JP5933032B2 - クロマトグラフィーピークを処理しグループ化するシステム及び方法 - Google Patents
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Description
[0009]本方法は、液体型及びガス型を含むあらゆる型式のクロマトグラフィーシステムに使用することができるものと理解されたい。或る実施形では、データは、質量分析計と関連付けられているデータ捕捉システムによって、解析向けに供給される。本開示の記載上、データ捕捉は、米国特許第7,501,621号、米国特許第7,825,373号、米国特許第7,884,319号に示されているシステムとされ得るものと理解されたい。
x:ベースピークのクロマトグラフィーピークの列ベクトル、
xi:xのi番目の要素のスカラー、
y:xとの併合を審査するクロマトグラフィーピークの列ベクトル、
yi:yのi番目の要素のスカラー、
ti:i番目の場所の保持時間のスカラー、
m:x及びyの長さのスカラー、
npx:ピークx中のイオン数のスカラー、
npy:ピークy中のイオン数のスカラー、
α:有意レベルのスカラー、
meanpx:ピークxの平均のスカラー、
meanpy:ピークyの平均のスカラー、
σpx:ピークxの標準偏差のスカラー、
σpy:ピークyの標準偏差のスカラー、
spx:ピークxの標準偏差の推定のスカラー、
spy:ピークyの標準偏差の推定のスカラー、
rxy:ベクトルxとベクトルyの相関係数のスカラー、とされている。
[0018]引き続き図2を参照して、第1のピーク(x)の標準偏差及び第2のピーク(y)の標準偏差はS220で求められる。これらのピーク標準偏差は、次式、即ち、
[0019]ピーク平均及びピーク標準偏差を求めるには、ここに示されている例以外の他の方法が使用されてもよいものと理解しておきたい。例えば、他にもあろうが中でも、高い強度と概ね滑らかなイオン確率密度関数(PDF)を有している正規(例えばガウス)分布を持つピークの場合、ピーク平均は頂点場所として推定することができ、ピーク標準偏差は信号の半値全幅(FWHM)と関係付けることができる。但し、頂点/FWHM関連付けは、低強度ピークの場合には、ピーク平均と頂点場所の間でバイアスが大きくなり得ることから、適用可能でないことも理解しておきたい。代わりに、頂点と平均の間、また同じくFWHMと標準偏差の間、のバイアスを最小限にするために、様々な平滑化を適用することができよう。
[0022]或る実施形では、S128で、t統計量を広げるために信頼区間が使用されるが、そのうちで次式、即ち、
[0023]S132で、
[0026]或る実施形では、S168で、値を広げるために信頼区間が使用されるが、そのうちで次式、即ち、
[0027]S172で、
を含んでいよう。
[0029]或る実施形では、表は、以下の様なF統計量に対する特異値分解、即ち、
[0030]従って、分解された表は、百万(1,000,000)個ではなしに六千(6,000)個の値を有することになり、それにより、メモリ所要量を削減でき、また上の式によってFtableX及びFtableY、追加的にFtable(i,j)を再構築すればよいだけなので計算速度を上げられる。
[0032]ここに記載されているシステム及び技法の様々な実施形は、デジタル電子回路構成、集積回路構成、特別に設計されたASIC(特定用途向け集積回路)、コンピュータハードウェア、ファームウェア、ソフトウェア、及び/又はそれらの組合せ、に実施することができるものと理解されたい。これらの様々な実施形は、専用又は汎用であって、データ及び命令をストレージシステム、少なくとも1つの入力デバイス、及び少なくとも1つの出力デバイスから受信するように、及びデータ及び命令をストレージシステム、少なくとも1つの入力デバイス、及び少なくとも1つの出力デバイスへ送信するように、連結されている少なくとも1つのプロセッサ、を含むプログラム可能なシステム上で実施可能及び/又は翻訳可能である1つ又はそれ以上のコンピュータプログラムでの実施形を含むことができる。
Claims (8)
- クロマトグラフィーシステムでのクロマトグラフィーピークを処理するための方法において、
第1のピークを第2のピークと、それらの間の1つ又はそれ以上の条件に基づいて、比較する段階(S110)と、
前記第1のピーク及び前記第2のピークを、1つ又はそれ以上の条件に基づいて、関係有り又は関係無しの何れかとして分類する段階(S180)と、を備え、
前記比較する段階(S110)が、前記第1のピークの平均保持時間を前記第2のピークの平均保持時間と比較する段階(S120)を備え、
平均保持時間と比較する前記段階(S120)が、
前記第1のピークと前記第2のピークの間のt統計量を求める段階(S124)と、
前記t統計量に関係付けられるt統計量信頼区間を割り当てる段階(S128)と、
前記t統計量信頼区間を既定のt統計量パラメータに対照して比較する段階(S132)と、
前記t統計量信頼区間を既定のt統計量パラメータに対照して比較する前記段階(S132)に基づいて、前記第1のピークと前記第2のピークを関係有り又は関係無しとして特徴付ける段階(S180)と、を備えている、方法。 - 前記比較する段階(S110)は、前記第1のピークの分散を前記第2のピークの分散と比較する段階(S160)をさらに備えている、請求項1に記載のクロマトグラフィーシステムでのクロマトグラフィーピークを処理するための方法。
- 前記第1のピークの分散を前記第2のピークの分散と比較する前記段階(S160)は、
前記第1のピークと前記第2のピークの間のF統計量を求める段階(S164)と、
前記F統計量に関係付けられるF統計量信頼区間を割り当てる段階(S168)と、
前記F統計量信頼区間を既定のF統計量パラメータに対照して比較する段階(S172)と、
前記F統計量信頼区間を既定のF統計量パラメータに対照して比較する前記段階(S172)に基づいて、前記第1のピークと前記第2のピークを関係有り又は関係無しとして特徴付ける段階(S180)と、を備えている、請求項2に記載のクロマトグラフィーシステムでのクロマトグラフィーピークを処理するための方法。 - クロマトグラフィーシステムでのクロマトグラフィーピークを処理するための方法において、
第1のピークを第2のピークと、それらの間の1つ又はそれ以上の条件に基づいて、比較する段階(S110)と、
前記第1のピーク及び前記第2のピークを、1つ又はそれ以上の条件に基づいて、関係有り又は関係無しの何れかとして分類する段階(S180)と、を備え、
前記比較する段階(S110)が、前記第1のピークの分散を前記第2のピークの分散と比較する段階(S160)を備え、
前記第1のピークの分散を前記第2のピークの分散と比較する前記段階(S160)が、
前記第1のピークと前記第2のピークの間のF統計量を求める段階(S164)と、
前記F統計量に関係付けられるF統計量信頼区間を割り当てる段階(S168)と、
前記F統計量信頼区間を既定のF統計量パラメータに対照して比較する段階(S172)と、
前記F統計量信頼区間を既定のF統計量パラメータに対照して比較する前記段階(S172)に基づいて、前記第1のピークと前記第2のピークを関係有り又は関係無しとして特徴付ける段階(S180)と、を備えている、方法。 - 前記クロマトグラフィーシステムはF統計量ルックアップ表を有するメモリ含んでおり、F統計量を求める前記段階は、前記ルックアップ表上の前記F統計量をルックアップする段階を含んでいる、請求項3に記載のクロマトグラフィーシステムでのクロマトグラフィーピークを処理するための方法。
- 前記F統計量ルックアップ表は、特異値分解を用いて計算され前記システムのメモリ内に記憶されている既定のF統計量値を含んでいる、請求項5に記載のクロマトグラフィーシステムでのクロマトグラフィーピークを処理するための方法。
- 前記クロマトグラフィーシステムはF統計量ルックアップ表を有するメモリを含んでおり、F統計量を求める前記段階は、前記ルックアップ表上の前記F統計量をルックアップする段階を含んでいる、請求項4に記載のクロマトグラフィーシステムでのクロマトグラフィーピークを処理するための方法。
- 前記F統計量ルックアップ表は、特異値分解を用いて計算され前記システムのメモリ内に記憶されている既定のF統計量値を含んでいる、請求項7に記載のクロマトグラフィーシステムでのクロマトグラフィーピークを処理するための方法。
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