JP6361358B2 - 電気泳動装置 - Google Patents
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Description
Vi=tinjνi(πr2)
で示すことができる。ここで、
tinj:注入時間、
νi:各イオンがキャピラリ端から注入されるときの線速度、
r:キャピラリ半径
である。
νi=μiEinj
(Einjは注入時の電場強度、μiは各イオン成分の移動度)であるので、注入体積Viは
Vi=tinjEinj(πr2)・μi
となり、μiに比例する。それを図示すると図5のようになり、その傾き(比例定数)はπr2tinjEinjである。
Vi=FiVB+(1−Fi)VA (1)
Fi=(Vi−VA)/(VB−VA)
=(νi−νA)/(νB−νA)
=(μi−μA)/(μB−μA) (2)
μ=ν/Einj=L/Einjt
として求めることができる。後述の実施例では、注入時の電場強度Einjを200V/cm、試料注入端から検出部までの分離長さを8.5cmとして、移動度μ(μi,μA,μB)を実験的に得られたピーク検出時間tから[cm2/V秒]単位で求めた。このようにして求めた移動度μ(μi,μA,μB)を(2)式に当てはめて任意の成分iに対する補間係数Fiを算出することができる。
1)横軸が時間軸の泳動パターンについてピーク面積を求める。
2)泳動パターンの横軸を時間軸から移動度軸に変換した上でピーク面積を求める。
(ピーク面積)=Σnhn×Δμn
=Σnhn×(μn+1−μn)
となる。ここで、hnはピーク高さ、μnは移動度である。
3)移動度軸について求めた任意の成分のピーク面積を、補間係数Fiを用いて補正する。内部標準物質Bのピーク面積と濃度をそれぞれABおよびCBとすると、任意の成分の補正前濃度Ciは、Ci=(Ai/AB)×CBであり、補正後の濃度Cicは、
Cic=Fi×Ciである。
νinj=Ka/πr2
ここで、Kaは分離バッファ液のpH、誘電率、イオン強度、粘度、DNA鎖長、キャピラリ内壁−泳動溶液間の電位差(ゼータ電位)などで決まる定数である。
dna(x,t)=Kaca(x,t)×I(t)dt
となる。
一実施形態の方法によりキャピラリ電気泳動分離された試料成分を定量分析した結果を以下に示す。
キャピラリ:内径50μm×有効長85mm、LPA(リニアポリアクリルアミド)コーティングキャピラリ
分離バッファ液:DNA−1000(株式会社島津製作所の製品)、
インターカレータ:GelStar(登録商標) 20,000倍希釈
試料:φX174−HaeIII消化物(1ng/μL)(プロメガ株式会社の製品)
注入条件:200V/cm×3秒
分離条件:200V/cm
4,6 バッファ溶液
8 高圧電源
10 シリンジポンプ
12 試料容器
14、14a 検出部
20、20a 制御部
24 電気泳動流路
30 ピーク面積算出部
32 補正部
36 相対移動度によるピーク面積補正部
38 線速度換算表保持部
40 注入時線速度によるピーク面積補正部
42 面積積分値算出部
44 面積積分値によるピーク面積補正部
Claims (6)
- (A)ゲルが充填された電気泳動流路にその一端から互いにサイズの異なる複数の試料成分を含む試料を電気的に注入するステップ、(B)注入された前記試料を前記電気泳動流路の両端間に電圧を印加して電気泳動させて前記試料成分をそのサイズによって分離するステップ、(C)分離された前記試料成分を前記電気泳動流路の検出位置で検出するステップ、(D)検出された前記試料成分のピーク面積を求めるステップ、及び(E)求められたピーク面積を前記試料成分ごとの注入速度に基づいて補正するステップを含み、
前記ステップ(E)における注入速度に基づく補正は、試料成分ごとのサイズに応じた相対移動度に基づく補正(E1)のほかに、
(E2)前記電気泳動流路中のインターカレータによる各試料成分の試料注入時の線速度へのブレーキ効果に基づく補正、及び
(E3)試料注入時の電流積分値に基づく補正、
のうちの少なくとも一方を含んで電気泳動分離された試料成分を定量分析する電気泳動方法。 - 前記ステップ(A)では、どの試料成分よりも移動度が小さい内部標準物質Aと、どの試料成分よりも移動度が大きい内部標準物質Bの2種類を試料とともに前記電気泳動流路に注入し、
前記補正(E1)では、前記相対移動度として試料成分ごとの補間係数Fiを用いる請求項1に記載の電気泳動方法。
ここで、補間係数Fは、内部標準物質Aの移動度μAが0、内部標準物質Bの移動度μBが1となるように規格化した係数である。 - 前記補正(E2)として、特定の条件下においてあらかじめ求められた、試料成分のフラグメントサイズを前記ブレーキ効果の大きさを示す係数に換算するための線速度換算表を用いる請求項1又は2に記載の電気泳動方法。
- ゲルが充填された電気泳動流路、前記電気泳動流路の一端への互いにサイズの異なる複数の試料成分を含む試料の注入及び前記電気泳動流路での電気泳動のための電圧を前記電気泳動流路の両端間に印加する電源装置、並びに前記電気泳動流路によりサイズによって分離された前記試料成分を検出する検出器を備えた電気泳動部と、
前記検出器からの電気泳動信号を取り込み前記試料成分ごとの定量分析を行う制御部と、を備え、
前記制御部は、前記電気泳動信号からピーク面積を求めるピーク面積算出部と、
前記ピーク面積算出部により求められたピーク面積を、前記試料成分ごとの注入速度に基づいて補正する補正部と、を備え、
前記補正部は注入速度に基づく補正を試料成分のサイズに応じた相対移動度に基づいて行う相対移動度によるピーク面積補正部を備え、
前記補正部はさらに、注入速度に基づく補正を前記電気泳動流路中のインターカレータによる各試料成分の試料注入時の線速度へのブレーキ効果に基づいて行う注入時線速度によるピーク面積補正部、及び注入速度に基づく補正を電流積分値に基づいて行う電流積分値によるピーク面積補正部のうちの少なくとも一方を備えている電気泳動装置。 - 該電気泳動装置は、特定の条件下においてあらかじめ求められた、試料成分のフラグメントサイズを前記ブレーキ効果の大きさを示す係数に換算するための線速度換算表を保持した線速度換算表保持部をさらに備え、
前記注入時線速度によるピーク面積補正部は前記線速度換算表保持部に保持されている線速度換算表を用いるように構成されている請求項4に記載の電気泳動装置。 - 該電気泳動装置は前記電源装置から試料注入時の電流値を取り込み、その電流積分値を求める電流積分値算出部を備え、
前記ピーク面積補正部は注入速度に基づく補正を前記電流積分値算出部により求められた電流積分値に基づいて行うように構成されている請求項4又は5に記載の電気泳動装置。
Priority Applications (1)
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| JP2014156693A JP6361358B2 (ja) | 2014-07-31 | 2014-07-31 | 電気泳動装置 |
Applications Claiming Priority (1)
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| JP2014156693A JP6361358B2 (ja) | 2014-07-31 | 2014-07-31 | 電気泳動装置 |
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| Publication Number | Publication Date |
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| JP2016033492A JP2016033492A (ja) | 2016-03-10 |
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Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
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| JP2014156693A Active JP6361358B2 (ja) | 2014-07-31 | 2014-07-31 | 電気泳動装置 |
Country Status (1)
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-
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- 2014-07-31 JP JP2014156693A patent/JP6361358B2/ja active Active
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| JP2016033492A (ja) | 2016-03-10 |
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