JP4736413B2 - 生体分子保持物及び生体分子の保存方法 - Google Patents
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また、本発明の生体分子保持物は、生体分子が粒子に結合している生体分子結合粒子と、前記生体分子結合粒子を包囲し、多糖類、アルギン酸ナトリウム、ゼラチン、カゼイン、ポリビニルアルコール、ポリアクリルアミド、ポリアクリル酸ナトリウム、ポリエチレンイミン、ポリエチレンオキシド及びポリビニルピロリドンから選択された少なくとも1種のバインダー剤と、紙、プラスチック、布、ガラス、セラミックス、金属またはこれら2種以上の組み合わせである基材と、を含むものである。
ここで、「包囲」とは、バインダー剤が生体分子結合粒子の周囲に存在している状態をいい、生体分子結合粒子がバインダー剤の完全に包埋されている状態から、生体分子結合粒子の周囲の一部にバインダー剤が存在している状態までのいずれもが該当する。また、生体分子結合粒子の周囲に密に存在している場合や、生体分子結合粒子を保持可能な程度に粗に存在している場合であってもよい。
本発明の生体分子保持物では、生体分子結合粒子がバインダー剤で包囲されることにより、生体分子結合粒子が飛散することがなくなり、保管、移動が容易になる。また、外界から遮断されるため保存性を高めることができる。更に、バインダー剤の種類に応じて種々の形状をとることができるため、取り扱いの自由度を飛躍的に高めることができる。
生体分子としては、特に限定されるものではないが、cDNAを含むDNA(デオキシリボ核酸)又はmRNA等のRNA(リボ核酸)を構成するヌクレオチド、ペプチド、タンパク質、糖鎖、脂質、ビタミン類、ステロイド類、色素、アルカロイド、各種ホルモン、抗生物質、天然毒、フェロモン物質等を挙げることができる。これらは、単独で又は2種以上を組み合わせたものであってもよい。保存頻度やその後の利用形態の観点から、ヌクレオチド又はペプチド若しくはタンパク質であることが好ましく、特に多くの場合、ヌクレオチドが2つ以上連結したポリヌクレオチド又は、ペプチドが2つ以上連結したペプチド、ポリペプチド若しくはタンパク質であることが好ましい。
粒子としては、材料は特に限定されるものではないが、多糖類、タンパク質、有機ポリマー、無機材料、金属等、あらゆる材料を挙げることができ、これらを単独で又は2種類以上組み合わせたものが該当する。2種類以上の組み合わせ方は、生体分子との結合やその後の取り扱いにおいて不利にならない限り特に限定されるものではなく、全体が均一混じりあったもの、不均一に混じりあったもの、例えば比較的小さな粒子と比較的大きな粒子とが重力により上下に偏在しているもの、層状に積層されたもの、例えば金属酸化物磁性体のコアにポリマーがコートしてある粒子等がある。生体分子に対する処理の観点から耐熱性の粒子であることが好ましく、PCR処理等に適用される少なくとも100℃の温度に対して耐熱性であるものが特に好ましい。
粒子の形は必要に応じて様々なものが使用できるが、球形、楕円形、多角形、不定形、針状形、多孔質形等あらゆる形のものを1種類もしくは2種類以上組み合わせて用いることができる。
生体分子を粒子表面に結合するため、必要に応じて化学修飾を行ってもよい。化学修飾の種類は特に限定されるものではないが、最終的に粒子上に現れる官能基にしたがって、ヒドロキシ化、アルデヒド化、カルボキシル化、アミノ化、マレイミド化、エポキシ化、アシル化、トレシル化、ホルミル化、チオール化等がある。これらの化学修飾の方法は、当業界で公知のいずれかの方法をそのまま適用することができる
上記粒子に生体分子を固定させる形式については、特に制限はなく、あらゆる既知の方法を用いることができ、このような方法としては、共有結合、水素結合、イオン結合、疎水結合等を単独にまたは複数組み合わせたものを挙げることができる。
共有結合方式としても特に限定されないが、生体分子のアミノ基、カルボキシル基、ヒドロキシ基、チオール基等と粒子の活性基の間で様々な形式で行うことができる。
本発明に用いられるバインダー剤は、生体分子と外部との接触を阻止し且つ飛散等を防止することによって安定して保存するなどのために、生体分子結合粒子を包囲するものである。このようなバインダー剤としては、特に限定されるものではないが、粒子を再び取り出して使用するために水溶性のものが好ましい。例えばコーンスターチや小麦でんぷん等天然でんぷん、マンナンやペクチン等の糖類、ふのり、寒天、アルギン酸ナトリウム等の海藻類、アラビアガム、ローカストビーンガム、トロロアオイ、トラガントガム等の植物粘質物、デキストラン、プルラン等の微生物粘質物、にかわ、ゼラチン、カゼイン等のタンパク質、カルボキシメチルセルロース、メチルセルロース、ヒドロキシメチルセルロース等のセルロース、酸化でんぷん、変性でんぷん等の合成でんぷん、ポリビニルアルコール、ポリアクリルアミド、ポリアクリル酸ナトリウム、ポリエチレンイミン、ポリエチレンオキシド、ポリビニルピロリドン等の合成高分子がある。このうち、使い勝手のよさや生体分子保持物に対するその後の処理での利便性を考慮して、天然物であることが好ましく、天然でんぷん、糖類、海草類などが特に好ましい。
本発明の生体分子保持物は、上記生体分子結合粒子と上記バインダー剤とを組み合わせること及びバインダー剤を固化することによって製造することができる。
ここで「組み合わせ」とは、生体分子結合粒子とバインダー剤とを所定の分散の程度に混合する場合のみならず、バインダー剤に対して生体分子結合粒子を単に添加するような場合も含む。
生体分子結合粒子とバインダー剤との組み合わせは、用途に応じて様々な比率で行われ限定されるものではないが、生体分子固定化粒子1重量部に対してバインダー剤(乾燥時)で0.01〜100000重量部、バインダーが粒子を必要充分つなぎとめることができるという観点から、好ましくは0.1から10000重量部の割合で行う。
生体分子結合粒子及びバインダー剤を担持可能な基材としては、紙、プラスチック、布、ガラス、セラミックス、金属等を挙げることができ、これらを単独で又は2種以上を組み合わせて使用することができる。このうち、使い勝手のよさや生体分子保持物のその後の処理に対する影響から、多くの場合には紙であることが好ましいが、生体分子保持物の用途に応じて適宜選択される。生体分子保持物のその後の処理によっては、基材を回収する必要のない分解性の基材、特に水溶性の基材、具体的には紙であってサイズ剤や湿潤強度付与剤の含有率が少ないものであることが好ましく、生体分子保持物に対するその後の処理によっては、バインダー剤と基材とが同一の成分で構成されていることが、バインダー剤の処理と同時に処理することができるため、好ましいことが多い。
プラスチックとしては、ポリエチレン、ポリプロピレン、ポリスチレン、ポリ塩化ビニル、フッ素系高分子、アクリル系高分子、ポリ酢酸ビニル、ポリビニルエーテル、セルロール系高分子などの熱可塑性樹脂や、これらの樹脂を、ジビニルベンゼン等の架橋剤で架橋したもの、2種以上を共重合したもの、共重合して架橋させたものを挙げることができる。また、フェノール樹脂、ユリア樹脂、メラミン樹脂、アルキドポリエステル樹脂、エポキシ樹脂、シリコーン樹脂、ポリウレタン樹脂等の熱硬化性樹脂や、更に、ナイロン、ポリアセタール、ポリカーボネート、ポリアリルエステル、ポリフェニレンオキシド、ポリフェニレンスルフィド、ポリアリルスルホン、ポリイミド、ポリエーテルエーテルケトン等のエンジニアリングプラスチックも挙げることができる。これらのプラスチックは、単独で又は2種以上を混合して使用することができる。
ガラス及びセラミックスとしては、アルミナ、シリカ、酸化チタン、ジルコニア、炭酸カルシウム、チタン酸バリウム、ボロンナイトライド、窒化アルミニウム、窒化ケイ素、炭化ケイ素、炭化ボロン、ポリシロキサン、タングステンカーバイト、カーボン等を挙げることができ、これらは単独で又は2種以上を組み合わせて使用することができる。
金属としては、アルミニウム、チタン、マンガン、鉄、ニッケル、銅、亜鉛、銀、スズ、白金、金、鉛等を挙げることができ、これらを単独で又は2種以上を組み合わせた合金又は混合物として使用することができる。
組み合わせ物を基材上に載置するときには、バインダー剤は、流動状態であってもよく、非流動状態であってもよい。バインダー剤が流動状態である場合には、基材への載置後に、固化工程を設けて基材上に生体分子結合粒子を固着させてもよい。また、基材が一定形状を有するので、バインダー剤の固化は、基材に生体分子結合粒子が担持できる程度でよい。このような固化工程の有無及び固化の程度については、基材の種類や生体分子保持物に対するその後の処理の種類に応じて当業者が適宜選択できる。固化工程としては、乾燥処理及びバインダー剤の流動停止処理を挙げることができる。
本発明の生体分子の保存方法は、生体分子が結合した生体分子結合粒子をバインダー剤と混合すること、前記バインダー剤を固化すること、を含む。即ち、本発明の生体分子の保存方法は、上記生体分子保持物の製造方法をそのまま適用することができる。
この保存方法によれば、生体分子は、生体分子結合粒子としてバインダー剤に包囲されているので、外界からの影響を受けにくく、保存性よく、また利便性よく保存することができる。
本発明の生体分子保持物では、生体分子の用途に応じた処理を行う前又は処理中に、生体分子結合粒子を生体分子保持物から取り出すことができる。
生体分子結合粒子の取り出し処理は、生体分子結合粒子の遊離処理を含む。
基材を含む生体分子保持物の場合の遊離処理としては、上記バインダー剤の可溶化処理及び基材の分解処理を挙げることができる。バインダー剤の可溶化処理は、基材に対する「のり」を無効にするため、生体分子結合粒子を効率よく遊離することができる。これらはそれぞれ単独で又は組み合わせて行うことができる。
特に前者についてはテンプレートが粒子に固定されているので、DNA増幅後もテンプレートが回収でき、何度でも使用可能である。使用後に再びバインダー剤と混合、固化させることも可能である。
また本発明の保存方法では、生体分子を半永久的に安定して保存することができる。また生体分子結合粒子を、活性を維持した状態で容易に取り出せるので、生体分子結合粒子を使用した後に再度保存を行うこともできる。
なお、下記実施例1は、本発明の参考例である。
t−ブチルメタクリレートをジビニルベンゼン1%で架橋した平均粒子径30μm樹脂粒子を25mg準備した。この樹脂粒子には、スペーサー分子として平均分子量200のポリエチレングリコール(炭素−炭素と炭素−酸素の合計結合数:12)を、粒子1gあたり約0.1mmol結合している。この粒子に、ジシクロヘキシルカルボジイミド試薬を用いて、任意の配列を有する300塩基対のcDNAの5’末端を結合した。
バインダー剤としてでんぷん1gを100mlの蒸留水に溶き、一度煮沸させた後、攪拌しながら冷却すると適度に粘性のあるバインダー液が得られた。
このバインダー液1mlに前記粒子25mgを加えて攪拌し、常温乾燥させて、粒子がバインダー剤に包囲されて分散している生体分子保持物を得た。これは容器から取り出しても一体化しており粒子が飛散することはなかった。
粒子を回収して再びPCRを行い、電気泳動で解析することを繰り返した。この操作を10回行ったが、全てにおいて元のcDNAの増幅が確認された。
実施例1と全く同じ方法でcDNA固定化粒子をバインダー液に分散させ、和紙の上にキャスト(載置)し、自然乾燥させて、和紙を含む生体分子保持物を得た。この生体分子保持物では、バインダー剤は強固に紙に固着しており、指でこすっても剥がれ落ちることはなかった。
この生体分子保持物を蒸留水につけて、バインダー剤を溶解し、混合溶液とした後、混合溶液から紙成分を除去した。その後、混合溶液に対して、遠心沈降を行って上澄みを除去して、粒子を回収した。この操作は3回繰り返した。この粒子を5mg測り取り、実施例1と同様にPCR処理を行ったところ、PCRを10回行っても元のcDNAの増幅が確認できた。
粒子径75〜100μmの1%ジビニルベンゼン架橋のポリスチレン粒子100mgを用いて、通常のメリーフィールド法により、任意の配列を有する15残基のアミノ酸を連結させたポリペプチドを粒子上に合成して、ペプチド結合粒子を得た。この粒子をジメチルホルムアミドで洗浄し、乾燥させた。これを、バインダー剤として市販のふのり(1g)を水1mlで溶いたものに混合分散させ、上質紙の上に塗布して乾燥させ、生体分子保持物を得た。
その紙を湾曲させたり、上から手でこすったりしても、塗布したものは剥がれ落ちることはなかった。
この粒子を蒸留水で数回洗浄後、無水トリフルオロ酢酸中に入れて臭化水素を通すことにより、合成されたペプチドをスチレン粒子から切り離した。その後、粒子を取り除き溶媒を乾燥させて、ペプチド固形物Aとして取り出した。
このペプチド固形物Aと、ふのり溶液と混合する前のペプチド結合粒子からなるペプチド固形物Bとを、それぞれα−シアノ−4−ヒドロキシケイヒ酸の飽和水溶液に溶解し、MARDI TOF/MS装置(ブルカー社製)で質量分析を行った。
この結果、ペプチド固形物Aでは、ペプチド固形物Bと同様に、15アミノ酸からなるペプチドを筆頭とする質量分布が観察され、バインダー剤と混合分散させてもペプチドに何ら影響しないことが明らかとなった。
実施例1と同じ方法でcDNAを固定した粒子を作製した。この粒子は、バインダー剤と混合してないため、飛散防止のために常に容器に入れておかなければならなかった。
実施例1と同じcDNAを、粒子に固定しないでそのままバインダー剤と混合して乾燥して、固形物を得た。これは容器から取り出しても一体化しており飛散することはなかった。
この固形物を1mlの蒸留水に溶解後、タカラバイオ(株)製SUPREC(登録商標)−PCRでDNA精製した。得られた液の一部を実施例1と同様な方法でPCR操作を行い、精製後、その一部の液を採取してさらにPCR操作を行うことを繰り返したところ、回を重ねるごとに電気泳動におけるバンドがスメアーになってしまい、10回後にはブロードなバンドしか確認できなかった。
12 cDNA(生体分子)
14 粒子
16 生体分子結合粒子
18 バインダー剤
22 基材
Claims (6)
- 生体分子が粒子に結合している生体分子結合粒子を、多糖類、アルギン酸ナトリウム、ゼラチン、カゼイン、ポリビニルアルコール、ポリアクリルアミド、ポリアクリル酸ナトリウム、ポリエチレンイミン、ポリエチレンオキシド及びポリビニルピロリドンから選択された少なくとも1種のバインダー剤と組み合わせて、前記生体分子結合粒子を前記バインダー剤で包囲すること、
前記生体分子結合粒子及びバインダー剤を、紙、プラスチック、布、ガラス、セラミックス、金属またはこれら2種以上の組み合わせである基材上に保持、又は基材内部に配置すること、
前記基材上の保持又は基材内部に配置された前記生体結合粒子及び前記バインダー剤を固化すること、
を含む生体分子の保存方法。 - 前記生体分子がポリヌクレオチドである請求項1記載の生体分子の保存方法。
- 前記生体分子がポリペプチド又はタンパク質である請求項1又は請求項2記載の生体分子の保存方法。
- 生体分子が粒子に結合している生体分子結合粒子と、
前記生体分子結合粒子を包囲し、多糖類、アルギン酸ナトリウム、ゼラチン、カゼイン、ポリビニルアルコール、ポリアクリルアミド、ポリアクリル酸ナトリウム、ポリエチレンイミン、ポリエチレンオキシド及びポリビニルピロリドンから選択された少なくとも1種のバインダー剤と、
前記生体分子結合粒子及び前記バインダー剤を保持又は内部に配置し、且つ、紙、プラスチック、布、ガラス、セラミックス、金属またはこれら2種以上の組み合わせである基材と、
を含む生体分子保持物。 - 前記生体分子がポリヌクレオチドである請求項4の生体分子保持物。
- 前記生体分子がポリペプチド又はタンパク質である請求項4又は請求項5の生体分子保持物。
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