)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b3)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c)下記(c1)、(c2)、または(c3)のポリヌクレオチド:
(c1)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c2)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c3)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d)下記(d1)、(d2)、または(d3)のポリヌクレオチド:
(d1)配列番号4の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(d2)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d3)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f)下記(f1)、(f2)、または(f3)のポリヌクレオチド:
(f1)配列番号72の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f2)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f3)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g)下記(g1)、(g2)、または(g3)のポリヌクレオチド:
(g1)配列番号73の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g2)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g3)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h)下記(h1)、(h2)、または(h3)のポリヌクレオチド:
(h1)配列番号74の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h2)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h3)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i)下記(i1)、(i2)、または(i3)のポリヌクレオチド:
(i1)配列番号75の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i2)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i3)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j)下記(j1)、(j2)、または(j3)のポリヌクレオチド:
(j1)配列番号76の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j2)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j3)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k)下記(k1)、(k2)、または(k3)のポリヌクレオチド:
(k1)配列番号77の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k2)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k3)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l)下記(l1)、(l2)、または(l3)のポリヌクレオチド:
(l1)配列番号78の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l2)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l3)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド。
(付記27)
前記(b)工程における前記選抜が、前記(b)、(c)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記26に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(付記28)
前記(b)工程における前記選抜が、前記染色体における、Egra20_3656645、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378、および/または、SNP1~66からなる群から選択された2つのSNPマーカーの部位間の領域に座乗しているユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記13から27のいずれかに記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(付記29)
前記(b)工程における前記選抜が、前記染色体における、
前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間、または
前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間、
の領域に座乗しているユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記28に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(付記30)
前記(b)工程における前記選抜が、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、およびEgra20_3914662からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP14~SNP59およびSNP60からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、または
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP18~SNP48およびSNP49からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、付記29に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
<付与方法>
(付記31)
第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を、ユーストマ植物に導入する導入工程を含むことを特徴とする、ユーストマ植物へのユーストマ立枯病抵抗性の付与方法。
(付記32)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378からなる群から選択されたSNPマーカー、および/または、SNP1~65および66からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、付記31に記載の付与方法。
(付記33)
Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、付記32に記載の付与方法。
(付記34)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、下記(a)~(d)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチド、および/または、SNP1~65および66を含むポリヌクレオチドからなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定される、付記31から33のいずれかに記載の付与方法:
(a)下記(a1)、(a2)、または(a3)のポリヌクレオチド:
(a1)配列番号1の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(a2)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(a3)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b)下記(b1)、(b2)、または(b3)のポリヌクレオチド:
(b1)配列番号2の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b2)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b3)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c)下記(c1)、(c2)、または(c3)のポリヌクレオチド:
(c1)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c2)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c3)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d)下記(d1)、(d2)、または(d3)のポリヌクレオチド:
(d1)配列番号4の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(d2)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d3)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f)下記(f1)、(f2)、または(f3)のポリヌクレオチド:
(f1)配列番号72の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f2)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f3)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g)下記(g1)、(g2)、または(g3)のポリヌクレオチド:
(g1)配列番号73の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g2)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g3)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h)下記(h1)、(h2)、または(h3)のポリヌクレオチド:
(h1)配列番号74の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h2)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h3)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i)下記(i1)、(i2)、または(i3)のポリヌクレオチド:
(i1)配列番号75の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i2)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i3)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j)下記(j1)、(j2)、または(j3)のポリヌクレオチド:
(j1)配列番号76の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j2)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j3)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k)下記(k1)、(k2)、または(k3)のポリヌクレオチド:
(k1)配列番号77の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k2)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k3)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l)下記(l1)、(l2)、または(l3)のポリヌクレオチド:
(l1)配列番号78の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l2)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l3)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド。
(付記35)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、前記(b)、(c)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定される、付記34に記載の付与方法。
(付記36)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、前記染色体における、Egra20_3656645、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378、および/または、SNP1~66からなる群から選択された2つのSNPマーカーの部位間の領域に座乗している、付記31から35のいずれかに記載の付与方法。
(付記37)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、前記染色体における、
前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間、または
前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間、
の領域に座乗している、付記36に記載の付与方法。
(付記38)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、およびEgra20_3914662からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP14~SNP59およびSNP60からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、または
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP18~SNP48およびSNP49からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
付記37に記載の付与方法。
(付記39)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、受託番号FERM BP-22427で特定されるユーストマ植物のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座に由来する、付記31から38のいずれかに記載の付与方法。
(付記40)
付記1から10のいずれかに記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物と交雑することにより、前記第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を導入する、付記31から39のいずれかに記載の付与方法。
(付記41)
前記ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物は、受託番号FERM BP-22427で特定されるユーストマ植物またはその後代系統である、付記40に記載の付与方法。
<ユーストマ植物のユーストマ立枯病抵抗性マーカー>
(付記42)
ユーストマ植物のユーストマ立枯病抵抗性マーカーであって、
第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含むことを特徴とする、マーカー。
(付記43)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378からなる群から選択されたSNPマーカー、および/または、SNP1~65および66からなる群から選択されたSNPマーカー
で特定される、付記42に記載のマーカー。
(付記44)
Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、付記43に記載のマーカー。
(付記45)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、下記(a)~(d)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチド、および/または、SNP1~65および66を含むポリヌクレオチドからなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定される、付記42から44のいずれかに記載のマーカー:
(a)下記(a1)、(a2)、または(a3)のポリヌクレオチド:
(a1)配列番号1の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(a2)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(a3)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b)下記(b1)、(b2)、または(b3)のポリヌクレオチド:
(b1)配列番号2の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b2)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b3)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c)下記(c1)、(c2)、または(c3)のポリヌクレオチド:
(c1)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c2)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c3)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d)下記(d1)、(d2)、または(d3)のポリヌクレオチド:
(d1)配列番号4の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(d2)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d3)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f)下記(f1)、(f2)、または(f3)のポリヌクレオチド:
(f1)配列番号72の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f2)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f3)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g)下記(g1)、(g2)、または(g3)のポリヌクレオチド:
(g1)配列番号73の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g2)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g3)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h)下記(h1)、(h2)、または(h3)のポリヌクレオチド:
(h1)配列番号74の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h2)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h3)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i)下記(i1)、(i2)、または(i3)のポリヌクレオチド:
(i1)配列番号75の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i2)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i3)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j)下記(j1)、(j2)、または(j3)のポリヌクレオチド:
(j1)配列番号76の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j2)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j3)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k)下記(k1)、(k2)、または(k3)のポリヌクレオチド:
(k1)配列番号77の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k2)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k3)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l)下記(l1)、(l2)、または(l3)のポリヌクレオチド:
(l1)配列番号78の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l2)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l3)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド。
(付記46)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、前記(b)、(c)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定される、付記45に記載のマーカー。
(付記47)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、前記染色体における、Egra20_3656645、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378、および/またはSN1~66からなる群から選択された2つのSNPマーカーの部位間の領域に座乗している、付記42から46いずれかに記載のマーカー。
(付記48)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、前記染色体における、
前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間、または
前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間、
の領域に座乗している、付記47に記載のマーカー。
(付記49)
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、およびEgra20_3914662からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP14~SNP59およびSNP60からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、または
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP18~SNP48およびSNP49からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
付記48に記載のマーカー。
<ユーストマ植物のユーストマ立枯病抵抗性の検出方法>
(付記50)
ユーストマ植物のユーストマ立枯病抵抗性の検出方法であって、
被検ユーストマ植物について、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を検出する検出工程を含む、方法。
(付記51)
前記検出工程において、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378からなる群から選択されたSNPマーカー、および/または、
SNP1~65および66からなる群から選択されたSNPマーカーを検出することにより、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を検出する、付記50に記載の検出方法。
(付記52)
前記検出工程において、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーを検出することにより、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を検出する、付記51に記載の検出方法。
(付記53)
前記検出工程において、下記(a)~(d)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチド、および/または、SNP1~65および66を含むポリヌクレオチドからなる群から選択されたポリヌクレオチドを検出することにより、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を検出する、付記50から52のいずれかに記載の検出方法:
(a)下記(a1)、(a2)、または(a3)のポリヌクレオチド:
(a1)配列番号1の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(a2)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(a3)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b)下記(b1)、(b2)、または(b3)のポリヌクレオチド:
(b1)配列番号2の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b2)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b3)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c)下記(c1)、(c2)、または(c3)のポリヌクレオチド:
(c1)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c2)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c3)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d)下記(d1)、(d2)、または(d3)のポリヌクレオチド:
(d1)配列番号4の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(d2)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d3)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f)下記(f1)、(f2)、または(f3)のポリヌクレオチド:
(f1)配列番号72の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f2)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f3)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g)下記(g1)、(g2)、または(g3)のポリヌクレオチド:
(g1)配列番号73の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g2)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g3)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h)下記(h1)、(h2)、または(h3)のポリヌクレオチド:
(h1)配列番号74の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h2)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h3)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i)下記(i1)、(i2)、または(i3)のポリヌクレオチド:
(i1)配列番号75の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i2)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i3)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j)下記(j1)、(j2)、または(j3)のポリヌクレオチド:
(j1)配列番号76の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j2)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j3)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k)下記(k1)、(k2)、または(k3)のポリヌクレオチド:
(k1)配列番号77の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k2)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k3)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l)下記(l1)、(l2)、または(l3)のポリヌクレオチド:
(l1)配列番号78の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l2)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l3)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド。
(付記54)
前記検出工程において、前記(b)、(c)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドを検出することにより、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を検出する、付記53に記載の検出方法。
(付記55)
前記検出工程において、前記染色体における、Egra20_3656645、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378、および/または、SNP1~66からなる群から選択された2つのSNPマーカーの部位間の領域に座乗しているユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を検出する、付記50から54のいずれかに記載の検出方法。
(付記56)
前記検出工程において、前記染色体における、
前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間、または
前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間、
の領域に座乗している、ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を検出する、付記55に記載の検出方法。
(付記57)
前記検出工程において、 前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、およびEgra20_3914662からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP14~SNP59およびSNP60からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、または
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP18~SNP48およびSNP49からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を検出する、付記56に記載の検出方法。
<ユーストマ植物のユーストマ立枯病抵抗性のスクリーニング方法>
(付記58)
ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物のスクリーニング方法であって、
被検ユーストマ植物から、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含むユーストマ植物を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する選抜工程を含む、スクリーニング方法。
(付記59)
前記選抜工程において、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378からなる群から選択されたSNPマーカー、および/または、SNP1~65および66からなる群から選択されたSNPマーカーで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ植物を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する、付記58に記載のスクリーニング方法。
(付記60)
前記選抜工程において、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する、付記59に記載のスクリーニング方法。
(付記61)
前記選抜工程において、下記(a)~(d)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチド、および/または、SNP1~65および66を含むポリヌクレオチドからなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ植物を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する、付記58から60のいずれかに記載のスクリーニング方法:
(a)下記(a1)、(a2)、または(a3)のポリヌクレオチド:
(a1)配列番号1の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(a2)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(a3)前記(a1)の101番目の塩基(T)が保存され、前記(a1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(a1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b)下記(b1)、(b2)、または(b3)のポリヌクレオチド:
(b1)配列番号2の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b2)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(b3)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(b1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c)下記(c1)、(c2)、または(c3)のポリヌクレオチド:
(c1)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c2)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(c3)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(c1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d)下記(d1)、(d2)、または(d3)のポリヌクレオチド:
(d1)配列番号4の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(d2)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(d3)前記(d1)の76番目の塩基(G)が保存され、前記(d1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(d1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f)下記(f1)、(f2)、または(f3)のポリヌクレオチド:
(f1)配列番号72の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f2)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(f3)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(f1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g)下記(g1)、(g2)、または(g3)のポリヌクレオチド:
(g1)配列番号73の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g2)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(g3)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(g1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h)下記(h1)、(h2)、または(h3)のポリヌクレオチド:
(h1)配列番号74の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h2)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(h3)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(h1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i)下記(i1)、(i2)、または(i3)のポリヌクレオチド:
(i1)配列番号75の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i2)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(i3)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(i1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j)下記(j1)、(j2)、または(j3)のポリヌクレオチド:
(j1)配列番号76の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j2)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(j3)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(j1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k)下記(k1)、(k2)、または(k3)のポリヌクレオチド:
(k1)配列番号77の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k2)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(k3)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(k1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l)下記(l1)、(l2)、または(l3)のポリヌクレオチド:
(l1)配列番号78の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l2)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド;
(l3)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなり、前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座において、前記ユーストマ立枯病抵抗性に関して前記(l1)のポリヌクレオチドと同等の機能を有するポリヌクレオチド。
(付記62)
前記選抜工程において、前記(b)、(c)および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する、付記61に記載のスクリーニング方法。
(付記63)
前記選抜工程において、前記染色体における、Egra20_3656645、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378、および/または、SNP1~66からなる群から選択された2つのSNPマーカーの部位間の領域に座乗しているユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ植物を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する、付記58から62のいずれかに記載のスクリーニング方法。
(付記64)
前記選抜工程において、前記染色体における、
前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間、または
前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間、
の領域に座乗しているユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する、付記63に記載のスクリーニング方法。
(付記65)
前記選抜工程において、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、または
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、およびEgra20_3914662からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP14~SNP59およびSNP60からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、または
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつSNP18~SNP48およびSNP49からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する、付記64にスクリーニング方法。
<寄託系統または後代系統の識別方法>
(付記66)
FERM BP-22427で特定される寄託系統またはその後代系統の識別方法であって、
被検ユーストマ植物のSNP1~65およびSNP66からなる群から選択された少なくとも1つのSNPを検出するSNP検出工程を含む、識別方法。
(付記67)
前記被検ユーストマ植物のSNPと、対応する基準SNPとを比較して、前記被検ユーストマ植物が前記寄託系統またはその後代系統であるかを評価する評価工程を含む、付記66に記載の識別方法。
Claims (25)
- ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物であって、
第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含み、
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、前記染色体における、
前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間、または
前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間、
の領域に座乗している、ユーストマ植物。 - ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物であって、
第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含み、
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物。 - 前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、下記(b)、(c)、および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定される、請求項2に記載のユーストマ植物:
(b)下記(b1)、(b2)、または(b3)のポリヌクレオチド:
(b1)配列番号2の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b2)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b3)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c)下記(c1)、(c2)、または(c3)のポリヌクレオチド:
(c1)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c2)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c3)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f)下記(f1)、(f2)、または(f3)のポリヌクレオチド:
(f1)配列番号72の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f2)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f3)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g)下記(g1)、(g2)、または(g3)のポリヌクレオチド:
(g1)配列番号73の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g2)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g3)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h)下記(h1)、(h2)、または(h3)のポリヌクレオチド:
(h1)配列番号74の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h2)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h3)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i)下記(i1)、(i2)、または(i3)のポリヌクレオチド:
(i1)配列番号75の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i2)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i3)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j)下記(j1)、(j2)、または(j3)のポリヌクレオチド:
(j1)配列番号76の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j2)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j3)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k)下記(k1)、(k2)、または(k3)のポリヌクレオチド:
(k1)配列番号77の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k2)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k3)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l)下記(l1)、(l2)、または(l3)のポリヌクレオチド:
(l1)配列番号78の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l2)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l3)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド。 - 前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、または
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、およびEgra20_3914662からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
請求項2に記載のユーストマ植物。 - 前記ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物は、受託番号FERM BP-22427で特定されるユーストマ植物またはその後代系統である、請求項1または2に記載のユーストマ植物。
- 前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、受託番号FERM BP-22427で特定されるユーストマ植物のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座に由来する、請求項1または2に記載のユーストマ植物。
- 請求項1または2に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の部分。
- 前記植物の部分が、種子である、請求項7に記載の植物の部分。
- 下記(a)および(b)工程を含むことを特徴とする、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法:
(a)請求項1または2に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物と、他のユーストマ植物とを交雑する工程;
(b)前記(a)工程より得られたユーストマ植物またはその後代系統から、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物を選抜する工程。 - 前記(a)工程に先立って、下記(x)工程を含む、請求項9に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
(x)被検ユーストマ植物から、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含むユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物を選抜する工程 - 前記(x)工程における前記選抜が、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、請求項10に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
- 前記(x)工程における前記選抜が、下記(b)、(c)、および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定されるユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、請求項10に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法:
(b)下記(b1)、(b2)、または(b3)のポリヌクレオチド:
(b1)配列番号2の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b2)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b3)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c)下記(c1)、(c2)、または(c3)のポリヌクレオチド:
(c1)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c2)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c3)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f)下記(f1)、(f2)、または(f3)のポリヌクレオチド:
(f1)配列番号72の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f2)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f3)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g)下記(g1)、(g2)、または(g3)のポリヌクレオチド:
(g1)配列番号73の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g2)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g3)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h)下記(h1)、(h2)、または(h3)のポリヌクレオチド:
(h1)配列番号74の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h2)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h3)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i)下記(i1)、(i2)、または(i3)のポリヌクレオチド:
(i1)配列番号75の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i2)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i3)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j)下記(j1)、(j2)、または(j3)のポリヌクレオチド:
(j1)配列番号76の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j2)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j3)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k)下記(k1)、(k2)、または(k3)のポリヌクレオチド:
(k1)配列番号77の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k2)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k3)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l)下記(l1)、(l2)、または(l3)のポリヌクレオチド:
(l1)配列番号78の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l2)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l3)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド。 - 前記(x)工程における前記選抜が、前記染色体における、Egra20_3656645、Egra20_3703734、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、Egra20_3939402、およびEgra20_3961378からなる群から選択された2つのSNPマーカーの部位間の領域に座乗しているユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、請求項10に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。
- 前記(x)工程における前記選抜が、前記染色体における、
前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間、または
前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間、
の領域に座乗しているユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、請求項13に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。 - 前記(x)工程における前記選抜が、
前記染色体における、前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、または
前記染色体における、前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間の領域に座乗し、かつEgra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、およびEgra20_3914662からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、
ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を有するユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の選抜である、請求項10に記載のユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物の製造方法。 - 第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を、ユーストマ植物に導入する導入工程を含み、
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、前記染色体における、
前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間、または
前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間、
の領域に座乗していることを特徴とする、ユーストマ植物へのユーストマ立枯病抵抗性の付与方法。 - 第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を、ユーストマ植物に導入する導入工程を含み、
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定されることを特徴とする、ユーストマ植物へのユーストマ立枯病抵抗性の付与方法。 - 第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含むユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物と交雑することにより、前記第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を導入する、請求項16または17に記載の付与方法。
- 前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、下記(b)、(c)、および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定される、請求項16に記載の付与方法:
(b)下記(b1)、(b2)、または(b3)のポリヌクレオチド:
(b1)配列番号2の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b2)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b3)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c)下記(c1)、(c2)、または(c3)のポリヌクレオチド:
(c1)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c2)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c3)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f)下記(f1)、(f2)、または(f3)のポリヌクレオチド:
(f1)配列番号72の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f2)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f3)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g)下記(g1)、(g2)、または(g3)のポリヌクレオチド:
(g1)配列番号73の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g2)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g3)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h)下記(h1)、(h2)、または(h3)のポリヌクレオチド:
(h1)配列番号74の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h2)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h3)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i)下記(i1)、(i2)、または(i3)のポリヌクレオチド:
(i1)配列番号75の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i2)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i3)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j)下記(j1)、(j2)、または(j3)のポリヌクレオチド:
(j1)配列番号76の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j2)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j3)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k)下記(k1)、(k2)、または(k3)のポリヌクレオチド:
(k1)配列番号77の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k2)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k3)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l)下記(l1)、(l2)、または(l3)のポリヌクレオチド:
(l1)配列番号78の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l2)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l3)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド。 - ユーストマ植物のユーストマ立枯病抵抗性の検出方法であって、
被検ユーストマ植物について、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を検出する検出工程を含み、
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、前記染色体における、
前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間、または
前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間、
の領域に座乗している、方法。 - ユーストマ植物のユーストマ立枯病抵抗性の検出方法であって、
被検ユーストマ植物について、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を検出する検出工程を含み、
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、方法。 - 前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、下記(b)、(c)、および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定される、請求項21に記載の方法:
(b)下記(b1)、(b2)、または(b3)のポリヌクレオチド:
(b1)配列番号2の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b2)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b3)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c)下記(c1)、(c2)、または(c3)のポリヌクレオチド:
(c1)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c2)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c3)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f)下記(f1)、(f2)、または(f3)のポリヌクレオチド:
(f1)配列番号72の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f2)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f3)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g)下記(g1)、(g2)、または(g3)のポリヌクレオチド:
(g1)配列番号73の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g2)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g3)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h)下記(h1)、(h2)、または(h3)のポリヌクレオチド:
(h1)配列番号74の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h2)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h3)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i)下記(i1)、(i2)、または(i3)のポリヌクレオチド:
(i1)配列番号75の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i2)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i3)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j)下記(j1)、(j2)、または(j3)のポリヌクレオチド:
(j1)配列番号76の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j2)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j3)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k)下記(k1)、(k2)、または(k3)のポリヌクレオチド:
(k1)配列番号77の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k2)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k3)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l)下記(l1)、(l2)、または(l3)のポリヌクレオチド:
(l1)配列番号78の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l2)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l3)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド。 - ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物のスクリーニング方法であって、
被検ユーストマ植物から、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含むユーストマ植物を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する選抜工程を含み、
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、前記染色体における、
前記Egra20_3759258および前記Egra20_3939402のSNPマーカーの部位間、または
前記Egra20_3833476および前記Egra20_3914662のSNPマーカーの部位間、
の領域に座乗している、スクリーニング方法。 - ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物のスクリーニング方法であって、
被検ユーストマ植物から、第20染色体上のユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座を含むユーストマ植物を、ユーストマ立枯病抵抗性ユーストマ植物として選抜する選抜工程を含み、
前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、Egra20_3759258、Egra20_3833476、Egra20_3839851、Egra20_3849059、Egra20_3854638、Egra20_3857016、Egra20_3879982、Egra20_3914662、およびEgra20_3939402からなる群から選択されたSNPマーカーで特定される、スクリーニング方法。 - 前記ユーストマ立枯病抵抗性遺伝子座は、下記(b)、(c)、および(f)~(l)からなる群から選択されたポリヌクレオチドで特定される、請求項24に記載のスクリーニング方法:
(b)下記(b1)、(b2)、または(b3)のポリヌクレオチド:
(b1)配列番号2の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b2)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(b3)前記(b1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(b1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c)下記(c1)、(c2)、または(c3)のポリヌクレオチド:
(c1)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c2)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列において、1~20個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(c3)前記(c1)の101番目の塩基(A)が保存され、前記(c1)の塩基配列に対して、90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f)下記(f1)、(f2)、または(f3)のポリヌクレオチド:
(f1)配列番号72の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f2)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(f3)前記(f1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(f1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g)下記(g1)、(g2)、または(g3)のポリヌクレオチド:
(g1)配列番号73の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g2)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(g3)前記(g1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(g1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h)下記(h1)、(h2)、または(h3)のポリヌクレオチド:
(h1)配列番号74の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h2)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(h3)前記(h1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(h1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i)下記(i1)、(i2)、または(i3)のポリヌクレオチド:
(i1)配列番号75の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i2)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(i3)前記(i1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(i1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j)下記(j1)、(j2)、または(j3)のポリヌクレオチド:
(j1)配列番号76の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j2)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(j3)前記(j1)の51番目の塩基(G)が保存され、前記(j1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k)下記(k1)、(k2)、または(k3)のポリヌクレオチド:
(k1)配列番号77の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k2)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(k3)前記(k1)の51番目の塩基(T)が保存され、前記(k1)の塩基配列に対して90%以上の同一性を有する塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l)下記(l1)、(l2)、または(l3)のポリヌクレオチド:
(l1)配列番号78の塩基配列からなるポリヌクレオチド;
(l2)前記(l1)の51番目の塩基(A)が保存され、前記(l1)の塩基配列において、1~15個の塩基が欠失、置換、挿入および/または付加された塩基配列からなるポリヌクレオチド;
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