JP5700592B2 - Primer and specific animal detection method - Google Patents

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茂 仲野
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  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Description

本発明は、アレルギーを引き起こす恐れのある特定の植物中のゴマ、メロン及び特定の
動物中のまぐろ、ぶり、あじ、たら、たこ、ほたてがいを検出対象とし、当該特定植物、
特定動物が食品原料や製品等に含まれていた場合に、その量が微量であっても高感度で検
出することを可能とする特定植物の検出方法、並びにその方法に使用するPCRプライマー
、プライマーセット、及びキットに関するものである。
The present invention is intended to detect sesame, melon in specific plants that may cause allergies, and tuna, yellowtail, horse mackerel, octopus, scallops in specific animals,
When a specific animal is contained in a food material or product, the detection method of a specific plant that enables detection with high sensitivity even if the amount is very small, and PCR primers and primers used in the method It relates to sets and kits.

特定の食物アレルギー疾患を持つ人の健康危害の発生を防止する観点から、食物アレル
ギーを引き起こすことが明らかになった食品のうち、特に発症数、重篤度から勘案して表
示する必要性の高い小麦、そば、卵、乳、及び落花生の5品目は省令により「特定原材料
」と定められ、過去に一定の頻度で重篤な健康危害が見られたアワビ、イカ、エビ、カニ
、サケ、サバ、鶏肉、豚肉、いくら、牛肉、ゼラチン、オレンジ、キウイフルーツ、くる
み、大豆、まつたけ、もも、やまいも、りんごの19品目は通知により「特定原材料に準ず
るもの」と定められた(厚生労働省医薬局食品保健部長通知、食品衛生法施行規則及び乳
及び乳製品の成分規格等に関する省令の一部を改正する省令等の施行について、平成13年
3月15日、食発第79号)。「特定原材料」を含む加工食品については、当該食品を含む旨
を商品に表示することが義務付けられ、「特定原材料に準ずるもの」を含む加工食品につ
いては、当該食品を含む旨を可能な限り表示するよう努めることが推奨された。その後の
食物アレルギーの実態及びアレルギー誘発物質の解明に関する研究成果を基に、アレルギ
ー食品制度は適宜見直しが行われており、平成16年12月にバナナが「特定原材料に準ずる
もの」に、平成20年6月に症例数が多く重篤な症状を引き起こすえび及びかにが「特定原
材料」に追加され、「特定原材料」が7品目、「特定原材料に準ずるもの」が18品目とな
った(食品衛生法施行規則及び乳及び乳製品の成分規格等に関する省令の一部を改正する
省令等の施行について、平成13年3月15日、食発第79号、改正 平成16年12月24日、食安発
第1224002号)(食品衛生法施行規則の一部を改正する省令の施行について、平成20年6月3
日、食安発第0603001号)。
From the viewpoint of preventing the occurrence of health hazards for people with certain food allergic diseases, it is highly necessary to display foods that have been shown to cause food allergies, especially considering the number of cases and severity Wheat, buckwheat, egg, milk, and peanuts are designated as “special ingredients” by the Ministerial Ordinance, and abalone, squid, shrimp, crab, salmon, mackerel, which have been seen to have serious health hazards at a certain frequency in the past. , Chicken, pork, how much, beef, gelatin, orange, kiwi fruit, walnuts, soybeans, matsutake, peach, yam, apples were defined as "according to specific raw materials" by notification (Ministry of Health, Labor and Welfare) Regarding the enforcement of ministerial ordinances, etc. that amend some of the ministerial ordinances regarding the notification of the Director of Food Health, the Food Sanitation Law Enforcement Regulations, and the standards for ingredients of milk and dairy products, etc.
March 15th, food departure No. 79). For processed foods containing “specified raw materials”, it is required to indicate that the food is included in the product, and for processed foods containing “specified raw materials”, indicate that the food is included as much as possible. It was recommended that efforts be made. The allergic food system has been reviewed as appropriate based on research on the actual state of food allergies and the elucidation of allergy-inducing substances since then. In December 2004, bananas were classified as “according to specified raw materials”. In June 2014, shrimp and crab that cause serious symptoms with a large number of cases were added to “Specified raw materials”, and “Specified raw materials” became 7 items and “Same as specified raw materials” became 18 items (Food Regarding the enforcement of ministerial ordinances to amend some of the ministerial ordinances regarding the hygiene law enforcement regulations and the ingredient standards for milk and dairy products, etc., March 15, 2001, Eisei No. 79, revised December 24, 2004 No. 1224002) (Regarding the enforcement of the ministerial ordinance to revise a part of the Food Sanitation Law Enforcement Regulations, June 3, 2008
Sun, food safety departure No. 0603001).

食物アレルギー原因食物は時代の変遷に伴い変化していくという観点から約3年ごとに
行われている全国即時型食物アレルギーモニタリング調査によると、「特定原材料」、「
特定原材料に準ずるもの」以外では、ゴマ、メロン、まぐろ、ぶり、あじ、たら、たこ、
ほたてがいが原因食物となった症例数、アナフィキラシーショック症例数が多いことが判
明している(平成19年3月食品の表示に関する共同会議)。調査年度によっては、これらの
食物が原因食物となった症例数は、「特定原材料に準ずるもの」に含まれるりんごの症例
数と同等以上であるため、これらの食物が適宜行われるアレルギー食品制度の見直しによ
り、「特定原材料に準ずるもの」に追加される可能性は大いにあると考えられる。また、
ゴマはEU、カナダ、オーストラリア及びニュージーランドで、貝類、イカ、タコ等の軟体動物は、EUで当該食品を含む旨を商品に表示することが義務付けられている。
アレルギーを起こす恐れのある食品原料、特にアレルギー原因動植物は、生産、流通、加
工段階での意図しない微量の混入も起こり得るため、食品原料ないし製品の提供者として
は、それらにアレルギー原因動植物が混入されているか否かの品質管理を行うことが重要
となる。
According to a nationwide immediate food allergy monitoring survey conducted every three years from the perspective that food allergy-causing foods change with the changing times, "specific ingredients", "
Other than “same as specified raw materials”, sesame, melon, tuna, burdock, horse mackerel, tara, tako,
It has been found that the number of cases of scallops causing food and the number of anaphylactic shock cases are large (March 2007, Joint Conference on Food Labeling). Depending on the survey year, the number of cases caused by these foods may be equal to or greater than the number of apple cases included in “same as specified raw materials”. It is considered that there is a great possibility that it will be added to “same as specified raw materials” by the review. Also,
Sesame is required in EU, Canada, Australia and New Zealand, and molluscs such as shellfish, squid and octopus are required to be labeled on the product as containing the food in the EU.
Food ingredients that may cause allergies, especially allergen-causing animals and plants, can be mixed in unintended traces in the production, distribution, and processing stages. It is important to perform quality control of whether or not

「特定原材料」である小麦、そば、卵、乳、落花生、えび及びかにの検出法としては、
ELISA法、ウェスタンブロッド法あるいはPCR法を用いた方法が確立されており、えび及び
かにのPCR法以外の当該検出法は、検査キットとして商用的に入手、利用可能となってい
る(厚生労働省医薬局食品保健部長通知、アレルギー物質を含む食品の検査方法について
、平成14年11月06日、食発第1106001号、改正 平成21年1月22日、食安発第0122001号)。
「特定原材料に準ずるもの」に対する検出法は、鶏肉、豚肉、牛肉(特開2003-230383号
、牛、豚、鶏検出用プライマー)、アワビ、イカ、サケ、サバ(特開2003-230383号、プ
ライマー及び特定動物の検出方法)、キウイフルーツ、くるみ、大豆、やまいも、りんご
及びバナナ(特開2006-333729号、プライマー及び特定植物の検出方法)は、PCR法を用いた検出方法が確立されていて、検査キットとして商用的に入手、利用可能となっている。
また、検査キットとして商用的に入手、利用可能には至っていないが、ゼラチンはELISA
法による検出法(土井啓利ら:第94回日本食品衛生学会学術講演会講演要旨集,2007)が、
モモはPCR法による検出法(渡辺聡ら:第95回日本食品衛生学会学術講演会講演要旨集,200
8)が、報告されている。しかし、「特定原材料に準ずるもの」に追加される可能性は大い
にあると考えられる食物アレルギー原因食物の、ゴマ、メロン、まぐろ、ぶり、あじ、た
ら、たこ、ほたてがいの検出法については、現在まで明確な報告はない。従って、これら
の検出法が定かでない食物アレルギー原因食物に相当する特定動植物の混入の有無に関し
て、科学的な検証をもって品質管理を行うことは、現在、困難な状況にある。
As detection methods for wheat, buckwheat, egg, milk, peanuts, shrimp and crab, which are “specific raw materials”
Methods using ELISA, Western blot, or PCR have been established, and the detection methods other than shrimp and crab PCR are commercially available and available as test kits (Ministry of Health, Labor and Welfare) Notification of the Director-General of Food Health Department, Pharmacy Department, Food Inspection Methods with Allergic Substances, November 06, 2002, Diet No. 1106001, Revised January 22, 2009, Food Safety No. 0122001).
Detection methods for “same as specified raw materials” are chicken, pork, beef (JP 2003-230383, primer for detection of beef, pork, chicken), abalone, squid, salmon, mackerel (JP 2003-230383, Detection methods using primers and specific animals), kiwifruit, walnuts, soybeans, sweet potatoes, apples and bananas (Japanese Patent Laid-Open No. 2006-333729, detection methods for primers and specific plants) have been established using the PCR method. It is commercially available and available as a test kit.
Although it is not commercially available and available as a test kit, gelatin is an ELISA.
Detection method by the method (Keito Doi et al .: Abstracts of the 94th Annual Meeting of the Japanese Society for Food Hygiene, 2007)
Momo is a detection method by PCR (Watanabe S. et al .: Proceedings of the 95th Annual Meeting of the Japan Society for Food Hygiene, 200
8) has been reported. However, the detection method of sesame, melon, tuna, burdock, horse mackerel, octopus and scallops of foods that cause food allergies, which are considered to have great potential to be added to `` something similar to specified raw materials '', is currently There is no clear report. Therefore, it is currently difficult to perform quality control with scientific verification regarding the presence or absence of specific animals and plants corresponding to food allergy causing foods for which these detection methods are unclear.

様々な加工処理工程を経た食品原料や製品中から検出対象生物を検出する場合、「特定
原材料」の検査法で確立されているように、検出対象生物に特徴的な蛋白質を検出する方
法(ELISA法やウェスタンブロッド法)や検出対象生物に特徴的なDNA塩基配列を検出する方法(PCR法)が有望な手法となる(厚生労働省医薬局食品保健部長通知、アレルギー物質を含む食品の検査方法について、平成14年11月06日、食発第1106001号、改正 平成21年1月22日、食安発第0122001号)。一般に、蛋白質は、DNAと比べて、食品製造工程における様々な加工処理に対する安定性が低いため、蛋白質を検出する方法は、高度に加工された被験食品に対しては適用できない可能性が高い。それ故に、蛋白質よりも加工処理に比較的強いとされるDNAの塩基配列を標的とした検出方法は、様々な加工処理工程を経た食品原料や製品中から検出対象生物の混入の有無を調べる手法として、有望な方法と考えられる。また、動植物のDNA塩基配列には、rRNA遺伝子クラスターのようにコピー数の多い塩基配列が存在し、このような多コピー数の塩基配列を標的配列に使用できれば、検出法の感度を高めることも可能となる。さらに、細胞中に複数存在するクロロプラスト由来DNAあるいはミトコンドリア由来DNAの塩基配列を標的配列とする場合も、同様に検出法の感度の向上化に寄与する。
When detecting target organisms from food ingredients and products that have undergone various processing steps, a method that detects proteins characteristic of the target organisms (ELISA), as established by the “specific raw material” testing method Method and Western blot method) and methods that detect DNA base sequences that are characteristic of the organism to be detected (PCR method) are promising methods. , November 6, 2002, food departure No. 1106001, amended January 22, 2009, food safety departure No. 0122001). In general, proteins are less stable to various processings in the food production process than DNA, and therefore, the method for detecting proteins is likely not applicable to highly processed test foods. Therefore, the detection method targeting DNA base sequences, which are considered to be relatively stronger in processing than protein, is a method for examining the presence of target organisms in food ingredients and products that have undergone various processing steps. As a promising method. In addition, DNA sequences of animals and plants have base sequences with a large copy number such as rRNA gene clusters. If such a multi-copy base sequence can be used as a target sequence, the sensitivity of the detection method can be increased. It becomes possible. Further, when the base sequence of chloroplast-derived DNA or mitochondrial-derived DNA existing in a plurality of cells is used as a target sequence, it similarly contributes to improvement in sensitivity of the detection method.

遺伝子組換え作物などをPCRで検出する場合、検出対象とするDNA塩基配列は、組換えられたDNA塩基配列に限定される。一方、自然界に存在する動植物の場合、無数にあるDNA塩基配列からどの塩基配列を検出対象に選ぶかという明確な知見はなく、さらには、様々な動植物について、選択した塩基配列の検出対象としての有効性の有無に関する明確な知見は見られない。検出対象とする動植物に特異的な蛋白質を選定し、その蛋白質をコードするDNA塩基配列を検出するための標的とすることも行われているが、この場合、個々の動植物に対して個別に特異的な蛋白質を選定する必要がある。また、このような特異的な蛋白質が選定できたとしても、そのDNA塩基配列のコピー数が少ない場合には、必要な検出感度が得られない場合があり、微量に混入する動植物の検出には、不都合となる。   When a genetically modified crop or the like is detected by PCR, the DNA base sequence to be detected is limited to the recombined DNA base sequence. On the other hand, in the case of animals and plants that exist in nature, there is no clear knowledge as to which base sequence to select as a detection target from a myriad of DNA base sequences. There is no clear knowledge about the effectiveness. Proteins specific to the animals and plants to be detected are selected and targeted to detect the DNA base sequence that encodes the proteins, but in this case, they are specific to each animal and plant. Specific proteins need to be selected. Even if such a specific protein can be selected, the required detection sensitivity may not be obtained if the number of copies of the DNA base sequence is small. It becomes inconvenient.

ゴマを検出する方法としては、ELISA法やPCR法を用いた方法がすでに報告されている。例えば、PCR法を用いた方法(非特許文献1)では、ゴマ2S alubumin遺伝子を増幅するPCRプライマーが用いられている。このゴマ検出PCRプライマーを用いたPCRでは、ゴマDNAが特異的に検出され、アーモンド、ヘーゼルナッツ等のナッツ類DNAは検出されないことが示されているが、ゴマ近縁種の食用植物であるエゴマ、シソDNAが検出されないことの確認は行っていない。また、このPCRプライマーの標的DNAは染色体DNAであり、一般に、その検出感度は、ミトコンドリア由来DNAやクロロプラスト由来DNAを標的としたPCRプライマーよりも低いことが予測される。   As a method for detecting sesame, a method using an ELISA method or a PCR method has already been reported. For example, in a method using the PCR method (Non-Patent Document 1), a PCR primer that amplifies the sesame 2S alubumin gene is used. In PCR using this sesame detection PCR primer, it is shown that sesame DNA is specifically detected and nuts DNA such as almonds and hazelnuts are not detected, but sesame, an edible plant of sesame related species, We have not confirmed that perilla DNA is not detected. Moreover, the target DNA of this PCR primer is chromosomal DNA, and its detection sensitivity is generally expected to be lower than that of PCR primers targeting mitochondrial DNA or chloroplast DNA.

被験試料であるウリ科キュウリ属メロンの分子系統分類を行うために、RAPD(randomlyamplified polymorphic DNA)マーカーを利用した方法(非特許文献2)やAFLP(amplifi
ed fragment length polymorphism)マーカーを利用した方法(非特許文献3)が報告され
ている。これらの方法は、主たる被験試料がメロンあるいは単一種の植物である試料から
抽出したDNAを試料として使用可能であるが、手法の特性上、複数の植物種が混合するよ
うな試料の場合、使用されるPCRプライマーは、他の植物DNAとも反応する可能性が非常に高いために、メロンを特異的に検出することは困難となる。それ故に、複数の植物を含む食品中のメロンDNAを特異的に検出するために、これらの方法を使用することはできない。
In order to classify molecular phylogeny of cucumber genus melon, which is the test sample, a method using a RAPD (randomly amplified polymorphic DNA) marker (Non-patent Document 2) or AFLP (amplifi)
ed fragment length polymorphism) marker (Non-Patent Document 3) has been reported. These methods can use DNA extracted from a sample whose main test sample is a melon or a single species of plant as a sample. However, due to the characteristics of the method, this method is used for samples in which multiple plant species are mixed. Since the PCR primer to be reacted has a high possibility of reacting with other plant DNAs, it is difficult to specifically detect melon. Therefore, these methods cannot be used to specifically detect melon DNA in foods containing multiple plants.

また、マグロ属、カツオ属、スマ属、ソウダガツオ属、Allothunnus属が属するサバ科
マグロ族の魚種を判別するために、ミトコンドリアのチトクロームb遺伝子配列を標的と
したマルチプレックスPCR法を用いた判別法が報告されている(非特許文献4)。この方
法に用いられたPCRプライマーは、被験試料であるマグロ属以外にサバ科マグロ族カツオ
属のカツオDNAも検出するため、マグロ属に属するまぐろ類DNAを特異的に検出するために、この方法を使用することはできない。
In addition, a discrimination method using a multiplex PCR method targeting a cytochrome b gene sequence of mitochondrion in order to discriminate a fish species of the mackerel family Tuna belonging to the genus Tuna, Skipjack, Suma, Soudagatsu, Allothunnus Has been reported (Non-Patent Document 4). The PCR primer used in this method detects not only the tuna genus which is the test sample, but also the bonito DNA of the tuna family Tuna bonito genus. Can not be used.

また、あじ塩干し加工品の魚種を判別するために、ミトコンドリアのND5タンパク遺伝
子配列を標的としたPCR-制限酵素断片長多型法を用いた判別法が報告されている(非特許
文献5)。この方法で使用されているPCRプライマーは、アジ科マアジ属のマアジ及びニシマアジから抽出されたDNAを増幅させることは可能であるが、その他の生物に対する当該PCRプライマーの交差反応性、すなわち、検出特異性の記載は無く、シマアジ、ムロアジ等の他のアジ亜科に属するあじ類DNAを特異的に検出する方法としては、十分に検証された方法ではない。
In addition, in order to discriminate the fish species of processed rainbow trout, a discrimination method using PCR-restriction fragment length polymorphism targeting the mitochondrial ND5 protein gene sequence has been reported (Non-patent Document 5). ). The PCR primers used in this method can amplify DNA extracted from the genus Maji and Nishimaji, but the cross-reactivity of the PCR primer to other organisms, i.e., detection specificity. There is no description of sex, and it is not a well-validated method as a method for specifically detecting hydrangea DNA belonging to other subfamily, such as Shimaji and Muroji.

また、商業的に重要なタラ科3種(スケトウダラ、マダラ、コマイ)の魚種を判別するた
めに、ミトコンドリアのチトクロームb遺伝子配列を標的としたPCR-制限酵素断片長多型法及びマルチプレックスPCR法を用いた判別法が報告されている(非特許文献6)。これらの方法で使用されているPCRプライマーは、タラ科3種(スケトウダラ、マダラ、コマイ)から抽出されたDNAを増幅させることは可能であるが、その他の生物に対する当該PCRプライマーの交差反応性、すなわち、検出特異性の記載は無く、タラ類DNAを特異的に検出する方法としては、十分に検証された方法ではない。
In addition, PCR-restriction fragment length polymorphism method and multiplex PCR targeting the mitochondrial cytochrome b gene sequence to discriminate the fish species of three commercially important codaceae (Spodoptera, Madara, Komai) Discrimination method using the method has been reported (Non-patent Document 6). The PCR primers used in these methods can amplify DNA extracted from three species of Codaceae (Spodoptera, Madara, Komai), but the PCR primer's cross-reactivity to other organisms, That is, there is no description of detection specificity, and the method for specifically detecting cod DNA is not a well-validated method.

また、頭足類(イカやタコの仲間)の種を同定あるいは推定する方法として、ミトコン
ドリアのチトクロームオキシダーゼIII遺伝子配列や同じくチトクロームオキシダーゼII
遺伝子配列を標的としたPCRプライマーによって増幅されたDNA塩基配列を公知の塩基配列と比較する方法も報告されている(非特許文献7)。この方法で使用されているPCRプライマーは、主成分が頭足類である試料から抽出されたDNAを増幅させることは可能であるが、その他の生物に対する当該PCRプライマーの交差反応性、すなわち、検出特異性の記載は無く、さらに、食品のように複数の動植物を含む試料中の頭足類DNAを特異的に検出できるという記載もなされていない。それ故に、複数の動植物を含む食品中の頭足類DNAを特異的に検出する方法としては、十分に検証された方法ではない。
In addition, mitochondrial cytochrome oxidase III gene sequence and cytochrome oxidase II can be used to identify or estimate species of cephalopods (squid and octopus friends).
A method for comparing a DNA base sequence amplified by a PCR primer targeting a gene sequence with a known base sequence has also been reported (Non-patent Document 7). The PCR primer used in this method can amplify DNA extracted from cephalopods as the main component, but the PCR primer's cross-reactivity to other organisms, ie detection. There is no description of specificity, and further, there is no description that cephalopod DNA in a sample containing a plurality of animals and plants such as food can be specifically detected. Therefore, it is not a well-validated method for specifically detecting cephalopod DNA in foods containing a plurality of animals and plants.

また、ホタテガイの分子系統分類を行うために、16SrRNA遺伝子配列を比較分析する方
法が報告されている(特許文献1)。この方法で使用されているPCRプライマーは、主成分がホタテガイである試料から抽出されたDNAを増幅させることは可能であるが、その他の生物に対する当該PCRプライマーの交差反応性、すなわち、検出特異性の記載は無く、さらに、食品のように複数の動植物を含む試料中のほたてがいDNAを特異的に検出できるという記載もなされていない。また、PCR増幅産物が、約1.3kbp及び約1.5kbpと長く、加工食品のようなDNAの断片化が進んだ試料中からほたてがいDNAを検出するには不適であり、複数の動植物を含む食品中のほたてがいDNAを特異的に検出する方法としては、十分に検証された方法ではない。
In addition, a method for comparative analysis of 16S rRNA gene sequences has been reported in order to perform molecular phylogeny classification of scallops (Patent Document 1). The PCR primer used in this method can amplify DNA extracted from a sample whose main component is scallop, but the PCR primer's cross-reactivity to other organisms, that is, detection specificity. Further, there is no description that scallop DNA can be specifically detected in a sample containing a plurality of animals and plants such as food. In addition, PCR amplification products are long, about 1.3 kbp and about 1.5 kbp, and are unsuitable for detecting scalloped DNA in samples such as processed foods that have undergone DNA fragmentation. The method for specifically detecting scallop DNA in the inside is not a well-validated method.

対象とする特定動植物の食品原料や製品中への混入の有無は、当該動植物に特異的な遺
伝子配列が食品原料や製品中から検出されるか否かを調べることによって、検査できる。
但し、その検査法は、目的とする植物に由来するDNAを検出できるが、食品原料や製品を
構成する複数の目的としない動植物由来DNAを検出しないような方法であることが強く望
まれる。
The presence or absence of the target specific animal or plant in the food material or product can be examined by examining whether a gene sequence specific to the animal or plant is detected in the food material or product.
However, the test method can detect DNA derived from the target plant, but it is strongly desired that the method does not detect a plurality of non-target animal and plant-derived DNAs constituting food ingredients and products.

上述したように、食物アレルギー原因食物であり、「特定原材料に準ずるもの」に追加
される可能性が大いにあると考えられる食物アレルギー原因食物の、ゴマ、メロン、まぐ
ろ、ブリ、あじ、たら、たこ、ほたてがいに対する明確な検出法は、報告されておらず、
これらの特定動植物が食品原料や製品に混入しているか否かを科学的に検証可能な手法が
、食品の品質管理手法として待望されている。
As mentioned above, sesame, melon, tuna, yellowtail, horse mackerel, tara, octopus are food allergens that are food allergens and are likely to be added to “similar to specific ingredients”. No clear detection method for scallops has been reported,
A method that can scientifically verify whether or not these specific animals and plants are mixed in food ingredients and products is awaited as a quality control method for food.

特開2001-321184、ホタテガイ系統解析方法JP 2001-321184, scallop system analysis method

Brzezinski JL; Detection of sesame seed DNA in foods using r eal-time PCR; Journal of food Protection, 70(4):1333-6, 2007Brzezinski JL; Detection of sesame seed DNA in foods using real-time PCR; Journal of food Protection, 70 (4): 1333-6, 2007 Katsunori T., Atuhi N., Yukari A., Yoshiteru S., Hidetaja N. , Hiromichi Y, and Kenji K; Molecular characterization of South and East Asi an melon,Cucumis melo L., and the origin og Group Conomon var.makuwa and var . conomon revealed by RAPD analysis; Euphytica, 153:233-247, 2007Katsunori T., Atuhi N., Yukari A., Yoshiteru S., Hidetaja N., Hiromichi Y, and Kenji K; Molecular characterization of South and East Asi an melon, Cucumis melo L., and the origin og Group Conomon var. makuwa and var .conomon revealed by RAPD analysis; Euphytica, 153: 233-247, 2007 Kazutoshi Y., Hiroyoshi I., Yukari A., Ken-o T., Maki K., Yo shihiko T., and Kenji K.; Genetic Relationship among East and South Asian Me lon(Cucumis melo L.) Revealed by AFLP Analysis; Breeding Science, 55: 197-20 6, 2005Kazutoshi Y., Hiroyoshi I., Yukari A., Ken-o T., Maki K., Yo shihiko T., and Kenji K .; Genetic Relationship among East and South Asian Me lon (Cucumis melo L.) Revealed by AFLP Analysis; Breeding Science, 55: 197-20 6, 2005 Michelini E., Cevenini L., Mezzanotte L., Simoni P., Baraldi ni M., De L., and Roda A; One-step triplex-polymerase chain reaction aasay f or the authentication of yellowfin(Thunnus albacares),bigeye(Thunnus obseus) ,and skipjack(Katsuwonus pelamis)tuna DNA from fresh,frozen and canned tuna samples.; Journal of agiricultual and food chemistry, 55(19): 7638-47, 2007Michelini E., Cevenini L., Mezzanotte L., Simoni P., Baraldi ni M., De L., and Roda A; One-step triplex-polymerase chain reaction aasay f or the authentication of yellowfin (Thunnus albacares), bigeye (Thunnus obseus), and skipjack (Katsuwonus pelamis) tuna DNA from fresh, frozen and canned tuna samples .; Journal of agiricultual and food chemistry, 55 (19): 7638-47, 2007 Yasuharu T., Takami M., and Michiaki Y; Complete mitochondri al DNA sequence of Atlantic horse mackerel Trachurus trachurus and molecular identification of two commercially importane species T.trachurus and T.japo nicus using PCR-RFLP;FISHERIES SCIENCE, 72:1054-1065, 2006Yasuharu T., Takami M., and Michiaki Y; Complete mitochondri al DNA sequence of Atlantic horse mackerel Trachurus trachurus and molecular identification of two commercially importane species T. trachurus and T. japo nicus using PCR-RFLP; FISHERIES SCIENCE, 72: 1054 -1065, 2006 柳本 卓,北村 徹; mtDNA シトクロームb遺伝子による北海道周辺の タラ科3種の種判別;Nippon Suisan Gakkaihi, 68(6):893-899, 2002Takashi Yanagimoto, Toru Kitamura; mtDNA cytochrome b gene identifies three species of codaceae around Hokkaido; Nippon Suisan Gakkaihi, 68 (6): 893-899, 2002 Bonnaud L., R. Boucher-Rodoni, and M. Monnerot; Phylogeny of cephalopods inferred from mitochondrial DNA sequences; Molecular Phylogenet ics and Evolution, 7: 44-54, 1997Bonnaud L., R. Boucher-Rodoni, and M. Monnerot; Phylogeny of cephalopods inferred from mitochondrial DNA sequences; Molecular Phylogenet ics and Evolution, 7: 44-54, 1997

本発明は、アレルギーを引き起こす恐れのある特定の動植物のうちゴマ、メロン、まぐ
ろ、ぶり、あじ、たら、たこ、ほたてがいを、食品原料や製品中から特異的に検出できる
方法、及びこの方法に用いるPCRプライマー、プライマーセット、キットを提供すること
を、主目的とする。
The present invention relates to a method capable of specifically detecting sesame, melon, tuna, burdock, horse mackerel, octopus, and scallop among specific animals and plants that may cause allergies, and to this method. The main purpose is to provide PCR primers, primer sets and kits to be used.

上記課題を達成するために、本発明者らは、分子生物学的観点から、検出対象とする動
植物及びその他の生物の遺伝子配列における共通性と特異性に着目し、「特定原材料に準
ずるもの」に追加される可能性が大いにあると考えられる食物アレルギー原因食物の、ゴ
マ、メロン、まぐろ、ブリ、あじ、たら、たこ、ほたてがい(本発明において、これらを
「特定動植物」と称する)を高感度に検出することができる方法を鋭意研究した。その結
果、ゴマ、メロン、まぐろ、ぶり、あじ、たら、たこ、あるいはほたてがいの各々に特徴
的な塩基配列を見いだし、これらの塩基配列を利用してPCR法などの核酸分析を行うこと
で、ゴマ、メロン、まぐろ、ブリ、あじ、たら、たこ、あるいはほたてがいを簡便に検出
し得ることを見いだし、更に鋭意検討を重ねて、本発明を完成するに至った。即ち、本発
明は、以下の特定動植物検出用PCRプライマーセット、特定動植物検出法、並びに、特定
動植物検出用キットに関与する。
In order to achieve the above-mentioned problems, the present inventors pay attention to the commonality and specificity in the gene sequences of animals and plants to be detected and other organisms from the viewpoint of molecular biology. Of foods that cause food allergies that are considered to be added to sesame, melon, tuna, yellowtail, horse mackerel, octopus, scallop (in the present invention, these are referred to as `` specific animals and plants ''). The method that can be detected with sensitivity was studied earnestly. As a result, we found a base sequence characteristic of each of sesame, melon, tuna, burdock, horse mackerel, octopus, or scallop, and by performing nucleic acid analysis such as PCR using these base sequences, It has been found that sesame, melon, tuna, yellowtail, horse mackerel, octopus or scallop can be easily detected, and further intensive studies have been made to complete the present invention. That is, the present invention relates to the following PCR primer set for detecting specific animals and plants, a method for detecting specific animals and plants, and a kit for detecting specific animals and plants.

項1. 下記の(1)〜(16)のいずれかのPCRプライマーセット。
(1) 配列表の配列番号1における塩基番号13〜27の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるPCRプライマーと、
配列表の配列番号2における塩基番号7〜21の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基
のDNAからなるPCRプライマー
とからなるPCRプライマーセット。
(2) 配列表の配列番号3における塩基番号9〜23の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基
のDNAからなるPCRプライマーと、
配列表の配列番号4における塩基番号11〜25の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるPCRプライマー
とからなるプライマーセット。
(3) 配列表の配列番号5における塩基番号10〜24の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるPCRプライマーと、
配列表の配列番号6における塩基番号7〜21の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基
のDNAからなるPCRプライマー
とからなるプライマーセット。
(4) 配列表の配列番号7における塩基番号8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基
のDNAからなるPCRプライマーと、
配列表の配列番号8における塩基番号9〜23の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基
のDNAからなるPCRプライマー
とからなるプライマーセット。
(5) 配列表の配列番号9における塩基番号8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基
のDNAからなるPCRプライマーと、
配列表の配列番号10における塩基番号8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるPCRプライマーと、
配列表の配列番号11における塩基番号8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるPCRプライマー
とからなるプライマーセット
(6) 配列表の配列番号12における塩基番号6〜20の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるPCRプライマーと、
配列表の配列番号13における塩基番号4〜18の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるPCRプライマー。
とからなるプライマーセット
(7) 配列表の配列番号14における塩基番号11〜25の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるPCRプライマーと、
配列表の配列番号15における塩基番号8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるPCRプライマー
とからなるプライマーセット
(8) 配列表の配列番号16における塩基番号7〜21の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるPCRプライマーと、
配列表の配列番号17における塩基番号10〜24の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるPCRプライマーと、
配列表の配列番号18における塩基番号10〜24の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるPCRプライマーと、
配列表の配列番号19における塩基番号9〜23の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるPCRプライマー
とからなるプライマーセット
(9) 配列表の配列番号1の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプラ
イマーと、配列表の配列番号2の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーとからなるプライマーセット
(10) 配列表の配列番号3の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプラ
イマーと、配列表の配列番号4の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーとからなるプライマーセット
(11) 配列表の配列番号5の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプラ
イマーと、
配列表の配列番号6の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプラ
イマーとからなるプライマーセット
(12) 配列表の配列番号7の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプラ
イマーと、配列表の配列番号8の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーとからなるプライマーセット
(13) 配列表の配列番号9の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプラ
イマーと、
配列表の配列番号10の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプラ
イマーと、配列表の配列番号11の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーとからなるプライマーセット
(14) 配列表の配列番号12の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプラ
イマーと、配列表の配列番号13の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーとからなるプライマーセット
(15) 配列表の配列番号14の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプラ
イマーと、配列表の配列番号15の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーとからなるプライマーセット
(16) 配列表の配列番号16の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプラ
イマーと、配列表の配列番号17の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーと、配列表の配列番号18の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーと、配列表の配列番号19の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーとからなるプライマーセット
Item 1. The PCR primer set according to any one of (1) to (16) below.
(1) a PCR primer comprising a DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 13 to 27 in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing on the 3 ′ end side;
A PCR primer set consisting of a PCR primer consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 7 to 21 on the 3 ′ end side in SEQ ID NO: 2 in the sequence listing.
(2) a PCR primer consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 9 to 23 on the 3 ′ end side in SEQ ID NO: 3 in the sequence listing;
A primer set consisting of a PCR primer consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 11 to 25 in the sequence listing in the sequence listing on the 3 ′ end side.
(3) a PCR primer consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 10 to 24 in SEQ ID NO: 5 on the 3 ′ end side of the sequence listing;
A primer set consisting of a PCR primer consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 7 to 21 in SEQ ID NO: 6 on the 3 ′ end side of the sequence listing.
(4) a PCR primer consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 8 to 22 on the 3 ′ end side in SEQ ID NO: 7 in the sequence listing;
A primer set consisting of a PCR primer consisting of a maximum of 30 bases of DNA comprising the base sequence of base numbers 9 to 23 in the sequence listing at the 3 ′ end.
(5) a PCR primer consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 8 to 22 on the 3 ′ end side in SEQ ID NO: 9 of the sequence listing;
PCR primers consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 8 to 22 in the sequence listing in SEQ ID NO: 10 on the 3 ′ end side;
Primer set consisting of a PCR primer consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 8 to 22 on the 3 ′ end side in SEQ ID NO: 11 in the sequence listing
(6) a PCR primer consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 6 to 20 on the 3 ′ end side in SEQ ID NO: 12 in the sequence listing;
A PCR primer comprising DNA of 30 nucleotides at the maximum containing the nucleotide sequence of nucleotide numbers 4 to 18 in SEQ ID NO: 13 in the sequence listing on the 3 ′ end side.
Primer set consisting of
(7) a PCR primer comprising a DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 11 to 25 in the sequence listing in SEQ ID NO: 14 on the 3 ′ end side;
Primer set consisting of a PCR primer consisting of a DNA of up to 30 bases containing the base sequence of base numbers 8 to 22 in the sequence listing in the sequence listing on the 3 ′ end side
(8) a PCR primer comprising a DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 7 to 21 in SEQ ID NO: 16 in the sequence listing on the 3 ′ end side;
PCR primers consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 10-24 in SEQ ID NO: 17 of the sequence listing on the 3 ′ end side;
PCR primers consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 10-24 in SEQ ID NO: 18 of the sequence listing on the 3 ′ end side,
Primer set consisting of a PCR primer consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 9 to 23 on the 3 ′ end side in SEQ ID NO: 19 in the sequence listing
(9) A PCR primer consisting of a DNA of up to 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 1 on the 3 ′ end side of the sequence listing, and a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 2 of the sequence listing on the 3 ′ end side Primer set consisting of DNA PCR primers
(10) A PCR primer consisting of a maximum of 30 bases of DNA containing the base sequence of SEQ ID NO: 3 on the 3 ′ end side of the sequence listing and a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 4 of the sequence list on the 3 ′ end side Primer set consisting of DNA PCR primers
(11) a PCR primer comprising a DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 5 in the sequence listing on the 3 ′ end side;
Primer set consisting of a PCR primer consisting of DNA of up to 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 6 on the 3 ′ end side of the sequence listing
(12) A PCR primer composed of a DNA having a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 7 on the 3 ′ end side of the sequence listing, and a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 8 of the sequence listing on the 3 ′ end side Primer set consisting of DNA PCR primers
(13) a PCR primer composed of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 9 in the sequence listing on the 3 ′ end side;
PCR primer consisting of up to 30 bases of DNA containing the base sequence of SEQ ID NO: 10 on the 3 ′ end side of the sequence listing, and DNA of up to 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 11 of the sequence listing on the 3 ′ end side Primer set consisting of PCR primers
(14) A PCR primer consisting of a DNA having a maximum of 30 bases containing the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 12 on the 3 ′ end side of the sequence listing, and a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 13 of the sequence listing on the 3 ′ end side Primer set consisting of DNA PCR primers
(15) A PCR primer consisting of a DNA with a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 14 on the 3 ′ end side of the sequence listing, and a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 15 of the sequence listing on the 3 ′ end side Primer set consisting of DNA PCR primers
(16) A PCR primer consisting of a DNA having a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 16 on the 3 ′ end side of the sequence listing, and a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 17 of the sequence listing on the 3 ′ end side A PCR primer consisting of DNA, a PCR primer consisting of up to 30 bases of DNA containing the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18 in the sequence listing on the 3 ′ end side, and a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19 in the sequence listing on the 3 ′ end side Primer set consisting of PCR primers consisting of up to 30 bases of DNA

項2. 請求項1の(1)に記載のプライマーセット。 Item 2. The primer set according to (1) of claim 1.

項3. 請求項1の(2)に記載のプライマーセット。 Item 3. The primer set according to (2) of claim 1.

項4. 請求項1の(3)に記載のプライマーセット。 Item 4. The primer set according to (1) of claim 1.

項5. 請求項1の(4)に記載のプライマーセット。 Item 5. The primer set according to (1) of claim 1.

項6. 請求項1の(5)に記載のプライマーセット。 Item 6. The primer set according to (5) of claim 1.

項7. 請求項1の(6)に記載のプライマーセット。 Item 7. The primer set according to (1) of claim 1.

項8. 請求項1の(7)に記載のプライマーセット。 Item 8. The primer set according to (7) of claim 1.

項9. 請求項1の(8)に記載のプライマーセット。 Item 9. The primer set according to (1) of claim 1.

項10. 請求項1の(9)に記載のプライマーセット。 Item 10. The primer set according to (9) of claim 1.

項11. 請求項1の(10)に記載のプライマーセット。 Item 11. The primer set according to (10) of claim 1.

項12. 請求項1の(11)に記載のプライマーセット。 Item 12. The primer set according to (11) of claim 1.

項13. 請求項1の(12)に記載のプライマーセット。 Item 13. The primer set according to (12) of claim 1.

項14. 請求項1の(13)に記載のプライマーセット。 Item 14. The primer set according to (13) of claim 1.

項15. 請求項1の(14)に記載のプライマーセット。 Item 15. The primer set according to (14) of claim 1.

項16. 請求項1の(15)に記載のプライマーセット。 Item 16. The primer set according to (15) of claim 1.

項17. 請求項1の(16)に記載のプライマーセット。 Item 17. The primer set according to (16) of claim 1.

項18. 試料からDNAを抽出する工程と、このDNAを鋳型として、請求項2〜15のいずれかに記載のプライマーセットを用いてPCRを行う工程と、増幅されたDNAを検出することにより試料中に特定動物、特定植物が存在しているか否かを検出する工程とを含む特定動物、特定植物の検出方法。 Item 18. A step of extracting DNA from a sample, a step of performing PCR using the primer set according to any one of claims 2 to 15 using the DNA as a template, and a sample by detecting the amplified DNA A method for detecting a specific animal and a specific plant, comprising the step of detecting whether or not the specific animal and the specific plant are present therein.

項19. 試料からDNAを抽出する工程と、このDNAを鋳型として、請求項2又は10記
載のプライマーセットを用いてPCRを行う工程と、増幅されたDNAを検出することにより試料中にゴマが存在しているか否かを検出する工程とを含む特定植物の検出方法。
Item 19. A step of extracting DNA from a sample, a step of performing PCR using the primer set according to claim 2 or 10 using this DNA as a template, and detecting sesame in the sample by detecting the amplified DNA. A method for detecting a specific plant, comprising a step of detecting whether or not the plant exists.

項20. 試料からDNAを抽出する工程と、このDNAを鋳型として、請求項3又は11記
載のプライマーセットを用いてPCRを行う工程と、増幅されたDNAを検出することにより試料中にメロンが存在しているか否かを検出する工程とを含む特定植物の検出方法。
Item 20. A step of extracting DNA from a sample, a step of performing PCR using the primer set according to claim 3 or 11 using this DNA as a template, and melon in the sample by detecting the amplified DNA. A method for detecting a specific plant, comprising a step of detecting whether or not the plant exists.

項21. 試料からDNAを抽出する工程と、このDNAを鋳型として、請求項4又は12記
載のプライマーセットを用いてPCRを行う工程と、増幅されたDNAを検出することにより試料中にまぐろが存在しているか否かを検出する工程とを含む特定動物の検出方法。
Item 21. A step of extracting DNA from a sample, a step of performing PCR using the primer set according to claim 4 or 12 using this DNA as a template, and a tuna in the sample by detecting the amplified DNA A method for detecting a specific animal, comprising the step of detecting whether or not it exists.

項22. 試料からDNAを抽出する工程と、このDNAを鋳型として、請求項5又は13記
載のプライマーセットを用いてPCRを行う工程と、増幅されたDNAを検出することにより試料中にブリが存在しているか否かを検出する工程とを含む特定動物の検出方法。
Item 22. A step of extracting DNA from a sample, a step of performing PCR using the primer set according to claim 5 or 13 using this DNA as a template, and detecting the amplified DNA, A method for detecting a specific animal, comprising the step of detecting whether or not it exists.

項23. 試料からDNAを抽出する工程と、このDNAを鋳型として、請求項6又は14記
載のプライマーセットを用いてPCRを行う工程と、増幅されたDNAを検出することにより試料中にあじが存在しているか否かを検出する工程とを含む特定動物の検出方法。
Item 23. A step of extracting DNA from a sample, a step of performing PCR using the primer set according to claim 6 or 14 using the DNA as a template, and detecting the amplified DNA A method for detecting a specific animal, comprising the step of detecting whether or not it exists.

項24 試料からDNAを抽出する工程と、このDNAを鋳型として、請求項7又は15記
載のプライマーセットを用いてPCRを行う工程と、増幅されたDNAを検出することにより試
料中にたらが存在しているか否かを検出する工程とを含む特定動物の検出方法。
Item 24: A step of extracting DNA from a sample, a step of performing PCR using the primer set according to claim 7 or 15 using the DNA as a template, and presence of tart in the sample by detecting the amplified DNA A method for detecting a specific animal, comprising: detecting whether or not

項25. 試料からDNAを抽出する工程と、このDNAを鋳型として、請求項8又は16記載のプライマーセットを用いてPCRを行う工程と、増幅されたDNAを検出することにより試料中にたこが存在しているか否かを検出する工程とを含む特定動物の検出方法。 Item 25: A step of extracting DNA from a sample, a step of performing PCR using the primer set according to claim 8 or 16 using the DNA as a template, and detecting tuna in the sample by detecting the amplified DNA. A method for detecting a specific animal, comprising the step of detecting whether or not it exists.

項26. 試料からDNAを抽出する工程と、このDNAを鋳型として、請求項9又は17記
載のプライマーセットを用いてPCRを行う工程と、増幅されたDNAを検出することにより試料中にほたてがいが存在しているか否かを検出する工程とを含む特定動物の検出方法。
Item 26. A step of extracting DNA from a sample, a step of performing PCR using the primer set according to claim 9 or 17 using the DNA as a template, and platting in the sample by detecting the amplified DNA And a step of detecting whether or not a specific animal is present.

本発明によれば、PCR等を用いた核酸分析による、精度及び検出感度の高い特定動植物
(ゴマ、メロン、まぐろ、ブリ、あじ、たら、たこ、ほたてがい)由来DNAの検出を可能
とし、被験食品原料や被験食品中に、上記特定動植物が混入しているか否か、又は、使用
されているか否かといった品質管理検査の実施を可能にするという効果を奏する。また、
アレルギーの未然防止、アレルギー症状が生じた際の原因物質の調査等にも寄与する。
According to the present invention, it is possible to detect DNA derived from a specific animal or plant (sesame, melon, tuna, yellowtail, horse mackerel, octopus, scallop) with high accuracy and detection sensitivity by nucleic acid analysis using PCR or the like. There is an effect that it is possible to perform a quality control inspection such as whether or not the specific animal or plant is mixed in the food material or the test food or whether it is used. Also,
It also contributes to prevention of allergies and investigation of causative substances when allergic symptoms occur.

本発明におけるプライマーセットを用いた場合のDNAの検出感度を示した電気泳動後の写真である。(A)配列番号1及び配列番号2を用いたPCRにおけるゴマDNAの検出感度を示した電気泳動後の写真である。(B)配列番号3及び配列番号4を用いたPCRにおけるメロンDNAの検出感度を示した電気泳動後の写真である。(C)配列番号5及び配列番号6を用いたPCRにおけるクロマグロDNAの検出感度を示した電気泳動後の写真である。(D)配列番号7及び配列番号8を用いたPCRにおけるブリDNAの検出感度を示した電気泳動後の写真である。(E)配列番号9、配列番号10及び配列番号11を用いたPCRにおけるマアジDNAの検出感度を示した電気泳動後の写真である。(F)配列番号12及び配列番号13を用いたPCRにおけるマダラDNAの検出感度を示した電気泳動後の写真である。(G)配列番号14及び配列番号15を用いたPCRにおけるマダコDNAの検出感度を示した電気泳動後の写真である。(H)配列番号16、配列番号17、配列番号18及び配列番号19を用いたPCRにおけるホタテガイDNAの検出感度を示した電気泳動後の写真である。It is the photograph after the electrophoresis which showed the detection sensitivity of DNA at the time of using the primer set in this invention. (A) A photograph after electrophoresis showing the detection sensitivity of sesame DNA in PCR using SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2. (B) A photograph after electrophoresis showing the detection sensitivity of melon DNA in PCR using SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 4. (C) A photograph after electrophoresis showing the detection sensitivity of bluefin tuna DNA in PCR using SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6. (D) A photograph after electrophoresis showing the sensitivity of detection of yellowtail DNA in PCR using SEQ ID NO: 7 and SEQ ID NO: 8. (E) A photograph after electrophoresis showing the detection sensitivity of horse mackerel DNA in PCR using SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 and SEQ ID NO: 11. (F) A photograph after electrophoresis showing the detection sensitivity of madara DNA in PCR using SEQ ID NO: 12 and SEQ ID NO: 13. (G) A photograph after electrophoresis showing the detection sensitivity of octopus DNA in PCR using SEQ ID NO: 14 and SEQ ID NO: 15. (H) A photograph after electrophoresis showing the detection sensitivity of scallop DNA in PCR using SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 18 and SEQ ID NO: 19. 本発明におけるプライマーセットを用い、特定動植物含有食品中の特定動植物由来DNAの検出を示した電気泳動後の写真である。(A)配列番号1及び配列番号2を用いたPCRにおける各動植物含有食品中の特定植物由来DNAの検出結果の電気泳動後の写真である。(B)配列番号3及び配列番号4を用いたPCRにおける各動植物含有食品中の特定植物由来DNAの検出結果の電気泳動後の写真である。(C)配列番号5及び配列番号6を用いたPCRにおける各動植物含有食品中の特定動物由来DNAの検出結果の電気泳動後の写真である。(D)配列番号7及び配列番号8を用いたPCRにおける各動植物含有食品中の特定動物由来DNAの検出結果の電気泳動後の写真である。(E)配列番号9、配列番号10及び配列番号11を用いたPCRにおける各動植物含有食品中の特定動物由来DNAの検出結果の電気泳動後の写真である。(F)配列番号12及び配列番号13を用いたPCRにおける各動植物含有食品中の特定動物由来DNAの検出結果の電気泳動後の写真である。(G)配列番号14及び配列番号15を用いたPCRにおける各動植物含有食品中の特定動物由来DNAの検出結果の電気泳動後の写真である。(H)配列番号16、配列番号17、配列番号18及び配列番号19を用いたPCRにおける各動植物含有食品中の特定動物由来DNAの検出結果の電気泳動後の写真である。It is the photograph after the electrophoresis which showed the detection of the DNA derived from the specific animals and plants in the food containing the specific animals and plants using the primer set in the present invention. (A) It is the photograph after the electrophoresis of the detection result of specific plant origin DNA in each animal and plant containing foodstuff in PCR using sequence number 1 and sequence number 2. (B) It is the photograph after the electrophoresis of the detection result of specific plant origin DNA in each animal and plant containing foodstuff in PCR using sequence number 3 and sequence number 4. (C) It is the photograph after the electrophoresis of the detection result of the DNA derived from the specific animal in each animal and plant containing food in PCR using sequence number 5 and sequence number 6. (D) It is the photograph after the electrophoresis of the detection result of the DNA derived from the specific animal in each animal and plant containing food in PCR using sequence number 7 and sequence number 8. (E) Photograph after electrophoresis of detection results of DNA derived from a specific animal in each animal and plant-containing food in PCR using SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 and SEQ ID NO: 11. (F) It is the photograph after electrophoresis of the detection result of the DNA derived from the specific animal in each animal and plant containing food in PCR using sequence number 12 and sequence number 13. (G) It is the photograph after the electrophoresis of the detection result of the DNA derived from the specific animal in each animal and plant containing food in PCR using sequence number 14 and sequence number 15. (H) It is the photograph after the electrophoresis of the detection result of the DNA derived from the specific animal in each animal and plant containing food in PCR using sequence number 16, sequence number 17, sequence number 18, and sequence number 19.

以下、本発明を詳細に説明する。
特定動植物検出用PCRプライマーセット
本発明者等は、上記の目的に従い、以下の8種の特定動植物検出用PCRプライマーセットを開発した。本発明の特定動植物検出用PCRプライマーセットには、ゴマに特徴的な塩基配列を有するもの、メロンに特徴的な塩基配列を有するもの、まぐろに特徴的な塩基配列を有するもの、ブリに特徴的な塩基配列を有するもの、あじに特徴的な塩基配列を有するもの、たらに特徴的な塩基配列を有するもの、たこに特徴的な塩基配列を有するもの、及びほたてがいに特徴的な塩基配列を有するものがある。
Hereinafter, the present invention will be described in detail.
PCR primer sets for detection of specific animals and plants The present inventors have developed the following 8 types of PCR primer sets for detection of specific animals and plants according to the above-mentioned purpose. The PCR primer set for detecting specific animals and plants of the present invention includes those having a base sequence characteristic of sesame, those having a base sequence characteristic of melon, those having a base sequence characteristic of tuna, characteristic of yellowtail That have a unique base sequence, those that have a unique base sequence, those that have a unique base sequence, those that have a characteristic base sequence in octopus, and those that have a characteristic base sequence There is something to have.

ゴマ検出用PCRプライマーセット、及びメロン検出用PCRプライマーセットの開発に際しては、まずゴマ近縁植物、メロン近縁植物を含む約550種の植物についてクロロプラストのrbcL(large subunit gene for ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase)遺伝子配列を既知のDNAデータベース(GenBank nucleotide sequence database)から取得あるいは、一部の植物の当該遺伝子配列を独自に解析することによって取得し、それらの厖大な塩基配列の多重並列配列図を作成し、当該塩基配列の類似性や特異性等の性状を詳細に比較検討したが、当該遺伝子の塩基配列は、ゴマは近縁種のシソ科シソ属のシソと、メロンは近縁種のキュウリ等、キュウリ属植物と相同性が高く特異的な当該遺伝子配列領域を選出することが困難であった。そこで、ゴマ近縁植物、メロン近縁植物を含む約250種の植物についてクロロプラストのmatk(maturase-encoding gene)遺伝子配列を既知のDNAデータベース(GenBank nucleotide sequence database)から取得あるいは、一部の植物の当該遺伝子配列を独自に解析することによって取得し、それらの厖大な塩基配列の多重並列配列図を作成し、当該塩基配列の類似性や特異性等の性状を詳細に比較検討し直したところ、各々に特異的な当該遺伝子配列領域を選出することができ、それらの領域からPCRプライマーセットを新規に設計した。設計の際には、検出目的とする生物種をゴマについては、白色系統及び黒色系統のゴマに、メロンについては、メロン及びメロン変種のフユメロンに設定し、検出目的とした生物種の当該遺伝子配列領域とは、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするが、検出目的としない生物種とはハイブリダイズしないように創意工夫して、設計した。   In developing a PCR primer set for detecting sesame and a PCR primer set for detecting melon, first, about 550 plants including sesame-related plants and melon-related plants, chloroplast rbcL (large subunit gene for ribulose-1, 5-bisphosphate carboxylase / oxygenase) gene sequence obtained from a known DNA database (GenBank nucleotide sequence database), or obtained by analyzing the gene sequence of some plants independently, and multiplex of these vast nucleotide sequences A parallel sequence map was created, and the properties such as the similarity and specificity of the base sequence were compared in detail, but the base sequence of the gene is that of sesame is a related species of Lamiaceae, and melon is It was difficult to select a specific gene sequence region having high homology with cucumber plants such as closely related cucumbers. Therefore, we obtained chloroplast matk (maturase-encoding gene) gene sequences from a known DNA database (GenBank nucleotide sequence database) for some 250 plants including sesame-related plants and melon-related plants, or some plants. Obtained by independently analyzing the gene sequence, creating a multiple parallel sequence diagram of those enormous base sequences, and reexamining properties such as similarity and specificity of the base sequences in detail The gene sequence region specific to each can be selected, and a PCR primer set was newly designed from these regions. At the time of design, the target species for detection is set to white and black sesame for sesame, and melon and melon variant fumelon for melon. The region was designed and designed so as to hybridize under stringent conditions, but not to hybridize with a non-detection species.

まぐろ検出用PCRプライマーセットの開発に際して、まず、マグロ類7種を含む、約250
種の各種生物についてミトコンドリアのチトクロームb遺伝子配列を既知のDNAデータベ
ースから取得あるいは、一部の生物の当該遺伝子配列を独自に解析することによって取得
し、それらの厖大な塩基配列の多重並列配列図を作成した。当該遺伝子領域では、近縁種
のサバ科カツオ属のカツオ等と相同性が高いため、特異的な当該遺伝子配列領域を選出す
ることが難しく、PCRプライマーセットを設計することは困難であったが、作成した多重
並列配列図を詳細に比較検討することによって、検出目的としたサバ科マグロ属のクロマ
グロ、キハダマグロ、メバチマグロ、ビンチョウマグロ、ミナミマグロ、コシナガ、タイ
セイヨウマグロに共通し、近縁種である同科カツオ属のカツオ、ソウダガツオ属のマルソ
ウダを始めとした検出目的以外の生物種とは異なる遺伝子領域を選出し、その領域からPCRプライマーセットを新規に設計した。設計の際には、検出目的とする生物種の当該遺伝子配列領域とは、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするが、検出目的としない生物種とはハイブリダイズしないように創意工夫して、設計した。
When developing a PCR primer set for tuna detection, first, about 250 including 7 tuna species
Obtain mitochondrial cytochrome b gene sequences from various known organisms from a known DNA database or by analyzing the gene sequences of some organisms independently, and create multiple parallel sequence diagrams of their vast base sequences Created. In this gene region, it is difficult to select a specific gene sequence region because it is highly homologous to the close-up bonito of the closely related species, but it was difficult to design a PCR primer set. By comparing and comparing the created multiple parallel arrangement diagrams in detail, common to common bluefin tuna, yellowfin tuna, bigeye tuna, bluefin tuna, southern bluefin tuna, cocinaga and Atlantic bluefin tuna for detection purposes. A gene region different from the species other than the detection purpose, such as bonito belonging to the genus Bonito and Marsouda belonging to the genus Soda, was selected, and a PCR primer set was newly designed from that region. At the time of design, the gene sequence region of the species of interest to be detected hybridizes under stringent conditions, but the design is devised so that it does not hybridize to the species not targeted for detection. did.

ブリ検出用PCRプライマーセットの開発に際して、まず、ブリ近縁種を含む、約250種の各種生物についてミトコンドリアのチトクロームb遺伝子配列を既知のDNAデータベースから取得あるいは、一部の生物の当該遺伝子配列を独自に解析することによって取得し、それらの厖大な塩基配列の多重並列配列図を作成した。当該遺伝子領域では、近縁種のアジ科ブリ属のヒラマサ、カンパチと相同性が高く、特異的な当該遺伝子配列領域を選出することが難しく、PCRプライマーセットを設計することは困難であったが、多重並列配列図を詳細に比較検討し、センスプライマー用の領域をヒラマサ、カンパチと相同性が高い領域から選出し、アンチセンスプライマー用の領域をヒラマサ、カンパチと相同性が低いが、マイワシとは相同性が高い領域を選出し、検出目的のブリ以外の生物種(ヒラマサ、カンパチ)に対して交錯性を示すセンスプライマーと、それらとはまた別の生物種(マイワシ)に対する交錯性を示すアンチセンスプライマーを互いに組み合わせることで、検出目的とするブリの当該遺伝子配列領域とは、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするが、検出目的としない生物種とはハイブリダイズしないPCRプライマーセットを創意工夫して、新規に設計した。   In developing a PCR primer set for detecting yellowtail, first obtain mitochondrial cytochrome b gene sequences from about 250 species of various organisms including yellowtail related species, or obtain the relevant gene sequences of some organisms. Obtained by independent analysis, we created a multiple parallel sequence diagram of those enormous base sequences. The gene region is highly homologous to the closely related species of the genus Hyacinthidae, Hiramasa and amberjack, and it was difficult to select a specific gene sequence region, and it was difficult to design a PCR primer set. By comparing the multiple parallel sequence diagrams in detail, the region for the sense primer was selected from the region having high homology with Hiramasa and Campati, and the region for the antisense primer was low with Hiramasa and Campati, but with sardine Selects regions with high homology, sense primer showing crossing property to species other than yellowtail (Hiramasa, amberjack) for detection purpose, and crossing property to another species (sardine) By combining antisense primers with each other, it hybridizes with the gene sequence region of the target yellowtail under stringent conditions. However, a PCR primer set that does not hybridize with non-detection species was devised and designed.

あじ検出用PCRプライマーセットの開発に際して、まず、商業的に重要なアジ亜科に属
する魚類を検出目的とし、アジ科約60種を含む約250種の各種生物についてミトコンドリ
アのチトクロームb遺伝子配列を既知のDNAデータベースから取得あるいは、一部の生物
の当該遺伝子配列を独自に解析することによって取得し、それらの厖大な塩基配列の多重
並列配列図を作成した。当該遺伝子領域では、検出目的としたアジ亜科の魚類に共通し、
近縁種であるアジ科ブリ属のブリ等と相同性が低い特異的な当該遺伝子配列領域を選出す
ることが難しく、PCRプライマーセットを設計することは困難であったが、多重並列配列
図を詳細に比較検討し、センスプライマー、アンチセンスプライマーを特定の領域におい
て2種ずつ設計し、ミックスプライマーとして用いることることを着想することで、検出
目的とするアジ亜科に属する魚類の当該遺伝子配列領域とは、ストリンジェントな条件下
でハイブリダイズするが、検出目的としない生物種とはハイブリダイズしないPCRプライ
マーセットを創意工夫して、新規に設計した。
When developing a PCR primer set for detection of horse mackerel, we first detected the fish belonging to the commercially important genus subfamily and known about mitochondrial cytochrome b gene sequences for about 250 different organisms including about 60 species From the DNA database or by analyzing the gene sequences of some organisms independently, and created a multiple parallel sequence diagram of these enormous base sequences. In this gene region, it is common to the fishes of the family Clinicaceae for detection purposes,
Although it was difficult to select a specific gene sequence region with a low homology with related species, such as the yellowtail of the family Asteraceae, it was difficult to design a PCR primer set. The gene sequence of the fish belonging to the subfamily of the subfamily that is the target of detection by comparing and studying in detail, and conceiving that two kinds of sense primer and antisense primer are designed in a specific region and used as a mix primer. The region was newly designed by ingeniously creating a PCR primer set that hybridizes under stringent conditions but does not hybridize with a species not intended for detection.

たら検出用PCRプライマーセットの開発に際して、まず、タラ科を含む約200種の各種生物についてミトコンドリアの16S rRNA遺伝子を既知のDNAデータベースから取得あるいは、一部の生物の当該遺伝子配列を独自に解析することによって取得し、それらの厖大な塩基配列の多重並列配列図を作成した。作成した多重並列配列図詳細に比較検討することによって、タラ科マダラ属のマダラ、タラ科マダラ属のタイセイヨウダラ、タラ科スケトウダラ属のスケトウダラ、タラ科コマイ属のコマイ等、商業的に重要なタラ科の魚類に共通し、検出目的以外の生物種とは異なる遺伝子領域を選出し、その領域からPCRプライマーセットを新規に設計した。設計の際には、検出目的とする生物種の当該遺伝子配列領域とは、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするが、検出目的としない生物種とはハイブリダイズしないように創意工夫して、新規に設計した。   When developing a PCR primer set for detection, first, obtain mitochondrial 16S rRNA genes from about 200 different organisms, including codaceae, from known DNA databases, or independently analyze the gene sequences of some organisms And created a multiple parallel sequence diagram of these enormous base sequences. By comparing and comparing the details of the created multiple parallel arrangement diagrams, it is possible to obtain commercially important items such as the cod of the cod family, the cod of the cod family, the cod of the cod family, the walleye cod of the cod family, and the cod of the cod family. A gene region that is common to cod fish and is different from the species other than the detection target was selected, and a PCR primer set was newly designed from that region. At the time of design, the gene sequence region of the species to be detected is hybridized under stringent conditions, but has been devised so that it does not hybridize to the species not to be detected. Designed.

たこ検出用PCRプライマーセットの開発に際して、まず、タコ類、イカ類、貝類等の軟
体動物約550種を含む約700種の各種生物についてミトコンドリアの16S rRNA遺伝子を既知のDNAデータベースから取得あるいは、一部の生物の当該遺伝子配列を独自に解析することによって取得し、それらの厖大な塩基配列の多重並列配列図を作成した。当該遺伝子領域では、検出目的としたタコ類(マダコ亜目、ヒゲダコ亜目)に共通し、近縁種であるイカ類(十腕目)と相同性が低い特異的な当該遺伝子配列領域を選出することが難しく、PCRプライマーセットを設計することは困難であったが、多重並列配列図を詳細に比較検討し、センスプライマー、アンチセンスプライマーを特定の領域において2種ずつ設計し、ミックスプライマーとして用いることを着想することで、検出目的とするタコ類に属する魚類の当該遺伝子配列領域とは、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするが、検出目的としない生物種とはハイブリダイズしないPCRプライマーセットを創意工夫して、新規に設計した。
In developing a PCR primer set for detecting octopus, we first acquired 16S rRNA genes of mitochondrion from a known DNA database for about 700 different organisms, including about 550 molluscs such as octopus, squid and shellfish. The gene sequences of some organisms were obtained by analyzing them independently, and a multiple parallel sequence diagram of their enormous base sequences was created. In this gene region, select the specific gene sequence region that is common to the octopus species (A. octopus, Apiaceae) and has low homology with the related squid species (Decapoda). Although it was difficult to design a PCR primer set, it was difficult to design a PCR primer set, and we compared multiple parallel sequence diagrams in detail, and designed two types of sense primers and antisense primers in a specific region. The PCR primer set that hybridizes under stringent conditions with the relevant gene sequence region of fish belonging to the octopus species targeted for detection but does not hybridize with species not targeted for detection. Innovatively designed.

ほたてがい検出用PCRプライマーセットの開発に際して、まず、タコ類、イカ類、貝類
等の軟体動物約550種を含む約700種の各種生物についてミトコンドリアの16S rRNA遺伝子を既知のDNAデータベースから取得あるいは、一部の生物の当該遺伝子配列を独自に解析することによって取得し、それらの厖大な塩基配列の多重並列配列図を作成した。当該遺伝子領域において、検出目的である日本近海に生息するイタヤガイ科Patinopecten属ホタテガイと、同様に検出目的である外海に生息する同科Pecten属のジェームスホタテ、ニュージーランドホタテ、ヨーロッパホタテ等では、塩基配列の相同性が極めて低いため、これらのほたてがいに共通し、近縁種である同科Aequipecten属のセイヨウイタヤDNA、Chlyms属のヒオウギガイDNAと相同性が低い特異的な当該遺伝子配列領域を選出することが難しく、PCRプライマーセットを設計することは困難であったが、イタヤガイ科Patinopecten属ホタテガイ検出用のプライマーセットとPecten属のジェームスホタテ、ニュージーランドホタテ、ヨーロッパホタテ等の外海に生息するホタテガイ類検出用のプライマーセットを特定の領域において各々設計し、ミックスプライマーとして用いることを着想することで、検出目的とするホタテガイ類の当該遺伝子配列領域とは、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズしないPCRプライマーセットを創意工夫して、新規に設計した。
When developing a PCR primer set for detecting scallops, first obtain mitochondrial 16S rRNA gene from a known DNA database for about 700 various organisms including about 550 molluscs such as octopus, squid, shellfish, or The gene sequences of some organisms were obtained by independently analyzing them, and a multiple parallel sequence diagram of their enormous base sequences was created. In this gene region, the base sequence of the scallop Patinopecten genus scallop inhabiting the sea near Japan, which is the detection purpose, and the James scallop, New Zealand scallop, European scallop, etc. Since the homology is extremely low, select a specific gene sequence region that is common to these scallops and has low homology with the related species Aequipecten genus Itaya DNA, Chlyms genus DNA Although it was difficult to design a PCR primer set, it was difficult to design a primer set for detecting the scallop Patinopecten scallops and for detecting scallops inhabiting the open sea such as Pecten scallops, New Zealand scallops, European scallops, etc. Design and mix primer sets in specific areas By conceive be used as primers, the gene sequence region scallops such as the detection object and is a PCR primer sets that do not hybridize under stringent conditions with ingenuity, newly designed.

本発明の特定植物検出用PCRプライマーセットを用いたPCR分析では、対象となる試料が加工品である場合も想定される。加工品を分析する場合、DNAが分解または、断片化している可能性があるので、70〜250 bp 程度の短めのPCR増幅産物を形成するようなPCRプライマーが、高感度分析のために好ましい。それ故に、PCRプライマーの設計の際には、PCR増幅産物の長さが250 bp以下となるように工夫して設計した。また、これらのPCRプライマーセットのPCR反応条件を同一条件にすることは、実際の分析における、PCR反応回数の低減化に寄与する。それ故に、PCR反応において、その反応条件を最も左右するPCRプライマーのアニーリング温度とアニーリング時間が同一となるように、具体的にはゴマ、メロン、たこは64℃で10秒間、まぐろ、ブリ、ほたてがいは66℃で10秒間のアニーリング条件となるように工夫して、PCRプライマーを設計した。   In the PCR analysis using the PCR primer set for detecting a specific plant according to the present invention, the target sample may be a processed product. When analyzing a processed product, since the DNA may be degraded or fragmented, a PCR primer that forms a PCR amplification product having a short length of about 70 to 250 bp is preferable for high sensitivity analysis. Therefore, when designing the PCR primers, the PCR amplification product was designed so that the length of the PCR amplification product was 250 bp or less. Moreover, making the PCR reaction conditions of these PCR primer sets the same contributes to a reduction in the number of PCR reactions in actual analysis. Therefore, in the PCR reaction, specifically, sesame, melon, and octopus at 64 ° C for 10 seconds, tuna, yellowtail, scallop, so that the annealing temperature and annealing time of the PCR primer that most affects the reaction conditions are the same. The PCR primer was designed by devising an annealing condition at 66 ° C. for 10 seconds.

従って、本発明の特定動植物検出用PCRプライマーセットを用いたPCR法などの核酸分析の手法を用いて、各種食品中に含まれるゴマ、メロン、まぐろ、ブリ、あじ、たら、たこ、あるいはほたてがい由来DNAを高感度かつ特異的に検出することができる。
ここで、核酸分析とは、生物分類における、個々の種、属、あるいは、グループによって
特徴的な塩基配列が存在することを利用して、その特徴的な塩基配列の有無を分析するこ
とによって、その生物の種、属、あるいは、グループを把握するために有効な手段であっ
て、特定の微生物の検出や生物種の同定などに有用に用いられる方法である。
Therefore, sesame, melon, tuna, yellowtail, horse mackerel, tuna, octopus, or scallops contained in various foods using nucleic acid analysis techniques such as PCR using the PCR primer set for detecting specific animals and plants of the present invention. The derived DNA can be detected with high sensitivity and specificity.
Here, nucleic acid analysis refers to the presence or absence of a characteristic base sequence by analyzing the presence or absence of a characteristic base sequence depending on individual species, genus, or group in biological classification. It is an effective means for grasping the species, genus, or group of the organism, and is a method usefully used for detecting a specific microorganism or identifying a species.

本発明が提供するプライマーの塩基配列は以下のとおりである。
塩基番号 123456789012345678901234567
配列番号1 (ゴマS) CGATTCTATCTCAACGAGTATTGTAAG
配列番号2 (ゴマAS) CCGTAGAAAGACGAAAATGGC
配列番号3 (メロンS) TTTCAAAAGATACGCCACTTCTT
配列番号4 (メロンAS) CCATACCACTGAAGTATTTAATCGA
配列番号5 (まぐろS) CTTCTTTTCCTTCACGAAACAGGT
配列番号6 (まぐろAS) CGAGTGCCACTAGCAGGATCA
配列番号7 (ブリS) GCTGGGCTTTGCTACCCTGCTG
配列番号8 (ブリAS) GTTACTAGGGGGTTTGCGGGGAC
配列番号9 (あじS) AACTCTAATGGCAAAnCTCCGT
(配列番号9において、nはC又はTを表す。)
但し、配列番号9のCのものと、Tのものは、ミックスプライマーとして用いる。以下、全
て同様である。
配列番号10(あじAS1) GAGCAGGGAGGTCAATTAGTGA
配列番号11(あじAS2) GAGCAGGGAGGTCGATTAATGA
配列番号12(たらS) CTTAGTGATATTTACTGAAG
配列番号13(たらAS) GTTATACCGGATCAGAAA
配列番号14(たこS) GGCTAGAATGAATGGTTTGACGAnA
(配列番号14において、nはG又はAを表す。)
但し、配列番号14のGのものと、Aのものは、ミックスプライマーとして用いる。以下、
全て同様である。
配列番号15(たこAS) TTATTCCTTGATCACCCCAAnC
(配列番号15において、nはC又はTを表す。)
但し、配列番号15のCのものと、Tのものは、ミックスプライマーとして用いる。以下、
全て同様である。
配列番号16(ほたてがいS1) TGTGTCAGCGTTAAAGAGCAGATA
配列番号17(ほたてがいS2) CCGAATCGTTGAGGAGCACTA
配列番号18(ほたてがいAS1) TCAAGATTTTCATGTTTTGTGGG
配列番号19(ほたてがいAS2) TAATCACACCTTAATGTTTGTGGG
また、本発明が提供する30塩基のDNAからなるプライマーとしては、例えば以下の塩
基配列のものを上げることができる。
配列番号20 (ゴマS) attCGATTCTATCTCAACGAGTATTGTAAG
配列番号21 (ゴマAS) agattggttCCGTAGAAAGACGAAAATGGC
配列番号22 (メロンS) attctggTTTCAAAAGATACGCCACTTCTT
配列番号23 (メロンAS) tgagtCCATACCACTGAAGTATTTAATCGA
配列番号24 (まぐろS) cttcacCTTCTTTTCCTTCACGAAACAGGT
配列番号25 (まぐろAS) ctagagaggCGAGTGCCACTAGCAGGATCA
配列番号26 (ブリS) aaggacctGCTGGGCTTTGCTACCCTGCTG
配列番号27 (ブリAS) aggcgggGTTACTAGGGGGTTTGCGGGGAC
配列番号28 (あじS) actacaagAACTCTAATGGCAAAnCTCCGT
(配列番号28において、nはC又はTを表す。)
但し、配列番号28のCのものと、Tのものは、ミックスプライマーとして用いる。以下、
全て同様である。
配列番号29(あじAS1) gttcgaggGAGCAGGGAGGTCAATTAGTGA
配列番号30(あじAS2) gttcgaggGAGCAGGGAGGTCGATTAATGA
配列番号31(たらS) acagtaaaaaCTTAGTGATATTTACTGAAG
配列番号32(たらAS) gttcgttgatcgGTTATACCGGATCAGAAA
配列番号33(たこS) attagGGCTAGAATGAATGGTTTGACGAnA
(配列番号33において、nはG又はAを表す。)
但し、配列番号33のGのものと、Aのものは、ミックスプライマーとして用いる。以下、
全て同様である。
配列番号34(たこAS) ttatatttTTATTCCTTGATCACCCCAAnC
(配列番号34において、nはC又はTを表す。)
但し、配列番号34のCのものと、Tのものは、ミックスプライマーとして用いる。以下、
全て同様である。
配列番号35(ほたてがいS1) attgacTGTGTCAGCGTTAAAGAGCAGATA
配列番号36(ほたてがいS2) tatttgtggCCGAATCGTTGAGGAGCACTA
配列番号37(ほたてがいAS1) ctgttaaTCAAGATTTTCATGTTTTGTGGG
配列番号38(ほたてがいAS2) ttctgaTAATCACACCTTAATGTTTGTGGG
The base sequences of the primers provided by the present invention are as follows.
Base number 123456789012345678901234567
Sequence number 1 (sesame S) CGATTCTATCTCAACGAGTATTGTAAG
Sequence number 2 (sesame AS) CCGTAGAAAGACGAAAATGGC
Sequence number 3 (melon S) TTTCAAAAGATACGCCACTTCTT
Sequence number 4 (melon AS) CCATACCACTGAAGTATTTAATCGA
Sequence number 5 (Tuna S) CTTCTTTTCCTTCACGAAACAGGT
Sequence number 6 (Tuna AS) CGAGTGCCACTAGCAGGATCA
Sequence number 7 (Buri S) GCTGGGCTTTGCTACCCTGCTG
Sequence number 8 (Buri AS) GTTACTAGGGGGTTTGCGGGGAC
Sequence number 9 (Aji S) AACTCTAATGGCAAAnCTCCGT
(In SEQ ID NO: 9, n represents C or T.)
However, those of SEQ ID NO: 9 C and T are used as mix primers. The same applies hereinafter.
Sequence number 10 (Aji AS1) GAGCAGGGAGGTCAATTAGTGA
Sequence number 11 (Aji AS2) GAGCAGGGAGGTCGATTAATGA
Sequence number 12 (Tara S) CTTAGTGATATTTACTGAAG
Sequence number 13 (Tara AS) GTTATACCGGATCAGAAA
Sequence number 14 (octopus S) GGCTAGAATGAATGGTTTGACGAnA
(In SEQ ID NO: 14, n represents G or A.)
However, G of SEQ ID NO: 14 and A are used as mix primers. Less than,
All are the same.
Sequence number 15 (octopus AS) TTATTCCTTGATCACCCCAAnC
(In SEQ ID NO: 15, n represents C or T.)
However, C and SEQ ID NO: 15 are used as mix primers. Less than,
All are the same.
Sequence number 16 (scallop S1) TGTGTCAGCGTTAAAGAGCAGATA
Sequence number 17 (scallop S2) CCGAATCGTTGAGGAGCACTA
Sequence number 18 (scallop AS1) TCAAGATTTTCATGTTTTGTGGG
Sequence number 19 (scallop AS2) TAATCACACCTTAATGTTTGTGGG
Moreover, as a primer which consists of DNA of 30 bases which this invention provides, the thing of the following base sequences can be raised, for example.
Sequence number 20 (sesame S) attCGATTCTATCTCAACGAGTATTGTAAG
Sequence number 21 (sesame AS) agattggttCCGTAGAAAGACGAAAATGGC
Sequence number 22 (melon S) attctggTTTCAAAAGATACGCCACTTCTT
Sequence number 23 (melon AS) tgagtCCATACCACTGAAGTATTTAATCGA
Sequence number 24 (tuna S) cttcacCTTCTTTTCCTTCACGAAACAGGT
Sequence number 25 (tuna AS) ctagagaggCGAGTGCCACTAGCAGGATCA
Sequence number 26 (Buri S) aaggacctGCTGGGCTTTGCTACCCTGCTG
Sequence number 27 (Buri AS) aggcgggGTTACTAGGGGGTTTGCGGGGAC
Sequence number 28 (Aji S) actacaagAACTCTAATGGCAAAnCTCCGT
(In SEQ ID NO: 28, n represents C or T.)
However, those of C in SEQ ID NO: 28 and those of T are used as mix primers. Less than,
All are the same.
SEQ ID NO: 29 (Aji AS1) gttcgaggGAGCAGGGAGGTCAATTAGTGA
Sequence number 30 (Aji AS2) gttcgaggGAGCAGGGAGGTCGATTAATGA
Sequence number 31 (Tara S) acagtaaaaaCTTAGTGATATTTACTGAAG
Sequence number 32 (Tara AS) gttcgttgatcgGTTATACCGGATCAGAAA
Sequence number 33 (octopus S) attagGGCTAGAATGAATGGTTTGACGAnA
(In SEQ ID NO: 33, n represents G or A.)
However, G of SEQ ID NO: 33 and A are used as mix primers. Less than,
All are the same.
Sequence number 34 (octopus AS) ttatatttTTATTCCTTGATCACCCCAAnC
(In SEQ ID NO: 34, n represents C or T.)
However, those of C in SEQ ID NO: 34 and those of T are used as mix primers. Less than,
All are the same.
Sequence number 35 (scallop S1) attgacTGTGTCAGCGTTAAAGAGCAGATA
Sequence number 36 (scallop S2) tatttgtggCCGAATCGTTGAGGAGCACTA
SEQ ID NO: 37 (scallop AS1) ctgttaaTCAAGATTTTCATGTTTTGTGGG
SEQ ID NO: 38 (scallop AS2) ttctgaTAATCACACCTTAATGTTTGTGGG

本発明は、第1のプライマーセットとして、配列表の配列番号1における塩基番号13〜27
の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをセンスプ
ライマーとし、配列表の配列番号2における塩基番号7〜21の塩基配列を3´末端側に含む
最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットは、ゴマ検出用に好適に使用できる。本プライマーセットは、PCRに供与されることにより、双方ともゴマのクロロプラストのmatK遺伝子に特異的に結合するが、その他の生物由来クロロプラストのmatK遺伝子を検出可能に増幅しないので、ゴマDNAを検出するのためのPCR用プライマーセットとして使用できる。また、高感度に当該DNAを検出することができる。
The present invention provides, as a first primer set, base numbers 13 to 27 in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing.
PCR primer consisting of DNA with a maximum of 30 bases at the shortest 15 including the nucleotide sequence of 3 'end side as a sense primer, and a minimum of 15 including the base sequence of base numbers 7 to 21 in SEQ ID NO: 2 in the sequence listing on the 3' end side We propose a primer set that uses PCR primers consisting of DNA of up to 30 bases as antisense primers. This primer set can be suitably used for sesame detection. This primer set, when donated to PCR, specifically binds to the matK gene of sesame chloroplasts, but does not detectably amplify the matK gene of chloroplasts from other organisms. It can be used as a primer set for PCR for detection. In addition, the DNA can be detected with high sensitivity.

また、本発明は、第2のプライマーセットとして、配列表の配列番号3における塩基番号
9〜23の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをセンスプライマーし、配列表の配列番号4における塩基番号11〜25の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットは、メロン検出用に好適に使用できる。本プライマーセットは、PCRに供与されることにより、双方ともメロンのクロロプラストのmatK遺伝子に特異的に結合するが、その他の生物由来クロロプラストのmatK遺伝子を検出可能に増幅しないので、メロンDNAを検出するのためのPCR用プライマーセットとして使用できる。また、高感度に当該DNAを検出することができる。
Further, the present invention provides the second primer set as a base number in SEQ ID NO: 3 in the sequence listing.
A PCR primer consisting of DNA with a maximum of 15 and 30 bases including the base sequence of 9 to 23 on the 3 'end side is sensed, and the base sequence of base numbers 11 to 25 in SEQ ID NO: 4 in the sequence listing is on the 3' end side We propose a primer set that uses as a antisense primer a PCR primer consisting of DNA consisting of a minimum of 15 and a maximum of 30 bases. This primer set can be suitably used for melon detection. This primer set both binds specifically to the melon chloroplast matK gene when donated to PCR, but does not detectably amplify the chloroplast matK gene from other organisms. It can be used as a primer set for PCR for detection. In addition, the DNA can be detected with high sensitivity.

また、本発明は、第3のプライマーセットとして、配列表の配列番号5における塩基番号
10〜24の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをセ
ンスプライマーとし、配列表の配列番号6における塩基番号7〜21の塩基配列を3´末端側
に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットは、PCRに供されることにより、双方ともまぐろのミトコンドリアのチトクロームb遺伝子に特異的に結合するが、その他の生物由来ミトコンドリアのチトクロームb遺伝子を検出可能に増幅しないので、まぐろDNAを検出するのためのPCR用プライマーセットとして使用できる。また高感度に当該DNAを検出することができる。
The present invention also provides a base number in SEQ ID NO: 5 in the sequence listing as the third primer set.
A PCR primer consisting of a DNA of a minimum of 15 and a maximum of 30 bases containing a 10-24 base sequence on the 3 ′ end side is used as a sense primer, and the base sequence of base numbers 7-21 in SEQ ID NO: 6 in the sequence listing is on the 3 ′ end side We propose a primer set that uses as a antisense primer a PCR primer consisting of DNA consisting of a minimum of 15 and a maximum of 30 bases. Both of these primer sets specifically bind to the tuna mitochondrial cytochrome b gene when subjected to PCR, but do not detectably amplify the mitochondrial cytochrome b gene from other organisms. It can be used as a primer set for PCR for detection. In addition, the DNA can be detected with high sensitivity.

また、本発明は、第4のプライマーセットとして、配列表の配列番号7における塩基番号
8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをセンスプライマーとし、配列表の配列番号8における塩基番号9〜23の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットは、PCRに供されることにより、双方ともブリのミトコンドリアのチトクロームb遺伝子に特異的に結合するが、その他の生物由来ミトコンドリアのチトクロームb遺伝子を検出可能に増幅しないので、ブリDNAを検出するのためのPCR用プライマーとして使用できる。また、高感度に当該DNAを検出することができる。
In addition, the present invention provides a base number in SEQ ID NO: 7 in the sequence listing as the fourth primer set.
A PCR primer consisting of a DNA of 8 to 22 nucleotides at the shortest and a maximum of 30 nucleotides containing the nucleotide sequence of 8 to 22 on the 3 ′ end side is used as a sense primer, and the nucleotide sequence of nucleotide numbers 9 to 23 in SEQ ID NO: 8 in the sequence listing is on the 3 ′ end side. We propose a primer set that uses as a antisense primer a PCR primer consisting of DNA consisting of a minimum of 15 and a maximum of 30 bases. When this primer set is subjected to PCR, both specifically bind to the cytochrome b gene of the mitochondrial mitochondrion, but do not detectably amplify the cytochrome b gene of other mitochondrial mitochondria. It can be used as a PCR primer for detection. In addition, the DNA can be detected with high sensitivity.

また、本発明は、第5のプライマーセットとして、配列表の配列番号9における塩基番号
8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをセンスプライマーとし、配列表の配列番号10における塩基番号8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー及び配列表の配列番号11における塩基番号8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットは、PCRに供されることにより、双方ともあじのミトコンドリアのチトクロームb遺伝子に特異的に結合するが、その他の生物由来ミトコンドリアのチトクロームb遺伝子を検出可能に増幅しないので、あじDNAを検出するのためのPCR用プライマーとして使用できる。また、高感度に当該DNAを検出することができる。
In addition, the present invention provides a base number in SEQ ID NO: 9 of the sequence listing as the fifth primer set.
A PCR primer consisting of DNA with a maximum of 15 bases and a maximum of 15 bases containing the base sequence of 8-22 on the 3 'end side is used as the sense primer, and the base sequence of base numbers 8-22 in SEQ ID NO: 10 of the sequence listing is on the 3' end side PCR primer consisting of DNA with a minimum of 15 and 30 bases, and PCR primer consisting of DNA with a minimum of 15 and a maximum of 30 bases including the base sequence of nucleotide numbers 8 to 22 in SEQ ID NO: 11 in the sequence list on the 3 ′ end side. A primer set is proposed. Both of these primer sets specifically bind to the mitochondrial cytochrome b gene of the same mitochondrion when subjected to PCR, but do not detectably amplify the mitochondrial cytochrome b gene of other organisms. It can be used as a PCR primer for detection. In addition, the DNA can be detected with high sensitivity.

また、本発明は、第6のプライマーセットとして、配列表の配列番号12における塩基番
号6〜20の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをセンスプライマーとし、配列表の配列番号13における塩基番号4〜18の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットは、PCRに供されることにより、双方ともたらのミトコンドリアの16S rRNA遺伝子に特異的に結合するが、その他の生物由来ミトコンドリアの16S rRNA遺伝子を検出可能に増幅しないので、たらDNAを検出するのためのPCR用プライマーとして使用できる。また、高感度に当該DNAを検出することができる。
Further, the present invention uses, as a sixth primer set, a PCR primer consisting of a DNA having a shortest of 15 and a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 6 to 20 in SEQ ID NO: 12 in the sequence listing on the 3 ′ end side as a sense primer. A primer set is proposed in which a PCR primer consisting of a DNA consisting of a shortest of 15 and a maximum of 30 bases including the base sequence of base numbers 4 to 18 in SEQ ID NO: 13 in the sequence list on the 3 ′ end side is used as an antisense primer. This primer set, when subjected to PCR, specifically binds to both and the resulting mitochondrial 16S rRNA gene, but does not detectably amplify mitochondrial 16S rRNA gene from other organisms, so DNA It can be used as a PCR primer for detection. In addition, the DNA can be detected with high sensitivity.

また、本発明は、第7のプライマーセットとして、配列表の配列番号14における塩基番
号11〜25の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーを
センスプライマーとし、第15のプライマーとして、配列表の配列番号15における塩基番号
8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットは、PCRに供されることにより、双方ともたこのミトコンドリアの16S rRNA遺伝子に特異的に結合するが、その他の生物由来ミトコンドリアの16S rRNA遺伝子を検出可能に増幅しないので、たこDNAを検出するのためのPCR用プライマーとして使用できる。また、高感度に当該DNAを検出することができる。
In addition, the present invention uses, as a seventh primer set, a PCR primer consisting of a DNA having a shortest of 15 and a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 11 to 25 in SEQ ID NO: 14 in the sequence listing on the 3 ′ end side as a sense primer. As the 15th primer, the base number in SEQ ID NO: 15 of the sequence listing
We propose a primer set using as a antisense primer a PCR primer consisting of DNA consisting of 15 to 30 bases at the shortest, containing 8-22 base sequences on the 3 'end side. This primer set, when subjected to PCR, specifically binds to the mitochondrial 16S rRNA gene, but does not detectably amplify mitochondrial 16S rRNA gene from other organisms. It can be used as a PCR primer for detection. In addition, the DNA can be detected with high sensitivity.

また、本発明は、第8のプライマーセットとして、配列表の配列番号16における塩基番
号7〜21の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー及び配列表の配列番号17における塩基番号10〜24の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30
塩基のDNAからなるPCRプライマーをセンスプライマーとし、配列表の配列番号18における塩基番号10〜24の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー及び配列表の配列番号19における塩基番号10〜24の塩基配列を3´末端側に含む最短15最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーをアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットは、PCRに供されることにより、双方ともほたてがいのミトコンドリアの16S rRNA遺伝子に特異的に結合するが、その他の生物由来ミトコンドリアの16S rRNA遺伝子を検出可能に増幅しないので、ほたてがいDNAを検出するのためのPCR用プライマーとして使用できる。また、高感度に当該DNAを検出することができる。
In addition, the present invention provides, as an eighth primer set, a PCR primer consisting of a DNA having a shortest of 15 and a maximum of 30 bases including the base sequence of base numbers 7 to 21 in SEQ ID NO: 16 of the sequence list on the 3 ′ end side, and The shortest 15 maximum 30 including the base sequence of base numbers 10-24 in SEQ ID NO: 17 on the 3 ′ end side
A PCR primer consisting of a DNA of a base is a sense primer, and a PCR primer consisting of a DNA of a maximum of 15 bases and a maximum of 30 bases including the base sequence of base numbers 10 to 24 in SEQ ID NO: 18 in the sequence list on the 3 ′ end side and the sequence list A primer set is proposed in which a PCR primer consisting of a DNA consisting of DNA of a maximum of 15 and a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 10 to 24 at number 19 on the 3 ′ end side is used as an antisense primer. This primer set, when subjected to PCR, specifically binds to mitochondrial 16S rRNA genes, but does not detectably amplify mitochondrial 16S rRNA genes from other organisms. It can be used as a primer for PCR for detecting DNA. In addition, the DNA can be detected with high sensitivity.

前記各プライマーにおいて、塩基配列の長さを15から30とするのは、PCR用プライマー
としての塩基配列の適切な長さが15〜30程度であること、また、3´末端側15個の塩基配
列を特定するのは、3´末端側15個程度がPCRの特異的な増幅反応において重要であって、5´末端側の塩基配列が若干異なっていたり、配列の長さが多少違っていたりしても、PCRの反応自体への悪影響が、たいていの場合、小さいためである。
In each primer, the length of the base sequence is 15 to 30 because the appropriate length of the base sequence as a primer for PCR is about 15 to 30, and 15 bases on the 3 ′ end side. It is important to specify the sequence about 15 at the 3 'end in the PCR-specific amplification reaction. The base sequence at the 5' end is slightly different or the sequence length is slightly different. Even so, the adverse effect on the PCR reaction itself is usually small.

本発明においては、さらに、第1のプライマーセットの好ましい態様としては、配列表
の配列番号1の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(1´)(最も好ましくは配列番号1の塩基配列のDNAからなるプライマー)をセンスプライマーとし、配列表の配列番号2の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(2´)(最も好ましくは配列番号2の塩基配列のDNAからなるプライマー)をアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットはゴマ検出用に好適に使用でき、配列番号1のプライマーと配列番号2のプライマーとをセットで用いることが最も好ましい。なお、(1´)の具体例としては配列番号20のプライマー、(2´)の具体例としては配列番号21のプライマーを例示できる。
In the present invention, furthermore, as a preferred embodiment of the first primer set, a PCR primer (1 ′) (most preferably) consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 1 in the sequence listing on the 3 ′ end side is most preferred. PCR primer (2 ') (most preferred) consisting of DNA with a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 2 in the sequence listing on the 3' end side as a primer, and a primer composed of DNA of the base sequence of SEQ ID NO: 1 Proposes a primer set using an antisense primer as a primer comprising DNA having the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2. This primer set can be suitably used for sesame detection, and it is most preferable to use the primer of SEQ ID NO: 1 and the primer of SEQ ID NO: 2 as a set. A specific example of (1 ′) is the primer of SEQ ID NO: 20, and a specific example of (2 ′) is the primer of SEQ ID NO: 21.

また、第2のプライマーセットの好ましい態様として、配列表の配列番号3の塩基配列を
3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(3´)(最も好ましくは配列番
号3の塩基配列のDNAからなるプライマー)をセンスプライマーとし、配列表の配列番号4
の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(4´)(最も好ま
しくは配列番号4の塩基配列のDNAからなるプライマー)をアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットはメロン検出用に好適に使用でき、配列番号3のプライマーと配列番号4のプライマーとをセットで用いることが最も好ましい。なお、(3´)の具体例としては配列番号22のプライマー、(4´)の具体例としては配列番号23のプライマーを例示できる。
As a preferred embodiment of the second primer set, the base sequence of SEQ ID NO: 3 in the sequence listing is used.
A PCR primer (3 ') (most preferably a primer consisting of DNA having the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3) consisting of DNA of a maximum of 30 bases contained on the 3' end side is used as a sense primer, and SEQ ID NO: 4 in the sequence listing.
We propose a primer set that uses as a antisense primer a PCR primer (4 ') (most preferably a primer consisting of DNA of SEQ ID NO: 4) consisting of up to 30 bases of DNA containing the base sequence of 3' at the 3 'end. . This primer set can be suitably used for melon detection, and it is most preferable to use the primer of SEQ ID NO: 3 and the primer of SEQ ID NO: 4 as a set. A specific example of (3 ′) is the primer of SEQ ID NO: 22, and a specific example of (4 ′) is the primer of SEQ ID NO: 23.

また、第3のプライマーセットの好ましい態様として、配列表の配列番号5の塩基配列を
3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(5´)(最も好ましくは配列番号5の塩基配列のDNAからなるプライマー)をセンスプライマーとし、配列表の配列番号4の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(6´)(最も好ましくは配列番号6の塩基配列のDNAからなるプライマー)をアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットはまぐろ検出用に好適に使用でき、配列番号5のプライマーと配列番号6のプライマーとをセットで用いることが最も好ましい。なお、(5´)の具体例としては配列番号24のプライマー、(6´)の具体例としては配列番号25のプライマーを例示できる。
Further, as a preferred embodiment of the third primer set, the base sequence of SEQ ID NO: 5 in the sequence listing is
A PCR primer (5 ') (most preferably a primer consisting of DNA having the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5) consisting of DNA of up to 30 bases included at the 3' end side is used as the sense primer, and the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4 in the sequence listing is A primer set is proposed in which a PCR primer (6 ') (most preferably a primer consisting of DNA having the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6) consisting of DNA of 30 nucleotides at the 3' end is used as an antisense primer. This primer set can be suitably used for tuna detection, and it is most preferable to use the primer of SEQ ID NO: 5 and the primer of SEQ ID NO: 6 as a set. A specific example of (5 ′) is the primer of SEQ ID NO: 24, and a specific example of (6 ′) is the primer of SEQ ID NO: 25.

また、第4のプライマーセットの好ましい態様として、配列表の配列番号7の塩基配列を
3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(7´)(最も好ましくは配列番号7の塩基配列のDNAからなるプライマー)をセンスプライマーとし、配列表の配列番号8の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(8´)(最も好ましくは配列番号8の塩基配列のDNAからなるプライマー)をアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットはぶり検出用に好適に使用でき、配列番号7のプライマーと配列番号8のプライマーとをセットで用いることが最も好ましい。なお、(7´)の具体例としては配列番号26のプライマー、(8´)の具体例としては配列番号28のプライマーを例示できる。
As a preferred embodiment of the fourth primer set, the base sequence of SEQ ID NO: 7 in the sequence listing is
The PCR primer (7 ') (most preferably a primer consisting of DNA of SEQ ID NO: 7) consisting of DNA of up to 30 bases contained at the 3' end is used as a sense primer, and the base sequence of SEQ ID NO: 8 in the sequence listing is A primer set is proposed in which a PCR primer (8 ') (most preferably a primer consisting of DNA with a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8) consisting of DNA consisting of a maximum of 30 bases at the 3' end is used as an antisense primer. This primer set can be suitably used for detection of buri, and it is most preferable to use the primer of SEQ ID NO: 7 and the primer of SEQ ID NO: 8 as a set. A specific example of (7 ′) is the primer of SEQ ID NO: 26, and a specific example of (8 ′) is the primer of SEQ ID NO: 28.

また、第5のプライマーセットの好ましい態様として、配列表の配列番号9の塩基配列を
3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(9´)(最も好ましくは配列番号9の塩基配列のDNAからなるプライマー)をセンスプライマーとし、配列表の配列番号10の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(10´)(最も好ましくは配列番号10の塩基配列のDNAからなるプライマー)及び配列表の配列番号11の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(11´)(最も好ましくは配列番号11の塩基配列のDNAからなるプライマー)をアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットはあじ検出用に好適に使用でき、配列番号9のプライマー、配列番号10のプライマー、配列番号11のプライマーとをセットで用いることが最も好ましい。なお、(9´)の具体例としては配列番号28のプライマー、(10´)の具体例としては配列番号29のプライマー、(11´)の具体例としては配列番号30のプライマーを例示できる。
Further, as a preferred embodiment of the fifth primer set, the base sequence of SEQ ID NO: 9 in the sequence listing is
The PCR primer (9 ') consisting of DNA of up to 30 bases included at the 3' end side (most preferably a primer consisting of DNA of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9) is used as a sense primer, and the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10 in the sequence listing is PCR primer (10 ') (most preferably a primer consisting of DNA of SEQ ID NO: 10) consisting of DNA of a maximum of 30 bases contained on the 3' end side and the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 in the sequence listing on the 3 'end side A primer set is proposed in which a PCR primer (11 ′) consisting of a maximum of 30 bases of DNA (most preferably a primer consisting of DNA of the base sequence of SEQ ID NO: 11) is used as an antisense primer. This primer set can be suitably used for horseradish detection, and it is most preferable to use the primer of SEQ ID NO: 9, the primer of SEQ ID NO: 10, and the primer of SEQ ID NO: 11 as a set. Specific examples of (9 ′) include the primer of SEQ ID NO: 28, specific examples of (10 ′) include the primer of SEQ ID NO: 29, and specific examples of (11 ′) include the primer of SEQ ID NO: 30.

また、第6のプライマーの好ましい態様として、配列表の配列番号12の塩基配列を3´末
端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(12´)(最も好ましくは配列番号12の塩基配列のDNAからなるプライマー)をセンスプライマーとし、配列表の配列番号13の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(13´)(最も好ましくは配列番号8の塩基配列のDNAからなるプライマー)をアンチセンスプライマーとするプライマーセット提案する。本プライマーセットは、たら検出用に好適に使用、配列番号12のプライマーと配列番号13のプライマーとをセットで用いることが最も好ましい。なお、(12´)の具体例としては配列番号31のプライマー、(13´)の具体例としては配列番号32のプライマーを例示できる。
Further, as a preferred embodiment of the sixth primer, a PCR primer (12 ′) consisting of a DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 12 in the sequence listing on the 3 ′ end side (most preferably the base sequence of SEQ ID NO: 12 PCR primer (13 ′) (most preferably SEQ ID NO: 8) consisting of up to 30 bases of DNA comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13 on the 3 ′ end side as a sense primer We propose a primer set that uses antisense primers as primers. This primer set is preferably used for detection, and most preferably the primer of SEQ ID NO: 12 and the primer of SEQ ID NO: 13 are used as a set. A specific example of (12 ′) is the primer of SEQ ID NO: 31, and a specific example of (13 ′) is the primer of SEQ ID NO: 32.

また、第7のプライマーの好ましい態様として、配列表の配列番号14の塩基配列を3´末
端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(14´)(最も好ましくは配列番号14の塩基配列のDNAからなるプライマー)をセンスプライマーとし、配列表の配列番号15の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(15´)(最も好ましくは配列番号15の塩基配列のDNAからなるプライマー)をアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットはたこ検出用に好適に使用でき、配列番号14のプライマーと配列番号15のプライマーとをセットで用いることが最も好ましい。なお、(14´)の具体例としては配列番号33のプライマー、(15´)の具体例として
は配列番号34のプライマーを例示できる。
In addition, as a preferred embodiment of the seventh primer, a PCR primer (14 ′) comprising DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 14 in the sequence listing on the 3 ′ end side (most preferably the base sequence of SEQ ID NO: 14 PCR primer (15 ′) (most preferably SEQ ID NO: 15) consisting of DNA of up to 30 bases containing the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15 on the 3 ′ end side as a sense primer We propose a primer set using a primer composed of DNA of This primer set can be suitably used for detecting octopus, and it is most preferable to use the primer of SEQ ID NO: 14 and the primer of SEQ ID NO: 15 as a set. A specific example of (14 ′) is the primer of SEQ ID NO: 33, and a specific example of (15 ′) is the primer of SEQ ID NO: 34.

また、第8のプライマーセットの好ましい態様として、配列表の配列番号16の塩基配列
を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(16´)(最も好ましくは配列番号16の塩基配列のDNAからなるプライマー)及び、配列表の配列番号17の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(17´)(最も好ましくは配列番号17の塩基配列のDNAからなるプライマー)をセンスプライマーとし、配列表の配列番号18の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(18´)(最も好ましくは配列番号18の塩基配列のDNAからなるプライマー)及び配列表の配列番号19の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマー(19´)(最も好ましくは配列番号19の塩基配列のDNAからなるプライマー)をアンチセンスプライマーとするプライマーセットを提案する。本プライマーセットはほたてがい検出用に好適に使用でき、配列番号16のプライマー、配列番号17のプライマー、配列番号18のプライマー、配列番号19のプライマーとをセットで用いることが最も好ましい。なお、(16´)の具体例としては配列番号35のプライマー、(17´)の具体例としては配列番号36のプライマー、(18´)の具体例としては配列番号37のプライマー、(19´)の具体例としては配列番号38のプライマーを例示できる。
Further, as a preferred embodiment of the eighth primer set, a PCR primer (16 ′) consisting of a DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 16 on the 3 ′ end side of the sequence listing (most preferably the base of SEQ ID NO: 16 PCR primer (17 ') (most preferably DNA of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17) consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17 on the 3' end side of the sequence listing) PCR primer (18 ') (most preferably DNA having the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18) consisting of DNA of a maximum of 30 bases containing the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18 on the 3' end side as a sense primer. PCR primer (19 ') (most preferably a primer consisting of DNA having the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19) consisting of DNA of a maximum of 30 nucleotides containing the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19 on the 3' end side of the sequence listing Antisen To propose a primer set to primer. This primer set can be suitably used for scallop detection, and it is most preferable to use the primer of SEQ ID NO: 16, the primer of SEQ ID NO: 17, the primer of SEQ ID NO: 18, and the primer of SEQ ID NO: 19 as a set. A specific example of (16 ′) is a primer of SEQ ID NO: 35, a specific example of (17 ′) is a primer of SEQ ID NO: 36, a specific example of (18 ′) is a primer of SEQ ID NO: 37, (19 ′ ) Can be exemplified by the primer of SEQ ID NO: 38.

なお、センスプライマーとアンチセンスプライマーのハイブリダイズや、個々のプライ
マー自身によるハイブリダイズを生じないように、すなわち、いわゆるプライマーダイマ
ーの形成を極力回避するような工夫を施して、各々のプライマーを設計した。例えば、プ
ライマーダイマーの形成を回避させるために、プライマーの検出特異性及び検出感度の低
下を導かないような塩基置換をプライマーに施している。ゴマ検出用プライマーのセンス
プライマーである配列番号1における塩基番号8の塩基は、本来、Tであるが、センスプラ
イマーとアンチセンスプライマーによるプライマーダイマーの形成を回避するために、プ
ライマーの検出特異性及び検出感度の低下を導かないような塩基置換として、Tの代わり
にAを採用している。同様に、配列番号7における塩基番号13の塩基をAからTに、配列番号17における塩基番号4の塩基をCからAに置換している。
In addition, each primer was designed so as not to cause hybridization between the sense primer and the antisense primer or hybridization by each primer itself, that is, to avoid so-called primer dimer formation as much as possible. . For example, in order to avoid the formation of primer dimers, base substitution is performed on the primers so as not to reduce the detection specificity and detection sensitivity of the primers. The base of base number 8 in SEQ ID NO: 1 which is a sense primer of the sesame detection primer is originally T, but in order to avoid the formation of primer dimers by the sense primer and the antisense primer, the detection specificity of the primer and As a base substitution that does not lead to a decrease in detection sensitivity, A is adopted instead of T. Similarly, the base of base number 13 in SEQ ID NO: 7 is substituted from A to T, and the base of base number 4 in SEQ ID NO: 17 is substituted from C to A.

本発明が提供するプライマーの塩基配列について網羅的に述べてきたが、理論上は首尾
よく設計されたプライマーであっても、意図する性能(検出感度等)を保有しえないプラ
イマーが設計される場合がある。例えば、本発明の研究段階において、配列番号39と配列
番号40とからなるゴマ検出用PCRプライマーセット、配列番号41と配列番号42とからなる
メロン検出用PCRプライマーセットを用いたPCRでは、低い検出感度(100 pg DNA)を示した。このように、単に論理的にプライマーを設計すれば、意図する性能(検出感度等)を取得できるとは限らず、必要な性能を保有しない場合も生じうるために、その設計の際には、論理的設計だけでなく、さらなる工夫とその性能評価試験が重要となる。本発明が提供するプライマーは、論理的設計の上に、さらなる工夫を施して設計したものであり、最終的には性能評価試験をクリアーしたものである。
Although the base sequence of the primer provided by the present invention has been comprehensively described, a primer that does not have the intended performance (detection sensitivity, etc.) is designed even if the primer is theoretically designed successfully. There is a case. For example, in the research stage of the present invention, detection is low in PCR using a PCR primer set for detecting sesame consisting of SEQ ID NO: 39 and SEQ ID NO: 40, and a PCR primer set for detecting melon consisting of SEQ ID NO: 41 and SEQ ID NO: 42 Sensitivity (100 pg DNA) was shown. In this way, simply designing a primer logically does not necessarily obtain the intended performance (detection sensitivity, etc.), and may not have the required performance. In addition to logical design, further innovation and performance evaluation tests are important. The primer provided by the present invention is designed by further devising the logical design, and finally the performance evaluation test is cleared.

配列番号39 ゴマS AATTCTCATGTATGTGAATATGAAG
配列番号40 ゴマAS GTTCGCCTGAAAATCCTTAAC
配列番号41 メロンS GACAAAAAATCCAGTTTACTAATG
配列番号42 メロンAS GGATGTTTGTTATAATAATTAGACGAC
( Sはセンスプライマーを表し、ASはアンチセンスプライマーを表す。)
Sequence number 39 sesame S AATTCTCATGTATGTGAATATGAAG
Sequence number 40 Sesame AS GTTCGCCTGAAAATCCTTAAC
SEQ ID NO: 41 Melon S GACAAAAAATCCAGTTTACTAATG
SEQ ID NO: 42 Melon AS GGATGTTTGTTATAATAATTAGACGAC
(S represents a sense primer and AS represents an antisense primer.)

特定動植物検出法
本発明の特定植物検出方法は、試料からDNAを抽出する工程と、このDNAを鋳型として、本発明のプライマーセットを用いてPCRを行う工程と、増幅されたDNAを検出することにより試料中にゴマ、メロン、まぐろ、ブリ、あじ、たら、たこ、又はほたてがいが存在しているか否かを検出する工程とを含む方法である。
Specific animal and plant detection method The specific plant detection method of the present invention comprises a step of extracting DNA from a sample, a step of performing PCR using the primer set of the present invention using this DNA as a template, and detecting the amplified DNA. And detecting whether sesame, melon, tuna, yellowtail, horse mackerel, octopus, or scallop is present in the sample.

即ち、上記本発明の特定植物検出用PCRプライマーセットを用いて、試料中のDNAをPCR等で核酸分析することにより、試料中の特定植物を特異的に検出することが可能となる。このとき、ゴマを検出する場合には、ゴマ検出用PCRプライマーセットを使用し、同様にメロン、まぐろ、ブリ、あじ、たら、たこ、ほたてがいを検出する場合には、それぞれメロン検出用PCRプライマーセット、まぐろ検出用PCRプライマーセット、ブリ検出用PCRプライマーセット、あじ検出用PCRプライマーセット、たら検出用PCRプライマーセット、たこ検出用PCRプライマーセット、ほたてがい検出用PCRプライマーセットを使用すればよい。   That is, by using the PCR primer set for detecting a specific plant of the present invention to analyze nucleic acid of DNA in a sample by PCR or the like, it is possible to specifically detect a specific plant in the sample. At this time, when detecting sesame, the PCR primer set for detecting sesame is used, and when detecting melon, tuna, yellowtail, horse mackerel, octopus, and scallop, PCR primers for detecting melon are also used. A PCR primer set for tuna detection, a PCR primer set for yellowtail detection, a PCR primer set for horsetail detection, a PCR primer set for detection, a PCR primer set for octopus detection, and a PCR primer set for scallop detection may be used.

検出法(核酸分析)の種類は、特に限定されず、適宜公知の方法を用いることができる
。例えば、PCRプライマーを用いてPCR増幅する方法やPCR増幅産物をプローブで検出する方法等を例示することができる。
The type of detection method (nucleic acid analysis) is not particularly limited, and a known method can be used as appropriate. For example, a method of PCR amplification using PCR primers, a method of detecting a PCR amplification product with a probe, and the like can be exemplified.

PCRプライマーを用いてPCR増幅する方法としては、検出目的に応じて選択した上記本発明の特定動植物検出用プライマーセットを用いて、試料中のDNAにおける標的塩基配列を選択的に増幅させ、PCR増幅産物の有無を測定する方法が挙げられる。PCR増幅産物の有無の確認は、通常、PCR増幅産物をアガロースゲル電気泳動により分離し、エチジウムブロマイドやサイバーグリーンIなどの核酸染色によって行うことができる。リアルタイムPCR装置を用いてPCRを行う場合は、その装置の検出システムにより自動的にPCR増幅産物の有無を確認することができる。例えば、PCR反応液中にサイバーグリーンIを添加した場合、サイバーグリーンIが二本鎖DNAに結合したときに発する蛍光量に依存したPCR増幅産物量をサイクル毎にモニターすることができる。さらに、PCR後に、PCR増幅産物の融解曲線分析を行い、その分析からPCR増幅産物の融解温度(Tm)値を導くことにより、PCR増幅産物が目的の増幅産物であるか否かを確認できる。状況によっては、このTm値による判断が困難な場合も想定されるが、そのような場合には、先述のアガロースゲル電気泳動によって増幅産物の有無とそのサイズを確認すればよい。   As a method of PCR amplification using PCR primers, the target nucleotide sequence in DNA in a sample is selectively amplified using the above-mentioned primer set for detecting specific animals and plants of the present invention selected according to the detection purpose, and PCR amplification The method of measuring the presence or absence of a product is mentioned. Confirmation of the presence or absence of a PCR amplification product can usually be performed by separating the PCR amplification product by agarose gel electrophoresis and staining with nucleic acid such as ethidium bromide or cyber green I. When PCR is performed using a real-time PCR apparatus, the presence or absence of a PCR amplification product can be automatically confirmed by the detection system of the apparatus. For example, when Cyber Green I is added to the PCR reaction solution, the amount of PCR amplification product depending on the amount of fluorescence emitted when Cyber Green I binds to double-stranded DNA can be monitored for each cycle. Furthermore, it is possible to confirm whether or not the PCR amplification product is the target amplification product by performing a melting curve analysis of the PCR amplification product after the PCR and deriving a melting temperature (Tm) value of the PCR amplification product from the analysis. Depending on the situation, it may be difficult to make a determination based on the Tm value. In such a case, the presence and size of the amplification product may be confirmed by the agarose gel electrophoresis described above.

具体的には、配列番号1記載のプライマーと配列番号2記載のプライマーを用いたPCR増
幅産物のTm値は約77.3℃であり、PCR増幅産物のサイズは約150 bpである。融解曲線分析
において、当該Tm値を得た場合、又は、アガロース電気泳動において当該サイズの増幅産物を検出した場合、被験試料中にゴマが存在していたことを示唆する。
Specifically, the Tm value of the PCR amplification product using the primer set forth in SEQ ID NO: 1 and the primer set forth in SEQ ID NO: 2 is about 77.3 ° C., and the size of the PCR amplification product is about 150 bp. In the melting curve analysis, when the Tm value is obtained, or when an amplification product of the size is detected in agarose electrophoresis, it indicates that sesame was present in the test sample.

また、配列番号3記載のプライマーと配列番号4記載のプライマーを用いたPCR増幅産物
のTm値は約79.5℃であり、PCR増幅産物のサイズは約179 bpである。融解曲線分析におい
て、当該Tm値を得た場合、又は、アガロース電気泳動において当該サイズの増幅産物を検出した場合、被験試料中にメロンが存在していたことを示唆する。
The Tm value of the PCR amplification product using the primer set forth in SEQ ID NO: 3 and the primer set forth in SEQ ID NO: 4 is about 79.5 ° C., and the size of the PCR amplification product is about 179 bp. When the Tm value is obtained in the melting curve analysis, or when an amplification product of the size is detected by agarose electrophoresis, it indicates that melon was present in the test sample.

また、配列番号5記載のプライマーと配列番号6記載のプライマーを用いたPCR増幅産物
のTm値は約80.5℃であり、PCR増幅産物のサイズは約130 bpである。融解曲線分析におい
て、当該Tm値を得た場合、又は、アガロース電気泳動において当該サイズの増幅産物を検出した場合、被験試料中にまぐろが存在していたことを示唆する。
The Tm value of the PCR amplification product using the primer set forth in SEQ ID NO: 5 and the primer set forth in SEQ ID NO: 6 is about 80.5 ° C, and the size of the PCR amplification product is about 130 bp. When the Tm value is obtained in the melting curve analysis, or when an amplification product of the size is detected by agarose electrophoresis, it indicates that tuna was present in the test sample.

また、配列番号7記載のプライマーと配列番号8記載のプライマーを用いたPCR増幅産物
のTm値は約84.7℃であり、PCR増幅産物のサイズは約105 bpである。融解曲線分析におい
て、当該Tm値を得た場合、又は、アガロース電気泳動において当該サイズの増幅産物を検出した場合、被験試料中にブリが存在していたことを示唆する。
The Tm value of the PCR amplification product using the primer set forth in SEQ ID NO: 7 and the primer set forth in SEQ ID NO: 8 is about 84.7 ° C., and the size of the PCR amplification product is about 105 bp. When the Tm value is obtained in the melting curve analysis, or when an amplification product of the size is detected by agarose electrophoresis, it indicates that yellowtail was present in the test sample.

また、配列番号9記載のプライマー、配列番号10、配列番号11記載のプライマーを用い
たPCR増幅産物のTm値は約79.5℃であり、PCR増幅産物のサイズは約77 bpである。融解曲線分析において、当該Tm値を得た場合、又は、アガロース電気泳動において当該サイズの増幅産物を検出した場合、被験試料中にあじが存在していたことを示唆する。
The Tm value of the PCR amplification product using the primer shown in SEQ ID NO: 9, the primer shown in SEQ ID NO: 10 and SEQ ID NO: 11 is about 79.5 ° C., and the size of the PCR amplification product is about 77 bp. In the melting curve analysis, when the Tm value is obtained, or when an amplification product of the size is detected by agarose electrophoresis, it indicates that a horse mackerel was present in the test sample.

また、配列番号12記載のプライマーと配列番号13記載のプライマーを用いたPCR増幅産
物のTm値は約83.4℃であり、PCR増幅産物のサイズは約144 bpである。融解曲線分析にお
いて、当該Tm値を得た場合、又は、アガロース電気泳動において当該サイズの増幅産物を検出した場合、被験試料中にたらが存在していたことを示唆する。
The Tm value of the PCR amplification product using the primer set forth in SEQ ID NO: 12 and the primer set forth in SEQ ID NO: 13 is about 83.4 ° C., and the size of the PCR amplification product is about 144 bp. In the melting curve analysis, when the Tm value is obtained, or when an amplification product of the size is detected by agarose electrophoresis, it suggests that potatoes were present in the test sample.

また、配列番号14記載のプライマーと配列番号15記載のプライマーを用いたPCR増幅産
物のTm値は約76.4℃であり、PCR増幅産物のサイズは約204 bpである。融解曲線分析にお
いて、当該Tm値を得た場合、又は、アガロース電気泳動において当該サイズの増幅産物を検出した場合、被験試料中にたこが存在していたことを示唆する。
The Tm value of the PCR amplification product using the primer set forth in SEQ ID NO: 14 and the primer set forth in SEQ ID NO: 15 is about 76.4 ° C., and the size of the PCR amplification product is about 204 bp. When the Tm value is obtained in the melting curve analysis, or when an amplification product of the size is detected by agarose electrophoresis, it indicates that octopus was present in the test sample.

また、配列番号16記載のプライマー、配列番号17記載のプライマー、配列番号18記載の
プライマー及び配列番号19記載のプライマーを用いたPCR増幅産物のTm値は約83.8℃であ
り、PCR増幅産物のサイズは約145また約180 bpである。融解曲線分析において、当該Tm値を得た場合、又は、アガロース電気泳動において当該サイズの増幅産物を検出した場合、被験試料中にほたてがいが存在していたことを示唆する。
In addition, the Tm value of the PCR amplification product using the primer shown in SEQ ID NO: 16, the primer shown in SEQ ID NO: 17, the primer shown in SEQ ID NO: 18 and the primer shown in SEQ ID NO: 19 is about 83.8 ° C., and the size of the PCR amplification product Is about 145 or about 180 bp. When the Tm value is obtained in the melting curve analysis, or when an amplification product of the size is detected by agarose electrophoresis, it indicates that scallop was present in the test sample.

PCR増幅産物をプローブで検出する方法としては、Taq Man法に代表されるように、PCR増幅産物の内部塩基配列とハイブリダイズするような蛍光物質標識プローブを反応液に添加し、該プローブがPCR増幅産物にハイブリダイズ後、該プローブが分解されるときに生じる蛍光量をリアルタイムPCR装置で自動的に検出することによって、PCR増幅産物の有無を確認する方法が挙げられる。なお、PCR増幅産物をプローブで検出するその他の方法としては、Molecular Beacon法、CycleavePCR法、ハイブリプローブを利用する方法等が挙げられる。これらの方法で使用するPCRプライマーは、本発明の特定動植物検出用PCRプライマーセットの何れかを使用すればよく、各々のPCRプライマーセットで増幅されるPCR増幅産物の内部塩基配列から標的とする生物種に共通な塩基配列領域を別途選択し、その領域に基づいたプローブを使用すればよい。   As a method for detecting a PCR amplification product with a probe, as represented by the Taq Man method, a fluorescent substance-labeled probe that hybridizes with the internal base sequence of the PCR amplification product is added to the reaction solution, and the probe is used for PCR. There is a method of confirming the presence or absence of a PCR amplification product by automatically detecting the amount of fluorescence generated when the probe is decomposed after hybridization with an amplification product with a real-time PCR apparatus. Examples of other methods for detecting a PCR amplification product with a probe include a Molecular Beacon method, a Cycleave PCR method, and a method using a hybrid probe. The PCR primer used in these methods may be any of the PCR primer sets for detecting specific animals and plants of the present invention, and the target organism from the internal base sequence of the PCR amplification product amplified by each PCR primer set. A base sequence region common to the species may be separately selected, and a probe based on that region may be used.

本発明の特定動植物の検出法において、対象となる被験試料の種類は、特に限定されな
い。例えば、被験試料としては、食品原料や加工食品等が挙げられる。食品原料としては
、特定動植物を取り扱う食品原料生産工場において、別途生産される特定動植物を意図的
に含まない食品原料が挙げられる。加工食品としては、菓子類、麺類、粉末スープ、液体
スープ、熱風乾燥又は凍結乾燥した具材、あるいは、これらの加工食品を含有する各種調
理食品等が挙げられる。また、特定動植物を取り扱う食品製造工場において、別途生産さ
れる特定動植物を意図的に含まない加工食品が挙げられる。また、特定動植物を含む加工
食品を製造後、特定動植物を含まない加工食品を製造する際には、特定動植物残渣の除去
を念頭においた食品製造設備の入念な清掃作業が必須となる。この清掃作業方法の有効性
、並びに、食品製造設備の特定動植物残渣の有無を確認する観点から、当該製造設備の拭
き取り試料も被験試料として挙げられる。
In the method for detecting a specific animal or plant of the present invention, the type of the test sample to be targeted is not particularly limited. For example, examples of the test sample include food raw materials and processed foods. Examples of the food raw material include food raw materials that do not intentionally include a specific animal or plant produced separately in a food raw material production plant that handles the specific animal or plant. Examples of processed foods include confectionery, noodles, powdered soup, liquid soup, hot-air dried or freeze-dried ingredients, and various cooked foods containing these processed foods. Moreover, in the food manufacturing factory which handles specific animals and plants, the processed food which does not contain the specific animals and plants produced separately is mentioned. In addition, after manufacturing a processed food containing a specific animal or plant, when manufacturing a processed food that does not include the specific animal or plant, a careful cleaning operation of the food production facility with the removal of the specific animal or plant residue in mind is essential. From the viewpoint of confirming the effectiveness of this cleaning method and the presence or absence of a specific animal or plant residue in the food production facility, a wiped sample of the production facility is also included as a test sample.

また、試料の形態も特に限定されず、一般的な既知のDNA抽出法(厚生労働省医薬局食
品保健部長通知、アレルギー物質を含む食品の検査方法について、平成14年11月06日、食
発第1106001号)や市販の各種DNA抽出キット[例えば、Nucleon PhytoPure, plant and f
ungal DNA extraction kits(Amersham Biosciences Corp., USA)、DNA Extraction Iso
plantII kit(Nippon Gene Co. Ltd., Japan)、DNeasy Plant Mini Kit(Qiagen GmbH,
Hilden, Germany)等]によって、DNAの回収が可能な試料であれば、上記の検出法に適用することができる。上記のDNA抽出法によって、ゲノムDNA及び細胞小器官由来DNA(ミトコンドリアDNAやクロロプラストDNA)を、通常、試料から抽出することができる。
In addition, the form of the sample is not particularly limited, and a general known DNA extraction method (Notice of the Director of Food Health Department, Ministry of Health, Labor and Welfare, Ministry of Health, Labor and Welfare, for the inspection method of foods containing allergens, November 6, 2002, 1106001) and various DNA extraction kits [for example, Nucleon PhytoPure, plant and f
ungal DNA extraction kits (Amersham Biosciences Corp., USA), DNA Extraction Iso
plantII kit (Nippon Gene Co. Ltd., Japan), DNeasy Plant Mini Kit (Qiagen GmbH,
Hilden, Germany), etc.] can be applied to the above detection method as long as the DNA can be recovered. Genomic DNA and organelle-derived DNA (mitochondrial DNA or chloroplast DNA) can usually be extracted from a sample by the above-described DNA extraction method.

特定動植物検出用キット
本発明は、また、特定動植物検出キットに関する。当該キットは、上記本発明の特定動植
物検出用PCRプライマーセットの少なくとも1セットを含んで成るものであれば、その構
成は特に限定されない。
具体的には、配列番号1における塩基番号13〜27の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基
のDNAからなるプライマーと、配列番号2における塩基番号7〜21の塩基配列を3´末端側に
含む最大30塩基のDNAからなるプライマーとのセット;
配列番号3における塩基番号9〜23の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなる
プライマーと、配列番号4における塩基番号11〜25の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるプライマーとのセット;
配列番号5における塩基番号10〜24の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからな
るプライマーと、配列番号6における塩基番号7〜21の塩基配列を3´末端側に含む最大30
塩基のDNAからなるプライマーとのセット;
配列番号7における塩基番号8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなる
プライマーと、配列番号8における塩基番号9〜23の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩
基のDNAからなるプライマーとのセット;
配列番号9における塩基番号8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなる
プライマー、配列番号10における塩基番号8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基
のDNAからなるプライマー、及び配列番号11における塩基番号8〜22の塩基配列を3´末端
側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーとのセット;
配列番号12における塩基番号6〜20の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからな
るプライマーと、配列番号13における塩基番号4〜18の塩基配列を3´末端側に含む最大30
塩基のDNAからなるプライマーとのセット;
配列番号14における塩基番号11〜25の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからな
るプライマーと、配列番号15における塩基番号8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最大30
塩基のDNAからなるプライマーとのセット;及び
配列番号16における塩基番号7〜21の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからな
るプライマー、配列番号17における塩基番号10〜24の塩基配列を3´末端側に含む最大30
塩基のDNAからなるプライマー、配列番号18における塩基番号10〜24の塩基配列を3´末端
側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマー、及び配列番号19における塩基番号9〜23の
塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーとのセットの1セット以
上を含む特定動植物検出キットが挙げられる。
The kit for detecting a specific animal or plant The present invention also relates to a kit for detecting a specific animal or plant. The configuration of the kit is not particularly limited as long as it comprises at least one PCR primer set for detecting specific animals and plants of the present invention.
Specifically, a primer composed of a DNA having a maximum of 30 bases including the base sequence of base numbers 13 to 27 in SEQ ID NO: 1 on the 3 ′ end side, and the base sequence of base numbers 7 to 21 in SEQ ID NO: 2 to the 3 ′ end Set with primers consisting of DNA of up to 30 bases on the side;
Primer consisting of a DNA of up to 30 bases containing the base sequence of base numbers 9-23 in SEQ ID NO: 3 on the 3 ′ end side and a maximum of 30 containing the base sequence of base numbers 11-25 in SEQ ID NO: 4 on the 3 ′ end side Set with primers consisting of base DNA;
Primer consisting of a DNA of up to 30 bases containing the base sequence of base numbers 10-24 in SEQ ID NO: 5 on the 3 'end side, and a maximum of 30 containing the base sequence of base numbers 7-21 in SEQ ID NO: 6 on the 3' end side
Set with primers consisting of base DNA;
Primer consisting of a DNA of up to 30 bases containing the base sequence of base numbers 8-22 in SEQ ID NO: 7 on the 3 ′ end side, and a maximum of 30 containing the base sequence of base numbers 9-23 in SEQ ID NO: 8 on the 3 ′ end side Set with primers consisting of base DNA;
Primer consisting of DNA of up to 30 bases containing the base sequence of nucleotide numbers 8-22 in SEQ ID NO: 9 on the 3 ′ end side, maximum 30 bases containing base sequence of base numbers 8-22 in SEQ ID NO: 10 on the 3 ′ end side A set consisting of a primer consisting of the DNA of and a primer consisting of a DNA consisting of a maximum of 30 bases comprising the base sequence of nucleotide numbers 8 to 22 in SEQ ID NO: 11 on the 3 ′ end side;
A primer composed of a DNA having a maximum of 30 bases including the base sequence of base numbers 6-20 in SEQ ID NO: 12 on the 3 ′ end side and a maximum of 30 including the base sequence of base numbers 4-18 in SEQ ID NO: 13 on the 3 ′ end side
Set with primers consisting of base DNA;
Primer consisting of a DNA of up to 30 bases containing the base sequence of base numbers 11-25 in SEQ ID NO: 14 on the 3 ′ end side, and a maximum of 30 containing the base sequence of base numbers 8-22 in SEQ ID NO: 15 on the 3 ′ end side
A primer set consisting of a base DNA; and a primer consisting of a maximum of 30 base DNAs containing the base sequence of base numbers 7 to 21 in SEQ ID NO: 16 on the 3 ′ end side; bases of base numbers 10 to 24 in SEQ ID NO: 17 Up to 30 sequences at the 3´ end
A primer composed of a base DNA, a primer composed of a maximum of 30 bases DNA containing the base sequence of base numbers 10 to 24 in SEQ ID NO: 18 on the 3 ′ end side, and a base sequence of base numbers 9 to 23 in SEQ ID NO: 19 Specific animal and plant detection kits containing one or more sets of primers consisting of a DNA consisting of a maximum of 30 bases contained on the 'terminal side are mentioned.

そして、好ましいものとして、配列番号1の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDN
Aからなるプライマーと、配列番号2の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからな
るプライマーとのセット;
配列番号3の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーと、配列番
号4の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーとのセット;
配列番号5の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーと、配列番
号6の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーとのセット;
配列番号7の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーと、配列番
号8の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーとのセット;
配列番号9の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマー、配列番号10の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマー、及び配列番号11の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーとのセット;
配列番号12の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーと、配列番号13の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーとのセット;
配列番号14の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーと、配列番号15の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーとのセット;及び配列番号16の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマー、配列番号17の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマー、配列番号18の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマー、配列番号19の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるプライマーとのセットの1セット以上を含む特定動植物検出キットが挙げられる。
And, as a preferable one, a DN of up to 30 bases including the base sequence of SEQ ID NO: 1 on the 3 ′ end side
A set of a primer consisting of A and a primer consisting of a DNA consisting of a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 2 on the 3 ′ end side;
A set of a primer composed of a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 3 on the 3 ′ end side and a primer composed of a DNA of a maximum of 30 bases including the base sequence of SEQ ID NO: 4 on the 3 ′ end side;
A set of a primer composed of a DNA having a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 5 on the 3 ′ end side and a primer consisting of a DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 6 on the 3 ′ end side;
A set of a primer composed of a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 7 on the 3 ′ end side and a primer composed of a DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 8 on the 3 ′ end side;
Primer consisting of up to 30 bases of DNA containing the base sequence of SEQ ID NO: 9 on the 3 ′ end side, primer consisting of up to 30 bases of DNA containing the base sequence of SEQ ID NO: 10 on the 3 ′ end side, and bases of SEQ ID NO: 11 Set with a primer consisting of DNA of up to 30 bases containing the sequence at the 3 ′ end;
A set of a primer consisting of a maximum of 30 bases DNA containing the base sequence of SEQ ID NO: 12 on the 3 ′ end side and a primer consisting of a DNA base of up to 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 13 on the 3 ′ end side;
A set of a primer composed of a maximum of 30 bases DNA containing the base sequence of SEQ ID NO: 14 on the 3 ′ end side and a primer composed of a DNA base of up to 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 15 on the 3 ′ end side; and a sequence Primer consisting of up to 30 bases of DNA containing the base sequence of No. 16 on the 3 ′ end side, primer consisting of up to 30 bases of DNA containing the base sequence of SEQ ID No. 17 on the 3 ′ end side, base sequence of SEQ ID No. 18 A specific animal and plant detection kit comprising one or more sets of a primer composed of a DNA comprising a maximum of 30 bases on the 3 ′ end side and a primer comprising a DNA sequence comprising a base sequence of SEQ ID NO: 19 on the 3 ′ end side and a DNA comprising a maximum of 30 bases Can be mentioned.

その中でも、特に好ましいものとして、配列番号1の塩基配列からなるプライマーと、
配列番号2の塩基配列からなるプライマーとのセット;
配列番号3の塩基配列からなるプライマーと、配列番号4の塩基配列からなるプライマーと
のセット;
配列番号5の塩基配列からなるプライマーと、配列番号6の塩基配列からなるプライマーと
のセット;
配列番号7の塩基配列からなるプライマーと、配列番号8の塩基配列からなるプライマーと
のセット;
配列番号9の塩基配列からなるプライマー、配列番号10の塩基配列からなるプライマー、
及び配列番号11の塩基配列からなるプライマーとのセット;
配列番号12の塩基配列からなるプライマーと、配列番号13の塩基配列からなるプライマー
とのセット;
配列番号14の塩基配列からなるプライマーと、配列番号15の塩基配列からなるプライマー
とのセット;
配列番号16の塩基配列からなるプライマー、配列番号17の塩基配列からなるプライマー、
配列番号18の塩基配列からなるプライマー、配列番号19の塩基配列からなるプライマーと
のセットの1セット以上を含む特定動植物検出キットが挙げられる。
また、上記の各々のプライマーセット、及び当該の各々のプライマーセットで増幅され
るPCR増幅産物を検出するためのプローブ等を含む特定動植物検出キットなども挙げられ
る。
Among them, as a particularly preferred one, a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 1,
Set with a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 2;
A set of a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 3 and a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 4;
A set of a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 5 and a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 6;
A set of a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 7 and a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 8;
A primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 9, a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 10,
And a set consisting of a primer consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11;
A set of a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 12 and a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 13;
A set of a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 14 and a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 15;
A primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 16, a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 17,
A specific animal and plant detection kit comprising one or more sets of a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 18 and a primer consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 19 can be mentioned.
In addition, specific animal and plant detection kits including the above-described primer sets and probes for detecting PCR amplification products amplified by the respective primer sets are also included.

当該キットには、使用目的等に応じて、適当な試薬や各種容器等を含めることができる
。具体的には、PCRプライマー伸長生成物を合成するための重合用試薬、例えば、耐熱性DNAポリメラーゼ、デオキシリボヌクレオチド、マグネシウム及び、PCR反応用緩衝液、並びに、それらの品質を適切に保持可能な保存容器等を含めることができる。
The kit can contain appropriate reagents and various containers according to the purpose of use. Specifically, polymerization reagents for synthesizing PCR primer extension products, such as heat-resistant DNA polymerase, deoxyribonucleotides, magnesium, and buffers for PCR reactions, and storage that can maintain their quality appropriately Containers and the like can be included.

実施例
以下に、本発明について実施例を用いて、さらに、詳細に説明するが、本発明は、これら
の実施例に限定して解釈されるものではない。また、本発明の要旨を逸脱することなく、
適宜変更することが可能である。
EXAMPLES Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to examples. However, the present invention is not construed as being limited to these examples. Also, without departing from the spirit of the present invention.
It can be changed as appropriate.

実施例1
各種動物、植物、真菌及び、細菌由来DNAに対する特定植物用PCRプライマーセットの検出特異性の確認
本発明の特定植物用PCRプライマーセットを使用したPCR分析法の有効性を確認するために、各種生物由来DNAに対するPCRの検出特異性を調べる実験を、下記のように実施した。ヒト、ウシ、ブタ、ニワトリ、アフリカツメガエル、及びチョウザメの精製DNAは、セマイン社(CeMines, LLC, USA)から購入したものを使用した。
クロマグロ、キハダマグロ、メバチマグロ、ビンチョウマグロ、カツオ、ゴマサバ、マサ
バ、タイセイヨウサバ、ブリ、ヒラマサ、カンパチ、マアジ、ニュージーランドマアジ、
メアジ、シマアジ、マルアジ、マアナゴ、マイワシ、マダラ、サケ(シロザケ)、ギンザ
ケ、スチールヘッド(ニジマス)、マダコ、ミズダコ、イイダコ、ヤナギダコ、スルメイ
カ、ヤリイカ、カミナリイカ、ホタルイカ、ホタテガイ、アメリカイタヤガイ、アメリカ
ヒナイタヤガイ、タイラギ、ムラサキイガイ、アサリ、エゾアワビ、トコブシ、ベニズワ
イガニ、タラバガニ、及びブラックタイガーエビの精製DNAは、商店から購入した各々の
試料の(筋)肉質部分を凍結後、マルチビーズショッカー(安井器械、大阪)で破砕した
試料からNucleon PhytoPure, plant and fungal DNA extraction kits(Amersham Biosci
ences Corp., USA)、DNA Extraction IsoplantII kit(Nippon Gene Co. Ltd., Japan)
、またはDNeasy Blood&Tissue kit(Qiagen GmbH, Germany)を用いて調製したものを使
用した。
Example 1
Confirmation of detection specificity of PCR primer set for specific plants against various animal, plant, fungus, and bacteria-derived DNA In order to confirm the effectiveness of PCR analysis method using PCR primer set for specific plants of the present invention, An experiment to examine the detection specificity of PCR for the derived DNA was performed as follows. Purified DNA from humans, cows, pigs, chickens, Xenopus, and sturgeon was purchased from CeMines, LLC, USA.
Bluefin tuna, yellowfin tuna, bigeye tuna, bincho tuna, bonito, sesame mackerel, chub mackerel, Atlantic mackerel, yellowtail, kingfish, amberjack, maji, New Zealand mahji,
Japanese horse mackerel, striped sea bream, maraji, maanago, sardine, madara, salmon (white salmon), coho salmon, steelhead (rainbow trout), octopus, octopus, octopus, willow octopus, squid, squid, sea squid, firefly squid, scallop Purified DNA of tiger swordfish, mussel, clams, tiger abalone, tocobushi, red crab, king crab, and black tiger shrimp, after freezing the (muscle) meat portion of each sample purchased from a store, multi-beads shocker (Yasui Kikai, Osaka) Nucleon PhytoPure, plant and fungal DNA extraction kits (Amersham Biosci
ences Corp., USA), DNA Extraction IsoplantII kit (Nippon Gene Co. Ltd., Japan)
Or prepared using DNeasy Blood & Tissue kit (Qiagen GmbH, Germany).

クロゴキブリの精製DNAは、その脚の部分を70%エタノールで洗浄し、さらに、TBS緩衝液で洗浄後、マルチビーズショッカーで粉砕した試料からNucleon PhytoPure, plant andfungal DNA extraction kitsを用いて調製したものを使用した。
ゴマ(白色系統、黒色系統)、シソ、エゴマ、タイム、スペアミント、バジル、オレガノ、
ローズマリー、ナス、ジャガイモ、トマト、トウガラシ、クコ、サツマイモ、キウイフル
ーツ、ニンジン、ゴボウ、メロン(アムスメロン、アールスメロン、レッドメロン、ハネ
デューメロン)、フユメロン(ハミウリ)、マクワウリ、シロウリ、キュウリ、スイカ、ト
ウガン、カボチャ、ツルレイシ、ニガウリ、ダイズ(黄色系統)、アズキ、クリ、クルミ、
リンゴ(フジ)、イチゴ、ナシ(幸水)、キャベツ、ウンシュウミカン、ネギ、アスパラガス
は、商店から購入し、モモ(白鳳)、イチゴ、及びイネは国内栽培農家から入手した。こ
れらの精製DNAは、各々の試料の一部(種子、果皮部、葉部、塊茎部)を70%エタノールで洗浄し、さらに、TE緩衝液で素早く洗浄後、マルチビーズショッカー(安井器械、大阪)で破砕した試料からNucleon PhytoPure, plant and fungal DNA extraction kits、 DNeasy plant Mini kits(Qiagen GmbH, Germany)または、DNA Extraction IsoplantII kit
を用いて調製したものを使用した。
The purified black cockroach DNA was prepared using Nucleon PhytoPure, plant and fungal DNA extraction kits from a sample that had been washed with 70% ethanol and then ground with a multi-bead shocker after washing with TBS buffer. It was used.
Sesame (white, black), perilla, egoma, thyme, spearmint, basil, oregano,
Rosemary, eggplant, potato, tomato, capsicum, wolfberry, sweet potato, kiwi fruit, carrot, burdock, melon (Amus melon, Earl melon, red melon, honeydew melon), fuyu melon (Hamiuri), cucumber, shirouri, cucumber, watermelon, Tougan, pumpkin, pickaxe, bitter gourd, soybean (yellow line), azuki, chestnut, walnut,
Apple (Fuji), strawberry, pear (Yoshimizu), cabbage, Satsuma mandarin, leek, asparagus were purchased from a store, while peach (white birch), strawberry, and rice were obtained from domestically grown farmers. For these purified DNAs, a portion of each sample (seed, pericarp, leaf, tuber) was washed with 70% ethanol, and then quickly washed with TE buffer, followed by a multi-bead shocker (Yasui Kikai, Osaka). Nucleon PhytoPure, plant and fungal DNA extraction kits, DNeasy plant Mini kits (Qiagen GmbH, Germany) or DNA Extraction Isoplant II kit
What was prepared using was used.

ソバの精製DNAは、商店から購入したそば粉をマルチビーズショッカーで、さらに粉砕
した試料からNucleon PhytoPure, plant and fungal DNA extraction kitsを用いて調製
したものを使用した。
The purified buckwheat DNA used was a buckwheat flour purchased from a store using a multi-bead shocker, and a pulverized sample prepared using Nucleon PhytoPure, plant and fungal DNA extraction kits.

コムギ及びトウモロコシの精製DNAは、バイオチェイン・インスティテュート社(BioChain Institute, Inc., USA)から購入したものを使用した。   Purified wheat and corn DNA was purchased from BioChain Institute, Inc., USA.

アスペルギウス・ニガー(Aspergillus niger IFO 9642)、サッカロマイセス・セレビ
シエ(Saccharomyces cerevisiae IFO 0282)、大腸菌(Escherichia coli JCM 1649T)
、及びバチルス・セレウス菌(Bacillus cereus DSM 4312)の精製DNAは、各々の菌株を
適切な培地で培養後、その培養液からPuregene Yeast and Gram-Positive DNA Isolation
kit(Gentra Systems Inc., USA)を用いて調製したものを使用した。
Aspergillus niger IFO 9642, Saccharomyces cerevisiae IFO 0282, Escherichia coli JCM 1649T
The purified DNA of Bacillus cereus DSM 4312 is obtained by culturing each strain in an appropriate medium, and then purifying the pure gene yeast and gram-positive DNA isolation from the culture solution.
What was prepared using kit (Gentra Systems Inc., USA) was used.

マツタケ、シイタケ、エノキダケ、ナメコ、及びエリンギの精製DNAは、商店から購入
した試料の小片を凍結後、マルチビーズショッカーで破砕した試料からNucleon PhytoPur
e, plant and fungal DNA extraction kitsを用いて調製したものを使用した。
なお、いずれの精製DNAもRNA分解酵素によるRNAの除去操作を実施してある。
Purified DNA of matsutake, shiitake, enoki mushrooms, nameko, and eringgi is obtained by freezing small pieces of samples purchased from a store and then crushing them with a multi-bead shocker. Nucleon PhytoPur
What was prepared using e, plant and fungal DNA extraction kits was used.
All purified DNAs have been subjected to RNA removal by RNase.

配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、及び19
に記載の各々のPCRプライマーは、オペロン・バイオテクノジー社(Operon Biotechnolog
ies GmbH, Germany)で合成されたものを、以下のPCRで使用した。
SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, and 19
Each PCR primer described in is described in Operon Biotechnolog.
ies GmbH, Germany) was used in the following PCR.

上述したように準備した各種動物、植物、真菌、及び細菌DNA量を測定後、滅菌水を用
いて、動物、植物、及び真菌DNAの濃度を1 ng/μLに、細菌DNAの濃度を50 pg/μLに調製した。調製した1 μLのDNA試料液を含む20 μL容量の反応液は、タカラバイオ社のSYBR Premix Ex Taq(Takara Bio Inc., Japan)を用いて調製した。この試薬は、TaKaRa Ex Taq HS(ホットスタートタイプ)、dNTP Mixture、Mg2+およびSYBR Green Iを溶液中に含んでいる。反応液は、SYBR Premix Ex Taqをベースとし、250 nMセンスプライマー、250 nMアンチセンスプライマーを含む組成として、調製した。PCR反応は、LightCycler(Roche Diagnostics GmbH, Germany)で行い、増幅反応条件は以下の通りである。
After measuring the amount of various animal, plant, fungal, and bacterial DNA prepared as described above, using sterile water, the concentration of animal, plant, and fungal DNA is 1 ng / μL, and the concentration of bacterial DNA is 50 pg. / μL. A 20 μL reaction solution containing the prepared 1 μL DNA sample solution was prepared using SYBR Premix Ex Taq (Takara Bio Inc., Japan) manufactured by Takara Bio Inc. This reagent contains TaKaRa Ex Taq HS (hot start type), dNTP Mixture, Mg2 + and SYBR Green I in the solution. The reaction solution was prepared as a composition containing 250 nM sense primer and 250 nM antisense primer based on SYBR Premix Ex Taq. PCR reaction is performed with LightCycler (Roche Diagnostics GmbH, Germany), and amplification reaction conditions are as follows.

95℃で1分間のサイクルを一回実施後、20℃/秒の速度で95℃まで昇温後、5秒間同温度
で保温、次に20℃/秒の速度でT℃まで降温後、10秒間同温度で保温、さらに10℃/秒の速
度で72℃まで昇温後、20秒間同温度で保温する3つのステップからなる増幅サイクルをぶ
り検出用PCRプライマーの場合には30回、ゴマ、メロン、まぐろ、あじ、たら、たこ、及
びほたてがい検出用PCRプライマーの場合には35回実施した。なお、Tは、ゴマ、メロン、及びたこ検出用PCRプライマーの場合には64、まぐろ、ぶり、及びほたてがい検出用PCRプライマーの場合には66、あじ検出用PCRプライマーの場合には62、たら検出用PCRプライマーの場合には53とした。PCR増幅産物は、SYBR Green I依存性の蛍光量として、各々のサイクルの最終ステップに記録した。増幅サイクル終了後、メルティングカーブは、20℃/秒の速度で95℃まで昇温後、次に20℃/秒の速度で60℃まで降温し、10秒間同温度で保温後、さらに0.2℃/秒の速度で97℃に至るまでのゆるやかな昇温中に0.2秒毎の蛍光強度を記録することによって得た。同PCR装置のソフトウェアによってメルティングカーブから得られたPCR増幅産物のTm値は、PCRによる特異的な増幅産物の有無を推定するために使用した。さらに、1.8%(wt/vol)アガロースゲル電気泳動によってPCR増幅産物(反応液の2μL)を分離し、分離後のゲルをエチジウムブロマイドで染色後、UV照射下において増幅産物を視覚化することによって、増幅産物の有無を確認した。分子量マーカーとしてΦX174 HaeIII digest DNA(Takara)を使用した。これらのPCRの結果を表1に記載した。表中の+(プラス)は電気泳動により標的サイズの増幅産物が検出されたことを示し、−(マイナス)は当該増幅産物が検出されなかったことを示す。
After one cycle of 95 ° C for 1 minute, heat up to 95 ° C at a rate of 20 ° C / second, hold at that temperature for 5 seconds, then drop to T ° C at a rate of 20 ° C / second, Incubate at the same temperature for 2 seconds, further increase the temperature to 72 ° C at a rate of 10 ° C / second, and then perform an amplification cycle consisting of 3 steps of keeping at the same temperature for 20 seconds. In the case of PCR primers for detection of melon, tuna, horse mackerel, tara, octopus, and scallop, 35 times were performed. T is 64 for PCR primers for detecting sesame, melon, and octopus, 66 for PCR primers for detecting tuna, yellowtail, and scallop, 62 for PCR primers for horse mackerel detection, In the case of the PCR primer for detection, it was set to 53. The PCR amplification product was recorded as the SYBR Green I-dependent fluorescence amount at the final step of each cycle. At the end of the amplification cycle, the melting curve was raised to 95 ° C at a rate of 20 ° C / s, then dropped to 60 ° C at a rate of 20 ° C / s, kept at the same temperature for 10 seconds, and then 0.2 ° C It was obtained by recording the fluorescence intensity every 0.2 seconds during a slow temperature increase to 97 ° C. at a rate of / sec. The Tm value of the PCR amplification product obtained from the melting curve by the PCR device software was used to estimate the presence or absence of a specific amplification product by PCR. Furthermore, by separating the PCR amplification product (2 μL of the reaction solution) by 1.8% (wt / vol) agarose gel electrophoresis, staining the separated gel with ethidium bromide, and then visualizing the amplification product under UV irradiation The presence or absence of the amplification product was confirmed. ΦX174 HaeIII digest DNA (Takara) was used as a molecular weight marker. The results of these PCRs are listed in Table 1. + (Plus) in the table indicates that an amplification product of the target size was detected by electrophoresis, and-(minus) indicates that the amplification product was not detected.

ゴマ検出用PCRプライマー(配列番号1及び2からなるPCRプライマーセット)を使用した場合、シソ目ゴマ科ゴマ属のゴマ(白色系統、黒色系統)DNAを使用した場合のみ150bp前後の増幅産物が確認され(表1)、これらの増幅産物のTm値は、約77.7℃であった。近縁種である同目シソ科シソ属のシソDNA、エゴマDNA、同目シソ科イブキジャコウソウ属のタイムDNA、同目シソ科ハッカ属のスペアミントDNA、同目シソ科メボウキ属のバジルDNA、同目シソ科ハナハッカ属のオレガノDNA、同目シソ科Rosmarinus属のローズマリーDNAや、他の植物を含むその他の生物種DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった(表1)。   When PCR primers for sesame detection (PCR primer set consisting of SEQ ID NOS: 1 and 2) are used, amplification products of around 150 bp are confirmed only when using sesame (white strain, black strain) DNA of the sesame family Sesameaceae (Table 1), the Tm value of these amplification products was about 77.7 ° C. Peripheral species Lamiaceae perilla genus, Sesame DNA, Lamiaceae Lactobacillus thyme DNA, Lamiaceae mint genus spearmint DNA, Lamiaceae Lactobacillus basil DNA, No amplification products were found when using Oregano DNA belonging to the genus Lamiaceae, Rosemary DNA belonging to the genus Rosmarinus, or other species DNA including other plants (Table 1).

なお、既知及び独自に解析した各種生物のクロロプラストのmatK遺伝子配列に関する多重並列配列図とPCRプライマー配列との関係から、当該PCRプライマーを用いたPCRは、ゴマ(白色系統、黒色系統)DNAを検出できるが、実施例1で供試しなかった他の植物を含むその他の生物種DNAを検出しないことが強く示唆されている。   In addition, from the relationship between multiple parallel sequence diagrams of the chloroplast matK gene sequences of various known organisms and independently analyzed and PCR primer sequences, PCR using the PCR primers is sesame (white strain, black strain) DNA. Although it can be detected, it is strongly suggested not to detect other species DNA including other plants not tested in Example 1.

また、メロン検出用PCRプライマー(配列番号3及び4からなるPCRプライマーセット)は、ウリ科キュウリ属のメロン(アムスメロン、アールスメロン、赤肉メロン、ハネデューメロン)DNA、フユメロン(ハミウリ)DNAを使用した場合のみ、179 bp前後の増幅産物が確認され(表1)、これらの増幅産物のTm値は、約79.5℃であった。近縁種である同科同属のマクワウリDNA、シロウリDNA、ハミウリDNA、キュウリDNA、同科スイカ属スイカDNA、同科トウガン属トウガンDNA、同科カボチャ属セイヨウカボチャDNA、同科ツルレイシ属ツルレイシDNA、ニガウリDNAや植物を含むその他の生物種DNAを使用した場合には増幅産物は見られなかった(表1)。   The PCR primer set for melon detection (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 3 and 4) uses cucumber melon (Ams melon, Earl melon, red meat melon, honeydew melon) DNA and fuyumelon (Hamiuri) DNA. Only when this was done, amplification products of around 179 bp were confirmed (Table 1), and the Tm value of these amplification products was about 79.5 ° C. Related species of the same genus Macwauli DNA, Shirouri DNA, Hamiuri DNA, Cucumber DNA, Family Watermelon Watermelon DNA, Family Carcinus Toucan DNA, Family Pumpkin genus Pumpkin DNA, No amplification products were found when using bitter gourd DNA or DNA of other species including plants (Table 1).

なお、既知及び独自に解析した各種生物のクロロプラストのmatK遺伝子配列に関する多重並列配列図とPCRプライマー配列との関係から、当該PCRプライマーを用いたPCRは、ウリ科キュウリ属のメロン(アムスメロン、アールスメロン、赤肉メロン、ハネデューメロン)DNA、フユメロン(ハミウリ)DNAを検出できるが、実施例1で供試しなかった他の植物を含むその他の生物種DNAを検出しないことが強く示唆されている。   In addition, from the relationship between the multiple parallel sequence diagrams related to the chloroplast matK gene sequences of various organisms known and uniquely analyzed and the PCR primer sequences, PCR using the PCR primers is a melon of the Cucurbitaceae genus (Amus melon, Although it is possible to detect Earl's melon, red meat melon, honeydew melon) DNA, fuyumelon (Hamiuri) DNA, it is strongly suggested not to detect other species DNA including other plants not tested in Example 1. .

また、まぐろ検出用PCRプライマー(配列番号5及び6からなるPCRプライマーセット)を使用した場合、サバ科マグロ属のクロマグロDNA、キハダマグロDNA、メバチマグロDNA、ビンチョウマグロDNAを使用した場合のみ130bp前後の増幅産物が確認され(表2)、これらの増幅産物のTm値は、約80.5℃であった。近縁種である同科カツオ属のカツオDNA、同科サバ属のマサバDNA、ゴマサバDNA、タイセイヨウマサバDNAや他の魚類を含むその他の
生物種DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった(表2)。
In addition, when using PCR primers for tuna detection (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 5 and 6), amplification of around 130 bp is only possible when using bluefin tuna DNA, yellowfin tuna DNA, bigeye tuna DNA, and bluefin tuna DNA. Products were identified (Table 2) and the Tm value of these amplification products was approximately 80.5 ° C. The amplification products are not seen when using other species species including bonito DNA of the related family bonito, mackerel DNA, sesame DNA, Atlantic mackerel DNA and other fish. (Table 2).

なお、既知及び、独自に解析した各種生物のミトコンドリアのチトクロームb遺伝子配
列に関する多重並列配列図とPCRプライマー配列との関係から、当該PCRプライマーを用いたPCRは、実施例1で供試したサバ科マグロ属のクロマグロDNA、キハダマグロDNA、メバチマグロDNA、ビンチョウマグロDNAに加えて同科同属のミナミマグロDNA、コシナガDNA、タイセイヨウマグロDNAを検出できるが、近縁種である同科ハガツオ属のハガツオ、タイセイヨウハガツオ、同科ソウダガツオ属のマルソウダ(トックリガツオ)、並びに、サワラ属のサワラの仲間(Scomberomorus tritor)DNA及び、他の魚類を含むその他の生物種DNAを検出しないことが強く示唆されている。
From the relationship between the multiplex parallel sequence diagram of mitochondrial cytochrome b gene sequences of known and uniquely analyzed mitochondrial cytochrome b gene sequences and PCR primer sequences, PCR using the PCR primers was carried out in Example 1. In addition to bluefin tuna DNA, yellowfin tuna DNA, bigeye tuna DNA, bluefin tuna DNA in addition to the same family of bluefin tuna DNA, cochinaga DNA, and Atlantic bluefin tuna DNA. It has been strongly suggested that it does not detect Spodoptera litura, Marsoda of the genus Solanum (Tockrigato), and DNA of other species, including Scomberomorus tritor DNA and other fish.

また、ブリ検出用PCRプライマー(配列番号7及び8からなるPCRプライマーセット)を使用した場合は、アジ科ブリモドキ亜科ブリ属のブリDNAを使用した場合のみ105bp前後の増幅産物が確認され(表2)、これらの増幅産物のTm値は、約84.7℃であった。近縁種である同科ブリモドキ亜科ブリ属のヒラマサDNA、カンパチDNA、同科アジ亜科マアジ属のマアジDNAや他の魚類を含むその他の生物種DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった(表2)。   In addition, when the yellowtail detection PCR primer (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 7 and 8) was used, an amplification product of around 105 bp was confirmed only when yellowtail DNA of the genus Glyceridae was added (Table 1). 2) The Tm value of these amplification products was about 84.7 ° C. When using closely related species, such as Chrysanthemum DNA, Amberjack DNA, Maajia DNA, and other species of DNA, including other fish, It was not seen (Table 2).

なお、既知及び、独自に解析した各種生物のミトコンドリアのチトクロームb遺伝子配
列に関する多重並列配列図とPCRプライマー配列との関係から、当該PCRプライマーを用いたPCRは、アジ科ブリモドキ亜科ブリ属のブリDNAを検出できるが、近縁種である同科同亜科アイブリ属のアイブリDNA、同科ツムブリ属のツムブリDNA及び、他の魚類を含むその他の生物種DNAを検出しないことが強く示唆されている。
From the relationship between the multiplex parallel sequence diagrams of the mitochondrial cytochrome b gene sequences of various organisms known and uniquely analyzed, and the PCR primer sequences, PCR using the PCR primers is a genus of the genus Glyceraceae. Although it can detect DNA, it is strongly suggested that it does not detect related species such as Aiburi DNA of the same family, the same subfamily Aiburi, Alumni of the same family, and other species including other fish. Yes.

また、あじ検出用PCRプライマー(配列番号9、10及び11からなるPCRプライマーセット)を使用した場合、アジ科アジ亜科マアジ属マアジDNA、アジ科アジ亜科マアジ属ニュージーランドマアジDNA、アジ科アジ亜科メアジ属メアジDNA、アジ科アジ亜科シマアジ属シマアジDNA、アジ科アジ亜科ムロアジ属マルアジDNAを使用した場合のみ77bp前後の増幅産物が確認され(表2)、これらの増幅産物のTm値は、約79.5℃であった。近縁種である同科ブリモドキ亜科ブリ属のブリDNA、ヒラマサDNA、カンパチDNAや他の魚類を含むその他の生物種DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった(表2)。なお、あじはアジ科に分類される魚類の総称で、特にアジ亜科に分類される魚類を指す。そのため、当該PCRプライマーはアジ亜科に分類される魚類を検出するよう意図的に設計しており、前述したようにアジ亜科に分類される魚類DNAを検出するが、アジ科ブリモドキ亜科に属する魚類DNAを検出しないことを確認した(表2)。   In addition, when PCR primers for the horse mackerel detection (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 9, 10 and 11) are used, the genus Ajiaceae Maazi genus Maazi DNA, the Physicaceae genus Maazi New Zealand maji DNA, Amplification products of around 77 bp were confirmed only when subfamily mejia maji DNA, maize family ajiidae shimajima aji DNA, and ajiidae subfamily Muroazima marazi DNA were used (Table 2). Tm of these amplification products The value was about 79.5 ° C. No amplification products were found when using other species of DNA, including related species such as yellowtail DNA, kingfish DNA, amberjack DNA, and other fishes of the related family, the family of the subfamily Bristolidae (Table 2). . Aji is a general term for fishes classified in the family Hlidaceae, and specifically refers to fishes classified in the subfamily Hydrangea. For this reason, the PCR primers are intentionally designed to detect fish classified in the subfamily, and detect fish DNA classified in the subfamily as described above. It was confirmed that fish DNA to which it belongs was not detected (Table 2).

なお、既知及び、独自に解析した各種生物のミトコンドリアのチトクロームb遺伝子配
列に関する多重並列配列図とPCRプライマー配列との関係から、当該PCRプライマーを用いたPCRは、実施例1で供試したアジ科アジ亜科マアジ属マアジDNA、アジ科アジ亜科マアジ属ニュージーランドマアジDNA、アジ科アジ亜科メアジ属メアジDNA、アジ科アジ亜科シマアジ属シマアジDNA、アジ科アジ亜科ムロアジ属マルアジDNAに加えて、アジ亜科に属するあじDNA(例えばアジ亜科ムロアジ属のクサヤムロDNA、ムロアジDNA、アジ亜科ホソヒラアジ属のホソヒラアジDNA、アジ亜科マテアジ属のマテアジDNA、アジ亜科ギンガメアジ属のギンガメアジ、アジ亜科ヨロイアジ属のヨロイアジDNA、アジ亜科イトヒキアジ属のイトヒキアジDNA等)を検出できるが、ブリモドキ亜科アイブリ属のアイブリDNA、ブリモドキ亜科ツムブリ属のツムブリDNA、コバンアジ亜科コバンアジ属のコバンアジDNA、マルコバンDNA及び、他の魚類を含むその他の生物種DNAを検出しないことが強く示唆されている。
In addition, PCR using the PCR primer was carried out in Example 1 based on the relationship between the multiplex parallel sequence diagram relating to the mitochondrial cytochrome b gene sequence of various known organisms and independently analyzed and the PCR primer sequence. In addition to the azimuthae maji genus maji DNA, the genus genus majiae new zealand maji DNA, the genus genus subfamily majiae genus maji DNA, the genus genus subfamily genus genus subfamily genus majia Aji DNA belonging to the family Hydrangea (e.g., Kusayamaro DNA of the genus Hydrangea, Muroazi DNA, Hosohiraaji DNA of the genus Hydrangea, Mateji DNA of the genus Hydrangea, Gingameji, Can be detected, but can be detected. Seriola Aiburi DNA of pilot fish subfamilies rainbow runner genus rainbow runner DNA of, pompano subfamilies pompano genus pompano DNA of Marukoban DNA and, it has been strongly suggested that does not detect other species DNA containing other fish.

また、たら検出用PCRプライマー(配列番号12及び13からなるPCRプライマーセット)を使用した場合は、タラ科マダラ属のマダラDNAを使用した場合のみ144bp前後の増幅産物が確認され(表2)、これらの増幅産物のTm値は、約83.4℃であった。他の魚類を含むその他の生物種DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった(表2)。   In addition, when PCR primers for detection (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 12 and 13) were used, an amplification product of about 144 bp was confirmed only when using the cod family Madara DNA (Table 2), The Tm value of these amplification products was about 83.4 ° C. When using other species DNA including other fish, amplification products were not found (Table 2).

なお、既知及び、独自に解析した各種生物のミトコンドリアの16SrRNA遺伝子配列に関
する多重並列配列図とPCRプライマー配列との関係から、当該PCRプライマーを用いたPCRは、実施例1で供試したタラ科マダラ属のマダラDNAに加えて、タラ科マダラ属のタイセイヨウダラDNA、タラ科スケトウダラ属のスケトウダラDNA、タラ科コマイ属のコマイDNA等の商業的に重要なタラ科の魚を検出できるが、他の魚類を含むその他の生物種DNAを検出しないことが強く示唆されている。
From the relationship between the multiplex parallel sequence diagrams of the 16S rRNA gene sequences of mitochondrion of known and uniquely analyzed mitochondrial and PCR primer sequences, PCR using the PCR primers was performed in Example 1 In addition to genus cod DNA, it can detect commercially important cod fish such as cod gene of codaceae, cod DNA of cod genus, and cod DNA of cod genus It is strongly suggested not to detect DNA of other species including some fish.

また、たこ検出用PCRプライマー(配列番号14及び15からなるPCRプライマーセット)を使用した場合は、マダコDNA、ミズダコDNA、イイダコDNA、ヤナギダコDNAを使用した場合のみ204 bp前後の増幅産物が確認され(表2)、これらの増幅産物のTm値は、約76.4℃であった。イカや貝類を含むその他の生物種DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった(表2)。   In addition, when PCR primers for detecting octopus (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 14 and 15) were used, amplification products of around 204 bp were confirmed only when octopus DNA, mizudako DNA, iidako DNA, and willow octopus DNA were used. (Table 2) The Tm value of these amplification products was about 76.4 ° C. When DNA from other species including squid and shellfish was used, amplification products were not observed (Table 2).

なお、既知及び、独自に解析した各種生物のミトコンドリアの16S rRNA遺伝子配列に関する多重並列配列図とPCRプライマー配列との関係から、当該PCRプライマーを用いたPCRは、実施例1で供試したマダコ科マダコ属のマダコDNA、ミズダコDNA、イイダコDNA、ヤナギダコDNAに加えて、タコ類(八腕目)の属するタコDNA(例えば、マダコ科のテナガダコ、スナダコ、ワモンダコ、メンダコ科のメンダコ、カンテンダコ科のカンテンダコ、スカシダコ科のスカシダコ、クラゲダコ科のクラゲダコ属の一種、ワタゾコダコ亜科のチヒロダコ等)を検出できるが、イカ類(十腕目)や他の軟体動物を含むその他の生物種DNAを検出しないことが強く示唆されている。   From the relationship between the multiplex parallel sequence diagrams of 16S rRNA gene sequences of mitochondrial mitochondrial of known and uniquely analyzed organisms and PCR primer sequences, PCR using the PCR primers was the octopus family tested in Example 1. In addition to octopus DNA, octopus DNA, octopus DNA, and willow octopus DNA, octopus DNA to which the octopus species (eight-armed) belongs (eg, octopus genus octopus, sunadaco, sea lion octopus, genus octopus, canten octopus) , But can not detect DNA of other species including squids (Decapoda) and other mollusks. It is strongly suggested.

さらに、ほたてがい検出用PCRプライマー(配列番号16、17、18及び19からなるPCRプライマーセット)を使用した場合は、イタヤガイ科Patinopecten属のホタテガイDNAを使用した場合のみ180 bp前後の増幅産物が確認され(表2)、これらの増幅産物のTm値は、約83.8℃であった。近縁種である同科Argopecten属のアメリカホンイタヤガイDNA、アメリカヒナイタヤガイDNAや他の貝類、軟体動物を含むその他の生物種DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった(表2)。   In addition, when using scallop detection PCR primers (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 16, 17, 18, and 19), an amplification product of about 180 bp was confirmed only when scallop DNA belonging to the genus Patinopecten was used. (Table 2), the Tm value of these amplification products was about 83.8 ° C. Amplification products were not seen when using the relative species Argopecten squirrel oyster oyster DNA, American cypress DNA, other shellfish, and other species of DNA including mollusks (Table 2). ).

なお、既知及び、独自に解析した各種生物のミトコンドリアの16S rRNA遺伝子配列に関する多重並列配列図とPCRプライマー配列との関係から、当該PCRプライマーを用いたPCRは、実施例1で供試したイタヤガイ科Patinopecten属のホタテガイDNAに加えて同科Pecten属のジェームスホタテDNA、ニュージーランドホタテDNA、ヨーロッパホタテDNAを検出できるが、近縁種である同科Aequipecten属のセイヨウイタヤDNA、Chlyms属のヒオウギガイDNA、アズマニシキガイDNA、フランスニシキDNA及び他の貝類を含むその他の生物種DNAを検出しないことが強く示唆されている。また、配列番号16、18のPCRプライマーは、日本近海で採れるホタテガイDNAの検出に好適であり、配列番号17、19のPCRプライマーは、海外で採れるジェームスホタテDNA、ニュージーランドホタテDNA、ヨーロッパホタテDNAを検出するのに好適である。





From the relationship between the multiplex parallel sequence diagrams of the 16S rRNA gene sequences of mitochondrion of known and uniquely analyzed organisms and the PCR primer sequences, PCR using the PCR primers is the oyster family tested in Example 1. In addition to Patinopecten scallop DNA, it can detect James scallop DNA, New Zealand scallop DNA, and European scallop DNA belonging to the same family, but closely related species Aequipecten genus Itaya DNA, Chlyms scallop DNA, Azumanishiki It has been strongly suggested not to detect other species DNA including Guy DNA, French Nishiki DNA and other shellfish. The PCR primers of SEQ ID NOs: 16 and 18 are suitable for detection of scallop DNA collected in the sea near Japan, and the PCR primers of SEQ ID NOs: 17 and 19 are James scallop DNA, New Zealand scallop DNA, and European scallop DNA collected overseas. Suitable for detection.










実施例2
特定動植物用PCRプライマーセットを用いたPCRの検出感度の確認
実施例1で使用した特定動植物用PCRプライマーセットを用いたPCRの検出感度を調べるために、下記のような実験を実施した。
実施例1で調製したゴマ(白色系統)、メロン(アールスメロン)、クロマグロ、ブリ、
マアジ、マダラ、マダコ、及びホタテガイの各DNAを滅菌水で希釈し、1 pg/μl、10 pg/
μl、100 pg/μl、1000 pg/μlのDNA溶液の希釈系列を作製し、これらの希釈した被験DNA液の1 μLを、実施例1に記載したPCR反応条件で、PCRに供した。PCR反応後、実施例1に記載したようにして、PCR増幅産物のTm値を求め、さらに、増幅産物の有無をアガロースゲル電気泳動によって確認した。
Example 2
Confirmation of PCR detection sensitivity using the PCR primer set for specific animals and plants In order to examine the detection sensitivity of PCR using the PCR primer set for specific animals and plants used in Example 1, the following experiment was performed.
Sesame (white strain), melon (earl melon), bluefin tuna, yellowtail, prepared in Example 1
Dilute the horse mackerel, madara, octopus, and scallop DNA with sterile water to obtain 1 pg / μl, 10 pg /
Dilution series of DNA solutions of μl, 100 pg / μl, and 1000 pg / μl were prepared, and 1 μL of these diluted test DNA solutions were subjected to PCR under the PCR reaction conditions described in Example 1. After the PCR reaction, the Tm value of the PCR amplification product was determined as described in Example 1, and the presence or absence of the amplification product was further confirmed by agarose gel electrophoresis.

図1に示すように、ゴマ検出用PCRプライマー(配列番号1及び2からなるPCRプライマーセット)を使用した場合の検出感度は、1 pg DNA/分析であり、メロン検出用PCRプライマー(配列番号3及び4からなるPCRプライマーセット)を使用した場合の検出感度は、10 pg DNA/分析であり、まぐろ検出用PCRプライマー(配列番号5及び6からなるPCRプライマーセット)を使用した場合の検出感度は、1 pg DNA/分析であり、ブリ検出用PCRプライマー(配列番号7及び8からなるPCRプライマーセット)を使用した場合の検出感度は、1 pg DNA/分析であり、あじ検出用PCRプライマー(配列番号9及び10のPCRプライマーセット)を使用した場合の検出感度は、1 pg DNA/分析であり、たら検出用PCRプライマー(配列番号11及び12からなるPCRプライマーセット)を使用した場合の検出感度は、1 pg DNA/分析であり、たこ検出用PCRプライマー(配列番号11及び12からなるPCRプライマーセット)を使用した場合の検出感度は、10 pg DNA/分析であり、ほたてがい検出用PCRプライマー(配列番号11及び12からなるPCRプライマーセット)を使用した場合の検出感度は、10 pg DNA/分析であった。
As shown in FIG. 1, the detection sensitivity when using PCR primers for detecting sesame (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 1 and 2) is 1 pg DNA / analysis, and PCR primers for detecting melon (SEQ ID NO: 3 The detection sensitivity when using the PCR primer set consisting of 4 and 4) is 10 pg DNA / analysis, and the detection sensitivity when using the tuna detection PCR primer (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 5 and 6) is , 1 pg DNA / analysis, and the detection sensitivity when using the PCR primer for detecting yellowtail (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 7 and 8) is 1 pg DNA / analysis, The detection sensitivity when using PCR primer sets (numbers 9 and 10) is 1 pg DNA / analysis, and the detection sensitivity when using PCR primers for detection (PCR primer sets consisting of SEQ ID NOs: 11 and 12) Is The detection sensitivity is 1 pg DNA / analysis, and the PCR sensitivity for detection of octopus (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 11 and 12) is 10 pg DNA / analysis. The detection sensitivity in the case of using the PCR primer set consisting of Nos. 11 and 12 was 10 pg DNA / analysis.

実施例3
特定動植物用PCRプライマーセットを用いたPCRによる特定動食物含有食品中の特定植物由来DNAの検出
ゴマ、メロン、まぐろ、あじ、たら、たこ、あるいはほたてがいを原料として含有する
市販食品等に対する本発明の特定動物用PCRプライマーセットを用いたPCR分析を下記のように行い、本発明の実用性を検討した。
Example 3
Detection of DNA derived from specific plants in foods containing specific animals and foods by PCR using PCR primer sets for specific animals and plants The present invention for commercial foods containing sesame, melon, tuna, horse mackerel, horse mackerel, octopus, or scallops as raw materials PCR analysis using the PCR primer set for specific animals was performed as follows to examine the practicality of the present invention.

ゴマ、メロン、まぐろ、あじ、たら、たこ、あるいはほたてがいをを原料として含有す
ることを明記されている市販食品(表2)を準備し、1〜10 gをマルチビーズショッカーで
粉砕した。その混合破砕物の0.1〜1 gから各々のDNAをDneasy Plant mini kitを用いて抽
出した。抽出時には、RNA分解酵素によるRNAの除去操作も実施した。抽出した食品試料DNA量を測定後、滅菌水を用いて、食品試料DNAの濃度を10 ng/μLに調製した。なお、ぶりを原料として含有する市販食品の入手が困難であったため、ぶり含有食品の代替試料として、まぐろ薄削り(林久右衛門商店)(10 ng/μL)にぶりDNAを50 pg/μLの濃度で添加したものを使用した。これらの調製DNA液の1 μLを、実施例1で使用した特定動植物用PCRプライマーセットを用い、実施例1に記載したPCR反応条件で、PCRに供した。PCR反応後、実施例1に記載したようにして、PCR増幅産物のTm値を求め、さらに、増幅産物の有無をアガロースゲル電気泳動によって確認した。これらのPCRの結果を表2に記載した。表中の+(プラス)は電気泳動により標的サイズの増幅産物が検出されたことを示し、−(マイナス)は当該増幅産物が検出されなかったことを示し、NDは検査が未実施であることを示す
。また、これらのPCRのアガロース電気泳動に関する結果を図2(A、B、C、D、E、F、G及び、H)に示した。さらに、食品試料DNAから増幅されたPCR増幅産物を、BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing kit(Applied Biosystems社)を用いて、両方向からダイレクトシーケンス後、Applied Biosystems 310 Genetic Analyzer(Applied Biosystems社)
によって塩基配列を分析した。分析した塩基配列データをGenBank nucleotide sequence
database(BLAST search)もしくは、発明者らが保有するDNAデータベースと比較解析し
、その塩基配列の類似性に基づいて、PCR増幅産物由来DNAの生物種を帰属・同定した。
Commercially available foods (Table 2) that clearly contain sesame, melon, tuna, horse mackerel, tuna, octopus, or scallop as raw materials were prepared, and 1 to 10 g was pulverized with a multi-bead shocker. Each DNA was extracted from 0.1-1 g of the mixed crushed material using Dneasy Plant mini kit. At the time of extraction, RNA was also removed by RNase. After measuring the amount of the extracted food sample DNA, the concentration of the food sample DNA was adjusted to 10 ng / μL using sterilized water. In addition, because it was difficult to obtain commercial foods containing yellowtail as a raw material, as a substitute sample for yellowtail-containing food, 50 pg / µL of burr DNA was added to tuna thin shaving (Hayashi Hisemon Shoten) (10 ng / µL) The one added at the concentration was used. 1 μL of these prepared DNA solutions were subjected to PCR under the PCR reaction conditions described in Example 1 using the PCR primer set for specific animals and plants used in Example 1. After the PCR reaction, the Tm value of the PCR amplification product was determined as described in Example 1, and the presence or absence of the amplification product was further confirmed by agarose gel electrophoresis. The results of these PCRs are listed in Table 2. + (Plus) in the table indicates that the amplification product of the target size was detected by electrophoresis,-(minus) indicates that the amplification product was not detected, and ND indicates that the test was not performed. Indicates. Moreover, the result regarding agarose electrophoresis of these PCR was shown in FIG. 2 (A, B, C, D, E, F, G, and H). Furthermore, PCR amplification products amplified from food sample DNA were directly sequenced in both directions using BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing kit (Applied Biosystems), then Applied Biosystems 310 Genetic Analyzer (Applied Biosystems)
The base sequence was analyzed by GenBank nucleotide sequence
Database (BLAST search) or compared with a DNA database owned by the inventors, and based on the similarity of the base sequence, the species of the DNA derived from the PCR amplification product was assigned and identified.

その結果、ゴマ検出用PCRプライマー(配列番号1及び2からなるPCRプライマーセット)を使用した場合、ゴマ含有食品である、出前一丁ごまとんこつ(日清食品)及び金のごまだれ(ミツカン)由来DNAにおいてのみ、150bp前後の増幅産物が確認され[表3、図2(A)]、この増幅産物のTm値は、約77.1℃であった。他の食品試料由来DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった[表3、図2(A)]。なお、PCR増幅産物の塩基配列解析の結果、出前一丁ごまとんこつ(日清食品)及び金のごまだれ(ミツカン)由来DNAから増幅されたPCR増幅産物の塩基配列は、ゴマのクロロプラストのmatK遺伝子配列と一致した。すなわち、当該PCRプライマーを用いたPCRは、複数の市販食品において、ゴマ非含有食品試料からゴマ由来DNAやその他のDNAを検出しないが、ゴマ含有食品試料からゴマ由来DNAを特異的に検出できることを確認した。   As a result, when using PCR primers for detection of sesame (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 1 and 2), DNA derived from sesame-containing foods, such as food delivery chopsticks (Nissin foods) and gold dish (Mitsukan) The amplification product of around 150 bp was confirmed only in [Table 3, FIG. 2 (A)], and the Tm value of this amplification product was about 77.1 ° C. When DNA from other food samples was used, amplification products were not observed [Table 3, Fig. 2 (A)]. As a result of the nucleotide sequence analysis of the PCR amplification product, the nucleotide sequence of the PCR amplification product amplified from the DNA derived from Ichimae-cho sesame tonkotsu (Nisshin Foods) and Kimo-dokoro (Mitsukan) is the matK gene of sesame chloroplasts. Matched the sequence. That is, PCR using the PCR primer does not detect sesame-derived DNA or other DNA from sesame-free food samples in a plurality of commercially available foods, but can specifically detect sesame-derived DNA from sesame-containing food samples. confirmed.

また、メロン検出用PCRプライマー(配列番号3及び4からなるPCRプライマーセット)を使用した場合、メロン含有食品である、夕張メロンキャラメル(札幌グルメフーズ)及び夕張メロンピュアゼリー(ホリ)由来DNAにおいてのみ、179bp前後の増幅産物が確認され[表3、図2(B)]、この増幅産物のTm値は、約79.2℃であった。他の食品試料由来DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった[表3、図2(B)]。なお、PCR増幅産物の塩基配列解析の結果、出前一丁ごまとんこつ(日清食品)及び金のごまだれ(ミツカン)由来DNAから増幅されたPCR増幅産物の塩基配列は、メロンのクロロプラストのmatK遺伝子配列と一致した。すなわち、当該PCRプライマーを用いたPCRは、複数の市販食品において、メロン非含有食品試料からメロン由来DNAやその他のDNAを検出しないが、メロン含有食品試料からメロン由来DNAを特異的に検出できることを確認した。   In addition, when PCR primers for melon detection (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 3 and 4) are used, only in melon-containing foods, DNA derived from Yubari Melon Caramel (Sapporo Gourmet Foods) and Yubari Melon Pure Jelly (Hori) An amplified product of around 179 bp was confirmed [Table 3, FIG. 2 (B)], and the Tm value of this amplified product was about 79.2 ° C. When DNA from other food samples was used, amplification products were not observed [Table 3, Fig. 2 (B)]. As a result of the nucleotide sequence analysis of the PCR amplification product, the nucleotide sequence of the PCR amplification product amplified from the DNA derived from Ichizen-cho sesame tonkotsu (Nisshin Foods) and gold rice dish (Mitsukan) is the matK gene of melon chloroplast Matched the sequence. That is, PCR using the PCR primer does not detect melon-derived DNA or other DNA from melon-free food samples in multiple commercial foods, but can specifically detect melon-derived DNA from melon-containing food samples. confirmed.

また、まぐろ検出用PCRプライマー(配列番号5及び6からなるPCRプライマーセット)を使用した場合、まぐろ含有食品である、Cezar吟撰ビーフまぐろ入り(マスターフーズ)及びまぐろ薄削り(株式会社 林久右衛門商店)由来DNAにおいてのみ、130bp前後の増幅産物が確認され[表3、図2(C)]、この増幅産物のTm値は、約80.6℃であった。他の食品試料由来DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった[表3、図2(C)]。なお、PCR増幅産物の塩基配列解析の結果、Cezar吟撰ビーフまぐろ入り(マスターフーズ)及びまぐろ薄削り(株式会社 林久右衛門商店)由来DNAから増幅されたPCR増幅産物の塩基配列は、マグロ属(キハダマグロ等)のミトコンドリア由来チトクロームb遺伝子配列と一致した。すなわち、当該PCRプライマーを用いたPCRは、複数の市販食品において、まぐろ非含有食品試料からまぐろ由来DNAやその他のDNAを検出しないが、まぐろ含有食品試料からまぐろ由来DNAを特異的に検出できることを確認した。   In addition, when using PCR primers for tuna detection (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 5 and 6), the tuna-containing foods, including Cezar Ginbei Beef Tuna (Master Foods) and Tuna Thinning (Hisao Hayashi Co., Ltd.) An amplification product of around 130 bp was confirmed only in DNA derived from Emon Shoten (Table 3, FIG. 2 (C)), and the Tm value of this amplification product was about 80.6 ° C. When DNA from other food samples was used, amplification products were not observed [Table 3, Fig. 2 (C)]. As a result of the base sequence analysis of the PCR amplification product, the base sequence of the PCR amplification product amplified from the DNA derived from Cezar Ginza Beef Tuna (Master Foods) and Tuna Shave (Hayashi Hisemon Co., Ltd.) It matched the mitochondrial cytochrome b gene sequence of the genus (yellowfin tuna etc.). That is, PCR using the PCR primer does not detect tuna-derived DNA or other DNA from tuna-free food samples in multiple commercial foods, but can specifically detect tuna-derived DNA from tuna-containing food samples. confirmed.

また、ブリ検出用PCRプライマー(配列番号7及び8からなるPCRプライマーセット)を使用した場合は、ぶり含有食品の代替試料[50pgブリDNAを添加したまぐろ薄削り(株式会社林久右衛門商店)]由来DNAにおいてのみ、105 bp前後の増幅産物が確認され[表3、図2(D)]、この増幅産物のTm値は、約84.3℃であった。他の食品試料由来DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった[表2、図2(D)]。なお、PCR増幅産物の塩基配列解析の結果、ぶり含有食品の代替試料由来DNAから増幅されたPCR増幅産物の塩基配列は、当然のことながら、ブリのミトコンドリア由来チトクロームb遺伝子配列と一致した。すなわち、当該PCRプライマーを用いたPCRは、複数の市販食品において、ブリ非含有食品試料からブリ由来DNAやその他のDNAを検出しないが、ブリ非含有食品中に添加された微量のブリ由来DNAを特異的に検出できることを確認した。   In addition, when using the PCR primer for detecting yellowtail (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 7 and 8), an alternative sample of food containing yellowtail [Tuna shaving with 50pg yellowtail DNA added (Hayashi Hisemon Co., Ltd.) Only in the derived DNA, an amplification product of around 105 bp was confirmed [Table 3, FIG. 2 (D)], and the Tm value of this amplification product was about 84.3 ° C. When DNA from other food samples was used, amplification products were not found [Table 2, Figure 2 (D)]. As a result of the analysis of the base sequence of the PCR amplification product, the base sequence of the PCR amplification product amplified from the DNA derived from the substitute sample of the food containing the yellowtail was, of course, the same as the cytochrome b gene sequence derived from the yellowtail mitochondria. That is, PCR using the PCR primer does not detect yellowtail-derived DNA or other DNA from yellowtail-free food samples in multiple commercial foods, but a small amount of yellowtail-derived DNA added to yellowtail-free food samples. It was confirmed that it could be detected specifically.

また、あじ検出用PCRプライマー(配列番号9、10及び11からなるPCRプライマーセット)を使用した場合、あじ含有食品である、鯵揚(長崎・井上蒲鉾工房)及びトップバリュ焼きあじ(イオン)由来DNAにおいてのみ、77bp前後の増幅産物が確認され[表3、図2(E)]、この増幅産物のTm値は、約79.0℃であった。他の食品試料由来DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった[表3、図2(E)]。なお、PCR増幅産物の塩基配列解析の結果、鯵揚(長崎・井上蒲鉾工房)及びトップバリュ焼きあじ(イオン)由来DNAから増幅されたPCR増幅産物の塩基配列は、いずれもマアジ属に属するあじ(マアジ等)のミトコンドリア由来チトクロームb遺伝子配列と最も高い類似性を示した。すなわち、当該PCRプライマーを用いたPCRは、複数の市販食品において、あじ非含有食品試料からあじ由来DNAやその他のDNAを検出しないが、あじ含有食品試料からあじ由来DNAを特異的に検出できることを確認した。   In addition, when using a primer for detecting horse mackerel (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 9, 10 and 11), it is derived from horse mackerel containing foods, Kakiage (Nagasaki / Inoue Kobo) and Topvalu Yakiji (Ion) An amplification product of around 77 bp was confirmed only in DNA [Table 3, FIG. 2 (E)], and the Tm value of this amplification product was about 79.0 ° C. When DNA from other food samples was used, amplification products were not found [Table 3, Figure 2 (E)]. As a result of the base sequence analysis of the PCR amplification products, the base sequences of the PCR amplification products amplified from the DNA derived from Toyo (Nagasaki / Inoue Kobo) and Topvalu Yakiji (Ion) are all belonging to the genus Maaji. It showed the highest similarity to the mitochondrial cytochrome b gene sequence (Maji, etc.). In other words, PCR using the PCR primer does not detect horse mackerel-derived DNA or other DNA from horse mackerel-free food samples, but can detect horse mackerel-derived DNA specifically from horse mackerel-containing food samples. confirmed.

また、たら検出用PCRプライマー(配列番号12及び13からなるPCRプライマーセット)を使用した場合、たら含有食品である、鯵揚(長崎・井上蒲鉾工房)、チーズかまぼこ(株式
会社 やおきん)及びマヨたら(株式会社 一栄食品)由来DNAにおいてのみ、144bp前後の
増幅産物が確認され[表3、図2(F)]、これらの増幅産物のTm値は、約82.9℃であった
。他の食品試料由来DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった[表3、図2(F)]。なお、PCR増幅産物の塩基配列解析の結果、鯵揚(長崎・井上蒲鉾工房)、チーズかまぼこ(株式会社 やおきん)及びマヨたら(株式会社 一栄食品)由来DNAから増幅されたPCR増幅産物の塩基配列は、いずれもマダラ属、スケトウダラ属に分類されるタラ類のミトコンドリア由来16SrRNA遺伝子配列と一致した。すなわち、当該PCRプライマーを用いたPCRは、複数の市販食品において、たら非含有食品試料からたら由来DNAやその他のDNAを検出しないが、たら含有食品試料からたら由来DNAを特異的に検出できることを確認した。
In addition, when PCR detection primers (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 12 and 13) are used, the foods that are included in the kite are Toyo (Nagasaki / Inoue Kobo), Cheese Kamaboko (Yakinen Co., Ltd.) and Mayo Only in DNA derived from (Ichiei Foods Co., Ltd.), amplification products of around 144 bp were confirmed [Table 3, FIG. 2 (F)], and the Tm value of these amplification products was about 82.9 ° C. When DNA from other food samples was used, amplification products were not observed [Table 3, Fig. 2 (F)]. As a result of the base sequence analysis of the PCR amplification products, the bases of the PCR amplification products amplified from DNA derived from Toyo (Nagasaki / Inoue Kobo), Cheese Kamaboko (Yakinen Co., Ltd.) and Mayo Tara (Ichiei Foods Co., Ltd.) The sequence was consistent with the mitochondrial 16S rRNA gene sequence of the cod species classified into the genus Genus and Walleye genus. In other words, PCR using the PCR primers does not detect any DNA or other DNA from a non-containing food sample in a plurality of commercially available foods, but can specifically detect the DNA derived from a cochlear food sample. confirmed.

また、たこ検出用PCRプライマー(配列番号14及び15からなるPCRプライマーセット)を使用した場合、たこ含有食品である、冷凍日清のたこ焼き(日清食品冷凍)及びちょうどおてごろたこせんべい(株式会社 かわさ)由来DNAにおいてのみ、204bp前後の増幅産物が確認され[表3、図2(G)]、これらの増幅産物のTm値は、約77.1℃であった。他の食品試料由来DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった[表3、図2(G)]。なお、PCR増幅産物の塩基配列解析の結果、冷凍日清のたこ焼き(日清食品冷凍)及びちょうどおてごろたこせんべい(株式会社 かわさ)由来DNAから増幅されたPCR増幅産物の塩基配列は、いずれもマダコ属の分類されるタコ(マダコ等)のミトコンドリア由来16SrRNA遺伝子配列と一致した。すなわち、当該PCRプライマーを用いたPCRは、複数の市販食品において、たこ非含有食品試料からたこ由来DNAやその他のDNAを検出しないが、たこ含有食品試料からたこ由来DNAを特異的に検出できることを確認した。   In addition, when using the PCR primer for detecting octopus (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 14 and 15), the food containing octopus, frozen Nissin's Takoyaki (Nisshin Food Frozen) and just trowel taco rice crackers (stock) Amplification products of around 204 bp were confirmed only in DNA derived from Company Kawasawa [Table 3, FIG. 2 (G)], and the Tm value of these amplification products was about 77.1 ° C. When DNA from other food samples was used, amplification products were not observed [Table 3, Fig. 2 (G)]. As a result of the base sequence analysis of the PCR amplification product, the base sequence of the PCR amplification product amplified from the DNA derived from frozen Nissin's Takoyaki (Nisshin Foods Frozen) and Otegoro Takosenbei (Kawasa Co., Ltd.) It also matched the mitochondrial 16S rRNA gene sequence of the octopus classified into the genus Octopus (Mako, etc.). That is, PCR using the PCR primer does not detect octopus-derived DNA or other DNA from octopus-free food samples in multiple commercial foods, but can detect octopus-derived DNA specifically from octopus-containing food samples. confirmed.

さらに、ほたてがい検出用PCRプライマー(配列番号16、17、18及び19からなるPCRプライマーセット)を使用した場合、ほたてがい含有食品である、ちょうどおてごろたこせんべい(株式会社 かわさ)、帆立だし(味の素)、ピアット帆立雑炊(エスビー食品)由来DNA
においてのみ、180bp前後の増幅産物が確認され[表3、図2(H)]、これらの増幅産物のTm値は、約83.6℃であった。他の食品試料由来DNAを使用した場合には、増幅産物は見られなかった[表3、図2(H)]。なお、PCR増幅産物の塩基配列解析の結果、ちょうどおてごろたこせんべい(株式会社 かわさ)、帆立だし(味の素)、ピアット帆立雑炊(エスビー食品)由来DNAから増幅されたPCR増幅産物の塩基配列は、いずれもホタテガイのミトコンドリア由来16SrRNA遺伝子配列と一致した。すなわち、当該PCRプライマーを用いたPCRは、複数の市販食品において、ほたてがい非含有食品試料からほたてがい由来DNAやその他のDNAを検出しないが、ほたてがい含有食品試料からほたてがい由来DNAを特異的に検出できることを確認した。
Furthermore, when using a scallop detection PCR primer (PCR primer set consisting of SEQ ID NOs: 16, 17, 18, and 19), it is a scallop-containing food, just trowel rice cracker (Kawasa Co., Ltd.), Scallop Dashi (Ajinomoto), Piat Scallops (Sb food) DNA
The amplification product of about 180 bp was confirmed only in Table 3 (Table 3, FIG. 2 (H)), and the Tm value of these amplification products was about 83.6 ° C. When DNA from other food samples was used, amplification products were not observed [Table 3, Fig. 2 (H)]. As a result of the base sequence analysis of the PCR amplification products, the bases of the PCR amplification products amplified from DNA derived from Otegoro Takosenbe (Kawasa Co., Ltd.), Scallop Dashi (Ajinomoto), and Piatt Scallop Chosen (Sb Food) All the sequences were identical to the 16S rRNA gene sequence derived from scallop mitochondria. That is, PCR using the PCR primer does not detect scallop-derived DNA or other DNA from scallop-free food samples in multiple commercially available foods, but specifically detects scallop-derived DNA from scallop-containing food samples. It was confirmed that it could be detected.

Claims (9)

配列表の配列番号12における塩基番号6〜20の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーと、配列表の配列番号13における塩基番号4〜18の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーとからなるプライマーセット A PCR primer consisting of a DNA with a maximum of 30 bases containing the base sequence of base numbers 6-20 in SEQ ID NO: 12 on the 3 ′ end side in the sequence listing and 3 base sequences of base numbers 4-18 in SEQ ID NO: 13 in the sequence listing A primer set consisting of a PCR primer consisting of up to 30 bases of DNA included at the end 配列表の配列番号14における塩基番号11〜25の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーと、配列表の配列番号15における塩基番号8〜22の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーとからなるプライマーセット A PCR primer consisting of a DNA of up to 30 bases containing the base sequence of base numbers 11 to 25 in the sequence listing SEQ ID NO: 14 on the 3 ′ end side, and the base sequence of base numbers 8 to 22 in SEQ ID NO: 15 of the sequence listing 3 A primer set consisting of a PCR primer consisting of up to 30 bases of DNA included at the end 配列表の配列番号16における塩基番号7〜21の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーと、 配列表の配列番号17における塩基番号10〜24の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーと、配列表の配列番号18における塩基番号10〜24の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーと、配列表の配列番号19における塩基番号9〜23の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーとからなるプライマーセット A PCR primer consisting of a DNA with a maximum of 30 bases including the base sequence of base numbers 7 to 21 in the sequence table in SEQ ID NO: 16 on the 3 ′ end side, and 3 base sequences of base numbers 10 to 24 in SEQ ID NO: 17 in the sequence list A PCR primer composed of DNA of up to 30 bases contained on the ′ end side, and a PCR primer composed of DNA of up to 30 bases containing the base sequence of base numbers 10 to 24 in SEQ ID NO: 18 in the sequence listing on the 3 ′ end side, Primer set consisting of a PCR primer consisting of a maximum of 30 bases of DNA containing the base sequence of base numbers 9 to 23 in the sequence number 19 of the sequence table on the 3 ′ end side 配列表の配列番号12の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーと、配列表の配列番号13の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーとからなるプライマーセット。 PCR primer consisting of DNA with a maximum of 30 bases including the base sequence of SEQ ID NO: 12 on the 3 ′ end side of the sequence listing, and DNA of maximum 30 bases including the base sequence of SEQ ID NO: 13 of the sequence listing on the 3 ′ end side Primer set consisting of PCR primers. 配列表の配列番号14の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーと、配列表の配列番号15の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーとからなるプライマーセット。 PCR primer consisting of up to 30 bases of DNA containing the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14 on the 3 ′ end side of the sequence listing and DNA of up to 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 15 of the sequence listing on the 3 ′ end side Primer set consisting of PCR primers. 配列表の配列番号16の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーと、配列表の配列番号17の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーと、配列表の配列番号18の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーと、配列表の配列番号19の塩基配列を3´末端側に含む最大30塩基のDNAからなるPCRプライマーとからなるプライマーセット。 It consists of a PCR primer consisting of a DNA with a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 16 on the 3 ′ end side and a DNA of a maximum of 30 bases containing the base sequence of SEQ ID NO: 17 of the sequence listing on the 3 ′ end side. PCR primer consisting of a PCR primer, a DNA primer having a maximum of 30 bases containing the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18 in the sequence listing on the 3 ′ end side, and a maximum of 30 bases including the base sequence of SEQ ID NO: 19 in the sequence listing on the 3 ′ end side Primer set consisting of PCR primers consisting of DNA. 試料からDNAを抽出する工程と、このDNAを鋳型として、請求項1又は4記載のプライマーセットを用いてPCRを行う工程と、増幅されたDNAを検出することにより試料中にたらが存在しているか否かを検出する工程とを含む特定動物の検出方法。 A step of extracting DNA from the sample, a step of performing PCR using the primer set according to claim 1 or 4 using this DNA as a template, and presence of tart in the sample by detecting the amplified DNA A method for detecting a specific animal, comprising the step of detecting whether or not there is. 試料からDNAを抽出する工程と、このDNAを鋳型として、請求項2又は5記載のプライマーセットを用いてPCRを行う工程と、増幅されたDNAを検出することにより試料中にたこが存在しているか否かを検出する工程とを含む特定動物の検出方法。 A step of extracting DNA from the sample, a step of performing PCR using the primer set according to claim 2 or 5 using this DNA as a template, and detecting otco in the sample by detecting the amplified DNA A method for detecting a specific animal, comprising the step of detecting whether or not there is. 試料からDNAを抽出する工程と、このDNAを鋳型として、請求項3又は6記載のプライマーセットを用いてPCRを行う工程と、増幅されたDNAを検出することにより試料中にほたてがいが存在しているか否かを検出する工程とを含む特定動物の検出方法。 A step of extracting DNA from the sample, a step of performing PCR using the primer set according to claim 3 or 6 using this DNA as a template, and scallops are present in the sample by detecting the amplified DNA. A method for detecting a specific animal, comprising the step of detecting whether or not the animal is present.
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