JP6902509B2 - プロセスチューブおよび搬送用トレイ - Google Patents

Description

本明細書に記載されている技術は、概して、増幅過程で使用されるプロセスチューブと、運搬および処理のためにプロセスチューブがしっかりと保管される搬送用トレイとに関し、また、それらプロセスチューブおよび搬送用トレイを製作および使用する方法にも関する。

医療診断産業は、今日の医療インフラストラクチャの重大な要素である。しかしながら、現在、インビトロ診断分析は、たとえ繰り返しであったとしても、患者治療における障害となっている。生体試料の診断アッセイがいくつかの重要なステップへと分解できることが理解でき、１つまたは複数のステップを自動化することがしばしば望ましい。例えば、患者から得られたものなどの生体試料は、目的の標的核酸（例えば、ＤＮＡ、ＲＮＡなど）を増幅するために、核酸増幅アッセイで用いられ得る。サーマルサイクラ装置で行われるポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）は、目的の試料を増幅するために用いられるこのような増幅アッセイの１つである。
増幅されると、標的核酸の存在または標的核酸の増幅産物（例えば、標的アンプリコンが）が検出でき、標的核酸および／または標的アンプリコンの存在が、標的（例えば、標的病原体、遺伝子変異、変化など）の存在を特定および／または定量化するために用いられる。しばしば、核酸増幅アッセイは複数のステップを含み、それらは、核酸の抽出および前処理と、核酸増幅と、標的核酸検出とを含み得る。
多くの核酸に基づく診断アッセイでは、分析される生物学、環境、または他の試料は、入手されると、処理のための試薬と混合される。このような処理は、生体試料から抽出された核酸を、プローブおよび蛍光物質など、増幅試薬および検出試薬と混合することを含み得る。増幅のために試料を処理することは、現在、時間がかかる労働集約的なステップである。

増幅のための試料の処理は、しばしば、抽出されたＤＮＡ試料を、増幅過程の前および最中に保つために用いられる専用のプロセスチューブで生じる。ある例では、プロセスチューブが、増幅のためにサーマルサイクラに直接的に配置される。ある例では、手順を単純化するために、プロセスチューブは、増幅前処理（チューブを増幅試薬で満たす、試薬を乾燥する、チューブをホットスタンプすることによってチューブに印付けするなど）のために、チューブラックに最初に配置される。プロセスチューブは、しばしば、研究技術者によってチューブラックから取り外され、個別に分けられてサーマルサイクラの加熱器ユニットと接した状態に配置される。プロセスチューブをサーマルサイクラに個別に置くことは、非効率的で時間がかかり、自動化するのが難しい可能性がある。さらに、このような過程は、人為的な誤りを受けやすい。
ある例では、プロセスチューブを収容するラックは、サーマルサイクラに直接的に配置され得る。しかしながら、この手法は、プロセスチューブが取り扱いおよび運搬の最中にラックで位置が変わる可能性があり、その結果、サーマルサイクラの加熱器と正確に並べられないことになる。また、研究技術者による介入が、チューブを位置合わせしてチューブをサーマルサイクラの加熱器に嵌め入れるために必要とされる。さらに、プロセスチューブがラックに堅固に連結されていない場合、プロセスチューブの印付けの最中に加工が取り外され、スタンプ装置によってラックから引っ張り上げられて外される可能性がある。

ラックにおけるプロセスチューブの取り扱いおよび運搬の難しさの多くは、増幅過程で一般的に用いられるチューブの形に起因する。プロセスチューブは、しばしば、形が円錐であり、プロセスチューブの底部においてよりも、プロセスチューブの最上部において、より大きな外径を有している。あるプロセスチューブは、形が円筒であり、最上部から底部へと一定の直径を有している。プロセスチューブが配置されるラックのポートは、（プロセスチューブの最上部における）プロセスチューブの最大外径より、大きな直径のものでなければならない。プロセスチューブおよびラックの製造に伴う許容誤差に対処するために、ラックのポートは、しばしば、プロセスチューブの外径よりかなり大きく、チューブがラックにおいて動き回ることを可能とし、落下させる可能性がある。ラックに堅固に嵌まっていない場合、プロセスチューブは一方の側または別の側へと傾く可能性がある。ラックに複数のプロセスチューブがある場合、傾いているプロセスチューブは、互いとぶつかり合い、内部に保管された試料および／または試薬の破壊および／または損失を引き起こす可能性がある。さらに、異なって傾けられたプロセスチューブを、サーマルサイクラの剛体の加熱器に並べることは、非常に困難であり得る。

したがって、増幅の前および最中にプロセスチューブの安全で効率的な取り扱いおよび運搬を可能にするために、堅固に一体的に嵌まるプロセスチューブおよびトレイに対する要求がある。さらに、サーマルサイクラの加熱器との位置合わせを容易にするために、トレイ内で適応または浮遊する能力も有するプロセスチューブに対する要求がある。
ここでの背景技術の詳述は、本明細書に記載されている本発明の文脈を説明するように意図されている。これは、言及される構成要素のいずれかが、請求項のいずれかの優先日において、公表されていること、公知されていること、または、共通の一般的な知識の一部であることを自認すると解釈されるものではない。

本明細書で開示している特定の実施形態は、環状隆条部、突出部、および、隆条部と突出部との間の首部を備える固定領域を有するプロセスチューブを企図している。プロセスチューブは、突出部の下に延びる本体部と、チューブへの開口を定める環状隆条部から鉛直方向上方に延びる最上環部とをも備える。
特定の実施形態では、首部の外側面が、プロセスチューブを通る長手軸線と平行であり得る。突出部は、頂部と、頂部から首部への上方傾斜部と、頂部から本体部への下方傾斜部とを備え得る。突出部における上方傾斜部の角度が、突出部における下方傾斜部の角度より急であり得る。プロセスチューブの環状隆条部は、上方面、下方面、および外側面を有し得る。突出部は、首部の外径より大きい外径を有し得る。環状隆条部は、突出部の外径より大きい外径を有し得る。プロセスチューブは、本体部の下に、プロセスチューブの底部を定める基部をさらに備え得る。

本明細書で開示している特定の実施形態は、複数のプロセスチューブを有するプロセスチューブストリップを備える。複数のプロセスチューブは、複数のチューブの環状隆条部に隣接するタブによって連結される。
特定の実施形態は、チューブから側方に延び、上方面、下方面、および外面を備える環状隆条部を有するプロセスチューブを企図している。プロセスチューブは、環状隆条部の上方面から鉛直方向上方に延び、プロセスチューブに開口を定める最上環部を備え得る。プロセスチューブは、チューブにおける環状隆条部の下の位置で、プロセスチューブから側方に延びる環状突出部をさらに備え得る。突出部は、頂部と、上方傾斜部と、下方傾斜部とを有し得る。プロセスチューブは、環状隆条部と突出部との間の首部と、突出部の下の本体部と、チューブの底部を定める基部とを備え得る。

開示しているプロセスチューブの実施形態は、搬送用トレイに堅固に嵌まるように構成され得る。搬送用トレイは棚部と基部とを、棚部がその棚部の最上部を貫く複数のポートを有し、ポートが内部壁を有するように、有し得る。特定の実施形態では、開示しているプロセスチューブの突出部は、搬送用トレイのポートの直径より大きい外径を有し得る。プロセスチューブの首部は、搬送用トレイのポートの直径より小さい外径を有し得る。プロセスチューブは、搬送用トレイのポートに堅固に嵌め入れられ得る。

プロセスチューブの特定の実施形態では、プロセスチューブの環状隆条部の下方面は、棚部最上部の外部に載りかかることができ、突出部の上方傾斜部は、ポートの内部壁の底縁に載りかかることができる。隙間は、プロセスチューブの首部とポートの内部壁との間に存在でき、隙間は、プロセスチューブを、搬送用トレイのポート内で傾かせる、または、適応させることができる。

本開示のさらなる実施形態は、内部を貫く複数のポートを備える搬送用トレイと、固定領域を有するプロセスチューブとを有するシステムを企図している。プロセスチューブの固定領域は、環状隆条部と、首部と、突出部とを備え得る。プロセスチューブの固定領域は、搬送用トレイのポートに堅固に嵌まることができる。このシステムでは、プロセスチューブの環状隆条部および突出部は、搬送用トレイのポートの直径より大きい外径を有することができ、プロセスチューブの首部は、ポートの直径より小さい外径を有することができる。プロセスチューブが搬送用トレイのポートに堅固に嵌められるとき、プロセスチューブは、搬送用トレイのポート内で傾く、または、適応することができる。

本明細書に記載されているような例示のプロセスチューブストリップの等角図である。 図１Ａのプロセスチューブストリップの側方平面図である。 図１Ａのプロセスチューブストリップの上面図である。 本明細書に記載されているような別の例示のプロセスチューブストリップの等角図である。 本明細書に記載されているような別の例示のプロセスチューブストリップの等角図である。 本明細書に記載されているような例示の単一のプロセスチューブの等角図である。 図１Ｃの線２Ｂに沿って切り取られた、図２Ａのプロセスチューブの断面図である。 本明細書に記載されているような例示の搬送用トレイの図である。 図３Ａの搬送用トレイの例示の複数のプロセスチューブストリップの図である。 プロセスチューブを搬送用トレイに固定する前の、搬送用トレイで位置決めされた１２個のプロセスチューブの断面図である。 プロセスチューブを搬送用トレイに固定する前の、搬送用トレイで位置決めされた２個の例示のプロセスチューブの断面図である。 プロセスチューブを搬送用トレイに固定した後の図４の１２個のプロセスチューブの、図３Ｂの線６Ａに沿って切り取られた断面図である。 プロセスチューブを搬送用トレイに固定した後の搬送用トレイに位置決めされたプロセスチューブストリップの、図３Ｂの線６Ｂに沿って切り取られた断面図である。 プロセスチューブを搬送用トレイに固定した後の、搬送用トレイで位置決めされた図５のプロセスチューブの断面図である。 サーマルサイクラの例示の加熱器組立体の等角図である。 本明細書に記載されているような加熱器組立体の加熱器ウェルに位置決めされた例示のプロセスチューブの断面図である。

実施形態をさらに説明する前に、本発明が、記載される具体的な実施形態に限定されず、変化し得ることは、理解されるものである。また、本明細書で用いられる専門用語は、具体的な実施形態を説明するだけの目的のためであり、限定するように意図されていないことも、理解されるものである。

ある範囲の値が与えられる場合、文脈が明確に指示していない場合、この範囲の上限と下限との間で、下限の単位の十分の一までの各々の仕切り値と、この規定された範囲における任意の他の規定されたまたは仕切っている値は、実施形態内に包含されると理解される。これらのより小さい範囲の上限および下限は、より小さい範囲に独立して含まれてもよく、規定された範囲の任意の明確に除外された限度に従って、実施形態内に同じく包含される。規定された範囲が限度のうちの一方または両方を含む場合、それらのいずれかまたは両方が含まれた限度を除外する範囲も、実施形態に同じく包含される。

他に定められていない場合、本明細書で用いられるすべての技術的用語および科学的用語は、実施形態が属する技術における当業者によって通常理解されるのと同じ意味を持っている。本明細書に記載されているものと同様または同等の任意の方法および材料が実施形態の実施または試験で使用されてもよいが、好ましい方法および材料がここでは記載されている。
本明細書および添付の請求項で用いられているように、単数形「１つ（ａ）」、「および（ａｎｄ）」、および「その（ｔｈｅ）」は、文脈が明確に指示していない場合、複数の指示対象を含んでいる。したがって、例えば、「１つの方法」との言及は、複数のこのような方法、および、当業者に知られているそのような方法の均等物などを含んでいる。

明細書の記載および請求を通じて、用語「備える（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）」と、「備えている（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」および「備える（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」など、その様々な変形とは、他の付加物、構成部品、整数、またはステップを排除するようには意図されていない。
本明細書に記載されているプロセスチューブおよび搬送用トレイは、サーマルサイクラで使用する前に、プロセスチューブを準備、保管、および運搬する安全で効率的なシステムを提供するために、また、増幅の最中に、プロセスチューブをサーマルサイクラに正確に堅固に位置決めするために、一体的に用いられ得る。

図１Ａは、本明細書に記載されている実施形態による例示のプロセスチューブストリップ１００の等角図である。図１Ｂは、図１Ａのプロセスチューブストリップの側方平面図である。図１Ｃは、図１Ａのプロセスチューブストリップの上面図である。図１Ａ〜図１Ｃで示すように、プロセスチューブストリップ１００は、連結タブ１０４によって一体的に連結された、プロセスチューブ１０２の集合である。例のプロセスチューブストリップ１００は、図１Ａ〜図１Ｃで示すように、プロセスチューブストリップ１００の最上部を指し示す最上端タブ１０６と、プロセスチューブストリップ１００の底部を指し示す底端タブ１０８とをも備え得る。図１Ａ〜図１Ｃで示すプロセスチューブストリップ１００は、プロセスチューブストリップ１００で一体的に連結された８個のプロセスチューブ１０２を備えている。しかしながら、当業者は、他の実施形態において、プロセスチューブストリップ１００は、例えば、プロセスチューブストリップ１００で連結された、任意の他の数のプロセスチューブ、例として、４０個、３０個、２０個、１９個、１８個、１７個、１６個、１５個、１４個、１３個、１２個、１１個、１０個、９個、７個、６個、５個、４個、３個、または２個のプロセスチューブ１０２を備えてもよいことは、すぐに理解することになる。プロセスチューブストリップ１００の実施形態は、最上端タブ１０６および底端タブ１０８の上方面に記号または目印を備え得る。一実施形態では、最上端タブ１０６は、プロセスチューブストリップ１００の最上部を指し示す「Ａ」で印付けされてもよく、底端タブ１０８は、プロセスチューブストリップ１００のプロセスチューブ１０２の数に対応する後のアルファベットで印付けされてもよい（例えば、プロセスチューブストリップ１００で一体的に連結された８個のプロセスチューブ１０２を有するプロセスチューブストリップ１００については、「Ｈ」がプロセスチューブストリップ１００の底端タブ１０８に印付けされることになる）。しかしながら、熟練した技術者は、例えば「１」および「８」などの英数字といった、様々な他の文字も、同じ目的を達成するために、プロセスチューブストリップ１００の最上端タブおよび底端タブの印付けにおいて容易に用いられ得ることを、容易に理解するものである。したがって、最上端タブ１０６および底端タブ１０８は、プロセスチューブ１０２の最上部および底部と、プロセスチューブストリップ１００におけるプロセスチューブ１０２の数とを指し示すために用いられ得る。また、端タブ１０６、１０８には、例えば、プロセスチューブ１０２の内容物、プロセスチューブストリップ１００で実施されるアッセイの種類、ならびに、プロセスチューブストリップ１００の製造の日付および場所を特定するために、色の印付け、バーコード、または何らかの他の指示で、印付けされてもよい。

図１Ｄは、プロセスチューブ１０２の各々において隆条延在部１１０を備えているプロセスチューブストリップ１００の別の実施形態である。図１Ｅは、各々のプロセスチューブ１０２の隆条延在部１１０に位置決めされたチューブタグ１１２を備えているプロセスチューブストリップ１００の別の実施形態である。これらの実施形態は、後でより詳細に説明されることになる。

プロセスチューブ１０２は、固体もしくは液体のための容器であり得るか、または、固体もしくは液体を収容し得る。例えば、プロセスチューブ１０２は、試薬、および／または、例えば増幅アッセイで用いられる核酸試料といった、試料を保持できる。プロセスチューブ１０２は、断面が円であり得るが、他の断面も可能であり、本明細書と矛盾はない。プロセスチューブ１０２は単一構造によって製造できるが、特定の例では、プロセスチューブは、適用可能であるとき、一体的に溶着または他の方法で結合された２つ以上の部品から製作されてもよい。典型的には、プロセスチューブ１０２は、プロセスチューブ１０２内での流体の貯留および／または回収のために、ピペット先端を受け取る／受け入れるように構成されている開口を有している。

ある実施形態では、プロセスチューブ１０２は、ポリプロピレン、または、当業者に知られている他の熱可塑性ポリマから製作され得る。代替で、プロセスチューブ１０２は、ポリカーボネートなど、他の適切な材料から製作できる。ある実施形態では、ポリプロピレンは、二酸化チタン、酸化亜鉛、酸化ジルコニウム、または炭酸カルシウムなどの顔料で有利に補われる。好ましくは、プロセスチューブ１０２は、蛍光を発しないことで、プロセスチューブ１０２の増幅された核酸の検出と干渉しないような材料を用いて製造される。

図２Ａおよび図２Ｂは、例示の単一のプロセスチューブ１０２の等角図と断面図とをそれぞれ示している。連結タブ１０４は図２Ａに示されており、プロセスチューブ１０２を、プロセスチューブ１０２の両側において、他のプロセスチューブ１０２へと連結している。図２Ｂでは、示した連結タブ１０４は、連結タブの下側に連結凹所２３２を備えている。ある実施形態では、連結凹所２３２は、プロセスストリップ１００の一部として連結された別々のプロセスチューブ１０２を簡単に切り離すために、分離点を提供する。プロセスチューブ１０２は、異なる乾燥試薬を有する異なるプロセスチューブ１０２を混ぜ合わせて組み合わせるために、最終使用者によって切り離すことができ、サーマルサイクラにおける増幅アッセイの必要な実施に適合するように、搬送用トレイ３００においてプロセスチューブを再配置できる。連結タブ１０４は、プロセスチューブストリップ１００の端におけるプロセスチューブ１０２と、最上端タブ１０６または底端タブ１０８との間にも位置決められ得る。このような連結タブ１０４は、端プロセスチューブ１０２を簡単に取り外せて、他のプロセスチューブストリップ１００からのプロセスチューブ１０２と混ぜ合わせて組み合わせることもできるか、または、サーマルサイクラで個別に使うことができる。

図２Ａおよび図２Ｂに示すように、プロセスチューブ１０２は、プロセスチューブ１０２の最上部で開口２２６を定める最上環部２０２を有する。最上環部２０２は、開口２２６の周囲の周りで延びている。プロセスチューブ１０２の一部として、環状隆条部２０４が、最上環部２０２の下でプロセスチューブ１０２の側部から側方へと外側に延びている。この手法で、最上環部２０２は、環状隆条部２０４の上方面２０６から上向きに延びている。上方面２０６に加えて、環状隆条部２０４は、外面２０８および下方面２１０によっても定められている。環状隆条部２０４の下はプロセスチューブ１０２の首部２２８であり、首部２２８は、環状隆条部２０４から、プロセスチューブ１０２の長手軸線２３０と平行に、鉛直方向に延びている。図２Ｂに示すように、首部２２８におけるプロセスチューブ１０２の外部は、プロセスチューブ１０２を鉛直方向に延びる長手軸線２３０と平行であり得る。ある実施形態では、外部首部２２８は、製造過程の間の射出成型からのプロセスチューブ１０２の取り出しを支援するために、長手軸線２３０に対して斜めであってもよい。

図２Ａおよび図２Ｂに示す例示のプロセスチューブ１０２の首部２２８の下は、プロセスチューブ１０２の側部から側方に延びる突出部２１２である。突出部２１２は、首部２２８から突出部２１２の頂部２１５へと延びる上方傾斜部２１４によって定められている。突出部２１２の頂部２１５は突出部２１２の最大外径を有し、したがって、突出部２１２は、頂部２１５からプロセスチューブ１０２の外部で下へと延びる下方傾斜部２１６を備えている。突出部２１２の上方傾斜部２１４は長手軸線２３０から離れるように傾斜し、下方傾斜部２１６は長手軸線２３０に向かって戻るように傾斜する。ある実施形態では、図２Ａおよび図２Ｂに示すように、突出部における上方傾斜部２１４の角度が、突出部２１２における下方傾斜部２１６の角度より急である。突出部２１２の下方傾斜部２１６は、プロセスチューブ１０２のより長い本体部分２１８と接している。本体部２１８は、突出部２１２の下方傾斜部２１６のように、長手軸線２３０に向かって傾斜するが、突出部２１２の下方傾斜部２１５より急ではない角度を有する。本体部２１８は、プロセスチューブ１０２の基部２２０へと延びている。基部２２０は、プロセスチューブ１０２の底部に、プロセスチューブ１０２の底部の窪み２２２によって定められた環状底環部２２４を備えている。この実施形態では、最上環部２０２、環状隆条部２０４、首部２２８、突出部２１２、および本体部２１８は、長手軸線２３０と同軸である。

環状隆条部２０４、首部２２８、および突出部２１２は、プロセスチューブ１０２の固定領域２００を一体的に定めている。後でより詳細に説明するように、固定領域２００は、運搬とその後のサーマルサイクラの加熱器における処理とのために、プロセスチューブ１０２（または、プロセスストリップ１００の形態の複数のプロセスチューブ１０２）を搬送用トレイに簡単に堅固に取り付けるための方法を提供する。

前述のように、プロセスチューブ１０２は、連結タブ１０４によって一体的に連結されたチューブ１０２のストリップ１００として製造できる。そして、複数のプロセスチューブストリップ１００が搬送用トレイ３００に堅固に挿入できる。図３Ａは、例示の搬送用トレイ３００を示している。図３Ａで分かるように、搬送用トレイ３００は、搬送用トレイ３００の棚部３０２に複数のポート３０６を収容できる。複数のポート３０６は、個々のプロセスチューブ１０２を受け入れるように構成でき、搬送用トレイ３００の一段のポート３０６の数は、プロセスチューブストリップ１００の長さに適合するように有利に設計され得る。したがって、ｙ方向におけるポート３０６の数は、プロセスチューブストリップ１００のプロセスチューブ１０２の数に対応するように設計され得る。一実施形態では、搬送用トレイ３００は、８個のプロセスチューブ１０２から成るプロセスチューブストリップ１００がｙ方向で搬送用トレイ３００のポート３０６に挿入されて固定され得るように、ｙ方向に８個のポート３０６を有し得る。

一実施形態では、搬送用トレイ３００のポート３０６は、形が楕円であり、ｙ方向においてより大きな断面直径を有している。この手法で、楕円ポート３０６のより大きな直径断面は、搬送用トレイ３００に挿入されるとき、プロセスチューブストリップ１００と同じ方向に並べられる。
図３Ｂは、例示の搬送用トレイ３００に堅固に嵌まる複数のプロセスチューブストリップ１００を示している。ひとたびプロセスチューブ１０２が搬送用トレイ３００に堅固に挿入されると、例えば増幅試薬および検出試薬といったアッセイ試薬が、自動化された手法でプロセスチューブ１０２に加えられ得る。ある実施形態では、液体試薬が個々のプロセスチューブ１０２へとピペットで移すことができ、そして、搬送用トレイ３００は、プロセスチューブ１０２の内部基底２２０の形に形成される固体塊として、液体試薬をプロセスチューブの底部で乾燥させるために、乾燥機に選択的に配置できる。ある実施形態では、液体試薬はプロセスチューブ１０２の下で乾燥されない。ある実施形態では、搬送用トレイ３００の各々のプロセスチューブ１０２は、同一の試薬が沈殿されてもよい。他の実施形態では、プロセスチューブストリップ１００のプロセスチューブ１０２の一部または各々は、異なる試薬または試料で満たされてもよい。

所望の試薬で満たされると、例えば、試薬が乾燥される実施形態では試薬の乾燥に続いて、または、試薬が乾燥されない実施形態では試薬の沈殿のみに続いて、プロセスチューブ１０２には、プロセスチューブ１０２の内容物（例えば、具体的な試薬）を特定するために、指標が印付けされ得る。ある実施形態では、プロセスチューブ１０２の印付けは、プロセスチューブ１０２の最上環部２０２を、プロセスチューブ１０２の内容物（例えば、試薬）を指示する特定の色でホットスタンプすることで達成され得る。最上環部２０２は、プロセスチューブ１０２の開口２２６を封止するために接着シールが適用され得る表面も提供する。

前述のように、図１Ｄは、各々のプロセスチューブ１００は、プロセスチューブ１００の環状隆条部２０４の一方の側部から延びる隆条延在部１１０を備えているプロセスチューブストリップ１００を示す。隆条延在部１１０は、個々のプロセスチューブ１０２の印付けのために、環状隆条部２０４に追加的な表面積を提供する。一実施形態では、隆条延在部１１０は、プロセスチューブストリップ１００内の個々のプロセスチューブ１０２を特定するために、英数字の識別子（例えば、Ａ、Ｂ、Ｃなど、または、１、２、３など）であらかじめ印付けされ得る。一実施形態では、最上環部２０２をホットスタンプするための代替として、プロセスチューブ１０２の隆条延在部１１０が、プロセスチューブ１０２における試薬の沈殿に続いて、プロセスチューブ１０２の内容物（例えば、試薬）を特定するために、ホットスタンプまたは印付けされてもよい。さらに、二次元バーコード（インクまたはレーザー）が隆条延在部１１０に直接的に印刷されてもよい。

図１Ｅに示すように、プロセスチューブストリップ１００の個々のプロセスチューブ１０２は、隆条延在部１１０の最上部に固定されたチューブタグ１１２を備え得る。タグ１１２は、特定のプロセスチューブ１０２において、試薬などの内容物を特定するために、プロセスチューブ１０２の最上環部２０２への印付け（例えば、ホットスタンプ）に加えて、または、その印付けと併せて、用いられ得る。タグ１１２は、関連付けられたプロセスチューブ１０２の内容物を特定するデータでエンコードされる二次元マトリックスバーコード（例えば、ＱＲコード（登録商標）またはＡｚｔｅｃコード）であり得る。プロセスチューブ１０２の内容物を指示するためにタグ１１２を用いる際、カメラ（例えば、ＣＣＤカメラ）が、プロセスチューブ１０２の内容物をスキャンおよび照合し、正しい増幅アッセイが関連付けられた試薬で実施されていることを確保するために、用いられ得る。カメラは、タグ１１２を読み込むことで各々のプロセスチューブ１０２の内容物を効率的に素早く照合でき、したがって、所与のポリヌクレオチド試料に必要とされる特定の増幅アッセイに誤った試薬を組み合わせる使用者の誤りの可能性を回避できる。

ある例では、同一の試薬が、搬送用トレイ３００で各々のプロセスチューブに加えられ得る。一例では、各々のチューブストリップ１００は８個のプロセスチューブ１０２を備え、そして、１２個のチューブストリップが９６個のポートの搬送用トレイ３００に堅固に嵌め入れられ得る。したがって、同一の試薬が搬送用トレイ３００において９６個のプロセスチューブの各々に加えられ得る。すべてのプロセスチューブ１０２に同一の試薬が提供される場合、全体の搬送用トレイ３００のすべてのプロセスチューブ１０２は、同じ色でホットスタンプされ得る。多くの搬送用トレイ３００が積み重ねられ、最終使用者へと一体的に送られ得る。ある実施形態では、チューブストリップ１００のプロセスチューブ１０２の各々または一部は、異なる試薬を含み得る。このような例では、同一の試薬を収容するプロセスチューブ１０２は、同じ色で印付けされ得る。異なる色が、異なる試薬を収容するプロセスチューブ１０２を特定するために用いられ得る。

最終使用者は、異なる試薬が提供された異なる増幅アッセイを実施するために、異なるスタンプがされたプロセスチューブ１０２を必要とする可能性がある。ある例では、最終使用者は、増幅アッセイにおいて異なる試薬を使用する必要がある可能性があり、そのため、すべて同じ試薬のプロセスチューブ１０２を有する搬送用トレイ３００を使用できない。この場合、最終使用者は、所与の増幅アッセイのための所望の数および種類の試薬を得るために、１つまたは複数のプロセスチューブストリップ１００を単一の色の搬送用トレイ３００から取り外し、それを異なる搬送用トレイ３００の異なる色とされたプロセスチューブストリップ１００で置き換えることができる。製造者が、異なる色とされたプロセスチューブストリップ１００を有する搬送用トレイ３００を最終使用者に提供できることも、企図される。

最終使用者は、プロセスチューブ１０２同士の間の連結凹所２３２において個々のプロセスチューブストリップ１００を切り離すことによって、増幅アッセイにおける異なる試薬の集合をさらに改善できる。例えば、８個のチューブのプロセスチューブストリップ１００は、１個、２個、３個、４個、５個、６個、または７個のプロセスチューブ１０２を有するプロセスチューブ１０２のより小さな集合へと切り離せる。プロセスチューブストリップ１００を切り離すことで、最終使用者は、搬送用トレイ３００の同じ段に、異なる試薬のプロセスチューブ１０２を含ませることができる。

先に記載したように、図３Ｂは、プロセスチューブが搬送用トレイ３００にすでに堅固に嵌め入れられているときのプロセスチューブ１０２の図示を提供している。図４は、プロセスチューブ１０２を搬送用トレイ３００に固定する前の、搬送用トレイ３００で位置決めされた１２個のプロセスチューブ１０２の断面図である。この図は、図３に示した断面視６Ａと類似であるが、プロセスチューブ１０２を搬送用トレイ３００に固定する前の、搬送用トレイ３００のポート３０６に載りかかっているプロセスチューブ１０２を示している。図３Ｂおよび図４で示すように、搬送用トレイ３００は基部３０４と棚部３０２とを有しており、基部３０４は、棚部３０２より幅広で長くなっており、したがって、棚部３０２より大きい平面の表面積を有している。搬送用トレイ３００の棚部３０２は、棚部側部３０８と棚部最上部３１０とを備えている。棚部最上部３１０は、棚部３０２の水平な平面の部分であり、搬送用トレイ３００の最上部を覆っている。棚部最上部３１０は外部面３１２と内部面３１４とを備えている。搬送用トレイ３００の基部３０４が棚部３０２より幅広で長くなっているため、基部３０４は、棚部側部３０８と基部側部３０５とを水平につないで延びる架橋部３２０を備えている。架橋部３２０は内部側３２２を備えている。搬送用トレイ３００における棚部３０２の棚部側部３０８は、棚部最上部３１０から下へと延び、架橋部３２０において、搬送用トレイ３００の基部３０４と結合する。図４に示すように、プロセスチューブストリップ１００のプロセスチューブ１０２は、搬送用トレイ３００の棚部３０２におけるポート３０６に位置決めされ得る。

図５は、２個の例示のプロセスチューブ１０２を例示の搬送用トレイ３００に固定する前の、搬送用トレイ３００で位置決めされたプロセスチューブ１０２の拡大した断面図である。プロセスチューブ１０２を搬送用トレイ３００に固定する前、プロセスチューブ１０２は、搬送用トレイ３００のポート３０６に載りかかることができる。プロセスチューブ１０２の本体部２１８の外径はポート３０６の直径より小さく、したがって、プロセスチューブ１０２の本体部２１８はポート３０６に挿入させることができる。プロセスチューブ１０２の突出部２１２は、ポート３０６の少なくとも１つの直径より大きい直径を有する。例えば、楕円であるポート３０６の例では、ポート３０６のより小さい直径（例えば、図３Ａおよび図３Ｂのｘ方向における幅直径）が、突出部２１２の直径より小さい。ある実施形態では、ポート３０６のより大きい直径（例えば、図３Ａおよび図３Ｂのｙ方向における長さ直径）が、突出部２１２の直径より大きくてよい。したがって、プロセスチューブ１０２の本体部２１８がポート３０６に挿入されるとき、本体部２１８は搬送用トレイ３００の下側領域に入るが、固定領域２００（突出部２１２、首部２２８、および環状隆条部２０４を備えている）と最上環部２０２とを含む、プロセスチューブ１０２の最上部分は、ポート３０６に入るのが妨げられる。この手法で、突出部２１２はポート３０６の最上部縁部３１８に載りかかることになる。より具体的には、突出部２１２の下方傾斜部２１６は、ポート最上部縁部３１８に載りかかることになる。

ある実施形態では、突出部２１２の頂部２１２は、円形であり、一定の外径を有している。楕円のポート３０６に関して、ある実施形態では、ポート３０６は、幅直径より大きい長さ直径を有し得る。この実施形態では、ポート３０６の幅（ｘ方向における）の直径は、突出部２１２の頂部２１５の直径より小さい可能性がある。したがって、プロセスチューブ１０２は、突出部２１２において、ポート３０６の最上部縁部３１８に載りかかることになる。一実施形態では、ポート３０６の長さ直径（ｙ方向における）は、突出部２１２の頂部２１５の直径より大きい可能性がある。したがって、ポート３０６の２つの端（ｙ方向における）において、必要な場合、ポート３０６にプロセスチューブ１０２のより簡単な固定を容易にし、ポート３０６からのプロセスチューブ１０２のより簡単な取り外しを容易にする小さな隙間が設けられる。他の実施形態では、ポート３０６は、円であってよく、一定の直径を有する。

プロセスチューブ１０２がポート３０６において最上部縁部３１８に対して載りかかるとき、プロセスチューブ１０２をさらにポート３０６へと押し込んでプロセスチューブ１０２を搬送用トレイ３００のポート３０６で固定するために、プロセスチューブ１０２の最上部に力を加えることができる。プロセスチューブ１０２をポート３０６へと固定するための力は、プロセスチューブ１０２の最上環部２０２へと加えられ得るか、または、力は、環状隆条部２０４上方面２０６に加えられ得る。

プロセスチューブ１０２をポート３０６で固定することは、最初に、突出部２１２の下方傾斜部２１６をポート３０６内に押し込むために、十分な力をプロセスチューブ１０２の最上部に加えることを含む。下方傾斜部２１６は、プロセスチューブ１０２の長手軸線２３０に向かって傾斜されている。継続して圧力がプロセスチューブ１０２の最上部へと加えられるにつれて、突出部２１２の下方傾斜部２１６は、突出部２１２の頂部２１５がポート最上部縁部３１８に達するまで、ポート最上部縁部３１８に沿って下へと滑っていく。ポート最上部縁部３１８は、突出部２１２のポート３０６を通る移動を容易にするために、丸められ得るか、または、斜めにされてもよい。
プロセスチューブ１０２がポート３０６へと押し込まれるとき、ポート３０６を通過した突出部２１２の下方傾斜部２１６の部分は、下方傾斜部２１６が長手軸線２３０に向かって傾斜されているため、ポート内部壁３１６と接しない。突出部２１２の下方傾斜部２１６は、下方傾斜部２１６が突出部２１２の頂部２１５に向かって上向きに延びるにつれて、徐々に幅広になる（外径が増加する）。下方傾斜部２１６の直径が幅広になるにつれて、プロセスチューブ１０２をポート３０６へと押すことに対する抵抗が大きくなる。したがって、プロセスチューブ１０２をポート３０６へと押し込むために加えられ得る力に対抗する抵抗力が発生させられる。プロセスチューブ１０２に対する抵抗力が増加し（および、プロセスチューブ１０２を押すために必要な力が増加し）、プロセスチューブ２１２がポート３０６内へとさらに下へと移動する。プロセスチューブ１０２に対する抵抗力は、突出部２１２の頂部２１５が最上部縁部３１８に達するまで増加し続ける。

楕円のポート３０６を有する搬送用トレイ３００の実施形態では、ｙ方向におけるポート３０６の直径がより大きいと、プロセスチューブ１０２をポート３０６により簡単に押し込み、搬送用トレイ３００に固定することができるため、プロセスチューブを固定するために必要とされる力を減らせる。楕円のポート３０６は、プロセスチューブ１０２を曲げてｙ方向で引き延ばしてｘ方向で圧縮させることができる２つの端で、プロセスチューブ１０２の突出部２１２とポート内部３１６との間に余分な空間（例えば、隙間）を提供できる。

下方傾斜部２１６の全体がポート最上部縁部３１８を通過し、突出部の頂部２１５がポート最上部縁部３１８を通過すると、突出部２１２の頂部２１５はポート内部壁３１６と接触する。頂部２１５は、突出部２１２の最も幅広の部分（最大外径）である。頂部２１５がポート３０６を通じて嵌められ、ポート内部壁３１６に押し付けられるにつれて、プロセスチューブ１０２は最大の歪みを受け、最大限に曲げられる。継続して力がプロセスチューブ１０２の最上部へと加えられるにつれて、頂部２１５は、ポート３０６の底縁３１９においてポート３０６を完全に通過するまで、ポート内部壁３１６を下へと滑らされる。頂部２１５が底縁３１９に躍り出ると、プロセスチューブ１０２への歪みが解放され、プロセスチューブ１０２は、ポート３０６における所定位置に堅固に「パチン」と嵌まり、搬送用トレイ３００に固定されることになる。搬送用トレイ３００でプロセスチューブストリップ１００の各々のプロセスチューブ１０２を固定するために必要な力は、０．７重量ポンドからおおよそ１．７重量ポンドまでの範囲であり得る。一実施形態では、ポート３０６でプロセスチューブ１０２を挿入および固定するために必要な力は、おおよそ１重量ポンドであり得る。一実施形態では、ポート３０６でプロセスチューブ１０２を固定するために必要な力は、おおよそ１．１８重量ポンドであり得る。

搬送用トレイ３００は、搬送用トレイ３００の効率的な積み重ねおよび運搬のために、有利に設計され得る。搬送用トレイ３００は、ポリカーボネート樹脂熱可塑性物質から製作され得る。図３、図４、および図５を参照すると、搬送用トレイ３００は、基部２２０の最上部に架橋部３２０を備え得る。架橋部３２０は、別の空の搬送用トレイ３００の底面３２６が位置決めされ得る台を提供する。２つの搬送用トレイ３００が互いの上に積み重ねられるとき、上の搬送用トレイ３００の架橋部内部３２２は、下の搬送用トレイ３００の棚部最上部３１０に載りかかることになり、上の搬送用トレイ３００の底面３２６は、下の搬送用トレイ３００の架橋部３２０に載りかかることになる。

搬送用トレイ３００は、プロセスチューブストリップ１００が装着されているとき、同様の手法で効率的に積み重ねできる。上の搬送用トレイ３００のプロセスチューブ１０２の本体部２１８は、下の搬送用トレイ３００のプロセスチューブ１０２の開口２２６に配置され得る。同様に、上の搬送用トレイ３００のプロセスチューブ１０２は、その上に積み重ねられる別の搬送用トレイ３００のプロセスチューブ１０２の本体部２１８をさらに受け入れることができる。

図６Ａは、図４に示した１２個のプロセスチューブ１０２の、図３Ｂの線６Ａに沿って切り取られた断面図である。図６Ａは、搬送用トレイ３００にここでは固定されているプロセスチューブ１０２を示している。図３Ｂの断面６Ａの方向は、それぞれが異なるプロセスチューブストリップ１００からである、１２個のプロセスチューブ１０２の図を提供している。図６Ｂは、プロセスチューブ１０２を搬送用トレイ３００に固定した後の搬送用トレイ３００に位置決めされた全体のプロセスチューブストリップ１００の、図３Ｂの線６Ｂに沿って切り取られた断面図である。図６Ｂに示すように、ｙ方向における楕円ポート３０６の断面直径は、突出部２１２の直径より大きくできる。

図７は、図６Ａに示すプロセスチューブ１０２のうちの２個の拡大図であり、プロセスチューブ１０２を搬送用トレイ３００に固定した後の図５のプロセスチューブ１０２に対応している。図７に示すように、ｘ方向における楕円ポートの断面直径は、突出部２１２の直径より小さくできる。突出部２１２の頂部２１５が底縁３１９に躍り出るとき、突出部２１２の上方傾斜部２１４は、固定領域２００の底部において、ポート３０６の底縁３１９と接触し、底縁３１９にもたれ掛かる。また、頂部２１５が底縁３１９に躍り出るとき、環状隆条部２０４の下方面２１０は、固定領域２００の最上部において、棚部３０２の棚部最上部外部３１２と接触し、棚部最上部の外部３１２にもたれ掛かる。固定領域２００の最上部において、環状隆条部２０４は、環状隆条部２０４がポート３０６を通過できないポート３０６の周りの少なくとも２つの点で、十分に幅広となっている。一実施形態では、環状隆条部２０４は、ポート３０６の周りのすべての点を網羅するのに十分な大きさの直径を有し得る。例えば、環状隆条部２０４は、ポート３０６の幅直径および長さ直径より大きい直径を有し得る。固定領域２００の高さ（環状隆条部２０４の下方面２１０から突出部２１２の上方傾斜部２１４の位置まで）は、ポート最上部縁部３１８とポート底縁３１９との間でのポート３０６の高さにおおよそ対応している。

図７に示すように、プロセスチューブ１０２の首部２２８は、ポート３０６の直径より小さい外径を有することができ、プロセスチューブ１０２とポート内部壁３１４との間に隙間３２４を作り出す。一実施形態では、首部２２８の外径は、一定の円の直径であり得る。ポート３０６は、形が楕円であってよく、一方の側でより大きい長さ直径を有し、他方の側でより小さい幅直径を有し得るため、隙間３２４の幅は、ポート３０６の長さ側（ｙ方向）と幅側（ｘ方向）との間で異なり得る。例えば、ポート３０６の各々の長さ側での隙間３２４の大きさは、ポート３０６の各々の幅側での隙間の大きさのおおよそ２倍であり得る。
隙間３２４は、固定領域２００におけるプロセスチューブ１０２についての適応の点を提供する。隙間３２４は、プロセスチューブ１０２の首部２２８とポート内部壁３１６との間に主に存在するが、隙間３２４は、突出部２１２の上方傾斜部２１４に沿って、および、環状隆条部２０４の下方面２１０の一部に沿っても存在する。隙間３２４は、ポート最上部縁部３１８の丸くされた角がポート３０６とプロセスチューブ１０２の首部２２８との間に追加的な隔たりを提供するため、固定領域２００の最上部分において若干拡大されている。隙間３２４は、プロセスチューブ１０２がポート３０６に固定されているときでさえ、プロセスチューブ１０２に搬送用トレイ３００のポート３０６内におけるある程度の自由な動きを提供できる。

プロセスチューブ１０２は、突出部２１２の上方傾斜部２１４と底縁３１９との間の接触の点が、プロセスチューブ１０２が傾く必要があるときに適応できるため、ポート３０６で適応され得る一方で、ポート３０６に堅固に維持され得る。プロセスチューブ１０２が傾くとき、プロセスチューブ１０２の固定領域２００と搬送用トレイ３００のポート３０６との間の接触の点の位置が適応することになる。例えば、プロセスチューブが一方の側に傾くとき、一方の側における上方傾斜部２１４とポート底縁３１９との間のプロセスチューブ１０２の接触の点が上方傾斜部２１４の最上部の近くに移動し、チューブの反対側では、別の接触の点が上方傾斜部２１４の底部の近く（頂部２１５の近く）になるように移動する。同様の適応は、首部２２８がプロセスチューブ１０２の一方の側で丸められたポート最上部縁部３１８に向かって傾かされ、プロセスチューブ１０２の他方の側でポート最上部縁部３１８から離れるように傾かされ得るように、ポート固定領域２００の最上部において可能である。

隙間３２４は、複数のプロセスチューブをプロセスチューブストリップ１００として搬送用トレイ１００に置くとき、プロセスチューブ１０２を適応させることができる。搬送用トレイ３００およびプロセスチューブ１０２の考えられる製造のばらつきのため、各々の搬送用トレイ３００は若干異なる大きさとされる可能性があり、各々のプロセスチューブ１０２は搬送用トレイ３００に異なって嵌まる可能性がある。プロセスチューブ１０２が、搬送用トレイ３００に挿入されるとき、プロセスチューブストリップ１０２の一部として一体的にしばしば取り付けられることを考えれば、留意事項を和らげない場合、搬送用トレイ３００およびプロセスチューブ１０２の製造のばらつきが、搬送用トレイ３００における全体のプロセスチューブストリップ１００の正確な配置を妨げ得ることが可能である。例えば、プロセスチューブストリップ１００の一方の端におけるプロセスチューブ１０２の搬送用トレイ３００への正確な挿入は、プロセスチューブ１０２がｘ方向（側方）またはｙ方向（前後）のいずれかにおいて位置がずらされる可能性があるため、プロセスチューブストリップ１００の他方の端におけるプロセスチューブ１０２の搬送用トレイ３００への正確な挿入を妨げる可能性がある。たとえ剛体のプロセスチューブストリップ１００が、位置がずらされているにもかかわらず、搬送用トレイ３００のポート３０６に押し込められたとしても、プロセスチューブ１０２の固い取り付けは、プロセスチューブ１０２が搬送用トレイ３００に平らな状態になり、ホットスタンププロセスを妨げる可能性を防止することになる。

本開示は、これらの問題に、プロセスチューブストリップ１００が搬送用トレイ３００で操作されて挿入されているとき、プロセスチューブ１０２をポート３０６で傾かせて適応させることができることを含め、多くの方法で対処している。プロセスチューブ１０２は、隙間３２４がこのような動きを可能にしているため、ポート３０６において傾いて適応できる。ポート３０６の楕円形は、ｙ方向において利用可能な適応を高めてもいる。また、プロセスチューブ１０２を連結する連結タブ１０４は、プロセスチューブ１０２を搬送用トレイ３００に挿入するとき、個々のプロセスチューブ１０２の間の操作および適応を許容するに十分に薄く柔らかい。また、連結タブ１０４の連結凹所２３２（図２Ｂに示す）は、プロセスチューブ１０２をポート３０６に挿入するとき、個々のプロセスチューブ１０２の間のさらなる曲げやすさを可能にしている。この手法では、隙間３２４、楕円形のポート３０６、および連結タブ１０４は、プロセスチューブストリップ１００を搬送用トレイ３００へと挿入するとき、適応して搬送用トレイ３００で常に平らな状態になる能力を提供する。さらに、搬送用トレイ３００で傾く、または、適応するプロセスチューブ１０２の能力は、後でより詳細に説明するように、サーマルサイクラの加熱器へのプロセスチューブ１０２の挿入を容易にする。

プロセスチューブ１０２が搬送用トレイ３００のポート３０６に固定されるとき、プロセスチューブ１０２は、サーマルサイクラでの使用のための準備において、処理を受けることができる。液体の試薬が、固定されたプロセスチューブ１０２に投入され得る。搬送用トレイ３００におけるプロセスチューブ１０２は、プロセスチューブ１０２の液体の試薬を乾燥するために、乾燥または凍結乾燥のための加熱または他の過程に曝され得る。搬送用トレイ３００に固定されている一方で、プロセスチューブ１０２は、プロセスチューブ１０２を印付けして、プロセスチューブ１０２に加えられた試薬の種類を指示するために、ホットスタンプされてもよい。ホットスタンプは、最上環部２０２および／または環状隆条部２０４における色のスタンプの形態であり得る。

搬送用トレイ３００のポート３０６にプロセスチューブ１０２を固定することに力を加える過程、液体の試薬を固定されたプロセスチューブ１０２へと投入する過程、プロセスチューブ１０２の液体の試薬を乾燥する過程、および、搬送用トレイ３００のプロセスチューブ１０２にホットスタンプする過程は、プロセスチューブ１０２および搬送用トレイ３００の製造および組立の現場においてすべて自動化されて実施され得る。したがって、準備されたプロセスチューブ１０２を収容している組み立てられた搬送用トレイ３００が、サーマルサイクラでプロセスチューブ１０２の試料に増幅アッセイを行う前に、抽出された核酸試料をプロセスチューブ１０２で沈殿するなど、追加の処理に向けて、最終使用者へと出荷され得る。プロセスチューブ１０２への抽出された核酸試料の追加は、乾燥された試薬を再構成して、試薬を再構成された溶液において核酸試料と関連付けさせるように作用する。

先に記載したように、最終使用者は、所与の増幅アッセイのための所望の数および種類の試薬を得るために、１つまたは複数のプロセスチューブストリップ１００を単一の色の搬送用トレイ３００から取り外し、それを異なる搬送用トレイ３００の異なる色とされたプロセスチューブストリップ１００で置き換えることができる。プロセスチューブストリップ１００を取り外すために必要な力は、プロセスチューブストリップ１００を挿入するために必要とされる力のおよそ半分であり得る。一実施形態では、プロセスチューブストリップ１００についての挿入力は、おおよそ０．７重量ポンドから１．７重量ポンドの範囲を有し得ると共に、プロセスチューブストリップ１００についての取り外す力は、おおよそ０．３重量ポンドから０．８重量ポンドの範囲を有し得る。一実施形態では、プロセスチューブストリップ１００についての挿入力は、おおよそ１重量ポンドであり得ると共に、プロセスチューブストリップ１００についての取り外す力は、おおよそ０．５重量ポンドであり得る。一実施形態では、ポート３０６でプロセスチューブストリップ１００を固定するために必要な力は、おおよそ１．１８重量ポンドであり得ると共に、プロセスチューブストリップを取り外すのに必要な力は、０．６０重量ポンドである。プロセスチューブストリップ１００について規定された挿入力および取り外し力は、プロセスチューブストリップ１００が搬送用トレイ３００に挿入または搬送用トレイ３００から取り外すのに過度に難しくないことを確保し、また、通常の取り扱いの条件において、プロセスチューブストリップ１００が搬送用トレイから落下するのを防止もする。

試薬および核酸試料の混合が生じる同じ搬送用トレイ３００（プロセスチューブ１０２を収容している）は、サーマルサイクラに直接的に投入され得ることは、留意すべきことである。したがって、最終使用者は、１個のチューブで試薬および核酸の混合を行ってから、混合された溶液を他のチューブへと移す、または、第１のチューブを別のトレイへと移動さえすることを、必要とされない。本開示では、試薬を収容すると共に搬送用トレイ３００に固定されたプロセスチューブ１０２は、例えば核酸試料といった試料を受け入れることができ、したがって、プロセスチューブ１０２を搬送用トレイ３００から取り外すことなく、増幅アッセイのためにサーマルサイクラに投入できる。
固体の試薬が、液体の試薬に加えて、または、液体の試薬の代わりに、プロセスチューブ１０２に加えられてもよいことも企図される。空のプロセスチューブ１０２と搬送用トレイ３００とが最終使用者に提供でき、最終使用者が、核酸試料を加える前に、プロセスチューブ１０２に固体または液体の試薬を沈殿させることができることも企図される。

固定力、すなわち、プロセスチューブ１０２をポート３０６に堅固に押し込むために必要な力は、搬送用トレイ３００で複数（または、すべて）のプロセスチューブ１０２へと同時に加えられ得る。代替で、固定力は、必要により、１回につき１つで個々のプロセスチューブ１０２へと別々に加えられ得る。固定力は、自動化された手法で加えることができ、プロセスチューブ１０２を試薬で満たす自動化されたステップと、プロセスチューブ１０２をホットスタンプする自動化されたステップと共に同時に行われ得る。ある例では、同じ装置は、ホットスタンプし、固定力をプロセスチューブ１０２に加えるために用いられ得る。代替で、別の装置が、ホットスタンプおよび固定力を加えるために用いられ得る。

別の固定力装置およびホットスタンプ装置が用いられるとき、固定力は、プロセスチューブ１０２の最上環部２０２をホットスタンプする前に、搬送用トレイ３００のポート３０６のプロセスチューブ１０２を固定するために先ず加えられ得る。ある例では、自動化されたホットスタンプ装置は、最上環部２０２に圧力を加えるとき、プロセスチューブ１０２の最上環部２０２に付着してもよい。プロセスチューブ１０２が、本明細書に記載された実施形態では、搬送用トレイ３００に固定される新規の方法のため、プロセスチューブ１０２は、ホットスタンプ装置がスタンプされているプロセスチューブ１０２から引き離されるとき、搬送用トレイ３００から上へと引っ張り出されない。さらに、プロセスチューブ１０２が搬送用トレイ３００に固定されるため、プロセスチューブ１０２は、プロセスチューブ１０２が搬送用トレイ３００から落下する危険性のない状態で運搬され得る。本明細書で開示している実施形態は、有利には、トレイの一方の側にチューブが集まること、または、トレイでの位置合わせからチューブが落下することなど、他のＰＣＲチューブトレイに提起される他の問題も克服する。

図８は、サーマルサイクラ（図示されていない）で使用される例示の加熱器組立体４００の等角図である。増幅アッセイ（ＰＣＲ増幅または等温増幅など）は、サーマルサイクラで実施され得る。加熱器組立体４００は、サーマルサイクラの温度サイクルサブシステムの一部であり、検出サブシステムなど、サーマルサイクラの他のサブシステムと併せて作動できる。図８に示した例示の加熱器組立体４００は、９６個の加熱器ウェル４０２を含む９６個のウェル組立体であるが、他の組立体も企図される（例えば、４８個のウェル組立体など）。加熱器組立体４００は、加熱器ウェル４０２と側面４１０との間に平坦な上面４０４を備えている。各々の加熱器ウェル４０２は、形が円錐であり、内部壁４０６とウェル底部４１２とから構成されている。加熱器組立体４００の加熱器ウェル４０２は、搬送用トレイ３００のプロセスチューブ１０２の空間的配置に対応するために、８列×１２段の配列で配置されている。

各々の加熱器ウェル４０２は、プロセスチューブ１０２を受け入れることができる。搬送用トレイ３００は、搬送用トレイ３００のすべてのプロセスチューブ１０２を加熱器組立体４００へと同時に配置するために、サーマルサイクラの加熱器組立体４００の上に直接的に配置され得る。図８に示していないのは、加熱器組立体４００の周りの筐体、または、熱を加熱器ウェル４０２に提供するために必要な回路である。

搬送用トレイ３００およびプロセスチューブ１０２の考えられる製造のばらつきのため、各々の搬送用トレイ３００は若干異なる大きさとされる可能性があり、各々のプロセスチューブ１０２は搬送用トレイ３００に異なって嵌まる可能性がある。プロセスチューブ１０２が搬送用トレイ３００にきつく取り付けられた場合、製造の許容誤差は、９６個のチューブの搬送用トレイ３００のプロセスチューブのすべてが加熱器ウェル４０２に正確に配置されるのを妨げる可能性がある。例えば、加熱器組立体４００の一方の側でプロセスチューブ１０２を加熱器ウェル４０２に嵌めると、加熱器組立体４００の他方の側のプロセスチューブ１０２がそれぞれの加熱器ウェル４０２に正確に堅固に配置されるのを妨げてしまう。先に記載したように、プロセスチューブ１０２は、ポート内部壁３１６とプロセスチューブ１０２の固定領域２００との間の隙間３２４のため、搬送用トレイ３００に固定されるとき、若干浮遊または適応することができる。また、連結タブ１０４の連結凹所２３２（図２Ｂに示す）は、プロセスチューブ１０２を加熱器ウェル４０２に挿入するとき、個々のプロセスチューブ１０２の間の曲げやすさも可能にしている。プロセスチューブ１０２を搬送用トレイ３００のポート３０６内で浮遊させることができることで、プロセスチューブ１０２を加熱器組立体４００の加熱器ウェル４０２へと正確に堅固に嵌め入れることができる。

図９は、加熱器組立体４００の加熱器ウェル４０２に位置決めされた２個の例示のプロセスチューブ１０２の断面図である。プロセスチューブ１０２が加熱器ウェル４０２に配置されるとき、プロセスチューブ１０２の本体部２１８は、加熱器ウェル４０２の内部壁４０６と物理的に接触し、一体にさせられる。ある実施形態では、プロセスチューブ１０２が搬送用トレイ３００のポート３０６に固定され、搬送用トレイ３００が加熱器組立体４００の上に位置決めされるとき、プロセスチューブ１０２の基部２２０がウェル底部４１２まで延びないように、加熱器ウェル４０２はプロセスチューブ１０２の本体部２１８より深くなっている。この手法では、隙間４１４が、プロセスチューブ１０２の基部２２０とウェル底部４１２との間に作り出される。隙間４１４は、プロセスチューブ１０２の本体部２１８がウェル内部壁４０６と物理的接触したままとなることを確保する。つまり、本体部２１８がウェル内部壁４０６に接する前に、プロセスチューブ１０２の基部２２０が、先ず加熱器ウェル底部４１２で底に着くようになっている場合、隙間が壁４０６とプロセスチューブ１０２の本体部２１８との間に存在し、加熱器ウェル４０２とプロセスチューブ１０２との間に小さな熱伝達をもたらし得る。したがって、プロセスチューブ１０２の下の隙間４１４は、壁４０６とプロセスチューブ１０２の本体部２１８との間に隙間が存在しないことを確保する。加熱器ウェル４０２は、プロセスチューブ１０２の本体部２１８を包囲でき、増幅アッセイの温度サイクルのステップの間に、プロセスチューブ１０２の内容物に一定の加熱を提供できる。プロセスチューブ１０２が加熱器ウェル４０２に配置されるとき、加熱器ウェル４０２は、突出部２１２の下方傾斜部２１６のすぐ下の位置にプロセスチューブの本体部２１８を包囲できる。

先の記載では、本明細書で開示している実施形態の複数の方法およびシステムを開示している。本明細書で開示している実施形態は、方法および材料の変更の影響と共に、製作方法および機器の修正の影響を受けやすい。このような変更は、本開示の検討、または、本明細書で開示している本発明の実施から、当業者には明らかとなるものである。その結果、本明細書で開示している実施形態が、本明細書で開示している具体的な実施形態に限定されず、本発明の真の範囲および精神内に入るすべての変更および修正を網羅することが、意図されている。

（例１）
この例は、最終使用者に提供される、プロセスチューブ１０２を備えた搬送用トレイ３００を準備するための具体的な過程を示している。
１．ポリプロピレンから形成された８個の連結されたプロセスチューブを収容する１２個のプロセスチューブストリップを製造する。
２．ポリカーボネートから、８ｘ１２の配列で９６個のポートを有する搬送用トレイを製造する。
３．１２個のプロセスチューブストリップが搬送用トレイに配置される。
４．プロセスチューブストリップのプロセスチューブが、プロセスチューブの最上環部に力を加えることで、搬送用トレイのポートに固定される。
５．搬送用トレイの各々のプロセスチューブが、同じ特定の液体試薬で満たされる。
６．搬送用トレイが、プロセスチューブの試薬を乾燥するために加熱される。
７．プロセスチューブが、使用されることになるアッセイを指示するために、特定の色でホットスタンプされる。
８．搬送用トレイが、同じまたは異なる試薬を有する他の搬送用トレイと積み重ねられて梱包され、最終使用者へと出荷される。
９．最終使用者は、全部そろっている搬送用トレイをそのまま使用できる、または、搬送用トレイを減らし、１つもしくは複数の搬送用トレイを、様々な試薬の種類の個別のプロセスチューブストリップもしくはチューブの混合で再び増やすことができる。

（例２）
この例は、搬送用トレイ３００のポート３０６のプロセスチューブストリップ１００を固定するために必要な力と、その後にプロセスチューブストリップ１００をポート３０６から取り外すために必要な力とを決定するための試験の試験手順および結果を表している。

Ａｍｔｅｋ ＡｃｃｕＦｏｒｃｅ Ｃａｄｅｔ Ｆｏｒｃｅ Ｇａｇｅ（０〜５ポンド）が、ポート３０６でプロセスチューブ１０２を固定および取り外すために必要な力を測定するために用いられた。
試験手順
１．搬送用トレイの段に１個のチューブのストリップを置く（搬送用トレイにまだ固定されていない）。
２．ゲージをオンにする。
３．ゲージが直立した位置の状態で、ゲージをゼロに設定する。
４．ゲージをクリアする。
５．「Ａ」列で始まるストリップ内の各々のチューブを、ゲージが各々のチューブに鉛直から２〜３度までの若干の角度にある状態で、すべてのチューブが所定位置に嵌まるまでゆっくりと押し下げる。
６．ゲージの力の値と、挿入値としての段の数とを記録する。
７．メモリを消去するために消去ボタンを押す。
８．第２の段に第２のチューブのストリップを置く。ステップ５〜７を繰り返す。
９．残りのストリップ３〜１２に対してステップ５〜７を繰り返す。
１０．搬送用トレイを上下反転し、第１のストリップから最初に、チューブを「Ａ」列で始まる搬送用トレイからゆっくりと押し出す。
１１．力の値と、取り出し値としての段の数とを記録する。
１２．メモリを消去するために消去ボタンを押す。
１３．残りのプロセスチューブストリップに対してステップ１０、１１、および１２を繰り返す。
１４．搬送用トレイで１２個のプロセスチューブストリップを再配置し、ステップ３〜１３を繰り返す。

結果
力試験の結果が表１に提供されている。表１は、搬送用トレイ３００でプロセスチューブストリップ１００のプロセスチューブ１０２のすべてを挿入および固定するために必要な力を示している。示すように、プロセスチューブストリップ１００を搬送用トレイ３００で固定するための平均挿入力は、１．１８重量ポンドであり、平均取り外し力は０．６０重量ポンドであった。

Claims (14)

1. 軸線に沿って配置され、複数の連結タブによって接続された複数のプロセスチューブ
   を備えた、搬送用トレイのポートに堅固に且つ取り外し可能に嵌合するためのプロセスチューブストリップであって、
   前記複数の連結タブの各々は、前記複数のプロセスチューブのうちの２つの隣接するプロセスチューブの間に延びてそれらを接続しており、
   前記複数のプロセスチューブの各々は、
   当該プロセスチューブの外面から延在する環状隆条部と、
   当該プロセスチューブの前記外面から延在する突出部と、
   を有しており、
   前記突出部は、当該プロセスチューブの首部だけ、前記環状隆条部から離れており、
   前記突出部は、前記首部から当該突出部の頂部に至る上方傾斜部と、当該頂部から当該プロセスチューブの本体に至る下方傾斜部と、を有しており、
   当該プロセスチューブの長手軸線に対する前記上方傾斜部の角度は、鋭角であって、当該長手軸線に対する前記下方傾斜部の角度よりも急であり、
   当該プロセスチューブは、搬送用トレイのポートに堅固に且つ取り外し可能に嵌合するように構成されており、当該プロセスチューブが当該搬送用トレイの当該ポート内に嵌合する時、前記首部が当該搬送用トレイの当該ポート内に取り外し可能に位置決めされる
   ことを特徴とするプロセスチューブストリップ。
2. 前記複数のプロセスチューブの各々において、当該プロセスチューブに接続された前記連結タブは、前記環状隆条部に接続されている
   ことを特徴とする請求項１に記載のプロセスチューブストリップ。
3. 前記複数の連結タブは、前記複数のプロセスチューブを前記搬送用トレイ内に挿入する時に当該複数のプロセスチューブ間の移動及び調整を許容するべく、柔軟である
   ことを特徴とする請求項１に記載のプロセスチューブストリップ。
4. 前記複数の連結タブは、前記複数のプロセスチューブが前記搬送用トレイ内に挿入される時に当該搬送用トレイ上で平らな姿勢でいることを許容する
   ことを特徴とする請求項１に記載のプロセスチューブストリップ。
5. 各連結タブは、その下側に連結凹所を有しており、
   前記連結凹所は、当該プロセスチューブストリップを切り離すための分離点を提供するように構成されている
   ことを特徴とする請求項１に記載のプロセスチューブストリップ。
6. 前記プロセスチューブを前記搬送用トレイの前記ポート内に挿入するために必要な力は、前記プロセスチューブを前記搬送用トレイの前記ポートから取り外すために必要な力の、およそ２倍である
   ことを特徴とする請求項１に記載のプロセスチューブストリップ。
7. 前記プロセスチューブを前記搬送用トレイの前記ポート内に挿入するために必要な力は、約０．７重量ポンド〜約１．７重量ポンドの間である
   ことを特徴とする請求項１に記載のプロセスチューブストリップ。
8. 請求項１に記載のプロセスチューブストリップと、
   搬送用トレイと、
   を備えたシステムであって、
   前記環状隆条部の直径は、前記ポートの直径よりも大きく、
   前記首部における前記プロセスチューブの直径は、前記ポートの直径よりも小さく、
   前記突出部の直径は、前記ポートの直径よりも大きい
   ことを特徴とするシステム。
9. 前記プロセスチューブが前記搬送用トレイの楕円形ポート内に固定される時、前記環状隆条部の底面は、前記搬送用トレイの頂面上に載りかかり、前記突出部の前記上方傾斜部は、前記ポートの底縁に接触する
   ことを特徴とする請求項１に記載のプロセスチューブストリップ。
10. 各プロセスチューブにおいて、前記環状隆条部は、当該プロセスチューブに印付けするための表面を提供するように構成された隆条延在部を有する
    ことを特徴とする請求項１に記載のプロセスチューブストリップ。
11. 各プロセスチューブにおいて、チューブタグが前記隆条延在部上に位置決めされている
    ことを特徴とする請求項１０に記載のプロセスチューブストリップ。
12. 前記チューブタグは、二次元マトリックスバーコードを有している
    ことを特徴とする請求項１１に記載のプロセスチューブストリップ。
13. 請求項１に記載のプロセスチューブストリップと、
    搬送用トレイと、
    を備えたシステムであって、
    各プロセスチューブは、円形断面を有しており、
    各プロセスチューブは、前記搬送用トレイの幅直径より大きい長さ直径を有する楕円ポート内に嵌合するように構成されている
    ことを特徴とするシステム。
14. 前記複数のプロセスチューブがそれに沿って位置決めされている軸線が、前記楕円ポートの前記長さ直径と平行である
    ことを特徴とする請求項１３に記載のシステム。

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