JP4417127B2 - 細胞壁溶解酵素生産菌 - Google Patents
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Description
細胞の形態:桿菌(0.5〜0.6×0.7〜0.8μm)
細胞の多形性の有無 :−
運動性 :+
胞子の有無 :−
2.培養的性質
(Nutrient Agar培地 30℃)
色 :薄黄色
光沢 :+
色素産生 :+
(Nutrient Agar培地 30℃)
表面発育の有無 :−
培地の混濁の有無 :+
(ゼラチン穿刺培養)
生育状態 :+
ゼラチン液化 :−
(リトマス・ミルク)
凝固 :−(酸化)
液化 :−
3.生理学的性質
グラム染色性 :+
硝酸銀の還元 :+
脱窒反応 :−
MRテスト :+
VPテスト :−
インドール産生 :−
硫化水素の生成 :−
デンプンの加水分解 :+
クエン酸の利用(Koser) :−
(Christensen) :−
無機窒素源の利用 硝酸銀:+
アンモニウム塩:+
ウレアーゼ活性 :−
オキシダーゼ :−
カタラーゼ :+
生育の範囲 PH5 :−
6 :+
9 :+
生育の範囲 温度(℃)25:+
37:+
45:+
50:−
生育条件(好気性/嫌気性):+/+
O−Fテスト :−/−
4.糖類からの酸産生/ガス産生
L−アラビノース :+/−
D−グルコース :+/−
D−フラクトース :+/−
マルトース :−/−
ラクトース :+/−
D−ソルビトール :−/−
イノシトール :−/−
D−キシロース :+/−
D−マンノース :+/−
D−ガラクトース :+/−
サークロース :+/−
トレハロース :−/−
D−マンニトール :−/−
グリセリン :−/−
5.その他の生理学的性質
β−ガラクトシダーゼ活性 :+
アルギニンジヒドロラーゼ活性:−
リジンデカルボキシラーゼ活性:−
トリプトファンデアミナーゼ活性:−
ゼラチナーゼ活性 :+
酵母細胞壁の調製は、文献(Takagi,M.,酵母の実験技術,pp179-201,1994)記載の方法に準じて行った。酵母細胞壁の調製の供試菌株として、サッカロミセス・セレビッシェEGY48株(Invitrogenn社より購入)を使用した。YPD培地(1%酵母エキス、2%グルコース、2%ポリペプトン)で30℃、20時間振とう培養したサッカロミセス・セレビッシェを遠心分離機で集菌し、50mMリン酸緩衝液(50mM KH2PO4,50mM Na2HPO4,pH7.0)に懸濁し、ガラスビーズ(B.BRAUN BIOTECH INTERNATIONAL,Glasperlen 0.45−0.50mm)を用いて菌体を破砕後、98%エタノールで洗浄し、乾燥させたものを酵母細胞壁画分とした。
実施例1で調製した酵母細胞壁画分を用いて、細胞壁溶解酵素生産菌をスクリーニングするための寒天プレートを文献(Yoshida,M., Nishi,A., Ohbuchi,K., Hojo,T., Matuzawa,A., Hamachi,M., Kumagai,C.:Screening of the lytic enzyme for the red yeast Phaffia rhodozyma cell wall and extraction of astaxanthin,生物工学会誌,Vol.75,pp229-238,1997))記載の方法に準じて調製した。スクリーニング用寒天プレートは、具体的には、シャーレに選択培地(0.2%酵母細胞壁分画、0.7%イーストナイトロジェンベース(Yeast Nitrogen Base)w/o Amino Acids、1.8%寒天;pH6.8)を用いて作製した。
土壌試料は、日本各地(主に近畿地方)の山林・草原・川原などから採取し、減菌した蒸留水で103〜105倍希釈し、スクリーニング用寒天プレートに塗沫した。プレートを37℃で2〜3日間静置後、培地中の細胞壁成分を溶解し、コロニーの周りに大きな透明帯(ハロー)を形成した菌株を分離した。分離した菌株はスクリーニング用寒天プレート上で培養し、4℃にて保存した。
分離した菌株の生産酵素の細胞壁溶解活性測定には、ハローアッセイ(Yoshida,M.,Nishi,A.,Ohbuchi,K.,Hojo,T.,Matuzawa,A.,Hamachi,M.,Kumagai,C.:Screening of the lytic enzyme for the red yeast Phaffia rhodozyma cell wall and extraction of astaxanthin,生物工学会誌,Vol.75,pp229-238,1997)を利用し、実施例1で調製したサッカロミセス・セレビッシェ細胞壁画分を基質として用いた。土壌試料から分離した菌株を酵素生産基本培地(0.2%酵母細胞壁分画、0.7%0.7%イーストナイトロジェンベース(Yeast Nitrogen Base)w/o Amino Acids、0.1%グルコース;pH6.8)に植菌し、37℃で48時間振とう培養した後、その遠心上清を粗酵素液とした。スクリーニング用寒天プレートにコルクボーラーで直径5.0mmの孔をあけ、粗酵素液30μlを注ぎ、37℃で24時間保温後に生じるハローの径を測定した。酵素活性は、酵素希釈系列によって作成した式(1)によって算出した。なお、式中dはハローの直径(mm)を表す。式(1)での1単位は、市販酵素Westase(TAKARA社製)1mg/mlが形成するハロー径に相当する。
分離した菌株を、酵素生産基本培地にて定常期まで30℃で振とう培養した。培養後、その遠心上清に硫酸アンモニウムを飽和濃度50%まで加えた。生じた沈殿を滅菌蒸留水に溶解し、分画分子量10,000及び100,000の濃縮フィルター(MILLIPORE,Microcon)を用いて濃縮した。遠心後、乾燥させた沈殿を粗酵素粉末とした。粗酵素粉末は滅菌蒸留水に溶解し、取得酵素のβ−D−グルカン、pNPGの分解活性測定及び至適条件、安定性の検討に用いた。
50mMリン酸緩衡液に2mM pNPGを溶解したものを基質溶液とした。基質溶液200μlに酵素液30μlを加え、37℃で10分間反応させた後、0.2M Na2CO3を1ml加えて反応を停止させた。反応を停止後、蒸留水2mlを加え、405nmにおける吸光度を測定した。活性は、1分間に1μmolのp-ニトロフェノール相当量を遊離する酵素量を1Uと定義した。
β−グルカン分解活性は、基質溶液(400mg/ml,pH7.0)240μlに酵素液10μlを加え、37℃における20時間反応後の遊離還元糖量より求めた。遊離した還元糖量はSomogyi-Nelson法(Nelson,N.,J.Biol.Chem:A photometric adaptation of the somogyi method for the determination of glucose, Vol. 153, pp375-380, 1944;Somogyi,M.:Notes on sugar determination ,J.Biol.Chem, Vol. 195, pp19-23,1952)により測定した。すなわち、反応後の溶液に銅試薬を加え、沸騰湯浴中で10分間放置後、Nelson試薬を加えて600nmにおける吸光度を測定した。活性は、1分間に1μmolのグルコース相当量を遊離する酵素量を1Uと定義した。
pHの影響検討に際し、Macllvaine緩衡液(0.1M C6H8O7,0.2M Na2HPO4;pH2.2〜9.0)及びGlycin-NaOH緩衡液(0.2M glycin,0.2M NaOH,pH10.0〜12.0)を用いた。基質として実施例1で調製したサッカロミセス・セレビッシェ細胞壁画分を用いた。pH安定性においては、4℃で一晩、温度安定性においてはpH6.8で一晩放置後の酵素溶液を用いて、ハローアッセイにより残存活性を比較した。
日本各地より採取した土壌試料232点からスクリーニング用寒天プレート上に生育した8615コロニーのうち、22.1%にあたる1901コロニーが、培地中のサッカロミセス・セレビッシェ細胞壁画分を溶解してハローを形成し、酵母細胞壁溶解活性を示した(図1)。細胞壁溶解活性をもつ菌株の分布に地域的な偏りはみられなかった。分離した細胞壁溶解酵素生産菌の培養液上清を用いたハローアッセイにおいて、24時間以内にハローを形成したサンプルは504サンプル中135サンプルであり、全体の37%であった(図2)。このハローアッセイで、酵素活性の強いKH−3株を酵素学的解析のために選抜した。
選抜したKH−3株は、桿状細菌で、長さは0.6〜0.8μm、幅は0.5〜0.6μmであった(図3)。スクリーニング用寒天プレート上では最初は白色を呈し、徐々に黄色のコロニーへと変化した。この分離したKH−3株はグラム陽性菌であり、増殖上限温度は45℃であった。なお、分離した菌株の観察と写真撮影には、オリンパス写真顕微鏡(OLYMPUS,AHBS3)を用いた。
選抜されたKH−3株を酵素生産基本培地及びLB培地(0.5%酵母エキス、1%トリプトン、1% NaCl)で培養し、その培養上清のハローアッセイによる酵素活性を測定したところ、細胞壁溶解活性が認められた。LB培地では定常期到達前後に最大の酵素活性を示した。
取得した酵素の各種基質分解活性の測定結果を表1に示す。KH−3株から取得した酵素はpNPGase,ラミナリナーゼ、リケナーゼ、カードラナーゼ活性を有していた。特に、KH−3株の生産酵素は強いβ−グルカナーゼ活性を示した。サッカロミセス・セレビッシェ細胞壁画分には、β−1,3−グルカン、β−1,6−グルカン、キチンなどが含まれており、主鎖のβ−1,3−グルカンに側鎖のβ−1,6−グルカンが付加する構造を主としている(Hrmova,M.,Fincher,G.B.: Purification and properties of three(1-3)-β-D-glucanase isoenzymes from young leaves of barley,Biochem.J., Vol.289, pp453-461, 1993;Montijin,R.C., Vink,E., Muller,W.H., Verkleij,A.J., Ende,H.V.D., Henrissat,B., Klis,F.M.: Localization of synthesis of β-1,6-glucan in Saccharomyces cerevisiae, J.Bacteriol., Vol.181, pp7414-7420, 1999)。今回取得したKH−3株由来の酵素はこのような構造に対して分解活性があると考えられるが、ハローアッセイにおいて透明度の異なる二重の円を生じたことから、複合酵素である可能性が示唆される。
KH−3株由来の酵素のS. cerevisiae細胞壁画分に対する至適温度は30℃〜40℃、至適pHは7.0〜9.0にあった(図4a,4b)。スクリーニングをおこなった条件が、37℃、pH6.8であったため、その付近が至適条件となったと考えられる。また、温度安定性では、pH6.8に調製した酵素溶液を25〜50℃で24時間放置後、37℃で反応させたところ、30℃までは溶解活性を維持していたが35℃以上では活性の低下が著しかった(図4c)。pH安定性ではpH2.2−12.0の範囲でそれぞれ4℃にて24時間放置後、pH6.8に再調整し37℃で反応させたところ、pH6.5を中心に残存活性の安定が見られた(図4d)。
選抜したKH−3株の同定を行った。16SrDNA(16SrRNA遺伝子)の部分塩基配列約500bpをもちいて検体の帰属分類群を推定した。KH−3株の5'末端側約500bpの塩基配列を配列番号1に示す。その結果、KH−3株の16SrDNA部分塩基配列は、セルロサイマイクロビウム・セルランスの16SrDNAに対し最も高い相同性を示すことがわかった。
選抜したKH−3株の形態学的及び生理学試験結果を表2及び表3に示す。その結果、KH−3株は、グラム染色陽性、桿菌、芽胞非形成、運動性、コロニー色彩で黄白色、カタラーゼ反応陽性、ブドウ糖の分解による酸産生等の性状を示し、また生化学試験や発酵性試験の結果から、その性状は多くの点でセルロサイマイクロビウム・セルランスの性状と一致することがわかった。一方、現在報告されているセルロサイマイクロビウム・セルランス(SCHUMANN (P.), WEISS (N.) and STACKEBRANDT (E.): Reclassification of Cellulomonascellulans (Stackebrandt and Keddie 1986) as Cellulosimicrobium cellulans gen. nov., comb.nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2001, 51, 1007-1010.)やセルロサイマイクロビウム・バリアビレ(BAKALIDOU (A.), KAMPFER (P.), BERCHTOLD (M.), KUHNIGK (T.), WENZEL (M.)and KONIG (H.): Cellulosimicrobium variabile sp. nov., a cellulolytic bacterium from the hindgut of the termite Mastotermes darwiniensis. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52,1185-1192.)は非運動性として報告されており、この点でKH−3株の性状は報告されているセルロサイマイクロビウム属微生物とは異なっている。
KH−3株の培養菌体から河村らの方法(河村好章,江崎孝行 細菌の系統分類と同定方法 第18 回日本細菌学会技術講習会テキスト 日本細菌学雑誌 55(3):545-584. 2000.)によりDNA を抽出し、抽出したDNAは多糖質由来と思われる粘性を生じていたため、田村らの方法(田村朋彦,中川恭好,川崎浩子: DNA の調製,日本放線菌学会 編 放線菌の分類と同定)によりHexadecyltrimethyl ammonium bromide(CTAB)を用いて精製し、GC含量測定のためのDNAを取得した。測定の主な手法は成書(鈴木健一朗:DNA塩基組成、鈴木健一朗、平石明、横田明編 微生物の分類・同定実験法 分子遺伝学・分子生物学的手法を中心に 28-33pp. シュプリンガー・フェアラーク東京. 2001.)によった。高速液体クロマトグラフ(HPLC)を用いた測定法は文献(KATAYAMA-FUJIMURA (Y.), KOMATSU (Y.), KURAISHI (H.) and KANEKO (T.):Estimation of DNA base composition by high performance liquid chromatography of its nuclease P1 hydrolysate. Agric. Biol. Chem., 1984, 48, 3169-3172.)記載の方法により行った。
KH−3株とセルロサイマイクロビウム・セルランス基準株(NBRC15516)とのDNA−DNAハイブリッド形成試験を行い、種の異同を決定した。KH−3株と基準株の培養菌体から前記河村の方法によりDNAを抽出し、抽出したDNA多糖質由来と思われる粘性を生じていたため、前記田村らの方法によりHexadecyltrimethyl ammonium bromide(CTAB)を用いて精製し、DNA−DNAハイブリッド形成試験に用いた。DNA−DNAハイブリッド形成試験の主な手法は河村の方法(河村好章,江崎孝行 細菌の系統分類と同定方法 第18 回日本細菌学会技術講習会テキスト 日本細菌学雑誌 55(3):545-584. 2000.)及び成書((鈴木健一朗:DNA−DNAハイブリダイゼーション、鈴木健一朗、平石明、横田明編 微生物の分類・同定実験法 分子遺伝学・分子生物学的手法を中心に 34-47pp. シュプリンガー・フェアラーク東京. 2001.)により、マイクロプレート法を用いて行った。結果(3回の試験の平均)を表4に示す。
Claims (6)
- サッカロミセス・セレビッシェ(Saccharomyces cerevisiae)の細胞壁溶解活性を有し、運動性を有することを特徴とするセルロサイマイクロビウム・セルランス(Cellulosimicrobium cellulans)KH−3(FERM p−19547)。
- セルロサイマイクロビウム・セルランス(Cellulosimicrobium cellulans)KH−3(FERM p−19547)を培地に培養し、培養物から、至適温度が30〜40℃、至適pHが7.0〜9.0である細胞壁溶解活性を有する細胞壁溶解酵素を採取することを特徴とする細胞壁溶解酵素粗精製物の製造方法。
- 請求項2記載の製造方法により得られる細胞壁溶解酵素粗精製物。
- 請求項3記載の細胞壁溶解酵素粗精製物を用いることを特徴とするプロトプラストの調製方法。
- 請求項3記載の細胞壁溶解酵素粗精製物を用いることを特徴とする細胞壁構成成分の分離・解析方法。
- 請求項3記載の細胞壁溶解酵素粗精製物を用いることを特徴とする菌体内成分の抽出方法。
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