JP6607486B2

JP6607486B2 - 細胞内膜構造形成方法および細胞内膜構造観察方法

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Publication number: JP6607486B2
Application number: JP2015126296A
Authority: JP
Inventors: 昇平小林; 徳子原口
Original assignee: National Institute of Information and Communications Technology
Current assignee: National Institute of Information and Communications Technology
Priority date: 2015-06-24
Filing date: 2015-06-24
Publication date: 2019-11-20
Anticipated expiration: 2035-06-24
Also published as: JP2017006070A

Description

本発明は、細胞内膜構造形成方法および細胞内膜構造観察方法に関する。

細胞内には核膜や小胞体膜をはじめとする様々な細胞内膜構造が存在する。これらの膜は単に脂質分子からなる脂質二重層ではなく、膜タンパク質等の様々な生体分子を構成成分とする非常に複雑な構造体である。

細胞内膜構造の構成成分や形態は、細胞の薬剤処理や細胞への病原体侵入といった環境変化に応じてダイナミックに変化するため、生細胞内における細胞内膜構造の特性解析は困難である。このため、生細胞内ではなく試験管内で細胞内膜構造を形成して、その形成過程を解析する方法が開発されている。

試験管内の反応により、細胞内膜構造を形成する方法としては、細胞をつぶして得た細胞抽出液を用いる方法と、人工的に合成した生体分子を溶液中で混ぜ合わせたものを用いる方法とがある。前者の例としては、アフリカツメガエル卵抽出液を用いた核膜形成法が挙げられる（非特許文献１）。後者の例としては、リポソーム膜を用いて、細胞内分解経路の一種であるオートファジー機構に関与する膜タンパク質の機能を解析した例が挙げられる（非特許文献２）。

また、生体分子を結合させたプラスチックビーズを生きたヒト培養細胞内に導入することにより、細胞が持つ生体分子分解機構の一つである「オートファジー」をビーズ周囲に限定して誘導する方法が報告されている（非特許文献３）。そして、オートファジーはビーズそのものではなくビーズの侵入によって生じた細胞膜の断片を標的として誘導されることが示唆されている（非特許文献４）。

Chuanmao Zhang and Paul R. Clarke, Science, 2000, Vol. 288, pp.1429-1432 Nakatogawa, H., et al., Cell, 2007, Vol. 130, pp.165-178 Kobayashi, S., et al., Autophagy, 2010, Vol. 6, pp.36-45 Fujita, N., et al., J. Cell Biol. , 2013, Vol. 203, pp.115-128

本発明は、生細胞内の特定の位置に細胞内膜構造を形成することができる、細胞内膜構造形成方法を提供することを目的とする。

本発明の第一は、標識された目的分子を保持する培養細胞を調製する工程と、前記標識された目的分子との間で特異的相互作用を示す分子が表面に結合した粒子を前記培養細胞に導入する工程とを有し、前記粒子の周囲に膜構造を形成する、細胞内膜構造形成方法に関する。

前記粒子がプラスチックビーズまたは磁気ビーズであることが好ましい。

前記目的分子の標識が蛍光タンパク質であり、前記標識された目的分子との間で特異的相互作用を示す分子が前記蛍光タンパク質に対する抗体であることが好ましい。

前記目的分子が、ＢＡＦ、Ｒａｎ、およびインポーティンβからなる群から選択される１以上のタンパク質であることが好ましい。

本発明の第二は、前記細胞内膜構造形成方法により形成された細胞内膜構造を蛍光顕微鏡法もしくは電子顕微鏡法、またはそれらを組み合わせた方法により観察する、細胞内膜構造観察方法に関する。

本発明によれば、生細胞内の特定の位置に細胞内膜構造を形成することができる、細胞内膜構造形成方法を提供することができる。

ビーズを導入したＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞のタイムラプス観察の蛍光像ＧＦＰ−ＢＡＦ陽性なビーズの割合を示すグラフ細胞内膜タンパク質（ｅｍｅｒｉｎ）の局在を観察した蛍光像ｅｍｅｒｉｎ陽性なビーズの割合を示すグラフビーズを導入したＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞およびＨｅＬａ／ＧＦＰ細胞のビーズ周囲を観察した蛍光像および電子顕微鏡像目的分子の違いに応じて形成された膜構造を観察した電子顕微鏡像

従来の試験内の反応により形成させられる膜構造の種類には限りがあり、また、試験管内と細胞内とでは生体分子の組成や空間的な制限に差があるため、試験管内で形成させた膜構造が生細胞内での膜の性質を反映しているとは限らない。また、従来の生体分子を結合させたプラスチックビーズを生きたヒト培養細胞内に導入する方法では、ビーズがオートファジー機構によって捕捉されて分解経路へと取り込まれてしまう。

本発明者は、ビーズがオートファジー機構によって捕捉されることなく、生細胞内の特定の位置に細胞内膜構造を形成することができることを見出した。

以下、本発明の細胞内膜構造形成方法について詳細に説明する。

本発明の細胞内膜構造形成方法は、標識された目的分子を保持する培養細胞を調製する工程と、前記標識された目的分子との間で特異的相互作用を示す分子が表面に結合した粒子を前記培養細胞に導入する工程とを有する。

［培養細胞の調製］
標識された目的分子を保持する培養細胞を調製する工程において、目的分子は、培養細胞に導入する粒子の表面に結合した分子と特異的相互作用を示す分子であればよい。ここで、特異的相互作用としては、例えば、抗原抗体反応、アビジン−ビオチンの反応、ストレプトアビジン−ビオチンの反応、酵素と基質の反応、レクチンと糖鎖の反応、核酸と転写因子の反応等の生体分子間相互作用のほか、生体分子と人工化合物との特異的相互作用等も含められる。

目的分子は、前記培養細胞の細胞質内を拡散により移動できる分子であることが好ましく、特には、タンパク質であり、当該培養細胞の核内外物質輸送や核膜形成などに関与するタンパク質等であることがより好ましい。具体的には、ＢＡＦ（ｂａｒｒｉｅｒ−ｔｏ−ａｕｔｏｉｎｔｅｇｒａｔｉｏｎｆａｃｔｏｒ）、Ｒａｎ（Ｒａｓ−ｒｅｌａｔｅｄｎｕｃｌｅａｒｐｒｏｔｅｉｎ）、およびインポーティンβ（Ｉｍｐｏｒｔｉｎ−β）等が挙げられる。これらの中でも、特に、細胞が持つタンパク質分解システムであるオートファジーを回避できることが報告されているＢＡＦが好ましい。

標識された目的分子としては、目的分子がタンパク質の場合、例えば、標識となるタンパク質と目的分子との融合タンパク質、標識となるタンパク質と目的分子とが抗原抗体反応やビオチン-アビジン反応などにより結合したものが挙げられる。

標識された目的分子を保持する培養細胞を調製する方法としては、融合タンパク質をコードする遺伝子を細胞に導入して、当該融合タンパク質を細胞内で発現（合成）させる方法や、マイクロインジェクション等により細胞外で合成した標識された目的分子を細胞に導入する方法等が挙げられる。

標識された目的分子が融合タンパク質の場合、標識された目的分子を保持する培養細胞は、公知の遺伝子工学的手法を用いることにより当該融合タンパク質をコードする遺伝子を細胞に導入して、当該融合タンパク質を細胞内で発現（合成）させることにより、調製することが好ましい。これは、細胞への当該融合タンパク質の導入の手間を省ける、導入過程におけるタンパク質の変性を防げる、当該融合タンパク質を安定に発現する細胞株を作製することで再現性の高い結果が得られる、という利点を有するためである。

発現は、標識となるタンパク質をコードする遺伝子と目的分子をコードする遺伝子とを人工的に連結した融合遺伝子を作製し、当該融合遺伝子を、発現ベクターのプロモーターの下流に挿入し、培養細胞に導入して融合タンパク質を発現させる方法が適用され得る。

また、標識された目的分子が標識となるタンパク質と目的分子とが抗原抗体反応やビオチン-アビジン反応などにより結合したものである場合、標識された目的分子を保持する培養細胞は、試験管内で標識した目的分子をマイクロインジェクション等の方法で細胞内に導入することにより、調製することができる。

標識としては、培養細胞に導入する粒子の表面に結合した分子との特異的相互作用を示すものが好ましい。また、蛍光イメージングまたは発光イメージングにより目的分子の集積の有無を観察することができるため、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）等の蛍光タンパク質、またはルシフェラーゼ、アルカリホスファターゼ、ベータガラクトシダーゼ、ジアホラーゼ、パーオキシダーゼ等の発光タンパク質等各種の蛍光物質や発光物質を用いることがより好ましい。

培養細胞の由来としては特に限定されず、ヒト、マウス等の動物細胞、特に哺乳類培養細胞が挙げられる。例えば、市販のトランスフェクション試薬の説明書に言及がある培養細胞であれば用いることができるが、外来物質の取り込み活性がある程度高い細胞を使用することが好ましい。例えば、上皮様付着細胞であるＨｅＬａ細胞やＨＥＫ２９３細胞等を、再現性良く使用することができる。

［粒子］
粒子は、培養細胞に由来するミトコンドリア等の細胞内粒子とは異なり、細胞外に存在するものであり、一般には、定形又は不定形の固体粒子を指す。その材料や性状は特に限定されず、例えばプラスチック等の有機物、ガラス、金属等の無機物からなるものであってよい。また、珪素等を加えて強化したリポソームや、磁気を帯びた粒子、蛍光標識された粒子を使用することも可能である。

粒子は、具体的には、ポリスチレンビーズ等のプラスチックビーズ、酸化鉄等の磁性体を含むポリスチレンビーズ等の磁気ビーズ、これらのビーズ表面がカルボキシル基やアミノ基等の親水性官能基を有するように処理されたもの、金、白金、コバルト等の金属からなる粒子等が挙げられる。これらの中でも、ビーズの材質自体が細胞へ与える影響を極力抑えるため、ポリスチレンビーズ等の生物学的に不活性な材質から成るビーズが好ましい。

粒子の直径は、目的の培養細胞の大きさに応じて適宜選択することができるが、例えば培養細胞の大きさが１０〜５０μｍ程度の範囲にあり、球状の粒子を用いる場合、数十ｎｍ〜１０μｍであればよい。しかし小さすぎると、複数個の粒子が凝集しやすくなる傾向が生じる、また、粒子の周知に形成される細胞内膜構造が小さく顕微鏡観時に検出感度が低下するため、好ましくは５００ｎｍ以上５μｍ以下の範囲であり、より好ましくは１μｍ以上３μｍ以下の範囲である。

粒子の表面に結合した分子としては、標識された目的分子との間で特異的相互作用を示すものであれば、限定されない。生体への親和性の観点から、生体分子であることが好ましく、例えば、タンパク質、ＤＮＡ、ＲＮＡ、脂質、糖、アミノ酸、およびこれらの組合せ等、生体中に存在するあらゆる分子が挙げられるが、標識された目的分子との相互作用を考慮して、当該標識または目的分子に応じて選択することが好ましい。具体的には、標識された目的分子の標識が蛍光タンパク質である場合、粒子の表面に結合した分子は蛍光タンパク質に対する抗体等が挙げられ、目的分子に施された標識が緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）であれば、抗ＧＦＰ抗体を、赤色蛍光タンパク質（ＲＦＰ）であれば、抗ＲＦＰ抗体を選択することができる。

なお、生体分子とは、生体から直接分離した化合物のみを指すものではなく、生体中に元来含まれ得る化合物であれば化学的に合成された化合物であってもよい。

粒子の表面に結合した、標識された目的分子との間で特異的相互作用を示す分子の結合量としては、特に限定されないが、例えば、酸化鉄等の磁性体を含む直径２．８μｍのポリスチレンビーズの場合、ビーズ１ｍｇ分あたり、０．４〜８μｇの量の抗体（ＩｇＧ）を結合させたものなどを用いることができる。

粒子の表面に、標識された目的分子との間で特異的相互作用を示す分子を結合する方法としては、特に限定されないが、化学的または物理的に結合しているものが好ましい。例えば、プラスチックビーズまたは磁気ビーズ粒子の表面に架橋剤による反応等を利用して生体分子を直接共有結合させる方法、プロテインＧ結合ビーズを利用したプロテインＧ−抗体相互作用、もしくは、ストレプトアビジン結合ビーズを利用したストレプトアビジン−ビオチン相互作用等の相互作用を利用して生体分子を粒子の表面に間接的に結合させる方法、また、その他タンパク質の精製において一般に使われているような相互作用を利用して生体分子を粒子の表面に間接的に結合させる方法等が挙げられる。

［導入］
標識された目的分子との間で特異的相互作用を示す分子が表面に結合した粒子を培養細胞に導入する方法としては、例えば従来法のインジェクション法を用いることも考えられるが、培養細胞にトランスフェクション試薬を作用させる方法を用いることが好ましい。トランスフェクション試薬とは従来、外来のＤＮＡやＲＮＡ、タンパク質などを培養細胞に導入することを目的に使用されているものである。トランスフェクション試薬により粒子を導入するにあたっては、トランスフェクション試薬の種類と粒子表面の性質を適宜選択することができる。トランスフェクション試薬としては特に限定されず、陽イオン性リポソーム、リン酸カルシウム、ポリリジン複合体を用いた物等が挙げられる。具体的な商品名としては、リポソーマル・トランスフェクション試薬であるＤＯＴＡＰ：Ｎ−［１−（２，３−Ｄｉｏｌｅｏｙｌｏｘｙ）ｐｒｏｐｙｌ］−Ｎ，Ｎ，Ｎ−ｔｒｉｍｅｔｈｙｌａｍｍｏｎｉｕｍｍｅｔｈｙｌｓｕｌｆａｔｅ、同じくリポソーマル・トランスフェクション試薬であるＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ（登録商標）２０００（ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社）、非リポソーマル・トランスフェクション試薬であるＥｆｆｅｃｔｅｎｅ（登録商標）（ＱＩＡＧＥＮ社）等が挙げられる。また、目的分子や粒子表面に結合している分子の性質に応じて、Ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ（登録商標）Ｐｌｕｓや、Ｏｌｉｇｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ（登録商標）、Ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ（登録商標）ＲＮＡｉＭＡＸなどといった、ペプチドあるいはＲＮＡを細胞に導入する際に汎用されている試薬等を用いることができる。

以上の中では、特にＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ（登録商標）２０００とＥｆｆｅｃｔｅｎｅが好ましい。前記のＥｆｆｅｃｔｅｎｅには、取り込み効率を改善する試薬としてｅｎｈａｎｃｅｒと呼ばれる試薬が添付されているが、本開示の培養細胞への粒子の導入効率に対する前記ｅｎｈａｎｃｅｒの有無による影響は確認されなかった。

なお、リポソーマル・トランスフェクション試薬とは、ＤＮＡ等の負電荷を持つ物質と混合した場合にリポソーム様の構造をとり、これによってＤＮＡ等の、細胞への取り込みを可能にするものとして知られている試薬をいい、一方、非リポソーマル・トランスフェクション試薬とは、前記のようなリポソーム様の構造ではない複合体の形態において細胞への取り込みを可能にする試薬のことをいう。

トランスフェクション試薬を作用させる場合、従来知られているトランスフェクション試薬の使用量（ＤＮＡ等を導入するための使用量）を参考に適宜決定すればよく、特に制限はない。市販品のトランスフェクション試薬を使用する場合にはメーカーが推奨する反応液量を参考に添加量を調整すればよく、使用する粒子の種類や、導入すべき粒子の量に応じて適宜変更することができる。

標識された目的分子を保持する培養細胞を調製し、前記標識された目的分子との間で特異的相互作用を示す分子が表面に結合した粒子を前記培養細胞に導入することにより、培養細胞内において、前記粒子の周囲にオートファジー関連タンパク質（オートファゴソームの膜を構成するタンパク質やリソソームを構成するタンパク質）ではなく、粒子の周囲に集積した目的分子との相互作用により、細胞内膜を構成するタンパク質、細胞内膜を構成するリン脂質等を粒子の周囲に集めることができ、細胞内で膜構造を形成することができる。また、当該膜構造は、ビーズ表面の形状に沿うようにして形成することができる。なお、粒子の周囲とは、粒子の外周全体または一部のいずれの場合も含む。

［細胞内膜構造］
標識された目的分子を保持する培養細胞を調製する工程と、前記標識された目的分子との間で特異的相互作用を示す分子が表面に結合した粒子を前記培養細胞に導入する工程とにより、膜構造を試験管内で形成させるのに比べ、生細胞内で生じる生命現象を反映した膜構造を観察することができる。また、膜構造を試験管内で形成させる場合に必要な、個々のタンパク質に応じた調製条件（合成条件、精製条件、保存条件など）の最適化のステップを大幅に省略することができ、時間や費用を低減することができる。

［観察方法］
粒子の周囲に形成された細胞内膜構造は、蛍光顕微鏡法もしくは電子顕微鏡法、またはそれらを組み合わせた方法により観察することができる。いずれの方法においても、培養細胞に取り込まれた粒子を基準点とすることによって、常時流動し変化している細胞の内部であっても定点観察することができる。

蛍光顕微鏡法によれば、目的分子、粒子に結合した標識された目的分子との間で特異的相互作用を示す分子、または粒子の少なくともいずれか１つを蛍光標識することにより、標識した対象物の局在や移動、その他定量的な解析が可能になり、生細胞内の膜構造の形成過程における情報を得ることが容易である。

電子顕微鏡法においては、培養細胞の固定、各種染色、樹脂包埋、超薄切片の作製等の操作を行って調製したサンプルを観察することにより、非常に高い空間分解能で細胞内構造を観察することができる。特に、細胞内膜構造の観察に適しており、後述するように蛍光顕微鏡法と組み合わせて用いることで、細胞内膜構造の形成過程の解析に有効に利用できる。

蛍光顕微鏡法および電子顕微鏡法を組み合わせた方法として、ＣＬＥＭ法、ＬｉｖｅＣＬＥＭ法等が挙げられる。

本発明の細胞内膜構造の観察は、蛍光顕微鏡法と電子顕微鏡法を組み合わせた方法によることが好ましい。特に、ＬｉｖｅＣＬＥＭ法を用いることが好ましい。ＬｉｖｅＣＬＥＭ法は、特定の細胞について生きたままの状態で蛍光顕微鏡による観察を行なった後に、その細胞を固定し、蛍光観察したのと同じ場所を電子顕微鏡で観察するものである。これにより、生細胞内における観察対象の状態を把握した上で、対象およびその周囲の様細胞内構造を電子顕微鏡法により高い空間分解能で観察することができる。細胞の固定は、例えばグルタルアルデヒドを加えることにより瞬間的に行うことができる。また、ＬｉｖｅＣＬＥＭ法では、基本的に、一連の試料作製の過程で界面活性剤を使用しないため、膜構造が本来の状態に保たれ、その特定の細胞について、蛍光顕微鏡で得られる情報のみならず、蛍光顕微鏡法では観察が困難な細胞内膜構造を観察することができる。

本発明を実施例に基づき、更に詳細に説明するが、本発明はこれらの実施例に限定されるものではない。

［培養細胞の調製］
以下のとおり、ヒト培養細胞を用いて、各種培養細胞を調製した。

（ＨｅＬａ／ＧＦＰ細胞）
ＧＦＰをコードするプラスミドＤＮＡを理研セルバンクから入手したＨｅＬａ細胞に導入してＧＦＰを発現させＨｅＬａ／ＧＦＰ細胞を調製した。発現については、プラスミドＤＮＡとしては市販のｐＥＧＦＰベクター（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ社）を使用し、プラスミドＤＮＡの細胞への導入はＥｆｆｅｃｔｅｎｅｔｒａｎｓｆｅｃｔｉｏｎｒｅａｇｅｎｔｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社、３０１４２５）を使用した。ＨｅＬａ／ＧＦＰ細胞は、１０％（ｖｏｌ／ｖｏｌ）のウシ胎仔血清（ＦＢＳ）と２００μｇ／ｍｌのＧｅｎｅｔｉｃｉｎ（登録商標）（ＬｉｆｅＴｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ社、１１８１１−０３１）を含むＤＭＥＭ培地で培養した。

（ＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞）
ＨｅＬａ／ＧＦＰ細胞における発現と同様の手順で、ＧＦＰ−ＢＡＦをコードするプラスミドＤＮＡを理研セルバンクから入手したＨｅＬａ細胞に導入してＧＦＰ−ＢＡＦを発現させＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞を調製した。ＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞は、１０％（ｖｏｌ／ｖｏｌ）のウシ胎仔血清（ＦＢＳ）を含むＤＭＥＭ培地で培養した。ここで、ＧＦＰ−ＢＡＦとは、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）とタンパク質ＢＡＦとの融合タンパク質である。

（ＨｅＬａ／ＧＦＰ−Ｒａｎ細胞）
ＨｅＬａ／ＧＦＰ細胞における発現と同様の手順で、ＧＦＰ−ＲａｎをコードするプラスミドＤＮＡを理研セルバンクから入手したＨｅＬａ細胞に導入してＧＦＰ−Ｒａｎを発現させＨｅＬａ／ＧＦＰ−Ｒａｎ細胞を調製した。ＨｅＬａ／ＧＦＰ−Ｒａｎ細胞は、１０％（ｖｏｌ／ｖｏｌ）のウシ胎仔血清（ＦＢＳ）を含むＤＭＥＭ培地で培養した。ここで、ＧＦＰ−Ｒａｎとは、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）とタンパク質Ｒａｎとの融合タンパク質である。

（ＨｅＬａ／ＧＦＰ−Ｉｍｐｏｒｔｉｎ−β細胞）
ＧＦＰ−Ｉｍｐｏｒｔｉｎ−βをコードするプラスミドＤＮＡを理研セルバンクから入手したＨｅＬａ細胞に導入してＧＦＰ−Ｉｍｐｏｒｔｉｎ−βを発現させＨｅＬａ／ＧＦＰ−Ｉｍｐｏｒｔｉｎ−β細胞を調製した。ＨｅＬａ／ＧＦＰ−Ｉｍｐｏｒｔｉｎ−β細胞は、１０％（ｖｏｌ／ｖｏｌ）のウシ胎仔血清（ＦＢＳ）を含むＤＭＥＭ培地で培養した。ここで、ＧＦＰ−Ｉｍｐｏｒｔｉｎ−βとは、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）とタンパク質Ｉｍｐｏｒｔｉｎ−βとの融合タンパク質である。

［粒子］
＜抗ＧＦＰ抗体結合ビーズの調製＞
（抗ＧＦＰ抗体が表面に直接結合した磁気ビーズ）
抗ＧＦＰ抗体が表面に直接結合した磁気ビーズのビーズ懸濁液Ａを以下のようにして調製した。
１）５μｌのＡｎｔｉ−ＧＦＰ−Ｍａｇｎｅｔｉｃｂｅａｄｓ（直径３μｍ；ＭＢＬ社、Ｄ１５３−９）をエッペンチューブに入れ、マグネットを用いて磁気ビーズを回収した。
２）上清を除去し、回収したビーズにＰＢＳ（ｐＨ７．４）を加えて再懸濁した。
３）前記１）および２）と同様の操作を計３回行い、最終的に５０μｌのＰＢＳ（ｐＨ７．４）で再懸濁して、ビーズ懸濁液Ａを調製した。

（抗ＧＦＰ抗体がプロテインＧ−抗体相互作用を利用して表面に結合した磁気ビーズ）
抗ＧＦＰ抗体がプロテインＧ−抗体相互作用を利用して表面に結合した磁気ビーズのビーズ懸濁液Ｂを以下のようにして調製した。

ＤｙｎａｂｅａｄｓＰｒｏｔｅｉｎＧ（直径２．８μｍ；Ｄｙｎａｌ社、ＤＢ１０００３）について、ビーズ懸濁液Ａと同様の処理をして得られたビーズ懸濁液に、抗ＧＦＰ抗体（ＭＢＬ社、５９８）を、ビーズ１ｍｇに対して８０μｇの比で混合し、１時間室温下でインキュベートした後、ＰＢＳ（ｐＨ７．４）による洗浄を行って、ビーズ懸濁液Ｂを調製した。

［実験１］
（細胞へのビーズ導入）
以下のとおり、Ｅｆｆｅｃｔｅｎｅ法により細胞へのビーズ導入を行った。
１）ビーズ導入処理の前日に、ＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞を２×１０^５／ｄｉｓｈの濃度になるように調製して、３５ｍｍｇｌａｓｓｂｏｔｔｏｍｄｉｓｈ（ＭａｔＴｅｋ社）へ播種した。
２）ＤＮＡ溶液の代わりにビーズ懸濁液Ａを使用した以外は、Ｅｆｆｅｃｔｅｎｅｔｒａｎｓｆｅｃｔｉｏｎｒｅａｇｅｎｔｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社、３０１４２５）の説明書に従って、ビーズ懸濁液Ａとキット中の各種溶液とを混合し、室温で１５分静置した。これをビーズ懸濁液Ａ−２とした。
３）前記１）で用意したｄｉｓｈの培地をビーズ懸濁液Ａ−２と交換した。
４）ＣＯ_２インキュベータ内で３７℃、１時間静置した。
５）ｄｉｓｈ上の細胞を１０％（ｖｏｌ／ｖｏｌ）ＦＢＳを含むＤＭＥＭ培地で２回洗浄した。

（蛍光顕微鏡による観察（ライブセルイメージング））
１）細胞へのビーズ導入の処理後、培地を観察用培地（２０ｍＭＨＥＰＥＳ（ｐＨ７．３）、フェノールレッド不含ＤＭＥＭ、１０％ＦＢＳ、８０μｇ／ｍｌカナマイシン硫酸塩）で置換した後、ＣＯ_２インキュベータ内で観察開始まで静置した。
２）観察用培地の上にミネラルオイルを重層した。
３）ミネラルオイル重層したｄｉｓｈを蛍光顕微鏡のステージ上に置いた。
４）３７℃下で観察した。蛍光顕微鏡観察には、ＤｅｌｔａＶｉｓｉｏｎＣｏｒｅｍｉｃｒｏｓｃｏｐｅｓｙｓｔｅｍ（ＡｐｐｌｉｅｄＰｒｅｃｉｓｉｏｎ社）を用い、レンズは、ＯｌｙｍｐｕｓｏｉｌｉｍｍｅｒｓｉｏｎｏｂｊｅｃｔｉｖｅｌｅｎｓＵＡｐｏ／３４０（倍率４０倍、ＮＡ＝１．３５）、光学フィルターは、ＤｅｌｔａＶｉｓｉｏｎ（登録商標）のＧＦＰを観察するための標準的な仕様のフィルターセットを用いた。

＜実験１−１＞タイムラプス観察
前記細胞へのビーズ導入の後、前記蛍光顕微鏡による観察を行い、観察開始から１分間隔で蛍光像を撮像した（タイムラプス観察）。結果は、図１に示す。図中のバーの長さは、１０μｍである。時間「０ｍｉｎ」は、細胞へのビーズ導入の前記５）の洗浄操作を行ってから約１時間の時点を示す。各撮像図「１」「２」および「３」は、順に経時変化であり、各撮像図「１」「２」および「３」は、特定の時間帯（ビーズ周囲で顕著なシグナル変化が見られた時間帯）の像のみを示している。

白抜き矢印で示すように、時間「０ｍｉｎ」では、ビーズ周囲にシグナル（ＧＦＰ−ＢＡＦ由来の蛍光）が見られなかったのに対し、時間の経過と共に、ビーズ周囲へのシグナルの集積が見られた。時間の経過と共に、細胞に取り込まれたビーズ表面にＧＦＰ−ＢＡＦが集積したことが分かる。なお、ビーズの右側にある大きな楕円形の領域は細胞核に相当する。

＜実験１−２＞ＧＦＰ−ＢＡＦ陽性なビーズの割合
前記細胞へのビーズ導入の処理後、細胞に導入された複数のビーズについて前記蛍光顕微鏡による観察を行った。様々な時点で、後述する「ビーズ位置判定法」による染色を行い、細胞を４％（ｗｔ／ｖｏｌ）ホルムアルデヒド固定して、蛍光顕微鏡によりＧＦＰ−ＢＡＦ陽性なビーズの数を調べた。結果は、図２に示す。横軸は、前記細胞へのビーズ導入の前記５）の洗浄操作を行った時点を時間０として、そこからの経過時間（単位は時間（ｈ））、縦軸は、細胞内に取り込まれたビーズ（ｉｎｃｏｒｐｏｒａｔｅｄｂｅａｄｓ）の個数における、ＧＦＰ−ＢＡＦの集積が確認されたビーズ（ＧＦＰ−ＢＡＦ−ｐｏｓｉｔｉｖｅａｎｔｉ−ＧＦＰ−ｂｅａｄｓ）の個数の割合（％）を示す。なお、「細胞内に取り込まれたビーズ（ｉｎｃｏｒｐｏｒａｔｅｄｂｅａｄｓ）」は、ビーズの位置判定法のＲｈｏｄａｍｉｎｅで染まらなかったものである。

（ビーズ位置判定法）
本ビーズ位置判定法は、細胞への物質取り込みを阻害した条件下（４℃）で、細胞表面のみをＲｈｏｄａｍｉｎｅで染色することにより、細胞外に接着しているビーズ（Ｒｈｏｄａｍｉｎｅで染まる）と、細胞内に取り込まれたビーズ（Ｒｈｏｄａｍｉｎｅで染まらない）とを染め分けることができる方法である。
１）前記細胞へのビーズ導入の処理を行った後、細胞を氷冷ＰＢＳ（ｐＨ７．４）で２回（各２ｍｌ）洗浄した。
２）液を完全に吸い取り、１００μｌの１００μｇ／ｍｌＳｕｌｆｏＮＨＳ−ＬＣ−Ｂｉｏｔｉｎ／ＰＢＳ（ｐＨ８．０）を加え、４℃で１０分静置した。
３）細胞を氷冷ＰＢＳ（ｐＨ７．４）で２回（各２ｍｌ）洗浄した。
４）液を完全に吸い取り、１０μｇ／ｍｌＳｔｒｅｐｔａｖｉｄｉｎ−Ｒｈｏｄａｍｉｎｅを加え、４℃で１０分静置した。
５）細胞を氷冷ＰＢＳ（ｐＨ７．４）で１回（２ｍｌ）洗浄した。
６）４％（ｗｔ／ｖｏｌ）ホルムアルデヒド／ＰＢＳ（ｐＨ７．４）で、室温で１５分固定した。
７）ＰＢＳ（ｐＨ７．４）で３回洗浄し、観察までＰＢＳ中４℃で保存した。

［実験２］
＜実験２−１＞細胞内膜タンパク質（ｅｍｅｒｉｎ）の局在の観察
ビーズを導入したＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞およびＨｅＬａ／ＧＦＰ細胞を対象に、細胞内膜タンパク質（ｅｍｅｒｉｎ）の局在を観察した。

ＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞およびＨｅＬａ／ＧＦＰ細胞（ｃｏｎｔｒｏｌ）のそれぞれについて、［実験１］細胞へのビーズ導入の処理と同様に前記５）の洗浄操作を行い、それから２時間後に細胞を４％（ｗｔ／ｖｏｌ）ホルムアルデヒド固定して、後述するａｎｔｉ−ｅｍｅｒｉｎ−ａｎｔｉｂｏｄｙ（ＥＤ１）を用いた細胞の免疫染色、およびＤＮＡについてはＤＮＡ特異的染色試薬であるＤＡＰＩを用いた染色を行った。［実験１］蛍光顕微鏡による観察と同様の手順により、蛍光像を撮像した。免疫染色サンプル（固定後のサンプル）の観察には、Ｏｌｙｍｐｕｓｏｉｌ−ｉｍｍｅｒｓｉｏｎｏｂｊｅｃｔｉｖｅｌｅｎｓＰＬＡＰＯＮ６０ＸＯＳＣ（倍率６０倍、ＮＡ＝１．４０）を使用した。光学フィルターは、ＤｅｌｔａＶｉｓｉｏｎ（登録商標）のＧＦＰを観察するための標準的な仕様のフィルターセットを用いた。結果は、図３に示す。図中のバーの長さは、１０μｍである。白抜き矢印で示すように、ＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞においては、ＧＦＰ由来のシグナル（ＧＦＰ−ＢＡＦ陽性）およびｅｍｅｒｉｎ陽性であることが確認できたが（（２）および（３）上段）、三角矢印で示すように、ＨｅＬａ／ＧＦＰ細胞においては、ＧＦＰ由来のシグナル（ＧＦＰ陽性）は確認できたが、ｅｍｅｒｉｎ陰性であった（（２）および（３）下段）。

（細胞の免疫染色）
１）細胞が生育しているｄｉｓｈに、ホルムアルデヒドの終濃度が４％（ｗｔ／ｖｏｌ）になるようにホルムアルデヒド水溶液を添加することで細胞を化学固定し（ホルムアルデヒド固定）、室温で１５ｍｉｎインキュベートした。
２）溶液を２ｍｌのＰＢＳ（ｐＨ７．４）と置換し、室温で５分間洗浄した後、同様の洗浄操作を計３回行った。その後、０．１％ＴｒｉｔｏｎＸ−１００／ＰＢＳ（ｐＨ７．４）で室温５分インキュベートした。
３）ＰＢＳ（ｐＨ７．４）で５分×３回洗浄後、１％ＢＳＡ／ＰＢＳ（ｐＨ７．４）で室温で１時間インキュベートした。
４）Ａｎｔｉ−ｅｍｅｒｉｎａｎｔｉｂｏｄｙ等の抗体を１％ＢＳＡ／ＰＢＳ（ｐＨ７．４）で１００〜５００倍程度希釈して得た抗体溶液を、３）の細胞が生育しているｄｉｓｈに入れ、４℃で一晩静置し、ｄｉｓｈ上の細胞を染色した。
５）一晩静置後、ＰＢＳ（ｐＨ７．４）で５分×３回洗浄後、室温で３時間二次抗体反応を行った後、ＰＢＳ（ｐＨ７．４）で５分×３回洗浄した。二次抗体溶液としては、Ａｌｅｘａ５９４で標識された抗ラビットＩｇＧ抗体（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社）を１％ＢＳＡ／ＰＢＳ（ｐＨ７．４）で１０００倍希釈した溶液を用いた。

＜実験２−２＞ｅｍｅｒｉｎ陽性なビーズの割合
＜実験２−１＞の手順と同様にして、ＧＦＰ−ＢＡＦあるいはＧＦＰ陽性となったビーズにおけるｅｍｅｒｉｎ陽性となったビーズの割合を調べた。結果は図４に示す。データは、独立した三回の実験を行った平均±標準偏差の形で示しており、各実験においてＧＦＰ−ＢＡＦあるいはＧＦＰ陽性となった５０個のビーズについて調べた。

［実験３］ビーズを導入したＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞およびＨｅＬａ／ＧＦＰ細胞のビーズ周囲の観察

ＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞およびＨｅＬａ／ＧＦＰ細胞（ｃｏｎｔｒｏｌ）のそれぞれについて、［実験１］の細胞へのビーズ導入と同様の処理を行った後、［実験１］蛍光顕微鏡による観察と同様の手順により、ＧＦＰ−ＢＡＦ陽性またはＧＦＰ陽性なビーズを確認してから１時間が経過した時点で細胞を２．５（ｗｔ／ｖｏｌ）グルタルアルデヒドで固定し、後述するＬｉｖｅＣＬＥＭ法により、蛍光像および電子顕微鏡像を撮像した。結果は、図５に示す。図中のバーの長さは、蛍光像は２μｍ、全体像は１μｍ、ならびに拡大図は１００ｎｍである。

図５中、「蛍光像」は、ＧＦＰ−ＢＡＦ（上段の蛍光像）あるいはＧＦＰ（下段の蛍光像）のビーズ周囲への集積を示し、「電子顕微鏡像」は、蛍光像で示したのと同一のビーズについて、電子顕微鏡法により細胞内構造を（特に、膜構造に注目して）観察した結果を示す。また、電子顕微鏡像については、「ビーズの全体像」および一部分の「拡大像」を示し、拡大像のうち、注目している部分を模式図として示している。拡大図および模式図中、矢印または三角矢印が注目している膜構造（脂質二重層が二枚ある、二重膜構造）を示す。上段の模式図は、ＢＡＦに依存的に形成される膜構造、下段の模式図は、オートファジーに典型的な膜構造、白抜き矢印はビーズ表面に集積させた目的分子（ＧＦＰ−ＢＡＦ等）と思われる電子密度の物体が存在する領域を示す。

図５に示されるとおり、ＧＦＰ−ＢＡＦではビーズ表面に集積したＧＦＰ−ＢＡＦに依存して膜構造が形成されるため、ビーズ表面をぴったりと覆うような膜が形成されているのに対し（上段の全体像）、ＧＦＰ（Ｃｏｎｔｒｏｌ）ではそのような膜の形成は見られず、オートファジー関連の膜構造がビーズのある領域一帯を覆うように形成されている（下段の全体像）ことが分かる。これは、オートファジー関連の膜構造形成のターゲットとなっているのが、ビーズそのものではなく、ビーズ周囲に残存しているエンドソーム膜の断片だからであると考えられる。

（ＬｉｖｅＣＬＥＭ法による観察）
１）蛍光顕微鏡による観察
細胞を２．５（ｗｔ／ｖｏｌ）グルタルアルデヒドで固定した後、蛍光顕微鏡として、Ｏｌｙｍｐｕｓｏｉｌ−ｉｍｍｅｒｓｉｏｎｏｂｊｅｃｔｉｖｅｌｅｎｓＰＬＡＰＯＮ６０ＸＯＳＣ（倍率６０倍、ＮＡ＝１．４０を用いて、三次元画像（０．２μｍ間隔で４０−６０の焦点面）を撮像した。この画像について、当該蛍光顕微鏡システムに搭載されたソフトを用いて非焦点面に由来するシグナルを除去した。

２）電子顕微鏡による観察
試料は、１％ＯｓＯ_４（日新ＥＭ社、３００２）で固定し、２％（ｗｔ／ｖｏｌ）酢酸ウラニル（Ｍｅｒｋ、８４７３−１Ｍ）で染色して、ＥＰＯＮ８１２（ＴＡＡＢ、Ｔ０２４）で包埋した。蛍光顕微鏡によって観察された細胞と同一の細胞をカバーガラス上の番地からから特定した。８０ｎｍの切片を作製し、２％酢酸ウラニルとクエン酸鉛（Ｓｉｇｍａ−Ａｌｄｒｉｃｈ、１８−０８７５−２）で染色した。電子顕微鏡像は、透過型電子顕微鏡（８０ｋＶ、ＪＥＯＬ、ＪＥＭ−１４００）を用いた。蛍光像と相間がある電子顕微鏡像が得られた。

［実験４］目的分子の違いによる膜構造の観察
ＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞に、抗ＧＦＰ抗体がプロテインＧ−抗体相互作用を利用して表面に結合した磁気ビーズを導入した。導入は、ビーズ懸濁液Ａに代えてビーズ懸濁液Ｂを用いた以外は、［実験１］の細胞へのビーズ導入の処理と同様に行った。細胞をグルタルアルデヒド固定した後、［実験３］のＬｉｖｅＣＬＥＭ法の電子顕微鏡による観察と同様に、試料を調製して電子顕微鏡像を撮像した。結果は、図６（１）に示す。図中のバーの長さは、１００ｎｍである。

ＨｅＬａ／ＧＦＰ−Ｒａｎ細胞、抗ＧＦＰ抗体がプロテインＧ−抗体相互作用を利用して表面に結合した磁気ビーズを導入した。導入は、ＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞に代えて、ＨｅＬａ／ＧＦＰ−Ｒａｎ細胞を用い、ビーズ懸濁液Ａに代えてビーズ懸濁液Ｂを用いた以外は、［実験１］の細胞へのビーズ導入の処理と同様に行った。細胞をグルタルアルデヒド固定した後、［実験３］のＬｉｖｅＣＬＥＭ法の電子顕微鏡による観察と同様に試料を調製し、電子顕微鏡像を撮像した。結果は、図６（２）に示す。図中のバーの長さは、１００ｎｍである。

ＨｅＬａ／ＧＦＰ−Ｉｍｐｏｒｔｉｎ−β細胞、抗ＧＦＰ抗体が表面に直接結合した磁気ビーズを導入した。導入は、ＨｅＬａ／ＧＦＰ−ＢＡＦ細胞に代えて、ＨｅＬａ／ＧＦＰ−Ｉｍｐｏｒｔｉｎ−β細胞を用いた以外は、［実験１］の細胞へのビーズ導入の処理と同様に行った。細胞をグルタルアルデヒド固定した後、［実験３］のＬｉｖｅＣＬＥＭ法の電子顕微鏡による観察と同様に試料を調製し、電子顕微鏡像を撮像した。結果は、図６（３）に示す。図中のバーの長さは、１００ｎｍである。

図６から分かるように、発現させた目的分子の種類に応じて、様々な形態の細胞内膜構造がビーズ（粒子）の周囲に形成された。ＲａｎやＩｍｐｏｒｔｉｎ−βは、核内外物質輸送や核膜形成などに関与していると言われているタンパク質であり、図６に示されるとおり、核膜孔複合体様の構造体（矢印）を含み、発現（集積）させた目的分子に応じてそれぞれ異なる膜構造がビーズ周囲に形成された。ＧＦＰ−ＲａｎおよびＧＦＰ−Ｉｍｐｏｒｔｉｎ−βを発現させた場合のいずれも、ＧＦＰ−ＢＡＦを発現させた場合と同様に、オートファジー関連とは異なる膜構造が形成されたことが分かる。

Claims

標識された目的分子を保持する培養細胞を調製する工程と、
前記標識との間で特異的相互作用を示す分子が表面に結合した粒子を前記培養細胞に導入する工程と、
前記粒子の周囲に膜構造を形成する工程とを有し、
前記目的分子が、前記培養細胞の細胞内膜構造の形成に関与するタンパク質である、細胞内膜構造形成方法。
前記粒子がプラスチックビーズまたは磁気ビーズである、請求項１に記載の細胞内膜構造形成方法。
前記目的分子の標識が蛍光タンパク質であり、
前記標識との間で特異的相互作用を示す分子が前記蛍光タンパク質に対する抗体である、請求項１または２に記載の細胞内膜構造形成方法。
前記目的分子が、ＢＡＦ、Ｒａｎ、およびインポーティンβからなる群から選択される１以上のタンパク質である、請求項１−３のいずれか１項に記載の細胞内膜構造形成方法。
請求項１−４のいずれか１項に記載の細胞内膜構造形成方法により形成された細胞内膜構造を蛍光顕微鏡法もしくは電子顕微鏡法、またはそれらを組み合わせた方法により観察する、細胞内膜構造観察方法。