JP5893623B2 - データ・セットにおける異常検出方法およびシステム - Google Patents
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Description
本発明の実施形態は、本明細書においてゼータ距離スコアと呼ぶデータ・セットの間の距離の正規化測度を利用するデータ処理技法に関する。特に、本発明の実施形態は、テスト・データ・セット内の異常なデータを、「正常」データを表す1つまたは複数の標準データ・セットに対して比較することにより自動的に検出することができることに関し、すなわち、データは、予測された正常範囲内にある値を有している。異常の1つの測度は、ガンマ(γ)と呼ばれることが多い、テスト・データ点とそれに最も類似する対応する複数の標準データ点、すなわちその最近傍との間の平均距離または差である。しかしながら、後に詳細に説明するように、より広い範囲に広がるセットに対して、そのセットにおけるデータ点の非常に多くが異常であるとみなされる可能性があるという点で、ガンマの使用には複数の欠点があり、そうした使用は、データ点の特定のセットが広がる値の密度または範囲に特に影響されやすい。
経験的データは、1つまたは複数の特徴からなるケースの形態をとることが多い。ケースはデータのインスタンスであり、その特徴はそれを定義する変数である。最も単純なケースは、単一の変数のみ、例えば棒の長さ、球の重量または表面の均一な明るさを有している。より複雑なデータ・セットは、複数の変数、例えばデジタル写真、ボリュメトリック磁気鏡面撮像または地理的表面温度測定値を有している。例えば、デジタル写真では、各画像の各ピクセルは、その特定のケースの特徴であり、ボリュメトリック・データの場合、各ボリューム要素(略してボクセル)が特徴である。ここで、本明細書では、特徴、変数または次元を同義に用いて、個々のケースを構成する1つまたはいくつかの態様を示す。
ζ異常検出の適用に対する前提条件は「標準」データ・セットであり、すなわち、異常の概念は、ある種の標準母集団に関してのみ適用可能であることが分かった。標準データ・セットの最適な特性は、用途によって異なり、それは、データの性質および検出したい異常によって決まる。
画像データにおける異常のセグメンテーションに適用可能な本発明の第1の全体的な実施形態を図3〜図7に示し、次に説明する。
ゼータ距離スコア=テスト・ピクセルから対応する最近傍標的ピクセルまでの平均距離−最近傍標的ピクセル間の平均距離
すなわち、
第1の実施形態で説明したように、高次元データ・セットに対してゼータ異常検出を適用することができる。本実施形態では、局所的に損傷した人の脳の画像の特定および特徴付けに対するゼータ異常検出の適用について説明する。ここでは、生データは、各患者の脳の各位置における信号強度を記録する実数値(ボクセル)の3次元マトリックスの形態をとる。ここでは、異常であるか検査したい1つまたは複数のテスト画像と、異常が判断されるための標準としての役割を果たす一連の正常画像とがある。各患者に対して1つまたは複数のボリューム画像がある可能性があり、各画像は異なる磁気共鳴撮像(MRI)シーケンスを使用し、したがって、撮像されている組織の異なる特徴を取り込んでいる。こうしたデータは、概して、2種類の前処理を必要とし、すなわち、第1の前処理、すなわち、画像データが非絶対値であるために、各画像の値のセンタリングおよび再スケーリングと、第2の前処理、すなわち患者の脳が互いに異なるため、脳の対応する特徴を患者群にわたって比較することができるようにする画像の重ね合せとである。これらのステップに続き、各ボクセルに対して独立してゼータ計算が実行され(マス単変量手法)、その場合、各データ点は、各ボクセルにおける信号のスカラー値であるか、または(患者毎に複数の画像が使用される場合)値のベクトルであり、結果としての距離はユークリッドまたは他の何らかの距離測度である。いずれの場合も、計算の結果は、元のものと同じ次元の画像であり、その場合、各ボクセルは、それに対応する脳の領域の信号の異常を反映するゼータ値を有している。望ましい場合、実数画像を二値画像に離散化することができ、その場合、各ボクセルは選択されたゼータ閾値に基づいて異常であるか非異常であるものとしてラベル付けされる。このプロセスについて以下より詳細に概説する。
ゼータ・マップのセットを生成するために、2種類のデータが必要である。すなわち、病変のある脳の標的画像のセット(1つまたは複数の撮像モダリティで)および本来標的セットに類似する特徴を有する病変のない脳の基準画像のセットである。ここでの例では、前者に対して、最近の脳卒中の脳の病変がある19人の患者から得られた拡散重み付き磁気共鳴撮像(DWI)データを使用し、後者に対して、脳卒中の可能性に対して検査されたがそれかまたは他のいかなる局所性脳異常の放射線医学的証拠がない65人の患者からのDWIデータを使用する。
すべての画像が位置合せされると、次に、各病変のある画像に対してボクセル毎にゼータ・マップを計算した。ゼータ・マップの計算は、第1の実施形態に関して上述したものと実質的に同じであるが、本実施形態では、ゼータをあらゆる距離測度に基づかせることができるため、2次元ユークリッド距離を選択し、1つの次元がb1000画像に対して指定されており、別の次元は、4mmFWHM等方性のガウス・カーネルによって平滑化された同じ画像によって指定されている。
本実施形態では、以下の発見的手続きを用いて最適な閾値が見つけられ、この手続きは、第1の実施形態に関して上述した適応的手続きに実質的に類似しており、ゼータ・マップ・セグメンテーション・プログラム3084によって実行することができる。特に、最適な閾値が、点を見つけ、ゼロで開始し、関数を徐々に増分することにより生成され、その関数では、閾値と病変があるものとして特定された脳のボリュームとの間の関係の勾配は、−1500ボクセル・ゼータ−1を超えた。そして、そのレベルで閾値処理によって生成された二値ボリュームは、隣接するボクセルの連結性に基づいてラベル付けされ、その結果、連結されたボクセルのクラスタの集まりがもたらされた。次に、2つの精緻化ステップが実行された。第1に、4未満のボクセルを含むすべてのクラスタがノイズとして破棄された。第2に、病変のある組織によって完全に包囲されている、正常であるとラベル付けされたボクセルが、病変があるものとして再度割り当てられた。明らかに、放射線医学的外観がいかなるものであっても、こうしたボクセルは、脳の残りの部分から完全に切断されている場合、生理学的に重要であり得ない。他の実施形態では、クラスタが削除されるクラスタ・サイズ閾値を、他の値であるように適応させることができることが留意されたい。
本実施形態において異常検出の品質を評価するように、標的画像および基準画像を使用して、19の病変の各々が65の基準脳の各々に「移植された」、1235の人為的に病変が形成された脳の合成データ・セットも生成された。これは、手動セグメンテーションによって定義されるように病変信号を抽出し、それを基準画像の一致する領域に挿入することによって行われた(後を参照)。この方法の要点は、同じ位置において病変のない信号から病変のある信号を識別するアルゴリズムの能力を評価することであった。
本実施形態を評価するために、グランド・トゥルース(ground truth)すなわち標準が必要であり、より適切なものがなければ、ここではこれは手動セグメンテーションとして定義される。したがって、各病変は、訓練された臨床医(YM)により、MIPAVの勾配、大きさおよび検出live−wireエッジ検出ツール(BarrettおよびMortensen、1997)を用いて、手動でセグメント化された(http://mipav.cit.nih.gov/index.php)。各画像の正規化バージョンに対して手動セグメンテーションが実行された(後を参照)。
本発明者らは、まず本来の病変データ・セットを検査し、その後、非現実データに進む。
病変および対象が区別できないため、ここでは、手動グランド・トゥルースに対して判断されるように、各ゼータ・セグメンテーションに対して感度値および特異度値の単一のセットがある。これらの値を図11に示し、図11は、各本来の病変に対する感度スコアおよび特異度スコアのプロットを示している。各病変画像に対してゼータ・マップが作成され、離散化バージョンが、手動セグメンテーションによって定義されたグランド・トゥルースに対して比較された。19の本来の病変に対して平均感度(実線)および平均特異度(点線)が優れていることに留意されたい。特に、感度に対する平均値は0.918であり、特異度に対する平均値は0.993であり、病変の空間的特性および信号特性の実質的な差にも関らず、それら病変にわたる変動は非常に適度であった。恐らくは最も重要なことには、あらゆる画像のこれらのパラメータに対する最小値(感度=0.78および特異度=0.96)が著しく高く、性能の優れた一貫性を論証した。
本明細書における非現実病変は、各ドナー病変の非現実画像(chimera)にわたってデータを比較するか、または各レシピエント・ボリュームの非現実画像にわたってデータを比較するかに応じて、対象毎の解析と同様に病変毎の解析を可能にする。
第1の実施形態および第2の実施形態では、第2の実施形態ではMRIに対する適用例により、高次データの自動の監視なし異常検出の方法について説明した。DWIの関連における手動セグメンテーションに対するその方法の忠実度は、対象および病変パラメータの範囲にわたって優れた性能を示した。
Claims (22)
- テスト・データ・セットにおいて異常データを特定する装置の作動方法であって、
複数の標準データ・ケースの1つまたは複数の標準データ・セットを格納するステップであって、各前記標準データ・ケースが正常な非異常データを表す1つまたは複数の標準データ点を含む、ステップと、
前記テスト・データ・セットにおける1つまたは複数のテスト・データ点と、複数の前記標準データ・ケースのうちの少なくとも2つにおける最近傍の対応する標準データ点のうちの1つまたは複数との間の第1の平均距離測度を計算するステップと、
複数の前記標準データ・ケースのうちの少なくとも2つにおける前記最近傍の対応する標準データ点の間の第2の平均距離測度を確定するステップと、
少なくとも前記第1の平均距離測度および前記第2の平均距離測度に応じて、1つまたは複数の前記テスト・データ点に関連する正規化距離測度を計算するステップと、
前記テスト・データ点に対する計算された前記正規化距離測度の値に応じて、テスト・データ点を異常であるものとして特定するステップと
を含み、
各前記標準データ・ケースは、前記標準データ点として複数の標準ピクセルまたはボクセルを含む標準画像であり、
前記テスト・データ・セットは、前記テスト・データ点として複数のテスト・ピクセルまたはボクセルを含むテスト画像である、方法。 - 複数の前記テスト・ピクセルまたはボクセルに関する複数の正規化距離測度が計算され、複数の前記正規化距離測度が、前記テスト画像に対応する正規化距離測度マップとして格納される、請求項1に記載の方法。
- 前記画像が、磁気共鳴撮像法(MRI)、コンピュータ断層撮影(CT)、超音波またはX線のうちの少なくとも1つを介して得られる医用画像である、請求項1または2に記載の方法。
- 前記テスト画像が、1つまたは複数の病理学的病変を含む可能性がある脳のMRI画像であり、前記標準画像が、いかなる局所性病変もない正常な脳の対応するMRI画像である、請求項3に記載の方法。
- 前記テスト・データ点を異常であるものとして特定するステップが、閾値に基づくセグメンテーション操作である、請求項1〜4のいずれか1項に記載の方法。
- 前記閾値が適応的閾値であり、前記適応的閾値が、前記適応的閾値が変化する際に異常であるものとして特定されるテスト・データ点の数の所定の変化率に応じて確定される、請求項5に記載の方法。
- セグメント化されたテスト・データ点をクラスタ化するようにクラスタリング操作を実行し、異常なセグメンテーションから、所定数未満の数のデータ点を含むクラスタ化されたテスト・データ点を除去するステップをさらに含む、請求項5または6に記載の方法。
- nおよびxが2以上である場合に、x個の対応する標準データ・ケースのn個のセットがあり、前記第1の平均距離測度が、各々が前記テスト・データ点からn個の対応する標準データ点までのx個のn次元距離測度の平均である、請求項1〜7のいずれか1項に記載の方法。
- 前記n次元距離測度がユークリッド距離である、請求項8に記載の方法。
- 各標準データ・ケースが第1の画像および第2の画像を含み、前記第2の画像が前記第1の画像の処理されたバージョンであり、前記テスト・データ・セットもまた2つのテスト画像を含み、テスト画像が、テスト・データ点としてテスト・ピクセルまたはボクセルを有し、前記第1の平均距離測度が、テスト画像の各対におけるそれぞれのテスト・ピクセルと前記標準の画像のセットにおけるそれぞれの対応する標準ピクセルとの間で取得される一連の2次元距離測度の平均である、請求項8または9に記載の方法。
- 前記テスト・データ・セットの前記テスト・データ点と、複数の前記標準データ・ケースの1つまたは複数のセットにおけるそれぞれの対応する前記標準データ点との間の対応関係を確立するステップをさらに含む、請求項1〜10のいずれか1項に記載の方法。
- 前記対応関係を確立するステップが、前記テスト・データ・セットおよび前記標準データ・セットとしての画像データに対し、前記テスト画像を前記標準画像と重ね合せるように位置合せすることを含む、請求項11に記載の方法。
- 前記正規化距離測度が、前記第1の平均距離測度および前記第2の平均距離測度の差として計算される、請求項1〜12のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第1の平均距離測度が、前記テスト・データ点からk1個の最近傍の対応する標準データ点までの平均距離であり、前記第2の平均距離測度が、k2個の最近傍の対応する標準データ点の間の平均距離測度であり、k1およびk2が異なる、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
- 前記標準データ点および前記テスト・データ点がn次元を含み、nが1より大きく、前記n次元が、i)複数の集合したデータ点、ii)複数の空間ベクトル値、またはiii)データ点が対応する異なるタイプの同じ特徴の複数の表現のうちの1つを含む、請求項1〜14のいずれか1項に記載の方法。
- 前記異なるタイプの同じ特徴の複数の表現が、前記同じ特徴のそれぞれの複数の画像から得られるマルチスペクトル画像データ点である、請求項15に記載の方法。
- 少なくとも1つのプロセッサと、
コンピュータ・プログラム・コードを含む少なくとも1つのメモリと
を具備し、
少なくとも1つの前記メモリおよび前記コンピュータ・プログラム・コードが、少なくとも1つの前記プロセッサにより、当該装置に対し少なくとも
複数の標準データ・ケースの1つまたは複数の標準データ・セットを提供することであって、各前記標準データ・ケースが正常の非異常データを表す1つまたは複数の標準データ点を含み、
テスト・データ・セットにおける1つまたは複数のテスト・データ点と、前記標準データ・セットにおける複数の前記標準データ・ケースのうちの少なくとも2つにおける1つまたは複数の対応する最近傍の標準データ点との間の第1の平均距離測度を計算することと、
前記標準データ・セットにおける複数の前記標準データ・ケースのうちの少なくとも2つにおける前記最近傍の対応する標準データ点の間の第2の平均距離測度を確定することと、
少なくとも前記第1の平均距離測度および前記第2の平均距離測度に応じて、1つまたは複数の前記テスト・データ点に関連する正規化距離測度を計算することと、
前記テスト・データ点に対する計算された前記正規化距離測度の値に応じて、テスト・データ点を異常であるものとして特定することと
を実行させ、
各前記標準データ・ケースは、前記標準データ点として複数の標準ピクセルまたはボクセルを含む標準画像であり、
前記テスト・データ・セットは、前記テスト・データ点として複数のテスト・ピクセルまたはボクセルを含むテスト画像である、装置。 - 複数の標準データ・ケースの1つまたは複数の標準データ・セットを提供する手段であって、各標準データ・ケースが正常の非異常データを表す1つまたは複数の標準データ点を含む、手段と、
テスト・データ・セットにおける1つまたは複数のテスト・データ点と、前記標準データ・セットにおける複数の前記標準データ・ケースのうちの少なくとも2つにおける1つまたは複数の対応する最近傍の標準データ点との間の第1の平均距離測度を計算する手段と、
前記標準データ・セットにおける複数の前記標準データ・ケースのうちの少なくとも2つにおける最近傍の対応する標準データ点の間の第2の平均距離測度を確定する手段と、
少なくとも前記第1の平均距離測度および前記第2の平均距離測度に応じて、1つまたは複数の前記テスト・データ点に関連する正規化距離測度を計算する手段と、
前記テスト・データ点に対する計算された前記正規化距離測度の値に応じて、テスト・データ点を異常であるものとして特定する手段と
を具備し、
各前記標準データ・ケースは、前記標準データ点として複数の標準ピクセルまたはボクセルを含む標準画像であり、
前記テスト・データ・セットは、前記テスト・データ点として複数のテスト・ピクセルまたはボクセルを含むテスト画像である、装置。 - 異常を特定するように構成されたシステムであって、
使用時に、異常があるか解析すべきテスト・データが受け取られる入力と、
正常データ値を表す複数の標準データ・セットを格納することができるデータ・メモリと、
前記テスト・データに対し、前記テスト・データおよび前記標準データの対応する部分の間の距離と、前記対応する標準データの間の距離との差を表す正規化距離測度を計算するように構成されたデータ・プロセッサと、
前記正規化距離測度の1つまたは複数の閾値との比較により異常なテスト・データを特定するように構成されたデータ・セグメント化器と
を具備し、
前記テスト・データは、複数のテスト・ピクセルまたはボクセルを含むテスト画像であり、
前記標準データ・セットは、複数の標準ピクセルまたはボクセルを含む標準画像である、システム。 - テスト・データにおける異常を特定する装置の作動方法であって、
異常があるか解析すべきテスト・データを受け取るステップと、
正常データ値を表す複数の標準データ・セットを提供するステップと、
前記テスト・データに対し、前記テスト・データおよび前記標準データの対応する部分の間の距離と、前記対応する標準データ内の最近傍の間の距離との差を表す正規化距離測度を計算するステップと、
前記正規化距離測度の1つまたは複数の閾値との比較により異常なテスト・データをセグメント化するステップと
を含み、
前記テスト・データは、複数のテスト・ピクセルまたはボクセルを含むテスト画像であり、
前記標準データ・セットは、複数の標準ピクセルまたはボクセルを含む標準画像である、方法。 - コンピュータによって実行されると、前記コンピュータに対し、請求項1〜16または20のいずれか1項に記載の方法に従って動作させるように構成された、コンピュータ・プログラムまたは1組のコンピュータ・プログラム。
- 請求項21に記載のコンピュータ・プログラムまたは1組のコンピュータ・プログラムのうちの少なくとも1つを格納するコンピュータ可読記憶媒体。
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