JP4668005B2 - 分析システム - Google Patents
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Description
G(Δt)=<I(t)×I(t+Δt)>/<I(t)> 2
検出器が散乱光の強度を検出可能な最小サンプル時間をt1とした場合、制御部は、散乱光の強度と、自己相関関数G(Δt)(0.95×G(t1)≦G(Δt)≦1.05×G(t1))の値とに基づいて、指標を求める。
G2(τ)=<I(t)×I(t+τ)>/<I(t)>2・・・(1)
I2=I×G2(0.5)・・・(2)
上記した本発明の一実施形態の結合速度を反映する指標を求めるために行った実験について説明する。この実験では、結合物質に機能性タンパク質を加えて、機能性タンパク質を加えた時間から所定時間経過するまで、上記式(2)で定義されるI2をプロットしたグラフを作成することにより、実施例1および2と、比較例1および2とによる機能性タンパク質と結合物質との結合速度を評価した。なお、実施例1および2と、比較例1および2とでは、それぞれ、10mMTris−HCl、150mMNaClおよび20mMCaCl2(pH7.5)からなる緩衝液が用いられた。
10pmolのラクトース所有ポリマーおよびグルコース所有ポリマーに、1μmolのガラクトース特異性レクチンCEL−IVを加え、15sec間隔毎に上記式(2)で定義されるI2をプロットしたグラフ(図11参照)を作成してパーソナルコンピュータ(PC)4(図1参照)の表示部43に表示した。
10pmolのラクトース所有ポリマーおよびグルコース所有ポリマーに、1μmolのマンノース・グルコース特異性レクチンConAを加え、15sec間隔毎に上記式(2)で定義されるI2をプロットしたグラフ(図12参照)を作成してパーソナルコンピュータ(PC)4(図1参照)の表示部43に表示した。
10pmolのラクトース所有ポリマーおよびグルコース所有ポリマーに、1μmolのガラクトース特異性レクチンCEL−IVを加え、15sec間隔毎に制御部41aにより求められる平均散乱光強度データI(intensity)をプロットしたグラフを作成した。この結果を図13に示す。
10pmolのラクトース所有ポリマーおよびグルコース所有ポリマーに、1μmolのマンノース・グルコース特異性レクチンConAを加え、15sec間隔毎に制御部41aにより求められる平均散乱光強度データI(intensity)をプロットしたグラフを作成した。この結果を図14に示す。
上記した本発明の一実施形態の結合力を反映する指標を求めるために行った実験について説明する。この実験では、ラクトース所有ポリマーに、ガラクトース特異性レクチンCEL−IVを段階的に添加していき、上記式(2)で定義されるI2をプロットしたグラフを作成することにより、実施例3による機能性タンパク質と結合物質との結合力を評価した。なお、実施例3では、10mMTris−HCl、150mMNaClおよび20mMCaCl2(pH7.5)からなる緩衝液が用いられた。
10pmolのラクトース所有ポリマーに、10pmolを最小量とするガラクトース特異性レクチンCEL−IVを倍量ずつ(10、20、40、80、160、320、640、1280、2560、3840(pmol))添加して、添加後5分後に測定し、上記式(2)で定義されるI2をプロットしたグラフ(図16参照)を作成してパーソナルコンピュータ(PC)4(図1参照)の表示部43に表示した。なお、結合速度を反映する指標を求める実験において、上記したように、添加直後から約2min間で、ガラクトース特異性レクチンCEL−IVとラクトース所有ポリマーとの結合が終了していることから、十分に反応が進んでいる添加5分後に測定した。
上記した本発明の一実施形態の親和性を反映する指標を求めるために行った実験について説明する。この実験では、機能性タンパク質に結合物質を加えた状態で、結合物質と機能性タンパク質との結合を解離させる阻害糖(マンノースおよびグルコース)を段階的に添加していき、上記式(2)で定義されるI2をプロットしたグラフを作成することにより、実施例4による機能性タンパク質と結合物質との親和性を評価した。なお、実施例4では、10mMTris−HCl、150mMNaClおよび20mMCaCl2(pH7.5)からなる緩衝液が用いられた。
10pmolのグルコース所有ポリマーに、1μmolのマンノース・グルコース特異性レクチンConAを加え10分以上静置させた反応液に、0.1μmolを最小量とする阻害糖(マンノースおよびグルコース)をそれぞれ倍量ずつ(0.1、0.2、0.4、0.8、1.6、3.2、6.4、12.8(μmol))添加して、添加後5分後に測定し、上記式(2)で定義されるI2をプロットしたグラフ(図17参照)を作成してパーソナルコンピュータ(PC)4(図1参照)の表示部43に表示した。なお、結合速度を反映する指標を求める実験において、上記したように、添加直後から約3min間で、マンノース・グルコース特異性レクチンConAとグルコース所有ポリマーとの結合が終了していることから、十分に反応が進んでいる添加5分後に測定した。
2 分析装置
4 コンピュータ
5 検出セル
21 光源(レーザー)
24 可動レンズ(レンズ部)
31 アバランシェ・フォトダイオード(検出器)
32 コリレータ
41a 制御部
43 表示部(出力部)
Claims (12)
- 機能性タンパク質と前記機能性タンパク質に特異的に結合する結合物質とを収容して反応させるための検出セルに光を照射するための光源と、
前記検出セルから散乱光を検出するための検出器と、
前記検出器で検出された前記散乱光の強度に基づいて、前記機能性タンパク質と前記結合物質との結合状態の変化を表す指標を求めるための制御部とを備え、
前記制御部は、前記散乱光の強度と、自己相関関数の値とに基づいて、前記指標を求め、
前記自己相関関数G(Δt)は、時間tにおける散乱光の強度I(t)と、前記時間tから所定時間Δt経過後の散乱光の強度I(t+Δt)とにより、以下の式を満たすように定義され、
G(Δt)=<I(t)×I(t+Δt)>/<I(t)> 2
前記検出器が前記散乱光の強度を検出可能な最小サンプル時間をt1とした場合、
前記制御部は、前記散乱光の強度と、前記自己相関関数G(Δt)(0.95×G(t1)≦G(Δt)≦1.05×G(t1))の値とに基づいて、前記指標を求める、分析システム。 - 前記指標は、結合速度を反映する指標、結合力を反映する指標、および、親和性を反映する指標からなるグループより選択される少なくとも1つの指標である、請求項1に記載の分析システム。
- 前記制御部は、前記機能性タンパク質と前記結合物質との反応状態が異なる複数のポイントにおいて検出された散乱光の強度に基づいて、前記機能性タンパク質と前記結合物質との結合状態の変化を表す指標を求める、請求項1または2に記載の分析システム。
- 前記散乱光は後方散乱光である、請求項1〜3のいずれか1項に記載の分析システム。
- 前記自己相関関数G(Δt)の値は、前記時間tから前記検出器が散乱光の強度を検出可能な最小サンプル時間t1経過後の自己相関関数の値G(t1)である、請求項1〜4のいずれか1項に記載の分析システム。
- 前記制御部は、前記指標として、前記散乱光の強度と、前記自己相関関数G(Δt)の値との積を求める、請求項1〜5のいずれか1項に記載の分析システム。
- 前記散乱光の強度は、前記時間tから所定時間の間に検出された複数の散乱光の強度の平均値である、請求項6に記載の分析システム。
- 分析結果を出力するための出力部をさらに備え、
前記制御部は、前記機能性タンパク質と前記結合物質との反応時間に対する前記散乱光の強度と前記自己相関関数G(Δt)の値との積をプロットしたグラフを前記出力部に表示する、請求項6または7に記載の分析システム。 - 分析結果を出力するための出力部をさらに備え、
前記制御部は、十分な結合物質の存在する条件下で、複数の濃度に設定された前記機能性タンパク質を混在させたときの前記機能性タンパク質の濃度に対する前記散乱光の強度と前記自己相関関数G(Δt)の値との積をプロットしたグラフを前記出力部に表示する、請求項6または7に記載の分析システム。 - 分析結果を出力するための出力部をさらに備え、
前記制御部は、前記機能性タンパク質および前記結合物質を混在させた条件下で、前記機能性タンパク質と前記結合物質との結合を解離させる複数の濃度に設定された阻害糖を添加したときの前記阻害糖の濃度に対する前記散乱光の強度と前記自己相関関数G(Δt)の値との積をプロットしたグラフを前記出力部に表示する、請求項6または7に記載の分析システム。 - 前記検出セルに照射される前記光源からの光を集光するとともに、集光する光の焦点位置を移動することが可能なレンズ部をさらに備える、請求項1〜10のいずれか1項に記載の分析システム。
- 前記光源と、前記検出器とを有する分析装置と、
前記制御部を有するとともに、前記分析装置に通信可能に接続されるコンピュータとを備え、
前記コンピュータの制御部は、前記検出器で検出された前記散乱光の強度を受信して、受信した前記散乱光の強度に基づいて、前記機能性タンパク質と前記結合物質との結合状態の変化を表す指標を求める、請求項1〜11のいずれか1項に記載の分析システム。
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