JP5988200B2 - 新規なポリペプチド及びその利用 - Google Patents
新規なポリペプチド及びその利用 Download PDFInfo
- Publication number
- JP5988200B2 JP5988200B2 JP2012138180A JP2012138180A JP5988200B2 JP 5988200 B2 JP5988200 B2 JP 5988200B2 JP 2012138180 A JP2012138180 A JP 2012138180A JP 2012138180 A JP2012138180 A JP 2012138180A JP 5988200 B2 JP5988200 B2 JP 5988200B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- polypeptide
- amino acid
- amino acids
- antibacterial activity
- antibacterial
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Description
(1) 以下の(a)又は(b)に示すポリペプチド:
(a)配列番号1に示すアミノ酸配列における連続する10個以上で16個以下のアミノ酸からなるポリペプチド
(b)配列番号2に示すアミノ酸配列における連続する10個以上で15個以下のアミノ酸からなるポリペプチド。
(2) 配列番号1に示すアミノ酸配列における1番目〜10番目のアミノ酸を含む上記(1)に記載のポリペプチド。
(3) 配列番号1に示すアミノ酸配列における1番目〜10番目のアミノ酸からなる上記(2)に記載のポリペプチド。
(4) 上記(1)から(3)の何れかに記載のポリペプチドにおいて、1から3個のアミノ酸が置換、欠失、及び/又は、付加されてなり、抗菌活性を有するポリペプチド。なお、「A及び/又はB」とは、A及びB、並びに、A又はBを意図する。
(5) 上記(1)から(3)の何れかに記載のポリペプチドにおいて、1又は2個のアミノ酸が置換されてなる、及び/又は、末端側に位置する1又は2個のアミノ酸が欠失されてなり、抗菌活性を有するポリペプチド。
(6) 上記(1)から(5)の何れかに記載のポリペプチドをコードしているポリヌクレオチド。
(7) 上記(6)に記載のポリヌクレオチドを含んでいるベクター。
(8) 上記(6)に記載のポリヌクレオチド、又は上記(7)に記載のベクターが発現可能に導入されている細胞、又は複数個の当該細胞により構成された形質転換体。
(9) 上記(7)に記載のベクターを用いて形質転換されている植物。
(10) 上記(1)から(5)の何れかに記載のポリペプチドを活性成分として含んでいる抗菌剤。
(11) 以下の(a)及び(b)に示すポリペプチドの両方を活性成分として含んでいる上記(10)に記載の抗菌剤:
(a)配列番号1に示すアミノ酸配列における連続する10個以上で16個以下のアミノ酸からなるポリペプチド
(b)配列番号2に示すアミノ酸配列における連続する10個以上で15個以下のアミノ酸からなるポリペプチド。
本発明に係るポリペプチドは、イネのディフェンシン様蛋白質であるγ−チオニン蛋白質の配列に基づき設計された、抗菌活性を有するポリペプチドである。
(a)配列番号1に示すアミノ酸配列における連続する10個以上で16個以下のアミノ酸からなるポリペプチド;(b)配列番号2に示すアミノ酸配列における連続する10個以上で15個以下のアミノ酸からなるポリペプチド。
1)フェニルアラニン(F)、チロシン(Y)、及びトリプトファン(W)からなる群から選択される1アミノ酸から、当該群中の他のアミノ酸への置換。
2)リシン(K)、アルギニン(R)、及びヒスチジン(H)からなる群から選択される1アミノ酸から、当該群中の他のアミノ酸への置換。
3)アスパラギン(N)、及びグルタミン(Q)からなる群から選択される1アミノ酸から、当該群中の他のアミノ酸への置換。
4)アスパラギン酸(D)、及びグルタミン酸(E)からなる群から選択される1アミノ酸から、当該群中の他のアミノ酸への置換。
5)アラニン(A)、バリン(V)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、及びプロリン(P)からなる群から選択される1アミノ酸から、当該群中の他のアミノ酸への置換。
6)セリン(S)、及びトレオニン(T)からなる群から選択される1アミノ酸から、当該群中の他のアミノ酸への置換。
7)アルギニン以外のアミノ酸からアルギニンへの置換。なお、アルギニン以外のアミノ酸は、酸性又は中性アミノ酸であることが好ましい。特に限定されないが、配列番号1に示すアミノ酸配列における3番目のアミノ酸、及び/又は、10番目のアミノ酸を、アルギニンに置換することが挙げられる。
(ポリヌクレオチド)
本発明に係るポリヌクレオチドは、上記した本発明に係るポリペプチドをコードしている。当該ポリヌクレオチドは、DNA又はRNAであり、一本鎖又は二本鎖である。当該ポリヌクレオチドを構成する塩基の配列は、コードすべきポリペプチドのアミノ酸配列に応じて適宜決定すればよい。
本発明に係るベクターは、本発明に係る上記ポリヌクレオチドを含んでいる。このベクターは、本発明に係るポリペプチドを産生するため、又は宿主細胞に抗菌活性を付与するために使用される。本発明に係るベクターは、細胞抽出液等を用いた無細胞ペプチド合成系に用いるベクターであっても、組換え発現に用いる発現ベクターであってもよい。
本発明に係る形質転換細胞、及び形質転換体には、本発明に係る上記ポリヌクレオチド、又は、本発明に係る上記ベクターが発現可能に導入されている。本発明において形質転換体とは、複数個の形質転換細胞により構成された単位(multicellular form)を指し、細胞とは区別される。形質転換体とは、例えば、組織または器官だけでなく、多細胞生物の個体がその範疇に含まれることを意図する。
1)本発明に係るポリペプチドをコードする遺伝子を発現する遺伝子組換えイネ。当該イネは、糸状菌等に代表されるイネ病原菌に対する抵抗性を示すようになる。
2)本発明に係るポリペプチドをコードする遺伝子を発現する、イネ以外の遺伝子組換え植物体。当該植物体は、糸状菌等に代表される植物病原菌に対する抵抗性を示すようになる。
なお、イネ以外の植物の種類は特に限定されないが、具体的には例えば、イネ科(コムギ、オオムギ、ライ麦、トウモロコシ等でイネを除く)、ウリ科(例えば、キュウリ、メロン、スイカ、カボチャ、ニガウリ)、ナス科(例えば、トマト、ナス、ピーマン、パプリカ、トウガラシ、ジャガイモ、ペチュニア)、マメ科(例えば、インゲン、ソラマメ、アズキ、ダイズ、ササゲ、エンドウ)、キク科(例えば、ゴボウ、シュンギク、レタス、キク、ガーベラ、シネラリア、マリーゴールド)、アブラナ科(例えば、ハクサイ、キャベツ、ダイコン、カブ、コマツナ、ブロッコリー、チンゲンサイ、ストック)、アオイ科(例えば、オクラ、ワタ)、セリ科(例えば、セロリ、ニンジン、パセリ)、ユリ科(例えば、タマネギ、ニラ、アスパラガス、ネギ)、ナデシコ科(例えば、カスミソウ、カーネーション)、ミカン科(例えば、ミカン)、バラ科(例えば、バラ、イチゴ、リンゴ、ナシ、洋ナシ、モモ、ネクタリン)、アカザ科(例えば、ホウレンソウ)、等に属する植物が挙げられる。
(抗菌剤、及びその具体的用途)
本発明に係る抗菌剤は、本発明に係る少なくとも一種のポリペプチドを抗菌活性成分として含んでいる。本発明に係る抗菌剤は、必要に応じて、当該ポリペプチドを安定化させる安定化剤、酸化防止剤、等を含んだ組成物であってもよい。本発明に係る抗菌剤は、必要に応じて、製剤化のための、担体、等を含んだ組成物であってもよい。本発明に係る抗菌剤は、抗菌活性を増強する目的、或いは抗菌スペクトルをより拡張する目的で、本発明に係るポリペプチド以外の他の抗菌成分をさらに含んだ組成物であってもよい。
(a)配列番号1に示すアミノ酸配列における連続する10個以上で16個以下のアミノ酸からなるポリペプチド;
(b)配列番号2に示すアミノ酸配列における連続する10個以上で15個以下のアミノ酸からなるポリペプチド。
本発明はまた殺菌又は制菌の方法を提供する。すなわち、当該方法は、殺菌又は制菌の対象となる原核菌類及び真核菌類に、本発明に係るポリペプチドを接触させることで、当該原核菌類及び真核菌類を殺菌又は制菌する。なお、「制菌」とは、本発明に係るポリペプチドを接触させない状態と比較して、原核菌類及び/又は真核菌類の活動が抑制されることを指す。なお、原核菌類及び/又は真核菌類の活動が抑制されたか否かは、例えば、増殖速度の低下、又は増殖の停止(静菌)等を指標にして判断することが出来る。
本発明に係るポリペプチドは何れも小分子で、その抗菌活性に立体構造の影響を受けない。そのため、他の蛋白質分子に融合させることで、融合蛋白質分子に新たに抗菌性を付与することが出来る。
(1)γ−チオニン蛋白質の活性部位(「AK121915(Def)」)の製造
イネ由来のγ−チオニン蛋白質は、抗菌活性に寄与する49個のアミノ酸から構成される活性部位(成熟領域)と、31個のアミノ酸から構成されるシグナルペプチド部位とからなる。本参考例では、以下の方法に従い、上記活性部位のみを製造した。
図1に示す複数種の糸状菌、酵母(真菌)、及び複数種の細菌に関して、AK121915(Def)が抗菌活性を示すか否かを確認した。結果を図1に示す。図1に示す通り、糸状菌及び酵母に対する抗菌活性が顕著であることが確認された。なお、糸状菌及び酵母に対する抗菌活性の試験方法は、後述する実施例2及び3に示す通りである。
AK121915(Def)のアミノ酸配列に基づき、短鎖ペプチドを合成した。短鎖ペプチドは北海道システムサイエンス社の受託ペプチド合成により合成した。純度は98%以上のものとした。
No.1: RHCLSQSHRF(1−10番目のアミノ酸)
No.2: VSSNNCANV(15−23番目のアミノ酸)
No.3: RTESFPDGE(25−33番目のアミノ酸)
No.4: KSHGLERKCF(35−44番目のアミノ酸)
No.5: SHRFKGMCVS(7−16番目のアミノ酸)
No.6: SNNCANVCRTE(17−27番目のアミノ酸)
No.7: FPDGECKSHG(29−38番目のアミノ酸)
No.8: ERKCFCKKVC(40−49番目のアミノ酸)
なお、上記No.1〜No.8の短鎖ペプチドを、順に、AK121915(1-10)、AK121915(15-23)、AK121915(25-33)、AK121915(35-44)、AK121915(7-16)、AK121915(17-27)、AK121915(29-38)、AK121915(40-49)、と称する場合もある。
参考例1で得たAK121915(Def)、及び実施例1で得た短鎖ペプチドを用いて、イネいもち病菌(Magnaporthe grisea)に対する抗菌活性の測定を行った。
参考例1で得たAK121915(Def)、及び実施例1で得た短鎖ペプチドを用いて、カンジダ(Candida albicans)に対する抗菌活性の測定を行った。
これまで、植物ディフェンシンが抗菌活性を発揮するための微生物上の標的分子として、グルコシルセラミド及びマンノシル・ジイノシトール・ホスホリル・セラミド(mannosyl diinositolphosphoryl ceramide)が候補とされてきた(参考文献:Thevissen et al. 2005 FEBS Let. 579 : 1973-1977)。
カラシナディフェンシンBj-AFP1、イネディフェンシンAK121915(Def)、及びAK121915(1-10)の三種の蛋白質及びペプチドを用い、Candida albicans CAI4株、C. albicans CAI4 △gcs株(新潟薬科大学高久洋暁博士がCAI4株より作製)、Saccharomyces cerevisiae W303-1A株(ATCCより入手可)に対する抗菌活性を測定した。抗菌活性の測定は、何れも実施例3の記載に従い行った。測定の結果は、表2に纏めて示す。表2中の○(抗菌活性有)はIC50値が15μg/mL以下であることを示し、×(抗菌活性無)はIC50値が25μg/mL以上であることを示す。
カラシナディフェンシンBj-AFP1、イネディフェンシンAK121915(Def)、及びAK121915(1-10)の三種の蛋白質及びペプチドを用い、S. cerevisiae W303-1A株、S. cerevisiae W303-1A△skn1△ipt1株(新潟薬科大学高久洋暁博士がW303-1A株より作製)、C. albicans CAI4株に対する抗菌活性を測定した。抗菌活性の測定は、何れも実施例3の記載に従い行った。測定の結果は、表3に纏めて示す。表3中の○(抗菌活性有)はIC50値が15μg/mL以下であることを示し、×(抗菌活性無)はIC50値が25μg/mL以上であることを示す。
図3に示すように、Bj-AFP1はAK121915(Def)とほぼ同様の位置に8つのシスティン残基を有するという、ディフェンシンに特有の共通構造を持つ。そこで、Bj-AFP1の配列に基づいて、実施例1に示す短鎖ペプチドAK121915(1-10)、AK121915(15-23)、AK121915(25-33)、及びAK121915(35-44)に対応する短鎖ペプチドを合成した。合成した短鎖ペプチドは順に、Bj-AFP1(1-10)、Bj-AFP1(16-24)、Bj-AFP1(26-35)、及びBj-AFP1(37-46)として図3中に示す。なお、これら短鎖ペプチドは、北海道システムサイエンス社の受託ペプチド合成により合成した。純度は98%以上のものとした。
AK121915(Def)のアミノ酸配列情報から、1―10番目のアミノ酸からなる短鎖ペプチドAK121915(1-10)(表4のNo.1。実施例1も参照)をベースに、アミノ酸の置換、欠失、及び付加を組み合わせた5種類の改変短鎖ペプチドを合成した。改変短鎖ペプチドは北海道システムサイエンス社の受託ペプチド合成により合成した。純度は98%以上のものとした。
Claims (11)
- 以下の(a)又は(b)に示すポリペプチド:
(a)配列番号1に示すアミノ酸配列における連続する10個以上で16個以下のアミノ酸からなるポリペプチド
(b)配列番号2に示すアミノ酸配列における連続する10個以上で15個以下のアミノ酸からなるポリペプチド。 - 配列番号1に示すアミノ酸配列における1番目〜10番目のアミノ酸を含む請求項1に記載のポリペプチド。
- 配列番号1に示すアミノ酸配列における1番目〜10番目のアミノ酸からなる請求項2に記載のポリペプチド。
- 請求項1から3の何れか1項に記載のポリペプチドにおいて、1から3個のアミノ酸が置換、欠失、及び/又は、付加されてなり(ただしアミノ酸の欠失は、2個以下のアミノ酸の欠失であり、アミノ酸の置換は、2個以下のアミノ酸の置換である)、抗菌活性を有するポリペプチド。
- 請求項1から3の何れか1項に記載のポリペプチドにおいて、1又は2個のアミノ酸が置換されてなる、及び/又は、末端側に位置する1又は2個のアミノ酸が欠失されてなり、抗菌活性を有するポリペプチド。
- 請求項1から5の何れか1項に記載のポリペプチドをコードしているポリヌクレオチド。
- 請求項6に記載のポリヌクレオチドを含んでいるベクター。
- 請求項6に記載のポリヌクレオチド、又は請求項7に記載のベクターが発現可能に導入されている細胞、又は複数個の当該細胞により構成された形質転換体。
- 請求項7に記載のベクターを用いて形質転換されている植物。
- 請求項1から5の何れか1項に記載のポリペプチドを活性成分として含んでいる抗菌剤。
- 以下の(a)及び(b)に示すポリペプチドの両方を活性成分として含んでいる請求項10に記載の抗菌剤:
(a)配列番号1に示すアミノ酸配列における連続する10個以上で16個以下のアミノ酸からなるポリペプチド
(b)配列番号2に示すアミノ酸配列における連続する10個以上で15個以下のアミノ酸からなるポリペプチド。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2012138180A JP5988200B2 (ja) | 2011-06-28 | 2012-06-19 | 新規なポリペプチド及びその利用 |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2011143550 | 2011-06-28 | ||
JP2011143550 | 2011-06-28 | ||
JP2012138180A JP5988200B2 (ja) | 2011-06-28 | 2012-06-19 | 新規なポリペプチド及びその利用 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2013031431A JP2013031431A (ja) | 2013-02-14 |
JP5988200B2 true JP5988200B2 (ja) | 2016-09-07 |
Family
ID=47787886
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2012138180A Active JP5988200B2 (ja) | 2011-06-28 | 2012-06-19 | 新規なポリペプチド及びその利用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP5988200B2 (ja) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2020184468A1 (en) | 2019-03-08 | 2020-09-17 | Toyota Jidosha Kabushiki Kaisha | Functional peptides having antimicrobial activity against phytopathogenic microorganisms |
WO2020184469A1 (en) | 2019-03-08 | 2020-09-17 | Toyota Jidosha Kabushiki Kaisha | Functional peptides having antimicrobial activity against phytopathogenic microorganisms |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20110131679A2 (en) * | 2000-04-19 | 2011-06-02 | Thomas La Rosa | Rice Nucleic Acid Molecules and Other Molecules Associated with Plants and Uses Thereof for Plant Improvement |
AU2002341541A1 (en) * | 2001-06-22 | 2003-03-03 | Syngenta Participations Ag | Abiotic stress responsive polynucleotides and polypeptides |
-
2012
- 2012-06-19 JP JP2012138180A patent/JP5988200B2/ja active Active
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2020184468A1 (en) | 2019-03-08 | 2020-09-17 | Toyota Jidosha Kabushiki Kaisha | Functional peptides having antimicrobial activity against phytopathogenic microorganisms |
WO2020184469A1 (en) | 2019-03-08 | 2020-09-17 | Toyota Jidosha Kabushiki Kaisha | Functional peptides having antimicrobial activity against phytopathogenic microorganisms |
US11952584B2 (en) | 2019-03-08 | 2024-04-09 | Toyota Jidosha Kabushiki Kaisha | Functional peptides having antimicrobial activity against phytopathogenic microorganisms |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2013031431A (ja) | 2013-02-14 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US8686224B2 (en) | Plant defense signal peptides | |
Langen et al. | Transgenic expression of gallerimycin, a novel antifungal insect defensin from the greater wax moth Galleria mellonella, confers resistance to pathogenic fungi in tobacco | |
Nadal et al. | Constitutive expression of transgenes encoding derivatives of the synthetic antimicrobial peptide BP100: impact on rice host plant fitness | |
CA2838523C (en) | Herbicide-resistant protein, encoding gene and use thereof | |
JPH05294995A6 (ja) | 抗菌性反転ペプチド、抗菌性オリゴペプチド及び他の抗菌性組成物、及びそれらの製造法ならびにそれらの使用法 | |
JPH05294995A (ja) | 抗菌性反転ペプチド、抗菌性オリゴペプチド及び他の抗菌性組成物、及びそれらの製造法ならびにそれらの使用法 | |
US20140090103A1 (en) | Methods and compositions for increasing plant disease resistance and yield | |
JP5988200B2 (ja) | 新規なポリペプチド及びその利用 | |
ES2808780T3 (es) | Nuevos péptidos antimicrobianos, sus variantes y usos | |
JP2002530274A (ja) | プロテアーゼ分解に対する安定性の高いペプチド | |
AU2018203072A1 (en) | Geminivirus replication inhibitor | |
Rodrigo Saldanha Gazzaneo et al. | Heterologous expression systems for plant defensin expression: examples of success and pitfalls | |
Chen et al. | Comparison of inducible versus constitutive expression of plectasin on yields and antimicrobial activities in Pichia pastoris | |
CA2378432A1 (en) | Proteins and peptides | |
WO2018016556A1 (ja) | ジェミニウイルス病の防除に有効なペプチドとその利用法 | |
AU2011262991B2 (en) | Gemini virus replication inhibitor | |
JP6396330B2 (ja) | 植物病原性真菌に対するポリペプチド | |
ES2809798T3 (es) | Nuevos péptidos antimicrobianos, sus variantes y usos | |
EP4340619A1 (en) | Modified antimicrobial peptides | |
Feiler | Novel aspects of receptor protein RLP30-mediated detection of Sclerotinia and Pseudomonas patterns | |
CN117956903A (zh) | 经修饰的抗微生物肽 | |
Zhang et al. | A nine amino acid peptide of Verticillium dahliae effector Ave1 is required but not sufficient for recognition by tomato immune receptor Ve1 | |
Nadal i Matamala et al. | Constitutive expression of transgenes encoding derivatives of the synthetic antimicrobial peptide BP100: impact on rice host plant fitness | |
JP2007020462A (ja) | 根粒の形成開始に関与する遺伝子とその利用 | |
MXPA01004316A (en) | Peptides with enhanced stability to protease degradation |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20150511 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20160405 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20160601 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20160719 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20160729 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5988200 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |