JP4239513B2 - 質量分析システム、質量分析方法、質量分析装置 - Google Patents
質量分析システム、質量分析方法、質量分析装置 Download PDFInfo
- Publication number
- JP4239513B2 JP4239513B2 JP2002230757A JP2002230757A JP4239513B2 JP 4239513 B2 JP4239513 B2 JP 4239513B2 JP 2002230757 A JP2002230757 A JP 2002230757A JP 2002230757 A JP2002230757 A JP 2002230757A JP 4239513 B2 JP4239513 B2 JP 4239513B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- mass
- ions
- database
- analysis
- ion
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
Images
Classifications
-
- H—ELECTRICITY
- H01—ELECTRIC ELEMENTS
- H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
- H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
- H01J49/004—Combinations of spectrometers, tandem spectrometers, e.g. MS/MS, MSn
-
- H—ELECTRICITY
- H01—ELECTRIC ELEMENTS
- H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
- H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
- H01J49/26—Mass spectrometers or separator tubes
- H01J49/34—Dynamic spectrometers
- H01J49/42—Stability-of-path spectrometers, e.g. monopole, quadrupole, multipole, farvitrons
- H01J49/426—Methods for controlling ions
- H01J49/427—Ejection and selection methods
- H01J49/4285—Applying a resonant signal, e.g. selective resonant ejection matching the secular frequency of ions
Description
【０００１】
【発明の属する技術分野】
本発明は夾雑成分を多く含む物質の質量分析システムなどに関し、特にタンパク質などの生体関連物質解析に向けた質量分析システム、分析方法、装置に関する。
【０００２】
【従来の技術】
レビューズ オブ モダーン フィジックス 第62巻（1990年）第531-540項 (Reviews of Modern Physics, Vol. 62 (1990) pp531-540)には、イオントラップに関する基本的な記載が見られる。このイオントラップの基本的構成の断面図を図１５に示す。四重極イオントラップは、二つのエンドキャップ電極と一つのリング電極から構成される。そして、これらの電極に高周波電圧を印加することにより、これらの電極間の中心部に四重極電界を形成し、気体状イオンを三次元的にトラップすることができる。高周波電圧を連続的に変化させることにより、排出されるイオンの質量を走査できる。また、四重極ポールは平行な四本のポールから構成される。そして、高周波電圧を電極に印加することにより、電極の中心部において気体状イオンを二次元的に閉じ込めることができる。また、印加する高周波電圧を調整することにより、特定の質量のイオンを排出したり、逆に特定の質量のイオンのみを閉じ込めることができる。
【０００３】
また、米国特許第Re.34000号に記載のように、四重極イオントラップではタンデム質量分析（MS/MS）を行うことができる。この装置では、ＭＳ/ＭＳの直前に分析不要のイオンを排出する。すなわち、分析不要のイオンの除去は１次質量分析の前に行われるものではない。。そして、そのイオンに共鳴する高周波電圧を印加し運動エネルギーを増加させる。以上の操作により、残留分子との衝突誘起解離（CID：Collision Induced Dissociation）による解離イオン（フラグメントイオン）が生成され、そのフラグメントイオンを質量分析（タンデム質量分析）することにより、フラグメントイオンの質量を決定することができる。この場合、先ず、CIDを施さない質量分析（１次質量分析）を行い、タンデム質量分析（MS/MS、あるいは、２次質量分析）の対象とするイオンを決定する必要がある。また、同様の操作により、特定の解離イオンに対して更なるタンデム質量分析（MSn）を行うこともできる。
【０００４】
さて、最近、タンパク質の網羅的な解析に、質量分析法が多用されている。アナリティカル ケミストリー 第73巻 （2001年） 第5683-5690項 (Analytical Chemistry, Vol. 73 (2001) pp5683-5690)には、ショットガン解析と呼ばれる分析例が記載されている。この手法では、タンパク質を酵素消化して調製したペプチド混合物を液体クロマトグラフで分離し、分離サンプルを四重極イオントラップ質量分析装置によりタンデム質量分析する。決定したイオンの質量、及び、フラグメントイオンの質量に対して、タンパク質あるいは遺伝子のデータベースで検索を行い、タンパク質の同定を行う。ペプチド混合物の種類が非常に多い場合には、液体クロマトグラフで必ずしも各ペプチドが完全に分離されない。そのため、質量分析装置には複数種のペプチドが同時に導入されることがある。そこで、データ依存分析（Data-dependent analysis）と呼ぶ自動タンデム分析が必要となっている。即ち、液体クロマトグラフで分離される分離サンプルのバンド幅が１分程度のオーダーであり、一度にタンデム質量分析を施すことができるイオンは５種類ほどに限定される。データ依存分析の設定にも依存するが、イオン強度の高いイオンを優先的にタンデム質量分析することが多い。
【０００５】
また、サーモフィニガン社製四重極イオントラップ質量分析装置（LCQ）の技術資料（www.thermo.com/eThermo/CMA/PDFs/Articles/articlesFile_10918.pdf）には、ダイナミック・イクスクルージョン機能の説明がある。分析を開始する前に、タンデム質量分析したくない分析対象外イオンの質量を入力し、リストを作成する。この操作により、質量値をリストに記載されたイオンをデータ依存分析（タンデム質量分析）の対象から外すことが可能である。この機能を用いる場合は、先ずCIDを施さない通常の質量分析を行い、検出されるイオンの質量を決定する。次に、検出イオンの中からタンデム質量分析の対象とするイオンの優先順位を決定するが、この際にリストに記載されたイオンをデータ依存分析（タンデム質量分析）の対象から外すというものである。
【０００６】
【発明が解決しようとする課題】
このように、質量分析装置に同時に導入される混合物サンプルの中で、タンデム質量分析を施すことができるサンプルの数は限られている。特に、先述のショットガン解析などでは夾雑成分が多いため、イオン強度が低くタンデム質量分析を施すことができないイオンが存在する場合が多い。そのため、分析したい微量サンプルのタンデム質量分析ができないという問題がある。データ依存分析を用いても、イオン強度の高いイオンを優先的にタンデム質量分析するため、分析対象外のイオンのみ分析することがあるためである。先述のダイナミック・イクスクルージョンが有効なのは、分析対象とする必要がない物質が予め既知の場合に限られる。未知の夾雑成分が多量に混入している場合には、分析したい微量サンプルのタンデム質量分析ができないことがある。
【０００７】
以上より本発明は、１次質量分析前に分析対象イオン、または分析対象イオンと共に分析対象外イオンを選択する機構を有することにより、未知の夾雑成分が多量に混入している場合にも分析したい微量サンプルについて分析可能なダンデム質量分析の提供を目的とする。
【０００８】
【課題を解決するための手段】
上記課題は以下の構成により達成される。
（１）分析対象候補物質のデータが記録された第一のデータベースと、分析対象でないイオンを排除するための高周波電圧を印加する高周波電源とを用い、１次質量分析の前に第１のデータベースにリストされていない分析対象でないイオンを、もしくは分析対象候補外物質のデータが記録された第２のデータベースのデータと一致する分析対象外イオンを高周波電圧により排除してから質量分析を行う。このことにより、分析対象外イオンからの悪影響を受けることがなくなり、分析対象イオンを質量分析で検出することができる。
（２）または、１次質量分析の後で、かつ残留分子との衝突誘起解離（CID）などによる解離過程及び解離イオンの質量分析（ダンデム質量分析）の前に、分析対象候補物質のデータが記録された第１のデータベースにリストされた分析対象イオンを選択し、選択されたイオンを対象にCIDを施し、ダンデム質量分析を行う。その結果、微量にしか存在しない分析対象イオンも、確実にタンデム質量分析を施すことが可能となる。
（３）さらに、（１）と（２）を組み合わせた構成としても勿論よい。
【０００９】
【発明の実施の形態】
図１に、本発明の質量分析システムの一実施例に基づくシステム構成図を示す。PCなどの端末装置において、分析対象イオンに関する第一のデータベースの入力操作を行う。新規データベースのファイル作成が必要な場合には、直接イオン質量（またはｍ/ｚ、ここでｍはイオン質量、ｚはイオンの電荷）を画面入力することも可能だが、外部データベースを利用するための情報（例えば、生物種などのカテゴリー（ヒューマンなど）、消化酵素、修飾の有無、器官など）を選択・入力することもできる。後者の場合には、遺伝子あるいはタンパク質などの外部データベースをダウンロードしたサーバーあるいはインターネットを利用してデータベースの作成や更新を行うことも可能である。既存のデータベースを利用する場合には、画面上で既存のデータベースリストから選択するなどの操作により、第一データベースを決定する。第一データベースに関する必要な入力情報を入力した後、送信入力を行う。以上の操作により、分析対象候補物質を記録した第一のデータベースは、データベース格納部に保存される。
実際の分析においては、第一データベースにリストされていない物質のイオンを検出され難くするために、情報処理部では質量分析計（MS）に印加する高周波電圧を制御する指示を高周波電圧電源に送信し、１次質量分析を行うことができる。その結果、第一データベースにリストされた分析対象候補物質のイオンが存在すれば、１次質量分析で検出される以前に、不要なイオンを排出できる。検出イオンの情報は、逐次データベース格納手段に保存されている第一のデータベースで検索される。２次質量分析の対象とするイオンの種類数は限定されるため、第一データベース内データと一致したイオンに対して優先的に２次質量分析（タンデム質量分析）を行う指示が情報処理部よりCIDに関与する電源に出される。
また、分析不要のイオンが既知の場合には、分析対象候補物質のデータを記録するための第二のデータベースを先述の第一のデータベースと同様に作成し、１次質量分析時に印加される高周波電圧の制御に用いることができる。さらに、第一のデータベースにリストされているイオンで、分析が完了したイオンの情報は、第二のデータベースに移行させることができる。このことにより、同一イオンを重複して分析することが回避され、より多種類の微量サンプルを分析することが可能となる。２次質量分析した結果とその親イオンの情報により物質の同定が行われる。
上記分析のフローの例を図２に示す。ここでは、一つのシーケンスでタンデム分析できる回数をNとし、第一のデータベースにリストされたイオンで、ｋ回検出されたものの情報は、第一データベース更新により一旦削除する。このようなデータベースの自動更新については、分析を開始する前に、（表示部の入力画面において）図１における画面操作により指定することができる。非常に微量の分析対象サンプルを分析する場合には、図３に示すように、第一データベースの自動更新はオフにする方が分析対象サンプルの検出には有利である。
また、第二のデータベースを持つ実施例のフローを図４に示す。非常にイオン強度が高いと予想される分析対象外イオンが既知の場合には、分析対象外イオンの情報を第二のデータベースとして先述の第一のデータベースと同様に作成し、１次質量分析時に印加される高周波電圧の制御に用いると便利である。これらフローの設定は、（表示部の入力操作）図１における画面操作によりにより行うことが出来る。
図５に、本発明の質量分析システムの一実施例に基づく装置構成図を示す。質量分析装置は四重極イオントラップ―飛行時間型質量分析装置である。四重極イオントラップと飛行時間型質量分析計を結合した四重極イオントラップ―飛行時間型質量分析装置自体については、例えば、アナリティカル ケミストリー 第67巻 （1995年） 第234A-242A項 (Analytical Chemistry, Vol. 67 (1995) pp234A-242A)に記載されている。ただ、本実施例では、イオントラップから排出されたイオンの軌道が飛行時間型質量分析計の加速部においてほぼ直角に曲げられる点が異なる。この形態は、飛行時間型質量分析計の加速部におけるイオンのエネルギー広がりを低減し、質量分解能を向上させるためである。液体クロマトグラフなどの液体分離部により分離されたサンプル溶液は、イオン源に導入され、エレクトロスプレーイオン化法やソニックスプレーイオン化法などの噴霧イオン化法により、気体状イオンに変換される。生成された気体状イオンは、細孔１より差動排気部２に導入される。さらに、細孔３より高真空部４に導入され、気体状イオンは多重極ポールなどで構成されるイオン輸送部５を通過し、イオントラップ６に導入される。イオントラップ６には高周波電圧が高周波電源より供給され、四重極電界によりイオントラップ６の中心部に気体状イオンはトラップされる。分析対象外イオンに対しては、分析対象外イオンをイオン輸送部５で排除するように、イオン輸送部の多重極ポールに高周波電圧を印加することができる。また、イオン輸送部５に多重極ポールが使用されない場合には、イオントラップ６で分析対象外イオンを排除し、分析対象イオンをトラップする高周波電圧がイオントラップ６に印加される。一定時間トラップされた気体状イオンは、電気的な力により右方に輸送され、飛行時間型質量分析計７のイオン加速部８に導入される。イオン加速部８では、導入された気体状イオンに対し、特定のタイミングでパルス状の高電圧を印加し、気体状イオンを特定の運動エネルギーになるまで加速する。加速された気体状イオンはリフレクター９により軌道の変更を受け、エネルギー収束されて、検出器１０で検出される。イオン加速部８から検出器１０に至るイオン軌道の長さは一定であり、イオン速度はイオンのｍ/ｚ（質量/電荷数）が大きいほど低いため、検出器１０にはｍ/ｚの低いイオンから順次検出される。検出器１０の出力は情報処理部に導入され、イオン検出時間に基づいてイオンのｍ/ｚが決定される。このようにして得られた１次質量分析結果より、２次質量分析の対象とするイオンの優先順位を情報処理部で決定する。次に、イオントラップ６に導入されるイオンの中から２次質量分析の対象とするイオンだけを単離（アイソレーション）するための高周波電圧をイオントラップ６に印加するため、情報処理部から高周波電源に指示が出される。さらに、単離イオンをCIDなどで解離するための指示が情報処理部から高周波電源に出され、解離したフラグメントイオンがイオントラップ６に生成される。フラグメントイオンは、電気的な力により右方に輸送され、飛行時間型質量分析計７のイオン加速部８に導入される。イオン加速部８では、導入された気体状イオンに対し、特定のタイミングでパルス状の高電圧を印加し、気体状イオンを特定の運動エネルギーになるまで加速する。加速された気体状イオンはリフレクター９により軌道の変更を受け、検出器１０で検出される。検出器１０の出力は情報処理部に導入され、イオン検出時間に基づいてイオンのｍ/ｚが決定される。このようにして、２次質量分析が実現する。一定数の優先順位付けされた２次質量分析対象イオンは、その優先順位に従い、順次２次質量分析が行われる。
【００１０】
イオントラップ６には、四重極イオントラップの代わりに、図６に示すような四重極ポールから構成されるリニアトラップを用いても構わない。リニアトラップ（四重極ポール）−飛行時間型質量分析装置自体については、例えば、ラピッド コミュニケーションズ イン マス スペクトロメトリー 第12巻（1998年）第1463-1474項 (Rapid Communications in Mass Spectrometry, Vol. 12 (1998) pp1463-1474)に記載がある。本実施例は図２の四重極イオントラップと機能はほぼ同等だが、一度にトラップできるイオンの量を増加させることができる点が特徴的である。リニアトラップには、分析対象外イオンを除去し、分析対象イオンはトラップできる高周波電圧を印加する。
【００１１】
また、図７に示すように、質量分析計は四重極イオントラップ質量分析計だけにすることも可能である。液体クロマトグラフなどの液体分離部により分離されたサンプル溶液は、イオン源に導入され、気体状イオンに変換される。生成された気体状イオンは、細孔１より差動排気部２に導入される。さらに、細孔３より高真空部４に設置されたイオン輸送部５を通過し、イオントラップ６に導入される。イントラップ６には高周波電圧が高周波電源より供給され、イオントラップ６の中心部に気体状イオンはトラップされる。イオントラップ６には、分析対象外イオンを除去し、分析対象イオンはトラップできる高周波電圧が印加される。一定時間トラップされた気体状イオンは、イオントラップ６に印加される高周波電圧を連続的に変化させることにより、イオンのｍ/ｚに応じてイオントラップ６より排出され、検出器１０で検出される。検出器１０の出力は情報処理部に導入され、イオン検出時間によりイオンのｍ/ｚを決定（１次質量分析）することができる。図２の例と同様に、２次質量分析を行うこともできる。飛行時間型質量分析計に比較して、四重極イオントラップでは質量分析範囲や質量分解能、質量精度は低いが、装置が小型化でき、高感度な分析が可能である。
【００１２】
以上の図5、６、７に示された実施例においては、情報処理部からの指示を受けて高周波電圧を印加することにより、分析対象外イオンを1次質量分析前に除去し、分析したい微量成分について確実に質量分析が行われる。特に図6に示されたリニアトラップを用いる場合には、リニアトラップは例えば図２の四重極イオントラップと比較して容量が2桁高いものであるため、微量成分をより確実に質量分析することができる。
図１における画面操作は、表示部と入力部とにより実行される。表示部で表示された入力画面では、分析に先立って、分析対象イオンの情報（イオンの質量やｍ/ｚなど）を入力部により入力することができる。先述のように第一のデータベースが製作され、格納手段において格納される。そして、第一のデータベースに基づき、情報処理部では高周波電源を制御し、イオントラップ６またはイオン輸送部５の多重極ポールに高周波電圧を印加する。その結果、イオン源よりイオントラップ６に導入されるイオンの中で、分析対象イオン以外のイオンに対して共鳴排出などの高周波電圧が印加され、分析対象イオンはイオントラップ６でトラップされる。また、分析に支障をきたす可能性のある分析対象外イオンが既知の場合、このようなイオンの情報を第二のデータベースに格納しておくこともできる。このことにより、分析対象外イオンは共鳴排出などの高周波電界により排除され、分析対象イオンはイオントラップ６でトラップさせることができる。以上の操作により、イオン源で生成されたイオンのなかで分析対象イオンが含まれる場合には、イオントラップ６でトラップされ、質量分析（１次質量分析）することができる。次に、１次質量分析で検出されたイオンの情報を第一のデータベースと照合し、一致するイオンに対して優先的にタンデム質量分析（２次質量分析）を行う。タンデム質量分析を行う際の優先順位としては、イオン強度の高いもの順、あるいは、フラグメントイオンが検出し易い多価イオンなどがある。次に、優先順位に従い、２次質量分析対象イオン（一種類）をイオントラップ６で単離（アイソレーション）し、CIDなどによりフラグメント化（解離）させる。図５や図６に示す実施例では、生成されたイオン（フラグメントイオン）は、電気的な力により右方に輸送され、飛行時間型質量分析計７で分析される。また、図７に示す実施例では、イオントラップ６で２次質量分析が実行される。このようなタンデム質量分析（MS/MS）シーケンスを分析対象イオンに対して順次施し、各々のMS/MSスペクトルを得る。さらに、同様の操作により、高次のタンデム質量分析｛MSｎ（ｎ＝３、４、、）｝を行うことも可能である。
図８に、イオントラップにおけるイオンのトラップに関する模式図を示す。図８（a）に示すように、通常は入射イオンをトラップする高周波電圧がイオントラップに印加されるため、左方より導入されるA+及びB+イオンの混合物はその存在比に従いイオントラップにおいてトラップされる。例えば、A+イオンがB+イオンより存在比が圧倒的に多い場合、トラップされるイオンはA+イオンが圧倒的に多くなる。一方、イオントラップでは、空間電荷効果によりトラップされるイオンの総量が制限される。そのため、イオントラップでトラップされるB+イオンの数が数個程度となることがあり、B+イオンの検出が困難となることがある。また、A+イオンのような存在比が高いイオンが幾つも混在する場合、イオントラップにおいて単離されCIDされるイオンは存在比が高いイオンのみとなり、B+イオンのような存在比の低いイオンはタンデム質量分析の対象とすることができないことがある。一方、イオントラップにおいて、入射イオンをトラップする高周波電圧の他にA+イオンを共鳴排出する高周波電圧を重ね合わせて印加する場合、図８（b）に示すように、A+イオンはイオントラップに一旦導入されるが、加熱されてイオントラップから外部に排出される。その結果、B+イオンはイオントラップで濃縮され、検出できるB+イオンの数を増加させることができる。このことは、B+イオンの検出感度が向上することを意味し、タンデム質量分析も可能となる。また、図５、６、７に示すように、イオン輸送部５に入射イオンをトラップする高周波電圧の他にA+イオンを共鳴排出する高周波電圧を重ね合わせて印加すると、A+イオンが直接イオントラップに導入されることを防止することができる。その結果、B+イオンの検出感度がさらに向上する。本件の実施例では、高周波電圧印加により、イオン存在比が低いイオンについて２‐３倍の検出感度の向上が見られた。
図９、１０、１１には、イオン源にMALDI（マトリックス支援レーザー脱離イオン化法）を用いた一実施例に基づく装置構成図示す。図９の装置例は四重極イオントラップ質量分析装置のものであり、図１０の装置例は四重極イオントラップ―飛行時間型質量分析装置のものである。イオントラップ６には、四重極イオントラップの他、図１１に示すように四重極リニアトラップを用いることもできる。試料サンプルはマトリックス物質とともにプレート１１に固定化し、乾燥させる。このようにして作製したプレート１１を真空装置内に設置し、パルスレーザー光を照射する。真空装置には窓１２が設置され、大気圧下で発振させたレーザーからのレーザー光が窓１２を透過して真空装置内に照射される。レーザー照射（ビーム径は約0.1mm）によりプレート１１からはマイクロ秒程度の間イオンが生成される。プレート１１上のレーザー照射部位を移動させることにより、次々に気体状イオンを生成する。生成されたイオンは多重極ポールなどで構成されるイオン輸送部５を通過し、イオントラップ６に導入される。イントラップ６には高周波電圧が高周波電源より供給され、イオントラップ６の中心部に気体状イオンはトラップされる。本実施例ではプレート１１は真空装置内に設置したが、大気圧下に設置することもできる。図９、１０、１１に示された実施例においても、情報処理部からの指示を受けて高周波電圧を印加することにより、分析対象外イオンを1次質量分析前に除去し、分析したい微量成分について確実に質量分析が行われる。
図１２に、本発明のさらに別の質量分析システムの一実施例に基づく装置構成図を示す。本実施例は、二次元液体クロマトグラフィー／質量分析システムである。一次元目の液体クロマトグラフカラム（LCカラム）にインジェクションバルブより液体サンプルが導入されるが、移動相溶液にグラジエントをかけるために、二つの液体リザーバー１に用意された移動相溶液２種類が２台のポンプ１により液体流量を調節されてインジェクションバルブに導入される。LCカラムで分離された液体サンプルは逐次スイッチングバルブ１３に導入され、トラップカラムで吸着される。トラップカラムでの吸着を一定時間行うと、ポンプ１は停止する。次に、別の二つの液体リザーバー２に用意された移動相溶液２種類が２台のポンプ２により液体流量を調節されて、トラップカラムに導入される。そして、トラップカラムに吸着された分離サンプルを溶出させ、二次元目液体クロマトグラフカラム（LCカラム）に導入され、さらに分離される。分離サンプルは逐次質量分析装置に導入され、質量分析される。分離終了後、ポンプ２は停止し、ポンプ１が動作する。一次元目LCカラムで分離される液体サンプルは、トラップカラムで一定時間吸着され、二次元目LCカラムで分離され、質量分析される。このようにして、二次元的にLC分離された液体サンプルは、逐次質量分析される。混合しているサンプルの種類が少ない場合には、一次元のLCだけで分離するLC/MS分析で対応可能だが、サンプル種類が非常に多い場合には二次元LCでも完全に分離することは出来ず、MSに導入されるサンプルは混合物であることが多い。先に述べたように、同一サンプルに対してタンデム質量分析できるイオンの種類には限りがあり、微量サンプルの場合には分析対象物質を優先的にタンデム質量分析することが非常に有効である。
分析対象物質が予め明確化されており、分析サンプル数が多い場合には、LCカラムを並列処理することにより、高スループット分析を行うことができる。図１３に示す実施例では、LC/MS分析を行うが、LC及びイオン源が２つ並列に用いられている。分析対象物質のLC溶出時間が予測できれば、LC分析の開始時間をずらすことにより、分析対象物質由来の気体状イオンが生成される時間をずらすことができる。即ち、イオン源１より生成される分析対象物質由来の気体状イオンを分析した後、イオン源２より生成される分析対象物質由来の気体状イオンを分析する。イオン源と質量分析装置との結合部では、複数のイオン源を時間的に切り替える。イオン源とLCカラムは一体化されていても構わない。別の方法としては、イオン源は一台に固定し、イオン源に導入される分離液体サンプルをバルブなどで切り替える方法があるが、LC末端からイオン源までの距離が長くなり、イオン生成時に分離度が低下する可能性がある。このようなLCの並列処理では、分析対象物質由来の気体状イオンを分析しない待ち時間（１時間程度）を有効活用でき、高スループット分析に有利である。本実施例では、並列処理数が２だが、数を増加させても構わない。複数種類の物質を分析することも可能とするため、イオン源の移動時間と第一のデータベースにリストされた分析対象イオンとの対応やLC分析の開始時間を予め入力部で指定しておくことが便利である。
代謝物質の評価や診断においては、分析対象物質が予め明確化されており、その物質の定量が必要である。このような場合、その物質と化学的な性質は殆ど同一だが分子量だけが異なるような内部標準物質を一定量だけサンプルに添加すると正確な定量分析が可能となる。典型的な内部標準物質は、重水素や１３C、１８O、１５Nなどの安定同位体で置換されたものである。LCなど分離手段での溶出時間は同一であり、壁面などへの吸着による損失や、イオン源におけるイオン化効率など化学的性質が同一で質量数が異なる点が特徴的である。このようなサンプルから得られる１次質量分析結果（質量スペクトル）では、図１４に示すように、二つのピークがペアとなって検出される。Aで示されたピークが分析対象物質のピークであり、Bで示されたものが同位体置換されたもののピークである。偶然にも同一質量で別物質由来のイオンが重なっている可能性があるため、二つのピークそれぞれにタンデム質量分析を施す。そして、２次質量分析の結果（MS/MSスペクトル）より分析対象物質の同定を行い、さらに、イオン強度（ピーク面積）の相対的な比率から定量を行っても構わない。このような定量を行う場合には、予め分析対象イオンをペアで第一データベースのリストに登録しておく必要がある。また、図１４では、矢印で示されたピーク以外にも幾つかのピークが検出されている。これらのピーク全てが第一データベースのリストに登録されたものと一致しても、矢印で示されたペアのピークは優先的にタンデム質量分析の対象とされなければならない。また、第一データベースのリストに登録されたイオンであっても、ペアの一方だけのピークしか検出されない場合、未検出として、タンデム質量分析の対象とする必要はない。このような分析の出力結果は、濃度あるいは相対的比率（％など）でサンプル番号とともに表示される。診断などの場合には、正常値あるいは異常値の範囲が予め定められている。そのため、分析結果が予想される範囲を逸脱した場合、分かり易くするために、画面やプリントアウト、電子メールなどで表示される出力結果にその旨の表示（色、アンダーライン、アステリスク、フォントなど）が追加される。
【００１３】
【発明の効果】
本発明によれば、１次質量分析を行う前に分析対象としないイオンを排除することができるため、１次質量分析において分析対象イオンの検出が容易になる。そのため、目的とする物質（分析対象イオン）のタンデム質量分析が、夾雑成分の多いサンプルに対しても、行うことができる。
【００１４】
また、本発明によれば、特にイオントラップを用いた質量分析装置の場合、分析対象としないイオンのトラップが困難となり、イオントラップの空間電荷効果の影響を低減することができる。そのため、目的とする物質（分析対象イオン）のタンデム質量分析が、高感度で行うことができる。
【図面の簡単な説明】
【図１】本発明の一実施例に基づく質量分析システムのシステム構成図。
【図２】本発明の別の一実施例に基づく質量分析システムの分析フローの例。
【図３】本発明のさらに別の一実施例に基づく質量分析システムの分析フローの例。
【図４】本発明のさらにまた別の一実施例に基づく質量分析システムの分析フローの例。
【図５】本発明の別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図６】リニアトラップを用いた本発明の別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図７】四重極イオントラップ質量分析計を用いた本発明の別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図８】イオントラップにおけるイオンのトラップに関する模式図。
【図９】イオン源にMALDIを用いた本発明の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図１０】イオン源にMALDIを用いた本発明の別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図１１】イオン源にMALDIを用いた本発明のさらに別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図１２】本発明のさらに別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図１３】本発明のさらにまた別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図１４】本発明のさらにまた別の一実施例に基づく質量分析システムより得られた質量スペクトルの例。
【図１５】四重極イオントラップの従来例の断面図。
【符号の説明】
１：細孔、２：差動排気部、３：細孔、４：高真空部、５：イオン輸送部、６：イントラップ、７：飛行時間型質量分析、８：イオン加速部、９：リフレクター、１０：検出器１１：プレート、１２：窓、１３：スイッチングバルブ、１４：リング電極、１５：エンドキャップ電極。
【発明の属する技術分野】
本発明は夾雑成分を多く含む物質の質量分析システムなどに関し、特にタンパク質などの生体関連物質解析に向けた質量分析システム、分析方法、装置に関する。
【０００２】
【従来の技術】
レビューズ オブ モダーン フィジックス 第62巻（1990年）第531-540項 (Reviews of Modern Physics, Vol. 62 (1990) pp531-540)には、イオントラップに関する基本的な記載が見られる。このイオントラップの基本的構成の断面図を図１５に示す。四重極イオントラップは、二つのエンドキャップ電極と一つのリング電極から構成される。そして、これらの電極に高周波電圧を印加することにより、これらの電極間の中心部に四重極電界を形成し、気体状イオンを三次元的にトラップすることができる。高周波電圧を連続的に変化させることにより、排出されるイオンの質量を走査できる。また、四重極ポールは平行な四本のポールから構成される。そして、高周波電圧を電極に印加することにより、電極の中心部において気体状イオンを二次元的に閉じ込めることができる。また、印加する高周波電圧を調整することにより、特定の質量のイオンを排出したり、逆に特定の質量のイオンのみを閉じ込めることができる。
【０００３】
また、米国特許第Re.34000号に記載のように、四重極イオントラップではタンデム質量分析（MS/MS）を行うことができる。この装置では、ＭＳ/ＭＳの直前に分析不要のイオンを排出する。すなわち、分析不要のイオンの除去は１次質量分析の前に行われるものではない。。そして、そのイオンに共鳴する高周波電圧を印加し運動エネルギーを増加させる。以上の操作により、残留分子との衝突誘起解離（CID：Collision Induced Dissociation）による解離イオン（フラグメントイオン）が生成され、そのフラグメントイオンを質量分析（タンデム質量分析）することにより、フラグメントイオンの質量を決定することができる。この場合、先ず、CIDを施さない質量分析（１次質量分析）を行い、タンデム質量分析（MS/MS、あるいは、２次質量分析）の対象とするイオンを決定する必要がある。また、同様の操作により、特定の解離イオンに対して更なるタンデム質量分析（MSn）を行うこともできる。
【０００４】
さて、最近、タンパク質の網羅的な解析に、質量分析法が多用されている。アナリティカル ケミストリー 第73巻 （2001年） 第5683-5690項 (Analytical Chemistry, Vol. 73 (2001) pp5683-5690)には、ショットガン解析と呼ばれる分析例が記載されている。この手法では、タンパク質を酵素消化して調製したペプチド混合物を液体クロマトグラフで分離し、分離サンプルを四重極イオントラップ質量分析装置によりタンデム質量分析する。決定したイオンの質量、及び、フラグメントイオンの質量に対して、タンパク質あるいは遺伝子のデータベースで検索を行い、タンパク質の同定を行う。ペプチド混合物の種類が非常に多い場合には、液体クロマトグラフで必ずしも各ペプチドが完全に分離されない。そのため、質量分析装置には複数種のペプチドが同時に導入されることがある。そこで、データ依存分析（Data-dependent analysis）と呼ぶ自動タンデム分析が必要となっている。即ち、液体クロマトグラフで分離される分離サンプルのバンド幅が１分程度のオーダーであり、一度にタンデム質量分析を施すことができるイオンは５種類ほどに限定される。データ依存分析の設定にも依存するが、イオン強度の高いイオンを優先的にタンデム質量分析することが多い。
【０００５】
また、サーモフィニガン社製四重極イオントラップ質量分析装置（LCQ）の技術資料（www.thermo.com/eThermo/CMA/PDFs/Articles/articlesFile_10918.pdf）には、ダイナミック・イクスクルージョン機能の説明がある。分析を開始する前に、タンデム質量分析したくない分析対象外イオンの質量を入力し、リストを作成する。この操作により、質量値をリストに記載されたイオンをデータ依存分析（タンデム質量分析）の対象から外すことが可能である。この機能を用いる場合は、先ずCIDを施さない通常の質量分析を行い、検出されるイオンの質量を決定する。次に、検出イオンの中からタンデム質量分析の対象とするイオンの優先順位を決定するが、この際にリストに記載されたイオンをデータ依存分析（タンデム質量分析）の対象から外すというものである。
【０００６】
【発明が解決しようとする課題】
このように、質量分析装置に同時に導入される混合物サンプルの中で、タンデム質量分析を施すことができるサンプルの数は限られている。特に、先述のショットガン解析などでは夾雑成分が多いため、イオン強度が低くタンデム質量分析を施すことができないイオンが存在する場合が多い。そのため、分析したい微量サンプルのタンデム質量分析ができないという問題がある。データ依存分析を用いても、イオン強度の高いイオンを優先的にタンデム質量分析するため、分析対象外のイオンのみ分析することがあるためである。先述のダイナミック・イクスクルージョンが有効なのは、分析対象とする必要がない物質が予め既知の場合に限られる。未知の夾雑成分が多量に混入している場合には、分析したい微量サンプルのタンデム質量分析ができないことがある。
【０００７】
以上より本発明は、１次質量分析前に分析対象イオン、または分析対象イオンと共に分析対象外イオンを選択する機構を有することにより、未知の夾雑成分が多量に混入している場合にも分析したい微量サンプルについて分析可能なダンデム質量分析の提供を目的とする。
【０００８】
【課題を解決するための手段】
上記課題は以下の構成により達成される。
（１）分析対象候補物質のデータが記録された第一のデータベースと、分析対象でないイオンを排除するための高周波電圧を印加する高周波電源とを用い、１次質量分析の前に第１のデータベースにリストされていない分析対象でないイオンを、もしくは分析対象候補外物質のデータが記録された第２のデータベースのデータと一致する分析対象外イオンを高周波電圧により排除してから質量分析を行う。このことにより、分析対象外イオンからの悪影響を受けることがなくなり、分析対象イオンを質量分析で検出することができる。
（２）または、１次質量分析の後で、かつ残留分子との衝突誘起解離（CID）などによる解離過程及び解離イオンの質量分析（ダンデム質量分析）の前に、分析対象候補物質のデータが記録された第１のデータベースにリストされた分析対象イオンを選択し、選択されたイオンを対象にCIDを施し、ダンデム質量分析を行う。その結果、微量にしか存在しない分析対象イオンも、確実にタンデム質量分析を施すことが可能となる。
（３）さらに、（１）と（２）を組み合わせた構成としても勿論よい。
【０００９】
【発明の実施の形態】
図１に、本発明の質量分析システムの一実施例に基づくシステム構成図を示す。PCなどの端末装置において、分析対象イオンに関する第一のデータベースの入力操作を行う。新規データベースのファイル作成が必要な場合には、直接イオン質量（またはｍ/ｚ、ここでｍはイオン質量、ｚはイオンの電荷）を画面入力することも可能だが、外部データベースを利用するための情報（例えば、生物種などのカテゴリー（ヒューマンなど）、消化酵素、修飾の有無、器官など）を選択・入力することもできる。後者の場合には、遺伝子あるいはタンパク質などの外部データベースをダウンロードしたサーバーあるいはインターネットを利用してデータベースの作成や更新を行うことも可能である。既存のデータベースを利用する場合には、画面上で既存のデータベースリストから選択するなどの操作により、第一データベースを決定する。第一データベースに関する必要な入力情報を入力した後、送信入力を行う。以上の操作により、分析対象候補物質を記録した第一のデータベースは、データベース格納部に保存される。
実際の分析においては、第一データベースにリストされていない物質のイオンを検出され難くするために、情報処理部では質量分析計（MS）に印加する高周波電圧を制御する指示を高周波電圧電源に送信し、１次質量分析を行うことができる。その結果、第一データベースにリストされた分析対象候補物質のイオンが存在すれば、１次質量分析で検出される以前に、不要なイオンを排出できる。検出イオンの情報は、逐次データベース格納手段に保存されている第一のデータベースで検索される。２次質量分析の対象とするイオンの種類数は限定されるため、第一データベース内データと一致したイオンに対して優先的に２次質量分析（タンデム質量分析）を行う指示が情報処理部よりCIDに関与する電源に出される。
また、分析不要のイオンが既知の場合には、分析対象候補物質のデータを記録するための第二のデータベースを先述の第一のデータベースと同様に作成し、１次質量分析時に印加される高周波電圧の制御に用いることができる。さらに、第一のデータベースにリストされているイオンで、分析が完了したイオンの情報は、第二のデータベースに移行させることができる。このことにより、同一イオンを重複して分析することが回避され、より多種類の微量サンプルを分析することが可能となる。２次質量分析した結果とその親イオンの情報により物質の同定が行われる。
上記分析のフローの例を図２に示す。ここでは、一つのシーケンスでタンデム分析できる回数をNとし、第一のデータベースにリストされたイオンで、ｋ回検出されたものの情報は、第一データベース更新により一旦削除する。このようなデータベースの自動更新については、分析を開始する前に、（表示部の入力画面において）図１における画面操作により指定することができる。非常に微量の分析対象サンプルを分析する場合には、図３に示すように、第一データベースの自動更新はオフにする方が分析対象サンプルの検出には有利である。
また、第二のデータベースを持つ実施例のフローを図４に示す。非常にイオン強度が高いと予想される分析対象外イオンが既知の場合には、分析対象外イオンの情報を第二のデータベースとして先述の第一のデータベースと同様に作成し、１次質量分析時に印加される高周波電圧の制御に用いると便利である。これらフローの設定は、（表示部の入力操作）図１における画面操作によりにより行うことが出来る。
図５に、本発明の質量分析システムの一実施例に基づく装置構成図を示す。質量分析装置は四重極イオントラップ―飛行時間型質量分析装置である。四重極イオントラップと飛行時間型質量分析計を結合した四重極イオントラップ―飛行時間型質量分析装置自体については、例えば、アナリティカル ケミストリー 第67巻 （1995年） 第234A-242A項 (Analytical Chemistry, Vol. 67 (1995) pp234A-242A)に記載されている。ただ、本実施例では、イオントラップから排出されたイオンの軌道が飛行時間型質量分析計の加速部においてほぼ直角に曲げられる点が異なる。この形態は、飛行時間型質量分析計の加速部におけるイオンのエネルギー広がりを低減し、質量分解能を向上させるためである。液体クロマトグラフなどの液体分離部により分離されたサンプル溶液は、イオン源に導入され、エレクトロスプレーイオン化法やソニックスプレーイオン化法などの噴霧イオン化法により、気体状イオンに変換される。生成された気体状イオンは、細孔１より差動排気部２に導入される。さらに、細孔３より高真空部４に導入され、気体状イオンは多重極ポールなどで構成されるイオン輸送部５を通過し、イオントラップ６に導入される。イオントラップ６には高周波電圧が高周波電源より供給され、四重極電界によりイオントラップ６の中心部に気体状イオンはトラップされる。分析対象外イオンに対しては、分析対象外イオンをイオン輸送部５で排除するように、イオン輸送部の多重極ポールに高周波電圧を印加することができる。また、イオン輸送部５に多重極ポールが使用されない場合には、イオントラップ６で分析対象外イオンを排除し、分析対象イオンをトラップする高周波電圧がイオントラップ６に印加される。一定時間トラップされた気体状イオンは、電気的な力により右方に輸送され、飛行時間型質量分析計７のイオン加速部８に導入される。イオン加速部８では、導入された気体状イオンに対し、特定のタイミングでパルス状の高電圧を印加し、気体状イオンを特定の運動エネルギーになるまで加速する。加速された気体状イオンはリフレクター９により軌道の変更を受け、エネルギー収束されて、検出器１０で検出される。イオン加速部８から検出器１０に至るイオン軌道の長さは一定であり、イオン速度はイオンのｍ/ｚ（質量/電荷数）が大きいほど低いため、検出器１０にはｍ/ｚの低いイオンから順次検出される。検出器１０の出力は情報処理部に導入され、イオン検出時間に基づいてイオンのｍ/ｚが決定される。このようにして得られた１次質量分析結果より、２次質量分析の対象とするイオンの優先順位を情報処理部で決定する。次に、イオントラップ６に導入されるイオンの中から２次質量分析の対象とするイオンだけを単離（アイソレーション）するための高周波電圧をイオントラップ６に印加するため、情報処理部から高周波電源に指示が出される。さらに、単離イオンをCIDなどで解離するための指示が情報処理部から高周波電源に出され、解離したフラグメントイオンがイオントラップ６に生成される。フラグメントイオンは、電気的な力により右方に輸送され、飛行時間型質量分析計７のイオン加速部８に導入される。イオン加速部８では、導入された気体状イオンに対し、特定のタイミングでパルス状の高電圧を印加し、気体状イオンを特定の運動エネルギーになるまで加速する。加速された気体状イオンはリフレクター９により軌道の変更を受け、検出器１０で検出される。検出器１０の出力は情報処理部に導入され、イオン検出時間に基づいてイオンのｍ/ｚが決定される。このようにして、２次質量分析が実現する。一定数の優先順位付けされた２次質量分析対象イオンは、その優先順位に従い、順次２次質量分析が行われる。
【００１０】
イオントラップ６には、四重極イオントラップの代わりに、図６に示すような四重極ポールから構成されるリニアトラップを用いても構わない。リニアトラップ（四重極ポール）−飛行時間型質量分析装置自体については、例えば、ラピッド コミュニケーションズ イン マス スペクトロメトリー 第12巻（1998年）第1463-1474項 (Rapid Communications in Mass Spectrometry, Vol. 12 (1998) pp1463-1474)に記載がある。本実施例は図２の四重極イオントラップと機能はほぼ同等だが、一度にトラップできるイオンの量を増加させることができる点が特徴的である。リニアトラップには、分析対象外イオンを除去し、分析対象イオンはトラップできる高周波電圧を印加する。
【００１１】
また、図７に示すように、質量分析計は四重極イオントラップ質量分析計だけにすることも可能である。液体クロマトグラフなどの液体分離部により分離されたサンプル溶液は、イオン源に導入され、気体状イオンに変換される。生成された気体状イオンは、細孔１より差動排気部２に導入される。さらに、細孔３より高真空部４に設置されたイオン輸送部５を通過し、イオントラップ６に導入される。イントラップ６には高周波電圧が高周波電源より供給され、イオントラップ６の中心部に気体状イオンはトラップされる。イオントラップ６には、分析対象外イオンを除去し、分析対象イオンはトラップできる高周波電圧が印加される。一定時間トラップされた気体状イオンは、イオントラップ６に印加される高周波電圧を連続的に変化させることにより、イオンのｍ/ｚに応じてイオントラップ６より排出され、検出器１０で検出される。検出器１０の出力は情報処理部に導入され、イオン検出時間によりイオンのｍ/ｚを決定（１次質量分析）することができる。図２の例と同様に、２次質量分析を行うこともできる。飛行時間型質量分析計に比較して、四重極イオントラップでは質量分析範囲や質量分解能、質量精度は低いが、装置が小型化でき、高感度な分析が可能である。
【００１２】
以上の図5、６、７に示された実施例においては、情報処理部からの指示を受けて高周波電圧を印加することにより、分析対象外イオンを1次質量分析前に除去し、分析したい微量成分について確実に質量分析が行われる。特に図6に示されたリニアトラップを用いる場合には、リニアトラップは例えば図２の四重極イオントラップと比較して容量が2桁高いものであるため、微量成分をより確実に質量分析することができる。
図１における画面操作は、表示部と入力部とにより実行される。表示部で表示された入力画面では、分析に先立って、分析対象イオンの情報（イオンの質量やｍ/ｚなど）を入力部により入力することができる。先述のように第一のデータベースが製作され、格納手段において格納される。そして、第一のデータベースに基づき、情報処理部では高周波電源を制御し、イオントラップ６またはイオン輸送部５の多重極ポールに高周波電圧を印加する。その結果、イオン源よりイオントラップ６に導入されるイオンの中で、分析対象イオン以外のイオンに対して共鳴排出などの高周波電圧が印加され、分析対象イオンはイオントラップ６でトラップされる。また、分析に支障をきたす可能性のある分析対象外イオンが既知の場合、このようなイオンの情報を第二のデータベースに格納しておくこともできる。このことにより、分析対象外イオンは共鳴排出などの高周波電界により排除され、分析対象イオンはイオントラップ６でトラップさせることができる。以上の操作により、イオン源で生成されたイオンのなかで分析対象イオンが含まれる場合には、イオントラップ６でトラップされ、質量分析（１次質量分析）することができる。次に、１次質量分析で検出されたイオンの情報を第一のデータベースと照合し、一致するイオンに対して優先的にタンデム質量分析（２次質量分析）を行う。タンデム質量分析を行う際の優先順位としては、イオン強度の高いもの順、あるいは、フラグメントイオンが検出し易い多価イオンなどがある。次に、優先順位に従い、２次質量分析対象イオン（一種類）をイオントラップ６で単離（アイソレーション）し、CIDなどによりフラグメント化（解離）させる。図５や図６に示す実施例では、生成されたイオン（フラグメントイオン）は、電気的な力により右方に輸送され、飛行時間型質量分析計７で分析される。また、図７に示す実施例では、イオントラップ６で２次質量分析が実行される。このようなタンデム質量分析（MS/MS）シーケンスを分析対象イオンに対して順次施し、各々のMS/MSスペクトルを得る。さらに、同様の操作により、高次のタンデム質量分析｛MSｎ（ｎ＝３、４、、）｝を行うことも可能である。
図８に、イオントラップにおけるイオンのトラップに関する模式図を示す。図８（a）に示すように、通常は入射イオンをトラップする高周波電圧がイオントラップに印加されるため、左方より導入されるA+及びB+イオンの混合物はその存在比に従いイオントラップにおいてトラップされる。例えば、A+イオンがB+イオンより存在比が圧倒的に多い場合、トラップされるイオンはA+イオンが圧倒的に多くなる。一方、イオントラップでは、空間電荷効果によりトラップされるイオンの総量が制限される。そのため、イオントラップでトラップされるB+イオンの数が数個程度となることがあり、B+イオンの検出が困難となることがある。また、A+イオンのような存在比が高いイオンが幾つも混在する場合、イオントラップにおいて単離されCIDされるイオンは存在比が高いイオンのみとなり、B+イオンのような存在比の低いイオンはタンデム質量分析の対象とすることができないことがある。一方、イオントラップにおいて、入射イオンをトラップする高周波電圧の他にA+イオンを共鳴排出する高周波電圧を重ね合わせて印加する場合、図８（b）に示すように、A+イオンはイオントラップに一旦導入されるが、加熱されてイオントラップから外部に排出される。その結果、B+イオンはイオントラップで濃縮され、検出できるB+イオンの数を増加させることができる。このことは、B+イオンの検出感度が向上することを意味し、タンデム質量分析も可能となる。また、図５、６、７に示すように、イオン輸送部５に入射イオンをトラップする高周波電圧の他にA+イオンを共鳴排出する高周波電圧を重ね合わせて印加すると、A+イオンが直接イオントラップに導入されることを防止することができる。その結果、B+イオンの検出感度がさらに向上する。本件の実施例では、高周波電圧印加により、イオン存在比が低いイオンについて２‐３倍の検出感度の向上が見られた。
図９、１０、１１には、イオン源にMALDI（マトリックス支援レーザー脱離イオン化法）を用いた一実施例に基づく装置構成図示す。図９の装置例は四重極イオントラップ質量分析装置のものであり、図１０の装置例は四重極イオントラップ―飛行時間型質量分析装置のものである。イオントラップ６には、四重極イオントラップの他、図１１に示すように四重極リニアトラップを用いることもできる。試料サンプルはマトリックス物質とともにプレート１１に固定化し、乾燥させる。このようにして作製したプレート１１を真空装置内に設置し、パルスレーザー光を照射する。真空装置には窓１２が設置され、大気圧下で発振させたレーザーからのレーザー光が窓１２を透過して真空装置内に照射される。レーザー照射（ビーム径は約0.1mm）によりプレート１１からはマイクロ秒程度の間イオンが生成される。プレート１１上のレーザー照射部位を移動させることにより、次々に気体状イオンを生成する。生成されたイオンは多重極ポールなどで構成されるイオン輸送部５を通過し、イオントラップ６に導入される。イントラップ６には高周波電圧が高周波電源より供給され、イオントラップ６の中心部に気体状イオンはトラップされる。本実施例ではプレート１１は真空装置内に設置したが、大気圧下に設置することもできる。図９、１０、１１に示された実施例においても、情報処理部からの指示を受けて高周波電圧を印加することにより、分析対象外イオンを1次質量分析前に除去し、分析したい微量成分について確実に質量分析が行われる。
図１２に、本発明のさらに別の質量分析システムの一実施例に基づく装置構成図を示す。本実施例は、二次元液体クロマトグラフィー／質量分析システムである。一次元目の液体クロマトグラフカラム（LCカラム）にインジェクションバルブより液体サンプルが導入されるが、移動相溶液にグラジエントをかけるために、二つの液体リザーバー１に用意された移動相溶液２種類が２台のポンプ１により液体流量を調節されてインジェクションバルブに導入される。LCカラムで分離された液体サンプルは逐次スイッチングバルブ１３に導入され、トラップカラムで吸着される。トラップカラムでの吸着を一定時間行うと、ポンプ１は停止する。次に、別の二つの液体リザーバー２に用意された移動相溶液２種類が２台のポンプ２により液体流量を調節されて、トラップカラムに導入される。そして、トラップカラムに吸着された分離サンプルを溶出させ、二次元目液体クロマトグラフカラム（LCカラム）に導入され、さらに分離される。分離サンプルは逐次質量分析装置に導入され、質量分析される。分離終了後、ポンプ２は停止し、ポンプ１が動作する。一次元目LCカラムで分離される液体サンプルは、トラップカラムで一定時間吸着され、二次元目LCカラムで分離され、質量分析される。このようにして、二次元的にLC分離された液体サンプルは、逐次質量分析される。混合しているサンプルの種類が少ない場合には、一次元のLCだけで分離するLC/MS分析で対応可能だが、サンプル種類が非常に多い場合には二次元LCでも完全に分離することは出来ず、MSに導入されるサンプルは混合物であることが多い。先に述べたように、同一サンプルに対してタンデム質量分析できるイオンの種類には限りがあり、微量サンプルの場合には分析対象物質を優先的にタンデム質量分析することが非常に有効である。
分析対象物質が予め明確化されており、分析サンプル数が多い場合には、LCカラムを並列処理することにより、高スループット分析を行うことができる。図１３に示す実施例では、LC/MS分析を行うが、LC及びイオン源が２つ並列に用いられている。分析対象物質のLC溶出時間が予測できれば、LC分析の開始時間をずらすことにより、分析対象物質由来の気体状イオンが生成される時間をずらすことができる。即ち、イオン源１より生成される分析対象物質由来の気体状イオンを分析した後、イオン源２より生成される分析対象物質由来の気体状イオンを分析する。イオン源と質量分析装置との結合部では、複数のイオン源を時間的に切り替える。イオン源とLCカラムは一体化されていても構わない。別の方法としては、イオン源は一台に固定し、イオン源に導入される分離液体サンプルをバルブなどで切り替える方法があるが、LC末端からイオン源までの距離が長くなり、イオン生成時に分離度が低下する可能性がある。このようなLCの並列処理では、分析対象物質由来の気体状イオンを分析しない待ち時間（１時間程度）を有効活用でき、高スループット分析に有利である。本実施例では、並列処理数が２だが、数を増加させても構わない。複数種類の物質を分析することも可能とするため、イオン源の移動時間と第一のデータベースにリストされた分析対象イオンとの対応やLC分析の開始時間を予め入力部で指定しておくことが便利である。
代謝物質の評価や診断においては、分析対象物質が予め明確化されており、その物質の定量が必要である。このような場合、その物質と化学的な性質は殆ど同一だが分子量だけが異なるような内部標準物質を一定量だけサンプルに添加すると正確な定量分析が可能となる。典型的な内部標準物質は、重水素や１３C、１８O、１５Nなどの安定同位体で置換されたものである。LCなど分離手段での溶出時間は同一であり、壁面などへの吸着による損失や、イオン源におけるイオン化効率など化学的性質が同一で質量数が異なる点が特徴的である。このようなサンプルから得られる１次質量分析結果（質量スペクトル）では、図１４に示すように、二つのピークがペアとなって検出される。Aで示されたピークが分析対象物質のピークであり、Bで示されたものが同位体置換されたもののピークである。偶然にも同一質量で別物質由来のイオンが重なっている可能性があるため、二つのピークそれぞれにタンデム質量分析を施す。そして、２次質量分析の結果（MS/MSスペクトル）より分析対象物質の同定を行い、さらに、イオン強度（ピーク面積）の相対的な比率から定量を行っても構わない。このような定量を行う場合には、予め分析対象イオンをペアで第一データベースのリストに登録しておく必要がある。また、図１４では、矢印で示されたピーク以外にも幾つかのピークが検出されている。これらのピーク全てが第一データベースのリストに登録されたものと一致しても、矢印で示されたペアのピークは優先的にタンデム質量分析の対象とされなければならない。また、第一データベースのリストに登録されたイオンであっても、ペアの一方だけのピークしか検出されない場合、未検出として、タンデム質量分析の対象とする必要はない。このような分析の出力結果は、濃度あるいは相対的比率（％など）でサンプル番号とともに表示される。診断などの場合には、正常値あるいは異常値の範囲が予め定められている。そのため、分析結果が予想される範囲を逸脱した場合、分かり易くするために、画面やプリントアウト、電子メールなどで表示される出力結果にその旨の表示（色、アンダーライン、アステリスク、フォントなど）が追加される。
【００１３】
【発明の効果】
本発明によれば、１次質量分析を行う前に分析対象としないイオンを排除することができるため、１次質量分析において分析対象イオンの検出が容易になる。そのため、目的とする物質（分析対象イオン）のタンデム質量分析が、夾雑成分の多いサンプルに対しても、行うことができる。
【００１４】
また、本発明によれば、特にイオントラップを用いた質量分析装置の場合、分析対象としないイオンのトラップが困難となり、イオントラップの空間電荷効果の影響を低減することができる。そのため、目的とする物質（分析対象イオン）のタンデム質量分析が、高感度で行うことができる。
【図面の簡単な説明】
【図１】本発明の一実施例に基づく質量分析システムのシステム構成図。
【図２】本発明の別の一実施例に基づく質量分析システムの分析フローの例。
【図３】本発明のさらに別の一実施例に基づく質量分析システムの分析フローの例。
【図４】本発明のさらにまた別の一実施例に基づく質量分析システムの分析フローの例。
【図５】本発明の別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図６】リニアトラップを用いた本発明の別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図７】四重極イオントラップ質量分析計を用いた本発明の別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図８】イオントラップにおけるイオンのトラップに関する模式図。
【図９】イオン源にMALDIを用いた本発明の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図１０】イオン源にMALDIを用いた本発明の別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図１１】イオン源にMALDIを用いた本発明のさらに別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図１２】本発明のさらに別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図１３】本発明のさらにまた別の一実施例に基づく質量分析システムの装置構成図。
【図１４】本発明のさらにまた別の一実施例に基づく質量分析システムより得られた質量スペクトルの例。
【図１５】四重極イオントラップの従来例の断面図。
【符号の説明】
１：細孔、２：差動排気部、３：細孔、４：高真空部、５：イオン輸送部、６：イントラップ、７：飛行時間型質量分析、８：イオン加速部、９：リフレクター、１０：検出器１１：プレート、１２：窓、１３：スイッチングバルブ、１４：リング電極、１５：エンドキャップ電極。
Claims (7)
- 試料をイオン化するイオン源と、
前記試料をイオン化したイオンの1次質量分析及び前記1次質量分析の後に前記イオンを解離させて生じた解離イオンの２次質量分析を行う質量分析部と、
分析対象外物質の少なくともイオンの質量又は質量電荷比を含む情報が記録された第２のデータベースと、
前記分析対象外物質のイオンを前記１次質量分析より前に排除するための高周波電圧を印加する高周波電源と、
前記第２のデータベースに記録された前記分析対象外物質の情報と一致する前記分析対象外物質のイオンの排除命令を前記高周波電源に出力する手段と、前記２次質量分析されたイオンの少なくとも質量又は質量電荷比を含む情報を、前記イオン源でイオン化された前記試料の分析時間中に前記第２のデータベースに加えることで前記第２のデータベースを更新する手段とを備えた制御部と、を有することを特徴とする質量分析システム。 - 分析対象候補物質の少なくともイオンの質量又は質量電荷比を含む情報が記録された第１のデータベースを更に有し、
前記制御部は、前記２次質量分析された前記第１のデータベースに記録されている前記情報を前記第２のデータベースに移行させることを特徴とする請求項１に記載の質量分析システム。 - 前記イオンをトラップするトラップ部が設置され、前記トラップ部は、前記高周波電源により、前記第２のデータベースに記録された情報と一致する前記分析対象外物質のイオンを前記１次質量分析より前に排除するための高周波電圧を印加されることを特徴とする請求項１に記載の質量分析システム。
- 前記第１のデータベースに記録された前記分析対象候補物質の少なくともイオンの質量又は質量電荷比を含む情報を選択する選択部を更に有し、
前記制御部は、前記選択部により選択された前記第１のデータベースに記録されている情報と一致する前記分析対象候補物質由来のイオンを解離させて生成された解離イオンを質量分析させる指令を出し、前記質量分析部は前記制御部からの指令に基づき前記解離イオンの質量分析を行うことを特徴とする請求項２に記載の質量分析システム。 - イオン源と、質量分析部と、高周波電源と、制御部と、分析対象外物質の少なくともイオンの質量又は質量電荷比を含む情報が記録された第２のデータベースを具備する装置を用い、
前記制御部は、（１）前記イオン源にて試料をイオン化する工程と、（２）前記イオン化したイオンの中から前記第２のデータベースに記録された情報と一致する分析対象外物質のイオンを前記高周波電源を用いることにより排除する工程と、（３）前記排除する工程の後に前記質量分析部において前記イオンの１次質量分析を行う工程と、（４）引き続き前記イオンを解離させて生じた解離イオンの２次質量分析を行う工程と、（５）前記２次質量分析が完了した前記イオンの少なくとも質量又は質量電荷比を含む情報を、前記イオン源にてイオン化された試料の分析時間中に前記第２のデータベースに追加する工程とを行い、
前記分析時間中に（２）から（５）までの工程を２回以上繰り返すことを特徴とする質量分析方法。 - 分析対象候補物質の少なくともイオンの質量又は質量電荷比を含む情報が記録された第１のデータベースを更に具備する前記装置を用い、
（４）及び（５）の工程は、前記質量分析部より入力される前記 1 次質量分析の情報に ついて、前記第１のデータベースに含まれる情報と一致する前記 1 次質量分析の情報を検索し、前記一致した情報のイオンを選択的に解離させ、生成される解離イオンを前記質量分析部で前記２次質量分析し、前記２次質量分析が完了した前記第１のデータベースに記録されている前記情報を、前記第２のデータベースに移行する工程であることを特徴とする請求項５に記載の質量分析方法。 - 分析対象候補物質の少なくともイオンの質量又は質量電荷比を含む情報が記録された第１のデータベースを更に具備する前記装置を用い、
（４）の工程は、前記制御部で前記質量分析部より入力される前記 1 次質量分析の情報について、前記第１のデータベースに含まれる情報と一致する前記 1 次質量分析の情報を検索し、前記一致した情報のイオンを選択的に解離させ、生成される解離イオンを前記質量分析部で前記２次質量分析をする工程であることを特徴とする請求項５に記載の質量分析方法。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2002230757A JP4239513B2 (ja) | 2002-08-08 | 2002-08-08 | 質量分析システム、質量分析方法、質量分析装置 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2002230757A JP4239513B2 (ja) | 2002-08-08 | 2002-08-08 | 質量分析システム、質量分析方法、質量分析装置 |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2004071420A JP2004071420A (ja) | 2004-03-04 |
| JP2004071420A5 JP2004071420A5 (ja) | 2005-06-23 |
| JP4239513B2 true JP4239513B2 (ja) | 2009-03-18 |
Family
ID=32016716
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2002230757A Expired - Fee Related JP4239513B2 (ja) | 2002-08-08 | 2002-08-08 | 質量分析システム、質量分析方法、質量分析装置 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JP4239513B2 (ja) |
Families Citing this family (10)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2005241251A (ja) | 2004-02-24 | 2005-09-08 | Hitachi High-Technologies Corp | 質量分析システム |
| JP4025850B2 (ja) * | 2004-03-19 | 2007-12-26 | 独立行政法人産業技術総合研究所 | 糖鎖構造同定方法及び同解析装置 |
| JP4491299B2 (ja) * | 2004-08-11 | 2010-06-30 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 質量分析装置 |
| JP4644560B2 (ja) * | 2005-08-09 | 2011-03-02 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 質量分析システム |
| JP4801455B2 (ja) * | 2006-01-26 | 2011-10-26 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 質量分析システム |
| JP4857000B2 (ja) * | 2006-03-24 | 2012-01-18 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 質量分析システム |
| US7884318B2 (en) * | 2008-01-16 | 2011-02-08 | Metabolon, Inc. | Systems, methods, and computer-readable medium for determining composition of chemical constituents in a complex mixture |
| JP5150370B2 (ja) * | 2008-05-30 | 2013-02-20 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 質量分析システムおよび質量分析方法 |
| WO2015104844A1 (ja) * | 2014-01-10 | 2015-07-16 | 株式会社島津製作所 | 質量分析データ処理方法及び質量分析データ処理装置 |
| CN111710588B (zh) * | 2015-04-23 | 2023-09-26 | 英国质谱公司 | 在离子阱中分离离子 |
-
2002
- 2002-08-08 JP JP2002230757A patent/JP4239513B2/ja not_active Expired - Fee Related
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JP2004071420A (ja) | 2004-03-04 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP5154511B2 (ja) | 質量分析のための方法および装置 | |
| JP4588925B2 (ja) | 質量分析方法および装置 | |
| US11378560B2 (en) | Mass spectrum data acquisition and analysis method | |
| JP5214607B2 (ja) | 質量分析計での解離型のデータ依存式選択 | |
| JP4644560B2 (ja) | 質量分析システム | |
| US7548818B2 (en) | Automated analysis of complex matrices using mass spectrometer | |
| US11075063B2 (en) | Two dimensional MSMS | |
| JP2001249114A (ja) | 質量分析方法および装置 | |
| JP7241821B2 (ja) | 最適化された標的を絞った分析 | |
| JP5579161B2 (ja) | 質量分析計を用いて物質を分析するシステムおよび方法 | |
| JP4239513B2 (ja) | 質量分析システム、質量分析方法、質量分析装置 | |
| JP5472068B2 (ja) | 質量分析方法及び装置 | |
| JP4491299B2 (ja) | 質量分析装置 | |
| EP1958233B1 (en) | Automated analysis of complex matrices using mass spectrometer | |
| US20200161112A1 (en) | Methods for multiplexed ms-3 analyses of peptides | |
| EP3745444A1 (en) | Operating a mass spectrometer utilizing mass spectral database search | |
| US11232936B2 (en) | Absolute quantitation of a target analyte using a mass spectrometer | |
| EP3745407A1 (en) | Operating a mass spectrometer utilizing a promotion list | |
| US10748752B2 (en) | Data independent acquisition with variable multiplexing degree | |
| WO2021240441A1 (en) | Operating a mass spectrometer for sample quantification | |
| WO2022106948A1 (en) | Operating a mass spectrometer for sample quantification | |
| James et al. | Quo Vadis |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20040928 |
|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20040928 |
|
| RD01 | Notification of change of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7421 Effective date: 20060419 |
|
| A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20070814 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20070828 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20071024 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20080603 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20080731 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20081202 |
|
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20081215 |
|
| FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20120109 Year of fee payment: 3 |
|
| R151 | Written notification of patent or utility model registration |
Ref document number: 4239513 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R151 |
|
| FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20120109 Year of fee payment: 3 |
|
| FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20130109 Year of fee payment: 4 |
|
| LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |